СПОСОБ ИНГИБИРОВАНИЯ ВОЗБУДИТЕЛЯ ХЛАМИДИЙНОЙ ИНФЕКЦИИ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ГЕНОВ АНТИМИКРОБНЫХ ПЕПТИДОВ ПАУКА LACHESANA TARABAEVI Российский патент 2012 года по МПК C12Q1/68 C07K14/00 

Описание патента на изобретение RU2468089C2

Область техники, к которой относится изобретение

Изобретение относится к области биотехнологии и молекулярной биологии, может быть использовано в фармацевтической промышленности и касается способов терапии внутриклеточных инфекций (хламидиозов).

Уровень техники

На протяжении последних лет во всем мире отмечается значительный рост устойчивости возбудителей инфекционных заболеваний к антибиотикам. Возникновение антимикробной резистентности является естественным биологическим ответом на использование антибиотиков, которые создают селективное давление, способствующее отбору, выживанию и размножению резистентных штаммов микроорганизмов [1].

В связи с этим ставится вопрос о создании альтернативных терапевтических средств, резистентность к которым будет развиваться ограниченно или полностью отсутствовать. Такими средствами могут явиться антимикробные пептиды (АМП) - уникальная и чрезвычайно разнообразная группа соединений, являющаяся важным компонентом врожденного иммунитета всех высших организмов. Несомненными преимуществами АМП перед другими антибиотиками являются более широкий спектр и быстрота антибактериального действия, трудность в селекции устойчивых мутантов in vitro, возможность синтеза аналогов природных пептидов с измененными свойствами [2]. Однако применение искусственно синтезированных АМП (с помощью пептидного синтеза) ограничено в силу высокой стоимости их получения.

До настоящего времени для подавления хламидийной инфекции при помощи АМП использовались дорогостоящие искусственно синтезированные химическим путем пептиды, которыми обрабатывали инфекционные формы хламидий - элементарные тельца [3, 4].

В разработке Bals R. et al. [5] (ближайший аналог) был предложен способ доставки гена, кодирующего АМП LL-37 из семейства кателицидинов в эпителиальные клетки дыхательных путей при муковисцидозе для наработки АМП непосредственно в очаге поражения с целью подавления инфекций Pseudomonas aeruginosa и Staphylococcus aureus. В качестве векторной системы использовался аденовирус человека. При введении этого вектора уровень содержания LL-37 возрастал в несколько раз, что вело к значительному ингибированию роста указанных патогенов. Возможность использования таких векторов для борьбы с другими инфекциями не исследовалась.

Задачей настоящего изобретения является создание прототипов генноинженерных препаратов для эффективного подавления хламидийной инфекции на основе рекомбинантных плазмидных векторов, содержащих гены АМП.

Поставленная задача решается путем конструирования рекомбинантных плазмидных векторов, содержащих последовательности генов АМП паука Lachesana tarabaevi, способных инактивировать Chlamydia trachomatis.

В данном изобретении мы используем гены АМП CIT1a и Ltc3a из яда среднеазиатского паука L. tarabaevi [6-8]. Отличительной особенностью этих пептидов является высокая антимикробная активность. Аминокислотные последовательности пептидов и нуклеотидные последовательности их генов приведены на рисунке 1.

Нуклеотидные последовательности, соответствующие генам АМП, синтезируют на автоматическом синтезаторе нуклеиновых кислот ASM-700 (Биоссет, Россия) и клонируют в плазмидный вектор pBI-EGFP (Clontech, США) с предварительно делегированным геном EGFP по сайту рестрикции PvuII. В этот плазмидный вектор по сайту рестрикции BglII также клонируют нуклеотидную последовательность гена трансактиваторного белка rtTA, представляющего собой составной полипептид из тетрациклинового белка-репрессора (TetR - последовательность из оперона тетрациклиновой устойчивости транспозона Tn10 Escherichia coli) и активаторного домена (AD - последовательность из белка VP16 вируса простого герпеса) [9]. Рекомбинантные плазмидные векторы имеют название pBI/rtTA/CIT1a (содержит ген CIT1a) и pBI/rtTA/Ltc3a (содержит ген Ltc3a) (рисунок 2). Экспрессия генов АМП начинается только в присутствии индуктора - доксициклина, что позволяет осуществлять регулирование уровня экспрессии генов АМП с помощью различных доз индуктора. Это является немаловажным в случае, если продукты экспрессии генов будут проявлять нежелательный побочный эффект.

Раскрытие изобретения

Поскольку показано, что гены АМП кателицидинов могут быть использованы в составе вирусных векторов для подавления стафилококковых и псевдомонадных инфекций, мы разработали рекомбинантные плазмидные векторы (прототипы генно-инженерных лекарственных средств), содержащие гены АМП паука L. tarabaevi для подавления инфекций, вызываемых внутриклеточной бактерией - хламидией. Для успешной борьбы с указанным возбудителем инфекции разработан протокол для проверки подавления хламидийной инфекции в культуре клеток, включающий:

1. трансфекцию культуры клеток HEK293 (АТСС CRL-1573) рекомбинантным плазмидным вектором pBI/rtTA/CIT1a или pBI/rtTA/Ltc3a с использованием липофектамина 2000 (Invitrogen, США);

2. заражение клеток хламидией С.trachomatis UW-57/Cx (АТСС VR-878) через 24 ч;

3. индукция экспрессии генов АМП с помощью доксициклина (Sigma, США).

4. окрашивание хламидийных включений с использованием моноклональных антител, конъюгированных с флуоресцеином (Orion Diagnostica, Финляндия) спустя 24 ч;

5. подсчет хламидийных включений в сравнении с контролем (нетрансфицированные клетки) с помощью люминесцентной микроскопии.

Пример реализации изобретения

Ингибирование инфекции С.trachomatis UW-57 в линии клеток HEK293 после трансфекции рекомбинантным плазмидным вектором pBI/rtTA/CIT1a или pBI/rtTA/Ltc3a.

1. Клетки линии НЕК293 выращивают в среде MEM (Invitrogen, США), содержащей 10% эмбриональной бычьей сыворотки (ЭБС), 2 мг/мл глюкозы в планшете на покровных стеклах. Инокулят (10-15 включений в поле зрения при увеличении ×900) вносят в линию клеток HEK293 через 24 ч после трансфекции рекомбинантными плазмидными векторами pBI/rtTA/CIT1a или pBI/rtTA/Ltc3a и центрифугируют при 3000 g 1 ч при комнатной температуре с последующей заменой ростовой среды.

2. Трансфекцию проводят с использованием липофектамина 2000. В одной пробирке к 1 мкг рекомбинантного плазмидного вектора добавляют 15 мкл среды MEM без ЭБС. В другой пробирке к 15 мкл среды MEM без ЭБС добавляют 5 мкл липофектамина. Перемешивают осторожным пипетированием, после чего содержимое пробирок объединяют и инкубируют при комнатной температуре 15 мин. Далее полученную смесь ДНК/липофектамин добавляют к клеткам на 5 ч.

3. Заражение хламидиями проводят, как описано в п.1, с последующим добавлением доксициклина в дозе 20 нг/мл. Контрольные клетки трансфицируют в тех же условиях, но не вызывают индукцию экспрессии генов АМП доксициклином.

4. Через 24 ч клетки промывают фосфатно-солевым буфером (ФСБ; 1,7 мМ KH2PO4, 5,2 мМ Na2HPO4, 150 мМ NaCl, pH 7,4) и фиксируют метанолом. Добавляют антитела и инкубируют 30 мин при комнатной температуре.

5. Далее препарат промывают ФСБ и проводят подсчет количества включений (не менее 50 полей зрения) с использованием микроскопа Eclipse E800 (Nikon, Япония) при увеличении ×400. Результаты приведены на рисунке 3.

Литература

1. Fischbach M.A., Walsh C.T. // Science. 2009. V.325. P.1089-1093.

2. Finlay B.B., Hancock R.E.W. //Nat. Rev. Microbiol. 2004. V.2. P.497-504.

3. Yasin В., Pang M., Wagar E.A. // J. Pept. Res. 2004. V.64. P.65-71.

4. Chong-Cerrillo С., Selsted M.E., Peterson E.M., de la Maza L.M. // J. Pept. Res. 2003. V.61. P.237-242.

5. Bals R., Weiner D.J., Meegalla R.L., Wilson J.M. // J. Clin. Invest. 1999. V.103. P.1113-1117.

6. Kozlov S.A., Vassilevski A.A., Feofanov A.V., Surovoy A.Y., Karpunin D.V., Grishin E.V. // J. Biol. Chem. 2006. V.281. P.20983-209892.

7. Vassilevski A.A., Kozlov S.A., Samsonova O.V., Egorova N.S., Karpunin D.V., Pluzhnikov K.A., Feofanov A.V., Grishin E.V. // Biochem. J. 2008. V.411 P.687-696.

8. RU 2302466, 2005.

9. Gossen M., Bujard H. // Proc. Natl. Acad. Sci. 1992. V.89. P.5547-5551.

Похожие патенты RU2468089C2

название год авторы номер документа
СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АКТИВНОСТИ ТРАНСКРИПЦИОННЫХ ФАКТОРОВ 2012
  • Лазарев Василий Николаевич
RU2520083C1
ПЕПТИДЫ ЛАТАРЦИНЫ, ПРОЯВЛЯЮЩИЕ АНТИМИКРОБНУЮ АКТИВНОСТЬ 2006
  • Козлов Сергей Александрович
  • Василевский Александр Александрович
  • Воронцова Ольга Валентиновна
  • Полянский Антон Александрович
  • Волынский Павел Евгеньевич
  • Феофанов Алексей Валерьевич
  • Ефремов Роман Гербертович
  • Арсеньев Александр Сергеевич
  • Гришин Евгений Васильевич
RU2306148C1
ПЕПТИДЫ ЛАТАРЦИНЫ, ПРОЯВЛЯЮЩИЕ АНТИМИКРОБНУЮ АКТИВНОСТЬ 2005
  • Козлов Сергей Александрович
  • Василевский Александр Александрович
  • Феофанов Алексей Валерьевич
  • Суровой Андрей Юрьевич
  • Арсеньев Александр Сергеевич
  • Гришин Евгений Васильевич
RU2302467C1
ПЕПТИДЫ ЛАТАРЦИНЫ, ПРОЯВЛЯЮЩИЕ АНТИМИКРОБНУЮ АКТИВНОСТЬ 2006
  • Козлов Сергей Александрович
  • Василевский Александр Александрович
  • Самсонова Ольга Вячеславовна
  • Полянский Антон Александрович
  • Волынский Павел Евгеньевич
  • Феофанов Алексей Валерьевич
  • Ефремов Роман Гербертович
  • Арсеньев Александр Сергеевич
  • Гришин Евгений Васильевич
RU2319745C1
ПЕПТИДЫ ЛАТАРЦИНЫ, ПРОЯВЛЯЮЩИЕ АНТИМИКРОБНУЮ АКТИВНОСТЬ 2005
  • Козлов Сергей Александрович
  • Василевский Александр Александрович
  • Феофанов Алексей Валерьевич
  • Суровой Андрей Юрьевич
  • Арсеньев Александр Сергеевич
  • Гришин Евгений Васильевич
RU2302466C1
ПЕПТИДЫ, ПРОЯВЛЯЮЩИЕ АНТИМИКРОБНУЮ АКТИВНОСТЬ 2005
  • Козлов Сергей Александрович
  • Василевский Александр Александрович
  • Феофанов Алексей Валерьевич
  • Арсеньев Александр Сергеевич
  • Гришин Евгений Васильевич
RU2302425C2
БЕТА-ШПИЛЕЧНЫЙ ПОЛИПЕПТИД, ОБЛАДАЮЩИЙ АНТИМИКРОБНОЙ АКТИВНОСТЬЮ 2015
  • Пантелеев Павел Валерьевич
  • Баландин Сергей Владимирович
  • Болосов Илья Александрович
  • Овчинникова Татьяна Владимировна
RU2624020C2
Пептид, проявляющий антибактериальные и противоопухолевые свойства 2019
  • Пантелеев Павел Валерьевич
  • Емельянова Анна Андреевна
  • Болосов Илья Александрович
  • Баландин Сергей Владимирович
  • Шамова Ольга Валерьевна
  • Кокряков Владимир Николаевич
  • Овчинникова Татьяна Владимировна
RU2702661C1
СПОСОБ ОЦЕНКИ БИОАКТИВНОСТИ ХИМИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЙ 2013
  • Лазарев Василий Николаевич
  • Полина Надежда Федоровна
  • Ковальчук Сергей Игоревич
  • Говорун Вадим Маркович
RU2556823C2
Способ получения рекомбинантного антимикробного пептида UBI18-35, рекомбинантная плазмидная ДНК pET31b-2хUBI18-35 и штамм-продуцент Escherichia coli BL21 Rosetta DE3 pLysS/ pET31b-2хUBI18-35 антимикробного пептида UBI18-35 2018
  • Першина Александра Геннадьевна
  • Ефимова Лина Викторовна
  • Ащеулова Дарья Олеговна
RU2698037C1

Иллюстрации к изобретению RU 2 468 089 C2

Реферат патента 2012 года СПОСОБ ИНГИБИРОВАНИЯ ВОЗБУДИТЕЛЯ ХЛАМИДИЙНОЙ ИНФЕКЦИИ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ГЕНОВ АНТИМИКРОБНЫХ ПЕПТИДОВ ПАУКА LACHESANA TARABAEVI

Изобретение раскрывает создание рекомбинантных плазмидных векторов pBI/rtTA/CIT1a и pBI/rtTA/Ltc3a, в состав которых входит минимальный промотор цитомегаловируса человека, последовательности ДНК, кодирующие антимикробные пептиды CIT1a и Ltc3a из среднеазиатского паука Lachesana tarabaevi, последовательность ДНК, кодирующая трансактиваторный белок для эффективной экспрессии генов пептидов. Для ингибирования Chlamydia trachomatis проводят липофекцию клеток НЕК293 полученными векторами, инкубируют в присутствии доксициклина для индукции экспрессии генов, кодирующих антимикробные пептиды, затем клетки заражают хламидиями. После инкубирования клетки окрашивают и подсчитывают включения хламидий с помощью моноклональных антител к поверхностным антигенам хламидий, конъюгированных с флуоресцеином. Уровень ингибирования определяют по уменьшению количества хламидийных включений в трансформированных клетках по сравнению с контролем - количеством хламидийных включений в нетрансформированных клетках. Способ обеспечивает уровень ингибирования хламидийной инфекции 70-80%. 4 ил.

Формула изобретения RU 2 468 089 C2

Способ ингибирования возбудителя хламидийной инфекции с использованием генов, кодирующих антимикробные пептиды (АМП), отличающийся тем, что культуру клеток трансфецируют рекомбинантным плазмидным вектором pBI/rtTA/CIT1a, содержащим ген CIT1a, или pBI/rtTA/Ltc3a, содержащим ген Ltc3a, кодирующим соответствующие пептиды из яда паука Lachesana tarabaevi, с использованием липофектамина, клетки инкубируют, добавляют доксициклин для индукции экспрессии генов АМП, заражают хламидиями, повторно инкубируют, затем окрашивают и подсчитывают хламидийные включения с помощью моноклональных антител к поверхностным антигенам хламидий, конъюгированных с флуоресцеином, и определяют ингибирование хламидий по уменьшению количества хламидийных включений в трансфецированных клетках по сравнению с контролем - нетрансфецированными клетками.

Документы, цитированные в отчете о поиске Патент 2012 года RU2468089C2

ПЕПТИДЫ ЛАТАРЦИНЫ, ПРОЯВЛЯЮЩИЕ АНТИМИКРОБНУЮ АКТИВНОСТЬ 2005
  • Козлов Сергей Александрович
  • Василевский Александр Александрович
  • Феофанов Алексей Валерьевич
  • Суровой Андрей Юрьевич
  • Арсеньев Александр Сергеевич
  • Гришин Евгений Васильевич
RU2302466C1
ПЕПТИДЫ, ПРОЯВЛЯЮЩИЕ АНТИМИКРОБНУЮ АКТИВНОСТЬ 2005
  • Козлов Сергей Александрович
  • Василевский Александр Александрович
  • Феофанов Алексей Валерьевич
  • Арсеньев Александр Сергеевич
  • Гришин Евгений Васильевич
RU2302425C2
СПОСОБ ЛЕЧЕНИЯ ХРОНИЧЕСКИХ ХЛАМИДИЙНЫХ ПРОСТАТИТОВ, УСТОЙЧИВЫХ К СТАНДАРТНОЙ ТЕРАПИИ 1999
  • Семёнов А.В.
  • Мартенова А.А.
  • Сотникова Н.Ю.
  • Стрельников А.И.
  • Паникратов К.Д.
RU2200025C2
US 5242686 A, 07.09.1993.

RU 2 468 089 C2

Авторы

Лазарев Василий Николаевич

Шкарупета Марина Михайловна

Левицкий Сергей Алексеевич

Василевский Александр Александрович

Козлов Сергей Александрович

Гришин Евгений Васильевич

Говорун Вадим Маркович

Даты

2012-11-27Публикация

2009-10-07Подача