ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Настоящее изобретение относится к плюрипотентным стволовым клеткам, которые легко выращиваются в культуре в полистироловой посуде для культивирования тканей и не требуют линии питающих клеток. В настоящем изобретении также предлагаются способы производства линии плюрипотентных стволовых клеток из эмбриональных стволовых клеток человека.
ПРЕДПОСЫЛКИ СОЗДАНИЯ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Достижения в области клеточной заместительной терапии сахарного диабета 1-го типа и нехватка трансплантируемых островков Лангерганса заставили обратить внимание на разработку источников инсулинпродуцирующих клеток, или β-клеток, подходящих для трансплантации. Одним из подходов является формирование функциональных β-клеток из плюрипотентных стволовых клеток, таких как, например, эмбриональные стволовые клетки.
При эмбриональном развитии позвоночных, плюрипотентные стволовые клетки дают начало группе клеток, формирующих три зародышевых листка (эктодерму, мезодерму и эндодерму) в ходе процесса, именуемого гаструляцией. Ткани, из которых состоят, например, щитовидная железа, тимус, поджелудочная железа, кишечник и печень, будут развиваться из эндодермы через промежуточную стадию. Промежуточной стадией данного процесса является образование сформированной эндодермы. Клетки сформированной эндодермы экспрессируют ряд маркеров, таких как HNF-3 beta, GATA-4, Mixl1, CXCR4 и SOX-17.
Формирование поджелудочной железы происходит при дифференцировке сформированной эндодермы в панкреатическую эндодерму. Клетки панкреатической эндодермы экспрессируют ген панкреатическо-дуоденального гомеобокса, PDX-1. При отсутствии PDX-1 развитие поджелудочной железы не идет дальше формирования вентрального и дорзального зачатков. Следовательно, экспрессия PDX-1 является важным этапом органогенеза поджелудочной железы. Зрелая поджелудочная железа содержит, среди других типов клеток, экзокринную ткань и эндокринную ткань. Экзокринная и эндокринная ткани образуются при дифференцировке панкреатической эндодермы.
Клетки, обладающие свойствами островковых клеток, как сообщалось, были получены из эмбриональных клеток мыши. Например, в публикации Lumelsky et al. (Science 292:1389, 2001) сообщается о дифференцировке мышиных эмбриональных стволовых клеток в инсулин-секретирующие структуры, сходные с островками поджелудочной железы. Soria et al. (Diabetes 49:157, 2000) сообщают, что инсулин-секретирующие клетки, полученные из мышиных эмбриональных стволовых клеток, нормализовали гликемию у мышей с диабетом, вызванным стрептозотоцином.
В одном примере, в публикации Hori et al. (PNAS 99: 16105, 2002) описывается, что обработка мышиных эмбриональных стволовых клеток ингибиторами фосфоинозитид 3-киназы (LY294002) приводила к образованию клеток, сходных с β-клетками.
В другом примере, Blyszczuk et al. (PNAS 100:998, 2003) сообщается о получении инсулин-продуцирующих клеток из мышиных эмбриональных стволовых клеток с конститутивной экспрессией Pax4.
Micallef et al. сообщают, что ретиноевая кислота может регулировать способность эмбриональных стволовых клеток формировать PDX-1-положительную панкреатическую эндодерму. Ретиноевая кислота с наибольшей эффективностью индуцирует экспрессию PDX-1 при добавлении в культуру на 4 день дифференцировки эмбриональных стволовых клеток в течение периода, соответствующего концу гаструляции эмбриона (Diabetes 54:301, 2005).
В публикации Miyazaki et al. сообщается о линии мышиных эмбриональных стволовых клеток со сверхэкспрессией PDX-1. Эти результаты показывают, что экспрессия экзогенного PDX-1, очевидно, повышает экспрессию генов инсулина, соматостатина, глюкокиназы, нейрогенина 3, P48, Pax6 и HNF6 в образующихся дифференцированных клетках (Diabetes 53: 1030, 2004).
В публикации Skoudy et al. сообщается, что активин-A (входящий в суперсемейство TGFβ) повышает экспрессию экзокринных панкреатических генов (p48 и амилаза) и эндокринных генов (PDX-1, инсулин и глюкагон) в эмбриональных стволовых клетках мыши. Максимальный эффект наблюдался при использовании активина-A в концентрации 1 нМ. Также эти авторы наблюдали, что на уровень экспрессии мРНК инсулина и PDX-1 не влияла ретиноевая кислота; однако обработка раствором FGF-7 с концентрацией 3 нМ приводила к повышению уровня транскрипта PDX-1 (Biochem. J. 379: 749, 2004).
В работе Shiraki et al. изучались эффекты ростовых факторов, специфически ускоряющих дифференцировку эмбриональных стволовых клеток в PDX-1-положительные клетки. Эти авторы наблюдали, что TGFβ2 приводил к воспроизводимому увеличению доли PDX-1-положительных клеток (Genes Cells. 2005 Jun; 10(6): 503-16.).
В публикации Gordon et al. продемонстрирована индукция образования эндодермальных клеток brachyury+/HNF-3 beta+ из эмбриональных стволовых клеток мыши в отсутствии сыворотки и в присутствии активина в сочетании с ингибитором сигнального пути Wnt (US2006/0003446A1).
В публикации Gordon et al. (PNAS, Vol 103, page 16806, 2006) говорится: “Для образования передней первичной полоски требовались, одновременно, сигнальные пути Wnt и TGF-beta/nodal/активин”.
Однако модель развития эмбриональных стволовых клеток на мышах может не имитировать в точности программу развития у высших млекопитающих, как, например, у человека.
Thomson et al. выделяли эмбриональные стволовые клетки из человеческих бластоцист (Science 282:114, 1998). Параллельно, Gearhart и соавторы получили клеточные линии человеческих эмбриональных зародышевых клеток (чЭЗ) из ткани половых желез эмбриона (Shamblott et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95:13726, 1998). В отличие от эмбриональных стволовых клеток мыши, воспрепятствовать дифференцировке которых можно путем простого культивирования с фактором торможения лейкемии (Leukemia Inhibitory Factor, LIF), человеческие эмбриональные стволовые клетки должны культивироваться в очень специфических условиях (США, патенты № 6200806; WO 99/20741; WO 01/51616).
D'Amour et al. описывают производство обогащенных культур сформированной эндодермы, производной от человеческих эмбриональных стволовых клеток, в присутствии высокой концентрации активина и низкой концентрации сыворотки (D'Amour KA et al. 2005). Трансплантация этих клеток под почечную капсулу мышей приводит к их дифференцировке в более зрелые клетки, обладающие характерными особенностями некоторых эндодермальных органов. Клетки сформированной эндодермы, производные от человеческих эмбриональных стволовых клеток, могут подвергаться дальнейшей дифференцировке в PDX-1-положительные клетки после добавления FGF-10 (US 2005/0266554A1).
В публикации D'Amour et al. (Nature Biotechnology - 24, 1392-1401 (2006)) говорится: “Мы разработали процесс дифференцировки, преобразующий человеческие эмбриональные стволовые клетки (чЭС) в эндокринные клетки, способные синтезировать гормоны поджелудочной железы, инсулин, глюкагон, соматостатин, панкреатический полипептид и грелин. Данный процесс имитирует органогенез поджелудочной железы in vivo, проводя клетки через фазы, напоминающие образование сформированной эндодермы, эндодермы кишечной трубки, панкреатической эндодермы и превращение предшественников эндокринных клеток в клетки, экспрессирующие эндокринные гормоны”.
В другом примере, Fisk et al. сообщают о системе для производства островковых клеток поджелудочной железы из человеческих эмбриональных стволовых клеток (заявка на патент US2006/0040387A1). В данном случае процесс дифференцировки был разделен на три стадии. Сначала человеческие эмбриональные стволовые клетки были дифференцированы до эндодермы с помощью сочетания н-бутирата и активина-А. Далее клетки культивировались с антагонистами TGFß, такими как Noggin, в сочетании с EGF или бетацеллюлином с получением PDX-1-положительных клеток. Окончательная дифференцировка запускалась никотинамидом.
В одном примере, Benvenistry et al. сообщают: “Мы сделали вывод, что сверхэкспрессия PDX-1 увеличивала экспрессию панкреатических обогащенных генов, а для индукции экспрессии инсулина могут потребоваться дополнительные сигналы, присутствующие только in vivo” (Benvenistry et al, Stem Cells 2006; 24:1923-1930).
Имеющиеся способы культивирования человеческих эмбриональных стволовых клеток требуют применения или белков экстраклеточного матрикса, или слоя питающих фибробластов, или добавления экзогенных ростовых факторов, таких как, например, bFGF.
В одном примере Cheon et al (BioReprod DOI:10.1095/biolreprod.105.046870, October 19, 2005) описывают не содержащую питающих клеток и сыворотки культуральную систему, в которой эмбриональные стволовые клетки поддерживаются в некондиционированной, заменяющей сыворотку среде (SR), обогащенной различными факторами роста, способными запустить самообновление эмбриональных стволовых клеток.
В другом примере, Levenstein et al (Stem Cells 24: 568-574, 2006) описывают способы длительного культивирования человеческих эмбриональных стволовых клеток в отсутствие фибробластов или кондиционированной среды, с применением среды, обогащенной основным фактором роста фибробластов (bFGF).
В другом примере, в заявке на патент US 2005 0148070, описывается способ культивирования человеческих эмбриональных стволовых клеток в среде с определенным составом без сыворотки и без питающих клеток-фибробластов, где данный способ включает: культивирование стволовых клеток в культуральной среде, содержащей альбумин, аминокислоты, витамины, минеральные вещества, по меньшей мере один трансферрин или заменитель трансферрина, по меньшей мере один инсулин или заместитель инсулина, культуральную среду, в основном, не включающую эмбриональную сыворотку млекопитающих и содержащую по меньшей мере около 100 нг/мл фактора роста фибробластов, способного активировать сигнальный рецептор фактора роста фибробластов, причем фактор роста происходит из источника, иного, чем просто слой питающих клеток-фибробластов, среду, поддерживающую пролиферацию стволовых клеток в недифференцированном состоянии без слоя питающих клеток или кондиционированной среды.
В другом примере, в заявке на патент US20050233446, описывается среда с определенным составом, которая может быть использована при культивировании стволовых клеток, включая недифференцированные зародышевые стволовые клетки приматов. В растворе среда является существенно изотонической относительно культивируемых стволовых клеток. В данной культуре указанная среда содержит основную среду и количество bFGF, инсулина и аскорбиновой кислоты, достаточное для поддержки роста зародышевых стволовых клеток без существенной дифференцировки.
В другом примере, в заявке на патент US6800480, отмечается: “В одном варианте осуществления предлагается культуральная среда для выращивания зародышевых стволовых клеток приматов в существенно недифференцированном состоянии, включающая основную среду с низким содержанием эндотоксина и низким осмотическим давлением, которая эффективно поддерживает рост зародышевых стволовых клеток приматов. Основная среда объединяется с питательной сывороткой, способной поддерживать рост зародышевых стволовых клеток приматов, и субстратом, выбираемым из группы, включающей питающие клетки и экстраклеточный матрикс, полученный из питающих клеток. Упомянутая среда также включает в себя заменимые аминокислоты, антиоксидант и первый фактор роста, выбираемый из группы, включающей в себя нуклеозиды и соль-пируват.”
В другом примере, в заявке на патент US20050244962, говорится: “В одном аспекте, в изобретении предлагается способ культивирования эмбриональных стволовых клеток приматов. Стволовые клетки культивируются в культуре, существенно свободной от эмбриональной сыворотки млекопитающих (предпочтительно также существенно свободной от сыворотки любых животных) и в присутствии фактора роста фибробластов, полученного из источника, иного, чем просто слой питающих фибробластов. В предпочтительной форме, слой питающих фибробластов, ранее необходимый для поддержания культуры стволовых клеток, становится необязательным вследствие добавления достаточного количества фактора роста фибробластов”.
В другом примере, в заявке на патент WO2005065354, описывается изотоническая культуральная среда определенного состава, в основном не содержащая питающих клеток и сыворотки, включающая: a. базальную среду; b. количество bFGF, достаточное для поддержки роста главным образом недифференцированных стволовых клеток млекопитающих; c. количество инсулина, достаточное для поддержки роста главным образом недифференцированных стволовых клеток млекопитающих; и d. количество аскорбиновой кислоты, достаточное для поддержки роста главным образом недифференцированных стволовых клеток млекопитающих.
В другом примере, в заявке на патент WO2005086845, описан способ поддержания недифференцированных стволовых клеток, причем упомянутый способ включает в себя воздействие на стволовые клетки одним из членов семейства белков трансформирующего ростовой фактор-бета (TGFβ), одним из членов семейства белков фактора роста фибробластов (FGF) или никотинамидом (NIC) в количестве, достаточном для поддержания клеток в недифференцированном состоянии в течение периода времени, достаточного для получения желаемого результата.
Кроме того, для формирования панкреатических эндокринных клеток, клеток, экспрессирующих гормоны поджелудочной железы, или клеток, секретирующих гормоны поджелудочной железы из эмбриональных стволовых клеток человека, может потребоваться проведение генетических манипуляций с человеческими эмбриональными стволовыми клетками. Трансфицирование человеческих эмбриональных стволовых клеток с применением традиционных технологий, таких как, например, липофектамин или электропорация, не дает нужного эффекта.
В публикации WO2007027157 описывается способ, включающий в себя: (a) получение эмбриональной стволовой (ES) клетки; и (b) формирование линии клеток-предшественников из этой эмбриональной стволовой клетки; причем линия клеток-предшественников отбирается на основе способности к самообновлению. Предпочтительно, по данному способу проводится отделение от соматических клеток, на основе их неспособности к самообновлению. Предпочтительно, линия клеток-предшественников формируется или определяется в отсутствие со-культуры, предпочтительно, в отсутствие питающих клеток, которые, предпочтительно, отделяются от эмбриональных стволовых клеток. При необходимости, способ также включает (d) получение дифференцированной клетки из линии клеток-предшественников.
Следовательно, насущной потребностью по-прежнему остается разработка условий для создания стабильных линий плюрипотентных стволовых клеток, способных расти для решения текущих клинических задач и сохраняющих потенциал дифференцировки в панкреатические эндокринные клетки, в клетки, экспрессирующие гормоны поджелудочной железы, или в клетки, секретирующие гормоны поджелудочной железы.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ
В настоящем изобретении предлагается популяция клеток, обладающих характеристиками человеческих эмбриональных стволовых клеток, способных легко расти в культуре при низком содержании сыворотки, не требующих линии питающих клеток или покрытия из сложных белков матрикса, способных пересеваться в виде суспензии одиночных клеток, трансфицироваться с очень высокой эффективностью и культивироваться в условиях гипоксии. Такое сочетание уникальных свойств отличает описанные клетки, составляющие предмет настоящего изобретения, от прототипа.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предлагается способ получения популяции, состоящей из клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности, включающий следующие этапы:
а. получение клеток; и
b. культивирование клеток в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся перед культивированием предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом.
Клетки могут представлять собой человеческие эмбриональные стволовые клетки или клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы. Человеческие эмбриональные стволовые клетки перед культивированием этих клеток на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом, могут культивироваться в среде с нормальным содержанием кислорода. В качестве альтернативы человеческие эмбриональные стволовые клетки могут культивироваться в условиях гипоксии.
Человеческие эмбриональные стволовые клетки перед культивированием этих клеток на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом, могут культивироваться в среде с нормальным содержанием кислорода и обрабатываться ингибитором Rho-киназы. В качестве альтернативы человеческие эмбриональные стволовые клетки могут культивироваться в условиях гипоксии и обрабатываться ингибитором Rho-киназы.
Клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, перед культивированием этих клеток на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом, могут культивироваться в среде с нормальным содержанием кислорода. В качестве альтернативы клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, могут культивироваться в условиях гипоксии.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предлагается способ получения популяции клеток, состоящей из клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности, включающий следующие этапы:
а. культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток,
b. дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, и
c. извлечение клеток с последующим их культивированием в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся перед культивированием предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом.
Клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, активин-А и Wnt-лиганд. В качестве альтернативы клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, активин-А, Wnt-лиганд и IGF-1.
Клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, ингибитор Rho-киназы, активин-А и Wnt-лиганд. В качестве альтернативы клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, ингибитор Rho-киназы, активин-А, Wnt-лиганд и IGF-1.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предлагается способ получения популяции, состоящей из клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности, включающий следующие этапы:
а. культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток, и
b. извлечение клеток с последующим их культивированием в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом.
Клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, активин-А и Wnt-лиганд. В качестве альтернативы клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, активин-А, Wnt-лиганд и IGF-1.
Клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, ингибитор Rho-киназы, активин-А и Wnt-лиганд. В качестве альтернативы клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, ингибитор Rho-киназы, активин-А, Wnt-лиганд и IGF-1.
Клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, способны расти в культуре в условиях гипоксии, на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предлагается способ выращивания клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, включающий этапы культивирования клеток в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся обработке белком или экстраклеточным матриксом. В одном варианте осуществления клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, получают из плюрипотентных клеток, формируемых способами, составляющими предмет настоящего изобретения.
Клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, активин-А, Wnt-лиганд и ингибитор GSK-3B.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ЧЕРТЕЖЕЙ
На Фиг. 1 показана экспрессия CXCR4 (CD 184, ось Y) и CD9 (ось X) в человеческих эмбриональных стволовых клетках линии H9, пассаж 54, которые были дифференцированы в сформированную эндодерму после обработки средой с низким содержанием сыворотки + Activin-A + WNT-3A в течение 4 дней.
На Фиг. 2 показан анализ способом ПЦР в реальном времени человеческих эмбриональных стволовых клеток линии H9, пассаж 54, на 4 и 6 день протокола дифференцировки в сформированную эндодерму, описанного в Примере 5. На панели a) показана экспрессия AFP, Bry, CXCR4, GSC и SOX-7. На панели b) показана экспрессия SOX-17, GATA-4 и HNF-3 beta.
На Фиг. 3 показан протокол выделения, использованный для получения клеток EXPRES из эмбриональных стволовых клеток в соответствии со способами, составляющими предмет настоящего изобретения.
На Фиг. 4 показана морфология выращенных клеток EXPRES на стадии P0, день 11, культивированных в 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл активина-A (панель a) или 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл активина-A + 20 нг/мл WNT-3A (панель b). На панели c показана морфология клеток EXPRES, пассаж 3.
На Фиг. 5 показан анализ способом ПЦР в реальном времени выращенных клеток EXPRES, культивируемых в 2-5% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл активина-A + 20 нг/мл WNT-3A на протяжении трех пассажей. На панели a) показана экспрессия AFP, Bry, CXCR4, GSC и SOX-7. На панели b) показана экспрессия SOX-17, GATA-4 и HNF-3 beta.
На Фиг. 6 показано влияние добавления Wnt-3A на экспрессию генов в клетках EXPRES. На панели a) показаны данные ПЦР в реальном времени для экспрессии SOX-17, GATA-4 и HNF-3 beta. На панели b) показаны данные ПЦР в реальном времени для экспрессии AFP, Bry, CXCR4, GSC и SOX-7.
На Фиг. 7 показано влияние IGF-1, Wnt-3A и активина-A на экспрессию генов в клетках EXPRES. На панели a) показаны данные ПЦР в реальном времени для экспрессии SOX-17, GATA-4, HNF-3 beta, Bry, CXCR4 и GSC. На панели b) показаны данные ПЦР в реальном времени для экспрессии SOX-7 и AFP. На панели c) показаны данные ПЦР в реальном времени для экспрессии OCT-4.
На Фиг. 8 показана морфология выращенных клеток EXPRES, полученных из линии человеческих эмбриональных стволовых клеток H9, пассаж 54, культивированных в a) 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A, b) 2% ЭТС + DMEMF12 + 100 нг/мл AA, c) 2% ЭТС + DMEM-F12 + 50 нг/мл IGF-I.
На Фиг. 9 показан потенциал роста клеток EXPRES 01 и 02, культивируемых на полистироле для тканевой культуры в условиях гипоксии. Клетки EXPRES 01 культивировались в 2% ЭТС + DM-F12 + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I, при этом клетки EXPRES 02 культивировались в 2% ЭТС + DM-F12 + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A.
На Фиг. 10 показана морфология клеток EXPRES, полученных из одиночно-клеточной суспензии недифференцированных эмбриональных стволовых клеток на TCPS (полистирол для тканевой культуры) в среде DM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT3A + 50 нг/мл IGF-I.
На Фиг. 11 показана экспрессия белков, определяемая способом сортировки клеток с возбуждением флуоресценции (FACS) в клетках EXPRES 01, пассаж 24. На панели a) показаны уровни экспрессии E-кадгерина, на панели b) показаны уровни экспрессии CXCR4, на панели c) показаны уровни экспрессии CD9, на панели d) показаны уровни экспрессии CD117, на панели e) показаны уровни экспрессии CD30, на панели f) показаны уровни экспрессии LIF-рецептора, на панели g) показаны уровни экспрессии TRA 1-60, на панели h) показаны уровни экспрессии TRA 1-81, на панели i) показаны уровни экспрессии SSEA-1, на панели j) показаны уровни экспрессии SSEA-3, на панели k) показаны уровни экспрессии SSEA-4 и на панели l) показаны уровни экспрессии CD56.
На Фиг. 12 показана экспрессия белков, определяемая способом сортировки клеток с возбуждением флуоресценции (FACS) в клетках EXPRES 02, пассаж 21. На панели a) показаны уровни экспрессии E-кадгерина, на панели b) показаны уровни экспрессии CXCR4, на панели c) показаны уровни экспрессии CD9, на панели d) показаны уровни экспрессии CD117, на панели e) показаны уровни экспрессии CD30, на панели f) показаны уровни экспрессии LIF-рецептора, на панели g) показаны уровни экспрессии TRA 1-60, на панели h) показаны уровни экспрессии TRA 1-81, на панели i) показаны уровни экспрессии SSEA-1, на панели j) показаны уровни экспрессии SSEA-3, на панели k) показаны уровни экспрессии SSEA-4 и на панели l) показаны уровни экспрессии CD56.
На Фиг. 13 показаны иммунофлуоресцентные изображения клеток EXPRES 01, пассаж 10, культивируемых в 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I. Панель a) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели b, панель b) Nanog, панель c) совместное окрашивание DAPI (синий) и Oct-4 (зеленый), панель d) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели e, панель e) SOX-2 и панель f) совместное окрашивание DAPI (синий) и HNF-3 beta (зеленый).
На Фиг. 14 показаны иммунофлуоресцентные изображения клеток EXPRES 02, пассаж 9, культивируемых в 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A. Панель a) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели b, панель b) HNf3B, панель c) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели d, панель d) OCT-4, панель e) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели f, панель f) SOX-2, панель g) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели h, панель h) NANOG.
На Фиг. 15 показана экспрессия генов, определенная способом ПЦР в реальном времени для клеток EXPRES 01, EXPRES 02, клеток EB, полученных из клеток H9, клеток SA002, культивированных на MATRIGEL в MEF-CM, и для недифференцированных клеток H9, культивированных на MATRIGEL в MEFCM. Все уровни экспрессии нормализованы к недифференцированным клеткам H9. На панели a) показана экспрессия SOX-1, на панели b) показана экспрессия FOXD3, MYOD1, POU5F1 и ZFP42, на панели c) показана экспрессия ABCG2, коннексина 43, коннексина 45 и цитокератина 15, на панели d) показана экспрессия нестина, SOX-2, UTF1 и виментина, на панели e) показана экспрессия GATA-2, Brachyury, TERT и тубулина-бета III, на панели f) показана экспрессия CFC1 и GATA-4, на панели g) показана экспрессия AFP и FOXA2 и на панели h) показана экспрессия IPF1A и MSX1.
На Фиг. 16 показана измеренная способом FACS экспрессия CXCR4 (ось Y) и CD9 (ось x) в a) клетках EXPRES 01, пассаж 5, культивированных на полистироле для тканевой культуры в среде для культивации, а затем в среде DMEM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл активина-A и 20 нг/мл WNT3A в течение 2 дней, затем еще 2 дней в DMEM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл активина-A, b) клетках EXPRES 02, пассаж 4, культивированных на полистироле для тканевой культуры в среде для культивации, а затем в среде DMEM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл активина-A и 20 нг/мл WNT3A в течение 2 дней, затем еще 2 дней в DMEM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл активина-A.
На Фиг. 17 показана измеренная способом ПЦР в реальном времени экспрессия генов a) в клетках EXPRES 01 и b) в клетках EXPRES 02, обработанных средой с низким содержанием сыворотки, плюс AA + WNT-3a.
На Фиг. 18 показаны иммунофлуоресцентные изображения клеток EXPRES 01, пассаж 5, культивированных в 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I, затем в среде DMEM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл активина-A и 20 нг/мл WNT3A в течение 2 дней, затем еще 2 дней в DMEM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл активина-A. Панель a) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели b, панель b) GATA-4, панель c) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели d, панель d) SOX-17, панель e) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели f, панель f) HNF-3 beta, панель g) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели h, панель h) OCT-4.
На Фиг. 19 показаны иммунофлуоресцентные изображения клеток EXPRES 02, пассаж 4, культивированных в 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A, затем в среде DMEM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл активина-A и 20 нг/мл WNT3A в течение 2 дней, затем еще 2 дней в DMEM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл активина-A. Панель a) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели b, панель b) GATA-4, панель c) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели d, панель d) SOX-17, панель e) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели f, панель f) HNF-3 beta, панель g) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели h, панель h) OCT-4.
На Фиг. 20 показана измеренная способом FACS экспрессия CXCR4 (ось Y) и CD9 (ось x) в a) клетках EXPRES 01, пассаж 19, и b) клетках EXPRES 02, пассаж 14, культивированных на полистироле для тканевой культуры в среде для культивации, затем в среде DMEM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл активина-A + 100 нМ GSK-3B-ингибитора IX и 20 нг/мл WNT3A в течение 4 дней.
На Фиг. 21 показаны иммунофлуоресцентные изображения клеток EXPRES 01, пассаж 19, культивированных в 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I, и клеток EXPRES 02, пассаж 14, культивированных в 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A, затем в среде DMEM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл активина-A + 100 нМ GSK-3B-ингибитора IX и 20 нг/мл WNT-3A в течение 5 дней. Панель a) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели b, панель b) HNF-3 beta, панель c) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели d, панель d) GATA-4, панель e) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели f, панель f) SOX-17, панель g) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели h, панель h) HNF-3 beta, панель i) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели j, панель j) GATA-4, панель k) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели l, панель l) SOX-17.
На Фиг. 22 показана измеренная способом ПЦР в реальном времени экспрессия генов a) в клетках EXPRES 01 и в клетках EXPRES 02, обработанных средой с низким содержанием сыворотки, плюс AA + WNT3a + GSK-3B-ингибитор IX в течение 5 дней. На панели a показана экспрессия AFP, Brachyury, CDX2, Mox1, OCT3/4, SOX-7 и ZIC1, на панели b показаны уровни экспрессии CXCR4, GATA-4, Goosecoid, HNf3B и SOX-17.
На Фиг. 23 показана экспрессия генов, измеренная способом ПЦР в реальном времени для клеток EXPRES 01, посеянных с плотностью 5000-40000 клеток/см2 на полистирол для культивирования ткани в культивационной среде, затем культивировавшихся в DMEM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 100 нМ GSK-3B-ингибитора IX в течение четырех дней в условиях гипоксии. На панели а) показаны уровни экспрессии AFP, Brachyury, SOX-7 и OTX2. На панели b) показаны уровни экспрессии CXCR4, HNF-3 beta, GATA-4, SOX-17, Cerb и GSC.
На Фиг. 24 показаны результаты анализа длины теломеров в клетках с пониженным контролем теломеров (полоса 1), клетках EXPRES 01, пассаж 24 (полоса 2), клетках EXPRES 02, пассаж 17 (полоса 3), недифференцированных человеческих эмбриональных стволовых клетках H1, пассаж 40 (полоса 4) и в клетках с повышенным контролем теломеров (полоса 5).
На Фиг. 25 показана экспрессия генов, измеренная способом ПЦР в реальном времени для клеток EXPRES 01, пассаж 21, дифференцированных в клетки эндодермы передней кишки (S3), клетки панкреатической эндодермы (S4) и панкреатические эндокринные клетки (S5).
На Фиг. 26 приведены иммунофлуоресцентные изображения клеток EXPRES 01, пассаж 35, культивированные по Примеру 18. Панель а) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели b), панель b) анти-1 трипсин, панель c) HNF-3 beta (зеленый), альбумин (красный), панель d) альбумин (красный) и DAPI (синий), панель e) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели f, панель f) PDX-1, панель g) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели h, панель h) SOX-17, панель i) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели j, панель j) CDX-2.
На Фиг. 27 показаны диаграммы рассеяния данных с биочипов, где сравниваются, панель a) клетки EXPRES 01 (ось y) с недифференцированными человеческими эмбриональными стволовыми клетками линии H9 (ось x), панель b) клетки EXPRES 02 (ось y) с недифференцированными человеческими эмбриональными стволовыми клетками линии H9 (ось x), панель c) клетки EXPRES 01 (ось y) с клетками EXPRES 02 (ось x), панель d) клетки EXPRES 01 (ось y) с человеческими эмбриональными стволовыми клетками линии H9, дифференцированными в сформированную эндодерму (ось x), панель e) клетки EXPRES 02 (ось y) с человеческими эмбриональными стволовыми клетками линии H9, дифференцированными в сформированную эндодерму (ось x), панель f) недифференцированные человеческие эмбриональные стволовые клетки линии H9 (ось y) с человеческими эмбриональными стволовыми клетками линии H9, дифференцированными в сформированную эндодерму (ось x).
На Фиг. 28 показана морфология телец EB, образованных клетками EXPRES 01.
На Фиг. 29 показана экспрессия генов, измеренная способом ПЦР в реальном времени, для клеток линии EXPRES 01, клеток линии EXPRES 02 и человеческих эмбриональных стволовых клеток линии H9, пассаж 43, через пять недель после трансплантации под почечную капсулу мышей NOD-SCID. На панелях a-e показаны маркеры мезодермы. На панелях f & g показаны маркеры эктодермы. На панелях h и i показаны маркеры эндодермы. На панели j показаны дополнительные маркеры эмбриональной эндодермы. На панелях k-m показаны маркеры плюрипотентности.
На Фиг. 30 показана пролиферация и состояние клеточного цикла клеток EXPRES 03, измеренная по включению бромдезоксиуридина (BRDU). Клетки EXPRES 03 культивировались в 2% ЭТС/DMEM/F12, с добавлением: панель a) активина-A (100 нг/мл) и wnt3a (20 нг/мл), панель b) активина-A (100 нг/мл) и wnt3a (20 нг/мл) и IGF (50 нг/мл). Показаны также другие клетки, панель c) чЭС клетки (H9p43), панель d) клетки амниотической жидкости (AFDX002) и панель e) клетки МЭФ (мышиные эмбриональные фибробласты), обработанные митомицином. На панели f) для разных изученных популяций клеток показана встречаемость клеток, находящихся в фазе S, G1 и G2/M клеточного цикла.
На Фиг. 31 показана эффективность трансфекции и экспрессия EGFP в клетках EXPRES 01 и в человеческих эмбриональных стволовых клетках, которые сеялись либо в виде одиночно-клеточных дисперсий, либо клеточных кластеров. Клетки были проанализированы через 24 часа при помощи флуоресцентной микроскопии и проточной цитометрии. На панели A) показаны данные, полученные на клетках EXPRES 01. На панели B) показаны данные, полученные на одиночно-клеточной суспензии человеческих эмбриональных стволовых клеток, на панели C) показаны данные, полученные на кластерах человеческих эмбриональных стволовых клеток.
На Фиг. 32 показаны, как функция количества клеток, усредненные данные по оптической плотности (OD), измеренные с помощью MTS-теста и отражающие активность фермента дегидрогеназы для a) клеток EXPRES 01, культивированных в атмосфере кислорода воздуха (около 21%), b) клеток EXPRES 01, культивированных в 3% O2, c) клеток EXPRES 02 культивированных в атмосфере кислорода воздуха (около 21%), d) клеток EXPRES 02, культивированных в 3% O2.
На Фиг. 33 показана экспрессия генов, измеренная способом ПЦР в реальном времени для клеток EXPRES 01 P27, посеянных с плотностью 10000 клеток/см2 на полистирол для культивирования ткани в среде DMEMF12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT3A + 100 нМ GSK-3B-ингибитора IX. На панели a показаны уровни экспрессии AFP, Brachyury, SOX-7 и OTX2. На панели b показаны уровни экспрессии CXCR4, HNF-3 beta, GATA-4, SOX-17, Cer1 и GSC.
На Фиг. 34 показана измеренная способом FACS экспрессия CXCR4 (ось Y) и CD9 (ось x) в клетках EXPRES 01 P27, культивированных на полистироле для культивирования ткани в среде DMEM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 100 нМ GSK-3B-ингибитора-IX для трех пассажей.
На Фиг. 35 показано влияние трансфекции малых интерферирующих РНК (миРНК) на экспрессию GSK-3B и бета-катенина. Клетки EXPRES были проанализированы путем флуоресцентной микроскопии и количественными способами ОТ-ПЦР. A) Флуоресцентная микроскопия клеток, трансфицированных i) миРНК, меченными с помощью CY3 и ii) миРНК, меченными флуоресцином. B) Нокдаун целевого гена, выраженный в процентной доле оставшейся активности, в клетках, трансфицированных олигонуклеотидными последовательностями миРНК для i) GSK3b и ii) бета-катенина.
На Фиг. 36 показан кариотип двух клеточных линий, полученных в соответствии со способами, представляющими предмет настоящего изобретения. Панель a: клеточная линия EXPRES 01. Панель b: клеточная линия EXPRES 02.
На Фиг. 37 показана морфология клеток EXPRES 15, пассаж 0, через 24 часа культивирования в среде a) 2% ЭТС + DM-F12 + 100 нг/мл активина-A + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF или b) 2% ЭТС + DM-F12 + 100 нг/мл активина-A + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF + 10 мкМ ингибитора Rho-киназы Y-27632.
На Фиг. 38 показан кариотип клеток EXPRES 15, культивированных в 2% ЭТС + DM-F12 + 100 нг/мл активина-A + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF + 10 мкМ ингибитора Rho-киназы Y-27632 для 12 пассажей.
На Фиг. 39 показана пролиферация, измеренная способом A490 для клеток EXPRES 11, культивированных в базальной среде с добавлением IGF, активина-A, Wnt-3A и GSK-ингибитора IX в обозначенных концентрациях, на момент 24 ч (панель a), 48 ч (панель b) и 96 ч (панель c).
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ
Для ясности описания, а не для ограничения изобретения, подробное описание изобретения разделено на следующие подразделы, описывающие или иллюстрирующие определенные особенности, варианты осуществления или области применения настоящего изобретения.
Определения
Стволовые клетки представляют собой недифференцированные клетки, определяющиеся по их способности на уровне единичной клетки самообновляться и дифференцироваться с образованием клеток-потомков, таких как самообновляющиеся предшественники, необновляющиеся предшественники и окончательно дифференцированные клетки. Стволовые клетки также характеризуются способностью дифференцироваться in vitro в функциональные клетки различных линий, происходящих из нескольких зародышевых листков (эндодермы, мезодермы и эктодермы), а также после трансплантации давать начало тканям, происходящим от нескольких зародышевых листков, и вносить существенный вклад в формирование большинства, если не всех, тканей после инъекции в бластоциты.
По потенциалу развития стволовые клетки классифицируются следующим образом: (1) тотипотентные, т.е. способные давать начало всем эмбриональным и внеэмбриональным типам клеток; (2) плюрипотентные, т.е. способные давать начало всем эмбриональным типам клеток; (3) мультипотентные, т.е. способные давать начало группе клеточных линий, в пределах конкретной ткани, органа или физиологической системы (например, гематопоэтические стволовые клетки (ГСК) могут давать таких потомков, как ГСК (самообновление), олигопотентные предшественники, ограниченные клетками крови, и все типы клеток и клеточных элементов (таких как тромбоциты), являющиеся нормальными компонентами крови); (4) олигопотентные, т.е. способные давать начало более ограниченному набору клеточных линий, чем мультипотентные стволовые клетки; и (5) унипотентные, т.е. способные давать начало единственной клеточной линии (например, сперматогенные стволовые клетки).
Дифференцировка представляет собой процесс, при помощи которого неспециализированная (“некоммитированная”) или малоспециализированная клетка приобретает свойства специализированной клетки, например, нервной или мышечной. Дифференцированная клетка или клетка с индуцированной дифференцировкой представляет собой клетку, занявшую более специализированное (“коммитированное”) положение в линии клеточной дифференцировки. Термин “коммитированная”, применительно к процессу дифференцировки, обозначает клетку, дошедшую в ходе дифференцировки до стадии, от которой, в нормальных условиях, она продолжит дифференцироваться до определенного типа клеток или набора типов клеток, и не сможет, в нормальных условиях, дифференцироваться в иной тип клеток или вернуться к менее дифференцированному типу. Дедифференцировкой называется процесс, в ходе которого клетка возвращается к менее специализированной (или коммитированной) позиции в линии дифференцировки. В настоящем документе линией дифференцировки клеток называется наследственность клетки, т.е. от каких клеток она происходит и каким клеткам может дать начало. В линии дифференцировки клетка помещается в наследственную схему развития и дифференцировки. Маркером, специфичным для линии дифференцировки, называется характерная особенность, специфически ассоциированная с фенотипом клеток конкретной линии дифференцировки, которая может использоваться для оценки дифференцировки некоммитированных клеток в данную линию дифференцировки.
Термин “AFP” или “белок альфа-фетопротеин” в настоящем документе означает антиген, образующийся в начальной стадии развития печени. AFP также может экспрессироваться во внезародышевых клетках.
“Альбумин” представляет собой растворимый мономерный белок, составляющий у взрослых около половины всех сывороточных белков.
“β-клеточной линией дифференцировки” называются клетки, положительные по экспрессии гена транскрипционного фактора PDX-1 и по меньшей мере одного из следующих транскрипционных факторов: NGN-3, Nkx2.2, Nkx6.1, NeuroD, Isl-1, HNF-3 beta, MAFA, Pax4 и Pax6. К клеткам, экспрессирующим маркеры, характерные для β-клеточной линии дифференцировки относятся β-клетки.
Термин “Brachyury” в настоящем документе означает члена семейства генов T-бокс. Он является маркером клеток первичной полоски и мезодермы.
Термин “клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы” в настоящем документе означает клетки, экспрессирующие по меньшей мере один из следующих маркеров: SOX-17, GATA-4, HNF-3 beta, GSC, Cer1, Nodal, FGF8, Brachyury, Mix-like homeobox protein, FGF4, CD48, эомезодермин (EOMES), DKK4, FGF17, GATA-6, CXCR4, C-Kit, CD99 или OTX2. К клеткам, экспрессирующим маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, относятся клетки-предшественники первичной полоски, клетки первичной полоски, клетки мезэндодермы и клетки сформированной эндодермы.
Термины “c-Kit” и “CD117” означают тирозинкиназу рецепторов клеточной поверхности с последовательностью, описанной под каталожным номером Genbank X06182, или вариант этой последовательности, имеющий природное происхождение (например, аллельный вариант).
Термин “CD99” в настоящем документе означает белок, кодируемый геном с каталожным номером NM_002414.
Термин “клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии панкреатической эндодермы” в настоящем документе означает клетки, экспрессирующие по меньшей мере один из следующих маркеров: PDX-1, HNF-1 beta, PTF-1 alpha, HNF-6 или HB9. К клеткам, экспрессирующим маркеры, характерные для линии панкреатической эндодермы, относятся клетки панкреатической эндодермы.
Термин “клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии панкреатических эндокринных клеток” в настоящем документе означает клетки, экспрессирующие по меньшей мере один из следующих маркеров: NGN-3, NeuroD, Islet-1, PDX-1, NKX6.1, Pax-4, Ngn-3 или PTF-1 alpha. Клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии дифференцировки в панкреатические эндокринные клетки, включают панкреатические эндокринные клетки, панкреатические клетки, экспрессирующие гормоны, и панкреатические клетки, секретирующие гормоны, а также клетки β-клеточной линии дифференцировки.
Термин “Cer1” или “Cerebrus” в настоящем документе означает белок, являющийся членом суперсемейства белков с цистеиновым узлом.
Термином “CXCR4” в настоящем документе обозначается рецептор к полученному из стромальных клеток фактору 1 (SDF-1), также имеющий названия “LESTR” или “фузин”. В эмбрионе мыши в стадии гаструляции CXCR4 экспрессируется в сформированной эндодерме и мезодерме, но не во внеэмбриональной эндодерме.
Используемый в настоящем документе термин “сформированная эндодерма” относится к клеткам, обладающим характерными особенностями клеток, возникающих из эпибласта в ходе гаструляции, и формирующим желудочно-кишечный тракт и его производные. Клетки сформированной эндодермы экспрессируют следующие маркеры: HNF-3 beta, GATA-4, SOX-17, Cerberus, OTX2, goosecoid, C-Kit, CD99 и Mixl1.
“Внеэмбриональной эндодермой” в настоящем документе называется популяция клеток, экспрессирующих по меньшей мере один из следующих маркеров: SOX-7, AFP и SPARC.
Терминами “FGF-2”, “FGF-4” “FGF-8” “FGF-10” и “FGF-17” в настоящем документе называются члены семейства факторов роста фибробластов.
“GATA-4” и “GATA-6” являются членами семейства транскрипционных факторов GATA. Данное семейство транскрипционных факторов индуцируется через сигнальный путь TGF-β и участвует в сохранении маркеров ранней эндодермы.
Термин “GLUT-2” в настоящем документе означает молекулу-переносчик глюкозы, экспрессирующуюся во многих эмбриональных и полностью развитых тканях, включая поджелудочную железу, печень, кишечник, мозг и почки.
Термин “Goosecoid” или “GSC” в настоящем документе означает гомеодоменный транскрипционный фактор, экспрессирующийся в дорзальной губе бластопора.
Термин “HB9” в настоящем документе означает ген гомеобокса 9.
Термины “HNF-1 alpha”, “HNF-1 beta”, “HNF-3 beta” и “HNF-6” относятся к семейству печеночных ядерных транскрипционных факторов, характеризующихся высококонсервативным ДНК-связывающим доменом и двумя короткими карбоксиконцевыми доменами.
Термины “Islet-1” или “Isl-1” в настоящем документе означают член семейства LIM/гомеодоменных транскрипционных факторов, экспрессирующихся в развивающейся поджелудочной железе.
Термин “MafA” в настоящем документе означает транскрипционный фактор, экспрессирующийся в поджелудочной железе и контролирующий экспрессию генов, участвующих в биосинтезе и секреции инсулина.
Используемый в настоящей заявке термин "маркеры" означает молекулы нуклеиновых кислот или полипептидов с дифференциальной экспрессией в интересующих клетках. В данном контексте под дифференциальной экспрессией подразумевается повышенный уровень положительного маркера и пониженный уровень отрицательного маркера. Определяемый уровень маркерной нуклеиновой кислоты или полипептида в интересующих клетках оказывается значительно выше или ниже по сравнению с другими клетками, что позволяет идентифицировать интересующую клетку и отличить ее от других клеток с помощью любого из множества известных в данной области способов.
“Мезэндодермальной клеткой” в настоящем документе называется клетка, экспрессирующая по меньшей мере один из следующих маркеров: CD48, эомезодермин (EOMES), SOX-17, DKK4, HNF-3 beta, GSC, FGF17, GATA-6.
Термином “Mixl1” в настоящем документе называется ген гомеобокса, являющийся маркером клеток первичной полоски, мезодермы и эндодермы.
Термином “NeuroD” называется основной транскрипционный фактор типа спираль-петля-спираль (bHLH), участвующий в нейрогенезе.
Термином “NGN-3” в настоящем документе называется член нейрогенинового семейства основных транскрипционных факторов типа петля-спираль-петля.
Терминами “Nkx-2.2” и “Nkx-6.1” в настоящем документе обозначаются члены семейства транскипционных факторов Nkx.
Термином “Nodal” в настоящем документе обозначается член суперсемейства белков TGF-beta.
“Oct-4” представляет собой транскрипционный фактор с доменом POU и является общепризнанным маркером плюрипотентных стволовых клеток. На связь Oct-4 с плюрипотентными стволовыми клетками указывает то, что его экспрессия жестко ограничена недифференцированными плюрипотентными стволовыми клетками. После дифференцировки в соматические линии, экспрессия Oct-4 быстро исчезает.
“Панкреатической эндокринной клеткой” или “клеткой, экспрессирующей гормон поджелудочной железы” в настоящем документе называется клетка, экспрессирующая по меньшей мере один из следующих гормонов: инсулин, глюкагон, соматостатин и панкреатический полипептид.
“Клеткой, секретирующей гормон поджелудочной железы” в настоящем документе называется клетка, способная секретировать по меньшей мере один из следующих гормонов: инсулин, глюкагон, соматостатин и панкреатический полипептид.
“Pax-4” и “Pax-6” в настоящем документе обозначают специфичные для панкреатических β-клеток транскрипционные факторы, участвующие в развитии островков.
“PDX-1” в настоящем документе обозначает гомеодоменный транскрипционный фактор, участвующий в развитии поджелудочной железы.
“Клеткой зародышевого диска” в настоящем документе называется клетка, способная экспрессировать по меньшей мере один из следующих маркеров: Nodal или FGF8.
“Клеткой первичной полоски” в настоящем документе называется клетка, способная экспрессировать по меньшей мере один из следующих маркеров: Brachyury, Mix-like homeobox protein или FGF4.
Термин “PTF-1 alpha” в настоящем документе означает основной белок типа спираль-петля-спираль с массой 48 кДа, представляющий собой специфичную к определенной последовательности ДНК-связывающую субъединицу тримерного панкреатического транскрипционного фактора-1 (PTF1).
Терминами “SOX-1”, “SOX-2”, “SOX-7” и “SOX-17” в настоящем документе обозначаются члены семейства транскрипционных факторов SOX, участвующих в эмбриогенезе.
Термин “SPARC”, используемый в настоящем документе, также носит наименование “секретированный белок, кислый и богатый цистеином”.
“SSEA-1” (стадиеспецифический эмбриональный антиген-1) представляет собой гликолипидный поверхностный антиген, присутствующий на поверхности мышиных тератокарциномных стволовых клеток (EC), мышиных и человеческих эмбриональных зародышевых клеток (EG) и мышиных эмбриональных стволовых клеток (ES).
“SSEA-3” (стадиеспецифический эмбриональный антиген-3) представляет собой гликолипидный поверхностный антиген, присутствующий на поверхности человеческих тератокарциномных стволовых клеток (EC), человеческих эмбриональных зародышевых клеток (EG) и человеческих эмбриональных стволовых клеток (ES).
“SSEA-4” (стадиеспецифический эмбриональный антиген-4) представляет собой гликолипидный поверхностный антиген, присутствующий на поверхности человеческих тератокарциномных стволовых клеток (EC), человеческих эмбриональных зародышевых клеток (EG) и человеческих эмбриональных стволовых клеток (ES).
“TRA1-60” представляет собой связанный с кератинсульфатом антиген, экспрессирующийся на поверхности человеческих тератокарциномных стволовых клеток (EC), человеческих эмбриональных зародышевых клеток (EG) и человеческих эмбриональных стволовых клеток (ES).
“TRA1-81” представляет собой связанный с кератинсульфатом антиген, экспрессирующийся на поверхности человеческих тератокарциномных стволовых клеток (EC), человеческих эмбриональных зародышевых клеток (EG) и человеческих эмбриональных стволовых клеток (ES).
“TRA2-49” представляет собой изофермент щелочной фосфатазы, экспрессирующийся на поверхности человеческих тератокарциномных стволовых клеток (EC) и человеческих эмбриональных стволовых клеток (ES).
Термин “UTF-1” в настоящем документе означает коактиватор транскрипции, экспрессирующийся в плюрипотентных эмбриональных стволовых клетках и во внеэмбриональных клетках.
Термином “Zic1” в настоящем документе обозначается член семейства транскрипционных факторов Zic. Zic1 регулирует экспрессию нейрональных и специфичных для нервного валика генов, экспрессируемых в клетках дорзальной нервной трубки и домиграционного нервного валика.
Способ получения клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности
Предметом настоящего изобретения является популяция клеток, обладающих характеристиками человеческих эмбриональных стволовых клеток, способных легко расти в культуре при низком содержании сыворотки, не требующих линии питающих клеток или покрытия из сложных белков матрикса, способных пересеваться в виде суспензии одиночных клеток, трансфицироваться с очень высокой эффективностью и культивироваться в условиях гипоксии. Такое сочетание уникальных свойств отличает описанные клетки, составляющие предмет настоящего изобретения, от прототипа.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предлагается способ получения популяции, состоящей из клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности, включающий следующие этапы:
а. получение клеток; и
b. культивирование клеток в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся перед культивированием предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом.
Клетки могут представлять собой человеческие эмбриональные стволовые клетки или клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы. Человеческие эмбриональные стволовые клетки перед культивированием этих клеток на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом, могут культивироваться в среде с нормальным содержанием кислорода. В качестве альтернативы человеческие эмбриональные стволовые клетки могут культивироваться в условиях гипоксии.
Клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, перед культивированием этих клеток на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом, могут культивироваться в среде с нормальным содержанием кислорода. В качестве альтернативы клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, могут культивироваться в условиях гипоксии.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предлагается способ получения популяции, состоящей из клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности, включающий следующие этапы:
а. культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток,
b. дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, и
c. извлечение клеток с последующим их культивированием в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся перед культивированием предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предлагается способ получения популяции, состоящей из клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности, включающий следующие этапы:
а. культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток, и
b. извлечение клеток с последующим их культивированием в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом.
Культивирование клеток в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом
В одном варианте осуществления клетки культивируются в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не покрытом экстраклеточным матриксом, в течение срока от приблизительно 1 до приблизительно 20 дней. В альтернативном варианте осуществления клетки культивируются в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не покрытом экстраклеточным матриксом, в течение срока от приблизительно 5 до приблизительно 20 дней. В альтернативном варианте осуществления клетки культивируются в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не покрытом экстраклеточным матриксом, в течение приблизительно 15 дней.
В одном варианте осуществления гипоксия представляет собой содержание от приблизительно 1% O2 до приблизительно 20% O2. В альтернативном варианте осуществления гипоксия представляет собой содержание от приблизительно 2% O2 до приблизительно 10% O2. В альтернативном варианте осуществления гипоксия представляет собой содержание приблизительно 3% O2.
Клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, активин-А и Wnt-лиганд. В качестве альтернативы среда также может содержать IGF-1.
Среда для культивирования может содержать сыворотку в концентрации от приблизительно 2% до приблизительно 5%. В альтернативном варианте осуществления концентрация сыворотки может составлять приблизительно 2%.
Активин-А может использоваться в концентрациях от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 100 мкг/мл. В альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 1 мкг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять приблизительно 100 нг/мл.
Wnt-лиганд может быть выбран из группы, состоящей из Wnt-1, Wnt-3a, Wnt-5a и Wnt-7a. В одном варианте осуществления Wnt-лиганд представляет собой Wnt-1. В альтернативном варианте осуществления Wnt-лиганд представляет собой Wnt-3a.
Wnt-лиганд может использоваться в концентрации от приблизительно 1 нг/мл до приблизительно 1000 нг/мл. В альтернативном варианте осуществления Wnt-лиганд может использоваться в концентрации от приблизительно 10 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В одном варианте осуществления Wnt-лиганд используется в концентрации приблизительно 20 нг/мл.
IGF-1 может использоваться в концентрациях от приблизительно 1 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В альтернативном варианте осуществления IGF-1 может использоваться в концентрации от приблизительно 10 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В одном варианте осуществления лиганд IGF-1 используется в концентрации приблизительно 50 нг/мл.
Клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, способны расти в культуре в условиях гипоксии, на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом.
Полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, экспрессируют по меньшей мере один маркер плюрипотентности, выбираемый из группы, состоящей из: ABCG2, cripto, FoxD3, Connexin43, Connexin45, Oct4, SOX-2, Nanog, hTERT, UTF-1, ZFP42, SSEA-3, SSEA-4, Tra1-60 и Tra1-81.
В одном варианте осуществления полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, способны экспрессировать маркеры, характерные для клеток зародышевого диска.
В одном варианте осуществления полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, способны экспрессировать маркеры, характерные для клеток первичной полоски.
В одном варианте осуществления полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, способны экспрессировать маркеры, характерные для клеток мезодермы.
В одном варианте осуществления полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, способны экспрессировать маркеры, характерные для клеток сформированной эндодермы.
Дальнейшая дифференцировка клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентости, полученных способами, составляющими предмет настоящего изобретения
Полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, любым известным специалистам способом.
Например, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, в соответствии со способами, описанными в публикации D'Amour et al, Nature Biotechnology 23, 1534-1541 (2005).
Например, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, в соответствии со способами, описанными в публикации Shinozaki et al, Development 131, 1651-1662 (2004).
Например, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, в соответствии со способами, описанными в публикации McLean et al, Stem Cells 25, 29-38 (2007).
Например, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, в соответствии со способами, описанными в публикации D'Amour et al, Nature Biotechnology 24, 1392-1401 (2006).
Например, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, путем культивирования плюрипотентных стволовых клеток в среде, содержащей активин-A в отсутствие сыворотки, затем культивирования клеток с активином-A и сывороткой и затем культивирования клеток с активином A и сывороткой в другой концентрации. Пример данного способа описан в публикации D'Amour et al, Nature Biotechnology, 23, 1534-1541, 2005.
Дальнейшая дифференцировка клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы.
Клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии панкреатической эндодермы, любым известным специалистам способом.
Например, клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии панкреатической эндодермы, в соответствии со способами, описанными в публикации D'Amour et al, Nature Biotechnology 24, 1392-1401 (2006).
Например, клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, дифференцируются в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии панкреатической эндодермы, путем обработки клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, фактором роста фибробластов и ингибитором сигнального пути и KAAD-циклопамином, затем удаления среды, содержащей фактор роста фибробластов и KAAD-циклопамин с последующим культивированием клеток в среде, содержащей ретиноевую кислоту, фактор роста фибробластов и KAAD-циклопамин. Пример данного способа описан в публикации D' Amour et al, Nature Biotechnology, 24: 1392-1401, (2006).
Дальнейшая дифференцировка клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии панкреатической эндодермы
Клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии панкреатической эндодермы, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии панкреатических эндокринных клеток, любым известным специалистам способом.
Например, клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии панкреатической эндодермы, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии панкреатических эндокринных клеток, в соответствии со способами, описанными в публикации D'Amour et al, Nature Biotechnology 24, 1392-1401 (2006).
В следующих разделах содержатся неограничительные примеры способов получения клеток, подходящих для использования в качестве исходного материала для формирования клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, в соответствии со способами, составляющими предмет настоящего изобретения.
Выделение, выращивание и культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток
Описание человеческих эмбриональных стволовых клеток: человеческие эмбриональные стволовые клетки могут экспрессировать один или несколько стадиеспецифичных эмбриональных антигенов (SSEA) 3 и 4, а также маркеры, определяемые антителами, обозначенными как Tra-1-60 и Tra-1-81 (Thomson et al., Science 282:1145, 1998). Дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток in vitro приводит к утрате экспрессии SSEA-4, Tra-1-60 и Tra-1-81 (если имеются) и к увеличению экспрессии SSEA-1. В недифференцированных человеческих эмбриональных стволовых клетках, как правило, активна щелочная фосфатаза, которая может быть обнаружена путем фиксации клеток с помощью 4% параформальдегида, с последующим обнаружением с помощью Vector Red, применяемого в качестве субстрата, в соответствии с инструкциями производителя (Vector Laboratories, Burlingame Calif.). Недифференцированные плюрипотентные стволовые клетки так же, как правило, экспрессируют Oct-4 и TERT, обнаруживаемые способом ОТ-ПЦР (RT-PCR).
Другим желательным фенотипическим свойством выращенных человеческих эмбриональных клеток является потенциал дифференцировки в клетки всех трех зародышевых листков: в эндодермальные, мезодермальные и эктодермальные ткани. Плюрипотентность человеческих эмбриональных стволовых клеток может быть подтверждена, например, путем инъекции клеток мышам с тяжелым комбинированным иммунодефицитом (SCID), фиксирования образующихся тератом с помощью 4% параформальдегида и их гистологического исследования на предмет наличия клеточных типов, происходящих от трех зародышевых листков. В качестве альтернативы плюрипотентность можно определить путем создания эмбриоидных телец и анализа их на предмет присутствия маркеров, ассоциирующихся с тремя зародышевыми листками.
Выращенные линии человеческих эмбриональных стволовых клеток могут быть кариотипированы с применением стандартного способа окрашивания красителем Гимза (G-banding) и сравнения с опубликованными кариотипами соответствующих видов приматов. Желательно получать клетки, имеющие “нормальный кариотип”, т.е. эуплоидные клетки, в которых присутствуют все человеческие хромосомы, не имеющие видимых изменений.
Источники получения человеческих эмбриональных стволовых клеток: к типам человеческих эмбриональных стволовых клеток, которые можно использовать, относятся стабильные линии человеческих эмбриональных клеток, получаемых из ткани, образующейся после беременности, в том числе, из преэмбриональной ткани (такой, как бластоциста), эмбриональной ткани или ткани плода, взятой в любой момент в ходе беременности, как правило, но не обязательно, до срока приблизительно 10-12 недель беременности. Примерами, не ограничивающими настоящее изобретение, являются стабильные линии человеческих эмбриональных стволовых клеток или человеческих эмбриональных зародышевых клеток, например, клеточные линии человеческих эмбриональных стволовых клеток H1, H7 и H9 (WiCell). Также возможно использование описываемых в настоящей заявке составов в ходе первоначального установления или стабилизации таких клеток; в этом случае исходными клетками являются первичные плюрипотентные клетки, взятые непосредственно из тканей-источников. Также подходящими являются клетки, взятые из популяции плюрипотентных стволовых клеток, уже культивируемых в отсутствие питающих клеток. Также подходящими являются мутантные линии человеческих эмбриональных стволовых клеток, например, BG01v (BresaGen, Athens, GA).
В одном из вариантов осуществления человеческие эмбриональные стволовые клетки подготавливаются как описано в публикации Thomson et al. (США Патент США № 5843780; Science 282:1145, 1998; Curr. Top. Dev. Biol. 38:133 ff., 1998; Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92:7844, 1995).
Культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток: в одном варианте осуществления человеческие эмбриональные стволовые клетки культивируются в системе культивации, по существу, не содержащей питающих клеток, но, тем не менее, поддерживающей пролиферацию человеческих эмбриональных стволовых клеток и не допускающей существенной дифференцировки. Выращивание человеческих эмбриональных стволовых клеток в культуре, не содержащей питающих клеток, без дифференцировки, осуществляется при помощи среды, кондиционированной путем предварительного культивирования в ней клеток другого типа. В качестве альтернативы выращивание человеческих эмбриональных стволовых клеток в культуре, не содержащей питающих клеток, без дифференцировки, осуществляется при помощи среды с определенным химическим составом.
В альтернативном варианте осуществления человеческие эмбриональные стволовые клетки исходно культивируются на слое питающих клеток, которые оказывают разностороннюю поддержку человеческим эмбриональным стволовым клеткам. Человеческие эмбриональные стволовые клетки далее переносятся в систему культивации, по существу, не содержащую питающих клеток, но, тем не менее, поддерживающую пролиферацию человеческих эмбриональных стволовых клеток и не допускающую их существенной дифференцировки.
Примеры кондиционированной среды, подходящей для использования в настоящем изобретении, описаны в публикациях US20020072117, US6642048, WO2005014799 и Xu et al (Stem Cells 22: 972-980, 2004).
Пример среды с определенным химическим составом, подходящей для использования в настоящем изобретении, можно найти в публикации US20070010011.
Подходящая культуральная среда может состоять из следующих компонентов, например, модифицированная способом Дульбекко среда Игла (DMEM), Gibco # 11965-092; модифицированная способом Дульбекко среда Игла Knockout (KO DMEM), Gibco #10829-018; базальная среда Хэма F12/50% DMEM; 200 мМ L-глутамина, Gibco # 15039-027; раствор заменимых аминокислот, Gibco 11140-050; β-меркаптоэтанол, Sigma # M7522; человеческий рекомбинантный основной фактор роста фибробластов (bFGF), Gibco # 13256-029.
В одном варианте осуществления человеческие эмбриональные стволовые клетки наносятся на подходящий культуральный субстрат, предварительно подвергнутый обработке в соответствии со способами, составляющими предмет настоящего изобретения. В одном осуществлении упомянутая обработка представляет собой компонент внеклеточного матрикса, например, компонент, полученный из базальной мембраны, или компонент, который может участвовать во взаимодействии лиганда с рецептором молекулы адгезии. В одном из вариантов осуществления подходящим культуральным субстратом является MATRIGEL (Becton Dickenson). MATRIGEL® представляет собой растворимый препарат из клеток опухоли Энгельбрета-Холма-Суорма, который при комнатной температуре превращается в гель и образует восстановленную базальную мембрану.
В качестве альтернативы можно использовать другие компоненты экстраклеточного матрикса и смеси компонентов. Это может быть ламинин, фибронектин, протеогликан, энтактин, гепарансульфат и т.п., отдельно или в различных сочетаниях.
Человеческие эмбриональные стволовые клетки могут наноситься на субстрат в подходящем распределении и в присутствии среды, способствующей выживанию, размножению клеток и сохранению ими желательных особенностей. На все эти характеристики оказывает влияние аккуратность распределения клеток при посеве, которая легко может быть определена специалистом в данной области.
Далее человеческие эмбриональные стволовые клетки извлекаются из обработанного субстрата тканевой культуры и наносятся на не подвергавшийся обработке субстрат тканевой культуры, и после этого обрабатываются в соответствии со способами, составляющими предмет настоящего изобретения, для формирования клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы.
Дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Человеческие эмбриональные стволовые клетки могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, с помощью любого способа, известного специалистам в данной области. Клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, можно подвергать обработке в соответствии со способами, составляющими предмет настоящего изобретения.
Например, человеческие эмбриональные стволовые клетки могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, в соответствии со способами, описанными в публикации D'Amour et al, Nature Biotechnology 23, 1534-1541 (2005).
Например, человеческие эмбриональные стволовые клетки могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, в соответствии со способами, описанными в публикации Shinozaki et al, Development 131, 1651-1662 (2004).
Например, человеческие эмбриональные стволовые клетки могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, в соответствии со способами, описанными в публикации McLean et al, Stem Cells 25, 29-38 (2007).
Дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предлагается способ дифференцировки человеческих эмбриональных стволовых клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, включающий следующие этапы:
а. нанесение человеческих эмбриональных стволовых клеток на субстрат тканевой культуры, покрытый экстраклеточным матриксом; и
b. культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток с активином-А и Wnt-лигандом.
Далее клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, подвергаются обработке в соответствии со способами, составляющими предмет настоящего изобретения, для формирования клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы.
Культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток с активином-А и Wnt-лигандом может осуществляться в одной культуральной среде. В качестве альтернативы культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток с активином-А и Wnt-лигандом может осуществляться в нескольких культуральных средах. В одном варианте осуществления культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток с активином-А и Wnt-лигандом осуществляется в двух культуральных средах.
Экстраклеточный матрикс: в одном аспекте настоящего изобретения, человеческие эмбриональные стволовые клетки культивируются и дифференцируются на субстрате тканевой культуры, покрытом экстраклеточным матриксом. Экстраклеточный матрикс может представлять собой солюбилизированный препарат базальной мембраны, полученный экстракцией из клеток саркомы мыши (продается компанией BD Biosciences под торговым наименованием MATRIGEL). В качестве альтернативы экстраклеточный матрикс может представлять собой MATRIGEL с пониженным содержанием ростовых факторов. В качестве альтернативы экстраклеточный матрикс может представлять собой фибронектин. В альтернативном варианте осуществления человеческие эмбриональные стволовые клетки культивируются и дифференцируются на субстрате тканевой культуры, покрытом человеческой сывороткой.
Экстраклеточный матрикс может быть растворен перед покрытием им субстрата тканевой культуры. Примеры подходящих способов растворения экстраклеточного матрикса и покрытия им субстрата тканевой культуры можно найти в публикациях Kleinman, H.K., et al., Biochemistry 25:312 (1986), и Hadley, M.A., et al., J.Cell.Biol. 101:1511 (1985).
В одном варианте осуществления экстраклеточный матрикс представляет собой MATRIGEL. В альтернативном варианте осуществления субстрат тканевой культуры покрывается раствором MATRIGEL в разведении 1:10. В альтернативном варианте осуществления субстрат тканевой культуры покрывается раствором MATRIGEL в разведении 1:15. В альтернативном варианте осуществления субстрат тканевой культуры покрывается раствором MATRIGEL в разведении 1:30. В альтернативном варианте осуществления субстрат тканевой культуры покрывается раствором MATRIGEL в разведении 1:60.
В одном варианте осуществления экстраклеточный матрикс может представлять собой MATRIGEL с пониженным содержанием ростовых факторов. В одном варианте осуществления субстрат тканевой культуры покрывается раствором MATRIGEL с пониженным содержанием фактора роста в разведении 1:10. В альтернативном варианте осуществления субстрат тканевой культуры покрывается раствором MATRIGEL с пониженным содержанием фактора роста в разведении 1:15. В альтернативном варианте осуществления субстрат тканевой культуры покрывается раствором MATRIGEL с пониженным содержанием фактора роста в разведении 1:30. В альтернативном варианте осуществления субстрат тканевой культуры покрывается раствором MATRIGEL с пониженным содержанием фактора роста в разведении 1:60.
Дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, на экстраклеточном матриксе с использованием одной культуральной среды: в одном варианте осуществления настоящего изобретения предлагается способ дифференцировки человеческих эмбриональных стволовых клеток, экспрессирующих маркеры характерные для линии сформированной эндодермы, включающий следующие этапы:
а. нанесение человеческих эмбриональных стволовых клеток на субстрат тканевой культуры, покрытый экстраклеточным матриксом; и
b. культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток с активином-А и Wnt-лигандом.
Для обеспечения дифференцировки человеческих эмбриональных стволовых клеток в сформированную эндодерму культуральная среда должна содержать достаточно низкие концентрации определенных факторов, например, инсулина и IGF (как описано в публикации WO2006020919). Этого можно добиться путем понижения концентрации сыворотки или, в качестве альтернативы, при помощи среды с заданным химическим составом, в котором отсутствуют инсулин и IGF. Примеры среды с заданным химическим составом приводятся в публикации Wiles et al (Exp Cell Res. 1999 Feb 25; 247(1): 241-8.).
Среда для культивирования может содержать сыворотку в концентрации от приблизительно 0% до приблизительно 10%. В альтернативном варианте осуществления концентрация сыворотки может составлять от приблизительно 0% до приблизительно 5%. В альтернативном варианте осуществления концентрация сыворотки может составлять от приблизительно 0% до приблизительно 2%. В альтернативном варианте осуществления концентрация сыворотки может составлять приблизительно 2%.
Время культивации с активином-A и Wnt-лигандом может составлять от приблизительно 1 дня до приблизительно 7 дней. В альтернативном варианте осуществления время культивации может составлять от приблизительно 1 дня до приблизительно 3 дней. В альтернативном варианте осуществления время культивации может составлять приблизительно 3 дня.
Активин-A может использоваться в концентрации, подходящей для индукции дифференцировки человеческих эмбриональных стволовых клеток. Данная концентрация может лежать в диапазоне от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 100 мкг/мл. В альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 1 мкг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 50 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять приблизительно 100 нг/мл.
Для увеличения эффективности процесса дифференцировки можно подобрать оптимальный Wnt-лиганд. Wnt-лиганд может выбираться из группы, состоящей из Wnt-1, Wnt-3a, Wnt-5a и Wnt-7a. В одном варианте осуществления Wnt-лиганд представляет собой Wnt-1. В альтернативном варианте осуществления Wnt-лиганд представляет собой Wnt-3a.
Wnt-лиганд может присутствовать в концентрации от приблизительно 1 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 10 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл.
Данная одна культуральная среда может также содержать ингибитор GSK-3B. Ингибитор GSK-3B может выбираться из группы, состоящей из GSK-3B-ингибитора IX и GSK-3B-ингибитора XI. В одном варианте осуществления ингибитор GSK-3B представляет собой GSK-3B-ингибитор IX.
При культивировании человеческих эмбриональных стволовых клеток с ингибитором GSK-3B концентрация ингибитора GSK-3B может составлять от приблизительно 1 нМ до приблизительно 1000 нМ. В альтернативном варианте осуществления человеческие эмбриональные стволовые клетки культивируются с ингибитором GSK-3B в концентрации от приблизительно 10 нМ до приблизительно 100 нМ.
Данная одна культуральная среда может также содержать по меньшей мере один дополнительный фактор, способный усилить формирование клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, из человеческих эмбриональных стволовых клеток. В качестве альтернативы по меньшей мере еще один дополнительный фактор может улучшить пролиферацию клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, полученные с помощью способов, составляющих предмет настоящего изобретения. Кроме того, по меньшей мере еще один дополнительный фактор может улучшить способность клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, полученных с помощью способов, которые составляют предмет настоящего изобретения, образовывать другие типы клеток или повышать эффективность дополнительных этапов дифференцировки.
По меньшей мере еще одним дополнительным фактором могут быть, например, никотинамид, члены семейства TGF-β, включая TGF-β1, 2 и 3, сывороточный альбумин, члены семейства факторов роста фибробластов, тромбоцитарные факторы роста-АА, и -BB, плазма, богатая тромбоцитами, инсулиноподобный фактор роста (IGF-I, II), фактор роста и дифференцировки (GDF-5, -6, -8, -10, -11), глюкагон-подобный пептид-I и II (GLP-I и II), миметические антитела GLP-1 и GLP-2, экзендин-4, ретиноевая кислота, паратиреоидный гормон, инсулин, прогестерон, апротинин, гидрокортизон, этаноламин, бета-меркаптоэтанол, эпидермальный фактор роста (EGF), гастрин I и II, хелатирующие агенты на основе меди, например, триэтиленпентамин, форсколин, бутират натрия, активин, бетацеллюлин, ITS, noggin, фактор роста нейритов, nodal, вальпроевая кислота, трихостатин-А, натрия бутират, фактор роста гепатоцитов (HGF), сфингозин 1, VEGF, MG132 (EMD, CA), добавки N2 и B27 (Gibco, CA), стероидный алкалоид, например, циклопамин (EMD, CA), фактор роста кератиноцитов (KGF), белки семейства Dickkopf, экстракт бычьего гипофиза, белок, ассоциированный с неогенезом островков (INGAP), Indian Hedgehog, Sonic Hedgehog, ингибиторы протеасомальной активности, ингибиторы сигнального пути Notch, ингибиторы Sonic Hedgehog и их сочетания.
По меньшей мере один дополнительный фактор может поступать из кондиционированной среды, полученной от линий панкреатических клеток, таких как PANC-1 (ATCC No: CRL-1469), CAPAN-1 (ATCC No: HTB-79), BxPC-3 (ATCC No: CRL-1687), HPAF-II (ATCC No: CRL-1997), линий клеток печени, таких как, HepG2 (ATCC No: HTB-8065), линий клеток кишечника, таких как, FHs 74 (ATCC No: CCL-241).
Дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, на экстраклеточном матриксе с использованием двух культуральных сред: дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток в клетки, экспрессирующие маркеры характерные для линии сформированной эндодермы, может осуществляться путем культивирования человеческих эмбриональных стволовых клеток с активином-А и Wnt-лигандом с применением двух культуральных сред. Следовательно, дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток может осуществляться следующим образом:
а. нанесение человеческих эмбриональных стволовых клеток на субстрат тканевой культуры, покрытый экстраклеточным матриксом;
b. культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток с активином-А и Wnt-лигандом в первой культуральной среде; и
c. культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток с активином-А во второй культуральной среде.
Первая культуральная среда может содержать сыворотку в низкой концентрации, вторая культуральная среда может содержать сыворотку в более высокой концентрации, чем первая культуральная среда.
Вторая культуральная среда может содержать Wnt-лиганд.
Первая культуральная среда: для обеспечения дифференцировки человеческих эмбриональных стволовых клеток в сформированную эндодерму первая культуральная среда должна содержать достаточно низкие концентрации определенных факторов, например, инсулина и IGF (как описано в публикации WO2006020919). Этого можно добиться путем понижения концентрации сыворотки или, в качестве альтернативы, при помощи среды с заданным химическим составом, в котором отсутствуют инсулин и IGF. Примеры среды с заданным химическим составом приводятся в публикации Wileset al (Exp Cell Res. 1999 Feb 25; 247(1):241-8.).
Первая культуральная среда может содержать более низкую концентрацию сыворотки, чем вторая культуральная среда. Повышение концентрации сыворотки во второй культуральной среде повышает выживание клеток или, с другой стороны, может усиливать пролиферацию клеток. Концентрация сыворотки в первой среде может лежать в диапазоне от приблизительно 0% до приблизительно 10%. В качестве альтернативы концентрация сыворотки в первой среде может лежать в диапазоне от приблизительно 0% до приблизительно 2%. В качестве альтернативы концентрация сыворотки в первой среде может лежать в диапазоне от приблизительно 0% до приблизительно 1%. В качестве альтернативы концентрация сыворотки в первой среде может составлять приблизительно 0,5%.
При культивации человеческих эмбриональных стволовых клеток с активином-А и Wnt-лигандом с применением по меньшей мере двух культуральных сред, время культивации в первой культуральной среде может варьировать от приблизительно 1 дня до приблизительно 3 дней.
Активин-А может использоваться в концентрации, подходящей для индукции дифференцировки человеческих эмбриональных стволовых клеток. Данная концентрация может лежать в диапазоне от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 100 мкг/мл. В альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 1 мкг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 50 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять приблизительно 100 нг/мл.
Для увеличения эффективности процесса дифференцировки можно подобрать оптимальный Wnt-лиганд. Wnt-лиганд может выбираться из группы, состоящей из Wnt-1, Wnt-3a, Wnt-5a и Wnt-7a. В одном варианте осуществления Wnt-лиганд представляет собой Wnt-1. В альтернативном варианте осуществления Wnt-лиганд представляет собой Wnt-3a.
Wnt-лиганд может присутствовать в концентрации от приблизительно 1 нг/мл до приблизительно 1000 нг/мл. В альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 10 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл.
Данная первая культуральная среда может также содержать ингибитор GSK-3B. Ингибитор GSK-3B может быть добавлен в первую культуральную среду, во вторую культуральную среду или как в первую, так и во вторую культуральную среду.
Ингибитор GSK-3B может выбираться из группы, состоящей из GSK-3B-ингибитора IX и GSK-3B-ингибитора XI. В одном варианте осуществления ингибитор GSK-3B представляет собой GSK-3B-ингибитор IX.
При культивировании человеческих эмбриональных стволовых клеток с ингибитором GSK-3B концентрация ингибитора GSK-3B может составлять от приблизительно 1 нМ до приблизительно 1000 нМ. В альтернативном варианте осуществления человеческие эмбриональные стволовые клетки культивируются с ингибитором GSK-3B в концентрации от приблизительно 10 нМ до приблизительно 100 нМ.
Данная первая культуральная среда может также содержать по меньшей мере один дополнительный фактор, способный усилить формирование клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, из человеческих эмбриональных стволовых клеток. В качестве альтернативы по меньшей мере еще один дополнительный фактор может улучшить пролиферацию клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, полученные с помощью способов, составляющих предмет настоящего изобретения. Кроме того, по меньшей мере еще один дополнительный фактор может улучшить способность клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, полученных с помощью способов, которые составляют предмет настоящего изобретения, образовывать другие типы клеток или повышать эффективность дополнительных этапов дифференцировки.
По меньшей мере еще одним дополнительным фактором могут быть, например, никотинамид, члены семейства TGF-β, включая TGF-β1, 2 и 3, сывороточный альбумин, члены семейства факторов роста фибробластов, тромбоцитарные факторы роста-AA и -BB, плазма, богатая тромбоцитами, инсулиноподобный фактор роста (IGF-I, II), фактор роста и дифференцировки (GDF-5, -6, -8, -10, 11), глюкагон-подобный пептид-I и II (GLP-I и II), миметические антитела GLP-1 и GLP-2, экзендин-4, ретиноевая кислота, паратиреоидный гормон, инсулин, прогестерон, апротинин, гидрокортизон, этаноламин, бета-меркаптоэтанол, эпидермальный фактор роста (EGF), гастрин I и II, хелатирующие агенты на основе меди, например, триэтиленпентамин, форсколин, бутират натрия, активин, бетацеллюлин, ITS, noggin, фактор роста нейритов, nodal, вальпроевая кислота, трихостатин-A, натрия бутират, фактор роста гепатоцитов (HGF), сфингозин-1, VEGF, MG132 (EMD, CA), добавки N2 и B27 (Gibco, CA), стероидный алкалоид, например, циклопамин (EMD, CA), фактор роста кератиноцитов (KGF), белки семейства Dickkopf, экстракт бычьего гипофиза, белок, ассоциированный с неогенезом островков (INGAP), Indian Hedgehog, Sonic Hedgehog, ингибиторы протеасомальной активности, ингибиторы сигнального пути Notch, ингибиторы Sonic Hedgehog и их сочетания.
По меньшей мере один дополнительный фактор может поступать из кондиционированной среды, полученной от линий панкреатических клеток, таких как PANC-1 (ATCC No: CRL-1469), CAPAN-1 (ATCC No: HTB-79), BxPC-3 (ATCC No: CRL-1687), HPAF-II (ATCC No: CRL-1997), линий клеток печени, таких как, HepG2 (ATCC No: HTB-8065), линий клеток кишечника, таких как, FHs 74 (ATCC No: CCL-241).
Вторая культуральная среда: вторая культуральная среда должна содержать определенные факторы, такие как, например, инсулин и IGF (как описывается в публикации WO2006020919), в концентрации, достаточной, чтобы способствовать выживанию культивируемых клеток. Для этого можно повысить концентрацию сыворотки или, в качестве альтернативы, использовать среду с заданным химическим составом, где концентрации инсулина и IGF выше, чем в первой культуральной среде. Примеры среды с заданным химическим составом приводятся в публикации Wiles et al (Exp Cell Res. 1999 Feb 25; 247(1): 241-8.).
Во второй культуральной среде, где используются более высокие концентрации сыворотки, концентрация сыворотки может лежать в диапазоне от приблизительно 0,5% до приблизительно 10%. В качестве альтернативы концентрация сыворотки во второй культуральной среде может лежать в диапазоне от приблизительно 0,5% до приблизительно 5%. В качестве альтернативы концентрация сыворотки во второй культуральной среде может лежать в диапазоне от приблизительно 0,5% до приблизительно 2%. В качестве альтернативы концентрация сыворотки во второй культуральной среде может составлять приблизительно 2%. При культивации человеческих эмбриональных стволовых клеток во второй культуральной среде, время культивации может варьироваться от приблизительно 1 дня до приблизительно 4 дней.
Аналогично первой культуральной среде, активин-A может использоваться в концентрации, подходящей для индукции дифференцировки человеческих эмбриональных стволовых клеток. Данная концентрация может лежать в диапазоне от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 100 мкг/мл. В альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 1 мкг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 50 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять приблизительно 100 нг/мл.
Wnt-лиганд может присутствовать в концентрации от приблизительно 1 нг/мл до приблизительно 1000 нг/мл. В альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 10 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл.
Wnt-лиганд может выбираться из группы, состоящей из Wnt-1, Wnt-3a, Wnt-5a и Wnt-7a. В одном варианте осуществления Wnt-лиганд представляет собой Wnt-1. В альтернативном варианте осуществления Wnt-лиганд представляет собой Wnt-3a.
Вторая культуральная среда может также содержать ингибитор GSK-3B. Ингибитор GSK-3B может быть добавлен в первую культуральную среду, во вторую культуральную среду или как в первую, так и во вторую культуральную среду.
Ингибитор GSK-3B может выбираться из группы, состоящей из GSK-3B-ингибитора IX и GSK-3B-ингибитора XI. В одном из вариантов осуществления ингибитор GSK-3B представляет собой GSK-3B-ингибитор IX.
При культивировании человеческих эмбриональных стволовых клеток с ингибитором GSK-3B концентрация ингибитора GSK-3B может составлять от приблизительно 1 нМ до приблизительно 1000 нМ. В альтернативном варианте осуществления человеческие эмбриональные стволовые клетки культивируются с ингибитором GSK-3B в концентрации от приблизительно 10 нМ до приблизительно 100 нМ.
Аналогично первой культуральной среде, вторая культуральная среда может также содержать по меньшей мере один дополнительный фактор, способный усилить формирование клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, из человеческих эмбриональных стволовых клеток. В качестве альтернативы по меньшей мере еще один дополнительный фактор может улучшить пролиферацию клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, полученные с помощью способов, составляющих предмет настоящего изобретения. Кроме того, по меньшей мере еще один дополнительный фактор может улучшить способность клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, полученных с помощью способов, которые составляют предмет настоящего изобретения, образовывать другие типы клеток или повышать эффективность дополнительных этапов дифференцировки.
По меньшей мере еще одним дополнительным фактором могут быть, например, никотинамид, члены семейства TGF-β, включая TGF-β1, 2 и 3, сывороточный альбумин, члены семейства факторов роста фибробластов, тромбоцитарные факторы роста-AA, и -BB, плазма, богатая тромбоцитами, инсулиноподобный фактор роста (IGF-I, II), фактор роста и дифференцировки (GDF-5, -6, -8, -10, 11), глюкагон-подобный пептид-I и II (GLP-I и II), миметические антитела GLP-1 и GLP-2, экзендин-4, ретиноевая кислота, паратиреоидный гормон, инсулин, прогестерон, апротинин, гидрокортизон, этаноламин, бета-меркаптоэтанол, эпидермальный фактор роста (EGF), гастрин I и II, хелатирующие агенты на основе меди, например, триэтиленпентамин, форсколин, бутират натрия, активин, бетацеллюлин, ITS, noggin, фактор роста нейритов, nodal, вальпроевая кислота, трихостатин-A, натрия бутират, фактор роста гепатоцитов (HGF), сфингозин-1, VEGF, MG132 (EMD, CA), добавки N2 и B27 (Gibco, CA), стероидный алкалоид, например, циклопамин (EMD, CA), фактор роста кератиноцитов (KGF), белки семейства Dickkopf, экстракт бычьего гипофиза, белок, ассоциированный с неогенезом островков (INGAP), Indian Hedgehog, Sonic Hedgehog, ингибиторы протеасомальной активности, ингибиторы сигнального пути Notch, ингибиторы Sonic Hedgehog и их сочетания.
По меньшей мере один дополнительный фактор может поступать из кондиционированной среды, полученной от линий панкреатических клеток, таких как PANC-1 (ATCC No: CRL-1469), CAPAN-1 (ATCC No: HTB-79), BxPC-3 (ATCC No: CRL-1687), HPAF-II (ATCC No: CRL-1997), линий клеток печени, таких как, HepG2 (ATCC No: HTB-8065), линий клеток кишечника, таких как, FHs 74 (ATCC No: CCL-241).
Настоящее изобретение иллюстрируют, но не ограничивают, следующие примеры.
Пример 1
Культура человеческих эмбриональных стволовых клеток
Стволовые клетки представляют собой недифференцированные клетки, определяющиеся по их способности на уровне единичной клетки самообновляться и дифференцироваться с образованием клеток-потомков, таких как самообновляющиеся предшественники, необновляющиеся предшественники и окончательно дифференцированные клетки. Стволовые клетки также характеризуются способностью дифференцироваться in vitro в функциональные клетки различных линий, происходящих из нескольких зародышевых листков (эндодермы, мезодермы и эктодермы), а также после трансплантации давать начало тканям, происходящим от нескольких зародышевых листков, и вносить существенный вклад в формирование большинства, если не всех, тканей после инъекции в бластоциты.
Линии человеческих эмбриональных стволовых клеток H1, H7 и H9 были получены в WiCell Research Institute, Inc., (Madison, WI) и культивировались в соответствии с инструкциями, предоставленными указанным выше институтом. Вкратце, клетки культивировались на питающих клетках, представляющих собой мышиные эмбриональные фибробласты (МЭФ) в среде для эмбриональных стволовых клеток, содержащей DMEM/F12 (Invitrogen/GIBCO), с добавкой 20% заменителя сыворотки Knockout, 100 нМ раствора заменимых аминокислот MEM, 0,5 мМ бета-меркаптоэтанола, 2 мМ L-глутамина с 4 нг/мл человеческого основного фактора роста фибробластов (bFGF) (все производства Invitrogen/GIBCO). МЭФ-клетки из мышиных эмбрионов E13 -13.5, были приобретены в Charles River. МЭФ-клетки выращивались в среде DMEM с добавлением 10% эмбриональной телячьей сыворотки (ЭТС) (Hyclone), 2 мМ глутамина и 100 мМ заменимых аминокислот MEM. Субконфлюэнтные культуры МЭФ-клеток были обработаны раствором 10 мкг/мл митомицина C (Sigma, St. Louis, MO) в течение 3 ч для остановки деления клеток, затем обработаны трипсином и рассеяны по 2×104/см2 на чашки Петри, покрытые 0,1% бычьим желатином. В качестве слоя питающих клеток использовались МЭФ-клетки пассажей со второго по четвертый. Человеческие эмбриональные стволовые клетки, нанесенные на слой питающих МЭФ-клеток, культивировались при 37°C в атмосфере, содержащей 5% CO2 в инкубаторе с увлажнением для тканевых культур. По достижении конфлюэнтного роста (приблизительно через 5-7 дней после нанесения), человеческие эмбриональные стволовые клетки обрабатывались раствором коллагенозы типа IV с концентрацией 1 мг/мл (Invitrogen/GIBCO) в течение 5-10 мин, а затем мягко счищались с поверхности при помощи пипетки на 5 мл. Клетки центрифугировались при 900 об/мин в течение 5 мин, осадок ресуспендировался и снова высевался с соотношением клеток от 1:3 до 1:4 в свежую культуральную среду.
Параллельно, человеческие эмбриональные стволовые клетки H1, H7 и H9 рассевались на планшеты, покрытые раствором MATRIGEL (BD Biosciences) со сниженным содержанием ростовых факторов в разведении 1:30, и культивировались в кондиционированной МЭФ-клетками среде с добавлением 8 нг/мл bFGF. Клетки, культивируемые на матриксе MATRIGEL, регулярно пересевались с использованием ферментов коллагеназы IV (Invitrogen/GIBCO), диспазы (BD Biosciences) или либеразы (LIBERASE). Некоторые культуры человеческих эмбриональных стволовых клеток инкубировались в условиях гипоксии (приблизительно, при 3% O2).
Пример 2
Сортировка клеток с активацией флуоресценции (FACS)
Прикрепленные человеческие эмбриональные стволовые клетки снимались с культуральных планшет при помощи пятиминутной инкубации с раствором TrypLE™ Express (Invitrogen, CA). Освобожденные клетки ресуспендировались в среде для культивации человеческих эмбриональных стволовых клеток и извлекались путем центрифугирования с последующей отмывкой и ресуспендированием в окрашивающем буфере, состоящем из 2% бычьего сывороточного альбумина BSA, 0,05% азида натрия в фосфатно-солевом буфере (PBS) (Sigma, MO). В зависимости от ситуации, на клетках в течение 15 минут блокировался Fc-рецептор путем инкубации с 0,1% раствором γ−глобулина (Sigma). Аликвоты (приблизительно по 1×105 клеток) инкубировались с моноклональными антителами, конъюгированными либо с фикоэритрином (PE), либо с аллофикоцианином (APC) (5 мкл антител на 1×106 клеток), как показано в Таблице IA, или с неконъюгированными первичными антителами. Контроль составляли антитела соответствующего изотипа, неокрашенные клетки и клетки, окрашенные только вторичными конъюгированными антителами. Инкубация с любыми антителами проводилась в течение 30 мин при 4°C, после чего клетки отмывались окрашивающим буфером. Образцы, которые были окрашены неконъюгированными первичными антителами, инкубировались в течение еще 30 мин при 4°C с вторичными конъюгированными антителами, меченными PE или APC. В Таблице IB приводится список используемых вторичных антител. Отмытые клетки были осаждены центрифугированием и ресуспендированы в окрашивающем буфере, после чего проведена идентификация молекул клеточной поверхности с помощью прибора для анализа FACS (BD Biosciences), при регистрации не менее 10000 событий.
Пример 3
Иммуноцитохимия
Прикрепленные клетки были зафиксированы 4% параформальдегидом в течение 20 мин при комнатной температуре. Зафиксированные клетки блокировались в течение 1 часа при комнатной температуре с помощью раствора PBS/0,1%BSA/10% нормальная сыворотка цыпленка/0,5% Triton X-100, а затем инкубировались в течение ночи с первичными антителами в растворе PBS/0,1%BSA/10% нормальная сыворотка цыпленка при 4°C. Список первичных антител и рабочие разведения приведены в Таблице IA. После трехкратной отмывки раствором PBS/0,1% BSA, клетки инкубировались с раствором флуоресцентных вторичных антител (Таблица IB) в разведении 1:100 в PBS в течение одного часа при комнатной температуре для осуществления связывания. Контрольные образцы включали реакции, где не использовались первичные антитела, или где первичные антитела заменялись соответствующими иммуноглобулинами отрицательного контроля в той же концентрации, что и первичные антитела. Окрашенные образцы промывались; к каждому образцу добавлялась капля реагента PROLONG® (Invitrogen, CA), содержащего диамидино-2-фенилиндола дигидрохлорид (DAPI), для контрастного окрашивания ядра, а также в качестве реагента, препятствующего обесцвечиванию. Изображения были получены с помощью инвертного микроскопа Nikon Confocal Eclipse C-1 (Nikon, Япония) с объективом 10-60X.
Пример 4
ПЦР-анализ клеток, полученных из эмбриональных стволовых клеток
Очистка и экстрагирование РНК и синтез кДНК: Образцы РНК очищали путем связывания с силикагелевой мембраной (Rneasy Mini Kit, Qiagen, CA) в присутствии этанолсодержащего высокосолевого буферного раствора, а затем промывали для удаления примесей. Дальнейшую очистку РНК проводили с помощью комплекта TURBO DNA-free kit (Ambion, INC), после чего высококачественная РНК разводилась водой. Выход и чистоту оценивали по показаниям A260 и A280 на спектрофотометре. Копии кДНК получали с очищенной РНК с помощью высокопроизводительного комплекта для создания архивов кДНК от ABI (ABI, CA).
Амплификация и количественный анализ с помощью ПЦР в реальном времени: если не указано иное, все реагенты приобретены в компании Applied Biosystems. Реакции ПЦР в режиме реального времени проводили с использованием системы для определения последовательности ABI PRISM® 7900 Sequence Detection System. Использовался мастер-микс TAQMAN® UNIVERSAL PCR MASTER MIX® (ABI, CA) с 20 нг обратно транскрибированной РНК в общем объеме реакционной смеси 20 мкл. Все исследования образцов кДНК дублировали для внесения поправки на погрешности дозирования пипеткой. Праймеры и зонды TAQMAN®, помеченные красителем FAM, использовали в концентрациях 200 нМ. Уровень экспрессии для каждого целевого гена нормализовали по эндогенному контролю человеческой глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы (ГАФДГ), ранее разработанному компанией Applied Biosystems. Наборы праймеров и зондов перечислены в Таблице II. Праймеры SOX-17 были разработаны с помощью программы PRIMERS (ABI, CA) и имели следующие последовательности: SOX-17: TGGCGCAGCAGATACCA, AGCGCCTTCCACGACTTG и CCAGCATCTTGCTCAACTCGGCG. После первоначальной инкубации при 50°C в течение 2 мин с последующей инкубацией при 95°C в течение 10 мин, образцы 40 раз были подвергнуты двустадийному циклу - этап денатурации при 95°C в течение 15 сек с последующим этапом отжига/элонгации при 60°C в течение 1 мин. Анализ данных проводился с помощью программного обеспечения GENEAMP®7000 Sequence Detection System. Для каждого комплекта праймеров и зондов значение порогового цикла (Ct) определялось как номер цикла, при котором интенсивность флуоресценции достигала определенного значения в середине экспоненциальной области амплификации. Уровни относительной экспрессии генов вычисляли способом сравнения Ct. Вкратце, для каждого образца кДНК значение Ct эндогенного контроля вычитали из значения Ct целевого гена и получали величину дельта Ct (ΔCt). Нормализованное количество целевого гена рассчитывали как 2-ΔCt, предполагая, что амплификация имеет 100% эффективность. Окончательные данные были выражены относительно калибровочного образца.
Пример 5
Дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток, культивированных на субстрате тканевой культуры, покрытом реактивом MATRIGEL , в сформированную эндодерму (СЭ)
Клетки линии человеческих эмбриональных стволовых клеток H9, пассаж 54, культивировались в условиях гипоксии (приблизительно, 3% O2) и наносились на чашки, покрытые реактивом MATRIGEL (раствор 1:30) и подвергались воздействию среды DMEM/F12 с добавлением 0,5% ЭТС и 20 нг/мл WNT-3a (№ по каталогу 1324-WN-002, R&D Systems, MN) и 100 нг/мл активина-A (R&D Systems, MN), в течение двух дней, с последующей обработкой средой DMEM/F12 с добавлением 2% ЭТС и 100 нг/мл активина-А (AA) в течение еще трех-четырех дней. На Фиг. 1 показана экспрессия CXCR4 по результатам FACS в день 4. На Фиг. 2 показаны данные ПЦР в реальном времени для культур человеческих эмбриональных стволовых клеток линии H9, обработанных средой с низким содержанием сыворотки + AA + WNT3A в дни 4 и 6. Данный протокол приводил к значительному повышению экспрессии маркеров сформированной эндодермы. Далее данная процедура будет именоваться протоколом сформированной эндодермы (DE-протокол).
Пример 6
Выделение и выращивание клеток, полученных из человеческих эмбриональных стволовых клеток, дифференцированных в стадию сформированной эндодермы
Клетки из линий человеческих эмбриональных стволовых клеток H1 и H9, различные пассажи (пассажи 30-54) культивировались в условиях гипоксии (приблизительно, 3% O2) в течение по меньшей мере трех пассажей. Клетки культивировались в среде MEF-CM с добавлением 8 нг/мл bFGF и наносились на планшеты, покрытые реактивом MATRIGEL в соответствии с Примером 1. К клеткам применялся DE-протокол, описанный в Примере 5. В дни 3-6 культуры обрабатывались раствором TrypLE™ Express (Invitrogen, CA) в течение 5 мин. Освобожденные клетки ресуспендировали в среде DMEM-F12 + 2% ЭТС, извлекли центрифугированием и подсчитали с помощью гемоцитометра. Освобожденные клетки высевали с плотностью 1000-10000 клеток/см2 в обработанные полистиролом для культивирования тканей (TCPS) флаконы и культивировались в среде DMEM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл активина-А + 20 нг/мл WNT-3A в условиях гипоксии (приблизительно, 3% O2) при 37°C в стандартном инкубаторе для тканевых культур. Флаконы TCPS не покрывали реактивом MATRIGEL или другими белками экстраклеточного матрикса. Среду ежедневно меняли. В случае некоторых культур к среде также добавляли 10-50 нг/мл IGF-I (инсулин-подобный фактор роста-I, производитель R&D Systems, MN) или 1X ITS (инсулин, трансферрин и селен, производитель Invitrogen, Ca). В случае некоторых культур к базовой среде (DM-F12+2% ЭТС) также добавляли 0,1 мМ меркаптоэтанола (Invitrogen, CA) и раствор заменимых аминокислот (1X, NEAA, Invitrogen, CA). Клетки первого пассажа обозначались Р1. Помимо этого, аналогичные культуры выращивали в условиях с нормальным содержанием кислорода (приблизительно 21% O2). Схема процедуры выделения показана на Фиг. 3.
Через 5-15 дней культивации, четко оформленные колонии клеток оказывались окружены большим количеством укрупненных клеток, имеющими облик старых (Фиг. 4a-b). При конфлюэнтности 50-60% производился пересев культур с добавлением раствора TrypLE™ Express в течение 5 мин при комнатной температуре. Освобожденные клетки ресуспендировались в среде DMEM-F12+2% ЭТС, извлекались центрифугированием и сеялись с плотностью 10000 клеток/см2 на флаконы, обработанные полистиролом для культивирования тканей (TCPS) в среде DMEM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл активина-А+20 нг/мл WNT-3A +/- 50 нг/мл IGF-I. Данная среда далее будет именоваться “средой для выращивания”. На Фиг. 4 c показана морфология клеток пассажа 3, посеянных с плотностью 10000 клеток/см2. В пассаже 3 (панель c) после исходного выделения морфология клеток была однородной, напоминающей эпителий, с большим отношением ядро/цитоплазма.
В случае некоторых культур в среду для выращивания добавлялся раствор 1X NEAA, плюс 0,1 мМ меркаптоэтанола. После трех-четырех пассажей прикрепленные клетки имели однородную морфологию с большим отношением ядро/цитоплазма. В параллельных культурах, ведущихся в условиях нормального содержания кислорода, не удалось добиться формирования прикрепленными клетками здоровых колоний. После 2-3 пассажей от культур, ведущихся в условиях нормального содержания кислорода, отказались из-за низкой скорости их роста.
Пример 7
Влияние активина-А, WNT-3A и IGF-I на рост и сохранение маркеров сформированной эндодермы после нескольких пассажей
Культуры, полученные из родительских человеческих эмбриональных стволовых клеток линии H9 в соответствии со способами, описанными в Примере 6, пересевались каждые 4-7 дней. На Фиг. 5 показаны данные ПЦР в реальном времени для выращенных клеток, культивировавшихся в среде 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл активина-А + 20 нг/мл WNT-3A в течение трех пассажей. Эти данные соответствуют линии, выделенной на 6 день применения DE-протокола, описанного в Примере 5. После каждого пассажа наблюдается отчетливое уменьшение экспрессии маркеров сформированной эндодермы, таких как SOX-17 и HNF-3 beta. Как показано на Фиг. 6, добавление WNT-3A в питательную среду, содержащую активин-А, приводило к значительному росту экспрессии маркеров сформированной эндодермы. Однако добавление 50 нг/мл IGF-I и отмена активина-А и WNT-3A (Фиг. 7 a-c) вызывали резкое падение экспрессии маркеров сформированной эндодермы и OCT-4, а также к увеличению экспрессии маркеров висцеральной эндодермы, таких как SOX-7 и AFP. На Фиг. 8 a-c показана морфология выращенных клеток, полученных из клеток H9p54, для пассажа 5 культивации в средах a) 2% ЭТС + DMF12 + 100 нг/мл активина-А + 20 нг/мл WNT-3A, b) 2% ЭТС + DM-F12 + 100 нг/мл активина-A, c) 2% ЭТС + DM-F12 + 50 нг/мл IGF-I. Морфологии клеток, культивированных в присутствии активина-А или активина-А + WNT-3A, были очень сходными и резко отличались от морфологии клеток, культивированных в 2% ЭТС + IGF-I.
Пример 8
Потенциал роста клеток, полученных из человеческих эмбриональных стволовых клеток, дифференцированных в стадию сформированной эндодермы
Культуры, полученные из родительских человеческих эмбриональных стволовых клеток линии H9 в соответствии со способами, описанными в Примере 6, пересевались каждые 4-5 дней, если питательная среда содержала 50 нг/мл IGF-I или ITS. Однако культуры, выращиваемые в среде, где отсутствовали добавки IGF или ITS, имели более низкую скорость роста и пересевались каждые 5-7 дней. Время удвоения популяций клеток, культивируемых на питательной среде + 50 нг/мл IGF-I, составляло приблизительно 55 часов, тогда как время удвоения популяций клеток, культивируемых на питательной среде без добавок, составляло приблизительно 75 часов. Популяция клеток, выращенная в соответствии с Примером 6, далее будет именоваться клетками EXPRES (EXpandable PRE-primitive Streak cells - размножающиеся клетки пред-первичной полоски). В Таблице III перечислены различные клетки EXPRES, полученные в соответствии со способами, описанными в Примере 6. Потенциал роста двух клеточных линий (EXPRES 01 и 02) показан на Фиг. 9.
Пример 9
Получение клеток EXPRES из суспензий одиночных человеческих эмбриональных стволовых клеток
Клетки из линий человеческих эмбриональных стволовых клеток H1 P33 и H9 P45 культивировались в условиях гипоксии (приблизительно, 3% O2) в течение по меньшей мере трех пассажей. Клетки культивировались в среде MEF-CM с добавлением 8 нг/мл bFGF и наносились на планшеты, покрытые реактивом MATRIGEL, в соответствии с Примером 1. При достижении приблизительно 60% конфлюентности, на культуры воздействовали раствором TrypLE™ Express (Invitrogen, CA) в течение 5 мин. Освобожденные клетки ресуспендировали в среде DMEM-F12+2% ЭТС, извлекли центрифугированием и подсчитали с помощью гемоцитометра. Освобожденные клетки сеялись с плотностью от 1000 до 10000 клеток/см2 на обработанные полистиролом для культивации тканей (TCPS) флаконы и культивировались в среде DM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл активина-A + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I + 0,1 мМ меркаптоэтанола (Invitrogen, CA) и раствора заменимых аминокислот (1X, NEAA, производитель Invitrogen, CA) в условиях гипоксии (приблизительно, 3% O2) при 37°C в стандартном инкубаторе для тканевых культур. Флаконы TCPS не покрывали реактивом MATRIGEL или другими белками экстраклеточного матрикса. Смена среды проводилась ежедневно. Клетки первого пассажа обозначаются P1. Помимо этого, аналогичные культуры выращивали в условиях с нормальным содержанием кислорода (приблизительно 21% O2). Культуры, полученные в атмосферной среде, не формировали колонии и демонстрировали плохую пролиферацию. Напротив, культуры, полученные в условиях гипоксии, формировали множество колоний (Фиг. 10), напоминающих колонии эмбриональных стволовых клеток, культивируемых на MATRIGEL или питающих МЭФ-клетках. Характеристики этих культур были очень похожи на характеристики клеток EXPRES, выделенных в ходе дифференцировки эмбриональных стволовых клеток в сформированную эндодерму.
Пример 10
Экспрессия белков клеточной поверхности в клетках EXPRES
Клеточные линии EXPRES 01 и EXPRES 02 оценивались на предмет экспрессии различных маркеров клеточной поверхности, включая маркеры, связанные с плюрипотентностью. Клетки линии EXPRES 01 анализировались в пассажах 9-24. Клетки линии EXPRES 02 анализировались в пассажах 7-20. Обе линии продемонстрировали сильную экспрессию маркеров плюрипотентности, обычно характерную для недифференцированных человеческих эмбриональных стволовых клеток. Однако линия EXPRES 02 показала более высокую процентную долю экспрессии маркеров дифференцировки, таких как CXCR4, LIF-рецептор и NCAM, чем линия EXPRES 01. Характерные диаграммы FACS представлены для линии EXPRES 01 P24 на Фиг. 11, а для линии EXPRES 02 P21 - на Фиг. 12. В Таблице IV приведены усредненные по трем разным экспериментам уровни экспрессии анализируемых маркеров клеточной поверхности с диапазонами (в квадратных скобках).
Пример 11
Экспрессия маркеров, ассоциирующихся с плюрипотентностью, измеренная путем иммунофлюоресцентного (ИФ) окрашивания клеток EXPRES
Клетки EXPRES 01 и 02, культивированные в питательной среде, окрашивались для выявления маркеров плюрипотентности с использованием способов, описанных в Примере 3. На Фиг. 13 показаны ИФ-изображения, окрашенные на OCT-4, Nanog, SOX-2 и HNF-3 beta, для клеток EXPRES 01 P10, культивированных в среде 2% ЭТС + DM-F12 + 100 нг/мл активина-А + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I. На Фиг. 14 показаны ИФ-изображения, окрашенные на OCT-4, Nanog, SOX-2 и HNF-3 beta, для клеток EXPRES 02, пассаж 9, культивированных в среде 2% ЭТС + DM-F12 + 100 нг/мл активина-А + 20 нг/мл WNT-3A. EXPRES 01 демонстрировали сильную положительную окрашиваемость на OCT-4, Nanog и SOX-2, и слабую - на HNF-3 beta. Напротив, клетки EXPRES 02 демонстрировали более сильную положительную окрашиваемость на HNF-3 beta и более слабую - на OCT-4, NANOG и SOX-2.
Пример 12
Экспрессия маркеров сформированной эндодермы и маркеров недифференцированных эмбриональных стволовых клеток по данным ПЦР в реальном времени
На Фиг. 15 a-h показан анализ способом ПЦР в реальном времени экспрессии эмбриональных маркеров (POU5F1, SOX-2, UTF1, ZFP42, Connexin43, Connexin45, FOXD3), внеэмбриональных маркеров (AFP, KRT15), эктодермальных маркеров (SOX-1, TUBB3, NESTIN), эндодермальных маркеров (FOXA2, IPF1, KRT15, GATA-4) и мезодермальных маркеров (GATA-4, GATA-2, MYOD, MSX1, CFC1, ABCG2) в клетках линий EXPRES 01, пассаж 11, и EXPRES 02, пассаж 7, культивируемых в соответствующих питательных средах. Все данные нормализованы к кратности изменения относительно недифференцированных человеческих эмбриональных стволовых клеток линии H9, культивированных в среде MEF-CM на планшетах, покрытых реактивом MATRIGEL. В качестве контроля из клеток H9 были сформированы эмбриоидные тельца с применением стандартных способов с обработкой коллагеназой и рассеванием на необработанные поверхности в среду DMEM-F12+20% ЭТС приблизительно на 10 дней. В эмбриоидных тельцах увеличивается экспрессия генов различных зародышевых листков в сравнении с недифференцированными эмбриональными стволовыми клетками. Другая эталонная РНК была получена из недифференцированной линии SA002 (Cellartis, Швеция), культивированной на матриксе MATRIGEL в среде MEF-CM. Как и прогнозировалось, в эмбриоидных тельцах сильно увеличивалась экспрессия генов различных зародышевых листков в сравнении с клеточными линиями EXPRES 01, EXPRES 02, SA002, и H9. Как в линии EXPRES 01, так и в линии EXPRES 02 наблюдалась экспрессия FOXA2, в отличие от линий SA002 и H9. Ни в одной из линий EXPRES не наблюдалось сильной экспрессии внеэмбриональных, мезодермальных или эктодермальных маркеров. Более того, экспрессия эмбриональных маркеров в клетках EXPRES была сходной с эталонными клеточными линиями SA002 и H9.
Пример 13
Различные культивационные среды, подходящие для выращивания клеток EXPRES
Клетки EXPRES успешно культивировались в средах указанных ниже составов в течение по меньшей мере 2-30 пассажей:
1. DM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A
2. DM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I
3. DM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 10 нг/мл IGF-I
4. DM-F12 + 2% ЭТС + 50 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I
5. DM-F12 + 2% ЭТС + 50 нг/мл AA + 10 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I
6. DM-F12 + 2% ЭТС + 50 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 10 нг/мл IGF-I
7. DM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл AA + 10 нг/мл WNT-3A + 10 нг/мл IGF-I
8. Среда заданного состава HEScGRO (Chemicon, CA)
Основной компонент упомянутой выше среды может быть заменен сходной средой, например, RPMI, DMEM, CRML, Knockout ™DMEM и F12.
Пример 14
Дифференцировка клеток EXPRES, культивируемых на субстрате тканевой культуры, в клетки сформированной эндодермы
Клетки EXPRES 01, пассаж 5, и клетки EXPRES 02, пассаж 4, культивируемые на TCPS в соответствующей среде, подвергались воздействию среды DMEM/F12 с добавлением 0,5% ЭТС, 20 нг/мл WNT-3a и 100 нг/мл активина-А (R&D Systems, MN) в течение двух дней с последующей обработкой средой DMEM/F12 с добавлением 2% ЭТС и 100 нг/мл активина-А (AA) еще в течение 3-5 дней. На Фиг. 16 показана экспрессия CXCR4 по данным FACS, на день 4, в клетках EXPRES 01 (Фиг. 16a приблизительно17% CXCR4-положительных) и EXPRES 02 (Фиг. 16b приблизительно 40% CXCR4-положительных). На Фиг. 17 показаны результаты анализа способом ПЦР в реальном времени для культур клеток EXPRES 01 (Фиг. 17a) и EXPRES 02 (Фиг. 17b) в среде с низким содержанием сыворотки + AA + WNT-3A в дни 2-5. На Фиг. 18 и 19 показаны иммунофлуоресцентные изображения клеток EXPRES 01 и 02, соответственно, подвергавшихся указанной выше обработке в течение 4 дней. В целом, в клетках EXPRES 02 наблюдалась более сильная экспрессия маркеров сформированной эндодермы, чем в клетках EXPRES 01. Как показывают данные, полученные способами FACS, иммунного окрашивания и ПЦР, снижение концентрации сыворотки и удаление IGF увеличивает экспрессию маркеров сформированной эндодермы. Тем не менее, общий уровень экспрессии маркеров сформированной эндодермы, таких как CXCR4 и HNF-3 beta, был ниже, чем обычно наблюдались в культурах недифференцированных человеческих эмбриональных стволовых клеток, дифференцированных в стадию сформированной эндодермы.
С целью увеличения экспрессии маркеров сформированной эндодермы, в протокол дифференцировки DE были внесены следующие изменения: на клетки EXPRES 01, пассаж 19, и EXPRES 02, пассаж 14, культивированных на TCPS в соответствующих средах, воздействовали средой DMEM/F12 с добавлением 0,5% ЭТС, 20 нг/мл WNT-3a, 100 нг/мл активина-А и 100 нМ GSK-3B-ингибитора IX (№ по каталогу 361550, Calbiochem, CA) в течение 4-5 дней. На Фиг. 20 показана экспрессия CXCR4 по данным FACS, на день 4, в клетках EXPRES 01 (Фиг. 20a, приблизительно 57% CXCR4-положительных) и EXPRES 02 (Фиг. 20b, приблизительно 86% CXCR4-положительных). На Фиг. 21 показаны соответствующие иммунофлуоресцентные изображения на день 5 для клеток EXPRES 01 (панели a-f) и EXPRES 02 (панели g-l), дифференцированных в стадию сформированной эндодермы. На Фиг. 22 показаны данные ПЦР в реальном времени для клеток EXPRES 01 (Фиг. 22a) и EXPRES 02 (Фиг. 22b).
Пример 15
Влияние плотности посева на дифференцировку клеток EXPRES 01 в сформированную эндодерму
Клетки EXPRES 01 P31 сеялись с плотностью 5000, 10000, 20000 или 40000 клеток/см2 на планшеты TCPS в среде DM-F12 + 2% ЭТС + 0,1 мМ меркаптоэтанола + 1X, NEAA + 100 нг/мл активина-A + 20 нг/мл WNT-3A в условиях гипоксии (приблизительно 3% O2) при 37°C в стандартном инкубаторе для тканевых культур. Через два дня после посева среду меняли на DMEM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл активина-А + 20 нг/мл WNT-3A + 100 нМ GSK-3B-ингибитора IX в течение четырех дней в условиях гипоксии (приблизительно 3% O2) при 37°C в стандартном инкубаторе для тканевых культур. На Фиг. 23 показаны результаты анализа маркеров сформированной эндодермы способом ПЦР в реальном времени на 4 день дифференцировки. Выяснилось, что для правильного формирования сформированной эндодермы требуется плотность посева по меньшей мере 10000-20000 клеток/см2.
Пример 16
Длина теломеров в клетках EXPRES
Длина теломеров в двух линиях EXPRES, выделенных, как описано в Примере 5, а также в недифференцированных человеческих эмбриональных стволовых клетках линии H1 анализировалась с помощью теста Telo TAGGG Telomere Length Assay (Roche, IN) в соответствии с инструкциями изготовителя. На Фиг. 24 показана длина теломера в клетках EXPRES 01, пассаж P24, в клетках EXPRES 02, пассаж 17, в клетках H1, пассаж 40, контроли с большой и малой длиной теломеров и масштабный маркер входили в состав комплекта. Выявлено, что обе линии имели более короткий теломер, чем недифференцированные эмбриональные стволовые клетки.
Пример 17
Дальнейшая дифференцировка клеток EXPRES, культивируемых на субстрате тканевой культуры, в клетки панкреатической эндодермы
Клетки EXPRES 01, пассаж 21, на 5 день дифференцировки подвергались обработке средой 0,5% ЭТС, DMEM:F12 с добавлением 100 нг/мл активина-А, 10 нг/мл Wnt-3a и 100 нМ GSK3 beta-ингибитора IX. Клетки были проанализированы способом FACS, и было показано, что 80% клеток были CXCR4-положительными. Затем клетки проходили описанные далее этапы обработки, каждый этап занимал 3 дня: 2% ЭТС DMEM:F12 с добавлением 50 нг/мл FGF-10 и 0,25 мкМ KAAD-Cyclopamine (Calbiochem, CA); затем 1% B27 DMEM, с низким содержанием глюкозы, с добавлением 50 нг/мл FGF-10, 0,25М KAAD-Cyclopamine и 1 мкМ ретиноевой кислоты (Sigma, MO); затем 1% B27 DMEM с низким содержанием глюкозы, с добавлением 1 мкМ DAPT (Calbiochem, CA) плюс 50 нг/мл Exendin4 (Sigma, MO); и, наконец, 1% B27 DMEM CMRL с добавлением по 50 нг/мл IGF, HGF и Exendin4. Образцы отбирались в конце каждого этапа, и из клеток экстрагировалась РНК. Для указанных маркеров проводился анализ способом количественной ПЦР в реальном времени. Как показано на Фиг. 25, уровни экспрессии инсулина были в 100 раз больше, чем в необработанных клетках, а уровни PDX-1 также были выше в 1000 раз.
Пример 18
Дальнейшая дифференцировка клеток EXPRES, культивируемых на субстрате тканевой культуры, в клетки эндодермы передней кишки
Клетки EXPRES 01, пассаж 35, на 5 день дифференцировки подвергались обработке средой 0,5% ЭТС, DMEM:F12 с добавлением 100 нг/мл активина-А, 20 нг/мл Wnt-3a и 100 нМ GSK3 beta-ингибитора IX. Клетки были проанализированы способом FACS, и было показано, что приблизительно 70% клеток были CXCR4-положительными. Затем клетки проходили описанные далее этапы обработки: 2% ЭТС DMEM:F12 с добавлением 50 нг/мл FGF-10 и 0,25 мкМ KAAD-Cyclopamine (Calbiochem, CA) в течение 3 дней; Этап 3, 1% B27 DMEM, с низким содержанием глюкозы с добавлением 50 нг/мл FGF-10, 0,25 мкМ KAAD-Cyclopamine и 1 мкМ ретиноевой кислоты (Sigma, MO) в течение 4 дней; и Этап 4, 1% B27 DMEM, с низким содержанием глюкозы с добавлением 1 мкМ DAPT (Calbiochem, CA), плюс 50 нг/мл Exendin4 (Sigma, MO) в течение 4 дней. Данный протокол основывается на ранее вышедшей публикации D'Amour et al (Nature Biotech, 24, 1392, 2006). В конце этапа 4 клетки фиксировались и окрашивались на PDX-1, HNF-3 beta, SOX-17, альбумин, анти-трипсин и CDX-2. Как показано на Фиг. 26, клетки EXPRES легко могут быть дифференцированы в эндодерму передней кишки, что оценивается по экспрессии PDX-1 (приблизительно 20% положительных клеток в культуре), HNF-3 beta (приблизительно 90% положительных), альбумина (приблизительно 5% положительных), анти-1-трипсина (приблизительно 70% положительных), SOX-17 (приблизительно 70%) и CDX-2 (приблизительно 5% положительных).
Пример 19
Сравнение клеток EXPRES с недифференцированными человеческими эмбриональными стволовыми клетками с помощью генных чипов
Общая РНК была выделена из культуры человеческих эмбриональных стволовых клеток линии H9, пассаж 44, из клеток EXPRES 01 P11 и из клеток EXPRES 02 P7 с помощью набора RNeasy mini kit (Qiagen): каждая группа имела три биологических повтора и для каждого биологического повтора были выполнены повторы на двух отдельных генных чипах. Приготовление образцов, гибридизация и анализ изображений проводили в соответствии с инструкциями к набору Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array. После нормализации и логарифмического преобразования анализ данных проводили с использованием программного обеспечения OmniViz® (MA) и GENESIFTER (VizXLabs, WA). Достоверное отклонение в экспрессии генов между образцами оценивали с помощью дисперсионного анализа и F-критерия с выровненным значением P (поправка Бенджамини и Хохберга), менее или равном 0,05. Анализу подвергались только те гены, для которых отклик имел состояние “Присутствует” (Present). В Таблице V приводятся средние нормализованные, преобразованные в логарифмическую форму значения интенсивности сигналов генов, для которых наблюдалось по меньшей мере 5-кратное различие между группами (недифференцированные эмбриональные стволовые клетки, EXPRES 01 и EXPRES 02), а также скорректированное значение P для каждого гена. Гены, соответствующие первичной полоске или сформированной эндодерме, выделены жирным шрифтом. В Таблице V показаны только 200 генов с наиболее сильно повышенной или пониженной экспрессией.
Пример 20
Сравнение с помощью генных чипов клеток EXPRES, дифференцированных в стадию сформированной эндодермы, с человеческими эмбриональными стволовыми клетками, дифференцированными в стадию сформированной эндодермы
Общая РНК выделялась из описанных ниже культур с помощью комплекта RNeasy mini kit (Qiagen): A) клетки H9 P33, культивированные на планшетах, покрытых реактивом MATRIGEL (разведение 1:30) и обработанных средой DMEM/F12 с добавлением 0,5% ЭТС и 100 нг/мл активина-А и 20 нг/мл wnt-3A в течение двух дней с последующей обработкой средой DMEM/F12 с добавлением 2% ЭТС и 100 нг/мл активина-А (AA) в течение еще трех дней; B) клетки EXPRES 01 P24, культивированные на TCPS и обработанные средой DMEM/F12 с добавлением 0,5% ЭТС, 100 нг/мл активина-А, 20 нг/мл WNT-3A и 100 нМ GSK-3B-ингибитора IX (№ по каталогу 361550, Calbiochem, CA) в течение 5 дней C) клетки EXPRES02 P17, культивированные на TCPS и обработанные средой DMEM/F12 с добавлением 0,5% ЭТС, 100 нг/мл активина-А, 20 нг/мл WNT-3A и 100 нМ GSK-3B-ингибитора IX (№ по каталогу 361550, Calbiochem, CA) в течение 5 дней, D) клетки H9P39, культивированные на планшетах, покрытых реактивом MATRIGEL (разведение 1:30), и обработанные средой DMEM/F12 с добавлением 0,5% ЭТС и 100 нг/мл активина-А и 20 нг/мл wnt-3A в течение двух дней с последующей обработкой средой DMEM/F12 с добавлением 2% ЭТС и 100 нг/мл активина-А (AA) в течение двух дополнительных дней. Образцы РНК отбирались из группы D на сроках 2 ч, 6 ч, 24 ч, 30 ч, 48 ч, 72 ч и 96 ч. Также в качестве контролей брались клетки EXPRES 01 и 02, культивированные в соответствующей питательной среде. Для каждой группы использовались три биологические повторности, и каждая биологическая повторность была повторена на двух отдельных генных чипах.
Приготовление образцов, гибридизация и анализ изображений проводили в соответствии с инструкциями к набору Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array. После нормализации и логарифмического преобразования анализ данных проводили с использованием программного обеспечения OmniViz® (MA) и GENESIFTER (VizXLabs, WA). Достоверное отклонение в экспрессии генов между образцами оценивали с помощью дисперсионного анализа и F-критерия с выровненным значением P (поправка Бенджамини и Хохберга), меньше или равном 0,05. Анализу подвергались только те гены, для которых отклик имел состояние “Присутствует” (Present). В Таблице VI приводятся средняя нормализованная, преобразованная в логарифмическую форму интенсивность сигналов генов, для которых наблюдалось по меньшей мере 5-кратное различие между группами A, B, C и D в разные сроки, а также скорректированное значение P для каждого гена. В Таблице VI показаны только 200 генов с наиболее сильно повышенной или пониженной экспрессией. Гены, соответствующие первичной полоске или сформированной эндодерме, выделены жирным шрифтом. В Таблице VII указаны коэффициенты корреляции для всех сравниваемых групп. Диаграммы рассеяния, соответствующие коэффициентам корреляции, показаны на Фиг. 27. Выявлено, что глобальный профиль экспрессии в клетках EXPRES 01 сходен с профилем экспрессии образцов, находящихся на 30-м и менее часе стадии сформированной эндодермы, а глобальный профиль экспрессии в клетках EXPRES 02 сходен с профилем экспрессии образцов, находящихся на 48-м и более часе стадии сформированной эндодермы.
Пример 21
Формирование эмбриоидных телец и дифференцировка в различные линии
Культуры клеток EXPRES 01, пассаж 27, были извлечены в форме одиночных клеток с применением раствора TrypLE™ Express, отцентрифугированы при 200 г в течение 4 мин и ресуспендированы в среде DMEM-F12 + 20% ЭТС. Клеточная суспензия была посеяна на чашки Петри с низкой адгезионной способностью. Через 3-4 дня после посева сформировались структуры, напоминающие эмбриоидные тельца (Фиг. 28). Обработка культур средой DMEM-F12 + 2% ЭТС + 1 мкМ ретиноевой кислоты вызвала экспрессию маркеров эктодермы, таких как NeuroD.
Пример 22
Образование тератом в почечных капсулах мышей NOD-SCID
Недифференцированные человеческие эмбриональные стволовые клетки линии H9, пассаж 42, клетки EXSPRES 01, пассаж 30, и клетки EXPRES 02, пассаж 22, были извлечены из культуры с помощью раствора TRYPLE, промыты базовой средой и суспендированы в базовой среде DMEM-F12. Приблизительно 1×106 недифференцированных клеток H9 P42, 1,5 миллиона клеток EXPRES 01 или EXPRES 02 были введены способом инъекции в почечную капсулу шестинедельных мышей NOD-SCID. Через пять недель после трансплантации животные были забиты, почки были извлечены и зафиксированы в формалине или помещены в лизирующий буфер с целью сбора РНК для последующего ПЦР-анализа. На Фиг. 29 показана экспрессия маркеров, характерных для мезодермы, эктодермы, эндодермы, внеэмбриональной висцеральной эндодермы и маркеров плюрипотентности в собранных образцах. Как и в линии H9, в клетках линий EXPRES наблюдалась сильная экспрессия всех зародышевых листков, а также внеэмбриональной эндодермы.
Пример 23
Анализ пролиферации и клеточного цикла в клетках EXPRES 03
Человеческие эмбриональные стволовые клетки имеют уникальное состояние клеточного цикла, легко отличимое от прочих соматических клеток, и характеризующееся высокой долей клеток, находящихся в S-фазе и более короткими или урезанными Gap-фазами (G1 и G2). Механизмы контроля клеточного цикла в чЭС клетках могут быть функционально связаны со способностью этих клеток к самообновлению и с их плюрипотентностью, и могут отличаться от механизмов контроля цикла в дифференцированных/коммитированных клетках. Данные эксперименты были разработаны для определения природы клеточного цикла в клетках EXPRES, которые, как было показано, экспрессируют многие маркеры, характерные для плюрипотентных чЭС клеток.
Способы: Клетки сеялись с плотностью 5000-10000 клеток/см2 во флаконы для культивирования тканей Cell Bind (Corning) и культивировались в течение 2-4 дней. Клетки EXPRES 03 культивировались в питательной среде, содержащей 2% ЭТС в DMEM/F12 с добавлением активина-A (100 нг/мл), wnt-3a (10-20 нг/мл) и IGF (50 нг/мл). Для проведения сравнительного анализа пролиферации, IGF иногда не вводился в смесь ростовых факторов. Пролиферацию клеток анализировали с помощью набора APC BRDU Flow в соответствии с рекомендациями изготовителя (BD Biosciences, San Diego, CA). Вкратце, на клетки кратковременно воздействовали бромдезоксиуридином (BRDU) в течение 1-2 часов в конце периода культивации, после чего клетки извлекались с использованием раствора Tryple E Express и подсчитывались. Клетки фиксировали буфером BD Cytofix/Cytosperm, инкубировали в течение 30 мин, после чего инкубировали в буфере BD Cytoperm в течение 10 минут на льду. Далее клетки обрабатывали ДНКазой в течение 1 часа при 37°C, чтобы открыть включенный в них BRDU, после чего окрашивали антителами к BRDU, конъюгированными с APC. Для анализа клеточного цикла клетки окрашивались с помощью 7AAD и анализировались способом FACS.
Результаты: подобно чЭС-клеткам, клетки EXPRES 03 сохраняли высокую скорость пролиферации, что показывает высокая процентная доля клеток, находящихся в S-фазе, измеренная по способности включать BRDU в культуре. Встречаемость клеток, находящихся в S-фазе, как правило, превышала 45% (диапазон 40-60%), что сходно с чЭС-клетками (Фиг. 30a-c). Хотя количество клеток EXPRES 03, выращенных в присутствии IGF, через 3-4 дня в 2-3 раза превышало количество клеток, выращенных без добавления IGF, различия во встречаемости клеток, находящихся в S-фазе при воздействии на них BRDU в течение 1 часа или более были незначительными (Фиг. 30f). Данная высокая встречаемость клеток, находящихся в S-фазе, а также структура клеточного цикла отличаются от характеристик соматических клеток, которые здесь показаны на примере человеческих клеток амниотической жидкости (AFDX002) (Фиг. 30d). Более того, обработанные митомицином мышиные эмбриональные фибробласты (МЭФ, Фиг. 30e) не переходят в S-фазу, но наблюдается их очевидное накопление в фазе G2/M (64%), что может быть связано с неспособностью клеток, обработанных митомицином, разделить нити ДНК при митозе.
Пример 24
Сравнение эффективности трансфекции в эмбриональных стволовых клетках и в клетках EXPRES
Крупным препятствием в генетических манипуляциях с чЭС-клетками является их относительная устойчивость к традиционным способам трансфекции и вирусной трансдукции. Клетки EXPRES, наряду с высокой скоростью пролиферации, легко трансфицируются in vitro. Для сравнения эффективности трансфекции, в клетки EXPRES и чЭС в культуре трансфицировали белок EGFP (усиленный зеленый флуоресцентный белок), после чего проводился анализ способами флуоресцентной микроскопии и проточной цитометрии.
Способы: Клетки EXPRES 01 высевались на покрытые человеческим фибронектином (10 мкг/мл) 6-луночные культуральные планшеты в питательную среду, содержащую 2% ЭТС в DMEM/F12, активин-А (100 нг/мл), wnt-3a (10-20 нг/мл) и IGF (50 нг/мл). Если использовались клеточные кластеры, чЭС-клетки сеялись обычными способами, с использованием коллагеназы, на покрытые реактивом MATRIGEL 6-луночные культуральные планшеты и культивировались в кондиционированной с помощью МЭФ среде для чЭС-клеток. В случае одиночных клеток, при пересевании обрабатывали чЭС-клетки раствором TRYPLE в течение 3 минут при 37°C, с последующим нанесением на покрытые реактивом MATRIGEL 6-луночные культуральные планшеты. Когда клетки достигали требуемой конфлюентности (70-80%), их трансфицировали реактивом Lipofectamine 2000 в соответствии с рекомендациями изготовителя (Invitrogen, Carlsbad, CA). Вкратце, 4 мкг ДНК разводили в 250 мкл среды Opti-MEM I с пониженным содержанием сыворотки. Пять микролитров реактива Lipofectamine 200 смешивали с общим объемом 250 мкл среды Opti-MEM I в течение 5 минут, и осторожно перемешивали с разведенной ДНК. Давали возможность сформироваться комплексам ДНК/Lipofectamine, выдерживая смесь при комнатной температуре в течение 20 минут, после чего добавляли ее в соответствующие лунки при осторожных круговых движениях планшеты для перемешивания. Клетки инкубировали с комплексами в течение еще 24 часов с последующей полной сменой среды. Анализ клеток способами флуоресцентной микроскопии и проточной цитометрии проводился через 48 часов после смешивания.
Результаты: Сравнивали захват и экспрессию eGFP при трансфекции клеток EXPRES 01 и чЭС-клеток, нанесенных в виде одиночных клеток или клеточных кластеров. Анализ проводился через 48 часов. В клетках EXPRES 01 наблюдался наиболее высокий уровень экспрессии белка eGFP. По данным проточной цитометрии, 75% клеток экспрессировали eGFP (Фиг. 31). С другой стороны, чЭС-клетки были более устойчивы к трансфекции, и при использовании кластеров, по данным FACS, только 3% клеток экспрессировали белок eGFP. При приготовлении суспензии одиночных чЭС-клеток, уровень захвата ДНК и экспрессии eGFP возрастал до около 20%, но и эта величина примерно втрое меньше экспрессии, наблюдавшейся в клетках EXPRES 01.
Пример 25
Клетки EXPRES как гибкий инструмент скрининга
Клетки EXPRES выращивались в среде DMEM:F12 с добавлением 2% ЭТС, 100 нг/мл рекомбинантного человеческого активина-А (R&D Systems) и 20 нг/мл рекомбинантного мышиного Wnt-3a (R&D Systems). Питательная среда для выращивания клеток EXPRES 01 также содержала 50 нг/мл рекомбинантного человеческого IGF-1 (R&D Systems). Обе клеточные линии, стандартно, выращивались при 37°C в атмосфере с пониженным содержанием кислорода (3%) и 5% CO2. Клетки EXPRES 01 и EXPRES 02 извлекались из культуры в виде суспензии одиночных клеток с помощью ферментного расщепления реактивом TrypLE (Invitrogen, CA), после чего отмывались и подсчитывались для определения точного количества клеток и их жизнеспособности (>95%). Аликвоты, содержащие от 1250 до 80000 клеток вводились в покрытые человеческим фибронектином лунки 96-луночного планшета (Corning-Costar) с итоговым объемом культуральной среды 100 мкл. Контрольные лунки были также покрыты фибронектином и содержали эквивалентный объем культуральной среды без клеток. Планшетам давали возможность достигнуть равновесия, инкубируя их в течение ночи в камере с увлажнением в стандартной атмосфере с пониженным содержанием кислорода и 5% CO2 при 37°C. За это время клетки прикреплялись и образовывали монослойные культуры с различными уровнями конфлюентности, зависящими от исходной плотности посева. После культивации в течение ночи, в каждую лунку добавляли 20 мкл реагента MTS (CellTiter 96 Aqueous Assay; Promega). Реактив MTS восстанавливался до формазана и мог использоваться в качестве меры активности фермента дегидрогеназы, прямо пропорциональной количеству живых клеток. Один планшет снова культивировали при пониженном содержании кислорода, а идентичный планшет параллельно инкубировали в атмосфере с нормальным содержанием кислорода (20%). Через 4 часа измерялось поглощение при длине волны 490 нм на спектрофотометрическом сканере для планшет (Molecular Devices). Производились вычисления статистических параметров, таких как средняя оптическая плотность (OD), стандартное отклонение и процентный коэффициент вариаций (CV), для повторяющихся наборов образцов в пределах каждой планшеты, после чего сравнивались соответствующие лунки между планшетами.
Значения стандартного отклонения и процентного коэффициента вариаций показывают, что клетки EXPRES распределены между лунками равномерно, обеспечивая высокую эффективность посева и хорошую воспроизводимость результатов в разных лунках (Таблица VIII a-f). Как видно по средним значениям OD490 для эквивалентных количеств клеток, линия EXPRES 01 имеет более высокую метаболическую активность, чем линия EXPRES 02. Значения процентного коэффициента вариаций между двумя планшетами для каждой из линий EXPRES свидетельствуют о том, что в данном краткосрочном анализе нет различий по метаболической активности при параллельной инкубации с разными уровнями кислорода в атмосфере. Путем графического определения среднего значения OD в пределах линейного диапазона данного анализа было выявлено оптимальное количество клеток в лунке (Фиг. 32): менее 20000 клеток в лунке для EXPRES 01 и менее 40000 клеток в лунке для EXPRES 02. И снова, различия в содержании кислорода в атмосфере не повлияли, в данном краткосрочном анализе, на результаты определения оптимального количества клеток. Эти результаты предполагают, что клетки EXPRES пригодны для использования в скрининговых протоколах, предназначенных для определения токсикологических эффектов различных реагентов на пролиферацию клеток и/или на скорость метаболизма.
Пример 26
Рост клеток, подобных сформированной эндодерме, полученных из клеток EXPRES
В предыдущих примерах было установлено, что клетки EXPRES могут быть получены из эмбриональных стволовых клеток и могут легко выращиваться на TCPS в различных культуральных средах. В состав многих этих сред входит IGF или инсулин/IGF и 2% ЭТС. Как было показано, эти факторы оказывают ингибирующее действие на гены, связанные со сформированной эндодермой, через сигнальный путь PI-3-киназы (Stem cells, 25:29-38, 2007). Была создана альтернативная среда на основе DM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 100 нМ GSK-3B-ингибитора IX (далее именуемая “питательной средой для клеток сформированной эндодермы”). Клетки EXPRES 01, пассаж 27, культивируемые в описанной выше среде, были способны размножаться с той же скоростью, что и клетки, культивируемые в среде DM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT3A + 50 нг/мл IGF-I. Более того, клетки, культивированные в питательной среде для клеток сформированной эндодермы, имели сильную экспрессию маркеров сформированной эндодермы по данным ПЦР в реальном времени (Фиг. 33) на протяжении трех пассажей. Приблизительно 72% клеток экспрессировали CXCR4 (Фиг. 34).
Пример 27
Нокдаун целевых генов в клетках EXPRES с помощью миРНК
Эффективность нокдауна целевых генов в человеческих эмбриональных стволовых клетках с помощью миРНК сильно ограничена возможностями обеспечения высокого уровня трансфекции в человеческих эмбриональных стволовых клетках, выращиваемых в виде кластерных колоний. Клетки EXPRES легко трансфицируются миРНК с использованием традиционных способов и, следовательно, являются полезной системой для скрининга олигонуклеотидных последовательностей миРНК, а также для анализа роли целевых генов.
Способы: Клетки EXPRES 03 высевались на покрытые человеческим фибронектином (10г/мл) 6-луночные культуральные планшеты в питательную среду, содержащую 2% ЭТС в DMEM/F12, активин-А (100 нг/мл), wnt-3a (10-20 нг/мл) и IGF (50 нг/мл). В случае 6-луночных планшет, 200000 клеток высевались за 24 часа до трансфекции олигонуклеотидными последовательностями миРНК.
Для анализа нокдауна целевых генов, клетки, достигшие конфлюентности 70-80%, трансфицировались с помощью реактива Lipofectamine 2000 в соответствии с инструкциями изготовителя (Ambion (Applied Biosystems), Foster City, CA). Вкратце, соответствующее количество миРНК разводили в 250 мкл среды Opti-MEM I с пониженным содержанием сыворотки для получения итоговой концентрации 100 нмоль. Пять микролитров реактива Lipofectamine 2000 разводили в 250 мкл среды Opti-MEM I и инкубировали в течение 5 минут. Комплексы инкубировались в течение 15-20 минут при комнатной температуре, а затем добавлялись к клеткам при осторожных круговых движениях планшета с целью аккуратного перемешивания. Клетки инкубировали с миРНК в течение еще 24 часов с последующей полной сменой среды. Клетки визуализировали при помощи флуоресцентной микроскопии через 24-48 часов после трансфекции, и собирали РНК для анализа нокдауна целевых генов способами количественной ПЦР в реальном времени. Были протестированы следующие предварительно проверенные олигонуклеотидные последовательности миРНК, производитель Ambion: бета-катенин (Ид. № 42816) и GSK3b (Ид. № 42839).
Результаты: Флуоресцентная микроскопия выявила очень высокий уровень захвата миРНК клетками EXPRES (>80%) при использовании флуоресцентно-окрашенной миРНК (Фиг. 35). РНК, собранная из клеток, анализировалась способом ПЦР на предмет нокдауна целевых генов и сравнивалась с клетками, трансфицированными контрольными олигонуклеотидными миРНК. Олигонуклеотидные миРНК бета-катенина и GSK3b приводили к очень высокому уровню нокдауна генов в клетках EXPRES, который составил более 93%. Другие, непроверенные олигонуклеотидные последовательности, соответствующие другим целевым генам, например, Hes-1, Oct-4, приводили к более низкому и изменчивому уровню нокдауна целевого гена. Специфичность олигонуклеотидных последовательностей подтверждалась путем анализа транскриптов других генов, в которых значимый нокдаун не был выявлен.
Пример 28
Анализ профиля цитокинов с помощью микромножеств антител в линиях EXPRES 01 и 02
Линии EXPRES 01 и 02, пассажи 22 и 23, соответственно, выращивались до достижения, приблизительно 70% конфлюентности в соответствующих средах, а затем были получены лизаты клеток с помощью набора для лизирования клеток млекопитающих (Sigma-Aldrich, MO). Анализ цитокинов производился с помощью панелей с микромножествами антител, производитель RayBiotech, GA (http://www.raybiotech.com/). В Таблице IX a-c приводится экспрессия цитокинов, а также рецепторов цитокинов и ростовых факторов после нормализации данных и вычитания фона. Для каждой панели также приводятся положительные и отрицательные контроли. Тест с панелями был проведен для двух разных образцов из каждого типа клеток.
Пример 29
Анализ кариотипа
Кариотип клеток EXPRES 01, пассаж 20, и клеток EXPRES 02, пассаж 15, определялся путем анализа Гимза-дисков. Цитогенетический анализ производился на двадцати одной клетке EXPRES 01 с Гимза-дисками и на двадцати клетках EXPRES 02 с Гимза-дисками. Половина клеток EXPRES 01 с Гимза-дисками имели нормальный кариотип 46XX, а оставшиеся имели аномальный кариотип, например, трисомию по 17 хромосоме. В клетках EXPRES 02 также наблюдалась реорганизация хромосом с почти повсеместным дублированием коротких плечей хромосомы 1.
Пример 30
Получение клеток EXPRES из суспензии одиночных человеческих эмбриональных створовых клеток в присутствии ингибитора Rho-киназы (ROCK)
Человеческие эмбриональные стволовые клетки линии H9, пассаж 35, культивировались в условиях гипоксии (приблизительно, 3% O2) в течение по меньшей мере трех пассажей. Клетки культивировались в среде MEF-CM с добавлением 8 нг/мл bFGF и наносились на планшеты, покрытые реактивом MATRIGEL, в соответствии с Примером 1. При достижении приблизительно 60% конфлюентности, на культуры воздействовали раствором TrypLE™ Express (Invitrogen, CA) в течение 5 мин. Освобожденные клетки ресуспендировали в среде DM-F12 + 2% ЭТС, извлекли центрифугированием и подсчитали с помощью гемоцитометра. Освобожденные клетки высевались с плотностью от 1000 до 10000 клеток/см2 на обработанные полистиролом для культивации тканей (TCPS) флаконы и культивировались в среде DM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл активина-A + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I + 0,1 мМ меркаптоэтанола (Invitrogen, CA) и раствора заменимых аминокислот (1X, NEAA, производитель Invitrogen, CA) +/- 10 мкм ингибитора ROCK (Y-27632, Calbiochem, CA) в условиях гипоксии (приблизительно, 3% 02) при 37°C в стандартном инкубаторе для тканевых культур. Флаконы TCPS не покрывали реактивом MATRIGEL или другими белками экстраклеточного матрикса. Смена среды проводилась ежедневно. Клетки первого пассажа обозначаются P1. Как показано на Фиг. 37, через 24 часа после посева добавление ингибитора ROCK привело к значительному увеличению количества прикрепленных клеток в сравнении с культурами, полученными без добавления ингибитора ROCK. Клетки EXPRES, полученные при использовании ингибитора ROCK, Y27632, были обозначены как EXPRES 15.
Пример 31
Анализ кариотипа
Кариотип клеток EXPRES 15, пассажи 5 и 12, определялся анализом Гимза-дисков. Цитогенетический анализ проводился на двадцати одной клетке EXPRES 15 с Гимза-дисками. Во всех клетках наблюдался нормальный кариотип 46XX (Фиг. 38). FISH-анализ хромосом 12 и 17 также показал, что все клетки имели нормальный сигнал гена ETV6 BAP (TEL), расположенного на хромосоме 12, и все клетки имели нормальный сигнал гена Her2/neu, расположенного на хромосоме 17.
Пример 32
Клетки EXPRES могут поддерживаться в среде, имеющей определенный диапазон концентраций IGF, WNT-3A, активина-А и ингибиторов GSK-3B
Клетки EXPRES 11 выращивались в среде DMEM/F12 (Invitrogen) с добавлением 2% ЭТС, 100 нг/мл активина-А, 20 нг/мл Wnt-3a и 50 нг/мл IGF. По достижении 80% конфлюентности клетки пересевались с применением раствора TrypLE Express (Invitrogen) в 96-луночные планшеты с плотностью 4000 клеток в лунке в среде DMEM/F12 с добавлением 2% ЭТС. Клеткам давали 1 час на прикрепление к субстрату в инкубаторе с увлажнением при 37°C с 5% CO2, после чего добавляли активин-A в диапазоне концентраций от 50 до 100 нг/мл, Wnt-3a, в диапазоне концентраций от 10 до 20 нг/мл, IGF в диапазоне концентраций от 10 до 50 нг/мл, и GSK-3B-ингибитор (IX) в диапазоне концентраций от 50 до 100 нМ. В сроки 24, 48 и 96 часов определяли жизнеспособность клеток с помощью теста CellTiter® 96 AQueous One Solution Cell Proliferation Assay (Promega). Вкратце, реагент MTS добавляли в 96-луночные планшеты и инкубировали его с клетками в течение 1-4 часов, после чего измеряли поглощение при длине волны 490 нм на сканере для планшет. Величина поглощения была прямо пропорциональна количеству живых клеток. На Фиг. 39a-c показаны величины поглощения в сроки a) 24 часа, b) 48 часов и c) 96 часов после посева.
Публикации, цитируемые в данном документе, полностью включаются в настоящий документ в форме ссылок. Хотя различные аспекты изобретения иллюстрируются выше ссылками на примеры и предпочтительные варианты осуществления, подразумевается, что область изобретения ограничивается не упомянутым выше описанием, а следующими пунктами формулы изобретения, составленными в соответствии с принципами патентного законодательства.
Таблица IA
Список первичных антител, использованных при анализе способом FACS и иммунном окрашивании
Антитело
Поставщик
Изотип
№ по каталогу
SSEA-1
Chemicon (CA)
Мышиный IgM
MAB4301
SSEA-3
Chemicon (CA)
Мышиный IgG3
MAB4303
SSEA-4
Chemicon (CA)
Крысиный IgM
MAB1435
TRA 1-60
Chemicon (CA)
Мышиный IgM
MAB4360
TRA 1-81
Chemicon (CA)
Мышиный IgM
MAB4381
TRA 1-85
Chemicon (CA)
Мышиный IgG1
MAB4385
AP
R&D Systems (MN)
Мышиный IgG1
FAB1448A
HNF3β
R&D systems
Козий IgG
AF2400
PDX1
Santa Cruz Biotechnology, INC (CA)
Козий IgG
sc-14664
GATA4
R&D systems
Козий IgG
AF2606
Sox 17
R&D systems
Козий IgG
AF1924
CD 9
BD Bioscience (CA)
Мышиный IgG1
341647
CXCR4
R&D systems
Мышиный IgG2A
FAB170A
SOX2
R&D systems
Козий IgG
AF2018
Nanog
R&D systems
Козий IgG
AF1997
OCT4
R&D systems
Козий IgG
AF1759
Gata6
R&D systems
Козий IgG
AF1700
Ecad
R&D systems
Мышиный IgG
MAB1838
Ncam
R&D systems
Мышиный IgG
MAB777
HNF1b
R&D systems
Козий IgG
AF3330
b-катенин
R&D systems
Мышиный IgG
MAB13291
HNF1a
BD Bioscience
Мышиный IgG
610902
CD99
Invitrogen (CA)
Мышиный IgG
18-0235
Cerebus
Santa Cruz Biotechnology, INC
Козий IgG
SC15131
Hex
Santa Cruz Biotechnology, INC
Козий IgG
SC15129
AFP
R&D systems
Мышиный IgG
MAB1269
Антитрипсин
DAKO (CA)
Кролики
A0012
islet 1
R&D systems
Козий IgG
AF1837
Таблица IB
Список вторичных конъюгированных антител, используемых при анализе способом FACS и иммунном окрашивании
Вторичное конъюгированное антитело
Поставщик
Разведение
Козий антимышиный IgG, конъюгированный с APC
Jackson ImmunoResearch (PA)
1:200
Козий антимышиный IgG, конъюгированный с PE
Jackson ImmunoResearch (PA)
1:200
Ослиный антикроличий, конъюгированный с PE или APC
Jackson ImmunoResearch (PA)
1:200
Ослиный антикозий, конъюгированный с PE или APC
Jackson ImmunoResearch (PA)
1:200
Козий антимышиный IgM, PE
SouthernBiotech (AL)
1:200
Козий антикрысиный IgM, PE
SouthernBiotech (AL)
1:200
Козий антимышиный IgG3, PE
SouthernBiotech (AL)
1:200
Таблица II
Список праймеров, используемых при анализе способом GWH в реальном времени с применением TAQMAN®зондов
Праймер/Зонд
Номер по каталогу
18s
4310893E
ABCG2
Hs00184979_m1
AchE
Hs00241307_m1
AFP
Hs00173490_m1
ALB
Hs00609411_m1
альфа-антитрипсин
Hs02384981_m1
Амилаза
Hs00420710_g1
AP
Hs00240993_m1
Atoh1
Hs00944192_s1
B2MG
4310886E
B3Tubulin
Hs00964962_g1
B-катенин
Hs99999168_m1
Barx1
Hs00222053_m1
Brachyury (T)
Hs00610080_m1
CCK
Hs00174937_m1
Cdx1
Hs00156451_m1
Cdx2
Hs00230919_m1
CEBPa
Hs00269972_s1
CEBPb
Hs00942496_s1
Cerberus
Hs00193796_m1
CFC1 (Cripto)
Hs00414425_m1
CGA
Hs00174938_m1
CK19 (KRT19)
Hs00761767_s1
CLDN4 (claudin4)
Hs00533616_s1
C-Myc-связывающий белок
Hs00429315_g1
Connexin32 (GJB-1)
Hs00939759_s1
Connexin45
Hs00271416_s1
CTNNβ1
Hs00170025_m1
CXCR4
Hs00237052_m1
Циклин-D1
Hs00277039_m1
Dapper1 (DACT-1)
Hs00420410_m1
DKK1
Hs00183740_m1
DKK4
Hs00205290_m1
Эндоглин
Hs00164438_m1
Exo1
Hs00243513_m1
F3
Hs00175225_m1
FAH
Hs00164611_m1
FGF4
Hs00173564_m1
FGF10
Hs00610298_m1
FGFR1
Hs00241111_m1
FGFR3
Hs00179839_m1
FGFR4
Hs00242558_m1
Flk1
Hs00911705_g1
FOXA1
Hs00270129_m1
FOXA3
Hs00270130_m1
FOXD3
Hs00255287_s1
FOXF1
Hs00230962_m1
GAPDH (человеческий)
4310884E
Гастрин
Hs00174945_m1
GATA1
Hs00231112_m1
GATA4
Hs00171403_m1
GATA5
Hs00388359_m1
GATA6
Hs00232018_m1
GCK
Hs00175951_m1
GFAP
Hs00157674_m1
GIP
Hs00175030_m1
Gli
Hs01110766_m1
Глюкагон
Hs00174967_m1
Glut-2
Hs00165775_m1
Goosecoid
Hs00418279_m1
GS
Hs00374213_m1
Handy1
Hs00231848_m1
HB9
Hs00232128_m1
Hes1
Hs00172878_m1
Hex1
Hs00172696_m1
HEYL
Hs00232718_m1
HHIP (белок, взаимодействующий с белком hedgehog)
Hs01011009_m1
hHIF1α
Hs00153153_m1
HNF1
Hs00167041_m1
HNF1α
Hs00167041_m1
HNF1β
Hs00172123_m1
HNF3β
Hs00232764_m1
HNF4α
Hs00230853_m1
HNF6 (onecut)
Hs00413554_m1
HoxB1
Hs00157973_m1
IBSP
Hs00173720_m1
Инсулин II
Hs00355773_m1
Islet-1
Hs00158126_m1
Jagged-1 (JAG1)
Hs00164982_m1
KDR
Hs00176676_m1
KRT15
Hs00267035_m1
MafA
Hs00999118_m1
MAML1
Hs00207373_m1
Map2
Hs00159041_m1
MapK14
Hs00176247_m1
MapK8
Hs00177083_m1
MBP (основной белок миелина)
Hs00921945_m1
MIXL1
Hs00430824_g1
MMP1 (матриксная металлопротеаза 1)
Hs00233958_m1
MOX1
Hs00793059_m1
MSX1
Hs00427183_m1
Mucin1
Hs00904328_m1
Mucin2
Hs00159374_m1
Myf5
Hs00271574_m1
MyoD1
Hs00159528_m1
N-кадгерин (CDH2)
Hs00169953_m1
N-Cam1
Hs00169851_m1
NEFH
Hs00606024_m1
NEFL
Hs00196245_m1
Нестин
Hs00707120_s1
NeuroD1
Hs00159598_m1
Ngn3
Hs00360700_q1
Nkx2.1
Hs00163037_m1
Nkx2.2
Hs00159616_m1
Nkx6.1
Hs00232355_m1
Notch1
Hs01062014_m1
NTS
Hs00175048_m1
O2
Hs00377820_m1
Oct3/4
Hs00742896_s1
OTX2
Hs00222238_m1
Pax3
Hs00240950_m1
Pax4
Hs00173014_m1
Pax6
Hs00240871_m1
Pax8
Hs00247586_m1
Pax9
Hs00196354_m1
PDX-1 (IPF1)
Hs00236830_m1
Ptch (Patched)
Hs00970985_m1
PTF1a
Hs00603586_q1
PYY
Hs01062281_m1
RA-рецептор-альфа
Hs00230907_m1
RALDH
Hs01125173_m1
RBPSUH
Hs00794653_m1
Rex1 (ZFP42)
Hs00399279_m1
SCGB1
Hs00171092_m1
Секретин
Hs00360814_q1
sFRP
Hs00610060_m1
sFRP5
Hs00169366_m1
SHH
Hs00179843_m1
SLC5A8
Hs01068911_m1
Snai1
Hs00195591_m1
Snai2
Hs00161904_m1
Соматостатин
Hs00174949_m1
Sox1
Hs00534426_s1
Sox10
Hs00366918_m1
SOX17
см. вкладку "Sox17"
SOX2
Hs00602736_s1
Sox3
Hs00271627_s1
SOX7
Hs00846731_s1
Sox9
Hs00165814_m1
Sparc
Hs00234160_m1
SP-C
Hs00161628_m1
TBX6
Hs00365539_m1
TERT
Hs00162669_m1
THBD
Hs00264920_s1
Twist1
Hs00361186_m1
UtF1
Hs00747497_q1
Vim
Hs00185584_m1
Wnt-3a (человеческий)
Hs01055707_m1
Wnt-3a (мышиный)
Mm00437337_m1
WT1
Hs01103754_m1
ZIC1
Hs00604749_m1
Zic2
Hs00600845_m1
Таблица III
Список линий EXPRES, полученных из родительских линий H1 и H9
Идентифика-
ционный номер
Линия родительских эмбриональных стволовых клеток, номер пассажа
День получения в ходе дифференцировки в сформированную эндодерму
Среда, используемая для выращивания клеток
EXPRES 01
H9P54
День 4
Питательная среда + 50 нг/мл IGF-I
EXPRES 02
H9P54
День 6
DM-F12-+ 2% ЭТС +100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A (питательная среда)
EXPRES 03
H9P39
День 3
Питательная среда + 50 нг/мл IGF-I
EXPRES 04
H9P39
День 4
Питательная среда + 50 нг/мл IGF-I
EXPRES 05
H9P39
День 5
Питательная среда + 50 нг/мл IGF-I
EXPRES 06
H9P49
День 5
Питательная среда
EXPRES 07
H1P50
День 5
Питательная среда
EXPRES 08
H1P39
День 4
Питательная среда + 50 нг/мл IGF-I + 0,1 мМ меркаптоэтанола
EXPRES 09
H1P39
День 6
Питательная среда + 50 нг/мл IGF-I + 0,1 мМ меркаптоэтанола
EXPRES 10
H1P49
День 4
Питательная среда
EXPRES 11
H9P30
День 4
Питательная среда + 50 нг/мл IGF-I + 0,1 мМ меркаптоэтанола
EXPRES 12
H9P30
День 6
Питательная среда + 50 нг/мл IGF-I + 0,1 мМ меркаптоэтанола
Таблица IV
Экспрессия маркеров клеточной поверхности линиями EXPRES 01 и 02
Маркер
EXPRES 01- % экспрессии
EXPRES 02- % экспрессии
TRA 1-60
100
100
TRA1-81
100
100
SSEA-3
100
86 (85-88)
SSEA-4
100
87 (83-88)
CD56 (NCAM)
<1
38 (35-40)
CXCR4
<1
20 (10-25)
SSEA-1
<1
26 (9-32)
E-Кадгерин
90 (85-95)
75 (72-79)
CD9
99
66 (62-68)
CD30
97 (96-98)
43 (40-46)
LIF-рецептор
<1
20 (15-21)
CD117
92 (90-95)
73 (67-75)
Таблица V
РАЗЛИЧИЕ в экспрессии генов между недифференцированными эмбриональными стволовыми клетками, культивированными на матриксе MATRIGELTM и клетками EXPRES 01 (a) и 02 (b), культивированными на TCPS
A) Эмбриональные стволовые клетки и EXPRES 01- Значения интенсивности даны в формате Log2.
Эмбриональные стволовые клетки
EXPRES 01
Отношение
Направление
скорректир. значение p
Идентификатор гена
Название гена
-5,03662
3,037629
269,52
Повышение
8.34E-05
BG099432
Гены EST
-2,82645
3,094183
60,57
Повышение
3.88E-03
NM_013445
Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD25, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD25 /FL=gb:NM_013445.1 gb:AF178853.1 gb:BC002815.1
-4,71714
0,961816
51,23
Повышение
6.59E-05
AI796169
GATA-связывающий белок 3 /FL=gb:NM_002051.1 gb:M69106.1 gb:BC003070.1
-1,57973
4,092731
51
Повышение
6.13E-03
AL513917
переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
-2,24566
3,409815
50,4
Повышение
1.19E-03
NM_016588
Homo sapiens, нейритин (LOC51299), мРНК. /PROD=neuritin /FL=gb:NM_016588.1 gb:BC002683.1 gb:AF136631.1
-0,66473
4,897427
47,25
Повышение
1.97E-04
R06655
Гены EST со средней степенью подобия с белком AF078844 1 hqp0376 (H.sapiens)
-2,96204
2,589425
46,9
Повышение
1.79E-03
NM_001311
Homo sapiens, богатый цистеином белок 1 (кишечный) (CRIP1), мРНК. /PROD=cysteine-rich protein 1 (intestinal) /FL=gb:U58630.1 gb:BC002738.1 gb:NM_001311.1 gb:U09770.1
-0,08298
5,388254
44,36
Повышение
2.48E-04
NM_004207
Homo sapiens, переносчик растворенных веществ семейства 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 (SLC16A3), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
-4,21525
1,240929
43,9
Повышение
4.36E-04
NM_006119
Homo sapiens, фактор роста фибробластов 8 (индуцированный андрогеном) (FGF8), мРНК. /PROD=fibroblast growth factor 8 (androgen-induced) /FL=gb:U36223.1 gb:U46212.1 gb:NM_006119.1
-3,11273
2,306225
42,78
Повышение
5.07E-03
AW444761
Гены EST
-4,05111
1,075159
34,93
Повышение
1.19E-03
J03580
Человеческий паратиреоидподобный белок (связанный со злокачественной гуморальной гиперкальцемией), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:J03580.1
-1,81534
3,025351
28,65
Повышение
7.00E-04
AW590925
Гены EST
-2,36335
2,448218
28,08
Повышение
1.62E-02
AI189359
мевалонат (дифосфо) декарбоксилаза /FL=gb:NM_002461.1 gb:BC000011.1 gb:U49260.1
-3,00328
1,794842
27,82
Повышение
7.77E-03
AI571798
Ингибитор диссоциации Rho GDP (GDI) альфа
-4,17258
0,510307
25,69
Повышение
2.29E-04
AI040887
Гены EST
-0,11332
4,420733
23,17
Повышение
8.78E-05
NM_003670
Homo sapiens, белок, содержащий основной домен спираль-петля-спираль, класс B, 2 (BHLHB2), мРНК. /PROD=differentiated embryo chondrocyte expressed gene1 /FL=gb:AB004066.1 gb:NM_003670.1
-1,94
2,590871
23,12
Повышение
3.90E-03
NM_016569
Homo sapiens, изо-белок TBX3 (TBX3-iso), мРНК. /PROD=TBX3-iso protein /FL=gb:NM_016569.1 gb:AF216750.1
-2,18113
2,33099
22,82
Повышение
1.12E-02
NM_004041
Homo sapiens, аррестин, бета 1 (ARRB1), вариант транскрипта 1, мРНК. /PROD=arrestin beta 1, isoform A /FL=gb:BC003636.1 gb:AF084040.1 gb:NM_004041.2
-2,85963
1,609384
22,15
Повышение
6.37E-03
BC005961
Homo sapiens, паратгормон-подобный гормон, клон MGC:14611, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=parathyroid hormone-like hormone /FL=gb:BC005961.1
0,044298
4,505436
22,03
Повышение
4.17E-05
W57613
Гены EST
-3,65051
0,757197
21,23
Повышение
7.11E-04
AF213459
Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
-1,25226
2,990178
18,93
Повышение
2.70E-04
NM_013445
Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD25, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD25 /FL=gb:NM_013445.1 gb:AF178853.1 gb:BC002815.1
-0,63516
3,41866
16,61
Повышение
1.05E-03
AA149250
Гены EST с низкой степенью подобия с КРЫСИНЫМ WDNM, КРЫСИНЫМ БЕЛКОМ-ПРЕДШЕСТВЕННИКОМ WDNM1 (R.norvegicus)
-0,14916
3,880272
16,33
Повышение
8.45E-04
NM_002521
Homo sapiens, натрийуретического пептида предшественник B (NPPB), мРНК. /PROD=natriuretic peptide precursor B /FL=gb:NM_002521.1 gb:M25296.1
-2,88485
1,143234
16,31
Повышение
2.83E-03
BF437711
Гены EST
-2,7136
1,194285
15,01
Повышение
2.14E-02
NM_001898
Homo sapiens, цистатин SN (CST1), мРНК. /PROD=cystatin SN /FL=gb:J03870.1 gb:NM_001898.1
-0,07353
3,816817
14,83
Повышение
1.62E-02
AF116616
Homo sapiens, PRO0998, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PRO0998 /FL=gb:AF116616.1
-1,44577
2,422113
14,6
Повышение
1.34E-02
AL544576
Гены EST
2,301255
6,091008
13,83
Повышение
6.50E-05
BC020935
Homo sapiens, белок, подобный отоконину 90, клон IMAGE:4277593, мРНК.
3,006559
6,79047
13,77
Повышение
8.80E-05
AI263909
семейство генов-гомологов ras, член B /FL=gb:NM_004040.1
-0,512
3,268087
13,74
Повышение
2.96E-03
AF345910
Homo sapiens, NYD-SP14, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NYD-SP14 /FL=gb:AF345910.1
3,484047
7,24746
13,58
Повышение
4.12E-04
NM_003564
Homo sapiens, трансгелин 2 (TAGLN2), мРНК. /PROD=transgelin 2 /FL=gb:D21261.1 gb:NM_003564.1
2,623145
6,382732
13,54
Повышение
7.32E-05
AI050866
nodal, мышиный, гомолог
2,91184
6,66195
13,46
Повышение
1.44E-04
BC002616
Homo sapiens, трансгелин 2, клон MGC:2989, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=transgelin 2 /FL=gb:BC002616.1
-1,18027
2,546953
13,24
Повышение
1.42E-02
AI123555
Гены EST
-0,92213
2,770179
12,93
Повышение
1.08E-04
AK000345
Homo sapiens, кДНК FLJ20338 fis, клон HEP12179.
-1,85154
1,840613
12,93
Повышение
6.40E-03
AI949760
Гены EST с низкой степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
0,899321
4,507212
12,19
Повышение
1.08E-04
AW196940
Гены EST
1,651788
5,252439
12,13
Повышение
5.58E-05
NM_001553
Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
-1,20347
2,387268
12,05
Повышение
2.76E-02
BF063186
Гены EST
3,669215
7,251816
11,98
Повышение
2.01E-05
NM_000700
Homo sapiens, аннексин A1 (ANXA1), мРНК. /PROD=annexin I /FL=gb:BC001275.1 gb:NM_000700.1
-3,52039
0,041471
11,81
Повышение
1.58E-02
AW162210
Homo sapiens, кДНК FLJ11490 fis, клон HEMBA1001918
3,006317
6,564471
11,78
Повышение
2.04E-04
NM_006183
Homo sapiens, нейротензин (NTS), мРНК. /PROD=neurotensin precursor /FL=gb:NM_006183.2 gb:U91618.1
3,227575
6,777916
11,72
Повышение
2.01E-05
U15174
Homo sapiens, взаимодействующий с белком BCL2adenovirus E1B 19 кДа белок 3 (BNIP3) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=BCL2adenovirus E1B 19kD-interacting protein 3 /FL=gb:AF002697.1 gb:NM_004052.2 gb:U15174.1
1,869893
5,411751
11,65
Повышение
2.01E-05
NM_001854
Homo sapiens, коллаген, тип XI, альфа 1 (COL11A1), мРНК. /PROD=collagen, type XI, alpha 1 /FL=gb:J04177.1 gb:NM_001854.1
2,851479
6,371229
11,47
Повышение
3.61E-05
AI950472
Гены EST
-0,1081
3,393761
11,33
Повышение
1.39E-03
BG028597
Гены EST
0,41954
3,911282
11,25
Повышение
1.42E-04
AI670948
Гены EST
-1,71451
1,771584
11,21
Повышение
7.77E-03
BI254089
Homo sapiens, полноразмерная вставка кДНК, клон ZD50E03
-1,66293
1,80547
11,07
Повышение
2.68E-02
NM_000817
Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD67, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD67 /FL=gb:NM_000817.1 gb:M81883.1 gb:L16888.1
0,451086
3,904705
10,96
Повышение
5.45E-04
NM_007038
Homo sapiens, дезинтегрин-подобный белок и металлопротеаза (репролизинового типа) с мотивом типа тромбоспондин-1, 5 (аггреканаза-2) (ADAMTS5), мРНК. /PROD=a disintegrin and metalloprotease with thrombospondin motifs-5 preproprotein /FL=gb:NM_007038.1 gb:AF14209
-1,44798
1,988376
10,83
Повышение
1.07E-02
AW376860
Гены EST
1,19822
4,633038
10,81
Повышение
1.22E-04
NM_016931
Homo sapiens, NADPH-оксидаза 4 (NOX4), мРНК. /PROD=NADPH oxidase 4 /FL=gb:AF261943.1 gb:NM_016931.1 gb:AF254621.1 gb:AB041035.1
1,552808
4,981033
10,76
Повышение
3.24E-04
NM_000602
Homo sapiens, ингибитор сериновой (или цистеиновой) протеиназы, ветвь E (нексин, ингибитор типа 1 активатора плазминогена), член 1 (SERPINE1), мРНК. /PROD=serine (or cysteine) proteinase inhibitor, cladeE (nexin, plasminogen activator inhibitor type 1), membe
-0,62725
2,792215
10,7
Повышение
3.24E-04
BC017942
Homo sapiens, белок, подобный отоконину 90, клон IMAGE:4285317, мРНК.
-1,22834
2,18828
10,68
Повышение
2.50E-02
BG402859
Гены EST
-0,85366
2,55067
10,59
Повышение
3.53E-04
N36408
гипотетический белок FLJ23306 /FL=gb:NM_024530.1
1,55625
4,952105
10,53
Повышение
1.52E-03
BG164365
белок, связанный с микротрубочками 1B /FL=gb:NM_005909.1
0,93094
4,285883
10,23
Повышение
4.17E-05
AL038787
6-фосфофрукто-2-киназафруктоза-2,6-бифосфатаза 4
-3,33551
0,008356
10,15
Повышение
9.88E-03
BF221850
Гены EST
-1,97569
1,35098
10,03
Повышение
2.12E-02
NM_002149
Homo sapiens, гиппокальцин-подобный белок 1 (HPCAL1), мРНК. /PROD=hippocalcin-like 1 /FL=gb:NM_002149.1 gb:D16227.1
0,624024
3,934756
9,92
Повышение
2.01E-05
AF154054
Homo sapiens, DRM (DRM), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=DRM /FL=gb:NM_013372.1 gb:AF110137.2 gb:AF045800.1 gb:AF154054.1
-2,37515
0,931587
9,9
Повышение
2.83E-02
NM_025136
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ22187 (FLJ22187), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ22187 /FL=gb:BC005059.1 gb:NM_025136.1
0,906004
4,154799
9,51
Повышение
1.45E-04
NM_013372
Homo sapiens, суперсемейство белков 1 с цистеиновым узлом, BMP-антагонист 1 (CKTSF1B1), мРНК. /PROD=cysteine knot superfamily 1, BMP antagonist 1 /FL=gb:NM_013372.1 gb:AF110137.2 gb:AF045800.1 gb:AF154054.1
1,423659
4,64236
9,31
Повышение
2.01E-05
AB019695
Homo sapiens, мРНК тиоредоксин-редуктазы II бета, полная кодовая последовательность. /PROD=thioredoxin reductase II beta /FL=gb:AB019695.1
0,620478
3,822765
9,2
Повышение
6.53E-05
AL567376
Связанный с G-белком рецептор 39
2,317589
5,509474
9,14
Повышение
1.02E-05
J04177
В кластер входят J04177:человеческий коллаген альфа-1 типа XI (COL11A1), мРНК, полная кодовая последовательность /cds=(161,5581) /gb=J04177 /gi=179729 /ug=Hs.82772 /len=6158
-0,01596
3,175621
9,14
Повышение
9.88E-03
L37033
Кластер включает L37033:гомолог человеческого белка, связывающего FK-506 (FKBP38) мРНК, полная кодовая последовательность /cds=(140,1207) /gb=L37033 /gi=965469 /ug=Hs.173464 /len=1613
3,119777
6,302535
9,08
Повышение
5.07E-03
AI954041
F-box только белок 9 /FL=gb:NM_012347.1
0,891337
4,058968
8,99
Повышение
1.66E-04
NM_000325
Homo sapiens, paired-подобный гомеодоменный транскрипционный фактор 2 (PITX2), мРНК. /PROD=paired-like homeodomain transcription factor 2 /FL=gb:NM_000325.1 gb:U69961.1 gb:AF048720.1
2,106895
5,247359
8,82
Повышение
2.13E-04
NM_001458
Homo sapiens, филамин C, гамма (актин-связывающий белок-280) (FLNC), мРНК. /PROD=gamma filamin /FL=gb:AF089841.1 gb:NM_001458.1
-1,42687
1,693258
8,69
Повышение
2.43E-02
AF243424
Homo sapiens, SG2NA, бета изоформа, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=SG2NA beta isoform
0,657996
3,771559
8,66
Повышение
2.06E-02
AU158380
Homo sapiens, кДНК FLJ13698 fis, клон PLACE2000176
0,23287
3,334996
8,59
Повышение
2.01E-05
R40917
фосфодиэстераза 4D, цАМФ-специфичная (гомологичная гену дрозофилы (Drosophila) фосфодиэстераза E3) /FL=gb:L20969.1 gb:NM_006203.1 gb:U02882.1
-0,06159
3,027095
8,51
Повышение
3.60E-04
U16797
Человеческий белок LERK-5 (EPLG5), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=LERK-5 /FL=gb:U16797.1 gb:NM_004093.1 gb:L38734.1 gb:U81262.1
4,07051
7,149479
8,45
Повышение
4.86E-05
M10943
Человеческий If-ген металлотионеина (hMT-If)
-0,35204
2,705807
8,33
Повышение
1.09E-03
BC004490
Homo sapiens, гомолог вирусного онкогена мышиной остеосаркомы v-fos FBJ, клон MGC:11074, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=v-fos FBJ murine osteosarcoma viral oncogenehomolog /FL=gb:NM_005252.2 gb:BC004490.1
-2,0132
1,043139
8,32
Повышение
3.61E-02
BE328496
гипотетический белок PRO2032 /FL=gb:AF116683.1 gb:NM_018615.1
-0,68954
2,36447
8,31
Повышение
8.94E-04
NM_005181
Homo sapiens, карбоангидраза III, специфичная для мышц (CA3), мРНК. /PROD=carbonic anhydrase III /FL=gb:BC004897.1 gb:NM_005181.2
-0,00953
3,031935
8,23
Повышение
9.88E-03
AA831438
Гомолог Mad4
3,079271
6,1137
8,19
Повышение
4.17E-05
NM_001553
Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
0,788995
3,806044
8,1
Повышение
6.41E-05
AV734646
Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
0,9926
4,004698
8,07
Повышение
8.48E-05
AI202327
Гены EST
0,051719
3,059444
8,04
Повышение
6.98E-04
NM_007350
Homo sapiens, домен, подобный домену плекстриновой гомологии, семейство A, член 1 (PHLDA1), мРНК. /PROD=pleckstrin homology-like domain, family A,member 1 /FL=gb:NM_007350.1
-1,69103
1,312148
8,02
Повышение
1.82E-03
U32500
Человеческий рецептор типа 2 к нейропептиду Y, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=type 2 neuropeptide Y receptor /FL=gb:U42766.1 gb:U36269.1 gb:U32500.1
-0,93931
2,060071
8
Повышение
6.51E-03
AA004300
гипотетический белок DKFZp566I133
1,164666
4,161028
7,98
Повышение
2.51E-03
BC005807
Homo sapiens, клон MGC:10264, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:10264) /FL=gb:BC005807.1
2,462987
5,441963
7,88
Повышение
1.45E-04
NM_016651
Homo sapiens, белок нового гена-3 гепатоклеточной карциномы (LOC51339), мРНК. /PROD=heptacellular carcinoma novel gene-3 protein /FL=gb:NM_016651.2 gb:AF251079.2
0,581498
3,560033
7,88
Повышение
1.07E-04
U38945
Человеческий гипотетический белок 18,1 кДа (CDKN2A) мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:U38945.1 gb:U26727.1
0,470814
3,417829
7,71
Повышение
8.26E-03
AF176039
Homo sapiens, белок R из группы белков высокой подвижности, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=high mobility group protein-R /FL=gb:AF176039.1
-1,50663
1,438639
7,7
Повышение
7.38E-04
BF223214
Гены EST
-2,43082
0,495104
7,6
Повышение
1.71E-02
BF508288
Гены EST
1,084464
4,009912
7,6
Повышение
1.16E-03
BC004865
Homo sapiens, ассоциированный с "заячьей губой" и "волчьей пастью" трансмембранный белок 1, клон MGC:10593, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cleft lip and palate associated transmembraneprotein 1 /FL=gb:BC004865.1
4,232374
7,152167
7,57
Повышение
1.54E-03
BF971587
тубулин, бета-полипептид /FL=gb:BC001352.1
0,129315
3,042634
7,53
Повышение
2.17E-04
NM_005442
Homo sapiens, гомолог эомезодермина (Xenopus laevis) (EOMES), мРНК. /PROD=eomesodermin (Xenopus laevis) homolog /FL=gb:AB031038.1 gb:NM_005442.1
-0,20075
2,710846
7,52
Повышение
2.58E-02
NM_003377
Homo sapiens, сосудистый эндотелиальный фактор роста B (VEGFB), мРНК. /PROD=vascular endothelial growth factor B /FL=gb:NM_003377.1 gb:U43368.1 gb:U52819.1
-0,45681
2,439084
7,44
Повышение
7.82E-03
AI417362
Гены EST со средней степенью подобия с ALU1_HUMAN ALU SUBFAMILY J, SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
0,155309
3,037724
7,37
Повышение
8.78E-04
NM_007061
Homo sapiens, конститутивный белок сыворотки (MSE55), мРНК. /PROD=serum constituent protein /FL=gb:M88338.1 gb:NM_007061.1
1,506057
4,362244
7,24
Повышение
7.30E-05
NM_001425
Homo sapiens, белок 3 эпителиальной мембраны (EMP3), мРНК. /PROD=epithelial membrane protein 3 /FL=gb:U52101.1 gb:NM_001425.1 gb:U87947.1
-1,75194
1,091177
7,18
Повышение
3.15E-02
NM_021570
Homo sapiens, BarH-подобный гомеобокс 1 (BARX1), мРНК. /PROD=BarH-like homeobox 1 /FL=gb:NM_021570.2 gb:AF213356.1
2,455614
5,294065
7,15
Повышение
9.88E-03
AF279899
Homo sapiens, PNAS-145, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-145 /FL=gb:U03105.1 gb:NM_006813.1 gb:AF279899.1
1,422626
4,257559
7,14
Повышение
2.01E-05
NM_006365
Homo sapiens, активатор транскрипции промотера c-fos (CROC4), мРНК. /PROD=transcriptional activator of the c-fos promoter /FL=gb:NM_006365.1 gb:U49857.1
-2,40588
0,424388
7,11
Повышение
1.64E-02
NM_002433
Homo sapiens, гликопротеин миелина олигодендроцитов (MOG), мРНК. /PROD=myelin oligodendrocyte glycoprotein /FL=gb:U18798.1 gb:U64564.1 gb:NM_002433.1
-1,86904
0,959227
7,1
Повышение
4.35E-02
AB033831
Homo sapiens, hSCDGF, мРНК фактора роста из спинного мозга, полная кодовая последовательность. /PROD=spinal cord-derived growth factor /FL=gb:NM_016205.1 gb:AB033831.1 gb:AF091434.1 gb:AF244813.1
1,811736
4,639749
7,1
Повышение
1.09E-03
M27830
Человеческий ген РНК рибосомы 28S, полная кодовая последовательность.
-0,54131
2,28595
7,1
Повышение
3.63E-03
BE504838
Гены EST
4,065536
6,887587
7,07
Повышение
4.08E-04
NM_005796
Homo sapiens, фактор ядерного транспорта 2 (плацентарный белок 15) (PP15), мРНК. /PROD=nuclear transport factor 2 (placental protein15) /FL=gb:BC002348.1 gb:NM_005796.1 gb:U43939.1
-0,4348
2,379408
7,03
Повышение
4.24E-03
BF686824
гибель-ассоциированная протеинкиназа 3 /FL=gb:AB007144.1 gb:AB022341.1 gb:NM_001348.1
1,448288
4,255531
7
Повышение
2.01E-05
AF096296
Homo sapiens, предшественник хемокина-1 стромы тимуса, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=thymic stroma chemokine-1 precursor /FL=gb:AF142434.1 gb:AF096296.1 gb:AF124601.1 gb:AB010447.1 gb:NM_006072.1
3,504052
6,307554
6,98
Повышение
4.05E-05
NM_006622
Homo sapiens, индуцируемая сывороткой киназа (SNK), мРНК. /PROD=serum-inducible kinase /FL=gb:AF059617.1 gb:NM_006622.1 gb:AF223574.1
2,124541
4,927935
6,98
Повышение
8.80E-05
J05008
Homo sapiens, ген эндотелина-1 (EDN1), полная кодовая последовательность /FL=gb:NM_001955.1
1,872394
4,674078
6,97
Повышение
1.02E-05
AK022852
Homo sapiens, кДНК FLJ12790 fis, клон NT2RP2001985, со слабой степенью подобия с белком Homo sapiens, нацеленным на онкопротеины вирусов папилломы человека E6 высокого риска, E6TP1альфа, мРНК.
1,764338
4,563535
6,96
Повышение
1.43E-04
AA909044
триптаза, альфа
1,401293
4,178686
6,86
Повышение
1.66E-04
NM_003256
Homo sapiens, тканевой ингибитор металлопротеиназы 4 (TIMP4), мРНК. /PROD=tissue inhibitor of metalloproteinase 4precursor /FL=gb:NM_003256.1 gb:U76456.1
0,767075
3,54446
6,86
Повышение
1.88E-03
AY029208
Homo sapiens, предшественник цепи альфа 2 коллагена типа VI (COL6A2), мРНК, полная кодовая последовательность, продукт альтернативного сплайсинга. /PROD=type VI collagen alpha 2 chain precursor /FL=gb:AY029208.1
-1,94468
0,831091
6,85
Повышение
1.92E-02
NM_153036
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32239 (FLJ32239), мРНК. /FL=gb:NM_153036.1
0,586923
3,359675
6,83
Повышение
4.17E-05
NM_000047
Homo sapiens, арилсульфатаза E (chondrodysplasia punctata 1) (ARSE), мРНК. /PROD=arylsulfatase E precursor /FL=gb:X83573.1 gb:NM_000047.1
1,064878
3,834572
6,82
Повышение
2.41E-04
NM_002610
Homo sapiens, пируват-дегидрогеназы киназа, изофермент 1 (PDK1), ядерный ген, кодирующий митохондриальный белок, мРНК. /PROD=pyruvate dehydrogenase kinase, isoenzyme 1 /FL=gb:NM_002610.2 gb:L42450.1
-0,11882
2,64743
6,8
Повышение
6.88E-04
AI702438
Гены EST
-0,34208
2,418198
6,78
Повышение
2.31E-04
AI860150
Гены EST с низкой степенью подобия A49134, регион V-I цепи Ig-каппа (H.sapiens)
4,156522
6,9125
6,76
Повышение
6.48E-05
NM_003240
Homo sapiens, фактор, ассоциированный с внутриматочным кровотечением (фактор А, определяющий лево-правостороннюю ассиметрию; суперсемейство трансформирующего фактора роста бета) (EBAF), мРНК. /PROD=transforming growth factor, beta 4 /FL=gb:U81523.1 gb:NM_003240.1 gb:AF081513.1
-1,8911
0,860193
6,73
Повышение
2.83E-03
NM_001191
Homo sapiens, BCL2-подобный белок 1 (BCL2L1), мРНК. /PROD=BCL2-like 1 /FL=gb:NM_001191.1
-0,53771
2,208449
6,71
Повышение
1.41E-02
AI806338
T-box 3 (локтевой синдром млекопитающих) /FL=gb:AF170708.2 gb:NM_005996.1
3,824397
6,568635
6,7
Повышение
1.66E-04
AL031602
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-1174N9 на хромосоме 1p34.1-35.3. Содержит ген нового белка с доменом IBR, ген (псевдо?) нового белка, сходного с MT1E (металлотионеин 1E (функциональный)), гены EST, STS, GSS и два предполагаемых Cp...
0,001822
2,741586
6,68
Повышение
4.44E-05
NM_004904
Homo sapiens, белок, связывающий элемент цАМФ-ответа, CRE-BPa (H_GS165L15.1), мРНК. /PROD=cAMP response element-binding protein CRE-BPa /FL=gb:NM_004904.1 gb:L05911.1
0,301216
3,030236
6,63
Повышение
4.76E-04
AA812232
стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
4,63387
7,360687
6,62
Повышение
4.17E-05
BF217861
металлотионеин 1E (функциональный)
0,413191
3,124723
6,55
Повышение
5.00E-02
AL136925
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp586H1320 (из клона DKFZp586H1320); полная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein /FL=gb:AL136925.1
-0,28056
2,427947
6,54
Повышение
1.39E-03
AW090187
дигидропиримидиназа-подобный белок 4 /FL=gb:NM_006426.1 gb:AB006713.1
1,095892
3,804014
6,53
Повышение
2.43E-04
NM_001146
Homo sapiens, ангиопоэтин 1 (ANGPT1), мРНК. /PROD=angiopoietin 1 /FL=gb:NM_001146.1 gb:D13628.1 gb:U83508.1
-0,0845
2,62025
6,52
Повышение
2.59E-04
AA625683
Гены EST
2,13274
4,835771
6,51
Повышение
2.01E-04
AL574210
ингибитор серин- (или цистеин-) протеиназы, ветвь E (нексин, ингибитор активатора плазминогена типа 1), член 1 /FL=gb:NM_000602.1 gb:M16006.1
-0,64252
2,055951
6,49
Повышение
2.10E-04
NM_001035
Homo sapiens, рианодиновый рецептор 2 (сердечный) (RYR2), мРНК. /PROD=ryanodine receptor 2 (cardiac) /FL=gb:NM_001035.1
4,450364
7,144308
6,47
Повышение
3.61E-05
BF246115
белок, связанный с РНК-геликазой
0,405368
3,094055
6,45
Повышение
6.25E-05
AW188198
индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 /FL=gb:NM_007115.1
-0,34351
2,332751
6,39
Повышение
5.54E-05
NM_000077
Homo sapiens, циклин-зависимой киназы ингибитор 2A (меланома, p16, ингибирует CDK4) (CDKN2A), мРНК. /PROD=cyclin-dependent kinase inhibitor 2A (melanoma,p16, inhibits CDK4) /FL=gb:NM_000077.1 gb:L27211.1
-0,88122
1,790331
6,37
Повышение
1.37E-03
AA775681
гипотетический белок FLJ23091
3,508565
6,179917
6,37
Повышение
8.80E-05
NM_000158
Homo sapiens, глюкан (1,4-альфа-), ветвящий фермент 1 (гликоген-ветвящий фермент, болезнь Андерсена, гликогеновая болезнь типа IV) (GBE1), мРНК. /PROD=glucan (1,4-alpha-), branching enzyme 1(glycogen branching enzyme) /FL=gb:L07956.1 gb:NM_000158.1
-1,84589
0,82486
6,37
Повышение
3.13E-03
AV705309
Гены EST
-0,18263
2,487276
6,36
Повышение
1.49E-02
AC006942
Homo sapiens, хромосома 19, космида R31181
3,759854
6,426778
6,35
Повышение
2.01E-05
AF313413
Homo sapiens, предполагаемый малый мембранный белок NID67, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=putative small membrane protein NID67 /FL=gb:AF313413.1
2,4094
5,066795
6,31
Повышение
3.61E-05
AI809870
белок HSKM-B
-2,08089
0,570296
6,28
Повышение
7.70E-03
BC016043
Homo sapiens, гипотетический белок MGC2865, клон MGC:20246 IMAGE:4635389, мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:BC016043.1
1,37641
4,004952
6,18
Повышение
1.20E-04
AU148611
Человеческий pTR7, мРНК для повторяющейся последовательности
1,384716
4,012773
6,18
Повышение
4.52E-04
NM_006275
Homo sapiens, фактор сплайсинга, богатый аргининсерином, 6 (SFRS6), мРНК. /PROD=splicing factor, arginineserine-rich 6 /FL=gb:U30883.1 gb:NM_006275.1
2,979212
5,604053
6,17
Повышение
1.52E-04
M27830
Человеческий ген 28S рибосомной РНК, полная кодовая последовательность.
0,310893
2,921559
6,11
Повышение
3.42E-04
NM_007279
Homo sapiens, U2 малый ядерный рибонуклеопротеиновый вспомогательный фактор (65 кДа) (U2AF65), мРНК. /PROD=U2 small nuclear ribonucleoprotein auxiliaryfactor (65kD) /FL=gb:NM_007279.1
0,65284
3,256353
6,08
Повышение
2.49E-04
AI819043
Гены EST
1,609773
4,213168
6,08
Повышение
1.35E-04
M29277
Человеческий изолят гликопротеина JuSo MUC18, мРНК (3 вариант), полная кодовая последовательность. /PROD=MUC18 glycoprotein /FL=gb:M29277.1
-0,62167
1,968272
6,02
Повышение
4.11E-04
AI963304
Гены EST
4,459837
7,047717
6,01
Повышение
1.02E-04
NM_004052
Homo sapiens, взаимодействующий с белком BCL2adenovirus E1B 19 кДа белок 3 (BNIP3), ядерный ген, кодирующий митохондриальный белок, мРНК. /PROD=BCL2adenovirus E1B 19kD-interacting protein 3 /FL=gb:AF002697.1 gb:NM_004052.2 gb:U15174.1
3,178404
5,762898
6
Повышение
1.27E-04
AB037810
Homo sapiens, мРНК белка KIAA1389, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1389 protein
-1,08931
1,494664
6
Повышение
2.35E-03
AB020683
Homo sapiens, мРНК белка KIAA0876, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA0876 protein
1,9194
4,501184
5,99
Повышение
3.61E-05
AK000162
Homo sapiens, кДНК FLJ20155 fis, клон COL08754, с высокой степенью подобия с ACSA_ECOLI ACETYL-COENZYNYME А-SYNTHETAZE.
0,671205
3,243641
5,95
Повышение
2.48E-04
AA463626
Гены EST
0,091029
2,660133
5,93
Повышение
9.55E-04
AF277174
Homo sapiens, PNAS-137, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-137 /FL=gb:AF277174.1
1,479222
4,042679
5,91
Повышение
6.34E-05
NM_005454
Homo sapiens, гомолог белка cerberus 1 (Xenopus laevis) (суперсемейство белков с цистеиновыми узлами) (CER1), мРНК. /PROD=cerberus 1 /FL=gb:NM_005454.1
-0,29455
2,259676
5,87
Повышение
2.79E-03
AF312393
Homo sapiens, белок “лейциновая застежка" FKSG13 (FKSG13) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=leucine-zipper protein FKSG13 /FL=gb:AF312393.1
-0,81321
1,740607
5,87
Повышение
3.72E-02
NM_002160
Homo sapiens, гексабрахион (тенасцин C, цитотактин) (HXB), мРНК. /PROD=hexabrachion (tenascin C, cytotactin) /FL=gb:M55618.1 gb:NM_002160.1
0,167058
2,720179
5,87
Повышение
1.02E-04
NM_021223
Homo sapiens, легкая цепь 2a миозина (LOC58498), мРНК. /PROD=myosin light chain 2a /FL=gb:NM_021223.1
0,901323
3,451092
5,86
Повышение
3.05E-05
NM_005767
Homo sapiens, пуринэргический рецептор (семейство A группа 5) (P2Y5), мРНК. /PROD=purinergic receptor (family A group 5) /FL=gb:AF000546.1 gb:NM_005767.1
1,007578
3,543738
5,8
Повышение
2.13E-04
NM_001955
Homo sapiens, эндотелин 1 (EDN1), мРНК. /PROD=endothelin 1 /FL=gb:NM_001955.1
1,327779
3,862686
5,8
Повышение
1.51E-04
NM_007115
Homo sapiens, индуцированный фактором некроза опухолей-альфа белок 6 (TNFAIP6), мРНК. /PROD=tumor necrosis factor, alpha-induced protein 6 /FL=gb:NM_007115.1
-0,2077
2,32716
5,8
Повышение
1.52E-04
AA211909
Гены EST
1,304257
3,835269
5,78
Повышение
3.02E-04
NM_005451
Homo sapiens, белок enigma (белок с доменом LIM) (ENIGMA), мРНК. /PROD=enigma protein /FL=gb:BC001093.1 gb:NM_005451.2 gb:AF265209.1
-0,30113
2,227329
5,77
Повышение
4.58E-03
BE968750
Homo sapiens, рианодиновый рецептор 2 (сердечный) (RYR2), мРНК
1,678635
4,204607
5,76
Повышение
9.75E-05
AA086229
enigma (белок с доменом LIM)
1,411335
3,932627
5,74
Повышение
1.58E-02
NM_003370
Homo sapiens, стимулируемый вазодилататорами фосфопротеин (VASP), мРНК. /PROD=vasodilator-stimulated phosphoprotein/FL=gb:NM_003370.1
-1,32153
1,183922
5,68
Повышение
2.72E-02
AF217536
Homo sapiens, урезанная мевалонат-киназа, мРНК, частичная кодовая последовательность, продукт альтернативного сплайсинга. /PROD=truncated mevalonate kinase
1,058988
3,560886
5,66
Повышение
3.56E-03
H05812
рецептор к инсулин-подобному фактору роста 1 /FL=gb:NM_000875.2
4,435207
6,93459
5,65
Повышение
3.61E-05
AF078844
Homo sapiens, белок hqp0376, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=hqp0376 protein /FL=gb:AF078844.1
2,418835
4,908301
5,62
Повышение
3.47E-03
NM_012268
Homo sapiens, белок, сходный с белком вируса вакцинальной болезни HindIII K4L ORF (HU-K4), мРНК. /PROD=similar to vaccinia virus HindIII K4L ORF /FL=gb:U60644.1 gb:BC000553.1 gb:NM_012268.1
-0,56112
1,927121
5,61
Повышение
6.37E-03
AL041124
гипотетический белок PP1665
-1,63462
0,844727
5,58
Повышение
4.98E-03
AI831874
Гены EST
-0,34446
2,130828
5,56
Повышение
3.75E-05
NM_006379
Homo sapiens, содержащий sema-домен, иммуноглобулиновый домен (Ig), короткий основной домен секретируемый белок (семафорин), 3C (SEMA3C), мРНК. /PROD=sema domain, immunoglobulin domain (Ig), shortbasic domain, secreted, (semaphorin) 3C /FL=gb:NM_006379.1 gb:AB000220.1
4,143258
6,618477
5,56
Повышение
1.18E-05
AU146532
киназа пируватдегидрогеназы, изофермент 1
-0,52233
1,950739
5,55
Повышение
1.54E-03
AI091047
переносчик растворенных веществ, семейство 2 (облегченный переносчик глюкозы), член 1 /FL=gb:K03195.1 gb:NM_006516.1
0,690529
3,155168
5,52
Повышение
9.91E-04
BC033088
Homo sapiens, белок, сходный с ламинином AC, клон MGC:45654 IMAGE:3623265, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Similar to lamin AC /FL=gb:BC033088.1
-0,00098
2,454314
5,48
Повышение
2.48E-04
NM_013281
Homo sapiens, фибронектиновый богатый лейцином трансмембранный белок 3 (FLRT3), мРНК. /PROD=fibronectin leucine rich transmembrane protein3 /FL=gb:AF169677.1 gb:NM_013281.1
-0,87622
1,577138
5,48
Повышение
1.84E-02
M15329
Человеческий интерлейкин 1-альфа (IL1A), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=interleukin 1-alpha /FL=gb:M15329.1
5,117294
7,564809
5,45
Повышение
6.25E-05
M83248
Человеческий нефропонтин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=nephropontin/FL=gb:M83248.1
2,352834
4,796495
5,44
Повышение
4.17E-05
AI653107
Гены EST
3,27933
5,719116
5,43
Повышение
3.24E-04
NM_016639
Homo sapiens, трансмембранный белок типа I Fn14 (FN14), мРНК. /PROD=type I transmembrane protein Fn14 /FL=gb:NM_016639.1 gb:BC002718.1 gb:AB035480.1 gb:AF191148.1
-2,06232
0,368788
5,39
Повышение
6.40E-03
AA148534
связанный с беременностью белок плазмы A /FL=gb:NM_002581.1 gb:U28727.1
3,982825
6,413408
5,39
Повышение
7.48E-05
AA678241
стеароил-КоА десатураза (дельта-9-десатураза)/FL=gb:AB032261.1 gb:AF097514.1 gb:NM_005063.1
0,399566
2,809822
5,32
Повышение
7.81E-04
AF144103
Homo sapiens, белок NJAC (NJAC), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NJAC protein /FL=gb:AF144103.1 gb:AF106911.1 gb:AF073957.1 gb:BC003513.1 gb:NM_004887.1
4,15299
6,560926
5,31
Повышение
6.59E-05
NM_000935
Homo sapiens, проколлаген-лизин, 2-оксоглутарат 5-диоксигеназа (лизин-гидроксилаза) 2 (PLOD2), мРНК. /PROD=procollagen-lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase(lysine hydroxylase) 2 /FL=gb:NM_000935.1 gb:U84573.1
0,319769
2,724257
5,29
Повышение
8.94E-04
AL552534
Человеческая мРНК для антигена CD44, 5UTR (последовательность от 5cap до стартового кодона).
3,347359
5,750515
5,29
Повышение
5.27E-03
AF047002
Homo sapiens, коактиватор транскрипции ALY, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=transcriptional coactivator ALY
4,571448
6,973787
5,29
Повышение
3.53E-04
AI631159
переносчик растворенных веществ, семейство 2 (облегченный переносчик глюкозы), член 3 /FL=gb:NM_006931.1 gb:M20681.1
1,93843
4,333496
5,26
Повышение
1.21E-04
NM_019886
Homo sapiens, карбогидрат (N-ацетилглюкозамин 6-O) сульфотрансфераза 7 (CHST7), мРНК. /PROD=carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O)sulfotransferase 7 /FL=gb:NM_019886.1 gb:AB037187.1 gb:AB040711.1
-0,3185
2,064012
5,21
Повышение
1.55E-03
U83508
Человеческий ангиопоэтин-1, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=angiopoietin-1 /FL=gb:NM_001146.1 gb:D13628.1 gb:U83508.1
1,484424
3,866551
5,21
Повышение
3.49E-04
BC000076
Homo sapiens, циклин D1 (PRAD1: белок 1 аденоматоза щитовидной железы), клон MGC:2316, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cyclin D1 (PRAD1: parathyroid adenomatosis 1) /FL=gb:M73554.1 gb:BC000076.1
4,465458
6,844763
5,2
Повышение
1.52E-04
AF003114
Homo sapiens, CYR61, мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:AF003114.1
-1,33756
1,041706
5,2
Повышение
8.51E-03
BF196010
Гены EST
3,747557
6,125638
5,2
Повышение
4.52E-04
AA554833
нейроэндокринный секреторный белок 55
-0,24196
2,129273
5,17
Повышение
2.80E-04
AV734646
Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
2,657439
5,023981
5,16
Повышение
1.66E-04
NM_006472
Homo sapiens, белок, стимулируемый 1,25-дигидроксивитамином D-3 (VDUP1), мРНК. /PROD=upregulated by 1,25-dihydroxyvitamin D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
1,275689
3,642133
5,16
Повышение
1.65E-04
BF982289
Гены EST, низкая степень подобия с эластин-подобным белком (D.melanogaster)
2,11271
4,458591
5,08
Повышение
1.97E-04
H15920
Гены EST, низкая степень подобия с RTA, ПРЕДПОЛАГАЕМЫМ КРЫСИНЫМ РЕЦЕПТОРОМ, СОПРЯЖЕННЫМ С G-БЕЛКОМ (R.norvegicus)
2,624088
4,968498
5,08
Повышение
1.45E-04
M28882
Человеческий гликопротеин MUC18, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=MUC18 glycoprotein /FL=gb:M28882.1
4,046173
6,388326
5,07
Повышение
6.34E-05
NM_015641
Homo sapiens, тестин (DKFZP586B2022), мРНК. /PROD=testin /FL=gb:BC001451.1 gb:AF245357.1 gb:AF245356.1 gb:NM_015641.1
0,946455
3,284436
5,06
Повышение
5.46E-04
BM976939
Homo sapiens кДНК FLJ31611 fis, клон NT2RI2002923.
1,389207
3,725552
5,05
Повышение
1.08E-04
AL136805
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434J1521 (из клона DKFZp434J1521); полная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein /FL=gb:AL136805.1
0,710433
3,041407
5,03
Повышение
1.08E-03
NM_004472
белок с вилкообразным регионом (forkhead box) D1 (FOXD1), мРНК. /PROD=forkhead box D1 /FL=gb:U59832.1 gb:NM_004472.1
2,800881
5,127991
5,02
Повышение
6.53E-05
NM_017817
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ20429 (FLJ20429), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ20429 /FL=gb:NM_017817.1
0,432778
2,759117
5,02
Повышение
2.50E-03
AI692523
Гены EST
-0,94056
1,385676
5,01
Повышение
4.17E-03
AI927458
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434A196 (из клона DKFZp434A196); полная кодовая последовательность
0,224112
2,550074
5,01
Повышение
4.11E-04
BF060767
Гены EST
-0,47823
1,845598
5,01
Повышение
2.75E-03
AA489100
Гены EST
4,590104
-3,36994
249,01
Снижение
2.26E-04
AA167449
ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
6,024741
-1,32044
162,6
Снижение
1.79E-03
AF017987
Homo sapiens, связанный с апоптозом секретированный белок 2 (SARP2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=secreted apoptosis related protein 2 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
1,940449
-5,04898
127,07
Снижение
3.05E-05
BE644917
ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
2,68759
-3,61621
79
Снижение
1.25E-03
AL569326
Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность
5,005827
-1,03397
65,79
Снижение
1.30E-04
NM_003020
Homo sapiens, секреторная гранула, нейроэндокринный белок 1 (белок 7B2) (SGNE1), мРНК. /PROD=secretory granule, neuroendocrine protein 1 (7B2protein) /FL=gb:BC005349.1 gb:NM_003020.1
0,357833
-5,67924
65,67
Снижение
2.26E-03
BG389789
Человеческая мРНК, стимулируемая при индуцированном камптотецином апоптозе клеток U937.
6,500961
0,756526
53,61
Снижение
4.17E-05
NM_003012
Homo sapiens, секретируемый frizzled-белок 1 (SFRP1), мРНК. /PROD=secreted frizzled-related protein 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
2,077151
-3,59883
51,13
Снижение
3.75E-03
BF223193
ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
3,29779
-2,3376
49,71
Снижение
3.05E-05
U17496
Человеческая протеасомная субъединица LMP7 (аллель LMP7B), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=proteasome subunit LMP7 /FL=gb:U17497.1 gb:U17496.1
4,803291
-0,78667
48,17
Снижение
3.75E-05
AA628440
ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
4,124115
-1,42293
46,75
Снижение
7.16E-04
AW262311
Гены EST
2,437935
-3,10907
46,75
Снижение
2.41E-04
BE672557
Гены EST
4,276201
-1,19736
44,43
Снижение
9.47E-04
AV699347
ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
1,710253
-3,7619
44,39
Снижение
8.66E-05
NM_016179
Homo sapiens, временный рецепторный потенциальный канал 4 (TRPC4), мРНК. /PROD=transient receptor potential 4 /FL=gb:NM_016179.1 gb:AF175406.1
2,313549
-3,12747
43,44
Снижение
5.45E-04
AV726956
Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
2,835599
-2,26295
34,26
Снижение
2.50E-03
AI735586
Гены EST
0,588183
-4,50758
34,2
Снижение
2.89E-04
AU118882
эндотелиновый рецептор типа A /FL=gb:NM_001957.1 gb:L06622.1
0,349102
-4,73558
33,93
Снижение
2.50E-02
BM682352
Homo sapiens, кДНК FLJ37204 fis, клон BRALZ2006976.
-0,10303
-5,00884
29,98
Снижение
1.97E-04
NM_022168
Homo sapiens, связанный с дифференцировкой меланомы белок-5 (MDA5), мРНК. /PROD=melanoma differentiation associated protein-5 /FL=gb:AY017378.1 gb:NM_022168.1 gb:AF095844.1
2,325274
-2,506
28,47
Снижение
1.35E-04
AW193693
белок DKFZP566K1924
0,252976
-4,55112
27,94
Снижение
2.54E-02
NM_018043
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10261 (FLJ10261), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10261 /FL=gb:NM_018043.1
2,719388
-2,08299
27,9
Снижение
1.72E-02
NM_002048
Homo sapiens, специфичный для задержки роста белок 1 (GAS1), мРНК. /PROD=growth arrest-specific 1 /FL=gb:NM_002048.1 gb:L13698.1
3,257726
-1,54343
27,88
Снижение
6.25E-05
NM_004335
Homo sapiens, антиген 2 клеток стромы костного мозга /FL=gb:NM_004335.2 gb:D28137.1
4,353788
-0,41404
27,24
Снижение
4.72E-04
AI332407
секретированный frizzled-белок 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
4,387855
-0,27888
25,4
Снижение
6.82E-05
AF225513
Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta /FL=gb:AF225513.1
0,027478
-4,62508
25,15
Снижение
9.89E-03
NM_152647
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32800 (FLJ32800), мРНК. /FL=gb:NM_152647.1
1,767203
-2,80617
23,81
Снижение
4.44E-04
AI742043
Гены EST
1,665643
-2,69521
20,55
Снижение
1.08E-04
AF282250
Homo sapiens, кальньюрон 1 (CALN1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=calneuron 1 /FL=gb:AF282250.1
0,414323
-3,84422
19,14
Снижение
3.42E-04
AF283777
Homo sapiens, клон TCBAP0702, последовательность мРНК.
3,779853
-0,4664
18,98
Снижение
4.72E-04
AV646597
Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
1,995324
-2,233
18,74
Снижение
1.01E-03
NM_014862
Homo sapiens, продукт гена KIAA0307 (KIAA0307), мРНК. /PROD=KIAA0307 gene product /FL=gb:AB002305.1 gb:NM_014862.1
1,946332
-2,24096
18,22
Снижение
2.40E-03
BG166705
малый индуцибельный цитокин, подсемейство B (Cys-X-Cys), член 5 (нейтрофил-активирующий пептид 78 эпителиального происхождения)
1,179963
-2,9904
18,01
Снижение
2.13E-04
U96136
Homo sapiens, дельта-катенин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=delta-catenin /FL=gb:NM_001332.1 gb:U72665.1 gb:AB013805.1 gb:U96136.1 gb:AF035302.1
2,060687
-2,07873
17,62
Снижение
1.01E-03
AI269290
переносчик растворенных веществ, семейство 18 (везикулярный моноамин), член 2 /FL=gb:L14269.1 gb:L23205.1 gb:L09118.1 gb:NM_003054.1
2,480221
-1,64839
17,49
Снижение
1.22E-03
NM_004900
Homo sapiens, форболин (сходный с аполипопротеином B мРНК-редактирующий белок) (DJ742C19.2), мРНК. /PROD=phorbolin (similar to apolipoprotein B мРНКediting protein) /FL=gb:NM_004900.1 gb:U61083.1
0,971941
-3,12304
17,09
Снижение
1.07E-02
NM_018018
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10191 (FLJ10191), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10191 /FL=gb:NM_018018.1
2,263194
-1,81469
16,89
Снижение
2.69E-03
AF052108
Homo sapiens, клон 23687, последовательность мРНК.
2,115848
-1,84267
15,55
Снижение
3.89E-02
AF213678
Homo sapiens, связанный с HAI-2 малый белок (HAI-2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=HAI-2 related small protein /FL=gb:AB038317.1 gb:AF213678.1
2,348373
-1,56046
15,02
Снижение
7.77E-03
NM_016354
Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 21 (переносчик органических анионов), член 12 (SLC21A12), мРНК. /PROD=organic anion transporter OATP-E /FL=gb:AB031051.1 gb:NM_016354.1 gb:AF205072.1 gb:AF187817.1
1,910263
-1,99418
14,97
Снижение
3.77E-04
NM_006994
Homo sapiens, бутирофилин, подсемейство 3, член A3 (BTN3A3), мРНК. /PROD=butyrophilin, subfamily 3, member A3 /FL=gb:U90548.1 gb:NM_006994.2
2,699795
-1,16113
14,53
Снижение
5.07E-03
NM_012281
Homo sapiens, потенциал-зависимый калиевый канал, подсемейство, связанное с Shal, член 2 (KCND2), мРНК. /PROD=potassium voltage-gated channel, Shal-relatedsubfamily, member 2 /FL=gb:NM_012281.1 gb:AB028967.1 gb:AF121104.1
2,172559
-1,66608
14,31
Снижение
7.83E-03
BE673445
Homo sapiens, хромосома 19, космида R28379
0,265765
-3,53873
13,97
Снижение
2.21E-03
AI675836
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-446H13 на хромосоме 10. Содержит 3 конец гена нового белка, подобного KIAA1059 (ортолог мышиного рецепторного белка SORCS, содержащего домен VPS10), псевдоген RPL23A (60S рибосомный белок 23A), гены EST, гены STS
5,440506
1,644236
13,89
Снижение
6.34E-05
M34455
Человеческая индуцируемая интерфероном-гамма индоламин-2,3-диоксигеназа (IDO), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:NM_002164.1 gb:M34455.1
0,330556
-3,45471
13,79
Снижение
5.46E-04
BE972639
Гены EST
0,437404
-3,31877
13,51
Снижение
4.52E-04
H05254
Гены EST
1,32524
-2,42314
13,44
Снижение
1.57E-02
H29627
Гены EST
1,673028
-2,06656
13,36
Снижение
5.30E-03
AF141339
Homo sapiens, взаимодействующий с LYST белок LIP3, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=LYST-interacting protein LIP3
1,319614
-2,39234
13,1
Снижение
1.43E-02
NM_004389
Homo sapiens, катенин (белок, связанный с кадгеринами), альфа 2 (CTNNA2), мРНК. /PROD=catenin (cadherin-associated protein), alpha 2 /FL=gb:NM_004389.1 gb:M94151.2
1,708627
-1,98647
12,95
Снижение
1.75E-02
NM_017596
Homo sapiens, белок KIAA0449 (KIAA0449), мРНК. /PROD=hypothetical protein DKFZp434J212 /FL=gb:NM_017596.1
2,777148
-0,8902
12,71
Снижение
4.36E-04
NM_022034
Homo sapiens, ген 1, регулируемый эстерогеном (ERG-1), мРНК. /PROD=estrogen regulated gene 1 /FL=gb:AF305835.1 gb:NM_022034.1
1,982765
-1,67669
12,64
Снижение
6.88E-04
BE672659
Гены EST
0,457009
-3,18081
12,45
Снижение
3.30E-04
AW449813
белок KIAA0918
0,510314
-3,12055
12,39
Снижение
1.71E-02
AW780006
Гены EST
0,536704
-3,05382
12,05
Снижение
1.92E-02
AL049250
Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp564D113 (из клона DKFZp564D113).
2,294336
-1,27392
11,86
Снижение
1.66E-02
U11058
Homo sapiens, альфа-субъединица высокопроводящего кальциевого и потенциалзависимого калиевого канала (MaxiK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=large conductance calcium- and voltage-dependentpotassium channel alpha subunit /FL=gb:U23767.1 gb:NM_002247.1 gb:AF025999
2,177763
-1,38062
11,78
Снижение
8.80E-05
NM_002590
Homo sapiens, протокадгерин 8 (PCDH8), мРНК. /PROD=protocadherin 8 /FL=gb:NM_002590.2 gb:AF061573.2
-0,48821
-4,01809
11,55
Снижение
2.29E-02
AB040812
Homo sapiens, мРНК протеинкиназы PAK5, полная кодовая последовательность. /PROD=protein kinase PAK5 /FL=gb:AB040812.1
1,785431
-1,74236
11,53
Снижение
2.18E-03
R15072
Гены EST
1,459269
-2,00069
11
Снижение
3.74E-04
NM_000277
Homo sapiens, фенилаланин-гидроксилаза (PAH), мРНК. /PROD=phenylalanine hydroxylase /FL=gb:U49897.1 gb:NM_000277.1
1,995493
-1,44407
10,85
Снижение
7.11E-03
U91903
Человеческий белок Fritz, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Fritz /FL=gb:U24163.1 gb:U68057.1 gb:NM_001463.1 gb:U91903.1
0,679665
-2,7484
10,76
Снижение
5.57E-03
BC000568
Homo sapiens, клон MGC:3040, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:3040) /FL=gb:BC000568.1
1,841888
-1,57619
10,69
Снижение
1.16E-03
AW072790
контактин 1
-0,42571
-3,8118
10,45
Снижение
1.58E-02
AK023699
Homo sapiens, кДНК FLJ13637 fis, клон PLACE1011165.
1,923237
-1,4606
10,44
Снижение
4.11E-04
AW072102
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434H205 (из клона DKFZp434H205)
0,931661
-2,45074
10,43
Снижение
1.07E-02
AW149405
нейриксин 1 /FL=gb:AB035356.1
0,781816
-2,56699
10,19
Снижение
2.50E-02
NM_000698
Homo sapiens, арахидонат 5-липоксигеназа (ALOX5), мРНК. /PROD=arachidonate 5-lipoxygenase /FL=gb:NM_000698.1 gb:J03600.1 gb:J03571.1
1,939598
-1,40726
10,17
Снижение
2.29E-03
AB014737
Homo sapiens, мРНК белка SMAP-2b, полная кодовая последовательность. /PROD=SMAP-2b /FL=gb:AB014737.1
0,874376
-2,46854
10,15
Снижение
1.59E-02
U82671
Homo sapiens, из хромосомы Xq28 семейство меланомных антигенов A2a (MAGEA2A), семейство меланомных антигенов A12 (MAGEA12), семейство меланомных антигенов A2b (MAGEA2B), семейство меланомных антигенов A3 (MAGEA3), кальтрактин (CALT), NAD(P)H дегидрогеназа-подобный белок (NSDHL), ...
3,315768
0,011663
9,88
Снижение
7.33E-04
AK098525
Homo sapiens, кДНК FLJ25659 fis, клон TST00427, высокая степень подобия с белком домовой мыши, взаимодействующим с белком hedgehog (Hip), мРНК.
0,121165
-3,1782
9,84
Снижение
4.65E-03
AI985987
Гены EST со средней степенью подобия с ALU1_HUMAN ALU SUBFAMILY J SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
0,686587
-2,59339
9,71
Снижение
2.72E-02
NM_000439
Homo sapiens, пропротеинконвертаза субтилизинкексинового типа 1 (PCSK1), мРНК. /PROD=proprotein convertase subtilisinkexin type 1 /FL=gb:NM_000439.2 gb:M90753.1
3,113317
-0,0881
9,2
Снижение
7.30E-05
AL565745
Гены EST с низкой степенью подобия с 2108402A, карнитин-пальмитоилтрансферазой I (H.sapiens)
2,890305
-0,29832
9,12
Снижение
3.24E-04
NM_015474
Homo sapiens, белок DKFZP564A032 (DKFZP564A032), мРНК. /PROD=DKFZP564A032 protein /FL=gb:AF228421.1 gb:AL050267.1 gb:AB013847.1 gb:NM_015474.1
0,447048
-2,73882
9,1
Снижение
4.19E-02
BE645435
Гены EST
3,142124
-0,03564
9,05
Снижение
3.76E-03
AL832535
Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp547J1816 (из клона DKFZp547J1816).
0,767101
-2,38787
8,91
Снижение
1.92E-02
BC003517
Homo sapiens, клон IMAGE:3542589, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3542589)
4,315048
1,168713
8,85
Снижение
7.92E-04
NM_016139
Homo sapiens, белок 16,7 кДа (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
-0,47937
-3,61302
8,78
Снижение
2.49E-02
BE968773
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp564O1262 (из клона DKFZp564O1262)
3,26376
0,151239
8,65
Снижение
1.74E-04
BE644809
Гены EST
0,384182
-2,72567
8,63
Снижение
3.02E-02
NM_005825
Homo sapiens, RAS гуанил-высвобождающий белок 2 (регулируемый кальцием и диацилглицерином) (RASGRP2), мРНК. /PROD=RAS guanyl releasing protein 2 (calcium andDAG-regulated) /FL=gb:AF043723.1 gb:NM_005825.1
2,363587
-0,72928
8,53
Снижение
7.38E-04
NM_024645
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ13842 (FLJ13842), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ13842 /FL=gb:NM_024645.1
4,756657
1,668488
8,5
Снижение
1.30E-04
AV715309
Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
0,995551
-2,07915
8,43
Снижение
3.01E-02
NM_005386
Homo sapiens, нейронатин (NNAT), мРНК. /PROD=neuronatin /FL=gb:NM_005386.1 gb:BC001768.1 gb:AB002392.1 gb:U25033.1
2,380226
-0,68921
8,39
Снижение
8.34E-05
NM_016546
Homo sapiens, предшественник комплемент-C1r-подобной протеиназы (LOC51279), мРНК. /PROD=complement C1r-like proteinase precursor, /FL=gb:AF178985.1 gb:NM_016546.1
2,598916
-0,46577
8,37
Снижение
6.59E-05
AW051591
Гены EST со средней степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
1,045717
-2,01579
8,35
Снижение
1.44E-02
AI937060
белок KIAA1151
3,009579
-0,04543
8,31
Снижение
7.08E-04
AB037730
Homo sapiens, мРНК белка KIAA1309, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1309 protein
1,440541
-1,60998
8,29
Снижение
1.58E-02
BE503640
Гены EST
0,4785
-2,56291
8,23
Снижение
2.46E-02
BG532690
интегрин, альфа 4 (антиген CD49D, субъединица альфа 4 рецептора VLA-4)
5,84374
2,812887
8,17
Снижение
6.34E-05
BC000069
Homo sapiens, белок-респондер рецептора ретиноевой кислоты (индуцируемый тазаротеном) 2, клон MGC:1544, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=retinoic acid receptor responder (tazaroteneinduced) 2 /FL=gb:BC000069.1 gb:NM_002889.2 gb:AB015632.1 gb:U77594.1
1,110683
-1,89628
8,04
Снижение
8.48E-04
AA557324
Гены EST с низкой степенью подобия с жирнокислотной омега-гидроксилазой (H.sapiens)
1,386384
-1,61585
8,01
Снижение
3.53E-04
AF196571
Homo sapiens, дельта-подобный-1 белок (DLL1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Delta-like-1 protein /FL=gb:NM_005618.2 gb:AF196571.1
5,363884
2,372618
7,95
Снижение
7.30E-05
NM_007015
Homo sapiens, предшественник хондромодулина I (CHM-I), мРНК. /PROD=chondromodulin I precursor /FL=gb:NM_007015.1 gb:AB006000.1
1,364581
-1,62447
7,94
Снижение
2.16E-02
NM_145280
Homo sapiens, белок, сходный с антигеном HCA557b, связанным с гепатоклеточной карциномой (LOC151194), мРНК. /FL=gb:BC009462.1 gb:NM_145280.1
2,628136
-0,35867
7,93
Снижение
1.22E-04
NM_001957
Homo sapiens, рецептор эндотелина, тип A (EDNRA), мРНК. /PROD=endothelin receptor type A /FL=gb:NM_001957.1 gb:L06622.1
1,712212
-1,25121
7,8
Снижение
8.48E-04
R62432
Кластер включает R62432:yg52e11.s1 Homo sapiens, кДНК, 3 конец/ clone=IMAGE-36023 /clone_end=3 /gb=R62432 /gi=834311 /ug=Hs.12321 /len=487
1,443731
-1,51616
7,78
Снижение
4.37E-03
AJ272267
Homo sapiens, часть мРНК холиндегидрогеназы (ген chdh). /PROD=choline dehydrogenase
3,106596
0,148375
7,77
Снижение
1.23E-02
NM_002305
Homo sapiens, лектин, галактозид-связывающий, растворимый, 1 (галектин 1) (LGALS1), мРНК. /PROD=beta-galactosidase binding lectin precursor /FL=gb:NM_002305.2 gb:BC001693.1 gb:J04456.1
1,961633
-0,98665
7,72
Снижение
8.93E-03
NM_001463
Homo sapiens, frizzled-белок (FRZB), мРНК. /PROD=frizzled-related protein /FL=gb:U24163.1 gb:U68057.1 gb:NM_001463.1 gb:U91903.1
2,38092
-0,54428
7,6
Снижение
6.34E-04
AF053712
Homo sapiens, лиганд остеопротегерина, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=osteoprotegerin ligand /FL=gb:AF053712.1 gb:AF019047.1
0,685413
-2,22507
7,52
Снижение
2.98E-02
NM_018383
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ11294 (FLJ11294), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ11294 /FL=gb:NM_018383.1
-0,24717
-3,14972
7,48
Снижение
3.67E-04
AF429305
Homo sapiens, белок C23up NCRMS, мРНК, частичная последовательность; продукт альтернативного сплайсинга.
3,893148
0,997757
7,44
Снижение
1.29E-04
AU144892
Homo sapiens, кДНК FLJ11569 fis, клон HEMBA1003304
0,82553
-2,06523
7,42
Снижение
4.10E-02
BC041933
Homo sapiens, клон IMAGE:5300703, мРНК.
0,728978
-2,13318
7,27
Снижение
1.25E-03
AL573058
компонент комплемента 1, подкомпонент r
1,033324
-1,8148
7,2
Снижение
5.93E-03
N80918
Новый человеческий ген, соответствующий хромосоме 13
2,858719
0,013383
7,19
Снижение
4.37E-03
L10374
Человеческая (клон CTG-A4) последовательность мРНК.
2,260317
-0,57539
7,14
Снижение
1.02E-03
AI138603
Гены EST
2,003902
-0,82254
7,09
Снижение
8.00E-03
BF109660
Гены EST
3,85985
1,037668
7,07
Снижение
2.70E-04
R40892
Гены EST
3,921983
1,12675
6,94
Снижение
3.53E-04
AA206141
Гены EST
-0,17018
-2,96268
6,93
Снижение
2.08E-02
AV741130
Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
1,610685
-1,16078
6,83
Снижение
9.82E-04
AA886335
Homo sapiens, серологически определяемый антиген NY-BR-20 рака молочной железы, мРНК, частичная кодовая последовательность
2,859538
0,089114
6,82
Снижение
2.22E-03
AW014734
Гены EST
3,212409
0,467551
6,7
Снижение
2.69E-04
BG434174
Homo sapiens кДНК FLJ13555 fis, клон PLACE1007677
2,116702
-0,60252
6,59
Снижение
3.35E-03
AF107846
Homo sapiens, ген нейроэндокрин-специфичного белка Гольджи p55 (XLalphas), экзон XL2 и полная кодовая последовательность
3,179908
0,462842
6,58
Снижение
3.24E-04
U82811
Человеческий гомеодомен-содержащий белок (HANF) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=HANF /FL=gb:U82811.1 gb:NM_003865.1
2,509452
-0,20066
6,54
Снижение
1.04E-03
NM_001609
Homo sapiens, ацил-коэнзим А-дегидрогеназа, коротко-ветвистая цепь (ACADSB), ядерный ген, кодирующий митохондриальный белок, мРНК. /PROD=acyl-Coenzyme A dehydrogenase, shortbranchedchain precursor /FL=gb:U12778.1 gb:NM_001609.1
2,596054
-0,10733
6,51
Снижение
1.39E-03
BC005107
Homo sapiens, клон IMAGE:3840937, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3840937)
0,559211
-2,13754
6,48
Снижение
2.20E-02
BF000203
Гены EST
4,534853
1,872557
6,33
Снижение
9.75E-05
R38389
ольфактомедин-связанный белок, локализованный в ЭР
2,068166
-0,59258
6,32
Снижение
1.69E-03
BF698797
Гены EST
2,168796
-0,49174
6,32
Снижение
2.44E-04
NM_002522
Homo sapiens, нейрональный пентраксин I (NPTX1), мРНК. /PROD=neuronal pentraxin I precursor /FL=gb:NM_002522.1 gb:U61849.1
-0,10024
-2,75761
6,31
Снижение
3.60E-02
BC033812
Homo sapiens, белок, сходный с LOC155399, клон MGC:45477 IMAGE:5181460, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Similar to LOC155399 /FL=gb:BC033812.1
0,994947
-1,65385
6,27
Снижение
7.39E-03
NM_024034
Homo sapiens, гипотетический белок MGC3129, сходный с белком, связанным с ганглиозид-индуцированной дифференцировкой (MGC3129), мРНК. /PROD=hypothetical protein MGC3129 similar toganglioside-induced differentiation-associated protein /FL=gb:NM_024034.1 gb:BC0
3,758058
1,109291
6,27
Снижение
4.39E-04
NM_005356
Homo sapiens, лимфоцит-специфическая белковая тирозинкиназа (LCK), мРНК. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
1,553207
-1,09181
6,26
Снижение
2.54E-02
AI653050
Гены EST с низкой степенью подобия с HPPD_HUMAN 4 - HYDROXYPHENYLPYRUVATE DIOXYGENASE (H.sapiens)
3,702164
1,060081
6,24
Снижение
4.08E-04
U26662
Человеческий нейрональный пентраксин II (NPTX2) мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=neuronal pentraxin II
4,260791
1,638346
6,16
Снижение
6.25E-05
AA603344
Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
2,172331
-0,44991
6,16
Снижение
2.44E-04
NM_003839
Homo sapiens, суперсемейство рецепторов фактора некроза опухолей, член 11a, активатор NFKB (TNFRSF11A), мРНК. /PROD=tumor necrosis factor receptor superfamily,member 11a, activator of NFKB /FL=gb:NM_003839.1 gb:AF018253.1
4,981307
2,359848
6,15
Снижение
4.17E-05
NM_005103
Homo sapiens, белок фасцикуляции и удлинения зета 1 (зигин I) (FEZ1), вариант транскрипта 1, мРНК. /PROD=zygin 1, isoform 1 /FL=gb:U60060.1 gb:U69139.1 gb:NM_005103.2
3,826815
1,207679
6,14
Снижение
6.48E-05
BG401568
Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp434H1235 (из клона DKFZp434H1235); частичная кодовая последовательность
1,027188
-1,59055
6,14
Снижение
8.40E-03
BG169832
аденилаткиназа 5 /FL=gb:NM_012093.1 gb:AF062595.1
2,054962
-0,54704
6,07
Снижение
2.86E-03
NM_002800
Homo sapiens, субъединица протеасомы (просома, макропаин), тип бета, 9 (большая многофункциональная протеаза 2) (PSMB9), мРНК. /PROD=proteasome (prosome, macropain) subunit, betatype, 9 (large multifunctional protease 2) /FL=gb:U01025.1 gb:NM_002800.1
5,372736
2,7744
6,06
Снижение
8.80E-05
AA669799
Кластер включает AA669799:ag36c04.s1 Homo sapiens, кДНК, 3 конец /clone=IMAGE-1118886 /clone_end=3 /gb=AA669799 /gi=2631298 /ug=Hs.6315 /len=679
0,24636
-2,3444
6,02
Снижение
1.31E-03
AW057589
Гены EST
1,145878
-1,44369
6,02
Снижение
9.46E-03
AI056877
Человеческая ДНК-последовательность от клонирования RP4-530I15 на хромосоме 20. Содержит 3 конец гена PTPN1, протеинтирозинфосфатазы, нерецепторного типа 1 (EC 3.1.3.48), гена нового белка, сходного с плацентарным белком DIFF40, RPL36 (60S рибос
0,976009
-1,61054
6,01
Снижение
5.39E-03
AW264204
Гены EST
0,497515
-2,08762
6
Снижение
2.83E-02
AF052117
Homo sapiens, клон 23809, последовательность мРНК.
0,381933
-2,20139
5,99
Снижение
8.66E-04
AI913749
Гены EST
0,528494
-2,05438
5,99
Снижение
4.17E-02
BG290908
Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
3,795925
1,232161
5,91
Снижение
2.20E-04
NM_004688
Homo sapiens, белок, взаимодействующий с N-myc (и STAT) (NMI), мРНК. /PROD=N-myc and STAT interactor /FL=gb:BC001268.1 gb:NM_004688.1 gb:U32849.1
1,934415
-0,62283
5,89
Снижение
4.93E-04
NM_001351
Homo sapiens, белок, подобный белку, удаленному из азооспермии (DAZL), мРНК. /PROD=deleted in azoospermia-like /FL=gb:U66726.2 gb:NM_001351.1 gb:U65918.1 gb:U66078.1
1,805448
-0,75007
5,88
Снижение
1.88E-03
AI681917
Гены EST с высокой степенью подобия с МЫШИНЫМ IRX3, ГОМЕОДОМЕННЫМ БЕЛКОМ IRX-3 КЛАССА IROQUOIS (M.musculus)
2,788534
0,237692
5,86
Снижение
7.40E-03
AW450929
гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A1
2,99034
0,457208
5,79
Снижение
5.23E-04
NM_002993
Homo sapiens, малый индуцибельный цитокин, подсемейство B (Cys-X-Cys), член 6 (гранулоцитарный хемотактический белок 2) (SCYB6), мРНК. /PROD=small inducible cytokine subfamily B(Cys-X-Cys), member 6 (granulocyte chemotactic protein 2) /FL=gb:U81234.1 gb:NM_00299
0,362564
-2,17012
5,79
Снижение
1.28E-02
AB018580
Homo sapiens, мРНК белка hluPGFS, полная кодовая последовательность. /PROD=hluPGFS /FL=gb:NM_003739.2 gb:AF149416.2 gb:AB018580.1 gb:D17793.1
1,673874
-0,85315
5,76
Снижение
8.93E-03
NM_005965
Homo sapiens, киназа легкого полипептида миозина (MYLK), мРНК. /PROD=myosin, light polypeptide kinase /FL=gb:AB037663.1 gb:AF069601.2 gb:NM_005965.1
1,858219
-0,66565
5,75
Снижение
2.13E-04
NM_005084
Homo sapiens, фосфолипаза A2, группа VII (ацетилгидролаза фактора активации тромбоцитов, плазматическая) (PLA2G7), мРНК. /PROD=phospholipase A2, group VII (platelet-activatingfactor acetylhydrolase, plasma) /FL=gb:U20157.1 gb:U24577.1 gb:NM_005084.1
3,016209
0,501482
5,71
Снижение
6.48E-05
AW026379
Гены EST
3,692792
1,179422
5,71
Снижение
1.52E-04
N21096
Гены EST
1,28245
-1,23083
5,71
Снижение
3.20E-04
AF063824
Homo sapiens, урезанный вариант-дельта связанного с trp белка 4, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=trp-related protein 4 truncated variant delta /FL=gb:AF063824.1
3,772564
1,260638
5,7
Снижение
3.53E-04
AA404269
Гены EST
2,016986
-0,49385
5,7
Снижение
6.37E-03
AI741439
Гены EST
2,453774
-0,04433
5,65
Снижение
1.01E-03
NM_007191
Homo sapiens, ингибирующий Wnt фактор-1 (WIF-1), мРНК. /PROD=Wnt inhibitory factor-1 /FL=gb:AF122922.1 gb:NM_007191.1
5,545158
3,061783
5,59
Снижение
1.71E-04
BF057809
Гены EST
5,219258
2,740374
5,57
Снижение
1.08E-04
AA974416
протеинфосфатаза 2 (ранее 2A), регуляторная субъединица B (PR 52), бета-изоформа
2,913327
0,434686
5,57
Снижение
2.99E-04
NM_012419
Homo sapiens, регулятор G-белковой сигнализации 17 (RGS17), мРНК. /PROD=regulator of G-protein signalling 17 /FL=gb:AF202257.2 gb:NM_012419.2
1,651332
-0,81962
5,54
Снижение
8.34E-02
NM_007181
Homo sapiens, митоген-активированной протеинкиназы киназы киназы киназа 1 (MAP4K1), мРНК. /PROD=mitogen-activated protein kinase kinase kinasekinase 1 /FL=gb:U66464.1 gb:NM_007181.1
1,293775
-1,16956
5,51
Снижение
1.15E-02
BF593660
Гены EST
1,417933
-1,04305
5,51
Снижение
4.93E-04
NM_002738
Homo sapiens, протеинкиназа C, бета 1 (PRKCB1), мРНК. /PROD=protein kinase C, beta 1 /FL=gb:NM_002738.1
3,66812
1,207732
5,5
Снижение
1.97E-04
NM_133329
Homo sapiens, потенциал-зависимый калиевый канал, подсемейство G, член 3 (KCNG3), вариант транскрипта 1, мРНК. /PROD=potassium voltage-gated channel, subfamily G,member 3 isoform 1 /FL=gb:AF454548.1 gb:AF348982.1 gb:AB070604.1 gb:NM_133329.4
3,002731
0,549124
5,48
Снижение
4.89E-04
R54042
Гены EST
5,276628
2,824048
5,47
Снижение
6.48E-05
BC005127
Homo sapiens, белок, связанный с дифференцировкой жировой ткани, клон MGC:10598, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=adipose differentiation-related protein /FL=gb:BC005127.1 gb:NM_001122.1
3,380946
0,937118
5,44
Снижение
1.22E-04
AU151342
Homo sapiens, кДНК FLJ12935 fis, клон NT2RP2004982
2,01577
-0,42783
5,44
Снижение
1.92E-03
BE220341
казеинкиназа 2, полипептид альфа 1
1,307387
-1,12824
5,41
Снижение
1.08E-04
AK021452
Homo sapiens, кДНК FLJ11390 fis, клон HEMBA1000561, с низкой степенью подобия с ЦИНК-ПАЛЬЦЕВЫМ БЕЛКОМ 91.
0,36507
-2,02151
5,23
Снижение
4.98E-03
BF062244
Гены EST
0,756663
-1,62346
5,21
Снижение
1.69E-03
BG533580
Гены EST
3,876819
1,518834
5,13
Снижение
4.76E-04
AI651212
Гены EST
0,619594
-1,73795
5,12
Снижение
1.18E-03
BE467611
Гены EST
0,482843
-1,87385
5,12
Снижение
1.04E-03
BG284890
Гены EST
1,048359
-1,30538
5,11
Снижение
8.93E-03
AA464273
Гены EST
3,527039
1,198446
5,02
Снижение
2.69E-03
BG283790
Гены EST
2,522705
0,194248
5,02
Снижение
3.09E-03
U07236
Человеческая мутантная лимфоцит-специфическая протеин-тирозинкиназа (LCK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
2,356401
0,028606
5,02
Снижение
6.23E-04
NM_024893
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ14220 (FLJ14220), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ14220 /FL=gb:NM_024893.1
4,587367
2,264046
5
Снижение
2.70E-04
AL049589
Последовательность человеческой ДНК из клона 570L12 на хромосоме Xq13.1-21.1. Содержит ген PGK1 для фосфоглицераткиназы 1, ген нового белка, подобного TAF2G (фактором, связанным с белком, связывающим TATA-участок (TBP), РНК-полимераза II, G, 32 кДа) (TAF...
B) Эмбриональные стволовые клетки и EXPRES 02- Значения интенсивности даны в формате Log2.
Эмбриональные стволовые клетки
EXPRES 02
Отношение
Направление
скорректир. значение p
Идентификатор гена
Название гена
-2,7136
7,077563
886
Повышение
9.62E-04
NM_001898
Homo sapiens, цистатин SN (CST1), мРНК. /PROD=cystatin SN /FL=gb:J03870.1 gb:NM_001898.1
-2,3713
6,959692
644,03
Повышение
6.55E-05
R72286
связанный с микрофибриллами белок 4
-3,78394
5,172093
496,63
Повышение
1.06E-04
AW157548
связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 5 /FL=gb:M65062.1 gb:M62782.1 gb:NM_000599.1 gb:AF055033.1
-4,79257
3,432794
299,28
Повышение
1.81E-03
AA352113
Гены EST
-5,16453
3,053666
297,8
Повышение
5.30E-03
NM_002345
Homo sapiens, люмикан (LUM), мРНК. /PROD=lumican /FL=gb:NM_002345.1 gb:U18728.1 gb:U21128.1
-2,55753
5,625595
290,65
Повышение
1.79E-04
D87811
Homo sapiens, мРНК для GATA-6, полная кодовая последовательность. /PROD=GATA-6 /FL=gb:U66075.1 gb:NM_005257.1 gb:D87811.1
-5,03662
3,030028
268,1
Повышение
7.79E-05
BG099432
Гены EST
-2,97296
4,901727
234,7
Повышение
5.95E-05
AI821586
Гены EST со средней степенью подобия с полученным из клеток JE0284 Mm-1 белком 1b, связанным с трансплантабельностью (H.sapiens)
-3,06613
4,772945
228,98
Повышение
2.57E-03
AI422986
Гены EST
-4,37538
3,399327
218,99
Повышение
7.01E-05
AA552969
Гены EST
-3,47045
4,200612
203,81
Повышение
4.26E-03
NM_025140
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ22471 (FLJ22471), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ22471 /FL=gb:NM_025140.1
-4,82833
2,813842
199,77
Повышение
1.40E-04
BF064262
Гены EST
-5,1127
2,479359
192,95
Повышение
1.06E-04
NM_002653
Homo sapiens, paired-подобный гомеодоменный транскрипционный фактор 1 (PITX1), мРНК. /PROD=paired-like homeodomain transcription factor 1 /FL=gb:NM_002653.1
-3,4841
4,092799
190,93
Повышение
4.34E-04
BM128432
Homo sapiens, полноразмерная вставка кДНК клон YA81B05
-4,64254
2,721466
164,74
Повышение
2.38E-05
AY177407
Homo sapiens, белок гомеобокса goosecoid, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=homeobox protein goosecoid /FL=gb:AY177407.1 gb:NM_173849.1
-3,40132
3,923976
160,37
Повышение
1.34E-02
BF589787
Гены EST
-1,20324
6,071574
154,86
Повышение
2.23E-04
NM_001643
Homo sapiens, аполипопротеин A-II (APOA2), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-II precursor /FL=gb:M29882.1 gb:NM_001643.1 gb:BC005282.1
-3,4292
3,808106
150,89
Повышение
4.62E-04
AB028021
Кластер включает AB028021:Homo sapiens, HNF-3 beta, мРНК для гепатоцитного ядерного фактора-3 бета, полная кодовая последовательность /cds=(196,1569) /gb=AB028021 /gi=4958949 /ug=Hs.155651 /len=1944
-4,71714
2,374201
136,37
Повышение
6.98E-05
AI796169
GATA-связывающий белок 3 /FL=gb:NM_002051.1 gb:M69106.1 gb:BC003070.1
-2,26798
4,781861
132,5
Повышение
9.04E-05
NM_001322
Homo sapiens, цистатин SA (CST2), мРНК. /PROD=cystatin SA /FL=gb:NM_001322.1
-0,81321
6,174771
126,94
Повышение
1.57E-03
NM_002160
Homo sapiens, гексабрахион (тенасцин C, цитотактин) (HXB), мРНК. /PROD=hexabrachion (tenascin C, cytotactin) /FL=gb:M55618.1 gb:NM_002160.1
-2,38522
4,594021
126,17
Повышение
6.89E-05
AA502609
Homo sapiens, анкирин-подобный белок с трансмембранными доменами 1 (ANKTM1), мРНК
-3,75387
3,204091
124,32
Повышение
2.13E-04
AI991459
Гены EST
-4,21525
2,671776
118,36
Повышение
1.99E-04
NM_006119
Homo sapiens, фактор роста фибробластов 8 (индуцированный андрогеном) (FGF8), мРНК. /PROD=fibroblast growth factor 8 (androgen-induced) /FL=gb:U36223.1 gb:U46212.1 gb:NM_006119.1
-2,02474
4,768631
110,92
Повышение
7.31E-03
NM_021827
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ23514 (FLJ23514), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ23514 /FL=gb:NM_021827.1
-2,38432
4,381798
108,84
Повышение
1.01E-03
AL534095
гипотетический белок FLJ23091
-2,25187
4,311095
94,55
Повышение
7.26E-03
AL136944
Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp586J0624 (из клона DKFZp586J0624); полная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein /FL=gb:AF215636.1 gb:NM_014585.1 gb:AF231121.1 gb:AF226614.1 gb:AL136944.1
-1,92189
4,619888
93,17
Повышение
9.02E-04
AV700724
GATA-связывающий белок 4 /FL=gb:NM_002052.1 gb:L34357.1 gb:D78260.1
-3,42725
2,997778
85,93
Повышение
2.95E-03
NM_022469
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ21195, сходный с белком, связанным с DAC и cerberus (FLJ21195), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ21195 similar to proteinrelated to DAC and cerberus /FL=gb:NM_022469.1
-3,14404
3,270152
85,28
Повышение
6.55E-05
AB028021
Homo sapiens, HNF-3 beta, мРНК гепатоцитного ядерного фактора-3 бета, полная кодовая последовательность. /PROD=hepatocyte nuclear factor-3 beta /FL=gb:AB028021.1 gb:NM_021784.1
-0,88122
5,526622
84,91
Повышение
1.25E-04
AA775681
гипотетический белок FLJ23091
-2,96204
3,439168
84,52
Повышение
1.08E-03
NM_001311
Homo sapiens, богатый цистеином белок 1 (кишечный) (CRIP1), мРНК. /PROD=cysteine-rich protein 1 (intestinal) /FL=gb:U58630.1 gb:BC002738.1 gb:NM_001311.1 gb:U09770.1
-3,42819
2,876705
79,06
Повышение
2.31E-04
AL121722
Человеческая ДНК-последовательность из клона RP4-788L20 на хромосоме 20. Содержит ген HNF-3B (гепатоцитарный ядерный фактор 3, бета). Новый ген, основанный на генах EST, EST, STS, GSS и островках CpG
-1,01231
5,27686
78,2
Повышение
1.85E-04
NM_001643
Homo sapiens, аполипопротеин A-II (APOA2), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-II precursor /FL=gb:M29882.1 gb:NM_001643.1 gb:BC005282.1
-2,13331
4,095704
75,01
Повышение
2.99E-04
NM_003867
Homo sapiens, фактор роста фибробластов 17 (FGF17), мРНК. /PROD=fibroblast growth factor 17 /FL=gb:NM_003867.1 gb:AB009249.1
-0,14916
6,052967
73,63
Повышение
2.30E-04
NM_002521
Homo sapiens, натрийуретического пептида предшественник B (NPPB), мРНК. /PROD=natriuretic peptide precursor B /FL=gb:NM_002521.1 gb:M25296.1
-2,9139
3,274181
72,91
Повышение
9.48E-04
NM_005143
Homo sapiens, гаптоглобин (HP), мРНК. /PROD=haptoglobin /FL=gb:K00422.1 gb:L29394.1 gb:NM_005143.1
-2,33028
3,85605
72,82
Повышение
2.04E-04
X02162
Человеческая мРНК аполипопротеина AI (apo AI)=. /PROD=preproapolipoprotein AI
-4,75249
1,427636
72,51
Повышение
8.97E-04
AJ276395
Homo sapiens, мРНК белка MSF-FN70 (ген FN). /PROD=migration stimulation factor FN70
-1,50663
4,672617
72,47
Повышение
9.82E-05
BF223214
Гены EST
-4,40099
1,778003
72,45
Повышение
8.87E-05
AI733179
Гены EST
-2,56553
3,594638
71,51
Повышение
4.24E-04
D31771
Homo sapiens, мРНК белка MSX-2, полная кодовая последовательность. /PROD=MSX-2 /FL=gb:NM_002449.2 gb:D31771.1
-3,67415
2,447201
69,62
Повышение
1.97E-02
BC042378
Homo sapiens, клон IMAGE:5277693, мРНК.
-1,33141
4,770833
68,7
Повышение
2.36E-04
AI640307
протокадгерин 10
-2,41293
3,673615
67,96
Повышение
8.00E-04
NM_000846
Homo sapiens, глутатион S-трансфераза A2 (GSTA2), мРНК. /PROD=glutathione S-transferase A2 /FL=gb:BC002895.1 gb:M25627.1 gb:M16594.1 gb:M14777.1 gb:M15872.1 gb:M21758.1 gb:NM_000846.1
-2,95346
3,079949
65,5
Повышение
7.93E-05
NM_000420
Homo sapiens, белок группы крови Келла (KEL), мРНК. /PROD=Kell blood group antigen /FL=gb:BC003135.1 gb:NM_000420.1
-3,41755
2,612638
65,35
Вверх
1,03E-02
AI808090
Гены EST
-4,08201
1,927438
64,42
Повышение
5.56E-04
AK000680
Homo sapiens кДНК FLJ20673 fis, клон KAIA4464. /FL=gb:AF240634.1 gb:NM_018440.1
-0,1416
5,830942
62,79
Повышение
6.89E-05
NM_022454
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ22252, сходный с содержащим SRY-бокс геном 17 (FLJ22252), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ22252 similar to SRY-boxcontaining gene 17 /FL=gb:NM_022454.1
-1,79329
4,15609
61,79
Повышение
7.58E-04
AL575177
noggin /FL=gb:NM_005450.1
-0,88683
5,039046
60,79
Повышение
8.36E-05
AI821669
Гены EST
-3,76697
2,141612
60,07
Повышение
2.25E-04
NM_001147
Homo sapiens, ангиопоэтин 2 (ANGPT2), мРНК. /PROD=angiopoietin 2 /FL=gb:AB009865.1 gb:AF004327.1 gb:NM_001147.1
0,720535
6,617979
59,61
Повышение
5.95E-05
AW007532
Человеческий связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 5 (IGFBP5), мРНК
-1,03589
4,784337
56,5
Повышение
2.23E-04
AI242583
Homo sapiens, кДНК FLJ11550 fis, клон HEMBA1002970
-2,28856
3,531402
56,49
Повышение
4.54E-04
AF211891
Homo sapiens, mix-like homeobox protein 1 (MILD1) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Mix-like homeobox protein 1 /FL=gb:AF211891.1
-2,04403
3,759502
55,85
Повышение
2.17E-03
NM_000039
Homo sapiens, аполипопротеин A-I (APOA1), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-I precursor /FL=gb:M27875.1 gb:M11791.1 gb:NM_000039.1 gb:BC005380.1
0,129315
5,920102
55,36
Повышение
6.89E-05
NM_005442
Homo sapiens, гомолог эомезодермина (Xenopus laevis) (EOMES), мРНК. /PROD=eomesodermin (Xenopus laevis) homolog /FL=gb:AB031038.1 gb:NM_005442.1
-1,57973
4,207564
55,23
Повышение
5.25E-03
AL513917
переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
-4,11172
1,670966
55,05
Повышение
4.57E-04
BG256677
индуцируемый гамма-интерфероном белок 16 /FL=gb:AF208043.1
-0,28789
5,482347
54,58
Повышение
6.89E-05
AW772192
Homo sapiens, клон 23736, последовательность мРНК
-1,44577
4,307421
53,94
Повышение
3.59E-03
AL544576
Гены EST
-3,9513
1,76416
52,54
Повышение
7.33E-05
NM_016341
Homo sapiens, обильная в поджелудочной железе фосфолипаза C (LOC51196), мРНК. /PROD=pancreas-enriched phospholipase C /FL=gb:AF117948.1 gb:NM_016341.1 gb:AF190642.2
0,05538
5,762108
52,23
Повышение
7.33E-05
AI817041
связанный с G-белком рецептор
-3,52376
2,14189
50,76
Повышение
8.23E-05
AW300217
Гены EST, со средней степенью подобия с C212_HUMAN 28.3 КДА C21ORF2 (H.sapiens)
-3,18877
2,469472
50,5
Повышение
7.47E-03
AF260333
Homo sapiens, белок AD036, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=AD036 /FL=gb:AF260333.1
-1,973
3,674867
50,14
Повышение
1.91E-04
AA772920
Гены EST
-2,30094
3,341814
49,96
Повышение
7.23E-03
AI806174
транскрипционный фактор 8 (подавляет экспрессию интерлейкина 2)
-2,25531
3,356433
48,9
Повышение
6.63E-03
AI380207
Гены EST
-2,71676
2,892681
48,82
Повышение
5.25E-04
AU144167
Homo sapiens, кДНК FLJ11428 fis, клон HEMBA1001071, высокая степень сходства с ПРЕДШЕСТВЕННИКОМ ЦЕПИ ПРОКОЛЛАГЕНА АЛЬФА 1(III)
-0,16429
5,442379
48,73
Повышение
6.83E-04
L01639
Человеческий (клон HSY3RR) рецептор к нейропептиду Y (NPYR) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=neuropeptide Y receptor /FL=gb:L06797.1 gb:NM_003467.1 gb:AF025375.1 gb:AF147204.1 gb:M99293.1 gb:L01639.1
-4,03477
1,563749
48,45
Повышение
1.19E-02
U12170
Человеческий гомеодоменный цинк-пальцевый белок, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=zinc finger homeodomain protein /FL=gb:U12170.1
-0,08298
5,493663
47,72
Повышение
2.19E-04
NM_004207
Homo sapiens, переносчик растворенных веществ семейства 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 (SLC16A3), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
-2,99405
2,552238
46,73
Повышение
4.78E-04
AI767388
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-1024N4 на хромосоме 1p32.1-33. Содержит ген нового члена семейства сопряженных переносчиков Натрий:переносимое вещество, подобного SLC5A1 (SGLT1), псевдоген, подобный части членов семейства бутирофилинов, новый ген, гены EST, STS, GS
-4,61432
0,925434
46,52
Повышение
2.53E-04
NM_005221
Homo sapiens, относящийся к типу distal-less гомеобокс 5 (DLX5), мРНК. /PROD=distal-less homeo box 5 /FL=gb:NM_005221.3
-3,22309
2,302183
46,05
Повышение
4.60E-03
AW207243
Гены EST
-2,82645
2,655384
44,69
Повышение
4.60E-03
NM_013445
Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD25, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD25 /FL=gb:NM_013445.1 gb:AF178853.1 gb:BC002815.1
0,533443
5,958927
42,98
Повышение
6.55E-05
NM_001899
Homo sapiens, цистатин S (CST4), мРНК. /PROD=cystatin S /FL=gb:NM_001899.1
0,116207
5,518477
42,29
Повышение
1.27E-04
NM_000599
Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 5 (IGFBP5), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 5 /FL=gb:M65062.1 gb:M62782.1 gb:NM_000599.1 gb:AF055033.1
-2,1675
3,230235
42,16
Повышение
1.53E-04
NM_021804
Homo sapiens, ангиотензин I -преобразующий фермент (пептидил-дипептидаза A) 2 (ACE2), мРНК. /PROD=angiotensin I converting enzyme(peptidyl-dipeptidase A) 2 /FL=gb:NM_021804.1 gb:AF241254.1 gb:AB046569.1 gb:AF291820.1
-0,61985
4,752547
41,42
Повышение
3.54E-04
NM_001963
Homo sapiens, эпидермальный фактор роста (бета-урогастрон) (EGF), мРНК. /PROD=epidermal growth factor (beta-urogastrone) /FL=gb:NM_001963.2
-1,73746
3,627971
41,22
Повышение
3.35E-04
NM_014391
Homo sapiens, сердечный белок с анкириновыми повторами (CARP), мРНК. /PROD=cardiac ankyrin repeat protein /FL=gb:NM_014391.1
-3,68848
1,657514
40,67
Повышение
2.86E-03
NM_018557
Homo sapiens, связанный с липопротеинами низкой плотности белок 1B (отсутствующий в опухолях) (LRP1B), мРНК. /PROD=low density lipoprotein-related protein 1B(deleted in tumors) /FL=gb:AF176832.1 gb:NM_018557.1
-3,11273
2,220281
40,31
Повышение
5.02E-03
AW444761
Гены EST
-2,78886
2,517881
39,58
Повышение
7.89E-03
NM_001115
Homo sapiens, аденилат-циклаза 8 (мозговая) (ADCY8), мРНК. /PROD=adenylate cyclase 8 /FL=gb:NM_001115.1
-1,93668
3,348112
38,98
Повышение
7.23E-03
BE670361
сопряженный с G-белком рецептор 72 /FL=gb:NM_016540.1 gb:AF236081.1
-3,65051
1,595241
37,94
Повышение
3.80E-04
AF213459
Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
0,767075
5,998268
37,56
Повышение
2.55E-04
AY029208
Homo sapiens, предшественник цепи альфа 2 коллагена типа VI (COL6A2), мРНК, полная кодовая последовательность, продукт альтернативного сплайсинга. /PROD=type VI collagen alpha 2 chain precursor /FL=gb:AY029208.1
-2,34732
2,874499
37,32
Повышение
6.51E-03
AI240545
гликофорин B (содержит белок группы крови Ss)
-2,41622
2,773394
36,49
Повышение
6.29E-04
NM_001977
Homo sapiens, глутамил-аминопептидаза (аминопептидаза A) (ENPEP), мРНК. /PROD=glutamyl aminopeptidase (aminopeptidase A) /FL=gb:L12468.1 gb:NM_001977.1 gb:L14721.1
-1,58875
3,588854
36,19
Повышение
2.45E-03
NM_152506
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32835 (FLJ32835), мРНК. /FL=gb:NM_152506.1
-0,93849
4,238505
36,18
Повышение
1.38E-02
BE222344
богатый аргинином и серином фактор сплайсинга 5
1,479222
6,611842
35,08
Повышение
5.95E-05
NM_005454
Homo sapiens, гомолог белка cerberus 1 (Xenopus laevis) (суперсемейство белков с цистеиновыми узлами) (CER1), мРНК. /PROD=cerberus 1 /FL=gb:NM_005454.1
-0,46494
4,666106
35,04
Повышение
2.90E-04
AI141603
коллаген, тип VI, альфа 1
-2,23021
2,897749
34,97
Повышение
4.92E-04
NM_001785
Homo sapiens, цитидин деаминаза (CDA), мРНК. /PROD=cytidine deaminase /FL=gb:L27943.1 gb:NM_001785.1
-3,12836
1,991299
34,77
Повышение
8.63E-04
NM_002770
Homo sapiens, протеаза, серин, 2 (трипсин 2) (PRSS2), мРНК. /PROD=protease, serine, 2 (trypsin 2) /FL=gb:M27602.1 gb:NM_002770.1
-0,98659
4,115782
34,35
Повышение
1.19E-04
M65062
Человеческий связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 5 (IGFBP-5) мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=insulin-like growth factor binding protein 5 /FL=gb:M65062.1 gb:M62782.1 gb:NM_000599.1 gb:AF055033.1
-2.,50194
2,569744
33,63
Повышение
4.84E-03
AJ277914
Homo sapiens, часть гена LHX9 для LIM-гомеобокса 9, 3UTR.
-1,27526
3,792158
33,53
Повышение
1.12E-03
AI688418
плексин A2
-3,34034
1,708137
33,09
Повышение
2.46E-03
AA781795
Гены EST
1,339655
6,36612
32,59
Повышение
7.93E-05
AJ224869
Homo sapiens, CXCR4 ген, кодирующий рецептор CXCR4
-0,6944
4,326307
32,46
Повышение
7.33E-05
R73554
Человеческий связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 5 (IGFBP5), мРНК
-0,67187
4,337831
32,22
Повышение
7.54E-05
AI692659
белок теплового шока 90 кДа 1, альфа
-0,46298
4,533319
31,92
Повышение
3.96E-04
S69738
MCP-1=моноцитарный хемотактический белок (человеческий, клетки эндотелия аорты, мРНК, 661 нуклеотид). /PROD=MCP-1
-2,56712
2,414446
31,59
Повышение
1.67E-03
AI813758
коллаген, тип III, альфа 1 (синдром Элерса-Данлоса, тип IV, аутосомальная доминанта) /FL=gb:NM_000090.1
-0,31684
4,651259
31,3
Повышение
7.83E-04
BF130943
Гены EST
-2,78124
2,184054
31,24
Повышение
8.36E-05
NM_020995
Homo sapiens, связанный с гаптоглобином белок (HPR), мРНК. /PROD=haptoglobin-related protein /FL=gb:NM_020995.1
-1,24179
3,719223
31,15
Повышение
4.92E-04
AL534095
гипотетический белок FLJ23091
-0,35003
4,606618
31,05
Повышение
6.88E-03
NM_001778
Homo sapiens, антиген CD48 (белок мембраны B-клеток) (CD48), мРНК. /PROD=CD48 antigen (B-cell membrane protein) /FL=gb:NM_001778.1 gb:M37766.1 gb:M59904.1
-1,81534
3,141104
31,05
Повышение
5.86E-04
AW590925
Гены EST
-1,93655
3,000448
30,63
Повышение
5.42E-03
NM_013369
Homo sapiens, ДНК (цитозин-5-)-метилтрансфераза 3-подобный белок (DNMT3L), мРНК. /PROD=DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3-like /FL=gb:BC002560.1 gb:NM_013369.1 gb:AF194032.1
1,122063
6,03378
30,1
Повышение
7.33E-05
X58851
Человеческий ген MLC1emb легкой щелочной цепи эмбрионального миозина, промотер и экзон 1
-0,4721
4,436335
30,03
Повышение
7.93E-05
D89377
Homo sapiens, мРНК белка MSX-2, полная кодовая последовательность /PROD=MSX-2 /FL=gb:D89377.1
0,044298
4,952379
30,02
Повышение
6.89E-05
W57613
Гены EST
-0,59928
4,305866
29,96
Повышение
1.03E-03
AF020769
Homo sapiens, сердечный вентрикулярный тропонин C, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cardiac ventricular troponin C /FL=gb:NM_003280.1 gb:AF020769.1
-1,04571
3,857701
29,93
Повышение
4.57E-03
NM_001362
Homo sapiens, деиодиназа, иодотиронин, тип III (DIO3), мРНК. /PROD=thyroxine deiodinase type III /FL=gb:NM_001362.1 gb:S79854.1
-3,24802
1,648226
29,78
Повышение
1.47E-03
AI694325
Гены EST
-2,50665
2,356234
29,1
Повышение
8.64E-03
BE222668
Гены EST
-2,27119
2,568908
28,64
Повышение
2.53E-03
NM_002608
Homo sapiens, бета-полипептид тромбоцитарного фактора роста (гомолог онкогена вируса обезьяней саркомы (v-sis)) (PDGFB), мРНК. /PROD=platelet-derived growth factor beta polypeptide(simian sarcoma viral (v-sis) oncogene homolog) /FL=gb:M12783.1 gb:NM_002
-4,34018
0,485509
28,36
Повышение
7.34E-05
AU144247
Homo sapiens, кДНК FLJ13443 fis, клон PLACE1002853
-1,02297
3,794799
28,2
Повышение
3.36E-03
AF208043
Homo sapiens, белок IFI16b (IFI16b) мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=IFI16b /FL=gb:AF208043.1
-2,79469
2,013598
28,02
Повышение
9.94E-05
AI700341
Гены EST
-2,73255
2,070789
27,92
Повышение
1.35E-03
X89271
H.sapiens, мРНК "сиротского" рецептора HG11. /PROD=HG11 orphan receptor /FL=gb:NM_005161.1
-3,05797
1,724772
27,53
Повышение
3.48E-04
AI801626
Гены EST со средней степенью подобия с ALU4_HUMAN ALU SUBFAMILY SB2 SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-2,83953
1,922194
27,13
Повышение
5.16E-04
BG290193
гипотетический белок FLJ14299 /FL=gb:NM_025069.1
-4,60716
0,149736
27,04
Повышение
1.22E-02
NM_004696
Homo sapiens, переносчик растворенных веществ семейства 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 4 (SLC16A4), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 4 /FL=gb:U59185.1 gb:NM_004696.1
-1,57919
3,174205
26,97
Повышение
5.94E-04
AL524520
связанный с G-белком рецептор 49
-1,36626
3,37132
26,68
Повышение
2.16E-03
AI824037
Гены EST с низкой степенью подобия с FCE2, МЫШИНЫМ НИЗКОАФФИННЫМ РЕЦЕПТОРОМ ДЛЯ ИММУНОГЛОБУЛИНА ЭПСИЛОН (M.musculus)
0,167058
4,895371
26,51
Повышение
6.90E-05
NM_021223
Homo sapiens, легкая цепь 2a миозина (LOC58498), мРНК. /PROD=myosin light chain 2a /FL=gb:NM_021223.1
-1,4009
3,316905
26,31
Повышение
6.35E-04
BC029835
Homo sapiens, клон IMAGE:5169759, мРНК.
-2,16518
2,549789
26,26
Повышение
1.77E-03
AI521166
Гены EST, со средней степенью подобия с MTR5_HUMAN, СВЯЗАННЫМ С МИОТУБУЛАРИНОМ БЕЛКОМ 5 (H.sapiens)
-3,32235
1,375121
25,95
Повышение
2.00E-04
BC039433
Homo sapiens, клон IMAGE:5303550, мРНК.
-5,7338
-1,05152
25,67
Повышение
8.80E-03
NM_020130
Homo sapiens, хромосома 8, открытая рамка считывания 4 (C8ORF4), мРНК. /PROD=chromosome 8 open reading frame 4 /FL=gb:NM_020130.1 gb:AF268037.1
1,214325
5,878585
25,36
Повышение
7.93E-05
M36172
Человеческая щелочная легкая цепь эмбрионального миозина (MLC1), мРНК, полная кодовая последовательность /FL=gb:M36172.1 gb:M24121.1 gb:NM_002476.1
-2,20104
2,461597
25,33
Повышение
4.67E-03
NM_000939
Homo sapiens, проопиомеланокортин (адренокортикотропин бета-липотропин альфа-меланоцит-стимулирующий гормон бета-меланоцит-стимулирующий гормон бета-эндорфин) (POMC), мРНК. /PROD=proopiomelanocortin (adrenocorticotropinbeta-lipotropin alpha-melanocyt
-0,2674
4,336009
24,31
Повышение
9.18E-05
N48299
Гены EST со средней степенью подобия с NFY-C (H.sapiens)
1,367677
5,968973
24,27
Повышение
1.00E-04
AF116676
Homo sapiens, PRO1957, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=PRO1957 /FL=gb:AF116676.1
-0,62697
3,974228
24,27
Повышение
4.69E-04
NM_005531
Homo sapiens, индуцируемый интерфероном-гамма белок 16 (IFI16), мРНК. /PROD=interferon, gamma-inducible protein 16 /FL=gb:M63838.1 gb:NM_005531.1
-3,90861
0,686447
24,17
Повышение
3.72E-03
BC022531
Homo sapiens, олфактомедин 3, клон MGC:26675 IMAGE:4812035, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=olfactomedin 3 /FL=gb:AF397394.1 gb:BC022531.1
-2,75089
1,840723
24,11
Повышение
2.60E-04
AL365343
Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 32539.
-0,6097
3,975428
24
Повышение
1.05E-04
L12468
Homo sapiens, аминопептидаза A, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=aminopeptidase A /FL=gb:L12468.1 gb:NM_001977.1 gb:L14721.1
-3,18285
1,397334
23,92
Повышение
3.32E-04
BC041441
Homo sapiens, клон IMAGE:5167131, мРНК.
-1,92796
2,645248
23,81
Повышение
1.20E-02
BE551416
Гены EST с низкой степенью подобия с белком KIAA1330 (H.sapiens)
-4,05111
0,51291
23,65
Повышение
1,05E-03
J03580
Человеческий паратиреоидподобный белок (связанный со злокачественной гуморальной гиперкальцемией), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:J03580.1
-2,79378
1,767388
23,61
Повышение
3.68E-02
AW291402
Гены EST
-2,80173
1,752943
23,5
Повышение
7.26E-03
AW088232
Гены EST
0,422022
4,975085
23,48
Повышение
1.38E-04
D49958
Homo sapiens, мРНК для мембранного гликопротеина M6, полная кодовая последовательность. /PROD=membrane glycoprotein M6 /FL=gb:D49958.1
-1,20314
3,343061
23,36
Повышение
3.63E-04
M60721
Человеческий гомеобоксовый ген, полная кодовая последовательность /FL=gb:M60721.1 gb:NM_021958.1
1,932439
6,477785
23,35
Повышение
7.33E-05
H92988
белок активации тирозин 3-монооксигеназы/триптофан 5-монооксигеназы, полипептид-эта
-3,00328
1,524799
23,07
Повышение
8.50E-03
AI571798
Ингибитор диссоциации Rho GDP (GDI) альфа
0,526605
5,052252
23,03
Повышение
7.01E-05
N71923
Homo sapiens, фибронектиновый богатый лейцином трансмембранный белок 3 /FL=gb:AF169677.1 gb:NM_013281.1
-1,26047
3,239318
22,62
Повышение
5.12E-03
NM_007250
Homo sapiens, Kruppel-подобный фактор 8 (KLF8), мРНК. /PROD=Kruppel-like factor 8 /FL=gb:U28282.1 gb:NM_007250.1
-1,93118
2,556654
22,44
Повышение
2.34E-04
L33477
Человеческий (клон 8B1) Br-кадгерин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Br-cadherin /FL=gb:L34057.1 gb:L33477.1 gb:NM_004061.1
0,005876
4,456564
21,87
Повышение
6.89E-05
AK023621
Homo sapiens, кДНК FLJ13559 fis, клон PLACE1007852, с высокой степенью подобия с Homo sapiens мРНК для белка KIAA0878.
-1,94
2,509492
21,85
Повышение
4.29E-03
NM_016569
Homo sapiens, изо-белок TBX3 (TBX3-iso), мРНК. /PROD=TBX3-iso protein /FL=gb:NM_016569.1 gb:AF216750.1
-3,44347
1,001698
21,78
Повышение
1.61E-02
AF187858
Homo sapiens, ангиопоэтин-2 изоформа-1 мРНК, полная кодовая последовательность, продукт альтернативного сплайсинга. /PROD=angiopoietin-2 isoform-1 /FL=gb:AF187858.1
0,586923
5,027737
21,72
Повышение
6.55E-05
NM_000047
Homo sapiens, арилсульфатаза E (chondrodysplasia punctata 1) (ARSE), мРНК. /PROD=arylsulfatase E precursor /FL=gb:X83573.1 gb:NM_000047.1
1,422626
5,860875
21,68
Повышение
5.95E-05
NM_006365
Homo sapiens, активатор транскрипции промотера c-fos (CROC4), мРНК. /PROD=transcriptional activator of the c-fos promoter /FL=gb:NM_006365.1 gb:U49857.1
-4,18575
0,241573
21,52
Повышение
7.54E-03
NM_001736
Homo sapiens, компонента комплемента 5 рецептор 1 (лиганд C5a) (C5R1), мРНК. /PROD=complement component 5 receptor 1 (C5a ligand) /FL=gb:M62505.1 gb:NM_001736.1
2,301255
6,712959
21,28
Повышение
7.68E-05
BC020935
Homo sapiens, белок, подобный отоконину 90, клон IMAGE:4277593, мРНК.
-3,61192
0,788317
21,12
Повышение
1.71E-03
R37101
Гены EST
-0,62474
3,768383
21,01
Повышение
6.55E-05
NM_000313
Homo sapiens, белок S (альфа) (PROS1), мРНК. /PROD=protein S (alpha) /FL=gb:M15036.1 gb:NM_000313.1
-0,62725
3,760374
20,93
Повышение
1.52E-04
BC017942
Homo sapiens, белок, подобный отоконину 90, клон IMAGE:4285317, мРНК.
-1,52261
2,858274
20,83
Повышение
2.98E-03
NM_002614
Homo sapiens, содержащий PDZ-домен белок 1 (PDZK1), мРНК. /PROD=PDZ domain containing 1 /FL=gb:NM_002614.1 gb:AF012281.1
-1,11347
3,25087
20,6
Повышение
4.26E-03
N69091
Гены EST
-0,11332
4,231933
20,33
Повышение
1.05E-04
NM_003670
Homo sapiens, белок, содержащий основной домен спираль-петля-спираль, класс B, 2 (BHLHB2), мРНК. /PROD=differentiated embryo chondrocyte expressed gene1 /FL=gb:AB004066.1 gb:NM_003670.1
-1,69238
2,643704
20,2
Повышение
3.73E-03
W05495
Гены EST
-2,18113
2,138504
19,97
Повышение
1.23E-02
NM_004041
Homo sapiens, аррестин бета 1 (ARRB1), вариант транскрипта 1, мРНК. /PROD=arrestin beta 1, isoform A /FL=gb:BC003636.1 gb:AF084040.1 gb:NM_004041.2
1,306329
5,625069
19,96
Повышение
6.90E-05
NM_001200
Homo sapiens, костный морфогенетический белок 2 (BMP2), мРНК. /PROD=bone morphogenetic protein 2 precursor /FL=gb:NM_001200.1
-1,23777
3,066156
19,75
Повышение
6.27E-04
AI917371
Гены EST
-0,00098
4,266076
19,25
Повышение
9.82E-05
NM_013281
Homo sapiens, фибронектиновый богатый лейцином трансмембранный белок 3 (FLRT3), мРНК. /PROD=fibronectin leucine rich transmembrane protein3 /FL=gb:AF169677.1 gb:NM_013281.1
-2,0132
2,250432
19,21
Повышение
1.37E-02
BE328496
гипотетический белок PRO2032 /FL=gb:AF116683.1 gb:NM_018615.1
1,758844
6,008618
19,02
Повышение
6.55E-05
N21138
белок KIAA0878 /FL=gb:NM_014899.1 gb:AB020685.1
0,095309
4,341668
18,98
Повышение
8.55E-04
AA524250
отсутствующий при раке печени белок 1
-0,96212
3,265791
18,74
Повышение
2,04E-04
AY113699
Homo sapiens, стабилизирующий пресенилин фактор b (PSF) мРНК, полная кодовая последовательность; продукт альтернативного сплайсинга. /PROD=presenilin stabilization factor b /FL=gb:AY113699.1
0,502339
4,722511
18,64
Повышение
1.04E-04
AI676059
Гены EST
-1,74369
2,474001
18,61
Повышение
7.33E-05
NM_001882
Homo sapiens, белок, связывающий кортиколиберин (CRHBP), мРНК. /PROD=corticotropin releasing hormone-binding protein /FL=gb:NM_001882.2
0,70975
4,924051
18,56
Повышение
1.64E-04
BF939489
гликопротеин M6A /FL=gb:D49958.1
-2,40752
1,7892
18,34
Повышение
4.46E-03
AI738662
гомеобокс HB9 /FL=gb:NM_005515.1
-1,34609
2,844235
18,26
Повышение
7.33E-05
NM_018388
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ11316 (FLJ11316), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ11316 /FL=gb:NM_018388.1
-0,74044
3,448679
18,24
Повышение
7.33E-05
N63706
Гены EST
-1,55229
2,611591
17,92
Повышение
4.34E-04
AU158444
Homo sapiens, кДНК FLJ14216 fis, клон NT2RP3003672, слабая степень подобия с ПРЕДШЕСТВЕННИКОМ ГЛИКОПРОТЕИНА Е2 ПОВЕРХНОСТИ Т-КЛЕТОК
0,082922
4,230149
17,72
Повышение
1.63E-04
AI632223
гипотетический белок DKFZp434F2322
-1,66293
2,482886
17,7
Повышение
1.56E-02
NM_000817
Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD67, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD67 /FL=gb:NM_000817.1 gb:M81883.1 gb:L16888.1
-1,82505
2,319685
17,69
Повышение
7.89E-03
T16257
сопряженный с G-белком рецептор 37 (белок, подобный эндотелиновому рецептору типа B) /FL=gb:NM_005302.1 gb:AF017262.1
-3,11387
1,027176
17,64
Повышение
9.68E-03
U70370
Человеческий, экспрессируемый в задних конечностях гомеобоксовый белок backfoot (Bft), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=hindlimb expressed homeobox protein backfoot /FL=gb:U70370.1 gb:BC003685.1
-0,98938
3,143558
17,54
Повышение
6.04E-03
AF190725
Homo sapiens, фермент, расщепляющий APP по бета-участку (BACE), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=beta-site APP cleaving enzyme /FL=gb:AF200343.1 gb:AF204943.1 gb:AF190725.1 gb:AF201468.1 gb:NM_012104.1
-0,74839
3,363245
17,29
Повышение
5.33E-03
M17955
Человеческий белок MHC класса II HLA-DQ-бета, мРНК, полная кодовая последовательность /FL=gb:M33907.1 gb:M17955.1 gb:M16996.1 gb:M17563.1 gb:M20432.1 gb:M26042.1
2,851479
6,958929
17,24
Повышение
5.95E-05
AI950472
Гены EST
-2,85963
1,242896
17,18
Повышение
7.55E-03
BC005961
Homo sapiens, паратгормон-подобный гормон, клон MGC:14611, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=parathyroid hormone-like hormone /FL=gb:BC005961.1
-1,18027
2,905057
16,97
Повышение
1.03E-02
AI123555
Гены EST
-1,53522
2,547506
16,94
Повышение
2.58E-03
NM_006456
Homo sapiens, сиалилтрансфераза (STHM), мРНК. /PROD=sialyltransferase /FL=gb:U14550.1 gb:NM_006456.1
1,620279
5,700292
16,91
Повышение
1,08E-04
AI583173
главный комплекс гистосовместимости, класс II, DQ бета 1
1,446234
5,516116
16,79
Повышение
6.55E-05
AF348491
Homo sapiens, хемокиновый рецептор CXCR4, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=chemokine receptor CXCR4 /FL=gb:AF348491.1
0,880085
4,948285
16,77
Повышение
6.90E-05
NM_006096
Homo sapiens, белок с нисходящей регуляцией белком N-myc (NDRG1), мРНК. /PROD=N-myc downstream regulated /FL=gb:AF004162.1 gb:BC003175.1 gb:D87953.1 gb:NM_006096.1
-1,11823
2,945099
16,72
Повышение
1.28E-02
NM_002100
Homo sapiens, гликофорин B (включает белок группы крови Ss) (GYPB), мРНК. /PROD=glycophorin B precursor /FL=gb:J02982.1 gb:NM_002100.2
-1,68075
2,377232
16,66
Повышение
4.35E-03
NM_012431
Homo sapiens, содержащий sema-домен, иммуноглобулиновый домен (Ig), короткий основной домен секретируемый белок (семафорин) 3E (SEMA3E), мРНК. /PROD=sema domain, immunoglobulin domain (Ig), shortbasic domain, secreted, (semaphorin) 3E /FL=gb:NM_012431.1 gb:AB002329.1
0,70158
4,759011
16,65
Повышение
1,07E-04
U46768
Человеческий станниокальцин, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=stanniocalcin /FL=gb:U25997.1 gb:NM_003155.1 gb:U46768.1
2,429693
6,487025
16,65
Повышение
6.89E-05
AA284532
белок активации тирозин 3-монооксигеназы/триптофан 5-монооксигеназы, полипептид-эта
1,964573
6,018949
16,61
Повышение
1.18E-04
NM_030781
Homo sapiens, скавенджер-рецептор с лектином типа C (SRCL), мРНК. /PROD=scavenger receptor with C-type lectin /FL=gb:NM_030781.1
0,399566
4,451136
16,58
Повышение
1.57E-04
AF144103
Homo sapiens, белок NJAC (NJAC), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NJAC protein /FL=gb:AF144103.1 gb:AF106911.1 gb:AF073957.1 gb:BC003513.1 gb:NM_004887.1
4,590104
-3,21322
223,38
Снижение
7.77E-05
AA167449
ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
1,940449
-5,370717
158,81
Снижение
8.36E-05
BE644917
ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
3,29779
-3,911445
147,98
Снижение
2.38E-05
U17496
Человеческая протеасомная субъединица LMP7 (аллель LMP7B), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=proteasome subunit LMP7 /FL=gb:U17497.1 gb:U17496.1
4,124115
-2,85548
126,2
Снижение
2.99E-03
AW262311
Гены EST
3,702164
-2,970402
102,01
Снижение
2.53E-03
U26662
Человеческий нейрональный пентраксин II (NPTX2) мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=neuronal pentraxin II
1,785431
-4,509786
78,53
Снижение
1.45E-03
R15072
Гены EST
5,545158
-0,710745
76,42
Снижение
7.01E-05
BF057809
Гены EST
1,946332
-3,865792
56,19
Снижение
7.43E-04
BG166705
малый индуцибельный цитокин, подсемейство B (Cys-X-Cys), член 5 (нейтрофил-активирующий пептид 78 эпителиального происхождения)
1,717184
-3,902593
49,17
Снижение
1.30E-04
AF237813
Homo sapiens, NPD009, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=NPD009 /FL=gb:NM_020686.1 gb:AF237813.1
3,179908
-2,381796
47,23
Снижение
9.96E-04
U82811
Человеческий гомеодомен-содержащий белок (HANF), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=HANF /FL=gb:U82811.1 gb:NM_003865.1
2,359289
-3,177031
46,41
Снижение
1.72E-04
NM_006334
Homo sapiens, белок нейробластомы (нервная ткань) (AMY), мРНК. /PROD=neuroblastoma (nerve tissue) protein /FL=gb:NM_006334.1 gb:D82343.1
4,276201
-1,247561
46,01
Снижение
7.33E-05
AV699347
ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
2,435058
-2,963261
42,18
Снижение
1.36E-04
BF056204
Homo sapiens, клон IMAGE:3603836, мРНК, частичная кодовая последовательность
2,348373
-2,98029
40,19
Снижение
7.34E-05
NM_016354
Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 21 (переносчик органических анионов), член 12 (SLC21A12), мРНК. /PROD=organic anion transporter OATP-E /FL=gb:AB031051.1 gb:NM_016354.1 gb:AF205072.1 gb:AF187817.1
4,315048
-0,819678
35,13
Снижение
3.33E-03
NM_016139
Homo sapiens, белок 16,7 кДа (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
2,348717
-2,72835
33,76
Снижение
9.42E-04
NM_001877
Homo sapiens, рецептор 2 компонента комплемента (3d вируса Эпштейна-Барр) (CR2), мРНК. /PROD=complement component (3dEpstein Barr virus)receptor 2 /FL=gb:NM_001877.1 gb:M26004.1
3,342331
-1,710595
33,2
Снижение
6.55E-05
AA876372
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp667D095 (из клона DKFZp667D095)
1,995324
-3,045119
32,91
Снижение
4.60E-03
NM_014862
Homo sapiens, продукт гена KIAA0307 (KIAA0307), мРНК. /PROD=KIAA0307 gene product /FL=gb:AB002305.1 gb:NM_014862.1
2,890305
-2,133881
32,54
Снижение
1.71E-03
NM_015474
Homo sapiens, белок DKFZP564A032 (DKFZP564A032), мРНК. /PROD=DKFZP564A032 protein /FL=gb:AF228421.1 gb:AL050267.1 gb:AB013847.1 gb:NM_015474.1
2,443445
-2,518495
31,17
Снижение
7.43E-03
NM_152332
Homo sapiens, хромосома 14, открытая рамка считывания 47 (C14orf47), мРНК. /FL=gb:NM_152332.1
3,692792
-1,250743
30,77
Снижение
8.80E-04
N21096
Гены EST
2,266312
-2,653405
30,27
Снижение
7.22E-03
NM_003026
Homo sapiens, GRB2-подобный белок 2 с SH3-доменом (SH3GL2), мРНК. /PROD=SH3-domain GRB2-like 2 /FL=gb:AF036268.1 gb:NM_003026.1
2,453774
-2,402069
28,96
Снижение
7.93E-05
NM_007191
Homo sapiens, ингибирующий Wnt фактор-1 (WIF-1), мРНК. /PROD=Wnt inhibitory factor-1 /FL=gb:AF122922.1 gb:NM_007191.1
2,325274
-2,512615
28,6
Снижение
3.19E-05
AW193693
белок DKFZP566K1924
1,982765
-2,836916
28,24
Снижение
1.21E-04
BE672659
Гены EST
0,997895
-3,793735
27,7
Снижение
3.97E-03
AW025928
Гены EST, с низкой степенью подобия с I38588, гомологом обратной транскриптазы (H.sapiens)
4,756657
0,005012
26,94
Снижение
6.55E-05
AV715309
Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
4,803291
0,085342
26,32
Снижение
7.34E-05
AA628440
ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
1,124153
-3,582082
26,1
Снижение
5.42E-03
W52934
Гены EST, с низкой степенью подобия с серин-треонинкиназой (C.elegans)
0,874376
-3,810554
25,72
Снижение
2.24E-02
U82671
Homo sapiens, из хромосомы Xq28 семейство меланомных антигенов A2a (MAGEA2A), семейство меланомных антигенов A12 (MAGEA12), семейство меланомных антигенов A2b (MAGEA2B), семейство меланомных антигенов A3 (MAGEA3), кальтрактин (CALT), NAD(P)H дегидрогеназа-подобный белок (NSDHL), ...
0,621075
-4,029928
25,12
Снижение
5.18E-03
BC028721
Homo sapiens, белок, сходный с переносчиком растворенных веществ, семейство 1 (высокоаффинный аспартатно-глутаматный переносчик), член 6, клон MGC:33092 IMAGE:5269300, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Similar to solute carrier family 1 (highaffinity aspartateglutamate transporter), memb
1,49883
-3,130556
24,75
Снижение
7.87E-04
BF057784
Гены EST
2,074855
-2,552806
24,72
Снижение
1.87E-03
AI420156
Гены EST
3,2597
-1,357805
24,55
Снижение
1,05E-03
NM_017671
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ20116 (FLJ20116), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ20116 /FL=gb:NM_017671.1
-0,10303
-4,717227
24,49
Снижение
7.33E-05
NM_022168
Homo sapiens, связанный с дифференцировкой меланомы белок-5 (MDA5), мРНК. /PROD=melanoma differentiation associated protein-5 /FL=gb:AY017378.1 gb:NM_022168.1 gb:AF095844.1
2,688175
-1,908993
24,2
Снижение
2.73E-04
NM_014178
Homo sapiens, белок HSPC156 (HSPC156), мРНК. /PROD=HSPC156 protein /FL=gb:NM_014178.1 gb:AF161505.1
1,24677
-3,309288
23,52
Снижение
2.54E-02
BC028359
Homo sapiens, клон IMAGE:4828836, мРНК.
0,686587
-3,862863
23,42
Снижение
1.28E-03
NM_000439
Homo sapiens, пропротеинконвертаза субтилизинкексинового типа 1 (PCSK1), мРНК. /PROD=proprotein convertase subtilisinkexin type 1 /FL=gb:NM_000439.2 gb:M90753.1
5,363884
0,82261
23,28
Снижение
7.68E-05
NM_007015
Homo sapiens, предшественник хондромодулина I (CHM-I), мРНК. /PROD=chondromodulin I precursor /FL=gb:NM_007015.1 gb:AB006000.1
3,962328
-0,577927
23,27
Снижение
6.90E-05
AL533416
аксонный транспорт синаптическизх везикул
2,086969
-2,410461
22,59
Снижение
9.65E-03
AL359055
Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 2344436.
0,536704
-3,939442
22,26
Снижение
4.78E-03
AL049250
Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp564D113 (из клона DKFZp564D113).
4,260791
-0,214844
22,25
Снижение
6.89E-05
AA603344
Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
0,121165
-4,34837
22,15
Снижение
1.36E-04
AI985987
Гены EST со средней степенью подобия с ALU1_HUMAN SUBFAMILY ALU J SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
0,437404
-4,019211
21,96
Снижение
2.48E-02
H05254
Гены EST
2,263194
-2,16575
21,54
Снижение
7.34E-04
AF052108
Homo sapiens, клон 23687, последовательность мРНК.
4,055226
-0,3701
21,49
Снижение
1.16E-04
NM_001307
Homo sapiens, клаудин 7 (CLDN7), мРНК. /PROD=claudin 7 /FL=gb:BC001055.1 gb:NM_001307.1
5,440506
1,023282
21,37
Снижение
1.02E-04
M34455
Человеческая индуцируемая интерфероном-гамма индоламин-2,3-диоксигеназа (IDO), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:NM_002164.1 gb:M34455.1
2,169025
-2,207268
20,77
Снижение
3.41E-03
NM_022467
Homo sapiens, N-ацетилгалактозамин-4-O-сульфотрансфераза (GALNAC-4-ST1), мРНК. /PROD=N-acetylgalactosamine-4-O-sulfotransferase /FL=gb:NM_022467.1 gb:AF300612.1
0,252976
-4,116368
20,67
Снижение
3.36E-03
NM_018043
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10261 (FLJ10261), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10261 /FL=gb:NM_018043.1
1,353776
-3,010836
20,6
Снижение
2.85E-02
AF147427
Homo sapiens, полноразмерная вставка кДНК клон YP80A10.
2,437935
-1,918781
20,49
Снижение
1.70E-03
BE672557
Гены EST
2,46341
-1,870689
20,17
Снижение
4.16E-04
NM_003182
Homo sapiens, тахикинин, предшественник 1 (субстанция K, субстанция P, нейрокинин 1, нейрокинин 2, нейромедин L, нейрокинин альфа, нейропептид K, нейропептид гамма) (TAC1), вариант транскрипта бета, мРНК. /PROD=tachykinin 2 precursor, isoform beta /FL=gb:U3
2,294336
-2,028037
20,01
Снижение
7.10E-03
U11058
Homo sapiens, альфа-субъединица высокопроводящего кальциевого и потенциалзависимого калиевого канала (MaxiK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=large conductance calcium- and voltage-dependentpotassium channel alpha subunit /FL=gb:U23767.1 gb:NM_002247.1 gb:AF025999
4,534853
0,221559
19,88
Снижение
7.68E-05
R38389
ольфактомедин-связанный белок, локализованный в ЭР
3,142124
-1,136699
19,41
Снижение
1.73E-02
AL832535
Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp547J1816 (из клона DKFZp547J1816).
3,85985
-0,410223
19,29
Снижение
7.34E-05
R40892
Гены EST
4,557488
0,304559
19,07
Снижение
1,43E-04
AK026546
Homo sapiens кДНК: FLJ22893 fis, клон KAT04792.
5,966394
1,719122
18,99
Снижение
1.99E-04
AL117612
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp564B1264 (из клона DKFZp564B1264).
1,212373
-3,013161
18,71
Снижение
5.22E-04
AI564075
Гены EST
2,27629
-1,932316
18,49
Снижение
1.09E-04
BC044830
Homo sapiens, белок, сходный с RIKEN кДНК ген 1700011F14, клон MGC:35062 IMAGE:5166167, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Similar to RIKEN cDNA 1700011F14 gene /FL=gb:BC044830.1
3,18092
-1,007603
18,23
Снижение
1.29E-03
AJ011712
Homo sapiens, ген TNNT1, экзоны 1-11 (и граничащая с ним кодовая последовательность)
2,598916
-1,553059
17,78
Снижение
2.46E-03
AW051591
Гены EST со средней степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
2,003902
-2,139208
17,67
Снижение
4.71E-03
BF109660
Гены EST
1,905278
-2,229324
17,56
Снижение
5.05E-04
NM_018964
Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 37 (переносчик глицерин-3-фосфата), член 1 (SLC37A1), мРНК. /PROD=solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphatetransporter), member 1 /FL=gb:NM_018964.1
0,330556
-3,792993
17,43
Снижение
3.26E-04
BE972639
Гены EST
1,044277
-3,067425
17,29
Снижение
1.23E-02
AL529104
Гены EST
0,733534
-3,349221
16,94
Снижение
4.39E-03
BF061389
Гены EST с низкой степенью подобия с JC1405 6-пирувоилтетрагидроптерин синтазой (H.sapiens)
2,684281
-1,394654
16,9
Снижение
2.91E-04
BF449063
коллаген, тип XIV, альфа 1 (ундулин)
4,572354
0,512428
16,68
Снижение
5.89E-04
BF437747
Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
2,313549
-1,734907
16,55
Снижение
6.84E-03
AV726956
Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
0,679665
-3,355919
16,4
Снижение
1.43E-03
BC000568
Homo sapiens, клон MGC:3040, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:3040) /FL=gb:BC000568.1
4,099873
0,092088
16,09
Снижение
6.90E-05
AI057619
Гены EST с высокой степенью подобия с T42654, гипотетическим белком DKFZp434G1115.1 (H.sapiens)
1,459269
-2,519
15,76
Снижение
6.26E-03
NM_000277
Homo sapiens, фенилаланин-гидроксилаза (PAH), мРНК. /PROD=phenylalanine hydroxylase /FL=gb:U49897.1 gb:NM_000277.1
2,220936
-1,733714
15,5
Снижение
1.34E-04
AF237813
Homo sapiens, NPD009, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=NPD009 /FL=gb:NM_020686.1 gb:AF237813.1
2,81177
-1,140906
15,48
Снижение
6.89E-05
NM_002593
Homo sapiens, белок-энхансер проколлаген C-эндопептидазы (PCOLCE), мРНК. /PROD=procollagen C-endopeptidase enhancer /FL=gb:BC000574.1 gb:NM_002593.2 gb:AB008549.1 gb:L33799.1
1,529971
-2,399749
15,24
Снижение
2.29E-02
NM_024789
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ22529 (FLJ22529), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ22529 /FL=gb:NM_024789.1
0,255558
-3,655262
15,04
Снижение
4.26E-03
BC039509
Homo sapiens, клон IMAGE:5578073, мРНК.
0,970967
-2,921559
14,85
Снижение
4.46E-03
AI144156
Гены EST
2,38092
-1,504443
14,78
Снижение
4,36E-04
AF053712
Homo sapiens, лиганд остеопротегерина, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=osteoprotegerin ligand /FL=gb:AF053712.1 gb:AF019047.1
3,779853
-0,095194
14,67
Снижение
3.22E-04
AV646597
Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
1,651332
-2,189895
14,33
Снижение
3.45E-03
NM_007181
Homo sapiens, митоген-активированной протеинкиназы киназы киназы киназа 1 (MAP4K1), мРНК. /PROD=mitogen-activated protein kinase kinase kinasekinase 1 /FL=gb:U66464.1 gb:NM_007181.1
3,786136
-0,030985
14,1
Снижение
1.49E-04
BF057731
Гены EST
3,257726
-0,553697
14,04
Снижение
4.48E-04
NM_004335
Homo sapiens, антиген 2 клеток стромы костного мозга /FL=gb:NM_004335.2 gb:D28137.1
-0,33527
-4,146199
14,03
Снижение
4.21E-03
BE968806
Гены EST с низкой степенью подобия с ALU4_HUMAN ALU SUBFAMILY SB2 SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
0,349102
-3,450633
13,93
Снижение
1.30E-02
BM682352
Homo sapiens, кДНК FLJ37204 fis, клон BRALZ2006976.
2,172559
-1,624126
13,9
Снижение
2.32E-03
BE673445
Homo sapiens, хромосома 19, космида R28379
0,381933
-3,390833
13,67
Снижение
1.84E-02
AI913749
Гены EST
1,120467
-2,648498
13,63
Снижение
1.85E-03
BE672607
Гены EST
1,924097
-1,801676
13,23
Снижение
8.92E-03
AW242920
Гены EST
1,491527
-2,224633
13,14
Снижение
7.01E-05
BG258131
Гены EST
2,060687
-1,652733
13,12
Снижение
5.63E-03
AI269290
переносчик растворенных веществ, семейство 18 (везикулярный моноамин), член 2 /FL=gb:L14269.1 gb:L23205.1 gb:L09118.1 gb:NM_003054.1
2,886142
-0,811762
12,98
Снижение
4.93E-04
U83115
Человеческий белок, подобный не связанному с хрусталиком бета-гамма-кристаллину (AIM1) мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=non-lens beta gamma-crystallin like protein
0,626797
-3,063928
12,91
Снижение
4.51E-02
AF393369
Homo sapiens, сигма1C-адаптин (AP1S3), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=sigma 1C adaptin /FL=gb:AF393369.1
1,575227
-2,112834
12,89
Снижение
1.85E-03
BE856544
гипотетический белок FLJ22573
0,4785
-3,197824
12,78
Снижение
1.72E-04
BG532690
интегрин, альфа 4 (антиген CD49D, субъединица альфа 4 рецептора VLA-4)
1,707178
-1,969084
12,78
Снижение
1.84E-02
AF043179
Homo sapiens, бета-цепь Т-клеточного рецептора (TCRBV13S1-TCRBJ2S1), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=T cell receptor beta chain /FL=gb:AF043179.1
0,47298
-3,177323
12,56
Снижение
8.00E-03
AF311324
Homo sapiens, убиквитин-подобный химерный белок, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=ubiquitin-like fusion protein /FL=gb:AF311324.1
2,641731
-0,985721
12,36
Снижение
1.49E-04
AL133653
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434M2415 (из клона DKFZp434M2415).
2,913327
-0,707745
12,3
Снижение
3.70E-03
NM_012419
Homo sapiens, регулятор G-белковой сигнализации 17 (RGS17), мРНК. /PROD=regulator of G-protein signalling 17 /FL=gb:AF202257.2 gb:NM_012419.2
2,127724
-1,49095
12,28
Снижение
1.49E-03
NM_001275
Homo sapiens, хромогранин A (секреторный белок 1 паращитовидной железы) (CHGA), мРНК. /PROD=chromogranin A /FL=gb:BC001059.1 gb:NM_001275.2 gb:J03915.1 gb:J03483.1
0,80034
-2,81487
12,25
Снижение
4.62E-03
AW003107
Гены EST
2,11511
-1,494168
12,2
Снижение
1.27E-03
NM_000593
Homo sapiens, ATP-связывающая кассета, подсемейство B (MDRTAP), член 2 (ABCB2), мРНК. /PROD=ATP-binding cassette, sub-family B, member 2 /FL=gb:NM_000593.2 gb:L21205.1 gb:L21206.1 gb:L21207.1 gb:L21204.1 gb:L21208.1
3,690675
0,086414
12,16
Снижение
1.85E-03
AW274018
Гены EST
1,283746
-2,317044
12,13
Снижение
4.10E-03
NM_014031
Homo sapiens, VLCS-H1, белок-гомолог 1 очень длинной цепи ацил-КоА, мРНК. /PROD=very long-chain acyl-CoA synthetase homolog 1 /FL=gb:AF064254.1 gb:NM_014031.1
0,467003
-3,132847
12,12
Снижение
4.39E-02
AL117530
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434B172 (из клона DKFZp434B172); частичная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein
2,6402
-0,955567
12,09
Снижение
3.80E-02
NM_013267
Homo sapiens, глутаминаза клеток молочной железы (GA), мРНК. /PROD=breast cell glutaminase /FL=gb:AF110331.1 gb:AF110330.1 gb:AF223944.1 gb:NM_013267.1
1,858597
-1,724557
11,98
Снижение
5.91E-04
AA757457
Гены EST
0,945333
-2,635993
11,97
Снижение
2.41E-03
BC040959
Homo sapiens, клон IMAGE:5242616, мРНК.
3,795925
0,223304
11,9
Снижение
1.71E-03
NM_004688
Homo sapiens, белок, взаимодействующий с N-myc (и STAT) (NMI), мРНК. /PROD=N-myc and STAT interactor /FL=gb:BC001268.1 gb:NM_004688.1 gb:U32849.1
2,074972
-1,490898
11,84
Снижение
2.94E-03
NM_017933
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ20701 (FLJ20701), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ20701 /FL=gb:NM_017933.1
-0,42571
-3,975429
11,71
Снижение
1,54E-03
AK023699
Homo sapiens, кДНК FLJ13637 fis, клон PLACE1011165.
3,742964
0,195658
11,69
Снижение
1.19E-04
T62571
связанный с микротрубочками белок 7 /FL=gb:NM_003980.1
1,621518
-1,924672
11,68
Снижение
2.63E-02
NM_003725
Homo sapiens, окислительная 3 альфа гидроксистероид дегидрогеназа; ретинолдегидрогеназа; 3-гидроксистероидэпимераза (RODH), мРНК. /PROD=oxidative 3 alpha hydroxysteroid dehydrogenase;retinol dehydrogenase; 3-hydroxysteroid epimerase /FL=gb:AF016509.1 gb:A
6,076777
2,566425
11,4
Снижение
6.90E-05
AF229180
Homo sapiens, альфа-аминоадипат полуальдегидсинтаза, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=alpha-aminoadipate semialdehyde synthase /FL=gb:AF229180.1
3,758058
0,25238
11,36
Снижение
1.89E-04
NM_005356
Homo sapiens, лимфоцит-специфическая белковая тирозинкиназа (LCK), мРНК. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
3,797019
0,297284
11,31
Снижение
2.69E-04
AI871745
Гены EST
2,469508
-1,020673
11,24
Снижение
9.14E-04
W63754
Homo sapiens, мРНК гикозилтрансферазы (ORF1)
1,048359
-2,438018
11,21
Снижение
1.39E-02
AA464273
Гены EST
3,146674
-0,339455
11,21
Снижение
1.26E-04
BF435773
белок, связывающий SH3-домен кортактина
1,627801
-1,848139
11,13
Снижение
3.70E-03
L39833
Homo sapiens (клон hKvBeta3), субъединица K+ канала-бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=K+ channel beta-subunit /FL=gb:U16953.1 gb:L39833.1
1,594689
-1,879508
11,11
Снижение
4.03E-02
AJ236915
Homo sapiens, мРНК белка pak5. /PROD=pak5 protein /FL=gb:NM_020168.1 gb:AF276893.1
2,806504
-0,6571
11,03
Снижение
1.21E-04
NM_003645
Homo sapiens, лигаза жирных кислот-коэнзима А, очень длинная цепь 1 (FACVL1), мРНК. /PROD=very long-chain fatty-acid-Coenzyme A ligase 1 /FL=gb:AF096290.1 gb:D88308.1 gb:NM_003645.1
3,826815
0,364324
11,02
Снижение
6.55E-05
BG401568
Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp434H1235 (из клона DKFZp434H1235); частичная кодовая последовательность
2,99034
-0,471936
11,02
Снижение
7.16E-04
NM_002993
Homo sapiens, малый индуцибельный цитокин, подсемейство B (Cys-X-Cys), член 6 (гранулоцитарный хемотактический белок 2) (SCYB6), мРНК. /PROD=small inducible cytokine subfamily B(Cys-X-Cys), member 6 (granulocyte chemotactic protein 2) /FL=gb:U81234.1 gb:NM_00299
3,788599
0,329467
11
Снижение
8.58E-05
NM_002252
Homo sapiens, потенциал-зависимый калиевый канал, выпрямитель с задержкой, подсемейство S, член 3 (KCNS3), мРНК. /PROD=potassium voltage-gated channel,delayed-rectifier, subfamily S, member 3 /FL=gb:AF043472.1 gb:NM_002252.1 gb:BC004987.1 gb:BC004148.1
4,397278
0,939176
10,99
Снижение
1,22E-04
NM_021614
Homo sapiens, активируемый кальцием калиевый канал с промежуточной и малой проводимостью, подсемейство N, член 2 (KCNN2), мРНК. /PROD=potassium intermediatesmall conductancecalcium-activated channel, subfamily N, member 2 /FL=gb:NM_021614.1 gb:AF239613.1
1,027188
-2,423197
10,93
Снижение
1.22E-03
BG169832
аденилаткиназа 5 /FL=gb:NM_012093.1 gb:AF062595.1
1,022495
-2,421211
10,88
Снижение
2.47E-02
BC002832
Homo sapiens, белок, сходный с бутирофилином, подсемейство 3, член A2, клон MGC:3790, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Similar to butyrophilin, subfamily 3, member A2 /FL=gb:U90144.1 gb:NM_007047.1 gb:U90546.1 gb:BC002832.1
0,311203
-3,122447
10,81
Снижение
1.70E-03
AI964053
Гены EST
1,673874
-1,728682
10,57
Снижение
2.25E-03
NM_005965
Homo sapiens, киназа легкого полипептида миозина (MYLK), мРНК. /PROD=myosin, light polypeptide kinase /FL=gb:AB037663.1 gb:AF069601.2 gb:NM_005965.1
1,443731
-1,955774
10,55
Снижение
1.43E-03
AJ272267
Homo sapiens, часть мРНК холиндегидрогеназы (ген chdh). /PROD=choline dehydrogenase
0,383563
-3,004508
10,47
Снижение
2.48E-02
AI377688
Гены EST
0,995551
-2,39165
10,46
Снижение
5.14E-03
NM_005386
Homo sapiens, нейронатин (NNAT), мРНК. /PROD=neuronatin /FL=gb:NM_005386.1 gb:BC001768.1 gb:AB002392.1 gb:U25033.1
3,45531
0,070626
10,44
Снижение
1.94E-04
AV733308
интегрин, альфа 6
3,527039
0,143408
10,44
Снижение
5.95E-05
BG283790
Гены EST
2,950823
-0,418278
10,33
Снижение
1.38E-03
NM_003645
Homo sapiens, лигаза жирных кислот-коэнзима А, очень длинная цепь 1 (FACVL1), мРНК. /PROD=very long-chain fatty-acid-Coenzyme A ligase 1 /FL=gb:AF096290.1 gb:D88308.1 gb:NM_003645.1
1,55078
-1,80799
10,26
Снижение
3.70E-03
H28597
тимопоэтин
5,005827
1,649812
10,24
Снижение
1.90E-04
NM_003020
Homo sapiens, секреторная гранула, нейроэндокринный белок 1 (белок 7B2) (SGNE1), мРНК. /PROD=secretory granule, neuroendocrine protein 1 (7B2protein) /FL=gb:BC005349.1 gb:NM_003020.1
0,760646
-2,590248
10,2
Снижение
2.29E-02
AW589793
Гены EST
2,209313
-1,126222
10,09
Снижение
5.95E-05
AA747379
полипептид, связанный с кальцитонином, бета /FL=gb:NM_000728.1
-0,10418
-3,43217
10,04
Снижение
4.66E-03
NM_017655
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ20075 (FLJ20075), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ20075 /FL=gb:NM_017655.1
2,598488
-0,722855
10
Снижение
2.03E-03
L08599
Человеческий увоморулин (E-кадгерин) (UVO), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=uvomorulin /FL=gb:NM_004360.1 gb:L08599.1
1,858219
-1,457169
9,95
Снижение
1.81E-03
NM_005084
Homo sapiens, фосфолипаза A2, группа VII (ацетилгидролаза фактора активации тромбоцитов, плазматическая) (PLA2G7), мРНК. /PROD=phospholipase A2, group VII (platelet-activatingfactor acetylhydrolase, plasma) /FL=gb:U20157.1 gb:U24577.1 gb:NM_005084.1
1,910263
-1,3945
9,88
Снижение
1.27E-03
NM_006994
Homo sapiens, бутирофилин, подсемейство 3, член A3 (BTN3A3), мРНК. /PROD=butyrophilin, subfamily 3, member A3 /FL=gb:U90548.1 gb:NM_006994.2
2,001097
-1,297629
9,84
Снижение
1,19E-03
BC028721
Homo sapiens, белок, сходный с переносчиком растворенных веществ, семейство 1 (высокоаффинный аспартатно-глутаматный переносчик), член 6, клон MGC:33092 IMAGE:5269300, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Similar to solute carrier family 1 (highaffinity aspartateglutamate transporter), memb
5,020283
1,723791
9,83
Снижение
1.63E-04
AK025084
Homo sapiens кДНК: FLJ21431 fis, клон COL04214, высокая степень подобия с HSU80736, Homo sapiens CAGF9, мРНК.
2,474373
-0,811562
9,75
Снижение
5.94E-03
NM_013272
Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 21 (переносчик органических анионов), член 11 (SLC21A11), мРНК. /PROD=solute carrier family 21 (organic aniontransporter), member 11 /FL=gb:NM_013272.2 gb:AF205074.1 gb:AB031050.2 gb:AF187816.1
2,116702
-1,16308
9,71
Снижение
4.40E-02
AF107846
Homo sapiens, ген нейроэндокрин-специфичного белка Гольджи p55 (XLalphas), экзон XL2 и полная кодовая последовательность
2,472358
-0,803312
9,68
Снижение
2.33E-03
NM_000363
Homo sapiens, тропонин I, сердечный (TNNI3), мРНК. /PROD=troponin I, cardiac /FL=gb:M64247.1 gb:NM_000363.1
0,384182
-2,880367
9,61
Снижение
4.26E-03
NM_005825
Homo sapiens, RAS гуанил-высвобождающий белок 2 (регулируемый кальцием и диацилглицерином) (RASGRP2), мРНК. /PROD=RAS guanyl releasing protein 2 (calcium andDAG-regulated) /FL=gb:AF043723.1 gb:NM_005825.1
2,394742
-0,866876
9,59
Снижение
1.57E-04
AI733027
Гены EST, слабая степень подобия с RET2_HUMAN, РЕТИНОЛ-СВЯЗЫВАЮЩИМ БЕЛКОМ II, КЛЕТОЧНЫМ (H.sapiens)
1,319792
-1,930717
9,52
Снижение
5.95E-05
M18767
Человеческий подкомпонент комплемента C1s, альфа- и бета-цепи, полная кодовая последовательность /FL=gb:J04080.1 gb:M18767.1 gb:NM_001734.1
3,859451
0,610002
9,51
Снижение
5.73E-04
AJ242502
Homo sapiens, мРНК эпителиального белка, связанного с микротрубочками, E-MAP-115105 (ген MAP). /PROD=epithelial microtubule-associated protein
3,009579
-0,239729
9,51
Снижение
5.22E-04
AB037730
Homo sapiens, мРНК белка KIAA1309, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1309 protein
2,600702
-0,646217
9,49
Снижение
1.43E-02
AA740186
биливердин-редуктаза A /FL=gb:NM_000712.1 gb:U34877.1
0,971941
-2,274152
9,49
Снижение
7.72E-04
NM_018018
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10191 (FLJ10191), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10191 /FL=gb:NM_018018.1
0,414323
-2,829854
9,48
Снижение
6.30E-03
AF283777
Homo sapiens, клон TCBAP0702, последовательность мРНК.
6,139688
2,900659
9,44
Снижение
4.48E-04
BC036488
Homo sapiens, клон MGC:43145 IMAGE:5261574, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Unknown (protein for MGC:43145) /FL=gb:BC036488.1
1,569503
-1,668679
9,44
Снижение
1.24E-03
BF195118
Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
1,665643
-1,567308
9,4
Снижение
8.63E-04
AF282250
Homo sapiens, кальньюрон 1 (CALN1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=calneuron 1 /FL=gb:AF282250.1
4,319584
1,104655
9,29
Снижение
5.53E-04
AA618420
Homo sapiens кДНК: FLJ23597 fis, клон LNG15281
4,436354
1,227541
9,25
Снижение
2.94E-04
AI912275
белок B-клеточной CLL / лимфомы 11A (цинк-пальцевый белок) /FL=gb:NM_022893.1 gb:NM_018014.1
1,923237
-1,283751
9,23
Снижение
3.70E-03
AW072102
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434H205 (из клона DKFZp434H205)
2,59299
-0,613677
9,23
Снижение
1.94E-04
NM_003887
Homo sapiens, усиливающий развитие и дифференцировку фактор 2 (DDEF2), мРНК. /PROD=ADP-ribosylation factor(arf)-directed GTPaseactivating protein /FL=gb:AB007860.1 gb:NM_003887.1
3,20248
0,002668
9,19
Снижение
5.80E-04
AF220153
Homo sapiens, содержащий четыре с половиной LIM-домена белок 1, изоформа C (FHL1), мРНК, полная кодовая последовательность, продукт альтернативного сплайсинга. /PROD=four and a half LIM domains 1 protein isoform C /FL=gb:AF220153.1
1,689335
-1,505873
9,16
Снижение
2.46E-03
NM_031272
Homo sapiens, экспрессируемая в семенниках последовательность 14 (TEX14), мРНК. /PROD=testis expressed sequence 14 /FL=gb:NM_031272.1
3,026209
-0,167981
9,15
Снижение
6.90E-05
BC032302
Homo sapiens, белок, сходный с УДФ-глюкозо-церамид-глюкозилтрансфераза-подобным белком 2, клон MGC:40268 IMAGE:5169731, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=similar to UDP-glucose ceramideglucosyltransferase-like 2 /FL=gb:BC032302.1
3,116245
-0,070826
9,11
Снижение
7.93E-05
NM_017947
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ20733 (FLJ20733), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ20733 /FL=gb:NM_017947.1
2,91664
-0,26326
9,06
Снижение
1.68E-03
AW003367
Homo sapiens, клон 25237, последовательность мРНК
4,453662
1,27718
9,04
Снижение
7.33E-05
AV681807
гомолог 3 онкогена вируса птичьей эритробластической лейкемии v-erb-b2
3,454075
0,278604
9,03
Снижение
1.86E-04
AV691491
Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp564D1462 (из клона DKFZp564D1462)
1,883578
-1,291525
9,03
Снижение
2.67E-02
BF970287
Человеческая ДНК-последовательность от клонирования RP1-310O13 на хромосоме 20q11.2. Содержит (части) четырех новых генов, EST, STS, GSS и четыре предполагаемых CpG-островка
2,326737
-0,838174
8,97
Снижение
2.61E-03
NM_015982
Homo sapiens, специфичный для зародышевых клеток Y-бокс-связывающий белок (LOC51087), мРНК. /PROD=germ cell specific Y-box binding protein /FL=gb:NM_015982.1 gb:AF096834.1
0,392456
-2,771428
8,96
Снижение
2.73E-02
NM_003007
Homo sapiens, семеногелин I (SEMG1), мРНК. /PROD=semenogelin I /FL=gb:J04440.1 gb:NM_003007.1
3,116953
-0,041715
8,93
Снижение
3.90E-04
AA469071
Кластер включает AA469071:ne17f11.s1 Homo sapiens кДНК, 3 конец /clone=IMAGE-881517 /clone_end=3 /gb=AA469071 /gi=2195605 /ug=Hs.180479 /len=758
3,113317
-0,040507
8,9
Снижение
2.36E-03
AL565745
Гены EST с низкой степенью подобия с 2108402A, карнитин-пальмитоилтрансферазой I (H.sapiens)
5,010828
1,86984
8,82
Снижение
3.28E-04
AK027006
Homo sapiens кДНК: FLJ23353 fis, клон HEP14321, высокая степень подобия с HSU80736, Homo sapiens CAGF9, мРНК.
3,249727
0,113464
8,79
Снижение
2.14E-04
BC001745
Homo sapiens, клон MGC:3328, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Unknown (protein for MGC:3328) /FL=gb:BC001745.1 gb:NM_014392.1
1,532208
-1,601117
8,77
Снижение
3.19E-03
AI796813
адвиллин
5,063502
1,934512
8,75
Снижение
1.01E-04
AB018289
Homo sapiens мРНК белка KIAA0746, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA0746 protein
1,934415
-1,192238
8,73
Снижение
3.13E-03
NM_001351
Homo sapiens, белок, подобный белку, отсутствующему при азооспермии (DAZL), мРНК. /PROD=deleted in azoospermia-like /FL=gb:U66726.2 gb:NM_001351.1 gb:U65918.1 gb:U66078.1
2,522705
-0,592752
8,67
Снижение
9.13E-03
U07236
Человеческая мутантная лимфоцит-специфическая протеин-тирозинкиназа (LCK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
3,995648
0,881994
8,66
Снижение
6.55E-05
AI961231
продукт гена KIAA0808 /FL=gb:AB018351.1 gb:NM_014729.1
2,077151
-1,020617
8,56
Снижение
7.33E-05
BF223193
ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
6,650173
3,554864
8,55
Снижение
8.55E-04
NM_004360
Homo sapiens, кадгерин 1, тип 1, E-кадгерин (эпителиальный) (CDH1), мРНК. /PROD=cadherin 1, type 1, E-cadherin (epithelial) /FL=gb:NM_004360.1 gb:L08599.1
1,440541
-1,650241
8,52
Снижение
1.11E-03
BE503640
Гены EST
1,344522
-1,721548
8,37
Снижение
1.97E-02
AW071705
дипептидилпептидаза VI
4,319671
1,253603
8,37
Снижение
1.05E-04
AF063002
Homo sapiens, LIM-белок SLIMMER, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=LIM protein SLIMMER /FL=gb:AF063002.1 gb:AF098518.1
2,575606
-0,489298
8,37
Снижение
1.24E-03
BC016785
Homo sapiens, белок, сходный с гипотетическим белком PRO1722, клон IMAGE:4096414, мРНК.
1,070412
-1,992167
8,35
Снижение
7.29E-04
AF070642
Homo sapiens, клон 24488, последовательность мРНК.
3,083054
0,021788
8,35
Снижение
2.33E-03
BC026969
Homo sapiens, клон IMAGE:5116073, мРНК, частичная кодовая последовательность.
6,075972
3,015223
8,34
Снижение
1.35E-04
NM_001449
Homo sapiens, содержащий четыре с половиной LIM-домена белок 1 (FHL1), мРНК. /PROD=four and a half LIM domains 1 /FL=gb:U60115.1 gb:NM_001449.1 gb:U29538.1
0,779095
-2,27952
8,33
Снижение
1,58E-02
AF497717
Homo sapiens, неизвестный белок, тип ткани - легкие, мРНК.
4,227241
1,173625
8,3
Снижение
3.47E-04
AI193252
Гены EST, с низкой степенью подобия с AF133270 1 SLIT2 (H.sapiens)
1,139113
-1,908335
8,27
Снижение
1.40E-02
AI741469
Гены EST
3,120689
0,079671
8,23
Снижение
6.27E-04
U01874
Человеческий белок me20m, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=me20m /FL=gb:NM_006928.1 gb:BC001414.1 gb:U01874.1
3,499377
0,460367
8,22
Снижение
2.16E-03
NM_024572
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ12691 (FLJ12691), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ12691 /FL=gb:NM_024572.1
2,568736
-0,463022
8,18
Снижение
4.78E-03
AA531287
Гены EST
Таблица VI
РАЗЛИЧИЕ в экспрессии генов между недифференцированными эмбриональными стволовыми клетками, культивированными на матриксе MATRIGELTM и клетками EXPRES 01 (a) и 02 (b), культивированными на TCPS
A) Сравнение клеток H9 P39 на 2 часу стадии сформированной эндодермы и клеток EXPRES 01- Значения интенсивности приводятся в формате Log2
EXPRES 01
2 ЧАС СТАДИИ СЭ
Отношение
Направление
скорректир. значение p
Идентификатор гена
Название гена
-3,61621
3,301718
120,92
Повышение
0,001179
AL569326
Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность
-1,32044
4,320344
49,89
Повышение
0,005081
AF017987
Homo sapiens, связанный с апоптозом секретированный белок 2 (SARP2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=secreted apoptosis related protein 2 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-3,12747
2,331072
43,97
Повышение
0,000718
AV726956
Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
-2,3376
2,787516
34,9
Повышение
0,000229
U17496
Человеческая протеасомная субъединица LMP7 (аллель LMP7B), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=proteasome subunit LMP7 /FL=gb:U17497.1 gb:U17496.1
-0,27888
4,715023
31,86
Повышение
0,000339
AF225513
Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta /FL=gb:AF225513.1
-1,56608
3,343812
30,06
Повышение
0.009753
NM_000767
Homo sapiens, цитохром P450, подсемейство IIB (индуцируемый фенобарбиталом), полипептид 6 (CYP2B6), мРНК. /PROD=cytochrome P450, subfamily IIB(phenobarbital-inducible), polypeptide 6 /FL=gb:NM_000767.2 gb:AF182277.1 gb:M29874.1
0,756526
5,558453
27,89
Повышение
0,000271
NM_003012
Homo sapiens, секретированный frizzled-связанный белок 1 (SFRP1), мРНК. /PROD=secreted frizzled-related protein 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-1,03397
3,688335
26,4
Повышение
0,000308
NM_003020
Homo sapiens, секреторная гранула, нейроэндокринный белок 1 (белок 7B2) (SGNE1), мРНК. /PROD=secretory granule, neuroendocrine protein 1 (7B2protein) /FL=gb:BC005349.1 gb:NM_003020.1
-1,64839
2,654165
19,73
Повышение
0,000963
NM_004900
Homo sapiens, форболин (сходный с аполипопротеином B мРНК-редактирующий белок) (DJ742C19.2), мРНК. /PROD=phorbolin (similar to apolipoprotein B мРНКediting protein) /FL=gb:NM_004900.1 gb:U61083.1
-0,41404
3,88291
19,66
Повышение
0,00068
AI332407
секретированный frizzled-связаный белок 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-4,55112
-0,49607
16,62
Повышение
0,040292
NM_018043
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10261 (FLJ10261), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10261 /FL=gb:NM_018043.1
-2,38787
1,639634
16,31
Повышение
0,010236
BC003517
Homo sapiens, клон IMAGE:3542589, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3542589)
-2,506
1,482042
15,87
Повышение
0,000737
AW193693
белок DKFZP566K1924
-1,89835
2,076299
15,72
Повышение
0,000308
AL122010
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-997D16 на хромосоме 1p34.1-35.3. Содержит часть гена белка DAP-1, гены STS, GSS и островок CpG
-2,80061
1,027087
14,2
Повышение
0.005931
NM_014624
Homo sapiens, S100 кальций-связывающий белок A6 (кальциклин) (S100A6), мРНК. /PROD=S100 calcium-binding protein A6 /FL=gb:NM_014624.2 gb:BC001431.1
-1,56046
2,251934
14,05
Повышение
0,009772
NM_016354
Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 21 (переносчик органических анионов), член 12 (SLC21A12), мРНК. /PROD=organic anion transporter OATP-E /FL=gb:AB031051.1 gb:NM_016354.1 gb:AF205072.1 gb:AF187817.1
1,109291
4,853054
13,4
Повышение
0,000308
NM_005356
Homo sapiens, лимфоцит-специфическая тирозинкиназа (LCK), мРНК. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
-2,69521
1,04038
13,32
Повышение
0,000271
AF282250
Homo sapiens, кальньюрон 1 (CALN1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=calneuron 1 /FL=gb:AF282250.1
1,168713
4,897416
13,26
Повышение
0,001059
NM_016139
Homo sapiens, белок 16,7 кДа (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
-3,05488
0,645316
13
Повышение
0,001719
AI569804
Гены EST
-0,10733
3,574485
12,83
Повышение
0,001042
BC005107
Homo sapiens, клон IMAGE:3840937, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3840937)
-3,12055
0,460578
11,97
Повышение
0,018849
AW780006
Гены EST
-0,8902
2,675714
11,84
Повышение
0,001172
NM_022034
Homo sapiens, ген 1, регулируемый эстерогеном (ERG-1), мРНК. /PROD=estrogen regulated gene 1 /FL=gb:AF305835.1 gb:NM_022034.1
-2,233
1,292642
11,52
Повышение
0,002196
NM_014862
Homo sapiens, продукт гена KIAA0307 (KIAA0307), мРНК. /PROD=KIAA0307 gene product /FL=gb:AB002305.1 gb:NM_014862.1
-1,16113
2,362911
11,5
Повышение
0,007894
NM_012281
Homo sapiens, потенциал-зависимый калиевый канал, подсемейство, связанное с Shal, член 2 (KCND2), мРНК. /PROD=potassium voltage-gated channel, Shal-relatedsubfamily, member 2 /FL=gb:NM_012281.1 gb:AB028967.1 gb:AF121104.1
-2,7484
0,710709
11
Повышение
0,006544
BC000568
Homo sapiens, клон MGC:3040, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:3040) /FL=gb:BC000568.1
-2,89467
0,509405
10,59
Повышение
0,010729
AW971205
Гены EST
-1,66608
1,669381
10,09
Повышение
0,01208
BE673445
Homo sapiens, хромосома 19, космида R28379
-1,38062
1,947029
10,04
Повышение
0,000277
NM_002590
Homo sapiens, протокадгерин 8 (PCDH8), мРНК. /PROD=protocadherin 8 /FL=gb:NM_002590.2 gb:AF061573.2
1,12675
4,40089
9,67
Повышение
0,000277
AA206141
Гены EST
-0,04543
3,208344
9,54
Повышение
0,000875
AB037730
Homo sapiens, мРНК белка KIAA1309, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1309 protein
-3,12304
0,081126
9,22
Повышение
0,025215
NM_018018
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10191 (FLJ10191), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10191 /FL=gb:NM_018018.1
-2,26295
0,940715
9,21
Повышение
0,013376
AI735586
Гены EST
3,061783
6,265115
9,21
Повышение
0,000149
BF057809
Гены EST
-1,57619
1,598447
9,03
Повышение
0,001707
AW072790
контактин 1
1,260638
4,356898
8,55
Повышение
0,000408
AA404269
Гены EST
-1,79406
1,19242
7,93
Повышение
0,023768
NM_004731
Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 7 (SLC16A7), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 7 /FL=gb:AF058056.1 gb:NM_004731.1
-1,25121
1,703716
7,75
Повышение
0,000875
R62432
Кластер включает R62432:yg52e11.s1 Homo sapiens, кДНК, 3 конец /clone=IMAGE-36023 /clone_end=3 /gb=R62432 /gi=834311 /ug=Hs.12321 /len=487
-2,01579
0,901094
7,55
Повышение
0,014339
AI937060
белок KIAA1151
0,194248
3,083487
7,41
Повышение
0,002413
U07236
Человеческая мутантная лимфоцит-специфическая протеин-тирозинкиназа (LCK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
-2,17012
0,714641
7,39
Повышение
0,011075
AB018580
Homo sapiens, мРНК белка hluPGFS, полная кодовая последовательность. /PROD=hluPGFS /FL=gb:NM_003739.2 gb:AF149416.2 gb:AB018580.1 gb:D17793.1
1,872557
4,741366
7,3
Повышение
0,000311
R38389
ольфактомедин-связанный белок, локализованный в ЭР
-1,81469
1,042382
7,25
Повышение
0,007408
AF052108
Homo sapiens, клон 23687, последовательность мРНК.
-1,51616
1,329372
7,19
Повышение
0,007084
AJ272267
Homo sapiens, часть мРНК холиндегидрогеназы (ген chdh). /PROD=choline dehydrogenase
-0,54428
2,289592
7,13
Повышение
0,000308
AF053712
Homo sapiens, лиганд остеопротегирина, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=osteoprotegerin ligand /FL=gb:AF053712.1 gb:AF019047.1
-3,17826
-0,38807
6,92
Повышение
0,040995
AI798098
Гены EST
-1,88254
0,903098
6,9
Повышение
0,007894
BF694956
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP1-187J11 на хромосоме 6q11.1-22.33. Содержит ген нового белка, сходного с предсказанными белками S. pombe и S. cerevisiae, ген нового белка, сходного с ингибиторами протеинкиназы C, 3-конец
-1,27392
1,501511
6,85
Повышение
0,036787
U11058
Homo sapiens, альфа-субъединица высокопроводящего кальциевого и потенциалзависимого калиевого канала (MaxiK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=large conductance calcium- and voltage-dependentpotassium channel alpha subunit /FL=gb:U23767.1 gb:NM_002247.1 gb:AF025999
-1,89628
0,858329
6,75
Повышение
0,001372
AA557324
Гены EST с низкой степенью подобия с жирнокислотной омега-гидроксилазой (H.sapiens)
-2,62694
0,10781
6,66
Повышение
0,017924
NM_000055
Homo sapiens, бутирилхолинэстераза (BCHE), мРНК. /PROD=butyrylcholinesterase precursor /FL=gb:M16541.1 gb:M16474.1 gb:NM_000055.1
-0,69028
2,041376
6,64
Повышение
0,001589
M16276
Человеческий белок MHC класса II, HLA-DR2-Dw12, мРНК, DQw1-бета, полная кодовая последовательность /FL=gb:NM_002123.1 gb:M16276.1 gb:M60028.1 gb:M17564.1 gb:M81141.1 gb:M81140.1
1,037668
3,763873
6,62
Повышение
0,00068
R40892
Гены EST
-1,4606
1,25243
6,56
Повышение
0,001042
AW072102
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434H205 (из клона DKFZp434H205)
-2,07873
0,629421
6,53
Повышение
0,006819
AI269290
переносчик растворенных веществ, семейство 18 (везикулярный моноамин), член 2 /FL=gb:L14269.1 gb:L23205.1 gb:L09118.1 gb:NM_003054.1
-1,17422
1,532018
6,53
Повышение
0,009466
AI962169
Гены EST
-1,85153
0,844198
6,48
Повышение
0,022892
AL359062
Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 1913076.
-0,32746
2,355449
6,42
Повышение
0,000657
L39833
Homo sapiens (клон hKvBeta3), субъединица K+ канала-бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=K+ channel beta-subunit /FL=gb:U16953.1 gb:L39833.1
-0,62283
2,054006
6,39
Повышение
0,000522
NM_001351
Homo sapiens, белок, подобный белку, отсутствующему при азооспермии (DAZL), мРНК. /PROD=deleted in azoospermia-like /FL=gb:U66726.2 gb:NM_001351.1 gb:U65918.1 gb:U66078.1
-0,04433
2,61928
6,34
Повышение
0,001042
NM_007191
Homo sapiens, ингибирующий Wnt фактор-1 (WIF-1), мРНК. /PROD=Wnt inhibitory factor-1 /FL=gb:AF122922.1 gb:NM_007191.1
0,462867
3,108247
6,26
Повышение
0,006847
AI807026
Гены EST
1,37261
4,006097
6,21
Повышение
0,000311
BC040605
Homo sapiens, клон IMAGE:5271039, мРНК.
0,997757
3,610644
6,12
Повышение
0,000246
AU144892
Homo sapiens, кДНК FLJ11569 fis, клон HEMBA1003304
2,214091
4,82397
6,1
Повышение
0,000277
N98595
Гены EST
-0,58317
2,018483
6,07
Повышение
0,000412
AL563460
GATA-связывающий белок 2 /FL=gb:M68891.1
-3,21441
-0,62151
6,03
Повышение
0,033157
NM_021981
Homo sapiens, белок, связанный с предшественниками TNK-клеток (1D12A), мРНК. /PROD=pre-TNK cell associated protein /FL=gb:L17325.1 gb:NM_021981.1
-1,61054
0,964359
5,96
Повышение
0,005872
AW264204
Гены EST
-0,46577
2,083834
5,85
Повышение
0,00021
AW051591
Гены EST со средней степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
-1,09181
1,45367
5,84
Повышение
0,027071
AI653050
Гены EST с низкой степенью подобия с HPPD_HUMAN 4 - ГИДРОКСИФЕНИЛПИРУВАТ-ДИОКСИГЕНАЗОЙ (H.sapiens)
-1,64801
0,893628
5,82
Повышение
0,000875
AW779917
Гены EST
-0,49174
2,041917
5,79
Повышение
0,005081
NM_002522
Homo sapiens, нейрональный пентраксин I (NPTX1), мРНК. /PROD=neuronal pentraxin I precursor /FL=gb:NM_002522.1 gb:U61849.1
-0,7841
1,740263
5,75
Повышение
0,00111
BF672975
липопротеин-липаза /FL=gb:M15856.1 gb:NM_000237.1
-0,75335
1,769582
5,75
Повышение
0,01551
AK023900
Homo sapiens кДНК FLJ13838 fis, клон THYRO1000756, с низкой степенью подобия с АЛЬФА-N-АЦЕТИЛГАЛАКТОЗАМИНИД АЛЬФА-2,6-СИАЛИЛТРАНСФЕРАЗОЙ (EC 2.4.99.-). /FL=gb:NM_013443.1 gb:AB035173.1
1,174608
3,695562
5,74
Повышение
0,001082
AI659533
Взаимодействующий с ArgAbl белок ArgBP2
-2,3444
0,162277
5,68
Повышение
0,00079
AW057589
Гены EST
-1,70607
0,798713
5,68
Повышение
0,006868
BC040321
Homo sapiens, белок, сходный с LIM-содержащим гомеобоксовым белком 8, клон IMAGE:4839343, мРНК.
-1,11642
1,371492
5,61
Повышение
0,016088
BC000185
Homo sapiens, белок, сходный с карнитин-пальмитоилтрансферазой I, печеночной, клон MGC:1772, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Similar to carnitine palmitoyltransferase I,liver /FL=gb:BC000185.1
2,631289
5,118301
5,61
Повышение
0,002033
AK026546
Homo sapiens кДНК: FLJ22893 fis, клон KAT04792.
-1,99418
0,464132
5,5
Повышение
0,002048
NM_006994
Homo sapiens, бутирофилин, подсемейство 3, член A3 (BTN3A3), мРНК. /PROD=butyrophilin, subfamily 3, member A3 /FL=gb:U90548.1 gb:NM_006994.2
-2,05438
0,400672
5,48
Повышение
0,047179
BG290908
Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-0,0881
2,345496
5,4
Повышение
0,001106
AL565745
Гены EST с низкой степенью подобия с 2108402A, карнитин-пальмитоилтрансферазой I (H.sapiens)
-1,67442
0,753821
5,38
Повышение
0,004073
AW117456
нейротримин
-0,2823
2,124629
5,3
Повышение
0,006868
NM_016582
Homo sapiens, переносчик пептидов 3 (LOC51296), мРНК. /PROD=peptide transporter 3 /FL=gb:NM_016582.1 gb:AB020598.1
-0,08433
2,303971
5,24
Повышение
0.003841
NM_000767
Homo sapiens, цитохром P450, подсемейство IIB (индуцируемый фенобарбиталом), полипептид 6 (CYP2B6), мРНК. /PROD=cytochrome P450, subfamily IIB(phenobarbital-inducible), polypeptide 6 /FL=gb:NM_000767.2 gb:AF182277.1 gb:M29874.1
-0,49385
1,890277
5,22
Повышение
0,005872
AI741439
Гены EST
2,372618
4,749882
5,2
Повышение
0,000339
NM_007015
Homo sapiens, предшественник хондромодулина I (CHM-I), мРНК. /PROD=chondromodulin I precursor /FL=gb:NM_007015.1 gb:AB006000.1
0,650035
3,011594
5,14
Повышение
0,011507
NM_004744
Homo sapiens, лецитин-ретинол-ацилтрансфераза (фосфатидилхолин--ретинол O-ацилтрансфераза) (LRAT), мРНК. /PROD=lecithin retinol acyltransferase(phosphatidylcholine--retinol O-acyltransferase) /FL=gb:NM_004744.1 gb:AF071510.1
-1,60594
0,753467
5,13
Повышение
0,027018
AL050090
Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp586F1018 (из клона DKFZp586F1018). /PROD=hypothetical protein
4,239108
6,593362
5,11
Повышение
0,001589
BG542521
пируват-дегидрогеназы фосфатаза /FL=gb:NM_018444.1 gb:AF155661.1
0,040412
2,375678
5,05
Повышение
0,00034
AA960844
Homo sapiens, клон IMAGE:4081483, мРНК
1,986226
4,31181
5,01
Повышение
0,000576
NM_018444
Homo sapiens, пируват-дегидрогеназы фосфатаза (PDP), мРНК. /PROD=pyruvate dehydrogenase phosphatase /FL=gb:NM_018444.1 gb:AF155661.1
3,409815
-3,01948
86,18
Снижение
0,000948
NM_016588
Homo sapiens, нейритин (LOC51299), мРНК. /PROD=neuritin /FL=gb:NM_016588.1 gb:BC002683.1 gb:AF136631.1
5,388254
-0,10197
44,95
Снижение
0,000308
NM_004207
Homo sapiens, переносчик растворенных веществ семейства 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 (SLC16A3), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
3,094183
-2,07205
35,91
Снижение
0,000277
NM_013445
Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD25, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD25 /FL=gb:NM_013445.1 gb:AF178853.1 gb:BC002815.1
4,092731
-0,56561
25,25
Снижение
0,000149
AL513917
переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
2,990178
-1,65945
25,1
Снижение
0,012588
NM_013445
Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD25, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD25 /FL=gb:NM_013445.1 gb:AF178853.1 gb:BC002815.1
6,777916
2,398415
20,81
Снижение
0,000465
U15174
Homo sapiens, взаимодействующий с белком BCL2adenovirus E1B 19 кДа белок 3 (BNIP3) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=BCL2adenovirus E1B 19kD-interacting protein 3 /FL=gb:AF002697.1 gb:NM_004052.2 gb:U15174.1
2,469646
-1,82868
19,68
Снижение
0,035416
N76327
Гены EST с высокой степенью подобия с трансферриновым рецептором 1011297A (H.sapiens)
2,306111
-1,98162
19,53
Снижение
0,000324
AI632223
гипотетический белок DKFZp434F2322
3,834572
-0,18549
16,22
Снижение
0,001082
NM_002610
Homo sapiens, пируват-дегидрогеназы киназа, изофермент 1 (PDK1), ядерный ген, кодирующий митохондриальный белок, мРНК. /PROD=pyruvate dehydrogenase kinase, isoenzyme 1 /FL=gb:NM_002610.2 gb:L42450.1
1,790331
-2,19355
15,82
Снижение
0,001383
AA775681
гипотетический белок FLJ23091
2,770179
-1,16728
15,32
Снижение
0,000149
AK000345
Homo sapiens, кДНК FLJ20338 fis, клон HEP12179.
3,025351
-0,90644
15,26
Снижение
0,000718
AW590925
Гены EST
4,505436
0,7876
13,16
Снижение
0,000277
W57613
Гены EST
4,749034
1,283923
11,04
Снижение
0,001992
NM_002130
Homo sapiens, 3-гидрокси-3-метилглутарил-коэнзим A синтаза 1 (растворимая) (HMGCS1), мРНК. /PROD=3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 1(soluble) /FL=gb:NM_002130.1 gb:L25798.1 gb:BC000297.1
2,792215
-0,63797
10,78
Снижение
0,000308
BC017942
Homo sapiens, белок, подобный отоконину 90, клон IMAGE:4285317, мРНК.
1,80547
-1,58337
10,47
Снижение
0,003516
NM_000817
Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD67, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD67 /FL=gb:NM_000817.1 gb:M81883.1 gb:L16888.1
5,095598
1,712881
10,43
Снижение
0,003841
NM_005542
Homo sapiens, индуцируемый инсулином ген 1 (INSIG1), мРНК. /PROD=insulin induced gene 1 /FL=gb:NM_005542.1
3,268087
-0,094
10,28
Снижение
0,000308
AF345910
Homo sapiens, NYD-SP14, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NYD-SP14 /FL=gb:AF345910.1
4,161028
0,812032
10,19
Снижение
0,01551
BC005807
Homo sapiens, клон MGC:10264, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:10264) /FL=gb:BC005807.1
2,62025
-0,70119
10
Снижение
0,002196
AA625683
Гены EST
1,840613
-1,45068
9,79
Снижение
0,004024
AI949760
Гены EST с низкой степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
1,389794
-1,83973
9,38
Снижение
0,001383
BG498699
Гены EST
1,075159
-2,15236
9,37
Снижение
0,002413
J03580
Человеческий паратиреоидподобный белок (связанный со злокачественной гуморальной гиперкальцемией), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:J03580.1
0,757197
-2,44574
9,21
Снижение
0,036787
AF213459
Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
0,831091
-2,3635
9,16
Снижение
0,026606
NM_153036
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32239 (FLJ32239), мРНК. /FL=gb:NM_153036.1
4,507212
1,314761
9,14
Снижение
0,000772
AW196940
Гены EST
1,194285
-1,99568
9,13
Снижение
0,018647
NM_001898
Homo sapiens, цистатин SN (CST1), мРНК. /PROD=cystatin SN /FL=gb:J03870.1 gb:NM_001898.1
3,030236
-0,13469
8,97
Снижение
0,001421
AA812232
стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
2,422113
-0,73175
8,9
Снижение
0,012832
AL544576
Гены EST
6,091008
2,976341
8,66
Снижение
0,000149
BC020935
Homo sapiens, белок, подобный отоконину 90, клон IMAGE:4277593, мРНК.
5,023981
1,92526
8,57
Снижение
0,000702
NM_006472
Homo sapiens, белок, стимулируемый 1,25-дигидроксивитамином D-3 (VDUP1), мРНК. /PROD=upregulated by 1,25-dihydroxyvitamin D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
4,285883
1,193881
8,53
Снижение
0,000308
AL038787
6-фосфофрукто-2-киназафруктоза-2,6-бифосфатаза 4
6,371229
3,380355
7,95
Снижение
0,000277
AI950472
Гены EST
3,953402
0,998399
7,75
Снижение
0,000728
BC005369
Homo sapiens, хромосома 1 открытая рамка считывания 12, клон MGC:12484, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=chromosome 1 open reading frame 12 /FL=gb:AF277176.1 gb:NM_022051.1 gb:AF229245.1 gb:BC005369.1
2,759117
-0,13047
7,41
Снижение
0,000277
AI692523
Гены EST
1,143234
-1,73889
7,37
Снижение
0,018647
BF437711
Гены EST
2,36447
-0,49577
7,26
Снижение
0,000358
NM_005181
Homo sapiens, карбоангидраза III, специфичная для мышц (CA3), мРНК. /PROD=carbonic anhydrase III /FL=gb:BC004897.1 gb:NM_005181.2
2,514693
-0,33184
7,19
Снижение
0,000412
NM_145032
Homo sapiens, гипотетический белок MGC21636 (MGC21636), мРНК. /FL=gb:BC020572.1 gb:NM_145032.2
1,956681
-0,85067
7
Снижение
0,045693
NM_005242
Homo sapiens, подобный рецептору фактора коагуляции II (тромбина) белок 1 (F2RL1), мРНК. /PROD=coagulation factor II (thrombin) receptor-like 1precursor /FL=gb:U34038.1 gb:NM_005242.2
4,103964
1,313863
6,92
Снижение
0,000149
AA579773
Гены EST
4,501184
1,716877
6,89
Снижение
0,000149
AK000162
Homo sapiens, кДНК FLJ20155 fis, клон COL08754, с высокой степенью подобия с ACSA_ECOLI АЦЕТИЛКОЭНЗИМ А-СИНТЕТАЗОЙ.
2,660133
-0,12206
6,88
Вниз
0.000412
AF277174
Homo sapiens, PNAS-137, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-137 /FL=gb:AF277174.1
4,560288
1,812725
6,72
Снижение
0,049122
BF979497
скваленэпоксидаза
0,300578
-2,4423
6,69
Снижение
0,047414
AI110886
протимозин альфа (генная последовательность 28)
3,816817
1,093203
6,61
Снижение
0,008646
AF116616
Homo sapiens, PRO0998, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PRO0998 /FL=gb:AF116616.1
7,047717
4,332472
6,57
Снижение
6.33E-05
NM_004052
Homo sapiens, взаимодействующий с белком BCL2adenovirus E1B 19 кДа белок 3 (BNIP3), ядерный ген, кодирующий митохондриальный белок, мРНК. /PROD=BCL2adenovirus E1B 19kD-interacting protein 3 /FL=gb:AF002697.1 gb:NM_004052.2 gb:U15174.1
4,897427
2,262649
6,21
Снижение
0,000149
R06655
Гены EST со средней степенью подобия с белком AF078844 1 hqp0376 (H.sapiens)
4,424942
1,790634
6,21
Снижение
0,010942
AF493929
Homo sapiens, регулятор G-белковой сигнализации 5 (RGS5) мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=regulator of G protein signalling 5 /FL=gb:AF493929.1
2,28595
-0,34058
6,18
Снижение
0,001421
BE504838
Гены EST
2,276913
-0,33923
6,13
Снижение
0,045179
AK025909
Homo sapiens кДНК: FLJ22256 fis, клон HRC02860.
2,33099
-0,27829
6,1
Снижение
0,020405
NM_004041
Homo sapiens, аррестин бета 1 (ARRB1), вариант транскрипта 1, мРНК. /PROD=arrestin beta 1, isoform A /FL=gb:BC003636.1 gb:AF084040.1 gb:NM_004041.2
5,319714
2,718977
6,07
Снижение
0,00034
AL117352
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-876B10 на хромосоме 1q42.12-43. Содержит 3-конец гена GNPAT для глицеронфосфат O-ацилтрансферазы (DHAPAT, DAPAT, дигидроксиацетонфосфат-ацилтрансфераза, EC 2.3.1.42), ген нового белка...
6,618477
4,029022
6,02
Снижение
0,000267
AU146532
киназа пируватдегидрогеназы, изофермент 1
2,658828
0,094296
5,92
Снижение
0,000277
NM_024603
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ11588 (FLJ11588), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ11588 /FL=gb:NM_024603.1
3,806044
1,246883
5,89
Снижение
0,001383
AV734646
Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
4,782763
2,225157
5,89
Снижение
0,000229
NM_004199
Homo sapiens, проколлаген-пролин, 2-оксоглутарат 4-диоксигеназа (пролин 4-гидроксилаза), альфа полипептид II, мРНК. /PROD=procollagen-proline, 2-oxoglutarate4-dioxygenase (proline 4-hydroxylase), alpha polypeptideII /FL=gb:NM_004199.1 gb:U904
2,350127
-0,15742
5,69
Снижение
0,001603
AK026106
Homo sapiens кДНК: FLJ22453 fis, клон HRC09679, высокая степень подобия с AF059516, Homo sapiens толлоид-подобный белок 2 (TLL2), мРНК.
5,979532
3,475949
5,67
Снижение
0,038914
U18197
Человеческая АТФ:цитрат-лиаза, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ATP:citrate lyase /FL=gb:U18197.1
2,322104
-0,13595
5,49
Снижение
0,001082
AW291369
Гены EST
2,951696
0,4944
5,49
Снижение
0,004024
AB019562
Homo sapiens, мРНК, экспрессируемая только в ворсинах плаценты, клон SMAP41.
2,265595
-0,17155
5,42
Снижение
0,00303
NM_022144
Homo sapiens, белок миодулин (LOC64102), мРНК. /PROD=myodulin protein /FL=gb:AB055421.1 gb:AF191770.1 gb:NM_022144.1 gb:AF234259.1
5,606506
3,176643
5,39
Снижение
0,000149
NM_013409
Homo sapiens, фоллистатин (FST), вариант транскрипта FST344, мРНК. /PROD=follistatin isoform FST344 precursor /FL=gb:NM_013409.1 gb:BC004107.1
4,03305
1,617698
5,33
Снижение
0,000512
BE300521
индуцируемый инсулином ген 1 /FL=gb:NM_005542.1
5,294065
2,87892
5,33
Снижение
0,01743
AF279899
Homo sapiens, PNAS-145, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-145 /FL=gb:U03105.1 gb:NM_006813.1 gb:AF279899.1
5,807319
3,40016
5,3
Снижение
0,000277
NM_018004
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10134 (FLJ10134), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10134 /FL=gb:NM_018004.1
2,64743
0,242871
5,29
Снижение
0,00111
AI702438
Гены EST
4,257559
1,873346
5,22
Снижение
0,00021
NM_006365
Homo sapiens, активатор транскрипции промотера c-fos (CROC4), мРНК. /PROD=transcriptional activator of the c-fos promoter /FL=gb:NM_006365.1 gb:U49857.1
B) Сравнение клеток H9 P39 на 6 часу стадии сформированной эндодермы и клеток EXPRES 01- Значения интенсивности приводятся в формате Log2
EXPRES 01
6 Ч СТАДИИ СЭ
Отношение
Направление
скорректир. значение p
Идентификатор гена
Название гена
-3,61621
3,039489
100,82
Повышение
0,001521
AL569326
Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность
-1,32044
4,397292
52,63
Повышение
0,005415
AF017987
Homo sapiens, связанный с апоптозом секретированный белок 2 (SARP2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=secreted apoptosis related protein 2 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-3,12747
2,554429
51,34
Повышение
0,000785
AV726956
Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
-1,56608
3,285259
28,87
Повышение
0,010886
NM_000767
Homo sapiens, цитохром P450, подсемейство IIB (индуцируемый фенобарбиталом), полипептид 6 (CYP2B6), мРНК. /PROD=cytochrome P450, subfamily IIB(phenobarbital-inducible), polypeptide 6 /FL=gb:NM_000767.2 gb:AF182277.1 gb:M29874.1
0,756526
5,442022
25,73
Повышение
0,000181
NM_003012
Homo sapiens, секретированный frizzled-связаный белок 1 (SFRP1), мРНК. /PROD=secreted frizzled-related protein 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-1,03397
3,570137
24,32
Повышение
0,000451
NM_003020
Homo sapiens, секреторная гранула, нейроэндокринный белок 1 (белок 7B2) (SGNE1), мРНК. /PROD=secretory granule, neuroendocrine protein 1 (7B2protein) /FL=gb:BC005349.1 gb:NM_003020.1
-0,27888
4,229001
22,75
Повышение
0,000262
AF225513
Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta /FL=gb:AF225513.1
-0,41404
4,064841
22,3
Повышение
0,000713
AI332407
секретированный frizzled-связаный белок 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-1,64839
2,511027
17,87
Повышение
0,001081
NM_004900
Homo sapiens, форболин (сходный с аполипопротеином B мРНК-редактирующий белок) (DJ742C19.2), мРНК. /PROD=phorbolin (similar to apolipoprotein B мРНКediting protein) /FL=gb:NM_004900.1 gb:U61083.1
-0,10733
3,921888
16,33
Повышение
0,001963
BC005107
Homo sapiens, клон IMAGE:3840937, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3840937)
-1,89835
2,08573
15,82
Повышение
0,000268
AL122010
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-997D16 на хромосоме 1p34.1-35.3. Содержит часть гена белка DAP-1, гены STS, GSS и островок CpG
-2,38787
1,510394
14,91
Повышение
0,012419
BC003517
Homo sapiens, клон IMAGE:3542589, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3542589)
1,168713
4,97383
13,98
Повышение
0,000908
NM_016139
Homo sapiens, белок 16,7 кДа (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
1,109291
4,713388
12,16
Повышение
0,000639
NM_005356
Homo sapiens, лимфоцит-специфическая тирозинкиназа (LCK), мРНК. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
-0,69028
2,890465
11,96
Повышение
0,001335
M16276
Человеческий белок MHC класса II, HLA-DR2-Dw12, мРНК, DQw1-бета, полная кодовая последовательность /FL=gb:NM_002123.1 gb:M16276.1 gb:M60028.1 gb:M17564.1 gb:M81141.1 gb:M81140.1
-2,89467
0,604102
11,3
Повышение
0,009629
AW971205
Гены EST
-1,66608
1,816524
11,18
Повышение
0,011253
BE673445
Homo sapiens, хромосома 19, космида R28379
3,061783
6,476101
10,66
Повышение
0,000192
BF057809
Гены EST
1,495888
4,907617
10,64
Повышение
0,000719
NM_002133
Homo sapiens, гем-оксигеназа (дециклирующая) 1 (HMOX1), мРНК. /PROD=heme oxygenase (decyclizing) 1 /FL=gb:NM_002133.1
-3,05488
0,24579
9,85
Повышение
0,002819
AI569804
Гены EST
-2,233
1,058708
9,79
Повышение
0,002994
NM_014862
Homo sapiens, продукт гена KIAA0307 (KIAA0307), мРНК. /PROD=KIAA0307 gene product /FL=gb:AB002305.1 gb:NM_014862.1
-3,588
-0,31418
9,67
Повышение
0,048375
AI743261
Гены EST
-2,01579
1,241268
9,56
Повышение
0,012905
AI937060
белок KIAA1151
-2,16864
1,08358
9,53
Повышение
0,053176
NM_001480
Homo sapiens, галаниновый рецептор 1 (GALR1), мРНК. /PROD=galanin receptor 1 /FL=gb:NM_001480.2 gb:U23854.1 gb:L34339.1 gb:U53511.1
-1,39784
1,792634
9,13
Повышение
0,006895
BE222344
богатый аргинином и серином фактор сплайсинга 5
-1,79406
1,292814
8,5
Повышение
0,025849
NM_004731
Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 7 (SLC16A7), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 7 /FL=gb:AF058056.1 gb:NM_004731.1
-0,04543
3,025604
8,4
Повышение
0,001481
AB037730
Homo sapiens, мРНК белка KIAA1309, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1309 protein
-2,62694
0,426879
8,3
Повышение
0,015097
NM_000055
Homo sapiens, бутирилхолинэстераза (BCHE), мРНК. /PROD=butyrylcholinesterase precursor /FL=gb:M16541.1 gb:M16474.1 gb:NM_000055.1
-3,17826
-0,15901
8,11
Повышение
0,032029
AI798098
Гены EST
1,875596
4,86264
7,93
Повышение
0,052512
M10098
Человеческий ген рРНК 18S, полный.
-2,87679
0,053356
7,62
Повышение
0,045164
AI378647
Гены EST
-2,39234
0,513238
7,49
Повышение
0,032932
NM_004389
Homo sapiens, катенин (белок, связанный с кадгеринами), альфа 2 (CTNNA2), мРНК. /PROD=catenin (cadherin-associated protein), alpha 2 /FL=gb:NM_004389.1 gb:M94151.2
-1,16113
1,724952
7,39
Повышение
0,016804
NM_012281
Homo sapiens, потенциал-зависимый калиевый канал, подсемейство, связанное с Shal, член 2 (KCND2), мРНК. /PROD=potassium voltage-gated channel, Shal-relatedsubfamily, member 2 /FL=gb:NM_012281.1 gb:AB028967.1 gb:AF121104.1
0,194248
3,078427
7,38
Повышение
0,002349
U07236
Человеческая мутантная лимфоцит-специфическая протеин-тирозинкиназа (LCK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
-1,57619
1,300336
7,34
Повышение
0,003836
AW072790
контактин 1
2,284174
5,158015
7,33
Повышение
0,031092
M10098
Человеческий ген рРНК 18S, полный.
-1,51992
1,341829
7,27
Повышение
0,008657
AA460960
H.sapiens, мРНК (клон ICRFp507L1876)
0,462867
3,324494
7,27
Повышение
0,005747
AI807026
Гены EST
-2,05438
0,78321
7,15
Повышение
0,031227
BG290908
Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
0,997757
3,818432
7,06
Повышение
0,000204
AU144892
Homo sapiens, кДНК FLJ11569 fis, клон HEMBA1003304
2,013831
4,834052
7,06
Повышение
0,044501
M10098
Человеческий ген рРНК 18S, полный.
-2,26295
0,550594
7,03
Повышение
0,018367
AI735586
Гены EST
-1,51616
1,294636
7,02
Повышение
0,005536
AJ272267
Homo sapiens, часть мРНК холиндегидрогеназы (ген chdh). /PROD=choline dehydrogenase
-2,13754
0,667215
6,99
Повышение
0,022696
BF000203
Гены EST
0,466394
3,270039
6,98
Повышение
0,000736
NM_003121
Homo sapiens, транскрипционный фактор Spi-B (связанный с Spi-1PU.1) (SPIB), мРНК. /PROD=Spi-B transcription factor (Spi-1PU.1 related) /FL=gb:NM_003121.1
-2,17012
0,632675
6,98
Повышение
0,0112
AB018580
Homo sapiens, мРНК белка hluPGFS, полная кодовая последовательность. /PROD=hluPGFS /FL=gb:NM_003739.2 gb:AF149416.2 gb:AB018580.1 gb:D17793.1
-2,45074
0,326451
6,86
Повышение
0,021849
AW149405
нейрексин 1 /FL=gb:AB035356.1
-0,8902
1,856598
6,71
Повышение
0,001423
NM_022034
Homo sapiens, ген 1, регулируемый эстрогеном (ERG-1), мРНК. /PROD=estrogen regulated gene 1 /FL=gb:AF305835.1 gb:NM_022034.1
-1,25121
1,488908
6,68
Повышение
0,001035
R62432
Кластер включает R62432:yg52e11.s1 Homo sapiens, кДНК, 3 конец /clone=IMAGE-36023 /clone_end=3 /gb=R62432 /gi=834311 /ug=Hs.12321 /len=487
-1,42062
1,315517
6,66
Повышение
0,053176
AI830490
глицеринкиназа
-1,85153
0,876867
6,63
Повышение
0,021533
AL359062
Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 1913076.
-3,12055
-0,40125
6,59
Повышение
0,044501
AW780006
Гены EST
1,037668
3,7519
6,56
Повышение
0,000736
R40892
Гены EST
-2,07873
0,630876
6,54
Повышение
0,00724
AI269290
переносчик растворенных веществ, семейство 18 (везикулярный моноамин), член 2 /FL=gb:L14269.1 gb:L23205.1 gb:L09118.1 gb:NM_003054.1
-1,88254
0,821519
6,52
Повышение
0,006908
BF694956
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP1-187J11 на хромосоме 6q11.1-22.33. Содержит ген нового белка, сходного с предсказанными белками S. pombe и S. cerevisiae, ген нового белка, сходного с ингибиторами протеинкиназы C, 3-конец
-0,5392
2,15739
6,48
Повышение
0,00126
AA769438
Гены EST со средней степенью подобия с ALU1_HUMAN ALU SUBFAMILY J SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
1,872557
4,557858
6,43
Повышение
0,000315
R38389
ольфактомедин-связанный белок, локализованный в ЭР
-2,06656
0,610015
6,39
Повышение
0,01711
AF141339
Homo sapiens, взаимодействующий с LYST белок LIP3, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=LYST-interacting protein LIP3
-1,4606
1,189801
6,28
Повышение
0,001394
AW072102
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434H205 (из клона DKFZp434H205)
-1,17422
1,42382
6,05
Повышение
0,007542
AI962169
Гены EST
-1,27392
1,293844
5,93
Повышение
0,042956
U11058
Homo sapiens, альфа-субъединица высокопроводящего кальциевого и потенциалзависимого калиевого канала (MaxiK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=large conductance calcium- and voltage-dependentpotassium channel alpha subunit /FL=gb:U23767.1 gb:NM_002247.1 gb:AF025999
-0,04433
2,486339
5,78
Повышение
0,001511
NM_007191
Homo sapiens, ингибирующий Wnt фактор-1 (WIF-1), мРНК. /PROD=Wnt inhibitory factor-1 /FL=gb:AF122922.1 gb:NM_007191.1
-1,38062
1,126483
5,68
Повышение
0,003297
NM_002590
Homo sapiens, протокадгерин 8 (PCDH8), мРНК. /PROD=protocadherin 8 /FL=gb:NM_002590.2 gb:AF061573.2
1,37261
3,87602
5,67
Повышение
0,000713
BC040605
Homo sapiens, клон IMAGE:5271039, мРНК.
-2,3444
0,156063
5,66
Повышение
0,002001
AW057589
Гены EST
-1,60594
0,882381
5,61
Повышение
0,016783
AL050090
Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp586F1018 (из клона DKFZp586F1018). /PROD=hypothetical protein
-1,09181
1,384319
5,56
Повышение
0,030796
AI653050
Гены EST с низкой степенью подобия с HPPD_HUMAN 4 - ГИДРОКСИФЕНИЛПИРУВАТ-ДИОКСИГЕНАЗОЙ (H.sapiens)
-0,32746
2,147256
5,56
Повышение
0,001039
L39833
Homo sapiens (клон hKvBeta3), субъединица K+ канала-бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=K+ channel beta-subunit /FL=gb:U16953.1 gb:L39833.1
-0,46577
2,00387
5,54
Повышение
0,000262
AW051591
Гены EST со средней степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
-2,19527
0,241495
5,41
Повышение
0,017156
NM_013333
Homo sapiens, EH домен-связывающий митотический фосфопротеин (EPSIN), мРНК. /PROD=EH domain-binding mitotic phosphoprotein /FL=gb:NM_013333.1 gb:AF073727.1
1,684042
4,109252
5,37
Повышение
0,000924
BE504979
белок, подобный белку синдрома Вискотта-Олдрича /FL=gb:D88460.1 gb:NM_003941.1
2,7744
5,196982
5,36
Повышение
0,001859
AA669799
Кластер включает AA669799:ag36c04.s1 Homo sapiens, кДНК, 3 конец /clone=IMAGE-1118886 /clone_end=3 /gb=AA669799 /gi=2631298 /ug=Hs.6315 /len=679
0,623369
3,023579
5,28
Повышение
0,000791
Homo sapiens, белок нейробластомы (нервная ткань) (AMY), мРНК. /PROD=neuroblastoma (nerve tissue) protein /FL=gb:NM_006334.1 gb:D82343.1
-0,0881
2,307249
5,26
Повышение
0,000742
AL565745
Гены EST с низкой степенью подобия с 2108402A, карнитин-пальмитоилтрансферазой I (H.sapiens)
0,225505
2,619908
5,26
Повышение
0,000552
AI968440
Гены EST
-1,67442
0,713629
5,23
Повышение
0008409
AW117456
нейротримин
0,040412
2,394979
5,11
Повышение
0,000552
AA960844
Homo sapiens, клон IMAGE:4081483, мРНК
1,638346
3,992456
5,11
Повышение
0,000281
AA603344
Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
1,923146
4,275361
5,11
Повышение
0,000799
BF057731
Гены EST
1,398961
3,745146
5,08
Повышение
0,000972
NM_024036
Homo sapiens, гипотетический белок MGC3103 (MGC3103), мРНК. /PROD=hypothetical protein MGC3103 /FL=gb:NM_024036.1 gb:BC000207.1
-0,2823
2,040956
5
Повышение
0,007542
NM_016582
Homo sapiens, переносчик пептидов 3 (LOC51296), мРНК. /PROD=peptide transporter 3 /FL=gb:NM_016582.1 gb:AB020598.1
3,409815
-2,62843
65,72
Снижение
0,0112
NM_016588
Homo sapiens, нейритин (LOC51299), мРНК. /PROD=neuritin /FL=gb:NM_016588.1 gb:BC002683.1 gb:AF136631.1
5,388254
0,009545
41,61
Снижение
0,000281
NM_004207
Homo sapiens, переносчик растворенных веществ семейства 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 (SLC16A3), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
3,094183
-1,98643
33,84
Снижение
0,012905
NM_013445
Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD25, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD25 /FL=gb:NM_013445.1 gb:AF178853.1 gb:BC002815.1
3,025351
-1,81749
28,7
Снижение
0,004056
AW590925
Гены EST
4,092731
-0,55563
25,08
Снижение
0,000627
AL513917
переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
6,777916
2,149128
24,74
Снижение
0,000281
U15174
Homo sapiens, взаимодействующий с белком BCL2adenovirus E1B 19 кДа белок 3 (BNIP3) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=BCL2adenovirus E1B 19kD-interacting protein 3 /FL=gb:AF002697.1 gb:NM_004052.2 gb:U15174.1
0,959227
-3,66704
24,7
Снижение
0,001627
AB033831
Homo sapiens, hSCDGF, мРНК фактора роста из спинного мозга, полная кодовая последовательность. /PROD=spinal cord-derived growth factor /FL=gb:NM_016205.1 gb:AB033831.1 gb:AF091434.1 gb:AF244813.1
1,470435
-3,07409
23,34
Снижение
0,029826
L49506
Homo sapiens, циклин G2, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cyclin G2 /FL=gb:L49506.1
4,161028
-0,3587
22,94
Снижение
0,006316
BC005807
Homo sapiens, клон MGC:10264, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:10264) /FL=gb:BC005807.1
2,446762
-1,7919
18,88
Снижение
0,029145
NM_005983
Homo sapiens, связанный с киназой S-фазы белок 2 (p45) (SKP2), мРНК. /PROD=S-phase kinase-associated protein 2 (p45) /FL=gb:U33761.1 gb:NM_005983.1
1,790331
-2,43995
18,77
Снижение
0,001074
AA775681
гипотетический белок FLJ23091
4,505436
0,27614
18,76
Снижение
0,000281
W57613
Гены EST
2,792215
-1,38592
18,1
Снижение
0,013563
BC017942
Homo sapiens, белок, подобный отоконину 90, клон IMAGE:4285317, мРНК.
4,507212
0,470029
16,42
Снижение
0,000262
AW196940
Гены EST
2,469646
-1,56158
16,35
Снижение
0,000649
N76327
Гены EST с высокой степенью подобия с трансферриновым рецептором 1011297A (H.sapiens)
2,770179
-1,16077
15,25
Снижение
0,000181
AK000345
Homo sapiens, кДНК FLJ20338 fis, клон HEP12179.
3,834572
-0,07465
15,02
Снижение
0,000272
NM_002610
Homo sapiens, пируват-дегидрогеназы киназа, изофермент 1 (PDK1), ядерный ген, кодирующий митохондриальный белок, мРНК. /PROD=pyruvate dehydrogenase kinase, isoenzyme 1 /FL=gb:NM_002610.2 gb:L42450.1
2,306111
-1,49375
13,93
Снижение
0,004398
AI632223
гипотетический белок DKFZp434F2322
3,030236
-0,72689
13,52
Снижение
0,006371
AA812232
стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
3,268087
-0,40455
12,75
Снижение
0,000114
AF345910
Homo sapiens, NYD-SP14, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NYD-SP14 /FL=gb:AF345910.1
5,294065
1,68926
12,17
Снижение
0,001199
AF279899
Homo sapiens, PNAS-145, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-145 /FL=gb:U03105.1 gb:NM_006813.1 gb:AF279899.1
0,173113
-3,3673
11,64
Снижение
0,006169
NM_152490
Homo sapiens, гипотетический белок MGC39558 (MGC39558), мРНК. /FL=gb:BC029564.1 gb:NM_152490.1
0,432613
-3,10597
11,62
Снижение
0,013508
BC004884
Homo sapiens, клон MGC:11141, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Unknown (protein for MGC:11141) /FL=gb:BC004884.1
6,371229
2,841928
11,55
Снижение
0,000432
AI950472
Гены EST
5,023981
1,496597
11,53
Снижение
0,000207
NM_006472
Homo sapiens, белок, стимулируемый 1,25-дигидроксивитамином D-3 (VDUP1), мРНК. /PROD=upregulated by 1,25-dihydroxyvitamin D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
2,036188
-1,4564
11,26
Снижение
0,023936
U55936
Человеческий SNAP-23, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=SNAP-23 /FL=gb:U55936.1 gb:BC000148.2 gb:BC003686.1 gb:Y09567.1
1,075159
-2,41498
11,24
Снижение
0,004979
J03580
Человеческий паратиреоидподобный белок (связанный со злокачественной гуморальной гиперкальцемией), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:J03580.1
6,091008
2,605414
11,2
Снижение
0,000741
BC020935
Homo sapiens, белок, подобный отоконину 90, клон IMAGE:4277593, мРНК.
0,783065
-2,6827
11,05
Снижение
0,030265
AB014486
Homo sapiens, мРНК белка RA70, полная кодовая последовательность /PROD=RA70 /FL=gb:AF051323.1 gb:BC002893.1 gb:AB014486.1 gb:AF072166.1 gb:NM_003930.1
2,505869
-0,95096
10,98
Снижение
0,001627
AV721177
фосфатидилинозитол-связывающий белок клатринового агрегата
4,749034
1,297636
10,94
Снижение
0,000464
NM_002130
Homo sapiens, 3-гидрокси-3-метилглутарил-коэнзим A синтаза 1 (растворимая) (HMGCS1), мРНК. /PROD=3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 1(soluble) /FL=gb:NM_002130.1 gb:L25798.1 gb:BC000297.1
1,840613
-1,60133
10,87
Снижение
0,015976
AI949760
Гены EST с низкой степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
2,060071
-1,36259
10,72
Снижение
0,003053
AA004300
гипотетический белок DKFZp566I133
2,990178
-0,3979
10,47
Снижение
0,000924
NM_013445
Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD25, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD25 /FL=gb:NM_013445.1 gb:AF178853.1 gb:BC002815.1
1,143234
-2,23959
10,43
Снижение
0,00724
BF437711
Гены EST
0,680039
-2,65005
10,06
Снижение
0,005452
AW268357
Гены EST с высокой степенью подобия с антигеном AF155116 1 NY-REN-60 (H.sapiens)
0,757197
-2,55666
9,94
Снижение
0,012419
AF213459
Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
3,953402
0,655224
9,84
Снижение
0,000312
BC005369
Homo sapiens, хромосома 1 открытая рамка считывания 12, клон MGC:12484, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=chromosome 1 open reading frame 12 /FL=gb:AF277176.1 gb:NM_022051.1 gb:AF229245.1 gb:BC005369.1
2,660133
-0,625
9,75
Снижение
0,000281
AF277174
Homo sapiens, PNAS-137, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-137 /FL=gb:AF277174.1
2,370141
-0,82549
9,16
Снижение
0,011076
BC020691
Homo sapiens, белок, сходный с фактором, стимулирующим колонии предшественников В-клеток, клон MGC:22427 IMAGE:4717726, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Similar to pre-B-cell colony-enhancing factor /FL=gb:BC020691.1
1,250277
-1,93752
9,11
Снижение
0,02358
BC035744
Homo sapiens, гипотетический белок HSPC129, клон MGC:46091 IMAGE:5744745, мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:BC035744.1
2,62025
-0,48479
8,6
Снижение
0,002377
AA625683
Гены EST
4,560288
1,479495
8,46
Снижение
0,000799
BF979497
скваленэпоксидаза
1,609384
-1,40302
8,07
Снижение
0,03374
BC005961
Homo sapiens, паратгормон-подобный гормон, клон MGC:14611, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=parathyroid hormone-like hormone /FL=gb:BC005961.1
2,422113
-0,58962
8,07
Снижение
0,035909
AL544576
Гены EST
4,285883
1,280326
8,03
Снижение
0,000262
AL038787
6-фосфофрукто-2-киназафруктоза-2,6-бифосфатаза 4
1,194285
-1,77245
7,82
Снижение
0,029849
NM_001898
Homo sapiens, цистатин SN (CST1), мРНК. /PROD=cystatin SN /FL=gb:J03870.1 gb:NM_001898.1
0,885541
-2,07053
7,76
Снижение
0,025326
AV721958
Гены EST
4,501184
1,559254
7,68
Снижение
0,000103
AK000162
Homo sapiens, кДНК FLJ20155 fis, клон COL08754, с высокой степенью подобия с ACSA_ECOLI АЦЕТИЛКОЭНЗИМ А-СИНТЕТАЗОЙ.
2,264785
-0,65782
7,58
Снижение
0,000552
AF005037
Homo sapiens, мембранный белок - секреторный переносчик (SCAMP1) мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=secretory carrier membrane protein /FL=gb:AF038966.1 gb:AF005037.1 gb:NM_004866.1
5,095598
2,21166
7,38
Снижение
0,001394
NM_005542
Homo sapiens, индуцируемый инсулином ген 1 (INSIG1), мРНК. /PROD=insulin induced gene 1 /FL=gb:NM_005542.1
5,979532
3,098176
7,37
Снижение
0,003586
U18197
Человеческая АТФ:цитрат-лиаза, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ATP:citrate lyase /FL=gb:U18197.1
4,782763
1,929757
7,23
Снижение
0,000451
NM_004199
Homo sapiens, проколлаген-пролин, 2-оксоглутарат 4-диоксигеназа (пролин 4-гидроксилаза), альфа полипептид II, мРНК. /PROD=procollagen-proline, 2-oxoglutarate4-dioxygenase (proline 4-hydroxylase), alpha polypeptideII /FL=gb:NM_004199.1 gb:U904
5,356771
2,540614
7,04
Снижение
0,000587
W92036
Гены EST
1,41468
-1,38083
6,94
Снижение
0,017389
NM_018470
Homo sapiens, неохарактеризованный белок гипоталамуса HT009 (HT009), мРНК. /PROD=uncharacterized hypothalamus protein HT009 /FL=gb:AF220183.1 gb:NM_018470.1
7,047717
4,25951
6,91
Снижение
0,000431
NM_004052
Homo sapiens, взаимодействующий с белком BCL2adenovirus E1B 19 кДа белок 3 (BNIP3), ядерный ген, кодирующий митохондриальный белок, мРНК. /PROD=BCL2adenovirus E1B 19kD-interacting protein 3 /FL=gb:AF002697.1 gb:NM_004052.2 gb:U15174.1
1,815339
-0,96912
6,89
Снижение
0,011253
BE206621
Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp434P228 (из клона DKFZp434P228)
5,319714
2,54291
6,85
Снижение
0,000213
AL117352
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-876B10 на хромосоме 1q42.12-43. Содержит 3-конец гена GNPAT для глицеронфосфат O-ацилтрансферазы (DHAPAT, DAPAT, дигидроксиацетонфосфат-ацилтрансфераза, EC 2.3.1.42), ген нового белка...
4,010007
1,2423
6,81
Снижение
0,00398
NM_006577
Homo sapiens, бета-1,3-N-ацетилглюкозаминилтрансфераза (BETA3GNT), мРНК. /PROD=beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase /FL=gb:NM_006577.2 gb:AF288208.1 gb:AF092051.2
1,390174
-1,34692
6,67
Снижение
0,014402
BC001224
Homo sapiens, клон MGC:982 IMAGE:3354306, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Unknown (protein for MGC:982) /FL=gb:BC001224.1
0,831091
-1,89825
6,63
Снижение
0,025217
NM_153036
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32239 (FLJ32239), мРНК. /FL=gb:NM_153036.1
2,33099
-0,39642
6,62
Снижение
0,000103
NM_004041
Homo sapiens, аррестин бета 1 (ARRB1), вариант транскрипта 1, мРНК. /PROD=arrestin beta 1, isoform A /FL=gb:BC003636.1 gb:AF084040.1 gb:NM_004041.2
1,389794
-1,32346
6,56
Снижение
0,006908
BG498699
Гены EST
4,424942
1,717072
6,53
Снижение
0,000627
AF493929
Homo sapiens, регулятор G-белковой сигнализации 5 (RGS5) мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=regulator of G protein signalling 5 /FL=gb:AF493929.1
1,987876
-0,71603
6,52
Снижение
0,032029
D84105
Человеческий CD46, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=CD46 /FL=gb:D84105.1
2,224696
-0,43842
6,33
Снижение
0,003781
NM_015601
Homo sapiens, белок DKFZP564G092 (DKFZP564G092), мРНК. /PROD=DKFZP564G092 protein /FL=gb:NM_015601.1
0,366041
-2,27572
6,24
Снижение
0,017238
AI242583
Homo sapiens, кДНК FLJ11550 fis, клон HEMBA1002970
0,899011
-1,74189
6,24
Снижение
0,031092
NM_002820
Homo sapiens, паратгормон-подобный гормон (PTHLH), мРНК. /PROD=parathyroid hormone-like hormone /FL=gb:J03802.1 gb:NM_002820.1
-0,00139
-2,64223
6,24
Снижение
0,045323
NM_002837
Homo sapiens, протеинтирозинфосфатаза, рецепторного типа, B (PTPRB), мРНК. /PROD=protein tyrosine phosphatase, receptor type, B /FL=gb:NM_002837.1
0,81216
-1,82788
6,23
Снижение
0,021836
NM_017763
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ20315 (FLJ20315), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ20315 /FL=gb:NM_017763.1
5,600865
2,995377
6,09
Снижение
0,000713
AI183997
регулятор G-белковой сигнализации 5 /FL=gb:AB008109.1 gb:NM_003617.1 gb:AF159570.1
2,350127
-0,2504
6,07
Снижение
0,030265
AK026106
Homo sapiens кДНК: FLJ22453 fis, клон HRC09679, высокая степень подобия с AF059516, Homo sapiens толлоид-подобный белок 2 (TLL2), мРНК.
3,732985
1,134619
6,06
Снижение
0,001697
AI459194
белок раннего ростового ответа 1
2,36447
-0,20141
5,92
Снижение
0,000552
NM_005181
Homo sapiens, карбоангидраза III, специфичная для мышц (CA3), мРНК. /PROD=carbonic anhydrase III /FL=gb:BC004897.1 gb:NM_005181.2
3,621319
1,058823
5,91
Снижение
0,001394
AY072911
Homo sapiens, рецептор аденовируса коксаки, изоформа CAR37 (CXADR), мРНК, полная кодовая последовательность; продукт альтернативного сплайсинга. /PROD=coxsackie-adenovirus-receptor isoform CAR37 /FL=gb:AY072911.1
3,816817
1,261309
5,88
Снижение
0,000279
AF116616
Homo sapiens, PRO0998, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PRO0998 /FL=gb:AF116616.1
2,003811
-0,52279
5,76
Снижение
0,012377
AK001291
Homo sapiens кДНК FLJ10429 fis, клон NT2RP1000413, высокая степень подобия с Homo sapiens мРНК для белка KIAA0587.
2,951696
0,463484
5,61
Снижение
0,000268
AB019562
Homo sapiens, мРНК, экспрессируемая только в ворсинах плаценты, клон SMAP41.
4,654166
2,17714
5,57
Снижение
0,006161
H09085
Homo sapiens, клон FLC0675 PRO2870 мРНК, полная кодовая последовательность
2,590871
0,126582
5,52
Снижение
0,00106
NM_016569
Homo sapiens, изо-белок TBX3 (TBX3-iso), мРНК. /PROD=TBX3-iso protein /FL=gb:NM_016569.1 gb:AF216750.1
2,432066
-0,0298
5,51
Снижение
0,005455
NM_007034
Homo sapiens, DnaJ-подобный белок теплового шока 40 (HLJ1), мРНК. /PROD=DnaJ-like heat shock protein 40 /FL=gb:NM_007034.2 gb:U40992.2
5,807319
3,352042
5,48
Снижение
0,000612
NM_018004
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10134 (FLJ10134), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10134 /FL=gb:NM_018004.1
2,006604
-0,43301
5,42
Снижение
0,000713
NM_004087
Homo sapiens, гомолог 1 белка discs large (Drosophila) (DLG1), мРНК. /PROD=discs, large (Drosophila) homolog 1 /FL=gb:NM_004087.1 gb:U13896.1
0,72592
-1,71056
5,41
Снижение
0,014643
AB050856
Homo sapiens, beta3GalNAcT-1, мРНК глобозид синтазы, полная кодовая последовательность, клон:тип 2. /PROD=globoside synthase /FL=gb:AB050856.1
3,805066
1,369345
5,41
Снижение
0,001099
BG330076
Человеческий альфа-катенин, мРНК, частичная кодовая последовательность.
3,70002
1,279892
5,35
Снижение
0,014262
NM_006544
Homo sapiens, SEC10 (S. cerevisiae)-подобный белок 1 (SEC10L1), мРНК. /PROD=SEC10 (S. cerevisiae)-like 1 /FL=gb:U85946.1 gb:NM_006544.1
0,873551
-1,53444
5,31
Снижение
0,031228
AW293376
Гены EST
5,850582
3,443167
5,31
Снижение
0,008657
AF394735
Homo sapiens, сходный с дефицитным при угнетении митоза белком MAD2 вариант белка 1 (MAD2L1) мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=MAD2 mitotic arrest deficient-like 1 variant /FL=gb:AF394735.1
5,252439
2,850969
5,28
Снижение
0,000192
NM_001553
Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
1,275104
-1,11616
5,25
Снижение
0,031092
AU146738
Homo sapiens кДНК FLJ11985 fis, клон HEMBB1001356
4,255531
1,866771
5,24
Снижение
0,001003
AF096296
Homo sapiens, предшественник хемокина-1 стромы тимуса, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=thymic stroma chemokine-1 precursor /FL=gb:AF142434.1 gb:AF096296.1 gb:AF124601.1 gb:AB010447.1 gb:NM_006072.1
4,075321
1,687619
5,23
Снижение
0,000791
AI652662
аминотрансфераза 1 с разветвленной цепью, цитозольная
3,806044
1,418363
5,23
Снижение
0,010886
AV734646
Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
2,276913
-0,10568
5,21
Снижение
0,042222
AK025909
Homo sapiens кДНК: FLJ22256 fis, клон HRC02860.
3,264799
0,883433
5,21
Снижение
0,001003
NM_016076
Homo sapiens, белок CGI-146 (LOC51029), мРНК. /PROD=CGI-146 protein /FL=gb:NM_016076.1 gb:AF151904.1
-0,70217
-3,08122
5,2
Снижение
0,046444
AV735100
Гены EST, с низкой степенью подобия с ALU1_HUMAN ALU SUBFAMILY J SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
2,28595
-0,08329
5,17
Снижение
0,001394
BE504838
Гены EST
0,424388
-1,93597
5,13
Снижение
0,039624
NM_002433
Homo sapiens, гликопротеин миелина олигодендроцитов (MOG), мРНК. /PROD=myelin oligodendrocyte glycoprotein /FL=gb:U18798.1 gb:U64564.1 gb:NM_002433.1
5,450694
3,100148
5,1
Снижение
0,000281
AF095771
Homo sapiens, реагирующий на PTH белок остеосаркомы B1 (B1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PTH-responsive osteosarcoma B1 protein /FL=gb:AF095771.1
2,176455
-0,15806
5,04
Снижение
0,000603
AB033281
Homo sapiens, BTRCP2, мРНК белка с F-боксом и WD-повторами, изоформа C, полная кодовая последовательность /PROD=F-box and WD-repeats protein beta-TRCP2 isoformC /FL=gb:AF176022.1 gb:AB033281.1
4,103964
1,770836
5,04
Снижение
0,000114
AA579773
Гены EST
4,970228
2,637225
5,04
Снижение
0,005013
AF450454
Homo sapiens, предполагаемый цинк-пальцевый белок 42 (ZFP42), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=putative zinc finger protein 42 /FL=gb:AF450454.1
1,951234
-0,37257
5,01
Снижение
0,032802
NM_016277
Homo sapiens, RAB23, член семейства RAS-онкогенов (RAB23), мРНК. /PROD=RAB23 protein /FL=gb:NM_016277.1 gb:AB034244.1
C) Сравнение клеток H9 P39 на 24 часу стадии сформированной эндодермы и клеток EXPRES 01- Значения интенсивности приводятся в формате Log2
EXPRES 01
24 ЧАС СТАДИИ СЭ
Отношение
Направление
скорректир. значение p
Идентификатор гена
Название гена
-3,61621
3,252949
116,9
Повышение
1.09E-03
AL569326
Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность
-3,12747
2,81955
61,69
Повышение
5.09E-04
AV726956
Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
-0,27888
4,796134
33,71
Повышение
2.25E-04
AF225513
Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta /FL=gb:AF225513.1
-3,26893
1,684842
30,99
Повышение
1.95E-04
NM_001785
Homo sapiens, цитидин деаминаза (CDA), мРНК. /PROD=cytidine deaminase /FL=gb:L27943.1 gb:NM_001785.1
-3,88742
0,690893
23,89
Повышение
2.83E-03
AA180985
Гены EST
-1,32044
3,115913
21,65
Повышение
9.44E-03
AF017987
Homo sapiens, связанный с апоптозом секретированный белок 2 (SARP2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=secreted apoptosis related protein 2 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
1,168713
5,393939
18,7
Повышение
4.05E-04
NM_016139
Homo sapiens, белок 16,7 кДа (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
-2,69521
1,432079
17,48
Повышение
7.06E-05
AF282250
Homo sapiens, кальньюрон 1 (CALN1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=calneuron 1 /FL=gb:AF282250.1
-2,506
1,523432
16,33
Повышение
2.66E-04
AW193693
белок DKFZP566K1924
-0,10733
3,827249
15,29
Повышение
5.09E-04
BC005107
Homo sapiens, клон IMAGE:3840937, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3840937)
-3,62742
0,232422
14,52
Повышение
1.32E-02
AA772920
Гены EST
-0,69028
3,077263
13,62
Повышение
8.84E-04
M16276
Человеческий белок MHC класса II, HLA-DR2-Dw12, мРНК, DQw1-бета, полная кодовая последовательность /FL=gb:NM_002123.1 gb:M16276.1 gb:M60028.1 gb:M17564.1 gb:M81141.1 gb:M81140.1
-2,38787
1,308962
12,97
Повышение
1.24E-02
BC003517
Homo sapiens, клон IMAGE:3542589, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3542589)
-1,03397
2,650732
12,86
Повышение
4.41E-04
NM_003020
Homo sapiens, секреторная гранула, нейроэндокринный белок 1 (белок 7B2) (SGNE1), мРНК. /PROD=secretory granule, neuroendocrine protein 1 (7B2protein) /FL=gb:BC005349.1 gb:NM_003020.1
-2,05438
1,576656
12,39
Повышение
1.46E-02
BG290908
Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
0,756526
4,2504
11,27
Повышение
1.84E-04
NM_003012
Homo sapiens, секретированный frizzled-связаный белок 1 (SFRP1), мРНК. /PROD=secreted frizzled-related protein 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-1,39784
2,037775
10,82
Повышение
4.58E-03
BE222344
богатый аргинином и серином фактор сплайсинга 5
-3,12304
0,280186
10,58
Повышение
1.86E-02
NM_018018
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10191 (FLJ10191), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10191 /FL=gb:NM_018018.1
-2,01579
1,387151
10,58
Повышение
7.46E-03
AI937060
белок KIAA1151
-2,19527
1,171426
10,32
Повышение
2.14E-03
NM_013333
Homo sapiens, EH домен-связывающий митотический фосфопротеин (EPSIN), мРНК. /PROD=EH domain-binding mitotic phosphoprotein /FL=gb:NM_013333.1 gb:AF073727.1
-1,16113
2,202477
10,29
Повышение
8.90E-03
NM_012281
Homo sapiens, потенциал-зависимый калиевый канал, подсемейство, связанное с Shal, член 2 (KCND2), мРНК. /PROD=potassium voltage-gated channel, Shal-relatedsubfamily, member 2 /FL=gb:NM_012281.1 gb:AB028967.1 gb:AF121104.1
1,109291
4,425076
9,96
Повышение
3.72E-04
NM_005356
Homo sapiens, лимфоцит-специфическая тирозинкиназа (LCK), мРНК. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
-1,66608
1,62119
9,76
Повышение
1.29E-02
BE673445
Homo sapiens, хромосома 19, космида R28379
-2,233
1,032915
9,62
Повышение
4.41E-03
NM_014862
Homo sapiens, продукт гена KIAA0307 (KIAA0307), мРНК. /PROD=KIAA0307 gene product /FL=gb:AB002305.1 gb:NM_014862.1
-3,17826
0,063512
9,46
Повышение
2.56E-02
AI798098
Гены EST
3,042634
6,275162
9,4
Повышение
1.84E-04
NM_005442
Homo sapiens, гомолог эомезодермина (Xenopus laevis) (EOMES), мРНК. /PROD=eomesodermin (Xenopus laevis) homolog /FL=gb:AB031038.1 gb:NM_005442.1
-2,62694
0,564089
9,13
Повышение
1.08E-02
NM_000055
Homo sapiens, бутирилхолинэстераза (BCHE), мРНК. /PROD=butyrylcholinesterase precursor /FL=gb:M16541.1 gb:M16474.1 gb:NM_000055.1
-3,588
-0,42279
8,97
Повышение
5.08E-02
AI743261
Гены EST
-1,75731
1,403919
8,95
Повышение
3.72E-02
BC008992
Homo sapiens, клон MGC:16926 IMAGE:4183000, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Unknown (protein for MGC:16926) /FL=gb:BC008992.1
-1,56608
1,492453
8,33
Повышение
3.48E-02
NM_000767
Homo sapiens, цитохром P450, подсемейство IIB (индуцируемый фенобарбиталом), полипептид 6 (CYP2B6), мРНК. /PROD=cytochrome P450, subfamily IIB(phenobarbital-inducible), polypeptide 6 /FL=gb:NM_000767.2 gb:AF182277.1 gb:M29874.1
-1,64839
1,373964
8,12
Повышение
2.63E-03
NM_004900
Homo sapiens, форболин (сходный с аполипопротеином B мРНК-редактирующий белок) (DJ742C19.2), мРНК. /PROD=phorbolin (similar to apolipoprotein B мРНКediting protein) /FL=gb:NM_004900.1 gb:U61083.1
-2,85395
0,154004
8,04
Повышение
3.89E-02
AY063451
Homo sapiens, D21S2088E, последовательность мРНК.
-1,61054
1,380575
7,95
Повышение
3.70E-03
AW264204
Гены EST
-3,12055
-0,14826
7,85
Повышение
3.16E-02
AW780006
Гены EST
-0,48291
2,475412
7,77
Повышение
6.01E-04
NM_000273
Homo sapiens, белок глазного альбинизма 1 (синдрома Неттлшопа-Фоллза) (OA1), мРНК. /PROD=ocular albinism 1 (Nettleship-Falls) protein /FL=gb:NM_000273.1
-0,01122
2,91624
7,61
Повышение
5.09E-04
AI356398
Реагирующий на бутират фактор 2 (реагирующий на EGF фактор 2) /FL=gb:BC005010.1 gb:NM_006887.1
-0,41404
2,492138
7,5
Повышение
1.22E-03
AI332407
секретированный frizzled-связаный белок 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-0,04543
2,826104
7,32
Повышение
8.38E-04
AB037730
Homo sapiens, мРНК белка KIAA1309, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1309 protein
3,061783
5,932074
7,31
Повышение
2.39E-04
BF057809
Гены EST
1,750623
4,603127
7,22
Повышение
3.35E-04
AA176289
Гены EST
1,37261
4,224545
7,22
Повышение
2.56E-04
BC040605
Homo sapiens, клон IMAGE:5271039, мРНК.
0,194248
2,977224
6,88
Повышение
1.76E-03
U07236
Человеческая мутантная лимфоцит-специфическая протеин-тирозинкиназа (LCK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
-2,17012
0,571059
6,69
Повышение
1.11E-02
AB018580
Homo sapiens, мРНК белка hluPGFS, полная кодовая последовательность. /PROD=hluPGFS /FL=gb:NM_003739.2 gb:AF149416.2 gb:AB018580.1 gb:D17793.1
0,270429
2,998558
6,63
Повышение
2.01E-02
AF493872
Homo sapiens, связывающий гуаниновый нуклеотид белок гамма 4 (GNG4), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=guanine nucleotide binding protein gamma 4 /FL=gb:AF493872.1
0,462867
3,188675
6,62
Повышение
5.56E-03
AI807026
Гены EST
-2,3444
0,379948
6,61
Повышение
5.18E-04
AW057589
Гены EST
-2,06656
0,644395
6,55
Повышение
1.48E-02
AF141339
Homo sapiens, взаимодействующий с LYST белок LIP3, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=LYST-interacting protein LIP3
-1,88254
0,823917
6,53
Повышение
5.94E-03
BF694956
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP1-187J11 на хромосоме 6q11.1-22.33. Содержит ген нового белка, сходного с предсказанными белками S. pombe и S. cerevisiae, ген нового белка, сходного с ингибиторами протеинкиназы C, 3-конец
-2,14678
0,54813
6,48
Повышение
2.59E-02
AA143060
Гены EST с высокой степенью подобия с I38945, повсеместно распространенным при меланоме мутантным белком (H.sapiens)
-1,09181
1,594917
6,44
Повышение
2.17E-02
AI653050
Гены EST с низкой степенью подобия с HPPD_HUMAN 4 - ГИДРОКСИФЕНИЛПИРУВАТ-ДИОКСИГЕНАЗОЙ (H.sapiens)
-1,57619
1,107388
6,42
Повышение
2.44E-03
AW072790
контактин 1
-1,42062
1,262234
6,42
Повышение
5.27E-02
AI830490
глицеринкиназа
-1,51992
1,159662
6,41
Повышение
4.58E-03
AA460960
H.sapiens, мРНК (клон ICRFp507L1876)
0,828954
3,501807
6,38
Повышение
9.79E-04
AK026659
Homo sapiens кДНК: FLJ23006 fis, клон LNG00414.
0,040412
2,69519
6,3
Повышение
3.16E-04
AA960844
Homo sapiens, клон IMAGE:4081483, мРНК
-0,0881
2,555378
6,25
Повышение
1.84E-04
AL565745
Гены EST с низкой степенью подобия с 2108402A, карнитин-пальмитоилтрансферазой I (H.sapiens)
-0,66924
1,971531
6,24
Повышение
1.10E-02
AI986120
связывающий латентный трансформирующий фактор роста бета белок 1 /FL=gb:M34057.1 gb:NM_000627.1
-1,25121
1,36043
6,11
Повышение
8.84E-04
R62432
Кластер включает R62432:yg52e11.s1 Homo sapiens, кДНК, 3 конец /clone=IMAGE-36023 /clone_end=3 /gb=R62432 /gi=834311 /ug=Hs.12321 /len=487
1,285793
3,892769
6,09
Повышение
1.84E-04
AI949827
Гены EST
-1,4606
1,131857
6,03
Повышение
1.46E-03
AW072102
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434H205 (из клона DKFZp434H205)
1,037668
3,589262
5,86
Повышение
3.89E-04
R40892
Гены EST
-2,13754
0,412333
5,86
Повышение
2.35E-02
BF000203
Гены EST
1,470195
4,017332
5,84
Повышение
1.93E-04
AI676059
Гены EST
0,780689
3,30524
5,75
Повышение
2.66E-04
AI016316
Гены EST
-1,41031
1,100005
5,7
Повышение
2.17E-02
AI832477
серологически определяемый антиген 43 колоректального рака
-0,68225
1,819364
5,66
Повышение
3.04E-03
N48299
Гены EST со средней степенью подобия с NFY-C (H.sapiens)
0,937118
3,415706
5,57
Повышение
2.66E-04
AU151342
Homo sapiens, кДНК FLJ12935 fis, клон NT2RP2004982
-0,41626
2,0614
5,57
Повышение
1.39E-03
BF110534
Гены EST
2,167442
4,632856
5,52
Повышение
2.19E-04
NM_001552
Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 4 (IGFBP4), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor-binding protein 4 /FL=gb:M62403.1 gb:NM_001552.1
-0,46577
1,990737
5,49
Повышение
1.62E-04
AW051591
Гены EST со средней степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
-1,98038
0,474231
5,48
Повышение
1.22E-02
NM_002442
Homo sapiens, гомолог 1 белка Musashi (Drosophila) (MSI1), мРНК. /PROD=Musashi (Drosophila) homolog 1 /FL=gb:AB012851.1 gb:NM_002442.1
0,466394
2,917466
5,47
Повышение
6.01E-04
NM_003121
Homo sapiens, транскрипционный фактор Spi-B (связанный с Spi-1PU.1) (SPIB), мРНК. /PROD=Spi-B transcription factor (Spi-1PU.1 related) /FL=gb:NM_003121.1
-2,73733
-0,30853
5,38
Повышение
1.36E-03
L41944
Homo sapiens, рецептор интерферона ifnar2-1 (вариант сплайсинга IFNAR2-1), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=interferon receptor /FL=gb:NM_000874.1 gb:L41944.1
0,923781
3,31197
5,23
Повышение
2.23E-04
BE897866
Гены EST
1,198446
3,56619
5,16
Повышение
3.79E-03
BG283790
Гены EST
0,013383
2,37551
5,14
Повышение
7.45E-03
L10374
Человеческая (клон CTG-A4) последовательность мРНК.
-1,39667
0,965049
5,14
Повышение
2.75E-03
AI018174
Гены EST
-3,38515
-1,06056
5,01
Повышение
3.31E-02
NM_172368
Homo sapiens, предполагаемый белок LG30 (G30), мРНК. /PROD=putative protein LG30 /FL=gb:AY138548.1 gb:NM_172368.1
3,409815
-1,99672
42,42
Снижение
8.38E-04
NM_016588
Homo sapiens, нейритин (LOC51299), мРНК. /PROD=neuritin /FL=gb:NM_016588.1 gb:BC002683.1 gb:AF136631.1
4,092731
-0,75499
28,79
Снижение
3.57E-04
AL513917
переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
5,388254
0,591477
27,8
Снижение
4.11E-05
NM_004207
Homo sapiens, переносчик растворенных веществ семейства 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 (SLC16A3), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
2,306225
-2,24414
23,43
Снижение
1.14E-03
AW444761
Гены EST
2,306111
-1,93483
18,91
Снижение
7.20E-04
AI632223
гипотетический белок DKFZp434F2322
3,025351
-1,21304
18,87
Снижение
6.42E-03
AW590925
Гены EST
0,757197
-3,40795
17,94
Снижение
7.19E-03
AF213459
Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
0,959227
-3,03425
15,93
Снижение
1.27E-02
AB033831
Homo sapiens, hSCDGF, мРНК фактора роста из спинного мозга, полная кодовая последовательность. /PROD=spinal cord-derived growth factor /FL=gb:NM_016205.1 gb:AB033831.1 gb:AF091434.1 gb:AF244813.1
4,505436
0,524918
15,79
Снижение
1.36E-04
W57613
Гены EST
0,942774
-2,97701
15,13
Снижение
8.44E-04
AW957786
Гены EST, с низкой степенью подобия с S51797, фосфопротеином, стимулируемым вазодилятаторами (H.sapiens)
1,1136
-2,73154
14,37
Снижение
1.61E-02
Z70519
H.sapiens, FASApo 1, мРНК для растворимого белка FAS (клон FAS Exo4Del). /PROD=FAS soluble protein
1,389794
-2,42829
14,1
Снижение
1.11E-02
BG498699
Гены EST
1,312148
-2,42325
13,32
Снижение
5.09E-04
U32500
Человеческий рецептор типа 2 к нейропептиду Y, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=type 2 neuropeptide Y receptor /FL=gb:U42766.1 gb:U36269.1 gb:U32500.1
2,62025
-1,04008
12,64
Снижение
1.04E-03
AA625683
Гены EST
3,268087
-0,32148
12,04
Снижение
1.86E-04
AF345910
Homo sapiens, NYD-SP14, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NYD-SP14 /FL=gb:AF345910.1
4,152765
0,57732
11,92
Снижение
3.06E-04
AW003173
станниокальцин 1
6,777916
3,231028
11,69
Снижение
3.37E-05
U15174
Homo sapiens, взаимодействующий с белком BCL2adenovirus E1B 19 кДа белок 3 (BNIP3) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=BCL2adenovirus E1B 19kD-interacting protein 3 /FL=gb:AF002697.1 gb:NM_004052.2 gb:U15174.1
1,143234
-2,39818
11,64
Снижение
6.01E-04
BF437711
Гены EST
2,36447
-1,1716
11,6
Снижение
3.57E-04
NM_005181
Homo sapiens, карбоангидраза III, специфичная для мышц (CA3), мРНК. /PROD=carbonic anhydrase III /FL=gb:BC004897.1 gb:NM_005181.2
4,285883
0,804811
11,17
Снижение
3.89E-04
AL038787
6-фосфофрукто-2-киназафруктоза-2,6-бифосфатаза 4
5,023981
1,567701
10,98
Снижение
2.66E-04
NM_006472
Homo sapiens, белок, стимулируемый 1,25-дигидроксивитамином D-3 (VDUP1), мРНК. /PROD=upregulated by 1,25-dihydroxyvitamin D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
2,590871
-0,83277
10,73
Снижение
2.00E-03
NM_016569
Homo sapiens, изо-белок TBX3 (TBX3-iso), мРНК. /PROD=TBX3-iso protein /FL=gb:NM_016569.1 gb:AF216750.1
2,332751
-1,07983
10,65
Снижение
2.06E-02
NM_000077
Homo sapiens, циклин-зависимой киназы ингибитор 2A (меланома, p16, ингибирует CDK4) (CDKN2A), мРНК. /PROD=cyclin-dependent kinase inhibitor 2A (melanoma,p16, inhibits CDK4) /FL=gb:NM_000077.1 gb:L27211.1
1,577138
-1,83389
10,64
Снижение
3.70E-03
M15329
Человеческий интерлейкин 1-альфа (IL1A), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=interleukin 1-alpha /FL=gb:M15329.1
0,831091
-2,57623
10,61
Снижение
1.77E-02
NM_153036
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32239 (FLJ32239), мРНК. /FL=gb:NM_153036.1
2,350127
-1,04844
10,55
Снижение
2.83E-03
AK026106
Homo sapiens кДНК: FLJ22453 fis, клон HRC09679, высокая степень подобия с AF059516, Homo sapiens толлоид-подобный белок 2 (TLL2), мРНК.
4,927935
1,558948
10,33
Снижение
6.84E-04
J05008
Homo sapiens, ген эндотелина-1 (EDN1), полная кодовая последовательность /FL=gb:NM_001955.1
2,951696
-0,34119
9,8
Снижение
5.52E-04
AB019562
Homo sapiens, мРНК, экспрессируемая только в ворсинах плаценты, клон SMAP41.
-0,42962
-3,66853
9,44
Снижение
3.14E-02
D28364
Человеческая мРНК для аннексина II, 5UTR (последовательность от 5cap до стартового кодона).
3,030236
-0,19682
9,36
Снижение
3.06E-04
AA812232
стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
4,528627
1,33908
9,12
Снижение
1.86E-04
NM_003155
Homo sapiens, станниокальцин 1 (STC1), мРНК. /PROD=stanniocalcin 1 /FL=gb:U25997.1 gb:NM_003155.1 gb:U46768.1
2,660133
-0,51613
9,04
Снижение
3.37E-05
AF277174
Homo sapiens, PNAS-137, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-137 /FL=gb:AF277174.1
2,422113
-0,74259
8,97
Снижение
6.51E-03
AL544576
Гены EST
3,806044
0,684261
8,7
Снижение
3.17E-04
AV734646
Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
3,953402
0,872354
8,46
Снижение
1.12E-03
BC005369
Homo sapiens, хромосома 1 открытая рамка считывания 12, клон MGC:12484, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=chromosome 1 open reading frame 12 /FL=gb:AF277176.1 gb:NM_022051.1 gb:AF229245.1 gb:BC005369.1
3,437271
0,406885
8,17
Снижение
1.28E-04
AB029025
Homo sapiens мРНК белка KIAA1102, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1102 protein
2,469646
-0,53314
8,02
Снижение
1.95E-03
N76327
Гены EST с высокой степенью подобия с трансферриновым рецептором 1011297A (H.sapiens)
4,255531
1,305501
7,73
Снижение
2.22E-03
AF096296
Homo sapiens, предшественник хемокина-1 стромы тимуса, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=thymic stroma chemokine-1 precursor /FL=gb:AF142434.1 gb:AF096296.1 gb:AF124601.1 gb:AB010447.1 gb:NM_006072.1
1,609384
-1,3385
7,72
Снижение
3.57E-04
BC005961
Homo sapiens, паратгормон-подобный гормон, клон MGC:14611, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=parathyroid hormone-like hormone /FL=gb:BC005961.1
5,356771
2,475735
7,37
Снижение
2.39E-04
W92036
Гены EST
4,055862
1,176103
7,36
Снижение
1.54E-04
AK026815
Homo sapiens кДНК: FLJ23162 fis, клон LNG09734.
4,782763
1,926881
7,24
Снижение
2.56E-04
NM_004199
Homo sapiens, проколлаген-пролин, 2-оксоглутарат 4-диоксигеназа (пролин 4-гидроксилаза), альфа полипептид II, мРНК. /PROD=procollagen-proline, 2-oxoglutarate4-dioxygenase (proline 4-hydroxylase), alpha polypeptideII /FL=gb:NM_004199.1 gb:U904
4,749034
1,911794
7,15
Снижение
6.01E-04
NM_002130
Homo sapiens, 3-гидрокси-3-метилглутарил-коэнзим A синтаза 1 (растворимая) (HMGCS1), мРНК. /PROD=3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 1(soluble) /FL=gb:NM_002130.1 gb:L25798.1 gb:BC000297.1
4,501184
1,674786
7,09
Снижение
3.37E-05
AK000162
Homo sapiens, кДНК FLJ20155 fis, клон COL08754, с высокой степенью подобия с ACSA_ECOLI АЦЕТИЛКОЭНЗИМ А-СИНТЕТАЗОЙ.
4,103964
1,279587
7,08
Снижение
1.86E-04
AA579773
Гены EST
5,294065
2,498324
6,94
Снижение
3.17E-04
AF279899
Homo sapiens, PNAS-145, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-145 /FL=gb:U03105.1 gb:NM_006813.1 gb:AF279899.1
6,179917
3,394324
6,9
Снижение
2.56E-04
NM_000158
Homo sapiens, глюкан (1,4-альфа-), ветвящий фермент 1 (гликоген-ветвящий фермент, болезнь Андерсена, гликогеновая болезнь типа IV) (GBE1), мРНК. /PROD=glucan (1,4-alpha-), branching enzyme 1(glycogen branching enzyme) /FL=gb:L07956.1 gb:NM_000158.1
3,880272
1,125517
6,75
Снижение
2.25E-04
NM_002521
Homo sapiens, натрийуретического пептида предшественник B (NPPB), мРНК. /PROD=natriuretic peptide precursor B /FL=gb:NM_002521.1 gb:M25296.1
1,075159
-1,64214
6,58
Снижение
2.88E-03
J03580
Человеческий паратиреоидподобный белок (связанный со злокачественной гуморальной гиперкальцемией), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:J03580.1
0,031255
-2,68323
6,56
Снижение
1.26E-02
AU142380
Homo sapiens кДНК FLJ34825 fis, клон NT2NE2008785, слабая степень подобия с ANTER-СПЕЦИФИЧНЫМ, БОГАТЫМ ПРОЛИНОМ БЕЛКОМ APG.
5,252439
2,540223
6,55
Снижение
1.93E-04
NM_001553
Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
1,58166
-1,12925
6,55
Снижение
3.72E-02
AF207990
Homo sapiens, fer-1-подобный белок 3 (FER1L3), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=fer-1 like protein 3 /FL=gb:AF207990.1
3,732985
1,022527
6,55
Снижение
8.08E-04
AI459194
белок раннего ростового ответа 1
6,1137
3,411176
6,51
Снижение
2.56E-04
NM_001553
Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
4,507212
1,810296
6,48
Снижение
1.84E-04
AW196940
Гены EST
2,770179
0,094942
6,39
Снижение
7.20E-04
AK000345
Homo sapiens, кДНК FLJ20338 fis, клон HEP12179.
4,633038
1,983552
6,27
Снижение
5.56E-04
NM_016931
Homo sapiens, NADPH-оксидаза 4 (NOX4), мРНК. /PROD=NADPH oxidase 4 /FL=gb:AF261943.1 gb:NM_016931.1 gb:AF254621.1 gb:AB041035.1
5,099016
2,450575
6,27
Снижение
4.88E-04
NM_018192
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10718 (FLJ10718), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10718 /FL=gb:NM_018192.1
3,41866
0,772516
6,26
Снижение
1.05E-03
AA149250
Гены EST с низкой степенью подобия с КРЫСИНЫМ WDNM, КРЫСИНЫМ БЕЛКОМ-ПРЕДШЕСТВЕННИКОМ WDNM1 (R.norvegicus)
4,506475
1,891343
6,13
Снижение
2.83E-04
AI300520
станниокальцин 1 /FL=gb:U25997.1 gb:NM_003155.1 gb:U46768.1
0,060743
-2,53505
6,05
Снижение
3.08E-02
NM_014795
Homo sapiens, гомеобоксовый цинк-пальцевый белок 1B (ZFHX1B), мРНК. /PROD=zinc finger homeobox 1B /FL=gb:NM_014795.1 gb:AB011141.1
1,470435
-1,11845
6,02
Снижение
1.04E-03
L49506
Homo sapiens, циклин G2, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cyclin G2 /FL=gb:L49506.1
7,564809
4,992443
5,95
Снижение
2.36E-04
M83248
Человеческий нефропонтин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=nephropontin /FL=gb:M83248.1
3,508683
0,95049
5,89
Снижение
3.89E-04
AK027231
Homo sapiens кДНК: FLJ23578 fis, клон LNG12709.
3,543738
0,987655
5,88
Снижение
4.67E-04
NM_001955
Homo sapiens, эндотелин 1 (EDN1), мРНК. /PROD=endothelin 1 /FL=gb:NM_001955.1
0,279226
-2,24474
5,75
Снижение
3.73E-02
AF278532
Homo sapiens, бета-нетрин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=beta-netrin /FL=gb:AF119916.1 gb:AF297711.1 gb:NM_021229.1 gb:AF278532.1
1,771584
-0,72454
5,64
Снижение
1.63E-03
BI254089
Homo sapiens, полноразмерная вставка кДНК, клон ZD50E03
5,450694
2,958035
5,63
Снижение
1.84E-04
AF095771
Homo sapiens, реагирующий на PTH белок остеосаркомы B1 (B1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PTH-responsive osteosarcoma B1 protein /FL=gb:AF095771.1
2,648874
0,166558
5,59
Снижение
1.84E-04
AW007532
Человеческий связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 5 (IGFBP5), мРНК
4,420733
1,940312
5,58
Снижение
1.95E-04
NM_003670
Homo sapiens, белок, содержащий основной домен спираль-петля-спираль, класс B, 2 (BHLHB2), мРНК. /PROD=differentiated embryo chondrocyte expressed gene1 /FL=gb:AB004066.1 gb:NM_003670.1
1,659275
-0,81556
5,56
Снижение
6.51E-03
L16895
Человеческий ген лизилоксидазы (LOX), экзон 7
3,334996
0,86328
5,55
Снижение
8.21E-04
R40917
фосфодиэстераза 4D, цАМФ-специфичная (гомологичная гену дрозофилы (Drosophila) фосфодиэстераза E3) /FL=gb:L20969.1 gb:NM_006203.1 gb:U02882.1
2,886643
0,429864
5,49
Снижение
1.63E-03
NM_022036
Homo sapiens, связанный с G-белком рецептор, семейство C, группа 5, член C (GPRC5C), вариант транскрипта 1, мРНК. /PROD=G protein-coupled receptor, family C, group 5,member C, isoform a, precursor /FL=gb:AF207989.1 gb:NM_022036.1
5,319714
2,870709
5,46
Снижение
1.84E-04
AL117352
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-876B10 на хромосоме 1q42.12-43. Содержит 3-конец гена GNPAT для глицеронфосфат O-ацилтрансферазы (DHAPAT, DAPAT, дигидроксиацетонфосфат-ацилтрансфераза, EC 2.3.1.42), ген нового белка...
5,398488
2,949509
5,46
Снижение
3.37E-05
NM_001134
Homo sapiens, альфа-фетопротеин (AFP), мРНК. /PROD=alpha-fetoprotein /FL=gb:NM_001134.1 gb:J00077.1
3,904705
1,46154
5,44
Снижение
4.81E-04
NM_007038
Homo sapiens, дезинтегрин-подобный белок и металлопротеаза (репролизинового типа) с мотивом типа тромбоспондин-1, 5 (аггреканаза-2) (ADAMTS5), мРНК. /PROD=a disintegrin and metalloprotease withthrombospondin motifs-5 preproprotein /FL=gb:NM_007038.1 gb:AF14209
2,001263
-0,41849
5,35
Снижение
2.30E-03
U46768
Человеческий станниокальцин, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=stanniocalcin /FL=gb:U25997.1 gb:NM_003155.1 gb:U46768.1
5,095598
2,679984
5,34
Снижение
3.06E-04
NM_005542
Homo sapiens, индуцируемый инсулином ген 1 (INSIG1), мРНК. /PROD=insulin induced gene 1 /FL=gb:NM_005542.1
0,899011
-1,48844
5,23
Снижение
7.45E-03
NM_002820
Homo sapiens, паратгормон-подобный гормон (PTHLH), мРНК. /PROD=parathyroid hormone-like hormone /FL=gb:J03802.1 gb:NM_002820.1
2,933166
0,546859
5,23
Снижение
1.54E-04
NM_005780
Homo sapiens, белок-партнер по слиянию для белка HMGIC в липоме (LHFP), мРНК. /PROD=lipoma HMGIC fusion partner /FL=gb:NM_005780.1 gb:AF098807.1
2,454314
0,080053
5,18
Снижение
3.37E-05
NM_013281
Homo sapiens, фибронектиновый богатый лейцином трансмембранный белок 3 (FLRT3), мРНК. /PROD=fibronectin leucine rich transmembrane protein3 /FL=gb:AF169677.1 gb:NM_013281.1
4,981033
2,626098
5,12
Снижение
1.14E-03
NM_000602
Homo sapiens, ингибитор сериновой (или цистеиновой) протеиназы, ветвь E (нексин, ингибитор типа 1 активатора плазминогена), член 1 (SERPINE1), мРНК. /PROD=serine (or cysteine) proteinase inhibitor, cladeE (nexin, plasminogen activator inhibitor type 1), membe
5,209052
2,857021
5,11
Снижение
2.66E-04
AI754404
проколлаген-лизин, 2-оксоглутарат 5-диоксигеназа (лизингидроксилаза) 2 /FL=gb:NM_000935.1 gb:U84573.1
7,251816
4,921229
5,03
Снижение
5.18E-04
NM_000700
Homo sapiens, аннексин A1 (ANXA1), мРНК. /PROD=annexin I /FL=gb:BC001275.1 gb:NM_000700.1
D) Сравнение клеток H9 P39 на 30 часу стадии сформированной эндодермы и клеток EXPRES 01- Значения интенсивности приводятся в формате Log2
EXPRES 01
30 ЧАС СТАДИИ СЭ
Отношение
Направление
скорректир. значение p
Идентификатор гена
Название гена
-3,61621
3,085829
104,12
Повышение
1.25E-03
AL569326
Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность
-3,12747
2,633618
54,23
Повышение
5.47E-04
AV726956
Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
-3,26893
2,480892
53,81
Повышение
3.52E-04
NM_001785
Homo sapiens, цитидин деаминаза (CDA), мРНК. /PROD=cytidine deaminase /FL=gb:L27943.1 gb:NM_001785.1
-3,62742
1,93392
47,22
Повышение
3.24E-03
AA772920
Гены EST
-0,27888
4,672575
30,94
Повышение
2.20E-04
AF225513
Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta /FL=gb:AF225513.1
-3,88742
0,719139
24,36
Повышение
2.32E-03
AA180985
Гены EST
1,168713
5,535315
20,63
Повышение
4.09E-04
NM_016139
Homo sapiens, белок 16,7 кДа (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
-2,05438
2,234331
19,54
Повышение
9.02E-03
BG290908
Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-0,69028
3,350018
16,45
Повышение
8.76E-04
M16276
Человеческий белок MHC класса II, HLA-DR2-Dw12, мРНК, DQw1-бета, полная кодовая последовательность. /FL=gb:NM_002123.1
-1,32044
2,675867
15,96
Повышение
1.31E-02
AF017987
Homo sapiens, связанный с апоптозом секретированный белок 2 (SARP2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=secreted apoptosis related protein 2 /FL=gb:AF056087.1
3,042634
6,981126
15,33
Повышение
2.51E-04
NM_005442
Homo sapiens, гомолог эомезодермина (Xenopus laevis) (EOMES), мРНК. /PROD=eomesodermin (Xenopus laevis) homolog /FL=gb:AB031038.1 gb:NM_005442.1
-0,41626
3,4773
14,86
Повышение
5.42E-04
BF110534
Гены EST
-2,69521
1,031628
13,24
Повышение
7.80E-05
AF282250
Homo sapiens, кальньюрон 1 (CALN1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=calneuron 1 /FL=gb:AF282250.1
-2,38787
1,314022
13,01
Повышение
1.37E-02
BC003517
Homo sapiens, клон IMAGE:3542589, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3542589)
-2,45311
1,22951
12,84
Повышение
4.18E-02
BC042378
Homo sapiens, клон IMAGE:5277693, мРНК.
-0,68225
2,956253
12,45
Повышение
2.72E-04
N48299
Гены EST со средней степенью подобия с NFY-C (H.sapiens)
-0,18256
3,454591
12,44
Повышение
2.72E-04
AI583173
главный комплекс гистосовместимости, класс II, DQ бета 1
-0,26005
3,330481
12,05
Повышение
1.37E-03
R72286
связанный с микрофибриллами белок 4
-1,75731
1,805232
11,81
Повышение
2.70E-02
BC008992
Homo sapiens, клон MGC:16926 IMAGE:4183000, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Unknown (protein for MGC:16926) /FL=gb:BC008992.1
-3,76077
-0,22572
11,59
Повышение
2.57E-02
AI040305
Гены EST
0,756526
4,287575
11,56
Повышение
4.69E-04
NM_003012
Homo sapiens, секретированный frizzled-связаный белок 1 (SFRP1), мРНК. /PROD=secreted frizzled-related protein 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-1,61054
1,918985
11,55
Повышение
2.71E-03
AW264204
Гены EST
-2,30432
1,221219
11,52
Повышение
3.31E-02
BC017958
Homo sapiens, клон IMAGE:4607409, мРНК.
-1,16113
2,306767
11,06
Повышение
6.77E-03
NM_012281
Homo sapiens, потенциал-зависимый калиевый канал, подсемейство, связанное с Shal, член 2 (KCND2), мРНК. /PROD=potassium voltage-gated channel, Shal-relatedsubfamily, member 2 /FL=gb:NM_012281.1 gb:AB028967.1 gb:AF121104.1
-1,03397
2,369328
10,58
Повышение
5.45E-04
NM_003020
Homo sapiens, секреторная гранула, нейроэндокринный белок 1 (белок 7B2) (SGNE1), мРНК. /PROD=secretory granule, neuroendocrine protein 1 (7B2protein) /FL=gb:BC005349.1 gb:NM_003020.1
-0,80043
2,583204
10,44
Повышение
9.08E-04
D87811
Homo sapiens, мРНК для GATA-6, полная кодовая последовательность. /PROD=GATA-6 /FL=gb:U66075.1 gb:NM_005257.1 gb:D87811.1
-1,16952
2,129685
9,84
Повышение
4.80E-02
NM_001343
Homo sapiens, гомолог 2 disabled-белка (дрозофила) (реагирующий на митоген фосфопротеин) (DAB2), мРНК. /PROD=disabled (Drosophila) homolog 2 /FL=gb:U39050.1 gb:NM_001343.1 gb:U53446.1 gb:BC003064.1
-0,10733
3,157091
9,61
Повышение
2.31E-03
BC005107
Homo sapiens, клон IMAGE:3840937, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3840937)
-0,70855
2,511903
9,32
Повышение
2.13E-03
AI917371
Гены EST
1,109291
4,227073
8,68
Повышение
1.36E-03
NM_005356
Homo sapiens, лимфоцит-специфическая тирозинкиназа (LCK), мРНК. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
-1,39784
1,697082
8,54
Повышение
1.04E-02
BE222344
богатый аргинином и серином фактор сплайсинга 5
-2,23133
0,840905
8,41
Повышение
8.31E-03
AA044140
ингибитор-бета ядерного фактора каппа (kappa light polypeptide gene enhancer) в В-клетках
-1,64839
1,38707
8,2
Повышение
2.49E-03
NM_004900
Homo sapiens, форболин (сходный с аполипопротеином B мРНК-редактирующий белок) (DJ742C19.2), мРНК. /PROD=phorbolin (similar to apolipoprotein B мРНКediting protein) /FL=gb:NM_004900.1 gb:U61083.1
0,502333
3,532743
8,17
Повышение
1.88E-03
AF211891
Homo sapiens, Mix-like homeobox protein 1 (MILD1) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Mix-like homeobox protein 1 /FL=gb:AF211891.1
1,470195
4,487924
8,1
Повышение
4.48E-04
AI676059
Гены EST
-1,66608
1,305765
7,85
Повышение
1.61E-02
BE673445
Homo sapiens, хромосома 19, космида R28379
-2,17012
0,717557
7,4
Повышение
8.40E-03
AB018580
Homo sapiens, мРНК белка hluPGFS, полная кодовая последовательность. /PROD=hluPGFS /FL=gb:NM_003739.2 gb:AF149416.2 gb:AB018580.1 gb:D17793.1
-3,17826
-0,30252
7,34
Повышение
3.88E-02
AI798098
Гены EST
-2,62694
0,235765
7,27
Повышение
1.61E-02
NM_000055
Homo sapiens, бутирилхолинэстераза (BCHE), мРНК. /PROD=butyrylcholinesterase precursor /FL=gb:M16541.1 gb:M16474.1 gb:NM_000055.1
-2,13754
0,709615
7,2
Повышение
1.59E-02
BF000203
Гены EST
1,750623
4,592477
7,17
Повышение
3.86E-04
AA176289
Гены EST
0,923781
3,753533
7,11
Повышение
5.45E-04
BE897866
Гены EST
-1,51616
1,306468
7,07
Повышение
3.70E-03
AJ272267
Homo sapiens, часть мРНК холиндегидрогеназы (ген chdh). /PROD=choline dehydrogenase
-3,12304
-0,30584
7,05
Повышение
3.13E-02
NM_018018
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10191 (FLJ10191), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10191 /FL=gb:NM_018018.1
0,828954
3,642692
7,03
Повышение
1.53E-03
AK026659
Homo sapiens кДНК: FLJ23006 fis, клон LNG00414.
3,061783
5,870643
7,01
Повышение
1.32E-04
BF057809
Гены EST
-0,20066
2,598953
6,96
Повышение
8.90E-04
NM_001609
Homo sapiens, ацил-коэнзим А-дегидрогеназа, коротко-ветвистая цепь (ACADSB), ядерный ген, кодирующий митохондриальный белок, мРНК. /PROD=acyl-Coenzyme A dehydrogenase, shortbranchedchain precursor /FL=gb:U12778.1 gb:NM_001609.1
-0,5777
2,186912
6,8
Повышение
2.34E-03
BC036592
Homo sapiens, клон IMAGE:4814184, мРНК.
-2,20139
0,556645
6,76
Повышение
1.88E-03
AI913749
Гены EST
-2,19527
0,555455
6,73
Повышение
3.02E-03
NM_013333
Homo sapiens, EH домен-связывающий митотический фосфопротеин (EPSIN), мРНК. /PROD=EH domain-binding mitotic phosphoprotein /FL=gb:NM_013333.1 gb:AF073727.1
0,194248
2,884093
6,45
Повышение
3.02E-03
U07236
Человеческая мутантная лимфоцит-специфическая протеин-тирозинкиназа (LCK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
-1,4606
1,195222
6,3
Повышение
1.88E-03
AW072102
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434H205 (из клона DKFZp434H205)
-0,41404
2,208672
6,16
Повышение
1.88E-03
AI332407
секретированный frizzled-связаный белок 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-1,98038
0,627155
6,09
Повышение
9.18E-03
NM_002442
Homo sapiens, гомолог 1 белка Musashi (Drosophila) (MSI1), мРНК. /PROD=Musashi (Drosophila) homolog 1 /FL=gb:AB012851.1 gb:NM_002442.1
-3,12055
-0,51875
6,07
Повышение
4.51E-02
AW780006
Гены EST
2,428694
5,011314
5,99
Повышение
8.90E-04
BF510715
фактор роста фибробластов 4 (гепариновый секреторный трансформирующий белок 1, онкоген саркомы Капоши) /FL=gb:M17446.1 gb:NM_002007.1
-2,06656
0,511613
5,97
Повышение
1.81E-02
AF141339
Homo sapiens, взаимодействующий с LYST белок LIP3, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=LYST-interacting protein LIP3
-1,18368
1,389404
5,95
Повышение
1.12E-03
AB011152
Homo sapiens, мРНК белка KIAA0580, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA0580 protein
0,884916
3,44953
5,92
Повышение
2.61E-04
NM_000104
Homo sapiens, цитохром P450, подсемейство I (индуцируемый диоксином), полипептид 1 (глаукома 3, первичная младенческая) (CYP1B1), мРНК. /PROD=cytochrome P450, subfamily I (dioxin-inducible),polypeptide 1 /FL=gb:U03688.1 gb:NM_000104.2
1,380324
3,936779
5,88
Повышение
4.48E-04
NM_006895
Homo sapiens, гистамин N-метилтрансфераза (HNMT), мРНК. /PROD=histamine N-methyltransferase /FL=gb:NM_006895.1 gb:D16224.1 gb:U08092.1
0,937118
3,476237
5,81
Повышение
5.45E-04
AU151342
Homo sapiens, кДНК FLJ12935 fis, клон NT2RP2004982
-2,3444
0,189019
5,79
Повышение
3.32E-03
AW057589
Гены EST
-1,09181
1,43832
5,78
Повышение
2.62E-02
AI653050
Гены EST с низкой степенью подобия с HPPD_HUMAN 4 - ГИДРОКСИФЕНИЛПИРУВАТ-ДИОКСИГЕНАЗОЙ (H.sapiens)
0,270429
2,788184
5,73
Повышение
2.50E-02
AF493872
Homo sapiens, связывающий гуаниновый нуклеотид белок гамма 4 (GNG4), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=guanine nucleotide binding protein gamma 4 /FL=gb:AF493872.1
2,453593
4,950008
5,64
Повышение
4.67E-04
NM_005410
Homo sapiens, селенопротеин P, плазматический, 1 (SEPP1), мРНК. /PROD=selenoprotein P precursor /FL=gb:NM_005410.1
-1,88254
0,61166
5,63
Повышение
6.09E-03
BF694956
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP1-187J11 на хромосоме 6q11.1-22.33. Содержит ген нового белка, сходного с предсказанными белками S. pombe и S. cerevisiae, ген нового белка, сходного с ингибиторами протеинкиназы C, 3-конец
0,462867
2,940232
5,57
Повышение
8.05E-03
AI807026
Гены EST
-0,04543
2,430022
5,56
Повышение
1.88E-03
AB037730
Homo sapiens, мРНК белка KIAA1309, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1309 protein
-0,01122
2,462282
5,55
Повышение
2.31E-03
AI356398
Реагирующий на бутират фактор 2 (реагирующий на EGF фактор 2) /FL=gb:BC005010.1 gb:NM_006887.1
1,285793
3,745524
5,5
Повышение
2.58E-03
AI949827
Гены EST
1,37261
3,832097
5,5
Повышение
4.48E-04
BC040605
Homo sapiens, клон IMAGE:5271039, мРНК.
-0,67823
1,780805
5,5
Повышение
3.24E-04
AA040057
протокадгерин 20
-1,41031
1,030229
5,43
Повышение
1.98E-02
AI832477
серологически определяемый антиген 43 колоректального рака
1,076427
3,500322
5,37
Повышение
1.17E-03
AI640307
протокадгерин 10
-0,35323
2,051621
5,3
Повышение
2.59E-03
BM666010
Homo sapiens, кДНК FLJ23803 fis, клон HEP22811.
0,040412
2,442774
5,29
Повышение
3.56E-04
AA960844
Homo sapiens, клон IMAGE:4081483, мРНК
-1,51992
0,881919
5,28
Повышение
6.04E-03
AA460960
H.sapiens, мРНК (клон ICRFp507L1876)
-2,32443
0,069216
5,25
Повышение
3.43E-03
BC035759
Homo sapiens, клон IMAGE:5557641, мРНК.
4,072718
6,466193
5,25
Повышение
1.53E-03
AU144598
молекула клеточного распознавания Caspr2 /FL=gb:AF193613.1 gb:NM_014141.1
0,143628
2,506522
5,14
Повышение
1.36E-02
AB037763
Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1342, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1342 protein /FL=gb:AF299075.1
-0,46577
1,883396
5,1
Повышение
6.92E-04
AW051591
Гены EST со средней степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
0,780689
3,126868
5,08
Повышение
7.58E-04
AI016316
Гены EST
3,409815
-2,82988
75,57
Снижение
1.48E-02
NM_016588
Homo sapiens, нейритин (LOC51299), мРНК. /PROD=neuritin /FL=gb:NM_016588.1 gb:BC002683.1 gb:AF136631.1
0,757197
-4,3571
34,64
Снижение
4.81E-03
AF213459
Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
5,388254
0,288621
34,29
Снижение
4.14E-05
NM_004207
Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 (SLC16A3), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
4,092731
-0,8862
31,54
Снижение
7.12E-04
AL513917
переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
2,306111
-2,22732
23,16
Снижение
8.51E-04
AI632223
гипотетический белок DKFZp434F2322
3,030236
-1,2974
20,08
Снижение
8.31E-03
AA812232
стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
4,505436
0,504147
16,01
Снижение
1.23E-04
W57613
Гены EST
3,025351
-0,90728
15,27
Снижение
2.53E-04
AW590925
Гены EST
3,268087
-0,54228
14,03
Снижение
2.76E-05
AF345910
Homo sapiens, NYD-SP14, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NYD-SP14 /FL=gb:AF345910.1
2,62025
-1,1154
13,32
Снижение
1.12E-03
AA625683
Гены EST
6,777916
3,123818
12,59
Снижение
6.00E-05
U15174
Homo sapiens, взаимодействующий с белком BCL2adenovirus E1B 19 кДа белок 3 (BNIP3), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=BCL2adenovirus E1B 19kD-interacting protein 3 /FL=gb:AF002697.1 gb:NM_004052.2 gb:U15174.1
2,590871
-1,03729
12,36
Снижение
1.53E-03
NM_016569
Homo sapiens, изо-белокTBX3 (TBX3-iso), мРНК. /PROD=TBX3-iso protein /FL=gb:NM_016569.1 gb:AF216750.1
4,152765
0,533234
12,29
Снижение
2.53E-04
AW003173
станниокальцин 1
4,528627
0,921256
12,19
Снижение
7.80E-05
NM_003155
Homo sapiens, станниокальцин 1 (STC1), мРНК. /PROD=stanniocalcin 1 /FL=gb:U25997.1 gb:NM_003155.1 gb:U46768.1
1,544409
-1,9767
11,48
Снижение
4.92E-02
NM_000599
Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 5 (IGFBP5), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 5 /FL=gb:M65062.1 gb:M62782.1 gb:NM_000599.1 gb:AF055033.1
5,023981
1,530419
11,26
Снижение
2.80E-04
NM_006472
Homo sapiens, стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 (VDUP1), мРНК. /PROD=upregulated by 1,25-dihydroxyvitamin D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
2,36447
-1,00627
10,34
Снижение
1.88E-03
NM_005181
Homo sapiens, карбоангидраза III, специфичная для мышц (CA3), мРНК. /PROD=carbonic anhydrase III /FL=gb:BC004897.1 gb:NM_005181.2
4,285883
0,94478
10,13
Снижение
7.80E-05
AL038787
6-фосфофрукто-2-киназафруктоза-2,6-бифосфатаза 4
4,782763
1,624946
8,92
Снижение
4.14E-05
NM_004199
Homo sapiens, проколлаген-пролин, 2-оксоглутарат 4-диоксигеназа (пролин 4-гидроксилаза), альфа полипептид II (P4HA2), мРНК. /PROD=procollagen-proline, 2-oxoglutarate4-dioxygenase (proline 4-hydroxylase), alpha polypeptideII /FL=gb:NM_004199.1 gb:U904
2,660133
-0,48383
8,84
Снижение
3.01E-04
AF277174
Homo sapiens, PNAS-137, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-137 /FL=gb:AF277174.1
1,99849
-1,11713
8,67
Снижение
1.48E-02
NM_002317
Homo sapiens, лизилоксидаза (LOX), мРНК. /PROD=lysyl oxidase /FL=gb:AF039291.1 gb:NM_002317.1 gb:M94054.1
4,927935
1,83445
8,54
Снижение
4.77E-04
J05008
Homo sapiens, ген эндотелина-1 (EDN1), полная кодовая последовательность. /FL=gb:NM_001955.1
5,356771
2,317383
8,22
Снижение
1.92E-05
W92036
Гены EST
3,806044
0,77917
8,15
Снижение
1.32E-04
AV734646
Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
2,350127
-0,67445
8,14
Снижение
1.86E-02
AK026106
Homo sapiens, кДНК: FLJ22453 fis, клон HRC09679, с высокой степенью подобия cAF059516, мРНК толлоид-подобного 2 (TLL2) белка, Homo sapiens.
5,450694
2,473087
7,88
Снижение
2.35E-04
AF095771
Homo sapiens, белок B1 реагирующей на PTH остеосаркомы (B1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PTH-responsive osteosarcoma B1 protein /FL=gb:AF095771.1
2,208449
-0,76852
7,87
Снижение
5.20E-03
AI806338
T-box 3 (локтевой синдром млекопитающих) /FL=gb:AF170708.2 gb:NM_005996.1
2,951696
-0,00873
7,78
Снижение
4.48E-04
AB019562
Homo sapiens, мРНК, экспрессируемая только в ворсинах плаценты, клон SMAP41.
3,953402
0,998843
7,75
Снижение
2.51E-04
BC005369
Homo sapiens, открытая рамка считывания 12 хромосомы 1, клон MGC:12484, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=chromosome 1 open reading frame 12 /FL=gb:AF277176.1 gb:NM_022051.1 gb:AF229245.1 gb:BC005369.1
4,507212
1,576505
7,62
Снижение
2.04E-04
AW196940
Гены EST
4,055862
1,195121
7,26
Снижение
5.45E-04
AK026815
Homo sapiens, кДНК: FLJ23162 fis, клон LNG09734.
4,103964
1,24922
7,23
Снижение
8.28E-05
AA579773
Гены EST
2,001263
-0,84882
7,21
Снижение
3.24E-03
U46768
Человеческий станниокальцин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=stanniocalcin /FL=gb:U25997.1 gb:NM_003155.1 gb:U46768.1
1,1136
-1,73388
7,2
Снижение
3.21E-04
Z70519
Homo sapiens, FASApo 1 мРНК для FAS растворимого белка (клон FAS Exo4Del). /PROD=FAS soluble protein
2,332751
-0,46123
6,94
Снижение
1.69E-04
NM_000077
Homo sapiens, циклин-зависимой киназы ингибитор 2A (меланома, p16, ингибирует CDK4) (CDKN2A), мРНК. /PROD=cyclin-dependent kinase inhibitor 2A (melanoma,p16, inhibits CDK4) /FL=gb:NM_000077.1 gb:L27211.1
5,187988
2,402941
6,89
Снижение
3.52E-04
AA074145
гомолог пролиноксидазы
4,255531
1,471522
6,89
Снижение
3.24E-04
AF096296
Homo sapiens, предшественник хемокина-1 стромы тимуса, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=thymic stroma chemokine-1 precursor /FL=gb:AF142434.1 gb:AF096296.1 gb:AF124601.1 gb:AB010447.1 gb:NM_006072.1
4,501184
1,72274
6,86
Снижение
7.80E-05
AK000162
Homo sapiens, кДНК: FLJ20155 fis, клон COL08754, с высокой степенью подобия с ACSA_ECOLI АЦЕТИЛКОЭНЗИМ А-СИНТЕТАЗОЙ.
2,770179
0,000064
6,82
Снижение
2.31E-03
AK000345
Homo sapiens, кДНК: FLJ20338 fis, клон HEP12179.
6,1137
3,356776
6,76
Снижение
2.20E-04
NM_001553
Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
4,506475
1,751272
6,75
Снижение
2.53E-04
AI300520
станниокальцин 1 /FL=gb:U25997.1 gb:NM_003155.1 gb:U46768.1
3,404056
0,670009
6,65
Снижение
4.14E-05
AI623211
лимфоцит-специфический белок 1
2,469646
-0,26027
6,63
Снижение
4.40E-03
N76327
Гены EST с высокой степенью подобия с трансферриновым рецептором 1011297A (H.sapiens)
5,252439
2,542675
6,54
Снижение
3,24E-04
NM_001553
Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
5,294065
2,607826
6,44
Снижение
1.45E-03
AF279899
Homo sapiens, PNAS-145, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-145 /FL=gb:U03105.1 gb:NM_006813.1 gb:AF279899.1
1,312148
-1,30796
6,15
Снижение
2.85E-04
U32500
Человеческий рецептор типа 2 к нейропептиду Y, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=type 2 neuropeptide Y receptor /FL=gb:U42766.1 gb:U36269.1 gb:U32500.1
6,179917
3,561259
6,14
Снижение
3.24E-04
NM_000158
Homo sapiens, глюкан (1,4-альфа-), ветвящий фермент 1 (гликоген-ветвящий фермент, болезнь Андерсена, гликогеновая болезнь типа IV) (GBE1), мРНК. /PROD=glucan (1,4-alpha-), branching enzyme 1(glycogen branching enzyme) /FL=gb:L07956.1 gb:NM_000158.1
0,959227
-1,64817
6,09
Снижение
2.57E-02
AB033831
Homo sapiens, hSCDGF, мРНК фактора роста из спинного мозга, полная кодовая последовательность. /PROD=spinal cord-derived growth factor /FL=gb:NM_016205.1 gb:AB033831.1 gb:AF091434.1 gb:AF244813.1
0,579765
-1,99563
5,96
Снижение
2.00E-02
AI393930
Гены EST
3,508683
0,978051
5,78
Снижение
4.14E-05
AK027231
Homo sapiens, кДНК: FLJ23578 fis, клон LNG12709.
1,577138
-0,9435
5,74
Снижение
1.09E-02
M15329
Человеческий интерлейкин 1-альфа (IL1A), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=interleukin 1-alpha /FL=gb:M15329.1
2,982965
0,463474
5,73
Снижение
5.03E-04
AK026829
Homo sapiens, кДНК: FLJ23176 fis, клон LNG10452.
3,86075
1,347537
5,71
Снижение
7.64E-04
U85995
Кластер включает U85995:Человеческий клон IMAGE-22181, неизвестный белок, мРНК, частичная кодовая последовательность /cds=(0,1291) /gb=U85995 /gi=1835749 /ug=Hs.79340 /len=1696
2,64743
0,138623
5,69
Снижение
2.04E-04
AI702438
Гены EST
3,437271
0,928673
5,69
Снижение
5.45E-04
AB029025
Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1102, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1102 protein
2,886643
0,386181
5,66
Снижение
1.25E-03
NM_022036
Homo sapiens, связанный с G-белком рецептор, семейство C, группа 5, член C (GPRC5C), вариант транскрипта 1, мРНК. /PROD=G protein-coupled receptor, family C, group 5,member C, isoform a, precursor /FL=gb:AF207989.1 gb:NM_022036.1
5,099016
2,60798
5,62
Снижение
4.48E-04
NM_018192
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10718 (FLJ10718), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10718 /FL=gb:NM_018192.1
5,807319
3,321529
5,6
Снижение
3.21E-04
NM_018004
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10134 (FLJ10134), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10134 /FL=gb:NM_018004.1
1,659275
-0,80393
5,51
Снижение
2.08E-03
L16895
Человеческий ген лизилоксидазы (LOX), экзон 7
2,060071
-0,40069
5,51
Снижение
5.45E-04
AA004300
гипотетический белок DKFZp566I133
3,094055
0,633797
5,5
Снижение
6.17E-04
AW188198
индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 /FL=gb:NM_007115.1
1,865674
-0,57364
5,42
Снижение
1.88E-03
AU156421
Homo sapiens, кДНК: FLJ13457 fis, клон PLACE1003343
5,207569
2,775215
5,4
Снижение
1.32E-04
AA083478
Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 746039
2,322104
-0,10923
5,39
Снижение
1.89E-03
AW291369
Гены EST
3,862686
1,433656
5,39
Снижение
1.88E-03
NM_007115
Homo sapiens, индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 (TNFAIP6), мРНК. /PROD=tumor necrosis factor, alpha-induced protein 6 /FL=gb:NM_007115.1
4,881197
2,470702
5,32
Снижение
1.33E-03
NM_001975
Homo sapiens, енолаза 2, (гамма, нейрональная) (ENO2), мРНК. /PROD=enolase 2, (gamma, neuronal) /FL=gb:NM_001975.1 gb:BC002745.1 gb:M22349.1
5,318139
2,908344
5,31
Снижение
4.67E-04
U87408
Кластер включает U87408:Человеческий клон IMAGE-74593 неизвестный белок, мРНК, частичная кодовая последовательность /cds=(0,1362) /gb=U87408 /gi=1842104 /ug=Hs.79340 /len=1982
3,41866
1,024231
5,26
Снижение
1.40E-03
AA149250
Гены EST с низкой степенью подобия с КРЫСИНЫМ WDNM, КРЫСИНЫМ БЕЛКОМ-ПРЕДШЕСТВЕННИКОМ WDNM1 (R.norvegicus)
2,28595
-0,10789
5,26
Снижение
1.74E-03
BE504838
Гены EST
1,143234
-1,2451
5,24
Снижение
2.07E-03
BF437711
Гены EST
2,164901
-0,22261
5,23
Снижение
2.00E-03
AI559300
Гены EST
0,38149
-2,00456
5,23
Снижение
1.36E-02
Z25433
Homo sapiens, ген протеин-серин/треонин киназы, полная кодовая последовательность /PROD=protein-serinethreonine kinase /FL=gb:Z25433.1
2,271332
-0,11134
5,22
Снижение
1.88E-03
NM_015198
Homo sapiens, белок KIAA0633 (COBL), мРНК. /PROD=KIAA0633 protein /FL=gb:NM_015198.1
2,933166
0,558335
5,19
Снижение
1.04E-03
NM_005780
Homo sapiens, партнер по слиянию липомы HMGIC (LHFP), мРНК. /PROD=lipoma HMGIC fusion partner /FL=gb:NM_005780.1 gb:AF098807.1
3,77776
1,406437
5,17
Снижение
3.24E-04
BU729850
гипотетический белок LOC153469
3,113698
0,751705
5,14
Снижение
7.12E-04
NM_002196
Homo sapiens, ассоциированный с инсулиномой белок 1 (INSM1), мРНК. /PROD=insulinoma-associated 1 /FL=gb:NM_002196.1 gb:M93119.1
7,564809
5,218561
5,09
Снижение
5.70E-04
M83248
Человеческий нефропонтин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=nephropontin /FL=gb:M83248.1
5,209052
2,875305
5,04
Снижение
3.17E-04
AI754404
проколлаген-лизин, 2-оксоглутарат 5-диоксигеназа (лизингидроксилаза) 2 /FL=gb:NM_000935.1 gb:U84573.1
1,639038
-0,68383
5
Снижение
2.00E-03
AW027879
Гены EST с низкой степенью подобия с предшественником декорина NBHUC8 (H.sapiens)
E) Клетки линии H9 39 пассажа через 48 часов стадии дифференцировки в сформированную эндодерму и клетки EXPRES 01- Значения интенсивности даны в формате Log2
EXPRES 01
48 ЧАС СТАДИИ СЭ
Отношение
Направление
скорректир. значение p
Идентификатор гена
Название гена
-3,62742
4,403382
261,52
Повышение
9.26E-04
AA772920
Гены EST
-3,26893
4,712617
252,75
Повышение
7.47E-05
NM_001785
Homo sapiens, цитидиндеаминаза (CDA), мРНК. /PROD=cytidine deaminase /FL=gb:L27943.1 gb:NM_001785.1
-4,01441
3,67249
206,06
Повышение
1.83E-04
AB028021
Кластер включает AB028021:Homo sapiens, HNF-3beta, мРНК для гепатоцитного ядерного фактора-3 бета, полная кодовая последовательность /cds=(196,1569) /gb=AB028021 /gi=4958949 /ug=Hs.155651 /len=1944
-4,29896
3,38304
205,36
Повышение
6.25E-05
AY177407
Homo sapiens, гомеобоксовый белок goosecoid, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=homeobox protein goosecoid /FL=gb:AY177407.1 gb:NM_173849.1
-0,80043
6,55024
163,22
Повышение
7.98E-05
D87811
Homo sapiens, мРНК для GATA-6, полная кодовая последовательность. /PROD=GATA-6 /FL=gb:U66075.1 gb:NM_005257.1 gb:D87811.1
-2,178
4,977566
142,57
Повышение
5.92E-04
NM_014420
Homo sapiens, гена dickkopf (Xenopus laevis) гомолог 4 (DKK4), мРНК. /PROD=dickkopf (Xenopus laevis) homolog 4 /FL=gb:AB017788.1 gb:AF177397.1 gb:NM_014420.1
-3,61621
3,360873
125,98
Повышение
8.64E-04
AL569326
Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность
-3,8752
2,947466
113,19
Повышение
8.92E-05
AB028021
Homo sapiens, HNF-3beta, мРНК гепатоцитного ядерного фактора-3 бета, полная кодовая последовательность. /PROD=hepatocyte nuclear factor-3 beta /FL=gb:AB028021.1 gb:NM_021784.1
-0,62093
5,956038
95,47
Повышение
7.47E-05
NM_022454
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ22252, сходный с содержащим SRY-бокс белком 17 (FLJ22252), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ22252 similar to SRY-boxcontaining gene 17 /FL=gb:NM_022454.1
-1,11159
5,388499
90,52
Повышение
1.05E-04
NM_003867
Homo sapiens, фактор роста фибробластов 17 (FGF17), мРНК. /PROD=fibroblast growth factor 17 /FL=gb:NM_003867.1 gb:AB009249.1
-3,7558
2,70012
87,79
Повышение
1.88E-03
AW473656
Гены EST
-0,83997
5,315997
71,31
Повышение
2.36E-04
AI821669
Гены EST
-0,26005
5,721539
63,19
Повышение
1.82E-04
R72286
связанный с микрофибриллами белок 4
-1,32044
4,378147
51,93
Повышение
4.06E-03
AF017987
Homo sapiens, связанный с апоптозом секретированный белок 2 (SARP2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=secreted apoptosis related protein 2 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-3,12747
2,481837
48,82
Повышение
4.18E-04
AV726956
Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
-0,69028
4,779809
44,33
Повышение
1.82E-04
M16276
Человеческий MHC, класс II, HLA-DR2-Dw12, мРНК, DQw1-beta, полная кодовая последовательность. /FL=gb:NM_002123.1 gb:M16276.1 gb:M60028.1 gb:M17564.1 gb:M81141.1 gb:M81140.1
-4,79201
0,661683
43,83
Повышение
3.06E-04
NM_012431
Homo sapiens, содержащий sema-домен, иммуноглобулиновый домен (Ig), короткий основной домен, секретируемый белок (семафорин), 3E (SEMA3E), мРНК. /PROD=sema domain, immunoglobulin domain (Ig), shortbasic domain, secreted, (semaphorin) 3E /FL=gb:NM_012431.1 gb:AB002329.1
-1,55323
3,862277
42,68
Повышение
1.26E-04
AI821586
Гены EST со средней степенью подобия с полученным из клеток JE0284 Mm-1 белком 1b, связанным с трансплантабельностью (H.sapiens)
-5,25658
0,098569
40,93
Повышение
1.11E-03
AW005572
предполагаемый белок 47 кДа
-2,45311
2,87165
40,08
Повышение
1.40E-02
BC042378
Homo sapiens, клон IMAGE:5277693, мРНК.
-3,10357
2,19103
39,25
Повышение
6.25E-05
NM_001453
Homo sapiens, белок с вилкообразным регионом (forkhead box) C1 (FOXC1), мРНК. /PROD=forkhead box C1 /FL=gb:NM_001453.1
-0,27888
4,97765
38,23
Повышение
7.98E-05
AF225513
Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta /FL=gb:AF225513.1
-0,81978
4,345795
35,89
Повышение
3.86E-04
AI824037
Гены EST с низкой степенью подобия с FCE2, МЫШИНЫМ НИЗКОАФФИННЫМ РЕЦЕПТОРОМ ДЛЯ ИММУНОГЛОБУЛИНА ЭПСИЛОН (M.musculus)
-2,4051
2,697137
34,35
Повышение
6.25E-05
NM_021020
Homo sapiens, связанного с F37/раком пищевода гена кодирующий мотив leucine-zipper motif (FEZ1), мРНК. /PROD=F37Esophageal cancer-related gene-codingleucine-zipper motif /FL=gb:AF123659.1 gb:NM_021020.1
0,756526
5,856918
34,31
Повышение
7.98E-05
NM_003012
Homo sapiens, секретируемый frizzled-связанный белок 1 (SFRP1), мРНК. /PROD=secreted frizzled-related protein 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-0,41626
4,620452
32,82
Повышение
2.24E-04
BF110534
Гены EST
0,502333
5,516306
32,31
Повышение
1.26E-04
AF211891
Homo sapiens, Mix-like homeobox protein 1 (MILD1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Mix-like homeobox protein 1 /FL=gb:AF211891.1
-2,39338
2,604622
31,96
Повышение
3.59E-03
M17955
Человеческий MHC, класс II, HLA-DQ-beta, мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:M33907.1 gb:M17955.1 gb:M16996.1 gb:M17563.1 gb:M20432.1 gb:M26042.1
-0,5292
4,348346
29,4
Повышение
1.25E-03
AI127440
Гены EST
-4,15276
0,716875
29,24
Повышение
1.59E-04
AA129444
Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1263, частичная кодовая последовательность
-0,18256
4,556137
26,7
Повышение
5.90E-05
AI583173
главный комплекс гистосовместимости (MHC), класс II, DQ бета 1
-3,47945
1,255979
26,64
Повышение
2.39E-04
NM_000854
Homo sapiens, глутатион S-трансфераза тэта 2 (GSTT2), мРНК. /PROD=glutathione S-transferase theta 2 /FL=gb:L38503.1 gb:BC002415.1 gb:NM_000854.2
-3,39007
1,340459
26,55
Повышение
9.26E-03
NM_006614
Homo sapiens, молекула клеточной адгезии с гомологией с L1CAM (близкий гомолог L1) (CHL1), мРНК. /PROD=cell adhesion molecule with homology to L1CAM(close homologue of L1) /FL=gb:AF002246.1 gb:NM_006614.1
-1,61054
3,073011
25,7
Повышение
6.48E-04
AW264204
Гены EST
-0,68225
3,994036
25,57
Повышение
8.92E-05
N48299
Гены EST со средней степенью подобия с NFY-C (H.sapiens)
-2,69284
1,94677
24,93
Повышение
1.03E-02
R33964
Homo sapiens, кДНК: FLJ11022 fis, клон PLACE1003771
-3,3099
1,316389
24,7
Повышение
4.00E-03
NM_172037
Homo sapiens, ретинолдегидрогеназа 10 (all-trans) (RDH10), мРНК. /PROD=retinol dehydrogenase 10 /FL=gb:NM_172037.1 gb:AF456765.1
-2,23941
2,381967
24,61
Повышение
2.32E-03
NM_005413
Homo sapiens, гомеобоксного гена sine oculis (Drosophila) гомолог 3 (SIX3), мРНК. /PROD=sine oculis homeobox (Drosophila) homolog 3 /FL=gb:NM_005413.1
-2,6422
1,964075
24,36
Повышение
8.92E-05
BF589787
Гены EST
-2,05438
2,54631
24,26
Повышение
6.59E-03
BG290908
Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
1,168713
5,686572
22,91
Повышение
2.60E-04
NM_016139
Homo sapiens, 16,7 кДа белок (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
-0,77864
3,712574
22,49
Повышение
5.77E-04
NM_022055
Homo sapiens, зарезервированный (KCNK12), мРНК. /PROD=tandem pore domain potassium channel THIK-2 /FL=gb:NM_022055.1 gb:AF287302.1
-0,70855
3,762307
22,17
Повышение
7.67E-04
AI917371
Гены EST
-2,06656
2,392721
22
Повышение
2.94E-03
AF141339
Homo sapiens, взаимодействующий с LYST белок LIP3, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=LYST-interacting protein LIP3
3,042634
7,476267
21,61
Повышение
5.90E-05
NM_005442
Homo sapiens, гомолог эомезодермина (Xenopus laevis) (EOMES), мРНК. /PROD=eomesodermin (Xenopus laevis) homolog /FL=gb:AB031038.1 gb:NM_005442.1
-1,28224
3,131936
21,32
Повышение
2.22E-04
NM_005568
Homo sapiens, LIM гомеобоксный белок 1 (LHX1), мРНК. /PROD=LIM homeobox protein 1 /FL=gb:NM_005568.1 gb:U14755.1
-2,83906
1,564539
21,16
Повышение
4.15E-04
T15545
Гены EST
-0,5777
3,802538
20,82
Повышение
8.57E-04
BC036592
Homo sapiens, клон IMAGE:4814184, мРНК.
-3,88742
0,452273
20,25
Повышение
2.18E-03
AA180985
Гены EST
-1,95127
2,384447
20,19
Повышение
2.26E-03
L12468
Homo sapiens, аминопептидаза A, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=aminopeptidase A /FL=gb:L12468.1 gb:NM_001977.1 gb:L14721.1
-4,63418
-0,31383
19,98
Повышение
2.41E-02
BF112218
Гены EST
-2,30432
1,94413
19,01
Повышение
1.88E-02
BC017958
Homo sapiens, клон IMAGE:4607409, мРНК.
-2,9769
1,2531
18,77
Повышение
1.55E-02
AW612111
Гены EST
0,420056
4,641313
18,65
Повышение
7.47E-05
NM_012242
Homo sapiens, гена dickkopf (Xenopus laevis) гомолог (DKK1), мРНК. /PROD=dickkopf (Xenopus laevis) homolog 1 /FL=gb:AF177394.1 gb:NM_012242.1 gb:AF127563.1
-0,41404
3,780442
18,31
Повышение
4.24E-04
AI332407
секретированный frizzled-связанный белок 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-2,90798
1,272589
18,13
Повышение
1.07E-04
NM_001643
Homo sapiens, аполипопротеин A-II (APOA2), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-II precursor /FL=gb:M29882.1 gb:NM_001643.1 gb:BC005282.1
-3,84662
0,311955
17,86
Повышение
2.27E-02
BF445031
Гены EST
-0,48487
3,656098
17,64
Повышение
7.98E-05
BG150534
Гены EST
0,442286
4,570914
17,49
Повышение
1.50E-04
NM_001778
Homo sapiens, CD48 антиген (B-клеточный мембранный белок) (CD48), мРНК. /PROD=CD48 antigen (B-cell membrane protein) /FL=gb:NM_001778.1 gb:M37766.1 gb:M59904.1
-2,0457
2,013773
16,67
Повышение
9.72E-04
AI422986
Гены EST
-1,37391
2,670539
16,5
Повышение
1.44E-02
NM_006605
Homo sapiens, подобный белку ret finger белок 2 (RFPL2), мРНК. /PROD=ret finger protein-like 2 /FL=gb:NM_006605.1
-3,51429
0,527621
16,47
Повышение
2.50E-03
AA352113
Гены EST
-0,15629
3,869435
16,29
Повышение
4.57E-04
AI799018
Гены EST
-0,81856
3,176308
15,94
Повышение
8.74E-05
AI129628
Гены EST
-2,38787
1,575045
15,59
Повышение
9.00E-03
BC003517
Homo sapiens, клон IMAGE:3542589, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3542589)
-1,39784
2,47691
14,67
Повышение
2.38E-03
BE222344
богатый аргинином и серином фактор сплайсинга 5
-2,20139
1,663866
14,57
Повышение
7.98E-05
AI913749
Гены EST
-3,18081
0,676419
14,49
Повышение
2.33E-04
AW449813
белок KIAA0918
-2,14545
1,70837
14,46
Повышение
3.27E-03
NM_015831
Homo sapiens, ацетилхолинэстераза (YT группа крови) (ACHE), вариант транскрипта E4-E5, мРНК. /PROD=acetylcholinesterase PI-linked form precursor /FL=gb:NM_015831.1
-2,233
1,502044
13,32
Повышение
1.33E-03
NM_014862
Homo sapiens, генный продукт KIAA0307 (KIAA0307), мРНК. /PROD=KIAA0307 gene product /FL=gb:AB002305.1 gb:NM_014862.1
-0,21464
3,518576
13,3
Повышение
5.92E-04
NM_005045
Homo sapiens, рилин (RELN), мРНК. /PROD=reelin /FL=gb:U79716.1 gb:NM_005045.1
-0,96765
2,760723
13,25
Повышение
1.83E-04
NM_024426
Homo sapiens, опухоль Вильмса 1 (WT1), вариант транскрипта D, мРНК. /PROD=Wilms tumor 1 isoform D /FL=gb:NM_024424.1 gb:NM_024426.1
1,076427
4,796662
13,18
Повышение
6.25E-05
AI640307
протокадгерин 10
1,197921
4,916826
13,17
Повышение
6.25E-05
AW150720
гипотетический белок FLJ10262
0,366041
4,082294
13,14
Повышение
1.82E-04
AI242583
Homo sapiens, кДНК: FLJ11550 fis, клон HEMBA1002970
-0,13396
3,581638
13,14
Повышение
5.99E-04
NM_006206
Homo sapiens, рецептор полученных из тромбоцитов факторов роста, альфа полипептид (PDGFRA), мРНК. /PROD=platelet-derived growth factor receptor, alphapolypeptide /FL=gb:NM_006206.1 gb:M21574.1
-2,08299
1,631534
13,13
Повышение
3.64E-02
NM_002048
Homo sapiens, специфичный для задержки роста белок 1 (GAS1), мРНК. /PROD=growth arrest-specific 1 /FL=gb:NM_002048.1 gb:L13698.1
0,502235
4,214192
13,1
Повышение
2.47E-04
NM_014899
Homo sapiens, белок KIAA0878 (KIAA0878), мРНК. /PROD=KIAA0878 protein /FL=gb:NM_014899.1 gb:AB020685.1
0,500662
4,2088
13,07
Повышение
4.57E-04
AB043703
Homo sapiens, FZD8 мРНК для 7-трансмембранного рецептора Frizzled-8, полная кодовая последовательность. /PROD=seven-transmembrane receptor Frizzled-8 /FL=gb:AB043703.1
-1,80959
1,846066
12,6
Повышение
2.72E-03
BF447246
белок KIAA0960
0,804491
4,446299
12,48
Повышение
2.36E-04
AA583044
костный морфогенетический белок 2 /FL=gb:NM_001200.1
0,937118
4,57509
12,45
Повышение
7.47E-05
AU151342
Homo sapiens, кДНК: FLJ12935 fis, клон NT2RP2004982
2,428694
6,062052
12,41
Повышение
7.98E-05
BF510715
фактор роста фибробластов 4 (гепариновый секреторный трансформирующий белок 1, онкоген саркомы Капоши) /FL=gb:M17446.1 gb:NM_002007.1
-4,25059
-0,61821
12,4
Повышение
2.17E-02
AL834407
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp547H074 (из клона DKFZp547H074).
-2,64131
0,98784
12,37
Повышение
4.22E-02
AU157303
Гены EST
1,370117
4,998653
12,37
Повышение
2.02E-04
M33653
Человеческий (клоны HT-(125,133)) альфа-2 тип IV коллаген (COL4A2), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=alpha-2 type IV collagen /FL=gb:M33653.1
-0,05814
3,523836
11,98
Повышение
5.01E-04
BF308645
белок KIAA1415
0,85401
4,424822
11,88
Повышение
3.70E-04
NM_001742
Homo sapiens, кальцитониновый рецептор (CALCR), мРНК. /PROD=calcitonin receptor /FL=gb:AB022177.1 gb:NM_001742.1 gb:U26553.1 gb:U26554.1
-0,4843
3,086083
11,88
Повышение
1.07E-04
NM_001766
Homo sapiens, CD1D антиген, d полипептид (CD1D), мРНК. /PROD=CD1D antigen, d polypeptide /FL=gb:NM_001766.1 gb:J04142.1
-3,03319
0,529885
11,82
Повышение
3.86E-02
AI378026
Гены EST
-0,45718
3,095926
11,74
Повышение
2.21E-04
BF939489
гликопротеин M6A /FL=gb:D49958.1
-1,35345
2,18761
11,64
Повышение
3.72E-03
AW157571
Гены EST с низкой степенью подобия с T00331, гипотетическим белком KIAA0555 (H.sapiens)
1,829497
5,364987
11,6
Повышение
2.65E-04
AA534817
Гены EST с низкой степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
0,828954
4,325235
11,28
Повышение
4.08E-04
AK026659
Homo sapiens, кДНК: FLJ23006 fis, клон LNG00414.
-1,68521
1,795916
11,17
Повышение
5.31E-03
NM_002770
Homo sapiens, протеаза, серин, 2 (трипсин 2) (PRSS2), мРНК. /PROD=protease, serine, 2 (trypsin 2) /FL=gb:M27602.1 gb:NM_002770.1
-1,75731
1,71717
11,12
Повышение
2.72E-02
BC008992
Homo sapiens, клон MGC:16926 IMAGE:4183000, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:16926) /FL=gb:BC008992.1
-0,33264
3,138536
11,09
Повышение
2.48E-04
NM_020353
Homo sapiens, фосфолипид-скрамблаза 4 (LOC57088), мРНК. /PROD=phospholipid scramblase 4 /FL=gb:NM_020353.1 gb:AF199023.1
-2,84061
0,614927
10,97
Повышение
1.85E-03
AI123532
Гены EST
-0,11092
3,32528
10,82
Повышение
1.51E-04
BF591483
Гены EST
-2,87916
0,555292
10,81
Повышение
6.20E-03
BF529886
Homo sapiens, кДНК: FLJ39329 fis, клон OCBBF2015751.
0,378586
3,8114
10,8
Повышение
6.60E-05
BF109231
Гены EST
0,53123
3,962218
10,79
Повышение
5.00E-04
BF112171
белок DKFZP564O0423
-1,82351
1,607197
10,78
Повышение
1.13E-03
AA603467
рибосомальный белок S11
-2,56291
0,847807
10,63
Повышение
1.68E-02
BG532690
интегрин, альфа 4 (антиген CD49D, субъединица альфа 4 рецептора VLA-4)
0,1187
3,529403
10,63
Повышение
1.31E-04
N21184
Кластер включает N21184:yx41a10.s1 Homo sapiens, кДНК, 3 конец /clone=IMAGE-264282 /clone_end=3 /gb=N21184 /gi=1126354 /ug=Hs.93605 /len=619
-3,12055
0,266255
10,46
Повышение
1.87E-02
AW780006
Гены EST
-0,27888
3,087584
10,31
Повышение
1.05E-04
NM_003078
Homo sapiens, связанный с SWISNF, ассоциированный с матриксом, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство d, член 3 (SMARCD3), мРНК. /PROD=SWISNF related, matrix associated, actindependent regulator of chromatin, subfamily d, member 3 /FL=gb:NM_003078.1 gb
1,223968
4,582504
10,26
Повышение
1.32E-04
AL574912
Гены EST с низкой степенью подобия с серинпротеазой (H.sapiens)
-0,52859
2,828373
10,25
Повышение
6.20E-03
AW590614
Гены EST
-1,20714
2,140319
10,18
Повышение
1.22E-03
BC042378
Homo sapiens, клон IMAGE:5277693, мРНК.
1,59762
4,944335
10,17
Повышение
1.33E-03
NM_018649
Homo sapiens, коровый гистон macroH2A2.2 (MACROH2A2), мРНК. /PROD=core histone macroH2A2.2 /FL=gb:AF151534.1 gb:NM_018649.1
-0,75724
2,582097
10,12
Повышение
5.49E-03
AL445192
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-269H4 на хромосоме 20. Содержит 3-конец гена KIAA1415, подобный индуцирующему заражение и метастазирование Т-лимфомы белку-1, гены EST, STS и GSS
0,884916
4,219652
10,09
Повышение
9.57E-05
NM_000104
Homo sapiens, цитохром P450, подсемейство I (диоксин-индуцируемые), полипептид 1 (глаукома 3, первичный инфантильный) (CYP1B1), мРНК. /PROD=cytochrome P450, subfamily I (dioxin-inducible),polypeptide 1 /FL=gb:U03688.1 gb:NM_000104.2
-2,62694
0,700178
10,04
Повышение
8.15E-03
NM_000055
Homo sapiens, бутирилхолинэстераза (BCHE), мРНК. /PROD=butyrylcholinesterase precursor /FL=gb:M16541.1 gb:M16474.1 gb:NM_000055.1
1,388898
4,709109
9,99
Повышение
1.48E-04
BE620739
Гены EST
0,345528
3,626449
9,72
Повышение
6.25E-05
AW276186
главный комплекс гистосовместимости (MHC), класс II, DQ бета 1
1,563993
4,835093
9,65
Повышение
7.47E-05
NM_002413
Homo sapiens, микросомальная глутатион S-трансфераза 2 (MGST2), мРНК. /PROD=microsomal glutathione S-transferase 2 /FL=gb:NM_002413.1 gb:U77604.1
0,923781
4,188917
9,61
Повышение
7.47E-05
BE897866
Гены EST
-1,64839
1,585806
9,41
Повышение
1.44E-03
NM_004900
Homo sapiens, форболин (сходный с аполипопротеином B мРНК-редактирующий белок) (DJ742C19.2), мРНК. /PROD=phorbolin (similar to apolipoprotein B mRNAediting protein) /FL=gb:NM_004900.1 gb:U61083.1
0,829254
4,053354
9,34
Повышение
1.19E-04
AV697515
гипотетический белок FLJ10262
-0,62897
2,594105
9,34
Повышение
2.12E-02
AI694545
Гены EST
1,040647
4,25749
9,3
Повышение
6.25E-05
AI348094
белок KIAA0882
-2,10316
1,110711
9,28
Повышение
1.17E-02
H49805
Гены EST
-0,67823
2,5328
9,26
Повышение
1.82E-04
AA040057
протокадгерин 20
-0,27302
2,923702
9,17
Повышение
3.58E-04
NM_014271
Homo sapiens, подобный вспомогательному белку рецептора интерлейкина 1 белок 1 (IL1RAPL1), мРНК. /PROD=interleukin 1 receptor accessory protein-like 1 /FL=gb:AF284435.1 gb:NM_014271.1 gb:AF181284.1
0,205308
3,376912
9,01
Повышение
1.73E-04
BF509230
Гены EST
-0,13427
3,027131
8,95
Повышение
1.71E-04
D49958
Homo sapiens, мРНК для мембранного гликопротеина M6, полная кодовая последовательность. /PROD=membrane glycoprotein M6 /FL=gb:D49958.1
-0,95386
2,202339
8,91
Повышение
5.60E-04
AF312769
Homo sapiens, криптическая мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cryptic /FL=gb:AF312769.1
-1,39976
1,747599
8,86
Повышение
1.07E-04
NM_005204
Homo sapiens, митоген-активированной протеинкиназы киназы киназы киназа 8 (MAP3K8), мРНК. /PROD=mitogen-activated protein kinase kinase kinase8 /FL=gb:NM_005204.1 gb:D14497.1
-1,12824
2,007285
8,79
Повышение
9.57E-05
AK021452
Homo sapiens, кДНК: FLJ11390 fis, клон HEMBA1000561, с низкой степенью подобия с ЦИНК-ПАЛЬЦЕВЫМ БЕЛКОМ 91.
4,042679
7,170301
8,74
Повышение
2.33E-04
NM_005454
Homo sapiens, гомолог гена cerberus 1 (Xenopus laevis) (суперсемейство белков с цистеиновым узлом) (CER1), мРНК. /PROD=cerberus 1 /FL=gb:NM_005454.1
2,430238
5,551898
8,7
Повышение
7.47E-05
NM_004929
Homo sapiens, кальбиндин 1, (28 кДа) (CALB1), мРНК. /PROD=calbindin 1 /FL=gb:NM_004929.2
-3,17826
-0,07573
8,59
Повышение
2.88E-02
AI798098
Гены EST
0,424882
3,515001
8,52
Повышение
1.13E-03
AI692659
белок теплового шока 90 кДа 1, альфа
2,19676
5,285103
8,51
Повышение
6.25E-05
AW264102
Гены EST
-1,16113
1,925599
8,5
Повышение
9.58E-03
NM_012281
Homo sapiens, потенциал-зависимый калиевый канал, подсемейство, связанное с Shal, член 2 (KCND2), мРНК. /PROD=potassium voltage-gated channel, Shal-relatedsubfamily, member 2 /FL=gb:NM_012281.1 gb:AB028967.1 gb:AF121104.1
1,071985
4,144927
8,41
Повышение
9.57E-05
NM_004560
Homo sapiens, побочный рецептор, подобный рецептору тирозинкиназы 2 (ROR2), мРНК. /PROD=receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 2 /FL=gb:M97639.1 gb:NM_004560.1
1,750623
4,809696
8,33
Повышение
2.20E-04
AA176289
Гены EST
-1,25995
1,783805
8,25
Повышение
1.48E-03
AK026607
Homo sapiens, кДНК: FLJ22954 fis, клон KAT09813, с высокой степенью подобия с мРНК белка AF010315, Homo sapiens Pig11 (PIG11).
0,828899
3,847136
8,1
Повышение
6.55E-04
NM_001200
Homo sapiens, костный морфогенетический белок 2 (BMP2), мРНК. /PROD=bone morphogenetic protein 2 precursor /FL=gb:NM_001200.1
1,690321
4,701963
8,06
Повышение
1.26E-04
NM_014045
Homo sapiens, белок DKFZP564C1940 (DKFZP564C1940), мРНК. /PROD=DKFZP564C1940 protein /FL=gb:BC000424.1 gb:AF131760.1 gb:NM_014045.1
1,979568
4,987789
8,05
Повышение
7.98E-05
M17565
Человеческий MHC, класс II, DQ-beta, связанный с DRw6, белок DQw1, полная кодовая последовательность. /FL=gb:M17565.1
-0,75007
2,251382
8,01
Повышение
1.88E-03
AI681917
Гены EST с высокой степенью подобия с МЫШИНЫМ IRX3, ГОМЕОДОМЕННЫМ БЕЛКОМ IRX-3 КЛАССА IROQUOIS (M.musculus)
2,109037
5,094219
7,92
Повышение
5.90E-05
AW014927
кальбиндин 1, (28 кДа) /FL=gb:NM_004929.2
1,380324
4,364081
7,91
Повышение
2.74E-04
NM_006895
Homo sapiens, гистамин N-метилтрансфераза (HNMT), мРНК. /PROD=histamine N-methyltransferase /FL=gb:NM_006895.1 gb:D16224.1 gb:U08092.1
0,143628
3,121397
7,88
Повышение
7.94E-03
AB037763
Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1342, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1342 protein /FL=gb:AF299075.1
-0,20066
2,775234
7,87
Повышение
4.95E-04
NM_001609
Homo sapiens, ацил-коэнзим А-дегидрогеназа, коротко-ветвистая цепь (ACADSB), ядерный ген, кодирующий митохондриальный белок, мРНК. /PROD=acyl-Coenzyme A dehydrogenase, shortbranchedchain precursor /FL=gb:U12778.1 gb:NM_001609.1
-2,16611
0,806244
7,85
Повышение
2.70E-02
NM_001977
Homo sapiens, глутамиламинопептидаза (аминопептидаза A) (ENPEP), мРНК. /PROD=glutamyl aminopeptidase (aminopeptidase A) /FL=gb:L12468.1 gb:NM_001977.1 gb:L14721.1
0,007601
2,978021
7,84
Повышение
3.96E-04
N63706
Гены EST
1,186033
4,154093
7,82
Повышение
1.02E-04
AI627704
Гены EST с низкой степенью подобия с T17346, гипотетическим белком DKFZp586O1624.1 (H.sapiens)
1,207341
4,163803
7,76
Повышение
7.98E-05
M31213
Кодируемый папиллярной карциномой щитовидной железы человека белок, мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:M31213.1
0,106425
3,062268
7,76
Повышение
1.05E-04
NM_018371
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ11264 (FLJ11264), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ11264 /FL=gb:NM_018371.1
1,997597
4,940494
7,69
Повышение
8.49E-05
BC005997
Homo sapiens, клон MGC:14801, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:14801) /FL=gb:BC005997.1
-0,29145
2,648165
7,67
Повышение
8.78E-04
AI197932
Гены EST
-1,20098
1,732939
7,64
Повышение
8.76E-03
NM_001794
Homo sapiens, кадгерин 4, тип 1, R-кадгерин (сетчаточный) (CDH4), мРНК. /PROD=cadherin 4, type 1, R-cadherin (retinal) /FL=gb:L34059.1 gb:NM_001794.1
-0,96106
1,954749
7,55
Повышение
3.03E-04
AU153412
Homo sapiens, кДНК: FLJ13136 fis, клон NT2RP3003139
4,072718
6,987624
7,54
Повышение
3.42E-04
AU144598
молекула клеточного распознавания Caspr2 /FL=gb:AF193613.1 gb:NM_014141.1
1,754933
4,669573
7,54
Повышение
1.40E-04
NM_013231
Homo sapiens, фибронектиновый богатый лейцином трансмембранный белок 2 (FLRT2), мРНК. /PROD=fibronectin leucine rich transmembrane protein2 /FL=gb:AB007865.1 gb:AF169676.1 gb:NM_013231.1
-2,81405
0,095993
7,52
Повышение
9.09E-03
AI694325
Гены EST
-1,80965
1,082014
7,42
Повышение
2.00E-02
NM_152506
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32835 (FLJ32835), мРНК. /FL=gb:NM_152506.1
0,360809
3,246455
7,39
Повышение
7.76E-03
N47315
субстрат протеинкиназы C и казеинкиназы в нейронах 1
-0,10733
2,776046
7,38
Повышение
2.10E-03
BC005107
Homo sapiens, клон IMAGE:3840937, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3840937)
-1,44407
1,430083
7,33
Повышение
1.37E-02
U91903
Человеческий белок Fritz, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Fritz /FL=gb:U24163.1 gb:U68057.1 gb:NM_001463.1 gb:U91903.1
2,383898
5,242759
7,25
Повышение
9.57E-05
BF476502
гипотетический белок FLJ11585
-1,74597
1,112559
7,25
Повышение
3.28E-02
AW269818
гипотетический белок FLJ23403 /FL=gb:NM_022068.1
-2,26295
0,569202
7,12
Повышение
1.70E-02
AI735586
Гены EST
-1,6164
1,213758
7,11
Повышение
2.52E-02
X00452
Человеческая мРНК для альфа-цепи антигена гистосовместимости DC, класс II. /PROD=DC classII histocompatibility antigenalpha-chain
-0,13959
2,687835
7,1
Повышение
3.70E-04
BG109855
Homo sapiens, клон TUA8, область, связанная с синдромом кошачьего крика, мРНК
-0,88175
1,936253
7,05
Повышение
3.50E-03
AI650874
Гены EST
-1,37453
1,440655
7,04
Повышение
1.15E-02
AF126966
Homo sapiens, изоформа а альфа1G субъединицы потенциал-зависимого кальциевого канала (CACNA1G), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=voltage-dependent calcium channel alpha 1Gsubunit a isoform /FL=gb:AF190860.1 gb:AF126966.1
-3,09265
-0,28152
7,02
Повышение
9.07E-03
AI093492
Гены EST
-0,54935
2,252035
6,97
Повышение
1.12E-03
NM_006877
Homo sapiens, гуанозинмонофосфатредуктаза (GMPR), мРНК. /PROD=guanosine monophosphate reductase /FL=gb:M24470.1 gb:NM_006877.1
1,956109
4,750668
6,94
Повышение
2.21E-04
AI332979
калиевый потенциал-зависимый канал, подсемейство G, член 1 /FL=gb:NM_002237.1 gb:AF033383.1
-1,26967
1,520668
6,92
Повышение
7.48E-03
AW166711
белок KIAA0403
-0,23726
2,551912
6,91
Повышение
3.23E-04
AA912476
Homo sapiens, кДНК: FLJ13221 fis, клон NT2RP4002075
2,093848
4,875184
6,87
Повышение
5.90E-05
AC004010
BAC клон человека GS1-99H8
-0,96264
1,812987
6,85
Повышение
6.20E-03
AB028998
Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1075, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1075 protein
-2,33994
0,434528
6,84
Повышение
3.67E-02
AL134708
Гены EST
-2,08762
0,681751
6,82
Повышение
2.01E-02
AF052117
Homo sapiens, последовательность мРНК клона 23809.
0,323675
3,088394
6,8
Повышение
8.50E-03
M32577
Человеческий MHC, HLA-DQ бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:M32577.1
3,287037
6,047807
6,78
Повышение
5.77E-04
AI633559
Гены EST
-2,02151
0,737644
6,77
Повышение
3.93E-03
BF062244
Гены EST
-1,66608
1,08864
6,75
Повышение
1.86E-02
BE673445
Homo sapiens, хромосома 19, космида R28379
0,449168
3,190138
6,69
Повышение
1.96E-04
AI688418
плексин A2
0,798972
3,539942
6,69
Повышение
4.35E-04
AI082827
гипотетический белок FLJ11585
0,83572
3,564527
6,63
Повышение
1.99E-03
N21138
белок KIAA0878 /FL=gb:NM_014899.1 gb:AB020685.1
1,231172
3,958844
6,62
Повышение
2.36E-04
AI949419
Гены EST
-2,31389
0,411671
6,61
Повышение
1.05E-02
AF302494
Homo sapiens, потенциал-зависимый калиевый канал, субъединица MIRP2 (KCNE3), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=voltage-gated K+ channel subunit MIRP2 /FL=gb:NM_005472.1 gb:AF076531.1 gb:AF302494.1
1,415513
4,132936
6,58
Повышение
3.18E-04
AI692703
калиевый потенциал-зависимый канал, Isk-связанное семейство, член 3
0,631332
3,346113
6,56
Повышение
5.92E-04
AI130705
Гены EST с низкой степенью подобия с A46302, фактором сплайсинга, ассоциированным с PTB, длинная форма (H.sapiens)
3,954335
6,666275
6,55
Повышение
7.98E-05
AB020675
Homo sapiens, мРНК для белка KIAA0868, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA0868 protein /FL=gb:AF193613.1 gb:NM_014141.1
-1,09181
1,620124
6,55
Повышение
2.00E-02
AI653050
Гены EST с низкой степенью подобия с HPPD_HUMAN 4 - ГИДРОКСИФЕНИЛПИРУВАТ-ДИОКСИГЕНАЗОЙ (H.sapiens)
1,888188
4,581731
6,47
Повышение
3.37E-04
AW340311
Гены EST
-1,83503
0,855966
6,46
Повышение
6.85E-03
AA552969
Гены EST
-2,08627
0,604316
6,46
Повышение
1.75E-03
N50714
Гены EST
-1,2719
1,416234
6,44
Повышение
4.00E-03
NM_020406
Homo sapiens, истинная первичная полицитемия 1; рецептор на поверхности клетки (PRV1), мРНК. /PROD=polycythemia rubra vera 1; cell surfacereceptor /FL=gb:NM_020406.1 gb:AF146747.1
2,444644
5,126622
6,42
Повышение
2.48E-04
AA789332
Гены EST со средней степенью подобия с белком KIAA1215 (H.sapiens)
-1,10551
1,574234
6,41
Повышение
1.76E-02
AL136859
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434P1735 (из клона DKFZp434P1735); полная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein /FL=gb:AL136859.1
-1,30127
1,354641
6,3
Повышение
4.69E-04
AI003579
переносчик растворенных веществ, семейство 6 (переносчик нейромедиаторов, GABA), член 1 /FL=gb:NM_003042.1
-0,22337
2,432405
6,3
Повышение
5.31E-03
NM_021822
Homo sapiens, форболин-подобный белок MDS019 (MDS019), мРНК. /PROD=phorbolin-like protein MDS019 /FL=gb:AF182420.1 gb:NM_021822.1
-1,25121
1,403996
6,3
Повышение
1.13E-03
R62432
Кластер включает R62432:yg52e11.s1 Homo sapiens, кДНК, 3-конец /clone=IMAGE-36023 /clone_end=3 /gb=R62432 /gi=834311 /ug=Hs.12321 /len=487
-1,55104
1,102459
6,29
Повышение
7.99E-04
AU157716
Homo sapiens, кДНК: FLJ13585 fis, клон PLACE1009150
-2,47063
0,175591
6,26
Повышение
1.53E-02
H09657
Гены EST
0,373467
3,018454
6,25
Повышение
1.79E-03
AU151239
Homo sapiens, кДНК: FLJ12927 fis, клон NT2RP2004743
1,861693
4,496649
6,21
Повышение
3.70E-04
AI374739
Гены EST
-1,73396
0,890885
6,17
Повышение
1.62E-02
AU145336
Homo sapiens, кДНК: FLJ11655 fis, клон HEMBA1004554
1,586056
4,195825
6,1
Повышение
4.67E-04
Z83851
Последовательность человеческой ДНК от клонирования 989H11 на хромосоме 22q13.1-13.2. Содержит часть нового гена, гены EST, GSS и четыре предполагаемых CpG-островка
0,569298
3,178582
6,1
Повышение
3.18E-04
NM_000362
Homo sapiens, тканевой ингибитор металлопротеиназы 3 (фундальная дистрофия Сорсби, псевдовоспалительная) (TIMP3), мРНК. /PROD=tissue inhibitor of metalloproteinase 3precursor /FL=gb:NM_000362.2 gb:U14394.1 gb:U67195.1 gb:U02571.1
-2,13754
0,46922
6,09
Повышение
2.02E-02
BF000203
Гены EST
0,013383
2,617624
6,08
Повышение
5.42E-03
L10374
Человеческая (клон CTG-A4) последовательность мРНК.
1,250788
3,85327
6,07
Повышение
1.09E-04
AF077040
Homo sapiens, SIH003 мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=SIH003 /FL=gb:AF077040.1
-1,09421
1,502221
6,05
Повышение
2.38E-03
AK023621
Homo sapiens, кДНК: FLJ13559 fis, клон PLACE1007852, с высокой степенью подобия с Homo sapiens мРНК для белка KIAA0878.
0,466394
3,059875
6,04
Повышение
5.79E-04
NM_003121
Homo sapiens, транскрипционный фактор Spi-B (связанный с Spi-1PU.1) (SPIB), мРНК. /PROD=Spi-B transcription factor (Spi-1PU.1 related) /FL=gb:NM_003121.1
-0,18863
2,401303
6,02
Повышение
3.85E-03
AV700724
GATA-связывающий белок 4 /FL=gb:NM_002052.1 gb:L34357.1 gb:D78260.1
2,182526
4,77117
6,02
Повышение
8.49E-05
NM_004010
Homo sapiens, дистрофин (мышечная дистрофия, типы Дюшена и Беккера), включает DXS142, DXS164, DXS206, DXS230, DXS239, DXS268, DXS269, DXS270, DXS272 (DMD), вариант транскрипта Dp427p2, мРНК. /PROD=dystrophin Dp427p2 isoform /FL=gb:NM_004010.1
1,08211
3,666711
6
Повышение
9.72E-04
AF010314
Homo sapiens, Pig10 (PIG10) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Pig10 /FL=gb:AF059611.1 gb:AF010314.1 gb:NM_003633.1 gb:BC000418.1 gb:AF005381.1
-1,4606
1,112751
5,95
Повышение
1.20E-03
AW072102
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434H205 (из клона DKFZp434H205)
2,092702
4,657439
5,92
Повышение
6.25E-05
AA700440
Гены EST
0,513482
3,076608
5,91
Повышение
3.96E-04
AU154504
цитохром P450, подсемейство I (диоксин-индуцируемые), полипептид 1 (глаукома 3, первичный инфантильный) /FL=gb:U03688.1 gb:NM_000104.2
-1,13676
1,422546
5,89
Повышение
6.80E-03
AB023144
Homo sapiens, мРНК для белка KIAA0927, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA0927 protein
1,297014
3,854685
5,89
Повышение
1.02E-04
NM_005756
Homo sapiens, связанный с G-белком рецептор 64 (GPR64), мРНК. /PROD=G protein-coupled receptor 64 /FL=gb:NM_005756.1
-0,68272
1,867351
5,86
Повышение
5.59E-03
AF159447
Homo sapiens, подавитель составной мРНК, альтернативная форма сплайсинга 2, полная кодовая последовательность. /PROD=Suppressor of Fused /FL=gb:NM_016169.1 gb:AF159447.1 gb:AF175770.1
-3,12304
-0,58481
5,81
Повышение
4.03E-02
NM_018018
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10191 (FLJ10191), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10191 /FL=gb:NM_018018.1
1,163123
3,692873
5,77
Повышение
1.63E-04
NM_002742
Homo sapiens, протеинкиназа C, мю (PRKCM), мРНК. /PROD=protein kinase C, mu /FL=gb:NM_002742.1
-0,35867
2,162789
5,74
Повышение
1.69E-04
NM_001957
Homo sapiens, эндотелиновый рецептор типа A (EDNRA), мРНК. /PROD=endothelin receptor type A /FL=gb:NM_001957.1 gb:L06622.1
2,405473
4,925144
5,73
Повышение
6.25E-05
AI283093
Гены EST
-1,58235
0,936512
5,73
Повышение
1.59E-03
NM_018419
Homo sapiens, SRY (определяющий пол участок Y-хромосомы)-бокс 18 (SOX18), мРНК. /PROD=SRY (sex determining region Y)-box 18 /FL=gb:AF270652.1 gb:AB033888.1 gb:NM_018419.1
-1,88254
0,627373
5,7
Повышение
6.20E-03
BF694956
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP1-187J11 на хромосоме 6q11.1-22.33. Содержит ген нового белка, подобного предсказанным белкам S. pombe и S. cerevisiae, ген нового белка, подобного ингибиторам протеинкиназы C, 3-конец
-0,68545
1,817815
5,67
Повышение
5.99E-03
BC035640
Homo sapiens, клон IMAGE:5547405, мРНК.
-1,92555
0,569805
5,64
Повышение
1.75E-03
BE856597
Гены EST
3,313759
5,801354
5,61
Повышение
1.18E-04
AB020657
Homo sapiens, мРНК для белка KIAA0850, полная кодовая последовательность. /PROD=KIAA0850 protein /FL=gb:AB020657.1 gb:AF161553.1 gb:AF205218.1 gb:NM_016389.1
4,49505
6,977964
5,59
Повышение
6.25E-05
AK093435
Homo sapiens, кДНК: FLJ36116 fis, клон TESTI2022338.
0,618056
3,100379
5,59
Повышение
1.33E-04
BG165333
Гены EST
-1,12392
1,354596
5,57
Повышение
2.50E-03
T82147
Гены EST
-1,17289
1,304294
5,57
Повышение
6.03E-03
AW025980
Гены EST с низкой степенью подобия с A47582, предшественником факторов роста B-клеток (H.sapiens)
-0,66753
1,784294
5,47
Повышение
9.05E-04
AF284435
Homo sapiens, TIGIRR-2 мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=TIGIRR-2 /FL=gb:AF284435.1 gb:NM_014271.1 gb:AF181284.1
-0,04543
2,399112
5,44
Повышение
1.46E-03
AB037730
Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1309, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1309 protein
-2,47478
-0,03132
5,44
Повышение
8.96E-03
NM_152687
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ33641 (FLJ33641), мРНК. /FL=gb:NM_152687.1
-1,89695
0,545787
5,44
Повышение
3.46E-03
AL136944
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp586J0624 (из клона DKFZp586J0624); полная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein /FL=gb:AF215636.1 gb:NM_014585.1 gb:AF231121.1 gb:AF226614.1 gb:AL136944.1
1,095538
3,529324
5,4
Повышение
1.59E-04
AF319520
Homo sapiens, ARG99 мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ARG99 /FL=gb:AF319520.1
2,130365
4,562488
5,4
Повышение
8.49E-05
BC005047
Homo sapiens, клон MGC:12852, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:12852) /FL=gb:NM_001946.1 gb:AB013382.1 gb:BC003562.1 gb:BC003143.1 gb:BC005047.1
3,686635
6,118029
5,39
Повышение
1.82E-04
AF205218
Homo sapiens, подобный связывающему белку NS1 белок, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NS1-binding protein-like protein /FL=gb:AB020657.1 gb:AF161553.1 gb:AF205218.1 gb:NM_016389.1
1,298769
3,727597
5,38
Повышение
2.76E-04
AI123815
Гены EST
1,182358
3,610132
5,38
Повышение
1.82E-04
AW270138
Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1729, частичная кодовая последовательность
-1,39667
1,02491
5,36
Повышение
6.51E-03
AI018174
Гены EST
-0,47241
1,946888
5,35
Повышение
6.80E-03
NM_006604
Homo sapiens, подобный белку ret finger белок 3 (RFPL3), мРНК. /PROD=ret finger protein-like 3 /FL=gb:NM_006604.1
-0,68921
1,725879
5,33
Повышение
1.34E-04
NM_016546
Homo sapiens, предшественник комплемент-C1r-подобной протеиназы, (LOC51279), мРНК. /PROD=complement C1r-like proteinase precursor, /FL=gb:AF178985.1 gb:NM_016546.1
-0,17505
2,238912
5,33
Повышение
1.05E-04
AA995925
Homo sapiens, последовательность мРНК клона 23741
-0,20099
2,21229
5,33
Повышение
1,55E-03
BF984830
индуцируемый ретиноевой кислотой белок 1
2,377335
4,79048
5,33
Повышение
4.69E-04
NM_005328
Homo sapiens, гиалуронансинтаза 2 (HAS2), мРНК. /PROD=hyaluronan synthase 2 /FL=gb:U54804.1 gb:NM_005328.1
-0,98665
1,425455
5,32
Повышение
1.34E-02
NM_001463
Homo sapiens, frizzled-связанный белок (FRZB), мРНК. /PROD=frizzled-related protein /FL=gb:U24163.1 gb:U68057.1 gb:NM_001463.1 gb:U91903.1
2,264046
4,672118
5,31
Повышение
1.25E-04
AL049589
Последовательность человеческой ДНК из клона 570L12 на хромосоме Xq13.1-21.1. Содержит ген PGK1 для фосфоглицераткиназы 1, ген нового белка, подобного TAF2G (фактором, ассоциированным с белком, связывающим TATA-участок (TBP), РНК-полимераза II, G, 32 кДа) (TAF...
-0,35323
2,046488
5,28
Повышение
2.37E-03
BM666010
Homo sapiens, кДНК: FLJ23803 fis, клон HEP22811.
3,472109
5,867303
5,26
Повышение
7.98E-05
AW069729
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434B2119 (из клона DKFZp434B2119); частичная кодовая последовательность
0,977201
3,368558
5,25
Повышение
7.47E-05
AI656807
Гены EST
2,732975
5,121756
5,24
Повышение
6.52E-04
AC005378
Homo sapiens, PAC клон RP5-1137M13 из хромосомы 7q33-q35
1,592667
3,976725
5,22
Повышение
6.48E-04
AI978754
Гены EST
1,008383
3,391251
5,22
Повышение
8.23E-04
BE397715
транскрипционный фактор 2 лейкимии предшественников В-клеток /FL=gb:NM_002586.1
0,134434
2,516313
5,21
Повышение
3.13E-04
AV758821
Гены EST с низкой степенью подобия с Z132_HUMAN, ЦИНК-ПАЛЬЦЕВЫМ БЕЛКОМ 13 (H.sapiens)
1,496791
3,877324
5,21
Повышение
8.49E-05
BF338045
калуменин
0,329872
2,705019
5,19
Повышение
1.05E-04
AI652899
Гены EST
-0,39856
1,964554
5,14
Повышение
1.29E-03
BC019064
Homo sapiens, подобный гипотетическому белку FLJ14743, клон MGC:29781 IMAGE:4590587, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Similar to hypothetical protein FLJ14743 /FL=gb:BC019064.1
0,462867
2,81993
5,12
Повышение
8.02E-03
AI807026
Гены EST
0,385307
2,742224
5,12
Повышение
4.37E-04
BF435123
содержащий бромодомен и белок PHD-finger 3
-1,10371
1,252512
5,12
Повышение
9.04E-04
NM_005985
Homo sapiens, snail 1 (drosophila, гомолог), цинк-пальцевый белок (SNAI1), мРНК. /PROD=snail 1 (drosophila homolog), zinc fingerprotein /FL=gb:AF125377.1 gb:NM_005985.1
1,094591
3,449692
5,12
Повышение
1.02E-04
NM_024064
Homo sapiens, гипотетический белок MGC5363 (MGC5363), мРНК. /PROD=hypothetical protein MGC5363 /FL=gb:BC001000.2 gb:NM_024064.1
2,167442
4,520183
5,11
Повышение
4.37E-04
NM_001552
Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 4 (IGFBP4), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor-binding protein 4 /FL=gb:M62403.1 gb:NM_001552.1
2,49682
4,845096
5,09
Повышение
2.00E-04
NM_014943
Homo sapiens, белок KIAA0854 (KIAA0854), мРНК. /PROD=KIAA0854 protein /FL=gb:NM_014943.1 gb:AB020661.1
0,089114
2,430633
5,07
Повышение
5.31E-03
AW014734
Гены EST
0,208844
2,544219
5,05
Повышение
4.90E-04
H09780
Человеческая (клон CTG-A4) последовательность мРНК
1,38879
3,721503
5,04
Повышение
1.05E-04
D21254
Человеческая мРНК для OB-кадгерин-1, полная кодовая последовательность. /PROD=OB-cadherin-1 /FL=gb:L34056.1 gb:NM_001797.1 gb:D21254.1
-0,07494
2,251273
5,01
Повышение
8.04E-04
NM_001394
Homo sapiens, двойной специфичности фосфатаза 4 (DUSP4), мРНК. /PROD=dual specificity phosphatase 4 /FL=gb:NM_001394.2 gb:BC002671.1 gb:U48807.1 gb:U21108.1
2,115363
4,439619
5,01
Повышение
1.50E-04
NM_018700
Homo sapiens, связывающий цинк белок Rbcc728 (Rbcc728), мРНК. /PROD=zinc-binding protein Rbcc728 /FL=gb:NM_018700.1
1,361153
-4,07391
43,26
Снижение
4.28E-04
NM_014352
Homo sapiens, транскрипционный фактор POU (OCT11), мРНК. /PROD=POU transcription factor /FL=gb:NM_014352.1 gb:AF133895.1 gb:AF162278.1
1,312148
-3,67593
31,74
Снижение
2.15E-02
U32500
Человеческий рецептор типа 2 к нейропептиду Y, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=type 2 neuropeptide Y receptor /FL=gb:U42766.1 gb:U36269.1 gb:U32500.1
3,409815
-1,40094
28,07
Снижение
4.88E-03
NM_016588
Homo sapiens, нейритин (LOC51299), мРНК. /PROD=neuritin /FL=gb:NM_016588.1 gb:BC002683.1 gb:AF136631.1
0,757197
-4,01309
27,29
Снижение
5.31E-03
AF213459
Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
5,187988
0,925716
19,19
Снижение
1.82E-04
AA074145
гомолог пролиноксидазы
3,862686
-0,33976
18,41
Снижение
1.79E-03
NM_007115
Homo sapiens, индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 (TNFAIP6), мРНК. /PROD=tumor necrosis factor, alpha-induced protein 6 /FL=gb:NM_007115.1
0,579765
-3,61266
18,28
Снижение
1.63E-03
AI393930
Гены EST
3,77776
-0,38219
17,88
Снижение
4.99E-04
BU729850
гипотетический белок LOC153469
2,951696
-1,16992
17,41
Снижение
5.31E-03
AB019562
Homo sapiens, мРНК, экспрессируемая только в ворсинах плаценты, клон SMAP41.
1,143234
-2,96901
17,29
Снижение
1.60E-04
BF437711
Гены EST
3,268087
-0,81338
16,93
Снижение
1.82E-04
AF345910
Homo sapiens, NYD-SP14 мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NYD-SP14 /FL=gb:AF345910.1
3,113698
-0,8325
15,41
Снижение
6.25E-05
NM_002196
Homo sapiens, ассоциированный с инсулиномой белок 1 (INSM1), мРНК. /PROD=insulinoma-associated 1 /FL=gb:NM_002196.1 gb:M93119.1
4,927935
1,009599
15,12
Снижение
1.75E-04
J05008
Homo sapiens, ген эндотелина-1 (EDN1), полная кодовая последовательность. /FL=gb:NM_001955.1
4,897427
1,053368
14,36
Снижение
6.25E-05
R06655
Гены EST со средней степенью подобия с белком AF078844 1 hqp0376 (H.sapiens)
2,271332
-1,54277
14,07
Снижение
1.21E-02
NM_015198
Homo sapiens, белок KIAA0633 (COBL), мРНК. /PROD=KIAA0633 protein /FL=gb:NM_015198.1
3,025351
-0,68158
13,06
Снижение
6.25E-05
AW590925
Гены EST
0,961816
-2,64027
12,14
Снижение
1.38E-02
AI796169
GATA-связывающий белок 3 /FL=gb:NM_002051.1 gb:M69106.1 gb:BC003070.1
1,840613
-1,75619
12,1
Снижение
1.31E-02
AI949760
Гены EST с низкой степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
2,350127
-1,16435
11,43
Снижение
1.75E-03
AK026106
Homo sapiens, кДНК: FLJ22453 fis, клон HRC09679, с высокой степенью подобия cAF059516, мРНК толлоид-подобного 2 (TLL2) белка, Homo sapiens.
2,36447
-1,11975
11,19
Снижение
1.26E-04
NM_005181
Homo sapiens, карбоангидраза III, специфичная для мышц (CA3), мРНК. /PROD=carbonic anhydrase III /FL=gb:BC004897.1 gb:NM_005181.2
3,806044
0,35797
10,91
Снижение
5.32E-04
AV734646
Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
5,023981
1,579769
10,88
Снижение
1.50E-04
NM_006472
Homo sapiens, стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 (VDUP1), мРНК. /PROD=upregulated by 1,25-dihydroxyvitamin D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
7,564809
4,126951
10,84
Снижение
6.52E-04
M83248
Человеческий нефропонтин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=nephropontin /FL=gb:M83248.1
4,055862
0,664604
10,49
Снижение
9.57E-05
AK026815
Homo sapiens, кДНК: FLJ23162 fis, клон LNG09734.
3,437271
0,12475
9,94
Снижение
3.82E-04
AB029025
Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1102, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1102 protein
2,129273
-1,1448
9,67
Снижение
1.66E-04
AV734646
Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
4,847114
1,573515
9,67
Снижение
1.73E-04
NM_006474
Homo sapiens, ассоциированный с клеточной мембраной гликопротеин легочного типа-I (T1A-2), вариант транскрипта 2, мРНК. /PROD=lung type-I cell membrane-associatedglycoprotein, isoform 2 precursor /FL=gb:NM_006474.1 gb:AF030428.1
1,577138
-1,67271
9,51
Снижение
7.76E-03
M15329
Человеческий интерлейкин 1-альфа (IL1A), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=interleukin 1-alpha /FL=gb:M15329.1
4,505436
1,287267
9,31
Снижение
9.57E-05
W57613
Гены EST
3,508683
0,294832
9,28
Снижение
1.97E-04
AK027231
Homo sapiens, кДНК: FLJ23578 fis, клон LNG12709.
2,62025
-0,53251
8,89
Снижение
5.60E-04
AA625683
Гены EST
1,659275
-1,48435
8,84
Снижение
9.40E-04
L16895
Человеческий ген лизилоксидазы (LOX), экзон 7
5,207569
2,064859
8,83
Снижение
2.72E-04
AA083478
Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 746039
2,306225
-0,8129
8,69
Снижение
2.76E-04
AW444761
Гены EST
2,000419
-1,10961
8,63
Снижение
5.03E-03
NM_031272
Homo sapiens, экспрессированная последовательность 14 яичек (TEX14), мРНК. /PROD=testis expressed sequence 14 /FL=gb:NM_031272.1
5,450694
2,394209
8,32
Снижение
9.84E-05
AF095771
Homo sapiens, белок B1 реагирующей на PTH остеосаркомы (B1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PTH-responsive osteosarcoma B1 protein /FL=gb:AF095771.1
5,252439
2,196404
8,32
Снижение
1.18E-03
NM_001553
Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
4,507212
1,458704
8,27
Снижение
1.26E-04
AW196940
Гены EST
3,543738
0,544705
7,99
Снижение
4.95E-04
NM_001955
Homo sapiens, эндотелин 1 (EDN1), мРНК. /PROD=endothelin 1 /FL=gb:NM_001955.1
3,334996
0,337521
7,99
Снижение
1.34E-05
R40917
фосфодиэстераза 4D, цАМФ-специфичная (гомологичная гену дрозофилы (Drosophila) фосфодиэстераза E3) /FL=gb:L20969.1 gb:NM_006203.1 gb:U02882.1
4,092731
1,098988
7,97
Снижение
7.83E-04
AL513917
переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
3,19487
0,215496
7,89
Снижение
2.37E-03
NM_173553
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ25801 (FLJ25801), мРНК. /FL=gb:NM_173553.1
5,388254
2,421904
7,82
Снижение
3.23E-04
NM_004207
Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 (SLC16A3), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
3,094055
0,128818
7,81
Снижение
3.00E-04
AW188198
индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 /FL=gb:NM_007115.1
2,332751
-0,63023
7,8
Снижение
9.35E-05
NM_000077
Homo sapiens, циклин-зависимой киназы ингибитор 2A (меланома, p16, ингибирует CDK4) (CDKN2A), мРНК. /PROD=cyclin-dependent kinase inhibitor 2A (melanoma,p16, inhibits CDK4) /FL=gb:NM_000077.1 gb:L27211.1
1,10782
-1,84525
7,74
Снижение
3.46E-03
BC029425
Homo sapiens, белок, подобный KIAA1275, клон IMAGE:4616553, мРНК.
3,655193
0,705514
7,73
Снижение
3.18E-04
AI659927
Homo sapiens, кДНК: FLJ22547 fis, клон HSI00356
5,356771
2,412135
7,7
Снижение
1.86E-04
W92036
Гены EST
2,28595
-0,65294
7,67
Снижение
2.78E-03
BE504838
Гены EST
6,1137
3,198978
7,54
Снижение
2.22E-04
NM_001553
Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
4,738703
1,825888
7,53
Снижение
1.59E-04
NM_014033
Homo sapiens, белок DKFZP586A0522 (DKFZP586A0522), мРНК. /PROD=DKFZP586A0522 protein /FL=gb:NM_014033.1
4,633038
1,723613
7,51
Снижение
7.34E-05
NM_016931
Homo sapiens, NADPH-оксидаза 4 (NOX4), мРНК. /PROD=NADPH oxidase 4 /FL=gb:AF261943.1 gb:NM_016931.1 gb:AF254621.1 gb:AB041035.1
0,831091
-2,07313
7,49
Снижение
1.64E-02
NM_153036
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32239 (FLJ32239), мРНК. /FL=gb:NM_153036.1
3,030236
0,148098
7,37
Снижение
1.06E-03
AA812232
стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
5,715937
2,845518
7,31
Снижение
6.25E-05
U85658
Человеческий транскрипционный фактор ERF-1, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ERF-1 /FL=gb:NM_003222.1 gb:U85658.1
2,597946
-0,264
7,27
Снижение
1.96E-04
AW138143
Гены EST
2,798327
-0,06241
7,26
Снижение
1.59E-04
BF062943
протокадгерин 18
2,590871
-0,2675
7,25
Снижение
5.03E-03
NM_016569
Homo sapiens, изо-белокTBX3 (TBX3-iso), мРНК. /PROD=TBX3-iso protein /FL=gb:NM_016569.1 gb:AF216750.1
2,967768
0,161666
6,99
Снижение
2.73E-03
AL121753
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP4-614O4 на хромосоме 20q11.1-12. Содержит 3-часть MMP24 (ген матриксной металлопротеазы 24 (вставленной в мембрану)), ген ITGB4BP (белка, связывающего интегрин-бета 4), 3-конец нового гена, 3-конец ...
1,041706
-1,73204
6,84
Снижение
3.48E-02
BF196010
Гены EST
0,424388
-2,34418
6,81
Снижение
3.04E-03
NM_002433
Homo sapiens, гликопротеин миелина олигодендроцитов (MOG), мРНК. /PROD=myelin oligodendrocyte glycoprotein /FL=gb:U18798.1 gb:U64564.1 gb:NM_002433.1
6,307554
3,554438
6,74
Снижение
3.96E-04
NM_006622
Homo sapiens, индуцируемая сывороткой киназа (SNK), мРНК. /PROD=serum-inducible kinase /FL=gb:AF059617.1 gb:NM_006622.1 gb:AF223574.1
3,876749
1,137352
6,68
Снижение
1.28E-03
AL574184
гидроксипростагландин-дегидрогеназа 15-(NAD) /FL=gb:NM_000860.1 gb:L76465.1
7,67265
4,935152
6,67
Снижение
3.86E-04
NM_002966
Homo sapiens, связывающего кальций белок S100 A10 (лиганд аннексина II, кальпактин I, легкий полипептид (p11)) (S100A10), мРНК. /PROD=S100 calcium-binding protein A10 /FL=gb:M81457.1 gb:M38591.1 gb:NM_002966.1
3,127666
0,401912
6,62
Снижение
4.36E-04
NM_003577
Homo sapiens, недифференцированной эмбриональной клетки транскрипционный фактор 1 (UTF1), мРНК. /PROD=undifferentiated embryonic cell transcriptionfactor 1 /FL=gb:NM_003577.1 gb:AB011076.1
2,677334
-0,04099
6,58
Снижение
4.48E-04
NM_000094
Homo sapiens, коллаген, тип VII, альфа 1 (epidermolysis bullosa, дистрофичный, доминантный и рецессивный) (COL7A1), мРНК. /PROD=collagen, type VII, alpha 1 (epidermolysisbullosa, dystrophic, dominant and recessive) /FL=gb:L02870.1 gb:NM_000094.1
4,796495
2,100178
6,48
Снижение
2.14E-05
AI653107
Гены EST
1,075159
-1,6205
6,48
Снижение
2.02E-02
J03580
Человеческий паратиреоидподобный белок (связанный со злокачественной гуморальной гиперкальцемией), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:J03580.1
3,86075
1,187353
6,38
Снижение
1.59E-04
U85995
Кластер включает U85995:Человеческий клон IMAGE-22181, неизвестный белок, мРНК, частичная кодовая последовательность /cds=(0,1291) /gb=U85995 /gi=1835749 /ug=Hs.79340 /len=1696
0,300578
-2,35535
6,3
Снижение
2.44E-02
AI110886
протимозин альфа (генная последовательность 28)
0,182328
-2,47093
6,29
Снижение
1.88E-02
BC036917
Homo sapiens, клон MGC:46457 IMAGE:5201433, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Unknown (protein for MGC:46457) /FL=gb:BC036917.1
6,568635
3,918368
6,28
Снижение
1.51E-04
AL031602
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-1174N9 на хромосоме 1p34.1-35.3. Содержит ген нового белка с доменом IBR, ген (псевдо?) нового белка, сходного с MT1E (металлотионеин 1E (функциональный)), гены EST, STS, GSS и два предполагаемых Cp...
1,639038
-1,00453
6,25
Снижение
5.77E-04
AW027879
Гены EST с низкой степенью подобия с предшественником декорина NBHUC8 (H.sapiens)
4,038177
1,406797
6,2
Снижение
1.02E-04
BF449053
Гены EST
6,008797
3,380703
6,18
Снижение
1.64E-03
W72516
дигидропиримидиназа-подобный белок 3 /FL=gb:NM_001387.1 gb:D78014.1
2,098906
-0,52676
6,17
Снижение
2.78E-03
NM_003914
Homo sapiens, циклин A1 (CCNA1), мРНК. /PROD=cyclin A1 /FL=gb:NM_003914.1 gb:U66838.1
1,99849
-0,59877
6,05
Снижение
5.92E-04
NM_002317
Homo sapiens, лизилоксидаза (LOX), мРНК. /PROD=lysyl oxidase /FL=gb:AF039291.1 gb:NM_002317.1 gb:M94054.1
2,982965
0,397911
6
Снижение
1.82E-04
AK026829
Homo sapiens, кДНК: FLJ23176 fis, клон LNG10452.
3,08363
0,500579
5,99
Снижение
1.74E-04
U73778
Предшественник человеческого коллагена типа XII альфа 1 (COL12A1), мРНК. /PROD=collagen type XII alpha-1 /FL=gb:NM_004370.3
0,857744
-1,71151
5,94
Снижение
4.12E-03
AB085901
Homo sapiens, DBL мРНК для DBL прото-онкогена, вариант сплайсинга 1, полная кодовая последовательность. /PROD=DBL proto-oncogene splicing variant 1 /FL=gb:AB085901.1
7,251816
4,700433
5,86
Снижение
3.86E-04
NM_000700
Homo sapiens, аннексин A1 (ANXA1), мРНК. /PROD=annexin I /FL=gb:BC001275.1 gb:NM_000700.1
5,318139
2,768691
5,85
Снижение
9.51E-05
U87408
Кластер включает U87408:Человеческого клона IMAGE-74593 неизвестный белок, мРНК, частичная кодовая последовательность /cds=(0,1362) /gb=U87408 /gi=1842104 /ug=Hs.79340 /len=1982
0,668218
-1,87886
5,84
Снижение
1.56E-02
BE048571
Гены EST
4,103964
1,558115
5,84
Снижение
8.74E-05
AA579773
Гены EST
0,549053
-1,9953
5,83
Снижение
4.41E-02
AI825645
Гены EST с низкой степенью подобия с GBX2_HUMAN, ГОМЕОБОКСОВЫМ БЕЛКОМ GBX-2 (H.sapiens)
2,98904
0,457127
5,78
Снижение
7.98E-05
AW138143
Гены EST
3,280973
0,749482
5,78
Снижение
2.21E-04
AL139377
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-251J8 на хромосоме 13. Содержит гены EST, STS, GSS и островок CpG. Содержит два новых гена с двумя изоформами каждый, и ген KIAA0610 с двумя изоформами
2,750597
0,238017
5,71
Снижение
1.92E-02
NM_006942
Homo sapiens, SRY (определяющий пол участок Y-хромосомы)-бокс 20 (SOX20), мРНК. /PROD=SRY (sex determining region Y)-box 20 /FL=gb:NM_006942.1 gb:BC000985.1 gb:AB006867.1
3,880272
1,369596
5,7
Снижение
1.82E-04
NM_002521
Homo sapiens, натрийуретического пептида предшественник B (NPPB), мРНК. /PROD=natriuretic peptide precursor B /FL=gb:NM_002521.1 gb:M25296.1
2,324824
-0,18374
5,69
Снижение
2.00E-04
AL096771
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP1-238D15 на хромосоме 6q12-14.3 Содержит часть гена COL12A1 (коллаген, тип XII, альфа 1) и гены STS
6,179917
3,681421
5,65
Снижение
6.25E-05
NM_000158
Homo sapiens, глюкан (1,4-альфа-), ветвящий фермент 1 (гликоген-ветвящий фермент, болезнь Андерсена, гликогеновая болезнь типа IV) (GBE1), мРНК. /PROD=glucan (1,4-alpha-), branching enzyme 1(glycogen branching enzyme) /FL=gb:L07956.1 gb:NM_000158.1
6,777916
4,283022
5,64
Снижение
3.42E-04
U15174
Homo sapiens, взаимодействующий с белком BCL2adenovirus E1B 19 кДа белок 3 (BNIP3), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=BCL2adenovirus E1B 19kD-interacting protein 3 /FL=gb:AF002697.1 gb:NM_004052.2 gb:U15174.1
3,560033
1,066273
5,63
Снижение
4.18E-04
U38945
Человеческий гипотетический белок 18,1 кДа (CDKN2A) мРНК, полная кодовая последовательность /FL=gb:U38945.1 gb:U26727.1
2,64743
0,1565
5,62
Снижение
7.06E-03
AI702438
Гены EST
4,981033
2,492173
5,61
Снижение
7.98E-05
NM_000602
Homo sapiens, ингибитор сериновой (или цистеиновой) протеиназы, ветвь E (нексин, ингибитор типа 1 активатора плазминогена), член 1 (SERPINE1), мРНК. /PROD=serine (or cysteine) proteinase inhibitor, cladeE (nexin, plasminogen activator inhibitor type 1), membe
5,13621
2,649783
5,6
Снижение
1.82E-04
BC013944
Homo sapiens, подобный миозину, тяжелый полипептид 7, сердечная мышца, бета, клон IMAGE:4064393, мРНК.
2,648874
0,170587
5,57
Снижение
2.39E-04
AW007532
Человеческий связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 5 (IGFBP5), мРНК
4,285883
1,811154
5,56
Снижение
1.26E-04
AL038787
6-фосфофрукто-2-киназафруктоза-2,6-бифосфатаза 4
3,41866
0,980192
5,42
Снижение
3.42E-04
AA149250
Гены EST с низкой степенью подобия с КРЫСИНЫМ WDNM, КРЫСИНЫМ БЕЛКОМ-ПРЕДШЕСТВЕННИКОМ WDNM1 (R.norvegicus)
3,932141
1,49687
5,41
Снижение
6.25E-05
NM_004490
Homo sapiens, связанный с рецепторами фактора роста белок 14 (GRB14), мРНК. /PROD=growth factor receptor-bound protein 14 /FL=gb:L76687.1 gb:NM_004490.1
4,64236
2,208805
5,4
Снижение
4.99E-04
AB019695
Homo sapiens, мРНК для тиоредоксин-редуктазы II бета, полная кодовая последовательность /PROD=thioredoxin reductase II beta /FL=gb:AB019695.1
2,256481
-0,17666
5,4
Снижение
2.51E-03
NM_018495
Homo sapiens, белок NAG22 (LOC55873), мРНК. /PROD=NAG22 protein /FL=gb:AF247820.3 gb:NM_018495.3
2,93223
0,515985
5,34
Снижение
1.40E-03
J05594
Homo sapiens, NAD+-зависимая 15-гидроксипростагландин-дегидрогеназа (PDGH), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NAD+-dependent 15-hydroxyprostaglandindehydrogenase /FL=gb:J05594.1
3,557525
1,145962
5,32
Снижение
1.74E-04
BF514079
Kruppel-подобный фактор 4 (кишечный)
6,844763
4,45073
5,26
Снижение
5.92E-04
AF003114
Homo sapiens, CYR61 мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:AF003114.1
3,947271
1,57134
5,19
Снижение
3.82E-04
AI928035
Гены EST
4,835771
2,460275
5,19
Снижение
1.74E-04
AL574210
ингибитор серин- (или цистеин-) протеиназы, ветвь E (нексин, ингибитор активатора плазминогена типа 1), член 1 /FL=gb:NM_000602.1 gb:M16006.1
5,332534
2,96686
5,15
Снижение
2.34E-04
AW189885
протокадгерин 18
5,43052
3,069652
5,14
Снижение
2.73E-04
AU154455
ассоциированный с клеточной мембраной гликопротеин легочного типа-I
3,041407
0,703421
5,06
Снижение
1.48E-04
NM_004472
Homo sapiens, белок с вилкообразным регионом (forkhead box) D1 (FOXD1), мРНК. /PROD=forkhead box D1 /FL=gb:U59832.1 gb:NM_004472.1
F) Клетки линии H9 Р39 на 78 час стадии дифференцировки в сформированную эндодерму и клетки EXPRES 01- Значения интенсивности даны в формате Log2
EXPRES 01
72 ЧАС СТАДИИ СЭ
Отношение
Направление
скорректир. значение p
Идентификатор гена
Название гена
-4,01441
5,083597
547,99
Повышение
9.50E-05
AB028021
Кластер включает AB028021:Homo sapiens, HNF-3 beta, мРНК для гепатоцитного ядерного фактора-3 бета, полная кодовая последовательность /cds=(196,1569) /gb=AB028021 /gi=4958949 /ug=Hs.155651 /len=1944
-4,79201
3,675687
354,02
Повышение
7.11E-05
NM_012431
Homo sapiens, содержащий sema-домен, иммуноглобулиновый домен (Ig), короткий основной домен, секретируемый белок (семафорин), 3E (SEMA3E), мРНК. /PROD=sema domain, immunoglobulin domain (Ig), shortbasic domain, secreted, (semaphorin) 3E /FL=gb:NM_012431.1 gb:AB002329.1
-5,25658
3,066715
320,3
Повышение
5.36E-05
AW005572
предполагаемый белок 47 кДа
-0,80043
7,317513
277,81
Повышение
3.10E-05
D87811
Homo sapiens, мРНК для GATA-6, полная кодовая последовательность. /PROD=GATA-6 /FL=gb:U66075.1 gb:NM_005257.1 gb:D87811.1
-3,8752
4,204423
270,53
Повышение
1.89E-05
AB028021
Homo sapiens, HNF-3 beta, мРНК гепатоцитного ядерного фактора-3 бета, полная кодовая последовательность /PROD=hepatocyte nuclear factor-3 beta /FL=gb:AB028021.1 gb:NM_021784.1
-3,26893
4,729085
255,65
Повышение
3.66E-05
NM_001785
Homo sapiens, цитидиндеаминаза (CDA), мРНК. /PROD=cytidine deaminase /FL=gb:L27943.1 gb:NM_001785.1
-4,29896
3,360647
202,2
Повышение
1.85E-05
AY177407
Homo sapiens, гомеобоксовый белок goosecoid, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=homeobox protein goosecoid /FL=gb:AY177407.1 gb:NM_173849.1
-0,62093
6,953987
190,67
Повышение
1.85E-05
NM_022454
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ22252, сходный с содержащим SRY-бокс белком 17 (FLJ22252), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ22252 similar to SRY-boxcontaining gene 17 /FL=gb:NM_022454.1
-4,50758
2,853368
164,39
Повышение
5.73E-05
AU118882
эндотелиновый рецептор типа A /FL=gb:NM_001957.1 gb:L06622.1
-1,11159
6,244682
163,85
Повышение
1.85E-05
NM_003867
Homo sapiens, фактор роста фибробластов 17 (FGF17), мРНК. /PROD=fibroblast growth factor 17 /FL=gb:NM_003867.1 gb:AB009249.1
-0,26005
7,057553
159,52
Повышение
8.58E-05
R72286
связанный с микрофибриллами белок 4
-3,62742
3,595825
149,42
Повышение
1.19E-03
AA772920
Гены EST
-3,61621
3,595293
148,21
Повышение
7.06E-04
AL569326
Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность
-1,32044
5,888668
147,96
Повышение
1.62E-03
AF017987
Homo sapiens, связанный с апоптозом секретированный белок 2 (SARP2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=secreted apoptosis related protein 2 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-0,83997
6,288395
139,91
Повышение
1.06E-04
AI821669
Гены EST
-1,89695
5,066236
124,78
Повышение
5.04E-05
AL136944
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp586J0624 (из клона DKFZp586J0624); полная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein /FL=gb:AF215636.1 gb:NM_014585.1 gb:AF231121.1 gb:AF226614.1 gb:AL136944.1
-2,90798
4,005677
120,56
Повышение
7.41E-05
NM_001643
Homo sapiens, аполипопротеин A-II (APOA2), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-II precursor /FL=gb:M29882.1 gb:NM_001643.1 gb:BC005282.1
-3,39007
3,146077
92,81
Повышение
2.92E-03
NM_006614
Homo sapiens, молекула клеточной адгезии с гомологией с L1CAM (близкий гомолог L1) (CHL1), мРНК. /PROD=cell adhesion molecule with homology to L1CAM(close homologue of L1) /FL=gb:AF002246.1 gb:NM_006614.1
-4,63418
1,846961
89,33
Повышение
5.54E-03
BF112218
Гены EST
-2,0457
4,332524
83,18
Повышение
1.95E-04
AI422986
Гены EST
0,756526
7,130796
82,96
Повышение
2.44E-05
NM_003012
Homo sapiens, секретируемый frizzled-связанный белок 1 (SFRP1), мРНК. /PROD=secreted frizzled-related protein 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-3,17056
3,112711
77,88
Повышение
5.66E-05
AI801626
Гены EST со средней степенью подобия с ALU4_HUMAN ALU SUBFAMILY SB2 SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-2,5679
3,691959
76,63
Повышение
1.85E-05
AL121722
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP4-788L20 на хромосоме 20. Содержит ген HNF3B (гепатоцитного ядерного фактора-3 бета), новый ген на основе генов EST, гены EST, STS, GSS и CpG-островки
-3,12184
3,093954
74,33
Повышение
1.27E-04
AI700341
Гены EST
-3,51429
2,6835
73,4
Повышение
7.26E-04
AA352113
Гены EST
0,502235
6,679567
72,37
Повышение
8.17E-06
NM_014899
Homo sapiens, белок KIAA0878 (KIAA0878), мРНК. /PROD=KIAA0878 protein /FL=gb:NM_014899.1 gb:AB020685.1
-3,7619
2,400862
71,64
Повышение
6.61E-05
NM_016179
Homo sapiens, временный рецепторный потенциальный канал 4 (TRPC4), мРНК. /PROD=transient receptor potential 4 /FL=gb:NM_016179.1 gb:AF175406.1
-1,66311
4,46486
69,94
Повышение
3.60E-04
S69738
MCP-1=моноцитарный хемотактический белок (человеческий, клетки эндотелия аорты, мРНК, 661 нт). /PROD=MCP-1
-2,26295
3,775709
65,74
Повышение
1.21E-03
AI735586
Гены EST
-3,20091
2,823883
65,11
Повышение
8.22E-03
NM_002614
Homo sapiens, содержащий PDZ-домен белок 1 (PDZK1), мРНК. /PROD=PDZ domain containing 1 /FL=gb:NM_002614.1 gb:AF012281.1
-0,81978
5,17876
63,94
Повышение
1.52E-04
AI824037
Гены EST с низкой степенью подобия с FCE2, МЫШИНЫМ НИЗКОАФФИННЫМ РЕЦЕПТОРОМ ДЛЯ ИММУНОГЛОБУЛИНА ЭПСИЛОН (M.musculus)
-3,10357
2,888163
63,63
Повышение
1.85E-05
NM_001453
Homo sapiens, белок с вилкообразным регионом (forkhead box) C1 (FOXC1), мРНК. /PROD=forkhead box C1 /FL=gb:NM_001453.1
-0,41404
5,48675
59,75
Повышение
1.39E-04
AI332407
секретированный frizzled-связанный белок 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-4,29055
1,60372
59,48
Повышение
5.86E-05
AI337300
Homo sapiens, клон MGC:4604, мРНК, полная кодовая последовательность /FL=gb:BC004219.1
-1,70149
4,121658
56,62
Повышение
6.46E-04
AF225426
Homo sapiens, HT016 мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=HT016 /FL=gb:AF225426.1
-2,07937
3,707398
55,21
Повышение
2.52E-03
NM_001643
Homo sapiens, аполипопротеин A-II (APOA2), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-II precursor /FL=gb:M29882.1 gb:NM_001643.1 gb:BC005282.1
0,800949
6,56634
54,39
Повышение
2.72E-07
NM_030781
Homo sapiens, захватывающий рецептор с лектином C-типа (SRCL), мРНК. /PROD=scavenger receptor with C-type lectin /FL=gb:NM_030781.1
-2,72686
2,973219
51,99
Повышение
1.82E-04
AI692180
белок 2, связывающий белок, взаимодействующий с PTPRF (липрин бета 2)
-1,55323
4,113731
50,81
Повышение
2.92E-05
AI821586
Гены EST со средней степенью подобия с полученным из клеток JE0284 Mm-1 белком 1b, связанным с трансплантабельностью (H.sapiens)
-3,53873
2,127137
50,77
Повышение
4.17E-04
AI675836
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-446H13 на хромосоме 10. Содержит 3-конец гена нового белка, подобного KIAA1059 (ортолог мышиного рецепторного белка SORCS, содержащего домен VPS10), псевдоген RPL23A (белок 23A рибосомы 60S), гены EST, гены STS
-2,45311
3,17372
49,41
Повышение
1.17E-02
BC042378
Homo sapiens, клон IMAGE:5277693, мРНК.
-2,91295
2,704851
49,1
Повышение
5.98E-03
AW005572
предполагаемый белок 47 кДа
-1,44407
4,173723
49,1
Повышение
1.23E-03
U91903
Человеческий белок Fritz, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Fritz /FL=gb:U24163.1 gb:U68057.1 gb:NM_001463.1 gb:U91903.1
-0,77864
4,836717
49,02
Повышение
2.61E-04
NM_022055
Homo sapiens, зарезервированный (KCNK12), мРНК. /PROD=tandem pore domain potassium channel THIK-2 /FL=gb:NM_022055.1 gb:AF287302.1
-3,90126
1,704039
48,68
Повышение
2.65E-04
AI004009
Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
1,388898
6,98175
48,26
Повышение
1.85E-05
BE620739
Гены EST
-3,91992
1,582406
45,33
Повышение
1.28E-04
AL553774
белок KIAA1462
-2,50168
2,984782
44,83
Повышение
6.69E-03
X16468
Человеческая мРНК для коллагена альфа-1 типа II.
-1,71797
3,748284
44,21
Повышение
2.10E-03
AL524520
связанный с G-белком рецептор 49
-0,5292
4,934946
44,14
Повышение
7.15E-04
AI127440
Гены EST
-0,69028
4,756395
43,61
Повышение
1.42E-04
M16276
Человеческий MHC, класс II, HLA-DR2-Dw12, мРНК, DQw1-beta, полная кодовая последовательность. /FL=gb:NM_002123.1 gb:M16276.1 gb:M60028.1 gb:M17564.1 gb:M81141.1 gb:M81140.1
0,83572
6,263504
43,05
Повышение
8.83E-05
N21138
белок KIAA0878 /FL=gb:NM_014899.1 gb:AB020685.1
-2,61405
2,778049
41,99
Повышение
4.08E-05
U71207
Человеческий гомолог гена отсутствия глаз (Eab1), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Eab1 /FL=gb:NM_005244.1 gb:U71207.1
-3,54017
1,841563
41,69
Повышение
9.86E-04
NM_002091
Homo sapiens, гастрин-высвобождающий белок (GRP), мРНК. /PROD=gastrin-releasing peptide /FL=gb:NM_002091.1 gb:K02054.1 gb:BC004488.1
-2,39338
2,964195
41
Повышение
2.62E-03
M17955
Человеческий MHC, класс II, HLA-DQ-beta, мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:M33907.1 gb:M17955.1 gb:M16996.1 gb:M17563.1 gb:M20432.1 gb:M26042.1
-1,77041
3,564655
40,37
Повышение
1.48E-03
NM_003966
Homo sapiens, содержащий sema-домен, 7 тромбоспондиновых повторов (типа 1 и сходного с типом 1), трансмембранный домен (TM) и короткий цитоплазменный домен белок, (семафорин), 5A (SEMA5A), мРНК. /PROD=sema domain, seven thrombospondin repeats (type1 and type 1-like), transmem
-0,27888
5,053648
40,29
Повышение
4.00E-05
AF225513
Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta /FL=gb:AF225513.1
-2,4051
2,925248
40,23
Повышение
2.25E-05
NM_021020
Homo sapiens, связанного с F37/раком пищевода гена кодирующий мотив leucine-zipper motif (FEZ1) , мРНК. /PROD=F37Esophageal cancer-related gene-codingleucine-zipper motif /FL=gb:AF123659.1 gb:NM_021020.1
-2,16079
3,152396
39,76
Повышение
4.00E-05
NM_000552
Homo sapiens, фактор фон Виллебранда (VWF), мРНК. /PROD=von Willebrand factor precursor /FL=gb:NM_000552.2
-2,6422
2,666218
39,63
Повышение
1.85E-05
BF589787
Гены EST
-1,09421
4,204596
39,36
Повышение
7.37E-05
AK023621
Homo sapiens, кДНК: FLJ13559 fis, клон PLACE1007852, с высокой степенью подобия с Homo sapiens мРНК для белка KIAA0878.
-3,7558
1,527474
38,94
Повышение
3.02E-03
AW473656
Гены EST
-3,21708
2,015336
37,59
Повышение
1.57E-04
NM_004438
Homo sapiens, EphA4 (EPHA4), мРНК. /PROD=EphA4 /FL=gb:L36645.1 gb:NM_004438.1
-0,18256
5,019816
36,82
Повышение
1.85E-05
AI583173
главный комплекс гистосовместимости (MHC), класс II, DQ бета 1
-0,18863
5,007893
36,67
Повышение
3.26E-04
AV700724
GATA-связывающий белок 4 /FL=gb:NM_002052.1 gb:L34357.1 gb:D78260.1
-2,69284
2,499705
36,57
Повышение
6.77E-03
R33964
Homo sapiens, кДНК: FLJ11022 fis, клон PLACE1003771
0,804491
5,966318
35,8
Повышение
4.00E-05
AA583044
костный морфогенетический белок 2 /FL=gb:NM_001200.1
0,828899
5,985645
35,67
Повышение
4.40E-05
NM_001200
Homo sapiens, костный морфогенетический белок 2 (BMP2), мРНК. /PROD=bone morphogenetic protein 2 precursor /FL=gb:NM_001200.1
0,663834
5,813725
35,5
Повышение
7.23E-05
AI817041
связанный с G-белком рецептор
-2,83906
2,291355
35,03
Повышение
8.28E-05
T15545
Гены EST
-3,25309
1,849989
34,37
Повышение
1.65E-03
AL050154
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp586L0120 (из клона DKFZp586L0120).
0,713597
5,813528
34,3
Повышение
2.17E-04
BF508344
Гены EST
-1,61054
3,372801
31,63
Повышение
6.80E-04
AW264204
Гены EST
-3,31261
1,666545
31,54
Повышение
5.69E-04
BG397856
главный комплекс гистосовместимости (MHC), класс II, DQ альфа 1
-1,35345
3,621423
31,45
Повышение
7.05E-04
AW157571
Гены EST с низкой степенью подобия с T00331, гипотетическим белком KIAA0555 (H.sapiens)
-0,81856
4,154852
31,42
Повышение
2.94E-05
AI129628
Гены EST
-0,45718
4,48679
30,78
Повышение
6.26E-05
BF939489
гликопротеин M6A /FL=gb:D49958.1
0,424882
5,366945
30,74
Повышение
1.58E-04
AI692659
белок теплового шока 90 кДа 1, альфа
-0,95386
3,986146
30,7
Повышение
7.87E-05
AF312769
Homo sapiens, криптическая мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cryptic /FL=gb:AF312769.1
-1,39784
3,506506
29,95
Повышение
9.97E-04
BE222344
богатый аргинином и серином фактор сплайсинга 5
-0,47614
4,408298
29,54
Повышение
3.38E-05
BF508639
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434E082 (из клона DKFZp434E082)
-3,12747
1,716365
28,72
Повышение
9.08E-04
AV726956
Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
-2,81405
2,019329
28,51
Повышение
9.96E-04
AI694325
Гены EST
1,829497
6,661623
28,48
Повышение
3.98E-05
AA534817
Гены EST с низкой степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-1,42034
3,409373
28,44
Повышение
4.12E-04
BE737251
Homo sapiens, кДНК: FLJ22482 fis, клон HRC10859, с высокой степенью подобия cIRO180147, Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 180147
1,563993
6,383462
28,24
Повышение
1.85E-05
NM_002413
Homo sapiens, микросомальная глутатион S-трансфераза 2 (MGST2), мРНК. /PROD=microsomal glutathione S-transferase 2 /FL=gb:NM_002413.1 gb:U77604.1
1,314051
6,126464
28,1
Повышение
1.89E-05
BC000740
Homo sapiens, рецептор холецистокинина B, клон MGC:2199, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cholecystokinin B receptor /FL=gb:L07746.1 gb:L08112.1 gb:S70057.1 gb:BC000740.1 gb:L04473.1 gb:NM_000731.1
0,420056
5,197721
27,43
Повышение
1.85E-05
NM_012242
Homo sapiens, гена dickkopf (Xenopus laevis) гомолог 1 (DKK1), мРНК. /PROD=dickkopf (Xenopus laevis) homolog 1 /FL=gb:AF177394.1 gb:NM_012242.1 gb:AF127563.1
-1,54464
3,22856
27,34
Повышение
5.11E-05
AI743534
Homo sapiens, МРНК; кДНК DKFZp564B1162 (из клона DKFZp564B1162); полная кодовая последовательность /FL=gb:AL136646.1
-4,15276
0,598294
26,93
Повышение
1.83E-04
AA129444
Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1263, частичная кодовая последовательность
-1,83503
2,912585
26,86
Повышение
8.60E-04
AA552969
Гены EST
0,442286
5,16846
26,47
Повышение
1.85E-05
NM_001778
Homo sapiens, CD48 антиген (B-клеточный мембранный белок) (CD48), мРНК. /PROD=CD48 antigen (B-cell membrane protein) /FL=gb:NM_001778.1 gb:M37766.1 gb:M59904.1
-2,05438
2,666454
26,37
Повышение
5.65E-03
BG290908
Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-3,25961
1,457558
26,3
Повышение
1.49E-02
NM_016341
Homo sapiens, обильная в поджелудочной железе фосфолипаза C (LOC51196), мРНК. /PROD=pancreas-enriched phospholipase C /FL=gb:AF117948.1 gb:NM_016341.1 gb:AF190642.2
-0,68225
4,022195
26,07
Повышение
4.08E-05
N48299
Гены EST со средней степенью подобия с NFY-C (H.sapiens)
-0,37709
4,293707
25,47
Повышение
5.32E-05
AU152102
Homo sapiens, кДНК: FLJ12993 fis, клон NT2RP3000197
-0,13959
4,521681
25,3
Повышение
5.89E-05
BG109855
Homo sapiens, клон TUA8, область, связанная с синдромом кошачьего крика, мРНК
-1,80965
2,799751
24,41
Повышение
4.74E-03
NM_152506
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32835 (FLJ32835), мРНК. /FL=gb:NM_152506.1
1,275191
5,879425
24,32
Повышение
3.33E-05
AI587307
гипотетический белок FLJ12838 /FL=gb:NM_024641.1
-3,79684
0,804733
24,28
Повышение
2.78E-04
AK026720
Homo sapiens, кДНК: FLJ23067 fis, клон LNG04993.
-0,13427
4,467037
24,27
Повышение
2.87E-05
D49958
Homo sapiens, мРНК для мембранного гликопротеина M6, полная кодовая последовательность. /PROD=membrane glycoprotein M6 /FL=gb:D49958.1
1,997597
6,595913
24,22
Повышение
2.84E-05
BC005997
Homo sapiens, клон MGC:14801, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:14801) /FL=gb:BC005997.1
-2,9769
1,607498
23,99
Повышение
1.19E-02
AW612111
Гены EST
-3,10679
1,463399
23,76
Повышение
3.41E-04
N59476
Гены EST
-2,06656
2,502146
23,73
Повышение
2.55E-03
AF141339
Homo sapiens, взаимодействующий с LYST белок LIP3, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=LYST-interacting protein LIP3
0,007601
4,558709
23,44
Повышение
1.02E-04
N63706
Гены EST
-0,15629
4,385668
23,3
Повышение
2.61E-04
AI799018
Гены EST
-3,10838
1,4221
23,11
Повышение
3.43E-04
N50412
Гены EST
-2,50006
1,997519
22,59
Повышение
1.83E-03
U66061
Бета-цепь человеческого Т-клеточного рецептора зародышевой линии TCRBV17S1A1T, TCRBV2S1, TCRBV10S1P, TCRBV29S1P, TCRBV19S1P, TCRBV15S1, TCRBV11S1A1T, HVB реликт, TCRBV28S1P, TCRBV34S1, TCRBV14S1, TCRBV3S1, TCRBV4S1A1T, TRY4, TRY5, TRY6, TRY7, TRY8, TCRBD1, TCRBJ1S1, TCRB...
-0,98665
3,469502
21,95
Повышение
1.93E-03
NM_001463
Homo sapiens, frizzled-связанный белок (FRZB), мРНК. /PROD=frizzled-related protein /FL=gb:U24163.1 gb:U68057.1 gb:NM_001463.1 gb:U91903.1
-0,62897
3,790333
21,4
Повышение
7.95E-03
AI694545
Гены EST
0,500662
4,91845
21,37
Повышение
1.92E-04
AB043703
Homo sapiens, FZD8 мРНК для 7-трансмембранного рецептора Frizzled-8, полная кодовая последовательность. /PROD=seven-transmembrane receptor Frizzled-8 /FL=gb:AB043703.1
-0,10733
4,302037
21,25
Повышение
2.88E-04
BC005107
Homo sapiens, клон IMAGE:3840937, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3840937)
-0,70855
3,6919
21,12
Повышение
4,93E-04
AI917371
Гены EST
-3,53207
0,857843
20,97
Повышение
1.12E-03
NM_002769
Homo sapiens, протеаза, серин, 1 (трипсин 1) (PRSS1), мРНК. /PROD=protease, serine, 1 (trypsin 1) /FL=gb:M22612.1 gb:NM_002769.1
1,168713
5,556831
20,94
Повышение
2.43E-04
NM_016139
Homo sapiens, 16,7 кДа белок (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
-1,68521
2,69622
20,84
Повышение
2.06E-03
NM_002770
Homo sapiens, протеаза, серин, 2 (трипсин 2) (PRSS2), мРНК. /PROD=protease, serine, 2 (trypsin 2) /FL=gb:M27602.1 gb:NM_002770.1
-2,14813
2,233148
20,84
Повышение
2.55E-04
NM_006034
Homo sapiens, p53-индуцированный белок (PIG11), мРНК. /PROD=p53-induced protein /FL=gb:AF010315.1 gb:BC000443.1 gb:BC003010.1 gb:NM_006034.1
-0,5982
3,780076
20,8
Повышение
1.63E-02
AI806510
предполагаемый белок 47 кДа
0,449168
4,82657
20,78
Повышение
2.33E-05
AI688418
плексин A2
1,223968
5,565279
20,27
Повышение
1.85E-05
AL574912
Гены EST с низкой степенью подобия с серинпротеазой (H.sapiens)
2,368939
6,691717
20,01
Повышение
3.09E-05
AJ224869
Homo sapiens, CXCR4, ген, кодирующий рецептор CXCR4
-1,83333
2,487663
19,99
Повышение
2.10E-03
NM_006501
Homo sapiens, связанный с миелином основной белок олигодендроцитов (MOBP), мРНК. /PROD=myelin-associated oligodendrocyte basic protein /FL=gb:D28113.1 gb:NM_006501.1
-2,16064
2,095432
19,11
Повышение
1.23E-02
NM_000475
Homo sapiens, ядерный рецептор, подсемейство 0, группа B, член 1 (NR0B1), мРНК. /PROD=adrenal hypoplasia protein /FL=gb:NM_000475.2
1,861693
6,103583
18,92
Повышение
2.59E-05
AI374739
Гены EST
-3,47945
0,755598
18,83
Повышение
5.51E-04
NM_000854
Homo sapiens, глутатион S-трансфераза тэта 2 (GSTT2), мРНК. /PROD=glutathione S-transferase theta 2 /FL=gb:L38503.1 gb:BC002415.1 gb:NM_000854.2
-1,25995
2,973193
18,81
Повышение
2.98E-04
AK026607
Homo sapiens, кДНК: FLJ22954 fis, клон KAT09813, с высокой степенью подобия с мРНК белка AF010315, Homo sapiens Pig11 (PIG11).
-0,27888
3,946435
18,7
Повышение
2.46E-05
NM_003078
Homo sapiens, связанный с SWISNF, ассоциированный с матриксом, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство d, член 3 (SMARCD3), мРНК. /PROD=SWISNF related, matrix associated, actindependent regulator of chromatin, subfamily d, member 3 /FL=gb:NM_003078.1 gb
1,740607
5,961556
18,65
Повышение
2.25E-05
NM_002160
Homo sapiens, гексабрахион (тенасцин C, цитотактин) (HXB), мРНК. /PROD=hexabrachion (tenascin C, cytotactin) /FL=gb:M55618.1 gb:NM_002160.1
-2,84061
1,378474
18,62
Повышение
7.18E-04
AI123532
Гены EST
3,042634
7,250084
18,47
Повышение
2.33E-05
NM_005442
Homo sapiens, гомолог эомезодермина (Xenopus laevis) (EOMES), мРНК. /PROD=eomesodermin (Xenopus laevis) homolog /FL=gb:AB031038.1 gb:NM_005442.1
1,192657
5,39941
18,47
Повышение
1.18E-04
NM_024641
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ12838 (FLJ12838), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ12838 /FL=gb:NM_024641.1
-2,81453
1,375898
18,26
Повышение
3.27E-02
BC014585
Homo sapiens, клон IMAGE:4047715, мРНК.
0,476688
4,64635
18
Повышение
1.14E-04
NM_024581
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ13942 (FLJ13942), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ13942 /FL=gb:NM_024581.1
-2,14545
2,018966
17,93
Повышение
2.47E-03
NM_015831
Homo sapiens, ацетилхолинэстераза (YT группа крови) (ACHE), вариант транскрипта E4-E5, мРНК. /PROD=acetylcholinesterase PI-linked form precursor /FL=gb:NM_015831.1
-2,24406
1,891442
17,58
Повышение
4.96E-05
NM_003275
Homo sapiens, тропомодулин (TMOD), мРНК. /PROD=tropomodulin /FL=gb:NM_003275.1 gb:M77016.1 gb:BC002660.1
-0,5777
3,557171
17,57
Повышение
5.59E-04
BC036592
Homo sapiens, клон IMAGE:4814184, мРНК.
-0,05814
4,076316
17,56
Повышение
1.83E-04
BF308645
белок KIAA1415
-1,27748
2,846094
17,43
Повышение
1.96E-04
D78260
Homo sapiens, мРНК для транскрипционного фактора GATA-4, полная кодовая последовательность. /PROD=GATA-4 transcription factor /FL=gb:NM_002052.1 gb:L34357.1 gb:D78260.1
-2,64131
1,466395
17,24
Повышение
2.99E-02
AU157303
Гены EST
-1,82351
2,283948
17,24
Повышение
3,95E-04
AA603467
рибосомальный белок S11
1,59762
5,701737
17,2
Повышение
5.72E-04
NM_018649
Homo sapiens, коровый гистон macroH2A2.2 (MACROH2A2), мРНК. /PROD=core histone macroH2A2.2 /FL=gb:AF151534.1 gb:NM_018649.1
-0,20099
3,88744
17,01
Повышение
1.99E-04
BF984830
индуцируемый ретиноевой кислотой белок 1
-0,41626
3,652079
16,78
Повышение
2.69E-04
BF110534
Гены EST
2,377335
6,437231
16,68
Повышение
1.89E-05
NM_005328
Homo sapiens, гиалуронансинтаза 2 (HAS2), мРНК. /PROD=hyaluronan synthase 2 /FL=gb:U54804.1 gb:NM_005328.1
-0,29145
3,768186
16,68
Повышение
2.40E-04
AI197932
Гены EST
-3,88742
0,162889
16,57
Повышение
2.95E-03
AA180985
Гены EST
-0,75724
3,289214
16,52
Повышение
2.66E-03
AL445192
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-269H4 на хромосоме 20. Содержит 3-конец гена KIAA1415, подобный индуцирующему заражение и метастазирование Т-лимфомы белку-1, гены EST, STS и GSS
-2,30432
1,732166
16,41
Повышение
2.23E-02
BC017958
Homo sapiens, клон IMAGE:4607409, мРНК.
-3,30412
0,716129
16,23
Повышение
3.22E-02
AU157224
Homo sapiens, кДНК: FLJ11570 fis, клон HEMBA1003309
-3,4744
0,544234
16,21
Повышение
8.79E-03
L32867
Homo sapiens, альфа 2,8-сиалилтрансфераза, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=alpha 2,8-sialyltransferase /FL=gb:L43494.1 gb:D26360.1 gb:L32867.1 gb:NM_003034.1
-3,09265
0,925475
16,2
Повышение
2.03E-03
AI093492
Гены EST
-1,39277
2,622602
16,17
Повышение
2.73E-04
AI629041
Гены EST
0,366041
4,354631
15,87
Повышение
8.71E-05
AI242583
Homo sapiens, кДНК: FLJ11550 fis, клон HEMBA1002970
-0,35867
3,62672
15,84
Повышение
3.71E-05
NM_001957
Homo sapiens, эндотелиновый рецептор типа A (EDNRA), мРНК. /PROD=endothelin receptor type A /FL=gb:NM_001957.1 gb:L06622.1
-0,66587
3,318505
15,83
Повышение
9.18E-05
NM_001362
Homo sapiens, деиодиназа, иодотиронин, тип III (DIO3), мРНК. /PROD=thyroxine deiodinase type III /FL=gb:NM_001362.1 gb:S79854.1
-1,80959
2,172774
15,81
Повышение
1.70E-03
BF447246
белок KIAA0960
-3,95752
0,007632
15,62
Повышение
1.52E-02
NM_001432
Homo sapiens, эпирегулин (EREG), мРНК. /PROD=epiregulin precursor /FL=gb:D30783.1 gb:NM_001432.1
-0,22337
3,730539
15,5
Повышение
9.97E-04
NM_021822
Homo sapiens, форболин-подобный белок MDS019 (MDS019), мРНК. /PROD=phorbolin-like protein MDS019 /FL=gb:AF182420.1 gb:NM_021822.1
-2,56291
1,390726
15,49
Повышение
1.14E-02
BG532690
интегрин, альфа 4 (антиген CD49D, субъединица альфа 4 рецептора VLA-4)
-2,89467
1,029195
15,18
Повышение
4.69E-03
AW971205
Гены EST
-1,16952
2,748825
15,12
Повышение
2.94E-02
NM_001343
Homo sapiens, гена disabled (Drosophila) гомолог 2 (реагирующий на митоген фосфопротеин) (DAB2), мРНК. /PROD=disabled (Drosophila) homolog 2 /FL=gb:U39050.1 gb:NM_001343.1 gb:U53446.1 gb:BC003064.1
0,798972
4,674672
14,68
Повышение
5.97E-05
AI082827
гипотетический белок FLJ11585
-0,33264
3,541617
14,66
Повышение
3.49E-05
NM_020353
Homo sapiens, фосфолипид-скрамблаза 4 (LOC57088), мРНК. /PROD=phospholipid scramblase 4 /FL=gb:NM_020353.1 gb:AF199023.1
-0,88175
2,988123
14,62
Повышение
1.30E-03
AI650874
Гены EST
-0.11092
3.758565
14.62
Повышение
4.96E-05
BF591483
Гены EST
1,370117
5,237165
14,59
Повышение
7.39E-05
M33653
Человеческий (клоны HT-(125,133)) альфа-2 тип IV коллаген (COL4A2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=alpha-2 type IV collagen /FL=gb:M33653.1
0,041468
3,902142
14,53
Повышение
9.62E-04
BF130943
Гены EST
-0,41994
3,432925
14,45
Повышение
1.98E-03
AI686957
белок KIAA1494
-3,44709
0,392958
14,32
Повышение
3.27E-02
H39185
Гены EST
1,071985
4,903249
14,23
Повышение
1.89E-05
NM_004560
Homo sapiens, побочный рецептор, подобный рецептору тирозинкиназы 2 (ROR2), мРНК. /PROD=receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 2 /FL=gb:M97639.1 gb:NM_004560.1
-0,60671
3,220921
14,2
Повышение
2.49E-03
NM_000458
Homo sapiens, транскрипционный фактор 2, гепатический; LF-B3; вариант гепатический ядерный фактор (TCF2), вариант транскрипта a, мРНК. /PROD=transcription factor 2, isoform a /FL=gb:NM_000458.1
1,186033
5,004503
14,11
Повышение
5.86E-05
AI627704
Гены EST с низкой степенью подобия с T17346, гипотетическим белком DKFZp586O1624.1 (H.sapiens)
-2,69521
1,121263
14,09
Повышение
5.32E-05
AF282250
Homo sapiens, кальньюрон 1 (CALN1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=calneuron 1 /FL=gb:AF282250.1
-2,70961
1,095539
13,98
Повышение
2.03E-02
AK055534
Homo sapiens, кДНК: FLJ30972 fis, клон HEART2000492.
-0,65009
3,149996
13,93
Повышение
2.55E-04
NM_017931
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ20699 (FLJ20699), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ20699 /FL=gb:NM_017931.1
-1,6164
2,173017
13,83
Повышение
9.97E-03
X00452
Человеческая мРНК для альфа-цепи антигена гистосовместимости DC, класс II. /PROD=DC classII histocompatibility antigenalpha-chain
-3,47125
0,312463
13,77
Повышение
3.91E-02
BF114815
Гены EST
-2,17973
1,59463
13,68
Повышение
1.03E-03
BE379542
связывающий ДНК хромодоменгеликазы белок 3 /FL=gb:U91543.1
-1,95127
1,804379
13,51
Повышение
3.31E-03
L12468
Homo sapiens, аминопептидаза A, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=aminopeptidase A /FL=gb:L12468.1 gb:NM_001977.1 gb:L14721.1
0,449933
4,203433
13,49
Повышение
6.43E-04
Z21533
H.sapiens, ген HEX, кодирующий связанный с гомеобоксом белок. /PROD=homeobox related protein
0,502333
4,255116
13,48
Повышение
3.46E-04
AF211891
Homo sapiens, Mix-like homeobox protein 1 (MILD1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Mix-like homeobox protein 1 /FL=gb:AF211891.1
0,151239
3,88836
13,33
Повышение
5.61E-05
BE644809
Гены EST
0,631332
4,364524
13,3
Повышение
8.23E-05
AI130705
Гены EST с низкой степенью подобия с A46302, фактором сплайсинга, ассоциированным с PTB, длинная форма (H.sapiens)
-1,83999
1,892454
13,29
Повышение
2.17E-04
AK074453
Homo sapiens, кДНК: FLJ23873 fis, клон LNG12941.
-0,28951
3,441091
13,27
Повышение
2.34E-04
NM_018388
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ11316 (FLJ11316), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ11316 /FL=gb:NM_018388.1
0,120924
3,842731
13,19
Повышение
4.04E-05
NM_001529
Homo sapiens, экпрессируемый в кроветворных клетках гомеобокс (HHEX), мРНК. /PROD=hematopoietically expressed homeobox /FL=gb:NM_001529.1 gb:L16499.1 gb:NM_002729.1
-0,4843
3,220215
13,04
Повышение
2.66E-05
NM_001766
Homo sapiens, CD1D антиген, d полипептид (CD1D), мРНК. /PROD=CD1D antigen, d polypeptide /FL=gb:NM_001766.1 gb:J04142.1
-3,18081
0,521542
13,02
Повышение
3.11E-04
AW449813
белок KIAA0918
-1,17885
2,522906
13,01
Повышение
7.75E-04
AB002155
Homo sapiens, мРНК для человеческого уроплакина Ib, полная кодовая последовательность. /PROD=human uroplakin Ib /FL=gb:NM_006952.1 gb:AB015234.1 gb:AF042331.1 gb:AB002155.1
2,383898
6,070755
12,88
Повышение
2.59E-05
BF476502
гипотетический белок FLJ11585
3,2061
6,89075
12,86
Повышение
2.73E-05
NM_006681
Homo sapiens, нейромедин U (NMU), мРНК. /PROD=neuromedin U /FL=gb:NM_006681.1
0,454394
4,138042
12,85
Повышение
2.43E-04
AL036088
белок KIAA1479
-2,233
1,436726
12,73
Повышение
1.41E-03
NM_014862
Homo sapiens, генный продукт KIAA0307 (KIAA0307), мРНК. /PROD=KIAA0307 gene product /FL=gb:AB002305.1 gb:NM_014862.1
-2,50335
1,160623
12,68
Повышение
4.71E-04
AA781795
Гены EST
0,414809
4,075067
12,64
Повышение
3.71E-05
NM_016179
Homo sapiens, временный рецепторный потенциальный канал 4 (TRPC4), мРНК. /PROD=transient receptor potential 4 /FL=gb:NM_016179.1 gb:AF175406.1
-0,40798
3,250175
12,62
Повышение
3.66E-05
AI143879
фосфодиэстераза 10A /FL=gb:AB020593.1 gb:AF127479.1 gb:NM_006661.1
-1,20714
2,448878
12,61
Повышение
9.04E-04
BC042378
Homo sapiens, клон IMAGE:5277693, мРНК.
0,999053
4,64687
12,53
Повышение
3.66E-05
AW129593
белок с повторяющимися tudor-доменами, ассоциирующийся с PCTAIRE 2
-1,0335
2,604062
12,45
Повышение
4.91E-04
AL553774
белок KIAA1462
-1,78964
1,842967
12,4
Повышение
1.49E-02
NM_004861
Homo sapiens, цереброзид (3-фосфоаденилсульфат:галактозилкерамид 3) сульфотрансфераза (CST), мРНК. /PROD=galactosylceramide sulfotransferase /FL=gb:NM_004861.1 gb:D88667.1
0,81871
4,448452
12,38
Повышение
9.04E-05
X06268
Человеческая мРНК для 3-конца C-терм. тройного геликоидного и C-терминальнального негеликоидного домена про-альфа 1 (II) коллагена. /PROD=pro-alpha 1 (II) collagen (313 AA; AA 975-271c) /FL=gb:NM_001844.2
1,040647
4,667276
12,35
Повышение
2.25E-05
AI348094
белок KIAA0882
-2,2316
1,390239
12,31
Повышение
1.38E-02
AA757630
Гены EST
1,076427
4,696942
12,3
Повышение
3.12E-05
AI640307
протокадгерин 10
-1,28224
2,327697
12,21
Повышение
3.34E-04
NM_005568
Homo sapiens, LIM гомеобоксный белок 1 (LHX1), мРНК. /PROD=LIM homeobox protein 1 /FL=gb:NM_005568.1 gb:U14755.1
-1,99136
1,617733
12,2
Повышение
4.20E-03
AL109653
Последовательность человеческой ДНК от клонирования GS1-115M3 на хромосоме Xq27.1-28. Содержит ген нового белка CXorf1 (хромосома X, открытая рамка считывания 1), гены EST, STS, GSS и островок CpG
-3,12055
0,469175
12,04
Повышение
1.54E-02
AW780006
Гены EST
0,1187
3,707767
12,03
Повышение
5.97E-05
N21184
Кластер включает N21184:yx41a10.s1 Homo sapiens, кДНК, 3-конец/clone=IMAGE-264282 /clone_end=3 /gb=N21184 /gi=1126354 /ug=Hs.93605 /len=619
-1,40826
2,177544
12,01
Повышение
7.18E-04
AB046770
Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1550, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1550 protein
1,316429
4,899037
11,98
Повышение
7.87E-05
AI769688
Homo sapiens, клон 23664 и 23905, последовательность мРНК
-1,08244
2,498502
11,97
Повышение
1.67E-03
X75208
X75208 /FEATURE=cds /DEFINITION=HSPTKR H.sapiens, HEK2, мРНК белка рецептора тирозинкиназы
-2,68947
0,886703
11,93
Повышение
4.38E-02
AW291402
Гены EST
1,438639
5,011903
11,9
Повышение
2.06E-04
BF223214
Гены EST
-0,10881
3,452952
11,81
Повышение
2.39E-04
AA701657
гипотетический белок FLJ12666
-2,33994
1,211956
11,73
Повышение
1.74E-02
AL134708
Гены EST
-0,52859
3,016773
11,68
Повышение
4.43E-03
AW590614
Гены EST
-1,77455
1,768056
11,65
Повышение
1.17E-02
AF140507
Homo sapiens, Ca2+кальмодулин-зависимой протеинкиназы киназа бета (CAMKKB), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Ca2+calmodulin-dependent protein kinase kinasebeta /FL=gb:AF140507.1
-2,84187
0,695267
11,61
Повышение
1.89E-03
NM_002244
Homo sapiens, калиевый выпрямляющийся внутрь канал, подсемейство J, ингибитор 1 (KCNJN1), мРНК. /PROD=potassium inwardly-rectifying channel, subfamilyJ, inhibitor 1 /FL=gb:NM_002244.1
4,042679
7,571956
11,55
Повышение
2.86E-05
NM_005454
Homo sapiens, гена cerberus 1 (Xenopus laevis) гомолог (суперсемейство белков с цистеиновым узлом) (CER1), мРНК. /PROD=cerberus 1 /FL=gb:NM_005454.1
0,581614
4,103441
11,49
Повышение
1.82E-04
AF005775
Homo sapiens, каспаза-подобный регулирующий апоптоз белок 2 (clarp), мРНК, продукт альтернативного сплайсинга, полная кодовая последовательность. /PROD=caspase-like apoptosis regulatory protein 2 /FL=gb:AF005775.1
3,287037
6,806239
11,47
Повышение
3.78E-05
AI633559
Гены EST
0,661121
4,174547
11,42
Повышение
4.53E-05
AA502609
Homo sapiens, анкирин-подобный белок с трансмембранными доменами 1 (ANKTM1), мРНК
1,888188
5,396458
11,38
Повышение
4.53E-05
AW340311
Гены EST
-1,24923
2,257525
11,37
Повышение
1.03E-03
R42166
Гены EST с низкой степенью подобия с AXO1_HUMAN, ПРЕДШЕСТВЕННИКОМ АКСОНИНА-1 (H.sapiens)
-0,21464
3,287026
11,33
Повышение
1.37E-03
NM_005045
Homo sapiens, рилин (RELN), мРНК. /PROD=reelin /FL=gb:U79716.1 gb:NM_005045.1
2,377686
5,872207
11,27
Повышение
2.86E-05
NM_000222
Homo sapiens, гомолог гена v-kit Харди-Цукермана 4 вирусного онкогена кошачьей саркомы (KIT), мРНК. /PROD=v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viraloncogene homolog precursor /FL=gb:NM_000222.1
4,897427
-1,39089
78,16
Снижение
7.30E-04
R06655
Гены EST со средней степенью подобия с белком AF078844 1 hqp0376 (H.sapiens)
3,409815
-2,69915
69,02
Снижение
1.89E-05
NM_016588
Homo sapiens, нейритин (LOC51299), мРНК. /PROD=neuritin /FL=gb:NM_016588.1 gb:BC002683.1 gb:AF136631.1
2,62025
-2,80479
42,96
Снижение
6.27E-03
AA625683
Гены EST
0,757197
-4,55188
39,65
Снижение
2.02E-04
AF213459
Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
3,113698
-2,03811
35,55
Снижение
2.91E-04
NM_002196
Homo sapiens, ассоциированный с инсулиномой белок 1 (INSM1), мРНК. /PROD=insulinoma-associated 1 /FL=gb:NM_002196.1 gb:M93119.1
2,36447
-2,49724
29,08
Снижение
2.24E-03
NM_005181
Homo sapiens, карбоангидраза III, специфичная для мышц (CA3), мРНК. /PROD=carbonic anhydrase III /FL=gb:BC004897.1 gb:NM_005181.2
3,77776
-1,04395
28,28
Снижение
5.05E-05
BU729850
гипотетический белок LOC153469
3,862686
-0,6228
22,4
Снижение
5.05E-05
NM_007115
Homo sapiens, индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 (TNFAIP6), мРНК. /PROD=tumor necrosis factor, alpha-induced protein 6 /FL=gb:NM_007115.1
0,579765
-3,59498
18,06
Снижение
5.51E-04
AI393930
Гены EST
0,300578
-3,86457
17,94
Снижение
5.00E-04
AI110886
протимозин альфа (генная последовательность 28)
2,28595
-1,84349
17,5
Снижение
2.27E-02
BE504838
Гены EST
4,507212
0,466223
16,46
Снижение
1.27E-04
AW196940
Гены EST
3,025351
-0,89578
15,15
Снижение
8.71E-05
AW590925
Гены EST
6,568635
2,65029
15,12
Снижение
6.26E-05
AL031602
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-1174N9 на хромосоме 1p34.1-35.3. Содержит ген нового белка с доменом IBR, ген (псевдо?) нового белка, сходного с MT1E (металлотионеин 1E (функциональный)), гены EST, STS, GSS и два предполагаемых Cp...
2,000419
-1,85226
14,45
Снижение
1.06E-02
NM_031272
Homo sapiens, экспрессируемая в яичках последовательность 14 (TEX14), мРНК. /PROD=testis expressed sequence 14 /FL=gb:NM_031272.1
1,361153
-2,47081
14,24
Снижение
6.49E-03
NM_014352
Homo sapiens, транскрипционный фактор POU (OCT11), мРНК. /PROD=POU transcription factor /FL=gb:NM_014352.1 gb:AF133895.1 gb:AF162278.1
2,350127
-1,47399
14,16
Снижение
7.74E-03
AK026106
Homo sapiens, кДНК: FLJ22453 fis, клон HRC09679 с высокой степенью подобия с AF059516, мРНК толлоид-подобного белка 2 (TLL2), Homo Sapiens.
7,360687
3,631772
13,26
Снижение
4.64E-05
BF217861
металлотионеин 1E (функциональный)
0,372329
-3,25088
12,32
Снижение
3.04E-02
AV64805
полимераза (РНК) III (направленная на ДНК) (32 кДа)
0,82229
-2,77919
12,14
Снижение
1.29E-02
АВ017269
Homo sapiens, TMEFF2 мРНК, полная кодовая последовательность /FL=gb:AB017269.1 gb:NM_016192.2 gb:AF179274.2 gb:AF242222.1
3,806044
0,220062
12,01
Снижение
7.25E-04
AV734646
Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
2,967768
-0,60775
11,92
Снижение
1.42E-02
AL121753
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP4-614O4 на хромосоме 20q11.1-12. Содержит 3-часть MMP24 (ген матриксной металлопротеазы 24 (вставленной в мембрану)), ген ITGB4BP (белка, связывающего интегрин-бета 4), 3-конец нового гена, 3-конец ...
2,129273
-1,43763
11,85
Снижение
1.15E-04
AV734646
Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
2,951696
-0,61466
11,85
Снижение
8.28E-05
AB019562
Homo sapiens, мРНК, экспрессируемая только в ворсинах плаценты, клон SMAP41.
0,860464
-2,69824
11,78
Снижение
2.25E-02
NM_003007
Homo sapiens семеногелин I (SEMG1), мРНК. /PROD=semenogelin I /FL=gb:J04440.1 gb:NM_003007.1
3,557525
0,063117
11,27
Снижение
1.07E-03
BF514079
Kruppel-подобный фактор 4 (кишечный)
3,094055
-0,35326
10,91
Снижение
4.64E-05
AW188198
индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 /FL=gb:NM_007115.1
4,847114
1,490225
10,25
Снижение
6.76E-05
NM_006474
Homo sapiens, ассоциированный с клеточной мембраной гликопротеин легочного типа-I (T1A-2), вариант транскрипта 2, мРНК. /PROD=lung type-I cell membrane-associatedglycoprotein, isoform 2 precursor /FL=gb:NM_006474.1 gb:AF030428.1
6,426778
3,157882
9,64
Снижение
1.85E-05
AF313413
Homo sapiens, предполагаемый малый трансмембранный белок NID67, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=putative small membrane protein NID67 /FL=gb:AF313413.1
4,927935
1,661339
9,62
Снижение
8.71E-05
J05008
Homo sapiens, ген эндотелина-1 (EDN1), полная кодовая последовательность /FL=gb:NM_001955.1
3,268087
0,027916
9,45
Снижение
1.05E-03
AF345910
Homo sapiens, NYD-SP14, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=NYD-SP14 /FL=gb:AF345910.1
3,655193
0,425727
9,38
Снижение
2.88E-04
AI659927
Homo sapiens, кДНК: FLJ22547 fis, клон HSI00356
7,149479
3,957802
9,14
Снижение
3.56E-05
M10943
Человеческий If-ген металлотионеина (hMT-If)
1,143234
-2,04451
9,11
Снижение
1.25E-02
BF437711
Гены EST
1,588735
-1,59544
9,09
Снижение
4.64E-02
AF279774
Homo sapiens, клон N4 NTera2D1 тератокарциномы, мРНК.
7,144308
3,960669
9,09
Снижение
2.18E-05
BF246115
белок, связанный с РНК-геликазой
3,437271
0,276071
8,95
Снижение
4.74E-05
AB029025
Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1102, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1102 protein
7,224807
4,073278
8,89
Снижение
2.46E-05
NM_005951
Homo sapiens, металлотионеин 1H (MT1H), мРНК. /PROD=metallothionein 1H /FL=gb:NM_005951.1
2,367534
-0,77672
8,84
Снижение
3.10E-03
AF098641
Homo sapiens, CD44 изоформа RC (CD44) мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=CD44 isoform RC /FL=gb:AF098641.1
4,253624
1,120681
8,77
Снижение
4.72E-05
NM_003385
Homo sapiens, визинин-подобный белок 1 (VSNL1), мРНК. /PROD=visinin-like 1 /FL=gb:AF039555.1 gb:U14747.1 gb:AB001104.1 gb:NM_003385.1
5,398488
2,316218
8,47
Снижение
6.93E-05
NM_001134
Homo sapiens, альфа-фетопротеин (AFP), мРНК. /PROD=alpha-fetoprotein /FL=gb:NM_001134.1 gb:J00077.1
3,947271
0,8794
8,39
Снижение
2.51E-04
AI928035
Гены EST
7,768254
4,72435
8,25
Снижение
2.44E-05
NM_005953
Homo sapiens, металлотионеин 2A (MT2A), мРНК. /PROD=metallothionein 2A /FL=gb:NM_005953.1
6,813053
3,774649
8,22
Снижение
2.87E-05
NM_005950
Homo sapiens, металлотионеин 1G (MT1G), мРНК. /PROD=metallothionein 1G /FL=gb:NM_005950.1
7,426418
4,406989
8,11
Снижение
1.89E-05
NM_005952
Homo sapiens, металлотионеин 1X (MT1X), мРНК. /PROD=metallothionein 1X /FL=gb:NM_005952.1
2,332751
-0,66491
7,99
Снижение
5.08E-03
NM_000077
Homo sapiens, циклин-зависимой киназы ингибитор 2A (меланома, p16, ингибирует CDK4) (CDKN2A), мРНК. /PROD=cyclin-dependent kinase inhibitor 2A (melanoma,p16, inhibits CDK4) /FL=gb:NM_000077.1 gb:L27211.1
4,738703
1,752163
7,93
Снижение
4.08E-05
NM_014033
Homo sapiens, белок DKFZP586A0522 (DKFZP586A0522), мРНК. /PROD=DKFZP586A0522 protein /FL=gb:NM_014033.1
5,601289
2,627505
7,86
Снижение
1.20E-04
AF039555
Homo sapiens, визинин-подобный белок 1 (VSNL1), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=visinin-like protein 1 /FL=gb:AF039555.1 gb:U14747.1 gb:AB001104.1 gb:NM_003385.1
7,564809
4,595208
7,83
Снижение
2.94E-05
M83248
Человеческий нефропонтин мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=nephropontin /FL=gb:M83248.1
3,602406
0,633934
7,83
Снижение
5.32E-05
AI493245
антиген CD44 (функция хоуминга и система группы крови Indian)
3,08363
0,127792
7,76
Снижение
9.96E-04
U73778
Предшественник человеческого коллагена типа XII альфа 1 (COL12A1), мРНК. /PROD=collagen type XII alpha-1 /FL=gb:NM_004370.3
3,030236
0,074899
7,76
Снижение
9.24E-03
AA812232
стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
7,493544
4,550383
7,69
Снижение
2.85E-05
NM_002450
Homo sapiens, металлотионеин 1L (MT1L), мРНК. /PROD=metallothionein 1L /FL=gb:NM_002450.1
3,19487
0,252626
7,69
Снижение
1.19E-04
NM_173553
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ25801 (FLJ25801), мРНК. /FL=gb:NM_173553.1
3,127666
0,186544
7,68
Снижение
5.32E-05
NM_003577
Homo sapiens, недифференцированной эмбриональной клетки транскрипционный фактор 1 (UTF1), мРНК. /PROD=undifferentiated embryonic cell transcriptionfactor 1 /FL=gb:NM_003577.1 gb:AB011076.1
2,514693
-0,40391
7,56
Снижение
4.74E-05
NM_145032
Homo sapiens, гипотетический белок MGC21636 (MGC21636), мРНК. /FL=gb:BC020572.1 gb:NM_145032.2
5,207569
2,290724
7,55
Снижение
5.33E-05
AA083478
Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 746039
0,041471
-2,87232
7,54
Снижение
4.34E-02
AW162210
Homo sapiens, кДНК FLJ11490 fis, клон HEMBA1001918
5,13621
2,236529
7,46
Снижение
5.86E-05
BC013944
Homo sapiens, подобный миозину, тяжелый полипептид 7, сердечная мышца, бета, клон IMAGE:4064393, мРНК.
4,255531
1,357834
7,45
Снижение
6.54E-05
AF096296
Homo sapiens, предшественник хемокина-1 стромы тимуса, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=thymic stroma chemokine-1 precursor /FL=gb:AF142434.1 gb:AF096296.1 gb:AF124601.1 gb:AB010447.1 gb:NM_006072.1
4,055862
1,169817
7,39
Снижение
1.10E-04
AK026815
Homo sapiens, кДНК: FLJ23162 fis, клон LNG09734.
4,715355
1,834956
7,36
Снижение
6.18E-04
AA788946
Гены EST со средней степенью подобия с CA1C, АЛЬФА 1-ЦЕПЬЮ КРЫСИНОГО КОЛЛАГЕНА (XII) (R.norvegicus)
2,597946
-0,27094
7,31
Снижение
6.26E-05
AW138143
Гены EST
4,796495
1,938561
7,25
Снижение
1.82E-04
AI653107
Гены EST
3,508683
0,663662
7,19
Снижение
1.82E-04
AK027231
Homo sapiens, кДНК: FLJ23578 fis, клон LNG12709.
5,441963
2,62358
7,05
Снижение
3.09E-05
NM_016651
Homo sapiens, белок нового гена-3 гепатоклеточной карциномы (LOC51339), мРНК. /PROD=heptacellular carcinoma novel gene-3 protein /FL=gb:NM_016651.2 gb:AF251079.2
1,389794
-1,42311
7,03
Снижение
4.34E-03
BG498699
Гены EST
2,194683
-0,60003
6,94
Снижение
3.56E-02
U63296
Человеческая 15-гидроксипростагландин-дегидрогеназа, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase /FL=gb:U63296.1
5,450694
2,658196
6,93
Снижение
1.85E-05
AF095771
Homo sapiens, белок B1 реагирующей на PTH остеосаркомы (B1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PTH-responsive osteosarcoma B1 protein /FL=gb:AF095771.1
0,907338
-1,88392
6,92
Снижение
3.84E-02
NM_025243
Homo sapiens, переносчик растворенных веществ (SLC19A3), мРНК. /PROD=solute carrier /FL=gb:NM_025243.1 gb:AF271633.1
6,93459
4,14838
6,9
Снижение
9.04E-05
AF078844
Homo sapiens, белок hqp0376, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=hqp0376 protein /FL=gb:AF078844.1
2,724257
-0,05687
6,87
Снижение
7.43E-04
AL552534
Человеческая мРНК для антигена CD44, 5UTR (последовательность от 5cap до стартового кодона).
3,86075
1,090793
6,82
Снижение
1.89E-05
U85995
Кластер включает U85995:Человеческий клон IMAGE-22181, неизвестный белок, мРНК, частичная кодовая последовательность /cds=(0,1291) /gb=U85995 /gi=1835749 /ug=Hs.79340 /len=1696
2,982965
0,222537
6,78
Снижение
1.19E-03
AK026829
Homo sapiens, кДНК: FLJ23176 fis, клон LNG10452.
0,873551
-1,88238
6,75
Снижение
5.65E-03
AW293376
Гены EST
5,023981
2,272773
6,73
Снижение
8.41Е-05
NM_006472
Homo sapiens, стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3, (VDUP1), мРНК. /PROD=upregulated by 1,25-dihydroxyvitamin D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
3,932141
1,1878
6,7
Снижение
3.66E-05
NM_004490
Homo sapiens, связанный с рецепторами фактора роста белок 14 (GRB14), мРНК. /PROD=growth factor receptor-bound protein 14 /FL=gb:L76687.1 gb:NM_004490.1
5,356771
2,61556
6,69
Снижение
4.40E-05
W92036
Гены EST
2,770179
0,05935
6,55
Снижение
1.17E-04
AK000345
Homo sapiens, кДНК FLJ20338 fis, клон HEP12179.
3,462851
0,769123
6,47
Снижение
2.19E-04
BE673800
Гены EST со средней степенью подобия с белком KIAA1238 (H.sapiens)
7,424722
4,734219
6,46
Снижение
7.86E-05
AF333388
Homo sapiens, металлотионеин 1H-подобный белок, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=metallothionein 1H-like protein /FL=gb:AF333388.1
3,610367
0,921088
6,45
Снижение
4.21E-05
ВС004372
Homo sapiens, подобный антигену CD44 (функция хоуминга и система группы крови Indian), клон MGC:10468, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Similar to CD44 antigen (homing function andIndian blood group system) /FL=gb:BC004372.1
2,798327
0,114281
6,43
Снижение
4.31E-04
BF062943
протокадгерин 18
2,387268
-0,26492
6,29
Снижение
2.59E-04
BF063186
Гены EST
4,622217
1,982686
6,23
Снижение
4.40E-05
AL537457
нейрофиламент, легкий полипептид (68 кДа) /FL=gb:NM_006158.1
5,295204
2,664042
6,2
Снижение
5.37E-04
D32039
мРНК человеческого pgH3 для протеогликана PG-M(V3), полная кодовая последовательность. /PROD=proteoglycan PG-M(V3) /FL=gb:D32039.1
-0,55251
-3,18076
6,18
Снижение
2.91E-02
AI277662
Гены EST с низкой степенью подобия с TRP7_HUMAN, ВРЕМЕННЫМ РЕЦЕПТОРНЫМ ПОТЕНЦИАЛЬНЫМ КАНАЛОМ 7 (H.sapiens)
2,060071
-0,56473
6,17
Снижение
8.28E-05
AA004300
гипотетический белок DKFZp566I133
1,892794
-0,71503
6,1
Снижение
5.25E-04
AL138349
белок KIAA0367
3,822765
1,223367
6,06
Снижение
2.86E-04
AL567376
связанный с G-белком рецептор 39
0,803559
-1,78647
6,02
Снижение
8.07E-04
BF673779
Гены EST
4,038177
1,461889
5,96
Снижение
1.52E-04
BF449053
Гены EST
3,280973
0,707817
5,95
Снижение
1.37E-03
AL139377
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-251J8 на хромосоме 13. Содержит гены EST, STS, GSS и островок CpG. Содержит два новых гена с двумя изоформами каждый, и ген KIAA0610 с двумя изоформами
3,059444
0,490104
5,94
Снижение
3.30E-02
NM_007350
Homo sapiens, домен, подобный домену плекстриновой гомологии, семейство A, член 1 (PHLDA1), мРНК. /FL=gb:NM_007350.1
3,876749
1,313133
5,91
Снижение
1.25E-03
AL574184
гидроксипростагландин-дегидрогеназа 15-(NAD) /FL=gb:NM_000860.1 gb:L76465.1
5,318139
2,762676
5,88
Снижение
2.55E-04
U87408
Кластер включает U87408:Человеческого клона IMAGE-74593 неизвестный белок, мРНК, частичная кодовая последовательность /cds=(0,1362) /gb=U87408 /gi=1842104 /ug=Hs.79340 /len=1982
1,99849
-0,55448
5,87
Снижение
1.01E-03
NM_002317
Homo sapiens, лизилоксидаза (LOX), мРНК. /PROD=lysyl oxidase /FL=gb:AF039291.1 gb:NM_002317.1 gb:M94054.1
1,312148
-1,23479
5,84
Снижение
1.36E-04
U32500
Человеческий рецептор типа 2 к нейропептиду Y, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=type 2 neuropeptide Y receptor /FL=gb:U42766.1 gb:U36269.1 gb:U32500.1
2,64743
0,101711
5,84
Снижение
6.52E-04
AI702438
Гены EST
2,918001
0,408444
5,69
Снижение
5.51E-04
BF674052
катгепсин D (лизосомальная аспартилпротеаза)
4,64236
2,137119
5,68
Снижение
3.09E-05
AB019695
Homo sapiens, мРНК для тиоредоксин-редуктазы II бета, полная кодовая последовательность. /PROD=thioredoxin reductase II beta /FL=gb:AB019695.1
4,505436
2,001428
5,67
Снижение
9.04E-05
W57613
Гены EST
2,98904
0,488717
5,66
Снижение
2.78E-04
AW138143
Гены EST
0,424388
-2,06318
5,61
Снижение
2.92E-02
NM_002433
Homo sapiens, гликопротеин миелина олигодендроцитов (MOG), мРНК. /PROD=myelin oligodendrocyte glycoprotein /FL=gb:U18798.1 gb:U64564.1 gb:NM_002433.1
3,560033
1,077194
5,59
Снижение
1.52E-04
U38945
Человеческий гипотетический белок 18,1 кДа, (CDKN2A) мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:U38945.1 gb:U26727.1
1,840613
-0,62498
5,52
Снижение
9.50E-05
AI949760
Гены EST с низкой степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
4,178686
1,713153
5,52
Снижение
1.61E-04
NM_003256
Homo sapiens, тканевый ингибитор металлопротеиназы 4 (TIMP4), мРНК. /PROD=tissue inhibitor of metalloproteinase 4precursor /FL=gb:NM_003256.1 gb:U76456.1
2,324824
-0,13601
5,51
Снижение
2.39E-04
AL096771
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP1-238D15 на хромосоме 6q12-14.3. Содержит часть гена COL12A1 (коллаген, тип XII, альфа 1) и гены STS
5,041032
2,59268
5,46
Снижение
2.25E-05
AK022686
Homo sapiens, кДНК FLJ12624 fis, клон NT2RM4001754.
1,294482
-1,14923
5,44
Снижение
2.97E-02
АА723810
кДНК для дифференциально экспрессируемого гена CO16 /FL=gb:BC001291.1
3,732985
1,29318
5,43
Снижение
4.32E-03
AI459194
белок раннего ростового ответа 1
1,117304
-1,32124
5,42
Снижение
1.63E-02
AL046992
сопряженный с G-белком рецептор 1 /FL=gb:NM_005279.1
6,120177
3,682667
5,42
Снижение
1.93E-04
NM_001753
Homo sapiens, кавеолин 1, белок кавеолы, 22 кДа (CAV1), мРНК. /PROD=caveolin 1 /FL=gb:NM_001753.2
3,365852
0,931215
5,41
Снижение
8.41E-05
NM_003392
Homo sapiens, белок типа wingless семейства сайта интеграции MMTV, член 5A (WNT5A), мРНК. /PROD=wingless-type MMTV integration site family,member 5A /FL=gb:NM_003392.1 gb:L20861.1
5,752704
3,318587
5,4
Снижение
5.75E-04
R94644
Homo sapiens, изоформа Vint верзикана, мРНК, частичная кодовая последовательность.
2,256481
-0,17157
5,38
Снижение
1.10E-04
NM_018495
Homo sapiens, белок NAG22 (LOC55873), мРНК. /PROD=NAG22 protein /FL=gb:AF247820.3 gb:NM_018495.3
5,522456
3,095555
5,38
Снижение
9.25E-05
BG054844
семейство генов-гомологов ras, член E /FL=gb:NM_005168.1
3,660753
1,237109
5,37
Снижение
1.10E-04
ВЕ903880
цинк-пальцевый белок 6 (CMPX1)
2,418198
0,007534
5,32
Снижение
9.96E-04
AI860150
Гены EST с низкой степенью подобия с A49134, регион V-I цепи Ig-каппа (H.sapiens)
1,659275
-0,74924
5,31
Снижение
2.40E-03
L16895
Человеческий ген лизилоксидазы (LOX), экзон 7
5,715937
3,314142
5,28
Снижение
1.74E-04
U85658
Человеческий транскрипционный фактор ERF-1, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ERF-1 /FL=gb:NM_003222.1 gb:U85658.1
2,572851
0,172113
5,28
Снижение
2.43E-04
AW592563
продукт гена KIAA0455
5,807319
3,410152
5,27
Снижение
6.54E-05
NM_018004
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10134 (FLJ10134), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10134 /FL=gb:NM_018004.1
4,138808
1,745346
5,25
Снижение
1.40E-03
AW590196
ассоциированный с клеточной мембраной гликопротеин легочного типа-I
6,003141
3,615412
5,23
Снижение
7.14E-04
М25915
Человеческий ингибитор цитолиза комплемента (CLI), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:J02908.1 gb:NM_001831.1 gb:M64722.1 gb:M25915.1
1,05854
-1,32898
5,23
Снижение
1.59E-03
AI703321
белок типа wingless семейства сайта интеграции MMTV, член 5A
4,285883
1,901821
5,22
Снижение
6.26E-05
AL038787
6-фосфофрукто-2-киназафруктоза-2,6-бифосфатаза 4
6,959783
4,576665
5,22
Снижение
1.85E-05
NM_014367
Homo sapiens, гипотетический белок, индуцируемый эстрадиолом (E2IG5), мРНК. /PROD=hypothetical protein, estradiol-induced /FL=gb:NM_014367.1 gb:AF191020.1
1,10782
-1,27174
5,2
Снижение
1.99E-04
BC029425
Homo sapiens, белок, подобный KIAA1275, клон IMAGE:4616553, мРНК.
5,252439
2,877592
5,19
Снижение
5.32E-05
NM_001553
Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
6,881969
4,510778
5,17
Снижение
1.85E-05
AF2011944
Homo sapiens HGTD-P (HGTD-P) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=HGTD-P /FL=gb:AF201944.1 gb:AF250321.1
3,543738
1,178007
5,15
Снижение
2.51E-05
NM_001955
Homo sapiens эндотелин 1 (EDN1), мРНК. /PROD=endothelin 1 /FL=gb:NM_001955.1
4,229884
1,871489
5,13
Снижение
1.55E-04
BC032716
Homo sapiens, клон MGC:45425 IMAGE:5518697, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:45425) /FL=gb:BC032716.1
3,035594
0,680769
5,12
Снижение
1.37E-03
AI963605
Гены EST
6,307554
3,95342
5,11
Снижение
7.03E-05
NM_006622
Homo sapiens, индуцируемая сывороткой киназа (SNK), мРНК. /PROD=serum-inducible kinase /FL=gb:AF059617.1 gb:NM_006622.1 gb:AF223574.1
2,271332
-0,08272
5,11
Снижение
1.59E-03
NM_015198
Homo sapiens, белок KIAA0633 (COBL), мРНК. /PROD=KIAA0633 protein /FL=gb:NM_015198.1
3,584234
1,244979
5,06
Снижение
7.30E-04
AF232772
Homo sapiens, гиалуронансинтаза 3 (HAS3), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=hyaluronan synthase 3 /FL=gb:NM_005329.1 gb:AF232772.1
6,883803
4,552208
5,03
Снижение
3.09E-05
AF107495
Homo sapiens, FWP001 и предполагаемый FWP002, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=FWP001 /FL=gb:AF107495.1
3,931505
1,606097
5,01
Снижение
5.32E-05
NM_000610
Homo sapiens, антиген CD44 (функция хоуминга и система группы крови Indian) (CD44), мРНК. /PROD=CD44 antigen (homing function and Indian bloodgroup system) /FL=gb:U40373.1 gb:NM_000610.1 gb:M59040.1 gb:M24915.1
G) Клетки линии H9 пассажа 39 на 96 час стадии дифференцировки в сформированную эндодерму и клетки EXPRES 01- Значения интенсивности даны в формате Log2
EXPRES 01
96 ЧАС СТАДИИ СЭ
Отношение
Направление
скорректир. значение p
Идентификатор гена
Название гена
-4,01441
4,896261
481,26
Повышение
1.67E-04
AB028021
Кластер включает AB028021:Homo sapiens, HNF-3 beta, мРНК для гепатоцитного ядерного фактора-3 бета, полная кодовая последовательность /cds=(196,1569) /gb=AB028021 /gi=4958949 /ug=Hs.155651 /len=1944
-4,79201
3,803312
386,77
Повышение
1.32E-04
NM_012431
Homo sapiens, содержащий sema-домен, иммуноглобулиновый домен (Ig), короткий основной домен, секретируемый белок (семафорин), 3E (SEMA3E), мРНК. /PROD=sema domain, immunoglobulin domain (Ig), shortbasic domain, secreted, (semaphorin) 3E /FL=gb:NM_012431.1 gb:AB002329.1
-5,25658
3,205654
352,69
Повышение
1.07E-04
AW005572
предполагаемый белок 47 кДа
-0,80043
7,232518
261,91
Повышение
5.61E-05
D87811
Homo sapiens, мРНК для GATA-6, полная кодовая последовательность. /PROD=GATA-6 /FL=gb:U66075.1 gb:NM_005257.1 gb:D87811.1
-4,50758
3,451939
248,92
Повышение
8.69E-05
AU118882
эндотелиновый рецептор типа A /FL=gb:NM_001957.1 gb:L06622.1
-3,8752
4,026704
239,17
Повышение
2.39E-05
AB028021
Homo sapiens, HNF-3 beta, мРНК гепатоцитного ядерного фактора-3 бета, полная кодовая последовательность. /PROD=hepatocyte nuclear factor-3 beta /FL=gb:AB028021.1 gb:NM_021784.1
-2,90798
4,967321
234,8
Повышение
2.99E-05
NM_001643
Homo sapiens, аполипопротеин A-II (APOA2), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-II precursor /FL=gb:M29882.1 gb:NM_001643.1 gb:BC005282.1
-4,29896
3,162606
176,26
Повышение
3.54E-05
AY177407
Homo sapiens, гомеобоксовый белок goosecoid, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=homeobox protein goosecoid /FL=gb:AY177407.1 gb:NM_173849.1
-3,61621
3,736424
163,44
Повышение
7.81E-04
AL569326
Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность
-1,11159
6,139499
152,33
Повышение
2.99E-05
NM_003867
Homo sapiens, фактор роста фибробластов 17 (FGF17), мРНК. /PROD=fibroblast growth factor 17 /FL=gb:NM_003867.1 gb:AB009249.1
-3,26893
3,979011
152
Повышение
7.78E-05
NM_001785
Homo sapiens, цитидиндеаминаза (CDA), мРНК. /PROD=cytidine deaminase /FL=gb:L27943.1 gb:NM_001785.1
-2,0457
5,103681
141,96
Повышение
2.15E-04
AI422986
Гены EST
-0,62093
6,499027
139,1
Повышение
2.99E-05
NM_022454
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ22252, сходный с содержащим SRY-бокс белком 17 (FLJ22252), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ22252 similar to SRY-boxcontaining gene 17 /FL=gb:NM_022454.1
-0,26005
6,792541
132,75
Повышение
1.17E-04
R72286
связанный с микрофибриллами белок 4
-3,62742
3,409798
131,34
Повышение
1.36E-03
AA772920
Гены EST
-1,89695
5,127766
130,21
Повышение
8.40E-05
AL136944
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp586J0624 (из клона DKFZp586J0624); полная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein /FL=gb:AF215636.1 gb:NM_014585.1 gb:AF231121.1 gb:AF226614.1 gb:AL136944.1
-1,32044
5,59755
120,93
Повышение
2.06E-03
AF017987
Homo sapiens, связанный с апоптозом секретированный белок 2 (SARP2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=secreted apoptosis related protein 2 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-0,83997
5,897601
106,71
Повышение
1.78E-04
AI821669
Гены EST
-3,51429
3,198717
104,91
Повышение
1.10E-03
AA352113
Гены EST
-2,5679
4,132538
104
Повышение
7.31E-05
AL121722
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP4-788L20 на хромосоме 20. Содержит ген HNF3B (гепатоцитного ядерного фактора-3 бета), новый ген на основе генов EST, гены EST, STS, GSS и CpG-островки
-3,53873
2,87541
85,28
Повышение
7.65E-04
AI675836
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-446H13 на хромосоме 10. Содержит 3-конец гена нового белка, подобного KIAA1059 (ортолог мышиного рецепторного белка SORCS, содержащего домен VPS10), псевдоген RPL23A (белок 23A рибосомы 60S), гены EST, гены STS
-3,39007
3,012851
84,62
Повышение
3.25E-03
NM_006614
Homo sapiens, молекула клеточной адгезии с гомологией с L1CAM (близкий гомолог L1) (CHL1), мРНК. /PROD=cell adhesion molecule with homology to L1CAM(close homologue of L1) /FL=gb:AF002246.1 gb:NM_006614.1
-1,66311
4,666455
80,42
Повышение
4.61E-04
S69738
MCP-1=моноцитарный хемотактический белок (человеческий, клетки эндотелия аорты, мРНК, 661 нт). /PROD=MCP-1
0,502235
6,820772
79,81
Повышение
1.83E-05
NM_014899
Homo sapiens, белок KIAA0878 (KIAA0878), мРНК. /PROD=KIAA0878 protein /FL=gb:NM_014899.1 gb:AB020685.1
-2,07937
4,232685
79,45
Повышение
1.97E-03
NM_001643
Homo sapiens, аполипопротеин A-II (APOA2), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-II precursor /FL=gb:M29882.1 gb:NM_001643.1 gb:BC005282.1
-3,17056
3,136032
79,15
Повышение
8.69E-05
AI801626
Гены EST со средней степенью подобия с ALU4_HUMAN ALU SUBFAMILY SB2 SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-3,54017
2,747179
78,11
Повышение
6.80E-04
NM_002091
Homo sapiens, гастрин-высвобождающий белок (GRP), мРНК. /PROD=gastrin-releasing peptide /FL=gb:NM_002091.1 gb:K02054.1 gb:BC004488.1
0,756526
7,035708
77,66
Повышение
3.90E-05
NM_003012
Homo sapiens, секретируемый frizzled-связанный белок 1 (SFRP1), мРНК. /PROD=secreted frizzled-related protein 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-1,44407
4,79513
75,54
Повышение
9.78E-04
U91903
Человеческий белок Fritz, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Fritz /FL=gb:U24163.1 gb:U68057.1 gb:NM_001463.1 gb:U91903.1
-2,72686
3,495506
74,67
Повышение
2.07E-04
AI692180
белок 2, связывающий белок, взаимодействующий с PTPRF (липрин бета 2)
-3,20091
3,013879
74,27
Повышение
7.33E-03
NM_002614
Homo sapiens, содержащий PDZ домен белок 1 (PDZK1), мРНК. /PROD=PDZ domain containing 1 /FL=gb:NM_002614.1 gb:AF012281.1
-3,7619
2,33669
68,53
Повышение
7.27E-05
NM_016179
Homo sapiens, временный рецепторный потенциальный канал 4 (TRPC4), мРНК. /PROD=transient receptor potential 4 /FL=gb:NM_016179.1 gb:AF175406.1
-3,12184
2,909781
65,42
Повышение
1.61E-04
AI700341
Гены EST
0,800949
6,787852
63,42
Повышение
2.39E-05
NM_030781
Homo sapiens, фагоцитарный рецептор лектина С-типа (SRCL), мРНК. /PROD=scavenger receptor with C-type lectin /FL=gb:NM_030781.1
-4,29055
1,624099
60,32
Повышение
2.39E-04
AI337300
Homo sapiens, клон MGC:4604, мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:BC004219.1
-2,91295
2,987854
59,75
Повышение
5.35E-03
AW005572
предполагаемый белок 47 кДа
-1,70149
4,156198
57,99
Повышение
7.75E-04
AF225426
Homo sapiens, HT016 мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=HT016 /FL=gb:AF225426.1
-1,71797
4,089548
56,01
Повышение
2.11E-03
AL524520
связанный с G-белком рецептор 49
-2,50168
3,192473
51,77
Повышение
6.18E-03
X16468
Человеческая мРНК для коллагена альфа-1 типа II.
-1,55323
4,102505
50,41
Повышение
6.30E-05
AI821586
Гены EST со средней степенью подобия с полученным из клеток JE0284 Mm-1 белком 1b, ассоциированным с трансплантабельностью (H.sapiens)
1,388898
7,006012
49,08
Повышение
2.00E-05
BE620739
Гены EST
0,663834
6,273873
48,84
Повышение
1.42E-04
AI817041
связанный с G-белком рецептор
-0,41404
5,168897
47,93
Повышение
2.80E-04
AI332407
секретированный frizzled-связанный белок 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-0,77864
4,801921
47,85
Повышение
3.26E-04
NM_022055
Homo sapiens, зарезервированный (KCNK12), мРНК. /PROD=tandem pore domain potassium channel THIK-2 /FL=gb:NM_022055.1 gb:AF287302.1
-3,10357
2,474935
47,79
Повышение
1.14E-04
NM_001453
Homo sapiens, белок с вилкообразным регионом (forkhead box) C1 (FOXC1), мРНК. /PROD=forkhead box C1 /FL=gb:NM_001453.1
-0,81978
4,721279
46,56
Повышение
2.62E-04
AI824037
Гены EST с низкой степенью подобия с FCE2, МЫШИНЫМ НИЗКОАФФИННЫМ РЕЦЕПТОРОМ ДЛЯ ИММУНОГЛОБУЛИНА ЭПСИЛОН (M.musculus)
-2,26295
3,255855
45,85
Повышение
1.71E-03
AI735586
Гены EST
-2,45311
3,005889
43,99
Повышение
1.26E-02
BC042378
Homo sapiens, клон IMAGE:5277693, мРНК.
-0,18863
5,2349
42,92
Повышение
3.48E-04
AV700724
GATA-связывающий белок 4 /FL=gb:NM_002052.1 gb:L34357.1 gb:D78260.1
-0,27888
5,117281
42,11
Повышение
1.28E-04
AF225513
Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta /FL=gb:AF225513.1
-1,83503
3,514396
40,77
Повышение
1.00E-03
AA552969
Гены EST
0,83572
6,138202
39,46
Повышение
1.51E-04
N21138
белок KIAA0878 /FL=gb:NM_014899.1 gb:AB020685.1
-3,79684
1,484084
38,88
Повышение
7.14E-05
AK026720
Homo sapiens, кДНК: FLJ23067 fis, клон LNG04993.
-1,77041
3,498637
38,56
Повышение
1.69E-03
NM_003966
Homo sapiens, содержащий sema-домен, 7 тромбоспондиновых повторов (типа 1 и сходного с типом 1), трансмембранный домен (TM) и короткий цитоплазменный домен белок, (семафорин), 5A (SEMA5A), мРНК. /PROD=sema domain, seven thrombospondin repeats (type1 and type 1-like), transmem
-3,31261
1,945323
38,26
Повышение
5.68E-04
BG397856
главный комплекс гистосовместимости, класс II, DQ альфа 1
0,804491
6,016482
37,07
Повышение
6.98E-05
AA583044
костный морфогенетический белок 2 /FL=gb:NM_001200.1
-3,10838
2,083703
36,56
Повышение
3.89E-04
N50412
Гены EST
-2,61405
2,571666
36,4
Повышение
7.27E-05
U71207
Человеческий гомолог гена отсутствия глаз (Eab1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Eab1 /FL=gb:NM_005244.1 gb:U71207.1
-3,12747
2,048588
36,15
Повышение
6.25E-04
AV726956
Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
-2,81405
2,361598
36,14
Повышение
1.28E-03
AI694325
Гены EST
-0,69028
4,475046
35,89
Повышение
2.18E-04
M16276
Человеческий MHC, класс II, HLA-DR2-Dw12, мРНК, DQw1-beta, полная кодовая последовательность. /FL=gb:NM_002123.1 gb:M16276.1 gb:M60028.1 gb:M17564.1 gb:M81141.1 gb:M81140.1
0,713597
5,840181
34,93
Повышение
2.79E-04
BF508344
Гены EST
0,828899
5,924976
34,2
Повышение
7.27E-05
NM_001200
Homo sapiens, костный морфогенетический белок 2 (BMP2), мРНК. /PROD=bone morphogenetic protein 2 precursor /FL=gb:NM_001200.1
-0,47614
4,618034
34,16
Повышение
6.98E-05
BF508639
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434E082 (из клона DKFZp434E082)
-0,5292
4,497879
32,61
Повышение
9.90E-04
AI127440
Гены EST
f
7,391827
32,51
Повышение
5.61E-05
AJ224869
Homo sapiens, CXCR4 ген, кодирующий рецептор CXCR4
-3,7558
1,259886
32,35
Повышение
4.07E-03
AW473656
Гены EST
-0,98665
4,021785
32,19
Повышение
1.71E-03
NM_001463
Homo sapiens, frizzled-связанный белок (FRZB), мРНК. /PROD=frizzled-related protein /FL=gb:U24163.1 gb:U68057.1 gb:NM_001463.1 gb:U91903.1
-4,30972
0,685002
31,88
Повышение
7.81E-04
AI911379
гипотетический белок FLJ11113
-3,25309
1,716276
31,33
Повышение
2.03E-03
AL050154
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp586L0120 (из клона DKFZp586L0120).
-0,45718
4,508664
31,25
Повышение
1.56E-04
BF939489
гликопротеин M6A /FL=gb:D49958.1
-2,39338
2,572327
31,25
Повышение
3.48E-03
M17955
Человеческий MHC, класс II, HLA-DQ-beta, мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:M33907.1 gb:M17955.1 gb:M16996.1 gb:M17563.1 gb:M20432.1 gb:M26042.1
1,314051
6,278914
31,23
Повышение
2.39E-05
BC000740
Homo sapiens, рецептор холецистокинина B, клон MGC:2199, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cholecystokinin B receptor /FL=gb:L07746.1 gb:L08112.1 gb:S70057.1 gb:BC000740.1 gb:L04473.1 gb:NM_000731.1
-2,16079
2,736566
29,8
Повышение
2.47E-04
NM_000552
Homo sapiens, фактор фон Виллебранда (VWF), мРНК. /PROD=von Willebrand factor precursor /FL=gb:NM_000552.2
-1,39784
3,483531
29,47
Повышение
1.14E-03
BE222344
богатый аргинином и серином фактор сплайсинга 5
-3,25961
1,618799
29,41
Повышение
1.38E-02
NM_016341
Homo sapiens, обильная в поджелудочной железе фосфолипаза C (LOC51196), мРНК. /PROD=pancreas-enriched phospholipase C /FL=gb:AF117948.1 gb:NM_016341.1 gb:AF190642.2
-4,15276
0,707307
29,04
Повышение
1.84E-04
AA129444
Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1263, частичная кодовая последовательность
-0,13959
4,718875
29,01
Повышение
6.98E-05
BG109855
Homo sapiens, клон TUA8, область, связанная с синдромом кошачьего крика, мРНК
1,829497
6,66646
28,58
Повышение
6.58E-05
AA534817
Гены EST с низкой степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-1,09421
3,740217
28,53
Повышение
8.67E-04
AK023621
Homo sapiens, кДНК FLJ13559 fis, клон PLACE1007852, с высокой степенью подобия с Homo sapiens мРНК для белка KIAA0878.
-0,37709
4,429943
27,99
Повышение
7.27E-05
AU152102
Homo sapiens, кДНК FLJ12993 fis, клон NT2RP3000197
-3,4744
1,320969
27,77
Повышение
5.88E-03
L32867
Homo sapiens, альфа 2,8-сиалилтрансфераза, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=alpha 2,8-sialyltransferase /FL=gb:L43494.1 gb:D26360.1 gb:L32867.1 gb:NM_003034.1
-2,4051
2,382948
27,63
Повышение
7.27E-05
NM_021020
Homo sapiens, связанного с F37/раком пищевода гена кодирующий мотив leucine-zipper motif (FEZ1), мРНК. /PROD=F37Esophageal cancer-related gene-codingleucine-zipper motif /FL=gb:AF123659.1 gb:NM_021020.1
1,563993
6,348869
27,57
Повышение
2.99E-05
NM_002413
Homo sapiens, микросомальная глутатион S-трансфераза 2 (MGST2), мРНК. /PROD=microsomal glutathione S-transferase 2 /FL=gb:NM_002413.1 gb:U77604.1
-4,63418
0,150462
27,56
Повышение
1.41E-02
BF112218
Гены EST
-2,83906
1,924807
27,17
Повышение
1.51E-04
T15545
Гены EST
-0,18256
4,580673
27,16
Повышение
2.39E-05
AI583173
главный комплекс гистосовместимости, класс II, DQ бета 1
-1,80965
2,891679
26,02
Повышение
4.11E-03
NM_152506
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32835 (FLJ32835), мРНК. /FL=gb:NM_152506.1
-0,10733
4,583423
25,83
Повышение
3.29E-04
BC005107
Homo sapiens, клон IMAGE:3840937, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3840937)
-1,42034
3,260135
25,64
Повышение
5.35E-04
BE737251
Homo sapiens, кДНК: FLJ22482 fis, клон HRC10859, с высокой степенью подобия cIRO180147, Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 180147
-2,6422
2,00977
25,14
Повышение
2.92E-05
BF589787
Гены EST
-2,50335
2,123365
24,7
Повышение
3.11E-04
AA781795
Гены EST
-2,68947
1,923908
24,48
Повышение
2.10E-02
AW291402
Гены EST
-2,14813
2,455272
24,31
Повышение
7.80E-04
NM_006034
Homo sapiens, p53-индуцированный белок (PIG11), мРНК. /PROD=p53-induced protein /FL=gb:AF010315.1 gb:BC000443.1 gb:BC003010.1 gb:NM_006034.1
-1,35345
3,203459
23,54
Повышение
9.11E-04
AW157571
Гены EST с низкой степенью подобия с T00331, гипотетическим белком KIAA0555 (H.sapiens)
0,424882
4,980575
23,52
Повышение
2.79E-04
AI692659
белок теплового шока 90 кДа 1, альфа
-2,05438
2,485242
23,26
Повышение
6.59E-03
BG290908
Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-0,35867
4,178782
23,22
Повышение
4.79E-05
NM_001957
Homo sapiens, эндотелиновый рецептор типа A (EDNRA), мРНК. /PROD=endothelin receptor type A /FL=gb:NM_001957.1 gb:L06622.1
-0,13427
4,37209
22,73
Повышение
3.30E-04
D49958
Homo sapiens, мРНК для мембранного гликопротеина M6, полная кодовая последовательность. /PROD=membrane glycoprotein M6 /FL=gb:D49958.1
-1,54464
2,95955
22,69
Повышение
1.14E-04
AI743534
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp564B1162 (из клона DKFZp564B1162); полная кодовая последовательность. /FL=gb:AL136646.1
-2,16064
2,33987
22,64
Повышение
1.03E-02
NM_000475
Homo sapiens, ядерный рецептор, подсемейство 0, группа B, член 1 (NR0B1), мРНК. /PROD=adrenal hypoplasia protein /FL=gb:NM_000475.2
1,168713
5,649978
22,34
Повышение
3.27E-04
NM_016139
Homo sapiens, 16,7кДа белок (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
1,740607
6,204585
22,07
Повышение
3.29E-05
NM_002160
Homo sapiens, гексабрахион (тенасцин C, цитотактин) (HXB), мРНК. /PROD=hexabrachion (tenascin C, cytotactin) /FL=gb:M55618.1 gb:NM_002160.1
-3,95062
0,506384
21,96
Повышение
3.04E-03
AU144247
Homo sapiens, кДНК FLJ13443 fis, клон PLACE1002853
-2,49959
1,953408
21,9
Повышение
2.53E-03
NM_000623
Homo sapiens, брадикинина рецептор B2 (BDKRB2), мРНК. /PROD=bradykinin receptor B2 /FL=gb:M88714.1 gb:NM_000623.1
1,997597
6,394209
21,06
Повышение
7.27E-05
BC005997
Homo sapiens, клон MGC:14801, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:14801) /FL=gb:BC005997.1
0,476688
4,86637
20,96
Повышение
1.84E-04
NM_024581
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ13942 (FLJ13942), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ13942 /FL=gb:NM_024581.1
-0,5982
3,789814
20,94
Повышение
1.67E-02
AI806510
предполагаемый белок 47 кДа
1,275191
5,659185
20,88
Повышение
2.29E-04
AI587307
гипотетический белок FLJ12838 /FL=gb:NM_024641.1
-0,81856
3,56477
20,87
Повышение
6.98E-05
AI129628
Гены EST
-1,25995
3,108032
20,65
Повышение
5.74E-04
AK026607
Homo sapiens, кДНК: FLJ22954 fis, клон KAT09813, с высокой степенью подобия с белком AF010315, Homo sapiens Pig11 (PIG11), мРНК.
-2,69284
1,656461
20,38
Повышение
1.26E-02
R33964
Homo sapiens, кДНК FLJ11022 fis, клон PLACE1003771
0,449168
4,77336
20,03
Повышение
2.99E-05
AI688418
плексин A2
-3,9115
0,399609
19,85
Повышение
2.57E-03
NM_005739
Homo sapiens, RAS гуанил-высвобождающий белок 2 (регулируемый кальцием и диацилглицерином) (RASGRP2), мРНК. /PROD=RAS guanyl releasing protein 1 /FL=gb:AF081195.1 gb:NM_005739.2 gb:AF106071.1
-1,61054
2,680455
19,58
Повышение
1.10E-03
AW264204
Гены EST
-1,40826
2,851659
19,16
Повышение
6.31E-04
AB046770
Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1550, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1550 protein
0,007601
4,206081
18,36
Повышение
8.27E-05
N63706
Гены EST
-0,15629
4,036024
18,28
Повышение
5.42E-04
AI799018
Гены EST
-0,95386
3,225705
18,12
Повышение
2.80E-04
AF312769
Homo sapiens, криптическая мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cryptic /FL=gb:AF312769.1
-1,16952
2,986121
17,82
Повышение
2.56E-02
NM_001343
Homo sapiens, гена disabled (Drosophila) гомолог 2 (реагирующий на митоген фосфопротеин) (DAB2), мРНК. /PROD=disabled (Drosophila) homolog 2 /FL=gb:U39050.1 gb:NM_001343.1 gb:U53446.1 gb:BC003064.1
-0,68225
3,470947
17,79
Повышение
9.21E-05
N48299
Гены EST со средней степенью подобия с NFY-C (H.sapiens)
1,861693
6,008305
17,71
Повышение
2.22E-04
AI374739
Гены EST
0,366041
4,503789
17,6
Повышение
2.15E-04
AI242583
Homo sapiens, кДНК: FLJ11550 fis, клон HEMBA1002970
0,420056
4,533726
17,31
Повышение
7.27E-05
NM_012242
Homo sapiens, гена dickkopf (Xenopus laevis) гомолог (DKK1), мРНК. /PROD=dickkopf (Xenopus laevis) homolog 1 /FL=gb:AF177394.1 gb:NM_012242.1 gb:AF127563.1
-2,64131
1,459191
17,15
Повышение
3.06E-02
AU157303
Гены EST
-1,39277
2,690011
16,94
Повышение
1.61E-04
AI629041
Гены EST
-0,88175
3,200899
16,94
Повышение
1.09E-03
AI650874
Гены EST
-2,14545
1,935001
16,92
Повышение
3.05E-03
NM_015831
Homo sapiens, ацетилхолинэстераза (группа крови YT) (ACHE), вариант транскрипта E4-E5, мРНК. /PROD=acetylcholinesterase PI-linked form precursor /FL=gb:NM_015831.1
-0,5777
3,489676
16,76
Повышение
7.55E-04
BC036592
Homo sapiens, клон IMAGE:4814184, мРНК.
-3,18582
0,860182
16,52
Повышение
1.89E-03
AI991033
гепаран-сульфат протеогликан 2 (perlecan) /FL=gb:M85289.1 gb:NM_005529.2
0,041468
4,081945
16,46
Повышение
6.89E-04
BF130943
Гены EST
-1,6164
2,402639
16,21
Повышение
8.12E-03
X00452
Человеческая мРНК для альфа-цепи антигена гистосовместимости DC, класс II. /PROD=DC classII histocompatibility antigenalpha-chain
-0,70855
3,310445
16,21
Повышение
8.09E-04
AI917371
Гены EST
1,186033
5,204849
16,21
Повышение
2.18E-04
AI627704
Гены EST с низкой степенью подобия с T17346, гипотетическим белком DKFZp586O1624.1 (H.sapiens)
-2,70961
1,305453
16,17
Повышение
1.75E-02
AK055534
Homo sapiens, кДНК: FLJ30972 fis, клон HEART2000492.
1,192657
5,206164
16,15
Повышение
6.23E-04
NM_024641
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ12838 (FLJ12838), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ12838 /FL=gb:NM_024641.1
-0,41626
3,581554
15,98
Повышение
4.74E-04
BF110534
Гены EST
-0,29145
3,703489
15,94
Повышение
3.27E-04
AI197932
Гены EST
-0,20099
3,787591
15,87
Повышение
4.75E-04
BF984830
индуцируемый ретиноевой кислотой белок 1
-0,62897
3,35485
15,82
Повышение
1.12E-02
AI694545
Гены EST
3,042634
7,019598
15,75
Повышение
2.39E-05
NM_005442
Homo sapiens, гомолог эомезодермина (Xenopus laevis) (EOMES), мРНК. /PROD=eomesodermin (Xenopus laevis) homolog /FL=gb:AB031038.1 gb:NM_005442.1
0,500662
4,465346
15,61
Повышение
5.59E-04
AB043703
Homo sapiens, FZD8 мРНК для 7-трансмембранного рецептора Frizzled-8, полная кодовая последовательность. /PROD=seven-transmembrane receptor Frizzled-8 /FL=gb:AB043703.1
-2,81453
1,143479
15,54
Повышение
4.26E-02
BC014585
Homo sapiens, клон IMAGE:4047715, мРНК.
-0,27888
3,6716
15,46
Повышение
7.27E-05
NM_003078
Homo sapiens, связанный с SWISNF, ассоциированный с матриксом, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство d, член 3 (SMARCD3), мРНК. /PROD=SWISNF related, matrix associated, actindependent regulator of chromatin, subfamily d, member 3 /FL=gb:NM_003078.1 gb
2,377335
6,2969
15,13
Повышение
7.27E-05
NM_005328
Homo sapiens, гиалуронансинтаза 2 (HAS2), мРНК. /PROD=hyaluronan synthase 2 /FL=gb:U54804.1 gb:NM_005328.1
-2,84061
1,073185
15,07
Повышение
1.33E-03
AI123532
Гены EST
0,81871
4,722909
14,97
Повышение
2.18E-04
X06268
Человеческая мРНК для 3-конца C-терм. тройного геликоидного и C-терминального негеликоидного домена про-альфа 1 (II) коллагена (313 AA; AA 975-271c) /FL=gb:NM_001844.2
3,2061
7,080736
14,67
Повышение
2.00E-05
NM_006681
Homo sapiens, нейромедин U (NMU), мРНК. /PROD=neuromedin U /FL=gb:NM_006681.1
-0,60671
3,260587
14,59
Повышение
2.39E-03
NM_000458
Homo sapiens, транскрипционный фактор 2, гепатический; LF-B3; вариант гепатический ядерный фактор (TCF2), вариант транскрипта a, мРНК. /PROD=transcription factor 2, isoform a /FL=gb:NM_000458.1
-3,75063
0,097574
14,4
Повышение
2.53E-03
AW243154
Гены EST
-0,66587
3,17829
14,36
Повышение
2.94E-04
NM_001362
Homo sapiens, деиодиназа, иодотиронин, тип III (DIO3), мРНК. /PROD=thyroxine deiodinase type III /FL=gb:NM_001362.1 gb:S79854.1
-2,17973
1,654509
14,26
Повышение
7.81E-04
BE379542
связывающий ДНК хромодоменгеликазы белок 3 /FL=gb:U91543.1
-0,40798
3,424074
14,24
Повышение
3.78E-04
AI143879
фосфодиэстераза 10A /FL=gb:AB020593.1 gb:AF127479.1 gb:NM_006661.1
1,194285
5,026057
14,24
Повышение
4.81E-04
NM_001898
Homo sapiens, цистатин SN (CST1), мРНК. /PROD=cystatin SN /FL=gb:J03870.1 gb:NM_001898.1
-0,22337
3,603991
14,2
Повышение
1.24E-03
NM_021822
Homo sapiens, форболин-подобный белок MDS019 (MDS019), мРНК. /PROD=phorbolin-like protein MDS019 /FL=gb:AF182420.1 gb:NM_021822.1
-3,47125
0,352559
14,16
Повышение
3.65E-02
BF114815
Гены EST
-3,95752
-0,14384
14,06
Повышение
1.63E-02
NM_001432
Homo sapiens, эпирегулин (EREG), мРНК. /PROD=epiregulin precursor /FL=gb:D30783.1 gb:NM_001432.1
-1,83999
1,973187
14,06
Повышение
2.96E-04
AK074453
Homo sapiens, кДНК: FLJ23873 fis, клон LNG12941.
-2,9769
0,834997
14,04
Повышение
2.11E-02
AW612111
Гены EST
-1,92059
1,887684
14,01
Повышение
1.43E-03
AI738662
гомеобокс HB9 /FL=gb:NM_005515.1
1,868094
5,672805
13,97
Повышение
7.78E-05
H92988
белок активации тирозин 3-монооксигеназы/триптофан 5-монооксигеназы, полипептид-эта
-1,42171
2,367519
13,83
Повышение
1.18E-04
NM_005010
Homo sapiens, молекула нейрональной клеточной адгезии (NRCAM), мРНК. /PROD=neuronal cell adhesion molecule /FL=gb:AB002341.1 gb:NM_005010.1
-3,18081
0,59108
13,66
Повышение
6.34E-04
AW449813
белок KIAA0918
-0,11092
3,655377
13,61
Повышение
1.43E-04
BF591483
Гены EST
-1,74597
2,018156
13,59
Повышение
1.45E-02
AW269818
гипотетический белок FLJ23403 /FL=gb:NM_022068.1
1,59762
5,358013
13,55
Повышение
9.35E-04
NM_018649
Homo sapiens, коровый гистон macroH2A2.2 (MACROH2A2), мРНК. /PROD=core histone macroH2A2.2 /FL=gb:AF151534.1 gb:NM_018649.1
-2,85208
0,904726
13,52
Повышение
4.53E-03
AI423201
Гены EST
-1,68521
2,068725
13,49
Повышение
3.53E-03
NM_002770
Homo sapiens, протеаза, серин, 2 (трипсин 2) (PRSS2), мРНК. /PROD=protease, serine, 2 (trypsin 2) /FL=gb:M27602.1 gb:NM_002770.1
0,753353
4,506029
13,48
Повышение
1.83E-05
NM_021827
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ23514 (FLJ23514), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ23514 /FL=gb:NM_021827.1
-1,54589
2,19498
13,37
Повышение
7.14E-03
AW088232
Гены EST
-2,06656
1,672721
13,35
Повышение
5.12E-03
AF141339
Homo sapiens, взаимодействующий с LYST белок LIP3, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=LYST-interacting protein LIP3
1,696658
5,415977
13,17
Повышение
8.38E-04
L01639
Человеческий (клон HSY3RR) рецептор к нейропептиду Y, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=neuropeptide Y receptor /FL=gb:L06797.1 gb:NM_003467.1 gb:AF025375.1 gb:AF147204.1 gb:M99293.1 gb:L01639.1
1,633768
5,346711
13,11
Повышение
2.39E-05
AI733465
коллаген, тип IX, альфа 2 /FL=gb:NM_001852.1
-0,65009
3,058078
13,07
Повышение
1.17E-04
NM_017931
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ20699 (FLJ20699), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ20699 /FL=gb:NM_017931.1
0,661121
4,360957
12,99
Повышение
1.08E-04
AA502609
Homo sapiens, анкирин-подобный белок с трансмембранными доменами 1 (ANKTM1), мРНК
1,048741
4,74741
12,98
Повышение
4.60E-04
NM_001899
Homo sapiens, цистатин S (CST4), мРНК. /PROD=cystatin S /FL=gb:NM_001899.1
-2,19527
1,501137
12,96
Повышение
1.06E-03
NM_013333
Homo sapiens, связывающий EH-домен митотический фосфопротеин (EPSIN), мРНК. /PROD=EH domain-binding mitotic phosphoprotein /FL=gb:NM_013333.1 gb:AF073727.1
-2,89467
0,794807
12,9
Повышение
7.39E-03
AW971205
Гены EST
-3,30412
0,383694
12,89
Повышение
3.93E-02
AU157224
Homo sapiens, кДНК: FLJ11570 fis, клон HEMBA1003309
1,223968
4,90936
12,87
Повышение
8.70E-05
AL574912
Гены EST с низкой степенью подобия с серин-протеазой (H.sapiens)
-2,30432
1,381011
12,86
Повышение
3.92E-02
BC017958
Homo sapiens, клон IMAGE:4607409, мРНК.
2,593137
6,238337
12,51
Повышение
2.99E-05
NM_001873
Homo sapiens, карбоксипептидаза E (CPE), мРНК. /PROD=carboxypeptidase E precursor /FL=gb:NM_001873.1
-1,43446
2,199521
12,41
Повышение
9.27E-03
AW291482
Гены EST
0,151239
3,777599
12,35
Повышение
1.16E-04
BE644809
Гены EST
-0,07494
3,527775
12,15
Повышение
9.39E-05
NM_001394
Homo sapiens, двойной специфичности фосфатаза 4 (DUSP4), мРНК. /PROD=dual specificity phosphatase 4 /FL=gb:NM_001394.2 gb:BC002671.1 gb:U48807.1 gb:U21108.1
-2,56291
1,033178
12,09
Повышение
1.48E-02
BG532690
интегрин, альфа 4 (антиген CD49D, субъединица альфа 4 рецептора VLA-4)
-3,10679
0,486734
12,07
Повышение
8.34E-04
N59476
Гены EST
-1,71673
1,874627
12,05
Повышение
9.46E-04
NM_000420
Homo sapiens, белок группы крови Келла (KEL), мРНК. /PROD=Kell blood group antigen /FL=gb:BC003135.1 gb:NM_000420.1
1,071985
4,656957
12
Повышение
6.98E-05
NM_004560
Homo sapiens, побочный рецептор, подобный рецептору тирозинкиназы 2 (ROR2), мРНК. /PROD=receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 2 /FL=gb:M97639.1 gb:NM_004560.1
-0,05814
3,51961
11,94
Повышение
8.07E-04
BF308645
белок KIAA1415
0,581614
4,158253
11,93
Повышение
1.95E-04
AF005775
Homo sapiens, каспаза-подобный регулирующий апоптоз белок 2 (clarp), мРНК, продукт альтернативного сплайсинга, полная кодовая последовательность. /PROD=caspase-like apoptosis regulatory protein 2 /FL=gb:AF005775.1
-3,51603
0,057356
11,9
Повышение
2.99E-02
AV724769
Гены EST
-1,99136
1,57545
11,85
Повышение
8.72E-03
AL109653
Последовательность человеческой ДНК от клонирования GS1-115M3 на хромосоме Xq27.1-28. Содержит ген нового белка CXorf1 (хромосома X, открытая рамка считывания 1), гены EST, STS, GSS и островок CpG
0,454394
4,013479
11,79
Повышение
3.30E-04
AL036088
белок KIAA1479
-0,41994
3,13818
11,78
Повышение
2.73E-03
AI686957
белок KIAA1494
1,355965
4,912341
11,76
Повышение
2.16E-04
AI141603
коллаген, тип VI, альфа 1
-2,33835
1,203342
11,65
Повышение
2.16E-02
L33477
Человеческий (клон 8B1) Br-кадгерин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Br-cadherin /FL=gb:L34057.1 gb:L33477.1 gb:NM_004061.1
2,453593
5,992042
11,62
Повышение
5.24E-05
NM_005410
Homo sapiens, селенопротеин P, плазма, белок 1 (SEPP1), мРНК. /PROD=selenoprotein P precursor /FL=gb:NM_005410.1
0,240245
3,777926
11,61
Повышение
8.44E-04
BF940761
Гены EST
-0,28951
3,242447
11,57
Повышение
3.11E-04
NM_018388
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ11316 (FLJ11316), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ11316 /FL=gb:NM_018388.1
-0,10881
3,416108
11,51
Повышение
3.44E-04
AA701657
гипотетический белок FLJ12666
-1,17666
2,334376
11,4
Повышение
7.27E-04
NM_024633
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ21276 (FLJ21276), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ21276 /FL=gb:NM_024633.1
2,59334
6,102285
11,38
Повышение
6.58E-05
AA045184
рибосомальный белок L14
0,451744
3,95936
11,37
Повышение
2.79E-04
NM_001399
Homo sapiens, эктодермальной дисплазии белок 1, ангидротический (ED1), мРНК. /PROD=ectodermal dysplasia 1, anhidrotic /FL=gb:AF060999.1 gb:NM_001399.1 gb:AF040628.1 gb:AF061189.1
1,040647
4,542431
11,33
Повышение
6.98E-05
AI348094
белок KIAA0882
-1,24923
2,248992
11,3
Повышение
1.02E-03
R42166
Гены EST с низкой степенью подобия с AXO1_HUMAN, ПРЕДШЕСТВЕННИКОМ АКСОНИНА-1 (H.sapiens)
0,414809
3,908697
11,27
Повышение
2.78E-04
NM_016179
Homo sapiens, временный рецепторный потенциальный канал 4 (TRPC4), мРНК. /PROD=transient receptor potential 4 /FL=gb:NM_016179.1 gb:AF175406.1
-2,9904
0,493882
11,19
Повышение
2.79E-04
U96136
Homo sapiens, дельта-катенин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=delta-catenin /FL=gb:NM_001332.1 gb:U72665.1 gb:AB013805.1 gb:U96136.1 gb:AF035302.1
1,076427
4,559689
11,18
Повышение
1.88E-04
AI640307
протокадгерин 10
-1,08244
2,395089
11,14
Повышение
2.32E-03
X75208
X75208 /FEATURE=cds /DEFINITION=HSPTKR H.sapiens HEK2 мРНК для рецептора протеинтирозинкиназы
-1,25121
2,224638
11,13
Повышение
3.78E-04
R62432
Кластер включает R62432:yg52e11.s1 Homo sapiens, кДНК, 3-конец /clone=IMAGE-36023 /clone_end=3 /gb=R62432 /gi=834311 /ug=Hs.12321 /len=487
0,631332
4,097155
11,05
Повышение
3.78E-04
AI130705
Гены EST с низкой степенью подобия с A46302, фактором сплайсинга, ассоциированным с PTB, длинная форма (H.sapiens)
1,438639
4,903827
11,04
Повышение
9.39E-05
BF223214
Гены EST
0,120924
3,584799
11,03
Повышение
9.41E-05
NM_001529
Homo sapiens, экспрессируемый в кроветворных клетках гомеобокс (HHEX), мРНК. /PROD=hematopoietically expressed homeobox /FL=gb:NM_001529.1 gb:L16499.1 gb:NM_002729.1
1,316429
4,768005
10,94
Повышение
1.37E-04
AI769688
Homo sapiens, клон 23664 и 23905, последовательность мРНК
0,449933
3,898646
10,92
Повышение
3.56E-03
Z21533
H.sapiens, ген HEX, кодирующий связанный с гомеобоксом белок. /PROD=homeobox related protein
2,383898
5,826754
10,87
Повышение
2.39E-05
BF476502
гипотетический белок FLJ11585
-2,21968
1,214412
10,81
Повышение
2.00E-02
AA946876
Гены EST
0,999053
4,427902
10,77
Повышение
2.39E-04
AW129593
белок с повторяющимися tudor-доменами, ассоциирующийся с PCTAIRE 2
1,750623
5,17881
10,76
Повышение
7.27E-05
AA176289
Гены EST
0,502333
3,925314
10,73
Повышение
2.47E-03
AF211891
Homo sapiens, Mix-like homeobox protein 1 (MILD1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Mix-like homeobox protein 1 /FL=gb:AF211891.1
-2,15454
1,256699
10,64
Повышение
4.44E-02
NM_012082
Homo sapiens, белок Friend of GATA2 (FOG2), мРНК. /PROD=Friend of GATA2 /FL=gb:NM_012082.2 gb:AF119334.1
-0,23726
3,166937
10,59
Повышение
3.27E-04
AA912476
Homo sapiens, кДНК: FLJ13221 fis, клон NT2RP4002075
-2,38435
1,018436
10,58
Повышение
1.74E-03
AI743137
Гены EST
-1,83333
1,555259
10,47
Повышение
5.26E-03
NM_006501
Homo sapiens, ассоциированный с миелином основной белок олигодендроцитов (MOBP), мРНК. /PROD=myelin-associated oligodendrocyte basic protein /FL=gb:D28113.1 gb:NM_006501.1
2,168853
5,557183
10,47
Повышение
2.75E-04
AA284532
белок активации тирозин 3-монооксигеназы/триптофан 5-монооксигеназы, полипептид-эта
-1,0335
2,347369
10,42
Повышение
9.35E-04
AL553774
белок KIAA1462
-1,78964
1,575618
10,3
Повышение
2.04E-02
NM_004861
Homo sapiens, цереброзид (3-фосфоаденилсульфат:галактозилкерамид 3) сульфотрансфераза (CST), мРНК. /PROD=galactosylceramide sulfotransferase /FL=gb:NM_004861.1 gb:D88667.1
-3,12055
0,243075
10,29
Повышение
2.31E-02
AW780006
Гены EST
2,194421
5,519803
10,02
Повышение
8.38E-04
AF348491
Homo sapiens, рецептор хемокина CXCR4, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=chemokine receptor CXCR4 /FL=gb:AF348491.1
-0,75724
2,561949
9,98
Повышение
5.19E-03
AL445192
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-269H4 на хромосоме 20. Содержит 3-конец гена KIAA1415, подобный индуцирующему заражение и метастазирование Т-лимфомы белку-1, гены EST, STS и GSS
-0,92287
2,395505
9,98
Повышение
3.26E-04
AA443280
Гены EST с высокой степенью подобия с миозином класса III AF229172, белок 1 (H.sapiens)
-0,38837
2,924326
9,94
Повышение
6.37E-04
BE551088
Гены EST
-1,06796
2,241523
9,91
Повышение
3,97E-02
AW664179
гипотетический белок MGC4342 /FL=gb:NM_024329.1 gb:BC003033.1
-0,65031
2,656212
9,89
Повышение
1.16E-04
AI760630
Гены EST
-0,2425
3,063759
9,89
Повышение
1.10E-04
NM_018286
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10970 (FLJ10970), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10970 /FL=gb:NM_018286.1
4,042679
7,345476
9,87
Повышение
3.22E-04
NM_005454
Homo sapiens, гомолог гена cerberus 1 (Xenopus laevis) (суперсемейство белков с цистеиновым узлом) (CER1), мРНК. /PROD=cerberus 1 /FL=gb:NM_005454.1
0,561438
3,86147
9,85
Повышение
3,49E-04
BF968270
Гены EST
-2,62694
0,672523
9,85
Повышение
8.33E-03
NM_000055
Homo sapiens, бутирилхолинэстераза (BCHE), мРНК. /PROD=butyrylcholinesterase precursor /FL=gb:M16541.1 gb:M16474.1 gb:NM_000055.1
-1,75731
1,539959
9,83
Повышение
3.37E-02
BC008992
Homo sapiens, клон MGC:16926 IMAGE:4183000, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:16926) /FL=gb:BC008992.1
3,287037
6,580588
9,81
Повышение
7.27E-05
AI633559
Гены EST
-1,20714
2,08291
9,78
Повышение
3.66E-03
BC042378
Homo sapiens, клон IMAGE:5277693, мРНК.
0,937118
4,225755
9,77
Повышение
7.27E-05
AU151342
Homo sapiens, кДНК: FLJ12935 fis, клон NT2RP2004982
0,447082
3,734688
9,76
Повышение
1.61E-04
NM_014942
Homo sapiens, белок KIAA0957 (KIAA0957), мРНК. /PROD=KIAA0957 protein /FL=gb:AB023174.1 gb:NM_014942.1
-3,09265
0,191299
9,74
Повышение
6.04E-03
AI093492
Гены EST
-2,20597
1,071614
9,7
Повышение
1.05E-02
AI968904
Гены EST
1,370117
4,641246
9,65
Повышение
7.27E-05
M33653
Человеческий (клоны HT-(125,133)) альфа-2 тип IV коллаген (COL4A2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=alpha-2 type IV collagen /FL=gb:M33653.1
0,205308
3,457432
9,53
Повышение
1.55E-04
BF509230
Гены EST
1,380324
4,628332
9,5
Повышение
3.46E-04
NM_006895
Homo sapiens, гистамин N-метилтрансфераза (HNMT), мРНК. /PROD=histamine N-methyltransferase /FL=gb:NM_006895.1 gb:D16224.1 gb:U08092.1
0,1187
3,354157
9,42
Повышение
2.39E-05
N21184
Кластер включает N21184:yx41a10.s1 Homo sapiens, кДНК, 3-конец /clone=IMAGE-264282 /clone_end=3 /gb=N21184 /gi=1126354 /ug=Hs.93605 /len=619
-0,30596
2,924622
9,39
Повышение
1.42E-03
BC029835
Homo sapiens, клон IMAGE:5169759, мРНК.
1,008383
4,233261
9,35
Повышение
1.84E-04
BE397715
транскрипционный фактор 2 лейкемии предшественников В-клеток /FL=gb:NM_002586.1
-1,28081
1,941655
9,33
Повышение
1.10E-03
NM_001735
Homo sapiens, компонент комплемента 5 (C5), мРНК. /PROD=complement component 5 /FL=gb:M57729.1 gb:NM_001735.1
-1,80959
1,41238
9,33
Повышение
3.47E-03
BF447246
белок KIAA0960
0,378586
3,596764
9,31
Повышение
3.90E-05
BF109231
Гены EST
-1,17885
2,035986
9,28
Повышение
1.34E-03
AB002155
Homo sapiens, мРНК для человеческого уроплакина Ib, полная кодовая последовательность. /PROD=human uroplakin Ib /FL=gb:NM_006952.1 gb:AB015234.1 gb:AF042331.1 gb:AB002155.1
-2,84187
0,3707
9,27
Повышение
2.06E-03
NM_002244
Homo sapiens, калиевый выпрямляющийся внутрь канал, подсемейство J, ингибитор 1 (KCNJN1), мРНК. /PROD=potassium inwardly-rectifying channel, subfamilyJ, inhibitor 1 /FL=gb:NM_002244.1
0,442286
3,651458
9,25
Повышение
6.22E-04
NM_001778
Homo sapiens, CD48 антиген (B-клеточный мембранный белок) (CD48), мРНК. /PROD=CD48 antigen (B-cell membrane protein) /FL=gb:NM_001778.1 gb:M37766.1 gb:M59904.1
-1,58477
1,612357
9,17
Повышение
3.93E-03
NM_016341
Homo sapiens, обильная в поджелудочной железе фосфолипаза C (LOC51196), мРНК. /PROD=pancreas-enriched phospholipase C /FL=gb:AF117948.1 gb:NM_016341.1 gb:AF190642.2
0,798972
3,993241
9,15
Повышение
2.02E-05
AI082827
гипотетический белок FLJ11585
-1,39976
1,793953
9,15
Повышение
8.10E-04
NM_005204
Homo sapiens, митоген-активированной протеинкиназы киназы киназы киназа 8 (MAP3K8), мРНК. /PROD=mitogen-activated protein kinase kinase kinase8 /FL=gb:NM_005204.1 gb:D14497.1
-1,2719
1,918316
9,13
Повышение
2.22E-03
NM_020406
Homo sapiens, истинная первичная полицитемия, белок 1; рецептор на поверхности клетки (PRV1), мРНК. /PROD=polycythemia rubra vera 1; cell surfacereceptor /FL=gb:NM_020406.1 gb:AF146747.1
-1,20098
1,986443
9,11
Повышение
7.28E-03
NM_001794
Homo sapiens, кадгерин 4, тип 1, R-кадгерин (сетчаточный) (CDH4), мРНК. /PROD=cadherin 4, type 1, R-cadherin (retinal) /FL=gb:L34059.1 gb:NM_001794.1
0,270283
3,456007
9,1
Повышение
1.24E-03
AI690433
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434K0621 (из клона DKFZp434K0621); частичная кодовая последовательность
-3,14727
0,038057
9,1
Повышение
4.46E-02
NM_001147
Homo sapiens, ангиопоэтин 2 (ANGPT2), мРНК. /PROD=angiopoietin 2 /FL=gb:AB009865.1 gb:AF004327.1 gb:NM_001147.1
-2,65285
0,529695
9,08
Повышение
5.20E-04
BE549700
Гены EST
-0,70603
2,476147
9,08
Повышение
2.75E-04
X02162
Человеческая мРНК для аполипопротеина AI (apo AI)=. /PROD=preproapolipoprotein AI
0,134434
3,31354
9,06
Повышение
7.31E-05
AV758821
Гены EST с низкой степенью подобия с Z132_HUMAN, ЦИНК-ПАЛЬЦЕВЫМ БЕЛКОМ 13 (H.sapiens)
1,488455
4,666225
9,05
Повышение
2.39E-05
NM_000177
Homo sapiens, гельсолин (финский амилоидоз) (GSN), мРНК. /PROD=gelsolin (amyloidosis, Finnish type) /FL=gb:NM_000177.1
0,37879
3,553097
9,03
Повышение
2.78E-04
BC039295
Homo sapiens, подобный подавляемому Ctnnb1 белку, a, клон MGC:39518 IMAGE:5267063, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Similar to down-regulated by Ctnnb1, a /FL=gb:BC039295.1
-2,03929
1,12953
8,99
Повышение
1.03E-02
NM_003855
Homo sapiens, интерлейкина 18 рецептор 1 (IL18R1), мРНК. /PROD=interleukin 18 receptor 1 /FL=gb:NM_003855.1 gb:U43672.1
-1,95127
1,210788
8,95
Повышение
6.65E-03
L12468
Homo sapiens, аминопептидаза A, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=aminopeptidase A /FL=gb:L12468.1 gb:NM_001977.1 gb:L14721.1
-3,03451
0,120756
8,91
Повышение
1.30E-03
BF432875
Гены EST
0,219552
3,367037
8,86
Повышение
1.61E-04
BE856336
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp761G151 (из клона DKFZp761G151); частичная кодовая последовательность
1,091867
4,237655
8,85
Повышение
3.97E-03
NM_004765
Homo sapiens, хроническая лимфоцитарная лейкемия B-клеток: семейство белков лимфома 7, член C (BCL7C), мРНК. /PROD=B-cell CLLlymphoma 7C /FL=gb:NM_004765.1
-1,37872
1,766362
8,85
Повышение
2.81E-03
AF063825
Homo sapiens, урезанный вариант-дельта связанного с trp белка 4, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=trp-related protein 4 truncated variant gamma /FL=gb:AF063825.1
-0,88126
2,263541
8,84
Повышение
1.10E-03
BC014364
Homo sapiens, клон MGC:24252 IMAGE:3932604, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:24252) /FL=gb:BC014364.1
0,345528
3,488906
8,84
Повышение
1.32E-04
AW276186
главный комплекс гистосовместимости (MHC), класс II, DQ бета 1
-1,23083
1,909333
8,82
Повышение
3.54E-05
AF063824
Homo sapiens, урезанный вариант-дельта связанного с trp белка 4, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=trp-related protein 4 truncated variant delta /FL=gb:AF063824.1
-0,95126
2,187719
8,81
Повышение
8.38E-04
NM_021170
Homo sapiens, bHLH фактор Hes4 (LOC57801), мРНК. /PROD=bHLH factor Hes4 /FL=gb:NM_021170.1 gb:AB048791.1
1,979568
5,115328
8,79
Повышение
1.83E-05
M17565
Человеческий MHC, класс II, DQ-beta, ассоциированный с DRw6, белок DQw1, полная кодовая последовательность. /FL=gb:M17565.1
1,425392
4,555892
8,76
Повышение
1.10E-03
AB018195
Homo sapiens, ca xi мРНК для ассоциированного с карбоангидразой белка XI, полная кодовая последовательность. /PROD=carbonic anhydrase-related protein XI /FL=gb:NM_001217.2 gb:AB018195.1 gb:BC002662.1 gb:AF067662.1
-0,94697
2,181933
8,75
Повышение
8.53E-03
BG208091
Homo sapiens, кДНК: FLJ37414 fis, клон BRAWH1000157.
-2,29059
0,832807
8,71
Повышение
1.45E-03
NM_000110
Homo sapiens, дигидропиримидин-дегидрогеназа (DPYD), мРНК. /PROD=dihydropyrimidine dehydrogenase /FL=gb:AB003063.1 gb:U09178.1 gb:NM_000110.2 gb:U20938.1
1,409091
4,531365
8,71
Повышение
3.78E-04
AF026219
Homo sapiens, белок HP (HP), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=HP protein /FL=gb:AF026219.1 gb:AF035119.1 gb:NM_006094.2
0,038661
3,158562
8,69
Повышение
1.38E-02
AL831967
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp451H072 (из клона DKFZp451H072); полная кодовая последовательность. /FL=gb:AL831967.1
-0,75335
2,363345
8,67
Повышение
7.05E-03
AK023900
Homo sapiens, кДНК: FLJ13838 fis, клон THYRO1000756, с низкой степенью подобия с АЛЬФА-N-АЦЕТИЛГАЛАКТОЗАМИНИД АЛЬФА-2,6-СИАЛИЛТРАНСФЕРАЗОЙ (EC 2.4.99.-). /FL=gb:NM_013443.1 gb:AB035173.1
-3,56757
-0,45104
8,67
Повышение
3.25E-03
R43486
Гены EST
2,377686
5,491345
8,66
Повышение
5.61E-05
NM_000222
Homo sapiens, гомолог гена v-kit Харди-Цукермана 4 вирусного онкогена кошачьей саркомы (KIT), мРНК. /PROD=v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viraloncogene homolog precursor /FL=gb:NM_000222.1
3,409815
-4,69755
275,78
Снижение
7.78E-05
NM_016588
Homo sapiens, нейритин (LOC51299), мРНК. /PROD=neuritin /FL=gb:NM_016588.1 gb:BC002683.1 gb:AF136631.1
2,62025
-3,04157
50,63
Снижение
2.62E-04
AA625683
Гены EST
4,897427
-0,73179
49,5
Снижение
3.89E-04
R06655
Гены EST со средней степенью подобия с белком AF078844 1 hqp0376 (H.sapiens)
3,77776
-1,65937
43,32
Снижение
9.82E-04
BU729850
гипотетический белок LOC153469
0,757197
-4,31965
33,75
Снижение
9.91E-03
AF213459
Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
3,025351
-1,38311
21,24
Снижение
1.78E-03
AW590925
Гены EST
2,350127
-1,99242
20,29
Снижение
2.82E-04
AK026106
Homo sapiens, кДНК: FLJ22453 fis, клон HRC09679, с высокой степенью подобия cAF059516, мРНК толлоид-подобного белка 2 (TLL2), Homo sapiens.
0,860464
-3,44694
19,8
Снижение
1.25E-02
NM_003007
Homo sapiens, семеногелин I (SEMG1), мРНК. /PROD=semenogelin I /FL=gb:J04440.1 gb:NM_003007.1
0,579765
-3,42804
16,09
Снижение
1.83E-03
AI393930
Гены EST
4,507212
0,732117
13,69
Снижение
6.09E-05
AW196940
Гены EST
3,862686
0,237876
12,34
Снижение
1.03E-03
NM_007115
Homo sapiens, индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 (TNFAIP6), мРНК. /PROD=tumor necrosis factor, alpha-induced protein 6 /FL=gb:NM_007115.1
2,36447
-1,22861
12,07
Снижение
2.57E-04
NM_005181
Homo sapiens, карбоангидраза III, специфичная для мышц (CA3), мРНК. /PROD=carbonic anhydrase III /FL=gb:BC004897.1 gb:NM_005181.2
3,113698
-0,4652
11,95
Снижение
1.17E-04
NM_002196
Homo sapiens, ассоциированный с инсулиномой белок 1 (INSM1), мРНК. /PROD=insulinoma-associated 1 /FL=gb:NM_002196.1 gb:M93119.1
1,05854
-2,46305
11,48
Снижение
2.94E-02
AI703321
белок типа wingless семейства сайта интеграции MMTV, член 5A
3,557525
0,041029
11,44
Снижение
2.62E-04
BF514079
Kruppel-подобный фактор 4 (кишечный)
3,806044
0,419409
10,46
Снижение
7.75E-04
AV734646
Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
2,64743
-0,69932
10,17
Снижение
2.48E-03
AI702438
Гены EST
3,030236
-0,17175
9,2
Снижение
4.80E-03
AA812232
стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
5,023981
1,931575
8,53
Снижение
1.95E-04
NM_006472
Homo sapiens, стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 (VDUP1), мРНК. /PROD=upregulated by 1,25-dihydroxyvitamin D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
6,426778
3,371755
8,31
Снижение
2,62E-04
AF313413
Homo sapiens, предполагаемый малый трансмембранный белок NID67, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=putative small membrane protein NID67 /FL=gb:AF313413.1
-0,42962
-3,45743
8,16
Снижение
2.90E-02
D28364
Человеческая мРНК для аннексина II, 5UTR (последовательность от 5cap до стартового кодона).
2,367534
-0,64534
8,07
Снижение
2.77E-02
AF098641
Homo sapiens, CD44 изоформа RC (CD44), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=CD44 isoform RC /FL=gb:AF098641.1
5,13621
2,189627
7,71
Снижение
2.78E-03
BC013944
Homo sapiens, подобный миозину, тяжелый полипептид 7, сердечная мышца, бета, клон IMAGE:4064393, мРНК.
2,951696
0,005808
7,71
Снижение
1.79E-02
AB019562
Homo sapiens, мРНК, экспрессируемая только в ворсинах плаценты, клон SMAP41.
6,568635
3,642312
7,6
Снижение
2.61E-04
AL031602
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-1174N9 на хромосоме 1p34.1-35.3. Содержит ген нового белка с доменом IBR, ген (псевдо?) нового белка, сходного с MT1E (металлотионеин 1E (функциональный)), гены EST, STS, GSS и два предполагаемых Cp...
0,237018
-2,68848
7,6
Снижение
1.69E-02
NM_002852
Homo sapiens, связанный с пентаксином ген, быстро индуцируемый IL-1 бета (PTX3), мРНК. /PROD=pentaxin-related gene, rapidly induced by IL-1beta /FL=gb:M31166.1 gb:NM_002852.1
3,094055
0,187515
7,5
Снижение
7.78E-05
AW188198
индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 /FL=gb:NM_007115.1
0,510307
-2,36971
7,36
Снижение
5.02E-02
AI040887
Гены EST
2,514693
-0,35098
7,29
Снижение
5.77E-05
NM_145032
Homo sapiens, гипотетический белок MGC21636 (MGC21636), мРНК. /FL=gb:BC020572.1 gb:NM_145032.2
5,356771
2,49399
7,27
Снижение
2.39E-04
W92036
Гены EST
4,622217
1,771706
7,21
Снижение
4.89E-05
AL537457
нейрофиламент, легкий полипептид (68 кДа) /FL=gb:NM_006158.1
7,360687
4,513462
7,2
Снижение
5.28E-04
BF217861
металлотионеин 1E (функциональный)
5,388254
2,562722
7,09
Снижение
4.27E-04
NM_004207
Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 (SLC16A3), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
3,462851
0,655394
7
Снижение
5.00E-04
BE673800
Гены EST со средней степенью подобия с белком KIAA1238 (H.sapiens)
4,749034
1,960178
6,91
Снижение
1.18E-02
NM_002130
Homo sapiens, 3-гидрокси-3-метилглутарил-Коэнзим A синтаза 1 (растворимая) (HMGCS1), мРНК. /PROD=3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 1(soluble) /FL=gb:NM_002130.1 gb:L25798.1 gb:BC000297.1
4,738703
1,971781
6,81
Снижение
7.81E-04
NM_014033
Homo sapiens, белок DKFZP586A0522 (DKFZP586A0522), мРНК. /PROD=DKFZP586A0522 protein /FL=gb:NM_014033.1
2,28595
-0,4498
6,66
Снижение
2.03E-03
BE504838
Гены EST
1,10782
-1,62775
6,66
Снижение
9.81E-04
BC029425
Homo sapiens, белок, подобный KIAA1275, клон IMAGE:4616553, мРНК.
4,092731
1,365462
6,62
Снижение
2.70E-04
AL513917
переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
3,437271
0,717704
6,59
Снижение
1.77E-04
AB029025
Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1102, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1102 protein
2,129273
-0,56464
6,47
Снижение
9.35E-04
AV734646
Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
3,508683
0,85988
6,27
Снижение
4.89E-05
AK027231
Homo sapiens, кДНК: FLJ23578 fis, клон LNG12709.
4,285883
1,64868
6,22
Снижение
4,39E-04
AL038787
6-фосфофрукто-2-киназафруктоза-2,6-бифосфатаза 4
4,847114
2,216008
6,2
Снижение
6.18E-03
NM_006474
Homo sapiens, ассоциированный с клеточной мембраной гликопротеин легочного типа-I (T1A-2), вариант транскрипта 2, мРНК. /PROD=lung type-I cell membrane-associatedglycoprotein, isoform 2 precursor /FL=gb:NM_006474.1 gb:AF030428.1
5,095598
2,488937
6,09
Снижение
5.96E-03
NM_005542
Homo sapiens, индуцируемый инсулином ген 1 (INSIG1), мРНК. /PROD=insulin induced gene 1 /FL=gb:NM_005542.1
0,547626
-2,03638
6
Снижение
2.43E-03
AI632015
переносчик растворенных веществ, семейство 12 (переносчики хлорида натрия и калия), член 1 /FL=gb:U58130.1 gb:NM_000338.1
3,127666
0,546103
5,99
Снижение
1.23E-03
NM_003577
Homo sapiens, недифференцированной эмбриональной клетки транскрипционный фактор 1 (UTF1), мРНК. /PROD=undifferentiated embryonic cell transcriptionfactor 1 /FL=gb:NM_003577.1 gb:AB011076.1
1,389794
-1,18154
5,94
Снижение
7.75E-04
BG498699
Гены EST
2,098906
-0,46916
5,93
Снижение
5.35E-03
NM_003914
Homo sapiens, циклин A1 (CCNA1), мРНК. /PROD=cyclin A1 /FL=gb:NM_003914.1 gb:U66838.1
1,361153
-1,18056
5,82
Снижение
5.68E-04
NM_014352
Homo sapiens, транскрипционный фактор POU (OCT11), мРНК. /PROD=POU transcription factor /FL=gb:NM_014352.1 gb:AF133895.1 gb:AF162278.1
4,308564
1,770347
5,81
Снижение
3.89E-04
NM_171999
Homo sapiens, sal-подобный белок 3 (Drosophila) (SALL3), мРНК. /PROD=sal-like 3 /FL=gb:NM_171999.1
2,798327
0,284755
5,71
Снижение
7.29E-03
BF062943
протокадгерин 18
4,255531
1,77831
5,57
Снижение
8.19E-04
AF096296
Homo sapiens, предшественник хемокина-1 стромы тимуса, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=thymic stroma chemokine-1 precursor /FL=gb:AF142434.1 gb:AF096296.1 gb:AF124601.1 gb:AB010447.1 gb:NM_006072.1
3,602406
1,138163
5,52
Снижение
2.16E-04
AI493245
антиген CD44 (функция хоуминга и система группы крови Indian)
1,892794
-0,57116
5,52
Снижение
8.90E-04
AL138349
белок KIAA0367
4,253624
1,806392
5,45
Снижение
2.55E-03
NM_003385
Homo sapiens, визинин-подобный белок 1 (VSNL1), мРНК. /PROD=visinin-like 1 /FL=gb:AF039555.1 gb:U14747.1 gb:AB001104.1 gb:NM_003385.1
4,055862
1,616613
5,42
Снижение
1.30E-03
AK026815
Homo sapiens, кДНК: FLJ23162 fis, клон LNG09734.
5,441963
3,012923
5,39
Снижение
5.89E-03
NM_016651
Homo sapiens, белок нового гена-3 гепатоклеточной карциномы (LOC51339), мРНК. /PROD=heptacellular carcinoma novel gene-3 protein /FL=gb:NM_016651.2 gb:AF251079.2
7,149479
4,725219
5,37
Снижение
2.79E-04
M10943
Человеческий If-ген металлотионеина (hMT-If)
4,590778
2,174965
5,34
Снижение
5.10E-04
BF055311
гипотетический белок
4,560288
2,150773
5,31
Снижение
4.80E-02
BF979497
скваленэпоксидаза
5,807319
3,418163
5,24
Снижение
4.84E-04
NM_018004
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10134 (FLJ10134), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10134 /FL=gb:NM_018004.1
7,224807
4,842369
5,21
Снижение
6.39E-04
NM_005951
Homo sapiens, металлотионеин 1H (MT1H), мРНК. /PROD=metallothionein 1H /FL=gb:NM_005951.1
7,144308
4,773705
5,17
Снижение
4.79E-04
BF246115
белок, связанный с РНК-геликазой
3,56272
1,19687
5,15
Снижение
2.14E-04
NM_003247
Homo sapiens, тромбоспондин 2 (THBS2), мРНК. /PROD=thrombospondin 2 /FL=gb:NM_003247.1 gb:L12350.1
3,280973
0,92641
5,11
Снижение
8.07E-04
AL139377
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-251J8 на хромосоме 13. Содержит гены EST, STS, GSS и островок CpG. Содержит два новых гена с двумя изоформами каждый, и ген KIAA0610 с двумя изоформами
2,770179
0,433532
5,05
Снижение
1.14E-04
AK000345
Homo sapiens, кДНК: FLJ20338 fis, клон HEP12179.
3,947271
1,623385
5,01
Снижение
6.54E-04
AI928035
Гены EST
H) Клетки линии H9 Р39 на 5 день стадии дифференцировки в сформированную эндодерму и клетки EXPRES 01- Значения интенсивности даны в формате Log2
EXPRES 01
5 ДЕНЬ СТАДИИ СЭ
Отношение
Направление
скорректир. значение p
Идентификатор гена
Название гена
-4,01441
5,124176
563,62
Повышение
2.04E-04
AB028021
Кластер включает AB028021:Homo sapiens, HNF-3 beta, мРНК для гепатоцитного ядерного фактора-3 бета, полная кодовая последовательность /cds=(196,1569) /gb=AB028021 /gi=4958949 /ug=Hs.155651 /len=1944
-2,90798
5,80468
419,54
Повышение
6.31E-05
NM_001643
Homo sapiens, аполипопротеин A-II (APOA2), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-II precursor /FL=gb:M29882.1 gb:NM_001643.1 gb:BC005282.1
-3,8752
4,686662
377,9
Повышение
9.07E-05
AB028021
Homo sapiens, HNF-3 beta, мРНК для гепатоцитного ядерного фактора-3 бета, полная кодовая последовательность. /PROD=hepatocyte nuclear factor-3 beta /FL=gb:AB028021.1 gb:NM_021784.1
-5,25658
3,291398
374,28
Повышение
1.45E-04
AW005572
предполагаемый белок 47 кДа
-4,79201
3,696679
359,21
Повышение
1.91E-04
NM_012431
Homo sapiens, содержащий sema-домен, иммуноглобулиновый домен (Ig), короткий основной домен секретируемый белок (семафорин), 3E (SEMA3E), мРНК. /PROD=sema domain, immunoglobulin domain (Ig), shortbasic domain, secreted, (semaphorin) 3E /FL=gb:NM_012431.1 gb:AB002329.1
-4,29896
3,55326
231,07
Повышение
6.31E-05
AY177407
Homo sapiens, гомеобоксовый белок goosecoid, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=homeobox protein goosecoid /FL=gb:AY177407.1 gb:NM_173849.1
-0,80043
6,860899
202,44
Повышение
1.45E-04
D87811
Homo sapiens, мРНК для GATA-6, полная кодовая последовательность. /PROD=GATA-6 /FL=gb:U66075.1 gb:NM_005257.1 gb:D87811.1
-2,0457
5,432491
178,3
Повышение
3.17E-04
AI422986
Гены EST
-0,62093
6,825713
174,45
Повышение
6.31E-05
NM_022454
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ22252, сходный с содержащим SRY-бокс белком 17 (FLJ22252), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ22252 similar to SRY-boxcontaining gene 17 /FL=gb:NM_022454.1
-3,20091
4,115748
159,42
Повышение
4.55E-03
NM_002614
Homo sapiens, содержащий PDZ-домен белок 1 (PDZK1), мРНК. /PROD=PDZ domain containing 1 /FL=gb:NM_002614.1 gb:AF012281.1
-1,55323
5,756709
158,68
Повышение
1.18E-04
AI821586
Гены EST со средней степенью подобия с полученным из клеток JE0284 Mm-1 белком 1b, ассоциированным с трансплантабельностью (H.sapiens)
-1,32044
5,931596
152,43
Повышение
1.87E-03
AF017987
Homo sapiens, связанный с апоптозом секретированный белок 2 (SARP2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=secreted apoptosis related protein 2 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-2,07937
5,100657
145,01
Повышение
1.38E-03
NM_001643
Homo sapiens, аполипопротеин A-II (APOA2), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-II precursor /FL=gb:M29882.1 gb:NM_001643.1 gb:BC005282.1
-1,44407
5,698139
141,26
Повышение
7.86E-04
U91903
Человеческий белок Fritz, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Fritz /FL=gb:U24163.1 gb:U68057.1 gb:NM_001463.1 gb:U91903.1
-1,89695
5,224062
139,2
Повышение
2.36E-04
AL136944
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp586J0624 (из клона DKFZp586J0624); полная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein /FL=gb:AF215636.1 gb:NM_014585.1 gb:AF231121.1 gb:AF226614.1 gb:AL136944.1
-1,39784
5,68934
135,97
Повышение
4.88E-04
BE222344
богатый аргинином и серином фактор сплайсинга 5
-0,77864
6,281843
133,48
Повышение
2.22E-04
NM_022055
Homo sapiens, зарезервированный (KCNK12), мРНК. /PROD=tandem pore domain potassium channel THIK-2 /FL=gb:NM_022055.1 gb:AF287302.1
-4,50758
2,549475
133,16
Повышение
2.17E-04
AU118882
эндотелиновый рецептор типа A /FL=gb:NM_001957.1 gb:L06622.1
-3,51429
3,503914
129,63
Повышение
4.95E-04
AA352113
Гены EST
-3,66072
3,328123
127,01
Повышение
3.78E-04
AI240545
гликофорин B (содержит белок группы крови Ss)
-1,11159
5,754168
116,63
Повышение
1.30E-04
NM_003867
Homo sapiens, фактор роста фибробластов 17 (FGF17), мРНК. /PROD=fibroblast growth factor 17 /FL=gb:NM_003867.1 gb:AB009249.1
-3,61621
3,217076
114,03
Повышение
1.27E-03
AL569326
Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность
-1,66311
5,134985
111,28
Повышение
4.22E-04
S69738
MCP-1=моноцитарный хемотактический белок (человеческий, клетки эндотелия аорты, мРНК, 661 нт). /PROD=MCP-1
-0,83997
5,93144
109,24
Повышение
2.98E-04
AI821669
Гены EST
-0,98665
5,726104
104,89
Повышение
5.59E-04
NM_001463
Homo sapiens, frizzled-связанный белок (FRZB), мРНК. /PROD=frizzled-related protein /FL=gb:U24163.1 gb:U68057.1 gb:NM_001463.1 gb:U91903.1
-2,5679
4,137457
104,36
Повышение
7.79E-05
AL121722
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP4-788L20 на хромосоме 20. Содержит ген HNF3B (гепатоцитного ядерного фактора-3 бета), новый ген на основе генов EST, гены EST, STS, GSS и CpG-островки
-1,80965
4,847846
100,95
Повышение
1.46E-03
NM_152506
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32835 (FLJ32835), мРНК. /FL=gb:NM_152506.1
0,502235
7,009369
90,96
Повышение
6.31E-05
NM_014899
Homo sapiens, белок KIAA0878 (KIAA0878), мРНК. /PROD=KIAA0878 protein /FL=gb:NM_014899.1 gb:AB020685.1
-2,72686
3,743779
88,69
Повышение
2.40E-04
AI692180
белок 2, связывающий белок, взаимодействующий с PTPRF (липрин бета 2)
-3,53873
2,900762
86,79
Повышение
7.01E-04
AI675836
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-446H13 на хромосоме 10. Содержит 3-конец гена нового белка, подобного KIAA1059 (ортолог мышиного рецепторного белка SORCS, содержащего домен VPS10), псевдоген RPL23A (белок 23A рибосомы 60S), гены EST, гены STS
0,756526
7,184293
86,09
Повышение
1.32E-04
NM_003012
Homo sapiens, секретируемый frizzled-связанный белок 1 (SFRP1), мРНК. /PROD=secreted frizzled-related protein 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
1,194285
7,539085
81,28
Повышение
1.91E-04
NM_001898
Homo sapiens, цистатин SN (CST1), мРНК. /PROD=cystatin SN /FL=gb:J03870.1 gb:NM_001898.1
-3,13458
3,167207
78,89
Повышение
3.78E-04
AI767388
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-1024N4 на хромосоме 1p32.1-33. Содержит ген нового члена семейства сопряженных переносчиков Натрий:переносимое вещество, подобного SLC5A1 (SGLT1), псевдоген, подобный части членов семейства бутирофилинов, новый ген, гены EST, STS, GS
-2,16064
4,140592
78,86
Повышение
3.71E-03
NM_000475
Homo sapiens, ядерный рецептор, подсемейство 0, группа B, член 1 (NR0B1), мРНК. /PROD=adrenal hypoplasia protein /FL=gb:NM_000475.2
-3,54017
2,700772
75,63
Повышение
7.42E-04
NM_002091
Homo sapiens, гастрин-высвобождающий белок (GRP), мРНК. /PROD=gastrin-releasing peptide /FL=gb:NM_002091.1 gb:K02054.1 gb:BC004488.1
-0,10733
6,129363
75,41
Повышение
1.89E-04
BC005107
Homo sapiens, клон IMAGE:3840937, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3840937)
-0,70603
5,511093
74,39
Повышение
1.32E-04
X02162
Человеческая мРНК для аполипопротеина AI (apo AI)=. /PROD=preproapolipoprotein AI
-1,71797
4,462566
72,53
Повышение
1.82E-03
AL524520
связанный с G-белком рецептор 49
-2,6422
3,482776
69,79
Повышение
1.32E-04
BF589787
Гены EST
-2,55363
3,5449
68,52
Повышение
7.88E-04
NM_005143
Homo sapiens, гаптоглобин (HP), мРНК. /PROD=haptoglobin /FL=gb:K00422.1 gb:L29394.1 gb:NM_005143.1
-1,68521
4,368534
66,43
Повышение
8.61E-04
NM_002770
Homo sapiens, протеаза, серин, 2 (трипсин 2) (PRSS2), мРНК. /PROD=protease, serine, 2 (trypsin 2) /FL=gb:M27602.1 gb:NM_002770.1
-0,81978
5,225222
66,03
Повышение
2.29E-04
AI824037
Гены EST с низкой степенью подобия с FCE2, МЫШИНЫМ НИЗКОАФФИННЫМ РЕЦЕПТОРОМ ДЛЯ ИММУНОГЛОБУЛИНА ЭПСИЛОН (M.musculus)
-3,86227
2,17108
65,5
Повышение
3.68E-03
U00178
Homo sapiens, ген гликофорина STA (GPErik), полная кодовая последовательность. /PROD=glycophorin Erik (STA) /FL=gb:U00178.1
-1,09421
4,938977
65,49
Повышение
6.31E-05
AK023621
Homo sapiens, кДНК: FLJ13559 fis, клон PLACE1007852, с высокой степенью подобия с Homo sapiens мРНК для белка KIAA0878.
0,663834
6,652281
63,49
Повышение
1.91E-04
AI817041
связанный с G-белком рецептор
-0,58181
5,375577
62,14
Повышение
1.45E-04
NM_000039
Homo sapiens, аполипопротеин A-I (APOA1), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-I precursor /FL=gb:M27875.1 gb:M11791.1 gb:NM_000039.1 gb:BC005380.1
-1,54589
4,362835
60,08
Повышение
1.73E-03
AW088232
Гены EST
-0,07494
5,828115
59,84
Повышение
1.54E-04
NM_001394
Homo sapiens, двойной специфичности фосфатаза 4 (DUSP4), мРНК. /PROD=dual specificity phosphatase 4 /FL=gb:NM_001394.2 gb:BC002671.1 gb:U48807.1 gb:U21108.1
-4,56294
1,310101
58,61
Повышение
1.11E-03
NM_002443
Homo sapiens, микросеминопротеин, бета- (MSMB), мРНК. /PROD=microseminoprotein, beta- /FL=gb:NM_002443.1
-3,4744
2,363586
57,2
Повышение
2.68E-03
L32867
Homo sapiens, альфа 2,8-сиалилтрансфераза, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=alpha 2,8-sialyltransferase /FL=gb:L43494.1 gb:D26360.1 gb:L32867.1 gb:NM_003034.1
-2,46443
3,369728
57,05
Повышение
1.45E-04
AL450314
Новый человеческий ген, соответствующий хромосоме 22. /PROD=hypothetical protein
1,388898
7,19192
55,83
Повышение
8.20E-05
BE620739
Гены EST
-4,00586
1,787905
55,48
Повышение
2.21E-04
AI032108
гепатоцитный ядерный фактор 4, альфа
-3,79684
1,959873
54,07
Повышение
2.17E-04
AK026720
Homo sapiens, кДНК: FLJ23067 fis, клон LNG04993.
-0,66587
5,083659
53,8
Повышение
1.91E-04
NM_001362
Homo sapiens, деиодиназа, иодотиронин, тип III (DIO3), мРНК. /PROD=thyroxine deiodinase type III /FL=gb:NM_001362.1 gb:S79854.1
-0,18863
5,551911
53,47
Повышение
3.52E-04
AV700724
GATA-связывающий белок 4 /FL=gb:NM_002052.1 gb:L34357.1 gb:D78260.1
0,800949
6,531642
53,1
Повышение
1.02E-04
NM_030781
Homo sapiens, фагоцитарный рецептор лектина С-типа (SRCL), мРНК. /PROD=scavenger receptor with C-type lectin /FL=gb:NM_030781.1
-1,61054
4,10541
52,56
Повышение
5.56E-04
AW264204
Гены EST
-2,91295
2,78771
52,01
Повышение
6.07E-03
AW005572
предполагаемый белок 47 кДа
-2,50006
3,186935
51,52
Повышение
8.45E-04
U66061
Бета-цепь человеческого Т-клеточного рецептора зародышевой линии TCRBV17S1A1T, TCRBV2S1, TCRBV10S1P, TCRBV29S1P, TCRBV19S1P, TCRBV15S1, TCRBV11S1A1T, HVB реликт, TCRBV28S1P, TCRBV34S1, TCRBV14S1, TCRBV3S1, TCRBV4S1A1T, TRY4, TRY5, TRY6, TRY7, TRY8, TCRBD1, TCRBJ1S1, TCRB...
-1,70149
3,97514
51,15
Повышение
1.10E-03
AF225426
Homo sapiens, HT016 мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=HT016 /FL=gb:AF225426.1
-2,50335
3,151666
50,39
Повышение
2.47E-04
AA781795
Гены EST
-3,2144
2,380089
48,32
Повышение
4.61E-03
NM_020995
Homo sapiens, связанный с гаптоглобином белок (HPR), мРНК. /PROD=haptoglobin-related protein /FL=gb:NM_020995.1
0,83572
6,417467
47,89
Повышение
1.94E-04
N21138
белок KIAA0878 /FL=gb:NM_014899.1 gb:AB020685.1
-2,4051
3,170689
47,7
Повышение
1.32E-04
NM_021020
Homo sapiens, связанного с F37/раком пищевода гена кодирующий мотив leucine-zipper motif (FEZ1), мРНК. /PROD=F37Esophageal cancer-related gene-codingleucine-zipper motif /FL=gb:AF123659.1 gb:NM_021020.1
-3,91992
1,65452
47,65
Повышение
2.78E-04
AL553774
белок KIAA1462
-3,39007
2,175099
47,35
Повышение
5.44E-03
NM_006614
Homo sapiens, молекула клеточной адгезии с гомологией с L1CAM (близкий гомолог L1) (CHL1), мРНК. /PROD=cell adhesion molecule with homology to L1CAM(close homologue of L1) /FL=gb:AF002246.1 gb:NM_006614.1
-1,77041
3,785027
47,03
Повышение
1.43E-03
NM_003966
Homo sapiens, содержащий sema-домен, 7 тромбоспондиновых повторов (типа 1 и сходного с типом 1), трансмембранный домен (TM) и короткий цитоплазменный домен белок, (семафорин), 5A (SEMA5A), мРНК. /PROD=sema domain, seven thrombospondin repeats (type1 and type 1-like), transmem
-2,1243
3,414352
46,48
Повышение
7.42E-04
AL590118
Новая человеческая мРНК из хромосомы 22. Вариант сплайсинга dJ222E13.C22.1. /PROD=hypothetical protein
-3,71922
1,808255
46,13
Повышение
6.31E-05
NM_012301
Homo sapiens, взаимодействующий с атрофином-1 белок 1; взаимодействующий с рецептором активина белок 1 (KIAA0705), мРНК. /PROD=atrophin-1 interacting protein 1; activinreceptor interacting protein 1 /FL=gb:NM_012301.1 gb:AF038563.1
0,282425
5,79006
45,49
Повышение
2.52E-04
AW772192
Homo sapiens, клон 23736, последовательность мРНК
1,314051
6,761422
43,63
Повышение
8.20E-05
BC000740
Homo sapiens, рецептор холецистокинина B, клон MGC:2199, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cholecystokinin B receptor /FL=gb:L07746.1 gb:L08112.1 gb:S70057.1 gb:BC000740.1 gb:L04473.1 gb:NM_000731.1
1,048741
6,488423
43,4
Повышение
1.43E-04
NM_001899
Homo sapiens, цистатин S (CST4), мРНК. /PROD=cystatin S /FL=gb:NM_001899.1
-0,26005
5,163577
42,92
Повышение
3.89E-04
R72286
ассоциированный с микрофибриллами белок 4
-3,53207
1,859147
41,97
Повышение
6.92E-04
NM_002769
Homo sapiens, протеаза, серин, 1 (трипсин 1) (PRSS1), мРНК. /PROD=protease, serine, 1 (trypsin 1) /FL=gb:M22612.1 gb:NM_002769.1
-0,2425
5,144972
41,86
Повышение
1.91E-04
NM_018286
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10970 (FLJ10970), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10970 /FL=gb:NM_018286.1
-3,14727
2,237789
41,79
Повышение
9.13E-03
NM_001147
Homo sapiens, ангиопоэтин 2 (ANGPT2), мРНК. /PROD=angiopoietin 2 /FL=gb:AB009865.1 gb:AF004327.1 gb:NM_001147.1
-3,69577
1,687554
41,74
Повышение
3.38E-03
AL133386
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP1-181C24 на хромосоме 6p11.1-12.2. Содержит 3-конец гена BMP5 костного морфогенетического белка, гены EST, STS и GSS /FL=gb:M60314.1 gb:NM_021073.1
0,828899
6,191145
41,13
Повышение
1.33E-04
NM_001200
Homo sapiens, костный морфогенетический белок 2 (BMP2), мРНК. /PROD=bone morphogenetic protein 2 precursor /FL=gb:NM_001200.1
-3,26893
2,058218
40,15
Повышение
5.08E-04
NM_001785
Homo sapiens, цитидиндеаминаза (CDA), мРНК. /PROD=cytidine deaminase /FL=gb:L27943.1 gb:NM_001785.1
0,804491
6,097871
39,22
Повышение
1.58E-04
AA583044
костный морфогенетический белок 2 /FL=gb:NM_001200.1
-3,25961
2,021534
38,89
Повышение
1.07E-02
NM_016341
Homo sapiens, обильная в поджелудочной железе фосфолипаза C (LOC51196), мРНК. /PROD=pancreas-enriched phospholipase C /FL=gb:AF117948.1 gb:NM_016341.1 gb:AF190642.2
-1,83503
3,428167
38,4
Повышение
1.04E-03
AA552969
Гены EST
-1,9473
3,313481
38,34
Повышение
1.92E-03
U43328
Человеческий связывающий белок, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=link protein /FL=gb:NM_001884.1 gb:U43328.1
1,563993
6,815362
38,09
Повышение
6.31E-05
NM_002413
Homo sapiens, микросомальная глутатион S-трансфераза 2 (MGST2), мРНК. /PROD=microsomal glutathione S-transferase 2 /FL=gb:NM_002413.1 gb:U77604.1
0,753353
5,985265
37,58
Повышение
6.31E-05
NM_021827
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ23514 (FLJ23514), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ23514 /FL=gb:NM_021827.1
-3,95062
1,221052
36,04
Повышение
2.88E-03
AU144247
Homo sapiens, кДНК: FLJ13443 fis, клон PLACE1002853
-1,92059
3,223801
35,37
Повышение
7.42E-04
AI738662
гомеобокс HB9 /FL=gb:NM_005515.1
0.007601
5.147748
35.26
Повышение
1.45E-04
N63706
Гены EST
-3,12184
2,01388
35,16
Повышение
5.36E-04
AI700341
Гены EST
1,470195
6,597094
34,94
Повышение
8.20E-05
AI676059
Гены EST
-2,81405
2,284598
34,26
Повышение
1.27E-03
AI694325
Гены EST
-2,83906
2,251765
34,08
Повышение
1.40E-04
T15545
Гены EST
-0,27888
4,797361
33,74
Повышение
1.91E-04
AF225513
Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta /FL=gb:AF225513.1
-2,80061
2,271493
33,64
Повышение
1.79E-03
NM_014624
Homo sapiens, связывающего кальций белка S100 A6 (кальциклин) (S100A6), мРНК. /PROD=S100 calcium-binding protein A6 /FL=gb:NM_014624.2 gb:BC001431.1
-3,7619
1,277348
32,88
Повышение
1.63E-04
NM_016179
Homo sapiens, временный рецепторный потенциальный канал 4 (TRPC4), мРНК. /PROD=transient receptor potential 4 /FL=gb:NM_016179.1 gb:AF175406.1
0,366041
5,37746
32,25
Повышение
1.45E-04
AI242583
Homo sapiens, кДНК: FLJ11550 fis, клон HEMBA1002970
1,696658
6,703009
32,14
Повышение
1.02E-04
L01639
Человеческий (клон HSY3RR) рецептор к нейропептиду Y, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=neuropeptide Y receptor /FL=gb:L06797.1 gb:NM_003467.1 gb:AF025375.1 gb:AF147204.1 gb:M99293.1 gb:L01639.1
-3,62742
1,377732
32,11
Повышение
4.73E-03
AA772920
Гены EST
-0,22337
4,733912
31,07
Повышение
6.84E-04
NM_021822
Homo sapiens, форболин-подобный белок MDS019 (MDS019), мРНК. /PROD=phorbolin-like protein MDS019 /FL=gb:AF182420.1 gb:NM_021822.1
-2,33835
2,59894
30,64
Повышение
8.18E-03
L33477
Человеческий (клон 8B1) Br-кадгерин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Br-cadherin /FL=gb:L34057.1 gb:L33477.1 gb:NM_004061.1
0,713597
5,633194
30,27
Повышение
4.33E-04
BF508344
Гены EST
0,299946
5,21645
30,2
Повышение
3.47E-03
NM_001322
Homo sapiens, цистатин SA (CST2), мРНК. /PROD=cystatin SA /FL=gb:NM_001322.1
-1,43446
3,469297
29,93
Повышение
3.61E-03
AW291482
Гены EST
-0,11092
4,785145
29,78
Повышение
2.75E-04
BF591483
Гены EST
2,368939
7,24917
29,45
Повышение
1.43E-04
AJ224869
Homo sapiens, CXCR4 ген, кодирующий рецептор CXCR4
-2,68947
2,167726
28,98
Повышение
1.86E-02
AW291402
Гены EST
-3,25309
1,589977
28,7
Повышение
2.04E-03
AL050154
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp586L0120 (из клона DKFZp586L0120).
-3,17056
1,66331
28,52
Повышение
2.66E-04
AI801626
Гены EST со средней степенью подобия с ALU4_HUMAN ALU SUBFAMILY SB2 SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-0,41404
4,412864
28,38
Повышение
3.12E-04
AI332407
секретированный frizzled-связанный белок 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-0,47614
4,348662
28,34
Повышение
2.59E-04
BF508639
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434E082 (из клона DKFZp434E082)
-0,88175
3,931755
28,12
Повышение
6.39E-04
AI650874
Гены EST
-2,66737
2,145076
28,1
Повышение
6.31E-05
BF060736
Гены EST
-1,42034
3,315265
26,64
Повышение
7.42E-04
BE737251
Homo sapiens, кДНК: FLJ22482 fis, клон HRC10859, с высокой степенью подобия cIRO180147, Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 180147
-3,9115
0,79001
26,02
Повышение
2.08E-03
NM_005739
Homo sapiens, RAS гуанил-высвобождающий белок 1 (регулируемый кальцием и диацилглицерином) (RASGRP1), мРНК. /PROD=RAS guanyl releasing protein 1 /FL=gb:AF081195.1 gb:NM_005739.2 gb:AF106071.1
0,041468
4,741042
25,98
Повышение
4.95E-04
BF130943
Гены EST
-2,45311
2,234445
25,77
Повышение
2.11E-02
BC042378
Homo sapiens, клон IMAGE:5277693, мРНК.
-2,50168
2,154999
25,22
Повышение
1.22E-02
X16468
Человеческая мРНК для коллагена альфа-1 типа II.
-2,81453
1,810003
24,67
Повышение
2.55E-02
BC014585
Homo sapiens, клон IMAGE:4047715, мРНК.
-1,54464
3,064723
24,41
Повышение
1.58E-04
AI743534
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp564B1162 (из клона DKFZp564B1162); полная кодовая последовательность /FL=gb:AL136646.1
-0,20114
4,391607
24,13
Повышение
2.40E-04
NM_000280
Homo sapiens, ген семейства paired box, член 6 (аниридия, кератит) (PAX6), мРНК. /PROD=paired box gene 6, isoform a /FL=gb:NM_000280.1 gb:M93650.1
-2,26295
2,328666
24,11
Повышение
3.38E-03
AI735586
Гены EST
2,194421
6,729686
23,19
Повышение
6.31E-05
AF348491
Homo sapiens, рецептор хемокина CXCR4, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=chemokine receptor CXCR4 /FL=gb:AF348491.1
-2,05438
2,47465
23,09
Повышение
7.80E-03
BG290908
Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-2,56112
1,953388
22,86
Повышение
3.79E-02
NM_002098
Homo sapiens, гуанилат-циклазы активатор 1B (сетчатка) (GUCA1B), мРНК. /PROD=guanylate cyclase activator 1B (retina) /FL=gb:M95174.1 gb:NM_002098.1 gb:M97496.1
1,186033
5,699787
22,84
Повышение
3.11E-04
AI627704
Гены EST с низкой степенью подобия с T17346, гипотетическим белком DKFZp586O1624.1 (H.sapiens)
-0,37709
4,122407
22,62
Повышение
1.32E-04
AU152102
Homo sapiens, кДНК: FLJ12993 fis, клон NT2RP3000197
-3,10838
1,371
22,31
Повышение
7.67E-04
N50412
Гены EST
0,581614
5,04863
22,12
Повышение
1.91E-04
AF005775
Homo sapiens, каспаза-подобный регулирующий апоптоз белок 2 (clarp), мРНК, продукт альтернативного сплайсинга, полная кодовая последовательность. /PROD=caspase-like apoptosis regulatory protein 2 /FL=gb:AF005775.1
-0,15629
4,305757
22,04
Повышение
5.69E-04
AI799018
Гены EST
-1,22896
3,220593
21,85
Повышение
3.57E-04
AA628967
Гены EST с высокой степенью подобия с IHH_HUMAN, ПРЕДШЕСТВЕННИКА БЕЛКА INDIAN HEDGEHOG (H.sapiens)
-0,5982
3,842585
21,72
Повышение
1.62E-02
AI806510
предполагаемый белок 47 кДа
-3,64219
0,7939
21,65
Повышение
4.82E-02
NM_016950
Homo sapiens, тестикан 3 (HSAJ1454), мРНК. /PROD=testican 3 /FL=gb:NM_016950.1 gb:BC000460.1 gb:BC003017.1
1,168713
5,589508
21,42
Повышение
7.42E-04
NM_016139
Homo sapiens, 16,7 кДа белок (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
-0,35867
4,059826
21,38
Повышение
3.11E-04
NM_001957
Homo sapiens, эндотелиновый рецептор типа A (EDNRA), мРНК. /PROD=endothelin receptor type A /FL=gb:NM_001957.1 gb:L06622.1
-2,06656
2,342712
21,25
Повышение
3.19E-03
AF141339
Homo sapiens, взаимодействующий с LYST белок LIP3, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=LYST-interacting protein LIP3
-0,5292
3,876079
21,19
Повышение
1.54E-03
AI127440
Гены EST
-3,10357
1,289233
21,01
Повышение
2.09E-04
NM_001453
Homo sapiens, белок с вилкообразным регионом (forkhead box) C1 (FOXC1), мРНК. /PROD=forkhead box C1 /FL=gb:NM_001453.1
0,143286
4,530622
20,93
Повышение
2.37E-03
AW157548
связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 5 /FL=gb:M65062.1 gb:M62782.1 gb:NM_000599.1 gb:AF055033.1
-2,7734
1,613669
20,92
Повышение
2.19E-03
BF515913
Гены EST
0,240245
4,617197
20,78
Повышение
7.42E-04
BF940761
Гены EST
1,203777
5,579613
20,76
Повышение
9.87E-05
AA633203
консервативный ген, амплифицируемый в остеосаркоме
-0,95126
3,407252
20,51
Повышение
3.70E-04
NM_021170
Homo sapiens, bHLH фактор Hes4 (LOC57801), мРНК. /PROD=bHLH factor Hes4 /FL=gb:NM_021170.1 gb:AB048791.1
-2,50705
1,830533
20,22
Повышение
1.44E-02
NM_001174
Homo sapiens, активирующий Rho-ГТФазу белок 6 (ARHGAP6), вариант транскрипта 2, мРНК. /PROD=Rho GTPase activating protein 6 isoform 2 /FL=gb:AF022212.2 gb:NM_001174.2
0,476688
4,813764
20,21
Повышение
2.22E-04
NM_024581
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ13942 (FLJ13942), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ13942 /FL=gb:NM_024581.1
-3,12747
1,195263
20,01
Повышение
1.04E-03
AV726956
Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
1,868094
6,17918
19,85
Повышение
1.30E-04
H92988
белок активации тирозин 3-монооксигеназы/триптофан 5-монооксигеназы, полипептид-эта
-2,08299
2,183935
19,25
Повышение
2.64E-02
NM_002048
Homo sapiens, специфичный для задержки роста белок 1 (GAS1), мРНК. /PROD=growth arrest-specific 1 /FL=gb:NM_002048.1 gb:L13698.1
0,417034
4,677559
19,17
Повышение
4.65E-04
AL571375
гипотетический белок FLJ21032
-1,42686
2,825005
19,05
Повышение
1.38E-03
NM_007250
Homo sapiens, Kruppel-подобный фактор 8 (KLF8), мРНК. /PROD=Kruppel-like factor 8 /FL=gb:U28282.1 gb:NM_007250.1
1,829497
6,079493
19,03
Повышение
2.21E-04
AA534817
Гены EST с низкой степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-2,33658
1,906847
18,94
Повышение
4.55E-03
AW299538
Гены EST
-3,7558
0,485727
18,92
Повышение
8.76E-03
AW473656
Гены EST
-2,20597
2,032138
18,87
Повышение
3.53E-03
AI968904
Гены EST
-0,23726
3,987817
18,7
Повышение
5.55E-04
AA912476
Homo sapiens, кДНК: FLJ13221 fis, клон NT2RP4002075
0,02885
4,245437
18,59
Повышение
1.45E-04
AL534095
гипотетический белок FLJ23091
1,275191
5,478497
18,42
Повышение
2.30E-04
AI587307
гипотетический белок FLJ12838 /FL=gb:NM_024641.1
-2,65285
1,547186
18,38
Повышение
5.15E-04
BE549700
Гены EST
-2,40046
1,790023
18,26
Повышение
9.66E-03
NM_002102
Homo sapiens, гликофорин E (GYPE), мРНК. /PROD=glycophorin E /FL=gb:NM_002102.1 gb:M29610.1
0,903379
5,089167
18,2
Повышение
5.59E-04
AF229179
Homo sapiens, специфичный для почек мембранный белок NX-17, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=kidney-specific membrane protein NX-17 /FL=gb:AF229179.1
-1,78964
2,376462
17,95
Повышение
9.77E-03
NM_004861
Homo sapiens, цереброзид (3-фосфоаденилсульфат:галактозилкерамид 3) сульфотрансфераза (CST), мРНК. /PROD=galactosylceramide sulfotransferase /FL=gb:NM_004861.1 gb:D88667.1
1,641644
5,800724
17,87
Повышение
9.96E-04
AI922855
карбоксипептидаза E /FL=gb:NM_001873.1
-3,18081
0,961939
17,66
Повышение
2.69E-04
AW449813
белок KIAA0918
-2,49139
1,64952
17,64
Повышение
2.29E-04
AJ277914
Homo sapiens, часть гена LHX9 для LIM-гомеобоксового белка 9, 3UTR.
0,780949
4,89808
17,35
Повышение
2.32E-04
NM_005630
Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 21 (переносчик простагландина), член 2 (SLC21A2), мРНК. /PROD=solute carrier family 21 (prostaglandintransporter), member 2 /FL=gb:U70867.1 gb:NM_005630.1
2,648874
6,762839
17,32
Повышение
1.18E-04
AW007532
Человеческий связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 5 (IGFBP5), мРНК
-1,99136
2,122261
17,31
Повышение
1.87E-03
AL109653
Последовательность человеческой ДНК от клонирования GS1-115M3 на хромосоме Xq27.1-28. Содержит ген нового белка CXorf1 (хромосома X, открытая рамка считывания 1), гены EST, STS, GSS и островок CpG
-3,18582
0,924726
17,27
Повышение
1.83E-03
AI991033
гепаран-сульфат протеогликан 2 (perlecan) /FL=gb:M85289.1 gb:NM_005529.2
2,59334
6,695074
17,17
Повышение
9.96E-05
AA045184
рибосомальный белок L14
-2,28658
1,813753
17,15
Повышение
4.49E-03
NM_030817
Homo sapiens, гипотетический белок DKFZp434F0318 (DKFZP434F0318), мРНК. /PROD=hypothetical protein DKFZp434F0318 /FL=gb:NM_030817.1
1,603889
5,703513
17,14
Повышение
2.09E-04
NM_001661
Homo sapiens, подобный фактору АДФ-рибозилирования 4 белок (ARF4L), мРНК. /PROD=ADP-ribosylation factor 4-like /FL=gb:U25771.1 gb:L38490.1 gb:NM_001661.1 gb:BC000043.1
-1,44072
2,657871
17,13
Повышение
9.96E-04
AF260333
Homo sapiens, AD036 мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=AD036 /FL=gb:AF260333.1
-0,74006
3,356451
17,11
Повышение
6.19E-04
NM_014391
Homo sapiens, сердечный белок с анкириновыми повторами (CARP), мРНК. /PROD=cardiac ankyrin repeat protein /FL=gb:NM_014391.1
-1,58689
2,507158
17,08
Повышение
5.06E-04
AI808090
Гены EST
0,800778
4,890724
17,03
Повышение
1.91E-04
AF020769
Homo sapiens, сердечный вентральный тропонин C, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cardiac ventricular troponin C /FL=gb:NM_003280.1 gb:AF020769.1
-1,39277
2,693344
16,98
Повышение
3.73E-04
AI629041
Гены EST
-0,70855
3,373415
16,94
Повышение
7.93E-04
AI917371
Гены EST
-1,18408
2,895859
16,91
Повышение
1.39E-03
NM_006456
Homo sapiens, сиалилтрансфераза (STHM), мРНК. /PROD=sialyltransferase /FL=gb:U14550.1 gb:NM_006456.1
1,076427
5,150301
16,84
Повышение
1.91E-04
AI640307
протокадгерин 10
-1,35345
2,70797
16,7
Повышение
1.40E-03
AW157571
Гены EST с низкой степенью подобия с T00331, гипотетическим белком KIAA0555 (H.sapiens)
-0,60671
3,453551
16,68
Повышение
2.09E-03
NM_000458
Homo sapiens, транскрипционный фактор 2, гепатический; LF-B3; вариант гепатический ядерный фактор (TCF2), вариант транскрипта a, мРНК. /PROD=transcription factor 2, isoform a /FL=gb:NM_000458.1
-1,65513
2,402967
16,66
Повышение
1.07E-02
NM_004923
Homo sapiens, металлотионеин-подобный белок 5, специфичный для яичек (tesmin) (MTL5), мРНК. /PROD=metallothionein-like 5, testis-specific(tesmin) /FL=gb:U86074.1 gb:NM_004923.1
-0,45718
3,590445
16,54
Повышение
4.87E-04
BF939489
гликопротеин M6A /FL=gb:D49958.1
-1,95127
2,075959
16,3
Повышение
3.25E-03
L12468
Homo sapiens, аминопептидаза A, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=aminopeptidase A /FL=gb:L12468.1 gb:NM_001977.1 gb:L14721.1
2,168853
6,193675
16,28
Повышение
8.20E-05
AA284532
белок активации тирозин 3-монооксигеназы/триптофан 5-монооксигеназы, полипептид-эта
-4,19938
-0,18035
16,21
Повышение
2.14E-02
BC027866
Homo sapiens, подобный сиалилтрансферазе 8D (альфа-2, 8-полисиалилтрансфераза), клон MGC:34450 IMAGE:5203343, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Similar to sialyltransferase 8D (alpha-2,8-polysialytransferase) /FL=gb:BC027866.1
-2,47297
1,540991
16,16
Повышение
3.51E-02
NM_005235
Homo sapiens, подобный гомологу вирусного онкогена птичьей эритробластической лейкемии v-erb-a белок 4 (ERBB4), мРНК. /PROD=v-erb-a avian erythroblastic leukemia viraloncogene homolog-like 4 /FL=gb:L07868.1 gb:NM_005235.1
1,166518
5,166811
16
Повышение
3.17E-04
BC002671
Homo sapiens, двойной специфичности фосфатаза 4, клон MGC:3713, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=dual specificity phosphatase 4 /FL=gb:NM_001394.2 gb:BC002671.1 gb:U48807.1 gb:U21108.1
-1,25086
2,738997
15,89
Повышение
4.57E-03
NM_021804
Homo sapiens, ангиотензин I преобразующий фермент (пептидил-дипептидаза A) 2 (ACE2), мРНК. /PROD=angiotensin I converting enzyme(peptidyl-dipeptidase A) 2 /FL=gb:NM_021804.1 gb:AF241254.1 gb:AB046569.1 gb:AF291820.1
0,502333
4,476006
15,71
Повышение
6.47E-04
AF211891
Homo sapiens, Mix-like homeobox protein 1 (MILD1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Mix-like homeobox protein 1 /FL=gb:AF211891.1
1,520924
5,473417
15,48
Повышение
4.31E-04
U87460
Человеческий предполагаемый подобный эндотелиновому рецептору типа A белок, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=putative endothelin receptor type B-likeprotein /FL=gb:U87460.1
1,740607
5,665717
15,19
Повышение
1.78E-04
NM_002160
Homo sapiens, гексабрахион (тенасцин C, цитотактин) (HXB), мРНК. /PROD=hexabrachion (tenascin C, cytotactin) /FL=gb:M55618.1 gb:NM_002160.1
0,449168
4,362026
15,06
Повышение
1.33E-04
AI688418
плексин A2
1,452987
5,359741
15
Повышение
1.54E-04
AI813654
Гены EST с низкой степенью подобия с T32252, гипотетическим белком T15B7.2 - нематода (C.elegans)
-1,10807
2,786741
14,87
Повышение
2.36E-04
BC028058
Homo sapiens, UDP-GlcNAc:betaGal, бета-1,3-N-ацетилглюкозаминилтрансфераза 5, клон MGC:39847 IMAGE:5175670, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=UDP-GlcNAc:betaGalbeta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 5 /FL=gb:BC028058.1
-2,2316
1,662544
14,87
Повышение
1.07E-02
AA757630
Гены EST
1,861693
5,752015
14,83
Повышение
3.11E-04
AI374739
Гены EST
0,219552
4,102867
14,76
Повышение
1.43E-04
BE856336
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp761G151 (из клона DKFZp761G151); частичная кодовая последовательность
0,608519
4,456307
14,4
Повышение
1.72E-04
U97075
Homo sapiens, FLICE-подобный ингибирующий белок, короткая форма, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=FLICE-like inhibitory protein short form /FL=gb:U97075.1
1,438639
5,28126
14,35
Повышение
3.45E-04
BF223214
Гены EST
-2,47063
1,370067
14,33
Повышение
3.55E-03
H09657
Гены EST
1,633768
5,465898
14,24
Повышение
1.32E-04
AI733465
коллаген, тип IX, альфа 2 /FL=gb:NM_001852.1
-0,94697
2,883335
14,22
Повышение
4.55E-03
BG208091
Homo sapiens, кДНК: FLJ37414 fis, клон BRAWH1000157.
0,177945
4,006546
14,21
Повышение
3.78E-04
NM_020672
Homo sapiens, белок, подобный связывающему кальций белку S100 A6 (S100A6), мРНК. /PROD=S100-type calcium binding protein A14 /FL=gb:BC005019.1 gb:NM_020672.1 gb:AY007220.1
-0,95386
2,873194
14,19
Повышение
3.57E-04
AF312769
Homo sapiens, криптическая мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cryptic /FL=gb:AF312769.1
-1,84267
1,976613
14,12
Повышение
4.45E-02
AF213678
Homo sapiens, связанный с HAI-2 малый белок (HAI-2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=HAI-2 related small protein /FL=gb:AB038317.1 gb:AF213678.1
-1,42965
2,38124
14,03
Повышение
5.47E-03
M60721
Человеческий гомеобоксовый ген, полная кодовая последовательность. /FL=gb:M60721.1 gb:NM_021958.1
-0,75724
3,050773
14,01
Повышение
3.87E-03
AL445192
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-269H4 на хромосоме 20. Содержит 3-конец гена KIAA1415, подобный индуцирующему заражение и метастазирование Т-лимфомы белку-1, гены EST, STS и GSS
-0,53584
3,260892
13,9
Повышение
5.76E-03
NM_002100
Homo sapiens, гликофорин B (содержит белок группы крови Ss) (GYPB), мРНК. /PROD=glycophorin B precursor /FL=gb:J02982.1 gb:NM_002100.2
0,424882
4,20576
13,75
Повышение
8.98E-04
AI692659
белок теплового шока 90 кДа 1, альфа
-0,13427
3,646365
13,74
Повышение
4.95E-04
D49958
Homo sapiens, мРНК для мембранного гликопротеина M6, полная кодовая последовательность. /PROD=membrane glycoprotein M6 /FL=gb:D49958.1
1,359845
5,139453
13,73
Повышение
2.09E-04
NM_002178
Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 6 (IGFBP6), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 6 /FL=gb:BC005007.1 gb:M62402.1 gb:BC003507.1 gb:NM_002178.1
0,451744
4,228949
13,71
Повышение
1.03E-03
NM_001399
Homo sapiens, эктодермальной дисплазии белок 1, ангидротический (ED1), мРНК. /PROD=ectodermal dysplasia 1, anhidrotic /FL=gb:AF060999.1 gb:NM_001399.1 gb:AF040628.1 gb:AF061189.1
-1,83238
1,938552
13,65
Повышение
1.15E-02
AI807197
Гены EST
-2,85208
0,915477
13,62
Повышение
4.87E-03
AI423201
Гены EST
-0,05814
3,703455
13,56
Повышение
3.59E-04
BF308645
белок KIAA1415
-1,25995
2,496941
13,52
Повышение
7.42E-04
AK026607
Homo sapiens, кДНК: FLJ22954 fis, клон KAT09813, с высокой степенью подобия с мРНК белка AF010315, Homo sapiens Pig11 (PIG11).
-1,42171
2,3129
13,31
Повышение
4.72E-04
NM_005010
Homo sapiens, молекула нейрональной клеточной адгезии (NRCAM), мРНК. /PROD=neuronal cell adhesion molecule /FL=gb:AB002341.1 gb:NM_005010.1
2,593137
6,314378
13,19
Повышение
1.91E-04
NM_001873
Homo sapiens, карбоксипептидаза E (CPE), мРНК. /PROD=carboxypeptidase E precursor /FL=gb:NM_001873.1
-2,15454
1,548754
13,03
Повышение
3.70E-02
NM_012082
Homo sapiens, белок Friend GATA2 (FOG2), мРНК. /PROD=Friend of GATA2 /FL=gb:NM_012082.2 gb:AF119334.1
-2,23424
1,463376
12,97
Повышение
3.45E-03
U22178
Человеческий секретируемый в простате белок 57, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PSP57 /FL=gb:U22178.1
0,882447
4,579373
12,97
Повышение
8.26E-04
U15979
Человеческая (dlk) мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:NM_003836.1 gb:U15979.1
0,999053
4,691273
12,93
Повышение
1.43E-04
AW129593
белок с повторяющимися tudor-доменами, ассоциирующийся с PCTAIRE 2
-0,20099
3,487721
12,89
Повышение
7.70E-04
BF984830
индуцируемый ретиноевой кислотой белок 1
-1,08244
2,60456
12,88
Повышение
1.81E-03
X75208
X75208 /FEATURE=cds /DEFINITION=HSPTKR H.sapiens HEK2 мРНК для рецептора белковой тирозинкиназы
-1,2719
2,409872
12,83
Повышение
1.92E-03
NM_020406
Homo sapiens, истинная первичная полицитемия, белок 1; рецептор на поверхности клетки (PRV1), мРНК. /PROD=polycythemia rubra vera 1; cell surfacereceptor /FL=gb:NM_020406.1 gb:AF146747.1
3,042634
6,716272
12,76
Повышение
1.52E-04
NM_005442
Homo sapiens, гомолог эомезодермина (Xenopus laevis) (EOMES), мРНК. /PROD=eomesodermin (Xenopus laevis) homolog /FL=gb:AB031038.1 gb:NM_005442.1
0,279226
3,951227
12,75
Повышение
2,73E-04
AF278532
Homo sapiens, бета-нетрин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=beta-netrin /FL=gb:AF119916.1 gb:AF297711.1 gb:NM_021229.1 gb:AF278532.1
1,071985
4,738394
12,7
Повышение
1.78E-04
NM_004560
Homo sapiens, побочный рецептор, подобный рецептору тирозинкиназы 2 (ROR2), мРНК. /PROD=receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 2 /FL=gb:M97639.1 gb:NM_004560.1
2,839833
6,489379
12,55
Повышение
1.45E-04
AI078167
ядерный фактор ингибитора энхансера гена легкого полипептида каппа в B-клетках, альфа /FL=gb:NM_020529.1 gb:BC002601.1 gb:BC004983.1 gb:M69043.1
-0,28951
3,358536
12,54
Повышение
3.81E-04
NM_018388
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ11316 (FLJ11316), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ11316 /FL=gb:NM_018388.1
-1,89628
1,750206
12,52
Повышение
1,09E-03
AA557324
Гены EST с низкой степенью подобия с жирнокислотной омега-гидроксилазой (H.sapiens)
-0,41578
3,210639
12,35
Повышение
9.09E-04
NM_002345
Homo sapiens, люмикан (LUM), мРНК. /PROD=lumican /FL=gb:NM_002345.1 gb:U18728.1 gb:U21128.1
-2,37004
1,251403
12,31
Повышение
2.48E-02
AL136607
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp564I0422 (из клона DKFZp564I0422); полная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein /FL=gb:AL136607.1
-1,71673
1,894393
12,22
Повышение
1.15E-03
NM_000420
Homo sapiens, белок группы крови Келла (KEL), мРНК. /PROD=Kell blood group antigen /FL=gb:BC003135.1 gb:NM_000420.1
1,192657
4,801382
12,2
Повышение
2.40E-04
NM_024641
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ12838 (FLJ12838), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ12838 /FL=gb:NM_024641.1
-1,18483
2,411486
12,09
Повышение
4.96E-03
BE551416
Гены EST с низкой степенью подобия с белком KIAA1330 (H.sapiens)
-2,33994
1,256182
12,09
Повышение
1.80E-02
AL134708
Гены EST
1,040647
4,635771
12,08
Повышение
5.15E-04
AI348094
белок KIAA0882
-0.68921
2.90298
12.06
Повышение
1.76E-04
NM_016546
Homo sapiens, предшественник комплемент-C1r-подобной протеиназы, (LOC51279), мРНК. /PROD=complement C1r-like proteinase precursor, /FL=gb:AF178985.1 gb:NM_016546.1
0,631332
4,218347
12,02
Повышение
2.78E-04
AI130705
Гены EST с низкой степенью подобия с A46302, фактором сплайсинга, ассоциированным с PTB, длинная форма (H.sapiens)
0,449933
4,035966
12,01
Повышение
1.08E-03
Z21533
H.sapiens, ген HEX, кодирующий связанный с гомеобоксом белок. /PROD=homeobox related protein
-0,29145
3,291186
11,98
Повышение
1.87E-03
AI197932
Гены EST
-0,12863
3,441776
11,88
Повышение
9.23E-04
AV699825
Homo sapiens, кДНК: FLJ13221 fis, клон NT2RP4002075
-1,2534
2,309237
11,82
Повышение
1.91E-03
AW167727
Гены EST
-3,44338
0,118393
11,81
Повышение
5.12E-04
AI336920
Гены EST с низкой степенью подобия с I38428, белком T-комплекса 10A (H.sapiens)
-1,74597
1,814225
11,8
Повышение
1.77E-02
AW269818
гипотетический белок FLJ23403 /FL=gb:NM_022068.1
-1,28224
2,27746
11,79
Повышение
4.88E-04
NM_005568
Homo sapiens, LIM гомеобоксный белок 1 (LHX1), мРНК. /PROD=LIM homeobox protein 1 /FL=gb:NM_005568.1 gb:U14755.1
-1,28314
2,272713
11,76
Повышение
1.08E-02
NM_001884
Homo sapiens, хрящевой связывающий белок 1 (CRTL1), мРНК. /PROD=cartilage linking protein 1 /FL=gb:NM_001884.1 gb:U43328.1
0,085832
3,636571
11,72
Повышение
5.91E-04
AA639753
Гены EST
-0,41626
3,117859
11,58
Повышение
4.87E-04
BF110534
Гены EST
0,134434
3,659063
11,51
Повышение
4.41E-04
AV758821
Гены EST с низкой степенью подобия с Z132_HUMAN, ЦИНК-ПАЛЬЦЕВЫМ БЕЛКОМ 13 (H.sapiens)
-0,13959
3,371263
11,4
Повышение
1.78E-04
BG109855
Homo sapiens, клон TUA8, область, связанная с синдромом кошачьего крика, мРНК
-0,21951
3,281608
11,32
Повышение
4.51E-04
AL575177
noggin /FL=gb:NM_005450.1
1,470971
4,963113
11,25
Повышение
1.58E-04
NM_022825
Homo sapiens, ген porcupine (MG61), мРНК. /PROD=porcupine /FL=gb:AF317059.1 gb:AF317058.1 gb:NM_022825.1
-1,77455
1,705193
11,16
Повышение
9.89E-03
AF140507
Homo sapiens, Ca2+кальмодулин-зависимой протеинкиназы киназа бета (CAMKKB), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Ca2+calmodulin-dependent protein kinase kinasebeta /FL=gb:AF140507.1
-0,63867
2,838534
11,14
Повышение
1.33E-04
BF508948
форболин-подобный белок MDS019
1,372194
4,848723
11,13
Повышение
2.69E-04
AI677701
Гены EST с низкой степенью подобия с S38383, белком SEB4B (H.sapiens)
2,377335
5,850689
11,11
Повышение
3.11E-04
NM_005328
Homo sapiens, гиалуронансинтаза 2 (HAS2), мРНК. /PROD=hyaluronan synthase 2 /FL=gb:U54804.1 gb:NM_005328.1
0,244521
3,706479
11,02
Повышение
1.54E-04
AF190725
Homo sapiens, фермент расщепления белка-предшественника амилоида по бета сайту (BACE), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=beta-site APP cleaving enzyme /FL=gb:AF200343.1 gb:AF204943.1 gb:AF190725.1 gb:AF201468.1 gb:NM_012104.1
1,790331
5,251922
11,02
Повышение
3.68E-04
AA775681
гипотетический белок FLJ23091
1,592531
5,049671
10,98
Повышение
7.29E-04
BE502982
Гены EST
4,042679
7,483078
10,86
Повышение
6.31E-05
NM_005454
Homo sapiens, гомолог гена cerberus 1 (Xenopus laevis) (суперсемейство белков с цистеиновым узлом) (CER1), мРНК. /PROD=cerberus 1 /FL=gb:NM_005454.1
4,897427
-0,40571
39,48
Снижение
5.51E-03
R06655
Гены EST со средней степенью подобия с белком AF078844 1 hqp0376 (H.sapiens)
2,000419
-2,84891
28,83
Снижение
3.77E-03
NM_031272
Homo sapiens, экспрессируемая в яичках последовательность 14 (TEX14), мРНК. /PROD=testis expressed sequence 14 /FL=gb:NM_031272.1
2,75017
-1,94826
25,96
Снижение
1.63E-04
NM_014851
Homo sapiens, генный продукт KIAA0469 (KIAA0469), мРНК. /PROD=KIAA0469 gene product /FL=gb:AB007938.1 gb:NM_014851.1
3,862686
-0,73843
24,27
Снижение
7.42E-04
NM_007115
Homo sapiens, индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 (TNFAIP6), мРНК. /PROD=tumor necrosis factor, alpha-induced protein 6 /FL=gb:NM_007115.1
0,144221
-4,24111
20,9
Снижение
1.35E-02
BC028359
Homo sapiens, клон IMAGE:4828836, мРНК.
3,77776
-0,50822
19,51
Снижение
1.45E-04
BU729850
гипотетический белок LOC153469
0,99752
-3,16289
17,88
Снижение
1.40E-02
AB046400
Homo sapiens, мРНК для белка SCCA2b, полная кодовая последовательность. /PROD=SCCA2b /FL=gb:AB046400.1
3,409815
-0,56562
15,73
Снижение
3.09E-04
NM_016588
Homo sapiens, нейритин (LOC51299), мРНК. /PROD=neuritin /FL=gb:NM_016588.1 gb:BC002683.1 gb:AF136631.1
0,757197
-3,1394
14,89
Снижение
1.40E-03
AF213459
Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
0,381955
-3,46654
14,41
Снижение
2.29E-03
NM_017655
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ20075 (FLJ20075), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ20075 /FL=gb:NM_017655.1
0,579765
-3,20358
13,77
Снижение
1.32E-04
AI393930
Гены EST
3,655193
-0,10882
13,59
Снижение
1.31E-02
AI659927
Homo sapiens кДНК: FLJ22547 fis, клон HSI00356
5,303843
1,677393
12,35
Снижение
4.78E-04
AI129626
Гены EST
1,10782
-2,42265
11,56
Снижение
1.71E-02
BC029425
Homo sapiens, белок, подобный KIAA1275, клон IMAGE:4616553, мРНК.
2,28595
-1,22933
11,43
Снижение
1.44E-03
BE504838
Гены EST
2,514693
-0,98766
11,33
Снижение
3.64E-04
NM_145032
Homo sapiens, гипотетический белок MGC21636 (MGC21636), мРНК. /FL=gb:BC020572.1 gb:NM_145032.2
2,982965
-0,50149
11,19
Снижение
1.41E-03
AK026829
Homo sapiens, кДНК: FLJ23176 fis, клон LNG10452.
2,350127
-1,0564
10,6
Снижение
4.33E-04
AK026106
Homo sapiens, кДНК: FLJ22453 fis, клон HRC09679, с высокой степенью подобия cAF059516, мРНК толлоид-подобного белка 2 (TLL2), Homo sapiens.
1,892794
-1,50555
10,54
Снижение
5.19E-03
AL138349
белок KIAA0367
1,357098
-1,99222
10,19
Снижение
1.15E-02
AW026426
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp761J1324 (из клона DKFZp761J1324)
0,860464
-2,46893
10,05
Снижение
1.07E-02
NM_003007
Homo sapiens, семеногелин I (SEMG1), мРНК. /PROD=semenogelin I /FL=gb:J04440.1 gb:NM_003007.1
4,308564
0,981775
10,03
Снижение
2.66E-04
NM_171999
Homo sapiens, sal-подобный белок 3 (Drosophila) (SALL3), мРНК. /PROD=sal-like 3 /FL=gb:NM_171999.1
0,857744
-2,42855
9,76
Снижение
3.75E-02
AB085901
Homo sapiens, DBL мРНК для DBL прото-онкогена, вариант сплайсинга 1, полная кодовая последовательность. /PROD=DBL proto-oncogene splicing variant 1 /FL=gb:AB085901.1
3,947271
0,673296
9,67
Снижение
6.85E-03
AI928035
Гены EST
4,847114
1,59891
9,5
Снижение
3.74E-03
NM_006474
Homo sapiens, связанный с клеточной мембраной гликопротеин легочного типа-I (T1A-2), вариант транскрипта 2, мРНК. /PROD=lung type-I cell membrane-associatedglycoprotein, isoform 2 precursor /FL=gb:NM_006474.1 gb:AF030428.1
4,796495
1,557748
9,44
Снижение
1.32E-04
AI653107
Гены EST
4,952105
1,726419
9,35
Снижение
1.09E-03
BG164365
белок, связанный с микротрубочками 1B /FL=gb:NM_005909.1
5.398488
2.236155
8.95
Снижение
2.40E-04
NM_001134
Homo sapiens, альфа-фетопротеин (AFP), мРНК. /PROD=alpha-fetoprotein /FL=gb:NM_001134.1 gb:J00077.1
1,360363
-1,7842
8,84
Снижение
7.29E-03
BM479034
Homo sapiens, клон IMAGE:5301169, мРНК
2,336954
-0,80072
8,8
Снижение
5.07E-02
AI632259
Гены EST
4,788115
1,679617
8,62
Снижение
1.42E-04
AW014743
Гены EST
3,094055
-0,00508
8,57
Снижение
1.58E-04
AW188198
индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 /FL=gb:NM_007115.1
3,380359
0,288493
8,53
Снижение
1.58E-04
AI553933
переносчик растворенных веществ, семейство 30 (переносчик цинка), член 1
6,568635
3,486111
8,47
Снижение
3.77E-04
AL031602
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-1174N9 на хромосоме 1p34.1-35.3. Содержит ген нового белка с IBR-доменом, ген (псевдо?) нового белка, сходного с MT1E (металлотионеин 1E (функциональный)), гены EST, STS, GSS и два предполагаемых Cp...
2,79562
-0,27455
8,4
Снижение
6.95E-04
NM_024582
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ23056 (FLJ23056), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ23056 /FL=gb:NM_024582.1
4,507212
1,466775
8,23
Снижение
1.45E-04
AW196940
Гены EST
1,349693
-1,67509
8,14
Снижение
2.76E-04
AI963083
Гены EST
3,19487
0,179371
8,09
Снижение
2.85E-03
NM_173553
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ25801 (FLJ25801), мРНК. /FL=gb:NM_173553.1
5,650767
2,645343
8,03
Снижение
1.24E-03
NM_002006
Homo sapiens, фактор роста фибробластов 2 (основной) (FGF2), мРНК. /PROD=fibroblast growth factor 2 (basic) /FL=gb:NM_002006.1 gb:M27968.1
3,113698
0,120494
7,96
Снижение
1.54E-03
NM_002196
Homo sapiens, ассоциированный с инсулиномой белок 1 (INSM1), мРНК. /PROD=insulinoma-associated 1 /FL=gb:NM_002196.1 gb:M93119.1
3,56272
0,596221
7,82
Снижение
1.58E-04
NM_003247
Homo sapiens, тромбоспондин 2 (THBS2), мРНК. /PROD=thrombospondin 2 /FL=gb:NM_003247.1 gb:L12350.1
2,273566
-0,68409
7,77
Снижение
1.21E-03
AL133653
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434M2415 (из клона DKFZp434M2415).
4,143011
1,250592
7,43
Снижение
8.26E-04
AW664953
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434P1115 (из клона DKFZp434P1115); частичная кодовая последовательность
4,012773
1,121978
7,42
Снижение
1.58E-04
NM_006275
Homo sapiens, фактор сплайсинга, богатый аргининсерином, 6 (SFRS6), мРНК. /PROD=splicing factor, arginineserine-rich 6 /FL=gb:U30883.1 gb:NM_006275.1
4,178686
1,291693
7,4
Снижение
1.22E-03
NM_003256
Homo sapiens, тканевый ингибитор металлопротеиназы 4 (TIMP4), мРНК. /PROD=tissue inhibitor of metalloproteinase 4precursor /FL=gb:NM_003256.1 gb:U76456.1
1,179422
-1,69499
7,33
Снижение
7.84E-03
N21096
Гены EST
4,39721
1,545243
7,22
Снижение
1.25E-02
NM_018063
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10339 (FLJ10339), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10339 /FL=gb:NM_018063.1
1,200505
-1,65141
7,22
Снижение
2.22E-04
AI939511
Гены EST
2,763752
-0,07502
7,15
Снижение
1.05E-02
AI078169
Homo sapiens, кДНК: FLJ23176 fis, клон LNG10452
2,456617
-0,3811
7,15
Снижение
1.10E-03
AW274018
Гены EST
3,806044
0,973798
7,12
Снижение
3.11E-04
AV734646
Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
1,05854
-1,7603
7,06
Снижение
1.28E-02
AI703321
белок типа wingless семейства сайта интеграции MMTV, член 5A
3,365852
0,550606
7,04
Снижение
4.65E-04
NM_003392
Homo sapiens, белок типа wingless семейства сайта интеграции MMTV, член 5A (WNT5A), мРНК. /PROD=wingless-type MMTV integration site family,member 5A /FL=gb:NM_003392.1 gb:L20861.1
2,768094
-0,0094
6,86
Снижение
1.91E-04
AI968085
белок типа wingless семейства сайта интеграции MMTV, член 5A
0,951905
-1,82311
6,84
Снижение
3.46E-02
NM_003070
Homo sapiens, связанный с SWISNF, ассоциированный с матриксом, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство a, член 2 (SMARCA2), мРНК. /PROD=SWISNF related, matrix associated, actindependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 /FL=gb:NM_003070.1 gb
4,715355
1,945181
6,82
Снижение
5.10E-04
AA788946
Гены EST со средней степенью подобия с CA1C, АЛЬФА 1-ЦЕПЬЮ КРЫСИНОГО КОЛЛАГЕНА (XII) (R.norvegicus)
2,967768
0,209555
6,77
Снижение
2.08E-03
AL121753
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP4-614O4 на хромосоме 20q11.1-12. Содержит 3-часть MMP24 (ген матриксной металлопротеиназы 24 (вставленной в мембрану)), ген ITGB4BP (белка, связывающего интегрин-бета 4), 3-конец нового гена, 3-конец ...
3,932141
1,175689
6,76
Снижение
9.73E-04
NM_004490
Homo sapiens, связанный с рецепторами фактора роста белок 14 (GRB14), мРНК. /PROD=growth factor receptor-bound protein 14 /FL=gb:L76687.1 gb:NM_004490.1
1,515893
-1,22358
6,68
Снижение
3.73E-04
AF146343
Homo sapiens, фактор связывания с промотером CYP7A (CPF), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=CYP7A promoter binding factor /FL=gb:NM_003822.1 gb:AF146343.1 gb:U80251.1
1,264681
-1,46804
6,65
Снижение
9.80E-03
BF724558
Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
1,713798
-1,01596
6,63
Снижение
1.04E-03
AI692645
Гены EST
3,725552
1,002058
6,6
Снижение
1.05E-03
AL136805
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434J1521 (из клона DKFZp434J1521); полная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein /FL=gb:AL136805.1
3,08363
0,365051
6,58
Снижение
1.15E-03
U73778
Предшественник человеческого коллагена типа XII альфа-1 (COL12A1), мРНК. /PROD=collagen type XII alpha-1 /FL=gb:NM_004370.3
5,13621
2,424893
6,55
Снижение
1.22E-03
BC013944
Homo sapiens, подобный миозину, тяжелый полипептид 7, сердечная мышца, бета, клон IMAGE:4064393, мРНК.
2,316204
-0,37946
6,48
Снижение
4.62E-03
R21486
sal-подобный (Drosophila) белок 3
4,90146
2,20907
6,46
Снижение
2.13E-03
AB037813
Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1392, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1392 protein
3,863484
1,1739
6,45
Снижение
2.04E-04
BE552428
гипотетический белок PRO2176
2,11536
-0,56359
6,4
Снижение
2.50E-04
AI919519
Гены EST
7,149479
4,474262
6,39
Снижение
4.95E-04
M10943
Человеческий If-ген металлотионеина (hMT-If)
7,360687
4,694371
6,35
Снижение
4.22E-04
BF217861
металлотионеин 1E (функциональный)
5,343502
2,678631
6,34
Снижение
1.35E-02
AI685060
калдезмон 1 /FL=gb:M64110.1 gb:NM_004342.2
7,144308
4,501103
6,25
Снижение
7.42E-04
BF246115
белок, связанный с РНК-геликазой
1,075159
-1,5631
6,23
Снижение
4.27E-02
J03580
Человеческий паратиреоидподобный белок (связанный со злокачественной гуморальной гиперкальцемией), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:J03580.1
1,640803
-0,9861
6,18
Снижение
3.01E-03
BC042832
Homo sapiens, клон IMAGE:5314747, мРНК.
1,012356
-1,60426
6,13
Снижение
5.10E-04
BC036731
Homo sapiens, подобный генному продукту KIAA0441 белок, клон MGC:45124 IMAGE:5578893, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Similar to KIAA0441 gene product /FL=gb:BC036731.1
2,64743
0,040287
6,09
Снижение
2.48E-03
AI702438
Гены EST
2,324824
-0,28186
6,09
Снижение
1.61E-03
AL096771
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP1-238D15 на хромосоме 6q12-14.3 Содержит часть гена COL12A1 (коллаген, тип XII, альфа 1) и гены STS
1,840613
-0,75086
6,03
Снижение
1.02E-02
AI949760
Гены EST с низкой степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
4,229884
1,643039
6,01
Снижение
1,12E-02
BC032716
Homo sapiens, клон MGC:45425 IMAGE:5518697, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:45425) /FL=gb:BC032716.1
1,041771
-1,52819
5,94
Снижение
2.75E-02
AI798863
Гены EST
5,715937
3,148402
5,93
Снижение
1.89E-04
U85658
Человеческий транскрипционный фактор ERF-1, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ERF-1 /FL=gb:NM_003222.1 gb:U85658.1
1,546166
-1,02082
5,93
Снижение
1.96E-03
NM_003182
Homo sapiens, тахикинин, предшественник 1 (соединение K, соединение P, нейрокинин 1, нейрокинин 2, нейромедин L, нейрокинин альфа, нейропептид K, нейропептид гамма) (TAC1), вариант транскрипта бета, мРНК. /PROD=tachykinin 2 precursor, isoform beta /FL=gb:U3
0,170617
-2,3896
5,9
Снижение
2.62E-02
AI760495
Гены EST
2,262799
-0,29226
5,88
Снижение
5.43E-03
AV725365
Связанный с SWISNF, ассоциированный с матриксом, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство a, член 2 /FL=gb:NM_003070.1 gb:D26155.1
2,256527
-0,29339
5,86
Снижение
9.65E-05
T68445
Гены EST
3,280973
0,732773
5,85
Снижение
8.36E-03
AL139377
Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-251J8 на хромосоме 13. Содержит гены EST, STS, GSS и островок CpG. Содержит два новых гена с двумя изоформами каждый, и ген KIAA0610 с двумя изоформами
2,396883
-0,14976
5,84
Снижение
9.07E-04
NM_000426
Homo sapiens, ламинин, альфа 2 (мерозин, врожденная мышечная дистрофия) (LAMA2), мРНК. /PROD=laminin alpha 2 subunit precursor /FL=gb:NM_000426.1
4,738703
2,192611
5,84
Снижение
5.19E-04
NM_014033
Homo sapiens, белок DKFZP586A0522 (DKFZP586A0522), мРНК. /PROD=DKFZP586A0522 protein /FL=gb:NM_014033.1
0,624075
-1,92148
5,84
Снижение
4.41E-02
NM_173549
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ39553 (FLJ39553), мРНК. /FL=gb:NM_173549.1
4,904591
2,37385
5,78
Снижение
4.91E-03
NM_003246
Homo sapiens, тромбоспондин 1 (THBS1), мРНК. /PROD=thrombospondin 1 /FL=gb:NM_003246.1
7,424722
4,894249
5,78
Снижение
3.11E-04
AF333388
Homo sapiens, металлотионеин 1H-подобный белок, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=metallothionein 1H-like protein /FL=gb:AF333388.1
3,368771
0,840887
5,77
Снижение
1.30E-04
BE502594
Гены EST
0,899011
-1,62659
5,76
Снижение
2.54E-02
NM_002820
Homo sapiens, подобный паратиреоидному гормону гормон (PTHLH), мРНК. /PROD=parathyroid hormone-like hormone /FL=gb:J03802.1 gb:NM_002820.1
2,626097
0,101116
5,76
Снижение
2.74E-03
NM_001149
Homo sapiens, анкирин 3, узел Ранвье (анкирин G) (ANK3), вариант транскрипта 2, мРНК. /PROD=ankyrin 3, isoform 2 /FL=gb:NM_001149.1 gb:U43965.1
0,424388
-2,09844
5,75
Снижение
2.63E-02
NM_002433
Homo sapiens, гликопротеин миелина олигодендроцитов (MOG), мРНК. /PROD=myelin oligodendrocyte glycoprotein /FL=gb:U18798.1 gb:U64564.1 gb:NM_002433.1
2,572851
0,057742
5,72
Снижение
1.48E-03
AW592563
продукт гена KIAA0455
7,768254
5,269899
5,65
Снижение
2.22E-04
NM_005953
Homo sapiens, металлотионеин 2A (MT2A), мРНК. /PROD=metallothionein 2A /FL=gb:NM_005953.1
2,883717
0,391944
5,62
Снижение
1.29E-03
NM_001236
Homo sapiens, карбонилредуктаза 3 (CBR3), мРНК. /PROD=carbonyl reductase 3 /FL=gb:NM_001236.2 gb:BC002812.1 gb:AB004854.1
2,36447
-0,12562
5,62
Снижение
6.57E-03
NM_005181
Homo sapiens, карбоангидраза III, специфичная для мышц (CA3), мРНК. /PROD=carbonic anhydrase III /FL=gb:BC004897.1 gb:NM_005181.2
1,578748
-0,89916
5,57
Снижение
2.81E-04
AW874669
Гены EST
5,295204
2,822156
5,55
Снижение
6.08E-04
D32039
мРНК человеческого pgH3 для протеогликана PG-M(V3), полная кодовая последовательность. /PROD=proteoglycan PG-M(V3) /FL=gb:D32039.1
5,817948
3,354828
5,51
Снижение
1.13E-04
NM_020662
Homo sapiens, переносчик, подобный дрожжевому белку MRS2 (MRS2L), мРНК. /PROD=transporter similar to yeast MRS2 /FL=gb:AF288288.1 gb:NM_020662.1
0,915911
-1,54553
5,51
Снижение
2.09E-02
N50912
Гены EST
3,557525
1,099544
5,49
Снижение
2.08E-03
BF514079
Kruppel-подобный фактор 4 (кишечный)
2,055951
-0,39628
5,47
Снижение
1.36E-02
NM_001035
Homo sapiens, рианодиновый рецептор 2 (сердечный) (RYR2), мРНК. /PROD=ryanodine receptor 2 (cardiac) /FL=gb:NM_001035.1
1,657973
-0,79412
5,47
Снижение
1.69E-02
NM_001709
Homo sapiens, нейротрофический фактор головного мозга (BDNF), мРНК. /PROD=brain-derived neurotrophic factor /FL=gb:NM_001709.1
4,154511
1,702833
5,47
Снижение
4.62E-03
AJ010395
Homo sapiens, ген DKC1, экзоны 1-11
5,041032
2,594003
5,45
Снижение
1.54E-03
AK022686
Homo sapiens, кДНК: FLJ12624 fis, клон NT2RM4001754.
3,795526
1,350041
5,45
Снижение
6.34E-04
AI871745
Гены EST
4,294951
1,865106
5,39
Снижение
7.73E-04
AI634411
Гены EST
1,677862
-0,74993
5,38
Снижение
2.64E-02
AW140122
Гены EST с низкой степенью подобия с ALU4_HUMAN ALU SUBFAMILY SB2 SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
5,43052
3,00534
5,37
Снижение
3.45E-04
AU154455
ассоциированный с клеточной мембраной гликопротеин легочного типа-I
2,056044
-0,36367
5,35
Снижение
2.80E-03
NM_004352
Homo sapiens, предшественник церебеллина 1 (CBLN1), мРНК. /PROD=cerebellin 1 precursor /FL=gb:NM_004352.1 gb:M58583.1
2,332365
-0,08446
5,34
Снижение
3.73E-04
NM_022783
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ12428 (FLJ12428), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ12428 /FL=gb:NM_022783.1 gb:AL136678.1
0,261162
-2,15545
5,34
Снижение
3.31E-03
AW023227
Гены EST
5,441963
3,026487
5,33
Снижение
9.59E-04
NM_016651
Homo sapiens, белок нового гена-3 гепатоклеточной карциномы (LOC51339), мРНК. /PROD=heptacellular carcinoma novel gene-3 protein /FL=gb:NM_016651.2 gb:AF251079.2
1,389794
-1,02563
5,33
Снижение
1.41E-03
BG498699
Гены EST
1,611395
-0,79534
5,3
Снижение
1.89E-02
AI633640
Гены EST
2,816671
0,411432
5,3
Снижение
1.27E-03
AB002438
Homo sapiens, мРНК из хромосомы 5q21-22, клон: FBR89.
3,12458
0,725853
5,27
Снижение
1.05E-03
AW028075
Гены EST с высокой степенью подобия с нестином S21424 (H.sapiens)
2,904034
0,514711
5,24
Снижение
1.73E-02
NM_017503
Homo sapiens, ген surfeit 2 (SURF2), мРНК. /PROD=surfeit 2 /FL=gb:NM_017503.1
1,639038
-0,74617
5,22
Снижение
4.51E-04
AW027879
Гены EST с низкой степенью подобия с предшественником декорина NBHUC8 (H.sapiens)
1,861339
-0,51278
5,18
Снижение
1.56E-03
NM_003822
Homo sapiens, ядерный рецептор, подсемейство 5, группа A, член 2 (NR5A2), мРНК. /PROD=nuclear receptor subfamily 5, group A, member 2 /FL=gb:NM_003822.1 gb:AF146343.1 gb:U80251.1
7,224807
4,851007
5,18
Снижение
4.41E-04
NM_005951
Homo sapiens, металлотионеин 1H (MT1H), мРНК. /PROD=metallothionein 1H /FL=gb:NM_005951.1
5,094773
2,721788
5,18
Снижение
2.50E-03
BC001811
Homo sapiens, подобный гомологу регулятора рибосомальной устойчивости (S. cerevisiae) белок, клон MGC:2755, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Similar to regulator for ribosome resistancehomolog (S. cerevisiae) /FL=gb:BC001811.1
5,332534
2,968398
5,15
Снижение
1.32E-03
AW189885
протокадгерин 18
1,117304
-1,24345
5,14
Снижение
1.21E-03
AL046992
сопряженный с G-белком рецептор 1 /FL=gb:NM_005279.1
7,426418
5,068036
5,13
Снижение
8.05E-04
NM_005952
Homo sapiens, металлотионеин 1X (MT1X), мРНК. /PROD=metallothionein 1X /FL=gb:NM_005952.1
3,508683
1,151949
5,12
Снижение
1.91E-04
AK027231
Homo sapiens, кДНК: FLJ23578 fis, клон LNG12709.
3,243916
0,897369
5,09
Снижение
1.91E-04
NM_021614
Homo sapiens, калиевый промежуточный активируемый кальцием канал с малой проводимостью, подсемейство N, член 2 (KCNN2), мРНК. /PROD=potassium intermediatesmall conductancecalcium-activated channel, subfamily N, member 2 /FL=gb:NM_021614.1 gb:AF239613.1
3,396839
1,052549
5,08
Снижение
3.25E-04
BC043295
Homo sapiens, цинк-пальцевый белок 398, клон MGC:44469 IMAGE:5298104, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=zinc finger protein 398 /FL=gb:BC043295.1
2,750597
0,411007
5,06
Снижение
1.55E-02
NM_006942
Homo sapiens, SRY (определяющий пол участок Y-хромосомы)-бокс 20 (SOX20), мРНК. /PROD=SRY (sex determining region Y)-box 20 /FL=gb:NM_006942.1 gb:BC000985.1 gb:AB006867.1
1,709228
-0,63019
5,06
Снижение
1.50E-02
AI375083
Гены EST
5,819522
3,484185
5,05
Снижение
4.28E-04
AK023446
Homo sapiens, кДНК: FLJ13384 fis, клон PLACE1001062, с высокой степенью подобия с Homo sapiens мРНК для лизин-кетоглутаратредуктазы сахаропиндегидрогеназы.
4,038177
1,706644
5,03
Снижение
6.66E-04
BF449053
Гены EST
0,310919
-2,01457
5,01
Снижение
4.41E-02
BG054792
Гены EST
2,360697
0,036146
5,01
Снижение
2.65E-02
NM_018042
Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10260 (FLJ10260), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10260 /FL=gb:NM_018042.1
3,553409
1,229902
5,01
Снижение
7.70E-04
NM_004845
Homo sapiens, фосфат-цитидилилтрансфераза 1, холин, изоформа бета (PCYT1B), мРНК. /PROD=phosphate cytidylyltransferase 1, choline, betaisoform /FL=gb:AF052510.1 gb:NM_004845.1
6,93459
4,611479
5
Снижение
4.34E-04
AF078844
Homo sapiens, мРНК для белка hqp0376, полная кодовая последовательность. /PROD=hqp0376 protein /FL=gb:AF078844.1
Таблица VII
Коэффициенты корреляции между дифференцированными эмбриональными стволовыми клетками, клетками EXPRES 01, EXPRES 02, и различные точки по времени в ходе дифференцировки в сформированную эндодерму
Эмбриональные стволовые клетки
EXPRES 02
EXPRES 01
EXPRES 02
0,882
EXPRES 01
0,906
0,912
2 час стадии СЭ
0,914
0,895
0,922
6 час стадии СЭ
0,904
0,887
0,915
24 час стадии СЭ
0,912
0,898
0,924
30 час стадии СЭ
0,91
0,902
0,926
48 час стадии СЭ
0,906
0,913
0,921
72 час стадии СЭ
0,896
0,918
0,91
96 час стадии СЭ
0,895
0,919
0,912
5 день стадии СЭ
0,883
0,925
0,904
Таблица VIII
Величины OD490 для клеток EXPRES 01 и 02, культивированных в течение 4 часов в условиях гипоксии или при атмосферном содержании кислорода
a)
Планшет 1 нормальный кислород
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
клеток/
лунка
1,2163
1,2607
1,2923
1,4392
1,3991
1,3549
0,8957
0,9162
0,8877
0,8854
0,9165
0,9030
80000
0,8215
0,8665
0,8850
0,9298
0,9727
0,9451
0,7175
0,7140
0,8123
0,8161
0,7516
0,6362
40000
0,5815
0,6768
0,8321
0,8127
0,8372
0,8159
0,5256
0,4501
0,5246
0,4877
0,4900
0,4308
20000
0,4118
0,4209
0,4460
0,4501
0,5507
0,4664
0,3158
0,3341
0,3181
0,3321
0,2936
0,2979
10000
0,3093
0,3326
0,3262
0,4011
0,3860
0,3997
0,2531
0,2498
0,2458
0,2458
0,2518
0,2189
5000
0,2289
0,2428
0,2292
0,2390
0,2239
0,2718
0,1943
0,1918
0,2006
0,1917
0,1877
0,1888
2500
0,1912
0,2041
0,2061
0,2094
0,2078
0,2089
0,1772
0,1779
0,1731
0,1714
0,1818
0,1758
1250
0,1529
0,1625
0,1637
0,1630
0,1618
0,1628
0,1622
0,1599
0,1696
0,1630
0,1616
0,1644
0
Планшет 2 пониженный кислород
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
клеток/
лунка
1,2492
1,2799
1,2998
1,3045
1,2598
1,2682
0,8743
0,8889
0,9029
0,9095
0,8978
0,9006
80000
0,9462
0,9493
1,1588
1,1644
1,1837
1,1095
0,7572
0,7734
0,8213
0,7843
0,8631
0,6452
40000
0,6420
0,7420
0,8089
0,7952
0,8037
0,7863
0,5278
0,5314
0,5436
0,5488
0,5688
0,4330
20000
0,4250
0,5385
0,5513
0,5684
0,5520
0,5080
0,3608
0,3573
0,3359
0,3490
0,3546
0,2779
10000
0,3191
0,3280
0,3714
0,3683
0,3815
0,3576
0,2547
0,2437
0,2503
0,2415
0,2436
0,2172
5000
0,2240
0,2465
0,2487
0,2642
0,2631
0,2575
0,2016
0,2036
0,1984
0,1952
0,1979
0,1805
2500
0,1919
0,2040
0,1977
0,2054
0,2015
0,2126
0,1827
0,1819
0,1787
0,1794
0,1802
0,1651
1250
0,1029
0,1007
0,1056
0,1048
0,1043
0,1030
0,1662
0,1673
0,1661
0,1633
0,1655
0,1623
0
Expres 01
Expres 02
b)
c)
ср OD планшета
ср OD планшета
Expres 01
Expres 02
Expres 01
Expres 02
1,327
0,901
1,277
0,896
0,903
0,741
1,085
0,774
0,759
0,485
0,763
0,526
0,458
0,315
0,524
0,339
0,359
0,244
0,354
0,242
0,239
0,192
0,251
0,196
0,205
0,176
0,202
0,178
0,161
0,163
0,104
0,165
d)
e)
f)
%CV внутри планшета
%CV внутри планшета
%CV внутри планшета
Expres 01
Expres 02
Expres 01
Expres 02
Expres 01
Expres 02
6,4
1,5
1,7
1,4
5,0
1,4
6,2
9,2
10,1
9,5
12,7
9,2
13,9
7,9
8,4
9,1
10,9
9,2
10,9
5,3
10,0
9,2
12,2
8,3
11,4
5,2
7,1
5,4
9,1
5,1
7,3
2,4
6,0
4,2
6,8
3,4
3,3
2,1
3,5
3,6
3,3
2,9
2,5
2,1
1,7
1,2
22,8
1,7
Таблица IX
Уровни экспрессии цитокинов, факторов роста и рецепторов по результатам измерения на белковых микрочипах
a)
EXPRES 01 Образец №1
EXPRES 01 Образец №2
EXPRES 02 Образец №1
EXPRES 02 Образец №2
ПОЛОЖ.
54,220
54,220
54,220
54,220
ОТРИЦ.
0
0
0
0
Ангиогенин
1,049
957
2,098
1,494
BDNF
461
383
165
219
BLC
173
182
0
206
BMP-4
0
0
0
29
BMP-6
0
0
0
114
CK beta 8-1
0
0
0
0
CNTF
751
870
745
654
EGF
38
88
118
137
Эотаксин
0
43
0
30
Эотаксин-2
0
0
36
44
Эотаксин-3
0
0
0
0
FGF-6
0
0
0
0
FGF-7
122
12
55
62
Flt-3-лиганд
74
39
33
6
Фракталкин
468
376
457
341
GCP-2
327
209
31
11
GDNF
0
0
0
0
GM-CSF
885
847
655
716
I-309
0
8
0
0
IFN-gamma
792
830
702
841
IGFBP-1
199
142
62
99
IGFBP-2
1,262
1,408
846
867
IGFBP-4
0
0
56
98
IGF-I
1,437
1,368
1,880
1,597
IL-10
111
125
95
48
IL-13
470
426
348
445
IL-15
758
633
631
553
IL-16
87
0
0
0
IL-1alpha
1,274
1,022
1,053
1,055
IL-1beta
219
53
0
0
IL-1ra
66
103
0
0
IL-2
934
946
815
829
IL-3
825
930
819
904
IL-4
212
230
213
304
IL-5
959
939
851
849
IL-6
930
891
994
975
IL-7
1,214
1,013
1,005
1,074
Лептин
0
0
0
0
LIGHT
0
0
0
0
MCP-1
1,611
1,632
6,146
4,338
MCP-2
225
203
212
257
MCP-3
463
445
364
248
MCP-4
228
170
244
149
M-CSF
267
342
307
282
MDC
218
299
140
252
MIG
898
863
789
976
MIP-1-delta
107
236
145
281
MIP-3-alpha
386
518
472
495
NAP-2
92
159
91
67
NT-3
0
0
0
0
PARC
90
77
69
230
PDGF-BB
2,623
1,755
467
583
RANTES
0
0
127
102
SCF
0
0
0
0
SDF-1
532
493
168
290
TARC
0
0
0
0
TGF-beta 1
716
788
806
840
TGF-beta 3
73
111
0
16
TNF-alpha
748
825
760
908
TNF-beta
269
316
247
307
b)
EXPRES 01 Образец №1
EXPRES 01 Образец №2
EXPRES 02 Образец №1
EXPRES 02 Образец №2
ПОЛОЖ.
43,203.88
39,506.01
36,640.81
42,748.84
ОТРИЦ.
0,00
0,00
0,00
0,00
Активин A
1,044.38
797,16
429,05
408,73
ALCAM
926,38
812,41
1,132.59
1,111.92
B7-1(CD80)
164,38
193,08
183,69
149,23
BMP-5
62,38
39,17
65,41
67,20
BMP-7
203,88
165,35
203,92
235,90
Кардиотрофин-1
420,38
390,43
330,99
529,97
CD14
551,38
581,78
449,28
504,69
CXCL- 16
144,38
126,52
114,65
144,58
DR6 (TNFRSF21)
317,88
278,12
254,92
294,20
Эндоглин
769,88
610,44
824,79
738,91
ErbB3
453,88
383,50
352,10
276,14
E-Селектин
175,88
145,47
158,63
204,43
Fas-лиганд
325,38
272,11
290,98
421,63
ICAM-2
165,88
105,73
97,51
244,15
IGF-II
8,897.88
9,437.80
8,026.40
5,317.62
IL-1 R II
92,38
2,66
28,91
131,69
IL-10 Rbeta
156,88
65,05
65,41
242,09
IL-13Ralpha2
362,88
140,39
82,12
312,77
IL-18 BPalpha
334,88
267,49
415,86
535,13
IL-18 Rbeta
161,38
97,87
152,47
127,04
IL-2 Ralpha
0,88
0,00
30,23
0,00
IL-2 Rbeta
0,00
2,20
19,24
0,00
IL-2 Rgamma
0,00
0,00
0,00
0,00
IL-21R
452,38
433,42
399,15
458,26
IL-5 Ralpha
446,88
302,62
397,83
297,81
IL-9
340,38
342,83
454,55
325,67
IP-10
364,88
310,01
295,82
382,42
LAP
1,194.38
1,087.42
3,883.43
4,764.05
Лептин R
272,38
200,47
179,29
286,46
LIF
326,38
89,09
74,64
180,18
L-Селектин
83,38
55,35
29,79
97,12
M-CSF R
60,38
0,00
21,00
0,00
MMP-1
12,88
36,86
23,63
62,55
MMP-13
158,38
25,30
54,85
144,58
MMP-9
504,38
450,98
282,19
257,05
MPIF-1
0,00
16,99
50,46
30,57
NGF R
30,38
43,79
29,35
6,84
PDGF AA
442,38
454,68
436,52
356,62
PDGF-AB
507,38
459,76
124,33
187,40
PDGF Ralpha
278,88
228,21
254,92
207,01
PDGF Rbeta
483,38
379,34
413,66
465,48
PECAM-1
199,38
148,25
157,75
181,21
Пролактин
312,88
218,04
184,13
182,25
SCF R
472,88
353,92
454,11
483,02
SDF-1beta
1,047,88
765,73
382,44
469,09
Siglec-5
0,00
0,00
0,00
0,00
TGF-alpha
113,88
123,29
50,90
55,33
TGF beta2
68,38
50,73
14,84
53,27
Tie-1
291,38
218,96
165,22
198,24
Tie-2
57,88
53,50
119,49
94,02
TIMP-4
166,88
143,16
109,38
180,70
VE-Кадгерин
432,38
329,89
1,175.24
208,04
VEGF R2
510,88
367,33
437,40
801,34
VEGF R3
41,38
38,25
20,12
0,00
Внутренний контроль
23,824.38
23,824.38
23,824.38
23,824.38
c)
EXPRES 01 Образец №1
EXPRES 01 Образец №2
EXPRES 02 Образец №1
EXPRES 02 Образец №2
ПОЛОЖ.
55,531.00
63,702.50
55,954.13
76,525.06
ОТРИЦ.
0,00
0,00
0,00
0,00
Acrp30
140,00
100,45
119,63
179,61
AgRP
221,50
239,23
261,80
443,17
Ангиопоэтин-2
0,00
0,00
58,85
104,61
Амфирегулин
0,00
0,00
0,00
0,00
Axl
210,00
351,20
368,94
523,07
bFGF
64,959.00
75,788.69
57,182.11
65,024.38
b-NGF
0,00
0,00
0,00
0,00
BTC
0,00
0,00
0,00
0,00
CCL-28
455,50
399,01
258,71
415,13
CTACK
57,00
48,55
70,18
12,09
Dtk
0,00
0,00
0,00
0,00
EGF-R
83,50
92,28
30,52
33,82
ENA-78
726,00
842,78
781,52
939,43
Fas/TNFRSF6
374,00
460,83
352,97
450,17
FGF-4
232,50
130,77
110,36
218,17
FGF-9
271,00
520,31
295,28
460,69
GCSF
688,00
895,85
223,68
973,77
GITR-Лиганд
0,00
0,00
0,00
0,00
GITR
242,00
109,19
140,75
167,00
GRO
1,380.00
1,572.29
929.87
1,270.97
GRO-alpha
962,00
1,043.39
920,08
1,080.31
HCC-4
162,50
108,03
194,83
217,46
HGF
0,00
0,00
0,00
0,00
ICAM-1
752,00
848,62
571,88
614,89
ICAM-3
0,00
0,00
0,00
0,00
IGFBP-3
169,00
439,25
190,20
372,37
IGFBP-6
314,50
285,89
245,31
368,17
IGF-I SR
236,00
314,46
133,54
237,09
IL-1 R4/ST2
226,00
354,11
283,43
373,77
IL-1 RI
0,00
32,80
0,00
92,70
IL-11
187,50
178,59
135,60
299,47
IL-12 p40
174,00
130,19
91,82
227,28
IL-12 p70
163,00
198,41
140,23
245,50
IL-17
120,00
114,44
72,24
164,89
IL-2 Ralpha
434,50
488,24
422,50
553,21
IL-6 R
163,00
114,44
327,73
144,57
IL-8
741,00
782,72
694,47
1,053,68
I-TAC
721,50
763,48
551,28
754,38
Лимфотактин
177,00
68,37
93,88
135,46
MIF
2,703.00
2,577.05
2,491.12
3,008.58
MIP-1alpha
251,00
257,89
236,56
341,53
MIP-1beta
15,50
0,00
14,55
56,95
MIP-3beta
242,50
233,99
184,02
279,15
MSP-alpha
376,50
303,38
250,98
408,12
NT-4
37,00
101,03
108,81
253,21
Остеопроте-герин
380,50
390,27
432,29
696,90
Онкостатин M
466,50
394,35
361,21
504,15
PIGF
180,50
198,41
195,86
220,27
sgp130
18,00
36,30
203,08
209,05
sTNF RII
0,00
0,00
0,00
0,00
sTNF-RI
11,50
0,00
694,47
267,93
TECK
0,00
0,00
0,00
0,00
TIMP-1
175,00
123,19
172,17
223,77
TIMP-2
1,718.50
2,953.76
487,41
502,74
Тромбопоэтин
256,50
231,65
227,80
256,02
TRAIL R3
0,00
0,00
127,36
94,10
TRAIL R4
239,00
273,64
277,25
370,27
uPAR
104,50
84,12
103,66
319,10
VEGF
311,00
289,97
305,06
523,77
VEGF-D
0,00
0,00
0,00
0,00
Внутренний контроль
18,664.17
18,664.17
18,664.17
18,664.17
