СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ НАСЛЕДСТВЕННОЙ ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТИ К НАРУШЕНИЮ БАРЬЕРНОЙ ФУНКЦИИ КОЖИ Российский патент 2016 года по МПК G01N33/50 

Описание патента на изобретение RU2585960C1

Изобретение относится к медицине и может быть использовано для определения наследственной предрасположенности к нарушению барьерной функции кожи.

Известен способ определения наследственной предрасположенности к нарушению барьерной функции кожи, включающий забор венозной крови, выделение генетического материала, проведение полимеразной цепной реакции синтеза ДНК с последующим анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов, определение нуклеотидной последовательности и на основании этого определение полиморфного варианта 2282del4 гена филаггрина (см. Хантимерова Э.Ф., Нуртдинова Г.М., Карунас А.С., Гималова Г.Ф. Клинико-генетическая характеристика больных атопическим дерматитом и крапивницей с мутациями в гене филаггрина // Фундаментальные исследования. - 2014. - №10 (4). - С. 752-756).

Однако данный способ имеет низкую пропускную способность ввиду невысокой скорости проведения обследования пациентов (время анализа 1-2 дня), ввиду сложности, трудоемкости используемых лабораторных технологий, являющихся вредными для медицинского персонала, проводящего их. Это затрудняет определение наследственной предрасположенности к нарушению барьерной функции кожи, например, при проведении диспансеризации или периодических медицинских осмотров большого количества работающих во вредных и/или опасных условиях труда за короткие (сжатые) сроки времени.

Задачей настоящего изобретения является обеспечение возможности определения наследственной предрасположенности к нарушению барьерной функции кожи за короткие (сжатые) сроки времени (3÷5) час, например, при проведении диспансеризации или периодических медицинских осмотров большого количества работающих во вредных и/или опасных условиях труда.

Техническим результатом изобретения является повышение скорости проведения определения наследственной предрасположенности к нарушению барьерной функции кожи при воздействии на организм факторов раздражающего и сенсибилизирующего действия.

Указанная задача достигается тем, что в известном способе определения наследственной предрасположенности к нарушению барьерной функции кожи, включающем забор венозной крови, выделение генетического материала, проведение полимеразной цепной реакции синтеза ДНК с последующим анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов, определение нуклеотидной последовательности и на основании этого определение полиморфного варианта 2282del4 филаггрина, при проведении полимеразной цепной реакции используют специфические праймеры: «FLG-2 F1» 5'Biotin-TgA-CCA-gCC-TgT-CCA-Tgg-C3'; «FLG-2 R1» 5'CAA-gTg-CAg-gAg-AAA-gAC-ATg-gAT3', размер ампликона - 205 пар оснований, а после проведения полимеразной цепной реакции проводят реакцию пиросеквенирования в режиме реального времени с использованием специфического праймера «FLG-2 S1» 5'gAC-ATT-CAg-AAg-ACT-CAg-AC3' и детекцию нуклеотидной последовательности с помощью хемилюминисцентного сигнала, далее проводят сравнение полученной нуклеотидной последовательности в положении 2282 с референсными последовательностями, после этого при выявлении на полученной пирограмме отсутствия делеции в положении 2282 гена филаггрина при воздействии на организм вредного производственного фактора раздражающего и сенсибилизирующего действия определяют низкую наследственную предрасположенность к нарушению барьерной функции кожи, при выявлении на полученной пирограмме гетерозиготного варианта ins/del в положении 2282 гена филаггрина при воздействии на организм вредного производственного фактора раздражающего и сенсибилизирующего действия определяют высокую наследственную предрасположенность к нарушению барьерной функции кожи.

Проведенные исследования по патентным и научно-техническим информационным источникам показали, что предлагаемый способ неизвестен и не следует явным образом из изученного уровня техники, т.е. соответствует критериям "новизна" и "изобретательский уровень".

Предлагаемый способ может быть применен в клинических, биохимических, молекулярно-генетических лабораториях, укомплектованных широко используемым оборудованием, выпускаемым отечественной или зарубежной промышленностью.

Следовательно, заявленный способ является доступным и практически применимым.

Таким образом, предложена совокупность приемов, позволяющих обеспечить повышение скорости проведения определения наследственной предрасположенности к нарушению барьерной функции кожи, что, в свою очередь, позволит повысить достоверность определения низкой наследственной предрасположенности к нарушению барьерной функции кожи при воздействии на организм вредных производственных факторов раздражающего и сенсибилизирующего действия, например, при проведении диспансеризации или периодических медицинских осмотров большого количества работающих во вредных и/или опасных условиях труда за короткие (сжатые) сроки времени.

В таблице 1 представлена последовательность использованных праймеров.

Предлагаемый способ пояснен на чертеже.

На фиг. 1 изображена пирограмма с вариантом гетерозиготного генотипа по определяемому аллельному варианту, имеющему делецию в положении 2282 (ins/del) (пример 1). На фиг. 2 изображена пирограмма с вариантом гомозиготного генотипа по определяемому аллельному варианту, не имеющему замены делеции, в положении 2282 (ins/ins) в нуклеотидной последовательности - соответствует норме (пример 2).

Предлагаемый способ осуществляют следующим образом.

У пациентов осуществляют забор венозной крови. Из 100 мкл цельной крови выделяют ДНК-сорбент однопробирочным методом с использованием комплекта для выделения "ДНК-сорб-В" (ТУ 9398-071-01897593-2008) в соответствии с инструкцией к используемому комплекту.

Из полученного препарата ДНК (объемом 50 мкл) готовят серии разведений в ТЕ-буфере до конечной концентрации 1-3 нг/мкл, добавляют 10 мкл конечного раствора ДНК в пробирку для осуществления полимеразной цепной реакции со специфическими праймерами.

Объем смеси для полимерной цепной реакции - 25 мкл, при этом используют реагенты производства ФБУН «Центрального НИИ Эпидемиологии»: «2,5×ПЦР-буфер-2-blue», «Смесь dNTPs», праймеры «FLG2-F1» и «FLG2-R1». Количество праймеров в реакцию - 7 пмоль. Для амплификации исследуемого генетического локуса используют специфические олигонуклеотидные праймеры «FLG-2 F1» 5'Biotin-TgA-CCA-gCC-TgT-CCA-Tgg-C3' и «FLG-2 R1» 5'CAA-gTg-CAg-gAg-AAA-gAC-ATg-gAT3', один из которых мечен биотином (последовательность используемых праймеров представлена в табл. 1). Количество праймеров «FLG-2 Fl» 5'Biotin-TgA-CCA-gCC-TgT-CCA-Tgg-C3' и «FLG-2 R1» 5'CAA-gTg-CAg-gAg-AAA-gAC-ATg-gAT3' в полимеразной цепной реакции - 7 пмоль.

Реакцию амплификации проводят по следующей программе.

При использовании, например, амплификатора «Т 100 Thermal Cycler» (фирма Bio Rad, США), когда температура достигнет 95°C (режим паузы), ставят пробирки в ячейки амплификатора и выдерживают их при температуре 95°C - 15 мин. Далее выдерживают пробирки 45 циклов 95°C - 15 секунд, 65°C - 15 секунд, 72°C - 20 секунд.

После проведения амплификации осуществляют пробоподготовку образцов для секвенирования. Продукт амплификации иммобилизируют с 1 мкл частиц «Streptavidin Sepharose» («GE Healthcare», Швеция) в 40 мкл «Буфера для связывания» (ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии»). После иммобилизации проводят серию отмывок с помощью станции для пробопродготовки «PyroMark Q24 Workstation)) («Qiagen», Германия) и набора реагентов «Пиро-преп» (ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии», регистрационное удостоверение № ФСР 2012/13246 от 19 марта 2012 г.). В результате пробоподготовки получают амплифицированный с биотинилированного праймера одноцепочечный ПЦР-фрагмент, который используют в качестве матрицы в реакции пиросеквенирования.

Пиросеквенирование проводят с использованием праймера «FLG2-S1» в количестве 7,5 пмоль и набора реагентов «PyroMark® Gold Q96 Reagents» («Qiagen», Германия) на приборе «PyroMark Q24» («Qiagen», Германия). Последовательность праймера для секвенирования «FLG-2 S1» следующая: 5'gAC-ATT-CAg-AAg-ACT-CAg-АС3'. Последовательность добавления нуклеотидов в реакцию пиросеквенирования: GACACAGATCAGTGTCA.

Далее проводят сравнение полученной нуклеотидной последовательности с референсными последовательностями с помощью программного обеспечения «PyroMark Q24 2.0.6» и по полученной пирограмме определяют, какой вариант мутации имеет место в нуклеотидной последовательности (см., например, фиг. 1 и 2).

При выявлении на полученной пирограмме отсутствия делеции в положении 2282 гена FLG и при воздействии на организм вредного производственного фактора раздражающего и сенсибилизирующего действия определяют низкую наследственную предрасположенность к нарушению барьерной функции кожи, при выявлении на полученной пирограмме гетерозиготного варианта ins/del в положении 2282 гена FLG и при воздействии на организм вредного производственного фактора раздражающего и сенсибилизирующего действия определяют высокую наследственную предрасположенность к нарушению барьерной функции кожи, при которой облегчается проникновение аллергенов и инфекционных агентов через эпидермис, последние инициируют развитие местной и системной аллергической реакции организма, что приводит к развитию профессиональных аллергодерматозов.

Пример 1. Больная Т., 48 лет

При анализе анамнеза и профессионального маршрута пациента было выявлено, что больная Т. работала с 1986 г. по настоящее время гальваником в контакте с соединениями хрома, никеля, кобальта. Считает себя больной с 1987 г., когда впервые появились высыпания на тыльных поверхностях кистей, сопровождавшиеся зудом. Обращалась к дерматологу по месту жительства, получала лечение с временным эффектом. В выходные дни, во время отпуска отмечает улучшение. Впервые направлена в клинику института ФГБНУ «НИИ МТ» для решения вопроса о связи заболевания кожи с профессией в 2002 г. При обследовании была выявлена повышенная чувствительность к солям хрома, никеля, кобальта и дано заключение о профессиональном характере кожного заболевания.

При биохимическом анализе крови обнаружено умеренное повышение уровня печеночных ферментов АЛТ 56 Ед/л (N 0-35 Ед/л), ACT 45 U/1 (N 0-35 U/1), превышение уровня холестерина в сыворотке крови 6,8 ммоль/л (N 3,0-6,2 ммоль/л). При иммунологическом исследовании было определено умеренное повышенное содержание Ig Е к Trichophyton rubrum 1,42 кЕд/л (N до 0,35 кЕд/л). При изучении состояния барьерной функции кожи с помощью прибора "Skin-o-mat" производства фирмы "Cosmomed GmbH", Германия показатели гидратантности были снижены 25,54 (N от 35), уровень рН повышен 6,54 (N 4,5-5,5), содержание липидов на поверхности кожи снижено 2,83 мкг/см2 (N 6,0-6,5 мкг/см2).

Кровь исследовали согласно предлагаемому способу.

Из 100 мкл цельной крови выделяли суммарную ДНК однопробирочным методом с использованием комплекта для выделения "ДНК-сорб-В" (ТУ 9398-071-01897593-2008) в соответствии с инструкцией к используемому комплекту.

Из полученного препарата ДНК (объемом 50 мкл) приготовили серии разведений в ТЕ-буфере до конечной концентрации 1÷3 нг/мкл, добавляли 10 мг конечного раствора ДНК в пробирку для полимеразной цепной реакции. Объем смеси для полимерной цепной реакции - 25 мкл, при этом использовали реагенты производства ФБУН «Центрального НИИ Эпидемиологии»: «2,5×ПЦР-буфер-2-blue», «Смесь dNTPs», праймеры «FLG2-F1» и «FLG2-R1». Количество праймеров в реакцию - 7 пмоль. Для амплификации исследуемого генетического локуса использовали специфические олигонуклеотидные праймеры «FLG-2 F1» 5'Biotin-TgA-CCA-gCC-TgT-CCA-Tgg-C3' и «FLG-2 R1» 5'CAA-gTg-CAg-gAg-AAA-gAC-ATg-gAT3', один из которых мечен биотином (последовательность используемых праймеров представлена в табл. 1). Количество праймеров «FLG-2 F1» 5'Biotin-TgA-CCA-gCC-TgT-CCA-Tgg-C3' и «FLG-2 R1» 5'CAA-gTg-CAg-gAg-AAA-gAC-ATg-gAT3' в полимеразной цепной реакции - 7 пмоль.

Реакцию амплификации проводили по следующей программе.

При использовании амплификатора «Т 100 Thermal Cycler» (фирма Bio Rad, США), когда температура достигла 95°C (режим паузы), ставят пробирки в ячейки амплификатора и выдерживают их при температуре 95°C - 15 мин. Далее выдерживали пробирки 45 циклов 95°C - 15 секунд, 65°C - 15 секунд, 72°C - 20 секунд.

После проведения амплификации осуществляли пробоподготовку образцов для секвенирования. Продукт амплификации иммобилизировали с 1 мкл частиц «Streptavidin Sepharose» («GE Healthcare», Швеция) в 40 мкл «Буфера для связывания» (ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии»). После иммобилизации проводили серию отмывок с помощью станции для пробопродготовки «PyroMark Q24 Workstation («Qiagen», Германия) и набора реагентов «Пиро-преп» (ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии», регистрационное удостоверение № ФСР 2012/13246 от 19 марта 2012 г.). В результате пробоподготовки получали амплифицированный с биотинилированного праймера одноцепочечный ПЦР-фрагмент, который использовали в качестве матрицы в реакции пиросеквенирования.

Пиросеквенирование проводили с использованием праймера «FLG2-S1» в количестве 7,5 пмоль и набора реагентов «PyroMark® Gold Q96 Reagents» («Qiagen», Германия) на приборе «PyroMark Q24» («Qiagen», Германия). Последовательность праймера для секвенирования «FLG-2 S1» следующая: 5'gAC-ATT-CAg-AAg-ACT-CAg-АС3'. Последовательность добавления нуклеотидов в реакцию пиросеквенирования: GACACAGATCAGTGTCA.

Далее провели сравнение полученной нуклеотидной последовательности с референсными последовательностями с помощью программного обеспечения «PyroMark Q24 2.0.6» и по полученной пирограмме определили делецию в гетерозиготном состоянии в положении 2282 (ins/del) гена филаггрин (см. фиг. 1), т.е. синтез белка филаггрина нарушен.

Вывод: у больной В. был выявлен гетерозиготный вариант 2282 (ins/del) гена филаггрин, имеющий делецию в гетерозиготном состоянии, свидетельствующий о нарушении синтеза белка филаггрина, что приводит к нарушению в процессе конечной дифференцировки эпидермиса, приводящего к выраженному нарушению барьерной функции кожи (снижены 25,54 (N от 35), уровень pH повышен 6,54 (N 4,5-5,5), содержание липидов на поверхности кожи снижено 2,83 мкг/см2 (N 6,0-6,5 мкг/см2)).

Это, в свою очередь, привело к развитию профессионального аллергодерматоза через 1 год от начала работы с веществами раздражающего и сенсибилизирующего действия. Время определения наследственной предрасположенности больной Т. к нарушению барьерной функции кожи составило 4,5 часа.

Пример 2. Больной К., 64 года

При анализе анамнеза и профессионального маршрута пациента было выявлено, что больной К. работал с 1969 г. по 2007 г. токарем в контакте с соединениями хрома, никеля, кобальта. Считает себя больным с 2005 г., когда впервые появились высыпания на тыльных поверхностях кистей и предплечий, сопровождавшиеся зудом, далее высыпания распространились на голени. Обращался к дерматологу по месту жительства, получал лечение с временным эффектом. В выходные дни, во время отпуска отмечал улучшение. Впервые направлен в клинику института ФГБНУ «НИИ МТ» для решения вопроса о связи заболевания кожи с профессией в 2008 г. При обследовании была выявлена повышенная чувствительность к солям хрома, никеля, кобальта и дано заключение о профессиональном характере кожного заболевания.

При биохимическом анализе крови не было обнаружено отклонений от норм.

При иммунологическом исследовании не было определено повышенное содержание Ig Е к Trichophyton rubrum 0,1 кЕд/л (N до 0,35 кЕд/л).

При изучении состояния барьерной функции кожи с помощью прибора "Skin-o-mat" производства фирмы "Cosmomed GmbH", Германия, показатели гидратантности были в норме 36,05 (N от 35), уровень pH в пределах нормы 5,3 (N 4,5-5,5), содержание липидов на поверхности кожи снижено 5,5 мкг/см2 (N 6,0-6,5 мкг/см2).

Кровь исследовали согласно предлагаемому способу.

Из 100 мкл цельной крови выделяли суммарную ДНК однопробирочным методом с использованием комплекта для выделения "ДНК-сорб-В"(ТУ 9398-071-01897593-2008) в соответствии с инструкцией к используемому комплекту.

Из полученного препарата ДНК (объемом 50 мкл) приготовили серии разведений в ТЕ-буфере до конечной концентрации 1÷3 нг/мкл, добавляли 10 мг конечного раствора ДНК в пробирку для полимеразной цепной реакции. Объем смеси для полимерной цепной реакции - 25 мкл, при этом использовали реагенты производства ФБУН «Центрального НИИ Эпидемиологии»: «2,5×ПЦР-буфер-2-blue», «Смесь dNTPs», праймеры «FLG2-F1» и «FLG2-R1». Количество праймеров в реакцию - 7 пмоль. Для амплификации исследуемого генетического локуса использовали специфические олигонуклеотидные праймеры «FLG-2 F1» 5'Biotin-TgA-CCA-gCC-TgT-CCA-Tgg-C3' и «FLG-2 R1» 5'CAA-gTg-CAg-gAg-AAA-gAC-ATg-gAT3', один из которых мечен биотином (последовательность используемых праймеров представлена в табл. 1). Количество праймеров «FLG-2 F1» 5'Biotin-TgA-CCA-gCC-TgT-CCA-Tgg-C3' и «FLG-2 R1» 5'CAA-gTg-CAg-gAg-AAA-gAC-ATg-gAT3' в полимеразной цепной реакции - 7 пмоль.

Реакцию амплификации проводили по следующей программе.

При использовании амплификатора «Т 100 Thermal Cycler» (фирма Bio Rad, США), когда температура достигла 95°C (режим паузы), ставят пробирки в ячейки амплификатора и выдерживают их при температуре 95°C - 15 мин. Далее выдерживали пробирки 45 циклов 95°C - 15 секунд, 65°C - 15 секунд, 72°C - 20 секунд.

После проведения амплификации осуществляли пробоподготовку образцов для секвенирования. Продукт амплификации иммобилизировали с 1 мкл частиц «Streptavidin Sepharose» («GE Healthcare», Швеция) в 40 мкл «Буфера для связывания» (ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии»). После иммобилизации проводили серию отмывок с помощью станции для пробопродготовки «PyroMark Q24 Workstation («Qiagen», Германия) и набора реагентов «Пиро-преп» (ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии», регистрационное удостоверение № ФСР 2012/13246 от 19 марта 2012 г.). В результате пробоподготовки получали амплифицированный с биотинилированного праймера одноцепочечный ПЦР-фрагмент, который использовали в качестве матрицы в реакции пиросеквенирования.

Пиросеквенирование проводили с использованием праймера «FLG2-S1» в количестве 7,5 пмоль и набора реагентов «PyroMark® Gold Q96 Reagents» («Qiagen», Германия) на приборе «PyroMark Q24» («Qiagen», Германия). Последовательность праймера для секвенирования «FLG-2 S1» следующая: 5'gAC-ATT-CAg-AAg-ACT-CAg-АС3'. Последовательность добавления нуклеотидов в реакцию пиросеквенирования: GACACAGATCAGTGTCA.

Далее проводили сравнение полученной нуклеотидной последовательности с референсными последовательностями с помощью программного обеспечения «PyroMark Q24 2.0.6» и по полученной пирограмме определили отсутствие делеции в положении 2282 (ins/ins) гена филаггрин (см. фиг. 2), соответствующего норме, т.е. белок филаггрин синтезируется нормально.

Вывод: у больного К. был выявлен гомозиготный вариант FLG (ins/ins) полиморфизма 2282del4, не имеющий делецию в положении 2282, свидетельствующий о нормальном синтезе этого белка, при этом наблюдали умеренное снижение барьерной функции кожи, которое проявляется лишь в снижении содержания липидов на поверхности кожи, что может быть вызвано большим стажем работы с факторами раздражающего и сенсибилизирующего действия (хром, никель, кобальт). При этом профессиональный аллергодерматоз развился через 38 лет от начала работы с факторами раздражающего и сенсибилизирующего действия (хром, никель, кобальт). Время определения наследственной предрасположенности больного К. к нарушению барьерной функции кожи составило 3,0 часа.

Предлагаемый способ прогнозирования наследственной предрасположенности к нарушению барьерной функции кожи позволяет повысить точность полученных результатов за счет снижения до минимума ошибки при интерпретации результатов путем использования компьютерной обработки полученных результатов и скорость проведения анализа (1-2 дня в известном способе и 3-5 часов в предлагаемом способе) по сравнению с прототипом за счет применения новой лабораторной технологии - метода пиросеквенирования, использование которого позволяет в единицу времени проводить большее количество анализов, по результатам которых определяют наследственную предрасположенность к нарушению барьерной функции кожи, например, при проведении диспансеризации или периодических медицинских осмотров большого количества работающих во вредных и/или опасных условиях труда за короткие (сжатые) сроки времени.

Предложенный способ определения наследственной предрасположенности к нарушению барьерной функции кожи может быть использован в клинических, биохимических, молекулярно-генетических лабораториях, укомплектованных оборудованием, выпускаемым отечественной или зарубежной промышленностью.

Похожие патенты RU2585960C1

название год авторы номер документа
Способ прогнозирования риска возникновения кожной патологии в виде меланоза или дисхромии у человека, ассоциированной с избыточной контаминацией мышьяком 2019
  • Долгих Олег Владимирович
  • Аликина Инга Николаевна
  • Кривцов Александр Владимирович
  • Гусельников Максим Анатольевич
  • Мазунина Алена Александровна
  • Никоношина Наталья Алексеевна
  • Челакова Юлия Александровна
  • Казакова Ольга Алексеевна
  • Вдовина Надежда Алексеевна
  • Мухачева Елена Александровна
RU2714325C1
СПОСОБ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ РИСКА РАННЕГО РАЗВИТИЯ ПРОФЕССИОНАЛЬНЫХ АЛЛЕРГИЧЕСКИХ ДЕРМАТОЗОВ 2011
  • Измеров Николай Федотович
  • Кузьмина Людмила Павловна
  • Коляскина Мария Михайловна
  • Измерова Наталья Ивановна
  • Шипулин Герман Александрович
  • Маркелов Михаил Леонидович
  • Миронов Константин Олегович
  • Лазарашвили Нана Анзориевна
  • Безрукавникова Людмила Михайловна
  • Дунаева Елена Алексеевна
  • Петинати Яна Александровна
  • Смирнова Елена Николаевна
RU2467330C1
Способ прогнозирования риска развития хронической истинной экземы у женщин с учетом генетических факторов 2021
  • Чурносов Михаил Иванович
  • Елыкова Анна Владимировна
  • Пономаренко Ирина Васильевна
  • Беляева Татьяна Михайловна
RU2753274C1
Способ прогнозирования риска развития хронической истинной экземы на основе молекулярно-генетических данных 2021
  • Чурносов Михаил Иванович
  • Беляева Татьяна Михайловна
  • Елыкова Анна Владимировна
  • Пономаренко Ирина Васильевна
RU2757936C1
Способ прогнозирования повышенного риска развития хронической истинной экземы у мужчин с использованием данных о полиморфизме гена филаггрина 2021
  • Чурносов Михаил Иванович
  • Беляева Татьяна Михайловна
  • Елыкова Анна Владимировна
  • Пономаренко Ирина Васильевна
RU2750963C1
СПОСОБ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ РИСКА РАЗВИТИЯ ПРОФЕССИОНАЛЬНОЙ БРОНХОЛЕГОЧНОЙ ПАТОЛОГИИ 2010
  • Измеров Николай Федотович
  • Кузьмина Людмила Павловна
  • Шипулин Герман Александрович
  • Миронов Константин Олегович
  • Фомина Валерия Сергеевна
  • Безрукавникова Людмила Михайловна
  • Коляскина Мария Михайловна
  • Дунаева Елена Алексеевна
  • Дедков Владимир Георгиевич
RU2459585C2
СПОСОБ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИАГНОСТИКИ МИТОХОНДРИАЛЬНЫХ ПАТОЛОГИЙ НА ОСНОВЕ ТЕХНОЛОГИИ ПИРОСЕКВЕНИРОВАНИЯ 2015
  • Можей Олег Игоревич
  • Королёва Юлия Александровна
  • Мазунин Илья Олегович
RU2633752C2
Способ выявления мутаций 2282del4, R501X, R2447X в гене филаггрина (FLG) при вульгарном ихтиозе и атопическом дерматите 2018
  • Максимов Владимир Николаевич
  • Максимова Юлия Владимировна
  • Воропаева Елена Николаевна
  • Иванова Анастасия Андреевна
  • Свечникова Елена Владимировна
  • Маринкин Игорь Олегович
  • Воевода Михаил Иванович
RU2673804C1
Способ генотипирования гена TLR8 по полиморфизму rs3764880 и набор олигонуклеотидных праймеров и зондов для его реализации 2023
  • Саламайкина Светлана Андреевна
  • Миронов Константин Олегович
  • Есьман Анна Сергеевна
  • Поздышева Елена Алексеевна
  • Акимкин Василий Геннадьевич
RU2805864C1
Набор олигонуклеотидных праймеров для определения метилирования промотора гена человека CXCR4 в образах биологического материала, подвергшегося предварительной бисульфитной конверсии, методом пиросеквенирования 2022
  • Есьман Анна Сергеевна
  • Саламайкина Светлана Андреевна
  • Салеева Дарья Владиславовна
  • Винокуров Михаил Андреевич
  • Акимкин Василий Геннадьевич
RU2804112C1

Иллюстрации к изобретению RU 2 585 960 C1

Реферат патента 2016 года СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ НАСЛЕДСТВЕННОЙ ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТИ К НАРУШЕНИЮ БАРЬЕРНОЙ ФУНКЦИИ КОЖИ

Изобретение относится к медицине, а именно к способу определения наследственной предрасположенности к нарушению барьерной функции кожи. Сущность способа состоит в том, что из венозной крови осуществляют выделение генетического материала. Проводят полимеразную цепную реакцию синтеза ДНК с последующим анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов, определение нуклеотидной последовательности и на основании этого определение полиморфного варианта 2282del4 филаггрина. При проведении полимеразной цепной реакции используют специфические праймеры: «FLG-2 F1» 5'Biotin-TgA-CCA-gCC-TgT-CCA-Tgg-C3'; «FLG-2 R1» 5'CAA-gTg-CAg-gAg-AAA-gAC-ATg-gAT3', размер ампликона - 205 пар оснований, а после проведения полимеразной цепной реакции проводят реакцию пиросеквенирования в режиме реального времени с использованием специфического праймера «FLG-2 S1» 5'gAC-ATT-CAg-AAg-ACT-CAg-AC3'. Детекцию нуклеотидной последовательности осуществляют с помощью хемилюминисцентного сигнала, далее проводят сравнение полученной нуклеотидной последовательности в положении 2282 с референсными последовательностями. При выявлении на полученной пирограмме отсутствия делеции в положении 2282 гена филаггрина при воздействии на организм вредного производственного фактора раздражающего и сенсибилизирующего действия определяют низкую наследственную предрасположенность к нарушению барьерной функции кожи. При выявлении на полученной пирограмме гетерозиготного варианта ins/del в положении 2282 гена филаггрина определяют высокую наследственную предрасположенность к нарушению барьерной функции кожи. Использование заявленного способа позволяет повысить эффективность определения наследственной предрасположенности к нарушению барьерной функции кожи при воздействии на организм факторов раздражающего и сенсибилизирующего действия. 2 ил., 1 табл., 2пр.

Формула изобретения RU 2 585 960 C1

Способ определения наследственной предрасположенности к нарушению барьерной функции кожи, включающий забор венозной крови, выделение генетического материала, проведение полимеразной цепной реакции синтеза ДНК с последующим анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов, определение нуклеотидной последовательности и на основании этого определение полиморфного варианта 2282del4 филаггрина, отличающийся тем, что при проведении полимеразной цепной реакции используют специфические праймеры: «FLG-2 F1» 5'Biotin -TgA-CCA-gCC-TgT-CCA-Tgg-C3'; «FLG-2 R1» 5'CAA-gTg-CAg-gAg-AAA-gAC-ATg-gAT3", размер ампликона - 205 пар оснований, а после проведения полимеразной цепной реакции проводят реакцию пиросеквенирования в режиме реального времени с использованием специфического праймера «FLG-2 S1» 5'gAC-ATT-CAg-AAg-ACT-CAg-АС3' и детекцию нуклеотидной последовательности с помощью хемилюминисцентного сигнала, далее проводят сравнение полученной нуклеотидной последовательности в положении 2282 с референсными последовательностями, после этого при выявлении на полученной пирограмме отсутствия делеции в положении 2282 гена филаггрина при воздействии на организм вредного производственного фактора раздражающего и сенсибилизирующего действия определяют низкую наследственную предрасположенность к нарушению барьерной функции кожи, при выявлении на полученной пирограмме гетерозиготного варианта ins/del в положении 2282 гена филаггрина при воздействии на организм вредного производственного фактора раздражающего и сенсибилизирующего действия определяют высокую наследственную предрасположенность к нарушению барьерной функции кожи.

Документы, цитированные в отчете о поиске Патент 2016 года RU2585960C1

ХАНТИМЕРОВА Э.Ф
и др
Способ защиты переносных электрических установок от опасностей, связанных с заземлением одной из фаз 1924
  • Подольский Л.П.
SU2014A1
ВЫДЕЛЕННАЯ НУКЛЕИНОВАЯ КИСЛОТА, ПЛАЗМИДА, РЕПЛИЦИРУЕМЫЙ ВЕКТОР ЭКСПРЕССИИ, ТРАНСФОРМИРОВАННАЯ ЛИНИЯ КЛЕТОК МЫШИ 127, ПОЛИПЕПТИД, СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ПРЕДШЕСТВЕННИКА ПОЛИПЕПТИДА, ОБЛАДАЮЩЕГО АКТИВНОСТЬЮ SCCE, ФАРМАЦЕВТИЧЕСКАЯ КОМПОЗИЦИЯ ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ НАРУШЕНИЙ, СВЯЗАННЫХ С КЕРАТИНИЗАЦИЕЙ 1994
  • Торбьерн Егельруд
  • Леннарт Ханссон
RU2160312C2
СПОСОБ ОДНОВРЕМЕННОГО ДНК-ТЕСТИРОВАНИЯ НА НАЛИЧИЕ ПОЛИМОРФИЗМОВ Н63D И C282Y В ГЕНЕ HFE, СВЯЗАННЫХ С НАСЛЕДСТВЕННЫМ ГЕМОХРОМАТОЗОМ 2006
  • Самоходская Лариса Михайловна
  • Ткачук Всеволод Арсеньевич
  • Бочков Валерий Николаевич
  • Балацкий Александр Владимирович
  • Макаревич Павел Игоревич
RU2304170C1
ПАППА И.В
Роль полиморфизма гена филлаггрина в семейной предрасположенности к атопическому дерматиту //

RU 2 585 960 C1

Авторы

Кузьмина Людмила Павловна

Измерова Наталья Ивановна

Коляскина Мария Михайловна

Шипулин Герман Александрович

Миронов Константин Олегович

Ивченко Елена Васильевна

Дунаева Елена Алексеевна

Петинати Яна Александровна

Кузьмин Сергей Николаевич

Коляскин Михаил Владимирович

Даты

2016-06-10Публикация

2015-02-17Подача