АНТИТЕЛО, СОДЕРЖАЩЕЕ Fc-ВАРИАНТНУЮ ЧАСТЬ (ВАРИАНТЫ), ФАРМАЦЕВТИЧЕСКАЯ КОМПОЗИЦИЯ, СОДЕРЖАЩАЯ АНТИТЕЛО, И СПОСОБ ЛЕЧЕНИЯ МЛЕКОПИТАЮЩЕГО Российский патент 2010 года по МПК C07K16/18 A61K39/395 A61P37/00 

Текст описания приведен в факсимильном виде.

Изобретение раскрывает антитело, содержащее Fc-вариантную часть с по меньшей мере одной аминокислотной заменой в Fc-районе исходного полипептида. Данная замена находится в положении аминокислоты, соответствующем положению аминокислоты в аминокислотной последовательности Fc-полипептида человека (положения приведены в формуле изобретения). Антитело проявляет модулированное связывание с FcγR. Описаны варианты антитела с увеличенным сродством к FcγR, в которых указанная замена находится в положении аминокислоты 239, 332 или 267, соответствующем положению аминокислоты в аминокислотной последовательности Fc-полипептида человека (нумерация в соответствии с индексом EU). В изобретении описаны также способ лечения млекопитающего, имеющего антитело-зависимое расстройство с использованием фармацевтической композиции, обладающей модулированным связыванием с FcγR и содержащей антитело или его вариант. Антитела по изобретению обеспечивают в 5 и более раз высокую аффинность по сравнению с исходным Fc-полипептидом. 5 н. и 38 з.п. ф-лы, 44 ил., 66 табл.

1. Антитело, проявляющее модулированное связывание с FcγR в сравнении с антителом, содержащим исходный Fc-полипептид, причем указанное антитело содержит Fc-вариантную часть, содержащую, по меньшей мере, одну аминокислотную замену в Fc-районе указанного исходного Fc-полипептида, причем указанная замена находится в положении аминокислоты, соответствующем положению аминокислоты в аминокислотной последовательности Fc-полипептида человека, выбранному из группы состоящей из 239, 243, 267, 298, 325, 328, 330, 332, 333 и 334, где нумерация приведена в соответствии с индексом EU.

2. Антитело по п.1, где указанная, по меньшей мере, одна аминокислотная замена находится в положении аминокислоты, соответствующем положению аминокислоты в аминокислотной последовательности Fc-полипептида человека, выбранному из группы, состоящей из: 239, 243, 267, 328 и 332.

3. Антитело по п.1, где указанный Fc-вариант содержит, по меньшей мере, одну аминокислотную замену в положении аминокислоты, соответствующем положению в аминокислотной последовательности Fc-полипептида человека, выбранному из группы, состоящей из: 298, 333 и 334.

4. Антитело по п.1, где указанный Fc-вариант содержит, по меньшей мере, одну аминокислотную замену, выбранную из группы, состоящей из 239D, 239Е, 239N, 239Q, 239F, 239Т, 239Н, 239Y, 243W, 243L, 243Y, 243R, 243Q, 267Q, 267L, 298Н, 325Q, 325L, 325I, 325D, 325Е, 325А, 325Т, 325V, 325H, 328М, 328D, 328Е, 328N, 328Q, 328F, 328I, 328V, 328T, 328Н, 328А, 330L, 330Y, 330V, 330I, 330F, 330R, 330Н, 332D, 332Е, 332N, 332Q, 332Т, 332Н, 332Y и 332А.

5. Антитело по п.1, где указанный Fc-вариант дополнительно содержит, по меньшей мере, одну аминокислотную замену, выбранную из группы, состоящей из 221, 222, 224, 227, 228, 230, 231, 223, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 243, 244, 245, 246, 247, 249, 250, 258, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 278, 280, 281, 283, 285, 286, 288, 290, 291, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 302,313, 317, 318, 320, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336 и 428.

6. Антитело по п.1, где указанный Fc-вариант выбран из группы, состоящей из 243W, 243L, 241L/243L/262I/264I, 241W/243W, 241W/243W/262A/264A, 243L/264I, 243L/262I/264W, 241Y/243Y/262T/264T, 241E/243R/262E/264R, 241E/243Q/262T/264E, 241R/243Q/262T/264R, 241E/243Y/262T/264R, 328М, 328Е, 328F, 332Е, 328М/332Е, 264I/332E, 241E/243R/262E/264R/332E, 241E/243Q/262T/264E/332E, 241R/243Q/262T/264R/332E, 241E/243Y/262T/264R/332E, 298А/332Е, 239Е/332Е, 239Q/332E, 239Е, 239E/265G, 239E/265N, 239E/265Q, 267Q/327S, 267L/327S, 330L, 330Y, 332D, 297S/332E, 297D/332E, 297Е/332Е, 265Y/297D/332E, 265Y/297D/299L/332E, 265F/297E/332E, 328I/332E, 328Q/332E, 332N, 332Q, 325Q, 325L, 325I, 239D, 239N, 239F, 239D/332D, 239D/332E, 239D/332N, 239D/332Q, 239E/332D, 239E/332N, 239E/332Q, 239N/332D, 239N/332E, 239N/332N, 239N/332Q, 239Q/332D, 239Q/332N, 239Q/332Q, 241Y/243Y/262T/264T/297D/332E, 330Y/332E, 264I/330Y/332E, 330L/332E, 264I/330L/332E, 239Т, 239Н, 239Y, 298Н, 330V, 330I, 330F, 330R, 330Н, 325D, 325Е, 325А, 325Т, 325V, 325H, 328D/332E, 328Е/332Е, 328N/332E, 328Q/332E, 328V/332E, 328Т/332Е, 328Н/332Е, 328I/332E, 328А, 332Т, 332Н, 332Y, 332А, 239E/264I/332E, 239Q/264I/332E, 239E/264I/330Y/332E, 239E/264I/298A/330Y/332E, 239D/297D/332E, 239E/297D/332E, 239D/265V/297D/332E, 239D/265I/297D/332E, 239D/265L/297D/332E, 239D/265F/297D/332E, 239D/265Y/297D/332E, 239D/265H/297D/332E, 239D/265T/297D/332E, 264E/297D/332E, 296D/297D/332E, 296E/297D/332E, 296N/297D/332E, 296Q/297D/332E, 296H/297D/332E, 296T/297D/332E, 297D/299V/332E, 297D/299I/332E, 297D/299L/332E, 297D/299F/332E, 297D/299H/332E, 297D/299E/332E, 297D/330Y/332E, 297D/298A7330Y/332E, 239D/330I/332E, 239N/330Y/332E, 239D/330L/332E, 239N/330L/332E, 264I/298A/332E, 239D/298A/332E, 239N/298A/332E, 239D/264I/332E, 239D/264I/298A/332E, и 239D/264I/330L/332E.

7. Антитело, проявляющее модулированное связывание с FcγR в сравнении с антителом, содержащим исходный Fc-полипептид, причем указанное антитело содержит Fc-вариантную часть, содержащую, по меньшей мере, одну аминокислотную замену в Fc-районе указанного исходного Fc-полипептида, причем указанная замена находится в положении аминокислоты, соответствующем положению аминокислоты в аминокислотной последовательности Fc-полипептида человека, выбранному из группы состоящей из 239 и 332, где нумерация приведена в соответствии с индексом EU.

8. Антитело по п.7, где указанный Fc-вариант содержит, по меньшей мере, одну аминокислотную замену, выбранную из группы, состоящей из 239D, 239Е, 239N, 239Q, 239F, 239Т, 239Н, 239Y, 332D, 332Е, 332N, 332Q, 332Т, 332Н, 332Y и 332А.

9. Антитело по п.7, где указанный Fc-вариант дополнительно содержит, по меньшей мере, одну аминокислотную замену, выбранную из группы, состоящей из: 221, 222, 224, 227, 228, 230, 231, 223, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 243, 244, 245, 246, 247, 249, 250, 258, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 278, 280, 281, 283, 285, 286, 288, 290, 291, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 302, 313, 317, 318, 320, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336 и 428.

10. Антитело по п.7, где указанный Fc-вариант выбран из группы, состоящей из 332Е, 328М/332Е, 264I/332E, 241E/243R/262E/264R/332E, 241E/243Q/262T/264E/332E, 241R/243Q/262T/264R/332E, 241E/243Y/262T/264R/332E, 298А/332Е, 239Е/332Е, 239Q/332E, 239Е, 239E/265G, 239E/265N, 239E/265Q, 332D, 297S/332E, 297D/332E, 297Е/332Е, 265Y/297D/332E, 265Y/297D/299L/332E, 265F/297E/332E, 328I/332E, 328Q/332E, 332N, 332Q, 239D, 239N, 239F, 239D/332D, 239D/332E, 239D/332N, 239D/332Q, 239E/332D, 239E/332N, 239E/332Q, 239N/332D, 239N/332E, 239N/332N, 239N/332Q, 239Q/332D, 239Q/332N, 239Q/332Q, 241Y/243Y/262T/264T/297D/332E, 330Y/332E, 264I/330Y/332E, 330L/332E, 264I/330L/332E, 239Т, 239Н, 239Y, 328D/332E, 328Е/332Е, 328N/332E, 328Q/332E, 328V/332E, 328Т/332Е, 328Н/332Е, 328I/332E, 332Т, 332Н, 332Y, 332А, 239E/264I/332E, 239Q/264I/332E, 239E/264I/330Y/332E, 239E/264I/298A/330Y/332E, 239D/297D/332E, 239E/297D/332E, 239D/265V/297D/332E, 239D/265I/297D/332E, 239D/265L/297D/332E, 239D/265F/297D/332E, 239D/265Y/297D/332E, 239D/265H/297D/332E, 239D/265T/297D/332E, 264E/297D/332E, 296D/297D/332E, 296E/297D/332E, 296N/297D/332E, 296Q/297D/332E, 296H/297D/332E, 296T/297D/332E, 297D/299V/332E, 297D/299I/332E, 297D/299L/332E, 297D/299F/332E, 297D/299H/332E, 297D/299E/332E, 297D/330Y/332E, 297D/298A/330Y/332E, 239D/330Y/332E, 239N/330Y/332E, 239D/330L/332E, 239N/330L/332E, 264I/298A/332E, 239D/298A/332E, 239N/298A/332E, 239D/264I/332E, 239D/264I/298A/332E и 239D/264I/330L/332E.

11. Антитело, проявляющее модулированное связывание с FcγR в сравнении с антителом, содержащим исходный Fc-полипептид, причем указанное антитело содержит Fc-вариантную часть, содержащую аминокислотную замену в положении, соответствующем положению аминокислоты 267 в аминокислотной последовательности Fc-полипептида человека, где нумерация приведена в соответствии с индексом EU.

12. Антитело по п.11, где указанная аминокислотная замена выбрана из группы, состоящей из 267Т, 267Н, 267D, 267N, 267Е, 267Q, 267К, 267R, 267V, 267L, 267I, 267F, 267М, 267Y, 267W и 267Р.

13. Антитело по п.11, где указанное антитело дополнительно содержит аминокислотную замену в положении, выбранном из группы, состоящей из 221,222, 224, 227, 228, 230, 231, 223, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 243, 244, 245, 246, 247, 249, 250, 258, 262, 263, 264, 265, 266, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 278, 280, 281, 283, 285, 286, 288, 290, 291, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 302, 313, 317, 318, 320,322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336 и 428, где указанной антитело имеет увеличенную аффинность свзяывания с FcγR по сравнению с указанным исходным Fc-полипептидом.

14. Антитело по п.11, где указанное антитело содержит аминокислотную замену в положении 267Т, 267Н, 267D, 267N, 267Е, 267Q, 267К, 267R, 267V, 267L, 267I, 267F, 267М, 267Y, 267W и 267Р, причем указное антитело дополнительно содержит аминокислотную замену в положении, выбранном из группы, состоящей из 221, 222, 224, 227, 228, 230, 231, 223, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 243, 244, 245, 246, 247, 249, 250, 258, 262, 263, 264, 265, 266, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 278, 280, 281, 283, 285, 286, 288, 290, 291, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 302, 313, 317, 318, 320, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336 и 428.

15. Антитело по п.14, где указанное антитело выбрано из группы, состоящей из 267Q/327S и 267L/327A.

16. Антитело по любому из пп.1, 7 или 11, где указанное модулирование представляет собой увеличение сродства указанного антитела к указанному FcγR.

17. Антитело по любому из пп.1, 7 или 11, где указанный FcγR является FcγRIIIa.

18. Антитело по п.17, где указанный FcγRIIIa является V158- или F158-аллотипом FcγRIIIa.

19. Антитело по п.16, где указанный исходный Fc-полипептид является, по существу, человеческим, и указанная аффинность является приблизительно в 5 раз более высокой, чем аффинность указанного исходного Fc-полипептида.

20. Антитело по п.19, где указанный исходный Fc-полипептид является, по существу, человеческим и указанная аффинность является приблизительно в 5 раз - приблизительно в 300 раз более высокой, чем аффинность указанного исходного Fc-полипептида.

21. Антитело по любому из пп.1, 7 или 11, где указанный исходный Fc-полипептид является, по существу, человеческим, по существу, мышиным, по существу, крысиным, или, по существу, обезьяньим.

22. Антитело по любому из пп.1, 7 или 11, где связывание с одним или несколькими лигандами Fc является неизмененным.

23. Антитело по п.22, где указанный лиганд Fc выбран из группы, состоящей из Clq, FcRn, белка А и белка G.

24. Антитело по любому из пп.1, 7 или 11, где CDC является незатронутой.

25. Антитело по любому из пп.1, 7 или 11, где связывание с одним или несколькими лигандами Fc является измененным.

26. Антитело по любому из пп.1, 7 или 11, где указанный Fc-вариант имеет отношение кратность по связыванию с FcγRIIIa: кратность по связыванию с FcγRIIb большее, чем 1.

27. Антитело по п.26, где указанный Fc-вариант имеет отношение кратность по связыванию с FcγRIIIa: кратность по связыванию с FcγRIIb большее, чем приблизительно 11:1.

28. Антитело по п.27, где указанный Fc-вариант имеет отношение кратность по связыванию с FcγRIIIa: кратность по связыванию с FcγRIIb между приблизительно 11:1 и приблизительно 86:1.

29. Антитело по любому из пп.1, 7 или 11, где указанный Fc-вариант связывается, по меньшей мере, с одним FcγR с уменьшенной аффинностью относительно исходного Fc-полипептида.

30. Антитело по п.29, где указанным FcγR является FcγRIIIa.

31. Антитело любому из пп.1, 7 или 11, где указанный Fc-вариант проявляет модулированную эффекторную функцию в сравнении с антителом, содержащим исходный Fc-полипептид.

32. Антитело по п.31, где указанной эффекторной функцией является ADCC.

33. Антитело по п.32, где указанный Fc-вариант улучшает ADCC в сравнении с указанным исходным Fc-полипептидом.

34. Антитело по п.33, где указанное улучшение ADCC является приблизительно в 5 раз большим, чем улучшение, вызываемое указанным исходным Fc-полипептидом.

35. Антитело по п.34, где указанное улучшение ADCC находится между приблизительно 5-кратным и 50-кратным улучшением в сравнении с улучшением, вызываемым указанным исходным Fc-полипептидом.

36. Антитело по любому из пп.1, 7 или 11, где указанный исходный Fc-полипептид является, по существу, человеческим, по существу, мышиным, по существу, крысиным, или, по существу, обезьяньим.

37. Антитело по п.32, где указанный Fc-вариант уменьшает ADCC в сравнении с указанным исходным Fc-полипептидом.

38. Антитело по любому из пп.1, 7 или 11, содержащее Fc-слитый белок, содержащий указанный Fc-вариант.

39. Антитело по любому из пп.1, 7 или 11, где указанное антитело дополнительно содержит сконструированную гликоформу.

40. Антитело по п.39, где указанная сконструированная гликоформа улучшает эффекторную функцию.

41. Антитело по любому из пп.1, 7 или 11, где указанное антитело имеет специфичность в отношении антигена-мишени, выбранного из группы, состоящей из: CD19, CD20, CD22, CD30, CD33, CD40, CD40L, CD52, Her2/neu, EGFR, EpCAM, MUC1, GD3, СЕА, СА 125, HLA-DR, TNFα, MUC18, простата-специфического мембранного антигена (PMSA) и VEGF.

42. Фармацевтическая композиция, обладающая модулированным связыванием с FcγR, содержащая антитело по любому из пп.1, 7 или 11 и фармацевтически приемлемый носитель.

43. Способ лечения млекопитающего, имеющего связанное с антителами нарушение, предусматривающий введение антитела по любому из пп.1, 7 или 11 указанному млекопитающему.