Тест-система для выявления РНК вируса болезни Шмалленберга у сельскохозяйственных животных Российский патент 2019 года по МПК C12Q1/68 

Описание патента на изобретение RU2694719C1

Изобретение относится к ветеринарной вирусологии, а именно к средствам диагностики вирусных и инфекционных заболеваний у животных, в частности к наборам для выявления РНК вируса болезни Шмалленберга у животных.

Известен набор для выявления инфекций методом мультиплексной ПЦР с детекцией в режиме реального времени (патент РФ №2460803, C12Q 1/68, 2014 г.), с помощью полимеразной цепной реакции с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени, включающий буфер для проведения полимеразной цепной реакции, смесь для ее проведения состоящая из дезоксинуклеозидтрифосфатов, праймеров и флуоресцентных зондов специфичные для возбудителя вируса инфекции и для внутреннего контрольного образца; смесь ферментов из ДНК полимеразы с антителами, ингибирующих активность фермента, TAQ POLYMERASE; буфер для разведения РНК, внутренний контрольный образец, отрицательный контрольный образец, положительный контрольный образец

Наиболее близким по технической сущности является тест-система для выявления РНК вируса болезни Шмалленберга, включающий буфер для проведения полимеразной цепной реакции, смесь для ее проведения состоящая из дезоксинуклеозидтрифосфатов, праймеров и флуоресцентных зондов специфичные для возбудителя вируса болезни Шмалленберга и для внутреннего контрольного образца; смесь ферментов из ДНК полимеразы с антителами, ингибирующих активность фермента, TAQ POLYMERASE; буфер для разведения РНК, внутренний контрольный образец, отрицательный контрольный образец, положительный контрольный образец (патент РФ №2515916, C12Q 1/68, 2014 г. - прототип).

Недостатком прототипа является недостаточная специфичность и чувствительность, олигонуклеотидных праймеров, флуоресцентно-меченного зонда и контрольных образцов, что влияет на точность диагностики.

Техническим результатом является повышение точности диагностики.

Технический результат достигается тем, что в тест-системе для выявления РНК вируса болезни Шмалленберга у сельскохозяйственных животных, включающем буфер для проведения полимеразной цепной реакции, смесь для ее проведения состоящая из дезоксинуклеозидтрифосфатов, праймеров и флуоресцентных зондов специфичные для возбудителя вируса болезни Шмалленберга и для внутреннего контрольного образца; смесь ферментов из ДНК полимеразы с антителами, ингибирующих активность фермента, TAQ POLYMERASE; буфер для разведения РНК, внутренний контрольный образец, отрицательный контрольный образец, положительный контрольный образец, согласно изобретению для внутреннего контрольного образца используют суспензию бактериофага MS2 с концентрацией 5×103 копий нуклеотидных последовательностей на 1 мкл, а для положительного контрольного образца используют смесь рекомбинантных плазмидных ДНК, содержащих фрагмент генома возбудителя вируса Шмалленберга и фрагмент генома бактериофага MS2 взятых в соотношении 1:1 со следующими нуклеотидными последовательностями:

Новизна заявляемого технического решения заключается в том, что для получения достоверной диагностики вируса болезни Шмалленберга используют набор, обеспечивающий возможность проведения последовательно двух реакции: обратной транскрипции вирусной РНК для получения кДНК и полимеразной цепной реакции для амплификации фрагмента полученной кДНК матрицы. Обе реакции проводятся последовательно в одной ПЦР-пробирке (one-tube) с использованием специфичных для участка генома артериита олигонуклеотидных праймеров, флуоресцентно-меченного зонда и разных видов контроля для которых используют различные формы материала бактериофага MS2: суспензия и фрагмент генома со специфическими к нему праймерами и зондом. Такая постановка ОТ-ПЦР в реальном времени сокращает и упрощает процедуру анализа, снижает риск контаминации и возможность ошибки при переносе кДНК в другую пробирку для ПЦР. Кроме того, детекция продуктов амплификации осуществляется с использованием принципа выщепления флуоресцентной метки на 5' конце олигонуклеотидного зонда.

Признаки, отличающие заявляемое техническое решение от прототипа, направлены на достижение технического результата и не выявлены при изучении данной и смежной областей науки и техники и, следовательно, соответствуют критерию «изобретательский уровень».

Заявляемый способ рекомендовано использовать в ветеринарной вирусологии, а именно к средствам диагностики возбудителя вируса болезни Шмалленберга, что соответствует критерию «промышленная применимость».

Сущность изобретения поясняется чертежом, где представлены скриншоты графиков и таблицы, на рис. 1 - представлен канал Cy5/Red - для тестирования сигнала внутреннего контрольного образца (ВКО), на рис. 2 представлен канал JOE/Yellow для специфического сигнала возбудителя вируса Шмалленберга; на рис. 3 - таблица количественных данных для Cycling А. A.Yellow (вирус Шмалленберга) и A.Red (ВКО).

Пример конкретного использования тест-систему выявления ДНК возбудителя вируса болезни Шмалленберга сельскохозяйственных животных.

Для исследования с целью выделения РНК используют биологический материал животных по выбору: цельная кровь, сыворотка крови, фрагменты тканей и органов взятые от животных инфицированных возбудителем вируса болезни Шмалленберга. Для внутреннего контрольного образца используют суспензию бактериофага MS2 с концентрацией 5×103 копий нуклеотидных последовательностей на 1 мкл, а для положительного контрольного образца используют смесь рекомбинантных плазмидных ДНК, содержащих фрагмент генома возбудителя вируса болезни Шмалленберга и фрагмент генома бактериофага MS2 взятых в соотношении 1:1, со следующими нуклеотидными последовательностями:

Затем измеряют накопление флуоресцентного сигнала по каналам: JOE/ Yellow для специфического сигнала возбудителя вируса Шмалленберга; Cy5/Red для сигнала внутреннего контроля, если кривые накопления флуоресцентного сигнала выходят до 35 цикла, то результат реакции считают положительным, а если кривые не пересекают пороговую линию или пересекают ее после 35 цикла, то результат реакции - отрицательный.

Вирус болезни Шмалленберг является представителем семейства буньявирусы (Bunyaviridae), рода ортобуньявирусы (Orthobunyavirus), серогруппы Симбу (Simbu serogroup). Вирус состоит из трех сегментов, называемых S (короткая), М (средняя) и L (длинная) и передается через кровососущих насекомых. Праймеры комплементарны консервативной области гена нуклеокапсидного белка N вируса болезни Шмалленберг (Schmallenberg virus N, NSs genes for nucleocapsid protein, non-structural protein, complete cds, strain: 167/Wiltshire/2012, код доступа LC3 09157.1, участок между 360 и 446) и не комплементарны каким-либо участкам геномов других вирусов. Праймеры были спроектированы с использованием Primer Express Software v3.0 (Applied Biosystems) и исследованы с использованием BLAST, чтобы подтвердить их специфичность. Для детекции продуктов амплификации был подобран олигонуклеотидный флуоресцентно-меченный зонд Shm-Z (комплементарный участку нуклеотидной последовательности, ограниченной позициями отжига праймеров Shm-F и Shm-R). Зонд был помечен красителем HEX. Для гашения самопроизвольной флуоресценции на 3'-конце олигонуклеотидного зонда прикреплен гаситель BHQ-1 Используя программу "Oligo 6.0" описаны основные свойства рассчитанных олигонуклеотидов, определившие возможность их использования в ПЦР.

С помощью программы «Oligo 6.0» проанализирована нуклеотидная последовательность бактериофага MS2 (Enterobacteria phage MS2 isolate ST4, complete genome. ACCESSION EF204940). Бактериофаг MS2 содержит однонитевую позитивно ориентрованную РНК размером 3569 оснований. В результате анализа внутри гена белка "созревания" (maturation protein) выбран участок между 200 и 350 нуклеотидами, содержащий уникальные нуклеотидные последовательности, рассчитаны первичные структуры олигонуклеотидных праймеров, фланкирующих выбранный участок генома. Для детекции продуктов амплификации подобран олигонуклеотидный флуоресцентномеченный зонд MS2P, комплементарный участку нуклеотидной последовательности, ограниченной позициями отжига праймеров MS2F и MS2R. Используя программу «Oligo 6.0» описаны основные свойства рассчитанных олигонуклеотидов, определившие возможность их использования в ПЦР.

Для исследования используют следующий материал:

- Цельную кровь забирают в пробирку с ЭДТА, желательно использовать одноразовые системы взятия крови. Закрытую пробирку с кровью несколько раз переворачивают.

- Сыворотку крови для ее получения берут 5 мл крови в пробирку без антикоагулянта. Желательно использовать одноразовые системы взятия крови.

- Фрагменты тканей и органов павших животных (головной мозг, спинной мозг, плацента, пуповина), отбирают в стерильный контейнер.

- Околоплодную жидкость новорожденных животных с пороками развития и мертворожденных плодов, берут в объеме не менее 1 мл в стерильные пробирки.

- Кровососущие насекомые, переносчики вируса (комары, мокрецы), отбирают не менее 20 особей в контейнер.

Исследуемые образцы подготавливают следующим образом.

Пробы цельной крови с ЭДТА, сыворотки крови, околоплодной жидкости используют без предварительной подготовки. Для экстракции РНК используют 50 мкл цельной крови, околоплодной жидкости или 100 мкл сыворотки.

Из тканей и органов вырезают небольшие кусочки до 1 г весом. Растирают в отдельных фарфоровых ступках, добавляют по 5-10 мл стерильного физиологического раствора и тщательно перемешивают. Смесь отстаивают при комнатной температуре в течение 3 мин, после чего переносят 50 мкл верхней фазы в пробирки типа «Эппендорф» и используют для экстракции РНК.

Пробу комаров (используют 20-40 особей) растирают в 1 мл стерильного физиологического раствора с использованием стерильных фарфоровых ступок и пестиков Полученные суспензии центрифугируют при 12 тыс об/мин в течение 1 мин. Для экстракции РНК используют 100 мкл надосадочной жидкости.

Далее проводят анализ с помощью набора реагентов «ПЦР-ШМАЛЛЕНБЕРГ-ФАКТОР»

Набор состоит из комплектов 1 и 2 реагентов для проведения обратной транскрипции и мультиплексной ПЦР РВ и контрольных образцов. Наборы используют в соответствии с инструкцией по применению набора реагентов «ПЦР-ШМАЛЛЕНБЕРГ-ФАКТОР» для выявления РНК вируса Шмалленберга в биологическом материале методом обратной транскрипции и полимеразной цепной реакцией (ПЦР) с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени (ОТ ПЦР РВ) ТУ 21.10.60-122-51062356-2016 (для диагностики in vitro) http://www.vetfaktor.ru/.

Состав набора приведен в таблицах 1 и 2.

Анализ состоит из трех этапов:

- экстракция (нуклеиновых кислот) НК;

- проведение ОТ-ПЦР РВ;

- учет результатов анализа.

Реакция ОТ-ПЦР РВ проводится в одной пробирке.

* Возможна легкая опалесценция

Экстракция (выделение) НК из клинического материала

Отбирают необходимое количество одноразовых пробирок объемом 1,5 мл, включая отрицательный контроль выделения. Вносят во все пробирки, включая пробирку для отрицательного контрольного образца (ОКО), внутренний контрольный образец (ВКО SHMAL) по 10 мкл.

Внести исследуемые пробы в объеме согласно инструкции к набору для выделения НК, в пробирку отрицательного контроля выделения вместо исследуемой пробы внести ОКО (пробирку обозначают как ВК-).

Выделять НК из анализируемых и контрольных образцов согласно протоколу инструкции производителя набора для выделения НК.

Выделенную РНК можно хранить до 3 часов при температуре от 2°C до 8°C или в течение месяца при температуре не выше минус 68°C.

Подготовка образцов к проведению ОТ-ПЦР РВ

Общий объем реакционной смеси - 25 мкл, объем РНК-пробы - 10 мкл.

Успешное прохождение реакции контролируют использованием положительного контрольного образца (ПКО SCHMAL), ВКО SCHMAL и РНК буфера.

В отдельной пробирке смешивают компоненты набора из расчета на каждую реакцию:

5 мкл ПЦР СМЕСЬ SCHMAL

10 мкл ПЦР БУФЕР SCHMAL

0,75 мкл RT PCR ENZ

Перемешивают смесь на вортексе и сбрасывают капли кратковременным центрифугированием. Отбирают необходимое количество пробирок для амплификации НК исследуемых и контрольных проб. Затем вносят по 15 мкл приготовленной реакционной смеси, используя наконечники с фильтром в подготовленные пробирки:

а) в пробирку отрицательного контроля ПЦР (К-) 10 мкл РНК буфера;

б) в ряд пробирок для исследуемых проб - в каждую внести по 10 мкл НК соответствующей пробы, (включая пробу ВК-);

в) в пробирку с положительным контролем ПЦР 10 мкл ПКО SCHMAL.

Проведение ОТ-ПЦР РВ с флуоресцентной детекцией

Параметры температурно-временного режима амплификации на приборе «Rotor-Gene Q», представлены в таблице 3.

Поместить подготовленные для проведения ПЦР пробирки в ячейки амплификатора и запрограммировать прибор, согласно инструкции производителя. Учет результатов анализа

Полученные данные - кривые накопления флуоресцентного сигнала анализируются с помощью программного обеспечения используемого прибора для проведения ПЦР в соответствии с инструкцией производителя к прибору.

Учет результатов ОТ-ПЦР РВ проводится по наличию или отсутствию пересечения кривой флуоресценции с установленной на соответствующем уровне пороговой линией (что соответствует наличию или отсутствию значения порогового никла «Ct» для исследуемого образца).

Результат считается достоверным в случае корректного прохождения положительных и отрицательных контролей амплификации и экстракции НК в соответствии с таблицей 4 и рис. 1, 2, 3.

Появление любого значения Ct (см. таблице 4, рис. 1,2) результатов для отрицательного контроля этапа экстракции ВК- на канале JOE (HEX)/Yellow и для отрицательного контроля этапа ОТ-ПЦР К- на любом из каналов свидетельствует о наличии контаминации реактивов или образцов. В этом случае результаты анализа но всем пробам считаются недействительными. Требуется повторить анализ всех проб, а также предпринять меры по выявлению и ликвидации источника контаминации.

Образцы, для которых по каналу Cy5/Red значение Ct отсутствует или превышает 35 цикл (при этом по каналу JOE (HEX)/Yellow значение Ct также отсутствует) требуют повторного проведения исследования с этапа ПЦР (таблица 4. Задержка в значениях пороговых циклов для исследуемых образцов на канале Cy5/Red указывает на присутствие ингибиторов в пробах или на ошибки при постановке реакции ОТ-ПЦР РВ. Требуется провести исследование, начиная с этапа экстракции НК.

Образец считается положительным (РНК вируса Шмалленберга обнаружена) если наблюдается экспоненциальный рост сигнала на канале JOE(HEX)/Yellow, при э том значения Ct контрольных образцов находятся в пределах нормы (табл. 4, рис. 2, 3). Если для исследуемого образца по каналу JOE(HEX)/ Yellow значение Ct определяется позднее 37 цикла при корректном прохождении положительных и отрицательных контролей - он считается спорным и исследуется повторно с этапа выделения НК. Если при повторной постановке наблюдается схожий результат (Ct на канале JOE(HEX)/Yellow > 37), требуется повторное взятие материала от того же животного для проведения ПЦР-исследования и (или) использование альтернативных методов диагностики.

Для оценки специфичности предлагаемых внутреннего и положительного контрольных образцов для метода обратной транскрипции и полимеразной цепной реакцией (ПЦР) с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени (ОТ ПЦР РВ) для выявления РНК вируса Шмалленберга в биологическом материале исследовали препараты РНК, выделенной из образцов, содержащих гетерологичные вирусы и кровь от интактных животных.

Показано отсутствие неспецифических реакций компонентов набора в отношении НК следующих вирусов и микроорганизмов: Bovine coronavirus, Bovine leukemia virus, Bovine respiratory syncytial virus, Bovine viral diarrhoea virus, Rotavirus, Brucella abortus, Pasteurella multocida, Leptospira interrogans, Listeria monocytogenes, Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium paratuberculosis, Escherichia coli, Campylobacter fetus, Clostridium perfringens, Salmonella dublin, Staphylococcus aureus, Yersinia enterocolitica, Yersinia pseudotuberculosis. Также показано отсутствие неспецифических реакций компонентов набора в отношении образцов ДНК КРС, овец, свиньи, курицы, человека, а также комаров рода Culex.

Для оценки чувствительности предлагаемого способа проводили постановку реакции с использованием в качестве матрицы титрованного препарата транкрипта, полученного на рекомбинантной плазмиде, содержащей ограниченный праймерами ShmF и ShmR фрагмент генома вируса болезни Шмалленберг. Чувствительность системы составила 105 г-экв/мл.

Похожие патенты RU2694719C1

название год авторы номер документа
Способ выявления РНК вируса болезни Шмалленберга у сельскохозяйственных животных 2018
  • Черных Олег Юрьевич
  • Баннов Василий Александрович
  • Малышев Денис Владиславович
  • Котельникова Александра Андреевна
  • Василевич Федор Иванович
  • Донник Ирина Михайловна
  • Дробин Юрий Дмитриевич
  • Гринь Светлана Анатольевна
  • Лысенко Александр Анатолиевич
  • Кривоногова Анна Сергеевна
  • Кривонос Роман Анатольевич
  • Дорожкин Василий Иванович
  • Шевкопляс Владимир Николаевич
  • Семененко Марина Петровна
  • Кощаев Андрей Георгиевич
  • Шкуратова Ирина Алексеевна
  • Дайбова Любовь Анатольевна
RU2696306C1
Тест-система для обнаружения генома вируса парагриппа 3 типа у крупного рогатого скота с помощью мультиплексной полимеразной цепной реакции с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени 2018
  • Черных Олег Юрьевич
  • Баннов Василий Александрович
  • Малышев Денис Владиславович
  • Дробин Юрий Дмитриевич
  • Донник Ирина Михайловна
  • Клименко Александр Иванович
  • Девришов Давудай Абдулсемедович
  • Лысенко Александр Анатольевич
  • Кривонос Роман Анатольевич
  • Кощаев Андрей Георгиевич
  • Калошкина Инна Муратовна
  • Забашта Сергей Николаевич
  • Кулакова Анна Леонидовна
RU2681473C1
Способ выявления генома возбудителя вируса парагриппа 3 типа у крупного рогатого скота 2018
  • Черных Олег Юрьевич
  • Сочнев Василий Васильевич
  • Баннов Василий Александрович
  • Малышев Денис Владиславович
  • Дробин Юрий Дмитриевич
  • Донник Ирина Михайловна
  • Иванов Аркадий Васильевич
  • Лысенко Александр Анатольевич
  • Кривонос Роман Анатольевич
  • Шевкопляс Владимир Николаевич
  • Кощаев Андрей Георгиевич
  • Калошкина Инна Муратовна
  • Кулакова Анна Леонидовна
RU2696069C2
Тест-система для выявления и генотипирования РНК вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней 2018
  • Черных Олег Юрьевич
  • Котельникова Александра Андреевна
  • Баннов Василий Александрович
  • Малышев Денис Владиславович
  • Дробин Юрий Дмитриевич
  • Донник Ирина Михайловна
  • Стекольников Анатолий Александрович
  • Уша Борис Вениаминович
  • Лысенко Александр Анатолиевич
  • Морозов Виталий Юрьевич
  • Кривонос Роман Анатольевич
  • Исаева Альбина Геннадиевна
  • Шевкопляс Владимир Николаевич
  • Кощаев Андрей Георгиевич
  • Барашкин Михаил Иванович
  • Дайбова Любовь Анатольевна
  • Кузьминова Елена Васильевна
  • Винокурова Диана Петровна
RU2703401C1
Способ выявления и генотипирования РНК вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней 2018
  • Баннов Василий Александрович
  • Черных Олег Юрьевич
  • Малышев Денис Владиславович
  • Котельникова Александра Андреевна
  • Дунин Иван Михайлович
  • Дробин Юрий Дмитриевич
  • Амерханов Харон Адиевич
  • Донник Ирина Михайловна
  • Дорожкин Василий Иванович
  • Лысенко Александр Анатолиевич
  • Племяшов Кирилл Владимирович
  • Кривонос Роман Анатольевич
  • Шевкопляс Владимир Николаевич
  • Бахарев Алексей Александрович
  • Кощаев Андрей Георгиевич
  • Коломиец Сергей Николаевич
  • Дайбова Любовь Анатольевна
  • Кривоногова Анна Сергеевна
RU2703394C1
Тест-система для выявления РНК возбудителя вируса артериита у лошадей 2018
  • Малышев Денис Владиславович
  • Черных Олег Юрьевич
  • Баннов Василий Александрович
  • Котельникова Александра Андреевна
  • Дробин Юрий Дмитриевич
  • Донник Ирина Михайловна
  • Шахов Алексей Гаврилович
  • Лысенко Александр Анатолиевич
  • Кривоногова Анна Сергеевна
  • Кривонос Роман Анатольевич
  • Гулюкин Михаил Иванович
  • Шевкопляс Владимир Николаевич
  • Калашникова Татьяна Валерьевна
  • Тюрин Владимир Григорьевич
  • Кощаев Андрей Георгиевич
  • Бахарев Алексей Александрович
  • Дайбова Любовь Анатольевна
RU2698662C1
Тест-система для обнаружения генома возбудителя ротовируса типа А у сельскохозяйственных животных с помощью мультиплексной полимеразной цепной реакции с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени 2018
  • Черных Олег Юрьевич
  • Баннов Василий Александрович
  • Малышев Денис Владиславович
  • Донник Ирина Михайловна
  • Джавадов Эдуард Джавадович
  • Макаров Юрий Анатольевич
  • Лысенко Александр Анатольевич
  • Кривонос Роман Анатольевич
  • Шевкопляс Владимир Николаевич
  • Кощаев Андрей Георгиевич
  • Морозов Виталий Юрьевич
  • Солдатенко Николай Александрович
  • Кулакова Анна Леонидовна
RU2694501C1
Способ выявления ДНК вируса ринотрахеита (bovine herpes virus 1, BoHV-1) у крупного рогатого скота 2018
  • Малышев Денис Владиславович
  • Котельникова Александра Андреевна
  • Черных Олег Юрьевич
  • Баннов Василий Александрович
  • Дробин Юрий Дмитриевич
  • Донник Ирина Михайловна
  • Шахов Алексей Гаврилович
  • Лысенко Александр Анатолиевич
  • Гугушвили Нино Нодариевна
  • Кривонос Роман Анатольевич
  • Гулюкин Алексей Михайлович
  • Шевкопляс Владимир Николаевич
  • Исаева Альбина Геннадиевна
  • Тюрин Владимир Григорьевич
  • Кощаев Андрей Георгиевич
  • Щукина Ирина Владимировна
  • Дайбова Любовь Анатольевна
  • Жолобова Инна Сергеевна
RU2700449C1
Тест-система для выявления ДНК вируса ринотрахеита (bovine herpes virus 1, BoHV-1) у крупного рогатого скота 2018
  • Черных Олег Юрьевич
  • Котельникова Александра Андреевна
  • Баннов Василий Александрович
  • Малышев Денис Владиславович
  • Василевич Федор Иванович
  • Дробин Юрий Дмитриевич
  • Донник Ирина Михайловна
  • Гринь Светлана Анатольевна
  • Лысенко Александр Анатолиевич
  • Кривоногова Анна Сергеевна
  • Кривонос Роман Анатольевич
  • Дорожкин Василий Иванович
  • Шевкопляс Владимир Николаевич
  • Лихоман Александр Владимирович
  • Кощаев Андрей Георгиевич
  • Шкуратова Ирина Алексеевна
  • Дайбова Любовь Анатольевна
  • Трошин Андрей Николаевич
RU2700254C1
Тест-система для обнаружения генома возбудителя коронавирусной инфекции у крупного рогатого скота с помощью мультиплексной полимеразной цепной реакции с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени 2018
  • Черных Олег Юрьевич
  • Баннов Василий Александрович
  • Малышев Денис Владиславович
  • Дробин Юрий Дмитриевич
  • Донник Ирина Михайловна
  • Уша Борис Вениаминович
  • Племяшов Кирилл Владимирович
  • Лысенко Александр Анатольевич
  • Кривонос Роман Анатольевич
  • Шевкопляс Владимир Николаевич
  • Кощаев Андрей Георгиевич
  • Мищенко Алексей Владимирович
  • Кулакова Анна Леонидовна
RU2694499C1

Иллюстрации к изобретению RU 2 694 719 C1

Реферат патента 2019 года Тест-система для выявления РНК вируса болезни Шмалленберга у сельскохозяйственных животных

Изобретение относится к области биотехнологии. Для повышение точности диагностики тест-система для выявления РНК вируса болезни Шмалленберга у сельскохозяйственных животных включает буфер для проведения полимеразной цепной реакции, смесь для ее проведения состоящую из дезоксинуклеозидтрифосфатов, праймеров и флуоресцентных зондов, специфичных для возбудителя вируса болезни Шмалленберга и для внутреннего контрольного образца; смесь ферментов из ДНК полимеразы с антителами, ингибирующих активность фермента, TAQ POLYMERASE; буфер для разведения РНК, внутренний контрольный образец, отрицательный контрольный образец, положительный контрольный образец, согласно изобретению для внутреннего контрольного образца используют суспензию бактериофага MS2 с концентрацией 5×103 копий нуклеотидных последовательностей на 1 мкл, а для положительного контрольного образца используют смесь рекомбинантных плазмидных ДНК, содержащих фрагмент генома возбудителя вируса Шмалленберга и фрагмент генома бактериофага MS2, взятых в соотношении 1:1 со следующими нуклеотидными последовательностями:

Изобретение позволяет повысить точность диагностики болезни Шмалленберга у сельскохозяйственных животных. 3 ил., 4 табл.

Формула изобретения RU 2 694 719 C1

Тест-система для выявления РНК вируса болезни Шмалленберга у сельскохозяйственных животных, включающая буфер для проведения полимеразной цепной реакции, смесь для ее проведения, состоящую из дезоксинуклеозидтрифосфатов, праймеров и флуоресцентных зондов, специфичных для возбудителя вируса болезни Шмалленберга и для внутреннего контрольного образца; смесь ферментов из ДНК полимеразы с антителами, ингибирующих активность фермента, TAQ POLYMERASE; буфер для разведения РНК, внутренний контрольный образец, отрицательный контрольный образец, положительный контрольный образец, отличающаяся тем, что для внутреннего контрольного образца используют суспензию бактериофага MS2 с концентрацией 5×103 копий нуклеотидных последовательностей на 1 мкл, а для положительного контрольного образца используют смесь рекомбинантных плазмидных ДНК, содержащих фрагмент генома возбудителя вируса Шмалленберга и фрагмент генома бактериофага MS2, взятых в соотношении 1:1 со следующими нуклеотидными последовательностями:

Документы, цитированные в отчете о поиске Патент 2019 года RU2694719C1

ТЕСТ-СИСТЕМА ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ РНК ВИРУСА БОЛЕЗНИ ШМАЛЛЕНБЕРГ И СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ ГЕНОМА ВИРУСА БОЛЕЗНИ ШМАЛЛЕНБЕРГ. 2012
  • Никитина Елена Григорьевна
  • Сальников Николай Игоревич
  • Гузалова Анна Григорьевна
  • Цыбанов Содном Жемьянович
  • Луницин Андрей Владимирович
  • Колбасов Денис Владимирович
RU2515916C2
СПОСОБ ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНОЙ ДИАГНОСТИКИ РЕСПИРАТОРНЫХ ВИРУСНЫХ ИНФЕКЦИЙ МЕТОДОМ МУЛЬТИПЛЕКСНОЙ ПЦР С ДЕТЕКЦИЕЙ В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ И ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ДЛЯ ЕГО ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ 2010
  • Файзулоев Евгений Бахтиерович
  • Никонова Александра Александровна
  • Оксанич Алексей Сергеевич
  • Лободанов Сергей Александрович
  • Малахо Софья Гарифовна
  • Зверев Виталий Васильевич
RU2460803C2

RU 2 694 719 C1

Авторы

Котельникова Александра Андреевна

Баннов Василий Александрович

Малышев Денис Владиславович

Черных Олег Юрьевич

Дробин Юрий Дмитриевич

Донник Ирина Михайловна

Уша Борис Вениаминович

Лысенко Александр Анатолиевич

Клименко Александр Иванович

Кривонос Роман Анатольевич

Юлдашбаев Юсупжан Артыкович

Гулюкин Алексей Михайлович

Шевкопляс Владимир Николаевич

Кривоногова Анна Сергеевна

Кощаев Андрей Георгиевич

Дельцов Александр Александрович

Дайбова Любовь Анатольевна

Даты

2019-07-16Публикация

2018-10-01Подача