ТОЛЕРОГЕННАЯ ДНК-ВАКЦИНА Российский патент 2021 года по МПК C12N15/64 C12N15/70 C12N15/85 A61K48/00 A61K39/00 A61K39/39 A61P3/10 

ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИ

Настоящее изобретение относится к толерогенным иммунотерапевтическим ДНК-вакцинам для уменьшения антигенспецифичной реактивности Т-клеток.

ПРЕДШЕСТВУЮЩИЙ УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ

Согласно традиционным подходам вакцинации очищенный белок/антиген инъецируется человеку/пациенту/животному для того, чтобы специфично стимулировать иммунные ответы на данный белок/антиген. Данный подход вакцинации имеет тенденцию к влиянию, главным образом, на продукцию антител, тогда как Т-клетки имеют тенденцию не подвергаться значимому влиянию, за исключением генерации памяти Т-клеток на антиген. Традиционные подходы вакцинации, таким образом, не считаются подходящими в связи с лечением и/или предупреждением заболеваний, возбуждаемых Т-клетками, таких как, например, диабет 1 типа (T1D), поскольку активация Т-клеток, особенно Т-клеток CD8⁺, считается этиологическим фактором данного заболевания. Экспериментальные подходы с толерогенными вакцинами на основе белков имели в качестве мишени, главным образом, В-клетки, продуцирующие антитела, а не релевантные для заболевания Т-клетки.

Вакцины на основе ДНК, в отличие от вакцин на основе белка, обычно представляют собой плазмиды, кодирующие конкретные антигены - данные плазмиды поглощаются клетками в организме хозяина («трансфицированными»). Данные трансфицированные клетки хозяина затем продуцируют антиген и перерабатывают антиген на маленькие фрагменты (эпитопы Т-клеток) для презентации иммунной системе, в частности, циркулирующим Т-клеткам. Поскольку Т-клетки могут выявлять только данные маленькие фрагменты антигена, а не целые белки, данный подход предпочтительно приводит к модификации Т-клеточных ответов, особенно в отношении Т-клеток CD8⁺ (или цитотоксических Т-клеток) - ключевых драйверов, например, T1D патологии. Таким образом, ДНК-вакцины, а не белковые вакцины, подходят для индуцирования Т-клеточных ответов. Тогда как в настоящее время не доступны ДНК-вакцины для человеческого применения, имеются три стимулирующие плазмидные ДНК-вакцины, лицензированные для ветеринарного применения, индуцирующие иммунитет на вирус инфекционной анемии у лошадей, вирус Западного Нила и некоторые раковые заболевания собак.

В отличие от стимулирующих ДНК-вакцин, толерогенные иммунотерапевтические ДНК-вакцины предназначены для подавления иммунореактивности в отношении антигена, а не для активации иммунных ответов против него. Данные вакцины не стимулируют иммунитет против закодированного антигена или не изменяют тип стимуляции (например, как делают антигенные десенсибилизирующие подходы вакцинации против аллергий), но вместо этого вызывают истощение и/или недостаток функции, и/или гибель Т-клеток, реагирующих на собственный антиген. Для того чтобы делать так, антиген должен презентироваться иммунной системе без костимулирующих или воспалительных эффектов, которые, в противном случае, примировали бы стимулирующие иммунные ответы. Данный подход презентирования антигена, подлежащего игнорированию иммунной системой или лишению иммуногенности, мог бы иметь ценность в лечении аутоиммунных заболеваний, так как таким образом осуществлялось бы нацеливание на специфический механизм заболевания, а не на системное подавление всего иммунного ответа. Толерогенная иммунотерапевтическая ДНК-вакцина, таким образом, представляет собой мягкий способ модулирования нежелательных иммунных ответов.

Конечной целью T1D-специфичной толерогенной иммунотерапевтической ДНК-вакцины является сохранение функции бета-клеток и эндгенной продукции инсулина. Это может происходить через предупреждение или задержку заболевания (что особенно ценно в когортах детей и молодых взрослых, где мониторинг затруднен, и «нормальность» жизни является главным стимулом для пациента) или продление «фазы медового месяца» минимального мониторинга и применения инсулина, что часто происходит в течение первых шести месяцев после постановки диагноза T1D.

В то время как известно то, что вакцины на основе ДНК являются безопасными, ни одна из (стимулирующих или толерогенных) ДНК-вакцин, которые были протестированы в клинических исследованиях, не имеет достаточной эффективности в качестве отдельного подхода для лечения, например, T1D. Толерогенные ДНК-вакцины, известные в данной области, показали малую эффективность и типично требуют высокоискусственных систем для индукции желательных эффектов. Таким образом, в данной области имеется потребность в толерогенных иммунотерапевтических ДНК-вакцинах со значительно увеличенной эффективностью, без нарушения профиля безопасности и предпочтительно также без потребности в неудобной схеме введения.

КРАТКОЕ ИЗЛОЖЕНИЕ СУЩНОСТИ ИЗОБРЕТЕНИЯ

Настоящее изобретение относится к мультицистронному вектору/плазмиде, который соэкспрессирует/кодирует антиген, удерживаемый в клетке, такой как инсулин, а также секретируемые иммуномодуляторы, такие как TGF-β (трансформирующий фактор роста-β), IL-10 (интерлейкин-10) и возможно IL-2. Настоящее изобретение, кроме того, относится к иммунотерапевтическим ДНК-вакцинам, содержащим такие плазмиды, а также к таким фармацевтическим препаратам и их наборам. Настоящее изобретение, наконец, относится к медицинскому применению таких продуктов, а также к способам получения таких плазмид.

Иммунотерапевтические вакцины на основе плазмид/ДНК, описанные в данном документе, имеют терапевтический потенциал в лечении аутоиммунных заболеваний, которые, главным образом, возбуждаются Т-клетками, таких как, например, диабет типа 1 (T1D).

В одном аспекте согласно настоящему изобретению предложена плазмида, которая кодирует:

i. инсулиновый антиген;

ii. TGF-β; и

iii. IL-10.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ГРАФИЧЕСКИХ МАТЕРИАЛОВ

Фиг. 1. Карта кольцевой плазмиды.

Фиг. 2. Карта мРНК и транслированного белка для продуктов вектора плазмиды из Фиг. 1.

Фиг. 3. Стабильность плазмиды к деформации сдвига на трех инъекционных пропусканиях через иглу G30 (30-го калибра).

Фиг. 4. Подтверждение фенотипа сохранения плазмиды посредством роста при 30°C (пассажи 1-50 с использованием 17-часовой инкубации и пассажи 51-100 с использованием 22-часовой инкубации).

ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ

Автор настоящего изобретения предложил в данном документе одиночный вектор, который управляет экспрессией многих секретируемых цитокинов, а также антигена, сохраняющегося в клетке, от одного промотора/мультицистронной мРНК.

Иммунотерапевтическая ДНК-вакцинация одиночным вектором, кодирующим все компоненты данной терапии в одной клетке, является весьма предпочтительной по сравнению с иммунотерапевтической вакцинацией смесью отдельных векторов/плазмид, каждый из которых управляет экспрессией одного компонента, так как случайная трансфекция клеток разными векторами не гарантирует экспрессии всех компонентов или даже любого конкретного соотношения компонентов из данной конкретной трансфицированной клетки.

Трансфекция одной мультицистронной плазмидой/вектором приводит к специфично сконструированному местному окружению/микроокружению вокруг трансфицированной клетки. Данным способом к антигенам могут быть добавлены комбинации иммуномодуляторов таким образом, что они потенцируют желательный иммунологический эффект одиночных Т-клеток без потребности в высоких системных дозах иммуномодулятора, которые в противном случае могли бы вызывать нежелательные явления и широкую иммунодепрессию.

Это местное ограничение продукции иммуномодулятора клетками-хозяевами, трансфицированными иммунотерапевтическими ДНК-вакцинами, обеспечивает безопасное применение высокоэффективных цитокиновых гормонов, которые являются синергичными в отношении модификации Т-клеточных ответов, но не могут дозироваться или достаточно часто для эффекта и/или титроваться с получением желательного ответа без неприемлемых нежелательных явлений.

Например, известно то, что и интерлейкин-10 (IL-10), и трансформирующий фактор роста-бета 1 (TGF-β1) способны индуцировать регуляторные Т-клетки (Treg) из наивных Т-клеток CD4⁺. Однако комбинация IL-10/TGF-β1 обеспечивает синергический эффект (в 15-20 раз более эффективный) в индуцировании Treg, чем один из двух цитокинов один (US 6083919 A), и данная комбинация, кроме того, приводит к иммунотолерантности в более широкой популяции клеток-мишеней, чем один из двух цитокинов один (Zeller JC, Panoskaltsis-Mortari A, Murphy WJ, et. al. 1999 J Immunol. 163(7):3684-91).

Кроме того, известно то, что интерлейкин-2 (IL-2) как размножает, так и стабилизирует Treg, но, с другой стороны, также может способствовать воспалительным ответам. Комбинация IL-2 и IL-10, однако, приводит к подавляющим Treg, а не к воспалительной стимуляции. Поскольку циркулирующие Т-клетки сталкиваются с клетками, которые трансфицированы описанной в данном документе иммунотерапевтической ДНК-вакциной, они временно подвергаются воздействию субоптимальных концентраций IL-10 и IL-2. Данные циркулирующие Т-клетки слегка отклоняются в направлении толерантности, и если они также являются реактивными в отношении соэкспрессируемого антигена (например, инсулина), они будут связываться с трансфицированной клеткой и, таким образом, получать более продолжительное воздействие иммуномодулятора, и, кроме того, они также будут получать другой сигнал, который программирует/переобучает их в отношении подавляющих эффектов. Данным способом те Т-клетки, которые отвечают на кодируемый антиген, селективно переобучаются до подавляющего фенотипа при их столкновении с трансфицированной клеткой.

Описанные в данном документе иммунотерапевтические вакцины на основе плазмид/векторов/ДНК, таким образом, сконструированы для индукции антигенспецифичных Treg, накапливающихся в сайтах аутоиммунитета, для ослабления заболевания (например, поджелудочной железы при T1D), а не для прямого влияния на заболевание через экспрессируемые цитокиновые гормоны.

Помимо антигена (инсулина в примере T1D), вектор/оперон/плазмида, описанные в данном документе, кодируют по меньшей мере два цитокина (например, TGF-β1 и IL-10), которые совместно синергетически подавляют антигенпрезентирующие клетки, а также функцию Т-клеток и управляют индукцией Treg. Данный эффект усиливается, если он также происходит в комбинации с эффективным воздействием антигена.

В одном воплощении TGF-β1 представляет собой конститутивно активную форму, которая не требует процессинга или воспалительного окружения для функции. В то время как Treg могут продуцироваться из наивных Т-клеток посредством воздействия антигена и TGF-β1, Treg, однако, являются «пластичными», означая то, что они могут дедифференцироваться и превращаться в эффекторные клетки Th17, и затем вызывать большую или меньшую аутоиммунную деструкцию. Комбинация IL-10 с TGF-β1, помимо того, что она является более мощным иммуномодулятором, подавляет среду, которая продуцировала бы патогенные клетки Th17, а не Treg.

В одном воплощении мультицистронный вектор, описанный в данном документе, также кодирует, помимо антигена, IL-2, TGF-β1 и IL-10. IL-2 увеличивает число Treg и стабилизирует их фенотип (предотвращает дедифференциацию Treg в эффекторные Т-клетки), и, таким образом, увеличивает их функциональную продолжительность жизни в воспаленных тканях-мишенях.

Три данных цитокина (TGF-β1, IL-10 и IL-2) в комбинации с антигеном, таким образом, имеют хорошо известные синергетические эффекты в отношении индуцирования толерантности посредством следующих механизмов: (i) значительно усиленная генерация антигенспецифичных подавляющих Treg, (ii) большая продолжительность жизни Treg и (iii) большая эффективность на индивидуальную клетку Treg в подавлении воспаления/аутореактивности. Однако требующиеся концентрации системно инфундируемого очищенного цитокина имели бы целый ряд серьезных или может быть даже летальных побочных эффектов, таких как: (i) смертельный фиброз из-за избытка TGF-β1, (ii) гриппоподобные симптомы, (iii) синдром утечки из капилляров из-за избытка IL-2, (iv) широкая иммунодепрессия, приводящая к хроническим инфекциям, (v) усиленное развитие опухоли, а также (vi) анемия из-за избытка IL-10.

Посредством соэкспрессии данных цитокинов от того же самого вектора/плазмиды и, следовательно, той же самой клеткой, презентирующей антиген иммунной системе, данный вектор достигает желательной местной среды для индукции толерантности без системного действия и соответствующих побочных эффектов, которые в противном случае возникали бы из-за введения очищенного цитокина в высокой дозе.

Инъекция «голой»/«обнаженной» плазмидной/векторной ДНК (вектора и одного буфера) приводит к очень низкому поглощению и показателю трансфекции - меньше, чем одна из примерно 100000 плазмидных молекул трансфицирует клетку - тогда как остальные деградируют и, таким образом, остаются без какого-либо биологического эффекта. Эта крайне низкая эффективность трансфекции обеспечивает механизм безопасности для распространения и ограничения трансфицированных клеток.

Введение системно активных количеств любого из данных цитокинов, либо посредством введения зрелых белков, либо посредством высокоэффективной трансдукции вирусного вектора, сделало бы затруднительным или даже невозможным титрование для получения безопасной и эффективной дозы. Ограничение общего воздействия до очень маленькой системной дозы, распределенной в некоторых из высокоэкспрессирующих микросред, приводит к имеющему значительные преимущества профилю безопасности и эффективности.

Комбинация антигена и данных трех цитокинов, описанных в данном документе, дает эффективную защиту от развития T1D и даже, по-видимому, способна стабильно обращать развитие заболевания. Из-за низкой эффективности трансфекции инъекции голой ДНК-плазмиды/вектора, очень мало клеток продуцируют данные рекомбинантные белки, и, таким образом, отсутствует выявляемое изменение уровней сывороточных цитокинов из цитокинов, кодируемых плазмидой/вектором - и, следовательно, отсутствует выявляемая иммуностимуляция или иммунодепрессия в отношении любых других антигенов, чем антиген, кодируемый плазмидой/вектором (препроинсулин). Это приводит к желательному профилю безопасности.

Обычно ДНК-вакцины плохо работают в связи с подкожной (п.к.) инъекцией, и, следовательно, типично вводятся с использованием внутримышечной инъекции (часто с электропорацией) или, в качестве альтернативы, с использованием внутрикожного безыгольного впрыскивания, требующего сложного прибора, а также существенного обслуживания и калибровки. Поскольку большинство проблем с побочными эффектами при использовании внутримышечной инъекции связаны с адъювантом (раздражение в месте инъекции), они, следовательно, не являются предметом беспокойства для описанного в данном документе формата иммунотерапевтической вакцины на основе голой ДНК. Кроме того, инъецируемые объемы обычно являются относительно малыми и, следовательно, не вызывают значительных мышечных растяжений и боли. В одном воплощении инъецируемые объемы составляют 1 мл или менее. В другом воплощении инъецируемые объемы составляют приблизительно 0,6 или 0,5 мл. Независимо от этого, предложенная в данном документе мультицитокиновая плазмида/вектор неожиданно, по-видимому, дает защиту от T1D даже при введении посредством п.к. пути, обеспечивая, посредством этого, многие потенциальные форматы дозировки для пациентов.

Помимо обеспечения местной синергии посредством кодирования всех трех или четырех транслированных продуктов одной плазмидой/вектором и от одного промотора, с предложением описанной в данном документе мультицистронной плазмиды дополнительно упрощаются регуляторная нагрузка и критерии выпуска лекарственного средства.

В отличие от этого, если каждый из белковых продуктов продуцируется от отдельной плазмиды, тогда синергетическая ценность соэкспрессии от той же самой трансфицированной клетки потенциально терялась или уменьшалась бы, так как трансфекция каждой плазмидой/вектором была бы независимым событием, вероятно нацеленным на разные клетки. При продукции трех-четырех рекомбинантных белков от двух, трех или четырех индивидуальных плазмид/векторов, любые синергетические эффекты в местном окружении трансфицированной клетки потенциально теряются; кроме того, таким образом, были бы необходимыми несколько индивидуальных клинических испытаний (одно для каждой плазмиды и каждой комбинации). Продуцирование всех белков от одной плазмиды/вектора и одной мРНК облегчает требования для анализа многих индивидуальных молекул и определения идеальных соотношений совместной упаковки, присущих формату множественной плазмиды/вектора.

В данном документе можно использовать любой формат вектора, подходящий для настоящего изобретения, такой как плазмиды (реплицирующиеся или пассивные), миникольца, линейные векторы (MiLV), вирусные векторы (как интегрирующие [например, лентивирусные], так и неинтегрирующие [например, аденовирусные], космиды, бактериальные искусственные хромосомы (ВАС), человеческие искусственные хромосомы (НАС) и т.д.

Кроме того, в данном документе можно использовать любой пермиссивный способ усиления трансфекции, например, электропорацию, сонопорацию (ультразвуковое усиление с усилением контраста микропузырьками или без него), агрегаты липид/полимер, гидродинамику (давление через большой инъекционный объем), биобаллистику / генную пушку (депонирование через кожу посредством сжатого газа) и т.д.

В одном воплощении в данном документе используется нереплицирующаяся эписомная плазмидная ДНК из-за: i) множества копий мРНК, образующихся в результате трансфекции одной плазмиды, и ii) увеличенных стабильности и функции плазмидных нуклеиновых кислот по сравнению с мРНК и другими форматами ДНК-векторов. Таким образом, в то время как экспрессионные системы и на основе мРНК, и ДНК могут обеспечивать внутриклеточную доставку и колокализацию, системы на основе плазмид обеспечивают больший контроль и стойкость дозировки.

В одном воплощении плазмиды/векторы кодируют четыре белка:

i) антиген,

ii) TGF бета 1 (TGF-β1),

iii) интерлейкин-10 и

iv) интерлейкин-2.

В одном воплощении антиген представляет собой нацеленный в эндосомы релевантный для T1D антиген, такой как инсулин или GAD65. Эндосомное нацеливание может осуществляться, например, посредством слияния Ii/CD74, слияния LIMPII/SCARB или слияния с трансферриновым рецептором.

В одном воплощении TGF-β1 представляет собой активированную форму.

Экспрессия четырех белков от одной плазмиды/вектора возможна, например, если желательные последовательности разделяются либо А) отдельными промоторами, Б) последовательностями IRES (внутренний сайт посадки рибосомы), которые рекрутируют новую рибосому для трансляции каждого сегмента, или В) вирусными последовательностями 2А (например, последовательности 2A FMDV или 2А TaV), которые транслируются и индуцируют приостановку/перескакивание рибосомы, что приводит к продукции отдельных полипептидов от одной открытой рамки считывания. Однако на практике каждая из этих стратегий является комплексной и сложной в осуществлении.

Экспрессия четырех независимых белков от одной плазмиды/вектора легче всего достигается посредством наличия отдельного промотора для каждого гена. Однако данный формат имеет значительные недостатки в том, что он А) приводит к очень большой, нестабильной и сложной в получении плазмиде из-за избыточной длины многих промоторов, Б) приводит к непредсказуемому поведению транслируемых белков по отношению друг к другу (они больше не продуцируются в фиксированных соотношениях друг с другом), В) каждый промотор может подвергаться независимому сайленсингу, приводя к селективной экспрессии некоторых генов, но не других, требующихся для полной эффективности, и Г) отсутствует простота регуляции. В отличие от этого, элементы IRES и последовательности 2А работают на уровнях мРНК и трансляции, и воспроизводимо соэкспрессируют фиксированные отношения каждого белка от одного промотора.

Каждый из четырех классов элементов IRES имеет разные требования к кофакторам для функционирования, а также разные требования к последовательности для трансляции работающего ниже гена. Например, IRES EMCV (вирус эндомиокардита) представляет собой IRES типа 1 из 630 пар оснований, который использует все эукариотические факторы инициации трансляции, тогда как IRES CrPv (вирус паралича сверчка) представляет собой IRES типа 4 из 200 пар оснований, который не имеет требующихся кофакторов, но использует нестандартный кодон инициации.

При использовании элементов IRES из других классов они мешают друг другу, таким образом, что каждый тип элемента IRES можно использовать только один раз в каждой плазмиде, и при использовании вместе разные типы элементов IRES ослабляют друг друга (уменьшают эффективность) способами, которые трудно прогнозировать.

Кроме того, осуществление перетасовки комбинаций ген/IRES приводит к непредсказуемым соотношениям транслированных продуктов, так как взаимодействия генов с элементами IRES не являются статичными, но зависимыми от контекста на фланкирующих нуклеотидных последовательностях. Кроме того, элементы IRES накладывают ограничения на первые несколько положений аминокислот в точке инициации или сразу после нее. Например, IRES CrPv требует того, чтобы первая аминокислота была аланином, а не стандартным метионином, и IRES EMCV не может переносить аминокислот P, W, C, R или K в пределах первых трех кодонов. В одном воплощении для приспособления к ограничениям N-концевых аминокислот, накладываемых IRES EMCV, ДНК-вакцина содержит трехаланиновое удлинение до N-конца гена IL-10.

Кроме того, каждый элемент IRES содержит значительное число пар оснований, варьирующее от 230 п.о. до более 700 п.о.; включение многих элементов IRES, таким образом, увеличивает размер и сложность плазмид/векторов в такой степени, что многие становятся нестабильными и сложными в промышленном производстве из-за спонтанных делеций и рекомбинаций. Кроме того, из-за высокой степени присутствия вторичной структуры, которую придают элементы IRES на транскрибированных мРНК, которые содержат их, они увеличивают вероятность активации рецепторов распознавания патогенов (Dabo S, Meurs EF. 2012 Viruses 4(11):2598-635.) в трансфицированной клетке, и продуцирование стимулирующих эффектов противодействует индукции толерантности, которая намечена.

Последовательности 2А, в отличие от элементов IRES, не взаимодействуют друг с другом и, следовательно, обеспечивают стабильную и согласованную эффективность. Однако они сами транслируются и, следовательно, влияют на сворачивание, функцию и стабильность конечных транслированных белковых продуктов. Все последовательности 2А приводят к значительному С-концевому слиянию (19-22 ак) на 5'-конце последовательностей, подлежащих отделению, и также начинают 3'-последовательность с пролина. Некоторые белки являются пермиссивными для данных модификаций, а некоторые - нет, приводя к практическим ограничениям применения последовательностей 2А. Например, продукт интерлейкин-10 является пермиссивным для 2А хвоста, но и интерлейкин-2, и TGF-β1 неправильно сворачивается и теряет функцию при экспрессии выше от метки 2А. Следовательно, в то время как возможно экспрессировать несколько независимых белков, разделенных последовательностями 2А, два из четырех белков, описанных в данном документе, не могут заканчиваться метками 2А, и, следовательно, должны использоваться другие стратегии.

Поскольку каждый тип аминокислотной последовательности 2А модифицирует рибосомальную функцию во время трансляции белка, он будет иметь разные эффективности в двух центральных свойствах семейства 2А, а именно: (i) разделении расположенных рядом генных продуктов и (ii) процессивности (повторной инициации) во второй генный продукт. Разные последовательности 2А имеют разные эффективности в генерации рибосомальной приостановки, которая разрушает пептидный остов (приводя к двум отдельным белкам), а также разные эффективности в повторной инициации пептидного синтеза второго генного продукта.

Способность последовательностей 2А разделять белковые продукты и повторно инициировать трансляцию белка зависит от аминокислотной последовательности 2А (Donnelly ML, Hughes LE, Luke G, et. al. 2001 J Gen Virol. 82(Pt 5):1027-41). Небольшие вариации в аминокислотных последовательностях 2А приводят к значительно отличающимся смесям разделенных и слитых фланкирующих генных продуктов, варьирующим от менее 5% (больше 95% слито) до полностью разделенных (0% слитых или 100% разделенных).

Кроме того, автор данного изобретения открыл в данном изобретении то, что смежные аминокислотные последовательности, кодирующие два фланкирующих белковых продукта, также влияют на эффективность повторной инициации и разделения последовательностей 2А, приводя к значительным отклонениям от описанных результатов. Эффективность повторной инициации, таким образом, варьирует в зависимости от типа использованной аминокислотной последовательности 2А, а также от окружения, предоставленного смежными аминокислотными последовательностями, и, таким образом, отношение генного продукта пре-2А и разделения белков будет определяться как использованной аминокислотной последовательностью 2А, так и ее контекстом.

В одном воплощении «2A FMDV» вставлена между последовательностью, кодирующей антиген, и последовательностью, кодирующей TGF-β1, описанными в данном документе, приводя к 100%-ному разделению, а также к отношению 1:1 данных белковых продуктов.

В другом воплощении «2A TaV» может быть вставлена между последовательностью, кодирующей IL-10, и последовательностью, кодирующей IL-2, описанными в данном документе, приводя к примерно 50% раздельных продуктов, а также к отношению данных белковых продуктов 10 к 6. Каждая трансфицированная клетка, таким образом, доставляет относительно низкую дозу интерлейкина-2, которая не способна стимулировать эффекторные Т-клетки, и более высокую дозу инерлейкина-10 для отклонения Т-клеток в направлении фенотипа Treg. Поскольку продукция слитого IL-10/IL-2 является неблагоприятной, были предприняты попытки сконструировать повышенную эффективность расщепления сегмента 2А TaV. Попытка того, чтобы сегменту 2А предшествовал «изолирующий сегмент», который представляет собой элемент, который удлиняет транслированную область выше 2А TaV для уменьшения влияния на элемент 2А расположенной выше последовательности, не улучшила разделение. В другой попытке решить проблему слияния добавляли расположенный выше разобщающий сегмент с последовательностью транслированного белка GSG; однако, данный подход привел только к добавочному улучшению эффективности расщепления.

Слияния цитокинов, как таковые, возникающие в результате разделения генов, кодирующих IL-10 и IL-2, посредством 2А TAV, по-видимому, являются иммуногенными.

В другом воплощении описанный в данном документе вектор/плазмида имеет сегмент «Р 2А». Разделение генов, кодирующих IL-10 и IL-2, посредством Р2А приводит к полному или почти полному разделению белковых продуктов, а также к по меньшей мере в два раза большему (или может быть даже вплоть до в четыре или пять раз большему) отношению IL-10 по сравнению с IL-2.

Для того чтобы устранить недостатки систем только IRES и только 2А, описанных выше, четыре описанные в данном документе последовательности кДНК (антиген, TGF-β1, IL-10, IL-2) организованы парами до и после одиночного IRES. Каждая пара дополнительно разделена последовательностью 2А, которая индуцирует перескакивание рибосомы и продукцию независимых белков от каждой последовательности в паре полипептидов. Поскольку TGF-β1 и IL-2 могут не находиться на N-концевой стороне слияния, один из них должен заканчиваться в центральном сайте IRES, а другой должен заканчивать транслируемую часть последовательности мРНК.

Хронология/последовательность экспрессируемых белков и элементов IRES/2A в данном документе, следовательно, может быть следующей: (i) антиген, (ii) 2A FMDV, (iii) TGF бета 1, (iv) IRES, (v) IL-10, (vi) P 2A и (vii) IL-2. Как следствие, все четыре белка могут независимо экспрессироваться от одного оперона/генного сегмента стабильным и предсказуемым способом. Поскольку каждый из данных белков экспрессируется от одной мРНК, отношения каждого продукта фиксируются - например, невозможно получать избыток IL-2 над IL-10.

Кроме применения комбинации элементов IRES и 2А для разделения закодированных генов, альтернативным решением в данном документе, могло бы быть применение двухнаправленного промотора для получения 2 мРНК - каждая из данных мРНК кодировала бы пару белков, а не все четыре в одной молекуле мРНК. Следовательно, можно сконструировать эквивалентные расположения с использованием пар экспрессионных кассет, подходящим образом организованных около двухнаправленного промотора млекопитающего и с использованием разделительных последовательностей 2А и/или элементов IRES. Данный подход, однако, ассоциирован с недостатками, прежде всего обусловленными большим размеров двухнаправленных промоторов, но также потенциальной повышенной регуляторной нагрузкой, имеющей отдельные элементы мРНК, включенные в один медицинский продукт. В предпочтительных воплощениях в данном документе, следовательно, используется один промотор и комбинация элеметов IRES и 2А, а не двухнаправленный промотор.

В теории некоторые последовательности 2А могли бы быть заменены внутриклеточными эндогенными протеазочувствительными последовательностями. Однако автор данного изобретения в данном документе открыл то, что такие протеазы ассоциированы со значительными недостатками (например, недостаток описанной функции, приводящий к секреции слитых белковых продуктов).

Для того чтобы антиген подвергался процессингу и презентировался иммунной системе в пределах местного окружения цитокиновых гормонов, кодируемых плазмидой, данный антиген должен удерживаться в пределах трансфицированной клетки. В случае диабета типа 1 продукция активного инсулина потенциально приводила бы к нежелательному снижению глюкозы в крови, если бы он секретировался или иным образом высвобождался из трансфицированной клетки.

Для того чтобы избежать секреции антигена, любые сигналы секреции могут быть удалены из последовательности, кодирующей антиген, например, из последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей препроинсулин, удаляется последовательность, кодирующая сигнал секреции, таким образом, был бы генерирован проинсулин, а не препроинсулин, обеспечивая, таким образом, накопление антигена внутри трансфицированной клетки. В то время как данный транслируемый антигенный продукт (например, инсулин) активно не секретировался бы, он мог бы высвобождаться во время лизиса из-за некроза, возникающего из-за атаки Т-клетками CD8⁺. Кроме того, сигнальная последовательность инсулина представляет собой область, для которой известно то, что она содержит эпитопы, релевантные для заболевания (потенциально индуцируя аутоиммунитет), и включение сигнальной последовательности, следовательно, обеспечивает индукцию более широкой толерантности и более высокую вероятность ослабления заболевания.

Кроме того, цитоплазматическое удерживание антигена обеспечивает лишь процессинг посредством протеасомы и презентацию через путь МНС (главный комплекс гистосовместимости) класса I, который выявляет внутриклеточные патогены посредством Т-клеток CD8⁺. Поскольку Т-клетки CD4⁺ являются важными соучастниками провоспалительных цитокинов, и большинство или даже все Treg, подавляющие аутоиммунитет, представляют собой CD4⁺, расширение презентации антигена для включения MHC класса II, который распознается Т-клетками CD4⁺, может быть полезным.

Процессинг MHC класса II и стимулирование Т-клеток CD4⁺ обычно не включают внутриклеточный антиген, так как доступ к данному пути осуществляется через эндоцитоз внеклеточного антигена. Обычно белковые продукты, продуцируемые в пределах трансфицированной клетки, презентируются только через внутриклеточный / протеасомный путь процессинга по умолчанию и MHC класса I, приводя к эффектам Т-клеток CD8⁺, но не к эффектам Т-клеток CD4⁺. Для того чтобы нацеливать и Т-клетки CD4⁺, и CD8⁺ для иммуномодуляции предпочтительное воплощение также включает факторы, приводящие к презентации MHC класса II.

В принципе, для индукции презентации MHC класса II антиген может быть слит с любым партнером, который направляет данное слияние в эндосомный компартмент, но имеются функциональные различия в активности и воздействии. Слияния с трансферриновым рецептором, также известным как белковый рецептор, транспортирующий железо, циклируют от плазматической мембраны/внеклеточного пространства до эндосомы и, следовательно, также могут экспонировать целому антигену другие иммунные клнтки, такие как В-клетки, макрофаги и т.д.. Слияния LimpII/SCARB нацелены непосредственно в эндосому, но предпочтительно в раннюю эндосому, и иногда приводят к чрезмерному процессингу и общему разрушению антигена. Слияния li (CD74), использующие такой же шапероновый сигнал, что и MHC класса II для локализации в поздней эндосоме, доставляют антиген и MHC класса II в такие же везикулы на той же самой стадии развития и максимизируют вероятность осуществления эффективной презентации антигена в контексте MHC класса II. Кроме того, даже с эндосомной сортировкой из слияний Ii последовательность секреции препроинсулина должна быть сделана неактивной, или антиген также секретировался бы и терялся бы перед процессингом.

Блокада секреции инсулинового антигена, в качестве альтернативы, осуществлялась в данном документе посредством мутирования двух аминокислот, требующихся для удаления сигнала секреции, посредством SRP (частица распознавания сигнала) на шероховатом эндоплазматическом ретикулуме. Мутации Ala (A) до Glu (E) полностью отменяли созревание и секрецию пре-проинсулина при поддержании требующейся эпитопной структуры антигена для индукции наилучшей толерантности.

В одном воплощении в данном изобретении используется плазмидная ДНК-вакцина. Данная плазмида выращивается/реплицируется, например, в E. coli и выделяется/очищается из среды и затем готовится в жидких препаратах, например, в воде, физиологическом растворе, жидких препаратах на основе PBS (фосфатно-солевой буферный раствор) или в виде лиофилизированного порошка для внутрикожного безыгольного впрыскивания, интраназального введения или ингаляции. В одном воплощении плазмиду в данном изобретении готовят в водном фармацевтическом препарате, возможно содержащем стабилизаторы. Для продукции плазмиды можно использовать любую подходящую микробную систему.

Стабилизаторы в препарате включают хелаторы, такие как EDTA (этилендиаминтетрауксусная кислота), EGTA (этиленгликольтетрауксусная кислота) или DPTA, но не ограничиваются ими, для захвата Mg⁺⁺ и Fe⁺⁺⁺, которые, в противном случае, могут участвовать в деградации ДНК, и/или цитрат, который защищает плазмиду от эффектов неспецифичной деградации. В одном воплощении плазмида, описанная в данном документе, может быть приготовлена в изотоничном PBS или, в качестве альтернативы, в TRIS плюс цитрат плюс EDTA. Такие плазмиды имеют преимущества стабильности, легкости в продукции, безопасности и удобства в применении.

В другом воплощении в связи с настоящим изобретением могли бы быть добавлены агенты для доставки, такие как вирус, липиды, липосомы, соупаковывающие препараты и т.д. Однако применение агентов для доставки в данном изобретении может иметь потенциальные проблемы с иммунитетом, интеграцией вируса и т.д.

Определения

Антиген: иммунотерапевтическая ДНК-вакцина в данном документе кодирует антиген. Антиген в данном документе может представлять собой любой тип белка, ассоциированного с иммуногенным заболеванием, или его фрагмент, который может распознаваться Т-клеточным компонентом иммунной системы. Например, в случае лечения или предупреждения диабета типа 1 можно использовать инсулиновый антиген. В одном примере инсулиновый антиген представляет собой иммунодоминантный пептид InsB 9-23. Для иммунотерапевтических ДНК-вакцин против рассеянного склероза в данном документе в качестве антигена можно использовать миелиновый основной белок (МВР), миелиновый олигодендроцитарный белок (MOG) и/или протеолипидный белковый антиген (PLP). Для применения в иммунотерапевтических ДНК-вакцинах в данном документе подходят последовательности, кодирующие аналогичный белковый антиген, для репрезентативных антигенов из алопеции, полимиозита/дерматомиозита, целиакии-спру и белковых аллергенов (например, белок арахиса ara h 2).

Нацеливание антиг ена: в одном воплощении антиген в данном документе нацелен в эндосомы. Антигены в данном документе включают цельный белок, предбелки с недостаточностью секреции или их функциональный или иммунодоминантный пептидный фрагмент.

Например, инсулиновый антиген в данном документе представляет собой антиген для применения в иммуномодулирующей терапии, а не агент, понижающий уровнь глюкозы. Он, следовательно, не должен быть полностью подвергнутым процессингу/созревшим или секретированным для убеждения в том, что он презентируется на молекулах МНС циркулирующим Т-клеткам. Иммунотерапевтическая ДНК-вакцина в данном документе, следовательно, не приводит к повышенным уровням инсулина в крови, но скорее к усиленной презентации антигенов иммунной системе, в частности, Т-клеткам.

Следовательно, инсулиновый антиген в данном документе может представлять собой фрагменты, кодирующие маленький иммунодоминантный пептид (например, пептид 9-23 цепи В инсулина, включая пептиды со сдвинутым регистром, демонстрирующие эквивалентные Т-клеточные эпитопы), цельный проинсулин, у которого отсутствует требующаяся последовательность секреции, но который является интактным в иных отношениях, или пре-проинсулиновые мутеины, которые содержат последовательность секреции, но модифицируются для предупреждения секреторной функции.

Примеры инсулиновых антигенов в данном документе включают:

Мышиный проинсулин (SEQ ID NO 1):

FVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVELGGGPGAGSLQPLALEGSLQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

Человеческий проинсулин (SEQ ID NO 2):

FVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVELGGGPGAGSLQPLALEGSLQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

Модифицированный мышиный пре-проинсулин, который не секретируется (замены по отношению к пре-проинсулину дикого типа показаны жирным шрифтом и подчеркиванием (SEQ ID NO 3)):

MALWMRLLPLLALLALWGPDPEQEFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVELGGGPGAGSLQPLALEGSLQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

Модифицированный человеческий пре-проинсулин, который не секретируется (замены по отношению к пре-проинсулину дикого типа показаны жирным шрифтом и подчеркиванием (SEQ ID NO 4)):

MALWMRLLPLLALLALWGPDPEQEFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVELGGGPGAGSLQPLALEGSLQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

Мышиный пре-проинсулин дикого типа (SEQ ID NO 5):

ALWMRLLPLLALLALWGPDPAQAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVELGGGPGAGSLQPLALEGSLQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

Человеческий пре-проинсулин дикого типа (SEQ ID NO 6):

MALWMRLLPLLALLALWGPDPAQAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVELGGGPGAGSLQPLALEGSLQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

Инсулиновый пептид «InsB 9-23», идентичный между мышиным и человеческим:

SHLVEALYLVCGERG (SEQ ID NO 7)

Модифицированный InsB 9-23 (замены по отношению к InsB 9-23 дикого типа показаны жирным шрифтом и подчеркиванием (SEQ ID NO 8) и (SEQ ID NO 27)):

SHLVEALYLVCGEEG и SHLVEALYLVCGGEG

Инсулиновые антигены, описанные в данном документе, таким образом, могут накапливаться в цитозоле трансфицированной клетки-хозяина и, таким образом, презентироваться посредством МНС класса I или высвобождаться при цитолизе.

Эндосомальное нацеливание, приводящее к презентации МНС класса II, может осуществляться в данном изобретении посредством слияния последовательности антигена с лидерными последовательностями, которые образуют трансмембранные сегменты с цитоплазматическими последовательностями «YXX∅», в которых Y представляет собой тирозин, Х представляет собой любую аминокислоту, и ∅ представляет собой объемную гидрофобную аминокислоту, такую как триптофан или изолейцин, «[DE]XXXL[LI]», где D и Е представляют собой аспарагиновую кислоту или глутаминовую кислоту, соответственно, тогда как L и I представляют собой лейцин и изолейцин, соответственно, или эндосомальные/лизосомальные сигналы сортировки «DXXLL», которые подчеркнуты в следующих типичных последовательностях. Домены белка, которые включают данные сигналы, следовательно, нацелены или циклируют в эндосому/лизосому, включают: трансферриновый рецептор, LimpII или CD74, также известный как инвариантная цепь, шаперон МНС II или li или любой аналогичный домен.

Примеры доменов эндосомального нацеливания в данном документе включают:

Мышиный CD74 / эндосомальный домен нацеливания инвариантной цепи (li) (SEQ ID NO 9):

MDDQRDLISNHEQLPILGNRPREPERCSRGALYTGVSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTITSQNLQLESLRMKLP

Человеческий CD74 / эндосомальный домен нацеливания инвариантной цепи (li) (SEQ ID NO 10):

MHRRRSRSCREDQKPVMDDQRDLISNNEQLPMLGRRPGAPESKCSRGALYTGFSILVTLLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTITSQNLQLESLRMKLP, но не ограничиваются ими.

Диабет типа 1: диабет типа 1 (T1D) считается хроническим аутоиммунным заболеванием, где аутоагрессивные Т-клетки инфильтрируют островки Лангерганса в поджелудочной железе и играют важную роль посредством специфичного разрушения популяции инсулинпродуцирующих бета-клеток. Как только разрушается значительное число островковых клеток, пониженное количество инсулина или полное отсутствие инсулина будет приводить к инсулиновой недостаточности и гипергликемии у пациента. Пациенты с T1D, таким образом, не способны продуцировать достаточно инсулина, и регулярные инъекции данного гормона необходимы на протяжении всей жизни. У некоторых пациентов с диабетом типа 1 диагностируется «диабет типа 1,5», «латентный аутоиммунный диабет»/LADA, «двойной диабет» и т.д., которые представляют собой диабетические заболевания, имеющие симптомы и диабета типа 1, и диабета типа 2 - все диабетические заболевания, имеющие черты и диабета типа 1, и типа 2, таким образом, также содержатся в данном документе в термине «диабет типа 1».

Толерогенная ДНК-вакцина: основанные на ДНК иммунотерапевтические вакцины/векторы/плазмиды, описанные в данном документе, сконструированы для выключения или осуществления понижающей регуляции части иммунной системы, ответственной за разрушение нормальных здоровых «собственных» клеток, и, таким образом, предупреждают или уменьшают интенсивность аутоиммунитета на основе Т-клеток.

Подразумевается то, что термин «иммунотерапевтическая ДНК-вакцина» в том виде, в котором он используется в данном документе, означает соединение или композицию, содержащую молекулу ДНК, и которая вводится субъекту для того, чтобы снизить риск развития у указанного субъекта одного или более чем одного заболевания.

В некоторых воплощениях иммунотерапевтические вакцины на основе ДНК, описанные в данном документе, представляют собой плазмиды/векторы, кодирующие конкретные антигены. После вакцинации данные плазмиды поглощаются, другими словами, трансфицируются в антигенпрезентирующие клетки в организме хозяина. Данные «трансфицированные» клетки-хозяева затем продуцируют антиген и презентируют маленькие фрагменты данного антигена иммунной системе, в частности Т-клеткам. Данный подход приводит к модификации специфичных ответов Т-клеток на кодируемый антиген, а также к минимальной модификации иммунных ответов на другие (незакодированные или «иррелевантные») антигены. Только очень мало клеток-хозяев типично трансформируется плазмидой/вектором ДНК-вакцины, описанной в данном документе, означая то, что вероятно меньше, чем одна из ста тысяч, одна из пятиста тысяч или даже меньше, чем одна из миллиона молекул плазмиды/вектора, в конечном счете, поступает в клетку-хозяина. ДНК-вакцины, описанные в данном документе, таким образом, представляют собой очень мягкий и специфичный подход для модулирования иммунных ответов на антигены, такие как инсулин, у пациентов с T1D или пациентов, подверженных риску развития T1D.

Плазмида: плазмида представляет собой маленькую молекулу ДНК, которая чаще всего находится в бактериях в виде маленьких, кольцевых, двухцепочечных молкул ДНК. Искусственные плазмиды широко используются в качестве векторов в молекулярном клонировании, служа для управления репликацией последовательностей рекомбинантной ДНК в организмах-хозяевах. Плазмиды можно конструировать так, чтобы они подходили для применения в качестве иммунотерапевтических ДНК-вакцин. Плазмиды считаются репликонами - элементами ДНК, способными автономно реплицироваться в подходящем хозяине. Плазмиды могут передаваться от одной бактерии к другой бактерии, которая могла бы принадлежать к такому же или к другому виду бактерии, посредством трех главных механизмов: трансформация, трансдукция и конъюгация. Плазмиды ДНК-вакцины могут поглощаться клеткой-хозяином посредством пассивной трансформации - обычно с относительно низкой скоростью. Плазмиды, описанные в данном документе, эффективно реплицируются, но не управляют экспрессией белка в бактериях. Плазмиды, описанные в данном документе, кроме того, управляют экспрессией белка, но не репликацией плазмиды у человека и других млекопитающих, например, мышей. В одном воплощении в данном документе используется вектор pVAX1 (Invitrogen/LifeTechnologies) в качестве каркаса для вставки элементов, которые являются частью настоящего изобретения. Другие подходящие векторые каркасы в данном документе включают любой остов вектора, содержащий эукариотический промоторный элемент, прокариотический многокопийный репликатор и систему селекции для поддержания плазмиды.

Селективный ген и система селекции: в одном аспекте иммунотерапевтические ДНК-вакцины, описанные в данном документе, содержат селективный ген/селективный маркер для целей изготовления. Селективный маркер в данном документе представляет собой, например, ген, который придает устойчивость к клеточному токсину, например, антибиотику, такому как ампициллин, канамицин, хлорамфеникол, стрептомицин и т.д.

Другие типы подходящих систем селекции в данном документе включают, например, условно-летальные системы сайленсинга (например, системы типа CcdA/CcdB или ParD/ParE Hok/Sok) или последовательности, которые комплементируют геномный дефект в продукции штамма клеток и, таким образом, обеспечивают рост в противном случае нежизнеспособного хозяина (например, ауксотрофная комплементация dapD^- или pyrF^-, комплементация инициации трансляции infA^- и т.д.).

Продукционные клетки, несущие вакцину на основе плазмиды/ДНК, которая включает селективный маркер, будут выживать при воздействии токсина/антибиотика/условия, тогда как клетки, которые не смогли поглотить последовательности плазмиды, погибнут. В одном воплощении ДНК-вакцины, как таковые, описанные в данном документе, содержат последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую селективный маркер, для того чтобы обеспечивать более высокий выход/чистоту и более эффективную продукцию/репликацию в продукционных клетках, таких как E. coli.

В то время как селекция с антибиотиком представляет собой обычную лабораторную стратегию, могут иметься преимущества, ассоциированные с системами селекции без антибиотиков, например, в связи с более эффективными регуляторными процессами. В то время как в данном изобретении также могут использоваться векторы, которые не содержат селективного механизма, такие как миникольца, синтетические линейные векторы и т.д., данные воплощения ассоциированы с определенными недостатками в продукции, в частности, из-за повышенных затрат на продукцию и контроль качества.

Примеры стратегий комплементации («спасения») известны в предшествующем уровне техники, однако, данные стратегии страдают от разных недостатков.

Системы метаболической комплементации, такие как системы dapD [биосинтез лизина] или pyrF [биосинтез уридина], часто приводят к «перекрестному кормлению» во время продукции E. coli в высокой плотности, где бактерия, содержащая плазмиду, будет продуцировать и секретировать избыток требующегося соединения и, посредством этого, «расслаблять» давление отбора в отношении соседних бактерий без плазмиды.

Другим примером подходящей системы селекции в данном изобретении являются плазмиды, кодирующие важные белки, как, например, infA, кодирующая IF1 / фактор инициации 1, который требуется для синтеза белка. В данной системе селекции перекрестное кормление не происходит, так как белок infA не секретируется. Однако не возможно дополнительно модифицировать плазмиду или размножить клетки, дефицитные по плазмиде, так как отсутствует способ экзогенной комплементации требующегося белка/infA (J Bacteriol. 1994 Jan;176(1):198-205 и J Biotechnol. 2004 Jul 1;111(1):17-30).

Для того чтобы обойти недостатки, ассоциированные с системой селекции infA, в данном документе была предложена альтернативная система селекции с температурочувствитель ным переключением трансляции (или «термосенсором») из гена белка инвазии prfA L. monocytogenes (Cell. 2002 Sep 6;110(5):551-61). Посредством размещения образующей шпильку части последовательности РНК «термосенсора» выше геномных копий infA E. coli посредством стандартной технологии генной инженерии его экспрессия становится регулируемой посредством контроля температуры ферментации, обеспечивая медленный рост клеток, не содержащих плазмиду, при 37°C и быструю гибель клеток при температурах меньше 30°C. Трансформация сконструированного термочувствительного продукционного штамма E. coli плазмидами, экспрессирующими infA дикого типа, таким образом, обеспечивает полные нормальные скорости роста при всех температурах, обеспечивая бесплазмидное размножение при 37°C, а также строгий отбор на плазмиду при 30°C. Кроме того, данная система не генерирует давления отбора для того, чтобы E. coli дикого типа сохранила плазмиду, и она, таким образом, теряется в пределах 8 часов в культуре, обеспечивая отсутствие сохранения в среде терапевтической плазмиды.

Нуклеотидная последовательность infA E. coli дикого типа (SEQ ID NO 11):

ATGGCCAAAGAAGACAATATTGAAATGCAAGGTACCGTTCTTGAAACGTTGCCTAATACCATGTTCCGCGTAGAGTTAGAAAACGGTCACGTGGTTACTGCACACATCTCCGGTAAAATGCGCAAAAACTACATCCGCATCCTGACGGGCGACAAAGTGACTGTTGAACTGACCCCGTACGACCTGAGCAAAGGCCGCATTGTCTTCCGTAGTCGCTGA

Последовательность белка IF1 E. coli дикого типа, образующегося в результате трансляции гена infA (исходный метионин/М не включен в слияние prfA - (SEQ ID NO 12)):

MAKEDNIEMQGTVLETLPNTMFRVELENGHVVTAHISGKMRKNYIRILTGDKVTVELTPYDLSKGRIVFRSR

Продукционные линии клеток E. coli, используемые в данном изобретении для продукции плазмид иммунотерапевтических ДНК-вакцин, могут, таким образом, содержать следующую нуклеотидную последовательность термочувствительного prfA:

Нуклеотидная последовательность prfA L. monocytogenes дикого типа («шпилька термосенсора») (последовательность Шайна Дальгарно подчеркнута, начало ATG выделено жирным шрифтом - (SEQ ID NO 13)):

TGTAAAAAACATCATTTAGCGTGACTTTCTTTCAACAGCTAACAATTGTTGTTACTGCCTAATGTTTTTAGGGTATTTTAAAAAAGGGCGATAAAAAACGATTGGGGGATGAGAAATGAACGCTCAA

Последовательность белка prfA L. monocytogenes дикого типа (слитая выше IF1 E. coli, возникающая в результате трансляции SEQ ID NO 13):

MNAQ

Репликатор («Ori»): репликатор, также именуемый точкой начала репликации, представляет собой конкретную последовательность в геноме, в которой инициируется репликация нити ДНК. В одном воплощении сайты репликатора в данном документе включают «Ori pUC», который обеспечивает репликацию в бактериальной продукционной линии клеток E. coli, но не в клетках-хозяевах млекопитающих, т.е. в клетках из организма вакцинированного субъекта/человека/пациента. Другие подходящие в данном документе бактериальные репликаторы включают R6K, pBR322, ColE1, pMB1, 15A, pSC101 и т.д., но не ограничиваются ими. В одном аспекте репликатор в данном документе представляет собой высококопийную версию, которая дает высокое отношение плазмида/биомасса для более эффективной продукции. В данном документе также могут использоваться векторы, которые не содержат репликатор, такие как миникольца, синтетические линейные векторы и т.д.

Промотор: промотор представляет собой область ДНК, которая инициирует транскрипцию конкретного гена. Промоторы находятся около сайтов начала транскрипции генов, на той же самой нити и выше на ДНК, ближе к 5'-концу смысловой нити. Для того чтобы происходила транскрипция РНК-полимераза должна прикрепляться к ДНК около гена. Промоторы содержат специфические последовательности ДНК, такие как элементы ответа, которые обеспечивают безопасный исходный сайт связывания для РНК-полимеразы и для транскрипционных факторов, которые рекрутируют РНК-полимеразу. Транскрипционные факторы имеют специфические активаторные или репрессорные последоваельности, которые присоединяются к специфичным промоторам и регулируют экспрессию генов. Промоторы, таким образом, представляют собой критически важные элементы, которые могут работать согласованно с другими регуляторными областями, такими как энхансеры, сайленсеры, пограничные элементы/изоляторы, для управления уровнем транскрипции данного гена. Классический промотор управляет продукцией одной матричной РНК (мРНК), тогда как двухнаправленные промоторы, описанные в данном документе, управляют продукцией двух мРНК, непосредственно прилегащих к промотору, как выше, так и ниже промотора.

В одном воплощении в данном документе используются эукариотические промоторы. Эукариотические промоторы не обязательно подчиняются правилу один ген/один промотор, как, например, некоторые вирусные промоторы, а также промоторы, которые демонстрируют широкую экспрессию (т.е. не имеют узкие специфичности в отношени типа клеток, как, например, экспрессия только в нейронах). Примеры промоторов, описанных в данном документе, которые способны управлять широкой транскрипцией молекул мРНК больших мультигенных семейств, включают: вирусный немедленный-ранний (IE) промотор CMV (цитомегаловирус) и промотор SV40; промоторы эндогенного EF1a, PGK1, Ubc и бета-актина; и синтетические промоторы, такие как гибридный промотор CAG. Существует много других подходящих промоторов млекопитающих, и еще больше конструируют посредством усилий синтетической биологии. Любой промотор, который приводит к желательным характеристикам экспрессии в человеческих клетках, может использоваться в описанных в данном документе плазмидах иммунотерапевтической ДНК-вакцины.

Энхансеры: энхансеры представляют собой элементы ДНК, которые увеличивают эффективность промоторов в продуцировании мРНК-транскриптов. Энхансеры в данном документе могут быть соответствующими (например, энхансер SV40/промотор CMV) или несоответствующими. В данном изобретении может использоваться любая подходящая комбинация энхансера/промотора для эукариотической функции.

Эукариотическое начало трансляции: эукариотическую последовательность начала трансляции обычно называют консенсусной последовательностью «Козака». Последовательность Козака на молекуле мРНК распознается рибосомой в качестве сайта начала трансляции, от которого кодируется белок. Для эукариотической рибосомы требуется данная последовательность или ее вариация для инициации трансляции белка. Последовательности Козака являются вырожденными или вариабельными и редко соответствуют консенсусным последовательностям. На самом деле, консенсусные последовательности Козака типично являются менее эффективными, чем варианты дикого типа, выделенные из мРНК млекопиающих. В то время как слабые последовательности Козака регулярно выделяют из природных мРНК, и они, вероятно, играют роль в контроле трансляции малочисленных белков, описанные в данном документе иммунотерапевтические ДНК-вакцины предпочтительно кодируют последовательность Козака средней или высокой эффективности. Примеры полезных последовательностей Козака в данном документе включают следующую нуклеотидную последовательность: gccRccATGG (SEQ ID NO 14), где основания, указанные строчными буквами, представляют собой самые обычные нуклеотиды, но они могут варьировать, тогда как нуклеотиды, указанные заглавными буквами, являются фиксированными (R представляет собой код неопределенности IUPAC (Международный союз теоретической и прикладной химии) для оснований А или G), и ATG показывает сайт начала трансляции - кодон метионина в положении +1.

Сигнал эндосомальной сортировки: эндосома представляет собой ограниченный мембраной компартмент внутри эукариотической клетки. Некоторые белки могут транспортироваться в эндосомы и деградировать там до пептидных фрагментов. Данные пептидные фрагменты могут связываться с молекулами МНС, присутствующими в эндосоме, с образованием комплексов МНС/пептид, которые могут затем транспортироваться к поверхности клетки для того, чтобы презентироваться циркулирующим Т-клеткам, в частности, Т-клекам CD4⁺. Сортировка белков в эндосомы опосредуется сигналами, присутствующими в цитозольных доменах белков. Эндосомальные сигналы обычно представляют собой короткие линейные аминокислотные последовательности. Описанные в данном документе антигены предпочтительно нацеливаются в эндосомы с использованием сигнала эндосомальной сортировки, такого как, например, сигналы эндосомальной/лизосомальной сортировки YXX∅, [DE]XXXL[LI] или DXXLL. Сигналы эндосомальной сортировки включают разные встречающиеся в природе или синтетические сигналы эндосомальной сортировки. Примеры в данном документе включают сигналы эндосомальной сортировки, присутствующие на Cd74/инвариантной цепи/li, LimpII/SCARB или трансферриновом рецепторе. Может быть использован любой домен эндосомального нацеливания, который является фармацевтически приемлемым и обеспечивает желательную функцию. Слияние таких доменов эндосомального нацеливания с антигенами направляет их в эндосомальный компартмент при трансляции для повышенной эффективности. Эндосомальная сортировка антигенов обеспечивает процессинг и презентацию иммунной системе в комплексах МНС класса II, помимо конститутивной презентации в комплексах МНС класса I, для более полной и надежной индукции толерантности и возможного размножения Treg (которое не может осуществляться посредством комплексов МНС класса I / антиген). В одном воплощении толерогенные ДНК-вакцины, описанные в данном документе, кодируют слияние антигена с CD74/инвариантной цепью/li для управления эндосомальным нацеливанием и презентацией антигена посредством МНС класса II.

Интроны: интроны представляют собой некодирующие последовательности в пределах мРНК. Известно то, что некоторые интроны значительно увеличивают трансляцию и функцию мРНК. Соответственно, в данном изобретении также может использоваться включение последовательностей интронов. Могут использоваться стандартные интроны, такие как интрон бета-глобина, или любой интрон, подчиняющийся правилам сплайсинга у млекопитающих, такой как MCM7. В одном воплощении описанные в данном документе векторы иммунотерапевтической ДНК-вакцины содержат последовательности, кодирующие один или более чем один интрон. В другом воплощении векторы иммунотерапевтической ДНК-вакцины, описанные в данном документе, не имеют последовательностей, кодирующих интроны.

Метка рибосомальной приостановки: в связи с настоящим изобретением может быть полезным включение одной или более чем одной последовательности метки рибосомальной приостановки между последовательностями, кодирующими белок, в описанном в данном документе векторе/плазмиде иммунотерапевтической ДНК-вакцины для того, чтобы разделять белковые продукты.

Примером является вирусная «метка 2А FMDV» (метка вируса ящура 2А). Транслированной аминокислотной последовательностью 2А FMDV является APVKQTLNFDLLKLAGDVESNPGP - (SEQ ID NO 15). Метка 2А FMDV способна приостанавливать и повторно инициировать рибосому. Отношение транслированного продукта до и после метки 2А FMDV является близким к 1:1, и образующиеся белковые продукты обычно полностью разделяются. Данные типы рибосомальных меток ранее использовали в связи с соэкспрессией двух разных доменов, например, тяжелой цепи и легкой цепи при продукции рекомбинантного антитела. Однако автор настоящего изобретения сделал неожиданное открытие того, что они являются полезными в связи с мультицистронными ДНК-вакцинами как для отделения фланкирующих продуктов, так и для контроля отношений экспрессированных белков из-за собственых эффективностей рибосомальной повторной инициации. Метки последовательности, которые благоприятствуют отношению транслированных продуктов 1:1, в данном изобретении предпочтительно вставляются между двумя последовательностями, кодирующими белки, которые должны предпочтительно продуцироваться в отношении 1:1 (или близком к нему), как, например, инсулиновый антиген и мощный цитокин, такой как, например, TGF-β.

Другим примером метки последовательности рибосомальной приостановки в данном документе является вирусная метка последовательноси «2A TaV» (2A вируса Thosea asigna - транслированная аминокислотная последовательность 2A TaV: RAEGRGSLLTCGDVEENPGP (SEQ ID NO 16). Сообщается то, что отношение транслированного продукта до/выше и после/ниже данной метки составляет 50:1 (или около того). Автор настоящего изобретения сделал неожиданное открытие того, что, в то время как данный тип метки может использоваться для контроля уровней экспрессии в случаях, где жизненно важным является то, что один транслированный продукт абсолютно преобладает над другим, отделение фланкирующих цитокиновых продуктов составляет меньше, чем 50% относительно последовательностей, раскрытых в литературе, и отношение экспрессии, таким образом, составляет примерно 10:6. В связи с настоящим изобретением метка последовательности рибосомальной приостановки типа 2А должна предпочтительно приводить к разным уровням экспрессии двух белков, кодируемых тем же самым вектором/плазмидой. Экспрессия маленьких количеств плейотропного цитокина (такого как IL-2) по отношению к противовоспалительному цитокину, такому как IL-10, является желательной в данном изобретении, а слитые продукты - нежелательными.

Другим примером аминокислотной последовательности метки рибосомальной приостановки в данном документе является вирусная последовательность «2A P» (2A свиного тешовируса-1, ATNFSLLKQAGDVEENPGP - (SEQ ID NO 17)). Последовательности 2А Р функционируют подходящим образом в данном изобретении при вставке между IL-10 и IL-2, приводя к почти полному разделению с отношением экспрессии больше 5:1 между IL-10 и IL-2.

В качестве альтернативы, в данном изобретении можно использовать протеазочувствительные последовательности, обеспечивающие эндогенное расщепление между полибелками, экспрессируемыми плазмидой. Для разделения белковых продуктов в данном изобретении можно использовать фуринчувствительную последовательность (распознающую мотивы RAKR) или карбоксипептидазочувствительную последовательность (распознающую мотивы RRRR, RKRR или RRKR). Однако автор настоящего изобретения сделал неожиданное открытие того, что ни фуриновые, ни карбоксипептидазные расщепляемые последовательности не приводят к разделенным продуктам в данном изобретении, таким образом, приводя к секреции нежелательных слитых белков IL-10/IL-2.

TGF-b/β/β1 (трансформирующий фактор роста бета/β1): TGF-β представляет собой секретируемый белок, который контролирует пролиферацию, клеточную дифференциацию и другие функции в большинстве клеток. TGF-β представляет собой очень мощный цитокин со значительными эффектами на судьбу и фенотип клетки способами, зависимыми от контекста, например, в зависимости от других одновременно получаемых цитокиновых сигналов. Эндогенный TGF-β продуцируется в латентной форме, ассоциированной с наружной поверхностью мембраны продуцирующей клетки, и требует активации (например, воспалительными макрофагами, экспрессирующими CD36 и протеиназу плазмин) для созревания и высвобождения активной формы. В одном воплощении TGF-β в данном документе представляет собой модифицированную форму, которая является конститутивно активной. Это достигается заменой цистеинов в положениях 223 и 225 аминокислотами, не способными образовать дисульфидные мостики. Например, для замены цистеинов в положениях 223 и 225 используются серин или валин. Это приводит к структуре активного пробелка, который высвобождается в местную микросреду.

Последовательность человеческого эндогенного TGF-β1 - SEQ ID NO 18:

MPPSGLRLLLLLLPLLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLASPPSQGEVPPGPLPEAVLALYNSTRDRVAGESAEPEPEPEADYYAKEVTRVLMVETHNEIYDKFKQSTHSIYMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLLRLKLKVEQHVELYQKYSNNSWRYLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAHCSCDSRDNTLQVDINGFTTGRRGDLATIHGMNRPFLLLMATPLERAQHLQSSRHRRALDTNYCFSSTEKNCCVRQLYIDFRKDLGWKWIHEPKGYHANFCLGPCPYIWSLDTQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCVPQALEPLPIVYYVGRKPKVEQLSNMIVRSCKCS.

Последовательность модифицированного человеческого TGF-β1, который является конститутивно активным и секретируется (замены по отношению к TGF-β1 дикого типа показаны жирным шрифтом и подчеркнуты) - SEQ ID NO 19:

MPPSGLRLLLLLLPLLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLASPPSQGEVPPGPLPEAVLALYNSTRDRVAGESAEPEPEPEADYYAKEVTRVLMVETHNEIYDKFKQSTHSIYMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLLRLKLKVEQHVELYQKYSNNSWRYLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAHVSVDSRDNTLQVDINGFTTGRRGDLATIHGMNRPFLLLMATPLERAQHLQSSRHRRALDTNYCFSSTEKNCCVRQLYIDFRKDLGWKWIHEPKGYHANFCLGPCPYIWSLDTQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCVPQALEPLPIVYYVGRKPKVEQLSNMIVRSCKCS.

Другой последовательностью модифицированного человеческого TGF-β1, которую можно использовать, является SEQ ID NO 25:

MPPSGLRLLLLLLPLLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLASPPSQGEVPPGPLPEAVLALYNSTRDRVAGESAEPEPEPEADYYAKEVTRVLMVETHNEIYDKFKQSTHSIYMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLLRLKLKVEQHVELYQKYSNNSWRYLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAHSSSDSRDNTLQVDINGFTTGRRGDLATIHGMNRPFLLLMATPLERAQHLQSSRHRRALDTNYCFSSTEKNCCVRQLYIDFRKDLGWKWIHEPKGYHANFCLGPCPYIWSLDTQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCVPQALEPLPIVYYVGRKPKVEQLSNMIVRSCKCS.

Последовательность терминатора: терминатор транскрипции представляет собой отрезок последовательности нуклеиновой кислоты, который маркирует конец гена во время транскрипции. Высвобождение транскрипционного комплекса высвобождает РНК-полимеразу и связанный транскрипционный аппарат для начала транскрипции новых мРНК. Кроме того, те же самые клеточные факторы добавляют нематричный «поли-А хвост», который значительно увеличивает время жизни и функциональность мРНК. Пример подходящего терминатора транскрипции включает в данном документе терминатор «bGH_PA»:

CGACTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCCCACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGGGTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCTGGGGATGCGGTGGGCTCTATGG (SEQ ID NO 20).

В данном изобретении может использоваться любая приемлемая последовательность терминатора. Вариации включают применение двух разных фланкирующих последовательностей терминатора в случае двухнапавленных промоторов, продуцирующих две противоположно ориентированные мРНК.

В одном воплощении плазмида по изобретению имеет последовательность, как изложено в SEQ ID NO 24.

Во втором воплощении плазмида по изобретению имеет последовательность SEQ ID NO 26: полная (неаннотированная) последовательность плазмиды:

GACTCTTCGCGATGTACGGGCCAGATATACGCGTTGACATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGACTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACATCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAACAACTCCGCCCCATTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGAGCTCTCTGGCTAACTAGAGAACCCACTGCTTACTGGCTTATCGAAATTAATACGACTCACTATAGGGAGACCCAAGCTGGCTAGCGTTTAAACTTAAGCTTGGTACCGAGCTCGGATCCACTAGTCCAGTGTGGTGGAATTCTGCACTGCAGCTCGCATCTCTCCTTCACGCGCCCGCCGCCCTACCTGAGGCCGCCATCCACGCCGGTTGAGTCGCGTTCTGCCGCCTCCCGCCTGTGGTGCCTCCTGAACTGCGTCCGCCGTCTAGGTAAGTTTAAAGCTCAGGTCGAGACCGGGCCTTTGTCCGGCGCTCCCTTGGAGCCTACCTAGACTCAGCCGGCTCTCCACGCTTTGCCTGACCCTGCTTGCTCAACTCTAGGTAAGTTAATGAGACAGATAGAAACTGGTCTTGTAGAAACAGAGTAGTCGCCTGCTTTTCTGCCAGGTGCTGACTTCTCTCCCCTGGGCTTTTTTCTTTTTCTCAGGTTGAAAAGAAGAAGACGAAGAAGACGAAGAAGACAAACCGTCGTCGACTGCCATGCGCCGCTGATTAACGCCGCCACCATGGCCCACCGACGCAGATCCAGAAGCTGCCGTGAGGACCAGAAGCCCGTGATGGATGATCAGAGGGACCTTATCTCTAACAATGAACAACTGCCAATGCTCGGCAGACGGCCTGGGGCCCCGGAGAGCAAGTGCAGCAGAGGAGCCTTGTACACGGGGTTCTCCATTTTAGTGACTCTCCTTCTCGCCGGCCAAGCTACCACCGCCTACTTTCTGTACCAACAGCAAGGCAGACTAGACAAACTGACAATCACAAGCCAGAACCTTCAGCTGGAGTCTCTGCGGATGAAGCTGCCCGCTTTGTGGATGAGATTGCTTCCTCTACTTGCTCTCCTGGCGCTCTGGGGACCTGACCCCGAGCAAGAGTTTGTTAATCAGCACCTGTGTGGGAGTCATCTGGTGGAGGCACTCTATTTAGTGTGCGGAGAGAGGGGCTTCTTCTACACTCCAAAGACCAGACGGGAGGCCGAAGACCTTCAAGTGGGGCAAGTAGAACTGGGTGGCGGACCCGGTGCCGGGAGCCTTCAGCCGCTCGCCCTGGAGGGCTCTCTTCAGAAACGCGGCATCGTGGAGCAGTGTTGCACATCCATTTGCTCACTCTACCAGCTGGAGAACTACTGCAACGGAAGCGGAGTGAAGCAGACGTTGAATTTTGATTTGTTGAAGTTGGCGGGGGATGTGGAGAGCAATCCGGGGCCGATGCCCCCTAGTGGCCTCAGACTTTTGTTATTGTTATTACCGCTTTTATGGCTCTTGGTGCTGACACCGGGCCGTCCGGCTGCTGGCTTGTCGACTTGTAAGACAATTGATATGGAATTGGTGAAACGAAAACGGATTGAGGCCATCCGAGGACAGATTTTGAGCAAGCTGCGGCTTGCCTCGCCACCCTCGCAAGGGGAAGTCCCACCCGGACCTCTACCAGAAGCAGTCCTAGCGCTGTACAACAGTACAAGAGATAGAGTGGCCGGGGAATCCGCAGAACCAGAGCCTGAGCCTGAAGCCGATTATTATGCAAAGGAAGTGACTAGGGTCCTGATGGTCGAGACCCATAACGAAATCTACGACAAATTCAAACAAAGTACCCACTCTATCTACATGTTCTTCAACACCAGTGAGCTAAGAGAAGCCGTGCCCGAACCTGTGCTTCTTTCCCGCGCAGAACTCCGCCTCTTGAGACTCAAATTGAAAGTTGAACAACACGTAGAGCTTTACCAGAAATACTCTAATAATTCATGGCGATATCTTTCTAATCGTCTCCTCGCCCCATCTGACAGCCCTGAATGGCTCTCCTTCGACGTTACGGGAGTTGTGCGCCAGTGGCTCAGCAGAGGCGGAGAGATAGAGGGCTTTCGGCTGAGCGCACATAGCTCTAGCGACTCAAGGGACAACACATTGCAAGTGGATATTAACGGTTTTACAACTGGACGGAGAGGGGACCTGGCGACCATCCACGGCATGAATAGACCTTTCCTGCTGCTGATGGCTACTCCCCTGGAGAGGGCACAGCACTTACAGTCTTCCAGACACCGGCGCGCCCTGGATACAAACTACTGCTTCAGCTCCACCGAAAAGAACTGTTGCGTGCGGCAGCTGTACATTGACTTCAGAAAGGATCTGGGCTGGAAGTGGATTCATGAGCCCAAGGGGTATCATGCCAACTTCTGTCTTGGGCCATGCCCATACATCTGGTCACTGGATACCCAGTACTCCAAAGTTCTGGCCTTGTACAATCAACACAACCCTGGAGCTTCCGCCGCTCCTTGCTGTGTGCCCCAAGCCCTAGAGCCCCTGCCCATCGTTTATTATGTCGGACGCAAGCCCAAAGTAGAACAGCTATCAAATATGATCGTGAGAAGCTGCAAGTGTAGCTGATAAACGCGTCGAGCATGCATCTAGGGCGGCCAATTCCGCCCCTCTCCCCCCCACCCCTCTCCCTCCCCCCCCCCTAACGTTACTGGCCGAAGCCGCTTGGAATAAGGCCGGTGTGCGTTTGTCTATATGTTATTTTCCACCATATTGCCGTCTTTTGGCAATGTGAGGGCCCGGAAACCTGGCCCTGTCTTCTTGACGAGCATTCCTAGGGGTCTTTCCCCTCTCGCCAAAGGAATGCAAGGTCTGTTGAATGTCGTGAAGGAAGCAGTTCCTCTGGAAGCTTCTTGAAGACAAACAACGTCTGTAGCGACCCTTTGTAGACAGCGGAACCCCCCACCTGGCGATAGATGCCTCTGCGGCCAAAAGCCACGTGTATAAGATACACCTGCAAAGGCGGCACAACCCCAGTGCCACGTTGTGAGTTGGATAGTTGTGGAAAGAGTCAAATGGCTCTCCTCAAGCGTATTCAACAAGGGGCTGAAGGATGCCCAGAAGGTACCCCATTGTATGGGATCTGATCTGGGGCCTCGGTGCACATGCTTTACATGTGTTTAGTCGAGGTTAAAAAACGTCTAGGCCCCCCGAACCACGGGGACGTGGTTTTCCTTTGAAAAACACGATGATAATATGATGCACAGCTCAGCACTGCTCTGTTGCCTGGTCCTCCTGACTGGGGTGAGGGCCAGCCCAGGCCAGGGCACCCAGTCTGAGAACAGCTGCACCCACTTCCCAGGCAACCTGCCTAACATGCTTCGAGATCTCCGAGATGCCTTCAGCAGAGTGAAGACTTTCTTTCAAATGAAGGATCAGCTGGACAACTTGTTGTTAAAGGAGTCCTTGCTGGAGGACTTTAAGGGTTACCTGGGTTGCCAAGCCTTGTCTGAGATGATCCAGTTTTACCTGGAGGAGGTGATGCCCCAAGCTGAGAACCAAGACCCAGACATCAAGGCGCATGTGAACTCCCTGGGGGAGAACCTGAAGACCCTCAGGCTGAGGCTACGGCGCTGTCATCGATTTCTTCCCTGTGAAAACAAGAGCAAGGCCGTGGAGCAGGTGAAGAATGCCTTTAATAAGCTCCAAGAGAAAGGCATCTACAAAGCCATGAGTGAGTTTGACATCTTCATCAACTACATAGAAGCCTACATGACAATGAAGATACGAAACGGGAGCGGCGCTACTAACTTCAGCCTGCTGAAGCAGGCTGGAGACGTGGAGGAGAACCCTGGACCTATGTACAGAATGCAGCTGCTGAGCTGCATCGCCCTGAGCCTGGCCCTGGTGACCAACAGCGCACCCACGTCCTCTAGCACCAAGAAGACCCAGTTACAGTTGGAGCATCTACTTTTAGACCTGCAAATGATTTTGAACGGCATCAACAACTACAAGAATCCTAAACTTACTCGCATGCTTACCTTCAAATTTTACATGCCCAAGAAGGCCACCGAACTGAAGCACTTGCAATGTCTGGAGGAAGAACTCAAGCCGCTGGAGGAAGTTCTCAACCTCGCGCAGTCCAAGAATTTCCACCTCCGGCCAAGAGACCTGATCAGTAACATTAATGTGATAGTGCTGGAGCTGAAGGGAAGCGAGACTACATTTATGTGCGAGTACGCCGATGAAACCGCTACAATCGTCGAGTTCCTGAATAGATGGATCACATTTTGCCAGTCAATTATCTCTACTCTGACATGATAACTCGAGGTCTAGAGGGCCCGTTTAAACCCGCTGATCAGCCTCGACTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCCCACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGGGTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCTGGGGATGCGGTGGGCTCTATGGCTTCTACTGGGCGGTTTTATGGACAGCAAGCGAACCGGAATTGCCAGCTGGGGCGCCCTCTGGTAAGGTTGGGAAGCCCTGCAAAGTAAACTGGATGGCTTTCTCGCCGCCAAGGATCTGATGGCGCAGGGGATCAAGCTCTGATCAAGAGACAGGATGAGGATCGTTTCGCATGGCCAAAGAAGACAATATTGAAATGCAAGGTACCGTTCTTGAAACGTTGCCTAATACCATGTTCCGCGTAGAGTTAGAAAACGGTCACGTGGTTACTGCACACATCTCCGGTAAAATGCGCAAAAACTACATCCGCATCCTGACGGGCGACAAAGTGACTGTTGAACTGACCCCGTACGACCTGAGCAAAGGCCGCATTGTCTTCCGTAGTCGCTGATAAATTATTAACGCTTACAATTTCCTGATGCGGTATTTTCTCCTTACGCATCTGTGCGGTATTTCACACCGCATACAGGTGGCACTTTTCGGGGAAATGTGCGCGGAACCCCTATTTGTTTATTTTTCTAAATACATTCAAATATGTATCCGCTCATGAGACAATAACCCTGATAAATGCTTCAATAATAGCACGTGCTAAAACTTCATTTTTAATTTAAAAGGATCTAGGTGAAGATCCTTTTTGATAATCTCATGACCAAAATCCCTTAACGTGAGTTTTCGTTCCACTGAGCGTCAGACCCCGTAGAAAAGATCAAAGGATCTTCTTGAGATCCTTTTTTTCTGCGCGTAATCTGCTGCTTGCAAACAAAAAAACCACCGCTACCAGCGGTGGTTTGTTTGCCGGATCAAGAGCTACCAACTCTTTTTCCGAAGGTAACTGGCTTCAGCAGAGCGCAGATACCAAATACTGTTCTTCTAGTGTAGCCGTAGTTAGGCCACCACTTCAAGAACTCTGTAGCACCGCCTACATACCTCGCTCTGCTAATCCTGTTACCAGTGGCTGCTGCCAGTGGCGATAAGTCGTGTCTTACCGGGTTGGACTCAAGACGATAGTTACCGGATAAGGCGCAGCGGTCGGGCTGAACGGGGGGTTCGTGCACACAGCCCAGCTTGGAGCGAACGACCTACACCGAACTGAGATACCTACAGCGTGAGCTATGAGAAAGCGCCACGCTTCCCGAAGGGAGAAAGGCGGACAGGTATCCGGTAAGCGGCAGGGTCGGAACAGGAGAGCGCACGAGGGAGCTTCCAGGGGGAAACGCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGGCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTTCTT.

В третьем воплощении плазмида по изобретению имеет последовательность SEQ ID NO 28: полная (неаннотированная) последовательность плазмиды:

GACTCTTCGCGATGTACGGGCCAGATATACGCGTTGACATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGACTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACATCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAACAACTCCGCCCCATTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGAGCTCTCTGGCTAACTAGAGAACCCACTGCTTACTGGCTTATCGAAATTAATACGACTCACTATAGGGAGACCCAAGCTGGCTAGCGTTTAAACTTAAGCTTGGTACCGAGCTCGGATCCACTAGTCCAGTGTGGTGGAATTCTGCAGCTCGCATCTCTCCTTCACGCGCCCGCCGCCCTACCTGAGGCCGCCATCCACGCCGGTTGAGTCGCGTTCTGCCGCCTCCCGCCTGTGGTGCCTCCTGAACTGCGTCCGCCGTCTAGGTAAGTTTAAAGCTCAGGTCGAGACCGGGCCTTTGTCCGGCGCTCCCTTGGAGCCTACCTAGACTCAGCCGGCTCTCCACGCTTTGCCTGACCCTGCTTGCTCAACTCTAGGTAAGTTAATGAGACAGATAGAAACTGGTCTTGTAGAAACAGAGTAGTCGCCTGCTTTTCTGCCAGGTGCTGACTTCTCTCCCCTGGGCTTTTTTCTTTTTCTCAGGTTGAAAAGAAGAAGACGAAGAAGACGAAGAAGACAAACCGTCGTCGACTGCCATGCGCCGCTGATTAACGCCGCCACCATGGCCCACCGACGCAGATCCAGAAGCTGCCGTGAGGACCAGAAGCCCGTGATGGATGATCAGAGGGACCTTATCTCTAACAATGAACAACTGCCAATGCTCGGCAGACGGCCTGGGGCCCCGGAGAGCAAGTGCAGCAGAGGAGCCTTGTACACGGGGTTCTCCATTTTAGTGACTCTCCTTCTCGCCGGCCAAGCTACCACCGCCTACTTTCTGTACCAACAGCAAGGCAGACTAGACAAACTGACAATCACAAGCCAGAACCTTCAGCTGGAGTCTCTGCGGATGAAGCTGCCCGCTTTGTGGATGAGATTGCTTCCTCTACTTGCTCTCCTGGCGCTCTGGGGACCTGACCCCGAGCAAGAGTTTGTTAATCAGCACCTGTGTGGGAGTCATCTGGTGGAGGCACTCTATTTAGTGTGCGGAGAGAGGGGCTTCTTCTACACTCCAAAGACCAGACGGGAGGCCGAAGACCTTCAAGTGGGGCAAGTAGAACTGGGTGGCGGACCCGGTGCCGGGAGCCTTCAGCCGCTCGCCCTGGAGGGCTCTCTTCAGAAACGCGGCATCGTGGAGCAGTGTTGCACATCCATTTGCTCACTCTACCAGCTGGAGAACTACTGCAACGGAAGCGGAGTGAAGCAGACGTTGAATTTTGATTTGTTGAAGTTGGCGGGGGATGTGGAGAGCAATCCGGGGCCGATGCCCCCTAGTGGCCTCAGACTTTTGTTATTGTTATTACCGCTTTTATGGCTCTTGGTGCTGACACCGGGCCGTCCGGCTGCTGGCTTGTCGACTTGTAAGACAATTGATATGGAATTGGTGAAACGAAAACGGATTGAGGCCATCCGAGGACAGATTTTGAGCAAGCTGCGGCTTGCCTCGCCACCCTCGCAAGGGGAAGTCCCACCCGGACCTCTACCAGAAGCAGTCCTAGCGCTGTACAACAGTACAAGAGATAGAGTGGCCGGGGAATCCGCAGAACCAGAGCCTGAGCCTGAAGCCGATTATTATGCAAAGGAAGTGACTAGGGTCCTGATGGTCGAGACCCATAACGAAATCTACGACAAATTCAAACAAAGTACCCACTCTATCTACATGTTCTTCAACACCAGTGAGCTAAGAGAAGCCGTGCCCGAACCTGTGCTTCTTTCCCGCGCAGAACTCCGCCTCTTGAGACTCAAATTGAAAGTTGAACAACACGTAGAGCTTTACCAGAAATACTCTAATAATTCATGGCGATATCTTTCTAATCGTCTCCTCGCCCCATCTGACAGCCCTGAATGGCTCTCCTTCGACGTTACGGGAGTTGTGCGCCAGTGGCTCAGCAGAGGCGGAGAGATAGAGGGCTTTCGGCTGAGCGCACATAGCTCTAGCGACTCAAGGGACAACACATTGCAAGTGGATATTAACGGTTTTACAACTGGACGGAGAGGGGACCTGGCGACCATCCACGGCATGAATAGACCTTTCCTGCTGCTGATGGCTACTCCCCTGGAGAGGGCACAGCACTTACAGTCTTCCAGACACCGGCGCGCCCTGGATACAAACTACTGCTTCAGCTCCACCGAAAAGAACTGTTGCGTGCGGCAGCTGTACATTGACTTCAGAAAGGATCTGGGCTGGAAGTGGATTCATGAGCCCAAGGGGTATCATGCCAACTTCTGTCTTGGGCCATGCCCATACATCTGGTCACTGGATACCCAGTACTCCAAAGTTCTGGCCTTGTACAATCAACACAACCCTGGAGCTTCCGCCGCTCCTTGCTGTGTGCCCCAAGCCCTAGAGCCCCTGCCCATCGTTTATTATGTCGGACGCAAGCCCAAAGTAGAACAGCTATCAAATATGATCGTGAGAAGCTGCAAGTGTAGCTGATAAACGCGTCGAGCATGCATCTAGGGCGGCCAATTCCGCCCCTCTCCCCCCCACCCCTCTCCCTCCCCCCCCCCTAACGTTACTGGCCGAAGCCGCTTGGAATAAGGCCGGTGTGCGTTTGTCTATATGTTATTTTCCACCATATTGCCGTCTTTTGGCAATGTGAGGGCCCGGAAACCTGGCCCTGTCTTCTTGACGAGCATTCCTAGGGGTCTTTCCCCTCTCGCCAAAGGAATGCAAGGTCTGTTGAATGTCGTGAAGGAAGCAGTTCCTCTGGAAGCTTCTTGAAGACAAACAACGTCTGTAGCGACCCTTTGTAGACAGCGGAACCCCCCACCTGGCGATAGATGCCTCTGCGGCCAAAAGCCACGTGTATAAGATACACCTGCAAAGGCGGCACAACCCCAGTGCCACGTTGTGAGTTGGATAGTTGTGGAAAGAGTCAAATGGCTCTCCTCAAGCGTATTCAACAAGGGGCTGAAGGATGCCCAGAAGGTACCCCATTGTATGGGATCTGATCTGGGGCCTCGGTGCACATGCTTTACATGTGTTTAGTCGAGGTTAAAAAACGTCTAGGCCCCCCGAACCACGGGGACGTGGTTTTCCTTTGAAAAACACGATGATAATATGATGCACAGCTCAGCACTGCTCTGTTGCCTGGTCCTCCTGACTGGGGTGAGGGCCAGCCCAGGCCAGGGCACCCAGTCTGAGAACAGCTGCACCCACTTCCCAGGCAACCTGCCTAACATGCTTCGAGATCTCCGAGATGCCTTCAGCAGAGTGAAGACTTTCTTTCAAATGAAGGATCAGCTGGACAACTTGTTGTTAAAGGAGTCCTTGCTGGAGGACTTTAAGGGTTACCTGGGTTGCCAAGCCTTGTCTGAGATGATCCAGTTTTACCTGGAGGAGGTGATGCCCCAAGCTGAGAACCAAGACCCAGACATCAAGGCGCATGTGAACTCCCTGGGGGAGAACCTGAAGACCCTCAGGCTGAGGCTACGGCGCTGTCATCGATTTCTTCCCTGTGAAAACAAGAGCAAGGCCGTGGAGCAGGTGAAGAATGCCTTTAATAAGCTCCAAGAGAAAGGCATCTACAAAGCCATGAGTGAGTTTGACATCTTCATCAACTACATAGAAGCCTACATGACAATGAAGATACGAAACGGGAGCGGCGCTACTAACTTCAGCCTGCTGAAGCAGGCTGGAGACGTGGAGGAGAACCCTGGACCTATGTACAGAATGCAGCTGCTGAGCTGCATCGCCCTGAGCCTGGCCCTGGTGACCAACAGCGCACCCACGTCCTCTAGCACCAAGAAGACCCAGTTACAGTTGGAGCATCTACTTTTAGACCTGCAAATGATTTTGAACGGCATCAACAACTACAAGAATCCTAAACTTACTCGCATGCTTACCTTCAAATTTTACATGCCCAAGAAGGCCACCGAACTGAAGCACTTGCAATGTCTGGAGGAAGAACTCAAGCCGCTGGAGGAAGTTCTCAACCTCGCGCAGTCCAAGAATTTCCACCTCCGGCCAAGAGACCTGATCAGTAACATTAATGTGATAGTGCTGGAGCTGAAGGGAAGCGAGACTACATTTATGTGCGAGTACGCCGATGAAACCGCTACAATCGTCGAGTTCCTGAATAGATGGATCACATTTTGCCAGTCAATTATCTCTACTCTGACATGATAACTCGAGTCTAGAGGGCCCGTTTAAACCCGCTGATCAGCCTCGACTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCCCACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGGGTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCTGGGGATGCGGTGGGCTCTATGGCTTCTACTGGGCGGTTTTATGGACAGCAAGCGAACCGGAATTGCCAGCTGGGGCGCCCTCTGGTAAGGTTGGGAAGCCCTGCAAAGTAAACTGGATGGCTTTCTCGCCGCCAAGGATCTGATGGCGCAGGGGATCAAGCTCTGATCAAGAGACAGGATGAGGATCGTTTCGCATGGCCAAAGAAGACAATATTGAAATGCAAGGTACCGTTCTTGAAACGTTGCCTAATACCATGTTCCGCGTAGAGTTAGAAAACGGTCACGTGGTTACTGCACACATCTCCGGTAAAATGCGCAAAAACTACATCCGCATCCTGACGGGCGACAAAGTGACTGTTGAACTGACCCCGTACGACCTGAGCAAAGGCCGCATTGTCTTCCGTAGTCGCTGATAAATTATTAACGCTTACAATTTCCTGATGCGGTATTTTCTCCTTACGCATCTGTGCGGTATTTCACACCGCATACAGGTGGCACTTTTCGGGGAAATGTGCGCGGAACCCCTATTTGTTTATTTTTCTAAATACATTCAAATATGTATCCGCTCATGAGACAATAACCCTGATAAATGCTTCAATAATAGCACGTGCTAAAACTTCATTTTTAATTTAAAAGGATCTAGGTGAAGATCCTTTTTGATAATCTCATGACCAAAATCCCTTAACGTGAGTTTTCGTTCCACTGAGCGTCAGACCCCGTAGAAAAGATCAAAGGATCTTCTTGAGATCCTTTTTTTCTGCGCGTAATCTGCTGCTTGCAAACAAAAAAACCACCGCTACCAGCGGTGGTTTGTTTGCCGGATCAAGAGCTACCAACTCTTTTTCCGAAGGTAACTGGCTTCAGCAGAGCGCAGATACCAAATACTGTTCTTCTAGTGTAGCCGTAGTTAGGCCACCACTTCAAGAACTCTGTAGCACCGCCTACATACCTCGCTCTGCTAATCCTGTTACCAGTGGCTGCTGCCAGTGGCGATAAGTCGTGTCTTACCGGGTTGGACTCAAGACGATAGTTACCGGATAAGGCGCAGCGGTCGGGCTGAACGGGGGGTTCGTGCACACAGCCCAGCTTGGAGCGAACGACCTACACCGAACTGAGATACCTACAGCGTGAGCTATGAGAAAGCGCCACGCTTCCCGAAGGGAGAAAGGCGGACAGGTATCCGGTAAGCGGCAGGGTCGGAACAGGAGAGCGCACGAGGGAGCTTCCAGGGGGAAACGCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGGCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTTCTT.

В четвертом воплощении плазмида по изобретению имеет последовательность SEQ ID NO 29: полная (неаннотированная) последовательность плазмиды:

GACTCTTCGCGATGTACGGGCCAGATATACGCGTTGACATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGACTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACATCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAACAACTCCGCCCCATTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGAGCTCTCTGGCTAACTAGAGAACCCACTGCTTACTGGCTTATCGAAATTAATACGACTCACTATAGGGAGACCCAAGCTGGCTAGCGTTTAAACTTAAGCTTGGTACCGAGCTCGGATCCACTAGTCCAGTGTGGTGGAATTCTGCAGCTCGCATCTCTCCTTCACGCGCCCGCCGCCCTACCTGAGGCCGCCATCCACGCCGGTTGAGTCGCGTTCTGCCGCCTCCCGCCTGTGGTGCCTCCTGAACTGCGTCCGCCGTCTAGGTAAGTTTAAAGCTCAGGTCGAGACCGGGCCTTTGTCCGGCGCTCCCTTGGAGCCTACCTAGACTCAGCCGGCTCTCCACGCTTTGCCTGACCCTGCTTGCTCAACTCTAGGTAAGTTAATGAGACAGATAGAAACTGGTCTTGTAGAAACAGAGTAGTCGCCTGCTTTTCTGCCAGGTGCTGACTTCTCTCCCCTGGGCTTTTTTCTTTTTCTCAGGTTGAAAAGAAGAAGACGAAGAAGACGAAGAAGACAAACCGTCGTCGACTGCCATGCGCCGCTGATTAACGCCGCCACCATGGCCCACCGACGCAGATCCAGAAGCTGCCGTGAGGACCAGAAGCCCGTGATGGATGATCAGAGGGACCTTATCTCTAACAATGAACAACTGCCAATGCTCGGCAGACGGCCTGGGGCCCCGGAGAGCAAGTGCAGCAGAGGAGCCTTGTACACGGGGTTCTCCATTTTAGTGACTCTCCTTCTCGCCGGCCAAGCTACCACCGCCTACTTTCTGTACCAACAGCAAGGCAGACTAGACAAACTGACAATCACAAGCCAGAACCTTCAGCTGGAGTCTCTGCGGATGAAGCTGCCCGCTTTGTGGATGAGATTGCTTCCTCTACTTGCTCTCCTGGCGCTCTGGGGACCTGACCCCGAGCAAGAGTTTGTTAATCAGCACCTGTGTGGGAGTCATCTGGTGGAGGCACTCTATTTAGTGTGCGGAGAGAGGGGCTTCTTCTACACTCCAAAGACCAGACGGGAGGCCGAAGACCTTCAAGTGGGGCAAGTAGAACTGGGTGGCGGACCCGGTGCCGGGAGCCTTCAGCCGCTCGCCCTGGAGGGCTCTCTTCAGAAACGCGGCATCGTGGAGCAGTGTTGCACATCCATTTGCTCACTCTACCAGCTGGAGAACTACTGCAACGGAAGCGGAGTGAAGCAGACGTTGAATTTTGATTTGTTGAAGTTGGCGGGGGATGTGGAGAGCAATCCGGGGCCGATGCCCCCTAGTGGCCTCAGACTTTTGTTATTGTTATTACCGCTTTTATGGCTCTTGGTGCTGACACCGGGCCGTCCGGCTGCTGGCTTGTCGACTTGTAAGACAATTGATATGGAATTGGTGAAACGAAAACGGATTGAGGCCATCCGAGGACAGATTTTGAGCAAGCTGCGGCTTGCCTCGCCACCCTCGCAAGGGGAAGTCCCACCCGGACCTCTACCAGAAGCAGTCCTAGCGCTGTACAACAGTACAAGAGATAGAGTGGCCGGGGAATCCGCAGAACCAGAGCCTGAGCCTGAAGCCGATTATTATGCAAAGGAAGTGACTAGGGTCCTGATGGTCGAGACCCATAACGAAATCTACGACAAATTCAAACAAAGTACCCACTCTATCTACATGTTCTTCAACACCAGTGAGCTAAGAGAAGCCGTGCCCGAACCTGTGCTTCTTTCCCGCGCAGAACTCCGCCTCTTGAGACTCAAATTGAAAGTTGAACAACACGTAGAGCTTTACCAGAAATACTCTAATAATTCATGGCGATATCTTTCTAATCGTCTCCTCGCCCCATCTGACAGCCCTGAATGGCTCTCCTTCGACGTTACGGGAGTTGTGCGCCAGTGGCTCAGCAGAGGCGGAGAGATAGAGGGCTTTCGGCTGAGCGCACATAGCTCTAGCGACTCAAGGGACAACACATTGCAAGTGGATATTAACGGTTTTACAACTGGACGGAGAGGGGACCTGGCGACCATCCACGGCATGAATAGACCTTTCCTGCTGCTGATGGCTACTCCCCTGGAGAGGGCACAGCACTTACAGTCTTCCAGACACCGGCGCGCCCTGGATACAAACTACTGCTTCAGCTCCACCGAAAAGAACTGTTGCGTGCGGCAGCTGTACATTGACTTCAGAAAGGATCTGGGCTGGAAGTGGATTCATGAGCCCAAGGGGTATCATGCCAACTTCTGTCTTGGGCCATGCCCATACATCTGGTCACTGGATACCCAGTACTCCAAAGTTCTGGCCTTGTACAATCAACACAACCCTGGAGCTTCCGCCGCTCCTTGCTGTGTGCCCCAAGCCCTAGAGCCCCTGCCCATCGTTTATTATGTCGGACGCAAGCCCAAAGTAGAACAGCTATCAAATATGATCGTGAGAAGCTGCAAGTGTAGCTGATAAACGCGTCGAGCATGCATCTAGGGCGGCCAATTCCGCCCCTCTCCCCCCCACCCCTCTCCCTCCCCCCCCCCTAACGTTACTGGCCGAAGCCGCTTGGAATAAGGCCGGTGTGCGTTTGTCTATATGTTATTTTCCACCATATTGCCGTCTTTTGGCAATGTGAGGGCCCGGAAACCTGGCCCTGTCTTCTTGACGAGCATTCCTAGGGGTCTTTCCCCTCTCGCCAAAGGAATGCAAGGTCTGTTGAATGTCGTGAAGGAAGCAGTTCCTCTGGAAGCTTCTTGAAGACAAACAACGTCTGTAGCGACCCTTTGTAGACAGCGGAACCCCCCACCTGGCGATAGATGCCTCTGCGGCCAAAAGCCACGTGTATAAGATACACCTGCAAAGGCGGCACAACCCCAGTGCCACGTTGTGAGTTGGATAGTTGTGGAAAGAGTCAAATGGCTCTCCTCAAGCGTATTCAACAAGGGGCTGAAGGATGCCCAGAAGGTACCCCATTGTATGGGATCTGATCTGGGGCCTCGGTGCACATGCTTTACATGTGTTTAGTCGAGGTTAAAAAACGTCTAGGCCCCCCGAACCACGGGGACGTGGTTTTCCTTTGAAAAACACGATGATAATATGATGCACAGCTCAGCACTGCTCTGTTGCCTGGTCCTCCTGACTGGGGTGAGGGCCAGCCCAGGCCAGGGCACCCAGTCTGAGAACAGCTGCACCCACTTCCCAGGCAACCTGCCTAACATGCTTCGAGATCTCCGAGATGCCTTCAGCAGAGTGAAGACTTTCTTTCAAATGAAGGATCAGCTGGACAACTTGTTGTTAAAGGAGTCCTTGCTGGAGGACTTTAAGGGTTACCTGGGTTGCCAAGCCTTGTCTGAGATGATCCAGTTTTACCTGGAGGAGGTGATGCCCCAAGCTGAGAACCAAGACCCAGACATCAAGGCGCATGTGAACTCCCTGGGGGAGAACCTGAAGACCCTCAGGCTGAGGCTACGGCGCTGTCATCGATTTCTTCCCTGTGAAAACAAGAGCAAGGCCGTGGAGCAGGTGAAGAATGCCTTTAATAAGCTCCAAGAGAAAGGCATCTACAAAGCCATGAGTGAGTTTGACATCTTCATCAACTACATAGAAGCCTACATGACAATGAAGATACGAAACGGGAGCGGCGCTACTAACTTCAGCCTGCTGAAGCAGGCTGGAGACGTGGAGGAGAACCCTGGACCTATGTACAGAATGCAGCTGCTGAGCTGCATCGCCCTGAGCCTGGCCCTGGTGACCAACAGCGCACCCACGTCCTCTAGCACCAAGAAGACCCAGTTACAGTTGGAGCATCTACTTTTAGACCTGCAAATGATTTTGAACGGCATCAACAACTACAAGAATCCTAAACTTACTCGCATGCTTACCTTCAAATTTTACATGCCCAAGAAGGCCACCGAACTGAAGCACTTGCAATGTCTGGAGGAAGAACTCAAGCCGCTGGAGGAAGTTCTCAACCTCGCGCAGTCCAAGAATTTCCACCTCCGGCCAAGAGACCTGATCAGTAACATTAATGTGATAGTGCTGGAGCTGAAGGGAAGCGAGACTACATTTATGTGCGAGTACGCCGATGAAACCGCTACAATCGTCGAGTTCCTGAATAGATGGATCACATTTTGCCAGTCAATTATCTCTACTCTGACATGATAACTCGAGTCTAGAGGGCCCGTTTAAACCCGCTGATCAGCCTCGACTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCCCACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGGGTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCTGGGGATGCGGTGGGCTCTATGGCTTCTACTGGGCGGTTTTATGGACAGCAAGCGAACCGGAATTGCCAGCTGGGGCGCCCTCTGGTAAGGTTGGGAAGCCCTGCAAAGTAAACTGGATGGCTTTCTCGCCGCCAAGGATCTGATGGCGCAGGGGATCAAGCTCTGATCAAGAGACAGGATGAGGATCGTTTCGCATGGCCAAAGAAGACAATATTGAAATGCAAGGTACCGTTCTTGAAACGTTGCCTAATACCATGTTCCGCGTAGAGTTAGAAAACGGTCACGTGGTTACTGCACACATCTCCGGTAAAATGCGCAAAAACTACATCCGCATCCTGACGGGCGACAAAGTGACTGTTGAACTGACCCCGTACGACCTGAGCAAAGGCCGCATTGTCTTCCGTAGTCGCTGATAAATTATTAACGCTTACAATTTCCTGATGCGGTATTTTCTCCTTACGCATCTGTGCGGTATTTCACACCGCATACAGGTGGCACTTTTCGGGGAAATGTGCGCGGAACCCCTATTTGTTTATTTTTCTAAATACATTCAAATATGTATCCGCTCATGAGACAATAACCCTGATAAATGCTTCAATAATAGCACGTGCTAAAACTTCATTTTTAATTTAAAAGGATCTAGGTGAAGATCCTTTTTGATAATCTCATGACCAAAATCCCTTAACGTGAGTTTTCGTTCCACTGAGCGTCAGACCCCGTAGAAAAGATCAAAGGATCTTCTTGAGATCCTTTTTTTCTGCGCGTAATCTGCTGCTTGCAAACAAAAAAACCACCGCTACCAGCGGTGGTTTGTTTGCCGGATCAAGAGCTACCAACTCTTTTTCCGAAGGTAACTGGCTTCAGCAGAGCGCAGATACCAAATACTGTTCTTCTAGTGTAGCCGTAGTTAGGCCACCACTTCAAGAACTCTGTAGCACCGCCTACATACCTCGCTCTGCTAATCCTGTTACCAGTGGCTGCTGCCAGTGGCGATAAGTCGTGTCTTACCGGGTTGGACTCAAGACGATAGTTACCGGATAAGGCGCAGCGGTCGGGCTGAACGGGGGGTTCGTGCACACAGCCCAGCTTGGAGCGAACGACCTACACCGAACTGAGATACCTACAGCGTGAGCTATGAGAAAGCGCCACGCTTCCCGAAGGGAGAAAGGCGGACAGGTATCCGGTAAGCGGCAGGGTCGGAACAGGAGAGCGCACGAGGGAGCTTCCAGGGGGAAACGCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGGCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTTCTT

Термин «GLP-1 (глюкагонподобный пептид-1)/пептид GLP-1/пептид-агонист GLP-1R» в том виде, в котором он используется в данном документе, относится к описанным в данном документе молекулам/пептидам/белкам/вариантам/агонистам GLP-1, которые представляют собой молекулы, имеющие функцию агониста GLP-1R, означая то, что они представляют собой агонисты рецептора GLP-1. Данный класс лекарственных средств обычно используется для лечения диабета, в частности, диабета типа 2. Аминокислотная последовательность зрелого «человеческого GLP-1» представляет собой: HAEGTFTSDVSSYLEGQAAKEFIAWLVKGRG (SEQ ID NO: 21).

Термин «аналог GLP-1» в том виде, в котором он используется в данном документе, относится к пептиду или соединению, которое представляет собой вариант GLP-1 (SEQ ID NO: 15). Термины «аналог GLP-1» и «аналог» могут использоваться в данном документе взаимозаменяемо.

Аналоги GLP-1 могут быть описаны посредством ссылки на i) число аминокислотных остатков в человеческом GLP-1 (SEQ ID NO: 15), которое соответствует аминокислотному остатку, который модифицирован (т.е. соответствующее положение в GLP-1 (SEQ ID NO: 15)), и ii) реальную модификацию.

Термин производные GLP-1 относится к производным аналогов GLP-1. Термин «производное» в том виде, в котором он используется в данном документе в контексте аналога GLP-1, означает химически модифицированный аналог GLP-1, в котором один или более чем один заместитель был ковалентно присоединен к аналогу GLP-1. Термин «заместитель» в том виде, в котором он используется в данном документе, означает химическую группировку или группу/боковую группу, конъюгированную с белком/агонистом/аналогом GLP-1. Производное может содержать одну или более чем одну модификацию, выбранную из амидов, углеводов, алкильных групп, ацильных групп, сложных эфиров и тому подобного.

В некоторых воплощениях заместитель ковалентно присоединен через аминокислотный остаток в указанном полипептиде, например, в одном из положений аминокислот, выбранном из группы, состоящей из положения 22, 23, 27, 34, 35 и 36.

В некоторых воплощениях производное GLP-1 содержит заместитель, содержащий липофильную группировку. Термин «липофильная группировка» в том виде, в котором он используется в данном документе, означает алифатическую или циклическую углеводородную группировку с более чем 6 и менее чем 30 атомами углерода, где указанная углеводородная группировка может содержать дополнительные заместители.

Примеры агонистов GLP-1 включают (но не ограничиваются) экзенатидом, лираглутидом, ликсисентидом, албиглутидом, дулаглутидом, таспоглутидом и семаглутидом. Иммунотерапевтические ДНК-вакцины с использованием плазмид в данном документе можно исходно объединять с параллельной обработкой агонистом GLP-1R при лечении, например, пациентов с недавним началом T1D. Совместное введение GLP-1 может быть хроническим или временным и включает пероральные пути, помимо парентеральных путей.

Лираглутид: (SEQ ID NO 22):

Семаглутид (SEQ ID NO 23):

Фармацевтические композиции в данном документе предпочтительно представляют собой водные препараты, содержащие по меньшей мере 50% воды, более предпочтительно, по меньшей мере 60% воды, более предпочтительно, по меньшей мере 75% воды, более предпочтительно, по меньшей мере 90% воды, более предпочтительно, по меньшей мере 95% воды и наиболее предпочтительно по меньшей мере 99% воды. Фармацевтические композиции в данном документе, в качестве альтернативы, могут представлять собой сухие препараты, такие как лиофилизированные препараты, предназначенные для разведения, ингаляции, закапывания в нос, внутрикожного введения и т.д.

Фармацевтические препараты в данном документе предпочтительно вводятся без применения способов усиления трансформации, таких как электропорация. В одном воплощении фармацевтические препараты предназначены для парентерального введения, например, подкожного введения, внутрикожного введения, внутривенного введения, внутримышечного введения и т.д. В другом воплощении фармацевтические композиции в данном документе могут дополнительно вводиться местно, перорально, ректально или посредством ингаляции.

Фармацевтические композиции в данном документе предпочтительно приготовлены без добавления каких-либо конденсрующих агентов или других эксципиентов, которые могут индуцировать локальные реакции. Препараты в данном документе предпочтительно содержат ловушки свободных радикалов (например, 1% этанол) и/или хелаторы, такие как, например, ловушки двухвалентных катионов (например, EDTA [CAS #60-00-4], EGTA [CAS #67-42-5] или DPTA [CAS #67-43-6]), для того, чтобы увеличивать стабильность водной плазмидной ДНК. Фармацевтические композиции в данном документе, кроме того, могут находиться в форме физиологического раствора и/или буферного раствора, или содержат физиологический раствор и/или содержат буферный раствор (например, PBS - фосфатно-солевой буферный раствор, буфер TRIS или эквивалентные фармацевтически приемлемые буферы). Фармацевтические препараты в данном документе предпочтительно не содержат каких-либо адъювантов, а также других типичных ингредиентов вакцин, таких как, например, гидроксид алюминия, фенол, сорбит, силикон и т.д.

Введение: иммунотерапевтическая ДНК-вакцина в данном документе может вводиться пациенту с T1D или пациенту, подверженному риску развития T1D. Данная вакцина может вводиться, например, на ежесуточной основе, через сутки, дважды в неделю, один раз в неделю, дважды в месяц, один раз в месяц, каждый второй месяц, четыре раза в год или один раз в год - частота может корректироваться согласно общим или индивидуальным потребностям. Иммунотерапия в данном документе может быть хронической. Продолжительность терапии может составлять, например, один месяц, два месяца, три месяца, 6 месяцев, один год, два года, три года, пять лет, шесть лет, семь лет, восемь лет, девять лет или 10 лет.

Воплощения

Следующие воплощения иллюстрируют данное изобретение, и их не следует понимать каким-либо ограничивающим образом. Понятно, что все воплощения можно объединять любыми возможными способами.

1. Плазмида, которая кодирует:

i. антиген;

ii. TGF-β; и

iii. IL-10.

2. Плазмида по воплощению 1, в которой указанный антиген представляет собой инсулиновый антиген.

3. Плазмида, которая соэкспрессирует/кодирует (предпочтительно от одного оперона): (i) антиген, такой как, например, инсулиновый антиген; (ii) TGF-β/TGF-β1 (такой как конститутивно активная форма); и (iii) IL-10.

4. Плазмида по любому из воплощений 1-3, где указанный инсулиновый антиген выбран из группы, состоящей из: проинсулина, не способного к секреции пре-проинсулина, или их функционального, или иммунодоминантного пептидного фрагмента.

5. Плазмида по любому из воплощений 1-4, где указанный инсулиновый антиген выбран из группы, состоящей из: проинсулина, пре-проинсулина и их функционального, или иммунодоминантного пептидного фрагмента.

6. Плазмида по любому из воплощений 1-5, где указанный инсулиновый антиген представляет собой нацеленный в эндосомы инсулин.

7. Плазмида по любому из воплощений 1-6, где указанная плазмида экспрессирует инсулиновый антиген и TGF-β в соотношении примерно 1:1.

8. Плазмида по любому из воплощений 1-7, где указанная плазмида экспрессирует инсулиновый антиген и TGF-β в количестве по меньшей мере в 200 раз меньшем, чем IL-10.

9. Плазмида по любому из воплощений 1-8, где указанная плазмида экспрессирует инсулиновый антиген и TGF-β в количестве по меньшей мере в 2 раз меньшем, чем IL-10.

10. Плазмида по любому из воплощений 1-9, где указанная плазмида, кроме того, соэкспрессирует интерлейкин-2 (IL-2).

11. Плазмида по любому из воплощений 1-10, где указанная плазмида экспрессирует избыток IL-10 и IL-2 по сравнению с антигеном (например, инсулином) и TGF-β.

12. Плазмида по любому из воплощений 1-11, где указанная плазмида экспрессирует по меньшей мере примерно однократный, двухкратный, пятикратный или по меньшей мере примерно стократный избыток IL-10 и IL-2 по сравнению с TGF-β и инсулиновым антигеном (отношение IL-10 плюс IL-2 к инсулину плюс TGF-β может составлять по меньшей мере 1:1 или 2:1, или 5:1, или 100:1).

13. Плазмида по любому из воплощений 1-12, где указанная плазмида экспрессирует по меньшей мере примерно стократный, двухсоткратный, пятисоткратный или по меньшей мере примерно тысячекратный избыток IL-10 и IL-2 по сравнению с TGF-β и инсулиновым антигеном (отношение IL-10 плюс IL-2 к инсулину плюс TGF-β может составлять по меньшей мере 100:1 или 200:1, или 500:1, или 1000:1).

14. Плазмида по любому из воплощений 1-13, где указанная плазмида экспрессирует IL-10 и IL-2 в отношении примерно 1:1 - 100:1, таком как, например, 1:1 - 50:1, таком как, например, 1:1 - 25:1, таком как, например, 1:1 - 10:1, в качестве альтернативы - 1:1 - 3:1, в качестве альтернативы - 1:1 - 2:1. В качестве альтернативы, отношение между экспрессируемым IL-10 и экспрессируемым IL-2 может составлять примерно 1:1; 1:0,9; 1:0,8; 1:0,7; 1:0,6; 1:0,5; 1:0,4; 1:0,3; 1:0,2 или 1:0,1.

15. Плазмида по любому из воплощений 1-14, где указанная плазмида содержит: (i) элемент 2А FMDV, отделяющий последовательность, кодирующую инсулиновый антиген, и последовательность, кодирующую TGF-β, (ii) элемент IRES EMCV, отделяющий последовательность, кодирующую TGF-β, и последовательность, кодирующую IL-10, и (iii) элемент 2А, отделяющий последовательность, кодирующую IL-10, и последовательность, кодирующую IL-2.

16. Плазмида по любому из воплощений 1-15, где указанная плазмида содержит:

(i) элемент 2А (такой как элемент 2А FMDV или 2А Р), отделяющий последовательность, кодирующую инсулиновый антиген, и последовательность, кодирующую TGF-β,

(ii) элемент IRES EMCV (в качестве альтернативы, двухнаправленный промотор), отделяющий последовательность, кодирующую TGF-β, и последовательность, кодирующую IL-10 (предпочтительно три аминокислоты аланин кодируются немедленно N-терминально по отношению к гену IL-10), и

(iii) элемент 2А (такой как элемент 2А Р), отделяющий последовательность, кодирующую IL-10, и последовательность, кодирующую IL-2.

17. Плазмида по любому из воплощений 1-16, в которой последовательность, кодирующая TGF-β, кодирует конститутивно активный TGF-β, предпочтительно конститутивно активный человеческий TGF-β1.

18. Плазмида по любому из воплощений 1-17, где указанная плазмида содержит: (i) нацеленную в эндосомы кодирующую последовательность препроинсулина, (ii) элемент 2А FMDV, (iii) последовательность, кодирующую TGF-β, (iv) элемент IRES EMCV, (v) последовательность, кодирующую IL-10, (vi) элемент 2А Р, (vii) последовательность, кодирующую IL-2, (viii) элемент полиаденилирования / терминации, (ix) селективный ген, (х) репликатор, (xi) эукариотический промоторный элемент, (xii) эукариотическую последовательность начала трансляции, (xiii) последовательность эндосомальной сортировки и (xiv) возможно интрон.

19. Плазмида по любому из воплощений 1-18, где указанная плазмида содержит следующие элементы:

(i) промотор (такой как промотор IE CMV),

(ii) интрон (локализованный в пределах некодирующей лидерной последовательности) и

(iii) эукариотическая последовательность начала трансляции (такая как элемент Козака),

(iv) последовательность, кодирующая антиген, нацеленный в эндосомы (такая как последовательность, кодирующая нацеленный в эндосомы человеческий пре-проинсулин, дефектный в отношении секреции),

(v) элемент 2А FMDV, предпочтительно отделяющий последовательность, кодирующую антиген, и последовательность, кодирующую TGF-β,

(vi) последовательность, кодирующая TGF-β (как, например, последовательность, кодирующая конститутивно активный человеческий TGF-β, предпочтительно последовательность, кодирующая конститутивно активный человеческий TGF-β1),

(vii) элемент IRES EMCV (или, в качестве альтернативы, двухнаправленный эукариотический промотор), где указанный элемент IRES EMCV отделяет последовательность, кодирующую TGF-β, и последовательность, кодирующую IL-10,

(viii) последовательность, кодирующая IL-10 (как, например, последовательность, кодирующая человеческий IL-10 с N-концевым добавлением трех аминокислот аланинов),

(ix) элемент 2А, такой как элемент 2А Р, где указанный элемент 2А отделяет последовательность, кодирующую IL-10, и последовательность, кодирующую IL-2,

(х) последовательность, кодирующая IL-2 (как, например, последовательность, кодирующая человеческий IL-2),

(xi) терминирующий элемент (такой как терминирующий элемент bGH_PA),

(xii) селективный ген (такой как последовательность, кодирующая канамицин, или последовательность, кодирующая infA wt (дикого типа)),

(xiii) репликатор (такой как прокариотический репликатор, такой как, например, pUC ori).

20. Плазмида по воплощению 18, в которой элементы (i)-(xiii) организованы по порядку экспрессии.

21. Плазмида по любому из воплощений 1-20, в которой последовательность ДНК плазмиды является такой, как изложено в SEQ ID NO 24, или по существу как изложено в SEQ ID NO 24.

22. Плазмида по воплощению 21, в которой в описанной в данном документе SEQ ID NO 24 делается несколько минорных модификаций, приводящих, например, к одной, двум, трем или четырем аминокислотным заменам в одном или более чем одном антигене и/или цитокине.

23. Плазмида по любому из воплощений 1-20, в которой последовательность ДНК плазмиды является такой, как изложено в SEQ ID NO:26 или модификации SEQ ID NO:26, приводящей, например, к одной, двум, трем или четырем аминокислотным заменам в одном или более чем одном антигене и/или цитокине, или модификации SEQ ID NO:26, которая приводит к экспрессии таких же полипептидных последовательностей, как и от SEQ ID NO:26.

24. Плазмида по любому из воплощений 1-20, в которой последовательность ДНК плазмиды является такой, как изложено в SEQ ID NO:26 или модификации SEQ ID NO:26, имеющей меньше, чем 100 оснований, которые отличаются от SEQ ID NO:26.

25. Плазмида по любому из воплощений 1-20, в которой последовательность ДНК плазмиды является такой, как изложено в SEQ ID NO:28 или модификации SEQ ID NO:28, приводящей, например, к одной, двум, трем или четырем аминокислотным заменам в одном или более чем одном антигене и/или цитокине, или модификации SEQ ID NO:28, которая приводит к экспрессии таких же полипептидных последовательностей, как и от SEQ ID NO:28.

26. Плазмида по любому из воплощений 1-20, в которой последовательность ДНК плазмиды является такой, как изложено в SEQ ID NO:28 или модификации SEQ ID NO:28, имеющей меньше, чем 100 оснований, которые отличаются от SEQ ID NO:28.

27. Плазмида по любому из воплощений 1-20, в которой последовательность ДНК плазмиды является такой, как изложено в SEQ ID NO:29 или модификации SEQ ID NO:29, приводящей, например, к одной, двум, трем или четырем аминокислотным заменам в одном или более чем одном антигене и/или цитокине, или модификации SEQ ID NO:29, которая приводит к экспрессии таких же полипептидных последовательностей, как и от SEQ ID NO:29.

28. Плазмида по любому из воплощений 1-20, в которой последовательность ДНК плазмиды является такой, как изложено в SEQ ID NO:29 или модификации SEQ ID NO:29, имеющей меньше, чем 100 оснований, которые отличаются от SEQ ID NO:29.

29. Плазмида по любому из воплощений 1-20, где указанная плазмида содержит ген TGF-β, содержащий SEQ ID NO:25 или SEQ ID NO:25, имеющую меньше, чем 10 замен оснований.

30. Плазмида по любому из воплощений 1-29 для применения в отсрочке или предупреждении диабета типа I.

31. Плазмида по любому из воплощений 1-30 для внутримышечного, внутрикожного, интраназального или подкожного введения.

32. Плазмида по воплощению 31 для подкожного введения.

33. Плазмида по воплощению 31 для внутримышечной инъекции.

34. Плазмида по любому из воплощений 1-33 для применения в лечении медицинского состояния у субъекта, такого как диабет типа I, диабет типа I с ранним началом или повышенный риск развития диабета типа I (включая состояния типа диабета типа 1,5).

35. Иммунотерапевтическая ДНК-вакцина, содержащая плазмиду по любому из воплощений 1-34.

36. Иммунотерапевтическая ДНК-вакцина по воплощению 35 для применения в отсрочке или предупреждении диабета типа I.

37. Иммунотерапевтическая ДНК-вакцина по любому из воплощений 35-36 для внутримышечного, внутрикожного, интраназального или подкожного введения.

38. Иммунотерапевтическая ДНК-вакцина по воплощению 37 для подкожного введения.

39. Иммунотерапевтическая ДНК-вакцина по воплощению 37 для внутримышечного введения.

40. Иммунотерапевтическая ДНК-вакцина по любому из воплощений 35-39, используемая в ассоциации с или параллельно с другими типами медицинских лечений, таких как, например, терапия бета-клетками/бета-стволовыми клетками, пересадка бета-клеток/бета-стволовых клеток и т.д. для продления выживания и эффективности пересаженных клеток.

41. Фармацевтическая композиция, содержащая иммунотерапевтическую ДНК-вакцину по любому из воплощений 34-39 или плазмиду по любому из воплощений 1-34, где указанная фармацевтическая композиция содержит физиологический раствор и/или буфер, и/или хелатор.

42. Фармацевтическая композиция, содержащая иммунотерапевтическую ДНК-вакцину по любому из воплощений 35-40 или плазмиду по любому из воплощений 1-34, где указанная фармацевтическая композиция содержит физиологический раствор и/или буфер, и/или хелатор, и/или этанол.

43. Фармацевтическая композиция по любому из воплощений 41-42, в которой объем/процентное содержание по объему этанола составляет меньше, чем 5%, меньше, чем 4%, меньше, чем 3%, меньше, чем 2% или меньше, чем 1%.

44. Фармацевтическая композиция по любому из воплощений 41-43, где указанная композиция не содержит какого-либо вируса, липидного соупаковочного агента или конденсирующего агента.

45. Фармацевтическая композиция по любому из воплощений 41-44, где указанная композиция дополнительно содержит агонист GLP-1R.

46. Фармацевтическая композиция по любому из воплощений 41-44, где указанная композиция дополнительно содержит аналог GLP-1/агонист GLP-1R.

47. Фармацевтическая композиция по любому из воплощений 45-46, где указанный аналог GLP-1 или указанный агонист GLP-1R выбран из лираглутида, семаглутида или их смеси.

48. Набор, содержащий фармацевтическую композицию по любому из воплощений 41-47 и фармацевтическую композицию, содержащую аналог GLP-1/агонист GLP-1R (например, лираглутид и/или семаглутид).

49. Способ получения плазмиды по любому из воплощений 1-34, где указанный способ включает (i) инкубирование клетки-хозяина, такой как клетка-хозяин бактериального происхождения, такой как, например, E. coli), трансфицированной указанной плазмидой, при подходящих условиях и (ii) выделение/очистка указанной плазмиды.

50. Способ по воплощению 49, где указанная клетка-хозяин представляет собой термочувствительный штамм E. coli infA.

51. Способ отсрочки начала диабета типа 1 (T1D) или его симптомов у пациента, подвергающегося риску развития T1D, или у которого недавно диагностирован T1D, причем указанный способ включает введение иммунотерапевтической ДНК-вакцины, содержащей плазмиду по любому из воплощений 1-31, возможно в комбинации с аналогом GLP-1/агонистом GLP-1R.

52. Способ сохранения функции бета-клеток и/или эндогенной продукции инсулина у индивида, включающий введение иммунотерапевтической ДНК-вакцины, содержащей плазмиду по любому из воплощений 1-34, возможно в комбинации с аналогом GLP-1/агонистом GLP-1R.

53. Способ лечения диабетика, включающий введение вакцины, содержащей плазмиду по любому из воплощений 1-34, возможно в комбинации с аналогом GLP-1/агонистом GLP-1R (например, лираглутидом и/или семаглутидом).

54. Вакцина для предупреждения или отсрочки начала симптомов диабета типа-1 (T1D) у пациента, подвергающегося риску развития, или у которого недавно диагностирован T1D, причем указанная вакцина содержит плазмиду по любому из воплощений 1-34.

55. Способ уменьшения дозировки инсулина у индивида, имеющего диабет типа-1 (T1D), или человека, подвергающегося риску развития T1D, включающий введение иммунотерапевтической ДНК-вакцины, содержащей плазмиду по любому из воплощений 1-33, возможно в комбинации с аналогом GLP-1/агонистом GLP-1R (например, лираглутидом и/или семаглутидом).

ПРИМЕРЫ

Не страдающие ожирением диабетические мыши (мышиная модель NOD диабета типа 1): иммунная функция в аутоиммунитете основывается на сложной сети клеточных взаимодействий, которые не могут быть адекватно оценены in vitro.

Оценки подавления и/или лечения заболевания в данном документе проводятся в мышиной модели NOD, данная модель представляет собой полигенную модель со спонтанным началом, где у большинства мышей развиваются повышенные концентрации глюкозы в крови (BVG - значение глюкозы в крови), определенное из использования укола в хвостовую вену и ручного измерителя) в возрасте от 12 до 30 недель. Заболеваемость и прогрессирование заболевания являются непредсказуемыми с общей заболеваемостью, варьирующей от 60% до 95% в возрасте 30 недель (WoA), и прогрессированием от постановки диагноза (два последовательных показания BVG больше 250) до смерти (два последовательных показания BVG 600 или выше), варьирующим от 2 суток до 4 недель. Повтор повышенных BVG при последовательных показаниях необходим, так как мышам дают пищу и воду без ограничений, что приводит к умеренной вариабельности BGV помимо той, которая вызвана иммунопатологией.

Примером нуклеотидной последовательности плазмиды в данном документе является:

SEQ ID NO 24: полная (неаннотированная) последовательность плазмиды (6401 пара оснований)

GACTCTTCGCGATGTACGGGCCAGATATACGCGTTGACATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGACTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACATCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAACAACTCCGCCCCATTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGAGCTCTCTGGCTAACTAGAGAACCCACTGCTTACTGGCTTATCGAAATTAATACGACTCACTATAGGGAGACCCAAGCTGGCTAGCGTTTAAACTTAAGCTTGGTACCGAGCTCGGATCCACTAGTCCAGTGTGGTGGAATTCTGCACTGCAGCTCGCATCTCTCCTTCACGCGCCCGCCGCCCTACCTGAGGCCGCCATCCACGCCGGTTGAGTCGCGTTCTGCCGCCTCCCGCCTGTGGTGCCTCCTGAACTGCGTCCGCCGTCTAGGTAAGTTTAAAGCTCAGGTCGAGACCGGGCCTTTGTCCGGCGCTCCCTTGGAGCCTACCTAGACTCAGCCGGCTCTCCACGCTTTGCCTGACCCTGCTTGCTCAACTCTAGGTAAGTTAATGAGACAGATAGAAACTGGTCTTGTAGAAACAGAGTAGTCGCCTGCTTTTCTGCCAGGTGCTGACTTCTCTCCCCTGGGCTTTTTTCTTTTTCTCAGGTTGAAAAGAAGAAGACGAAGAAGACGAAGAAGACAAACCGTCGTCGACTGCCATGCGCCGCTGATTAACGCCGCCACCATGGCCCACCGACGCAGATCCAGAAGCTGCCGTGAGGACCAGAAGCCCGTGATGGATGATCAGAGGGACCTTATCTCTAACAATGAACAACTGCCAATGCTCGGCAGACGGCCTGGGGCCCCGGAGAGCAAGTGCAGCAGAGGAGCCTTGTACACGGGGTTCTCCATTTTAGTGACTCTCCTTCTCGCCGGCCAAGCTACCACCGCCTACTTTCTGTACCAACAGCAAGGCAGACTAGACAAACTGACAATCACAAGCCAGAACCTTCAGCTGGAGTCTCTGCGGATGAAGCTGCCCGCTTTGTGGATGAGATTGCTTCCTCTACTTGCTCTCCTGGCGCTCTGGGGACCTGACCCCGAGCAAGAGTTTGTTAATCAGCACCTGTGTGGGAGTCATCTGGTGGAGGCACTCTATTTAGTGTGCGGAGAGAGGGGCTTCTTCTACACTCCAAAGACCAGACGGGAGGCCGAAGACCTTCAAGTGGGGCAAGTAGAACTGGGTGGCGGACCCGGTGCCGGGAGCCTTCAGCCGCTCGCCCTGGAGGGCTCTCTTCAGAAACGCGGCATCGTGGAGCAGTGTTGCACATCCATTTGCTCACTCTACCAGCTGGAGAACTACTGCAACGGAAGCGGAGTGAAGCAGACGTTGAATTTTGATTTGTTGAAGTTGGCGGGGGATGTGGAGAGCAATCCGGGGCCGATGCCCCCTAGTGGCCTCAGACTTTTGTTATTGTTATTACCGCTTTTATGGCTCTTGGTGCTGACACCGGGCCGTCCGGCTGCTGGCTTGTCGACTTGTAAGACAATTGATATGGAATTGGTGAAACGAAAACGGATTGAGGCCATCCGAGGACAGATTTTGAGCAAGCTGCGGCTTGCCTCGCCACCCTCGCAAGGGGAAGTCCCACCCGGACCTCTACCAGAAGCAGTCCTAGCGCTGTACAACAGTACAAGAGATAGAGTGGCCGGGGAATCCGCAGAACCAGAGCCTGAGCCTGAAGCCGATTATTATGCAAAGGAAGTGACTAGGGTCCTGATGGTCGAGACCCATAACGAAATCTACGACAAATTCAAACAAAGTACCCACTCTATCTACATGTTCTTCAACACCAGTGAGCTAAGAGAAGCCGTGCCCGAACCTGTGCTTCTTTCCCGCGCAGAACTCCGCCTCTTGAGACTCAAATTGAAAGTTGAACAACACGTAGAGCTTTACCAGAAATACTCTAATAATTCATGGCGATATCTTTCTAATCGTCTCCTCGCCCCATCTGACAGCCCTGAATGGCTCTCCTTCGACGTTACGGGAGTTGTGCGCCAGTGGCTCAGCAGAGGCGGAGAGATAGAGGGCTTTCGGCTGAGCGCACATGTATCTGTGGACTCAAGGGACAACACATTGCAAGTGGATATTAACGGTTTTACAACTGGACGGAGAGGGGACCTGGCGACCATCCACGGCATGAATAGACCTTTCCTGCTGCTGATGGCTACTCCCCTGGAGAGGGCACAGCACTTACAGTCTTCCAGACACCGGCGCGCCCTGGATACAAACTACTGCTTCAGCTCCACCGAAAAGAACTGTTGCGTGCGGCAGCTGTACATTGACTTCAGAAAGGATCTGGGCTGGAAGTGGATTCATGAGCCCAAGGGGTATCATGCCAACTTCTGTCTTGGGCCATGCCCATACATCTGGTCACTGGATACCCAGTACTCCAAAGTTCTGGCCTTGTACAATCAACACAACCCTGGAGCTTCCGCCGCTCCTTGCTGTGTGCCCCAAGCCCTAGAGCCCCTGCCCATCGTTTATTATGTCGGACGCAAGCCCAAAGTAGAACAGCTATCAAATATGATCGTGAGAAGCTGCAAGTGTAGCTGATAAACGCGTCGAGCATGCATCTAGGGCGGCCAATTCCGCCCCTCTCCCCCCCACCCCTCTCCCTCCCCCCCCCCTAACGTTACTGGCCGAAGCCGCTTGGAATAAGGCCGGTGTGCGTTTGTCTATATGTTATTTTCCACCATATTGCCGTCTTTTGGCAATGTGAGGGCCCGGAAACCTGGCCCTGTCTTCTTGACGAGCATTCCTAGGGGTCTTTCCCCTCTCGCCAAAGGAATGCAAGGTCTGTTGAATGTCGTGAAGGAAGCAGTTCCTCTGGAAGCTTCTTGAAGACAAACAACGTCTGTAGCGACCCTTTGTAGACAGCGGAACCCCCCACCTGGCGATAGATGCCTCTGCGGCCAAAAGCCACGTGTATAAGATACACCTGCAAAGGCGGCACAACCCCAGTGCCACGTTGTGAGTTGGATAGTTGTGGAAAGAGTCAAATGGCTCTCCTCAAGCGTATTCAACAAGGGGCTGAAGGATGCCCAGAAGGTACCCCATTGTATGGGATCTGATCTGGGGCCTCGGTGCACATGCTTTACATGTGTTTAGTCGAGGTTAAAAAACGTCTAGGCCCCCCGAACCACGGGGACGTGGTTTTCCTTTGAAAAACACGATGATAATATGGCTGCCGCTCATTCTAGTGCCCTTCTTTGCTGCCTGGTCCTGCTCACCGGGGTGCGAGCTAGCCCTGGACAAGGGACACAATCCGAAAACTCGTGCACCCACTTCCCGGGCAACCTCCCTAACATGCTGAGGGACCTCCGTGATGCCTTCAGTAGAGTGAAGACGTTCTTCCAAATGAAAGATCAGTTAGATAACCTGCTCCTGAAGGAGTCACTCTTAGAAGACTTCAAAGGATACCTCGGCTGCCAAGCACTTAGCGAGATGATTCAATTCTACTTAGAAGAAGTCATGCCTCAAGCTGAGAATCAAGACCCCGACATCAAAGCTCATGTGAATTCTTTGGGAGAAAATTTGAAGACTTTGCGGCTGCGGCTGCGGAGATGTCACCGCTTTCTGCCCTGTGAGAACAAATCAAAAGCGGTCGAGCAAGTTAAGAATGCCTTCAATAAGCTACAAGAGAAGGGCATCTACAAAGCAATGAGCGAGTTTGATATCTTTATCAATTACATTGAAGCCTACATGACAATGAAGATTAGGAATGCCGCGGGGAGCGGCGCTACTAACTTCAGCCTGCTGAAGCAGGCTGGAGACGTGGAGGAGAACCCTGGACCTATGTACAGAATGCAGCTGCTGAGCTGCATCGCCCTGAGCCTGGCCCTGGTGACCAACAGCGCACCCACGTCCTCTAGCACCAAGAAGACCCAGTTACAGTTGGAGCATCTACTTTTAGACCTGCAAATGATTTTGAACGGCATCAACAACTACAAGAATCCTAAACTTACTCGCATGCTTACCTTCAAATTTTACATGCCCAAGAAGGCCACCGAACTGAAGCACTTGCAATGTCTGGAGGAAGAACTCAAGCCGCTGGAGGAAGTTCTCAACCTCGCGCAGTCCAAGAATTTCCACCTCCGGCCAAGAGACCTGATCAGTAACATTAATGTGATAGTGCTGGAGCTGAAGGGAAGCGAGACTACATTTATGTGCGAGTACGCCGATGAAACCGCTACAATCGTCGAGTTCCTGAATAGATGGATCACATTTTGCCAGTCAATTATCTCTACTCTGACATGATAACTCGAGGTCTAGAGGGCCCGTTTAAACCCGCTGATCAGCCTCGACTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCCCACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGGGTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCTGGGGATGCGGTGGGCTCTATGGCTTCTACTGGGCGGTTTTATGGACAGCAAGCGAACCGGAATTGCCAGCTGGGGCGCCCTCTGGTAAGGTTGGGAAGCCCTGCAAAGTAAACTGGATGGCTTTCTCGCCGCCAAGGATCTGATGGCGCAGGGGATCAAGCTCTGATCAAGAGACAGGATGAGGATCGTTTCGCATGGCCAAAGAAGACAATATTGAAATGCAAGGTACCGTTCTTGAAACGTTGCCTAATACCATGTTCCGCGTAGAGTTAGAAAACGGTCACGTGGTTACTGCACACATCTCCGGTAAAATGCGCAAAAACTACATCCGCATCCTGACGGGCGACAAAGTGACTGTTGAACTGACCCCGTACGACCTGAGCAAAGGCCGCATTGTCTTCCGTAGTCGCTGATAAATTATTAACGCTTACAATTTCCTGATGCGGTATTTTCTCCTTACGCATCTGTGCGGTATTTCACACCGCATACAGGTGGCACTTTTCGGGGAAATGTGCGCGGAACCCCTATTTGTTTATTTTTCTAAATACATTCAAATATGTATCCGCTCATGAGACAATAACCCTGATAAATGCTTCAATAATAGCACGTGCTAAAACTTCATTTTTAATTTAAAAGGATCTAGGTGAAGATCCTTTTTGATAATCTCATGACCAAAATCCCTTAACGTGAGTTTTCGTTCCACTGAGCGTCAGACCCCGTAGAAAAGATCAAAGGATCTTCTTGAGATCCTTTTTTTCTGCGCGTAATCTGCTGCTTGCAAACAAAAAAACCACCGCTACCAGCGGTGGTTTGTTTGCCGGATCAAGAGCTACCAACTCTTTTTCCGAAGGTAACTGGCTTCAGCAGAGCGCAGATACCAAATACTGTTCTTCTAGTGTAGCCGTAGTTAGGCCACCACTTCAAGAACTCTGTAGCACCGCCTACATACCTCGCTCTGCTAATCCTGTTACCAGTGGCTGCTGCCAGTGGCGATAAGTCGTGTCTTACCGGGTTGGACTCAAGACGATAGTTACCGGATAAGGCGCAGCGGTCGGGCTGAACGGGGGGTTCGTGCACACAGCCCAGCTTGGAGCGAACGACCTACACCGAACTGAGATACCTACAGCGTGAGCTATGAGAAAGCGCCACGCTTCCCGAAGGGAGAAAGGCGGACAGGTATCCGGTAAGCGGCAGGGTCGGAACAGGAGAGCGCACGAGGGAGCTTCCAGGGGGAAACGCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGGCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTTCTT

Пример 1 - плазмиды, кодирующие антиген, по сравнению с плазмидами, кодирующими антиген плюс IL-10

В предыдущем уровне техники было предложено то, что обеднение иммуностимулирующими последовательностями CpG в остове плазмиды потребовалось бы для эффективного ДНК-иммунотерапевтического лечения T1D. Данный эксперимент, таким образом, был смоделирован после опубликованных ранее экспериментов (2008 J Immunol. 181(12):8298-307).

Мышам NOD давали восемь еженедельных доз плазмиды, начиная с недели 9 (возраст): давали либо пустой вектор (pVAX1, 50 мкг), либо pVAX1- проинсулиновый Ag (антиген) (не нацеленный в эндосомы, не препроинсулин), либо обедненный CpG pVAX1-проинсулиновый Ag, либо бицистронную конструкцию pVAX1-IL10-IRES-проинсулиновый Ag в эквимолярных отношениях.

Все введения были внутримышечными в левый квадрицепс под изофлурановой анестезией и содержали только плазмиду в PBS плюс EDTA. BGV оценивали у всех мышей на еженедельной основе, и заболеваемость диабетом типа 1 подсчитывали на основе двух показаний BGV больше 250 мг/дл. Мышей оценивали до возраста 30 недель или до достижения BGV 600, с последующим умерщвлением.

Результаты из данного эксперимента (таблица 1) демонстрируют то, что А) обеднение CpG не является ни необходимым, ни полезным для эффективности, Б) включение иммуномодулирующих цитокинов значимо увеличивает эффективность, и В) остов плазмиды (пустой вектор) является эквивалентным необработанным группам.

Таблица 1: заболеваемость T1D у мышей NOD в возрасте 30 недель

Плазмида Заболеваемость T1D в возрасте 30 недель Историческая заболеваемость колонии, не подвергавшейся лечению 77,8% pVAX1 (негативный контроль в виде пустого вектора) 23/29 равно 79,3% Обедненый CpG pVAX1-проинсулиновый Ag (антиген плюс модифицированный вектор) 24/29 равно 82,7% pVAX1-проинсулиновый Ag (антиген) 18/30 равно 60% pVAX1-IL10-IRES-проинсулиновый Ag (антиген + IL-10) 10/26 равно 38,5%

Пример 2 - экспрессируемые белковые продукты, образующиеся от плазмид, кодирующих антиген, IL-10, IL-2 и TGF-β

Создавали мультицистронные плазмиды для соэкспрессии TGF-β, IL-10 и, возможно, IL-2. Клетки Freestyle293 временно трансфицировали и культивировали в бессывороточных средах. Супернатанты отбирали и подвергали количественному измерению ELISA (твердофазный иммуноферментный анализ) через 72 часа.

Результаты в Таблице 2 ниже показывают то, что: А) от одного вектора достигается экспрессия многих независимых цитокинов, Б) продуцируются значимые количества каждого цитокина и в ожидаемых соотношениях, В) небольшие изменения последовательности значимо улучшают экспрессию IL-10 от первого поколения плазмиды IL10/проинсулин и Г) ни остов плазмиды (пустой вектор), ни эндосомальное нацеливание антигена (IIAg) не индуцирует продукцию или неправильную регуляцию цитокина.

Таблица 2: количественное измерение ELISA экспрессируемых белковых продуктов

Плазмида Активный TGF-β1 (нг/мл) Интерлейкин-10 (нг/мл) Интерлейкин-2 (нг/мл) pVAX1 (пустой вектор) <0,0035 <0,0027 <0,0009 pVAX1-IL10/проинсулин (антиген+IL-10) <0,0035 85,3 <0,0009 pVAX1-IIAg/TGFβ/IL10/(антиген+TGFb+IL-10) 7,35 1238,8 <0,0009 pVAX1-IIAg/TGFβ/IL10/IL2 (антиген+TGFb+IL-10+IL-2) 2,39 1259,5 777,0

Пример 3 - влияние TGF-β и IL-2 на подавление заболевания

Мультицистронные плазмиды оценивали в отношении предупреждения заболевания у мышей NOD как и в Примере 1, за исключением того, что дозирование продолжали один раз в неделю до умерщвления (начало диабета) или до недели 30. Одну мышь из каждой группы (исходно n равно 24) высылали для полной некропсии после 10 недель дозирования - включающей патологию на 10 стандартных перфузируемых тканях, полный анализ крови и клиническую химию. Кроме слабого разрушения мышцы и повторного роста, обусловленных механической травмой в месте инъекции, не было отклонений от животных, не подвергавшихся дозированию.

Результаты в Таблице 3, приведенной ниже, показывают то, что: А) добавление TGFb значительно увеличивает эффективность, Б) включение интерлейкина-2 может увеличивать эффективность и не индуцирует патологию, В) хроническое дозирование плазмид, экспрессирующих IL-10 и антиген, увеличивает эффективность предупреждения заболевания и Г) хроническое дозирование плазмид, экспрессирующих TGFβ, IL-10 и IL-2, увеличивает эффективность, не приводя к каким-либо сигналам, связанным с безопасностью.

Таблица 3: заболеваемость T1D у мышей NOD.

Плазмида Частота заболевания в возрасте 30 недель Историческая заболеваемость колонии, не подвергавшейся лечению 77,8% Не подвергавшиеся лечению (негативный контроль) 18/21 = 85,7% pVAX1-Ag/IL10 (антиген + IL-10) 5/23 = 21,7% pVAX1-IIAg/TGFβ/IL10 (антиген + TGFb + IL-10) 2/23 = 8,7% pVAX1-IIAg/TGFβ/IL10/IL2 (антиген + TGFb + IL-10 + IL-2) 1/23 = 4,3%

Пример 4. Оценка элементов IRES, интронов, а также подкожного введения

Мультицистронные плазмиды оценивали на предупреждение заболевания у мешей NOD так же, как и в Примере 3, за исключением того, что дозирование начиналось раньше (в неделю 5) для того, чтобы лучше имитировать хроническое педиатрическое введение. Помимо подтверждения содержащих интроны плазмид pVAX1-IIAg/TGFβ/IL10 и pVAX1-IIAg/TGFβ/IL10/IL2, проверяли другие контрольные группы. В частности, на предмет ожидаемых увеличений эффективности оценивали другой сегмент IRES (CrPV [из вируса паралича сверчка], в отличие от EMCV [из вируса энцефаломиокардита]), также как и делецию сегмента интрона для оценки его необходимости. Из-за очевидного отсутствия эффективности по сравнению с родительской плазмидой (pVAX1-IIAg/TGFβ/IL10/IL2) исследования групп CrPV и не содержащих интрон (н.и. - нет интрона) прекращали рано. Кроме того, когорта мышей, использованных в данном эксперименте, испытывала более быстрое прогрессирование заболевания, чем предыдущие когорты, со временем от постановки диагноза до умерщвления, составляющим в среднем 1,25 недели, а не 2,75 из предыдущих экспериментов. Наконец, добавляли группу с подкожным введением. Данной группе дозировали плазмиду для трех цитокинов (pVAX1-IIAg/TGFβ/IL10/IL2) с инъекцией один раз в неделю в п.к. (подкожное) пространство в загривок шеи без анестезии.

Результаты в Таблице 4 демонстрируют то, что: А) элементы IRES EMCV обеспечивают значительно лучшую эффективность, чем IRES CrPV, Б) включение интрона (в данной плазмиде расположен в пределах области эндосомального нацеливания CD74) значительно увеличивает эффективность, В) в то время как включение IL-2 дает минимальную пользу в условиях легкого заболевания, его присутствие значительно увеличивает эффективность и надежность лечения в условиях агрессивного заболевания, и Г) подкожное дозирование, которое является неэффективным при большинстве применений ДНК-вакцин, здесь демонстрирует умеренную эффективность и значительную задержку заболевания даже без оптимизации.

Таблица 4: заболеваемость T1D у мышей NOD

Тип обработки Диабетические/всего % диабетических Исторический контроль 80% / 30 недель Не подвергавшиеся лечению 15/21 71,4% / 30 недель Контроль в виде пустого вектора, в.м. (внутримышечно) 13/21 61,9% / 30 недель pVAX1-IIAg/TGFβ/IL10/IL2 (нет интрона) в.м. 10/24 41,6% / 22 недели pVAX1-IIAg/TGFβ/IL10/IL2 (IRES CrPv вместо IRES EMCV) в.м. 7/22 31,8% / 22 недели pVAX1-IIAg/TGFβ/IL10 в.м. (без IL-2) 12/42 28,6% / 30 недель pVAX1-IIAg/TGFβ/IL10/IL2 в.м. 1/42 2,4% / 30 недель pVAX1-IIAg/TGFβ/IL10/IL2 п.к. 12/42 28,6% / 30 недель

Пример 5. Сравнение имеющихся в продаже систем селекции без антибиотика с селекцией с антибиотиком

Был оценен альтернативный остов плазмиды с целью удаления устойчивости к канамицину для соответствия руководству Европейского агенства по оценке лекарственных средств. Такую же вставку (IIAg/TGFβ/IL10/IL2, включающую интрон) клонировали в «наноплазмидный» остов NTC9385R Nature Technology. Образующуюся плазмиду оценивали в мышах NOD так же, как и в Примере 3, за исключением того, что лечение начиналось в неделю 11 (позднее начало) и рано заканчивалось из-за неуспеха плазмиды на основе NTC9385R.

Результаты в Таблице 5 ниже показывают то, что: А) изменения в отношении системы селекции остова плазмиды неожиданно индуцируют значительные изменения эффективности плазмиды и Б) позднее начало в отношении лечения приводит к ранним превращениям. Данные из других, связанных экспериментов показывают то, что дозирование с использованием данных плазмид толерогенной ДНК-вакцины требует от двух до четырех недель для того, чтобы иметь эффективность, таким образом, что позднее начало в отношении лечения приводит к нескольким ранним случаям диабета перед тем, как лечение станет эффективным.

Таблица 5: заболеваемость T1D у мышей NOD

Плазмида Частота заболевания в возрасте 30 недель Историческая заболеваемость в колонии не подвергавшихся лечению 77,8% Не подвергавшиеся лечению (негативный контроль) 16/21 = 76,2% pVAX1-IIAg/TGFβ/IL10/IL2 с интроном (устойчивая к канамицину) 5/21 = 23,8% pNTC9385R-IIAg/TGFβ/IL10/IL2 с интроном (имеющаяся в продаже система селекции без антибиотика) 13/21 = 61,9%

Пример 6. Эффективность подавления заболевания с использованием плазмид с антигеном и без него

Для определения роли закодированного антигена в функции плазмиды были проведены два эксперимента (Примеры 6 и 7). Альтернативную плазмиду оценивали с целью удаления области, кодирующей антиген (пре-проинсулин), при сохранении нацеливающего домена CD74 и всех трех секретируемых цитокинов. Образующуюся плазмиду оценивали в мышах NOD так же, как в Примере 3, за исключением того, что лечение начиналось в неделю 11 (позднее начало).

Данный эксперимент демонстрирует то, что для полной эффективности требуется антигенная часть, и что не просто продукция цитокинов управляет функцией плазмиды. Это один из двух критериев, необходимых для демонстрации антигенспецифичности лечения.

Таблица 6: заболеваемость T1D у мышей NOD

Плазмида Частота заболевания в возрасте 30 недель Историческая заболеваемость в колонии не подвергавшихся лечению 77,8% pVAX1-IIAg/TGFβ/IL10/IL2 (антиген + цитокины) 2/22 = 9,1% pVAX1-II/TGFβ/IL10/IL2 (без антигена + цитокинов) 15/28 = 53,5%

Пример 7. Влияние описанной в данном документе иммунотерапии антигеном на эффективность неродственных антигенных вакцин

Для определения роли закодированного антигена в функции плазмиды были проведены два эксперимента (Примеры 6 и 7). У мышей NOD либо проводили имитацию лечения с использованием инъекции PBS, либо лечили их плазмидой pVAX1-IIAg/TGFβ/IL10/IL2 так же, как и в Примере 3. После четырех доз (т.е. в возрасте 13 недель) каждую мышь в.б. (внутрибрюшинно) иммунизировали 50 мкг иррелевантного антигена (овальбумин курицы, OVA) в 100 мкл суспензии квасцов 1:1. Имитацию лечения или лечение плазмидами продолжали один раз в неделю до умерщвления через три недели (21 сутки) после иммунизации, причем в данное время отбирали сыворотку. Определяли антитела с переключением класса (общие IgG и IgG2a) против овальбуминового антигена посредством имеющихся в продаже наборов ELISA (твердофазный иммуноферментный анализ). Не наблюдали значимых различий между группами, которых лечили плазмидой, или с имитацией лечения по их общим уровням IgG против OVA, ни одна из групп не продуцировала IgG2a проив OVA.

Результаты в Таблице 7 ниже показывают то, что в то время как плазмида подавляет иммунные ответы, связанные с заболеванием-мишенью, она не подавляет иммунореактивность по отношению к неродственным антигенам (т.е. любым антигенам, не кодируемым данной плазмидой). Это является вторым из двух критериев, необходимых для демонстрации антигенспецифичности лечения. Поскольку лечение педиатрических пациентов будет включать сопутствующее введение стандартных детских вакцин, это является значительным преимуществом над системной / общей иммунодепрессией посредством таких агентов, как метотрексат или циклоспорин А.

Таблица 7: ответ на иррелевантный антиген у мышей NOD, которые получали иммунотерапевтическую ДНК-вакцинацию против T1D

Лечение Число образцов Среднее количество мкг IgG против OVA / мл сыворотки Ошибка Подвергавшиеся лечению плазмидой 8 7,517 +/- 0,967 Обработанные PBS (имитация) 5 8,954 +/- 1,227

Данные значения приводят к незначимому значению р 0,377 и доверительному интервалу от -1,99 до 4,87. Данные результаты показывают то, что лечение иммуномодулирующей плазмидой не влияет на иммунный ответ на другие антигены, не кодируемые плазмидой и, следовательно, не приводит к широкой или системной иммунодепрессии.

Пример 8. Индивидуальные белковые продукты, экспрессируемые от плазмиды

Элемент 2А TaV приводил в данном документе к неожиданным слитым продуктам IL-10 плюс IL-2 (данные не показаны), и, следовательно, были оценены другие стратегии разделения. Исходные методики разделения включали расположенные выше удлинения последовательности 2А TaV (приводящие к быстрой деградации и отсутствию секретированного IL-10) и также сайт расщепления карбоксипептидазой (который индуцировал гибель линий трансфицированных клеток). Дополнительными оцененными стратегиями разделения были GSG-2A TaV, фуриновый сайт расщепления, фуриновый сайт, с последующим 2А TaV, 2A P и 2А Е (вирус ринита лошади А).

Клетки Freestyle293 временно трансфицировали и культивировали в бессывороточной среде. И клеточные осадки, и супернатанты отбирали и подвергали полуколичественному многоцветному вестерн-блоттингу через 72 часа.

Результаты в Таблице 8, приведенной ниже, показывают то, что: А) неожиданно, сайты протеолитического расщепления между генами IL-10 и IL-2 не могут функционировать, Б) метки GSG (разобщающие последовательности) между IL-10 и IL-2 являются предпочтительными по отношению к удлиненным изолирующим последовательностям, В) 2А Р является предпочтительной по отношению либо к 2А TaV, либо к 2А Е и Г) последовательности 2А могут иметь значительные и неожиданные влияния на деградацию и секрецию экспрессируемых, расположенных выше белков, таких как IL-10.

Таблица 8: разделение экспрессированных белковых продуктов IL-10 и IL-2

Плазмида Клеточный интерлейкин-10 Секретируемый интер лейкин-10 Клеточный интерлейкин-2 Секретируемый интерлейкин -2 Клеточный слитый продукт Секретируемый слитый продукт GSG-2A TaV ++++ ++ - +++ ++ - Фуриновый сайт расщепления + - - - ++++ ++ Фурин/2A TaV +++ ++ - ++ ++ + 2A P ++ ++++ - +++ + - 2A E +++ ++ - ++ ++ -

Пример 9. Сравнение имеющейся в продаже системы селекции с термочувствительной системой селекции, предложенной в данном документе, а также сравнение между плазмидами, кодирующими IL-2, и плазмидами, не кодирующими IL-2 (подкожное введение)

Остовы плазмид создавали и оценивали с целью удаления устойчивости к канамицину для соответствия руководству Европейского агентсва по оценке лекарственных средств. Откорректированную вставку (IIAg/GSG-2A FMDV /TGFβ/ IRES EMCV/IL10/GSG-2A P/IL2, включающую интрон в расположенной выше некодирующей области) клонировали либо в модифицированный/минимально модифицированный вектор pVAX1, содержащий селективный маркер «RNA-OUT» от Nature Technology, либо эквивалентный минимально модифицированный вектор pVAX1, кодирующий infA дикого типа («pNN»), в качестве остовов. Кроме того, получали плазмиды либо содержащие дополнительный энхансерный элемент SV40, либо дефицитные по IL-2. Образующиеся плазмиды оценивали у мышей NOD также, как и в Примере 3, за исключением того, что введение было п.к. либо один раз в неделю, либо три раза в неделю (предпочтительно).

Результаты, показанные в Таблице 9 и 10 ниже, демонстрируют то, что: А) имеющаяся в продаже замена RNA-OUT на устойчивость к антибиотику канамицину в остове pVAX1 все еще неожиданно недостаточно эффективно работает, Б) комплементация infA системы селекции без антибиотика работает эквивалентно родительскому вектору pVAX1, В) интерлейкин-2 требуется для оптимальной эффективности, Г) добавление энхансерного элемента SV40 не улучшает эффективность и Д) откорректированная тройная цитокиновая вставка сохраняет полную функциональность.

Таблица 9: заболеваемость T1D у мышей NOD

Плазмида, введенная 3ґ в неделю (оптимальная) Частота заболевания в возрасте
30 недель Историческая заболеваемость в колонии не подвергавшихся лечению 78,9% Не подвергавшиеся лечению (негативный контроль) 12/15 = 80% Пустой вектор pNN (негативный контроль с термочувствительной селекцией, но без последовательностей, кодирующих белки) 12/16 = 75% pVAX1-IIAg/FMDV/TGFβ/IL10/2ATaV/IL2 (селекция с канамицином и последовательности, кодирующие белки) 1/16 = 6,3% pNN-IIAg/FMDV/TGFβ/IL10/2AP/IL2 (температурочувствительная селективная система и последовательности, кодирующие белки) 1/23 = 4,3% pVAX1-RNA-OUT-IIAg/FMDV/TGFβ/IL10/2AP/IL2 (имеющаяся в продаже система селекции и последовательности, кодирующие белки) 9/23 = 39,1%

Таблица 10: заболеваемость T1D у мышей NOD

Плазмида, введенная 1ґ в неделю (субоптимальная) Частота заболевания в возрасте 27 недель Историческая заболеваемость в колонии не подвергавшихся лечению 78,9% Не подвергавшиеся лечению (негативный контроль) 12/15 = 80% pNN-IIAg/FMDV/TGFβ/IL10/2AP/IL2 (температурочувствительная селективная система и последовательности, кодирующие белки) 16/37 = 43,2% pNN-SV40e-IIAg/FMDV/TGFβ/IL10/2AP/IL2 (температурочувствительная селективная система и последовательности, кодирующие белки, а также энхансер) 20/37 = 54% pNN-IIAg/FMDV/TGFβ/IL10 (IL-2 дефицитный) (температурочувствительная селективная система и последовательности, кодирующие белки, за исключением IL-2) 25/40 = 62,5% pVAX1-RNA-OUT-IIAg/FMDV/TGFβ/IL10/2AP/IL2 (имеющаяся в продаже селективная система и последовательности, кодирующие белки) 27/38 = 71%

Пример 10. Проверка надежности эффекта толерантности после прекращения введения плазмиды

В предыдущем эксперименте (представленном в Таблице 9) группу IIAg/FMDV/TGFβ/IL10/2A P/IL2 не умерщвляли в возрасте 30 недель, но прекращали дозирование плазмиды. Значения глюкозы в крови отслеживали в течение дополнительных десяти (10) недель до общего возраста 40 недель для оценки того, индуцировала ли плазмида надежное состояние толерантности, или было ли необходимым для эффективности непрерывное дозирование.

Результаты, показанные в Таблице 11 ниже, указывают на то, что непрерывное дозирование требуется для надежности толерантности, так как стабильное состояние без заболевания до возраста 30 недель быстро ухудшалось после прерывания дозирования. Это указывает на полезный профиль безопасности, так как также ожидалось бы то, что любые вредные события, с которыми можно сталкиваться при дозировании плазмиды, прекращались бы с дозированием.

Таблица 11: заболеваемость T1D у мышей NOD после прекращения дозирования плазмиды

Частота заболевания до возраста 30 недель Частота заболевания до возраста 40 недель 1/23 = 4,3% 9/23 = 39,1%

Пример 11. Проверка стабильности и надежности плазмиды при инъекции

Ключевым вопросом с введением плазмиды является деградация при введении. В случае инъекции силы сдвига, с которыми сталкиваются большие и вязкие молекулы плазмиды, проходящие через тонкую иглу под давлением, приводят к разрушению ковалентно замкнутой кольцевой структуры плазмиды, делая ее линейной и подверженной как пониженной способности к трансфекции, так и быстрой деструкции. Большинство плазмид имеют от 5 до 15% деградации до линейных форм при инъекции через иглы размеров, приемлемых для клинического применения, что приводит либо к пониженной эффективности, либо к необходимости больших исходных доз для компенсации потери. Несколько типов структур последовательности, которые могут приводить к разворачиванию плазмиды и чувствительности к деградации под напряжением сдвига, были преднамеренно минимизированы в раскрытых плазмидах с целью увеличения прочности и надежности при использовании протоколов инъекции. Для того чтобы оценить деградацию плазмиды под напряжением сдвига, которая может варьировать с изменением вязкости и, следовательно, концентрации, лидирующую плазмиду человека ресуспендировали в буфере Tris EDTA до концентраций 5, 7 и 9 мг/мл и три раза пропускали через иглу G30 (выталкивали, повторно втягивали в шприц, затем повторно выталкивали), и один (1) микрограмм образцов разделяли на агарозном геле относительно контрольных образцов, которые не проходили процесс инъекции.

Результаты, показанные на Фиг. 3, неожиданно показывают то, что плазмида заметно не деградирует посредством трех инъекционных пропусканий при любой протестированной концентрации или вязкости. Деградация плазмиды визуализировалась бы и как размазывание меньших полос (между главной суперспиральной полосой при 6 т.п.н. и меньшей полосой примесей процесса внизу геля или грубо при 600 п.н.). Такие мазки линеаризации / деградации не видны для любого образца, пропускаемого через процесс инъекции. Эта надежная физическая стабильность при дозировании является весьма желательной и большей, чем предполагаемая или описанная ранее в литературе.

Пример 12. Подтверждение сохранения плазмиды с использованием системы комплементации infA

Для того чтобы подтвердить то, что система селекции сохранения плазмиды на основе infA функционировала как желательно, бактерии, трансформированные плазмидой, выращивали на протяжении 100 пассажей (грубо 36 удвоений/поколений на пассаж, в течение всего 3600 поколений проверяли потенциальный дрейф или потерю плазмиды). Пассажи 1-100 получали по 11 в неделю - по 2 пассажа в будний день при 37°C и один в каждый выходной при 30°C. Все проводили в жидкой среде LB, не содержащей животных продуктов (сойтон Teknova), дополненной 15 микрограммами/мл наладиксовой кислоты (селекция на штамм на основе DH5a, не на присутствие плазмиды). Из каждого пассажа получали глицериновые маточные растворы и сохраняли, пока не было получено 100 пассажей для сопутствующего процессинга.

Соскобы глицериновых маточных растворов использовали для инокуляции 5 мл выращеных в течение ночи культур, которые перерабатывали посредством инструкций поставщика на наборах для минипрепаратов от Qiagen с использованием многократного вакуума (либо 16, либо 32 культуры на прогон, из- за ограничений размера геля). Не делали попыток получения показаний ОП600 (оптическая плотность при 600 нм) для нормирования введения клеток, и все препараты получали на основе стандартных объемов. Один микролитр каждого минипрепарата подвергали расщеплению PstI/Xhol для отделения остова (приблизительно 2,4 т.п.н.) от вставки (приблизительно 4 т.п.н.) без поправки на концентрацию плазмиды, получающуюся из каждого минипрепарата. Разделение на каждом геле проводили с фланкирующими лестницами Tridye 2-Log (NEB https://www.neb.com/products/n3200-2-log-dna-ladder-01-100-kb), первой полосой образца - нерасщепленной плазмидой, и визуализировали с использованием красителя SybrSafe. На изображениях гелей, несмотря на отсутствие контроля качества нуклеиновых кислот, все полосы продуктов расщепления демонстрируют и присутствие, и ожидаемую картину расщепления для плазмиды (видна на изображениях для пассажей 1-16, 17-48, 49-80 и 81-100).

В качестве дополнительного подтверждения глицериновые маточные растворы для пассажей 1-100 также вводили в качестве внутреннего стандарта на 50 сектор чашек с LB агаром, не содержащим антибиотик и животных продуктов, и инкубировали в течение ночи при 30°C. Не делали попытки контроля инокулята внутреннего стандарта. Как показано на Фиг. 4, все репрезентативные внутренние стандарты на основе глицериновых маточных растворов приводили к заметному росту и, таким образом, сохранению плазмиды.

Пример 13. Пригодность для увеличения масштаба с использованием системы комплементации infA

Для того чтобы подтвердить то, что система селекции сохранения плазмиды на основе infA функционировала как желательно в производственном масштабе, бактерии, трансформированные плазмидой, использовали в 50 л пилотном ферментере с периодической загрузкой, работающем со специфической стадией сдвига температуры, увеличивающей выход. Использовали минимальную среду с добавлением дрожжевого экстракта, уменьшая скорость удвоения до 0,88/час. Подпитку начинали в 17 ч 00 мин после инокуляции, и регуляцию растворенного кислорода на уровне 30% осуществляли последовательным увеличением каскадных параметров рО₂ (перемешивание в 32 ч 15 мин, приложение давления в 40 ч 30 мин, затем ток воздуха в 45 ч 40 мин). Скорость увеличения биомассы ослабевала немедленно после сдвига до 42°C, как и ожидалось. Количество продуцированной плазмидной ДНК было оценено на уровне 1,03 плюс/минус 0,17 г/л с использованием методики экстракции плазмиды в малом масштабе, имитирующей немедленный выход после лизиса.

--->

ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

<110> Ново Ноордиск А/С

<120> Толерогенная ДНК-вакцина

<130> 150042WO01

<150> US 62/415717

<151> 2016-11-01

<150> EP 17150037.4

<151> 2017-01-02

<150> EP 17169019.1

<151> 2017-05-02

<150> EP 17177289.0

<151> 2017-06-22

<150> EP 17198041.0

<151> 2017-10-24

<160> 29

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 86

<212> ПРТ

<213> mus musculus

<400> 1

Phe Val Asn Gln His Leu Cys Gly Ser His Leu Val Glu Ala Leu Tyr

1 5 10 15

Leu Val Cys Gly Glu Arg Gly Phe Phe Tyr Thr Pro Lys Thr Arg Arg

20 25 30

Glu Ala Glu Asp Leu Gln Val Gly Gln Val Glu Leu Gly Gly Gly Pro

35 40 45

Gly Ala Gly Ser Leu Gln Pro Leu Ala Leu Glu Gly Ser Leu Gln Lys

50 55 60

Arg Gly Ile Val Glu Gln Cys Cys Thr Ser Ile Cys Ser Leu Tyr Gln

65 70 75 80

Leu Glu Asn Tyr Cys Asn

85

<210> 2

<211> 86

<212> ПРТ

<213> homo sapiens

<400> 2

Phe Val Asn Gln His Leu Cys Gly Ser His Leu Val Glu Ala Leu Tyr

1 5 10 15

Leu Val Cys Gly Glu Arg Gly Phe Phe Tyr Thr Pro Lys Thr Arg Arg

20 25 30

Glu Ala Glu Asp Leu Gln Val Gly Gln Val Glu Leu Gly Gly Gly Pro

35 40 45

Gly Ala Gly Ser Leu Gln Pro Leu Ala Leu Glu Gly Ser Leu Gln Lys

50 55 60

Arg Gly Ile Val Glu Gln Cys Cys Thr Ser Ile Cys Ser Leu Tyr Gln

65 70 75 80

Leu Glu Asn Tyr Cys Asn

85

<210> 3

<211> 110

<212> ПРТ

<213> синтетическая

<400> 3

Met Ala Leu Trp Met Arg Leu Leu Pro Leu Leu Ala Leu Leu Ala Leu

1 5 10 15

Trp Gly Pro Asp Pro Glu Gln Glu Phe Val Asn Gln His Leu Cys Gly

20 25 30

Ser His Leu Val Glu Ala Leu Tyr Leu Val Cys Gly Glu Arg Gly Phe

35 40 45

Phe Tyr Thr Pro Lys Thr Arg Arg Glu Ala Glu Asp Leu Gln Val Gly

50 55 60

Gln Val Glu Leu Gly Gly Gly Pro Gly Ala Gly Ser Leu Gln Pro Leu

65 70 75 80

Ala Leu Glu Gly Ser Leu Gln Lys Arg Gly Ile Val Glu Gln Cys Cys

85 90 95

Thr Ser Ile Cys Ser Leu Tyr Gln Leu Glu Asn Tyr Cys Asn

100 105 110

<210> 4

<211> 110

<212> ПРТ

<213> синтетическая

<400> 4

Met Ala Leu Trp Met Arg Leu Leu Pro Leu Leu Ala Leu Leu Ala Leu

1 5 10 15

Trp Gly Pro Asp Pro Glu Gln Glu Phe Val Asn Gln His Leu Cys Gly

20 25 30

Ser His Leu Val Glu Ala Leu Tyr Leu Val Cys Gly Glu Arg Gly Phe

35 40 45

Phe Tyr Thr Pro Lys Thr Arg Arg Glu Ala Glu Asp Leu Gln Val Gly

50 55 60

Gln Val Glu Leu Gly Gly Gly Pro Gly Ala Gly Ser Leu Gln Pro Leu

65 70 75 80

Ala Leu Glu Gly Ser Leu Gln Lys Arg Gly Ile Val Glu Gln Cys Cys

85 90 95

Thr Ser Ile Cys Ser Leu Tyr Gln Leu Glu Asn Tyr Cys Asn

100 105 110

<210> 5

<211> 109

<212> ПРТ

<213> mus musculus

<400> 5

Ala Leu Trp Met Arg Leu Leu Pro Leu Leu Ala Leu Leu Ala Leu Trp

1 5 10 15

Gly Pro Asp Pro Ala Gln Ala Phe Val Asn Gln His Leu Cys Gly Ser

20 25 30

His Leu Val Glu Ala Leu Tyr Leu Val Cys Gly Glu Arg Gly Phe Phe

35 40 45

Tyr Thr Pro Lys Thr Arg Arg Glu Ala Glu Asp Leu Gln Val Gly Gln

50 55 60

Val Glu Leu Gly Gly Gly Pro Gly Ala Gly Ser Leu Gln Pro Leu Ala

65 70 75 80

Leu Glu Gly Ser Leu Gln Lys Arg Gly Ile Val Glu Gln Cys Cys Thr

85 90 95

Ser Ile Cys Ser Leu Tyr Gln Leu Glu Asn Tyr Cys Asn

100 105

<210> 6

<211> 110

<212> ПРТ

<213> homo sapiens

<400> 6

Met Ala Leu Trp Met Arg Leu Leu Pro Leu Leu Ala Leu Leu Ala Leu

1 5 10 15

Trp Gly Pro Asp Pro Ala Gln Ala Phe Val Asn Gln His Leu Cys Gly

20 25 30

Ser His Leu Val Glu Ala Leu Tyr Leu Val Cys Gly Glu Arg Gly Phe

35 40 45

Phe Tyr Thr Pro Lys Thr Arg Arg Glu Ala Glu Asp Leu Gln Val Gly

50 55 60

Gln Val Glu Leu Gly Gly Gly Pro Gly Ala Gly Ser Leu Gln Pro Leu

65 70 75 80

Ala Leu Glu Gly Ser Leu Gln Lys Arg Gly Ile Val Glu Gln Cys Cys

85 90 95

Thr Ser Ile Cys Ser Leu Tyr Gln Leu Glu Asn Tyr Cys Asn

100 105 110

<210> 7

<211> 15

<212> ПРТ

<213> homo sapiens

<400> 7

Ser His Leu Val Glu Ala Leu Tyr Leu Val Cys Gly Glu Arg Gly

1 5 10 15

<210> 8

<211> 15

<212> ПРТ

<213> синтетическая

<400> 8

Ser His Leu Val Glu Ala Leu Tyr Leu Val Cys Gly Glu Glu Gly

1 5 10 15

<210> 9

<211> 81

<212> ПРТ

<213> mus musculus

<400> 9

Met Asp Asp Gln Arg Asp Leu Ile Ser Asn His Glu Gln Leu Pro Ile

1 5 10 15

Leu Gly Asn Arg Pro Arg Glu Pro Glu Arg Cys Ser Arg Gly Ala Leu

20 25 30

Tyr Thr Gly Val Ser Val Leu Val Ala Leu Leu Leu Ala Gly Gln Ala

35 40 45

Thr Thr Ala Tyr Phe Leu Tyr Gln Gln Gln Gly Arg Leu Asp Lys Leu

50 55 60

Thr Ile Thr Ser Gln Asn Leu Gln Leu Glu Ser Leu Arg Met Lys Leu

65 70 75 80

Pro

<210> 10

<211> 98

<212> ПРТ

<213> homo sapiens

<400> 10

Met His Arg Arg Arg Ser Arg Ser Cys Arg Glu Asp Gln Lys Pro Val

1 5 10 15

Met Asp Asp Gln Arg Asp Leu Ile Ser Asn Asn Glu Gln Leu Pro Met

20 25 30

Leu Gly Arg Arg Pro Gly Ala Pro Glu Ser Lys Cys Ser Arg Gly Ala

35 40 45

Leu Tyr Thr Gly Phe Ser Ile Leu Val Thr Leu Leu Leu Ala Gly Gln

50 55 60

Ala Thr Thr Ala Tyr Phe Leu Tyr Gln Gln Gln Gly Arg Leu Asp Lys

65 70 75 80

Leu Thr Ile Thr Ser Gln Asn Leu Gln Leu Glu Ser Leu Arg Met Lys

85 90 95

Leu Pro

<210> 11

<211> 219

<212> ДНК

<213> E. coli

<400> 11

atggccaaag aagacaatat tgaaatgcaa ggtaccgttc ttgaaacgtt gcctaatacc 60

atgttccgcg tagagttaga aaacggtcac gtggttactg cacacatctc cggtaaaatg 120

cgcaaaaact acatccgcat cctgacgggc gacaaagtga ctgttgaact gaccccgtac 180

gacctgagca aaggccgcat tgtcttccgt agtcgctga 219

<210> 12

<211> 72

<212> ПРТ

<213> E. coli

<400> 12

Met Ala Lys Glu Asp Asn Ile Glu Met Gln Gly Thr Val Leu Glu Thr

1 5 10 15

Leu Pro Asn Thr Met Phe Arg Val Glu Leu Glu Asn Gly His Val Val

20 25 30

Thr Ala His Ile Ser Gly Lys Met Arg Lys Asn Tyr Ile Arg Ile Leu

35 40 45

Thr Gly Asp Lys Val Thr Val Glu Leu Thr Pro Tyr Asp Leu Ser Lys

50 55 60

Gly Arg Ile Val Phe Arg Ser Arg

65 70

<210> 13

<211> 127

<212> ДНК

<213> L. monocytogenes

<400> 13

tgtaaaaaac atcatttagc gtgactttct ttcaacagct aacaattgtt gttactgcct 60

aatgttttta gggtatttta aaaaagggcg ataaaaaacg attgggggat gagaaatgaa 120

cgctcaa 127

<210> 14

<211> 10

<212> ДНК

<213> синтетическая

<400> 14

gccrccatgg 10

<210> 15

<211> 24

<212> ПРТ

<213> синтетическая

<400> 15

Ala Pro Val Lys Gln Thr Leu Asn Phe Asp Leu Leu Lys Leu Ala Gly

1 5 10 15

Asp Val Glu Ser Asn Pro Gly Pro

20

<210> 16

<211> 20

<212> ПРТ

<213> Thosea asigna

<400> 16

Arg Ala Glu Gly Arg Gly Ser Leu Leu Thr Cys Gly Asp Val Glu Glu

1 5 10 15

Asn Pro Gly Pro

20

<210> 17

<211> 19

<212> ПРТ

<213> синтетическая

<400> 17

Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn

1 5 10 15

Pro Gly Pro

<210> 18

<211> 390

<212> ПРТ

<213> homo sapiens

<400> 18

Met Pro Pro Ser Gly Leu Arg Leu Leu Leu Leu Leu Leu Pro Leu Leu

1 5 10 15

Trp Leu Leu Val Leu Thr Pro Gly Arg Pro Ala Ala Gly Leu Ser Thr

20 25 30

Cys Lys Thr Ile Asp Met Glu Leu Val Lys Arg Lys Arg Ile Glu Ala

35 40 45

Ile Arg Gly Gln Ile Leu Ser Lys Leu Arg Leu Ala Ser Pro Pro Ser

50 55 60

Gln Gly Glu Val Pro Pro Gly Pro Leu Pro Glu Ala Val Leu Ala Leu

65 70 75 80

Tyr Asn Ser Thr Arg Asp Arg Val Ala Gly Glu Ser Ala Glu Pro Glu

85 90 95

Pro Glu Pro Glu Ala Asp Tyr Tyr Ala Lys Glu Val Thr Arg Val Leu

100 105 110

Met Val Glu Thr His Asn Glu Ile Tyr Asp Lys Phe Lys Gln Ser Thr

115 120 125

His Ser Ile Tyr Met Phe Phe Asn Thr Ser Glu Leu Arg Glu Ala Val

130 135 140

Pro Glu Pro Val Leu Leu Ser Arg Ala Glu Leu Arg Leu Leu Arg Leu

145 150 155 160

Lys Leu Lys Val Glu Gln His Val Glu Leu Tyr Gln Lys Tyr Ser Asn

165 170 175

Asn Ser Trp Arg Tyr Leu Ser Asn Arg Leu Leu Ala Pro Ser Asp Ser

180 185 190

Pro Glu Trp Leu Ser Phe Asp Val Thr Gly Val Val Arg Gln Trp Leu

195 200 205

Ser Arg Gly Gly Glu Ile Glu Gly Phe Arg Leu Ser Ala His Cys Ser

210 215 220

Cys Asp Ser Arg Asp Asn Thr Leu Gln Val Asp Ile Asn Gly Phe Thr

225 230 235 240

Thr Gly Arg Arg Gly Asp Leu Ala Thr Ile His Gly Met Asn Arg Pro

245 250 255

Phe Leu Leu Leu Met Ala Thr Pro Leu Glu Arg Ala Gln His Leu Gln

260 265 270

Ser Ser Arg His Arg Arg Ala Leu Asp Thr Asn Tyr Cys Phe Ser Ser

275 280 285

Thr Glu Lys Asn Cys Cys Val Arg Gln Leu Tyr Ile Asp Phe Arg Lys

290 295 300

Asp Leu Gly Trp Lys Trp Ile His Glu Pro Lys Gly Tyr His Ala Asn

305 310 315 320

Phe Cys Leu Gly Pro Cys Pro Tyr Ile Trp Ser Leu Asp Thr Gln Tyr

325 330 335

Ser Lys Val Leu Ala Leu Tyr Asn Gln His Asn Pro Gly Ala Ser Ala

340 345 350

Ala Pro Cys Cys Val Pro Gln Ala Leu Glu Pro Leu Pro Ile Val Tyr

355 360 365

Tyr Val Gly Arg Lys Pro Lys Val Glu Gln Leu Ser Asn Met Ile Val

370 375 380

Arg Ser Cys Lys Cys Ser

385 390

<210> 19

<211> 390

<212> ПРТ

<213> синтетическая

<400> 19

Met Pro Pro Ser Gly Leu Arg Leu Leu Leu Leu Leu Leu Pro Leu Leu

1 5 10 15

Trp Leu Leu Val Leu Thr Pro Gly Arg Pro Ala Ala Gly Leu Ser Thr

20 25 30

Cys Lys Thr Ile Asp Met Glu Leu Val Lys Arg Lys Arg Ile Glu Ala

35 40 45

Ile Arg Gly Gln Ile Leu Ser Lys Leu Arg Leu Ala Ser Pro Pro Ser

50 55 60

Gln Gly Glu Val Pro Pro Gly Pro Leu Pro Glu Ala Val Leu Ala Leu

65 70 75 80

Tyr Asn Ser Thr Arg Asp Arg Val Ala Gly Glu Ser Ala Glu Pro Glu

85 90 95

Pro Glu Pro Glu Ala Asp Tyr Tyr Ala Lys Glu Val Thr Arg Val Leu

100 105 110

Met Val Glu Thr His Asn Glu Ile Tyr Asp Lys Phe Lys Gln Ser Thr

115 120 125

His Ser Ile Tyr Met Phe Phe Asn Thr Ser Glu Leu Arg Glu Ala Val

130 135 140

Pro Glu Pro Val Leu Leu Ser Arg Ala Glu Leu Arg Leu Leu Arg Leu

145 150 155 160

Lys Leu Lys Val Glu Gln His Val Glu Leu Tyr Gln Lys Tyr Ser Asn

165 170 175

Asn Ser Trp Arg Tyr Leu Ser Asn Arg Leu Leu Ala Pro Ser Asp Ser

180 185 190

Pro Glu Trp Leu Ser Phe Asp Val Thr Gly Val Val Arg Gln Trp Leu

195 200 205

Ser Arg Gly Gly Glu Ile Glu Gly Phe Arg Leu Ser Ala His Val Ser

210 215 220

Val Asp Ser Arg Asp Asn Thr Leu Gln Val Asp Ile Asn Gly Phe Thr

225 230 235 240

Thr Gly Arg Arg Gly Asp Leu Ala Thr Ile His Gly Met Asn Arg Pro

245 250 255

Phe Leu Leu Leu Met Ala Thr Pro Leu Glu Arg Ala Gln His Leu Gln

260 265 270

Ser Ser Arg His Arg Arg Ala Leu Asp Thr Asn Tyr Cys Phe Ser Ser

275 280 285

Thr Glu Lys Asn Cys Cys Val Arg Gln Leu Tyr Ile Asp Phe Arg Lys

290 295 300

Asp Leu Gly Trp Lys Trp Ile His Glu Pro Lys Gly Tyr His Ala Asn

305 310 315 320

Phe Cys Leu Gly Pro Cys Pro Tyr Ile Trp Ser Leu Asp Thr Gln Tyr

325 330 335

Ser Lys Val Leu Ala Leu Tyr Asn Gln His Asn Pro Gly Ala Ser Ala

340 345 350

Ala Pro Cys Cys Val Pro Gln Ala Leu Glu Pro Leu Pro Ile Val Tyr

355 360 365

Tyr Val Gly Arg Lys Pro Lys Val Glu Gln Leu Ser Asn Met Ile Val

370 375 380

Arg Ser Cys Lys Cys Ser

385 390

<210> 20

<211> 228

<212> ДНК

<213> синтетическая

<400> 20

cgactgtgcc ttctagttgc cagccatctg ttgtttgccc ctcccccgtg ccttccttga 60

ccctggaagg tgccactccc actgtccttt cctaataaaa tgaggaaatt gcatcgcatt 120

gtctgagtag gtgtcattct attctggggg gtggggtggg gcaggacagc aagggggagg 180

attgggaaga caatagcagg catgctgggg atgcggtggg ctctatgg 228

<210> 21

<211> 31

<212> ПРТ

<213> homo sapiens

<400> 21

His Ala Glu Gly Thr Phe Thr Ser Asp Val Ser Ser Tyr Leu Glu Gly

1 5 10 15

Gln Ala Ala Lys Glu Phe Ile Ala Trp Leu Val Lys Gly Arg Gly

20 25 30

<210> 22

<211> 31

<212> ПРТ

<213> синтетическая

<400> 22

His Ala Glu Gly Thr Phe Thr Ser Asp Val Ser Ser Tyr Leu Glu Gly

1 5 10 15

Gln Ala Ala Lys Glu Phe Ile Ala Trp Leu Val Arg Gly Arg Gly

20 25 30

<210> 23

<211> 31

<212> ПРТ

<213> синтетическая

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (2)..(2)

<223> 2-аминоизомасляная кислота

<400> 23

His Xaa Glu Gly Thr Phe Thr Ser Asp Val Ser Ser Tyr Leu Glu Gly

1 5 10 15

Gln Ala Ala Lys Glu Phe Ile Ala Trp Leu Val Arg Gly Arg Gly

20 25 30

<210> 24

<211> 6401

<212> ДНК

<213> синтетическая

<400> 24

gactcttcgc gatgtacggg ccagatatac gcgttgacat tgattattga ctagttatta 60

atagtaatca attacggggt cattagttca tagcccatat atggagttcc gcgttacata 120

acttacggta aatggcccgc ctggctgacc gcccaacgac ccccgcccat tgacgtcaat 180

aatgacgtat gttcccatag taacgccaat agggactttc cattgacgtc aatgggtgga 240

ctatttacgg taaactgccc acttggcagt acatcaagtg tatcatatgc caagtacgcc 300

ccctattgac gtcaatgacg gtaaatggcc cgcctggcat tatgcccagt acatgacctt 360

atgggacttt cctacttggc agtacatcta cgtattagtc atcgctatta ccatggtgat 420

gcggttttgg cagtacatca atgggcgtgg atagcggttt gactcacggg gatttccaag 480

tctccacccc attgacgtca atgggagttt gttttggcac caaaatcaac gggactttcc 540

aaaatgtcgt aacaactccg ccccattgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga 600

ggtctatata agcagagctc tctggctaac tagagaaccc actgcttact ggcttatcga 660

aattaatacg actcactata gggagaccca agctggctag cgtttaaact taagcttggt 720

accgagctcg gatccactag tccagtgtgg tggaattctg cactgcagct cgcatctctc 780

cttcacgcgc ccgccgccct acctgaggcc gccatccacg ccggttgagt cgcgttctgc 840

cgcctcccgc ctgtggtgcc tcctgaactg cgtccgccgt ctaggtaagt ttaaagctca 900

ggtcgagacc gggcctttgt ccggcgctcc cttggagcct acctagactc agccggctct 960

ccacgctttg cctgaccctg cttgctcaac tctaggtaag ttaatgagac agatagaaac 1020

tggtcttgta gaaacagagt agtcgcctgc ttttctgcca ggtgctgact tctctcccct 1080

gggctttttt ctttttctca ggttgaaaag aagaagacga agaagacgaa gaagacaaac 1140

cgtcgtcgac tgccatgcgc cgctgattaa cgccgccacc atggcccacc gacgcagatc 1200

cagaagctgc cgtgaggacc agaagcccgt gatggatgat cagagggacc ttatctctaa 1260

caatgaacaa ctgccaatgc tcggcagacg gcctggggcc ccggagagca agtgcagcag 1320

aggagccttg tacacggggt tctccatttt agtgactctc cttctcgccg gccaagctac 1380

caccgcctac tttctgtacc aacagcaagg cagactagac aaactgacaa tcacaagcca 1440

gaaccttcag ctggagtctc tgcggatgaa gctgcccgct ttgtggatga gattgcttcc 1500

tctacttgct ctcctggcgc tctggggacc tgaccccgag caagagtttg ttaatcagca 1560

cctgtgtggg agtcatctgg tggaggcact ctatttagtg tgcggagaga ggggcttctt 1620

ctacactcca aagaccagac gggaggccga agaccttcaa gtggggcaag tagaactggg 1680

tggcggaccc ggtgccggga gccttcagcc gctcgccctg gagggctctc ttcagaaacg 1740

cggcatcgtg gagcagtgtt gcacatccat ttgctcactc taccagctgg agaactactg 1800

caacggaagc ggagtgaagc agacgttgaa ttttgatttg ttgaagttgg cgggggatgt 1860

ggagagcaat ccggggccga tgccccctag tggcctcaga cttttgttat tgttattacc 1920

gcttttatgg ctcttggtgc tgacaccggg ccgtccggct gctggcttgt cgacttgtaa 1980

gacaattgat atggaattgg tgaaacgaaa acggattgag gccatccgag gacagatttt 2040

gagcaagctg cggcttgcct cgccaccctc gcaaggggaa gtcccacccg gacctctacc 2100

agaagcagtc ctagcgctgt acaacagtac aagagataga gtggccgggg aatccgcaga 2160

accagagcct gagcctgaag ccgattatta tgcaaaggaa gtgactaggg tcctgatggt 2220

cgagacccat aacgaaatct acgacaaatt caaacaaagt acccactcta tctacatgtt 2280

cttcaacacc agtgagctaa gagaagccgt gcccgaacct gtgcttcttt cccgcgcaga 2340

actccgcctc ttgagactca aattgaaagt tgaacaacac gtagagcttt accagaaata 2400

ctctaataat tcatggcgat atctttctaa tcgtctcctc gccccatctg acagccctga 2460

atggctctcc ttcgacgtta cgggagttgt gcgccagtgg ctcagcagag gcggagagat 2520

agagggcttt cggctgagcg cacatgtatc tgtggactca agggacaaca cattgcaagt 2580

ggatattaac ggttttacaa ctggacggag aggggacctg gcgaccatcc acggcatgaa 2640

tagacctttc ctgctgctga tggctactcc cctggagagg gcacagcact tacagtcttc 2700

cagacaccgg cgcgccctgg atacaaacta ctgcttcagc tccaccgaaa agaactgttg 2760

cgtgcggcag ctgtacattg acttcagaaa ggatctgggc tggaagtgga ttcatgagcc 2820

caaggggtat catgccaact tctgtcttgg gccatgccca tacatctggt cactggatac 2880

ccagtactcc aaagttctgg ccttgtacaa tcaacacaac cctggagctt ccgccgctcc 2940

ttgctgtgtg ccccaagccc tagagcccct gcccatcgtt tattatgtcg gacgcaagcc 3000

caaagtagaa cagctatcaa atatgatcgt gagaagctgc aagtgtagct gataaacgcg 3060

tcgagcatgc atctagggcg gccaattccg cccctctccc ccccacccct ctccctcccc 3120

cccccctaac gttactggcc gaagccgctt ggaataaggc cggtgtgcgt ttgtctatat 3180

gttattttcc accatattgc cgtcttttgg caatgtgagg gcccggaaac ctggccctgt 3240

cttcttgacg agcattccta ggggtctttc ccctctcgcc aaaggaatgc aaggtctgtt 3300

gaatgtcgtg aaggaagcag ttcctctgga agcttcttga agacaaacaa cgtctgtagc 3360

gaccctttgt agacagcgga accccccacc tggcgataga tgcctctgcg gccaaaagcc 3420

acgtgtataa gatacacctg caaaggcggc acaaccccag tgccacgttg tgagttggat 3480

agttgtggaa agagtcaaat ggctctcctc aagcgtattc aacaaggggc tgaaggatgc 3540

ccagaaggta ccccattgta tgggatctga tctggggcct cggtgcacat gctttacatg 3600

tgtttagtcg aggttaaaaa acgtctaggc cccccgaacc acggggacgt ggttttcctt 3660

tgaaaaacac gatgataata tggctgccgc tcattctagt gcccttcttt gctgcctggt 3720

cctgctcacc ggggtgcgag ctagccctgg acaagggaca caatccgaaa actcgtgcac 3780

ccacttcccg ggcaacctcc ctaacatgct gagggacctc cgtgatgcct tcagtagagt 3840

gaagacgttc ttccaaatga aagatcagtt agataacctg ctcctgaagg agtcactctt 3900

agaagacttc aaaggatacc tcggctgcca agcacttagc gagatgattc aattctactt 3960

agaagaagtc atgcctcaag ctgagaatca agaccccgac atcaaagctc atgtgaattc 4020

tttgggagaa aatttgaaga ctttgcggct gcggctgcgg agatgtcacc gctttctgcc 4080

ctgtgagaac aaatcaaaag cggtcgagca agttaagaat gccttcaata agctacaaga 4140

gaagggcatc tacaaagcaa tgagcgagtt tgatatcttt atcaattaca ttgaagccta 4200

catgacaatg aagattagga atgccgcggg gagcggcgct actaacttca gcctgctgaa 4260

gcaggctgga gacgtggagg agaaccctgg acctatgtac agaatgcagc tgctgagctg 4320

catcgccctg agcctggccc tggtgaccaa cagcgcaccc acgtcctcta gcaccaagaa 4380

gacccagtta cagttggagc atctactttt agacctgcaa atgattttga acggcatcaa 4440

caactacaag aatcctaaac ttactcgcat gcttaccttc aaattttaca tgcccaagaa 4500

ggccaccgaa ctgaagcact tgcaatgtct ggaggaagaa ctcaagccgc tggaggaagt 4560

tctcaacctc gcgcagtcca agaatttcca cctccggcca agagacctga tcagtaacat 4620

taatgtgata gtgctggagc tgaagggaag cgagactaca tttatgtgcg agtacgccga 4680

tgaaaccgct acaatcgtcg agttcctgaa tagatggatc acattttgcc agtcaattat 4740

ctctactctg acatgataac tcgaggtcta gagggcccgt ttaaacccgc tgatcagcct 4800

cgactgtgcc ttctagttgc cagccatctg ttgtttgccc ctcccccgtg ccttccttga 4860

ccctggaagg tgccactccc actgtccttt cctaataaaa tgaggaaatt gcatcgcatt 4920

gtctgagtag gtgtcattct attctggggg gtggggtggg gcaggacagc aagggggagg 4980

attgggaaga caatagcagg catgctgggg atgcggtggg ctctatggct tctactgggc 5040

ggttttatgg acagcaagcg aaccggaatt gccagctggg gcgccctctg gtaaggttgg 5100

gaagccctgc aaagtaaact ggatggcttt ctcgccgcca aggatctgat ggcgcagggg 5160

atcaagctct gatcaagaga caggatgagg atcgtttcgc atggccaaag aagacaatat 5220

tgaaatgcaa ggtaccgttc ttgaaacgtt gcctaatacc atgttccgcg tagagttaga 5280

aaacggtcac gtggttactg cacacatctc cggtaaaatg cgcaaaaact acatccgcat 5340

cctgacgggc gacaaagtga ctgttgaact gaccccgtac gacctgagca aaggccgcat 5400

tgtcttccgt agtcgctgat aaattattaa cgcttacaat ttcctgatgc ggtattttct 5460

ccttacgcat ctgtgcggta tttcacaccg catacaggtg gcacttttcg gggaaatgtg 5520

cgcggaaccc ctatttgttt atttttctaa atacattcaa atatgtatcc gctcatgaga 5580

caataaccct gataaatgct tcaataatag cacgtgctaa aacttcattt ttaatttaaa 5640

aggatctagg tgaagatcct ttttgataat ctcatgacca aaatccctta acgtgagttt 5700

tcgttccact gagcgtcaga ccccgtagaa aagatcaaag gatcttcttg agatcctttt 5760

tttctgcgcg taatctgctg cttgcaaaca aaaaaaccac cgctaccagc ggtggtttgt 5820

ttgccggatc aagagctacc aactcttttt ccgaaggtaa ctggcttcag cagagcgcag 5880

ataccaaata ctgttcttct agtgtagccg tagttaggcc accacttcaa gaactctgta 5940

gcaccgccta catacctcgc tctgctaatc ctgttaccag tggctgctgc cagtggcgat 6000

aagtcgtgtc ttaccgggtt ggactcaaga cgatagttac cggataaggc gcagcggtcg 6060

ggctgaacgg ggggttcgtg cacacagccc agcttggagc gaacgaccta caccgaactg 6120

agatacctac agcgtgagct atgagaaagc gccacgcttc ccgaagggag aaaggcggac 6180

aggtatccgg taagcggcag ggtcggaaca ggagagcgca cgagggagct tccaggggga 6240

aacgcctggt atctttatag tcctgtcggg tttcgccacc tctgacttga gcgtcgattt 6300

ttgtgatgct cgtcaggggg gcggagccta tggaaaaacg ccagcaacgc ggccttttta 6360

cggttcctgg gcttttgctg gccttttgct cacatgttct t 6401

<210> 25

<211> 390

<212> ПРТ

<213> синтетическая

<400> 25

Met Pro Pro Ser Gly Leu Arg Leu Leu Leu Leu Leu Leu Pro Leu Leu

1 5 10 15

Trp Leu Leu Val Leu Thr Pro Gly Arg Pro Ala Ala Gly Leu Ser Thr

20 25 30

Cys Lys Thr Ile Asp Met Glu Leu Val Lys Arg Lys Arg Ile Glu Ala

35 40 45

Ile Arg Gly Gln Ile Leu Ser Lys Leu Arg Leu Ala Ser Pro Pro Ser

50 55 60

Gln Gly Glu Val Pro Pro Gly Pro Leu Pro Glu Ala Val Leu Ala Leu

65 70 75 80

Tyr Asn Ser Thr Arg Asp Arg Val Ala Gly Glu Ser Ala Glu Pro Glu

85 90 95

Pro Glu Pro Glu Ala Asp Tyr Tyr Ala Lys Glu Val Thr Arg Val Leu

100 105 110

Met Val Glu Thr His Asn Glu Ile Tyr Asp Lys Phe Lys Gln Ser Thr

115 120 125

His Ser Ile Tyr Met Phe Phe Asn Thr Ser Glu Leu Arg Glu Ala Val

130 135 140

Pro Glu Pro Val Leu Leu Ser Arg Ala Glu Leu Arg Leu Leu Arg Leu

145 150 155 160

Lys Leu Lys Val Glu Gln His Val Glu Leu Tyr Gln Lys Tyr Ser Asn

165 170 175

Asn Ser Trp Arg Tyr Leu Ser Asn Arg Leu Leu Ala Pro Ser Asp Ser

180 185 190

Pro Glu Trp Leu Ser Phe Asp Val Thr Gly Val Val Arg Gln Trp Leu

195 200 205

Ser Arg Gly Gly Glu Ile Glu Gly Phe Arg Leu Ser Ala His Ser Ser

210 215 220

Ser Asp Ser Arg Asp Asn Thr Leu Gln Val Asp Ile Asn Gly Phe Thr

225 230 235 240

Thr Gly Arg Arg Gly Asp Leu Ala Thr Ile His Gly Met Asn Arg Pro

245 250 255

Phe Leu Leu Leu Met Ala Thr Pro Leu Glu Arg Ala Gln His Leu Gln

260 265 270

Ser Ser Arg His Arg Arg Ala Leu Asp Thr Asn Tyr Cys Phe Ser Ser

275 280 285

Thr Glu Lys Asn Cys Cys Val Arg Gln Leu Tyr Ile Asp Phe Arg Lys

290 295 300

Asp Leu Gly Trp Lys Trp Ile His Glu Pro Lys Gly Tyr His Ala Asn

305 310 315 320

Phe Cys Leu Gly Pro Cys Pro Tyr Ile Trp Ser Leu Asp Thr Gln Tyr

325 330 335

Ser Lys Val Leu Ala Leu Tyr Asn Gln His Asn Pro Gly Ala Ser Ala

340 345 350

Ala Pro Cys Cys Val Pro Gln Ala Leu Glu Pro Leu Pro Ile Val Tyr

355 360 365

Tyr Val Gly Arg Lys Pro Lys Val Glu Gln Leu Ser Asn Met Ile Val

370 375 380

Arg Ser Cys Lys Cys Ser

385 390

<210> 26

<211> 6389

<212> ДНК

<213> синтетическая

<400> 26

gactcttcgc gatgtacggg ccagatatac gcgttgacat tgattattga ctagttatta 60

atagtaatca attacggggt cattagttca tagcccatat atggagttcc gcgttacata 120

acttacggta aatggcccgc ctggctgacc gcccaacgac ccccgcccat tgacgtcaat 180

aatgacgtat gttcccatag taacgccaat agggactttc cattgacgtc aatgggtgga 240

ctatttacgg taaactgccc acttggcagt acatcaagtg tatcatatgc caagtacgcc 300

ccctattgac gtcaatgacg gtaaatggcc cgcctggcat tatgcccagt acatgacctt 360

atgggacttt cctacttggc agtacatcta cgtattagtc atcgctatta ccatggtgat 420

gcggttttgg cagtacatca atgggcgtgg atagcggttt gactcacggg gatttccaag 480

tctccacccc attgacgtca atgggagttt gttttggcac caaaatcaac gggactttcc 540

aaaatgtcgt aacaactccg ccccattgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga 600

ggtctatata agcagagctc tctggctaac tagagaaccc actgcttact ggcttatcga 660

aattaatacg actcactata gggagaccca agctggctag cgtttaaact taagcttggt 720

accgagctcg gatccactag tccagtgtgg tggaattctg cactgcagct cgcatctctc 780

cttcacgcgc ccgccgccct acctgaggcc gccatccacg ccggttgagt cgcgttctgc 840

cgcctcccgc ctgtggtgcc tcctgaactg cgtccgccgt ctaggtaagt ttaaagctca 900

ggtcgagacc gggcctttgt ccggcgctcc cttggagcct acctagactc agccggctct 960

ccacgctttg cctgaccctg cttgctcaac tctaggtaag ttaatgagac agatagaaac 1020

tggtcttgta gaaacagagt agtcgcctgc ttttctgcca ggtgctgact tctctcccct 1080

gggctttttt ctttttctca ggttgaaaag aagaagacga agaagacgaa gaagacaaac 1140

cgtcgtcgac tgccatgcgc cgctgattaa cgccgccacc atggcccacc gacgcagatc 1200

cagaagctgc cgtgaggacc agaagcccgt gatggatgat cagagggacc ttatctctaa 1260

caatgaacaa ctgccaatgc tcggcagacg gcctggggcc ccggagagca agtgcagcag 1320

aggagccttg tacacggggt tctccatttt agtgactctc cttctcgccg gccaagctac 1380

caccgcctac tttctgtacc aacagcaagg cagactagac aaactgacaa tcacaagcca 1440

gaaccttcag ctggagtctc tgcggatgaa gctgcccgct ttgtggatga gattgcttcc 1500

tctacttgct ctcctggcgc tctggggacc tgaccccgag caagagtttg ttaatcagca 1560

cctgtgtggg agtcatctgg tggaggcact ctatttagtg tgcggagaga ggggcttctt 1620

ctacactcca aagaccagac gggaggccga agaccttcaa gtggggcaag tagaactggg 1680

tggcggaccc ggtgccggga gccttcagcc gctcgccctg gagggctctc ttcagaaacg 1740

cggcatcgtg gagcagtgtt gcacatccat ttgctcactc taccagctgg agaactactg 1800

caacggaagc ggagtgaagc agacgttgaa ttttgatttg ttgaagttgg cgggggatgt 1860

ggagagcaat ccggggccga tgccccctag tggcctcaga cttttgttat tgttattacc 1920

gcttttatgg ctcttggtgc tgacaccggg ccgtccggct gctggcttgt cgacttgtaa 1980

gacaattgat atggaattgg tgaaacgaaa acggattgag gccatccgag gacagatttt 2040

gagcaagctg cggcttgcct cgccaccctc gcaaggggaa gtcccacccg gacctctacc 2100

agaagcagtc ctagcgctgt acaacagtac aagagataga gtggccgggg aatccgcaga 2160

accagagcct gagcctgaag ccgattatta tgcaaaggaa gtgactaggg tcctgatggt 2220

cgagacccat aacgaaatct acgacaaatt caaacaaagt acccactcta tctacatgtt 2280

cttcaacacc agtgagctaa gagaagccgt gcccgaacct gtgcttcttt cccgcgcaga 2340

actccgcctc ttgagactca aattgaaagt tgaacaacac gtagagcttt accagaaata 2400

ctctaataat tcatggcgat atctttctaa tcgtctcctc gccccatctg acagccctga 2460

atggctctcc ttcgacgtta cgggagttgt gcgccagtgg ctcagcagag gcggagagat 2520

agagggcttt cggctgagcg cacatagctc tagcgactca agggacaaca cattgcaagt 2580

ggatattaac ggttttacaa ctggacggag aggggacctg gcgaccatcc acggcatgaa 2640

tagacctttc ctgctgctga tggctactcc cctggagagg gcacagcact tacagtcttc 2700

cagacaccgg cgcgccctgg atacaaacta ctgcttcagc tccaccgaaa agaactgttg 2760

cgtgcggcag ctgtacattg acttcagaaa ggatctgggc tggaagtgga ttcatgagcc 2820

caaggggtat catgccaact tctgtcttgg gccatgccca tacatctggt cactggatac 2880

ccagtactcc aaagttctgg ccttgtacaa tcaacacaac cctggagctt ccgccgctcc 2940

ttgctgtgtg ccccaagccc tagagcccct gcccatcgtt tattatgtcg gacgcaagcc 3000

caaagtagaa cagctatcaa atatgatcgt gagaagctgc aagtgtagct gataaacgcg 3060

tcgagcatgc atctagggcg gccaattccg cccctctccc ccccacccct ctccctcccc 3120

cccccctaac gttactggcc gaagccgctt ggaataaggc cggtgtgcgt ttgtctatat 3180

gttattttcc accatattgc cgtcttttgg caatgtgagg gcccggaaac ctggccctgt 3240

cttcttgacg agcattccta ggggtctttc ccctctcgcc aaaggaatgc aaggtctgtt 3300

gaatgtcgtg aaggaagcag ttcctctgga agcttcttga agacaaacaa cgtctgtagc 3360

gaccctttgt agacagcgga accccccacc tggcgataga tgcctctgcg gccaaaagcc 3420

acgtgtataa gatacacctg caaaggcggc acaaccccag tgccacgttg tgagttggat 3480

agttgtggaa agagtcaaat ggctctcctc aagcgtattc aacaaggggc tgaaggatgc 3540

ccagaaggta ccccattgta tgggatctga tctggggcct cggtgcacat gctttacatg 3600

tgtttagtcg aggttaaaaa acgtctaggc cccccgaacc acggggacgt ggttttcctt 3660

tgaaaaacac gatgataata tgatgcacag ctcagcactg ctctgttgcc tggtcctcct 3720

gactggggtg agggccagcc caggccaggg cacccagtct gagaacagct gcacccactt 3780

cccaggcaac ctgcctaaca tgcttcgaga tctccgagat gccttcagca gagtgaagac 3840

tttctttcaa atgaaggatc agctggacaa cttgttgtta aaggagtcct tgctggagga 3900

ctttaagggt tacctgggtt gccaagcctt gtctgagatg atccagtttt acctggagga 3960

ggtgatgccc caagctgaga accaagaccc agacatcaag gcgcatgtga actccctggg 4020

ggagaacctg aagaccctca ggctgaggct acggcgctgt catcgatttc ttccctgtga 4080

aaacaagagc aaggccgtgg agcaggtgaa gaatgccttt aataagctcc aagagaaagg 4140

catctacaaa gccatgagtg agtttgacat cttcatcaac tacatagaag cctacatgac 4200

aatgaagata cgaaacggga gcggcgctac taacttcagc ctgctgaagc aggctggaga 4260

cgtggaggag aaccctggac ctatgtacag aatgcagctg ctgagctgca tcgccctgag 4320

cctggccctg gtgaccaaca gcgcacccac gtcctctagc accaagaaga cccagttaca 4380

gttggagcat ctacttttag acctgcaaat gattttgaac ggcatcaaca actacaagaa 4440

tcctaaactt actcgcatgc ttaccttcaa attttacatg cccaagaagg ccaccgaact 4500

gaagcacttg caatgtctgg aggaagaact caagccgctg gaggaagttc tcaacctcgc 4560

gcagtccaag aatttccacc tccggccaag agacctgatc agtaacatta atgtgatagt 4620

gctggagctg aagggaagcg agactacatt tatgtgcgag tacgccgatg aaaccgctac 4680

aatcgtcgag ttcctgaata gatggatcac attttgccag tcaattatct ctactctgac 4740

atgataactc gaggtctaga gggcccgttt aaacccgctg atcagcctcg actgtgcctt 4800

ctagttgcca gccatctgtt gtttgcccct cccccgtgcc ttccttgacc ctggaaggtg 4860

ccactcccac tgtcctttcc taataaaatg aggaaattgc atcgcattgt ctgagtaggt 4920

gtcattctat tctggggggt ggggtggggc aggacagcaa gggggaggat tgggaagaca 4980

atagcaggca tgctggggat gcggtgggct ctatggcttc tactgggcgg ttttatggac 5040

agcaagcgaa ccggaattgc cagctggggc gccctctggt aaggttggga agccctgcaa 5100

agtaaactgg atggctttct cgccgccaag gatctgatgg cgcaggggat caagctctga 5160

tcaagagaca ggatgaggat cgtttcgcat ggccaaagaa gacaatattg aaatgcaagg 5220

taccgttctt gaaacgttgc ctaataccat gttccgcgta gagttagaaa acggtcacgt 5280

ggttactgca cacatctccg gtaaaatgcg caaaaactac atccgcatcc tgacgggcga 5340

caaagtgact gttgaactga ccccgtacga cctgagcaaa ggccgcattg tcttccgtag 5400

tcgctgataa attattaacg cttacaattt cctgatgcgg tattttctcc ttacgcatct 5460

gtgcggtatt tcacaccgca tacaggtggc acttttcggg gaaatgtgcg cggaacccct 5520

atttgtttat ttttctaaat acattcaaat atgtatccgc tcatgagaca ataaccctga 5580

taaatgcttc aataatagca cgtgctaaaa cttcattttt aatttaaaag gatctaggtg 5640

aagatccttt ttgataatct catgaccaaa atcccttaac gtgagttttc gttccactga 5700

gcgtcagacc ccgtagaaaa gatcaaagga tcttcttgag atcctttttt tctgcgcgta 5760

atctgctgct tgcaaacaaa aaaaccaccg ctaccagcgg tggtttgttt gccggatcaa 5820

gagctaccaa ctctttttcc gaaggtaact ggcttcagca gagcgcagat accaaatact 5880

gttcttctag tgtagccgta gttaggccac cacttcaaga actctgtagc accgcctaca 5940

tacctcgctc tgctaatcct gttaccagtg gctgctgcca gtggcgataa gtcgtgtctt 6000

accgggttgg actcaagacg atagttaccg gataaggcgc agcggtcggg ctgaacgggg 6060

ggttcgtgca cacagcccag cttggagcga acgacctaca ccgaactgag atacctacag 6120

cgtgagctat gagaaagcgc cacgcttccc gaagggagaa aggcggacag gtatccggta 6180

agcggcaggg tcggaacagg agagcgcacg agggagcttc cagggggaaa cgcctggtat 6240

ctttatagtc ctgtcgggtt tcgccacctc tgacttgagc gtcgattttt gtgatgctcg 6300

tcaggggggc ggagcctatg gaaaaacgcc agcaacgcgg cctttttacg gttcctgggc 6360

ttttgctggc cttttgctca catgttctt 6389

<210> 27

<211> 15

<212> ПРТ

<213> синтетическая

<400> 27

Ser His Leu Val Glu Ala Leu Tyr Leu Val Cys Gly Gly Glu Gly

1 5 10 15

<210> 28

<211> 6383

<212> ДНК

<213> синтетическая

<400> 28

gactcttcgc gatgtacggg ccagatatac gcgttgacat tgattattga ctagttatta 60

atagtaatca attacggggt cattagttca tagcccatat atggagttcc gcgttacata 120

acttacggta aatggcccgc ctggctgacc gcccaacgac ccccgcccat tgacgtcaat 180

aatgacgtat gttcccatag taacgccaat agggactttc cattgacgtc aatgggtgga 240

ctatttacgg taaactgccc acttggcagt acatcaagtg tatcatatgc caagtacgcc 300

ccctattgac gtcaatgacg gtaaatggcc cgcctggcat tatgcccagt acatgacctt 360

atgggacttt cctacttggc agtacatcta cgtattagtc atcgctatta ccatggtgat 420

gcggttttgg cagtacatca atgggcgtgg atagcggttt gactcacggg gatttccaag 480

tctccacccc attgacgtca atgggagttt gttttggcac caaaatcaac gggactttcc 540

aaaatgtcgt aacaactccg ccccattgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga 600

ggtctatata agcagagctc tctggctaac tagagaaccc actgcttact ggcttatcga 660

aattaatacg actcactata gggagaccca agctggctag cgtttaaact taagcttggt 720

accgagctcg gatccactag tccagtgtgg tggaattctg cagctcgcat ctctccttca 780

cgcgcccgcc gccctacctg aggccgccat ccacgccggt tgagtcgcgt tctgccgcct 840

cccgcctgtg gtgcctcctg aactgcgtcc gccgtctagg taagtttaaa gctcaggtcg 900

agaccgggcc tttgtccggc gctcccttgg agcctaccta gactcagccg gctctccacg 960

ctttgcctga ccctgcttgc tcaactctag gtaagttaat gagacagata gaaactggtc 1020

ttgtagaaac agagtagtcg cctgcttttc tgccaggtgc tgacttctct cccctgggct 1080

tttttctttt tctcaggttg aaaagaagaa gacgaagaag acgaagaaga caaaccgtcg 1140

tcgactgcca tgcgccgctg attaacgccg ccaccatggc ccaccgacgc agatccagaa 1200

gctgccgtga ggaccagaag cccgtgatgg atgatcagag ggaccttatc tctaacaatg 1260

aacaactgcc aatgctcggc agacggcctg gggccccgga gagcaagtgc agcagaggag 1320

ccttgtacac ggggttctcc attttagtga ctctccttct cgccggccaa gctaccaccg 1380

cctactttct gtaccaacag caaggcagac tagacaaact gacaatcaca agccagaacc 1440

ttcagctgga gtctctgcgg atgaagctgc ccgctttgtg gatgagattg cttcctctac 1500

ttgctctcct ggcgctctgg ggacctgacc ccgagcaaga gtttgttaat cagcacctgt 1560

gtgggagtca tctggtggag gcactctatt tagtgtgcgg agagaggggc ttcttctaca 1620

ctccaaagac cagacgggag gccgaagacc ttcaagtggg gcaagtagaa ctgggtggcg 1680

gacccggtgc cgggagcctt cagccgctcg ccctggaggg ctctcttcag aaacgcggca 1740

tcgtggagca gtgttgcaca tccatttgct cactctacca gctggagaac tactgcaacg 1800

gaagcggagt gaagcagacg ttgaattttg atttgttgaa gttggcgggg gatgtggaga 1860

gcaatccggg gccgatgccc cctagtggcc tcagactttt gttattgtta ttaccgcttt 1920

tatggctctt ggtgctgaca ccgggccgtc cggctgctgg cttgtcgact tgtaagacaa 1980

ttgatatgga attggtgaaa cgaaaacgga ttgaggccat ccgaggacag attttgagca 2040

agctgcggct tgcctcgcca ccctcgcaag gggaagtccc acccggacct ctaccagaag 2100

cagtcctagc gctgtacaac agtacaagag atagagtggc cggggaatcc gcagaaccag 2160

agcctgagcc tgaagccgat tattatgcaa aggaagtgac tagggtcctg atggtcgaga 2220

cccataacga aatctacgac aaattcaaac aaagtaccca ctctatctac atgttcttca 2280

acaccagtga gctaagagaa gccgtgcccg aacctgtgct tctttcccgc gcagaactcc 2340

gcctcttgag actcaaattg aaagttgaac aacacgtaga gctttaccag aaatactcta 2400

ataattcatg gcgatatctt tctaatcgtc tcctcgcccc atctgacagc cctgaatggc 2460

tctccttcga cgttacggga gttgtgcgcc agtggctcag cagaggcgga gagatagagg 2520

gctttcggct gagcgcacat agctctagcg actcaaggga caacacattg caagtggata 2580

ttaacggttt tacaactgga cggagagggg acctggcgac catccacggc atgaatagac 2640

ctttcctgct gctgatggct actcccctgg agagggcaca gcacttacag tcttccagac 2700

accggcgcgc cctggataca aactactgct tcagctccac cgaaaagaac tgttgcgtgc 2760

ggcagctgta cattgacttc agaaaggatc tgggctggaa gtggattcat gagcccaagg 2820

ggtatcatgc caacttctgt cttgggccat gcccatacat ctggtcactg gatacccagt 2880

actccaaagt tctggccttg tacaatcaac acaaccctgg agcttccgcc gctccttgct 2940

gtgtgcccca agccctagag cccctgccca tcgtttatta tgtcggacgc aagcccaaag 3000

tagaacagct atcaaatatg atcgtgagaa gctgcaagtg tagctgataa acgcgtcgag 3060

catgcatcta gggcggccaa ttccgcccct ctccccccca cccctctccc tccccccccc 3120

ctaacgttac tggccgaagc cgcttggaat aaggccggtg tgcgtttgtc tatatgttat 3180

tttccaccat attgccgtct tttggcaatg tgagggcccg gaaacctggc cctgtcttct 3240

tgacgagcat tcctaggggt ctttcccctc tcgccaaagg aatgcaaggt ctgttgaatg 3300

tcgtgaagga agcagttcct ctggaagctt cttgaagaca aacaacgtct gtagcgaccc 3360

tttgtagaca gcggaacccc ccacctggcg atagatgcct ctgcggccaa aagccacgtg 3420

tataagatac acctgcaaag gcggcacaac cccagtgcca cgttgtgagt tggatagttg 3480

tggaaagagt caaatggctc tcctcaagcg tattcaacaa ggggctgaag gatgcccaga 3540

aggtacccca ttgtatggga tctgatctgg ggcctcggtg cacatgcttt acatgtgttt 3600

agtcgaggtt aaaaaacgtc taggcccccc gaaccacggg gacgtggttt tcctttgaaa 3660

aacacgatga taatatgatg cacagctcag cactgctctg ttgcctggtc ctcctgactg 3720

gggtgagggc cagcccaggc cagggcaccc agtctgagaa cagctgcacc cacttcccag 3780

gcaacctgcc taacatgctt cgagatctcc gagatgcctt cagcagagtg aagactttct 3840

ttcaaatgaa ggatcagctg gacaacttgt tgttaaagga gtccttgctg gaggacttta 3900

agggttacct gggttgccaa gccttgtctg agatgatcca gttttacctg gaggaggtga 3960

tgccccaagc tgagaaccaa gacccagaca tcaaggcgca tgtgaactcc ctgggggaga 4020

acctgaagac cctcaggctg aggctacggc gctgtcatcg atttcttccc tgtgaaaaca 4080

agagcaaggc cgtggagcag gtgaagaatg cctttaataa gctccaagag aaaggcatct 4140

acaaagccat gagtgagttt gacatcttca tcaactacat agaagcctac atgacaatga 4200

agatacgaaa cgggagcggc gctactaact tcagcctgct gaagcaggct ggagacgtgg 4260

aggagaaccc tggacctatg tacagaatgc agctgctgag ctgcatcgcc ctgagcctgg 4320

ccctggtgac caacagcgca cccacgtcct ctagcaccaa gaagacccag ttacagttgg 4380

agcatctact tttagacctg caaatgattt tgaacggcat caacaactac aagaatccta 4440

aacttactcg catgcttacc ttcaaatttt acatgcccaa gaaggccacc gaactgaagc 4500

acttgcaatg tctggaggaa gaactcaagc cgctggagga agttctcaac ctcgcgcagt 4560

ccaagaattt ccacctccgg ccaagagacc tgatcagtaa cattaatgtg atagtgctgg 4620

agctgaaggg aagcgagact acatttatgt gcgagtacgc cgatgaaacc gctacaatcg 4680

tcgagttcct gaatagatgg atcacatttt gccagtcaat tatctctact ctgacatgat 4740

aactcgagtc tagagggccc gtttaaaccc gctgatcagc ctcgactgtg ccttctagtt 4800

gccagccatc tgttgtttgc ccctcccccg tgccttcctt gaccctggaa ggtgccactc 4860

ccactgtcct ttcctaataa aatgaggaaa ttgcatcgca ttgtctgagt aggtgtcatt 4920

ctattctggg gggtggggtg gggcaggaca gcaaggggga ggattgggaa gacaatagca 4980

ggcatgctgg ggatgcggtg ggctctatgg cttctactgg gcggttttat ggacagcaag 5040

cgaaccggaa ttgccagctg gggcgccctc tggtaaggtt gggaagccct gcaaagtaaa 5100

ctggatggct ttctcgccgc caaggatctg atggcgcagg ggatcaagct ctgatcaaga 5160

gacaggatga ggatcgtttc gcatggccaa agaagacaat attgaaatgc aaggtaccgt 5220

tcttgaaacg ttgcctaata ccatgttccg cgtagagtta gaaaacggtc acgtggttac 5280

tgcacacatc tccggtaaaa tgcgcaaaaa ctacatccgc atcctgacgg gcgacaaagt 5340

gactgttgaa ctgaccccgt acgacctgag caaaggccgc attgtcttcc gtagtcgctg 5400

ataaattatt aacgcttaca atttcctgat gcggtatttt ctccttacgc atctgtgcgg 5460

tatttcacac cgcatacagg tggcactttt cggggaaatg tgcgcggaac ccctatttgt 5520

ttatttttct aaatacattc aaatatgtat ccgctcatga gacaataacc ctgataaatg 5580

cttcaataat agcacgtgct aaaacttcat ttttaattta aaaggatcta ggtgaagatc 5640

ctttttgata atctcatgac caaaatccct taacgtgagt tttcgttcca ctgagcgtca 5700

gaccccgtag aaaagatcaa aggatcttct tgagatcctt tttttctgcg cgtaatctgc 5760

tgcttgcaaa caaaaaaacc accgctacca gcggtggttt gtttgccgga tcaagagcta 5820

ccaactcttt ttccgaaggt aactggcttc agcagagcgc agataccaaa tactgttctt 5880

ctagtgtagc cgtagttagg ccaccacttc aagaactctg tagcaccgcc tacatacctc 5940

gctctgctaa tcctgttacc agtggctgct gccagtggcg ataagtcgtg tcttaccggg 6000

ttggactcaa gacgatagtt accggataag gcgcagcggt cgggctgaac ggggggttcg 6060

tgcacacagc ccagcttgga gcgaacgacc tacaccgaac tgagatacct acagcgtgag 6120

ctatgagaaa gcgccacgct tcccgaaggg agaaaggcgg acaggtatcc ggtaagcggc 6180

agggtcggaa caggagagcg cacgagggag cttccagggg gaaacgcctg gtatctttat 6240

agtcctgtcg ggtttcgcca cctctgactt gagcgtcgat ttttgtgatg ctcgtcaggg 6300

gggcggagcc tatggaaaaa cgccagcaac gcggcctttt tacggttcct gggcttttgc 6360

tggccttttg ctcacatgtt ctt 6383

<210> 29

<211> 6383

<212> ДНК

<213> синтетическая

<400> 29

gactcttcgc gatgtacggg ccagatatac gcgttgacat tgattattga ctagttatta 60

atagtaatca attacggggt cattagttca tagcccatat atggagttcc gcgttacata 120

acttacggta aatggcccgc ctggctgacc gcccaacgac ccccgcccat tgacgtcaat 180

aatgacgtat gttcccatag taacgccaat agggactttc cattgacgtc aatgggtgga 240

ctatttacgg taaactgccc acttggcagt acatcaagtg tatcatatgc caagtacgcc 300

ccctattgac gtcaatgacg gtaaatggcc cgcctggcat tatgcccagt acatgacctt 360

atgggacttt cctacttggc agtacatcta cgtattagtc atcgctatta ccatggtgat 420

gcggttttgg cagtacatca atgggcgtgg atagcggttt gactcacggg gatttccaag 480

tctccacccc attgacgtca atgggagttt gttttggcac caaaatcaac gggactttcc 540

aaaatgtcgt aacaactccg ccccattgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga 600

ggtctatata agcagagctc tctggctaac tagagaaccc actgcttact ggcttatcga 660

aattaatacg actcactata gggagaccca agctggctag cgtttaaact taagcttggt 720

accgagctcg gatccactag tccagtgtgg tggaattctg cagctcgcat ctctccttca 780

cgcgcccgcc gccctacctg aggccgccat ccacgccggt tgagtcgcgt tctgccgcct 840

cccgcctgtg gtgcctcctg aactgcgtcc gccgtctagg taagtttaaa gctcaggtcg 900

agaccgggcc tttgtccggc gctcccttgg agcctaccta gactcagccg gctctccacg 960

ctttgcctga ccctgcttgc tcaactctag gtaagttaat gagacagata gaaactggtc 1020

ttgtagaaac agagtagtcg cctgcttttc tgccaggtgc tgacttctct cccctgggct 1080

tttttctttt tctcaggttg aaaagaagaa gacgaagaag acgaagaaga caaaccgtcg 1140

tcgactgcca tgcgccgctg attaacgccg ccaccatggc ccaccgacgc agatccagaa 1200

gctgccgtga ggaccagaag cccgtgatgg atgatcagag ggaccttatc tctaacaatg 1260

aacaactgcc aatgctcggc agacggcctg gggccccgga gagcaagtgc agcagaggag 1320

ccttgtacac ggggttctcc attttagtga ctctccttct cgccggccaa gctaccaccg 1380

cctactttct gtaccaacag caaggcagac tagacaaact gacaatcaca agccagaacc 1440

ttcagctgga gtctctgcgg atgaagctgc ccgctttgtg gatgagattg cttcctctac 1500

ttgctctcct ggcgctctgg ggacctgacc ccgagcaaga gtttgttaat cagcacctgt 1560

gtgggagtca tctggtggag gcactctatt tagtgtgcgg agagaggggc ttcttctaca 1620

ctccaaagac cagacgggag gccgaagacc ttcaagtggg gcaagtagaa ctgggtggcg 1680

gacccggtgc cgggagcctt cagccgctcg ccctggaggg ctctcttcag aaacgcggca 1740

tcgtggagca gtgttgcaca tccatttgct cactctacca gctggagaac tactgcaacg 1800

gaagcggagt gaagcagacg ttgaattttg atttgttgaa gttggcgggg gatgtggaga 1860

gcaatccggg gccgatgccc cctagtggcc tcagactttt gttattgtta ttaccgcttt 1920

tatggctctt ggtgctgaca ccgggccgtc cggctgctgg cttgtcgact tgtaagacaa 1980

ttgatatgga attggtgaaa cgaaaacgga ttgaggccat ccgaggacag attttgagca 2040

agctgcggct tgcctcgcca ccctcgcaag gggaagtccc acccggacct ctaccagaag 2100

cagtcctagc gctgtacaac agtacaagag atagagtggc cggggaatcc gcagaaccag 2160

agcctgagcc tgaagccgat tattatgcaa aggaagtgac tagggtcctg atggtcgaga 2220

cccataacga aatctacgac aaattcaaac aaagtaccca ctctatctac atgttcttca 2280

acaccagtga gctaagagaa gccgtgcccg aacctgtgct tctttcccgc gcagaactcc 2340

gcctcttgag actcaaattg aaagttgaac aacacgtaga gctttaccag aaatactcta 2400

ataattcatg gcgatatctt tctaatcgtc tcctcgcccc atctgacagc cctgaatggc 2460

tctccttcga cgttacggga gttgtgcgcc agtggctcag cagaggcgga gagatagagg 2520

gctttcggct gagcgcacat agctctagcg actcaaggga caacacattg caagtggata 2580

ttaacggttt tacaactgga cggagagggg acctggcgac catccacggc atgaatagac 2640

ctttcctgct gctgatggct actcccctgg agagggcaca gcacttacag tcttccagac 2700

accggcgcgc cctggataca aactactgct tcagctccac cgaaaagaac tgttgcgtgc 2760

ggcagctgta cattgacttc agaaaggatc tgggctggaa gtggattcat gagcccaagg 2820

ggtatcatgc caacttctgt cttgggccat gcccatacat ctggtcactg gatacccagt 2880

actccaaagt tctggccttg tacaatcaac acaaccctgg agcttccgcc gctccttgct 2940

gtgtgcccca agccctagag cccctgccca tcgtttatta tgtcggacgc aagcccaaag 3000

tagaacagct atcaaatatg atcgtgagaa gctgcaagtg tagctgataa acgcgtcgag 3060

catgcatcta gggcggccaa ttccgcccct ctccccccca cccctctccc tccccccccc 3120

ctaacgttac tggccgaagc cgcttggaat aaggccggtg tgcgtttgtc tatatgttat 3180

tttccaccat attgccgtct tttggcaatg tgagggcccg gaaacctggc cctgtcttct 3240

tgacgagcat tcctaggggt ctttcccctc tcgccaaagg aatgcaaggt ctgttgaatg 3300

tcgtgaagga agcagttcct ctggaagctt cttgaagaca aacaacgtct gtagcgaccc 3360

tttgtagaca gcggaacccc ccacctggcg atagatgcct ctgcggccaa aagccacgtg 3420

tataagatac acctgcaaag gcggcacaac cccagtgcca cgttgtgagt tggatagttg 3480

tggaaagagt caaatggctc tcctcaagcg tattcaacaa ggggctgaag gatgcccaga 3540

aggtacccca ttgtatggga tctgatctgg ggcctcggtg cacatgcttt acatgtgttt 3600

agtcgaggtt aaaaaacgtc taggcccccc gaaccacggg gacgtggttt tcctttgaaa 3660

aacacgatga taatatgatg cacagctcag cactgctctg ttgcctggtc ctcctgactg 3720

gggtgagggc cagcccaggc cagggcaccc agtctgagaa cagctgcacc cacttcccag 3780

gcaacctgcc taacatgctt cgagatctcc gagatgcctt cagcagagtg aagactttct 3840

ttcaaatgaa ggatcagctg gacaacttgt tgttaaagga gtccttgctg gaggacttta 3900

agggttacct gggttgccaa gccttgtctg agatgatcca gttttacctg gaggaggtga 3960

tgccccaagc tgagaaccaa gacccagaca tcaaggcgca tgtgaactcc ctgggggaga 4020

acctgaagac cctcaggctg aggctacggc gctgtcatcg atttcttccc tgtgaaaaca 4080

agagcaaggc cgtggagcag gtgaagaatg cctttaataa gctccaagag aaaggcatct 4140

acaaagccat gagtgagttt gacatcttca tcaactacat agaagcctac atgacaatga 4200

agatacgaaa cgggagcggc gctactaact tcagcctgct gaagcaggct ggagacgtgg 4260

aggagaaccc tggacctatg tacagaatgc agctgctgag ctgcatcgcc ctgagcctgg 4320

ccctggtgac caacagcgca cccacgtcct ctagcaccaa gaagacccag ttacagttgg 4380

agcatctact tttagacctg caaatgattt tgaacggcat caacaactac aagaatccta 4440

aacttactcg catgcttacc ttcaaatttt acatgcccaa gaaggccacc gaactgaagc 4500

acttgcaatg tctggaggaa gaactcaagc cgctggagga agttctcaac ctcgcgcagt 4560

ccaagaattt ccacctccgg ccaagagacc tgatcagtaa cattaatgtg atagtgctgg 4620

agctgaaggg aagcgagact acatttatgt gcgagtacgc cgatgaaacc gctacaatcg 4680

tcgagttcct gaatagatgg atcacatttt gccagtcaat tatctctact ctgacatgat 4740

aactcgagtc tagagggccc gtttaaaccc gctgatcagc ctcgactgtg ccttctagtt 4800

gccagccatc tgttgtttgc ccctcccccg tgccttcctt gaccctggaa ggtgccactc 4860

ccactgtcct ttcctaataa aatgaggaaa ttgcatcgca ttgtctgagt aggtgtcatt 4920

ctattctggg gggtggggtg gggcaggaca gcaaggggga ggattgggaa gacaatagca 4980

ggcatgctgg ggatgcggtg ggctctatgg cttctactgg gcggttttat ggacagcaag 5040

cgaaccggaa ttgccagctg gggcgccctc tggtaaggtt gggaagccct gcaaagtaaa 5100

ctggatggct ttctcgccgc caaggatctg atggcgcagg ggatcaagct ctgatcaaga 5160

gacaggatga ggatcgtttc gcatggccaa agaagacaat attgaaatgc aaggtaccgt 5220

tcttgaaacg ttgcctaata ccatgttccg cgtagagtta gaaaacggtc acgtggttac 5280

tgcacacatc tccggtaaaa tgcgcaaaaa ctacatccgc atcctgacgg gcgacaaagt 5340

gactgttgaa ctgaccccgt acgacctgag caaaggccgc attgtcttcc gtagtcgctg 5400

ataaattatt aacgcttaca atttcctgat gcggtatttt ctccttacgc atctgtgcgg 5460

tatttcacac cgcatacagg tggcactttt cggggaaatg tgcgcggaac ccctatttgt 5520

ttatttttct aaatacattc aaatatgtat ccgctcatga gacaataacc ctgataaatg 5580

cttcaataat agcacgtgct aaaacttcat ttttaattta aaaggatcta ggtgaagatc 5640

ctttttgata atctcatgac caaaatccct taacgtgagt tttcgttcca ctgagcgtca 5700

gaccccgtag aaaagatcaa aggatcttct tgagatcctt tttttctgcg cgtaatctgc 5760

tgcttgcaaa caaaaaaacc accgctacca gcggtggttt gtttgccgga tcaagagcta 5820

ccaactcttt ttccgaaggt aactggcttc agcagagcgc agataccaaa tactgttctt 5880

ctagtgtagc cgtagttagg ccaccacttc aagaactctg tagcaccgcc tacatacctc 5940

gctctgctaa tcctgttacc agtggctgct gccagtggcg ataagtcgtg tcttaccggg 6000

ttggactcaa gacgatagtt accggataag gcgcagcggt cgggctgaac ggggggttcg 6060

tgcacacagc ccagcttgga gcgaacgacc tacaccgaac tgagatacct acagcgtgag 6120

ctatgagaaa gcgccacgct tcccgaaggg agaaaggcgg acaggtatcc ggtaagcggc 6180

agggtcggaa caggagagcg cacgagggag cttccagggg gaaacgcctg gtatctttat 6240

agtcctgtcg ggtttcgcca cctctgactt gagcgtcgat ttttgtgatg ctcgtcaggg 6300

gggcggagcc tatggaaaaa cgccagcaac gcggcctttt tacggttcct gggcttttgc 6360

tggccttttg ctcacatgtt ctt 6383

<---

Изобретение относится к области биотехнологии, конкретно к плазмидам, кодирующим инсулиновые антигены и цитокины, и может быть использовано в медицине для лечения или предупреждения диабета типа I. Экспрессионная плазмида содержит i) нуклеотидную последовательность, кодирующую инсулиновый антиген, ii) нуклеотидную последовательность, кодирующую TGF-β, iii) нуклеотидную последовательность, кодирующую IL-10, и iv) нуклеотидную последовательность, кодирующую IL-2. При этом предложенная плазмида также содержит элемент 2А FMDV, отделяющий последовательность, кодирующую инсулиновый антиген, и последовательность, кодирующую TGF-β, элемент IRES EMCV, отделяющий последовательность, кодирующую TGF-β, и последовательность, кодирующую IL-10, и элемент 2А, отделяющий последовательность, кодирующую IL-10, и последовательность, кодирующую IL-2. Изобретение позволяет проводить придающую толерантность иммунизацию для эффективного предупреждения и/или отсрочки диабета типа I. 3 н. и 7 з.п. ф-лы, 4 ил., 11 табл., 13 пр.

1. Экспрессионная плазмида, которая содержит:

i) нуклеотидную последовательность, кодирующую инсулиновый антиген;

ii) нуклеотидную последовательность, кодирующую TGF-β;

iii) нуклеотидную последовательность, кодирующую IL-10; и

iv) нуклеотидную последовательность, кодирующую IL-2,

где указанная плазмида также содержит:

- элемент 2А FMDV, отделяющий последовательность, кодирующую инсулиновый антиген, и последовательность, кодирующую TGF-β,

- элемент IRES EMCV, отделяющий последовательность, кодирующую TGF-β, и последовательность, кодирующую IL-10, и

- элемент 2А, отделяющий последовательность, кодирующую IL-10, и последовательность, кодирующую IL-2.

2. Плазмида по п. 1, где указанный инсулиновый антиген выбран из группы, состоящей из проинсулина, пре-проинсулина и их функционального или иммунодоминантного пептидного фрагмента.

3. Плазмида по любому из пп. 1, 2, где указанный инсулиновый антиген представляет собой инсулин, нацеленный в эндосомы.

4. Плазмида по любому из пп. 1-3, где указанная плазмида экспрессирует инсулиновый антиген и TGF-β в по меньшей мере в 2 раза меньшем количестве, чем IL-10.

5. Плазмида по любому из пп. 1-4, где последовательность, кодирующая TGF-β, кодирует конститутивно активный TGF-β.

6. Иммунотерапевтическая ДНК-вакцина для лечения или предупреждения диабета типа I, содержащая эффективное количество плазмиды по любому из пп. 1-5.

7. Иммунотерапевтическая ДНК-вакцина по п. 6 для подкожного введения.

8. Иммунотерапевтическая ДНК-вакцина по п. 6 для внутримышечного введения.

9. Фармацевтическая композиция для лечения или предупреждения диабета типа I, содержащая эффективное количество иммунотерапевтической ДНК-вакцины по п. 6 или плазмиды по любому из пп. 1-5, где указанная фармацевтическая композиция содержит физиологический раствор и/или буфер, и/или хелатор.

10. Фармацевтическая композиция по п. 9, где указанный буфер не содержит какого- либо вируса, липидного сопакующего агента или конденсирующего агента.