Перечень последовательностей
Настоящая заявка подана вместе с перечнем последовательностей в электронном формате. Перечень последовательностей представлен в виде файла, озаглавленного BIOL0175WOSEQ.txt, который был создан 18 апреля 2012 года и имеет размер около 256 кБ. Информация о перечне последовательностей в электронном формате включена в настоящий документ путем ссылки в полном объеме.
Область изобретения
В некоторых аспектах реализации данного изобретения представлены способы, соединения и композиции для ингибирования экспрессии мРНК и белка вируса гепатита В (HBV) у животного. Такие способы, соединения и композиции применимы для лечения, предупреждения или улучшения связанных с HBV заболеваний и расстройств.
Уровень техники
Гепатит В представляет собой вирусное заболевание, которое передается парентерально через зараженный материал, такой как кровь и продукты крови, зараженные иглы, половым путем, а также вертикально от инфицированных матерей к их потомству. По оценкам Всемирной организации здравоохранения, во всем мире инфицировано более 2 миллиардов людей, каждый год возникает около 4 миллионов острых случаев, происходит 1 миллион смертей в год и появляется 350-400 миллионов хронических носителей (Всемирная организация здравоохранения: Geographic Prevalence of Hepatitis B Prevalence, 2004. http://www.who.int/vaccines-surveillance/graphics/htmls/hepbprev.htm).
Вирус HBV представляет собой двухцепочечный гепатотропный вирус, который инфицирует только людей и приматов, не являющихся человеком. Репликация вируса происходит преимущественно в печени и, в меньшей степени, в почках, поджелудочной железе, костном мозге и селезенке (Hepatitis В virus biology. Microbiol Mol Biol Rev. 64: 2000; 51-68.). Вирусные и иммунные маркеры могут быть обнаружены в крови, и они характеризуют развивающиеся со временем структуры антигенов-антител. Первый обнаруживаемый вирусный маркер представляет собой HBsAg, за ним следует е-антиген гепатита В (HBeAg) и ДНК HBV. В инкубационный период титры могут быть высокими, однако уровни ДНК и HBeAg HBV падают при возникновении заболевания и могут быть не обнаруживаемыми во время пика клинической болезни (Hepatitis В virus infection-natural history and clinical consequences. N Engl J Med.. 350: 2004; 1118-1129). HBeAg представляет собой вирусный маркер, обнаруживаемый в крови, который коррелирует с активной вирусной репликацией и, следовательно, высокой вирусной нагрузкой и инфективностью (Hepatitis В е antigen-the dangerous end game of hepatitis B. N Engl J Med. 347: 2002; 208-210). Присутствие анти-HBsAb и анти-HBcAb (IgG) указывает на выздоровление и иммунитет у ранее инфицированного субъекта.
В настоящее время терапии для хронической инфекции HBV, которые рекомендованы Американской ассоциацией по изучению болезней печени (AASLD) и Европейской ассоциацией по изучению печени (EASL), включают интерферон альфа (INFα), пегилированный интерферон альфа-2а (Peg-IFN2a), энтекавир и тенофовир. Нуклеозидные и нуклеотидные терапии, энтекавир и тенофовир, являются успешными для снижения вирусной нагрузки, однако скорости снижения сероконверсии HBeAg и HBeAg даже ниже, чем эти показатели, полученные при терапии с IFNα. Также используют другие аналогичные терапии, включая ламивудин (ЗТС), телбивудин (LdT) и адефовир, однако для нуклеозидной/нуклеотидной терапии в целом, возникновение резистентности ограничивает терапевтическую эффективность.
Следовательно, в данной области техники существует необходимость открытия и разработки новых противовирусных терапий. Кроме того, существует необходимость в новых анти-HBV терапиях, способных увеличивать скорости сероконверсии HBeAg и HBsAg. В недавнем клиническом исследовании была обнаружена корреляция между, сероконверсией и снижением HBeAg (Fried et аl. (2008) Hepatology 47:428) и снижением HBsAg (Moucari et al. (2009) Hepatology 49:1151). Снижение уровней антигенов может обеспечивать возможность иммунологического контроля инфекции HBV, поскольку высокие уровни антигенов, предположительно, вызывают иммунологическую толерантность. Существующие нуклеозидные терапии для HBV способны существенно снижать уровни HBV, однако они слабо влияют на уровни HBeAg и HBsAg.
Антисмысловая технология развивается как эффективное средство снижения экспрессии специфических генных продуктов, и, следовательно, может быть подтверждена ее уникальная полезность в ряде терапевтических, диагностических и исследовательских применений для модулирования экспрессии HBV (смотри публикации патентов США №№2008/0039418 и 2007/0299027). Антисмысловая терапия отличается от нуклеозидной терапии тем, что она может напрямую влиять на транскрипты для антигенов HBV и, посредством этого, снижать уровни HBeAg и HBsAg в сыворотке. Из-за большого количества перекрывающихся транскриптов, вырабатываемых при инфекции HBV, существует также возможность снижения ДНК HBV, помимо HBeAg и HBsAg, одним антисмысловым олигомером. Следовательно, антисмысловая технология развивается как эффективное средство снижения экспрессии определенных генных продуктов, и, следовательно, может быть подтверждена ее уникальная полезность в ряде терапевтических, диагностических и исследовательских применений для модулирования HBV.
Краткое описание изобретения
В настоящем документе представлены способы, соединения и композиции для модулирования экспрессии мРНК и белка HBV. В некоторых аспектах реализации данного изобретения, соединения, применимые для модулирования экспрессии мРНК и белка HBV, представляют собой антисмысловые соединения. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения представляют собой антисмысловые олигонуклеотиды.
В некоторых вариантах реализации, модулирование может происходить в клетке или ткани. В некоторых вариантах реализации клетка или ткань находится в организме животного. В некоторых вариантах реализации животное представляет собой человека. В некоторых вариантах реализации снижаются уровни мРНК HBV. В некоторых вариантах реализации снижаются уровни ДНК HBV. В некоторых вариантах реализации снижаются уровни белка HBV. В некоторых вариантах реализации снижаются уровни антигена HBV. В некоторых вариантах реализации снижаются уровни s-антигена HBV (HBsAg). В некоторых вариантах реализации снижаются уровни е-антигена HBV (HBeAg). Такое снижение может происходить в зависимости от времени или в зависимости от дозы.
Также представлены способы, соединения и композиции, применимые для предупреждения, лечения и улучшения заболеваний, расстройств и состояний. В некоторых вариантах реализации, такие связанные с HBV заболевания, расстройства и состояния представляют собой болезни печени. В некоторых вариантах реализации, такие заболевания, расстройства и состояния печени включают желтуху, рак печени, воспаление печени, фиброз печени, воспаление, цирроз печени, печеночную недостаточность, диффузное гепатоцеллюлярное воспалительное заболевание, гемофагоцитарный синдром, серозный гепатит, виремию HBV и заболевание печени, связанное с трансплантацией. В некоторых вариантах реализации, такие связанные с HBV заболевания, расстройства и состояния представляют собой гиперпролиферативные заболевания, расстройства и состояния. В некоторых вариантах реализации такие гиперпролиферативные заболевания, расстройства и состояния включают рак, а также связанные злокачественные образования и метастазы. В некоторых вариантах реализации, такие виды рака включают рак печени и гепатоцеллюлярный рак (НСС).
Такие заболевания, расстройства и состояния могут в совокупности иметь один или несколько факторов риска, причин или последствий. Некоторые факторы риска и причины развития заболевания печени или гиперпролиферативного заболевания включают возраст; табакокурение; воздействие солнечного света и ионизирующей радиации; контакт с некоторыми химическими веществами; инфекцию некоторыми вирусами и бактериями; некоторые гормональные терапии; семейный анамнез рака; употребление алкоголя; и некоторые особенности образа жизни, включая плохое питание, недостаток физической активности и/или избыток веса. Некоторые симптомы и последствия, связанные с развитием заболевания печени или гиперпролиферативного заболевания, включают, но не ограничиваясь этим: болезнь, похожую на грипп, слабость, боли, головную боль, жар, потерю аппетита, диарею, желтуху, тошноту и рвоту, боль в области печени, стул земляного или серого цвета, зуд по всему телу и мочу темного цвета.
В некоторых вариантах реализации, способы лечения включают введение антисмыслового соединения HBV пациенту, нуждающемуся в этом. В некоторых вариантах реализации, способы лечения включают введение антисмыслового олигонуклеотида HBV пациенту, нуждающемуся в этом.
Подробное описание
Следует понимать, что изложенное выше общее описание и следующее подробное описание являются лишь примерными и пояснительными, и не являются ограничивающими заявленное изобретение. В настоящем документе применение единственного числа включает множественное число, если специально не оговорено иное. При использовании в настоящем документе, применение «или» означает «и/или», если не указано иное. Кроме того, использование термина «включая», а также других форм, таких как «включает» и «включен», не является ограничивающим. Также, такие термины как «элемент» или «компонент» охватывают элементы и компоненты, составляющие одно целое, а также элементы и компоненты, которые составляют более одной субъединицы, если специально не указано иное.
Заголовки разделов, используемые в настоящем документе, предназначены только для организационных целей, и их не следует толковать как ограничения описываемого предмета обсуждения. Все документы или части документов, которые упомянуты в настоящей заявке, включая, но не ограничиваясь этим, патенты, патентные заявки, статьи, книги и трактаты, в явной форме включены в настоящий документ путем ссылки в отношении фрагментов указанных документов, рассматриваемых в настоящем документе, а также в полном объеме.
Определения
Если не даны конкретные определения, то номенклатура, используемая в связи с методиками и приемами, а также сами методики и приемы аналитической химии, синтетической органической химии и медицинской и фармацевтической химии, описанные в настоящем документе, представляют собой те, которые хорошо известны и общеприняты в данной области техники. Для химического синтеза и химического анализа могут быть использованы стандартные методики. Где это допустимо, все патенты, заявки, опубликованные заявки и другие публикации, номера доступа GENBANK и связанная информация о последовательностях, которую можно получить из таких баз данных как Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), а также другие данные, упомянутые в тексте настоящего описания, включены в настоящий документ путем ссылки в отношении фрагментов указанных документов, рассматриваемых в настоящем документе, а также в полном объеме.
Если не указано иное, то следующие термины имеют следующие значения:
«2'-O-метоксиэтил» (также 2'-МОЕ и 2'-O(СН2)2-ОСН3) относится к O-метокси-этиловой модификации в 2'-положении фуранозного кольца. Сахар с 2'-O-метоксиэтиловой модификацией представляет собой модифицированный сахар.
«2'-МОЕ нуклеозид» (также 2'-O-метоксиэтиловый нуклеозид) обозначает нуклеозид, содержащий 2'-МОЕ модифицированный сахарный фрагмент.
«2'-замещенный нуклеозид» обозначает нуклеозид, содержащий заместитель в 2'-положении фуранозильного кольца, отличный от Н или ОН. В некоторых вариантах реализации, 2'-замещенные нуклеозиды содержат нуклеозиды с бициклическими сахарными модификациями.
«3'-сайт-мишень» относится к нуклеотиду целевой нуклеиновой кислоты, который комплементарен к 3'-основному нуклеотиду конкретного антисмыслового соединения.
«5'-сайт-мишень» относится к нуклеотиду целевой нуклеиновой кислоты, который комплементарен к 5'-основному нуклеотиду конкретного антисмыслового соединения.
«5-метилцитозин» обозначает цитозин, модифицированный метильной группой, присоединенной в 5-положении. 5-метилцитозин представляет собой модифицированное нуклеооснование.
«Около» обозначает в пределах ±7% от значения. Например, если указано «соединения, по меньшей мере примерно на 70% ингибирующие HBV», подразумевается, что уровни HBV ингибированы в диапазоне от 63% до 77%.
«Приемлемый профиль безопасности» обозначает характеристику побочных эффектов, которая находится в пределах клинически допустимых пределов.
«Активное фармацевтическое средство» обозначает вещество или вещества в фармацевтической композиции, которые обеспечивают терапевтическое преимущество при введении пациенту. Например, в некоторых вариантах реализации, антисмысловый олигонуклеотид, направленный на HBV, представляет собой активное фармацевтическое средство.
«Активная область мишени» обозначает область мишени, на которую направлено одно или несколько активных антисмысловых соединений. «Активные антисмысловые соединения» обозначают антисмысловые соединения, которые снижают уровни целевой нуклеиновой кислоты или уровни белка.
«Острая инфекция гепатита В» возникает, если у пациента, на которого воздействовал вирус гепатита В, начали развиваться признаки и симптомы вирусного гепатита. Этот период времени, называемый инкубационным периодом, составляет около 90 дней, но может быть коротким, лишь 45 дней, или более продолжительным, до 6 месяцев. Для большинства людей эта инфекция вызывает слабый или умеренный дискомфорт, и проходит самостоятельно благодаря иммунной реакции организма, борющейся с вирусом. Однако у некоторых людей, особенно у людей с ослабленной иммунной системой, таких как пациенты, страдающие СПИДом, проходящие химиотерапию, принимающие иммуноподавляющие лекарства или принимающие стероиды, из-за острой инфекции HBV существуют серьезные проблемы, которые перерастают в более тяжелые состояния, такие как скоротечная печеночная недостаточность.
«Введенные одновременно» относится к совместному введению двух средств любым способом, при котором фармакологическое действие обоих средств проявляется у пациента одновременно. При одновременном введении не требуется, чтобы оба агенты были введены в одной фармацевтической композиции, в одной лекарственной форме или одним способом введения. Действие обоих средств не обязательно должно проявляться одновременно. Их действие должно лишь перекрываться в течение определенного периода времени, и оно не обязательно должно иметь одинаковую протяженность по времени.
«Введение» обозначает предоставление фармацевтического средства пациенту, и включает, но не ограничиваясь этим, введение медицинским специалистом или самостоятельное введение.
«Средство» обозначает активное вещество, которое может обеспечивать терапевтическое преимущество при введении животному. «Первое средство» обозначает терапевтическое соединение, описанное в настоящем документе. Например, первое средство может быть антисмысловым олигонуклеотид ом, направленным на HBV. «Второе средство» обозначает второе терапевтическое соединение, описанное в настоящем документе (например, второй антисмысловый олигонуклеотид, направленный на HBV) и/или не-HBV терапевтическое соединение.
«Улучшение» относится к уменьшению по меньшей мере одного показателя тяжести состояния или заболевания. Тяжесть показателей может быть определена субъективными или объективными оценками, известными специалистам в данной области.
«Животное» относится к человеку или животному, не являющемуся человеком, включая, но не ограничиваясь этим, мышей, крыс, кроликов, собак, котов, свиней и приматов, не являющихся человеком, включая, но не ограничиваясь этим, обезьян и шимпанзе.
«Антитело» относится к молекуле, которая характеризуется каким-либо специфическим взаимодействием с антителом, причем каждое антитело и антиген определены в отношении друг друга. Антитело может относиться к полной молекуле антигена или его фрагменту или области, такой как тяжелая цепь, легкая цепь, область Fab и область Fc.
«Антисмысловая активность» обозначает любую обнаруживаемую или измеримую активность, которая относится к гибридизации антисмыслового соединения с его целевой нуклеиновой кислотой. В некоторых вариантах реализации, антисмысловая активность представляет собой снижение количества или экспрессии целевой нуклеиновой кислоты или белка, кодируемого такой целевой нуклеиновой кислотой.
«Антисмысловое соединение» обозначает олигомерное соединение, способное подвергаться гибридизации с целевой нуклеиновой кислотой при помощи водородной связи. Примеры антисмысловых соединений включают одноцепочечные и двухцепочечные соединения, такие как антисмысловые олигонуклеотиды, миРНК, шкРНК, мноРНК, микроРНК и сателлитные повторы.
«Антисмысловое ингибирование» обозначает снижение уровней целевой нуклеиновой кислоты в присутствии антисмыслового соединения, комплементарного к целевой нуклеиновой кислоте по сравнению с уровнями целевой нуклеиновой кислоты в отсутствие антисмыслового соединения.
«Антисмысловые механизмы» представляют собой все механизмы, включающие гибридизацию соединения с целевой нуклеиновой кислотой, причем результат или эффект гибридизации заключается в целевом разрушении или целевой оккупации с сопутствующей остановкой клеточного механизма, включающего, например, транскрипцию или сплайсинг.
«Антисмысловый олигонуклеотид» обозначает одноцепочечный олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований, которая допускает гибридизацию с соответствующей областью или сегментом целевой нуклеиновой кислоты.
«Основная комплементарность» относится к способности точного спаривания нуклеооснований антисмыслового олигонуклеотида с соответствующими нуклеооснованиями в целевой нуклеиновой кислоте (то есть гибридизации), и она опосредована водородным связыванием Уотсона-Крика, Хугстина или обратным водородным связыванием Хугстина между соответствующими нуклеооснованиями.
«Бициклический сахар» обозначает фуранозное кольцо, модифицированное мостиковым присоединением двух не геминальных атомов углерода. Бициклический сахар представляет собой модифицированный сахар.
«Вес тела» относится к полному весу тела животного, включая все ткани, в том числе жировую ткань.
«Кэп-структура» или «концевой кэп-фрагмент» обозначает химические модификации, которые были внедрены в любой конец антисмыслового соединения.
«cEt» или «затрудненный этил» обозначает бициклический сахарный фрагмент, включающий мостик, соединяющий 4'-углерод и 2'-углерод, причем указанный мостик имеет формулу: 4'-СН(СН3)-O-2'.
«Затрудненный этилнуклеозид» (также cEt нуклеозид) обозначает нуклеозид, включающий бициклический сахарный фрагмент, содержащий мостик 4'-СН(СН3)-O-2'.
«Химически отличная область» относится к области антисмыслового соединения, которая каким-либо образом химически отличается от другой области того же антисмыслового соединения. Например, область, имеющая 2'-O-метоксиэтил нуклеотиды является химически отличной от области, имеющей нуклеотиды с 2'-O-метоксиэтиловыми модификациями.
«Химерные антисмысловые соединения» обозначает антисмысловые соединения, которые имеют по меньшей мере 2 химически отличных области, каждое положение имеет множество субъединиц.
«Хроническая инфекция гепатита В» возникает, если субъект, который изначально страдал острой инфекцией, впоследствии не поборол эту инфекцию. Станет ли заболевание хроническим или будет полностью излечено, - зависит, в основном, от возраста инфицированного субъекта. Хроническое заболевание развивается примерно у 90% детей, инфицированных при рождении. Однако, по мере взросления субъекта, риск хронической инфекции снижается, и острая инфекция перерастает в хроническую у 20%-50% детей и менее 10% подростков и взрослых. Хронические инфекции HBV представляют собой основную лечебную цель для вариантов реализации настоящего изобретения, хотя композиции антисмысловых нуклеотидов (ASO) настоящего изобретения также могут лечить связанные с HBV состояния, такие как воспаление, фиброз, цирроз, рак печени, серозный гепатит и другие.
«Совместное введение» обозначает введение пациенту двух или более фармацевтических средств. Два или более фармацевтических средств могут быть в одной фармацевтической композиции или могут быть в отдельных фармацевтических композициях. Каждый из двух или более фармацевтических средств может вводиться таким же или другим способом введения. Совместное введение включает параллельное или последовательное введение.
«Комплементарность» обозначает способность спаривания между нуклеооснованиями первой нуклеиновой кислоты и второй нуклеиновой кислоты.
«Выполнение» обозначает соблюдение пациентом рекомендованного лечения.
«Включают», «включает» и «включающий» следует понимать как предполагающие включение указанной стадии или элемента, или группы стадий или элементов, но не как исключение какой-либо другой стадии или элемента, или группы стадий или элементов.
«Смежные нуклеооснования» обозначает нуклеооснования, расположенные непосредственно рядом друг с другом.
«Курс лечения» обозначает способ или курс, который восстанавливает здоровье или представляет собой предписанное лечение определенной болезни.
«Дезоксирибонуклеотид» обозначает нуклеотид, имеющий водород в 2' положении сахарной части нуклеотида. Дезоксирибонуклеотиды могут быть модифицированы любым из множества заместителей.
«Разработан» или «разработан для» относится к процессу разработки олигомерного соединения, которое специфически гибридизуется с определенной молекулой нуклеиновой кислоты.
«Разбавитель» обозначает ингредиент в композиции, которые не обладает фармакологической активностью, но является фармацевтически необходимым или желательным. Например, в лекарствах для инъекций разбавитель может быть жидкостью, например, солевым раствором.
«Лекарственная форма» обозначает форму, в которой представлено фармацевтическое средство, например, пилюля, таблетка или другая лекарственная форма, известная в данной облатти техники.
«Доза» обозначает определенное количество фармацевтического средства, которое обеспечивается при разовом введении или в течение определенного периода времени. В некоторых вариантах реализации, доза может быть введена двумя или более болюсами, таблетками или инъекциями. Например, в некоторых вариантах реализации, если необходимо подкожное введение, то для заданной дозы необходим объем, который не может быть обеспечен одной инъекцией. В таких вариантах реализации для достижения заданной дозы может быть использовано две или более инъекций. В некоторых вариантах реализации доза может быть введена двумя или более инъекциями для минимизации реакции пациента в точке инъекции. В других вариантах реализации, фармацевтическое средство вводят инфузией в течение продолжительного периода времени или непрерывно. Дозы могут быть определены как количество фармацевтического средства в час, день, неделю или месяц.
«Режим дозирования» представляет собой комбинацию доз, предназначенную для достижения одного или нескольких заданных эффектов.
«Продолжительность» обозначает период времени, в течение которого продолжается определенная активность или событие. В некоторых вариантах реализации продолжительность лечения представляет собой период времени, в течение которого вводят дозы фармацевтического средства.
«Эффективное количество» в контексте модулирования активности или лечения, или предупреждения состояния, обозначает введение такого количества активного ингредиента пациенту, нуждающемуся в таком модулировании, лечении или профилактике, как в однократной дозе, так и в составе серии доз, которое является эффективным для модулирования указанного эффекта, или для лечения, или для профилактики, или для улучшения указанного состояния. Эффективное количество может варьироваться в зависимости от состояния здоровья и физического состояния пациента, подлежащего лечению, таксономической группы пациентов, подлежащих лечению, состава композиции, оценки медико-санитарной обстановки и других релевантных факторов.
«Эффективность» обозначает способность вызывать заданный эффект.
«Экспрессия» включает все функции, при помощи которых кодированная геном информация превращается в структуры, существующие и функционирующие в клетке. Такие структуры включают, но не ограничиваясь этим, продукты транскрипции и трансляции.
«Полная комплементарность» или «100% комплементаность» обозначает, что каждое нуклеооснование первой нуклеиновой кислоты имеет комплементарное нуклеооснование во второй нуклеиновой кислоте. В некоторых вариантах реализации, первая нуклеиновая кислота представляет собой антисмысловое соединение, а целевая нуклеиновая кислота представляет собой вторую нуклеиновую кислоту.
«Полностью модифицированный мотив» относится к антисмысловому соединению, включающему смежную последовательность нуклеозидов, причем практически каждый нуклеозид представляет собой нуклеозид с модифицированным сахаром, имеющий однообразную модификацию.
«Химерный олигонуклеотид» обозначает химерное антисмысловое соединение, в котором внутренняя область, имеющая множество нуклеозидов, которые поддерживают Н расщепление РНазы, расположена между внешними областями, имеющими один или несколько нуклеозидов, причем нуклеозиды, включающие внутреннюю область, являются химически отличными от нуклеозида или нуклеозидов, составляющих внешние области. Внутренняя область может быть упомянута как «гэп», а внешние области могут быть упомянуты как «крылья».
«С увеличенным гэп» обозначает антисмысловое соединение, имеющее сегмент гэп из 12 или более смежных 2'-дезоксирибонуклеотидов, расположенных между 5' и 3' сегментами крыльев, имеющими от одного до шести нуклеотидов с фрагментами модифицированного сахара.
«HBV» обозначает вирус гепатита В млекопитающих, включая вирус гепатита В человека. Этот термин охватывает географические генотипы вируса гепатита В, в частности, вирус гепатита В человека, а также различные штаммы географических генотипов вируса гепатита В.
«Антиген HBV» обозначает любой антиген или белок вируса гепатита В, включая ядерный белок, такой как «ядерный антиген гепатита В» или «HBcAG» и «антиген Е гепатита В», или «HBeAG» и белки оболочки, такие как «поверхностный антиген HBV» или «HBsAg», или «HBsAG».
«Антиген Е гепатита В» или «HBeAg», или «HBeAG» представляет собой секретируемую, нечастичную форму ядерного белка HBV. Антигены HBV HBeAg и HBeAg имеют общие первичные аминокислотные последовательности, поэтому демонстрируют перекрестную активность на Т-клеточном уровне. HBeAg не является необходимым для вирусной сборки или репликации, хотя исследования позволяют предположить, что они могут быть необходимы для создания хронической инфекции. Неонатальное инфицирование HBeAg-негативным мутантом зачастую приводит к моментальному возникновению острой, а не хронической инфекции HBV (Terezawa et al. (1991) Pediatr. Res. 29:5), тогда как инфицирование молодых североамериканских лесных сурков WHeAg-негативным мутантом приводит к гораздо более низкому уровню хронической инфекции WHV (Cote et al. (2000) Hepatology 31:190). HBeAg может потенциально действовать как толераген путем инактивации сердцевинных специфических Т-клеток за счет удаления или клональной анэргии (Milich et al. (1998) J. Immunol. 160:8102). Существует положительная корреляция между снижением вирусной нагрузки и антигенов HBV и снижением экспрессии Т-клетками ингибирующего рецептора, программирующего гибель, 1 (PD-1, известного также как PDCD1), отрицательного регулятора активированных Т-клеток, при противовирусной терапии и сероконверсии HbeAg(Evans et al. (2008) Hepatology 48:759).
«мРНК HBV» обозначает любую матричную РНК, экспрессируемую вирусом гепатита В.
«Нуклеиновая кислота HBV» или «ДНК HBV» обозначает любую нуклеиновую кислоту, кодирующую HBV. Например, в некоторых вариантах реализации, нуклеиновая кислота HBV включает, без ограничения, любую последовательность ДНК вируса, кодирующую геном HBV или его часть, любую последовательность РНК, транскрибируемую из вирусной ДНК, включая любую последовательность мРНК, кодирующую белок HBV.
«Белок HBV» обозначает любой белок, секретируемый вирусом гепатита В. Этот термин охватыват различные антигены HBV, включая ядерные белки, такие как «антиген Е гепатита», «HBeAg», или «HBeAG» и оболочечные белки, такие как «поверхностный антиген HBV» или «HBsAg».
«Поверхностный антиген HBV» или «HBsAg», или «HBsAG» представляет собой оболочечный белок инфекционных вирусных частиц HBV, но он также секретируется как неинфекционная частица с содержанием в сыворотке в 1000 раз выше, чем вирусные частицы HBV. Уровни HBsAg в сыворотке инфицированного человека или животного могут достигать 1000 мкг/мл (Kann and Gehrlich (1998) Topley & Wilson’s Microbiology and Microbial Infections, 9th ed. 745). При острых инфекциях HBV, период полувыведения HBsAg из сыворотки, или t½, составляет 8,3 дня (Chulanov et al. (2003) J. Med. Virol. 69: 313). Интернализация HBsAg миелоидными дендритными клетками ингибирует повышующую регуляцию со-стимулирующих молекул (то есть В7) и ингибирует стимулирующую способность Т-клеток (den Brouw et al. (2008) Immunology 126:280), и дендритные клетки хронически инфицированных пациентов также демонстрируют недостаток экспрессии со-стимулирующих молекул, секреции IL-12 и стимуляции Т-клеток в присутствии HBsAg (Zheng et al. (2004) J. Viral Hepatitis 11:217). HBsAg-специфичные клетки CD8 пациентов с СНВ демонстрируют измененное тетрамерное связывание. Эти клетки CD8 не являются анэргическими, но они могут обладать топологией TCR, которая обусловливает частичную переносимость или невосприимчивость (Reignat et al. (2002) J. Exp. Med. 195:1089). Более того, снижение HBsAg в сыворотке >1 log на 24 неделе имеет высокое предиктивное значение (92%) для устойчивой вирологической реакции (SVR - определяется как не обнаруживаемая ДНК HBV по ПЦР через 1 год после лечения) в ходе Peg-IFNα2a терапии (Moucari et al. (2009) Hepatology 49:1151).
«Состояние, связанное с гепатитом В» или «HBV-связанное состояние» обозначает любое заболевание, биологическое состояние, медицинское состояние или событие, которое обострено, обусловлено, связано, имеет отношение или приписано к инфекции, воздействию или болезни гепатита В. Термин «состояние, связанное с гепатитом В» включает хроническую инфекцию HBV, воспаление, фиброз, цирроз, рак печени, серозный гепатит, желтуху, рак печени, воспаление печени, фиброз печени, цирроз печени, печеночную недостаточность, диффузное гепатоцеллюляное воспалительное заболевание, гемофагоцитарный синдром, серозный гепатит, виремию HBV, заболевание печени, связанное с трансплантацией, и состояния, имеющие симптомы, которые могут включать любой или все из следующих: болезнь, похожую на грипп, слабость, боли, головную боль, жар, потерю аппетита, диарею, тошноту и рвоту, боль в области печени, стул земляного или серого цвета, зуд по всему телу и мочу темного цвета, в сочетании с положительным тестом на присутствие вируса гепатита В, вирусного антигена гепатита В или положительным тестом на присутствие антитела, специфичного к вирусному антигену гепатита В.
«Гибридизация» обозначает гибридизацию молекул комплементарных нуклеиновых кислот. В некоторых вариантах реализации, молекулы комплементарных нуклеиновых кислот включают, но не ограничиваясь этим, антисмысловое соединение и целевую нуклеиновую кислоту. В некоторых вариантах реализации, молекулы комплементарных нуклеиновых кислот включают, но не ограничиваясь этим, антисмысловый олигонуклеотид и целевую нуклеиновую кислоту.
«Идентификация животного, имеющего инфекцию HBV» обозначает определение животного, у которого диагностирован HBV; или определение животного, имеющего любой симптом инфекции HBV, включая, но не ограничиваясь этим, хроническую инфекцию HBV, воспаление, фиброз, цирроз, рак печени, серозный гепатит, желтуху, рак печени, воспаление печени, фиброз печени, цирроз печени, печеночную недостаточность, диффузное гепатоцеллюлярное воспалительное заболевание, гемофагоцитарный синдром, серозный гепатит, виремию HBV, заболевание печени, связанное с трансплантацией, и состояния, имеющие симптомы, которые могут включать любой или все из следующих: болезнь, похожую на грипп, слабость, боли, головную боль, жар, потерю аппетита, диарею, тошноту и рвоту, боль в области печени, стул земляного или серого цвета, зуд по всему телу и мочу темного цвета, в сочетании с положительным тестом на присутствие вируса гепатита В, вирусного антигена гепатита В или положительным тестом на присутствие антитела, специфичного к вирусному антигену гепатита В, в сочетании с положительным тестом на присутствие вируса гепатита В, вирусного антигена гепатита В или положительным тестом на присутствие антитела, специфичного к вирусному антигену гепатита В.
«Непосредственно смежные» обозначает отсутствие промежуточных элементов между непосредственно смежными элементами.
«Пациент» обозначает человека или животного, не являющегося человеком, выбранного для лечения или терапии.
«Выполнение пациентом» обозначает соблюдение пациентом рекомендованного или предписанного лечения.
«Вызывает», «ингибирует», «потенцирует», «повышает», «увеличивает», «снижает» и тому подобные, обычно обозначают количественные различия между двумя состояниями. Такие термины могут относиться к статистически значимому различию между двумя состояниями. Например, «количество, эффективное для ингибирования активности или экспрессии HBV», обозначает, что уровень активности или экспрессии HBV в обработанном образце количественно отличается, и может быть статистически значимым, от уровня активности или экспрессии HBV в необработанных клетках. Такие термины применяют, например, к уровням экспрессии и уровням активности.
«Ингибирование HBV» обозначает снижение уровня экспрессии мРНК, ДНК и/или белка HBV. В некоторых вариантах реализации, HBV ингибируют в присутствии антисмыслового соединения, направленного на HBV, включая антисмысловый олигонуклеотид, направленный на HBV, по сравнению с уровнями экспрессии мРНК, ДНК и/или белка HBV в отсутствие HBV антисмыслового соединения, такого как антисмысловый олигонуклеотид.
«Ингибирование экспрессии или активности» относится к снижению, блокированию экспрессии или активности и не обязательно обозначает полное исключение экспрессии или активности.
«Реакция в точке инъекции» обозначает воспаление или аномальное покраснение кожи пациента в месте инъекции.
«Межнуклеозидная связь» относится к химической связи между нуклеозидами.
«Внутрибрюшинное введение» обозначает введение в брюшину инфузией или инъекцией.
«Внутривенное введение» обозначает введение в вену.
«Удлиненные» антисмысловые олигонуклеотиды представляют собой те, которые имеют один или несколько дополнительных нуклеозидов по сравнению с антисмысловым олигонуклеотидом, описанным в настоящем документе.
«Связанный дезоксинуклеозид» обозначает основание нуклеиновой кислоты (A, G, С, Т, U), замещенное дезоксирибозой, связанной фосфатным эфиром с образованием нуклеотида.
«Связанные нуклеозиды» обозначает соседние нуклеозиды, связанные вместе межнуклеозидной связью.
«Блокированная нуклеиновая кислота» или «БНК», или «БЫК нуклеозиды» обозначает мономеры нуклеиновых кислот, имеющие мостиковое соединение двух атомов углеродов между положением 4' и 2' нуклеозидного сахарного звена, с образованием посредством этого бициклического сахара. Примеры такого бициклического сахара включают, но не ограничиваясь этим, А) α-L-метиленокси (4'-СН2-O-2') БНК, (В) β-D-метиленокси (4'-СН2-O-2') БНК, (С) этиленокси (4'-(СН2)2-O-2') БНК, (D) аминоокси (4'-CH2-O-N(R)-2') БНК и (Е) оксиамино (4'-CH2-N(R)-O-2') БНК, как показано ниже.
При использовании в настоящем документе, БНК соединения включают, но не ограничиваясь этим, соединения, имеющие по меньшей мере один мостик между положением 4' и 2' сахара, причем каждый из мостиков независимо включает 1 или от 2 до 4 связанных групп, независимо выбранных из -[C(R1)(R2)]n-, -C(R1)=C(R2)-, -C(R1)=N-, -C(=NR1)-, -C(=O)-, -C(=S)-, -O-, -Si(R1)2-, -S(=O)x- и -N(R1)-; причем: х равен 0, 1 или 2; n равен 1, 2, 3 или 4; каждый R1 и R2 независимо представляет собой Н, защитную группу, гидроксил, C1-C12 алкил, замещенный C1-С12 алкил, C2-C12 алкенил, замещенный C2-C12 алкенил, C2-C12 алкинил, замещенный C2-C12 алкинил, C5-C20 арил, замещенный C5-C20 арил, гетероциклический радикал, замещенный гетероциклический радикал, гетероарил, замещенный гетероарил, Cs-C-j алициклический радикал, замещенный C5-C7 алициклический радикал, галоген, OJ1, NJ1J2, SJ1, N3, COOJ1, ацил (С(=O)-Н), замещенный ацил, CN, сульфонил (S(=O)2-J1), или сульфоксил (S(=O)-J1); и каждый Ji и J2 независимо представляет собой Н, C1-C12 алкил, замещенный C1-C12 алкил, C2-C12 алкенил, замещенный C2-C12 алкенил, C2-C12 алкинил, замещенный C2-C12 алкинил, С5-С20 арил, замещенный C5-C20 арил, ацил (С(=O)-Н), замещенный ацил, гетероциклический радикал, замещенный гетероциклический радикал, C1-C12 аминоалкил, замещенный C1-С12 аминоалкил или защитную группу.
Примеры 4'-2' мостиковых групп, входящих в определение БНК, включают, но не ограничиваясь этим, группы формул: -[C(R1)(R2)]n-, -[C(R1)(R2)]n-O-, -C(R1R2)-N(R1)-O- или -C(R1R2)-O-N(R1)-. Более того, другие группы, входящие в определение БНК, представляют собой 4'-СН2-2', 4'-(СН2)2-2', 4'-(СН2)3-2', 4'-СН2-O-2', 4'-(СН2)2-O-2', 4'-CH2-O-N(R1)-2' и 4'-CH2-N(R1)-O-2'- мостики, причем каждый R1 и R2 независимо представляет собой Н, защитную группу или С1-С12 алкил.
Также в определение БНК по настоящему изобретению включены БНК, в которых 2'-гидроксильная группа рибозильного сахарного кольца связана с 4' углеродным атомом сахарного кольца с образованием посредством этого метиленокси (4'-СН2-O-2') мостика для получения бициклического сахарного фрагмента. Мостик также может быть метиленовой (-СН2-) группой, соединяющей 2' кислородный атом и 4' углеродный атом, для которой используют термин метиленокси (4'-СН2-O-2') БНК. Более того, в случае бициклического сахарного фрагмента, имеющего этиленовую мостиковую группу в этом положении, используют термин этиленокси (4'-СН2СН2-O-2') БНК. a-L-метиленокси (4'-СН2-O-2'), изомер метиленокси (4'-СН2-O-2') БНК, также входит в определение БНК, используемое в настоящем документе.
«Не совпадающий» или «не комплементарный нуклеозид» относится к случаю, когда нуклеооснование первой нуклеиновой кислоты не может спариваться с соответствующим нуклеооснованием второй или целевой нуклеиновой кислоты.
«Модифицированная межнуклеозидная связь» относится к замещению или любому изменению природной межнуклеозидной связи (то есть фосфодиэфирной межнуклеозидной связи).
«Модифицированное нуклеооснование» обозначает нуклеооснование, отличное от аденина, цитозина, гуанина, тимидина или урацила. «Не модифицированное нуклеооснование» обозначает пуриновые основания аденин (А) и гуанин (G), а также пиримидиновые основания тимин (Т), цитозин (С) и урацил (U).
«Модифицированный нуклеозид» обозначает нуклеозид, имеющий, независимо, модифицированный сахарный фрагмент и/или модифицированное нуклеооснование.
«Модифицированный нуклеотид» обозначает нуклеотид, имеющий, независимо, модифицированный сахарный фрагмент, модифицированную межнуклеозидную связь или модифицированное нуклеооснование.
«Модифицированный олигонуклеотид» обозначает олигонуклеотид, включающий по меньшей мере одну модифицированную межнуклеозидную связь, модифицированный сахар и/или модифицированное нуклеооснование.
«Модифицированный сахар» обозначает замещение и/или любое изменение природного сахарного фрагмента.
«Мономер» относится к одному звену олигомера. Мономеры включают, но не ограничиваясь этим, нуклеозиды и нуклеотиды, будь то природные или модифицированные.
«Мотив» обозначает схему не модифицированных и модифицированных нуклеозидов в антисмысловом соединении.
«Природный сахарный фрагмент» обозначает сахарный фрагмент, который находится в ДНК (2'-Н) или РНК (2'-ОН).
«Природная межнуклеозидная связь» обозначает 3'-5' фосфодиэфирную связь.
«Некомплементарное нуклеооснование» относится к паре нуклеооснований, которые не образуют водородные связи друг с другом или иным образом не поддерживают гибридизацию.
«Нуклеиновая кислота» относится к молекулам, состоящим из мономерных нуклеотидов. Нуклеиновая кислота включает, но не ограничиваясь этим, рибонуклеиновые кислоты (РНК), дезоксирибонуклеиновые кислоты (ДНК), одноцепочечные нуклеиновые кислоты, двухцепочечные нуклеиновые кислоты, малые интерферирующие рибонуклеиновые кислоты (миРНК) и микроРНК (микроРНК).
«Нуклеооснование» обозначает гетероциклический фрагмент, способный спариваться с основанием другой нуклеиновой кислоты.
«Комплементарность нуклеооснования» относится к нуклеооснованию, которое способно к спариванию с другим нуклеооснованием. Например, аденин (А) в ДНК комплементарен тимину (Т). Например, аденин (А) в РНК комплементарен урацилу (U). В некоторых вариантах реализации комплементарное нуклеооснование относится к нуклеооснованию антисмыслового соединения, которое способно к спариванию с нуклеооснованием его целевой нуклеиновой кислоты. Например, если нуклеооснование в определенном положении антисмыслового соединения способно к водородному связыванию с нуклеооснованием в определенном положении целевой нуклеиновой кислоты, то это положение водородного связывания между указанным олигонуклеотидом и целевой нуклеиновой кислоты считают комплементарным по этой паре нуклеооснований.
«Последовательность нуклеооснований» обозначает порядок смежных нуклеооснований, независимый от какого-либо сахара, связи и/или модификации нуклеооснования.
«Нуклеозид» обозначает нуклеооснование, связанное с сахаром.
«Нуклеозид-миметик» включает такие структуры, используемые для замены сахара или сахара и основания, и необязательно связи в одном или нескольких положениях олигомерного соединения, как, например, нуклеозид-миметики, имеющие морфолино, циклогексенил, циклогексил, тетрагидропиранил, бицикло или трицикло-сахарные заменители, например, не фуранозные сахарные звенья. Нуклеотид-миметик включает такие структуры, используемые для замены нуклеозида и связи в одном или нескольких положениях олигомерного соединения, как, например, пептидные нуклеиновые кислоты или морфолиновые соединения (морфолиновые соединения, связанные при помощи -N(H)-C(=O)-O- или другой не фосфодиэфирной связи). Заменитель сахара пересекается с несколько более широким термином нуклеозид-миметика, но он предназначен для указания замены только сахарного звена (фуранозного кольца). Тетрагидропираниловые кольца, представленные в настоящем документе, являются иллюстративными для примера заменителя сахара, в котором группа фуранозного сахара заменена тетрагидропираниловой кольцевой системой. «Миметик» относится к группам, которые являются заменой для сахара, нуклеооснования и/или межнуклеозидной связи. Как правило, миметик используют вместо сахара или комбинации сахара и межнуклеозидной связи, а нуклеооснование сохраняется для гибридизации с выбранной мишенью.
«Нуклеотид» обозначает нуклеозид, имеющий фосфатную группу, ковалентно связанную с сахарной частью нуклеозида.
«Нецелевое действие» относится к нежелательному или пагубному биологическому действию, связанному с модулированием экспрессии РНК или белка гена, отличного от целевой нуклеиновой кислоты.
«Олигомерное соединение» обозначает полимер связанных мономерных субъединиц, который способен гибридизоваться по меньшей мере с какой-либо областью молекулы нуклеиновой кислоты.
«Олигонуклеозид» обозначает олигонуклеотид, в котором межнуклеозидные связи не содержат атом фосфора.
«Олигонуклеотид» обозначает полимер связанных нуклеозидов, каждый из которых может быть модифицированным или не модифицированным, не зависимо друг от друга.
«Парентеральное введение» обозначает введение инъекцией (например, болюсной инъекцией) или инфузией. Парентеральное введение включает подкожное введение, внутривенное введение, внутримышечное введение, внутриартериальное введение, внутрибрюшинное введение или внутричерепное введение, например, интратекальное или интрацеребровентрикулярное введение.
«Пептид» обозначает молекулу, образованную связыванием по меньшей мере двух аминокислот амидными связями. Без ограничения, при использовании в настоящем документе, «пептид» относится к полипептидам и белкам.
«Фармацевтически приемлемый носитель» обозначает среду или разбавитель, который не взаимодействует со структурой олигонуклеотида. Некоторые такие носители обеспечивают возможность составления фармацевтических композиций, таких как, например, таблетки, пилюли, драже, капсулы, жидкости, гели, сиропы, взвеси, суспензии и пастилки для перорального приема пациентом.
«Фармацевтически приемлемое производное» охватывает фармацевтически приемлемые соли, конъюгаты, пролекарства или изомеры соединений, описанных в настоящем документе.
«Фармацевтически приемлемые соли» обозначает физиологически и фармацевтически приемлемые соли антисмысловых соединений, то есть соли, которые сохраняют заданную биологическую активность исходного олигонуклеотида и не наделяют его нежелательным токсикологическим действием.
«Фармацевтическое средство» обозначает вещество, которое обеспечивает терапевтическое преимущество при введении пациенту. Например, в некоторых вариантах реализации, антисмысловый олигонуклеотид, направленный на HBV, представляет собой фармацевтическое средство.
«Фармацевтическая композиция» обозначает смесь веществ, пригодную для введения субъекту. Например, фармацевтическая композиция может включать антисмысловый олигонуклеотид и стерильный водный раствор. В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция демонстрирует активность в анализе свободного поглощения в некоторых клеточных линиях.
«Фосфотиоатная связь» обозначает связь между нуклеозидами, где фосфодиэфирная связь модифицирована заменой одного из не мостиковых атомов кислорода атомом серы. Фосфотиоатная связь представляет собой модифицированную межнуклеозидную связь.
«Часть» обозначает определенное количество смежных (то есть связанных) нуклеооснований нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации, часть является определенным количеством смежных нуклеооснований целевой нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации, часть является определенным количеством смежных нуклеооснований антисмыслового соединения.
«Предупреждение» или «профилактика» относится к отсрочке или предотвращению возникновения или развития состояния или заболевания в течение периода времени от часов до дней, предпочтительно от недель до месяцев.
«Пролекарство» обозначает терапевтическое средство, которое готовят в неактивной форме, которая превращается в активную форму (то есть лекарство) внутри организма или его клеток под действием эндогенных ферментов или других химических веществ и/или условий.
«Профилактически эффективное количество» относится к количеству фармацевтического средства, которое обеспечивает профилактическое или превентивное преимущество для животного.
«Рекомендованная терапия» обозначает лечебную схему, рекомендованную медицинским специалистом для лечения, улучшения или предупреждения заболевания.
«Область» определяют как часть целевой нуклеиновой кислоты, имеющую по меньшей мере одну идентифицируемую структуру, функцию или характеристику.
«Рибонуклеотид» обозначает нуклеотид, имеющий гидрокси-группу в 2' положении сахарной части нуклеотида. Рибонуклеотиды могут быть модифицированы любым из множества заместителей.
«Соли» обозначают физиологически и фармацевтически приемлемые соли антисмысловых соединений, то есть соли, которые сохраняют заданную биологическую активность исходного олигонуклеотида и не наделяют его нежелательным токсикологическим действием.
«Сегменты» определяют как более мелкие или субфрагменты областей целевой нуклеиновой кислоты.
«Сероконверсию» определяют как отсутствие HBeAg в сыворотке плюс присутствие HBeAb в сыворотке, в случае мониторинга HBeAg как определителя сероконверсии, или определяют как отсутствие HBsAg в сыворотке, в случае мониторинга HBsAg как определителя сероконверсии, по результатам определения доступных в настоящее время пределов обнаружения коммерческих систем иммуноферментного твердофазного анализа (ELISA).
«Укороченные» или «усеченные» версии антисмысловых олигонуклеотидов, представленных в настоящем документе, имеют один, два или более удаленных нуклеозидов.
«Побочные эффекты» обозначает физиологические реакции, приписываемые лечению, которые отличны от заданного действия. В некоторых вариантах реализации, побочные эффекты включают, без ограничения, реакции в точке инъекции, аномалии при испытании функции печени, аномалии функции почек, печеночную токсичность, почечную токсичность, аномалии центральной нервной системы и миопатии. Например, повышенные уровни аминотрансферазы в сыворотке могут указывать на печеночную токсичность или аномалию функции печени. Например, повышенный билирубин может указывать на печеночную токсичность или аномалию функции печени.
«Существенный», при использовании в настоящем документе, обозначает измеримый или наблюдаемый, например, существенный результат, такой как существенное улучшение или существенное снижение, как правило, относится к измеримому или наблюдаемому результату, такому как измеримое или наблюдаемое улучшение или снижение.
«Сайты», при использовании в настоящем документе, определяют как уникальные положения нуклеооснований в целевой нуклеиновой кислоте.
«Замедляет прогрессирование» обозначает уменьшение развития указанного заболевания.
«Может специфически гибридизоваться» относится к антисмысловому соединению, имеющему достаточную степень комплементарности между антисмысловым олигонуклеотидом и целевой нуклеиновой кислотой для инициации заданного эффекта, одновременно демонстрирующему минимальное влияние или отсутствие влияния на нецелевые нуклеиновые кислоты в условиях, в которых необходимо специфическое связывание, то есть при физиологических условиях в случае анализов in vivo и при терапевтическом лечении. «Строгие условия гибридизации» или «строгие условия» относятся к условиям, в которых олигомерное соединение гибридизуется с его целевой последовательностью, но с минимальным количеством других последовательностей.
«Статистически значимый», при использовании в настоящем документе, обозначает измеримый или наблюдаемый параметр, который маловероятно является случайным результатом.
«Подкожное введение» обозначает введение непосредственно под кожу.
«Субъект» обозначает человека или животного, не являющегося человеком, выбранного для лечения или терапии.
«Мишень» относится к белку, модулирование которого задано. «Целевой ген» относится к гену, кодирующему мишень.
«Таргетинг» обозначает процесс разработки и выбора антисмыслового соединения, которое будет специфически гибридизоваться с целевой нуклеиновой кислотой и вызывать заданный эффект.
«Целевая нуклеиновая кислота», «целевая РНК», «целевой РНК транскрипт» и «мишень нуклеиновой кислоты», все эти термины обозначают нуклеиновую кислоту, на которую могут быть нацелены антисмысловые соединения.
«Целевая область» обозначает часть целевой нуклеиновой кислоты, на которую направлено одно или несколько антисмысловых соединений.
«Целевой сегмент» обозначает последовательность нуклеотидов целевой нуклеиновой кислоты, на которую направлено антисмысловое соединение. «Сайт-мишень 5'» относится к 5'-основному нуклеотиду целевого сегмента. «Сайт-мишень 3'» относится к 3'-основному нуклеотиду целевого сегмента.
«Терапевтически эффективное количество» обозначает количество фармацевтического средства, которое обеспечивает пациенту терапевтическое преимущество.
«Лечение» относится к введению композиции для изменения или улучшения заболевания или состояния.
«Не модифицированные» нуклеооснования обозначают пуриновые основания аденин (А) и гуанин (G), а также пиримидиновые основания тимин (Т), цитозин (С) и урацил (U).
«Не модифицированный нуклеотид» обозначает нуклеотид, состоящий из природных нуклеооснований, сахарных фрагментов и межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации не модифицированный нуклеотид представляет собой нуклеотид РНК (то есть β-D-рибонуклеозиды) или нуклеотид ДНК (то есть β-D-дезоксирибонуклеозид).
«Валидированный целевой сегмент» определяют как часть целевой области, состоящую по меньшей мере из 8 нуклеооснований (то есть 8 смежных нуклеооснований), на которую направлено активное олигомерное соединение.
«Сегмент крыла» обозначает множество нуклеозидов, модифицированных для влияния на свойства олигонуклеотида, такие как усиленная ингибирующая активность, повышенная связывающая аффиность к целевой нуклеиновой кислоте или устойчивость к разложению нуклеазами in vivo.
Некоторые варианты реализации
В некоторых вариантах реализации представлены способы, соединения и композиции для ингибирования экспрессии мРНК HBV.
В некоторых вариантах реализации представлены антисмысловые соединения, нацеленные на нуклеиновую кислоту HBV. В некоторых вариантах реализации нуклеиновая кислота HBV является последовательностями, представленными далее под номером доступа GENBANK U95551.1 (включена в настоящий документ как SEQ ID NO:1).
В некоторых вариантах реализации, соединения, представленные в настоящем документе, представляют собой или включают модифицированный олигонуклеотид. В некоторых вариантах реализации эти соединения включают модифицированный олигонуклеотид и конъюгат, описанный в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид представляет собой фармацевтически приемлемое производное.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид длиной от 10 до 30 связанных нуклеооснований, нацеленный на HBV. Мишень HBV может иметь последовательность, указанную в SEQ ID NO:1, или ее часть, или ее вариант.
В некоторых вариантах реализации, соединения или модифицированные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, имеют длину от 10 до 30 связанных нуклеооснований, и нацелены на HBV. В некоторых вариантах реализации, мишень HBV имеет последовательность, указанную в SEQ ID NO:1. В некоторых вариантах реализации, такие соединения или олигонуклеотиды нацелены на одну из следующих нуклеотидных областей HBV: CCTGCTGGTGGCTCCAGTTC (SEQ ID NO:1273); AGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCA (SEQ ID NO:1354); CATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTT (SEQ ID NO:1276); CAAGGTATGTTGCCCGT (SEQ ID NO:1277); CCTATGGGAGTGGGCCTCAG (SEQ ID NO:1279; TGGCTCAGTTTACTAGTGCCATTTGTTCAGTGGTTCG (SEQ ID NO:1287); TATATGGATGATGTGGT (SEQ ID NO:1359); TGCCAAGTGTTTGCTGA (SEQ ID NO:1360); TGCCGATCCATACTGCGGAACTCCT (SEQ ID NO:1361); CCGTGTGCACTTCGCTTCACCTCTGCACGT (SEQ ID NO:1352); GGAGGCTGTAGGCATAAATTGGT (SEQ ID NO:1353); CTTTTTCACCTCTGCCTA (SEQ ID NO:1362); TTCAAGCCTCCAAGCTGTGCCTTGG (SEQ ID NO:1363); AGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGG (SEQ ID NO:1274); TGGATGTGTCTGCGGCGTTTTATCAT (SEQ ID NO:1275); TGTATTCCCATCCCATC (SEQ ID NO:1278); TGGCTCAGTTTACTAGTGC (SEQ ID NO:1280); GGGCTTTCCCCCACTGT (SEQ ID NO:1281); TCCTCTGCCGATCCATACTGCGGAACTCCT (SEQ ID NO:1282); CGCACCTCTCTTTACGCGG (SEQ ID NO:1283); GGAGTGTGGATTCGCAC (SEQ ID NO:1284); или GAAGAAGAACTCCCTCGCCT (SEQ ID NO:1285). В некоторых вариантах реализации, такие соединения или олигонуклеотиды имеют сегмент гэп из 9, 10 или более связанных дезоксинуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, такие соединения или олигонуклеотиды имеют сегмент гэп из 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 или 16 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, такой сегмент гэп находится между двумя сегментами крыльев, которые независимо имеют 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 связанных модифицированных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, один или несколько модифицированных нуклеозидов в сегменте крыла содержит модифицированный сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный сахар представляет собой бициклический сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой нуклеозид БНК. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, 2'-замещенные нуклеозиды включают нуклеозид ы с бициклическими сахарными модификациями. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой затрудненный этилнуклеозид (cEt).
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированные олигонуклеотиды, состоящие из 10-30 связанных нуклеозидов, и имеющие последовательность нуклеооснований, содержащую часть, содержащую по меньшей мере 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 или 30 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1. В некоторых вариантах реализации, такие олигонуклеотиды имеют сегмент гэп из 9, 10 или более связанных дезоксинуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, такой сегмент гэп находится между двумя сегментами крыльев, которые независимо имеют 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 связанных модифицированных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, один или несколько модифицированных нуклеозидов в сегменте крыла содержит модифицированный сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный сахар представляет собой бициклический сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой нуклеозид БНК. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, 2'-замещенные нуклеозиды содержат нуклеозиды с бициклическими сахарными модификациями. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой затрудненный этилнуклеозид (cEt). В некоторых вариантах реализации, каждый модифицированный нуклеозид в каждом сегменте крыла независимо представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид или нуклеозид с бициклической сахарной модификацией, такой как затрудненный этилнуклеозид (cEt) или нуклеозид БЫК.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 10-30 связанных нуклеозидов, и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных нуклеооснований любой из последовательностей SEQ ID NO:5-310, 321-802, 804-1272, 1288-1350, 1364-1372, 1375, 1376 или 1379. В некоторых вариантах реализации, такие олигонуклеотиды имеют сегмент гэп из 9, 10 или более связанных дезоксинуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, такой сегмент гэп находится между двумя сегментами крыльев, которые независимо имеют 1-5, 1-4, 1-3, 2-5, 2-4 или 2-3 связанных модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации, такой сегмент гэп находится между двумя сегментами крыльев, которые независимо имеют 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 связанных модифицированных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, один или несколько модифицированных нуклеозидов в сегменте крыла содержит модифицированный сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный сахар представляет собой бициклический сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой нуклеозид БЫК. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, 2'-замещенные нуклеозиды включают нуклеозиды с бициклическими сахарными модификациями. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой затрудненный этилнуклеозид (cEt).
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3 или 4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, каждый нуклеозид с модифицированным сахаром независимо представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид или нуклеозид с бициклическим сахарным фрагментом, такой как затрудненный этилнуклеозид (cEt) или нуклеозид БНК. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, каждый нуклеозид с модифицированным сахаром независимо представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид или бициклический нуклеозид, такой как затрудненный этилнуклеозид (cEt) или нуклеозид БНК.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 10-30 связанных нуклеозидов, и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных нуклеооснований любой из последовательностей SEQ ID NO:5-310, 321-802, 804-1272, 1288-1350, 1364-1372, 1375, 1376 или 1379. В некоторых вариантах реализации, такие олигонуклеотиды имеют сегмент гэп из 10 или более связанных дезоксинуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, такой сегмент гэп находится между двумя сегментами крыльев, которые независимо имеют 1-5, 1-4, 1-3, 2-5, 2-4 или 2-3 связанных модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации, такой сегмент гэп находится между двумя сегментами крыльев, которые независимо имеют 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 связанных модифицированных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, один или несколько модифицированных нуклеозидов в сегменте крыла содержит модифицированный сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный сахар представляет собой бициклический сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой нуклеозид БНК. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, 2'-замещенные нуклеозиды включают нуклеозиды с бициклическими сахарными модификациями. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 10-30 связанных нуклеозидов, и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных нуклеооснований любой из последовательностей SEQ ID NO:5, 15, 16, 33, 39-95, 123-135, 163-175, 180-310, 321-406, 413-455, 461-802 или 804-1272. В некоторых вариантах реализации, такие олигонуклеотиды имеют сегмент гэп из 10 или более связанных дезоксинуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, такой сегмент гэп находится между двумя сегментами крыльев, которые независимо имеют 1-5, 1-4, 1-3, 2-5, 2-4 или 2-3 связанных модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации, один или несколько модифицированных нуклеозидов в сегменте крыла содержит модифицированный сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный сахар представляет собой бициклический сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой нуклеозид БЫК. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, 2'-замещенные нуклеозиды включают нуклеозиды с бициклическими сахарными модификациями. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 10-30 связанных нуклеозидов, и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных нуклеооснований любой из последовательностей SEQ ID NO:6-14, 17-32, 34-38, 96-122, 136-162, 176-179, 407-412, 456-462, 523-538. В некоторых вариантах реализации, такие олигонуклеотиды имеют сегмент гэп из 10 или более связанных дезоксинуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, такой сегмент гэп находится между двумя сегментами крыльев, которые независимо имеют 1-5, 1-4, 1-3, 2-5, 2-4 или 2-3 связанных модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации, один или несколько модифицированных нуклеозидов в сегменте крыла содержит модифицированный сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 14 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-3 или 2 нуклеозида с модифицированным сахаром.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром, как нуклеозиды 2'-МОЕ.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 17 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 или 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3-4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4, 5 или 6 нуклеозидов с модифицированным сахаром, как нуклеозиды 2'-МОЕ.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 18 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 3-5 или 4 нуклеозида с модифицированным сахаром.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 20 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 22, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 нуклеозидов с модифицированным сахаром, как нуклеозиды 2'-МОЕ.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат соль модифицированного олигонуклеотида.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции дополнительно содержат фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
В некоторых вариантах реализации, последовательность нуклеооснований модифицированного олигонуклеотида по меньшей мере на 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 100% комплементарна последовательности SEQ ID NO:1, по результатам измерения целостности модифицированного олигонуклеотида.
В некоторых вариантах реализации, последовательность нуклеооснований модифицированного олигонуклеотида по меньшей мере на 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 100% комплементарна любой из последовательностей SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, по результатам измерения целостности модифицированного олигонуклеотида.
В некоторых вариантах реализации, соединение или модифицированный олигонуклеотид является одноцепочечным.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 или 30 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 18 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 14 связанных нуклеозидов.
В некоторых вариантах реализации, по меньшей мере одна межнуклеозидная связь модифицированного олигонуклеотида представляет собой модифицированную межнуклеозидную связь. В некоторых вариантах реализации, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную межнуклеозидную связь.
В некоторых вариантах реализации, по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонуклеотида включает модифицированный сахар. В некоторых вариантах реализации, по меньшей мере один модифицированный сахар содержит 2'-O-метоксиэтиловую группу (2'-O(СН2)2-ОСН3). В некоторых вариантах реализации, модифицированный сахар содержит группу 2'-O-СН3.
В некоторых вариантах реализации, по меньшей мере один модифицированный сахар представляет собой бициклический сахар. В некоторых вариантах реализации, по меньшей мере один модифицированный сахар, бициклический сахар содержит мостик 4'-(СН2)nO-2', причем n равен 1 или 2. В некоторых вариантах реализации, бициклический сахар содержит мостик 4'-CH2-O-2'. В некоторых вариантах реализации, бициклический сахар содержит мостик 4'-СН(СН3)-O-2'.
В некоторых вариантах реализации, по меньшей мере один нуклеозид указанного модифицированного олигонуклеотида содержит модифицированное нуклеооснование. В некоторых вариантах реализации, модифицированнле нуклеооснование представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из связанных нуклеозидов. Сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', и каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит модифицированный сахар.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 10 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из трех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из трех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар и/или затрудненный этиловый (cEt) сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин. В некоторых аспектах, каждый из трех связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, и каждый из трех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой затрудненный этиловый (cEt) сахар. В других аспектах, три связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3', а три связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'. В других аспектах, три связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3', а три связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 10 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из двух связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин. В некоторых аспектах, два связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3', а четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 9 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из пяти связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из двух связанных нуклеозидов; пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид и затрудненный (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; два связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 8 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из трех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из пяти связанных нуклеозидов; три связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из пяти связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 8 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из трех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из пяти связанных нуклеозидов, каждый из трех связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляет собой затрудненный этиловый (cEt) сахар; каждый из пяти связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 9 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из четырех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин. В некоторых аспектах, четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3', а четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 9 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из четырех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов; четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 9 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из четырех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов; четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 8 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из пяти связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов; пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 8 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из пяти связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов; пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 7 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из пяти связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из пяти связанных нуклеозидов; пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 7 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из шести связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов; шесть связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 7 связанных дезоксинуклеозидов, и сегмент крыла 5' состоит из шести связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов; шесть связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 10 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из пяти связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из пяти связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит затрудненный этиловый (cEt) сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 10 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из пяти связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из пяти связанных нуклеозидов, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин, причем пять связанных нуклеозидов крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3', и каждый из пяти связанных нуклеозидов крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из трех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из трех связанных нуклеозидов. В некоторых аспектах, сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3'; каждый из трех связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, и каждый из трех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой затрудненный этиловый (cEt) сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин. В других аспектах, сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3'; три связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; три связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин. В других аспектах, три связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3', а три связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из двух связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов. В некоторых аспектах, сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3'; два связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 9 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоязий из двух связанных нуклеозидов, причем пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид и затрудненный (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; два связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 8 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из трех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из пяти связанных нуклеозидов, причем три связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из пяти связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 8 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из трех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из пяти связанных нуклеозидов, причем каждый из трех связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляет собой затрудненный этиловый (cEt) сахар; каждый из пяти связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 9 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из четырех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин. В некоторых аспектах, четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3', а четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 9 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из четырех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов, причем четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 9 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из четырех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов, причем четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ Ю NO: 1, и причем модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 8 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов, причем пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 8 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов, причем пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 7 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из пяти связанных нуклеозидов, причем пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь преставляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 7 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из шести связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов, причем шесть связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 7 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из шести связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов, причем шесть связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из пяти связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает затрудненный этиловый (cEt) сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из пяти связанных нуклеозидов, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин, причем пять связанных нуклеозидов крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3', и каждый из пяти связанных нуклеозидов крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из пяти связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из пяти связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из двух связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из восьми связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из восьми связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из двух связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из трех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из семи связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из семи связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из трех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из четырех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из шести связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из шести связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 18 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из четырех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нулеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из трех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из девяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из двух связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из шести связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из девяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из шести связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из двух связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из девяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из четырех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из девяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из пяти связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из трех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из девяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из трех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из пяти связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из трех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из трех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из девяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из пяти связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из двух связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из девяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из двух связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из пяти связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из девяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из четырех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из трех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из девяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из трех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 14 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из двух связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из двух связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из пяти связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из двух связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из восьми связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из восьми связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из двух связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из трех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из семи связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из семи связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из трех связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из четырех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из шести связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из шести связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 18 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из четырех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из трех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из девяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из двух связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из шести связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из девяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из шести связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из двух связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из девяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из четырех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из девяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из трех связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из девяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из трех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из пяти связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из трех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из трех связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO: 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из девяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из двух связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из девяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из двух связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из пяти связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из девяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из четырех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из трех связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из девяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из трех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 14 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из двух связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из двух связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации, представленные способы, соединения и композиции ингибируют уровни экспрессии мРНК и/или ДНК HBV и/или уровни белка, и/или уровни антигена.
В другом варианте реализации представлен способ лечения HBV-связанных заболеваний, расстройств и состояний у млекопитающих, включающий введение терапевтически эффективного количества любой фармацевтической композиции, описанной выше, млекопитающему, нуждающемуся в этом, для лечения HBV-связанных заболеваний, расстройств и состояний. В родственных вариантах реализации млекопитающим является человек, а HBV-состояние заболевание, расстройство и состояние представляет собой инфекцию вируса гепатита В от вируса гепатита В человека. Более конкретно, вирус гепатита В человека может быть любым из человеческих географических генотипов: А (Северо-Западная Европа, Северная Америка, Центральная Америка); В (Индонезия, Китай, Вьетнам); С (Восточная Азия, Корея, Китай, Япония, Полинезия, Вьетнам); D (Средиземноморский регион, Ближний восток, Индия); Е (Африка); F (коренные американцы, Полинезия); G (Соединенные Штаты, Франция); или Н (Центральная Америка).
В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение или олигонуклеотид, направленный на нуклеиновую кислоту HBV, комплементарен в пределах следующих нуклеотидных областей последовательности SEQ ID NO:1: 1-20, 10-29, 10-56, 13-38, 13-35, 19-38, 25-47, 25-50, 25-56, 43-68, 43-63, 55-74, 58-73, 58-74, 58-77, 58-79, 58-80, 58-84, 59-74, 59-75, 59-80, 60-75, 60-76, 60-79, 61-76, 61-77, 61-80, 62-77, 63-84, 68-114, 101-123, 98-123, 113-138, 116-138, 131-150, 137-162, 152-186, 158-177, 167-186, 191-215, 196-224, 196-215, 196-218, 199-228, 199-218, 199-224, 200-224, 205-224, 206-228, 218-237, 224-243, 233-264, 242-263, 243-262, 244-263, 245-274; 245-260, 245-264, 246-266, 247-266, 247-269, 247-270, 245-267, 251-267, 245-266, 250-269, 251-266, 251-268, 251-269, 245-269, 245-266, 245-261, 250-265, 250-266, 250-267, 250-268, 250-269, 251-270, 252-267, 253-268, 253-269, 253-272, 253-274, 254-269, 254-270, 254-274, 255-270, 255-271, 255-274, 255-401, 255-400, 255-274, 255-273, 255-272, 255-271, 256-271, 256-275, 255-276, 256-272, 256-276, 253-275, 256-279, 257-276, 258-273, 259-274, 260-279, 262-281, 262-321, 262-315, 262-312, 265-312, 266-288, 266-291, 266-285, 281-321, 281-303, 290-321, 290-312, 292-311, 290-312, 293-312, 293-315, 293-321, 296-321, 302-321, 324-343, 339-361, 339-367, 348-367, 342-367, 358-392, 358-378, 360-392, 360-383, 360-388, 360-385, 362-381, 366-388, 369-388, 366-385, 366-392, 370-389, 370-392, 380-399, 382-401, 384-433, 384-400, 384-401, 385-401, 405-424, 409-428, 405-428, 411-426, 411-427, 411-430, 411-431, 411-437, 412-431, 411-426, 411-427, 412-428, 412-431, 412-427, 413-433, 413-432, 413-428, 413-429, 413-432, 413-433, 414-427, 415-427, 414-429, 414-430, 414-433, 415-428, 415-429, 415-430, 415-431, 415-434, 416-431, 416-432, 416-429, 416-435, 417-432, 417-433, 417-436, 418-433, 418-435, 418-434, 418-437, 419-435, 419-434, 420-435, 419-432, 419-434, 421-436, 422-437, 422-441, 423-436, 425-465, 454-473, 454-472, 457-476, 457-472, 457-473, 454-476, 455-472, 457-485, 458-485, 458-483, 458-477, 458-473, 459-485, 460-485, 463-498, 463-485, 466-485, 463-482, 457-491, 458-491, 459-491, 460-491, 463-491, 466-491, 472-491, 472-493, 473-492, 475-491, 459-494, 460-494, 463-494, 466-494, 467-498, 472-494, 475-494, 457-473, 457-472, 458-494, 454-494, 457-494, 457-473, 485-513, 470-493, 476-519, 485-519, 500-519, 512-534, 512-550, 524-546, 536-559, 548-567, 548-570, 550-570, 548-594, 554-573, 548-576, 560-594, 584-606, 611-645, 617-363, 623-642, 617-645, 639-754, 639-658, 639-654, 641-656, 642-657, 643-658, 642-754, 653-672, 662-685, 665-685,665-689, 668-687, 670-754, 670-706, 670-685, 670-686, 670-689, 671-690, 671-691, 671-686, 671-687, 672-693, 672-697, 672-707, 672-687, 672-688, 673-688, 674-693, 678-693, 679-694, 679-707, 679-698, 679-701, 679-702, 679-707, 680-695, 680-699, 679-699, 681-706, 681-696, 682-697, 682-706, 682-707, 682-702, 682-701, 683-698, 684-699, 685-700, 686-701, 687-754, 688-704, 689-709, 689-710, 690-705, 679-705, 679-710, 679-706, 690-710, 691-710, 690-754, 690-706, 684-703, 687-705, 687-702, 687-703, 687-706, 688-703, 688-704, 688-705, 689-704, 689-705, 689-708, 690-705, 690-706, 690-709, 691-706, 692-711, 693-716, 693-712, 695-715, 697-716, 697-716, 690-716, 724-746, 724-752, 724-754, 724-758, 733-752, 738-754, 738-753, 739-758, 739-754, 739-775, 739-754, 740-754, 742-785, 742-773, 757-776, 757-785, 790-815, 793-812, 811-833, 811-844, 814-833, 811-906, 820-839, 822-844, 822-867, 823-842, 845-864, 845-867, 854-906, 845-909, 845-906, 854-876, 863-882, 863-885, 878-900, 887-906, 899-918, 899-933, 899-958, 905-927, 905-933, 914-933, 936-958, 936-955, 945-964, 951-970, 951-985, 951-1044, 951-1024, 951-1056, 951-997, 960-985, 963-1044, 963-1024, 963-997, 972-1015, 1025-1044, 1031-1056, 1037-1056, 1046-1083, 1049-1068, 1070-1089, 1070-1095, 1082-1101, 1081-1134, 1081-1143, 1082-1101, 1088-1107, 1088-1134, 1094-1119, 1097-1119, 1112-1134, 1118-1143, 1118-1146, 1088-1146, 1121-1140, 1127-1146, 1127-1193, 1150-1193, 1156-1187, 1165-1187, 1170-1192, 1171-1191, 1172-1191, 1176-1192, 1176-1285, 1177-1192, 1176-1191, 1203-1297, 1206-1228, 1206-1255, 1209-1228, 1215-1255, 1245-1265, 1251-1280, 1262-1285, 1251-1285, 1259-1296, 1259-1290, 1259-1287, 1261-1296, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1296, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1264-1297, 1265-1280, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1268-1296, 1269-1284, 1269-1285, 1269-1288, 1270-1285, 1271-1290, 1271-1296, 1277-1296, 1261-1290, 1262-1290, 1268-1290, 1263-1305, 1259-1305, 1259-1305, 1266-1305, 1259-1302, 1275-1294, 1281-1306, 1281-1324, 1281-1336, 1282-1301, 1286-1306, 1290-1324, 1293-1318, 1290-1324, 1293-1315, 1296-1315, 1311-1336, 1311-1333, 1326-1345, 1353-1381, 1359-1378, 1395-1414, 1498-1532, 1498-1523, 1498-1535, 1510-1529, 1515-1535, 1515-1563, 1515-1596, 1515-1605, 1515-1602, 1515-1540, 1515-1535, 1518-1605, 1518-1602, 1518-1537, 1521-1563, 1521-1540, 1550-1655, 1550-1563, 1550-1569, 1553-1578, 1553-1599, 1553-1590, 1565-1584, 1571-1595, 1577-1605, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1578-1598, 1571-1598, 1579-1594, 1579-1594, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1580-1605, 1580-1602, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1582-1602, 1553-1655, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1602, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1586-1652, 1642-1664, 1651-1720, 1651-1673, 1655-1679, 1695-1720, 1716-1738, 1743-1763, 1743-1768, 1764-1783, 1773-1792, 1777-1796, 1777-1800, 1778-1800, 1778-1793, 1778-1794, 1778-1797, 1779-1798, 1779-1797, 1779-1796, 1779-1795, 1779-1794, 1780-1799, 1780-1796, 1780-1795, 1781-1797, 1781-1796, 1781-1796, 1781-1800, 1781-1797, 1782-1799, 1782-1797, 1782-1798, 1783-1798, 1783-1799, 1784-1800, 1784-1799, 1779-1799, 1778-1889, 1778-1794, 1779-1795, 1780-1799, 1785-1800, 1794-1813, 1806-1837, 1806-1828, 1806-1825, 1809-1828, 1812-1843, 1812-1837, 1812-1831, 1815-1843, 1815-1844, 1815-1840, 1815-1834, 1818-1837, 1821-1840, 1821-1844, 1821-1837, 1822-1843, 1822-1839, 1822-1837, 1823-1843, 1823-1838, 1824-1839, 1827-1846, 1861-1884, 1861-1880, 1865-1885, 1866-1881, 1867-1882, 1867-1886, 1868-1883, 1869-1885, 1869-1884, 1870-1885, 1871-1886, 1872-1887, 1874-1889, 1876-1895, 1888-1914, 1888-1908, 1891-1910, 1891-1914, 1895-1938, 1895-1935, 1913-1935, 1898-1920, 1907-1929, 1913-1935, 1918-1934, 1919-1938, 1919-1934, 1921-1934, 1928-1956, 1957-1976, 2035-2057, 2083-2141, 2230-2261, 2368-2393, 2381-2397, 2368-2394, 2379-2394, 2381-2396, 2368-2397, 2368-2396, 2420-2439, 2458-2476, 2459-2478, 2819-2838, 2818-2838, 2873-2892 и 3161-3182.
В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение или олигонуклеотид, направленный на нуклеиновую кислоту HBV, направлен на следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1: 1-20, 10-29, 10-56, 13-38, 13-35, 19-38, 25-47, 25-50, 25-56, 43-68, 43-63, 55-74, 58-73, 58-74, 58-77, 58-79, 58-80, 58-84, 59-74, 59-75, 59-80, 60-75, 60-76, 60-79, 61-76, 61-77, 61-80, 62-77, 63-84, 68-114, 101-123, 98-123, 113-138, 116-138, 131-150, 137-162, 152-186, 158-177, 167-186, 191-215, 196-224, 196-215, 196-218, 199-228, 199-218, 199-224, 200-224, 205-224, 206-228, 218-237, 224-243, 233-264, 242-263, 243-262, 244-263, 245-274; 245-260, 245-264, 246-266, 247-266, 247-269, 247-270, 245-267, 251-267, 245-266, 250-269, 251-266, 251-268, 251-269, 245-269, 245-266, 245-261, 250-265, 250-266, 250-267, 250-268, 250-269, 251-270, 252-267, 253-268, 253-269, 253-272, 253-274, 254-269, 254-270, 254-274, 255-270, 255-271, 255-274, 255-401, 255-400, 255-274, 255-273, 255-272, 255-271, 256-271, 256-275, 255-276, 256-272, 256-276, 253-275, 256-279, 257-276, 258-273, 259-274, 260-279, 262-281, 262-321, 262-315, 262-312, 265-312, 266-288, 266-291, 266-285, 281-321, 281-303, 290-321, 290-312, 292-311, 290-312, 293-312, 293-315, 293-321, 296-321, 302-321, 324-343, 339-361, 339-367, 348-367, 342-367, 358-392, 358-378, 360-392, 360-383, 360-388, 360-385, 362-381, 366-388, 369-388, 366-385, 366-392, 370-389, 370-392, 380-399, 382-401, 384-433, 384-400, 384-401, 385-401, 405-424, 409-428, 405-428, 411-426, 411-427, 411-430, 411-431, 411-437, 412-431, 411-426, 411-427, 412-428, 412-431, 412-427, 413-433, 413-432, 413-428, 413-429, 413-432, 413-433, 414-427, 415-427, 414-429, 414-430, 414-433, 415-428, 415-429, 415-430, 415-431, 415-434, 416-431, 416-432, 416-429, 416-435, 417-432, 417-433, 417-436, 418-433, 418-435, 418-434, 418-437, 419-435, 419-434, 420-435, 419-432, 419-434, 421-436, 422-437, 422-441, 423-436, 425-465, 454-473, 454-472, 457-476, 457-472, 457-473, 454-476, 455-472, 457-485, 458-485, 458-483, 458-477, 458-473, 459-485, 460-485, 463-498, 463-485, 466-485, 463-482, 457-491, 458-491, 459-491, 460-491, 463-491, 466-491, 472-491, 472-493, 473-492, 475-491, 459-494, 460-494, 463-494, 466-494, 467-498, 472-494, 475-494, 457-473, 457-472, 458-494, 454-494, 457-494, 457-473, 485-513, 470-493, 476-519, 485-519, 500-519, 512-534, 512-550, 524-546, 536-559, 548-567, 548-570, 550-570, 548-594, 554-573, 548-576, 560-594, 584-606, 611-645, 617-363, 623-642, 617-645, 639-754, 639-658, 639-654, 641-656, 642-657, 643-658, 642-754, 653-672, 662-685, 665-685,665-689, 668-687, 670-754, 670-706, 670-685, 670-686, 670-689, 671-690, 671-691, 671-686, 671-687, 672-693, 672-697, 672-707, 672-687, 672-688, 673-688, 674-693, 678-693, 679-694, 679-707, 679-698, 679-701, 679-702, 679-707, 680-695, 680-699, 679-699, 681-706, 681-696, 682-697, 682-706, 682-707, 682-702, 682-701, 683-698, 684-699, 685-700, 686-701, 687-754, 688-704, 689-709, 689-710, 690-705, 679-705, 679-710, 679-706, 690-710, 691-710, 690-754, 690-706, 684-703, 687-705, 687-702, 687-703, 687-706, 688-703, 688-704, 688-705, 689-704, 689-705, 689-708, 690-705, 690-706, 690-709, 691-706, 692-711, 693-716, 693-712, 695-715, 697-716, 697-716, 690-716, 724-746, 724-752, 724-754, 724-758, 733-752, 738-754, 738-753, 739-758, 739-754, 739-775, 739-754, 740-754, 742-785, 742-773, 757-776, 757-785, 790-815, 793-812, 811-833, 811-844, 814-833, 811-906, 820-839, 822-844, 822-867, 823-842, 845-864, 845-867, 854-906, 845-909, 845-906, 854-876, 863-882, 863-885, 878-900, 887-906, 899-918, 899-933, 899-958, 905-927, 905-933, 914-933, 936-958, 936-955, 945-964, 951-970, 951-985, 951-1044, 951-1024, 951-1056, 951-997, 960-985, 963-1044, 963-1024, 963-997, 972-1015, 1025-1044, 1031-1056, 1037-1056, 1046-1083, 1049-1068, 1070-1089, 1070-1095, 1082-1101, 1081-1134, 1081-1143, 1082-1101, 1088-1107, 1088-1134, 1094-1119, 1097-1119, 1112-1134,1118-1143, 1118-1146, 1088-1146, 1121-1140, 1127-1146, 1127-1193, 1150-1193, 1156-1187, 1165-1187, 1170-1192, 1171-1191, 1172-1191, 1176-1192, 1176-1285, 1177-1192, 1176-1191, 1203-1297, 1206-1228, 1206-1255, 1209-1228, 1215-1255, 1245-1265, 1251-1280, 1262-1285, 1251-1285, 1259-1296, 1259-1290, 1259-1287, 1261-1296, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1296, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1264-1297, 1265-1280, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1268-1296, 1269-1284, 1269-1285, 1269-1288, 1270-1285, 1271-1290, 1271-1296, 1277-1296, 1261-1290, 1262-1290, 1268-1290, 1263-1305, 1259-1305, 1259-1305, 1266-1305, 1259-1302, 1275-1294, 1281-1306, 1281-1324, 1281-1336, 1282-1301, 1286-1306, 1290-1324, 1293-1318, 1290-1324, 1293-1315, 1296-1315, 1311-1336, 1311-1333, 1326-1345, 1353-1381, 1359-1378, 1395-1414, 1498-1532, 1498-1523, 1498-1535, 1510-1529, 1515-1535, 1515-1563, 1515-1596, 1515-1605, 1515-1602, 1515-1540, 1515-1535, 1518-1605, 1518-1602,1518-1537, 1521-1563, 1521-1540, 1550-1655, 1550-1563, 1550-1569, 1553-1578, 1553-1599, 1553-1590, 1565-1584, 1571-1595, 1577-1605, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1578-1598, 1571-1598, 1579-1594, 1579-1594, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1580-1605, 1580-1602, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1582-1602, 1553-1655, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1602, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1586-1652, 1642-1664, 1651-1720, 1651-1673, 1655-1679, 1695-1720, 1716-1738, 1743-1763, 1743-1768, 1764-1783, 1773-1792, 1777-1796, 1777-1800, 1778-1800, 1778-1793, 1778-1794, 1778-1797, 1779-1798, 1779-1797, 1779-1796, 1779-1795, 1779-1794, 1780-1799, 1780-1796, 1780-1795, 1781-1797, 1781-1796, 1781-1796, 1781-1800, 1781-1797, 1782-1799, 1782-1797, 1782-1798, 1783-1798, 1783-1799, 1784-1800, 1784-1799, 1779-1799, 1778-1889, 1778-1794, 1779-1795, 1780-1799, 1785-1800, 1794-1813, 1806-1837, 1806-1828, 1806-1825, 1809-1828, 1812-1843, 1812-1837, 1812-1831, 1815-1843, 1815-1844, 1815-1840, 1815-1834, 1818-1837, 1821-1840, 1821-1844, 1821-1837, 1822-1843, 1822-1839, 1822-1837, 1823-1843, 1823-1838, 1824-1839, 1827-1846, 1861-1884, 1861-1880, 1865-1885, 1866-1881, 1867-1882, 1867-1886, 1868-1883, 1869-1885, 1869-1884, 1870-1885, 1871-1886, 1872-1887, 1874-1889, 1876-1895, 1888-1914, 1888-1908, 1891-1910, 1891-1914, 1895-1938, 1895-1935, 1913-1935, 1898-1920, 1907-1929, 1913-1935, 1918-1934, 1919-1938, 1919-1934, 1921-1934, 1928-1956, 1957-1976, 2035-2057, 2083-2141, 2230-2261, 2368-2393, 2381-2397, 2368-2394, 2379-2394, 2381-2396, 2368-2397, 2368-2396, 2420-2439, 2458-2476, 2459-2478, 2819-2838, 2818-2838, 2873-2892 и 3161-3182.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение или олигонуклеотид, направленный на нуклеиновую кислоту HBV, комплементарен в пределах генной области второй части pre-Sl HBV, соответствующей нуклеотидной области 1-1932 последовательности SEQ ID NO:1. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение или олигонуклеотид, направленный на нуклеиновую кислоту HBV, комплементарен в пределах генной области первой части pre-Sl HBV, соответствующей нуклеотидной области 2831-3182 последовательности SEQ ID NO:1.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение или олигонуклеотид, направленный на нуклеиновую кислоту HBV, нацелен на генную область второй части pre-S I HBV, соответствующую нуклеотидной области 1-1932 последовательности SEQ ID NO:1. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение или олигонуклеотид, направленный на нуклеиновую кислоту HBV, нацелен на генную область первой части pre-Sl HBV, соответствующую нуклеотидной области 2831-3182 последовательности SEQ ID NO:1.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на область нуклеиновой кислоты HBV. В некоторых вариантах реализации, такие соединения или олигонуклеотиды направлены на область нуклеиновой кислоты HBV, имеющую часть смежных нуклеооснований, которая комплементарна равной по длине части нуклеооснований указанной области. Например, эта часть может быть частью, содержащей по меньшей мере 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных нуклеооснований, комплементарной равной по длине части области, упомянутой в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации такие соединения или олигонуклеотиды направлены на следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1: 1-20, 10-29, 10-56, 13-38, 13-35, 19-38, 25-47, 25-50, 25-56, 43-68, 43-63, 55-74, 58-73, 58-74, 58-77, 58-79, 58-80, 58-84, 59-74, 59-75, 59-80, 60-75, 60-76, 60-79, 61-76, 61-77, 61-80, 62-77, 63-84, 68-114, 101-123, 98-123, 113-138, 116-138, 131-150, 137-162, 152-186, 158-177, 167-186, 191-215, 196-224, 196-215, 196-218, 199-228, 199-218, 199-224, 200-224, 205-224, 206-228, 218-237, 224-243, 233-264, 242-263, 243-262, 244-263, 245-274; 245-260, 245-264, 246-266, 247-266, 247-269, 247-270, 245-267, 251-267, 245-266, 250-269, 251-266, 251-268, 251-269, 245-269, 245-266, 245-261, 250-265, 250-266, 250-267, 250-268, 250-269, 251-270, 252-267, 253-268, 253-269, 253-272, 253-274, 254-269, 254-270, 254-274, 255-270, 255-271, 255-274, 255-401, 255-400, 255-274, 255-273, 255-272, 255-271, 256-271, 256-275, 255-276, 256-272, 256-276, 253-275, 256-279, 257-276, 258-273, 259-274, 260-279, 262-281, 262-321, 262-315, 262-312, 265-312, 266-288, 266-291, 266-285, 281-321, 281-303, 290-321, 290-312, 292-311, 290-312, 293-312, 293-315, 293-321, 296-321, 302-321, 324-343, 339-361, 339-367, 348-367, 342-367, 358-392, 358-378, 360-392, 360-383, 360-388, 360-385, 362-381, 366-388, 369-388, 366-385, 366-392, 370-389, 370-392, 380-399, 382-401, 384-433, 384-400, 384-401, 385-401, 405-424, 409-428, 405-428, 411-426, 411-427, 411-430, 411-431, 411-437, 412-431, 411-426, 411-427, 412-428, 412-431, 412-427, 413-433, 413-432, 413-428, 413-429, 413-432, 413-433, 414-427, 415-427, 414-429, 414-430, 414-433, 415-428, 415-429, 415-430, 415-431, 415-434, 416-431, 416-432, 416-429, 416-435, 417-432, 417-433, 417-436, 418-433, 418-435, 418-434, 418-437, 419-435, 419-434, 420-435, 419-432, 419-434, 421-436, 422-437, 422-441, 423-436, 425-465, 454-473, 454-472, 457-476, 457-472, 457-473, 454-476, 455-472, 457-485, 458-485, 458-483, 458-477, 458-473, 459-485, 460-485, 463-498, 463-485, 466-485, 463-482, 457-491, 458-491, 459-491, 460-491, 463-491, 466-491, 472-491, 472-493, 473-492, 475-491, 459-494, 460-494, 463-494, 466-494, 467-498, 472-494, 475-494, 457-473, 457-472, 458-494, 454-494, 457-494, 457-473, 485-513, 470-493, 476-519, 485-519, 500-519, 512-534, 512-550, 524-546, 536-559, 548-567, 548-570, 550-570, 548-594, 554-573, 548-576, 560-594, 584-606, 611-645, 617-363, 623-642, 617-645, 639-754, 639-658, 639-654, 641-656, 642-657, 643-658, 642-754, 653-672, 662-685, 665-685,665-689, 668-687, 670-754, 670-706, 670-685, 670-686, 670-689, 671-690, 671-691, 671-686, 671-687, 672-693, 672-697, 672-707, 672-687, 672-688, 673-688, 674-693, 678-693, 679-694, 679-707, 679-698, 679-701, 679-702, 679-707, 680-695, 680-699, 679-699, 681-706, 681-696, 682-697, 682-706, 682-707, 682-702, 682-701, 683-698, 684-699, 685-700, 686-701, 687-754, 688-704, 689-709, 689-710, 690-705, 679-705, 679-710, 679-706, 690-710, 691-710, 690-754, 690-706, 684-703, 687-705, 687-702, 687-703, 687-706, 688-703, 688-704, 688-705, 689-704, 689-705, 689-708, 690-705, 690-706, 690-709, 691-706, 692-711, 693-716, 693-712, 695-715, 697-716, 697-716, 690-716, 724-746, 724-752, 724-754, 724-758, 733-752, 738-754, 738-753, 739-758, 739-754, 739-775, 739-754, 740-754, 742-785, 742-773, 757-776, 757-785, 790-815, 793-812, 811-833, 811-844, 814-833, 811-906, 820-839, 822-844, 822-867, 823-842, 845-864, 845-867, 854-906, 845-909, 845-906, 854-876, 863-882, 863-885, 878-900, 887-906, 899-918, 899-933, 899-958, 905-927, 905-933, 914-933, 936-958, 936-955, 945-964, 951-970, 951-985, 951-1044, 951-1024, 951-1056, 951-997, 960-985, 963-1044, 963-1024, 963-997, 972-1015, 1025-1044, 1031-1056, 1037-1056, 1046-1083, 1049-1068, 1070-1089, 1070-1095, 1082-1101, 1081-1134, 1081-1143, 1082-1101, 1088-1107, 1088-1134, 1094-1119, 1097-1119, 1112-1134, 1118-1143, 1118-1146, 1088-1146, 1121-1140, 1127-1146, 1127-1193, 1150-1193, 1156-1187, 1165-1187, 1170-1192, 1171-1191, 1172-1191, 1176-1192, 1176-1285, 1177-1192, 1176-1191, 1203-1297, 1206-1228, 1206-1255, 1209-1228, 1215-1255, 1245-1265, 1251-1280, 1262-1285, 1251-1285, 1259-1296, 1259-1290, 1259-1287, 1261-1296, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1296, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1264-1297, 1265-1280, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1268-1296, 1269-1284, 1269-1285, 1269-1288, 1270-1285, 1271-1290, 1271-1296, 1277-1296, 1261-1290, 1262-1290, 1268-1290, 1263-1305, 1259-1305, 1259-1305, 1266-1305, 1259-1302, 1275-1294, 1281-1306, 1281-1324, 1281-1336, 1282-1301, 1286-1306, 1290-1324, 1293-1318, 1290-1324, 1293-1315, 1296-1315, 1311-1336, 1311-1333, 1326-1345, 1353-1381, 1359-1378, 1395-1414, 1498-1532, 1498-1523, 1498-1535, 1510-1529, 1515-1535, 1515-1563, 1515-1596, 1515-1605, 1515-1602, 1515-1540, 1515-1535, 1518-1605, 1518-1602, 1518-1537, 1521-1563, 1521-1540, 1550-1655, 1550-1563, 1550-1569, 1553-1578, 1553-1599, 1553-1590, 1565-1584, 1571-1595, 1577-1605, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1578-1598, 1571-1598, 1579-1594, 1579-1594, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1580-1605, 1580-1602, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1582-1602, 1553-1655, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1602, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1586-1652, 1642-1664, 1651-1720, 1651-1673, 1655-1679, 1695-1720, 1716-1738, 1743-1763, 1743-1768, 1764-1783, 1773-1792, 1777-1796, 1777-1800, 1778-1800, 1778-1793, 1778-1794, 1778-1797, 1779-1798, 1779-1797, 1779-1796, 1779-1795, 1779-1794, 1780-1799, 1780-1796, 1780-1795, 1781-1797, 1781-1796, 1781-1796, 1781-1800, 1781-1797, 1782-1799, 1782-1797, 1782-1798, 1783-1798, 1783-1799, 1784-1800, 1784-1799, 1779-1799, 1778-1889, 1778-1794, 1779-1795, 1780-1799, 1785-1800, 1794-1813, 1806-1837, 1806-1828, 1806-1825, 1809-1828, 1812-1843, 1812-1837, 1812-1831, 1815-1843, 1815-1844, 1815-1840, 1815-1834, 1818-1837, 1821-1840, 1821-1844, 1821-1837, 1822-1843, 1822-1839, 1822-1837, 1823-1843, 1823-1838, 1824-1839, 1827-1846, 1861-1884, 1861-1880, 1865-1885, 1866-1881, 1867-1882, 1867-1886, 1868-1883, 1869-1885, 1869-1884, 1870-1885, 1871-1886, 1872-1887, 1874-1889, 1876-1895, 1888-1914, 1888-1908, 1891-1910, 1891-1914, 1895-1938, 1895-1935, 1913-1935, 1898-1920, 1907-1929, 1913-1935, 1918-1934, 1919-1938, 1919-1934, 1921-1934, 1928-1956, 1957-1976, 2035-2057, 2083-2141, 2230-2261, 2368-2393, 2381-2397, 2368-2394, 2379-2394, 2381-2396, 2368-2397, 2368-2396, 2420-2439, 2458-2476, 2459-2478, 2819-2838, 2818-2838, 2873-2892 и 3161-3182.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на область нуклеиновой кислоты HBV. В некоторых вариантах реализации, такие соединения или олигонуклеотиды направлены на область нуклеиновой кислоты HBV, имеющую часть смежных нуклеооснований, которая комплементарна равной по длине части нуклеооснований указанной области. Например, эта часть может быть частью, содержащей по меньшей мере 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных нуклеооснований, комплементарной равной по длине части области, упомянутой в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации такие соединения или олигонуклеотиды направлены на следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1: 58-73, 58-74, 58-77, 59-74, 60-75, 61-76, 62-77, 245-274; 245-260, 250-265, 251-266, 252-267, 253-268, 254-269, 255-270, 256-271, 256-272, 258-273, 259-274, 380-399, 382-401, 411-437, 411-427, 411-426, 412-427, 413-428, 413-432, 414-429, 415-430, 416-431, 417-432, 418-433, 419-434, 420-435, 421-436, 422-437, 457-472, 458-473, 639-754, 639-658, 639-654, 641-656, 642-657, 643-658, 670-754, 670-706, 670-685, 671-686, 672-687, 673-688, 678-693, 679-694, 680-695, 681-706, 681-696, 682-697, 683-698, 684-699, 685-700, 686-701, 687-702, 688-703, 689-704, 690-705, 691-706, 738-754, 738-753, 739-754, 1176-1285, 1176-1191, 1177-1192, 1261-1285, 1261-1276, 1262-1277, 1263-1278, 1264-1279, 1265-1280, 1266-1281, 1267-1282, 1268-1283, 1269-1284, 1270-1285, 1577-1606, 1577-1592, 1578-1593, 1579-1594, 1580-1595, 1581-1596, 1582-1597, 1583-1598, 1584-1599, 1585-1600, 1586-1601, 1587-1602, 1588-1603, 1589-1604, 1590-1605, 1591-1606, 1778-1889, 1778-1800, 1778-1793, 1779-1794, 1780-1799, 1780-1796, 1780-1795, 1781-1796, 1782-1797, 1783-1798, 1784-1799, 1785-1800, 1822-1839, 1822-1837, 1823-1838, 1824-1839, 1866-1881, 1867-1882, 1868-1883, 1869-1884, 1870-1885, 1871-1886, 1872-1887 или 1874-1889, и причем по меньшей мере один нуклеозид соединения или модифицированного олигонуклеотида включает по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый или затрудненный этиловый (cEt) сахар.
В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение или олигонуклеотид, направленный на нуклеиновую кислоту HBV, комплементарен в пределах следующих нуклеотидных областей последовательности SEQ ID NO:1: 58-73, 58-74, 58-77, 59-74, 59-75, 60-75, 60-76, 61-76, 61-77, 62-77, 253-272, 253-269, 254-270, 255-271, 256-272, 411-437, 411-426, 411-427, 411-430, 412-427, 412-428, 412-431, 413-428, 413-429, 413-432, 414-429, 414-430, 414-433, 415-430, 415-431, 415-434, 416-431, 416-432, 416-435, 417-432, 417-433, 417-436, 418-433, 418-434, 418-437, 457-472, 457-473, 458-473, 670-706, 670-685, 670-686, 671-686, 671-687, 672-687, 672-688, 673-688, 687-702, 687-703, 687-706, 688-703, 688-704, 689-704, 689-705, 690-705, 690-706, 691-706, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1265-1280, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1269-1284, 1269-1285, 1270-1285, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1579-1594, 1579-1594, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1602, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1778-1800, 1778-1793, 1778-1794, 1778-1797, 1779-1794, 1779-1795, 1779-1798, 1780-1795, 1780-1796, 1780-1799, 1781-1796, 1781-1797, 1781-1800, 1782-1797, 1782-1798, 1783-1798, 1783-1799, 1784-1799 и 1784-1800.
В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение или олигонуклеотид, направленный на нуклеиновую кислоту HBV, направлен на следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1: 58-73, 58-74, 58-77, 59-74, 59-75, 60-75, 60-76, 61-76, 61-77, 62-77, 253-272, 253-269, 254-270, 255-271, 256-272, 411-437, 411-426, 411-427, 411-430, 412-427, 412-428, 412-431, 413-428, 413-429, 413-432, 414-429, 414-430, 414-433, 415-430, 415-431, 415-434, 416-431, 416-432, 416-435, 417-432, 417-433, 417-436, 418-433, 418-434, 418-437, 457-472, 457-473, 458-473, 670-706, 670-685, 670-686, 671-686, 671-687, 672-687, 672-688, 673-688, 687-702, 687-703, 687-706, 688-703, 688-704, 689-704, 689-705, 690-705, 690-706, 691-706, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1265-1280, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1269-1284, 1269-1285, 1270-1285, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1579-1594, 1579-1594, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1602, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1778-1800, 1778-1793, 1778-1794, 1778-1797, 1779-1794, 1779-1795, 1779-1798, 1780-1795, 1780-1796, 1780-1799, 1781-1796, 1781-1797, 1781-1800, 1782-1797, 1782-1798, 1783-1798, 1783-1799, 1784-1799 и 1784-1800.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на область нуклеиновой кислоты HBV. В некоторых вариантах реализации, такие соединения или олигонуклеотиды направлены на область нуклеиновой кислоты HBV, имеющую часть смежных нуклеооснований, которая комплементарна равной по длине части нуклеооснований указанной области. Например, эта часть может быть частью, содержащей по меньшей мере 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных нуклеооснований, комплементарной равной по длине части области, упомянутой в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации такие соединения или олигонуклеотиды направлены на следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1: 1-20, 10-29, 10-56, 13-38, 13-35, 19-38, 25-47, 25-50, 25-56, 43-68, 43-63, 55-74, 58-73, 58-74, 58-77, 58-79, 58-80, 58-84, 59-74, 59-75, 59-80, 60-75, 60-76, 60-79, 61-76, 61-77, 61-80, 62-77, 63-84, 68-114, 101-123, 98-123, 113-138, 116-138, 131-150, 137-162, 152-186, 158-177, 167-186, 191-215, 196-224, 196-215, 196-218, 199-228, 199-218, 199-224, 200-224, 205-224, 206-228, 218-237, 224-243, 233-264, 242-263, 243-262, 244-263, 245-264, 246-266, 247-266, 247-269, 247-270, 245-267, 251-267, 245-266, 250-269, 251-268, 251-269, 245-269, 245-266, 245-261, 250-266, 250-267, 250-268, 250-269, 251-270, 253-269, 253-272, 253-274, 254-270, 254-274, 255-271, 255-274, 255-401, 255-400, 255-274, 255-273, 255-272, 255-271, 256-275, 255-276, 256-272, 256-276, 253-275, 256-279, 257-276, 260-279, 262-281, 262-321, 262-315, 262-312, 265-312, 266-288, 266-291, 266-285, 281-321, 281-303, 290-321, 290-312, 292-311, 290-312, 293-312, 293-315, 293-321, 296-321, 302-321, 324-343, 339-361, 339-367, 348-367, 342-367, 358-392, 358-378, 360-392, 360-383, 360-388, 360-385, 362-381, 366-388, 369-388, 366-385, 366-392, 370-389, 370-392, 384-433, 384-400, 384-401, 385-401, 405-424, 409-428, 405-428, 411-426, 411-427, 411-430, 411-431, 411-437, 412-431, 411-426, 411-427, 412-428, 412-431, 412-427, 413-433, 413-432, 413-428, 413-429, 413-432, 413-433, 414-427, 415-427, 414-429, 414-430, 414-433, 415-428, 415-429, 415-430, 415-431, 415-434, 416-431, 416-432, 416-429, 416-435, 417-432, 417-433, 417-436, 418-433, 418-435, 418-434, 418-437, 419-435, 419-434, 420-435, 419-432, 419-434, 422-441, 423-436, 425-465, 454-473, 454-472, 457-476, 457-472, 457-473, 454-476, 455-472, 457-485, 458-485, 458-483, 458-477, 458-473, 459-485, 460-485, 463-498, 463-485, 466-485, 463-482, 457-491, 458-491, 459-491, 460-491, 463-491, 466-491, 472-491, 472-493, 473-492, 475-491, 459-494, 460-494, 463-494, 466-494, 467-498, 472-494, 475-494, 457-473, 457-472, 458-494, 454-494, 457-494, 457-473, 485-513, 470-493, 476-519, 485-519, 500-519, 512-534, 512-550, 524-546, 536-559, 548-567, 548-570, 550-570, 548-594, 554-573, 548-576, 560-594, 584-606, 611-645, 617-363, 623-642, 617-645, 642-754, 653-672, 662-685, 665-685, 665-689, 668-687, 670-706, 670-685, 670-686, 670-689, 671-690, 671-691, 671-686, 671-687, 672-693, 672-697, 672-707, 672-687, 672-688, 673-688, 674-693, 679-707, 679-698, 679-701, 679-702, 679-707, 680-699, 679-699, 682-706, 682-707, 682-702, 682-701, 687-754, 688-704, 689-709, 689-710, 690-705, 679-705, 679-710, 679-706, 690-710, 691-710, 690-754, 690-706, 684-703, 687-705, 687-702, 687-703, 687-706, 688-703, 688-704, 688-705, 689-704, 689-705, 689-708, 690-705, 690-706, 690-709, 691-706, 692-711, 693-716, 693-712, 695-715, 697-716, 697-716, 690-716, 724-746, 724-752, 724-754, 724-758, 733-752, 738-754, 739-758, 739-754, 739-775, 739-754, 740-754, 742-785, 742-773, 757-776, 757-785, 790-815, 793-812, 811-833, 811-844, 814-833, 811-906, 820-839, 822-844, 822-867, 823-842, 845-864, 845-867, 854-906, 845-909, 845-906, 854-876, 863-882, 863-885, 878-900, 887-906, 899-918, 899-933, 899-958, 905-927, 905-933, 914-933, 936-958, 936-955, 945-964, 951-970, 951-985, 951-1044, 951-1024, 951-1056, 951-997, 960-985, 963-1044, 963-1024, 963-997, 972-1015, 1025-1044, 1031-1056, 1037-1056, 1046-1083, 1049-1068, 1070-1089, 1070-1095, 1082-1101, 1081-1134, 1081-1143, 1082-1101, 1088-1107, 1088-1134, 1094-1119, 1097-1119, 1112-1134, 1118-1143, 1118-1146, 1088-1146, 1121-1140, 1127-1146, 1127-1193,1150-1193, 1156-1187, 1165-1187, 1170-1192, 1171-1191, 1172-1191, 1176-1192, 1177-1192, 1176-1191, 1203-1297, 1206-1228, 1206-1255, 1209-1228, 1215-1255, 1245-1265, 1251-1280, 1262-1285, 1251-1285, 1259-1296, 1259-1290, 1259-1287, 1261-1296, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1296, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1264-1297, 1265-1280, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1268-1296, 1269-1284, 1269-1285, 1269-1288, 1270-1285, 1271-1290, 1271-1296, 1277-1296, 1261-1290, 1262-1290, 1268-1290, 1263-1305, 1259-1305, 1259-1305, 1266-1305, 1259-1302, 1275-1294, 1281-1306, 1281-1324, 1281-1336, 1282-1301, 1286-1306, 1290-1324, 1293-1318, 1290-1324, 1293-1315, 1296-1315, 1311-1336, 1311-1333, 1326-1345, 1353-1381, 1359-1378, 1395-1414, 1498-1532, 1498-1523, 1498-1535, 1510-1529, 1515-1535, 1515-1563, 1515-1596, 1515-1605, 1515-1602, 1515-1540, 1515-1535, 1518-1605, 1518-1602, 1518-1537, 1521-1563, 1521-1540, 1550-1655, 1550-1563, 1550-1569, 1553-1578, 1553-1599, 1553-1590, 1565-1584, 1571-1595, 1577-1605, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1578-1598, 1571-1598, 1579-1594, 1579-1594, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1580-1605, 1580-1602, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1582-1602, 1553-1655, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1602, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1586-1652, 1642-1664, 1651-1720, 1651-1673, 1655-1679, 1695-1720, 1716-1738, 1743-1763, 1743-1768, 1764-1783, 1773-1792, 1777-1796, 1777-1800, 1778-1800, 1778-1793, 1778-1794, 1778-1797, 1779-1798, 1779-1797, 1779-1796, 1779-1795, 1779-1794, 1780-1799, 1780-1796, 1780-1795, 1781-1797, 1781-1796, 1781-1796, 1781-1800, 1781-1797, 1782-1799, 1782-1797, 1782-1798, 1783-1798, 1783-1799, 1784-1800, 1784-1799, 1779-1799, 1778-1794, 1779-1795, 1780-1799, 1794-1813, 1806-1837, 1806-1828, 1806-1825, 1809-1828, 1812-1843, 1812-1837, 1812-1831, 1815-1843, 1815-1844, 1815-1840, 1815-1834, 1818-1837, 1821-1840, 1821-1844, 1821-1837, 1822-1843, 1822-1839, 1823-1843, 1827-1846, 1861-1884, 1861-1880, 1865-1885, 1867-1886, 1869-1885, 1876-1895, 1888-1914, 1888-1908, 1891-1910, 1891-1914, 1895-1938, 1895-1935, 1913-1935, 1898-1920, 1907-1929, 1913-1935, 1918-1934, 1919-1938, 1919-1934, 1921-1934, 1928-1956, 1957-1976, 2035-2057, 2083-2141, 2230-2261, 2368-2393, 2381-2397, 2368-2394, 2379-2394, 2381-2396, 2368-2397, 2368-2396, 2420-2439, 2458-2476, 2459-2478, 2819-2838, 2818-2838, 2873-2892 и 3161-3182.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на область нуклеиновой кислоты HBV. В некоторых вариантах реализации, такие соединения или олигонуклеотиды направлены на область нуклеиновой кислоты HBV, имеющую часть смежных нуклеооснований, которая комплементарна равной по длине части нуклеооснований указанной области. Например, эта часть может быть частью, содержащей по меньшей мере 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных нуклеооснований, комплементарной равной по длине части области, упомянутой в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации такие соединения или олигонуклеотиды направлены на следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1: 233-264, 242-263, 243-262, 244-263, 245-264, 246-266, 247-266, 247-269, 247-270, 245-267, 251-267, 245-266, 250-269, 251-268, 251-269, 245-269, 245-266, 245-261, 250-266, 250-267, 250-268, 250-269, 251-270, 253-272, 253-274, 254-274, 255-274, 255-401, 255-400, 255-274, 255-273, 255-272, 255-271, 256-275, 255-276, 256-276, 253-275, 256-279, 257-276, 260-279, 262-281, 262-321, 262-315, 262-312, 265-312, 266-288, 266-291, 266-285, 281-321, 281-303, 405-424, 409-428, 405-428, 411-430, 411-431, 411-431, 412-431, 411-426, 411-427, 412-428, 412-431, 412-427, 413-433, 413-432, 413-428, 413-433, 411-427, 414-427, 415-427, 415-428, 415-429, 416-432, 416-429, 418-435, 418-434, 419-435, 419-434, 420-435, 419-432, 419-434, 422-441, 423-436, 425-465, 584-606, 611-645, 617-363, 623-642, 617-645, 642-754, 653-672, и причем по меньшей мере один нуклеозид соединения или модифицированного олигонуклеотида включает по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый сахар.
В некоторых вариантах реализации, следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1, при направленном действии антисмысловых соединений или олигонуклеотидов, демонстрируют по меньшей мере 50% ингибирование: 1-20, 10-29, 10-56, 13-38, 13-35, 19-38, 25-47, 25-50, 25-56, 43-68, 43-63, 55-74, 58-77, 58-74, 58-73, 58-79, 58-80, 58-84, 59-74, 59-75, 59-80, 60-79, 60-75, 60-76, 61-80, 61-76, 61-77, 62-77, 63-84, 68-114, 101-123, 98-123, 113-138, 116-138, 131-150, 137-162, 152-186, 158-177, 167-186, 191-215, 196-224, 196-215, 196-218, 199-228, 199-218, 199-224,200-224, 205-224, 206-228, 218-237, 224-243, 233-264, 242-263, 243-262, 244-263, 245-264, 246-266, 247-266, 247-269, 247-270, 245-267, 251-267, 245-266, 250-269, 251-268, 251-269, 245-269, 245-266, 245-261, 250-265, 250-266, 250-267, 250-268, 250-269, 251-266, 251-270, 252-267, 253-268, 253-269, 253-272, 253-274, 254-269, 254-270, 254-274, 255-274, 255-401, 255-400, 255-274, 255-273, 255-272, 255-271, 255-270, 256-271, 256-272, 256-275, 255-276, 256-276, 253-275, 256-279, 257-276, 258-273, 259-274, 260-279, 262-281, 262-321, 262-315, 262-312, 265-312, 266-288, 266-291, 266-285, 281-321, 281-303, 290-321, 290-312, 292-311, 290-312, 293-312, 293-315, 293-321, 296-321, 302-321, 324-343, 339-361, 339-367, 348-367, 342-367, 358-392, 358-378, 360-392, 360-383, 360-388, 360-385, 362-381, 366-388, 369-388, 366-385, 366-392, 370-389, 370-392, 380-399, 382-401, 384-433, 384-400, 384-401, 385-401, 405-424, 409-428, 405-428, 411-430, 411-431, 411-431, 412-431, 411-426, 411-427, 411-430, 411-437, 412-428, 412-431, 412-427, 413-432, 413-428, 413-429, 413-433, 411-427, 414-427, 414-429, 414-430, 414-433, 415-427, 415-428, 415-429, 415-430, 415-431, 415-434, 416-435, 416-432, 416-431, 416-429, 417-432, 417-433, 417-436, 418-437, 418-435, 418-434, 418-433, 419-435, 419-434, 420-435, 419-432, 419-434, 421-436, 422-441, 422-437, 423-436, 425-465, 454-473, 454-472, 457-476, 454-476, 455-472, 457-485, 457-473, 457-472, 458-485, 458-483, 458-477, 458-473, 459-485, 460-485, 463-498, 463-485, 466-485, 463-482, 457-491, 458-491, 459-491, 460-491, 463-491, 466-491, 472-491, 472-493, 473-492, 475-491, 459-494, 460-494, 463-494, 466-494, 467-498, 472-494, 475-494, 457-473, 457-472, 458-494, 454-494, 457-494, 457-473, 485-513, 470-493, 476-519, 485-519, 500-519, 512-534, 512-550, 524-546, 536-559, 548-567, 548-570, 550-570, 548-594, 554-573, 548-576, 560-594, 584-606, 611-645, 617-363, 623-642, 617-645, 639-654, 641-656, 642-657, 642-754, 643-658, 653-672, 662-685, 665-685,665-689, 668-687, 670-689, 670-706, 670-685, 670-686, 671-686, 671-687, 671-690, 671-691, 672-687, 672-688, 672-693, 672-697, 672-707, 673-688, 674-693, 678-693, 679-707, 679-694, 679-698, 679-701, 679-702, 679-707, 680-699, 679-699, 680-695, 681-696, 682-706, 682-707, 682-702, 682-701, 682-697, 683-698, 684-699, 685-700, 686-701, 687-702, 687-703, 687-706, 687-754, 688-703, 688-704, 689-704, 689-705, 689-709, 689-710, 690-705, 690-706, 691-706, 679-705, 679-710, 679-706, 690-710, 691-710, 690-754, 690-706, 684-703, 687-705, 687-703, 687-706, 688-705, 689-708, 690-709, 692-711, 693-716, 693-712, 695-715, 697-716, 697-716, 690-716, 724-746, 724-752, 724-754, 724-758, 733-752, 738-753, 738-754, 739-758, 739-754, 739-775, 739-754, 740-754, 742-785, 742-773, 757-776, 757-785, 790-815, 793-812, 811-833, 811-844, 814-833, 811-906, 820-839, 822-844, 822-867, 823-842, 845-864, 845-867, 854-906, 845-909, 845-906, 854-876, 854-873, 863-882, 863-885, 878-900, 878-897, 887-906, 899-918, 899-933, 899-958, 905-927, 905-933, 914-933, 936-958, 936-955, 945-964, 951-970, 951-985, 951-1044, 951-1024, 951-1056, 951-997, 960-985, 963-1044, 963-1024, 963-997, 966-985, 972-1015, 978-997, 1025-1044, 1031-1056, 1037-1056, 1046-1083, 1049-1068, 1070-1089, 1070-1095, 1082-1101, 1081-1134, 1081-1143, 1082-1101, 1088-1107, 1088-1134, 1094-1119, 1097-1119, 1112-1134, 1118-1143, 1118-1146, 1088-1146, 1121-1140, 1127-1146, 1127-1193, 1150-1193, 1156-1187, 1165-1187, 1170-1192, 1171-1191, 1172-1191, 1176-1192, 1177-1192, 1176-1191, 1203-1297, 1206-1228, 1206-1255, 1209-1228, 1215-1255, 1215-1234, 1218-1237, 1221-1240, 1224-1243, 1227-1246, 1230-1249, 1233-1252, 1236-1255, 1245-1265, 1251-1280, 1251-1285, 1251-1270, 1254-1273, 1254-1279, 1257-1276, 1258-1277, 1259-1296, 1259-1290, 1259-1287, 1260-1279, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1261-1296, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1262-1285, 1262-1296, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1264-1297, 1265-1280, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1268-1296, 1269-1284, 1269-1285, 1269-1288, 1270-1285, 1271-1290, 1271-1296, 1277-1296, 1261-1290, 1262-1290, 1268-1290, 1263-1305, 1259-1305, 1259-1305, 1266-1305, 1259-1302, 1275-1294, 1281-1306, 1281-1324, 1281-1336, 1782-1797, 1282-1301, 1286-1306, 1290-1324, 1293-1318, 1290-1324, 1293-1315, 1296-1315, 1311-1336, 1311-1333, 1326-1345, 1353-1381, 1359-1378, 1395-1414, 1498-1532, 1498-1523, 1498-1535, 1510-1529, 1515-1535, 1515-1563, 1515-1596, 1515-1605, 1515-1602, 1515-1540, 1515-1535, 1518-1605, 1518-1602, 1518-1537, 1521-1563, 1521-1540, 1550-1655, 1550-1563, 1550-1569, 1553-1578, 1553-1599, 1553-1590, 1565-1584, 1571-1595, 1577-1606, 1577-1605, 1577-1596, 1577-1592, 1577-1593, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1578-1598, 1579-1594, 1579-1595, 1579-1598, 1571-1598, 1580-1605, 1580-1602, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1582-1602, 1553-1655, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1602, 1586-1605, 1586-1652, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1642-1664, 1651-1720, 1651-1673, 1655-1679, 1695-1720, 1716-1738, 1743-1763, 1743-1768, 1764-1783, 1773-1792, 1777-1796, 1777-1800, 1778-1800, 1778-1793, 1778-1794, 1778-1797, 1779-1798, 1779-1797, 1779-1796, 1779-1795, 1779-1794, 1780-1796, 1781-1797, 1781-1796, 1781-1800, 1781-1797, 1782-1799, 1784-1800, 1779-1799, 1778-1794, 1779-1795, 1780-1799, 1794-1813, 1780-1795, 1780-1796, 1780-1799, 1781-1796, 1781-1797, 1781-1800, 1782-1798, 1783-1799, 1784-1799, 1784-1800, 1785-1800, 1806-1837, 1806-1828, 1806-1825, 1809-1828, 1812-1843, 1812-1837, 1812-1831, 1815-1843, 1815-1844, 1815-1840, 1815-1834, 1818-1837, 1821-1840, 1821-1844, 1821-1837, 1822-1843, 1822-1839, 1823-1843, 1827-1846, 1861-1884, 1861-1880, 1865-1885, 1867-1886, 1869-1885, 1876-1895, 1888-1914, 1888-1908, 1891-1910, 1891-1914, 1895-1938, 1895-1935, 1913-1935, 1898-1920, 1907-1929, 1913-1935, 1918-1934, 1919-1938, 1919-1934, 1921-1934, 1928-1956, 1957-1976, 2035-2057, 2083-2141, 2230-2261, 2278-2297, 2281-2300, 2284-2303, 2368-2393, 2381-2397, 2368-2394, 2379-2394, 2381-2396, 2368-2397, 2368-2396, 2420-2439, 2458-2476, 2459-2478, 2819-2838, 2818-2838, 2873-2892 и 3161-3182.
В некоторых вариантах реализации, следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1, при направленном действии антисмысловых соединений или олигонуклеотидов, демонстрируют по меньшей мере 60% ингибирование: 1-20, 10-29, 10-53, 13-38, 25-50, 43-68, 55-74, 58-84, 58-77, 58-74, 58-73, 58-79, 59-80, 59-74, 59-75, 60-75, 60-76, 61-77, 61-76, 61-80, 62-77, 68-114, 98-123, 101-123, 113-138, 116-138, 131-150, 137-162, 152-186, 191-215, 196-224, 196-215, 199-228, 199-218, 200-223, 199-218, 205-224, 206-228, 218-237, 224-243, 233-263, 244-263, 245-264, 247-266, 250-265, 251-266, 252-267, 253-272, 253-269, 251-267, 253-274, 254-270, 255-276, 256-279, 256-276, 256-274, 256-272, 256-271, 258-273, 259-274, 265-388, 265-284, 266-291, 266-288, 260-279, 281-321, 281-303, 290-321, 290-312, 293-312, 296-315, 302-321, 324-343, 339-367, 339-361, 342-367, 348-367, 358-392, 358-378, 360-392, 360-379, 366-392, 366-385, 369-388, 370-392, 382-401, 405-428, 405-424, 409-428, 411-436, 411-433, 411-431, 411-426, 411-430, 411-427, 412-431, 412-428, 412-427, 413-428, 413-429, 413-433, 414-433, 414-430, 414-429, 414-433, 415-430, 415-431, 415-434, 415-435, 415-436, 416-429, 416-434, 416-431, 416-432, 416-436, 416-435, 417-436, 417-433, 417-432, 418-434, 418-433, 418-437, 419-434, 420-435, 421-436, 422-437, 423-436, 425-465, 454-472, 455-472, 457-476, 457-472, 457-473, 458-485, 458-473, 458-483, 463-498, 467-498, 463-482, 470-493, 472-491, 485-519, 485-513, 500-519, 512-534, 524-546, 536-558, 548-567, 554-573, 548-576, 560-594, 584-606, 608-648, 639-654, 640-656, 641-656, 642-657, 642-658, 643-658, 653-672, 662-685, 665-685, 670-706, 670-689, 670-685, 670-686, 671-690, 671-686, 671-687, 672-707, 672-697, 672-693, 672-687, 672-688, 673-688, 679-707, 679-698, 679-694, 680-695, 681-696, 682-697, 682-701, 683-698, 684-699, 685-700, 686-701, 687-754, 687-702, 687-705, 687-703, 687-706, 688-704, 688-703, 688-704, 688-705, 688-707, 689-710, 689-709, 689-705, 689-704, 690-754, 690-705, 690-706, 691-706, 691-710, 692-711, 697-716, 724-758, 724-754, 724-752, 724-746, 738-754, 738-753, 739-754, 742-785, 757-785, 790-815, 811-906, 811-844, 811-833, 822-867, 822-844, 823-842, 845-867, 854-906, 854-873, 878-897, 899-958, 899-933, 936-958, 945-964, 951-1044, 951-1024, 951-985, 951-997, 963-1044, 963-1024, 963-997, 966-985, 978-997, 1031-1056, 1046-1083, 1070-1095, 1081-1143, 1081-1134, 1082-1101, 1088-1146, 1088-1134, 1118-1146, 1118-1143, 1127-1193, 1170-1189, 1176-1192, 1176-1191, 1177-1192, 1203-1297, 1206-1255, 1209-1228, 1215-1234, 1218-1237, 1221-1240, 1224-1243, 1227-1246, 1230-1249, 1233-1252, 1236-1255, 1251-1270, 1251-1285, 1254-1273, 1254-1279, 1257-1276, 1258-1277, 1259-1278, 1260-1279, 1261-1276, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1281, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1297, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1265-1280, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1268-1287, 1269-1284, 1269-1285, 1270-1285, 1281-1336, 1281-1324, 1281-1306, 1286-1305, 1290-1324, 1311-1336, 1326-1345, 1353-1381, 1395-1414, 1498-1535, 1498-1532, 1515-1535, 1515-1534, 1521-1540, 1550-1655, 1553-1599, 1553-1590, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1579-1594, 1579-1595, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1602, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1642-1664, 1651-1720, 1716-1738, 1743-1763, 1764-1783, 1773-1792, 1777-1800, 1777-1797, 1655-1674, 1778-1794, 1778-1800, 1781-1800, 1781-1797, 1784-1800, 1779-1799, 1778-1794, 1778-1797, 1779-1795, 1779-1798, 1780-1795, 1780-1796, 1780-1799, 1781-1796, 1781-1797, 1781-1800, 1782-1797, 1794-1813, 1806-1837, 1806-1825, 1812-1837, 1812-1831, 1815-1844, 1815-1834, 1818-1837, 1821-1837, 1822-1838, 1827-1846, 1861-1884, 1821-1840, 1866-1885, 1867-1886, 1888-1914, 1888-1907, 1891-1914, 1895-1938, 1895-1935, 1919-1938, 1928-1956, 1957-1976, 2035-2057, 2083-2141, 2230-2261, 2278-2297, 2281-2300, 2284-2303, 2368-2397, 2368-2396, 2368-2394, 2368-2393, 2379-2394, 2381-2396, 2420-2439, 2458-2476, 2819-2838, 2873-2892 и 3161-3182.
В некоторых вариантах реализации, следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1, при направленном действии антисмысловых соединений или олигонуклеотидов, демонстрируют по меньшей мере 65% ингибирование: 1-20, 10-29, 10-53, 13-38, 25-50, 43-68, 55-74, 58-84, 58-79, 58-74, 58-73, 58-77, 59-75, 59-80, 58-77, 60-75, 60-76, 61-77, 61-76, 61-80, 62-77, 68-114, 98-123, 101-123, 113-138, 116-138, 131-150, 137-162, 152-186, 191-215, 196-215, 199-228, 199-218, 200-223,199-218, 205-224, 206-228, 218-237, 224-243, 233-263, 244-263, 245-264, 250-265, 251-266, 253-269, 253-274, 255-276, 256-279, 256-276, 256-274, 256-272, 256-271, 247-266, 253-272, 258-273, 266-291, 266-288, 260-279, 281-321, 281-303, 290-321, 290-312, 296-315, 293-312, 302-321, 324-343, 339-367, 339-361, 342-367, 348-367, 358-392, 358-378, 360-392, 360-379, 366-392, 366-385, 369-388, 370-392, 382-401, 405-428, 405-424, 409-428, 411-433, 411-431, 411-430, 411-427, 411-426, 412-431, 412-428, 412-427, 413-433, 413-428, 413-429, 413-432, 414-433, 414-430, 414-429, 415-430, 415-431, 415-434, 415-435, 415-436, 416-434, 416-436, 416-435, 416-432, 416-431, 417-436, 417-433, 417-432, 418-433, 418-434, 418-437, 420-435, 422-437, 423-436, 425-465, 454-472, 455-472, 457-472, 458-485, 458-483, 458-473, 463-498, 467-498, 457-476, 470-493, 472-491, 485-519, 485-513, 500-519, 512-534, 524-546, 536-558, 548-567, 554-573, 548-576, 560-594, 584-606, 608-648, 639-654, 640-656, 641-656, 642-657, 642-658, 643-658, 653-672, 662-685, 665-685, 670-685, 670-706, 670-689, 670-686, 670-685, 671-686, 671-687, 671-690, 672-688, 672-687, 672-707, 672-697, 672-693, 673-688, 679-698, 680-695, 681-696, 682-697, 682-701, 683-698, 684-699, 685-700, 686-701, 687-702, 688-703, 688-707, 687-754, 690-754, 690-706, 690-705, 687-705, 687-703, 687-706, 687-702, 688-705, 688-703, 688-704, 689-705, 691-706, 692-711, 697-716, 724-758, 724-754, 724-752, 724-746, 738-754, 739-754, 742-785, 757-785, 790-815, 811-906, 811-844, 811-833, 822-867, 822-844, 823-842, 845-867, 854-906, 854-873, 878-897, 899-958, 899-933, 936-958, 945-964, 951-1044, 951-1024, 951-985, 951-997, 963-1044, 963-1024, 963-997, 966-985, 978-997, 1031-1056, 1046-1083, 1070-1095, 1081-1143, 1081-1134, 1082-1101, 1088-1146, 1088-1134, 1118-1146, 1118-1143, 1127-1193, 1170-1189, 1176-1192, 1177-1192, 1203-1297, 1206-1255, 1209-1228, 1215-1234, 1218-1237, 1221-1240, 1224-1243, 1227-1246, 1230-1249, 1233-1252, 1236-1255, 1251-1270, 1251-1285, 1254-1273, 1254-1279, 1257-1276, 1258-1277, 1259-1278, 1260-1279, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1281, 1262-1277, 1262-1278, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1297, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1265-1280, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1268-1287, 1269-1284, 1269-1285, 1270-1285, 1281-1336, 1281-1324, 1281-1306, 1290-1324, 1311-1336, 1326-1345, 1353-1381, 1395-1414, 1498-1535, 1498-1532, 1515-1535, 1515-1534, 1550-1655, 1553-1599, 1553-1590, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1579-1594, 1579-1595, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1602, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1642-1664, 1651-1720, 1655-1674, 1716-1738, 1743-1763, 1764-1783, 1773-1792, 1777-1800, 1777-1797, 1778-1800, 1778-1797, 1779-1799, 1778-1794, 1779-1794, 1779-1795, 1779-1798, 1780-1796, 1780-1799, 1780-1795, 1781-1796, 1781-1797, 1781-1800, 1782-1797, 1794-1813, 1806-1837, 1806-1825, 1812-1837, 1812-1831, 1815-1844, 1815-1834, 1818-1837, 1821-1837, 1822-1838, 1827-1846, 1861-1884, 1866-1885, 1867-1886, 1888-1914, 1888-1907, 1891-1914, 1895-1938, 1895-1935, 1919-1938, 1928-1956, 1957-1976, 2035-2057, 2083-2141, 2230-2261, 2278-2297, 2281-2300, 2284-2303, 2368-2397, 2368-2396, 2368-2394, 2368-2393, 2379-2394, 2381-2396, 2420-2439, 2458-2476, 2819-2838, 2873-2892 и 3161-3182.
В некоторых вариантах реализации, следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1, при направленном действии антисмысловых соединений или олигонуклеотидов, демонстрируют по меньшей мере 70% ингибирование: 1-20, 10-29, 10-53, 13-38, 25-50, 43-68, 55-74, 58-84, 58-79, 58-74, 59-75, 59-80, 58-77, 60-75, 60-76, 61-77, 68-114, 98-123, 101-123, 113-138, 116-138, 131-150, 137-162, 152-186, 191-215, 199-228, 199-218, 200-223, 205-224, 206-228, 218-237, 224-243, 233-263, 244-263, 245-264, 253-269, 253-274, 255-276, 256-279, 256-276, 256-274, 256-272, 247-266, 250-265, 251-266, 253-272, 256-271, 266-291, 266-288, 260-279, 281-321, 281-303, 290-321, 290-312, 293-312, 302-321, 324-343, 339-367, 339-361, 342-367, 348-367, 358-392, 358-378, 360-392, 360-379, 366-392, 366-385, 370-392, 382-401, 405-428, 405-424, 409-428, 411-433, 411-431, 411-430, 411-427, 411-426, 412-431, 412-428, 412-427, 413-428, 413-429, 413-432, 414-433, 414-430, 414-429, 415-430, 414-433, 415-434, 415-435, 415-436, 416-431, 416-434, 416-436, 416-435, 416-432, 417-436, 417-433, 418-433, 418-437, 423-436, 425-465, 454-472, 455-472, 457-472, 457-476, 458-473, 458-485, 458-483, 463-498, 467-498, 457-476, 470-493, 470-493, 472-491, 485-519, 485-513, 485-519, 485-513, 500-519, 512-534, 524-546, 536-558, 548-567, 554-573, 548-576, 560-594, 584-606, 608-648, 639-654, 640-656, 641-656, 642-657, 642-658, 643-658, 653-672, 662-685, 665-685, 670-706, 670-689, 670-685, 670-686, 671-690, 671-686, 671-687, 672-687, 672-688, 672-707, 672-697, 672-693, 673-688, 679-698, 681-696, 682-697, 682-701, 683-698, 684-699, 686-701, 687-702, 687-754, 687-702, 688-703, 690-754, 690-706, 687-705, 687-703, 687-706, 692-711, 697-716, 724-758, 724-754, 724-752, 724-746, 738-754, 739-754, 738-754, 742-785, 757-785, 790-815, 811-906, 811-844, 811-833, 822-867, 822-844, 845-867, 854-906, 854-873, 878-897, 899-958, 899-933, 936-958, 945-964, 951-1044, 951-1024, 951-985, 951-997, 963-1044, 963-1024, 963-997, 966-985, 978-997, 1031-1056, 1046-1083, 1070-1095, 1081-1143, 1081-1134, 1082-1101, 1088-1146, 1088-1134, 1118-1146, 1118-1143, 1127-1193, 1170-1189, 1176-1192, 1177-1192, 1203-1297, 1206-1255, 1209-1228, 1215-1234, 1218-1237, 1221-1240, 1224-1243, 1227-1246, 1230-1249, 1233-1252, 1236-1255, 1251-1285, 1251-1270, 1254-1273, 1254-1279, 1257-1276, 1258-1277, 1259-1278, 1260-1279, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1281, 1262-1277, 1262-1278, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1297, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1268-1287, 1269-1284, 1269-1285, 1270-1285, 1281-1336, 1281-1324, 1281-1306, 1290-1324, 1311-1336, 1326-1345, 1353-1381, 1395-1414, 1498-1535, 1498-1532, 1515-1535, 1550-1655, 1553-1599, 1553-1590, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1579-1594, 1579-1595, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1602, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1642-1664, 1651-1720, 1716-1738, 1743-1763, 1764-1783, 1773-1792, 1777-1800, 1777-1797, 1778-1800, 1778-1797, 1779-1799, 1778-1794, 1779-1795, 1779-1798, 1780-1795, 1780-1796, 1780-1799, 1781-1800, 1782-1797, 1794-1813, 1806-1837, 1806-1825, 1812-1837, 1812-1831, 1815-1844, 1815-1834, 1818-1837, 1821-1837, 1822-1838, 1827-1846, 1861-1884, 1866-1885, 1867-1886, 1888-1914, 1888-1907, 1891-1914, 1895-1938, 1895-1935, 1919-1938, 1928-1956, 1957-1976, 2035-2057, 2083-2141, 2230-2261, 2278-2297, 2281-2300, 2284-2303, 2368-2397, 2368-2396, 2368-2394, 2368-2393, 2379-2394, 2381-2396, 2420-2439, 2458-2476, 2819-2838, 2873-2892 и 3161-3182.
В некоторых вариантах реализации, следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1, при направленном действии антисмысловых соединений или олигонуклеотидов, демонстрируют по меньшей мере 75% ингибирование: 13-32, 16-35, 19-38, 25-44, 28-47, 31-50, 43-62, 46-65, 49-68, 55-74, 58-82, 58-74, 58-77, 59-75, 60-75, 60-76, 61-77, 65-84, 98-117, 101-120, 104-123, 116-135, 119-138, 131-150, 137-156, 140-159, 143-162, 158-177, 161-180, 164-183, 167-186,200-219,203-226, 209-228, 218-237, 233-252, 236-255, 239-258, 242-264, 247-266, 251-266, 253-272, 255-276, 266-285, 269-288, 281-300, 284-303, 290-313, 298-317, 302-321, 324-343, 339-358, 342-361, 348-367, 358-381, 364-383, 366-386, 370-389, 373-392, 382-401, 405-424, 409-428, 411-430, 411-426, 411-427, 412-427, 412-431, 413-428, 413-429, 413-432, 414-436, 414-430, 414-429, 415-430, 416-431, 416-432, 417-433, 418-437, 422-441, 425-444, 428-447, 434-453, 440-459, 443-462, 446-465, 456-477, 458-473, 464-483, 470-493, 476-495, 479-498, 488-507, 491-510, 494-513, 500-519, 512-531, 515-534, 524-543, 527-546, 536-555, 539-558, 560-579, 566-585, 569-588, 572-591, 575-594, 584-603, 587-606, 608-627, 614-633, 617-636, 620-639, 623-642, 626-645, 629-648, 639-654, 641-656, 642-657, 643-658, 653-672, 665-684, 668-688, 670-706, 670-686, 670-685, 671-691, 671-687, 671-686, 672-688, 673-688, 679-703, 681-696, 682-697, 686-701, 686-706, 687-702, 687-703, 688-703, 689-708, 693-712, 695-714, 696-715, 697-716, 727-746, 739-754, 742-761, 748-767, 751-770, 754-773, 757-776, 760-779, 763-782, 766-785, 790-809, 793-812, 796-815, 811-830, 814-833, 817-836, 820-839, 822-844, 845-864, 854-873, 857-876, 863-882, 866-885, 872-891, 875-894, 878-897, 881-900, 884-903, 887-906, 899-918, 902-921, 905-924, 908-927, 911-930, 914-933, 936-955, 939-958, 951-970, 954-973, 957-976, 960-979, 963-982, 966-985, 969-988, 972-991, 975-994, 978-997, 996-1015, 1002-1021, 1025-1044, 1031-1050, 1034-1053, 1037-1056, 1046-1065, 1049-1068, 1052-1071, 1055-1074, 1058-1077, 1061-1080, 1064-1083, 1070-1089, 1073-1092, 1076-1095, 1082-1101, 1088-1107, 1094-1113, 1097-1116, 1100-1119, 1103-1122, 1106-1125, 1109-1128, 1112-1131, 1115-1134, 1121-1140, 1127-1146, 1153-1172, 1156-1175, 1159-1178, 1162-1181, 1165-1184, 1168-1191, 1174-1193, 1206-1225, 1209-1228, 1212-1231, 1215-1234, 1218-1237, 1221-1240, 1224-1243, 1227-1246, 1230-1249, 1233-1252, 1236-1255, 1239-1258, 1242-1261, 1245-1264, 1251-1270, 1254-1273, 1254-1279, 1257-1283, 1257-1276, 1258-1277, 1260-1279, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1277, 1262-1278, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1268-1287, 1269-1284, 1269-1285, 1270-1285, 1272-1291, 1275-1294, 1282-1303, 1286-1306, 1290-1309, 1293-1312, 1296-1315, 1299-1318, 1305-1324, 1311-1330, 1314-1333, 1317-1336, 1353-1381, 1356-1375, 1359-1378, 1498-1517, 1501-1520, 1504-1523, 1510-1529, 1553-1572, 1556-1575, 1559-1578, 1562-1581, 1565-1584, 1571-1590, 1574-1599, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1579-1594, 1579-1595, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1582-1602, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1605, 1586-1602, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1604-1623, 1607-1626, 1630-1649, 1633-1652, 1645-1664, 1651-1670, 1654-1674, 1657-1676, 1660-1679, 1663-1682, 1666-1685, 1689-1708, 1695-1714, 1698-1717, 1701-1720, 1716-1735, 1778-1797, 1778-1794, 1778-1797, 1779-1795, 1779-1798, 1780-1795, 1780-1796, 1780-1799, 1781-1800, 1794-1813, 1895-1914, 1898-1917, 1901-1920, 1907-1926, 1910-1929, 1913-1932, 1916-1935, 1919-1938, 2278-2297, 2281-2300 и 2284-2303.
В некоторых вариантах реализации, следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1, при направленном действии антисмысловых соединений или олигонуклеотидов, демонстрируют по меньшей мере 80% ингибирование: 13-32, 16-35, 19-38, 25-44, 28-47, 46-65, 49-68, 58-77, 59-80, 63-82, 98-120, 116-135, 137-159, 158-177, 167-186, 203-224, 205-224, 209-228, 218-237, 233-252, 236-263, 245-264, 253-272, 256-275, 257-276, 266-288, 281-300, 290-312, 293-312, 324-343, 339-358, 348-367, 358-378, 360-379, 361-383, 366-385, 373-392, 382-401, 405-424, 411-431, 411-426, 411-427, 411-430, 413-428, 414-433, 414-434, 415-430, 415-434, 416-431, 416-435, 417-436, 418-437, 422-441, 425-444, 434-453, 456-476, 458-473, 458-477, 464-483, 471-493, 488-507, 494-513, 512-531, 524-543, 527-546, 536-558, 560-579, 566-585, 572-591, 575-594, 584-603, 587-606, 608-627, 614-633, 617-636, 620-639, 623-642, 626-645, 629-648, 639-654, 641-656, 642-657, 643-658, 665-688, 670-687, 670-686, 671-686, 671-687, 671-691, 673-688, 679-699, 682-697, 682-706, 686-701, 687-702, 687-706, 687-703, 693-715, 727-746, 742-761, 748-767, 757-776, 766-785, 790-815, 814-833, 820-839, 822-844, 845-864, 854-873, 854-876, 863-885, 872-906, 878-897, 899-918, 905-933, 936-955, 951-979, 963-985, 966-985, 972-1015, 978-997, 1002-1021, 1025-1044, 1031-1056, 1049-1074, 1061-1083, 1070-1089, 1082-1101, 1088-11107, 1094-1119, 1109-1134, 1121-1140, 1127-1146, 1159-1187, 1171-1191, 1206-1228, 1209-1228, 1215-1255, 1215-1234, 1218-1237, 1221-1240, 1224-1243, 1227-1246, 1230-1249, 1233-1252, 1236-1255, 1245-1264, 1251-1279, 1251-1270, 1254-1273, 1254-1279, 1257-1276, 1258-1277, 1259-1278, 1260-1279, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1263-1278, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1283, 1265-1284, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1269-1284, 1269-1285, 1269-1288, 1270-1285, 1275-1294, 1282-1301, 1286-1306, 1293-1318, 1311-1333, 1326-1345, 1359-1378, 1553-1578, 1565-1584, 1571-1590, 1574-1599, 1577-1592, 1577-1596, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1579-1595, 1579-1598, 1580-1596, 1580-1599, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1601, 1582-1602, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1603, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1606, 1588-1603, 1589-1604, 1589-1605, 1657-1679, 1780-1795, 1780-1796, 1780-1799, 1913-1935, 2278-2297, 2281-2300 и 2284-2303.
В некоторых вариантах реализации, следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1, при направленном действии антисмысловых соединений или олигонуклеотидов, демонстрируют по меньшей мере 85% ингибирование: 13-32, 16-35, 19-38, 25-44, 46-65, 59-80, 101-120, 140-159, 158-177, 167-186, 200-219, 205-224, 209-228, 233-252, 242-263, 253-272, 266-285, 281-300, 290-311, 293-312, 359-379, 361-381, 370-389, 382-401, 411-426, 411-430, 411-427, 413-428, 414-433, 415-430, 416-435, 417-436, 422-441, 456-476, 458-473, 470-493, 512-531, 524-543, 536-558, 566-585, 575-594, 587-606, 608-627, 614-636, 623-645, 639-654, 665-687, 671-686, 671-687, 680-699, 682-703, 687-706, 687-703, 727-746, 742-761, 757-776, 793-812, 822-843, 854-876, 854-873, 863-885, 878-900, 878-897, 887-906, 899-918, 905-927, 914-933, 936-955, 951-985, 966-985, 972-1015, 978-997, 1002-1021, 1025-1044, 1037-1056, 1049-1074, 1064-1083, 1070-1089, 1088-1107, 1094-1119, 1109-1128, 1121-1140, 1156-1175, 1162-1187, 1172-1191, 1206-1228, 1209-1228, 1215-1255, 1215-1234, 1218-1237, 1221-1240, 1224-1243, 1227-1246, 1230-1249, 1233-1252, 1236-1255, 1245-1264, 1251-1279, 1251-1270, 1254-1273, 1254-1279, 1257-1276, 1258-1277, 1259-1278, 1260-1279, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1263-1278, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1283, 1265-1284, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1284, 1269-1284, 1269-1285, 1269-1288, 1270-1285, 1275-1294, 1282-1301, 1293-1315, 1311-1330, 1359-1378, 1574-1593, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1577-1606, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1579-1598, 1580-1596, 1580-1599, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1601, 1583-1598, 1583-1602, 1584-1603, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1605, 1587-1602, 1588-1603, 1780-1799, 1780-1796 и 2278-2297,2281-2300 и 2284-2303.
В некоторых вариантах реализации, следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1, при направленном действии антисмысловых соединений или олигонуклеотидов, демонстрируют по меньшей мере 90% ингибирование: 13-32, 16-35, 60-80, 140-159, 158-177, 167-186, 242-261, 292-311, 362-381, 370-389, 382-401, 411-427, 411-426, 413-428, 415-430, 416-435, 422-441, 473-492, 617-636, 623-642, 639-654, 668-687, 680-699, 682-701, 684-703, 687-706, 727-746, 757-776, 824-843, 854-873, 854-876, 863-882, 878-897, 878-900, 887-906, 899-918, 905-927, 914-933, 936-955, 951-970, 960-985, 966-985, 972-1015, 978-997, 1025-1044, 1037-1056, 1070-1089, 1097-1119, 1109-1128, 1121-1140, 1165-1187, 1172-1191, 1206-1228, 1209-1228, 1215-1234, 1215-1234, 1215-1255, 1218-1237, 1221-1240, 1224-1243, 1227-1246, 1230-1249, 1233-1252, 1236-1255, 1245-1264, 1251-1279, 1251-1270, 1254-1273, 1254-1279, 1257-1276, 1258-1277, 1259-1278, 1260-1279, 1261-1285, 1261-1280, 1262-1278, 1261-1276, 1262-1281, 1262-1277, 1263-1282, 1263-1278, 1264-1283, 1265-1284, 1266-1285, 1268-1284, 1269-1284, 1269-1285, 1269-1288, 1296-1315, 1577-1605, 1577-1596, 1577-1593, 1577-1592, 1578-1597, 1581-1600, 1582-1601, 1583-1602, 1583-1598, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1605, 1588-1603, 1780-1799, 1780-1796, 2278-2297, 2281-2300 и 2284-2303.
В некоторых вариантах реализации, следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1, при направленном действии антисмысловых соединений или олигонуклеотидов, демонстрируют по меньшей мере 95% ингибирование: 411-426, 411-427, 413-428, 617-636, 623-642, 668-687, 680-699, 682-701, 854-873, 878-897, 887-906, 914-933, 966-985, 978-997, 1209-1228, 1215-1234, 1218-1237, 1221-1240, 1224-1243, 1227-1246, 1230-1249, 1233-1252, 1236-1255, 1245-1264, 1251-1270, 1254-1273, 1254-1279, 1257-1276, 1258-1277, 1259-1278, 1260-1279, 1261-1285, 1261-1280, 1262-1281, 1263-1282, 1263-1278, 1264-1283, 1265-1284, 1266-1285, 1268-1284, 1269-1288, 1577-1592, 1577-1596, 1577-1601, 1583-1598, 1585-1601, 1588-1603, 1780-1799, 2278-2297, 2281-2300 и 2284-2303.
В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 50% ингибирование мРНК HBV, ISIS ID: 510088, 510089, 510090, 510092, 510096, 510097, 510098, 510099, 510100, 510101, 510102, 505330, 509928, 510104, 509929, 510105, 509930, 510106, 510107, 510108, 510111, 510115, 509931, 510116, 510117, 510118, 510119, 510120, 510121, 509932, 510122, 509933, 510123, 509934, 510124, 509935, 510125, 510126, 510127, 510128, 510140, 146779, 505314, 505315, 505316, 505317, 146821, 505318, 509922, 505319, 509925, 505320, 509952, 505321, 505322, 505323, 505324, 505325, 505326, 505327, 505328, 505329, 509956, 509957, 509927, 509958, 510038, 505330, 509959, 510039, 509960, 510040, 509961, 510041, 509962, 509963, 505331, 505332, 509968, 509969, 510050, 510052, 505333, 505334, 505335, 505336, 509972, 146823, 509974, 505338, 505339, 509975, 505340, 509978, 505341, 509979, 510058, 505342, 509981, 510061, 505344, 505345, 509983, 505346, 509984, 505347, 505348, 505350, 505352, 505353, 505354, 505355, 505356, 146786, 505357, 505358, 505359, 505360, 509985, 509986, 509987, 509988, 505363, 505364, 505365, 505366, 146787, 510079, 524410, 524411, 524413, 524414, 524415, 524416, 524417, 524418, 524419, 524420, 524421, 524422, 524424, 524425, 524426, 524427, 524428, 524429, 524431, 524432, 524433, 524434, 524435, 524436, 524439, 524440, 524442, 524444, 524446, 524447, 524448, 524450, 524451, 524452, 524453, 524454, 524455, 524456, 524457, 524458, 524459, 524460, 524461, 524462, 524464, 524466, 524467, 524468, 524469, 524470, 524471, 524472, 524473, 524474, 524475, 524477, 524478, 524479, 524480, 524481, 524482, 524483, 524484, 524485, 524486, 524487, 524489, 524490, 524491, 524492, 524493, 524494, 524495, 524496, 524498, 524499, 524500, 524501, 524502, 524503, 524504, 524506, 524507, 524508, 524509, 524510, 524511, 524512, 524513, 524514, 524515, 524516, 524517, 524518, 524519, 524520, 524521, 524522, 524523, 524524, 524525, 524526, 524527, 524528, 524529, 524530, 524531, 524532, 524533, 524534, 524535, 524536, 524537, 524538, 524539, 524540, 524541, 524543, 524544, 524546, 524547, 524548, 524549, 524550, 524551, 524552, 524553, 524554, 524555, 524556, 524557, 524558, 524559, 524560, 524561, 524562, 524563, 524564, 524565, 524568, 524569, 524570, 524571, 524572, 524573, 524574, 524575, 524576, 524577, 524578, 524579, 524580, 524581, 524582, 524584, 524585, 524586, 524587, 524588, 524589, 524590, 524591, 524592, 524593, 524594, 524595, 524598, 524599, 524600, 524601, 524602, 524603, 524604, 524605, 524606, 524607, 524608, 524609, 524610, 524611, 524614, 524615, 524616, 524617, 524618, 524619, 524620, 524621, 524622, 524623, 524624, 524625, 524626, 524627, 524629, 524632, 524633, 524634, 524635, 524636, 524637, 524638, 524639, 524640, 524641, 524642, 524643, 524644, 524646, 524647, 524648, 524649, 524650, 524651, 524652, 524654, 524656, 524657, 524658, 524659, 524660, 524661, 524662, 524663, 524664, 524665, 524666, 524667, 524668, 524669, 524670, 524672, 524673, 524675, 524676, 524678, 524679, 524680, 524682, 524683, 524684, 524685, 524686, 524687, 524688, 524689, 524690, 524691, 524692, 524693, 524694, 524695, 524696, 524697, 524698, 524699, 524700, 524701, 524702, 524703, 524704, 524705, 524706, 524707, 524708, 524709, 524710, 524712, 524713, 524714, 524715, 524716, 524717, 524718, 524719, 524721, 524722, 524723, 524724, 524726, 524727, 524728, 524729, 524730, 524731, 524732, 524733, 524734, 524735, 524736, 524737, 524738, 524739, 524740, 524741, 524742, 524743, 524744, 524745, 524746, 524747, 524748, 524749, 524750, 524751, 524752, 524753, 524754, 524755, 524756, 524757, 524758, 524759, 524760, 524761, 524762, 524763, 524764, 524765, 524766, 524767, 524768, 524769, 524770, 524771, 524772, 524773, 524774, 524775, 524776, 524777, 524778, 524779, 524780, 524781, 524782, 524783, 524784, 524785, 524786, 524787, 524788, 524789, 524790, 524791, 524792, 524793, 524794, 524795, 524796, 524797, 524798, 524799, 524800, 524801, 524802, 524803, 524804, 524805, 524806, 524807, 524808, 524809, 524810, 524811, 524812, 524813, 524814, 524815, 524816, 524817, 524818, 524819, 524820, 524821, 524822, 524823, 524824, 524825, 524826, 524827, 524828, 524829, 524830, 524831, 524632, 524833, 524834, 524835, 524842, 524843, 524844, 524845, 524847, 524848, 524856, 524857, 524861, 524866, 524867, 524868, 524869, 524870, 524871, 524872, 524873, 524875, 524876, 524877, 524878, 524879, 524880, 524881, 524882, 524883, 524884, 524885, 524886, 524887, 524888, 524889, 524890, 524891, 524892, 524893, 524894, 524895, 524896, 524897, 524898, 524899, 524900, 524901, 524902, 524903, 524904, 524905, 524906, 524907, 524908, 524909, 524910, 524911, 524912, 524913, 524914, 524915, 524916, 524917, 524918, 524919, 524921, 524922, 524923, 524924, 524925, 524926, 524927, 524928, 524929, 524930, 524931, 524932, 524933, 524934, 524935, 524936, 524937, 524938, 524939, 524940, 524941, 524942, 524943, 524944, 524945, 524946, 524947, 524948, 524949, 524950, 524951, 524952, 524953, 524954, 524955, 524956, 524957, 524958, 524959, 524960, 524961, 524962, 524964, 524965, 524976, 524977, 524978, 524979, 524980, 524981, 524982, 524983, 524984, 524985, 524986, 524987, 524988, 524989, 524991, 524992, 524993, 524994, 524997, 524998, 525021, 525022, 525037, 525039, 525043, 525050, 525052, 525086, 525090, 525100, 551909, 551910, 551911, 551912, 551913, 551916, 551917, 551918, 551919, 551920, 551921, 551922, 551923, 551924, 551925, 551926, 551927, 551928, 551929, 551930, 551932, 551933, 551934, 551935, 551936, 551937, 551939, 551940, 551941, 551942, 551943, 551944, 551945, 551946, 551947, 551948, 551949, 551950, 551951, 551952, 551953, 551954, 551955, 551956, 551957, 551958, 551959, 551960, 551962, 551963, 551964, 551965, 551966, 551967, 551968, 551971, 551972, 551973, 551974, 551975, 551976, 551977, 551978, 551979, 551980, 551981, 551982, 551983, 551984, 551985, 551986, 551987, 551988, 551989, 551990, 551992, 551993, 551994, 551995, 551996, 551997, 551998, 551999, 552000, 552001, 552002, 552003, 552004, 552005, 552006, 552007, 552009, 552010, 552011, 552012, 552013, 552014, 552015, 552016, 552017, 552018, 552019, 552020, 552021, 552022, 552023, 552024, 552025, 552026, 552027, 552028, 552029, 552030, 552031, 552032, 552033, 552034, 552035, 552036, 552037, 552038, 552039, 552040, 552041, 552042, 552043, 552044, 552045, 552046, 552047, 552048, 552049, 552050, 552051, 552052, 552053, 552054, 552055, 552056, 552057, 552058, 552059, 552060, 552061, 552062, 552063, 552064, 552065, 552067, 552068, 552069, 552070, 552071, 552072, 552073, 552074, 552075, 552076, 552077, 552078, 552079, 552080, 552081, 552082, 552083, 552084, 552085, 552086, 552087, 552088, 552089, 552090, 552091, 552092, 552093, 552094, 552095, 552096, 552097, 552098, 552099, 552100, 552101, 552102, 552114, 552115, 552116, 552117, 552118, 552119, 552122, 552123, 552124, 552125, 552126, 552127, 552128, 552129, 552131, 552132, 552133, 552134, 552135, 552136, 552137, 552138, 552139, 552140, 552141, 552142, 552143, 552144, 552145, 552146, 552147, 552148, 552149, 552150, 552151, 552152, 552153, 552154, 552155, 552158, 552159, 552160, 552161, 552162, 552163, 552164, 552165, 552167, 552168, 552169, 552170, 552171, 552175, 552176, 552177, 552178, 552179, 552180, 552181, 552182, 552183, 552185, 552186, 552187, 552188, 552189, 552191, 552192, 552193, 552194, 552195, 552196, 552197, 552198, 552199, 552200, 552201, 552202, 552203, 552204, 552205, 552206, 552207, 552208, 552209, 552210, 552211, 552212, 552213, 552214, 552215, 552216, 552217, 552218, 552220, 552222, 552224, 552225, 552230, 552239, 552240, 552241, 552242, 552243, 552246, 552247, 552248, 552249, 552250, 552251, 552252, 552253, 552254, 552255, 552256, 552257, 552258, 552259, 552260, 552261, 552262, 552263, 552264, 552265, 552266, 552267, 552268, 552269, 552270, 552271, 552279, 552285, 552288, 552293, 552294, 552295, 552296, 552297, 552300, 552301, 552302, 552303, 552304, 552305, 552306, 552307, 552308, 552309, 552310, 552312, 552313, 552314, 552315, 552316, 552317, 552318, 552319, 552320, 552321, 552322, 552323, 552325, 552326, 552330, 552331, 552332, 552333, 552337, 552338, 552339, 552340, 552341, 552342, 552343, 552344, 552345, 552347, 552348, 552349, 552350, 552351, 552352, 552354, 552355, 552356, 552357, 552358, 552359, 552360, 552361, 552362, 552363, 552364, 552365, 552366, 552367, 552368, 552369, 552370, 552371, 552372, 552373, 552374, 552375, 552376, 552377, 552378, 552379, 552380, 552385, 552386, 552390, 552391, 552393, 552394, 552395, 552396, 552397, 552398, 552399, 552400, 552401, 552402, 552403, 552408, 552409, 552410, 552411, 552412, 552413, 552414, 552415, 552416, 552417, 552418, 552419, 552420, 552421, 552422, 552423, 552424, 552425, 552428, 552430, 552431, 552432, 552433, 552440, 552442, 552443, 552444, 552445, 552446, 552447, 552448, 552449, 552450, 552452, 552453, 552455, 552456, 552458, 552459, 552464, 552465, 552466, 552467, 552468, 552469, 552470, 552471, 552472, 552473, 552474, 552475, 552476, 552477, 552478, 552479, 552480, 552481, 552482, 552484, 552485, 552486, 552487, 552488, 552490, 552491, 552493, 552497, 552499, 552500, 552501, 552502, 552503, 552504, 552505, 552506, 552508, 552509, 552510, 552511, 552512, 552513, 552514, 552515, 552516, 552517, 552520, 552521, 552522, 552523, 552525, 552526, 552527, 552528, 552529, 552530, 552531, 552532, 552533, 552534, 552535, 552538, 552539, 552540, 552541, 552542, 552544, 552547, 552548, 552553, 552554, 552555, 552557, 552558, 552559, 552561, 552562, 552565, 552566, 552567, 552568, 552569, 552570, 552571, 552572, 552576, 552577, 552578, 552579, 552580, 552581, 552582, 552583, 552584, 552585, 552586, 552587, 552588, 552589, 552590, 552591, 552592, 552594, 552595, 552596, 552597, 552598, 552600, 552606, 552608, 552787, 552788, 552789, 552790, 552791, 552794, 552795, 552796, 552797, 552798, 552799, 552800, 552801, 552802, 552803, 552804, 552805, 552806, 552807, 552808, 552809, 552810, 552811, 552812, 552813, 552814, 552815, 552816, 552817, 552818, 552819, 552820, 552821, 552822, 552823, 552824, 552825, 552826, 552827, 552828, 552829, 552830, 552831, 552832, 552833, 552834, 552835, 552836, 552837, 552838, 552839, 552840, 552841, 552842, 552843, 552844, 552845, 552846, 552847, 552848, 552849, 552850, 552851, 552852, 552853, 552854, 552855, 552856, 552857, 552858, 552859, 552860, 552861, 552862, 552863, 552864, 552865, 552866, 552868, 552870, 552871, 552872, 552876, 552889, 552890, 552891, 552892, 552893, 552894, 552895, 552896, 552898, 552899, 552901, 552902, 552903, 552904, 552905, 552907, 552908, 552909, 552910, 552911, 552912, 552913, 552914, 552915, 552916, 552917, 552918, 552919, 552922, 552923, 552925, 552926, 552927, 552928, 552929, 552930, 552931, 552932, 552933, 552934, 552935, 552936, 552937, 552938, 552939, 552940, 552941, 552942, 552943, 552944, 552945, 552946, 552947, 552948, 552950, 552951, 552953, 552954, 552955, 552956, 552957, 552958, 552959, 552960, 552961, 552965, 552966, 552969, 552970, 552971, 552972, 552973, 552974, 552975, 552976, 552977, 552979, 552980, 552981, 552982, 552983, 552984, 552987, 552988, 552989, 552990, 552991, 552992, 552993, 552994, 552995, 552996, 552997, 552998, 552999, 553000, 553001, 553002, 553003, 553004, 553005, 553006, 553007, 553008, 553009, 553010, 553011, 553012, 553014, 553015, 553016, 566828, 566829, 566830, 566831, 566832, 577120, 577121, 577122, 577123, 577124, 577125, 577126, 577127, 577128, 577129, 577130, 577131, 577132, 577133, 577134, 577135, 577136, 582665 и 582666.
В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 50% ингибирование мРНК HBV, SEQ ID NO:5, 6, 7, 9, 10, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 33, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 74, 83, 85, 86, 87, 88, 89, 92, 96, 98, 99, 100, 102, 103, 104, 106, 108, 109, 111, 112, 115, 117,121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 136, 137, 139, 140, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 153, 155, 157, 159, 161, 165, 166, 167, 168, 169, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 197, 198, 199, 201, 203, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 215, 217, 218, 220, 221, 222, 224, 225, 226, 227, 228, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 240, 241, 242, 243, 244, 250, 283, 321, 322, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 350, 351, 353, 355, 357, 358, 359, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 416, 417, 418, 419, 420 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 453, 454, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 473, 474, 475, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 534, 535, 536, 537, 539, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 562, 564, 566, 567, 568, 569, 570, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 582, 583, 585, 586, 588, 589, 590, 592, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600, 601, 602, 603, 604, 605, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613, 614, 615, 616, 617, 618, 619, 620, 622, 623, 624, 625, 626, 627, 628, 629, 631, 632, 633, 634, 636, 637, 638, 639, 640, 641, 642, 643, 644, 645, 646, 647, 648, 649, 650, 651, 652, 653, 654, 655, 656, 657, 658, 659, 660, 661, 662, 663, 664, 665, 666, 667, 668, 669, 670, 671, 672, 673, 674, 675, 676, 677, 678, 679, 680, 681, 682, 683, 684, 685, 686, 687, 688, 689, 690, 691, 692, 693, 694, 695, 696, 697, 698, 699, 700, 701, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 710, 711, 712, 713, 714, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 724, 725, 726, 727, 728, 729, 730, 731, 732, 733, 734, 735, 736, 737, 738, 739, 740, 741, 742, 743, 744, 745, 746, 747, 754, 755, 756, 757, 759, 760, 768, 769, 773, 777, 778, 779, 780, 781, 782, 783, 784, 786, 787, 788, 789, 790, 791, 792, 793, 794, 795, 796, 797, 798, 799, 800, 801, 802, 803, 804, 805, 806, 807, 808, 809, 810, 811, 812, 813, 814, 815, 816, 817, 818, 819, 820, 821, 822, 823, 824, 825, 826, 827, 828, 829, 830, 831, 833, 834, 835, 836, 837, 838, 839, 840, 841, 842, 843, 844, 845, 846, 847, 848, 849, 850, 851, 852, 853, 854, 855, 856, 857, 858, 859, 860, 861, 862, 863, 864, 865, 866, 867, 868, 869, 870, 871, 872, 873, 874, 876, 877, 888, 889, 890, 891, 892, 893, 894, 895, 896, 897, 898, 899, 900, 901, 903, 904, 905, 906, 909, 910, 933, 934, 949, 951, 955, 962, 964, 998, 1002, 1013, 1052, 1267, 1271, 1272, 1288, 1289, 1290, 1291, 1292, 1293, 1294, 1295, 1296, 1297, 1298, 1299, 1300, 1301, 1302, 1303, 1304, 1305, 1306, 1307, 1308, 1309, 1310, 1311, 1312, 1313, 1314, 1315, 1316, 1317, 1318, 1319, 1320, 1321, 1322, 1323, 1324, 1325, 1326, 1327, 1328, 1329, 1330, 1331, 1332, 1333, 1334, 1335, 1336, 1337, 1338, 1339, 1340, 1341, 1342, 1343, 1344, 1345, 1346, 1347, 1348, 1349, 1350, 1364, 1365, 1366, 1367, 1368, 1369, 1370, 1371, 1372, 1375 и 1376.
В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 60% ингибирование мРНК HBV, ISIS ID: 510090, 510100, 510102, 505330, 509928, 510104, 509929, 510105, 509930, 510106, 510107, 510111, 509931, 510116, 510117, 510118, 510119, 510120, 510121, 509932, 510122, 509933, 510123, 509934, 510124, 509935, 510125, 510128, 146779, 505314, 505315, 505316, 505317, 146821, 505318, 505319, 505322, 505323, 505324, 505325, 505326, 505327, 505328, 505329, 509956, 509957, 509958, 505330, 509959, 510041, 505332, 509968, 505333, 505335, 146823, 509974, 505338, 505339, 509975, 505340, 505341, 509979, 505342, 509981, 505344, 505345, 509983, 505346, 509984, 505347, 505348, 505353, 505354, 505356, 146786, 505357, 505358, 505359, 505360, 509985, 509986, 505363, 505366, 524410, 524413, 524414, 524415, 524416, 524417, 524418, 524419, 524420, 524421, 524422, 524424, 524425, 524426, 524428, 524431, 524432, 524433, 524434, 524435, 524439, 524440, 524446, 524447, 524448, 524451, 524452, 524453, 524454, 524455, 524456, 524457, 524459, 524460, 524461, 524464, 524466, 524467, 524468, 524469, 524471, 524472, 524473, 524474, 524475, 524477, 524478, 524479, 524480, 524481, 524482, 524485, 524486, 524487, 524489, 524490, 524491, 524492, 524493, 524494, 524495, 524496, 524499, 524500, 524501, 524502, 524503, 524504, 524506, 524507, 524508, 524509, 524510, 524511, 524512, 524513, 524514, 524515, 524516, 524517, 524519, 524520, 524521, 524523, 524525, 524526, 524527, 524528, 524529, 524532, 524533, 524534, 524535, 524536, 524537, 524538, 524539, 524540, 524541, 524543, 524546, 524547, 524549, 524550, 524552, 524553, 524554, 524555, 524556, 524557, 524558, 524559, 524560, 524561, 524562, 524563, 524564, 524565, 524568, 524569, 524570, 524571, 524572, 524573, 524574, 524575, 524576, 524577, 524578, 524579, 524580, 524581, 524582, 524585, 524586, 524587, 524588, 524589, 524590, 524591, 524593, 524594, 524595, 524598, 524599, 524600, 524602, 524603, 524604, 524605, 524606, 524607, 524610, 524611, 524614, 524615, 524616, 524617, 524618, 524619, 524620, 524621, 524622, 524623, 524625, 524627, 524629, 524632, 524633, 524634, 524635, 524636, 524637, 524638, 524639, 524640, 524641, 524642, 524643, 524644, 524646, 524647, 524648, 524649, 524650, 524651, 524654, 524656, 524657, 524658, 524659, 524661, 524662, 524663, 524664, 524665, 524666, 524667, 524668, 524669, 524670, 524673, 524675, 524676, 524678, 524679, 524680, 524683, 524684, 524685, 524686, 524687, 524688, 524689, 524690, 524691, 524692, 524694, 524695, 524696, 524697, 524698, 524699, 524700, 524701, 524702, 524703, 524704, 524705, 524706, 524707, 524708, 524709, 524710, 524713, 524714, 524715, 524716, 524717, 524718, 524719, 524721, 524722, 524724, 524726, 524727, 524728, 524729, 524730, 524731, 524732, 524733, 524734, 524735, 524736, 524737, 524738, 524739, 524741, 524742, 524743, 524744, 524746, 524747, 524748, 524749, 524750, 524751, 524752, 524753, 524754, 524755, 524756, 524757, 524758, 524759, 524760, 524761, 524762, 524763, 524764, 524765, 524766, 524767, 524768, 524769, 524770, 524771, 524772, 524773, 524774, 524775, 524776, 524777, 524778, 524779, 524780, 524781, 524782, 524783, 524784, 524785, 524787, 524788, 524789, 524790, 524791, 524792, 524793, 524794, 524795, 524796, 524797, 524798, 524799, 524800, 524801, 524802, 524803, 524804, 524805, 524806, 524807, 524808, 524809, 524810, 524811, 524812, 524813, 524814, 524815, 524816, 524817, 524818, 524819, 524820, 524821, 524822, 524823, 524824, 524825, 524826, 524827, 524828, 524829, 524830, 524632, 524833, 524842, 524843, 524844, 524845, 524847, 524856, 524866, 524867, 524868, 524869, 524870, 524871, 524872, 524873, 524876, 524878, 524879, 524880, 524881, 524882, 524883, 524884, 524885, 524886, 524887, 524888, 524889, 524890, 524891, 524892, 524893, 524894, 524895, 524896, 524897, 524898, 524899, 524900, 524901, 524902, 524903, 524904, 524905, 524906, 524907, 524908, 524909, 524910, 524911, 524912, 524913, 524914, 524915, 524916, 524921, 524922, 524923, 524924, 524925, 524926, 524928, 524929, 524930, 524931, 524932, 524933, 524936, 524937, 524938, 524939, 524940, 524941, 524942, 524944, 524946, 524947, 524948, 524949, 524950, 524952, 524953, 524954, 524955, 524961, 524977, 524978, 524979, 524980, 524981, 524982, 524983, 524984, 524985, 524986, 524987, 524988, 524991, 524992, 524993, 524994, 525037, 525052, 551909, 551911, 551919, 551920, 551921, 551922, 551924, 551925, 551926, 551927, 551928, 551932, 551933, 551934, 551935, 551936, 551941, 551943, 551944, 551948, 551949, 551950, 551951, 551952, 551953, 551954, 551955, 551956, 551957, 551958, 551959, 551960, 551962, 551963, 551965, 551966, 551967, 551968, 551973, 551975, 551979, 551981, 551982, 551983, 551984, 551985, 551986, 551987, 551989, 551990, 551992, 551993, 551994, 551995, 551996, 551997, 551998, 551999, 552000, 552001, 552002, 552003, 552005, 552006, 552007, 552009, 552010, 552012, 552013, 552014, 552015, 552016, 552017, 552018, 552019, 552020, 552021, 552022, 552023, 552024, 552025, 552026, 552027, 552028, 552029, 552030, 552031, 552032, 552033, 552034, 552035, 552036, 552038, 552039, 552041, 552042, 552044, 552045, 552046, 552047, 552048, 552049, 552050, 552051, 552052, 552053, 552054, 552055, 552056, 552057, 552058, 552059, 552060, 552061, 552062, 552063, 552064, 552065, 552068, 552069, 552070, 552071, 552073, 552074, 552075, 552076, 552077, 552078, 552079, 552080, 552081, 552082, 552083, 552084, 552085, 552086, 552087, 552088, 552089, 552090, 552091, 552092, 552093, 552094, 552095, 552096, 552097, 552098, 552099, 552100, 552101, 552102, 552114, 552115, 552116, 552117, 552118, 552119, 552123, 552124, 552125, 552126, 552127, 552128, 552129, 552131, 552132, 552133, 552134, 552135, 552136, 552138, 552139, 552140, 552141, 552143, 552144, 552145, 552146, 552147, 552148, 552149, 552150, 552151, 552152, 552153, 552155, 552158, 552159, 552160, 552162, 552163, 552168, 552169, 552170, 552171, 552176, 552178, 552179, 552180, 552182, 552183, 552185, 552187, 552188, 552191, 552192, 552193, 552194, 552195, 552196, 552197, 552198, 552199, 552200, 552201, 552202, 552203, 552204, 552205, 552206, 552207, 552208, 552209, 552210, 552211, 552212, 552213, 552214, 552215, 552216, 552222, 552224, 552225, 552239, 552240, 552242, 552246, 552247, 552248, 552252, 552253, 552254, 552255, 552256, 552257, 552258, 552259, 552261, 552263, 552265, 552266, 552268, 552285, 552293, 552294, 552295, 552296, 552301, 552302, 552303, 552306, 552307, 552308, 552309, 552310, 552312, 552313, 552314, 552315, 552316, 552317, 552318, 552320, 552321, 552322, 552323, 552325, 552326, 552331, 552332, 552337, 552338, 552339, 552340, 552343, 552345, 552347, 552348, 552349, 552351, 552354, 552355, 552356, 552358, 552359, 552360, 552361, 552362, 552363, 552364, 552365, 552366, 552367, 552368, 552369, 552370, 552371, 552372, 552373, 552374, 552375, 552376, 552377, 552378, 552379, 552396, 552397, 552398, 552403, 552408, 552409, 552410, 552411, 552412, 552414, 552416, 552418, 552419, 552420, 552421, 552422, 552423, 552424, 552431, 552442, 552445, 552449, 552455, 552456, 552459, 552464, 552465, 552466, 552467, 552469, 552472, 552473, 552474, 552475, 552477, 552478, 552479, 552480, 552484, 552487, 552497, 552508, 552509, 552511, 552512, 552515, 552516, 552520, 552521, 552522, 552523, 552526, 552527, 552528, 552529, 552530, 552531, 552534, 552540, 552541, 552542, 552559, 552567, 552568, 552569, 552570, 552572, 552576, 552577, 552578, 552579, 552582, 552583, 552584, 552585, 552586, 552587, 552588, 552590, 552595, 552596, 552597, 552788, 552789, 552790, 552791, 552796, 552800, 552801, 552803, 552804, 552805, 552806, 552807, 552808, 552809, 552811, 552812, 552813, 552814, 552815, 552816, 552817, 552818, 552819, 552820, 552821, 552822, 552823, 552824, 552826, 552827, 552828, 552829, 552830, 552831, 552832, 552833, 552834, 552835, 552836, 552837, 552838, 552839, 552841, 552842, 552843, 552844, 552845, 552846, 552847, 552848, 552849, 552850, 552851, 552852, 552853, 552854, 552855, 552856, 552857, 552858, 552859, 552860, 552861, 552862, 552863, 552864, 552865, 552866, 552872, 552891, 552892, 552893, 552894, 552902, 552903, 552904, 552905, 552907, 552908, 552909, 552910, 552911, 552912, 552913, 552914, 552915, 552916, 552917, 552918, 552922, 552923, 552925, 552927, 552928, 552929, 552930, 552931, 552932, 552933, 552934, 552935, 552936, 552937, 552938, 552939, 552940, 552941, 552942, 552943, 552944, 552945, 552946, 552951, 552955, 552956, 552957, 552958, 552960, 552961, 552966, 552969, 552971, 552972, 552973, 552974, 552975, 552976, 552977, 552979, 552980, 552981, 552982, 552983, 552984, 552988, 552989, 552990, 552991, 552992, 552993, 552994, 552995, 552996, 552998, 552999, 553000, 553001, 553002, 553003, 553004, 553005, 553006, 553007, 553008, 553009, 553010, 553011, 553012, 553016, 566828, 566829, 566830, 566831, 566832, 577120, 577121, 577122, 577123, 577124, 577125, 577126, 577127, 577128, 577129, 577130, 577131, 577132, 577133, 577134, 577135, 577136 и 582666.
В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 60% ингибирование мРНК HBV, SEQ ID NO:7, 9, 10, 12, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 33, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 56, 83, 85, 86, 87, 88, 89, 92, 96, 98, 100, 102, 103, 112, 115, 117, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 136, 137, 139, 140, 142, 143, 145, 147, 149, 150, 151, 153, 155, 157, 159, 161, 166, 167, 168, 172, 174, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 198, 199, 201, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 218, 220, 222, 224, 225, 226, 227, 228, 230, 231, 232, 233, 234, 240, 243, 321, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 335, 336, 337, 339, 342, 343, 344, 345, 346, 350, 351, 357, 358, 359, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 370, 371, 372, 375, 376, 377, 378, 379, 381, 382, 383, 384, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 395, 396, 397, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 416, 417, 418, 419, 420 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 429, 430, 431, 433, 435, 436, 437, 438, 439, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 453, 456, 457, 459, 460, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 473, 474, 475, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 503, 504, 505, 508, 509, 510, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 520, 521, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 535, 537, 539, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 564, 566, 567, 568, 569, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 583, 585, 586, 588, 589, 590, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600, 601, 602, 604, 605, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613, 614, 615, 616, 617, 618, 619, 620, 623, 624, 625, 626, 627, 628, 629, 631, 632, 634, 636, 637, 638, 639, 640, 641, 642, 643, 644, 645, 646, 647, 648, 649, 650, 652, 653, 654, 655, 657, 658, 659, 660, 661, 662, 663, 664, 665, 666, 667, 668, 669, 670, 671, 672, 673, 674, 675, 676, 677, 678, 679, 680, 681, 682, 683, 684, 685, 686, 687, 688, 689, 690, 691, 692, 693, 694, 695, 696, 698, 699, 700, 701, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 710, 711, 712, 713, 714, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 724, 725, 726, 727, 728, 729, 730, 731, 732, 733, 734, 735, 736, 737, 738, 740, 741, 742, 744, 745, 754, 755, 756, 757, 759, 768, 777, 778, 779, 780, 781, 782, 783, 784, 787, 789, 790, 791, 792, 793, 794, 795, 796, 797, 798, 799, 800, 801, 802, 803, 804, 805, 806, 807, 808, 809, 810, 811, 812, 813, 814, 815, 816, 817, 818, 819, 820, 821, 822, 823, 824, 825, 826, 827, 828, 833, 834, 835, 836, 837, 838, 840, 841, 842, 843, 844, 845, 848, 849, 850, 851, 852, 853, 854, 856, 858, 859, 860, 861, 862, 864, 865, 866, 867, 873, 889, 890, 891, 892, 893, 894, 895, 896, 897, 898, 899, 900, 903, 904, 905, 906, 949, 964, 1271, 1288, 1289, 1290, 1291, 1292, 1293, 1294, 1295, 1296, 1297, 1298, 1299, 1300, 1301, 1302, 1303, 1304, 1305, 1306, 1307, 1308, 1309, 1310, 1311, 1312, 1313, 1314, 1315, 1316, 1317, 1318, 1319, 1320, 1321, 1322, 1323, 1324, 1325, 1326, 1327, 1328, 1329, 1330, 1331, 1332, 1333, 1334, 1335, 1336, 1337, 1338, 1339, 1340, 1341, 1342, 1343, 1344, 1345, 1346, 1347, 1348, 1349, 1350, 1365, 1366, 1367, 1368, 1369, 1370, 1371, 1372 и 1376.
В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 70% ингибирование мРНК HBV, ISIS ID: 510100, 505330, 509928, 509929, 509930, 510106, 509931, 510116, 510119, 510120, 510121, 509932, 510122, 509933, 510123, 509934, 510124, 509935, 146779, 505317, 146821, 505318, 505319, 505323, 505325, 505326, 505327, 509957, 505330, 505332, 505335, 509974, 505338, 505339, 509975, 505342, 509981, 505345, 505346, 505347, 505348, 146786, 505357, 505358, 505359, 505363, 524410, 524413, 524414, 524415, 524416, 524418, 524419, 524420, 524421, 524424, 524425, 524426, 524428, 524431, 524432, 524433, 524434, 524435, 524446, 524447, 524448, 524452, 524453, 524457, 524459, 524460, 524461, 524464, 524466, 524467, 524468, 524469, 524472, 524473, 524474, 524475, 524477, 524478, 524479, 524480, 524481, 524482, 524485, 524487, 524490, 524491, 524492, 524493, 524494, 524495, 524499, 524500, 524502, 524503, 524507, 524508, 524510, 524511, 524512, 524513, 524514, 524515, 524516, 524517, 524520, 524525, 524526, 524528, 524532, 524533, 524534, 524535, 524536, 524537, 524538, 524539, 524540, 524541, 524547, 524549, 524552, 524553, 524554, 524555, 524556, 524557, 524558, 524559, 524560, 524561, 524563, 524564, 524565, 524568, 524569, 524570, 524571, 524572, 524573, 524574, 524575, 524577, 524578, 524579, 524580, 524582, 524586, 524587, 524590, 524591, 524594, 524595, 524598, 524600, 524602, 524603, 524604, 524605, 524606, 524607, 524610, 524611, 524614, 524615, 524616, 524617, 524618, 524619, 524620, 524621, 524629, 524633, 524634, 524635, 524636, 524637, 524638, 524641, 524642, 524643, 524644, 524646, 524647, 524648, 524649, 524650, 524651, 524656, 524657, 524659, 524661, 524662, 524663, 524664, 524665, 524666, 524667, 524668, 524669, 524670, 524678, 524679, 524680, 524685, 524686, 524687, 524688, 524689, 524690, 524691, 524692, 524695, 524696, 524698, 524699, 524700, 524701, 524702, 524703, 524704, 524705, 524706, 524707, 524708, 524709, 524713, 524714, 524715, 524716, 524717, 524718, 524721, 524722, 524724, 524726, 524727, 524728, 524729, 524730, 524731, 524732, 524733, 524734, 524735, 524736, 524737, 524738, 524739, 524741, 524742, 524743, 524746, 524747, 524748, 524749, 524750, 524751, 524752, 524754, 524755, 524756, 524758, 524760, 524761, 524762, 524763, 524764, 524765, 524766, 524767, 524768, 524769, 524771, 524773, 524775, 524776, 524777, 524778, 524779, 524780, 524781, 524782, 524783, 524784, 524785, 524787, 524788, 524789, 524790, 524791, 524792, 524793, 524794, 524795, 524796, 524797, 524798, 524799, 524800, 524801, 524802, 524803, 524804, 524805, 524806, 524807, 524808, 524809, 524810, 524811, 524812, 524813, 524814, 524815, 524816, 524817, 524818, 524819, 524821, 524822, 524823, 524824, 524825, 524826, 524827, 524828, 524829, 524830, 524833, 524842, 524843, 524844, 524845, 524856, 524866, 524867, 524868, 524869, 524870, 524871, 524873, 524879, 524880, 524881, 524882, 524883, 524884, 524885, 524886, 524887, 524888, 524889, 524890, 524891, 524892, 524893, 524894, 524895, 524896, 524897, 524898, 524899, 524900, 524902, 524903, 524905, 524906, 524907, 524908, 524909, 524910, 524911, 524912, 524913, 524914, 524915, 524916, 524921, 524922, 524930, 524931, 524932, 524937, 524940, 524942, 524948, 524980, 524981, 524982, 524983, 524984, 524985, 524986, 524987, 524988, 551919, 551921, 551922, 551924, 551925, 551926, 551933, 551941, 551950, 551951, 551952, 551953, 551955, 551956, 551957, 551958, 551966, 551983, 551984, 551985, 551986, 551987, 551989, 551990, 551992, 551993, 551994, 551995, 551996, 551997, 551998, 551999, 552000, 552005, 552006, 552009, 552012, 552013, 552014, 552015, 552017, 552018, 552019, 552020, 552021, 552022, 552023, 552024, 552025, 552026, 552027, 552028, 552029, 552030, 552031, 552032, 552033, 552034, 552038, 552039, 552041, 552044, 552046, 552047, 552049, 552050, 552051, 552052, 552053, 552054, 552055, 552056, 552057, 552058, 552059, 552060, 552061, 552062, 552063, 552064, 552065, 552068, 552069, 552070, 552071, 552073, 552074, 552075, 552076, 552077, 552078, 552079, 552080, 552081, 552082, 552083, 552084, 552085, 552086, 552087, 552088, 552089, 552090, 552091, 552092, 552093, 552094, 552095, 552096, 552097, 552098, 552099, 552100, 552101, 552115, 552117, 552123, 552125, 552127, 552128, 552129, 552132, 552133, 552138, 552139, 552140, 552141, 552143, 552144, 552145, 552146, 552147, 552148, 552149, 552150, 552151, 552152, 552158, 552159, 552160, 552163, 552168, 552179, 552187, 552188, 552192, 552193, 552195, 552199, 552200, 552201, 552202, 552203, 552204, 552205, 552206, 552207, 552208, 552210, 552211, 552213, 552214, 552222, 552246, 552247, 552248, 552253, 552254, 552255, 552258, 552294, 552301, 552302, 552306, 552307, 552308, 552309, 552310, 552312, 552314, 552315, 552317, 552318, 552321, 552322, 552323, 552325, 552332, 552337, 552339, 552347, 552348, 552349, 552354, 552355, 552358, 552359, 552360, 552361, 552362, 552363, 552364, 552365, 552366, 552367, 552368, 552369, 552371, 552373, 552374, 552375, 552376, 552377, 552378, 552379, 552403, 552408, 552409, 552411, 552418, 552419, 552420, 552424, 552442, 552464, 552465, 552466, 552467, 552472, 552474, 552475, 552477, 552478, 552521, 552522, 552523, 552527, 552528, 552529, 552530, 552534, 552567, 552578, 552579, 552584, 552586, 552587, 552588, 552590, 552789, 552803, 552804, 552805, 552808, 552816, 552817, 552818, 552819, 552820, 552821, 552822, 552823, 552824, 552828, 552829, 552830, 552833, 552834, 552835, 552842, 552843, 552844, 552846, 552848, 552849, 552850, 552851, 552852, 552853, 552854, 552855, 552856, 552857, 552858, 552859, 552860, 552861, 552863, 552864, 552865, 552872, 552894, 552903, 552904, 552907, 552909, 552910, 552911, 552913, 552914, 552915, 552916, 552917, 552918, 552922, 552923, 552925, 552927, 552928, 552929, 552930, 552931, 552932, 552933, 552934, 552935, 552936, 552937, 552938, 552939, 552940, 552941, 552942, 552943, 552944, 552945, 552946, 552957, 552961, 552966, 552969, 552971, 552972, 552974, 552976, 552979, 552980, 552981, 552983, 552984, 552988, 552989, 552990, 552991, 552995, 552996, 552998, 552999, 553001, 553002, 553003, 553004, 553006, 553008, 553009, 553010, 553011, 553012, 566828, 566829, 566830, 566831, 566832, 577120, 577121, 577122, 577123, 577124, 577125, 577126, 577127, 577128, 577129, 577130, 577131, 577132, 577133, 577134, 577135, 577136 и 582666.
В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 70% ингибирование мРНК HBV, SEQ ID NO:12, 17, 18, 20, 21, 22, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 39, 40, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 83, 89, 92, 96, 98, 100, 103, 112, 123, 125, 126, 127, 136, 137, 139, 140, 142, 143, 145, 147, 149, 151, 153, 166, 167, 168, 174, 176, 177, 178, 179, 181, 186, 187, 188, 190, 198, 201, 207, 209, 210, 211, 212, 213, 224, 225, 226, 227, 232, 234, 240, 321, 324, 325, 326, 327, 329, 330, 331, 332, 335, 336, 337, 339, 342, 343, 344, 345, 346, 357, 358, 359, 363, 364, 368, 370, 371, 372, 375, 376, 377, 378, 379, 382, 383, 384, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 395, 397, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 409, 410, 412, 413, 417, 418, 420 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 430, 435, 436, 438, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 457, 459, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 473, 474, 475, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 487, 488, 489, 490, 492, 496, 497, 500, 501, 504, 505, 508, 510, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 520, 521, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 539, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 566, 567, 569, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 588, 589, 590, 595, 596, 597, 598, 599, 600, 601, 602, 605, 606, 608, 609, 610, 611, 612, 613, 614, 615, 616, 617, 618, 619, 623, 624, 625, 626, 627, 628, 631, 632, 634, 636, 637, 638, 639, 640, 641, 642, 643, 644, 645, 646, 647, 648, 649, 650, 652, 653, 654, 657, 658, 659, 660, 661, 662, 663, 665, 666, 667, 669, 671, 672, 673, 674, 675, 676, 677, 678, 679, 680, 682, 684, 686, 687, 688, 689, 690, 691, 692, 693, 694, 695, 696, 698, 699, 700, 701, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 710, 711, 712, 713, 714, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 724, 725, 726, 727, 728, 729, 730, 731, 733, 734, 735, 736, 737, 738, 740, 741, 742, 745, 754, 755, 756, 757, 768, 777, 778, 779, 780, 781, 782, 784, 790, 791, 792, 793, 794, 795, 796, 797, 798, 799, 800, 801, 802, 803, 804, 805, 806, 807, 808, 809, 810, 811, 812, 814, 815, 817, 818, 819, 820, 821, 822, 823, 824, 825, 826, 827, 828, 833, 834, 842, 843, 844, 849, 852, 854, 860, 892, 893, 894, 895, 896, 897, 898, 899, 900, 1288, 1289, 1290, 1291, 1292, 1293, 1294, 1295, 1296, 1297, 1298, 1299, 1300, 1301, 1302, 1303, 1304, 1305, 1306, 1307, 1308, 1309, 1310, 1311, 1312, 1313, 1314, 1315, 1316, 1317, 1320, 1322, 1323, 1324, 1325, 1326, 1327, 1329, 1330, 1331, 1332, 1333, 1334, 1335, 1336, 1337, 1338, 1340, 1341, 1342, 1343, 1344, 1345, 1346, 1347, 1348, 1349 и 1350, 1367, 1368, 1369, 1370, 1372 и 1376.
В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 80% ингибирование мРНК HBV, ISIS ID: 510100, 509931, 510116, 505317, 505319, 505323, 505326, 505327, 505330, 505339, 505346, 505347, 505358, 509934, 146786, 524414, 524415, 524416, 524418, 524419, 524425, 524426, 524431, 524432, 524434, 524446, 524447, 524452, 524459, 524460, 524466, 524469, 524475, 524477, 524478, 524479, 524482, 524485, 524490, 524491, 524492, 524493, 524494, 524495, 524499, 524502, 524503, 524507, 524510, 524511, 524512, 524520, 524525, 524528, 524532, 524533, 524534, 524535, 524536, 524540, 524541, 524547, 524552, 524553, 524556, 524561, 524564, 524565, 524568, 524570, 524571, 524572, 524573, 524578, 524580, 524586, 524590, 524591, 524594, 524595, 524602, 524604, 524606, 524607, 524610, 524611, 524614, 524616, 524617, 524618, 524619, 524620, 524621, 524633, 524634, 524635, 524636, 524637, 524641, 524643, 524644, 524646, 524649, 524650, 524651, 524657, 524662, 524664, 524667, 524670, 524678, 524679, 524680, 524686, 524688, 524690, 524691, 524692, 524695, 524698, 524699, 524701, 524702, 524704, 524705, 524706, 524707, 524708, 524709, 524713, 524715, 524716, 524717, 524718, 524721, 524726, 524727, 524728, 524729, 524730, 524731, 524733, 524734, 524735, 524737, 524739, 524741, 524742, 524743, 524747, 524748, 524749, 524751, 524752, 524754, 524758, 524760, 524762, 524763, 524764, 524767, 524768, 524769, 524771, 524773, 524777, 524778, 524779, 524780, 524781, 524783, 524784, 524788, 524789, 524791, 524792, 524793, 524794, 524795, 524796, 524797, 524798, 524801, 524803, 524804, 524805, 524806, 524807, 524808, 524809, 524810, 524811, 524813, 524816, 524819, 524822, 524823, 524824, 524827, 524828, 524829, 524833, 524842, 524844, 524880, 524881, 524882, 524884, 524886, 524887, 524888, 524889, 524890, 524891, 524893, 524907, 524908, 524980, 524986, 524987, 551921, 551924, 551925, 551953, 551956, 551957, 551984, 551986, 551987, 551989, 551990, 551993, 551994, 551995, 551996, 551997, 551998, 551999, 552000, 552005, 552006, 552018, 552019, 552020, 552021, 552022, 552023, 552024, 552025, 552026, 552027, 552028, 552029, 552030, 552031, 552032, 552033, 552034, 552039, 552044, 552046, 552050, 552051, 552052, 552053, 552054, 552055, 552056, 552057, 552058, 552059, 552060, 552061, 552062, 552063, 552064, 552065, 552073, 552077, 552078, 552079, 552080, 552082, 552083, 552084, 552085, 552086, 552087, 552088, 552089, 552090, 552091, 552092, 552093, 552094, 552095, 552096, 552097, 552098, 552138, 552139, 552145, 552146, 552147, 552149, 552192, 552193, 552199, 552200, 552201, 552207, 552246, 552247, 552253, 552301, 552307, 552308, 552310, 552317, 552347, 552348, 552354, 552355, 552360, 552361, 552362, 552363, 552364, 552365, 552366, 552367, 552371, 552375, 552464, 552465, 552521, 552808, 552816, 552817, 552818, 552819, 552820, 552822, 552824, 552834, 552844, 552849, 552850, 552851, 552852, 552853, 552854, 552916, 552922, 552923, 552925, 552930, 552931, 552932, 552933, 552936, 552937, 552938, 552939, 552942, 552943, 552944, 552980, 552988, 552989, 552996, 552998, 553002, 553003, 566828, 566829, 566830, 566831, 566832, 577120, 577121, 577122, 577123, 577124, 577125, 577126, 577127, 577128, 577130, 577131, 577132, 577133, 577134, 577135, 577136 и 582666.
В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 80% ингибирование мРНК HBV, SEQ ID NO:17, 20, 22, 24, 26, 28, 39, 40, 50, 51, 83, 89, 103, 123, 126, 127, 136, 137, 143, 147, 149, 168, 176, 177, 178, 179, 187, 188, 210, 211, 212, 224, 225, 226, 227, 232, 325, 326, 327, 329, 330, 336, 337, 342, 343, 345, 357, 358, 363, 370, 371, 376, 379, 387, 388, 389, 392, 395, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 409, 412, 413, 417, 420 421, 422, 430, 435, 438, 442, 443, 444, 445, 446, 450, 451, 457, 462, 463, 466, 474, 475, 478, 480, 481, 482, 483, 488, 490, 496, 500, 501, 504, 505, 512, 514, 516, 517, 520, 521, 524, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 543, 544, 545, 546, 547, 551, 553, 554, 555, 559, 560, 561, 567, 572, 574, 577, 580, 588, 589, 590, 596, 598, 600, 601, 602, 605, 608, 609, 611, 612, 614, 615, 616, 617, 618, 619, 623, 625, 626, 627, 628, 631, 636, 637, 638, 639, 640, 641, 643, 644, 645, 646, 648, 650, 652, 653, 654, 658, 659, 660, 662, 663, 665, 669, 671, 673, 674, 675, 678, 679, 680, 682, 684, 688, 689, 690, 691, 692, 694, 695, 699, 700, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 712, 714, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 725, 728, 731, 734, 735, 736, 740, 741, 745, 756, 791, 792, 793, 795, 797, 798, 799, 800, 801, 802, 804, 805, 806, 807, 819, 820, 892, 898, 899, 1292, 1293, 1295, 1296, 1301, 1302, 1303, 1304, 1305, 1306, 1307, 1308, 1310, 1312, 1316, 1322, 1324, 1325, 1326, 1327, 1330, 1331, 1332, 1333, 1334, 1335, 1338, 1339, 1340, 1341, 1344, 1345, 1349, 1350, 1368, 1372 и 1376.
В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 90% ингибирование мРНК HBV, ISIS ID: 524414, 524415, 524432, 524460, 524466, 524469, 524475, 524477, 524493, 524512, 524535, 524540, 524552, 524561, 524572, 524617, 524619, 524634, 524641, 524644, 524657, 524667, 524691, 524698, 524699, 524701, 524706, 524707, 524709, 524713, 524715, 524716, 524718, 524721, 524726, 524729, 524730, 524731, 524733, 524734, 524735, 524739, 524743, 524754, 524763, 524764, 524767, 524771, 524780, 524781, 524784, 524788, 524789, 524791, 524792, 524793, 524794, 524795, 524796, 524797, 524798, 524801, 524803, 524804, 524805, 524806, 524807, 524808, 524809, 524810, 524811, 524822, 524827, 524842, 551986, 551987, 551989, 552005, 552018, 552019, 552020, 552021, 552022, 552023, 552025, 552046, 552050, 552051, 552052, 552053, 552054, 552055, 552057, 552082, 552083, 552084, 552085, 552086, 552087, 552088, 552089, 552092, 552093, 552096, 552097, 552307, 552317, 552355, 552361, 552362, 552363, 552817, 552851, 552922, 552923, 566828, 566829, 566830, 566831, 566832, 577120, 577121, 577122, 577123, 577124, 577125, 577126, 577127, 577128, 577130, 577131, 577132, 577134, 577135, 577136 и 582666.
В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 90% ингибирование мРНК HBV, SEQ ID NO:17, 24, 50, 51, 137, 143, 147, 176, 211, 212, 224, 226, 227, 325, 326, 343, 371, 376, 379, 403, 422, 445, 450, 462, 482, 527, 529, 544, 551, 554, 567, 577, 601, 608, 609, 611, 616, 617, 619, 623, 625, 626, 628, 631, 636, 639, 640, 641, 643, 644, 645, 646, 650, 654, 665, 674, 675, 678, 682, 691, 692, 695, 699, 700, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 712, 714, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 735, 801, 804, 805, 807, 1296, 1302, 1303, 1304, 1312, 1325, 1326, 1332, 1334, 1340, 1345, 1349 и 1376.
В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 95% ингибирование мРНК HBV, ISIS ID: 524619, 524634, 524641, 505339, 524698, 524709, 524718, 524731, 524734, 524789, 524791, 524792, 524793, 524794, 524795, 524796, 524797, 524798, 524801, 524803, 524804, 524805, 524806, 505346, 146785, 524807, 505347, 524808, 524809, 524810, 524811, 146786, 525101, 525102, 525103, 525107, 525108, 525109, 525110, 525111, 525112, 525113, 525114, 525115, 525116, 525117, 525118, 525119, 525120, 552018, 552050, 552019, 552051, 552020, 552052, 551987, 552021, 552053, 552005, 552022, 552054, 551989, 552023, 552055, 552084, 552085, 552086, 552087, 552088, 552361, 552317, 566831, 577123, 577124, 566830, 566828, 566829, 577127, 577135, 577132, 577136, 566832 и 577122.
В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 95% ингибирование мРНК HBV, SEQ ID NO:17, 50, 137, 143, 187, 210, 212, 224, 529, 544, 551, 608, 619, 628, 641, 645, 700, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 712, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 1014, 1015, 1016, 1020, 1021, 1022, 1023, 1024, 1025, 1026, 1027, 1028, 1029, 1030, 1031, 1032, 1033, 1236, 1302, 1312, 1334, 1340, 1345, 1349.
В некоторых вариантах реализации представлены способы лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния у животного, включающие введение животному, нуждающемуся в этом, соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 10-30 связанных нуклеозидов и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:5-310, 321-802, 804-1272, 1288-1350, 1364-1372, 1375, 1376 и 1379.
В некоторых вариантах реализации представлены способы лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния у животного, включающие введение животному, нуждающемуся в этом, соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 10-30 связанных нуклеозидов и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:17, 51, 86, 93, 95, 98, 100, 102, 104, 106, 109, 112, 115, 117, 137, 140, 143, 145, 147, 149, 151, 153, 155, 157, 159, 161, 167, 168, 176, 177-179, 181, 188, 190-192, 194, 199, 201, 208, 209, 211, 226, 230-237, 244, 245, 247, 252, 254, 256, 258, 260, 262, 264, 266, 271, 1318-1347, 1364-1372, 1375, 1376 и 1379, при чем по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонукеотида включает по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый сахар и/или затрудненный этиловый (cEt) сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3 или 4 нуклеозида с модифицированным сахаром.
В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения экспрессии HBV у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной 10-30 связанных нуклеозидов, направленный на HBV и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:5-310, 321-802, 804-1272, 1288-1350, 1364-1372, 1375, 1376 и 1379.
В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения экспрессии HBV у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной 10-30 связанных нуклеозидов, направленный на HBV и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:17, 51, 86, 93, 95, 98, 100, 102, 104, 106, 109, 112, 115, 117, 137, 140, 143, 145, 147, 149,151, 153, 155, 157, 159, 161, 167, 168, 176, 177-179, 181, 188, 190-192, 194, 199, 201, 208, 209, 211, 226, 230-237, 244, 245, 247, 252, 254, 256, 258, 260, 262, 264, 266, 271, 1318-1347, 1364-1372, 1375 и 1376, причем по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонуклеотида включает по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый сахар и/или затрудненный этиловый (cEt) сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 или 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром.
В некоторых вариантах реализации представлен способ предотвращения, улучшения или лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной 10-30 связанных нуклеозидов, направленный на HBV и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:17, 51, 86, 93, 95, 98, 100, 102, 104, 106, 109, 112, 115, 117, 137, 140, 143, 145, 147, 149, 151, 153, 155, 157, 159, 161, 167, 168, 176, 177-179,181, 188, 190-192, 194, 199, 201, 208, 209, 211, 226, 230-237, 244, 245, 247, 252, 254, 256, 258, 260, 262, 264, 266, 271, 1318-1347, 1364-1372, 1375 и 1376, причем по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонуклеотида включает по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый сахар и/или затрудненный этиловый (cEt) сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 или 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром.
В некоторых вариантах реализации представлены способы лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния у животного, включающие введение животному, нуждающемуся в этом, соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 10-30 связанных нуклеозидов и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:5, 15, 16, 33, 39-95, 123-135, 163-175, 180-310, 321-406, 413-455, 461-802 или 804-1272.
В некоторых вариантах реализации представлены способы лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния у животного, включающие введение животному, нуждающемуся в этом, соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 10-30 связанных нуклеозидов и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:6-14, 17-32, 34-38, 96-122, 136-162, 176-179, 407-412, 456-462, 523-538, причем по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонуклеотида включает по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый сахар.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 14 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-3 или 2 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 или 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 17 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 или 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3-4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4, 5 или 6 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 18 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 3-5 или 4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 20 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 нуклеозидов с модифицированным сахаром.
В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения экспрессии HBV у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной 10-30 связанных нуклеозидов, направленный на HBV и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:5-310, 321-802, 804-1272 или 1288-1350.
В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения экспрессии HBV у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной 10-30 связанных нуклеозидов, направленный на HBV и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:5, 15, 16, 33, 39-95, 123-135, 163-175, 180-310, 321-406, 413-455, 461-802 или 804-1272.
В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения экспрессии HBV у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной 10-30 связанных нуклеозидов, направленный на HBV и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:6-14, 17-32, 34-38, 96-122, 136-162, 176-179, 407-412, 456-462, 523-538, причем по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонуклеотида включает по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый сахар.
В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 14 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-3 или 2 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 или 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 17 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 или 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4, 5 или 6 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 17 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3-4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 18 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 3-5 или 4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 20 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 20 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром.
В некоторых вариантах реализации представлен способ предотвращения, улучшения или лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной от 10 до 30 связанных нуклеозидов, нацеленный на HBV. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной 10-30 связанных нуклеозидов, направленный на HBV и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:5-310, 321-802, 804-1272 или 1288-1350, причем по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонуклеотида содержит по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:5-310, 321-802 или 804-1272. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, включающую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ Ю NO: 5, 15, 16, 33, 39-95, 123-135, 163-175, 180-310, 321-406, 413-455, 461-802 или 804-1272. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:6-14, 17-32, 34-38, 96-122, 136-162, 176-179, 407-412, 456-462, 523-538, причем по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонуклеотида содержит по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 14 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-3 или 2 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 или 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 17 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 или 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4, 5 или 6 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 17 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3-4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 18 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 3-5 или 4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 20 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 20 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром.
Примеры HBV-связанных заболеваний, расстройств или состояний включают, но не ограничиваясь этим, хроническую инфекцию HBV, желтуху, рак печени, воспаление печени, фиброз печени, цирроз печени, печеночную недостаточность, диффузное гепатоцеллюлярное воспалительное заболевание, гемофагоцитарный синдром, серозный гепатит, виремию HBV и состояния, имеющие симптомы, которые могут включать любой или все из следующих: болезнь, похожую на грипп, слабость, боли, головную боль, жар, потерю аппетита, диарею, тошноту и рвоту, боль в области печени, стул земляного или серого цвета, зуд по всему телу и мочу темного цвета, в сочетании с положительным тестом на присутствие вируса гепатита В, вирусного антигена гепатита В или положительным тестом на присутствие антитела, специфичного к вирусному антигену гепатита В.
В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения экспрессии мРНК HBV у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной от 10 до 30 связанных нуклеозидов, нацеленный на HBV. В некоторых вариантах реализации снижение экспрессии мРНК HBV у животного предупреждает, улучшает или лечит HBV-связанное заболевание, расстройство или состояние. В некоторых вариантах реализации снижение экспрессии мРНК HBV у животного предупреждает, улучшает или лечит заболевание печени. В некоторых вариантах реализации экспрессия мРНК HBV снижается по меньшей мере на 5%, 10%, 20%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 100%.
В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения уровня белка HBV у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной от 10 до 30 связанных нуклеозидов, нацеленный на HBV. В некоторых вариантах реализации снижение уровня белка HBV у животного предупреждает, улучшает или лечит HBV-связанное заболевание, расстройство или состояние. В некоторых вариантах реализации снижение уровня белка HBV у животного предупреждает, улучшает или лечит заболевание печени. В некоторых вариантах реализации уровень белка HBV снижается по меньшей мере на 5%, 10%, 20%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 100%.
В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения уровня ДНК HBV у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной от 10 до 30 связанных нуклеозидов, нацеленный на HBV. В некоторых вариантах реализации снижение уровня ДНК HBV у животного предупреждает, улучшает или лечит HBV-связанное заболевание, расстройство или состояние. В некоторых вариантах реализации млекопитающим может быть человек, а вирусом гепатита В может быть вирус гепатита В человека. Более конкретно, вирус гепатита В человека может быть любым из человеческих географических генотипов: А (Северо-Западная Европа, Северная Америка, Центральная Америка); В (Индонезия, Китай, Вьетнам); С (Восточная Азия, Корея, Китай, Япония, Полинезия, Вьетнам); D (Средиземноморский регион, Ближний восток, Индия); Е (Африка); F (коренные американцы, Полинезия); G (Соединенные Штаты, Франция); или Н (Центральная Америка). В некоторых вариантах реализации снижение уровня ДНК HBV у животного предупреждает, улучшает или лечит заболевание печени. В некоторых вариантах реализации уровень ДНК HBV снижается по меньшей мере на 5%, 10%, 20%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 100%.
В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения уровня антигена HBV у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной от 10 до 30 связанных нуклеозидов, нацеленный на HBV. В некоторых вариантах реализации антиген представляет собой HBsAG или HBeAG. В некоторых вариантах реализации снижение уровня антигена HBV у животного предупреждает, улучшает или лечит HBV-связанное заболевание, расстройство или состояние. В некоторых вариантах реализации снижение уровня антигена HBV у животного предупреждает, улучшает или лечит заболевание печени. В некоторых вариантах реализации уровень антигена HBV снижается по меньшей мере на 5%, 10%, 20%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 100%.
В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения уровня ДНК HBV и антигена HBV у животного, инфицированного вирусом гепатита В, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной от 10 до 30 связанных нуклеозидов, нацеленный на HBV. В некоторых вариантах реализации антиген представляет собой HBsAG или HBeAG. В некоторых вариантах реализации количество антигена HBV может быть снижено достаточно для сероконверсии, которую определяют как отсутствие HBeAg в сыворотке плюс присутствие HBeAb в сыворотке, в случае мониторинга HBeAg как определителя сероконверсии, или которую определяют как отсутствие HBsAg в сыворотке, в случае мониторинга HBsAg как определителя сероконверсии, по результатам определения доступных в настоящее время пределов обнаружения коммерческих систем иммуноферментного твердофазного анализа (ELISA).
В некоторых вариантах реализации представлен способ лечения животного с HBV-связанным заболеванием, расстройством или состоянием, включающий: а) идентификацию указанного животного с HBV-связанным заболеванием, расстройством или состоянием, и b) введение указанному животному терапевтически эффективного количества соединения или композиции, содержащей модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 14-20 связанных нуклеозидов и имеющий последовательность нуклеооснований по меньшей мере на 90% комплементарную любой из последовательностей SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, по результатам измерения целостности указанного модифицированного олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации терапевтически эффективное количество соединения или композиции, введенной животному, лечит или уменьшает HBV-связанное заболевание, расстройство или состояние, или его симптом, у животного. В некоторых вариантах реализации HBV-связанное заболевание, расстройство или состояние представляет собой заболевание печени. В некоторых вариантах реализации, связанное заболевание, расстройство или состояние представляет собой хроническую инфекцию HBV, желтуху, рак печени, воспаление печени, фиброз печени, цирроз печени, печеночную недостаточность, диффузное гепатоцеллюлярное воспалительное заболевание, гемофагоцитарный синдром, серозный гепатит, виремию HBV или заболевание печени, связанное с трансплантацией.
В некоторых вариантах реализации представлен способ лечения животного с HBV-связанным заболеванием, расстройством или состоянием, включающий: а) идентификацию указанного животного с HBV-связанным заболеванием, расстройством или состоянием, и b) введение указанному животному терапевтически эффективного количества соединения или композиции, содержащей модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 14-20 связанных нуклеозидов и имеющий последовательность нуклеооснований по меньшей мере на 90% комплементарную последовательности SEQ Ю NO:1, по результатам измерения целостности указанного модифицированного олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации терапевтически эффективное количество соединения или композиции, введенной животному, лечит или уменьшает HBV-связанное заболевание, расстройство или состояние, или его симптом, у животного. В некоторых вариантах реализации HBV-связанное заболевание, расстройство или состояние представляет собой заболевание печени. В некоторых вариантах реализации, связанное заболевание, расстройство или состояние представляет собой хроническую инфекцию HBV, желтуху, рак печени, воспаление печени, фиброз печени, цирроз печени, печеночную недостаточность, диффузное гепатоцеллюлярное воспалительное заболевание, гемофагоцитарный синдром, серозный гепатит, виремию HBV или заболевание печени, связанное с трансплантацией.
В некоторых вариантах реализации HBV имеет последовательность, представленную далее под номером доступа GenBank U95551.1 (включена в настоящий документ как SEQ ID NO:1) или любой ее вариант или фрагмент. В некоторых вариантах реализации HBV имеет усеченные части человеческой последовательности, как представлено далее в SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363.
В некоторых вариантах реализации животное представляет собой человека.
В некоторых вариантах реализации соединения или композиции разработаны в качестве первого средства. В некоторых вариантах реализации способы включают введение первого средства и одного или нескольких вторых средств. В некоторых вариантах реализации способы включают введение первого средства и одного или нескольких вторых средств. В некоторых вариантах реализации первое средство и одно или несколько вторых средство вводят совместно. В некоторых вариантах реализации первое средство и одно или несколько вторых средств вводят совместно последовательно или параллельно.
В некоторых вариантах реализации одно или несколько вторых средств также представляют собой соединение или композицию, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации одно или несколько вторых средств являются отличными от соединения или композиции, описанной в настоящем документе. Примеры одного или нескольких вторых средств включают, но не ограничиваясь этим, противовоспалительное средство, химиотерапевтическое средство или противоинфекционное средство.
В других родственных вариантах реализации, дополнительное терапевтическое средство может быть агентом HBV, агентом HCV, химиотерапевтическим средством, антибиотиком, анальгетиком, нестероидным противовоспалительным средством (NSAID), противогрибковым средством, антипаразитарным средством, средством против тошноты, средством против диареи или иммуноподавляющим средством.
В некоторых вариантах реализации одно или несколько вторых агентов представляют собой агент HBV. В некоторых вариантах реализации агент HBV может включать, но не ограничиваясь этим, интерферон альфа-2b, интерферон альфа-2а и интерферон альфакон-1 (пегилированный и не пегилированный), рибавирин; ингибитор репликации РНК HBV; второй антисмысловый олигомер; терапевтическую вакцину HBV; профилактическую вакцину HBV; ламивудин (3ТС); энтекавир (ETV); тенофовир диизопроксил-фумарат (TDF); телбивудин (LdT); адефовир; или любую терапию HBV антителами (моноклональными или поликлональными).
В некоторых вариантах реализации одно или несколько вторых агентов представляют собой агент HCV. В некоторых вариантах реализации агент HBV может включать, но не ограничиваясь этим, интерферон альфа-2b, интерферон альфа-2а и интерферон альфакон-1 (пегилированный и не пегилированный); рибавирин; ингибитор репликации РНК HCV (например, серии VP50406 производства ViroPharma); антисмысловый агент HCV; терапевтическую вакцину HCV; ингибитор протеазы HCV; ингибитор геликазы HCV; или терапию HCV моноклональными или поликлональными антителами.
В некоторых вариантах реализации одно или несколько вторых средств представляют собой противовоспалительное средство (то есть терапию, снижающую воспаление). В некоторых вариантах реализации терапия, снижающая воспаление, может включать, но не ограничиваясь этим, терапевтическое изменение образа жизни, стероид, NSAID или DMARD. Стероид может быть кортикостероидом. NSAID может быть аспирином, ацетаминофеном, ибупрофеном, напроксеном, ингибиторами СОХ, индометацином и тому подобными. DMARD может быть ингибитором TNF, ингибитором синтеза пурина, ингибитором кальциневрина, ингибитором синтеза пиримидина, сульфасалазином, метотрексатом и тому подобными.
В некоторых вариантах реализации одно или несколько вторых средств представляют собой химиотерапевтическое средство (то есть средство лечения рака). Химиотерапевтические средства могут включать, но не ограничиваясь этим, даунорубицин, дауномицин, дактиномицин, доксорубицин, эпирубицин, идарубицин, эзорубицин, блеомицин, мафосфамид, ифосфамид, цитозин арабинозид, бис-хлорэтилнитрозомочевину, бусульфан, митомицин С, актиномицин D, митрамицин, преднизон, гидроксипрогестерон, тестостерон, тамоксифен, дакарбазин, прокарбазин, гексаметилмеламин, пентаметилмеламин, митоксантрон, амсакрин, хлорамбуцил, метилциклогексилнитрозомочевину, азотные иприты, мелфалан, циклофосфамид, 6-меркаптопурин, 6-тиогуанин, цитарабин (СА), 5-азацитидин, гидроксимочевину, дезоксикоформицин, 4-гидроксипероксициклофосфорамид, 5-фторурацил (5-FU), 5-фтордезоксиуридин (5-FUdR), метотрексат (МТХ), колхицин, таксол, винкристин, винбластин, этопозид, триметрексат, тенипозид, цисплатин, гемцитабин и диэтилстильбэстрол (DES).
В некоторых вариантах реализации одно или несколько вторых агентов представляют собой противоинфекционное средство. Примеры противомикробных средств включают, но не ограничиваясь этим, антибиотики, противогрибковые лекарства и противовирусные лекарства.
В некоторых вариантах реализации, введение включает парентеральное введение.
В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения количества мРНК, ДНК, белка HBV и/или антигена HBV у млекопитающего, инфицированного вирусом гепатита В, включающий введение терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции, описанной выше, млекопитающему, нуждающемуся в этом, для снижения инфекции вируса гепатита В и антигена гепатита В, по сравнению с количеством мРНК, белка HBV и количеством антигена HBV у млекопитающего до лечения. В некоторых вариантах реализации млекопитающим может быть человек, а вирусом гепатита В может быть вирус гепатита В человека. Более конкретно, вирус гепатита В человека может быть любым из человеческих географических генотипов: А (Северо-Западная Европа, Северная Америка, Центральная Америка); В (Индонезия, Китай, Вьетнам); С (Восточная Азия, Корея, Китай, Япония, Полинезия, Вьетнам); D (Средиземноморский регион, Ближний восток, Индия); Е (Африка); F (коренные американцы, Полинезия); G (Соединенные Штаты, Франция); или Н (Центральная Америка).
В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения количества мРНК, ДНК, белка HBV и/или антигена HBV у млекопитающего, инфицированного вирусом гепатита В, включающий введение терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции, описанной выше, млекопитающему, нуждающемуся в этом, для снижения инфекции вируса гепатита В и антигена гепатита В, по сравнению с количеством мРНК, белка HBV и количеством антигена HBV у млекопитающего до лечения, причем количество мРНК снижается по меньшей мере на 70% по сравнению с количеством до введения модифицированного анисмыслового олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения количества мРНК, ДНК, белка HBV и/или антигена HBV у млекопитающего, инфицированного вирусом гепатита В, включающий введение терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции, описанной выше, млекопитающему, нуждающемуся в этом, для снижения инфекции вируса гепатита В и антигена гепатита В, по сравнению с количеством мРНК, белка HBV и количеством антигена HBV у млекопитающего до лечения, причем количество мРНК снижается по меньшей мере на 75% по сравнению с количеством до введения модифицированного анисмыслового олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения количества мРНК, ДНК, белка HBV и/или антигена HBV у млекопитающего, инфицированного вирусом гепатита В, включающий введение терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции, описанной выше, млекопитающему, нуждающемуся в этом, для снижения инфекции вируса гепатита В и антигена гепатита В, по сравнению с количеством мРНК, белка HBV и количеством антигена HBV у млекопитающего до лечения, причем количество мРНК снижается по меньшей мере на 80% по сравнению с количеством до введения модифицированного анисмыслового олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения количества мРНК, ДНК, белка HBV и/или антигена HBV у млекопитающего, инфицированного вирусом гепатита В, включающий введение терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции, описанной выше, млекопитающему, нуждающемуся в этом, для снижения инфекции вируса гепатита В и антигена гепатита В, по сравнению с количеством мРНК, белка HBV и количеством антигена HBV у млекопитающего до лечения, причем количество мРНК снижается по меньшей мере на 85% по сравнению с количеством до введения модифицированного анисмыслового олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения количества мРНК, ДНК, белка HBV и/или антигена HBV у млекопитающего, инфицированного вирусом гепатита В, включающий введение терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции, описанной выше, млекопитающему, нуждающемуся в этом, для снижения инфекции вируса гепатита В и антигена гепатита В, по сравнению с количеством мРНК, белка HBV и количеством антигена HBV у млекопитающего до лечения, причем количество мРНК снижается по меньшей мере на 90% по сравнению с количеством до введения модифицированного анисмыслового олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения количества мРНК, ДНК, белка HBV и/или антигена HBV у млекопитающего, инфицированного вирусом гепатита В, включающий введение терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции, описанной выше, млекопитающему, нуждающемуся в этом, для снижения инфекции вируса гепатита В и антигена гепатита В, по сравнению с количеством мРНК, белка HBV и количеством антигена HBV у млекопитающего до лечения, причем количество мРНК снижается по меньшей мере на 95% по сравнению с количеством до введения модифицированного анисмыслового олигонуклеотида. В родственных способах антигеном HBV может быть HBsAg или может быть HBeAg, и более конкретно, количество антигена HBV может быть существенно снижено для сероконверсии, которую определяют как отсутствие HBeAg в сыворотке плюс присутствие HBeAb в сыворотке, в случае мониторинга HBeAg как определителя сероконверсии, или которую определяют как отсутствие HBsAg в сыворотке, в случае мониторинга HBsAg как определителя сероконверсии, по результатам определения доступных в настоящее время пределов обнаружения коммерческих систем иммуноферментного твердофазного анализа (ELISA).
В некоторых вариантах реализации представлен способ ускорения сероконверсии вируса гепатита В у млекопитающего, инфицированного HBV, включающий введение терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции, описанной выше, млекопитающему, инфицированному гепатитом В; мониторинг присутствия HBeAg плюс HBeAb в образце сыворотки млекопитающего, или мониторинг присутствия HBsAg в образце сыворотки млекопитающего, как отсутствие HBeAg в сыворотке плюс присутствие HBeAb в образце сыворотки, в случае мониторинга HBeAg как определителя сероконверсии, или отсутствие HBsAg в образце сыворотки, в случае мониторинга HBsAg как определителя сероконверсии, по результатам определения доступных в настоящее время пределов обнаружения коммерческих систем иммуноферментного твердофазного анализа (ELISA), представляет собой показатель сероконверсии у млекопитающего.
В некоторых вариантах реализации представлено применение соединения или композиции, описанной в настоящем документе, для предупреждения, улучшения или лечения заболевания печени или его симптома у млекопитающего. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной от 10 до 30 связанных нуклеозидов, нацеленный на HBV. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, включающую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:17, 51, 86, 93, 95, 98, 100, 102, 104, 106, 109, 112, 115, 117, 137, 140, 143, 145, 147, 149, 151, 153,155, 157, 159, 161, 167, 168, 176, 177-179, 181, 188, 190-192, 194, 199, 201, 208, 209, 211, 226, 230-237, 244, 245, 247, 252, 254, 256, 258, 260, 262, 264, 266, 271, 1318-1347, 1364- 1372, 1375, 1376 и 1379.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции, описанные в настоящем документе, являются эффективными на основании того, что они имеют значение in vitro IC50 менее 250 нМ, менее 200 нМ, менее 150 нМ, менее 100 нМ, менее 90 нМ, менее 80 нМ, менее 70 нМ, менее 65 нМ, менее 60 нМ, менее 55 нМ, менее 50 нМ, менее 49 нМ, менее 47 нМ, менее 46 нМ, при доставке в клетки HepG2.2.1. В некоторых вариантах реализации, ингибирование измеряют при помощи набора затравочных зондов RTS3370, описанного в настоящем документе.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции, описанные в настоящем документе, являются эффективными на основании того, что они имеют значение in vitro IC50 менее 250 нМ, менее 200 нМ, менее 100 нМ, менее 90 нМ, менее 80 нМ, менее 70 нМ, менее 60 нМ, менее 50 нМ, менее 40 нМ, менее 35 нМ, менее 34 нМ, менее 33 нМ, менее 32 нМ, менее 31 нМ, при доставке в клетки HepG2.2.1. В некоторых вариантах реализации, ингибирование измеряют при помощи набора затравочных зондов RTS3371, описанного в настоящем документе.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции, описанные в настоящем документе, являются эффективными на основании того, что они имеют значение in vitro IC50 менее 20 мкМ, менее 10 мкМ, менее 9, 5 мкМ, менее 9,0 мкМ, менее 8, 5 мкМ, менее 8,0 мкМ, менее 7, 5 мкМ, менее 7,0 мкМ, менее 6, 5 мкМ, менее 6,0 мкМ, менее 5, 5 мкМ, менее 5,0 мкМ, менее 4, 5 мкМ, менее 4,0 мкМ, менее 3, 5 мкМ мегее 3,0 мкМ, менее 2, 5 мкМ, при доставке в клетки HepG2.2.1, как описано в настоящем документе.
В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции, описанные в настоящем документе, являются высоко переносимыми, что демонстрируется тем, что они увеличивают по меньшей мере одно из значений ALT или AST не более чем в 4 раза, 3 раза или 2 раза по сравнению с животными, обработанными солевым раствором, или увеличивают вес печени, селезенки или почек не более чем на 30%, 20%, 15%, 12%, 10%, 5% или 2%. В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции, описанные в настоящем документе, являются высоко переносимыми, что демонстрируется тем, что они не увеличивают ALT или AST по сравнению с животными, обработанными солевым раствором. В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции, описанные в настоящем документе, являются высоко переносимыми, что демонстрируется тем, что они не увеличивают вес печени, селезенки или почек по сравнению с животными, обработанными солевым раствором. В некоторых вариантах реализации, эти соединения или композиции содержат ISIS 146779, ISIS 146786, ISIS 505317, ISIS 505329, ISIS 505332, ISIS 505346, ISIS 505347, ISIS 505358, ISIS 509926, ISIS 509927, ISIS 509932, ISIS 509934, ISIS 509960, ISIS 509974, ISIS 510038, ISIS 510039, ISIS 510040, ISIS 510041, ISIS 510050 ISIS 509975, ISIS 510100, ISIS 510106 и ISIS 510116. В некоторых вариантах реализации, такие соединения или композиции содержат соединения, содержащие последовательность нуклеооснований любой из последовательностей SEQ ID NO:5-310, 321-802 или 804-1272. В некоторых вариантах реализации, такие соединения или композиции содержат соединения, содержащие последовательность нуклеооснований любой из последовательностей SEQ ID NO:5, 15, 16, 33, 39-95, 123-135, 163-175, 180-310, 321-406, 413-455, 461-802 или 804-1272. В некоторых вариантах реализации, такие соединения или композици содержат последовательность нуклеооснований любой из последовательностей SEQ ID NO:6-14, 17-32, 34-38, 96-122, 136-162, 176-179, 407-412, 456-462, 523-538 (обновленные SEQ ID NO), причем по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонуклеотида содержит по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 14 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-3 или 2 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 17 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3-4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 18 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 3-5 или 4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 20 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром.
В некоторых вариантах реализации представлено применение соединения или композиции, описанной в настоящем документе, в производстве лекарственного средства для лечения, улучшения, отсрочки или предупреждения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния у животного.
В некоторых вариантах реализации представлено применение соединения или композиции, описанной в настоящем документе, в производстве лекарственного средства для лечения, улучшения, отсрочки или предупреждения заболевания печени у животного.
В некоторых вариантах реализации представлен набор для лечения, предупреждения или улучшения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния, или его симптома, как описано в настоящем документе, причем указанный набор включает: а) соединение или композиции, описанные в настоящем документе; и необязательно b) дополнительное средство или терапию, описанную в настоящем документе. Набор может дополнительно включать инструкции или этикетку по применнию набора для лечения, предупреждения или улучшения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния.
Антисмысловые соединения
Олигомерные соединения включают, но не ограничиваясь этим, олигонуклеотиды, олигонуклеозиды, олигонуклеотидные аналоги, олигонуклеотид-миметики, антисмысловые соединения, антисмысловые олигонуклеотиды и миРНК. Олигомерное соединение может быть «антисмысловым» для целевой нуклеиновой кислоты, что означает, что оно способно подвергаться гибридизации с целевой нуклеиновой кислотой посредством водородного связывания.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение имеет последовательность нуклеооснований, которая, при прочтении в направлении от 5' к 3', содержит обратный комплемент целевого сегмента целевой нуклеиновой кислоты, на который он направлен. В некоторых таких вариантах реализации, антисмысловый олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, которая, при прочтении в направлении от 5' к 3', содержит обратный комплемент целевого сегмента целевой нуклеиновой кислоты, на который он направлен.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 10-30 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 12-30 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 12-22 субъединицы. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 14-30 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 14-20 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 15-30 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 15-20 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 16-30 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 16-20 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 17-30 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 17-20 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 18-30 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 18-21 субъединицы. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 18-20 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 20-30 субъединиц. Другими словами, такие антисмысловые соединения имеют от 12 до 30 связанных субъединиц, от 14 до 30 связанных субъединиц, от 14 до 20 связанных субъединиц, от 15 до 30 связанных субъединиц, от 15 до 20 связанных субъединиц, от 16 до 30 связанных субъединиц, от 16 до 20 связанных субъединиц, от 17 до 30 связанных субъединиц, от 17 до 20 связанных субъединиц, от 18 до 30 связанных субъединиц, от 18 до 20 связанных субъединиц, от 18 до 21 связанных субъединиц, от 20 до 30 связанных субъединиц или от 12 до 22 связанных субъединиц, соответственно. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 14 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 16 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 17 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 18 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 20 субъединиц. В других вариантах реализации, антисмысловое соединение имеет 8-80, 12-50, 13-30, 13-50, 14-30, 14-50, 15-30, 15-50, 16-30, 16-50, 17-30, 17-50, 18-22, 18-24, 18-30, 18-50, 19-22, 19-30, 19-50 или 20-30 связанных субъединиц. В некоторых таких вариантах реализации, антисмысловые соединения имеют длину 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79 или 80 связанных субъединиц, или диапазон, определяемый любыми двумя из представленных выше значений. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение представляет собой антисмысловый олигонуклеотид, а связанные субъединицы являются нуклеотидами.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на нуклеиновую кислоту HBV, могут быть укорочены или усечены. Например, одна субъединица может быть удалена с конца 5' (усечение 5'), или, альтернативно, с конца 3' (усечение 3'). Укороченное или усеченное антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, может иметь две субъединицы, удаленные с конца 5', или, альтернативно, может иметь две субъединицы, удаленные с конца 3' антисмыслового соединения. Альтернативно, удаленные нуклеозиды могут быть рассредоточены в антисмысловом соединении, например, в антисмысловом соединении, имеющем один нуклеозид, удаленный с конца 5', и один нуклеозид, удаленный с конца 3'.
При наличии одной дополнительной субъединицы в удлиненном антисмысловом соединении, эта дополнительная субъединица может быть расположена на конце 5' или 3' антисмыслового соединения. При наличии двух или более дополнительных субъединиц, добавленные субъединицы могут быть соседними относительно друг друга, например, в антисмысловом соединении, имеющем две субъединицы, добавленные в конце 5' (присоединение 5'), или, альтернативно, в конце 3' (присоединение 3') антисмыслового соединения. Альтернативно,добавленные субъединицы могут быть рассредоточены в антисмысловом соединении, например, в антисмысловом соединении, имеющем одну субъединицу, присоединенную к концу 5', и одну субъединицу, присоединенную к концу 3'.
Можно увеличивать или уменьшать длину антисмыслового соединения, такого как антисмысловый олигонуклеотид, и/или внедрять несовпадающие основания без аннулирования активности. Например, в публикации Woolf et al. (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:7305-7309, 1992), были испытаны серии антисмысловых олигонуклеотидов из 13-25 нуклеооснований на их способность вызывать расщепление целевой РНК в модели инъекции ооцита. Антисмысловые олигонуклеотиды длиной 25 нуклеооснований с 8 или 11 не совпадающими основаниями вблизи концов антисмысловых олигонуклеотидов были способны направлять специфическое расщепление целевой мРНК, хотя и в меньшей степени, чем антисмысловые олигонуклеотиды, не содержащие несовпадений. Точно так же, целевое специфическое расщепление было достигнуто с использованием антисмысловых олигонуклеотидов из 13 нуклеооснований, включая олигонуклеотиды с 1 или 3 несовпадениями.
Gautschi et al. (J. Natl. Cancer Inst. 93:463-471, March 2001) продемонстрировали способность олигонуклеотида, имеющего 100% комплементарность с мРНК bcl-2 и имеющего 3 несовпадения с мРНК bcl-xL, снижать экспрессию bcl-2 и bcl-xL in vitro и in vivo. Более того, этот олигонуклеотид показал потенциальную противоопухолевую активность т vivo.
Maher and Dolnick (Nuc. Acid. Res. 16:3341-3358, 1988) исследовали серию последовательных антисмысловых олигонуклеотидов из 14 нуклеооснований, а также антисмысловые олигонуклеотиды из 28 и 42 нуклеооснований, включающих последовательность из двух или трех последовательных антисмысловых олигонуклеотидов, соответственно, на их способность блокировать трансляцию DHFR человека в анализе ретикулоцитов кроликов. Каждый из трех антисмысловых олигонуклеотидов из 14 нуклеооснований по отдельности был способен ингибировать трансляцию, хотя и на более слабом уровне, чем антисмысловые олигонуклеотиды из 28 или 42 нуклеооснований.
Мотивы антисмысловых соединений
В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту HBV, содержали химически модифицированные субъединицы, расположенные в таких последовательностях, или мотивах, чтобы придавать антисмысловым соединениям такие свойства, как усиленная ингибирующая активность, повышенная связывающая аффиность к целевой нуклеиновой кислоте или устойчивость к разрушению под действием нуклеаз in vivo.
Химерные антисмысловые соединения обычно содержат по меньшей мере одну область, модифицированную так, чтобы придавать повышенную устойчивость к нуклеазному расщеплению, повышенное клеточное поглощение, повышенную связывающую аффинность к целевой нуклеиновой кислоте и/или повышенную ингибирующую активность. Вторая область химерного антисмыслового соединения может необязательно служить в качестве субстрата для клеточной эндонкулеазы РНазы Н, которая расщепляет цепь РНК дуплекса РНК: ДНК.
Антисмысловые соединения, имеющие мотив химерного олигонуклеотида, считают химерными антисмысловыми соединениями. В химерном олигонуклеотиде, внутренняя область, содержащая множество нуклеотидов, которые поддерживают расщепление РНазы Н, расположена между внешними областями, содержащими множество нуклеотидов, которые являются химически отличными от нуклеозидов внутренней области. В случае если антисмысловый олигонуклеотид имеет мотив химерного олигонуклеотида, то сегмент гэп обычно служит в качестве субстрата для эндонуклеазного расщепления, тогда как сегменты крыльев включают модифицированные нуклеозиды. В некоторых вариантах реализации, области химерного олигонуклеотида дифференцируются по типу сахарных фрагментов, составляющих кажду отдельную область. Типы сахарных фрагментов, которые используют для дифференциации областей химерного олигонуклеотида, могут, в некоторых вариантах реализации, включать β-D-рибонуклеозиды, β-D-дезоксирибонуклеозиды, 2'-модифицированные нуклеозиды (такие 2'-модифицированные нуклеозиды могут включать 2'-МОЕ и 2'-O-СН3, среди прочих) и модифицированные нуклеозиды с бициклическим сахаром (такие модифицированные нуклеозиды с бициклическим сахаром могут включать нуклеозиды, содержащие затрудненный этил). В некоторых вариантах реализации, нуклеозиды в крыльях могут включать несколько модифицированных сахарных фрагментов, включая, например, 2'-МОЕ и бициклические сахарные фрагменты, такие как затрудненный этил или БНК. В некоторых вариантах реализации, крылья могут включать несколько модифицированных и не модифицированных сахарных фрагментов. В некоторых вариантах реализации, крылья могут включать различные комбинации нуклеозидов 2'-МОЕ, бициклических сахарных фрагментов, таких как затрудненные этилнуклеозиды или БНК-нуклеозиды, и 2'-дезоксинуклеозидов.
Каждая отдельная область может включать одинаковые сахарные фрагменты, вариантные или измененные сахарные фрагменты. Мотив крыло-гэп-крыло зачастую описывают как «X-Y-Z», где «X» представляет собой длину 5'-крыла, «Y» представляет собой длину гэп, и «Z» представляет собой длину 3'-крыла. «X» и «Z» могут содержать одинаковые, вариантные или измененные сахарные фрагменты. В некоторых вариантах реализации, «X» и «Y» могут включать один или несколько 2'-дезоксинуклеозидов. «Y» может включать 2'-дезоксинуклеозиды. При использовании в настоящем документе, химерный олигонуклеотид, описанный как «X-Y-Z», имеет такую конфигурацию, что гэп расположен сразу возле каждого из 5'-крыла и 3'-крыла. Следовательно, между 5'-крылом и гэп, или между гэп и 3'-крылом нет промежуточных нуклеотидов. Любые антисмысловые соединения, описанные в настоящем документе, могут иметь мотив химерного олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации, «X» и «Z» являются одинаковыми; в других вариантах реализации они различные. В некоторых вариантах реализации, «Y» содержит от 8 до 15 нуклеозидов. X, Y или Z могут иметь 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30 или более нуклеозидов.
В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 11-меры, имеющие мотив 1-9-1.
В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 12-меры, имеющие мотив 1-9-2, 2-9-1 или 1-10-1.
В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 13-меры, имеющие мотив 1-9-3, 2-9-2, 3-9-1, 1-10-2 или 2-10-1.
В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 14-меры, имеющие мотив 1-9-4, 2-9-3, 3-9-2, 4-9-1, 1-10-3, 2-10-2 или 3-10-1.
В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 15-меры, имеющие мотив 1-9-5, 2-9-4, 3-9-3, 4-9-2, 5-9-1, 1-10-4, 2-10-3, 3-10-2 или 4-10-1.
В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 16-меры, имеющие мотив 4-8-4, 2-9-5, 3-9-4, 4-9-3, 5-9-2, 1-10-5, 2-10-4, 3-10-3, 4-10-2, 3-8-5 или 5-10-1.
В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 17-меры, имеющие мотив 3-9-5, 3-10-4, 4-9-4, 5-9-3, 2-10-5, 3-10-4, 4-10-3, 5-10-2, 2-9-6, 5-8-4, 5-7-5, 6-7-4 или 6-9-2.
В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 18-меры, имеющие мотив 4-9-5, 5-9-4, 3-10-5, 4-10-4 или 5-10-3.
В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 19-меры, имеющие мотив 5-9-5, 4-10-5 или 5-10-4.
В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 20-меры, имеющие мотив 5-10-5, 2-10-8, 8-10-2, 3-10-7, 7-10-3, 4-10-6 или 6-10-4.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение содержит мотив «олигомера крыла», имеющий конфигурацию крыло-гэп или гэп-крыло, то есть конфигурацию X-Y или Y-Z, как описано выше для конфигурации химерного олигонуклеотида. Следовательно, конфигурации олигомера крыла, представленные в настоящем документе, включают, но не ограничиваясь этим, например, 5-10, 8-4, 4-12, 12-4, 3-14, 16-2, 18-1, 10-3, 2-10, 1-10, 8-2, 2-13, 5-13, 5-8 или 6-8.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 2-10-2.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 3-10-3.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 4-10-4.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 5-10-5.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 3-10-4.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 2-10-4.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 2-10-8.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 8-10-2.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 3-10-7.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 7-10-3.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 4-10-6.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 6-10-4.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 2-9-6.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 6-9-2.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 4-9-4.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 5-9-3.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 3-9-5.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 5-9-2.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 2-9-5.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 4-9-3.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 3-9-4.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет гэп-расширенный мотив.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида, в котором гэп состоит из 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 или 16 связанных нуклеозидов.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту HBV, содержат любой из следующих сахарных мотивов:
k-d(10)-k
e-d(10)-k
k-d(10)-e
k-k-d(10)-k-k
k-k-d(10)-e-e
e-e-d(10)-k-k
k-k-k-d(10)-k-k-k
e-e-e-d(10)-k-k-k
k-k-k-d(10)-e-e-e
k-k-k-d(10)-k-k-k
e-k-k-d(10)-k-k-e
e-e-k-d(10)-k-k-e
e-d-k-d(10)-k-k-e
e-k-d(10)-k-e-k-e
k-d(10)-k-e-k-e-e
e-e-k-d(10)-k-e-k-e
e-d-d-k-d(9)-k-k-e
e-e-e-e-d(9)-k-k-e
e-e-e-e-e-d(10)-e-e-e-e-e
k-d-k-d-k-d(9)-e-e
e-e-k-k-d(9)-e-k-e-e
k-d-k-d-k-d(10)-e-e-e-e-e
k-e-k-d(10)-k-e-k
e-e-e-k-k-d(8)-e-e-e-e
e-e-e-k-k-d(7)-k-k-e-e-e
e-e-e-k-d(9)-k-e-e-e
e-e-e-k-k-d(7)-k-k-e-e-e
e-e-e-e-k-k-d(7)-e-e-e-e
e-k-e-k-d(9)-e-e-e-e
e-k-e-k-d-k-d(7)-e-e-e-e
e-e-e-k-k-d(7)-k-k-e-e-e
k-d-k-d-k-d(8)-e-e-e-e-e
причем k представляет собой затруденный этилнуклеозид, е представляет собой 2'-МОЕ замещенный нуклеозид, и d представляет собой 2'-дезоксинуклеозид.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловый олигонуклеотид имеет сахарный мотив, описанный Формулой А, представленной ниже: (J)m-(B)n-(J)p-(B)r-(A)t-(D)g-(A)v-(B)w-(J)x-(B)y-(J)z
причем:
каждый А независимо представляет собой 2'-замещенный нуклеозид;
каждый В независимо представляет собой бициклический нуклеозид;
каждый J независимо представляет собой 2'-замещенный нуклеозид или 2'-дезоксинуклеозид;
каждый D представляет собой 2'-дезоксинуклеозид;
m равен O-4; n равен O-2; р равен O-2; r равен O-2; t равен O-2; v равен O-2; w равен O-4; х равен O-2; y равен O-2; z равен O-4; g равен 6-14;
при условии, что:
по меньшей мере, один из m, n и r является отличным от 0;
по меньшей мере, один из w и y является отличным от 0;
сумма m, n, р, r и t составляет от 2 до 5; и сумма v, w, х, y и z составляет от 2 до 5.
Целевые нуклеиновые кислоты, целевые области и нуклеотидные последовательности
Нуклеотидная последовательность, кодирующая HBV, включает, без ограничения, следующую: номер доступа GENBANK U95551.1 (в настоящий документ включена как SEQ ID NO:1).
Следует понимать, что последовательность, представленная далее в каждом SEQ ID NO в Примерах, содержащихся в настоящем документе, является не зависимой от любых модификаций сахарного фрагмента, межнуклеозидной связи или нуклеооснования. Поэтому антисмысловые соединения, определенные номером SEQ ID NO, могут включать, независимо, одну или несколько модификаций сахарного фрагмента, межнуклеозидной связи или нуклеооснования. Антисмысловые соединения, описанные этим номером Isis (Isis №), указывают комбинацию последовательности нуклеооснования и мотива.
В некоторых вариантах реализации, целевая область является структурно определенной областью целевой нуклеиновой кислоты. Например, целевая область может охватывать 3' не транслируемую область (UTR), 5' не транслируемую область, экзон, интрон, экзон-интронное сочленение, кодирующую область, область инициации трансляции, область обрыва трансляции или другую определенную область нуклеиновой кислоты. Структурно определенные области для HBV могут быть получены по номеру доступа из базы данных последовательностей, такой как NCBI, и такая информация включена в настоящий документ путем ссылки. В некоторых вариантах реализации, целевая область может охватывать последовательность от 5' целевого сайта любого целевого сегмента в пределах целевой области от 3' целевого сайта другого целевого сегмента в пределах той же целевой области.
Таргетинг включает определение по меньшей мере одного целевого сегмента, с которым гибридизуется антисмысловое соединение с возникновением заданного эффекта. В некоторых вариантах реализации заданный эффект представляет собой снижение уровней целевой нуклеиновой кислоты мРНК. В некоторых вариантах реализации, заданный эффект представляет собой снижение уровней белка, кодирующего целевую нуклеиновую кислоту или фенотипическое изменение, связанное с целевой нуклеиновой кислотой.
Целевая область може содержать один или несколько целевых сегментов. Несколько целевых сегментов в пределах целевой области могут перекрываться. Альтернативно, они могут не перекрываться. В некоторых вариантах реализации, целевые сегменты в пределах целевой области разделены не более чем около 300 нуклеотидами. В некоторых вариантах реализации, целевые сегменты в пределах целевой области разделены количеством нуклеотидов, которое составляет, или примерно равно, или не превышает, или примерно не превышает 250, 200, 150, 100, 90, 80, 70, 60, 50, 40, 30, 20 или 10 нуклеотидов целевой нуклеиновой кислоты, или находится в диапазоне, определенном любыми из двух предшествующих значений. В некоторых вариантах реализации, целевые сегменты в пределах целевой области разделены не более чем или примерно не более чем 5 нуклеотидами целевой нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации, целевые сегменты являются смежными. Подразумевается целевые области, определенные диапазоном, имеющим исходную нуклеиновую кислоту, то есть любой из 5' целевых сайтов или 3' целевых сайтов, перечисленных в настоящем документе.
Соответствующие целевые сегменты могут находиться в 5' не транслируемой области, кодирующей области, 3' не транслируемой области, интроне, экзоне или экзон-интронном сочленении. Целевые сегменты, содержащие инициирующий кодон или стоп-кодон, также являются пригодными целевыми сегментами. Соответствующий целевой сегмент может специально исключать некоторую структурно определенную область, такую как инициирующий кодон или стоп-кодон.
Определение соответствующих целевых сегментов может включать сравнение последовательности целевой нуклеиновой кислоты с другими последовательностями генома. Например, для определения областей сходства среди различных нуклеиновых кислот может быть использован алгоритм BLAST. Это сравнение может предотвращать выбор последовательностей антисмысловых соединений, которые могут гибридизоваться неспецифическим образом с последовательностями, отличными от выбранной целевой нуклеиновой кислоты (то есть нецелевыми последовательностями).
В пределах активной целевой области может наблюдаться изменение активности (например, по результатам определения процентного снижения уровней целевой нуклеиновой кислоты) антисмысловых соединений. В некоторых вариантах реализации, снижение уровней мРНК HBV является показателем ингибирования экспрессии HBV. Снижение уровней белка HBV также является показателем ингибирования экспрессии целевой мРНК. Кроме того, показателем ингибирования экспрессии HBV являются фенотипические изменения. В некоторых вариантах реализации, показателем ингибирования экспрессии HBV может быть уменьшение усталости, уменьшение симптомов, похожих на грипп, улучшение аппетита, снижение тошноты, уменьшение боли в суставах, уменьшение желтухи, уменьшение боли в животе, снижение слабости, снижение потери веса, уменьшение роста молочной железы у мужчин, уменьшение сыпи на пальцах, уменьшение проблем свертываемости крови, уменьшение цирроза, уменьшение пауковидных кровеносных сосудов на коже, повышение абсорбции витаминов А и D, снижение роста опухоли, снижение объема опухоли, уменьшение головной боли, уменьшение жара, уменьшение диареии, уменьшение боли в области печени организма, уменьшение стула земляного или серого цвета, уменьшение зуда, уменьшение мочи темного цвета и уменьшение тошноты и рвоты. В некоторых вариантах реализации, показателем ингибирования экспрессии HBV может быть улучшение симптомов, обусловленных HBV-связанными состояниями, заболеваниями и расстройствами. В некоторых вариантах реализации, показателем ингибирования экспрессии HBV является уменьшение цирроза. В некоторых вариантах реализации, показателем ингибирования экспрессии HBV является уменьшение маркеров рака печени.
Гибридизация
В некоторых вариантах реализации, гибридизация происходит между антисмысловым соединением, описанным в настоящем документе, и нуклеиновой кислотой HBV. Наиболее общий механизм гибридизации включает водородное связывание (например, Уотсона-Крика, Хугстина или обратное водородное связывание Хугстина) между комплементарными нуклеооснованиями молекул нуклеиновых кислот.
Гибридизация может происходить при различных условиях. Обязательным условием является зависимость от последовательностей, и она определяется природой и составом молекул нуклеиновых кислот, подлежащих гибридизации.
Способы определения того, может ли определенная последовательность специфически гибридизоваться с целевой нуклеиновой кислотой, хорошо известны в данной области техники. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения, представленные в настоящем документе, могут специфически гибридизоваться с нуклеиновой кислотой HBV.
Комплементарностъ
Антисмысловое соединение и целевая нуклеиновая кислоты комплементарны друг другу, если достаточное количество нуклеооснований антисмыслового соединения может быть связано водородной связью с соответствующими нуклеооснованиями целевой нуклеиновой кислоты, так что возникает заданный эффект (например, антисмысловое ингибирование целевой нуклеиновой кислоты, такой как нуклеиновая кислота HBV).
Не комплементарные нуклеооснования между антисмысловым соединением и нуклеиновой кислотой HBV могут быть допустимы при условии, что антисмысловое соединение остается способным специфически гибридизоваться с целевой нуклеиновой кислотой. Более того, антисмысловое соединение может гибридизоваться в одном или нескольких сегментах нуклеиновой кислоты HBV, так что промежуточные или соседние сегменты не участвуют в гибридизации (например, петлевая структура, не совпадающая или шпилечная структура).
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, представленное в настоящем документе, или его определенная часть комплементарны или по меньшей мере на 70%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% комплементарны нуклеиновой кислоте HBV, целевой области, целевому сегменту или определенной их части. Процент комплементарности антисмыслового соединения с целевой нуклеиновой кислотой может быть определен стандартными способами.
Например, антисмысловое соединение, в котором 18 из 20 нуклеооснований указанного антисмыслового соединения комплементарны целевой области и, следовательно, будут специфически гибридизоваться, представляет 90 процентнов комплементарности. В этом примере оставшиеся не комплементарные нуклеооснования могут быть сгруппированы или перемежаться с комплементарными нуклеооснованиями, и не обязательно должны быть смежными друг с другом или с комплементарными нуклеооснованиями. Поэтому антисмысловое соединение длиной 18 нуклеооснований, имеющее четыре не комплементарных нуклеооснования, к которым примыкают две области полной комплементарности с целевой нуклеиновой кислотой, имеет общую комплементарность с целевой нуклеиновой кислотой 77,8%, и, следовательно, входит в рамки настоящего изобретения. Процент комплементарности антисмыслового соединения с областью целевой нуклеиновой кислоты может быть определен обычным способом с использованием программ BLAST (программ для обнаружения сходства последовательностей белков путем их локального выравнивания) и программ Power BLAST, известных в данной области техники (Altschul et al., J. Mol. Biol., 1990, 215, 403 410; Zhang and Madden, Genome Res., 1997, 7, 649 656). Процент гомологичности, идентичности или комплементарности последовательности может быть определен, например, программой Gap (Wisconsin Sequence Analysis Package, версия 8 для Unix, Genetics Computer Group, University Research Park, Мэдисон, штат Висконсин), с использованием настроек по умолчанию, в которых используется алогритм Smith and Waterman (Adv. Appl. Math., 1981, 2, 482 489).
В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, представленное в настоящем документе, или определенная его часть полностью комплементарны (то есть на 100% комплементарны) целевой нуклеиновой кислоте или определенной ее части. Например, антисмысловое соединение может быть полностью комплементерно к нуклеиновой кислоте HBV, или ее целевой области, или целевому сегменту, или целевой последовательности. При использовании в настоящем документе, «полностью комплементарен» обозначает, что каждое нуклеооснование антисмыслового соединения может участвовать в точном спаривании оснований с соответствующими нуклеооснованиями целевой нуклеиновой кислоты. Например, антисмысловое соединение из 20 нуклеооснований полностью комплементарно целевой последовательности длиной 400 нуклеооснований, если существует соответствующая часть из 20 нуклеооснований целевой нуклеиновой кислоты, которая полностью комплементарна указанному антисмысловому соединению. Термин «полностью комплементарен» может быть использован также в отношении определенной части первой и/или второй нуклеиновой кислоты. Например, часть из 20 нуклеооснований антисмыслового соединения, состоящего из 30 нуклеооснований, может быть «полностью комплементарна» целевой последовательности длиной 400 нуклеооснований. Часть из 20 нулеооснований олигонуклеотида, состоящего из 30 нуклеооснований, полностью комплементерна целевой последовательности, если целевая последовательность имеет соответствующую часть из 20 нуклеооснований, в которой каждое нуклеооснование комплементарно части из 20 нуклеооснований указанного антисмыслового соединения. В то же время целое антисмысловое соединение из 30 нуклеооснований может быть или может не быть полностью комплементарным к целевой последовательности, в зависимости от того, являются ли оставшиеся 10 нуклеооснований антисмыслового соединения также комплементарными целевой последовательности.
Не комплементарное нуклеооснование может быть расположено у конца 5' или конца 3' антисмыслового соединения Альтернативно, не комплементарное нуклеооснование или нуклеооснования могут быть во внутреннем положении антисмыслового соединения. В случае наличия двух или более не комплементарных нуклеооснований, они могут быть смежными (то есть связанными) или не смежными. В одном варианте реализации, не комплементарное нуклеооснование расположено в сегменте крыла химерного антисмыслового олигонуклеотида.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения, которые имеют длину или которые содержат до 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 нуклеооснований, содержат не более 4, не более 3, не более 2 или не более 1 не комплементарного нуклеооснования(ий) относительно целевой нуклеиновой кислоты, такой как нуклеиновая кислота HBV, или ее определенная часть.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения, которые имеют длину или которые содержат до 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 или 30 нуклеооснований, содержат не более 6, не более 5, не более 4, не более 3, не более 2 или не более 1 не комплементарного нуклеооснования(ий) относительно целевой нуклеиновой кислоты, такой как нуклеиновая кислота HBV, или ее определенная часть.
Представленные антисмысловые соединения включают также те, которые комплементарны части целевой нуклеиновой кислоты. При использовании в настоящем документе, «часть» относится к определенному количеству смежных (то есть связанных) нуклеооснований в пределах области или сегмента целевой нуклеиновой кислоты. «Часть» может также относиться к определенному количеству смежных нуклеооснований антисмыслового соединения. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения комплементарны части целевого сегмента по меньшей мере из 8 нуклеооснований. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения комплементарны части целевого сегмента по меньшей мере из 9 нуклеооснований. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения комплементарны части целевого сегмента по меньшей мере из 10 нуклеооснований. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения комплементарны части целевого сегмента по меньшей мере из 11 нуклеооснований. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения комплементарны части целевого сегмента по меньшей мере из 12 нуклеооснований. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения комплементарны части целевого сегмента по меньшей мере из 13 нуклеооснований. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения комплементарны части целевого сегмента по меньшей мере из 14 нуклеооснований. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения комплементарны части целевого сегмента по меньшей мере из 15 нуклеооснований. Также подразумеваются антисмысловые соединения, которые комплементарны части целевого сегмента по меньшей мере из 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более нуклеооснований, или в диапазоне между любыми из двух этих значений.
Идентичность
Антисмыловые соединения, представленные в настоящем документе, также могут иметь определенный процент идентичности с определенной нуклеотидной последовательностью, SEQ ID NO или соединением, представленным номером Isis, или их частью. При использовании в настоящем документе, антисмысловое соединение является идентичным к последовательности, описанной в настоящем документе, если оно имеет такую же способность к спариванию нуклеооснований. Например, РНК, которая содержит урацил вместо тимидина в описанной последовательности ДНК, считается идентичной к этой последовательности ДНК, поскольку и урацил, и тимидин спариваются с аденином. Подразумеваются также укороченные и удлиненные версии антисмысловых соединений, описанных в настоящем документе, а также соединения, имеющие не идентичные основания по сравнению с антисмысловыми соединениями, представленными в настоящем документе. Не идентичные основания могут быть соседними друг к другу или рассредоточены в антисмысловом соединении. Процент идентичности антисмыслового соединения рассчитывают по количеству оснований, имеющих идентичное спаривание оснований, по сравнению с последовательностью, с которой его сравнивают.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения или их части являются по меньшей мере на 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичными к одному или нескольким антисмысловым соединениями или последовательностям SEQ ID NO, или их частям, описанным в настоящем документе.
В некоторых вариантах реализации, часть антисмыслового соединения сравнивают с частью целевой нуклеиновой кислоты такой же длины. В некоторых вариантах реализации сравнивают часть из 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 или 25 нуклеооснований с равной по длине частью целевой нуклеиновой кислоты.
В некоторых вариантах реализации, часть антисмыслового олигонуклеотида сравнивают с частью целевой нуклеиновой кислоты такой же длины. В некоторых вариантах реализации сравнивают часть из 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 или 25 нуклеооснований с равной по длине частью целевой нуклеиновой кислоты.
Модификации
Нуклеозид представляет собой комбинацию основания и сахара. Часть нуклеооснования (известная также как основание) нуклеозида, как правило, представляет собой фрагмент гетероциклического основания. Нуклеотиды представляют собой нуклеозиды, которые дополнительно включают фосфатную группу, ковалентно связанную с сахарной частью нуклеозида. Для тех нуклеозидов, которые включают пентафуранозный сахар, фосфатная группа может быть связана с 2', 3' или 5' гидроксильным фрагментом сахара. Олигонуклеотиды образуются посредством ковалентного связывания соседних нуклеозидов друг с другом с образованием линейного полимерного олигонуклеотида. В пределах олигонуклеотидной структуры, фосфатные группы обычно упоминают как образующие межнуклеозидные связи олигонуклеотида.
Модификации антисмысловых соединений включают замещения или изменения межнуклеозидных связей, сахарных фрагментов или нуклеооснований. Модифицированные антисмысловые соединения зачастую являются предпочтительными по сравнению с нативными формами за счет желательных свойств, таких как, например, усиленное клеточное поглощение, усиленная аффинность к целевой нуклеиновой кислоте, увеличенная устойчивость в присутствии нуклеаз или увеличенная ингибирующая активность.
Химически модифицированные нуклеозиды также могут быть использованы для увеличения связывающей аффинности укороченного или усеченного антисмыслового соединения к его целевой нуклеиновой кислоте. Следовательно, зачастую могут быть получены сравнимые результаты с укороченными антисмысловыми соединениями, которые имеют такие химически модифицированные нуклеозиды.
Модифицированные межнуклеозидные связи
Природная межнуклеозидная связь РНК и ДНК представляет собой фосфодиэфирную связь 3' с 5'. Антисмысловые соединения, имеющие одну или несколько модифицированных, то есть неприродных, межнуклеозидных связей, зачастую выбирают вместо антисмысловых соединений, имеющих природные межнуклеозидные связи из-за желательных свойств, таких как, например, усиленное клеточное полощение, усиленная аффиность к целевым нуклеиновым кислотам и увеличенная устойчивость в присутствии нуклеаз.
Олигонуклеотиды, имеющие модифицированные межнуклеозидные связи, включают межнуклеозидные связи, которые сохраняют атом фосфора, а также межнуклеозидные связи, которые не имеют атома фосфора. Иллюстративные межнуклеозидные связи, содержащие фосфор, включают, но не ограничиваясь этим, фосфодиэфиры, фосфотриэфиры, метилфосфонаты, фосфорамидаты и фосфотиоаты. Хорошо известны способы получения фосфоросодержащих и не фосфоросодержащих связей.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту HBV, содержат одну или несколько модифицированных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации, модифицированные межнуклеозидные связи представляют собой фосфотиоатные связи. В некоторых вариантах реализации, каждая межнуклеозидная связь антисмыслового соединения представляет собой фосфотиоатную межнуклеозидную связь.
Модифицированные сахарные фрагменты
Антисмысловые соединения, представленные в настоящем документе, могут необязательно содержать один или несколько нуклеозидов, в которых модифицирована сахарная группа. Такие нуклеозиды с модифицированным сахаром могут придавать улучшенную устойчивость к действию нуклеаз, увеличенную связывающую аффинность или какое-либо другое преимущественное биологическое свойство антисмысловым соединениям. В некоторых вариантах реализации, нуклеозиды включают химически модифицированный рибофуранозный кольцевой фрагмент.Примеры химически модифицированных рибофуранозных колец включают, без ограничения, добавление групп заместителей (включая 5' и 2' группы заместителей); связывание мостиком не геминальных кольцевых атомов с образованием бициклических нуклеиновых кислот (БцНК); замену рибозильного кольцевого кислородного атома на S, N(R) или C(R1)(R)2 (R=Н, С1-С12 алкил или защитная группа); и их комбинации. Примеры химически модифицированных сахаров включают 2'-F-5'-метил-замещенный нуклеозид (смотри Международную заявку РСТ WO 2008/101157, опубликованную 8/21/08, где описаны другие 5', 2'-бис-замещенные нуклеозиды), замену рибозильного кольцевого кислородного атома на S с дополнительным замещением в 2'-положении (смотри опубликованную заявку на патент США US2005/0130923, опубликованную 16 июня 2005 года), или, альтернативно, 5'-замещение БцНК (смотри Международную заявку РСТ WO 2007/134181, опубликованную 11/22/07, в которой БНК замещена, например, 5'-метиловой или 5'-виниловой группой).
Примеры нуклеозидов, имеющих модифицированные сахарные фрагменты включают, без ограничения, нуклеозиды, включающие 5'-винил, 5'-метил (R или S), 4'-S, 2'-F, 2'-ОСН3 и 2'-O(СН2)2OCH3 группы заместителей. Заместитель в 2' положении также может быть выбран из аллила, амино, азидо, тио, O-аллила, O-C1-С10 алкила, OCF3, O(СН2)2SCH3, O(CH2)2-O-N(Rm)(Rn) и O-CH2-C(=0)-N(Rm)(Rn), причем каждый Rm и Rn независимо представляет собой Н или замещенный или незамещенный C1-С10 алкил.
При использовании в настоящем документе, «бициклические нуклеозиды» относятся к модифицированным нуклеозидам, содержащим бициклический сахарный фрагмент. Примеры бициклических нуклеозидов включают, без ограничения, нуклеозиды, содержащие мостик между 4' и 2' рибозильными кольцевыми атомами. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения, представленные в настоящем документе, содержат один или несколько бициклических нуклеозидов, причем мостик содержит бициклический нуклеозид 4'-2'. Примеры таких бициклических нуклеозидов 4'-2' включают, но не ограничиваясь этим, нуклеозиды формул: 4'-(CH2)-O-2' (БНК); 4'-(CH2)-S-2'; 4'-(CH2)2-O-2' (ENA); 4'-СН(СН3)-O-2' (cEt) и 4'-СН(СН20СНз)-O-2', и их аналоги (смотри патент США 7399845, опубликованный 15 июля 2008 года; 4'-С(СН3)(СН3)-O-2', и его аналоги (смотри опубликованную Международную заявку РСТ W02009/006478, опубликованную 8 января 2009 года); 4'-СН2-N(ОСН3)-2', и его аналоги (смотри опубликованную Международную заявку РСТ WO 2008/150729, опубликованную 11 декабря 2008 года); 4'-СН2-O-N(СН3)-2' (смотри опубликованную заявку на патент США US 2004/0171570, опубликованную 2 сентября 2004 года); 4'-CH2-N(R)-O-2', причем R представляет собой Н, С1-С12 алкил или защитную группу (смотри патент США 7427672, опубликованный 23 сентября 2008 года); 4'-СН2-С(Н)(СН3)-2' (смотри публикацию Chattopadhyaya, et al., J. Org. Chem., 2009, 74, 118-134); и 4'-СН2-С(=СН2)-2', и его аналоги (смотри опубликованную Международную заявку РСТ WO 2008/154401, опубликованную 8 декабря 2008 года). Также смотри, например: Singh et al., Chem. Commun., 1998, 4, 455-456; Koshkin et al., Tetrahedron, 1998, 54, 3607-3630; Wahlestedt et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2000, 97, 5633-5638; Kumar et al., Bioorg. Med. Chem. Lett., 1998, 8, 2219-2222; Singh et al., J. Org. Chem., 1998, 63, 10035-10039; Srivastava et al., J. Am. Chem. Soc., 129(26) 8362-8379 (Jul. 4, 2007); Elayadi et al., Curr. Opinion Invens. Drugs, 2001, 2, 558-561; Braasch et al., Chem. Biol., 2001, 8, 1-7; Orum et al., Curr. Opinion Mol. Ther., 2001, 3, 239-243; патенты США №№ U.S. 6670461, 7053207, 6268490, 6770748, 6794499, 7034133, 6525191, 7399845; опубликованный Международные заявки РСТ WO 2004/106356, WO 94/14226, WO 2005/021570 и WO 2007/134181; публикации патентов США №№US 2004/0171570, US 2007/0287831 и US 2008/0039618; и патенты США серийных №№12/129154, 60/989574, 61/026995, 61/026998, 61/056564, 61/086231, 61/097787 и 61/099844; а также Международный заявки РСТ №№PCT/US2008/064591, PCT/US2008/066154 и PCT/US2008/068922. Каждый из представленных выше бициклических нуклеозидов может быть получен с одним или несколькими стереохимическими конфигурациями сахара, включая, например, α-L-рибофуранозу и β-D-рибофуранозу (смотри Международную заявку РСТ PCT/DK98/00393, опубликованную 25 марта 1999 года как WO 99/14226).
В некоторых вариантах реализации, бициклические сахарные фрагменты БцНК нуклеозидов включают, но не ограничиваясь этим, соединения, имеющие по меньшей мере один мостик между положением 4' и 2' пентафуранозного сахарного фрагмента, причем такие мостики независимо содержат 1 или от 2 до 4 связанных групп, независимо выбранных из -[С(Ra)(Rb)]n-, -C(Ra)=C(Rb)-, -C(Ra)=N-, -C(=NRa)-, -C(=O)-, -C(=S)-, -O-, -Si(Ra)2-, -S(=O)x- и -N(Ra)-;
причем:
x равен 0, 1 или 2;
n равен 1, 2, 3 или 4;
каждый Ra и Rb независимо представляет собой Н, защитную группу, гидроксил, C2-C12 алкил, замещенный C1-С12 алкил, C2-C12 алкенил, замещенный C1-С12 алкенил, C2-C12 алкинил, замещенный C2-C12 алкинил, С5-С20 арил, замещенный С5-С20 арил, гетероциклический радикал, замещенный гетероциклический радикал, гетероарил, замещенный гетероарил, C5-C7 алициклический радикал, замещенный C5-C7 алициклический радикал, галоген, OJ1, NJ1J2, SJ1, N3, COOJ1, ацил (С(=O)-Н), замещенный ацил, CN, сульфонил (S(=O)2-J1) или сульфоксил (S(=O)2-J1); и
каждый J1 и J2 независимо представляет собой, Н, С1-С12 алкил, замещенный C2-С12 алкил, С2-C12 алкенил, замещенный С2-С12 алкенил, C2-C12 алкинил, замещенный C2-C12 алкинил, C5-C20 арил, замещенный С5-С20 арил, ацил (С(=O)-Н), замещенный ацил, гетероциклический радикал, замещенный гетероциклический радикал, C1-С12 аминоалкил, замещенный C1-C12 аминоалкил или защитную группу.
В некоторых вариантах реализации, мостик бициклического сахарного фрагмента представляет собой -[C(Ra)(Rb)]n-, -[C(Ra)(Rb)]n-O-, -C(RaRb)-N(R)-O- или -C(RaRb)-O-N(R)-. В некоторых вариантах реализации, мостик представляет собой 4'-СН2-2', 4'-(СН2)2-2', 4'-(СН2)3-2', 4'-СН2-O-2', 4'-(СН2)2-O-2', 4'-CH2-O-N(R)-2' и 4'-CH2-N(R)-O-2'-, причем каждый R независимо представляет собой Н, защитную группу или C1-C12 алкил.
В некоторых вариантах реализации, бициклические нуклеозиды дополнительно определены по изомерной конфигурации. Например, нуклеозид, содержащий 4'-2' метиленокси-мостик, может быть в α-L конфигурации или β-D конфигурации. Ранее в антисмысловые олигонуклеотиды, демонстрирующие антисмысловую активность, были внедрены a-L-метиленокси (4'-СН2-O-2') БцНК (Frieden et al., Nucleic Acids Research, 2003, 21, 6365-6372).
В некоторых вариантах реализации, бициклические нуклеозиды включают, но не ограничиваясь этим, (А) α-L-метиленокси (4'-СН2-O-2') БцНК, (В) β-D-метиленокси (4'-СН2-O-2') БцНК, (С) этиленокси (4'-(СН2)2-O-2') БцНК, (D) аминоокси (4'-CH2-O-N(R)-2') БцНК, (Е) оксиамино (4'-CH2-N(R)-O-2') БцНК, (F) метил(метиленокси) (4'-СН(СН3)-O-2') БцНК, (G) метилен-тио (4'-СН2-S-2') БцНК, (Н) метилен-амино (4'-CH2-N(R)-2') БцНК, (I) метил-карбоциклические (4'-СН2-СН(СН3)-2') БцНК и (J) пропилен-карбоциклические (4'-(СН2)3-2') БцНК, изображенные ниже.
причем Вх представляет собой фрагмент основания, a R независимо представляет собой Н, защитную группу или C1-C12 алкил.
В некоторых вариантах реализации, бициклический нуклеозид имеет Формулу I:
причем:
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания;
-Qa-Qb-Qc- представляет собой -CH2-N(Rc)-CH2-, -C(=O)-N(Rc)-CH2-, -CH2-O-N(Rc)-, -СН2-N(Rc)-O- или -N(Rc)-O-CH2;
Rc представляет собой C1-C12 алкил или амино-защитную группу; и
Та и Tb, каждый независимо, представляют собой Н, гидрокси-защитную группу, сопряженную группу, химически активную фосфорную группу, фосфорный фрагмент или ковалентное связывание со стабилизирующей средой.
В некоторых вариантах реализации, бициклический нуклеозид имеет Формулу II:
причем:
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания;
Та и Tb, каждый независимо, представляют собой Н, гидрокси-защитную группу, сопряженную группу, химически активную фосфорную группу, фосфорный фрагмент или ковалентное присоединение к среде подложки;
Za представляет собой C1-С6 алкил, С2-С6 алкенил, C2-С6 алкинил, замещенный C1-С6 алкил, замещенный С3-С6 алкенил, замещенный С2-С6 алкинил, ацил, замещенный ацил, замещенный амид, тиол или замещенный тио.
В одном варианте реализации, каждая из замещенных групп независимо представляет собой моно- или полизамещенную группу с группами заместителей, независимо выбранными из галогена, оксо, гидроксила, OJc, NJcJd, SJc, N3, OC(=X)Jc и NJcC(=X)NJcJd, причем каждый Jc, Jd и Jc независимо представляют собой Н, C1-С6 алкил ил изамещенный C1-С6 алкил, и Х представляет собой О или NJc.
В некоторых вариантах реализации, бициклический нуклеозид имеет Формулу III:
причем:
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания;
Та и Tb, каждый независимо, представляют собой Н, гидрокси-защитную группу, сопряженную группу, химически активную фосфорную группу, фосфорный фрагмент или ковалентное присоединение к среде подложки;
Zb представляет собой C1-С6 алкил, С2-С6 алкенил, С2-С6 алкинил, замещенный C1-С6 алкил, 5 замещенный C1-С6 алкенил, замещенный С2-С6 алкинил или замещенный ацил (С(=O)-). В некоторых вариантах реализации, бициклический нуклеозид имеет Формулу IV:
причем:
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания;
Ta и Tb, каждый независимо, представляют собой Н, гидрокси-защитную группу, сопряженную группу, химически активную фосфорную группу, фосфорный фрагмент или ковалентное присоединение к среде подложки;
Rd представляет собой C1-С6 алкил, замещенный C1-С6 алкил, С2-С6 алкенил, замещенный C1-С6 алкенил, С2-С6 алкинил или замещенный С2-С6 алкинил;
каждый qa, qb, qc и qd независимо представляет собой Н, галоген, C1-С6 алкил, замещенный С1-С6 алкил, С2-С6 алкенил, замещенный С2-С6 алкенил, С2-С6 алкинил или замещенный С2-С6 алкинил, C1-С6 алкоксил, замещенный C1-С6 алкоксил, ацил, замещенный ацил, C1-С6 аминоалкил или замещенный C1-С6 аминоалкил;
В некоторых вариантах реализации, бициклический нуклеозид имеет Формулу V:
причем:
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания;
Та и Tb, каждый независимо, представляют собой Н, гидрокси-защитную группу, сопряженную группу, химически активную фосфорную группу, фосфорный фрагмент или ковалентное присоединение к среде подложки;
qa, qb, qe и qf, каждый независимо, представляют собой водород, галоген, С1-С12 алкил, замещенный C1-С12 алкил, С2-С12 алкенил, замещенный C2-C12 алкенил, C2-C12 алкинил, замещенный C2-C12 алкинил, C1-C12 алкокси, замещенный C1-C12 алкокси, OJj, SJj, SOJj, SO2Jj, NJjJk, N3, CN, C(=O)OJj, C(=O)NJjJk, C(=O)Jj, O-C(=O)NJjJk, N(H)C(=NH)NJjJk, N(H)C(=O)NJjJk или N(H)C(=S)NJjJk;
или qe и qf вместе представляют собой =C(qg)(qh);
qg и qh, каждый независимо, представляют собой Н, галоген, C1-С12 алкил или замещенный C1-C12 алкил.
Были описаны синтез и получение метиленокси (4'-СН2-O-2') БцНК мономеров аденина, цитозина, гуанина, 5-метил-цитозина, тимина и урацила, а также их олигомеризация и свойства распознавания нуклеиновых кислот (смотри, например, Koshkin et al., Tetrahedron, 1998, 54, 3607-3630). БцНК и их получение описаны также в WO 98/39352 и WO 99/14226.
Также были получены аналоги метиленокси (4'-СН2-O-2') БцНК, метиленокси (4'-СН2-O-2') БцНК и 2'-тио-БцНК (смотри, например, Kumar et al., Bioorg. Med. Chem. Lett., 1998, 8, 2219-2222). Было описано также получение блокированных нуклеозидных аналогов, включающих олигодезоксирибонуклеотидные дуплексы в качестве субстратов для полимераз нуклеиновых кислот (смотри, например, Wengel et al., WO 99/14226). Кроме того, в данной области техники описан синтез 2'-амино-БцНК, нового конформационно ограниченного олигонуклеотидного аналога с высокой аффинностью (смотри, например, Singh et al., J. Org. Chem., 1998, 63, 10035-10039). Кроме того, ранее были описаны 2'-амино- и 2'-метиламино-БцНк, а также термическая устойчивость их дуплексов с комплементарными цепями РНК и ДНК.
В некоторых вариантах реализации, бициклический нуклеозид имеет Формулу VI:
причем:
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания;
Та и Tb, каждый независимо, представляют собой Н, гидрокси-защитную группу, сопряженную группу, химически активную фосфорную группу, фосфорный фрагмент или ковалентное присоединение к среде подложки;
каждый qi, qj, qk и qj независимо, представляет собой Н, галоген, C1-C12 алкил, замещенный C1-C12 алкил, С2-С12 алкенил, замещенный С2-С12 алкенил, C2-C12 алкинил, замещенный C2-C12 алкинил, C1-C12 алкоксил, замещенный C1-C12 алкоксил, OJj, SJj, SOJj, SO2Jj, NJjJk, N3, CN, C(=O)OJj, C(=O)NJjJk, C(=O)Jj, O-C(=O)NJjJk, N(H)C(=NH)NJjJk, N(H)C(=0)NJjJk или N(Н)С(=S)NJjJk; и
qi и qj иди qi и qk вместе представляют собой =C(qg)(qh), причем qg и qh, каждый независимо, представляют собой Н, галоген, C1-C12 алкил или замещенный C1-C12 алкил.
Описан один карбоциклический бициклический нуклеозид, имеющий мостик 4'-(СН2)3-2', и алкениловый аналог, мостик 4'-СН=СН-СН2-2' (смотри, например, Freier et al., Nucleic Acids Research, 1997, 25(22), 4429-4443 и Albaek et al., J. Org. Chem., 2006, 71, 7731-7740). Также был описан синтез и получение карбоциклических бициклических нуклеозидов, их олигомеризация и биохимические исследования (смотри, например, Srivastava et al., J. Am. Chem. Soc. 2007, 129(26), 8362-8379).
При использовании в настоящем документе, «бициклический нуклеозид» относится к нуклеозиду, содержащему мостиковое соединение двух атомов углерода сахарного кольца, с образованием посредством этого бициклического сахарного фрагмента. В некоторых вариантах реализации, мостик соединяет 2' углерод и другой углерод сахарного кольца.
При использовании в настоящем документе, «4'-2' бициклический нуклеозид» или «4'-2' бициклический нуклеозид» относится к бициклическому нуклеозиду, содержащему фуранозное кольцо, содержащее мостиковое соединение 2' углеродного атома и 4' углеродного атома.
При использовании в настоящем документе, «моноциклические нуклеозиды» относятся к нуклеозидам, содержащим модифицированные сахарные фрагменты, которые не являются бициклическими сахарными фрагментами. В некоторых вариантах реализации, сахарный фрагмент или аналог сахарного фрагмента нуклеозида может быть модифицированным или замещенным в любом положении.
При использовании в настоящем документе, «2'-модифицированный сахар» обозначает фуранозный сахар, модифицированный в 2'-положении. В некоторых вариантах реализации, такие модификации включают заместители, выбранные из: галогенида, включая, но не ограничиваясь этим, замещенный и незамещенный алкокси, замещенный и незамещенный тиоалкил, замещенный и незамещенный аминоалкил, замещенный и незамещенный алкил, замещенный и незамещенный аллил, и замещенный и незамещенный алкинил. В некоторых вариантах реализации, 2'-модификации выбраны из заместителей, включающих, но не ограничиваясь этим: O[(СН2)nO]mCH3, O(CH2)nNH2, O(СН2)nCH3, O(CH2)nONH2, ОСН2С(=O)n(Н)СН3 и O(СН2)nO|N[(СН2)nCH3]2, причем пит равны от 1 до около 10. Другие группы 2'-заместителей также могут быть выбраны из: C1-C12 алкила; замещенного алкила; алкенила; алкинила; алкарила; аралкила; O-алкарила или O-аралкила; SH; SCH3; OCN; Cl; Br; CN; CF3; OCF3; SOCH3; SO2CH3; ONO2; NO2; N3; NH2; гетероциклоалкила; гетероциклоалкарила; аминоалкиламино; полиалкиламино; замещенного силила; РНК-расщепляющей группы; репортерной группы; интеркалятора; групп для улучшения фармакокинетических свойств; и групп для улучшения фармакодинамических свойств антисмыслового соединения, а также других заместителей, имеющих аналогичные свойства. В некоторых вариантах реализации, модифицированные нуклеозиды включают боковую цепь 2'-МОЕ (смотри, например. Baker et al., J. Biol. Chem., 1997, 272, 11944-12000). Такое 2'-МОЕ замещение может быть описано как обладающее улучшенной связывающей аффинностью по сравнению с не модифицированными нуклеозидами и с другими модифицированными нуклеозидами, такими как 2'-O-метил, O-пропил и O-аминопропил. Было также показано, что олигонуклеотиды, имеющие заместитель 2'-МОЕ, являются антисмысловыми ингибиторами генной экспрессии с многообещающими характеристиками для применения in vivo (смотри, например, Martin, P., Helv. Chim. Acta, 1995, 78, 486-504; Altmann et al., Chimia, 1996, 50, 168-176; Altmann et al., Biochem. Soc. Trans., 1996, 24, 630-637; и Altmann et al., Nucleosides Nucleotides, 1997, 16, 917-926).
При использовании в настоящем документе, «модифицированный тетрагидропирановый нуклеозид» или «модифицированный ТГП нуклеозид» обозначает нуклеозид, имеющий шестичленный тетрагидропирановый «сахар», замещающий пентафуранозный остаток в нормальных нуклеозидах (заменитель сахара). Модифицированные ТГП нуклеозиды включают, но не ограничиваясь этим, так называемые гекситоловые нуклеиновые кислоты (ГНК), анитоловые нуклеиновые кислоты (АНК), маннитоловые нуклеиновые кислоты (МНК) (смотри Leumann, CJ. Bioorg. & Med. Chem. (2002) 10:841-854), фтор-ГНК (F-ГНК) или соединения, имеющие Формулу X:
Формула X:
причем независимо для каждого из упомянутого по меньшей мере одного тетрагидропиранового нуклеозидного аналога Формулы X:
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания;
Т3 и Т4, каждый независимо, межнуклеозидная связывающая группа, связывающая тетрагидропирановый нуклеозидный аналог с антисмысловым соединением или одним из Т3 и Т4, представляет собой межнуклеозидную связывающую группу, связывающую тетрагидропирановый нуклеозидный аналог с антисмысловым соединением, а другой из Т3 и Т4 представляет собой Н, гидрокси-защитную группу, связанную сопряженную группу или 5' или 3'-концевую группу;
q1, q2, q3, q4, q5, q6 и q7, каждый независимо, представляет собой, Н, C1-С6 алкил, замещенный C1-С6 алкил, С2-С6 алкенил, замещенный С2-С6 алкенил, С2-С6 алкинил или замещенный С2-С6 алкинил; и
один из R1 и R2 представляет собой водород, а другой выбран из галогена, замещенного или незамещенного алкокси, NJ1J2, SJ1, N3, OC(=X)J1, ОС(=Х)NJ1J2, NJ3C(=X)NJ1J2 и CN, причем X представляет собой О, S или NJ1, и каждый J1, J2 и J3 независимо представляет собой Н или C1-С6 алкил.
В некоторых вариантах реализации, представлены модифицированные ТГП нуклеозиды Формулы X, в которых каждый qm, qn, qp, qr, qs, qt и qu представляет собой Н. В некоторых вариантах реализации по меньшей мере один из qm, qn, qp, qr, qs, qt и qu является отличным от Н. В некоторых вариантах реализации, по меньшей мере один из qm, qn, qp, qr, qs, qt и qu представляет собой метил. В некоторых вариантах реализации представлены ТГП нуклеозиды Формулы X, в которых один из R1 и R2 представляет собой F. В некоторых вариантах реализации R1 представляет собой фтор, a R2 представляет собой Н, R1 представляет собой метокси, а R2 представляет собой Н, и R1 представляет собой метоксиэтокси, а R2 представляет собой Н.
При использовании в настоящем документе, «2'-модифицированный нуклеозид» или «2'-замещенный нуклеозид» относится к нуклеозиду, включающему сахар, содержащий заместитель в 2'-положении фуранозного кольца, отличный от Н или ОН. 2'-модифицированные нуклеозиды включают, но не ограничиваясь этим, бициклические нуклеозиды, в которых мостик, соединяющий два углеродных атома сахароного кольца, соединяет 2' углерода и другой углерод сахарного кольца, а также нуклеозиды с немостиковыми 2' заместителями, такими как аллил, амино, азидо, тио, O-аллил, O-C1-C10 алкил, -OCF3, O-(СН2)2-O-СН3, 2'-O(СН2)2SCH3, O-(CH2)2-O-N(Rm)(Rn) или O-СН2-С(=O)-N(Rm)(Rn), причем каждый Rm и Rn независимо представляет собой Н или замещенный или незамещенный C1-С10 алкил. 2'-модифицированные нуклеозиды могут дополнительно содержать другие модификации, например, в других положениях сахара и/или в нуклеоосновании.
При использовании в настоящем документе, «2'-F» относится к сахару, содержащему фтор-группу в 2'-положении.
При использовании в настоящем документе, «2'-ОМе» или «2'-ОСН3», или «2'-O-метил», каждый относится к нуклеозиду, включающему сахар, содержащий группу -ОСН3 в 2'-положении сахарного кольца.
При использовании в настоящем документе, «олигонуклеотид» относится к соединению, содержащему множество связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, один или несколько из множества нуклеозидов являются модифицированными. В некоторых вариантах реализации, олигонуклеотид содержит один или несколько рибонуклеозидов (РНК) и/или дезоксирибонуклеозидов (ДНК).
В данной области техники известны многие другие бициклические и трициклические кольцевые системы, заменяющие сахар, которые могут быть использованы для модификации нуклеозидов для внедрения в антисмысловые соединения (смотри, например, обзорную статью: Leumann, J.С, Bioorganic & Medicinal Chemistry, 2002, 10, 841-854). Такие кольцевые системы могут подвергаться различным дополнительным замещениям для усиления активности.
Специалистам в данной области хорошо известны способы получения модифицированных сахаров.
В нуклеотидах, имеющих модифицированные сахарные фрагменты, фрагменты нуклеооснования (природные, модифицированные или их комбинации) сохраняются для гибридизации с соответствующей мишенью нуклеиновой кислоты.
В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения содержат один или несколько нуклеотидов, имеющих модифицированные сахарные фрагменты. В некоторых вариантах реализации, модифицированный сахарный фрагмент представляет собой 2'-МОЕ. В некоторых вариантах реализации, 2'-МОЕ модифицированные нуклеотиды расположены в мотиве химерного олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации, модифицированный сахарный фрагмент представляет собой cEt. В некоторых вариантах реализации cEt модифицированные нуклеотиды расположены в крыльях мотива химерного олигонуклеотида.
Композиции и способы составления фармацевтических композиций
Антисмысловые олигонуклеотиды могут быть смешаны с фармацевтически приемлемыми активными или инертными веществами для получения фармацевтических композиций или рецептур. Композиции и способы составления фармацевтических композиций зависят от ряда критериев, включая, но не ограничиваясь этим, способ введения, степень заболевания или дозу, подлежащую введению.
Антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, может быть использовано в фармацевтических композициях путем смешивания указанного антисмыслового соединения с соответствующим фармацевтически приемлемым разбавителем или носителем. Фармацевтически приемлемый разбавитель включает фосфатно-солевой буферный раствор (PBS). PBS представляет собой разбавитель, пригодный для применения в композициях, доставляемых парентерально. Соответственно, в одном варианте реализации, используемом в способах, описанных в настоящем документе, представлена фармацевтическая композиция, включающая антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, и фармацевтически приемлемый разбавитель. В некоторых вариантах реализации, фармацевтически приемлемый разбавитель представляет собой PBS. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение представляет собой антисмысловый олигонуклеотид.
Фармацевтические композиции, включающие антисмысловые соединения, охватывают любые фармацевтически приемлемые соли, сложные эфиры или соли таких сложных эфиров, или любые другие олигонуклеотиды, которые, при введении животному, включая человека, могут обеспечивать (прямо или косвенно) биологически активный метаболит или его остаток. Соответственно, например, настоящее описание относится также к фармацевтически приемлемым солям антисмысловых соединений, пролекарствам, фармацевтически приемлемым солям таких пролекарств и другим биоэквивалентам. Применимые фармацевтически приемлемые соли включают, но не ограничиваясь этим, соли натрия и калия.
Пролекарство может включать внедрение дополнительных нуклеозидов с одного или с обоих концов антисмыслового соединения, которые расщепляются под действием эндогенных нуклеаз в организме, с образованием активного антисмыслового соединения.
Сопряженные антисмысловые соединения
Антисмысловые соединения могут быть ковалентно связаны с одним или несколькими фрагментами или конъюгатами, которые усиливают активность, клеточное распределение или клеточное поглощение образующихся антисмысловых олигонуклеотидов. Типичные сопряженные группы включают холестериновые фрагменты и жировые фрагменты. Дополнительные сопряженные группы включают углеводы, фосфолипиды, биотин, феназин, фолат, фенантридин, антрахинон, акридин, флуоресцеины, родамины, кумарины и красители.
Антисмысловые соединения могут быть также модифицированы для получения одной или нескольких стабилизирующих групп, которые обычно присоединяются к одному или к обоим концам антисмысловых соединений для усиления свойств, таких как, например, устойчивость к действию нуклеаз. В стабилизирующие группы включены кэп-структуры. Эти концевые модификации защищают антисмысловое соединение, имеющее концевую нуклеиновую кислоту, от экзонуклеазного расщепления, и могут способствовать доставке и/или локализации в клетке. Кэп может присутствовать на 5'-конце (5'-кэп) или на 3'-конце (3'-кэп), или может присутствовать на обоих концах. Кэп-структуры хорошо известны в данной области и включают, например, инвертированные дезокси-кэпы с удаленными азотистыми основаниями. Дополнительные 3' и 5'-стабилизирующие группы, которые могут быть использованы для закрывания одного или обоих концов антисмыслового соединения, чтобы обеспечить устойчивость к действию нуклеаз, включают группы, описанные в WO 03/004602, опубликованной 16 января 2003 года.
Клеточная культура и обработка антисмысловыми соединениями
Влияние антисмысловых соединений на уровень, активность или экспрессию нуклеиновых кислот HBV может быть испытана in vitro в различных типах клеток. Клеточные, используемые для таких анализов, доступны в продаже у коммерческих поставщиков (например, American Type Culture Collection, Manassus, штат Вирджиния; Zen-Bio, Inc., Research Triangle Park, штат Северная Калифорния; Clonetics Corporation, Walkersville, штат Мэриленд), и их выращивают в соответствии с инструкциями поставщика с использованием имеющихся в продаже реактивов (например, Invitrogen Life Technologies, Carlsbad, штат Калифорния). Иллюстративные клеточные типы включают, но не ограничиваясь этим, клетки HuVEC, клетки b.END, клетки HepG2, клетки Нер3В и первичные гепатоциты.
In vitro испытание антисмысловых олигонуклеотидов
В настоящем документе описаны способы обработки клеток антисмысловыми олигонуклеотидами, которые могут быть модифицированы соответствующим образом для обаботки другими антисмысловыми соединениями.
Клетки могут быть обработаны антисмысловыми олигонуклеотидами, когда клетки достигают примерно 60-80% слияния в культуре.
Один реагент, которые обычно используют для введения антисмысловых олигонуклеотидов в выращенные клетки, включает катионный липидный реагент трансфекции LIPOFECTIN (Invitrogen, Карлсбад, штат Калифорния). Антисмысловые олигонуклеотиды могут быть смешаны с LIPOFECTIN в среде OPTI-MEM 1 (Invitrogen, Карлсбад, штат Калифорния) для достижения заданной конечной концентрации антисмыслового олигонуклеотида и концентрации LIPOFECTIN, которая может находиться в диапазоне от 2 до 12 мкг/мл на 100 нМ антисмыслового олигонуклеотида.
Другой реагент, используемый для введения антисмысловых олигонуклеотидов в выращенные клетки, включает LIPOFECTAMINE (Invitrogen, Карлсбад, штат Калифорния). Антисмысловый олигонуклеотид может быть смешан с LIPOFECTAMINE в среде OPTI-MEM 1 с пониженным содержанием сыворотки (Invitrogen, Карлсбад, штат Калифорния) для достижения заданной концентрации антисмыслового олигонуклеотида и концентрации LIPOFECTAMINE, которая может находиться в диапазоне от 2 до 12 мкг/мл на 100 нМ антисмыслового олигонуклеотида.
Другие методики, используемые для введения антисмысловых олигонуклеотидов в выращенные клетки, включают электропорацию.
Клетки обрабатывают антисмысловыми олигонуклеотидами стандартами способами. Клетки могут быть собраны через 16-24 часа после обработки антисмысловым олигонуклеотидов, и в это время измеряют уровни РНК или белка целевых нуклеиновых кислот по способам, известным в данной области техники и описанным в настоящем документе. Как правило, при выполнении обработки в нескольких экземплярах, данные представляют как среднее значение повторных обработок.
Используемая концентрация антисмыслового олигонуклеотида варьируется от одной клеточной линии к другой. Способы определения оптимальной концентрации антисмыслового олигонуклеотида для конкретной клеточной линии хорошо известны в данной области. Антисмысловые олигонуклеотиды, как правило, используют в концентрациях от 1 нМ до 300 нМ, при трансфекции с LIPOFECTAMINE. Антисмысловые олигонуклеотиды использую в более высоких концентрациях, от 625 до 20000 нМ, при трансфекции при помощи электропорации.
Выделение РНК
Анализ РНК может быть выполнен на общей клеточной РНК или поли(А)+мРНК. В данной области техники известны способы выделения РНК. РНК готовят с использованием способов, хорошо известных в данной области, например, используя реагент TRIZOL (Invitrogen, Карлсбад, штат Калифорния) по методикам, рекомендованным производителем.
Анализ ингибированш уровней или экспрессии мишени
Ингибирование уровней или экспрессии нуклеиновой кислоты HBV может быть анализировано различными способами, известными в данной области. Нарпимер, уровни целевой нуклеиновой кислоты могут быть количественно определены, например, нозерн-блоттингом, сравнительной полимеразной цепной реакцией (ПЦР) или количественной ПЦР в реальном времени. Анализ РНК может быть выполнен на общей клеточной РНК или поли(А)+мРНК. Способы выделения РНК хорошо известны в данной области. Анализ нозерн-блоттинга также является стандартным в данной области. Количественная ПЦР в реальном времени может быть легко осуществлена с использованием имеющейся в продаже системы обнаружения последовательностей ABI PRISM 7600, 7700 или 7900 производства PE-Applied Biosystems, Фостер-сити, штат Калифорния, которую используют в соответствии с инструкциями производителя.
Количественный анализ ПЦР в реальном времени уровней целевой РНК
Количественное определение уровней целевой РНК может быть осуществлено количественной ПЦР в реальном времени с использованием системы обнаружения последовательностей ABI PRISM 7600, 7700 или 7900 (PE-Applied Biosystems, Фостер-сити, штат Калифорния) по инструкциям производителя. Способы количественной ПЦР в реальном времени хорошо известны в данной области техники.
Перед ПЦР в реальном времени, выделенную РНК подвергают реакции с обратной транскриптазой (RT), в результате чего образуется комплементарная ДНК (кДНК), которую затем используют как субстрат для амплификации ПЦР в реальном времени. Реакции RT и ПЦР в реальном времени выполняют последовательно в одной и той же лунке с образцом. Реактивы для RT и ПЦР в реальном времени можно приобрести у компании Invitrogen (Карлсбад, штат Калифорния). Реакции RT и ПЦР в реальном времени выполняют по способам, хорошо известным специалистам в данной области.
Количества целевого гена (или РНК), полученные по ПЦР в реальном времени, нормализуют с использованием уровня экспрессии гена, экспрессия которого является постоянной, такого как циклофилин А, или количественным определением общей РНК, используя RIBOGREEN (Invitrogen Inc., Карлсбад, штат Калифорния). Экспрессию циклофилина А количественно определяют по ПЦР в реальном времени, которую осуществляют одновременно с мишенью, поочередно или отдельно. Общую РНК количественно определяют с использованием реагента для количественного определения РНК RIBOGREEN (Invetrogen Inc., Юджин, штат Орегон). Способы количественного определения РНК при помощи RIBOGREEN описаны в публикации Jones, L.J., et al., (Analytical Biochemistry, 1998, 265, 368-374). Для измерения флуоресценции RIBOGREEN используют прибор CYTOFLUOR 4000 (РЕ Applied Biosystems).
Образцы и праймеры предназначены для гибридизации с нуклеиновой кислотой HBV. Способы разработки образцов и праймеров для ПЦР в реальном времени хорошо известны в данной области, и могут включать применение программного обеспечения, такого как программа PRIMER EXPRESS (Applied Biosystems, Фостер-сити, штат Калифорния).
Количественный анализ ПЦР в реальном времени уровней целевой ДНК
Количественное определение уровней целевой ДНК может быть осуществлено количественной ПЦР в реальном времени с использованием системы обнаружения последовательностей ABI PRISM 7600, 7700 или 7900 (PE-Applied Biosystems, Фостер-сити, штат Калифорния) по инструкциям производителя. Способы количественной ПЦР в реальном времени хорошо известны в данной области техники.
Количества целевого гена (или ДНК), полученные по ПЦР в реальном времени, нормализуют с использованием уровня экспрессии гена, экспрессия которого является постоянной, такого как циклофилин А, или количественным определением общей ДНК, используя RIBOGREEN (Invitrogen Inc., Карлсбад, штат Калифорния). Экспрессию циклофилина А количественно определяют по ПЦР в реальном времени, которую осуществляют одновременно с мишенью, поочередно или отдельно. Общую ДНК количественно определяют с использованием реагента для количественного определения РНК RIBOGREEN (Invetrogen Inc., Юджин, штат Орегон). Способы количественного определения ДНК при помощи RIBOGREEN описаны в публикации Jones, L.J., et al., (Analytical Biochemistry, 1998, 265, 368-374). Для измерения флуоресценции RIBOGREEN используют прибор CYTOFLUOR 4000 (РЕ Applied Biosystems).
Образцы и праймеры предназначены для гибридизации с нуклеиновой кислотой HBV. Способы разработки образцов и праймеров для ПЦР в реальном времени хорошо известны в данной области, и могут включать применение программного обеспечения, такого как программа PRIMER EXPRESS (Applied Biosystems, Фостер-сити, штат Калифорния).
Анализ уровней белка
Антисмысловое ингибирование нуклеиновых кислот HBV может быть определено измерением уровней белка HBV. Уровни белка HBV могут быть оценены или количественно определены различными способами, хорошо известными в данной области, такими как иммунопреципитация, анализ вестерн-блоттинга (иммуноблоттинг), иммуноферментный твердофазный анализ (ELISA), количественные анализы белка, анализы активности белка (например, анализы активности каспазы), иммуногистохимия, иммуноцитохимия или сортировка флуоресцентно-активированных клеток (FACS). Антитела, направленные на мишень, могут быть идентифицированы и получены из различных источников, таких как каталог антител MSRS (Aerie Corporation, Бирмингем, штат Мичиган), или могут быть получены стандартными способами получения моноклональных или поликлональных антител, хорошо известными в данной области.
In vivo исследование антисмысловых соединений
Антисмысловые соединения, например, антисмысловые олигониклеотиды, испытывают на животных для оценки их способности ингибировать экспрессию HBV и вызывать фенотипические изменения. Испытание может быть выполнено на здоровых животных или в экспериментальных моделях заболеваний. Для введения животным, антисмысловые олигонуклеотиды составляют в композицию в фармацевтически приемлемом разбавителе, таком как фосфатно-солевой буферный раствор. Введение включает парентеральные пути введения, такие как внутрибрюшинное, внутривенное, подкожное, интратекальное и интрацеребровентрикулярное. Расчет дозы антисмыслового олигонуклеотида и частоты доз находится в рамках возможностей специалистов в данной области и зависит от таких факторов, как способ введения и вес тела животного. После периода обработки антисмысловыми олигонуклеотидами, РНК выделяют из печеночной ткани и измеряют изменения экспрессии нуклеиновой кислоты HBV. Измеряют также изменения уровней ДНК HBV. Измеряют также изменения уровней белка HBV. Измеряют также изменения уровней HBeAg HBV. Измеряют также изменения уровней HBsAg HBV.
Некоторые показания
В некоторых вариантах реализации, в настоящем документе представлены способы, соединения и композиции для лечения пациента, включающие введение одной или нескольких фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, пациент страдает HBV-связанным состоянием. В некоторых вариантах реализации, хроническая инфекция HBV, воспаление, фиброз, цирроз, рак печени, серозный гепатит, желтуха, рак печени, воспаление печени, фиброз печени, цирроз печени, печеночная недостаточность, диффузное гепатоцеллюлярное воспалительное заболевание, гепофагоцитарный синдром, серозный гепатит и виремия HBV. В некоторых вариантах реализации, HBV-связанное состояние может включать любое или все из следующих: болезнь, похожую на грипп, слабость, боли, головную боль, жар, потерю аппетита, диарею, желтуху, тошноту и рвоту, боль в области печени, стул земляного или серого цвета, зуд по всему телу и мочу темного цвета, в сочетании с положительным тестом на присутствие вируса гепатита В, вирусного антигена гепатита В или положительным тестом на присутствие антитела, специфичного к вирусному антигену гепатита В. В некоторых вариантах реализации, пациент имеет риск HBV-связанного состояния. Сюда входят пациенты, имеющие один или несколько факторов риска для развития HBV-связанного состояния, включая половые отношения с пациентом, инфицированным вирусом гепатита В, проживание в одном доме с пациентом с хронической инфекцией вируса гепатита В, воздействие крови человека, инфицированного вирусом гепатита В, инъекция запрещенных лекарств, заболевание гемофилией и посещение мест распространения гепатита В. В некоторых вариантах реализации, пациента определяют как нуждающегося в лечении HBV-связанного состояния. В некоторых вариантах реализации, в настоящем документе представлены способы профилактического снижения экспрессии HBV у пациента. Некоторые варианты реализации включают лечение пациента, нуждающегося в этом, путем введения пациенту терапевтически эффективного количества антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV.
За счет пересечения путей передачи, многие люди подвергаются воздействию вируса гепатита В (HBV) и вируса гепатита С (HCV), и меньшая часть является хронически инфицированной обоими вирусами, особенно в таких регионах, как Азия, где HBV является эндемичным. По оценкам, до 10% людей с HCV могут также страдать HBV, тогда как, вероятно, 20% людей с HBV инфицированы также HCV. Однако лечение гепатита В или гепатита В у пациентов, инфицированных одновременно HBV-HCV, не было хорошо изучено. Лечение усложняется тем фактом, что HCV и HBV ингибируют репликацию друг друга (хотя это взаимодействие наблюдалось не во всех исследованиях). Следовательно, лечение, которое полностью подавляет HBV, может потенциально снижать рецидив HCV или наоборот. Поэтому соединения и композиции, описанные в настоящем документе, могут быть преимущественно использованы для лечения пациентов, инфицированных одновременно HBV и HCV. Примеры возможностей лечения гепатита С (HCV) включают интерфероны, например, интерферон-альфа-2b, интерферон альфа-2а и интерферон альфакон-1. Более редкая частота дозирования интерферона может быть достигнута при использовании пегилированного интерферона (интерферона, присоединенного к полиэтиленгликольному фрагменту, что улучшает его фармакокинетический профиль). Было также показано, что комплексная терапия с интерфероном альфа-2b (пегилированным и не пегилированным) и рибавирином является преимущественной для некоторых групп пациентов. Другие средства, разработанные в настоящее время, включают ингибиторы репликации РНК HCV (например, серии VP50406 производства ViroPharma), антисмысловые агенты HCV, терапевтические вакцины HCV, ингибиторы протеазы HCV, ингибиторы геликазы HCV и терапию антителами HCV (моноклональными или поликлональными).
В некоторых вариантах реализации, лечение способами, соединениями и композициями, описанными в настоящем документе, применимо для предупреждения HBV-связанного состояния, обусловленного наличием вируса гепатита В. В некоторых вариантах реализации, лечение способами, соединениями и композициями, описанными в настоящем документе, применимо для предупреждения HBV-связанного состояния.
В одном варианте реализации, введение терапевтически эффективного количества антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV, сопровождается контролированием уровней мРНК HBV в сыворотке пациента для определения реакции пациента на введение антисмыслового соединения. В некоторых вариантах реализации, введение терапевтически эффективного количества антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV, сопровождается контролированием уровней ДНК HBV в сыворотке пациента для определения реакции пациента на введение антисмыслового соединения. В некоторых вариантах реализации, введение терапевтически эффективного количества антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV, сопровождается контролированием уровней белка HBV в сыворотке пациента для определения реакции пациента на введение антисмыслового соединения. В некоторых вариантах реализации, введение терапевтически эффективного количества антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV, сопровождается контролированием уровней антигена S HBV (HbsAg) в сыворотке пациента для определения реакции пациента на введение антисмыслового соединения. В некоторых вариантах реализации, введение терапевтически эффективного количества антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV, сопровождается контролированием уровней антигена Е HBV (HBeAg) в сыворотке пациента для определения реакции пациента на введение антисмыслового соединения. Реакцию пациента на введение антисмыслового соединения врач использует для определения количества и продолжительности терапевтического вмешательства.
В некоторых вариантах реализации, введение антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV, приводит к снижению экспрессии HBV по меньшей мере на 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95 или 99%, или в диапазоне, определенном двумя из этих значений. В некоторых вариантах реализации, введение антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV, приводит к уменьшению симптомов, связанных с HBV-связанным состоянием, и к снижению HBV-связанных маркеров в крови. В некоторых вариантах реализации, введение антисмыслового соединения HBV снижает уровни РНК HBV, уровни ДНК HBV, уровни белка HBV, уровни HBsAg или уровни HBeAg по меньшей мере на 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95 или 99%, или в диапазоне, определенном двумя из этих значений.
В некоторых вариантах реализации, фармацевтические композиции, содержащие антисмысловое соединение, направленное на HBV, используют для получения лекарственных средств для лечения пациента, страдающего или восприимчивого к HBV-связанному состоянию.
Некоторые комплексные терапии
В некоторых вариантах реализации, одну или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе, вводят совместно с одним или несколькими другими фармацевтическими средствами. В некоторых вариантах реализации, такое одно или несколько других фармацевтических средств предназначены для лечения того же заболевания, расстройства или состояния, что и одна или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, такое одно или несколько других фармацевтических средств предназначены для лечения другого заболевания, расстройства или состояния, чем одна или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, такое одно или несколько других фармацевтических средств предназначены для лечения нежелательного побочного действия одной или нескольких фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, одну или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе, вводят совместно с другим фармацевтическим средством для лечения нежелательного действия этого другого фармацевтического средства. В некоторых вариантах реализации, одну или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе, вводят совместно с другим фармацевтическим средством для получения комбинационного эффекта. В некоторых вариантах реализации, одну или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе, вводят совместно с другим фармацевтическим средством для получения синергетического эффекта.
В некоторых вариантах реализации, одну или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе, и один или несколько других фармацевтических средств вводят одновременно. В некоторых вариантах реализации, одну или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе, и один или несколько других фармацевтических средств вводят в разное время. В некоторых вариантах реализации, одну или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе, и один или несколько других фармацевтических средств готовят вместе в одной композиции. В некоторых вариантах реализации, одну или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе, и один или несколько других фармацевтических средств готовят по отдельности. В некоторых вариантах реализации, описанные антисмысловые олигонуклеотиды вводят в комбинации с HCV агентом. В следующих вариантах реализации, HCV соединение вводят одновременно с антисмысловым соединением; в других вариантах реализации, HCV соединение вводят отдельно; так, чтобы дозы HCV агента и антисмыслового соединения перекрывались, по времени, в организме пациента. В родственных вариантах реализации, агент HCV может быть выбран из интерферона альфа-2b, интерферона альфа-2а и интерферона альфакон-1 (пегилированного и не пегилированного); рибавирина; ингибитора репликации РНК HCV (например, серии VP50406 производства ViroPharma); антисмыслового агента HCV; терапевтической вакцины HCV; ингибитора протеазы HCV; ингибитора геликазы HCV; и терапии HCV антителами (моноклональными или поликлональными антителами).
В других вариантах реализации, антисмысловое соединение HBV настоящего изобретения может быть введено пациенту, инфицированному HBV, в комбинации с одним или несколькими HBV терапевтическими средствами, причем одно или несколько HBV терапевтических средств могут быть введены в той же лекарственной композиции, что и соединение антисмыслового олигонуклеотида HBV, или могут быть введены в отдельной композиции. Одно или несколько HBV терапевтических средств могут быть введены одновременно с соединением антисмыслового олигонуклеотида HBV, или могут быть введены отдельно, так, чтобы дозы соединения антисмыслового олигонуклеотида HBV и терапевтического агента HBV перекрывались, по времени, в организме пациента. В родственных вариантах реализации, одно или несколько HBV терапевтических средств могут быть выбраны из интерферона альфа-2b, интерферона альфа-2а и интерферона альфакон-1 (пегилированного и не пегилированного), рибавирина; ингибитора репликации РНК HBV; второго антисмыслового соединения HBV; терапевтической вакцины HBV; профилактической вакцины HBV; ламивудина (3ТС); энтекавира (ETV); тенофовира; телбивудина (LdT); адефовира; и терапии HBV антителами (моноклональными или поликлональными).
ПРИМЕРЫ
Исключение ограничения настоящего описания и включение путем ссылки
Хотя некоторые соединения, композиции и способы, описанные в настоящем документе, были описаны с особенностями в соответствии с некоторыми вариантами реализации, следующие примеры служат лишь для иллюстрации соединений, описанных в настоящем документе, и не предназначены для их ограничения. Каждая ссылка, цитируемая в настоящей заявке, включена в настоящий документ путем ссылки в полном объеме.
Пример 1: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК HBV в клетках HepG2.2.15 химерными олигонуклеотидами МОЕ
Антисмысловые олигонуклеотиды были разработаны для направленного действия на вирусную нуклеиновую кислоту HBV, и были испытаны на их действие на мРНК HBV in vitro. Культивированные клетки HepG2.2.15 при плотности 25000 клеток на лунку трансфицировали при помощи электропорации 15000 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Набор вирусных затравочных зондов RTS3370 (прямая последовательность CTTGGTCATGGGCCATCAG, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:2; обратная последовательность CGGCTAGGAGTTCCGCAGTA, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:3; последовательность зонда TGCGTGGAACCTTTTCGGCTCC, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:4) использовали для измерения уровней мРНК. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.
Новые разработанные химерные антисмысловые олигонуклеотиды в Таблице 1 разработали как 5-10-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды или 3-10-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды. 5-10-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по пять нуклеозидов. 3-10-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 17 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие три и 4 нуклеозида, соответственно. Каждый нуклеозид в 5' сегменте крыла, и каждый нуклеозид в 3' сегменте крыла имеет МОЕ модификацию сахара. Каждый нуклеозид в центральном сегменте гэп имеет дезокси-сахарную модификацию. Межнуклеозидные связи в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой фосфотиоатные (P=S) связи. Все цитозиновые остатки в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой 5-метилцитозины.
«Вирусный целевой сайт инициации» указывает 5'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. «Вирусный целевой терминирующий сайт» указывает 3'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. Колонка «мотив» указывает структуру гэп и крыльев каждого химерного олигонуклеотида. Каждый химерный олигонуклеотид, перечисленный в Таблице 1, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1 (доступ GENBANK №U95551.1).
Пример 2: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК ИВУ в клетках HepG2.2.15 химерными олигонуклеотидами МОЕ
Дополнительные антисмысловые олигонуклеотиды были разработаны для направленного действия на вирусную нуклеиновую кислоту HBV, и были испытаны на их действие на мРНК HBV in vitro. Культивированные клетки HepG2.2.15 при плотности 25000 клеток на лунку трансфицировали при помощи электропорации 15000 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3370. RTS3370 обнаружил первичную мРНК и вторичные части транскриптов мРНК pre-S1, pre-S2 и pre-C. Химерные олигонуклеотиды испытали также с дополнительными наборами затравочных зондов. Набор вирусных затравочных зондов RTS3371 (прямая последовательность CCAAACCTTCGGACGGAAA, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:311; обратная последовательность TGAGGCCCACTCCCATAGG, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO: 312; последовательность зонда CCCATCATCCTGGGCTTTCGGAAAAT, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:313) также использовали для измерения уровней мРНК. RTS3371 обнаружил первичную мРНК и вторичные части транскриптов мРНК pre-S1, pre-S2 и pre-C, аналогичные RTS3370, но в других областях. Набор вирусных затравочных зондов RTS3372 (прямая последовательность ATCCTATCAACACTTCCGGAAACT, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:314; обратная последовательность CGACGCGGCGATTGAG, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:315; последовательность зонда AAGAACTCCCTCGCCTCGCAGACG, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:316) использовали для измерения уровней мРНК. RTS3372 обнарружил первичную геномную последовательность. Набор вирусных затравочных зондов RTS3373MGB (прямая последовательность CCGACCTTGAGGCATACTTCA, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:317; обратная последовательность AATTTATGCCTACAGCCTCCTAGTACA, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:318; последовательность зонда TTAAAGACTGGGAGGAGTTG, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:319) использовали для измерения уровней мРНК. RTS3373MGB обнаружил первичную мРНК и вторичные части транскриптов мРНК pre-S 1, pre-S2, pre-C и pre-Х.
Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.
Новые разработанные химерные антисмысловые олигонуклеотиды в Таблице 2 разработали как 5-10-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды или 3-10-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды, или 2-10-2 МОЕ химерные олигонуклеотиды. 5-10-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по пять нуклеозидов. 3-10-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 16 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по три нуклеозида. 2-10-2 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 14 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по два нуклеозида. Каждый нуклеозид в 5' сегменте крыла, и каждый нуклеозид в 3' сегменте крыла имеет МОЕ модификацию сахара. Каждый нуклеозид в центральном сегменте гэп имеет дезокси-сахарную модификацию. Межнуклеозидные связи в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой фосфотиоатные (P=S) связи. Все цитозиновые остатки в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой 5-метилцитозины.
«Сайт инициации» указывает 5'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. «Терминирующий сайт» указывает 3'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. Колонка «мотив» указывает структуру гэп и крыльев каждого химерного олигонуклеотида. Каждый химерный олигонуклеотид, перечисленный в Таблице 2, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1 (доступ GENBANK №U95551.1).
Пример 3: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК HBV в клетках HepAD38 (Tet-HBV) химерными олигонуклеотидами МОЕ
Некоторые антисмысловые олигонуклеотиды, выбранные из исследования, описанного в Примере 2, испытали на их влияние на мРНК HBV в другой клеточной линии, клетках гепатомы человека HepAD38, в которых выработка HBV контролируется тетрациклин-регулируемым промотором. Культивированные клетки HepAD38 (Tet-HBV) при плотности 45000 клеток на лунку трансфицировали при помощи электропорации 15000 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПНР в реальном времени. Наборы вирусных затравочных зондов RTS3372 и RTS3373MGB использовали по отдельности для измерения уровней мРНК. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены в Таблице 3 как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.
Пример 4: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК HBV в клетках HepAD38 (Tet-HBV) химерными олигонуклеотидами МОЕ
Некоторые антисмысловые олигонуклеотиды из исследования, описанного в Примерах 1 и 2, испытали на их влияние на мРНК HBV in vitro. Культивированные клетки HepAD38 (Tet-HBV) при плотности 45000 клеток на лунку трансфицировали при помощи электропорации 15000 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПНР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3372. При помощи набора затравочных зондов RTS3373MGB измерили также уровни мРНК. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены в Таблице 4 как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.
Пример 5: Зависимое от дозы ингибирование вирусной РНК HBV в клетках HepG2.2.15 химерными олигонуклеотидами МОЕ
Некоторые химерные олигонуклеотиды из исследования, описанного в Примерах 3 и 4, испытали при различных дозах в клетках HepG2.2.15 человека. Клетки поместили на планшет при плотности 25000 клеток на лунку и трансфицировали электропорацией антисмысловыми олигонуклеотидами в концентрациях 2, 5 мкМ, 5,0 мкМ, 10,0 мкМ и 20,0 мкМ, как показано в Таблице 5. Примерно через 16 часов обработки, РНК выделили из клеток, и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3370. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.
Полумаксимальные ингибирующие концентрации (IC50) каждого олигонуклеотида также представлены в Таблице 5. Как показано в Таблице 5, в клетках, обработанных антисмысловыми олигонуклеотидами, существенно снизились уровни мРНК HBV зависимым от дозы образом.
Пример б: Зависимое от дозы ингибирование вирусной РНК HBV в клетках HepG2.2.15 химерными олигонуклеотидами МОЕ
Дополнительные химерные олигонуклеотиды из исследования, описанного в Примерах 3 и 4, дополнительно испытали при различных дозах в клетках HepG2.2.15 человека. Клетки поместили на планшет при плотности 28000 клеток на лунку и трансфицировали при помощи реагента LipofectAMINE 2000® антисмысловыми олигонуклеотидами в концентрациях 15,625 нМ, 31,25 нМ, 62, 5 нМ, 125,0 нМ и 250,0 нМ, как показано в Таблице 6. Примерно через 16 часов обработки, РНК выделили из клеток, и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3370. Уровни мРНК
HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.
Полумаксимальные ингибирующие концентрации (IC50) каждого олигонуклеотида также представлены в Таблице 6. Как показано в Таблице 6, в некоторых клетках, обработанных антисмысловыми олигонуклеотидами, существенно снизились уровни мРНК HBV зависимым от дозы образом.
При помощи набора затравочных зондов RTS3371 измерили также уровни мРНК. Результаты представлены в Таблице 7.
Пример 7: Переносимость МОЕ химерных олигонуклеотидов, направленных на HBV, у мышей BALB/c
Мыши BALB/c mice (Charles River, штат Массачусетс) представляют собой многоцелевую модель мышей, которую часто использвют для испытаний безопасности и эффективности. Мышей обработали антисмысловыми олигонуклеотидами ISIS, выбранными из исследований, описанных выше, и оценили изменения уровней различных метаболических маркеров.
Испытание 1
Каждой мыши из группы четырех мышей BALB/c дважды в неделю, в течение 3 недель, подкожно вводили 50 мг/кг ISIS 146779, ISIS 146786, ISIS 505317, ISIS 505319, ISIS 505330, ISIS 505332, ISIS 505339, ISIS 505346, ISIS 505347, ISIS 505358, ISIS 509929, ISIS 509931, ISIS 509932, ISIS 509934, ISIS 509957, ISIS 510100, ISIS 510106, ISIS 510116 и ISIS 510140. Группе из четырех мышей BALB/c дважды в неделю, в течение 3 недель, подкожно вводили 50 мг/кг ISIS 141923 (CCTTCCCTGAAGGTTCCTCC (SEQ ID NO:320)), МОЕ химерного олигонуклеотида 5-10-5 без известной гомологии с какой-либо генной последовательностью человека или мыши. Другой группе из 4 мышей BALB/c дважды в неделю, в течение 3 недель, подкожно вводили PBS. Эта группа мышей служила в качестве контрольной группы. Через три дня после последней дозы в каждой временной точке измерили вес тела, мышей умертвили и собрали органы и плазму для дальнейшего анализа.
Вес тела и органов
Вес тела мышей измерили перед введением дозы и в конце каждого периода обработки. Вес тела представлен в Таблице 8 и выражен как процентное изменение от веса, измеренного перед началом обработки. В конце исследования измерили вес печени, селезенки и почек, значения представлены в Таблице 9 как процентная разница от веса соответствующего органа контрольного образца с PBS. Результаты показывают, что большинство олигонуклеотидов ISIS не приводят к каким-либо неблагоприятным эффектам на вес тела или органов.
Функция печени
Для оценки влияния олигонуклеотидов ISIS на печеночную функцию, измерили концентрации трансаминаз в плазме при помощи автоматического клинического анализатора химического состава (Hitachi Olympus AU400e, Мелвилл, штат Нью-Йорк). Измерили концентрации ALT (аланин-трансаминазы) и AST (аспартат-трансаминазы) в плазме и представили результаты, выраженные в МЕ/л, в Таблице 10. Измерили также уровни холестерина и триглицеридов в плазме, используя тот же клинический анализатор химического состава, и также представили результаты в Таблице 10.
Функция печени
Для оценки влияния олигонуклеотидов ISIS на почечную функцию, измерили концентрации азота мочевины крови (BUN) при помощи автоматического клинического анализатора химического состава (Hitachi Olympus AU400e, Мелвилл, штат Нью-Йорк). Результаты, выраженные в мг/дл, представлены в Таблице 11.
Испытание 2
Каждой мыши из группы четырех мышей BALB/c дважды в неделю, в течение 3 недель, подкожно вводили 50 мг/кг ISIS 505329, ISIS 509926, ISIS 509927, ISIS 509958, ISIS 509959, ISIS 509960, ISIS 509974, ISIS 509975, ISIS 510038, ISIS 510039, ISIS 510040, ISIS 510041 и ISIS 510050. Группе из 4 мышей BALB/c дважды в неделю, в течение 3 недель, подкожно вводили PBS. Эта группа мышей служила в качестве контрольной группы. Через три дня после последней дозы в каждой временной точке измерили вес тела, мышей умертвили и собрали органы и плазму для дальнейшего анализа.
Вес органов
В конце исследования измерили вес печени, селезенки и почек, и значения также представлены в Таблице 12 как процентное изменение от веса соответствующего органа контрольного образца с PBS.
Функция печени
Для оценки влияния олигонуклеотидов ISIS на печеночную функцию, измерили концентрации трансаминаз в плазме при помощи автоматического клинического анализатора химического состава (Hitachi Olympus AU400e, Мелвилл, штат Нью-Йорк). Измерили концентрации ALT (аланин-трансаминазы) и AST (аспартат-трансаминазы) в плазме и представили результаты, выраженные в МЕ/л, в Таблице 13.
Функция печени
Для оценки влияния олигонуклеотидов ISIS на почечную функцию, измерили концентрации азота мочевины крови (BUN) при помощи автоматического клинического анализатора химического состава (Hitachi Olympus AU400e, Мелвилл, штат Нью-Йорк). Результаты, выраженные в мг/дл, представлены в Таблице 14.
Пример 8: Завимое от дозы подтверждение направленного действия МОЕ химерных олигонуклеотидов на HBV в клетках HepG2.2.15
Химерные олигонуклеотиды выбрали на основании сохранения последовательности, активности и переносимости, по результатам измерения в исследовании, описанном в Примерах 7 и 8, и испытали в различных дозах на клетках HepG2.2.15. Клетки поместили на планшет при плотности 28000 клеток на лунку и трансфицировали при помощи реагента LipofectAMINE 2000 антисмысловым олигонуклеотидом в концентрациях 15,625 нМ, 31,25 нМ, 62, 5 нМ, 125,0 нМ и 250,0 нМ. Через два дня после трансфекции среду заменили свежей средой. Образцы собрали через 4 дня после трансфекции. В надосадочной жидкости измерили уровни ДНК, РНК, HBsAg и HBeAg.
Уровни мРНК HBV измерили количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор затравочных зондов RTS3370. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками. Как показано в Таблице 15, уровни мРНК HBV снизились зависимым от дозы образом в большинстве клеток, обработанных антисмысловым олигонуклеотидом.
Антигены HBV в надосадочных жидкостях обнаружили при помощи иммуноферментого анализа твердофазного (ELISA). Уровни антигена HBs (HBsAg) обнаружили иммуноферментным твердофазным анализом компании Abazyme LLC, штат Массачусетс. Как показано в Таблице 16, обработка олигонуклеотидами ISIS 146779, 146786, 505329, 505330, 505339, 505347, 505358, 509927, 509934, 509958, 509959, 509960, 509974, 5100038, 510039, 510040, 510041, 510100, 510106 и 510116 вызвала существенное снижение уровней HBsAg. Уровни антигена НВе (HBeAg) обнаружили иммуноферментным твердофазным анализом компании International Immune-diagnostics, штат Калифорния. Как показано в Таблице 17, обработка олигонуклеотидами ISIS 146779, 146786, 505329, 505330, 505339, 505347, 505358, 509927, 509934, 509958, 509959, 509960, 509974, 5100038, 510039, 510040, 510041, 510100, 510106 и 510116 вызвала существенное снижение уровней HBeAg. Уровни ДНК HBV измерили при помощи набора затравочных зондов RTS3370. Как показано в Таблице 18, обработка олигонуклеотидами ISIS 146779, 146786, 505329, 505330, 505339, 505347, 505358, 509927, 509934, 509958, 509959, 509960, 509974, 5100038, 510039, 510040, 510041, 510100, 510106 и 510116 вызвала существенное снижение уровней ДНК HBV. Общее содержание белка в надосадочных жидкостях измерили DC анализом белка (BioRad), как показано в Таблице 19.
Пример 9: In vivo ингибирование мРНК HBV МОЕ химерными олигонуклеотиды у HBV-трансгенных мышей
ISIS 146786, МОЕ химерный олигонуклеотид 5-10-5, и ISIS 510100, МОЕ химерный олигонуклеотид 3-10-4 МОЕ, демонстрирующие существенное ингибирование мРНК HBV, испытали на трансгенных мышах, содержащих ген HBV (линия Chisari 1.3.32) (Guidotti, L.G. et al., J. Virol. 1995, 69, 6158-6169) и оценили эффективность указанных химерных олигонуклеотидов.
Обработка
Двум группам по десять-одиннадцать HBV-трансгенных самцов и самок мышей дважды в неделю, в течение четырех недель, подкожно вводили 25 мг/кг ISIS 146786 или ISIS 510100. Другой группе из 14 самцов и самок HBV-трансгенных мышей вводили энтекавир, пероральное противовирусное лекарство, которое используют для лечения инфекции гепатита В, в дозе 1 мг/кг, ежедневно в течение двух недель. Другой группе из 10 самцов и самок HBV-трансгенных самок мышей подкожно вводили PBS дважны в неделю, в течение четырех недель. Мышей, которым делали инъекции PBS, использовали в качестве контрольной группы. Измерили уровни мРНК и ДНК HBV, ALT в плазме и вес тела и органов.
Анализ РНК
РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР HBV в реальном времени, используя наборы затравочных зондов RTS3370, RTS3371 и RTS3372. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК HBV, по сравнению с контрольным образцом с PBS. Как показано в Таблице 20, обработка антисмысловыми олигонуклеотидами ISIS привела к существенному снижению мРНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом, независимо от набора затравочных зондов, использованного для измерения. Энтекавир не снижает экспрессию мРНК HBV.
Анализ ДНК
ДНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР HBV в реальном времени, используя наборы затравочных зондов RTS3370 и RTS3371. Уровни нормализовали к RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом с PBS. Как показано в Таблице 21, обработка антисмысловыми олигонуклеотидами ISIS привела к существенному снижению ДНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом, независимо от набора затравочных зондов, использованного для измерения. Обработка энтекавиром, как и ожидалось, также снижает уровни ДНК.
Функция печени
Для оценки влияния олигонуклеотидов ISIS на печеночную функцию, измерили концентрации трансаминазы в плазме с использованием ручного клинического анализатора химическогосостава (Тесо Diagnostics, Анахайм, штат Калифорния). Измерили концентрации ALT (аланин-трансаминазы) и представили результаты, выраженные в МЕ/л, в Таблице 22. Эти результаты показывают, что антисмысловое ингибирование HBV не вызывает неблагоприятного действия на функцию печени мышей.
Данные этого исследования показывают, что ISIS 146786 and ISIS 510100 вызывают устойчивое снижение РНК и ДНК HBV в печени, и обработка этими олигонуклеотидами хорошо переносится трансгенными мышами.
Пример 10: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК HBV в клетках HepG2.2.15 химерными олигонуклеотидами МОЕ
Дополнительные антисмысловые олигонуклеотиды были разработаны для направленного действия на вирусную нуклеиновую кислоту HBV, и были испытаны на их действие на мРНК HBV in vitro. В этот анализ включили также несколько антисмысловых олигонуклеотидов из исследований, описанных выше. Культивированные клетки HepG2.2.15 при плотности 28000 клеток на лунку трансфицировали при помощи LipofectAMINE 2000® 100 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3370. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.
Новые разработанные химерные антисмысловые олигонуклеотиды в Таблице 23 были разработаны как 5-10-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды. Эти химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по пять нуклеозидов. Каждый нуклеозид в 5' сегменте крыла, и каждый нуклеозид в 3' сегменте крыла имеет МОЕ модификацию сахара. Каждый нуклеозид в центральном сегменте гэп имеет дезокси-сахарную модификацию. Межнуклеозидные связи в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой фосфотиоатные (P=S) связи. Все цитозиновые остатки в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой 5-метилцитозины.
«Вирусный целевой сайт инициации» указывает 5'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. «Вирусный целевой терминирующий сайт» указывает 3'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. Каждый химерный олигонуклеотид, перечисленный в Таблице 23, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1 (доступ GENBANK №U95551.1).
Пример 11: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК ИВУ в клетках HepG2.2.15 химерными олигонуклеотидами МОЕ
Дополнительные антисмысловые олигонуклеотиды были разработаны для направленного действия на вирусную нуклеиновую кислоту HBV, и были испытаны на их действие на мРНК HBV in vitro. В этот анализ включили также несколько антисмысловых олигонуклеотидов из исследований, описанных выше. Культивированные клетки HepG2.2.15 при плотности 28000 клеток на лунку трансфицировали при помощи LipofectAMINE 2000® 70 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3370. Уровни мРНК некоторых химерных олигонуклеотидов также измерили при помощи RTS3372. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.
Новые разработанные химерные антисмысловые олигонуклеотиды в Таблицах 24 и 25 были разработаны как 5-10-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды. Эти химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по пять нуклеозидов. Каждый нуклеозид в 5' сегменте крыла, и каждый нуклеозид в 3' сегменте крыла имеет МОЕ модификацию сахара. Каждый нуклеозид в центральном сегменте гэп имеет дезокси-сахарную модификацию. Межнуклеозидные связи в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой фосфотиоатные (P=S) связи. Все цитозиновые остатки в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой 5-метилцитозины.
«Вирусный целевой сайт инициации» указывает 5'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. «Вирусный целевой терминирующий сайт» указывает 3'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. Каждый химерный олигонуклеотид, перечисленный в Таблице 24, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1 (доступ GENBANK №U95551.1). Каждый химерный олигонуклеотид, перечисленный в Таблице 25, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1286 (переставленная версия доступа GENBANK №U95551.1). «Н/и» указывает, что данные ингибирования для этого конкретного химерного олигонуклеотида не были измерены конкретным набором затравочных зондов.
Пример 12: Зависимое от дозы ингибирование вирусной РНК HBV в клетках HepG2.2.15 химерными олигонуклеотидами МОЕ
Некоторые химерные олигонуклеотиды из исследования, описанного в Примерах 11 и 12, испытали при различных дозах в клетках HepG2.2.15 человека. Клетки поместили на планшет при плотности 28 ООО клеток на лунку и трансфицировали при помощи реагента LipofectAMINE 2000® антисмысловыми олигонуклеотидами в концентрациях 5, 56 нМ, 16,67 нМ, 50,0 нМ и 150,0 нМ, как показано в Таблице 26. Примерно через 16 часов обработки, РНК выделили из клеток, и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3370. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.
Полумаксимальные ингибирующие концентрации (IC50) каждого олигонуклеотида также представлены в Таблице 26. Как показано в Таблице 26, в клетках, обработанных антисмысловыми олигонуклеотидами, уровни мРНК HBV снизились зависимым от дозы образом.
Некоторые ISIS-олигонуклеотиды испытали также с использованием набора затравочных зондов RTS3372. Результаты представлены в Таблице 27.
Пример 13: Зависимое от дозы ингибирование вирусной РНК HBV в клетках HepG2.2.15 химерными олигонуклеотидами МОЕ
Некоторые химерные олигонуклеотиды из исследований, описанных выше, испытали при различных дозах на клетках HepG2.2.15 человека. Клетки поместили на планшет при плотности 30000 клеток на лунку и трансфицировали при помощи реагента LipofectAMINE 2000® антисмысловыми олигонуклеотидами в концентрациях 7,8125 нМ, 15,625 нМ, 31,25 нМ, 62, 5 нМ, 125,0 нМ и 250,0 нМ, как показано в Таблице 28. Примерно через 16 часов обработки, РНК выделили из клеток, и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3370. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.
Полумаксимальные ингибирующие концентрации (ICso) каждого олигонуклеотида также представлены в Таблице 28. Как показано в Таблице 28, в некоторых клетках, обработанных антисмысловыми олигонуклеотидами, уровни мРНК HBV снизились зависимым от дозы образом.
Пример 14: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК HBV в клетках HepG2 химерными олигонуклеотидами МОЕ
Антисмысловые олигонуклеотиды были разработаны для направленного действия на вирусную нуклеиновую кислоту HBV, и были испытаны на их действие на мРНК HBV in vitro. Антисмысловые олигонуклеотиды испытали в серии экспериментов, имеющих такие же культуральные условия. Результаты каждого эксперимента представлены в отдельных таблицах. Включили также ISIS 146786, 509934, ISIS 509959 и ISIS 510100 из исследований, описанных выше. Культивированные клетки HepG2 при плотности 28000 клеток на лунку трансфицировали при помощи LipofectAMINE 2000® 70 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПНР в реальном времени. Набор вирусных затравочных зондов RTS3370 (прямая последовательность CTTGGTCATGGGCCATCAG, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:2; обратная последовательность CGGCTAGGAGTTCCGCAGTA, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO: 3; последовательность зонда TGCGTGGAACCTTTTCGGCTCC, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:4) использовали для измерения уровней мРНК. Уровни измерили также с использованием набора затравочных зондов RTS3371 (прямая последовательность CCAAACCTTCGGACGGAAA, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:311; обратная последовательность TGAGGCCCACTCCCATAGG, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO: 312; последовательность зонда CCCATCATCCTGGGCTTTCGGAAAAT, в настоящем документе обозначена как SEQ Ю NO: 313). Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками. В некоторых анализах, показанных в Таблицах 32, 35, 42, 45 и 46, эффективность ISIS 146786 измерили в двух лунках на одном планшете. В этих случаях представлены значения уровней ингибирования в обеих лунках.
Новые разработанные химерные антисмысловые олигонуклеотиды в Таблицах ниже были разработаны как 2-9-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 2-9-6 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 2-10-8 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 3-9-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 3-9-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 3-10-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 3-10-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 3-10-7 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 4-9-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 4-9-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 4-10-6 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 5-9-2 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 5-9-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 5-10-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 6-9-2 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 6-10-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 7-10-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды или 8-10-2 МОЕ химерные олигонуклеотиды. 2-9-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 16 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит девять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие два и пять нуклеозидов, соответственно. 2-9-6 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 17 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит девять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие два и шесть нуклеозидов, соответственно. 2-10-8 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие два и восемь нуклеозидов, соответственно. 3-9-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 16 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит девять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие три и четыре нуклеозида, соответственно. 3-9-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 17 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит девять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие три и пять нуклеозидов, соответственно. 3-10-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 16 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по три нуклеозида. 3-10-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 17 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие три и четыре нуклеозида, соответственно. 3-10-7 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие три и семь нуклеозидов, соответственно. 4-9-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 16 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит девять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие четыре и три нуклеозида, соответственно. 4-9-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 17 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит девять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по четыре нуклеозидов. 4-10-6 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие четыре и шесть нуклеозидов, соответственно. 5-9-2 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 16 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит девять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие пять и два нуклеозида, соответственно. 5-9-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 17 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит девять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие пять и три нуклеозида, соответственно. 5-10-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по пять нуклеозидов. 6-9-2 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 17 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит девять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие шесть и два нуклеозида, соответственно. 6-10-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие шесть и четыре нуклеозида, соответственно. 7-10-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие семь и три нуклеозида, соответственно. 8-10-2 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие восемь и два нуклеозида, соответственно. Каждый нуклеозид в 5' сегменте крыла, и каждый нуклеозид в 3' сегменте крыла имеет МОЕ модификацию сахара. Колонка «мотив» указывает мотивы с количеством нуклеозидов в крыльях и сегменте гэп каждого олигонуклеотида. Межнуклеозидные связи в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой фосфотиоатные (P=S) связи. Все цитозиновые остатки в каждом олигонуклеотиде представляют собой 5-метилцитозины.
«Вирусный целевой сайт инициации» указывает 5'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. «Вирусный целевой терминирующий сайт» указывает 3'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. Колонка «мотив» указывает структуру гэп и крыльев каждого химерного олигонуклеотида. Каждый химерный олигонуклеотид, перечисленный в Таблицах, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1 (доступ GENBANK №LJ95551.1). Эффективность новых разработанных олигонуклеотидов сравнили с ISIS 146786, 509934, ISIS 509959 и 510100, информация для которых помещена в верхнюю часть каждой таблице.
Пример 15: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК HBV в клетках HepG2 дезокси-, МОЕ и (S)-cEt-химерными олигонуклеотидами
Антисмысловые олигонуклеотиды были разработаны для направленного действия на вирусную нуклеиновую кислоту HBV, и были испытаны на их действие на мРНК HBV in vitro. Антисмысловые олигонуклеотиды испытали в серии экспериментов, имеющих такие же культуральные условия. Результаты каждого эксперимента показаны в отдельных таблицах, представленных ниже. ISIS 146786 и ISIS 509934, которые были описаны в более ранней заявке (предварительная заявка на патент США №61/478040, поданная 21 апреля 2011 года), также включили в эти исследования для сравнения. Культивированные клетки HepG2 при плотности 28000 клеток на лунку трансфицировали при помощи LipofectAMINE 2000® 70 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Набор вирусных затравочных зондов RTS3370 (прямая последовательность CTTGGTCATGGGCCATCAG, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:1; обратная последовательность CGGCTAGGAGTTCCGCAGTA, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:2; последовательность зонда TGCGTGGAACCTTTTCGGCTCC, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:3) использовали для измерения уровней мРНК. Уровни измерили также с использованием набора затравочных зондов RTS3371 (прямая последовательность CCAAACCTTCGGACGGAAA, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:311; обратная последовательность TGAGGCCCACTCCCATAGG, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:312; последовательность зонда CCCATCATCCTGGGCTTTCGGAAAAT, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:313). Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.
Новые разработанные химерные антисмысловые олигонуклеотиды в Таблицах ниже были разработаны как дезокси-, МОЕ и (S)-cEt химерные олигонуклеотиды. Эти химерные олигонуклеотиды имеют 16 нуклеозидов в длину, причем нуклеозид имеет или МОЕ сахарную модификацию, или (S)-cEt сахарную модификацию, или дезокси-модификацию. Колонка «химия» описывает модификации сахара каждого олигонуклеотида. «k» обозначает (S)-cEt модификацию сахара; число обозначает количество дезоксинуклеозидов; и «е» обозначает модификацию МОЕ. Межнуклеозидные связи в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой фосфотиоатные (P=S) связи. Все цитозиновые остатки в каждом олигонуклеотиде представляют собой 5-метилцитозины.
«Вирусный целевой сайт инициации» указывает 5'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. «Вирусный целевой терминирующий сайт» указывает 3'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. Каждый химерный олигонуклеотид, перечисленный в Таблицах, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1 (доступ GENBANK №U95551.1). Эффективность новых разработанных олигонуклеотидов сравнили с ISIS 146786, 509934, ISIS 509959 и ISIS 510100.
Пример 16: Зависимое от дозы антисмысловое ингибирование РНК HBV в клетках HepG2 химерными олигонуклеотидами МОЕ
Антисмысловые олигонуклеотиды из исследования, описанного в Примере 14, демонстрирующие т vitro ингибирование мРНК HBV, отобрали и испытали при различных дозах в клетках HepG2. Клетки поместили на планшет при плотности 28000 клеток на лунку и трансфицировали при помощи LipofectAMINE 2000® антисмысловыми олигонуклеотидами в концентрациях 9,26 нМ, 27,78 нМ, 83,33 нМ и 250,00 нМ, как показано в Таблице 53. Примерно через 16 часов обработки, РНК выделили из клеток, и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор затравочных зондов HBV RTS3371. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.
Как показано в Таблице 53, уровни мРНК HBV снизились зависимым от дозы образом в клетках, обработанных антисмысловым олигонуклеотидом. «н/д» показывает, что для указанной дозы нет данных.
Пример 17: Зависимое от дозы антисмысловое ингибирование мРНК ИВУ в клетках HepG2 дезокси-, МОЕ и (S)-cEt-химерными олигонуклеотидами
Антисмысловые олигонуклеотиды из исследования, описанного в Примере 15, демонстрирующие in vitro ингибирование мРНК HBV, отобрали и испытали при различных дозах в клетках HepG2. Клетки поместили на планшет при плотности 28 ООО клеток на лунку и трансфицировали при помощи LipofectAMINE 2000® антисмысловыми олигонуклеотидами в концентрациях 9,26 нМ, 27,78 нМ, 83,33 нМ и 250,00 нМ, как показано в Таблице 54. Примерно через 16 часов обработки, РНК выделили из клеток, и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор затравочных зондов HBV RTS3371. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN*. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.
Как показано в Таблице 54, уровни мРНК HBV снизились зависимым от дозы образом в клетках, обработанных антисмысловым олигонуклеотидом.
Пример 18: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК ИВУ в клетках HepG2 дезокси-, МОЕ и (S)-cEt-химерными олигонуклеотидами
Дополнительные антисмысловые олигонуклеотиды были разработаны для направленного действия на вирусную нуклеиновую кислоту HBV, и были испытаны на их действие на мРНК HBV in vitro. ISIS 5808 и ISIS 9591, описанные в US 5985662, а также ISIS 146781, ISIS 146786, 524518, ISIS 552859 и ISIS 552870 также включили в эти исследования для сравнения и обозначили звездочкой. Культивированные клетки HepG2 при плотности 28000 клеток на лунку трансфицировали при помощи LipofectAMINE 2000® 100 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Наборы вирусных затравочных зондов RTS3370 и RTS3371 использовали для измерения уровней мРНК по отдельности. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.
Новые разработанные химерные антисмысловые олигонуклеотиды в Таблице ниже были разработаны как МОЕ химерные олигонуклеотиды или дезокси-, МОЕ и (S)-cEt химерные олигонуклеотиды. 5-10-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по пять нуклеозидов. Дезокси-, МОЕ и (S)-cEt химерные олигонуклеотиды имеют 16 нуклеозидов в длину, причем нуклеозид имеет или МОЕ сахарную модификацию, или (S)-cEt сахарную модификацию, или дезокси-модификацию. Колонка «химия» описывает модификации сахара каждого олигонуклеотида. «k» обозначает (S)-cEt модификацию сахара; число обозначает количество дезоксинуклеозидов; в противном случае, «d» обозначает дезоксинуклеозид; и «е» обозначает модификацию МОЕ. Межнуклеозидные связи в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой фосфотиоатные (P=S) связи. Все цитозиновые остатки в каждом олигонуклеотиде представляют собой 5-метилцитозины.
«Вирусный целевой сайт инициации» указывает 5'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. «Вирусный целевой терминирующий сайт» указывает 3'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. Каждый химерный олигонуклеотид, перечисленный в Таблице 55, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1 (доступ GENBANK №U95551.1).
Пример 19: Эффективность химерных олигонуклеотидов, направленных на HBV, у трансгенных мышей
В нескольких исследованиях трансгенных мышей обрабатывали антисмысловыми олигонуклеотидами ISIS для оценки эффективности химерных олигонуклеотидов. Оценили уровни ДНК и РНК HBV.
Испытание 1
Каждой мыши в группе из 12 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 50 мг/кг ISIS 510106, ISIS 510116, ISIS 505347 или ISIS 509934. Контрольной группе из 12 мышей подкожно вводили PBS два раза в неделю, в течение 4 недель. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали печени для дальнейшего анализа.
Анализ ДНК и РНК
РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя наборы затравочных зондов RTS3370, RTS3371 и RTS3372. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с наборами затравочных зондов RTS3370 и RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Данные, выраженные как процентное ингибирование по сравнению с контрольной группой, представлены в Таблице 56. Как показано в Таблице 56, большинство антисмысловых олигонуклеотидов привело к снижению ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» показывает мотив гэп-крыла каждого химерного олигонуклеотида.
Испытание 2
Каждой мыши в группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 50 мг/кг ISIS 146779, ISIS 505358, ISIS 146786, ISIS 509974, ISIS 509958 или ISIS 509959. Контрольной группе из 10 мышей подкожно вводили PBS два раза в неделю, в течение 4 недель. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали печени для дальнейшего анализа.
Анализ ДНК и РНК
РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя набор затравочных зондов RTS3370. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с набором затравочных зондов RTS3370 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Данные, выраженные как процентное ингибирование по сравнению с контрольной группой, представлены в Таблице 57. Как показано в Таблице 57, большинство антисмысловых олигонуклеотидов привело к снижению ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» показывает мотив гэп-крыла каждого химерного олигонуклеотида.
Испытание 3
Каждой мыши в группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 50 мг/кг ISIS 509960, ISIS 505329, ISIS 146786, ISIS 505339 или ISIS 509927. Другой группе из 6 мышей вводили энтекавир, пероральное противовирусное лекарство, используемое для лечения инфекции гепатита В, в дозе 1 мг/кг, ежедневно, в течение двух недель. Контрольной группе из 10 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили PBS. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали печени для дальнейшего анализа.
Анализ ДНК и РНК
РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя набор затравочных зондов RTS3371. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с набором затравочных зондов RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Данные, выраженные как процентное ингибирование по сравнению с контрольной группой, представлены в Таблице 58. Как показано в Таблице 58, большинство антисмысловых олигонуклеотидов привело к снижению ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» показывает мотив гэп-крыла каждого химерного олигонуклеотида.
Испытание 4
Каждой мыши в группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 25 мг/кг ISIS 146786, ISIS 552176 и ISIS 552073. Одной группе из 10 мышей подкожно вводили PBS два раза в неделю, в течение 4 недель. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали органы и плазму для дальнейшего анализа.
Анализ ДНК и РНК
РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя набор затравочных зондов RTS3371. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с набором затравочных зондов RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Данные представлены в Таблице 59. Как показано в Таблице 59, антисмысловые олигонуклеотиды вызывают снижение ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» показывает мотив гэп-крыла каждого химерного олигонуклеотида.
Функция печени
Для оценки влияния олигонуклеотидов ISIS на печеночную функцию, измерили концентрации ALT в плазме при помощи автоматического клинического анализатора химического состава (Hitachi Olympus AU400e, Мелвилл, штат Нью-Йорк) (Nyblom, H. et al., Alcohol & Alcoholism 39: 336-339, 2004; Tietz NW (Ed): Clinical Guide to Laboratory Tests, 3е изд. W.B. Saunders, Филадельфия, штат Пенсильвания, 1995). Результаты, выраженные в МЕ/л, представлены в Таблице 60. Оба ISIS олигонуклеотида считаются переносимыми мышами, что демонстрируется их профилем трансаминазы в печени.
Испытание 5
Каждой мыши в группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 25 мг/кг ISIS 146786, ISIS 552056, ISIS 552088 и ISIS 552309. Одной группе из 10 мышей подкожно вводили PBS два раза в неделю, в течение 4 недель. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали органы и плазму для дальнейшего анализа.
Анализ ДНК и РНК
РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя набор затравочных зондов RTS3371. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с набором затравочных зондов RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Как показано в Таблице 61, антисмысловые олигонуклеотиды приводят к снижению ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» показывает мотив гэп-крыла каждого химерного олигонуклеотида.
Испытание 6
Каждой мыши в группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 25 мг/кг ISIS 146786, ISIS 505330, ISIS 509932, ISIS 552032, ISIS 552057, ISIS 552075, ISIS 552092 и ISIS 552255. Одной группе из 10 мышей подкожно вводили PBS два раза в неделю, в течение 4 недель. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали органы и плазму для дальнейшего анализа.
Анализ ДНК и РНК
РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя набор затравочных зондов RTS3371. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с набором затравочных зондов RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Как показано в Таблице 62, антисмысловые олигонуклеотиды приводят к снижению ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» показывает мотив гэп-крыла каждого химерного олигонуклеотида.
Испытание 7
Каждой мыши в группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 20 мг/кг ISIS 552859, ISIS 577121, ISIS 577122, ISIS 577123, ISIS 577132, ISIS 577133 и ISIS 577134. Эти химерные олигонуклеотиды имеют дезокси-, МОЕ и (S)-cEt химию. Одной группе из 10 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили PBS. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали органы и плазму для дальнейшего анализа.
Анализ ДНК и РНК
РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя набор затравочных зондов RTS3371. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с набором затравочных зондов RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Как показано в Таблице 63, антисмысловые олигонуклеотиды приводят к снижению ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» описывает модификации сахара каждого олигонуклеотида. «k» обозначает (S)-cEt модификацию сахара; число обозначает количество дезоксинуклеозидов; в противном случае, «d» обозначает дезоксинуклеозид; и «е» обозначает модификацию МОЕ.
Испытание 8
Группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 25 мг/кг ISIS 146786, химерного олигонуклеотида 5-10-5 МОЕ. Каждой мыши в группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 10 мг/кг ISIS 552803, ISIS 552903, ISIS 552817, ISIS 552822 и ISIS 552907. Эти химерные олигонуклеотиды имеют дезокси-, МОЕ и (S)-cEt химию. Одной группе из 10 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили PBS. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали органы и плазму для дальнейшего анализа.
Анализ ДНК и РНК
РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя набор затравочных зондов RTS3371. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с набором затравочных зондов RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Данные представлены в Таблице 64. Как показано в Таблице 64, антисмысловые олигонуклеотиды вызывают снижение ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Колонка «химия» описывает модификации сахара каждого олигонуклеотида. «k» обозначает (S)-cEt модификацию сахара; число обозначает количество дезоксинуклеозидов; в противном случае, «d» обозначает дезоксинуклеозид; и «е» обозначает модификацию МОЕ; в случае МОЕ химерных олигонуклеотидов, колонка «химия» указывает структуру гэп-крыла.
Испытание 9
Группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 25 мг/кг ISIS 146786. Группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 10 мг/кг ISIS 552853, ISIS 552854, ISIS 552932 и ISIS 552938. Одной группе из 10 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили PBS. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали органы и плазму для дальнейшего анализа.
Анализ ДНК и РНК
РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя набор затравочных зондов RTS3371. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с набором затравочных зондов RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Как показано в Таблице 65, антисмысловые олигонуклеотиды приводят к снижению ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» описывает модификации сахара каждого олигонуклеотида. «k» обозначает (S)-cEt модификацию сахара; число обозначает количество дезоксинуклеозидов; в противном случае, «d» обозначает дезоксинуклеозид; и «е» обозначает модификацию МОЕ; в случае МОЕ химерных олигонуклеотидов, колонка «химия» указывает структуру гэп-крыла.
Испытание 10
Группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 25 мг/кг ISIS 146786. Группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 10 мг/кг ISIS 552922, ISIS 552923, ISIS 552942, ISIS 552872, ISIS 552925, ISIS 552937 и ISIS 552939. Одной группе из 10 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили PBS. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали органы и плазму для дальнейшего анализа.
Анализ ДНК и РНК
РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя набор затравочных зондов RTS3371. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с набором затравочных зондов RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Как показано в Таблице 66, антисмысловые олигонуклеотиды приводят к снижению ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» описывает модификации сахара каждого олигонуклеотида. «k» обозначает (S)-cEt модификацию сахара; число обозначает количество дезоксинуклеозидов; в противном случае, «d» обозначает дезоксинуклеозид; и «е» обозначает модификацию МОЕ; в случае МОЕ химерных олигонуклеотидов, колонка «химия» указывает структуру гэп-крыла.
Пример 20: Эффективность химерных олигонуклеотидов, направленных на HBV, у трансгенных мышей
Использовали мышей с фрагментом гена HBV (Guidotti, L.G. et al., J. Virol. 1995, 69, 6158-6169) Мышей обрабатывали ISIS антисмысловыми олигонуклеотидами, выбранными из исследований, описанных выше, и оценили их эффективность в этой модели. Оценили уровни ДНК, РНК и антигена HBV.
Каждой мыши из группы 10 мышей дважды в неделю подкожно вводили сначала 50 мг/кг, а затем, дважды в неделю, в течение следующих 3 недель, 25 мг/кг ISIS 146786 или ISIS 510100. Каждую мышь в контрольной группе из 10 мышей обрабатывали таким же образом при помощи ISIS 141923 (CCTTCCCTGAAGGTTCCTCC, SEQ ID NO:320; 5-10-5 МОЕ химерный олигонуклеотид без известной мишени у мышей) или ISIS 459024 (CGGTCCTTGGAGGATGC, SEQ ID NO:1351; 3-10-4 МОЕ химерный олигонуклеотид без известной мишени у мышей). Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали органы и сыворотку для дальнейшего анализа.
Анализ ДНК и РНК
РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя наборы затравочных зондов RTS3370, RTS3371 или RTS3372 (прямая последовательность ATCCTATCAACACTTCCGGAAACT, обозначенная SEQ ID NO: 314; обратная последовательность CGACGCGGCGATTGAG, обозначенная SEQ ID NO:315; последовательность зонда AAGAACTCCCTCGCCTCGCAGACG, обозначенная SEQ ID NO:316). Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с наборами затравочных зондов RTS3370 и RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Данные представлены в Таблице 67. Образцы ДНК в сыворотке анализировали после испытательного периода. Данные, выраженные относительно уровней, измеренных в контрольной группе, представлены в Таблице 68. Как показано в Таблицах 67 и 68, антисмысловые олигонуклеотиды приводят к снижению ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» указывает структуру гэп-крыла каждого химерного олигонуклеотида.
Анализ антигена HBV
Антигены HBV в надосадочных жидкостях обнаружили при помощи иммуноферментого анализа твердофазного (ELISA). Уровни антигена HBs (HBsAg) обнаружили иммуноферментным твердофазным анализом компании Abazyme LLC, штат Массачусетс. Как показано в Таблице 57, обработка олигонуклеотидами ISIS 146786 или 510100 вызывает снижение уровней HBsAg. Уровни антигена НВе (HBeAg) обнаружили иммуноферментным твердофазным анализом компании International Immune-diagnostics, штат Калифорния. Как показано в Таблице 69, обработка олигонуклеотидами ISIS 146786 или 510100 вызывает также снижение уровней HBeAg.
Пример 21: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК HBV в клетках HepG2 дезокси-, МОЕ и (S)-cEt-химерными олигонуклеотидами
Дополнительные антисмысловые олигонуклеотиды были разработаны для направленного действия на вирусную нуклеиновую кислоту HBV, и были испытаны на их действие на мРНК HBV in vitro. В этот анализ включили также ISIS 146786, ISIS 505358, ISIS 509932 и ISIS 510100, описанные в предварительной заявке на патент США №61/478040, поданной 21 апреля 2011 года; ISIS 552859, описанный в предварительной заявке на патент США №61/596692, поданной 8 февраля 2012 года; ISIS 577121, ISIS 577122, ISIS 577123, ISIS 577132, ISIS 577133 и ISIS 577134, описанные в исследовании, раскрытом выше. Культивированные клетки HepG2 при плотности 28000 клеток на лунку трансфицировали при помощи Cytofectin 9,375 нМ, 18,75 нМ, 37, 50 нМ, 75,00 нМ, 15,00 нМ или 300,00 нМ антисмыслового олигонуклеотида После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3371. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.
Новые разработанные химерные антисмысловые олигонуклеотиды в Таблицах ниже были разработаны как дезокси-, МОЕ и (S)-cEt химерные олигонуклеотиды. Дезокси-, МОЕ и (S)-cEt химерные олигонуклеотиды имеют 16, 17 или 18 нуклеозидов в длину, причем нуклеозиды имеют или МОЕ сахарную модификацию, или (S)-cEt сахарную модификацию, или дезокси-модификацию. Колонка «химия» описывает модификации сахара каждого олигонуклеотида. «k» обозначает (S)-cEt модификацию сахара; число обозначает количество дезоксинуклеозидов; в противном случае, «d» обозначает дезоксинуклеозид; и «е» обозначает модификацию МОЕ. Межнуклеозидные связи в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой фосфотиоатные (P=S) связи. Все цитозиновые остатки в каждом олигонуклеотиде представляют собой 5-метилцитозины.
«Вирусный целевой сайт инициации» указывает 5'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. «Вирусный целевой терминирующий сайт» указывает 3'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. Каждый химерный олигонуклеотид, перечисленный в Таблице 70, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1 (доступ GENBANK №U95551.1).
Пример 22: Анализ эффективности однообразных дезоксиолигонуклеотидов при ингибровании мРНК HBV в клетках HepG2
Дополнительные антисмысловые олигонуклеотиды были испытаны на их влияние на мРНК HBV in vitro. В этот анализ включили также ISIS 5808 и ISIS 9591, описанные в US 5985662. В этот анализ включили ISIS 146786 в качестве эталона. Культивированные клетки HepG2 при плотности 28000 клеток на лунку трансфицировали при помощи LipofectAMINE2000® 18,75 нМ, 37, 50 нМ, 75,00 нМ, 150,00 нМ или 300,00 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК и ДНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3371. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Уровни антигена S и антигена Е также измерили при помощи иммуноферментного твердофазного анализа (ELISA). Результаты представлены как процентное ингибирование, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.
Исследованные антисмысловые олигонуклеотиды, ISIS 582699, ISIS 582700 и ISIS 582701, были разработаны в соответствии с последовательностями и химическими структурами, описанными в публикации Korba and Germ, Antiviral Research, 1995, Vol.28, 225-242; соответствующие названия олигонуклеотидов в представленной ссылке - S1, C1 и L2c, соответственно. Антисмысловые олигонуклеотиды в Таблицах ниже были разработаны как однообразные дезокси-олигонуклеотиды длиной 16 или 21 нуклеозида, причем эти нуклеозиды имеют дезокси-модификации. «Вирусный целевой сайт инициации» указывает 5'-основной нуклеотид, на который направлен олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. «Вирусный целевой терминирующий сайт» указывает 3'-основной нуклеотид, на который направлен олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. Каждый олигонуклеотид, перечисленный в Таблице 73, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1 (доступ GENBANK №U95551.1). Результаты показывают, что дезокси-олигонуклеотиды имеют незначительное влияние на уровни экспрессии мРНК HBV, уровни ДНК и уровни антигена HBV.
название | год | авторы | номер документа |
---|---|---|---|
Модулирование экспрессии рецептора андрогенов | 2013 |
|
RU2670486C9 |
СОЕДИНЕНИЯ И СПОСОБЫ МОДУЛЯЦИИ ЭКСПРЕССИИ ДИСТРОФИЧЕСКОЙ МИОТОНИН-ПРОТЕИНКИНАЗЫ (DMPK) | 2014 |
|
RU2690333C2 |
КОМПОЗИЦИИ ДЛЯ МОДУЛИРОВАНИЯ ЭКСПРЕССИИ SOD-1 | 2015 |
|
RU2704619C2 |
МОДУЛЯЦИЯ ЭКСПРЕССИИ ТРАНСТИРЕТИНА | 2011 |
|
RU2592669C2 |
КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ МОДУЛИРОВАНИЯ ЭКСПРЕССИИ HBV И TTR | 2014 |
|
RU2670614C9 |
МОДУЛЯЦИЯ ЭКСПРЕССИИ АНГИОПОЭТИН-ПОДОБНОГО БЕЛКА 3 | 2014 |
|
RU2706964C2 |
КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ МОДУЛИРОВАНИЯ ЭКСПРЕССИИ АПОЛИПОПРОТЕИНА (A) | 2014 |
|
RU2824214C1 |
МОДУЛЯЦИЯ ЭКСПРЕССИИ ФАКТОРА 11 | 2009 |
|
RU2535964C2 |
СОПРЯЖЕННЫЕ АНТИСМЫСЛОВЫЕ СОЕДИНЕНИЯ И ИХ ПРИМЕНЕНИЕ | 2014 |
|
RU2697152C2 |
МОДУЛЯТОРЫ ФАКТОРА В КОМПЛЕМЕНТА | 2014 |
|
RU2662967C2 |
Изобретение может применяться в медицине и относится к одноцепочечному модифицированному олигонуклеотиду, состоящему из 16-30 связанных нуклеозидов и имеющему последовательность нуклеооснований, состоящую из последовательностей SEQ ID NO: 226, 17, 50, 224, 722, 807, 1327, 1340 и 1379, причем указанный олигонуклеотид содержит: сегмент гэп, состоящий из связанных дезоксинуклеозидов; сегмент крыла 5', состоящий из связанных нуклеозидов; и сегмент крыла 3', состоящий из связанных нуклеозидов; сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3'; каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар или затрудненный этиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь или фосфодиэфирную связь; каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин. Предложены новые модифицированные олигонуклеотиды и композиции на их основе, эффективные для лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния. 6 н. и 10 з.п. ф-лы, 22 пр., 77 табл., перечень последовательностей.
1. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16-30 связанных нуклеозидов и имеющий последовательность нуклеооснований, состоящую из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO: 226, 17, 50, 224, 722, 807, 1327, 1340 и 1379, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид содержит:
сегмент гэп, состоящий из связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент крыла 5', состоящий из связанных нуклеозидов; и
сегмент крыла 3', состоящий из связанных нуклеозидов;
причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3'; и при этом каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар или затрудненный этиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь или фосфодиэфирную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
2. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 226, и содержит:
сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент крыла 5', состоящий из 5 связанных нуклеозидов; и
сегмент крыла 3', состоящий из 5 связанных нуклеозидов;
причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
3. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 17, и содержит:
сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент крыла 5', состоящий из 3 связанных нуклеозидов; и
сегмент крыла 3', состоящий из 4 связанных нуклеозидов;
причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой 5-метилцитозин.
4. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 50, и содержит:
сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент крыла 5', состоящий из 5 связанных нуклеозидов; и
сегмент крыла 3', состоящий из 5 связанных нуклеозидов;
причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой 5-метилцитозин.
5. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 722, и содержит:
сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент крыла 5', состоящий из 6 связанных нуклеозидов; и
сегмент крыла 3', состоящий из 4 связанных нуклеозидов;
причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой 5-метилцитозин.
6. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 1327, и содержит:
сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент крыла 5', состоящий из 2 связанных нуклеозидов; и
сегмент крыла 3', состоящий из 4 связанных нуклеозидов;
причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3'; 2 связанных нуклеозида сегмента крыла 5' содержат 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый сахар в направлении от 5' к 3'; 4 связанных нуклеозида сегмента крыла 3' содержат затрудненный этиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'; каждая межнуклеозидная связь указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой 5-метилцитозин.
7. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 1340, и содержит:
сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент крыла 5', состоящий из 3 связанных нуклеозидов; и
сегмент крыла 3', состоящий из 3 связанных нуклеозидов;
причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3'; 3 связанных нуклеозида сегмента крыла 5' содержат 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый сахар и затрудненный этиловый сахар в направлении от 5' к 3'; 3 связанных нуклеозида сегмента крыла 3' содержат затрудненный этиловый сахар, затрудненный этиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'; каждая межнуклеозидная связь указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой 5-метилцитозин.
8. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид состоит из 18 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 1379, и содержит:
сегмент гэп, состоящий из 8 связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент крыла 5', состоящий из 5 связанных нуклеозидов; и
сегмент крыла 3', состоящий из 5 связанных нуклеозидов;
причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3'; 5 связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' содержат затрудненный этиловый сахар, дезоксисахар, затрудненный этиловый сахар, дезоксисахар и затрудненный этиловый сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из 5 связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой 5-метилцитозин.
9. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 224, и содержит:
сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент крыла 5', состоящий из 6 связанных нуклеозидов; и
сегмент крыла 3', состоящий из 4 связанных нуклеозидов;
причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой 5-метилцитозин.
10. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 807, и содержит:
сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент крыла 5', состоящий из 6 связанных нуклеозидов; и
сегмент крыла 3', состоящий из 4 связанных нуклеозидов;
причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой 5-метилцитозин.
11. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по любому из пп. 1-10, отличающийся тем, что одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид является сопряженным.
12. Композиция для лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния, содержащая одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по любому из пп. 1-10 или его фармацевтически приемлемое производное и по меньшей мере один фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
13. Применение соединения по любому из пп. 1-10, для производства лекарства для лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния у пациента, при этом заболевание, расстройство или состояние представляет собой желтуху, воспаление печени, фиброз печени, воспаление, цирроз печени, печеночную недостаточность, рак печени, диффузное гепатоцеллюлярное воспалительное заболевание, гемофагоцитарный синдром, серозный гепатит, виремию HBV или заболевание печени, связанное с трансплантацией.
14. Применение композиции по п. 12, для производства лекарства для лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния у пациента, при этом заболевание, расстройство или состояние представляет собой желтуху, воспаление печени, фиброз печени, воспаление, цирроз печени, печеночную недостаточность, рак печени, диффузное гепатоцеллюлярное воспалительное заболевание, гемофагоцитарный синдром, серозный гепатит, виремию HBV или заболевание печени, связанное с трансплантацией.
15. Применение соединения по любому из пп. 1-10 для производства лекарства для снижения уровней HBsAG у пациента, инфицированного HBV.
16. Применение композиции по п. 12 для производства лекарства для снижения уровней HBsAG у пациента, инфицированного HBV.
US 20090318676 A1, 24.12.2009 | |||
US 20030068301 A1, 10.04.2003 | |||
US 20100056607 A1, 04.03.2010 | |||
US 20090318536 A1, 24.12.2009 | |||
US 20100197762 A1, 05.08.2010 | |||
Qureshi H | |||
et al, JPMA, 2002, vol | |||
Устройство для устранения мешающего действия зажигательной электрической системы двигателей внутреннего сгорания на радиоприем | 1922 |
|
SU52A1 |
ПОЛИНУКЛЕОТИДЫ, СПОСОБ ИХ ПОЛУЧЕНИЯ, ГИБРИДИЗАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ НУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ | 1991 |
|
RU2142467C1 |
Авторы
Даты
2018-09-21—Публикация
2012-04-20—Подача