МОДУЛИРОВАНИЕ ЭКСПРЕССИИ ВИРУСА ГЕПАТИТА B (HBV) Российский патент 2018 года по МПК C07H21/02 A61K31/712 

Описание патента на изобретение RU2667524C2

Перечень последовательностей

Настоящая заявка подана вместе с перечнем последовательностей в электронном формате. Перечень последовательностей представлен в виде файла, озаглавленного BIOL0175WOSEQ.txt, который был создан 18 апреля 2012 года и имеет размер около 256 кБ. Информация о перечне последовательностей в электронном формате включена в настоящий документ путем ссылки в полном объеме.

Область изобретения

В некоторых аспектах реализации данного изобретения представлены способы, соединения и композиции для ингибирования экспрессии мРНК и белка вируса гепатита В (HBV) у животного. Такие способы, соединения и композиции применимы для лечения, предупреждения или улучшения связанных с HBV заболеваний и расстройств.

Уровень техники

Гепатит В представляет собой вирусное заболевание, которое передается парентерально через зараженный материал, такой как кровь и продукты крови, зараженные иглы, половым путем, а также вертикально от инфицированных матерей к их потомству. По оценкам Всемирной организации здравоохранения, во всем мире инфицировано более 2 миллиардов людей, каждый год возникает около 4 миллионов острых случаев, происходит 1 миллион смертей в год и появляется 350-400 миллионов хронических носителей (Всемирная организация здравоохранения: Geographic Prevalence of Hepatitis B Prevalence, 2004. http://www.who.int/vaccines-surveillance/graphics/htmls/hepbprev.htm).

Вирус HBV представляет собой двухцепочечный гепатотропный вирус, который инфицирует только людей и приматов, не являющихся человеком. Репликация вируса происходит преимущественно в печени и, в меньшей степени, в почках, поджелудочной железе, костном мозге и селезенке (Hepatitis В virus biology. Microbiol Mol Biol Rev. 64: 2000; 51-68.). Вирусные и иммунные маркеры могут быть обнаружены в крови, и они характеризуют развивающиеся со временем структуры антигенов-антител. Первый обнаруживаемый вирусный маркер представляет собой HBsAg, за ним следует е-антиген гепатита В (HBeAg) и ДНК HBV. В инкубационный период титры могут быть высокими, однако уровни ДНК и HBeAg HBV падают при возникновении заболевания и могут быть не обнаруживаемыми во время пика клинической болезни (Hepatitis В virus infection-natural history and clinical consequences. N Engl J Med.. 350: 2004; 1118-1129). HBeAg представляет собой вирусный маркер, обнаруживаемый в крови, который коррелирует с активной вирусной репликацией и, следовательно, высокой вирусной нагрузкой и инфективностью (Hepatitis В е antigen-the dangerous end game of hepatitis B. N Engl J Med. 347: 2002; 208-210). Присутствие анти-HBsAb и анти-HBcAb (IgG) указывает на выздоровление и иммунитет у ранее инфицированного субъекта.

В настоящее время терапии для хронической инфекции HBV, которые рекомендованы Американской ассоциацией по изучению болезней печени (AASLD) и Европейской ассоциацией по изучению печени (EASL), включают интерферон альфа (INFα), пегилированный интерферон альфа-2а (Peg-IFN2a), энтекавир и тенофовир. Нуклеозидные и нуклеотидные терапии, энтекавир и тенофовир, являются успешными для снижения вирусной нагрузки, однако скорости снижения сероконверсии HBeAg и HBeAg даже ниже, чем эти показатели, полученные при терапии с IFNα. Также используют другие аналогичные терапии, включая ламивудин (ЗТС), телбивудин (LdT) и адефовир, однако для нуклеозидной/нуклеотидной терапии в целом, возникновение резистентности ограничивает терапевтическую эффективность.

Следовательно, в данной области техники существует необходимость открытия и разработки новых противовирусных терапий. Кроме того, существует необходимость в новых анти-HBV терапиях, способных увеличивать скорости сероконверсии HBeAg и HBsAg. В недавнем клиническом исследовании была обнаружена корреляция между, сероконверсией и снижением HBeAg (Fried et аl. (2008) Hepatology 47:428) и снижением HBsAg (Moucari et al. (2009) Hepatology 49:1151). Снижение уровней антигенов может обеспечивать возможность иммунологического контроля инфекции HBV, поскольку высокие уровни антигенов, предположительно, вызывают иммунологическую толерантность. Существующие нуклеозидные терапии для HBV способны существенно снижать уровни HBV, однако они слабо влияют на уровни HBeAg и HBsAg.

Антисмысловая технология развивается как эффективное средство снижения экспрессии специфических генных продуктов, и, следовательно, может быть подтверждена ее уникальная полезность в ряде терапевтических, диагностических и исследовательских применений для модулирования экспрессии HBV (смотри публикации патентов США №№2008/0039418 и 2007/0299027). Антисмысловая терапия отличается от нуклеозидной терапии тем, что она может напрямую влиять на транскрипты для антигенов HBV и, посредством этого, снижать уровни HBeAg и HBsAg в сыворотке. Из-за большого количества перекрывающихся транскриптов, вырабатываемых при инфекции HBV, существует также возможность снижения ДНК HBV, помимо HBeAg и HBsAg, одним антисмысловым олигомером. Следовательно, антисмысловая технология развивается как эффективное средство снижения экспрессии определенных генных продуктов, и, следовательно, может быть подтверждена ее уникальная полезность в ряде терапевтических, диагностических и исследовательских применений для модулирования HBV.

Краткое описание изобретения

В настоящем документе представлены способы, соединения и композиции для модулирования экспрессии мРНК и белка HBV. В некоторых аспектах реализации данного изобретения, соединения, применимые для модулирования экспрессии мРНК и белка HBV, представляют собой антисмысловые соединения. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения представляют собой антисмысловые олигонуклеотиды.

В некоторых вариантах реализации, модулирование может происходить в клетке или ткани. В некоторых вариантах реализации клетка или ткань находится в организме животного. В некоторых вариантах реализации животное представляет собой человека. В некоторых вариантах реализации снижаются уровни мРНК HBV. В некоторых вариантах реализации снижаются уровни ДНК HBV. В некоторых вариантах реализации снижаются уровни белка HBV. В некоторых вариантах реализации снижаются уровни антигена HBV. В некоторых вариантах реализации снижаются уровни s-антигена HBV (HBsAg). В некоторых вариантах реализации снижаются уровни е-антигена HBV (HBeAg). Такое снижение может происходить в зависимости от времени или в зависимости от дозы.

Также представлены способы, соединения и композиции, применимые для предупреждения, лечения и улучшения заболеваний, расстройств и состояний. В некоторых вариантах реализации, такие связанные с HBV заболевания, расстройства и состояния представляют собой болезни печени. В некоторых вариантах реализации, такие заболевания, расстройства и состояния печени включают желтуху, рак печени, воспаление печени, фиброз печени, воспаление, цирроз печени, печеночную недостаточность, диффузное гепатоцеллюлярное воспалительное заболевание, гемофагоцитарный синдром, серозный гепатит, виремию HBV и заболевание печени, связанное с трансплантацией. В некоторых вариантах реализации, такие связанные с HBV заболевания, расстройства и состояния представляют собой гиперпролиферативные заболевания, расстройства и состояния. В некоторых вариантах реализации такие гиперпролиферативные заболевания, расстройства и состояния включают рак, а также связанные злокачественные образования и метастазы. В некоторых вариантах реализации, такие виды рака включают рак печени и гепатоцеллюлярный рак (НСС).

Такие заболевания, расстройства и состояния могут в совокупности иметь один или несколько факторов риска, причин или последствий. Некоторые факторы риска и причины развития заболевания печени или гиперпролиферативного заболевания включают возраст; табакокурение; воздействие солнечного света и ионизирующей радиации; контакт с некоторыми химическими веществами; инфекцию некоторыми вирусами и бактериями; некоторые гормональные терапии; семейный анамнез рака; употребление алкоголя; и некоторые особенности образа жизни, включая плохое питание, недостаток физической активности и/или избыток веса. Некоторые симптомы и последствия, связанные с развитием заболевания печени или гиперпролиферативного заболевания, включают, но не ограничиваясь этим: болезнь, похожую на грипп, слабость, боли, головную боль, жар, потерю аппетита, диарею, желтуху, тошноту и рвоту, боль в области печени, стул земляного или серого цвета, зуд по всему телу и мочу темного цвета.

В некоторых вариантах реализации, способы лечения включают введение антисмыслового соединения HBV пациенту, нуждающемуся в этом. В некоторых вариантах реализации, способы лечения включают введение антисмыслового олигонуклеотида HBV пациенту, нуждающемуся в этом.

Подробное описание

Следует понимать, что изложенное выше общее описание и следующее подробное описание являются лишь примерными и пояснительными, и не являются ограничивающими заявленное изобретение. В настоящем документе применение единственного числа включает множественное число, если специально не оговорено иное. При использовании в настоящем документе, применение «или» означает «и/или», если не указано иное. Кроме того, использование термина «включая», а также других форм, таких как «включает» и «включен», не является ограничивающим. Также, такие термины как «элемент» или «компонент» охватывают элементы и компоненты, составляющие одно целое, а также элементы и компоненты, которые составляют более одной субъединицы, если специально не указано иное.

Заголовки разделов, используемые в настоящем документе, предназначены только для организационных целей, и их не следует толковать как ограничения описываемого предмета обсуждения. Все документы или части документов, которые упомянуты в настоящей заявке, включая, но не ограничиваясь этим, патенты, патентные заявки, статьи, книги и трактаты, в явной форме включены в настоящий документ путем ссылки в отношении фрагментов указанных документов, рассматриваемых в настоящем документе, а также в полном объеме.

Определения

Если не даны конкретные определения, то номенклатура, используемая в связи с методиками и приемами, а также сами методики и приемы аналитической химии, синтетической органической химии и медицинской и фармацевтической химии, описанные в настоящем документе, представляют собой те, которые хорошо известны и общеприняты в данной области техники. Для химического синтеза и химического анализа могут быть использованы стандартные методики. Где это допустимо, все патенты, заявки, опубликованные заявки и другие публикации, номера доступа GENBANK и связанная информация о последовательностях, которую можно получить из таких баз данных как Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), а также другие данные, упомянутые в тексте настоящего описания, включены в настоящий документ путем ссылки в отношении фрагментов указанных документов, рассматриваемых в настоящем документе, а также в полном объеме.

Если не указано иное, то следующие термины имеют следующие значения:

«2'-O-метоксиэтил» (также 2'-МОЕ и 2'-O(СН2)2-ОСН3) относится к O-метокси-этиловой модификации в 2'-положении фуранозного кольца. Сахар с 2'-O-метоксиэтиловой модификацией представляет собой модифицированный сахар.

«2'-МОЕ нуклеозид» (также 2'-O-метоксиэтиловый нуклеозид) обозначает нуклеозид, содержащий 2'-МОЕ модифицированный сахарный фрагмент.

«2'-замещенный нуклеозид» обозначает нуклеозид, содержащий заместитель в 2'-положении фуранозильного кольца, отличный от Н или ОН. В некоторых вариантах реализации, 2'-замещенные нуклеозиды содержат нуклеозиды с бициклическими сахарными модификациями.

«3'-сайт-мишень» относится к нуклеотиду целевой нуклеиновой кислоты, который комплементарен к 3'-основному нуклеотиду конкретного антисмыслового соединения.

«5'-сайт-мишень» относится к нуклеотиду целевой нуклеиновой кислоты, который комплементарен к 5'-основному нуклеотиду конкретного антисмыслового соединения.

«5-метилцитозин» обозначает цитозин, модифицированный метильной группой, присоединенной в 5-положении. 5-метилцитозин представляет собой модифицированное нуклеооснование.

«Около» обозначает в пределах ±7% от значения. Например, если указано «соединения, по меньшей мере примерно на 70% ингибирующие HBV», подразумевается, что уровни HBV ингибированы в диапазоне от 63% до 77%.

«Приемлемый профиль безопасности» обозначает характеристику побочных эффектов, которая находится в пределах клинически допустимых пределов.

«Активное фармацевтическое средство» обозначает вещество или вещества в фармацевтической композиции, которые обеспечивают терапевтическое преимущество при введении пациенту. Например, в некоторых вариантах реализации, антисмысловый олигонуклеотид, направленный на HBV, представляет собой активное фармацевтическое средство.

«Активная область мишени» обозначает область мишени, на которую направлено одно или несколько активных антисмысловых соединений. «Активные антисмысловые соединения» обозначают антисмысловые соединения, которые снижают уровни целевой нуклеиновой кислоты или уровни белка.

«Острая инфекция гепатита В» возникает, если у пациента, на которого воздействовал вирус гепатита В, начали развиваться признаки и симптомы вирусного гепатита. Этот период времени, называемый инкубационным периодом, составляет около 90 дней, но может быть коротким, лишь 45 дней, или более продолжительным, до 6 месяцев. Для большинства людей эта инфекция вызывает слабый или умеренный дискомфорт, и проходит самостоятельно благодаря иммунной реакции организма, борющейся с вирусом. Однако у некоторых людей, особенно у людей с ослабленной иммунной системой, таких как пациенты, страдающие СПИДом, проходящие химиотерапию, принимающие иммуноподавляющие лекарства или принимающие стероиды, из-за острой инфекции HBV существуют серьезные проблемы, которые перерастают в более тяжелые состояния, такие как скоротечная печеночная недостаточность.

«Введенные одновременно» относится к совместному введению двух средств любым способом, при котором фармакологическое действие обоих средств проявляется у пациента одновременно. При одновременном введении не требуется, чтобы оба агенты были введены в одной фармацевтической композиции, в одной лекарственной форме или одним способом введения. Действие обоих средств не обязательно должно проявляться одновременно. Их действие должно лишь перекрываться в течение определенного периода времени, и оно не обязательно должно иметь одинаковую протяженность по времени.

«Введение» обозначает предоставление фармацевтического средства пациенту, и включает, но не ограничиваясь этим, введение медицинским специалистом или самостоятельное введение.

«Средство» обозначает активное вещество, которое может обеспечивать терапевтическое преимущество при введении животному. «Первое средство» обозначает терапевтическое соединение, описанное в настоящем документе. Например, первое средство может быть антисмысловым олигонуклеотид ом, направленным на HBV. «Второе средство» обозначает второе терапевтическое соединение, описанное в настоящем документе (например, второй антисмысловый олигонуклеотид, направленный на HBV) и/или не-HBV терапевтическое соединение.

«Улучшение» относится к уменьшению по меньшей мере одного показателя тяжести состояния или заболевания. Тяжесть показателей может быть определена субъективными или объективными оценками, известными специалистам в данной области.

«Животное» относится к человеку или животному, не являющемуся человеком, включая, но не ограничиваясь этим, мышей, крыс, кроликов, собак, котов, свиней и приматов, не являющихся человеком, включая, но не ограничиваясь этим, обезьян и шимпанзе.

«Антитело» относится к молекуле, которая характеризуется каким-либо специфическим взаимодействием с антителом, причем каждое антитело и антиген определены в отношении друг друга. Антитело может относиться к полной молекуле антигена или его фрагменту или области, такой как тяжелая цепь, легкая цепь, область Fab и область Fc.

«Антисмысловая активность» обозначает любую обнаруживаемую или измеримую активность, которая относится к гибридизации антисмыслового соединения с его целевой нуклеиновой кислотой. В некоторых вариантах реализации, антисмысловая активность представляет собой снижение количества или экспрессии целевой нуклеиновой кислоты или белка, кодируемого такой целевой нуклеиновой кислотой.

«Антисмысловое соединение» обозначает олигомерное соединение, способное подвергаться гибридизации с целевой нуклеиновой кислотой при помощи водородной связи. Примеры антисмысловых соединений включают одноцепочечные и двухцепочечные соединения, такие как антисмысловые олигонуклеотиды, миРНК, шкРНК, мноРНК, микроРНК и сателлитные повторы.

«Антисмысловое ингибирование» обозначает снижение уровней целевой нуклеиновой кислоты в присутствии антисмыслового соединения, комплементарного к целевой нуклеиновой кислоте по сравнению с уровнями целевой нуклеиновой кислоты в отсутствие антисмыслового соединения.

«Антисмысловые механизмы» представляют собой все механизмы, включающие гибридизацию соединения с целевой нуклеиновой кислотой, причем результат или эффект гибридизации заключается в целевом разрушении или целевой оккупации с сопутствующей остановкой клеточного механизма, включающего, например, транскрипцию или сплайсинг.

«Антисмысловый олигонуклеотид» обозначает одноцепочечный олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований, которая допускает гибридизацию с соответствующей областью или сегментом целевой нуклеиновой кислоты.

«Основная комплементарность» относится к способности точного спаривания нуклеооснований антисмыслового олигонуклеотида с соответствующими нуклеооснованиями в целевой нуклеиновой кислоте (то есть гибридизации), и она опосредована водородным связыванием Уотсона-Крика, Хугстина или обратным водородным связыванием Хугстина между соответствующими нуклеооснованиями.

«Бициклический сахар» обозначает фуранозное кольцо, модифицированное мостиковым присоединением двух не геминальных атомов углерода. Бициклический сахар представляет собой модифицированный сахар.

«Вес тела» относится к полному весу тела животного, включая все ткани, в том числе жировую ткань.

«Кэп-структура» или «концевой кэп-фрагмент» обозначает химические модификации, которые были внедрены в любой конец антисмыслового соединения.

«cEt» или «затрудненный этил» обозначает бициклический сахарный фрагмент, включающий мостик, соединяющий 4'-углерод и 2'-углерод, причем указанный мостик имеет формулу: 4'-СН(СН3)-O-2'.

«Затрудненный этилнуклеозид» (также cEt нуклеозид) обозначает нуклеозид, включающий бициклический сахарный фрагмент, содержащий мостик 4'-СН(СН3)-O-2'.

«Химически отличная область» относится к области антисмыслового соединения, которая каким-либо образом химически отличается от другой области того же антисмыслового соединения. Например, область, имеющая 2'-O-метоксиэтил нуклеотиды является химически отличной от области, имеющей нуклеотиды с 2'-O-метоксиэтиловыми модификациями.

«Химерные антисмысловые соединения» обозначает антисмысловые соединения, которые имеют по меньшей мере 2 химически отличных области, каждое положение имеет множество субъединиц.

«Хроническая инфекция гепатита В» возникает, если субъект, который изначально страдал острой инфекцией, впоследствии не поборол эту инфекцию. Станет ли заболевание хроническим или будет полностью излечено, - зависит, в основном, от возраста инфицированного субъекта. Хроническое заболевание развивается примерно у 90% детей, инфицированных при рождении. Однако, по мере взросления субъекта, риск хронической инфекции снижается, и острая инфекция перерастает в хроническую у 20%-50% детей и менее 10% подростков и взрослых. Хронические инфекции HBV представляют собой основную лечебную цель для вариантов реализации настоящего изобретения, хотя композиции антисмысловых нуклеотидов (ASO) настоящего изобретения также могут лечить связанные с HBV состояния, такие как воспаление, фиброз, цирроз, рак печени, серозный гепатит и другие.

«Совместное введение» обозначает введение пациенту двух или более фармацевтических средств. Два или более фармацевтических средств могут быть в одной фармацевтической композиции или могут быть в отдельных фармацевтических композициях. Каждый из двух или более фармацевтических средств может вводиться таким же или другим способом введения. Совместное введение включает параллельное или последовательное введение.

«Комплементарность» обозначает способность спаривания между нуклеооснованиями первой нуклеиновой кислоты и второй нуклеиновой кислоты.

«Выполнение» обозначает соблюдение пациентом рекомендованного лечения.

«Включают», «включает» и «включающий» следует понимать как предполагающие включение указанной стадии или элемента, или группы стадий или элементов, но не как исключение какой-либо другой стадии или элемента, или группы стадий или элементов.

«Смежные нуклеооснования» обозначает нуклеооснования, расположенные непосредственно рядом друг с другом.

«Курс лечения» обозначает способ или курс, который восстанавливает здоровье или представляет собой предписанное лечение определенной болезни.

«Дезоксирибонуклеотид» обозначает нуклеотид, имеющий водород в 2' положении сахарной части нуклеотида. Дезоксирибонуклеотиды могут быть модифицированы любым из множества заместителей.

«Разработан» или «разработан для» относится к процессу разработки олигомерного соединения, которое специфически гибридизуется с определенной молекулой нуклеиновой кислоты.

«Разбавитель» обозначает ингредиент в композиции, которые не обладает фармакологической активностью, но является фармацевтически необходимым или желательным. Например, в лекарствах для инъекций разбавитель может быть жидкостью, например, солевым раствором.

«Лекарственная форма» обозначает форму, в которой представлено фармацевтическое средство, например, пилюля, таблетка или другая лекарственная форма, известная в данной облатти техники.

«Доза» обозначает определенное количество фармацевтического средства, которое обеспечивается при разовом введении или в течение определенного периода времени. В некоторых вариантах реализации, доза может быть введена двумя или более болюсами, таблетками или инъекциями. Например, в некоторых вариантах реализации, если необходимо подкожное введение, то для заданной дозы необходим объем, который не может быть обеспечен одной инъекцией. В таких вариантах реализации для достижения заданной дозы может быть использовано две или более инъекций. В некоторых вариантах реализации доза может быть введена двумя или более инъекциями для минимизации реакции пациента в точке инъекции. В других вариантах реализации, фармацевтическое средство вводят инфузией в течение продолжительного периода времени или непрерывно. Дозы могут быть определены как количество фармацевтического средства в час, день, неделю или месяц.

«Режим дозирования» представляет собой комбинацию доз, предназначенную для достижения одного или нескольких заданных эффектов.

«Продолжительность» обозначает период времени, в течение которого продолжается определенная активность или событие. В некоторых вариантах реализации продолжительность лечения представляет собой период времени, в течение которого вводят дозы фармацевтического средства.

«Эффективное количество» в контексте модулирования активности или лечения, или предупреждения состояния, обозначает введение такого количества активного ингредиента пациенту, нуждающемуся в таком модулировании, лечении или профилактике, как в однократной дозе, так и в составе серии доз, которое является эффективным для модулирования указанного эффекта, или для лечения, или для профилактики, или для улучшения указанного состояния. Эффективное количество может варьироваться в зависимости от состояния здоровья и физического состояния пациента, подлежащего лечению, таксономической группы пациентов, подлежащих лечению, состава композиции, оценки медико-санитарной обстановки и других релевантных факторов.

«Эффективность» обозначает способность вызывать заданный эффект.

«Экспрессия» включает все функции, при помощи которых кодированная геном информация превращается в структуры, существующие и функционирующие в клетке. Такие структуры включают, но не ограничиваясь этим, продукты транскрипции и трансляции.

«Полная комплементарность» или «100% комплементаность» обозначает, что каждое нуклеооснование первой нуклеиновой кислоты имеет комплементарное нуклеооснование во второй нуклеиновой кислоте. В некоторых вариантах реализации, первая нуклеиновая кислота представляет собой антисмысловое соединение, а целевая нуклеиновая кислота представляет собой вторую нуклеиновую кислоту.

«Полностью модифицированный мотив» относится к антисмысловому соединению, включающему смежную последовательность нуклеозидов, причем практически каждый нуклеозид представляет собой нуклеозид с модифицированным сахаром, имеющий однообразную модификацию.

«Химерный олигонуклеотид» обозначает химерное антисмысловое соединение, в котором внутренняя область, имеющая множество нуклеозидов, которые поддерживают Н расщепление РНазы, расположена между внешними областями, имеющими один или несколько нуклеозидов, причем нуклеозиды, включающие внутреннюю область, являются химически отличными от нуклеозида или нуклеозидов, составляющих внешние области. Внутренняя область может быть упомянута как «гэп», а внешние области могут быть упомянуты как «крылья».

«С увеличенным гэп» обозначает антисмысловое соединение, имеющее сегмент гэп из 12 или более смежных 2'-дезоксирибонуклеотидов, расположенных между 5' и 3' сегментами крыльев, имеющими от одного до шести нуклеотидов с фрагментами модифицированного сахара.

«HBV» обозначает вирус гепатита В млекопитающих, включая вирус гепатита В человека. Этот термин охватывает географические генотипы вируса гепатита В, в частности, вирус гепатита В человека, а также различные штаммы географических генотипов вируса гепатита В.

«Антиген HBV» обозначает любой антиген или белок вируса гепатита В, включая ядерный белок, такой как «ядерный антиген гепатита В» или «HBcAG» и «антиген Е гепатита В», или «HBeAG» и белки оболочки, такие как «поверхностный антиген HBV» или «HBsAg», или «HBsAG».

«Антиген Е гепатита В» или «HBeAg», или «HBeAG» представляет собой секретируемую, нечастичную форму ядерного белка HBV. Антигены HBV HBeAg и HBeAg имеют общие первичные аминокислотные последовательности, поэтому демонстрируют перекрестную активность на Т-клеточном уровне. HBeAg не является необходимым для вирусной сборки или репликации, хотя исследования позволяют предположить, что они могут быть необходимы для создания хронической инфекции. Неонатальное инфицирование HBeAg-негативным мутантом зачастую приводит к моментальному возникновению острой, а не хронической инфекции HBV (Terezawa et al. (1991) Pediatr. Res. 29:5), тогда как инфицирование молодых североамериканских лесных сурков WHeAg-негативным мутантом приводит к гораздо более низкому уровню хронической инфекции WHV (Cote et al. (2000) Hepatology 31:190). HBeAg может потенциально действовать как толераген путем инактивации сердцевинных специфических Т-клеток за счет удаления или клональной анэргии (Milich et al. (1998) J. Immunol. 160:8102). Существует положительная корреляция между снижением вирусной нагрузки и антигенов HBV и снижением экспрессии Т-клетками ингибирующего рецептора, программирующего гибель, 1 (PD-1, известного также как PDCD1), отрицательного регулятора активированных Т-клеток, при противовирусной терапии и сероконверсии HbeAg(Evans et al. (2008) Hepatology 48:759).

«мРНК HBV» обозначает любую матричную РНК, экспрессируемую вирусом гепатита В.

«Нуклеиновая кислота HBV» или «ДНК HBV» обозначает любую нуклеиновую кислоту, кодирующую HBV. Например, в некоторых вариантах реализации, нуклеиновая кислота HBV включает, без ограничения, любую последовательность ДНК вируса, кодирующую геном HBV или его часть, любую последовательность РНК, транскрибируемую из вирусной ДНК, включая любую последовательность мРНК, кодирующую белок HBV.

«Белок HBV» обозначает любой белок, секретируемый вирусом гепатита В. Этот термин охватыват различные антигены HBV, включая ядерные белки, такие как «антиген Е гепатита», «HBeAg», или «HBeAG» и оболочечные белки, такие как «поверхностный антиген HBV» или «HBsAg».

«Поверхностный антиген HBV» или «HBsAg», или «HBsAG» представляет собой оболочечный белок инфекционных вирусных частиц HBV, но он также секретируется как неинфекционная частица с содержанием в сыворотке в 1000 раз выше, чем вирусные частицы HBV. Уровни HBsAg в сыворотке инфицированного человека или животного могут достигать 1000 мкг/мл (Kann and Gehrlich (1998) Topley & Wilson’s Microbiology and Microbial Infections, 9th ed. 745). При острых инфекциях HBV, период полувыведения HBsAg из сыворотки, или t½, составляет 8,3 дня (Chulanov et al. (2003) J. Med. Virol. 69: 313). Интернализация HBsAg миелоидными дендритными клетками ингибирует повышующую регуляцию со-стимулирующих молекул (то есть В7) и ингибирует стимулирующую способность Т-клеток (den Brouw et al. (2008) Immunology 126:280), и дендритные клетки хронически инфицированных пациентов также демонстрируют недостаток экспрессии со-стимулирующих молекул, секреции IL-12 и стимуляции Т-клеток в присутствии HBsAg (Zheng et al. (2004) J. Viral Hepatitis 11:217). HBsAg-специфичные клетки CD8 пациентов с СНВ демонстрируют измененное тетрамерное связывание. Эти клетки CD8 не являются анэргическими, но они могут обладать топологией TCR, которая обусловливает частичную переносимость или невосприимчивость (Reignat et al. (2002) J. Exp. Med. 195:1089). Более того, снижение HBsAg в сыворотке >1 log на 24 неделе имеет высокое предиктивное значение (92%) для устойчивой вирологической реакции (SVR - определяется как не обнаруживаемая ДНК HBV по ПЦР через 1 год после лечения) в ходе Peg-IFNα2a терапии (Moucari et al. (2009) Hepatology 49:1151).

«Состояние, связанное с гепатитом В» или «HBV-связанное состояние» обозначает любое заболевание, биологическое состояние, медицинское состояние или событие, которое обострено, обусловлено, связано, имеет отношение или приписано к инфекции, воздействию или болезни гепатита В. Термин «состояние, связанное с гепатитом В» включает хроническую инфекцию HBV, воспаление, фиброз, цирроз, рак печени, серозный гепатит, желтуху, рак печени, воспаление печени, фиброз печени, цирроз печени, печеночную недостаточность, диффузное гепатоцеллюляное воспалительное заболевание, гемофагоцитарный синдром, серозный гепатит, виремию HBV, заболевание печени, связанное с трансплантацией, и состояния, имеющие симптомы, которые могут включать любой или все из следующих: болезнь, похожую на грипп, слабость, боли, головную боль, жар, потерю аппетита, диарею, тошноту и рвоту, боль в области печени, стул земляного или серого цвета, зуд по всему телу и мочу темного цвета, в сочетании с положительным тестом на присутствие вируса гепатита В, вирусного антигена гепатита В или положительным тестом на присутствие антитела, специфичного к вирусному антигену гепатита В.

«Гибридизация» обозначает гибридизацию молекул комплементарных нуклеиновых кислот. В некоторых вариантах реализации, молекулы комплементарных нуклеиновых кислот включают, но не ограничиваясь этим, антисмысловое соединение и целевую нуклеиновую кислоту. В некоторых вариантах реализации, молекулы комплементарных нуклеиновых кислот включают, но не ограничиваясь этим, антисмысловый олигонуклеотид и целевую нуклеиновую кислоту.

«Идентификация животного, имеющего инфекцию HBV» обозначает определение животного, у которого диагностирован HBV; или определение животного, имеющего любой симптом инфекции HBV, включая, но не ограничиваясь этим, хроническую инфекцию HBV, воспаление, фиброз, цирроз, рак печени, серозный гепатит, желтуху, рак печени, воспаление печени, фиброз печени, цирроз печени, печеночную недостаточность, диффузное гепатоцеллюлярное воспалительное заболевание, гемофагоцитарный синдром, серозный гепатит, виремию HBV, заболевание печени, связанное с трансплантацией, и состояния, имеющие симптомы, которые могут включать любой или все из следующих: болезнь, похожую на грипп, слабость, боли, головную боль, жар, потерю аппетита, диарею, тошноту и рвоту, боль в области печени, стул земляного или серого цвета, зуд по всему телу и мочу темного цвета, в сочетании с положительным тестом на присутствие вируса гепатита В, вирусного антигена гепатита В или положительным тестом на присутствие антитела, специфичного к вирусному антигену гепатита В, в сочетании с положительным тестом на присутствие вируса гепатита В, вирусного антигена гепатита В или положительным тестом на присутствие антитела, специфичного к вирусному антигену гепатита В.

«Непосредственно смежные» обозначает отсутствие промежуточных элементов между непосредственно смежными элементами.

«Пациент» обозначает человека или животного, не являющегося человеком, выбранного для лечения или терапии.

«Выполнение пациентом» обозначает соблюдение пациентом рекомендованного или предписанного лечения.

«Вызывает», «ингибирует», «потенцирует», «повышает», «увеличивает», «снижает» и тому подобные, обычно обозначают количественные различия между двумя состояниями. Такие термины могут относиться к статистически значимому различию между двумя состояниями. Например, «количество, эффективное для ингибирования активности или экспрессии HBV», обозначает, что уровень активности или экспрессии HBV в обработанном образце количественно отличается, и может быть статистически значимым, от уровня активности или экспрессии HBV в необработанных клетках. Такие термины применяют, например, к уровням экспрессии и уровням активности.

«Ингибирование HBV» обозначает снижение уровня экспрессии мРНК, ДНК и/или белка HBV. В некоторых вариантах реализации, HBV ингибируют в присутствии антисмыслового соединения, направленного на HBV, включая антисмысловый олигонуклеотид, направленный на HBV, по сравнению с уровнями экспрессии мРНК, ДНК и/или белка HBV в отсутствие HBV антисмыслового соединения, такого как антисмысловый олигонуклеотид.

«Ингибирование экспрессии или активности» относится к снижению, блокированию экспрессии или активности и не обязательно обозначает полное исключение экспрессии или активности.

«Реакция в точке инъекции» обозначает воспаление или аномальное покраснение кожи пациента в месте инъекции.

«Межнуклеозидная связь» относится к химической связи между нуклеозидами.

«Внутрибрюшинное введение» обозначает введение в брюшину инфузией или инъекцией.

«Внутривенное введение» обозначает введение в вену.

«Удлиненные» антисмысловые олигонуклеотиды представляют собой те, которые имеют один или несколько дополнительных нуклеозидов по сравнению с антисмысловым олигонуклеотидом, описанным в настоящем документе.

«Связанный дезоксинуклеозид» обозначает основание нуклеиновой кислоты (A, G, С, Т, U), замещенное дезоксирибозой, связанной фосфатным эфиром с образованием нуклеотида.

«Связанные нуклеозиды» обозначает соседние нуклеозиды, связанные вместе межнуклеозидной связью.

«Блокированная нуклеиновая кислота» или «БНК», или «БЫК нуклеозиды» обозначает мономеры нуклеиновых кислот, имеющие мостиковое соединение двух атомов углеродов между положением 4' и 2' нуклеозидного сахарного звена, с образованием посредством этого бициклического сахара. Примеры такого бициклического сахара включают, но не ограничиваясь этим, А) α-L-метиленокси (4'-СН2-O-2') БНК, (В) β-D-метиленокси (4'-СН2-O-2') БНК, (С) этиленокси (4'-(СН2)2-O-2') БНК, (D) аминоокси (4'-CH2-O-N(R)-2') БНК и (Е) оксиамино (4'-CH2-N(R)-O-2') БНК, как показано ниже.

При использовании в настоящем документе, БНК соединения включают, но не ограничиваясь этим, соединения, имеющие по меньшей мере один мостик между положением 4' и 2' сахара, причем каждый из мостиков независимо включает 1 или от 2 до 4 связанных групп, независимо выбранных из -[C(R1)(R2)]n-, -C(R1)=C(R2)-, -C(R1)=N-, -C(=NR1)-, -C(=O)-, -C(=S)-, -O-, -Si(R1)2-, -S(=O)x- и -N(R1)-; причем: х равен 0, 1 или 2; n равен 1, 2, 3 или 4; каждый R1 и R2 независимо представляет собой Н, защитную группу, гидроксил, C1-C12 алкил, замещенный C112 алкил, C2-C12 алкенил, замещенный C2-C12 алкенил, C2-C12 алкинил, замещенный C2-C12 алкинил, C5-C20 арил, замещенный C5-C20 арил, гетероциклический радикал, замещенный гетероциклический радикал, гетероарил, замещенный гетероарил, Cs-C-j алициклический радикал, замещенный C5-C7 алициклический радикал, галоген, OJ1, NJ1J2, SJ1, N3, COOJ1, ацил (С(=O)-Н), замещенный ацил, CN, сульфонил (S(=O)2-J1), или сульфоксил (S(=O)-J1); и каждый Ji и J2 независимо представляет собой Н, C1-C12 алкил, замещенный C1-C12 алкил, C2-C12 алкенил, замещенный C2-C12 алкенил, C2-C12 алкинил, замещенный C2-C12 алкинил, С520 арил, замещенный C5-C20 арил, ацил (С(=O)-Н), замещенный ацил, гетероциклический радикал, замещенный гетероциклический радикал, C1-C12 аминоалкил, замещенный C112 аминоалкил или защитную группу.

Примеры 4'-2' мостиковых групп, входящих в определение БНК, включают, но не ограничиваясь этим, группы формул: -[C(R1)(R2)]n-, -[C(R1)(R2)]n-O-, -C(R1R2)-N(R1)-O- или -C(R1R2)-O-N(R1)-. Более того, другие группы, входящие в определение БНК, представляют собой 4'-СН2-2', 4'-(СН2)2-2', 4'-(СН2)3-2', 4'-СН2-O-2', 4'-(СН2)2-O-2', 4'-CH2-O-N(R1)-2' и 4'-CH2-N(R1)-O-2'- мостики, причем каждый R1 и R2 независимо представляет собой Н, защитную группу или С112 алкил.

Также в определение БНК по настоящему изобретению включены БНК, в которых 2'-гидроксильная группа рибозильного сахарного кольца связана с 4' углеродным атомом сахарного кольца с образованием посредством этого метиленокси (4'-СН2-O-2') мостика для получения бициклического сахарного фрагмента. Мостик также может быть метиленовой (-СН2-) группой, соединяющей 2' кислородный атом и 4' углеродный атом, для которой используют термин метиленокси (4'-СН2-O-2') БНК. Более того, в случае бициклического сахарного фрагмента, имеющего этиленовую мостиковую группу в этом положении, используют термин этиленокси (4'-СН2СН2-O-2') БНК. a-L-метиленокси (4'-СН2-O-2'), изомер метиленокси (4'-СН2-O-2') БНК, также входит в определение БНК, используемое в настоящем документе.

«Не совпадающий» или «не комплементарный нуклеозид» относится к случаю, когда нуклеооснование первой нуклеиновой кислоты не может спариваться с соответствующим нуклеооснованием второй или целевой нуклеиновой кислоты.

«Модифицированная межнуклеозидная связь» относится к замещению или любому изменению природной межнуклеозидной связи (то есть фосфодиэфирной межнуклеозидной связи).

«Модифицированное нуклеооснование» обозначает нуклеооснование, отличное от аденина, цитозина, гуанина, тимидина или урацила. «Не модифицированное нуклеооснование» обозначает пуриновые основания аденин (А) и гуанин (G), а также пиримидиновые основания тимин (Т), цитозин (С) и урацил (U).

«Модифицированный нуклеозид» обозначает нуклеозид, имеющий, независимо, модифицированный сахарный фрагмент и/или модифицированное нуклеооснование.

«Модифицированный нуклеотид» обозначает нуклеотид, имеющий, независимо, модифицированный сахарный фрагмент, модифицированную межнуклеозидную связь или модифицированное нуклеооснование.

«Модифицированный олигонуклеотид» обозначает олигонуклеотид, включающий по меньшей мере одну модифицированную межнуклеозидную связь, модифицированный сахар и/или модифицированное нуклеооснование.

«Модифицированный сахар» обозначает замещение и/или любое изменение природного сахарного фрагмента.

«Мономер» относится к одному звену олигомера. Мономеры включают, но не ограничиваясь этим, нуклеозиды и нуклеотиды, будь то природные или модифицированные.

«Мотив» обозначает схему не модифицированных и модифицированных нуклеозидов в антисмысловом соединении.

«Природный сахарный фрагмент» обозначает сахарный фрагмент, который находится в ДНК (2'-Н) или РНК (2'-ОН).

«Природная межнуклеозидная связь» обозначает 3'-5' фосфодиэфирную связь.

«Некомплементарное нуклеооснование» относится к паре нуклеооснований, которые не образуют водородные связи друг с другом или иным образом не поддерживают гибридизацию.

«Нуклеиновая кислота» относится к молекулам, состоящим из мономерных нуклеотидов. Нуклеиновая кислота включает, но не ограничиваясь этим, рибонуклеиновые кислоты (РНК), дезоксирибонуклеиновые кислоты (ДНК), одноцепочечные нуклеиновые кислоты, двухцепочечные нуклеиновые кислоты, малые интерферирующие рибонуклеиновые кислоты (миРНК) и микроРНК (микроРНК).

«Нуклеооснование» обозначает гетероциклический фрагмент, способный спариваться с основанием другой нуклеиновой кислоты.

«Комплементарность нуклеооснования» относится к нуклеооснованию, которое способно к спариванию с другим нуклеооснованием. Например, аденин (А) в ДНК комплементарен тимину (Т). Например, аденин (А) в РНК комплементарен урацилу (U). В некоторых вариантах реализации комплементарное нуклеооснование относится к нуклеооснованию антисмыслового соединения, которое способно к спариванию с нуклеооснованием его целевой нуклеиновой кислоты. Например, если нуклеооснование в определенном положении антисмыслового соединения способно к водородному связыванию с нуклеооснованием в определенном положении целевой нуклеиновой кислоты, то это положение водородного связывания между указанным олигонуклеотидом и целевой нуклеиновой кислоты считают комплементарным по этой паре нуклеооснований.

«Последовательность нуклеооснований» обозначает порядок смежных нуклеооснований, независимый от какого-либо сахара, связи и/или модификации нуклеооснования.

«Нуклеозид» обозначает нуклеооснование, связанное с сахаром.

«Нуклеозид-миметик» включает такие структуры, используемые для замены сахара или сахара и основания, и необязательно связи в одном или нескольких положениях олигомерного соединения, как, например, нуклеозид-миметики, имеющие морфолино, циклогексенил, циклогексил, тетрагидропиранил, бицикло или трицикло-сахарные заменители, например, не фуранозные сахарные звенья. Нуклеотид-миметик включает такие структуры, используемые для замены нуклеозида и связи в одном или нескольких положениях олигомерного соединения, как, например, пептидные нуклеиновые кислоты или морфолиновые соединения (морфолиновые соединения, связанные при помощи -N(H)-C(=O)-O- или другой не фосфодиэфирной связи). Заменитель сахара пересекается с несколько более широким термином нуклеозид-миметика, но он предназначен для указания замены только сахарного звена (фуранозного кольца). Тетрагидропираниловые кольца, представленные в настоящем документе, являются иллюстративными для примера заменителя сахара, в котором группа фуранозного сахара заменена тетрагидропираниловой кольцевой системой. «Миметик» относится к группам, которые являются заменой для сахара, нуклеооснования и/или межнуклеозидной связи. Как правило, миметик используют вместо сахара или комбинации сахара и межнуклеозидной связи, а нуклеооснование сохраняется для гибридизации с выбранной мишенью.

«Нуклеотид» обозначает нуклеозид, имеющий фосфатную группу, ковалентно связанную с сахарной частью нуклеозида.

«Нецелевое действие» относится к нежелательному или пагубному биологическому действию, связанному с модулированием экспрессии РНК или белка гена, отличного от целевой нуклеиновой кислоты.

«Олигомерное соединение» обозначает полимер связанных мономерных субъединиц, который способен гибридизоваться по меньшей мере с какой-либо областью молекулы нуклеиновой кислоты.

«Олигонуклеозид» обозначает олигонуклеотид, в котором межнуклеозидные связи не содержат атом фосфора.

«Олигонуклеотид» обозначает полимер связанных нуклеозидов, каждый из которых может быть модифицированным или не модифицированным, не зависимо друг от друга.

«Парентеральное введение» обозначает введение инъекцией (например, болюсной инъекцией) или инфузией. Парентеральное введение включает подкожное введение, внутривенное введение, внутримышечное введение, внутриартериальное введение, внутрибрюшинное введение или внутричерепное введение, например, интратекальное или интрацеребровентрикулярное введение.

«Пептид» обозначает молекулу, образованную связыванием по меньшей мере двух аминокислот амидными связями. Без ограничения, при использовании в настоящем документе, «пептид» относится к полипептидам и белкам.

«Фармацевтически приемлемый носитель» обозначает среду или разбавитель, который не взаимодействует со структурой олигонуклеотида. Некоторые такие носители обеспечивают возможность составления фармацевтических композиций, таких как, например, таблетки, пилюли, драже, капсулы, жидкости, гели, сиропы, взвеси, суспензии и пастилки для перорального приема пациентом.

«Фармацевтически приемлемое производное» охватывает фармацевтически приемлемые соли, конъюгаты, пролекарства или изомеры соединений, описанных в настоящем документе.

«Фармацевтически приемлемые соли» обозначает физиологически и фармацевтически приемлемые соли антисмысловых соединений, то есть соли, которые сохраняют заданную биологическую активность исходного олигонуклеотида и не наделяют его нежелательным токсикологическим действием.

«Фармацевтическое средство» обозначает вещество, которое обеспечивает терапевтическое преимущество при введении пациенту. Например, в некоторых вариантах реализации, антисмысловый олигонуклеотид, направленный на HBV, представляет собой фармацевтическое средство.

«Фармацевтическая композиция» обозначает смесь веществ, пригодную для введения субъекту. Например, фармацевтическая композиция может включать антисмысловый олигонуклеотид и стерильный водный раствор. В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция демонстрирует активность в анализе свободного поглощения в некоторых клеточных линиях.

«Фосфотиоатная связь» обозначает связь между нуклеозидами, где фосфодиэфирная связь модифицирована заменой одного из не мостиковых атомов кислорода атомом серы. Фосфотиоатная связь представляет собой модифицированную межнуклеозидную связь.

«Часть» обозначает определенное количество смежных (то есть связанных) нуклеооснований нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации, часть является определенным количеством смежных нуклеооснований целевой нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации, часть является определенным количеством смежных нуклеооснований антисмыслового соединения.

«Предупреждение» или «профилактика» относится к отсрочке или предотвращению возникновения или развития состояния или заболевания в течение периода времени от часов до дней, предпочтительно от недель до месяцев.

«Пролекарство» обозначает терапевтическое средство, которое готовят в неактивной форме, которая превращается в активную форму (то есть лекарство) внутри организма или его клеток под действием эндогенных ферментов или других химических веществ и/или условий.

«Профилактически эффективное количество» относится к количеству фармацевтического средства, которое обеспечивает профилактическое или превентивное преимущество для животного.

«Рекомендованная терапия» обозначает лечебную схему, рекомендованную медицинским специалистом для лечения, улучшения или предупреждения заболевания.

«Область» определяют как часть целевой нуклеиновой кислоты, имеющую по меньшей мере одну идентифицируемую структуру, функцию или характеристику.

«Рибонуклеотид» обозначает нуклеотид, имеющий гидрокси-группу в 2' положении сахарной части нуклеотида. Рибонуклеотиды могут быть модифицированы любым из множества заместителей.

«Соли» обозначают физиологически и фармацевтически приемлемые соли антисмысловых соединений, то есть соли, которые сохраняют заданную биологическую активность исходного олигонуклеотида и не наделяют его нежелательным токсикологическим действием.

«Сегменты» определяют как более мелкие или субфрагменты областей целевой нуклеиновой кислоты.

«Сероконверсию» определяют как отсутствие HBeAg в сыворотке плюс присутствие HBeAb в сыворотке, в случае мониторинга HBeAg как определителя сероконверсии, или определяют как отсутствие HBsAg в сыворотке, в случае мониторинга HBsAg как определителя сероконверсии, по результатам определения доступных в настоящее время пределов обнаружения коммерческих систем иммуноферментного твердофазного анализа (ELISA).

«Укороченные» или «усеченные» версии антисмысловых олигонуклеотидов, представленных в настоящем документе, имеют один, два или более удаленных нуклеозидов.

«Побочные эффекты» обозначает физиологические реакции, приписываемые лечению, которые отличны от заданного действия. В некоторых вариантах реализации, побочные эффекты включают, без ограничения, реакции в точке инъекции, аномалии при испытании функции печени, аномалии функции почек, печеночную токсичность, почечную токсичность, аномалии центральной нервной системы и миопатии. Например, повышенные уровни аминотрансферазы в сыворотке могут указывать на печеночную токсичность или аномалию функции печени. Например, повышенный билирубин может указывать на печеночную токсичность или аномалию функции печени.

«Существенный», при использовании в настоящем документе, обозначает измеримый или наблюдаемый, например, существенный результат, такой как существенное улучшение или существенное снижение, как правило, относится к измеримому или наблюдаемому результату, такому как измеримое или наблюдаемое улучшение или снижение.

«Сайты», при использовании в настоящем документе, определяют как уникальные положения нуклеооснований в целевой нуклеиновой кислоте.

«Замедляет прогрессирование» обозначает уменьшение развития указанного заболевания.

«Может специфически гибридизоваться» относится к антисмысловому соединению, имеющему достаточную степень комплементарности между антисмысловым олигонуклеотидом и целевой нуклеиновой кислотой для инициации заданного эффекта, одновременно демонстрирующему минимальное влияние или отсутствие влияния на нецелевые нуклеиновые кислоты в условиях, в которых необходимо специфическое связывание, то есть при физиологических условиях в случае анализов in vivo и при терапевтическом лечении. «Строгие условия гибридизации» или «строгие условия» относятся к условиям, в которых олигомерное соединение гибридизуется с его целевой последовательностью, но с минимальным количеством других последовательностей.

«Статистически значимый», при использовании в настоящем документе, обозначает измеримый или наблюдаемый параметр, который маловероятно является случайным результатом.

«Подкожное введение» обозначает введение непосредственно под кожу.

«Субъект» обозначает человека или животного, не являющегося человеком, выбранного для лечения или терапии.

«Мишень» относится к белку, модулирование которого задано. «Целевой ген» относится к гену, кодирующему мишень.

«Таргетинг» обозначает процесс разработки и выбора антисмыслового соединения, которое будет специфически гибридизоваться с целевой нуклеиновой кислотой и вызывать заданный эффект.

«Целевая нуклеиновая кислота», «целевая РНК», «целевой РНК транскрипт» и «мишень нуклеиновой кислоты», все эти термины обозначают нуклеиновую кислоту, на которую могут быть нацелены антисмысловые соединения.

«Целевая область» обозначает часть целевой нуклеиновой кислоты, на которую направлено одно или несколько антисмысловых соединений.

«Целевой сегмент» обозначает последовательность нуклеотидов целевой нуклеиновой кислоты, на которую направлено антисмысловое соединение. «Сайт-мишень 5'» относится к 5'-основному нуклеотиду целевого сегмента. «Сайт-мишень 3'» относится к 3'-основному нуклеотиду целевого сегмента.

«Терапевтически эффективное количество» обозначает количество фармацевтического средства, которое обеспечивает пациенту терапевтическое преимущество.

«Лечение» относится к введению композиции для изменения или улучшения заболевания или состояния.

«Не модифицированные» нуклеооснования обозначают пуриновые основания аденин (А) и гуанин (G), а также пиримидиновые основания тимин (Т), цитозин (С) и урацил (U).

«Не модифицированный нуклеотид» обозначает нуклеотид, состоящий из природных нуклеооснований, сахарных фрагментов и межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации не модифицированный нуклеотид представляет собой нуклеотид РНК (то есть β-D-рибонуклеозиды) или нуклеотид ДНК (то есть β-D-дезоксирибонуклеозид).

«Валидированный целевой сегмент» определяют как часть целевой области, состоящую по меньшей мере из 8 нуклеооснований (то есть 8 смежных нуклеооснований), на которую направлено активное олигомерное соединение.

«Сегмент крыла» обозначает множество нуклеозидов, модифицированных для влияния на свойства олигонуклеотида, такие как усиленная ингибирующая активность, повышенная связывающая аффиность к целевой нуклеиновой кислоте или устойчивость к разложению нуклеазами in vivo.

Некоторые варианты реализации

В некоторых вариантах реализации представлены способы, соединения и композиции для ингибирования экспрессии мРНК HBV.

В некоторых вариантах реализации представлены антисмысловые соединения, нацеленные на нуклеиновую кислоту HBV. В некоторых вариантах реализации нуклеиновая кислота HBV является последовательностями, представленными далее под номером доступа GENBANK U95551.1 (включена в настоящий документ как SEQ ID NO:1).

В некоторых вариантах реализации, соединения, представленные в настоящем документе, представляют собой или включают модифицированный олигонуклеотид. В некоторых вариантах реализации эти соединения включают модифицированный олигонуклеотид и конъюгат, описанный в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид представляет собой фармацевтически приемлемое производное.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид длиной от 10 до 30 связанных нуклеооснований, нацеленный на HBV. Мишень HBV может иметь последовательность, указанную в SEQ ID NO:1, или ее часть, или ее вариант.

В некоторых вариантах реализации, соединения или модифицированные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, имеют длину от 10 до 30 связанных нуклеооснований, и нацелены на HBV. В некоторых вариантах реализации, мишень HBV имеет последовательность, указанную в SEQ ID NO:1. В некоторых вариантах реализации, такие соединения или олигонуклеотиды нацелены на одну из следующих нуклеотидных областей HBV: CCTGCTGGTGGCTCCAGTTC (SEQ ID NO:1273); AGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCA (SEQ ID NO:1354); CATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTT (SEQ ID NO:1276); CAAGGTATGTTGCCCGT (SEQ ID NO:1277); CCTATGGGAGTGGGCCTCAG (SEQ ID NO:1279; TGGCTCAGTTTACTAGTGCCATTTGTTCAGTGGTTCG (SEQ ID NO:1287); TATATGGATGATGTGGT (SEQ ID NO:1359); TGCCAAGTGTTTGCTGA (SEQ ID NO:1360); TGCCGATCCATACTGCGGAACTCCT (SEQ ID NO:1361); CCGTGTGCACTTCGCTTCACCTCTGCACGT (SEQ ID NO:1352); GGAGGCTGTAGGCATAAATTGGT (SEQ ID NO:1353); CTTTTTCACCTCTGCCTA (SEQ ID NO:1362); TTCAAGCCTCCAAGCTGTGCCTTGG (SEQ ID NO:1363); AGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGG (SEQ ID NO:1274); TGGATGTGTCTGCGGCGTTTTATCAT (SEQ ID NO:1275); TGTATTCCCATCCCATC (SEQ ID NO:1278); TGGCTCAGTTTACTAGTGC (SEQ ID NO:1280); GGGCTTTCCCCCACTGT (SEQ ID NO:1281); TCCTCTGCCGATCCATACTGCGGAACTCCT (SEQ ID NO:1282); CGCACCTCTCTTTACGCGG (SEQ ID NO:1283); GGAGTGTGGATTCGCAC (SEQ ID NO:1284); или GAAGAAGAACTCCCTCGCCT (SEQ ID NO:1285). В некоторых вариантах реализации, такие соединения или олигонуклеотиды имеют сегмент гэп из 9, 10 или более связанных дезоксинуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, такие соединения или олигонуклеотиды имеют сегмент гэп из 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 или 16 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, такой сегмент гэп находится между двумя сегментами крыльев, которые независимо имеют 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 связанных модифицированных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, один или несколько модифицированных нуклеозидов в сегменте крыла содержит модифицированный сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный сахар представляет собой бициклический сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой нуклеозид БНК. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, 2'-замещенные нуклеозиды включают нуклеозид ы с бициклическими сахарными модификациями. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой затрудненный этилнуклеозид (cEt).

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированные олигонуклеотиды, состоящие из 10-30 связанных нуклеозидов, и имеющие последовательность нуклеооснований, содержащую часть, содержащую по меньшей мере 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 или 30 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1. В некоторых вариантах реализации, такие олигонуклеотиды имеют сегмент гэп из 9, 10 или более связанных дезоксинуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, такой сегмент гэп находится между двумя сегментами крыльев, которые независимо имеют 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 связанных модифицированных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, один или несколько модифицированных нуклеозидов в сегменте крыла содержит модифицированный сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный сахар представляет собой бициклический сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой нуклеозид БНК. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, 2'-замещенные нуклеозиды содержат нуклеозиды с бициклическими сахарными модификациями. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой затрудненный этилнуклеозид (cEt). В некоторых вариантах реализации, каждый модифицированный нуклеозид в каждом сегменте крыла независимо представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид или нуклеозид с бициклической сахарной модификацией, такой как затрудненный этилнуклеозид (cEt) или нуклеозид БЫК.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 10-30 связанных нуклеозидов, и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных нуклеооснований любой из последовательностей SEQ ID NO:5-310, 321-802, 804-1272, 1288-1350, 1364-1372, 1375, 1376 или 1379. В некоторых вариантах реализации, такие олигонуклеотиды имеют сегмент гэп из 9, 10 или более связанных дезоксинуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, такой сегмент гэп находится между двумя сегментами крыльев, которые независимо имеют 1-5, 1-4, 1-3, 2-5, 2-4 или 2-3 связанных модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации, такой сегмент гэп находится между двумя сегментами крыльев, которые независимо имеют 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 связанных модифицированных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, один или несколько модифицированных нуклеозидов в сегменте крыла содержит модифицированный сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный сахар представляет собой бициклический сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой нуклеозид БЫК. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, 2'-замещенные нуклеозиды включают нуклеозиды с бициклическими сахарными модификациями. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой затрудненный этилнуклеозид (cEt).

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3 или 4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, каждый нуклеозид с модифицированным сахаром независимо представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид или нуклеозид с бициклическим сахарным фрагментом, такой как затрудненный этилнуклеозид (cEt) или нуклеозид БНК. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, каждый нуклеозид с модифицированным сахаром независимо представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид или бициклический нуклеозид, такой как затрудненный этилнуклеозид (cEt) или нуклеозид БНК.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 10-30 связанных нуклеозидов, и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных нуклеооснований любой из последовательностей SEQ ID NO:5-310, 321-802, 804-1272, 1288-1350, 1364-1372, 1375, 1376 или 1379. В некоторых вариантах реализации, такие олигонуклеотиды имеют сегмент гэп из 10 или более связанных дезоксинуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, такой сегмент гэп находится между двумя сегментами крыльев, которые независимо имеют 1-5, 1-4, 1-3, 2-5, 2-4 или 2-3 связанных модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации, такой сегмент гэп находится между двумя сегментами крыльев, которые независимо имеют 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 связанных модифицированных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, один или несколько модифицированных нуклеозидов в сегменте крыла содержит модифицированный сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный сахар представляет собой бициклический сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой нуклеозид БНК. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, 2'-замещенные нуклеозиды включают нуклеозиды с бициклическими сахарными модификациями. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 10-30 связанных нуклеозидов, и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных нуклеооснований любой из последовательностей SEQ ID NO:5, 15, 16, 33, 39-95, 123-135, 163-175, 180-310, 321-406, 413-455, 461-802 или 804-1272. В некоторых вариантах реализации, такие олигонуклеотиды имеют сегмент гэп из 10 или более связанных дезоксинуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, такой сегмент гэп находится между двумя сегментами крыльев, которые независимо имеют 1-5, 1-4, 1-3, 2-5, 2-4 или 2-3 связанных модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации, один или несколько модифицированных нуклеозидов в сегменте крыла содержит модифицированный сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный сахар представляет собой бициклический сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой нуклеозид БЫК. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, 2'-замещенные нуклеозиды включают нуклеозиды с бициклическими сахарными модификациями. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 10-30 связанных нуклеозидов, и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных нуклеооснований любой из последовательностей SEQ ID NO:6-14, 17-32, 34-38, 96-122, 136-162, 176-179, 407-412, 456-462, 523-538. В некоторых вариантах реализации, такие олигонуклеотиды имеют сегмент гэп из 10 или более связанных дезоксинуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, такой сегмент гэп находится между двумя сегментами крыльев, которые независимо имеют 1-5, 1-4, 1-3, 2-5, 2-4 или 2-3 связанных модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации, один или несколько модифицированных нуклеозидов в сегменте крыла содержит модифицированный сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 14 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-3 или 2 нуклеозида с модифицированным сахаром.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром, как нуклеозиды 2'-МОЕ.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 17 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 или 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3-4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4, 5 или 6 нуклеозидов с модифицированным сахаром, как нуклеозиды 2'-МОЕ.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 18 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 3-5 или 4 нуклеозида с модифицированным сахаром.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 20 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 22, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 нуклеозидов с модифицированным сахаром, как нуклеозиды 2'-МОЕ.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат соль модифицированного олигонуклеотида.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции дополнительно содержат фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.

В некоторых вариантах реализации, последовательность нуклеооснований модифицированного олигонуклеотида по меньшей мере на 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 100% комплементарна последовательности SEQ ID NO:1, по результатам измерения целостности модифицированного олигонуклеотида.

В некоторых вариантах реализации, последовательность нуклеооснований модифицированного олигонуклеотида по меньшей мере на 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 100% комплементарна любой из последовательностей SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, по результатам измерения целостности модифицированного олигонуклеотида.

В некоторых вариантах реализации, соединение или модифицированный олигонуклеотид является одноцепочечным.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 или 30 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 18 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 14 связанных нуклеозидов.

В некоторых вариантах реализации, по меньшей мере одна межнуклеозидная связь модифицированного олигонуклеотида представляет собой модифицированную межнуклеозидную связь. В некоторых вариантах реализации, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную межнуклеозидную связь.

В некоторых вариантах реализации, по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонуклеотида включает модифицированный сахар. В некоторых вариантах реализации, по меньшей мере один модифицированный сахар содержит 2'-O-метоксиэтиловую группу (2'-O(СН2)2-ОСН3). В некоторых вариантах реализации, модифицированный сахар содержит группу 2'-O-СН3.

В некоторых вариантах реализации, по меньшей мере один модифицированный сахар представляет собой бициклический сахар. В некоторых вариантах реализации, по меньшей мере один модифицированный сахар, бициклический сахар содержит мостик 4'-(СН2)nO-2', причем n равен 1 или 2. В некоторых вариантах реализации, бициклический сахар содержит мостик 4'-CH2-O-2'. В некоторых вариантах реализации, бициклический сахар содержит мостик 4'-СН(СН3)-O-2'.

В некоторых вариантах реализации, по меньшей мере один нуклеозид указанного модифицированного олигонуклеотида содержит модифицированное нуклеооснование. В некоторых вариантах реализации, модифицированнле нуклеооснование представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из связанных нуклеозидов. Сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', и каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит модифицированный сахар.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 10 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из трех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из трех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар и/или затрудненный этиловый (cEt) сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин. В некоторых аспектах, каждый из трех связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, и каждый из трех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой затрудненный этиловый (cEt) сахар. В других аспектах, три связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3', а три связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'. В других аспектах, три связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3', а три связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 10 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из двух связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин. В некоторых аспектах, два связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3', а четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 9 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из пяти связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из двух связанных нуклеозидов; пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид и затрудненный (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; два связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 8 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из трех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из пяти связанных нуклеозидов; три связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из пяти связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 8 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из трех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из пяти связанных нуклеозидов, каждый из трех связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляет собой затрудненный этиловый (cEt) сахар; каждый из пяти связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 9 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из четырех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин. В некоторых аспектах, четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3', а четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 9 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из четырех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов; четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 9 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из четырех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов; четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 8 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из пяти связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов; пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 8 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из пяти связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов; пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 7 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из пяти связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из пяти связанных нуклеозидов; пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 7 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из шести связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов; шесть связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 7 связанных дезоксинуклеозидов, и сегмент крыла 5' состоит из шести связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов; шесть связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 10 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из пяти связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из пяти связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит затрудненный этиловый (cEt) сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из 10 связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из пяти связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из пяти связанных нуклеозидов, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин, причем пять связанных нуклеозидов крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3', и каждый из пяти связанных нуклеозидов крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из трех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из трех связанных нуклеозидов. В некоторых аспектах, сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3'; каждый из трех связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, и каждый из трех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой затрудненный этиловый (cEt) сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин. В других аспектах, сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3'; три связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; три связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин. В других аспектах, три связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3', а три связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из двух связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов. В некоторых аспектах, сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3'; два связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 9 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоязий из двух связанных нуклеозидов, причем пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид и затрудненный (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; два связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 8 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из трех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из пяти связанных нуклеозидов, причем три связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из пяти связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 8 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из трех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из пяти связанных нуклеозидов, причем каждый из трех связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляет собой затрудненный этиловый (cEt) сахар; каждый из пяти связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 9 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из четырех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин. В некоторых аспектах, четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3', а четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 9 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из четырех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов, причем четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 9 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из четырех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов, причем четыре связанных нуклеозида сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ Ю NO: 1, и причем модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 8 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов, причем пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 8 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов, причем пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 7 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из пяти связанных нуклеозидов, причем пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; пять связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь преставляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 7 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из шести связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов, причем шесть связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 7 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из шести связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов, причем шесть связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' представляют собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из четырех связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из пяти связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает затрудненный этиловый (cEt) сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1, 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из пяти связанных нуклеозидов, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин, причем пять связанных нуклеозидов крыла 5' представляют собой затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид, затрудненный этиловый (cEt) сахар, 2'-дезоксинуклеозид и затрудненный этиловый (cEt) сахар в направлении от 5' к 3', и каждый из пяти связанных нуклеозидов крыла 3' представляет собой 2'-O-метоксиэтиловый сахар.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из пяти связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из пяти связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из двух связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из восьми связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из восьми связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из двух связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из трех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из семи связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из семи связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из трех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из четырех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из шести связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из шести связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 18 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из четырех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нулеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из трех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из девяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из двух связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из шести связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из девяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из шести связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из двух связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из девяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из четырех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из девяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из пяти связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из трех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из девяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из трех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из пяти связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из трех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из трех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из девяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из пяти связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из двух связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из девяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из двух связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из пяти связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из девяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из четырех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из трех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из девяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из трех связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из четырех связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид состоит из 14 связанных нуклеозидов, сегмент гэп состоит из десяти связанных дезоксинуклеозидов, сегмент крыла 5' состоит из двух связанных нуклеозидов, сегмент крыла 3' состоит из двух связанных нуклеозидов, каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из пяти связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из двух связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из восьми связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из восьми связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из двух связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из трех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из семи связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из семи связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из трех связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из четырех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из шести связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из шести связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 18 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из четырех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из трех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из девяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из двух связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из шести связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из девяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из шести связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из двух связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из девяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из четырех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из девяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из трех связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из девяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из трех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из пяти связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из трех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из трех связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO: 1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из девяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из двух связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из девяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из двух связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из пяти связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из девяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из четырех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из трех связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из девяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из трех связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из четырех связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции содержат модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 14 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований, содержащую часть, состоящую по меньшей мере из 8 смежных нуклеооснований, комплементарную равной по длине части любого из нуклеооснований, представленных далее в последовательностях SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, причем указанная последовательность нуклеооснований комплементарна к SEQ ID NO:1, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; b) сегмент крыла 5', состоящий из двух связанных нуклеозидов; и с) сегмент крыла 3', состоящий из двух связанных нуклеозидов. Сегмент гэп располагается между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла включает 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.

В некоторых вариантах реализации, представленные способы, соединения и композиции ингибируют уровни экспрессии мРНК и/или ДНК HBV и/или уровни белка, и/или уровни антигена.

В другом варианте реализации представлен способ лечения HBV-связанных заболеваний, расстройств и состояний у млекопитающих, включающий введение терапевтически эффективного количества любой фармацевтической композиции, описанной выше, млекопитающему, нуждающемуся в этом, для лечения HBV-связанных заболеваний, расстройств и состояний. В родственных вариантах реализации млекопитающим является человек, а HBV-состояние заболевание, расстройство и состояние представляет собой инфекцию вируса гепатита В от вируса гепатита В человека. Более конкретно, вирус гепатита В человека может быть любым из человеческих географических генотипов: А (Северо-Западная Европа, Северная Америка, Центральная Америка); В (Индонезия, Китай, Вьетнам); С (Восточная Азия, Корея, Китай, Япония, Полинезия, Вьетнам); D (Средиземноморский регион, Ближний восток, Индия); Е (Африка); F (коренные американцы, Полинезия); G (Соединенные Штаты, Франция); или Н (Центральная Америка).

В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение или олигонуклеотид, направленный на нуклеиновую кислоту HBV, комплементарен в пределах следующих нуклеотидных областей последовательности SEQ ID NO:1: 1-20, 10-29, 10-56, 13-38, 13-35, 19-38, 25-47, 25-50, 25-56, 43-68, 43-63, 55-74, 58-73, 58-74, 58-77, 58-79, 58-80, 58-84, 59-74, 59-75, 59-80, 60-75, 60-76, 60-79, 61-76, 61-77, 61-80, 62-77, 63-84, 68-114, 101-123, 98-123, 113-138, 116-138, 131-150, 137-162, 152-186, 158-177, 167-186, 191-215, 196-224, 196-215, 196-218, 199-228, 199-218, 199-224, 200-224, 205-224, 206-228, 218-237, 224-243, 233-264, 242-263, 243-262, 244-263, 245-274; 245-260, 245-264, 246-266, 247-266, 247-269, 247-270, 245-267, 251-267, 245-266, 250-269, 251-266, 251-268, 251-269, 245-269, 245-266, 245-261, 250-265, 250-266, 250-267, 250-268, 250-269, 251-270, 252-267, 253-268, 253-269, 253-272, 253-274, 254-269, 254-270, 254-274, 255-270, 255-271, 255-274, 255-401, 255-400, 255-274, 255-273, 255-272, 255-271, 256-271, 256-275, 255-276, 256-272, 256-276, 253-275, 256-279, 257-276, 258-273, 259-274, 260-279, 262-281, 262-321, 262-315, 262-312, 265-312, 266-288, 266-291, 266-285, 281-321, 281-303, 290-321, 290-312, 292-311, 290-312, 293-312, 293-315, 293-321, 296-321, 302-321, 324-343, 339-361, 339-367, 348-367, 342-367, 358-392, 358-378, 360-392, 360-383, 360-388, 360-385, 362-381, 366-388, 369-388, 366-385, 366-392, 370-389, 370-392, 380-399, 382-401, 384-433, 384-400, 384-401, 385-401, 405-424, 409-428, 405-428, 411-426, 411-427, 411-430, 411-431, 411-437, 412-431, 411-426, 411-427, 412-428, 412-431, 412-427, 413-433, 413-432, 413-428, 413-429, 413-432, 413-433, 414-427, 415-427, 414-429, 414-430, 414-433, 415-428, 415-429, 415-430, 415-431, 415-434, 416-431, 416-432, 416-429, 416-435, 417-432, 417-433, 417-436, 418-433, 418-435, 418-434, 418-437, 419-435, 419-434, 420-435, 419-432, 419-434, 421-436, 422-437, 422-441, 423-436, 425-465, 454-473, 454-472, 457-476, 457-472, 457-473, 454-476, 455-472, 457-485, 458-485, 458-483, 458-477, 458-473, 459-485, 460-485, 463-498, 463-485, 466-485, 463-482, 457-491, 458-491, 459-491, 460-491, 463-491, 466-491, 472-491, 472-493, 473-492, 475-491, 459-494, 460-494, 463-494, 466-494, 467-498, 472-494, 475-494, 457-473, 457-472, 458-494, 454-494, 457-494, 457-473, 485-513, 470-493, 476-519, 485-519, 500-519, 512-534, 512-550, 524-546, 536-559, 548-567, 548-570, 550-570, 548-594, 554-573, 548-576, 560-594, 584-606, 611-645, 617-363, 623-642, 617-645, 639-754, 639-658, 639-654, 641-656, 642-657, 643-658, 642-754, 653-672, 662-685, 665-685,665-689, 668-687, 670-754, 670-706, 670-685, 670-686, 670-689, 671-690, 671-691, 671-686, 671-687, 672-693, 672-697, 672-707, 672-687, 672-688, 673-688, 674-693, 678-693, 679-694, 679-707, 679-698, 679-701, 679-702, 679-707, 680-695, 680-699, 679-699, 681-706, 681-696, 682-697, 682-706, 682-707, 682-702, 682-701, 683-698, 684-699, 685-700, 686-701, 687-754, 688-704, 689-709, 689-710, 690-705, 679-705, 679-710, 679-706, 690-710, 691-710, 690-754, 690-706, 684-703, 687-705, 687-702, 687-703, 687-706, 688-703, 688-704, 688-705, 689-704, 689-705, 689-708, 690-705, 690-706, 690-709, 691-706, 692-711, 693-716, 693-712, 695-715, 697-716, 697-716, 690-716, 724-746, 724-752, 724-754, 724-758, 733-752, 738-754, 738-753, 739-758, 739-754, 739-775, 739-754, 740-754, 742-785, 742-773, 757-776, 757-785, 790-815, 793-812, 811-833, 811-844, 814-833, 811-906, 820-839, 822-844, 822-867, 823-842, 845-864, 845-867, 854-906, 845-909, 845-906, 854-876, 863-882, 863-885, 878-900, 887-906, 899-918, 899-933, 899-958, 905-927, 905-933, 914-933, 936-958, 936-955, 945-964, 951-970, 951-985, 951-1044, 951-1024, 951-1056, 951-997, 960-985, 963-1044, 963-1024, 963-997, 972-1015, 1025-1044, 1031-1056, 1037-1056, 1046-1083, 1049-1068, 1070-1089, 1070-1095, 1082-1101, 1081-1134, 1081-1143, 1082-1101, 1088-1107, 1088-1134, 1094-1119, 1097-1119, 1112-1134, 1118-1143, 1118-1146, 1088-1146, 1121-1140, 1127-1146, 1127-1193, 1150-1193, 1156-1187, 1165-1187, 1170-1192, 1171-1191, 1172-1191, 1176-1192, 1176-1285, 1177-1192, 1176-1191, 1203-1297, 1206-1228, 1206-1255, 1209-1228, 1215-1255, 1245-1265, 1251-1280, 1262-1285, 1251-1285, 1259-1296, 1259-1290, 1259-1287, 1261-1296, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1296, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1264-1297, 1265-1280, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1268-1296, 1269-1284, 1269-1285, 1269-1288, 1270-1285, 1271-1290, 1271-1296, 1277-1296, 1261-1290, 1262-1290, 1268-1290, 1263-1305, 1259-1305, 1259-1305, 1266-1305, 1259-1302, 1275-1294, 1281-1306, 1281-1324, 1281-1336, 1282-1301, 1286-1306, 1290-1324, 1293-1318, 1290-1324, 1293-1315, 1296-1315, 1311-1336, 1311-1333, 1326-1345, 1353-1381, 1359-1378, 1395-1414, 1498-1532, 1498-1523, 1498-1535, 1510-1529, 1515-1535, 1515-1563, 1515-1596, 1515-1605, 1515-1602, 1515-1540, 1515-1535, 1518-1605, 1518-1602, 1518-1537, 1521-1563, 1521-1540, 1550-1655, 1550-1563, 1550-1569, 1553-1578, 1553-1599, 1553-1590, 1565-1584, 1571-1595, 1577-1605, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1578-1598, 1571-1598, 1579-1594, 1579-1594, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1580-1605, 1580-1602, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1582-1602, 1553-1655, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1602, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1586-1652, 1642-1664, 1651-1720, 1651-1673, 1655-1679, 1695-1720, 1716-1738, 1743-1763, 1743-1768, 1764-1783, 1773-1792, 1777-1796, 1777-1800, 1778-1800, 1778-1793, 1778-1794, 1778-1797, 1779-1798, 1779-1797, 1779-1796, 1779-1795, 1779-1794, 1780-1799, 1780-1796, 1780-1795, 1781-1797, 1781-1796, 1781-1796, 1781-1800, 1781-1797, 1782-1799, 1782-1797, 1782-1798, 1783-1798, 1783-1799, 1784-1800, 1784-1799, 1779-1799, 1778-1889, 1778-1794, 1779-1795, 1780-1799, 1785-1800, 1794-1813, 1806-1837, 1806-1828, 1806-1825, 1809-1828, 1812-1843, 1812-1837, 1812-1831, 1815-1843, 1815-1844, 1815-1840, 1815-1834, 1818-1837, 1821-1840, 1821-1844, 1821-1837, 1822-1843, 1822-1839, 1822-1837, 1823-1843, 1823-1838, 1824-1839, 1827-1846, 1861-1884, 1861-1880, 1865-1885, 1866-1881, 1867-1882, 1867-1886, 1868-1883, 1869-1885, 1869-1884, 1870-1885, 1871-1886, 1872-1887, 1874-1889, 1876-1895, 1888-1914, 1888-1908, 1891-1910, 1891-1914, 1895-1938, 1895-1935, 1913-1935, 1898-1920, 1907-1929, 1913-1935, 1918-1934, 1919-1938, 1919-1934, 1921-1934, 1928-1956, 1957-1976, 2035-2057, 2083-2141, 2230-2261, 2368-2393, 2381-2397, 2368-2394, 2379-2394, 2381-2396, 2368-2397, 2368-2396, 2420-2439, 2458-2476, 2459-2478, 2819-2838, 2818-2838, 2873-2892 и 3161-3182.

В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение или олигонуклеотид, направленный на нуклеиновую кислоту HBV, направлен на следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1: 1-20, 10-29, 10-56, 13-38, 13-35, 19-38, 25-47, 25-50, 25-56, 43-68, 43-63, 55-74, 58-73, 58-74, 58-77, 58-79, 58-80, 58-84, 59-74, 59-75, 59-80, 60-75, 60-76, 60-79, 61-76, 61-77, 61-80, 62-77, 63-84, 68-114, 101-123, 98-123, 113-138, 116-138, 131-150, 137-162, 152-186, 158-177, 167-186, 191-215, 196-224, 196-215, 196-218, 199-228, 199-218, 199-224, 200-224, 205-224, 206-228, 218-237, 224-243, 233-264, 242-263, 243-262, 244-263, 245-274; 245-260, 245-264, 246-266, 247-266, 247-269, 247-270, 245-267, 251-267, 245-266, 250-269, 251-266, 251-268, 251-269, 245-269, 245-266, 245-261, 250-265, 250-266, 250-267, 250-268, 250-269, 251-270, 252-267, 253-268, 253-269, 253-272, 253-274, 254-269, 254-270, 254-274, 255-270, 255-271, 255-274, 255-401, 255-400, 255-274, 255-273, 255-272, 255-271, 256-271, 256-275, 255-276, 256-272, 256-276, 253-275, 256-279, 257-276, 258-273, 259-274, 260-279, 262-281, 262-321, 262-315, 262-312, 265-312, 266-288, 266-291, 266-285, 281-321, 281-303, 290-321, 290-312, 292-311, 290-312, 293-312, 293-315, 293-321, 296-321, 302-321, 324-343, 339-361, 339-367, 348-367, 342-367, 358-392, 358-378, 360-392, 360-383, 360-388, 360-385, 362-381, 366-388, 369-388, 366-385, 366-392, 370-389, 370-392, 380-399, 382-401, 384-433, 384-400, 384-401, 385-401, 405-424, 409-428, 405-428, 411-426, 411-427, 411-430, 411-431, 411-437, 412-431, 411-426, 411-427, 412-428, 412-431, 412-427, 413-433, 413-432, 413-428, 413-429, 413-432, 413-433, 414-427, 415-427, 414-429, 414-430, 414-433, 415-428, 415-429, 415-430, 415-431, 415-434, 416-431, 416-432, 416-429, 416-435, 417-432, 417-433, 417-436, 418-433, 418-435, 418-434, 418-437, 419-435, 419-434, 420-435, 419-432, 419-434, 421-436, 422-437, 422-441, 423-436, 425-465, 454-473, 454-472, 457-476, 457-472, 457-473, 454-476, 455-472, 457-485, 458-485, 458-483, 458-477, 458-473, 459-485, 460-485, 463-498, 463-485, 466-485, 463-482, 457-491, 458-491, 459-491, 460-491, 463-491, 466-491, 472-491, 472-493, 473-492, 475-491, 459-494, 460-494, 463-494, 466-494, 467-498, 472-494, 475-494, 457-473, 457-472, 458-494, 454-494, 457-494, 457-473, 485-513, 470-493, 476-519, 485-519, 500-519, 512-534, 512-550, 524-546, 536-559, 548-567, 548-570, 550-570, 548-594, 554-573, 548-576, 560-594, 584-606, 611-645, 617-363, 623-642, 617-645, 639-754, 639-658, 639-654, 641-656, 642-657, 643-658, 642-754, 653-672, 662-685, 665-685,665-689, 668-687, 670-754, 670-706, 670-685, 670-686, 670-689, 671-690, 671-691, 671-686, 671-687, 672-693, 672-697, 672-707, 672-687, 672-688, 673-688, 674-693, 678-693, 679-694, 679-707, 679-698, 679-701, 679-702, 679-707, 680-695, 680-699, 679-699, 681-706, 681-696, 682-697, 682-706, 682-707, 682-702, 682-701, 683-698, 684-699, 685-700, 686-701, 687-754, 688-704, 689-709, 689-710, 690-705, 679-705, 679-710, 679-706, 690-710, 691-710, 690-754, 690-706, 684-703, 687-705, 687-702, 687-703, 687-706, 688-703, 688-704, 688-705, 689-704, 689-705, 689-708, 690-705, 690-706, 690-709, 691-706, 692-711, 693-716, 693-712, 695-715, 697-716, 697-716, 690-716, 724-746, 724-752, 724-754, 724-758, 733-752, 738-754, 738-753, 739-758, 739-754, 739-775, 739-754, 740-754, 742-785, 742-773, 757-776, 757-785, 790-815, 793-812, 811-833, 811-844, 814-833, 811-906, 820-839, 822-844, 822-867, 823-842, 845-864, 845-867, 854-906, 845-909, 845-906, 854-876, 863-882, 863-885, 878-900, 887-906, 899-918, 899-933, 899-958, 905-927, 905-933, 914-933, 936-958, 936-955, 945-964, 951-970, 951-985, 951-1044, 951-1024, 951-1056, 951-997, 960-985, 963-1044, 963-1024, 963-997, 972-1015, 1025-1044, 1031-1056, 1037-1056, 1046-1083, 1049-1068, 1070-1089, 1070-1095, 1082-1101, 1081-1134, 1081-1143, 1082-1101, 1088-1107, 1088-1134, 1094-1119, 1097-1119, 1112-1134,1118-1143, 1118-1146, 1088-1146, 1121-1140, 1127-1146, 1127-1193, 1150-1193, 1156-1187, 1165-1187, 1170-1192, 1171-1191, 1172-1191, 1176-1192, 1176-1285, 1177-1192, 1176-1191, 1203-1297, 1206-1228, 1206-1255, 1209-1228, 1215-1255, 1245-1265, 1251-1280, 1262-1285, 1251-1285, 1259-1296, 1259-1290, 1259-1287, 1261-1296, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1296, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1264-1297, 1265-1280, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1268-1296, 1269-1284, 1269-1285, 1269-1288, 1270-1285, 1271-1290, 1271-1296, 1277-1296, 1261-1290, 1262-1290, 1268-1290, 1263-1305, 1259-1305, 1259-1305, 1266-1305, 1259-1302, 1275-1294, 1281-1306, 1281-1324, 1281-1336, 1282-1301, 1286-1306, 1290-1324, 1293-1318, 1290-1324, 1293-1315, 1296-1315, 1311-1336, 1311-1333, 1326-1345, 1353-1381, 1359-1378, 1395-1414, 1498-1532, 1498-1523, 1498-1535, 1510-1529, 1515-1535, 1515-1563, 1515-1596, 1515-1605, 1515-1602, 1515-1540, 1515-1535, 1518-1605, 1518-1602,1518-1537, 1521-1563, 1521-1540, 1550-1655, 1550-1563, 1550-1569, 1553-1578, 1553-1599, 1553-1590, 1565-1584, 1571-1595, 1577-1605, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1578-1598, 1571-1598, 1579-1594, 1579-1594, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1580-1605, 1580-1602, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1582-1602, 1553-1655, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1602, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1586-1652, 1642-1664, 1651-1720, 1651-1673, 1655-1679, 1695-1720, 1716-1738, 1743-1763, 1743-1768, 1764-1783, 1773-1792, 1777-1796, 1777-1800, 1778-1800, 1778-1793, 1778-1794, 1778-1797, 1779-1798, 1779-1797, 1779-1796, 1779-1795, 1779-1794, 1780-1799, 1780-1796, 1780-1795, 1781-1797, 1781-1796, 1781-1796, 1781-1800, 1781-1797, 1782-1799, 1782-1797, 1782-1798, 1783-1798, 1783-1799, 1784-1800, 1784-1799, 1779-1799, 1778-1889, 1778-1794, 1779-1795, 1780-1799, 1785-1800, 1794-1813, 1806-1837, 1806-1828, 1806-1825, 1809-1828, 1812-1843, 1812-1837, 1812-1831, 1815-1843, 1815-1844, 1815-1840, 1815-1834, 1818-1837, 1821-1840, 1821-1844, 1821-1837, 1822-1843, 1822-1839, 1822-1837, 1823-1843, 1823-1838, 1824-1839, 1827-1846, 1861-1884, 1861-1880, 1865-1885, 1866-1881, 1867-1882, 1867-1886, 1868-1883, 1869-1885, 1869-1884, 1870-1885, 1871-1886, 1872-1887, 1874-1889, 1876-1895, 1888-1914, 1888-1908, 1891-1910, 1891-1914, 1895-1938, 1895-1935, 1913-1935, 1898-1920, 1907-1929, 1913-1935, 1918-1934, 1919-1938, 1919-1934, 1921-1934, 1928-1956, 1957-1976, 2035-2057, 2083-2141, 2230-2261, 2368-2393, 2381-2397, 2368-2394, 2379-2394, 2381-2396, 2368-2397, 2368-2396, 2420-2439, 2458-2476, 2459-2478, 2819-2838, 2818-2838, 2873-2892 и 3161-3182.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение или олигонуклеотид, направленный на нуклеиновую кислоту HBV, комплементарен в пределах генной области второй части pre-Sl HBV, соответствующей нуклеотидной области 1-1932 последовательности SEQ ID NO:1. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение или олигонуклеотид, направленный на нуклеиновую кислоту HBV, комплементарен в пределах генной области первой части pre-Sl HBV, соответствующей нуклеотидной области 2831-3182 последовательности SEQ ID NO:1.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение или олигонуклеотид, направленный на нуклеиновую кислоту HBV, нацелен на генную область второй части pre-S I HBV, соответствующую нуклеотидной области 1-1932 последовательности SEQ ID NO:1. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение или олигонуклеотид, направленный на нуклеиновую кислоту HBV, нацелен на генную область первой части pre-Sl HBV, соответствующую нуклеотидной области 2831-3182 последовательности SEQ ID NO:1.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на область нуклеиновой кислоты HBV. В некоторых вариантах реализации, такие соединения или олигонуклеотиды направлены на область нуклеиновой кислоты HBV, имеющую часть смежных нуклеооснований, которая комплементарна равной по длине части нуклеооснований указанной области. Например, эта часть может быть частью, содержащей по меньшей мере 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных нуклеооснований, комплементарной равной по длине части области, упомянутой в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации такие соединения или олигонуклеотиды направлены на следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1: 1-20, 10-29, 10-56, 13-38, 13-35, 19-38, 25-47, 25-50, 25-56, 43-68, 43-63, 55-74, 58-73, 58-74, 58-77, 58-79, 58-80, 58-84, 59-74, 59-75, 59-80, 60-75, 60-76, 60-79, 61-76, 61-77, 61-80, 62-77, 63-84, 68-114, 101-123, 98-123, 113-138, 116-138, 131-150, 137-162, 152-186, 158-177, 167-186, 191-215, 196-224, 196-215, 196-218, 199-228, 199-218, 199-224, 200-224, 205-224, 206-228, 218-237, 224-243, 233-264, 242-263, 243-262, 244-263, 245-274; 245-260, 245-264, 246-266, 247-266, 247-269, 247-270, 245-267, 251-267, 245-266, 250-269, 251-266, 251-268, 251-269, 245-269, 245-266, 245-261, 250-265, 250-266, 250-267, 250-268, 250-269, 251-270, 252-267, 253-268, 253-269, 253-272, 253-274, 254-269, 254-270, 254-274, 255-270, 255-271, 255-274, 255-401, 255-400, 255-274, 255-273, 255-272, 255-271, 256-271, 256-275, 255-276, 256-272, 256-276, 253-275, 256-279, 257-276, 258-273, 259-274, 260-279, 262-281, 262-321, 262-315, 262-312, 265-312, 266-288, 266-291, 266-285, 281-321, 281-303, 290-321, 290-312, 292-311, 290-312, 293-312, 293-315, 293-321, 296-321, 302-321, 324-343, 339-361, 339-367, 348-367, 342-367, 358-392, 358-378, 360-392, 360-383, 360-388, 360-385, 362-381, 366-388, 369-388, 366-385, 366-392, 370-389, 370-392, 380-399, 382-401, 384-433, 384-400, 384-401, 385-401, 405-424, 409-428, 405-428, 411-426, 411-427, 411-430, 411-431, 411-437, 412-431, 411-426, 411-427, 412-428, 412-431, 412-427, 413-433, 413-432, 413-428, 413-429, 413-432, 413-433, 414-427, 415-427, 414-429, 414-430, 414-433, 415-428, 415-429, 415-430, 415-431, 415-434, 416-431, 416-432, 416-429, 416-435, 417-432, 417-433, 417-436, 418-433, 418-435, 418-434, 418-437, 419-435, 419-434, 420-435, 419-432, 419-434, 421-436, 422-437, 422-441, 423-436, 425-465, 454-473, 454-472, 457-476, 457-472, 457-473, 454-476, 455-472, 457-485, 458-485, 458-483, 458-477, 458-473, 459-485, 460-485, 463-498, 463-485, 466-485, 463-482, 457-491, 458-491, 459-491, 460-491, 463-491, 466-491, 472-491, 472-493, 473-492, 475-491, 459-494, 460-494, 463-494, 466-494, 467-498, 472-494, 475-494, 457-473, 457-472, 458-494, 454-494, 457-494, 457-473, 485-513, 470-493, 476-519, 485-519, 500-519, 512-534, 512-550, 524-546, 536-559, 548-567, 548-570, 550-570, 548-594, 554-573, 548-576, 560-594, 584-606, 611-645, 617-363, 623-642, 617-645, 639-754, 639-658, 639-654, 641-656, 642-657, 643-658, 642-754, 653-672, 662-685, 665-685,665-689, 668-687, 670-754, 670-706, 670-685, 670-686, 670-689, 671-690, 671-691, 671-686, 671-687, 672-693, 672-697, 672-707, 672-687, 672-688, 673-688, 674-693, 678-693, 679-694, 679-707, 679-698, 679-701, 679-702, 679-707, 680-695, 680-699, 679-699, 681-706, 681-696, 682-697, 682-706, 682-707, 682-702, 682-701, 683-698, 684-699, 685-700, 686-701, 687-754, 688-704, 689-709, 689-710, 690-705, 679-705, 679-710, 679-706, 690-710, 691-710, 690-754, 690-706, 684-703, 687-705, 687-702, 687-703, 687-706, 688-703, 688-704, 688-705, 689-704, 689-705, 689-708, 690-705, 690-706, 690-709, 691-706, 692-711, 693-716, 693-712, 695-715, 697-716, 697-716, 690-716, 724-746, 724-752, 724-754, 724-758, 733-752, 738-754, 738-753, 739-758, 739-754, 739-775, 739-754, 740-754, 742-785, 742-773, 757-776, 757-785, 790-815, 793-812, 811-833, 811-844, 814-833, 811-906, 820-839, 822-844, 822-867, 823-842, 845-864, 845-867, 854-906, 845-909, 845-906, 854-876, 863-882, 863-885, 878-900, 887-906, 899-918, 899-933, 899-958, 905-927, 905-933, 914-933, 936-958, 936-955, 945-964, 951-970, 951-985, 951-1044, 951-1024, 951-1056, 951-997, 960-985, 963-1044, 963-1024, 963-997, 972-1015, 1025-1044, 1031-1056, 1037-1056, 1046-1083, 1049-1068, 1070-1089, 1070-1095, 1082-1101, 1081-1134, 1081-1143, 1082-1101, 1088-1107, 1088-1134, 1094-1119, 1097-1119, 1112-1134, 1118-1143, 1118-1146, 1088-1146, 1121-1140, 1127-1146, 1127-1193, 1150-1193, 1156-1187, 1165-1187, 1170-1192, 1171-1191, 1172-1191, 1176-1192, 1176-1285, 1177-1192, 1176-1191, 1203-1297, 1206-1228, 1206-1255, 1209-1228, 1215-1255, 1245-1265, 1251-1280, 1262-1285, 1251-1285, 1259-1296, 1259-1290, 1259-1287, 1261-1296, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1296, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1264-1297, 1265-1280, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1268-1296, 1269-1284, 1269-1285, 1269-1288, 1270-1285, 1271-1290, 1271-1296, 1277-1296, 1261-1290, 1262-1290, 1268-1290, 1263-1305, 1259-1305, 1259-1305, 1266-1305, 1259-1302, 1275-1294, 1281-1306, 1281-1324, 1281-1336, 1282-1301, 1286-1306, 1290-1324, 1293-1318, 1290-1324, 1293-1315, 1296-1315, 1311-1336, 1311-1333, 1326-1345, 1353-1381, 1359-1378, 1395-1414, 1498-1532, 1498-1523, 1498-1535, 1510-1529, 1515-1535, 1515-1563, 1515-1596, 1515-1605, 1515-1602, 1515-1540, 1515-1535, 1518-1605, 1518-1602, 1518-1537, 1521-1563, 1521-1540, 1550-1655, 1550-1563, 1550-1569, 1553-1578, 1553-1599, 1553-1590, 1565-1584, 1571-1595, 1577-1605, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1578-1598, 1571-1598, 1579-1594, 1579-1594, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1580-1605, 1580-1602, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1582-1602, 1553-1655, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1602, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1586-1652, 1642-1664, 1651-1720, 1651-1673, 1655-1679, 1695-1720, 1716-1738, 1743-1763, 1743-1768, 1764-1783, 1773-1792, 1777-1796, 1777-1800, 1778-1800, 1778-1793, 1778-1794, 1778-1797, 1779-1798, 1779-1797, 1779-1796, 1779-1795, 1779-1794, 1780-1799, 1780-1796, 1780-1795, 1781-1797, 1781-1796, 1781-1796, 1781-1800, 1781-1797, 1782-1799, 1782-1797, 1782-1798, 1783-1798, 1783-1799, 1784-1800, 1784-1799, 1779-1799, 1778-1889, 1778-1794, 1779-1795, 1780-1799, 1785-1800, 1794-1813, 1806-1837, 1806-1828, 1806-1825, 1809-1828, 1812-1843, 1812-1837, 1812-1831, 1815-1843, 1815-1844, 1815-1840, 1815-1834, 1818-1837, 1821-1840, 1821-1844, 1821-1837, 1822-1843, 1822-1839, 1822-1837, 1823-1843, 1823-1838, 1824-1839, 1827-1846, 1861-1884, 1861-1880, 1865-1885, 1866-1881, 1867-1882, 1867-1886, 1868-1883, 1869-1885, 1869-1884, 1870-1885, 1871-1886, 1872-1887, 1874-1889, 1876-1895, 1888-1914, 1888-1908, 1891-1910, 1891-1914, 1895-1938, 1895-1935, 1913-1935, 1898-1920, 1907-1929, 1913-1935, 1918-1934, 1919-1938, 1919-1934, 1921-1934, 1928-1956, 1957-1976, 2035-2057, 2083-2141, 2230-2261, 2368-2393, 2381-2397, 2368-2394, 2379-2394, 2381-2396, 2368-2397, 2368-2396, 2420-2439, 2458-2476, 2459-2478, 2819-2838, 2818-2838, 2873-2892 и 3161-3182.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на область нуклеиновой кислоты HBV. В некоторых вариантах реализации, такие соединения или олигонуклеотиды направлены на область нуклеиновой кислоты HBV, имеющую часть смежных нуклеооснований, которая комплементарна равной по длине части нуклеооснований указанной области. Например, эта часть может быть частью, содержащей по меньшей мере 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных нуклеооснований, комплементарной равной по длине части области, упомянутой в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации такие соединения или олигонуклеотиды направлены на следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1: 58-73, 58-74, 58-77, 59-74, 60-75, 61-76, 62-77, 245-274; 245-260, 250-265, 251-266, 252-267, 253-268, 254-269, 255-270, 256-271, 256-272, 258-273, 259-274, 380-399, 382-401, 411-437, 411-427, 411-426, 412-427, 413-428, 413-432, 414-429, 415-430, 416-431, 417-432, 418-433, 419-434, 420-435, 421-436, 422-437, 457-472, 458-473, 639-754, 639-658, 639-654, 641-656, 642-657, 643-658, 670-754, 670-706, 670-685, 671-686, 672-687, 673-688, 678-693, 679-694, 680-695, 681-706, 681-696, 682-697, 683-698, 684-699, 685-700, 686-701, 687-702, 688-703, 689-704, 690-705, 691-706, 738-754, 738-753, 739-754, 1176-1285, 1176-1191, 1177-1192, 1261-1285, 1261-1276, 1262-1277, 1263-1278, 1264-1279, 1265-1280, 1266-1281, 1267-1282, 1268-1283, 1269-1284, 1270-1285, 1577-1606, 1577-1592, 1578-1593, 1579-1594, 1580-1595, 1581-1596, 1582-1597, 1583-1598, 1584-1599, 1585-1600, 1586-1601, 1587-1602, 1588-1603, 1589-1604, 1590-1605, 1591-1606, 1778-1889, 1778-1800, 1778-1793, 1779-1794, 1780-1799, 1780-1796, 1780-1795, 1781-1796, 1782-1797, 1783-1798, 1784-1799, 1785-1800, 1822-1839, 1822-1837, 1823-1838, 1824-1839, 1866-1881, 1867-1882, 1868-1883, 1869-1884, 1870-1885, 1871-1886, 1872-1887 или 1874-1889, и причем по меньшей мере один нуклеозид соединения или модифицированного олигонуклеотида включает по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый или затрудненный этиловый (cEt) сахар.

В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение или олигонуклеотид, направленный на нуклеиновую кислоту HBV, комплементарен в пределах следующих нуклеотидных областей последовательности SEQ ID NO:1: 58-73, 58-74, 58-77, 59-74, 59-75, 60-75, 60-76, 61-76, 61-77, 62-77, 253-272, 253-269, 254-270, 255-271, 256-272, 411-437, 411-426, 411-427, 411-430, 412-427, 412-428, 412-431, 413-428, 413-429, 413-432, 414-429, 414-430, 414-433, 415-430, 415-431, 415-434, 416-431, 416-432, 416-435, 417-432, 417-433, 417-436, 418-433, 418-434, 418-437, 457-472, 457-473, 458-473, 670-706, 670-685, 670-686, 671-686, 671-687, 672-687, 672-688, 673-688, 687-702, 687-703, 687-706, 688-703, 688-704, 689-704, 689-705, 690-705, 690-706, 691-706, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1265-1280, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1269-1284, 1269-1285, 1270-1285, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1579-1594, 1579-1594, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1602, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1778-1800, 1778-1793, 1778-1794, 1778-1797, 1779-1794, 1779-1795, 1779-1798, 1780-1795, 1780-1796, 1780-1799, 1781-1796, 1781-1797, 1781-1800, 1782-1797, 1782-1798, 1783-1798, 1783-1799, 1784-1799 и 1784-1800.

В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение или олигонуклеотид, направленный на нуклеиновую кислоту HBV, направлен на следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1: 58-73, 58-74, 58-77, 59-74, 59-75, 60-75, 60-76, 61-76, 61-77, 62-77, 253-272, 253-269, 254-270, 255-271, 256-272, 411-437, 411-426, 411-427, 411-430, 412-427, 412-428, 412-431, 413-428, 413-429, 413-432, 414-429, 414-430, 414-433, 415-430, 415-431, 415-434, 416-431, 416-432, 416-435, 417-432, 417-433, 417-436, 418-433, 418-434, 418-437, 457-472, 457-473, 458-473, 670-706, 670-685, 670-686, 671-686, 671-687, 672-687, 672-688, 673-688, 687-702, 687-703, 687-706, 688-703, 688-704, 689-704, 689-705, 690-705, 690-706, 691-706, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1265-1280, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1269-1284, 1269-1285, 1270-1285, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1579-1594, 1579-1594, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1602, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1778-1800, 1778-1793, 1778-1794, 1778-1797, 1779-1794, 1779-1795, 1779-1798, 1780-1795, 1780-1796, 1780-1799, 1781-1796, 1781-1797, 1781-1800, 1782-1797, 1782-1798, 1783-1798, 1783-1799, 1784-1799 и 1784-1800.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на область нуклеиновой кислоты HBV. В некоторых вариантах реализации, такие соединения или олигонуклеотиды направлены на область нуклеиновой кислоты HBV, имеющую часть смежных нуклеооснований, которая комплементарна равной по длине части нуклеооснований указанной области. Например, эта часть может быть частью, содержащей по меньшей мере 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных нуклеооснований, комплементарной равной по длине части области, упомянутой в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации такие соединения или олигонуклеотиды направлены на следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1: 1-20, 10-29, 10-56, 13-38, 13-35, 19-38, 25-47, 25-50, 25-56, 43-68, 43-63, 55-74, 58-73, 58-74, 58-77, 58-79, 58-80, 58-84, 59-74, 59-75, 59-80, 60-75, 60-76, 60-79, 61-76, 61-77, 61-80, 62-77, 63-84, 68-114, 101-123, 98-123, 113-138, 116-138, 131-150, 137-162, 152-186, 158-177, 167-186, 191-215, 196-224, 196-215, 196-218, 199-228, 199-218, 199-224, 200-224, 205-224, 206-228, 218-237, 224-243, 233-264, 242-263, 243-262, 244-263, 245-264, 246-266, 247-266, 247-269, 247-270, 245-267, 251-267, 245-266, 250-269, 251-268, 251-269, 245-269, 245-266, 245-261, 250-266, 250-267, 250-268, 250-269, 251-270, 253-269, 253-272, 253-274, 254-270, 254-274, 255-271, 255-274, 255-401, 255-400, 255-274, 255-273, 255-272, 255-271, 256-275, 255-276, 256-272, 256-276, 253-275, 256-279, 257-276, 260-279, 262-281, 262-321, 262-315, 262-312, 265-312, 266-288, 266-291, 266-285, 281-321, 281-303, 290-321, 290-312, 292-311, 290-312, 293-312, 293-315, 293-321, 296-321, 302-321, 324-343, 339-361, 339-367, 348-367, 342-367, 358-392, 358-378, 360-392, 360-383, 360-388, 360-385, 362-381, 366-388, 369-388, 366-385, 366-392, 370-389, 370-392, 384-433, 384-400, 384-401, 385-401, 405-424, 409-428, 405-428, 411-426, 411-427, 411-430, 411-431, 411-437, 412-431, 411-426, 411-427, 412-428, 412-431, 412-427, 413-433, 413-432, 413-428, 413-429, 413-432, 413-433, 414-427, 415-427, 414-429, 414-430, 414-433, 415-428, 415-429, 415-430, 415-431, 415-434, 416-431, 416-432, 416-429, 416-435, 417-432, 417-433, 417-436, 418-433, 418-435, 418-434, 418-437, 419-435, 419-434, 420-435, 419-432, 419-434, 422-441, 423-436, 425-465, 454-473, 454-472, 457-476, 457-472, 457-473, 454-476, 455-472, 457-485, 458-485, 458-483, 458-477, 458-473, 459-485, 460-485, 463-498, 463-485, 466-485, 463-482, 457-491, 458-491, 459-491, 460-491, 463-491, 466-491, 472-491, 472-493, 473-492, 475-491, 459-494, 460-494, 463-494, 466-494, 467-498, 472-494, 475-494, 457-473, 457-472, 458-494, 454-494, 457-494, 457-473, 485-513, 470-493, 476-519, 485-519, 500-519, 512-534, 512-550, 524-546, 536-559, 548-567, 548-570, 550-570, 548-594, 554-573, 548-576, 560-594, 584-606, 611-645, 617-363, 623-642, 617-645, 642-754, 653-672, 662-685, 665-685, 665-689, 668-687, 670-706, 670-685, 670-686, 670-689, 671-690, 671-691, 671-686, 671-687, 672-693, 672-697, 672-707, 672-687, 672-688, 673-688, 674-693, 679-707, 679-698, 679-701, 679-702, 679-707, 680-699, 679-699, 682-706, 682-707, 682-702, 682-701, 687-754, 688-704, 689-709, 689-710, 690-705, 679-705, 679-710, 679-706, 690-710, 691-710, 690-754, 690-706, 684-703, 687-705, 687-702, 687-703, 687-706, 688-703, 688-704, 688-705, 689-704, 689-705, 689-708, 690-705, 690-706, 690-709, 691-706, 692-711, 693-716, 693-712, 695-715, 697-716, 697-716, 690-716, 724-746, 724-752, 724-754, 724-758, 733-752, 738-754, 739-758, 739-754, 739-775, 739-754, 740-754, 742-785, 742-773, 757-776, 757-785, 790-815, 793-812, 811-833, 811-844, 814-833, 811-906, 820-839, 822-844, 822-867, 823-842, 845-864, 845-867, 854-906, 845-909, 845-906, 854-876, 863-882, 863-885, 878-900, 887-906, 899-918, 899-933, 899-958, 905-927, 905-933, 914-933, 936-958, 936-955, 945-964, 951-970, 951-985, 951-1044, 951-1024, 951-1056, 951-997, 960-985, 963-1044, 963-1024, 963-997, 972-1015, 1025-1044, 1031-1056, 1037-1056, 1046-1083, 1049-1068, 1070-1089, 1070-1095, 1082-1101, 1081-1134, 1081-1143, 1082-1101, 1088-1107, 1088-1134, 1094-1119, 1097-1119, 1112-1134, 1118-1143, 1118-1146, 1088-1146, 1121-1140, 1127-1146, 1127-1193,1150-1193, 1156-1187, 1165-1187, 1170-1192, 1171-1191, 1172-1191, 1176-1192, 1177-1192, 1176-1191, 1203-1297, 1206-1228, 1206-1255, 1209-1228, 1215-1255, 1245-1265, 1251-1280, 1262-1285, 1251-1285, 1259-1296, 1259-1290, 1259-1287, 1261-1296, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1296, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1264-1297, 1265-1280, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1268-1296, 1269-1284, 1269-1285, 1269-1288, 1270-1285, 1271-1290, 1271-1296, 1277-1296, 1261-1290, 1262-1290, 1268-1290, 1263-1305, 1259-1305, 1259-1305, 1266-1305, 1259-1302, 1275-1294, 1281-1306, 1281-1324, 1281-1336, 1282-1301, 1286-1306, 1290-1324, 1293-1318, 1290-1324, 1293-1315, 1296-1315, 1311-1336, 1311-1333, 1326-1345, 1353-1381, 1359-1378, 1395-1414, 1498-1532, 1498-1523, 1498-1535, 1510-1529, 1515-1535, 1515-1563, 1515-1596, 1515-1605, 1515-1602, 1515-1540, 1515-1535, 1518-1605, 1518-1602, 1518-1537, 1521-1563, 1521-1540, 1550-1655, 1550-1563, 1550-1569, 1553-1578, 1553-1599, 1553-1590, 1565-1584, 1571-1595, 1577-1605, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1578-1598, 1571-1598, 1579-1594, 1579-1594, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1580-1605, 1580-1602, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1582-1602, 1553-1655, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1602, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1586-1652, 1642-1664, 1651-1720, 1651-1673, 1655-1679, 1695-1720, 1716-1738, 1743-1763, 1743-1768, 1764-1783, 1773-1792, 1777-1796, 1777-1800, 1778-1800, 1778-1793, 1778-1794, 1778-1797, 1779-1798, 1779-1797, 1779-1796, 1779-1795, 1779-1794, 1780-1799, 1780-1796, 1780-1795, 1781-1797, 1781-1796, 1781-1796, 1781-1800, 1781-1797, 1782-1799, 1782-1797, 1782-1798, 1783-1798, 1783-1799, 1784-1800, 1784-1799, 1779-1799, 1778-1794, 1779-1795, 1780-1799, 1794-1813, 1806-1837, 1806-1828, 1806-1825, 1809-1828, 1812-1843, 1812-1837, 1812-1831, 1815-1843, 1815-1844, 1815-1840, 1815-1834, 1818-1837, 1821-1840, 1821-1844, 1821-1837, 1822-1843, 1822-1839, 1823-1843, 1827-1846, 1861-1884, 1861-1880, 1865-1885, 1867-1886, 1869-1885, 1876-1895, 1888-1914, 1888-1908, 1891-1910, 1891-1914, 1895-1938, 1895-1935, 1913-1935, 1898-1920, 1907-1929, 1913-1935, 1918-1934, 1919-1938, 1919-1934, 1921-1934, 1928-1956, 1957-1976, 2035-2057, 2083-2141, 2230-2261, 2368-2393, 2381-2397, 2368-2394, 2379-2394, 2381-2396, 2368-2397, 2368-2396, 2420-2439, 2458-2476, 2459-2478, 2819-2838, 2818-2838, 2873-2892 и 3161-3182.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на область нуклеиновой кислоты HBV. В некоторых вариантах реализации, такие соединения или олигонуклеотиды направлены на область нуклеиновой кислоты HBV, имеющую часть смежных нуклеооснований, которая комплементарна равной по длине части нуклеооснований указанной области. Например, эта часть может быть частью, содержащей по меньшей мере 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных нуклеооснований, комплементарной равной по длине части области, упомянутой в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации такие соединения или олигонуклеотиды направлены на следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1: 233-264, 242-263, 243-262, 244-263, 245-264, 246-266, 247-266, 247-269, 247-270, 245-267, 251-267, 245-266, 250-269, 251-268, 251-269, 245-269, 245-266, 245-261, 250-266, 250-267, 250-268, 250-269, 251-270, 253-272, 253-274, 254-274, 255-274, 255-401, 255-400, 255-274, 255-273, 255-272, 255-271, 256-275, 255-276, 256-276, 253-275, 256-279, 257-276, 260-279, 262-281, 262-321, 262-315, 262-312, 265-312, 266-288, 266-291, 266-285, 281-321, 281-303, 405-424, 409-428, 405-428, 411-430, 411-431, 411-431, 412-431, 411-426, 411-427, 412-428, 412-431, 412-427, 413-433, 413-432, 413-428, 413-433, 411-427, 414-427, 415-427, 415-428, 415-429, 416-432, 416-429, 418-435, 418-434, 419-435, 419-434, 420-435, 419-432, 419-434, 422-441, 423-436, 425-465, 584-606, 611-645, 617-363, 623-642, 617-645, 642-754, 653-672, и причем по меньшей мере один нуклеозид соединения или модифицированного олигонуклеотида включает по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый сахар.

В некоторых вариантах реализации, следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1, при направленном действии антисмысловых соединений или олигонуклеотидов, демонстрируют по меньшей мере 50% ингибирование: 1-20, 10-29, 10-56, 13-38, 13-35, 19-38, 25-47, 25-50, 25-56, 43-68, 43-63, 55-74, 58-77, 58-74, 58-73, 58-79, 58-80, 58-84, 59-74, 59-75, 59-80, 60-79, 60-75, 60-76, 61-80, 61-76, 61-77, 62-77, 63-84, 68-114, 101-123, 98-123, 113-138, 116-138, 131-150, 137-162, 152-186, 158-177, 167-186, 191-215, 196-224, 196-215, 196-218, 199-228, 199-218, 199-224,200-224, 205-224, 206-228, 218-237, 224-243, 233-264, 242-263, 243-262, 244-263, 245-264, 246-266, 247-266, 247-269, 247-270, 245-267, 251-267, 245-266, 250-269, 251-268, 251-269, 245-269, 245-266, 245-261, 250-265, 250-266, 250-267, 250-268, 250-269, 251-266, 251-270, 252-267, 253-268, 253-269, 253-272, 253-274, 254-269, 254-270, 254-274, 255-274, 255-401, 255-400, 255-274, 255-273, 255-272, 255-271, 255-270, 256-271, 256-272, 256-275, 255-276, 256-276, 253-275, 256-279, 257-276, 258-273, 259-274, 260-279, 262-281, 262-321, 262-315, 262-312, 265-312, 266-288, 266-291, 266-285, 281-321, 281-303, 290-321, 290-312, 292-311, 290-312, 293-312, 293-315, 293-321, 296-321, 302-321, 324-343, 339-361, 339-367, 348-367, 342-367, 358-392, 358-378, 360-392, 360-383, 360-388, 360-385, 362-381, 366-388, 369-388, 366-385, 366-392, 370-389, 370-392, 380-399, 382-401, 384-433, 384-400, 384-401, 385-401, 405-424, 409-428, 405-428, 411-430, 411-431, 411-431, 412-431, 411-426, 411-427, 411-430, 411-437, 412-428, 412-431, 412-427, 413-432, 413-428, 413-429, 413-433, 411-427, 414-427, 414-429, 414-430, 414-433, 415-427, 415-428, 415-429, 415-430, 415-431, 415-434, 416-435, 416-432, 416-431, 416-429, 417-432, 417-433, 417-436, 418-437, 418-435, 418-434, 418-433, 419-435, 419-434, 420-435, 419-432, 419-434, 421-436, 422-441, 422-437, 423-436, 425-465, 454-473, 454-472, 457-476, 454-476, 455-472, 457-485, 457-473, 457-472, 458-485, 458-483, 458-477, 458-473, 459-485, 460-485, 463-498, 463-485, 466-485, 463-482, 457-491, 458-491, 459-491, 460-491, 463-491, 466-491, 472-491, 472-493, 473-492, 475-491, 459-494, 460-494, 463-494, 466-494, 467-498, 472-494, 475-494, 457-473, 457-472, 458-494, 454-494, 457-494, 457-473, 485-513, 470-493, 476-519, 485-519, 500-519, 512-534, 512-550, 524-546, 536-559, 548-567, 548-570, 550-570, 548-594, 554-573, 548-576, 560-594, 584-606, 611-645, 617-363, 623-642, 617-645, 639-654, 641-656, 642-657, 642-754, 643-658, 653-672, 662-685, 665-685,665-689, 668-687, 670-689, 670-706, 670-685, 670-686, 671-686, 671-687, 671-690, 671-691, 672-687, 672-688, 672-693, 672-697, 672-707, 673-688, 674-693, 678-693, 679-707, 679-694, 679-698, 679-701, 679-702, 679-707, 680-699, 679-699, 680-695, 681-696, 682-706, 682-707, 682-702, 682-701, 682-697, 683-698, 684-699, 685-700, 686-701, 687-702, 687-703, 687-706, 687-754, 688-703, 688-704, 689-704, 689-705, 689-709, 689-710, 690-705, 690-706, 691-706, 679-705, 679-710, 679-706, 690-710, 691-710, 690-754, 690-706, 684-703, 687-705, 687-703, 687-706, 688-705, 689-708, 690-709, 692-711, 693-716, 693-712, 695-715, 697-716, 697-716, 690-716, 724-746, 724-752, 724-754, 724-758, 733-752, 738-753, 738-754, 739-758, 739-754, 739-775, 739-754, 740-754, 742-785, 742-773, 757-776, 757-785, 790-815, 793-812, 811-833, 811-844, 814-833, 811-906, 820-839, 822-844, 822-867, 823-842, 845-864, 845-867, 854-906, 845-909, 845-906, 854-876, 854-873, 863-882, 863-885, 878-900, 878-897, 887-906, 899-918, 899-933, 899-958, 905-927, 905-933, 914-933, 936-958, 936-955, 945-964, 951-970, 951-985, 951-1044, 951-1024, 951-1056, 951-997, 960-985, 963-1044, 963-1024, 963-997, 966-985, 972-1015, 978-997, 1025-1044, 1031-1056, 1037-1056, 1046-1083, 1049-1068, 1070-1089, 1070-1095, 1082-1101, 1081-1134, 1081-1143, 1082-1101, 1088-1107, 1088-1134, 1094-1119, 1097-1119, 1112-1134, 1118-1143, 1118-1146, 1088-1146, 1121-1140, 1127-1146, 1127-1193, 1150-1193, 1156-1187, 1165-1187, 1170-1192, 1171-1191, 1172-1191, 1176-1192, 1177-1192, 1176-1191, 1203-1297, 1206-1228, 1206-1255, 1209-1228, 1215-1255, 1215-1234, 1218-1237, 1221-1240, 1224-1243, 1227-1246, 1230-1249, 1233-1252, 1236-1255, 1245-1265, 1251-1280, 1251-1285, 1251-1270, 1254-1273, 1254-1279, 1257-1276, 1258-1277, 1259-1296, 1259-1290, 1259-1287, 1260-1279, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1261-1296, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1262-1285, 1262-1296, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1264-1297, 1265-1280, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1268-1296, 1269-1284, 1269-1285, 1269-1288, 1270-1285, 1271-1290, 1271-1296, 1277-1296, 1261-1290, 1262-1290, 1268-1290, 1263-1305, 1259-1305, 1259-1305, 1266-1305, 1259-1302, 1275-1294, 1281-1306, 1281-1324, 1281-1336, 1782-1797, 1282-1301, 1286-1306, 1290-1324, 1293-1318, 1290-1324, 1293-1315, 1296-1315, 1311-1336, 1311-1333, 1326-1345, 1353-1381, 1359-1378, 1395-1414, 1498-1532, 1498-1523, 1498-1535, 1510-1529, 1515-1535, 1515-1563, 1515-1596, 1515-1605, 1515-1602, 1515-1540, 1515-1535, 1518-1605, 1518-1602, 1518-1537, 1521-1563, 1521-1540, 1550-1655, 1550-1563, 1550-1569, 1553-1578, 1553-1599, 1553-1590, 1565-1584, 1571-1595, 1577-1606, 1577-1605, 1577-1596, 1577-1592, 1577-1593, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1578-1598, 1579-1594, 1579-1595, 1579-1598, 1571-1598, 1580-1605, 1580-1602, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1582-1602, 1553-1655, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1602, 1586-1605, 1586-1652, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1642-1664, 1651-1720, 1651-1673, 1655-1679, 1695-1720, 1716-1738, 1743-1763, 1743-1768, 1764-1783, 1773-1792, 1777-1796, 1777-1800, 1778-1800, 1778-1793, 1778-1794, 1778-1797, 1779-1798, 1779-1797, 1779-1796, 1779-1795, 1779-1794, 1780-1796, 1781-1797, 1781-1796, 1781-1800, 1781-1797, 1782-1799, 1784-1800, 1779-1799, 1778-1794, 1779-1795, 1780-1799, 1794-1813, 1780-1795, 1780-1796, 1780-1799, 1781-1796, 1781-1797, 1781-1800, 1782-1798, 1783-1799, 1784-1799, 1784-1800, 1785-1800, 1806-1837, 1806-1828, 1806-1825, 1809-1828, 1812-1843, 1812-1837, 1812-1831, 1815-1843, 1815-1844, 1815-1840, 1815-1834, 1818-1837, 1821-1840, 1821-1844, 1821-1837, 1822-1843, 1822-1839, 1823-1843, 1827-1846, 1861-1884, 1861-1880, 1865-1885, 1867-1886, 1869-1885, 1876-1895, 1888-1914, 1888-1908, 1891-1910, 1891-1914, 1895-1938, 1895-1935, 1913-1935, 1898-1920, 1907-1929, 1913-1935, 1918-1934, 1919-1938, 1919-1934, 1921-1934, 1928-1956, 1957-1976, 2035-2057, 2083-2141, 2230-2261, 2278-2297, 2281-2300, 2284-2303, 2368-2393, 2381-2397, 2368-2394, 2379-2394, 2381-2396, 2368-2397, 2368-2396, 2420-2439, 2458-2476, 2459-2478, 2819-2838, 2818-2838, 2873-2892 и 3161-3182.

В некоторых вариантах реализации, следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1, при направленном действии антисмысловых соединений или олигонуклеотидов, демонстрируют по меньшей мере 60% ингибирование: 1-20, 10-29, 10-53, 13-38, 25-50, 43-68, 55-74, 58-84, 58-77, 58-74, 58-73, 58-79, 59-80, 59-74, 59-75, 60-75, 60-76, 61-77, 61-76, 61-80, 62-77, 68-114, 98-123, 101-123, 113-138, 116-138, 131-150, 137-162, 152-186, 191-215, 196-224, 196-215, 199-228, 199-218, 200-223, 199-218, 205-224, 206-228, 218-237, 224-243, 233-263, 244-263, 245-264, 247-266, 250-265, 251-266, 252-267, 253-272, 253-269, 251-267, 253-274, 254-270, 255-276, 256-279, 256-276, 256-274, 256-272, 256-271, 258-273, 259-274, 265-388, 265-284, 266-291, 266-288, 260-279, 281-321, 281-303, 290-321, 290-312, 293-312, 296-315, 302-321, 324-343, 339-367, 339-361, 342-367, 348-367, 358-392, 358-378, 360-392, 360-379, 366-392, 366-385, 369-388, 370-392, 382-401, 405-428, 405-424, 409-428, 411-436, 411-433, 411-431, 411-426, 411-430, 411-427, 412-431, 412-428, 412-427, 413-428, 413-429, 413-433, 414-433, 414-430, 414-429, 414-433, 415-430, 415-431, 415-434, 415-435, 415-436, 416-429, 416-434, 416-431, 416-432, 416-436, 416-435, 417-436, 417-433, 417-432, 418-434, 418-433, 418-437, 419-434, 420-435, 421-436, 422-437, 423-436, 425-465, 454-472, 455-472, 457-476, 457-472, 457-473, 458-485, 458-473, 458-483, 463-498, 467-498, 463-482, 470-493, 472-491, 485-519, 485-513, 500-519, 512-534, 524-546, 536-558, 548-567, 554-573, 548-576, 560-594, 584-606, 608-648, 639-654, 640-656, 641-656, 642-657, 642-658, 643-658, 653-672, 662-685, 665-685, 670-706, 670-689, 670-685, 670-686, 671-690, 671-686, 671-687, 672-707, 672-697, 672-693, 672-687, 672-688, 673-688, 679-707, 679-698, 679-694, 680-695, 681-696, 682-697, 682-701, 683-698, 684-699, 685-700, 686-701, 687-754, 687-702, 687-705, 687-703, 687-706, 688-704, 688-703, 688-704, 688-705, 688-707, 689-710, 689-709, 689-705, 689-704, 690-754, 690-705, 690-706, 691-706, 691-710, 692-711, 697-716, 724-758, 724-754, 724-752, 724-746, 738-754, 738-753, 739-754, 742-785, 757-785, 790-815, 811-906, 811-844, 811-833, 822-867, 822-844, 823-842, 845-867, 854-906, 854-873, 878-897, 899-958, 899-933, 936-958, 945-964, 951-1044, 951-1024, 951-985, 951-997, 963-1044, 963-1024, 963-997, 966-985, 978-997, 1031-1056, 1046-1083, 1070-1095, 1081-1143, 1081-1134, 1082-1101, 1088-1146, 1088-1134, 1118-1146, 1118-1143, 1127-1193, 1170-1189, 1176-1192, 1176-1191, 1177-1192, 1203-1297, 1206-1255, 1209-1228, 1215-1234, 1218-1237, 1221-1240, 1224-1243, 1227-1246, 1230-1249, 1233-1252, 1236-1255, 1251-1270, 1251-1285, 1254-1273, 1254-1279, 1257-1276, 1258-1277, 1259-1278, 1260-1279, 1261-1276, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1281, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1297, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1265-1280, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1268-1287, 1269-1284, 1269-1285, 1270-1285, 1281-1336, 1281-1324, 1281-1306, 1286-1305, 1290-1324, 1311-1336, 1326-1345, 1353-1381, 1395-1414, 1498-1535, 1498-1532, 1515-1535, 1515-1534, 1521-1540, 1550-1655, 1553-1599, 1553-1590, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1579-1594, 1579-1595, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1602, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1642-1664, 1651-1720, 1716-1738, 1743-1763, 1764-1783, 1773-1792, 1777-1800, 1777-1797, 1655-1674, 1778-1794, 1778-1800, 1781-1800, 1781-1797, 1784-1800, 1779-1799, 1778-1794, 1778-1797, 1779-1795, 1779-1798, 1780-1795, 1780-1796, 1780-1799, 1781-1796, 1781-1797, 1781-1800, 1782-1797, 1794-1813, 1806-1837, 1806-1825, 1812-1837, 1812-1831, 1815-1844, 1815-1834, 1818-1837, 1821-1837, 1822-1838, 1827-1846, 1861-1884, 1821-1840, 1866-1885, 1867-1886, 1888-1914, 1888-1907, 1891-1914, 1895-1938, 1895-1935, 1919-1938, 1928-1956, 1957-1976, 2035-2057, 2083-2141, 2230-2261, 2278-2297, 2281-2300, 2284-2303, 2368-2397, 2368-2396, 2368-2394, 2368-2393, 2379-2394, 2381-2396, 2420-2439, 2458-2476, 2819-2838, 2873-2892 и 3161-3182.

В некоторых вариантах реализации, следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1, при направленном действии антисмысловых соединений или олигонуклеотидов, демонстрируют по меньшей мере 65% ингибирование: 1-20, 10-29, 10-53, 13-38, 25-50, 43-68, 55-74, 58-84, 58-79, 58-74, 58-73, 58-77, 59-75, 59-80, 58-77, 60-75, 60-76, 61-77, 61-76, 61-80, 62-77, 68-114, 98-123, 101-123, 113-138, 116-138, 131-150, 137-162, 152-186, 191-215, 196-215, 199-228, 199-218, 200-223,199-218, 205-224, 206-228, 218-237, 224-243, 233-263, 244-263, 245-264, 250-265, 251-266, 253-269, 253-274, 255-276, 256-279, 256-276, 256-274, 256-272, 256-271, 247-266, 253-272, 258-273, 266-291, 266-288, 260-279, 281-321, 281-303, 290-321, 290-312, 296-315, 293-312, 302-321, 324-343, 339-367, 339-361, 342-367, 348-367, 358-392, 358-378, 360-392, 360-379, 366-392, 366-385, 369-388, 370-392, 382-401, 405-428, 405-424, 409-428, 411-433, 411-431, 411-430, 411-427, 411-426, 412-431, 412-428, 412-427, 413-433, 413-428, 413-429, 413-432, 414-433, 414-430, 414-429, 415-430, 415-431, 415-434, 415-435, 415-436, 416-434, 416-436, 416-435, 416-432, 416-431, 417-436, 417-433, 417-432, 418-433, 418-434, 418-437, 420-435, 422-437, 423-436, 425-465, 454-472, 455-472, 457-472, 458-485, 458-483, 458-473, 463-498, 467-498, 457-476, 470-493, 472-491, 485-519, 485-513, 500-519, 512-534, 524-546, 536-558, 548-567, 554-573, 548-576, 560-594, 584-606, 608-648, 639-654, 640-656, 641-656, 642-657, 642-658, 643-658, 653-672, 662-685, 665-685, 670-685, 670-706, 670-689, 670-686, 670-685, 671-686, 671-687, 671-690, 672-688, 672-687, 672-707, 672-697, 672-693, 673-688, 679-698, 680-695, 681-696, 682-697, 682-701, 683-698, 684-699, 685-700, 686-701, 687-702, 688-703, 688-707, 687-754, 690-754, 690-706, 690-705, 687-705, 687-703, 687-706, 687-702, 688-705, 688-703, 688-704, 689-705, 691-706, 692-711, 697-716, 724-758, 724-754, 724-752, 724-746, 738-754, 739-754, 742-785, 757-785, 790-815, 811-906, 811-844, 811-833, 822-867, 822-844, 823-842, 845-867, 854-906, 854-873, 878-897, 899-958, 899-933, 936-958, 945-964, 951-1044, 951-1024, 951-985, 951-997, 963-1044, 963-1024, 963-997, 966-985, 978-997, 1031-1056, 1046-1083, 1070-1095, 1081-1143, 1081-1134, 1082-1101, 1088-1146, 1088-1134, 1118-1146, 1118-1143, 1127-1193, 1170-1189, 1176-1192, 1177-1192, 1203-1297, 1206-1255, 1209-1228, 1215-1234, 1218-1237, 1221-1240, 1224-1243, 1227-1246, 1230-1249, 1233-1252, 1236-1255, 1251-1270, 1251-1285, 1254-1273, 1254-1279, 1257-1276, 1258-1277, 1259-1278, 1260-1279, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1281, 1262-1277, 1262-1278, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1297, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1265-1280, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1268-1287, 1269-1284, 1269-1285, 1270-1285, 1281-1336, 1281-1324, 1281-1306, 1290-1324, 1311-1336, 1326-1345, 1353-1381, 1395-1414, 1498-1535, 1498-1532, 1515-1535, 1515-1534, 1550-1655, 1553-1599, 1553-1590, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1579-1594, 1579-1595, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1602, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1642-1664, 1651-1720, 1655-1674, 1716-1738, 1743-1763, 1764-1783, 1773-1792, 1777-1800, 1777-1797, 1778-1800, 1778-1797, 1779-1799, 1778-1794, 1779-1794, 1779-1795, 1779-1798, 1780-1796, 1780-1799, 1780-1795, 1781-1796, 1781-1797, 1781-1800, 1782-1797, 1794-1813, 1806-1837, 1806-1825, 1812-1837, 1812-1831, 1815-1844, 1815-1834, 1818-1837, 1821-1837, 1822-1838, 1827-1846, 1861-1884, 1866-1885, 1867-1886, 1888-1914, 1888-1907, 1891-1914, 1895-1938, 1895-1935, 1919-1938, 1928-1956, 1957-1976, 2035-2057, 2083-2141, 2230-2261, 2278-2297, 2281-2300, 2284-2303, 2368-2397, 2368-2396, 2368-2394, 2368-2393, 2379-2394, 2381-2396, 2420-2439, 2458-2476, 2819-2838, 2873-2892 и 3161-3182.

В некоторых вариантах реализации, следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1, при направленном действии антисмысловых соединений или олигонуклеотидов, демонстрируют по меньшей мере 70% ингибирование: 1-20, 10-29, 10-53, 13-38, 25-50, 43-68, 55-74, 58-84, 58-79, 58-74, 59-75, 59-80, 58-77, 60-75, 60-76, 61-77, 68-114, 98-123, 101-123, 113-138, 116-138, 131-150, 137-162, 152-186, 191-215, 199-228, 199-218, 200-223, 205-224, 206-228, 218-237, 224-243, 233-263, 244-263, 245-264, 253-269, 253-274, 255-276, 256-279, 256-276, 256-274, 256-272, 247-266, 250-265, 251-266, 253-272, 256-271, 266-291, 266-288, 260-279, 281-321, 281-303, 290-321, 290-312, 293-312, 302-321, 324-343, 339-367, 339-361, 342-367, 348-367, 358-392, 358-378, 360-392, 360-379, 366-392, 366-385, 370-392, 382-401, 405-428, 405-424, 409-428, 411-433, 411-431, 411-430, 411-427, 411-426, 412-431, 412-428, 412-427, 413-428, 413-429, 413-432, 414-433, 414-430, 414-429, 415-430, 414-433, 415-434, 415-435, 415-436, 416-431, 416-434, 416-436, 416-435, 416-432, 417-436, 417-433, 418-433, 418-437, 423-436, 425-465, 454-472, 455-472, 457-472, 457-476, 458-473, 458-485, 458-483, 463-498, 467-498, 457-476, 470-493, 470-493, 472-491, 485-519, 485-513, 485-519, 485-513, 500-519, 512-534, 524-546, 536-558, 548-567, 554-573, 548-576, 560-594, 584-606, 608-648, 639-654, 640-656, 641-656, 642-657, 642-658, 643-658, 653-672, 662-685, 665-685, 670-706, 670-689, 670-685, 670-686, 671-690, 671-686, 671-687, 672-687, 672-688, 672-707, 672-697, 672-693, 673-688, 679-698, 681-696, 682-697, 682-701, 683-698, 684-699, 686-701, 687-702, 687-754, 687-702, 688-703, 690-754, 690-706, 687-705, 687-703, 687-706, 692-711, 697-716, 724-758, 724-754, 724-752, 724-746, 738-754, 739-754, 738-754, 742-785, 757-785, 790-815, 811-906, 811-844, 811-833, 822-867, 822-844, 845-867, 854-906, 854-873, 878-897, 899-958, 899-933, 936-958, 945-964, 951-1044, 951-1024, 951-985, 951-997, 963-1044, 963-1024, 963-997, 966-985, 978-997, 1031-1056, 1046-1083, 1070-1095, 1081-1143, 1081-1134, 1082-1101, 1088-1146, 1088-1134, 1118-1146, 1118-1143, 1127-1193, 1170-1189, 1176-1192, 1177-1192, 1203-1297, 1206-1255, 1209-1228, 1215-1234, 1218-1237, 1221-1240, 1224-1243, 1227-1246, 1230-1249, 1233-1252, 1236-1255, 1251-1285, 1251-1270, 1254-1273, 1254-1279, 1257-1276, 1258-1277, 1259-1278, 1260-1279, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1281, 1262-1277, 1262-1278, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1297, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1268-1287, 1269-1284, 1269-1285, 1270-1285, 1281-1336, 1281-1324, 1281-1306, 1290-1324, 1311-1336, 1326-1345, 1353-1381, 1395-1414, 1498-1535, 1498-1532, 1515-1535, 1550-1655, 1553-1599, 1553-1590, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1579-1594, 1579-1595, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1580-1599, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1602, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1642-1664, 1651-1720, 1716-1738, 1743-1763, 1764-1783, 1773-1792, 1777-1800, 1777-1797, 1778-1800, 1778-1797, 1779-1799, 1778-1794, 1779-1795, 1779-1798, 1780-1795, 1780-1796, 1780-1799, 1781-1800, 1782-1797, 1794-1813, 1806-1837, 1806-1825, 1812-1837, 1812-1831, 1815-1844, 1815-1834, 1818-1837, 1821-1837, 1822-1838, 1827-1846, 1861-1884, 1866-1885, 1867-1886, 1888-1914, 1888-1907, 1891-1914, 1895-1938, 1895-1935, 1919-1938, 1928-1956, 1957-1976, 2035-2057, 2083-2141, 2230-2261, 2278-2297, 2281-2300, 2284-2303, 2368-2397, 2368-2396, 2368-2394, 2368-2393, 2379-2394, 2381-2396, 2420-2439, 2458-2476, 2819-2838, 2873-2892 и 3161-3182.

В некоторых вариантах реализации, следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1, при направленном действии антисмысловых соединений или олигонуклеотидов, демонстрируют по меньшей мере 75% ингибирование: 13-32, 16-35, 19-38, 25-44, 28-47, 31-50, 43-62, 46-65, 49-68, 55-74, 58-82, 58-74, 58-77, 59-75, 60-75, 60-76, 61-77, 65-84, 98-117, 101-120, 104-123, 116-135, 119-138, 131-150, 137-156, 140-159, 143-162, 158-177, 161-180, 164-183, 167-186,200-219,203-226, 209-228, 218-237, 233-252, 236-255, 239-258, 242-264, 247-266, 251-266, 253-272, 255-276, 266-285, 269-288, 281-300, 284-303, 290-313, 298-317, 302-321, 324-343, 339-358, 342-361, 348-367, 358-381, 364-383, 366-386, 370-389, 373-392, 382-401, 405-424, 409-428, 411-430, 411-426, 411-427, 412-427, 412-431, 413-428, 413-429, 413-432, 414-436, 414-430, 414-429, 415-430, 416-431, 416-432, 417-433, 418-437, 422-441, 425-444, 428-447, 434-453, 440-459, 443-462, 446-465, 456-477, 458-473, 464-483, 470-493, 476-495, 479-498, 488-507, 491-510, 494-513, 500-519, 512-531, 515-534, 524-543, 527-546, 536-555, 539-558, 560-579, 566-585, 569-588, 572-591, 575-594, 584-603, 587-606, 608-627, 614-633, 617-636, 620-639, 623-642, 626-645, 629-648, 639-654, 641-656, 642-657, 643-658, 653-672, 665-684, 668-688, 670-706, 670-686, 670-685, 671-691, 671-687, 671-686, 672-688, 673-688, 679-703, 681-696, 682-697, 686-701, 686-706, 687-702, 687-703, 688-703, 689-708, 693-712, 695-714, 696-715, 697-716, 727-746, 739-754, 742-761, 748-767, 751-770, 754-773, 757-776, 760-779, 763-782, 766-785, 790-809, 793-812, 796-815, 811-830, 814-833, 817-836, 820-839, 822-844, 845-864, 854-873, 857-876, 863-882, 866-885, 872-891, 875-894, 878-897, 881-900, 884-903, 887-906, 899-918, 902-921, 905-924, 908-927, 911-930, 914-933, 936-955, 939-958, 951-970, 954-973, 957-976, 960-979, 963-982, 966-985, 969-988, 972-991, 975-994, 978-997, 996-1015, 1002-1021, 1025-1044, 1031-1050, 1034-1053, 1037-1056, 1046-1065, 1049-1068, 1052-1071, 1055-1074, 1058-1077, 1061-1080, 1064-1083, 1070-1089, 1073-1092, 1076-1095, 1082-1101, 1088-1107, 1094-1113, 1097-1116, 1100-1119, 1103-1122, 1106-1125, 1109-1128, 1112-1131, 1115-1134, 1121-1140, 1127-1146, 1153-1172, 1156-1175, 1159-1178, 1162-1181, 1165-1184, 1168-1191, 1174-1193, 1206-1225, 1209-1228, 1212-1231, 1215-1234, 1218-1237, 1221-1240, 1224-1243, 1227-1246, 1230-1249, 1233-1252, 1236-1255, 1239-1258, 1242-1261, 1245-1264, 1251-1270, 1254-1273, 1254-1279, 1257-1283, 1257-1276, 1258-1277, 1260-1279, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1277, 1262-1278, 1263-1278, 1263-1279, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1280, 1264-1283, 1265-1281, 1265-1284, 1266-1281, 1266-1282, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1268-1287, 1269-1284, 1269-1285, 1270-1285, 1272-1291, 1275-1294, 1282-1303, 1286-1306, 1290-1309, 1293-1312, 1296-1315, 1299-1318, 1305-1324, 1311-1330, 1314-1333, 1317-1336, 1353-1381, 1356-1375, 1359-1378, 1498-1517, 1501-1520, 1504-1523, 1510-1529, 1553-1572, 1556-1575, 1559-1578, 1562-1581, 1565-1584, 1571-1590, 1574-1599, 1577-1606, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1579-1594, 1579-1595, 1579-1598, 1580-1595, 1580-1596, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1598, 1582-1601, 1582-1602, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1600, 1584-1603, 1585-1600, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1601, 1586-1605, 1586-1602, 1587-1602, 1587-1603, 1587-1606, 1588-1603, 1588-1604, 1589-1604, 1589-1605, 1590-1605, 1590-1606, 1591-1606, 1604-1623, 1607-1626, 1630-1649, 1633-1652, 1645-1664, 1651-1670, 1654-1674, 1657-1676, 1660-1679, 1663-1682, 1666-1685, 1689-1708, 1695-1714, 1698-1717, 1701-1720, 1716-1735, 1778-1797, 1778-1794, 1778-1797, 1779-1795, 1779-1798, 1780-1795, 1780-1796, 1780-1799, 1781-1800, 1794-1813, 1895-1914, 1898-1917, 1901-1920, 1907-1926, 1910-1929, 1913-1932, 1916-1935, 1919-1938, 2278-2297, 2281-2300 и 2284-2303.

В некоторых вариантах реализации, следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1, при направленном действии антисмысловых соединений или олигонуклеотидов, демонстрируют по меньшей мере 80% ингибирование: 13-32, 16-35, 19-38, 25-44, 28-47, 46-65, 49-68, 58-77, 59-80, 63-82, 98-120, 116-135, 137-159, 158-177, 167-186, 203-224, 205-224, 209-228, 218-237, 233-252, 236-263, 245-264, 253-272, 256-275, 257-276, 266-288, 281-300, 290-312, 293-312, 324-343, 339-358, 348-367, 358-378, 360-379, 361-383, 366-385, 373-392, 382-401, 405-424, 411-431, 411-426, 411-427, 411-430, 413-428, 414-433, 414-434, 415-430, 415-434, 416-431, 416-435, 417-436, 418-437, 422-441, 425-444, 434-453, 456-476, 458-473, 458-477, 464-483, 471-493, 488-507, 494-513, 512-531, 524-543, 527-546, 536-558, 560-579, 566-585, 572-591, 575-594, 584-603, 587-606, 608-627, 614-633, 617-636, 620-639, 623-642, 626-645, 629-648, 639-654, 641-656, 642-657, 643-658, 665-688, 670-687, 670-686, 671-686, 671-687, 671-691, 673-688, 679-699, 682-697, 682-706, 686-701, 687-702, 687-706, 687-703, 693-715, 727-746, 742-761, 748-767, 757-776, 766-785, 790-815, 814-833, 820-839, 822-844, 845-864, 854-873, 854-876, 863-885, 872-906, 878-897, 899-918, 905-933, 936-955, 951-979, 963-985, 966-985, 972-1015, 978-997, 1002-1021, 1025-1044, 1031-1056, 1049-1074, 1061-1083, 1070-1089, 1082-1101, 1088-11107, 1094-1119, 1109-1134, 1121-1140, 1127-1146, 1159-1187, 1171-1191, 1206-1228, 1209-1228, 1215-1255, 1215-1234, 1218-1237, 1221-1240, 1224-1243, 1227-1246, 1230-1249, 1233-1252, 1236-1255, 1245-1264, 1251-1279, 1251-1270, 1254-1273, 1254-1279, 1257-1276, 1258-1277, 1259-1278, 1260-1279, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1263-1278, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1283, 1265-1284, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1283, 1268-1284, 1269-1284, 1269-1285, 1269-1288, 1270-1285, 1275-1294, 1282-1301, 1286-1306, 1293-1318, 1311-1333, 1326-1345, 1359-1378, 1553-1578, 1565-1584, 1571-1590, 1574-1599, 1577-1592, 1577-1596, 1577-1593, 1577-1596, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1579-1595, 1579-1598, 1580-1596, 1580-1599, 1581-1596, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1597, 1582-1601, 1582-1602, 1583-1598, 1583-1599, 1583-1602, 1584-1599, 1584-1603, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1605, 1587-1602, 1587-1606, 1588-1603, 1589-1604, 1589-1605, 1657-1679, 1780-1795, 1780-1796, 1780-1799, 1913-1935, 2278-2297, 2281-2300 и 2284-2303.

В некоторых вариантах реализации, следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1, при направленном действии антисмысловых соединений или олигонуклеотидов, демонстрируют по меньшей мере 85% ингибирование: 13-32, 16-35, 19-38, 25-44, 46-65, 59-80, 101-120, 140-159, 158-177, 167-186, 200-219, 205-224, 209-228, 233-252, 242-263, 253-272, 266-285, 281-300, 290-311, 293-312, 359-379, 361-381, 370-389, 382-401, 411-426, 411-430, 411-427, 413-428, 414-433, 415-430, 416-435, 417-436, 422-441, 456-476, 458-473, 470-493, 512-531, 524-543, 536-558, 566-585, 575-594, 587-606, 608-627, 614-636, 623-645, 639-654, 665-687, 671-686, 671-687, 680-699, 682-703, 687-706, 687-703, 727-746, 742-761, 757-776, 793-812, 822-843, 854-876, 854-873, 863-885, 878-900, 878-897, 887-906, 899-918, 905-927, 914-933, 936-955, 951-985, 966-985, 972-1015, 978-997, 1002-1021, 1025-1044, 1037-1056, 1049-1074, 1064-1083, 1070-1089, 1088-1107, 1094-1119, 1109-1128, 1121-1140, 1156-1175, 1162-1187, 1172-1191, 1206-1228, 1209-1228, 1215-1255, 1215-1234, 1218-1237, 1221-1240, 1224-1243, 1227-1246, 1230-1249, 1233-1252, 1236-1255, 1245-1264, 1251-1279, 1251-1270, 1254-1273, 1254-1279, 1257-1276, 1258-1277, 1259-1278, 1260-1279, 1261-1285, 1261-1276, 1261-1277, 1261-1280, 1262-1277, 1262-1278, 1262-1281, 1263-1278, 1263-1282, 1264-1279, 1264-1283, 1265-1284, 1266-1285, 1267-1282, 1267-1283, 1268-1284, 1269-1284, 1269-1285, 1269-1288, 1270-1285, 1275-1294, 1282-1301, 1293-1315, 1311-1330, 1359-1378, 1574-1593, 1577-1592, 1577-1593, 1577-1596, 1577-1606, 1578-1593, 1578-1594, 1578-1597, 1579-1598, 1580-1596, 1580-1599, 1581-1597, 1581-1600, 1582-1601, 1583-1598, 1583-1602, 1584-1603, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1605, 1587-1602, 1588-1603, 1780-1799, 1780-1796 и 2278-2297,2281-2300 и 2284-2303.

В некоторых вариантах реализации, следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1, при направленном действии антисмысловых соединений или олигонуклеотидов, демонстрируют по меньшей мере 90% ингибирование: 13-32, 16-35, 60-80, 140-159, 158-177, 167-186, 242-261, 292-311, 362-381, 370-389, 382-401, 411-427, 411-426, 413-428, 415-430, 416-435, 422-441, 473-492, 617-636, 623-642, 639-654, 668-687, 680-699, 682-701, 684-703, 687-706, 727-746, 757-776, 824-843, 854-873, 854-876, 863-882, 878-897, 878-900, 887-906, 899-918, 905-927, 914-933, 936-955, 951-970, 960-985, 966-985, 972-1015, 978-997, 1025-1044, 1037-1056, 1070-1089, 1097-1119, 1109-1128, 1121-1140, 1165-1187, 1172-1191, 1206-1228, 1209-1228, 1215-1234, 1215-1234, 1215-1255, 1218-1237, 1221-1240, 1224-1243, 1227-1246, 1230-1249, 1233-1252, 1236-1255, 1245-1264, 1251-1279, 1251-1270, 1254-1273, 1254-1279, 1257-1276, 1258-1277, 1259-1278, 1260-1279, 1261-1285, 1261-1280, 1262-1278, 1261-1276, 1262-1281, 1262-1277, 1263-1282, 1263-1278, 1264-1283, 1265-1284, 1266-1285, 1268-1284, 1269-1284, 1269-1285, 1269-1288, 1296-1315, 1577-1605, 1577-1596, 1577-1593, 1577-1592, 1578-1597, 1581-1600, 1582-1601, 1583-1602, 1583-1598, 1585-1601, 1585-1604, 1586-1605, 1588-1603, 1780-1799, 1780-1796, 2278-2297, 2281-2300 и 2284-2303.

В некоторых вариантах реализации, следующие нуклеотидные области последовательности SEQ ID NO:1, при направленном действии антисмысловых соединений или олигонуклеотидов, демонстрируют по меньшей мере 95% ингибирование: 411-426, 411-427, 413-428, 617-636, 623-642, 668-687, 680-699, 682-701, 854-873, 878-897, 887-906, 914-933, 966-985, 978-997, 1209-1228, 1215-1234, 1218-1237, 1221-1240, 1224-1243, 1227-1246, 1230-1249, 1233-1252, 1236-1255, 1245-1264, 1251-1270, 1254-1273, 1254-1279, 1257-1276, 1258-1277, 1259-1278, 1260-1279, 1261-1285, 1261-1280, 1262-1281, 1263-1282, 1263-1278, 1264-1283, 1265-1284, 1266-1285, 1268-1284, 1269-1288, 1577-1592, 1577-1596, 1577-1601, 1583-1598, 1585-1601, 1588-1603, 1780-1799, 2278-2297, 2281-2300 и 2284-2303.

В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 50% ингибирование мРНК HBV, ISIS ID: 510088, 510089, 510090, 510092, 510096, 510097, 510098, 510099, 510100, 510101, 510102, 505330, 509928, 510104, 509929, 510105, 509930, 510106, 510107, 510108, 510111, 510115, 509931, 510116, 510117, 510118, 510119, 510120, 510121, 509932, 510122, 509933, 510123, 509934, 510124, 509935, 510125, 510126, 510127, 510128, 510140, 146779, 505314, 505315, 505316, 505317, 146821, 505318, 509922, 505319, 509925, 505320, 509952, 505321, 505322, 505323, 505324, 505325, 505326, 505327, 505328, 505329, 509956, 509957, 509927, 509958, 510038, 505330, 509959, 510039, 509960, 510040, 509961, 510041, 509962, 509963, 505331, 505332, 509968, 509969, 510050, 510052, 505333, 505334, 505335, 505336, 509972, 146823, 509974, 505338, 505339, 509975, 505340, 509978, 505341, 509979, 510058, 505342, 509981, 510061, 505344, 505345, 509983, 505346, 509984, 505347, 505348, 505350, 505352, 505353, 505354, 505355, 505356, 146786, 505357, 505358, 505359, 505360, 509985, 509986, 509987, 509988, 505363, 505364, 505365, 505366, 146787, 510079, 524410, 524411, 524413, 524414, 524415, 524416, 524417, 524418, 524419, 524420, 524421, 524422, 524424, 524425, 524426, 524427, 524428, 524429, 524431, 524432, 524433, 524434, 524435, 524436, 524439, 524440, 524442, 524444, 524446, 524447, 524448, 524450, 524451, 524452, 524453, 524454, 524455, 524456, 524457, 524458, 524459, 524460, 524461, 524462, 524464, 524466, 524467, 524468, 524469, 524470, 524471, 524472, 524473, 524474, 524475, 524477, 524478, 524479, 524480, 524481, 524482, 524483, 524484, 524485, 524486, 524487, 524489, 524490, 524491, 524492, 524493, 524494, 524495, 524496, 524498, 524499, 524500, 524501, 524502, 524503, 524504, 524506, 524507, 524508, 524509, 524510, 524511, 524512, 524513, 524514, 524515, 524516, 524517, 524518, 524519, 524520, 524521, 524522, 524523, 524524, 524525, 524526, 524527, 524528, 524529, 524530, 524531, 524532, 524533, 524534, 524535, 524536, 524537, 524538, 524539, 524540, 524541, 524543, 524544, 524546, 524547, 524548, 524549, 524550, 524551, 524552, 524553, 524554, 524555, 524556, 524557, 524558, 524559, 524560, 524561, 524562, 524563, 524564, 524565, 524568, 524569, 524570, 524571, 524572, 524573, 524574, 524575, 524576, 524577, 524578, 524579, 524580, 524581, 524582, 524584, 524585, 524586, 524587, 524588, 524589, 524590, 524591, 524592, 524593, 524594, 524595, 524598, 524599, 524600, 524601, 524602, 524603, 524604, 524605, 524606, 524607, 524608, 524609, 524610, 524611, 524614, 524615, 524616, 524617, 524618, 524619, 524620, 524621, 524622, 524623, 524624, 524625, 524626, 524627, 524629, 524632, 524633, 524634, 524635, 524636, 524637, 524638, 524639, 524640, 524641, 524642, 524643, 524644, 524646, 524647, 524648, 524649, 524650, 524651, 524652, 524654, 524656, 524657, 524658, 524659, 524660, 524661, 524662, 524663, 524664, 524665, 524666, 524667, 524668, 524669, 524670, 524672, 524673, 524675, 524676, 524678, 524679, 524680, 524682, 524683, 524684, 524685, 524686, 524687, 524688, 524689, 524690, 524691, 524692, 524693, 524694, 524695, 524696, 524697, 524698, 524699, 524700, 524701, 524702, 524703, 524704, 524705, 524706, 524707, 524708, 524709, 524710, 524712, 524713, 524714, 524715, 524716, 524717, 524718, 524719, 524721, 524722, 524723, 524724, 524726, 524727, 524728, 524729, 524730, 524731, 524732, 524733, 524734, 524735, 524736, 524737, 524738, 524739, 524740, 524741, 524742, 524743, 524744, 524745, 524746, 524747, 524748, 524749, 524750, 524751, 524752, 524753, 524754, 524755, 524756, 524757, 524758, 524759, 524760, 524761, 524762, 524763, 524764, 524765, 524766, 524767, 524768, 524769, 524770, 524771, 524772, 524773, 524774, 524775, 524776, 524777, 524778, 524779, 524780, 524781, 524782, 524783, 524784, 524785, 524786, 524787, 524788, 524789, 524790, 524791, 524792, 524793, 524794, 524795, 524796, 524797, 524798, 524799, 524800, 524801, 524802, 524803, 524804, 524805, 524806, 524807, 524808, 524809, 524810, 524811, 524812, 524813, 524814, 524815, 524816, 524817, 524818, 524819, 524820, 524821, 524822, 524823, 524824, 524825, 524826, 524827, 524828, 524829, 524830, 524831, 524632, 524833, 524834, 524835, 524842, 524843, 524844, 524845, 524847, 524848, 524856, 524857, 524861, 524866, 524867, 524868, 524869, 524870, 524871, 524872, 524873, 524875, 524876, 524877, 524878, 524879, 524880, 524881, 524882, 524883, 524884, 524885, 524886, 524887, 524888, 524889, 524890, 524891, 524892, 524893, 524894, 524895, 524896, 524897, 524898, 524899, 524900, 524901, 524902, 524903, 524904, 524905, 524906, 524907, 524908, 524909, 524910, 524911, 524912, 524913, 524914, 524915, 524916, 524917, 524918, 524919, 524921, 524922, 524923, 524924, 524925, 524926, 524927, 524928, 524929, 524930, 524931, 524932, 524933, 524934, 524935, 524936, 524937, 524938, 524939, 524940, 524941, 524942, 524943, 524944, 524945, 524946, 524947, 524948, 524949, 524950, 524951, 524952, 524953, 524954, 524955, 524956, 524957, 524958, 524959, 524960, 524961, 524962, 524964, 524965, 524976, 524977, 524978, 524979, 524980, 524981, 524982, 524983, 524984, 524985, 524986, 524987, 524988, 524989, 524991, 524992, 524993, 524994, 524997, 524998, 525021, 525022, 525037, 525039, 525043, 525050, 525052, 525086, 525090, 525100, 551909, 551910, 551911, 551912, 551913, 551916, 551917, 551918, 551919, 551920, 551921, 551922, 551923, 551924, 551925, 551926, 551927, 551928, 551929, 551930, 551932, 551933, 551934, 551935, 551936, 551937, 551939, 551940, 551941, 551942, 551943, 551944, 551945, 551946, 551947, 551948, 551949, 551950, 551951, 551952, 551953, 551954, 551955, 551956, 551957, 551958, 551959, 551960, 551962, 551963, 551964, 551965, 551966, 551967, 551968, 551971, 551972, 551973, 551974, 551975, 551976, 551977, 551978, 551979, 551980, 551981, 551982, 551983, 551984, 551985, 551986, 551987, 551988, 551989, 551990, 551992, 551993, 551994, 551995, 551996, 551997, 551998, 551999, 552000, 552001, 552002, 552003, 552004, 552005, 552006, 552007, 552009, 552010, 552011, 552012, 552013, 552014, 552015, 552016, 552017, 552018, 552019, 552020, 552021, 552022, 552023, 552024, 552025, 552026, 552027, 552028, 552029, 552030, 552031, 552032, 552033, 552034, 552035, 552036, 552037, 552038, 552039, 552040, 552041, 552042, 552043, 552044, 552045, 552046, 552047, 552048, 552049, 552050, 552051, 552052, 552053, 552054, 552055, 552056, 552057, 552058, 552059, 552060, 552061, 552062, 552063, 552064, 552065, 552067, 552068, 552069, 552070, 552071, 552072, 552073, 552074, 552075, 552076, 552077, 552078, 552079, 552080, 552081, 552082, 552083, 552084, 552085, 552086, 552087, 552088, 552089, 552090, 552091, 552092, 552093, 552094, 552095, 552096, 552097, 552098, 552099, 552100, 552101, 552102, 552114, 552115, 552116, 552117, 552118, 552119, 552122, 552123, 552124, 552125, 552126, 552127, 552128, 552129, 552131, 552132, 552133, 552134, 552135, 552136, 552137, 552138, 552139, 552140, 552141, 552142, 552143, 552144, 552145, 552146, 552147, 552148, 552149, 552150, 552151, 552152, 552153, 552154, 552155, 552158, 552159, 552160, 552161, 552162, 552163, 552164, 552165, 552167, 552168, 552169, 552170, 552171, 552175, 552176, 552177, 552178, 552179, 552180, 552181, 552182, 552183, 552185, 552186, 552187, 552188, 552189, 552191, 552192, 552193, 552194, 552195, 552196, 552197, 552198, 552199, 552200, 552201, 552202, 552203, 552204, 552205, 552206, 552207, 552208, 552209, 552210, 552211, 552212, 552213, 552214, 552215, 552216, 552217, 552218, 552220, 552222, 552224, 552225, 552230, 552239, 552240, 552241, 552242, 552243, 552246, 552247, 552248, 552249, 552250, 552251, 552252, 552253, 552254, 552255, 552256, 552257, 552258, 552259, 552260, 552261, 552262, 552263, 552264, 552265, 552266, 552267, 552268, 552269, 552270, 552271, 552279, 552285, 552288, 552293, 552294, 552295, 552296, 552297, 552300, 552301, 552302, 552303, 552304, 552305, 552306, 552307, 552308, 552309, 552310, 552312, 552313, 552314, 552315, 552316, 552317, 552318, 552319, 552320, 552321, 552322, 552323, 552325, 552326, 552330, 552331, 552332, 552333, 552337, 552338, 552339, 552340, 552341, 552342, 552343, 552344, 552345, 552347, 552348, 552349, 552350, 552351, 552352, 552354, 552355, 552356, 552357, 552358, 552359, 552360, 552361, 552362, 552363, 552364, 552365, 552366, 552367, 552368, 552369, 552370, 552371, 552372, 552373, 552374, 552375, 552376, 552377, 552378, 552379, 552380, 552385, 552386, 552390, 552391, 552393, 552394, 552395, 552396, 552397, 552398, 552399, 552400, 552401, 552402, 552403, 552408, 552409, 552410, 552411, 552412, 552413, 552414, 552415, 552416, 552417, 552418, 552419, 552420, 552421, 552422, 552423, 552424, 552425, 552428, 552430, 552431, 552432, 552433, 552440, 552442, 552443, 552444, 552445, 552446, 552447, 552448, 552449, 552450, 552452, 552453, 552455, 552456, 552458, 552459, 552464, 552465, 552466, 552467, 552468, 552469, 552470, 552471, 552472, 552473, 552474, 552475, 552476, 552477, 552478, 552479, 552480, 552481, 552482, 552484, 552485, 552486, 552487, 552488, 552490, 552491, 552493, 552497, 552499, 552500, 552501, 552502, 552503, 552504, 552505, 552506, 552508, 552509, 552510, 552511, 552512, 552513, 552514, 552515, 552516, 552517, 552520, 552521, 552522, 552523, 552525, 552526, 552527, 552528, 552529, 552530, 552531, 552532, 552533, 552534, 552535, 552538, 552539, 552540, 552541, 552542, 552544, 552547, 552548, 552553, 552554, 552555, 552557, 552558, 552559, 552561, 552562, 552565, 552566, 552567, 552568, 552569, 552570, 552571, 552572, 552576, 552577, 552578, 552579, 552580, 552581, 552582, 552583, 552584, 552585, 552586, 552587, 552588, 552589, 552590, 552591, 552592, 552594, 552595, 552596, 552597, 552598, 552600, 552606, 552608, 552787, 552788, 552789, 552790, 552791, 552794, 552795, 552796, 552797, 552798, 552799, 552800, 552801, 552802, 552803, 552804, 552805, 552806, 552807, 552808, 552809, 552810, 552811, 552812, 552813, 552814, 552815, 552816, 552817, 552818, 552819, 552820, 552821, 552822, 552823, 552824, 552825, 552826, 552827, 552828, 552829, 552830, 552831, 552832, 552833, 552834, 552835, 552836, 552837, 552838, 552839, 552840, 552841, 552842, 552843, 552844, 552845, 552846, 552847, 552848, 552849, 552850, 552851, 552852, 552853, 552854, 552855, 552856, 552857, 552858, 552859, 552860, 552861, 552862, 552863, 552864, 552865, 552866, 552868, 552870, 552871, 552872, 552876, 552889, 552890, 552891, 552892, 552893, 552894, 552895, 552896, 552898, 552899, 552901, 552902, 552903, 552904, 552905, 552907, 552908, 552909, 552910, 552911, 552912, 552913, 552914, 552915, 552916, 552917, 552918, 552919, 552922, 552923, 552925, 552926, 552927, 552928, 552929, 552930, 552931, 552932, 552933, 552934, 552935, 552936, 552937, 552938, 552939, 552940, 552941, 552942, 552943, 552944, 552945, 552946, 552947, 552948, 552950, 552951, 552953, 552954, 552955, 552956, 552957, 552958, 552959, 552960, 552961, 552965, 552966, 552969, 552970, 552971, 552972, 552973, 552974, 552975, 552976, 552977, 552979, 552980, 552981, 552982, 552983, 552984, 552987, 552988, 552989, 552990, 552991, 552992, 552993, 552994, 552995, 552996, 552997, 552998, 552999, 553000, 553001, 553002, 553003, 553004, 553005, 553006, 553007, 553008, 553009, 553010, 553011, 553012, 553014, 553015, 553016, 566828, 566829, 566830, 566831, 566832, 577120, 577121, 577122, 577123, 577124, 577125, 577126, 577127, 577128, 577129, 577130, 577131, 577132, 577133, 577134, 577135, 577136, 582665 и 582666.

В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 50% ингибирование мРНК HBV, SEQ ID NO:5, 6, 7, 9, 10, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 33, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 74, 83, 85, 86, 87, 88, 89, 92, 96, 98, 99, 100, 102, 103, 104, 106, 108, 109, 111, 112, 115, 117,121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 136, 137, 139, 140, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 153, 155, 157, 159, 161, 165, 166, 167, 168, 169, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 197, 198, 199, 201, 203, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 215, 217, 218, 220, 221, 222, 224, 225, 226, 227, 228, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 240, 241, 242, 243, 244, 250, 283, 321, 322, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 350, 351, 353, 355, 357, 358, 359, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 416, 417, 418, 419, 420 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 453, 454, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 473, 474, 475, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 534, 535, 536, 537, 539, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 562, 564, 566, 567, 568, 569, 570, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 582, 583, 585, 586, 588, 589, 590, 592, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600, 601, 602, 603, 604, 605, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613, 614, 615, 616, 617, 618, 619, 620, 622, 623, 624, 625, 626, 627, 628, 629, 631, 632, 633, 634, 636, 637, 638, 639, 640, 641, 642, 643, 644, 645, 646, 647, 648, 649, 650, 651, 652, 653, 654, 655, 656, 657, 658, 659, 660, 661, 662, 663, 664, 665, 666, 667, 668, 669, 670, 671, 672, 673, 674, 675, 676, 677, 678, 679, 680, 681, 682, 683, 684, 685, 686, 687, 688, 689, 690, 691, 692, 693, 694, 695, 696, 697, 698, 699, 700, 701, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 710, 711, 712, 713, 714, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 724, 725, 726, 727, 728, 729, 730, 731, 732, 733, 734, 735, 736, 737, 738, 739, 740, 741, 742, 743, 744, 745, 746, 747, 754, 755, 756, 757, 759, 760, 768, 769, 773, 777, 778, 779, 780, 781, 782, 783, 784, 786, 787, 788, 789, 790, 791, 792, 793, 794, 795, 796, 797, 798, 799, 800, 801, 802, 803, 804, 805, 806, 807, 808, 809, 810, 811, 812, 813, 814, 815, 816, 817, 818, 819, 820, 821, 822, 823, 824, 825, 826, 827, 828, 829, 830, 831, 833, 834, 835, 836, 837, 838, 839, 840, 841, 842, 843, 844, 845, 846, 847, 848, 849, 850, 851, 852, 853, 854, 855, 856, 857, 858, 859, 860, 861, 862, 863, 864, 865, 866, 867, 868, 869, 870, 871, 872, 873, 874, 876, 877, 888, 889, 890, 891, 892, 893, 894, 895, 896, 897, 898, 899, 900, 901, 903, 904, 905, 906, 909, 910, 933, 934, 949, 951, 955, 962, 964, 998, 1002, 1013, 1052, 1267, 1271, 1272, 1288, 1289, 1290, 1291, 1292, 1293, 1294, 1295, 1296, 1297, 1298, 1299, 1300, 1301, 1302, 1303, 1304, 1305, 1306, 1307, 1308, 1309, 1310, 1311, 1312, 1313, 1314, 1315, 1316, 1317, 1318, 1319, 1320, 1321, 1322, 1323, 1324, 1325, 1326, 1327, 1328, 1329, 1330, 1331, 1332, 1333, 1334, 1335, 1336, 1337, 1338, 1339, 1340, 1341, 1342, 1343, 1344, 1345, 1346, 1347, 1348, 1349, 1350, 1364, 1365, 1366, 1367, 1368, 1369, 1370, 1371, 1372, 1375 и 1376.

В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 60% ингибирование мРНК HBV, ISIS ID: 510090, 510100, 510102, 505330, 509928, 510104, 509929, 510105, 509930, 510106, 510107, 510111, 509931, 510116, 510117, 510118, 510119, 510120, 510121, 509932, 510122, 509933, 510123, 509934, 510124, 509935, 510125, 510128, 146779, 505314, 505315, 505316, 505317, 146821, 505318, 505319, 505322, 505323, 505324, 505325, 505326, 505327, 505328, 505329, 509956, 509957, 509958, 505330, 509959, 510041, 505332, 509968, 505333, 505335, 146823, 509974, 505338, 505339, 509975, 505340, 505341, 509979, 505342, 509981, 505344, 505345, 509983, 505346, 509984, 505347, 505348, 505353, 505354, 505356, 146786, 505357, 505358, 505359, 505360, 509985, 509986, 505363, 505366, 524410, 524413, 524414, 524415, 524416, 524417, 524418, 524419, 524420, 524421, 524422, 524424, 524425, 524426, 524428, 524431, 524432, 524433, 524434, 524435, 524439, 524440, 524446, 524447, 524448, 524451, 524452, 524453, 524454, 524455, 524456, 524457, 524459, 524460, 524461, 524464, 524466, 524467, 524468, 524469, 524471, 524472, 524473, 524474, 524475, 524477, 524478, 524479, 524480, 524481, 524482, 524485, 524486, 524487, 524489, 524490, 524491, 524492, 524493, 524494, 524495, 524496, 524499, 524500, 524501, 524502, 524503, 524504, 524506, 524507, 524508, 524509, 524510, 524511, 524512, 524513, 524514, 524515, 524516, 524517, 524519, 524520, 524521, 524523, 524525, 524526, 524527, 524528, 524529, 524532, 524533, 524534, 524535, 524536, 524537, 524538, 524539, 524540, 524541, 524543, 524546, 524547, 524549, 524550, 524552, 524553, 524554, 524555, 524556, 524557, 524558, 524559, 524560, 524561, 524562, 524563, 524564, 524565, 524568, 524569, 524570, 524571, 524572, 524573, 524574, 524575, 524576, 524577, 524578, 524579, 524580, 524581, 524582, 524585, 524586, 524587, 524588, 524589, 524590, 524591, 524593, 524594, 524595, 524598, 524599, 524600, 524602, 524603, 524604, 524605, 524606, 524607, 524610, 524611, 524614, 524615, 524616, 524617, 524618, 524619, 524620, 524621, 524622, 524623, 524625, 524627, 524629, 524632, 524633, 524634, 524635, 524636, 524637, 524638, 524639, 524640, 524641, 524642, 524643, 524644, 524646, 524647, 524648, 524649, 524650, 524651, 524654, 524656, 524657, 524658, 524659, 524661, 524662, 524663, 524664, 524665, 524666, 524667, 524668, 524669, 524670, 524673, 524675, 524676, 524678, 524679, 524680, 524683, 524684, 524685, 524686, 524687, 524688, 524689, 524690, 524691, 524692, 524694, 524695, 524696, 524697, 524698, 524699, 524700, 524701, 524702, 524703, 524704, 524705, 524706, 524707, 524708, 524709, 524710, 524713, 524714, 524715, 524716, 524717, 524718, 524719, 524721, 524722, 524724, 524726, 524727, 524728, 524729, 524730, 524731, 524732, 524733, 524734, 524735, 524736, 524737, 524738, 524739, 524741, 524742, 524743, 524744, 524746, 524747, 524748, 524749, 524750, 524751, 524752, 524753, 524754, 524755, 524756, 524757, 524758, 524759, 524760, 524761, 524762, 524763, 524764, 524765, 524766, 524767, 524768, 524769, 524770, 524771, 524772, 524773, 524774, 524775, 524776, 524777, 524778, 524779, 524780, 524781, 524782, 524783, 524784, 524785, 524787, 524788, 524789, 524790, 524791, 524792, 524793, 524794, 524795, 524796, 524797, 524798, 524799, 524800, 524801, 524802, 524803, 524804, 524805, 524806, 524807, 524808, 524809, 524810, 524811, 524812, 524813, 524814, 524815, 524816, 524817, 524818, 524819, 524820, 524821, 524822, 524823, 524824, 524825, 524826, 524827, 524828, 524829, 524830, 524632, 524833, 524842, 524843, 524844, 524845, 524847, 524856, 524866, 524867, 524868, 524869, 524870, 524871, 524872, 524873, 524876, 524878, 524879, 524880, 524881, 524882, 524883, 524884, 524885, 524886, 524887, 524888, 524889, 524890, 524891, 524892, 524893, 524894, 524895, 524896, 524897, 524898, 524899, 524900, 524901, 524902, 524903, 524904, 524905, 524906, 524907, 524908, 524909, 524910, 524911, 524912, 524913, 524914, 524915, 524916, 524921, 524922, 524923, 524924, 524925, 524926, 524928, 524929, 524930, 524931, 524932, 524933, 524936, 524937, 524938, 524939, 524940, 524941, 524942, 524944, 524946, 524947, 524948, 524949, 524950, 524952, 524953, 524954, 524955, 524961, 524977, 524978, 524979, 524980, 524981, 524982, 524983, 524984, 524985, 524986, 524987, 524988, 524991, 524992, 524993, 524994, 525037, 525052, 551909, 551911, 551919, 551920, 551921, 551922, 551924, 551925, 551926, 551927, 551928, 551932, 551933, 551934, 551935, 551936, 551941, 551943, 551944, 551948, 551949, 551950, 551951, 551952, 551953, 551954, 551955, 551956, 551957, 551958, 551959, 551960, 551962, 551963, 551965, 551966, 551967, 551968, 551973, 551975, 551979, 551981, 551982, 551983, 551984, 551985, 551986, 551987, 551989, 551990, 551992, 551993, 551994, 551995, 551996, 551997, 551998, 551999, 552000, 552001, 552002, 552003, 552005, 552006, 552007, 552009, 552010, 552012, 552013, 552014, 552015, 552016, 552017, 552018, 552019, 552020, 552021, 552022, 552023, 552024, 552025, 552026, 552027, 552028, 552029, 552030, 552031, 552032, 552033, 552034, 552035, 552036, 552038, 552039, 552041, 552042, 552044, 552045, 552046, 552047, 552048, 552049, 552050, 552051, 552052, 552053, 552054, 552055, 552056, 552057, 552058, 552059, 552060, 552061, 552062, 552063, 552064, 552065, 552068, 552069, 552070, 552071, 552073, 552074, 552075, 552076, 552077, 552078, 552079, 552080, 552081, 552082, 552083, 552084, 552085, 552086, 552087, 552088, 552089, 552090, 552091, 552092, 552093, 552094, 552095, 552096, 552097, 552098, 552099, 552100, 552101, 552102, 552114, 552115, 552116, 552117, 552118, 552119, 552123, 552124, 552125, 552126, 552127, 552128, 552129, 552131, 552132, 552133, 552134, 552135, 552136, 552138, 552139, 552140, 552141, 552143, 552144, 552145, 552146, 552147, 552148, 552149, 552150, 552151, 552152, 552153, 552155, 552158, 552159, 552160, 552162, 552163, 552168, 552169, 552170, 552171, 552176, 552178, 552179, 552180, 552182, 552183, 552185, 552187, 552188, 552191, 552192, 552193, 552194, 552195, 552196, 552197, 552198, 552199, 552200, 552201, 552202, 552203, 552204, 552205, 552206, 552207, 552208, 552209, 552210, 552211, 552212, 552213, 552214, 552215, 552216, 552222, 552224, 552225, 552239, 552240, 552242, 552246, 552247, 552248, 552252, 552253, 552254, 552255, 552256, 552257, 552258, 552259, 552261, 552263, 552265, 552266, 552268, 552285, 552293, 552294, 552295, 552296, 552301, 552302, 552303, 552306, 552307, 552308, 552309, 552310, 552312, 552313, 552314, 552315, 552316, 552317, 552318, 552320, 552321, 552322, 552323, 552325, 552326, 552331, 552332, 552337, 552338, 552339, 552340, 552343, 552345, 552347, 552348, 552349, 552351, 552354, 552355, 552356, 552358, 552359, 552360, 552361, 552362, 552363, 552364, 552365, 552366, 552367, 552368, 552369, 552370, 552371, 552372, 552373, 552374, 552375, 552376, 552377, 552378, 552379, 552396, 552397, 552398, 552403, 552408, 552409, 552410, 552411, 552412, 552414, 552416, 552418, 552419, 552420, 552421, 552422, 552423, 552424, 552431, 552442, 552445, 552449, 552455, 552456, 552459, 552464, 552465, 552466, 552467, 552469, 552472, 552473, 552474, 552475, 552477, 552478, 552479, 552480, 552484, 552487, 552497, 552508, 552509, 552511, 552512, 552515, 552516, 552520, 552521, 552522, 552523, 552526, 552527, 552528, 552529, 552530, 552531, 552534, 552540, 552541, 552542, 552559, 552567, 552568, 552569, 552570, 552572, 552576, 552577, 552578, 552579, 552582, 552583, 552584, 552585, 552586, 552587, 552588, 552590, 552595, 552596, 552597, 552788, 552789, 552790, 552791, 552796, 552800, 552801, 552803, 552804, 552805, 552806, 552807, 552808, 552809, 552811, 552812, 552813, 552814, 552815, 552816, 552817, 552818, 552819, 552820, 552821, 552822, 552823, 552824, 552826, 552827, 552828, 552829, 552830, 552831, 552832, 552833, 552834, 552835, 552836, 552837, 552838, 552839, 552841, 552842, 552843, 552844, 552845, 552846, 552847, 552848, 552849, 552850, 552851, 552852, 552853, 552854, 552855, 552856, 552857, 552858, 552859, 552860, 552861, 552862, 552863, 552864, 552865, 552866, 552872, 552891, 552892, 552893, 552894, 552902, 552903, 552904, 552905, 552907, 552908, 552909, 552910, 552911, 552912, 552913, 552914, 552915, 552916, 552917, 552918, 552922, 552923, 552925, 552927, 552928, 552929, 552930, 552931, 552932, 552933, 552934, 552935, 552936, 552937, 552938, 552939, 552940, 552941, 552942, 552943, 552944, 552945, 552946, 552951, 552955, 552956, 552957, 552958, 552960, 552961, 552966, 552969, 552971, 552972, 552973, 552974, 552975, 552976, 552977, 552979, 552980, 552981, 552982, 552983, 552984, 552988, 552989, 552990, 552991, 552992, 552993, 552994, 552995, 552996, 552998, 552999, 553000, 553001, 553002, 553003, 553004, 553005, 553006, 553007, 553008, 553009, 553010, 553011, 553012, 553016, 566828, 566829, 566830, 566831, 566832, 577120, 577121, 577122, 577123, 577124, 577125, 577126, 577127, 577128, 577129, 577130, 577131, 577132, 577133, 577134, 577135, 577136 и 582666.

В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 60% ингибирование мРНК HBV, SEQ ID NO:7, 9, 10, 12, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 33, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 56, 83, 85, 86, 87, 88, 89, 92, 96, 98, 100, 102, 103, 112, 115, 117, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 136, 137, 139, 140, 142, 143, 145, 147, 149, 150, 151, 153, 155, 157, 159, 161, 166, 167, 168, 172, 174, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 198, 199, 201, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 218, 220, 222, 224, 225, 226, 227, 228, 230, 231, 232, 233, 234, 240, 243, 321, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 335, 336, 337, 339, 342, 343, 344, 345, 346, 350, 351, 357, 358, 359, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 370, 371, 372, 375, 376, 377, 378, 379, 381, 382, 383, 384, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 395, 396, 397, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 416, 417, 418, 419, 420 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 429, 430, 431, 433, 435, 436, 437, 438, 439, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 453, 456, 457, 459, 460, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 473, 474, 475, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 503, 504, 505, 508, 509, 510, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 520, 521, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 535, 537, 539, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 564, 566, 567, 568, 569, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 583, 585, 586, 588, 589, 590, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600, 601, 602, 604, 605, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613, 614, 615, 616, 617, 618, 619, 620, 623, 624, 625, 626, 627, 628, 629, 631, 632, 634, 636, 637, 638, 639, 640, 641, 642, 643, 644, 645, 646, 647, 648, 649, 650, 652, 653, 654, 655, 657, 658, 659, 660, 661, 662, 663, 664, 665, 666, 667, 668, 669, 670, 671, 672, 673, 674, 675, 676, 677, 678, 679, 680, 681, 682, 683, 684, 685, 686, 687, 688, 689, 690, 691, 692, 693, 694, 695, 696, 698, 699, 700, 701, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 710, 711, 712, 713, 714, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 724, 725, 726, 727, 728, 729, 730, 731, 732, 733, 734, 735, 736, 737, 738, 740, 741, 742, 744, 745, 754, 755, 756, 757, 759, 768, 777, 778, 779, 780, 781, 782, 783, 784, 787, 789, 790, 791, 792, 793, 794, 795, 796, 797, 798, 799, 800, 801, 802, 803, 804, 805, 806, 807, 808, 809, 810, 811, 812, 813, 814, 815, 816, 817, 818, 819, 820, 821, 822, 823, 824, 825, 826, 827, 828, 833, 834, 835, 836, 837, 838, 840, 841, 842, 843, 844, 845, 848, 849, 850, 851, 852, 853, 854, 856, 858, 859, 860, 861, 862, 864, 865, 866, 867, 873, 889, 890, 891, 892, 893, 894, 895, 896, 897, 898, 899, 900, 903, 904, 905, 906, 949, 964, 1271, 1288, 1289, 1290, 1291, 1292, 1293, 1294, 1295, 1296, 1297, 1298, 1299, 1300, 1301, 1302, 1303, 1304, 1305, 1306, 1307, 1308, 1309, 1310, 1311, 1312, 1313, 1314, 1315, 1316, 1317, 1318, 1319, 1320, 1321, 1322, 1323, 1324, 1325, 1326, 1327, 1328, 1329, 1330, 1331, 1332, 1333, 1334, 1335, 1336, 1337, 1338, 1339, 1340, 1341, 1342, 1343, 1344, 1345, 1346, 1347, 1348, 1349, 1350, 1365, 1366, 1367, 1368, 1369, 1370, 1371, 1372 и 1376.

В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 70% ингибирование мРНК HBV, ISIS ID: 510100, 505330, 509928, 509929, 509930, 510106, 509931, 510116, 510119, 510120, 510121, 509932, 510122, 509933, 510123, 509934, 510124, 509935, 146779, 505317, 146821, 505318, 505319, 505323, 505325, 505326, 505327, 509957, 505330, 505332, 505335, 509974, 505338, 505339, 509975, 505342, 509981, 505345, 505346, 505347, 505348, 146786, 505357, 505358, 505359, 505363, 524410, 524413, 524414, 524415, 524416, 524418, 524419, 524420, 524421, 524424, 524425, 524426, 524428, 524431, 524432, 524433, 524434, 524435, 524446, 524447, 524448, 524452, 524453, 524457, 524459, 524460, 524461, 524464, 524466, 524467, 524468, 524469, 524472, 524473, 524474, 524475, 524477, 524478, 524479, 524480, 524481, 524482, 524485, 524487, 524490, 524491, 524492, 524493, 524494, 524495, 524499, 524500, 524502, 524503, 524507, 524508, 524510, 524511, 524512, 524513, 524514, 524515, 524516, 524517, 524520, 524525, 524526, 524528, 524532, 524533, 524534, 524535, 524536, 524537, 524538, 524539, 524540, 524541, 524547, 524549, 524552, 524553, 524554, 524555, 524556, 524557, 524558, 524559, 524560, 524561, 524563, 524564, 524565, 524568, 524569, 524570, 524571, 524572, 524573, 524574, 524575, 524577, 524578, 524579, 524580, 524582, 524586, 524587, 524590, 524591, 524594, 524595, 524598, 524600, 524602, 524603, 524604, 524605, 524606, 524607, 524610, 524611, 524614, 524615, 524616, 524617, 524618, 524619, 524620, 524621, 524629, 524633, 524634, 524635, 524636, 524637, 524638, 524641, 524642, 524643, 524644, 524646, 524647, 524648, 524649, 524650, 524651, 524656, 524657, 524659, 524661, 524662, 524663, 524664, 524665, 524666, 524667, 524668, 524669, 524670, 524678, 524679, 524680, 524685, 524686, 524687, 524688, 524689, 524690, 524691, 524692, 524695, 524696, 524698, 524699, 524700, 524701, 524702, 524703, 524704, 524705, 524706, 524707, 524708, 524709, 524713, 524714, 524715, 524716, 524717, 524718, 524721, 524722, 524724, 524726, 524727, 524728, 524729, 524730, 524731, 524732, 524733, 524734, 524735, 524736, 524737, 524738, 524739, 524741, 524742, 524743, 524746, 524747, 524748, 524749, 524750, 524751, 524752, 524754, 524755, 524756, 524758, 524760, 524761, 524762, 524763, 524764, 524765, 524766, 524767, 524768, 524769, 524771, 524773, 524775, 524776, 524777, 524778, 524779, 524780, 524781, 524782, 524783, 524784, 524785, 524787, 524788, 524789, 524790, 524791, 524792, 524793, 524794, 524795, 524796, 524797, 524798, 524799, 524800, 524801, 524802, 524803, 524804, 524805, 524806, 524807, 524808, 524809, 524810, 524811, 524812, 524813, 524814, 524815, 524816, 524817, 524818, 524819, 524821, 524822, 524823, 524824, 524825, 524826, 524827, 524828, 524829, 524830, 524833, 524842, 524843, 524844, 524845, 524856, 524866, 524867, 524868, 524869, 524870, 524871, 524873, 524879, 524880, 524881, 524882, 524883, 524884, 524885, 524886, 524887, 524888, 524889, 524890, 524891, 524892, 524893, 524894, 524895, 524896, 524897, 524898, 524899, 524900, 524902, 524903, 524905, 524906, 524907, 524908, 524909, 524910, 524911, 524912, 524913, 524914, 524915, 524916, 524921, 524922, 524930, 524931, 524932, 524937, 524940, 524942, 524948, 524980, 524981, 524982, 524983, 524984, 524985, 524986, 524987, 524988, 551919, 551921, 551922, 551924, 551925, 551926, 551933, 551941, 551950, 551951, 551952, 551953, 551955, 551956, 551957, 551958, 551966, 551983, 551984, 551985, 551986, 551987, 551989, 551990, 551992, 551993, 551994, 551995, 551996, 551997, 551998, 551999, 552000, 552005, 552006, 552009, 552012, 552013, 552014, 552015, 552017, 552018, 552019, 552020, 552021, 552022, 552023, 552024, 552025, 552026, 552027, 552028, 552029, 552030, 552031, 552032, 552033, 552034, 552038, 552039, 552041, 552044, 552046, 552047, 552049, 552050, 552051, 552052, 552053, 552054, 552055, 552056, 552057, 552058, 552059, 552060, 552061, 552062, 552063, 552064, 552065, 552068, 552069, 552070, 552071, 552073, 552074, 552075, 552076, 552077, 552078, 552079, 552080, 552081, 552082, 552083, 552084, 552085, 552086, 552087, 552088, 552089, 552090, 552091, 552092, 552093, 552094, 552095, 552096, 552097, 552098, 552099, 552100, 552101, 552115, 552117, 552123, 552125, 552127, 552128, 552129, 552132, 552133, 552138, 552139, 552140, 552141, 552143, 552144, 552145, 552146, 552147, 552148, 552149, 552150, 552151, 552152, 552158, 552159, 552160, 552163, 552168, 552179, 552187, 552188, 552192, 552193, 552195, 552199, 552200, 552201, 552202, 552203, 552204, 552205, 552206, 552207, 552208, 552210, 552211, 552213, 552214, 552222, 552246, 552247, 552248, 552253, 552254, 552255, 552258, 552294, 552301, 552302, 552306, 552307, 552308, 552309, 552310, 552312, 552314, 552315, 552317, 552318, 552321, 552322, 552323, 552325, 552332, 552337, 552339, 552347, 552348, 552349, 552354, 552355, 552358, 552359, 552360, 552361, 552362, 552363, 552364, 552365, 552366, 552367, 552368, 552369, 552371, 552373, 552374, 552375, 552376, 552377, 552378, 552379, 552403, 552408, 552409, 552411, 552418, 552419, 552420, 552424, 552442, 552464, 552465, 552466, 552467, 552472, 552474, 552475, 552477, 552478, 552521, 552522, 552523, 552527, 552528, 552529, 552530, 552534, 552567, 552578, 552579, 552584, 552586, 552587, 552588, 552590, 552789, 552803, 552804, 552805, 552808, 552816, 552817, 552818, 552819, 552820, 552821, 552822, 552823, 552824, 552828, 552829, 552830, 552833, 552834, 552835, 552842, 552843, 552844, 552846, 552848, 552849, 552850, 552851, 552852, 552853, 552854, 552855, 552856, 552857, 552858, 552859, 552860, 552861, 552863, 552864, 552865, 552872, 552894, 552903, 552904, 552907, 552909, 552910, 552911, 552913, 552914, 552915, 552916, 552917, 552918, 552922, 552923, 552925, 552927, 552928, 552929, 552930, 552931, 552932, 552933, 552934, 552935, 552936, 552937, 552938, 552939, 552940, 552941, 552942, 552943, 552944, 552945, 552946, 552957, 552961, 552966, 552969, 552971, 552972, 552974, 552976, 552979, 552980, 552981, 552983, 552984, 552988, 552989, 552990, 552991, 552995, 552996, 552998, 552999, 553001, 553002, 553003, 553004, 553006, 553008, 553009, 553010, 553011, 553012, 566828, 566829, 566830, 566831, 566832, 577120, 577121, 577122, 577123, 577124, 577125, 577126, 577127, 577128, 577129, 577130, 577131, 577132, 577133, 577134, 577135, 577136 и 582666.

В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 70% ингибирование мРНК HBV, SEQ ID NO:12, 17, 18, 20, 21, 22, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 39, 40, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 83, 89, 92, 96, 98, 100, 103, 112, 123, 125, 126, 127, 136, 137, 139, 140, 142, 143, 145, 147, 149, 151, 153, 166, 167, 168, 174, 176, 177, 178, 179, 181, 186, 187, 188, 190, 198, 201, 207, 209, 210, 211, 212, 213, 224, 225, 226, 227, 232, 234, 240, 321, 324, 325, 326, 327, 329, 330, 331, 332, 335, 336, 337, 339, 342, 343, 344, 345, 346, 357, 358, 359, 363, 364, 368, 370, 371, 372, 375, 376, 377, 378, 379, 382, 383, 384, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 395, 397, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 409, 410, 412, 413, 417, 418, 420 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 430, 435, 436, 438, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 457, 459, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 473, 474, 475, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 487, 488, 489, 490, 492, 496, 497, 500, 501, 504, 505, 508, 510, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 520, 521, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 539, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 566, 567, 569, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 588, 589, 590, 595, 596, 597, 598, 599, 600, 601, 602, 605, 606, 608, 609, 610, 611, 612, 613, 614, 615, 616, 617, 618, 619, 623, 624, 625, 626, 627, 628, 631, 632, 634, 636, 637, 638, 639, 640, 641, 642, 643, 644, 645, 646, 647, 648, 649, 650, 652, 653, 654, 657, 658, 659, 660, 661, 662, 663, 665, 666, 667, 669, 671, 672, 673, 674, 675, 676, 677, 678, 679, 680, 682, 684, 686, 687, 688, 689, 690, 691, 692, 693, 694, 695, 696, 698, 699, 700, 701, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 710, 711, 712, 713, 714, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 724, 725, 726, 727, 728, 729, 730, 731, 733, 734, 735, 736, 737, 738, 740, 741, 742, 745, 754, 755, 756, 757, 768, 777, 778, 779, 780, 781, 782, 784, 790, 791, 792, 793, 794, 795, 796, 797, 798, 799, 800, 801, 802, 803, 804, 805, 806, 807, 808, 809, 810, 811, 812, 814, 815, 817, 818, 819, 820, 821, 822, 823, 824, 825, 826, 827, 828, 833, 834, 842, 843, 844, 849, 852, 854, 860, 892, 893, 894, 895, 896, 897, 898, 899, 900, 1288, 1289, 1290, 1291, 1292, 1293, 1294, 1295, 1296, 1297, 1298, 1299, 1300, 1301, 1302, 1303, 1304, 1305, 1306, 1307, 1308, 1309, 1310, 1311, 1312, 1313, 1314, 1315, 1316, 1317, 1320, 1322, 1323, 1324, 1325, 1326, 1327, 1329, 1330, 1331, 1332, 1333, 1334, 1335, 1336, 1337, 1338, 1340, 1341, 1342, 1343, 1344, 1345, 1346, 1347, 1348, 1349 и 1350, 1367, 1368, 1369, 1370, 1372 и 1376.

В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 80% ингибирование мРНК HBV, ISIS ID: 510100, 509931, 510116, 505317, 505319, 505323, 505326, 505327, 505330, 505339, 505346, 505347, 505358, 509934, 146786, 524414, 524415, 524416, 524418, 524419, 524425, 524426, 524431, 524432, 524434, 524446, 524447, 524452, 524459, 524460, 524466, 524469, 524475, 524477, 524478, 524479, 524482, 524485, 524490, 524491, 524492, 524493, 524494, 524495, 524499, 524502, 524503, 524507, 524510, 524511, 524512, 524520, 524525, 524528, 524532, 524533, 524534, 524535, 524536, 524540, 524541, 524547, 524552, 524553, 524556, 524561, 524564, 524565, 524568, 524570, 524571, 524572, 524573, 524578, 524580, 524586, 524590, 524591, 524594, 524595, 524602, 524604, 524606, 524607, 524610, 524611, 524614, 524616, 524617, 524618, 524619, 524620, 524621, 524633, 524634, 524635, 524636, 524637, 524641, 524643, 524644, 524646, 524649, 524650, 524651, 524657, 524662, 524664, 524667, 524670, 524678, 524679, 524680, 524686, 524688, 524690, 524691, 524692, 524695, 524698, 524699, 524701, 524702, 524704, 524705, 524706, 524707, 524708, 524709, 524713, 524715, 524716, 524717, 524718, 524721, 524726, 524727, 524728, 524729, 524730, 524731, 524733, 524734, 524735, 524737, 524739, 524741, 524742, 524743, 524747, 524748, 524749, 524751, 524752, 524754, 524758, 524760, 524762, 524763, 524764, 524767, 524768, 524769, 524771, 524773, 524777, 524778, 524779, 524780, 524781, 524783, 524784, 524788, 524789, 524791, 524792, 524793, 524794, 524795, 524796, 524797, 524798, 524801, 524803, 524804, 524805, 524806, 524807, 524808, 524809, 524810, 524811, 524813, 524816, 524819, 524822, 524823, 524824, 524827, 524828, 524829, 524833, 524842, 524844, 524880, 524881, 524882, 524884, 524886, 524887, 524888, 524889, 524890, 524891, 524893, 524907, 524908, 524980, 524986, 524987, 551921, 551924, 551925, 551953, 551956, 551957, 551984, 551986, 551987, 551989, 551990, 551993, 551994, 551995, 551996, 551997, 551998, 551999, 552000, 552005, 552006, 552018, 552019, 552020, 552021, 552022, 552023, 552024, 552025, 552026, 552027, 552028, 552029, 552030, 552031, 552032, 552033, 552034, 552039, 552044, 552046, 552050, 552051, 552052, 552053, 552054, 552055, 552056, 552057, 552058, 552059, 552060, 552061, 552062, 552063, 552064, 552065, 552073, 552077, 552078, 552079, 552080, 552082, 552083, 552084, 552085, 552086, 552087, 552088, 552089, 552090, 552091, 552092, 552093, 552094, 552095, 552096, 552097, 552098, 552138, 552139, 552145, 552146, 552147, 552149, 552192, 552193, 552199, 552200, 552201, 552207, 552246, 552247, 552253, 552301, 552307, 552308, 552310, 552317, 552347, 552348, 552354, 552355, 552360, 552361, 552362, 552363, 552364, 552365, 552366, 552367, 552371, 552375, 552464, 552465, 552521, 552808, 552816, 552817, 552818, 552819, 552820, 552822, 552824, 552834, 552844, 552849, 552850, 552851, 552852, 552853, 552854, 552916, 552922, 552923, 552925, 552930, 552931, 552932, 552933, 552936, 552937, 552938, 552939, 552942, 552943, 552944, 552980, 552988, 552989, 552996, 552998, 553002, 553003, 566828, 566829, 566830, 566831, 566832, 577120, 577121, 577122, 577123, 577124, 577125, 577126, 577127, 577128, 577130, 577131, 577132, 577133, 577134, 577135, 577136 и 582666.

В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 80% ингибирование мРНК HBV, SEQ ID NO:17, 20, 22, 24, 26, 28, 39, 40, 50, 51, 83, 89, 103, 123, 126, 127, 136, 137, 143, 147, 149, 168, 176, 177, 178, 179, 187, 188, 210, 211, 212, 224, 225, 226, 227, 232, 325, 326, 327, 329, 330, 336, 337, 342, 343, 345, 357, 358, 363, 370, 371, 376, 379, 387, 388, 389, 392, 395, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 409, 412, 413, 417, 420 421, 422, 430, 435, 438, 442, 443, 444, 445, 446, 450, 451, 457, 462, 463, 466, 474, 475, 478, 480, 481, 482, 483, 488, 490, 496, 500, 501, 504, 505, 512, 514, 516, 517, 520, 521, 524, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 543, 544, 545, 546, 547, 551, 553, 554, 555, 559, 560, 561, 567, 572, 574, 577, 580, 588, 589, 590, 596, 598, 600, 601, 602, 605, 608, 609, 611, 612, 614, 615, 616, 617, 618, 619, 623, 625, 626, 627, 628, 631, 636, 637, 638, 639, 640, 641, 643, 644, 645, 646, 648, 650, 652, 653, 654, 658, 659, 660, 662, 663, 665, 669, 671, 673, 674, 675, 678, 679, 680, 682, 684, 688, 689, 690, 691, 692, 694, 695, 699, 700, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 712, 714, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 725, 728, 731, 734, 735, 736, 740, 741, 745, 756, 791, 792, 793, 795, 797, 798, 799, 800, 801, 802, 804, 805, 806, 807, 819, 820, 892, 898, 899, 1292, 1293, 1295, 1296, 1301, 1302, 1303, 1304, 1305, 1306, 1307, 1308, 1310, 1312, 1316, 1322, 1324, 1325, 1326, 1327, 1330, 1331, 1332, 1333, 1334, 1335, 1338, 1339, 1340, 1341, 1344, 1345, 1349, 1350, 1368, 1372 и 1376.

В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 90% ингибирование мРНК HBV, ISIS ID: 524414, 524415, 524432, 524460, 524466, 524469, 524475, 524477, 524493, 524512, 524535, 524540, 524552, 524561, 524572, 524617, 524619, 524634, 524641, 524644, 524657, 524667, 524691, 524698, 524699, 524701, 524706, 524707, 524709, 524713, 524715, 524716, 524718, 524721, 524726, 524729, 524730, 524731, 524733, 524734, 524735, 524739, 524743, 524754, 524763, 524764, 524767, 524771, 524780, 524781, 524784, 524788, 524789, 524791, 524792, 524793, 524794, 524795, 524796, 524797, 524798, 524801, 524803, 524804, 524805, 524806, 524807, 524808, 524809, 524810, 524811, 524822, 524827, 524842, 551986, 551987, 551989, 552005, 552018, 552019, 552020, 552021, 552022, 552023, 552025, 552046, 552050, 552051, 552052, 552053, 552054, 552055, 552057, 552082, 552083, 552084, 552085, 552086, 552087, 552088, 552089, 552092, 552093, 552096, 552097, 552307, 552317, 552355, 552361, 552362, 552363, 552817, 552851, 552922, 552923, 566828, 566829, 566830, 566831, 566832, 577120, 577121, 577122, 577123, 577124, 577125, 577126, 577127, 577128, 577130, 577131, 577132, 577134, 577135, 577136 и 582666.

В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 90% ингибирование мРНК HBV, SEQ ID NO:17, 24, 50, 51, 137, 143, 147, 176, 211, 212, 224, 226, 227, 325, 326, 343, 371, 376, 379, 403, 422, 445, 450, 462, 482, 527, 529, 544, 551, 554, 567, 577, 601, 608, 609, 611, 616, 617, 619, 623, 625, 626, 628, 631, 636, 639, 640, 641, 643, 644, 645, 646, 650, 654, 665, 674, 675, 678, 682, 691, 692, 695, 699, 700, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 712, 714, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 735, 801, 804, 805, 807, 1296, 1302, 1303, 1304, 1312, 1325, 1326, 1332, 1334, 1340, 1345, 1349 и 1376.

В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 95% ингибирование мРНК HBV, ISIS ID: 524619, 524634, 524641, 505339, 524698, 524709, 524718, 524731, 524734, 524789, 524791, 524792, 524793, 524794, 524795, 524796, 524797, 524798, 524801, 524803, 524804, 524805, 524806, 505346, 146785, 524807, 505347, 524808, 524809, 524810, 524811, 146786, 525101, 525102, 525103, 525107, 525108, 525109, 525110, 525111, 525112, 525113, 525114, 525115, 525116, 525117, 525118, 525119, 525120, 552018, 552050, 552019, 552051, 552020, 552052, 551987, 552021, 552053, 552005, 552022, 552054, 551989, 552023, 552055, 552084, 552085, 552086, 552087, 552088, 552361, 552317, 566831, 577123, 577124, 566830, 566828, 566829, 577127, 577135, 577132, 577136, 566832 и 577122.

В некоторых вариантах реализации, следующие антисмысловые соединения или олигонуклеотиды направлены на определенную область нуклеиновой кислоты HBV и вызывают по меньшей мере 95% ингибирование мРНК HBV, SEQ ID NO:17, 50, 137, 143, 187, 210, 212, 224, 529, 544, 551, 608, 619, 628, 641, 645, 700, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 712, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 1014, 1015, 1016, 1020, 1021, 1022, 1023, 1024, 1025, 1026, 1027, 1028, 1029, 1030, 1031, 1032, 1033, 1236, 1302, 1312, 1334, 1340, 1345, 1349.

В некоторых вариантах реализации представлены способы лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния у животного, включающие введение животному, нуждающемуся в этом, соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 10-30 связанных нуклеозидов и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:5-310, 321-802, 804-1272, 1288-1350, 1364-1372, 1375, 1376 и 1379.

В некоторых вариантах реализации представлены способы лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния у животного, включающие введение животному, нуждающемуся в этом, соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 10-30 связанных нуклеозидов и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:17, 51, 86, 93, 95, 98, 100, 102, 104, 106, 109, 112, 115, 117, 137, 140, 143, 145, 147, 149, 151, 153, 155, 157, 159, 161, 167, 168, 176, 177-179, 181, 188, 190-192, 194, 199, 201, 208, 209, 211, 226, 230-237, 244, 245, 247, 252, 254, 256, 258, 260, 262, 264, 266, 271, 1318-1347, 1364-1372, 1375, 1376 и 1379, при чем по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонукеотида включает по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый сахар и/или затрудненный этиловый (cEt) сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3 или 4 нуклеозида с модифицированным сахаром.

В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения экспрессии HBV у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной 10-30 связанных нуклеозидов, направленный на HBV и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:5-310, 321-802, 804-1272, 1288-1350, 1364-1372, 1375, 1376 и 1379.

В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения экспрессии HBV у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной 10-30 связанных нуклеозидов, направленный на HBV и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:17, 51, 86, 93, 95, 98, 100, 102, 104, 106, 109, 112, 115, 117, 137, 140, 143, 145, 147, 149,151, 153, 155, 157, 159, 161, 167, 168, 176, 177-179, 181, 188, 190-192, 194, 199, 201, 208, 209, 211, 226, 230-237, 244, 245, 247, 252, 254, 256, 258, 260, 262, 264, 266, 271, 1318-1347, 1364-1372, 1375 и 1376, причем по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонуклеотида включает по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый сахар и/или затрудненный этиловый (cEt) сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 или 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром.

В некоторых вариантах реализации представлен способ предотвращения, улучшения или лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной 10-30 связанных нуклеозидов, направленный на HBV и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:17, 51, 86, 93, 95, 98, 100, 102, 104, 106, 109, 112, 115, 117, 137, 140, 143, 145, 147, 149, 151, 153, 155, 157, 159, 161, 167, 168, 176, 177-179,181, 188, 190-192, 194, 199, 201, 208, 209, 211, 226, 230-237, 244, 245, 247, 252, 254, 256, 258, 260, 262, 264, 266, 271, 1318-1347, 1364-1372, 1375 и 1376, причем по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонуклеотида включает по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый сахар и/или затрудненный этиловый (cEt) сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 или 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром.

В некоторых вариантах реализации представлены способы лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния у животного, включающие введение животному, нуждающемуся в этом, соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 10-30 связанных нуклеозидов и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:5, 15, 16, 33, 39-95, 123-135, 163-175, 180-310, 321-406, 413-455, 461-802 или 804-1272.

В некоторых вариантах реализации представлены способы лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния у животного, включающие введение животному, нуждающемуся в этом, соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 10-30 связанных нуклеозидов и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:6-14, 17-32, 34-38, 96-122, 136-162, 176-179, 407-412, 456-462, 523-538, причем по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонуклеотида включает по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый сахар.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 14 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-3 или 2 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 или 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 17 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 или 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3-4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4, 5 или 6 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 18 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 3-5 или 4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 20 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 нуклеозидов с модифицированным сахаром.

В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения экспрессии HBV у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной 10-30 связанных нуклеозидов, направленный на HBV и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:5-310, 321-802, 804-1272 или 1288-1350.

В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения экспрессии HBV у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной 10-30 связанных нуклеозидов, направленный на HBV и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:5, 15, 16, 33, 39-95, 123-135, 163-175, 180-310, 321-406, 413-455, 461-802 или 804-1272.

В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения экспрессии HBV у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной 10-30 связанных нуклеозидов, направленный на HBV и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:6-14, 17-32, 34-38, 96-122, 136-162, 176-179, 407-412, 456-462, 523-538, причем по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонуклеотида включает по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый сахар.

В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 14 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-3 или 2 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 или 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 17 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 или 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4, 5 или 6 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 17 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3-4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 18 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 3-5 или 4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 20 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 20 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром.

В некоторых вариантах реализации представлен способ предотвращения, улучшения или лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной от 10 до 30 связанных нуклеозидов, нацеленный на HBV. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной 10-30 связанных нуклеозидов, направленный на HBV и имеющий последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:5-310, 321-802, 804-1272 или 1288-1350, причем по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонуклеотида содержит по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:5-310, 321-802 или 804-1272. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, включающую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ Ю NO: 5, 15, 16, 33, 39-95, 123-135, 163-175, 180-310, 321-406, 413-455, 461-802 или 804-1272. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:6-14, 17-32, 34-38, 96-122, 136-162, 176-179, 407-412, 456-462, 523-538, причем по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонуклеотида содержит по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 14 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-3 или 2 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 или 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 17 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 9 или 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4, 5 или 6 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 17 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3-4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 18 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 3-5 или 4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 20 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 нуклеозидов с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 20 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром.

Примеры HBV-связанных заболеваний, расстройств или состояний включают, но не ограничиваясь этим, хроническую инфекцию HBV, желтуху, рак печени, воспаление печени, фиброз печени, цирроз печени, печеночную недостаточность, диффузное гепатоцеллюлярное воспалительное заболевание, гемофагоцитарный синдром, серозный гепатит, виремию HBV и состояния, имеющие симптомы, которые могут включать любой или все из следующих: болезнь, похожую на грипп, слабость, боли, головную боль, жар, потерю аппетита, диарею, тошноту и рвоту, боль в области печени, стул земляного или серого цвета, зуд по всему телу и мочу темного цвета, в сочетании с положительным тестом на присутствие вируса гепатита В, вирусного антигена гепатита В или положительным тестом на присутствие антитела, специфичного к вирусному антигену гепатита В.

В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения экспрессии мРНК HBV у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной от 10 до 30 связанных нуклеозидов, нацеленный на HBV. В некоторых вариантах реализации снижение экспрессии мРНК HBV у животного предупреждает, улучшает или лечит HBV-связанное заболевание, расстройство или состояние. В некоторых вариантах реализации снижение экспрессии мРНК HBV у животного предупреждает, улучшает или лечит заболевание печени. В некоторых вариантах реализации экспрессия мРНК HBV снижается по меньшей мере на 5%, 10%, 20%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 100%.

В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения уровня белка HBV у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной от 10 до 30 связанных нуклеозидов, нацеленный на HBV. В некоторых вариантах реализации снижение уровня белка HBV у животного предупреждает, улучшает или лечит HBV-связанное заболевание, расстройство или состояние. В некоторых вариантах реализации снижение уровня белка HBV у животного предупреждает, улучшает или лечит заболевание печени. В некоторых вариантах реализации уровень белка HBV снижается по меньшей мере на 5%, 10%, 20%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 100%.

В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения уровня ДНК HBV у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной от 10 до 30 связанных нуклеозидов, нацеленный на HBV. В некоторых вариантах реализации снижение уровня ДНК HBV у животного предупреждает, улучшает или лечит HBV-связанное заболевание, расстройство или состояние. В некоторых вариантах реализации млекопитающим может быть человек, а вирусом гепатита В может быть вирус гепатита В человека. Более конкретно, вирус гепатита В человека может быть любым из человеческих географических генотипов: А (Северо-Западная Европа, Северная Америка, Центральная Америка); В (Индонезия, Китай, Вьетнам); С (Восточная Азия, Корея, Китай, Япония, Полинезия, Вьетнам); D (Средиземноморский регион, Ближний восток, Индия); Е (Африка); F (коренные американцы, Полинезия); G (Соединенные Штаты, Франция); или Н (Центральная Америка). В некоторых вариантах реализации снижение уровня ДНК HBV у животного предупреждает, улучшает или лечит заболевание печени. В некоторых вариантах реализации уровень ДНК HBV снижается по меньшей мере на 5%, 10%, 20%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 100%.

В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения уровня антигена HBV у животного, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной от 10 до 30 связанных нуклеозидов, нацеленный на HBV. В некоторых вариантах реализации антиген представляет собой HBsAG или HBeAG. В некоторых вариантах реализации снижение уровня антигена HBV у животного предупреждает, улучшает или лечит HBV-связанное заболевание, расстройство или состояние. В некоторых вариантах реализации снижение уровня антигена HBV у животного предупреждает, улучшает или лечит заболевание печени. В некоторых вариантах реализации уровень антигена HBV снижается по меньшей мере на 5%, 10%, 20%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 100%.

В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения уровня ДНК HBV и антигена HBV у животного, инфицированного вирусом гепатита В, включающий введение этому животному соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной от 10 до 30 связанных нуклеозидов, нацеленный на HBV. В некоторых вариантах реализации антиген представляет собой HBsAG или HBeAG. В некоторых вариантах реализации количество антигена HBV может быть снижено достаточно для сероконверсии, которую определяют как отсутствие HBeAg в сыворотке плюс присутствие HBeAb в сыворотке, в случае мониторинга HBeAg как определителя сероконверсии, или которую определяют как отсутствие HBsAg в сыворотке, в случае мониторинга HBsAg как определителя сероконверсии, по результатам определения доступных в настоящее время пределов обнаружения коммерческих систем иммуноферментного твердофазного анализа (ELISA).

В некоторых вариантах реализации представлен способ лечения животного с HBV-связанным заболеванием, расстройством или состоянием, включающий: а) идентификацию указанного животного с HBV-связанным заболеванием, расстройством или состоянием, и b) введение указанному животному терапевтически эффективного количества соединения или композиции, содержащей модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 14-20 связанных нуклеозидов и имеющий последовательность нуклеооснований по меньшей мере на 90% комплементарную любой из последовательностей SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363, по результатам измерения целостности указанного модифицированного олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации терапевтически эффективное количество соединения или композиции, введенной животному, лечит или уменьшает HBV-связанное заболевание, расстройство или состояние, или его симптом, у животного. В некоторых вариантах реализации HBV-связанное заболевание, расстройство или состояние представляет собой заболевание печени. В некоторых вариантах реализации, связанное заболевание, расстройство или состояние представляет собой хроническую инфекцию HBV, желтуху, рак печени, воспаление печени, фиброз печени, цирроз печени, печеночную недостаточность, диффузное гепатоцеллюлярное воспалительное заболевание, гемофагоцитарный синдром, серозный гепатит, виремию HBV или заболевание печени, связанное с трансплантацией.

В некоторых вариантах реализации представлен способ лечения животного с HBV-связанным заболеванием, расстройством или состоянием, включающий: а) идентификацию указанного животного с HBV-связанным заболеванием, расстройством или состоянием, и b) введение указанному животному терапевтически эффективного количества соединения или композиции, содержащей модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 14-20 связанных нуклеозидов и имеющий последовательность нуклеооснований по меньшей мере на 90% комплементарную последовательности SEQ Ю NO:1, по результатам измерения целостности указанного модифицированного олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации терапевтически эффективное количество соединения или композиции, введенной животному, лечит или уменьшает HBV-связанное заболевание, расстройство или состояние, или его симптом, у животного. В некоторых вариантах реализации HBV-связанное заболевание, расстройство или состояние представляет собой заболевание печени. В некоторых вариантах реализации, связанное заболевание, расстройство или состояние представляет собой хроническую инфекцию HBV, желтуху, рак печени, воспаление печени, фиброз печени, цирроз печени, печеночную недостаточность, диффузное гепатоцеллюлярное воспалительное заболевание, гемофагоцитарный синдром, серозный гепатит, виремию HBV или заболевание печени, связанное с трансплантацией.

В некоторых вариантах реализации HBV имеет последовательность, представленную далее под номером доступа GenBank U95551.1 (включена в настоящий документ как SEQ ID NO:1) или любой ее вариант или фрагмент. В некоторых вариантах реализации HBV имеет усеченные части человеческой последовательности, как представлено далее в SEQ ID NO:1273, 1274, 1275, 1276, 1277, 1278, 1279, 1280, 1281, 1282, 1283, 1284, 1285, 1287, 1352, 1353, 1354, 1359, 1360, 1361, 1362 и 1363.

В некоторых вариантах реализации животное представляет собой человека.

В некоторых вариантах реализации соединения или композиции разработаны в качестве первого средства. В некоторых вариантах реализации способы включают введение первого средства и одного или нескольких вторых средств. В некоторых вариантах реализации способы включают введение первого средства и одного или нескольких вторых средств. В некоторых вариантах реализации первое средство и одно или несколько вторых средство вводят совместно. В некоторых вариантах реализации первое средство и одно или несколько вторых средств вводят совместно последовательно или параллельно.

В некоторых вариантах реализации одно или несколько вторых средств также представляют собой соединение или композицию, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации одно или несколько вторых средств являются отличными от соединения или композиции, описанной в настоящем документе. Примеры одного или нескольких вторых средств включают, но не ограничиваясь этим, противовоспалительное средство, химиотерапевтическое средство или противоинфекционное средство.

В других родственных вариантах реализации, дополнительное терапевтическое средство может быть агентом HBV, агентом HCV, химиотерапевтическим средством, антибиотиком, анальгетиком, нестероидным противовоспалительным средством (NSAID), противогрибковым средством, антипаразитарным средством, средством против тошноты, средством против диареи или иммуноподавляющим средством.

В некоторых вариантах реализации одно или несколько вторых агентов представляют собой агент HBV. В некоторых вариантах реализации агент HBV может включать, но не ограничиваясь этим, интерферон альфа-2b, интерферон альфа-2а и интерферон альфакон-1 (пегилированный и не пегилированный), рибавирин; ингибитор репликации РНК HBV; второй антисмысловый олигомер; терапевтическую вакцину HBV; профилактическую вакцину HBV; ламивудин (3ТС); энтекавир (ETV); тенофовир диизопроксил-фумарат (TDF); телбивудин (LdT); адефовир; или любую терапию HBV антителами (моноклональными или поликлональными).

В некоторых вариантах реализации одно или несколько вторых агентов представляют собой агент HCV. В некоторых вариантах реализации агент HBV может включать, но не ограничиваясь этим, интерферон альфа-2b, интерферон альфа-2а и интерферон альфакон-1 (пегилированный и не пегилированный); рибавирин; ингибитор репликации РНК HCV (например, серии VP50406 производства ViroPharma); антисмысловый агент HCV; терапевтическую вакцину HCV; ингибитор протеазы HCV; ингибитор геликазы HCV; или терапию HCV моноклональными или поликлональными антителами.

В некоторых вариантах реализации одно или несколько вторых средств представляют собой противовоспалительное средство (то есть терапию, снижающую воспаление). В некоторых вариантах реализации терапия, снижающая воспаление, может включать, но не ограничиваясь этим, терапевтическое изменение образа жизни, стероид, NSAID или DMARD. Стероид может быть кортикостероидом. NSAID может быть аспирином, ацетаминофеном, ибупрофеном, напроксеном, ингибиторами СОХ, индометацином и тому подобными. DMARD может быть ингибитором TNF, ингибитором синтеза пурина, ингибитором кальциневрина, ингибитором синтеза пиримидина, сульфасалазином, метотрексатом и тому подобными.

В некоторых вариантах реализации одно или несколько вторых средств представляют собой химиотерапевтическое средство (то есть средство лечения рака). Химиотерапевтические средства могут включать, но не ограничиваясь этим, даунорубицин, дауномицин, дактиномицин, доксорубицин, эпирубицин, идарубицин, эзорубицин, блеомицин, мафосфамид, ифосфамид, цитозин арабинозид, бис-хлорэтилнитрозомочевину, бусульфан, митомицин С, актиномицин D, митрамицин, преднизон, гидроксипрогестерон, тестостерон, тамоксифен, дакарбазин, прокарбазин, гексаметилмеламин, пентаметилмеламин, митоксантрон, амсакрин, хлорамбуцил, метилциклогексилнитрозомочевину, азотные иприты, мелфалан, циклофосфамид, 6-меркаптопурин, 6-тиогуанин, цитарабин (СА), 5-азацитидин, гидроксимочевину, дезоксикоформицин, 4-гидроксипероксициклофосфорамид, 5-фторурацил (5-FU), 5-фтордезоксиуридин (5-FUdR), метотрексат (МТХ), колхицин, таксол, винкристин, винбластин, этопозид, триметрексат, тенипозид, цисплатин, гемцитабин и диэтилстильбэстрол (DES).

В некоторых вариантах реализации одно или несколько вторых агентов представляют собой противоинфекционное средство. Примеры противомикробных средств включают, но не ограничиваясь этим, антибиотики, противогрибковые лекарства и противовирусные лекарства.

В некоторых вариантах реализации, введение включает парентеральное введение.

В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения количества мРНК, ДНК, белка HBV и/или антигена HBV у млекопитающего, инфицированного вирусом гепатита В, включающий введение терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции, описанной выше, млекопитающему, нуждающемуся в этом, для снижения инфекции вируса гепатита В и антигена гепатита В, по сравнению с количеством мРНК, белка HBV и количеством антигена HBV у млекопитающего до лечения. В некоторых вариантах реализации млекопитающим может быть человек, а вирусом гепатита В может быть вирус гепатита В человека. Более конкретно, вирус гепатита В человека может быть любым из человеческих географических генотипов: А (Северо-Западная Европа, Северная Америка, Центральная Америка); В (Индонезия, Китай, Вьетнам); С (Восточная Азия, Корея, Китай, Япония, Полинезия, Вьетнам); D (Средиземноморский регион, Ближний восток, Индия); Е (Африка); F (коренные американцы, Полинезия); G (Соединенные Штаты, Франция); или Н (Центральная Америка).

В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения количества мРНК, ДНК, белка HBV и/или антигена HBV у млекопитающего, инфицированного вирусом гепатита В, включающий введение терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции, описанной выше, млекопитающему, нуждающемуся в этом, для снижения инфекции вируса гепатита В и антигена гепатита В, по сравнению с количеством мРНК, белка HBV и количеством антигена HBV у млекопитающего до лечения, причем количество мРНК снижается по меньшей мере на 70% по сравнению с количеством до введения модифицированного анисмыслового олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения количества мРНК, ДНК, белка HBV и/или антигена HBV у млекопитающего, инфицированного вирусом гепатита В, включающий введение терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции, описанной выше, млекопитающему, нуждающемуся в этом, для снижения инфекции вируса гепатита В и антигена гепатита В, по сравнению с количеством мРНК, белка HBV и количеством антигена HBV у млекопитающего до лечения, причем количество мРНК снижается по меньшей мере на 75% по сравнению с количеством до введения модифицированного анисмыслового олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения количества мРНК, ДНК, белка HBV и/или антигена HBV у млекопитающего, инфицированного вирусом гепатита В, включающий введение терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции, описанной выше, млекопитающему, нуждающемуся в этом, для снижения инфекции вируса гепатита В и антигена гепатита В, по сравнению с количеством мРНК, белка HBV и количеством антигена HBV у млекопитающего до лечения, причем количество мРНК снижается по меньшей мере на 80% по сравнению с количеством до введения модифицированного анисмыслового олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения количества мРНК, ДНК, белка HBV и/или антигена HBV у млекопитающего, инфицированного вирусом гепатита В, включающий введение терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции, описанной выше, млекопитающему, нуждающемуся в этом, для снижения инфекции вируса гепатита В и антигена гепатита В, по сравнению с количеством мРНК, белка HBV и количеством антигена HBV у млекопитающего до лечения, причем количество мРНК снижается по меньшей мере на 85% по сравнению с количеством до введения модифицированного анисмыслового олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения количества мРНК, ДНК, белка HBV и/или антигена HBV у млекопитающего, инфицированного вирусом гепатита В, включающий введение терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции, описанной выше, млекопитающему, нуждающемуся в этом, для снижения инфекции вируса гепатита В и антигена гепатита В, по сравнению с количеством мРНК, белка HBV и количеством антигена HBV у млекопитающего до лечения, причем количество мРНК снижается по меньшей мере на 90% по сравнению с количеством до введения модифицированного анисмыслового олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации представлен способ снижения количества мРНК, ДНК, белка HBV и/или антигена HBV у млекопитающего, инфицированного вирусом гепатита В, включающий введение терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции, описанной выше, млекопитающему, нуждающемуся в этом, для снижения инфекции вируса гепатита В и антигена гепатита В, по сравнению с количеством мРНК, белка HBV и количеством антигена HBV у млекопитающего до лечения, причем количество мРНК снижается по меньшей мере на 95% по сравнению с количеством до введения модифицированного анисмыслового олигонуклеотида. В родственных способах антигеном HBV может быть HBsAg или может быть HBeAg, и более конкретно, количество антигена HBV может быть существенно снижено для сероконверсии, которую определяют как отсутствие HBeAg в сыворотке плюс присутствие HBeAb в сыворотке, в случае мониторинга HBeAg как определителя сероконверсии, или которую определяют как отсутствие HBsAg в сыворотке, в случае мониторинга HBsAg как определителя сероконверсии, по результатам определения доступных в настоящее время пределов обнаружения коммерческих систем иммуноферментного твердофазного анализа (ELISA).

В некоторых вариантах реализации представлен способ ускорения сероконверсии вируса гепатита В у млекопитающего, инфицированного HBV, включающий введение терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции, описанной выше, млекопитающему, инфицированному гепатитом В; мониторинг присутствия HBeAg плюс HBeAb в образце сыворотки млекопитающего, или мониторинг присутствия HBsAg в образце сыворотки млекопитающего, как отсутствие HBeAg в сыворотке плюс присутствие HBeAb в образце сыворотки, в случае мониторинга HBeAg как определителя сероконверсии, или отсутствие HBsAg в образце сыворотки, в случае мониторинга HBsAg как определителя сероконверсии, по результатам определения доступных в настоящее время пределов обнаружения коммерческих систем иммуноферментного твердофазного анализа (ELISA), представляет собой показатель сероконверсии у млекопитающего.

В некоторых вариантах реализации представлено применение соединения или композиции, описанной в настоящем документе, для предупреждения, улучшения или лечения заболевания печени или его симптома у млекопитающего. В некоторых вариантах реализации, соединение или композиция содержит модифицированный олигонуклеотид длиной от 10 до 30 связанных нуклеозидов, нацеленный на HBV. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, включающую по меньшей мере 10 смежных нуклеооснований любой из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO:17, 51, 86, 93, 95, 98, 100, 102, 104, 106, 109, 112, 115, 117, 137, 140, 143, 145, 147, 149, 151, 153,155, 157, 159, 161, 167, 168, 176, 177-179, 181, 188, 190-192, 194, 199, 201, 208, 209, 211, 226, 230-237, 244, 245, 247, 252, 254, 256, 258, 260, 262, 264, 266, 271, 1318-1347, 1364- 1372, 1375, 1376 и 1379.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции, описанные в настоящем документе, являются эффективными на основании того, что они имеют значение in vitro IC50 менее 250 нМ, менее 200 нМ, менее 150 нМ, менее 100 нМ, менее 90 нМ, менее 80 нМ, менее 70 нМ, менее 65 нМ, менее 60 нМ, менее 55 нМ, менее 50 нМ, менее 49 нМ, менее 47 нМ, менее 46 нМ, при доставке в клетки HepG2.2.1. В некоторых вариантах реализации, ингибирование измеряют при помощи набора затравочных зондов RTS3370, описанного в настоящем документе.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции, описанные в настоящем документе, являются эффективными на основании того, что они имеют значение in vitro IC50 менее 250 нМ, менее 200 нМ, менее 100 нМ, менее 90 нМ, менее 80 нМ, менее 70 нМ, менее 60 нМ, менее 50 нМ, менее 40 нМ, менее 35 нМ, менее 34 нМ, менее 33 нМ, менее 32 нМ, менее 31 нМ, при доставке в клетки HepG2.2.1. В некоторых вариантах реализации, ингибирование измеряют при помощи набора затравочных зондов RTS3371, описанного в настоящем документе.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции, описанные в настоящем документе, являются эффективными на основании того, что они имеют значение in vitro IC50 менее 20 мкМ, менее 10 мкМ, менее 9, 5 мкМ, менее 9,0 мкМ, менее 8, 5 мкМ, менее 8,0 мкМ, менее 7, 5 мкМ, менее 7,0 мкМ, менее 6, 5 мкМ, менее 6,0 мкМ, менее 5, 5 мкМ, менее 5,0 мкМ, менее 4, 5 мкМ, менее 4,0 мкМ, менее 3, 5 мкМ мегее 3,0 мкМ, менее 2, 5 мкМ, при доставке в клетки HepG2.2.1, как описано в настоящем документе.

В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции, описанные в настоящем документе, являются высоко переносимыми, что демонстрируется тем, что они увеличивают по меньшей мере одно из значений ALT или AST не более чем в 4 раза, 3 раза или 2 раза по сравнению с животными, обработанными солевым раствором, или увеличивают вес печени, селезенки или почек не более чем на 30%, 20%, 15%, 12%, 10%, 5% или 2%. В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции, описанные в настоящем документе, являются высоко переносимыми, что демонстрируется тем, что они не увеличивают ALT или AST по сравнению с животными, обработанными солевым раствором. В некоторых вариантах реализации, соединения или композиции, описанные в настоящем документе, являются высоко переносимыми, что демонстрируется тем, что они не увеличивают вес печени, селезенки или почек по сравнению с животными, обработанными солевым раствором. В некоторых вариантах реализации, эти соединения или композиции содержат ISIS 146779, ISIS 146786, ISIS 505317, ISIS 505329, ISIS 505332, ISIS 505346, ISIS 505347, ISIS 505358, ISIS 509926, ISIS 509927, ISIS 509932, ISIS 509934, ISIS 509960, ISIS 509974, ISIS 510038, ISIS 510039, ISIS 510040, ISIS 510041, ISIS 510050 ISIS 509975, ISIS 510100, ISIS 510106 и ISIS 510116. В некоторых вариантах реализации, такие соединения или композиции содержат соединения, содержащие последовательность нуклеооснований любой из последовательностей SEQ ID NO:5-310, 321-802 или 804-1272. В некоторых вариантах реализации, такие соединения или композиции содержат соединения, содержащие последовательность нуклеооснований любой из последовательностей SEQ ID NO:5, 15, 16, 33, 39-95, 123-135, 163-175, 180-310, 321-406, 413-455, 461-802 или 804-1272. В некоторых вариантах реализации, такие соединения или композици содержат последовательность нуклеооснований любой из последовательностей SEQ ID NO:6-14, 17-32, 34-38, 96-122, 136-162, 176-179, 407-412, 456-462, 523-538 (обновленные SEQ ID NO), причем по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонуклеотида содержит по меньшей мере один 2'-O-метоксиэтиловый сахар. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 14 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-3 или 2 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 16 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 17 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 2-4 или 3-4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 18 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5, 3-5 или 4 нуклеозида с модифицированным сахаром. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет 20 нуклеозидов в длину и имеет сегмент гэп из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, модифицированный олигонуклеотид имеет сегмент крыла на конце 5' и конце 3' сегмента гэп, каждый независимо имеет 1-5 или 5 нуклеозидов с модифицированным сахаром.

В некоторых вариантах реализации представлено применение соединения или композиции, описанной в настоящем документе, в производстве лекарственного средства для лечения, улучшения, отсрочки или предупреждения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния у животного.

В некоторых вариантах реализации представлено применение соединения или композиции, описанной в настоящем документе, в производстве лекарственного средства для лечения, улучшения, отсрочки или предупреждения заболевания печени у животного.

В некоторых вариантах реализации представлен набор для лечения, предупреждения или улучшения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния, или его симптома, как описано в настоящем документе, причем указанный набор включает: а) соединение или композиции, описанные в настоящем документе; и необязательно b) дополнительное средство или терапию, описанную в настоящем документе. Набор может дополнительно включать инструкции или этикетку по применнию набора для лечения, предупреждения или улучшения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния.

Антисмысловые соединения

Олигомерные соединения включают, но не ограничиваясь этим, олигонуклеотиды, олигонуклеозиды, олигонуклеотидные аналоги, олигонуклеотид-миметики, антисмысловые соединения, антисмысловые олигонуклеотиды и миРНК. Олигомерное соединение может быть «антисмысловым» для целевой нуклеиновой кислоты, что означает, что оно способно подвергаться гибридизации с целевой нуклеиновой кислотой посредством водородного связывания.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение имеет последовательность нуклеооснований, которая, при прочтении в направлении от 5' к 3', содержит обратный комплемент целевого сегмента целевой нуклеиновой кислоты, на который он направлен. В некоторых таких вариантах реализации, антисмысловый олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, которая, при прочтении в направлении от 5' к 3', содержит обратный комплемент целевого сегмента целевой нуклеиновой кислоты, на который он направлен.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 10-30 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 12-30 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 12-22 субъединицы. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 14-30 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 14-20 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 15-30 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 15-20 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 16-30 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 16-20 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 17-30 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 17-20 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 18-30 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 18-21 субъединицы. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 18-20 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 20-30 субъединиц. Другими словами, такие антисмысловые соединения имеют от 12 до 30 связанных субъединиц, от 14 до 30 связанных субъединиц, от 14 до 20 связанных субъединиц, от 15 до 30 связанных субъединиц, от 15 до 20 связанных субъединиц, от 16 до 30 связанных субъединиц, от 16 до 20 связанных субъединиц, от 17 до 30 связанных субъединиц, от 17 до 20 связанных субъединиц, от 18 до 30 связанных субъединиц, от 18 до 20 связанных субъединиц, от 18 до 21 связанных субъединиц, от 20 до 30 связанных субъединиц или от 12 до 22 связанных субъединиц, соответственно. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 14 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 16 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 17 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 18 субъединиц. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет длину 20 субъединиц. В других вариантах реализации, антисмысловое соединение имеет 8-80, 12-50, 13-30, 13-50, 14-30, 14-50, 15-30, 15-50, 16-30, 16-50, 17-30, 17-50, 18-22, 18-24, 18-30, 18-50, 19-22, 19-30, 19-50 или 20-30 связанных субъединиц. В некоторых таких вариантах реализации, антисмысловые соединения имеют длину 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79 или 80 связанных субъединиц, или диапазон, определяемый любыми двумя из представленных выше значений. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение представляет собой антисмысловый олигонуклеотид, а связанные субъединицы являются нуклеотидами.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на нуклеиновую кислоту HBV, могут быть укорочены или усечены. Например, одна субъединица может быть удалена с конца 5' (усечение 5'), или, альтернативно, с конца 3' (усечение 3'). Укороченное или усеченное антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, может иметь две субъединицы, удаленные с конца 5', или, альтернативно, может иметь две субъединицы, удаленные с конца 3' антисмыслового соединения. Альтернативно, удаленные нуклеозиды могут быть рассредоточены в антисмысловом соединении, например, в антисмысловом соединении, имеющем один нуклеозид, удаленный с конца 5', и один нуклеозид, удаленный с конца 3'.

При наличии одной дополнительной субъединицы в удлиненном антисмысловом соединении, эта дополнительная субъединица может быть расположена на конце 5' или 3' антисмыслового соединения. При наличии двух или более дополнительных субъединиц, добавленные субъединицы могут быть соседними относительно друг друга, например, в антисмысловом соединении, имеющем две субъединицы, добавленные в конце 5' (присоединение 5'), или, альтернативно, в конце 3' (присоединение 3') антисмыслового соединения. Альтернативно,добавленные субъединицы могут быть рассредоточены в антисмысловом соединении, например, в антисмысловом соединении, имеющем одну субъединицу, присоединенную к концу 5', и одну субъединицу, присоединенную к концу 3'.

Можно увеличивать или уменьшать длину антисмыслового соединения, такого как антисмысловый олигонуклеотид, и/или внедрять несовпадающие основания без аннулирования активности. Например, в публикации Woolf et al. (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:7305-7309, 1992), были испытаны серии антисмысловых олигонуклеотидов из 13-25 нуклеооснований на их способность вызывать расщепление целевой РНК в модели инъекции ооцита. Антисмысловые олигонуклеотиды длиной 25 нуклеооснований с 8 или 11 не совпадающими основаниями вблизи концов антисмысловых олигонуклеотидов были способны направлять специфическое расщепление целевой мРНК, хотя и в меньшей степени, чем антисмысловые олигонуклеотиды, не содержащие несовпадений. Точно так же, целевое специфическое расщепление было достигнуто с использованием антисмысловых олигонуклеотидов из 13 нуклеооснований, включая олигонуклеотиды с 1 или 3 несовпадениями.

Gautschi et al. (J. Natl. Cancer Inst. 93:463-471, March 2001) продемонстрировали способность олигонуклеотида, имеющего 100% комплементарность с мРНК bcl-2 и имеющего 3 несовпадения с мРНК bcl-xL, снижать экспрессию bcl-2 и bcl-xL in vitro и in vivo. Более того, этот олигонуклеотид показал потенциальную противоопухолевую активность т vivo.

Maher and Dolnick (Nuc. Acid. Res. 16:3341-3358, 1988) исследовали серию последовательных антисмысловых олигонуклеотидов из 14 нуклеооснований, а также антисмысловые олигонуклеотиды из 28 и 42 нуклеооснований, включающих последовательность из двух или трех последовательных антисмысловых олигонуклеотидов, соответственно, на их способность блокировать трансляцию DHFR человека в анализе ретикулоцитов кроликов. Каждый из трех антисмысловых олигонуклеотидов из 14 нуклеооснований по отдельности был способен ингибировать трансляцию, хотя и на более слабом уровне, чем антисмысловые олигонуклеотиды из 28 или 42 нуклеооснований.

Мотивы антисмысловых соединений

В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту HBV, содержали химически модифицированные субъединицы, расположенные в таких последовательностях, или мотивах, чтобы придавать антисмысловым соединениям такие свойства, как усиленная ингибирующая активность, повышенная связывающая аффиность к целевой нуклеиновой кислоте или устойчивость к разрушению под действием нуклеаз in vivo.

Химерные антисмысловые соединения обычно содержат по меньшей мере одну область, модифицированную так, чтобы придавать повышенную устойчивость к нуклеазному расщеплению, повышенное клеточное поглощение, повышенную связывающую аффинность к целевой нуклеиновой кислоте и/или повышенную ингибирующую активность. Вторая область химерного антисмыслового соединения может необязательно служить в качестве субстрата для клеточной эндонкулеазы РНазы Н, которая расщепляет цепь РНК дуплекса РНК: ДНК.

Антисмысловые соединения, имеющие мотив химерного олигонуклеотида, считают химерными антисмысловыми соединениями. В химерном олигонуклеотиде, внутренняя область, содержащая множество нуклеотидов, которые поддерживают расщепление РНазы Н, расположена между внешними областями, содержащими множество нуклеотидов, которые являются химически отличными от нуклеозидов внутренней области. В случае если антисмысловый олигонуклеотид имеет мотив химерного олигонуклеотида, то сегмент гэп обычно служит в качестве субстрата для эндонуклеазного расщепления, тогда как сегменты крыльев включают модифицированные нуклеозиды. В некоторых вариантах реализации, области химерного олигонуклеотида дифференцируются по типу сахарных фрагментов, составляющих кажду отдельную область. Типы сахарных фрагментов, которые используют для дифференциации областей химерного олигонуклеотида, могут, в некоторых вариантах реализации, включать β-D-рибонуклеозиды, β-D-дезоксирибонуклеозиды, 2'-модифицированные нуклеозиды (такие 2'-модифицированные нуклеозиды могут включать 2'-МОЕ и 2'-O-СН3, среди прочих) и модифицированные нуклеозиды с бициклическим сахаром (такие модифицированные нуклеозиды с бициклическим сахаром могут включать нуклеозиды, содержащие затрудненный этил). В некоторых вариантах реализации, нуклеозиды в крыльях могут включать несколько модифицированных сахарных фрагментов, включая, например, 2'-МОЕ и бициклические сахарные фрагменты, такие как затрудненный этил или БНК. В некоторых вариантах реализации, крылья могут включать несколько модифицированных и не модифицированных сахарных фрагментов. В некоторых вариантах реализации, крылья могут включать различные комбинации нуклеозидов 2'-МОЕ, бициклических сахарных фрагментов, таких как затрудненные этилнуклеозиды или БНК-нуклеозиды, и 2'-дезоксинуклеозидов.

Каждая отдельная область может включать одинаковые сахарные фрагменты, вариантные или измененные сахарные фрагменты. Мотив крыло-гэп-крыло зачастую описывают как «X-Y-Z», где «X» представляет собой длину 5'-крыла, «Y» представляет собой длину гэп, и «Z» представляет собой длину 3'-крыла. «X» и «Z» могут содержать одинаковые, вариантные или измененные сахарные фрагменты. В некоторых вариантах реализации, «X» и «Y» могут включать один или несколько 2'-дезоксинуклеозидов. «Y» может включать 2'-дезоксинуклеозиды. При использовании в настоящем документе, химерный олигонуклеотид, описанный как «X-Y-Z», имеет такую конфигурацию, что гэп расположен сразу возле каждого из 5'-крыла и 3'-крыла. Следовательно, между 5'-крылом и гэп, или между гэп и 3'-крылом нет промежуточных нуклеотидов. Любые антисмысловые соединения, описанные в настоящем документе, могут иметь мотив химерного олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации, «X» и «Z» являются одинаковыми; в других вариантах реализации они различные. В некоторых вариантах реализации, «Y» содержит от 8 до 15 нуклеозидов. X, Y или Z могут иметь 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30 или более нуклеозидов.

В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 11-меры, имеющие мотив 1-9-1.

В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 12-меры, имеющие мотив 1-9-2, 2-9-1 или 1-10-1.

В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 13-меры, имеющие мотив 1-9-3, 2-9-2, 3-9-1, 1-10-2 или 2-10-1.

В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 14-меры, имеющие мотив 1-9-4, 2-9-3, 3-9-2, 4-9-1, 1-10-3, 2-10-2 или 3-10-1.

В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 15-меры, имеющие мотив 1-9-5, 2-9-4, 3-9-3, 4-9-2, 5-9-1, 1-10-4, 2-10-3, 3-10-2 или 4-10-1.

В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 16-меры, имеющие мотив 4-8-4, 2-9-5, 3-9-4, 4-9-3, 5-9-2, 1-10-5, 2-10-4, 3-10-3, 4-10-2, 3-8-5 или 5-10-1.

В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 17-меры, имеющие мотив 3-9-5, 3-10-4, 4-9-4, 5-9-3, 2-10-5, 3-10-4, 4-10-3, 5-10-2, 2-9-6, 5-8-4, 5-7-5, 6-7-4 или 6-9-2.

В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 18-меры, имеющие мотив 4-9-5, 5-9-4, 3-10-5, 4-10-4 или 5-10-3.

В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 19-меры, имеющие мотив 5-9-5, 4-10-5 или 5-10-4.

В некоторых вариантах реализации, химерные олигонуклеотиды, представленные в настоящем документе, содержат, например, 20-меры, имеющие мотив 5-10-5, 2-10-8, 8-10-2, 3-10-7, 7-10-3, 4-10-6 или 6-10-4.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение содержит мотив «олигомера крыла», имеющий конфигурацию крыло-гэп или гэп-крыло, то есть конфигурацию X-Y или Y-Z, как описано выше для конфигурации химерного олигонуклеотида. Следовательно, конфигурации олигомера крыла, представленные в настоящем документе, включают, но не ограничиваясь этим, например, 5-10, 8-4, 4-12, 12-4, 3-14, 16-2, 18-1, 10-3, 2-10, 1-10, 8-2, 2-13, 5-13, 5-8 или 6-8.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 2-10-2.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 3-10-3.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 4-10-4.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 5-10-5.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 3-10-4.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 2-10-4.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 2-10-8.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 8-10-2.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 3-10-7.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 7-10-3.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 4-10-6.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 6-10-4.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 2-9-6.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 6-9-2.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 4-9-4.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 5-9-3.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 3-9-5.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 5-9-2.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 2-9-5.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 4-9-3.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида 3-9-4.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет гэп-расширенный мотив.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, имеет мотив химерного олигонуклеотида, в котором гэп состоит из 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 или 16 связанных нуклеозидов.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту HBV, содержат любой из следующих сахарных мотивов:

k-d(10)-k

e-d(10)-k

k-d(10)-e

k-k-d(10)-k-k

k-k-d(10)-e-e

e-e-d(10)-k-k

k-k-k-d(10)-k-k-k

e-e-e-d(10)-k-k-k

k-k-k-d(10)-e-e-e

k-k-k-d(10)-k-k-k

e-k-k-d(10)-k-k-e

e-e-k-d(10)-k-k-e

e-d-k-d(10)-k-k-e

e-k-d(10)-k-e-k-e

k-d(10)-k-e-k-e-e

e-e-k-d(10)-k-e-k-e

e-d-d-k-d(9)-k-k-e

e-e-e-e-d(9)-k-k-e

e-e-e-e-e-d(10)-e-e-e-e-e

k-d-k-d-k-d(9)-e-e

e-e-k-k-d(9)-e-k-e-e

k-d-k-d-k-d(10)-e-e-e-e-e

k-e-k-d(10)-k-e-k

e-e-e-k-k-d(8)-e-e-e-e

e-e-e-k-k-d(7)-k-k-e-e-e

e-e-e-k-d(9)-k-e-e-e

e-e-e-k-k-d(7)-k-k-e-e-e

e-e-e-e-k-k-d(7)-e-e-e-e

e-k-e-k-d(9)-e-e-e-e

e-k-e-k-d-k-d(7)-e-e-e-e

e-e-e-k-k-d(7)-k-k-e-e-e

k-d-k-d-k-d(8)-e-e-e-e-e

причем k представляет собой затруденный этилнуклеозид, е представляет собой 2'-МОЕ замещенный нуклеозид, и d представляет собой 2'-дезоксинуклеозид.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловый олигонуклеотид имеет сахарный мотив, описанный Формулой А, представленной ниже: (J)m-(B)n-(J)p-(B)r-(A)t-(D)g-(A)v-(B)w-(J)x-(B)y-(J)z

причем:

каждый А независимо представляет собой 2'-замещенный нуклеозид;

каждый В независимо представляет собой бициклический нуклеозид;

каждый J независимо представляет собой 2'-замещенный нуклеозид или 2'-дезоксинуклеозид;

каждый D представляет собой 2'-дезоксинуклеозид;

m равен O-4; n равен O-2; р равен O-2; r равен O-2; t равен O-2; v равен O-2; w равен O-4; х равен O-2; y равен O-2; z равен O-4; g равен 6-14;

при условии, что:

по меньшей мере, один из m, n и r является отличным от 0;

по меньшей мере, один из w и y является отличным от 0;

сумма m, n, р, r и t составляет от 2 до 5; и сумма v, w, х, y и z составляет от 2 до 5.

Целевые нуклеиновые кислоты, целевые области и нуклеотидные последовательности

Нуклеотидная последовательность, кодирующая HBV, включает, без ограничения, следующую: номер доступа GENBANK U95551.1 (в настоящий документ включена как SEQ ID NO:1).

Следует понимать, что последовательность, представленная далее в каждом SEQ ID NO в Примерах, содержащихся в настоящем документе, является не зависимой от любых модификаций сахарного фрагмента, межнуклеозидной связи или нуклеооснования. Поэтому антисмысловые соединения, определенные номером SEQ ID NO, могут включать, независимо, одну или несколько модификаций сахарного фрагмента, межнуклеозидной связи или нуклеооснования. Антисмысловые соединения, описанные этим номером Isis (Isis №), указывают комбинацию последовательности нуклеооснования и мотива.

В некоторых вариантах реализации, целевая область является структурно определенной областью целевой нуклеиновой кислоты. Например, целевая область может охватывать 3' не транслируемую область (UTR), 5' не транслируемую область, экзон, интрон, экзон-интронное сочленение, кодирующую область, область инициации трансляции, область обрыва трансляции или другую определенную область нуклеиновой кислоты. Структурно определенные области для HBV могут быть получены по номеру доступа из базы данных последовательностей, такой как NCBI, и такая информация включена в настоящий документ путем ссылки. В некоторых вариантах реализации, целевая область может охватывать последовательность от 5' целевого сайта любого целевого сегмента в пределах целевой области от 3' целевого сайта другого целевого сегмента в пределах той же целевой области.

Таргетинг включает определение по меньшей мере одного целевого сегмента, с которым гибридизуется антисмысловое соединение с возникновением заданного эффекта. В некоторых вариантах реализации заданный эффект представляет собой снижение уровней целевой нуклеиновой кислоты мРНК. В некоторых вариантах реализации, заданный эффект представляет собой снижение уровней белка, кодирующего целевую нуклеиновую кислоту или фенотипическое изменение, связанное с целевой нуклеиновой кислотой.

Целевая область може содержать один или несколько целевых сегментов. Несколько целевых сегментов в пределах целевой области могут перекрываться. Альтернативно, они могут не перекрываться. В некоторых вариантах реализации, целевые сегменты в пределах целевой области разделены не более чем около 300 нуклеотидами. В некоторых вариантах реализации, целевые сегменты в пределах целевой области разделены количеством нуклеотидов, которое составляет, или примерно равно, или не превышает, или примерно не превышает 250, 200, 150, 100, 90, 80, 70, 60, 50, 40, 30, 20 или 10 нуклеотидов целевой нуклеиновой кислоты, или находится в диапазоне, определенном любыми из двух предшествующих значений. В некоторых вариантах реализации, целевые сегменты в пределах целевой области разделены не более чем или примерно не более чем 5 нуклеотидами целевой нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации, целевые сегменты являются смежными. Подразумевается целевые области, определенные диапазоном, имеющим исходную нуклеиновую кислоту, то есть любой из 5' целевых сайтов или 3' целевых сайтов, перечисленных в настоящем документе.

Соответствующие целевые сегменты могут находиться в 5' не транслируемой области, кодирующей области, 3' не транслируемой области, интроне, экзоне или экзон-интронном сочленении. Целевые сегменты, содержащие инициирующий кодон или стоп-кодон, также являются пригодными целевыми сегментами. Соответствующий целевой сегмент может специально исключать некоторую структурно определенную область, такую как инициирующий кодон или стоп-кодон.

Определение соответствующих целевых сегментов может включать сравнение последовательности целевой нуклеиновой кислоты с другими последовательностями генома. Например, для определения областей сходства среди различных нуклеиновых кислот может быть использован алгоритм BLAST. Это сравнение может предотвращать выбор последовательностей антисмысловых соединений, которые могут гибридизоваться неспецифическим образом с последовательностями, отличными от выбранной целевой нуклеиновой кислоты (то есть нецелевыми последовательностями).

В пределах активной целевой области может наблюдаться изменение активности (например, по результатам определения процентного снижения уровней целевой нуклеиновой кислоты) антисмысловых соединений. В некоторых вариантах реализации, снижение уровней мРНК HBV является показателем ингибирования экспрессии HBV. Снижение уровней белка HBV также является показателем ингибирования экспрессии целевой мРНК. Кроме того, показателем ингибирования экспрессии HBV являются фенотипические изменения. В некоторых вариантах реализации, показателем ингибирования экспрессии HBV может быть уменьшение усталости, уменьшение симптомов, похожих на грипп, улучшение аппетита, снижение тошноты, уменьшение боли в суставах, уменьшение желтухи, уменьшение боли в животе, снижение слабости, снижение потери веса, уменьшение роста молочной железы у мужчин, уменьшение сыпи на пальцах, уменьшение проблем свертываемости крови, уменьшение цирроза, уменьшение пауковидных кровеносных сосудов на коже, повышение абсорбции витаминов А и D, снижение роста опухоли, снижение объема опухоли, уменьшение головной боли, уменьшение жара, уменьшение диареии, уменьшение боли в области печени организма, уменьшение стула земляного или серого цвета, уменьшение зуда, уменьшение мочи темного цвета и уменьшение тошноты и рвоты. В некоторых вариантах реализации, показателем ингибирования экспрессии HBV может быть улучшение симптомов, обусловленных HBV-связанными состояниями, заболеваниями и расстройствами. В некоторых вариантах реализации, показателем ингибирования экспрессии HBV является уменьшение цирроза. В некоторых вариантах реализации, показателем ингибирования экспрессии HBV является уменьшение маркеров рака печени.

Гибридизация

В некоторых вариантах реализации, гибридизация происходит между антисмысловым соединением, описанным в настоящем документе, и нуклеиновой кислотой HBV. Наиболее общий механизм гибридизации включает водородное связывание (например, Уотсона-Крика, Хугстина или обратное водородное связывание Хугстина) между комплементарными нуклеооснованиями молекул нуклеиновых кислот.

Гибридизация может происходить при различных условиях. Обязательным условием является зависимость от последовательностей, и она определяется природой и составом молекул нуклеиновых кислот, подлежащих гибридизации.

Способы определения того, может ли определенная последовательность специфически гибридизоваться с целевой нуклеиновой кислотой, хорошо известны в данной области техники. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения, представленные в настоящем документе, могут специфически гибридизоваться с нуклеиновой кислотой HBV.

Комплементарностъ

Антисмысловое соединение и целевая нуклеиновая кислоты комплементарны друг другу, если достаточное количество нуклеооснований антисмыслового соединения может быть связано водородной связью с соответствующими нуклеооснованиями целевой нуклеиновой кислоты, так что возникает заданный эффект (например, антисмысловое ингибирование целевой нуклеиновой кислоты, такой как нуклеиновая кислота HBV).

Не комплементарные нуклеооснования между антисмысловым соединением и нуклеиновой кислотой HBV могут быть допустимы при условии, что антисмысловое соединение остается способным специфически гибридизоваться с целевой нуклеиновой кислотой. Более того, антисмысловое соединение может гибридизоваться в одном или нескольких сегментах нуклеиновой кислоты HBV, так что промежуточные или соседние сегменты не участвуют в гибридизации (например, петлевая структура, не совпадающая или шпилечная структура).

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, представленное в настоящем документе, или его определенная часть комплементарны или по меньшей мере на 70%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% комплементарны нуклеиновой кислоте HBV, целевой области, целевому сегменту или определенной их части. Процент комплементарности антисмыслового соединения с целевой нуклеиновой кислотой может быть определен стандартными способами.

Например, антисмысловое соединение, в котором 18 из 20 нуклеооснований указанного антисмыслового соединения комплементарны целевой области и, следовательно, будут специфически гибридизоваться, представляет 90 процентнов комплементарности. В этом примере оставшиеся не комплементарные нуклеооснования могут быть сгруппированы или перемежаться с комплементарными нуклеооснованиями, и не обязательно должны быть смежными друг с другом или с комплементарными нуклеооснованиями. Поэтому антисмысловое соединение длиной 18 нуклеооснований, имеющее четыре не комплементарных нуклеооснования, к которым примыкают две области полной комплементарности с целевой нуклеиновой кислотой, имеет общую комплементарность с целевой нуклеиновой кислотой 77,8%, и, следовательно, входит в рамки настоящего изобретения. Процент комплементарности антисмыслового соединения с областью целевой нуклеиновой кислоты может быть определен обычным способом с использованием программ BLAST (программ для обнаружения сходства последовательностей белков путем их локального выравнивания) и программ Power BLAST, известных в данной области техники (Altschul et al., J. Mol. Biol., 1990, 215, 403 410; Zhang and Madden, Genome Res., 1997, 7, 649 656). Процент гомологичности, идентичности или комплементарности последовательности может быть определен, например, программой Gap (Wisconsin Sequence Analysis Package, версия 8 для Unix, Genetics Computer Group, University Research Park, Мэдисон, штат Висконсин), с использованием настроек по умолчанию, в которых используется алогритм Smith and Waterman (Adv. Appl. Math., 1981, 2, 482 489).

В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение, представленное в настоящем документе, или определенная его часть полностью комплементарны (то есть на 100% комплементарны) целевой нуклеиновой кислоте или определенной ее части. Например, антисмысловое соединение может быть полностью комплементерно к нуклеиновой кислоте HBV, или ее целевой области, или целевому сегменту, или целевой последовательности. При использовании в настоящем документе, «полностью комплементарен» обозначает, что каждое нуклеооснование антисмыслового соединения может участвовать в точном спаривании оснований с соответствующими нуклеооснованиями целевой нуклеиновой кислоты. Например, антисмысловое соединение из 20 нуклеооснований полностью комплементарно целевой последовательности длиной 400 нуклеооснований, если существует соответствующая часть из 20 нуклеооснований целевой нуклеиновой кислоты, которая полностью комплементарна указанному антисмысловому соединению. Термин «полностью комплементарен» может быть использован также в отношении определенной части первой и/или второй нуклеиновой кислоты. Например, часть из 20 нуклеооснований антисмыслового соединения, состоящего из 30 нуклеооснований, может быть «полностью комплементарна» целевой последовательности длиной 400 нуклеооснований. Часть из 20 нулеооснований олигонуклеотида, состоящего из 30 нуклеооснований, полностью комплементерна целевой последовательности, если целевая последовательность имеет соответствующую часть из 20 нуклеооснований, в которой каждое нуклеооснование комплементарно части из 20 нуклеооснований указанного антисмыслового соединения. В то же время целое антисмысловое соединение из 30 нуклеооснований может быть или может не быть полностью комплементарным к целевой последовательности, в зависимости от того, являются ли оставшиеся 10 нуклеооснований антисмыслового соединения также комплементарными целевой последовательности.

Не комплементарное нуклеооснование может быть расположено у конца 5' или конца 3' антисмыслового соединения Альтернативно, не комплементарное нуклеооснование или нуклеооснования могут быть во внутреннем положении антисмыслового соединения. В случае наличия двух или более не комплементарных нуклеооснований, они могут быть смежными (то есть связанными) или не смежными. В одном варианте реализации, не комплементарное нуклеооснование расположено в сегменте крыла химерного антисмыслового олигонуклеотида.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения, которые имеют длину или которые содержат до 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 нуклеооснований, содержат не более 4, не более 3, не более 2 или не более 1 не комплементарного нуклеооснования(ий) относительно целевой нуклеиновой кислоты, такой как нуклеиновая кислота HBV, или ее определенная часть.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения, которые имеют длину или которые содержат до 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 или 30 нуклеооснований, содержат не более 6, не более 5, не более 4, не более 3, не более 2 или не более 1 не комплементарного нуклеооснования(ий) относительно целевой нуклеиновой кислоты, такой как нуклеиновая кислота HBV, или ее определенная часть.

Представленные антисмысловые соединения включают также те, которые комплементарны части целевой нуклеиновой кислоты. При использовании в настоящем документе, «часть» относится к определенному количеству смежных (то есть связанных) нуклеооснований в пределах области или сегмента целевой нуклеиновой кислоты. «Часть» может также относиться к определенному количеству смежных нуклеооснований антисмыслового соединения. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения комплементарны части целевого сегмента по меньшей мере из 8 нуклеооснований. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения комплементарны части целевого сегмента по меньшей мере из 9 нуклеооснований. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения комплементарны части целевого сегмента по меньшей мере из 10 нуклеооснований. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения комплементарны части целевого сегмента по меньшей мере из 11 нуклеооснований. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения комплементарны части целевого сегмента по меньшей мере из 12 нуклеооснований. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения комплементарны части целевого сегмента по меньшей мере из 13 нуклеооснований. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения комплементарны части целевого сегмента по меньшей мере из 14 нуклеооснований. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения комплементарны части целевого сегмента по меньшей мере из 15 нуклеооснований. Также подразумеваются антисмысловые соединения, которые комплементарны части целевого сегмента по меньшей мере из 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более нуклеооснований, или в диапазоне между любыми из двух этих значений.

Идентичность

Антисмыловые соединения, представленные в настоящем документе, также могут иметь определенный процент идентичности с определенной нуклеотидной последовательностью, SEQ ID NO или соединением, представленным номером Isis, или их частью. При использовании в настоящем документе, антисмысловое соединение является идентичным к последовательности, описанной в настоящем документе, если оно имеет такую же способность к спариванию нуклеооснований. Например, РНК, которая содержит урацил вместо тимидина в описанной последовательности ДНК, считается идентичной к этой последовательности ДНК, поскольку и урацил, и тимидин спариваются с аденином. Подразумеваются также укороченные и удлиненные версии антисмысловых соединений, описанных в настоящем документе, а также соединения, имеющие не идентичные основания по сравнению с антисмысловыми соединениями, представленными в настоящем документе. Не идентичные основания могут быть соседними друг к другу или рассредоточены в антисмысловом соединении. Процент идентичности антисмыслового соединения рассчитывают по количеству оснований, имеющих идентичное спаривание оснований, по сравнению с последовательностью, с которой его сравнивают.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения или их части являются по меньшей мере на 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичными к одному или нескольким антисмысловым соединениями или последовательностям SEQ ID NO, или их частям, описанным в настоящем документе.

В некоторых вариантах реализации, часть антисмыслового соединения сравнивают с частью целевой нуклеиновой кислоты такой же длины. В некоторых вариантах реализации сравнивают часть из 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 или 25 нуклеооснований с равной по длине частью целевой нуклеиновой кислоты.

В некоторых вариантах реализации, часть антисмыслового олигонуклеотида сравнивают с частью целевой нуклеиновой кислоты такой же длины. В некоторых вариантах реализации сравнивают часть из 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 или 25 нуклеооснований с равной по длине частью целевой нуклеиновой кислоты.

Модификации

Нуклеозид представляет собой комбинацию основания и сахара. Часть нуклеооснования (известная также как основание) нуклеозида, как правило, представляет собой фрагмент гетероциклического основания. Нуклеотиды представляют собой нуклеозиды, которые дополнительно включают фосфатную группу, ковалентно связанную с сахарной частью нуклеозида. Для тех нуклеозидов, которые включают пентафуранозный сахар, фосфатная группа может быть связана с 2', 3' или 5' гидроксильным фрагментом сахара. Олигонуклеотиды образуются посредством ковалентного связывания соседних нуклеозидов друг с другом с образованием линейного полимерного олигонуклеотида. В пределах олигонуклеотидной структуры, фосфатные группы обычно упоминают как образующие межнуклеозидные связи олигонуклеотида.

Модификации антисмысловых соединений включают замещения или изменения межнуклеозидных связей, сахарных фрагментов или нуклеооснований. Модифицированные антисмысловые соединения зачастую являются предпочтительными по сравнению с нативными формами за счет желательных свойств, таких как, например, усиленное клеточное поглощение, усиленная аффинность к целевой нуклеиновой кислоте, увеличенная устойчивость в присутствии нуклеаз или увеличенная ингибирующая активность.

Химически модифицированные нуклеозиды также могут быть использованы для увеличения связывающей аффинности укороченного или усеченного антисмыслового соединения к его целевой нуклеиновой кислоте. Следовательно, зачастую могут быть получены сравнимые результаты с укороченными антисмысловыми соединениями, которые имеют такие химически модифицированные нуклеозиды.

Модифицированные межнуклеозидные связи

Природная межнуклеозидная связь РНК и ДНК представляет собой фосфодиэфирную связь 3' с 5'. Антисмысловые соединения, имеющие одну или несколько модифицированных, то есть неприродных, межнуклеозидных связей, зачастую выбирают вместо антисмысловых соединений, имеющих природные межнуклеозидные связи из-за желательных свойств, таких как, например, усиленное клеточное полощение, усиленная аффиность к целевым нуклеиновым кислотам и увеличенная устойчивость в присутствии нуклеаз.

Олигонуклеотиды, имеющие модифицированные межнуклеозидные связи, включают межнуклеозидные связи, которые сохраняют атом фосфора, а также межнуклеозидные связи, которые не имеют атома фосфора. Иллюстративные межнуклеозидные связи, содержащие фосфор, включают, но не ограничиваясь этим, фосфодиэфиры, фосфотриэфиры, метилфосфонаты, фосфорамидаты и фосфотиоаты. Хорошо известны способы получения фосфоросодержащих и не фосфоросодержащих связей.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту HBV, содержат одну или несколько модифицированных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации, модифицированные межнуклеозидные связи представляют собой фосфотиоатные связи. В некоторых вариантах реализации, каждая межнуклеозидная связь антисмыслового соединения представляет собой фосфотиоатную межнуклеозидную связь.

Модифицированные сахарные фрагменты

Антисмысловые соединения, представленные в настоящем документе, могут необязательно содержать один или несколько нуклеозидов, в которых модифицирована сахарная группа. Такие нуклеозиды с модифицированным сахаром могут придавать улучшенную устойчивость к действию нуклеаз, увеличенную связывающую аффинность или какое-либо другое преимущественное биологическое свойство антисмысловым соединениям. В некоторых вариантах реализации, нуклеозиды включают химически модифицированный рибофуранозный кольцевой фрагмент.Примеры химически модифицированных рибофуранозных колец включают, без ограничения, добавление групп заместителей (включая 5' и 2' группы заместителей); связывание мостиком не геминальных кольцевых атомов с образованием бициклических нуклеиновых кислот (БцНК); замену рибозильного кольцевого кислородного атома на S, N(R) или C(R1)(R)2 (R=Н, С112 алкил или защитная группа); и их комбинации. Примеры химически модифицированных сахаров включают 2'-F-5'-метил-замещенный нуклеозид (смотри Международную заявку РСТ WO 2008/101157, опубликованную 8/21/08, где описаны другие 5', 2'-бис-замещенные нуклеозиды), замену рибозильного кольцевого кислородного атома на S с дополнительным замещением в 2'-положении (смотри опубликованную заявку на патент США US2005/0130923, опубликованную 16 июня 2005 года), или, альтернативно, 5'-замещение БцНК (смотри Международную заявку РСТ WO 2007/134181, опубликованную 11/22/07, в которой БНК замещена, например, 5'-метиловой или 5'-виниловой группой).

Примеры нуклеозидов, имеющих модифицированные сахарные фрагменты включают, без ограничения, нуклеозиды, включающие 5'-винил, 5'-метил (R или S), 4'-S, 2'-F, 2'-ОСН3 и 2'-O(СН2)2OCH3 группы заместителей. Заместитель в 2' положении также может быть выбран из аллила, амино, азидо, тио, O-аллила, O-C110 алкила, OCF3, O(СН2)2SCH3, O(CH2)2-O-N(Rm)(Rn) и O-CH2-C(=0)-N(Rm)(Rn), причем каждый Rm и Rn независимо представляет собой Н или замещенный или незамещенный C110 алкил.

При использовании в настоящем документе, «бициклические нуклеозиды» относятся к модифицированным нуклеозидам, содержащим бициклический сахарный фрагмент. Примеры бициклических нуклеозидов включают, без ограничения, нуклеозиды, содержащие мостик между 4' и 2' рибозильными кольцевыми атомами. В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения, представленные в настоящем документе, содержат один или несколько бициклических нуклеозидов, причем мостик содержит бициклический нуклеозид 4'-2'. Примеры таких бициклических нуклеозидов 4'-2' включают, но не ограничиваясь этим, нуклеозиды формул: 4'-(CH2)-O-2' (БНК); 4'-(CH2)-S-2'; 4'-(CH2)2-O-2' (ENA); 4'-СН(СН3)-O-2' (cEt) и 4'-СН(СН20СНз)-O-2', и их аналоги (смотри патент США 7399845, опубликованный 15 июля 2008 года; 4'-С(СН3)(СН3)-O-2', и его аналоги (смотри опубликованную Международную заявку РСТ W02009/006478, опубликованную 8 января 2009 года); 4'-СН2-N(ОСН3)-2', и его аналоги (смотри опубликованную Международную заявку РСТ WO 2008/150729, опубликованную 11 декабря 2008 года); 4'-СН2-O-N(СН3)-2' (смотри опубликованную заявку на патент США US 2004/0171570, опубликованную 2 сентября 2004 года); 4'-CH2-N(R)-O-2', причем R представляет собой Н, С112 алкил или защитную группу (смотри патент США 7427672, опубликованный 23 сентября 2008 года); 4'-СН2-С(Н)(СН3)-2' (смотри публикацию Chattopadhyaya, et al., J. Org. Chem., 2009, 74, 118-134); и 4'-СН2-С(=СН2)-2', и его аналоги (смотри опубликованную Международную заявку РСТ WO 2008/154401, опубликованную 8 декабря 2008 года). Также смотри, например: Singh et al., Chem. Commun., 1998, 4, 455-456; Koshkin et al., Tetrahedron, 1998, 54, 3607-3630; Wahlestedt et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2000, 97, 5633-5638; Kumar et al., Bioorg. Med. Chem. Lett., 1998, 8, 2219-2222; Singh et al., J. Org. Chem., 1998, 63, 10035-10039; Srivastava et al., J. Am. Chem. Soc., 129(26) 8362-8379 (Jul. 4, 2007); Elayadi et al., Curr. Opinion Invens. Drugs, 2001, 2, 558-561; Braasch et al., Chem. Biol., 2001, 8, 1-7; Orum et al., Curr. Opinion Mol. Ther., 2001, 3, 239-243; патенты США №№ U.S. 6670461, 7053207, 6268490, 6770748, 6794499, 7034133, 6525191, 7399845; опубликованный Международные заявки РСТ WO 2004/106356, WO 94/14226, WO 2005/021570 и WO 2007/134181; публикации патентов США №№US 2004/0171570, US 2007/0287831 и US 2008/0039618; и патенты США серийных №№12/129154, 60/989574, 61/026995, 61/026998, 61/056564, 61/086231, 61/097787 и 61/099844; а также Международный заявки РСТ №№PCT/US2008/064591, PCT/US2008/066154 и PCT/US2008/068922. Каждый из представленных выше бициклических нуклеозидов может быть получен с одним или несколькими стереохимическими конфигурациями сахара, включая, например, α-L-рибофуранозу и β-D-рибофуранозу (смотри Международную заявку РСТ PCT/DK98/00393, опубликованную 25 марта 1999 года как WO 99/14226).

В некоторых вариантах реализации, бициклические сахарные фрагменты БцНК нуклеозидов включают, но не ограничиваясь этим, соединения, имеющие по меньшей мере один мостик между положением 4' и 2' пентафуранозного сахарного фрагмента, причем такие мостики независимо содержат 1 или от 2 до 4 связанных групп, независимо выбранных из -[С(Ra)(Rb)]n-, -C(Ra)=C(Rb)-, -C(Ra)=N-, -C(=NRa)-, -C(=O)-, -C(=S)-, -O-, -Si(Ra)2-, -S(=O)x- и -N(Ra)-;

причем:

x равен 0, 1 или 2;

n равен 1, 2, 3 или 4;

каждый Ra и Rb независимо представляет собой Н, защитную группу, гидроксил, C2-C12 алкил, замещенный C112 алкил, C2-C12 алкенил, замещенный C112 алкенил, C2-C12 алкинил, замещенный C2-C12 алкинил, С520 арил, замещенный С520 арил, гетероциклический радикал, замещенный гетероциклический радикал, гетероарил, замещенный гетероарил, C5-C7 алициклический радикал, замещенный C5-C7 алициклический радикал, галоген, OJ1, NJ1J2, SJ1, N3, COOJ1, ацил (С(=O)-Н), замещенный ацил, CN, сульфонил (S(=O)2-J1) или сульфоксил (S(=O)2-J1); и

каждый J1 и J2 независимо представляет собой, Н, С112 алкил, замещенный C212 алкил, С2-C12 алкенил, замещенный С212 алкенил, C2-C12 алкинил, замещенный C2-C12 алкинил, C5-C20 арил, замещенный С520 арил, ацил (С(=O)-Н), замещенный ацил, гетероциклический радикал, замещенный гетероциклический радикал, C112 аминоалкил, замещенный C1-C12 аминоалкил или защитную группу.

В некоторых вариантах реализации, мостик бициклического сахарного фрагмента представляет собой -[C(Ra)(Rb)]n-, -[C(Ra)(Rb)]n-O-, -C(RaRb)-N(R)-O- или -C(RaRb)-O-N(R)-. В некоторых вариантах реализации, мостик представляет собой 4'-СН2-2', 4'-(СН2)2-2', 4'-(СН2)3-2', 4'-СН2-O-2', 4'-(СН2)2-O-2', 4'-CH2-O-N(R)-2' и 4'-CH2-N(R)-O-2'-, причем каждый R независимо представляет собой Н, защитную группу или C1-C12 алкил.

В некоторых вариантах реализации, бициклические нуклеозиды дополнительно определены по изомерной конфигурации. Например, нуклеозид, содержащий 4'-2' метиленокси-мостик, может быть в α-L конфигурации или β-D конфигурации. Ранее в антисмысловые олигонуклеотиды, демонстрирующие антисмысловую активность, были внедрены a-L-метиленокси (4'-СН2-O-2') БцНК (Frieden et al., Nucleic Acids Research, 2003, 21, 6365-6372).

В некоторых вариантах реализации, бициклические нуклеозиды включают, но не ограничиваясь этим, (А) α-L-метиленокси (4'-СН2-O-2') БцНК, (В) β-D-метиленокси (4'-СН2-O-2') БцНК, (С) этиленокси (4'-(СН2)2-O-2') БцНК, (D) аминоокси (4'-CH2-O-N(R)-2') БцНК, (Е) оксиамино (4'-CH2-N(R)-O-2') БцНК, (F) метил(метиленокси) (4'-СН(СН3)-O-2') БцНК, (G) метилен-тио (4'-СН2-S-2') БцНК, (Н) метилен-амино (4'-CH2-N(R)-2') БцНК, (I) метил-карбоциклические (4'-СН2-СН(СН3)-2') БцНК и (J) пропилен-карбоциклические (4'-(СН2)3-2') БцНК, изображенные ниже.

причем Вх представляет собой фрагмент основания, a R независимо представляет собой Н, защитную группу или C1-C12 алкил.

В некоторых вариантах реализации, бициклический нуклеозид имеет Формулу I:

причем:

Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания;

-Qa-Qb-Qc- представляет собой -CH2-N(Rc)-CH2-, -C(=O)-N(Rc)-CH2-, -CH2-O-N(Rc)-, -СН2-N(Rc)-O- или -N(Rc)-O-CH2;

Rc представляет собой C1-C12 алкил или амино-защитную группу; и

Та и Tb, каждый независимо, представляют собой Н, гидрокси-защитную группу, сопряженную группу, химически активную фосфорную группу, фосфорный фрагмент или ковалентное связывание со стабилизирующей средой.

В некоторых вариантах реализации, бициклический нуклеозид имеет Формулу II:

причем:

Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания;

Та и Tb, каждый независимо, представляют собой Н, гидрокси-защитную группу, сопряженную группу, химически активную фосфорную группу, фосфорный фрагмент или ковалентное присоединение к среде подложки;

Za представляет собой C16 алкил, С26 алкенил, C26 алкинил, замещенный C16 алкил, замещенный С36 алкенил, замещенный С26 алкинил, ацил, замещенный ацил, замещенный амид, тиол или замещенный тио.

В одном варианте реализации, каждая из замещенных групп независимо представляет собой моно- или полизамещенную группу с группами заместителей, независимо выбранными из галогена, оксо, гидроксила, OJc, NJcJd, SJc, N3, OC(=X)Jc и NJcC(=X)NJcJd, причем каждый Jc, Jd и Jc независимо представляют собой Н, C16 алкил ил изамещенный C16 алкил, и Х представляет собой О или NJc.

В некоторых вариантах реализации, бициклический нуклеозид имеет Формулу III:

причем:

Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания;

Та и Tb, каждый независимо, представляют собой Н, гидрокси-защитную группу, сопряженную группу, химически активную фосфорную группу, фосфорный фрагмент или ковалентное присоединение к среде подложки;

Zb представляет собой C16 алкил, С26 алкенил, С26 алкинил, замещенный C16 алкил, 5 замещенный C16 алкенил, замещенный С26 алкинил или замещенный ацил (С(=O)-). В некоторых вариантах реализации, бициклический нуклеозид имеет Формулу IV:

причем:

Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания;

Ta и Tb, каждый независимо, представляют собой Н, гидрокси-защитную группу, сопряженную группу, химически активную фосфорную группу, фосфорный фрагмент или ковалентное присоединение к среде подложки;

Rd представляет собой C16 алкил, замещенный C16 алкил, С26 алкенил, замещенный C16 алкенил, С26 алкинил или замещенный С26 алкинил;

каждый qa, qb, qc и qd независимо представляет собой Н, галоген, C16 алкил, замещенный С16 алкил, С26 алкенил, замещенный С26 алкенил, С26 алкинил или замещенный С26 алкинил, C16 алкоксил, замещенный C16 алкоксил, ацил, замещенный ацил, C16 аминоалкил или замещенный C16 аминоалкил;

В некоторых вариантах реализации, бициклический нуклеозид имеет Формулу V:

причем:

Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания;

Та и Tb, каждый независимо, представляют собой Н, гидрокси-защитную группу, сопряженную группу, химически активную фосфорную группу, фосфорный фрагмент или ковалентное присоединение к среде подложки;

qa, qb, qe и qf, каждый независимо, представляют собой водород, галоген, С112 алкил, замещенный C112 алкил, С212 алкенил, замещенный C2-C12 алкенил, C2-C12 алкинил, замещенный C2-C12 алкинил, C1-C12 алкокси, замещенный C1-C12 алкокси, OJj, SJj, SOJj, SO2Jj, NJjJk, N3, CN, C(=O)OJj, C(=O)NJjJk, C(=O)Jj, O-C(=O)NJjJk, N(H)C(=NH)NJjJk, N(H)C(=O)NJjJk или N(H)C(=S)NJjJk;

или qe и qf вместе представляют собой =C(qg)(qh);

qg и qh, каждый независимо, представляют собой Н, галоген, C112 алкил или замещенный C1-C12 алкил.

Были описаны синтез и получение метиленокси (4'-СН2-O-2') БцНК мономеров аденина, цитозина, гуанина, 5-метил-цитозина, тимина и урацила, а также их олигомеризация и свойства распознавания нуклеиновых кислот (смотри, например, Koshkin et al., Tetrahedron, 1998, 54, 3607-3630). БцНК и их получение описаны также в WO 98/39352 и WO 99/14226.

Также были получены аналоги метиленокси (4'-СН2-O-2') БцНК, метиленокси (4'-СН2-O-2') БцНК и 2'-тио-БцНК (смотри, например, Kumar et al., Bioorg. Med. Chem. Lett., 1998, 8, 2219-2222). Было описано также получение блокированных нуклеозидных аналогов, включающих олигодезоксирибонуклеотидные дуплексы в качестве субстратов для полимераз нуклеиновых кислот (смотри, например, Wengel et al., WO 99/14226). Кроме того, в данной области техники описан синтез 2'-амино-БцНК, нового конформационно ограниченного олигонуклеотидного аналога с высокой аффинностью (смотри, например, Singh et al., J. Org. Chem., 1998, 63, 10035-10039). Кроме того, ранее были описаны 2'-амино- и 2'-метиламино-БцНк, а также термическая устойчивость их дуплексов с комплементарными цепями РНК и ДНК.

В некоторых вариантах реализации, бициклический нуклеозид имеет Формулу VI:

причем:

Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания;

Та и Tb, каждый независимо, представляют собой Н, гидрокси-защитную группу, сопряженную группу, химически активную фосфорную группу, фосфорный фрагмент или ковалентное присоединение к среде подложки;

каждый qi, qj, qk и qj независимо, представляет собой Н, галоген, C1-C12 алкил, замещенный C1-C12 алкил, С212 алкенил, замещенный С212 алкенил, C2-C12 алкинил, замещенный C2-C12 алкинил, C1-C12 алкоксил, замещенный C1-C12 алкоксил, OJj, SJj, SOJj, SO2Jj, NJjJk, N3, CN, C(=O)OJj, C(=O)NJjJk, C(=O)Jj, O-C(=O)NJjJk, N(H)C(=NH)NJjJk, N(H)C(=0)NJjJk или N(Н)С(=S)NJjJk; и

qi и qj иди qi и qk вместе представляют собой =C(qg)(qh), причем qg и qh, каждый независимо, представляют собой Н, галоген, C1-C12 алкил или замещенный C1-C12 алкил.

Описан один карбоциклический бициклический нуклеозид, имеющий мостик 4'-(СН2)3-2', и алкениловый аналог, мостик 4'-СН=СН-СН2-2' (смотри, например, Freier et al., Nucleic Acids Research, 1997, 25(22), 4429-4443 и Albaek et al., J. Org. Chem., 2006, 71, 7731-7740). Также был описан синтез и получение карбоциклических бициклических нуклеозидов, их олигомеризация и биохимические исследования (смотри, например, Srivastava et al., J. Am. Chem. Soc. 2007, 129(26), 8362-8379).

При использовании в настоящем документе, «бициклический нуклеозид» относится к нуклеозиду, содержащему мостиковое соединение двух атомов углерода сахарного кольца, с образованием посредством этого бициклического сахарного фрагмента. В некоторых вариантах реализации, мостик соединяет 2' углерод и другой углерод сахарного кольца.

При использовании в настоящем документе, «4'-2' бициклический нуклеозид» или «4'-2' бициклический нуклеозид» относится к бициклическому нуклеозиду, содержащему фуранозное кольцо, содержащее мостиковое соединение 2' углеродного атома и 4' углеродного атома.

При использовании в настоящем документе, «моноциклические нуклеозиды» относятся к нуклеозидам, содержащим модифицированные сахарные фрагменты, которые не являются бициклическими сахарными фрагментами. В некоторых вариантах реализации, сахарный фрагмент или аналог сахарного фрагмента нуклеозида может быть модифицированным или замещенным в любом положении.

При использовании в настоящем документе, «2'-модифицированный сахар» обозначает фуранозный сахар, модифицированный в 2'-положении. В некоторых вариантах реализации, такие модификации включают заместители, выбранные из: галогенида, включая, но не ограничиваясь этим, замещенный и незамещенный алкокси, замещенный и незамещенный тиоалкил, замещенный и незамещенный аминоалкил, замещенный и незамещенный алкил, замещенный и незамещенный аллил, и замещенный и незамещенный алкинил. В некоторых вариантах реализации, 2'-модификации выбраны из заместителей, включающих, но не ограничиваясь этим: O[(СН2)nO]mCH3, O(CH2)nNH2, O(СН2)nCH3, O(CH2)nONH2, ОСН2С(=O)n(Н)СН3 и O(СН2)nO|N[(СН2)nCH3]2, причем пит равны от 1 до около 10. Другие группы 2'-заместителей также могут быть выбраны из: C1-C12 алкила; замещенного алкила; алкенила; алкинила; алкарила; аралкила; O-алкарила или O-аралкила; SH; SCH3; OCN; Cl; Br; CN; CF3; OCF3; SOCH3; SO2CH3; ONO2; NO2; N3; NH2; гетероциклоалкила; гетероциклоалкарила; аминоалкиламино; полиалкиламино; замещенного силила; РНК-расщепляющей группы; репортерной группы; интеркалятора; групп для улучшения фармакокинетических свойств; и групп для улучшения фармакодинамических свойств антисмыслового соединения, а также других заместителей, имеющих аналогичные свойства. В некоторых вариантах реализации, модифицированные нуклеозиды включают боковую цепь 2'-МОЕ (смотри, например. Baker et al., J. Biol. Chem., 1997, 272, 11944-12000). Такое 2'-МОЕ замещение может быть описано как обладающее улучшенной связывающей аффинностью по сравнению с не модифицированными нуклеозидами и с другими модифицированными нуклеозидами, такими как 2'-O-метил, O-пропил и O-аминопропил. Было также показано, что олигонуклеотиды, имеющие заместитель 2'-МОЕ, являются антисмысловыми ингибиторами генной экспрессии с многообещающими характеристиками для применения in vivo (смотри, например, Martin, P., Helv. Chim. Acta, 1995, 78, 486-504; Altmann et al., Chimia, 1996, 50, 168-176; Altmann et al., Biochem. Soc. Trans., 1996, 24, 630-637; и Altmann et al., Nucleosides Nucleotides, 1997, 16, 917-926).

При использовании в настоящем документе, «модифицированный тетрагидропирановый нуклеозид» или «модифицированный ТГП нуклеозид» обозначает нуклеозид, имеющий шестичленный тетрагидропирановый «сахар», замещающий пентафуранозный остаток в нормальных нуклеозидах (заменитель сахара). Модифицированные ТГП нуклеозиды включают, но не ограничиваясь этим, так называемые гекситоловые нуклеиновые кислоты (ГНК), анитоловые нуклеиновые кислоты (АНК), маннитоловые нуклеиновые кислоты (МНК) (смотри Leumann, CJ. Bioorg. & Med. Chem. (2002) 10:841-854), фтор-ГНК (F-ГНК) или соединения, имеющие Формулу X:

Формула X:

причем независимо для каждого из упомянутого по меньшей мере одного тетрагидропиранового нуклеозидного аналога Формулы X:

Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания;

Т3 и Т4, каждый независимо, межнуклеозидная связывающая группа, связывающая тетрагидропирановый нуклеозидный аналог с антисмысловым соединением или одним из Т3 и Т4, представляет собой межнуклеозидную связывающую группу, связывающую тетрагидропирановый нуклеозидный аналог с антисмысловым соединением, а другой из Т3 и Т4 представляет собой Н, гидрокси-защитную группу, связанную сопряженную группу или 5' или 3'-концевую группу;

q1, q2, q3, q4, q5, q6 и q7, каждый независимо, представляет собой, Н, C16 алкил, замещенный C16 алкил, С26 алкенил, замещенный С26 алкенил, С26 алкинил или замещенный С26 алкинил; и

один из R1 и R2 представляет собой водород, а другой выбран из галогена, замещенного или незамещенного алкокси, NJ1J2, SJ1, N3, OC(=X)J1, ОС(=Х)NJ1J2, NJ3C(=X)NJ1J2 и CN, причем X представляет собой О, S или NJ1, и каждый J1, J2 и J3 независимо представляет собой Н или C16 алкил.

В некоторых вариантах реализации, представлены модифицированные ТГП нуклеозиды Формулы X, в которых каждый qm, qn, qp, qr, qs, qt и qu представляет собой Н. В некоторых вариантах реализации по меньшей мере один из qm, qn, qp, qr, qs, qt и qu является отличным от Н. В некоторых вариантах реализации, по меньшей мере один из qm, qn, qp, qr, qs, qt и qu представляет собой метил. В некоторых вариантах реализации представлены ТГП нуклеозиды Формулы X, в которых один из R1 и R2 представляет собой F. В некоторых вариантах реализации R1 представляет собой фтор, a R2 представляет собой Н, R1 представляет собой метокси, а R2 представляет собой Н, и R1 представляет собой метоксиэтокси, а R2 представляет собой Н.

При использовании в настоящем документе, «2'-модифицированный нуклеозид» или «2'-замещенный нуклеозид» относится к нуклеозиду, включающему сахар, содержащий заместитель в 2'-положении фуранозного кольца, отличный от Н или ОН. 2'-модифицированные нуклеозиды включают, но не ограничиваясь этим, бициклические нуклеозиды, в которых мостик, соединяющий два углеродных атома сахароного кольца, соединяет 2' углерода и другой углерод сахарного кольца, а также нуклеозиды с немостиковыми 2' заместителями, такими как аллил, амино, азидо, тио, O-аллил, O-C1-C10 алкил, -OCF3, O-(СН2)2-O-СН3, 2'-O(СН2)2SCH3, O-(CH2)2-O-N(Rm)(Rn) или O-СН2-С(=O)-N(Rm)(Rn), причем каждый Rm и Rn независимо представляет собой Н или замещенный или незамещенный C110 алкил. 2'-модифицированные нуклеозиды могут дополнительно содержать другие модификации, например, в других положениях сахара и/или в нуклеоосновании.

При использовании в настоящем документе, «2'-F» относится к сахару, содержащему фтор-группу в 2'-положении.

При использовании в настоящем документе, «2'-ОМе» или «2'-ОСН3», или «2'-O-метил», каждый относится к нуклеозиду, включающему сахар, содержащий группу -ОСН3 в 2'-положении сахарного кольца.

При использовании в настоящем документе, «олигонуклеотид» относится к соединению, содержащему множество связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации, один или несколько из множества нуклеозидов являются модифицированными. В некоторых вариантах реализации, олигонуклеотид содержит один или несколько рибонуклеозидов (РНК) и/или дезоксирибонуклеозидов (ДНК).

В данной области техники известны многие другие бициклические и трициклические кольцевые системы, заменяющие сахар, которые могут быть использованы для модификации нуклеозидов для внедрения в антисмысловые соединения (смотри, например, обзорную статью: Leumann, J.С, Bioorganic & Medicinal Chemistry, 2002, 10, 841-854). Такие кольцевые системы могут подвергаться различным дополнительным замещениям для усиления активности.

Специалистам в данной области хорошо известны способы получения модифицированных сахаров.

В нуклеотидах, имеющих модифицированные сахарные фрагменты, фрагменты нуклеооснования (природные, модифицированные или их комбинации) сохраняются для гибридизации с соответствующей мишенью нуклеиновой кислоты.

В некоторых вариантах реализации, антисмысловые соединения содержат один или несколько нуклеотидов, имеющих модифицированные сахарные фрагменты. В некоторых вариантах реализации, модифицированный сахарный фрагмент представляет собой 2'-МОЕ. В некоторых вариантах реализации, 2'-МОЕ модифицированные нуклеотиды расположены в мотиве химерного олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации, модифицированный сахарный фрагмент представляет собой cEt. В некоторых вариантах реализации cEt модифицированные нуклеотиды расположены в крыльях мотива химерного олигонуклеотида.

Композиции и способы составления фармацевтических композиций

Антисмысловые олигонуклеотиды могут быть смешаны с фармацевтически приемлемыми активными или инертными веществами для получения фармацевтических композиций или рецептур. Композиции и способы составления фармацевтических композиций зависят от ряда критериев, включая, но не ограничиваясь этим, способ введения, степень заболевания или дозу, подлежащую введению.

Антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, может быть использовано в фармацевтических композициях путем смешивания указанного антисмыслового соединения с соответствующим фармацевтически приемлемым разбавителем или носителем. Фармацевтически приемлемый разбавитель включает фосфатно-солевой буферный раствор (PBS). PBS представляет собой разбавитель, пригодный для применения в композициях, доставляемых парентерально. Соответственно, в одном варианте реализации, используемом в способах, описанных в настоящем документе, представлена фармацевтическая композиция, включающая антисмысловое соединение, направленное на нуклеиновую кислоту HBV, и фармацевтически приемлемый разбавитель. В некоторых вариантах реализации, фармацевтически приемлемый разбавитель представляет собой PBS. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение представляет собой антисмысловый олигонуклеотид.

Фармацевтические композиции, включающие антисмысловые соединения, охватывают любые фармацевтически приемлемые соли, сложные эфиры или соли таких сложных эфиров, или любые другие олигонуклеотиды, которые, при введении животному, включая человека, могут обеспечивать (прямо или косвенно) биологически активный метаболит или его остаток. Соответственно, например, настоящее описание относится также к фармацевтически приемлемым солям антисмысловых соединений, пролекарствам, фармацевтически приемлемым солям таких пролекарств и другим биоэквивалентам. Применимые фармацевтически приемлемые соли включают, но не ограничиваясь этим, соли натрия и калия.

Пролекарство может включать внедрение дополнительных нуклеозидов с одного или с обоих концов антисмыслового соединения, которые расщепляются под действием эндогенных нуклеаз в организме, с образованием активного антисмыслового соединения.

Сопряженные антисмысловые соединения

Антисмысловые соединения могут быть ковалентно связаны с одним или несколькими фрагментами или конъюгатами, которые усиливают активность, клеточное распределение или клеточное поглощение образующихся антисмысловых олигонуклеотидов. Типичные сопряженные группы включают холестериновые фрагменты и жировые фрагменты. Дополнительные сопряженные группы включают углеводы, фосфолипиды, биотин, феназин, фолат, фенантридин, антрахинон, акридин, флуоресцеины, родамины, кумарины и красители.

Антисмысловые соединения могут быть также модифицированы для получения одной или нескольких стабилизирующих групп, которые обычно присоединяются к одному или к обоим концам антисмысловых соединений для усиления свойств, таких как, например, устойчивость к действию нуклеаз. В стабилизирующие группы включены кэп-структуры. Эти концевые модификации защищают антисмысловое соединение, имеющее концевую нуклеиновую кислоту, от экзонуклеазного расщепления, и могут способствовать доставке и/или локализации в клетке. Кэп может присутствовать на 5'-конце (5'-кэп) или на 3'-конце (3'-кэп), или может присутствовать на обоих концах. Кэп-структуры хорошо известны в данной области и включают, например, инвертированные дезокси-кэпы с удаленными азотистыми основаниями. Дополнительные 3' и 5'-стабилизирующие группы, которые могут быть использованы для закрывания одного или обоих концов антисмыслового соединения, чтобы обеспечить устойчивость к действию нуклеаз, включают группы, описанные в WO 03/004602, опубликованной 16 января 2003 года.

Клеточная культура и обработка антисмысловыми соединениями

Влияние антисмысловых соединений на уровень, активность или экспрессию нуклеиновых кислот HBV может быть испытана in vitro в различных типах клеток. Клеточные, используемые для таких анализов, доступны в продаже у коммерческих поставщиков (например, American Type Culture Collection, Manassus, штат Вирджиния; Zen-Bio, Inc., Research Triangle Park, штат Северная Калифорния; Clonetics Corporation, Walkersville, штат Мэриленд), и их выращивают в соответствии с инструкциями поставщика с использованием имеющихся в продаже реактивов (например, Invitrogen Life Technologies, Carlsbad, штат Калифорния). Иллюстративные клеточные типы включают, но не ограничиваясь этим, клетки HuVEC, клетки b.END, клетки HepG2, клетки Нер3В и первичные гепатоциты.

In vitro испытание антисмысловых олигонуклеотидов

В настоящем документе описаны способы обработки клеток антисмысловыми олигонуклеотидами, которые могут быть модифицированы соответствующим образом для обаботки другими антисмысловыми соединениями.

Клетки могут быть обработаны антисмысловыми олигонуклеотидами, когда клетки достигают примерно 60-80% слияния в культуре.

Один реагент, которые обычно используют для введения антисмысловых олигонуклеотидов в выращенные клетки, включает катионный липидный реагент трансфекции LIPOFECTIN (Invitrogen, Карлсбад, штат Калифорния). Антисмысловые олигонуклеотиды могут быть смешаны с LIPOFECTIN в среде OPTI-MEM 1 (Invitrogen, Карлсбад, штат Калифорния) для достижения заданной конечной концентрации антисмыслового олигонуклеотида и концентрации LIPOFECTIN, которая может находиться в диапазоне от 2 до 12 мкг/мл на 100 нМ антисмыслового олигонуклеотида.

Другой реагент, используемый для введения антисмысловых олигонуклеотидов в выращенные клетки, включает LIPOFECTAMINE (Invitrogen, Карлсбад, штат Калифорния). Антисмысловый олигонуклеотид может быть смешан с LIPOFECTAMINE в среде OPTI-MEM 1 с пониженным содержанием сыворотки (Invitrogen, Карлсбад, штат Калифорния) для достижения заданной концентрации антисмыслового олигонуклеотида и концентрации LIPOFECTAMINE, которая может находиться в диапазоне от 2 до 12 мкг/мл на 100 нМ антисмыслового олигонуклеотида.

Другие методики, используемые для введения антисмысловых олигонуклеотидов в выращенные клетки, включают электропорацию.

Клетки обрабатывают антисмысловыми олигонуклеотидами стандартами способами. Клетки могут быть собраны через 16-24 часа после обработки антисмысловым олигонуклеотидов, и в это время измеряют уровни РНК или белка целевых нуклеиновых кислот по способам, известным в данной области техники и описанным в настоящем документе. Как правило, при выполнении обработки в нескольких экземплярах, данные представляют как среднее значение повторных обработок.

Используемая концентрация антисмыслового олигонуклеотида варьируется от одной клеточной линии к другой. Способы определения оптимальной концентрации антисмыслового олигонуклеотида для конкретной клеточной линии хорошо известны в данной области. Антисмысловые олигонуклеотиды, как правило, используют в концентрациях от 1 нМ до 300 нМ, при трансфекции с LIPOFECTAMINE. Антисмысловые олигонуклеотиды использую в более высоких концентрациях, от 625 до 20000 нМ, при трансфекции при помощи электропорации.

Выделение РНК

Анализ РНК может быть выполнен на общей клеточной РНК или поли(А)+мРНК. В данной области техники известны способы выделения РНК. РНК готовят с использованием способов, хорошо известных в данной области, например, используя реагент TRIZOL (Invitrogen, Карлсбад, штат Калифорния) по методикам, рекомендованным производителем.

Анализ ингибированш уровней или экспрессии мишени

Ингибирование уровней или экспрессии нуклеиновой кислоты HBV может быть анализировано различными способами, известными в данной области. Нарпимер, уровни целевой нуклеиновой кислоты могут быть количественно определены, например, нозерн-блоттингом, сравнительной полимеразной цепной реакцией (ПЦР) или количественной ПЦР в реальном времени. Анализ РНК может быть выполнен на общей клеточной РНК или поли(А)+мРНК. Способы выделения РНК хорошо известны в данной области. Анализ нозерн-блоттинга также является стандартным в данной области. Количественная ПЦР в реальном времени может быть легко осуществлена с использованием имеющейся в продаже системы обнаружения последовательностей ABI PRISM 7600, 7700 или 7900 производства PE-Applied Biosystems, Фостер-сити, штат Калифорния, которую используют в соответствии с инструкциями производителя.

Количественный анализ ПЦР в реальном времени уровней целевой РНК

Количественное определение уровней целевой РНК может быть осуществлено количественной ПЦР в реальном времени с использованием системы обнаружения последовательностей ABI PRISM 7600, 7700 или 7900 (PE-Applied Biosystems, Фостер-сити, штат Калифорния) по инструкциям производителя. Способы количественной ПЦР в реальном времени хорошо известны в данной области техники.

Перед ПЦР в реальном времени, выделенную РНК подвергают реакции с обратной транскриптазой (RT), в результате чего образуется комплементарная ДНК (кДНК), которую затем используют как субстрат для амплификации ПЦР в реальном времени. Реакции RT и ПЦР в реальном времени выполняют последовательно в одной и той же лунке с образцом. Реактивы для RT и ПЦР в реальном времени можно приобрести у компании Invitrogen (Карлсбад, штат Калифорния). Реакции RT и ПЦР в реальном времени выполняют по способам, хорошо известным специалистам в данной области.

Количества целевого гена (или РНК), полученные по ПЦР в реальном времени, нормализуют с использованием уровня экспрессии гена, экспрессия которого является постоянной, такого как циклофилин А, или количественным определением общей РНК, используя RIBOGREEN (Invitrogen Inc., Карлсбад, штат Калифорния). Экспрессию циклофилина А количественно определяют по ПЦР в реальном времени, которую осуществляют одновременно с мишенью, поочередно или отдельно. Общую РНК количественно определяют с использованием реагента для количественного определения РНК RIBOGREEN (Invetrogen Inc., Юджин, штат Орегон). Способы количественного определения РНК при помощи RIBOGREEN описаны в публикации Jones, L.J., et al., (Analytical Biochemistry, 1998, 265, 368-374). Для измерения флуоресценции RIBOGREEN используют прибор CYTOFLUOR 4000 (РЕ Applied Biosystems).

Образцы и праймеры предназначены для гибридизации с нуклеиновой кислотой HBV. Способы разработки образцов и праймеров для ПЦР в реальном времени хорошо известны в данной области, и могут включать применение программного обеспечения, такого как программа PRIMER EXPRESS (Applied Biosystems, Фостер-сити, штат Калифорния).

Количественный анализ ПЦР в реальном времени уровней целевой ДНК

Количественное определение уровней целевой ДНК может быть осуществлено количественной ПЦР в реальном времени с использованием системы обнаружения последовательностей ABI PRISM 7600, 7700 или 7900 (PE-Applied Biosystems, Фостер-сити, штат Калифорния) по инструкциям производителя. Способы количественной ПЦР в реальном времени хорошо известны в данной области техники.

Количества целевого гена (или ДНК), полученные по ПЦР в реальном времени, нормализуют с использованием уровня экспрессии гена, экспрессия которого является постоянной, такого как циклофилин А, или количественным определением общей ДНК, используя RIBOGREEN (Invitrogen Inc., Карлсбад, штат Калифорния). Экспрессию циклофилина А количественно определяют по ПЦР в реальном времени, которую осуществляют одновременно с мишенью, поочередно или отдельно. Общую ДНК количественно определяют с использованием реагента для количественного определения РНК RIBOGREEN (Invetrogen Inc., Юджин, штат Орегон). Способы количественного определения ДНК при помощи RIBOGREEN описаны в публикации Jones, L.J., et al., (Analytical Biochemistry, 1998, 265, 368-374). Для измерения флуоресценции RIBOGREEN используют прибор CYTOFLUOR 4000 (РЕ Applied Biosystems).

Образцы и праймеры предназначены для гибридизации с нуклеиновой кислотой HBV. Способы разработки образцов и праймеров для ПЦР в реальном времени хорошо известны в данной области, и могут включать применение программного обеспечения, такого как программа PRIMER EXPRESS (Applied Biosystems, Фостер-сити, штат Калифорния).

Анализ уровней белка

Антисмысловое ингибирование нуклеиновых кислот HBV может быть определено измерением уровней белка HBV. Уровни белка HBV могут быть оценены или количественно определены различными способами, хорошо известными в данной области, такими как иммунопреципитация, анализ вестерн-блоттинга (иммуноблоттинг), иммуноферментный твердофазный анализ (ELISA), количественные анализы белка, анализы активности белка (например, анализы активности каспазы), иммуногистохимия, иммуноцитохимия или сортировка флуоресцентно-активированных клеток (FACS). Антитела, направленные на мишень, могут быть идентифицированы и получены из различных источников, таких как каталог антител MSRS (Aerie Corporation, Бирмингем, штат Мичиган), или могут быть получены стандартными способами получения моноклональных или поликлональных антител, хорошо известными в данной области.

In vivo исследование антисмысловых соединений

Антисмысловые соединения, например, антисмысловые олигониклеотиды, испытывают на животных для оценки их способности ингибировать экспрессию HBV и вызывать фенотипические изменения. Испытание может быть выполнено на здоровых животных или в экспериментальных моделях заболеваний. Для введения животным, антисмысловые олигонуклеотиды составляют в композицию в фармацевтически приемлемом разбавителе, таком как фосфатно-солевой буферный раствор. Введение включает парентеральные пути введения, такие как внутрибрюшинное, внутривенное, подкожное, интратекальное и интрацеребровентрикулярное. Расчет дозы антисмыслового олигонуклеотида и частоты доз находится в рамках возможностей специалистов в данной области и зависит от таких факторов, как способ введения и вес тела животного. После периода обработки антисмысловыми олигонуклеотидами, РНК выделяют из печеночной ткани и измеряют изменения экспрессии нуклеиновой кислоты HBV. Измеряют также изменения уровней ДНК HBV. Измеряют также изменения уровней белка HBV. Измеряют также изменения уровней HBeAg HBV. Измеряют также изменения уровней HBsAg HBV.

Некоторые показания

В некоторых вариантах реализации, в настоящем документе представлены способы, соединения и композиции для лечения пациента, включающие введение одной или нескольких фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, пациент страдает HBV-связанным состоянием. В некоторых вариантах реализации, хроническая инфекция HBV, воспаление, фиброз, цирроз, рак печени, серозный гепатит, желтуха, рак печени, воспаление печени, фиброз печени, цирроз печени, печеночная недостаточность, диффузное гепатоцеллюлярное воспалительное заболевание, гепофагоцитарный синдром, серозный гепатит и виремия HBV. В некоторых вариантах реализации, HBV-связанное состояние может включать любое или все из следующих: болезнь, похожую на грипп, слабость, боли, головную боль, жар, потерю аппетита, диарею, желтуху, тошноту и рвоту, боль в области печени, стул земляного или серого цвета, зуд по всему телу и мочу темного цвета, в сочетании с положительным тестом на присутствие вируса гепатита В, вирусного антигена гепатита В или положительным тестом на присутствие антитела, специфичного к вирусному антигену гепатита В. В некоторых вариантах реализации, пациент имеет риск HBV-связанного состояния. Сюда входят пациенты, имеющие один или несколько факторов риска для развития HBV-связанного состояния, включая половые отношения с пациентом, инфицированным вирусом гепатита В, проживание в одном доме с пациентом с хронической инфекцией вируса гепатита В, воздействие крови человека, инфицированного вирусом гепатита В, инъекция запрещенных лекарств, заболевание гемофилией и посещение мест распространения гепатита В. В некоторых вариантах реализации, пациента определяют как нуждающегося в лечении HBV-связанного состояния. В некоторых вариантах реализации, в настоящем документе представлены способы профилактического снижения экспрессии HBV у пациента. Некоторые варианты реализации включают лечение пациента, нуждающегося в этом, путем введения пациенту терапевтически эффективного количества антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV.

За счет пересечения путей передачи, многие люди подвергаются воздействию вируса гепатита В (HBV) и вируса гепатита С (HCV), и меньшая часть является хронически инфицированной обоими вирусами, особенно в таких регионах, как Азия, где HBV является эндемичным. По оценкам, до 10% людей с HCV могут также страдать HBV, тогда как, вероятно, 20% людей с HBV инфицированы также HCV. Однако лечение гепатита В или гепатита В у пациентов, инфицированных одновременно HBV-HCV, не было хорошо изучено. Лечение усложняется тем фактом, что HCV и HBV ингибируют репликацию друг друга (хотя это взаимодействие наблюдалось не во всех исследованиях). Следовательно, лечение, которое полностью подавляет HBV, может потенциально снижать рецидив HCV или наоборот. Поэтому соединения и композиции, описанные в настоящем документе, могут быть преимущественно использованы для лечения пациентов, инфицированных одновременно HBV и HCV. Примеры возможностей лечения гепатита С (HCV) включают интерфероны, например, интерферон-альфа-2b, интерферон альфа-2а и интерферон альфакон-1. Более редкая частота дозирования интерферона может быть достигнута при использовании пегилированного интерферона (интерферона, присоединенного к полиэтиленгликольному фрагменту, что улучшает его фармакокинетический профиль). Было также показано, что комплексная терапия с интерфероном альфа-2b (пегилированным и не пегилированным) и рибавирином является преимущественной для некоторых групп пациентов. Другие средства, разработанные в настоящее время, включают ингибиторы репликации РНК HCV (например, серии VP50406 производства ViroPharma), антисмысловые агенты HCV, терапевтические вакцины HCV, ингибиторы протеазы HCV, ингибиторы геликазы HCV и терапию антителами HCV (моноклональными или поликлональными).

В некоторых вариантах реализации, лечение способами, соединениями и композициями, описанными в настоящем документе, применимо для предупреждения HBV-связанного состояния, обусловленного наличием вируса гепатита В. В некоторых вариантах реализации, лечение способами, соединениями и композициями, описанными в настоящем документе, применимо для предупреждения HBV-связанного состояния.

В одном варианте реализации, введение терапевтически эффективного количества антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV, сопровождается контролированием уровней мРНК HBV в сыворотке пациента для определения реакции пациента на введение антисмыслового соединения. В некоторых вариантах реализации, введение терапевтически эффективного количества антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV, сопровождается контролированием уровней ДНК HBV в сыворотке пациента для определения реакции пациента на введение антисмыслового соединения. В некоторых вариантах реализации, введение терапевтически эффективного количества антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV, сопровождается контролированием уровней белка HBV в сыворотке пациента для определения реакции пациента на введение антисмыслового соединения. В некоторых вариантах реализации, введение терапевтически эффективного количества антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV, сопровождается контролированием уровней антигена S HBV (HbsAg) в сыворотке пациента для определения реакции пациента на введение антисмыслового соединения. В некоторых вариантах реализации, введение терапевтически эффективного количества антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV, сопровождается контролированием уровней антигена Е HBV (HBeAg) в сыворотке пациента для определения реакции пациента на введение антисмыслового соединения. Реакцию пациента на введение антисмыслового соединения врач использует для определения количества и продолжительности терапевтического вмешательства.

В некоторых вариантах реализации, введение антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV, приводит к снижению экспрессии HBV по меньшей мере на 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95 или 99%, или в диапазоне, определенном двумя из этих значений. В некоторых вариантах реализации, введение антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV, приводит к уменьшению симптомов, связанных с HBV-связанным состоянием, и к снижению HBV-связанных маркеров в крови. В некоторых вариантах реализации, введение антисмыслового соединения HBV снижает уровни РНК HBV, уровни ДНК HBV, уровни белка HBV, уровни HBsAg или уровни HBeAg по меньшей мере на 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95 или 99%, или в диапазоне, определенном двумя из этих значений.

В некоторых вариантах реализации, фармацевтические композиции, содержащие антисмысловое соединение, направленное на HBV, используют для получения лекарственных средств для лечения пациента, страдающего или восприимчивого к HBV-связанному состоянию.

Некоторые комплексные терапии

В некоторых вариантах реализации, одну или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе, вводят совместно с одним или несколькими другими фармацевтическими средствами. В некоторых вариантах реализации, такое одно или несколько других фармацевтических средств предназначены для лечения того же заболевания, расстройства или состояния, что и одна или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, такое одно или несколько других фармацевтических средств предназначены для лечения другого заболевания, расстройства или состояния, чем одна или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, такое одно или несколько других фармацевтических средств предназначены для лечения нежелательного побочного действия одной или нескольких фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации, одну или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе, вводят совместно с другим фармацевтическим средством для лечения нежелательного действия этого другого фармацевтического средства. В некоторых вариантах реализации, одну или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе, вводят совместно с другим фармацевтическим средством для получения комбинационного эффекта. В некоторых вариантах реализации, одну или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе, вводят совместно с другим фармацевтическим средством для получения синергетического эффекта.

В некоторых вариантах реализации, одну или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе, и один или несколько других фармацевтических средств вводят одновременно. В некоторых вариантах реализации, одну или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе, и один или несколько других фармацевтических средств вводят в разное время. В некоторых вариантах реализации, одну или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе, и один или несколько других фармацевтических средств готовят вместе в одной композиции. В некоторых вариантах реализации, одну или несколько фармацевтических композиций, представленных в настоящем документе, и один или несколько других фармацевтических средств готовят по отдельности. В некоторых вариантах реализации, описанные антисмысловые олигонуклеотиды вводят в комбинации с HCV агентом. В следующих вариантах реализации, HCV соединение вводят одновременно с антисмысловым соединением; в других вариантах реализации, HCV соединение вводят отдельно; так, чтобы дозы HCV агента и антисмыслового соединения перекрывались, по времени, в организме пациента. В родственных вариантах реализации, агент HCV может быть выбран из интерферона альфа-2b, интерферона альфа-2а и интерферона альфакон-1 (пегилированного и не пегилированного); рибавирина; ингибитора репликации РНК HCV (например, серии VP50406 производства ViroPharma); антисмыслового агента HCV; терапевтической вакцины HCV; ингибитора протеазы HCV; ингибитора геликазы HCV; и терапии HCV антителами (моноклональными или поликлональными антителами).

В других вариантах реализации, антисмысловое соединение HBV настоящего изобретения может быть введено пациенту, инфицированному HBV, в комбинации с одним или несколькими HBV терапевтическими средствами, причем одно или несколько HBV терапевтических средств могут быть введены в той же лекарственной композиции, что и соединение антисмыслового олигонуклеотида HBV, или могут быть введены в отдельной композиции. Одно или несколько HBV терапевтических средств могут быть введены одновременно с соединением антисмыслового олигонуклеотида HBV, или могут быть введены отдельно, так, чтобы дозы соединения антисмыслового олигонуклеотида HBV и терапевтического агента HBV перекрывались, по времени, в организме пациента. В родственных вариантах реализации, одно или несколько HBV терапевтических средств могут быть выбраны из интерферона альфа-2b, интерферона альфа-2а и интерферона альфакон-1 (пегилированного и не пегилированного), рибавирина; ингибитора репликации РНК HBV; второго антисмыслового соединения HBV; терапевтической вакцины HBV; профилактической вакцины HBV; ламивудина (3ТС); энтекавира (ETV); тенофовира; телбивудина (LdT); адефовира; и терапии HBV антителами (моноклональными или поликлональными).

ПРИМЕРЫ

Исключение ограничения настоящего описания и включение путем ссылки

Хотя некоторые соединения, композиции и способы, описанные в настоящем документе, были описаны с особенностями в соответствии с некоторыми вариантами реализации, следующие примеры служат лишь для иллюстрации соединений, описанных в настоящем документе, и не предназначены для их ограничения. Каждая ссылка, цитируемая в настоящей заявке, включена в настоящий документ путем ссылки в полном объеме.

Пример 1: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК HBV в клетках HepG2.2.15 химерными олигонуклеотидами МОЕ

Антисмысловые олигонуклеотиды были разработаны для направленного действия на вирусную нуклеиновую кислоту HBV, и были испытаны на их действие на мРНК HBV in vitro. Культивированные клетки HepG2.2.15 при плотности 25000 клеток на лунку трансфицировали при помощи электропорации 15000 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Набор вирусных затравочных зондов RTS3370 (прямая последовательность CTTGGTCATGGGCCATCAG, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:2; обратная последовательность CGGCTAGGAGTTCCGCAGTA, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:3; последовательность зонда TGCGTGGAACCTTTTCGGCTCC, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:4) использовали для измерения уровней мРНК. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.

Новые разработанные химерные антисмысловые олигонуклеотиды в Таблице 1 разработали как 5-10-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды или 3-10-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды. 5-10-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по пять нуклеозидов. 3-10-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 17 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие три и 4 нуклеозида, соответственно. Каждый нуклеозид в 5' сегменте крыла, и каждый нуклеозид в 3' сегменте крыла имеет МОЕ модификацию сахара. Каждый нуклеозид в центральном сегменте гэп имеет дезокси-сахарную модификацию. Межнуклеозидные связи в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой фосфотиоатные (P=S) связи. Все цитозиновые остатки в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой 5-метилцитозины.

«Вирусный целевой сайт инициации» указывает 5'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. «Вирусный целевой терминирующий сайт» указывает 3'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. Колонка «мотив» указывает структуру гэп и крыльев каждого химерного олигонуклеотида. Каждый химерный олигонуклеотид, перечисленный в Таблице 1, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1 (доступ GENBANK №U95551.1).

Таблица 1 Ингибирование уровней мРНК HBV действием МОЕ химерных олигонуклеотидов, направленных на SEQ ID NO:1 Вирусный сайт инициации Вирусный терминирующий сайт ISIS № Последовательность Мотив % ингибирование SEQ ID NO 245 261 510088 CCACGAGTCTAGACTCT 3-10-4 55 5 250 266 510089 GTCCACCACGAGTCTAG 3-10-4 59 6 251 267 510090 AGTCCACCACGAGTCTA 3-10-4 60 7 252 268 510091 AAGTCCACCACGAGTCT 3-10-4 47 8 253 269 510092 GAAGTCCACCACGAGTC 3-10-4 59 9 254 270 510093 AGAAGTCCACCACGAGT 3-10-4 32 10 255 271 510094 GAGAAGTCCACCACGAG 3-10-4 41 11 256 272 510095 AGAGAAGTCCACCACGA 3-10-4 44 12 257 273 510096 GAGAGAAGTCCACCACG 3-10-4 54 13 258 274 510097 TGAGAGAAGTCCACCAC 3-10-4 57 14 384 400 510098 TGATAAAACGCCGCAGA 3-10-4 55 15 385 401 510099 ATGATAAAACGCCGCAG 3-10-4 59 16 411 427 510100 GGCATAGCAGCAGGATG 3-10-4 85 17 412 428 510101 AGGCATAGCAGCAGGAT 3-10-4 51 18 413 429 510102 GAGGCATAGCAGCAGGA 3-10-4 69 19 414 433 505330 AGATGAGGCATAGCAGCAGG 5-10-5 74 20 414 430 510103 TGAGGCATAGCAGCAGG 3-10-4 12 21 415 434 509928 AAGATGAGGCATAGCAGCAG 5-10-5 71 22 415 431 510104 ATGAGGCATAGCAGCAG 3-10-4 69 23 416 435 509929 GAAGATGAGGCATAGCAGCA 5-10-5 78 24 416 432 510105 GATGAGGCATAGCAGCA 3-10-4 69 25 417 436 509930 AGAAGATGAGGCATAGCAGC 5-10-5 72 26 417 433 510106 AGATGAGGCATAGCAGC 3-10-4 77 27 418 437 146783 AAGAAGATGAGGCATAGCAG 5-10-5 15 28 418 434 510107 AAGATGAGGCATAGCAG 3-10-4 69 29 419 435 510108 GAAGATGAGGCATAGCA 3-10-4 59 30 420 436 510109 AGAAGATGAGGCATAGC 3-10-4 0 31 421 437 510110 AAGAAGATGAGGCATAG 3-10-4 38 32 457 473 510111 ACGGGCAACATACCTTG 3-10-4 62 33 639 658 146784 CTGAGGCCCACTCCCATAGG 5-10-5 5 34 639 655 510112 AGGCCCACTCCCATAGG 3-10-4 44 35 640 656 510113 GAGGCCCACTCCCATAG 3-10-4 27 36 641 657 510114 TGAGGCCCACTCCCATA 3-10-4 44 37 642 658 510115 CTGAGGCCCACTCCCAT 3-10-4 52 38 687 706 509931 CGAACCACTGAACAAATGGC 5-10-5 89 39 687 703 510116 ACCACTGAACAAATGGC 3-10-4 89 40 688 704 510117 AACCACTGAACAAATGG 3-10-4 69 41

689 705 510118 GAACCACTGAACAAATG 3-10-4 63 42 690 706 510119 CGAACCACTGAACAAAT 3-10-4 74 43 738 754 510120 АССАСАТСАТССАТАТА 3-10-4 71 44 1176 1192 510121 TCAGCAAACACTTGGCA 3-10-4 73 45 1778 1797 509932 AATTTATGCCTACAGCCTCC 5-10-5 76 46 1778 1794 510122 TTATGCCTACAGCCTCC 3-10-4 76 47 1779 1798 509933 CAATTTATGCCTACAGCCTC 5-10-5 72 48 1779 1795 510123 TTTATGCCTACAGCCTC 3-10-4 75 49 1780 1799 509934 CCAATTTATGCCTACAGCCT 5-10-5 75 50 1780 1796 510124 ATTTATGCCTACAGCCT 3-10-4 73 51 1781 1800 509935 ACCAATTTATGCCTACAGCC 5-10-5 72 52 1781 1797 510125 AATTTATGCCTACAGCC 3-10-4 69 53 1782 1798 510126 CAATTTATGCCTACAGC 3-10-4 59 54 1783 1799 510127 CCAATTTATGCCTACAG 3-10-4 58 55 1784 1800 510128 ACCAATTTATGCCTACA 3-10-4 60 56 1822 1838 510129 AGGCAGAGGTGAAAAAG 3-10-4 47 57 1823 1839 510130 TAGGCAGAGGTGAAAAA 3-10-4 30 58 1865 1884 509936 GCACAGCTTGGAGGCTTGAA 5-10-5 39 59 1865 1881 510131 CAGCTTGGAGGCTTGAA 3-10-4 4 60 1866 1885 509937 GGCACAGCTTGGAGGCTTGA 5-10-5 35 61 1866 1882 510132 ACAGCTTGGAGGCTTGA 3-10-4 0 62 1867 1886 505370 AGGCACAGCTTGGAGGCTTG 5-10-5 36 63 1867 1883 510133 CACAGCTTGGAGGCTTG 3-10-4 12 64 1868 1887 509938 AAGGCACAGCTTGGAGGCTT 5-10-5 7 65 1868 1884 510134 GCACAGCTTGGAGGCTT 3-10-4 20 66 1869 1888 509939 CAAGGCACAGCTTGGAGGCT 5-10-5 36 67 1869 1885 510135 GGCACAGCTTGGAGGCT 3-10-4 22 68 1870 1889 505371 CCAAGGCACAGCTTGGAGGC 5-10-5 35 69 1870 1886 510136 AGGCACAGCTTGGAGGC 3-10-4 14 70 1871 1887 510137 AAGGCACAGCTTGGAGG 3-10-4 0 71 1872 1888 510138 CAAGGCACAGCTTGGAG 3-10-4 6 72 1873 1889 510139 CCAAGGCACAGCTTGGA 3-10-4 17 73 1918 1934 510140 GCTCCAAATTCTTTATA 3-10-4 59 74 2378 2397 509940 TCTGCGAGGCGAGGGAGTTC 3-10-4 10 75 2378 2394 510141 GCGAGGCGAGGGAGTTC 3-10-4 5 76 2379 2395 510142 TGCGAGGCGAGGGAGTT 3-10-4 0 77 2380 2396 510143 CTGCGAGGCGAGGGAGT 3-10-4 8 78 2381 2397 510144 TCTGCGAGGCGAGGGAG 3-10-4 17 79 2820 2836 510145 TTCCCAAGAATATGGTG 3-10-4 22 80 2821 2837 510146 GTTCCCAAGAATATGGT 3-10-4 11 81 2822 2838 510147 TGTTCCCAAGAATATGG 3-10-4 21 82

Пример 2: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК ИВУ в клетках HepG2.2.15 химерными олигонуклеотидами МОЕ

Дополнительные антисмысловые олигонуклеотиды были разработаны для направленного действия на вирусную нуклеиновую кислоту HBV, и были испытаны на их действие на мРНК HBV in vitro. Культивированные клетки HepG2.2.15 при плотности 25000 клеток на лунку трансфицировали при помощи электропорации 15000 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3370. RTS3370 обнаружил первичную мРНК и вторичные части транскриптов мРНК pre-S1, pre-S2 и pre-C. Химерные олигонуклеотиды испытали также с дополнительными наборами затравочных зондов. Набор вирусных затравочных зондов RTS3371 (прямая последовательность CCAAACCTTCGGACGGAAA, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:311; обратная последовательность TGAGGCCCACTCCCATAGG, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO: 312; последовательность зонда CCCATCATCCTGGGCTTTCGGAAAAT, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:313) также использовали для измерения уровней мРНК. RTS3371 обнаружил первичную мРНК и вторичные части транскриптов мРНК pre-S1, pre-S2 и pre-C, аналогичные RTS3370, но в других областях. Набор вирусных затравочных зондов RTS3372 (прямая последовательность ATCCTATCAACACTTCCGGAAACT, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:314; обратная последовательность CGACGCGGCGATTGAG, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:315; последовательность зонда AAGAACTCCCTCGCCTCGCAGACG, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:316) использовали для измерения уровней мРНК. RTS3372 обнарружил первичную геномную последовательность. Набор вирусных затравочных зондов RTS3373MGB (прямая последовательность CCGACCTTGAGGCATACTTCA, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:317; обратная последовательность AATTTATGCCTACAGCCTCCTAGTACA, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:318; последовательность зонда TTAAAGACTGGGAGGAGTTG, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:319) использовали для измерения уровней мРНК. RTS3373MGB обнаружил первичную мРНК и вторичные части транскриптов мРНК pre-S 1, pre-S2, pre-C и pre-Х.

Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.

Новые разработанные химерные антисмысловые олигонуклеотиды в Таблице 2 разработали как 5-10-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды или 3-10-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды, или 2-10-2 МОЕ химерные олигонуклеотиды. 5-10-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по пять нуклеозидов. 3-10-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 16 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по три нуклеозида. 2-10-2 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 14 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по два нуклеозида. Каждый нуклеозид в 5' сегменте крыла, и каждый нуклеозид в 3' сегменте крыла имеет МОЕ модификацию сахара. Каждый нуклеозид в центральном сегменте гэп имеет дезокси-сахарную модификацию. Межнуклеозидные связи в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой фосфотиоатные (P=S) связи. Все цитозиновые остатки в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой 5-метилцитозины.

«Сайт инициации» указывает 5'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. «Терминирующий сайт» указывает 3'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. Колонка «мотив» указывает структуру гэп и крыльев каждого химерного олигонуклеотида. Каждый химерный олигонуклеотид, перечисленный в Таблице 2, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1 (доступ GENBANK №U95551.1).

Таблица 2 Ингибирование уровней мРНК HBV действием МОЕ химерных олигонуклеотидов, направленных на SEQ ID NO:1 (обнаружено по RTS3370, RTS3371, RTS3372 и RTS3373MGB) Сайт инициации Терминирующий сайт № ISIS Последовательность RTS3370% ингибирование RTS3371% ингибирование RTS3372% ингибирование RTS3373 MGB % ингибирование Мотив SEQ ID NO 58 77 146779 GAACTGGACCACCAGCAGG 76 80 82 81 5-10-5 83 58 71 510019 GAGCCACCAGCAGG 38 32 45 31 2-10-2 84 61 80 505314 CCTGAACTGGAGCCACCAGC 68 71 67 66 5-10-5 85 62 77 509941 GAACTGGAGCCACCAG 36 32 71 53 3-10-3 86 196 215 505315 AAAAACCCCGCCTGTAACAC 69 74 80 88 5-10-5 87

199 218 505316 AAGAAAAACCCCGCCTGTAA 60 60 64 64 5-10-5 88 205 224 505317 GTCAACAAGAAAAACCCCGC 85 83 79 85 5-10-5 89 228 241 510020 GTATTGTGAGGATT 28 18 0 16 2-10-2 90 229 242 510021 GGTATTGTGAGGAT 40 37 19 34 2-10-2 91 244 263 146821 CACCACGAGTCTAGACTCTG 74 73 62 75 5-10-5 92 245 260 509942 CACGAGTCTAGACTCT 18 15 45 46 3-10-3 93 245 258 510022 CGAGTCTAGACTCT 32 26 23 19 2-10-2 94 246 261 509943 CCACGAGTCTAGACTC 34 35 63 60 3-10-3 95 247 266 505318 GTCCACCACGAGTCTAGACT 75 77 64 75 5-10-5 96 250 269 509921 GAAGTCCACCACGAGTCTAG 46 46 39 40 5-10-5 97 250 265 509944 TCCACCACGAGTCTAG 38 39 65 59 3-10-3 98 251 270 509922 AGAAGTCCACCACGAGTCTA 55 56 17 38 5-10-5 99 251 266 509945 GTCCACCACGAGTCTA 34 35 64 51 3-10-3 100 252 271 509923 GAGAAGTCCACCACGAGTCT 39 38 39 33 5-10-5 101 252 267 509946 AGTCCACCACGAGTCT 47 51 50 45 3-10-3 102 253 272 505319 AGAGAAGTCCACCACGAGTC 88 83 80 78 5-10-5 103 253 268 509947 AAGTCCACCACGAGTC 46 50 56 46 3-10-3 104 254 273 509924 GAGAGAAGTCCACCACGAGT 43 40 49 44 5-10-5 105 254 269 509948 GAAGTCCACCACGAGT 41 46 51 44 3-10-3 106 254 267 510023 AGTCCACCACGAGT 41 32 47 48 2-10-2 107 255 274 509925 TGAGAGAAGTCCACCACGAG 50 57 55 55 5-10-5 108

255 270 509949 AGAAGTCCACCACGAG 40 41 52 34 3-10-3 109 255 268 510024 AAGTCCACCACGAG 26 29 19 23 2-10-2 110 256 275 505320 TTGAGAGAAGTCCACCACGA 51 57 55 66 5-10-5 111 256 271 509950 GAGAAGTCCACCACGA 30 31 43 33 3-10-3 112 256 269 510025 GAAGTCCACCACGA 44 38 53 54 2-10-2 113 257 270 510026 AGAAGTCCACCACG 39 42 32 25 2-10-2 114 258 273 509952 GAGAGAAGTCCACCAC 54 52 60 48 3-10-3 115 258 271 510027 GAGAAGTCCACCAC 29 30 25 19 2-10-2 116 259 274 509953 TGAGAGAAGTCCACCA 39 44 47 38 3-10-3 117 259 272 510028 AGAGAAGTCCACCA 31 29 3 15 2-10-2 118 260 273 510029 GAGAGAAGTCCACC 21 19 23 18 2-10-2 119 261 274 510030 TGAGAGAAGTCCAC 16 22 21 20 2-10-2 120 262 281 505321 AGAAAATTGAGAGAAGTCCA 53 58 52 56 5-10-5 121 265 284 505322 CCTAGAAAATTGAGAGAAGT 62 65 69 67 5-10-5 122 293 312 505323 ATTTTGGCCAAGACACACGG 86 84 81 85 5-10-5 123 296 315 505324 CGAATTTTGGCCAAGACACA 67 67 69 64 5-10-5 124 302 321 505325 GGACTGCGAATTTTGGCCAA 77 75 73 76 5-10-5 125 360 379 505326 TCCAGCGATAACCAGGACAA 89 90 77 91 5-10-5 126 366 385 505327 GACACATCCAGCGATAACCA 83 85 75 86 5-10-5 127 369 388 505328 GCAGACACATCCAGCGATAA 65 68 49 57 5-10-5 128 384 399 509954 GATAAAACGCCGCAGA 37 46 53 35 3-10-3 129

384 397 510031 TAAAACGCCGCAGA 36 36 33 33 2-10-2 130 385 398 510032 ATAAAACGCCGCAG 12 7 19 15 2-10-2 131 386 401 509955 ATGATAAAACGCCGCA 49 55 57 53 3-10-3 132 386 399 510033 GATAAAACGCCGCA 39 39 45 37 2-10-2 133 387 400 510034 TGATAAAACGCCGC 40 37 29 39 2-10-2 134 388 401 510035 ATGATAAAACGCCG 22 24 9 22 2-10-2 135 411 430 505329 TGAGGCATAGCAGCAGGATG 60 64 47 55 5-10-5 136 411 426 509956 GCATAGCAGCAGGATG 62 64 71 60 3-10-3 137 411 424 510036 ATAGCAGCAGGATG 44 34 30 48 2-10-2 138 412 431 509926 ATGAGGCATAGCAGCAGGAT 45 54 71 62 5-10-5 139 412 427 509957 GGCATAGCAGCAGGAT 72 75 80 71 3-10-3 140 412 425 510037 CATAGCAGCAGGAT 29 24 24 20 2-10-2 141 413 432 509927 GATGAGGCATAGCAGCAGGA 54 58 54 49 5-10-5 142 413 428 509958 AGGCATAGCAGCAGGA 63 66 68 64 3-10-3 143 413 426 510038 GCATAGCAGCAGGA 55 54 37 46 2-10-2 144 414 433 505330 AGATGAGGCATAGCAGCAGG 85 87 74 82 5-10-5 20 414 429 509959 GAGGCATAGCAGCAGG 64 64 80 68 3-10-3 145 414 427 510039 GGCATAGCAGCAGG 58 54 41 45 2-10-2 146 415 430 509960 TGAGGCATAGCAGCAG 59 59 66 64 3-10-3 147 415 428 510040 AGGCATAGCAGCAG 58 55 38 41 2-10-2 148 416 431 509961 ATGAGGCATAGCAGCA 56 54 65 56 3-10-3 149 416 429 510041 GAGGCATAGCAGCA 64 62 64 57 2-10-2 150 417 432 509962 GATGAGGCATAGCAGC 57 52 58 49 3-10-3 151

417 430 510042 TGAGGCATAGCAGC 48 50 55 48 2-10-2 152 418 433 509963 AGATGAGGCATAGCAG 50 52 64 51 3-10-3 153 418 431 510043 ATGAGGCATAGCAG 36 31 36 26 2-10-2 154 419 434 509964 AAGATGAGGCATAGCA 48 47 72 65 3-10-3 155 419 432 510044 GATGAGGCATAGCA 44 28 0 14 2-10-2 156 420 435 509965 GAAGATGAGGCATAGC 45 41 65 62 3-10-3 157 420 433 510045 AGATGAGGCATAGC 41 43 37 29 2-10-2 158 421 436 509966 AGAAGATGAGGCATAG 32 29 64 51 3-10-3 159 421 434 510046 AAGATGAGGCATAG 21 18 26 27 2-10-2 160 422 437 509967 AAGAAGATGAGGCATA 21 17 55 46 3-10-3 161 422 435 510047 GAAGATGAGGCATA 25 24 23 25 2-10-2 162 423 436 510048 AGAAGATGAGGCAT 21 17 25 19 2-10-2 163 424 437 510049 AAGAAGATGAGGCA 17 11 38 27 2-10-2 164 454 473 505331 ACGGGCAACATACCTTGATA 55 57 65 60 5-10-5 165 457 476 505332 CAAACGGGCAACATACCTTG 73 77 77 74 5-10-5 166 457 472 509968 CGGGCAACATACCTTG 60 61 73 70 3-10-3 167 458 473 509969 ACGGGCAACATACCTT 58 63 64 58 3-10-3 168 458 471 510050 GGGCAACATACCTT 58 56 57 46 2-10-2 169 459 472 510051 CGGGCAACATACCT 49 43 47 37 2-10-2 170 460 473 510052 ACGGGCAACATACC 50 50 54 51 2-10-2 171 463 482 505333 AGAGGACAAACGGGCAACAT 64 68 64 71 5-10-5 172 466 485 505334 ATTAGAGGACAAACGGGCAA 59 62 42 69 5-10-5 173 472 491 505335 CCTGGAATTAGAGGACAAAC 78 81 73 86 5-10-5 174

475 494 505336 GATCCTGGAATTAGAGGACA 56 65 61 72 5-10-5 175 639 654 509970 GGCCCACTCCCATAGG 38 55 74 48 3-10-3 176 641 656 509971 GAGGCCCACTCCCATA 30 46 77 54 3-10-3 177 642 657 509972 TGAGGCCCACTCCCAT 58 57 84 66 3-10-3 178 643 658 509973 CTGAGGCCCACTCCCA 38 53 70 66 3-10-3 179 670 689 146823 GGCACTAGTAAACTGAGCCA 61 64 63 63 5-10-5 180 670 685 509974 CTAGTAAACTGAGCCA 71 71 78 80 3-10-3 181 670 683 510053 AGTAAACTGAGCCA 49 48 52 53 2-10-2 182 671 684 510054 TAGTAAACTGAGCC 41 38 19 30 2-10-2 183 672 685 510055 CTAGTAAACTGAGC 25 27 42 47 2-10-2 184 673 692 505337 AATGGCACTAGTAAACTGAG 34 46 49 52 5-10-5 185 679 698 505338 TGAACAAATGGCACTAGTAA 74 77 71 80 5-10-5 186 682 701 505339 CACTGAACAAATGGCACTAG 82 83 71 82 5-10-5 187 687 702 509975 CCACTGAACAAATGGC 72 73 76 80 3-10-3 188 688 707 505340 ACGAACCACTGAACAAATGG 69 69 78 76 5-10-5 189 688 703 509976 ACCACTGAACAAATGG 47 48 67 65 3-10-3 190 689 704 509977 AACCACTGAACAAATG 33 33 39 41 3-10-3 191 690 705 509978 GAACCACTGAACAAAT 50 49 63 48 3-10-3 192 691 710 505341 CCTACGAACCACTGAACAAA 64 70 70 72 5-10-5 193 691 706 509979 CGAACCACTGAACAAA 67 66 78 77 3-10-3 194 691 704 510056 AACCACTGAACAAA 36 36 23 32 2-10-2 195 692 705 510057 GAACCACTGAACAA 45 44 51 43 2-10-2 196

693 706 510058 CGAACCACTGAACA 59 52 48 49 2-10-2 197 697 716 505342 GAAAGCCCTACGAACCACTG 76 80 73 83 5-10-5 198 738 753 509980 ССАСАТСАТССАТАТА 40 33 62 54 3-10-3 199 738 751 510059 АСАТСАТССАТАТА 19 9 30 27 2-10-2 200 739 754 509981 АССАСАТСАТССАТАТ 76 78 93 85 3-10-3 201 739 752 510060 САСАТСАТССАТАТ 45 35 24 17 2-10-2 202 740 753 510061 ССАСАТСАТССАТА 52 49 43 40 2-10-2 203 741 754 510062 АССАСАТСАТССАТ 44 45 48 47 2-10-2 204 756 775 505343 TGTACAGACTTGGCCCCCAA 47 56 55 68 5-10-5 205 823 842 505344 AGGGTTTAAATGTATACCCA 66 71 64 72 5-10-5 206 1170 1189 505345 GCAAACACTTGGCACAGACC 76 80 35 70 5-10-5 207 1176 1191 509982 CAGCAAACACTTGGCA 42 44 56 54 3-10-3 208 1177 1192 509983 TCAGCAAACACTTGGC 60 54 74 70 3-10-3 209 1259 1278 505346 CCGCAGTATGGATCGGCAGA 88 82 57 80 5-10-5 210 1261 1276 509984 GCAGTATGGATCGGCA 61 58 65 72 3-10-3 211 1262 1281 505347 GTTCCGCAGTATGGATCGGC 84 81 71 83 5-10-5 212 1268 1287 505348 CTAGGAGTTCCGCAGTATGG 78 68 70 79 5-10-5 213 1271 1290 505349 CGGCTAGGAGTTCCGCAGTA 47 54 59 61 5-10-5 214 1277 1296 505350 AACAAGCGGCTAGGAGTTCC 55 62 69 69 5-10-5 215 1280 1299 505351 CAAAACAAGCGGCTAGGAGT 20 49 49 54 5-10-5 216

1283 1302 505352 GAGCAAAACAAGCGGCTAGG 53 83 73 87 5-10-5 217 1286 1305 505353 TGCGAGCAAAACAAGCGGCT 64 73 68 78 5-10-5 218 1413 1426 510063 ACAAAGGACGTCCC 14 8 0 0 2-10-2 219 1515 1534 505354 GAGGTGCGCCCCGTGGTCGG 68 81 61 80 5-10-5 220 1518 1537 505355 AGAGAGGTGCGCCCCGTGGT 59 75 75 84 5-10-5 221 1521 1540 505356 TAAAGAGAGGTGCGCCCCGT 63 76 83 78 5-10-5 222 1550 1563 510064 AAGGCACAGACGGG 35 38 25 32 2-10-2 223 1577 1596 146786 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 88 91 84 93 5-10-5 224 1580 1599 505357 GAGGTGAAGCGAAGTGCACA 70 75 71 82 5-10-5 225 1583 1602 505358 GCAGAGGTGAAGCGAAGTGC 77 82 72 84 5-10-5 226 1586 1605 505359 CGTGCAGAGGTGAAGCGAAG 72 73 67 80 5-10-5 227 1655 1674 505360 AGTCCAAGAGTCCTCTTATG 66 68 54 68 5-10-5 228 1706 1719 510065 CAGTCTTTGAAGTA 19 19 26 17 2-10-2 229 1778 1793 509985 TATGCCTACAGCCTCC 64 60 64 63 3-10-3 230 1779 1794 509986 TTATGCCTACAGCCTC 66 66 77 73 3-10-3 231 1780 1795 509987 TTTATGCCTACAGCCT 56 55 68 67 3-10-3 232 1781 1796 509988 ATTTATGCCTACAGCC 52 52 68 63 3-10-3 233 1782 1797 509989 AATTTATGCCTACAGC 48 44 70 59 3-10-3 234 1783 1798 509990 CAATTTATGCCTACAG 24 18 39 40 3-10-3 235 1784 1799 509991 CCAATTTATGCCTACA 37 37 55 55 3-10-3 236 1785 1800 509992 ACCAATTTATGCCTAC 35 36 60 55 3-10-3 237

1806 1825 505361 AAAGTTGCATGGTGCTGGTG 42 55 75 61 5-10-5 238 1809 1828 505362 GAAAAAGTTGCATGGTGCTG 45 56 64 53 5-10-5 239 1812 1831 505363 GGTGAAAAAGTTGCATGGTG 71 70 80 72 5-10-5 240 1815 1834 505364 AGAGGTGAAAAAGTTGCATG 51 57 77 82 5-10-5 241 1818 1837 505365 GGCAGAGGTGAAAAAGTTGC 54 63 76 78 5-10-5 242 1821 1840 505366 TTAGGCAGAGGTGAAAAAGT 61 65 80 66 5-10-5 243 1822 1837 509993 GGCAGAGGTGAAAAAG 47 51 74 54 3-10-3 244 1823 1838 509994 AGGCAGAGGTGAAAAA 47 40 76 54 3-10-3 245 1824 1843 505367 TGATTAGGCAGAGGTGAAAA 41 39 62 29 5-10-5 246 1824 1839 509995 TAGGCAGAGGTGAAAA 46 42 79 59 3-10-3 247 1826 1839 510066 TAGGCAGAGGTGAA 40 33 44 31 2-10-2 248 1827 1846 505368 AGATGATTAGGCAGAGGTGA 27 46 62 51 5-10-5 249 1861 1880 146787 AGCTTGGAGGCTTGAACAGT 59 61 65 72 5-10-5 250 1864 1883 505369 CACAGCTTGGAGGCTTGAAC 11 21 48 31 5-10-5 251 1865 1880 509996 AGCTTGGAGGCTTGAA 13 1 45 40 3-10-3 252 1865 1878 510067 CTTGGAGGCTTGAA 22 17 20 14 2-10-2 253 1866 1881 509997 CAGCTTGGAGGCTTGA 29 19 51 45 3-10-3 254 1866 1879 510068 GCTTGGAGGCTTGA 24 25 37 32 2-10-2 255 1867 1886 505370 AGGCACAGCTTGGAGGCTTG 32 36 58 33 5-10-5 63 1867 1882 509998 ACAGCTTGGAGGCTTG 1 4 23 12 3-10-3 256

1867 1880 510069 AGCTTGGAGGCTTG 23 24 17 23 2-10-2 257 1868 1883 509999 CACAGCTTGGAGGCTT 5 1 48 41 3-10-3 258 1868 1881 510070 CAGCTTGGAGGCTT 21 20 0 18 2-10-2 259 1869 1884 510000 GCACAGCTTGGAGGCT 14 10 50 37 3-10-3 260 1869 1882 510071 ACAGCTTGGAGGCT 19 22 24 27 2-10-2 261 1870 1889 505371 CCAAGGCACAGCTTGGAGGC 27 40 68 38 5-10-5 69 1870 1885 510001 GGCACAGCTTGGAGGC 10 12 43 16 3-10-3 262 1870 1883 510072 CACAGCTTGGAGGC 28 31 33 30 2-10-2 263 1871 1886 510002 AGGCACAGCTTGGAGG 24 20 46 25 3-10-3 264 1871 1884 510073 GCACAGCTTGGAGG 20 18 22 15 2-10-2 265 1872 1887 510003 AAGGCACAGCTTGGAG 6 0 45 24 3-10-3 266 1872 1885 510074 GGCACAGCTTGGAG 18 18 32 23 2-10-2 267 1873 1892 505372 CACCCAAGGCACAGCTTGGA 18 8 55 16 5-10-5 268 1873 1888 510004 CAAGGCACAGCTTGGA 9 0 31 15 3-10-3 269 1873 1886 510075 AGGCACAGCTTGGA 23 9 27 10 2-10-2 270 1874 1889 510005 CCAAGGCACAGCTTGG 0 0 39 25 3-10-3 271 1876 1895 505373 AGCCACCCAAGGCACAGCTT 47 50 69 56 5-10-5 272 1879 1898 505374 CAAAGCCACCCAAGGCACAG 27 27 55 30 5-10-5 273 1882 1901 505375 CCCCAAAGCCACCCAAGGCA 34 40 54 39 5-10-5 274 1885 1904 505376 ATGCCCCAAAGCCACCCAAG 41 43 54 52 5-10-5 275 1888 1907 505377 TCCATGCCCCAAAGCCACCC 40 42 72 40 5-10-5 276 1891 1910 505378 ATGTCCATGCCCCAAAGCCA 35 33 70 40 5-10-5 277

1918 1933 510006 СТССАААТТСТТТАТА 9 2 53 41 3-10-3 278 1918 1931 510076 ССАААТТСТТТАТА 28 22 7 22 2-10-2 279 1919 1934 510007 GCTCCAAATTCTTTAT 43 39 72 57 3-10-3 280 1919 1932 510077 ТССАААТТСТТТАТ 19 11 0 2 2-10-2 281 1920 1933 510078 СТССАААТТСТТТА 19 11 0 0 2-10-2 282 1921 1934 510079 GCTCCAAATTCTTT 50 48 61 55 2-10-2 283 1957 1976 505379 GGAAAGAAGTCAGAAGGCAA 17 14 81 39 5-10-5 284 2270 2285 510008 GTGCGAATCCACACTC 21 4 36 11 3-10-3 285 2270 2283 510080 GCGAATCCACACTC 32 29 41 33 2-10-2 286 2271 2284 510081 TGCGAATCCACACT 28 20 25 11 2-10-2 287 2272 2285 510082 GTGCGAATCCACAC 28 20 32 22 2-10-2 288 2368 2387 505380 GAGGGAGTTCTTCTTCTAGG 24 22 90 48 5-10-5 289 2378 2393 510009 CGAGGCGAGGGAGTTC 12 1 65 10 3-10-3 290 2378 2391 510083 AGGCGAGGGAGTTC 17 18 29 25 2-10-2 291 2379 2394 510010 GCGAGGCGAGGGAGTT 18 13 82 37 3-10-3 292 2379 2392 510084 GAGGCGAGGGAGTT 29 22 54 30 2-10-2 293 2380 2395 510011 TGCGAGGCGAGGGAGT 13 11 69 44 3-10-3 294 2380 2393 510085 CGAGGCGAGGGAGT 25 20 53 42 2-10-2 295 2381 2396 510012 CTGCGAGGCGAGGGAG 17 14 79 53 3-10-3 296 2381 2394 510086 GCGAGGCGAGGGAG 33 29 66 48 2-10-2 297 2382 2397 510013 TCTGCGAGGCGAGGGA 18 4 77 47 3-10-3 298 2420 2439 505381 CCGAGATTGAGATCTTCTGC 12 18 83 28 5-10-5 299 2459 2478 505382 CCCACCTTATGAGTCCAAGG 14 19 80 36 5-10-5 300

2819 2838 505383 TGTTCCCAAGAATATGGTGA 29 32 78 44 5-10-5 301 2820 2835 510014 TCCCAAGAATATGGTG 10 10 68 40 3-10-3 302 2821 2836 510015 TTCCCAAGAATATGGT 5 0 62 24 3-10-3 303 2822 2837 510016 GTTCCCAAGAATATGG 6 2 42 16 3-10-3 304 2823 2838 510017 TGTTCCCAAGAATATG 18 18 47 18 3-10-3 305 2824 2839 510018 TTGTTCCCAAGAATAT 7 5 57 19 3-10-3 306 2825 2838 510087 TGTTCCCAAGAATA 25 20 44 25 2-10-2 307 2873 2892 505384 GAAAGAATCCCAGAGGATTG 8 4 61 22 5-10-5 308 3161 3180 146833 ACTGCATGGCCTGAGGATGA 47 46 82 54 5-10-5 309 3163 3182 505385 CCACTGCATGGCCTGAGGAT 25 34 69 19 5-10-5 310

Пример 3: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК HBV в клетках HepAD38 (Tet-HBV) химерными олигонуклеотидами МОЕ

Некоторые антисмысловые олигонуклеотиды, выбранные из исследования, описанного в Примере 2, испытали на их влияние на мРНК HBV в другой клеточной линии, клетках гепатомы человека HepAD38, в которых выработка HBV контролируется тетрациклин-регулируемым промотором. Культивированные клетки HepAD38 (Tet-HBV) при плотности 45000 клеток на лунку трансфицировали при помощи электропорации 15000 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПНР в реальном времени. Наборы вирусных затравочных зондов RTS3372 и RTS3373MGB использовали по отдельности для измерения уровней мРНК. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены в Таблице 3 как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.

Таблица 3 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV МОЕ химерными олигонуклеотидами в клетках HepAD38 (Tet-HBV) (обнаружено по RTS3372 и RTS3373MGB) Сайт инициации Терминирующий сайт № ISIS Мотив RTS3373MGB % ингибирование RTS3372% ингибирование SEQ ID NO

58 77 146779 5-10-5 76 82 83 58 71 510019 5-10-5 0 9 84 61 80 505314 5-10-5 65 75 85 196 215 505315 5-10-5 46 65 87 199 218 505316 5-10-5 57 71 88 205 224 505317 5-10-5 83 87 89 228 241 510020 2-10-2 6 0 90 229 242 510021 2-10-2 19 24 91 244 263 146821 5-10-5 72 71 92 245 258 510022 2-10-2 6 24 94 247 266 505318 5-10-5 68 77 96 250 269 509921 5-10-5 25 47 97 251 270 509922 5-10-5 28 46 99 252 271 509923 5-10-5 19 40 101 253 272 505319 5-10-5 69 66 103 254 273 509924 5-10-5 9 39 105 254 267 510023 2-10-2 19 15 107 255 274 509925 5-10-5 26 55 108 255 268 510024 2-10-2 0 5 110 256 275 505320 5-10-5 62 68 111 256 269 510025 2-10-2 0 8 113 257 270 510026 2-10-2 7 21 114 258 271 510027 2-10-2 0 0 116 259 272 510028 2-10-2 0 0 118 260 273 510029 2-10-2 0 9 119 261 274 510030 2-10-2 0 0 120 262 281 505321 5-10-5 53 54 121 265 284 505322 5-10-5 59 60 122 293 312 505323 5-10-5 65 77 123 296 315 505324 5-10-5 78 83 124 302 321 505325 5-10-5 71 80 125 360 379 505326 5-10-5 76 84 126 366 385 505327 5-10-5 77 83 127 369 388 505328 5-10-5 65 78 128 384 397 510031 2-10-2 0 16 130 385 398 510032 2-10-2 0 0 131 386 399 510033 2-10-2 1 21 133 387 400 510034 2-10-2 8 28 134 388 401 510035 2-10-2 0 0 135 411 430 505329 5-10-5 58 72 136 411 424 510036 2-10-2 6 11 138 412 431 509926 5-10-5 20 54 139 412 425 510037 2-10-2 0 10 141

413 432 509927 5-10-5 56 76 142 413 426 510038 2-10-2 54 68 144 414 433 505330 5-10-5 66 81 20 414 427 510039 2-10-2 60 74 146 415 428 510040 2-10-2 33 39 148 416 429 510041 2-10-2 30 58 150 417 430 510042 2-10-2 34 57 152 418 431 510043 2-10-2 0 2 154 419 432 510044 2-10-2 0 29 156 420 433 510045 2-10-2 3 31 158 421 434 510046 2-10-2 0 0 160 422 435 510047 2-10-2 0 0 162 423 436 510048 2-10-2 0 0 163 424 437 510049 2-10-2 0 0 164 454 473 505331 5-10-5 60 77 165 457 476 505332 5-10-5 55 74 166 458 471 510050 2-10-2 47 47 169 459 472 510051 2-10-2 35 55 170 460 473 510052 2-10-2 27 41 171 463 482 505333 5-10-5 66 78 172 466 485 505334 5-10-5 53 63 173 472 491 505335 5-10-5 70 76 174 475 494 505336 5-10-5 64 77 175 670 689 146823 5-10-5 74 79 180 670 683 510053 2-10-2 18 20 182 671 684 510054 2-10-2 13 21 183 672 685 510055 2-10-2 4 2 184 673 692 505337 5-10-5 60 72 185 679 698 505338 5-10-5 62 75 186 682 701 505339 5-10-5 81 90 187 688 707 505340 5-10-5 67 81 189 691 710 505341 5-10-5 68 80 193 691 704 510056 2-10-2 0 0 195 692 705 510057 2-10-2 37 48 196 693 706 510058 2-10-2 44 59 197 697 716 505342 5-10-5 80 87 198 738 751 510059 2-10-2 0 0 200 739 752 510060 2-10-2 0 0 202 740 753 510061 2-10-2 23 19 203 741 754 510062 2-10-2 25 30 204 756 775 505343 5-10-5 62 71 205 823 842 505344 5-10-5 52 66 206 1170 1189 505345 5-10-5 83 81 207

1259 1278 505346 5-10-5 84 81 210 1262 1281 505347 5-10-5 89 84 212 1268 1287 505348 5-10-5 78 78 213 1271 1290 505349 5-10-5 74 77 214 1277 1296 505350 5-10-5 75 77 215 1280 1299 505351 5-10-5 49 62 216 1283 1302 505352 5-10-5 70 66 217 1286 1305 505353 5-10-5 62 60 218 1413 1426 510063 2-10-2 0 0 219 1515 1534 505354 5-10-5 85 75 220 1518 1537 505355 5-10-5 81 74 221 1521 1540 505356 5-10-5 57 52 222 1550 1563 510064 2-10-2 0 0 223 1577 1596 146786 5-10-5 94 85 224 1580 1599 505357 5-10-5 86 79 225 1583 1602 505358 5-10-5 89 79 226 1586 1605 505359 5-10-5 82 68 227 1655 1674 505360 5-10-5 84 74 228 1706 1719 510065 2-10-2 0 0 229 1806 1825 505361 5-10-5 66 66 238 1809 1828 505362 5-10-5 52 59 239 1812 1831 505363 5-10-5 72 75 240 1815 1834 505364 5-10-5 73 80 241 1818 1837 505365 5-10-5 68 82 242 1821 1840 505366 5-10-5 50 76 243 1824 1843 505367 5-10-5 58 76 246 1826 1839 510066 2-10-2 0 31 248 1827 1846 505368 5-10-5 71 84 249 1861 1880 146787 5-10-5 25 35 250 1864 1883 505369 5-10-5 29 65 251 1865 1878 510067 2-10-2 0 0 253 1866 1879 510068 2-10-2 0 20 255 1867 1886 505370 5-10-5 45 70 63 1867 1880 510069 2-10-2 0 0 257 1868 1881 510070 2-10-2 0 0 259 1869 1882 510071 2-10-2 0 0 261 1870 1889 505371 5-10-5 48 66 69 1870 1883 510072 2-10-2 0 0 263 1871 1884 510073 2-10-2 0 0 265 1872 1885 510074 2-10-2 0 2 267 1873 1892 505372 5-10-5 48 67 268 1873 1886 510075 2-10-2 0 0 270 1876 1895 505373 5-10-5 23 48 272

1879 1898 505374 5-10-5 0 34 273 1882 1901 505375 5-10-5 39 66 274 1885 1904 505376 5-10-5 0 40 275 1888 1907 505377 5-10-5 4 47 276 1891 1910 505378 5-10-5 65 77 277 1918 1931 510076 2-10-2 0 0 279 1919 1932 510077 2-10-2 0 0 281 1920 1933 510078 2-10-2 0 0 282 1921 1934 510079 2-10-2 18 50 283 1957 1976 505379 5-10-5 42 84 284 2270 2283 510080 2-10-2 0 0 286 2271 2284 510081 2-10-2 0 0 287 2272 2285 510082 2-10-2 0 10 288 2368 2387 505380 5-10-5 29 79 289 2378 2391 510083 2-10-2 0 0 291 2379 2392 510084 2-10-2 31 17 293 2380 2393 510085 2-10-2 0 8 295 2381 2394 510086 2-10-2 10 2 297 2420 2439 505381 5-10-5 30 86 299 2459 2478 505382 5-10-5 16 87 300 2819 2838 505383 5-10-5 26 81 301 2825 2838 510087 2-10-2 0 0 307 2873 2892 505384 5-10-5 31 59 308 3161 3180 146833 5-10-5 55 76 309 3163 3182 505385 5-10-5 58 83 310

Пример 4: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК HBV в клетках HepAD38 (Tet-HBV) химерными олигонуклеотидами МОЕ

Некоторые антисмысловые олигонуклеотиды из исследования, описанного в Примерах 1 и 2, испытали на их влияние на мРНК HBV in vitro. Культивированные клетки HepAD38 (Tet-HBV) при плотности 45000 клеток на лунку трансфицировали при помощи электропорации 15000 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПНР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3372. При помощи набора затравочных зондов RTS3373MGB измерили также уровни мРНК. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены в Таблице 4 как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.

Таблица 4 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV МОЕ химерными олигонуклеотидами (RTS3372 и RTS3373MGB) Сайт инициации Терминирующий сайт № ISIS Мотив RTS3372% ингибирование RTS3373MGB % ингибирование SEQ ID NO 62 77 509941 3-10-3 36 5 86 245 260 509942 3-10-3 3 0 93 245 261 510088 3-10-4 24 10 5 246 261 509943 3-10-3 27 13 95 250 265 509944 3-10-3 46 34 98 250 266 510089 3-10-4 61 33 6 251 266 509945 3-10-3 54 43 100 251 267 510090 3-10-4 58 32 7 252 267 509946 3-10-3 50 28 102 252 268 510091 3-10-4 60 42 8 253 268 509947 3-10-3 49 40 104 253 269 510092 3-10-4 40 9 9 254 269 509948 3-10-3 13 22 106 254 270 510093 3-10-4 39 2 10 255 270 509949 3-10-3 33 24 109 255 271 510094 3-10-4 40 16 11 256 271 509950 3-10-3 31 23 112 256 272 510095 3-10-4 24 6 12 257 273 510096 3-10-4 62 44 13 258 273 509952 3-10-3 42 40 115 258 274 510097 3-10-4 65 48 14 259 274 509953 3-10-3 35 29 117 384 399 509954 3-10-3 35 18 129 384 400 510098 3-10-4 62 43 15 385 401 510099 3-10-4 67 50 16 386 401 509955 3-10-3 44 37 132 411 426 509956 3-10-3 67 53 137 411 427 510100 3-10-4 88 69 17 412 427 509957 3-10-3 86 76 140 412 428 510101 3-10-4 71 46 18 413 428 509958 3-10-3 78 74 143 413 429 510102 3-10-4 77 52 19 414 433 505330 5-10-5 81 60 20 414 429 509959 3-10-3 62 49 145 414 430 510103 3-10-4 9 5 21 415 434 509928 5-10-5 81 66 22 415 430 509960 3-10-3 67 57 147 415 431 510104 3-10-4 71 57 23

416 435 509929 5-10-5 82 69 24 416 431 509961 3-10-3 62 43 149 416 432 510105 3-10-4 81 64 25 417 436 509930 5-10-5 74 45 26 417 432 509962 3-10-3 59 48 151 417 433 510106 3-10-4 86 70 27 418 437 146783 5-10-5 19 3 28 418 433 509963 3-10-3 48 28 153 418 434 510107 3-10-4 74 51 29 419 434 509964 3-10-3 50 39 155 419 435 510108 3-10-4 67 50 30 420 435 509965 3-10-3 49 38 157 420 436 510109 3-10-4 12 13 31 421 436 509966 3-10-3 23 22 159 421 437 510110 3-10-4 34 16 32 422 437 509967 3-10-3 3 12 161 457 472 509968 3-10-3 56 38 167 457 473 510111 3-10-4 68 51 33 458 473 509969 3-10-3 53 39 168 639 658 146784 5-10-5 0 0 34 639 654 509970 3-10-3 51 15 176 639 655 510112 3-10-4 66 32 35 640 656 510113 3-10-4 70 31 36 641 656 509971 3-10-3 54 31 177 641 657 510114 3-10-4 67 45 37 642 657 509972 3-10-3 51 25 178 642 658 510115 3-10-4 73 50 38 643 658 509973 3-10-3 49 32 179 670 685 509974 3-10-3 74 67 181 687 706 509931 5-10-5 92 83 39 687 702 509975 3-10-3 72 71 188 687 703 510116 3-10-4 83 74 40 688 703 509976 3-10-3 46 52 190 688 704 510117 3-10-4 71 57 41 689 704 509977 3-10-3 18 22 191 689 705 510118 3-10-4 71 50 42 690 705 509978 3-10-3 57 37 192 690 706 510119 3-10-4 80 64 43 691 706 509979 3-10-3 65 55 194 738 753 509980 3-10-3 48 44 199 738 754 510120 3-10-4 70 54 44 739 754 509981 3-10-3 54 45 201 1176 1191 509982 3-10-3 44 36 208

1176 1192 510121 3-10-4 74 69 45 1177 1192 509983 3-10-3 57 53 209 1261 1276 509984 3-10-3 57 50 211 1778 1797 509932 5-10-5 30 76 46 1778 1793 509985 3-10-3 0 46 230 1778 1794 510122 3-10-4 0 60 47 1779 1798 509933 5-10-5 54 78 48 1779 1794 509986 3-10-3 56 81 231 1779 1795 510123 3-10-4 74 85 49 1780 1799 509934 5-10-5 69 84 50 1780 1795 509987 3-10-3 52 78 232 1780 1796 510124 3-10-4 75 84 51 1781 1800 509935 5-10-5 72 85 52 1781 1796 509988 3-10-3 57 68 232 1781 1797 510125 3-10-4 68 72 53 1782 1797 509989 3-10-3 46 41 234 1782 1798 510126 3-10-4 56 51 54 1783 1798 509990 3-10-3 16 25 234 1783 1799 510127 3-10-4 61 69 55 1784 1799 509991 3-10-3 41 41 236 1784 1800 510128 3-10-4 61 68 56 1785 1800 509992 3-10-3 43 43 237 1822 1837 509993 3-10-3 72 44 244 1822 1838 510129 3-10-4 66 33 57 1823 1838 509994 3-10-3 79 32 245 1823 1839 510130 3-10-4 49 31 58 1824 1839 509995 3-10-3 63 30 247 1865 1884 509936 5-10-5 74 59 59 1865 1880 509996 3-10-3 36 0 252 1865 1881 510131 3-10-4 26 0 60 1866 1885 509937 5-10-5 78 63 61 1866 1881 509997 3-10-3 5 0 254 1866 1882 510132 3-10-4 37 4 62 1867 1886 505370 5-10-5 54 17 63 1867 1882 509998 3-10-3 13 0 256 1867 1883 510133 3-10-4 42 25 64 1868 1887 509938 5-10-5 9 6 65 1868 1883 509999 3-10-3 47 6 258 1868 1884 510134 3-10-4 56 27 66 1869 1888 509939 5-10-5 64 29 67 1869 1884 510000 3-10-3 24 1 260 1869 1885 510135 3-10-4 70 43 68 1870 1889 505371 5-10-5 63 46 69

1870 1885 510001 3-10-3 39 12 262 1870 1886 510136 3-10-4 52 23 70 1871 1886 510002 3-10-3 10 0 264 1871 1887 510137 3-10-4 28 0 71 1872 1887 510003 3-10-3 21 0 266 1872 1888 510138 3-10-4 25 7 72 1873 1888 510004 3-10-3 21 38 269 1873 1889 510139 3-10-4 18 0 73 1874 1889 510005 3-10-3 8 0 271 1918 1933 510006 3-10-3 0 0 278 1918 1934 510140 3-10-4 81 67 74 1919 1934 510007 3-10-3 69 66 280 2270 2285 510008 3-10-3 23 0 285 2378 2397 509940 3-10-4 66 7 75 2378 2393 510009 3-10-3 23 0 290 2378 2394 510141 3-10-4 10 11 76 2379 2394 510010 3-10-3 39 6 292 2379 2395 510142 3-10-4 46 24 77 2380 2395 510011 3-10-3 33 23 294 2380 2396 510143 3-10-4 59 36 78 2381 2396 510012 3-10-3 38 22 296 2381 2397 510144 3-10-4 54 20 79 2382 2397 510013 3-10-3 42 0 298 2820 2835 510014 3-10-3 51 9 302 2820 2836 510145 3-10-4 68 19 80 2821 2836 510015 3-10-3 35 2 303 2821 2837 510146 3-10-4 65 15 81 2822 2837 510016 3-10-3 9 0 304 2822 2838 510147 3-10-4 30 0 85 2823 2838 510017 3-10-3 18 0 305 2824 2839 510018 3-10-3 24 5 306

Пример 5: Зависимое от дозы ингибирование вирусной РНК HBV в клетках HepG2.2.15 химерными олигонуклеотидами МОЕ

Некоторые химерные олигонуклеотиды из исследования, описанного в Примерах 3 и 4, испытали при различных дозах в клетках HepG2.2.15 человека. Клетки поместили на планшет при плотности 25000 клеток на лунку и трансфицировали электропорацией антисмысловыми олигонуклеотидами в концентрациях 2, 5 мкМ, 5,0 мкМ, 10,0 мкМ и 20,0 мкМ, как показано в Таблице 5. Примерно через 16 часов обработки, РНК выделили из клеток, и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3370. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.

Полумаксимальные ингибирующие концентрации (IC50) каждого олигонуклеотида также представлены в Таблице 5. Как показано в Таблице 5, в клетках, обработанных антисмысловыми олигонуклеотидами, существенно снизились уровни мРНК HBV зависимым от дозы образом.

Таблица 5 Зависимое от дозы антисмысловое ингибирование РНК HBV в клетках HepG2.2.15 с использованием RTS3370 № ISIS 2, 5 мкМ 5,0 мкМ 10,0 мкМ 20,0 мкМ IC50 (мкМ) 146786 33 50 54 81 5,7 505317 35 40 63 67 6,6 505323 16 33 48 63 11,1 505326 27 44 64 67 6,9 509929 21 44 60 62 8,4 509931 51 63 75 75 <2, 5 509957 37 53 57 70 5,4 509974 25 35 54 63 9, 5 509975 36 55 62 81 4,7 509981 7 23 35 52 18,8 510039 27 46 60 69 6,9 510040 10 28 43 59 13,4 510041 29 41 53 66 8,3 510058 9 34 42 63 11,9

Пример б: Зависимое от дозы ингибирование вирусной РНК HBV в клетках HepG2.2.15 химерными олигонуклеотидами МОЕ

Дополнительные химерные олигонуклеотиды из исследования, описанного в Примерах 3 и 4, дополнительно испытали при различных дозах в клетках HepG2.2.15 человека. Клетки поместили на планшет при плотности 28000 клеток на лунку и трансфицировали при помощи реагента LipofectAMINE 2000® антисмысловыми олигонуклеотидами в концентрациях 15,625 нМ, 31,25 нМ, 62, 5 нМ, 125,0 нМ и 250,0 нМ, как показано в Таблице 6. Примерно через 16 часов обработки, РНК выделили из клеток, и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3370. Уровни мРНК

HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.

Полумаксимальные ингибирующие концентрации (IC50) каждого олигонуклеотида также представлены в Таблице 6. Как показано в Таблице 6, в некоторых клетках, обработанных антисмысловыми олигонуклеотидами, существенно снизились уровни мРНК HBV зависимым от дозы образом.

Таблица 6 Зависимое от дозы антисмысловое ингибирование РНК HBV в клетках HepG2.2.15 с использованием RTS3370 № ISIS 15,625 нМ 31,25 нМ 62, 5 нМ 125,0 нМ 250,0 нМ IC50 (нМ) 146779 14 25 44 70 78 73,1 146786 10 35 64 85 93 49,4 146833 12 16 32 62 72 99,8 505317 19 31 44 69 83 65,2 505319 5 11 24 39 69 152,8 505323 2 11 26 68 90 85,4 505326 1 15 45 72 89 73,7 505327 0 4 12 56 74 128, 5 505329 3 16 33 51 64 130,4 505339 26 32 59 82 92 46,0 505342 10 4 34 69 74 95,7 505347 20 26 41 70 92 63,0 505356 0 0 0 38 69 182,0 505358 8 28 47 71 84 67,9 505382 5 0 3 26 19 >250,0 509926 0 6 18 42 67 159,3 509927 3 17 33 55 76 103,2 509929 7 19 36 60 69 102,9 509931 18 28 52 76 87 57,4 509934 14 14 40 61 76 89,3 509957 20 28 51 71 79 63,1 509958 12 17 37 56 76 96,4 509959 12 11 18 59 70 121,7 509960 9 19 30 57 74 103,4 509972 15 6 17 27 45 >250,0 509974 25 35 57 83 92 45,3 509975 33 44 45 61 80 53,1 509981 0 15 11 35 60 224,4 510007 0 0 15 31 45 >250,0

510038 12 19 48 73 84 68,9 510039 17 25 44 69 72 77,3 510040 17 20 23 59 72 108,6 510041 11 21 43 64 79 80, 5 510050 3 21 16 51 70 132,4 510058 7 9 16 22 46 >250,0 510079 0 6 11 29 32 >250,0 510100 18 34 50 79 83 56,1 510106 23 25 35 69 74 78,4 510116 20 44 65 79 91 42,6 510140 7 28 30 55 58 136, 5

При помощи набора затравочных зондов RTS3371 измерили также уровни мРНК. Результаты представлены в Таблице 7.

Таблица 7 Зависимое от дозы антисмысловое ингибирование РНК HBV в клетках HepG2.2.15 с использованием RTS3371 № ISIS 15,625 нМ 31,25 нМ 62, 5 нМ 125,0 нМ 250,0 нМ IC50 (нМ) 146779 16 7 38 69 68 96,9 146786 28 39 65 86 93 35 146833 26 22 52 61 65 82,3 505317 18 33 40 77 84 61,4 505319 0 0 0 15 55 >250,0 505323 0 0 33 66 87 100, 5 505326 0 21 7 57 85 114,6 505327 0 0 40 50 63 132,3 505329 11 22 35 66 77 90,7 505342 15 0 1 40 59 190,1 505347 3 35 44 65 90 68,4 505356 0 0 3 42 76 153,2 505358 20 11 39 71 78 79,7 505382 0 0 0 0 0 >250,0 509926 0 4 14 55 72 130,6 509927 11 25 31 61 78 88,4 509929 11 26 41 70 77 75,8 509931 25 39 55 79 85 46,6 509934 0 25 32 54 65 119,9 509957 25 44 48 74 80 50,6 509958 24 18 20 57 72 114, 5 509959 2 9 31 52 65 132,3

509960 16 28 22 57 75 101,8 509972 3 5 1 39 60 236,3 509974 38 46 65 83 94 31,2 509975 30 7 24 49 67 148,2 509981 22 22 23 46 58 194,7 510007 3 0 15 33 39 >250,0 510038 16 22 50 76 84 62,9 510039 23 36 32 70 68 79,7 510040 18 15 41 59 67 101,9 510041 0 27 38 62 81 84, 5 510050 1 16 17 52 63 149 510058 20 19 40 44 51 214,1 510079 0 2 5 41 49 >250,0 510100 35 52 61 86 90 30,7 510106 27 23 5 75 81 87,9 510116 11 44 70 72 94 46, 5 510140 0 18 26 45 41 >250,0

Пример 7: Переносимость МОЕ химерных олигонуклеотидов, направленных на HBV, у мышей BALB/c

Мыши BALB/c mice (Charles River, штат Массачусетс) представляют собой многоцелевую модель мышей, которую часто использвют для испытаний безопасности и эффективности. Мышей обработали антисмысловыми олигонуклеотидами ISIS, выбранными из исследований, описанных выше, и оценили изменения уровней различных метаболических маркеров.

Испытание 1

Каждой мыши из группы четырех мышей BALB/c дважды в неделю, в течение 3 недель, подкожно вводили 50 мг/кг ISIS 146779, ISIS 146786, ISIS 505317, ISIS 505319, ISIS 505330, ISIS 505332, ISIS 505339, ISIS 505346, ISIS 505347, ISIS 505358, ISIS 509929, ISIS 509931, ISIS 509932, ISIS 509934, ISIS 509957, ISIS 510100, ISIS 510106, ISIS 510116 и ISIS 510140. Группе из четырех мышей BALB/c дважды в неделю, в течение 3 недель, подкожно вводили 50 мг/кг ISIS 141923 (CCTTCCCTGAAGGTTCCTCC (SEQ ID NO:320)), МОЕ химерного олигонуклеотида 5-10-5 без известной гомологии с какой-либо генной последовательностью человека или мыши. Другой группе из 4 мышей BALB/c дважды в неделю, в течение 3 недель, подкожно вводили PBS. Эта группа мышей служила в качестве контрольной группы. Через три дня после последней дозы в каждой временной точке измерили вес тела, мышей умертвили и собрали органы и плазму для дальнейшего анализа.

Вес тела и органов

Вес тела мышей измерили перед введением дозы и в конце каждого периода обработки. Вес тела представлен в Таблице 8 и выражен как процентное изменение от веса, измеренного перед началом обработки. В конце исследования измерили вес печени, селезенки и почек, значения представлены в Таблице 9 как процентная разница от веса соответствующего органа контрольного образца с PBS. Результаты показывают, что большинство олигонуклеотидов ISIS не приводят к каким-либо неблагоприятным эффектам на вес тела или органов.

Таблица 8 Изменение веса тела мышей BALB/c после обработки антисмысловым олигонуклеотидом (%) Вес тела PBS 9 ISIS 141923 9 ISIS 146779 11 ISIS 146786 9 ISIS 505317 10 ISIS 505319 14 ISIS 505330 11 ISIS 505332 10 ISIS 505339 14 ISIS 505346 12 ISIS 505347 16 ISIS 505358 12 ISIS 509929 8 ISIS 509931 9 ISIS 509932 21 ISIS 509934 14 ISIS 509957 10 ISIS 510100 10 ISIS 510106 15 ISIS 510116 16 ISIS 510140 19 Таблица 9 Изменение веса органов мышей BALB/c после обработки антисмысловым олигонуклеотидом (%) Печень Почки Селезенка PBS - - - ISIS 141923 3 -3 -9 ISIS 146779 10 1 13 ISIS 146786 19 -3 4

ISIS 505317 -4 -7 9 ISIS 505319 1 -16 23 ISIS 505330 12 -4 9 ISIS 505332 7 -2 14 ISIS 505339 5 -6 7 ISIS 505346 7 -6 0 ISIS 505347 12 -7 5 ISIS 505358 8 0 3 ISIS 509929 17 14 200 ISIS 509931 -4 -9 3 ISIS 509932 18 -9 79 ISIS 509934 6 -6 2 ISIS 509957 0 -2 15 ISIS 510100 2 1 8 ISIS 510106 5 -2 58 ISIS 510116 12 -8 7 ISIS 510140 20 -8 49

Функция печени

Для оценки влияния олигонуклеотидов ISIS на печеночную функцию, измерили концентрации трансаминаз в плазме при помощи автоматического клинического анализатора химического состава (Hitachi Olympus AU400e, Мелвилл, штат Нью-Йорк). Измерили концентрации ALT (аланин-трансаминазы) и AST (аспартат-трансаминазы) в плазме и представили результаты, выраженные в МЕ/л, в Таблице 10. Измерили также уровни холестерина и триглицеридов в плазме, используя тот же клинический анализатор химического состава, и также представили результаты в Таблице 10.

Таблица 10 Влияние обработки антисмысловым олигонуклеотидом на метаболические маркеры в печени мышей BALB/c ALT (МЕ/л) AST (МЕ/л) Холестерин (мг/дл) Триглицериды (мг/дл) PBS 37 58 114 238 ISIS 141923 36 57 114 234 ISIS 146779 43 56 121 221 ISIS 146786 53 76 118 327 ISIS 505317 68 103 117 206 ISIS 505319 136 152 144 168 ISIS 505330 281 194 119 188 ISIS 505332 67 70 123 226

ISIS 505339 113 111 135 249 ISIS 505346 56 63 128 234 ISIS 505347 79 83 122 347 ISIS 505358 78 175 112 214 ISIS 509929 111 166 61 175 ISIS 509931 635 508 110 179 ISIS 509932 92 113 118 131 ISIS 509934 38 89 97 176 ISIS 509957 159 229 85 173 ISIS 510100 90 87 86 222 ISIS 510106 61 88 79 239 ISIS 510116 70 95 124 214 ISIS 510140 1247 996 161 167

Функция печени

Для оценки влияния олигонуклеотидов ISIS на почечную функцию, измерили концентрации азота мочевины крови (BUN) при помощи автоматического клинического анализатора химического состава (Hitachi Olympus AU400e, Мелвилл, штат Нью-Йорк). Результаты, выраженные в мг/дл, представлены в Таблице 11.

Таблица 11 Влияние обработки антисмысловым олигонуклеотидом на почечные маркеры мышей BALB/c BUN (мг/дл) PBS 29 ISIS 141923 29 ISIS 146779 28 ISIS 146786 30 ISIS 505317 30 ISIS 505319 30 ISIS 505330 29 ISIS 505332 28 ISIS 505339 29 ISIS 505346 27 ISIS 505347 26 ISIS 505358 26 ISIS 509929 25 ISIS 509931 23 ISIS 509932 28 ISIS 509934 25

ISIS 509957 24 ISIS 510100 27 ISIS 510106 27 ISIS 510116 25 ISIS 510140 22

Испытание 2

Каждой мыши из группы четырех мышей BALB/c дважды в неделю, в течение 3 недель, подкожно вводили 50 мг/кг ISIS 505329, ISIS 509926, ISIS 509927, ISIS 509958, ISIS 509959, ISIS 509960, ISIS 509974, ISIS 509975, ISIS 510038, ISIS 510039, ISIS 510040, ISIS 510041 и ISIS 510050. Группе из 4 мышей BALB/c дважды в неделю, в течение 3 недель, подкожно вводили PBS. Эта группа мышей служила в качестве контрольной группы. Через три дня после последней дозы в каждой временной точке измерили вес тела, мышей умертвили и собрали органы и плазму для дальнейшего анализа.

Вес органов

В конце исследования измерили вес печени, селезенки и почек, и значения также представлены в Таблице 12 как процентное изменение от веса соответствующего органа контрольного образца с PBS.

Таблица 12 Изменение веса органов мышей BALB/c после обработки антисмысловым олигонуклеотидом (%) № ISIS Печень Почки Селезенка 505329 12 2 12 509926 23 3 30 509927 8 -4 27 509958 1 -4 9 509959 7 0 26 509960 16 6 30 509974 5 8 7 509975 1 -1 7 510038 6 4 23 510039 0 15 9 510040 3 1 2 510041 6 6 10 510050 5 5 18

Функция печени

Для оценки влияния олигонуклеотидов ISIS на печеночную функцию, измерили концентрации трансаминаз в плазме при помощи автоматического клинического анализатора химического состава (Hitachi Olympus AU400e, Мелвилл, штат Нью-Йорк). Измерили концентрации ALT (аланин-трансаминазы) и AST (аспартат-трансаминазы) в плазме и представили результаты, выраженные в МЕ/л, в Таблице 13.

Таблица 13 Влияние обработки антисмысловым олигонуклеотидом на трансаминазы (МЕ/л) в печени мышей BALB/c ALT AST PBS 37 78 ISIS 505329 48 65 ISIS 509926 77 120 ISIS 509927 71 92 ISIS 509958 106 105 ISIS 509959 119 122 ISIS 509960 40 66 ISIS 509974 38 43 ISIS 509975 33 45 ISIS 510038 69 66 ISIS 510039 32 61 ISIS 510040 83 113 ISIS 510041 32 45 ISIS 510050 26 47

Функция печени

Для оценки влияния олигонуклеотидов ISIS на почечную функцию, измерили концентрации азота мочевины крови (BUN) при помощи автоматического клинического анализатора химического состава (Hitachi Olympus AU400e, Мелвилл, штат Нью-Йорк). Результаты, выраженные в мг/дл, представлены в Таблице 14.

Таблица 14 Влияние обработки антисмысловым олигонуклеотидом на почечные маркеры мышей BALB/c BUN PBS 21 ISIS 505329 22 ISIS 509926 20 ISIS 509927 20 ISIS 509958 22 ISIS 509959 21 ISIS 509960 20 ISIS 509974 19 ISIS 509975 19 ISIS 510038 19 ISIS 510039 19 ISIS 510040 22 ISIS 510041 18 ISIS 510050 22

Пример 8: Завимое от дозы подтверждение направленного действия МОЕ химерных олигонуклеотидов на HBV в клетках HepG2.2.15

Химерные олигонуклеотиды выбрали на основании сохранения последовательности, активности и переносимости, по результатам измерения в исследовании, описанном в Примерах 7 и 8, и испытали в различных дозах на клетках HepG2.2.15. Клетки поместили на планшет при плотности 28000 клеток на лунку и трансфицировали при помощи реагента LipofectAMINE 2000 антисмысловым олигонуклеотидом в концентрациях 15,625 нМ, 31,25 нМ, 62, 5 нМ, 125,0 нМ и 250,0 нМ. Через два дня после трансфекции среду заменили свежей средой. Образцы собрали через 4 дня после трансфекции. В надосадочной жидкости измерили уровни ДНК, РНК, HBsAg и HBeAg.

Уровни мРНК HBV измерили количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор затравочных зондов RTS3370. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками. Как показано в Таблице 15, уровни мРНК HBV снизились зависимым от дозы образом в большинстве клеток, обработанных антисмысловым олигонуклеотидом.

Антигены HBV в надосадочных жидкостях обнаружили при помощи иммуноферментого анализа твердофазного (ELISA). Уровни антигена HBs (HBsAg) обнаружили иммуноферментным твердофазным анализом компании Abazyme LLC, штат Массачусетс. Как показано в Таблице 16, обработка олигонуклеотидами ISIS 146779, 146786, 505329, 505330, 505339, 505347, 505358, 509927, 509934, 509958, 509959, 509960, 509974, 5100038, 510039, 510040, 510041, 510100, 510106 и 510116 вызвала существенное снижение уровней HBsAg. Уровни антигена НВе (HBeAg) обнаружили иммуноферментным твердофазным анализом компании International Immune-diagnostics, штат Калифорния. Как показано в Таблице 17, обработка олигонуклеотидами ISIS 146779, 146786, 505329, 505330, 505339, 505347, 505358, 509927, 509934, 509958, 509959, 509960, 509974, 5100038, 510039, 510040, 510041, 510100, 510106 и 510116 вызвала существенное снижение уровней HBeAg. Уровни ДНК HBV измерили при помощи набора затравочных зондов RTS3370. Как показано в Таблице 18, обработка олигонуклеотидами ISIS 146779, 146786, 505329, 505330, 505339, 505347, 505358, 509927, 509934, 509958, 509959, 509960, 509974, 5100038, 510039, 510040, 510041, 510100, 510106 и 510116 вызвала существенное снижение уровней ДНК HBV. Общее содержание белка в надосадочных жидкостях измерили DC анализом белка (BioRad), как показано в Таблице 19.

Таблица 15 Зависимое от дозы антисмысловое ингибирование РНК HBV в клетках HepG2.2.15 № ISIS 15,625 нМ 31,25 нМ 62, 5 нМ 125 нМ 250 нМ 146779 10 25 42 64 95 146786 23 59 78 84 90 505329 45 49 57 69 83 505330 31 61 65 80 93 505339 31 56 78 89 97 505347 30 50 72 87 96 505358 28 52 75 86 95 509927 41 61 67 61 76 509934 38 61 64 82 58 509958 50 67 72 79 89 509959 50 63 73 80 86 509960 63 61 72 82 74 509974 29 44 75 91 96 510038 29 40 85 89 93 510039 32 34 63 84 84 510040 18 0 51 71 77 510041 34 53 67 76 71 510100 29 64 70 89 93 510106 28 65 64 81 85 510116 13 34 78 89 95 Таблица 16 Зависимое от дозы снижение антигена S в надосадочной жидкости клеток HepG2.2.15 № ISIS 15,625 нМ 31,25 нМ 62, 5 нМ 125 нМ 146779 40 58 80 92 146786 47 75 92 98

505329 37 58 71 89 505330 45 66 84 95 505339 62 79 93 96 505347 68 71 89 97 505358 69 83 92 96 509927 54 74 88 94 509934 40 59 78 89 509958 57 77 91 93 509959 54 72 84 100 509960 44 72 91 91 509974 58 77 92 95 510038 58 78 94 98 510039 53 74 89 95 510040 39 70 80 90 510041 47 65 82 92 510100 74 83 95 96 510106 54 75 86 92 510116 61 74 91 94 Таблица 17 Зависимое от дозы снижение антигена Е в надосадочной жидкости клеток HepG2.2.15 № ISIS 15,625 нМ 31,25 нМ 62, 5 нМ 125 нМ 146779 14 45 66 76 146786 26 58 75 80 505329 19 26 60 73 505330 28 70 69 80 505339 31 57 77 82 505347 24 33 64 77 505358 26 45 72 81 509927 34 54 72 79 509934 21 42 59 73 509958 29 45 72 77 509959 60 64 77 80 509960 19 36 67 77 509974 16 48 72 80 510038 20 35 79 80 510039 14 41 64 78 510040 0 8 37 69 510041 9 34 63 76 510100 26 52 73 81

510106 7 42 62 76 510116 27 56 76 81 Таблица 18 Зависимое от дозы антисмысловое ингибирование ДНК HBV в клетках HepG2.2.15 № ISIS 15,625 нМ 31,25 нМ 62, 5 нМ 125 нМ 146779 71 71 84 85 146786 67 81 82 75 505329 53 65 72 67 505330 72 76 86 90 505339 83 85 89 88 505347 76 78 81 87 505358 79 82 90 87 509927 51 75 78 69 509934 61 60 64 75 509958 57 73 69 71 509959 59 54 73 73 509960 48 66 63 54 509974 76 90 84 85 510038 69 76 90 87 510039 70 79 81 86 510040 40 67 68 68 510041 53 71 62 68 510100 76 81 87 87 510106 46 74 73 76 510116 79 84 89 86 Таблица 19 Общие уровни белка в надосадочной жидкости клеток HepG2.2.15 15,625 нМ 31,25 нМ 62, 5 нМ 125 нМ PBS 5601 5601 5601 5601 146779 6491 6631 6027 5067 146786 5408 5328 4839 3518 505329 5719 5285 5384 4994 505330 7514 7262 6627 5179 505339 6572 6343 5349 4550 505347 7315 6602 6378 5908 505358 6357 6871 5798 5720

509927 5581 5487 5145 3601 509934 5476 5610 5394 4127 509958 5193 5492 5071 3957 509959 5051 5312 5144 3893 509960 4726 5160 5071 3305 509974 6913 7624 5798 5389 510038 5707 6381 5772 6733 510039 5981 7629 4802 6156 510040 4302 5209 5049 4188 510041 5565 5607 5205 3757 510100 8466 8378 7985 6402 510106 5703 5940 5231 4005 510116 5880 5380 4797 4757

Пример 9: In vivo ингибирование мРНК HBV МОЕ химерными олигонуклеотиды у HBV-трансгенных мышей

ISIS 146786, МОЕ химерный олигонуклеотид 5-10-5, и ISIS 510100, МОЕ химерный олигонуклеотид 3-10-4 МОЕ, демонстрирующие существенное ингибирование мРНК HBV, испытали на трансгенных мышах, содержащих ген HBV (линия Chisari 1.3.32) (Guidotti, L.G. et al., J. Virol. 1995, 69, 6158-6169) и оценили эффективность указанных химерных олигонуклеотидов.

Обработка

Двум группам по десять-одиннадцать HBV-трансгенных самцов и самок мышей дважды в неделю, в течение четырех недель, подкожно вводили 25 мг/кг ISIS 146786 или ISIS 510100. Другой группе из 14 самцов и самок HBV-трансгенных мышей вводили энтекавир, пероральное противовирусное лекарство, которое используют для лечения инфекции гепатита В, в дозе 1 мг/кг, ежедневно в течение двух недель. Другой группе из 10 самцов и самок HBV-трансгенных самок мышей подкожно вводили PBS дважны в неделю, в течение четырех недель. Мышей, которым делали инъекции PBS, использовали в качестве контрольной группы. Измерили уровни мРНК и ДНК HBV, ALT в плазме и вес тела и органов.

Анализ РНК

РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР HBV в реальном времени, используя наборы затравочных зондов RTS3370, RTS3371 и RTS3372. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК HBV, по сравнению с контрольным образцом с PBS. Как показано в Таблице 20, обработка антисмысловыми олигонуклеотидами ISIS привела к существенному снижению мРНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом, независимо от набора затравочных зондов, использованного для измерения. Энтекавир не снижает экспрессию мРНК HBV.

Таблица 20 Ингибирование мРНК HBV в печени HBV-трансгенных мышей по сравнению с PBS контролем № ISIS RTS3370 RTS3371 RTS3372 146786 82 75 81 510100 93 83 89

Анализ ДНК

ДНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР HBV в реальном времени, используя наборы затравочных зондов RTS3370 и RTS3371. Уровни нормализовали к RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом с PBS. Как показано в Таблице 21, обработка антисмысловыми олигонуклеотидами ISIS привела к существенному снижению ДНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом, независимо от набора затравочных зондов, использованного для измерения. Обработка энтекавиром, как и ожидалось, также снижает уровни ДНК.

Таблица 21 Ингибирование ДНК HBV в печени HBV-трансгенных мышей по сравнению с PBS контролем № ISIS RTS3370 RTS3371 146786 65 69 510100 67 73 Энтекавир 75 96

Функция печени

Для оценки влияния олигонуклеотидов ISIS на печеночную функцию, измерили концентрации трансаминазы в плазме с использованием ручного клинического анализатора химическогосостава (Тесо Diagnostics, Анахайм, штат Калифорния). Измерили концентрации ALT (аланин-трансаминазы) и представили результаты, выраженные в МЕ/л, в Таблице 22. Эти результаты показывают, что антисмысловое ингибирование HBV не вызывает неблагоприятного действия на функцию печени мышей.

Таблица 22 Влияние обработки антисмысловым олигонуклеотидом на ALT в печени трансгенных мышей МЕ/мл PBS 12,7 ISIS 146786 24,1 ISIS 510100 25,8 Энтекавир 23,7

Данные этого исследования показывают, что ISIS 146786 and ISIS 510100 вызывают устойчивое снижение РНК и ДНК HBV в печени, и обработка этими олигонуклеотидами хорошо переносится трансгенными мышами.

Пример 10: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК HBV в клетках HepG2.2.15 химерными олигонуклеотидами МОЕ

Дополнительные антисмысловые олигонуклеотиды были разработаны для направленного действия на вирусную нуклеиновую кислоту HBV, и были испытаны на их действие на мРНК HBV in vitro. В этот анализ включили также несколько антисмысловых олигонуклеотидов из исследований, описанных выше. Культивированные клетки HepG2.2.15 при плотности 28000 клеток на лунку трансфицировали при помощи LipofectAMINE 2000® 100 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3370. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.

Новые разработанные химерные антисмысловые олигонуклеотиды в Таблице 23 были разработаны как 5-10-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды. Эти химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по пять нуклеозидов. Каждый нуклеозид в 5' сегменте крыла, и каждый нуклеозид в 3' сегменте крыла имеет МОЕ модификацию сахара. Каждый нуклеозид в центральном сегменте гэп имеет дезокси-сахарную модификацию. Межнуклеозидные связи в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой фосфотиоатные (P=S) связи. Все цитозиновые остатки в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой 5-метилцитозины.

«Вирусный целевой сайт инициации» указывает 5'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. «Вирусный целевой терминирующий сайт» указывает 3'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. Каждый химерный олигонуклеотид, перечисленный в Таблице 23, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1 (доступ GENBANK №U95551.1).

Таблица 23 Ингибирование уровней мРНК HBV действием химерных антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на SEQ ID NO:1 (RTS3370) Вирусный сайт инициации Вирусный терминирующий сайт № ISIS Последовательность % ингибирования SEQ ID NO 1 20 524410 TGGTGAAAGGTTGTGGAATT 70 321 4 23 524411 GTTTGGTGAAAGGTTGTGGA 51 322 7 26 524412 AGAGTTTGGTGAAAGGTTGT 47 323 10 29 524413 TGCAGAGTTTGGTGAAAGGT 74 324 13 32 524414 TCTTGCAGAGTTTGGTGAAA 91 325 16 35 524415 GGATCTTGCAGAGTTTGGTG 93 326 19 38 524416 CTGGGATCTTGCAGAGTTTG 85 327 22 41 524417 ACTCTGGGATCTTGCAGAGT 66 328 25 44 524418 CTCACTCTGGGATCTTGCAG 86 329 28 47 524419 CCTCTCACTCTGGGATCTTG 81 330 31 50 524420 AGGCCTCTCACTCTGGGATC 77 331 34 53 524421 TACAGGCCTCTCACTCTGGG 71 332 37 56 524422 AAATACAGGCCTCTCACTCT 68 333 40 59 524423 GGGAAATACAGGCCTCTCAC 43 334 43 62 524424 GCAGGGAAATACAGGCCTCT 76 335 46 65 524425 CCAGCAGGGAAATACAGGCC 89 336 49 68 524426 CCACCAGCAGGGAAATACAG 82 337 52 71 524427 GAGCCACCAGCAGGGAAATA 53 338 55 74 524428 CTGGAGCCACCAGCAGGGAA 76 339 56 75 524429 ACTGGAGCCACCAGCAGGGA 55 340 57 76 524430 AACTGGAGCCACCAGCAGGG 45 341 58 77 146779 GAACTGGAGCCACCAGCAGG 57 83 59 78 524431 TGAACTGGAGCCACCAGCAG 85 342 60 79 524432 CTGAACTGGAGCCACCAGCA 90 343 61 80 505314 CCTGAACTGGAGCCACCAGC 93 85 62 81 524433 TCCTGAACTGGAGCCACCAG 79 344 63 82 524434 CTCCTGAACTGGAGCCACCA 82 345 65 84 524435 TGCTCCTGAACTGGAGCCAC 78 346 68 87 524436 TACTGCTCCTGAACTGGAGC 58 347 71 90 524437 GTTTACTGCTCCTGAACTGG 40 348 74 93 524438 AGGGTTTACTGCTCCTGAAC 45 349 77 96 524439 AACAGGGTTTACTGCTCCTG 69 350 80 99 524440 CGGAACAGGGTTTACTGCTC 67 351

83 102 524441 AGTCGGAACAGGGTTTACTG 47 352 86 105 524442 AGTAGTCGGAACAGGGTTTA 59 353 89 108 524443 GGCAGTAGTCGGAACAGGGT 47 354 92 111 524444 AGAGGCAGTAGTCGGAACAG 54 355 95 114 524445 GGGAGAGGCAGTAGTCGGAA 49 356 98 117 524446 TAAGGGAGAGGCAGTAGTCG 81 357 101 120 524447 CGATAAGGGAGAGGCAGTAG 86 358 104 123 524448 TGACGATAAGGGAGAGGCAG 79 359 107 126 524449 GATTGACGATAAGGGAGAGG 27 360 110 129 524450 GAAGATTGACGATAAGGGAG 53 361 113 132 524451 CGAGAAGATTGACGATAAGG 67 362 116 135 524452 CCTCGAGAAGATTGACGATA 84 363 119 138 524453 AATCCTCGAGAAGATTGACG 79 364 122 141 524454 CCCAATCCTCGAGAAGATTG 65 365 125 144 524455 GTCCCCAATCCTCGAGAAGA 66 366 128 147 524456 AGGGTCCCCAATCCTCGAGA 67 367 131 150 524457 CGCAGGGTCCCCAATCCTCG 76 368 134 153 524458 CAGCGCAGGGTCCCCAATCC 59 369 137 156 524459 GTTCAGCGCAGGGTCCCCAA 80 370 140 159 524460 CATGTTCAGCGCAGGGTCCC 90 371 143 162 524461 CTCCATGTTCAGCGCAGGGT 75 372 146 165 524462 GTTCTCCATGTTCAGCGCAG 54 373 149 168 524463 GATGTTCTCCATGTTCAGCG 27 374 152 171 524464 TGTGATGTTCTCCATGTTCA 72 375 158 177 524466 TCCTGATGTGATGTTCTCCA 91 376 161 180 524467 GAATCCTGATGTGATGTTCT 77 377 164 183 524468 TAGGAATCCTGATGTGATGT 77 378 167 186 524469 TCCTAGGAATCCTGATGTGA 94 379 170 189 524470 GGGTCCTAGGAATCCTGATG 56 380 188 207 524471 CGCCTGTAACACGAGAAGGG 65 381 191 210 524472 CCCCGCCTGTAACACGAGAA 71 382 194 213 524473 AAACCCCGCCTGTAACACGA 74 383 195 214 524474 AAAACCCCGCCTGTAACACG 72 384 196 215 505315 AAAAACCCCGCCTGTAACAC 52 87 197 216 524475 GAAAAACCCCGCCTGTAACA 38 385 198 217 524476 AGAAAAACCCCGCCTGTAAC 18 386 200 219 524477 CAAGAAAAACCCCGCCTGTA 86 387 203 222 524478 CAACAAGAAAAACCCCGCCT 84 388 204 223 524479 TCAACAAGAAAAACCCCGCC 80 389 205 224 505317 GTCAACAAGAAAAACCCCGC 84 89 206 225 524480 TGTCAACAAGAAAAACCCCG 79 390 207 226 524481 TTGTCAACAAGAAAAACCCC 76 391 209 228 524482 TCTTGTCAACAAGAAAAACC 86 392

212 231 524483 GATTCTTGTCAACAAGAAAA 57 393 215 234 524484 GAGGATTCTTGTCAACAAGA 51 394 218 237 524485 TGTGAGGATTCTTGTCAACA 83 395 221 240 524486 TATTGTGAGGATTCTTGTCA 61 396 224 243 524487 CGGTATTGTGAGGATTCTTG 74 397 227 246 524488 CTGCGGTATTGTGAGGATTC 49 398 230 249 524489 ACTCTGCGGTATTGTGAGGA 67 399 233 252 524490 TAGACTCTGCGGTATTGTGA 88 400 236 255 524491 GTCTAGACTCTGCGGTATTG 84 401 239 258 524492 CGAGTCTAGACTCTGCGGTA 82 402 242 261 524493 CCACGAGTCTAGACTCTGCG 94 403 243 262 524494 ACCACGAGTCTAGACTCTGC 87 404 244 263 146821 CACCACGAGTCTAGACTCTG 87 92 245 264 524495 CCACCACGAGTCTAGACTCT 80 405 246 265 524496 TCCACCACGAGTCTAGACTC 65 406 247 266 505318 GTCCACCACGAGTCTAGACT 65 96 248 267 524497 AGTCCACCACGAGTCTAGAC 46 407 249 268 524498 AAGTCCACCACGAGTCTAGA 54 408 250 269 509921 GAAGTCCACCACGAGTCTAG 35 97 251 270 509922 AGAAGTCCACCACGAGTCTA 51 99 252 271 509923 GAGAAGTCCACCACGAGTCT 49 101 253 272 505319 AGAGAAGTCCACCACGAGTC 60 103 254 273 509924 GAGAGAAGTCCACCACGAGT 46 105 255 274 509925 TGAGAGAAGTCCACCACGAG 79 108 256 275 505320 TTGAGAGAAGTCCACCACGA 84 111 257 276 524499 ATTGAGAGAAGTCCACCACG 83 409 260 279 524500 AAAATTGAGAGAAGTCCACC 71 410 263 282 524501 TAGAAAATTGAGAGAAGTCC 67 411 266 285 524502 CCCTAGAAAATTGAGAGAAG 88 412 269 288 524503 TCCCCCTAGAAAATTGAGAG 82 413 272 291 524504 AGTTCCCCCTAGAAAATTGA 66 414 275 294 524505 GGTAGTTCCCCCTAGAAAAT 0 415 278 297 524506 CACGGTAGTTCCCCCTAGAA 65 416 281 300 524507 ACACACGGTAGTTCCCCCTA 87 417 284 303 524508 AAGACACACGGTAGTTCCCC 76 418 287 306 524509 GCCAAGACACACGGTAGTTC 61 419 290 309 524510 TTGGCCAAGACACACGGTAG 87 420 291 310 524511 TTTGGCCAAGACACACGGTA 87 421 292 311 524512 TTTTGGCCAAGACACACGGT 93 422 293 312 505323 ATTTTGGCCAAGACACACGG 83 123 294 313 524513 AATTTTGGCCAAGACACACG 79 423 295 314 524514 GAATTTTGGCCAAGACACAC 74 424 298 317 524515 TGCGAATTTTGGCCAAGACA 78 425

300 319 524516 ACTGCGAATTTTGGCCAAGA 71 426 301 320 524517 GACTGCGAATTTTGGCCAAG 71 427 302 321 505325 GGACTGCGAATTTTGGCCAA 50 125 303 322 524518 GGGACTGCGAATTTTGGCCA 55 428 321 340 524519 GTGAGTGATTGGAGGTTGGG 68 429 324 343 524520 TTGGTGAGTGATTGGAGGTT 84 430 327 346 524521 AGGTTGGTGAGTGATTGGAG 64 431 330 349 524522 AGGAGGTTGGTGAGTGATTG 58 432 333 352 524523 GACAGGAGGTTGGTGAGTGA 62 433 336 355 524524 GAGGACAGGAGGTTGGTGAG 56 434 339 358 524525 TTGGAGGACAGGAGGTTGGT 81 435 342 361 524526 AAGTTGGAGGACAGGAGGTT 77 436 345 364 524527 GACAAGTTGGAGGACAGGAG 69 437 348 367 524528 CAGGACAAGTTGGAGGACAG 82 438 351 370 524529 AACCAGGACAAGTTGGAGGA 67 439 354 373 524530 GATAACCAGGACAAGTTGGA 53 440 357 376 524531 AGCGATAACCAGGACAAGTT 55 441 358 377 524532 CAGCGATAACCAGGACAAGT 84 442 359 378 524533 CCAGCGATAACCAGGACAAG 86 443 360 379 505326 TCCAGCGATAACCAGGACAA 79 126 361 380 524534 ATCCAGCGATAACCAGGACA 85 444 362 381 524535 CATCCAGCGATAACCAGGAC 90 445 364 383 524536 CACATCCAGCGATAACCAGG 82 446 365 384 524537 ACACATCCAGCGATAACCAG 72 447 366 385 505327 GACACATCCAGCGATAACCA 61 127 367 386 524538 AGACACATCCAGCGATAACC 79 448 368 387 524539 CAGACACATCCAGCGATAAC 73 449 370 389 524540 CGCAGACACATCCAGCGATA 94 450 373 392 524541 CGCCGCAGACACATCCAGCG 84 451 390 409 524542 AGAGGAAGATGATAAAACGC 45 452 393 412 524543 TGAAGAGGAAGATGATAAAA 62 453 396 415 524544 GGATGAAGAGGAAGATGATA 58 454 399 418 524545 GCAGGATGAAGAGGAAGAT G 48 455 402 421 524546 GCAGCAGGATGAAGAGGAA G 60 456 405 424 524547 ATAGCAGCAGGATGAAGAGG 84 457 408 427 524548 GGCATAGCAGCAGGATGAAG 56 458 409 428 524549 AGGCATAGCAGCAGGATGAA 78 459 410 429 524550 GAGGCATAGCAGCAGGATGA 67 460 411 430 505329 TGAGGCATAGCAGCAGGATG 85 136 412 431 509926 ATGAGGCATAGCAGCAGGAT 84 139 413 432 509927 GATGAGGCATAGCAGCAGGA 68 142

414 433 505330 AGATGAGGCATAGCAGCAGG 82 20 415 434 509928 AAGATGAGGCATAGCAGCAG 83 22 416 435 509929 GAAGATGAGGCATAGCAGCA 80 24 417 436 509930 AGAAGATGAGGCATAGCAGC 78 26 418 437 146783 AAGAAGATGAGGCATAGCAG 80 28 419 438 524551 CAAGAAGATGAGGCATAGCA 55 461 422 441 524552 CAACAAGAAGATGAGGCATA 90 462 425 444 524553 AACCAACAAGAAGATGAGGC 82 463 428 447 524554 AAGAACCAACAAGAAGATG А 79 464 431 450 524555 CAGAAGAACCAACAAGAAG А 72 465 434 453 524556 GTCCAGAAGAACCAACAAGA 87 466 437 456 524557 ATAGTCCAGAAGAACCAACA 72 467 440 459 524558 TTGATAGTCCAGAAGAACCA 76 468 443 462 524559 ACCTTGATAGTCCAGAAGAA 78 469 446 465 524560 CATACCTTGATAGTCCAGAA 77 470 449 468 524561 CAACATACCTTGATAGTCCA 69 471 452 471 524562 GGGCAACATACCTTGATAGT 39 472 455 474 524563 AACGGGCAACATACCTTGAT 72 473 456 475 524564 AAACGGGCAACATACCTTGA 86 474 457 476 505332 CAAACGGGCAACATACCTTG 85 166 458 477 524565 ACAAACGGGCAACATACCTT 80 475 459 478 524566 GACAAACGGGCAACATACCT 42 476 461 480 524567 AGGACAAACGGGCAACATAC 47 477 464 483 524568 TAGAGGACAAACGGGCAACA 81 478 467 486 524569 AATTAGAGGACAAACGGGCA 72 479 470 489 524570 TGGAATTAGAGGACAAACGG 84 480 471 490 524571 CTGGAATTAGAGGACAAACG 86 481 472 491 505335 CCTGGAATTAGAGGACAAAC 89 174 473 492 524572 TCCTGGAATTAGAGGACAAA 92 482 474 493 524573 ATCCTGGAATTAGAGGACAA 86 483 476 495 524574 GGATCCTGGAATTAGAGGAC 76 484 479 498 524575 TGAGGATCCTGGAATTAGAG 77 485 482 501 524576 GGTTGAGGATCCTGGAATTA 62 486 485 504 524577 GGTGGTTGAGGATCCTGGAA 73 487 488 507 524578 GCTGGTGGTTGAGGATCCTG 84 488 491 510 524579 CGTGCTGGTGGTTGAGGATC 79 489 494 513 524580 TCCCGTGCTGGTGGTTGAGG 83 490 497 516 524581 TGGTCCCGTGCTGGTGGTTG 66 491 500 519 524582 GCATGGTCCCGTGCTGGTGG 77 492 503 522 524583 TCGGCATGGTCCCGTGCTGG 0 493 506 525 524584 GGTTCGGCATGGTCCCGTGC 56 494

509 528 524585 GCAGGTTCGGCATGGTCCCG 61 495 512 531 524586 CATGCAGGTTCGGCATGGTC 87 496 515 534 524587 AGTCATGCAGGTTCGGCATG 77 497 518 537 524588 AGTAGTCATGCAGGTTCGGC 64 498 521 540 524589 AGCAGTAGTCATGCAGGTTC 61 499 524 543 524590 TTGAGCAGTAGTCATGCAGG 86 500 527 546 524591 TCCTTGAGCAGTAGTCATGC 80 501 530 549 524592 GGTTCCTTGAGCAGTAGTCA 50 502 533 552 524593 AGAGGTTCCTTGAGCAGTAG 61 503 536 555 524594 CATAGAGGTTCCTTGAGCAG 89 504 539 558 524595 ATACATAGAGGTTCCTTGAG 87 505 542 561 524596 GGGATACATAGAGGTTCCTT 0 506 545 564 524597 GGAGGGATACATAGAGGTTC 38 507 548 567 524598 ACAGGAGGGATACATAGAGG 73 508 551 570 524599 GCAACAGGAGGGATACATAG 67 509 554 573 524600 ACAGCAACAGGAGGGATACA 72 510 557 576 524601 GGTACAGCAACAGGAGGGAT 59 511 560 579 524602 TTTGGTACAGCAACAGGAGG 81 512 563 582 524603 AGGTTTGGTACAGCAACAGG 74 513 566 585 524604 CGAAGGTTTGGTACAGCAAC 85 514 569 588 524605 GTCCGAAGGTTTGGTACAGC 76 515 572 591 524606 TCCGTCCGAAGGTTTGGTAC 80 516 575 594 524607 ATTTCCGTCCGAAGGTTTGG 88 517 578 597 524608 GCAATTTCCGTCCGAAGGTT 50 518 581 600 524609 GGTGCAATTTCCGTCCGAAG 55 519 584 603 524610 ACAGGTGCAATTTCCGTCCG 81 520 587 606 524611 AATACAGGTGCAATTTCCGT 88 521 590 609 524612 GGGAATACAGGTGCAATTTC 32 522 593 612 524613 GATGGGAATACAGGTGCAAT 49 523 608 627 524614 AGCCCAGGATGATGGGATGG 89 524 611 630 524615 GAAAGCCCAGGATGATGGGA 71 525 614 633 524616 TCCGAAAGCCCAGGATGATG 86 526 617 636 524617 TTTTCCGAAAGCCCAGGATG 97 527 620 639 524618 GAATTTTCCGAAAGCCCAGG 80 528 623 642 524619 TAGGAATTTTCCGAAAGCCC 95 529 626 645 524620 CCATAGGAATTTTCCGAAAG 88 530 629 648 524621 CTCCCATAGGAATTTTCCGA 83 531 632 651 524622 CCACTCCCATAGGAATTTTC 68 532 635 654 524623 GGCCCACTCCCATAGGAATT 60 533 638 657 524624 TGAGGCCCACTCCCATAGGA 57 534 641 660 524625 GGCTGAGGCCCACTCCCATA 62 535 644 663 524626 ACGGGCTGAGGCCCACTCCC 57 536 647 666 524627 GAAACGGGCTGAGGCCCACT 62 537

650 669 524628 GGAGAAACGGGCTGAGGCCC 31 538 653 672 524629 CCAGGAGAAACGGGCTGAGG 77 539 656 675 524630 GAGCCAGGAGAAACGGGCTG 48 540 659 678 524631 ACTGAGCCAGGAGAAACGGG 43 541 662 681 524632 TAAACTGAGCCAGGAGAAAC 67 542 665 684 524633 TAGTAAACTGAGCCAGGAGA 86 543 668 687 524634 CACTAGTAAACTGAGCCAGG 96 544 669 688 524635 GCACTAGTAAACTGAGCCAG 83 545 671 690 524636 TGGCACTAGTAAACTGAGCC 84 546 672 691 524637 ATGGCACTAGTAAACTGAGC 82 547 674 693 524638 AAATGGCACTAGTAAACTGA 74 548 677 696 524639 AACAAATGGCACTAGTAAAC 63 549 678 697 524640 GAACAAATGGCACTAGTAAA 67 550 679 698 505338 TGAACAAATGGCACTAGTAA 84 186 680 699 524641 CTGAACAAATGGCACTAGTA 95 551 681 700 524642 ACTGAACAAATGGCACTAGT 77 552 682 701 505339 CACTGAACAAATGGCACTAG 95 187 683 702 524643 CCACTGAACAAATGGCACTA 89 553 684 703 524644 ACCACTGAACAAATGGCACT 90 554 686 705 524646 GAACCACTGAACAAATGGCA 82 555 687 706 509931 CGAACCACTGAACAAATGGC 90 39 689 708 524647 TACGAACCACTGAACAAATG 79 556 690 709 146824 CTACGAACCACTGAACAAAT 72 557 692 711 524648 CCCTACGAACCACTGAACAA 73 558 693 712 524649 GCCCTACGAACCACTGAACA 83 559 695 714 524650 AAGCCCTACGAACCACTGAA 82 560 696 715 524651 AAAGCCCTACGAACCACTGA 81 561 697 716 505342 GAAAGCCCTACGAACCACTG 66 198 698 717 524652 GGAAAGCCCTACGAACCACT 59 562 699 718 524653 GGGAAAGCCCTACGAACCAC 46 563 718 737 524654 ACTGAAAGCCAAACAGTGGG 64 564 721 740 524655 ATAACTGAAAGCCAAACAGT 0 565 724 743 524656 CATATAACTGAAAGCCAAAC 70 566 727 746 524657 ATCCATATAACTGAAAGCCA 91 567 730 749 524658 ATCATCCATATAACTGAAAG 69 568 733 752 524659 CACATCATCCATATAACTGA 70 569 736 755 524660 ТАССАСАТСАТССАТАТААС 57 570 739 758 524661 СААТАССАСАТСАТССАТАТ 70 571 742 761 524662 ССССААТАССАСАТСАТССА 85 572 745 764 524663 GGCCCCCAATACCACATCAT 70 573 748 767 524664 CTTGGCCCCCAATACCACAT 82 574 751 770 524665 AGACTTGGCCCCCAATACCA 77 575 754 773 524666 TACAGACTTGGCCCCCAATA 77 576

757 776 524667 CTGTACAGACTTGGCCCCCA 90 577 760 779 524668 ATGCTGTACAGACTTGGCCC 79 578 763 782 524669 AAGATGCTGTACAGACTTGG 79 579 766 785 524670 CTCAAGATGCTGTACAGACT 84 580 769 788 524671 GGACTCAAGATGCTGTACAG 24 581 772 791 524672 AAGGGACTCAAGATGCTGTA 57 582 775 794 524673 AAAAAGGGACTCAAGATGCT 66 583 778 797 524674 GGTAAAAAGGGACTCAAGAT 30 584 781 800 524675 AGCGGTAAAAAGGGACTCAA 68 585 784 803 524676 AACAGCGGTAAAAAGGGACT 67 586 787 806 524677 GGTAACAGCGGTAAAAAGGG 48 587 790 809 524678 ATTGGTAACAGCGGTAAAAA 81 588 793 812 524679 AAAATTGGTAACAGCGGTAA 89 589 796 815 524680 AAGAAAATTGGTAACAGCGG 84 590 799 818 524681 CAAAAGAAAATTGGTAACAG 41 591 802 821 524682 AGACAAAAGAAAATTGGTAA 51 592 805 824 524683 CAAAGACAAAAGAAAATTGG 66 593 808 827 524684 ACCCAAAGACAAAAGAAAAT 61 594 811 830 524685 TATACCCAAAGACAAAAGAA 79 595 814 833 524686 ATGTATACCCAAAGACAAAA 84 596 817 836 524687 TAAATGTATACCCAAAGACA 77 597 820 839 524688 GTTTAAATGTATACCCAAAG 80 598 821 840 524689 GGTTTAAATGTATACCCAAA 71 599 822 841 524690 GGGTTTAAATGTATACCCAA 85 600 823 842 505344 AGGGTTTAAATGTATACCCA 85 206 824 843 524691 TAGGGTTTAAATGTATACCC 90 601 825 844 524692 TTAGGGTTTAAATGTATACC 83 602 827 846 524693 TGTTAGGGTTTAAATGTATA 53 603 830 849 524694 TTTTGTTAGGGTTTAAATGT 67 604 845 864 524695 AACCCCATCTCTTTGTTTTG 81 605 848 867 524696 AGTAACCCCATCTCTTTGTT 71 606 851 870 524697 GAGAGTAACCCCATCTCTTT 65 607 854 873 524698 TCAGAGAGTAACCCCATCTC 96 608 857 876 524699 AATTCAGAGAGTAACCCCAT 94 609 860 879 524700 TAAAATTCAGAGAGTAACCC 71 610 863 882 524701 CCATAAAATTCAGAGAGTAA 90 611 866 885 524702 AACCCATAAAATTCAGAGAG 86 612 869 888 524703 CATAACCCATAAAATTCAGA 72 613 872 891 524704 TGACATAACCCATAAAATTC 81 614 875 894 524705 CAATGACATAACCCATAAAA 81 615 878 897 524706 TTCCAATGACATAACCCATA 95 616 881 900 524707 AACTTCCAATGACATAACCC 91 617 884 903 524708 CATAACTTCCAATGACATAA 83 618

887 906 524709 ACCCATAACTTCCAATGACA 95 619 890 909 524710 AGGACCCATAACTTCCAATG 66 620 893 912 524711 GCAAGGACCCATAACTTCCA 41 621 896 915 524712 GTGGCAAGGACCCATAACTT 53 622 899 918 524713 CTTGTGGCAAGGACCCATAA 91 623 902 921 524714 GTTCTTGTGGCAAGGACCCA 77 624 905 924 524715 TGTGTTCTTGTGGCAAGGAC 90 625 908 927 524716 TGATGTGTTCTTGTGGCAAG 90 626 911 930 524717 GTATGATGTGTTCTTGTGGC 82 627 914 933 524718 TTTGTATGATGTGTTCTTGT 95 628 930 949 524719 AAACATTCTTTGATTTTTTG 61 629 933 952 524720 CTAAAACATTCTTTGATTTT 43 630 936 955 524721 TTTCTAAAACATTCTTTGAT 90 631 939 958 524722 AGTTTTCTAAAACATTCTTT 75 632 942 961 524723 GGAAGTTTTCTAAAACATTC 52 633 945 964 524724 ATAGGAAGTTTTCTAAAACA 74 634 948 967 524725 TTAATAGGAAGTTTTCTAAA 40 635 951 970 524726 CTGTTAATAGGAAGTTTTCT 93 636 954 973 524727 GGCCTGTTAATAGGAAGTTT 87 637 957 976 524728 ATAGGCCTGTTAATAGGAAG 85 638 960 979 524729 TCAATAGGCCTGTTAATAGG 92 639 963 982 524730 CAATCAATAGGCCTGTTAAT 90 640 966 985 524731 TTCCAATCAATAGGCCTGTT 96 641 969 988 524732 ACTTTCCAATCAATAGGCCT 77 642 972 991 146826 CATACTTTCCAATCAATAGG 92 643 975 994 524733 TGACATACTTTCCAATCAAT 91 644 978 997 524734 CGTTGACATACTTTCCAATC 95 645 996 1015 524735 CCCAAAAGACCCACAATTCG 92 646 999 1018 524736 AAACCCAAAAGACCCACAAT 74 647 1002 1021 524737 GCAAAACCCAAAAGACCCAC 85 648 1005 1024 524738 GCAGCAAAACCCAAAAGACC 70 649 1025 1044 524739 AACCACATTGTGTAAATGGG 90 650 1028 1047 524740 GATAACCACATTGTGTAAAT 58 651 1031 1050 524741 CAGGATAACCACATTGTGTA 83 652 1034 1053 524742 ACGCAGGATAACCACATTGT 84 653 1037 1056 524743 TTAACGCAGGATAACCACAT 93 654 1040 1059 524744 GCATTAACGCAGGATAACCA 60 655 1043 1062 524745 AGGGCATTAACGCAGGATAA 58 656 1046 1065 524746 ACAAGGGCATTAACGCAGGA 75 657 1049 1068 524747 CATACAAGGGCATTAACGCA 89 658 1052 1071 524748 ATGCATACAAGGGCATTAAC 87 659 1055 1074 524749 TACATGCATACAAGGGCATT 86 660 1058 1077 524750 GAATACATGCATACAAGGGC 75 661

1061 1080 524751 ATTGAATACATGCATACAAG 81 662 1064 1083 524752 TAGATTGAATACATGCATAC 85 663 1067 1086 524753 GCTTAGATTGAATACATGCA 69 664 1070 1089 524754 CCTGCTTAGATTGAATACAT 90 665 1073 1092 524755 AAGCCTGCTTAGATTGAATA 76 666 1076 1095 524756 TGAAAGCCTGCTTAGATTGA 76 667 1079 1098 524757 AAGTGAAAGCCTGCTTAGAT 68 668 1082 1101 524758 AGAAAGTGAAAGCCTGCTTA 81 669 1085 1104 524759 GCGAGAAAGTGAAAGCCTGC 61 670 1088 1107 524760 TTGGCGAGAAAGTGAAAGCC 89 671 1091 1110 524761 AAGTTGGCGAGAAAGTGAAA 74 672 1094 1113 524762 TGTAAGTTGGCGAGAAAGTG 85 673 1097 1116 524763 CCTTGTAAGTTGGCGAGAAA 90 674 1100 1119 524764 AGGCCTTGTAAGTTGGCGAG 93 675 1103 1122 524765 GAAAGGCCTTGTAAGTTGGC 78 676 1106 1125 524766 ACAGAAAGGCCTTGTAAGTT 76 677 1109 1128 524767 TACACAGAAAGGCCTTGTAA 94 678 1112 1131 524768 GTTTACACAGAAAGGCCTTG 80 679 1115 1134 524769 ATTGTTTACACAGAAAGGCC 83 680 1118 1137 524770 GGTATTGTTTACACAGAAAG 63 681 1121 1140 524771 TCAGGTATTGTTTACACAGA 93 682 1124 1143 524772 GGTTCAGGTATTGTTTACAC 68 683 1127 1146 524773 AAAGGTTCAGGTATTGTTTA 82 684 1130 1149 524774 GGTAAAGGTTCAGGTATTGT 68 685 1150 1169 524775 TGGCCGTTGCCGGGCAACGG 74 686 1153 1172 524776 ACCTGGCCGTTGCCGGGCAA 77 687 1156 1175 524777 CAGACCTGGCCGTTGCCGGG 88 688 1159 1178 524778 GCACAGACCTGGCCGTTGCC 80 689 1162 1181 524779 TTGGCACAGACCTGGCCGTT 85 690 1165 184 524780 CACTTGGCACAGACCTGGCC 93 691 1168 187 524781 AAACACTTGGCACAGACCTG 90 692 1169 188 524782 CAAACACTTGGCACAGACCT 75 693 1170 189 505345 GCAAACACTTGGCACAGACC 78 207 1171 190 524783 AGCAAACACTTGGCACAGAC 84 694 1172 1191 524784 CAGCAAACACTTGGCACAGA 90 695 1174 1193 524785 GTCAGCAAACACTTGGCACA 79 696 1200 1219 524786 ACCAAGCCCCAGCCAGTGGG 57 697 1203 1222 524787 ATGACCAAGCCCCAGCCAGT 74 698 1206 1225 524788 CCCATGACCAAGCCCCAGCC 90 699 1209 1228 524789 TGGCCCATGACCAAGCCCCA 96 700 1212 1231 524790 TGATGGCCCATGACCAAGCC 79 701 1215 1234 524791 CGCTGATGGCCCATGACCAA 97 702 1218 1237 524792 ACGCGCTGATGGCCCATGAC 98 703

1221 1240 524793 CGCACGCGCTGATGGCCCAT 98 704 1224 1243 524794 CCACGCACGCGCTGATGGCC 98 705 1227 1246 524795 GTTCCACGCACGCGCTGATG 98 706 1230 1249 524796 AAGGTTCCACGCACGCGCTG 99 707 1233 1252 524797 GAAAAGGTTCCACGCACGCG 97 708 1236 1255 524798 GCCGAAAAGGTTCCACGCAC 98 709 1239 1258 524799 GGAGCCGAAAAGGTTCCACG 75 710 1242 1261 524800 AGAGGAGCCGAAAAGGTTCC 79 711 1245 1264 524801 GGCAGAGGAGCCGAAAAGGT 98 712 1248 1267 524802 ATCGGCAGAGGAGCCGAAAA 73 713 1251 1270 524803 TGGATCGGCAGAGGAGCCGA 91 714 1254 1273 524804 GTATGGATCGGCAGAGGAGC 98 715 1257 1276 524805 GCAGTATGGATCGGCAGAGG 98 716 1258 1277 524806 CGCAGTATGGATCGGCAGAG 98 717 1259 1278 505346 CCGCAGTATGGATCGGCAGA 98 210 1260 1279 146785 TCCGCAGTATGGATCGGCAG 98 718 1261 1280 524807 TTCCGCAGTATGGATCGGCA 98 719 1262 1281 505347 GTTCCGCAGTATGGATCGGC 98 212 1263 1282 524808 AGTTCCGCAGTATGGATCGG 96 720 1264 1283 524809 GAGTTCCGCAGTATGGATCG 97 721 1266 1285 524810 AGGAGTTCCGCAGTATGGAT 96 722 1269 1288 524811 GCTAGGAGTTCCGCAGTATG 96 723 1272 1291 524812 GCGGCTAGGAGTTCCGCAGT 75 724 1275 1294 524813 CAAGCGGCTAGGAGTTCCGC 86 725 1278 1297 524814 AAACAAGCGGCTAGGAGTTC 73 726 1281 1300 524815 GCAAAACAAGCGGCTAGGAG 71 727 1282 1301 524816 AGCAAAACAAGCGGCTAGGA 89 728 1283 1302 505352 GAGCAAAACAAGCGGCTAGG 76 217 1284 1303 524817 CGAGCAAAACAAGCGGCTAG 78 729 1285 1304 524818 GCGAGCAAAACAAGCGGCTA 71 730 1286 1305 505353 TGCGAGCAAAACAAGCGGCT 82 218 1287 1306 524819 CTGCGAGCAAAACAAGCGGC 82 731 1288 1307 524820 GCTGCGAGCAAAACAAGCGG 67 732 1290 1309 524821 CTGCTGCGAGCAAAACAAGC 79 733 1293 1312 524822 GACCTGCTGCGAGCAAAACA 87 734 1296 1315 524823 CCAGACCTGCTGCGAGCAAA 94 735 1299 1318 524824 GCTCCAGACCTGCTGCGAGC 80 736 1302 1321 524825 TTTGCTCCAGACCTGCTGCG 70 737 1305 1324 524826 ATGTTTGCTCCAGACCTGCT 75 738 1308 1327 524827 ATAATGTTTGCTCCAGACCT 55 739 1311 1330 524828 CCGATAATGTTTGCTCCAGA 87 740 1314 1333 524829 GTCCCGATAATGTTTGCTCC 80 741

1317 1336 524830 TCAGTCCCGATAATGTTTGC 76 742 1320 1339 524831 TTATCAGTCCCGATAATGTT 53 743 1577 1596 146786 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 96 224

Пример 11: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК ИВУ в клетках HepG2.2.15 химерными олигонуклеотидами МОЕ

Дополнительные антисмысловые олигонуклеотиды были разработаны для направленного действия на вирусную нуклеиновую кислоту HBV, и были испытаны на их действие на мРНК HBV in vitro. В этот анализ включили также несколько антисмысловых олигонуклеотидов из исследований, описанных выше. Культивированные клетки HepG2.2.15 при плотности 28000 клеток на лунку трансфицировали при помощи LipofectAMINE 2000® 70 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3370. Уровни мРНК некоторых химерных олигонуклеотидов также измерили при помощи RTS3372. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.

Новые разработанные химерные антисмысловые олигонуклеотиды в Таблицах 24 и 25 были разработаны как 5-10-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды. Эти химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по пять нуклеозидов. Каждый нуклеозид в 5' сегменте крыла, и каждый нуклеозид в 3' сегменте крыла имеет МОЕ модификацию сахара. Каждый нуклеозид в центральном сегменте гэп имеет дезокси-сахарную модификацию. Межнуклеозидные связи в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой фосфотиоатные (P=S) связи. Все цитозиновые остатки в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой 5-метилцитозины.

«Вирусный целевой сайт инициации» указывает 5'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. «Вирусный целевой терминирующий сайт» указывает 3'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. Каждый химерный олигонуклеотид, перечисленный в Таблице 24, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1 (доступ GENBANK №U95551.1). Каждый химерный олигонуклеотид, перечисленный в Таблице 25, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1286 (переставленная версия доступа GENBANK №U95551.1). «Н/и» указывает, что данные ингибирования для этого конкретного химерного олигонуклеотида не были измерены конкретным набором затравочных зондов.

Таблица 24 Ингибирование уровней мРНК HBV действием химерных антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на SEQ ID NO:1 (RTS3370 и RTS3372) Сайт инициации Терминирующий сайт № ISIS Последовательность RTS3370% ингибирование RTS3372% ингибирование SEQ ID NO 1323 1342 524832 GAGTTATCAGTCCCGATAAT 63 н/и 744 1326 1345 524833 ACAGAGTTATCAGTCCCGAT 82 н/и 745 1329 1348 524834 ACAACAGAGTTATCAGTCCC 52 н/и 746 1332 1351 524835 AGGACAACAGAGTTATCAGT 57 н/и 747 1335 1354 524836 GAGAGGACAACAGAGTTATC 49 н/и 748 1338 1357 524837 CGGGAGAGGACAACAGAGTT 0 н/и 749 1341 1360 524838 TTGCGGGAGAGGACAACAGA 17 н/и 750 1344 1363 524839 TATTTGCGGGAGAGGACAAC 30 н/и 751 1347 1366 524840 GTATATTTGCGGGAGAGGAC 22 н/и 752 1350 1369 524841 GATGTATATTTGCGGGAGAG 32 н/и 753 1353 1372 524842 TACGATGTATATTTGCGGGA 76 н/и 754 1356 1375 524843 GGATACGATGTATATTTGCG 76 н/и 755 1359 1378 524844 CATGGATACGATGTATATTT 87 н/и 756 1362 1381 524845 AGCCATGGATACGATGTATA 70 н/и 757 1365 1384 524846 AGCAGCCATGGATACGATGT 22 н/и 758 1368 1387 524847 CCTAGCAGCCATGGATACGA 67 н/и 759 1371 1390 524848 CAGCCTAGCAGCCATGGATA 56 н/и 760 1374 1393 524849 GCACAGCCTAGCAGCCATGG 38 н/и 761 1377 1396 524850 GCAGCACAGCCTAGCAGCCA 11 н/и 762 1380 1399 524851 TTGGCAGCACAGCCTAGCAG 34 н/и 763 1383 1402 524852 CAGTTGGCAGCACAGCCTAG 47 н/и 764

1386 1405 524853 ATCCAGTTGGCAGCACAGCC 45 н/и 765 1389 1408 524854 AGGATCCAGTTGGCAGCACA 36 н/и 766 1392 1411 524855 CGCAGGATCCAGTTGGCAGC 41 н/и 767 1395 1414 524856 CCGCGCAGGATCCAGTTGGC 72 н/и 768 1398 1417 524857 GTCCCGCGCAGGATCCAGTT 55 н/и 769 1457 1476 524858 AGCGACCCCGAGAAGGGTCG 17 н/и 770 1460 1479 524859 CCAAGCGACCCCGAGAAGGG 45 н/и 771 1463 1482 524860 GTCCCAAGCGACCCCGAGAA 8 н/и 772 1466 1485 524861 AGAGTCCCAAGCGACCCCGA 51 н/и 773 1469 1488 524862 GAGAGAGTCCCAAGCGACCC 28 н/и 774 1472 1491 524863 GACGAGAGAGTCCCAAGCGA 37 н/и 775 1492 1511 524864 GAACGGCAGACGGAGAAGGG 27 н/и 776 1498 1517 524866 CGGTCGGAACGGCAGACGGA 78 н/и 777 1501 1520 524867 GGTCGGTCGGAACGGCAGAC 78 н/и 778 1504 1523 524868 CGTGGTCGGTCGGAACGGCA 79 н/и 779 1507 1526 524869 CCCCGTGGTCGGTCGGAACG 70 н/и 780 1510 1529 524870 GCGCCCCGTGGTCGGTCGGA 78 н/и 781 1513 1532 524871 GGTGCGCCCCGTGGTCGGTC 74 н/и 782 1514 1533 524872 AGGTGCGCCCCGTGGTCGGT 63 н/и 783 1515 1534 505354 GAGGTGCGCCCCGTGGTCGG 70 н/и 220 1516 1535 524873 AGAGGTGCGCCCCGTGGTCG 72 н/и 784 1517 1536 524874 GAGAGGTGCGCCCCGTGGTC 49 н/и 785 1518 1537 505355 AGAGAGGTGCGCCCCGTGGT 64 н/и 221 1519 1538 524875 AAGAGAGGTGCGCCCCGTGG 57 н/и 786 1520 1539 524876 AAAGAGAGGTGCGCCCCGTG 63 н/и 787

1521 1540 505356 TAAAGAGAGGTGCGCCCCGT 68 н/и 222 1522 1541 524877 GTAAAGAGAGGTGCGCCCCG 50 н/и 788 1523 1542 524878 CGTAAAGAGAGGTGCGCCCC 64 н/и 789 1550 1569 524879 GATGAGAAGGCACAGACGGG 70 н/и 790 1553 1572 524880 GCAGATGAGAAGGCACAGAC 81 н/и 791 1556 1575 524881 CCGGCAGATGAGAAGGCACA 80 н/и 792 1559 1578 524882 GGTCCGGCAGATGAGAAGGC 84 н/и 793 1562 1581 524883 CACGGTCCGGCAGATGAGAA 79 н/и 794 1565 1584 524884 GCACACGGTCCGGCAGATGA 83 н/и 795 1568 1587 524885 AGTGCACACGGTCCGGCAGA 77 н/и 796 1571 1590 524886 CGAAGTGCACACGGTCCGGC 89 н/и 797 1574 1593 524887 AAGCGAAGTGCACACGGTCC 85 н/и 798 1575 1594 524888 GAAGCGAAGTGCACACGGTC 83 н/и 799 1576 1595 524889 TGAAGCGAAGTGCACACGGT 83 н/и 800 1577 1596 146786 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 88 85 224 1578 1597 524890 GGTGAAGCGAAGTGCACACG 83 н/и 801 1579 1598 524891 AGGTGAAGCGAAGTGCACAC 82 н/и 802 1580 1599 505357 GAGGTGAAGCGAAGTGCACA 79 н/и 803 1581 1600 524892 AGAGGTGAAGCGAAGTGCAC 73 н/и 804 1582 1601 524893 CAGAGGTGAAGCGAAGTGCA 80 н/и 805 1583 1602 505358 GCAGAGGTGAAGCGAAGTGC 84 н/и 226 1584 1603 524894 TGCAGAGGTGAAGCGAAGTG 74 н/и 806 1585 1604 524895 GTGCAGAGGTGAAGCGAAGT 72 н/и 807 1586 1605 505359 CGTGCAGAGGTGAAGCGAAG 78 н/и 227 1604 1623 524896 ACGGTGGTCTCCATGCGACG 79 н/и 808 1607 1626 524897 TTCACGGTGGTCTCCATGCG 75 н/и 809

1630 1649 524898 CCTTGGGCAACATTCGGTGG 77 н/и 810 1633 1652 524899 AGACCTTGGGCAACATTCGG 76 н/и 811 1636 1655 524900 GTAAGACCTTGGGCAACATT 73 н/и 812 1639 1658 524901 TATGTAAGACCTTGGGCAAC 60 н/и 813 1642 1661 524902 TCTTATGTAAGACCTTGGGC 72 н/и 814 1645 1664 524903 TCCTCTTATGTAAGACCTTG 75 н/и 815 1648 1667 524904 GAGTCCTCTTATGTAAGACC 65 н/и 816 1651 1670 524905 CAAGAGTCCTCTTATGTAAG 76 н/и 817 1654 1673 524906 GTCCAAGAGTCCTCTTATGT 78 н/и 818 1657 1676 524907 AGAGTCCAAGAGTCCTCTTA 82 н/и 819 1660 1679 524908 CAGAGAGTCCAAGAGTCCTC 82 н/и 820 1663 1682 524909 TTGCAGAGAGTCCAAGAGTC 76 н/и 821 1666 1685 524910 ACATTGCAGAGAGTCCAAGA 76 н/и 822 1669 1688 524911 TTGACATTGCAGAGAGTCCA 74 н/и 823 1689 1708 524912 GTATGCCTCAAGGTCGGTCG 76 н/и 824 1692 1711 524913 GAAGTATGCCTCAAGGTCGG 73 н/и 825 1695 1714 524914 TTTGAAGTATGCCTCAAGGT 76 н/и 826 1698 1717 524915 GTCTTTGAAGTATGCCTCAA 75 н/и 827 1701 1720 524916 ACAGTCTTTGAAGTATGCCT 77 н/и 828 1704 1723 524917 CAAACAGTCTTTGAAGTATG 55 н/и 829 1707 1726 524918 AAACAAACAGTCTTTGAAGT 59 н/и 830 1710 1729 524919 TTTAAACAAACAGTCTTTGA 53 н/и 831 1713 1732 524920 GTCTTTAAACAAACAGTCTT 3 н/и 832 1716 1735 524921 CCAGTCTTTAAACAAACAGT 75 н/и 833 1719 1738 524922 CTCCCAGTCTTTAAACAAAC 70 н/и 834

1722 1741 524923 CTCCTCCCAGTCTTTAAACA 68 н/и 835 1725 1744 524924 CAACTCCTCCCAGTCTTTAA 62 н/и 836 1728 1747 524925 CCCCAACTCCTCCCAGTCTT 63 н/и 837 1731 1750 524926 CTCCCCCAACTCCTCCCAGT 62 н/и 838 1734 1753 524927 СТССТСССССААСТССТССС 55 н/и 839 1737 1756 524928 ААТСТССТСССССААСТССТ 61 н/и 840 1740 1759 524929 ТСТААТСТССТСССССААСТ 61 н/и 841 1743 1762 524930 ТААТСТААТСТССТСССССА 70 н/и 842 1746 1765 524931 СТТТААТСТААТСТССТССС 74 н/и 843 1749 1768 524932 GACCTTTAATCTAATCTCCT 74 н/и 844 1752 1771 524933 AAAGACCTTTAATCTAATCT 60 н/и 845 1755 1774 524934 TACAAAGACCTTTAATCTAA 55 н/и 846 1758 1777 524935 TAGTACAAAGACCTTTAATC 54 н/и 847 1761 1780 524936 TCCTAGTACAAAGACCTTTA 69 н/и 848 1764 1783 524937 GCCTCCTAGTACAAAGACCT 72 н/и 849 1767 1786 524938 ACAGCCTCCTAGTACAAAGA 60 н/и 850 1770 1789 524939 CCTACAGCCTCCTAGTACAA 66 н/и 851 1773 1792 524940 ATGCCTACAGCCTCCTAGTA 70 н/и 852 1776 1795 524941 TTTATGCCTACAGCCTCCTA 63 н/и 853 1777 1796 524942 ATTTATGCCTACAGCCTCCT 70 н/и 854 1778 1797 509932 AATTTATGCCTACAGCCTCC 68 н/и 46 1779 1798 509933 CAATTTATGCCTACAGCCTC 68 н/и 48 1780 1799 509934 CCAATTTATGCCTACAGCCT 65 н/и 50 1781 1800 509935 ACCAATTTATGCCTACAGCC 64 н/и 52 1782 1801 524943 GACCAATTTATGCCTACAGC 57 н/и 855 1783 1802 524944 AGACCAATTTATGCCTACAG 60 н/и 856

1785 1804 524945 GCAGACCAATTTATGCCTAC 54 н/и 857 1788 1807 524946 TGCGCAGACCAATTTATGCC 68 н/и 858 1791 1810 524947 TGGTGCGCAGACCAATTTAT 64 н/и 859 1794 1813 524948 TGCTGGTGCGCAGACCAATT 75 н/и 860 1797 1816 524949 TGGTGCTGGTGCGCAGACCA 68 н/и 861 1800 1819 524950 GCATGGTGCTGGTGCGCAGA 69 н/и 862 1803 1822 524951 GTTGCATGGTGCTGGTGCGC 59 н/и 863 1807 1826 524952 AAAAGTTGCATGGTGCTGGT 61 н/и 864 1810 1829 524953 TGAAAAAGTTGCATGGTGCT 60 н/и 865 1813 1832 524954 AGGTGAAAAAGTTGCATGGT 61 н/и 866 1816 1835 524955 CAGAGGTGAAAAAGTTGCAT 63 н/и 867 1819 1838 524956 AGGCAGAGGTGAAAAAGTTG 57 н/и 868 1822 1841 524957 ATTAGGCAGAGGTGAAAAAG 50 н/и 869 1823 1842 524958 GATTAGGCAGAGGTGAAAAA 57 н/и 870 1825 1844 524959 ATGATTAGGCAGAGGTGAAA 54 н/и 871 1828 1847 524960 GAGATGATTAGGCAGAGGTG 59 н/и 872 1831 1850 524961 CAAGAGATGATTAGGCAGAG 61 н/и 873 1834 1853 524962 GAACAAGAGATGATTAGGCA 56 н/и 874 1837 1856 524963 CATGAACAAGAGATGATTAG 24 н/и 875 1840 1859 524964 GGACATGAACAAGAGATGAT 54 н/и 876 1843 1862 524965 GTAGGACATGAACAAGAGAT 52 н/и 877 1846 1865 524966 ACAGTAGGACATGAACAAGA 47 н/и 878 1849 1868 524967 TGAACAGTAGGACATGAACA 33 н/и 879 1852 1871 524968 GCTTGAACAGTAGGACATGA 44 н/и 880 1855 1874 524969 GAGGCTTGAACAGTAGGACA 43 н/и 881

1858 1877 524970 TTGGAGGCTTGAACAGTAGG 28 н/и 882 1862 1881 524971 CAGCTTGGAGGCTTGAACAG 30 н/и 883 1871 1890 524972 CCCAAGGCACAGCTTGGAGG 38 н/и 884 1874 1893 524973 CCACCCAAGGCACAGCTTGG 47 н/и 885 1877 1896 524974 AAGCCACCCAAGGCACAGCT 49 н/и 886 1880 1899 524975 CCAAAGCCACCCAAGGCACA 32 н/и 887 1883 1902 524976 GCCCCAAAGCCACCCAAGGC 56 н/и 888 1886 1905 524977 CATGCCCCAAAGCCACCCAA 63 н/и 889 1889 1908 524978 GTCCATGCCCCAAAGCCACC 64 н/и 890 1892 1911 524979 GATGTCCATGCCCCAAAGCC 65 н/и 891 1895 1914 524980 GTCGATGTCCATGCCCCAAA 80 н/и 892 1898 1917 524981 AGGGTCGATGTCCATGCCCC 79 н/и 893 1901 1920 524982 ATAAGGGTCGATGTCCATGC 79 н/и 894 1904 1923 524983 TTTATAAGGGTCGATGTCCA 71 н/и 895 1907 1926 524984 TTCTTTATAAGGGTCGATGT 77 н/и 896 1910 1929 524985 AAATTCTTTATAAGGGTCGA 79 н/и 897 1913 1932 524986 TCCAAATTCTTTATAAGGGT 80 н/и 898 1916 1935 524987 AGCTCCAAATTCTTTATAAG 80 н/и 899 1919 1938 524988 AGTAGCTCCAAATTCTTTAT 76 н/и 900 1922 1941 524989 CACAGTAGCTCCAAATTCTT 59 н/и 901 1925 1944 524990 CTCCACAGTAGCTCCAAATT 46 н/и 902 1928 1947 524991 TAACTCCACAGTAGCTCCAA 63 н/и 903 1931 1950 524992 GAGTAACTCCACAGTAGCTC 65 н/и 904 1934 1953 524993 CGAGAGTAACTCCACAGTAG 69 н/и 905 1937 1956 524994 AAACGAGAGTAACTCCACAG 61 н/и 906 1940 1959 524995 CAAAAACGAGAGTAACTCCA 46 н/и 907

1943 1962 524996 AGGCAAAAACGAGAGTAACT 39 н/и 908 1946 1965 524997 AGAAGGCAAAAACGAGAGTA 53 н/и 909 1949 1968 524998 GTCAGAAGGCAAAAACGAGA 56 н/и 910 1952 1971 524999 GAAGTCAGAAGGCAAAAACG 49 н/и 911 1955 1974 525000 AAAGAAGTCAGAAGGCAAAA 29 н/и 912 1958 1977 525001 AGGAAAGAAGTCAGAAGGCA 41 н/и 913 1961 1980 525002 TGAAGGAAAGAAGTCAGAAG 34 н/и 914 1964 1983 525003 TACTGAAGGAAAGAAGTCAG 26 н/и 915 1984 2003 525004 GCGGTATCTAGAAGATCTCG 24 н/и 916 1987 2006 525005 GAGGCGGTATCTAGAAGATC 29 н/и 917 1990 2009 525006 GCTGAGGCGGTATCTAGAAG 29 н/и 918 1993 2012 525007 AGAGCTGAGGCGGTATCTAG 13 н/и 919 1996 2015 525008 TACAGAGCTGAGGCGGTATC 6 н/и 920 1999 2018 525009 CGATACAGAGCTGAGGCGGT 3 н/и 921 2002 2021 525010 TCCCGATACAGAGCTGAGGC 27 н/и 922 2005 2024 525011 GCTTCCCGATACAGAGCTGA 43 н/и 923 2008 2027 525012 AAGGCTTCCCGATACAGAGC 33 н/и 924 2011 2030 525013 TCTAAGGCTTCCCGATACAG 34 н/и 925 2014 2033 525014 GACTCTAAGGCTTCCCGATA 38 н/и 926 2017 2036 525015 GGAGACTCTAAGGCTTCCCG 16 н/и 927 2020 2039 525016 TCAGGAGACTCTAAGGCTTC 16 н/и 928 2023 2042 525017 TGCTCAGGAGACTCTAAGGC 14 н/и 929 2026 2045 525018 CAATGCTCAGGAGACTCTAA 34 н/и 930 2029 2048 525019 GAACAATGCTCAGGAGACTC 32 н/и 931 2032 2051 525020 GGTGAACAATGCTCAGGAGA 9 н/и 932

2035 2054 525021 TGAGGTGAACAATGCTCAGG 50 н/и 933 2038 2057 525022 TGGTGAGGTGAACAATGCTC 54 н/и 934 2041 2060 525023 GTATGGTGAGGTGAACAATG 47 н/и 935 2044 2063 525024 GCAGTATGGTGAGGTGAACA 40 н/и 936 2047 2066 525025 AGTGCAGTATGGTGAGGTGA 35 н/и 937 2050 2069 525026 CTGAGTGCAGTATGGTGAGG 43 н/и 938 2053 2072 525027 TGCCTGAGTGCAGTATGGTG 45 н/и 939 2056 2075 525028 GCTTGCCTGAGTGCAGTATG 42 н/и 940 2059 2078 525029 ATTGCTTGCCTGAGTGCAGT 39 н/и 941 2062 2081 525030 AGAATTGCTTGCCTGAGTGC 27 н/и 942 2065 2084 525031 CAAAGAATTGCTTGCCTGAG 42 н/и 943 2068 2087 525032 CAGCAAAGAATTGCTTGCCT 49 н/и 944 2071 2090 525033 CCCCAGCAAAGAATTGCTTG 41 н/и 945 2074 2093 525034 TCCCCCCAGCAAAGAATTGC 39 н/и 946 2077 2096 525035 AGTTCCCCCCAGCAAAGAAT 39 н/и 947 2080 2099 525036 ATTAGTTCCCCCCAGCAAAG 43 н/и 948 2083 2102 525037 GTCATTAGTTCCCCCCAGCA 64 н/и 949 2086 2105 525038 AGAGTCATTAGTTCCCCCCA 45 н/и 950 2089 2108 525039 GCTAGAGTCATTAGTTCCCC 58 н/и 951 2092 2111 525040 GTAGCTAGAGTCATTAGTTC 45 н/и 952 2095 2114 525041 CAGGTAGCTAGAGTCATTAG 44 н/и 953 2098 2117 525042 ACCCAGGTAGCTAGAGTCAT 39 н/и 954 2101 2120 525043 CCCACCCAGGTAGCTAGAGT 51 н/и 955 2104 2123 525044 ACACCCACCCAGGTAGCTAG 27 н/и 956 2107 2126 525045 TTAACACCCACCCAGGTAGC 41 н/и 957 2110 2129 525046 AAATTAACACCCACCCAGGT 44 н/и 958

2113 2132 525047 ТССАААТТААСАСССАСССА 29 н/и 959 2116 2135 525048 TCTTCCAAATTAACACCCAC 31 н/и 960 2119 2138 525049 GGATCTTCCAAATTAACACC 42 н/и 961 2122 2141 525050 GCTGGATCTTCCAAATTAAC 53 н/и 962 2125 2144 525051 GATGCTGGATCTTCCAAATT 41 н/и 963 2128 2147 525052 CTAGATGCTGGATCTTCCAA 62 н/и 964 2131 2150 525053 TCTCTAGATGCTGGATCTTC 41 83 965 2134 2153 525054 AGGTCTCTAGATGCTGGATC 26 73 966 2137 2156 525055 ACTAGGTCTCTAGATGCTGG 36 74 967 2140 2159 525056 ACTACTAGGTCTCTAGATGC 22 63 968 2143 2162 525057 CTGACTACTAGGTCTCTAGA 28 80 969 2146 2165 525058 TAACTGACTACTAGGTCTCT 47 83 970 2149 2168 525059 ACATAACTGACTACTAGGTC 31 77 971 2152 2171 525060 TTGACATAACTGACTACTAG 34 75 972 2155 2174 525061 GTGTTGACATAACTGACTAC 42 75 973 2158 2177 525062 TTAGTGTTGACATAACTGAC 48 81 974 2161 2180 525063 ATATTAGTGTTGACATAACT 33 73 975 2164 2183 525064 CCCATATTAGTGTTGACATA 41 82 976 2167 2186 525065 AGGCCCATATTAGTGTTGAC 39 77 977 2170 2189 525066 TTTAGGCCCATATTAGTGTT 46 83 978 2173 2192 525067 AACTTTAGGCCCATATTAGT 38 69 979 2176 2195 525068 CTGAACTTTAGGCCCATATT 41 85 980 2179 2198 525069 TGCCTGAACTTTAGGCCCAT 38 81 981 2182 2201 525070 AGTTGCCTGAACTTTAGGCC 17 67 982 2185 2204 525071 AAGAGTTGCCTGAACTTTAG 27 62 983

2188 2207 525072 CACAAGAGTTGCCTGAACTT 27 64 984 2191 2210 525073 AACCACAAGAGTTGCCTGAA 41 80 985 2194 2213 525074 TGAAACCACAAGAGTTGCCT 32 75 986 2197 2216 525075 ATGTGAAACCACAAGAGTTG 43 67 987 2200 2219 525076 GAAATGTGAAACCACAAGAG 34 74 988 2203 2222 525077 CAAGAAATGTGAAACCACAA 22 65 989 2206 2225 525078 AGACAAGAAATGTGAAACCA 39 70 990 2209 2228 525079 GTGAGACAAGAAATGTGAAA 32 74 991 2212 2231 525080 AAAGTGAGACAAGAAATGTG 30 63 992 2215 2234 525081 CCAAAAGTGAGACAAGAAAT 25 58 993 2218 2237 525082 CTTCCAAAAGTGAGACAAGA 36 74 994 2221 2240 525083 TCTCTTCCAAAAGTGAGACA 42 84 995 2224 2243 525084 GTTTCTCTTCCAAAAGTGAG 33 75 996 2227 2246 525085 ACGGTTTCTCTTCCAAAAGT 32 68 997 2230 2249 525086 ATAACGGTTTCTCTTCCAAA 51 80 998 2233 2252 525087 TCTATAACGGTTTCTCTTCC 36 77 999 2236 2255 525088 TACTCTATAACGGTTTCTCT 23 69 1000 2239 2258 525089 AAATACTCTATAACGGTTTC 45 77 1001 2242 2261 525090 ACCAAATACTCTATAACGGT 57 82 1002 2245 2264 525091 GACACCAAATACTCTATAAC 36 77 1003 2248 2267 525092 AAAGACACCAAATACTCTAT 42 80 1004 2251 2270 525093 CCGAAAGACACCAAATACTC 41 89 1005 2254 2273 525094 ACTCCGAAAGACACCAAATA 29 73 1006 2257 2276 525095 CACACTCCGAAAGACACCAA 33 92 1007 2260 2279 525096 ATCCACACTCCGAAAGACAC 18 74 1008 2263 2282 525097 CGAATCCACACTCCGAAAGA 30 57 1009

2266 2285 525098 GTGCGAATCCACACTCCGAA 28 67 1010 2269 2288 146789 GGAGTGCGAATCCACACTCC 37 72 1011 2272 2291 525099 GGAGGAGTGCGAATCCACAC 36 64 1012 2275 2294 525100 GCTGGAGGAGTGCGAATCCA 52 90 1013 2278 2297 525101 TAAGCTGGAGGAGTGCGAAT 49 96 1014 2281 2300 525102 CTATAAGCTGGAGGAGTGCG 37 96 1015 2284 2303 525103 GGTCTATAAGCTGGAGGAGT 30 97 1016 2287 2306 525104 GGTGGTCTATAAGCTGGAGG 22 77 1017 2290 2309 525105 TTTGGTGGTCTATAAGCTGG 41 76 1018 2293 2312 525106 GCATTTGGTGGTCTATAAGC 39 76 1019 2313 2332 525107 GAAGTGTTGATAGGATAGGG 27 97 1020 2316 2335 525108 CCGGAAGTGTTGATAGGATA 42 97 1021 2319 2338 525109 TTTCCGGAAGTGTTGATAGG 48 99 1022 2322 2341 525110 TAGTTTCCGGAAGTGTTGAT 18 98 1023 2325 2344 525111 CAGTAGTTTCCGGAAGTGTT 19 98 1024 2328 2347 525112 CAACAGTAGTTTCCGGAAGT 29 96 1025 2331 2350 525113 TAACAACAGTAGTTTCCGGA 39 95 1026 2334 2353 525114 GTCTAACAACAGTAGTTTCC 40 99 1027 2369 2388 525115 CGAGGGAGTTCTTCTTCTAG 42 98 1028 2372 2391 525116 AGGCGAGGGAGTTCTTCTTC 31 97 1029 2375 2394 525117 GCGAGGCGAGGGAGTTCTTC 22 98 1030 2379 2398 525118 GTCTGCGAGGCGAGGGAGTT 20 99 1031 2398 2417 525119 CGCGGCGATTGAGACCTTCG 26 97 1032 2401 2420 525120 CGACGCGGCGATTGAGACCT 23 97 1033 2404 2423 525121 CTGCGACGCGGCGATTGAGA 47 92 1034

2407 2426 525122 CTTCTGCGACGCGGCGATTG 27 74 1035 2410 2429 525123 GATCTTCTGCGACGCGGCGA 36 87 1036 2413 2432 146790 TGAGATCTTCTGCGACGCGG 25 85 1037 2416 2435 525124 GATTGAGATCTTCTGCGACG 17 84 1038 2419 2438 525125 CGAGATTGAGATCTTCTGCG 24 82 1039 2422 2441 525126 TCCCGAGATTGAGATCTTCT 29 74 1040 2425 2444 525127 GGTTCCCGAGATTGAGATCT 14 79 1041 2428 2447 525128 TGAGGTTCCCGAGATTGAGA 41 76 1042 2431 2450 525129 CATTGAGGTTCCCGAGATTG 39 72 1043 2434 2453 525130 TAACATTGAGGTTCCCGAGA 37 71 1044 2437 2456 525131 TACTAACATTGAGGTTCCCG 42 76 1045 2440 2459 525132 GAATACTAACATTGAGGTTC 21 75 1046 2443 2462 525133 AAGGAATACTAACATTGAGG 36 75 1047 2446 2465 525134 TCCAAGGAATACTAACATTG 29 77 1048 2449 2468 525135 GAGTCCAAGGAATACTAACA 32 76 1049 2452 2471 525136 TATGAGTCCAAGGAATACTA 23 62 1050 2455 2474 525137 CCTTATGAGTCCAAGGAATA 27 57 1051 2458 2477 525138 CCACCTTATGAGTCCAAGGA 52 82 1052 2461 2480 525139 TCCCCACCTTATGAGTCCAA 46 80 1053 2464 2483 525140 AGTTCCCCACCTTATGAGTC 14 59 1054 2467 2486 525141 TAAAGTTCCCCACCTTATGA 20 45 1055 2470 2489 525142 CAGTAAAGTTCCCCACCTTA 14 72 1056 2473 2492 525143 GACCAGTAAAGTTCCCCACC 30 77 1057 2476 2495 525144 AAAGACCAGTAAAGTTCCCC 19 72 1058 2479 2498 525145 AATAAAGACCAGTAAAGTTC 18 55 1059 2482 2501 525146 AAGAATAAAGACCAGTAAAG 16 51 1060

2485 2504 525147 TAGAAGAATAAAGACCAGTA 22 68 1061 2488 2507 525148 CAGTAGAAGAATAAAGACCA 13 59 1062 2491 2510 525149 GTACAGTAGAAGAATAAAGA 0 45 1063 2494 2513 525150 CAGGTACAGTAGAAGAATAA 31 62 1064 2497 2516 525151 AGACAGGTACAGTAGAAGAA 8 62 1065 2500 2519 525152 TAAAGACAGGTACAGTAGAA 29 61 1066 2503 2522 525153 GATTAAAGACAGGTACAGTA 28 67 1067 2506 2525 525154 GAGGATTAAAGACAGGTACA 38 76 1068 2509 2528 525155 AATGAGGATTAAAGACAGGT 30 72 1069 2512 2531 525156 TCCAATGAGGATTAAAGACA 24 67 1070 2515 2534 525157 TTTTCCAATGAGGATTAAAG 0 44 1071 2518 2537 525158 GTGTTTTCCAATGAGGATTA 20 74 1072 2521 2540 525159 ATGGTGTTTTCCAATGAGGA 30 71 1073 2524 2543 525160 AAGATGGTGTTTTCCAATGA 22 68 1074 2527 2546 525161 GAAAAGATGGTGTTTTCCAA 19 61 1075 2530 2549 525162 TAGGAAAAGATGGTGTTTTC 14 52 1076 2533 2552 525163 TATTAGGAAAAGATGGTGTT 1 47 1077 2536 2555 525164 GTATATTAGGAAAAGATGGT 0 60 1078 2539 2558 525165 AATGTATATTAGGAAAAGAT 0 30 1079 2542 2561 525166 GTAAATGTATATTAGGAAAA 1 18 1080 2545 2564 525167 GGTGTAAATGTATATTAGGA 23 72 1081 2548 2567 525168 CTTGGTGTAAATGTATATTA 32 75 1082 2551 2570 525169 TGTCTTGGTGTAAATGTATA 12 65 1083 2554 2573 525170 TAATGTCTTGGTGTAAATGT 3 51 1084 2557 2576 525171 TGATAATGTCTTGGTGTAAA 24 62 1085

2560 2579 525172 TTTTGATAATGTCTTGGTGT 18 66 1086 2563 2582 525173 ATTTTTTGATAATGTCTTGG 11 63 1087 2566 2585 525174 CACATTTTTTGATAATGTCT 20 68 1088 2569 2588 525175 GTTCACATTTTTTGATAATG 38 68 1089 2572 2591 525176 ACTGTTCACATTTTTTGATA 12 61 1090 2575 2594 525177 CAAACTGTTCACATTTTTTG 25 56 1091 2578 2597 525178 CTACAAACTGTTCACATTTT 21 47 1092 2581 2600 525179 GGCCTACAAACTGTTCACAT 28 83 1093 2584 2603 525180 GTGGGCCTACAAACTGTTCA 7 72 1094 2587 2606 525181 TAAGTGGGCCTACAAACTGT 26 75 1095 2590 2609 525182 CTGTAAGTGGGCCTACAAAC 35 78 1096 2593 2612 525183 TAACTGTAAGTGGGCCTACA 29 69 1097 2596 2615 525184 CATTAACTGTAAGTGGGCCT 22 73 1098 2599 2618 525185 TCTCATTAACTGTAAGTGGG 31 81 1099 2602 2621 525186 TTTTCTCATTAACTGTAAGT 15 58 1100 2605 2624 525187 TTCTTTTCTCATTAACTGTA 14 71 1101 2608 2627 525188 ATCTTCTTTTCTCATTAACT 19 71 1102 2611 2630 525189 GCAATCTTCTTTTCTCATTA 36 79 1103 2614 2633 525190 ATTGCAATCTTCTTTTCTCA 38 82 1104 2617 2636 525191 TCAATTGCAATCTTCTTTTC 23 61 1105 2620 2639 525192 TAATCAATTGCAATCTTCTT 10 67 1106 2623 2642 525193 GCATAATCAATTGCAATCTT 27 71 1107 2626 2645 525194 CAGGCATAATCAATTGCAAT 23 71 1108 2629 2648 525195 TAGCAGGCATAATCAATTGC 30 77 1109 2632 2651 525196 ACCTAGCAGGCATAATCAAT 7 70 1110 2635 2654 525197 AAAACCTAGCAGGCATAATC 47 70 1111

2638 2657 525198 GATAAAACCTAGCAGGCATA 41 81 1112 2641 2660 525199 TTGGATAAAACCTAGCAGGC 30 78 1113 2644 2663 525200 CCTTTGGATAAAACCTAGCA 31 76 1114 2647 2666 525201 TAACCTTTGGATAAAACCTA 25 63 1115 2650 2669 525202 TGGTAACCTTTGGATAAAAC 24 76 1116 2653 2672 525203 ATTTGGTAACCTTTGGATAA 20 64 1117 2656 2675 525204 AATATTTGGTAACCTTTGGA 16 77 1118 2659 2678 525205 GTAAATATTTGGTAACCTTT 39 80 1119 2662 2681 525206 ATGGTAAATATTTGGTAACC 40 75 1120 2665 2684 525207 CCAATGGTAAATATTTGGTA 38 75 1121 2668 2687 525208 TATCCAATGGTAAATATTTG 0 0 1122 2671 2690 525209 CCTTATCCAATGGTAAATAT 28 57 1123 2674 2693 525210 TACCCTTATCCAATGGTAAA 18 71 1124 2677 2696 525211 TAATACCCTTATCCAATGGT 35 76 1125 2680 2699 525212 GTTTAATACCCTTATCCAAT 41 77 1126 2683 2702 525213 AAGGTTTAATACCCTTATCC 11 79 1127 2686 2705 525214 AATAAGGTTTAATACCCTTA 35 75 1128 2689 2708 525215 GATAATAAGGTTTAATACCC 22 54 1129 2692 2711 525216 CTGGATAATAAGGTTTAATA 19 35 1130 2695 2714 525217 GTTCTGGATAATAAGGTTTA 24 58 1131 2698 2717 525218 GATGTTCTGGATAATAAGGT 20 73 1132 2701 2720 525219 CTAGATGTTCTGGATAATAA 26 66 1133 2704 2723 525220 TAACTAGATGTTCTGGATAA 21 66 1134 2707 2726 525221 GATTAACTAGATGTTCTGGA 30 78 1135 2710 2729 525222 AATGATTAACTAGATGTTCT 30 61 1136

2713 2732 525223 AGTAATGATTAACTAGATGT 9 57 1137 2716 2735 525224 GGAAGTAATGATTAACTAGA 18 72 1138 2719 2738 525225 TTTGGAAGTAATGATTAACT 7 67 1139 2722 2741 525226 TAGTTTGGAAGTAATGATTA 2 30 1140 2725 2744 525227 GTCTAGTTTGGAAGTAATGA 27 78 1141 2728 2747 525228 AGTGTCTAGTTTGGAAGTAA 27 75 1142 2731 2750 525229 AATAGTGTCTAGTTTGGAAG 34 73 1143 2734 2753 525230 GTAAATAGTGTCTAGTTTGG 28 68 1144 2737 2756 525231 TGTGTAAATAGTGTCTAGTT 27 79 1145 2740 2759 525232 GAGTGTGTAAATAGTGTCTA 27 71 1146 2743 2762 525233 ATAGAGTGTGTAAATAGTGT 17 75 1147 2746 2765 525234 TCCATAGAGTGTGTAAATAG 18 75 1148 2749 2768 525235 CCTTCCATAGAGTGTGTAAA 23 80 1149 2752 2771 525236 CCGCCTTCCATAGAGTGTGT 26 82 1150 2755 2774 525237 TACCCGCCTTCCATAGAGTG 19 80 1151 2758 2777 525238 ATATACCCGCCTTCCATAGA 0 67 1152 2761 2780 525239 ATAATATACCCGCCTTCCAT 19 70 1153 2764 2783 525240 TATATAATATACCCGCCTTC 9 73 1154 2767 2786 525241 TCTTATATAATATACCCGCC 20 80 1155 2770 2789 525242 CTCTCTTATATAATATACCC 29 76 1156 2773 2792 525243 TTTCTCTCTTATATAATATA 16 58 1157 2776 2795 525244 TTGTTTCTCTCTTATATAAT 26 57 1158 2779 2798 525245 GTGTTGTTTCTCTCTTATAT 35 85 1159 2782 2801 525246 TATGTGTTGTTTCTCTCTTA 34 82 1160 2785 2804 525247 CGCTATGTGTTGTTTCTCTC 34 86 1161 2802 2821 525248 TGACCCACAAAATGAGGCGC 17 71 1162

2805 2824 525249 TGGTGACCCACAAAATGAGG 31 67 1163 2808 2827 525250 ATATGGTGACCCACAAAATG 38 69 1164 2811 2830 525251 AGAATATGGTGACCCACAAA 37 77 1165 2814 2833 525252 CCAAGAATATGGTGACCCAC 35 79 1166 2817 2836 146831 TTCCCAAGAATATGGTGACC 27 75 1167 2820 2839 525253 TTGTTCCCAAGAATATGGTG 33 69 1168 2823 2842 525254 ATCTTGTTCCCAAGAATATG 27 65 1169 2826 2845 525255 TAGATCTTGTTCCCAAGAAT 31 70 1170 2829 2848 525256 CTGTAGATCTTGTTCCCAAG 42 81 1171 2832 2851 525257 ATGCTGTAGATCTTGTTCCC 34 80 1172 2835 2854 525258 CCCATGCTGTAGATCTTGTT 38 80 1173 2838 2857 525259 TGCCCCATGCTGTAGATCTT 36 80 1174 2841 2860 525260 TTCTGCCCCATGCTGTAGAT 32 74 1175 2844 2863 525261 AGATTCTGCCCCATGCTGTA 27 75 1176 2847 2866 525262 GAAAGATTCTGCCCCATGCT 34 70 1177 2850 2869 525263 GTGGAAAGATTCTGCCCCAT 22 76 1178 2853 2872 525264 CTGGTGGAAAGATTCTGCCC 36 72 1179 2856 2875 525265 TTGCTGGTGGAAAGATTCTG 32 71 1180 2859 2878 525266 GGATTGCTGGTGGAAAGATT 20 74 1181 2862 2881 525267 AGAGGATTGCTGGTGGAAAG 25 73 1182 2865 2884 525268 CCCAGAGGATTGCTGGTGGA 40 82 1183 2868 2887 525269 AATCCCAGAGGATTGCTGGT 32 79 1184 2871 2890 525270 AAGAATCCCAGAGGATTGCT 23 69 1185 2874 2893 525271 GGAAAGAATCCCAGAGGATT 10 66 1186 2877 2896 525272 TCGGGAAAGAATCCCAGAGG 29 73 1187

2880 2899 525273 TGGTCGGGAAAGAATCCCAG 31 77 1188 2883 2902 525274 TGGTGGTCGGGAAAGAATCC 38 71 1189 2886 2905 525275 AACTGGTGGTCGGGAAAGAA 33 78 1190 2889 2908 525276 TCCAACTGGTGGTCGGGAAA 29 76 1191 2892 2911 525277 GGATCCAACTGGTGGTCGGG 19 81 1192 2895 2914 525278 GCTGGATCCAACTGGTGGTC 24 74 1193 2898 2917 525279 AAGGCTGGATCCAACTGGTG 33 83 1194 2901 2920 525280 CTGAAGGCTGGATCCAACTG 18 81 1195 2904 2923 525286 GCTCTGAAGGCTGGATCCAA 40 79 1196 2907 2926 525287 TTTGCTCTGAAGGCTGGATC 34 69 1197 2910 2929 525288 GTGTTTGCTCTGAAGGCTGG 38 72 1198 2913 2932 525289 GCTGTGTTTGCTCTGAAGGC 40 82 1199 2916 2935 525290 TTTGCTGTGTTTGCTCTGAA 44 78 1200 2919 2938 525291 GGATTTGCTGTGTTTGCTCT 38 76 1201 2922 2941 525292 TCTGGATTTGCTGTGTTTGC 28 79 1202 2925 2944 525293 CAATCTGGATTTGCTGTGTT 26 61 1203 2928 2947 525294 TCCCAATCTGGATTTGCTGT 32 68 1204 2931 2950 525295 AAGTCCCAATCTGGATTTGC 33 59 1205 2934 2953 146832 TTGAAGTCCCAATCTGGATT 17 35 1206 2937 2956 525296 GGATTGAAGTCCCAATCTGG 35 62 1207 2940 2959 525297 TTGGGATTGAAGTCCCAATC 10 36 1208 2943 2962 525298 TTGTTGGGATTGAAGTCCCA 24 49 1209 2946 2965 525299 TCCTTGTTGGGATTGAAGTC 16 52 1210 2949 2968 525300 GTGTCCTTGTTGGGATTGAA 18 71 1211 2952 2971 525301 CAGGTGTCCTTGTTGGGATT 25 73 1212 2955 2974 525302 GGCCAGGTGTCCTTGTTGGG 31 70 1213

2958 2977 525303 TCTGGCCAGGTGTCCTTGTT 29 75 1214 2978 2997 525304 CAGCTCCTACCTTGTTGGCG 29 71 1215 2981 3000 525305 CTCCAGCTCCTACCTTGTTG 19 63 1216 2984 3003 525306 ATGCTCCAGCTCCTACCTTG 35 75 1217 2987 3006 525307 CGAATGCTCCAGCTCCTACC 13 77 1218 2990 3009 525308 GCCCGAATGCTCCAGCTCCT 28 72 1219 2993 3012 525309 CCAGCCCGAATGCTCCAGCT 32 77 1220 2996 3015 525310 AACCCAGCCCGAATGCTCCA 34 72 1221 2999 3018 525311 TGAAACCCAGCCCGAATGCT 28 69 1222 3002 3021 525312 GGGTGAAACCCAGCCCGAAT 18 68 1223 3020 3039 525313 AAAGGCCTCCGTGCGGTGGG 36 77 1224 3023 3042 525314 CCAAAAGGCCTCCGTGCGGT 34 83 1225 3026 3045 525315 ACCCCAAAAGGCCTCCGTGC 28 70 1226 3029 3048 525316 TCCACCCCAAAAGGCCTCCG 26 65 1227 3032 3051 525317 GGCTCCACCCCAAAAGGCCT 19 36 1228 3035 3054 525318 GAGGGCTCCACCCCAAAAGG 14 36 1229 3038 3057 525319 CCTGAGGGCTCCACCCCAAA 32 71 1230 3041 3060 525320 GAGCCTGAGGGCTCCACCCC 37 61 1231 3044 3063 525321 CCTGAGCCTGAGGGCTCCAC 42 70 1232 3047 3066 525322 TGCCCTGAGCCTGAGGGCTC 24 56 1233 3050 3069 525323 GTATGCCCTGAGCCTGAGGG 14 75 1234 3053 3072 525324 GTAGTATGCCCTGAGCCTGA 29 83 1235 3056 3075 525325 TTTGTAGTATGCCCTGAGCC 32 61 1236 3059 3078 525326 AAGTTTGTAGTATGCCCTGA 35 70 1237 3062 3081 525327 GCAAAGTTTGTAGTATGCCC 37 61 1238

3065 3084 525328 CTGGCAAAGTTTGTAGTATG 26 63 1239 3068 3087 525329 TTGCTGGCAAAGTTTGTAGT 37 74 1240 3071 3090 525330 GATTTGCTGGCAAAGTTTGT 20 56 1241 3074 3093 525331 GCGGATTTGCTGGCAAAGTT 28 80 1242 3077 3096 525332 GAGGCGGATTTGCTGGCAAA 38 74 1243 3080 3099 525333 CAGGAGGCGGATTTGCTGGC 41 66 1244 3083 3102 525334 AGGCAGGAGGCGGATTTGCT 27 55 1245 3086 3105 525335 TGGAGGCAGGAGGCGGATTT 13 17 1246 3089 3108 525336 TGGTGGAGGCAGGAGGCGGA 7 21 1247 3092 3111 525337 GATTGGTGGAGGCAGGAGGC 21 44 1248 3095 3114 525338 GGCGATTGGTGGAGGCAGGA 31 65 1249 3098 3117 525339 TCTGGCGATTGGTGGAGGCA 15 76 1250 3101 3120 525340 CTGTCTGGCGATTGGTGGAG 35 73 1251 3104 3123 525341 TTCCTGTCTGGCGATTGGTG 32 72 1252 3107 3126 525342 GCCTTCCTGTCTGGCGATTG 28 64 1253 3110 3129 525343 GCTGCCTTCCTGTCTGGCGA 25 69 1254 3113 3132 525344 TAGGCTGCCTTCCTGTCTGG 32 79 1255 3116 3135 525345 GGGTAGGCTGCCTTCCTGTC 35 80 1256 3134 3153 525346 TCAAAGGTGGAGACAGCGGG 4 57 1257 3137 3156 525347 TTCTCAAAGGTGGAGACAGC 32 72 1258 3140 3159 525348 TGTTTCTCAAAGGTGGAGAC 32 66 1259 3143 3162 525349 GAGTGTTTCTCAAAGGTGGA 34 63 1260 3146 3165 525350 GATGAGTGTTTCTCAAAGGT 35 68 1261 3149 3168 525351 GAGGATGAGTGTTTCTCAAA 36 84 1262 3152 3171 525352 CCTGAGGATGAGTGTTTCTC 44 77 1263 3155 3174 52535 TGGCCTGAGGATGAGTGTTT 32 72 1264

3158 3177 525354 GCATGGCCTGAGGATGAGTG 27 73 1265 3162 3181 525355 CACTGCATGGCCTGAGGATG 40 69 1266 Таблица 25 Ингибирование уровней мРНК HBV действием химерных антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на SEQ ID NO:1286 (RTS3370 и RTS3372) Вирусный сайт инициации Вирусный терминирующий сайт № ISIS Последовательность RTS3370% ингибирование RTS3372% ингибирование SEQ ID NO 85 104 525356 TTCCACTGCATGGCCTGAGG 53 78 1267 88 107 525357 GAATTCCACTGCATGGCCTG 44 68 1268 91 110 525358 GTGGAATTCCACTGCATGGC 42 80 1269 94 113 525359 GTTGTGGAATTCCACTGCAT 45 77 1270 97 116 525360 AAGGTTGTGGAATTCCACTG 65 67 1271 100 119 525361 TGAAAGGTTGTGGAATTCCA 56 61 1272

Пример 12: Зависимое от дозы ингибирование вирусной РНК HBV в клетках HepG2.2.15 химерными олигонуклеотидами МОЕ

Некоторые химерные олигонуклеотиды из исследования, описанного в Примерах 11 и 12, испытали при различных дозах в клетках HepG2.2.15 человека. Клетки поместили на планшет при плотности 28 ООО клеток на лунку и трансфицировали при помощи реагента LipofectAMINE 2000® антисмысловыми олигонуклеотидами в концентрациях 5, 56 нМ, 16,67 нМ, 50,0 нМ и 150,0 нМ, как показано в Таблице 26. Примерно через 16 часов обработки, РНК выделили из клеток, и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3370. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.

Полумаксимальные ингибирующие концентрации (IC50) каждого олигонуклеотида также представлены в Таблице 26. Как показано в Таблице 26, в клетках, обработанных антисмысловыми олигонуклеотидами, уровни мРНК HBV снизились зависимым от дозы образом.

Таблица 26 Зависимое от дозы антисмысловое ингибирование РНК HBV в клетках HepG2.2.15 с использованием RTS3370 № ISIS 5, 5556 нМ 16,6667 нМ 50,0 нМ 150,0 нМ IC50 (нМ) 146785 0 0 14 66 120,8 146786 40 64 78 88 8, 5 505314 23 35 58 84 28,8 505339 28 42 62 84 23,2 505347 9 21 45 75 53, 5 514469 11 22 69 79 35,4 524493 13 39 56 81 32,8 524540 15 38 54 80 34,0 524617 14 32 78 83 27,1 524619 33 42 60 84 21,3 524634 20 45 63 80 26,3 524641 39 49 62 86 14,9 524698 34 34 49 64 47,4 524699 25 31 44 63 66,1 524706 29 20 36 58 128,8 524709 32 26 48 56 89,1 524718 46 41 61 79 15,8 524731 49 53 68 83 8,1 524734 42 31 35 64 87,2 524767 19 38 62 84 27,8 524768 35 38 62 75 23, 5 524769 16 26 61 75 38,1 524806 0 0 0 35 >150,0 524807 3 22 39 74 60,2 524907 22 35 63 80 29,1 524908 25 45 67 78 22,9 524976 7 3 0 16 >150,0 524978 6 0 0 27 >150,0 524979 3 0 11 34 >150,0 524980 18 51 48 59 51, 5 524981 16 27 49 61 65,8 524982 21 19 29 54 >150,0 524983 23 40 50 60 53,2 524984 19 25 45 74 50,0 524985 13 19 40 56 107,2 524986 29 48 46 64 39,3 524987 17 0 43 61 102,8

524988 22 39 52 63 47,6 524991 0 7 19 20 >150,0 524997 17 0 1 9 >150,0 524998 1 5 8 34 >150,0 525095 5 0 0 18 >150,0 525100 14 5 14 26 >150,0 525101 0 0 15 19 >150,0 525102 0 0 18 23 >150,0 525103 0 0 3 15 >150,0 525179 18 7 9 18 >150,0 525245 0 0 8 8 >150,0 525247 12 15 16 23 >150,0 525289 1 1 15 30 >150,0 525314 17 0 18 25 >150,0 525324 0 6 13 16 >150,0 525351 28 13 22 30 >150,0

Некоторые ISIS-олигонуклеотиды испытали также с использованием набора затравочных зондов RTS3372. Результаты представлены в Таблице 27.

Таблица 27 Зависимое от дозы антисмысловое ингибирование РНК HBV в клетках HepG2.2.15 с использованием RTS3372 № ISIS 5, 5556 нМ 16,6667 нМ 50,0 нМ 150,0 нМ IC50 (нМ) 146785 0 0 0 51 >150,0 146786 41 68 81 91 7,9 505347 0 13 44 75 59,7 524103 0 0 1 9 >150,0 524245 0 0 6 10 >150,0 524767 18 46 60 85 25,8 524768 34 41 66 79 20, 5 524769 12 38 60 77 34, 5 524806 0 0 0 0 >150,0 524807 0 9 34 70 78,6 524907 20 41 62 84 26,4 524908 27 45 66 82 21,3 524976 0 0 0 16 >150,0 524978 3 0 0 22 >150,0 524979 0 0 0 33 >150,0 524980 28 51 52 67 30,1 524981 7 29 51 66 55,8

524982 22 29 37 63 83, 5 524983 20 51 43 62 50,9 524984 20 30 38 75 51,7 524985 30 33 40 60 83,6 524986 25 51 51 66 33,8 524987 19 0 24 65 157,6 524988 12 41 45 62 59,2 524991 0 0 4 8 >150,0 524997 19 0 0 15 >150,0 524998 0 0 1 42 >150,0 525095 0 0 0 17 >150,0 525100 10 0 4 19 >150,0 525101 10 0 21 25 >150,0 525102 0 0 10 15 >150,0 525247 11 12 15 28 >150,0 525289 0 9 11 33 >150,0 525314 1 0 18 24 >150,0 525324 9 8 15 10 >150,0

Пример 13: Зависимое от дозы ингибирование вирусной РНК HBV в клетках HepG2.2.15 химерными олигонуклеотидами МОЕ

Некоторые химерные олигонуклеотиды из исследований, описанных выше, испытали при различных дозах на клетках HepG2.2.15 человека. Клетки поместили на планшет при плотности 30000 клеток на лунку и трансфицировали при помощи реагента LipofectAMINE 2000® антисмысловыми олигонуклеотидами в концентрациях 7,8125 нМ, 15,625 нМ, 31,25 нМ, 62, 5 нМ, 125,0 нМ и 250,0 нМ, как показано в Таблице 28. Примерно через 16 часов обработки, РНК выделили из клеток, и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3370. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.

Полумаксимальные ингибирующие концентрации (ICso) каждого олигонуклеотида также представлены в Таблице 28. Как показано в Таблице 28, в некоторых клетках, обработанных антисмысловыми олигонуклеотидами, уровни мРНК HBV снизились зависимым от дозы образом.

Таблица 28 Зависимое от дозы антисмысловое ингибирование РНК HBV в клетках HepG2.2.15 с использованием RTS3370 № ISIS 7,8125 нМ 15,625 нМ 31,25 нМ 62, 5 нМ 125,0 нМ 250,0 нМ IC50 (нМ) 146786 0 0 14 49 33 50 161,2 510100 0 17 30 28 44 53 177,8 510106 0 4 0 0 29 0 >250,0 509934 0 0 0 7 16 0 >250,0 510116 0 0 8 21 27 25 >250,0 505347 31 3 30 63 80 81 48,7

Пример 14: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК HBV в клетках HepG2 химерными олигонуклеотидами МОЕ

Антисмысловые олигонуклеотиды были разработаны для направленного действия на вирусную нуклеиновую кислоту HBV, и были испытаны на их действие на мРНК HBV in vitro. Антисмысловые олигонуклеотиды испытали в серии экспериментов, имеющих такие же культуральные условия. Результаты каждого эксперимента представлены в отдельных таблицах. Включили также ISIS 146786, 509934, ISIS 509959 и ISIS 510100 из исследований, описанных выше. Культивированные клетки HepG2 при плотности 28000 клеток на лунку трансфицировали при помощи LipofectAMINE 2000® 70 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПНР в реальном времени. Набор вирусных затравочных зондов RTS3370 (прямая последовательность CTTGGTCATGGGCCATCAG, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:2; обратная последовательность CGGCTAGGAGTTCCGCAGTA, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO: 3; последовательность зонда TGCGTGGAACCTTTTCGGCTCC, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:4) использовали для измерения уровней мРНК. Уровни измерили также с использованием набора затравочных зондов RTS3371 (прямая последовательность CCAAACCTTCGGACGGAAA, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:311; обратная последовательность TGAGGCCCACTCCCATAGG, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO: 312; последовательность зонда CCCATCATCCTGGGCTTTCGGAAAAT, в настоящем документе обозначена как SEQ Ю NO: 313). Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками. В некоторых анализах, показанных в Таблицах 32, 35, 42, 45 и 46, эффективность ISIS 146786 измерили в двух лунках на одном планшете. В этих случаях представлены значения уровней ингибирования в обеих лунках.

Новые разработанные химерные антисмысловые олигонуклеотиды в Таблицах ниже были разработаны как 2-9-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 2-9-6 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 2-10-8 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 3-9-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 3-9-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 3-10-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 3-10-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 3-10-7 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 4-9-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 4-9-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 4-10-6 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 5-9-2 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 5-9-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 5-10-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 6-9-2 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 6-10-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды, 7-10-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды или 8-10-2 МОЕ химерные олигонуклеотиды. 2-9-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 16 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит девять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие два и пять нуклеозидов, соответственно. 2-9-6 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 17 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит девять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие два и шесть нуклеозидов, соответственно. 2-10-8 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие два и восемь нуклеозидов, соответственно. 3-9-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 16 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит девять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие три и четыре нуклеозида, соответственно. 3-9-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 17 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит девять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие три и пять нуклеозидов, соответственно. 3-10-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 16 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по три нуклеозида. 3-10-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 17 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие три и четыре нуклеозида, соответственно. 3-10-7 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие три и семь нуклеозидов, соответственно. 4-9-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 16 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит девять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие четыре и три нуклеозида, соответственно. 4-9-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 17 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит девять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по четыре нуклеозидов. 4-10-6 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие четыре и шесть нуклеозидов, соответственно. 5-9-2 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 16 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит девять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие пять и два нуклеозида, соответственно. 5-9-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 17 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит девять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие пять и три нуклеозида, соответственно. 5-10-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по пять нуклеозидов. 6-9-2 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 17 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит девять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие шесть и два нуклеозида, соответственно. 6-10-4 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие шесть и четыре нуклеозида, соответственно. 7-10-3 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие семь и три нуклеозида, соответственно. 8-10-2 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие восемь и два нуклеозида, соответственно. Каждый нуклеозид в 5' сегменте крыла, и каждый нуклеозид в 3' сегменте крыла имеет МОЕ модификацию сахара. Колонка «мотив» указывает мотивы с количеством нуклеозидов в крыльях и сегменте гэп каждого олигонуклеотида. Межнуклеозидные связи в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой фосфотиоатные (P=S) связи. Все цитозиновые остатки в каждом олигонуклеотиде представляют собой 5-метилцитозины.

«Вирусный целевой сайт инициации» указывает 5'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. «Вирусный целевой терминирующий сайт» указывает 3'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. Колонка «мотив» указывает структуру гэп и крыльев каждого химерного олигонуклеотида. Каждый химерный олигонуклеотид, перечисленный в Таблицах, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1 (доступ GENBANK №LJ95551.1). Эффективность новых разработанных олигонуклеотидов сравнили с ISIS 146786, 509934, ISIS 509959 и 510100, информация для которых помещена в верхнюю часть каждой таблице.

Таблица 29 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3370 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 146786 5-10-5 50 224 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 510100 3-10-4 62 17 58 74 CTGGAGCCACCAGCAGG 552276 5-9-3 42 1288 59 75 ACTGGAGCCACCAGCAG 552277 5-9-3 46 1289 60 76 AACTGGAGCCACCAGCA 552278 5-9-3 31 1290 61 77 GAACTGGAGCCACCAGC 552279 5-9-3 41 1291 253 269 GAAGTCCACCACGAGTC 552280 5-9-3 5 9 254 270 AGAAGTCCACCACGAGT 552281 5-9-3 11 10 255 271 GAGAAGTCCACCACGAG 552282 5-9-3 20 11 256 272 AGAGAAGTCCACCACGA 552283 5-9-3 28 12 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 552230 4-9-4 57 17 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 552284 5-9-3 0 17 412 428 AGGCATAGCAGCAGGAT 552231 4-9-4 29 18 412 428 AGGCATAGCAGCAGGAT 552285 5-9-3 61 18 413 429 GAGGCATAGCAGCAGGA 552232 4-9-4 35 19 413 429 GAGGCATAGCAGCAGGA 552286 5-9-3 47 19 414 430 TGAGGCATAGCAGCAGG 552233 4-9-4 38 21 414 430 TGAGGCATAGCAGCAGG 552287 5-9-3 45 21 415 431 ATGAGGCATAGCAGCAG 552234 4-9-4 0 23 415 431 ATGAGGCATAGCAGCAG 552288 5-9-3 50 23 416 432 GATGAGGCATAGCAGCA 552235 4-9-4 0 25 416 432 GATGAGGCATAGCAGCA 552289 5-9-3 46 25 417 433 AGATGAGGCATAGCAGC 552236 4-9-4 45 27 417 433 AGATGAGGCATAGCAGC 552290 5-9-3 41 27 418 434 AAGATGAGGCATAGCAG 552237 4-9-4 44 29 418 434 AAGATGAGGCATAGCAG 552291 5-9-3 26 29 670 686 ACTAGTAAACTGAGCCA 552239 4-9-4 62 1292 670 686 ACTAGTAAACTGAGCCA 552293 5-9-3 67 1292 671 687 CACTAGTAAACTGAGCC 552240 4-9-4 61 1293 671 687 CACTAGTAAACTGAGCC 552294 5-9-3 71 1293

672 688 GCACTAGTAAACTGAGC 552241 4-9-4 55 1294 672 688 GCACTAGTAAACTGAGC 552295 5-9-3 58 1294 687 703 ACCACTGAACAAATGGC 552242 4-9-4 60 40 687 703 ACCACTGAACAAATGGC 552296 5-9-3 59 40 688 704 AACCACTGAACAAATGG 552243 4-9-4 57 41 688 704 AACCACTGAACAAATGG 552297 5-9-3 55 41 689 705 GAACCACTGAACAAATG 552244 4-9-4 33 42 689 705 GAACCACTGAACAAATG 552298 5-9-3 48 42 690 706 CGAACCACTGAACAAAT 552245 4-9-4 48 43 690 706 CGAACCACTGAACAAAT 552299 5-9-3 34 43 1261 1277 CGCAGTATGGATCGGCA 552246 4-9-4 81 1295 1261 1277 CGCAGTATGGATCGGCA 552300 5-9-3 56 1295 1262 1278 CCGCAGTATGGATCGGC 552247 4-9-4 87 1296 1262 1278 CCGCAGTATGGATCGGC 552301 5-9-3 86 1296 1263 1279 TCCGCAGTATGGATCGG 552248 4-9-4 72 1297 1263 1279 TCCGCAGTATGGATCGG 552302 5-9-3 77 1297 1264 1280 TTCCGCAGTATGGATCG 552249 4-9-4 56 1298 1264 1280 TTCCGCAGTATGGATCG 552303 5-9-3 65 1298 1265 1281 GTTCCGCAGTATGGATC 552250 4-9-4 52 1299 1265 1281 GTTCCGCAGTATGGATC 552304 5-9-3 57 1299 1266 1282 AGTTCCGCAGTATGGAT 552251 4-9-4 43 1300 1266 1282 AGTTCCGCAGTATGGAT 552305 5-9-3 56 1300 1267 1283 GAGTTCCGCAGTATGGA 552252 4-9-4 62 1301 1267 1283 GAGTTCCGCAGTATGGA 552306 5-9-3 75 1301 1268 1284 GGAGTTCCGCAGTATGG 552253 4-9-4 82 1302 1268 1284 GGAGTTCCGCAGTATGG 552307 5-9-3 90 1302 1269 1285 AGGAGTTCCGCAGTATG 552254 4-9-4 74 1303 1577 1593 AAGCGAAGTGCACACGG 552255 4-9-4 78 1304 1578 1594 GAAGCGAAGTGCACACG 552256 4-9-4 65 1305 1579 1595 TGAAGCGAAGTGCACAC 552257 4-9-4 62 1306 1580 1596 GTGAAGCGAAGTGCACA 552258 4-9-4 72 1307 1581 1597 GGTGAAGCGAAGTGCAC 552259 4-9-4 63 1308 1582 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCA 552260 4-9-4 58 1309 1583 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGC 552261 4-9-4 63 1310 1584 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTG 552262 4-9-4 50 1311 1585 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGT 552263 4-9-4 60 1312 1586 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAG 552264 4-9-4 52 1313 1587 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAA 552265 4-9-4 68 1314 1588 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGA 552266 4-9-4 62 1315 1589 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCG 552267 4-9-4 58 1316 1590 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGC 552268 4-9-4 62 1317 1778 1794 TTATGCCTACAGCCTCC 552269 4-9-4 52 47 1779 1795 TTTATGCCTACAGCCTC 552270 4-9-4 54 49

1780 1796 ATTTATGCCTACAGCCT 552271 4-9-4 58 51 1781 1797 AATTTATGCCTACAGCC 552272 4-9-4 40 53 1782 1798 CAATTTATGCCTACAGC 552273 4-9-4 34 54 1783 1799 CCAATTTATGCCTACAG 552274 4-9-4 34 55 1784 1800 ACCAATTTATGCCTACA 552275 4-9-4 39 56 Таблица 30 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3370 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACA CGG 146786 5-10-5 49 224 414 429 GAGGCATAGCAGCAGG 509959 3-10-3 43 145 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 510100 3-10-4 54 17 58 73 TGGAGCCACCAGCAGG 552384 2-9-5 29 1318 58 73 TGGAGCCACCAGCAGG 552440 3-9-4 58 1318 59 74 CTGGAGCCACCAGCAG 552385 2-9-5 57 1319 59 74 CTGGAGCCACCAGCAG 552441 3-9-4 42 1319 60 75 ACTGGAGCCACCAGCA 552386 2-9-5 53 1320 60 75 ACTGGAGCCACCAGCA 552442 3-9-4 53 1320 61 76 AACTGGAGCCACCAGC 552387 2-9-5 48 1321 61 76 AACTGGAGCCACCAGC 552443 3-9-4 59 1321 62 77 GAACTGGAGCCACCAG 552388 2-9-5 40 86 62 77 GAACTGGAGCCACCAG 552444 3-9-4 51 86 411 426 GCATAGCAGCAGGATG 552389 2-9-5 39 137 411 426 GCATAGCAGCAGGATG 552445 3-9-4 60 137 412 427 GGCATAGCAGCAGGAT 552390 2-9-5 52 140 412 427 GGCATAGCAGCAGGAT 552446 3-9-4 54 140 413 428 AGGCATAGCAGCAGGA 552391 2-9-5 57 143 413 428 AGGCATAGCAGCAGGA 552447 3-9-4 54 143 414 429 GAGGCATAGCAGCAGG 552392 2-9-5 0 145 414 429 GAGGCATAGCAGCAGG 552448 3-9-4 58 145 415 430 TGAGGCATAGCAGCAG 552393 2-9-5 59 147 415 430 TGAGGCATAGCAGCAG 552449 3-9-4 60 147 416 431 ATGAGGCATAGCAGCA 552394 2-9-5 53 149 416 431 ATGAGGCATAGCAGCA 552450 3-9-4 53 149 417 432 GATGAGGCATAGCAGC 552395 2-9-5 57 151 417 432 GATGAGGCATAGCAGC 552451 3-9-4 39 151 418 433 AGATGAGGCATAGCAG 552396 2-9-5 62 153

418 433 AGATGAGGCATAGCAG 552452 3-9-4 57 153 457 473 ACGGGCAACATACCTTG 552238 4-9-4 38 33 457 473 ACGGGCAACATACCTTG 552292 5-9-3 48 33 457 473 ACGGGCAACATACCTTG 552346 6-9-2 0 33 457 472 CGGGCAACATACCTTG 552397 2-9-5 63 167 457 472 CGGGCAACATACCTTG 552453 3-9-4 56 167 458 473 ACGGGCAACATACCTT 552398 2-9-5 61 168 458 473 ACGGGCAACATACCTT 552454 3-9-4 48 168 670 685 CTAGTAAACTGAGCCA 552399 2-9-5 52 181 671 686 ACTAGTAAACTGAGCC 552400 2-9-5 57 1322 672 687 CACTAGTAAACTGAGC 552401 2-9-5 52 1323 673 688 GCACTAGTAAACTGAG 552402 2-9-5 54 1324 687 702 CCACTGAACAAATGGC 552403 2-9-5 74 188 688 703 ACCACTGAACAAATGG 552404 2-9-5 43 190 689 704 AACCACTGAACAAATG 552405 2-9-5 15 191 690 705 GAACCACTGAACAAAT 552406 2-9-5 37 192 691 706 CGAACCACTGAACAAA 552407 2-9-5 37 194 1261 1276 GCAGTATGGATCGGCA 552408 2-9-5 76 211 1262 1277 CGCAGTATGGATCGGC 552409 2-9-5 76 1325 1263 1278 CCGCAGTATGGATCGG 552410 2-9-5 63 1326 1264 1279 TCCGCAGTATGGATCG 552411 2-9-5 70 1327 1265 1280 TTCCGCAGTATGGATC 552412 2-9-5 62 1328 1266 1281 GTTCCGCAGTATGGAT 552413 2-9-5 56 1329 1267 1282 AGTTCCGCAGTATGGA 552414 2-9-5 63 1330 1268 1283 GAGTTCCGCAGTATGG 552415 2-9-5 52 1331 1269 1284 GGAGTTCCGCAGTATG 552416 2-9-5 67 1332 1270 1285 AGGAGTTCCGCAGTAT 552417 2-9-5 50 1333 1577 1592 AGCGAAGTGCACACGG 552418 2-9-5 79 1334 1578 1593 AAGCGAAGTGCACACG 552419 2-9-5 70 1335 1579 1594 GAAGCGAAGTGCACAC 552420 2-9-5 71 1336 1580 1595 TGAAGCGAAGTGCACA 552421 2-9-5 69 1337 1581 1596 GTGAAGCGAAGTGCAC 552422 2-9-5 68 1338 1582 1597 GGTGAAGCGAAGTGCA 552423 2-9-5 65 1339 1583 1598 AGGTGAAGCGAAGTGC 552424 2-9-5 70 1340 1584 1599 GAGGTGAAGCGAAGTG 552425 2-9-5 51 1341 1585 1600 AGAGGTGAAGCGAAGT 552426 2-9-5 40 1342 1586 1601 CAGAGGTGAAGCGAAG 552427 2-9-5 35 1343 1587 1602 GCAGAGGTGAAGCGAA 552428 2-9-5 58 1344 1588 1603 TGCAGAGGTGAAGCGA 552429 2-9-5 46 1345 1589 1604 GTGCAGAGGTGAAGCG 552430 2-9-5 53 1346 1590 1605 CGTGCAGAGGTGAAGC 552431 2-9-5 51 1347 1591 1606 ACGTGCAGAGGTGAAG 552432 2-9-5 57 1348 1778 1793 TATGCCTACAGCCTCC 552433 2-9-5 54 230

1779 1794 TTATGCCTACAGCCTC 552434 2-9-5 44 231 1780 1795 TTTATGCCTACAGCCT 552435 2-9-5 46 232 1781 1796 ATTTATGCCTACAGCC 552436 2-9-5 36 233 1782 1797 AATTTATGCCTACAGC 552437 2-9-5 27 234 1783 1798 CAATTTATGCCTACAG 552438 2-9-5 27 235 1784 1799 CCAATTTATGCCTACA 552439 2-9-5 13 236 Таблица 31 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3370 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 146786 5-10-5 35 224 414 429 GAGGCATAGCAGCAGG 509959 3-10-3 52 145 58 73 TGGAGCCACCAGCAGG 552496 4-9-3 47 1318 59 74 CTGGAGCCACCAGCAG 552497 4-9-3 57 1319 60 75 ACTGGAGCCACCAGCA 552498 4-9-3 45 1320 61 76 AACTGGAGCCACCAGC 552499 4-9-3 52 1321 62 77 GAACTGGAGCCACCAG 552500 4-9-3 46 86 411 426 GCATAGCAGCAGGATG 552501 4-9-3 44 137 412 427 GGCATAGCAGCAGGAT 552502 4-9-3 57 140 413 428 AGGCATAGCAGCAGGA 552503 4-9-3 52 143 414 429 GAGGCATAGCAGCAGG 552504 4-9-3 45 145 415 430 TGAGGCATAGCAGCAG 552505 4-9-3 56 147 416 431 ATGAGGCATAGCAGCA 552506 4-9-3 54 149 417 432 GATGAGGCATAGCAGC 552507 4-9-3 34 151 418 433 AGATGAGGCATAGCAG 552508 4-9-3 34 153 457 472 CGGGCAACATACCTTG 552509 4-9-3 48 167 458 473 ACGGGCAACATACCTT 552510 4-9-3 50 168 670 685 CTAGTAAACTGAGCCA 552455 3-9-4 66 181 670 685 CTAGTAAACTGAGCCA 552511 4-9-3 66 181 671 686 ACTAGTAAACTGAGCC 552456 3-9-4 64 1322 671 686 ACTAGTAAACTGAGCC 552512 4-9-3 62 1322 672 687 CACTAGTAAACTGAGC 552457 3-9-4 14 1323 672 687 CACTAGTAAACTGAGC 552513 4-9-3 56 1323 673 688 GCACTAGTAAACTGAG 552458 3-9-4 59 1324 673 688 GCACTAGTAAACTGAG 552514 4-9-3 52 1324 687 702 CCACTGAACAAATGGC 552459 3-9-4 69 188 687 702 CCACTGAACAAATGGC 552515 4-9-3 57 188 688 703 ACCACTGAACAAATGG 552460 3-9-4 0 190

688 703 ACCACTGAACAAATGG 552516 4-9-3 54 190 689 704 AACCACTGAACAAATG 552461 3-9-4 20 191 689 704 AACCACTGAACAAATG 552517 4-9-3 52 191 690 705 GAACCACTGAACAAAT 552462 3-9-4 46 192 690 705 GAACCACTGAACAAAT 552518 4-9-3 34 192 691 706 CGAACCACTGAACAAA 552463 3-9-4 48 194 691 706 CGAACCACTGAACAAA 552519 4-9-3 44 194 1261 1276 GCAGTATGGATCGGCA 552464 3-9-4 81 211 1261 1276 GCAGTATGGATCGGCA 552520 4-9-3 69 211 1262 1277 CGCAGTATGGATCGGC 552465 3-9-4 84 1325 1262 1277 CGCAGTATGGATCGGC 552521 4-9-3 80 1325 1263 1278 CCGCAGTATGGATCGG 552466 3-9-4 75 1326 1263 1278 CCGCAGTATGGATCGG 552522 4-9-3 76 1326 1264 1279 TCCGCAGTATGGATCG 552467 3-9-4 65 1327 1264 1279 TCCGCAGTATGGATCG 552523 4-9-3 71 1327 1265 1280 TTCCGCAGTATGGATC 552468 3-9-4 53 1328 1265 1280 TTCCGCAGTATGGATC 552524 4-9-3 43 1328 1266 1281 GTTCCGCAGTATGGAT 552469 3-9-4 51 1329 1266 1281 GTTCCGCAGTATGGAT 552525 4-9-3 57 1329 1267 1282 AGTTCCGCAGTATGGA 552470 3-9-4 46 1330 1267 1282 AGTTCCGCAGTATGGA 552526 4-9-3 60 1330 1268 1283 GAGTTCCGCAGTATGG 552471 3-9-4 54 1331 1268 1283 GAGTTCCGCAGTATGG 552527 4-9-3 72 1331 1269 1284 GGAGTTCCGCAGTATG 552472 3-9-4 78 1332 1269 1284 GGAGTTCCGCAGTATG 552528 4-9-3 78 1332 1270 1285 AGGAGTTCCGCAGTAT 552473 3-9-4 67 1333 1270 1285 AGGAGTTCCGCAGTAT 552529 4-9-3 77 1333 1577 1592 AGCGAAGTGCACACGG 552474 3-9-4 79 1334 1577 1592 AGCGAAGTGCACACGG 552530 4-9-3 78 1334 1578 1593 AAGCGAAGTGCACACG 552475 3-9-4 74 1335 1578 1593 AAGCGAAGTGCACACG 552531 4-9-3 68 1335 1579 1594 GAAGCGAAGTGCACAC 552476 3-9-4 52 1336 1580 1595 TGAAGCGAAGTGCACA 552477 3-9-4 76 1337 1581 1596 GTGAAGCGAAGTGCAC 552478 3-9-4 70 1338 1582 1597 GGTGAAGCGAAGTGCA 552479 3-9-4 67 1339 1583 1598 AGGTGAAGCGAAGTGC 552480 3-9-4 68 1340 1584 1599 GAGGTGAAGCGAAGTG 552481 3-9-4 57 1341 1585 1600 AGAGGTGAAGCGAAGT 552482 3-9-4 51 1342 1586 1601 CAGAGGTGAAGCGAAG 552483 3-9-4 48 1343 1587 1602 GCAGAGGTGAAGCGAA 552484 3-9-4 58 1344 1588 1603 TGCAGAGGTGAAGCGA 552485 3-9-4 51 1345 1589 1604 GTGCAGAGGTGAAGCG 552486 3-9-4 55 1346 1590 1605 CGTGCAGAGGTGAAGC 552487 3-9-4 62 1347

1591 1606 ACGTGCAGAGGTGAAG 552488 3-9-4 51 1348 1778 1793 TATGCCTACAGCCTCC 552489 3-9-4 49 230 1779 1794 TTATGCCTACAGCCTC 552490 3-9-4 51 231 1780 1795 TTTATGCCTACAGCCT 552491 3-9-4 51 232 1781 1796 ATTTATGCCTACAGCC 552492 3-9-4 38 233 1782 1797 AATTTATGCCTACAGC 552493 3-9-4 52 234 1783 1798 CAATTTATGCCTACAG 552494 3-9-4 17 235 1784 1799 CCAATTTATGCCTACA 552495 3-9-4 49 236 Таблица 32 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3370 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 146786 5-10-5 43 224 52 414 429 GAGGCATAGCAGCAGG 509959 3-10-3 38 145 58 73 TGGAGCCACCAGCAGG 552552 5-9-2 33 1318 59 74 CTGGAGCCACCAGCAG 552553 5-9-2 46 1319 60 75 ACTGGAGCCACCAGCA 552554 5-9-2 54 1320 61 76 AACTGGAGCCACCAGC 552555 5-9-2 50 1321 62 77 GAACTGGAGCCACCAG 552556 5-9-2 46 86 411 426 GCATAGCAGCAGGATG 552557 5-9-2 57 137 412 427 GGCATAGCAGCAGGAT 552558 5-9-2 55 140 413 428 AGGCATAGCAGCAGGA 552559 5-9-2 66 143 414 429 GAGGCATAGCAGCAGG 552560 5-9-2 44 145 415 430 TGAGGCATAGCAGCAG 552561 5-9-2 48 147 416 431 ATGAGGCATAGCAGCA 552562 5-9-2 52 149 417 432 GATGAGGCATAGCAGC 552563 5-9-2 45 151 418 433 AGATGAGGCATAGCAG 552564 5-9-2 41 153 457 472 CGGGCAACATACCTTG 552565 5-9-2 54 167 458 473 ACGGGCAACATACCTT 552566 5-9-2 56 168 670 685 CTAGTAAACTGAGCCA 552567 5-9-2 71 181 671 686 ACTAGTAAACTGAGCC 552568 5-9-2 64 1322 672 687 CACTAGTAAACTGAGC 552569 5-9-2 59 1323 673 688 GCACTAGTAAACTGAG 552570 5-9-2 60 1324 687 702 CCACTGAACAAATGGC 552571 5-9-2 55 188 688 703 ACCACTGAACAAATGG 552572 5-9-2 60 190 689 704 AACCACTGAACAAATG 552573 5-9-2 24 191 690 705 GAACCACTGAACAAAT 552574 5-9-2 34 192

691 706 CGAACCACTGAACAAA 552575 5-9-2 36 194 1261 1276 GCAGTATGGATCGGCA 552576 5-9-2 67 211 1262 1277 CGCAGTATGGATCGGC 552577 5-9-2 64 1325 1263 1278 CCGCAGTATGGATCGG 552578 5-9-2 75 1326 1264 1279 TCCGCAGTATGGATCG 552579 5-9-2 75 1327 1265 1280 TTCCGCAGTATGGATC 552580 5-9-2 59 1328 1266 1281 GTTCCGCAGTATGGAT 552581 5-9-2 54 1329 1267 1282 AGTTCCGCAGTATGGA 552582 5-9-2 61 1330 1268 1283 GAGTTCCGCAGTATGG 552583 5-9-2 69 1331 1269 1284 GGAGTTCCGCAGTATG 552584 5-9-2 74 1332 1270 1285 AGGAGTTCCGCAGTAT 552585 5-9-2 62 1333 1577 1592 AGCGAAGTGCACACGG 552586 5-9-2 79 1334 1578 1593 AAGCGAAGTGCACACG 552587 5-9-2 71 1335 1579 1594 GAAGCGAAGTGCACAC 552532 4-9-3 48 1336 1579 1594 GAAGCGAAGTGCACAC 552588 5-9-2 70 1336 1580 1595 TGAAGCGAAGTGCACA 552533 4-9-3 43 1337 1580 1595 TGAAGCGAAGTGCACA 552589 5-9-2 59 1337 1581 1596 GTGAAGCGAAGTGCAC 552534 4-9-3 62 1338 1581 1596 GTGAAGCGAAGTGCAC 552590 5-9-2 70 1338 1582 1597 GGTGAAGCGAAGTGCA 552535 4-9-3 55 1339 1582 1597 GGTGAAGCGAAGTGCA 552591 5-9-2 51 1339 1583 1598 AGGTGAAGCGAAGTGC 552536 4-9-3 3 1340 1583 1598 AGGTGAAGCGAAGTGC 552592 5-9-2 50 1340 1584 1599 GAGGTGAAGCGAAGTG 552537 4-9-3 14 1341 1584 1599 GAGGTGAAGCGAAGTG 552593 5-9-2 46 1341 1585 1600 AGAGGTGAAGCGAAGT 552538 4-9-3 52 1342 1585 1600 AGAGGTGAAGCGAAGT 552594 5-9-2 55 1342 1586 1601 CAGAGGTGAAGCGAAG 552539 4-9-3 47 1343 1586 1601 CAGAGGTGAAGCGAAG 552595 5-9-2 60 1343 1587 1602 GCAGAGGTGAAGCGAA 552540 4-9-3 60 1344 1587 1602 GCAGAGGTGAAGCGAA 552596 5-9-2 63 1344 1588 1603 TGCAGAGGTGAAGCGA 552541 4-9-3 60 1345 1588 1603 TGCAGAGGTGAAGCGA 552597 5-9-2 61 1345 1589 1604 GTGCAGAGGTGAAGCG 552542 4-9-3 64 1346 1589 1604 GTGCAGAGGTGAAGCG 552598 5-9-2 57 1346 1590 1605 CGTGCAGAGGTGAAGC 552543 4-9-3 46 1347 1590 1605 CGTGCAGAGGTGAAGC 552600 5-9-2 59 1347 1591 1606 ACGTGCAGAGGTGAAG 552544 4-9-3 53 1348 1591 1606 ACGTGCAGAGGTGAAG 552602 5-9-2 6 1348 1778 1793 TATGCCTACAGCCTCC 552545 4-9-3 33 230 1778 1793 TATGCCTACAGCCTCC 552604 5-9-2 47 230 1779 1794 TTATGCCTACAGCCTC 552546 4-9-3 42 231 1779 1794 TTATGCCTACAGCCTC 552606 5-9-2 53 231

1780 1795 TTTATGCCTACAGCCT 552547 4-9-3 51 232 1780 1795 TTTATGCCTACAGCCT 552608 5-9-2 53 232 1781 1796 ATTTATGCCTACAGCC 552548 4-9-3 52 233 1781 1796 ATTTATGCCTACAGCC 552610 5-9-2 47 233 1782 1797 AATTTATGCCTACAGC 552549 4-9-3 38 234 1782 1797 AATTTATGCCTACAGC 552612 5-9-2 39 234 1783 1798 CAATTTATGCCTACAG 552550 4-9-3 19 235 1783 1798 CAATTTATGCCTACAG 552614 5-9-2 24 235 1784 1799 CCAATTTATGCCTACA 552551 4-9-3 24 236 1784 1799 CCAATTTATGCCTACA 552616 5-9-2 15 236 Таблица 33 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3370 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 146786 5-10-5 51 224 1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 509934 5-10-5 76 50 58 77 GAACTGGAGCCACCAGCAGG 552007 6-10-4 61 83 58 77 GAACTGGAGCCACCAGCAGG 552039 7-10-3 84 83 253 272 AGAGAAGTCCACCACGAGTC 552008 6-10-4 48 103 253 272 AGAGAAGTCCACCACGAGTC 552040 7-10-3 48 103 411 430 TGAGGCATAGCAGCAGGATG 552009 6-10-4 77 136 411 430 TGAGGCATAGCAGCAGGATG 552041 7-10-3 73 136 412 431 ATGAGGCATAGCAGCAGGAT 552010 6-10-4 63 139 412 431 ATGAGGCATAGCAGCAGGAT 552042 7-10-3 66 139 413 432 GATGAGGCATAGCAGCAGGA 552011 6-10-4 52 142 413 432 GATGAGGCATAGCAGCAGGA 552043 7-10-3 54 142 414 433 AGATGAGGCATAGCAGCAGG 552012 6-10-4 73 20 414 433 AGATGAGGCATAGCAGCAGG 552044 7-10-3 86 20

415 434 AAGATGAGGCATAGCAGCAG 552013 6-10-4 73 22 415 434 AAGATGAGGCATAGCAGCAG 552045 7-10-3 65 22 416 435 GAAGATGAGGCATAGCAGCA 552014 6-10-4 76 24 416 435 GAAGATGAGGCATAGCAGCA 552046 7-10-3 93 24 417 436 AGAAGATGAGGCATAGCAGC 552015 6-10-4 70 26 417 436 AGAAGATGAGGCATAGCAGC 552047 7-10-3 77 26 418 437 AAGAAGATGAGGCATAGCAG 552016 6-10-4 61 28 418 437 AAGAAGATGAGGCATAGCAG 552048 7-10-3 66 28 687 706 CGAACCACTGAACAAATGGC 552017 6-10-4 73 39 687 706 CGAACCACTGAACAAATGGC 552049 7-10-3 73 39 1261 1280 TTCCGCAGTATGGATCGGCA 552018 6-10-4 98 719 1261 1280 TTCCGCAGTATGGATCGGCA 552050 7-10-3 98 719 1262 1281 GTTCCGCAGTATGGATCGGC 552019 6-10-4 98 212 1262 1281 GTTCCGCAGTATGGATCGGC 552051 7-10-3 99 212 1263 1282 AGTTCCGCAGTATGGATCGG 551986 4-10-6 92 720 1263 1282 AGTTCCGCAGTATGGATCGG 552020 6-10-4 97 720 1263 1282 AGTTCCGCAGTATGGATCGG 552052 7-10-3 98 720 1264 1283 GAGTTCCGCAGTATGGATCG 551987 4-10-6 95 721 1264 1283 GAGTTCCGCAGTATGGATCG 552021 6-10-4 97 721 1264 1283 GAGTTCCGCAGTATGGATCG 552053 7-10-3 98 721 1265 1284 GGAGTTCCGCAGTATGGATC 551988 4-10-6 50 1349 1265 1284 GGAGTTCCGCAGTATGGATC 552005 5-10-5 99 1349 1265 1284 GGAGTTCCGCAGTATGGATC 552022 6-10-4 99 1349 1265 1284 GGAGTTCCGCAGTATGGATC 552054 7-10-3 99 1349 1266 1285 AGGAGTTCCGCAGTATGGAT 551989 4-10-6 96 722 1266 1285 AGGAGTTCCGCAGTATGGAT 552023 6-10-4 99 722

1266 1285 AGGAGTTCCGCAGTATGGAT 552055 7-10-3 98 722 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 551990 4-10-6 86 224 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 552024 6-10-4 89 224 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 552056 7-10-3 88 224 1578 1597 GGTGAAGCGAAGTGCACACG 551991 4-10-6 0 801 1578 1597 GGTGAAGCGAAGTGCACACG 552025 6-10-4 90 801 1578 1597 GGTGAAGCGAAGTGCACACG 552057 7-10-3 92 801 1579 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCACAC 551992 4-10-6 72 802 1579 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCACAC 552026 6-10-4 88 802 1579 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCACAC 552058 7-10-3 86 802 1580 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGCACA 551993 4-10-6 82 225 1580 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGCACA 552027 6-10-4 87 225 1580 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGCACA 552059 7-10-3 88 225 1581 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTGCAC 551994 4-10-6 85 804 1581 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTGCAC 552028 6-10-4 83 804 1581 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTGCAC 552060 7-10-3 82 804 1582 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGTGCA 551995 4-10-6 84 805 1582 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGTGCA 552029 6-10-4 88 805 1582 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGTGCA 552061 7-10-3 85 805 1583 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAGTGC 551996 4-10-6 87 226 1583 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAGTGC 552030 6-10-4 88 226 1583 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAGTGC 552062 7-10-3 85 226 1584 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAAGTG 551997 4-10-6 83 806 1584 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAAGTG 552031 6-10-4 82 806 1585 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGAAGT 551998 4-10-6 85 807

1585 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGAAGT 552032 6-10-4 87 807 1586 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCGAAG 551999 4-10-6 82 227 1586 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCGAAG 552033 6-10-4 87 227 1587 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGCGAA 552000 4-10-6 83 1350 1587 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGCGAA 552006 5-10-5 88 1350 1587 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGCGAA 552034 6-10-4 89 1350 1778 1797 AATTTATGCCTACAGCCTCC 552001 4-10-6 65 46 1778 1797 AATTTATGCCTACAGCCTCC 552035 6-10-4 60 46 1779 1798 CAATTTATGCCTACAGCCTC 552002 4-10-6 63 48 1779 1798 CAATTTATGCCTACAGCCTC 552036 6-10-4 65 48 1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 552003 4-10-6 65 50 1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 552037 6-10-4 58 50 1781 1800 ACCAATTTATGCCTACAGCC 552004 4-10-6 58 52 1781 1800 ACCAATTTATGCCTACAGCC 552038 6-10-4 70 52 Таблица 34 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3370 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 146786 5-10-5 64 224 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 510100 3-10-4 62 17 58 74 CTGGAGCCACCAGCAGG 552168 3-9-5 79 1288 58 74 CTGGAGCCACCAGCAGG 552222 4-9-4 79 1288 59 75 ACTGGAGCCACCAGCAG 552169 3-9-5 67 1289 59 75 ACTGGAGCCACCAGCAG 552223 4-9-4 40 1289

60 76 AACTGGAGCCACCAGCA 552170 3-9-5 69 1290 60 76 AACTGGAGCCACCAGCA 552224 4-9-4 64 1290 61 77 GAACTGGAGCCACCAGC 552171 3-9-5 65 1291 61 77 GAACTGGAGCCACCAGC 552225 4-9-4 69 1291 253 269 GAAGTCCACCACGAGTC 552172 3-9-5 33 9 253 269 GAAGTCCACCACGAGTC 552226 4-9-4 48 9 254 270 AGAAGTCCACCACGAGT 552173 3-9-5 41 10 254 270 AGAAGTCCACCACGAGT 552227 4-9-4 32 10 255 271 GAGAAGTCCACCACGAG 552174 3-9-5 31 11 255 271 GAGAAGTCCACCACGAG 552228 4-9-4 42 11 256 272 AGAGAAGTCCACCACGA 552175 3-9-5 59 12 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 552176 3-9-5 68 17 412 428 AGGCATAGCAGCAGGAT 552177 3-9-5 55 18 413 429 GAGGCATAGCAGCAGGA 552178 3-9-5 66 19 414 430 TGAGGCATAGCAGCAGG 552179 3-9-5 70 21 415 431 ATGAGGCATAGCAGCAG 552180 3-9-5 66 23 416 432 GATGAGGCATAGCAGCA 552181 3-9-5 51 25 417 433 AGATGAGGCATAGCAGC 552182 3-9-5 69 27 418 434 AAGATGAGGCATAGCAG 552183 3-9-5 69 29 457 473 ACGGGCAACATACCTTG 552184 3-9-5 43 33 670 686 ACTAGTAAACTGAGCCA 552185 3-9-5 66 1292 671 687 CACTAGTAAACTGAGCC 552186 3-9-5 54 1293 672 688 GCACTAGTAAACTGAGC 552187 3-9-5 74 1294 687 703 ACCACTGAACAAATGGC 552188 3-9-5 78 40 688 704 AACCACTGAACAAATGG 552189 3-9-5 57 41 689 705 GAACCACTGAACAAATG 552190 3-9-5 39 42

690 706 CGAACCACTGAACAAAT 552191 3-9-5 60 43 1261 1277 CGCAGTATGGATCGGCA 552192 3-9-5 85 1295 1262 1278 CCGCAGTATGGATCGGC 552193 3-9-5 86 1296 1263 1279 TCCGCAGTATGGATCGG 552194 3-9-5 68 1297 1264 1280 TTCCGCAGTATGGATCG 552195 3-9-5 73 1298 1265 1281 GTTCCGCAGTATGGATC 552196 3-9-5 60 1299 1266 1282 AGTTCCGCAGTATGGAT 552197 3-9-5 60 1300 1267 1283 GAGTTCCGCAGTATGGA 552198 3-9-5 61 1301 1268 1284 GGAGTTCCGCAGTATGG 552199 3-9-5 89 1302 1269 1285 AGGAGTTCCGCAGTATG 552200 3-9-5 85 1303 1577 1593 AAGCGAAGTGCACACGG 552201 3-9-5 81 1304 1578 1594 GAAGCGAAGTGCACACG 552202 3-9-5 76 1305 1579 1595 TGAAGCGAAGTGCACAC 552203 3-9-5 74 1306 1580 1596 GTGAAGCGAAGTGCACA 552204 3-9-5 71 1307 1581 1597 GGTGAAGCGAAGTGCAC 552151 2-9-6 77 1308 1581 1597 GGTGAAGCGAAGTGCAC 552205 3-9-5 78 1308 1582 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCA 552152 2-9-6 72 1309 1582 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCA 552206 3-9-5 77 1309 1583 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGC 552153 2-9-6 67 1310 1583 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGC 552207 3-9-5 81 1310 1584 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTG 552154 2-9-6 56 1311 1584 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTG 552208 3-9-5 70 1311 1585 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGT 552155 2-9-6 61 1312 1585 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGT 552209 3-9-5 63 1312 1586 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAG 552156 2-9-6 20 1313

1586 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAG 552210 3-9-5 75 1313 1587 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAA 552157 2-9-6 39 1314 1587 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAA 552211 3-9-5 75 1314 1588 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGA 552158 2-9-6 70 1315 1588 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGA 552212 3-9-5 67 1315 1589 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCG 552159 2-9-6 74 1316 1589 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCG 552213 3-9-5 70 1316 1590 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGC 552160 2-9-6 78 1317 1590 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGC 552214 3-9-5 79 1317 1778 1794 TTATGCCTACAGCCTCC 552161 2-9-6 56 47 1778 1794 TTATGCCTACAGCCTCC 552215 3-9-5 61 47 1779 1795 TTTATGCCTACAGCCTC 552162 2-9-6 64 49 1779 1795 TTTATGCCTACAGCCTC 552216 3-9-5 62 49 1780 1796 ATTTATGCCTACAGCCT 552163 2-9-6 71 51 1780 1796 ATTTATGCCTACAGCCT 552217 3-9-5 58 51 1781 1797 AATTTATGCCTACAGCC 552164 2-9-6 52 53 1781 1797 AATTTATGCCTACAGCC 552218 3-9-5 56 53 1782 1798 CAATTTATGCCTACAGC 552165 2-9-6 53 54 1782 1798 CAATTTATGCCTACAGC 552219 3-9-5 33 54 1783 1799 CCAATTTATGCCTACAG 552166 2-9-6 41 55 1783 1799 CCAATTTATGCCTACAG 552220 3-9-5 53 55 1784 1800 ACCAATTTATGCCTACA 552167 2-9-6 54 56 1784 1800 ACCAATTTATGCCTACA 552221 3-9-5 31 56

Таблица 35 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3370 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 146786 5-10-5 60 224 85 1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 509934 5-10-5 76 50 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 510100 3-10-4 73 17 58 77 GAACTGGAGCCACCAGCAGG 552071 8-10-2 79 83 58 74 CTGGAGCCACCAGCAGG 552114 2-9-6 66 1288 59 75 ACTGGAGCCACCAGCAG 552115 2-9-6 70 1289 60 76 AACTGGAGCCACCAGCA 552116 2-9-6 68 1290 61 77 GAACTGGAGCCACCAGC 552117 2-9-6 70 1291 253 272 AGAGAAGTCCACCACGAGTC 552072 8-10-2 50 103 253 269 GAAGTCCACCACGAGTC 552118 2-9-6 66 9 254 270 AGAAGTCCACCACGAGT 552119 2-9-6 62 10 255 271 GAGAAGTCCACCACGAG 552120 2-9-6 35 11 256 272 AGAGAAGTCCACCACGA 552121 2-9-6 39 12 411 430 TGAGGCATAGCAGCAGGATG 552073 8-10-2 80 136 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 552122 2-9-6 55 17 412 431 ATGAGGCATAGCAGCAGGAT 552074 8-10-2 73 139 412 428 AGGCATAGCAGCAGGAT 552123 2-9-6 75 18 413 432 GATGAGGCATAGCAGCAGGA 552075 8-10-2 78 142 413 429 GAGGCATAGCAGCAGGA 552124 2-9-6 64 19 414 433 AGATGAGGCATAGCAGCAGG 552076 8-10-2 70 20 414 430 TGAGGCATAGCAGCAGG 552125 2-9-6 73 21 415 434 AAGATGAGGCATAGCAGCAG 552077 8-10-2 83 22 415 431 ATGAGGCATAGCAGCAG 552126 2-9-6 64 23 416 435 GAAGATGAGGCATAGCAGCA 552078 8-10-2 80 24 416 432 GATGAGGCATAGCAGCA 552127 2-9-6 72 25 417 436 AGAAGATGAGGCATAGCAGC 552079 8-10-2 86 26 417 433 AGATGAGGCATAGCAGC 552128 2-9-6 76 27 418 437 AAGAAGATGAGGCATAGCAG 552080 8-10-2 83 28 418 434 AAGATGAGGCATAGCAG 552129 2-9-6 72 29 670 686 ACTAGTAAACTGAGCCA 552131 2-9-6 61 1292

671 687 CACTAGTAAACTGAGCC 552132 2-9-6 73 1293 672 688 GCACTAGTAAACTGAGC 552133 2-9-6 75 1294 687 706 CGAACCACTGAACAAATGGC 552081 8-10-2 76 39 687 703 ACCACTGAACAAATGGC 552134 2-9-6 58 40 688 704 AACCACTGAACAAATGG 552135 2-9-6 67 41 689 705 GAACCACTGAACAAATG 552136 2-9-6 65 42 690 706 CGAACCACTGAACAAAT 552137 2-9-6 55 43 1261 1280 TTCCGCAGTATGGATCGGCA 552082 8-10-2 98 719 1261 1277 CGCAGTATGGATCGGCA 552138 2-9-6 82 1295 1262 1281 GTTCCGCAGTATGGATCGGC 552083 8-10-2 99 212 1262 1278 CCGCAGTATGGATCGGC 552139 2-9-6 86 1296 1263 1282 AGTTCCGCAGTATGGATCGG 552084 8-10-2 99 720 1263 1279 TCCGCAGTATGGATCGG 552140 2-9-6 74 1297 1264 1283 GAGTTCCGCAGTATGGATCG 552085 8-10-2 100 721 1264 1280 TTCCGCAGTATGGATCG 552141 2-9-6 67 1298 1265 1284 GGAGTTCCGCAGTATGGATC 552086 8-10-2 100 1349 1265 1281 GTTCCGCAGTATGGATC 552142 2-9-6 45 1299 1266 1285 AGGAGTTCCGCAGTATGGAT 552087 8-10-2 100 722 1266 1282 AGTTCCGCAGTATGGAT 552143 2-9-6 68 1300 1267 1283 GAGTTCCGCAGTATGGA 552144 2-9-6 78 1301 1268 1284 GGAGTTCCGCAGTATGG 552145 2-9-6 88 1302 1269 1285 AGGAGTTCCGCAGTATG 552146 2-9-6 81 1303 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 552088 8-10-2 95 224 1577 1593 AAGCGAAGTGCACACGG 552147 2-9-6 88 1304 1578 1597 GGTGAAGCGAAGTGCACACG 552089 8-10-2 93 801 1578 1594 GAAGCGAAGTGCACACG 552148 2-9-6 79 1305 1579 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCACAC 552090 8-10-2 87 802 1579 1595 TGAAGCGAAGTGCACAC 552149 2-9-6 81 1306 1580 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGCACA 552091 8-10-2 88 225 1581 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTGCAC 552092 8-10-2 90 804 1582 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGTGCA 552093 8-10-2 91 805 1583 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAGTGC 552094 8-10-2 88 226 1584 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAAGTG 552063 7-10-3 81 806

1584 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAAGTG 552095 8-10-2 89 806 1585 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGAAGT 552064 7-10-3 85 807 1585 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGAAGT 552096 8-10-2 92 807 1586 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCGAAG 552065 7-10-3 86 227 1586 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCGAAG 552097 8-10-2 93 227 1587 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGCGAA 552066 7-10-3 33 1350 1587 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGCGAA 552098 8-10-2 88 1350 1778 1797 AATTTATGCCTACAGCCTCC 552067 7-10-3 50 46 1778 1797 AATTTATGCCTACAGCCTCC 552099 8-10-2 70 46 1779 1798 CAATTTATGCCTACAGCCTC 552068 7-10-3 73 48 1779 1798 CAATTTATGCCTACAGCCTC 552100 8-10-2 70 48 1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 552069 7-10-3 73 50 1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 552101 8-10-2 76 50 1781 1800 ACCAATTTATGCCTACAGCC 552070 7-10-3 71 52 1781 1800 ACCAATTTATGCCTACAGCC 552102 8-10-2 64 52 Таблица 36 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3370 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 146786 5-10-5 84 224 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 510100 3-10-4 76 17 58 74 CTGGAGCCACCAGCAGG 552330 6-9-2 54 1288 59 75 ACTGGAGCCACCAGCAG 552331 6-9-2 66 1289 60 76 AACTGGAGCCACCAGCA 552332 6-9-2 70 1290 61 77 GAACTGGAGCCACCAGC 552333 6-9-2 55 1291 253 269 GAAGTCCACCACGAGTC 552334 6-9-2 42 9 254 270 AGAAGTCCACCACGAGT 552335 6-9-2 39 10

255 271 GAGAAGTCCACCACGAG 552336 6-9-2 27 11 256 272 AGAGAAGTCCACCACGA 552337 6-9-2 74 12 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 552338 6-9-2 68 17 412 428 AGGCATAGCAGCAGGAT 552339 6-9-2 71 18 413 429 GAGGCATAGCAGCAGGA 552340 6-9-2 61 19 414 430 TGAGGCATAGCAGCAGG 552341 6-9-2 58 21 415 431 ATGAGGCATAGCAGCAG 552342 6-9-2 55 23 416 432 GATGAGGCATAGCAGCA 552343 6-9-2 63 25 417 433 AGATGAGGCATAGCAGC 552344 6-9-2 51 27 418 434 AAGATGAGGCATAGCAG 552345 6-9-2 65 29 457 473 ACGGGCAACATACCTTG 552346 6-9-2 0 33 670 686 ACTAGTAAACTGAGCCA 552347 6-9-2 84 1292 671 687 CACTAGTAAACTGAGCC 552348 6-9-2 87 1293 672 688 GCACTAGTAAACTGAGC 552349 6-9-2 74 1294 687 703 ACCACTGAACAAATGGC 552350 6-9-2 59 40 688 704 AACCACTGAACAAATGG 552351 6-9-2 60 41 689 705 GAACCACTGAACAAATG 552352 6-9-2 53 42 690 706 CGAACCACTGAACAAAT 552353 6-9-2 0 43 1261 1277 CGCAGTATGGATCGGCA 552354 6-9-2 83 1295 1262 1278 CCGCAGTATGGATCGGC 552355 6-9-2 90 1296 1263 1279 TCCGCAGTATGGATCGG 552356 6-9-2 0 1297 1264 1280 TTCCGCAGTATGGATCG 552357 6-9-2 45 1298 1265 1281 GTTCCGCAGTATGGATC 552358 6-9-2 74 1299 1266 1282 AGTTCCGCAGTATGGAT 552359 6-9-2 72 1300 1267 1283 GAGTTCCGCAGTATGGA 552360 6-9-2 87 1301 1268 1284 GGAGTTCCGCAGTATGG 552361 6-9-2 96 1302 1269 1285 AGGAGTTCCGCAGTATG 552308 5-9-3 81 1303 1269 1285 AGGAGTTCCGCAGTATG 552362 6-9-2 92 1303 1577 1593 AAGCGAAGTGCACACGG 552309 5-9-3 77 1304 1577 1593 AAGCGAAGTGCACACGG 552363 6-9-2 92 1304 1578 1594 GAAGCGAAGTGCACACG 552310 5-9-3 80 1305 1578 1594 GAAGCGAAGTGCACACG 552364 6-9-2 87 1305 1579 1595 TGAAGCGAAGTGCACAC 552311 5-9-3 13 1306 1579 1595 TGAAGCGAAGTGCACAC 552365 6-9-2 84 1306 1580 1596 GTGAAGCGAAGTGCACA 552150 2-9-6 73 1307 1580 1596 GTGAAGCGAAGTGCACA 552312 5-9-3 77 1307 1580 1596 GTGAAGCGAAGTGCACA 552366 6-9-2 87 1307 1581 1597 GGTGAAGCGAAGTGCAC 552313 5-9-3 64 1308 1581 1597 GGTGAAGCGAAGTGCAC 552367 6-9-2 85 1308 1582 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCA 552314 5-9-3 73 1309 1582 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCA 552368 6-9-2 77 1309 1583 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGC 552315 5-9-3 75 1310 1583 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGC 552369 6-9-2 75 1310

1584 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTG 552316 5-9-3 64 1311 1584 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTG 552370 6-9-2 63 1311 1585 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGT 552317 5-9-3 99 1312 1585 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGT 552371 6-9-2 81 1312 1586 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAG 552318 5-9-3 76 1313 1586 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAG 552372 6-9-2 65 1313 1587 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAA 552319 5-9-3 55 1314 1587 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAA 552373 6-9-2 74 1314 1588 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGA 552320 5-9-3 68 1315 1588 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGA 552374 6-9-2 78 1315 1589 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCG 552321 5-9-3 74 1316 1589 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCG 552375 6-9-2 81 1316 1590 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGC 552322 5-9-3 73 1317 1590 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGC 552376 6-9-2 78 1317 1778 1794 TTATGCCTACAGCCTCC 552323 5-9-3 75 47 1778 1794 TTATGCCTACAGCCTCC 552377 6-9-2 70 47 1779 1795 TTTATGCCTACAGCCTC 552324 5-9-3 0 49 1779 1795 TTTATGCCTACAGCCTC 552378 6-9-2 72 49 1780 1796 ATTTATGCCTACAGCCT 552325 5-9-3 70 51 1780 1796 ATTTATGCCTACAGCCT 552379 6-9-2 74 51 1781 1797 AATTTATGCCTACAGCC 552326 5-9-3 63 53 1781 1797 AATTTATGCCTACAGCC 552380 6-9-2 53 53 1782 1798 CAATTTATGCCTACAGC 552327 5-9-3 30 54 1782 1798 CAATTTATGCCTACAGC 552381 6-9-2 26 54 1783 1799 CCAATTTATGCCTACAG 552328 5-9-3 25 55 1783 1799 CCAATTTATGCCTACAG 552382 6-9-2 13 55 1784 1800 ACCAATTTATGCCTACA 552329 5-9-3 33 56 1784 1800 ACCAATTTATGCCTACA 552383 6-9-2 5 56 Таблица 37 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3370 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 509934 5-10-5 30 50 58 77 GAACTGGAGCCACCAGCAGG 551909 2-10-8 62 83 58 77 GAACTGGAGCCACCAGCAGG 551941 3-10-7 74 83 58 77 GAACTGGAGCCACCAGCAGG 551973 4-10-6 64 83

253 272 AGAGAAGTCCACCACGAGTC 551910 2-10-8 52 103 253 272 AGAGAAGTCCACCACGAGTC 551942 3-10-7 54 103 253 272 AGAGAAGTCCACCACGAGTC 551974 4-10-6 51 103 411 430 TGAGGCATAGCAGCAGGATG 551911 2-10-8 58 136 411 430 TGAGGCATAGCAGCAGGATG 551943 3-10-7 64 136 411 430 TGAGGCATAGCAGCAGGATG 551975 4-10-6 57 136 412 431 ATGAGGCATAGCAGCAGGAT 551912 2-10-8 59 139 412 431 ATGAGGCATAGCAGCAGGAT 551944 3-10-7 66 139 412 431 ATGAGGCATAGCAGCAGGAT 551976 4-10-6 57 139 413 432 GATGAGGCATAGCAGCAGGA 551913 2-10-8 58 142 413 432 GATGAGGCATAGCAGCAGGA 551945 3-10-7 56 142 413 432 GATGAGGCATAGCAGCAGGA 551977 4-10-6 56 142 414 433 AGATGAGGCATAGCAGCAGG 551914 2-10-8 0 20 414 433 AGATGAGGCATAGCAGCAGG 551946 3-10-7 48 20 414 433 AGATGAGGCATAGCAGCAGG 551978 4-10-6 53 20 415 434 AAGATGAGGCATAGCAGCAG 551915 2-10-8 44 22 415 434 AAGATGAGGCATAGCAGCAG 551947 3-10-7 53 22 415 434 AAGATGAGGCATAGCAGCAG 551979 4-10-6 64 22 416 435 GAAGATGAGGCATAGCAGCA 551916 2-10-8 57 24 416 435 GAAGATGAGGCATAGCAGCA 551948 3-10-7 68 24 416 435 GAAGATGAGGCATAGCAGCA 551980 4-10-6 56 24 417 436 AGAAGATGAGGCATAGCAGC 551917 2-10-8 58 26 417 436 AGAAGATGAGGCATAGCAGC 551949 3-10-7 64 26 417 436 AGAAGATGAGGCATAGCAGC 551981 4-10-6 63 26 418 437 AAGAAGATGAGGCATAGCAG 551918 2-10-8 59 28 418 437 AAGAAGATGAGGCATAGCAG 551950 3-10-7 71 28

418 437 AAGAAGATGAGGCATAGCAG 551982 4-10-6 63 28 687 706 CGAACCACTGAACAAATGGC 551919 2-10-8 76 39 687 706 CGAACCACTGAACAAATGGC 551951 3-10-7 71 39 687 706 CGAACCACTGAACAAATGGC 551983 4-10-6 73 39 1261 1280 TTCCGCAGTATGGATCGGCA 551920 2-10-8 68 719 1261 1280 TTCCGCAGTATGGATCGGCA 551952 3-10-7 76 719 1261 1280 TTCCGCAGTATGGATCGGCA 551984 4-10-6 81 719 1262 1281 GTTCCGCAGTATGGATCGGC 551921 2-10-8 83 212 1262 1281 GTTCCGCAGTATGGATCGGC 551953 3-10-7 82 212 1262 1281 GTTCCGCAGTATGGATCGGC 551985 4-10-6 76 212 1263 1282 AGTTCCGCAGTATGGATCGG 551922 2-10-8 73 720 1263 1282 AGTTCCGCAGTATGGATCGG 551954 3-10-7 68 720 1264 1283 GAGTTCCGCAGTATGGATCG 551923 2-10-8 59 721 1264 1283 GAGTTCCGCAGTATGGATCG 551955 3-10-7 71 721 1265 1284 GGAGTTCCGCAGTATGGATC 551924 2-10-8 80 1349 1265 1284 GGAGTTCCGCAGTATGGATC 551956 3-10-7 80 1349 1266 1285 AGGAGTTCCGCAGTATGGAT 551925 2-10-8 82 722 1266 1285 AGGAGTTCCGCAGTATGGAT 551957 3-10-7 88 722 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 551926 2-10-8 71 224 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 551958 3-10-7 74 224 1578 1597 GGTGAAGCGAAGTGCACACG 551927 2-10-8 68 801 1578 1597 GGTGAAGCGAAGTGCACACG 551959 3-10-7 69 801 1579 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCACAC 551928 2-10-8 69 802 1579 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCACAC 551960 3-10-7 62 802 1580 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGCACA 551929 2-10-8 54 225

1580 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGCACA 551961 3-10-7 20 225 1581 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTGCAC 551930 2-10-8 53 804 1581 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTGCAC 551962 3-10-7 60 804 1582 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGTGCA 551931 2-10-8 47 805 1582 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGTGCA 551963 3-10-7 63 805 1583 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAGTGC 551932 2-10-8 68 226 1583 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAGTGC 551964 3-10-7 56 226 1584 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAAGTG 551933 2-10-8 72 806 1584 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAAGTG 551965 3-10-7 67 806 1585 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGAAGT 551934 2-10-8 64 807 1585 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGAAGT 551966 3-10-7 73 807 1586 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCGAAG 551935 2-10-8 68 227 1586 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCGAAG 551967 3-10-7 60 227 1587 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGCGAA 551936 2-10-8 67 1350 1587 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGCGAA 551968 3-10-7 63 1350 1778 1797 AATTTATGCCTACAGCCTCC 551937 2-10-8 47 46 1778 1797 AATTTATGCCTACAGCCTCC 551969 3-10-7 36 46 1779 1798 CAATTTATGCCTACAGCCTC 551938 2-10-8 41 48 1779 1798 CAATTTATGCCTACAGCCTC 551970 3-10-7 43 48 1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 551939 2-10-8 53 50 1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 551971 3-10-7 55 50 1781 1800 ACCAATTTATGCCTACAGCC 551940 2-10-8 50 52 1781 1800 ACCAATTTATGCCTACAGCC 551972 3-10-7 58 52

Таблица 38 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3371 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 509934 5-10-5 21 50 58 77 GAACTGGAGCCACCAGCAGG 551909 2-10-8 52 83 58 77 GAACTGGAGCCACCAGCAGG 551941 3-10-7 62 83 58 77 GAACTGGAGCCACCAGCAGG 551973 4-10-6 58 83 253 272 AGAGAAGTCCACCACGAGTC 551910 2-10-8 48 103 253 272 AGAGAAGTCCACCACGAGTC 551942 3-10-7 36 103 253 272 AGAGAAGTCCACCACGAGTC 551974 4-10-6 45 103 411 430 TGAGGCATAGCAGCAGGATG 551911 2-10-8 61 136 411 430 TGAGGCATAGCAGCAGGATG 551943 3-10-7 56 136 411 430 TGAGGCATAGCAGCAGGATG 551975 4-10-6 60 136 412 431 ATGAGGCATAGCAGCAGGAT 551912 2-10-8 53 139 412 431 ATGAGGCATAGCAGCAGGAT 551944 3-10-7 48 139 412 431 ATGAGGCATAGCAGCAGGAT 551976 4-10-6 48 139 413 432 GATGAGGCATAGCAGCAGGA 551913 2-10-8 53 142 413 432 GATGAGGCATAGCAGCAGGA 551945 3-10-7 54 142 413 432 GATGAGGCATAGCAGCAGGA 551977 4-10-6 48 142 414 433 AGATGAGGCATAGCAGCAGG 551914 2-10-8 0 20 414 433 AGATGAGGCATAGCAGCAGG 551946 3-10-7 56 20 414 433 AGATGAGGCATAGCAGCAGG 551978 4-10-6 36 20 415 434 AAGATGAGGCATAGCAGCAG 551915 2-10-8 47 22 415 434 AAGATGAGGCATAGCAGCAG 551947 3-10-7 45 22 415 434 AAGATGAGGCATAGCAGCAG 551979 4-10-6 54 22 416 435 GAAGATGAGGCATAGCAGCA 551916 2-10-8 44 24

416 435 GAAGATGAGGCATAGCAGCA 551948 3-10-7 59 24 416 435 GAAGATGAGGCATAGCAGCA 551980 4-10-6 49 24 417 436 AGAAGATGAGGCATAGCAGC 551917 2-10-8 48 26 417 436 AGAAGATGAGGCATAGCAGC 551949 3-10-7 60 26 417 436 AGAAGATGAGGCATAGCAGC 551981 4-10-6 57 26 418 437 AAGAAGATGAGGCATAGCAG 551918 2-10-8 53 28 418 437 AAGAAGATGAGGCATAGCAG 551950 3-10-7 57 28 418 437 AAGAAGATGAGGCATAGCAG 551982 4-10-6 57 28 687 706 CGAACCACTGAACAAATGGC 551919 2-10-8 65 39 687 706 CGAACCACTGAACAAATGGC 551951 3-10-7 57 39 687 706 CGAACCACTGAACAAATGGC 551983 4-10-6 53 39 1261 1280 TTCCGCAGTATGGATCGGCA 551920 2-10-8 57 719 1261 1280 TTCCGCAGTATGGATCGGCA 551952 3-10-7 67 719 1261 1280 TTCCGCAGTATGGATCGGCA 551984 4-10-6 62 719 1262 1281 GTTCCGCAGTATGGATCGGC 551921 2-10-8 60 212 1262 1281 GTTCCGCAGTATGGATCGGC 551953 3-10-7 57 212 1262 1281 GTTCCGCAGTATGGATCGGC 551985 4-10-6 58 212 1263 1282 AGTTCCGCAGTATGGATCGG 551922 2-10-8 63 720 1263 1282 AGTTCCGCAGTATGGATCGG 551954 3-10-7 61 720 1264 1283 GAGTTCCGCAGTATGGATCG 551923 2-10-8 50 721 1264 1283 GAGTTCCGCAGTATGGATCG 551955 3-10-7 44 721 1265 1284 GGAGTTCCGCAGTATGGATC 551924 2-10-8 52 1349 1265 1284 GGAGTTCCGCAGTATGGATC 551956 3-10-7 46 1349 1266 1285 AGGAGTTCCGCAGTATGGAT 551925 2-10-8 54 722 1266 1285 AGGAGTTCCGCAGTATGGAT 551957 3-10-7 51 722 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 551926 2-10-8 70 224

1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 551958 3-10-7 72 224 1578 1597 GGTGAAGCGAAGTGCACACG 551927 2-10-8 60 801 1578 1597 GGTGAAGCGAAGTGCACACG 551959 3-10-7 61 801 1579 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCACAC 551928 2-10-8 57 802 1579 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCACAC 551960 3-10-7 58 802 1580 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGCACA 551929 2-10-8 49 225 1580 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGCACA 551961 3-10-7 26 225 1581 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTGCAC 551930 2-10-8 54 804 1581 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTGCAC 551962 3-10-7 57 804 1582 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGTGCA 551931 2-10-8 46 805 1582 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGTGCA 551963 3-10-7 56 805 1583 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAGTGC 551932 2-10-8 57 226 1583 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAGTGC 551964 3-10-7 53 226 1584 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAAGTG 551933 2-10-8 65 806 1584 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAAGTG 551965 3-10-7 54 806 1585 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGAAGT 551934 2-10-8 58 807 1585 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGAAGT 551966 3-10-7 69 807 1586 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCGAAG 551935 2-10-8 63 227 1586 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCGAAG 551967 3-10-7 53 227 1587 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGCGAA 551936 2-10-8 67 1350 1587 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGCGAA 551968 3-10-7 60 1350 1778 1797 AATTTATGCCTACAGCCTCC 551937 2-10-8 51 46 1778 1797 AATTTATGCCTACAGCCTCC 551969 3-10-7 42 46 1779 1798 CAATTTATGCCTACAGCCTC 551938 2-10-8 40 48 1779 1798 CAATTTATGCCTACAGCCTC 551970 3-10-7 38 48

1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 551939 2-10-8 32 50 1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 551971 3-10-7 46 50 1781 1800 ACCAATTTATGCCTACAGCC 551940 2-10-8 39 52 1781 1800 ACCAATTTATGCCTACAGCC 551972 3-10-7 51 52 Таблица 39 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3371 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 146786 5-10-5 40 224 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 510100 3-10-4 60 17 58 74 CTGGAGCCACCAGCAGG 552276 5-9-3 44 1288 59 75 ACTGGAGCCACCAGCAG 552277 5-9-3 39 1289 60 76 AACTGGAGCCACCAGCA 552278 5-9-3 37 1290 61 77 GAACTGGAGCCACCAGC 552279 5-9-3 50 1291 253 269 GAAGTCCACCACGAGTC 552280 5-9-3 2 9 254 270 AGAAGTCCACCACGAGT 552281 5-9-3 0 10 255 271 GAGAAGTCCACCACGAG 552282 5-9-3 13 11 256 272 AGAGAAGTCCACCACGA 552229 4-9-4 17 12 256 272 AGAGAAGTCCACCACGA 552283 5-9-3 27 12 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 552230 4-9-4 53 17 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 552284 5-9-3 0 17 412 428 AGGCATAGCAGCAGGAT 552231 4-9-4 31 18 412 428 AGGCATAGCAGCAGGAT 552285 5-9-3 56 18 413 429 GAGGCATAGCAGCAGGA 552232 4-9-4 35 19 413 429 GAGGCATAGCAGCAGGA 552286 5-9-3 43 19 414 430 TGAGGCATAGCAGCAGG 552233 4-9-4 40 21 414 430 TGAGGCATAGCAGCAGG 552287 5-9-3 44 21 415 431 ATGAGGCATAGCAGCAG 552234 4-9-4 0 23 415 431 ATGAGGCATAGCAGCAG 552288 5-9-3 44 23 416 432 GATGAGGCATAGCAGCA 552235 4-9-4 13 25 416 432 GATGAGGCATAGCAGCA 552289 5-9-3 21 25 417 433 AGATGAGGCATAGCAGC 552236 4-9-4 40 27 417 433 AGATGAGGCATAGCAGC 552290 5-9-3 34 27 418 434 AAGATGAGGCATAGCAG 552237 4-9-4 37 29

418 434 AAGATGAGGCATAGCAG 552291 5-9-3 34 29 670 686 ACTAGTAAACTGAGCCA 552239 4-9-4 58 1292 670 686 ACTAGTAAACTGAGCCA 552293 5-9-3 61 1292 671 687 CACTAGTAAACTGAGCC 552240 4-9-4 54 1293 671 687 CACTAGTAAACTGAGCC 552294 5-9-3 62 1293 672 688 GCACTAGTAAACTGAGC 552241 4-9-4 47 1294 672 688 GCACTAGTAAACTGAGC 552295 5-9-3 63 1294 687 703 ACCACTGAACAAATGGC 552242 4-9-4 61 40 687 703 ACCACTGAACAAATGGC 552296 5-9-3 61 40 688 704 AACCACTGAACAAATGG 552243 4-9-4 55 41 688 704 AACCACTGAACAAATGG 552297 5-9-3 52 41 689 705 GAACCACTGAACAAATG 552244 4-9-4 45 42 689 705 GAACCACTGAACAAATG 552298 5-9-3 27 42 690 706 CGAACCACTGAACAAAT 552245 4-9-4 41 43 690 706 CGAACCACTGAACAAAT 552299 5-9-3 32 43 1261 1277 CGCAGTATGGATCGGCA 552246 4-9-4 67 1295 1261 1277 CGCAGTATGGATCGGCA 552300 5-9-3 57 1295 1262 1278 CCGCAGTATGGATCGGC 552247 4-9-4 74 1296 1262 1278 CCGCAGTATGGATCGGC 552301 5-9-3 76 1296 1263 1279 TCCGCAGTATGGATCGG 552248 4-9-4 65 1297 1263 1279 TCCGCAGTATGGATCGG 552302 5-9-3 68 1297 1264 1280 TTCCGCAGTATGGATCG 552249 4-9-4 38 1298 1264 1280 TTCCGCAGTATGGATCG 552303 5-9-3 59 1298 1265 1281 GTTCCGCAGTATGGATC 552250 4-9-4 43 1299 1265 1281 GTTCCGCAGTATGGATC 552304 5-9-3 30 1299 1266 1282 AGTTCCGCAGTATGGAT 552251 4-9-4 52 1300 1266 1282 AGTTCCGCAGTATGGAT 552305 5-9-3 49 1300 1267 1283 GAGTTCCGCAGTATGGA 552252 4-9-4 51 1301 1267 1283 GAGTTCCGCAGTATGGA 552306 5-9-3 56 1301 1268 1284 GGAGTTCCGCAGTATGG 552253 4-9-4 47 1302 1268 1284 GGAGTTCCGCAGTATGG 552307 5-9-3 49 1302 1269 1285 AGGAGTTCCGCAGTATG 552254 4-9-4 50 1303 1577 1593 AAGCGAAGTGCACACGG 552255 4-9-4 64 1304 1578 1594 GAAGCGAAGTGCACACG 552256 4-9-4 57 1305 1579 1595 TGAAGCGAAGTGCACAC 552257 4-9-4 51 1306 1580 1596 GTGAAGCGAAGTGCACA 552258 4-9-4 62 1307 1581 1597 GGTGAAGCGAAGTGCAC 552259 4-9-4 59 1308 1582 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCA 552260 4-9-4 56 1309 1583 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGC 552261 4-9-4 54 1310 1584 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTG 552262 4-9-4 47 1311 1585 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGT 552263 4-9-4 45 1312 1586 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAG 552264 4-9-4 52 1313 1587 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAA 552265 4-9-4 58 1314

1588 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGA 552266 4-9-4 54 1315 1589 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCG 552267 4-9-4 43 1316 1590 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGC 552268 4-9-4 57 1317 1778 1794 TTATGCCTACAGCCTCC 552269 4-9-4 34 47 1779 1795 TTTATGCCTACAGCCTC 552270 4-9-4 37 49 1780 1796 ATTTATGCCTACAGCCT 552271 4-9-4 42 51 1781 1797 AATTTATGCCTACAGCC 552272 4-9-4 36 53 1782 1798 CAATTTATGCCTACAGC 552273 4-9-4 25 54 1783 1799 CCAATTTATGCCTACAG 552274 4-9-4 11 55 1784 1800 ACCAATTTATGCCTACA 552275 4-9-4 38 56 Таблица 40 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3371 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 146786 5-10-5 38 1354 414 429 GAGGCATAGCAGCAGG 509959 3-10-3 49 145 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 510100 3-10-4 55 17 58 73 TGGAGCCACCAGCAGG 552384 2-9-5 41 1318 58 73 TGGAGCCACCAGCAGG 552440 3-9-4 57 1318 59 74 CTGGAGCCACCAGCAG 552385 2-9-5 53 1319 59 74 CTGGAGCCACCAGCAG 552441 3-9-4 38 1319 60 75 ACTGGAGCCACCAGCA 552386 2-9-5 42 1320 60 75 ACTGGAGCCACCAGCA 552442 3-9-4 72 1320 61 76 AACTGGAGCCACCAGC 552387 2-9-5 43 1321 61 76 AACTGGAGCCACCAGC 552443 3-9-4 56 1321 62 77 GAACTGGAGCCACCAG 552388 2-9-5 18 86 62 77 GAACTGGAGCCACCAG 552444 3-9-4 39 86 411 426 GCATAGCAGCAGGATG 552389 2-9-5 24 137 411 426 GCATAGCAGCAGGATG 552445 3-9-4 53 137 412 427 GGCATAGCAGCAGGAT 552390 2-9-5 40 140 412 427 GGCATAGCAGCAGGAT 552446 3-9-4 57 140 413 428 AGGCATAGCAGCAGGA 552391 2-9-5 51 143 413 428 AGGCATAGCAGCAGGA 552447 3-9-4 53 143 414 429 GAGGCATAGCAGCAGG 552392 2-9-5 0 145 414 429 GAGGCATAGCAGCAGG 552448 3-9-4 57 145 415 430 TGAGGCATAGCAGCAG 552393 2-9-5 52 147 415 430 TGAGGCATAGCAGCAG 552449 3-9-4 49 147

416 431 ATGAGGCATAGCAGCA 552394 2-9-5 32 149 416 431 ATGAGGCATAGCAGCA 552450 3-9-4 44 149 417 432 GATGAGGCATAGCAGC 552395 2-9-5 33 151 417 432 GATGAGGCATAGCAGC 552451 3-9-4 38 151 418 433 AGATGAGGCATAGCAG 552396 2-9-5 46 153 418 433 AGATGAGGCATAGCAG 552452 3-9-4 30 153 457 473 ACGGGCAACATACCTTG 552130 2-9-6 46 33 457 473 ACGGGCAACATACCTTG 552184 3-9-5 34 33 457 473 ACGGGCAACATACCTTG 552238 4-9-4 41 33 457 473 ACGGGCAACATACCTTG 552292 5-9-3 45 33 457 473 ACGGGCAACATACCTTG 552346 6-9-2 0 33 457 472 CGGGCAACATACCTTG 552397 2-9-5 37 167 457 472 CGGGCAACATACCTTG 552453 3-9-4 45 167 458 473 ACGGGCAACATACCTT 552398 2-9-5 42 168 458 473 ACGGGCAACATACCTT 552454 3-9-4 39 168 670 685 CTAGTAAACTGAGCCA 552399 2-9-5 34 181 671 686 ACTAGTAAACTGAGCC 552400 2-9-5 47 1322 672 687 CACTAGTAAACTGAGC 552401 2-9-5 53 1323 673 688 GCACTAGTAAACTGAG 552402 2-9-5 47 1324 687 702 CCACTGAACAAATGGC 552403 2-9-5 70 188 688 703 ACCACTGAACAAATGG 552404 2-9-5 44 190 689 704 AACCACTGAACAAATG 552405 2-9-5 0 191 690 705 GAACCACTGAACAAAT 552406 2-9-5 25 192 691 706 CGAACCACTGAACAAA 552407 2-9-5 23 194 1261 1276 GCAGTATGGATCGGCA 552408 2-9-5 73 211 1262 1277 CGCAGTATGGATCGGC 552409 2-9-5 71 1325 1263 1278 CCGCAGTATGGATCGG 552410 2-9-5 52 1326 1264 1279 TCCGCAGTATGGATCG 552411 2-9-5 62 1327 1265 1280 TTCCGCAGTATGGATC 552412 2-9-5 50 1328 1266 1281 GTTCCGCAGTATGGAT 552413 2-9-5 55 1329 1267 1282 AGTTCCGCAGTATGGA 552414 2-9-5 64 1330 1268 1283 GAGTTCCGCAGTATGG 552415 2-9-5 45 1331 1269 1284 GGAGTTCCGCAGTATG 552416 2-9-5 45 1332 1270 1285 AGGAGTTCCGCAGTAT 552417 2-9-5 37 1333 1577 1592 AGCGAAGTGCACACGG 552418 2-9-5 73 1334 1578 1593 AAGCGAAGTGCACACG 552419 2-9-5 68 1335 1579 1594 GAAGCGAAGTGCACAC 552420 2-9-5 64 1336 1580 1595 TGAAGCGAAGTGCACA 552421 2-9-5 54 1337 1581 1596 GTGAAGCGAAGTGCAC 552422 2-9-5 60 1338 1582 1597 GGTGAAGCGAAGTGCA 552423 2-9-5 62 1339 1583 1598 AGGTGAAGCGAAGTGC 552424 2-9-5 60 1340 1584 1599 GAGGTGAAGCGAAGTG 552425 2-9-5 46 1341 1585 1600 AGAGGTGAAGCGAAGT 552426 2-9-5 48 1342

1586 1601 CAGAGGTGAAGCGAAG 552427 2-9-5 36 1343 1587 1602 GCAGAGGTGAAGCGAA 552428 2-9-5 57 1344 1588 1603 TGCAGAGGTGAAGCGA 552429 2-9-5 36 1345 1589 1604 GTGCAGAGGTGAAGCG 552430 2-9-5 42 1346 1590 1605 CGTGCAGAGGTGAAGC 552431 2-9-5 60 1347 1591 1606 ACGTGCAGAGGTGAAG 552432 2-9-5 44 1348 1778 1793 TATGCCTACAGCCTCC 552433 2-9-5 55 230 1779 1794 TTATGCCTACAGCCTC 552434 2-9-5 46 231 1780 1795 TTTATGCCTACAGCCT 552435 2-9-5 47 232 1781 1796 ATTTATGCCTACAGCC 552436 2-9-5 25 233 1782 1797 AATTTATGCCTACAGC 552437 2-9-5 19 234 1783 1798 CAATTTATGCCTACAG 552438 2-9-5 25 235 1784 1799 CCAATTTATGCCTACA 552439 2-9-5 22 236 Таблица 41 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3371 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 414 429 GAGGCATAGCAGCAGG 509959 3-10-3 49 145 58 73 TGGAGCCACCAGCAGG 552496 4-9-3 35 1318 59 74 CTGGAGCCACCAGCAG 552497 4-9-3 60 1319 60 75 ACTGGAGCCACCAGCA 552498 4-9-3 20 1320 61 76 AACTGGAGCCACCAGC 552499 4-9-3 45 1321 62 77 GAACTGGAGCCACCAG 552500 4-9-3 53 86 411 426 GCATAGCAGCAGGATG 552501 4-9-3 56 137 412 427 GGCATAGCAGCAGGAT 552502 4-9-3 50 140 413 428 AGGCATAGCAGCAGGA 552503 4-9-3 36 143 414 429 GAGGCATAGCAGCAGG 552504 4-9-3 50 145 415 430 TGAGGCATAGCAGCAG 552505 4-9-3 53 147 416 431 ATGAGGCATAGCAGCA 552506 4-9-3 49 149 417 432 GATGAGGCATAGCAGC 552507 4-9-3 35 151

418 433 AGATGAGGCATAGCAG 552508 4-9-3 62 153 457 472 CGGGCAACATACCTTG 552509 4-9-3 65 167 458 473 ACGGGCAACATACCTT 552510 4-9-3 54 168 670 685 CTAGTAAACTGAGCCA 552455 3-9-4 60 181 670 685 CTAGTAAACTGAGCCA 552511 4-9-3 65 181 671 686 ACTAGTAAACTGAGCC 552456 3-9-4 69 1322 671 686 ACTAGTAAACTGAGCC 552512 4-9-3 63 1322 672 687 CACTAGTAAACTGAGC 552457 3-9-4 4 1323 672 687 CACTAGTAAACTGAGC 552513 4-9-3 50 1323 673 688 GCACTAGTAAACTGAG 552458 3-9-4 59 1324 673 688 GCACTAGTAAACTGAG 552514 4-9-3 53 1324 687 702 CCACTGAACAAATGGC 552459 3-9-4 69 188 687 702 CCACTGAACAAATGGC 552515 4-9-3 68 188 688 703 ACCACTGAACAAATGG 552460 3-9-4 3 190 688 703 ACCACTGAACAAATGG 552516 4-9-3 65 190 689 704 AACCACTGAACAAATG 552461 3-9-4 37 191 689 704 AACCACTGAACAAATG 552517 4-9-3 54 191 690 705 GAACCACTGAACAAAT 552462 3-9-4 42 192 690 705 GAACCACTGAACAAAT 552518 4-9-3 23 192 691 706 CGAACCACTGAACAAA 552463 3-9-4 28 194 691 706 CGAACCACTGAACAAA 552519 4-9-3 32 194 1261 1276 GCAGTATGGATCGGCA 552464 3-9-4 72 211 1261 1276 GCAGTATGGATCGGCA 552520 4-9-3 61 211 1262 1277 CGCAGTATGGATCGGC 552465 3-9-4 68 1325 1262 1277 CGCAGTATGGATCGGC 552521 4-9-3 68 1325 1263 1278 CCGCAGTATGGATCGG 552466 3-9-4 76 1326

1263 1278 CCGCAGTATGGATCGG 552522 4-9-3 71 1326 1264 1279 TCCGCAGTATGGATCG 552467 3-9-4 72 1327 1264 1279 TCCGCAGTATGGATCG 552523 4-9-3 73 1327 1265 1280 TTCCGCAGTATGGATC 552468 3-9-4 50 1328 1265 1280 TTCCGCAGTATGGATC 552524 4-9-3 49 1328 1266 1281 GTTCCGCAGTATGGAT 552469 3-9-4 65 1329 1266 1281 GTTCCGCAGTATGGAT 552525 4-9-3 45 1329 1267 1282 AGTTCCGCAGTATGGA 552470 3-9-4 58 1330 1267 1282 AGTTCCGCAGTATGGA 552526 4-9-3 39 1330 1268 1283 GAGTTCCGCAGTATGG 552471 3-9-4 30 1331 1268 1283 GAGTTCCGCAGTATGG 552527 4-9-3 39 1331 1269 1284 GGAGTTCCGCAGTATG 552472 3-9-4 43 1332 1269 1284 GGAGTTCCGCAGTATG 552528 4-9-3 43 1332 1270 1285 AGGAGTTCCGCAGTAT 552473 3-9-4 25 1333 1270 1285 AGGAGTTCCGCAGTAT 552529 4-9-3 50 1333 1577 1592 AGCGAAGTGCACACGG 552474 3-9-4 70 1334 1577 1592 AGCGAAGTGCACACGG 552530 4-9-3 73 1334 1578 1593 AAGCGAAGTGCACACG 552475 3-9-4 64 1335 1578 1593 AAGCGAAGTGCACACG 552531 4-9-3 62 1335 1579 1594 GAAGCGAAGTGCACAC 552476 3-9-4 50 1336 1580 1595 TGAAGCGAAGTGCACA 552477 3-9-4 66 1337 1581 1596 GTGAAGCGAAGTGCAC 552478 3-9-4 68 1338 1582 1597 GGTGAAGCGAAGTGCA 552479 3-9-4 60 1339 1583 1598 AGGTGAAGCGAAGTGC 552480 3-9-4 58 1340 1584 1599 GAGGTGAAGCGAAGTG 552481 3-9-4 54 1341 1585 1600 AGAGGTGAAGCGAAGT 552482 3-9-4 44 1342

1586 1601 CAGAGGTGAAGCGAAG 552483 3-9-4 17 1343 1587 1602 GCAGAGGTGAAGCGAA 552484 3-9-4 64 1344 1588 1603 TGCAGAGGTGAAGCGA 552485 3-9-4 56 1345 1589 1604 GTGCAGAGGTGAAGCG 552486 3-9-4 26 1346 1590 1605 CGTGCAGAGGTGAAGC 552487 3-9-4 42 1347 1591 1606 ACGTGCAGAGGTGAAG 552488 3-9-4 35 1348 1778 1793 TATGCCTACAGCCTCC 552489 3-9-4 46 230 1779 1794 TTATGCCTACAGCCTC 552490 3-9-4 41 231 1780 1795 TTTATGCCTACAGCCT 552491 3-9-4 38 232 1781 1796 ATTTATGCCTACAGCC 552492 3-9-4 47 233 1782 1797 AATTTATGCCTACAGC 552493 3-9-4 49 234 1783 1798 CAATTTATGCCTACAG 552494 3-9-4 22 235 1784 1799 CCAATTTATGCCTACA 552495 3-9-4 0 236 Таблица 42 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3371 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 146786 5-10-5 56 224 55 414 429 GAGGCATAGCAGCAGG 509959 3-10-3 54 145 58 73 TGGAGCCACCAGCAGG 552552 5-9-2 32 1355 59 74 CTGGAGCCACCAGCAG 552553 5-9-2 53 1319 60 75 ACTGGAGCCACCAGCA 552554 5-9-2 48 1320 61 76 AACTGGAGCCACCAGC 552555 5-9-2 39 1321 62 77 GAACTGGAGCCACCAG 552556 5-9-2 39 86 411 426 GCATAGCAGCAGGATG 552557 5-9-2 54 137 412 427 GGCATAGCAGCAGGAT 552558 5-9-2 41 140 413 428 AGGCATAGCAGCAGGA 552559 5-9-2 56 143 414 429 GAGGCATAGCAGCAGG 552560 5-9-2 39 145 415 430 TGAGGCATAGCAGCAG 552561 5-9-2 51 147 416 431 ATGAGGCATAGCAGCA 552562 5-9-2 56 149 417 432 GATGAGGCATAGCAGC 552563 5-9-2 31 151 418 433 AGATGAGGCATAGCAG 552564 5-9-2 31 153 457 472 CGGGCAACATACCTTG 552565 5-9-2 53 167

458 473 ACGGGCAACATACCTT 552566 5-9-2 46 168 670 685 CTAGTAAACTGAGCCA 552567 5-9-2 63 181 671 686 ACTAGTAAACTGAGCC 552568 5-9-2 66 1322 672 687 CACTAGTAAACTGAGC 552569 5-9-2 60 1323 673 688 GCACTAGTAAACTGAG 552570 5-9-2 60 1324 687 702 CCACTGAACAAATGGC 552571 5-9-2 44 188 688 703 ACCACTGAACAAATGG 552572 5-9-2 52 190 689 704 AACCACTGAACAAATG 552573 5-9-2 20 191 690 705 GAACCACTGAACAAAT 552574 5-9-2 36 192 691 706 CGAACCACTGAACAAA 552575 5-9-2 19 194 1261 1276 GCAGTATGGATCGGCA 552576 5-9-2 61 211 1262 1277 CGCAGTATGGATCGGC 552577 5-9-2 57 1325 1263 1278 CCGCAGTATGGATCGG 552578 5-9-2 71 1326 1264 1279 TCCGCAGTATGGATCG 552579 5-9-2 59 1327 1265 1280 TTCCGCAGTATGGATC 552580 5-9-2 58 1328 1266 1281 GTTCCGCAGTATGGAT 552581 5-9-2 51 1329 1267 1282 AGTTCCGCAGTATGGA 552582 5-9-2 40 1330 1268 1283 GAGTTCCGCAGTATGG 552583 5-9-2 35 1331 1269 1284 GGAGTTCCGCAGTATG 552584 5-9-2 50 1332 1270 1285 AGGAGTTCCGCAGTAT 552585 5-9-2 48 1333 1577 1592 AGCGAAGTGCACACGG 552586 5-9-2 74 1334 1578 1593 AAGCGAAGTGCACACG 552587 5-9-2 68 1335 1579 1594 GAAGCGAAGTGCACAC 552532 4-9-3 59 1336 1579 1594 GAAGCGAAGTGCACAC 552588 5-9-2 67 1336 1580 1595 TGAAGCGAAGTGCACA 552533 4-9-3 52 1337 1580 1595 TGAAGCGAAGTGCACA 552589 5-9-2 47 1337 1581 1596 GTGAAGCGAAGTGCAC 552534 4-9-3 71 1338 1581 1596 GTGAAGCGAAGTGCAC 552590 5-9-2 58 1338 1582 1597 GGTGAAGCGAAGTGCA 552535 4-9-3 59 1339 1582 1597 GGTGAAGCGAAGTGCA 552591 5-9-2 46 1339 1583 1598 AGGTGAAGCGAAGTGC 552536 4-9-3 19 1340 1583 1598 AGGTGAAGCGAAGTGC 552592 5-9-2 44 1340 1584 1599 GAGGTGAAGCGAAGTG 552537 4-9-3 26 1341 1584 1599 GAGGTGAAGCGAAGTG 552593 5-9-2 39 1341 1585 1600 AGAGGTGAAGCGAAGT 552538 4-9-3 54 1342 1585 1600 AGAGGTGAAGCGAAGT 552594 5-9-2 52 1342 1586 1601 CAGAGGTGAAGCGAAG 552539 4-9-3 50 1343 1586 1601 CAGAGGTGAAGCGAAG 552595 5-9-2 57 1343 1587 1602 GCAGAGGTGAAGCGAA 552540 4-9-3 60 1344 1587 1602 GCAGAGGTGAAGCGAA 552596 5-9-2 58 1344 1588 1603 TGCAGAGGTGAAGCGA 552541 4-9-3 68 1345 1588 1603 TGCAGAGGTGAAGCGA 552597 5-9-2 52 1345 1589 1604 GTGCAGAGGTGAAGCG 552542 4-9-3 63 1346

1589 1604 GTGCAGAGGTGAAGCG 552598 5-9-2 51 1346 1590 1605 CGTGCAGAGGTGAAGC 552543 4-9-3 44 1347 1590 1605 CGTGCAGAGGTGAAGC 552600 5-9-2 51 1347 1591 1606 ACGTGCAGAGGTGAAG 552544 4-9-3 45 1348 1591 1606 ACGTGCAGAGGTGAAG 552602 5-9-2 13 1348 1778 1793 TATGCCTACAGCCTCC 552545 4-9-3 42 230 1778 1793 TATGCCTACAGCCTCC 552604 5-9-2 42 230 1779 1794 TTATGCCTACAGCCTC 552546 4-9-3 46 231 1779 1794 TTATGCCTACAGCCTC 552606 5-9-2 42 231 1780 1795 TTTATGCCTACAGCCT 552547 4-9-3 38 232 1780 1795 TTTATGCCTACAGCCT 552608 5-9-2 37 232 1781 1796 ATTTATGCCTACAGCC 552548 4-9-3 49 233 1781 1796 ATTTATGCCTACAGCC 552610 5-9-2 41 233 1782 1797 AATTTATGCCTACAGC 552549 4-9-3 34 234 1782 1797 AATTTATGCCTACAGC 552612 5-9-2 23 234 1783 1798 CAATTTATGCCTACAG 552550 4-9-3 13 235 1783 1798 CAATTTATGCCTACAG 552614 5-9-2 11 235 1784 1799 CCAATTTATGCCTACA 552551 4-9-3 8 236 1784 1799 CCAATTTATGCCTACA 552616 5-9-2 6 236 Таблица 43 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3371 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 146786 5-10-5 47 224 1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 509934 5-10-5 67 50 58 77 GAACTGGAGCCACCAGCAGG 552007 6-10-4 53 83 58 77 GAACTGGAGCCACCAGCAGG 552039 7-10-3 74 83 253 272 AGAGAAGTCCACCACGAGTC 552008 6-10-4 47 103 253 272 AGAGAAGTCCACCACGAGTC 552040 7-10-3 57 103 411 430 TGAGGCATAGCAGCAGGATG 552009 6-10-4 70 136 411 430 TGAGGCATAGCAGCAGGATG 552041 7-10-3 65 136 412 431 ATGAGGCATAGCAGCAGGAT 552010 6-10-4 51 139

412 431 ATGAGGCATAGCAGCAGGAT 552042 7-10-3 59 139 413 432 GATGAGGCATAGCAGCAGGA 552011 6-10-4 47 142 413 432 GATGAGGCATAGCAGCAGGA 552043 7-10-3 36 142 414 433 AGATGAGGCATAGCAGCAGG 552012 6-10-4 62 20 414 433 AGATGAGGCATAGCAGCAGG 552044 7-10-3 82 20 415 434 AAGATGAGGCATAGCAGCAG 552013 6-10-4 72 22 415 434 AAGATGAGGCATAGCAGCAG 552045 7-10-3 62 22 416 435 GAAGATGAGGCATAGCAGCA 552014 6-10-4 73 24 416 435 GAAGATGAGGCATAGCAGCA 552046 7-10-3 74 24 417 436 AGAAGATGAGGCATAGCAGC 552015 6-10-4 66 26 417 436 AGAAGATGAGGCATAGCAGC 552047 7-10-3 60 26 418 437 AAGAAGATGAGGCATAGCAG 552016 6-10-4 67 28 418 437 AAGAAGATGAGGCATAGCAG 552048 7-10-3 60 28 687 706 CGAACCACTGAACAAATGGC 552017 6-10-4 72 39 687 706 CGAACCACTGAACAAATGGC 552049 7-10-3 68 39 1261 1280 TTCCGCAGTATGGATCGGCA 552018 6-10-4 89 719 1261 1280 TTCCGCAGTATGGATCGGCA 552050 7-10-3 86 719 1262 1281 GTTCCGCAGTATGGATCGGC 552019 6-10-4 87 212 1262 1281 GTTCCGCAGTATGGATCGGC 552051 7-10-3 86 212 1263 1282 AGTTCCGCAGTATGGATCGG 551986 4-10-6 64 720 1263 1282 AGTTCCGCAGTATGGATCGG 552020 6-10-4 86 720 1263 1282 AGTTCCGCAGTATGGATCGG 552052 7-10-3 87 720 1264 1283 GAGTTCCGCAGTATGGATCG 551987 4-10-6 76 721 1264 1283 GAGTTCCGCAGTATGGATCG 552021 6-10-4 84 721 1264 1283 GAGTTCCGCAGTATGGATCG 552053 7-10-3 75 721 1265 1284 GGAGTTCCGCAGTATGGATC 551988 4-10-6 5 1349

1265 1284 GGAGTTCCGCAGTATGGATC 552005 5-10-5 72 1349 1265 1284 GGAGTTCCGCAGTATGGATC 552022 6-10-4 80 1349 1265 1284 GGAGTTCCGCAGTATGGATC 552054 7-10-3 83 1349 1266 1285 AGGAGTTCCGCAGTATGGAT 551989 4-10-6 64 722 1266 1285 AGGAGTTCCGCAGTATGGAT 552023 6-10-4 78 722 1266 1285 AGGAGTTCCGCAGTATGGAT 552055 7-10-3 57 722 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 551990 4-10-6 83 224 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 552024 6-10-4 89 224 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 552056 7-10-3 82 224 1578 1597 GGTGAAGCGAAGTGCACACG 551991 4-10-6 0 801 1578 1597 GGTGAAGCGAAGTGCACACG 552025 6-10-4 89 801 1578 1597 GGTGAAGCGAAGTGCACACG 552057 7-10-3 89 801 1579 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCACAC 551992 4-10-6 67 802 1579 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCACAC 552026 6-10-4 84 802 1579 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCACAC 552058 7-10-3 82 802 1580 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGCACA 551993 4-10-6 78 225 1580 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGCACA 552027 6-10-4 85 225 1580 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGCACA 552059 7-10-3 85 225 1581 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTGCAC 551994 4-10-6 82 804 1581 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTGCAC 552028 6-10-4 82 804 1581 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTGCAC 552060 7-10-3 74 804 1582 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGTGCA 551995 4-10-6 81 805 1582 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGTGCA 552029 6-10-4 81 805 1582 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGTGCA 552061 7-10-3 81 805 1583 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAGTGC 551996 4-10-6 79 226

1583 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAGTGC 552030 6-10-4 86 226 1583 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAGTGC 552062 7-10-3 85 226 1584 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAAGTG 551997 4-10-6 80 806 1584 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAAGTG 552031 6-10-4 86 806 1585 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGAAGT 551998 4-10-6 74 807 1585 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGAAGT 552032 6-10-4 78 807 1586 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCGAAG 551999 4-10-6 79 227 1586 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCGAAG 552033 6-10-4 80 227 1587 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGCGAA 552000 4-10-6 84 1350 1587 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGCGAA 552006 5-10-5 86 1350 1587 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGCGAA 552034 6-10-4 81 1350 1778 1797 AATTTATGCCTACAGCCTCC 552001 4-10-6 66 46 1778 1797 AATTTATGCCTACAGCCTCC 552035 6-10-4 55 46 1779 1798 CAATTTATGCCTACAGCCTC 552002 4-10-6 54 48 1779 1798 CAATTTATGCCTACAGCCTC 552036 6-10-4 58 48 1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 552003 4-10-6 50 50 1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 552037 6-10-4 43 50 1781 1800 ACCAATTTATGCCTACAGCC 552004 4-10-6 56 52 1781 1800 ACCAATTTATGCCTACAGCC 552038 6-10-4 66 52 Таблица 44 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3371 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 146786 5-10-5 61 224

411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 510100 3-10-4 66 17 58 74 CTGGAGCCACCAGCAGG 552168 3-9-5 64 1288 58 74 CTGGAGCCACCAGCAGG 552222 4-9-4 76 1288 59 75 ACTGGAGCCACCAGCAG 552169 3-9-5 65 1289 59 75 ACTGGAGCCACCAGCAG 552223 4-9-4 41 1289 60 76 AACTGGAGCCACCAGCA 552170 3-9-5 58 1290 60 76 AACTGGAGCCACCAGCA 552224 4-9-4 58 1290 61 77 GAACTGGAGCCACCAGC 552171 3-9-5 51 1291 61 77 GAACTGGAGCCACCAGC 552225 4-9-4 49 1291 253 269 GAAGTCCACCACGAGTC 552172 3-9-5 23 9 253 269 GAAGTCCACCACGAGTC 552226 4-9-4 36 9 254 270 AGAAGTCCACCACGAGT 552173 3-9-5 44 10 254 270 AGAAGTCCACCACGAGT 552227 4-9-4 20 10 255 271 GAGAAGTCCACCACGAG 552174 3-9-5 28 11 255 271 GAGAAGTCCACCACGAG 552228 4-9-4 29 11 256 272 AGAGAAGTCCACCACGA 552175 3-9-5 56 12 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 552176 3-9-5 66 17 412 428 AGGCATAGCAGCAGGAT 552177 3-9-5 53 18 413 429 GAGGCATAGCAGCAGGA 552178 3-9-5 57 19 414 430 TGAGGCATAGCAGCAGG 552179 3-9-5 56 21 415 431 ATGAGGCATAGCAGCAG 552180 3-9-5 51 23 416 432 GATGAGGCATAGCAGCA 552181 3-9-5 51 25 417 433 AGATGAGGCATAGCAGC 552182 3-9-5 63 27 418 434 AAGATGAGGCATAGCAG 552183 3-9-5 60 29 670 686 ACTAGTAAACTGAGCCA 552185 3-9-5 67 1292 671 687 CACTAGTAAACTGAGCC 552186 3-9-5 37 1293 672 688 GCACTAGTAAACTGAGC 552187 3-9-5 68 1294 687 703 ACCACTGAACAAATGGC 552188 3-9-5 71 40 688 704 AACCACTGAACAAATGG 552189 3-9-5 51 41 689 705 GAACCACTGAACAAATG 552190 3-9-5 47 42 690 706 CGAACCACTGAACAAAT 552191 3-9-5 50 43 1261 1277 CGCAGTATGGATCGGCA 552192 3-9-5 80 1295 1262 1278 CCGCAGTATGGATCGGC 552193 3-9-5 73 1296 1263 1279 TCCGCAGTATGGATCGG 552194 3-9-5 58 1297 1264 1280 TTCCGCAGTATGGATCG 552195 3-9-5 60 1298 1265 1281 GTTCCGCAGTATGGATC 552196 3-9-5 54 1299 1266 1282 AGTTCCGCAGTATGGAT 552197 3-9-5 64 1300 1267 1283 GAGTTCCGCAGTATGGA 552198 3-9-5 62 1301 1268 1284 GGAGTTCCGCAGTATGG 552199 3-9-5 57 1302 1269 1285 AGGAGTTCCGCAGTATG 552200 3-9-5 52 1303 1577 1593 AAGCGAAGTGCACACGG 552201 3-9-5 73 1304 1578 1594 GAAGCGAAGTGCACACG 552202 3-9-5 60 1305 1579 1595 TGAAGCGAAGTGCACAC 552203 3-9-5 60 1306

1580 1596 GTGAAGCGAAGTGCACA 552204 3-9-5 63 1307 1581 1597 GGTGAAGCGAAGTGCAC 552151 2-9-6 71 1308 1581 1597 GGTGAAGCGAAGTGCAC 552205 3-9-5 64 1308 1582 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCA 552152 2-9-6 69 1309 1582 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCA 552206 3-9-5 71 1309 1583 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGC 552153 2-9-6 63 1310 1583 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGC 552207 3-9-5 71 1310 1584 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTG 552154 2-9-6 56 1311 1584 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTG 552208 3-9-5 52 1311 1585 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGT 552155 2-9-6 61 1312 1585 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGT 552209 3-9-5 50 1312 1586 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAG 552156 2-9-6 40 1313 1586 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAG 552210 3-9-5 66 1313 1587 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAA 552157 2-9-6 45 1314 1587 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAA 552211 3-9-5 63 1314 1588 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGA 552158 2-9-6 66 1315 1588 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGA 552212 3-9-5 62 1315 1589 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCG 552159 2-9-6 68 1316 1589 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCG 552213 3-9-5 64 1316 1590 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGC 552160 2-9-6 78 1317 1590 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGC 552214 3-9-5 72 1317 1778 1794 TTATGCCTACAGCCTCC 552161 2-9-6 57 47 1778 1794 TTATGCCTACAGCCTCC 552215 3-9-5 54 47 1779 1795 TTTATGCCTACAGCCTC 552162 2-9-6 54 49 1779 1795 TTTATGCCTACAGCCTC 552216 3-9-5 49 49 1780 1796 ATTTATGCCTACAGCCT 552163 2-9-6 65 51 1780 1796 ATTTATGCCTACAGCCT 552217 3-9-5 50 51 1781 1797 AATTTATGCCTACAGCC 552164 2-9-6 48 53 1781 1797 AATTTATGCCTACAGCC 552218 3-9-5 39 53 1782 1798 CAATTTATGCCTACAGC 552165 2-9-6 46 54 1782 1798 CAATTTATGCCTACAGC 552219 3-9-5 41 54 1783 1799 CCAATTTATGCCTACAG 552166 2-9-6 42 55 1783 1799 CCAATTTATGCCTACAG 552220 3-9-5 32 55 1784 1800 ACCAATTTATGCCTACA 552167 2-9-6 47 56 1784 1800 ACCAATTTATGCCTACA 552221 3-9-5 33 56 Таблица 45 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3371 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO

1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 146786 5-10-5 87 224 56 1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 509934 5-10-5 56 50 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 510100 3-10-4 69 17 58 77 GAACTGGAGCCACCAGCAGG 552071 8-10-2 73 83 58 74 CTGGAGCCACCAGCAGG 552114 2-9-6 64 1288 59 75 ACTGGAGCCACCAGCAG 552115 2-9-6 61 1289 60 76 AACTGGAGCCACCAGCA 552116 2-9-6 53 1290 61 77 GAACTGGAGCCACCAGC 552117 2-9-6 69 1291 253 272 AGAGAAGTCCACCACGAGTC 552072 8-10-2 39 103 253 269 GAAGTCCACCACGAGTC 552118 2-9-6 49 9 254 270 AGAAGTCCACCACGAGT 552119 2-9-6 49 10 255 271 GAGAAGTCCACCACGAG 552120 2-9-6 21 11 256 272 AGAGAAGTCCACCACGA 552121 2-9-6 27 12 411 430 TGAGGCATAGCAGCAGGATG 552073 8-10-2 73 136 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 552122 2-9-6 48 17 412 431 ATGAGGCATAGCAGCAGGAT 552074 8-10-2 69 139 412 428 AGGCATAGCAGCAGGAT 552123 2-9-6 68 18 413 432 GATGAGGCATAGCAGCAGGA 552075 8-10-2 78 142 413 429 GAGGCATAGCAGCAGGA 552124 2-9-6 47 19 414 433 AGATGAGGCATAGCAGCAGG 552076 8-10-2 63 20 414 430 TGAGGCATAGCAGCAGG 552125 2-9-6 72 21 415 434 AAGATGAGGCATAGCAGCAG 552077 8-10-2 62 22 415 431 ATGAGGCATAGCAGCAG 552126 2-9-6 64 23 416 435 GAAGATGAGGCATAGCAGCA 552078 8-10-2 59 24 416 432 GATGAGGCATAGCAGCA 552127 2-9-6 65 25 417 436 AGAAGATGAGGCATAGCAGC 552079 8-10-2 80 26 417 433 AGATGAGGCATAGCAGC 552128 2-9-6 78 27 418 437 AAGAAGATGAGGCATAGCAG 552080 8-10-2 74 28 418 434 AAGATGAGGCATAGCAG 552129 2-9-6 68 29 457 473 ACGGGCAACATACCTTG 552130 2-9-6 46 33 670 686 ACTAGTAAACTGAGCCA 552131 2-9-6 61 1292 671 687 CACTAGTAAACTGAGCC 552132 2-9-6 66 1293 672 688 GCACTAGTAAACTGAGC 552133 2-9-6 78 1294

687 706 CGAACCACTGAACAAATGGC 552081 8-10-2 69 39 687 703 ACCACTGAACAAATGGC 552134 2-9-6 68 40 688 704 AACCACTGAACAAATGG 552135 2-9-6 59 41 689 705 GAACCACTGAACAAATG 552136 2-9-6 39 42 690 706 CGAACCACTGAACAAAT 552137 2-9-6 36 43 1261 1280 TTCCGCAGTATGGATCGGCA 552082 8-10-2 86 719 1261 1277 CGCAGTATGGATCGGCA 552138 2-9-6 80 1295 1262 1281 GTTCCGCAGTATGGATCGGC 552083 8-10-2 85 212 1262 1278 CCGCAGTATGGATCGGC 552139 2-9-6 80 1296 1263 1282 AGTTCCGCAGTATGGATCGG 552084 8-10-2 86 720 1263 1279 TCCGCAGTATGGATCGG 552140 2-9-6 70 1297 1264 1283 GAGTTCCGCAGTATGGATCG 552085 8-10-2 83 721 1264 1280 TTCCGCAGTATGGATCG 552141 2-9-6 72 1298 1265 1284 GGAGTTCCGCAGTATGGATC 552086 8-10-2 83 1349 1265 1281 GTTCCGCAGTATGGATC 552142 2-9-6 58 1299 1266 1285 AGGAGTTCCGCAGTATGGAT 552087 8-10-2 77 722 1266 1282 AGTTCCGCAGTATGGAT 552143 2-9-6 70 1300 1267 1283 GAGTTCCGCAGTATGGA 552144 2-9-6 66 1301 1268 1284 GGAGTTCCGCAGTATGG 552145 2-9-6 78 1302 1269 1285 AGGAGTTCCGCAGTATG 552146 2-9-6 63 1303 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 552088 8-10-2 90 224 1577 1593 AAGCGAAGTGCACACGG 552147 2-9-6 80 1304 1578 1597 GGTGAAGCGAAGTGCACACG 552089 8-10-2 87 801 1578 1594 GAAGCGAAGTGCACACG 552148 2-9-6 74 1305 1579 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCACAC 552090 8-10-2 85 802 1579 1595 TGAAGCGAAGTGCACAC 552149 2-9-6 79 1306 1580 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGCACA 552091 8-10-2 84 225 1581 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTGCAC 552092 8-10-2 86 804 1582 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGTGCA 552093 8-10-2 82 805 1583 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAGTGC 552094 8-10-2 84 226 1584 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAAGTG 552063 7-10-3 79 806 1584 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAAGTG 552095 8-10-2 85 806

1585 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGAAGT 552064 7-10-3 83 807 1585 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGAAGT 552096 8-10-2 88 807 1586 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCGAAG 552065 7-10-3 86 227 1586 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCGAAG 552097 8-10-2 90 227 1587 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGCGAA 552066 7-10-3 35 1350 1587 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGCGAA 552098 8-10-2 86 1350 1778 1797 AATTTATGCCTACAGCCTCC 552067 7-10-3 53 46 1778 1797 AATTTATGCCTACAGCCTCC 552099 8-10-2 66 46 1779 1798 CAATTTATGCCTACAGCCTC 552068 7-10-3 70 48 1779 1798 CAATTTATGCCTACAGCCTC 552100 8-10-2 67 48 1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 552069 7-10-3 68 50 1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 552101 8-10-2 65 50 1781 1800 ACCAATTTATGCCTACAGCC 552070 7-10-3 64 52 1781 1800 ACCAATTTATGCCTACAGCC 552102 8-10-2 54 52 Таблица 46 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3371 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 146786 5-10-5 69 224 57 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 510100 3-10-4 59 17 58 74 CTGGAGCCACCAGCAGG 552330 6-9-2 50 1288 59 75 ACTGGAGCCACCAGCAG 552331 6-9-2 46 1289 60 76 AACTGGAGCCACCAGCA 552332 6-9-2 50 1290 61 77 GAACTGGAGCCACCAGC 552333 6-9-2 48 1291 253 269 GAAGTCCACCACGAGTC 552334 6-9-2 42 9 254 270 AGAAGTCCACCACGAGT 552335 6-9-2 30 10 255 271 GAGAAGTCCACCACGAG 552336 6-9-2 23 11

256 272 AGAGAAGTCCACCACGA 552337 6-9-2 42 12 411 427 GGCATAGCAGCAGGATG 552338 6-9-2 40 17 412 428 AGGCATAGCAGCAGGAT 552339 6-9-2 50 18 413 429 GAGGCATAGCAGCAGGA 552340 6-9-2 45 19 414 430 TGAGGCATAGCAGCAGG 552341 6-9-2 44 21 415 431 ATGAGGCATAGCAGCAG 552342 6-9-2 51 23 416 432 GATGAGGCATAGCAGCA 552343 6-9-2 44 25 417 433 AGATGAGGCATAGCAGC 552344 6-9-2 24 27 418 434 AAGATGAGGCATAGCAG 552345 6-9-2 41 29 457 473 ACGGGCAACATACCTTG 552346 6-9-2 0 33 670 686 ACTAGTAAACTGAGCCA 552347 6-9-2 75 1292 671 687 CACTAGTAAACTGAGCC 552348 6-9-2 72 1293 672 688 GCACTAGTAAACTGAGC 552349 6-9-2 65 1294 687 703 ACCACTGAACAAATGGC 552350 6-9-2 42 40 688 704 AACCACTGAACAAATGG 552351 6-9-2 45 41 689 705 GAACCACTGAACAAATG 552352 6-9-2 43 42 690 706 CGAACCACTGAACAAAT 552353 6-9-2 20 43 1261 1277 CGCAGTATGGATCGGCA 552354 6-9-2 70 1295 1262 1278 CCGCAGTATGGATCGGC 552355 6-9-2 66 1296 1263 1279 TCCGCAGTATGGATCGG 552356 6-9-2 62 1297 1264 1280 TTCCGCAGTATGGATCG 552357 6-9-2 53 1298 1265 1281 GTTCCGCAGTATGGATC 552358 6-9-2 57 1299 1266 1282 AGTTCCGCAGTATGGAT 552359 6-9-2 46 1300 1267 1283 GAGTTCCGCAGTATGGA 552360 6-9-2 45 1301 1268 1284 GGAGTTCCGCAGTATGG 552361 6-9-2 44 1302 1269 1285 AGGAGTTCCGCAGTATG 552308 5-9-3 38 1303 1269 1285 AGGAGTTCCGCAGTATG 552362 6-9-2 51 1303 1577 1593 AAGCGAAGTGCACACGG 552309 5-9-3 76 1304 1577 1593 AAGCGAAGTGCACACGG 552363 6-9-2 73 1304 1578 1594 GAAGCGAAGTGCACACG 552310 5-9-3 58 1305 1578 1594 GAAGCGAAGTGCACACG 552364 6-9-2 66 1305 1579 1595 TGAAGCGAAGTGCACAC 552311 5-9-3 38 1306 1579 1595 TGAAGCGAAGTGCACAC 552365 6-9-2 64 1306 1580 1596 GTGAAGCGAAGTGCACA 552150 2-9-6 68 1307 1580 1596 GTGAAGCGAAGTGCACA 552312 5-9-3 75 1307 1580 1596 GTGAAGCGAAGTGCACA 552366 6-9-2 55 1307 1581 1597 GGTGAAGCGAAGTGCAC 552313 5-9-3 66 1308 1581 1597 GGTGAAGCGAAGTGCAC 552367 6-9-2 67 1308 1582 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCA 552314 5-9-3 56 1309 1582 1598 AGGTGAAGCGAAGTGCA 552368 6-9-2 41 1309 1583 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGC 552315 5-9-3 46 1310 1583 1599 GAGGTGAAGCGAAGTGC 552369 6-9-2 52 1310 1584 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTG 552316 5-9-3 55 1311

1584 1600 AGAGGTGAAGCGAAGTG 552370 6-9-2 35 1311 1585 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGT 552317 5-9-3 53 1312 1585 1601 CAGAGGTGAAGCGAAGT 552371 6-9-2 58 1312 1586 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAG 552318 5-9-3 59 1313 1586 1602 GCAGAGGTGAAGCGAAG 552372 6-9-2 68 1313 1587 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAA 552319 5-9-3 56 1314 1587 1603 TGCAGAGGTGAAGCGAA 552373 6-9-2 63 1314 1588 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGA 552320 5-9-3 62 1315 1588 1604 GTGCAGAGGTGAAGCGA 552374 6-9-2 70 1315 1589 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCG 552321 5-9-3 63 1316 1589 1605 CGTGCAGAGGTGAAGCG 552375 6-9-2 64 1316 1590 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGC 552322 5-9-3 52 1317 1590 1606 ACGTGCAGAGGTGAAGC 552376 6-9-2 58 1317 1778 1794 TTATGCCTACAGCCTCC 552323 5-9-3 45 47 1778 1794 TTATGCCTACAGCCTCC 552377 6-9-2 42 47 1779 1795 TTTATGCCTACAGCCTC 552324 5-9-3 49 49 1779 1795 TTTATGCCTACAGCCTC 552378 6-9-2 37 49 1780 1796 ATTTATGCCTACAGCCT 552325 5-9-3 48 51 1780 1796 ATTTATGCCTACAGCCT 552379 6-9-2 57 51 1781 1797 AATTTATGCCTACAGCC 552326 5-9-3 50 53 1781 1797 AATTTATGCCTACAGCC 552380 6-9-2 48 53 1782 1798 CAATTTATGCCTACAGC 552327 5-9-3 13 54 1782 1798 CAATTTATGCCTACAGC 552381 6-9-2 22 54 1783 1799 CCAATTTATGCCTACAG 552328 5-9-3 9 55 1783 1799 CCAATTTATGCCTACAG 552382 6-9-2 20 55 1784 1800 ACCAATTTATGCCTACA 552329 5-9-3 18 56 1784 1800 ACCAATTTATGCCTACA 552383 6-9-2 18 56

Пример 15: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК HBV в клетках HepG2 дезокси-, МОЕ и (S)-cEt-химерными олигонуклеотидами

Антисмысловые олигонуклеотиды были разработаны для направленного действия на вирусную нуклеиновую кислоту HBV, и были испытаны на их действие на мРНК HBV in vitro. Антисмысловые олигонуклеотиды испытали в серии экспериментов, имеющих такие же культуральные условия. Результаты каждого эксперимента показаны в отдельных таблицах, представленных ниже. ISIS 146786 и ISIS 509934, которые были описаны в более ранней заявке (предварительная заявка на патент США №61/478040, поданная 21 апреля 2011 года), также включили в эти исследования для сравнения. Культивированные клетки HepG2 при плотности 28000 клеток на лунку трансфицировали при помощи LipofectAMINE 2000® 70 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Набор вирусных затравочных зондов RTS3370 (прямая последовательность CTTGGTCATGGGCCATCAG, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:1; обратная последовательность CGGCTAGGAGTTCCGCAGTA, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:2; последовательность зонда TGCGTGGAACCTTTTCGGCTCC, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:3) использовали для измерения уровней мРНК. Уровни измерили также с использованием набора затравочных зондов RTS3371 (прямая последовательность CCAAACCTTCGGACGGAAA, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:311; обратная последовательность TGAGGCCCACTCCCATAGG, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:312; последовательность зонда CCCATCATCCTGGGCTTTCGGAAAAT, в настоящем документе обозначена как SEQ ID NO:313). Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.

Новые разработанные химерные антисмысловые олигонуклеотиды в Таблицах ниже были разработаны как дезокси-, МОЕ и (S)-cEt химерные олигонуклеотиды. Эти химерные олигонуклеотиды имеют 16 нуклеозидов в длину, причем нуклеозид имеет или МОЕ сахарную модификацию, или (S)-cEt сахарную модификацию, или дезокси-модификацию. Колонка «химия» описывает модификации сахара каждого олигонуклеотида. «k» обозначает (S)-cEt модификацию сахара; число обозначает количество дезоксинуклеозидов; и «е» обозначает модификацию МОЕ. Межнуклеозидные связи в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой фосфотиоатные (P=S) связи. Все цитозиновые остатки в каждом олигонуклеотиде представляют собой 5-метилцитозины.

«Вирусный целевой сайт инициации» указывает 5'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. «Вирусный целевой терминирующий сайт» указывает 3'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. Каждый химерный олигонуклеотид, перечисленный в Таблицах, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1 (доступ GENBANK №U95551.1). Эффективность новых разработанных олигонуклеотидов сравнили с ISIS 146786, 509934, ISIS 509959 и ISIS 510100.

Таблица 47 30 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3370 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1780 1799 CCAATTTATGCCTACAGCCT 509934 еееее-10-еееее 30 50

58 73 TGGAGCCACCAGCAGG 552787 ekk-10-kke 57 1318 59 74 CTGGAGCCACCAGCAG 552788 ekk-10-kke 60 1319 60 75 ACTGGAGCCACCAGCA 552789 ekk-10-kke 67 1320 61 76 AACTGGAGCCACCAGC 552790 ekk-10-kke 67 1321 62 77 GAACTGGAGCCACCAG 552791 ekk-10-kke 65 86 245 260 CACGAGTCTAGACTCT 552792 ekk-10-kke 44 93 246 261 CCACGAGTCTAGACTC 552793 ekk-10-kke 0 95 250 265 TCCACCACGAGTCTAG 552794 ekk-10-kke 54 98 251 266 GTCCACCACGAGTCTA 552795 ekk-10-kke 55 100 252 267 AGTCCACCACGAGTCT 552796 ekk-10-kke 62 102 253 268 AAGTCCACCACGAGTC 552797 ekk-10-kke 59 104 254 269 GAAGTCCACCACGAGT 552798 ekk-10-kke 59 106 255 270 AGAAGTCCACCACGAG 552799 ekk-10-kke 58 109 256 271 GAGAAGTCCACCACGA 552800 ekk-10-kke 62 112 258 273 GAGAGAAGTCCACCAC 552801 ekk-10-kke 65 115 259 274 TGAGAGAAGTCCACCA 552802 ekk-10-kke 53 117 411 426 GCATAGCAGCAGGATG 552803 ekk-10-kke 67 137 412 427 GGCATAGCAGCAGGAT 552804 ekk-10-kke 75 140 413 428 AGGCATAGCAGCAGGA 552805 ekk-10-kke 72 143 414 429 GAGGCATAGCAGCAGG 552806 ekk-10-kke 64 145 415 430 TGAGGCATAGCAGCAG 552807 ekk-10-kke 68 147 416 431 ATGAGGCATAGCAGCA 552808 ekk-10-kke 65 149 417 432 GATGAGGCATAGCAGC 552809 ekk-10-kke 60 151 418 433 AGATGAGGCATAGCAG 552810 ekk-10-kke 59 153 419 434 AAGATGAGGCATAGCA 552811 ekk-10-kke 64 155 420 435 GAAGATGAGGCATAGC 552812 ekk-10-kke 69 157 421 436 AGAAGATGAGGCATAG 552813 ekk-10-kke 64 159 422 437 AAGAAGATGAGGCATA 552814 ekk-10-kke 62 161 457 472 CGGGCAACATACCTTG 552815 ekk-10-kke 61 167 458 473 ACGGGCAACATACCTT 552816 ekk-10-kke 63 168 639 654 GGCCCACTCCCATAGG 552817 ekk-10-kke 42 176 641 656 GAGGCCCACTCCCATA 552818 ekk-10-kke 44 177 642 657 TGAGGCCCACTCCCAT 552819 ekk-10-kke 56 178 643 658 CTGAGGCCCACTCCCA 552820 ekk-10-kke 59 179 670 685 CTAGTAAACTGAGCCA 552821 ekk-10-kke 76 181 671 686 ACTAGTAAACTGAGCC 552822 ekk-10-kke 77 1322 672 687 CACTAGTAAACTGAGC 552823 ekk-10-kke 73 1323 673 688 GCACTAGTAAACTGAG 552824 ekk-10-kke 73 1324 678 693 AAATGGCACTAGTAAA 552825 ekk-10-kke 51 1364 679 694 CAAATGGCACTAGTAA 552826 ekk-10-kke 55 1365 680 695 ACAAATGGCACTAGTA 552827 ekk-10-kke 67 1366 681 696 AACAAATGGCACTAGT 552828 ekk-10-kke 78 1367 682 697 GAACAAATGGCACTAG 552829 ekk-10-kke 72 1368

683 698 TGAACAAATGGCACTA 552830 ekk-10-kke 71 1369 684 699 CTGAACAAATGGCACT 552831 ekk-10-kke 69 1370 685 700 ACTGAACAAATGGCAC 552832 ekk-10-kke 67 1371 686 701 CACTGAACAAATGGCA 552833 ekk-10-kke 65 1372 687 702 CCACTGAACAAATGGC 552834 ekk-10-kke 78 188 688 703 ACCACTGAACAAATGG 552835 ekk-10-kke 70 190 689 704 AACCACTGAACAAATG 552836 ekk-10-kke 64 191 690 705 GAACCACTGAACAAAT 552837 ekk-10-kke 65 192 691 706 CGAACCACTGAACAAA 552838 ekk-10-kke 64 194 738 753 ССАСАТСАТССАТАТА 552839 ekk-10-kke 60 199 739 754 АССАСАТСАТССАТАТ 552840 ekk-10-kke 35 201 1176 1191 CAGCAAACACTTGGCA 552841 ekk-10-kke 62 208 1177 1192 TCAGCAAACACTTGGC 552842 ekk-10-kke 67 209 1261 1276 GCAGTATGGATCGGCA 552843 ekk-10-kke 77 211 1262 1277 CGCAGTATGGATCGGC 552844 ekk-10-kke 81 1325 1263 1278 CCGCAGTATGGATCGG 552845 ekk-10-kke 63 1326 1264 1279 TCCGCAGTATGGATCG 552846 ekk-10-kke 79 1327 1265 1280 TTCCGCAGTATGGATC 552847 ekk-10-kke 47 1328 1266 1281 GTTCCGCAGTATGGAT 552848 ekk-10-kke 69 1329 1267 1282 AGTTCCGCAGTATGGA 552849 ekk-10-kke 59 1330 1268 1283 GAGTTCCGCAGTATGG 552850 ekk-10-kke 83 1331 1269 1284 GGAGTTCCGCAGTATG 552851 ekk-10-kke 90 1332 1270 1285 AGGAGTTCCGCAGTAT 552852 ekk-10-kke 89 1333 1577 1592 AGCGAAGTGCACACGG 552853 ekk-10-kke 83 1334 1578 1593 AAGCGAAGTGCACACG 552854 ekk-10-kke 80 1335 1579 1594 GAAGCGAAGTGCACAC 552855 ekk-10-kke 75 1336 1580 1595 TGAAGCGAAGTGCACA 552856 ekk-10-kke 69 1337 1581 1596 GTGAAGCGAAGTGCAC 552857 ekk-10-kke 68 1338 1582 1597 GGTGAAGCGAAGTGCA 552858 ekk-10-kke 79 1339 1583 1598 AGGTGAAGCGAAGTGC 552859 ekk-10-kke 79 1340 1584 1599 GAGGTGAAGCGAAGTG 552860 ekk-10-kke 71 1341 1585 1600 AGAGGTGAAGCGAAGT 552861 ekk-10-kke 68 1342 1586 1601 CAGAGGTGAAGCGAAG 552862 ekk-10-kke 65 1343 1587 1602 GCAGAGGTGAAGCGAA 552863 ekk-10-kke 70 1344 1588 1603 TGCAGAGGTGAAGCGA 552864 ekk-10-kke 71 1345 Таблица 48 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3371 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO

58 73 TGGAGCCACCAGCAGG 552787 ekk-10-kke 53 1318 59 74 CTGGAGCCACCAGCAG 552788 ekk-10-kke 45 1319 60 75 ACTGGAGCCACCAGCA 552789 ekk-10-kke 75 1320 61 76 AACTGGAGCCACCAGC 552790 ekk-10-kke 68 1321 62 77 GAACTGGAGCCACCAG 552791 ekk-10-kke 51 86 245 260 CACGAGTCTAGACTCT 552792 ekk-10-kke 38 93 246 261 CCACGAGTCTAGACTC 552793 ekk-10-kke 0 95 250 265 TCCACCACGAGTCTAG 552794 ekk-10-kke 44 98 251 266 GTCCACCACGAGTCTA 552795 ekk-10-kke 56 100 252 267 AGTCCACCACGAGTCT 552796 ekk-10-kke 45 102 253 268 AAGTCCACCACGAGTC 552797 ekk-10-kke 46 104 254 269 GAAGTCCACCACGAGT 552798 ekk-10-kke 53 106 255 270 AGAAGTCCACCACGAG 552799 ekk-10-kke 48 109 256 271 GAGAAGTCCACCACGA 552800 ekk-10-kke 54 112 258 273 GAGAGAAGTCCACCAC 552801 ekk-10-kke 63 115 259 274 TGAGAGAAGTCCACCA 552802 ekk-10-kke 49 117 411 426 GCATAGCAGCAGGATG 552803 ekk-10-kke 71 137 412 427 GGCATAGCAGCAGGAT 552804 ekk-10-kke 64 140 413 428 AGGCATAGCAGCAGGA 552805 ekk-10-kke 70 143 414 429 GAGGCATAGCAGCAGG 552806 ekk-10-kke 67 145 415 430 TGAGGCATAGCAGCAG 552807 ekk-10-kke 61 147 416 431 ATGAGGCATAGCAGCA 552808 ekk-10-kke 83 149 417 432 GATGAGGCATAGCAGC 552809 ekk-10-kke 59 151 418 433 AGATGAGGCATAGCAG 552810 ekk-10-kke 56 153 419 434 AAGATGAGGCATAGCA 552811 ekk-10-kke 62 155

420 435 GAAGATGAGGCATAGC 552812 ekk-10-kke 66 157 421 436 AGAAGATGAGGCATAG 552813 ekk-10-kke 63 159 422 437 AAGAAGATGAGGCATA 552814 ekk-10-kke 65 161 457 472 CGGGCAACATACCTTG 552815 ekk-10-kke 63 167 458 473 ACGGGCAACATACCTT 552816 ekk-10-kke 88 168 639 654 GGCCCACTCCCATAGG 552817 ekk-10-kke 94 176 641 656 GAGGCCCACTCCCATA 552818 ekk-10-kke 82 177 642 657 TGAGGCCCACTCCCAT 552819 ekk-10-kke 80 178 643 658 CTGAGGCCCACTCCCA 552820 ekk-10-kke 84 179 670 685 CTAGTAAACTGAGCCA 552821 ekk-10-kke 71 181 671 686 ACTAGTAAACTGAGCC 552822 ekk-10-kke 85 1322 672 687 CACTAGTAAACTGAGC 552823 ekk-10-kke 71 1323 673 688 GCACTAGTAAACTGAG 552824 ekk-10-kke 81 1324 678 693 AAATGGCACTAGTAAA 552825 ekk-10-kke 51 1364 679 694 CAAATGGCACTAGTAA 552826 ekk-10-kke 64 1365 680 695 ACAAATGGCACTAGTA 552827 ekk-10-kke 61 1366 681 696 AACAAATGGCACTAGT 552828 ekk-10-kke 76 1367 682 697 GAACAAATGGCACTAG 552829 ekk-10-kke 61 1368 683 698 TGAACAAATGGCACTA 552830 ekk-10-kke 59 1369 684 699 CTGAACAAATGGCACT 552831 ekk-10-kke 58 1370 685 700 ACTGAACAAATGGCAC 552832 ekk-10-kke 64 1371 686 701 CACTGAACAAATGGCA 552833 ekk-10-kke 75 1372 687 702 CCACTGAACAAATGGC 552834 ekk-10-kke 84 188 688 703 ACCACTGAACAAATGG 552835 ekk-10-kke 57 190 689 704 AACCACTGAACAAATG 552836 ekk-10-kke 51 191

690 705 GAACCACTGAACAAAT 552837 ekk-10-kke 53 192 691 706 CGAACCACTGAACAAA 552838 ekk-10-kke 48 194 738 753 ССАСАТСАТССАТАТА 552839 ekk-10-kke 50 199 739 754 АССАСАТСАТССАТАТ 552840 ekk-10-kke 54 201 1176 1191 CAGCAAACACTTGGCA 552841 ekk-10-kke 61 208 1177 1192 TCAGCAAACACTTGGC 552842 ekk-10-kke 71 209 1261 1276 GCAGTATGGATCGGCA 552843 ekk-10-kke 75 211 1262 1277 CGCAGTATGGATCGGC 552844 ekk-10-kke 78 1325 1263 1278 CCGCAGTATGGATCGG 552845 ekk-10-kke 52 1326 1264 1279 TCCGCAGTATGGATCG 552846 ekk-10-kke 76 1327 1265 1280 TTCCGCAGTATGGATC 552847 ekk-10-kke 61 1328 1266 1281 GTTCCGCAGTATGGAT 552848 ekk-10-kke 72 1329 1267 1282 AGTTCCGCAGTATGGA 552849 ekk-10-kke 87 1330 1268 1283 GAGTTCCGCAGTATGG 552850 ekk-10-kke 76 1331 1269 1284 GGAGTTCCGCAGTATG 552851 ekk-10-kke 76 1332 1270 1285 AGGAGTTCCGCAGTAT 552852 ekk-10-kke 79 1333 1577 1592 AGCGAAGTGCACACGG 552853 ekk-10-kke 82 1334 1578 1593 AAGCGAAGTGCACACG 552854 ekk-10-kke 85 1335 1579 1594 GAAGCGAAGTGCACAC 552855 ekk-10-kke 78 1336 1580 1595 TGAAGCGAAGTGCACA 552856 ekk-10-kke 77 1337 1581 1596 GTGAAGCGAAGTGCAC 552857 ekk-10-kke 75 1338 1582 1597 GGTGAAGCGAAGTGCA 552858 ekk-10-kke 75 1339 1583 1598 AGGTGAAGCGAAGTGC 552859 ekk-10-kke 79 1340 1584 1599 GAGGTGAAGCGAAGTG 552860 ekk-10-kke 71 1341 1585 1600 AGAGGTGAAGCGAAGT 552861 ekk-10-kke 74 1342 1586 1601 CAGAGGTGAAGCGAAG 552862 ekk-10-kke 66 1343

1587 1602 GCAGAGGTGAAGCGAA 552863 ekk-10-kke 70 1344 1588 1603 TGCAGAGGTGAAGCGA 552864 ekk-10-kke 73 1345 Таблица 49 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3371 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 146786 еееее-10-еееее 60 224 58 73 TGGAGCCACCAGCAGG 552889 ek-10-keke 59 1318 59 74 CTGGAGCCACCAGCAG 552890 ek-10-keke 56 1319 60 75 ACTGGAGCCACCAGCA 552891 ek-10-keke 67 1320 61 76 AACTGGAGCCACCAGC 552892 ek-10-keke 65 1321 62 77 GAACTGGAGCCACCAG 552893 ek-10-keke 68 86 250 265 TCCACCACGAGTCTAG 552894 ek-10-keke 71 98 251 266 GTCCACCACGAGTCTA 552895 ek-10-keke 51 100 252 267 AGTCCACCACGAGTCT 552896 ek-10-keke 51 102 253 268 AAGTCCACCACGAGTC 552897 ek-10-keke 43 104 254 269 GAAGTCCACCACGAGT 552898 ek-10-keke 43 106 255 270 AGAAGTCCACCACGAG 552899 ek-10-keke 55 109 256 271 GAGAAGTCCACCACGA 552900 ek-10-keke 34 112 258 273 GAGAGAAGTCCACCAC 552901 ek-10-keke 42 115 259 274 TGAGAGAAGTCCACCA 552902 ek-10-keke 60 117 411 426 GCATAGCAGCAGGATG 552903 ek-10-keke 76 137 412 427 GGCATAGCAGCAGGAT 552904 ek-10-keke 74 140 413 428 AGGCATAGCAGCAGGA 552905 ek-10-keke 66 143 415 430 TGAGGCATAGCAGCAG 552907 ek-10-keke 69 147 416 431 ATGAGGCATAGCAGCA 552908 ek-10-keke 63 149 417 432 GATGAGGCATAGCAGC 552909 ek-10-keke 70 151 418 433 AGATGAGGCATAGCAG 552910 ek-10-keke 72 153 457 472 CGGGCAACATACCTTG 552911 ek-10-keke 72 167 458 473 ACGGGCAACATACCTT 552912 ek-10-keke 67 168 670 685 CTAGTAAACTGAGCCA 552913 ek-10-keke 74 181 682 697 GAACAAATGGCACTAG 552914 ek-10-keke 75 1368 684 699 CTGAACAAATGGCACT 552915 ek-10-keke 58 1370 686 701 CACTGAACAAATGGCA 552916 ek-10-keke 74 1372 687 702 CCACTGAACAAATGGC 552917 ek-10-keke 76 188 688 703 ACCACTGAACAAATGG 552918 ek-10-keke 75 190 689 704 AACCACTGAACAAATG 552919 ek-10-keke 55 191

690 705 GAACCACTGAACAAAT 552920 ek-10-keke 49 192 691 706 CGAACCACTGAACAAA 552921 ek-10-keke 45 194 1261 1276 GCAGTATGGATCGGCA 552922 ek-10-keke 83 211 1262 1277 CGCAGTATGGATCGGC 552923 ek-10-keke 83 1325 1263 1278 CCGCAGTATGGATCGG 552924 ek-10-keke 0 1326 1264 1279 TCCGCAGTATGGATCG 552925 ek-10-keke 85 1327 1265 1280 TTCCGCAGTATGGATC 552926 ek-10-keke 50 1328 1266 1281 GTTCCGCAGTATGGAT 552927 ek-10-keke 76 1329 1267 1282 AGTTCCGCAGTATGGA 552928 ek-10-keke 78 1330 1268 1283 GAGTTCCGCAGTATGG 552929 ek-10-keke 75 1331 1269 1284 GGAGTTCCGCAGTATG 552930 ek-10-keke 78 1332 1270 1285 AGGAGTTCCGCAGTAT 552931 ek-10-keke 74 1333 1577 1592 AGCGAAGTGCACACGG 552932 ek-10-keke 86 1334 1578 1593 AAGCGAAGTGCACACG 552933 ek-10-keke 82 1335 1579 1594 GAAGCGAAGTGCACAC 552934 ek-10-keke 74 1336 1580 1595 TGAAGCGAAGTGCACA 552935 ek-10-keke 76 1337 1581 1596 GTGAAGCGAAGTGCAC 552936 ek-10-keke 81 1338 1582 1597 GGTGAAGCGAAGTGCA 552937 ek-10-keke 80 1339 1583 1598 AGGTGAAGCGAAGTGC 552938 ek-10-keke 78 1340 1584 1599 GAGGTGAAGCGAAGTG 552939 ek-10-keke 75 1341 1585 1600 AGAGGTGAAGCGAAGT 552940 ek-10-keke 63 1342 1586 1601 CAGAGGTGAAGCGAAG 552941 ekk-10-kke 78 1343 1587 1602 GCAGAGGTGAAGCGAA 552942 ek-10-keke 80 1344 1589 1604 GTGCAGAGGTGAAGCG 552865 ekk-10-kke 67 1346 1590 1605 CGTGCAGAGGTGAAGC 552866 ekk-10-kke 68 1347 1778 1793 TATGCCTACAGCCTCC 552868 ekk-10-kke 55 230 1779 1794 TTATGCCTACAGCCTC 552869 ekk-10-kke 48 231 1780 1795 TTTATGCCTACAGCCT 552870 ekk-10-kke 55 232 1781 1796 ATTTATGCCTACAGCC 552871 ekk-10-kke 57 233 1782 1797 AATTTATGCCTACAGC 552872 ekk-10-kke 70 234 1783 1798 CAATTTATGCCTACAG 552873 ekk-10-kke 49 235 1784 1799 CCAATTTATGCCTACA 552874 ekk-10-kke 42 236 1785 1800 ACCAATTTATGCCTAC 552875 ekk-10-kke 41 237 1822 1837 GGCAGAGGTGAAAAAG 552876 ekk-10-kke 50 244 1823 1838 AGGCAGAGGTGAAAAA 552877 ek-10-keke 39 245 1824 1839 TAGGCAGAGGTGAAAA 552878 ekk-10-kke 31 247 1865 1880 AGCTTGGAGGCTTGAA 552879 ekk-10-kke 5 252 1866 1881 CAGCTTGGAGGCTTGA 552880 ekk-10-kke 5 254 1867 1882 ACAGCTTGGAGGCTTG 552881 ekk-10-kke 10 256 1868 1883 CACAGCTTGGAGGCTT 552882 ekk-10-kke 11 258 1869 1884 GCACAGCTTGGAGGCT 552883 ekk-10-kke 27 260 1870 1885 GGCACAGCTTGGAGGC 552884 ekk-10-kke 36 262 1871 1886 AGGCACAGCTTGGAGG 552885 ekk-10-kke 12 264

1872 1887 AAGGCACAGCTTGGAG 552886 ekk-10-kke 32 266 1874 1889 CCAAGGCACAGCTTGG 552888 ekk-10-kke 1 271 Таблица 50 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3371 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 1577 1596 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 146786 еееее-10-еееее 59 224 58 73 TGGAGCCACCAGCAGG 552955 eee-10-kkk 60 1318 59 74 CTGGAGCCACCAGCAG 552956 eee-10-kkk 60 1319 60 75 ACTGGAGCCACCAGCA 552957 eee-10-kkk 64 1320 61 76 AACTGGAGCCACCAGC 552958 eee-10-kkk 56 1321 62 77 GAACTGGAGCCACCAG 552959 eee-10-kkk 59 86 250 265 TCCACCACGAGTCTAG 552960 eee-10-kkk 42 98 251 266 GTCCACCACGAGTCTA 552961 eee-10-kkk 41 100 252 267 AGTCCACCACGAGTCT 552962 eee-10-kkk 35 102 253 268 AAGTCCACCACGAGTC 552963 eee-10-kkk 19 104 254 269 GAAGTCCACCACGAGT 552964 eee-10-kkk 34 106 255 270 AGAAGTCCACCACGAG 552965 eee-10-kkk 42 109 256 271 GAGAAGTCCACCACGA 552966 eee-10-kkk 60 112 258 273 GAGAGAAGTCCACCAC 552967 eee-10-kkk 38 115 259 274 TGAGAGAAGTCCACCA 552968 eee-10-kkk 35 117 411 426 GCATAGCAGCAGGATG 552969 eee-10-kkk 67 137 412 427 GGCATAGCAGCAGGAT 552970 eee-10-kkk 56 140 413 428 AGGCATAGCAGCAGGA 552971 eee-10-kkk 69 143 414 429 GAGGCATAGCAGCAGG 552972 eee-10-kkk 75 145 415 430 TGAGGCATAGCAGCAG 552973 eee-10-kkk 59 145 416 431 ATGAGGCATAGCAGCA 552974 eee-10-kkk 71 149 417 432 GATGAGGCATAGCAGC 552975 eee-10-kkk 56 151 418 433 AGATGAGGCATAGCAG 552976 eee-10-kkk 50 153 457 472 CGGGCAACATACCTTG 552977 eee-10-kkk 56 167 458 473 ACGGGCAACATACCTT 552978 eee-10-kkk 43 168 670 685 CTAGTAAACTGAGCCA 552979 eee-10-kkk 71 181 682 697 GAACAAATGGCACTAG 552980 eee-10-kkk 80 1368 684 699 CTGAACAAATGGCACT 552981 eee-10-kkk 64 1370 686 701 CACTGAACAAATGGCA 552982 ek-10-keke 61 1372 687 702 CCACTGAACAAATGGC 552983 eee-10-kkk 77 188 688 703 ACCACTGAACAAATGG 552984 eee-10-kkk 65 190 689 704 AACCACTGAACAAATG 552985 eee-10-kkk 41 191 690 705 GAACCACTGAACAAAT 552986 eee-10-kkk 30 192

691 706 CGAACCACTGAACAAA 552987 eee-10-kkk 41 194 1261 1276 GCAGTATGGATCGGCA 552988 eee-10-kkk 74 211 1262 1277 CGCAGTATGGATCGGC 552989 eee-10-kkk 85 1325 1263 1278 CCGCAGTATGGATCGG 552990 eee-10-kkk 72 1326 1264 1279 TCCGCAGTATGGATCG 552991 eee-10-kkk 73 1327 1265 1280 TTCCGCAGTATGGATC 552992 eee-10-kkk 60 1328 1266 1281 GTTCCGCAGTATGGAT 552993 eee-10-kkk 52 1329 1267 1282 AGTTCCGCAGTATGGA 552994 eee-10-kkk 58 1330 1268 1283 GAGTTCCGCAGTATGG 552995 eee-10-kkk 70 1331 1269 1284 GGAGTTCCGCAGTATG 552996 eee-10-kkk 74 1332 1270 1285 AGGAGTTCCGCAGTAT 552997 eee-10-kkk 59 1333 1577 1592 AGCGAAGTGCACACGG 552998 eee-10-kkk 82 1334 1578 1593 AAGCGAAGTGCACACG 552999 eee-10-kkk 70 1335 1579 1594 GAAGCGAAGTGCACAC 553000 eee-10-kkk 67 1336 1580 1595 TGAAGCGAAGTGCACA 553001 eee-10-kkk 67 1337 1581 1596 GTGAAGCGAAGTGCAC 553002 eee-10-kkk 74 1338 1582 1597 GGTGAAGCGAAGTGCA 553003 eee-10-kkk 72 1339 1583 1598 AGGTGAAGCGAAGTGC 553004 eee-10-kkk 73 1340 1584 1599 GAGGTGAAGCGAAGTG 553005 eee-10-kkk 67 1341 1585 1600 AGAGGTGAAGCGAAGT 553006 eee-10-kkk 69 1342 1586 1601 CAGAGGTGAAGCGAAG 553007 eee-10-kkk 60 1343 1587 1602 GCAGAGGTGAAGCGAA 553008 eee-10-kkk 71 1344 1588 1603 TGCAGAGGTGAAGCGA 552943 ek-10-keke 77 1345 1588 1603 TGCAGAGGTGAAGCGA 553009 eee-10-kkk 78 1345 1589 1604 GTGCAGAGGTGAAGCG 552944 ek-10-keke 74 1346 1589 1604 GTGCAGAGGTGAAGCG 553010 eee-10-kkk 78 1346 1590 1605 CGTGCAGAGGTGAAGC 552945 ek-10-keke 76 1347 1590 1605 CGTGCAGAGGTGAAGC 553011 eee-10-kkk 72 1347 1591 1606 ACGTGCAGAGGTGAAG 552946 ek-10-keke 71 1348 1591 1606 ACGTGCAGAGGTGAAG 553012 eee-10-kkk 74 1348 1778 1793 TATGCCTACAGCCTCC 552947 ek-10-keke 54 230 1778 1793 TATGCCTACAGCCTCC 553013 eee-10-kkk 39 230 1779 1794 TTATGCCTACAGCCTC 552948 ek-10-keke 50 231 1779 1794 TTATGCCTACAGCCTC 553014 eee-10-kkk 37 231 1780 1795 TTTATGCCTACAGCCT 552949 ek-10-keke 8 232 1780 1795 TTTATGCCTACAGCCT 553015 eee-10-kkk 45 232 1781 1796 ATTTATGCCTACAGCC 552950 ek-10-keke 44 233 1781 1796 ATTTATGCCTACAGCC 553016 eee-10-kkk 47 233 1782 1797 AATTTATGCCTACAGC 552951 ek-10-keke 60 234 1782 1797 AATTTATGCCTACAGC 553017 eee-10-kkk 47 234 1783 1798 CAATTTATGCCTACAG 552952 ek-10-keke 35 235 1783 1798 CAATTTATGCCTACAG 553018 eee-10-kkk 30 235 1784 1799 CCAATTTATGCCTACA 552953 ek-10-keke 37 236

1784 1799 CCAATTTATGCCTACA 553019 eee-10-kkk 37 236 1785 1800 ACCAATTTATGCCTAC 552954 ek-10-keke 40 237 1785 1800 ACCAATTTATGCCTAC 553020 eee-10-kkk 24 237 Таблица 51 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3370 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 58 73 TGGAGCCACCAGCAGG 552889 ek-10-keke 42 1318 59 74 CTGGAGCCACCAGCAG 552890 ek-10-keke 56 1319 60 75 ACTGGAGCCACCAGCA 552891 ek-10-keke 55 1320 61 76 AACTGGAGCCACCAGC 552892 ek-10-keke 53 1321 62 77 GAACTGGAGCCACCAG 552893 ek-10-keke 56 86 250 265 TCCACCACGAGTCTAG 552894 ek-10-keke 53 98 251 266 GTCCACCACGAGTCTA 552895 ek-10-keke 38 100 252 267 AGTCCACCACGAGTCT 552896 ek-10-keke 43 102 253 268 AAGTCCACCACGAGTC 552897 ek-10-keke 40 104 254 269 GAAGTCCACCACGAGT 552898 ek-10-keke 50 106 255 270 AGAAGTCCACCACGAG 552899 ek-10-keke 37 109 256 271 GAGAAGTCCACCACGA 552900 ek-10-keke 43 112 258 273 GAGAGAAGTCCACCAC 552901 ek-10-keke 56 115 259 274 TGAGAGAAGTCCACCA 552902 ek-10-keke 43 117 411 426 GCATAGCAGCAGGATG 552903 ek-10-keke 78 137 412 427 GGCATAGCAGCAGGAT 552904 ek-10-keke 75 140

413 428 AGGCATAGCAGCAGGA 552905 ek-10-keke 52 143 415 430 TGAGGCATAGCAGCAG 552907 ek-10-keke 75 147 416 431 ATGAGGCATAGCAGCA 552908 ek-10-keke 57 149 417 432 GATGAGGCATAGCAGC 552909 ek-10-keke 66 151 418 433 AGATGAGGCATAGCAG 552910 ek-10-keke 60 153 457 472 CGGGCAACATACCTTG 552911 ek-10-keke 65 167 458 473 ACGGGCAACATACCTT 552912 ek-10-keke 37 168 670 685 CTAGTAAACTGAGCCA 552913 ek-10-keke 76 181 682 697 GAACAAATGGCACTAG 552914 ek-10-keke 79 1368 684 699 CTGAACAAATGGCACT 552915 ek-10-keke 71 1370 686 701 CACTGAACAAATGGCA 552916 ek-10-keke 82 1372 687 702 CCACTGAACAAATGGC 552917 ek-10-keke 78 188 688 703 ACCACTGAACAAATGG 552918 ek-10-keke 64 190 689 704 AACCACTGAACAAATG 552919 ek-10-keke 38 191 690 705 GAACCACTGAACAAAT 552920 ek-10-keke 43 192 691 706 CGAACCACTGAACAAA 552921 ek-10-keke 49 194 1261 1276 GCAGTATGGATCGGCA 552922 ek-10-keke 90 211 1262 1277 CGCAGTATGGATCGGC 552923 ek-10-keke 92 1325 1263 1278 CCGCAGTATGGATCGG 552924 ek-10-keke 30 1326 1264 1279 TCCGCAGTATGGATCG 552925 ek-10-keke 81 1327 1265 1280 TTCCGCAGTATGGATC 552926 ek-10-keke 39 1328 1266 1281 GTTCCGCAGTATGGAT 552927 ek-10-keke 53 1329 1267 1282 AGTTCCGCAGTATGGA 552928 ek-10- keke 48 1330 1268 1283 GAGTTCCGCAGTATGG 552929 ek-10-keke 68 1331 1269 1284 GGAGTTCCGCAGTATG 552930 ek-10-keke 87 1332 1270 1285 AGGAGTTCCGCAGTAT 552931 ek-10-keke 87 1333 1577 1592 AGCGAAGTGCACACGG 552932 ek-10-keke 88 1334 1578 1593 AAGCGAAGTGCACACG 552933 ek-10-keke 75 1335 1579 1594 GAAGCGAAGTGCACAC 552934 ek-10-keke 76 1336 1580 1595 TGAAGCGAAGTGCACA 552935 ek-10-keke 71 1337 1581 1596 GTGAAGCGAAGTGCAC 552936 ek-10-keke 80 1338 1582 1597 GGTGAAGCGAAGTGCA 552937 ek-10-keke 81 1339 1583 1598 AGGTGAAGCGAAGTGC 552938 ek-10-keke 85 1340 1584 1599 GAGGTGAAGCGAAGTG 552939 ek-10-keke 82 1341 1585 1600 AGAGGTGAAGCGAAGT 552940 ek-10-keke 76 1342 1586 1601 CAGAGGTGAAGCGAAG 552941 ekk-10-kke 72 1343 1587 1602 GCAGAGGTGAAGCGAA 552942 ek-10-keke 85 1344 1589 1604 GTGCAGAGGTGAAGCG 552865 ekk-10-kke 70 1346 1590 1605 CGTGCAGAGGTGAAGC 552866 ekk-10-kke 65 1347 1778 1793 TATGCCTACAGCCTCC 552868 ekk-10-kke 36 230 1779 1794 TTATGCCTACAGCCTC 552869 ekk-10-kke 23 231 1780 1795 TTTATGCCTACAGCCT 552870 ekk-10-kke 49 232 1781 1796 ATTTATGCCTACAGCC 552871 ekk-10-kke 46 233 1782 1797 AATTTATGCCTACAGC 552872 ekk-10-kke 73 234 1783 1798 CAATTTATGCCTACAG 552873 ekk-10-kke 41 235

1784 1799 CCAATTTATGCCTACA 552874 ekk-10-kke 18 236 1785 1800 ACCAATTTATGCCTAC 552875 ekk-10-kke 0 237 1822 1837 GGCAGAGGTGAAAAAG 552876 ekk-10-kke 49 244 1823 1838 AGGCAGAGGTGAAAAA 552877 ek-10-keke 37 245 1824 1839 TAGGCAGAGGTGAAAA 552878 ekk-10-kke 28 247 1865 1880 AGCTTGGAGGCTTGAA 552879 ekk-10-kke 0 252 1866 1881 CAGCTTGGAGGCTTGA 552880 ekk-10-kke 12 254 1867 1882 ACAGCTTGGAGGCTTG 552881 ekk-10-kke 0 256 1868 1883 CACAGCTTGGAGGCTT 552882 ekk-10-kke 0 258 1869 1884 GCACAGCTTGGAGGCT 552883 ekk-10-kke 12 260 1870 1885 GGCACAGCTTGGAGGC 552884 ekk-10-kke 39 262 1871 1886 AGGCACAGCTTGGAGG 552885 ekk-10-kke 37 264 1872 1887 AAGGCACAGCTTGGAG 552886 ekk-10-kke 15 266 1874 1889 CCAAGGCACAGCTTGG 552888 ekk-10-kke 0 271 Таблица 52 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3370 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт Последовательность № ISIS Мотив % ингибирования SEQ ID NO 58 73 TGGAGCCACCAGCAGG 552955 eee-10-kkk 67 1318 59 74 CTGGAGCCACCAGCAG 552956 eee-10-kkk 60 1319 60 75 ACTGGAGCCACCAGCA 552957 eee-10-kkk 73 1320 61 76 AACTGGAGCCACCAGC 552958 eee-10-kkk 63 1321 62 77 GAACTGGAGCCACCAG 552959 eee-10-kkk 58 86 250 265 TCCACCACGAGTCTAG 552960 eee-10-kkk 67 98 251 266 GTCCACCACGAGTCTA 552961 eee-10-kkk 78 100 252 267 AGTCCACCACGAGTCT 552962 eee-10-kkk 29 102

253 268 AAGTCCACCACGAGTC 552963 eee-10-kkk 25 104 254 269 GAAGTCCACCACGAGT 552964 eee-10-kkk 33 106 255 270 AGAAGTCCACCACGAG 552965 eee-10-kkk 55 109 256 271 GAGAAGTCCACCACGA 552966 eee-10-kkk 71 112 258 273 GAGAGAAGTCCACCAC 552967 eee-10-kkk 23 115 259 274 TGAGAGAAGTCCACCA 552968 eee-10-kkk 41 117 411 426 GCATAGCAGCAGGATG 552969 eee-10-kkk 76 137 412 427 GGCATAGCAGCAGGAT 552970 eee-10-kkk 44 140 413 428 AGGCATAGCAGCAGGA 552971 eee-10-kkk 77 143 414 429 GAGGCATAGCAGCAGG 552972 eee-10-kkk 74 145 415 430 TGAGGCATAGCAGCAG 552973 eee-10-kkk 61 145 416 431 ATGAGGCATAGCAGCA 552974 eee-10-kkk 73 149 417 432 GATGAGGCATAGCAGC 552975 eee-10-kkk 66 151 418 433 AGATGAGGCATAGCAG 552976 eee-10-kkk 70 153 457 472 CGGGCAACATACCTTG 552977 eee-10-kkk 65 167 458 473 ACGGGCAACATACCTT 552978 eee-10-kkk 40 168 670 685 CTAGTAAACTGAGCCA 552979 eee-10-kkk 79 181 682 697 GAACAAATGGCACTAG 552980 eee-10-kkk 81 64 684 699 CTGAACAAATGGCACT 552981 eee-10-kkk 74 66 686 701 CACTGAACAAATGGCA 552982 ek-10-keke 52 68 687 702 CCACTGAACAAATGGC 552983 eee-10-kkk 78 188 688 703 ACCACTGAACAAATGG 552984 eee-10-kkk 71 190 689 704 AACCACTGAACAAATG 552985 eee-10-kkk 38 191 690 705 GAACCACTGAACAAAT 552986 eee-10-kkk 48 192 691 706 CGAACCACTGAACAAA 552987 eee-10-kkk 54 194 1261 1276 GCAGTATGGATCGGCA 552988 eee-10-kkk 85 211 1262 1277 CGCAGTATGGATCGGC 552989 eee-10-kkk 84 1325 1263 1278 CCGCAGTATGGATCGG 552990 eee-10-kkk 79 1326 1264 1279 TCCGCAGTATGGATCG 552991 eee-10-kkk 53 1327 1265 1280 TTCCGCAGTATGGATC 552992 eee-10-kkk 68 1328 1266 1281 GTTCCGCAGTATGGAT 552993 eee-10-kkk 67 1329 1267 1282 AGTTCCGCAGTATGGA 552994 eee-10-kkk 69 1330 1268 1283 GAGTTCCGCAGTATGG 552995 eee-10-kkk 62 1331 1269 1284 GGAGTTCCGCAGTATG 552996 eee-10-kkk 82 1332 1270 1285 AGGAGTTCCGCAGTAT 552997 eee-10-kkk 58 1333 1577 1592 AGCGAAGTGCACACGG 552998 eee-10-kkk 86 1334 1578 1593 AAGCGAAGTGCACACG 552999 eee-10-kkk 63 1335 1579 1594 GAAGCGAAGTGCACAC 553000 eee-10-kkk 67 1336 1580 1595 TGAAGCGAAGTGCACA 553001 eee-10-kkk 70 1337 1581 1596 GTGAAGCGAAGTGCAC 553002 eee-10-kkk 84 1338 1582 1597 GGTGAAGCGAAGTGCA 553003 eee-10-kkk 83 1339 1583 1598 AGGTGAAGCGAAGTGC 553004 eee-10-kkk 68 1340 1584 1599 GAGGTGAAGCGAAGTG 553005 eee-10-kkk 57 1341

1585 1600 AGAGGTGAAGCGAAGT 553006 eee-10-kkk 74 1342 1586 1601 CAGAGGTGAAGCGAAG 553007 eee-10-kkk 62 1343 1587 1602 GCAGAGGTGAAGCGAA 553008 eee-10-kkk 50 1344 1588 1603 TGCAGAGGTGAAGCGA 552943 ek-10-keke 86 1345 1588 1603 TGCAGAGGTGAAGCGA 553009 eee-10-kkk 79 1345 1589 1604 GTGCAGAGGTGAAGCG 552944 ek-10-keke 83 1346 1589 1604 GTGCAGAGGTGAAGCG 553010 eee-10-kkk 74 1346 1590 1605 CGTGCAGAGGTGAAGC 552945 ek-10-keke 79 1347 1590 1605 CGTGCAGAGGTGAAGC 553011 eee-10-kkk 60 1347 1591 1606 ACGTGCAGAGGTGAAG 552946 ek-10-keke 68 1348 1591 1606 ACGTGCAGAGGTGAAG 553012 eee-10-kkk 78 1348 1778 1793 TATGCCTACAGCCTCC 552947 ek-10-keke 51 230 1778 1793 TATGCCTACAGCCTCC 553013 eee-10-kkk 45 230 1779 1794 TTATGCCTACAGCCTC 552948 ek-10-keke 56 231 1779 1794 TTATGCCTACAGCCTC 553014 eee-10-kkk 53 231 1780 1795 TTTATGCCTACAGCCT 552949 ek-10-keke 1 232 1780 1795 TTTATGCCTACAGCCT 553015 eee-10-kkk 55 232 1781 1796 ATTTATGCCTACAGCC 552950 ek-10-keke 52 233 1781 1796 ATTTATGCCTACAGCC 553016 eee-10-kkk 65 233 1782 1797 AATTTATGCCTACAGC 552951 ek-10-keke 59 234 1782 1797 AATTTATGCCTACAGC 553017 eee-10-kkk 36 234 1783 1798 CAATTTATGCCTACAG 552952 ek-10-keke 34 235 1783 1798 CAATTTATGCCTACAG 553018 eee-10-kkk 20 235 1784 1799 CCAATTTATGCCTACA 552953 ek-10-keke 55 236 1784 1799 CCAATTTATGCCTACA 553019 eee-10-kkk 34 236 1785 1800 ACCAATTTATGCCTAC 552954 ek-10-keke 51 237 1785 1800 ACCAATTTATGCCTAC 553020 eee-10-kkk 28 237

Пример 16: Зависимое от дозы антисмысловое ингибирование РНК HBV в клетках HepG2 химерными олигонуклеотидами МОЕ

Антисмысловые олигонуклеотиды из исследования, описанного в Примере 14, демонстрирующие т vitro ингибирование мРНК HBV, отобрали и испытали при различных дозах в клетках HepG2. Клетки поместили на планшет при плотности 28000 клеток на лунку и трансфицировали при помощи LipofectAMINE 2000® антисмысловыми олигонуклеотидами в концентрациях 9,26 нМ, 27,78 нМ, 83,33 нМ и 250,00 нМ, как показано в Таблице 53. Примерно через 16 часов обработки, РНК выделили из клеток, и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор затравочных зондов HBV RTS3371. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.

Как показано в Таблице 53, уровни мРНК HBV снизились зависимым от дозы образом в клетках, обработанных антисмысловым олигонуклеотидом. «н/д» показывает, что для указанной дозы нет данных.

Таблица 53 Зависимое от дозы антисмысловое ингибирование HBV человека в клетках HepG2 № ISIS 9,2593 нМ 27,7778 нМ 83,3333 нМ 250,0 нМ 146786 10 43 74 89 509934 12 31 52 79 509959 4 24 49 67 510100 11 28 60 77 510124 3 11 13 41 551926 1 26 51 76 551958 15 17 56 82 551987 4 40 65 81 551990 7 55 78 91 551993 15 30 70 80 551994 0 30 39 58 551995 6 41 73 85 551996 13 47 71 85 551997 16 38 68 89 551998 4 36 69 85 551999 10 31 67 86 552000 0 17 61 78 552006 6 37 74 89 552009 1 5 39 60 552013 0 28 3 72 552014 0 26 32 77 552018 6 27 63 81 552019 15 34 65 90 552020 2 35 65 91 552021 4 11 53 82 552022 6 35 57 79 552023 11 33 59 81 552024 15 43 69 91 552025 17 35 69 87 552026 14 26 66 86 552027 3 46 62 88 552028 9 43 58 78 552029 8 40 72 89 552030 18 48 77 92

552031 0 38 66 89 552032 42 48 80 88 552033 2 40 64 84 552034 6 40 70 81 552039 2 33 56 83 552044 19 30 63 84 552046 4 21 47 77 552050 15 44 70 92 552051 8 33 69 90 552052 17 38 71 91 552053 0 40 59 86 552054 7 15 58 75 552056 19 62 86 92 552057 11 33 69 86 552058 30 55 79 90 552059 11 25 69 90 552060 9 32 61 86 552061 6 40 69 88 552062 22 48 75 89 552064 23 49 69 90 552065 10 8 69 86 552069 11 4 28 60 552073 9 31 62 78 552075 21 18 33 65 552077 0 17 40 72 552079 1 12 44 70 552080 3 12 34 69 552082 13 29 66 87 552083 24 54 69 88 552084 10 25 48 82 552085 28 35 64 85 552086 0 24 65 84 552088 33 53 77 93 552089 0 41 69 92 552090 17 35 70 87 552091 13 31 69 89 552092 6 23 66 89 552093 0 17 61 89 552094 12 38 65 88 552095 20 42 73 88 552096 Н/Д 39 66 91 552097 24 43 67 88 552098 0 24 56 85

552101 3 13 28 61 552147 11 27 58 80 552160 20 25 69 89 552163 0 21 22 53 552176 16 11 40 66 552192 7 38 78 89 552222 0 24 65 79 552247 0 38 69 86 552255 5 27 69 81 552301 5 38 65 86 552309 8 26 62 85 552312 0 4 32 62 552347 2 15 38 75 552348 12 40 42 65 552354 10 35 44 76 552361 2 25 55 74 552363 20 36 54 76 552374 7 4 38 76 552379 0 12 24 46 552403 8 27 54 76 552408 2 25 44 77 552409 6 31 56 80 552418 0 30 72 84 552420 9 34 53 81 552442 4 23 46 56 552466 0 23 56 79 552474 11 34 66 87 552477 11 22 44 64 552530 25 37 73 87 552559 9 13 29 51

Пример 17: Зависимое от дозы антисмысловое ингибирование мРНК ИВУ в клетках HepG2 дезокси-, МОЕ и (S)-cEt-химерными олигонуклеотидами

Антисмысловые олигонуклеотиды из исследования, описанного в Примере 15, демонстрирующие in vitro ингибирование мРНК HBV, отобрали и испытали при различных дозах в клетках HepG2. Клетки поместили на планшет при плотности 28 ООО клеток на лунку и трансфицировали при помощи LipofectAMINE 2000® антисмысловыми олигонуклеотидами в концентрациях 9,26 нМ, 27,78 нМ, 83,33 нМ и 250,00 нМ, как показано в Таблице 54. Примерно через 16 часов обработки, РНК выделили из клеток, и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор затравочных зондов HBV RTS3371. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN*. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.

Как показано в Таблице 54, уровни мРНК HBV снизились зависимым от дозы образом в клетках, обработанных антисмысловым олигонуклеотидом.

Таблица 54 Зависимое от дозы антисмысловое ингибирование HBV человека в клетках HepG2 № ISIS 9,2593 нМ 27,7778 нМ 83,3333 нМ 250,0 нМ 146786 10 43 74 89 552808 13 14 55 70 552816 38 73 87 92 552818 29 63 87 85 552820 58 83 90 90 552821 33 49 71 88 552822 24 55 74 88 552824 8 24 65 87 552834 11 28 68 89 552849 12 25 73 84 552851 13 42 74 89 552852 4 35 70 87 552853 19 52 86 93 552854 28 57 80 89 552916 5 26 64 82 552922 25 44 77 89 552923 22 49 82 91 552925 33 56 80 92 552930 12 49 79 89 552931 12 40 62 82 552932 24 62 84 91 552933 20 40 75 89 552936 18 36 75 88 552937 22 51 82 88 552938 12 36 67 80 552939 17 40 65 79 552942 21 48 74 88 552943 5 39 70 85 552944 14 33 70 77 552980 15 40 69 86 552988 4 36 58 84

552989 0 50 74 81 552996 0 25 53 72 552998 17 49 79 90 553002 0 32 68 86 553003 15 42 67 88

Пример 18: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК ИВУ в клетках HepG2 дезокси-, МОЕ и (S)-cEt-химерными олигонуклеотидами

Дополнительные антисмысловые олигонуклеотиды были разработаны для направленного действия на вирусную нуклеиновую кислоту HBV, и были испытаны на их действие на мРНК HBV in vitro. ISIS 5808 и ISIS 9591, описанные в US 5985662, а также ISIS 146781, ISIS 146786, 524518, ISIS 552859 и ISIS 552870 также включили в эти исследования для сравнения и обозначили звездочкой. Культивированные клетки HepG2 при плотности 28000 клеток на лунку трансфицировали при помощи LipofectAMINE 2000® 100 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Наборы вирусных затравочных зондов RTS3370 и RTS3371 использовали для измерения уровней мРНК по отдельности. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.

Новые разработанные химерные антисмысловые олигонуклеотиды в Таблице ниже были разработаны как МОЕ химерные олигонуклеотиды или дезокси-, МОЕ и (S)-cEt химерные олигонуклеотиды. 5-10-5 МОЕ химерные олигонуклеотиды имеют 20 нуклеозидов в длину, причем центральный сегмент гэп содержит десять 2'-дезоксинуклеозидов, к которому с обоеих сторон (в направлениях 5' и 3') присоединены крылья, содержащие по пять нуклеозидов. Дезокси-, МОЕ и (S)-cEt химерные олигонуклеотиды имеют 16 нуклеозидов в длину, причем нуклеозид имеет или МОЕ сахарную модификацию, или (S)-cEt сахарную модификацию, или дезокси-модификацию. Колонка «химия» описывает модификации сахара каждого олигонуклеотида. «k» обозначает (S)-cEt модификацию сахара; число обозначает количество дезоксинуклеозидов; в противном случае, «d» обозначает дезоксинуклеозид; и «е» обозначает модификацию МОЕ. Межнуклеозидные связи в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой фосфотиоатные (P=S) связи. Все цитозиновые остатки в каждом олигонуклеотиде представляют собой 5-метилцитозины.

«Вирусный целевой сайт инициации» указывает 5'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. «Вирусный целевой терминирующий сайт» указывает 3'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. Каждый химерный олигонуклеотид, перечисленный в Таблице 55, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1 (доступ GENBANK №U95551.1).

Таблица 55 5 Ингибирование уровней вирусной мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами, измеренное с RTS3370 или RTS3371 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт №1818 Мотив % ингибирование (RTS3370) % ингибирование (RTS3371) Последовательность SEQ ID NO 156 176 5808* Равномерно дезокси 57 64 CCTGATGTGATGTTCTCCATG 1373 303 322 524518* еееее-10-еееее 62 72 GGGACTGCGAATTTTGGCCA 428 376 395 146781* еееее-10-еееее 72 93 AAACGCCGCAGACACATCCA 1374 380 399 582665 еееее-10-еееее 57 59 GATAAAACGCCGCAGACACA 1375 382 401 582666 еееее-10-еееее 49 92 ATGATAAAACGCCGCAGACA 1376 411 426 566831 kdkdk-9-ee 96 73 GCATAGCAGCAGGATG 137 411 427 577123 eekk-9-ekee 84 96 GGCATAGCAGCAGGATG 17 411 427 577124 kdkdk-8-eeee 92 96 GGCATAGCAGCAGGATG 17 411 426 577126 kkk-8-eeeee 87 90 GCATAGCAGCAGGATG 137 413 428 566830 kdkdk-9-ee 93 95 AGGCATAGCAGCAGGA 143 415 430 577130 eek-10-kke 87 94 TGAGGCATAGCAGCAG 147 415 430 577131 kdkdk-9-ee 83 93 TGAGGCATAGCAGCAG 147 1263 1278 566828 kdkdk-9-ee 97 90 CCGCAGTATGGATCGG 1236 1577 1596 146786* еееее-10-еееее 93 71 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 224 1577 1592 566829 kdkdk-9-ee 98 84 AGCGAAGTGCACACGG 1334 1577 1596 577120 kdkdk-10-eeeee 94 93 GTGAAGCGAAGTGCACACGG 224 1577 1592 577127 kkk-8-eeeee 95 70 AGCGAAGTGCACACGG 1334 1577 1592 577134 kek-8-eeeee 94 89 AGCGAAGTGCACACGG 1334 1577 1592 577135 kek-10-kek 96 94 AGCGAAGTGCACACGG 1334 1583 1598 552859* ekk-10-kke 92 91 AGGTGAAGCGAAGTGC 1340 1583 1602 577121 kdkdk-10-eeeee 91 74 GCAGAGGTGAAGCGAAGTGC 226 1583 1598 577128 kkk-8-eeeee 92 85 AGGTGAAGCGAAGTGC 1340 1583 1598 577132 kdkdk-9-ee 97 81 AGGTGAAGCGAAGTGC 1340 1583 1598 577136 kek-10-kek 95 95 AGGTGAAGCGAAGTGC 1340 1588 1603 566832 kdkdk-9-ee 95 78 TGCAGAGGTGAAGCGA 1345 1780 1795 552870* ekk-10-kke 71 93 TTTATGCCTACAGCCT 232 1780 1799 577122 kdkdk-10-eeeee 70 96 CCAATTTATGCCTACAGCCT 50 1780 1796 577125 kdkdk-8-eeee 70 94 ATTTATGCCTACAGCCT 51 1780 1795 577129 kkk-8-eeeee 76 51 TTTATGCCTACAGCCT 232 1780 1795 577133 kdkdk-9-ee 80 52 TTTATGCCTACAGCCT 232 1873 1892 9591* Равномерно дезокси 30 14 CACCCAAGGCACAGCTTGG 1377

Пример 19: Эффективность химерных олигонуклеотидов, направленных на HBV, у трансгенных мышей

В нескольких исследованиях трансгенных мышей обрабатывали антисмысловыми олигонуклеотидами ISIS для оценки эффективности химерных олигонуклеотидов. Оценили уровни ДНК и РНК HBV.

Испытание 1

Каждой мыши в группе из 12 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 50 мг/кг ISIS 510106, ISIS 510116, ISIS 505347 или ISIS 509934. Контрольной группе из 12 мышей подкожно вводили PBS два раза в неделю, в течение 4 недель. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали печени для дальнейшего анализа.

Анализ ДНК и РНК

РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя наборы затравочных зондов RTS3370, RTS3371 и RTS3372. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с наборами затравочных зондов RTS3370 и RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Данные, выраженные как процентное ингибирование по сравнению с контрольной группой, представлены в Таблице 56. Как показано в Таблице 56, большинство антисмысловых олигонуклеотидов привело к снижению ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» показывает мотив гэп-крыла каждого химерного олигонуклеотида.

Таблица 56 Процентное ингибирование РНК и ДНК HBV в печени трансгенных мышей № ISIS Химия % ингибирование ДНК (RTS3370) % ингибирование ДНК (RTS3371) % ингибирование ДНК (RTS3372) % ингибирование РНК (RTS3370) % ингибирование РНК (RTS3371) % ингибирование РНК (RTS3372) 505347 5-10-5 МОЕ 72 79 75 54 28 30 509934 5-10-5 МОЕ 93 95 94 72 75 92 510106 3-10-4 МОЕ 0 0 51 0 0 12 510116 3-10-4 МОЕ 68 79 68 49 54 66

Испытание 2

Каждой мыши в группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 50 мг/кг ISIS 146779, ISIS 505358, ISIS 146786, ISIS 509974, ISIS 509958 или ISIS 509959. Контрольной группе из 10 мышей подкожно вводили PBS два раза в неделю, в течение 4 недель. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали печени для дальнейшего анализа.

Анализ ДНК и РНК

РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя набор затравочных зондов RTS3370. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с набором затравочных зондов RTS3370 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Данные, выраженные как процентное ингибирование по сравнению с контрольной группой, представлены в Таблице 57. Как показано в Таблице 57, большинство антисмысловых олигонуклеотидов привело к снижению ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» показывает мотив гэп-крыла каждого химерного олигонуклеотида.

Таблица 57 Процентное ингибирование РНК и ДНК HBV в печени трансгенных мышей № ISIS Химия % ингибирование ДНК % ингибирование РНК 146779 5-10-5 МОЕ 39 5 146786 5-10-5 МОЕ 83 73 505358 5-10-5 МОЕ 84 77 509958 3-10-3 МОЕ 82 29 509959 3-10-3 МОЕ 54 30 509974 3-10-3 МОЕ 56 28

Испытание 3

Каждой мыши в группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 50 мг/кг ISIS 509960, ISIS 505329, ISIS 146786, ISIS 505339 или ISIS 509927. Другой группе из 6 мышей вводили энтекавир, пероральное противовирусное лекарство, используемое для лечения инфекции гепатита В, в дозе 1 мг/кг, ежедневно, в течение двух недель. Контрольной группе из 10 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили PBS. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали печени для дальнейшего анализа.

Анализ ДНК и РНК

РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя набор затравочных зондов RTS3371. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с набором затравочных зондов RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Данные, выраженные как процентное ингибирование по сравнению с контрольной группой, представлены в Таблице 58. Как показано в Таблице 58, большинство антисмысловых олигонуклеотидов привело к снижению ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» показывает мотив гэп-крыла каждого химерного олигонуклеотида.

Таблица 58 Процентное ингибирование РНК и ДНК HBV в печени трансгенных мышей Химия олигонуклеотида % ингибирование ДНК % ингибирование РНК энтекавир - 94 0 ISIS 146786 5-10-5 МОЕ 97 92 ISIS 505329 5-10-5 МОЕ 70 63 ISIS 505339 5-10-5 МОЕ 74 63 ISIS 509927 5-10-5 МОЕ 80 57 ISIS 509960 3-10-3 МОЕ 86 60

Испытание 4

Каждой мыши в группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 25 мг/кг ISIS 146786, ISIS 552176 и ISIS 552073. Одной группе из 10 мышей подкожно вводили PBS два раза в неделю, в течение 4 недель. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали органы и плазму для дальнейшего анализа.

Анализ ДНК и РНК

РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя набор затравочных зондов RTS3371. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с набором затравочных зондов RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Данные представлены в Таблице 59. Как показано в Таблице 59, антисмысловые олигонуклеотиды вызывают снижение ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» показывает мотив гэп-крыла каждого химерного олигонуклеотида.

Таблица 59 Процентное ингибирование РНК и ДНК HBV у трансгенных мышей № ISIS Химия % ингибирование РНК % ингибированиеДНК 146786 5-10-5 МОЕ 81 91 552073 8-10-2 МОЕ 39 22 552176 3-9-5 МОЕ 55 56

Функция печени

Для оценки влияния олигонуклеотидов ISIS на печеночную функцию, измерили концентрации ALT в плазме при помощи автоматического клинического анализатора химического состава (Hitachi Olympus AU400e, Мелвилл, штат Нью-Йорк) (Nyblom, H. et al., Alcohol & Alcoholism 39: 336-339, 2004; Tietz NW (Ed): Clinical Guide to Laboratory Tests, 3е изд. W.B. Saunders, Филадельфия, штат Пенсильвания, 1995). Результаты, выраженные в МЕ/л, представлены в Таблице 60. Оба ISIS олигонуклеотида считаются переносимыми мышами, что демонстрируется их профилем трансаминазы в печени.

Таблица 60 Уровни ALT (МЕ/л) трансгеных мышей ALT PBS 77 ISIS 146786 21 ISIS 552073 19 ISIS 552176 27

Испытание 5

Каждой мыши в группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 25 мг/кг ISIS 146786, ISIS 552056, ISIS 552088 и ISIS 552309. Одной группе из 10 мышей подкожно вводили PBS два раза в неделю, в течение 4 недель. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали органы и плазму для дальнейшего анализа.

Анализ ДНК и РНК

РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя набор затравочных зондов RTS3371. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с набором затравочных зондов RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Как показано в Таблице 61, антисмысловые олигонуклеотиды приводят к снижению ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» показывает мотив гэп-крыла каждого химерного олигонуклеотида.

Таблица 61 Процентное ингибирование ДНК и РНК HBV у трансгенных мышей Химия % ингибирование (РНК) % ингибирование(ДНК) ISIS 146786 5-10-5 МОЕ 60 90 ISIS 552056 7-10-3 МОЕ 25 58 ISIS 552088 8-10-2 МОЕ 8 0 ISIS 552309 5-9-3 МОЕ 35 84

Испытание 6

Каждой мыши в группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 25 мг/кг ISIS 146786, ISIS 505330, ISIS 509932, ISIS 552032, ISIS 552057, ISIS 552075, ISIS 552092 и ISIS 552255. Одной группе из 10 мышей подкожно вводили PBS два раза в неделю, в течение 4 недель. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали органы и плазму для дальнейшего анализа.

Анализ ДНК и РНК

РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя набор затравочных зондов RTS3371. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с набором затравочных зондов RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Как показано в Таблице 62, антисмысловые олигонуклеотиды приводят к снижению ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» показывает мотив гэп-крыла каждого химерного олигонуклеотида.

Таблица 62 Процентное ингибирование ДНК и РНК HBV у трансгенных мышей № ISIS Химия % ингибирование (РНК) % ингибирование(ДНК) 146786 5-10-5 МОЕ 52 95 505330 5-10-5 МОЕ 7 61 509932 5-10-5 МОЕ 83 98 552032 6-10-4 МОЕ 54 97 552057 7-10-3 МОЕ 19 62 552075 8-10-2 МОЕ 12 18 552092 8-10-2 МОЕ 25 74 552255 4-9-4 МОЕ 41 89

Испытание 7

Каждой мыши в группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 20 мг/кг ISIS 552859, ISIS 577121, ISIS 577122, ISIS 577123, ISIS 577132, ISIS 577133 и ISIS 577134. Эти химерные олигонуклеотиды имеют дезокси-, МОЕ и (S)-cEt химию. Одной группе из 10 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили PBS. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали органы и плазму для дальнейшего анализа.

Анализ ДНК и РНК

РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя набор затравочных зондов RTS3371. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с набором затравочных зондов RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Как показано в Таблице 63, антисмысловые олигонуклеотиды приводят к снижению ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» описывает модификации сахара каждого олигонуклеотида. «k» обозначает (S)-cEt модификацию сахара; число обозначает количество дезоксинуклеозидов; в противном случае, «d» обозначает дезоксинуклеозид; и «е» обозначает модификацию МОЕ.

Таблица 63 Процентное ингибирование ДНК и РНК HBV у трансгенных мышей № ISIS Химия % ингибирование (РНК) % ингибирование (ДНК) 552859 ekk-10-kke 60 86 577121 kdkdk-10-eeeee 59 93 577122 kdkdk-10-eeeee 42 68 577123 eekk-9-ekee 0 77 577132 kdkdk-9-ee 4 24 577133 kdkdk-9-ee 46 64 577134 kek-8-eeeee 0 17

Испытание 8

Группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 25 мг/кг ISIS 146786, химерного олигонуклеотида 5-10-5 МОЕ. Каждой мыши в группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 10 мг/кг ISIS 552803, ISIS 552903, ISIS 552817, ISIS 552822 и ISIS 552907. Эти химерные олигонуклеотиды имеют дезокси-, МОЕ и (S)-cEt химию. Одной группе из 10 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили PBS. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали органы и плазму для дальнейшего анализа.

Анализ ДНК и РНК

РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя набор затравочных зондов RTS3371. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с набором затравочных зондов RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Данные представлены в Таблице 64. Как показано в Таблице 64, антисмысловые олигонуклеотиды вызывают снижение ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Колонка «химия» описывает модификации сахара каждого олигонуклеотида. «k» обозначает (S)-cEt модификацию сахара; число обозначает количество дезоксинуклеозидов; в противном случае, «d» обозначает дезоксинуклеозид; и «е» обозначает модификацию МОЕ; в случае МОЕ химерных олигонуклеотидов, колонка «химия» указывает структуру гэп-крыла.

Таблица 64 Процентное ингибирование РНК и ДНК HBV у трансгенных мышей № ISIS Химия Доза (мг/кг в неделю) % ингибирование РНК % ингибирование ДНК 146786 5-10-5 МОЕ 50 81 91 552803 ekk-10-kke 20 71 95 552817 ekk-10-kke 20 86 51 552822 ekk-10-kke 20 90 89 552903 ek-10-keke 20 56 82 552907 ek-10-keke 20 41 45

Испытание 9

Группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 25 мг/кг ISIS 146786. Группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 10 мг/кг ISIS 552853, ISIS 552854, ISIS 552932 и ISIS 552938. Одной группе из 10 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили PBS. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали органы и плазму для дальнейшего анализа.

Анализ ДНК и РНК

РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя набор затравочных зондов RTS3371. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с набором затравочных зондов RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Как показано в Таблице 65, антисмысловые олигонуклеотиды приводят к снижению ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» описывает модификации сахара каждого олигонуклеотида. «k» обозначает (S)-cEt модификацию сахара; число обозначает количество дезоксинуклеозидов; в противном случае, «d» обозначает дезоксинуклеозид; и «е» обозначает модификацию МОЕ; в случае МОЕ химерных олигонуклеотидов, колонка «химия» указывает структуру гэп-крыла.

Таблица 65 Процентное ингибирование ДНК и РНК HBV у трансгенных мышей Химия Доза (мг/кг в неделю) % ингибирование (ДНК) % ингибирование (РНК) ISIS 146786 5-10-5 МОЕ 50 90 60 ISIS 552853 ekk-10-kke 20 94 60 ISIS 552854 ekk-10-kke 20 61 23 ISIS 552932 ek-10-keke 20 75 70 ISIS 552938 ek-10-keke 20 67 56

Испытание 10

Группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 25 мг/кг ISIS 146786. Группе из 6 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили 10 мг/кг ISIS 552922, ISIS 552923, ISIS 552942, ISIS 552872, ISIS 552925, ISIS 552937 и ISIS 552939. Одной группе из 10 мышей дважды в неделю, в течение 4 недель, подкожно вводили PBS. Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали органы и плазму для дальнейшего анализа.

Анализ ДНК и РНК

РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя набор затравочных зондов RTS3371. Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с набором затравочных зондов RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Как показано в Таблице 66, антисмысловые олигонуклеотиды приводят к снижению ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» описывает модификации сахара каждого олигонуклеотида. «k» обозначает (S)-cEt модификацию сахара; число обозначает количество дезоксинуклеозидов; в противном случае, «d» обозначает дезоксинуклеозид; и «е» обозначает модификацию МОЕ; в случае МОЕ химерных олигонуклеотидов, колонка «химия» указывает структуру гэп-крыла.

Таблица 66 Процентное ингибирование ДНК и РНК HBV у трансгенных мышей № ISIS Химия Доза (мг/кг в неделю) % ингибирование(ДНК) % ингибирование (РНК) 146786 5-10-5 МОЕ 50 52 57 552922 ekk-10-kke 20 61 50 552923 ek-10-keke 20 89 76 552942 ek-10-keke 20 58 52 552872 ek-10-keke 20 77 46 552925 ek-10-keke 20 89 65 552937 ek-10-keke 20 59 35 552939 ek-10-keke 20 57 19

Пример 20: Эффективность химерных олигонуклеотидов, направленных на HBV, у трансгенных мышей

Использовали мышей с фрагментом гена HBV (Guidotti, L.G. et al., J. Virol. 1995, 69, 6158-6169) Мышей обрабатывали ISIS антисмысловыми олигонуклеотидами, выбранными из исследований, описанных выше, и оценили их эффективность в этой модели. Оценили уровни ДНК, РНК и антигена HBV.

Каждой мыши из группы 10 мышей дважды в неделю подкожно вводили сначала 50 мг/кг, а затем, дважды в неделю, в течение следующих 3 недель, 25 мг/кг ISIS 146786 или ISIS 510100. Каждую мышь в контрольной группе из 10 мышей обрабатывали таким же образом при помощи ISIS 141923 (CCTTCCCTGAAGGTTCCTCC, SEQ ID NO:320; 5-10-5 МОЕ химерный олигонуклеотид без известной мишени у мышей) или ISIS 459024 (CGGTCCTTGGAGGATGC, SEQ ID NO:1351; 3-10-4 МОЕ химерный олигонуклеотид без известной мишени у мышей). Мышей умертвили через 48 часов после последней дозы, и собрали органы и сыворотку для дальнейшего анализа.

Анализ ДНК и РНК

РНК экстрагировали из печеночной ткани для анализа ПЦР ДНК HBV в реальном времени, используя наборы затравочных зондов RTS3370, RTS3371 или RTS3372 (прямая последовательность ATCCTATCAACACTTCCGGAAACT, обозначенная SEQ ID NO: 314; обратная последовательность CGACGCGGCGATTGAG, обозначенная SEQ ID NO:315; последовательность зонда AAGAACTCCCTCGCCTCGCAGACG, обозначенная SEQ ID NO:316). Уровни ДНК нормализовали к Picogreen. Образцы РНК HBV также анализировали с наборами затравочных зондов RTS3370 и RTS3371 после анализа ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК нормализовали к RIBOGREEN®. Данные представлены в Таблице 67. Образцы ДНК в сыворотке анализировали после испытательного периода. Данные, выраженные относительно уровней, измеренных в контрольной группе, представлены в Таблице 68. Как показано в Таблицах 67 и 68, антисмысловые олигонуклеотиды приводят к снижению ДНК и РНК HBV по сравнению с PBS контрольным образцом. Результаты представлены как процентное ингибирование мРНК или ДНК HBV, по сравнению с контрольным образцом. Колонка «химия» указывает структуру гэп-крыла каждого химерного олигонуклеотида.

Таблица 67 10 Процентное ингибирование РНК и ДНК HBV в печени трансгенных мышей № ISIS Химия % ингибирование ДНК (RTS3370) % ингибирование ДНК (RTS3371) % ингибирование ДНК (RTS3372) % ингибирование РНК (RTS3370) % ингибирование РНК (RTS3371) % ингибировании РНК (RTS3372) 146786 5-10-5 МОЕ 97 97 95 86 85 89 510100 3-10-4 МОЕ 95 94 94 56 64 77 141923 5-10-5 МОЕ 2 0 13 0 7 31 459024 3-10-4 МОЕ 19 0 8 0 0 0 Таблица 68 Процентное ингибирование ДНК HBV в сыворотке трансгенных мышей № ISIS % ингибирование (RTS3370) % ингибирование (RTS3371) 146786 98 98 510100 99 98 141923 0 0 459024 0 0

Анализ антигена HBV

Антигены HBV в надосадочных жидкостях обнаружили при помощи иммуноферментого анализа твердофазного (ELISA). Уровни антигена HBs (HBsAg) обнаружили иммуноферментным твердофазным анализом компании Abazyme LLC, штат Массачусетс. Как показано в Таблице 57, обработка олигонуклеотидами ISIS 146786 или 510100 вызывает снижение уровней HBsAg. Уровни антигена НВе (HBeAg) обнаружили иммуноферментным твердофазным анализом компании International Immune-diagnostics, штат Калифорния. Как показано в Таблице 69, обработка олигонуклеотидами ISIS 146786 или 510100 вызывает также снижение уровней HBeAg.

Таблица 69 Уровни антигенов HBV (Единицы Института Пауля-Эрлиха/мл) у трансгенных мышей HBsAg HBeAg PBS 40 80 146786 3 15 510100 15 22 141923 32 80 459024 44 51

Пример 21: Антисмысловое ингибирование вирусной мРНК HBV в клетках HepG2 дезокси-, МОЕ и (S)-cEt-химерными олигонуклеотидами

Дополнительные антисмысловые олигонуклеотиды были разработаны для направленного действия на вирусную нуклеиновую кислоту HBV, и были испытаны на их действие на мРНК HBV in vitro. В этот анализ включили также ISIS 146786, ISIS 505358, ISIS 509932 и ISIS 510100, описанные в предварительной заявке на патент США №61/478040, поданной 21 апреля 2011 года; ISIS 552859, описанный в предварительной заявке на патент США №61/596692, поданной 8 февраля 2012 года; ISIS 577121, ISIS 577122, ISIS 577123, ISIS 577132, ISIS 577133 и ISIS 577134, описанные в исследовании, раскрытом выше. Культивированные клетки HepG2 при плотности 28000 клеток на лунку трансфицировали при помощи Cytofectin 9,375 нМ, 18,75 нМ, 37, 50 нМ, 75,00 нМ, 15,00 нМ или 300,00 нМ антисмыслового олигонуклеотида После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3371. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Результаты представлены как процентное ингибирование HBV, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.

Новые разработанные химерные антисмысловые олигонуклеотиды в Таблицах ниже были разработаны как дезокси-, МОЕ и (S)-cEt химерные олигонуклеотиды. Дезокси-, МОЕ и (S)-cEt химерные олигонуклеотиды имеют 16, 17 или 18 нуклеозидов в длину, причем нуклеозиды имеют или МОЕ сахарную модификацию, или (S)-cEt сахарную модификацию, или дезокси-модификацию. Колонка «химия» описывает модификации сахара каждого олигонуклеотида. «k» обозначает (S)-cEt модификацию сахара; число обозначает количество дезоксинуклеозидов; в противном случае, «d» обозначает дезоксинуклеозид; и «е» обозначает модификацию МОЕ. Межнуклеозидные связи в каждом химерном олигонуклеотиде представляют собой фосфотиоатные (P=S) связи. Все цитозиновые остатки в каждом олигонуклеотиде представляют собой 5-метилцитозины.

«Вирусный целевой сайт инициации» указывает 5'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. «Вирусный целевой терминирующий сайт» указывает 3'-основной нуклеотид, на который направлен химерный олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. Каждый химерный олигонуклеотид, перечисленный в Таблице 70, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1 (доступ GENBANK №U95551.1).

Таблица 70 Химерные антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на SEQ ID NO:1 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт № ISIS Мотив Последовательность SEQ ID NO 411 427 585163 eeekk-8-eeee GGCATAGCAGCAGGATG 17 414 430 585164 eeekk-7-kkeee TGAGGCATAGCAGCAGG 21 414 430 585165 eeek-9-keee TGAGGCATAGCAGCAGG 21 1577 1593 585170 eeekk-7-kkeee AAGCGAAGTGCACACGG 1304 1577 1593 585171 eeek-9-keee AAGCGAAGTGCACACGG 1304 1577 1593 585172 eeeekk-7-eeee AAGCGAAGTGCACACGG 1304 1577 1593 585173 ekek-9-eeee AAGCGAAGTGCACACGG 1304 1577 1593 585174 ekekdk-7-eeee AAGCGAAGTGCACACGG 1304 1583 1599 585166 eeekk-7-kkeee GAGGTGAAGCGAAGTGC 1310 1583 1599 585167 eeek-9-keee GAGGTGAAGCGAAGTGC 1310 1780 1797 577119 kdkdk-8-eeeee AATTTATGCCTACAGCCT 1379 1780 1796 585168 eeekk-7-kkeee ATTTATGCCTACAGCCT 51 1780 1796 585169 eeek-9-keee ATTTATGCCTACAGCCT 51 Таблица 71 Зависимое от дозы ингибирование уровней мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами № ISIS 9,375 нМ 18,75 нМ 37, 5 нМ 75,0 нМ 150,0 нМ 300,0 нМ 146786 37 37 58 70 81 93 505358 30 26 28 57 74 85

510100 42 30 43 61 77 91 552859 21 30 39 61 79 91 577119 42 43 46 66 74 75 577121 10 15 42 64 82 89 577122 21 30 53 66 78 84 577123 27 29 45 56 78 84 577132 14 21 42 61 80 92 577133 12 14 32 47 62 77 577134 37 39 59 72 86 90 585174 31 28 48 61 80 90 Таблица 72 Зависимое от дозы ингибирование уровней мРНК HBV химерными антисмысловыми олигонуклеотидами № ISIS 9,375 нМ 18,75 нМ 37, 5 нМ 75,0 нМ 150,0 нМ 300,0 нМ 146786 25 34 57 71 85 92 509932 9 28 59 62 70 74 585163 17 32 52 68 77 81 585164 23 4 29 31 36 56 585165 6 31 42 58 66 82 585166 19 27 35 48 50 63 585167 22 25 50 69 76 88 585168 4 30 44 52 67 76 585169 32 32 42 62 76 80 585170 23 19 39 49 66 75 585171 28 27 42 59 81 88 585172 26 29 30 64 80 91 585173 29 30 41 71 86 88

Пример 22: Анализ эффективности однообразных дезоксиолигонуклеотидов при ингибровании мРНК HBV в клетках HepG2

Дополнительные антисмысловые олигонуклеотиды были испытаны на их влияние на мРНК HBV in vitro. В этот анализ включили также ISIS 5808 и ISIS 9591, описанные в US 5985662. В этот анализ включили ISIS 146786 в качестве эталона. Культивированные клетки HepG2 при плотности 28000 клеток на лунку трансфицировали при помощи LipofectAMINE2000® 18,75 нМ, 37, 50 нМ, 75,00 нМ, 150,00 нМ или 300,00 нМ антисмыслового олигонуклеотида. После примерно 24 часов обработки, РНК выделили из клеток и измерили уровни мРНК HBV количественной ПЦР в реальном времени. Для измерения уровней мРНК и ДНК использовали набор вирусных затравочных зондов RTS3371. Уровни мРНК HBV скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, по результатам измерения с RIBOGREEN®. Уровни антигена S и антигена Е также измерили при помощи иммуноферментного твердофазного анализа (ELISA). Результаты представлены как процентное ингибирование, по сравнению с не обработанными контрольными клетками.

Исследованные антисмысловые олигонуклеотиды, ISIS 582699, ISIS 582700 и ISIS 582701, были разработаны в соответствии с последовательностями и химическими структурами, описанными в публикации Korba and Germ, Antiviral Research, 1995, Vol.28, 225-242; соответствующие названия олигонуклеотидов в представленной ссылке - S1, C1 и L2c, соответственно. Антисмысловые олигонуклеотиды в Таблицах ниже были разработаны как однообразные дезокси-олигонуклеотиды длиной 16 или 21 нуклеозида, причем эти нуклеозиды имеют дезокси-модификации. «Вирусный целевой сайт инициации» указывает 5'-основной нуклеотид, на который направлен олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. «Вирусный целевой терминирующий сайт» указывает 3'-основной нуклеотид, на который направлен олигонуклеотид в последовательности вирусного гена. Каждый олигонуклеотид, перечисленный в Таблице 73, направлен на вирусную геномную последовательность, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO:1 (доступ GENBANK №U95551.1). Результаты показывают, что дезокси-олигонуклеотиды имеют незначительное влияние на уровни экспрессии мРНК HBV, уровни ДНК и уровни антигена HBV.

Таблица 73 Однообразные дезокси-олигонуклеотиды, направленные на SEQ ID NO:1 Вирусный целевой сайт инициации Вирусный целевой терминирующий сайт № ISIS Последовательность SEQ ID NO 160 180 582699 GAATCCTGATGTGATGTTCTC 1378 1884 1899 582701 CCAAAGCCACCCAAGG 1380 1910 1930 582700 CAAATTCTTTATAAGGGTCGA 1381 Таблица 74 Зависимое от дозы ингибирование уровней мРНК HBV после обработки олигонуклеотидами № ISIS 18,75 нМ 37, 5 нМ 75,0 нМ 150,0 нМ 300,0 нМ 5808 38 23 29 40 54 9591 35 20 32 26 40 146786 11 5 45 66 92 582699 32 28 27 39 52 582700 18 12 20 16 23 582701 4 0 0 3 13

Таблица 75 Зависимое от дозы ингибирование уровней ДНК HBV в клетках HepG2 после обработки олигонуклеотидами № ISIS 18,75 нМ 37, 5 нМ 75,0 нМ 150,0 нМ 5808 20 17 0 0 9591 0 0 0 0 146786 32 50 77 83 582699 0 44 0 17 582700 0 0 0 0 582701 0 0 0 0 Таблица 76 Уровни антигена S HBV после обработки олигонуклеотидами (произвольные единицы) № ISIS 18,75 нМ 37, 5 нМ 75,0 нМ 150,0 нМ 5808 9254 8228 4168 2540 9591 10924 8683 9334 12142 146786 12501 7265 3408 1 017 582699 9340 9325 7589 4712 582700 9697 8350 11 168 10703 582701 15283 18209 14632 15299 Таблица 77 Уровни антигена Е HBV после обработки олигонуклеотидами (произвольные единицы) ISIS No 18,75 нМ 37, 5 нМ 75,0 нМ 150,0 нМ 5808 8075 8587 5036 3286 9591 9242 8093 8257 6944 146786 8532 4034 2301 449 582699 7815 7191 7026 5278 582700 8690 9304 7941 6315 582701 8847 8257 8211 6276

Похожие патенты RU2667524C2

название год авторы номер документа
Модулирование экспрессии рецептора андрогенов 2013
  • Маклеод Роберт А.
  • Ким Янсу
  • Чжоу Тяньюань
  • Фрейер Сюзан М.
  • Сет Пунит П.
  • Суэйзи Эрик
  • Монья Бретт П.
RU2670486C9
СОЕДИНЕНИЯ И СПОСОБЫ МОДУЛЯЦИИ ЭКСПРЕССИИ ДИСТРОФИЧЕСКОЙ МИОТОНИН-ПРОТЕИНКИНАЗЫ (DMPK) 2014
  • Пэнди Санджай К.
  • Маклеод Роберт А.
  • Свэйз Эрик Э.
  • Беннет С. Фрэнк
RU2690333C2
КОМПОЗИЦИИ ДЛЯ МОДУЛИРОВАНИЯ ЭКСПРЕССИИ SOD-1 2015
  • Свэйз Эрик Э.
  • Коул Трэйси
  • Кордасиевиц Холли
  • Фрэйер Сьюзан М.
  • Кондон Томас П.
  • Ванчевиц Эдвард
  • Локхарт Триша
  • Викерс Тимоти
  • Сингх Приям
RU2704619C2
МОДУЛЯЦИЯ ЭКСПРЕССИИ ТРАНСТИРЕТИНА 2011
  • Мониа Бретт П.
  • Фрейер Сюзан М.
  • Сивковски Эндрю М.
RU2592669C2
КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ МОДУЛИРОВАНИЯ ЭКСПРЕССИИ HBV И TTR 2014
  • Пракаш Тхажа П.
  • Сет Пунит П.
  • Свейз Эрик Е.
RU2670614C9
МОДУЛЯЦИЯ ЭКСПРЕССИИ АНГИОПОЭТИН-ПОДОБНОГО БЕЛКА 3 2014
  • Фрэйер Сьюзан М.
  • Грэхам Марк Дж.
  • Крук Розанне М.
RU2706964C2
КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ МОДУЛИРОВАНИЯ ЭКСПРЕССИИ АПОЛИПОПРОТЕИНА (A) 2014
  • Пракаш, Тхажа, П.
  • Сет, Пунит, П.
  • Свейз, Эрик, Е.
  • Грэхам, Марк, Дж.
RU2824214C1
МОДУЛЯЦИЯ ЭКСПРЕССИИ ФАКТОРА 11 2009
  • Фрейер Сьюзан М.
  • Мония Бретт П.
  • Чжан Хун
  • Чжао Чэньгуан
  • Кросби Джеффри Р.
  • Сивковски Эндрю М.
RU2535964C2
СОПРЯЖЕННЫЕ АНТИСМЫСЛОВЫЕ СОЕДИНЕНИЯ И ИХ ПРИМЕНЕНИЕ 2014
  • Пракаш Тхажа П.
  • Сет Пунит П.
  • Свейз Эрик Е.
RU2697152C2
МОДУЛЯТОРЫ ФАКТОРА В КОМПЛЕМЕНТА 2014
  • Гроссман Тамар Р.
  • Маккалеб Майкл Л.
  • Уатт Эндрю Т.
  • Фрэйер Сьюзан М.
RU2662967C2

Иллюстрации к изобретению RU 2 667 524 C2

Реферат патента 2018 года МОДУЛИРОВАНИЕ ЭКСПРЕССИИ ВИРУСА ГЕПАТИТА B (HBV)

Изобретение может применяться в медицине и относится к одноцепочечному модифицированному олигонуклеотиду, состоящему из 16-30 связанных нуклеозидов и имеющему последовательность нуклеооснований, состоящую из последовательностей SEQ ID NO: 226, 17, 50, 224, 722, 807, 1327, 1340 и 1379, причем указанный олигонуклеотид содержит: сегмент гэп, состоящий из связанных дезоксинуклеозидов; сегмент крыла 5', состоящий из связанных нуклеозидов; и сегмент крыла 3', состоящий из связанных нуклеозидов; сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3'; каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар или затрудненный этиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь или фосфодиэфирную связь; каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин. Предложены новые модифицированные олигонуклеотиды и композиции на их основе, эффективные для лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния. 6 н. и 10 з.п. ф-лы, 22 пр., 77 табл., перечень последовательностей.

Формула изобретения RU 2 667 524 C2

1. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 16-30 связанных нуклеозидов и имеющий последовательность нуклеооснований, состоящую из последовательностей нуклеооснований SEQ ID NO: 226, 17, 50, 224, 722, 807, 1327, 1340 и 1379, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид содержит:

сегмент гэп, состоящий из связанных дезоксинуклеозидов;

сегмент крыла 5', состоящий из связанных нуклеозидов; и

сегмент крыла 3', состоящий из связанных нуклеозидов;

причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3'; и при этом каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар или затрудненный этиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь или фосфодиэфирную связь; и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

2. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 226, и содержит:

сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов;

сегмент крыла 5', состоящий из 5 связанных нуклеозидов; и

сегмент крыла 3', состоящий из 5 связанных нуклеозидов;

причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.

3. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид состоит из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 17, и содержит:

сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов;

сегмент крыла 5', состоящий из 3 связанных нуклеозидов; и

сегмент крыла 3', состоящий из 4 связанных нуклеозидов;

причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой 5-метилцитозин.

4. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 50, и содержит:

сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов;

сегмент крыла 5', состоящий из 5 связанных нуклеозидов; и

сегмент крыла 3', состоящий из 5 связанных нуклеозидов;

причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой 5-метилцитозин.

5. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 722, и содержит:

сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов;

сегмент крыла 5', состоящий из 6 связанных нуклеозидов; и

сегмент крыла 3', состоящий из 4 связанных нуклеозидов;

причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой 5-метилцитозин.

6. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 1327, и содержит:

сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов;

сегмент крыла 5', состоящий из 2 связанных нуклеозидов; и

сегмент крыла 3', состоящий из 4 связанных нуклеозидов;

причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3'; 2 связанных нуклеозида сегмента крыла 5' содержат 2'-O-метоксиэтиловый сахар и затрудненный этиловый сахар в направлении от 5' к 3'; 4 связанных нуклеозида сегмента крыла 3' содержат затрудненный этиловый сахар, 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'; каждая межнуклеозидная связь указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой 5-метилцитозин.

7. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид состоит из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 1340, и содержит:

сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов;

сегмент крыла 5', состоящий из 3 связанных нуклеозидов; и

сегмент крыла 3', состоящий из 3 связанных нуклеозидов;

причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3'; 3 связанных нуклеозида сегмента крыла 5' содержат 2'-O-метоксиэтиловый сахар, затрудненный этиловый сахар и затрудненный этиловый сахар в направлении от 5' к 3'; 3 связанных нуклеозида сегмента крыла 3' содержат затрудненный этиловый сахар, затрудненный этиловый сахар и 2'-O-метоксиэтиловый сахар в направлении от 5' к 3'; каждая межнуклеозидная связь указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой 5-метилцитозин.

8. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид состоит из 18 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 1379, и содержит:

сегмент гэп, состоящий из 8 связанных дезоксинуклеозидов;

сегмент крыла 5', состоящий из 5 связанных нуклеозидов; и

сегмент крыла 3', состоящий из 5 связанных нуклеозидов;

причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3'; 5 связанных нуклеозидов сегмента крыла 5' содержат затрудненный этиловый сахар, дезоксисахар, затрудненный этиловый сахар, дезоксисахар и затрудненный этиловый сахар в направлении от 5' к 3'; каждый из 5 связанных нуклеозидов сегмента крыла 3' содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар; каждая межнуклеозидная связь указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой фосфотиоатную связь; и каждый цитозин указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой 5-метилцитозин.

9. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 224, и содержит:

сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов;

сегмент крыла 5', состоящий из 6 связанных нуклеозидов; и

сегмент крыла 3', состоящий из 4 связанных нуклеозидов;

причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой 5-метилцитозин.

10. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что указанный одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 807, и содержит:

сегмент гэп, состоящий из 10 связанных дезоксинуклеозидов;

сегмент крыла 5', состоящий из 6 связанных нуклеозидов; и

сегмент крыла 3', состоящий из 4 связанных нуклеозидов;

причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, каждая межнуклеозидная связь указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой фосфотиоатную связь, и каждый цитозин указанного одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида представляет собой 5-метилцитозин.

11. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по любому из пп. 1-10, отличающийся тем, что одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид является сопряженным.

12. Композиция для лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния, содержащая одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид по любому из пп. 1-10 или его фармацевтически приемлемое производное и по меньшей мере один фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.

13. Применение соединения по любому из пп. 1-10, для производства лекарства для лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния у пациента, при этом заболевание, расстройство или состояние представляет собой желтуху, воспаление печени, фиброз печени, воспаление, цирроз печени, печеночную недостаточность, рак печени, диффузное гепатоцеллюлярное воспалительное заболевание, гемофагоцитарный синдром, серозный гепатит, виремию HBV или заболевание печени, связанное с трансплантацией.

14. Применение композиции по п. 12, для производства лекарства для лечения HBV-связанного заболевания, расстройства или состояния у пациента, при этом заболевание, расстройство или состояние представляет собой желтуху, воспаление печени, фиброз печени, воспаление, цирроз печени, печеночную недостаточность, рак печени, диффузное гепатоцеллюлярное воспалительное заболевание, гемофагоцитарный синдром, серозный гепатит, виремию HBV или заболевание печени, связанное с трансплантацией.

15. Применение соединения по любому из пп. 1-10 для производства лекарства для снижения уровней HBsAG у пациента, инфицированного HBV.

16. Применение композиции по п. 12 для производства лекарства для снижения уровней HBsAG у пациента, инфицированного HBV.

Документы, цитированные в отчете о поиске Патент 2018 года RU2667524C2

US 20090318676 A1, 24.12.2009
US 20030068301 A1, 10.04.2003
US 20100056607 A1, 04.03.2010
US 20090318536 A1, 24.12.2009
US 20100197762 A1, 05.08.2010
Qureshi H
et al, JPMA, 2002, vol
Устройство для устранения мешающего действия зажигательной электрической системы двигателей внутреннего сгорания на радиоприем 1922
  • Кулебакин В.С.
SU52A1
ПОЛИНУКЛЕОТИДЫ, СПОСОБ ИХ ПОЛУЧЕНИЯ, ГИБРИДИЗАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ НУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ 1991
  • Майкл С.Урди
  • Томас Хорн
  • Чу-Ан Чанг
RU2142467C1

RU 2 667 524 C2

Авторы

Суэйзи Эрик Е.

Фрайер Сьюзан М.

Маккалеб Майкл Л.

Даты

2018-09-21Публикация

2012-04-20Подача