Способ получения библиотеки генов для диагностики патологий печени Российский патент 2021 года по МПК C12Q1/686 C12Q1/6874 C12Q1/6883 C40B50/06 

Изобретение относится к области медицины, оно позволяет проводить диагностику целого ряда наследственных заболеваний, в основе патогенеза которых лежит поражение печени. Изобретение дает возможность проводить исследование кодирующих последовательностей (фрагментов) 47 ядерных генов, ответственных за наследственную патологию печени, включенных в специализированную библиотеку (панель) «Гепатопатии». Согласно настоящему изобретению, библиотека «Гепатопатии» — совокупность фрагментов 47 ядерных генов ДНК, ответственных за патологию печени.

Наследственные болезни обмена веществ являются одной из частых причин развития печёночной недостаточности, чаще всего, после инфекционных и токсических поражений печени у детей.

Дифференциальный диагноз для таких пациентов часто играет ключевую роль для выбора стратегии лечения: назначения диетотерапии, решения вопроса о трансплантации печени, курса таргетной терапии. Таргетная терапия - вид лекарственного лечения наследственных заболеваний, основанный на избирательном вмешательстве в биохимические процессы в организме. Для лечения некоторых наследственных метаболических синдромов с патологией печени разработаны высокоэффективные методы таргентной терапии: фермент-заместительные, либо субстрат-редуцирующие препараты.

Для стратегии ведения подобных больных постановка дифференциального диагноза и его объективное подтверждение играет ключевую роль. Генетическая гетерогенность этой группы болезней, многообразие клинических проявлений не позволяет провести точную диагностику во многих случаях с применением стандартных алгоритмов биохимического и генетического анализа.

Применение методов прямого автоматического секвенирования по методу Сенгера для диагностирования оказывается нецелесообразным из-за сходства клинической картины целого ряда наследственных заболеваний печени, обусловленных мутациями в разных генах и необходимости последовательного исследования длинного списка генов для каждого пациента, что делает диагностику крайне продолжительной и дорогостоящей.

Казалось бы, следовало обратить внимание на секвенирование клинического экзома. То есть одновременное секвенирование всех генов в геноме человека, для которых известна их клиническая значимость. Но в данном случае врач-лаборант сталкивается с огромным объемом полученных данных для каждого пациента, для анализа которого требуются большие трудозатраты высококвалифицированного биоинформатика. Кроме того, следует отметить, что секвенирование клинического экзома- дорогостоящий и длительный метод диагностики, что препятствует его широкому применению.

Известен способ диагностики гликогеновой болезни IXa типа у детей с использованием технологии секвенирования нового поколения. Проводят молекулярно-генетический анализ кодирующих, прилегающих интронных 3' и 5' нетранслируемых областей генов PGM1, AGL, GBE1, GYG1, PGAM2, LDHA, PYGM, SLC37A4, GYS2, LDHB, PFKM, PYGL, ALDOA, PHKG2, PHKB, ENO3, G6PC, GYS1, PHKA2, PHKA1, LAMP2 с использованием технологии таргетного секвенирования (RU 2621161). Этот метод характеризуется тем, что позволяет анализировать только гены, ответственные за развитие гликогенозов. Предлагаемая нами панель позволяет проводить диагностики более широкого спектра генов, ответственных за развитие наследственных заболеваний печени.

Известен способ, в котором перечислены реактивы и методы, позволяющие приготовить геномную библиотеку с ограниченной выборкой локусов из бисульфитно-конвертированной геномной ДНК путем гибридизации образца с локус-специфическими зондами (WO 2015014759). Этот метод характеризуется длительностью протокола проведения анализа и тем, что получается большое число неспецифичных фрагментов помимо тех, которые исследуются, что является результатом применения бисульфита натрия.

Известен способ приготовления геномных библиотек ограниченных выборок локусов из деградированной ДНК, ограниченных отбором по длине фрагментов ДНК после обработки геномной ДНК эндонуклеазой рестрикции (RU 2625012). Данный протокол направлен на исследование ограниченного числа локусов из деградированной ДНК. Заявляемый нами способ имеет иные цели и задачи и рассчитан на исследование большого числа локусов, ответственных за наследственную патологию печени, при использовании минимальных количеств хорошо очищенной ДНК.

Технической проблемой, на разрешение которой направлено заявляемое изобретение, является создание эффективного способа получения библиотеки генов для диагностики патологий печени на основе наиболее адекватного состава генов библиотеки, который позволит быстро и экономически выгодно проводить исследование пациентов с наследственными заболеваниями печени. В связи с этим библиотека (панель) «Гепатопатии» составлена, исходя из задачи сфокусироваться сразу на нескольких основных симптомокомплексах печеночной патологии.

Технический результат, достигаемый при реализации настоящего изобретения, заключается в упрощении технологии, уменьшении расхода используемых реагентов и сокращении времени, требуемого на проведение анализа полученных данных, обеспечении возможности диагностики детей с раннего возраста и сокращении длительности и себестоимости процесса получения библиотеки с применением таргетного секвенирования, благодаря одновременному анализу наиболее адекватного состава генов и расширяет, тем самым, возможности по анализу спектра мутаций и изучению вклада генов в развитие патологии печени. Это позволяет достаточно быстро дифференцировать заболевания со сходными клиническими синдромами, причем одновременно для группы пациентов. Сокращение времени исследования помогает в более быстрые сроки поставить правильный диагноз, подобрать адекватное лечение и дать реальный прогноз для пациента.

Способ получения библиотеки генов для диагностики патологий печени, предусматривает:

- взятие образцов исходной геномной ДНК пациента из его крови;

- первоначальное измерение концентрации ДНК в образце;

- разведение образца до концентрации ДНК около 5.0 мкг/мл с помощью буфера ТЕ с низким содержанием ЭДТА;

- подготовка реакционной смеси для первой амплификации, включающей 4-5 нг разведенной ДНК образца, полимеразу, буфер, пригодный для работы этой полимеразы, два пула праймеров, специфичных для 47 генов, ассоциированных с наследственными патологиями печени, и нуклеотиды, в двух пробирках объемом по 200 мкл;

- проведение первой амплификации подготовленной реакционной смеси путем полимеразной цепной реакции при циклическом изменении температуры с получением первичного набора фрагментов ДНК упомянутых 47 генов будущей библиотеки;

- добавление реактива, содержащего фермент, осуществляющий частичное расщепление концов фрагментов ДНК 47 генов будущей библиотеки, полученных после первой амплификации;

- лигирование фрагментов ДНК генов будущей библиотеки с помощью последовательной инкубации, проводимой при нескольких значениях температуры с добавлением индивидуального баркода и фермента лигазы, присоединяющего молекулу баркода к концу каждого фрагмента ДНК генов будущей библиотеки,

- чистку будущей библиотеки генов ДНК пациента от баркодов, неприсоединенных к фрагментам ДНК 47 генов будущей библиотеки, и неиспользованных избыточных реагентов, которую производят с помощью раствора, содержащего магнитные частицы, с образованием осадка магнитных частиц, абсорбирующих на своей поверхности фрагменты ДНК 47 генов будущей библиотеки;

- промывку полученного осадка 70% этиловым спиртом;

- смывание фрагментов ДНК 47 генов будущей библиотеки с поверхности магнитных частиц с помощью состава, содержащего буфер, свободные нуклеотиды, полимеразу и универсальные праймеры, и перенос полученной для финальной амплификации реакционной смеси в чистые пробирки объемом 200 мкл;

- проведение финальной амплификации полученной реакционной смеси путем полимеразной цепной реакции реакционной смеси при циклическом изменении температуры, с получением готовой библиотеки фрагментов ДНК 47 генов;

- повторную, в три этапа, чистку готовой библиотеки фрагментов ДНК 47 генов от фрагментов, которые получились короче или длиннее допустимой длины, а также от оставшихся неиспользованными при амплификации праймеров, нуклеотидов и фермента, причем на первом этапе повторную чистку проводят с троекратным добавлением раствора, содержащего магнитные частицы, и завершают в два этапа промывкой осадка 70% этиловым спиртом, в результате чего получают осадок магнитных частиц, абсорбирующих на своей поверхности фрагменты ДНК 47 генов индивидуальной библиотеки пациента;

- смывание фрагментов ДНК 47 генов библиотеки с магнитных частиц с помощью буфера ТЕ с низким содержанием ЭДТА, и получение надосадочной жидкости, содержащей фрагменты ДНК 47 генов готовой библиотеки, ассоциированных с наследственными патологиями печени, указанных в таблице 1;

- измерение концентрации полученной готовой библиотеки фрагментов ДНК 47 генов, которая должна находиться в диапазоне 200-1000 нг/мл,

- проведение проверочной амплификации пробы в количестве 1 мкл, отобранной из полученной готовой библиотеки 47 генов, путем полимеразной цепной реакции при циклическом изменении температуры с использованием универсальных праймеров, специфичных для всех фрагментов 47 генов, ассоциированных с наследственными патологиями печени, и обеспечивающих амплификацию каждого из фрагментов ДНК 47 генов готовой библиотеки;

- проверку качества готовой библиотеки 47 генов путем электрофореза в полиакриламидном геле с последующей окраской серебром;

- считывание последовательности всех фрагментов ДНК 47 генов готовой библиотеки путем таргентного ионного полупроводникового секвенирования готовой библиотеки 47 генов с использованием чипа с лунками, которые поочередно наполняют одним из четырех нуклеотидов реакционной смеси, и с помощью полимеразы проводят синтез новой цепи ДНК, используя для этого один из фрагментов ДНК библиотеки 47 генов в каждой лунке в качестве матрицы;

- контроль присоединения каждого нуклеотида к строящейся новой цепи ДНК путем фиксации скачка разности потенциалов в соответствующей лунке, обусловленного высвобождением ионов водорода;

- считывание и анализ фрагментов ДНК генов готовой библиотеки на наличие среди них полиморфизмов и ассоциированных с патологиями печени мутаций.

Предпочтительно, после проведения первой амплификации реакционные составы двух пулов фрагментов ДНК будущей библиотеки 47 генов смешивают в одной пробирке.

Предпочтительно, таргентное секвенирование проводят одновременно на двух чипах.

Предпочтительно, одновременно проводят пробоподготовку библиотек 47 генов образцов ДНК нескольких пациентов с патологией печени, причем фрагменты ДНК каждой библиотеки 47 генов метят ее индивидуальным баркодом, позволяющим отличать библиотеки разных пациентов.

Предпочтительно, одновременно проводят оценку качества нескольких библиотек фрагментов ДНК 47 генов, полученных из образцов ДНК разных пациентов.

Предпочтительно, при проведении проверочной амплификации подбирают количество циклов реакции в зависимости от измеренной концентрации библиотеки, с последующим проведением проверочного электрофореза в полиакриламидном геле и окраской серебром.

Предпочтительно, в том случае, если проверочный электрофорез показал плохое качество полученной библиотеки фрагментов 47 генов, проб подготовку проводят повторно.

Предпочтительно, в том случае, если проверочный электрофорез показал наличие остатков праймеров, не удаленных при очистке библиотеки фрагментов ДНК 47 генов, проводят дополнительную чистку этой библиотеки с использованием магнитных частиц.

Таким образом, достижение технического результата обусловлено тем, что в соответствии с настоящим изобретением в панель «Гепатопатии» включены гены, ответственные за печеночные формы гликогеновой болезни (гликогенозы типов I, II, III, IV, VI, IX). Это гетерогенная группа заболеваний, обусловленных дефектом ферментов метаболизма гликогена, каждое из которых имеет свои особенности, но в то же время и сходные симптомы, такие как гепатоспленомегалия, гипогликемия, синдром цитолиза, которые затрудняют постановку окончательного диагноза.

Диагностика гликогенозов посредством прямого секвенирования была бы затруднительна из-за генетической гетерогенности и большой протяжённости многих генов, изменения в которых ассоциированы с ними. В соответствии с настоящим изобретением в состав панели «Гепатопатии» включены 9 генов, патогенные аллели которых обуславливают развитие печеночных гликогенозов, включая гены фосфоррилазной системы PHKA2, PHKB и PHKG2, отличающиеся большой протяженностью и ассоциированные с гликогенозом типа IX, составляющим 25% от всех случаев данной группы патологий.

В соответствии с настоящим изобретением в панель «Гепатопатии» включены гены, ответственные за заболевания, протекающие с ведущим синдромом холестаза – прогрессирующие семейные внутрипечёночные холестазы (ПСВХ) и также синдром Алажиля. Такие симптомы как желтушность кожных покровов, кожный зуд, ахолия, синдром мальабсорбции могут наблюдаться при любом из этих заболеваний. Генетическая этиология в данном случае является первейшим основанием для выбора тактики операционного лечения.

В соответствии с настоящим изобретением в панель «Гепатопатии» включены гены, ответственные за митохондриальные гепатопатии. Они вносят немалый вклад в развитие печёночной недостаточности у детей раннего возраста и трудно поддаются дифференциальной диагностике с другими метаболическими заболеваниями. В соответствии с настоящим изобретением в панель «Гепатопатии» включены гены, ответственные за ряд лизосомных болезней накопления, в том числе наиболее распространенное в России наследственное заболевание обмена веществ – болезнь Гоше.

Таким образом, в группу 47 генов библиотеки (панель «Гепатопатии») для диагностики патологий печени включены гены, указанные в таблице 1.

Таблица 1

№ Ген
библиотеки Наследственные патологии печени,
ассоциированные с генами библиотеки ABCB11 семейный внутри печеночный холестазтип 2 ABCB4 семейный внутри печеночный холестазтип 3 ABCD3 врожденные нарушения синтеза желчных кислот тип 5 AGL гликогенозтип 3 AKR1D1 врожденные нарушения синтеза желчных кислот тип 2 ALAD острая перемежающаяся порфирия ALDOB фруктоземия ATP7B болезнь Вильсона-Коновалова ATP8B1 семейный внутри печеночный холестазтип 1 BCS1L GRACILE синдром, митохондриальная гепатопатия C10orf2 синдром истощения мтдНК, гепатоцеребральная форма, митохондриальная гепатопатия CYP7B1 врожденные нарушения синтеза желчных кислот тип 3 DGUOK синдром истощения мтДНК,митохондриальная гепатопатия FAH тирозинемиятип 1 FBP1 фруктозо 1,6 бифосфатазная недостаточность G6PC гликогенозтип 1 GAA гликогенозтип 2, болезнь Помпе GALE галактоземиятип 3 GALT галактоземиятип 1 GBA болезньГоше GBE1 гликогенозтип 4 GYS2 гликогенозтип 0 HADHA недостаточность длинноцепочечной гидроксиацилКоА дегидрогеназы жк JAG1 синдром Аладжиля LARS синдром младенческой печеночной недостаточности LIPA недостаточность кислой липазы MPI врожденные нарушения гликозилирования тип 1b MPV17 синдром истощения мтДНК, митохондриальная гепатопатия NBAS синдром младенческой печеночной недостаточности OTC недостаточность орнитинтранскарбомилазы PFKM гликогенозтип 7 PGAM2 гликогенозтип 10 PGM1 врожденные нарушения гликозилирования тип 1t PHKA2 гликогенозтип 9A PHKB гликогенозтип 9B PHKG2 гликогенозтип 9C POLG1 синдром истощения мтДНК, митохондриальная гепатопатия, болезнь Альперса PYGL гликогенозтип 6 SCO1 митохондриальная гепатопатия SERAC1 3-метилглутаконовая ацидуриятип 6 SERPINA1 альфа1 антитрипсина недостаточность LC25A13 цитруллинемиятип 2 SLC37A4 гликогенозтип 1b SMPD1 болезнь Ниманна-Пика тип А/В TALDO1 недостаточность трансальдолазы TJP2 семейный внутри печеночный холестазтип 4 TRMU синдром младенческой печеночной недостаточности

Способ получения библиотеки генов для диагностики патологий печени реализуется следующим образом.

ПРОБОПОДГОТОВКА

Материал для исследования:

Образцы геномной ДНК пациента, выделенные из клеток цельной крови, буккального эпителия и других тканей колоночными наборами.

Для проведения исследования 47 ядерных генов, ответственных за патологию печени, используются специально выбранные для каждого гена искусственно-синтезированные последовательности олигонуклеотидов (праймеры) панели «Гепатопатии», специфичные для 47 генов, ассоциированных с наследственными патологиями печени.

Последовательности специфичных праймеров приведены в таблице 2. В Таблице 2 представлены последовательности всех праймеров специфичных для 47 генов, название каждого соответствующего гена, геномные координаты и название. Пример записи последовательности:

IAD84954_1_A,A,1,AMPL7153084244,AAAAACTTGGCCATCTGAGGTTTTG,CCCTGTGTTTGTGGAATACATAGAAAAA*,JAG1 ** ,hg19 ***,chr20 ****,10629161,10629186,10629406,10629434 *****,

где вставленными звездочками последовательно выделены:

* последовательности двух праймеров (подчеркнуты), необходимых для амплификации одного определенного фрагмента ДНК.

** Название гена (выделено жирным шрифтом).

*** Название референсного генома, по которому указаны координаты.

**** Название хромосомы, на которой расположен ген, чей фрагмент дают возможность амплифицировать эти праймеры.

*****Две пары координат, которые показывают, где в референсном геноме расположены начало и окончание каждого праймера.

Аналогично выполнены записи во всех строках Таблицы 2.

Таблица 2

IAD84954_1_A,A,1,AMPL7153084244,AAAAACTTGGCCATCTGAGGTTTTG,CCCTGTGTTTGTGGAATACATAGAAAAA,JAG1,hg19,chr20,10629161,10629186,10629406,10629434 IAD84954_1_A,A,2,AMPL7153191796,TGGAACTAATAAAAACCAAGACACCAGT,AGTTAAGGAAAATGCTCTTCACATTTTGC,GBE1,hg19,chr3,81642974,81643002,81643202,81643231 IAD84954_1_A,A,3,AMPL7153084259,CCATTCAGACACTGGTTAACCGA,CAAAGAGAACATCTCAGCCTTTTGTTC,JAG1,hg19,chr20,10621691,10621714,10621938,10621965 IAD84954_1_A,A,4,AMPL7153191816,AGATAAATGAAGCAACACAGTATTCACAGA,CCTGGGCTTTACAGTCAGAATATTTACTAA,GBE1,hg19,chr3,81635185,81635215,81635378,81635408 IAD84954_1_A,A,5,AMPL7153084285,AAGAACCAGGCCCAGAGAAATATC,CCACTGGGACTCACACTGAAAT,JAG1,hg19,chr20,10625689,10625713,10625916,10625938 IAD84954_1_A,A,6,AMPL7153191888,CGGGCTGCCTGTCTAAGTG,GTCCCAGCTAGAGCTCCAG,GBE1,hg19,chr3,81810483,81810502,81810726,81810745 IAD84954_1_A,A,7,AMPL7153084362,GCACAAGGATCCTTAGAATGGACA,TGGTTTTTGAAATATGCTTGCACTAGTG,JAG1,hg19,chr20,10632184,10632208,10632430,10632458 IAD84954_1_A,A,8,AMPL7153194906,ATTCATGTAAGATTACTGCCAGATTGGTAG,GCTTACATTGCTTTTTGGATTTATGTTGC,HADHA,hg19,chr2,26461683,26461713,26461912,26461941 IAD84954_1_A,A,9,AMPL7153084461,CCTGACTCAGAACTTGCATTTTAAACAC,TTTGCTGGTGTTAACTACGACTTTATCA,JAG1,hg19,chr20,10624880,10624908,10625126,10625154 IAD84954_1_A,A,10,AMPL7153194950,AACATACATGGTCCAGAATGGCA,GCATAAACTAACAAGGGAATCTAGGCT,HADHA,hg19,chr2,26437222,26437245,26437467,26437494 IAD84954_1_A,A,11,AMPL7153084484,CGGAGAAGGGCTCCTACCT,CGTGCATGCTCCAATCGG,JAG1,hg19,chr20,10654081,10654100,10654299,10654317 IAD84954_1_A,A,12,AMPL7153194959,TCTAGCTCTGTAGATCTTCAAAGCCT,TCAGAGGAACCTGAACTGAAGGA,HADHA,hg19,chr2,26432565,26432591,26432815,26432838 IAD84954_1_A,A,13,AMPL7153084528,CCTGAGCACAGTGGCTTATTTG,AAACAATCTCAAAACATTGCCACACA,JAG1,hg19,chr20,10623039,10623061,10623285,10623311 IAD84954_1_A,A,14,AMPL7153194965,TGTTTTCTGTTCACTACACTAGGATTCAA,ATAAACGTTAGTTTCCTTTTCTTCCCATCT,HADHA,hg19,chr2,26423968,26423997,26424212,26424242 IAD84954_1_A,A,15,AMPL7153084536,AAAGAAAGTTTTCCCACGTTGAAGTG,CATGAAAACTGCTGAACAGTGCT,JAG1,hg19,chr20,10626536,10626562,10626787,10626810 IAD84954_1_A,A,16,AMPL7153194978,AGCCTGGAGGTAAAAGGAGTCT,AGGAATGCTCTCAGGTTCCTCA,HADHA,hg19,chr2,26417891,26417913,26418143,26418165 IAD84954_1_A,A,17,AMPL7153084559,TGTTACATACTGGTGACATCATCTCCT,CTAAGCTGCCAGCTTCTGTTTTTC,JAG1,hg19,chr20,10622098,10622125,10622346,10622370 IAD84954_1_A,A,18,AMPL7153194993,CCAAAGACTTTGCCCAGATCTTC,GTTTTACACAAGGCAGTGTTTGGAG,HADHA,hg19,chr2,26416508,26416531,26416713,26416738 IAD84954_1_A,A,19,AMPL7153084569,AAAAAGCTTTCTTGTTCTCCAAGGAA,TCGTGGAATTTGCAGACTTTAATGC,JAG1,hg19,chr20,10636934,10636960,10637181,10637206 IAD84954_1_A,A,20,AMPL7153195000,AAGCTTTGGGCTGTCAGAGAAA,AGGGTTCTGAGAACAAATAGTAACACTC,HADHA,hg19,chr2,26415120,26415142,26415340,26415368 IAD84954_1_A,A,21,AMPL7153084577,ACAAGCCCTCAGACTCTACCTAG,ACTCCAAAATGTCTAAAATAAGGACACACA,JAG1,hg19,chr20,10620101,10620124,10620345,10620375 IAD84954_1_A,A,22,AMPL7153195076,TACAATAACGATTGCCCTTTTCCGT,CCTTAGCAGTCTAAGCTTTTACTGGAA,PGM1,hg19,chr1,64104270,64104295,64104517,64104544 IAD84954_1_A,A,23,AMPL7153084597,CAAGTCGGCTACCCAAGTTTCA,AGACAAACTCTGGCCTGTTCTTTTT,JAG1,hg19,chr20,10630117,10630139,10630348,10630373 IAD84954_1_A,A,24,AMPL7153195101,TGGATTCTTTGTATTTCCATGTGAGCT,GAAAGGAAAATCGCTCAACTTGGAA,PGM1,hg19,chr1,64095549,64095576,64095796,64095821 IAD84954_1_A,B,1,AMPL7153452505,ACACAGATTTTACCTGTCAACTCTTTACA,GCTTGAACATGAAACACAACACACT,PHKB,hg19,chr16,47733070,47733099,47733318,47733343 IAD84954_1_A,B,2,AMPL7154584476,TGAAAACAGTTTTAACTTTTTGGCATGGA,AGAGTCTGAAGGGTTCACAAAGAAC,PGM1,hg19,chr1,64101689,64101718,64101933,64101958 IAD84954_1_A,B,3,AMPL7153457668,GTACCCTCCAGAGAGGTGAGT,CCCGCTCCATAAACCCTGTTC,GALE,hg19,chr1,24122900,24122921,24123088,24123109 IAD84954_1_A,B,4,AMPL7154584512,ACGATCAGAAACCAGGAACAAGTG,GGAGAGCCAGAAACATAACAATACTTATCA,PGM1,hg19,chr1,64089223,64089247,64089440,64089470 IAD84954_1_A,B,5,AMPL7153457675,GGGACTAGCCAGACACACATTC,AGCCACCTCTGAGACTCTGTAT,GALE,hg19,chr1,24125274,24125296,24125512,24125534 IAD84954_1_A,B,6,AMPL7154586943,GGACTTCTGGCCTTGCTTTGT,GTTTCCTGGACACCATGAGCAT,POLG1,hg19,chr15,89872201,89872222,89872306,89872328 IAD84954_1_A,B,7,AMPL7153457941,CTGCATAGTATTCCAACACTTACCCA,GCCTTCAGGTCATCACACCAAC,ABCB11,hg19,chr2,169788864,169788890,169789085,169789107 IAD84954_1_A,B,8,AMPL7154586976,GGGCTTCCCACATTACAGCTAT,CAATCAGGGATTTGCCTCAGACT,POLG1,hg19,chr15,89866105,89866127,89866240,89866263 IAD84954_1_A,B,9,AMPL7153457945,CCCTCATTGGAGATTAAGTAACCTCCA,CCCTTGTATTCCTAAGACTCTTTTTCAATC,ABCB11,hg19,chr2,169791718,169791745,169791940,169791970 IAD84954_1_A,B,10,AMPL7154595454,CTGACAAGGCCATCACCCAGGA,GTGGCCGTGTAGCCCATT,GAA,hg19,chr17,78078666,78078688,78078819,78078837 IAD84954_1_A,B,11,AMPL7153457951,AGTTCTTAGGGCTTCTGATTAGCTTAAAG,CCCTCTATATCCACAAATGTAATCTCTGGT,ABCB11,hg19,chr2,169853037,169853066,169853280,169853310 IAD84954_1_A,B,12,AMPL7154596284,GGGTACCTAATACTGTTTTTCTGTCTTTTG,CCTTATCCATCTCAAGTTGCTACTAAGTTA,HADHA,hg19,chr2,26455087,26455117,26455186,26455216 IAD84954_1_A,B,13,AMPL7153457954,AAGCATTTCCACATGGACCTGTA,AGAAGCCATCAAATTCTTTTCCCTTCA,ABCB11,hg19,chr2,169826508,169826531,169826749,169826776 IAD84954_1_A,B,14,AMPL7154598234,GAACCTCGTCATGGATGCTGAT,CCTGGAGTTAATTGGTATGTAGCATAGC,POLG1,hg19,chr15,89861842,89861864,89862012,89862040 IAD84954_1_A,B,15,AMPL7153457956,TCTCTCATAGGGAATGGCTCTGA,AACCTAATGACCTGTCATCTCCTCT,ABCB11,hg19,chr2,169783631,169783654,169783880,169783905 IAD84954_1_A,B,16,AMPL7154598238,TCCCTTCTTCTGAACCCAGACT,CACCTAAACTCATGGCACTTACCT,POLG1,hg19,chr15,89868564,89868586,89868810,89868834 IAD84954_1_A,B,17,AMPL7153457962,GAAACAGAGTCAGGCTTCAGAAAATG,TTTGAATTGAGTTGTGCATCTTAGTTTGAG,ABCB11,hg19,chr2,169832986,169833012,169833230,169833260 IAD84954_1_A,B,18,AMPL7154598246,CGAAGGCCATTATTACTTTGTGACAAC,TTTCCTTTGACCGAGCTCATATCAG,POLG1,hg19,chr15,89873081,89873108,89873330,89873355 IAD84954_1_A,B,19,AMPL7153457963,TCCCATGGAGAGATGCAAAAAGAC,ACTGAGACTTTCAGCAAGATATTTGAATGA,ABCB11,hg19,chr2,169850189,169850213,169850433,169850463 IAD84954_1_A,B,20,AMPL7154598463,TCTTTGCGGACCAGTTCCTTC,GGGTGAGACCCGTAGAGGTT,GAA,hg19,chr17,78081382,78081403,78081607,78081627 IAD84954_1_A,B,21,AMPL7153457967,TTTCTGAGATACCAGAAGGAAATGCTATG,CTTGAGCTGTTTCTGCCGAAATT,ABCB11,hg19,chr2,169842567,169842596,169842818,169842841 IAD84954_1_A,B,22,AMPL7154598467,AGCCTCTCGTTGTCCAGGTAT,TCGTTCATGTCCTGCAAGAGAAG,GAA,hg19,chr17,78084509,78084530,78084727,78084750 IAD84954_1_A,B,23,AMPL7153457968,AAAACTCATATTCTCAGGCTTAAAGGGTAC,TATGAAATGTAAACTTGGACACCAGTTGA,ABCB11,hg19,chr2,169820628,169820658,169820873,169820902 IAD84954_1_A,B,24,AMPL7154598474,GTGCCAGGTGAGCTCCTAC,AGCTCCTCTGAGGTGTTGC,GAA,hg19,chr17,78086504,78086523,78086737,78086756 IAD84954_1_A,C,1,AMPL7153089733,AAAGAATGATGGGAGCTGGGTTT,ACTGCTCATCTGATGTCAAATGTCC,BCS1L,hg19,chr2,219526067,219526090,219526314,219526339 IAD84954_1_A,C,2,AMPL7153202704,AGGGTATCTGAGAGGCGAAGAA,CCTGTTCTGAGGACGTGACATTG,SLC37A4,hg19,chr11,118896557,118896579,118896808,118896831 IAD84954_1_A,C,3,AMPL7153089749,GGGCCTGTAAGGTTTGGTGTTT,CCAGCTAAGCAACCAGGCATAG,BCS1L
,hg19,chr2,219525679,219525701,219525886,219525908 IAD84954_1_A,C,4,AMPL7153208497,GATTTATTGAGCACCTACTAAAAGTCTACCA,TAAGCCCTGCCCAGGAGAGTAG,GBA,hg19,chr1,155210308,155210339,155210560,155210582 IAD84954_1_A,C,5,AMPL7153089772,CCTGAGGAAGCATTTCCAGGTT,ACAGTTACCCACTCCACTTCCT,BCS1L,hg19,chr2,219527178,219527200,219527420,219527442 IAD84954_1_A,C,6,AMPL7153230623,GGACATTTGCTGGTTCCAGTTC,CTTTGTGGACTTGAACTCAAACTATTTCAT,CYP7B1,hg19,chr8,65509371,65509393,65509522,65509552 IAD84954_1_A,C,7,AMPL7153115928,TGGGAGGATATTTTTCCAAAGCTTAAACT,CGTTACCCAAAAGAGAGTTTTCCCTTTATA,AGL,hg19,chr1,100336332,100336361,100336475,100336505 IAD84954_1_A,C,8,AMPL7153249354,TCCTAAAGGCTACTTCAGATATAACAGCT,AATTGCAACTGTTGAATCTCCTCCTA,ALDOB,hg19,chr9,104188730,104188759,104188977,104189003 IAD84954_1_A,C,9,AMPL7153124131,CCTGAACCTGCTTACCCTGAAG,CTTCCTTTGTCCAGATAGGGAAACAG,MPI,hg19,chr15,75188590,75188612,75188713,75188739 IAD84954_1_A,C,10,AMPL7153252931,GACCTACCCTACAGTTTCTCAACC,CAAGTGATAAGCAGAGTCCCATACT,GBA,hg19,chr1,155208238,155208262,155208487,155208512 IAD84954_1_A,C,11,AMPL7153125638,TCCTGAGAATGGAGCAAGGGTA,GTGGGAGCAGATCTTATTGAGAGTTC,POLG1,hg19,chr15,89869784,89869806,89870007,89870033 IAD84954_1_A,C,12,AMPL7153252980,GCCTTCCATTGGAAGGAGGGATA,GCACTGATAACCACACAGCCTT,FAH,hg19,chr15,80452024,80452047,80452270,80452292 IAD84954_1_A,C,13,AMPL7153125666,GCTGGTTCCTTCTTCACCTTCTT,CTCCAGCGGGAGATGAAGAAGT,POLG1,hg19,chr15,89870205,89870228,89870446,89870468 IAD84954_1_A,C,14,AMPL7153253001,CCAGTGCTTGGAACAGTCCATT,CCCAGTTTACTTTAAGAAGAACTTGGCA,FAH,hg19,chr15,80454513,80454535,80454754,80454782 IAD84954_1_A,C,15,AMPL7153125772,GGGAAGGAAATGGGTCTTAGCA,TGGGTAATGGAGTATAGCAGTCCT,POLG1,hg19,chr15,89865099,89865121,89865335,89865359 IAD84954_1_A,C,16,AMPL7153253006,CCTCCGGGATGCTAGGCTAA,GGGCCTGAAATCTCTTCTCGA,FAH,hg19,chr15,80472405,80472425,80472648,80472669 IAD84954_1_A,C,17,AMPL7153125841,GGCTCCATTCTTTCAGCCTAGA,CTGAGAGCTGGTGGTGGTAAT,POLG1,hg19,chr15,89871556,89871578,89871809,89871830 IAD84954_1_A,C,18,AMPL7153253018,CCATGACGAGCCCTACACATTT,TTTAGACGAGCCACACACATCTC,FAH,hg19,chr15,80467384,80467406,80467547,80467570 IAD84954_1_A,C,19,AMPL7153125852,GAACTCTGGCTGGGAAGAACTA,CCTGCAGTGTCTGAGTACCATG,POLG1,hg19,chr15,89866957,89866979,89867203,89867225 IAD84954_1_A,C,20,AMPL7153253513,GAGCTATAAGACACAAAGAGAAAAGGAGA,CAGTACCACTCTGATTGCCATTG,ATP7B,hg19,chr13,52548008,52548037,52548259,52548282 IAD84954_1_A,C,21,AMPL7153126615,CTGGGCCTGCAACAGCAAGT,AGCAAATCTTCGGGCAAGGA,POLG1,hg19,chr15,89876503,89876523,89876712,89876732 IAD84954_1_A,C,22,AMPL7153253737,TTGCCTGATATCTGCAGAAAACTGT,TTGCATGGTTTTTAGTTCACAGTGAAATT,ATP7B,hg19,chr13,52515152,52515177,52515397,52515426 IAD84954_1_A,C,23,AMPL7153126634,GCCCTCCGAGGATAGCACT,CCAAAGCCAGGTGTTCTGACTC,POLG1,hg19,chr15,89876788,89876807,89877011,89877033 IAD84954_1_A,C,24,AMPL7153253802,AGGTCTATTGCAATGTCAATACAACATG,CTCTAACACCACGCTTGTGACT,ATP7B,hg19,chr13,52531556,52531584,52531808,52531830 IAD84954_1_A,D,1,AMPL7153457972,GTTTGGAGCAGCAGAGCTTTTATT,TGACAGAGCCCTAGGGCTTATT,ABCB4,hg19,chr7,87042839,87042863,87043091,87043113 IAD84954_1_A,D,2,AMPL7154598475,CTTGAGCTCCAGAGAGCAGAAT,GTCTGCAGGTCGTACCATGT,GAA,hg19,chr17,78090653,78090675,78090887,78090907 IAD84954_1_A,D,3,AMPL7153457973,GAGAAGCAGCAGCTGATGAATTG,TCTATGTCTACAGACTCTGGTAACTGTTG,ABCB4,hg19,chr7,87053161,87053184,87053406,87053435 IAD84954_1_A,D,4,AMPL7154598486,TGTTCTGGGACGATGGAGAGA,CTAGAGTGTCCTAGTGGCAGGTA,GAA,hg19,chr17,78092080,78092101,78092248,78092271 IAD84954_1_A,D,5,AMPL7153457976,CAACTTCTTTCCAAGGGTGAACTTAGT,CGGAGAGGGTGTACTTGGTTCT,ABCB4,hg19,chr7,87104626,87104653,87104808,87104830 IAD84954_1_A,D,6,AMPL7154598488,GCCCAGAACACGATCGTGAAT,GGTCCCAGCATCCTCTGTTC,GAA,hg19,chr17,78092446,78092467,78092694,78092714 IAD84954_1_A,D,7,AMPL7153457979,ACATACCACAAAGAAGAAGCAACAAAATG,GGTTGACCAGAGTGCCTTTAAAC,ABCB4,hg19,chr7,87079211,87079240,87079452,87079475 IAD84954_1_A,D,8,AMPL7154599042,TCTCAGAGCTGCTTTGAGAGC,TGAGCTGGGTGAGTCTCCTC,GAA,hg19,chr17,78078278,78078299,78078532,78078552 IAD84954_1_A,D,9,AMPL7153457989,GTTGACAGCAAAATCCCTTCTATTTCA,ATAGAACTGTCAACTGTTAAGCAACAGT,ABCB4,hg19,chr7,87032386,87032413,87032632,87032660 IAD84954_1_A,D,10,AMPL7154599145,TTTACAGGGAAAAGCAGTTACCGT,CCATGGTTCATACAGTAACATTTACAAGTT,AGL,hg19,chr1,100327090,100327114,100327331,100327361 IAD84954_1_A,D,11,AMPL7153457990,GTGAATCTGGGTAAAGAGTACACGT,CAGATTTTTAAAAACCTGGCAATGCCTA,ABCB4,hg19,chr7,87083744,87083769,87083955,87083983 IAD84954_1_A,D,12,AMPL7154599148,AAATGAGAAAAGTGGTGGAGGTTACA,TGCAATGAGAGAATGGACTAATACACAAAA,AGL,hg19,chr1,100327813,100327839,100328054,100328084 IAD84954_1_A,D,13,AMPL7153458002,CCCAAAGGAAAAGGCACATAAGTATC,ATGCAACTTGTTTGTGCTATGATGG,ABCB4,hg19,chr7,87072872,87072898,87073117,87073142 IAD84954_1_A,D,14,AMPL7154599158,GCGAGTAACCAAGTCTGATCCA,GGAAAATGTCATGTGCTGAAATAGTAGAAT,AGL,hg19,chr1,100340250,100340272,100340488,100340518 IAD84954_1_A,D,15,AMPL7153458003,GGGAAAACATGCATATCGACATAACA,TGCTACATAAAAGTTGAACATGATTGGTCT,ABCB4,hg19,chr7,87049215,87049241,87049446,87049476 IAD84954_1_A,D,16,AMPL7154599160,ACTGCTGCTTTTCCTTGCATCTTA,CACCTGGTAACTAAAGGATGCTTTCTA,AGL,hg19,chr1,100340830,100340854,100340987,100341014 IAD84954_1_A,D,17,AMPL7153458005,GCTAGTGTCTGGCCTTTCTTCAC,ACTACAGTCTTTGGTAAAGTTTCCTTGAAA,ABCB4,hg19,chr7,87037435,87037458,87037614,87037644 IAD84954_1_A,D,18,AMPL7154599192,TGGAATCCTGAAGCATTGCCTT,TGGATGCTAGGTGAGTGTCTTGTTA,AGL,hg19,chr1,100346884,100346906,100347133,100347158 IAD84954_1_A,D,19,AMPL7153458181,GTGTCTACAGCTTAAATGTTATCGAGTCA,TGACTTTTGCAGATGTGTATACATTGTGAT,ATP8B1,hg19,chr18,55371719,55371748,55371942,55371972 IAD84954_1_A,D,20,AMPL7154599202,TAGAGAACATATTCAGGTATTTGGGACTCT,CAACAGTTTGAGCTCAATTAACATACCTG,AGL,hg19,chr1,100349785,100349815,100350004,100350033 IAD84954_1_A,D,21,AMPL7153458195,CAGAGGCAAGGCCAGATATCAA,ATTCTGCTTCTCTTGTTCCTTGTTCT,ATP8B1,hg19,chr18,55364740,55364762,55364988,55365014 IAD84954_1_A,D,22,AMPL7154599210,TACAGCATGACATGTCTCTGAATTTTCA,GGAAAATGGTTCAGGTTAGAAAACAATGT,AGL,hg19,chr1,100356747,100356775,100356987,100357016 IAD84954_1_A,D,23,AMPL7153458198,TTCTTCCATTGTGCCAGTGTCA,GCCTTTGCTACAAGGAAATTGAAGAAA,ATP8B1,hg19,chr18,55336413,55336435,55336656,55336683 IAD84954_1_A,D,24,AMPL7154599216,TACCATTTGTTTTACAACCATCTGTGGA,AACCCAATGAAAGGTGTTTCACAAAG,AGL,hg19,chr1,100357767,100357795,100358008,100358034 IAD84954_1_A,E,1,AMPL7153132406,CTTTGTGGAGATGGCAGTGCTA,GGAGCTTCCTGCAGAGAATGTG,FAH,hg19,chr15,80465241,80465263,80465491,80465513 IAD84954_1_A,E,2,AMPL7153255550,TGATGGCTTGAAGAGAGGTAGGT,ACAACTGATGAGAATGTATCAACTCCTTT,SLC25A13,hg19,chr7,95750539,95750562,95750782,95750811 IAD84954_1_A,E,3,AMPL7153132420,CCCATGGGACAGATGAAACCTG,CCGGGTGTCTATAGATCCCATG,FAH,hg19,chr15,80460464,80460486,80460683,80460705 IAD84954_1_A,E,4,AMPL7153255572,CTGTGGCACCAACCCAGACA,CCGGGACTAGAAGTGAGCC,SLC25A13,hg19,chr7,95951158,95951178,95951334,95951353 IAD84954_1_A,E,5,AMPL7153133186,GACAGAGGAAATATGCCAATGATGTG,CTTTACACACCTCTCTCATGGGAT,GALT,hg19,chr9,34648251,34648277,34648501,34648525 IAD84954_1_A,E,6,AMPL7153256041,ACCACATCTTGAAAAAGGGAAGGA,CATTTGTCAGCAACAGCTTGGTAC,OTC,hg19,chrX,38267882,38267906,38268132,38268156 IAD84954_1_A,E,7,AMPL7153133967,TGTAGAGTGATGTAAGCCATCCGAT,CGCCTTTGTCTCTTTGCCTTTG,GBA,hg19,chr1,155205396,155205421,155205647,155205669 IAD84954_1_A,E,8,AMPL7153256672,GGAGCAGTCAGCCGACTAC,GGCCCATCCAAAGGAGTCC,SMPD1,hg19,chr11,6411699,6411718,6411912,6411931 IAD84954_1_A,E,9,AMPL7153134162,GCTCCAGCTTCTCACTGGTCTA,CTTTCCGACTCTGAATGCCACT,SLC37A4,hg19,chr11,118895827,118895849,118896057,118896079 IAD84954_1_A,E,10,AMPL7153256732,TCCCTCTTTGGCCTCTGAAAGTA,ACATGGAGTGATTCATATCAATGCCTT,AGL,hg19,chr1,100318175,100318198,100318360,100318387 IAD84954_1_A,E,11,AMPL7153136544,GTGTAGACCTCCTGTGGACTCT,GGGTTTCAAGGAGTCAAAGACGT,G6PC,hg19,chr17,41063061,41063083,41063288,41063311 IAD84954_1_A,E,12,AMPL7153256956,GGAACGCTCAGGGAACTACATT,GGACTCAACCTGGCCGATAATG,MPI,hg19,chr15,75182312,75182334,75182494,75182516 IAD84954_1_A,E,13,AMPL7153154193,CAGCAAAGACAGGTACTGTGGA,CTTCTTTCATTGCTCCTGTGTTTCTC,SLC37A4,hg19,chr11,118898972,118898994,118899174,118899200 IAD84954_1_A,E,14,AMPL7153262972,ACTCCCGTGTACATAAACCTTTACTTC,CCATGGTTCTGTGCACAACTCT,ALDOB,hg19,chr9,104192944,104192971,104193196,104193218 IAD84954_1_A,E,15,AMPL7153154298,TGTTTCAGGGCTCACCCAAATC,AGCAGATCTGGGAACTGTGAGA,SLC37A4,hg19,chr11,118899917,118899939,118900144,118900166 IAD84954_1_A,E,16,AMPL7153263200,TGAATCACCATAGTACATGGGTCTTTTC,CTTTGGGAAGGCTGCCTTTAAAAA,OTC,hg19,chrX,38226477,38226505,38226727,38226751 IAD84954_1_A,E,17,AMPL7153171257,GTTCATGCTGGTTGACAGGATG,CTCTTCCCTGTAATGTGAGCTTCT,SLC37A4,hg19,chr11,118898526,118898548,118898657,118898681 IAD84954_1_A,E,18,AMPL7153263203,CTGAAGAAAACAAATATGACTGCCACAT,GGCATGAATGACCAAGTTGGAAC,OTC,hg19,chrX,38271049,38271077,38271293,38271316 IAD84954_1_A,E,19,AMPL7153176963,CCTTGTAGCCTGTCCAGTCTTT,CCTGAGGTAAAGGAGTATCACTCTCTG,GALT,hg19,chr9,34647404,34647426,34647627,34647654 IAD84954_1_A,E,20,AMPL7153263348,CCCACACATTCTTCCCTACAGA,GGTCCCAGAAGAACAAGAGGAATG,SERPINA1,hg19,chr14,94845743,94845765,94845984,94846008 IAD84954_1_A,E,21,AMPL7153176967,AAAAATGAAGTCCATGCCACCATT,GATTCAAGGCCCTTTCTGCTTAATTC,GALT,hg19,chr9,34650291,34650315,34650497,34650523 IAD84954_1_A,E,22,AMPL7153266909,GGTCCTGGGTGTTAAAGTGGAT,ATGACACTGCAGGGCAGGAAGA,POLG1,hg19,chr15,89863958,89863980,89864201,89864223 IAD84954_1_A,E,23,AMPL7153176974,GGTGTGGACGGAGAAAGTGAAA,GGGACGAAAGCTTCCTAAGGAAG,GALT,hg19,chr9,34646632,34646654,34646833,34646856 IAD84954_1_A,E,24,AMPL7153266916,GAGTGAGAAAAGCAGCTCAGGAA,GGGTAGGAAGAGTCTCATTTGGGT,POLG1,hg19,chr15,89864259,89864282,89864509,89864533 IAD84954_1_A,F,1,AMPL7153458205,TCAGAATCCCTTGCAGAAAGAATAAAAGT,CTACAGTGAGCCGATACTGAACTG,ATP8B1,hg19,chr18,55338662,55338691,55338911,55338935 IAD84954_1_A,F,2,AMPL7154599221,GGCTGCAGTGTATCCAGGATTA,GGTGCCAAATCAATACTGACATTTGAATAA,AGL,hg19,chr1,100366299,100366321,100366525,100366555 IAD84954_1_A,F,3,AMPL7153458211,AGCATCTAAAAGTGGCTCCAAATGA,AAGTTATCTCAGAGTCAAGGGCCTAT,ATP8B1,hg19,chr18,55329643,55329668,55329890,55329916 IAD84954_1_A,F,4,AMPL7154599227,TATACACATCTCCAACTTTGTGCTTGT,CATTTTATCCATCCATGTGCCACAATT,AGL,hg19,chr1,100376084,100376111,100376329,100376356 IAD84954_1_A,F,5,AMPL7153458217,CTCTGAATGTGTTTCTAGGCAGAGT,CTTTAAGTTCTCGTGCCTTCCTTCT,ATP8B1,hg19,chr18,55368201,55368226,55368377,55368402 IAD84954_1_A,F,6,AMPL7154599243,AACACATGATTAAAGTCCTGTGAACTCA,CAAGATTGTAGTTGTCATTGTCTAATGCA,AGL,hg19,chr1,100381770,100381798,100381995,100382024 IAD84954_1_A,F,7,AMPL7153458231,TGGAGTGCCCAATAATTTTTCTATTCCA,GGTGAGCTAGTGAATTGATTTTTCCC,ATP8B1,hg19,chr18,55361687,55361715,55361935,55361961 IAD84954_1_A,F,8,AMPL7154599247,CCGGAGACTACTGCAAAGACTAT,GGCATACAGAAATCAATTCTAAGAAACTGT,AGL,hg19,chr1,100382217,100382240,100382355,100382385 IAD84954_1_A,F,9,AMPL7153458240,CTGTTGGGAAACGCTTTGGTTT,ACCTGGCGAAATATTAACTATGTTCTTAGG,ATP8B1,hg19,chr18,55317536,55317558,55317770,55317800 IAD84954_1_A,F,10,AMPL7154599677,CATTGATGGCAGCCACAATAGG,GCTATTGTGCTATTTGAAGCAAAATCATTC,HADHA,hg19,chr2,26457111,26457133,26457355,26457385 IAD84954_1_A,F,11,AMPL7153458252,TCTAATGCCTGAGATGCCAGAGA,GCCTTTGAAGAAAAGTTCATGTCATTTGTT,ATP8B1,hg19,chr18,55351236,55351259,55351476,55351506 IAD84954_1_A,F,12,AMPL7154599807,GGAATAATTCAGTATAACTGAGTCGAGCAA,GTCTTCTTTTCATTTTCAACTTCCATCCAA,GBE1,hg19,chr3,81584156,81584186,81584391,81584421 IAD84954_1_A,F,13,AMPL7153458256,GCCATGACCCACATGAGGATTT,CCTTTTAAGCAGGTAGTTCCAATTTGC,ATP8B1,hg19,chr18,55398801,55398823,55399046,55399073 IAD84954_1_A,F,14,AMPL7154599814,AACACAAATTGCATATGTGTTTAACTCACA,TTTACTCCAGTTATTGATCGTGGAATACAG,GBE1,hg19,chr3,81627041,81627071,81627139,81627169 IAD84954_1_A,F,15,AMPL7153458478,CAAAGTCCCAAAGGAAGCCAGTA,CCGGATGGCAGGAGAAGTG,CYP7B1,hg19,chr8,65710877,65710900,65711129,65711148 IAD84954_1_A,F,16,AMPL7154599816,CTACTGCATTTTGAAACTGGAGTTTCTC,GCGCTACCTTGAAAAGTGCATTG,GBE1,hg19,chr3,81630087,81630115,81630338,81630361 IAD84954_1_A,F,17,AMPL7153458521,ACAGCAGAGGAATGAATAGGAGAGA,TTCTCAGGATGGTAAAACCCTCTCT,AKR1D1,hg19,chr7,137801243,137801268,137801492,137801517 IAD84954_1_A,F,18,AMPL7154599826,CTTTCTATGCTATCACTATTACAGGGCAA,CTTCCCATGAAGGAAAAGTAGCTTCTTATA,GBE1,hg19,chr3,81697836,81697865,81698048,81698078 IAD84954_1_A,F,19,AMPL7153458534,CACAGTCACCCTTATAAACATTCATTCTTG,GCTGAGGCTTCTTTGTGTCATGTAAA,AKR1D1,hg19,chr7,137789977,137790007,137790221,137790247 IAD84954_1_A,F,20,AMPL7154599828,ACTTCTATATGTTACTGGCTACAGAAGACA,CGTGAAGGTGATAATGTGAATTATGATTGG,GBE1,hg19,chr3,81698756,81698786,81698976,81699006 IAD84954_1_A,F,21,AMPL7153462649,GTCGCCACCATGGTGAAGAT,CGATGCGAGCGATGAGCT,PGM1,hg19,chr1,64059151,64059171,64059373,64059391 IAD84954_1_A,F,22,AMPL7154599832,CTCCAGTAAGAAAAACTCCTTCTGCT,ACATTGGAGAAAATGAAGGTGGTATTGAT,GBE1,hg19,chr3,81754601,81754627,81754706,81754735 IAD84954_1_A,F,23,AMPL7153507289,CTGAGATCCTTGGTCATGGAGTT,TCACTGAAGCAGGTATAGTTCTCCA,ABCD3,hg19,chr1,94982445,94982468,94982692,94982717 IAD84954_1_A,F,24,AMPL7154600066,CCCGTAATGCCGCTCATTGA,CATGGAACCAGGAGAACCGTTT,PGAM2,hg19,chr7,44104850,44104870,44105063,44105085 IAD84954_1_A,G,1,AMPL7153182903,GTGAGCCAGCCATCCACAG,GGCTCCTTGATAACCTACACTGC,GAA,hg19,chr17,78091448,78091467,78091663,78091686 IAD84954_1_A,G,2,AMPL7153266918,CTCCAGCACCATACCTGGAA,CCATGTCCCTTGCTCTGGTT,POLG1,hg19,chr15,89871902,89871922,89872068,89872088 IAD84954_1_A,G,3,AMPL7153183029,CAGCACCCAAGTGCTTCCT,CTAGGTCACTCACTCCAGGAAGA,GAA,hg19,chr17,78086977,78086996,78087155,78087178 IAD84954_1_A,G,4,AMPL7153267072,ATGGATCAAGAGTATGTGTATGTTCTTGTC,CTGGTCACACCTACCCACTCTA,C10orf2,hg19,chr10,102750553,102750583,102750803,102750825 IAD84954_1_A,G,5,AMPL7153183248,GGAGGAAGCTCCCTGGAAAC,CCTTGTAGGACAGGCTGTGAG,GAA,hg19,chr17,78085743,78085763,78085933,78085954 IAD84954_1_A,G,6,AMPL7153267111,TCTCTTCAGAAGGTCACGGGAA,CGTTAGAGGCGCTCTCCA,HADHA,hg19,chr2,26467230,26467252,26467486,26467504 IAD84954_1_A,G,7,AMPL7153183493,GCTGTACACACGCATGATGTCA,CTGGAGGCCTCTGCTTTCTAAC,GAA,hg19,chr17,78083628,78083650,78083880,78083902 IAD84954_1_A,G,8,AMPL7153267112,TAAGGTCTGACTCTGAGATGTGCT,GCATAAACATATGGCTTGACTTTTCTCATT,HADHA,hg19,chr2,26453027,26453051,26453252,26453282 IAD84954_1_A,G,9,AMPL7153183682,CCTGCAGGATACCCGTTCATG,AGTCCATGTAGTCCAGGTCGTT,GAA,hg19,chr17,78082281,78082302,78082507,78082529 IAD84954_1_A,G,10,AMPL7153267113,CGTTACTCTGATAAATCTAGACACCACTCT,GTCTCCTTCAACGAAGTCCTCT,HADHA,hg19,chr2,26414024,26414054,26414276,26414298 IAD84954_1_A,G,11,AMPL7153183722,CAGAGCCCTCCAAGTGAAGAA,TACCCACAACGTCCAGGTACT,GAA,hg19,chr17,78082033,78082054,78082190,78082211 IAD84954_1_A,G,12,AMPL7153267252,GGCTCCTGGTTTGCTTCTCATT,CTGCCATCTTCTTACACTGCCTA,PFKM,hg19,chr12,48527071,48527093,48527281,48527304 IAD84954_1_A,G,13,AMPL7153184014,GCGGGTTGTTCTCTGGAGA,CTCCCTGCCGTGTGAGAAAT,GAA,hg19,chr17,78079484,78079503,78079738,78079758 IAD84954_1_A,G,14,AMPL7153267256,TTCTTCCTATAAACCTTTGGTAGAAGTTGA,GGTGTGAGCTGACCATGATCAG,PFKM,hg19,chr12,48539270,48539300,48539520,48539542 IAD84954_1_A,G,15,AMPL7153184192,CTGAAGGATCTGCACCTGTGTT,TGCTGGGATTTTGTCCTGATTAGG,G6PC,hg19,chr17,41061271,41061293,41061490,41061514 IAD84954_1_A,G,16,AMPL7153267257,CATGAGTGTAGCTGGTCCATGT,CCGTATTTACACTAGAAAGCCTCACA,PFKM,hg19,chr12,48501063,48501085,48501308,48501334 IAD84954_1_A,G,17,AMPL7153184236,CTTCTCAGGCTACACTCTTCTTGAA,CCCTCAAGGTCAGTTTCATCCA,G6PC,hg19,chr17,41055859,41055884,41056111,41056133 IAD84954_1_A,G,18,AMPL7153267543,TGTGCCTTGGTTTATGCTGATCA,CAACCCACTGTCATTCCTCCAA,TRMU,hg19,chr22,46742242,46742265,46742494,46742516 IAD84954_1_A,G,19,AMPL7153184932,AAATAGTACTTAAAGGACGCCAACTTAAAG,GGGTTTTCCGATATTAGCTGATAGAATCAA,AGL,hg19,chr1,100377905,100377935,100378145,100378175 IAD84954_1_A,G,20,AMPL7153267549,TTTTTGAGGAATGTTTCACACTTGGA,CCAAATTACTTACCAAGATTATCCACAGCA,TRMU,hg19,chr22,46739107,46739133,46739248,46739278 IAD84954_1_A,G,21,AMPL7153185121,CTTCTTTTGTTTCTATTGACAACAAGCGA,GTAAAGAAGACACCAGATGACCCTAAA,AGL,hg19,chr1,100353466,100353495,100353703,100353730 IAD84954_1_A,G,22,AMPL7153267551,CCTACCCTGGAAGCAAAGTGTG,CTGCAGATACTGGAAAACAAACATGT,TRMU,hg19,chr22,46747895,46747917,46748143,46748169 IAD84954_1_A,G,23,AMPL7153185244,ATAGCACTTTGCATTTGAAAGAAAGCA,TGGACAAAGGTAAAATTTAGCATGGATACA,AGL,hg19,chr1,100346575,100346602,100346816,100346846 IAD84954_1_A,G,24,AMPL7153267603,AGTTAAAAATTTGAGGCCTCTAGGCTT,TGGTCTGCGATGGATTCACATC,SERAC1,hg19,chr6,158541386,158541413,158541637,158541659 IAD84954_1_A,H,1,AMPL7153507291,ATCCCAGAACTTTGTGTATCTTTCTCTC,AGTGTCACTAGACTTTTTGGAGTCAATTTA,ABCD3,hg19,chr1,94945979,94946007,94946222,94946252 IAD84954_1_A,H,2,AMPL7154600270,GTAGAAGGCCGTCACCAAGCAA,TTTTGTTCCTGCGATGATGCTTTTT,JAG1,hg19,chr20,10620533,10620555,10620648,10620673 IAD84954_1_A,H,3,AMPL7153507293,GCTGTTTATGTTGACTTAGATGAAACATGG,TACCCAGCCTCAGGTATTTTATTAAAGAAC,ABCD3,hg19,chr1,94930238,94930268,94930468,94930498 IAD84954_1_A,H,4,AMPL7154600696,ATTCCCGGATGAGGGAGTCTTA,TGTGATCTGATCCCAAGCCTATCT,JAG1,hg19,chr20,10627564,10627586,10627756,10627780 IAD84954_1_A,H,5,AMPL7153507301,CCTCTATAGGTTTGATCATGTTCCTTTAGC,GAGACTAAGTCGAGCCTTAAAGTTACTTT,ABCD3,hg19,chr1,94956731,94956761,94956878,94956907 IAD84954_1_A,H,6,AMPL7154600703,CTTTAAATCCCTCTCGCAAGGGAT,GCGACGAGTGTGACACATACTT,JAG1,hg19,chr20,10653261,10653285,10653511,10653533 IAD84954_1_A,H,7,AMPL7153507304,GTTTGTTTCGGCTTACTAATTTTAGGTCTG,AGATTTGGACATAGTTTACACTAGGTAGGA,ABCD3,hg19,chr1,94972027,94972057,94972235,94972265 IAD84954_1_A,H,8,AMPL7154630862,CCAGGAAGCCAGTACAGATCTTTG,CTCTGGACAAATCTGTATAGTGTTGTCTTT,DGUOK,hg19,chr2,74173988,74174012,74174156,74174186 IAD84954_1_A,H,9,AMPL7153507305,GGGCCAAAGTACAAAGTGGG,AGCCAGCGAGGAGTTTCG,ABCD3,hg19,chr1,94883850,94883870,94884064,94884082 IAD84954_1_A,H,10,AMPL7154631055,AAGAACCGCTTTGATGGAGATGTA,CTATCAGGCTCATTTCAGTGACCA,C10orf2,hg19,chr10,102753031,102753055,102753281,102753305 IAD84954_1_A,H,11,AMPL7153507307,TAAGGATTACTACCAAAGTGGAAGAATGC,CCTGGGCTAGGAAATGTTGACC,ABCD3,hg19,chr1,94953444,94953473,94953628,94953650 IAD84954_1_A,H,12,AMPL7154631059,AGTATGCCCTGGATTTGTGTTCC,GGATATGTCTGGGAAAGCAAGGT,C10orf2,hg19,chr10,102749437,102749460,102749663,102749686 IAD84954_1_A,H,13,AMPL7153507308,ACGGGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATA,AAGGTCTGAAACCAAACAGGTAAGAT,ABCD3,hg19,chr1,94952980,94953009,94953228,94953254 IAD84954_1_A,H,14,AMPL7154631062,TGCGTGGGATATCCCTAGAGTT,AGTTACAGGCAACACTGGCATAT,C10orf2,hg19,chr10,102747875,102747897,102748112,102748135 IAD84954_1_A,H,15,AMPL7153507309,GCACAATGGTCTCACAACAGGA,GCAATTGTAAGCTGAAAAAGAAAGACTACT,ABCD3,hg19,chr1,94955346,94955368,94955582,94955612 IAD84954_1_A,H,16,AMPL7154631064,CCTTCAGCCTCTTCATTGACAAGA,GAGTGTGTCATCTGTAACCTTGGT,C10orf2,hg19,chr10,102748263,102748287,102748513,102748537 IAD84954_1_A,H,17,AMPL7153507311,TGAAGTAAGTACAAGTTGGCCTCAAA,AGGTCTCTGACAGTAGTAGAGCAAA,ABCD3,hg19,chr1,94964232,94964258,94964481,94964506 IAD84954_1_A,H,18,AMPL7154673049,TCCGCCTCATCTCTCTCAATATGAA,GGAATGCCAGGAAAATAAAACTTCTGTG,SMPD1,hg19,chr11,6414484,6414509,6414690,6414718 IAD84954_1_A,H,19,AMPL7153507312,ACATAGTGGGACCTCTACATGTTGA,TCTTACAGGCCATCAAGCTATTCAC,ABCD3,hg19,chr1,94943683,94943708,94943931,94943956 IAD84954_1_A,H,20,AMPL7154673051,CTCTGCCTCTGATTTCTCACCAT,GGCACAGTAGGCAAAGAGATGT,SMPD1,hg19,chr11,6412573,6412596,6412824,6412846 IAD84954_1_A,H,21,AMPL7153507314,AGAAGTTTCCAAGAGTAATTTTAGAGCTTTACA,AAAGATTTTAATAAGATGCAAATTTCCCGTGT,ABCD3,hg19,chr1,94939224,94939257,94939420,94939452 IAD84954_1_A,H,22,AMPL7154673053,CTGTCAGCCGCATCCTCTT,GTCTGGTGCCAGACATCATGT,SMPD1,hg19,chr11,6412891,6412910,6413143,6413164 IAD84954_1_A,H,23,AMPL7153508038,GAGATGAATGTATGGGTATGGCTTCA,TGGTGGTCTGTTTGGTTCTCTG,LIPA,hg19,chr10,91007202,91007228,91007361,91007383 IAD84954_1_A,H,24,AMPL7154673057,CGTGTGTACCAAATAGATGGAAACTACTC,AGAAGGTCTGGAAAAGTTGCATGT,SMPD1,hg19,chr11,6415433,6415462,6415634,6415658 IAD84954_1_A,I,1,AMPL7153185314,CTCTCCAAGGAGTTTCTTTGTATGGATT,ACCTTGCCATGAACTATTCTTTCCC,AGL,hg19,chr1,100341962,100341990,100342182,100342207 IAD84954_1_A,I,2,AMPL7153267604,TTAAGTGGTGGGATCAGTGATTAAATCC,GATATAGGTAGAGACTTACACTGTTGCCTA,SERAC1,hg19,chr6,158576199,158576227,158576440,158576470 IAD84954_1_A,I,3,AMPL7153187887,TCTGGTTCTCCTTTCTTCCCAGT,CACAAATGCTGGGCCATACATG,PHKG2,hg19,chr16,30762752,30762775,30762969,30762991 IAD84954_1_A,I,4,AMPL7153267610,CACCATACCTGGCCTGATTAATTTTC,AATTTTATAATCATTTTAGGTATTGCCTGGCAG,SERAC1,hg19,chr6,158569761,158569787,158569972,158570005 IAD84954_1_A,I,5,AMPL7153188445,TCATATTGAAAGCCCTGCTGTCTAC,CAGTGCAAGAGGAAAGGATTCACT,PHKB,hg19,chr16,47727216,47727241,47727466,47727490 IAD84954_1_A,I,6,AMPL7153267618,CATTGGAAAGGGTGGACACTCA,GCAAATATTGGCTTTGAGTCTTTGGATATT,SERAC1,hg19,chr6,158564034,158564056,158564273,158564303 IAD84954_1_A,I,7,AMPL7153188653,CTGTTATGTTTGGAAGAACTCCTGGAA,CAAAAGACATATTTAACCTTCAGAGTGCAA,PHKB,hg19,chr16,47698719,47698746,47698938,47698968 IAD84954_1_A,I,8,AMPL7153267620,GGCCACAGTGGCTGAAAATAAC,TGGTCCTGTAGACTAAAGTTCTTAACTCT,SERAC1,hg19,chr6,158537156,158537178,158537382,158537411 IAD84954_1_A,I,9,AMPL7153188731,CCCTCAGTTACATAGTAAAGTGTTTCTTCT,TTCAAGGCTAGAGAGGTCCTCTT,PHKB,hg19,chr16,47695510,47695540,47695740,47695763 IAD84954_1_A,I,10,AMPL7153267622,AAGAAACAGAACACCAAGTTTCTTGC,CGGCCTCTTTCAGTATTGTCAAGG,SERAC1,hg19,chr6,158532335,158532361,158532584,158532608 IAD84954_1_A,I,11,AMPL7153188969,GAGACTTACAGCACTGCACCTT,CACAGATACCTGGGAGTACTCAATATAGTA,PHKB,hg19,chr16,47682938,47682960,47683178,47683208 IAD84954_1_A,I,12,AMPL7153267732,TGGCTTAGGTGTGAGAGTCCAA,CCAGGAGATGTCCTGACAACAC,MPV17,hg19,chr2,27535766,27535788,27535993,27536015 IAD84954_1_A,I,13,AMPL7153188994,CATGTTCCCTTTTATCCTCCTCCTT,ACTGTGTGACTTGTCTGTAAACTAAGTC,PHKB,hg19,chr16,47675421,47675446,47675662,47675690 IAD84954_1_A,I,14,AMPL7153267736,TTTATCCCTGTAAAACCTGTCTTCTTCC,ATCAGGTGAGCAGGAGAACAGAGT,MPV17,hg19,chr2,27535281,27535309,27535527,27535551 IAD84954_1_A,I,15,AMPL7153189042,GAGGATGTTTCATGTACACTGAGAAAAATG,GCTTAAATGTCTCTGGACGAGTCTAA,PHKB,hg19,chr16,47644608,47644638,47644856,47644882 IAD84954_1_A,I,16,AMPL7153267743,GGGTCTAAGGTAGCTCAAGGTTG,ACCTTTTTCTTGTGTGCAGAAGTTG,MPV17,hg19,chr2,27534669,27534692,27534896,27534921 IAD84954_1_A,I,17,AMPL7153189364,TTTGCTCGTGAATATTCATCAGATAATGG,GCATGAGCTTCTACATAAATTTTGGACATT,PHKB,hg19,chr16,47614120,47614149,47614364,47614394 IAD84954_1_A,I,18,AMPL7153267899,GTTTAGTAGCAGCCTTCTCCTTCA,TGGGCTACTTTACTCACTGAGAGTAAAT,DGUOK,hg19,chr2,74165968,74165992,74166213,74166241 IAD84954_1_A,I,19,AMPL7153189452,AACCTTTTAATGTTTCTGTTTGTTGCAGA,GACTTTTTCATTCAACAACCAACATCTACT,PHKB,hg19,chr16,47549404,47549433,47549638,47549668 IAD84954_1_A,I,20,AMPL7153267901,AGACTGCATTGTAGCAGCCAAA,TGAACTTGTTTTTAACAACTGGCTGTT,DGUOK,hg19,chr2,74184190,74184212,74184413,74184440 IAD84954_1_A,I,21,AMPL7153189480,TGCCTTAGCTTTGTTCATTAAAAAGTTTCA,GGGATCACTGTTCTATGCTATATAATATAAGGA,PHKB,hg19,chr16,47545468,47545498,47545709,47545742 IAD84954_1_A,I,22,AMPL7153267902,ACTTCCTGTCTGACGATCTCCT,CCAATGTTGCCTTCGATGGAGA,DGUOK,hg19,chr2,74153925,74153947,74154158,74154180 IAD84954_1_A,I,23,AMPL7153189509,GAAGATTAAAACATTTAGCCCAAGGAAAGT,CTTGGTCCTACAAAACCCTATTATCCAC,PHKB,hg19,chr16,47533594,47533624,47533840,47533868 IAD84954_1_A,I,24,AMPL7153267903,CCCACATTTCTTCTCCATGCCTA,GAAAGGTGGTTGGGAGACACAA,DGUOK,hg19,chr2,74185697,74185720,74185924,74185946 IAD84954_1_A,J,1,AMPL7153508041,CATTCCCACCTCTCCCATATCATTC,TGAAATGCTGAGATGTTCTTGGGT,LIPA,hg19,chr10,90983354,90983379,90983604,90983628 IAD84954_1_A,J,2,AMPL7154673059,TGTCTGACTCTCGGGTTCTCT,GGTGAATAGACCTTTGCAGATTGG,SMPD1,hg19,chr11,6411974,6411995,6412101,6412125 IAD84954_1_A,J,3,AMPL7153508045,CTGTTTGGCATTTAAAAATAAATGGAATTTGAA,TGTACTATTTCAATGAAAGAGTTCCTTTCT,LIPA,hg19,chr10,90986529,90986562,90986771,90986801 IAD84954_1_A,J,4,AMPL7154673149,CCTGAGGACATCCACAGGGAATA,TGCCACATACTGTGACTCCTTTG,GBA,hg19,chr1,155209553,155209576,155209787,155209810 IAD84954_1_A,J,5,AMPL7153508046,ATACCTGAAAGCCCAGAATTCATCC,GCTACTGCCTCCTAAACAATGAATGTTT,LIPA,hg19,chr10,90987953,90987978,90988160,90988188 IAD84954_1_A,J,6,AMPL7154673162,GCCAGAAAGTCCAGGTACCAAT,CTAGAAGTTCCAGAAGCCTGTGT,GBA,hg19,chr1,155206190,155206212,155206294,155206317 IAD84954_1_A,J,7,AMPL7153508048,CAAACACTAGTCAACTCCTGCAAAC,GCTAGCTCCAGCAACCTATGAT,LIPA,hg19,chr10,90975568,90975593,90975820,90975842 IAD84954_1_A,J,8,AMPL7154673192,AGTGAACTGGGCATCTTCAAAGT,TCACCAACTTGGTGTTCCATGAG,LIPA,hg19,chr10,90974433,90974456,90974683,90974706 IAD84954_1_A,J,9,AMPL7153557527,CTTGTTAGGAGACACTTAATGTCAGGT,GATACTATCCTAAAAGTGACTGCAGCAA,TJP2,hg19,chr9,71853511,71853538,71853756,71853784 IAD84954_1_A,J,10,AMPL7154725790,CTTTTTCTTGGTTTGCCACAGTGTATT,GCAAGTCAGGAATTATTTGATTTTGCTCTT,OTC,hg19,chrX,38260507,38260534,38260706,38260736 IAD84954_1_A,J,11,AMPL7153557528,GCGTTTTCTGGCTTTAGAGATTTACTTC,AGCCCAGTCAGTTCATTTCCAG,TJP2,hg19,chr9,71851820,71851848,71852072,71852094 IAD84954_1_A,J,12,AMPL7154727839,AATCTCCAGCCTCAACAGAGATAAATG,GCCTGTCCCTTTGGTAGATGAC,PHKA2,hg19,chrX,18912265,18912292,18912517,18912539 IAD84954_1_A,J,13,AMPL7153557541,AGACACTGAGCCCTTTAGAAAGC,AAAAACCAAAATGCTATTAAGGCAAGCT,TJP2,hg19,chr9,71833051,71833074,71833296,71833324 IAD84954_1_A,J,14,AMPL7154727841,ACACAGGACTCCTCAGCTCTATC,GATGACCTACCTAACAAGAGCAGT,PHKA2,hg19,chrX,18911404,18911427,18911654,18911678 IAD84954_1_A,J,15,AMPL7153557542,GGTATAGAAAGTGTGAGCTGGACTT,AAAAAGCCAAAACTGTGTGTAGGT,TJP2,hg19,chr9,71827351,71827376,71827590,71827614 IAD84954_1_A,J,16,AMPL7154789586,CGTTGGTCATCCAGCATGAGTA,CCGGATCATTCATGACCTTTCTCTT,GBA,hg19,chr1,155207160,155207182,155207374,155207399 IAD84954_1_A,J,17,AMPL7153557551,CTTGTACATGTCATTGTGAATGTACACAC,GTGAGCACACACTTCTGAACAC,TJP2,hg19,chr9,71842811,71842840,71843063,71843085 IAD84954_1_A,J,18,AMPL7154859495,CGGAGGCATAAGTGATGCCATT,CTTTCACAGGCTTTCCTTGATCCT,ATP7B,hg19,chr13,52539088,52539110,52539203,52539227 IAD84954_1_A,J,19,AMPL7153557552,CTCATTTGCTAATGTTGTTCTCCCTTTT,AGTGCACTCCTTACAAGTAACTTCTAGA,TJP2,hg19,chr9,71844924,71844952,71845170,71845198 IAD84954_1_A,J,20,AMPL7154872784,TTCCTAGGAACGTCTGGTCCTAA,GGTCAAGAGCTTCTTCATGATGGA,GALT,hg19,chr9,34648752,34648775,34649002,34649026 IAD84954_1_A,J,21,AMPL7153604425,AGGGATGAGGGTATAATGTGGGT,GCTTCCTGTTTCTATGGCCCTTT,ALAD,hg19,chr9,116151808,116151831,116152055,116152078 IAD84954_1_A,J,22,AMPL7154875117,CCACTTCCCAAAGTCAACACCA,GAGAACTCCTTCCCTTTATTAGAAGCC,ALDOB,hg19,chr9,104189860,104189882,104189979,104190006 IAD84954_1_A,J,23,AMPL7153604428,CAAGCTCTCAGGACGTCGTT,CCACATCCACCCTCCATTTCAG,ALAD,hg19,chr9,116151167,116151187,116151413,116151435 IAD84954_1_A,J,24,AMPL7154875200,GTTCTCTGTGGGAAGATGACGA,GACAGTTCCATCAACCAGAGCAT,ALDOB,hg19,chr9,104191892,104191914,104192139,104192162 IAD84954_1_A,K,1,AMPL7153189604,TGGTTCTTGCAAGCATGGTCAT,CTTTACCCAGAGCTGTAGGAAATGG,PYGL,hg19,chr14,51401741,51401763,51401965,51401990 IAD84954_1_A,K,2,AMPL7153268343,TGTCCTATTTCACAAGGCACTGTAAG,AGCACGTCCTATACTCTCCTGT,SCO1,hg19,chr17,10595095,10595121,10595347,10595369 IAD84954_1_A,K,3,AMPL7153189652,AATACTATACAAAACGCTGGCTATACGAG,AAGTGCTAGGTTCATATTTCCTGACAAAT,PYGL,hg19,chr14,51390646,51390675,51390849,51390878 IAD84954_1_A,K,4,AMPL7153268350,GCTCCTATGCGAGACAGTTTCC,CAGCATACATTCAGTAAAATAAGCAGCT,SCO1,hg19,chr17,10584370,10584392,10584614,10584642 IAD84954_1_A,K,5,AMPL7153189683,GCTTGTTCTGCACATGGAAAAACA,AGAGCCAGTGAGATCAAGAGGT,PYGL,hg19,chr14,51387143,51387167,51387395,51387417 IAD84954_1_A,K,6,AMPL7153303021,GACATGGTGAGGAATAAAAGAGCATTG,TGGTCAGTGAGTTGTGGTTGTT,ATP7B,hg19,chr13,52518183,52518210,52518435,52518457 IAD84954_1_A,K,7,AMPL7153189725,CTTTGAAAAACTAAAAAGGGAGTTTTTGGC,AGTGCTTTCTCCAGATGTGTTAGG,PYGL,hg19,chr14,51383270,51383300,51383512,51383536 IAD84954_1_A,K,8,AMPL7153303030,AACTGTCTGATTTCCCAGAACTCTTC,GCTGAGCAAGTGACAGTTGTCT,ATP7B,hg19,chr13,52524063,52524089,52524312,52524334 IAD84954_1_A,K,9,AMPL7153189775,CATCATTCCATTAATGGATCAGTGTCAGA,CCAATGTTGCATTAAACCTGAGTGA,PYGL,hg19,chr14,51381998,51382027,51382247,51382272 IAD84954_1_A,K,10,AMPL7153339067,CTGCTTTTCCTGGTCCTTGGTA,CCTTAGGGCTGGACAGGATGT,GALE,hg19,chr1,24122406,24122428,24122640,24122661 IAD84954_1_A,K,11,AMPL7153189819,CAAAAACTACAGGATAAACTCTCACAGTGA,GCCCATTTGGACTTGATTACCATC,PYGL,hg19,chr14,51379682,51379712,51379884,51379908 IAD84954_1_A,K,12,AMPL7153384534,GGATCTTCCACACCCTCTGGTA,GGTGTTCTGGCATTTGTGCCTA,PHKA2,hg19,chrX,18915289,18915311,18915538,18915560 IAD84954_1_A,K,13,AMPL7153189875,ATTGACAGAAGGCAGCCATGAT,GTGGAAGCAGCAGACTCAGCAT,PYGL,hg19,chr14,51378613,51378635,51378815,51378837 IAD84954_1_A,K,14,AMPL7153384768,GCTGATTAATTTCCCAAGAAACTCTGAAC,AGTTGCTTGGTTCAATTCCTATTGATTAAA,ATP8B1,hg19,chr18,55362370,55362399,55362614,55362644 IAD84954_1_A,K,15,AMPL7153189989,GAGTTGGTTGGTTTAAGATTTTCTTGTCC,GTGTTGTTAATCACACAACACAATAACAG,PYGL,hg19,chr14,51375466,51375495,51375710,51375739 IAD84954_1_A,K,16,AMPL7153385047,CTTACGTCGCTGTAAGCTCACA,CAGGATCACACTCTCAGCTTCT,GBA,hg19,chr1,155204663,155204685,155204907,155204929 IAD84954_1_A,K,17,AMPL7153190305,TGTGTGTCTAGATATCTCTGCCACTT,GGGCAGTCAGCTTCTATACTGG,PFKM,hg19,chr12,48538744,48538770,48538956,48538978 IAD84954_1_A,K,18,AMPL7153385761,CCCACACATATCATTCATTTGCTCA,GATTTCTTTCTTGCTCTAGAAATCAACTGA,FBP1,hg19,chr9,97372136,97372161,97372332,97372362 IAD84954_1_A,K,19,AMPL7153190349,TCAGGCCCAGGATTGTAAACAAC,TGTCCCAACAATGGCCATTCTA,PFKM,hg19,chr12,48537405,48537428,48537657,48537679 IAD84954_1_A,K,20,AMPL7153386113,GGCGCAGAAATGGAAAGTGAAA,ACCATTGCCAAGCACTACAGTT,SLC37A4,hg19,chr11,118895502,118895524,118895732,118895754 IAD84954_1_A,K,21,AMPL7153190434,GTGCCTCTAACTCTAGCTTTTCTCC,GTAAGCCTAAGAAGAAGAGAGCACA,PFKM,hg19,chr12,48535428,48535453,48535677,48535702 IAD84954_1_A,K,22,AMPL7153386393,GATACAGCTTGGGCTCTGTGTT,AGGGCATTGCCAAGGACTAAAA,GALE,hg19,chr1,24124513,24124535,24124756,24124778 IAD84954_1_A,K,23,AMPL7153190452,TGCTGGGTTTCTGTCCTCATTTT,AGGTCATTCTTGCTACACTTATCTTCC,PFKM,hg19,chr12,48534461,48534484,48534691,48534718 IAD84954_1_A,K,24,AMPL7153388599,AGGATGGTTTATTAACCTTTGGTTCTCAT,CATACCCATCTTTTCACATCTCCAAAAG,AKR1D1,hg19,chr7,137792092,137792121,137792338,137792366 IAD84954_1_A,L,1,AMPL7153625165,CTGCTCCTCCGTTGTATCACTAT,CATGACTTAATATCACTACATGGCTGTGT,GYS2,hg19,chr12,21728763,21728786,21729005,21729034 IAD84954_1_A,L,2,AMPL7154875719,CTATAAAGGTCTCATATGATGAGTGGAACA,GAACTAAGCAAACTCTAGCACATCATTTTT,AGL,hg19,chr1,100379089,100379119,100379323,100379353 IAD84954_1_A,L,3,AMPL7153767733,TTACAAATGTGAAAATACACCTTGGGTAGA,CTTCCTATAAGGTTTCGTGTTTCTCTCAAT,AGL,hg19,chr1,100349503,100349533,100349710,100349740 IAD84954_1_A,L,4,AMPL7154877247,GGCTGGTACAAGAAGGGTCATA,AAAGCACTAACCCAAAGAGACCTTTA,ATP7B,hg19,chr13,52548434,52548456,52548647,52548673 IAD84954_1_A,L,5,AMPL7153767751,AACCATTGAAAGCAATCTCTTTTCTGAAC,GCTAGGAAGGAACACTGAATTTCTTTTCTT,AGL,hg19,chr1,100343166,100343195,100343410,100343440 IAD84954_1_A,L,6,AMPL7154877249,GCTGAGTGAGACTTTGACTCTCA,ACTGTGAAATATGTGCCATCGGTT,ATP7B,hg19,chr13,52548819,52548842,52549037,52549061 IAD84954_1_A,L,7,AMPL7153773218,CGCCTACCACAATCTGTTTGGA,TCAGTTTTCGTGCAAACAACTTGG,C10orf2,hg19,chr10,102748693,102748715,102748919,102748943 IAD84954_1_A,L,8,AMPL7154877251,GCTGATGATGCCTTTCAAATTGGA,CTGGGATGTTGTAGAAAATATTTGGTTTCA,ATP7B,hg19,chr13,52549092,52549116,52549336,52549366 IAD84954_1_A,L,9,AMPL7153773219,CCTGAACGGAGGCTTCAATCTT,CTTGCTTTTGTCACCTGATCTTCTG,C10orf2,hg19,chr10,102749002,102749024,102749247,102749272 IAD84954_1_A,L,10,AMPL7154877256,CTAGCTTTTTAGAAAGGACCAGAGTGA,CCTGGTCCTGGCACTGATTTAT,ATP7B,hg19,chr13,52511188,52511215,52511439,52511461 IAD84954_1_A,L,11,AMPL7153786718,GGAGGCGGAGTAGTGTCTGA,GAGTCTTGCTGAGGCAGTTCT,SCO1,hg19,chr17,10600451,10600471,10600691,10600712 IAD84954_1_A,L,12,AMPL7154877259,GGGCAATGAACACAAAGAGCATG,TGAACTCTCCTCCCTACTTGCT,ATP7B,hg19,chr13,52532476,52532499,52532708,52532730 IAD84954_1_A,L,13,AMPL7153787553,TGCTCTCTAGGAATGTAAGGTGCA,CATGGCCTACGTCATGGAGAAG,FBP1,hg19,chr9,97365562,97365586,97365806,97365828 IAD84954_1_A,L,14,AMPL7154877260,AGGGCAGGATGACTGGACATAT,AAGTGGTCTCTGCTCCTGAATG,ATP7B,hg19,chr13,52508751,52508773,52508917,52508939 IAD84954_1_A,L,15,AMPL7153787554,CCTTTCTTCTTCCTAAACTAAATCGCGT,AGAAACTTAGGAGACACCAAGAAAACTC,FBP1,hg19,chr9,97367660,97367688,97367906,97367934 IAD84954_1_A,L,16,AMPL7154877270,TGATGGACGTCTGGAAAGCAAA,TAGAGTTCTGGGAGCTTCCTTATTGA,ATP7B,hg19,chr13,52520551,52520573,52520650,52520676 IAD84954_1_A,L,17,AMPL7153787613,TAGCTCCAGGTTCTACTGTAGAACTC,GGGCAGAAGCAAATTTAGTTAGGGA,LARS,hg19,chr5,145529087,145529113,145529334,145529359 IAD84954_1_A,L,18,AMPL7154877424,GGCACACACCATTGATCTGTGA,CCCACCAGAATGATACATTTCCTACAATTA,ABCB11,hg19,chr2,169801417,169801439,169801660,169801690 IAD84954_1_A,L,19,AMPL7153787621,GGAGACTATGTCCAAGGCTTTTCC,GGTCACATCTACTGTTCTGCCTT,LARS,hg19,chr5,145505907,145505931,145506158,145506181 IAD84954_1_A,L,20,AMPL7154877430,CAAGATTACCTGTCCCACCATCT,AAAAGCGACTGTGTGTCTGAGA,ABCB11,hg19,chr2,169792731,169792754,169792969,169792991 IAD84954_1_A,L,21,AMPL7153787623,TAACGTGTCTTCTATAATCTGAGAACTGGA,GCCAACCTAGTTAATTTTATTTGGCTCATT,LARS,hg19,chr5,145515098,145515128,145515280,145515310 IAD84954_1_A,L,22,AMPL7154877444,TCACTTGCTCTAGATAATTGTCTTTTGGTT,AAAATCTTGCTACTAGATGAAGCCACTT,ABCB11,hg19,chr2,169781007,169781037,169781192,169781220 IAD84954_1_A,L,23,AMPL7153787666,TCCACCAGAGTATCAGGACTACATC,GAAATTAGGTGCAACACAGGCAA,LARS,hg19,chr5,145538844,145538869,145539094,145539117 IAD84954_1_A,L,24,AMPL7154877493,CCTTGAACTTGGGAAGCATCTGT,TCACCCAATTTCTACAGGTAAGAAATGTT,ABCB11,hg19,chr2,169801116,169801139,169801354,169801383 IAD84954_1_A,M,1,AMPL7153190461,AGGATCTAGTCACAATCCCAGAGATG,GCAGCAGAAGCTCATGTTTTGG,PFKM,hg19,chr12,48532958,48532984,48533210,48533232 IAD84954_1_A,M,2,AMPL7153388602,ATGTGTACGAGTGTTTTACAAAGAAAAAGG,CACATAGCTATTGGCTCATGGTTG,AKR1D1,hg19,chr7,137776423,137776453,137776670,137776694 IAD84954_1_A,M,3,AMPL7153190489,AGCTGTCCATGGTTTACCCAAG,GTAAGTCCCTGTCTGGTGAAGTG,PFKM,hg19,chr12,48528986,48529008,48529237,48529260 IAD84954_1_A,M,4,AMPL7153389762,ACTGGCAAGAATCTTCAATAGGTTTCA,TTTAAGTTACTTCAAGAGCTGATCCATGTT,ABCB4,hg19,chr7,87068920,87068947,87069164,87069194 IAD84954_1_A,M,5,AMPL7153190512,AGGACTAGGAGAACTTGTTGGGT,GCTGATGGGTGGGAAAGAGATC,PFKM,hg19,chr12,48528421,48528444,48528664,48528686 IAD84954_1_A,M,6,AMPL7153390562,GGAATTCTGTATCAGAGAAGTTGGAGA,TATCCATCAGATTCTGAAATCAGCTTTGG,OTC,hg19,chrX,38240459,38240486,38240704,38240733 IAD84954_1_A,M,7,AMPL7153190571,TGGCTTGACTCTCAGAGAATCTCT,CCACATGACAGGGAATTTAGGAGA,PFKM,hg19,chr12,48524999,48525023,48525249,48525273 IAD84954_1_A,M,8,AMPL7153400773,CGGCCATACCCTTTTAACTTTTTAAGA,CAGACCACAATTCATCAACATATTCCATTT,SLC25A13,hg19,chr7,95838112,95838139,95838236,95838266 IAD84954_1_A,M,9,AMPL7153190589,GCCAGTCTAATTGCCGTTCCTTTA,CCCGTGAACCTACAGAAGAATAATTCTATT,PFKM,hg19,chr12,48516470,48516494,48516711,48516741 IAD84954_1_A,M,10,AMPL7153401979,GAAGAATAGTTTCTGCATTAGGAGATGAGA,TCTTCCTGACCCACCTTACCAT,SLC25A13,hg19,chr7,95775799,95775829,95776047,95776069 IAD84954_1_A,M,11,AMPL7153190632,CACTGCTCTTCTGACAGCATCA,GGGCTTAGTGGATCCTAAATGCTAATTTAA,GYS2,hg19,chr12,21733303,21733325,21733540,21733570 IAD84954_1_A,M,12,AMPL7153401981,CCAAACCTTTGAGTGTTATTTCACCTAAC,ACCTTCTTCTTTCTTCTGACCTATCTTACT,SLC25A13,hg19,chr7,95813536,95813565,95813780,95813810 IAD84954_1_A,M,13,AMPL7153190703,GAAAATCATACCCATAGAAATGACCTCGAA,TGGTACCCTCTTTGAAAAGAGAATTTTCAT,GYS2,hg19,chr12,21716151,21716181,21716303,21716333 IAD84954_1_A,M,14,AMPL7153401982,CCTGATACCAAAGAGTTAGTTAAGAACACA,ACCAGACTGAGATGGTGTTGTG,SLC25A13,hg19,chr7,95751109,95751139,95751321,95751343 IAD84954_1_A,M,15,AMPL7153190713,GAAAGTTCTCCCTACAAGAGTGTTATACC,CATGTGTACATTTTGTTACTGTTGCTGTAT,GYS2,hg19,chr12,21715803,21715832,21716007,21716037 IAD84954_1_A,M,16,AMPL7153401985,CCCAGAATGCAAGTTTGCTCCT,CCAAACTGAAGGCTATACTGAAATATGAGA,SLC25A13,hg19,chr7,95818574,95818596,95818777,95818807 IAD84954_1_A,M,17,AMPL7153190748,TCTTGTAGATGTAAAAACAACTAAGGAAAGC,GAAATTAGTCACCCTTATTAATTCTTTCCGC,GYS2,hg19,chr12,21711037,21711068,21711278,21711309 IAD84954_1_A,M,18,AMPL7153401986,AAAAAGAAAATGCTCACACAAGTCCA,ATGTTTGTATATGCTTCTGTTTTCCACAAG,SLC25A13,hg19,chr7,95864052,95864078,95864266,95864296 IAD84954_1_A,M,19,AMPL7153190757,AGTTAGGCTCTGTAAAGACCCTGT,TCTTAGGAGGACTAGGGCCTTTTC,GYS2,hg19,chr12,21695348,21695372,21695594,21695618 IAD84954_1_A,M,20,AMPL7153401992,GGACCGAACCATCTTTGTGCATA,TTTCTCCTGAAACATCAGTGATGCATAT,SLC25A13,hg19,chr7,95799389,95799412,95799635,95799663 IAD84954_1_A,M,21,AMPL7153190774,TAGCTTGTGTGCATAGCTACTTCC,TATGTTTCAGAACTAGGAGAATAAGGCCT,GYS2,hg19,chr12,21692097,21692121,21692342,21692371 IAD84954_1_A,M,22,AMPL7153451227,TGGCTAGACAACTGTATTCTGAAAAGC,CTGTAACTTTAGGCAGATGTGAGACT,GBE1,hg19,chr3,81539449,81539476,81539697,81539723 IAD84954_1_A,M,23,AMPL7153191351,TCTCTTCCTCTTGAGAAGAAAAGTACAAA,CCACAGTGATCAGGAGGTGATT,PHKA2,hg19,chrX,18970503,18970532,18970712,18970734 IAD84954_1_A,M,24,AMPL7153451258,TTTCTCCCACAATTATCATGCATCAGT,AGTCCTATCATGCTGTTGTTAACTGATC,GBE1,hg19,chr3,81719874,81719901,81720120,81720148 IAD84954_1_A,N,1,AMPL7153787683,AGACAAAGTGTATCTTTACTGGTTCACTT,TCTGTGTGACCAGTGGTTAGTCT,LARS,hg19,chr5,145523928,145523957,145524178,145524201 IAD84954_1_A,N,2,AMPL7154897764,AGCATGAGAATGGACTAATACAGATTTGTT,GAAATCGTTTTTGACTACCAGGGTTATTTT,PHKB,hg19,chr16,47630222,47630252,47630340,47630370 IAD84954_1_A,N,3,AMPL7153787684,GAAGCCAAAATCAAAACCACTCGA,AAAACCAAGATACTGCAATTTTTCCCTTT,LARS,hg19,chr5,145509533,145509557,145509774,145509803 IAD84954_1_A,N,4,AMPL7154897771,GATGGCATTGAATGTGAATTTCCCAT,TGCTCTTCTTTAAACCACTTAAATCCTACA,PHKB,hg19,chr16,47627417,47627443,47627520,47627550 IAD84954_1_A,N,5,AMPL7153787702,CTCTTGAATTGGGTATTACTATTTGCTCCA,ATTCCAAAGGAGGATGTAAAGAAGAAAACT,LARS,hg19,chr5,145551404,145551434,145551634,145551664 IAD84954_1_A,N,6,AMPL7154898271,AGGCCATTAGAGTATGGCTTGATG,GCCGTTTGACTTTTGAATGTTTGG,PHKB,hg19,chr16,47694355,47694379,47694605,47694629 IAD84954_1_A,N,7,AMPL7153787706,AGAAATACAATGTGCAGAACTTCACAA,GTGCTGAAATACAGAGTGGATTATTCTCTT,LARS,hg19,chr5,145557071,145557098,145557240,145557270 IAD84954_1_A,N,8,AMPL7154898276,CTTGCAAAATTAGGAAGATTCCTTCCATAG,GCCGACTCTGATCTTTTTGAAATTCATT,PHKB,hg19,chr16,47732207,47732237,47732451,47732479 IAD84954_1_A,N,9,AMPL7153787707,AAGCACATACTTGTAAATGCTTTCCTC,GAGTGTTGGTTATTCTTTGATCGAGTTT,LARS,hg19,chr5,145543825,145543852,145544055,145544083 IAD84954_1_A,N,10,AMPL7154898278,CAAGGGCAGGCCTCATTTTTAA,CGCCACGGATCTGAAGTTCATAC,PHKB,hg19,chr16,47722749,47722771,47722972,47722995 IAD84954_1_A,N,11,AMPL7153787715,GGAAAACATGTTAGCTCTTCTTTTTCTCT,TCTCTATGGAGAGGAGAACAAATAGAAACT,LARS,hg19,chr5,145532663,145532692,145532887,145532917 IAD84954_1_A,N,12,AMPL7154898284,ACTAGACTGTGAACCATCATGAATTCC,TTTTGAATCACTCTTGGAGACAAAGGA,PHKB,hg19,chr16,47702922,47702949,47703169,47703196 IAD84954_1_A,N,13,AMPL7153787716,TTCCTTTCTGCTTAGAACTCACCAAAT,GAAAACGTAGCAGAGATTCCTCCT,LARS,hg19,chr5,145499865,145499892,145500115,145500139 IAD84954_1_A,N,14,AMPL7154898297,AGAAGTAAGGTACGTGTGTCTCACT,CCACATGAACTTTGACTCCTCCAAT,PHKB,hg19,chr16,47684551,47684576,47684796,47684821 IAD84954_1_A,N,15,AMPL7153913562,CCCAAACCAAGTGCTTAAGATATCAC,CCATGACAGTACAAATAAATAAGACCCACA,FBP1,hg19,chr9,97380017,97380043,97380248,97380278 IAD84954_1_A,N,16,AMPL7154914101,AGCTAGCCTGTTGTTTCAATACTTCA,AGAAAGGCATCTATTTTTCAATGGTCAGT,ABCB4,hg19,chr7,87031194,87031220,87031438,87031467 IAD84954_1_A,N,17,AMPL7153913564,TGTGTGGGTTCCATCTTACCATTC,GCATTGCACCCAACCAGGAATA,MPI,hg19,chr15,75185422,75185446,75185674,75185696 IAD84954_1_A,N,18,AMPL7154914102,CCCACTGGACAGTGGAAAGATT,GGTATGGATCCACTCTAGTCATATCAAAAG,ABCB4,hg19,chr7,87076205,87076227,87076375,87076405 IAD84954_1_A,N,19,AMPL7153923700,GTCACTAAGAGACGCCTGTGAA,CGTCCACGGCATCTGTAATGAG,JAG1,hg19,chr20,10632918,10632940,10633167,10633189 IAD84954_1_A,N,20,AMPL7154914111,GAAAGGATGTATGTTGGCAGCTTTG,GATCCTCCAAATGGACAATCTAGTAACTTT,ABCB4,hg19,chr7,87035622,87035647,87035866,87035896 IAD84954_1_A,N,21,AMPL7154026731,GCAGGAAGCAGTTTGATGAGCT,AAAAGGGATGGGAAGTGGTGATAG,PFKM,hg19,chr12,48535728,48535750,48535857,48535881 IAD84954_1_A,N,22,AMPL7154914114,CCCGCAAAATGAAACTGCACTT,TGTTTTCGATTTGGTGCATATCTCATTG,ABCB4,hg19,chr7,87041015,87041037,87041242,87041270 IAD84954_1_A,N,23,AMPL7154030949,GTCCAAGAGTAACGCTCTTCCA,ACCCTTTGGTCTCACTTGTGTC,POLG1,hg19,chr15,89873460,89873482,89873617,89873639 IAD84954_1_A,N,24,AMPL7154914115,CAGCTCGCCTAGCTAGACAATC,AAAAACGAAGACAGTGAAAATGATTGGA,ABCB4,hg19,chr7,87101826,87101848,87101948,87101976 IAD84954_1_A,O,1,AMPL7153191366,CCTGGCCCTCAAAACACTGTAT,GGGTAAAAGGGTTTATTTCCTAGTGTGATA,PHKA2,hg19,chrX,18966781,18966803,18967010,18967040 IAD84954_1_A,O,2,AMPL7153451652,GAGGGTTTTAGAGGATTTGCAGGT,ACATAAACTCGCAGTACAACACTTTAGA,AGL,hg19,chr1,100361709,100361733,100361955,100361983 IAD84954_1_A,O,3,AMPL7153191380,CAAAGTATCACCAAGCCAGCAA,AAAAAGGAACACCAGATATTGGAGTGT,PHKA2,hg19,chrX,18961725,18961747,18961969,18961996 IAD84954_1_A,O,4,AMPL7153451662,ATGAGATACTCCTTTGTGTCTCCTTTT,TTTTTCTGTTTTAGTGTGATACTCCTCTGT,AGL,hg19,chr1,100335921,100335948,100336147,100336177 IAD84954_1_A,O,5,AMPL7153191394,AAAATTATAATCAGCAGAGGGAGAACAACA,GACAGCAAAGAACACTTGGTATAAAATTCA,PHKA2,hg19,chrX,18958023,18958053,18958264,18958294 IAD84954_1_A,O,6,AMPL7153451680,CAGCACTTGTGAGGAAGTTCCT,TTCATTCACCTTTCTTTTCCCTTCCT,SMPD1,hg19,chr11,6413200,6413222,6413409,6413435 IAD84954_1_A,O,7,AMPL7153191418,ATAAAGAATACCAACAGGCCAAGCAA,TTTTTCTATGTTGCACCGCTGTTAC,PHKA2,hg19,chrX,18954093,18954119,18954321,18954346 IAD84954_1_A,O,8,AMPL7153452164,GGAGGTGCCTTTATTGCCCAA,GGGCTAAGGACACCTATTCCTT,PGAM2,hg19,chr7,44102333,44102354,44102538,44102560 IAD84954_1_A,O,9,AMPL7153191440,GTTAAATATGAACAGTAAACACGCTCACAA,TTCACAGAAAATAAGCAATTGACTCGAAAA,PHKA2,hg19,chrX,18947314,18947344,18947543,18947573 IAD84954_1_A,O,10,AMPL7153452214,GTTTAAATAAATTCAGCGAACTACCCACA,CCACACACTACCTGTGTCCCTA,PHKA2,hg19,chrX,18938102,18938131,18938339,18938361 IAD84954_1_A,O,11,AMPL7153191462,ATTTTAAACATTTGTAAGAGCCCAAACCA,AGCTGGTGTTTCCAGGTAAAGAA,PHKA2,hg19,chrX,18942428,18942457,18942679,18942702 IAD84954_1_A,O,12,AMPL7153452216,GGAGATTGGAAGTGGAAGAGGAA,AAACTTTCTGGACCATATTTCTGGGTT,PHKA2,hg19,chrX,18925944,18925967,18926191,18926218 IAD84954_1_A,O,13,AMPL7153191508,CTAAACTGAAAGGTCCCTGATATCGAG,AAAAAGTGTTGTTCTTCCTCCTCAGA,PHKA2,hg19,chrX,18928859,18928886,18929107,18929133 IAD84954_1_A,O,14,AMPL7153452220,CCAGACCTGGGAAGGAGAATGA,CAAGAACCGACTAAGGCTGTGA,PHKA2,hg19,chrX,19001900,19001922,19002143,19002165 IAD84954_1_A,O,15,AMPL7153191547,ACACGGAGATAGGGTTTCAGAGA,GATGCGTCTAGCACAGAAAATAAGG,PHKA2,hg19,chrX,18924756,18924779,18925005,18925030 IAD84954_1_A,O,16,AMPL7153452221,ATGCCAAAAAGGCCCAGGTAAT,GTCATGAGCTAACGCTCATTCTGT,PHKA2,hg19,chrX,18944535,18944557,18944719,18944743 IAD84954_1_A,O,17,AMPL7153191561,CCCACAGTGCTGGTTCTAATGT,CGTCCACCTGACCCTACCTTTA,PHKA2,hg19,chrX,18923797,18923819,18924026,18924048 IAD84954_1_A,O,18,AMPL7153452372,CAGGTGTTATTGTGCACTATGCAT,TTCACAAGGCTTGTATTGGTGAGA,PHKG2,hg19,chr16,30771352,30771376,30771598,30771622 IAD84954_1_A,O,19,AMPL7153191577,TCACAGCCTCACTTTCCACATTC,TTAAGAGAGAGGGCAATAGAAGAAGCAC,PHKA2,hg19,chrX,18918715,18918738,18918869,18918897 IAD84954_1_A,O,20,AMPL7153452373,CATGCGGGTCGTCTCAGA,GCGAACTCTCCAGCCTTCAAA,PHKG2,hg19,chr16,30760062,30760080,30760298,30760319 IAD84954_1_A,O,21,AMPL7153191607,GGCTAGACAGCTCAGAGCTACA,TGCATGCATGTGCTTATCCCAT,PHKA2,hg19,chrX,18913119,18913141,18913348,18913370 IAD84954_1_A,O,22,AMPL7153452500,TGTGGACACTCACAGTCTCTCT,GCTCTGATATGCGATTACCATGGA,PHKB,hg19,chr16,47622778,47622800,47623027,47623051 IAD84954_1_A,O,23,AMPL7153191702,GGAACAATCTCCTCGTTCCAGAAG,CCTACTACAACTCCATTAGCAAGGT,PGAM2,hg19,chr7,44104508,44104532,44104712,44104737 IAD84954_1_A,O,24,AMPL7153452503,AACACTGATTGCTTCTAACCTTTACTAAAC,GCCCACCAAAGAAGAAATAAAGACATAATG,PHKB,hg19,chr16,47497761,47497791,47497985,47498015 IAD84954_1_A,P,1,AMPL7154407586,TTGCCCAGGTATTTCATCAGCA,CTACACTCTTCCAAACCTTCACTCA,SERPINA1,hg19,chr14,94847313,94847335,94847511,94847536 IAD84954_1_A,P,2,AMPL7154939455,TGCTCTTCAGCATGTCCTTCATC,GAAAAATGGCACAAGCCTCCAT,FAH,hg19,chr15,80445386,80445409,80445578,80445600 IAD84954_1_A,P,3,AMPL7154407717,CGTTGATCTGTTTCTTGGCCTCTT,CTGAATTTCAACCTCACGGAGATTC,SERPINA1,hg19,chr14,94849028,94849052,94849240,94849265 IAD84954_1_A,P,4,AMPL7154939827,GTCTGATCAAAGGATGAAAAACACACG,CACATCCCATCAAGTTAGTTTCTCCTATTT,SLC25A13,hg19,chr7,95820271,95820298,95820515,95820545 IAD84954_1_A,P,5,AMPL7154407718,TGATCTTGTTGAAGGTTGGGTGAT,ATCCCTGATCACTGGGAGTCAT,SERPINA1,hg19,chr14,94849424,94849448,94849624,94849646 IAD84954_1_A,P,6,AMPL7154939831,TGATCCACCACTCCACTTAAAAGTTC,GGTCATTATGAAGCGTACATGATCATATCT,SLC25A13,hg19,chr7,95906520,95906546,95906757,95906787 IAD84954_1_A,P,7,AMPL7154416764,TTTTAAAGATGGCAAAGGAGGTGGTA,ACATCTGTCAGCTAGTTTTGGTATTAACAA,SERAC1,hg19,chr6,158565334,158565360,158565473,158565503 IAD84954_1_A,P,8,AMPL7154939834,TCCGTATTACCCAGACAACAAATTAACC,GACTTCCGAGACATCATGGTCA,SLC25A13,hg19,chr7,95822146,95822174,95822398,95822420 IAD84954_1_A,P,9,AMPL7154420532,CCCAAATGGAAATTATACAACATAGGGTGA,TGAGCAGGCTGTAATTGAAAAACCTA,SERAC1,hg19,chr6,158539870,158539900,158540098,158540124 IAD84954_1_A,P,10,AMPL7154973505,CCACCTGTCATCCATGCCTATG,TCTAGAATGGCTCAGATGCTGTTG,ATP7B,hg19,chr13,52509060,52509082,52509181,52509205 IAD84954_1_A,P,11,AMPL7154420551,AAATAAGTGAAGGGCTTTTCTCCTTTTAC,CTTCCTTATGCTGAAAGTTTTGGAGAAG,SERAC1,hg19,chr6,158551284,158551313,158551460,158551488 IAD84954_1_A,P,12,AMPL7154973967,GGTGGGAGGGTGTTACACATTG,CCAGTTCTTCCTTATCCAGGAGAAA,SLC37A4,hg19,chr11,118897437,118897459,118897665,118897690 IAD84954_1_A,P,13,AMPL7154420725,TATCAAAGAAAAATCAAGCCCAACCCAAA,TGGCTGAATACTCTGTTAATATTCGCTATC,SERAC1,hg19,chr6,158535655,158535684,158535859,158535889 IAD84954_1_A,P,14,AMPL7154973985,GGGTGATCTTGTTCACACTCCT,CTAGGAGAGACCCAGAGCATGA,PHKG2,hg19,chr16,30767699,30767721,30767888,30767910 IAD84954_1_A,P,15,AMPL7154483595,TCATCATTTTCTGGACTTGTGTCCT,ACAAAATTTTTCTACATCTTGTGTAAGCAG,ABCD3,hg19,chr1,94940985,94941010,94941227,94941257 IAD84954_1_A,P,16,AMPL7154973986,GGAAGGGAGAGCTGTTTGACTA,GAGAATATTCTCGGGCTTCAGATCTC,PHKG2,hg19,chr16,30764558,30764580,30764776,30764802 IAD84954_1_A,P,17,AMPL7154483609,GCCTAGTAAGAGTCAGGTGGACTA,TTTTACCTCATTGTTCTGTAATGGTGGT,ABCD3,hg19,chr1,94923992,94924016,94924177,94924205 IAD84954_1_A,P,18,AMPL7154973992,TACAACTCCTGCTGAAATGTCAAATCT,CGAAGCCTATGTCAAGTGTCAAGATA,PYGL,hg19,chr14,51374761,51374788,51375008,51375034 IAD84954_1_A,P,19,AMPL7154483654,AGCTACTAGACATATTTTGTCAAGTTTGGT,CAAGGATATGACCCAACTGGACAT,ABCD3,hg19,chr1,94964844,94964874,94965072,94965096 IAD84954_1_A,P,20,AMPL7154973995,ACAGCCTAGACACGTCTCCT,CTGGTCAAGGACCGCAACGT,PYGL,hg19,chr14,51410731,51410751,51410984,51411004 IAD84954_1_A,P,21,AMPL7154584473,CTCATAACCCTTCCCTGAAATCCT,CCTCCAAGTCCTTCATCATTTTGTTT,PGM1,hg19,chr1,64117124,64117148,64117372,64117398 IAD84954_1_A,P,22,AMPL7154973998,CCCATTCCCAGAGATACTCAACTATTATAG,TTCTCCAGTGACCGAACAATTAAAGAAT,PYGL,hg19,chr14,51371990,51372020,51372192,51372220 IAD84954_1_A,P,23,AMPL7154584475,CCCACCTTTTCCAACATAATCTCTCA,CACCGAGTTCTTCACAGAGGAT,PGM1,hg19,chr1,64100279,64100305,64100522,64100544 IAD84954_1_A,P,24,AMPL7154974000,TCCAAAGTGGGACAGAAATCAGG,GTGCAGCAAATATTGATTTCTACAACCA,GYS2,hg19,chr12,21726842,21726865,21727087,21727115 IAD84954_1_B,A,1,AMPL7154974006,ATTCACTCAATTTCTTCCACTTTTTAGGC,GGTTAAATATCAAGTCACCATTTTCACTGA,GYS2,hg19,chr12,21689739,21689768,21689937,21689967 IAD84954_1_B,A,2,AMPL7157266195,AGGCAAGGGTTATTCTTCTAATTTTCCA,CTCAATGCCTCCAACCTCATCTA,ALAD,hg19,chr9,116155490,116155518,116155741,116155764 IAD84954_1_B,A,3,AMPL7154974009,CCTTCAATGGTAGCTCATTCCAAAATTT,AAATAATTTCAACGTGGAAACCCTGAAAG,GYS2,hg19,chr12,21713099,21713127,21713344,21713373 IAD84954_1_B,A,4,AMPL7157490117,GCGTGTTCAGACAACACAGTTC,TGCCAGAGATTTTCATGGCACA,MPI,hg19,chr15,75189369,75189391,75189591,75189613 IAD84954_1_B,A,5,AMPL7155033504,GTGATGGCTGGAAAGAAGGGTT,CTTCAAAAGCAACATGGTGACACTTT,CYP7B1,hg19,chr8,65536729,65536751,65536976,65537002 IAD84954_1_B,A,6,AMPL7157739003,GGCGAGATCAAAGCACTGG,GTGGGAGGGATCACCCACAG,TALDO1,hg19,chr11,763833,763852,764010,764030 IAD84954_1_B,A,7,AMPL7155033506,AAAAATTTTCAAGGTCGCCATTTTGTC,AGAAAAGTTAGCCAAGATGCAAGGAT,CYP7B1,hg19,chr8,65528155,65528182,65528319,65528345 IAD84954_1_B,A,8,AMPL7157739007,GTGTTGTTTGGAGCAGAAATACTAAAGAA,GGAGAGCTCAAAATAAACCTCCTCTT,TALDO1,hg19,chr11,758993,759022,759172,759198 IAD84954_1_B,A,9,AMPL7155033507,TGTTGTTGTCACAAACAATAACTTTTCCAT,GATGAGCTTCACCTCTGCTATCAA,CYP7B1,hg19,chr8,65528479,65528509,65528668,65528692 IAD84954_1_B,A,10,AMPL7157739011,CCAAGCCAGTGACCTGGAAAAA,CATATGTAGGTACCCACACACAACA,TALDO1,hg19,chr11,764289,764311,764438,764463 IAD84954_1_B,A,11,AMPL7155033509,CTTGCACAGTTAATTACCTAGGCCTTA,AAGAAAGGGTCTGGATTTCCCATC,CYP7B1,hg19,chr8,65527374,65527401,65527622,65527646 IAD84954_1_B,A,12,AMPL7157739012,GGGAATTACAGGGTTCCTTCACA,GGAAGCAAGGCCAACTAGACTA,TALDO1,hg19,chr11,755797,755820,756045,756067 IAD84954_1_B,A,13,AMPL7155033512,TGATGGGCTTTGTGACTAAGGAC,TGATGATAAGCCCATAGGACTAAACTACA,CYP7B1,hg19,chr8,65509031,65509054,65509266,65509295 IAD84954_1_B,A,14,AMPL7157739015,GGATGGGTTCTTCTTGCTCCTA,CTCTGAGAGCTCCTTCCTTGTG,TALDO1,hg19,chr11,760097,760119,760266,760288 IAD84954_1_B,A,15,AMPL7155056772,ATACTACAACCATTACCTGATTCCAATCAC,TCAAGTCACTGCTACCCATGATG,NBAS,hg19,chr2,15615671,15615701,15615830,15615853 IAD84954_1_B,A,16,AMPL7157739917,GGAGACCCAGCCTGTAGGAT,GACTCCATCCTCTGACGCTT,TALDO1,hg19,chr11,747265,747285,747499,747519 IAD84954_1_B,A,17,AMPL7155056794,TAGTTTTTGTTTCTACTGTCTACAACAGCA,TTCTTCTACCTCCTTGCCTTCTCT,NBAS,hg19,chr2,15468254,15468284,15468475,15468499 IAD84954_1_B,A,18,AMPL7157774496,GAGGAAAAGTTGCTCCCTTTCAG,GGTTTGACTGGTTTCCCATGAGA,ALDOB,hg19,chr9,104184023,104184046,104184253,104184276 IAD84954_1_B,A,19,AMPL7155056800,ACTTACTCTGCCAGACCAAGGAT,GTTGGTAAAATGTCTTCTTTTCCATGTCTT,NBAS,hg19,chr2,15432655,15432678,15432896,15432926 IAD84954_1_B,A,20,AMPL7157998386,CCTGATGCCAGGGTCTCTC,TCTCCAGGTTCCTTCTAGCAGATC,TRMU,hg19,chr22,46752712,46752731,46752911,46752935 IAD84954_1_B,A,21,AMPL7155056805,ACTTACCAAGACACTAGTCCACTGT,CTTCCTGGGCTTGATGGACATT,NBAS,hg19,chr2,15427064,15427089,15427314,15427336 IAD84954_1_B,A,22,AMPL7158541185,ATAAGGTTGCTTTGAGGTTAAAGTCAGAT,TCCTGCCAGCACTTTCAATGATAG,LARS,hg19,chr5,145512253,145512282,145512472,145512496 IAD84954_1_B,A,23,AMPL7155056807,AAAAAGAAACAGGAGGAAATGGCATG,GGGCTGAAAACATGGCATTTAATAACT,NBAS,hg19,chr2,15449183,15449209,15449423,15449450 IAD84954_1_B,A,24,AMPL7158541189,TTTCCTGCAACTTTTATACTCACCCAT,TGAAAAGGCTGTGCTTATGGAGAATATAG,LARS,hg19,chr5,145503364,145503391,145503567,145503596 IAD84954_1_B,C,1,AMPL7155056812,GGAGAAATTTTCATTTCTTCTACTGTGCT,CTGGTTACAGAAGTTGTTCTGGACT,NBAS,hg19,chr2,15415549,15415578,15415760,15415785 IAD84954_1_B,C,2,AMPL7158541206,CTTTATCCTCCTTAATAGTTAGCATTGGGA,TTTTGATTACTAGCTTCTCAGGGCTTAAAA,LARS,hg19,chr5,145533456,145533486,145533616,145533646 IAD84954_1_B,C,3,AMPL7155056826,TAATATTACTTCCAGGGTAGCTTATGGTCA,ATTGTTTTCTTTCCCTCTTCCTTGTCT,NBAS,hg19,chr2,15523233,15523263,15523460,15523487 IAD84954_1_B,C,4,AMPL7158541210,GTCTTCTAGACGGTAAAAGAAAGGAAAAAC,TAACACATGACCTTAGACTACGACTCA,LARS,hg19,chr5,145508341,145508371,145508569,145508596 IAD84954_1_B,C,5,AMPL7155056828,CCCTTCACACTCTTTTATTCAAGTACCT,TTGTTAGAAGCACCTCTTGTTTTCTTTTG,NBAS,hg19,chr2,15679266,15679294,15679486,15679515 IAD84954_1_B,C,6,AMPL7158541213,ACCACGCCATTGTCTTTGGTAA,CATCAGATAGTTGTTACAGAGTTGACATGT,LARS,hg19,chr5,145536994,145537016,145537222,145537252 IAD84954_1_B,C,7,AMPL7155056829,CCCTCTCATCCACAAGGTTAGG,TTTCAAGCCTATATTGTGATGAGAAGCA,NBAS,hg19,chr2,15492033,15492055,15492252,15492280 IAD84954_1_B,C,8,AMPL7158553014,GGCAAAAACCATTTCTCTTGGACA,GGATAAGGGTGGATATTGGCGATAC,LARS,hg19,chr5,145493444,145493468,145493690,145493715 IAD84954_1_B,C,9,AMPL7155056847,AAAAATTCGAGGTTCATTCAGCTTTGA,GGACATTTTACAACGATAAGTCATTTCAGT,NBAS,hg19,chr2,15644177,15644204,15644370,15644400 IAD84954_1_B,C,10,AMPL7159801559,CAACTCTTACTGACAAATTATGCTCCTTTC,ATGAAATGTCTCTCAGGTTCCTCATG,LARS,hg19,chr5,145522927,145522957,145523133,145523159 IAD84954_1_B,C,11,AMPL7155056850,AAAAACACAATAAGACTGGCATACTGTG,CTGTTGACAGTAGTATTGGGATATGGAAAA,NBAS,hg19,chr2,15542255,15542283,15542476,15542506 IAD84954_1_B,C,12,AMPL7159984637,CTCCCTTCTTAGCCCTTCCTTTG,TTTCTAACAGAGGCACACAGTGT,ALAD,hg19,chr9,116153775,116153798,116153970,116153993 IAD84954_1_B,C,13,AMPL7155056851,TTTTTCTTTTGGGTTTCCACTTGAGAT,CCGTTGGATGTCTTGAAGAATTTGG,NBAS,hg19,chr2,15514556,15514583,15514754,15514779 IAD84954_1_B,C,14,AMPL7160390445,CTCAGGAGCCCTTCAGGACAGA,AATCCATCTGTTGAGGAAGACCTTC,ALAD,hg19,chr9,116152947,116152969,116153138,116153163 IAD84954_1_B,C,15,AMPL7155056857,GAAAATGATTAATATTCCGTTGAGCCCAAA,GGAGCTCAAGAAGAGACAAGAACTAC,NBAS,hg19,chr2,15607597,15607627,15607809,15607835 IAD84954_1_B,C,16,AMPL7160478499,CGGGTAAGCCTGAGTGTATCAG,GTAGAGCCGGAAGGCACAGTTG,PHKG2,hg19,chr16,30768034,30768056,30768249,30768271 IAD84954_1_B,C,17,AMPL7155056863,AGTGATCATGAAGAGGTTAACCAATAAAGG,GCTAAGGATTCTAAAGTTACCTATGCAGAT,NBAS,hg19,chr2,15378434,15378464,15378675,15378705 IAD84954_1_B,C,18,AMPL7160478501,CTCAGCAGGAGACTTGGCAGAA,TGGGTTTCATCCATGGAGCATT,PHKG2,hg19,chr16,30767354,30767376,30767544,30767566 IAD84954_1_B,C,19,AMPL7155056879,CTAACTTCTCAGGTCTGTAGAACATTTCAT,GAAGCCAGGTGTGATGTAACTCT,NBAS,hg19,chr2,15557540,15557570,15557711,15557734 IAD84954_1_B,C,20,AMPL7160517372,GAAGGGAAGACCGTGATGTACA,ATGTCAAAAACAGCACAGCCAAGA,BCS1L,hg19,chr2,219526508,219526530,219526693,219526717 IAD84954_1_B,C,21,AMPL7155056888,TCTTTCATTGGCTCTTTGGAAGGT,TGCCACCAGCTTTAAGTGTGTATT,NBAS,hg19,chr2,15330296,15330320,15330538,15330562 IAD84954_1_B,C,22,AMPL7160517391,CTGGCGAAGTTGGGCGACT,CTCCGAACCAAAGTCAGAGGAC,TRMU,hg19,chr22,46731638,46731657,46731878,46731900 IAD84954_1_B,C,23,AMPL7155056918,AAAGTGCAGCAAAAGTATCTAGAGACTT,AAGGGAAAGCGTCATCTCTTTATTTGA,NBAS,hg19,chr2,15618244,15618272,15618491,15618518 IAD84954_1_B,C,24,AMPL7160626647,CCAGATGCTCCATGAACACAGT,CCTCTTCATGGGAAAAGTGGTGAAT,SERPINA1,hg19,chr14,94844577,94844599,94844800,94844825 IAD84954_1_B,E,1,AMPL7155056928,ATTCAGACACTCCCTTACCTGTCT,GGAGTTTACAGATACCTCTGGATTTTGC,NBAS,hg19,chr2,15358879,15358903,15359099,15359127 IAD84954_1_B,E,2,AMPL7160849941,AGAATGTAACTGGCAAATCTATACCATCC,GATCAGTTAAAGCAGGAGTTTGAATTCTG,LARS,hg19,chr5,145522317,145522346,145522530,145522559 IAD84954_1_B,E,3,AMPL7155056938,TGATTTCAGAACAGACCTTTTCCATTATCC,TGAAAGACAGTGTTAACAAGCTCTTCTATC,NBAS,hg19,chr2,15496348,15496378,15496589,15496619 IAD84954_1_B,E,4,AMPL7160849979,TTTTCACAAAGTCACCTTTACTTTGAATCC,TCTGAAGGCAGTTGTAATGTGTTGT,NBAS,hg19,chr2,15608457,15608487,15608705,15608730 IAD84954_1_B,E,5,AMPL7155056961,CCGACTCCGTGTACTGAATCCTA,CTAGTCAGTTATTAATTGGTCCTTTTGTGC,NBAS,hg19,chr2,15564360,15564383,15564599,15564629 IAD84954_1_B,E,6,AMPL7160849982,CTAAATTTGAACGTAGGTTTTCAAAGACCA,GAGGCAACCACAAAGCTTCATG,NBAS,hg19,chr2,15536315,15536345,15536567,15536589 IAD84954_1_B,E,7,AMPL7155057018,TCTCTCACTTTTGTAAAGTCCTTCAAAACT,GCTGTGGCTATTTGTTTAGATGGTC,NBAS,hg19,chr2,15374546,15374576,15374777,15374802 IAD84954_1_B,E,8,AMPL7160850001,GGGAACAGCATTCAACTCCAGA,AAGTGTGTCTCCACTCCCTTCTA,NBAS,hg19,chr2,15307113,15307135,15307361,15307384 IAD84954_1_B,E,9,AMPL7155057034,CTACCCTAAGTCTACTGAGATATCTTGTCA,CAGCTGATTTATATTTGGCTTTGCCAT,NBAS,hg19,chr2,15696719,15696749,15696958,15696985 IAD84954_1_B,E,10,AMPL7160850024,CGGCATCCACTGCAACATG,CACCTCACTGCTTGTTGATGC,TALDO1,hg19,chr11,763362,763381,763601,763622 IAD84954_1_B,E,11,AMPL7155057035,CATTAACTGCACAGCTCAAAGATTTAGAG,GCAGGCAGAGTTGTAAAGGTTTTTAATATT,NBAS,hg19,chr2,15601738,15601767,15601977,15602007 IAD84954_1_B,E,13,AMPL7155057054,GAATCTATGCCAACATTTCTATGTCCCA,CTCAGCAATATTTGGTATTGTCTGTCTTTT,NBAS,hg19,chr2,15674611,15674639,15674849,15674879 IAD84954_1_B,E,15,AMPL7155057093,GTCAATGATCCAACATCCCTCTTGA,CCAAGGCTCGCTACTTTGGTTATA,NBAS,hg19,chr2,15614075,15614100,15614324,15614348 IAD84954_1_B,E,17,AMPL7155057123,AAGTTGGTGTTTGACACTCACAAAATTA,TTAAATAATTCCATCTGTGCTGAAAACTGC,NBAS,hg19,chr2,15693404,15693432,15693647,15693677 IAD84954_1_B,E,19,AMPL7155057125,AAGAAGCTGATGGACATTCATAACATAGTT,GAAAAGAGTATTGACTTGGTTTTGGCT,NBAS,hg19,chr2,15519540,15519570,15519787,15519814 IAD84954_1_B,E,21,AMPL7155057131,TGAGAATGAAAGTGCTAATTCATTCCTTTG,GTGAGAAGTACGTCGTGGAGTT,NBAS,hg19,chr2,15319034,15319064,15319268,15319290 IAD84954_1_B,E,23,AMPL7155057133,TTTGTGCTCATTAAGTTAAGGTAAGCCT,GTCCAACTTTCCAGAGACCACTT,NBAS,hg19,chr2,15601121,15601149,15601361,15601384 IAD84954_1_B,G,1,AMPL7155057148,TCCCTCAACTATAAGTGAAAGAGTTGGA,AAAACTGTGGCTGTGCAGATTTG,NBAS,hg19,chr2,15416801,15416829,15417041,15417064 IAD84954_1_B,G,3,AMPL7155057671,CGAATTCTGAGCCCAGGAAGAA,GATTCTCTATGACTTGTTGGTCAACAC,NBAS,hg19,chr2,15701095,15701117,15701339,15701366 IAD84954_1_B,G,5,AMPL7155152340,GGCATCCTGAGACTTAGGCAAG,GCAAAGTTCTCAGCTAAGGAAGGT,BCS1L,hg19,chr2,219527738,219527760,219527967,219527991 IAD84954_1_B,G,7,AMPL7155152620,GGATGCCAAGATCCTTGACAAC,GCCTTAGCATAAGCCCTTCTGTAC,MPI,hg19,chr15,75183746,75183768,75183951,75183975 IAD84954_1_B,G,9,AMPL7155152622,ATGGGTTCCAACAGCGAAGT,CCTGACCTGCGGGTAAAGTG,MPI,hg19,chr15,75182912,75182932,75183020,75183040 IAD84954_1_B,G,11,AMPL7155152625,GCCAATGAGAGTGTCTCACTGAAG,AGCTCTTCCAGGGTATACCTAAGG,MPI,hg19,chr15,75189997,75190021,75190170,75190194 IAD84954_1_B,G,13,AMPL7155153388,GTCCATGATGAAGTTGTAGGCATTG,TGAAAGATTCCAAAAGTTGTGATGTTGTG,ABCB11,hg19,chr2,169828366,169828391,169828574,169828603 IAD84954_1_B,G,15,AMPL7155153394,GGGATGGAATTGAAAGTTAGAAGCCT,CCAGGGAAATCAAGCTCTTAATGAAGAG,ABCB11,hg19,chr2,169825646,169825672,169825869,169825897 IAD84954_1_B,G,17,AMPL7155291186,ATGTACCTACCTGGAGTAGGCAA,GATGTAATCTTCTTTTTGCTGTGTTCTTCA,GBE1,hg19,chr3,81691922,81691945,81692148,81692178 IAD84954_1_B,G,19,AMPL7155291194,AGTAGATAAGAGGTGGCAGCATCT,GGACTAATAGAGTGAAATGGCTTCTCT,ALDOB,hg19,chr9,104187098,104187122,104187332,104187359 IAD84954_1_B,G,21,AMPL7155291620,CCTGAACATGTTTGCATCAACCT,GTGTTGACTGGATCCCAAAGTCAT,G6PC,hg19,chr17,41052668,41052691,41052918,41052942 IAD84954_1_B,G,23,AMPL7155319552,TAAGTTCAACATGGGCGTTCATCT,CTAACCCTCTTGGAAACCACAGT,ATP7B,hg19,chr13,52544599,52544623,52544850,52544873 IAD84954_1_B,I,1,AMPL7155416978,CCTCACTTCTCCCTTCTCTTCCTA,GGCAATGACTATGACACAGAGGAT,GALE,hg19,chr1,24123162,24123186,24123372,24123396 IAD84954_1_B,I,3,AMPL7155416991,TACCTGGGAGACATAAGGCATGA,AGAGGTTGAAGTGAGCCAAATCAG,GALE,hg19,chr1,24123521,24123544,24123770,24123794 IAD84954_1_B,I,5,AMPL7155561922,GTTTATGTGTTTGTCTCCTAGAGTATGGT,CAGTATGCACACTACCGTTCTCT,TJP2,hg19,chr9,71840199,71840228,71840339,71840362 IAD84954_1_B,I,7,AMPL7155561924,GATCAATGGGACTGTAACTGAGAACAT,CCTTACTTCCAGCTAAGCTCACA,TJP2,hg19,chr9,71840937,71840964,71841108,71841131 IAD84954_1_B,I,9,AMPL7155561926,CCCAGTGGTTCCCAATTGTGAT,GAGTCATGAACACAATTTCAAATTCTCCAT,TJP2,hg19,chr9,71854908,71854930,71855147,71855177 IAD84954_1_B,I,11,AMPL7155561931,GTTTGCCCTGCTGTATTACATTCC,CAGGAGGAGGATAACCTTTGGTAGA,TJP2,hg19,chr9,71865800,71865824,71866049,71866074 IAD84954_1_B,I,13,AMPL7155561933,AGCAAGATAATGCTCCCAAATCAGT,CTGTTCGCTGTTATGTTGAAATCAAACTTA,TJP2,hg19,chr9,71866168,71866193,71866322,71866352 IAD84954_1_B,I,15,AMPL7155561937,TTTTGAGGTGATGGACGAGTTTGA,GCCCAAAGTCGTGGTCCA,TJP2,hg19,chr9,71835877,71835901,71836133,71836151 IAD84954_1_B,I,17,AMPL7155561941,AAGCTGTTGAAGTGGTGCAAATC,GCCTGGATCCACATCCTATGTAG,TJP2,hg19,chr9,71819845,71819868,71820095,71820118 IAD84954_1_B,I,19,AMPL7155823101,AGCAGATGGTGGTGTCTTCAG,GGCAGCGAGTTGCGTAGT,ATP8B1,hg19,chr18,55334340,55334361,55334596,55334614 IAD84954_1_B,I,21,AMPL7155823251,TGGCACAGAGTGGATACTCAAATG,TACCGTGGATTCCTCATTTTCTGG,ATP8B1,hg19,chr18,55358851,55358875,55359088,55359112 IAD84954_1_B,I,23,AMPL7155851278,CGAAGTGGGCATTGGATTTGAC,GGCATCACTGCCATAACTTCCTC,TJP2,hg19,chr9,71868930,71868952,71869177,71869200 IAD84954_1_B,K,1,AMPL7155851284,GAGCATTGACCAGGACTACGA,GCTTTTCTTCCCACATCAAGCATG,TJP2,hg19,chr9,71836189,71836210,71836417,71836441 IAD84954_1_B,K,3,AMPL7155851286,CCGCCTCATCAGTGACTTTGAA,AGAGACTCCCTGGAAGTCATCTG,TJP2,hg19,chr9,71863008,71863030,71863251,71863274 IAD84954_1_B,K,5,AMPL7155972744,CTATTGTTTAATAGTCCAACCCAAGGAGT,TACGCGGACCTCATCTCCT,ATP8B1,hg19,chr18,55315557,55315586,55315808,55315827 IAD84954_1_B,K,7,AMPL7155998801,CCCTACACATTCCAGCCATTTCT,AAAGTAAAAGGAGGCTAGAAGCTAAGAAAG,ATP8B1,hg19,chr18,55328337,55328360,55328573,55328603 IAD84954_1_B,K,9,AMPL7155998806,CTGCCCTACGGTTTGCAGATAA,TGCTTTGACCTGATGAATAAAATACCATCA,ATP8B1,hg19,chr18,55319794,55319816,55319979,55320009 IAD84954_1_B,K,11,AMPL7155998807,CTCTGGTGCTTAGCTGGAGAAT,GGACACTCACACAAAATATCATGACCTTTA,ATP8B1,hg19,chr18,55355379,55355401,55355560,55355590 IAD84954_1_B,K,13,AMPL7156398157,GTCAGTTTCTCCTGCTGCTGAA,CAACTTCGTGTTCATTTTGGTAGATGTAG,AKR1D1,hg19,chr7,137773180,137773202,137773417,137773446 IAD84954_1_B,K,15,AMPL7156413497,CCACAACGTGTTCCATTTGTCA,CCATAGATGATCTCTGAACCCTTTGTTTT,ABCB11,hg19,chr2,169869782,169869804,169870025,169870054 IAD84954_1_B,K,17,AMPL7156413499,TCCAGCAGCTTCCAGTTCTTTTT,CTACAGTTGCTTTGTGCTTTTTCTCT,ABCB4,hg19,chr7,87046631,87046654,87046836,87046862 IAD84954_1_B,K,19,AMPL7156413500,ACATCAAGGCTCTTCTGACACATTT,CACACACACACACTTTAATGTCTTGATATT,ABCB4,hg19,chr7,87056082,87056107,87056243,87056273 IAD84954_1_B,K,21,AMPL7156413501,GAAAGCCAACATGCAATGGCATA,ATTCTACGACAGGAAATAGGATGGTTTG,ABCB4,hg19,chr7,87082079,87082102,87082299,87082327 IAD84954_1_B,K,23,AMPL7156413553,ATTTTTGGAATTTGGAAATACCAACCTGTA,GAGTGCTCTGTTTTTCTCTGGTTTC,ATP8B1,hg19,chr18,55319241,55319271,55319411,55319436 IAD84954_1_B,M,1,AMPL7156564208,TATTCTCTGCTTTGTGCCTTTGATATGA,TCTAGAGCAAATTTCTTAATGACTGCGTT,ABCB11,hg19,chr2,169873206,169873234,169873363,169873392 IAD84954_1_B,M,3,AMPL7156567693,GGGTACGTGGTATGTCAGACGTA,AGACAAAGTCTGCCCTCTGTTTC,POLG1,hg19,chr15,89862218,89862241,89862341,89862364 IAD84954_1_B,M,5,AMPL7156572069,CACCTCAGATCCTATGTGTAATGAGG,CCAGGAGTGATGCATCTGTTCAC,POLG1,hg19,chr15,89860561,89860587,89860808,89860831 IAD84954_1_B,M,7,AMPL7156572089,ACCCAGTAAGGTCATGTGCTTC,CCTGTGGAAACAGAAATGTTACTCC,GALT,hg19,chr9,34647823,34647845,34648020,34648045 IAD84954_1_B,M,9,AMPL7156614263,TTTTCCTTACATGAGCCATTTCTCCA,GTAAACTAATCTGCCCTCTTCATGACTA,AGL,hg19,chr1,100345976,100346002,100346206,100346234 IAD84954_1_B,M,11,AMPL7156614302,GGTAAAATGTTTTTACAGCACCAGAAACA,CTTTACTTTGGTTCATTTCTGGTACTCCT,ATP8B1,hg19,chr18,55322237,55322266,55322448,55322477 IAD84954_1_B,M,13,AMPL7156614304,CCCAGGTAGAGGAAGGGACTTAG,AATTTCCAAAGCTGAAAAGTGCTTTCT,ATP7B,hg19,chr13,52535914,52535937,52536114,52536141 IAD84954_1_B,M,15,AMPL7156614321,CTTCGGACAGTCCTCTTGGAAA,AGAATAAAGGGAAGAAAGTCGCCAT,ATP7B,hg19,chr13,52511474,52511496,52511723,52511748 IAD84954_1_B,M,17,AMPL7156614326,TGGTAATTTCATGATAAACTCATAGGCGTT,TCATGAATGGTCCTGATACTTCAGCTATTA,ABCB4,hg19,chr7,87069518,87069548,87069758,87069788 IAD84954_1_B,M,19,AMPL7156614329,GACTTCAGTGACATGTTTTGACAACC,CGGCAGTTTCATTTAACTGACGA,GBE1,hg19,chr3,81585898,81585924,81586149,81586172 IAD84954_1_B,M,21,AMPL7156614333,GGCAAACGCCTAGTCTTCAACA,CCTATCCTGGCAACCATCCTTG,SLC37A4,hg19,chr11,118898263,118898285,118898485,118898507 IAD84954_1_B,M,23,AMPL7156653872,AGCCTTCCATGCAAGTTTTGTTG,GGCTGCAATGTGAATATTAACATGATTCA,JAG1,hg19,chr20,10639140,10639163,10639385,10639414 IAD84954_1_B,O,1,AMPL7156655507,GACAAGATGATGGAGTGCCACTT,CTCCACAACGGGACTTTCCTAC,TRMU,hg19,chr22,46751437,46751460,46751572,46751594 IAD84954_1_B,O,3,AMPL7156702026,CCCTCCCTAGAATCTTCTGAATGTAGT,CCTATCCCACCAACTCCAGGATAA,SMPD1,hg19,chr11,6415086,6415113,6415297,6415321 IAD84954_1_B,O,5,AMPL7156898026,CCTGCACAAAAACGACCATAATATCAA,GGCTGTCGCAACTCAGATAGTC,TJP2,hg19,chr9,71862735,71862762,71862987,71863009 IAD84954_1_B,O,7,AMPL7156898028,TGAACACACAGGATTTCAGAGGATT,TGGTACCAAGACACCTCTCTCA,TJP2,hg19,chr9,71849356,71849381,71849518,71849540 IAD84954_1_B,O,9,AMPL7156909440,CCCATCCATGGTCCCGATAGTTA,CAAAACAGCCCAACTTAATAAATGCTTCA,PYGL,hg19,chr14,51376705,51376728,51376880,51376909 IAD84954_1_B,O,11,AMPL7156954792,GCCCAGCAACTTTGTGACTGAT,GCACAATGGCTTTATTTGTCACTGA,FAH,hg19,chr15,80478429,80478451,80478645,80478670 IAD84954_1_B,O,13,AMPL7157015409,AGTGATGGCTTTCTTACCTATTTCATCC,TTTTTGGTGTCGATATGTTTTTGTCTCC,SCO1,hg19,chr17,10596064,10596092,10596283,10596311 IAD84954_1_B,O,15,AMPL7157089225,GAGAGAGGCGCTCAGACATC,GAGTTGACCCAGCTGCTCAA,FBP1,hg19,chr9,97401288,97401308,97401485,97401505 IAD84954_1_B,O,17,AMPL7157133338,CCTCATAATTTGCCAGCCTTCAGT,ACAGGCTCAATGGGAAACTATCATT,PGM1,hg19,chr1,64119936,64119960,64120182,64120207 IAD84954_1_B,O,19,AMPL7157133587,GCTATTTACAAGTTTTGTCAAATGAAGGGT,GTTGCACATTCTGTGAAGGAAAAGT,GYS2,hg19,chr12,21712406,21712436,21712615,21712640 IAD84954_1_B,O,21,AMPL7157135097,AGCCTCATGGAGAAACTGTCTTTC,GGACAGGAACAGAGTTAGTCACAG,TRMU,hg19,chr22,46749635,46749659,46749872,46749896 IAD84954_1_B,O,23,AMPL7157266191,CCGGCAGTTCTGTGATTCTTAG,CGTCGGACATGATGGATGGA,ALAD,hg19,chr9,116152596,116152618,116152735,116152755 IAD84954_2_A,A,1,AMPL7153084272,GGGAATGGTGGCTTTGTTTTTAAAGA,GACTGTAACTGGTGTGGTGACA,JAG1,hg19,chr20,10624328,10624354,10624579,10624601 IAD84954_2_A,A,2,AMPL7153194963,AAACAACTAACCAAGAAACAAAGGACATTC,GCAATCTTCCACTTTGACTGAAATGATTAA,HADHA,hg19,chr2,26426870,26426900,26427104,26427134 IAD84954_2_A,A,3,AMPL7153084298,CTGACTGTCACCTGGAGGAAAAT,TGAATGGTCCTGGATCTCGTCT,JAG1,hg19,chr20,10625894,10625917,10626146,10626168 IAD84954_2_A,A,4,AMPL7153194970,CACTCCGTAATCCACTGTCTCTT,CCCAGGTGTCACTCATTAGCTT,HADHA,hg19,chr2,26420458,26420481,26420710,26420732 IAD84954_2_A,A,5,AMPL7153084339,ATCAAACAGCTCTGCTTCTGGT,CCCTCCAGACTGTTTCTGGATAC,JAG1,hg19,chr20,10625413,10625435,10625663,10625686 IAD84954_2_A,A,6,AMPL7153194984,GGTGTATCAGAAGGAAGCTTGGT,ACAGTGACTTTCAAATGACTTTGAAGTG,HADHA,hg19,chr2,26417338,26417361,26417583,26417611 IAD84954_2_A,A,7,AMPL7153084349,GAAAAACAGAAGCTGGCAGCTTAG,CATTTCATAACAGGGACCAAAGAATTGA,JAG1,hg19,chr20,10622347,10622371,10622593,10622621 IAD84954_2_A,A,8,AMPL7153195007,GCTCCAGGCTAAAGTGAGCTTC,CCCGACTTCCATTCTGCATCTG,HADHA,hg19,chr2,26414308,26414330,26414558,26414580 IAD84954_2_A,A,9,AMPL7153084376,CGCTCGTCTTCTGTAATGGCTT,CTCATGTAAGAGGTGATGTTAAAGGATCT,JAG1,hg19,chr20,10630819,10630841,10631063,10631092 IAD84954_2_A,A,10,AMPL7153195072,GCCAAACCATATCAAGTACCTTCTCA,GCAAGAATTCTCTCTGCCCACTT,PGM1,hg19,chr1,64114111,64114137,64114362,64114385 IAD84954_2_A,A,11,AMPL7153084387,GGACAAAAGGAGCAAGTCTGGA,TATCGTGACACCTTTGTTTTACTCTGATC,JAG1,hg19,chr20,10628556,10628578,10628791,10628820 IAD84954_2_A,A,12,AMPL7153195096,CAGGTTTACAGCAATATAGTCACATCAGA,CACAGAAGAGGGCAACTTCCTA,PGM1,hg19,chr1,64097240,64097269,64097492,64097514 IAD84954_2_A,A,13,AMPL7153084400,TAAGCCCTAGCGAAACTTCCAAG,TCTATCCTGAGCTGAGAAGGCTT,JAG1,hg19,chr20,10629567,10629590,10629818,10629841 IAD84954_2_A,A,14,AMPL7153230639,AGGACATCTTGCCTGCTTTGAAA,TCTGCAGCTCAATAATATTTGAGATCACAT,CYP7B1,hg19,chr8,65528286,65528309,65528520,65528550 IAD84954_2_A,A,15,AMPL7153084472,CTCGACCTGATGGCTTTATTGAATAGT,TTTGAGTATTCCTCTGACTCTCAAGTCT,JAG1,hg19,chr20,10621352,10621379,10621598,10621626 IAD84954_2_A,A,16,AMPL7153230642,GCTTTCCAAGAGTATGTCCAAAGATTTG,TGTGGTGTTTATTTCTGTTTTATTAACAAACGA,CYP7B1,hg19,chr8,65528630,65528658,65528871,65528904 IAD84954_2_A,A,17,AMPL7153084509,CTGATACTCCTTGAGGCACACTT,CCTCTATACTCGAAGAAAACAGCTTTCTC,JAG1,hg19,chr20,10653487,10653510,10653687,10653716 IAD84954_2_A,A,18,AMPL7153252155,GGTCTCATCCAACAGCCTACAA,CTCTGCATAAGGCTTGTCCTCT,MPI,hg19,chr15,75182732,75182754,75182973,75182995 IAD84954_2_A,A,19,AMPL7153084520,ACAGAAAAATTAGACAAAGGGCTCTCAT,TCACAGGCGTCTCTTAGTGACT,JAG1,hg19,chr20,10632733,10632761,10632916,10632938 IAD84954_2_A,A,20,AMPL7153252183,GTAATGGCTGTACCCTCACCAT,GCCACTGTTCCTATCATCTTGGTTC,MPI,hg19,chr15,75184953,75184975,75185195,75185220 IAD84954_2_A,A,21,AMPL7153084545,TAAGGAGACAGATCCAGCTCCAA,CAACAACCAACAGAATTTTTATTTTGGCAT,JAG1,hg19,chr20,10644524,10644547,10644764,10644794 IAD84954_2_A,A,22,AMPL7153252961,CCATGTGTATGTGGCGACTCTT,CACAGAACTCTCTGTGTGGGAA,FAH,hg19,chr15,80460287,80460309,80460536,80460558 IAD84954_2_A,A,23,AMPL7153089717,CTGGGCTATGACTACTCATGCTT,ACACTAGCACCCAACAGAGATG,BCS1L,hg19,chr2,219527561,219527584,219527808,219527830 IAD84954_2_A,A,24,AMPL7153252966,GGGACCTGTGGACTCTTCAATAG,TCTCTTGTTGGCATCCACAGTAAG,FAH,hg19,chr15,80450304,80450327,80450553,80450577 IAD84954_2_A,B,1,AMPL7153457948,TGATCAATATACTGCCATTTGCACTTTACT,TGTAGCCTAATTGTTTGATTTGGTAAACAG,ABCB11,hg19,chr2,169830158,169830188,169830387,169830417 IAD84954_2_A,B,2,AMPL7154483640,TGATTTGCATTTTCCTGATGACTGAGAT,CAAAATTAAGGTCTCGGATCAAAACATCTC,ABCD3,hg19,chr1,94956545,94956573,94956771,94956801 IAD84954_2_A,B,3,AMPL7153457950,AAATTCAACACTTACCTTTTCACTTTCTGT,ACAGGAGCAATAACTGTTTCTATTTCTCAA,ABCB11,hg19,chr2,169781152,169781182,169781334,169781364 IAD84954_2_A,B,4,AMPL7154584477,CCCAAGGATCGAAACATGATTCTG,CTAAGACAGGAAGGCCAAGGGAATG,PGM1,hg19,chr1,64101899,64101923,64102070,64102095 IAD84954_2_A,B,5,AMPL7153457952,ACAAACTGAGAGACTCAGGGTACT,AATGAATCTGAATGACAGACTGACTTACC,ABCB11,hg19,chr2,169847239,169847263,169847481,169847510 IAD84954_2_A,B,6,AMPL7154584511,ACCCTCTATTTTAGTTACTCATACGACACT,GCATGGCTTTTCCTCAAAATAATAGGTTTT,PGM1,hg19,chr1,64089014,64089044,64089257,64089287 IAD84954_2_A,B,7,AMPL7153457953,TGCGTCATGTGTGTCTGAGATT,TCTTTGCATCAACTTTCCATCTTCTCT,ABCB11,hg19,chr2,169780099,169780121,169780338,169780365 IAD84954_2_A,B,8,AMPL7154584514,CCTTTAAGGAGGAGGGCCAAA,CCTGGTACGCCTGGGTCTTA,PGM1,hg19,chr1,64059013,64059034,64059179,64059199 IAD84954_2_A,B,9,AMPL7153457955,TTTCTGCTCCTTGAAACTTGACCA,AATTGTTCTTTCGTTTGGCTACTTTGATT,ABCB11,hg19,chr2,169874471,169874495,169874715,169874744 IAD84954_2_A,B,10,AMPL7154586937,GTAGTGGCTGTCTTACTGTGTAGATC,GCAGAATGTTCCTGAGCTGCTT,POLG1,hg19,chr15,89864165,89864191,89864267,89864289 IAD84954_2_A,B,11,AMPL7153457957,CATAGGCAAAGCCTATGACTGAAAAAG,TAACTCATAAAATCACCACCTAGGGAGAA,ABCB11,hg19,chr2,169870673,169870700,169870918,169870947 IAD84954_2_A,B,12,AMPL7154596867,TTTCACTCAGCTCTGCATCGAA,CTATTATAAAGCTGGGAGTGTTGGGAA,PGAM2,hg19,chr7,44105032,44105054,44105172,44105199 IAD84954_2_A,B,13,AMPL7153457958,TCACACACTAAAATACTGTTTTACCAGCT,GCAATGCTAAACATTCCTTTGTCCAT,ABCB11,hg19,chr2,169851824,169851853,169851998,169852024 IAD84954_2_A,B,14,AMPL7154598231,GGGCTATGCTACATACCAATTAACTCC,CACAGAGTCAGAAATGTTCAATAAGCTT,POLG1,hg19,chr15,89862011,89862038,89862251,89862279 IAD84954_2_A,B,15,AMPL7153457959,CCCACCTGTTAATGGCCTTTACT,CGTTAACATGGAAGACCCAAATGATAGTAA,ABCB11,hg19,chr2,169836337,169836360,169836544,169836574 IAD84954_2_A,B,16,AMPL7154598233,GGGATGAAAAGTCAAAACTGACCAGT,GCTGTTTGAAGAGTTTGCCATAGATG,POLG1,hg19,chr15,89861671,89861697,89861874,89861900 IAD84954_2_A,B,17,AMPL7153457960,TACTCTGCAGAAGGCAAAATTCTCAA,GAGCATCTCTAATTTTGATCCTCCCAT,ABCB11,hg19,chr2,169787131,169787157,169787378,169787405 IAD84954_2_A,B,18,AMPL7154598243,GCATCATTGGCCAGATCCATCA,TTTATGGCAGCTCCTGGTGTTT,POLG1,hg19,chr15,89870422,89870444,89870589,89870611 IAD84954_2_A,B,19,AMPL7153457974,GCAGAGCCTTATGCCAATCATG,AGTTATGTAATCCAAGTGGGCGTTT,ABCB4,hg19,chr7,87051309,87051331,87051558,87051583 IAD84954_2_A,B,20,AMPL7154598245,GCTGCTGCTGGAAAACCTCAT,GTGAAGGGCACCATGAAGGACA,POLG1,hg19,chr15,89871706,89871727,89871932,89871954 IAD84954_2_A,B,21,AMPL7153457975,AGAACACTATATTGAGGAGCAAATAGCAG,GTGTGCCAATACTGTAACCCTGA,ABCB4,hg19,chr7,87060667,87060696,87060905,87060928 IAD84954_2_A,B,22,AMPL7154598247,CCCAGGAACCTTACCTGGATCA,TCACCTCCCTCAGGTATTCCTG,POLG1,hg19,chr15,89873298,89873320,89873498,89873520 IAD84954_2_A,B,23,AMPL7153457982,CCCAAATTTTTACCCAGTTAAAGAAATGCT,AATTATGGAAGAGGAGAAATTCCATTCCA,ABCB4,hg19,chr7,87092011,87092041,87092256,87092285 IAD84954_2_A,B,24,AMPL7154598462,TCCCAGGGTCAGTGTGCTG,GAGGCCTGTGATATACTGCGAG,GAA,hg19,chr17,78081216,78081235,78081421,78081443 IAD84954_2_A,C,1,AMPL7153089740,ATGAGAATGATTTATTTCCGTACCAAGGT,CCCTTCCAACCCTATCAGCCTA,BCS1L,hg19,chr2,219526809,219526838,219527037,219527059 IAD84954_2_A,C,2,AMPL7153253025,TAAGTGAAATCATGTTGGACAATGGGA,GCTGACCCATCATCATATCCCAAA,FAH,hg19,chr15,80469764,80469791,80470013,80470037 IAD84954_2_A,C,3,AMPL7153089755,GCCATTACATGATCACACTGGAAGT,CTCCCATCATTCTTTTCTACTCTCACA,BCS1L,hg19,chr2,219525844,219525869,219526054,219526081 IAD84954_2_A,C,4,AMPL7153253032,CCAGAGCCAAGGCATAAATTCATG,CGTGAGAACAGATGGCTTCATG,FAH,hg19,chr15,80473330,80473354,80473582,80473604 IAD84954_2_A,C,5,AMPL7153104111,AAATCACTTCAGCCACCCAGAA,CTTTGCATATAGACCAGTGAGAAGCT,SLC37A4,hg19,chr11,118895700,118895722,118895831,118895857 IAD84954_2_A,C,6,AMPL7153253635,CATGTGACCTGACAGCTGCTAT,TAACAGCTGGCCTAGAACCTGA,ATP7B,hg19,chr13,52524348,52524370,52524586,52524608 IAD84954_2_A,C,7,AMPL7153118068,GCTTCTGCAGGTGCTCGA,CAGCCGCAAGTGCTATCC,POLG1,hg19,chr15,89876658,89876676,89876796,89876814 IAD84954_2_A,C,8,AMPL7153253668,TTGTCTCTAACTGCTTTTATGAGCTTTACA,CATTGCAAGTGTGGTATCTTGGTG,ATP7B,hg19,chr13,52513131,52513161,52513378,52513402 IAD84954_2_A,C,9,AMPL7153125683,CCTTCCCTGGGTGGAATACAGA,GAATTGTGGAAGGCACTAGCAAG,POLG1,hg19,chr15,89867274,89867296,89867521,89867544 IAD84954_2_A,C,10,AMPL7153255452,GGTGTTCACGGTGAGACCAA,CGTAGGGCAGGTTGTGGATG,FAH,hg19,chr15,80445221,80445241,80445434,80445454 IAD84954_2_A,C,11,AMPL7153125792,AAAAACAAAGCATCCAAGCTCTTCT,AACATTCCTTGCCAAGGCACTA,POLG1,hg19,chr15,89862383,89862408,89862633,89862655 IAD84954_2_A,C,12,AMPL7153255520,TAGCTAGCACCTCTGAGAAAACAAAC,ATTGCAGCAGAGATTAAGCAGTTTTTAAG,SLC25A13,hg19,chr7,95800674,95800700,95800919,95800948 IAD84954_2_A,C,13,AMPL7153125824,CCTCTGTGGGAATCCAGGGTTA,CTTCCTTTGCTCTGTCCAGGAT,POLG1,hg19,chr15,89865886,89865908,89866130,89866152 IAD84954_2_A,C,14,AMPL7153255527,TCAGTTTGGCTTCTTTTTCTCCTGA,TTCACTCATTCCAGTGCCTTGA,SLC25A13,hg19,chr7,95818799,95818824,95819051,95819073 IAD84954_2_A,C,15,AMPL7153125836,CCCTCAGAGCCCAGTTTCTACA,AGGTGAGGTGGTAGGTCCTAAG,POLG1,hg19,chr15,89864898,89864920,89865132,89865154 IAD84954_2_A,C,16,AMPL7153255571,GGGCTGACACTTTGGGACTTTT,AGATTTATTTTCCTTTAGTCGGCTAGCTT,SLC25A13,hg19,chr7,95926088,95926110,95926314,95926343 IAD84954_2_A,C,17,AMPL7153125877,GGCCTTGAGCAGAATGAGGAAA,CAGCTGATGACGACAGTTTCAG,POLG1,hg19,chr15,89866581,89866603,89866826,89866848 IAD84954_2_A,C,18,AMPL7153255584,GACTAGACTGAGGTACCTTTCCCT,TGGTGGTATGGAAATAATGTGTTCTTAACT,SLC25A13,hg19,chr7,95750884,95750908,95751125,95751155 IAD84954_2_A,C,19,AMPL7153132204,CAGCTACAAGCTGGAGAACCT,GCACACAGTGGTGCAACATG,GAA,hg19,chr17,78078787,78078808,78079016,78079036 IAD84954_2_A,C,20,AMPL7153255980,GGATTCAGCTCATGGTCACTGT,CAGGGATGGTGAGATGCTCAAG,SMPD1,hg19,chr11,6414736,6414758,6414983,6415005 IAD84954_2_A,C,21,AMPL7153133121,TGTGAAAAATGCCACTAGGATATACTGG,GCGCTGTGCTCAGTACAAGAAA,ALDOB,hg19,chr9,104189632,104189660,104189883,104189905 IAD84954_2_A,C,22,AMPL7153256735,GGTAACTCATTCGACTGTGGAGTT,CTTTAAAACATTTAACAGGACTGCCAATGA,AGL,hg19,chr1,100316532,100316556,100316732,100316762 IAD84954_2_A,C,23,AMPL7153133988,GGAGAAGCTGAGAGTGTGATCCT,GTGGGTGGGTGACTTCTTAGAT,GBA,hg19,chr1,155204906,155204929,155205157,155205179 IAD84954_2_A,C,24,AMPL7153263013,TCCAAACCCACCTCTAGCAAAG,GTGTCAATGTGGACCCATTCTG,G6PC,hg19,chr17,41062863,41062885,41063111,41063133 IAD84954_2_A,D,1,AMPL7153457983,TATACAAGCTCAAAGACTTCTTTTGGCA,AATGAATGCCAGAATGTGACTTAAACTTTT,ABCB4,hg19,chr7,87074129,87074157,87074311,87074341 IAD84954_2_A,D,2,AMPL7154598466,GAACGACCTGGACTACATGGA,ACAAAGACCCTCAGAAAACATCCTC,GAA,hg19,chr17,78082507,78082528,78082725,78082750 IAD84954_2_A,D,3,AMPL7153457984,ACTTCTGCATATTAAAGATTACTGTGTGCA,CTGCCTGTAACCACTTAGGTGT,ABCB4,hg19,chr7,87080871,87080901,87081122,87081144 IAD84954_2_A,D,4,AMPL7154598473,ACGAGCCTTCCAACTTCATCAG,TCAGAGATGAGGGTGCTAAGTCTC,GAA,hg19,chr17,78084747,78084769,78084888,78084912 IAD84954_2_A,D,5,AMPL7153457996,ACAGAATAACATCTCTGAAGCGCAT,GCTGAAGAGATGGTTACAAGTATACTGATT,ABCB4,hg19,chr7,87041207,87041232,87041359,87041389 IAD84954_2_A,D,6,AMPL7154598476,GCCGAAGTGACTGGCTACTT,ACTCAACACATACGTTCCTCTTTCC,GAA,hg19,chr17,78090858,78090878,78090999,78091024 IAD84954_2_A,D,7,AMPL7153457997,TGATCAAGCATCATCAGGCATCA,CTGGTAAGCACTATACCTTTAGACTTTCAA,ABCB4,hg19,chr7,87038519,87038542,87038763,87038793 IAD84954_2_A,D,8,AMPL7154598487,ACGATGGCTACCTGCCACTA,AGCTCCCTCACTGGTCACA,GAA,hg19,chr17,78092241,78092261,78092477,78092496 IAD84954_2_A,D,9,AMPL7153458000,TACTGTAGCAAAAGTTCATAAGTTCTGTGT,TTTTGGGATAAGGTGTCTGTCTGATTTATC,ABCB4,hg19,chr7,87031397,87031427,87031623,87031653 IAD84954_2_A,D,10,AMPL7154599043,CGAGAGCTGAGTGGCTCCT,GCACTGTTCCTGGGTGATGG,GAA,hg19,chr17,78078503,78078522,78078674,78078694 IAD84954_2_A,D,11,AMPL7153458001,TCTAGCTGGAAGCATCTTAACAAGTG,AAATTTCCTCAGCATTGGAGCTTTG,ABCB4,hg19,chr7,87047758,87047784,87048006,87048031 IAD84954_2_A,D,12,AMPL7154599144,AGCTAAATTGGAATACAAAGTAGTGCCAA,CTCTATTAAATGTTTCTCCAGGAAATGGGT,AGL,hg19,chr1,100326892,100326921,100327124,100327154 IAD84954_2_A,D,13,AMPL7153458004,TGTGGTCATTGTATCAAACAGGATTCTAG,CTATCCCACCCGAGCAAACGT,ABCB4,hg19,chr7,87037232,87037261,87037485,87037506 IAD84954_2_A,D,14,AMPL7154599147,GATTGTGAAAGGGTAAAAGTAGCTTTTCC,CAGCACCAACACGTAAAATGGG,AGL,hg19,chr1,100327626,100327655,100327849,100327871 IAD84954_2_A,D,15,AMPL7153458006,TGAAAAACCAATTTCAAAGGGCCAAT,TGAATCGAATTATTCCCATTTTAGGGCT,ABCB4,hg19,chr7,87072563,87072589,87072800,87072828 IAD84954_2_A,D,16,AMPL7154599156,ACCATATGAATGTCAGTATGTACAGAGGA,CCGCTTTGTTGACATCTACTTGGA,AGL,hg19,chr1,100336127,100336156,100336371,100336395 IAD84954_2_A,D,17,AMPL7153458188,GAGGTCATCTTGGGCAAAGGAA,TACAGGTTGGCAACCTGTAATTACAG,ATP8B1,hg19,chr18,55335582,55335604,55335829,55335855 IAD84954_2_A,D,18,AMPL7154599157,GGAGGTAGGAGGATACCTGTGA,CGTCTGTATTCAGGATCTTGAATAATCGTA,AGL,hg19,chr1,100340103,100340125,100340282,100340312 IAD84954_2_A,D,19,AMPL7153458193,CGAGCGCTTCTTGCGGAT,CTGGTGTGGATCTTATTTTCATCCCT,ATP8B1,hg19,chr18,55315780,55315798,55315965,55315991 IAD84954_2_A,D,20,AMPL7154599161,GCTGGCCATGGTCCAAAACTA,AACTATGAATTGGTTTATACTGATGACAGT,AGL,hg19,chr1,100340956,100340977,100341199,100341229 IAD84954_2_A,D,21,AMPL7153458243,AATCAATAGGAATTGAACCAAGCAACTAAA,GGATGATTAACTTCCACTTTGAACTCAAAA,ATP8B1,hg19,chr18,55362618,55362648,55362802,55362832 IAD84954_2_A,D,22,AMPL7154599174,GTAATGCTCTGCAGAGGCAATG,CCAAGTGTCAGAGAGTTAAATATCAAAGCA,AGL,hg19,chr1,100346174,100346196,100346390,100346420 IAD84954_2_A,D,23,AMPL7153458245,CATCTAAATGAGCGATTCATAGACAGACT,GTTTTTACAGCTTTTCTGGGATTTCTCTC,ATP8B1,hg19,chr18,55342022,55342051,55342267,55342296 IAD84954_2_A,D,24,AMPL7154599186,TTGTTGTTGTTGTCTTCTAGCATAGATCA,CCACTTAGTGTAAAACCGTTCTTCAGAAA,AGL,hg19,chr1,100346612,100346641,100346857,100346886 IAD84954_2_A,E,1,AMPL7153134631,GGCAGATCAGCTCCAGATTCTAA,ACTCTCAGTCACTGCATCACCT,FAH,hg19,chr15,80464448,80464471,80464691,80464713 IAD84954_2_A,E,2,AMPL7153263014,CATTCCGCCTCAGCTCTATTGTAG,TTCAAATAGTAGTCCTCCTCAATCCCT,G6PC,hg19,chr17,41063247,41063271,41063484,41063511 IAD84954_2_A,E,3,AMPL7153134845,CTGGGTAGATGATGCACTGTCT,TGGTGTGTCAGCTACAGAGAGA,G6PC,hg19,chr17,41059467,41059489,41059692,41059714 IAD84954_2_A,E,4,AMPL7153263198,ATTGCTACACATAAGCGAATTTACGC,GGGTAATTGCATCTGAGGATGATTTAAGA,OTC,hg19,chrX,38262811,38262837,38263027,38263056 IAD84954_2_A,E,5,AMPL7153135199,GTGTGGCTCTAAGACCAGTGTA,TTCAACTCCTTGATCTGTAAAAGATGCA,ALDOB,hg19,chr9,104190635,104190657,104190879,104190907 IAD84954_2_A,E,6,AMPL7153263201,GCAACTGAACACATTTCTTAGTTTTTAGGT,TGGCACTACATTCTGCAGAAAGAG,OTC,hg19,chrX,38211850,38211880,38212100,38212124 IAD84954_2_A,E,7,AMPL7153135616,CACCTGGCCTAAATTCACTTTTTAAACA,CTTCAATCCCTCTCTTCAACACAAGT,OTC,hg19,chrX,38228904,38228932,38229152,38229178 IAD84954_2_A,E,8,AMPL7153263204,CTGTAACCCTGCAAAGCTGAAAC,CATACCACGTGTTAGGGATTTGTTTATTTT,OTC,hg19,chrX,38280174,38280197,38280418,38280448 IAD84954_2_A,E,9,AMPL7153154331,GCTGTCCTCAGGATTTACACAAAC,CCTCTCAGATACCCTTTTCAGTTCTG,SLC37A4,hg19,chr11,118896297,118896321,118896545,118896571 IAD84954_2_A,E,10,AMPL7153263206,AAGCTATTATTGCCTTTTACTGTCCCAT,GGTTCTGGCCTTCATGAATGGA,OTC,hg19,chrX,38268067,38268095,38268312,38268334 IAD84954_2_A,E,11,AMPL7153176926,AGGTGCTAACCTGGATAACTGTAAAAG,CCTGCACATACTGCATGTGAGA,GALT,hg19,chr9,34649343,34649370,34649594,34649616 IAD84954_2_A,E,12,AMPL7153263239,CATCTGTGCCTTGCTCAAAGAG,GGCTAACCTAGTGCCTATAGCTAAG,GBA,hg19,chr1,155210752,155210774,155211001,155211026 IAD84954_2_A,E,13,AMPL7153176937,GTCACCTTGATGACTTCCTATCCATT,TGGAATCAGAGCCTGACTCTCA,GALT,hg19,chr9,34648721,34648747,34648971,34648993 IAD84954_2_A,E,14,AMPL7153266912,CCCATGCCTGCTTATGTCC,AGAGCCTGCCCTACCTGGAG,POLG1,hg19,chr15,89876288,89876307,89876529,89876549 IAD84954_2_A,E,15,AMPL7153176944,GGGTGATGAAGCTTTGGTTCTG,CATTGGCATATTTCCTCTGTCCCAT,GALT,hg19,chr9,34647998,34648020,34648246,34648271 IAD84954_2_A,E,16,AMPL7153266919,CAAGCCCTTTTGCAAAAAGCAC,TCTCCTTTTGACCTTAGCATTAAGCTC,POLG1,hg19,chr15,89859882,89859904,89860129,89860156 IAD84954_2_A,E,17,AMPL7153176946,GCTAGACCTCTTGAGGGACTTCT,TGAGTGGCAGCGTTACATCC,GALT,hg19,chr9,34647601,34647624,34647855,34647875 IAD84954_2_A,E,18,AMPL7153267075,AGGCAGCCAAGAGAGTTTTCAG,CTGCCTGAGAAGTGTGTGTTGTA,C10orf2,hg19,chr10,102750102,102750124,102750345,102750368 IAD84954_2_A,E,19,AMPL7153176957,AGAGCTCTGAGGACTGATCTTGA,AGGACAGTTCTAAGAGGGAACTACTC,GALT,hg19,chr9,34647049,34647072,34647296,34647322 IAD84954_2_A,E,20,AMPL7153267251,TCATAGGGAAAATGAAAGGGAGTAAGGA,ACTATGCATACAACTTTCACTTTCCCA,PFKM,hg19,chr12,48501772,48501800,48502019,48502046 IAD84954_2_A,E,21,AMPL7153182811,CTGCAGATCCTAGTTACTGGCA,CCAGGAAGATGACCTGTGTGTAG,GAA,hg19,chr17,78091875,78091897,78092125,78092148 IAD84954_2_A,E,22,AMPL7153267253,CCCTGATCATGTCTTTCTAACTATAACCC,GATCACTGTGGAAACAGTCTGGA,PFKM,hg19,chr12,48536523,48536552,48536771,48536794 IAD84954_2_A,E,23,AMPL7153183059,GGAGCCGTACAGCTTCAGC,TTGTCTCACTCAGCGGCAA,GAA,hg19,chr17,78087022,78087041,78087274,78087293 IAD84954_2_A,E,24,AMPL7153267255,GGGAGCTGACTTCTACCTCTTC,CGACACAAATAAGCAATACTGATGTGAAAA,PFKM,hg19,chr12,48526624,48526646,48526849,48526879 IAD84954_2_A,F,1,AMPL7153458246,GAAAGAAGTAAACACCAGAAGAATGCATT,GTTAAATAAAGGAAGCAGATGAGTATGTGC,ATP8B1,hg19,chr18,55321121,55321150,55321365,55321395 IAD84954_2_A,F,2,AMPL7154599200,CCTAGGCAAAATTGAAGAAGTAGTTCTTG,GCAACTCCAGCTTGTTTAACAATTTTACTT,AGL,hg19,chr1,100349671,100349700,100349902,100349932 IAD84954_2_A,F,3,AMPL7153458250,ATAACACCGAGACCCTGAGGGAAA,CTCTGTGACTTGCATATTTTCCAGAATCTA,ATP8B1,hg19,chr18,55364943,55364967,55365176,55365206 IAD84954_2_A,F,4,AMPL7154599209,CCCTTCAGTATGCCTTTGTAACTTG,TCATTCTTTGGTCTTATTTCTGCCAATACA,AGL,hg19,chr1,100356558,100356583,100356785,100356815 IAD84954_2_A,F,5,AMPL7153458266,CTCAATAGAGAAGGAAGGCACGAGAA,GCAAGCTTAGAATTAGCAATAAGTTACCTG,ATP8B1,hg19,chr18,55368370,55368396,55368597,55368627 IAD84954_2_A,F,6,AMPL7154599217,TCAATCACTTTTGTTACAGCTTTGTTCAG,TTTTCCTATAACTTTTCTTCCGCGAATACT,AGL,hg19,chr1,100357969,100357998,100358202,100358232 IAD84954_2_A,F,7,AMPL7153458354,GTGCCCACAGGATCTAAGAAGT,CAGGACCAGCCCTATCTTAATAAGC,CYP7B1,hg19,chr8,65517189,65517211,65517437,65517462 IAD84954_2_A,F,8,AMPL7154599220,GAGAGAAAACGCATTCAAAATATAGTCACC,CACTTGAGAATGTCTAGACCATTTGGAA,AGL,hg19,chr1,100366087,100366117,100366331,100366359 IAD84954_2_A,F,9,AMPL7153458479,CGGACACTTCTCCTGCCATC,CCACGGTGACATTCCTGTCTG,CYP7B1,hg19,chr8,65711126,65711146,65711280,65711301 IAD84954_2_A,F,10,AMPL7154599228,TGATGAAGAAACAGGATTTGTTTATGGAG,GGCAGGGAAATTTTGATTGACTTAATGTAA,AGL,hg19,chr1,100376290,100376319,100376494,100376524 IAD84954_2_A,F,11,AMPL7153458498,CTCCTCTTAGACATTTGCAGAGATATTCA,TATGAGCCTTGTTGCTTGACACA,AKR1D1,hg19,chr7,137798319,137798348,137798569,137798592 IAD84954_2_A,F,12,AMPL7154599235,GGTGCTACATCTTCATAATCCAGCT,GGAAACATGAAATAGCTTTTCAAAGTTGTC,AGL,hg19,chr1,100378886,100378911,100379129,100379159 IAD84954_2_A,F,13,AMPL7153458508,CCTCTGGCCTTCCTTTCTTTGAT,AAATTGCAGATTATGCTATAGGCAAATGTT,AKR1D1,hg19,chr7,137761165,137761188,137761401,137761431 IAD84954_2_A,F,14,AMPL7154599244,TTTGCAGTGATATGGTTTACTGTGGA,AATTTTGCACGAAGAAAATACCCAATAGG,AGL,hg19,chr1,100381959,100381985,100382165,100382194 IAD84954_2_A,F,15,AMPL7153458512,TTTTTAACAGTACAATTGCATTCAACAACG,CATTCCAATCAAATACAGTAGTTCACATGA,AKR1D1,hg19,chr7,137791282,137791312,137791510,137791540 IAD84954_2_A,F,16,AMPL7154599676,CAAAGCGGATTCTCCTCCAGAA,AGCACAGAGAATAGTTGAGAAACTTGAAA,HADHA,hg19,chr2,26456968,26456990,26457143,26457172 IAD84954_2_A,F,17,AMPL7153458526,CTCACAATTATGAAGACTGGGAAGTCTAAA,AGGGTGCATCTCTCTCCATAAATATGA,AKR1D1,hg19,chr7,137782516,137782546,137782755,137782782 IAD84954_2_A,F,18,AMPL7154599815,CCCATGCGTAATGAGTCGAATC,CCATGCATTGTTCTATTGTAAATCACAACT,GBE1,hg19,chr3,81627107,81627129,81627296,81627326 IAD84954_2_A,F,19,AMPL7153505649,ATCATTTTGCTGAAAGGTACTGAAGGA,CATTCTTGTGCAACTTCTTCACAGTATA,ABCD3,hg19,chr1,94965035,94965062,94965175,94965203 IAD84954_2_A,F,20,AMPL7154599829,TCTCACCTCATATGAGTGTTCTGGA,GCAGTGCTCCTAAACCATTATGTATTATCA,GBE1,hg19,chr3,81698941,81698966,81699119,81699149 IAD84954_2_A,F,21,AMPL7153505665,TTTTTCCTCTGCAGTAAGAAAAGTGG,AGAAGACTGGAGTATTTTTAAGTTCCCTAC,ABCD3,hg19,chr1,94924149,94924175,94924293,94924323 IAD84954_2_A,F,22,AMPL7154599831,ACATTATAACAGAAACAGCTGCACCAT,GCTGATGGTGGTTTATACTGCAAAGAA,GBE1,hg19,chr3,81754410,81754437,81754637,81754664 IAD84954_2_A,F,23,AMPL7153507288,GCACCAGATAAGCTCTTAGTCACA,GTCGGCCATAGGCAAAACAAAC,ABCD3,hg19,chr1,94948596,94948620,94948848,94948870 IAD84954_2_A,F,24,AMPL7154599833,GGACGCCAAATGATTCATAGCCT,CCTACCAGGTAGCCTCTACTAATAAATGAA,GBE1,hg19,chr3,81754673,81754696,81754896,81754926 IAD84954_2_A,G,1,AMPL7153183213,TGACAGGGTTCCCGAGTGA,GGCAAGCCTCCCATAGAGG,GAA,hg19,chr17,78086316,78086335,78086556,78086575 IAD84954_2_A,G,2,AMPL7153267544,TGCCGTTTTACCGAAGGTTGAT,CAAGGATCCACAGTGTGAGGAA,TRMU,hg19,chr22,46733618,46733640,46733870,46733892 IAD84954_2_A,G,3,AMPL7153183421,GGGTGCAGGTCTCTCAGATTTG,GGCCACACTTACAATCCACATG,GAA,hg19,chr17,78084385,78084407,78084629,78084651 IAD84954_2_A,G,4,AMPL7153267548,GTCGACCAGGAAAGGCCTGT,GGGTGCAGAGCAGTACAGT,TRMU,hg19,chr22,46751835,46751855,46752001,46752020 IAD84954_2_A,G,5,AMPL7153183760,GATCCTGGATGTCTACATCTTCCTG,GGTGATAGCGGTGGAGGAGTA,GAA,hg19,chr17,78082138,78082163,78082343,78082364 IAD84954_2_A,G,6,AMPL7153267553,TCCTGCATCGTCTTTTGTTCTTTATTCT,ACAGGCACTAATCAAAGGCAACT,TRMU,hg19,chr22,46746154,46746182,46746372,46746395 IAD84954_2_A,G,7,AMPL7153184351,ACTGAAAGGGACCCTTCTCCTT,CCTGTACCTCTCCAGGTTTAAGC,SLC37A4,hg19,chr11,118897269,118897291,118897474,118897497 IAD84954_2_A,G,8,AMPL7153267554,ATGTGTTTCATCGGGAAGAGGAAT,GGTCTAGTCTCCCAGAGCTGAA,TRMU,hg19,chr22,46748027,46748051,46748279,46748301 IAD84954_2_A,G,9,AMPL7153184518,AAAAATCACCAGGTCTTGCCTATTTTG,CCTGTGCATATAAGGCATTTACATATGATG,AGL,hg19,chr1,100387013,100387040,100387257,100387287 IAD84954_2_A,G,10,AMPL7153267606,GCCAGCACGTCGTATATCTGTC,AAAGCAGTAATGCATTTATTCTGCTTCTTT,SERAC1,hg19,chr6,158540066,158540088,158540224,158540254 IAD84954_2_A,G,11,AMPL7153184868,CTTATGAATAGTTTCTGTGGGTAGGAACT,CCTTTTGTTGCCCTGGCAAAAA,AGL,hg19,chr1,100380865,100380894,100381117,100381139 IAD84954_2_A,G,12,AMPL7153267608,ATAGCTTCTAAACAGAACATTTCCACTGT,GCCCTACACATTAGTATTTTCTAACACCAT,SERAC1,hg19,chr6,158551421,158551450,158551605,158551635 IAD84954_2_A,G,13,AMPL7153184988,CACATTACTTCAGTTGTCGGATTTGG,AGTGAACAATTGCAAGGTTTAATTTCATCA,AGL,hg19,chr1,100368155,100368181,100368389,100368419 IAD84954_2_A,G,14,AMPL7153267613,GGGTAGAGGTGGGAGAACAAAGTA,CTCACGTCATGAATTTGTACAATGTCAA,SERAC1,hg19,chr6,158549088,158549112,158549330,158549358 IAD84954_2_A,G,15,AMPL7153185206,GGTGTATGTGGATCAAGTTGATGAAGA,CGTCCACAGTAGCACTGTGTTATAATATAT,AGL,hg19,chr1,100347096,100347123,100347340,100347370 IAD84954_2_A,G,16,AMPL7153267614,ACTTCCCATCCAAGAGGACCTA,AGTGCAAGAGGCCTTTAGTTATAAATTTG,SERAC1,hg19,chr6,158538683,158538705,158538921,158538950 IAD84954_2_A,G,17,AMPL7153185347,GGTTTCTGTGACCTTTGTTAGAAAGTTTT,GTGTTAGATCATCACCATCCTCAAGAC,AGL,hg19,chr1,100340622,100340651,100340869,100340896 IAD84954_2_A,G,18,AMPL7153267615,GCTAGGTATAATTAAGCATCTAACAGCCA,TATGAATTGGGTAAACAACTTGTCACAGT,SERAC1,hg19,chr6,158534429,158534458,158534646,158534675 IAD84954_2_A,G,19,AMPL7153187769,GTTCCAGCACTGTCAAAGACCT,GGGAAAGATCATGGGACAGAGAA,PHKG2,hg19,chr16,30767819,30767841,30768068,30768091 IAD84954_2_A,G,20,AMPL7153267621,CTGGCCACTCCCTTGTCTTTTAT,AACTTTTCACATTGTCTTGGCTTTTTCT,SERAC1,hg19,chr6,158567736,158567759,158567955,158567983 IAD84954_2_A,G,21,AMPL7153187862,CATGGCATAATGCAGGTATTTCAGC,CCTTACCTGGTTTCCTTTTCAGAGAG,PHKG2,hg19,chr16,30764352,30764377,30764598,30764624 IAD84954_2_A,G,22,AMPL7153267729,TCCTGGGAATGAAAGAGTAATCCCA,TGAGGGTTATGGTGCAGGAATG,MPV17,hg19,chr2,27534960,27534985,27535211,27535233 IAD84954_2_A,G,23,AMPL7153188689,GATCGATGTATCAACTCTAGTGAAGCA,ATTGGTCCATTTTCTTTAGGCTATCGAA,PHKB,hg19,chr16,47697472,47697499,47697693,47697721 IAD84954_2_A,G,24,AMPL7153267734,GCCTCTGGCTTCCAAATCAGTC,CCTTTAAGTCACATTGGAAGTGGGAA,MPV17,hg19,chr2,27545256,27545278,27545481,27545507 IAD84954_2_A,H,1,AMPL7153507292,ACTGTCCTCTTAACAGCTTAAAGTACATG,AACCACCTTTTCTCCTTAAGACATATGTTT,ABCD3,hg19,chr1,94980614,94980643,94980858,94980888 IAD84954_2_A,H,2,AMPL7154600065,CAGCCCTCCTTTTTCAGTGAATG,AGAGCCTCAAGGACACCATTG,PGAM2,hg19,chr7,44104292,44104315,44104544,44104565 IAD84954_2_A,H,3,AMPL7153507294,TGGAAACCAAAAATTGTTACCAAGGT,TAGCATTTCATACATATAGGAGGAAGGTGA,ABCD3,hg19,chr1,94933388,94933414,94933575,94933605 IAD84954_2_A,H,4,AMPL7154600249,AAAAACTTTCAACACCAATGATCCCA,CAAAGGCTTCACGGGAACATAC,JAG1,hg19,chr20,10627485,10627511,10627596,10627618 IAD84954_2_A,H,5,AMPL7153507297,AGTAAGCAGAAATGAAAAGCAAAACCAA,CTTCTGTACCTAAGAGTGGTTTTCTTAGAA,ABCD3,hg19,chr1,94940648,94940676,94940891,94940921 IAD84954_2_A,H,6,AMPL7154600693,GGGCCATACCTTTGTCACAGAG,TCTCTTAACGTTCAAAAGGCTAACCT,JAG1,hg19,chr20,10633107,10633129,10633269,10633295 IAD84954_2_A,H,7,AMPL7153507299,TTCACATGATTTACCTAACAAAGTCTGGT,GAAGCGGGTCTCGCTTTTTG,ABCD3,hg19,chr1,94943984,94944013,94944218,94944238 IAD84954_2_A,H,8,AMPL7154600710,AGACCCTAAAACGATTTTTAAAAACCCAC,AGGATAACTGTGCGAACATCACATT,JAG1,hg19,chr20,10621888,10621917,10622135,10622160 IAD84954_2_A,H,9,AMPL7153507310,GCCAGGAGCTATTAATATTTGAGTCTAAGG,AGAGAGAGAAGGGAGAAGAACAATTGTA,ABCD3,hg19,chr1,94964060,94964090,94964303,94964331 IAD84954_2_A,H,10,AMPL7154600712,TTTGTCCATGTCGTCCTCTTCTAC,TGCTGAGCTCTGTCTTAACTGTG,JAG1,hg19,chr20,10620314,10620338,10620565,10620588 IAD84954_2_A,H,11,AMPL7153507313,AAAGATGTGACAATAGTCTGGAGTTTTGAT,GACTTGTACTCCTTCAATACCTTAAATGGA,ABCD3,hg19,chr1,94955225,94955255,94955448,94955478 IAD84954_2_A,H,12,AMPL7154630861,CCCATGGAGTAAATATGCTTTCTAGGA,GCTTGGCATTTTACCTGTCACTGTA,DGUOK,hg19,chr2,74173789,74173816,74174022,74174047 IAD84954_2_A,H,13,AMPL7153507315,TTTATGTTCCTCAGGTAAGACCTAGCT,AATCTGGAGTATTTTCAGTGGATCTAGGA,ABCD3,hg19,chr1,94964391,94964418,94964607,94964636 IAD84954_2_A,H,14,AMPL7154631054,CCTTTCTGCTTTGCTCATGTCCT,AGGGAGTTCTTGTTGAACTCAAGC,C10orf2,hg19,chr10,102752885,102752908,102753065,102753089 IAD84954_2_A,H,15,AMPL7153508040,CTTCAGATCTCAGGAGGAAATCTGC,GTTTTCTGAGAAGGAAATCCCAGATGA,LIPA,hg19,chr10,90984790,90984815,90985019,90985046 IAD84954_2_A,H,16,AMPL7154631058,GGGCAGAAGATCAGGTGACAAA,TCACATTGCTGATCTCGAAGCTAC,C10orf2,hg19,chr10,102749245,102749267,102749481,102749505 IAD84954_2_A,H,17,AMPL7153508042,GATTTGTAAGCAGGTTGTCTTTCTATTTGG,TCTAGTTTTTAGTGCTTTGAAGGGCAA,LIPA,hg19,chr10,90982165,90982195,90982410,90982437 IAD84954_2_A,H,18,AMPL7154631065,GAGGTTCAGCTGGCTGATACAA,ACCTCAGCATCTCGACGACTAA,C10orf2,hg19,chr10,102748481,102748503,102748724,102748746 IAD84954_2_A,H,19,AMPL7153508047,AAATCTGAACTTGGTTACTAACACAAAACC,GCTTGTTAATGTGGGAGACTGTTTCA,LIPA,hg19,chr10,91005362,91005392,91005591,91005617 IAD84954_2_A,H,20,AMPL7154673048,TCTTTTGTGTCACACAGACCCAA,TTGATCAAGAGCCAGAAGTTCTCAC,SMPD1,hg19,chr11,6414274,6414297,6414519,6414544 IAD84954_2_A,H,21,AMPL7153512771,AGGAAATGAGGATGGAGGAAGGAAT,TTCTTGCTGATCTCCTCTCTATATGGTT,G6PC,hg19,chr17,41052883,41052908,41053128,41053156 IAD84954_2_A,H,22,AMPL7154673052,TGTGGGCACTGGGACATTTT,CAGGTCACACTTGCTGTATTCG,SMPD1,hg19,chr11,6412794,6412814,6413035,6413057 IAD84954_2_A,H,23,AMPL7153514929,CATTTACCCTTCCACCTCTGGAA,TTTTCTTCAAGGTGAACGATTTTGTGAG,SLC25A13,hg19,chr7,95799174,95799197,95799420,95799448 IAD84954_2_A,H,24,AMPL7154673054,CCCTTTTGATATGGTGTACTGGACA,TGTGCTTTCATGGTTACCCACA,SMPD1,hg19,chr11,6413105,6413130,6413245,6413267 IAD84954_2_A,I,1,AMPL7153188933,TGCTACATAAGAATTTTGTTGGCTCTTTG,TACAAAAACATCCAAGGAGGCCTTT,PHKB,hg19,chr16,47684355,47684384,47684603,47684628 IAD84954_2_A,I,2,AMPL7153267738,GTGGAAACTGGTATGCCCACTT,TCATGATCCCTCCTTTGCCATTT,MPV17,hg19,chr2,27532686,27532708,27532921,27532944 IAD84954_2_A,I,3,AMPL7153188980,TCTCTGGAAAGATCAAAAATTAACAGGACA,TGAAAAAGGATGCATAGCAGGTCA,PHKB,hg19,chr16,47682347,47682377,47682591,47682615 IAD84954_2_A,I,4,AMPL7153267740,CCCTAGGGAAGAGAAATTAAAGTCCTATG,GCAGGGAGCTTAGTGAGGTAGA,MPV17,hg19,chr2,27535455,27535484,27535690,27535712 IAD84954_2_A,I,5,AMPL7153189015,GAACTGCTTAGAGATGGTTAATATTGTCCT,AGGAGTTTCTGAAGTTAATCTCTTCTACCA,PHKB,hg19,chr16,47674845,47674875,47675086,47675116 IAD84954_2_A,I,6,AMPL7153267897,GTGCCTTTCATTCCATTTCCCAT,CTTGGAGAATGTCACTTCTTAGGTTTCA,DGUOK,hg19,chr2,74177651,74177674,74177897,74177925 IAD84954_2_A,I,7,AMPL7153189122,TGAGATCCTTATTAAGCTCAGCTGCTA,AAACATTCAGGAAATGTTGGTAGGAAGA,PHKB,hg19,chr16,47627996,47628023,47628148,47628176 IAD84954_2_A,I,8,AMPL7153267898,CTGAGTAAGACTTGGCGAGTATGTG,CCCATGATATTGAACTTTGAAGCAAAGG,DGUOK,hg19,chr2,74185188,74185213,74185434,74185462 IAD84954_2_A,I,9,AMPL7153189166,TATAGTCCCAGCCCTCCCACT,AGGAAAAAGCTTACTTACCATCAATCATCATAT,PHKB,hg19,chr16,47627218,47627239,47627453,47627486 IAD84954_2_A,I,10,AMPL7153268346,TGCTAGTCCATAGCCAGGAAGA,ATTTAACATCATGGCCTGTGTGTATGTATA,SCO1,hg19,chr17,10598999,10599021,10599231,10599261 IAD84954_2_A,I,11,AMPL7153189317,CAGTCAAAATGCCAAAGTTCTACAAGT,CTGGACGATCACTAACATTTTAGAGTACTT,PHKB,hg19,chr16,47621508,47621535,47621752,47621782 IAD84954_2_A,I,12,AMPL7153268347,TCTTCTCAGAAGCTAGTCAGTCATTGA,TTTTTGAAGTAGAGATGGTTGTTTTACTGG,SCO1,hg19,chr17,10589953,10589980,10590197,10590227 IAD84954_2_A,I,13,AMPL7153189393,CGGCCTATGTCCTGTTATTGAGT,ACAGTTCCAATCTAATGCTTCAGTATTTCT,PHKB,hg19,chr16,47581289,47581312,47581518,47581548 IAD84954_2_A,I,14,AMPL7153303006,TCTGTGGTTTGACCCACCTCTA,CCCTCTTGGCTTACAGTTTCCT,ATP7B,hg19,chr13,52516464,52516486,52516714,52516736 IAD84954_2_A,I,15,AMPL7153189492,TATCAAAAGCTCTGCTTCCTTTTCAAATG,TTCAGAAGAAACCATTGCGATACTAGTTAA,PHKB,hg19,chr16,47536834,47536863,47537053,47537083 IAD84954_2_A,I,16,AMPL7153303008,GCCCAGTGAATCTAAGATATGAAAGAACA,CTTCATAGGTTGTAATTTCCCATGGTCT,ATP7B,hg19,chr13,52523707,52523736,52523951,52523979 IAD84954_2_A,I,17,AMPL7153189526,TGGAAGTTAGATTAAGCACTGCTTCTTC,GGGAATACTAATCGCAGATACCTAAGG,PHKB,hg19,chr16,47531208,47531236,47531425,47531452 IAD84954_2_A,I,18,AMPL7153303018,GCAGCATTTGTCCCAGGTGAAT,CTAGGTGTGAGTGCGAGTTCTT,ATP7B,hg19,chr13,52509610,52509632,52509841,52509863 IAD84954_2_A,I,19,AMPL7153189594,CCCAAGTTTCCTGAAGTGCACA,CACATGACCTTGTGTTTTTATGTTAAGTGA,PYGL,hg19,chr14,51404387,51404409,51404601,51404631 IAD84954_2_A,I,20,AMPL7153303028,TATCTGAGGGCCACACACAGCAT,GCAGCATCTGATATATCTGTGTTGCT,ATP7B,hg19,chr13,52534226,52534249,52534473,52534499 IAD84954_2_A,I,21,AMPL7153189622,AAATCATCCAGAGCACCATGAAAGA,GGAAAGACTGGAAATTTTGGCTCA,PYGL,hg19,chr14,51398324,51398349,51398536,51398560 IAD84954_2_A,I,22,AMPL7153303032,GCACACTTTTTCTAAAGGGTCCTTT,GACCTTTTGCTCTGAGCCAGAT,ATP7B,hg19,chr13,52585251,52585276,52585503,52585525 IAD84954_2_A,I,23,AMPL7153189703,TGATAGGAAATCCCAGTCAATCCCT,AGTCACATTTTGGCCACACCTA,PYGL,hg19,chr14,51383617,51383642,51383862,51383884 IAD84954_2_A,I,24,AMPL7153303038,TTACTAATCACAAAGATGGATGTGTCCAAA,GAGTGTTACAGCCATGACCTGA,ATP7B,hg19,chr13,52542500,52542530,52542752,52542774 IAD84954_2_A,J,1,AMPL7153557375,CAAAGAATGAGGGCTAAGACCTTGA,GGCTCTATGACTAGCTTTGAGTTTCAC,ALDOB,hg19,chr9,104187686,104187711,104187933,104187960 IAD84954_2_A,J,2,AMPL7154673056,CACCCAGTGCAACTACCTACAT,AGATTCAGGATGTAGGTCTCATGGT,SMPD1,hg19,chr11,6415236,6415258,6415484,6415509 IAD84954_2_A,J,3,AMPL7153557530,CGAAGACCGCATGTCCTACTTAAC,GAAAACACCAGGCTCTCCTGTT,TJP2,hg19,chr9,71862951,71862975,71863166,71863188 IAD84954_2_A,J,4,AMPL7154673058,CGTGTAGGAAGCGCGACA,GGAGAAAGAGGGTGAGCCTCT,SMPD1,hg19,chr11,6411811,6411829,6412004,6412025 IAD84954_2_A,J,5,AMPL7153557533,GTGCAATTTCTCTGGGTAGGAGAA,ACGTAAATGTCTCAAGAGATAACAGTTTCA,TJP2,hg19,chr9,71842610,71842634,71842850,71842880 IAD84954_2_A,J,6,AMPL7154673159,CCCTAGAAAGGTTTCAAGCGACA,CTCGCCAACAGTACTCACCA,GBA,hg19,chr1,155206960,155206983,155207192,155207212 IAD84954_2_A,J,7,AMPL7153557534,AAATGGGATGGGAAAATAAGTAGGATATGG,CTTTCTTCAAGTCCCAGTCCTTGA,TJP2,hg19,chr9,71867611,71867641,71867858,71867882 IAD84954_2_A,J,8,AMPL7154673173,CCTTACTGCTAGTCATTAAATTCCTAGCA,CTGGTCTCGGAAACATAAGACACTC,LIPA,hg19,chr10,90987783,90987812,90987988,90988013 IAD84954_2_A,J,9,AMPL7153557538,ACAGAAAGCTCCTTCCAGACCTTA,TGCATTCTAACTGGAGAAGAACCATC,TJP2,hg19,chr9,71869143,71869167,71869360,71869386 IAD84954_2_A,J,10,AMPL7154725789,ATGTAAAATCGCTGGTCACTGGAT,ACTCGAGCCAATACTGCATCTG,OTC,hg19,chrX,38260305,38260329,38260544,38260566 IAD84954_2_A,J,11,AMPL7153557545,TGGTGACATATGTGGCATAGACTTAC,ACCATCTAGGCAAAAACCACCA,TJP2,hg19,chr9,71843987,71844013,71844239,71844261 IAD84954_2_A,J,12,AMPL7154727838,CATGCCTTGCCAGGACAGTAA,GACTCGGGAGGACATCACATC,PHKA2,hg19,chrX,18915219,18915240,18915388,18915409 IAD84954_2_A,J,13,AMPL7153557546,CAAAAGCCCATACAATACTTTTACTGCTT,GTTCATGATTCTTCCAACTCCTCTGT,TJP2,hg19,chr9,71852711,71852740,71852943,71852969 IAD84954_2_A,J,14,AMPL7154727840,TCGACATGGACAGCAAACTTGA,CTACGGTCACCCTTGGTTACTC,PHKA2,hg19,chrX,18912485,18912507,18912587,18912609 IAD84954_2_A,J,15,AMPL7153557547,GCTCTGTTCTCTCTGCTTGGATG,GTAATTAAACACCATCTCAGTGTGCAT,TJP2,hg19,chr9,71864235,71864258,71864480,71864507 IAD84954_2_A,J,16,AMPL7154727842,ATTCAAGACAACAATTGCTTTGTAGAAAGT,CCACTTCAGTCAAACCTGATGTTG,PHKA2,hg19,chrX,18947120,18947150,18947354,18947378 IAD84954_2_A,J,17,AMPL7153557555,GCCTGGACCAAGACCATGC,GCTCGTAGTCTGGGTCGTAG,TJP2,hg19,chr9,71836071,71836090,71836227,71836247 IAD84954_2_A,J,18,AMPL7154875201,TAGAGGGTCTCGTGGAAAAGGA,AGATGATGTGGAGAAGGGTGACA,ALDOB,hg19,chr9,104192107,104192129,104192297,104192320 IAD84954_2_A,J,19,AMPL7153557557,TCAAATAGCATCCTTAATAAACATGCCTCT,CCCTCTTGAGAAAAGTTTCAGAACAG,TJP2,hg19,chr9,71861538,71861568,71861744,71861770 IAD84954_2_A,J,20,AMPL7154875611,AGGACAAATTTTTAGAAGAGACTGTAAGCT,CCAGCAAATAAGTTCTCTCCTTAGGTAAA,AGL,hg19,chr1,100342967,100342997,100343205,100343234 IAD84954_2_A,J,21,AMPL7153572612,TGCCAGGTTACATCGCATAGTG,CTCCATCAGGGATGCATTCTGAG,SMPD1,hg19,chr11,6412038,6412060,6412227,6412250 IAD84954_2_A,J,22,AMPL7154877246,CCTTCAATGGAATGGACACAGGAT,CAAGTGTCCTTGGAGAACAAAACTG,ATP7B,hg19,chr13,52548220,52548244,52548466,52548491 IAD84954_2_A,J,23,AMPL7153604412,CCCAAAAGCTGGGCTTGACTTA,TCCTTCCCAGCCTAGGTTCTTT,ALAD,hg19,chr9,116151936,116151958,116152181,116152203 IAD84954_2_A,J,24,AMPL7154877248,CCCAAGGTCTCAGAATTATTAAAATTCTGG,TTGAAGGCAAGGTCCGGAAACT,ATP7B,hg19,chr13,52548607,52548637,52548852,52548874 IAD84954_2_A,K,1,AMPL7153189796,GTTACAAGTATAGTCATATGCCTCTTGCA,GAATATAACTCCGAACTTTGTCCAGTGT,PYGL,hg19,chr14,51381349,51381378,51381588,51381616 IAD84954_2_A,K,2,AMPL7153339068,GCATGCCCAGATCTGATTTAGC,TGCACTTCTGCTTCTTAAAGACCTG,GALE,hg19,chr1,24122577,24122599,24122812,24122837 IAD84954_2_A,K,3,AMPL7153189848,GCAGTGAGACCTATGCTGAGTCT,CCACCCAATTCTTCTAGGCCAA,PYGL,hg19,chr14,51378804,51378827,51379053,51379075 IAD84954_2_A,K,4,AMPL7153383859,CCTGGCACAACCTGGTATATCG,CCTACATCAAGAACTTTCCCAAATGTG,SMPD1,hg19,chr11,6415602,6415624,6415849,6415876 IAD84954_2_A,K,5,AMPL7153189905,CCCATCTTTCATACCATGTAATCTCTAGAG,GCCATTCTTCTACTTCATCATGGCT,PYGL,hg19,chr14,51378378,51378408,51378625,51378650 IAD84954_2_A,K,6,AMPL7153384470,CTTACTCCCTTACCTGGAACAGTTC,CCACATTTGACAGTTCTCCTAGCA,C10orf2,hg19,chr10,102748846,102748871,102749096,102749120 IAD84954_2_A,K,7,AMPL7153190036,CTTGGCAATTTACTCACCATGTACAG,CCATGCCTGATATTAAGCAAAAGATGATTT,PYGL,hg19,chr14,51374972,51374998,51375130,51375160 IAD84954_2_A,K,8,AMPL7153384740,CACAGATCAGCATGGCTAAATGG,CAACTCTGGGTGCTTCTCTCTT,GBA,hg19,chr1,155207863,155207886,155208115,155208137 IAD84954_2_A,K,9,AMPL7153190287,TCAAAGAGAGTTACCGTAATGGTAGGT,ACAGGTTGAGGACAGTAGAGCT,PFKM,hg19,chr12,48538893,48538920,48539145,48539167 IAD84954_2_A,K,10,AMPL7153385043,AGTAAGAGGTCTGAGGTCTGCTT,AGAAGCAGCTAAATATGTTCATGGCA,GBA,hg19,chr1,155205985,155206008,155206220,155206246 IAD84954_2_A,K,11,AMPL7153190326,GAATCCTTGGAGGAGATAAAAATTGAAAGG,GGTATGGCTGTTGGCAGGTATG,PFKM,hg19,chr12,48537727,48537757,48537979,48538001 IAD84954_2_A,K,12,AMPL7153385339,CCATTCTTGGAGACTCACGTGA,TCCAGATGTGACCATCTCCTGA,ALAD,hg19,chr9,116155709,116155731,116155957,116155979 IAD84954_2_A,K,13,AMPL7153190413,ACTGATCAACTAGGACTCTACCCAA,GACTGTAGCAGGAATGACCACAA,PFKM,hg19,chr12,48535510,48535535,48535760,48535783 IAD84954_2_A,K,14,AMPL7153385788,AGTGCTTGTAATAAATCCTGAAAGCCA,AGTGGACACCAACCAAAATACCC,TJP2,hg19,chr9,71831186,71831213,71831436,71831459 IAD84954_2_A,K,15,AMPL7153190443,GGGTAGGGTTAGAACTCAAGCA,CCAGACAACAGGGTGGTTGAAG,PFKM,hg19,chr12,48535002,48535024,48535245,48535267 IAD84954_2_A,K,16,AMPL7153386112,CCCATGCTCATCTTACCTACAAGG,CTGTGGCTGGTTAATGAATGTTGG,SLC37A4,hg19,chr11,118897631,118897655,118897867,118897891 IAD84954_2_A,K,17,AMPL7153190456,AGGTTTGCCCTATGGAACTTCC,GGCAAGGCTTATGTTGTATGGAC,PFKM,hg19,chr12,48533518,48533540,48533769,48533792 IAD84954_2_A,K,18,AMPL7153386517,GTTCCTGGAAGCCTTCATGGAT,GCCCAGAAGACAGATACATCCCA,SERPINA1,hg19,chr14,94849208,94849230,94849458,94849481 IAD84954_2_A,K,19,AMPL7153190471,GTGATTTGGAAAAGGGCTCGAGTA,GGGCTTGAGAGTGTTAAGAAAGGG,PFKM,hg19,chr12,48531408,48531432,48531648,48531672 IAD84954_2_A,K,20,AMPL7153387209,GGTATTAATAGAAGTGCTTCTTACCACCAA,ACCACCTGTATTCGAATAAGAATGATTTGA,CYP7B1,hg19,chr8,65536936,65536966,65537136,65537166 IAD84954_2_A,K,21,AMPL7153190499,CCTTAAGAAATCCCTCACCCTGTT,GGAGAAGCAATGTCAGGAGACT,PFKM,hg19,chr12,48528633,48528657,48528882,48528904 IAD84954_2_A,K,22,AMPL7153387557,ATGATTGAAAGATGTTTGGTAAGAGGGAA,CAAGCAGCTGACTCCTTCCTTT,PYGL,hg19,chr14,51382444,51382473,51382696,51382718 IAD84954_2_A,K,23,AMPL7153190523,GCCTGGCAGCATACATGTATCT,CCTCCAGATCTGCTGCTACTGA,PFKM,hg19,chr12,48527903,48527925,48528141,48528163 IAD84954_2_A,K,24,AMPL7153390421,CATATTAGATATGCTGGCAGCCCTTA,GTGGAGAATAAAACCTTAAGTCAAAAACCT,PHKB,hg19,chr16,47684760,47684786,47684917,47684947 IAD84954_2_A,L,1,AMPL7153604418,AGGATGCATGCTTAAGGGCAAA,GCTGTGGTGAGTGACTAGGACT,ALAD,hg19,chr9,116151612,116151634,116151862,116151884 IAD84954_2_A,L,2,AMPL7154877250,CCCAATTTGATGGCAAACCTGT,CCAGTCATGTGTGAAGTCCATTG,ATP7B,hg19,chr13,52549005,52549027,52549126,52549149 IAD84954_2_A,L,3,AMPL7153604435,TCTGTCTGTCCGCATCTTCTACT,ACCATCTCCACTTCCATATTTCTTTCC,ALAD,hg19,chr9,116154288,116154311,116154535,116154562 IAD84954_2_A,L,4,AMPL7154877258,CTGGGATTTCAGAAGTAGTGACCA,GAGGAGCCCTGTGACATTCTTC,ATP7B,hg19,chr13,52532257,52532281,52532509,52532531 IAD84954_2_A,L,5,AMPL7153604448,GGCATGAGGGCACAGTTCTAAA,TGCTTCTTCATGGTAGCCTTCTTC,ALAD,hg19,chr9,116150475,116150497,116150725,116150749 IAD84954_2_A,L,6,AMPL7154877261,CCTGAAGTCATCAGATGTACTGCT,GCCTGACCTGGAGAGGTATGAG,ATP7B,hg19,chr13,52508882,52508906,52509134,52509156 IAD84954_2_A,L,7,AMPL7153618408,GGTTCCCAGGCAATAGCCA,CGGAACGCTACCGGAAATC,SCO1,hg19,chr17,10600633,10600652,10600861,10600880 IAD84954_2_A,L,8,AMPL7154877266,GAGCTTATTTCCATGGGAAAAGTTGAAG,TGTGTCCACAACATAGAGTCCAAAC,ATP7B,hg19,chr13,52538871,52538899,52539120,52539145 IAD84954_2_A,L,9,AMPL7153625158,TTTAAGTGGTCTGCTGTGTTTATCTAAACT,TTTACTTGTGCTTTGGCTTTTGTGT,GYS2,hg19,chr12,21693307,21693337,21693514,21693539 IAD84954_2_A,L,10,AMPL7154877423,AGCATTGCCCTGAAACCAAATTT,CCAAGACTTTTTCAATTCCTGATAAAGAGG,ABCB11,hg19,chr2,169801206,169801229,169801446,169801476 IAD84954_2_A,L,11,AMPL7153625168,TGTGAAATCTTACTCTACATTCCTCAGTCA,AGTTCTCTTCTCCTGGGATTACAACTAA,GYS2,hg19,chr12,21757333,21757363,21757569,21757597 IAD84954_2_A,L,12,AMPL7154877429,TGTTCACTCCGCTATTTCTCCAC,GACAGGATTTGCCTCTCGAGATAA,ABCB11,hg19,chr2,169792514,169792537,169792764,169792788 IAD84954_2_A,L,13,AMPL7153700129,GCTGAATGCAACAAACGATGCT,GGGTATGTGAGAATGCGATCTCT,TJP2,hg19,chr9,71850910,71850932,71851159,71851182 IAD84954_2_A,L,14,AMPL7154877477,AAACAATGTGTTTTCAGATGAAAGGAAACA,AACAATGGAAGACATAGTCCAAGCT,ABCB11,hg19,chr2,169828178,169828208,169828401,169828426 IAD84954_2_A,L,15,AMPL7153757609,GGCTCTCAGGCTTTTCTCTCAA,ACATCTCCCAGACAGAGGTGAT,ATP7B,hg19,chr13,52520333,52520355,52520579,52520601 IAD84954_2_A,L,16,AMPL7154877492,GGTGCATGCCATATATTGATTCTGG,AAATAGCCCTGGAGCATTGACAA,ABCB11,hg19,chr2,169800900,169800925,169801149,169801172 IAD84954_2_A,L,17,AMPL7153763103,GCACATATTCATTTACCTGATCATGGCT,GGGTGGACTAATATGTGCTTATCAAATAGT,GBE1,hg19,chr3,81630300,81630328,81630519,81630549 IAD84954_2_A,L,18,AMPL7154898260,TTCCCTAATCCAGTGTTATCCATTACAATG,CATTTCCACAAGGTAAAGGAGATAAAGTGA,PHKB,hg19,chr16,47549200,47549230,47549443,47549473 IAD84954_2_A,L,19,AMPL7153773217,AGACGTTACAGGAAGGAGACTCT,CTAGGCTGGTCATGCAGAGAAA,C10orf2,hg19,chr10,102748079,102748102,102748297,102748319 IAD84954_2_A,L,20,AMPL7154898269,ACTATTATGTGCCAGCTGACTTTGT,AACATAAACACCAGCAAAGGCATATTTATT,PHKB,hg19,chr16,47630305,47630330,47630496,47630526 IAD84954_2_A,L,21,AMPL7153786150,TCTGTGGGAATGACGTCTAACAC,TTTACGCAATACCTTCTGATACAAGGAG,FBP1,hg19,chr9,97365751,97365774,97365879,97365907 IAD84954_2_A,L,22,AMPL7154898272,GGCTTCCAGAATTTAAGAGTTTTGAGGA,TATGGTCTGATTCTGGGAGCTTCT,PHKB,hg19,chr16,47694567,47694595,47694778,47694802 IAD84954_2_A,L,23,AMPL7153787546,CTGGGAAGAAGACCGGCTACAT,CTCATCTACATGTTCTGGTGGTCAT,FBP1,hg19,chr9,97382557,97382579,97382805,97382830 IAD84954_2_A,L,24,AMPL7154898277,ACAAAGTAGATCTAGACAGACTGGTCA,CCTATTTTGCACCTGTGAATCTGTTTT,PHKB,hg19,chr16,47732414,47732441,47732594,47732621 IAD84954_2_A,M,1,AMPL7153190582,GCCTTTTCTTAGGAGCAACCTCT,GGCAGATTTAGAAGAAGACAGAGAAAGA,PFKM,hg19,chr12,48524095,48524118,48524247,48524275 IAD84954_2_A,M,2,AMPL7153390720,GTTCAGCTTCTATTAACTCTGTTAACCCT,TGTGGCTTTTAATTTAGATTTGACCATTGC,GBE1,hg19,chr3,81695415,81695444,81695642,81695672 IAD84954_2_A,M,3,AMPL7153190685,CGATGGAAAACAAAATCCTCATAGTGTAAC,GCTTGTGTAGAAGGGCCATTGT,GYS2,hg19,chr12,21721725,21721755,21721977,21721999 IAD84954_2_A,M,4,AMPL7153390724,CCCTGTCAAAATTATTTAGGAACTTGTAGC,ACACAGGTCTAGTAAATGATAGCCTAAACT,GBE1,hg19,chr3,81586109,81586139,81586344,81586374 IAD84954_2_A,M,5,AMPL7153190742,TGTCTTTTCTAGCCTCAGGTCTGA,AATCTGATGCTTAGGAATCACTGAATTAGT,GYS2,hg19,chr12,21711906,21711930,21712146,21712176 IAD84954_2_A,M,6,AMPL7153401983,AAAAATTTCAATGTAGTAGCATGCAGCTA,CTCAATGGGATATGTGTTTCATGTGG,SLC25A13,hg19,chr7,95760970,95760999,95761218,95761244 IAD84954_2_A,M,7,AMPL7153190753,ACTAACAAAATTCAAAACATTCCACACTCT,GGAGATTTTTCACTTTACTTGCTCCTTTTT,GYS2,hg19,chr12,21699233,21699263,21699437,21699467 IAD84954_2_A,M,8,AMPL7153401984,CACAGGTAGAAACTGATAACTGGCA,ATCTTCTTTTCTGTCACCTGTTTTCCT,SLC25A13,hg19,chr7,95814105,95814130,95814352,95814379 IAD84954_2_A,M,9,AMPL7153191358,CGGATTGTCACTCCTTATACAATGGG,TGATCTCTGCCAGCCATGAAC,PHKA2,hg19,chrX,18969176,18969202,18969429,18969450 IAD84954_2_A,M,10,AMPL7153431896,CTGAAGGTACCAAGGGCAGGAAA,CAGACCTCACTCTGCTTGTACTC,GBA,hg19,chr1,155209754,155209777,155209880,155209903 IAD84954_2_A,M,11,AMPL7153191376,GCTGACTTTTGACAAATATGCTAATCAGAT,AGGAACATAAAGGAAGCATTTTTCCCA,PHKA2,hg19,chrX,18963085,18963115,18963332,18963359 IAD84954_2_A,M,12,AMPL7153449034,CAGAGTTAGTCTTGATCCACATGCA,GGCAAATCTCTACCAAACAAGGCATA,AGL,hg19,chr1,100350122,100350147,100350264,100350290 IAD84954_2_A,M,13,AMPL7153191388,CATGCACATCACACAGGACAGA,CCTATTAGCGCATCTCCAGGTT,PHKA2,hg19,chrX,18959599,18959621,18959819,18959841 IAD84954_2_A,M,14,AMPL7153451009,GATCTCGGGCTGCTCCATTT,GCGGCTTGGAATGGTTAGTG,GAA,hg19,chr17,78093033,78093053,78093247,78093267 IAD84954_2_A,M,15,AMPL7153191407,GAAAATAATTATCAACGTAACACCCAGCAT,CCATGAGGCACAATGGTATTATGTATGTAT,PHKA2,hg19,chrX,18956707,18956737,18956908,18956938 IAD84954_2_A,M,16,AMPL7153451656,GATTTACCTCTAAAAACACACCTAGTCTGT,TTTCAACACAGATATGCCCATTTATTCAAG,AGL,hg19,chr1,100357092,100357122,100357310,100357340 IAD84954_2_A,M,17,AMPL7153191425,GGTTCCCTGAACCTCCAATCAC,TCAGGTATCATGGCCATTTTATCCTC,PHKA2,hg19,chrX,18949702,18949724,18949901,18949927 IAD84954_2_A,M,18,AMPL7153451657,GTTTTTACAGTGGTCTTTCCTTTATTTGCT,TCAAAATTAATGAAGGCAGTCAATGAAGC,AGL,hg19,chr1,100329906,100329936,100330151,100330180 IAD84954_2_A,M,19,AMPL7153191456,GCAGAATTCTGTCATATTCACAGGAGA,CTTAGCCTGAGTTGCCTGGATT,PHKA2,hg19,chrX,18943697,18943724,18943948,18943970 IAD84954_2_A,M,20,AMPL7153451663,TTTTTCTATGTCAAATCATGCCTCCTTTTG,AAGCTAAAGTTTTAGAGGGAAATACACTCC,AGL,hg19,chr1,100345372,100345402,100345613,100345643 IAD84954_2_A,M,21,AMPL7153191471,CTAAAACTGCATGCTTTTAGGTTCAACA,GGTGTTGATGAAAATGTTTCAGTGCA,PHKA2,hg19,chrX,18942058,18942086,18942306,18942332 IAD84954_2_A,M,22,AMPL7153451706,GCTTTGCTGCCTACTTGACTTT,GCTGGGAAAGGTCAGTGATGAG,FAH,hg19,chr15,80452706,80452728,80452946,80452968 IAD84954_2_A,M,23,AMPL7153191516,TTTCTGTTGTTCCTAAGCCAATCTGT,TCACTTCTTGATCTTCCGAAAGTTCC,PHKA2,hg19,chrX,18926848,18926874,18927095,18927121 IAD84954_2_A,M,24,AMPL7153452209,TGCTGTATATAGTTGTGGGACCGTAT,GCACCAGAGTTCACTTAAATGCACTTATA,PGM1,hg19,chr1,64100488,64100514,64100695,64100724 IAD84954_2_A,N,1,AMPL7153787610,GTGCTAGTACTGGGAATGCACA,CTGAAATTGTGTCTACCTTGATTTTGAACT,LARS,hg19,chr5,145547613,145547635,145547853,145547883 IAD84954_2_A,N,2,AMPL7154898279,CCTGTTTTGTTTCAGGTGGATCATC,GCCTCTGACACTCTGTTGAATTTTACTTAT,PHKB,hg19,chr16,47722937,47722962,47723181,47723211 IAD84954_2_A,N,3,AMPL7153787612,GTCTGTTTCTTCCAATTCTCTTCTCCA,ATCCTTGAGGAATGAAGATTGATTTGACA,LARS,hg19,chr5,145524062,145524089,145524307,145524336 IAD84954_2_A,N,4,AMPL7154914099,GGGACTTATCTAGCAAAGTTGGACA,TGTAACCATGGATGAGATAAAGAAAGCTG,ABCB4,hg19,chr7,87069387,87069412,87069558,87069587 IAD84954_2_A,N,5,AMPL7153787616,ACTGCTTTCAATTCAGAAAACACTAGAAT,TGTGGAAACAGTAAAGTTGAAATGCAAC,LARS,hg19,chr5,145523716,145523745,145523961,145523989 IAD84954_2_A,N,6,AMPL7154914103,GAGAACTACTTACTGTCATTGCATTTCC,GTGACTCGGACTATGGATTGTTATTCTTAA,ABCB4,hg19,chr7,87076337,87076365,87076553,87076583 IAD84954_2_A,N,7,AMPL7153787619,GCTGCCATTTTCTTCAAAACAATATTCGT,CCCACTTCCTTATTGTAAAAGGAACTTAAC,LARS,hg19,chr5,145552177,145552206,145552380,145552410 IAD84954_2_A,N,8,AMPL7154914104,ATAGGCTCAACGTTTTATGTTAATCACCT,GAAATGAAATTGTTGGCTGGAAATGC,ABCB4,hg19,chr7,87046423,87046452,87046664,87046690 IAD84954_2_A,N,9,AMPL7153787620,CCTCTGTGCCCAACTGATTTTT,ACAAAATTTGTGTATTTCTCAGTAATTGCCTT,LARS,hg19,chr5,145539884,145539906,145540069,145540101 IAD84954_2_A,N,10,AMPL7154914110,CACTACATTTGTATGAGGTAGGCATAATGT,CCGGGTTGTATCACAGGATGAAATT,ABCB4,hg19,chr7,87035408,87035438,87035657,87035682 IAD84954_2_A,N,11,AMPL7153787631,TGTGGGTTTAGATGTAATGATCTCTAGGT,TGTTCTTGGTGAAATGAGGTGATGATTAAT,LARS,hg19,chr5,145501977,145502006,145502202,145502232 IAD84954_2_A,N,12,AMPL7154914116,TCACATTTAACATTTCACAGCTTACCAATG,TGCTTGCTATGTTTGTTGAACTGAATAATT,ABCB4,hg19,chr7,87101912,87101942,87102124,87102154 IAD84954_2_A,N,13,AMPL7153787645,TTTACCTTTCAGGCCACTGAGAAAA,TTAGGGACTTGAATCAGATCTCTCACA,LARS,hg19,chr5,145537176,145537201,145537423,145537450 IAD84954_2_A,N,14,AMPL7154914117,CTTTACAAAGAGTATGGCTCATAGTAGCA,CCTATTTAGGCATTCTACTCAGAAAAACCT,ABCB4,hg19,chr7,87055939,87055968,87056117,87056147 IAD84954_2_A,N,15,AMPL7153787650,CTCTACGAAAGGCACGCCTTAA,GTGTGAAGCGTGTGCTTTAGTT,LARS,hg19,chr5,145561916,145561938,145562162,145562184 IAD84954_2_A,N,16,AMPL7154939438,TACTGCTATCCAGGGACACAGT,CCTACAACATACCTTTCAGGTTAACAGAG,FAH,hg19,chr15,80467186,80467208,80467416,80467445 IAD84954_2_A,N,17,AMPL7153787677,TGTTCACATTGACATGTTTTATAGCTACCA,GCAGTATTTTAAATTTGTGTATGCAGCAGT,LARS,hg19,chr5,145510534,145510564,145510734,145510764 IAD84954_2_A,N,18,AMPL7154939826,TCTTTTCCAAAATGTAGTTGCACAAATTCT,AGGGTTCTTTTATTTCTGCCATAGTTTGTA,SLC25A13,hg19,chr7,95838196,95838226,95838417,95838447 IAD84954_2_A,N,19,AMPL7153787701,GCACCACACCTGGACACATTATTT,CTTAGCAAGCCTTTATGAGTCTATTAGCT,LARS,hg19,chr5,145519655,145519679,145519899,145519928 IAD84954_2_A,N,20,AMPL7154939828,TCTTTCTAATGAGTTCCATGTTGTTAAGGAG,TCTTGTACATGCATTTTTGATTACTTTCAAACT,SLC25A13,hg19,chr7,95820469,95820500,95820639,95820672 IAD84954_2_A,N,21,AMPL7153787705,TTTCTTCTCCCAGACATTGCCAA,GGGAGGGTTCTTCTCATTTTTGGT,LARS,hg19,chr5,145508140,145508163,145508390,145508414 IAD84954_2_A,N,22,AMPL7154939830,CCCAACTTGAAACAATGATTGAAGGA,CATTTTTGGAGAAAGCCAGCCTAATC,SLC25A13,hg19,chr7,95906321,95906347,95906556,95906582 IAD84954_2_A,N,23,AMPL7153787717,GAAAATCACAGAGCATGGAGTAAAGC,CAAAAGGACTTGTGCCCTACAGA,LARS,hg19,chr5,145531369,145531395,145531615,145531638 IAD84954_2_A,N,24,AMPL7154939835,ACATTCTTCTACAAAAGGAGTCAAGACATG,CAAGATGTAAACTCTCTTTCTTCAGTCTGA,SLC25A13,hg19,chr7,95822358,95822388,95822572,95822602 IAD84954_2_A,O,1,AMPL7153191540,TTTTCTGTGCTAGACGCATCCAT,CTGTCTGTCGTCTTTGCCAGTA,PHKA2,hg19,chrX,18925011,18925034,18925259,18925281 IAD84954_2_A,O,2,AMPL7153452213,TGGAAGTAGGCAGTCAGACGTA,GGTGAATACATTTTGTTTCTGTCATGCT,PGM1,hg19,chr1,64125167,64125189,64125409,64125437 IAD84954_2_A,O,3,AMPL7153191554,GGTTCGAGATAACCTAAGCAGTTCT,CACCCTGTCTCTGAAACCCTATC,PHKA2,hg19,chrX,18924511,18924536,18924762,18924785 IAD84954_2_A,O,4,AMPL7153452215,ACAGCTACTTCTCTGTGGGTTTTT,GATGGCACTGAGCCATTTTGTG,PHKA2,hg19,chrX,18972293,18972317,18972545,18972567 IAD84954_2_A,O,5,AMPL7153191568,CCTCATGCCCTAGGTTTCTGTC,CGGGTTGGATGCTGTAGAGTTC,PHKA2,hg19,chrX,18919514,18919536,18919753,18919775 IAD84954_2_A,O,6,AMPL7153452217,TCCCTGCATTACTTTGATAAAAGAAGGT,TGGTTTCATTGGCTCTTTTTCTTGC,PHKA2,hg19,chrX,18936738,18936766,18936986,18937011 IAD84954_2_A,O,7,AMPL7153191586,CATCCCGCTGAAAACACTTCAG,GCTTTCTGTGGGTGTTTCGGAT,PHKA2,hg19,chrX,18917171,18917193,18917422,18917444 IAD84954_2_A,O,8,AMPL7153452219,GAATTGGGCAACAATTCCTGCA,GCCAAGGCTCTACTAGAGCAAC,PHKA2,hg19,chrX,18911622,18911644,18911873,18911895 IAD84954_2_A,O,9,AMPL7153191678,CACCTTGCTAATGGAGTTGTAGTAGG,TTTGACATCTGCTACACGTCAGT,PGAM2,hg19,chr7,44104712,44104738,44104952,44104975 IAD84954_2_A,O,10,AMPL7153452369,GAGGCCCTGACTTGTGCTATTT,CTGCTAACAGGAGCAAGGAAGA,PHKG2,hg19,chr16,30762391,30762413,30762611,30762633 IAD84954_2_A,O,11,AMPL7153191807,GGGTCAGAAGGTAAGACTTCACTATG,TGCAGAGTTAAGACTTGCTTGTTAACATAA,GBE1,hg19,chr3,81640155,81640181,81640344,81640374 IAD84954_2_A,O,12,AMPL7153452501,GATGATGTGAGGATTCCACTGTGT,AAAATTAAGGGTCCTAGCCAGAAATCTTT,PHKB,hg19,chr16,47699740,47699764,47699984,47700013 IAD84954_2_A,O,13,AMPL7153194624,CTGTTCCAACTCGGTAGTCAGT,AGGTACAGCAAAATTGTAACATGTTCAAAA,GBE1,hg19,chr3,81584359,81584381,81584602,81584632 IAD84954_2_A,O,14,AMPL7153452504,TGCCTTTGGGCATGAAGAAGAA,CTCTTTATGCAAATGCAAAGGACTTCA,PHKB,hg19,chr16,47703137,47703159,47703333,47703360 IAD84954_2_A,O,15,AMPL7153194628,TTTTTCCATGTTGCTTATTTGAAGAGTTGT,TACAATGTCTCATTCAACTCCTCAACTG,GBE1,hg19,chr3,81548156,81548186,81548402,81548430 IAD84954_2_A,O,16,AMPL7153456175,GCCTGCACCCACCTTTTTGA,TGATGTGGCCTACATGTACCCT,GALE,hg19,chr1,24125093,24125113,24125225,24125247 IAD84954_2_A,O,17,AMPL7153194902,AGATACCTTTGAATTGGGAGAGTTAATTCG,AAAAGGTACTACAGAAATTGTTTCGCAA,HADHA,hg19,chr2,26461796,26461826,26462039,26462067 IAD84954_2_A,O,18,AMPL7153457653,TAATCCCGGACACCTGCAGAGAA,ATGTCTCCCAGGTAAGGCAAAAG,GALE,hg19,chr1,24123260,24123283,24123511,24123534 IAD84954_2_A,O,19,AMPL7153194912,AGGAGAAATTATTAGGCCTAAGAAACACAC,TGATGGTGGTACGTACATCCAGT,HADHA,hg19,chr2,26459649,26459679,26459900,26459923 IAD84954_2_A,O,20,AMPL7153457672,CCTGAGGAGTCCATCGATCAGT,TAATGTGTGAGGCAGAGGTCACT,GALE,hg19,chr1,24124132,24124154,24124383,24124406 IAD84954_2_A,O,21,AMPL7153194945,TACCACTTCCTCATTTTGAATCTACAGC,TTTTCACTACCTGGGACTGGTCTA,HADHA,hg19,chr2,26437834,26437862,26438083,26438107 IAD84954_2_A,O,22,AMPL7153457942,AGGTATGAGAAGAAGAAAGCTAGTCCA,GCTGCAAAATGTCTTGAGTACATTTAGAT,ABCB11,hg19,chr2,169814434,169814461,169814666,169814695 IAD84954_2_A,O,23,AMPL7153194955,CCTTTTTCAGCTTTATACAGAGGATTGGA,AACACTGGCAATTTTATTCAGCATTATTGT,HADHA,hg19,chr2,26435358,26435387,26435547,26435577 IAD84954_2_A,O,24,AMPL7153457946,TCTCTGAGGATTAGGACTACAGAGGA,AAGTTAACAGAATGTTTTGGCATTTGACA,ABCB11,hg19,chr2,169824860,169824886,169825098,169825127 IAD84954_2_A,P,1,AMPL7153913563,CTCGATCCCAAGGATCCCTTTC,TCTCCACCTTTCCTTCCTTGTCTA,FBP1,hg19,chr9,97368989,97369011,97369239,97369263 IAD84954_2_A,P,2,AMPL7154940044,TCTGGTTAAGAAAACACCCAGAAAATGA,GCTACATTTGCAGGGATTGAAAACAA,SLC25A13,hg19,chr7,95750331,95750359,95750572,95750598 IAD84954_2_A,P,3,AMPL7154029741,TCTACGGGTCTCACCCTTTCTAC,GACTCATTTCCCAGAAAACACAAGG,GAA,hg19,chr17,78081612,78081635,78081795,78081820 IAD84954_2_A,P,4,AMPL7154973966,CTCCCACATGCTCTTTAGGCAT,GGTTGGCCTGGTCAACATATTCT,SLC37A4,hg19,chr11,118898842,118898864,118899004,118899027 IAD84954_2_A,P,5,AMPL7154030930,CCTCTGCCAGACTGTTGACAC,CAGTCTGTGGATAGCAGCCAA,POLG1,hg19,chr15,89872011,89872032,89872249,89872270 IAD84954_2_A,P,6,AMPL7154973975,ACCACAAATACATGTGCTATACAAAACAA,AGAGGGACTCATGATCTTTGGGA,GBE1,hg19,chr3,81691755,81691784,81691955,81691978 IAD84954_2_A,P,7,AMPL7154031092,CGCCTCTTTCTAAGTCGGCTT,CTCCTCGCAGCCCAGAAAAAGAG,DGUOK,hg19,chr2,74154050,74154071,74154283,74154306 IAD84954_2_A,P,8,AMPL7154973977,GCCTTTGATTCTTGGTAGTACATTGCA,TACCAGAATTCCTGGCTTAACTCTATACAT,GBE1,hg19,chr3,81698011,81698038,81698159,81698189 IAD84954_2_A,P,9,AMPL7154107511,TGGTGCCCAGGAGGAGTAGG,GGAGAATCCCAGCTTCCTACG,TJP2,hg19,chr9,71789207,71789227,71789455,71789476 IAD84954_2_A,P,10,AMPL7154973982,GCACTGTTGAGGGACCCTTATG,GAGAGTTCTGCTTCCTGGGAATC,PHKG2,hg19,chr16,30768200,30768222,30768433,30768456 IAD84954_2_A,P,11,AMPL7154349229,AGAAATCCTGCAGTTTAACCTGCT,GGGAGAGCTGCACTTCTCAG,GAA,hg19,chr17,78086673,78086697,78086927,78086947 IAD84954_2_A,P,12,AMPL7154973984,GGTATCTAGCGCCAGAGATCCT,TGATCATGCGTAACATCAGGATCTG,PHKG2,hg19,chr16,30767521,30767543,30767751,30767776 IAD84954_2_A,P,13,AMPL7154407716,TGAAAAGCATTGCTATGGCCCATA,CTCAGAAGCCTTCACTGTCAACTT,SERPINA1,hg19,chr14,94848813,94848837,94849062,94849086 IAD84954_2_A,P,14,AMPL7154973993,GCTGCCACCTCTTATGTGATCC,GGACAGGCAATATGAAGTTCATGCT,PYGL,hg19,chr14,51376489,51376511,51376738,51376763 IAD84954_2_A,P,15,AMPL7154420726,GCTGAGTTCTTTGACTTCCAACGA,GGGAAGGAAAATAGCTTATGCATTGTTTTT,SERAC1,hg19,chr6,158535825,158535849,158536022,158536052 IAD84954_2_A,P,16,AMPL7154974001,GTAAGAGGGAGGGAGGAAGGAATATTTA,CTTCATCAACAACTTTTCTGAATGCTTTTT,GYS2,hg19,chr12,21727049,21727077,21727274,21727304 IAD84954_2_A,P,17,AMPL7154420872,CCCTCCTGAGGAACCAAATCTT,CGAAGCGAAGAGAGTGATCTTCG,SERAC1,hg19,chr6,158565153,158565175,158565370,158565393 IAD84954_2_A,P,18,AMPL7154974002,CCTTCCTCCTCGGTTTTCACAA,GAAGACTCAGGTGGAACAGTGT,GYS2,hg19,chr12,21733087,21733109,21733335,21733357 IAD84954_2_A,P,19,AMPL7154483596,GGGAATCTGGACAACAGAATAGCTA,AAAGCATTAAATATTTACATGCTGCTGTTA,ABCD3,hg19,chr1,94941192,94941217,94941382,94941412 IAD84954_2_A,P,20,AMPL7154974007,CCATGCAGCTTTTTCTTCCCATG,CCAAGAAACTGTTGTGATGTTTATGTCTTA,GYS2,hg19,chr12,21689904,21689927,21690125,21690155 IAD84954_2_A,P,21,AMPL7154483602,CGGCCTTCAGCAAGTACTT,GTCGGGCAAAGAGACCTGT,ABCD3,hg19,chr1,94884039,94884058,94884222,94884241 IAD84954_2_A,P,22,AMPL7154974008,GAACAAAGTCTTTTCAAGATCAAAGTCGA,ATGCCATGTACAAGGCCAGAAT,GYS2,hg19,chr12,21715939,21715968,21716191,21716213 IAD84954_2_A,P,23,AMPL7154483625,GCCAGGTGGAACACCTACATAA,GCGACTGACAACTAGGTAACCAA,ABCD3,hg19,chr1,94953093,94953115,94953264,94953287 IAD84954_2_A,P,24,AMPL7154974010,GTGAGATTACCACAGCTGTTTTCG,GGAAGGTGAATATAATCTCTCTGTGAAACA,GYS2,hg19,chr12,21713310,21713334,21713549,21713579 IAD84954_2_B,A,1,AMPL7154974050,GAGTCCAACATCAGCAGGTTCA,GGTTTGAGCCATCTCAGTTTGG,SLC37A4,hg19,chr11,118898375,118898397,118898559,118898581 IAD84954_2_B,A,2,AMPL7158541186,ACACAAAATGATTGGGATCTACAGATTACC,GGACACAGTTGATACTCAGTAACCATATTT,LARS,hg19,chr5,145512432,145512462,145512676,145512706 IAD84954_2_B,A,3,AMPL7155033510,GCAGATTAGGCTGTCCAATTGTTCT,ACTGCAAATCTAATCAGTGTAATAAACGCT,CYP7B1,hg19,chr8,65527587,65527612,65527821,65527851 IAD84954_2_B,A,4,AMPL7158541205,CAATGAGATGGTGAGGACGAAATACA,TTCTGCACCTTTAACATCATACAAGGT,LARS,hg19,chr5,145533249,145533275,145533496,145533523 IAD84954_2_B,A,5,AMPL7155033513,ACATCAGAATCTGGATACTGAATACCAAAC,GAGGGAAAAAGCTGAAGTGTTACCT,CYP7B1,hg19,chr8,65509227,65509257,65509403,65509428 IAD84954_2_B,A,6,AMPL7158541211,CTTTACCTTCCCTTTAGCTGGCAT,CCTTGGTATGAAACTATAATCAAGAACCGT,LARS,hg19,chr5,145508535,145508559,145508739,145508769 IAD84954_2_B,A,7,AMPL7155056769,AACATTGGAAACCATTGCGCAT,TCTAGTCCACAGTATCTGGTATTTTATGGT,NBAS,hg19,chr2,15691556,15691578,15691711,15691741 IAD84954_2_B,A,8,AMPL7158541212,TTGATTTAGGTGGTGTTTACGTAAGTGT,CCAAAAAGCAGCCAGGAATATGTC,LARS,hg19,chr5,145536780,145536808,145537026,145537050 IAD84954_2_B,A,9,AMPL7155056773,AGGAAAAAGCCTTACCTCCAAACT,TTTTGAATTTAAACCACATTAGCAGATGCA,NBAS,hg19,chr2,15615796,15615820,15616033,15616063 IAD84954_2_B,A,10,AMPL7159801560,CCAATGTGCATGAGTTTAATGAACCA,AGGGTTTGAGTGACTGTAATTAAATGCTTA,LARS,hg19,chr5,145493654,145493680,145493898,145493928 IAD84954_2_B,A,11,AMPL7155056777,TCCAGTCTCTGGGATTGCTTACA,ATGATAACTTTAGTCATTTCCAGTGCCTT,NBAS,hg19,chr2,15326783,15326806,15327027,15327056 IAD84954_2_B,A,12,AMPL7160391729,CTCTTTGGTCTCAGGAACTGCT,TTCAGGAAGGAGTTGACCCGAAGAAG,HADHA,hg19,chr2,26416374,26416396,26416620,26416646 IAD84954_2_B,A,13,AMPL7155056785,CATTATTTCAAATATGGCTTCCAAAGCACA,CCTGAAGCCAGTGTATCAGATATTCTCTAA,NBAS,hg19,chr2,15676505,15676535,15676742,15676772 IAD84954_2_B,A,14,AMPL7160464979,ATCACAGGACCTTCCCAGAGACA,CTAGCCTTCGGCTTAGCCTTAG,POLG1,hg19,chr15,89870082,89870105,89870321,89870343 IAD84954_2_B,A,15,AMPL7155056799,GAATGCTGGCTGCATCTACTGA,CGGTTTACTGCAGATGACCAGTATA,NBAS,hg19,chr2,15432465,15432487,15432688,15432713 IAD84954_2_B,A,16,AMPL7160478536,ATTAAATGAGAACCAGAGCATAACGGT,TTTTCACGGAGCAGAGAGAAGGCAT,PHKB,hg19,chr16,47730233,47730260,47730431,47730456 IAD84954_2_B,A,17,AMPL7155056813,GAGCCTGGGACTTGTTTAATGAGA,TGGAATGAACCACTTACCTACTTTCTTTTT,NBAS,hg19,chr2,15415726,15415750,15415953,15415983 IAD84954_2_B,A,18,AMPL7160478541,AAAAAGCAGTGGAGCTAGGGT,AAGCACCACCCAAGGTACTC,PHKB,hg19,chr16,47495118,47495139,47495368,47495388 IAD84954_2_B,A,19,AMPL7155056835,CACACAATAAAAATCAAGACTGAAAGCCA,TGTGCTATTTGTCTGCATATATGTGGT,NBAS,hg19,chr2,15694075,15694104,15694306,15694333 IAD84954_2_B,A,20,AMPL7160517371,CTTTCTAGGGACATTGCAGGGAT,ATAGCCAAAGGGACGCCATTCAGA,BCS1L,hg19,chr2,219526290,219526313,219526540,219526564 IAD84954_2_B,A,21,AMPL7155056837,ACACGTGTTTTGAGTATTTTAGAAAAGGC,TGATCTTCATAATTTCCTTTCAGCTGAGTT,NBAS,hg19,chr2,15448269,15448298,15448500,15448530 IAD84954_2_B,A,22,AMPL7160626648,TTGAGGAGCGAGAGGCAGTTAT,CTTACAACGTGTCTCTGCTTCTCT,SERPINA1,hg19,chr14,94844768,94844790,94844986,94845010 IAD84954_2_B,A,23,AMPL7155056843,CTTTTATTAGGCTCCACATCAGAAGTCT,TGTGCCCAAAACTCTGAGTATTAGTAAAT,NBAS,hg19,chr2,15698617,15698645,15698845,15698874 IAD84954_2_B,A,24,AMPL7160848277,CTGGTTCACCTGTACTTCAGTCTC,TGAGGGATTCCGTAGAGACACT,NBAS,hg19,chr2,15701303,15701327,15701455,15701477 IAD84954_2_B,C,1,AMPL7155056852,GAAAACTCACCTTGCAAAGGCA,AGAAAGGTGAACATATGTTGCTTCTTTTTA,NBAS,hg19,chr2,15514722,15514744,15514867,15514897 IAD84954_2_B,C,2,AMPL7160849942,ATCCTTGCCAGAGACGCGAAGAT,CGATTCAGGTACTGATTCTTCCAAAGAAAT,LARS,hg19,chr5,145522497,145522520,145522692,145522722 IAD84954_2_B,C,3,AMPL7155056858,ACAGTAACAACTCATTTACTTGGAAAAGTT,GAAAGCTTTTCACAACACGAAGTTTTTAAA,NBAS,hg19,chr2,15607769,15607799,15607964,15607994 IAD84954_2_B,C,4,AMPL7160849954,GCCCTCTTACCTCAAGCGAATT,TGATTTTGTTTTTCCATACCATTTTGGCT,LARS,hg19,chr5,145503535,145503557,145503654,145503683 IAD84954_2_B,C,5,AMPL7155056864,GTGGGCAAGTGATTTCTCCAGA,AGGGTTCTTTGGTCTCACTATTCTTTTT,NBAS,hg19,chr2,15378643,15378665,15378816,15378844 IAD84954_2_B,C,6,AMPL7160850000,GGACGTCATACAGGTTAGGATTTCC,GCCATTGCATTTGTCATCTTAGATTGAA,NBAS,hg19,chr2,15493635,15493660,15493881,15493909 IAD84954_2_B,C,7,AMPL7155056880,TCAATGTCTTTCATCTGCTGGAGTT,AATACTCAGGAACTTATTGTTGCTTTTCAA,NBAS,hg19,chr2,15557676,15557701,15557842,15557872 IAD84954_2_B,C,8,AMPL7160850002,AGTGAGGTTGGTAGAAGAATTGAAGTAC,CTTCATTTCACTGAGAACTGAATCTTCC,NBAS,hg19,chr2,15519749,15519777,15519992,15520020 IAD84954_2_B,C,9,AMPL7155056927,CCACACCAGGCTGTTTGTAGAT,ACTGAAGCCATTCTCAAAGCCT,NBAS,hg19,chr2,15358701,15358723,15358913,15358935 IAD84954_2_B,C,10,AMPL7160850003,CTTCGGGCAGCAAAACAGAATA,GGCTAGGAAAAACTAGGGTCATTTCAA,NBAS,hg19,chr2,15601329,15601351,15601574,15601601 IAD84954_2_B,C,11,AMPL7155056951,CACAATGAGGTTGTCAGAAAAAGAGAAAT,GCCTAAGATTCTTAGACTCTTTTTGTTTGG,NBAS,hg19,chr2,15534265,15534294,15534509,15534539 IAD84954_2_B,C,12,AMPL7160850023,GCGGCTCAAGGTAGTGCA,AGGAGCTTGGGTGAGATGGT,TALDO1,hg19,chr11,763652,763670,763868,763888 IAD84954_2_B,C,13,AMPL7155056954,ATCAAGTAAGGTTTCATTGGTCAGACA,GTTATAGAGATGCTGTTTGCATTTTACTCC,NBAS,hg19,chr2,15567736,15567763,15567980,15568010 IAD84954_2_B,C,15,AMPL7155056981,TCTAAGACAAATAGCACAGTGAAATGACA,GTTTCTGCTCTCTTTGTTTTGCTCTTATTT,NBAS,hg19,chr2,15651273,15651302,15651517,15651547 IAD84954_2_B,C,17,AMPL7155056997,GGGAAAAAGTGCCCAGAATTTTAAGA,AACTTCATTCTTGTTTGTCTGTTTTGCT,NBAS,hg19,chr2,15555627,15555653,15555858,15555886 IAD84954_2_B,C,19,AMPL7155057019,CCTCTAGCAGCTGCTGAATCAT,ATGTTTCACTTTGTGCATGTAGATACATTT,NBAS,hg19,chr2,15374745,15374767,15374915,15374945 IAD84954_2_B,C,21,AMPL7155057039,TCTCACCTGAGAATTTGTTCCAGTTG,TCTGTAACAGAGAATATTGTTCTACTCTAGCAT,NBAS,hg19,chr2,15536531,15536557,15536770,15536803 IAD84954_2_B,C,23,AMPL7155057052,AGACCAAGAATATCCGATATTAGGGCA,GGGCTCAACGGAATATTAATCATTTTCAT,NBAS,hg19,chr2,15607363,15607390,15607594,15607623 IAD84954_2_B,E,1,AMPL7155057074,TCACAAATTTTTGGTTAACAATGTTCACCT,TAAGCATATGTTTGTAGGACAAAAGGCA,NBAS,hg19,chr2,15467803,15467833,15468029,15468057 IAD84954_2_B,E,3,AMPL7155057088,TCTTGGAAGCCTCATACATACGGA,CCAGCCAGGTTCATTTAAGGGT,NBAS,hg19,chr2,15372453,15372477,15372704,15372726 IAD84954_2_B,E,5,AMPL7155057094,GCTCCATTTCAGTCACCAAGTAAAG,AGCTGATTTAATGAATCAAACCAGAGTAGA,NBAS,hg19,chr2,15614289,15614314,15614533,15614563 IAD84954_2_B,E,7,AMPL7155057102,GCACATATTCTGCTATTGTCCTGCAA,GCCTTGCATTAGGAAGGCCATT,NBAS,hg19,chr2,15506621,15506647,15506872,15506894 IAD84954_2_B,E,9,AMPL7155057109,CCATGCAGTTGATTTTAAAAAGAAAGATGC,CATTTTTGCCCTTGCTATTTTGTTTCT,NBAS,hg19,chr2,15470683,15470713,15470898,15470925 IAD84954_2_B,E,11,AMPL7155057113,TTGTCAATACTCACCCTTAAGAGAGTATCA,CCTCTAAAGAGTGTCATTTACTTCTGAGTT,NBAS,hg19,chr2,15628966,15628996,15629197,15629227 IAD84954_2_B,E,13,AMPL7155057115,CAGCAATGTAAAGTACTCTAAAATGAAGCC,GACCCTGTGGATAATTCAGTCATGT,NBAS,hg19,chr2,15613253,15613283,15613502,15613527 IAD84954_2_B,E,15,AMPL7155057149,GTCGAATGTGGGTTTCTGGTTTAATG,ATCTTAACACAGTTCCTTTGGCTCTTAAT,NBAS,hg19,chr2,15417005,15417031,15417230,15417259 IAD84954_2_B,E,17,AMPL7155057669,CTAGCCAAGAGGTGGTCAACAA,GGGCATGAATGATGATGAAGGCA,NBAS,hg19,chr2,15307332,15307354,15307529,15307552 IAD84954_2_B,E,19,AMPL7155152341,ACCCAGATGTTCCAGAGGTTCTAT,GGCAGATGTTTATTGAGCTAGAGGA,BCS1L,hg19,chr2,219527933,219527957,219528135,219528160 IAD84954_2_B,E,21,AMPL7155152614,CTGACAATAATGGGTGACCTGTCA,GCACATCAATGAACTTGGGTGT,MPI,hg19,chr15,75189162,75189186,75189401,75189423 IAD84954_2_B,E,23,AMPL7155152618,GCAGGGACCTTTTCCTAGGACT,TACGTTGGCCTCCAGAAACATG,MPI,hg19,chr15,75188397,75188419,75188622,75188644 IAD84954_2_B,G,1,AMPL7155152619,GGTCTACTGCCTCCCTGTATGT,CAATCCACTGGCTTAGGGTCTTC,MPI,hg19,chr15,75183546,75183568,75183778,75183801 IAD84954_2_B,G,3,AMPL7155152624,CATGAGCTGATGAGAGCAGAGT,CACGGAATATCAGCAGGTCCTT,MPI,hg19,chr15,75189795,75189817,75190032,75190054 IAD84954_2_B,G,5,AMPL7155153391,TAAGATAGAAGGAAACTTGAGGCAGAGTA,CCATTGTATGGACTAACAGTTCCCT,ABCB11,hg19,chr2,169869604,169869633,169869814,169869839 IAD84954_2_B,G,7,AMPL7155291238,TGAGCTTTCTCCATGCCAACAA,CCAAGCCTATTAGGGCACTAGATC,PHKG2,hg19,chr16,30764744,30764766,30764885,30764909 IAD84954_2_B,G,9,AMPL7155291611,CTGAAGGTTCCACGTTCCAGAT,CTCTGGGCTGTATATGCATATGTTGTT,PYGL,hg19,chr14,51372160,51372182,51372279,51372306 IAD84954_2_B,G,11,AMPL7155319553,GTGTACCATCTGTAGTTTGCACCAT,CCTGAAACCTCTTGTTCTGAAAAACATATT,ATP7B,hg19,chr13,52544814,52544839,52544928,52544958 IAD84954_2_B,G,13,AMPL7155416977,TTCTCCATAGCCTGGACCATCT,CCTTAAGGAAGCTGAAAGAACAGTG,GALE,hg19,chr1,24123015,24123037,24123196,24123221 IAD84954_2_B,G,15,AMPL7155561921,GAAGAGTTCAGGCCAGTCATCTT,GGTCATTTCCTTTACGAAGATCTGACTC,TJP2,hg19,chr9,71840075,71840098,71840238,71840266 IAD84954_2_B,G,17,AMPL7155561923,GCAGAGTAACTTACACCTGTATTTGGG,CTCTTGACTTTTCTATCAATTTTCGAGCAT,TJP2,hg19,chr9,71840731,71840758,71840974,71841004 IAD84954_2_B,G,19,AMPL7155561932,TCTGCCGTTGCTGGTAATGAAA,CCTTGTGATCCATCTTCTCAAATATTTTGA,TJP2,hg19,chr9,71866017,71866039,71866203,71866233 IAD84954_2_B,G,21,AMPL7155561936,GTCCGTTTCCGGATGAGGAA,CTGTAGCCACTCCGGAAACTT,TJP2,hg19,chr9,71835657,71835677,71835906,71835927 IAD84954_2_B,G,23,AMPL7155823115,TGGCAGCCATAAACTTTTTATTCCATTC,CCCTCTCTAAAGTGTATTTGTACAGAATCT,ATP8B1,hg19,chr18,55336618,55336646,55336843,55336873 IAD84954_2_B,I,1,AMPL7155823252,GGGTACCATGGTGTTGAGAACA,GTTGGAAATCCATCTTCAGAATGCATTTAA,ATP8B1,hg19,chr18,55359056,55359078,55359247,55359277 IAD84954_2_B,I,3,AMPL7155826140,CTCAAATTTAGGCTGCACCTTGAT,GAAACTGCTGAAAATATAGGATTTGCTTGT,ATP8B1,hg19,chr18,55334135,55334159,55334370,55334400 IAD84954_2_B,I,5,AMPL7155850369,CCCAGCCATTCCACCTTGTATA,GCTGGAATACATGTTCTCTTTCCATCT,ATP8B1,hg19,chr18,55319159,55319181,55319281,55319308 IAD84954_2_B,I,7,AMPL7155851287,TGCATCTCCAGAGACCATGAAGA,AAGCACAAATCAATCTGAGGATAAAGGA,TJP2,hg19,chr9,71820062,71820085,71820235,71820263 IAD84954_2_B,I,9,AMPL7155982200,CCAAATGAAGTCAAGATGCTCCCAT,AGGCTTTCTCTGGTTCCTTTTCAT,LIPA,hg19,chr10,90974648,90974673,90974823,90974847 IAD84954_2_B,I,11,AMPL7155998805,GGATGTGCATGCCACCCTATAT,TCCTAACATCGATGATCCTCTTCTTCATA,ATP8B1,hg19,chr18,55319637,55319659,55319826,55319855 IAD84954_2_B,I,13,AMPL7155998809,AGCTCATGATGCTATTACTCTTCTTTTGG,TTTCTGCCACGGCTTAGTCATT,ATP8B1,hg19,chr18,55362287,55362316,55362409,55362431 IAD84954_2_B,I,15,AMPL7156398158,CTATTGACACAGGGTACCGACAT,CACACACACGGAAGATGAATAATAAAATGA,AKR1D1,hg19,chr7,137773384,137773407,137773566,137773596 IAD84954_2_B,I,17,AMPL7156413496,GTCAGCCCAGGTCAGAAGAACC,GCATCATGTTTATTGCGAATTCTGCT,ABCB11,hg19,chr2,169791512,169791534,169791755,169791781 IAD84954_2_B,I,19,AMPL7156413498,AACATACAAGTATAGGGAAAAAGCACTTG,GTTTTGTTTAATGGTGCACTGTACATTCT,ABCB11,hg19,chr2,169825830,169825859,169826066,169826095 IAD84954_2_B,I,21,AMPL7156413502,CCGCGTATTGAGTTCAGTGGT,GAGAAGGTATTTAATAGAGCCTTTCTCTTT,ABCB4,hg19,chr7,87082268,87082289,87082459,87082489 IAD84954_2_B,I,23,AMPL7156413619,AGGCCAGGTCCACAAAGTTTTT,TGAATGTAACCTTTTCCCTCTCTGATTT,ATP8B1,hg19,chr18,55328541,55328563,55328699,55328727 IAD84954_2_B,K,1,AMPL7156413620,CACTTACCATATATCTGCCCGTTGAT,GCTCTCTACGGAAAATAATCTTCTGTCTT,ATP8B1,hg19,chr18,55355524,55355550,55355744,55355773 IAD84954_2_B,K,3,AMPL7156572067,GAAGCTGCTTAGCCCTGAGAT,CATGAACAAGCATGAGGATTCTGTATTTG,POLG1,hg19,chr15,89872276,89872297,89872483,89872512 IAD84954_2_B,K,5,AMPL7156572068,TGACGCTCTGAGTAGTGCAGA,CCCAACAACTGCCCTTACCAT,POLG1,hg19,chr15,89868777,89868798,89868949,89868970 IAD84954_2_B,K,7,AMPL7156572550,CCTCAGTCCCAACATGGCTAAG,CATGTTTAACATCCAGCACTGTAAGAA,SERPINA1,hg19,chr14,94847143,94847165,94847351,94847378 IAD84954_2_B,K,9,AMPL7156595664,TGTCCTTCAGTCTCCTGTCATCA,ACCCAGGAGGCTTTTATGAAGC,ALDOB,hg19,chr9,104186902,104186925,104187132,104187154 IAD84954_2_B,K,11,AMPL7156614283,GAAGGTAGTAAGCATGCCAGCTA,GAGGTTTAGGACTTCAACATTTGAATCTG,ATP8B1,hg19,chr18,55373648,55373671,55373891,55373920 IAD84954_2_B,K,13,AMPL7156614301,ACGAAAGAGTCTTCCCTAGACCTT,TGTCCAGGCCGTATATGGTCTTA,ATP8B1,hg19,chr18,55352206,55352230,55352436,55352459 IAD84954_2_B,K,15,AMPL7156614305,CCTACCTGCTGCAATGGGTATC,GACGTCGTCCTTATCAGAGTGAG,ATP7B,hg19,chr13,52511407,52511429,52511606,52511629 IAD84954_2_B,K,17,AMPL7156614324,GCATGCACACACACGTCAAATAA,CATCATTGGTGGAAGAGATCCCTT,SLC37A4,hg19,chr11,118899718,118899741,118899949,118899973 IAD84954_2_B,K,19,AMPL7156624646,GGATCCACAGCTGTCAGTTTCC,GTTCAGAACTTTTTGTGGGAGCATTAA,LIPA,hg19,chr10,91007314,91007336,91007470,91007497 IAD84954_2_B,K,21,AMPL7156631946,GAAAAGTTTCAATGGCTCTATGTCATCTT,CGCTGGGTACTGATACCCTTATTC,GBA,hg19,chr1,155209361,155209390,155209570,155209594 IAD84954_2_B,K,23,AMPL7156653871,GCACCAACAGCATCTTCTACACTC,GACTTCTTTGGACACTATGCCTGT,JAG1,hg19,chr20,10638949,10638973,10639173,10639197 IAD84954_2_B,M,1,AMPL7156657172,GCAACAAGCACATCAAATTTAGTTGC,AGTTGTGACACCATCTCCACAAAA,TRMU,hg19,chr22,46739212,46739238,46739448,46739472 IAD84954_2_B,M,3,AMPL7156657176,GTGTGTGCTGGTAGGACAGTT,GTCAGTCACCTAGTGCCATCT,TRMU,hg19,chr22,46751242,46751263,46751473,46751494 IAD84954_2_B,M,5,AMPL7156657240,CGCATTTTTAAATGCAATAACTAGCTTCCA,AGAGTAGCTCTTGTGTTACATTTTGATTGT,SERAC1,hg19,chr6,158571421,158571451,158571655,158571685 IAD84954_2_B,M,7,AMPL7156657258,CTTAGAAATGGCCACAATTCTATCACTG,ACTGTGATGGTAACATGTTCTTGTAGTTAA,SERAC1,hg19,chr6,158579238,158579266,158579455,158579485 IAD84954_2_B,M,9,AMPL7156807788,GTACCAGGAATAAAGTCTGTCACTGATC,CAAAGGTTGCCATTTCATGCCAATA,HADHA,hg19,chr2,26454879,26454907,26455127,26455152 IAD84954_2_B,M,11,AMPL7156860306,AACATTACATTACCTGCGCAGAGTA,TATGATCCACAGTGTTTTCTCCCTCT,ATP8B1,hg19,chr18,55322413,55322438,55322658,55322684 IAD84954_2_B,M,13,AMPL7156898025,AGCCTTTACTTATTAAAACAAAGTATTTGATGC,TTTGACACCTTGTCTGGAGTCTG,TJP2,hg19,chr9,71854770,71854803,71854940,71854963 IAD84954_2_B,M,15,AMPL7156898027,GAGGACTTGAATAGTGACATTAAGGACT,GATTTCTAACAGGTAGAGAACGGCAT,TJP2,hg19,chr9,71849173,71849201,71849391,71849417 IAD84954_2_B,M,17,AMPL7156908760,GGCACTTGTCGTAGTAGTGCT,CGTGGCAGAGCTGAAGAAGAG,PYGL,hg19,chr14,51410884,51410905,51411029,51411050 IAD84954_2_B,M,19,AMPL7156909439,GTTTCAAGCTCAATTTGGTTCTAACTACC,CCCTTGTTCAACCTATGTCATCACA,PYGL,hg19,chr14,51387591,51387620,51387826,51387851 IAD84954_2_B,M,21,AMPL7157015408,CATCAAAACAAGCTTCTTTCAGTGGA,ATGTCTGTCCAGAAGAACTAGAAAAGATG,SCO1,hg19,chr17,10595888,10595914,10596102,10596131 IAD84954_2_B,M,23,AMPL7157089226,CGAAGAGATGGCTTTGACTGCT,AGTGCCTACTGCCCTCTCTT,FBP1,hg19,chr9,97401452,97401474,97401660,97401680 IAD84954_2_B,O,1,AMPL7157089227,GGTTGCAGAGCATCCTTCTCAG,AGAATGCCTCCTGTTAATGGTTGAA,FBP1,hg19,chr9,97372303,97372325,97372402,97372427 IAD84954_2_B,O,3,AMPL7157133252,AAGCACCTACCTTAATAATGCATCATAGAG,TCAACAAAACAATAGCATTATCGTGACAAA,GYS2,hg19,chr12,21712575,21712605,21712699,21712729 IAD84954_2_B,O,5,AMPL7157229966,AGGTATGATTACGAGGAGGTGGAA,TGAGGTCTCTCTCTCACTTACACAC,PGM1,hg19,chr1,64117338,64117362,64117537,64117562 IAD84954_2_B,O,7,AMPL7157229967,GTGACTCTGGATGTATTGATGTTAAAGAGT,TTTGTCCTACTGAATGTAAACTTACCTGTC,PGM1,hg19,chr1,64095043,64095073,64095280,64095310 IAD84954_2_B,O,9,AMPL7157266192,GCCATCAGGGCCTCTTTGATG,CTGAAGGGCTCCTGAGTGAAAA,ALAD,hg19,chr9,116152704,116152725,116152940,116152962 IAD84954_2_B,O,11,AMPL7157266194,GTAGGGACACAGGCAGACATCACAG,TCCTGCCTTCCAAAGCTACATG,ALAD,hg19,chr9,116153097,116153122,116153250,116153272 IAD84954_2_B,O,13,AMPL7157739005,CCTCGGTCTTGCTATGTCGA,CTCATTCCTCCCGGAACGA,TALDO1,hg19,chr11,747469,747489,747694,747713 IAD84954_2_B,O,15,AMPL7157739006,GGCGAACCTCAGAAGCTTCTAA,CTTGCGTCTACTTCTGTGGATACTC,TALDO1,hg19,chr11,758901,758923,759032,759057 IAD84954_2_B,O,17,AMPL7157739008,CCGTGAGCGTCTTTGGCA,CCTGGGCGAAGGAGAAGAGTA,TALDO1,hg19,chr11,763132,763150,763384,763405 IAD84954_2_B,O,19,AMPL7157739010,GGGCTTGGCTTTCCTAACACAT,GCAACCAACGGAAAGACTTCTCA,TALDO1,hg19,chr11,764084,764106,764321,764344 IAD84954_2_B,O,21,AMPL7157739013,GGCTTCAAGGTGCAGAAGGTAG,ATGAAACAGCACAGGAAAAGTGACT,TALDO1,hg19,chr11,764754,764776,765000,765025 IAD84954_2_B,O,23,AMPL7157739014,CCACTGAGGACCTCTGTTTGTG,GGCCACCATCGCATCTTTATCAA,TALDO1,hg19,chr11,759915,759937,760129,760152

Таким образом, каждая пара специфичных праймеров дает возможность амплифицировать конкретный фрагмент (ампликон) и обеспечивает синтез определенного фрагмента ДНК. Длина каждого праймера примерно 20 нуклеотидов. Длина амплифицируемого фрагмента около 200 нуклеотидов. Праймеры определяют начало и окончание амплифицируемого фрагмента.

Праймеры для генов панели «Гепатопатии» разделены на два пула (или группы фрагментов 47 генов), таким образом, чтобы обеспечить более технологически эффективное проведение этапа первой амплификации. Каждая пара праймеров обеспечивает получение ампликона (цепочки ДНК) соответствующего строго определенному участку ДНК. Всего данный набор праймеров для получения библиотеки фрагментов ДНК 47 генов, ответственных за заболевания печени, позволяет получить 1007 различных ампликонов. Эти 1007 ампликонов позволяют проанализировать кодирующие последовательности ДНК всех 47 генов панели «Гепатопатии». Для удобства проведения пробоподготовки праймеры разделены на два пула. Первый пул праймеров обеспечивает получение 509 ампликонов, а второй пул позволяет получить 498 ампликонов в соответствии с Таблицей 2. Последовательности всех праймеров приведены в таблице. Для пробоподготовки используют стандартный коммерческий набор реактивов IonAmpliSeqLibraryKit. Набор Ion AmpliSeq Library Kit включает в себя реагенты для проведения подготовки библиотек фрагментов из исходной геномной ДНК пациентов). 

Действия, реализуемые при проведении пробоподготовки:

Суть этапа пробоподготовки- последовательное получение из образца геномной ДНК качественной библиотеки, которая позволит провести секвенирование, указанных генов, на любых чипах и приборах платформы IonTorrent (промышленные приборы для таргетного секвенирования).

Готовая библиотека ДНК состоит из большого количества фрагментов обеспечивающих одновременное прочтение кодирующих последовательностей (фрагментов) ДНК каждого из 47 генов, ответственных за патологию печени. Длина одного фрагмента около 200 пар нуклеотидов.

Основные этапы проведения пробоподготовки:

1. Измерение концентрации геномной ДНК пациентов

Из образца крови пациента выделяют ДНК с помощью колоночных наборов реактивов, например коммерческого набора QIAampDNABloodMiniKit (набор пригоден для выделения геномной ДНК из крови и тканей человека). Измерение концентрации ДНК проводят с помощью промышленного флуориметра, например, Qubit с использованием наборов реактивов, специфичных для ДНК, пригодных к использованию на этом приборе. Целью данного этапа является разведение геномной ДНК пациентов до концентрации близкой к 5.0 мкг/мл с помощью буфера TE с очень низким содержанием ЭДТА. Буфер TE — широко используемый раствор, применяемый для растворения ДНК и предотвращения ее деградации. Название буфера (ТЕ) является аббревиатурой наименований его компонентов Трис-HCl и ЭДТА.

2. Составление плана пробоподготовки. Этот этап включает присвоение образцу геномной ДНК пациента своего номера и номера баркода, а также расчёты для проведения следующего этапа (амплификации №1).

3. Подготовка реакционной смеси для первой амплификации. Поскольку праймеры для данной панели генов находятся, как указано выше, в двух пулах (группах), данная амплификация ставится в двух отдельных пробирках. Для проведения реакции используют пробирки объемом 200 мкл.

Таким образом, в каждой пробирке для проведения первой реакции амплификации находится по 5 мкл реакционной смеси, содержащей один из двух пулов праймеров, специфичных для 47 генов будущей библиотеки, ответственных за патологию печени, нуклеотиды (дезоксинуклеозидтрифосфаты), необходимые для построения цепей ДНК при амплификации фрагментов ДНК, ДНК-полимераза (фермент, который осуществляет построение цепи ДНК из свободных нуклеотидов), специальный буфер (соответствующий полимеразе) необходимый для работы этого фермента и 4-5 нг исходной ДНК. Дезоксинуклеозидтрифосфаты (нуклеотиды) являются основными молекулами, из которых ДНК полимераза синтезирует новую цепь ДНК во время последовательных циклов амплификации. Четыре основных нуклеотида ПЦР реакционной смеси – dATP, dCTP, dGTP и dTTP (аденин, цитозин, гуанин, и тимин). Эти нуклеотиды являются молекулами-кирпичиками, из которых состоит цепочка ДНК. Праймеры– короткие цепочки (около 20 нуклеотидов) химически связанных между собой четырех основных видов нуклеотидов, комплементарные концевым участкам, каждого исследуемого фрагмента ДНК 47 генов, ответственных за патологию печени, которые является необходимой «затравкой» для дальнейшего синтеза этих фрагментов ДНК ДНК-полимеразой (фермент, который осуществляет построение цепи ДНК из свободных нуклеотидов). Это позволяет с помощью специальных реактивов и ДНК-полимеразы проводить амплификацию (многократное удвоение) исследуемого участка ДНК, что дает возможность получить большое количество копий исследуемого фрагмента. Праймеры для исследования 47 генов, ответственных за патологию печени, искусственно синтезированные в специальной лаборатории, именно они определяют специфичность амплификации;

Четыре основных нуклеотида для построения цепи ДНК в процессе амплификации: dATP, dCTP, dGTP и dTTP.

3.Проведение амплификации №1

Первая амплификация реакционной смеси исходной ДНК проводится путем полимеразной цепной реакции в амплификаторе - приборе обеспечивающим точное циклическое изменение температуры, необходимое для прохождения реакции получения первичного набора фрагментов ДНК целевых 47 генов будущей библиотеки.

После этого этапа каждая из двух пробирок содержит набор первичных (еще требующих дальнейшей обработки и очистки) фрагментов ДНК 47 генов будущей библиотеки. После проведения первой амплификации реакционные смеси двух пулов фрагментов ДНК библиотеки 47 генов из двух пробирок смешивают путем переноса их в одну пробирку. Это в два раза уменьшает число пробирок, облегчает проведение дальнейших этапов пробоподготовки и уменьшает расход пластика.

4. Частичное расщепление концов полученных фрагментов ДНК 47 генов. К полученной смеси добавляют реактив, который содержит фермент, который частично расщепляет концы всех полученных после амплификации 1 первичных фрагментов ДНК 47 генов. Этот процесс необходим для последующего пришивания баркода (метки) к каждому фрагменту ДНК.

1. Лигирование (присоединение с помощью специального фермента- лигазы) баркодов. Баркод – особая молекула, которая присоединяется к каждому фрагменту ДНК 47 генов библиотеки и таким образом метит ее. Библиотеку пациента метят своим отдельным баркодом. Номер баркода был выбран еще на этапе составления плана пробоподготовки. Именно то, что каждая библиотека мечена своим определенным баркодом, позволит в дальнейшем на этапе секвенирования проводить одновременное исследование большого количества библиотек фрагментов, полученных из образцов ДНК разных пациентов. В пробирку с фрагментами ДНК 47 генов будущей библиотеки добавляют баркод, с заранее выбранным номером, и фермент лигазу, который пришьет молекулу баркода к концу каждого фрагмента ДНК будущей библиотеки.

2. Первая чистка будущей библиотеки ДНК. Вначале раствор, содержащий фрагменты ДНК 47 генов будущей библиотеки, переносят в новую чистую пробирку на 1,5 мл.

Будущую библиотеку необходимо очистить от лишних, не прикрепленных к фрагментам ДНК будущей библиотеки, баркодов и других реагентов, которые использовались на первых этапах. Эту чистку проводят с помощью раствора, содержащего магнитные частицы, на поверхности которых абсорбируются фрагменты ДНК генов библиотеки. Этот раствор вносят в пробирку, содержащую фрагменты ДНК генов будущей библиотеки. Специальный магнитный штатив обеспечивает образование на дне пробирки осадка из магнитных частиц, содержащих на своей поверхности фрагменты ДНК будущей библиотеки. Это позволяет легко удалять надосадочную жидкость, оставляя при этом на дне осадок из магнитных частиц, с адсорбированными на них фрагментами ДНК будущей библиотеки. Полученный осадок дважды промывают 70% этиловым спиртом.

Фрагменты ДНК генов будущей библиотеки смывают с поверхности магнитных частиц с помощью реакционной смеси и переносят в заранее подписанную пробирку на 0,2мл. Эта реакционная смесь содержит буфер, свободные нуклеотиды, полимеразу и универсальные праймеры, которые на следующем этапе обеспечивают амплификацию №2 (финальную) всех фрагментов 47 генов.

3. Проведение амплификации №2 (финальной).

Финальная амплификация очищенной после лигирования баркодов фрагментов ДНК генов первоначальной библиотеки 47 генов производится путем полимеразной цепной реакции в ампликаторе при циклическом изменении температуры. Этот этап необходим для дополнительного многократного увеличения числа копий фрагментов ДНК, исследованных 47 генов.

4. Повторная чистка фрагментов ДНК 47 генов будущей библиотеки. После завершения финальной амплификации раствор, содержащий фрагменты ДНК 47 генов будущей библиотеки, переносят в чистую пробирку на 1.5 мл. Затем образец, содержащий фрагменты ДНК 47 генов будущей библиотеки, необходимо очистить от фрагментов, которые получились короче требуемой длины, от фрагментов, которые получились длиннее требуемой длины, от оставшихся неиспользованными при финальной амплификации праймеров, нуклеотидов и фермента. Данный процесс проводится с помощью трехкратного добавления различного количества раствора, содержащего магнитные частицы, и завершающей двухкратной промывки осадка, содержащего нужные фрагменты ДНК 47 генов будущей библиотеки, 70% этиловым спиртом. После завершения этой чистки на дне пробирки остается осадок из магнитных частиц с абсорбированными на их поверхности фрагментами ДНК 47 генов библиотеки исследуемого пациента, к этому осадку добавляют буфер ТЕ с очень низким содержанием ЭДТА, который обеспечивает смывание получаемой библиотеки фрагментов ДНК 47 генов с магнитных частиц. После этого магнитные частицы с помощью магнитного штатива собираются на дне в виде осадка, а надосадочная жидкость содержит фрагменты ДНК 47 генов готовой библиотеки, которую нужно перенести в чистую подписанную пробирку на 1.5 мл. Полученный раствор содержит фрагменты ДНК 47 ядерных генов готовой библиотеки, ответственных за патологии печени.

5. Измерение концентрации полученной библиотеки фрагментов ДНК 47 генов.

Концентрацию готовой библиотеки фрагментов ДНК 47 генов измеряют, используя набор HS на флуориметре Qubit.

Конечная концентрация библиотеки должна попадать в диапазон 200-1000 нг/мл. Если концентрация библиотеки превышает 1000 нг/мл, то ее следует разбавить в 2 раза буфером TE с очень низким содержанием ЭДТА и провести повторное измерение концентрации.

6. Контроль качества полученной библиотеки.

Для уменьшения расхода реактивов и сокращения времени работ целесообразно одновременно проводить проверку нескольких библиотек разных пациентов. Это позволяет более продуктивно использовать оборудование и рабочее время сотрудников.

С целью оценки качества подготовленных библиотек проводят проверочную третью амплификацию на образцах - отобранной небольшой части полученных библиотек, (отбирают из библиотеки 1 мкл для 3-ей амплификации для каждого пациента). Третью проверочную амплификацию проводят в амплификаторе при циклическом изменении температуры, подбирая количество циклов реакции в зависимости от величины измеренной концентрации каждой библиотеки, используя универсальные праймеры, которые позволяют амплифицировать каждый фрагмент 47 генов библиотеки.

Последовательности универсальных праймеров приведены в таблице 3.

Таблица 3

1; ION-PCR-A; CCATCTCATCCCTGCGTGTC 2; ION-PCR-P1; CCACTACGCCTCCGCTTTCCTCTCTATG

Это необходимо делать для того, чтобы в результате проверочной амплификации получились продукты близкие по концентрации, что позволит в дальнейшем визуально для этих образцов оценить качество фрагментов ДНК 47 генов библиотек (чистоту, наличие неспецифичных фрагментов, остатков праймеров).

Это позволит в дальнейшем оценить качество библиотек пациентов при проведении проверочного электрофореза в полиакриламидном геле с последующей окраской серебром.

Равномерность пулов каждого пациента подтверждается при проведении проверочного электрофореза прошедших 3-ю амплификацию образцов в полиакриламидном геле с последующей окраской серебром.

В том случае, если проверочный электрофорез показал плохое качество полученной библиотеки фрагментов ДНК 47 генов, пробоподготовку проводят повторно.

В том случае, если проверочный электрофорез показал наличие остатков праймеров, не удаленных при очистке библиотеки фрагментов ДНК 47 генов, проводят дополнительную чистку этой библиотеки с использованием магнитных частиц.

ТАРГЕТНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ БИБЛИОТЕКИ ФРАГМЕНТОВ ДНК 47 ГЕНОВ ПАНЕЛИ «ГЕПАТОПАТИИ».

Таргетное секвенирование библиотеки фрагментов ДНК 47 генов, ответственных за заболевания печени, осуществляется, как правило, в течение 2-х дней, с помощью прибора IONS5 с использованием чипов, предпочтительно используются 540е чипы. В основе таргетного секвенирования для анализа последовательностей фрагментов групп генов различных библиотек на приборе IonS5 (далее для краткости - «прибор») лежит ионное полупроводниковое таргетное секвенирование. Для проведения этого этапа используют коммерческие наборы реактивов и пластика, а также инструкцию для работы с IonS5. 540е чипы – разновидность чипов, которые оптимальны для таргетного секвенирования библиотек ДНК с длиной фрагментов около 200 пар нуклеотидов. Каждый чип (пластина) содержит крошечные (нано) лунки (в данном случае нанолунки или микролунки), в каждую из которых может поместиться и прикрепиться только один фрагмент библиотеки. После этого все эти нанолунки прибор IONS5 с помощью специального картриджа заполняет одним из четырех видов свободных дезоксинуклеозидтрифосфатов (dATP, dCTP, dGTP, и dTTP) и с помощью полимеразы проводит синтез новой цепи ДНК, используя для этого исходный фрагмент, закрепленный в нанолунке, в качестве матрицы. В случае присоединения нуклеотида к строящейся цепи, происходит высвобождение ионов водорода и скачек разницы потенциала в данной конкретной лунке, что фиксируется прибором IONS5. После отмывки микролунки (прибор делает в автоматическом режиме) происходит наполнение ее другой разновидностью нуклеотида, и процесс продолжается. В результате прибор IONS5 считывает последовательность всех фрагментов ДНК библиотек, которые находятся в нанолунках чипа.

Таргетное секвенирование целесообразно проводить с помощью прибора ШЕФ одновременно на двух чипах.

Этапы секвенирования :

Проводят расчёты для скапывания ранее подготовленных библиотек. В результате скапывания мы получаем одну пробирку, которая содержит все библиотеки, подготовленные для запуска секвенирования на конкретном чипе. В результате проводимых на этом этапе расчётов определяется, какой нужно взять объем каждой конкретной библиотеки, учитывая ее концентрацию и требуемое число прочтений каждого фрагмента библиотеки. Для панели «Гепатопатии» (47 ядерных генов, ответственных за патологию печени) требуемое число прочтений каждого фрагмента - 300.

В 1-й день секвенирования проводят:

Создание виртуального плана запуска на сайте RCMGS5 Torrent Server. Это проводится согласно инструкции по запуску Ion S5.

Скапывание заранее подготовленных для запуска библиотек согласно проведенным расчетам. После этого этапа мы получаем две пробирки, отдельную для каждого чипа, содержащие смеси библиотек, ранее подготовленных для запуска.

Запуск прибора ШЕФ. ШЕФ – промышленный роботизированный прибор, который проводит все этапы подготовки смесей библиотек ДНК и нанесение их на 540е чипы для прибора IONS5.

Прибор ШЕФ одновременно наносит образцы на два 540-х чипа. Для запуска ШЕФа используются коммерческие наборы пластика, а также специальные картриджи с реактивами и два 540х чипа. Запуск ШЕФа проходит строго согласно инструкции к прибору и продолжается до 2-го дня

2й день секвенирования

1. На 2 день ровно за час до окончания работы ШЕФа, проводят инициализацию (запуск и проверку) прибора IonS5. Для этого используют специальные реактивы: буфер, промывочный раствор и картридж с нуклеотидами.

2. После окончания работы ШЕФа, полученные библиотеки нанесены на два 540-х чипа.

3. В Ion S5 чипы запускаются по очереди. Пока идет сбор данных с нанолунок (определение последовательности каждого фрагмента по очередности прикрепленния четырех упомянутых типов нуклеотидов) первого чипа, второй чип должен находиться при температуре +4^оС.

АНАЛИЗ ПОЛУЧЕННЫХ ДАННЫХ.

После проведения секвенирования происходит выравнивание (нахождение аналогичной, т.е. сходной, области) прочитанных последовательностей фрагментов генов ДНК относительно референсного (эталонного) виртуального генома. Все выявленные различия (варианты) между ними выводятся в таблицу, отдельную для каждого пациента. В процессе анализа результатов секвенирования для каждого пациента врач-лаборант должен отсортировать и удалить среди выявленных изменений часто встречающиеся в популяции полиморфизмы. Оставшиеся варианты проверяют на наличие среди них описанных в литературе ассоциированных с патологиями печени мутаций. Неописанные варианты проверяют с помощью специальных программ предсказания, которые рассчитывают вероятность того, что данный вариант является патогенным.

После этого врач-лаборант должен внимательно проанализировать выписку пациента (с которой образец поступил на исследование), выбрать среди выявленных подозрительных вариантов наиболее вероятные. Наиболее подозрительными принято считать варианты в генах, мутации в которых по литературным данным приводят к заболеваниям с клинической картиной, наиболее схожей с клиникой пациента. Окончательный диагноз ставится по совокупности молекулярно-генетических, клинических и биохимических данных.

ПРИМЕРЫ ДИАГНОСТИКИ С ПРИМЕНЕНИЕМ ПАНЕЛИ «ГЕПАТОПАТИИ»

Гликогенозы

Гены: AGL, G6PC, GAA, GBE1, GYS2, PFKM, PGAM2 , PHKA2, PHKB, PHKG2, PYGL, SLC37A4.

Пациент 1: Мальчик 3 мес

При рождении: вес 3790 г, рост 52 см, 8-9 баллов по шкале Апгар.

Гипогликемия новорожденных, анемия. В 2 месяца перенес пневмонию. При кормлении реже 2х часов наблюдается снижение глюкозы менее 0,3 ммоль/л.

Объективно в 3 мес.: телосложение правильное. Кукольное лицо. Вес 6190. Печень +7 см, селезенка +1, см. Транзиторная нейтропения, умеренное повышение трансаминаз и триглицеридов. Лактат – 9,78 ммоль/л.

При таргетном секвенировании в гене SLC37A4 (NM_001164277) выявлены замены c.1015G>T, p.Gly339Cys и c.1243C>T, p.Arg415Term в гетерозиготном состоянии. Данные замены описаны в базе HGMD как патогенные (CM970551 и CM992167 соответственно).

Диагноз: гликогеноз, тип 1b, аутосомно-рецессивный тип наследования, патогенные варианты c.1015G>T и c.1243C>T унаследованы от отца и матери соответственно.

Пациент 2: Девочка 1 год 1 мес

Раннее развитие по возрасту. Прививки по возрасту. Хронические заболевания родители отрицают.

Увеличение живота, увеличение печени (8 см ниже реберной дуги), слабость, сонливость, снижение аппетита.

Б/х крови: АСТ 334-1480 Е/л, АЛТ 516-1018 Е/л, ЩФ 501, ГГТ 286-440 Е/л, холестерин 8,66 ммоль/л, ЛПНП 6,61 ммоль/л, лактат 2,7 ммоль/л, тенденция к ацидозу, билирубин в норме. Гликемия в течении суток 2,7-5,0 ммоль/л.

Активность лизосомных ферментов кислой липазы, галактоцериброзидазы, альфа-глюкозидазы, альфа-галактозидазы, бета-глюкоцериброзидазы, сфингомиелиназы, альфа-идуронидазы в пределах референсных значений.

При таргетном секвенировании в гене AGL (NM_000642) выявлены нонсенс-замены c.22C>T: p.Arg8Term и c.2590C>T:p.Arg864Term в гетерозиготном состоянии. Данные замены описаны в базе HGMD, как патогенные (CM169820 и CM960017 соответственно).

Диагноз: гликогеноз, тип 3, аутосомно-рецессивный тип наследования, патогенные варианты c.22C>T и c.2590C>T унаследованы от отца и матери соответственно.

Пациент 3: Мальчик 3,5 года

В 2 года 8 месяцев на фоне высокой температуры впервые возникли генерализованные судороги с потерей сознания - стационарное лечение. Отмечались повторные эпизоды судорог, не провоцированные внешними воздействиями и инфекционными заболеваниями. С 3х лет получает Депакин-хроно, доза увеличивалась со 150 до 200 мг 2 раза в день, на фоне чего отмечалась выраженная слабость, заторможенность.

Задержка роста. Эхографические признаки умеренной гепатомегалии (за счёт правой доли), деформации желчного пузыря

Б/х крови: трансаминазы в норме, липидный профиль в норме, билирубин в норме, ЩФ 80, глюкоза 0,45 ммоль/л.

Проба с глюкагоном:

Гликемия: 0' - 1,9 ммоль/л, 5' - 2,9 ммоль/л, 10' - 2,7 ммоль/л, 15' - 2,7 ммоль/л. Отсутствие подъема глюкозы на фоне введения глюкагона подтверждает наличие гликогеноза.

Проба с нагрузкой глюкозой:

0': глюкоза - 0,9 ммоль/л, лактат 0,7 ммоль/л, кетоны - 3,8 ммоль/л;

120': глюкоза - 4,6 ммоль/л, лактат - 5,1 ммоль/л, кетоны - 0,4 ммоль/л.

При таргетном секвенировании в гене GYS2 (NM_021957) выявлена миссенс-замена c.1553A>C p.(Glu518Ala) в гетерозиготном состоянии, замена описана в HGMD как патогенная (CM177641); и нонсенс-замена c.1644C>A p.(Tyr548Term) в гетерозиготном состоянии – данный вариант не зарегистрирован в базах HGMD и ClinVar, однако, согласно руководству ^*, расценивается как патогенный .

Диагноз: гликогеноз, тип 0, аутосомно-рецессивный тип наследования, патогенные варианты c.1553A>C и c.1644C>A унаследованы от матери и отца соответственно.

Другие дефекты углеводного обмена

Гены: ALDOB, FBP1, GALE, GALT, TALDO1

Пациент 4: Девочка, 8 лет

Раннее развитие по возрасту. В раннем неонатальном периоде отмечалась протяженная желтуха. С 8 мес при введении в рацион цельного коровьего молока появилась многократная рвота, вялость, нарушение стула. Ухудшение состояния отмечалось между 2 и 5 годами (анемия, декомпенсированный кетоацидоз, дислипидемия, умеренный синдром цитолиза)

При обследовании: кукольное лицо, УЗИ признаки гепатоспленомегалии, внутрипеченочный холестаз, периодическая гипогликемия до 1,2 ммоль/л.

Б/х крови: трансаминазы в норме, ЩФ 366 Ед/л, липидный профиль в норме, глюкоза 4,78 ммоль/л, тенденция к ацидозу.

Данных за наследственные аминоацидопатии, органические ацидурии, дефекты митохондриального бета-окисления не выявлено.

При таргетном секвенировании в гене FBP1 (MIM 611570; NM_000507) выявлена замена c.544G>T:p.Val182Phe в гомозиготном состоянии. Вариант не зарегистрирован в HGMD и ClinVar, однако, согласно руководству ^*, оценивается как вероятно патогенный.

Диагноз недостаточность глюкозо-1,6-бифосфатазы, аутосомно-рецессивный тип наследования, патогенный вариант унаследован от обоих родителей.

Заболевания с холестатическим синдромом: семейные внутрипеченочные холестазы

Гены: ABCB11, ABCB4, ATP8B1, TJP2

Пациент 5: Девочка. 6 мес

Иктеричность кожных покровов, выраженный зуд, увеличение в объёме живота.

При рождении: 3150г, 51 см, 8-9 баллов по шкале Апгар.

При обследовании выявлен холестатический гепатит. Старший ребенок в семье: с двух месяце отмечалась гипербиллирубинемия, в 6 месяцев сформировался цирроз печени. В 9 мес. Была проведена пересадка печени. Умер в возрасте 1 г. 5 мес. от сепсиса.

Объективно: Вес 7 кг, рост 67 см. Кожные покровы и склеры ярко иктеричны. Гепатомегалия (печень +3 см), селезенка в норме.

Б/х крови биллирубин 175,0 мкмоль/л (прямой 130), АЛТ – 261 Ед/л. АСТ – 354 Ед/л, глюкоза 4,3 ммоль/л.

Обследования:

1. Уринолизис – позитивная проба Бенедикта

2. Лактат - 3,26 ммоль/л;

3. Амоний – 59,1 мкмоль/л

При таргетном секвенировании в гене ABCB11 (NM_003742) выявлен частый патогенный вариант c.A1445G: p.D482G в гетерозиготном состоянии (CM980247) и миссенс-замена c.G1295T: p.R432I в гетерозиготном состоянии; данная замена не зарегистрирована в базах HGMD и ClinVar, однако другая миссенс-замена в кодоне 342 описана в базе HGMD, как патогенная (CM056278). Согласно руководству^*, вариант расценивается, как вероятно патогенный.

Диагноз семейный внутрипеченочный холестаз, тип 2, аутосомно-рецессивный тип наследования, варианты c.1445A>G и c.1295G>T унаследованы от отца и матери соответственно.

Заболевания с холестатическим синдромом: синдром Алажиля

Ген: JAG1

Пациент 6: Девочка 2 мес

При рождении: вес 2820, рост 48см, 8/8 по Апгар.

Желтуха появилась на 3 сутки жизни. Стул с рождения светло-желтый лимонного цвета. Печень не увеличена, структура однородная, холедох достоверно не визуализируется. МР картина не исключает атрезию ЖВП. ССС: дефект межжелудочковой перегородки. Нормохромная норморегенераторная анемия тяжелой степени, Hb 71 г/л, гипокоагуляция, лейкоцитоз с нейтрофилезом.

Б/х крови: АСТ 400 Ед/л, АЛТ 743 Ед/л, ГГТ 120 Ед/л, ЩФ 1763 Ед/л, билирубин 100,5 ммоль/л (прямой 57 ммоль/л)

При таргетном секвенировании в гене JAG1 (NM_000214) выявлена замена c.1528C>T:p.Gln510Term в гетерозиготном состоянии, данная замена описана в базе HGMD, как патогенная CM061803.

Диагноз синдром Алажиля, аутосомно-доминантный тип наследования с неполной пенетрантностью, вариант c.1528C>T унаследован от отца.

Дефекты обмена микроэлементов

Гены: ALAD, АТР7В

Пациент 7: Девочка 4 года

Раннее развитие по возрасту. Прививки по возрасту. С 3 лет жалуется на периодические ноющие боли в околопупочной области, не связанные с приемом пищи.

УЗИ признаки гепатомегалии, повышенная эхогенность паренхимы печени. Гемолитическая анемия. Выявлена глюкозурия.

Б/х крови: АСТ 64-233 Ед/л, АЛТ 108-405 Ед/л, ГГТ 123-129 Ед/л, ЩФ 1111 Ед/л, билирубин – норма, глюкоза – норма, липидный профиль в норме.

Данных за наследственные аминоацидопатии, органические ацидурии, дефекты митохондриального бета-окисления не выявлено.

Активность лизосомных ферментов кислой липазы, галактоцериброзидазы, альфа-глюкозидазы, альфа-галактозидазы, бета-глюкоцериброзидазы, сфингомиелиназы, альфа-идуронидазы в пределах референсных значений.

При таргетном секвенировании в гене АТР7В (NM_000053) выявлен частый патогенный вариант c.3207C>A:p.His1069Gln (CM930059) в гетерозиготном состоянии и замена c.2998G>A:p.Gly1000Arg в гетерозиготном состоянии, также описанная в базе HGMD, как патогенная (CM053124).

Диагноз: болезнь Вильсона-Коновалова, аутосомно-рецессивный тип наследования, патогенные варианты c.3207C>A и c.2998G>A унаследованы от матери и отца соответственно.

Митохондриальные гепатопатии

Гены: BCS1L, C10orf2, DGUOK, HADHA, MPV17, POLG, TRMU, SCO1, SERAC1

Пациент 8: Девочка, 10 мес

При рождении: вес 4020, рост 59см, 9/9 по Апгар.

С 6 мес не прибавляла в весе, наблюдалось отставание в психомоторном развитии. Заболела остро в 10 мес. Многократная рвота, субфебрильная температура, судороги, внезапная потеря сознания. Смерть через 4 дня от полиорганной недостаточности.

При вскрытии выявлен мелкоузловой цирроз печени крупнокапельная дистрофия гепатоцитов, тромбоз сосудов микроциркуляции внутренних органов, асцит, двухсторонний гидротторакс, некроз нефротелия в почках.

При таргетном секвенировании в гене TRMU (NM_018006) выявлены вариант сплайсинга c.706-1G>A и миссенс-замена c.835G>A:p.Val279Met в гетерозиготном состоянии. Варианты описаны в базе HGMD, как патогенные (и CS095562 и CM095558 соответственно)

Диагноз транзиторная инфантильная печёночная недостаточность, аутосомно-рецессивный тип наследования, варианты c.706-1G>A и c.835G>A унаследованы от отца и матери соответственно.

Липидозы из группы ЛБН

Гены: GBA, LIPA, SMPD1

Пациент 9: Мальчик, 3 года

С рождения плохая прибавка в весе, плохой аппетит, стул со склонностью к запорам. В 2,5 года - рецидивирующая уртикарная сыпь, боли в животе, редко рвота в течение 2-3 месяцев. УЗИ признаки гепатомегалии.

Б/х крови: АСТ 152-335 Ед/л, АСТ 252-439 Ед/л, билирубин 8,4 ммоль/л, ЩФ 251 Ед/л, глюкоза 3,9 ммоль/л, холестерин 8,8 ммоль/л, ЛПНП 6,7 ммоль/л, ЛПВП 0,7 ммоль/л, ТГ 3,6 ммоль/л

Данных за наследственные аминоацидопатии, органические ацидурии, дефекты митохондриального бета-окисления не выявлено.

При таргетном секвенировании в гене LIPA (NM_000235) выявлен частый патогенный вариант c.894G>A (CS951467) в гомозиготном состоянии.

Диагноз: дефицит лизосомной кислой липазы (болезнь накопления эфиров холестерина), аутосомно-рецессивный тип наследования, патогенный вариант унаследован от обоих родителей.

Дефекты цикла мочевины

Гены: OTC, SLC25A13

Пациент 10: Мальчик, 4 мес

Близкородственный брак. При рождении вес 2890 г, рост 50 см, 7/8 по Апгар.

Неонатальная затяжная желтуха, анемия II степени смешанного генеза, двухсторонняя пиэлоэктазия, паховая грыжа, ССС: межпредсердное сообщение с умеренным сбросом.

Б/х крови: трансаминазы – норма, билирубин 180 ммоль/л (прямой 152 ммоль/л), глюкоза 7,61 ммоль/л. Определен повышенный уровень общей галактозы в крови (9,6 мг/дл). Подозрение на галактоземию.

При таргетном секвенировании в гене гена SLC25A13 (MIM 603859, RefSeq: NM_014251) выявлена нонсенс-замена c.1078C>T (p.Arg360Term) в гомозиготном состоянии. Глубина прочтения варианта х496. Данная замена описана в базе HGMD, как патогенная (CM081806).

Диагноз: цитруллинемия II типа, аутосомно-рецессивный тип наследования, патогенный вариант унаследован от обоих родителей.

Дефекты гликозилирования

Гены: MPI, PGM1

Пациент 11: Мальчик 5 мес

При рождении вес 2810г, рост 50см, 7/8 Апгар

С рождения низкая прибавка в весе, с 4 месяцев – срыгивание фонтаном, рвота, низкий аппетит, увеличение живота. На УЗИ брюшной полости выявлен выраженный асцит и гепатомегалия.

Б/х крови: АСТ134-960 Е/л, АЛТ104-464 Е/л, ГГТ 150 Е/л, билирубин в норме, глюкоза в норме, холестерин в норме.

Данных за наследственные аминоацидопатии, органические ацидурии, дефекты митохондриального бета-окисления не выявлено.

Активность лизосомных ферментов галактоцериброзидазы, альфа-глюкозидазы, альфа-галактозидазы, бета-глюкоцериброзидазы, сфингомиелиназы, альфа-идуронидазы в пределах референсных значений.

При таргетном секвенировании в экзоне 8 гена MPI (NM_002435) выявлена замена с.1252C>T (p.Arg418Cys) в гомозиготном состоянии. Данная замена описана в базе HGMD, как патогенная (CM098490).

Диагноз: нарушения гликозилирования типа 1b, аутосомно-рецессивный тип наследования, патогенный вариант унаследован от обоих родителей.

Дефекты синтеза желчных кислот

Гены: ABCD3, AKR1D1, CYP7B1

Пациент 12: мальчик 6 мес

Близкородственный брак. При рождении вес 3360г, рос 56 см, Апгар 8/8.

На 3и суток жизни развилась желтуха, в дальнейшем протекавшая волнообразно. Неустойчивый стул 5-7 раз в день с прожилками крови. Эпизоды артериальной гипертензии (максимально 120/80 мм.рт.ст.). При обследовании в возрасте 1 мес: билирубин общий/прямой 200/148 мкмоль/л, ГГТ 26 Е/л, ЩФ 1221 Е/л, повышение печеночных трансаминаз до 3-14 норм, снижение синтетической функции печени. На УЗИ брюшной полости выявлена гепатоспленомегалия, признаки портальной гипертензии. Улучшений по состоянию гепатобилиарной системы не наблюдалось. Рекомендована трансплантация печени.

Данных за наследственные аминоацидопатии, органические ацидурии, дефекты митохондриального бета-окисления не выявлено.

При таргетном секвенировании в экзоне 5 гена CYP7B1 (NM_004820) выявлена замена c.1162C>T (p.Arg388Term) в гомозиготном состоянии. Данная описана в базе HGMD, как патогенная (CM982052).

Диагноз: нарушения синтеза желчных кислот типа 3, аутосомно-рецессивный тип наследования, патогенный вариант унаследован от обоих родителей.

Синдром младенческой печеночной недостаточности

Гены: LARS, NBAS

Пациент 13: Мальчик, 6 мес

При рождении вес 3450г, рос 52 см, Апгар 8/8

Заболел остро. Желтуха, вялость, субфебрильная температура, внезапная потеря сознания. Острая печеночная недостаточность. Инфекционные и токсические причины исключены.

Б/х крови: АСТ 798 ммоль/л, АЛТ 310 ммоль/л, билирубин 111 ммоль/л, гликоза 1,7 ммоль/л, амоний 58,9 ммоль/л

Через сутки приступ купировался самостоятельно, состояние улучшилось, б/х показатели снизились.

При таргетном секвенировании в гене NBAS (NM_015909) выявлены замены c.1150C>T (p.Pro348Ser) и c.2708T>G (p.Leu903Arg) в гетерозиготном состоянии. Данные замены описаны в базе HGMD, как патогенные (CM157040 и CM157021 соответственно).

Диагноз: младенческая печеночная недостаточность, тип 2, аутосомно-рецессивный тип наследования, патогенные варианты c.1150C>T и c.2708T>G унаследованы от отца и матери соответственно.

Недостаточность альфа-1-антитрипсина

Ген: SERPINA1

Пациент 14: Мальчик, 3 года

Раннее развитие по возрасту. На искусственном вскармливании с 1 мес, прикормы введены с 4 мес. Транзиторная желтуха, синдром цитолиза. При обследовании: увеличение живота, гепатоспленомегалия, хронический гепатит, признаки цирроза, расширение вен пищевода I степени, портальная гипертензия, легочная гипертензия, пальмарная эритема.

Б/х крови: АСТ 103-315 Ед/л, АЛТ 95-290 Ед/л, билирубин 27 ммоль/л, глюкоза – норма.

Данных за наследственные аминоацидопатии, органические ацидурии, дефекты митохондриального бета-окисления не выявлено.

Активность лизосомных ферментов кислой липазы, галактоцериброзидазы, альфа-глюкозидазы, альфа-галактозидазы, бета-глюкоцериброзидазы, сфингомиелиназы, альфа-идуронидазы в пределах референсных значений.

При таргетном секвенировании в гене SERPINA1 (NM_000295) выявлен частый патогенный вариант c.1096G>A:p.Glu366Lys (CM830003) в гомозиготном состоянии.

Диагноз: недостаточность альфа-1-антитррипсина, аутосомно-рецессивный тип наследования, патогенный вариант унаследован от обоих родителей.

Дефекты аминокислотного обмена

Ген: FAH

Пациент 15: Девочка 9 мес

При рождении: вес 4001 г, рост 53 см, 7/7 по Апгар

Отставание в развитии, увеличение живота, гепатоспленомегалия (печень на уровне пупка), сосудистая сеть на передней стенке живота, цирроз печени, острая печеночная недостаточность, коагулопатия, портальная гипертензия, расширение вен пищевода II степени, кардиомиопатия. Выявлено повышение сукцинилацетона в моче.

При таргетном секвенировании в гене FAH (NM_000137) выявлена замена c.1000C>T (p.Ser334Phe) в гомозиготном состоянии. Данная замена описана в базе HGMD, как патогенная (CM119756).

Диагноз тирозинемия I, аутосомно-рецессивный тип наследования, патогенный вариант унаследован от обоих родителей.

Таким образом, при использовании настоящего изобретения достигается технический результат, который заключается в упрощении технологии и сокращении времени, требуемого на проведение анализа полученных данных, обеспечении возможности диагностики детей с раннего возраста и сокращении длительности и себестоимости процесса получения библиотеки с применением таргетного секвенирования, благодаря одновременному анализу наиболее адекватного состава генов и расширяет, тем самым, возможности по анализу спектра мутаций и изучению вклада генов в развитие патологии печени. Это позволяет достаточно быстро дифференцировать заболевания со сходными клиническими синдромами, причем одновременно для группы пациентов. Сокращение времени исследования помогает в более быстрые сроки поставить правильный диагноз, подобрать адекватное лечение и дать реальный прогноз для пациента.

Тем самым разрешается проблема создания эффективного способа получения библиотеки генов для диагностики патологий печени на основе наиболее адекватного состава генов библиотеки, который позволит быстро и экономически выгодно проводить исследование пациентов с наследственными заболеваниями печени, позволяя сфокусироваться сразу на нескольких основных симптомокомплексах печеночной патологии.

Изобретение относится к области биотехнологии. Предложен способ получения библиотеки генов для диагностики патологий печени. Проводят пробоподготовку, включающую несколько этапов, в том числе две амплификации, лигирование баркодов, несколько чисток и этап проверки качества библиотеки ДНК с помощью дополнительной проверочной амплификации с последующим форезом. Получают библиотеку фрагментов ДНК 47 генов, ассоциированных с наследственными патологиями печени. Затем считывают последовательности всех фрагментов готовой библиотеки ДНК путем таргетного ионного полупроводникового секвенирования с использованием чипа. Полученные в результате секвенирования данные анализируют на наличие полиморфизмов и ассоциированных с патологиями печени мутаций. Изобретение обеспечивает упрощение процесса проведения одновременного анализа 47 генов, ответственных за наследственные заболевания печени, сокращение времени, требуемого на проведение анализа полученных данных, и позволяет проводить диагностику клинически схожих случаев, имеющих разные молекулярно-генетические повреждения. Данный подход можно использовать в диагностике наследственных заболеваний печени взрослым и детям с раннего возраста. 7 з.п. ф-лы, 3 табл.

1. Способ получения библиотеки генов для диагностики патологий печени, предусматривающий:

- взятие образцов исходной геномной ДНК пациента из его крови;

- первоначальное измерение концентрации ДНК в образце;

- разведение образца до концентрации ДНК около 5.0 мкг/мл с помощью буфера ТЕ с низким содержанием ЭДТА;

- подготовку реакционной смеси для первой амплификации, включающей 4-5 нг разведенной ДНК образца, полимеразу, буфер, пригодный для работы этой полимеразы, два пула праймеров из Таблицы 2, специфичных для 47 генов, ассоциированных с наследственными патологиями печени, и нуклеотиды, в двух пробирках объемом по 200 мкл.

- проведение первой амплификации подготовленной реакционной смеси путем полимеразной цепной реакции при циклическом изменении температуры с получением первичного набора фрагментов упомянутых 47 генов ДНК будущей библиотеки;

- добавление реактива, содержащего фермент, осуществляющий частичное расщепление концов фрагментов 47 генов ДНК будущей библиотеки, полученных после первой амплификации;

- лигирование фрагментов генов ДНК будущей библиотеки с помощью последовательной инкубации, проводимой при нескольких значениях температуры с добавлением индивидуального баркода и фермента лигазы, присоединяющего молекулу баркода к концу каждого фрагмента генов ДНК будущей библиотеки,

- чистку будущей библиотеки генов ДНК пациента от баркодов, неприсоединенных к фрагментам 47 генов ДНК будущей библиотеки, и неиспользованных избыточных реагентов, которую производят с помощью раствора, содержащего магнитные частицы, с образованием осадка магнитных частиц, абсорбирующих на своей поверхности фрагменты 47 генов ДНК будущей библиотеки;

- промывку полученного осадка 70% этиловым спиртом;

- смывание фрагментов 47 генов ДНК будущей библиотеки с поверхности магнитных частиц с помощью состава, содержащего буфер, свободные нуклеотиды, полимеразу и универсальные праймеры, и перенос полученной для финальной амплификации реакционной смеси в чистые пробирки объемом 200 мкл;

- проведение финальной амплификации полученной реакционной смеси путем полимеразной цепной реакции реакционной смеси при циклическом изменении температуры с получением готовой библиотеки фрагментов 47 генов ДНК;

- повторную, в три этапа, чистку готовой библиотеки фрагментов 47 генов ДНК от фрагментов, которые получились короче или длиннее допустимой длины, а также от оставшихся неиспользованными при амплификации праймеров, нуклеотидов и фермента, причем на первом этапе повторную чистку проводят с троекратным добавлением раствора, содержащего магнитные частицы, и завершают в два этапа промывкой осадка 70% этиловым спиртом, в результате чего получают осадок магнитных частиц, абсорбирующих на своей поверхности фрагменты 47 генов индивидуальной ДНК библиотеки пациента;

- смывание фрагментов 47 генов ДНК библиотеки с магнитных частиц с помощью буфера ТЕ с низким содержанием ЭДТА и получение надосадочной жидкости, содержащей фрагменты следующих 47 генов ДНК готовой библиотеки, ассоциированных с наследственными патологиями печени:

№ Ген
библиотеки Наследственные патологии печени,
ассоциированные с генами библиотеки 1 ABCB11 семейный внутрипеченочный холестаз тип 2 2 ABCB4 семейный внутрипеченочный холестаз тип 3 3 ABCD3 врожденные нарушения синтеза желчных кислот тип 5 4 AGL Гликогеноз тип 3 5 AKR1D1 врожденные нарушения синтеза желчных кислот тип 2 6 ALAD острая перемежающаяся порфирия 7 ALDOB фруктоземия 8 ATP7B болезнь Вильсона-Коновалова 9 ATP8B1 семейный внутрипеченочный холестаз тип 1 10 BCS1L GRACILE синдром, митохондриальная гепатопатия 11 C10orf2 синдром истощения мтдНК, гепатоцеребральная форма, митохондриальная гепатопатия 12 CYP7B1 врожденные нарушения синтеза желчных кислот тип 3 13 DGUOK синдром истощения мтДНК, митохондриальная гепатопатия 14 FAH Тирозинемия тип 1 15 FBP1 фруктозо 1,6 бифосфатазная недостаточность 16 G6PC Гликогеноз тип 1 17 GAA Гликогеноз тип 2, болезнь Помпе 18 GALE Галактоземия тип 3 19 GALT Галактоземия тип 1 20 GBA болезньГоше 21 GBE1 Гликогеноз тип 4 22 GYS2 Гликогеноз тип 0 23 HADHA недостаточность длинноцепочечной гидроксиацилКоА дегидрогеназы жк 24 JAG1 синдром Аладжиля 25 LARS синдром младенческой печеночной недостаточности 26 LIPA недостаточность кислой липазы 27 MPI врожденные нарушения гликозилирования тип 1b 28 MPV17 синдром истощения мтДНК, митохондриальная гепатопатия 29 NBAS синдром младенческой печеночной недостаточности 30 OTC недостаточность орнитинтранскарбомилазы 31 PFKM Гликогеноз тип 7 32 PGAM2 Гликогеноз тип 10 33 PGM1 врожденные нарушения гликозилирования тип 1t 34 PHKA2 Гликогеноз тип 9A 35 PHKB Гликогеноз тип 9B 36 PHKG2 Гликогеноз тип 9C 37 POLG1 синдром истощения мтДНК, митохондриальная гепатопатия, болезнь Альперса 38 PYGL Гликогеноз тип 6 39 SCO1 митохондриальная гепатопатия 40 SERAC1 3-метилглутаконовая ацидурия тип 6 41 SERPINA1 альфа1 антитрипсина недостаточность 42 SLC25A13 Цитруллинемия тип 2 43 SLC37A4 Гликогеноз тип 1b 44 SMPD1 болезнь Ниманна-Пика тип А/В 45 TALDO1 недостаточность трансальдолазы 46 TJP2 семейный внутрипеченочный холестаз тип 4 47 TRMU синдром младенческой печеночной недостаточности

- измерение концентрации полученной готовой библиотеки фрагментов 47 генов ДНК, которая должна находиться в диапазоне 200-1000 нг/мл,

- проведение проверочной амплификации пробы в количестве 1 мкл, отобранной из полученной готовой библиотеки 47 генов ДНК, путем полимеразной цепной реакции при циклическом изменении температуры с использованием универсальных праймеров, специфичных для 47 генов, ассоциированных с наследственными патологиями печени и обеспечивающих амплификацию каждого из фрагментов 47 генов ДНК готовой библиотеки;

- проверку качества готовой библиотеки 47 генов ДНК путем электрофореза в полиакриламидном геле с последующей окраской серебром;

- считывание последовательности всех фрагментов 47 генов готовой библиотеки ДНК путем таргентного ионного полупроводникового секвенирования готовой библиотеки 47 генов с использованием чипа с лунками, которые поочередно наполняют одним из четырех нуклеотидов реакционной смеси и с помощью полимеразы проводят синтез новой цепи ДНК, используя для этого один из фрагментов библиотеки 47 генов в каждой лунке в качестве матрицы;

- контроль присоединения каждого нуклеотида к строящейся новой цепи ДНК путем фиксации скачка разности потенциалов в соответствующей лунке, обусловленного высвобождением ионов водорода;

- считывание и анализ фрагментов генов ДНК готовой библиотеки на наличие среди них полиморфизмов и ассоциированных с патологиями печени мутаций.

2. Способ по п.1, отличающийся тем, что после проведения первой амплификации реакционные составы двух пулов фрагментов будущей библиотеки 47 генов смешивают в одной пробирке.

3. Способ по любому из пп.1, 2, отличающийся тем, что таргентное секвенирование проводят одновременно на двух чипах.

4. Способ по любому из пп.1, 2 отличающийся тем, что одновременно проводят пробоподготовку библиотек 47 генов образцов ДНК нескольких пациентов с патологией печени, причем фрагменты каждой библиотеки 47 генов метят ее индивидуальным баркодом, позволяющим отличать библиотеки разных пациентов.

5. Способ по п. 4, отличающийся тем, что одновременно проводят оценку качества нескольких библиотек фрагментов 47 генов, полученных из образцов ДНК разных пациентов.

6. Способ по любому из пп.1 ,2 ,5, отличающийся тем, что при проведении проверочной амплификации подбирают количество циклов реакции в зависимости от измеренной концентрации библиотеки с последующим проведением проверочного электрофореза в полиакриламидном геле и окраской серебром.

7. Способ по п. 6, отличающийся тем, что в том случае, если проверочный электрофорез показал плохое качество полученной библиотеки фрагментов 47 генов, пробоподготовку проводят повторно.

8. Способ по п. 6, отличающийся тем, что в том случае, если проверочный электрофорез показал наличие остатков праймеров, не удаленных при очистке библиотеки фрагментов 47 генов, проводят дополнительную чистку этой библиотеки с использованием магнитных частиц.