Настоящее изобретение относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, при температуре, находящейся в диапазоне от приблизительно 23°C до 29°C.
Настоящее изобретение дополнительно относится к композиции, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, где композиция содержит трифторуксусную кислоту в количестве, составляющем 95-99% объем/объем, и 1,2-этандитиол в количестве, составляющем 1-5% объем/объем.
В настоящем изобретении дополнительно представлено применение композиции, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, где композиция содержит трифторуксусную кислоту в количестве, составляющем 95-99% объем/объем, и 1,2-этандитиол в количестве, составляющем 1-5% объем/объем, для отщепления пептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы.
Разработанные способы твердофазного синтеза пептидов предусматривают связывание посредством линкера предварительно определенной С-концевой аминокислоты синтезируемой аминокислотной цепи с полимерным носителем. Используемая для присоединения аминокислота представляет собой аминокислотный структурный блок с защищенной на N-конце аминогруппой, при этом указанная защитная группа представляет собой временно связанную группу Fmoc. После успешного присоединения защитную группу Fmoc отщепляют и осуществляют присоединение следующего Fmoc-защищенного аминокислотного структурного блока к свободной функциональной аминогруппе. После синтеза требуемой аминокислотной цепи ее отщепляют от твердой фазы. На фигуре 1 представлен обзор описываемого подхода.
Твердофазный синтез ликсисенатида (также известного под названием AVE0010 или ZP-10), описанный в патентном документе WO 01/04156 A1, который включен в данный документ посредством ссылки, предусматривает присоединение каждого из отдельных Fmoc-защищенных аминокислотных структурных блоков посредством одним способом.
Ликсисенатид имеет последовательность дез-Pro36-эксендин-4(1-39)-Lys6-NH2. Данное вещество раскрыто в WO 01/04156, SEQ ID NO: 93 (см. SEQ ID NO:1 и фигуру 2 настоящей заявки). Эксендины представляют собой группу пептидов, которые могут снижать концентрацию глюкозы в крови. Эксендины обладают определенной схожестью с последовательностью GLP-1(7-36) (53%, Göke et al., J. Biol. Chem. 268, 19650-55). При взаимодействии с эксендиновыми рецепторами эксендин-3 и эксендин-4 стимулируют повышение внутриклеточного синтеза цАМФ в ациноцитах поджелудочной железы морских свинок (Raufman, 1996, Reg. Peptides 61:1-18). В отличие от эксендина-4 эксендин-3 оказывает свое действие путем увеличения высвобождения амилазы в ациноцитах поджелудочной железы. Эксендины выполняют роль антагонистов GLP-1.
Глюкагон-подобный пептид 1 (GLP-1) представляет собой эндокринный гормон, который усиливает инсулиновый ответ после перорального приема глюкозы или жира. Обычно GLP-1 снижает концентрации глюкагона, замедляет опорожнение желудка, стимулирует биосинтез (про-)инсулина, повышает чувствительность к инсулину и стимулирует инсулин-независимый биосинтез гликогена (Holst (1999), Curr. Med. Chem. 6:1005, Nauck et al. (1997), Exp. Clin. Endocrinol. Diabetes 105:187, Lopez-Delgado et al. (1998), Endocrinology 139:2811). Человеческий GLP-1 имеет 37 аминокислотных остатков (Heinrich et al., Endocrinol. 115:2176 (1984), Uttenthal et al., J. Clin. Endocrinol. Metabol. (1985), 61:472). К активным фрагментам GLP-1 относятся GLP-1(7-36) и GLP-1(7-37).
Было высказано предположение о том, что эксендин-3, эксендин-4 и агонисты эксендина можно применять для лечения сахарного диабета и для предупреждения развития гипергликемии, поскольку они уменьшают опорожнение и моторику желудка (US 5424286 и WO 98/0535 A1).
Аналоги эксендина можно охарактеризовать с помощью аминокислотных замен и/или С-концевых усечений нативной последовательности эксендина-4. Такие аналоги эксендина описаны в WO 99/07404, WO 99/25727 и WO 99/25728.
Отщепление пептида, синтезированного на твердой фазе, в частности на смоле, представляет собой сложную химическую реакцию. С одной стороны, требуется отщепить пептид от твердой фазы. С другой стороны, могут удаляться защитные группы, присутствующие на боковых цепях аминокислотных структурных блоков. Защитные группы и фрагменты защитных групп, теперь присутствующие в жидкой фазе, инактивируют с помощью так называемых "акцепторов", поскольку они все еще могут вступать в реакцию с пептидом с образованием нежелательных побочных продуктов.
Связанные с твердой фазой пептиды, получаемые с помощью Fmoc-защищенных аминокислотных структурных блоков, можно отщепить от твердой фазы с помощью трифторуксусной кислоты (TFA). Кроме того, TFA удаляет кислотолабильные защитные группы, которые могут присутствовать в боковых цепях аминокислотных структурных блоков.
Известные из уровня техники способы отщепления пептидов, связанных с твердой фазой, предусматривают использование композиции, содержащей TFA и ряд акцепторов, например 3, 4 или 5 акцепторов, для удаления групп с высокой реакционной способностью, образующихся после отщепления защитных групп от боковых цепей и способных ковалентно модифицировать аминокислотные остатки пептида. В публикации King et al. (Int. J. Peptide Proteine Res: 36, 1990, 255-266) раскрыто сравнение "реагента K" (82,5% TFA, 5% фенола, 5% H2O, 5% тиоанизола, 2,5% 1,2-этандитиола) с композициями, содержащими TFA с 2-4 различными акцепторами. Было обнаружено, что "реагент К" наиболее эффективен в отщеплении и ингибировании нежелательных побочных реакций у 10 различных пептидов, каждый из которых содержит 20-50 аминокислотных остатков и получен с помощью Fmoc-подхода твердофазного синтеза. Тесты проводили при комнатной температуре.
Если отщепление от твердой фазы является неполным или защитные группы боковой цепи не полностью удалены, реакцию отщепления можно повторить. Такое дополнительное отщепление называют в данном документе "вторым отщеплением" или "последующим отщеплением".
Цель изобретения заключается в повышении выхода пептида при твердофазном синтезе пептидов, в частности агониста GLP-1. Если присоединение аминокислотных структурных блоков к аминокислотной цепи, связанной с твердой фазой, завершено, аминокислотную цепь отщепляют от твердой фазы. Твердую фазу, содержащую пептид, приводят в контакт с реагентом для отщепления, где пептид, в частности агонист GLP-1, отщепляется от твердой фазы и удаляются защитные группы, необязательно присутствующие на боковых цепях аминокислот.
Авторами настоящего изобретения было обнаружено, что температура реакции и состав реагента для отщепления оказывают значительное влияние на показатель выхода пептида. В свете известных из уровня техники способов отщепления способ отщепления по настоящему изобретению характеризуется:
1. Повышением температуры реакции выше комнатной;
2. Уменьшением количества компонентов в реагенте для отщепления или композиции для отщепления или/и
3. Необязательно отсутствием "второго отщепления".
Авторами настоящего изобретения было обнаружено, что с помощью заявляемого способа отщепления пептида (в частности агониста GLP-1), связанного с твердой фазой, от твердой фазы выход пептида (неочищенного пептида) можно увеличить на 5%, что приводит к снижению затрат и увеличению производительности. Кроме того, профиль примесей не подвергался существенному изменению.
За счет уменьшения количества компонентов в смеси для отщепления (с учетом пяти компонентов в сравнительной смеси Кинга) улучшается аналитический контроль качества, снижаются затраты и упрощается выполнение технологических операций в ходе производственного процесса.
За счет отсутствия второй стадии отщепления снижаются затраты и облегчается выполнение технологических операций в ходе производственного процесса. Уменьшаются количества TFA, поэтому упрощается удаление TFA.
В первом аспекте настоящего изобретения представлен способ отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, при температуре, находящейся в диапазоне от приблизительно 23°C до приблизительно 29°C.
Способы твердофазного синтеза известны специалисту в данной области техники. В предпочтительном аспекте циклы присоединения осуществляют в направлении от C-конца к N-концу синтезируемой последовательности. Специалисту в данной области техники известны условия реакции, используемые при твердофазном пептидном синтезе от С-конца к N-конца с применением аминокислотных структурных блоков. В данном документе описаны аминокислотные структурные блоки, подходящие для твердофазного синтеза. В частности, обеспечивают защиту N-концевой аминогруппы аминокислотного структурного блока с помощью отщепляемой в основных условиях защитной группы, такой как Fmoc. На фигуре 1 показан синтез Fmoc-защищенных аминокислотных структурных блоков.
Твердофазный синтез ликсисенатида (также известного под названием AVE0010 или ZP-10), описанный в патентном документе WO 01/04156 A1, который включен в данный документ посредством ссылки, предусматривает присоединение каждого из отдельных Fmoc-защищенных аминокислотных структурных блоков посредством одним способом.
Можно использовать все виды твердых фаз, подходящих для твердофазного синтеза пептидов. В частности, можно использовать твердую фазу, содержащую смолу. Смола может представлять собой смолу Ринка (амидную смолу Ринка) или смолу Tentagel®. В предпочтительном аспекте смола, выступающая в качестве твердой фазы, представляет собой смолу Ринка или амидную смолу Ринка.
В частности, полипептид связан со смолой, в частности с амидной смолой Ринка, посредством линкера. Специалисту в данной области техники известны подходящие линкеры.
В настоящем изобретении термин "приблизительно" или "примерно" означает диапазон ±10%, ±5% или ±1%.
В настоящем изобретении выражение "состоящая по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола" означает, в частности, что в композиции могут в небольших количествах присутствовать дополнительные соединения. В частности, трифторуксусную кислоту и 1,2-этандитиол используют в способе по настоящему изобретению со стандартной степенью чистоты. Поэтому композиция по настоящему изобретению, состоящая по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, может содержать примеси, которые обычно присутствуют в трифторуксусной кислоте и 1,2-этандитиоле. Процентная доля трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола в композиции по настоящему изобретению или согласно способу по настоящему изобретению составляет в целом 100%, включая примеси, которые могут присутствовать в трифторуксусной кислоте или/и 1,2-этандитиоле.
В настоящем изобретении "в небольших количествах" означает, в частности, что в композиции по настоящему изобретению или в реакционной смеси, используемой в способе по настоящему изобретению, могут присутствовать дополнительные соединения, такие как примеси трифторуксусной кислоты или/и 1,2-этандитиола, в количестве, составляющем не более 1% объем/объем, не более 0,5% объем/объем, не более 0,2% объем/объем, не более 0,1% объем/объем, не более 0,05% объем/объем или не более 0,02% объем/объем. Если присутствуют примеси, которые могут быть твердыми веществами, содержание в процентах выражают как вес/объем.
В способе по настоящему изобретению композиция для отщепления содержит трифторуксусную кислоту, в частности, в количестве, составляющем от приблизительно 95 до приблизительно 99% объем/объем.
Предпочтительно композиция для отщепления содержит трифторуксусную кислоту в количестве, составляющем от приблизительно 96 до приблизительно 98% объем/объем, или в количестве, составляющем от приблизительно 97 до приблизительно 99% объем/объем.
В частности, композиция содержит трифторуксусную кислоту в количестве, составляющем приблизительно 97% объем/объем.
В способе по настоящему изобретению композиция для отщепления содержит 1,2-этандитиол, в частности, в количестве, составляющем от приблизительно 1 до приблизительно 5% объем/объем.
Предпочтительно композиция для отщепления содержит 1,2-этандитиол в количестве, составляющем от приблизительно 2 до приблизительно 4% объем/объем, или в количестве, составляющем от приблизительно 1 до приблизительно 3% объем/объем.
В частности, композиция содержит 1,2-этандитиол в количестве, составляющем приблизительно 3% объем/объем.
В способе по настоящему изобретению предпочтительная композиция для отщепления состоит по сути из трифторуксусной кислоты в количестве от приблизительно 96 до приблизительно 98% объем/объем, а остаток представлен 1,2-этандитиолом в количестве от приблизительно 4 до приблизительно 2% объем/объем.
В способе по настоящему изобретению предпочтительная композиция для отщепления состоит по сути из трифторуксусной кислоты в количестве от приблизительно 97 до приблизительно 99% объем/объем, а остаток представлен 1,2-этандитиолом в количестве от приблизительно 3 до приблизительно 1% объем/объем.
В способе по настоящему изобретению другая предпочтительная композиция для отщепления состоит по сути из трифторуксусной кислоты в количестве от приблизительно 96,5 до приблизительно 97,5% объем/объем, а остаток представлен 1,2-этандитиолом в количестве от приблизительно 3,5 до приблизительно 2,5% объем/объем.
В способе по настоящему изобретению другая предпочтительная композиция состоит по сути из трифторуксусной кислоты в количестве приблизительно 97% объем/объем и 1,2-этандитиола в количестве приблизительно 3% объем/объем.
В способе по настоящему изобретению, описанном в данном документе, другая предпочтительная композиция состоит по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола в соотношении 8,25:0,25 (объем:объем).
Композиция по настоящему изобретению может представлять собой жидкую композицию. В способе по настоящему изобретению композицию можно использовать в количестве, составляющем от приблизительно 5 до 12 мл/г связанного с твердой фазой пептида, в частности, от 7 до 9 мл/г связанного с твердой фазой пептида или приблизительно 8,5 мл/г связанного с твердой фазой пептида. Вес "пептида, связанного с твердой фазой" или "пептида, связанного со смолой" означает вес пептида вместе с весом твердой фазы или смолы, подлежащей приведению в контакт с композицией по настоящему изобретению.
В частности, в способе по настоящему изобретению можно использовать 8,25 мл TFA/г связанного с твердой фазой пептида и приблизительно 0,25 мл 1,2-этандитиола/г связанного с твердой фазой пептида.
В настоящем изобретении неожиданно было обнаружено, что отщепление пептида от смолы при температуре, превышающей комнатную температуру, приводит в результате к повышенному выходу пептида, в частности агониста GLP-1.
В способе по настоящему изобретению композицию приводят в контакт с твердой фазой, с которой связан полипептид, в частности при температуре, составляющей от приблизительно 25°C до приблизительно 27°C, или при температуре, составляющей от приблизительно 26°C до приблизительно 29°C, более конкретно при температуре, составляющей от приблизительно 25,5°C до приблизительно 26,5°C, наиболее конкретно при температуре, составляющей приблизительно 26°C.
Предпочтительно твердую фазу приводят в контакт с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты в количестве приблизительно 97% объем/объем и 1,2-этандитиола в количестве приблизительно 3% объем/объем, при температуре, составляющей от приблизительно 25°C до приблизительно 27°C.
Также в настоящем изобретении предпочтительно твердую фазу приводить в контакт с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты в количестве приблизительно 97% объем/объем и 1,2-этандитиола в количестве приблизительно 3% объем/объем, при температуре, составляющей от приблизительно 26°C до приблизительно 29°C.
Более предпочтительно твердую фазу приводят в контакт с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты в количестве приблизительно 97% объем/объем и 1,2-этандитиола в количестве приблизительно 3% объем/объем, при температуре, составляющей от приблизительно 25,5°C до приблизительно 26,5°C, предпочтительно приблизительно 26°C.
В способе по настоящему изобретению композицию приводят в контакт с твердой фазой, с которой связан полипептид, на период времени, составляющий 1-8 ч, более конкретно на период времени, составляющий 4-8 ч. Предпочтительно приводить композицию в контакт с твердой фазой, с которой связан полипептид, на период времени, составляющий приблизительно 4 ч, приблизительно 5 ч, приблизительно 6 ч, приблизительно 7 или приблизительно 8 ч.
В способе по настоящему изобретению наиболее предпочтительно приводить композицию в контакт с твердой фазой, с которой связан полипептид, на период времени, составляющий 3-5 ч, в частности на период времени, составляющий 4 ч.
Более предпочтительно твердую фазу приводят в контакт с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты в количестве приблизительно 97% объем/объем и 1,2-этандитиола в количестве приблизительно 3% объем/объем, при температуре, составляющей от приблизительно 25,5°C до приблизительно 26,5°C, на период времени, составляющий приблизительно 4 ч, предпочтительно при температуре, составляющей приблизительно 26°C, на период времени, составляющий приблизительно 4 ч.
В еще одном аспекте настоящего изобретения дополнительное или последующее отщепление не осуществляют. В данном аспекте при твердофазном синтезе полипептида отщепление в соответствии со способом по настоящему изобретению осуществляют за одну стадию.
Аминокислотный структурный блок по настоящему изобретению представляет собой соединение, которое обеспечивает удлинение синтезируемой аминокислотной цепи на одну или несколько аминокислот за один цикл пептидного синтеза. В предпочтительном аспекте аминокислотный структурный блок по настоящему изобретению обеспечивает удлинение синтезируемой аминокислотной цепи на 1, 2, 3 или 4 аминокислоты. В конкретном предпочтительном аспекте аминокислотный структурный блок по настоящему изобретению обеспечивает удлинение синтезируемой аминокислотной цепи на одну или две аминокислоты.
Аминокислотный структурный блок по настоящему изобретению предпочтительно содержит одну аминокислоту (структурный блок из одной аминокислоты) или олигонуклеотид, содержащий 2, 3, 4 или больше аминокислот. В предпочтительном аспекте аминокислотный структурный блок по настоящему изобретению содержит одну аминокислоту или пептид, содержащий две аминокислоты, такие как, например, Pro-Pro или His-Gly. Аминокислоты из аминокислотного структурного блока, содержащего более одной аминокислоты, предпочтительно соединяются пептидными связями. Особенно предпочтительными аминокислотными структурными блоками, содержащими две аминокислоты, являются Fmoc-Pro-Pro-OH и Fmoc-His(Trt)-Gly-OH.
Было обнаружено, что применение Fmoc-His(Trt)-Gly-OH вместо аминокислотных структурных блоков His и Gly в положениях 1 и 2 в синтезе ликсисенатида и эксендина-4 позволяет предотвратить образование нежелательного дез-Gly(2)-ликсисенатида. Более того, у полученного ликсисенатида не наблюдали увеличенные значения D-His, которые являются следствием рацемизации.
Fmoc-His(Trt)-Gly-OH можно получить, например, посредством способа, предусматривающего стадии:
i) проведения реакции между Fmoc-His(Trt)-OH и тозилатом H-Gly-OBzl и
ii) отщепления бензильной группы от продукта, полученного на стадии i),
с получением Fmoc-His(Trt)-Gly-OH.
Иллюстративные условия реакции изложены в примере 3.
Аминокислотные структурные блоки по настоящему изобретению могут содержать модификации, подходящие для избирательного удлинения аминокислотной цепи только в требуемых положениях. Модификации аминокислотного структурного блока можно осуществлять на N-конце, на C-конце и/или на боковых цепях аминокислот.
Для защиты N-концевой функциональной аминогруппы в аминокислотном структурном блоке (т. е. аминогруппы, которая после успешного присоединения представляет собой N-конец аминоцепи) можно использовать все виды защитных групп, обычно применяемых для синтеза пептидов, особенно для твердофазного синтеза полипептидов. Специалисту в данной области техники известны такие виды подходящих временных защитных групп. В предпочтительном аспекте можно применять защитные группы, которые являются нестабильными в щелочной среде. В предпочтительном аспекте N-концевую аминогруппу в аминокислотном структурном блоке защищают посредством защитной группы Fmoc.
С-концевую карбоксильную группу из аминокислотного структурного блока предпочтительно оставляют незащищенной.
Аминокислотный структурный блок по настоящему изобретению может содержать независимо от других D-аминокислоты и глицин, L-аминокислоты и глицин и/или их комбинации. В предпочтительном аспекте аминокислоты в аминокислотном структурном блоке по настоящему изобретению выбраны независимо друг от друга из L-аминокислот и глицина. В предпочтительном аспекте аминокислоты могут быть выбраны из α-аминокислот. В дополнительном аспекте аминокислоты могут быть выбраны из встречающихся в природе аминокислот, таких как аминокислоты, встречающиеся в природе в полипептидах. В другом аспекте аминокислотный структурный блок по настоящему изобретению может содержать искусственные аминокислоты, такие как Met(O) (метионинсульфоксид или метионинсульфон), Trp(O2) (N-формилкинуренин) и/или изо-Asp (β-аспартат или изоаспартат). В еще одном дополнительном предпочтительном аспекте аминокислоты выбраны из Ser, Thr, Trp, Lys, Ala, Asn, Asp, Val, Met, Phe, Ile, Pro, Arg, Glu, Gln, Leu, каждая из которых, в частности, представлена в D-форме или каждая из которых представлена в L-форме, и Gly. В особенно предпочтительном аспекте аминокислотный структурный блок по настоящему изобретению содержит аминокислоты, выбранные из Arg, Glu, Gln, Leu, каждая из которых, в частности, представлена в D-форме или каждая из которых представлена в L-форме, и Gly.
В частности, аминокислоты выбраны независимо друг от друга, например, независимо из Ser, Thr, Trp, Lys, Ala, Asn, Asp, Val, Met, Phe, Ile, Pro, Arg, Glu, Gln, Leu, каждая из которых, в частности, представлена в D-форме или каждая из которых представлена в L-форме, и Gly.
В одном аспекте по меньшей мере одну боковую цепь аминокислотного структурного блока по настоящему изобретению можно защитить дополнительной защитной группой. Дополнительная защитная группа является предпочтительно ортогональной по отношению к N-концевой защитной группе. Подходящие защитные группы для указанных боковых цепей известны специалисту в данной области техники. Примерами подходящих защитных групп являются, например, Trt, Boc, Bzl, Pdf, tBu и OtBu, которые можно использовать для защиты определенных боковых цепей. Специалист в данной области техники осведомлен, какую боковую цепь нужно защищать и каким типом защитной группы. В одном аспекте можно использовать аминокислотные структурные блоки, которые упомянуты в примере 1.4. В случае, когда аминокислотный структурный блок содержит больше одной боковой цепи, одну или несколько данных боковых цепей можно защитить посредством защитных групп, независимо выбранных из подходящих защитных групп, которые известны специалисту в данной области техники.
Синтезируемым полипептидом может быть любой возможный пептид с предварительно определенной последовательностью. В предпочтительном аспекте синтезируемым полипептидом является агонист GLP-1. Полипептидом может быть агонист GLP-1, при этом агонист GLP-1 выбран из группы, состоящей из GLP-1 и его аналогов и производных, эксендина-3 и его аналогов и производных, эксендина-4 и его аналогов и производных. В предпочтительном аспекте полипептид выбран из группы, состоящей из эксендина-4 и ликсисенатида. Наиболее предпочтительным пептидом является ликсисенатид. В дополнительном предпочтительном аспекте полипептид выбран из албиглутида, дулаглутида и семаглутида.
Эксендин-3, аналоги и производные эксендина-3, эксендин-4 и аналоги и производные эксендина-4 описаны в WO 01/04156, WO 98/30231, US 5424286, EP 99610043.4 и WO 2004/005342. Эти документы включены в данный документ посредством ссылки. Эксендин-3, эксендин-4 и их аналоги и производные, описанные в данных документах, можно синтезировать посредством способа по настоящему изобретению, в то же время после завершения синтеза можно осуществить дополнительные модификации.
Ликсисенатид (SEQ ID NO: 1, фигура 2), эксендин-4 (SEQ ID NO: 2, фигура 2) и эксендин-3 (SEQ ID NO: 3, фигура 2) имеют высокую степень идентичности последовательности. Последовательности ликсисенатида и эксендина-4 идентичны в положениях 1-37. Последовательность 1-39 эксендина-4 идентична эксендину-3 в положениях 37 из 39 (94%) (J. Biol. Chem. 267, 1992, 7402-7405). Положения в последовательности приведены в данном документе применительно к последовательности ликсисенатида или эксендина-4. На основе данных последовательностей специалист в данной области техники сможет легко определить соответствующие положения в других последовательностях.
Аналоги и производные эксендина-3 и/или эксендина-4, в частности, содержат модифицированную аминокислотную последовательность. В одном аспекте аминокислотную последовательность модифицируют путем удаления одной или нескольких аминокислот (например дез-Pro36, дез-Pro37, дез-Asp28, дез-Met(O14) в эксендине-4 и соответствующих положений в эксендине-3). В одном аспекте можно осуществить замену одной или нескольких аминокислот (например Met(O14), Trp(O2)25, изо-Asp28, Asp28, Pro38 в эксендине-4 и в соответствующих положениях в эксендине-3), при этом можно ввести встречающиеся в природе или искусственные аминокислоты, такие как, например, Met(O) (метионинсульфоксид или метионинсульфон), Trp(O2) (N-формилкинуренин) и/или изо-Asp (β-аспартат или изоаспартат). За один цикл синтеза в последовательность можно легко встроить искусственные аминокислоты с применением соответствующих аминокислотных структурных блоков.
В одном аспекте C-конец и/или N-конец полипептида можно модифицировать, например, путем добавления таких последовательностей, как -(Lys)-, -(Lys)2-, -(Lys)3-, -(Lys)4-, -(Lys)5-, -(Lys)6- и -Asn-(Glu)5-. В предпочтительном аспекте дополнительные аминокислотные последовательности представляют собой, например, -(Lys)4-, -(Lys)5-, -(Lys)6- и -Asn-(Glu)5-. С-концевая карбоксильная группа предпочтительно представляет собой кислую аминогруппу (-NH2). Необязательно модификацию C-конца и/или N-конца осуществляют на отдельной стадии после завершения циклов синтеза способа по настоящему изобретению.
После завершения циклов синтеза способа по настоящему изобретению на дополнительной стадии необязательно можно получить фармацевтически приемлемые соли синтезированных полипептидов. Способы получения фармацевтически приемлемых солей полипептидов известны специалисту в данной области техники. Предпочтительными фармацевтически приемлемыми солями являются, например, ацетатные соли.
Еще один предпочтительный агонист GLP-1 представляет собой аналог эксендина-4, выбранный из группы, состоящей из:
H-дез-Pro36-эксендин-4-Lys6-NH2,
H-дез-(Pro36,37)-эксендин-4-Lys4-NH2,
H-дез-(Pro36,37)-эксендин-4-Lys5-NH2 и их фармацевтически приемлемых солей.
Еще один предпочтительный агонист GLP-1 представляет собой аналог эксендина-4, выбранный из группы, состоящей из:
дез-Pro36[Asp28]эксендина-4 (1-39),
дез-Pro36[изо-Asp28]эксендина-4 (1-39),
дез-Pro36[Met(O)14,Asp28]эксендина-4 (1-39),
дез-Pro36[Met(O)14,изо-Asp28]эксендина-4 (1-39),
дез-Pro36[Trp(O2)25,Asp28]эксендина-2 (1-39),
дез-Pro36[Trp(O2)25,изо-Asp28]эксендина-2 (1-39),
дез-Pro36[Met(O)14Trp(O2)25,Asp28]эксендина-4 (1-39),
дез-Pro36[Met(O)14Trp(O2)25, изо-Asp28]эксендина-4(1-39) и их фармацевтически приемлемых солей.
Еще один предпочтительный агонист GLP-1 представляет собой аналог эксендина-4, выбранный из описанных выше групп, дополнительно модифицированный пептидом -Lys6-NH2 на C-конце.
Еще один предпочтительный агонист GLP-1 представляет собой аналог эксендина-4, выбранный из группы, состоящей из:
H-(Lys)6-дез-Pro36[Asp28]эксендин-4(1-39)-Lys6-NH2, дез-Asp28Pro36,Pro37,Pro38эксендин-4(1-39)-NH2,
H-(Lys)6-дез-Pro36,Pro37,Pro38[Asp28]эксендин-4(1-39)-NH2,
H-Asn-(Glu)5дез-Pro36,Pro37,Pro38[Asp28]эксендин-4(1-39)-NH2,
дез-Pro36,Pro37,Pro38[Asp28]эксендин-4(1-39)-(Lys)6-NH2,
H-(Lys)6-дез-Pro36,Pro37,Pro38[Asp28]эксендин-4(1-39)-(Lys)6-NH2,
H-Asn-(Glu)5-дез-Pro36,Pro37,Pro38[Asp28]эксендин-4(1-39)-(Lys)6-NH2,
H-(Lys)6-дез-Pro36[Trp(O2)25,Asp28]эксендин-4(1-39)-Lys6-NH2,
H-дез-Asp28 Pro36,Pro37,Pro38[Trp(O2)25]эксендин-4(1-39)-NH2,
H-(Lys)6-дез-Pro36,Pro37,Pro38[Trp(O2)25,Asp28]эксендин-4(1-39)-NH2,
H-Asn-(Glu)5-дез-Pro36,Pro37,Pro38[Trp(O2)25,Asp28]эксендин-4(1-39)-NH2,
дез-Pro36,Pro37,Pro38[Trp(O2)25,Asp28]эксендин-4(1-39)-(Lys)6-NH2,
H-(Lys)6-дез-Pro36,Pro37,Pro38[Trp(O2)25,Asp28]эксендин-4(1-39)-(Lys)6-NH2,
H-Asn-(Glu)5-дез-Pro36,Pro37,Pro38[Trp(O2)25,Asp28]эксендин-4(1-39)-(Lys)6-NH2,
H-(Lys)6-дез-Pro36[Met(O)14,Asp28]эксендин-4(1-39)-Lys6-NH2,
desMet(O)14,Asp28,Pro36,Pro37,Pro38-эксендин-4(1-39)-NH2,
H-(Lys)6-дез-Pro36,Pro37,Pro38[Met(O)14,Asp28]эксендин-4(1-39)-NH2,
H-Asn-(Glu)5-дез-Pro36,Pro37,Pro38[Met(O)14,Asp28]эксендин-4(1-39)-NH2,
дез-Pro36,Pro37,Pro38[Met(O)14,Asp28]эксендин-4(1-39)-(Lys)6-NH2,
H-(Lys)6-дез-Pro36,Pro37,Pro38[Met(O)14,Asp28]эксендин-4(1-39)-Lys6-NH2,
H-Asn-(Glu)5-дез-Pro36,Pro37,Pro38[Met(O)14,Asp28]эксендин-4(1-39)-(Lys)6-NH2,
H-(Lys)6-дез-Pro36[Met(O)14, Trp(O2)25,Asp28]эксендин-4(1-39)-Lys6-NH2,
дез-Asp28Pro36,Pro37,Pro38[Met(O)14, Trp(O2)25]эксендин-4(1-39)-NH2,
H-(Lys)6-дез-Pro36,Pro37,Pro38[Met(O)14, Trp(O2)25,Asp28]эксендин-4(1-39)-NH2,
H-Asn-(Glu)5-дез-Pro36,Pro37,Pro38[Met(O)14,Asp28]эксендин-4(1-39)-NH2,
дез-Pro36,Pro37,Pro38[Met(O)14,Trp(O2)25,Asp28]эксендин-4(1-39)-(Lys)6-NH2,
H-(Lys)6-дез-Pro36,Pro37,Pro38[Met(O)14,Trp(O2)25,Asp28]эксендин-4(1-39)-(Lys)6-NH2,
H-Asn-(Glu)5-дез-Pro36,Pro37,Pro38[Met(O)14,Trp(O2)25,Asp28]эксендин-4(1-39)-(Lys)6-NH2 и их фармацевтически приемлемых солей.
В дополнительном аспекте предпочтительный агонист GLP-1 выбран из группы, состоящей из GLP-1 (в частности, GLP-1(7-36)-амида, SEQ ID NO: 4), Arg34,Lys26(Nε(γ-глутамил(Nαгексадеканоил)))GLP-1(7-37) (лираглутида), албиглутида, дулаглутида, семаглутида и их фармацевтически приемлемых солей. В частности, предпочтительный агонист GLP-1 выбран из группы, состоящей из албиглутида, дулаглутида, семаглутида и их фармацевтически приемлемых солей.
Еще один предпочтительный агонист GLP-1 представляет собой ликсисенатид (SEQ ID NO: 1), а также его фармацевтически приемлемые соли.
Предпочтительный аспект настоящего изобретения относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, при температуре, находящейся в диапазоне от приблизительно 23°C до приблизительно 29°C, где полипептид представляет собой ликсисенатид.
Другой предпочтительный аспект настоящего изобретения относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, при температуре, находящейся в диапазоне от приблизительно 23°C до приблизительно 29°C, где твердая фаза представляет собой амидную смолу Ринка, и полипептид представляет собой ликсисенатид.
Другой предпочтительный аспект настоящего изобретения относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, при температуре, находящейся в диапазоне от приблизительно 26°C до приблизительно 29°C.
Другой предпочтительный аспект настоящего изобретения относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, при температуре, находящейся в диапазоне от приблизительно 26°C до приблизительно 29°C, где полипептид представляет собой ликсисенатид.
Другой предпочтительный аспект настоящего изобретения относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, при температуре, находящейся в диапазоне от приблизительно 26°C до приблизительно 29°C, где твердая фаза представляет собой амидную смолу Ринка, и полипептид представляет собой ликсисенатид.
Другой предпочтительный аспект настоящего изобретения относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, при температуре, составляющей 26°C.
Другой предпочтительный аспект настоящего изобретения относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, при температуре, составляющей приблизительно 26°C, где полипептид представляет собой ликсисенатид.
Другой предпочтительный аспект настоящего изобретения относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, при температуре, составляющей приблизительно 26°C, где твердая фаза представляет собой амидную смолу Ринка, и полипептид представляет собой ликсисенатид.
Еще один предпочтительный аспект настоящего изобретения относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты в количестве 97% и 1,2-этандитиола в количестве 3%, при температуре, находящейся в диапазоне от приблизительно 23°C до приблизительно 29°C.
Еще один предпочтительный аспект настоящего изобретения относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты в количестве 97% и 1,2-этандитиола в количестве 3%, при температуре, находящейся в диапазоне от приблизительно 23°C до приблизительно 29°C, где полипептид представляет собой ликсисенатид.
Еще один предпочтительный аспект настоящего изобретения относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты в количестве 97% и 1,2-этандитиола в количестве 3%, при температуре, находящейся в диапазоне от приблизительно 23°C до приблизительно 29°C, где твердая фаза представляет собой амидную смолу Ринка, и полипептид представляет собой ликсисенатид.
Еще один предпочтительный аспект настоящего изобретения относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты в количестве 97% и 1,2-этандитиола в количестве 3%, при температуре, находящейся в диапазоне от приблизительно 26°C до приблизительно 29°C.
Еще один предпочтительный аспект настоящего изобретения относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты в количестве 97% и 1,2-этандитиола в количестве 3%, при температуре, находящейся в диапазоне от приблизительно 26°C до приблизительно 29°C, где полипептид представляет собой ликсисенатид.
Еще один предпочтительный аспект настоящего изобретения относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты в количестве 97% и 1,2-этандитиола в количестве 3%, при температуре, находящейся в диапазоне от приблизительно 26°C до приблизительно 29°C, где твердая фаза представляет собой амидную смолу Ринка, и полипептид представляет собой ликсисенатид.
Еще один предпочтительный аспект настоящего изобретения относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты в количестве 97% и 1,2-этандитиола в количестве 3%, при температуре, составляющей 26°C.
Еще один предпочтительный аспект настоящего изобретения относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты в количестве 97% и 1,2-этандитиола в количестве 3%, при температуре, составляющей 26°C, где полипептид представляет собой ликсисенатид.
Еще один предпочтительный аспект настоящего изобретения относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты в количестве 97% и 1,2-этандитиола в количестве 3%, при температуре, составляющей 26°C, где твердая фаза представляет собой амидную смолу Ринка, и полипептид представляет собой ликсисенатид.
Еще один аспект настоящего изобретения представляет собой способ твердофазного синтеза полипептида, содержащего предварительно определенную аминокислотную последовательность, при этом указанный способ предусматривает:
(a) присоединение аминокислотного структурного блока, содержащего незащищенную С-концевую карбоксильную группу и защищенную N-концевую аминогруппу, по С-концу к твердой фазе, такой как амидная смола Ринка,
(b) удаление защитной группы с N-концевой аминогруппы аминокислотного структурного блока,
(c) присоединение аминокислотного структурного блока, содержащего незащищенную С-концевую карбоксильную группу и защищенную N-концевую аминогруппу, по С-концу к незащищенной N-концевой аминогруппе из стадии (b),
(d) необязательно повторение стадий (b) и (c) и
(e) отщепление полипептида от твердой фазы посредством способа по настоящему изобретению, описанного в данном документе.
В данном документе описаны аминокислотные структурные блоки, подходящие для способа твердофазного синтеза по настоящему изобретению.
В способе твердофазного синтеза по настоящему изобретению могут отсутствовать вторая или последующая стадия отщепления. В твердофазном синтезе полипептида стадию отщепления (e) предпочтительно осуществляют однократно.
Специалисту в данной области техники известны подходящие условия присоединения на стадиях (a) или/и (c) и удаления защитной группы в соответствии со стадией (b).
Синтезируемый пептид может представлять собой описываемый в данном документе пептид. В способе твердофазного синтеза полипептид может быть выбран из GLP-1, его аналогов и производных, эксендина-3, его аналогов и производных и эксендина-4, его аналогов и производных, описанных в данном документе. В частности, полипептид выбран из эксендина-4 и ликсисенатида. Предпочтительный полипептид представляет собой ликсисенатид. Полипептид также можно выбрать из албиглутида, дулаглутида и семаглутида.
В одном аспекте синтезируемый полипептид предпочтительно представляет собой ликсисенатид или эксендин-4, при этом после присоединения аминокислотного структурного блока Arg(20), Glu (17), Gln(13), Leu(10) или/и Gly(4) между стадиями (c) и (d) можно осуществить стадию кэппирования. В соответствии с настоящим изобретением, "кэппирование" представляет собой ацетилирование свободной незащищенной N-концевой аминогруппы, к которой ни один аминокислотный структурный блок не присоединился, с целью завершения удлинения цепи в таких молекулах. Такие кэппированные молекулы можно удалить из продукта в ходе очистки. Кэппирование описано на фигуре 1.
В частности, "кэппирование" по настоящему изобретению означает приведение в контакт продукта, полученного на стадии (c), с кэппирующим реагентом или кэппирующей композицией, содержащей кэппирующее соединение, при этом кэппирующее соединение связывается с незащищенной N-концевой аминогруппой аминокислотной цепи, к которой на стадии (c) не присоединился ни один структурный блок.
В одном аспекте кэппирующая композиция содержит уксусный ангидрид в концентрации, составляет 0,5-5% объем/объем. В предпочтительном аспекте концентрация уксусного ангидрида составляет 1-3% объем/объем, более предпочтительно 2% объем/объем.
В одном аспекте кэппирующая композиция содержит диизопропилэтиламин, при этом концентрация диизопропилэтиламина может составлять 0,2-2% объем/объем и предпочтительно составляет 0,5-2% объем/объем. Предпочтительная концентрация диизопропилэтиламина составляет 1% объем/объем.
В одном аспекте кэппирующая композиция содержит диизопропилэтиламин и уксусный ангидрид, при этом концентрация диизопропилэтиламина может составлять 0,2-2% объем/объем и предпочтительно составляет 0,5-2% объем/объем, а концентрация уксусного ангидрида может составлять 0,5-5% объем/объем и предпочтительно составляет 1-3% объем/объем.
Предпочтительно, чтобы кэппирующая композиция содержала 2% объем/объем уксусного ангидрида и 1% объем/объем диизопропилэтиламина.
Кэппирование можно осуществлять в течение 5-15 мин, в частности приблизительно 10 мин.
Предпочтительное кэппирование осуществляют в течение приблизительно 10 мин с кэппирующим реагентом или кэппирующей композицией, содержащей 2% объем/объем уксусного ангидрида и 1% объем/объем диизопропилэтиламина.
Реакцию кэппирования по настоящему изобретению можно осуществлять при комнатной температуре. Комнатная температура в соответствии с настоящим изобретением относится к температуре, составляющей примерно 15-25°C, температуре, находящейся в диапазоне примерно 20-23°C, температуре, находящейся в диапазоне примерно 19-21°C, или температуре составляющей примерно 20°C.
Растворитель, используемый на стадии кэппирования, предпочтительно представляет собой полярный безводный растворитель, такой как ацетонитрил, диметилсульфоксид (DMSO), метанол, метиленхлорид, N, N-диметилформамид (DMA), N, N-диметилформамид (DMF), N-метилпирролидон или их смеси. В предпочтительном аспекте растворитель, используемый на стадии кэппирования, представляет собой DMF.
Еще один аспект настоящего изобретения представлен композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, при этом композиция содержит трифторуксусную кислоту в количестве, составляющем 95-99% объем/объем, и 1,2-этандитиол в количестве, составляющем 1-5% объем/объем.
В частности, композиция по настоящему изобретению состоит по сути из трифторуксусной кислоты в количестве приблизительно 97% объем/объем и 1,2-этандитиола в количестве приблизительно 3% объем/объем.
Другая предпочтительная композиция состоит по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола в соотношении 8,25:0,25 (объем:объем).
Дополнительные характеристик композиции описаны выше в связи со способом по настоящему изобретению. В частности, композицию по настоящему изобретению можно использовать в твердофазном синтезе полипептида, описанного в данном документе, отщепления полипептида от твердой фазы, описанного в данном документе.
Сокращения
Ac(N1-N2): ацетилированный на N-конце фрагмент полипептида от положения N1 до N2.
H(N1-N2) или (N1-N2): фрагмент полипептида от положения N1 до N2, содержащий свободную, N-концевую функциональную аминогруппу.
Fmoc(N1-N2): фрагмент полипептида от положения N1 до N2, содержащий защищенную N-концевую функциональную аминогруппу, где защитной группой является Fmoc.
(N-1)-примесь: относится к образованию непредусмотренного пептида в ходе синтеза пептида, у которого в определенном положении отсутствует структурный блок. Если предусмотренный синтезированный полипептид имеет длину N, примесь имеет длину N-1. Появление примесей (N-1) предотвращают путем кэппирования.
Fmoc флуоренилметилхлороформиат
Boc трет-бутоксикарбонил
Bzl бензил
Pbf 2,2,5,7,8-пентаметилдигидробензофуран-5-сульфонил
tBu трет-бутил
OtBu O-трет-бутил
Trt тритил
DIPE простой диизопропиловый эфир
Настоящее изобретение дополнительно охарактеризовано приведенными ниже фигурами и примерами.
Фигуры
Фигура 1: твердофазный синтез пептидов.
Фигура 2: последовательность ликсисенатида (SEQ ID NO: 1), эксендина-4 (SEQ ID NO: 2), эксендина-3 (SEQ ID NO: 3) и GLP-1(GLP-1(7-36)-амида, SEQ ID NO: 4).
Фигура 3: образование ацетилированных ошибочных последовательностей в ходе синтеза ликсисенатида. Присоединение Fmoc-Arg(20)-OH и последующее кэппирование/отщепление Fmoc. Следует отметить, что из синтеза было исключено положение 21 (Leu). (1) Fmoc-(22-44)+Arg, (2) (22-44)+Arg, (3) Ac(22-44)+Arg, (4) Fmoc-(22-44)+Arg+Val. По этим данным видно, что в ходе стадии кэппирования уж образовались ацетилированные фрагменты, однако ацетилировано неправильное положение [Ас(22-24)+Arg уже присутствует в ходе кэппирования Arg].
Фигура 4: образование ацетилированных ошибочных последовательностей в ходе синтеза ликсисенатида. Присоединение Fmoc-Gln(13)-OH и последующее кэппирование/отщепление Fmoc. (1) Ac(14-44), (2) Fmoc(13-44), (3) Ac(13-44), (4) (13-44), (5) (14-44). По этим данным видно, что в ходе стадии кэппирования уже образовались ацетилированные фрагменты, однако ацетилировано неправильное положение (Ac(13-44)).
Фигура 5: образование ацетилированных ошибочных последовательностей в ходе синтеза ликсисенатида. Присоединение Fmoc-Lys(12)-OH и последующее кэппирование/отщепление Fmoc. (1) Ac(13-44), (2) Fmoc(12-44), (3) Ac(12-44), (4) (12-44). По этим данным видно, что в ходе стадии кэппирования уже образовались ацетилированные фрагменты, однако ацетилировано неправильное положение (Ac(12-44)).
Фигура 6: результаты сравнения синтеза ликсисенатида с использованием способа кэппирования по настоящему изобретению (B) с кэппированием с использованием 10% уксусного ангидрида и 5% объем/объем DIPEA в DMF в течение 20 мин (A), полученные посредством HPLC-хроматографии. (C) Наложение HPLC-хроматограмм (A) и (B).
Фигура 7: HPLC ликсисенатида (неочищенный продукт). Красным: нежелательные ацетилированные побочные продукты.
Фигура 8: образование Ac(36-44) в зависимости от кэппирующей смеси и температуры.
Фигура 9: образование Ac(23-44) в зависимости от кэппирующей смеси и температуры.
Фигура 10: образование Ac(21-44) в зависимости от кэппирующей смеси и температуры.
Фигура 11: образование Ac(19-44) в зависимости от кэппирующей смеси и температуры.
Фигура 12: образование Ac(18-44) в зависимости от кэппирующей смеси и температуры.
Фигура 13: образование Ac(15-44) в зависимости от кэппирующей смеси и температуры.
Фигура 14: образование Ac(12-44) в зависимости от кэппирующей смеси и температуры.
Фигура 15: образование Ac(8-44) в зависимости от кэппирующей смеси и температуры.
Фигура 16: образование Ac(6-44) в зависимости от кэппирующей смеси и температуры.
Фигура 17: результаты сравнения содержания Ac(X-44) при кэппировании в 9 различных положениях в ходе синтеза ликсисенатида при 15°C, комнатной температуре (RT) и 30°C.
Фигура 18: результаты сравнения содержания Ac[(X-1)-44] при кэппировании в 9 различных положениях в ходе синтеза ликсисенатида при 15°C, комнатной температуре (RT) и 30°C.
Фигура 19: результаты сравнения содержания Ac(X-44) при кэппировании при различных условиях или без кэппирования в 9 различных положениях в ходе синтеза ликсисенатида при различных условиях кэппирования.
Фигура 20: результаты сравнения содержания Ac[(X-1)-44] при кэппировании при различных условиях или без кэппирования в 9 различных положениях в ходе синтеза ликсисенатида при различных условиях кэппирования.
Пример 1
Синтез ликсисенатида
Активное вещество ликсисенатид представляет собой амид полипептида, состоящий из 44 аминокислот; при этом ацетат выполняет функцию противоиона.
В однобуквенном коде аминокислотная последовательность ликсисенатида выглядит следующим образом:
H-G-E-G-T-F-T-S-D-L-S-K-Q-M-E-E-E-A-V-R-L-F-l-E-W-L-K-N-G-G-P-S-S-G-A-P-P-S-K-K-K-K-K-K-NH2
Пептидную цепь синтезировали посредством линейного твердофазного синтеза, начиная от C-конца Lys-44.
Способ синтеза представляет собой твердофазный пептидный синтеза с использованием Fmoc, в котором для получения амида пептида использовали амидную смолу Ринка. Реакции осуществляли в DMF при комнатной температуре. Между реакциями периодически проводили промывки, преимущественно посредством DMF, при этом одну из промежуточных стадий промывки проводили с использованием изопропанола.
Синтез ликсисенатида на полимерной подложке можно разделить на следующие стадии:
присоединение первой Fmoc-аминокислоты (Fmoc-Lys(Boc)-OH) со смолой Ринка;
кэппирование не вступившей в реакцию аминогруппы;
отщепление временной защитной группы Fmoc;
присоединение дополнительных Fmoc-аминокислот или Fmoc-дипептидов;
кэппирование не вступившей в реакцию аминогруппы;
конечное отщепление Fmoc;
отщепление ликсисенатида от смолы и одновременное удаление защитных групп на боковых цепях.
Цикл синтеза проиллюстрирован на фигуре 1.
1.1 Присоединение первой Fmoc-аминокислоты (Fmoc-Lys(Boc)-OH) со смолой Ринка
До начала синтеза амидную смолу Ринка обрабатывали DMF, чтобы она набухла. Набуханию ее подвергали на протяжении 2-15 ч. После этого от амидной смолы Ринка отщепляли временную защитную группу Fmoc с использованием 25% пиперидина в DMF. Данное отщепление проводили дважды; время отщепления составляло 5 минут и 20 минут. После отщепления Fmoc смолу повторно промывали DMF и однократно изопропанолом.
Присоединение первой Fmoc-аминокислоты, Fmoc-Lys(Boc)-OH, осуществляли в избытке, составлявшем 2,4 экв., с целью загрузки смолы. Гидрат HOBt, HBTU и DIPEA выступали в качестве конденсирующих реагентов. Время присоединения составляло 60-120 мин.
Для полной загрузки смолы Ринка посредством Fmoc-Lys(Boc)-OH проводили дополнительную загрузку с помощью конденсирующих реагентов - гидрата HOBt и DIC. Время присоединения составляло 6-18 ч. В ходе осуществления стадии 1.1 смесь перемешивали. Затем осуществляли кэппирование.
1.2 Кэппирование не вступившей в реакцию аминогруппы
Следствием неполной загрузки смолы было то, что на смоле еще оставались не вступившие в реакцию аминогруппы. Их инактивировали, а значит делали недоступными для дальнейшего присоединения, путем добавления смеси уксусный ангидрид/DIPEA/DMF (10:5:85). Кэппирующую смесь оставляли на смоле в течение 20 минут при перемешивании. Ацилировали оставшуюся свободную аминогруппу. После этого смолу повторно промывали DMF и однократно изопропанолом.
Способ кэппирования по настоящему изобретению в по меньшей мере 5 положениях в ходе синтеза ликсисенатида описан в примерах 4 и 5.
1.3. Отщепление временной защитной группы Fmoc
Временную защитную группу Fmoc отщепляли с использованием 25% пиперидина в DMF. Данное отщепление проводили дважды; время отщепления составляло 5 минут и 20 минут. После отщепления Fmoc смолу повторно промывали DMF и однократно изопропанолом.
1.4 Присоединение дополнительных Fmoc-аминокислот или Fmoc-дипептидов
Следующую Fmoc-аминокислоту присоединяли к незащищенной аминогруппе, присутствующей на смоле. Присоединение осуществляли в DMF в разных эквивалентах. Время присоединения составляло от 2 ч до 18 ч. В качестве конденсирующих реагентов использовали HOBt/DIC, а также HBTU/DIPEA.
В качестве Fmoc-аминокислот использовали следующие производные:
Fmoc-Lys(Boc)-OH
Fmoc-Ser(tBu)-OH
Fmoc-Pro-OH
Fmoc-Ala-OH x H2O
Fmoc-Gly-OH
Fmoc-Asn(Trt)-OH
Fmoc-Leu-OH
Fmoc-Trp(Boc)-OH
Fmoc-Glu(OtBu)-OH x H2O
Fmoc-lle-OH
Fmoc-Phe-OH
Fmoc-Arg(Pbf)-OH
Fmoc-Val-OH
Fmoc-Met-OH
Fmoc-Gln(Trt)-OH
Fmoc-Asp(OtBu)-OH
Fmoc-Thr(tBu)-OH
Fmoc-His(Trt)-OH
Альтернативно можно было использовать Fmoc-дипептиды (способ по настоящему изобретению):
Fmoc-Pro-Pro-OH (CAS 129223-22-9)
Fmoc-Ala-Pro-OH (CAS 186023-44-9)
Fmoc-Ser(tBu)-Gly-OH (CAS 113247-80-6)
Fmoc-Gly-Pro-OH (CAS 212651-48-4)
Fmoc-Gly-Gly-OH (CAS 35665-38-4)
Fmoc-Asn(Trt)-Gly-OH (от Bachem B-3630)
Fmoc-Glu(OtBu)-Gly-OH (CAS 866044-63-5)
Fmoc-His(Trt)-Gly-OH
Если присоединение оказывалось неполным в соответствии с тестом Кайзера (E. Kaiser et al, Anal. Biochem. 34, 1970, 595), тогда можно провести дополнительное присоединение. С этой целью Fmoc-аминокислоту повторно присоединяли с использованием HBTU/DIPEA/гидрата HOBt.
1.5 Кэппирование не вступившей в реакцию аминогруппы
См. описание в разделе 1.2.
1.6 Конечное отщепление Fmoc
Конечное отщепление Fmoc осуществляли так, как описано в пункте 1.3. В завершении смолу повторно промывали простым диизопропиловым эфиром и высушивали при пониженном давлении.
1.7 Отщепление ликсисенатида от смолы и одновременное удаление защитных групп на боковых цепях
Отщепление ликсисенатида от смолы Ринка осуществляли так, как это описано в примере 6.
1.8 Синтез ликсисенатида с применением дипептидов по настоящему изобретению
Присоединение первой Fmoc-Lys(Boc)-OH к смоле осуществляли с использованием HBTU/DIPEA/гидрата HOBt. После присоединения первой аминокислоты Fmoc-Lys(Boc)-OH к свободному амину амидной смолы Ринка дальнейшие стадии способа проводили в длительно повторяющемся цикле (также см. стадии 1.3-1.6):
отщепление Fmoc;
присоединение;
дополнительное присоединение, если это необходимо;
кэппирование;
отщепление N-концевой группы Fmoc после присоединения конечного аминокислотного звена.
Стандартные Fmoc-защищенные аминокислоты присоединяли к DIC/HOBt, при этом избыток аминокислот и конденсирующих реагентов составлял от 2 до 4 эквивалентов.
В положениях Pro(36) и Pro(37) вместо двух аминокислотных производных Fmoc-Pro-OH осуществляли присоединение дипептида Fmoc-Pro-Pro-OH с использованием HBTU/DIPEA.
В положении Pro(31) присоединение осуществляли с использованием HBTU/DIPEA/гидрата HOBt.
В положениях His(1) и Gly(2) вместо аминокислотных производных Fmoc-His(Boc)-OH и Fmoc-Gly-OH осуществляли присоединение дипептида Fmoc-His(Trt)-Gly-OH.
После стадий присоединения осуществляли кэппирование, в каждом случае с использованием Ac2O/DIPEA, как это описано в примерах 4 и 5.
Отщепление Fmoc осуществляли с использованием 25% пиперидина в DMF, в каждом случае последовательно, начиная с 5-минутного времени реакции и продолжая 20-40-минутным временем реакции.
Степень завершенности присоединения проверяли в тесте Кайзера.
После последнего присоединения и последнего отщепления группы Fmoc смолу промывали сначала несколько раз DMF, затем изопропанолом, а в завершении простым диизопропиловым эфиром, и затем ее сушили при 35°C при пониженном давлении.
Отщепление неочищенного пептида от смолы осуществляли в трифторуксусной кислоте с такими акцепторами, как 1,2-этандитиол.
Неочищенный пептид подвергали очистке в двухстадийной HPLC, при этом в качестве твердой фазы выступал силикагель C18 RP. На первой стадии очистки применяли буферную систему с ацетонитрилом/водой и 0,1% TFA; на второй стадии применяли буферную систему с ацетонитрилом/водой и AcOH. После концентрирования объединенных растворов чистый пептид получали посредством лиофилизации.
Использование 3500 г амидной смолы Ринка с загрузкой 0,3 ммоль/г (т. е. 1,05 мольную партию) давало 9970 г пептида, связанного со смолой. Из него получали 4636 г неочищенного пептида.
После очистки из них получали 576 г чистого пептида. MS: 4855,5 (моноизотопная молярная масса); полученная: 4855,6. Секвенирование аминокислотной последовательности: получена правильная последовательность. Анализ: 89,0% (как есть).
1.9 Синтез ликсисенатида без применения дипептидов
Пептидную цепь синтезировали посредством линейного твердофазного синтеза, начиная от C-конца Lys-44.
Стандартные Fmoc-защищенные аминокислоты присоединяли к DIC/HOBt, при этом избыток аминокислот и конденсирующих реагентов составлял от 2 до 4 эквивалентов.
В положениях Pro(37), Pro(36), Pro(31) присоединение осуществляли с использованием HBTU/DIPEA/гидрата HOBt.
После каждого присоединения проводили кэппирование с использованием Ac2O/DIPEA. Отщепление Fmoc осуществляли с использованием 25% пиперидина в DMF, в каждом случае последовательно, начиная с 5-минутного времени реакции и продолжая 20-минутным временем реакции.
Степень завершенности присоединения проверяли в тесте Кайзера. После последнего присоединения и последнего отщепления группы Fmoc смолу промывали сначала несколько раз DMF, затем изопропанолом, а в завершении простым диизопропиловым эфиром, и затем ее сушили при 35°C при пониженном давлении.
Отщепление неочищенного пептида от смолы осуществляли в трифторуксусной кислоте с такими акцепторами, как 1,2-этандитиол, тиоанизол, фенол и вода.
Неочищенный пептид подвергали очистке в двухстадийной HPLC, при этом в качестве твердой фазы выступал силикагель C18 RP. После концентрирования объединенных растворов чистый пептид получали посредством лиофилизации. В таблице 1 представлены результаты сравнения содержания рацемизированного D-His-ликсисенатида и содержания некоторых примесей в чистом пептиде при синтезе с использованием и без использования дипептидов.
Таблица 1
Результаты сравнения синтезов ликсисенатида с использованием и без использования дипептидов.
дез-Gly(2)-
ликсисенатид
дез-Pro(36)-
ликсисенатид
ди-Pro(36)-
ликсисенатид
по настоящему изобретению
По этим данным видно, что применение дипептида Fmoc-His (Trt)-GIy-OH давало ликсисенатид, который не содержал повышенных количеств D-His, возникающих в результате рацемизации. Более того, при использовании Fmoc-His(Trt)-GIy-OH дез-Gly(2)-ликсисенатид больше не выявляли. Кроме того, не были выявлены и пептиды N-1 и N+1 рядом с положением Pro(36) и Pro(37) в цепи (например, дез-Pro(36)-ликсисенатид или ди-Pro(36)ликсисенатид).
Пример 2
Синтез, очистка и определение характеристик эксендина-4 (по настоящему изобретению)
Активное вещество эксендин-4 представляет собой амид полипептида, состоящий из 39 аминокислот; при этом ацетат выполняет функцию противоиона.
В однобуквенном коде аминокислотная последовательность выглядит следующим образом:
H-G-E-G-T-F-T-S-D-L-S-K-Q-M-E-E-E-A-V-R-L-F-I-E-W-L-K-N-G-G-P-S-S-G-A-P-P-P-S-NH2
MW 4186,66 г/моль; MW (моноизотопная) = 4184,03 г/моль.
Синтез эксендина-4 осуществляли так же, как это описано в синтезе ликсисенатида, в соответствии с указанной выше последовательностью. В положениях 1 и 2 присоединение осуществляли за один цикл с Fmoc-His(Trt)-Gly-OH. В положениях 37 и 38 присоединение осуществляли за один цикл с Fmoc-Pro-Pro-OH. В других положениях присоединение осуществляли с Fmoc-аминокислотами (звеньями моноаминокислот).
Использование 26,666 г амидной смолы Ринка с загрузкой 0,42 ммоль/г (т. е. партия с 11,2 ммоль) давало 74 г пептида, связанного со смолой. Из этого количества отбирали 65 г пептида, связанного со смолой, для отщепления и получали 28 г неочищенного пептида. Для очистки из этого количества брали 21,3 г неочищенного пептида и получали 4,01 г чистого пептида. MS: 4184,03 (моноизотопная молярная масса); полученная: 4185,1[M+H]. Чистота 98,25 FI%.
Использование дипептидов подтверждало результаты, полученные для ликсисенатида. Применение дипептида Fmoc-His(Trt)-GIy-OH давало эксендин-4, который не содержал повышенных количеств D-His, возникающих в результате рацемизации. Более того, при использовании Fmoc-His(Trt)-Gly-OH дез-Gly(2)-эксендин-4 больше не выявляли. Кроме того, не были выявлены и пептиды N-1 и N+1 рядом с положением Pro(36) и Pro(37) в цепи (например, дез-Pro(36)-эксендин-4 или ди-Pro(36)эксендин-4)ликсисенатид).
Пример 3
Синтез Fmoc-His(Trt)-Gly-OH
3.1 Fmoc-His(Trt)-Gly-OBzl
40 г Fmoc-His(Trt)-OH растворяли вместе с 32,7 г тозилата H-Gly-OBzl и 29,37 г HBTU в 400 мл этилацетата. Затем добавляли 33,32 мл N-этилморфолина. Реакционную смесь перемешивали в течение 4 ч при 30°C. Затем трижды экстрагировали с использованием каждый раз 256 г 8% раствора бикарбоната натрия, а затем осуществляли однократное промывание с использованием 250 мл воды. Половину полученного в результате раствора в этилацетате выпаривали и дополнительно обрабатывали на следующей стадии.
3.2 Fmoc-His(Trt)-Gly-OH
К этилацетатной фазе добавляли THF и метанол с тем, чтобы образовывалась 5:2:2 (вес/вес/вес) смесь THF/этилацетат/MeOH. После этого добавляли 10 г палладия на углеродном катализаторе (5%) и данную смесь подвергали гидрогенизации при 30°C и под давлением водорода, равным 1,1 бар, в течение 2,5 ч. Затем катализатор отфильтровывали и полученный в результате раствор выпаривали до начала образования осадка. После этого осуществляли перемешивание в течение 1 ч и оставляли раствор отстаиваться при комнатной температуре на 4 дня. Продукт отфильтровывали и после этого экстрагировали путем перемешивания в 2-бутаноне при 80°C в течение 4 ч. Выход: 32,9 г Fmoc-His(Trt)-Gly-OH (75%).
Пример 4
Ацетилированные ошибочных последовательностей в ходе синтеза ликсисенатида
4.1 Определение содержания ацетилированных ошибочных последовательностей в ходе синтеза ликсисенатида
В HPLC-профиле неочищенного продукта ликсисенатида можно встретить некоторые ацетилированные ошибочные последовательности. Обычно они возникают из-за кэппирования не вступивших в реакцию аминогрупп на смоле. С помощью кэппирования достигается отсутствие примесей (N-1), которые лишь незначительно отличаются от целевого продукта, и, следовательно, их трудно удалить при очистке.
Степень завершенности, а также кинетику связывания в выбранных положениях контролировали с помощью реакции расщепления Эдмана. Отбирали образец смолы, полученный в результате синтеза ликсисенатида, и отщепляли от него группу Fmoc. Затем данный образец смолы подвергали расщеплению по Эдману, и, таким образом, можно было определить соотношение присоединенной аминокислоты и (N-1) аминокислоты, из чего можно непосредственно сделать вывод о конечном результате присоединения. Результаты расщепления по Эдману (таблица 2) демонстрировали высокие значения присоединения. Эти значения были настолько высоки, что они не могли пояснить таких количеств ацетилированных ошибочных последовательностей (данные HPLC в таблице 2). Это означает, что должен был существовать альтернативный способ образования данных побочных продуктов. Разъяснение по данному вопросу будет описано в следующих разделах.
Ac(5-44)
Ac(4-44)
Gly(4)
Glu(3)
99,1-99,8%
98,2-99,4%
Таблица 2: конечные данные присоединения и содержания ацетилированных фрагментов в ходе синтеза ликсисенатида. Сравнивали процентное содержание ацетилированных ошибочных последовательностей согласно данным HPLC и данным по Эдману (совместное элюирование Ас(6-44), Ас(5-44) и Ас(4-44)).
4.2 Образование ацетилированных ошибочных последовательностей
Для исследования в цикле синтеза точек, в которых образуются ацетилированные ошибочные последовательности, в ходе цикла присоединения отбирали образцы смолы и отщепляли пептид и исследовали его с помощью LC-MS. Данные исследования проводили в положениях присоединения Fmoc-Arg(20)-OH и присоединения Fmoc-Gln(13)-OH.
При присоединении Fmoc-Arg(20)-OH к пептиду, связанному с твердой фазой, с частичной последовательностью ликсисенатида H(22-24) отбирали образцы после периодов присоединения, составляющих 1 ч, 2 ч, 4 ч, 8 ч и 24 ч, а также после кэппирования, последующего отщепления Fmoc и присоединении валина(19). На фигуре 3 видно, что ошибочная последовательность Ac(22-44)+Arg впервые возникала на стадии кэппирования (3,1%). Следовательно, в ходе кэппирования небольшая часть группы Fmoc отщеплялась (утрачивалась) и сразу же ацилировалась. Для пояснения обозначения Ac(22-24)+Arg следует отметить, что положение 21 (Leu) исключили из синтеза.
Тот же эксперимент проводили для присоединения Fmoc-Gln(13)-OH в ходе синтеза ликсисенатида (фигура 4). В данном случае ошибочную последовательность Ac(13-44) впервые выявили (4,6%) при отщеплении Fmoc после связывания и кэппирования глутамина(13). В остальном цикле синтеза после присоединения Fmoc-Lys(12)-OH можно было увидеть, что в ходе кэппирования также образовывался Ac(12-44) (4,1%) (см. фигуру 5).
Эксперимент продемонстрировал, что необходим поиск условий кэппирования, при которых предотвращается нежелательное образование ацетилированной ошибочной последовательности с N-й аминокислотой (последней присоединенной) без снижения кэппирующей способности используемой смеси до такой степени, чтобы потенциальная примесь (N-1) больше не подвергалась кэппированию.
4.3 Варианты условий кэппирования
Изучали варианты присоединения Fmoc-Arg(20)-OH, Fmoc-Leu(10)-OH, Fmoc-Gly(4)-OH и Fmoc-Thr(5)-OH. Сравнивали различные условия кэппирования.
Варьировали условия кэппирования в ходе лабораторного синтеза ликсисенатида. Особое внимание уделяли содержанию нежелательного Ас(N-44) и требуемого Ас([N-1]-44). Тестируемые условия были следующими:
10% уксусный ангидрид/5% DIPEA в DMF в течение 20 минут;
10% уксусный ангидрид/5% DIPEA в DMF в течение 10 минут;
2% уксусный ангидрид/1% DIPEA в DMF в течение 20 минут;
2% уксусный ангидрид/1% DIPEA в DMF в течение 10 минут.
Исследования проводили в положениях Arg(20), Leu(10), Thr(5) и Gly(4). Результаты собраны в таблицах 3-6.
Данные также сравнивали с результатом GMP-синтеза ликсисенатида ("GMP-кэппирование" в таблицах 3-6). Условия кэппирования соответствовали условиям 10% уксусного ангидрида/5% DIPEA в DMF. Время контакта смолы с кэппирующей смесью в GMP-партии было на 7-8 минут дольше и, следовательно, составило 27-28 минут. Причиной этому было то, что на откачку кэппирующей смеси затрачивалось больше времени.
4.3.1 Присоединение в положении Arg(20)
Осуществляли присоединение Fmoc-Arg(Pbf)-OH к Leu(21). На тех же цепях, на которых не происходило присоединение (продукт H(21-44)), при последующем кэппировании образовывался продукт Ac(21-44). Оба продукта Ac(20-44) и H(20-44) образовывались, если во время кэппирования группа Fmoc нежелательным образом отщеплялась (образование H(20-44)) и происходило ацетилирование (образование Ac(2044)).
Из таблицы 3 видно, что степень образования нежелательных продуктов H(20-44) и Ac(20-44) зависела как от времени кэппирования, так и от количества уксусного ангидрида и DIPEA (см. столбец Ac(20-44)%). Наивысшее процентное значение можно увидеть при GMP-кэппировании. Наименьшее содержание Ас(20-44) обнаруживали в условиях "2% уксусный ангидрид/1% DIPEA в DMF в течение 10 минут".
Кэппирующая способность различных кэппирующих смесей (и, следовательно, исходное назначение) примерно была одинаковой (см. столбец Ас(21-44)), т. е. все кэппирующие смеси превращали H(21-44)). Смесь "2% уксусный ангидрид/1% DIPEA в DMF в течение 10 минут" также выполняла свое назначение по исключению примесей (N-1).
Таблица 3: результаты присоединения Fmoc-Arg(Pbf)-OH в положении 20. В таблице показано содержание ацетилированных и неацетилированных фрагментов в зависимости от условий кэппирования. Результаты получили с помощью LC-MS. Данные сравнивали с результатами GMP-синтеза ("GMP-кэппирование").
4.3.2 Связывание в положениях Leu(10), Gly(4) и Thr(5)
Результаты для Leu(10) приведены в таблице 4 и подтверждают результаты, полученные для положения Arg(20). Содержание нежелательных продуктов Ac(10-44) и H(10-44), которые образовывались в ходе кэппирования свободных аминогрупп продукта H(11-44), было наиболее низким в условиях "2% уксусный ангидрид, 1% DIPEA в течение 10 минут". Кэппирующую способность сравнивали у различных кэппирующих смесей.
Таблица 4: результаты связывания Fmoc-Leu-OH в положении 10. В таблице показано содержание ацетилированных и неацетилированных фрагментов в зависимости от условий кэппирования. Результаты получили с помощью LC-MS.
Также в случае связывания Gly(4) содержание нежелательных продуктов Ас(4-44) зависело от кэппирующей смеси и времени реакции. Кэппирующая способность у различных смесей была одинаковой (таблица 5).
Таблица 5: результаты присоединения Fmoc-Gly-OH в положении 4. В таблице показано содержание ацетилированных и неацетилированных фрагментов в зависимости от условий кэппирования. Результаты получили с помощью LC-MS.
Помимо положений Arg(20), Leu(10) и Gly(4) также исследовали положение Thr(5). В отличие от трех предыдущих положений содержание нежелательного продукта Ас(N-44) (Ас(5-44) в положении 5) было примерно одинаковым при различных условиях кэппирования. Тем не менее, в данном случае кэппирующая способность различных смесей также была сопоставимой (таблица 6).
Таблица 6: результаты присоединения Fmoc-Thr(tBu)-OH в положении 5. В таблице показано содержание ацетилированных и неацетилированных фрагментов в зависимости от условий кэппирования. Результаты получили с помощью LC-MS.
4.3.3 Выводы
В положениях Arg(20), Leu(10) и Gly(4) смесь для умеренного кэппирования (2% уксусный ангидрид/1% DIPEA в DMF в течение 10 минут) была достаточной эффективной для того, чтобы сохранялся требуемый эффект устранения (N-1) примесей при ацилировании. Тем не менее, в этих трех случаях соответствующее образование Ас(20-44), Ас(10-44) и Ас(4-44) зависело от времени кэппирования, а также от кэппирующей смеси. Это не применимо к положению Thr(5).
Пример 5
Синтез ликсисенатида
Пример относится к синтезу ликсисенатида (см. SEQ ID NO: 1). В начале синтеза линкер, связанный с твердой фазой, несет защитную группу Fmoc. Осуществляли присоединение отдельных аминокислотных звеньев, начиная от С-конца (положения 44) в направлении N-конца в циклах присоединения, которые состояли из стадий:
отщепления Fmoc;
присоединения Fmoc-защищенного аминокислотного звена и
кэппирования.
В положениях Arg(20), Glu(17), Gln(13), Leu(10) и Gly(4) использовали способ кэппирования по настоящему изобретению (2% уксусный ангидрид/1% DIPEA в DMF в течение 10 минут). Для этих положений указания относительно цикла присоединения описаны ниже. В других положениях кэппирование осуществляли с использованием 10% уксусного ангидрида/5% DIPEA в DMF в течение 20 минут. В качестве примера данное кэппирование описано в положении Thr(5). Способ кэппирования по настоящему изобретению предусматривает более мягкие условия.
Размер партии составил 1050 ммоль смолы Ринка.
5.1. Присоединение Fmoc-Arg(Pbf)-OH в положении 20
5.1.1 Отщепление Fmoc
В реактор вносили 7 л DMF, а затем смесь 7,9 л пиперидина в 16,6 л DMF. Данную смесь перемешивали в течение 5 минут, затем фильтровали с откачкой. Данный процесс повторяли и осуществляли перемешивание в течение 30 минут; затем снова проводили фильтрацию с откачкой. После отщепления Fmoc смолу промывали 7 раз в следующей последовательности: DMF (31,1 л), DMF (31,1 л), изопропанол (31,1 л), DMF (31,1 л), DMF (8 л), DMF (31,1 л), DMF (31,1 л). При этом реактор каждый раз заполняли соответствующим промывающим растворителем, затем осуществляли перемешивание в течение 3 минут и снова проводили фильтрацию с откачкой.
5.1.2 Присоединение Fmoc-Arg(Pbf)-OH
В реактор вносили 21 л DMF. Затем добавляли навеску 2,125 кг FmocArg(Pbf)-OH и добавляли 5,3 л DMF. После полного растворения данный раствор выливали в реактор с последующим внесением раствора 502 г гидрата гидроксибензотриазола (гидрата HOBt) в 2,2 л DMF. И в завершении, в реактор вносили 413 г N, N-диизопропилкарбодиимида (DIC). Время присоединения составило 6-18 ч. После присоединения растворитель отфильтровывали из смолы путем откачки и без остановки осуществляли кэппирование.
5.1.3 Кэппирование (по настоящему изобретению)
В реактор заливали 26,3 л DMF. Одновременно 1,2 л DMF, 0,53 л уксусного ангидрида и 0,26 л диизопропилэтиламина (DIPEA) смешивали в 2-литровом сосуде Шотта и добавляли к смоле в реакторе. Содержимое реактора перемешивали в течение 10 минут, затем проводили фильтрацию с откачкой. После кэппирования смолу промывали 5 раз в следующей последовательности: DMF (24 л), изопропанол (31,1 л), DMF (8 л), DMF (31,5 л), DMF (31,5 л). При этом реактор каждый раз заполняли соответствующим промывающим растворителем, затем осуществляли перемешивание в течение 3 минут и снова проводили фильтрацию с откачкой.
5.2. Присоединение гидрата Fmoc-Glu(OtBu)-OH в положении 17
5.2.1 Отщепление Fmoc
В реактор вносили 7 л DMF, а затем смесь 7,9 л пиперидина в 16,6 л DMF. Данную смесь перемешивали в течение 5 минут, затем фильтровали с откачкой. Данный процесс повторяли и осуществляли перемешивание в течение 30 мин; затем снова проводили фильтрацию с аспирацией. После отщепления Fmoc смолу промывали 7 раз в следующей последовательности: DMF (31,1 л), DMF (31,1 л), изопропанол (31,1 л), DMF (31,1 л), DMF (8 л), DMF (31,1 л), DMF (31,1 л). При этом реактор каждый раз заполняли соответствующим промывающим растворителем, затем осуществляли перемешивание в течение 3 минут и снова проводили фильтрацию с откачкой.
5.2.2 Присоединение гидрата Fmoc-Glu(OtBu)-OH
В реактор вносили 21 л DMF. Затем добавляли навеску 1,453 кг гидрата FmocGlu(OtBu)-OH и добавляли 5,3 л DMF. После полного растворения данный раствор выливали в реактор с последующим внесением раствора 502 г гидрата гидроксибензотриазола (гидрата HOBt) в 2,2 л DMF. И в завершении, в реактор вносили 413 г N, N-диизопропилкарбодиимида (DIC). Время присоединения составило 6-18 ч. После присоединения растворитель отфильтровывали из смолы путем откачки и без остановки осуществляли кэппирование.
5.2.3 Кэппирование (по настоящему изобретению)
В реактор заливали 26,3 л DMF. Одновременно 1,2 л DMF, 0,53 л уксусного ангидрида и 0,26 л диизопропилэтиламина (DIPEA) смешивали в 2-литровом сосуде Шотта и добавляли к смоле в реакторе. Содержимое реактора перемешивали в течение 10 минут, затем проводили фильтрацию с откачкой. После кэппирования смолу промывали 5 раз в следующей последовательности: DMF (24 л), изопропанол (31,1 л), DMF (8 л), DMF (31,5 л), DMF (31,5 л). При этом реактор каждый раз заполняли соответствующим промывающим растворителем, затем осуществляли перемешивание в течение 3 минут и снова проводили фильтрацию с откачкой.
5.3 Присоединение Fmoc-Gln(Trt)-OH в положении 13
5.3.1 Отщепление Fmoc
В реактор вносили 7 л DMF, а затем смесь 7,9 л пиперидина в 16,6 л DMF. Данную смесь перемешивали в течение 5 минут, затем фильтровали с откачкой. Данный процесс повторяли и осуществляли перемешивание в течение 35 минут; затем снова проводили фильтрацию с откачкой. После отщепления Fmoc смолу промывали 7 раз в следующей последовательности: DMF (31,1 л), DMF (31,1 л), изопропанол (31,1 л), DMF (31,1 л), DMF (8 л), DMF (31,1 л), DMF (31,1 л). При этом реактор каждый раз заполняли соответствующим промывающим растворителем, затем осуществляли перемешивание в течение 3 минут и снова проводили фильтрацию с откачкой.
5.3.2 Присоединение Fmoc-Gln(Trt)-OH
В реактор вносили 21 л DMF. Затем добавляли навеску 2,001 кг FmocGln(Trt)-OH и добавляли 5,3 л DMF. После полного растворения данный раствор выливали в реактор с последующим внесением раствора 502 г гидрата гидроксибензотриазола (гидрата HOBt) в 2,2 л DMF. И в завершении, в реактор вносили 413 г N, N-диизопропилкарбодиимида (DIC). Время присоединения составило 6-18 ч. После присоединения растворитель отфильтровывали из смолы путем откачки и без остановки осуществляли кэппирование.
5.3.3 Кэппирование (по настоящему изобретению)
В реактор заливали 26,3 л DMF. Одновременно 1,2 л DMF, 0,53 л уксусного ангидрида и 0,26 л диизопропилэтиламина (DIPEA) смешивали в 2-литровом сосуде Шотта и добавляли к смоле в реакторе. Содержимое реактора перемешивали в течение 10 минут, затем проводили фильтрацию с откачкой. После кэппирования смолу промывали 5 раз в следующей последовательности: DMF (24 л), изопропанол (31,1 л), DMF (8 л), DMF (31,5 л), DMF (31,5 л). При этом реактор каждый раз заполняли соответствующим промывающим растворителем, затем осуществляли перемешивание в течение 3 минут и снова проводили фильтрацию с откачкой.
5.4 Присоединение Fmoc-Leu-OH в положении 10
5.4.1 Отщепление Fmoc
В реактор вносили 7 л DMF, а затем смесь 7,9 л пиперидина в 16,6 л DMF. Данную смесь перемешивали в течение 5 минут, затем фильтровали с откачкой. Данный процесс повторяли и осуществляли перемешивание в течение 35 минут; затем снова проводили фильтрацию с откачкой. После отщепления Fmoc смолу промывали 7 раз в следующей последовательности: DMF (31,1 л), DMF (31,1 л), изопропанол (31,1 л), DMF (31,1 л), DMF (8 л), DMF (31,1 л), DMF (31,1 л). При этом реактор каждый раз заполняли соответствующим промывающим растворителем, затем осуществляли перемешивание в течение 3 минут и снова проводили фильтрацию с откачкой.
5.4.2 Присоединение Fmoc-Leu-OH
В реактор вносили 21 л DMF. Затем добавляли навеску 1,158 кг Fmoc-Leu-OH и добавляли 5,3 л DMF. После полного растворения данный раствор выливали в реактор с последующим внесением раствора 502 г гидрата гидроксибензотриазола (гидрата HOBt) в 2,2 л DMF. И в завершении, в реактор вносили 413 г N, N-диизопропилкарбодиимида (DIC). Время присоединения составило 6-18 ч. После присоединения растворитель отфильтровывали из смолы путем откачки и без остановки осуществляли кэппирование.
5.4.3 Кэппирование (по настоящему изобретению)
В реактор заливали 26,3 л DMF. Одновременно 1,2 л DMF, 0,53 л уксусного ангидрида и 0,26 л диизопропилэтиламина (DIPEA) смешивали в 2-литровом сосуде Шотта и добавляли к смоле в реакторе. Содержимое реактора перемешивали в течение 10 минут, затем проводили фильтрацию с откачкой. После кэппирования смолу промывали 5 раз в следующей последовательности: DMF (24 л), изопропанол (31,1 л), DMF (8 л), DMF (31,5 л), DMF (31,5 л). При этом реактор каждый раз заполняли соответствующим промывающим растворителем, затем осуществляли перемешивание в течение 3 минут и снова проводили фильтрацию с откачкой.
5.5 Связывание Fmoc-Gly-OH в положении 4
5.5.1 Отщепление Fmoc
В реактор вносили 7 л DMF, а затем смесь 7,9 л пиперидина в 16,6 л DMF. Данную смесь перемешивали в течение 5 минут, затем фильтровали с откачкой. Данный процесс повторяли и осуществляли перемешивание в течение 35 минут; затем снова проводили фильтрацию с откачкой. После отщепления Fmoc смолу промывали 7 раз в следующей последовательности: DMF (31,1 л), DMF (31,1 л), изопропанол (31,1 л), DMF (31,1 л), DMF (8 л), DMF (31,1 л), DMF (31,1 л). При этом реактор каждый раз заполняли соответствующим промывающим растворителем, затем осуществляли перемешивание в течение 3 минут и снова проводили фильтрацию с откачкой.
5.5.2 Присоединение Fmoc-Gly-OH
В реактор вносили 21 л DMF. Затем добавляли навеску 1,217 кг Fmoc-Gly-OH и добавляли 5,3 л DMF. После полного растворения данный раствор выливали в реактор с последующим внесением раствора 627 г гидрата гидроксибензотриазола (гидрата HOBt) в 2,2 л DMF. И в завершении, в реактор вносили 517 г N, N-диизопропилкарбодиимида (DIC). Время присоединения составило 6-18 ч. После присоединения растворитель отфильтровывали из смолы путем откачки и без остановки осуществляли кэппирование.
5.5.3 Кэппирование (по настоящему изобретению)
В реактор заливали 26,3 л DMF. Одновременно 1,2 л DMF, 0,53 л уксусного ангидрида и 0,26 л диизопропилэтиламина (DIPEA) смешивали в 2-литровом сосуде Шотта и добавляли к смоле в реакторе. Содержимое реактора перемешивали в течение 10 минут, затем проводили фильтрацию с откачкой. После кэппирования смолу промывали 5 раз в следующей последовательности: DMF (24 л), изопропанол (31,1 л), DMF (8 л), DMF (31,5 л), DMF (31,5 л). При этом реактор каждый раз заполняли соответствующим промывающим растворителем, затем осуществляли перемешивание в течение 3 минут и снова проводили фильтрацию с откачкой.
5.6 Присоединение Fmoc-Thr(tBu)-OH в положении 5
5.6.1 Отщепление Fmoc
В реактор вносили 7 л DMF, а затем смесь 7,9 л пиперидина в 16,6 л DMF. Данную смесь перемешивали в течение 5 минут, затем фильтровали с откачкой. Данный процесс повторяли и осуществляли перемешивание в течение 35 минут; затем снова проводили фильтрацию с откачкой. После отщепления Fmoc смолу промывали 7 раз в следующей последовательности: DMF (31,1 л), DMF (31,1 л), изопропанол (31,1 л), DMF (31,1 л), DMF (8 л), DMF (31,1 л), DMF (31,1 л). При этом реактор каждый раз заполняли соответствующим промывающим растворителем, затем осуществляли перемешивание в течение 3 минут и снова проводили фильтрацию с откачкой.
5.6.2 Присоединение Fmoc-Thr(tBu)-OH
В реактор вносили 21 л DMF. Затем добавляли навеску 1,628 кг FmocThr(tBu)-OH и добавляли 5,3 л DMF. После полного растворения данный раствор выливали в реактор с последующим внесением раствора 627 г гидрата гидроксибензотриазола (гидрата HOBt) в 2,2 л DMF. И в завершении, в реактор вносили 517 г N, N-диизопропилкарбодиимида (DIC). Время присоединения составило 6-18 ч. После присоединения растворитель отфильтровывали из смолы путем откачки и без остановки осуществляли кэппирование.
5.6.3 Кэппирование
В реактор заливали 10,5 л DMF. Одновременно 15,8 л DMF, 3,2 л уксусного ангидрида и 1,6 л диизопропилэтиламина (DIPEA) смешивали в сосуде для перемешивания и добавляли к смоле в реакторе. Содержимое реактора перемешивали в течение 20 минут, затем проводили фильтрацию с откачкой. После кэппирования смолу промывали 5 раз в следующей последовательности: DMF (24 л), изопропанол (31,1 л), DMT (8 л), DMF (31,5 л), DMF (31,5 л). При этом реактор каждый раз заполняли соответствующим промывающим растворителем, затем осуществляли перемешивание в течение 3 минут и снова проводили фильтрацию с откачкой.
5.7 Результаты
На фигуре 6 показана HPLC-хроматограмма неочищенного продукта синтеза ликсисенатида при помощи способа кэппирования по настоящему изобретению в положениях Arg(20), Glu(17), Gln(13), Leu(10) и Gly(4) и с кэппированием на других стадиях присоединения, как описано в разделе 5.6.3. Указаны пики, соответствующие примесями ацетил(20-44), ацетил(17-44), ацетил(13-44), ацетил(10-44) и ацетил(4-44)/ацетил(6-44).
5.8 Сравнение
Проводили стадии кэппирования со всеми вариантами присоединения, как это описано в разделе 5.6.3, что приводило к увеличению образования нежелательных ошибочных последовательностей Ac(20-44), Ac(17-44), Ac(13-44), Ac(10-44) и Ас(4-44)/Ас(6-44). HPLC-хроматограмма неочищенного ликсисенатида по результатам данного теста показана на фигуре 6А.
На фигуре 6B показана HPLC-хроматограмма неочищенного ликсисенатида, синтезированного посредством способа кэппирования по настоящему изобретению в положениях Arg(20), Glu(17), Gln(13), Leu(10) и Gly(4).
На фигуре 6C показано наложение HPLC-хроматограмм из фигур 6A и B. Очевидно, что синтез ликсисенатида посредством способа кэппирования по настоящему изобретению в периодическом режиме приводил к отчетливому снижению количества ошибочных последовательностей Ac(20-44), Ас(17-44), Ас(13-44), Ас(10-44) и Ас(4-44)/Ас(6-44).
При использовании смеси для более мягкого кэппирования (2% уксусного ангидрида/1% DIPEA в DMF в течение 10 минут) можно было снизить количество ацетилированных ошибочных последовательностей Ac(20-44), Ac(17-44), Ac(13-44), Ас(10-44) и Ас(4-44) в неочищенном продукте ликсисенатида или устранить их из него. Поскольку неочищенный продукт ликсисенатида, который был получен путем кэппирования по настоящему изобретению, содержал ацетилированные побочные продукты Ас(17-44), Ас(13-44) и Ас(10-44), в частности, в значительно сниженных количествах, очистка ликсисенатида упрощалась. Как результат, объединение фракций после первого цикла препаративной хроматографии с ликсисенатидом давало больше фракций, которые соответствовали техническим критериям и поэтому не подлежали отбраковке. Это приводило к увеличению выхода.
Пример 6
Кэппирование в 9 конкретных положениях при синтезе ликсисенатида
Как рассмотрено в примере 5, использование "мягких" условий кэппирования при синтезе ликсисенатида в положениях Arg(20), Glu(17), Gln(13), Leu(10) или/и Gly(4) улучшило профиль нежелательных побочных продуктов.
В данном примере описано влияние условий кэппирования на образование ацетилированных и неацетилированных побочных продуктов. Варьировали температуру (15°C, комнатная температура [20°C-23°C], 30°C), длительность кэппирования и ингредиенты кэппирующей композиции:
без кэппирования,
мягкие условия кэппирования: 10 мин кэппирования с 2% уксусным ангидридом и 1% DIPEA (диизопропилэтиламина),
"нормальные" условия кэппирования: 20 мин кэппирования с 10% уксусным ангидридом и 5% DIPEA,
40 мин кэппирования с 10% уксусным ангидридом и 5% DIPEA.
Условия кэппирования по настоящему изобретению являются "мягкими условиями". Данные условия использовали в примере 5. Обнаружили, что данные условия являются предпочтительными.
В 9 положениях, выбранных в данном примере, получали ацетилированные последовательности с кэппированием (N-1) положения (фигура 7). Кроме того, на стадии кэппирования может происходить нежелательное удаление группы Fmoc в аминокислотном структурном блоке. Незащищенную аминогруппу можно ацетилировать кэппирующим реагентом или кэппирующей композицией. В таком случае улучшенные условия кэппирования могут позволить избежать нежелательного отщепления группы Fmoc.
6.1 Кэппирование в положении 36/35 после присоединения дипептидного структурного блока Pro-Pro (36-44)
Пептид Fmoc-(36-44)-AVE0010 получали путем твердофазного синтеза. Смолу сушили разделенной на 4 порции. Каждую порцию подвергали одной из четырех описанных выше процедур кэппирования при комнатной температуре (20°C - 23°C). Образцы высушивали и отщепляли пептид от смолы. Данную процедуру повторяли, при этом кэппирование проводили при 15°C или при 30°C.
Всего получали 12 образцов пептидов. 12 образцов пептидов анализировали с помощью LCMS. Показатели молекулярной массы определяли исходя из TIC (полного ионного тока). Определяли показатели молекулярной массы у следующих соединений:
Таблица 7
В таблице 8 показано содержание продуктов, полученных после присоединения Fmoc-ProPro и последующего кэппирования (% от общего содержания пептидов).
Результаты описаны на фигуре 8. Соединения (36-44), (38-44) и Ac(38-44) не были обнаружены или были обнаружены в небольших количествах. Во всех случаях количество нежелательного продукта Ac(36-44) возрастало с увеличением концентрации кэппирующей смеси и продолжительности кэппирования. Количество данного продукта увеличивалось с повышением температуры.
6.2 Кэппирование в положении 23 после присоединения структурного блока Ile, (23-44)
Синтез Fmoc(23-44) проводили так, как описано в разделе 6.1. Эксперименты при 15°C/30°C и при комнатной температуре проводили с разными партиями.
В таблице 9 показано содержание продуктов, полученных после присоединения Fmoc-Ile и последующего кэппирования (% от общего содержания пептидов).
Результаты описаны на фигуре 9. В зависимости от реагента для кэппирования при RT и 30°C увеличивалось содержание нежелательного соединения Ac(23-44). "Нормальное" кэппирование при 20°C давало в результате 0,26% Ac(23-44). Продление кэппирования (40 мин вместо 20 мин) оказывало отрицательное влияние на содержание Ac(23-44).
Образование целевого продукта Ac(24-44) не зависело от кэппирующей композиции.
6.3 Кэппирование в положении 21 после связывания структурного блока Leu (21-44)
Синтез Fmoc(21-44) проводили так, как описано в разделе 6.1. Эксперименты при 15°C/30°C и при комнатной температуре проводили с разными партиями.
В таблице 10 показано содержание продуктов, полученных после присоединения Fmoc-Leu и последующего кэппирования (% от общего содержания пептидов).
Результаты описаны на фигуре 10. Содержание нежелательного соединения Ac(21-44) было наибольшим при "40 мин, 10% Ac2O, 5% DIPEA" при 15°C, RT и 30°C. Содержание соединения Ac(21-44) возрастало с увеличением температуры.
Образование целевого соединения Ac(22-44) не зависело от кэппирующей композиции. Данное соединение образовывалось даже без кэппирования.
6.4 Кэппирование в положении 19 после связывания структурного блока Val (19-44)
Синтез Fmoc(19-44) проводили так, как описано в разделе 6.1. Эксперименты при 15°C/30°C и при комнатной температуре проводили с разными партиями.
В таблице 11 показано содержание продуктов, полученных после присоединения Fmoc-Val и последующего кэппирования (% от общего содержания пептидов).
Результаты описаны на фигуре 11. Содержание соединения Ac(19-44) было наибольшим при "40 мин, 10% Ac2O, 5% DIPEA" при 15°C, RT и 30°C. Содержание соединения Ac(19-44) возрастало с увеличением температуры.
Образование целевого соединения Ac(20-44) возрастало с увеличением концентрации кэппирующей композиции. Содержание нежелательного продукта (20-44) снижалось с увеличением концентрации кэппирующей композиции.
6.5 Кэппирование в положении 18 после присоединения структурного блока Ala (18-44)
Синтез Fmoc(18-44) проводили так, как описано в разделе 6.1. Эксперименты при 15°C/30°C и при комнатной температуре проводили с разными партиями.
В таблице 12 показано содержание продуктов, полученных после присоединения Fmoc-Ala и последующего кэппирования (% от общего содержания пептидов).
Результаты описаны на фигуре 12. Содержание нежелательного соединения Ac(18-44) было наибольшим при "40 мин, 10% Ac2O, 5% DIPEA" при 15°C и 30°C. Содержание соединения Ac(18-44) возрастало с увеличением температуры от 15°C до 30°C.
Образование целевого соединения Ac(19-44) возрастало при 15°C и 30°C с увеличением концентрации кэппирующей композиции.
6.6 Кэппирование в положении 15 после присоединения структурного блока Glu (15-44)
Синтез Fmoc(15-44) проводили так, как описано в разделе 6.1. Эксперименты при 15°C/30°C и при комнатной температуре проводили с разными партиями.
В таблице 13 показано содержание продуктов, полученных после присоединения Fmoc-Glu и последующего кэппирования (% от общего содержания пептидов).
Результаты описаны на фигуре 13. Содержание нежелательного соединения Ac(15-44) было наибольшим при "40 мин, 10% Ac2O, 5% DIPEA" при 15°C, RT и 30°C. Содержание соединения Ac(15-44) возрастало с увеличением температуры.
Образование целевого соединения Ac(16-44) не зависело от кэппирующей композиции. Данное соединение образовывалось даже без кэппирования.
6.7 Кэппирование в положении 12 после присоединения структурного блока Lys (12-44)
Синтез Fmoc(12-44) проводили так, как описано в разделе 6.1. Эксперименты при 15°C/30°C и при комнатной температуре проводили с разными партиями.
В таблице 14 показано содержание продуктов, полученных после присоединения Fmoc-Lys и последующего кэппирования (% от общего содержания пептидов).
Результаты описаны на фигуре 14. Содержание нежелательного соединения Ac(12-44) было наибольшим при "40 мин, 10% Ac2O, 5% DIPEA" при 15°C, RT и 30°C. Содержание соединения Ac(12-44) возрастало с увеличением температуры.
Образование целевого соединения Ac(13-44) не зависело от кэппирующей композиции. Данное соединение образовывалось даже без кэппирования.
6.8 Кэппирование в положении 8 после присоединения структурного блока Ser (8-44)
Синтез Fmoc(8-44) проводили так, как описано в разделе 6.1. Эксперименты при 15°C, RT и 30°C проводили с одной и той же партией.
В таблице 15 показано содержание продуктов, полученных после присоединения Fmoc-Ser связывания и последующего кэппирования (% от общего содержания пептидов).
Результаты описаны на фигуре 15. Содержание нежелательного соединения Ac(8-44) было наибольшим при "40 мин, 10% Ac2O, 5% DIPEA" при 15°C, RT и 30°C. Содержание соединения Ac(8-44) возрастало с увеличением температуры.
6.9 Кэппирование в положении 6 после присоединения структурного блока Phe (6-44)
Синтез Fmoc(86-44) проводили так, как описано в разделе 6.1. Эксперименты при 15°C, RT и 30°C проводили с одной и той же партией.
В таблице 16 показано содержание продуктов, полученных после присоединения Fmoc-Phe и последующего кэппирования (% от общего содержания пептидов).
Результаты описаны на фигуре 16. Содержание нежелательного соединения Ac(6-44) было наибольшим при "40 мин, 10% Ac2O, 5% DIPEA" при 15°C, RT и 30°C. Содержание соединения Ac(6-44) возрастало с увеличением температуры.
Образование целевого соединения Ac(7-44) не зависело от кэппирующей композиции. Данное соединение образовывалось даже без кэппирования.
Температура оказывала лишь незначительное влияние на образование целевого соединения Ac(7-44). Содержание нежелательного продукта (7-44) снижалось с увеличением концентрации кэппирующей композиции.
6.10 Выводы
Нежелательное образование соединения Ac(X-44) в значительной степени зависело от продолжительности кэппирования, кэппирующей композиции и температуры кэппирования. При увеличении продолжительности кэппирования, повышении температуры кэппирования и повышенном содержании уксусного ангидрида и DIPEA в кэппирующей композиции возрастало содержание нежелательного соединения Ac(X-44).
6.11 Кэппирование при "нормальных" условиях в зависимости от температуры
На фигурах 17 и 18 обобщены данные, полученные при кэппировании при различных температурах в 9 положениях в ходе синтеза ликсисенатида при "нормальных" условиях "20 мин, 10% Ac2O, 5% DIPEA", как описано в данном примере.
На фигуре 17 показаны результаты сравнения GMP-кэппирования Ac(X-44) в зависимости от температуры реакции. Значения, приведенные для условий 15°C и 30°C, являются положительными и отрицательными отклонениями от значений для условия "комнатная температура" (серая область).
Образование нежелательного продукта Ac(X-44) составило ≤0,5% в 5 из 9 положений, в 3 положениях от 0,5% до 1% и лишь в одном положении >1%. Значительное увеличение наблюдали при 30°C, тогда как при 15°C образование Ac(X-44) несколько уменьшалось.
Это означает, что GMP-кэппирование "20 мин, 10% Ac2O, 5% DIPEA" можно осуществлять в различных положениях в диапазоне от 15°C до комнатной температуры, которая может составлять 20-23°C.
На фигуре 18 показаны результаты сравнения GMP-кэппирования Ac[(X-1)-44] в зависимости от температуры реакции. Значения, приведенные для условий 15°C и 30°C, являются положительными и отрицательными отклонениями от значений для условия "комнатная температура" (серая область).
Что касается требуемого образования соединений Ac[(X-1)-44] при RT, то отклонение при 15°C составило от +0,23 до -0,25%. При 30°C отклонение составило от +0,29 до -0,33%. Таким образом, образование целевого продукта кэппирования Ac[(X-1)-44] в меньшей степени зависело от температуры, чем нежелательное образование Ac(X-44).
При 15°C и 30°C наблюдали отрицательные отклонения содержания целевого соединения Ac[(X-1)-44] по сравнению с кэппированием при комнатной температуре. Это означает, что кэппирование при "нормальных" условиях следует проводить при комнатной температуре.
6.12 Кэппирование с различными кэппирующими композициями при комнатной температуре.
На фигурах 19 и 20 обобщены данные, полученные при кэппировании с разными кэппирующими композициями при комнатной температуре в 9 положениях при синтезе ликсисенатида, как описано в данном примере.
На фигуре 19 показаны результаты сравнения содержания Ac(X-44) в зависимости от кэппирующей композиции при комнатной температуре. Значения, приведенные для условий "без кэппирования", "мягкие условия" и "40 мин", являются положительными и отрицательными отклонениями от значений при "нормальном кэппировании" (серая область).
Наибольшим образование нежелательного продукта Ac(X-44) было при условиях "20 мин, 10% Ac2O, 5% DIPEA" и "40 мин, 10% Ac2O, 5% DIPEA". Образование Ac(X-44) при "нормальных" условиях (40 мин, 10% Ac2O, 5% DIPEA) составило от 0,2% до 1,12%. Значительное снижение наблюдали при мягких условиях кэппирования.
На фигуре 20 показаны результаты сравнения содержания Ac[(X-1)-44] в зависимости от кэппирующей композиции при комнатной температуре. Значения, приведенные для "без кэппирования", "мягкие условия" и "40 мин", являются положительными и отрицательными отклонениями от значений "нормальное кэппирование" (серая область).
Образование целевого продукта Ac[(X-1)-44] при условиях "без кэппирования", "мягкие условия" и "40 мин" составляло в пределах от -0,14% до +0,16% в сравнении с "нормальными" условиями.
В частности, при "мягких" условиях (10 мин, 2% Ac2O, 1% DIPEA) по настоящему изобретению можно осуществить достаточное кэппирование при синтезе ликсисенатида.
Таким образом, мягкие условия кэппирования, в частности кэппирование в течение 10 мин с 2% Ac2O и 1% DIPEA в растворителе, являются предпочтительными в твердофазном синтезе ликсисенатида, который описан в данном документе.
Если кэппирование отсутствует после присоединения в определенных аминокислотных положениях, то в ходе очистки может быть затруднительным удаление нежелательных побочных продуктов, содержащих неполную аминокислотную последовательность и присутствующих в небольшом количестве.
Пример 7
Отщепление ликсисенатида от твердой фазы
Данный пример относится к отщеплению по настоящему изобретению ликсисенатида от твердой фазы. Брали твердую фазу (смолу Ринка), с которой был связан пептид ликсисенатид. Пептид синтезировали на смоле путем постадийного присоединения аминокислотных звеньев.
В качестве сравнительного теста проводили отщепление согласно известному из уровня техники способу (King et al., Int. J. Peptide Protein Res. 1990, 36: 255-266).
Способ отщепления по настоящему изобретению отличается от способа, известного из предшествующего уровня техники, следующими изменениями:
температура реакции от 20°C до 26°C
количество компонентов в отщепляющей смеси уменьшено с 5 до 2 компонентов в сочетании с увеличением соотношения смолы и используемой смеси для расщепления.
a) 0,5 г фенола
b) 0,5 мл тиоанизола
c) 0,25 мл 1‚2-этандитиола
d) 0,5 мл воды
e) 8,25 мл TFA
("смесь Кинга")
смоле"]:
a) 0,25 мл 1‚2-этандитиола
b) 8,25 мл TFA
Профильтрованную смолу добавляли к TFA (10 мл на г смолы), перемешивали в течение 1 ч и отфильтровывали смолу.
Профильтрованную смолу добавляли к TFA (10 мл на г смолы), перемешивали в течение 1 ч и отфильтровывали смолу.
Таблица 17: результаты сравнения способа отщепления по настоящему изобретению и способа отщепления, известного из предшествующего уровня техники. Отличия выделены жирным шрифтом/подчеркнуты.
За счет использования отщепления по настоящему изобретению по сравнению с отщеплением, известным из предшествующего уровня техники, стало возможным увеличение показателей выхода неочищенного ликсисенатида на примерно 5% (с 20% до 25%) с незначительным изменением профиля примесей.
Способ из данного примера является подходящим для увеличения масштаба до полупромышленного и промышленного.
В таблице 18 обобщены результаты, полученные в сравнительном способе (см. таблицу 17). Использовали три разные партии: 2E002, 2B008 и 2B006 ликсисенатида, связанного со смолой (1-44). Средние значения и стандартное отклонение рассчитывали отдельно для каждой партии. Сравнение между разными условиями отщепления должно проводиться в тестах с использованием той же партии ликсисенатида, связанного со смолой (1-44). В различных партиях на выход мог оказывать влияние твердофазный синтез. Если не указано иное, в качестве исходного материала использовали 10 г ликсисенатида, связанного со смолой (1-44).
Таблица 18: содержание ликсисенатида в смоле и выход ликсисенатида после отщепления ликсисенатида от смолы в стандартных условиях (сравнительный способ, см. таблицу 17).
7.1 Выход после отщепления в зависимости от температуры отщепления от 20°C до 35°C
Отщепление ликсисенатида от смолы (1-44) проводили в стандартных условиях (сравнительный способ, см. таблицу 17) в течение 4 ч.
[°C]
Таблица 19: выход после отщепления в зависимости от температуры
Результаты: выход ликсисенатида после отщепления в стандартных условиях повышался с увеличением температуры до оптимальной, составляющей приблизительно 26°C. Повышение температуры от 23°C до 26°C неожиданно приводило к значительному увеличению выхода.
7.2 Выход после отщепления в зависимости от продолжительности отщепления
Отщепление ликсисенатида от смолы (1-44) проводили в стандартных условиях (сравнительный способ, см. таблицу 17) при 20°C.
[°C]
Таблица 20: выход после отщепления в зависимости от продолжительности отщепления
Результаты: выход ликсисенатида возрастал с увеличением продолжительности отщепления. Максимальный выход достигался через приблизительно 8 ч отщепления.
7.3 Выход после отщепления в зависимости от температуры при продолжительности отщепления 12 ч
Отщепление ликсисенатида от смолы (1-44) проводили в стандартных условиях (сравнительный способ, см. таблицу 17) в течение 4 ч.
[°C]
Таблица 21: выход после отщепления в зависимости от температуры при продолжительности отщепления 12 ч
Результаты: выход увеличивался при продолжительности отщепления 12 ч, если повышали температуру реакции. Максимальный выход получали при 26°C, как описано в примере 7.1 для 4-часового отщепления. Тесты 70586-044 (4 ч, 26°C, пример 7) и 70586-045 (12 ч, 26°C) давали аналогичные показатели выхода (14,8% в сравнении с 14,0%).
7.4 Выход после отщепления в зависимости от температуры отщепления не более 20°C
Отщепление ликсисенатида от смолы (1-44) проводили в стандартных условиях (сравнительный способ, см. таблицу 17) в течение 4 ч.
[°C]
Таблица 22: выход после отщепления в зависимости от температуры отщепления не более 20°C
Результаты: в случае отщепления при температуре ниже 20°C требовалась большая продолжительность, как и ожидалось, для достижения выхода, получаемого при отщеплении при 20°C в течение 4 ч (стандартные условия, сравнительный способ, таблица 17).
7.5 Модифицированная смесь для отщепления
Стандартный способ предусматривает применение смеси для отщепления, содержащей пять компонентов: фенол, тиоанизол, 1,2-этандитиол, воду и TFA. Предметом данного примера были упрощенные смеси для отщепления с исключением от одного до трех из тиоанизола, фенола и воды. Определяли выход ликсисенатида после отщепления ликсисенатида от смолы (1-44). Смесь "без модификации" описана в таблице 17, "сравнительный способ".
Таблица 23: модифицированная смесь для отщепления
Результаты: отсутствие одного или нескольких компонентов приводило к увеличенному выходу за исключением теста 71002-010 (исключение тиоанизола).
Упрощенная отщепляющая смесь (смесь для отщепления) обладала рядом преимуществ:
(a) упрощение определения аналитических показателей и контроля качества,
(b) снижение затрат,
(c) упрощение манипуляций в производственном цикле.
7.6 Содержание TFA и 1,2-этандитиола в смеси для отщепления
Начиная с теста 71002-042, исследовали влияние соотношения TFA:1,2-этандитиол на выход после отщепления:
TFA и 1,2-этандитиола на г "пептида, связанного со смолой"
Таблица 24: разное соотношение TFA и 1,2-этандитиола в смеси для отщепления
Результаты: увеличение содержания 1,2-этандитиола приводило к значительному снижению выхода ликсисенатида. Было выявлено, что соотношение TFA:1,2-этандитиол 8,25:0,25 обеспечивает наибольший выход (партия 2E002). Этот результат был подтвержден в экспериментах с использованием партии 2B008.
7.7 Объем смеси для отщепления
Изучали влияние объема (и, следовательно, концентрации) смеси для отщепления.
Таблица 25: выход после отщепления в зависимости от объема смеси для отщепления
Результаты: уменьшение до 30% включительно не оказывало влияния на выход после отщепления. Более крупные уменьшения объема приводили к сниженному выходу.
7.8 Обеспечение набухания "пептида, связанного со смолой" посредством coрастворителя (толуола или CH2Cl2) перед отщеплением
Обоснованием для данного эксперимента было обнаружение того, что отщепление ликсисенатида от смолы может приводить к повышению температуры на 5-8°C включительно, что может приводить к образованию нежелательных побочных продуктов и потенциально может отрицательно влиять на стабильность и, следовательно, выход после отщепления. Обеспечение набухания "пептида, связанного со смолой" в органическом растворителе могло уменьшить экзотермический эффект, а значит могло увеличить выход.
Таблица 26: выход после отщепления в зависимости от присутствия сорастворителя. * Общий объем TFA и толуола/CH2Cl2 сохраняли постоянным.
Результаты: обеспечение набухания при помощи органического сорастворителя не повышало выход после отщепления.
7.9 Концентрация в присутствии сорастворителя
Присутствие сорастворителя с более высокой температурой кипения, чем у TFA, и в котором ликсисенатид не растворим, может увеличивать выход после отщепления от смолы, поскольку в ходе отгонки TFA из фильтрата присутствие сорастворителя может приводить к осаждению ликсисенатида, а значит может предотвращать деградацию ликсисенатида в ходе отщепления в смеси Кинга.
Таблица 27: выход после отщепления в зависимости от присутствия сорастворителя в ходе отгонки TFA.
Результаты: присутствие толуола при отгонке фильтрата после отщепления ликсисенатида от смолы давало незначительно повышенный выход.
7.10 Оптимизированная процедура отщепления по настоящему изобретению
Исходя из описанных выше результатов, полученных в данном примере, выбрали и протестировали следующие оптимизированные условия отщепления:
(a) температура реакции 26°C,
(b) смесь для отщепления из TFA и 1,2-этандитиола. Смесь содержала приблизительно 97% TFA и приблизительно 3% 1,2-этандитиола. Использовали следующие количества: 8,25 мл/г "пептида, связанного со смолой" в случае TFA и 0,25 мл/г "пептида, связанного со смолой" в случае 1,2-этандитиола.
Выход после отщепления у данной смеси по сравнению со стандартной сравнительной смесью тестировали в партиях 2E002 и 2B008.
Таблица 28: оптимизированная процедура отщепления по настоящему изобретению
Результаты: в обеих партиях выход увеличивался на приблизительно 5%, что свидетельствовало о значительном улучшении отщепления пептида от твердой фазы при использовании способа по настоящему изобретению.
7.11 Второе (последующее) отщепление
После отщепления с применением сравнительной смеси (смеси Кинга) или смеси для отщепления по настоящему изобретению проводили второе (последующее) отщепление (см. таблицу 17).
Проводили первое отщепление, получали фильтрат. К смеси TFA-влажная смола добавляли TFA. После 1 ч перемешивания фильтровали смолу. Фильтраты объединяли и концентрировали.
Исследовали влияние второго последующего отщепления на выход ликсисенатида.
Таблица 29: влияние второго (последующего) отщепления на выход ликсисенатида. EDT: 1,2-этандитиол.
Результаты: последующее отщепление приводило к повышению выхода лишь на приблизительно 0,7%. Данное повышение связано со значительным ростом затрат на исходные материалы (TFA) и дополнительные усилия по удалению TFA из пептидного продукта. Необходимо учитывать, что при объединении фильтратов из первой и второй стадии отщепления значительно увеличивалось количество TFA.
Авторы пришли к выводу, что ввиду небольшого повышения выхода исключение второго отщепления приводит к снижению затрат, а также упрощается манипуляция в ходе производственного процесса. Уменьшаются количества TFA, поэтому упрощается удаление TFA.
7.12 Аналитические показатели
Получали две партии: 71001-016 (сравнительная партия, отщепление с использованием смеси Кинга в соответствии со стандартным способом) и 71001-013 (отщепление ликсисенатида в соответствии с настоящим изобретением).
Таблица 30: аналитические показатели
Результаты: при анализе партий наблюдали практически идентичную чистоту. Содержание в полученной партии по настоящему изобретению было несколько сниженным. В партии по настоящему изобретению выход по весу увеличивался, что давало повышенный выход.
7.13 Выводы
Способ отщепления по настоящему изобретению обладает следующими преимуществами:
(a) увеличение выхода ликсисенатида на приблизительно 5%, что дает снижение затрат и повышение производительности,
(b) в смеси для отщепления присутствуют лишь два компонента (по сравнению с пятью компонентами в сравнительной смеси Кинга), поэтому улучшен аналитический контроль качества и снижены затраты,
(c) отсутствие второй стадии отщепления дает снижение затрат и облегчает выполнение технологических операций в ходе производственного процесса. Уменьшаются количества TFA, поэтому упрощается удаление TFA.
Предметом настоящего изобретения также являются следующие аспекты:
1. Способ отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, при температуре, находящейся в диапазоне от приблизительно 23°C до приблизительно 29°C.
2. Способ по пункту 1, где твердая фаза содержит амидную смолу Ринка.
3. Способ по пункту 1 или пункту 2, где полипептид связан с амидной смолой Ринка посредством линкера.
4. Способ по любому из предыдущих пунктов, где композиция содержит трифторуксусную кислоту в количестве, составляющем от приблизительно 95 до приблизительно 99% объем/объем.
5. Способ по любому из предыдущих пунктов, где композиция содержит 1,2-этандитиол в количестве, составляющем от приблизительно 1 до приблизительно 5% объем/объем.
6. Способ по любому из предыдущих пунктов, где композиция состоит по сути из трифторуксусной кислоты в количестве приблизительно 97% объем/объем и 1,2-этандитиола в количестве приблизительно 3% объем/объем.
7. Способ по любому из предыдущих пунктов, где композицию приводят в контакт с твердой фазой, с которой связан полипептид, при температуре, составляющей от приблизительно 25°C до приблизительно 27°C, или при температуре, составляющей от приблизительно 26°C до приблизительно 29°C.
8. Способ по любому из предыдущих пунктов, где композицию приводят в контакт с твердой фазой, с которой связан полипептид, при температуре, составляющей приблизительно 26°C.
9. Способ по любому из предыдущих пунктов, где композицию приводят в контакт с твердой фазой, с которой связан полипептид, на период времени, составляющий 1-8 ч.
10. Способ по любому из пунктов 1-9, где композицию приводят в контакт с твердой фазой, с которой связан полипептид, на период времени, составляющий 4-8 ч.
11. Способ по любому из пунктов 1-9, где композицию приводят в контакт с твердой фазой, с которой связан полипептид, на период времени, составляющий 3-5 ч.
12. Способ по любому из предыдущих пунктов, где композицию приводят в контакт с твердой фазой, с которой связан полипептид, на период времени, составляющий приблизительно 4 ч.
13. Способ по любому из предыдущих пунктов, где полипептид выбран из GLP-1, его аналогов и производных, эксендина-3, его аналогов и производных и эксендина-4, его аналогов и производных.
14. Способ по пункту 13, где полипептид выбран из эксендина-4 и ликсисенатида.
15. Способ по пункту 13, где полипептид выбран из албиглутида, дулаглутида и семаглутида.
16. Способ по пункту 13 или пункту 14, где полипептид представляет собой ликсисенатид.
17. Способ твердофазного синтеза полипептида, содержащего предварительно определенную аминокислотную последовательность, при этом указанный способ предусматривает:
(a) присоединение аминокислотного структурного блока, содержащего незащищенную С-концевую карбоксильную группу и защищенную N-концевую аминогруппу, по С-концу к твердой фазе, такой как амидная смола Ринка,
(b) удаление защитной группы с N-концевой аминогруппы аминокислотного структурного блока,
(c) присоединение аминокислотного структурного блока, содержащего незащищенную С-концевую карбоксильную группу и защищенную N-концевую аминогруппу, по С-концу к незащищенной N-концевой аминогруппе из стадии (b),
(d) необязательно повторение стадий (b) и (c) и
(e) отщепление полипептида от твердой фазы посредством способа по любому из пунктов 1-16.
18. Способ по пункту 17, где полипептид выбран из GLP-1, его аналогов и производных, эксендина-3, его аналогов и производных и эксендина-4, его аналогов и производных.
19. Способ по пункту 17 или пункту 18, где полипептид выбран из эксендина-4 и ликсисенатида.
20. Способ по пункту 17 или пункту 18, где полипептид выбран из албиглутида, дулаглутида и семаглутида.
21. Способ по любому из пунктов 17-19, где полипептид представляет собой ликсисенатид.
22. Композиция, состоящая по сути из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, где композиция содержит трифторуксусную кислоту в количестве 95-99% объем/объем и 1,2-этандитиол в количестве 1-5% объем/объем.
23. Композиция по пункту 22, состоящая по сути из трифторуксусной кислоты в количестве приблизительно 97% объем/объем и 1,2-этандитиола в количестве приблизительно 3% объем/объем.
24. Применение композиции по пункту 22 или пункту 23 в твердофазном синтезе полипептида.
25. Применение по пункту 24, где композиция применяется для отщепления полипептида от твердой фазы.
26. Применение по пункту 24 или пункту 25, где полипептид выбран из GLP-1, его аналогов и производных, эксендина-3, его аналогов и производных и эксендина-4, его аналогов и производных.
27. Применение по любому из пунктов 24-26, где полипептид выбран из эксендина-4, ликсисенатида, албиглутида, дулаглутида и семаглутида.
28. Применение по любому из пунктов 24-27, где полипептид представляет собой ликсисенатид.
--->
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
<110> Sanofi-Aventis Deutschland GmbH
<120> Способ отщепления пептидов, связанных с твердой фазой, от
твердой фазы
<130> 65961PEP
<160> 4
<170> PatentIn версия 3.5
<210> 1
<211> 44
<212> БЕЛОК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> ликсисенатид
<400> 1
His Gly Glu Gly Thr Phe Thr Ser Asp Leu Ser Lys Gln Met Glu Glu
1 5 10 15
Glu Ala Val Arg Leu Phe Ile Glu Trp Leu Lys Asn Gly Gly Pro Ser
20 25 30
Ser Gly Ala Pro Pro Ser Lys Lys Lys Lys Lys Lys
35 40
<210> 2
<211> 39
<212> БЕЛОК
<213> Heloderma suspectum
<220>
<223> эксендин-4
<400> 2
His Gly Glu Gly Thr Phe Thr Ser Asp Leu Ser Lys Gln Met Glu Glu
1 5 10 15
Glu Ala Val Arg Leu Phe Ile Glu Trp Leu Lys Asn Gly Gly Pro Ser
20 25 30
Ser Gly Ala Pro Pro Pro Ser
35
<210> 3
<211> 39
<212> БЕЛОК
<213> Heloderma horridum
<220>
<223> эксендин-3
<400> 3
His Ser Asp Gly Thr Phe Thr Ser Asp Leu Ser Lys Gln Met Glu Glu
1 5 10 15
Glu Ala Val Arg Leu Phe Ile Glu Trp Leu Lys Asn Gly Gly Pro Ser
20 25 30
Ser Gly Ala Pro Pro Pro Ser
35
<210> 4
<211> 30
<212> БЕЛОК
<213> Человек
<220>
<223> GLP-1(7-36)
<400> 4
His Ala Glu Gly Thr Phe Thr Ser Asp Val Ser Ser Tyr Leu Glu Gly
1 5 10 15
Gln Ala Ala Lys Glu Phe Ile Ala Trp Leu Val Lys Gly Arg
20 25 30
<---
название | год | авторы | номер документа |
---|---|---|---|
СИНТЕЗ ЛИКСИСЕНАТИДА С КЭППИРОВАНИЕМ | 2019 |
|
RU2782772C2 |
СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ПЕПТИДОВ, СОДЕРЖАЩИХ ЛИПОФИЛЬНО МОДИФИЦИРОВАННУЮ БОКОВУЮ ЦЕПЬ ЛИЗИНА | 2017 |
|
RU2755543C2 |
СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ПЕПТИДА ЭКСЕНАТИДА | 2011 |
|
RU2458066C1 |
ДВОЙНЫЕ АГОНИСТЫ GLP1/GIP ИЛИ ТРОЙНЫЕ АГОНИСТЫ GLP1/GIP/ГЛЮКАГОНА | 2013 |
|
RU2652783C2 |
КОМПЛЕКСЫ ТИПА САХАРИДНАЯ ЦЕПОЧКА-ПОЛИПЕПТИД | 2014 |
|
RU2664539C2 |
ПРОЛЕКАРСТВА, СОДЕРЖАЩИЕ КОНЪЮГАТ ЭКСЕНДИН-ЛИНКЕР | 2011 |
|
RU2593774C2 |
ПРОЛЕКАРСТВА, СОДЕРЖАЩИЕ КОНЬЮГАТ ГИАЛУРОНОВОЙ КИСЛОТЫ, ЛИНКЕРА И ДВОЙНОГО АГОНИСТА GLP-1/ГЛЮКАГОНА | 2016 |
|
RU2719482C2 |
СИНТЕЗ ЛИРАГЛУТИДА | 2017 |
|
RU2766331C2 |
НОВЫЙ ПОЛИПЕПТИД И ФАРМАЦЕВТИЧЕСКАЯ КОМПОЗИЦИЯ ПРОТИВ ВИЧ-ИНФЕКЦИИ | 1994 |
|
RU2136696C1 |
ПЕПТИД GLP-1 С ПРИСОЕДИНЕННОЙ ОЛИГОСАХАРИДНОЙ ЦЕПЬЮ | 2008 |
|
RU2539829C2 |
Изобретение относится к способу отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по существу из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, при температуре, находящейся в диапазоне от 23 до 29°C, где композицию приводят в контакт с твердой фазой, с которой связан полипептид, на период времени, составляющий 3-5 ч, где полипептид выбран из GLP-1, его аналогов и производных, эксендина-3, его аналогов и производных и эксендина-4, его аналогов и производных. Способ позволяет увеличить выход пептида. 3 н. и 7 з.п. ф-лы, 20 ил., 30 табл., 7 пр.
1. Способ отщепления полипептида, связанного с твердой фазой, от твердой фазы, при этом способ предусматривает приведение в контакт твердой фазы, с которой связан полипептид, с композицией, состоящей по существу из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, при температуре, находящейся в диапазоне от 23 до 29°C, где композицию приводят в контакт с твердой фазой, с которой связан полипептид, на период времени, составляющий 3-5 ч,
где полипептид выбран из GLP-1, его аналогов и производных, эксендина-3, его аналогов и производных и эксендина-4, его аналогов и производных.
2. Способ по п. 1, где твердая фаза содержит амидную смолу Ринка.
3. Способ по п. 1 или 2, где полипептид связан с амидной смолой Ринка посредством линкера.
4. Способ по любому из предыдущих пунктов, где композиция содержит трифторуксусную кислоту в количестве 95-99% объем/объем и 1,2-этандитиол в количестве 1-5% объем/объем.
5. Способ по любому из предыдущих пунктов, где композиция состоит по существу из трифторуксусной кислоты в количестве 97% объем/объем и 1,2-этандитиола в количестве 3% объем/объем.
6. Способ по любому из предыдущих пунктов, где композицию приводят в контакт с твердой фазой, с которой связан полипептид, при температуре, составляющей от 25 до 27°C, предпочтительно при температуре, составляющей 26°C.
7. Способ по п. 1, где полипептид выбран из эксендина-4, ликсисенатида, албиглутида, дулаглутида и семаглутида.
8. Способ твердофазного синтеза полипептида, содержащего предварительно определенную аминокислотную последовательность, при этом указанный способ предусматривает:
(a) присоединение аминокислотного структурного блока, содержащего незащищенную С-концевую карбоксильную группу и защищенную N-концевую аминогруппу, по С-концу к твердой фазе, такой как амидная смола Ринка,
(b) удаление защитной группы с N-концевой аминогруппы аминокислотного структурного блока,
(c) присоединение аминокислотного структурного элемента, содержащего незащищенную С-концевую карбоксильную группу и защищенную N-концевую аминогруппу, по С-концу к незащищенной N-концевой аминогруппе из стадии (b),
(d) необязательно повторение стадий (b) и (c) и
(e) отщепление полипептида от твердой фазы посредством способа по любому из пп. 1-7,
где полипептид выбран из GLP-1, его аналогов и производных, эксендина-3, его аналогов и производных и эксендина-4, его аналогов и производных.
9. Способ по п. 8, где полипептид выбран из эксендина-4, ликсисенатида, албиглутида, дулаглутида и семаглутида.
10. Применение композиции, состоящей по существу из трифторуксусной кислоты и 1,2-этандитиола, где композиция содержит трифторуксусную кислоту в количестве 97-99% объем/объем и 1,2-этандитиол в количестве 1-3% объем/объем, или композиции, состоящей по существу из трифторуксусной кислоты в количестве 97% объем/объем и 1,2-этандитиола в количестве 3% объем/объем, в твердофазном синтезе полипептида, где композиция, в частности, применяется для отщепления полипептида от твердой фазы,
где полипептид выбран из GLP-1, его аналогов и производных, эксендина-3, его аналогов и производных и эксендина-4, его аналогов и производных.
Прибор для сигнализации о появлении рудничных газов | 1929 |
|
SU20497A1 |
WO 2004035623 A2, 29.04.2004 | |||
US 6528486 B1, 04.03.2003 | |||
US 20170313740 A1, 02.11.2017 | |||
Azuma, Y., Imai et al "Dipicolylamine as a unique structural switching element for helical peptides." Organic & Biomolecular Chemistry, 2012, 10(30), 6062-6068. |
Авторы
Даты
2022-05-11—Публикация
2019-04-10—Подача