Перекрестные ссылки на родственные заявки
Настоящая заявка испрашивает приоритет согласно международной заявке No. PCT/CN2019/070572, поданной 7 января 2019 г. и PCT/CN2019/084369, поданной 25 апреля 2019 г., и китайской патентной заявке No. 201811351660.9, поданной 14 ноября, 2018, содержание каждой из которых полностью включено посредством ссылки для всех целей.
Уровень техники изобретения
Область, к которой относится изобретение
Изобретение в целом относится к технической области диагностики и лечения глазных заболеваний и, в частности, относится к способам скрининга, животным моделям и способам лечения или профилактики глазных заболеваний или нарушений. В различных вариантах осуществления настоящее изобретение также относится к соединениям, композициям и способам лечения и/или профилактики возрастной дегенерации желтого пятна (AMD) у субъекта, например, пациента-человека или позвоночного животного, такого как собака, кошка, лошадь или обезьяна.
Уровень техники
Глаза представляют собой зеркало души, которые являются очень важными для всех. Люди пользуются глазами каждый день, но при этом глаза являются очень хрупким органом. Легко вызвать дискомфорт в глазах или повреждения под воздействием различных факторов. Общие глазные заболевания включают конъюнктивит и синдром сухого глаза, и более серьезные внутриглазные заболевания или нарушения включают катаракту (Cat), возрастную дегенерацию желтого пятна (AMD), глаукому (GLA), болезнь Бехчета (BD), синдром Фогта-Коянаги-Харада (VKH), увеит и так далее.
У пожилого населения возрастная дегенерация желтого пятна (AMD) является ведущей причиной необратимой потери зрения во всем мире. Она характеризуется сливающимися мягкими друзами, отложенными между пигментным эпителием сетчатки (RPE) и мембраной Бруха, и/или пигментными изменениями сетчатки в макуле на ранней стадии (промежуточная AMD). На более поздних стадиях прогрессирующая AMD характеризуется двумя основными подтипами: географическая атрофия (сухая AMD) или хориоидальная неоваскуляризация (влажная AMD) в макуле. Хотя анти-VEGF терапия использовалась для контроля влажной AMD, в настоящее время нет одобренной терапии сухой AMD.
Патогенез AMD включает как генетические факторы, так и факторы окружающей среды. В настоящее время неясны факторы окружающей среды, вызывающие локальное воспаление и приводящие к раннему появлению мягких друзов при патологии AMD. Многочисленные исследования выявили вариации в локусах генов, которые связаны с восприимчивостью к AMD, включая фактор комплемента H (CFH), возрастную предрасположенность к макулопатии 2 (ARMS2), сериновую пептидазу 1 HtrA (HTRA1), что указывает на то, что AMD возможно воспалительное заболевание.
В настоящее время неясны факторы окружающей среды, вызывающие локальное воспаление и приводящие к раннему появлению мягких друзов при патологии AMD. Существует потребность в улучшенных композициях и способах оценки, лечения или профилактики внутриглазных заболеваний или нарушений у субъекта, например, млекопитающего или человека. Настоящее изобретение направлено на эту и другие связанные потребности.
Краткое изложение сущности изобретения
В различных вариантах осуществления настоящее изобретение направлено на способы скрининга и животные модели для различных глазных заболеваний, таких как глазные болезни человека. Способы скрининга и модели на животных частично основаны на неожиданном открытии того, что внутриглазная среда нестерильна и определенная внутриглазная микробиота, такая как Bacillus megaterium, может быть патогенной причиной различных глазных заболеваний, таких как AMD.
В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение предоставляет способ скрининга для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики глазных заболеваний, таких как AMD. Метод скрининга может представлять собой метод скрининга in vitro, например, в чашке Петри, или метод скрининга in vivo, например, с использованием животной модели, описанной в настоящем документе.
В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение предоставляет способ скрининга, который включает a) культивирование микроорганизма в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; b) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и, необязательно, c) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые ингибируют рост микроорганизма по сравнению с контролем. В некоторых вариантах осуществления микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве (например, водянистая влага в передней камере, подвешивающая связка, цилиарное тело, цилиарное тело и мышца, стекловидное тело в задней камере, сетчатка, хориоидея, зрительный нерв, хрусталик или радужка) у субъекта, страдающего глазным заболеванием, по сравнению со здоровым субъектом, где глазное заболевание выбрано из возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), болезни Бехчета (BD), катаракты (Cat), эндофтальмита (EOS), глаукомы (GLA), синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), и их комбинаций. В некоторых вариантах осуществления субъект является человеком-субъектом. В некоторых вариантах осуществления способ предназначен для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики глазных заболеваний человека, таких как AMD, BD, Cat, EOS, GLA, VKH или их комбинации.
В некоторых конкретных вариантах осуществления способ скрининга предназначен для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики AMD. В некоторых вариантах осуществления микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве (например, водянистая влага, стекловидное тело, мягкие друзы) у субъекта, страдающего AMD, по сравнению со здоровым субъектом. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм включает один или несколько видов, выбранных из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, и Xanthomonas oryzae. В некоторых вариантах осуществления микроорганизм включает Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida. В некоторых вариантах осуществления микроорганизм по меньшей мере включает Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления микроорганизм включает смесь видов микробов, по существу аналогичных тем, которые наблюдаются в водянистой влаге, стекловидном теле и/или мягких друзах субъекта, страдающего AMD. В некоторых вариантах осуществления микроорганизм получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна.
Способы скрининга для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики других глазных заболеваний, таких как BD, Cat, EOS, GLA, VKH, являются аналогичными тем, которые описаны для AMD, но с другим микроорганизмом, как подробно описано в настоящем документе. Например, для BD микроорганизм, культивируемый в присутствии тестируемого соединения, обычно может включать один или несколько видов, выбранных из Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii и Meiothermus silvanus(D). Для Cat, микроорганизм, культивируемый в присутствии тестируемого соединения, обычно может включать один или несколько видов, выбранных из Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti и Acidovorax ebreus. Для GLA, микроорганизм, культивируемый в присутствии тестируемого соединения, обычно может включать один или несколько видов, выбранных из Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants и Serratia marcescens. Для VKH, микроорганизм, культивируемый в присутствии тестируемого соединения, обычно может включать один или несколько видов, выбранных из Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum и Finegoldia magna. В некоторых вариантах осуществления микроорганизм, используемый для метода скрининга, может также включать смесь видов микроорганизмов, по существу аналогичных тем, которые наблюдаются в водянистой влаге и/или стекловидном теле субъекта, страдающего BD, Cat, EOS, GLA или VKH, соответственно. В некоторых вариантах осуществления микроорганизм, используемый для метода скрининга, также может быть получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего BD, Cat, EOS, GLA или VKH, соответственно.
Способы скрининга в настоящем документе не ограничиваются какими-либо конкретными тестируемыми соединениями или какими-либо конкретными типами тестируемых соединений. Некоторые иллюстративные тестируемые соединения описаны в настоящем документе. Способы скрининга в настоящем документе могут быть способами с низкой пропускной способностью, средней пропускной способностью или высокой пропускной способностью и могут при необходимости тестировать множество тестируемых соединений параллельно. Идентификация в способах скрининга также не ограничивается каким-либо конкретным способом. Например, в некоторых вариантах осуществления, идентификация может включать идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые предотвращают видимый рост микроорганизма при максимальной тестируемой концентрации или ниже. В некоторых вариантах осуществления идентификация может включать идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые предотвращают образование видимых колоний микроорганизма при максимальной тестируемой концентрации или ниже.
Способы скрининга, описанные в настоящем документе, могут дополнительно включать определение одного или нескольких видов микробов или уже определенные один или несколько видов микробов, как присутствующих в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего глазным заболеванием, по сравнению со здоровым субъектом, где глазное заболевание выбрано из возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), болезни Бехчета (BD), катаракты (Cat), эндофтальмита (EOS), глаукомы (GLA), синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), и их комбинаций. Например, в некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ скрининга, который включает a) определение одного или нескольких видов микробов или уже определенные один или несколько видов микробов, как присутствующих в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), по сравнению со здоровым субъектом; b) культивирование микроорганизма, включающего по меньшей мере один из видов микробов в повышенном количестве, в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; c) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и, необязательно, d) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые ингибируют рост микроорганизма по сравнению с контролем.
Некоторые варианты осуществления настоящего изобретения относятся к способу получения животной модели глазного заболевания, описанного в настоящем документе. Обычно животная модель предназначена для заболевания глаз человека. Животные модели, полученные этими способами, также являются вариантами осуществления настоящего изобретения.
Как правило, способ получения животной модели включает введение микроорганизма и/или инактивированного белка из него во внутриглазное пространство глаза животного, где микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего глазным заболеванием, по сравнению со здоровым субъектом, где глазное заболевание выбрано из катаракты (Cat), возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), глаукомы (GLA), болезни Бехчета (BD), синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), эндофтальмита (EOS), и их комбинаций, и где введение вызывает один или несколько симптомов глазного заболевания.
В некоторых конкретных вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ получения животной модели для AMD. В некоторых вариантах осуществления, способ включает введение микроорганизма и/или инактивированного белка из него во внутриглазное пространство глаза животного, где микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего AMD, по сравнению со здоровым субъектом, и где введение вызывает один или несколько симптомов AMD. Способ обычно вводит живые микроорганизмы во внутриглазное пространство животного. В некоторых вариантах осуществления, интродуцируемый микроорганизм включает по меньшей мере живую Bacillus megaterium. Предпочтительно, животное представляет собой примата, не относящегося к человеку (например, обезьяна). В некоторых вариантах осуществления, животное представляет собой макаку.
Животные модели AMD, полученные в настоящем документе, также могут быть использованы для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики AMD. Например, в некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение также предоставлет способ скрининга, включающий a) введение тестируемого соединения животной модели AMD, как описано в настоящем документе; b) определение степени тяжести одного или нескольких симптомов глазного заболевания после введения; и, необязательно, c) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые облегчают, по меньшей мере, один из симптомов по сравнению с контролем.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение также предоставляет способ лечения или профилактики глазного заболевания, описанного в настоящем документе, такого как AMD. В некоторых вариантах осуществления, способ включает введение субъекту, нуждающемуся в этом, эффективного количества любого из терапевтических средств-кандидатов, идентифицированных в любом из способов скрининга в настоящем документе, направленных на соответствующее глазное заболевание, такое как AMD.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее описание относится к различным соединениям и/или композициям, включающим соединения, которые могут вызывать гибель или ингибировать рост микроорганизмов, связанных с AMD, таких как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет соединение согласно любой из формул I, II, III, IV-1, IV-2, V и любой из его подформул, как определено в настоящем документе, или его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир. В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет соединение согласно любому из соединений 1-8, или его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир. В некоторых вариантах осуществления соединения по настоящему изобретению могут быть получены из синтетических источников. В некоторых вариантах осуществления, соединения настоящего изобретения могут быть выделенным соединением или по существу чистым соединением.
Некоторые варианты осуществления относятся к фармацевтической композиции, включающей одно или несколько соединений по настоящему изобретению и, необязательно, фармацевтически приемлемый эксципиент. Например, в некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция включает соединение формулы I, II, III, IV-1, IV-2, V, любые его подформулы или любое одно или несколько соединений 1-8, или его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир, например, в количестве, эффективном для уничтожения или ингибирования роста микроорганизма, указанного в настоящем документе, такого как B. megaterium, например, в глазу (например, внутриглазное пространство), крови и/или желудочно-кишечном тракте, таком как кишечник субъекта. Фармацевтическая композиция, описанная в настоящем документе, может быть сформулирована для доставки любым из известных путей доставки, например для перорального, местного, интравитреального, внутримышечного, подкожного или внутривенного введения. В некоторых вариантах осуществления, фармацевтическая композиция, описанная в настоящем документе, может дополнительно включать антибиотик и/или анти-VEGF препарат, например, как описано в настоящем документе.
В различных вариантах осуществления, настоящее изобретение также предоставляет способ применения соединений согласно настоящему изобретению или фармацевтических композиций, описанных в настоящем документе, для лечения инфекций (например, глазных инфекций, например во внутриглазном пространстве), связанных с микроорганизмом, описанным в настоящем документе, таким как Bacillus megaterium, и для лечения или профилактики заболеваний или нарушений, связанных с такими инфекциями, такого как AMD.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение также предоставляет способ уничтожения или ингибирования роста микроорганизма, описанного в настоящем документе, такого как Bacillus megaterium, у субъекта, нуждающегося в этом. В некоторых вариантах осуществления способ включает введение субъекту терапевтически эффективного количества соединения согласно настоящему изобретению (например, соединения Формулы I, II, III, IV-1, IV-2, V, любой его подформулы или любого одного или нескольких соединений 1-8, или его фармацевтически приемлемой соли или сложного эфира, или фармацевтической композиции, представленной в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления субъект страдает AMD. В некоторых вариантах осуществления субъект не страдает AMD. В некоторых вариантах осуществления субъект подвержен риску развития AMD. В некоторых вариантах осуществления, субъект страдает глазной инфекцией, связанной с микроорганизмом, таким как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, способ дополнительно включает идентификацию, или уже идентифицированного, субъекта как инфицированного, например, во внутриглазном пространстве, микроорганизмом, таким как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, субъекту дополнительно вводят антибиотик и/или анти-VEGF препарат, например, как описано в настоящем документе.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ лечения или профилактики AMD у субъекта, нуждающегося в этом. В некоторых вариантах осуществления, способ включает введение субъекту терапевтически эффективного количества соединения согласно настоящему изобретению (например, соединения формулы I, II, III, IV-1, IV-2, V, любой его подформулы или любого одного или нескольких соединений 1-8, или его фармацевтически приемлемой соли или сложного эфира). В некоторых вариантах осуществления способ дополнительно включает введение субъекту антибиотика и/или анти-VEGF препарата, например, как описано в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления, AMD может представлять собой сухую или влажную возрастную дегенерацию желтого пятна с симптомами друзы, включая твердые друзы, мягкие друзы, смешанные друзы и/или деградированные друзы, например, сухая или влажная возрастная дегенерация желтого пятна с симптомами мягкой друзы. В некоторых вариантах осуществления, способ дополнительно включает идентификацию, или уже идентифицированного, субъекта как инфицированного, например, во внутриглазном пространстве, микроорганизмом, указанным в настоящем документе, таким как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, субъект инфицирован, например, во внутриглазном пространстве, микроорганизмом в настоящем документе, таким как Bacillus megaterium.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ использования экстрактов средств традиционной китайской медицины (TCM), которые обладают антибактериальной активностью. В некоторых вариантах осуществления, способ предназначен для уничтожения или ингибирования роста микроорганизма, описанного в настоящем документе, способ лечения инфекции (например, глазной инфекции, например, во внутриглазном пространстве), связанной с микроорганизмом, таким как Bacillus megaterium, или для лечения или профилактики AMD у субъекта, нуждающегося в этом. В некоторых вариантах осуществления, способ включает введение субъекту экстракта одного или нескольких TCM, выбранных из солодки (например, Glycyrrhiza uralensis), корня белого пиона (например, Cynanchum otophyllum), форзиции (например, Forsythia suspense), плодов померанца (например, Citrus aurantium L.), ремании клейкой (например, Rehmannia glutinosa Libosch), кожуры мандарина (например, Citrus reticulata Blanco) и женьшеня ложного (например, Panax notoginseng). В некоторых вариантах осуществления, способ дополнительно включает идентификацию, или уже идентифицированного, субъекта как инфицированного, например, во внутриглазном пространстве, микроорганизмом, описанным в настоящем документе, таким как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, субъект инфицирован, например, во внутриглазном пространстве микроорганизмом, таким как Bacillus megaterium. Экстракт может быть экстрактом одного TCM или экстрактом более чем одного TCM. Обычно экстракт представляет собой водный экстракт. В некоторых вариантах осуществления, экстракты могут существовать в жидкой, полутвердой или твердой форме или в любой другой форме. В некоторых вариантах осуществления, субъекту дополнительно вводят антибиотик и/или анти-VEGF препарат, например, как описано в настоящем документе.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение обеспечивает способ применения антибиотика, например, для уничтожения или ингибирования роста микроорганизма, описанного в настоящем описании, лечения инфекции (например, глазной инфекции, например, во внутриглазном пространстве), связанной с микроорганизмом, таким как Bacillus megaterium, или для лечения или профилактики AMD, у субъекта, нуждающегося в этом. В некоторых вариантах осуществления способ включает введение субъекту эффективного количества антибиотика, например, как описано в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления, можно использовать любые коммерчески доступные антибиотики, например, одобренные FDA США. В некоторых вариантах осуществления, способ дополнительно включает идентификацию, или уже идентифицированного, субъекта как инфицированного, например, во внутриглазном пространстве, микроорганизмом, таким как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, субъект инфицирован, например, во внутриглазном пространстве, микроорганизмом, таким как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, субъекту дополнительно вводят анти-VEGF препарат, например, как описано в настоящем документе.
Введение в настоящем описании не ограничено каким-либо конкретным способом введения. Например, в некоторых вариантах осуществления, введение может осуществляться перорально, местно, интравитреально, внутримышечно, подкожно или внутривенно.
Следует понимать, что как приведенное выше краткое изложение, так и последующее подробное описание являются только примерными и пояснительными и не ограничивают настоящее изобретение.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ЧЕРТЕЖЕЙ/ФИГУР
На фиг. 1 показана чувствительность Bacillus megaterium к нескольким антимикробным средствам.
На фиг. 2 показаны культуры в жидкой среде с отварным мясом, покрытой жидким парафиновым воском.
На фиг. 3 показано обнаружение бактерий в культурах под стандартным световым микроскопом. Культивированные E. coli визуализировали с помощью световой микроскопии. Отрицательный контроль состоит из буфера для подготовки образца без инокуляции AH или VH. Бактерии в культивируемых образцах AH или VH (примеры положительных и отрицательных образцов культуры) визуализировали с помощью световой микроскопии.
На фиг. 4 показана глазная поверхность и глазное дно макак до и после бактериальной инокуляции (P. acnes и Bacillus megaterium). Правый (OD) и левый (OS) глаза макак инокулировали P. acnes и B. megaterium, соответственно. Показаны глазная поверхность и глазное дно до бактериальной инокуляции и через 3 дня после инокуляции.
На фиг. 5 показана глазная поверхность и глазное дно макак до и после бактериальной инокуляции (P. acnes и Pseudomonas putida). Правый (OD) и левый (OS) глаза макак инокулировали P. acnes и Pseudomonas putida, соответственно. Показаны глазная поверхность и глазное дно до бактериальной инокуляции и через 3 дня после инокуляции.
На фиг. 6 показаны анатомические области и области сетчатки при субретинальной инъекции.
На фиг. 7 представлен вид глазного дна макаки на День 47 после инъекции у макаки, получившей субретинальную инокуляцию 20 КОЕ культуры AH, культуры VH и B. megaterium.
На фиг. 8 показано, что лечение антибиотиками способно изменить вызываемую бактериями друзеноидную патологию в тканях сетчатки обезьяны.
На фиг. 9 показаны виды с высокой концентрацией во внутриглазных метагеномах, у пациентов с катарактой, AMD, глаукомой, BD, VKH, идентифицированные с помощью LefSe.
На фиг. 10 показано, что каждое из соединений 1-8 эффективно контролирует рост Bacillus megaterium. Условия тестирования: 1 мг соединения, B. megaterium, 1×105/100 мкл в 15 мл среды.
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ
В различных вариантах осуществления, настоящее изобретение частично основано на неожиданном открытии того, что внутриглазная среда нестерильна и определенная внутриглазная микробиота может быть патогенной причиной различных глазных заболеваний, таких как AMD. Исходя из этого первоначального открытия, которое подробно описано в заявке PCT No. PCT/CN2018/112022, поданной 26 октября 2018 г., озаглавленной METHODS AND COMPOSITIONS FOR ASSESSING AND TREATING INTRAOCULAR DISEASES AND DISORDERS, содержание которой в полном объеме включено в качестве ссылки, также было обнаружено, что такие микроорганизмы, например, Bacillus megaterium (B. megaterium), при введении живым, могут активировать систему комплемента и вызывать друзеноидные поражения у макак in vivo. Кроме того, уничтожение или ингибирование роста таких микроорганизмов, например, путем интравитреального введения антибиотика ванкомицина, может привести к уменьшению размера друзеноидного поражения в ткани сетчатки макака по сравнению с контролем. См. также пример 9, в настоящем документе. Эти данные и результаты показывают, что средства, способные уничтожать или подавлять рост таких микроорганизмов, таких как Bacillus megaterium, являются полезными при лечении возрастной дегенерации желтого пятна.
Как подробно описано в заявке PCT No. PCT/CN2018/112022, анализ метагеномного секвенирования проводили на образцах водянистой влаги (AH) от 41 пациента с катарактой (Cat), 20 пациентов с AMD, 18 пациентов с глаукомой (GLA), 9 пациентов с болезнью Бехчета (BD), 9 пациентов с синдромом Фогта-Коянаги-Харада (VKH) и 8 пациентов с эндофтальмитом (EOS). Интересно, что альфа-разнообразие и равномерность внутриглазных микробных сообществ значительно различались у этих 6 типов пациентов, несмотря на то, что у всех пациентов бактерии были основным компонентом их внутриглазного микробиома. Анализ основных компонентов (PCA) состава внутриглазной микробиоты (с использованием всех видов микробов) показал четкие различия между пациентами с катарактой, EOS и некоторыми пациентами с глаукомой. Однако, пациенты с AMD, VKH, BD и некоторые пациенты с глаукомой имели неразличимые особенности в своем внутриглазном микробиоме. Аналогичным образом, анализ иерархической кластеризации избытка функциональных микробных генов из всех метагеномов показал, что каждое глазное проявление имеет общую характеристику микробной функции, в то время как в каждой группе заболеваний были выбросы, которые можно было классифицировать по другим кластерам заболевания. Несмотря на значительную индивидуальность, представленную внутриглазным микробиомом, авторы изобретения смогли идентифицировать характерные виды бактерий для каждой группы глазных заболеваний, которую авторы изобретения тестировали. Взятые вместе, результаты авторов изобретения показывают, что состав и функция внутриглазной микробиоты может дифференцировать глазные заболевания, такие как AMD, катаракта, глаукома, BD, VKH, и EOS.
14 видов бактерий были идентифицированы как присутствующие в высоком количестве в AH пациентов с AMD с использованием метагеномного анализа. В то время как P. acnes был преобладающим микроорганизмом в AH у пациентов с AMD, Bacillus licheniformis (B. licheniformis) и Bacillus megaterium (B. megaterium) были наиболее обогащенными видами среди 14 видов, специфичных для AMD, в образцах AH при AMD. Затем авторы настоящего изобретения провели ПЦР-анализ, чтобы выяснить, можно ли обнаружить 14 AMD-специфических бактерий в твердых или мягких тканях друзы по сравнению с тканями сетчатки без друзов из 6 архивных слайдов глаз пациентов с AMD. Результаты показали, что удалось обнаружить только 8 бактерий, среди которых P. acnes был наиболее распространенным видом, и B. megaterium был видом, присутствующим в повышенном количестве мягких друзах. Относительное количество P. acnes было сравнимо в тканях с твердыми друзами, мягкими друзами и тканях, с поражением AMD сухого типа по сравнению с тканями сетчатки без поражения, без друз. Относительное количество B. megaterium было увеличено примерно в 18 раз в мягких друзах, но не в тканях с поражениями AMD, по сравнению с тканями без друзов/без поражения. Эти данные предполагают возможную роль B. megaterium в формировании друзы и патогенезе AMD.
Предыдущие исследования показали, что друзы содержат множество компонентов комплемента и полисахаридов в дополнение ко многим другим белкам. Кроме того, компоненты друзов активируют инфламмасомы и способствуют экспрессии IL-1β и IL-18. Поэтому авторы настоящего изобретения сначала исследовали, способен ли B. megaterium, как компонент друзы, индуцировать активацию системы комплемента и способствовать секреции IL-1β и IL-18 клетками острого ретинального пигментного эпителиита-19 (ARPE19) in vitro. Авторы настоящего изобретения обнаружили, что B. megaterium, но не P. acnes, значительно увеличивают пироптоз клеток RPE в зависимости от времени. Активация системы комплемента была подтверждена продукцией активной формы белка C5A. Обе бактерии индуцировали секрецию белков CFH, секретируемых клеткой ARPE19, в то время как индукция CFH была более сильной у B. megaterium, чем у P. acnes. В результате пироптоза инфекция in vitro B. megaterium, но не P. acnes, привело к секреции активных IL-1β и IL-18 клетками RPE. Эти результаты показывают, что инфекция B. megaterium может привести к воспалению, аналогичному обнаруженному в мягких друзах.
Затем авторы настоящего изобретения проверили, может ли B. megaterium индуцировать воспаление in vivo. Примат, не относящийся к человеку, макака (Macaca fascicularis) как модельная система, учитывающая анатомию глаза и внутриглазную среду, общую для человека и макаки. Инфицирование живой бактерией P. acnes или инокуляция ее белков, инактивированных ультразвуком, в глаз не вызывала значительного внутриглазного воспаления. Однако инфицирование живой B. megaterium, но не ее белков, в глаз привело к сильному внутриглазному воспалению. Внутриглазное воспаление, индуцированное живой B. megaterium, характеризовалось повышением экспрессии TNFA и IL6, но не экспрессии IFNG и IL17A. Важно отметить, что только живые B. megaterium были способны активировать систему комплемента, включая C5A и CFH, и индуцировать пироптотические цитокины IL-1β и IL-18 in vivo. Бактерии оставались живыми в глазах после начала воспаления, что позволяет предположить, что внутриглазное воспаление может иметь длительный характер. Взятые вместе, данные авторов изобретения демонстрируют, что инфекция B. megaterium может активировать систему комплемента и вызывать пироптоз глазных клеток in vitro и in vivo.
Не желая быть связанными теориями, тот факт, что бактерии, такие как B. megaterium, расположенные в друзах и активирующие локальный комплемент-опосредованный иммунный ответ, может объяснить образование разнообразных друзов между RPE и мембраной Бруха. Основные белки, содержащиеся в друзе, включая компоненты комплемента, такие как C1Q и иммуноглобулин, являются первой линией противоинфекционных агентов. Другие белки друзов, такие как витронектин и аполипопротеин Е, недавно доказали свою эффективность в качестве противоинфекционных агентов. Следовательно, образование друзов вполне возможно является ключевым ответом стареющей сетчатки в борьбе с инфильтрированными бактериальными патогенами. Из-за разнообразия бактерий форма и размер друзы могут различаться. В случае жестких друзов, когда инфекция может быть устранена, друзы исчезнут. Однако некоторые патогены, такие как B. megaterium, будут вызывать долгосрочную активацию иммунных ответов в мягких друзах и приводить к повреждению клеток RPE и фоторецепторов. Активация воспаления макрофагов и пироптоз клеток RPE являются защитными ответами против местной инфекции, что согласуется с предыдущим открытием, что активация воспаления, опосредованная NLRP3, и продукция IL-18 защищают сетчатку от неоваскуляризации.
Не желая быть связанными теориями, инфекционная этиология AMD также согласуется с выводами всех генетических исследований. Например, дефектный CFH, негативный регулятор активации комплемента, индуцированный инфекцией B. megaterium, приведет к неконтролируемой активации комплемента. Дефектный HTRA1, протеаза, продуцирующая активную форму иммуносупрессивного цитокина TGF-β, приведет к снижению количества локальных белков семейства TGF-β. Обе эти генетические вариации могут привести к нарушению регуляции местных противоинфекционных реакций, что повреждает клетки RPE и фоторецепторы.
Кроме того, потенциальная разница в патогенной микробиоте, обнаруживаемой в друзах, может объяснять связь различных генетических факторов риска с разными этническими группами (например, европеоидные vs азиатские). Таким образом, данные показывают, что инфекционная этиология AMD является одним из механизмов, с помощью которого у пожилых людей инициируется ранняя патология AMD.
Таким образом, в различных вариантах осуществления авторы настоящего изобретения показывают, что уничтожение и/или ингибирование роста микроорганизмов может лечить и/или предотвращать AMD, такую как сухая или влажная возрастная дегенерация желтого пятна с симптомами друзов, включая твердые друзы, мягкие друзы, смешанные друзы и/или деградированные друзы, например, сухая или влажная возрастная дегенерация желтого пятна с симптомами мягких друзов.
Способы скрининга
Открытие того, что различные внутриглазные заболевания связаны с конкретными микроорганизмами, также поддерживает способы скрининга для идентификации терапевтических средств-кандидатов для внутриглазных заболеваний, таких как AMD. Соответственно, некоторые варианты осуществления настоящего изобретения направлены на различные способы скрининга. Способы скрининга в настоящем документе могут быть способом in vitro (например, в чашке Петри) или способом in vivo (например, с использованием животной модели, описанной в настоящем документе).
В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение предоставляет способ скрининга, который включает a) культивирование микроорганизма в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; b) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения, и, необязательно, c) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые ингибируют рост микроорганизма по сравнению с контролем. Обычно микроорганизм включает по меньшей мере один вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве (например, водянистая влага в передней камере, подвешивающая связка, цилиарное тело, цилиарное тело и мышца, стекловидное тело в задней камере, сетчатка, хориоидея, зрительный нерв, хрусталик или радужка) у субъекта, страдающего глазным заболеванием, по сравнению со здоровым субъектом, и глазное заболевание выбрано из возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), болезни Бехчета (BD), катаракты (Cat), эндофтальмита (EOS), глаукомы (GLA), синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), и их комбинаций. В некоторых вариантах осуществления способ дополнительно включает d) определение одного или нескольких видов микробов или уже определенные один или несколько видов микробов, как присутствующие в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего глазным заболеванием, по сравнению со здоровым субъектом, где глазное заболевание выбрано из возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), болезни Бехчета (BD), катаракты (Cat), эндофтальмита (EOS), глаукомы (GLA), синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), и их комбинаций. Здоровый субъект для целей сравнения в способе относится к субъекту, который не страдает глазным заболеванием. Термин «контроль», упоминаемый в способе, относится к плацебо-контролю, где тестируемое соединение не используется. Специалисты в данной области будут знать, как провести надлежащий контрольный эксперимент для целей сравнения. В любом из вариантов осуществления, описанных в настоящем документе, в той степени, в которой это прямо не противоречит, субъект может быть субъектом-человеком. В любом из вариантов осуществления, описанных в настоящем документе, в той степени, в которой это прямо не противоречит, способ скрининга может быть предназначен для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики заболевания человека, например, заболевания глаз человека, описанного в настоящем документе.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность лечения или профилактики глазного заболевания, включающий: получение образца, взятого из водянистой влаги или стекловидного тела субъекта, выбранного из субъекта, страдающего глазным заболеванием, члена семьи или близкого генетического родственника субъекта, страдающего глазным заболеванием, или скончавшегося субъекта, который, как известно, страдал глазным заболеванием; культивирование одного или нескольких организмов в образце в условиях, выбранных из условий, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур; добавление соединения или комбинации соединений к одной или нескольким культурам; и определение уменьшает ли соединение или комбинация соединений рост или уменьшает популяцию одной или нескольких культур. В некоторых вариантах осуществления, способ может дополнительно включать идентификацию, основанную на определении, соединения или комбинации соединений, которые уменьшают рост или уменьшают популяцию одной или нескольких культур in vitro.
В некоторых вариантах осуществления, член семьи может включать ближайшего родственника субъекта, например, родителя, ребенка или брата или сестру. В некоторых вариантах осуществления, член семьи может включать человека, занимающего ту же жилую площадь, что и субъект, страдающий глазным заболеванием, в течение длительного периода времени. В некоторых вариантах осуществления, близкое генетическое родство может включать отношение к субъекту, страдающему заболеванием, такое, что родство находится в пределах 3 линий поколений генетического родства субъекта, таких как прадедушка или прабабушка, дедушка или бабушка, родители, дети, внук или внучка, или правнук или правнучка субъекта. В некоторых вариантах осуществления, близкое генетическое родство может включать брата или сестру субъекта. В некоторых вариантах осуществления, близкое генетическое родство может включать родство к субъекту, страдающему заболеванием, такое что родство является боковой линией родства, включающее тетю или дядю, двоюродных родственников или племянницу или племянника субъекта.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность лечения или профилактики глазного заболевания, включающий: культивирование одного или нескольких организмов в условиях, выбранных из условий, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus(D), Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants, Serratia marcescens, Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna, и их комбинаций; добавление соединения или комбинации соединений к одной или нескольким культурам; и определение уменьшает ли соединение или комбинация соединений рост или уменьшает популяцию одной или нескольких культур. В некоторых вариантах осуществления, способ может дополнительно включать идентификацию, основанную на определении, соединения или комбинации соединений, которые уменьшают рост или уменьшают популяцию одной или нескольких культур in vitro.
В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение предоставляет способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность лечения или профилактики глазного заболевания, включающий: получение образца, взятого из водянистой влаги или стекловидного тела субъекта, выбранного из субъекта, страдающего глазным заболеванием, члена семьи или близкого генетического родственника субъекта, страдающего глазным заболеванием, или скончавшегося субъекта, который, как известно, страдал глазным заболеванием; культивирование одного или нескольких организмов в образце в условиях, выбранных из условий, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур; получение раствора одного или нескольких инактивированных белков, полученных из одной или нескольких культур; смешивание соединения или комбинации соединений с раствором одного или нескольких инактивированных белков; и определение связывается ли соединение или комбинация соединений с одним или несколькими инактивированными белками.
В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение предоставляет способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность в лечении глазных заболеваний, включающий: получение образца, взятого из водянистой влаги или стекловидного тела субъекта, выбранного из субъекта, страдающего глазным заболеванием, члена семьи или близкого генетического родственника субъекта, страдающего глазным заболеванием, или скончавшегося субъекта, который, как известно, страдал глазным заболеванием; культивирование одного или нескольких организмов в образце в условиях, выбранных из условий, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур; получение раствора одного или нескольких инактивированных белков, полученных из одной или нескольких культур; введение одного или нескольких инактивированных белков в модель воспаления у млекопитающего; введение соединения или комбинации соединений в модель воспаления у млекопитающего; и определение снижает ли соединение или комбинация соединений воспалительную активность в модели.
В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение предоставляет способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность лечения или профилактики глазного заболевания, включающий: культивирование одного или нескольких организмов в условиях, выбранных из условий, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus(D), Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants, Serratia marcescens, Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna, и их комбинаций; получение раствора одного или нескольких инактивированных белков, полученных из одной или нескольких культур; смешивание соединения или комбинации соединений с раствором одного или нескольких инактивированных белков; и определение связывается ли соединение или комбинация соединений с одним или несколькими инактивированными белками. В некоторых вариантах осуществления, способ может дополнительно включать идентификацию, основанную на определении, соединения или комбинации соединений, которые связывают один или несколько инактивированных белков in vitro.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность лечения или профилактики глазного заболевания, включающий: культивирование одного или нескольких организмов в условиях, выбранных из условий, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus(D), Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants, Serratia marcescens, Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna, и их комбинаций; получение раствора одного или нескольких инактивированных белков, полученных из одной или нескольких культур; введение одного или нескольких инактивированных белков в модель воспаления у млекопитающего; введение соединения или комбинации соединений в модель воспаления у млекопитающего; и определение снижает ли соединение или комбинация соединений воспалительную активность в модели. В некоторых вариантах осуществления, способ может дополнительно включать идентификацию, основанную на определении, соединения или комбинации соединений, которые уменьшают рост или уменьшают популяцию одной или нескольких культур in vitro. В некоторых вариантах осуществления, соединение или комбинация соединений могут быть одним или несколькими противовоспалительными соединениями.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность лечения или профилактики глазного заболевания, включающий: введение соединения или комбинации соединений в модель млекопитающих, описанную в настоящем документе; и определение является ли соединение или комбинация соединений эффективным для уменьшения или предотвращения одного или нескольких симптомов глазного заболевания. В некоторых вариантах осуществления введение соединения или комбинации соединений происходит после образования друзеноидных поражений в модели у млекопитающего. В некоторых вариантах осуществления, соединение или комбинация соединений представляет собой одно или несколько соединений или комбинацию соединений, идентифицированных в соответствии со способом скрининга in vitro, описанным в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления инъекция может включать внутриглазную инъекцию. В некоторых вариантах осуществления, один или несколько симптомов выбраны из группы, состоящей из образования друзеноидных поражений, роста микробов или микробиологической нагрузки, продукции молекулы воспаления или маркера, и их комбинаций.
Микроорганизм, используемый в способах, может быть по существу биологически чистым видом или множеством различных биологических видов. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм включает по меньшей мере один вид, который является патогенной причиной глазного заболевания. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм включает по меньшей мере один вид, где уничтожение или ингибирование роста по меньшей мере одного вида является полезным для лечения или профилактики глазного заболевания. Для культивирования микроорганизмов и выбора культурной среды можно использовать любую методику, известную в данной области, некоторые примерные подробности показаны в разделе Примеры. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм можно культивировать в жидкой среде с отварным мясом. Способы измерения или определения роста микроорганизма также не ограничиваются особым образом и в целом известны в данной области техники, некоторые примерные способы описаны в настоящем документе в разделе «Примеры». Во избежание неоднозначного толкования, измерение или определение роста микроорганизма в настоящем документе не требует количественного измерения. В некоторых вариантах осуществления, визуального наблюдения может быть достаточно, например, когда тестируемое соединение предотвращает видимый рост микроорганизма при максимальной тестируемой концентрации или ниже и/или тестируемое соединение предотвращает образование видимых колоний микроорганизма при максимальной тестируемой концентрации или ниже.
Терапевтические средства-кандидаты могут быть идентифицированы любыми подходящими методами, известными в данной области. В некоторых вариантах осуществления, когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизма по сравнению с контролем при его максимальной протестированной концентрации или ниже, его можно идентифицировать как терапевтическое средство-кандидат, например, для лечения или профилактики соответствующих глазных заболеваний. В некоторых вариантах осуществления, когда тестируемое соединение предотвращает видимый рост микроорганизма при максимальной тестируемой концентрации или ниже, его можно идентифицировать как терапевтическое средство-кандидат. В некоторых вариантах осуществления, когда тестируемое соединение предотвращает образование видимых колоний микроорганизма при максимальной тестируемой концентрации или ниже, его можно идентифицировать как терапевтическое средство-кандидат.
Тестируемые соединения можно тестировать в одной концентрации или тестировать в различных концентрациях. В некоторых вариантах осуществления, минимальная ингибирующая концентрация (MIC) также может быть установлена для соответствующего тестируемого соединения, что позволяет проводить сравнения между различными тестируемыми соединениями и помогает в дальнейшей идентификации/выборе терапевтических средств-кандидатов.
Способ скрининга AMD
В некоторых конкретных вариантах осуществления способ скрининга может быть использован для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики AMD. В любом из вариантов осуществления, описанных в настоящем документе, если явно не противоречит контексту, AMD может представлять собой сухую или влажную возрастную дегенерацию желтого пятна с симптомами друзы, включая твердые друзы, мягкие друзы, смешанные друзы и/или деградированные друзы, например, сухая или влажная возрастная дегенерация желтого пятна с симптомами мягкой друзы. В некоторых вариантах осуществления способ включает a) культивирование микроорганизма в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и b) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения. Обычно, микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве (например, водянистая влага в передней камере, подвешивающая связка, цилиарное тело, цилиарное тело и мышца, стекловидное тело в задней камере, сетчатка, хориоидея, зрительный нерв, хрусталик или радужка) у субъекта, страдающего AMD, по сравнению со здоровым субъектом. Например, в некоторых вариантах осуществления, микроорганизм включает вид, который присутствует в повышеном количестве в водянистой влаге, стекловидным теле и/или мягких друзах у субъекта, страдающего AMD, по сравнению со здоровым контролем. В некоторых вариантах осуществления микроорганизм может включать один или несколько видов, выбранных из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis и Xanthomonas oryzae. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может включать Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida. В некоторых вариантах осуществления микроорганизм по меньшей мере включает Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм также может быть по существу биологически чистой популяцией Bacillus megaterium.
Различные начальные концентрации микроорганизма могут быть использованы для описанных в настоящем документе способов скрининга. Например, в некоторых вариантах осуществления, для способов скрининга, описанных в настоящем документе, от примерно 10 мкл (микролитров) до примерно 500 мкл (например, примерно 100 мкл) суспензии Bacillus megaterium в концентрации от примерно 1*105 до 1*109 (например, примерно 1*106, примерно 1*108 или примерно 1*108) на мл можно поместить в чашку для культивирования с примерно 10-15 мл культуральной среды, которую можно инкубировать при подходящей температуре и условиях, например, при 37°С в течение 24 часов. Например, в некоторых вариантах осуществления, для способов скрининга, описанных в настоящем документе, можно использовать от примерно 1*105 до 1*109 (например, примерно 1*105 или 1*107) Bacillus megaterium на культуру.
В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может включать смесь видов микробов, по существу аналогичных тем, которые наблюдаются в водянистой влаге, стекловидном теле и/или мягких друзах субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна. Например, в некоторых вариантах осуществления, патогенные виды, которые идентифицированы в водянистой влаге, стекловидном теле и/или мягких друзах субъекта, страдающего AMD, могут быть включены в микроорганизм для способов скрининга. Термин «по существу аналогичный» не требует, чтобы микроорганизм имел такой же состав микробных видов, что и микроорганизмы, обнаруженные в водянистой влаге, стекловидном теле и/или мягких друзах субъекта, страдающего AMD. Достаточно, чтобы микроорганизм включал большинство идентифицированных присутствующих в повышенном количестве (предпочтительно патогенных) видов микробов в водянистой влаге, стекловидном теле и/или мягких друзах субъекта, страдающего AMD, например, как описано в настоящем документе. Термин «по существу аналогичный», используемый в отношении других глазных заболеваний, следует понимать аналогичным образом. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может происходить, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна. Например, в некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен путем культивирования образца, полученного из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна. В некоторых вариантах осуществления, когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизма (например, Bacillus megaterium) по сравнению с контролем, его можно идентифицировать как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики AMD.
В некоторых вариантах осуществления способы скрининга для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики AMD может также включать a) определение одного или нескольких видов микробов или уже определенные один или несколько видов микробов, как присутствующих в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), по сравнению со здоровым субъектом; b) культивирование микроорганизма, включающего по меньшей мере один из видов микробов в повышенном количестве, в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; c) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и, необязательно, d) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые ингибируют рост микроорганизма по сравнению с контролем.
В некоторых вариантах осуществления определение может представлять собой получение информации о том, что один или несколько видов микробов присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве субъекта, страдающего AMD, по сравнению со здоровым субъектом. В некоторых вариантах осуществления, определение может представлять собой оценку присутствия, отсутствия и/или количества микроорганизма в образце из внутриглазного пространства субъекта, страдающего AMD, и необязательно, сравнение присутствия, отсутствия и/или количества микроорганизма с таковым у здорового субъекта контрольной группы. Способы оценки присутствия, отсутствия и/или количества микроорганизма включают способы, описанные в заявке PCT No. PCT/CN2018/112022. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может включать смесь видов микробов, по существу сходных с теми, которые наблюдаются в водянистой влаге, стекловидном теле и/или мягких друзах субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна. Например, в некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен путем культивирования образца, полученного из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна. В некоторых вариантах осуществления, когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизма по сравнению с контролем, его можно идентифицировать как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики AMD.
В некоторых вариантах осуществления способы скрининга для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики AMD могут также включать a) получение образца из внутриглазного пространства субъекта, страдающего AMD, такого как водянистая влага, стекловидное тело и/или мягкие друзы; b) инкубирование образца в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; c) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и, необязательно, d) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые ингибируют рост микроорганизма по сравнению с контролем. В некоторых вариантах осуществления, образец получен из водянистой влаги субъекта, страдающего AMD. В некоторых вариантах осуществления, образец получен из стекловидного тела субъекта, страдающего AMD. В некоторых вариантах осуществления, образец получен из мягких друзов субъекта, страдающего AMD. Как показано в разделе “Примеры” в настоящем описании, инкубирование образца обычно можно проводить в стерильной культуральной среде в стерильной среде, такой как герметичная среда, чтобы не внести виды микробов, изначально не присутствующие в образце от субъекта. В некоторых вариантах осуществления, может быть использован отрицательный контроль. В некоторых вариантах осуществления, когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизмов в культуральной среде по сравнению с контролем, его можно идентифицировать как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики AMD.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность лечения или профилактики AMD, включающий: получение образца, взятого из водянистой влаги или стекловидного тела субъекта, выбранного из субъекта, страдающего AMD, члена семьи или близкого генетического родственника субъекта, страдающего AMD, или умершего субъекта, который, как известно, страдал AMD; культивирование одного или нескольких организмов в образце в условиях, выбранных из условий, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур; добавление соединения или комбинации соединений к одной или нескольким культурам; и определение уменьшает ли соединение или комбинация соединений рост или уменьшает популяцию одной или нескольких культур. В некоторых вариантах осуществления, способ может дополнительно включать идентификацию, основанную на определении, соединения или комбинации соединений, которые уменьшают рост или уменьшают популяцию одной или нескольких культур in vitro.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность в лечении глазных заболеваний, включающий: культивирование одного или нескольких организмов в условиях, выбранных из условий, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus(D), Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants, Serratia marcescens, Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna, и их комбинаций; добавление соединения или комбинации соединений к одной или нескольким культурам; и определение уменьшает ли соединение или комбинация соединений рост или уменьшает популяцию одной или нескольких культур. В некоторых вариантах осуществления, способ может дополнительно включать идентификацию, основанную на определении, соединения или комбинации соединений, которые уменьшают рост или уменьшают популяцию одной или нескольких культур in vitro.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность лечения или профилактики AMD, включающий: получение образца, взятого из водянистой влаги или стекловидного тела субъекта, выбранного из субъекта, страдающего AMD, члена семьи или близкого генетического родственника субъекта, страдающего AMD, или умершего субъекта, который, как известно, страдал AMD; культивирование одного или нескольких организмов в образце в условиях, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур; получение раствора одного или нескольких инактивированных белков, полученных из одной или нескольких культур; смешивание соединения или комбинации соединений с раствором одного или нескольких инактивированных белков; и определение связывается ли соединение или комбинация соединений с одним или несколькими инактивированными белками.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность лечения или профилактики AMD, включающий: получение образца, взятого из водянистой влаги или стекловидного тела субъекта, выбранного из субъекта, страдающего AMD, члена семьи или близкого генетического родственника субъекта, страдающего AMD, или умершего субъекта, который, как известно, страдал AMD; культивирование одного или нескольких организмов в образце в условиях, выбранных из условий, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур; получение раствора одного или нескольких инактивированных белков, полученных из одной или нескольких культур; введение одного или нескольких инактивированных белков в модель воспаления у млекопитающего; введение соединения или комбинации соединений в модель воспаления у млекопитающего; и определение снижает ли соединение или комбинация соединений воспалительную активность в модели.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность лечения или профилактики глазного заболевания, включающий: культивирование одного или нескольких организмов в условиях, выбранных из условий, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus(D), Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants, Serratia marcescens, Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna, и их комбинаций; получение раствора одного или нескольких инактивированных белков, полученных из одной или нескольких культур; смешивание соединения или комбинации соединений с раствором одного или нескольких инактивированных белков; и определение связывается ли соединение или комбинация соединений с одним или несколькими инактивированными белками. В некоторых вариантах осуществления способ может дополнительно включать идентификацию, основанную на определении, соединения или комбинации соединений, которые связывают один или несколько инактивированных белков in vitro.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность в лечении глазных заболеваний, включающий: культивирование одного или нескольких организмов в условиях, выбранных из условий, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus(D), Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants, Serratia marcescens, Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna, и их комбинаций; получение раствора одного или нескольких инактивированных белков, полученных из одной или нескольких культур; введение одного или нескольких инактивированных белков в модель воспаления у млекопитающего; введение соединения или комбинации соединений в модель воспаления у млекопитающего; и определение снижает ли соединение или комбинация соединений воспалительную активность в модели. В некоторых вариантах осуществления, способ может дополнительно включать идентификацию, основанную на определении, соединения или комбинации соединений, которые уменьшают рост или уменьшают популяцию одной или нескольких культур in vitro. В некоторых вариантах осуществления, соединение или комбинация соединений могут быть одним или несколькими противовоспалительными соединениями.
В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение предоставляет способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность в лечении глазных заболеваний, включающий: введение соединения или комбинации соединений в модель млекопитающих, описанную в настоящем документе; и определение является ли соединение или комбинация соединений эффективным для уменьшения или предотвращения одного или нескольких симптомов AMD. В некоторых вариантах осуществления введение соединения или комбинации соединений происходит после образования друзеноидных поражений в модели у млекопитающего. В некоторых вариантах осуществления, соединение или комбинация соединений представляет собой одно или несколько соединений или комбинацию соединений, идентифицированных в соответствии со способом скрининга in vitro, описанным в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления введение может включать внутриглазную инъекцию. В некоторых вариантах осуществления, один или несколько симптомов выбраны из группы, состоящей из образования друзеноидных поражений, роста микробов или микробиологической нагрузки, продукции молекулы воспаления или маркера, и их комбинаций.
Способ скрининга для других заболеваний
В некоторых вариантах осуществления способ скрининга может быть использован для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики BD. В некоторых вариантах осуществления, способ включает a) культивирование микроорганизма в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и b) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения, где микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве (например, водянистая влага в передней камере, подвешивающая связка, цилиарное тело, цилиарное тело и мышца, стекловидное тело в задней камере, сетчатка, хориоидея, зрительный нерв, хрусталик или радужка) у субъекта, страдающего BD, по сравнению со здоровым субъектом. Например, в некоторых вариантах осуществления, микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве в водянистой влаге и/или стекловидном теле у субъекта, страдающего BD, по сравнению со здоровым субъектом контрольной группы. В некоторых вариантах осуществления микроорганизм может включать один или несколько видов, выбранных из Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii и Meiothermus silvanus(D). В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может включать смесь видов микробов, по существу сходных с теми, которые наблюдаются в водянистой влаге и/или стекловидном теле субъекта, страдающего BD. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего BD. Например, в некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен путем культивирования образца, полученного из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего BD. В некоторых вариантах осуществления, когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизма по сравнению с контролем, его можно идентифицировать как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики BD.
В некоторых вариантах осуществления способы скрининга для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики BD может также включать a) определение одного или нескольких видов микробов или уже определенные один или несколько видов микробов, как присутствующих в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего BD, по сравнению со здоровым субъектом; b) культивирование микроорганизма, включающего по меньшей мере один из видов микробов в повышенном количестве, в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; c) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и, необязательно, d) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые ингибируют рост микроорганизма по сравнению с контролем. В некоторых вариантах осуществления, определение может представлять собой получение информации о том, что один или несколько видов микробов присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве субъекта, страдающего BD, по сравнению со здоровым субъектом. В некоторых вариантах осуществления, определение может представлять собой оценку присутствия, отсутствия и/или количества микроорганизма в образце из внутриглазного пространства субъекта, страдающего, BD, и необязательно, сравнение присутствия, отсутствия и/или количества микроорганизма с таковым у здорового субъекта контрольной группы. Способы оценки присутствия, отсутствия и/или количества микроорганизма включают способы, описанные в заявке PCT No. PCT/CN2018/112022. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может включать смесь видов микробов, по существу сходных с теми, которые наблюдаются в водянистой влаге и/или стекловидном теле субъекта, страдающего BD. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего BD. Например, в некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен путем культивирования образца, полученного из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего BD. В некоторых вариантах осуществления, когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизма по сравнению с контролем, его можно идентифицировать как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики BD.
В некоторых вариантах осуществления способы скрининга для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики BD могут также включать a) получение образца из внутриглазного пространства субъекта, страдающего BD, такого как водянистая влага и/или стекловидное тело; b) инкубирование образца в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; c) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и, необязательно, d) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые ингибируют рост микроорганизма по сравнению с контролем. В некоторых вариантах осуществления, образец получен из водянистой влаги субъекта, страдающего BD. В некоторых вариантах осуществления, образец получен из стекловидного тела субъекта, страдающего BD. Как показано в разделе “Примеры” в настоящем описании, инкубирование образца обычно можно проводить в стерильной культуральной среде в стерильной среде, такой как герметичная среда, чтобы не внести виды микробов, изначально не присутствующие в образце от субъекта. В некоторых вариантах осуществления, может быть использован отрицательный контроль. В некоторых вариантах осуществления, когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизмов в культуральной среде по сравнению с контролем, его можно идентифицировать как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики BD.
В некоторых вариантах осуществления способ скрининга может быть использован для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики катаракты. В некоторых вариантах осуществления способ включает a) культивирование микроорганизма в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и b) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения, где микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве (например, водянистая влага в передней камере, подвешивающая связка, цилиарное тело, цилиарное тело и мышца, стекловидное тело в задней камере, сетчатка, хориоидея, зрительный нерв, хрусталик или радужка) у субъекта, страдающего катарактой, по сравнению со здоровым субъектом. Например, в некоторых вариантах осуществления, микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве в водянистой влаге и/или стекловидном теле у субъекта, страдающего катарактой, по сравнению со здоровым субъектом контрольной группы. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может включать один или несколько видов, выбранных из Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti и Acidovorax ebreus. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может включать смесь видов микробов, по существу сходных с теми, которые наблюдаются в водянистой влаге и/или стекловидном теле субъекта, страдающего катарактой. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего катарактой. Например, в некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен путем культивирования образца, полученного из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего катарактой. В некоторых вариантах осуществления, когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизма по сравнению с контролем, его можно идентифицировать как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики катаракты.
В некоторых вариантах осуществления способы скрининга для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики катаракты может также включать a) определение одного или нескольких видов микробов или уже определенные один или несколько видов микробов, как присутствующих в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего cataract, по сравнению со здоровым субъектом; b) культивирование микроорганизма, включающего по меньшей мере один из видов микробов в повышенном количестве, в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; c) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и, необязательно, d) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые ингибируют рост микроорганизма по сравнению с контролем. В некоторых вариантах осуществления, определение может представлять собой получение информации о том, что один или несколько видов микробов присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве субъекта, страдающего катарактой, по сравнению со здоровым субъектом. В некоторых вариантах осуществления, определение может представлять собой оценку присутствия, отсутствия и/или количества микроорганизма в образце из внутриглазного пространства субъекта, страдающего катарактой, и необязательно, сравнение присутствия, отсутствия и/или количества микроорганизма с таковым у здорового субъекта контрольной группы. Способы оценки присутствия, отсутствия и/или количества микроорганизма включают способы, описанные в заявке PCT No. PCT/CN2018/112022. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может включать смесь видов микробов, по существу сходных с теми, которые наблюдаются в водянистой влаге и/или стекловидном теле субъекта, страдающего катарактой. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего катарактой. Например, в некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен путем культивирования образца, полученного из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего катарактой. В некоторых вариантах осуществления, когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизма по сравнению с контролем, его можно идентифицировать как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики катаракты.
В некоторых вариантах осуществления способы скрининга для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики катаракты могут также включать a) получение образца из внутриглазного пространства субъекта, страдающего катарактой, такого как водянистая влага и/или стекловидное тело; b) инкубирование образца в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; c) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и, необязательно, d) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые ингибируют рост микроорганизма по сравнению с контролем. В некоторых вариантах осуществления, образец получен из водянистой влаги субъекта, страдающего катарактой. В некоторых вариантах осуществления, образец получен из стекловидного тела субъекта, страдающего катарактой. Как показано в разделе “Примеры” в настоящем описании, инкубирование образца обычно можно проводить в стерильной культуральной среде в стерильной среде, такой как герметичная среда, чтобы не внести виды микробов, изначально не присутствующие в образце от субъекта. В некоторых вариантах осуществления, может быть использован отрицательный контроль. В некоторых вариантах осуществления, когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизмов в культуральной среде по сравнению с контролем, его можно идентифицировать как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики катаракты.
В некоторых вариантах осуществления, способ скрининга может быть использован для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики GLA. В некоторых вариантах осуществления способ включает a) культивирование микроорганизма в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и b) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения, где микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве (например, водянистая влага в передней камере, подвешивающая связка, цилиарное тело, цилиарное тело и мышца, стекловидное тело в задней камере, сетчатка, хориоидея, зрительный нерв, хрусталик или радужка) у субъекта, страдающего GLA, по сравнению со здоровым субъектом. Например, в некоторых вариантах осуществления, микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве в водянистой влаге и/или стекловидном теле у субъекта, страдающего GLA, по сравнению со здоровым субъектом контрольной группы. В некоторых вариантах осуществления микроорганизм может включать один или несколько видов, выбранных из Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants и Serratia marcescens. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может включать смесь видов микробов, по существу сходных с теми, которые наблюдаются в водянистой влаге и/или стекловидном теле субъекта, страдающего GLA. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего GLA. Например, в некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен путем культивирования образца, полученного из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего GLA. В некоторых вариантах осуществления, когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизма по сравнению с контролем, его можно идентифицировать как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики GLA.
В некоторых вариантах осуществления способы скрининга для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики GLA могут также включать a) определение одного или нескольких видов микробов или уже определенные один или несколько видов микробов, как присутствующих в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего GLA, по сравнению со здоровым субъектом; b) культивирование микроорганизма, включающего по меньшей мере один из видов микробов в повышенном количестве, в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; c) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и, необязательно, d) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые ингибируют рост микроорганизма по сравнению с контролем. В некоторых вариантах осуществления, определение может представлять собой получение информации о том, что один или несколько видов микробов присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве субъекта, страдающего GLA, по сравнению со здоровым субъектом. В некоторых вариантах осуществления, определение может представлять собой оценку присутствия, отсутствия и/или количества микроорганизма в образце из внутриглазного пространства субъекта, страдающего GLA, и необязательно, сравнение присутствия, отсутствия и/или количества микроорганизма с таковым у здорового субъекта контрольной группы. Способы оценки присутствия, отсутствия и/или количества микроорганизма включают способы, описанные в заявке PCT No. PCT/CN2018/112022. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может включать смесь видов микробов, по существу сходных с теми, которые наблюдаются в водянистой влаге и/или стекловидном теле субъекта, страдающего GLA. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего GLA. Например, в некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен путем культивирования образца, полученного из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего GLA. В некоторых вариантах осуществления, когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизма по сравнению с контролем, его можно идентифицировать как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики GLA.
В некоторых вариантах осуществления способы скрининга для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики GLA могут также включать a) получение образца из внутриглазного пространства субъекта, страдающего GLA, такого как водянистая влага и/или стекловидное тело; b) инкубирование образца в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; c) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и, необязательно, d) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые ингибируют рост микроорганизма по сравнению с контролем. В некоторых вариантах осуществления, образец получен из водянистой влаги субъекта, страдающего GLA. В некоторых вариантах осуществления, образец получен из стекловидного тела субъекта, страдающего GLA. Как показано в разделе “Примеры” в настоящем описании, инкубирование образца обычно можно проводить в стерильной культуральной среде в стерильной среде, такой как герметичная среда, чтобы не внести виды микробов, изначально не присутствующие в образце от субъекта. В некоторых вариантах осуществления, может быть использован отрицательный контроль. В некоторых вариантах осуществления, когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизмов в культуральной среде по сравнению с контролем, его можно идентифицировать как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики GLA.
В некоторых вариантах осуществления способ скрининга может быть использован для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики VKH. В некоторых вариантах осуществления способ включает a) культивирование микроорганизма в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и b) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения, где микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве (например, водянистая влага в передней камере, подвешивающая связка, цилиарное тело, цилиарное тело и мышца, стекловидное тело в задней камере, сетчатка, хориоидея, зрительный нерв, хрусталик или радужка) у субъекта, страдающего VKH, по сравнению со здоровым субъектом. Например, в некоторых вариантах осуществления, микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве в водянистой влаге и/или стекловидном теле у субъекта, страдающего VKH, по сравнению со здоровым субъектом контрольной группы. В некоторых вариантах осуществления микроорганизм может включать один или несколько видов, выбранных из Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, и Finegoldia magna. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может включать смесь видов микробов, по существу сходных с теми, которые наблюдаются в водянистой влаге и/или стекловидном теле субъекта, страдающего VKH. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего VKH. Например, в некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен путем культивирования образца, полученного из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего VKH. В некоторых вариантах осуществления, когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизма по сравнению с контролем, его можно идентифицировать как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики VKH.
В некоторых вариантах осуществления способы скрининга для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики VKH могут также включать a) определение одного или нескольких видов микробов или уже определенные один или несколько видов микробов, как присутствующих в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего VKH, по сравнению со здоровым субъектом; b) культивирование микроорганизма, включающего по меньшей мере один из видов микробов в повышенном количестве, в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; c) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и, необязательно, d) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые ингибируют рост микроорганизма по сравнению с контролем. В некоторых вариантах осуществления, определение может представлять собой получение информации о том, что один или несколько видов микробов присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве субъекта, страдающего VKH, по сравнению со здоровым субъектом. В некоторых вариантах осуществления, определение может представлять собой оценку присутствия, отсутствия и/или количества микроорганизма в образце из внутриглазного пространства субъекта, страдающего VKH, и необязательно, сравнение присутствия, отсутствия и/или количества микроорганизма с таковым у здорового субъекта контрольной группы. Способы оценки присутствия, отсутствия и/или количества микроорганизма включают способы, описанные в заявке PCT No. PCT/CN2018/112022. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может включать смесь видов микробов, по существу сходных с теми, которые наблюдаются в водянистой влаге и/или стекловидном теле субъекта, страдающего VKH. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего VKH. Например, в некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен путем культивирования образца, полученного из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего VKH. В некоторых вариантах осуществления, когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизма по сравнению с контролем, его можно идентифицировать как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики VKH.
В некоторых вариантах осуществления способы скрининга для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики VKH могут также включать a) получение образца из внутриглазного пространства субъекта, страдающего VKH, такого как водянистая влага и/или стекловидное тело; b) инкубирование образца в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; c) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и, необязательно, d) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые ингибируют рост микроорганизма по сравнению с контролем. В некоторых вариантах осуществления, образец получен из водянистой влаги субъекта, страдающего VKH. В некоторых вариантах осуществления, образец получен из стекловидного тела субъекта, страдающего VKH. Как показано в разделе “Примеры” в настоящем описании, инкубирование образца обычно можно проводить в стерильной культуральной среде в стерильной среде, такой как герметичная среда, чтобы не внести виды микробов, изначально не присутствующие в образце от субъекта. В некоторых вариантах осуществления, может быть использован отрицательный контроль. В некоторых вариантах осуществления, когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизмов в культуральной среде по сравнению с контролем, его можно идентифицировать как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики VKH.
Тестируемые соединения
Тестируемое соединение для способов скрининга, описанных в настоящем документе, (например, для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики AMD) особо не ограничивается. Например, тестируемое соединение может представлять собой малую молекулу, биопрепараты, включая полипептиды и полинуклеотиды, или конъюгаты малой молекулы с биопрепаратом, такие как конъюгаты антитела и лекарственного средства. Другие подходящие категории тестируемых соединений также можно подвергнуть скринингу с помощью способов, описанных в настоящем документе. Тестируемое соединение не обязательно должно быть одним соединением. В некоторых случаях для скрининга можно использовать смесь соединений. Например, в некоторых вариантах осуществления, экстракт или его фракция, например экстракт средства традиционной китайской медицины (TCM), можно использовать в качестве тестируемого соединения для скрининга.
Например, тестируемое соединение может представлять собой низкомолекулярное лекарственное средство, химическое лекарственное средство, лекарственное средство на основе макромолекул, биологическое лекарственное средство или природное лекарственное средство (традиционной китайской медицины или экстракты средства традиционной китайской медицины). В некоторых вариантах осуществления, тестируемое соединение может включать β-лактамный антибиотик, аминогликозидный антибиотик, тетрациклиновый антибиотик, хлорамфениколовый антибиотик, макролидный антибиотик, гликопептидный антибиотик, хинолоновый антибиотик, нитроимидазольный антибиотик, рифамициновый антибиотик, эхинокандиновый антибиотик, полиеновый антибиотик, пиримидиновый антибиотик, аллиламиновый антибиотик или азольный антибиотик, или их комбинацию.
В некоторых вариантах осуществления тестируемое соединение может включать одно или несколько из следующих: β-лактамные антибиотики, включая пенициллины, цефалоспорины, тиенамицины, монобактамы, ингибиторы β-лактамаз, метоксипенициллины и т.п.; аминогликозидные антибиотики: включая стрептомицин, гентамицин, канамицин, тобрамицин, амикацин, неомицин, рибомицин, микрономицин, азитромицин, и т.п.; тетрациклиновые антибиотики: включая тетрациклин, окситетрациклин, хлортетрациклин и доксициклин; хлорамфениколовые антибиотики: включая хлорамфеникол, тиамфеникол, и т.п.; макролидные антибиотики: включая эритромицин, лейкомицин, эритромицин без запаха, ацетилспирамицин, медимицин, джозамицин, азитромицин, и т.п.; гликопептидные антибиотики: включая ванкомицин, норванкомицин, тейкопланин, и т.п.; хинолоновые антибиотики: включая норфлоксацин, офлоксацин, ципрофлоксацин, пефлоксацин, гатифлоксацин; нитроимидазольные антибиотики: включая метронидазол, тинидазол, орнидазол, и т.п.; рифамициноидные антибиотики: включая рифампицин; эхинокандиновые антибиотики; полиеновые антибиотики; пиримидиновые антибиотики; аллиламиновые антибиотики; азольные антибиотики; другие антибиотики: фосфомицин, капреомицин, циклосерин, линкомицин, клиндамицин, митомицин, актиномицин D, блеомицин, доксорубицин, изониазид, пиразинамид, циклоспорин и т.п.
В некоторых вариантах осуществления, тестируемое соединение может включать одно или несколько из следующих: антибактериальные пептиды насекомых, например, антибактериальный пептид чешуекрылых, антибактериальный пептид двукрылых, антибактериальный пептид жесткокрылых, антибактериальный пептид одоната, антибактериальный пептид перепончатокрылых, антибактериальный пептид тутового шелкопряда, и т.п.; антибактериальные пептиды млекопитающих, например, антибактериальный пептид свиньи, антибактериальный пептид овцы, антибактериальный пептид крупного рогатого скота, антибактериальный пептид человека, и т.п.; антибактериальные пептиды амфибий: xenopus, и т.п.; антибактериальные пептиды рыб, моллюсков, ракообразных: антибактериальный пептид pardachirus pavoninus, антибактериальный пептид parasilurus asotus, антибактериальный пептид мидий, антибактериальный пептид креветок и т.п.; растительный антибактериальный пептид: тионины и т.п., антибактериальный пептид бактерий: бацитрацин, грамицидин, полимиксин и низин.
В некоторых вариантах осуществления, тестируемое соединение может включать экстракты или их фракции одного или нескольких из следующих: Calcined ancient ink, Salvia Miltiorrhiza, Arnebiaeuchroma, Radix Isatidis, Houttuynia, Honeysuckle, Rhizoma Coptis, Scutellaria, Dandelion, Purslane, Hawthorn, Isatidis Folium, Fructus Forsythiae, Herba Artemisiae Capillaris, Andrographis Paniculata Nees, Radix Bupleuri, Rhubarb, Euphorbia Humifusa, Stemonae, Garlic, Cortex Phellodendri, Eucommia, Cortex Fraxini, Fructus Cnidii, Galla Chinensis, viola yedoensis makino, Fructus Mume, Radix Glycyrrhizae, Pericarpium Granati, Schisandra chinensis, Spina Gleditsiae, Terminalia Chebula, Sophora flavescens, Cortex Pseudolaricis, Epimedium, Artemisia apiacea Hance.
Вышеупомянутые способы скрининга могут быть способом скрининга с низкой, средней или высокой пропускной способностью и обычно могут анализировать множество тестируемых соединений. Например, в некоторых вариантах осуществления, способы скрининга позволяют проводить скрининг более одного тестируемого соединения параллельно (включая тесты, проводимые практически в одно и то же время), например, более 10, более 100, более 1000 соединений могут быть подвергнуты скринингу параллельно. Тестируемые соединения можно тестировать в одной концентрации или тестировать в различных концентрациях. В некоторых вариантах осуществления, при скрининге множества тестируемых соединений множество тестируемых соединений включает по меньшей мере одно тестируемое соединение, которое не является известным антибиотиком широкого спектра действия или известным антибиотиком, обладающим эффективностью против одного или нескольких видов микроорганизмов. В некоторых вариантах осуществления множество тестируемых соединений включает по меньшей мере одно тестируемое соединение, которое не является ампициллином, ванкомицином, неомицином, метронидазолом, или тетрациклином. В некоторых вариантах осуществления тестируемое соединение не является известным антибиотиком широкого спектра действия или известным антибиотиком, обладающим эффективностью против одного или нескольких видов микроорганизмов. Например, в некотором варианте осуществления, тестируемое соединение не представляет собой ампициллин, ванкомицин, неомицин, метронидазол или тетрациклин.
В некоторых вариантах осуществления, тестируемое соединение может включать противовоспалительное соединение. Подходящие противовоспалительные соединения могут включать те, которые известны в данной области для офтальмологического применения. В некоторых вариантах осуществления, противовоспалительное соединение может включать в качестве стероидного или нестероидного противовоспалительного соединения, растительный экстракт или фракцию экстракта, или их комбинации.
Животные модели
В различных вариантах осуществления, настоящее изобретение также предоставляет животную модель глазного заболевания и способ получения животной модели.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ получения животной модели, включающий введение микроорганизма и/или инактивированного белка из него во внутриглазное пространство глаза животного. Обычно, микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве (например, водянистая влага в передней камере, подвешивающая связка, цилиарное тело, цилиарное тело и мышца, стекловидное тело в задней камере, сетчатка, хориоидея, зрительный нерв, хрусталик или радужка) у субъекта, страдающего глазным заболеванием, по сравнению со здоровым субъектом, где глазное заболевание выбрано из катаракты (Cat), возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), глаукомы (GLA), болезни Бехчета (BD), синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), эндофтальмита (EOS), и их комбинаций, и введение вызывает один или несколько симптомов глазного заболевания. В некоторых вариантах осуществления, способ дополнительно включает определение одного или нескольких видов микробов или уже определенные один или несколько видов микробов, как присутствующих в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего глазным заболеванием, по сравнению со здоровым субъектом, где глазное заболевание выбрано из возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), болезни Бехчета (BD), катаракты (Cat), эндофтальмита (EOS), глаукомы (GLA), синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), и их комбинаций.
В некоторых вариантах осуществления, способ позволяет вводить живой микроорганизм во внутриглазное пространство глаза животного. В некоторых вариантах осуществления, способ позволяет вводить инактивированный белок микроорганизма, например, инактивированные ультразвуком белки из микроорганизма, во внутриглазное пространство глаза животного. Субъект и животное, упомянутые в данном способе, могут быть одинаковыми или разными. Например, в некоторых вариантах осуществления, когда заболевание глаз представляет собой болезнь домашнего животного, субъект и животное могут быть одним и тем же. В некоторых вариантах осуществления, В некоторых вариантах реализации заболевание глаз может представлять собой заболевание человека, т.е. субъект является субъектом-человеком, и животное предпочтительно представляет собой не относящееся к человеку млекопитающее, более предпочтительно, примата, не относящегося к человеку (например, обезьяна). В некоторых вариантах осуществления, животное имеет анатомию глаза и/или внутриглазную среду, аналогичную таковой у человека. Предпочтительно, чтобы до введения микроорганизма и/или инактивированного белка из него у животного не было глазного заболевания.
Животная модель для AMD
В некоторых конкретных вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ получения животной модели для AMD. В некоторых вариантах осуществления, способ включает введение микроорганизма и/или инактивированного белка из него во внутриглазное пространство глаза животного. Обычно, микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве (например, водянистая влага в передней камере, подвешивающая связка, цилиарное тело, цилиарное тело и мышца, стекловидное тело в задней камере, сетчатка, хориоидея, зрительный нерв, хрусталик или радужка) у субъекта, страдающего AMD, по сравнению со здоровым субъектом, и где введение вызывает один или несколько симптомов AMD. Если иное не очевидно из контекста, микроорганизм, введенный во внутриглазное пространство животного, должен относиться к живому микроорганизму. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм включает один или несколько видов, выбранных из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, и Xanthomonas oryzae. В некоторых вариантах осуществления микроорганизм включает Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм включает по меньшей мере Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм представляет собой практически биологически чистую популяцию Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм включает смесь видов микробов, по существу аналогичных тем, которые наблюдаются в водянистой влаге, стекловидном теле, и/или мягких друзах субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна. В некоторых вариантах осуществления микроорганизм получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна. Например, в некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может быть получен путем культивирования образца, полученного из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна. Предпочтительно, животное является млекопитающим, не относящийся к человеку, более предпочтительно, приматом, не относящимся к человеку (например, обезьяна). В некоторых вариантах осуществления, животное имеет анатомию глаза и/или внутриглазную среду, аналогичную таковой у человека. В некоторых вариантах осуществления животное представляет собой макаку, такую как Macaca fascicularis. В некоторых вариантах осуществления животное не является макакой. В некоторых вариантах осуществления животное не является Macaca fascicularis.
Микроорганизм и/или инактивированный белок из него могут быть введены в любое подходящее внутриглазное пространство животного. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят в субретинальное пространство животного. Хотя микроорганизм и/или инактивированный белок из него обычно вводят в глаз животного, другие способы доставки также могут быть подходящими.
Обычно микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят в количестве и концентрации, достаточных для того, чтобы индуцировать один или несколько симптомов AMD. Например, как показано в разделе «Примеры», 20 КОЕ бактерий в примерно 20 мкл раствора PBS могут индуцировать один или несколько симптомов AMD, таких как друзеноидные поражения. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят в количестве и концентрации, достаточных для индуцирования 1) друзеноидного поражения, например, на тканях сетчатки у животного; 2) узелков, подобных друзам, например, под слоем пигментного эпителия сетчатки в глазу животного; 3) пироптоза, например, клеток пигментного эпителия сетчатки в глазу животного; 4) активации системы комплемента и/или воспаления в глазу животного, например, с повышенной экспрессией белков C5A, CFH, CASPASE1 и NLRP3; 5) секреции активного IL-1β и/или IL-18, например, клетками пигментного эпителия сетчатки в глазу животного; или 6) любой комбинации 1)-5).
Животное, используемое для способов получения животной модели в настоящем документе, предпочтительно является здоровым животным, например, у животного не было заболевания глаз до введения микроорганизма и/или инактивированного белка из него. Предпочтительно также, чтобы животное не получало никаких антибиотиков до и во время введения микроорганизма и/или инактивированного белка из него, например, до появления одного или нескольких симптомов AMD.
В некоторых вариантах осуществления, способ получения животной модели для AMD может включать введение образца от субъекта, страдающего AMD, во внутриглазное пространство глаза животного, где образец получают из внутриглазного пространства субъекта, и где введение вызывает один или несколько симптомов AMD. В некоторых вариантах осуществления, перед введением животному образец инкубируют в культуральной среде и, необязательно, очищают и/или формулируют для инъекции. В некоторых вариантах осуществления, способ дополнительно включает 1) получение образца из внутриглазного пространства субъекта, такого как водянистая влага, стекловидное тело и/или мягкие друзы; и 2) инкубирование образца в питательной среде. В некоторых вариантах осуществления, образец получен из водянистой влаги субъекта, страдающего AMD. В некоторых вариантах осуществления, образец получен из стекловидного тела субъекта, страдающего AMD. В некоторых вариантах осуществления, образец получен из мягких друзов субъекта, страдающего AMD. Как показано в разделе “Примеры” в настоящем описании, инкубирование образца обычно можно проводить в стерильной культуральной среде в стерильной среде, такой как герметичная среда, чтобы не внести виды микробов, изначально не присутствующие в образце от субъекта.
Как правило, способы получения животной модели для AMD могут обеспечить животное с одним или несколькими симптомами AMD в течение устойчивого периода времени. Например, без вмешательства животная модель, полученная способами, описанными в настоящем документе, обычно показывает один или несколько симптомов AMD в течение периода времени более 1 недели, 1 месяца или в течение времени жизни животного. Животные модели, полученные способами, описанными в настоящем документе, также являются новыми особенностями вариантов осуществления настоящего изобретения.
Животные модели AMD, полученные в настоящем документе, также могут быть использованы для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики AMD. Например, в некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение также предоставляет способ скрининга, включающий a) введение тестируемого соединения животной модели AMD, как описано в настоящем документе; b) определение степени тяжести одного или нескольких симптомов глазного заболевания после введения; и, необязательно, c) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые облегчают, по меньшей мере, один из симптомов по сравнению с контролем. В некоторых вариантах осуществления, введение тестируемого соединения по сравнению с контролем 1) уменьшает друзеноидное поражение, например, на тканях сетчатки у животного; 2) уменьшает узелки, подобные друзам, например, под слоем пигментного эпителия сетчатки в глазу животного; 3) уменьшает пироптоз, например, клеток пигментного эпителия сетчатки в глазу животного; 4) уменьшает активацию системы комплемента и/или воспаление в глазу животного, например, уменьшает экспрессию белков C5A, CFH, CASPASE1 и NLRP3; 5) уменьшает секрецию активного IL-1β и/или IL-18 клетками пигментного эпителия сетчатки в глазу животного; или 6) любая комбинация 1)-5), и такое тестируемое соединение может быть идентифицировано как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики AMD. В некоторых вариантах осуществления, введение тестируемого соединения по сравнению с контролем уничтожает или подавляет рост микроорганизма в глазу (например, внутриглазном пространстве или полости), крови и/или желудочно-кишечном тракте, таком как кишечник животной модели, и такое тестируемое соединение также может быть идентифицировано как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики AMD. В некоторых вариантах осуществления, соответствующая информация «контроля» может быть получена от животного до введения тестируемого соединения. В некоторых вариантах осуществления, релевантная информация «контроля» может быть получена от животных, получавших лечение плацебо, например, введение композиции плацебо без тестируемого соединения.
Тестируемое соединение для способа скрининга с использованием животной модели для AMD (как описано в настоящем документе) не ограничено, хотя предпочтительно, чтобы тестируемое соединение подвергалось предварительному скринингу (например, с использованием любого из способов скрининга, описанных в настоящем документе), на эффективность в уничтожении или ингибировании роста микроорганизма (например, Bacillus megaterium), присутствующего в повышенном количестве во внутриглазном пространстве субъекта, страдающего AMD, по сравнению со здоровым субъектом контрольной группы. Тестируемое соединение также можно вводить любым подходящим путем с любым исследованным режимом дозирования с любым подходящим исследованным количеством дозировки, которое может быть выбрано специалистами в данной области на основании таких факторов, как эффективность исследованных соединений (если они известны). Например, тестируемое соединение можно вводить перорально, местно, интравитреально, внутримышечно, подкожно или внутривенно.
Способ скрининга с использованием животной модели для AMD (как описано в настоящем документе), как правило, представляет собой метод скрининга с низкой или средней производительностью. В некоторых вариантах осуществления, проводят скрининг множества тестируемых соединений, и множество тестируемых соединений включает по меньшей мере одно тестируемое соединение, которое не является известным антибиотиком широкого спектра действия или известным антибиотиком, обладающим эффективностью против одного или нескольких видов микроорганизмов. В некоторых вариантах осуществления множество тестируемых соединений включает по меньшей мере одно тестируемое соединение, которое не является ампициллином, ванкомицином, неомицином, метронидазолом, или тетрациклином. В некоторых вариантах осуществления тестируемое соединение не является известным антибиотиком широкого спектра действия или известным антибиотиком, обладающим эффективностью против одного или нескольких видов микроорганизмов. Например, в некотором варианте осуществления, тестируемое соединение не представляет собой ампициллин, ванкомицин, неомицин, метронидазол или тетрациклин.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ получения модели глазного заболевания у млекопитающих, включающий: введение одного или нескольких микроорганизмов и/или одного или нескольких инактивированных белков одного или нескольких микроорганизмов в глаз млекопитающего, тем самым создавая модель на млекопитающем. В некоторых вариантах осуществления, способ может дополнительно включать мониторинг развития и прогрессирования одного или нескольких маркеров глазного заболевания. Маркеры глазного заболевания могут включать те биологические и/или химические маркеры, известные в данной области для данного заболевания, и могут включать, но не ограничиваются ими, симптомы глазного заболевания. В некоторых вариантах осуществления, мониторинг развития и прогрессирования одного или нескольких маркеров глазного заболевания может включать мониторинг воспалительной реакции глаза у млекопитающего. В некоторых вариантах осуществления, мониторинг развития и прогрессирования одного или нескольких маркеров глазного заболевания может включать мониторинг формирования или прогрессирования друзеноидных поражений. В некоторых вариантах осуществления, способ может дополнительно включать обеспечение прохождения достаточного времени после введения одного или нескольких микроорганизмов или одного или нескольких инактивированных белков одного или нескольких микроорганизмов, для развития у млекопитающего друзеноидных поражений. В некоторых вариантах осуществления, введение одного или нескольких микроорганизмов или одного или нескольких инактивированных белков одного или нескольких микроорганизмов может включать внутриглазную инъекцию одного или нескольких микроорганизмов или одного или нескольких инактивированных белков одного или нескольких микроорганизмов. В некоторых вариантах осуществления, внутриглазная инъекция может включать инъекцию в стекловидное тело или водянистую влагу млекопитающего.
Способы лечения
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение также предоставляет способ лечения или профилактики AMD. В некоторых вариантах осуществления, способ включает введение субъекту, нуждающемуся в этом, эффективного количества любого из терапевтических средств-кандидатов, идентифицированных в любом из способов скрининга в настоящем документе, направленных на AMD. В некоторых вариантах осуществления, способ включает идентификацию, или уже идентифицированного, субъекта как инфицированного одним или несколькими видами, выбранными из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, и Xanthomonas oryzae, например, во внутриглазном пространстве, и введение субъекту эффективного количества любого из терапевтических средств-кандидатов, идентифицированных в любом из описанных в настоящем документе способов скрининга, направленных на AMD. В некоторых вариантах осуществления, способ включает идентификацию или, уже идентифицированного, субъекта как инфицированного Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida, предпочтительно, по меньшей мере, Bacillus megaterium, например, во внутриглазном пространстве, и введение субъекту эффективного количества любого из терапевтических средств-кандидатов, идентифицированных в любом из описанных в настоящем документе способов скрининга, направленных на AMD. В некоторых вариантах осуществления, способ включает выбор субъекта, инфицированного одним или несколькими видами, выбранными из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, и Xanthomonas oryzae, например, во внутриглазном пространстве, и введение субъекту эффективного количества любого из терапевтических средств-кандидатов, идентифицированных в любом из описанных в настоящем документе способов скрининга, направленных на AMD. В некоторых вариантах осуществления, способ включает выбор субъекта, инфицированного Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida, предпочтительно, по меньшей мере Bacillus megaterium, например, во внутриглазном пространстве, и введение субъекту эффективного количества любого из терапевтических средств-кандидатов, идентифицированных в любом из описанных в настоящем документе способов скрининга, направленных на AMD. В некоторых вариантах осуществления, субъект не страдает болезнью Бехчета (BD), катарактой (Cat), эндофтальмитом (EOS), глаукоой (GLA), синдромом Фогта-Коянаги-Харада (VKH), или любыми их комбинациями. В некоторых вариантах осуществления субъект страдает AMD. В некоторых вариантах осуществления, у субъекта не диагностирована AMD. В некоторых вариантах осуществления субъект подвержен риску развития AMD. Введение не ограничивается какими-либо конкретными путями, например, оно может быть пероральным, местным, интравитреальным, внутримышечным, подкожным и/или внутривенным.
В некоторых вариантах осуществления, способ лечения или профилактики AMD включает идентификацию, или уже идентифицированного, субъекта как инфицированного одним или несколькими видами, выбранными из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, и Xanthomonas oryzae, например, во внутриглазном пространстве, и введение субъекту эффективного количества антибиотика. Антибиотик, используемый в настоящем документе, в широком смысле относится к соединению, обладающему антибактериальной активностью, которое может быть природного происхождения или синтетическим. Примеры некоторых антибиотиков приведены в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления, способ включает идентификацию или, уже идентифицированного, субъекта как инфицированного Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida, предпочтительно, по меньшей мере Bacillus megaterium, например, во внутриглазном пространстве, и введение субъекту эффективного количества антибиотика. В некоторых вариантах осуществления, способ включает выбор субъекта, инфицированного одним или несколькими видами, выбранными из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, и Xanthomonas oryzae, например, во внутриглазном пространстве, и введение субъекту эффективного количества антибиотика. В некоторых вариантах осуществления, способ включает выбор субъекта, инфицированного Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida, предпочтительно, по меньшей мере Bacillus megaterium, например, во внутриглазном пространстве, и введение субъекту эффективного количества антибиотика. В некоторых вариантах осуществления, способ включает выбор субъекта, инфицированного Bacillus megaterium, например, во внутриглазном пространстве, и введение субъекту эффективного количества антибиотика. В некоторых вариантах осуществления, субъект не страдает болезнью Бехчета (BD), катарактой (Cat), эндофтальмитом (EOS), глаукомой (GLA), синдромом Фогта-Коянаги-Харада (VKH), или любой их комбинацией. В некоторых вариантах осуществления субъект страдает AMD. В некоторых вариантах осуществления у субъекта не диагностирована AMD. В некоторых вариантах осуществления субъект подвержен риску развития AMD. Введение не ограничивается какими-либо конкретными путями, например, оно может быть пероральным, местным, интравитреальным, внутримышечным, подкожным и/или внутривенным. В любом из вариантов осуществления в настоящем документе, «эффективное количество» антибиотика может представлять собой количество, которое эффективно для уничтожения или ингибирования роста одного или нескольких видов микробов в глазу подвергающегося лечению субъекта, где один или несколько видов микробов присутствуют в повышенном количестве у пациента с AMD, по сравнению со здоровым субъектом контрольной группы, например, одним или несколькими видами микробов могут быть Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida, предпочтительно, по меньшей мере Bacillus megaterium.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение также предоставляет способ 1) уменьшения друзеноидного поражения, например, на тканях сетчатки; 2) уменьшения узелков, подобных друзам, например, под слоем пигментного эпителия сетчатки в глазу; 3) уменьшения пироптоза клеток пигментного эпителия сетчатки глаза; 4) уменьшения активации системы комплемента и/или воспаления в глазу, например, уменьшения экспрессии белков C5A, CFH, CASPASE1 и NLRP3; 5) уменьшения секреции активного IL-1β и/или IL-18 клетками пигментного эпителия сетчатки в глазу; или 6) любая комбинация 1)-5), у субъекта, нуждающегося в этом, причем способ включает введение субъекту эффективного количества любого из терапевтических средств-кандидатов, идентифицированных в любом из описанных в настоящем документе способов скрининга, направленных на AMD. В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение также обеспечивает способ лечения симптома друзы (например, мягкие друзы) у субъекта, нуждающегося в этом, причем способ включает введение субъекту эффективного количества любого из терапевтических средств-кандидатов, идентифицированных в любом из описанных в настоящем документе способов скрининга, направленных на AMD. Симптом друзы (например, мягкие друзы) может быть индуцирован микробной инфекцией, например патогенными бактериями, описанными в настоящем документе. Симптом друзы, например мягкие друзы, может быть связан с субъектами, страдающими AMD.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение также предоставляет способ 1) уменьшения друзеноидного поражения, например, на тканях сетчатки; 2) уменьшения узелков, подобных друзам, например, под слоем пигментного эпителия сетчатки в глазу; 3) уменьшения пироптоза клеток пигментного эпителия сетчатки глаза; 4) уменьшения активации системы комплемента и/или воспаления в глазу, например, уменьшения экспрессии белков C5A, CFH, CASPASE1 и NLRP3; 5) уменьшения секреции активного IL-1β и/или IL-18 клетками пигментного эпителия сетчатки в глазу; или 6) любой комбинации 1)-5), у субъекта, нуждающегося в этом, причем способ включает введение субъекту эффективного количества антибиотика. Например, в некоторых вариантах осуществления, способ предназначен для уменьшения друзеноидного поражения у субъекта. В некоторых вариантах осуществления, способ предназначен для уменьшения узелков, подобных друзам, у субъекта. В некоторых вариантах осуществления, способ предназначен для уменьшения пироптоза клеток пигментного эпителия сетчатки в глазу субъекта. В некоторых вариантах осуществления, способ предназначен для уменьшения активации системы комплемента и/или воспаления в глазу субъекта. В некоторых вариантах осуществления, способ предназначен для уменьшения секреции активного IL-1β и/или IL-18 клетками пигментного эпителия сетчатки в глазу у субъекта. Не желая быть связанными теориями, считается, что антибиотик может уничтожать или ингибировать рост бактерий (например, патогенных бактерий), например, во внутриглазном пространстве субъекта, и, следовательно, может уменьшать образование друзов, друзеноидное поражение и/или узелки, подобные друзам, такие как у субъекта, страдающего AMD, которая, как показано в настоящем документе, связана с инфекцией одним или несколькими патогенными микроорганизмами, например, Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida. Также считается, что патогенные микроорганизмы, например, описанные в настоящем документе, такие как Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida, могут вызывать воспаление в глазу. Следовательно, вводимый антибиотик, который может уничтожать или ингибировать рост патогенных микроорганизмов, также может уменьшать воспаление глаз у субъекта, например, кто страдает AMD. В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение также предоставляет способ лечения симптома друзов (например, мягкие друзы) у субъекта, нуждающегося в этом, способ включает введение субъекту эффективного количества антибиотика. Симптом друз (например, мягких друз) может быть индуцирован микробной инфекцией, такой как патогенные бактерии, описанные в настоящем документе. Симптом друз, например мягких друз, может быть связан с пациентами, страдающими AMD. В некоторых вариантах осуществления, способ уменьшает друзеноидные поражения и/или узелки.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение также предоставляет способ 1) уменьшения друзеноидного поражения, например, на тканях сетчатки; 2) уменьшения узелков, подобных друзам, например, под слоем пигментного эпителия сетчатки в глазу; 3) уменьшения пироптоза клеток пигментного эпителия сетчатки глаза; 4) уменьшения активации системы комплемента и/или воспаления в глазу, например, уменьшения экспрессии белков C5A, CFH, CASPASE1 и NLRP3; 5) уменьшения секреции активного IL-1β и/или IL-18 клетками пигментного эпителия сетчатки в глазу; или 6) любой комбинации 1)-5), у субъекта, нуждающегося в этом, способ, включающий введение субъекту эффективного количества соединения по настоящему изобретению (например, соединения формулы I (например, формулы I-1, формулы I-2, формулы I-3, формулы I-4, формулы I-5), формулы II (например, формулы II-1, формулы II-2, формулы II-3, формулы II-4, формулы II-5, формулы II-6, формулы II-7, формулы II-8, формулы II-9, формулы II-10), формулы III (например, формулы III-1, формулы III-2, формулы III-3), формулы IV-1 или IV-2 (например, формулы IV-3, формулы IV-4, формулы IV-5, формулы IV-6), гликозида (например, формулы V), где агликон гликозида представляет собой фенольное соединение, флавоноид, кумарин, бензойную кислоту или стерол, соединения, выбранного из соединений 1-8, или его фармацевтически приемлемой соли или сложного эфира, или фармацевтической композиции, включающей соединение или его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир). Например, в некоторых вариантах осуществления, способ предназначен для уменьшения друзеноидного поражения у субъекта. В некоторых вариантах осуществления, способ предназначен для уменьшения узелков, подобных друзам, у субъекта. В некоторых вариантах осуществления, способ предназначен для уменьшения пироптоза клеток пигментного эпителия сетчатки в глазу субъекта. В некоторых вариантах осуществления, способ предназначен для уменьшения активации системы комплемента и/или воспаления в глазу субъекта. В некоторых вариантах осуществления, способ предназначен для уменьшения секреции активного IL-1β и/или IL-18 клетками пигментного эпителия сетчатки в глазу у субъекта. Не желая быть связанными теориями, считается, что соединения по настоящему изобретению могут уничтожать или ингибировать рост бактерий (например, патогенных бактерий), например, во внутриглазном пространстве субъекта, и следовательно, может уменьшать образование друзов, друзеноидное поражение и/или узелки, подобные друзам, такие как у субъекта, страдающего AMD, которая, как показано в настоящем документе, связана с инфекцией одним или несколькими патогенными микроорганизмами, например, Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida. Также считается, что патогенные микроорганизмы, например, описанные в настоящем документе, такие как Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida, могут вызывать воспаление в глазу. Следовательно, вводимое соединение по настоящему изобретению, которое может уничтожать или ингибировать рост патогенных микроорганизмов, также может уменьшать воспаление глаз у субъекта, например, кто страдает AMD. В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение также предоставляет способ лечения симптома друзов (например, мягких друзов) у субъекта, нуждающегося в этом, причем способ включает введение субъекту эффективного количества соединения по настоящему изобретению. Симптом друз (например, мягких друз) может быть индуцирован микробной инфекцией, такой как патогенные бактерии, описанные в настоящем документе. Симптом друз, например мягких друз, может быть связан с субъектами, страдающими AMD. В некоторых вариантах осуществления, способ уменьшает друзеноидные поражения и/или узелки.
Субъект, подходящий для лечения описанными здесь способами, особо не ограничивается. В некоторых предпочтительных вариантах осуществления субъект страдает AMD. В некоторых вариантах осуществления, AMD может представлять собой сухую или влажную возрастную дегенерацию желтого пятна с симптомами друзы, включая твердые друзы, мягкие друзы, смешанные друзы и/или деградированные друзы, например, сухая или влажная возрастная дегенерация желтого пятна с симптомами мягкой друзы. В некоторых вариантах осуществления, субъект не страдает AMD. В некоторых вариантах осуществления субъект подвержен риску развития AMD. В некоторых вариантах осуществления, у субъекта имеются мягкие друзы, отложенные между пигментным эпителием сетчатки (RPE) и мембраной Бруха. В некоторых вариантах осуществления субъект имеет пигментные изменения сетчатки в макуле. В некоторых вариантах осуществления, субъект страдает сухой формой AMD. В некоторых вариантах осуществления, субъект страдает влажной формой AMD. В некоторых вариантах осуществления субъект является человеком-субъектом. В некоторых вариантах осуществления, субъект инфицирован во внутриглазном пространстве одним или несколькими видами, присутствующими в повышенном количестве во внутриглазном пространстве пациента с AMD, по сравнению со здоровым субъектом, например, как описано в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления, субъект инфицирован во внутриглазном пространстве одним или несколькими видами, выбранными из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, и Xanthomonas oryzae. В некоторых вариантах осуществления, субъект инфицирован Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida, предпочтительно, по меньшей мере Bacillus megaterium, во внутриглазном пространстве. В некоторых вариантах осуществления, субъект не страдает болезнью Бехчета (BD), катарактой (Cat), эндофтальмитом (EOS), глаукомой (GLA), синдромом Фогта-Коянаги-Харада (VKH), или любой их комбинацией. В некоторых вариантах осуществления, способ может дополнительно включать идентификацию или, уже идентифицированного, субъекта как инфицированного во внутриглазном пространстве одним или несколькими видами, присутствующими в повышенном количестве во внутриглазном пространстве пациента с AMD, по сравнению со здоровым субъектом, например, как описано в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления, способ может дополнительно включать идентификацию или, уже идентифицированного, субъекта как инфицированного во внутриглазном пространстве одним или несколькими видами, выбранными из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, и Xanthomonas oryzae. В некоторых вариантах осуществления, способ может дополнительно включать идентификацию или, уже идентифицированного, субъекта как инфицированного Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida, предпочтительно, по меньшей мере Bacillus megaterium, во внутриглазном пространстве.
Введение антибиотика не ограничивается каким-либо конкретным способом введения. Например, введение может быть пероральным, местным, интравитреальным, внутримышечным, подкожным и/или внутривенным введением. Например, в некоторых вариантах осуществления, антибиотик вводится посредством интравитреальной инъекции, такой как интравитреальная инъекция вещества замедленного всасывания, или интравитреального имплантата. В некоторых вариантах осуществления, может использоваться комбинация двух или более способов введения (например, пероральный и интравитреальный пути). Например, в некоторых вариантах осуществления, антибиотик можно вводить перорально и интравитреально, одновременно или последовательно в любом порядке. Например, в некоторых вариантах осуществления, антибиотик можно вводить перорально и внутривенно, одновременно или последовательно в любом порядке. Другие способы введения также могут использоваться в комбинациях для одного и того же активного ингредиента или двух разных активных ингредиентов. Антибиотик может быть сформулирован в виде твердого, жидкого, полутвердого, раствора, суспензии, имплантата или любых других подходящих форм. Например, пероральный антибиотик обычно может быть в твердой или жидкой форме. В некоторых вариантах осуществления, антибиотик может быть получен в виде имплантата. Когда выполняется интравитреальная инъекция, место инъекции также особо не ограничивается. Например, в некоторых вариантах осуществления, инъекция может быть инъекцией в супрахориоидальное пространство. Другие подходящие места являются известными в данной области. Эффективное количество может варьироваться в зависимости от различных факторов, таких как время введения, способ введения, продолжительность лечения, эффективность антибиотика (например, для уничтожения или ингибирования роста одного или нескольких микроорганизмов, которые присутствуют в повышенном количестве во внутриглазном пространстве по сравнению со здоровым субъектом контрольной группы), скорость его клиренса и то, вводится ли другое лекарственное средство совместно или нет. В способах, описанных в настоящем документе, могут использоваться различные антибиотики, например, любые из описанных в настоящем документе, а также любые из тех, что описаны в PCT/CN2019/070572, поданной 7 января 2019 г., содержание которого включено в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме.
В некоторых вариантах осуществления, антибиотик может представлять собой β-лактамный антибиотик, аминогликозидный антибиотик, тетрациклиновый антибиотик, хлорамфениколовый антибиотик, макролидный антибиотик, гликопептидный антибиотик, хинолоновый антибиотик, нитроимидазольный антибиотик, рифамициновый антибиотик, эхинокандиновый антибиотик, полиеновый антибиотик, пиримидиновый антибиотик, аллиламиновый антибиотик или азольный антибиотик, или их комбинацию.
В некоторых вариантах осуществления, антибиотики могут включать один или несколько из следующих: β-лактамные антибиотики, включая пенициллины (например, пенициллин V), амоксициллин, ампициллин, бакампициллин, карбенициллин, клоксациллин, диклоксациллин, флуклоксациллин, мезлоциллин, нафциллин, оксациллин, пенициллин G, пиперациллин, пивампициллин, пивмециллинам, тикарциллин, цефалоспорины, такие как цефацетрил, цефадроксил, цефалексин, цефалоглицин, цефалоний, цефалоридин, цефалотин, цефапирин, цефатризин, цефазафлур, цефазедон, цефазолин, цефрадин, цефроксадин, цефтезол, цефаклор, цефамандол, цефметазол, цефоницид, цефотетан, цефокситин, цефпрозил, цефуроксим, цефузонам, цефкапен, цефдалоксим, цефдинир, цефдиторен, цефетамет, цефиксим, цефменоксим, цефодизим, цефотаксим, цефпимизол, цефподоксим, цефтерам, цефтибутен, цефтиофур, цефтиолен, цефтизоксим, цефтриаксон, цефоперазон, цефтазидим, цефклидин, цефепим, цефлупренам, цефоселис, цефозопран, цефпиром, цефкином, цефтобипрол, цефтаролин, цефакломезин, цефалорам, цефапарол, цефканел, цефедролор, цефемпидон, цефетризол, цефивитрил, цефматилен, цефмепидиум, цефовецин, цефоксазол, цефротил, цефсумид, цефурацетим, цефтиоксид, тиенамицины, монобактамы, ингибиторы β-лактамаз, метоксипенициллины, и т.п.; аминогликозидные антибиотики: включая стрептомицин, гентамицин, канамицин (например, канамицин A), тобрамицин, амикацин, неомицин (например, неомицин B, неомицин C, неомицин E), рибомицин, микрономицин, азитромицин, дибекацин, сизомицин, нетилмицин, парамомицин, брамицин, и т.п.; тетрациклиновые антибиотики: включая тетрациклин, окситетрациклин, хлортетрациклин и доксициклин; хлорамфениколовые антибиотики: включая хлорамфеникол, тиамфеникол, и т.п.; макролидные антибиотики: включая эритромицин, лейкомицин, эритромицин без запаха, ацетилспирамицин, медимицин, джозамицин, азитромицин, кларитромицин, диритромицин, окситромицин, телитромицин, и т.п.; гликопептидные антибиотики: включая ванкомицин, норванкомицин, тейкопланин, и т.п.; хинолоновые антибиотики: включая норфлоксацин, офлоксацин, ципрофлоксацин, пефлоксацин, гатифлоксацин, эноксацин, ломефлоксацин, налидиксовая кислота, левофлоксацин, моксифлоксацин, безифлоксацин; нитроимидазольные антибиотики: включая метронидазол, тинидазол, орнидазол, и т.п.; рифамициноидные антибиотики: включая рифампицин; эхинокандиновые антибиотики; полиеновые антибиотики; пиримидиновые антибиотики; аллиламиновые антибиотики; азольные антибиотики; другие антибиотики: фосфомицин, капреомицин, циклосерин, линкомицин, клиндамицин, митомицин, актиномицин D, блеомицин, доксорубицин, изониазид, пиразинамид, циклоспорин, комбинации полимиксина B, такие как полимиксин B/триметоприм, полимиксин B/бацитрацин, полимиксин B/неомицин/грамицидин, и т.п.
В некоторых вариантах осуществления, антибиотик может быть выбран из амикацина, амоксициллина, ампициллина, арсфенамина, азитромицина, азлоциллина, азтреонама, бацитрацина, капреомицина, карбенициллина, цефаклора, цефадроксила, цефалексина, цефалотина, цефамандола, цефазолина, цефдинира, цефдиторена, цефиксима, цефоперазона, цефотаксима, цефокситина, цефподоксима, цефпрозила, цефтазидима, цефтибутена, цефтизоксима, цефтриаксона, цефуроксима, хлорамфеникола, циластатина, кларитромицина, клавуланата, клиндамицина, клофазимина, клоксациллина, колистина, циклосерина, дальфопристина, дапсона, даптомицина, диклоксациллина, диритромицина, дорипенема, доксициклина, эритромицина, этамбутола, этионамида, флуклоксациллина, фосфомицина, фуразолидона, фузидовой кислоты, гентамицина, имипенема, изониазида, канамицина, линкомицина, линезолида, лоракарбефа, мафенида, меропенема, метициллина, метронидазола, мезлоциллина, миноциклина, мупироцина, нафциллина, неомицина, нетилмицина, нитрофурантоина, оксациллина, окситетрациклина, паромомицина, пенициллина G, пенициллина V, пиперациллина, платенсимицина, полимиксина B, пиразинамида, квинупристина, рапамицина, рифабутина, рифампицина, рифампина, рифапентина, рифаксимина, рокситромицина, сульфадиазина серебра, спектиномицина, стрептомицин, сульбактама, сульфацетамида, сульфадиазина, сульфаметизола, сульфаметоксазола, сульфанилимида, сульфасалазина, сульфизоксазола, тазобактама, тейкопланина, телаванцина, телитромицина, темоциллина, тетрациклина, тиамфеникола, тикарциллина, тигециклина, тинидазола, тобрамицина, триметоприма, тролеандомицин ванкомицина, эноксацина, ломефлоксацина, налидиксовой кислоты, ципрофлоксацина, левофлоксацина, гатифлоксацина, моксифлоксацина, офлоксацина, норфлоксацина, цефотетана, цефоницида, цефрадина, цефапирина, цефалотина, цефметазола, цефотаксима, моксалактама, цефепима, цефтаролин фозамила, цефтобипрола, далбаванцина, демеклоциклина, метациклина, эртапенема, фидаксомицина, гелданамицина, гербимицина, позизолида, радезолида, торезолида, оритаванцина, спирамицина, сульфадиметоксина, сульфонамидохризоидина, гемифлоксацин надифлоксацин тровафлоксацин грепафлоксацин спарфлоксацин темафлоксацина, теиксобактина, малацидина, и их комбинаций.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение также относится к терапевтическим средствам-кандидатам, идентифицированным с помощью любого из способов скрининга, описанных в настоящем документе, или к фармацевтической композиции, включающей терапевтические средства-кандидаты для лечения или профилактики AMD.
Соединения
В некоторых вариантах осуществления, настоящее описание относится к различным соединениям и/или композициям, включающим соединения, которые могут уничтожать или ингибировать рост микроорганизмов, связанных с AMD, таких как Bacillus megaterium.
Соединения, описанные в настоящем документе, обычно обладают антибактериальной активностью сами по себе или в комбинации с другим средством. Соединения в настоящем документе могут быть бактерицидными или бактериостатическими. Различные соединения, о которых известно, что они обладают антибактериальной активностью, могут использоваться для вариантов осуществления настоящего изобретения. Например, в некоторых вариантах осуществления, соединения в настоящем документе могут включать любые из спиртов, фенольных соединений, аминов, сульфонамидов, хинолонов, антрахинона и/или соединений, родственных бензойной кислоте, которые, как известно, обладают антибактериальной активностью. Неограничивающие примеры пригодных соединений включают бензоидную кислоту, бензиловый спирт, кумарины, катехолы, полифенолы, халконоиды (включая ликохалконы) и т.п., стильбены, такие как ресвератрол, изоресвератрол и т.п., фенольные кислоты, такие как п-гидроксбензойная кислота, 2,4-дигидроксбензоидная кислота, протокатеховая кислота, галловая кислота, ванилиновая кислота, сиреневая кислота, коричная кислота, кумаровые кислоты, кофейная кислота, феруловая кислота, хлорогеновая кислота, синапиеновые кислоты и т.п., флавоноиды, такие как катехин, наригенин, кверцетин, рутин, хризин и т.п., таннины, такие как эллаговая кислота, и их сложные эфиры и их гликозиды.
Соединения в настоящем документе обычно характеризуются определенными функциональными группами, присутствующими в их молекулярных структурах. Например, в некоторых вариантах осуществления, соединения в настоящем документе характеризуются наличием спиртовой гидроксильной группы, фенольной гидроксильной группы и/или группы карбоновой кислоты или их производных, таких как сложные эфиры, амиды, карбонаты, карбаматы, сульфонаты, гликозиды и т.п. В некоторых вариантах осуществления, соединения с аминогруппой, сульфонамидной группой, тиоловой группой и/или сульфоксидной или сульфоновой группой также могут быть полезны для композиций и способов, описанных в настоящем документе.
Соединения в настоящем документе могут иметь полициклическую коровую структуру, бициклическую коровую структуру или моноциклическую коровую структуру, каждое из которых может быть замещено различными группами, как описано в настоящем документе.
В некоторых вариантах осуществления, соединения в настоящем документе могут быть охарактеризованы формулой I или их фармацевтически приемлемой солью или сложным эфиром:
Во избежание неоднозначного толкования, в формуле I циклическая структура Cy1 связана с другой циклической структурой Cy2, которая может быть такой же или другой, через два линкера, L и L’, которые образуют дополнительную кольцевую структуру между Cy1 и Cy2. Следует понимать, что и Cy1 и Cy2 по отдельности представляют собой кольцевую структуру, которая не зависит от L и L’.
В формуле I, Cy1 и Cy2, каждый, независимо представляет собой необязательно замещенное циклоалкильное кольцо (например, C3-7 циклоалкильное кольцо), необязательно замещенное гетероциклическое кольцо, такое как необязательно замещенное 4-7-членное гетероциклическое кольцо (например, имеющее один или два кольцевых гетероатома, независимо выбранных из N, O и S), необязательно замещенное арильное кольцо (например, C6-10 арильное кольцо (например, фенил)), или необязательно замещенное гетероарильное кольцо, такое как необязательно замещенное 5-10-членное гетероарильное кольцо (например, 5- или 6-членное гетероарильное кольцо с одним или двумя кольцевыми гетероатомами, независимо выбранными из N, O и S);
L и L’, каждый независимо, отсутствуют или представляют собой линкер (например, описанный в настоящем документе); используемый в настоящем описании термин «линкер» не ограничивается какими-либо конкретными типами связывающих групп. Например, в некоторых вариантах осуществления, линкер также может образовывать кольцевую структуру с одним из фрагментов, к которому он присоединен, например, L и Cy1 могут образовывать кольцевую структуру, независимую от Cy2;
L2 отсутствует, представляет собой необязательно замещенный C1-6 алкилен, необязательно замещенный C1-6 гетероалкилен, необязательно замещенный C2-6 алкенилен, необязательно замещенный C2-6 алкинилен, необязательно замещенный C3-6 циклоалкилен, необязательно замещенный арилен, необязательно замещенный гетероарилен или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклилен;
W представляет собой -OR1; -COR2; -COOR1a; -OCOOR1a; -NR3R4; -CONR3aR4a; -OCONR3bR4b; -SO2NR3cR4c; -OSO2NR3dR4d; -SR5; -SO2R5a; -OCOR2a; -OSO2R5a или 
;
где:
R1 и R1a каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный алкил, необязательно замещенный алкенил, необязательно замещенный алкинил, необязательно замещенный циклоалкил, необязательно замещенный арил, необязательно замещенный гетероарил или необязательно замещенный гетероциклил;
R3 и R4 каждый независимо представляет собой водород, -COR2b, -SO2R5b, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил, или R3 и R4 вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил;
R2, R2a, R2b, R5, R5a и R5b каждый независимо представляет собой водород, -OH, -NR3eR4e, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; и
R3a, R3b, R3c, R3d, R3e, R4a, R4b, R4c, R4d и R4e каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или R3a и R4a, R3b и R4b, R3c и R4c, R3d и R4d, или R3e и R4e, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил.
Cy1 и Cy2 в формуле I могут быть ароматической или неароматической кольцевой системой и в некоторых случаях могут включать гетероатомы. В предпочтительных вариантах осуществления, по меньшей мере один из Cy1 и Cy2 в формуле I представляет собой арильное или гетероарильное кольцо, такое как необязательно замещенное C6-10 арильное кольцо или необязательно замещенное 5-10-членное гетероарильное кольцо. Например, в некоторых вариантах осуществления, Cy1 и Cy2 являются таковыми, что коровая структура формулы I, структура 
без указания необязательных заместителей, может быть любой из следующих:
,
где L2-W может быть присоединен либо к левому, либо к правому кольцу, где L и L’ могут быть любыми из тех, что описаны в настоящем документе, и подходящие заместители для колец описаны в настоящем документе.
В некоторых вариантах осуществления, как Cy1, так и Cy2 в формуле I могут быть арильным или гетероарильным кольцом. Например, в некоторых вариантах осуществления, соединение формулы I может иметь формулу I-1:
В некоторых вариантах осуществления, Ar1 и Ar2 в формуле I-1, каждый, независимо представляют собой необязательно замещенное C6-10 арильное кольцо или необязательно замещенное 5-10-членное гетероарильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления, Ar1 и Ar2 в формуле I-1, каждый, независимо представляют собой необязательно замещенное фенильное кольцо или 5- или 6-членное гетероарильное кольцо. Например, в некоторых вариантах осуществления, Ar1 и Ar2 в формуле I-1, каждый, независимо представляют собой необязательно замещенное фенильное кольцо, необязательно замещенное тиенильное кольцо, необязательно замещенное фуранильное кольцо, необязательно замещенное пиридильное кольцо или необязательно замещенное пиримидинильное кольцо.
Формула I-1 обычно имеет полициклическую коровую структуру. Например, в некоторых вариантах осуществления, Ar1 и Ar2 таковы, что коровая структура формулы I-1, 
без указания необязательных заместителей, может быть любой из следующих:
,
где L2-W может быть присоединен либо к левому, либо к правому кольцу, где L и L’ определены в настоящем документе, и подходящие заместители для колец описаны в настоящем документе.
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы I может иметь формулу I-2:
,
где:
m имеет значение 0, 1, 2, или 3,
R10 в каждом случае независимо представляет собой галоген, L2’-W’, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или два смежных R10, или один R10 и L или L’, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное циклоалкильное, гетероциклильное, арильное или гетероарильное кольцо;
где -L2’-W’ в каждом случае выбирается независимо; и
L2’, в каждом случае независимо, отсутствует, представляет собой необязательно замещенный C1-6 алкилен, необязательно замещенный C1-6 гетероалкилен, необязательно замещенный C2-6 алкенилен, необязательно замещенный C2-6 алкинилен, необязательно замещенный C3-6 циклоалкилен, необязательно замещенный арилен, необязательно замещенный гетероарилен, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклилен; и W’ в каждом случае независимо представляет собой -OR1; -COR2; -COOR1a; -OCOOR1a; -NR3R4; -CONR3aR4a; -OCONR3bR4b; -SO2NR3cR4c; -OSO2NR3dR4d; -SR5; -SO2R5a; -OCOR2a; -OSO2R5a или 
, где R1, R1a, R2, R2a, R2b, R3, R4, R3a, R3b, R3c, R3d, R3e, R4a, R4b, R4c, R4d, R4e, R5, R5a и R5b определены в настоящем документе, см., например, формулу I.
Следует отметить, что каждый пример структурной единицы -L2’-W’ и -L2-W выбирают независимо и могут быть одинаковыми или разными.
В некоторых вариантах осуществления, Cy1 в формуле I-2 представляет собой необязательно замещенное фенильное кольцо, необязательно замещенное тиенильное кольцо, необязательно замещенное фуранильное кольцо, необязательно замещенное пиридильное кольцо или необязательно замещенное пиримидинильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления, Cy1 в формуле I-2 представляет собой необязательно замещенное C3-6 циклоалкильное кольцо или необязательно замещенное 4-7 гетероциклическое кольцо с 1 или 2 кольцевыми гетероатомами, независимо выбранными из N, O и S.
В некоторых вариантах осуществления, Cy1 является таким, что коровая структура формулы I-2 может быть любой из следующих:
, где -L2-W присоединен к правому фенильному кольцу, L и L’ определены в настоящем документе и подходящие заместители для колец описаны в настоящем документе.
В более предпочтительных вариантах осуществления, как Cy1, так и Cy2 в формуле I представляют собой фенильные кольца. Например, в некоторых вариантах осуществления соединение формулы I-2 может иметь формулу I-3:
где: L, L’, L2, W, R10 и m определены в настоящем документе, см., например, формулу I-2,
n имеет значение 0, 1, 2, или 3,
R11 в каждом случае независимо представляет собой галоген, -L2’-W’, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или два смежных R11, или один R11 и L или L’, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное циклоалкильное, гетероциклильное, арильное или гетероарильное кольцо; где L2’ и W’ определены в настоящем документе, см., например, для формулы I-2, и -L2’-W’ в каждом случае выбирается независимо.
L и L’ в формуле I (например, любая из формул I-1 - I-3) могут независимо отсутствовать или быть линкерами. В некоторых вариантах осуществления, L и L’ в формуле I, каждый независимо, отсутствуют, представляют собой -C(O)-, необязательно замещенный C1-4 алкилен, необязательно замещенный C2-4 алкенилен, -O-, -S-, -NR100-, -S(O)-, -SO2-, -X1-G1-, -X2-G2-X2a- или -CR101R102-,
где:
X1, X2, и X2a независимо представляют собой необязательно замещенный C1-4 алкилен, необязательно замещенный C2-4 алкенилен, -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-;
G1 и G2 независимо представляют собой необязательно замещенный C1-4 алкилен, необязательно замещенный C2-4 алкенилен, -C(O)-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-;
предпочтительно, в некоторых вариантах осуществления, -X1-G1- или -X2-G2-X2a- не содержит связь O-N, S-S, S-N (кроме SO2-N), или -C(O)-S;
R100 и R100a каждый независимо представляют собой неподеленную пару (для данного случая), водород, COR2c, -SO2R5c, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или R100 или R100a образует необязательно замещенное гетероциклическое или гетероарильное кольцо с группой R10 или R11;
R101, R101a, R102 и R102a, когда присутствуют, каждый независимо представляет собой водород, -OH, галоген, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенную аминогруппу, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил, или R101 и R102, или R101a и R102a, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное 3-7-членное циклоалкильное или гетероциклильное кольцо; или один из R101 и R102, или один из R101a и R102a образует необязательно замещенное циклоалкильное или гетероциклильное кольцо вместе с группой R10 или R11; и
R2c и R5c каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил.
Когда линкер L или L’ образует двойную связь с одним из атомов углерода в кольце, это не может быть CR101R102, в котором присутствуют как R101, так и R102, поскольку валентность углерода будет превышать 4. В таких случаях следует понимать, что один из R101 и R102 отсутствует, и L или L’ представляют собой CR101 или CR102, как определено в настоящем документе. Когда L или L’ образует двойную связь с одним из атомов углерода кольца, это может быть NR100, с R100 обычно являются неподеленной парой. Аналогичным образом следует понимать и другие подобные ситуации в настоящем раскрытии.
В некоторых вариантах осуществления, L и L’ в формуле I, каждый независимо, отсутствуют, представляют собой -O-, -C(O)-, -S-, -NR100-, -S(O)-, -SO2- или -CR101R102-. В некоторых вариантах осуществления соединение Формулы I имеет формулу согласно любой из I-4 - I-5:
и 
,
где:
X3, X4 и X5, каждый независимо, отсутствуют, представляют собой -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-; и
R10, R11, R100a, R101a, R102a, W, L2, m и n определены в настоящем документе.
В некоторых вариантах осуществления соединение имеет формулу I-4, где X3 и X4, каждый независимо, представляют собой -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a- или -SO2-. В некоторых вариантах осуществления соединение имеет формулу I-5, где X5 представляет собой -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a- или -SO2-. В некоторых вариантах осуществления R100a представляет собой водород или необязательно замещенный C1-4 алкил.
L2 в формуле I (например, любая из подформул, описанных в настоящем документе, таких как формула I-1 - I-5) обычно отсутствует, то есть группа W непосредственно присоединена к Cy2. В некоторых вариантах осуществления, L2 в формуле I также может представлять собой C1-4 алкилен, C2-4 алкенилен, C2-4 алкинилен или C1-4 гетероалкилен. Например, группа W может быть присоединена к Cy2 через метиленовую или винильную группу.
Различные группы W подходят для соединений формулы I (например, любая из подформул, описанных в настоящем документе, таких как формула I-1 - I-5). В предпочтительных вариантах осуществления, группа W в каждом случае независимо представляет собой -OH, -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(C1-4 алкил), -SO2NH(C1-4 алканоил), -COOH, 
, -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил), -OC(O)NH2, -OC(O)NH(C1-4 алкил)-, -O-(CO)-(C1-4 алкил), -O-(C1-4 алкил), где каждый из C1-4 алкила независимо необязательно замещен 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2, и фтора. В некоторых вариантах осуществления, W в формуле I представляет собой -OH, -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(Ацетил), -COOH, 
или -O-C(O)-CH3.
Как описано в настоящем документе, L2’-W’ в некоторых вариантах осуществления может быть выбран в качестве заместителя для Cy1 или Cy2, например, для Ar1 или Ar2. Когда это применимо, L2’ в формуле I, включая любую из подформул, описанных в настоящем документе, такую как формула I-1 - I-5, в каждом случае может независимо отсутствовать, т.е. группа W’ непосредственно присоединена к Cy1 или Cy2, такой как Ar1 или Ar2, когда применимо, или может быть C1-4 алкиленом, C2-4 алкениленом, C2-4 алкиниленом или C1-4 гетероалкиленом. Например, группа W’ может быть присоединена к Cy1 или Cy2, например, для Ar1 или Ar2, когда применимо, через метиленовую или винильную группу. Когда это применимо, W’ в формуле I, включая любую из подформул, описанных в настоящем документе, такую как формула I-1 - I-5, в каждом случае может независимо представлять собой -OH, -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(C1-4 алкил), -SO2NH(C1-4 алканоил), -COOH, 
, -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил), -OC(O)NH2, -OC(O)NH(C1-4 алкил)-, -O-(CO)-(C1-4 алкил), -O-(C1-4 алкил), где каждый из C1-4 алкила независимо необязательно замещен 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2, и фтора. В некоторых вариантах осуществления, в каждом случае W’ в формуле I, когда применимо, может представлять собой -OH, -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(Ацетил), -COOH, 
или -O-C(O)-CH3.
Различные группы могут подходить для R10 и R11 в любой из применимых формул I (например, любая из подформул, описанных в настоящем документе, таких как формула I-2 - I-5, когда применимо). В некоторых вариантах осуществления, каждый из R10 и R11 в каждом случае может независимо представлять собой F; Cl; -OH; -NH2; -SO2NH2; -SO2NH(C1-4 алкил); -SO2NH(C1-4 алканоил); -COOH; 
; -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил), -OC(O)NH2; -OC(O)NH(C1-4 алкил)-; -O-(CO)-(C1-4 алкил); C1-4 алкил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2, и фтора; C2-6 алкенил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2, и фтора; C2-6 алкинил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2, и фтора; C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила и фтора; C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила и фтора; или C1-4 алкокси, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2, и фтора. В некоторых вариантах осуществления, каждый из R10 и R11 в каждом случае может независимо представлять собой -OH; -NH2; -SO2NH2; -SO2NH(C1-4 алкил); -SO2NH(C1-4 алканоил); -COOH; 
; -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил), -OC(O)NH2; -OC(O)NH(C1-4 алкил)-; -O-(CO)-(C1-4 алкил); C1-4 алкил; или C1-4 алкокси. В некоторых вариантах осуществления, один или несколько R10 и/или один или несколько R11 могут быть независимо выбранными L2’-W’, как описано в настоящем документе.
Обычно m, когда применимо, имеет значение 0, 1 или 2; предпочтительно, 1.
Обычно, n, когда применимо, имеет значение 0, 1, 2 или 3; предпочтительно, 1 или 2.
В некоторых вариантах осуществления соединения в настоящем документе могут быть охарактеризованы формулой II или его фармацевтически приемлемой солью или сложным эфиром:
,
где:
Cy10 и Cy11 каждый независимо представляют собой необязательно замещенное циклоалкильное кольцо (например, C3-7 циклоалкильное кольцо), необязательно замещенное гетероциклическое кольцо (например, 4-7-членное гетероциклическое кольцо), необязательно замещенное арильное кольцо (например, C6-10 арильное кольцо), необязательно замещенное гетероарильное кольцо (например, 5-10-членное гетероарильное кольцо), или необязательно замещенную кольцевую структуру, содержащую циклоалкильное кольцо или гетероциклическое кольцо, и арильное или гетероарильное кольцо, где кольцевая структура может быть конденсированным кольцом или иным образом связанной;
L10 отсутствует или представляет собой линкер;
L11 отсутствует, представляет собой необязательно замещенный C1-6 алкилен, необязательно замещенный C1-6 гетероалкилен, необязательно замещенный C2-6 алкенилен, необязательно замещенный C2-6 алкинилен, необязательно замещенный C3-6 циклоалкилен, необязательно замещенный арилен, необязательно замещенный гетероарилен или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклилен,
W10 представляет собой -OR1; -COOR1a; -OCOOR1a; -COR2; -NR3R4; -CONR3aR4a; -OCONR3bR4b; -SO2NR3cR4c; -OSO2NR3dR4d; -SR5; -SO2R5a; -OCOR2a; -OSO2R5a; или 
;
где:
R1 и R1a каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный алкил, необязательно замещенный алкенил, необязательно замещенный алкинил, необязательно замещенный циклоалкил, необязательно замещенный арил, необязательно замещенный гетероарил или необязательно замещенный гетероциклил;
R3 и R4 каждый независимо представляет собой водород, -COR2b, -SO2R5b, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил, или R3 и R4 вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил;
R2, R2a, R2b, R5, R5a и R5b каждый независимо представляет собой водород, -OH, -NR3eR4e, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; и
R3a, R3b, R3c, R3d, R3e, R4a, R4b, R4c, R4d и R4e каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или R3a и R4a, R3b и R4b, R3c и R4c, R3d и R4d, или R3e и R4e, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил.
В некоторых вариантах осуществления, в формуле II, по меньшей мере один из Cy10 и Cy11 представляет собой необязательно замещенное C6-10 арильное кольцо, или необязательно замещенное 5-10-членное гетероарильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления, Cy11 представляет собой необязательно замещенное C6-10 арильное кольцо, или необязательно замещенное 5-10-членное гетероарильное кольцо. Когда Cy11 представляет собой бициклическое или полициклическое арильное или гетероарильное кольцо, L10-Cy10 и L11-W10 могут быть независимо связаны с Cy11 через любое из колец. В некоторых вариантах осуществления, Cy11 может иметь конденсированную кольцевую структуру, включающую арильное или гетероарильное кольцо и циклоалкильную или гетероциклическую кольцевую структуру. В таких вариантах осуществления, Cy11 может быть связан с L10-Cy10 и L11-W10 через арильное или гетероарильное кольцо и циклоалкильную или гетероциклическую кольцевую структуру; или, альтернативно, один из L10-Cy10 и L11-W10 связан с Cy11 через арильное или гетероарильное кольцо, и другой из L10-Cy10 и L11-W10 связан с Cy11 через циклоалкильную или гетероциклическую кольцевую структуру.
В некоторых вариантах осуществления, соединение формулы II имеет по меньшей мере одно фенильное кольцо, которое может иметь следующую коровую структуру, как Cy10-L10-Cy11:
где Cy10 может быть левым кольцом или правым кольцом на приведенных выше чертежах, т.е. чертежи не ограничиваются конкретным направление, где L11-W10 может соединяться либо с левым, либо с правым кольцом, оба из которых могут быть необязательно замещены.
В некоторых вариантах осуществления, соединение формулы II может иметь следующую коровую структуру как Cy10-L10-Cy11:
где Cy10 может быть левым кольцом или правым кольцом на приведенных выше чертежах, т.е. чертежи не ограничиваются конкретным направление, где L11-W10 может соединяться либо с левым, либо с правым кольцом, оба из которых могут быть необязательно замещены.
В некоторых вариантах осуществления, как Cy10, так и Cy11 в формуле II представляют собой арильное или гетероарильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы II имеет формулу II-1:
,
где Ar10 и Ar11 каждый независимо представляют собой необязательно замещенное C6-10 арильное кольцо, или необязательно замещенное 5-10-членное гетероарильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления, Ar10 и Ar11 в формуле II-1, каждый, независимо представляют собой необязательно замещенное фенильное кольцо или необязательно замещенное 5- или 6-членное гетероарильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления, Ar10 и Ar11 в формуле II-1, каждый, независимо представляют собой необязательно замещенное фенильное кольцо, необязательно замещенное тиенильное кольцо, необязательно замещенное фуранильное кольцо, необязательно замещенное пиридильное кольцо или необязательно замещенное пиримидинильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления, один из Ar10 и Ar11 в формуле II-1 представляет собой бициклическое арильное или бициклическое гетероарильное кольцо, каждое из которых необязательно замещено, например, в некоторых вариантах осуществления, Ar11 может быть необязательно замещенным бициклическим арильным или бициклическим гетероарильным кольцом.
В некоторых вариантах осуществления, Cy11 в формуле II представляет собой фенильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы II имеет формулу II-2:
,
где Ar10, L10, L11 и W10 определены в настоящем документе, см., например, формулу II-1,
m имеет значение 0, 1, 2 или 3,
R20 в каждом случае независимо представляет собой галоген, -L11’-W10’, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или два смежных R20, или один R20 и L10 или L11, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное циклоалкильное, гетероциклильное, арильное или гетероарильное кольцо;
где -L11’-W10’ в каждом случае выбирается независимо;
где L11’, в каждом случае независимо, отсутствует, представляет собой необязательно замещенный C1-6 алкилен, необязательно замещенный C1-6 гетероалкилен, необязательно замещенный C2-6 алкенилен, необязательно замещенный C2-6 алкинилен, необязательно замещенный C3-6 циклоалкилен, необязательно замещенный арилен, необязательно замещенный гетероарилен или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклилен; и W10’ в каждом случае независимо представляет собой -OR1; -COR2; -COOR1a; -OCOOR1a; -NR3R4; -CONR3aR4a; -OCONR3bR4b; -SO2NR3cR4c; -OSO2NR3dR4d; -SR5; -SO2R5a; -OCOR2a; -OSO2R5a или 
, где R1, R1a, R2, R2a, R2b, R3, R4, R3a, R3b, R3c, R3d, R3e, R4a, R4b, R4c, R4d, R4e, R5, R5a и R5b определены в настоящем документе, см., например, формулу II. Следует отметить, что каждый пример структурной единицы -L11’-W10’ и -L11-W10 выбирают независимо и могут быть одинаковыми или разными.
В некоторых вариантах осуществления, Cy11 в формуле II представляет собой бензоконденсированное кольцо. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы II имеет формулу II-3:
,
где Ar10, L10, L11 и W10 определены в настоящем документе, см., например, формулу II-1,
m имеет значение 0, 1, 2, или 3,
R20 в каждом случае независимо представляет собой галоген, -L11’-W10’, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или два смежных R20, или один R20 и L10 или L11, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное циклоалкильное, гетероциклильное, арильное или гетероарильное кольцо;
где L11’ и W10’ определены в настоящем документе, см., например, формулу II-2, и -L11’-W10’ в каждом случае выбирается независимо; и
кольцо B представляет собой 4-7-членное циклоалкильное кольцо, 4-7-членное гетероциклическое кольцо, фенильное кольцо, 5- или 6-членное гетероарильное кольцо, каждое из которых необязательно замещено.
В некоторых вариантах осуществления, Cy11 в формуле II представляет собой бензоконденсированное бициклическое арильное или гетероарильное кольцо. Например, в некоторых вариантах осуществления, Cy11 в формуле II может иметь следующую коровую структуру:
где L10-Cy10 и L11-W10 могут быть независимо связаны с Cy11 через любое из двух колец, где фенильное кольцо может быть необязательно замещено 1-3 группами R20, определенными в настоящем документе. Например, в случае бензотиофенового кольца, в некоторых вариантах осуществления, L10-Cy10 может быть присоединен к тиофеновому кольцу, тогда как L11-W10 может быть присоединен к фенильному кольцу или наоборот, и в некоторых случаях и L10-Cy10 и L11-W10 могут быть присоединены к тому же кольцу, например к фенильному кольцу.
В некоторых вариантах осуществления, соединение формулы II может иметь структуру любую из следующих:
где: Cy10, L10, R20, m, R21, n, R100a, L11 и W10 определены в настоящем документе, см., например, формулу II и подформулы в настоящем документе, такие как формула II-3. В некоторых вариантах осуществления, Cy10 представляет собой Ar10, как определено для формулы II-3.
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы II-3 может иметь формулу II-4:
,
где: Ar10, L10, R20, m, L11 и W10 определены в настоящем документе, см., например, формулу II-3,
n имеет значение 0 или 1,
R21 в каждом случае независимо представляет собой галоген, оксо, -L11’-W10’, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; где L11’ и W10’ определены в настоящем документе, см., например, формулу II-2, и -L11’-W10’ в каждом случае выбирается независимо;
X10 и X11, каждый независимо, отсутствуют, представляют собой -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-, в зависимости от валентности;
где R100a представляет собой неподеленную пару (когда применимо), водород, COR2c, -SO2R5c, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или R100a образует необязательно замещенное гетероциклическое или гетероарильное кольцо с группой R20 или R21;
R101a и R102a, когда присутствуют, каждый независимо представляет собой водород, -OH, галоген; необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенную аминогруппу, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или R101a и R102a, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное 3-7-членное циклоалкильное или гетероциклильное кольцо; или один из R101a и R102a образует необязательно замещенное циклоалкильное или гетероциклильное кольцо вместе с группой R20 или R21; и
R2c и R5c каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил;
или R20, или R21 и L10, X10 или X11, вместе с атомами, которые они связаны, образуют необязательно замещенное циклоалкильное, гетероциклильное, арильное или гетероарильное кольцо.
Когда X10 или X11 образует двойную связь с одним из атомов углерода в кольце, это не может быть CR101aR102a, в котором присутствуют как R101a, так и R102a, поскольку валентность углерода будет превышать 4. В таких случаях следует понимать, что один из R101a и R102a отсутствует, и X10 или X11 представляют собой CR101a или CR102a, как определено в настоящем документе. Когда X10 или X11 образует двойную связь с одним из атомов углерода кольца, это может быть NR100a с R100a обычно является неподеленной парой.
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы II имеет формулу II-5:
,
где: Ar10, L10, R20, m, R21, n, L11 и W10 определены в настоящем документе, см., например, формулу II-4.
Cy10 и Cy11 в формуле II (например, подформулы, описанные в настоящем документе, такие как формулы II-1 - II-4) могут быть связаны напрямую или через различные группы. Например, в некоторых вариантах осуществления, L10 в формуле II (например, формула II-1 - II-5) отсутствует, представляет собой -C(O)-, необязательно замещенный C1-4 алкилен, необязательно замещенный C2-4 алкенилен, необязательно замещенный C3-6 циклоалкилен, необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклилен, необязательно замещенный фенилен, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарилен, -O-, -S-, -NR100-, -S(O)-, -SO2-, -X1-G1-, -X2-G2-X2a-, -X12-G10-, -X13-G11-X13a- или -CR101R102-,
где:
X1, X2, и X2a независимо представляют собой необязательно замещенный C1-4 алкилен, необязательно замещенный C2-4 алкенилен, необязательно замещенный C3-6 циклоалкилен, необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклилен, необязательно замещенный фенилен, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарилен, -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-;
G1 и G2 независимо представляют собой необязательно замещенный C1-4 алкилен, необязательно замещенный C2-4 алкенилен, необязательно замещенный C3-6 циклоалкилен, необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклилен, необязательно замещенный фенилен, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарилен, -C(O)-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-;
предпочтительно, в некоторых вариантах осуществления, -X1-G1- или -X2-G2-X2a- не содержит связи O-N, S-S, S-N (кроме связи SO2-N), или -C(O)-S;
X12, X13 и X13a независимо представляют собой необязательно замещенный C1-4 алкилен, необязательно замещенный C2-4 алкенилен, необязательно замещенный C3-6 циклоалкилен, необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклилен, необязательно замещенный фенилен, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарилен, -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-;
и G10 и G11 независимо представляют собой -X1-G1- или -X2-G2-X2a-;
в некоторых вариантах осуществления, предпочтительно, -X12-G10- или -X13-G11-X13a- не содержит связи O-O, O-N, S-S, S-N (кроме связи SO2-N) или -C(O)-S или трех (или более) последовательных гетероатомов, за исключением O-SO2-O, O-SO2-N и N-SO2-N;
R100 и R100a каждый независимо представляют собой неподеленную пару (для данного случая), водород, COR2c, -SO2R5c, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил;
R101, R101a, R102 и R102a каждый независимо представляет собой водород, -OH, галоген; необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенную аминогруппу, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или R101 и R102, или R101a и R102a, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное 3-7-членное циклоалкильное или гетероциклильное кольцо.
В некоторых вариантах осуществления, L10 в формуле II может отсутствовать, и Cy10 непосредственно связан с Cy11. В некоторых вариантах осуществления, L10 в формуле II может отсутствовать, может представлять собой -O-, -C(O)-, -S-, -NR100-, -S(O)-, -SO2- или -CR101R102-. В некоторых вариантах осуществления, L10 в формуле II может представлять собой -X1-G1- или -X2-G2-X2a-, где: X1, X2, и X2a независимо представляют собой -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-; и G1 и G2 независимо представляют собой -C(O)-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-.
В некоторых вариантах осуществления, L10 в формуле II может представлять собой -X12-G10-. В некоторых вариантах осуществления, X12 представляет собой необязательно замещенный C2-4 алкенилен, предпочтительно, 
, и G10 представляет собой -X1-G1- или -X2-G2-X2a-; где: X1, X2 и X2a независимо представляют собой -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-; и G1 и G2 независимо представляют собой -C(O)-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-.
В некоторых предпочтительных вариантах осуществления, L10 в формуле II может представлять собой 
или 
.
В некоторых вариантах осуществления, соединение формулы II может иметь следующую коровую структуру:
где L11-W10 может быть присоединен к любому из колец, предпочтительно к одному из двух фенильных колец или единственному фенильному кольцу, где каждое из колец может быть необязательно замещено одним или несколькими подходящими заместителями, описанными в настоящем документе, например, каждый заместитель может быть независимо выбран из F; Cl; -OH; -NH2; -SO2NH2; -SO2NH(C1-4 алкил); -SO2NH(C1-4 алканоил); -COOH; 
; -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил), -OC(O)NH2; -OC(O)NH(C1-4 алкил)-; -O-(CO)-(C1-4 алкил); C1-4 алкила, необязательно замещенного 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2, и фтора; C2-6 алкенила, необязательно замещенного 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2, и фтора; C2-6 алкинила, необязательно замещенного 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2, и фтора; C3-6 циклоалкила, необязательно замещенного 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила и фтора; C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенного 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила и фтора; или C1-4 алкокси, необязательно замещенного 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2, и фтора; необязательно замещенного C3-6 циклоалкила; необязательно замещенного 4-10-членного гетероциклила; необязательно замещенного 5-10-членного гетероарила; или необязательно замещенного C6-10 арила. Например, в некоторых вариантах осуществления, L11-W10 представляет собой NH2 или NH(C1-4 алканоил), который связан с одним из двух фенильных колец или единственным фенильным кольцом, тогда как другое кольцо необязательно замещено 1 или 2 заместителями, выбранными из метила и метокси.
В некоторых конкретных вариантах осуществления соединение формулы II имеет формулу в соответствии с формулой II-6 или II-7:
или 
,
где: L11, W10, R20 и m определены в настоящем документе, см., например, формулу II-3,
p имеет значение 0, 1, 2, 3, или 4,
R22 в каждом случае независимо представляет собой галоген, -L11’-W10’, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или два смежных R22 вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное циклоалкильное, гетероциклильное, арильное или гетероарильное кольцо;
где L11’ и W10’ определены в настоящем документе, см., например, формулу II-2, и -L11’-W10’ в каждом случае выбирается независимо.
L11 в формуле II (например, любая из подформул, например, формулы II-1 - II-7) обычно отсутствует, то есть группа W10 непосредственно присоединена к Cy11, когда применимо. В некоторых вариантах осуществления, L11 в формуле II также может представлять собой C1-4 алкилен, C2-4 алкенилен, C2-4 алкинилен или C1-4 гетероалкилен. Например, группа W10 может быть присоединена к Cy11 через метиленовую или винильную группу.
Различные группы W10 подходят для соединений формулы II (например, формула II-1 - II-7). В предпочтительных вариантах осуществления, группа W10 в каждом случае независимо представляет собой -OH, -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(C1-4 алкил); -SO2NH(C1-4 алканоил), -COOH, 
, -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил), -OC(O)NH2, -OC(O)NH(C1-4 алкил)-, -O-(CO)-(C1-4 алкил), -O-(C1-4 алкил), где каждый из C1-4 алкила независимо необязательно замещен 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2, и фтора. В некоторых вариантах осуществления, группа W10 в формуле II представляет собой -OH, -OMe, -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(Ацетил), -COOH, или -O-C(O)-CH3.
Как описано в настоящем документе, L11’-W10’ в некоторых вариантах осуществления может быть выбран в качестве заместителя для Cy10 или Cy11, например, для Ar10 или Ar11. Когда это применимо, L11’ в формуле II, включая любую из подформул, описанных в настоящем документе, такую как формулы II-1 - I-7, в каждом случае может независимо отсутствовать, т.е. группа W10’ непосредственно присоединена к Cy10 или Cy11, такой как Ar10 или Ar11, когда применимо, или может представлять собой C1-4 алкилен, C2-4 алкенилен, C2-4 алкинилен или C1-4 гетероалкилен. Например, группа W10’ может быть присоединена к Cy10 или Cy11, например, для Ar10 или Ar11, когда применимо, через метиленовую или винильную группу. Когда это применимо, W10’ в формуле II, включая любую из подформул, описанных в настоящем документе, такую как формула II-1 - II-7, в каждом случае может независимо представлять собой -OH, -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(C1-4 алкил), -SO2NH(C1-4 алканоил), -COOH, 
, -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил), -OC(O)NH2, -OC(O)NH(C1-4 алкил)-, -O-(CO)-(C1-4 алкил), -O-(C1-4 алкил), где каждый из C1-4 алкила независимо необязательно замещен 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2, и фтора. В некоторых вариантах осуществления, в каждом случае W10’ в формуле II, когда применимо, может представлять собой -OH, -OMe, -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(Ацетил), -COOH или -O-C(O)-CH3.
Различные группы могут подходить для R20, R21 и R22 в любой из применимых формул II (например, формула II-1 - II-7, когда применимо). В некоторых вариантах осуществления, каждый из R20, R21 и R22 в каждом случае может независимо представлять собой F; Cl; -OH; -NH2; -SO2NH2; -SO2NH(C1-4 алкил); -SO2NH(C1-4 алканоил); -COOH; 
; -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил), -OC(O)NH2; -OC(O)NH(C1-4 алкил)-; -O-(CO)-(C1-4 алкил); C1-4 алкил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора; C2-6 алкенил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора; C2-6 алкинил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора; C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила и фтора; C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила и фтора; или C1-4 алкокси, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора. В некоторых вариантах осуществления, каждый из R20, R21, и R22 в каждом случае может независимо представлять собой F; Cl; -OH; -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(C1-4 алкил), -SO2NH(C1-4 алканоил), -COOH; 
; -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил), -OC(O)NH2; -OC(O)NH(C1-4 алкил)-; -O-(CO)-(C1-4 алкил); -O-(C1-6 алкил); -O-(C2-6 алкенил); C1-6 алкил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-6 алкокси, -OH, -NH2 и фтора; или C2-6 алкенил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-6 алкокси, -OH, -NH2 и фтора. В некоторых вариантах осуществления, каждый из R20, R21 и R22 в каждом случае может независимо представлять собой -OH, C1-4 алкил, C2-6 алкенил или -O-(C1-4 алкил). В некоторых вариантах осуществления, каждый из R20, R21 и R22 в каждом случае может независимо представлять собой -OH, -OMe или 
. В некоторых вариантах осуществления, один или несколько R20, один или несколько R21, и/или один или несколько R22 могут быть независимо выбранными L11’-W10’, как описано в настоящем документе.
Обычно, m и p, когда применимо, имеет значение 0, 1, 2 или 3; предпочтительно, 1 или 2.
Обычно, n, когда применимо, имеет значение 0, 1 или 2; предпочтительно, 0 или 1.
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы II может иметь формулу в соответствии с любой формулой II-8 - II-10:
или
,
где R20, R22, m и p определены в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления m имеет значение 1 или 2, p имеет значение 1, 2 или 3. В некоторых вариантах осуществления, каждый из R20 и R22 в каждом случае независимо представляет собой F; Cl; -OH; -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(C1-4 алкил), -SO2NH(C1-4 алканоил), -COOH; 
; -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил), -OC(O)NH2; -OC(O)NH(C1-4 алкил)-; -O-(CO)-(C1-4 алкил); -O-(C1-6 алкил); -O-(C2-6 алкенил); C1-6 алкил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-6 алкокси, -OH, -NH2 и фтора; или C2-6 алкенил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-6 алкокси, -OH, -NH2 и фтора.
В некоторых вариантах осуществления, структурная единица 
в любой из применимых формул II может быть выбрана из
В некоторых конкретных вариантах осуществления соединение формулы II может представлять собой:
или его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир.
В некоторых вариантах осуществления соединения в настоящем документе могут быть охарактеризованы формулой III или их фармацевтически приемлемой солью или сложным эфиром:
,
где Ar20 представляет собой необязательно замещенное арильное кольцо (например, C6-10 арильное кольцо), или необязательно замещенное гетероарильное кольцо (например, 5-10-членное гетероарильное кольцо);
L20 отсутствует, представляет собой необязательно замещенный C1-6 алкилен, необязательно замещенный C1-6 гетероалкилен, необязательно замещенный C2-6 алкенилен, необязательно замещенный C2-6 алкинилен, необязательно замещенный C3-6 циклоалкилен, необязательно замещенный арилен, необязательно замещенный гетероарилен, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклилен,
W20 представляет собой -OR1; -COR2; -COOR1a; -OCOOR1a; -NR3R4; -CONR3aR4a; -OCONR3bR4b; -SO2NR3cR4c; -OSO2NR3dR4d; -SR5; -SO2R5a; -OCOR2a; -OSO2R5a; или 
,
где:
R1 и R1a каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный алкил, необязательно замещенный алкенил, необязательно замещенный алкинил, необязательно замещенный циклоалкил, необязательно замещенный арил, необязательно замещенный гетероарил или необязательно замещенный гетероциклил;
R3 и R4 каждый независимо представляет собой водород, -COR2b, -SO2R5b, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил, или R3 и R4 вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил;
R2, R2a, R2b, R5, R5a и R5b каждый независимо представляет собой водород, -OH, -NR3eR4e, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; и
R3a, R3b, R3c, R3d, R3e, R4a, R4b, R4c, R4d и R4e каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или R3a и R4a, R3b и R4b, R3c и R4c, R3d и R4d, или R3e и R4e, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил.
В некоторых вариантах осуществления, Ar20 в формуле III представляет собой необязательно замещенное фенильное кольцо или необязательно замещенное 5- или 6-членное гетероарильное кольцо. Например, в некоторых вариантах осуществления, Ar20 в формуле III может представлять собой необязательно замещенно фенильное кольцо, необязательно замещенное тиенильное кольцо, необязательно замещенное фуранильное кольцо, необязательно замещенное пиридильное кольцо, или необязательно замещенное пиримидинильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления, Ar20 в формуле III также может представлять собой необязательно замещенное бициклическое арильное или бициклическое гетероарильное кольцо, каждое из которых необязательно замещено. В таких вариантах осуществления, L20-W20 может быть присоединен к любому из бициклических колец.
В некоторых вариантах осуществления, Ar20 в формуле III может быть необязательно замещенным фенильным кольцом, где два соседних заместителя вместе с атомом углерода, к которому они присоединены, образуют необязательно замещенное циклоалкильное, гетероциклильное, арильное или гетероарильное кольцо.
Например, в некоторых вариантах осуществления, Ar20 в формуле III может представлять собой бензоконденсированное бициклическое арильное или гетероарильное кольцо. Например, в некоторых вариантах осуществления, Ar20 в формуле III может иметь следующую структуру:
где -L20-W20 может быть присоединен к любому из двух колец, где одно или оба кольца могут быть необязательно замещены.
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы III может иметь формулу III-1, III-2 или III-3:
,
где L20 и W20 определены в настоящем документе,
m имеет значение 0, 1, 2, или 3; n имеет значение 0, 1, 2, или 3;
каждый из R30 и R31 в каждом случае независимо представляет собой галоген, -L20’-W20’, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; где -L20’-W20’ в каждом случае выбирается независимо; где L20’, в каждом случае независимо, отсутствует, представляет собой необязательно замещенный C1-6 алкилен, необязательно замещенный C1-6 гетероалкилен, необязательно замещенный C2-6 алкенилен, необязательно замещенный C2-6 алкинилен, необязательно замещенный C3-6 циклоалкилен, необязательно замещенный арилен, необязательно замещенный гетероарилен или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклилен; и W20’ в каждом случае независимо представляет собой -OR1; -COR2; -COOR1a; -OCOOR1a; -NR3R4; -CONR3aR4a; -OCONR3bR4b; -SO2NR3cR4c; -OSO2NR3dR4d; -SR5; -SO2R5a; -OCOR2a; -OSO2R5a или 
, где R1, R1a, R2, R2a, R2b, R3, R4, R3a, R3b, R3c, R3d, R3e, R4a, R4b, R4c, R4d, R4e, R5, R5a и R5b определены в настоящем документе, см., например, формулу III,
кольцо B представляет собой 4-7-членное циклоалкильное кольцо, 4-7-членное гетероциклическое кольцо, фенильное кольцо, 5- или 6-членное гетероарильное кольцо, каждое из которых необязательно замещено 1-3 независимо выбранными R31;
X20 и X21, каждый независимо, отсутствуют, представляют собой, -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-, в зависимости от валентности;
где R100a представляет собой неподеленную пару (когда применимо), водород, COR2c, -SO2R5c, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или R100a и один из R30 или R31, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное гетероциклическое или гетероарильное кольцо, например, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил;
R101a и R102a, когда присутствуют, каждый независимо представляет собой водород, -OH, галоген; необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенную аминогруппу, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил, или R101a и R102a, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное 3-7-членное циклоалкильное или гетероциклильное кольцо; или один из R101a и R102a образует необязательно замещенное циклоалкильное или гетероциклильное кольцо вместе с группой R30 или R31; и
R2c и R5c каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил;
или два смежных R30 или два смежных R31, или R30 или R31 и X20 или X21, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное циклоалкильное, гетероциклильное, арильное или гетероарильное кольцо.
Когда X20 или X21 образует двойную связь с одним из атомов углерода в кольце, это не может быть CR101aR102a, в котором присутствуют как R101a, так и R102a, поскольку валентность углерода будет превышать 4. В таких случаях следует понимать, что один из R101a и R102a отсутствует, и X20 или X21 представляют собой CR101a или CR102a, как определено в настоящем документе. Когда X20 или X21 образует двойную связь с одним из атомов углерода кольца, это может быть NR100a, с R100a обычно является неподеленной парой.
Следует отметить, что каждый пример структурной единицы -L20’-W20’ и -L20-W20 выбирают независимо и могут быть одинаковыми или разными.
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы III может иметь структуру любую из следующих:
где: R30, m, R31, n, R100a, L20 и W20 определены в настоящем документе, см., например, формулу III и подформулы в настоящем документе, такие как формула III-1 - III-3, где для трициклических структур пиперидиновое кольцо или морфолиновое кольцо может быть необязательно замещено.
L20 в формуле III (например, любая из подформул, таких как формула III-1 - III-3) обычно отсутствует, то есть группа W20 непосредственно присоединена к Ar20. В некоторых вариантах осуществления, L20 в формуле III также может представлять собой C1-4 алкилен, C2-4 алкенилен, C2-4 алкинилен или C1-4 гетероалкилен. Например, группа W20 может быть присоединена к Ar20 через метиленовую или винильную группу.
Различные группы W20 подходят для соединений формулы III (например, любая из подформул, таких как формула III-1 - III-3). В предпочтительных вариантах осуществления, W20 в формуле III может представлять собой -OH, -COOH, 
, -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил),-OC(O)NH2, -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(C1-4 алкил); -SO2NH(C1-4 алканоил), -OC(O)NH(C1-4 алкил)-, -O-(CO)-(C1-4 алкил), -O-(C1-4 алкил), где каждый из C1-4 алкила независимо необязательно замещен 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора. В некоторых вариантах осуществления, группа W20 в формуле III (например, любая из подформул, таких как формула III-1 - III-3) представляет собой -OH, -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(Ацетил), 
, -C(O)-(O-C8 алкил), -COOH или -O-C(O)-CH3.
Как описано в настоящем документе, L20’-W20’ в некоторых вариантах осуществления может быть выбран в качестве заместителя для Ar20. Когда это применимо, L20’ в формуле III, включая любую из подформул, описанных в настоящем документе, таких как формула III-1 - III-3, в каждом случае может независимо отсутствовать, т.е., группа W20’ непосредственно присоединена к Ar20, когда применимо, или может представлять собой C1-4 алкилен, C2-4 алкенилен, C2-4 алкинилен или C1-4 гетероалкилен. Например, группа W20’ может быть присоединена к Ar20, когда применимо, через метиленовую или винильную группу. Когда это применимо, W20’ в формуле III, включая любую из подформул, описанных в настоящем документе, таких как формула III-1 - III-3, в каждом случае может независимо представлять собой -OH, -COOH, 
, -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил),-OC(O)NH2, -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(C1-4 алкил); -SO2NH(C1-4 алканоил), -OC(O)NH(C1-4 алкил)-, -O-(CO)-(C1-4 алкил), -O-(C1-4 алкил), где каждый из C1-4 алкила независимо необязательно замещен 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора. В некоторых вариантах осуществления, в каждом случае W20’ в формуле III, когда применимо, может представлять собой -OH, -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(Ацетил), 
, -COOH, -C(O)(O-C8 алкил) или -O-C(O)-CH3.
Различные группы могут подходить для R30 и R31 в любой из применимых формул III (например, любая из подформул, таких как формула III-1 - III-3). В некоторых вариантах осуществления, каждый из R30 и R31 в каждом случае может независимо представлять собой F; Cl; -OH; -COOH; -OC(O)NH2; -OC(O)NH(C1-4 алкил)-; -O-(CO)-(C1-4 алкил); C1-4 алкил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора; C2-6 алкенил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора; C2-6 алкинил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора; C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила и фтора; C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила и фтора; или C1-4 алкокси, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора. В некоторых вариантах осуществления, каждый из R30 и R31 в каждом случае может независимо представлять собой -OH, C2-6 алкенил, -O-(C1-4 алкил), -COOH, или -C(O)(O-C1-10 алкил). В некоторых вариантах осуществления, каждый из R30 и R31 в каждом случае может быть -OH или -OMe. В некоторых вариантах осуществления, один или несколько R30 и/или один или несколько R31 могут быть независимо выбранными L20’-W20’, как описано в настоящем документе.
Обычно, m имеет значение 0, 1, 2, или 3; предпочтительно, 2 или 3. Обычно, n имеет значение 1, 2 или 3.
В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение также предоставляет следующее соединение, 
, его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир.
В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение также предоставляет следующее соединение, 
, его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир, где q имеет значение 1, 2, 3, 4 или 5, и Glu представляет собой остаток глюкозы. В некоторых конкретных вариантах осуществления настоящее изобретение также предоставляет
, его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир.
В некоторых вариантах осуществления, соединения в настоящем описании также могут быть алкалоидами, обладающими антибактериальной активностью. Как показано в настоящем документе, некоторые индольные алкалоиды, такие как алкалоиды барвинка, таберсонин, виндолин, винбластин, винкристин и т.п., эффективны в уничтожении таких микроорганизмов, как B. megaterium. В некоторых вариантах осуществления соединения в настоящем документе характеризуются формулой IV-1 или IV-2, которые представляют собой таберсонин или виндолин и производные:
,
где:
R40 представляет собой водород; -COR2; -COOR1a; -SO2R5a; необязательно замещенный алкил, необязательно замещенный алкенил, необязательно замещенный алкинил, необязательно замещенный циклоалкил, необязательно замещенный арил, необязательно замещенный гетероарил или необязательно замещенный гетероциклил;
R41 представляет собой -OR1; -OCOOR1a; -OCONR3bR4b; -OCOR2a; или -OSO2R5a; n имеет значение 0 или 1;
R42, R43 и R44 каждый независимо представляет собой водород, -OR1, OCOR2a; или -OSO2R5a;
L30 отсутствует или представляет собой метилен,
W30 представляет собой -OR1; -COR2; -COOR1a; -OCOOR1a; -NR3R4; -CONR3aR4a; -OCONR3bR4b; -OSO2NR3dR4d; -OCOR2a; или -OSO2R5a
где:
R1 и R1a каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный алкил, необязательно замещенный алкенил, необязательно замещенный алкинил, необязательно замещенный циклоалкил, необязательно замещенный арил, необязательно замещенный гетероарил или необязательно замещенный гетероциклил;
R3 и R4 каждый независимо представляет собой водород, -COR2b, -SO2R5b, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил, или R3 и R4 вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил;
R2, R2a, R2b, R5, R5a и R5b каждый независимо представляет собой водород, -OH, -NR3eR4e, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; и
R3a, R3b, R3c, R3d, R3e, R4a, R4b, R4c, R4d и R4e каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или R3a и R4a, R3b и R4b, R3c и R4c, R3d и R4d, или R3e и R4e, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил.
В некоторых вариантах осуществления, соединение формулы IV-1 или IV-2 имеет формулу в соответствии с одной из формул IV-3 - IV-6:
,
или 
,
где R45 представляет собой водород или метил.
В некоторых вариантах осуществления, R40 в любой из формул IV-1 - IV-6 может быть водородом, C1-4 алкилом или C1-4 алканоилом.
L30 в формуле IV-1 - IV-6 обычно отсутствует. Однако, в некоторых вариантах осуществления, L30 в формуле IV-1 - IV-6 также может быть CH2.
W30 в формуле IV-1 - IV-6 обычно представляет собой производное карбоновой кислоты, производное амина или производное спирта, которые используются в композициях и способах, описанных в настоящем документе. Встречающийся в природе индольный алкалоид таберсонин содержит группу CO2Me в виде W30, при этом L30 отсутствует. Группа CO2Me может быть преобразована в соответствующую кислоту, амид и т.п. посредством обычных преобразований, или она может быть восстановлена или преобразована в амин посредством перегруппировки, такой как перегруппировка Курциуса. В некоторых вариантах осуществления W30 в формуле IV-1 - IV-6 может представлять собой -OH, -NH2, -OSO2NH2, -COOH, -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил), -OC(O)NH2, -OC(O)NH(C1-4 алкил)-, -O-(CO)-(C1-4 алкил), -O-(C1-4 алкил), где каждый из C1-4 алкила независимо необязательно замещен 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора. В некоторых вариантах осуществления W30 в формуле IV-1 - IV-6 может представлять собой -OH, -NH2, -OSO2NH2, -C(O)-(O-C8 алкил), -COOH, или -OC(O)NH2.
В некоторых конкретных вариантах осуществления соединение может иметь следующую структуру:
.
В некоторых вариантах осуществления соединения в настоящем документе также могут быть гликозидом, обладающим антибактериальной активностью, или его фармацевтически приемлемой солью или сложным эфиром. Как показано в настоящем документе, некоторые гликозиды, такие как гинзенозиды и гликозиды галловой кислоты, показывают эффективность в уничтожении микроорганизмов, таких как B. megaterium. Другие полезные гликозиды включают любые из тех, которые известны в данной области как обладающие антибактериальной активностью, которые могут, например, включать гликозиды, характеризующиеся тем, что соответствующий аглион представляет собой фенольное соединение, флавоноид, кумарин, бензойную кислоту или стерол. Обычно гликозид представляет собой глюкозид, хотя другие гликозиды также могут быть полезны. В некоторых вариантах осуществления, гликозиды можно охарактеризовать как амфифильные, которые могут разрушать биологические мембраны и придавать антимикробную активность гликозидам. В некоторых вариантах осуществления, гликозиды также можно охарактеризовать как сапонин, который, например, включает различные гликозиды растительного происхождения, которые могут действовать как «поверхностно-активные вещества» и могут помочь в уничтожении бактерий.
В некоторых вариантах осуществления, гликозиды в настоящем описании могут быть охарактеризованы формулой V:
где каждый R50 независимо представляет собой водород, -L50-D, кислород-защитную группу или остаток сахара;
L50 отсутствует или представляет собой -C(O)-;
D представляет собой необязательно замещенный арил (например, C6-10 арил), необязательно замещенный гетероарил (например, 5-14-членный гетероарил), необязательно замещенное конденсированное кольцо, содержащее два или более колец, независимо выбранных из арила, гетероарила, циклоалкила и гетероциклила (например, 8-14-членный (например, бензоконденсированный циклоалкил/гетероциклил, пиридоконденсированный циклоалкил/гетероциклил) или стероидный остаток, имеющий формулу V-A:
;
где 
может соединяться с формулой V-A через стероидный каркас или любую группу (группы) R51, в зависимости от валентности,
где R51 в каждом случае независимо представляет собой необязательно замещенный алкил, необязательно замещенный алкенил, необязательно замещенный алкинил, -OH, необязательно замещенный кислород-защитной группой, оксо, галоген, необязательно замещенный циклоалкил, необязательно замещенный алкокси, необязательно замещенный циклоалкокси, необязательно замещенную аминогруппу, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный гетероарил или необязательно замещенный гетероциклил, или две группы R51 вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное циклоалкильное, гетероциклильное, арильное или гетероарильное кольцо;
m представляет собой целое число от 1 до 8; и
где -L50-D в каждом случае выбирается независимо.
В некоторых вариантах осуществления, каждый R50 представляет собой водород.
В некоторых вариантах осуществления, от одного до четырех R50 могут представлять собой -L50-D, которые выбираются независимо. Когда два или более звена -L50-D связаны со звеном пиранозы в формуле V, они предпочтительно являются одинаковыми. В некоторых вариантах осуществления, один или несколько (например, 1 или 2) R50 могут быть остатком сахара, который соединяется с остатком формулы V через гликозидную связь. В некоторых вариантах осуществления, остаток сахара представляет собой остаток глюкозы или остаток рамнозы.
L50 в формуле V может отсутствовать или представлять собой карбонильную группу, -C(O)-, в зависимости от того, является ли связывающая группа фенольной -OH или COOH-группой из бензойной кислоты или гетерарильного аналога.
Различные остатки могут быть использованы в качестве D, который обычно является остатком фенольного соединения, кумарина, флавоноида или стерола, которые в некоторых вариантах осуществления могут обладать антибактериальной активностью без гликозидной единицы.
В некоторых вариантах осуществления, D может представлять собой необязательно замещенное кольцо, выбранное из:
где
R100a представляет собой неподеленную пару (когда применимо), водород, азотзащитную группу, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или R100a образует необязательно замещенное гетероциклическое или гетероарильное кольцо с фенильным или пиридильным кольцом;
где 
может соединяться с D через любое из доступных положений, и
каждая из кольцевых систем D необязательно замещена 1-5 (например, 1, 2 или 3) заместителями, каждый независимо выбран из -OH; -COOH; -C(O)(O-C1-10 алкил); -C(O)(O-C2-10 алкенил); -OC(O)NH2; -OC(O)NH(C1-4 алкил)-; -O-(CO)-(C1-4 алкил); -NH2; -SO2NH2; -SO2NH(C1-4 алкил); -SO2NH(C1-4 алканоил); галогена; необязательно замещенного C1-6 алкила; необязательно замещенного C2-6 алкенила; необязательно замещенного C2-6 алкинила; необязательно замещенного C3-6 циклоалкила; необязательно замещенного C1-6 алкокси; необязательно замещенного C3-6 циклоалкокси; необязательно замещенной аминогруппы; необязательно замещенного фенила; необязательно замещенного 5- или 6-членного гетероарила; или необязательно замещенного 4-7-членного гетероциклила.
В некоторых вариантах осуществления, каждая из кольцевых систем D, как показано выше, может быть необязательно замещена 1-5 заместителями, каждый независимо выбран из F; Cl; -OH; -COOH; -C(O)(O-C1-10 алкил); -C(O)(O-C2-10 алкенил); -OC(O)NH2; -OC(O)NH(C1-4 алкил)-; -O-(CO)-(C1-4 алкил); -NH2; -SO2NH2; -SO2NH(C1-4 алкил); -SO2NH(C1-4 алканоил); C1-4 алкила, необязательно замещенного 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила; C1-4 алкокси, -OH, -NH2, и фтора; C2-6 алкенила, необязательно замещенного 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора; C2-6 алкинила, необязательно замещенного 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора; C3-6 циклоалкила, необязательно замещенного 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила и фтора; C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенного 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила и фтора; или C1-4 алкокси, необязательно замещенного 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора.
В некоторых вариантах осуществления, D можно выбрать из:
,
где каждая фенольная группа ОН необязательно связана с сахаром (например, глюкозой) через гликозидную связь.
В некоторых вариантах осуществления D получен из стерола. Например, в некоторых вариантах осуществления D представляет собой
,
где R52 представляет собой необязательно замещенный алкил или необязательно замещенный алкенил,
где каждая из оставшихся -ОН-групп в D необязательно связана с сахаром через гликозидную связь.
Предпочтительно, R52 может представлять собой 
.
В любом из вариантов осуществления, описанных выше, гликозид может иметь формулу V-1 или V-2:
или 
.
В некоторых вариантах осуществления гликозид может быть соединением, выбранным из:
и 
В некоторых вариантах осуществления соединения в настоящем документе могут быть любым одним или несколькими соединениями, выбранными из бензоидной кислоты, бензилового спирта, кумаринов, катехолов, полифенолов, халконоидов (включая ликохалконы) и т.п., стильбенов, таких как ресвератрол, изоресвератрол и т.п., фенольных кислот, таких как п-гидроксбензойная кислота, 2,4-дигидроксбензоидная кислота, протокатеховая кислота, галловая кислота, ванилиновая кислота, сиреневая кислота, коричная кислота, кумаровые кислоты, кофейная кислота, феруловая кислота, хлорогеновая кислота, синапиеновые кислоты и т.п., флавоноиды, такие как катехин, наригенин, кверцетин, рутин, хризин и т.п., таннины, такие как эллаговая кислота, и их фармацевтически приемлемые соли или сложные эфиры и их гликозиды.
В некоторых вариантах осуществления, соединения в настоящем документе могут быть одним или несколькими из соединений 1-8 или его фармацевтически приемлемой солью или сложным эфиром.
Соединения, описанные в настоящем документе, обычно могут быть выделены из природного источника или, альтернативно, могут быть получены обычным химическим синтезом. Например, каждое из соединений 1-8 является коммерчески доступным и было идентифицировано как компонент в растении. Если не указано иное, в любом из вариантов осуществления, описанных в настоящем документе, соединения могут быть получены из синтетического источника. Если не указано иное, в любом из вариантов осуществления, описанных в данном документе, соединения могут существовать в выделенной форме или по существу в чистой форме. Следует понимать, что термин «выделенная форма» относится к соединению, которое было выделено и/или обогащено из его источников, таких как синтетическая реакционная смесь или природные источники. Обычно такие выделенные соединения также являются по существу чистыми, например, с чистотой более 80%, 85%, 90%, 95% или более по массе. Также следует понимать, что композиция, такая как фармацевтическая композиция, содержащая соединение в выделенной или практически чистой форме, означает, что соединение было выделено или очищено, т.е. в выделенной или практически чистой форме, перед смешиванием с другими ингредиентами композиции. Преобразования синтетической химии и методики работы с защитными группами (защита и снятие защиты), используемые при синтезе применимых соединений, известны в данной области и включают, например, описанные в R. Larock, Comprehensive Organic Transformations, VCH Publishers (1989); T.W. Greene and P.G.M. Wuts, Protective Groups in Organic Synthesis, 3rd Ed., John Wiley and Sons (1999); L. Fieser and M. Fieser, Fieser and Fieser’s Reagents for Organic Synthesis, John Wiley and Sons (1994); and L. Paquette, ed., Encyclopedia of Reagents for Organic Synthesis, John Wiley and Sons (1995) и их последующих изданиях.
Фармацевтические композиции
Некоторые варианты осуществления относятся к фармацевтической композиции, включающей одно или несколько соединений по настоящему изобретению и, необязательно, фармацевтически приемлемый эксципиент. В некоторых вариантах осуществления, фармацевтическая композиция включает соединение по настоящему изобретению и фармацевтически приемлемый эксципиент. Фармацевтически приемлемые эксципиенты известны в данной области. Неограничивающие подходящие эксципиенты включают, например, инкапсулирующие вещества или добавки, такие как ускорители абсорбции, антиоксиданты, связующие, буферы, носители, покрывающие агенты, красители, разбавители, дезинтегрирующие агенты, эмульгаторы, экстендеры, наполнители, ароматизаторы, увлажнители, смазывающие вещества, отдушки, консерванты, пропелленты, разделительные агенты, стерилизующие агенты, подсластители, солюбилизаторы, смачивающие агенты и их смеси. См. также Remington's The Science and Practice of Pharmacy, 21st Edition, A. R. Gennaro (Lippincott, Williams & Wilkins, Baltimore, Md., 2005; включенный в настоящее описание в качестве ссылки), в котором описаны различные эксципиенты, используемые при составлении фармацевтических композиций, и известные методы их получения.
Фармацевтическая композиция может включать любое одно или несколько соединений по настоящему изобретению. Например, в некоторых вариантах осуществления, фармацевтическая композиция включает соединение формулы I, II, III, IV-1, IV-2, V, любые его подформулы или любое одно или несколько соединений 1-8, или его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир. Если не указано иное, в любом из вариантов осуществления, описанных в настоящем документе, фармацевтическая композиция может включать соединение, выбранное из соединений 1-8, или его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир. Если не указано иное, в любом из вариантов осуществления, описанных в настоящем документе, фармацевтическая композиция также может быть свободной или по существу свободной от соединения, выбранного из соединений 1-8, или его фармацевтически приемлемой соли или сложного эфира.
Фармацевтическая композиция может включать различные количества соединений по настоящему изобретению, в зависимости от различных факторов, таких как предполагаемое применение и эффективность соединений. В некоторых вариантах осуществления, фармацевтическая композиция включает терапевтически эффективное количество соединения по настоящему изобретению и фармацевтически приемлемый эксципиент. В некоторых вариантах осуществления, терапевтически эффективное количество соединения по настоящему изобретению может быть количеством, эффективным для лечения AMD (например, влажной AMD, сухой AMD), как описано в настоящем документе, которое может зависеть от реципиента, получающего лечения, стадии и тяжести AMD, композиции, содержащей соединение, времени введения, способа введения, продолжительности лечения, эффективности соединения, скорости его клиренса и вводится ли другой препарат совместно или нет. В некоторых вариантах осуществления, терапевтически эффективное количество соединения по настоящему изобретению может быть количеством, эффективным для уничтожения или ингибирования роста микроорганизма, например, B. megaterium, например, в глазу (например, внутриглазное пространство), крови и/или желудочно-кишечном тракте, таком как кишечник субъекта. В некоторых вариантах осуществления, терапевтически эффективное количество соединения по настоящему изобретению может быть количеством, эффективным для уничтожения или ингибирования роста микроорганизма, например, одного или нескольких, выбранных из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis или Xanthomonas oryzae, например, в глазу (например, внутриглазное пространство), крови и/или желудочно-кишечном тракте, таком как кишечник субъекта. В некоторых вариантах осуществления, терапевтически эффективное количество соединения по настоящему изобретению может быть количеством, эффективным для лечения симптомов мягких друзов, таких как уменьшение поражения мягкими друзами.
В различных вариантах осуществления, фармацевтические композиции, описанные в настоящем документе, являются полезными для лечения AMD и/или для уничтожения или ингибирования роста микроорганизмов, например, B. megaterium. Микроорганизмы в настоящем документе особо не ограничиваются и обычно связаны с микроорганизмами, такими как бактерии, обнаруженные во внутриглазном пространстве в глазу субъекта, более предпочтительно, с микроорганизмами, связанными с AMD, такими как присутствующие в повышенном количестве у пациента, страдающего AMD. Если не указано иное, в любом из вариантов осуществления, описанных в настоящем документе, микроорганизм может включать B. megaterium. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может включать один или несколько организмов, выбранных из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis или Xanthomonas oryzae.
Относительные количества активных ингредиентов, фармацевтически приемлемого эксципиента и/или любых дополнительных ингредиентов в фармацевтической композиции, описанной в настоящем документе, будут варьироваться в зависимости от идентичности, размера и/или состояния субъекта, получающего лечение, и, кроме того, в зависимости от пути введения композиции.
Фармацевтическая композиция, описанная в настоящем документе, может быть получена для доставки любым из известных путей доставки, которые включают, но не ограничиваются ими, пероральный, инъекционный или инфузионный, местный, внутриглазной, ингаляционный и т.п.
В некоторых вариантах осуществления, фармацевтическая композиция может быть получена для перорального введения. Пероральные лекарственные формы могут быть представлены в виде дискретных единиц, таких как капсулы, пилюли, облатки, лепешки или таблетки, каждая из которых содержит заранее определенное количество активного соединения; в виде порошка или гранул; в виде раствора или суспензии в водной или неводной жидкости; или в виде эмульсии масло-в-воде или вода-в-масле. Эксципиенты для получения композиций для перорального введения являются известными в данной области. Неограничивающие подходящие эксципиенты включают, например, агар, альгиновую кислоту, гидроксид алюминия, бензиловый спирт, бензилбензоат, 1,3-бутиленгликоль, карбомеры, касторовое масло, целлюлозу, ацетат целлюлозы, масло какао, кукурузный крахмал, кукурузное масло, хлопковое масло, кросс-повидон, диглицериды, этанол, этилцеллюлозу, этиллаурат, этилолеат, сложные эфиры жирных кислот, желатин, масло зародышей, глюкозу, глицерин, арахисовое масло, гидроксипропилметилцеллюлозу, изопропанол, изотонический солевой раствор, лактозу, гидроксид магния, стеарат магния, солод, маннит, моноглицериды, оливковое масло, арахисовое масло, соли фосфата калия, картофельный крахмал, повидон, пропиленгликоль, раствор Рингера, сафлоровое масло, кунжутное масло, карбоксиметилцеллюлозу натрия, соли фосфата натрия, лаурилсульфат натрия, сорбитол натрия, соевое масло, стеариновые кислоты, стеарилфумарат, сахарозу, поверхностно-активные вещества, тальк, трагакант, тетрагидрофурфуриловый спирт, триглицериды, воду и их смеси.
В некоторых вариантах осуществления, фармацевтическая композиция получена для инъекции или инфузии, такой как внутривенная инъекция или инфузия, подкожная или внутримышечная инъекция, или внутриглазная, такая как интравитреальная инъекция. Композиции для инъекций/инфузий могут быть, например, водным раствором, суспензией, депо-формой, имплантатом или эмульсией. Эксципиенты для получения лекарственных форм для инъекций/инфузий являются известными в данной области. Неограничивающие подходящие эксципиенты включают, например, 1,3-бутандиол, касторовое масло, кукурузное масло, хлопковое масло, декстрозу, масло зародышей, арахисовое масло, липосомы, олеиновую кислоту, оливковое масло, арахисовое масло, раствор Рингера, сафлоровое масло, кунжутное масло, соевое масло, U.S.P. или изотонический раствор хлорида натрия, воду и их смеси. В некоторых вариантах осуществления, фармацевтическая композиция получена для внутриглазного введения, такого как интравитреальная инъекция.
В некоторых вариантах осуществления, фармацевтическая композиция получена для местного применения. Лекарственные формы для местного применения и эксципиенты для лекарственных форм для местного применения являются хорошо известными в данной области.
Соединения по настоящему изобретению можно использовать в качестве монотерапии, в комбинации друг с другом или в комбинированном лечении. Например, в некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция, описанная в настоящем документе, может дополнительно включать другой антибиотик и/или анти-VEGF препарат. В некоторых вариантах осуществления, такой антибиотик и/или анти-VEGF препарат может быть включен в отдельную лекарственную форму. В некоторых вариантах осуществления, любые коммерчески доступные, например, одобренные FDA, антибиотики и анти-VEGF препараты могут использоваться в комбинации с соединениями и композициями, описанными в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления антибиотик может представлять собой β-лактамный антибиотик, аминогликозидный антибиотик, тетрациклиновый антибиотик, хлорамфениколовый антибиотик, макролидный антибиотик, гликопептидный антибиотик, хинолоновый антибиотик, нитроимидазольный антибиотик, рифамициновый антибиотик, эхинокандиновый антибиотик, полиеновый антибиотик, пиримидиновый антибиотик, аллиламиновый антибиотик или азольный антибиотик, или их комбинацию. Например, в некоторых вариантах осуществления, антибиотики могут включать один или несколько из следующих: β-лактамные антибиотики, включая пенициллины (например, пенициллин V), амоксициллин, ампициллин, бакампициллин, карбенициллин, клоксациллин, диклоксациллин, флуклоксациллин, мезлоциллин, нафциллин, оксациллин, пенициллин G, пиперациллин, пивампициллин, пивмециллинам, тикарциллин, цефалоспорины, такие как цефацетрил, цефадроксил, цефалексин, цефалоглицин, цефалоний, цефалоридин, цефалотин, цефапирин, цефатризин, цефазафлур, цефазедон, цефазолин, цефрадин, цефроксадин, цефтезол, цефаклор, цефамандол, цефметазол, цефоницид, цефотетан, цефокситин, цефпрозил, цефуроксим, цефузонам, цефкапен, цефдалоксим, цефдинир, цефдиторен, цефетамет, цефиксим, цефменоксим, цефодизим, цефотаксим, цефпимизол, цефподоксим, цефтерам, цефтибутен, цефтиофур, цефтиолен, цефтизоксим, цефтриаксон, цефоперазон, цефтазидим, цефклидин, цефепим, цефлупренам, цефоселис, цефозопран, цефпиром, цефкином, цефтобипрол, цефтаролин, цефакломезин, цефалорам, цефапарол, цефканел, цефедролор, цефемпидон, цефетризол, цефивитрил, цефматилен, цефмепидиум, цефовецин, цефоксазол, цефротил, цефсумид, цефурацетим, цефтиоксид, тиенамицины, монобактамы, ингибиторы β-лактамаз, метоксипенициллины, и т.п.; аминогликозидные антибиотики: включая стрептомицин, гентамицин, канамицин (например, канамицин A), тобрамицин, амикацин, неомицин (например, неомицин B, неомицин C, неомицин E), рибомицин, микрономицин, азитромицин, дибекацин, сизомицин, нетилмицин, парамомицин, брамицин, и т.п.; тетрациклиновые антибиотики: включая тетрациклин, окситетрациклин, хлортетрациклин и доксициклин; хлорамфениколовые антибиотики: включая хлорамфеникол, тиамфеникол, и т.п.; макролидные антибиотики: включая эритромицин, лейкомицин, эритромицин без запаха, Ацетилспирамицин, медимицин, джозамицин, азитромицин, кларитромицин, диритромицин, окситромицин, телитромицин, и т.п.; гликопептидные антибиотики: включая ванкомицин, норванкомицин, тейкопланин, и т.п.; хинолоновые антибиотики: включая норфлоксацин, офлоксацин, ципрофлоксацин, пефлоксацин, гатифлоксацин, эноксацина, ломефлоксацина, налидиксовой кислоты, левофлоксацина, моксифлоксацина, безифлоксацин,; нитроимидазольные антибиотики: включая метронидазол, тинидазол, орнидазол, и т.п.; рифамициноидные антибиотики: включая рифампицин; эхинокандиновые антибиотики; полиеновые антибиотики; пиримидиновые антибиотики; аллиламиновые антибиотики; азольные антибиотики; другие антибиотики: фосфомицин, капреомицин, циклосерин, линкомицин, клиндамицин, митомицин, актиномицин D, блеомицин, доксорубицин, изониазид, пиразинамид, циклоспорин, комбинации полимиксина B, такие как полимиксин B/триметоприм, полимиксин B/бацитрацин, полимиксин B/неомицин/грамицидин, и т.п.
В некоторых вариантах осуществления, антибиотик может быть выбран из амикацина, амоксициллина, ампициллина, арсфенамина, азитромицина, азлоциллина, азтреонама, бацитрацина, капреомицина, карбенициллина, цефаклора, цефадроксила, цефалексина, цефалотина, цефамандола, цефазолина, цефдинира, цефдиторена, цефиксима, цефоперазона, цефотаксима, цефокситина, цефподоксима, цефпрозила, цефтазидима, цефтибутена, цефтизоксима, цефтриаксона, цефуроксима, хлорамфеникола, циластатина, кларитромицина, клавуланата, клиндамицина, клофазимина, клоксациллина, колистина, циклосерина, дальфопристина, дапсона, даптомицина, диклоксациллина, диритромицина, дорипенема, доксициклина, эритромицина, этамбутола, этионамида, флуклоксациллина, фосфомицина, фуразолидона, фузидовой кислоты, гентамицина, имипенема, изониазида, канамицина, линкомицина, линезолида, лоракарбефа, мафенида, меропенема, метициллина, метронидазола, мезлоциллина, миноциклина, мупироцина, нафциллина, неомицина, нетилмицина, нитрофурантоина, оксациллина, окситетрациклина, паромомицина, пенициллина G, пенициллина V, пиперациллина, платенсимицина, полимиксина B, пиразинамида, квинупристина, рапамицина, рифабутина, рифампицина, рифампина, рифапентина, рифаксимина, рокситромицина, сульфадиазина серебра, спектиномицина, стрептомицина, сульбактама, сульфацетамида, сульфадиазина, сульфаметизола, сульфаметоксазола, сульфанилимида, сульфасалазина, сульфизоксазола, тазобактама, тейкопланина, телаванцина, телитромицина, темоциллина, тетрациклина, тиамфеникола, тикарциллина, тигециклина, тинидазола, тобрамицина, триметоприма, тролеандомицин ванкомицина, эноксацина, ломефлоксацина, налидиксовой кислоты, ципрофлоксацина, левофлоксацина, гатифлоксацина, моксифлоксацина, офлоксацина, норфлоксацина, цефотетана, цефоницида, цефрадина, цефапирина, цефалотина, цефметазола, цефотаксима, моксалактама, цефепима, цефтаролин фозамила, цефтобипрола, далбаванцина, демеклоциклина, метациклина, эртапенема, фидаксомицина, гелданамицина, гербимицина, позизолида, радезолида, торезолида, оритаванцина, спирамицина, сульфадиметоксина, сульфонамидохризоидина, гемифлоксацин надифлоксацин тровафлоксацин грепафлоксацин спарфлоксацин темафлоксацина, теиксобактина, малацидина, и их комбинаций. Антибиотики могут быть в любой форме, например, в форме или в смеси с их соответствующими фармацевтически приемлемыми солями. Антибиотики могут быть получены и введены в соответствии с известным способом введения и не имеют особых ограничений.
Анти-VEGF препараты обычно включают биологические лекарственные средства, нацеленные на VEGF, такие как ранибизумаб, афлиберцепт, бевацизумаб, конберцепт и т.п.
Метод лечения
Соединения по настоящему изобретению являются полезными в качестве терапевтически активных веществ для лечения и/или профилактики заболеваний или нарушений, которые связаны с инфекциями (например, глазной инфекцией, например, во внутриглазном пространстве), связанными с микроорганизмами, описанными в настоящем документе, такими как Bacillus megaterium. Как показано в разделе «Примеры», репрезентативные соединения по настоящему изобретению демонстрируют сильный эффект в отношении уничтожения или ингибирования репрезентативного микроорганизма, Bacillus megaterium в тесте. Кроме того, примеры показывают, что путем уничтожения или ингибирования Bacillus megaterium in vivo, например, в модели на макаке, описанной в настоящем документе, антибиотики, такие как ванкомицин, были способны уменьшать друзеноидное поражение, индуцированное Bacillus megaterium.
Соответственно, в различных вариантах осуществления, настоящее изобретение также предоставляет способ применения соединений согласно настоящему изобретению или фармацевтических композиций, описанных в настоящем документе, для лечения инфекций, связанных с микроорганизмом, описанным в настоящем документе, таким как Bacillus megaterium, и для лечения или профилактики заболеваний или нарушений, связанных с такими инфекциями, такого как AMD.
Если не указано иное, в любом из вариантов осуществления, описанных в настоящем документе, инфекция может включать глазную инфекцию, например, во внутриглазном пространстве. Если не указано иное, в любом из вариантов осуществления, описанных в настоящем документе, микроорганизм может включать B. megaterium. В некоторых вариантах осуществления, микроорганизм может включать один или несколько организмов, выбранных из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, или Xanthomonas oryzae.
В различных вариантах осуществления, соединения по настоящему изобретению могут быть использованы для уничтожения или ингибирования роста микроорганизмов в настоящем документе, таких как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, соединения по настоящему изобретению можно использовать для лечения или профилактики AMD, такой как сухая или влажная возрастная дегенерация желтого пятна с симптомами друзов, включая твердые друзы, мягкие друзы, смешанные друзы и/или деградированные друзы, например, сухая или влажная возрастная дегенерация желтого пятна с симптомами мягких друз. Соединения по настоящему изобретению можно использовать по отдельности, в комбинации друг с другом или в комбинации с другим антибиотиком и/или анти-VEGF препаратом, например, как описано в настоящем документе.
В некоторых вариантах осуществления, в настоящем изобретение предложен способ уничтожения или ингибирования роста микроорганизма, описанного в данном документе, такого как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, способ включает контактирование микроорганизма с эффективным количеством соединения по настоящему изобретению или фармацевтической композицией, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления, контактирование может происходить in vitro, ex vivo или in vivo.
В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение также предоставляет способ уничтожения или ингибирования роста микроорганизма, описанного в настоящем документе, такого как Bacillus megaterium, у субъекта, нуждающегося в этом. В некоторых вариантах осуществления, способ включает введение субъекту соединения по настоящему изобретению (например, соединения формулы I, II, III, IV-1, IV-2, V, любой его подформулы или любого одного или нескольких соединений 1-8, или его фармацевтически приемлемой соли или сложного эфира. Если не указано иное, в любом из вариантов осуществления, описанных в настоящем документе, способ может включать введение субъекту соединения, выбранного из соединений 1-8, или его фармацевтически приемлемой соли или сложного эфира. Если не указано иное, в любом из вариантов осуществления, описанных в настоящем документе, способ также может включать введение субъекту фармацевтической композиции, которая не содержит или по существу не содержит соединение, выбранное из соединений 1-8, или его фармацевтически приемлемой соли или сложного эфира. В некоторых вариантах осуществления, соединение или фармацевтическая композиция вводится в количестве, эффективном для уничтожения или ингибирования роста микроорганизма у субъекта, например, в глазу (например, внутриглазное пространство), крови и/или желудочно-кишечном тракте, таком как кишечник субъекта. В некоторых вариантах осуществления субъект страдает AMD. В некоторых вариантах осуществления, субъект не страдает AMD. В некоторых вариантах осуществления субъект подвержен риску развития AMD. В некоторых вариантах осуществления, субъект страдает глазной инфекцией, связанной с микроорганизмом, указанным в настоящем документе, таким как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, способ дополнительно включает идентификацию, или уже идентифицированного, субъекта как инфицированного, например, во внутриглазном пространстве, микроорганизмом, таким как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, субъекту дополнительно вводят антибиотик и/или анти-VEGF препарат, например, как описано в настоящем документе. В таких вариантах осуществления, антибиотик и/или анти-VEGF препарат можно вводить субъекту либо одновременно, либо последовательно в любом порядке с соединениями по настоящему изобретению или фармацевтическими композициями, описанными в настоящем документе.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ лечения или профилактики AMD у субъекта, нуждающегося в этом. В некоторых вариантах осуществления, способ включает введение субъекту терапевтически эффективного количества соединения согласно настоящему изобретению (например, соединения формулы I, II, III, IV-1, IV-2, V), любой его подформулы или любого одного или нескольких соединений 1-8, или его фармацевтически приемлемой соли или сложного эфира. Если не указано иное, в любом из вариантов осуществления, описанных в настоящем документе, способ может включать введение субъекту соединения, выбранного из соединений 1-8, или его фармацевтически приемлемой соли или сложного эфира. Если не указано иное, в любом из вариантов осуществления, описанных в настоящем документе, способ также может включать введение субъекту фармацевтической композиции, которая не содержит или по существу не содержит соединение, выбранное из соединений 1-8, или его фармацевтически приемлемой соли или сложного эфира. В некоторых вариантах осуществления, способ дополнительно включает введение субъекту антибиотика и/или анти-VEGF препарата, например, как описано в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления, AMD может представлять собой сухую или влажную возрастную дегенерацию желтого пятна с симптомами друзы, включая твердые друзы, мягкие друзы, смешанные друзы и/или деградированные друзы, например, сухая или влажная возрастная дегенерация желтого пятна с симптомами мягких друз. В некоторых вариантах осуществления, способ дополнительно включает идентификацию, или уже идентифицированного, субъекта как инфицированного, например, во внутриглазном пространстве, микроорганизмом, указанным в настоящем документе, таким как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, субъект инфицирован, например, во внутриглазном пространстве микроорганизмом в настоящем документе, таким как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, способ включает введение субъекту соединения или фармацевтической композиции в количестве, эффективном для уничтожения или ингибирования роста микроорганизма, такого как Bacillus megaterium, у субъекта, например, в глазу (например, внутриглазное пространство), крови и/или желудочно-кишечном тракте, таком как кишечник субъекта.
Введение в настоящем описании не ограничено каким-либо конкретным способом введения. Например, в некоторых вариантах осуществления, введение может быть перорально, назально, местно, внутриглазным способом, интравитреально, трансдермально, легочно, ингаляционно, буккально, сублингвально, интраперитонеально, подкожно, внутримышечно, внутривенно, ректально, интраплеврально, интратекально и парентерально. В некоторых вариантах осуществления, введение может осуществляться перорально, местно, интравитреально, внутримышечно, подкожно или внутривенно. В некоторых вариантах осуществления, введение осуществляется перорально. В некоторых вариантах осуществления, введение осуществляется интравитреально.
Режим дозирования, такой как количества и частота, будет варьироваться в зависимости от различных факторов, таких как реципиент, получающий лечение, заболевание или расстройство, подлежащее лечению, и его тяжесть, композиция, содержащая соединение, временя введения, способ введения, продолжительность лечения, эффективность соединения, скорость его клиренса и вводится ли другой препарат совместно или нет.
Экстракты
В одном аспекте настоящее изобретение также предоставляет экстракт некоторых средств традиционной китайской медицины (TCM), которые обладают антибактериальной активностью. Термин «традиционная китайская медицина» следует толковать в широком смысле как включающий как травяные, так и не-травяные китайские лекарственные средства, например, как описано в соответствующих разделах Фармакопеи Китайской Народной Республики (текущее издание). Как подробно описано в разделе «Примеры», было обнаружено, что различные TCM обладают активностью против репрезентативного в настоящем документе микроорганизма, B. megaterium. Хотя некоторые из выделенных компонентов из этих TCM были дополнительно идентифицированы как активные против B. megaterium, экстракты сами по себе могут быть полезны для лечения инфекций, связанных с микроорганизмами, описанными в настоящем документе, и связанных заболеваний или расстройств, таких как AMD.
Соответственно, в некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ лечения или профилактики AMD у субъекта, нуждающегося в этом, причем способ включает введение субъекту экстракта одного или нескольких TCM, выбранных из солодки (например, Glycyrrhiza uralensis), корня белого пиона (например, Cynanchum otophyllum), форзиции (например, Forsythia suspense), плодов померанца (например, Citrus aurantium L.), ремании клейкой (например, Rehmannia glutinosa Libosch), кожуры мандарина (например, Citrus reticulata Blanco), и женьшеня ложного (например, Panax notoginseng). В некоторых вариантах осуществления, AMD может представлять собой сухую или влажную возрастную дегенерацию желтого пятна с симптомами друзы, включая твердые друзы, мягкие друзы, смешанные друзы и/или деградированные друзы, например, сухая или влажная возрастная дегенерация желтого пятна с симптомами мягкой друзы. В некоторых вариантах осуществления, способ дополнительно включает идентификацию, или уже идентифицированного, субъекта как инфицированного, например, во внутриглазном пространстве, микроорганизмом, указанным в настоящем документе, таким как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, субъект инфицирован, например, во внутриглазном пространстве микроорганизмом в настоящем документе, таким как Bacillus megaterium.
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение предоставляет способ уничтожения или ингибирования роста микроорганизмов в настоящем документе, или способ лечения инфекции, связанной с микроорганизмом, таким как Bacillus megaterium, у субъекта, нуждающегося в этом, причем способ включает введение субъекту экстракта одного или нескольких TCM, выбранных из солодки (например, Glycyrrhiza uralensis), корня белого пиона (например, Cynanchum otophyllum), форзиции (например, Forsythia suspense), плодов померанца (например, Citrus aurantium L.), ремании клейкой (например, Rehmannia glutinosa Libosch), кожуры мандарина (например, Citrus reticulata Blanco), и женьшеня ложного (например, Panax notoginseng). В некоторых вариантах осуществления субъект страдает AMD. В некоторых вариантах осуществления, субъект не страдает AMD. В некоторых вариантах осуществления субъект подвержен риску развития AMD. В некоторых вариантах осуществления, субъект страдает глазной инфекцией, связанной с микроорганизмом, указанным в настоящем документе, таким как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, способ дополнительно включает идентификацию, или уже идентифицированного, субъекта как инфицированного, например, во внутриглазном пространстве, микроорганизмом, таким как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, субъекту дополнительно вводят антибиотик и/или анти-VEGF препарат, например, как описано в настоящем документе.
В некоторых вариантах осуществления, экстракт может быть экстрактом из одного TCM. Например, в некоторых вариантах осуществления, способ включает введение субъекту экстракта солодки (например, Glycyrrhiza uralensis). В некоторых вариантах осуществления, способ включает введение субъекту экстракта корня белого пиона (например, Cynanchum otophyllum). В некоторых вариантах осуществления, способ включает введение субъекту экстракта форзиции (например, Forsythia suspense). В некоторых вариантах осуществления, способ включает введение субъекту экстракта плодов померанца (например, Citrus aurantium L.). В некоторых вариантах осуществления, способ включает введение субъекту экстракта ремании клейкой (например, Rehmannia glutinosa Libosch), кожуры мандарина (например, Citrus reticulata Blanco). В некоторых вариантах осуществления, способ включает введение субъекту экстракта женьшеня ложного (например, Panax notoginseng).
В некоторых вариантах осуществления, экстракт может быть экстрактом комбинации двух или нескольких TCM. Например, в некоторых вариантах осуществления, способ включает введение субъекту экстракта из двух или нескольких средств TCM, выбранных из солодки (например, Glycyrrhiza uralensis), корня белого пиона (например, Cynanchum otophyllum), форзиции (например, Forsythia suspense), плодов померанца (например, Citrus aurantium L.), ремании клейкой (например, Rehmannia glutinosa Libosch), кожуры мандарина (например, Citrus reticulata Blanco), и женьшеня ложного (например, Panax notoginseng). В некоторых вариантах осуществления, способ включает введение субъекту экстракта из (a) одного TCM, выбранного из солодки (например, Glycyrrhiza uralensis), корня белого пиона (например, Cynanchum otophyllum), форзиции (например, Forsythia suspense), плодов померанца (например, Citrus aurantium L.), ремании клейкой (например, Rehmannia glutinosa Libosch), кожуры мандарина (например, Citrus reticulata Blanco) и женьшеня ложного (например, Panax notoginseng); и (b) одного или нескольких других TCM. В некоторых вариантах осуществления, способ включает введение субъекту экстракта из (a) 1-7, но не всех, TCM, в любой комбинации, каждый из которых независимо выбран из Glycyrrhiza uralensis, Cynanchum otophyllum, Forsythia suspense, Citrus aurantium L., Rehmannia glutinosa Libosch, Citrus reticulata Blanco, и Panax notoginseng; и, необязательно, (b) одного или нескольких других TCM.
Экстракт в настоящем докумнте обычно получают в соответствии с общепринятой практикой TCM. См., например, раздел "Примеры". Когда используются два или несколько TCM, экстракт может быть получен путем экстракции каждого TCM по отдельности (или экстракции любой подгруппы TCM), и затем объединения экстрактов; или экстракции двух или нескольких TCM вместе. Обычно экстракт представляет собой водный экстракт. В некоторых вариантах осуществления, неводный экстракт также может быть полезен. Также следует отметить, что для некоторых TCM могут быть полезны различные части растения, такие как лист, стебель, корень, фрукты, семена и т.п. В вариантах осуществления настоящего изобретения экстракт не ограничивается какой-либо конкретной частью растения TCM, когда применимо.
Экстракты в настоящем документе могут существовать или вводиться в жидкой, полутвердой или твердой форме или в любой другой форме. Например, экстракты можно вводить в виде водного раствора, суспензии или эмульсии. В качестве альтернативы экстракты также могут быть получены в виде капсулы, таблетки, порошка и т.п. и могут вводиться соответственно, обычно перорально. Введение экстракта(ов) может соответствовать типичной практике, касающейся TCM, и не ограничивается конкретным путем введения. Режим дозирования, такой как количества и частота, можно регулировать на основе различных факторов, таких как реципиент, получающий лечение, заболевание или расстройство, подлежащее лечению, и его тяжесть, композиция, содержащий экстракт, время введения, путь введения, продолжительность лечения, эффективность экстракта, скорость его клиренса и вводится ли другой препарат совместно или нет. В некоторых вариантах осуществления, экстракт вводят в количестве, эффективном для уничтожения или ингибирования роста микроорганизмов, представленных в настоящем документе, таких как Bacillus megaterium, у субъекта, например, в глазу (например, внутриглазное пространство), крови и/или желудочно-кишечном тракте, таком как кишечник субъекта.
Антибиотики
Как уже обсуждалось в настоящем документе, настоящее изобретение частично основано на неожиданном открытии того, что внутриглазная среда является нестерильной и определенная внутриглазная микробиота может быть патогенными причинами AMD. Таким образом, любые антибиотики, такие как те, которые известны в данной области, могут быть полезны для лечения инфекций, связанных с микроорганизмами, описанными в настоящем документе, и могут использоваться для лечения или профилактики AMD. Соответственно, в некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение также предоставляет способ уничтожения или ингибирования роста микроорганизма, такого как Bacillus megaterium, способ лечения инфекции (например, глазной инфекции, например, во внутриглазном пространстве), связанной с микроорганизмом, и/или способ лечения или предотвращения заболевания или расстройства, связанного с микроорганизмом или инфекцией, такого как AMD, у субъекта, нуждающегося в этом, причем способ включает введение субъекту эффективного количества антибиотика. В некоторых вариантах осуществления, можно использовать любые коммерчески доступные антибиотики, например, одобренные FDA США. В некоторых вариантах осуществления, антибиотики можно охарактеризовать как антибиотики широкого спектра действия. В некоторых вариантах осуществления, антибиотики могут быть антибиотиками против грамположительных бактерий. В некоторых вариантах осуществления субъект страдает AMD. В некоторых вариантах осуществления, субъект не страдает AMD. В некоторых вариантах осуществления субъект подвержен риску развития AMD. В некоторых вариантах осуществления, субъект страдает глазной инфекцией, например, связанной с одним из микроорганизмов, описанных в настоящем документе, таким как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, AMD может представлять собой сухую или влажную возрастную дегенерацию желтого пятна с симптомами друзы, включая твердые друзы, мягкие друзы, смешанные друзы и/или деградированные друзы, например, сухую или влажную возрастную дегенерацию желтого пятна с симптомами мягкой друзы. В некоторых вариантах осуществления, способ дополнительно включает идентификацию, или уже идентифицированного, субъекта как инфицированного, например, во внутриглазном пространстве, микроорганизмом, таким как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, субъект инфицирован, например, во внутриглазном пространстве микроорганизмом, таким как Bacillus megaterium. В некоторых вариантах осуществления, субъекту дополнительно вводят анти-VEGF препарат, например, как описано в настоящем документе.
Соединения по настоящему изобретению (см., например, раздел «Соединения») обычно обладают антибактериальной активностью и, следовательно, могут быть антибиотиком. Однако антибиотики, описанные в этом разделе, могут быть независимыми от соединений по настоящему изобретению (например, как определено в настоящем документе). В некоторых вариантах осуществления, антибиотики также являются соединениями настоящего изобретения. В некоторых вариантах осуществления, антибиотики не являются соединениями настоящего изобретения. В некоторых вариантах осуществления, антибиотики и соединения по настоящему изобретению используются вместе в комбинированной терапии, которую можно вводить субъекту, нуждающемуся в этом, одновременно (например, в одной лекарственной форме) или последовательно в любом порядке.
В некоторых вариантах осуществления антибиотик может представлять собой β-лактамный антибиотик, аминогликозидный антибиотик, тетрациклиновый антибиотик, хлорамфениколовый антибиотик, макролидный антибиотик, гликопептидный антибиотик, хинолоновый антибиотик, нитроимидазольный антибиотик, рифамициновый антибиотик, эхинокандиновый антибиотик, полиеновый антибиотик, пиримидиновый антибиотик, аллиламиновый антибиотик или азольный антибиотик, или их комбинацию.
В некоторых вариантах осуществления, антибиотики могут включать один или несколько из следующих: β-лактамные антибиотики, включая пенициллины (например, пенициллин V), амоксициллин, ампициллин, бакампициллин, карбенициллин, клоксациллин, диклоксациллин, флуклоксациллин, мезлоциллин, нафциллин, оксациллин, пенициллин G, пиперациллин, пивампициллин, пивмециллинам, тикарциллин, цефалоспорины, такие как цефацетрил, цефадроксил, цефалексин, цефалоглицин, цефалоний, цефалоридин, цефалотин, цефапирин, цефатризин, цефазафлур, цефазедон, цефазолин, цефрадин, цефроксадин, цефтезол, цефаклор, цефамандол, цефметазол, цефоницид, цефотетан, цефокситин, цефпрозил, цефуроксим, цефузонам, цефкапен, цефдалоксим, цефдинир, цефдиторен, цефетамет, цефиксим, цефменоксим, цефодизим, цефотаксим, цефпимизол, цефподоксим, цефтерам, цефтибутен, цефтиофур, цефтиолен, цефтизоксим, цефтриаксон, цефоперазон, цефтазидим, цефклидин, цефепим, цефлупренам, цефоселис, цефозопран, цефпиром, цефкином, цефтобипрол, цефтаролин, цефакломезин, цефалорам, цефапарол, цефканел, цефедролор, цефемпидон, цефетризол, цефивитрил, цефматилен, цефмепидиум, цефовецин, цефоксазол, цефротил, цефсумид, цефурацетим, цефтиоксид, тиенамицины, монобактамы, ингибиторы β-лактамаз, метоксипенициллины, и т.п.; аминогликозидные антибиотики: включая стрептомицин, гентамицин, канамицин (например, канамицин A), тобрамицин, амикацин, неомицин (например, неомицин B, неомицин C, неомицин E), рибомицин, микрономицин, азитромицин, дибекацин, сизомицин, нетилмицин, парамомицин, брамицин, и т.п.; тетрациклиновые антибиотики: включая тетрациклин, окситетрациклин, хлортетрациклин и доксициклин; хлорамфениколовые антибиотики: включая хлорамфеникол, тиамфеникол, и т.п.; макролидные антибиотики: включая эритромицин, лейкомицин, эритромицин без запаха, ацетилспирамицин, медимицин, джозамицин, азитромицин, кларитромицин, диритромицин, окситромицин, телитромицин, и т.п.; гликопептидные антибиотики: включая ванкомицин, норванкомицин, тейкопланин, и т.п.; хинолоновые антибиотики: включая норфлоксацин, офлоксацин, ципрофлоксацин, пефлоксацин, гатифлоксацин, эноксацина, ломефлоксацина, налидиксовой кислоты, левофлоксацина, моксифлоксацина, безифлоксацин; нитроимидазольные антибиотики: включая метронидазол, тинидазол, орнидазол, и т.п.; рифамициноидные антибиотики: включая рифампицин; эхинокандиновые антибиотики; полиеновые антибиотики; пиримидиновые антибиотики; аллиламиновые антибиотики; азольные антибиотики; другие антибиотики: фосфомицин, капреомицин, циклосерин, линкомицин, клиндамицин, митомицин, актиномицин D, блеомицин, доксорубицин, изониазид, пиразинамид, циклоспорин, комбинации полимиксина B, такие как полимиксин B/триметоприм, полимиксин B/бацитрацин, полимиксин B/неомицин/грамицидин, и т.п.
В некоторых вариантах осуществления, антибиотик может быть выбран из амикацина, амоксициллина, ампициллина, арсфенамина, азитромицина, азлоциллина, азтреонама, бацитрацина, капреомицина, карбенициллина, цефаклора, цефадроксила, цефалексина, цефалотина, цефамандола, цефазолина, цефдинира, цефдиторена, цефиксима, цефоперазона, цефотаксима, цефокситина, цефподоксима, цефпрозила, цефтазидима, цефтибутена, цефтизоксима, цефтриаксона, цефуроксима, хлорамфеникола, циластатина, кларитромицина, клавуланата, клиндамицина, клофазимина, клоксациллина, колистина, циклосерина, дальфопристина, дапсона, даптомицина, диклоксациллина, диритромицина, дорипенема, доксициклина, эритромицина, этамбутола, этионамида, флуклоксациллина, фосфомицина, фуразолидона, фузидовой кислоты, гентамицина, имипенема, изониазида, канамицина, линкомицина, линезолида, лоракарбефа, мафенида, меропенема, метициллина, метронидазола, мезлоциллина, миноциклина, мупироцина, нафциллина, неомицина, нетилмицина, нитрофурантоина, оксациллина, окситетрациклина, паромомицина, пенициллина G, пенициллина V, пиперациллина, платенсимицина, полимиксина B, пиразинамида, квинупристина, рапамицина, рифабутина, рифампицина, рифампина, рифапентина, рифаксимина, рокситромицина, сульфадиазина серебра, спектиномицина, стрептомицина, сульбактама, сульфацетамида, сульфадиазина, сульфаметизола, сульфаметоксазола, сульфанилимида, сульфасалазина, сульфизоксазола, тазобактама, тейкопланина, телаванцина, телитромицина, темоциллина, тетрациклина, тиамфеникола, тикарциллина, тигециклина, тинидазола, тобрамицина, триметоприма, тролеандомицин ванкомицина, эноксацина, ломефлоксацина, налидиксовой кислоты, ципрофлоксацина, левофлоксацина, гатифлоксацина, моксифлоксацина, офлоксацина, норфлоксацина, цефотетана, цефоницида, цефрадина, цефапирина, цефалотина, цефметазола, цефотаксима, моксалактама, цефепима, цефтаролин фозамила, цефтобипрола, далбаванцина, демеклоциклина, метациклина, эртапенема, фидаксомицина, гелданамицина, гербимицина, позизолида, радезолида, торезолида, оритаванцина, спирамицина, сульфадиметоксина, сульфонамидохризоидина, гемифлоксацин надифлоксацин тровафлоксацин грепафлоксацин спарфлоксацин темафлоксацина, теиксобактина, малацидина, и их комбинаций.
В некоторых вариантах осуществления, антибиотик вводят в количестве, эффективном для уничтожения или ингибирования роста микроорганизма, такого как Bacillus megaterium, у субъекта, например, в глазу (например, внутриглазное пространство), крови и/или желудочно-кишечном тракте, таком как кишечник субъекта.
Антибиотики могут быть в любой форме, например, в форме или в смеси с их соответствующими фармацевтически приемлемыми солями. Антибиотики могут быть получены и введены в соответствии с известным способом введения и не имеют особых ограничений. В некоторых вариантах осуществления, введение может осуществляться перорально, местно, интравитреально, внутримышечно, подкожно или внутривенно. В некоторых вариантах осуществления, введение осуществляется перорально. В некоторых вариантах осуществления, введение осуществляется интравитреально.
Режим дозирования, такой как количества и частота, будет варьироваться в зависимости от различных факторов, таких как реципиент, получающий лечение, заболевание или расстройство, подлежащее лечению, и его тяжесть, композиция, содержащая антибиотик, время введения, способ введения, продолжительность лечения, эффективность антибиотика, скорость его клиренса и вводится ли другой препарат совместно или нет.
Иллюстративные альтернативные варианты осуществления
В некотором аспекте настоящее изобретение относится к способу создания модели и модели, созданной с помощью этого способа. В другом аспекте в настоящем документе раскрывается способ скрининга лекарственного средства, и лекарственное средство, идентифицированное с помощью способа. В некоторых вариантах осуществления, настоящее раскрытие относится к применению микроорганизма при создании модели и при скрининге лекарственного средства.
В одном аспекте в настоящем документе раскрыт способ создания модели, включающий заражение модельного носителя микроорганизмом. Микроорганизм может содержать или включает бактерии, археи, протисты, грибки, вирусы или их комбинацию. Предпочтительно, микроорганизм включает бактерию, где бактерии могут быть выбраны из одного или нескольких из следующих: Clostridium, Acinetobacter, Streptococcus, Mannheimia, Fibrobacter, Prevotella, Campylobacter, Actinomyces, Hymenobacter, Escherichia, Tissierella, Klebsiella, Porphyromonas, Azospira, Aquimarina, Achromobacter, Acidithiobacillus, Burkholderia, Marinobacter, Treponema, Actinosporangium, Vibrio, Ruminococcus, Methanobrevibacter, Shigella, Frankia, Anaeroplasma и Coprococcus.
В некоторых предпочтительных вариантах осуществления бактерии могут быть выбраны из одного или нескольких из следующих: Clostridium tetanus, Clostridium perfringens, Clostridium botulinum, Acinetobacter acetate, Acinetobacter rufi, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter hemolyticus, Acinetobacter junii, Acinetobacter johnsonii, Streptococcus pyogenes, Streptococcus hemolyticus, Porphyromonas asacharolytica, Porphyromonas gingivalis, Porphyromonas gingivalis, Campylobacter jejuni, Campylobacter coli, Campylobacter seabirds, Campylobacter Uppsala, Campylobacter concisely, Campylobacter fitus, Actinomyces israelii, Actinomyces naeslundii, Actinomyces odontolyticus, Escherichia coli, Escherichia blattae, Escherichia fergusonii, Escherichia hermannii, Escherichia vulneris, Tissierella apical, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella odorata, Azospirillum brasilence, Achromobacter, Thiobacillus denitrificans, Thiobacillus ferrooxidans, Thiobacillus thiooxidans, Thiobacillus neapolitanus, Burkholderia, Mycobacterium marinum, Treponema Pallidum, Treponema hyodysenteriae, Vibrio metschnikovi, Ruminococcus albus, Ruminococcus flavefaciens, Methanobrevibacter ruminantium, Shigella dysenteriae, Shigella flexneri, Shigella bogdii, Shigella sonnei, Frankiaceae, Streptomyces albus, Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentans, Serratia marcescens, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus (D), Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna.
В некоторых предпочтительных вариантах осуществления, бактерии могут быть выбраны из одного или нескольких из следующих: Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentans, Serratia marcescens, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus (D), Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna.
В некоторых предпочтительных вариантах осуществления, бактерии выбраны из одного или нескольких из следующих: Pseudomonas putida, Bacillus megaterium, Propionibacterium acnes. В предпочтительном варианте осуществления бактерия представляет собой Bacillus megaterium.
В некоторых предпочтительных вариантах осуществления, настоящее изобретение относится к способу создания модели катаракты (Cat), который включает заражение модельного носителя микроорганизмом, выбранным из одного или нескольких из следующих: Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti или Acidovorax ebreus.
В некоторых предпочтительных вариантах осуществления, настоящее изобретение относится к способу создания модели возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), который включает заражение модельного носителя микроорганизмом, выбранным из одного или нескольких из следующих: Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis или Xanthomonas oryzae.
В некоторых предпочтительных вариантах осуществления, настоящее изобретение относится к способу создания модели глаукомы (GLA), который включает заражение модельного носителя микроорганизмом, выбранным из одного или нескольких из следующих: Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants или Serratia marcescens.
В некоторых предпочтительных вариантах осуществления, настоящее изобретение относится к способу создания модели болезни Бехчета (BD), который включает заражение модельного носителя микроорганизмом, выбранным из одного или нескольких из следующих: Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii или Meiothermus silvanus(D).
В некоторых предпочтительных вариантах осуществления, настоящее изобретение относится к способу создания модели синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), который включает заражение модельного носителя микроорганизмом, выбранным из одного или нескольких из следующих: Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum или Finegoldia magna.
Модельный носитель может включать одно или несколько из следующего: человек, млекопитающее, не являющееся человеком, органы, ткани, срезы тканей, экстракты тканей, биологические жидкости, культуры биологических жидкостей, клетки, вирусы, ферменты, культуральные среды. К млекопитающим, не относящимся к человеку, относятся любые млекопитающие экспериментального, домашнего или хозяйственного назначения. Примеры млекопитающих, не относящихся к человеку, включают мышь, крысу, кролика, кошку, собаку, свинью, корову, быка, овцу, козу, лошадь, обезьяну или примата, не относящегося к человеку. Примеры органов включают сердце, печень, легкие, желудок, почки, глаз, ухо, нос, язык. Ткани, срезы тканей и экстракты тканей включают ткани, срезы тканей или экстракты тканей из любой части субъекта или животного-субъекта. В некоторых вариантах осуществления, ткани включают подвешивающую связку, цилиарное тело, цилиарное тело и мышцу, стекловидное тело, сетчатку, хориоидею, зрительный нерв, хрусталик, или радужку субъекта. В некоторых вариантах осуществления, экстракты тканей включают ДНК, РНК или белок. В некоторых вариантах осуществления, жидкости организма включают лимфу, спинномозговую жидкость, водянистую влагу (AH), стекловидное тело (VH), кровь, пот или мочу. В некоторых вариантах осуществления, культуры биологических жидкостей включают культуры AH и VH.
В другом аспекте в настоящем документе раскрыто использование микробов для создания модели, конкретная модель создается путем заражения модельного носителя микроорганизмом. Определенный спектр микроорганизмов и модельных носителей описаны в настоящем документе.
В еще одном аспекте в настоящем документе раскрыта модель, созданная путем заражения модельного носителя микроорганизмом. Определенный спектр микроорганизмов и модельных носителей описаны в настоящем документе.
В еще одном аспекте в настоящем документе раскрыт способ скрининга лекарственного средства, включающий (1) нанесение лекарственного средства на модель; (2) анализ результатов. Предпочтительно, способ включает: (1) заражение модельного носителя микроорганизмом для создания модели; (2) нанесение лекарственного средства на модель; (3) анализ результатов. Лекарственное средство, которое уничтожает или ингибирует микроорганизмы в модели, может быть идентифицировано как обладающее терапевтическим или профилактическим действием.
Микроорганизм может содержать или включает бактерии, археи, протисты, грибки, вирусы или их комбинацию. Предпочтительно микроорганизм включает бактерии, где бактерии могут быть выбраны из одного или нескольких из следующих: Clostridium, Acinetobacter, Streptococcus, Mannheimia, Fibrobacter, Prevotella, Campylobacter, Actinomyces, Hymenobacter, Escherichia, Tissierella, Klebsiella, Porphyromonas, Azospira, Aquimarina, Achromobacter, Acidithiobacillus, Burkholderia, Marinobacter, Treponema, Actinosporangium, Vibrio, Ruminococcus, Methanobrevibacter, Shigella, Frankia, Anaeroplasma и Coprococcus.
В некоторых предпочтительных вариантах осуществления, бактерии могут быть выбраны из одного или нескольких из следующих: Clostridium tetanus, Clostridium perfringens, Clostridium botulinum, Acinetobacter acetate, Acinetobacter rufi, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter hemolyticus, Acinetobacter junii, Acinetobacter johnsonii, Streptococcus pyogenes, Streptococcus hemolyticus, Porphyromonas asacharolytica, Porphyromonas gingivalis, Porphyromonas gingivalis, Campylobacter jejuni, Campylobacter coli, Campylobacter seabirds, Campylobacter Uppsala, Campylobacter concisely, Campylobacter fitus, Actinomyces israelii, Actinomyces naeslundii, Actinomyces odontolyticus, Escherichia coli, Escherichia blattae, Escherichia fergusonii, Escherichia hermannii, Escherichia vulneris, Tissierella apical, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella odorata, Azospirillum brasilence, Achromobacter, Thiobacillus denitrificans, Thiobacillus ferrooxidans, Thiobacillus thiooxidans, Thiobacillus neapolitanus, Burkholderia, Mycobacterium marinum, Treponema Pallidum, Treponema hyodysenteriae, Vibrio metschnikovi, Ruminococcus albus, Ruminococcus flavefaciens, Methanobrevibacter ruminantium, Shigella dysenteriae, Shigella flexneri, Shigella bogdii, Shigella sonnei, Frankiaceae, Streptomyces albus, Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentans, Serratia marcescens, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus (D), Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna.
В некоторых предпочтительных вариантах осуществления, бактерии могут быть выбраны из одного или нескольких из следующих: Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentans, Serratia marcescens, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus (D), Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna.
В некоторых предпочтительных вариантах осуществления, бактерии могут быть выбраны из одного или нескольких из следующих: Pseudomonas putida, Bacillus megaterium, Propionibacterium acnes.
В предпочтительном варианте осуществления бактерия представляет собой Bacillus megaterium.
Модельный носитель может быть одним или несколькими из следующих: человек, млекопитающее, не являющееся человеком, органы, ткани, срезы тканей, экстракты тканей, биологические жидкости, культуры биологических жидкостей, клетки, вирусы, ферменты, культуральные среды. Млекопитающее, не относящееся к человеку, включает любых млекопитающих экспериментального назначения, домашних животных или хозяйственного назначения. Примеры млекопитающих, не относящихся к человеку, включают мышь, крысу, кролика, кошку, собаку, свинью, корову, быка, овцу, козу, лошадь, обезьяну или примата, не относящегося к человеку. Примеры органов включают сердце, печень, легкие, желудок, почки, глаз, ухо, нос, язык. Ткани, срезы тканей и экстракты тканей включают ткани, срезы тканей или экстракты тканей из любой части субъекта или животного-субъекта. В некоторых вариантах осуществления, ткани включают подвешивающую связку, цилиарное тело, цилиарное тело и мышцу, стекловидное тело, сетчатку, хориоидею, зрительный нерв, хрусталик, или радужку субъекта. В некоторых вариантах осуществления, экстракты тканей включают ДНК, РНК или белок. В некоторых вариантах осуществления, жидкости организма включают лимфу, спинномозговую жидкость, водянистую влагу (AH), стекловидное тело (VH), кровь, пот или мочу. В некоторых вариантах осуществления, культуры биологических жидкостей включают культуры AH и VH.
Лекарственное средство может включать одно или несколько из следующего: низкомолекулярное лекарственное средство, химическое лекарственное средство, лекарственное средство на основе макромолекул, биологическое лекарственное средство или природное лекарственное средство (средства традиционной китайской медицины или экстракты средства традиционной китайской медицины).
Предпочтительно лекарственное средство оказывает терапевтическое действие на внутриглазное заболевание или расстройство, которое включает возрастную дегенерацию желтого пятна (AMD), болезнь Бехчета (BD), синдром Фогта-Коянаги-Харада (VKH), увеит, ретинопатию, сухой кератоконъюнктивит, симпатическую офтальмию, трахому, катаракту (Cat), конъюнктивит, халязион, глаукому (GLA), симптом "летающих мушек".
Химическое лекарственное средство может включать: β-лактамный антибиотик: пенициллины, цефалоспорины, ингибитор β-лактамаз и метициллин; аминогликозидный антибиотик: стрептомицин, гентамицин, канамицин, тобрамицин, амикацин, неомицин, рибомицин и новомицин; тетрациклиновый антибиотик: тетрациклин, окситетрациклин и хлортетрациклин; хлорамфениколовый антибиотик: хлорамфеникол и тиамфеникол; макролидный антибиотик: эритромицин, лейкомицин, эритромицин без запаха, ацетилспирамицин, медимицин, джозамицин и азитромицин; гликопептидный антибиотик: ванкомицин, норванкомицин и тейкопланин; хинолоновый антибиотик: норфлоксацин, офлоксацин, ципрофлоксацин, пефлоксацин и гатифлоксацин; нитроимидазольный антибиотик: метронидазол, тинидазол и орнидазол; рифамициновый антибиотик: рифампин; эхинокандиновый антибиотик, полиеновый антибиотик, пиримидиновый антибиотик, аллиламиновый антибиотик, азольный антибиотик, и другие антибиотики: фосфомицин, циклосерин, линкомицин, клиндамицин, митомицин, актиномицин D, блеомицин, доксорубицин, изониазид, пиразинамид, циклоспорин, или их комбинацию.
Биологическое лекарственное средство может представлять собой антимикробный пептид, который может включать антимикробный пептид насекомых: антибактериальный пептид чешуекрылых, антибактериальный пептид двукрылых, антибактериальный пептид жесткокрылых, антибактериальный пептид перепончатокрылых и антибактериальный пептид тутового шелкопряда; антимикробный пептид млекопитающих: антибактериальный пептид свиньи, антибактериальный пептид овцы, антибактериальный пептид крупного рогатого скота и антибактериальный пептид человека; антибактериальный пептид амфибий: xenopus; антибактериальный пептид, полученный из рыбы, моллюсков или ракообразных: антибактериальный пептид leopard, антибактериальный пептид мидий и антибактериальный пептид креветок; антибактериальный пептид бактерий: бацитрацин, грамицидин, полимиксин и низин; растительный антибактериальный пептид, или их комбинацию.
Природное лекарственное средство может включать: Astragalus, Polygonatum, Angelica, Sanqi, Rhizoma Imperatae, Rhubarb Charcoal, Curcuma aromatica, Fritillary, Coix Seed, Pinellia, Calcined ancient ink, Salvia Miltiorrhiza, Arnebiaeuchroma, Radix Isatidis, Houttuynia, Honeysuckle, Rhizoma Coptis, Scutellaria, Dandelion, Purslane, Hawthorn, Isatidis Folium, Fructus Forsythiae, Herba Artemisiae Capillaris, Andrographis Paniculata Nees, Radix Bupleuri, Rhubarb, Euphorbia Humifusa, Stemonae, Garlic, Cortex Phellodendri, Eucommia, Cortex Fraxini, Fructus Cnidii, Galla Chinensis, viola yedoensis makino, Fructus Mume, Radix Glycyrrhizae, Pericarpium Granati, Schisandra chinensis, Spina Gleditsiae, Terminalia Chebula, Sophora flavescens, Cortex Pseudolaricis, Epimedium, Artemisia apiacea Hance, их экстракт, или их комбинацию.
Лекарственное средство в настоящем изобретении может быть лекарственным средством для перорального введения, инъекции или местного применения, которое включает лекарственное средство для слизистых оболочек, предпочтительно офтальмологическое лекарственное средство.
Лекарственное средство в настоящем изобретении может быть в форме раствора, таблетки, пилюли, капсулы, инъекции, порошка, порошка для инъекций, пластыря, покрывающего агента или препарата для введения через слизистую, предпочтительно для глазных капель, глазные мази или препараты в виде спрея для глаз и т.п.
В некоторых предпочтительных вариантах осуществления, настоящее изобретение относится к способу скрининга лекарственного средства для лечения или профилактики катаракты (Cat), стадии способа являются следующими:
(1) заражение модельного носителя микроорганизмом одним или несколькими из следующих: Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, или Acidovorax ebreus для создания модели;
(2) нанесение лекарственного средства на модель;
(3) анализ результатов. Лекарственное средство, которое может уничтожать или ингибировать микроорганизмы в модели, может быть идентифицировано как имеющее терапевтическое или профилактическое действие на пациентов с Cat.
В некоторых предпочтительных вариантах осуществления, настоящее изобретение относится к способу скрининга лекарственного средства для лечения или профилактики возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), стадии способа являются следующими:
(1) заражение модельного носителя микроорганизмом одним или несколькими из следующих: Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis или Xanthomonas oryzae для создания модели;
(2) нанесение лекарственного средства на модель;
(3) анализ результатов. Лекарственное средство, которое может уничтожать или ингибировать микроорганизмы в модели, может быть идентифицировано как имеющее терапевтическое или профилактическое действие на пациентов с AMD.
В некоторых предпочтительных вариантах осуществления, настоящее изобретение относится к способу скрининга лекарственного средства для лечения или профилактики глаукомы (GLA), стадии способа являются следующими:
(1) заражение модельного носителя микроорганизмом одним или несколькими из следующих: Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants или Serratia marcescens для создания модели;
(2) нанесение лекарственного средства на модель;
(3) анализ результатов. Лекарственное средство, которое может уничтожать или ингибировать микроорганизмы в модели, может быть идентифицировано как имеющее терапевтическое или профилактическое действие на пациентов с GLA.
В некоторых предпочтительных вариантах осуществления, настоящее изобретение относится к способу скрининга лекарственного средства для лечения или профилактики болезни Бехчета (BD), стадии способа являются следующими:
(1) заражение микроорганизмом одним или несколькими из следующих Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, или Meiothermus silvanus(D) модельного носителя для создания модели;
(2) нанесение лекарственного средства на модель;
(3) анализ результатов. Лекарственное средство, которое может уничтожать или ингибировать микроорганизмы в модели, может быть идентифицировано как имеющее терапевтическое или профилактическое действие на пациентов с BD.
В некоторых предпочтительных вариантах осуществления, настоящее изобретение относится к способу скрининга лекарственного средства для лечения или профилактики синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), стадии способа являются следующими:
(1) заражение модельного носителя микроорганизмом одним или несколькими из следующих: Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum или Finegoldia magna для создания модели;
(2) нанесение лекарственного средства на модель;
(3) Анализ результатов. Лекарственное средство, которое может уничтожать или ингибировать микроорганизмы в модели, может быть идентифицировано как имеющее терапевтическое или профилактическое действие на пациентов с VKH.
В еще одном аспекте в настоящем документе раскрыто использование микроба при скрининге лекарственного средства, специфические стадии скрининга лекарственного средства являются следующими: заражение модельного носителя микроорганизмом для создания модели; нанесение лекарственного средства на модель; скрининг лекарственного средства на терапевтический или профилактический эффект. Определенный спектр микроорганизмов, модельного носителя и лекарственного средства описан выше.
В еще одном аспекте в настоящем документе раскрыто лекарственное средство, которое идентифицируют с помощью следующих стадий: заражение модельного носителя микроорганизмом для создания модели; нанесение лекарственного средства на модель; скрининг лекарственного средства на положительный результат. Определенный спектр микроорганизмов, модельного носителя и лекарственного средства описан выше.
Положительный результат означает, что идентифицированное лекарственное средство может уничтожать или ингибировать микроорганизм в модели.
Иллюстративные варианты осуществления 1-25
Вариант осуществления 1. Способ создания модели внутриглазного заболевания или нарушения, который включает заражение модельного носителя микроорганизмом.
Вариант осуществления 2. Способ по варианту осуществления 1, где микроорганизм включает бактерии, археи, протисты, грибки, вирусы или их комбинацию.
Вариант осуществления 3. Способ по варианту осуществления 1, где модельный носитель включает одно или несколько из человека, млекопитающего, не являющегося человеком, органов, тканей, срезов тканей, экстрактов тканей, биологических жидкостей, культур биологических жидкостей, клеток, вирусов, ферментов, культуральных сред.
Вариант осуществления 4. Способ по варианту осуществления 2, где микроорганизм включает бактерии, выбранные из одного или нескольких из следующих: Clostridium, Acinetobacter, Streptococcus, Mannheimia, Fibrobacter, Prevotella, Campylobacter, Actinomyces, Hymenobacter, Escherichia, Tissierella, Klebsiella, Porphyromonas, Azospira, Aquimarina, Achromobacter, Acidithiobacillus, Burkholderia, Marinobacter, Treponema, Actinosporangium, Vibrio, Ruminococcus, Methanobrevibacter, Shigella, Frankia, Anaeroplasma и Coprococcus.
Вариант осуществления 5. Способ по варианту осуществления 4, где бактерии выбраны из одного или нескольких из следующих: Clostridium tetanus, Clostridium perfringens, Clostridium botulinum, Acinetobacter acetate, Acinetobacter rufi, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter hemolyticus, Acinetobacter junii, Acinetobacter johnsonii, Streptococcus pyogenes, Streptococcus hemolyticus, Porphyromonas asacharolytica, Porphyromonas gingivalis, Porphyromonas gingivalis, Campylobacter jejuni, Campylobacter coli, Campylobacter seabirds, Campylobacter Uppsala, Campylobacter concisely, Campylobacter fitus, Actinomyces israelii, Actinomyces naeslundii, Actinomyces odontolyticus, Escherichia coli, Escherichia blattae, Escherichia fergusonii, Escherichia hermannii, Escherichia vulneris, Tissierella apical, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella odorata, Azospirillum brasilence, Achromobacter, Thiobacillus denitrificans, Thiobacillus ferrooxidans, Thiobacillus thiooxidans, Thiobacillus neapolitanus, Burkholderia, Mycobacterium marinum, Treponema Pallidum, Treponema hyodysenteriae, Vibrio metschnikovi, Ruminococcus albus, Ruminococcus flavefaciens, Methanobrevibacter ruminantium, Shigella dysenteriae, Shigella flexneri, Shigella bogdii, Shigella sonnei, Frankiaceae, Streptomyces albus, Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentans, Serratia marcescens, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus (D), Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna.
Вариант осуществления 6. Способ по варианту осуществления 1, где внутриглазное заболевание или нарушение выбрано из катаракты, возрастной дегенерации желтого пятна, глаукомы, болезни Бехчета, синдрома Фогта-Коянаги-Харада или увеита.
Вариант осуществления 7. Способ по варианту осуществления 1, где внутриглазное заболевание или нарушение представляет собой катаракту, где способ включает заражение модельного носителя микроорганизмом, выбранным из одного или нескольких из следующих Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti или Acidovorax ebreus.
Вариант осуществления 8. Способ по варианту осуществления 1, где внутриглазное заболевание или нарушение представляет собой возрастную дегенерацию желтого пятна, где способ включает модельный носитель с микроорганизмом, выбранным из одного или нескольких из следующих Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, или Xanthomonas oryzae.
Вариант осуществления 9. Способ по варианту осуществления 1, где внутриглазное заболевание или нарушение представляет собой глаукому, где способ включает заражение модельного носителя микроорганизмом, выбранным из одного или нескольких из следующих Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants, или Serratia marcescens.
Вариант осуществления 10. Способ по варианту осуществления 1, где внутриглазное заболевание или нарушение представляет собой болезнь Бехчета, где способ включает заражение модельного носителя микроорганизмом, выбранным из одного или нескольких из следующих Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, или Meiothermus silvanus(D).
Вариант осуществления 11. Способ по варианту осуществления 1, где внутриглазное заболевание или нарушение представляет собой синдром Фогта-Коянаги-Харада, где способ включает заражение модельного носителя микроорганизмом, выбранным из одного или нескольких из следующих Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, или Finegoldia magna.
Вариант осуществления 12. Применение микроба для создания модели внутриглазного заболевания или нарушения.
Вариант осуществления 13. Модель глазного заболевания, которая получена способом по варианту осуществления 1.
Вариант осуществления 14. Применение микроба при получении модели для скрининга лекарственного средства в отношении глазного заболевания.
Вариант осуществления 15. Применение по варианту осуществления 14, где лекарственное средство включает одно или несколько из химического лекарственного средства, биологического лекарственного средства или природного лекарственного средства.
Вариант осуществления 16. Применение по варианту осуществления 15, где химическое лекарственное средство включает β-лактамный антибиотик, аминогликозидный антибиотик, тетрациклиновый антибиотик, хлорамфениколовый антибиотик, макролидный антибиотик, гликопептидный антибиотик, хинолоновый антибиотик, нитроимидазольный антибиотик, рифамициновый антибиотик, эхинокандиновый антибиотик, полиеновый антибиотик, пиримидиновый антибиотик, аллиламиновый антибиотик, азольный антибиотик, и другие антибиотики, или их комбинацию.
Вариант осуществления 17. Применение по варианту осуществления 15, где биологическое лекарственное средство представляет собой антимикробный пептид.
Вариант осуществления 18. Применение по варианту осуществления 15, где природное лекарственное средство включает Astragalus, Polygonatum, Angelica, Sanqi, Rhizoma Imperatae, Rhubarb Charcoal, Curcuma aromatica, Fritillary, Coix Seed, Pinellia, Calcined ancient ink, Salvia Miltiorrhiza, Arnebiaeuchroma, Radix Isatidis, Houttuynia, Honeysuckle, Rhizoma Coptis, Scutellaria, Dandelion, Purslane, Hawthorn, Isatidis Folium, Fructus Forsythiae, Herba Artemisiae Capillaris, Andrographis Paniculata Nees, Radix Bupleuri, Rhubarb, Euphorbia Humifusa, Stemonae, Garlic, Cortex Phellodendri, Eucommia, Cortex Fraxini, Fructus Cnidii, Galla Chinensis, viola yedoensis makino, Fructus Mume, Radix Glycyrrhizae, Pericarpium Granati, Schisandra chinensis, Spina Gleditsiae, Terminalia Chebula, Sophora flavescens, Cortex Pseudolaricis, Epimedium, Artemisia apiacea Hance, их экстракт или их комбинацию.
Вариант осуществления 19. Применение по варианту осуществления 14, где микроорганизм включает бактерии, археи, протисты, грибки, вирусы или их комбинацию.
Вариант осуществления 20. Применение по варианту осуществления 19, где микроорганизм включает бактерии, выбранные из одного или нескольких из следующих: Clostridium, Acinetobacter, Streptococcus, Mannheimia, Fibrobacter, Prevotella, Campylobacter, Actinomyces, Hymenobacter, Escherichia, Tissierella, Klebsiella, Porphyromonas, Azospira, Aquimarina, Achromobacter, Acidithiobacillus, Burkholderia, Marinobacter, Treponema, Actinosporangium, Vibrio, Ruminococcus, Methanobrevibacter, Shigella, Frankia, Anaeroplasma и Coprococcus.
Вариант осуществления 21. Применение по варианту осуществления 20, где бактерии выбраны из одного или нескольких из следующих: Clostridium tetanus, Clostridium perfringens, Clostridium botulinum, Acinetobacter acetate, Acinetobacter rufi, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter hemolyticus, Acinetobacter junii, Acinetobacter johnsonii, Streptococcus pyogenes, Streptococcus hemolyticus, Porphyromonas asacharolytica, Porphyromonas gingivalis, Porphyromonas gingivalis, Campylobacter jejuni, Campylobacter coli, Campylobacter seabirds, Campylobacter Uppsala, Campylobacter concisely, Campylobacter fitus, Actinomyces israelii, Actinomyces naeslundii, Actinomyces odontolyticus, Escherichia coli, Escherichia blattae, Escherichia fergusonii, Escherichia hermannii, Escherichia vulneris, Tissierella apical, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella odorata, Azospirillum brasilence, Achromobacter, Thiobacillus denitrificans, Thiobacillus ferrooxidans, Thiobacillus thiooxidans, Thiobacillus neapolitanus, Burkholderia, Mycobacterium marinum, Treponema Pallidum, Treponema hyodysenteriae, Vibrio metschnikovi, Ruminococcus albus, Ruminococcus flavefaciens, Methanobrevibacter ruminantium, Shigella dysenteriae, Shigella flexneri, Shigella bogdii, Shigella sonnei, Frankiaceae, Streptomyces albus, Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentans, Serratia marcescens, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus (D), Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna.
Вариант осуществления 22. Применение по варианту осуществления 14, где глазное заболевание выбрано из катаракты, возрастной дегенерации желтого пятна, глаукомы, болезни Бехчета, синдрома Фогта-Коянаги-Харада или увеита.
Вариант осуществления 23. Способ скрининга лекарственного средства, включающий: (1) нанесение лекарственного средства на модель варианта осуществления 13; (2) анализ результатов.
Вариант осуществления 24. Способ по варианту осуществления 23, где лекарственное средство включает одно или несколько из химического лекарственного средства, биологического лекарственного средства или природного лекарственного средства.
Вариант осуществления 25. Лекарственное средство, которое идентифицируют способом по варианту осуществления 23.
Дополнительные иллюстративные варианты осуществления B1-B104
Настоящее изобретение также предоставляет следующие дополнительные иллюстративные варианты осуществления B1-B104.
Вариант осуществления B1. Способ лечения или профилактики возрастной дегенерации желтого пятна (AMD) у субъекта, нуждающегося в этом, включающий введение субъекту терапевтически эффективного количества соединения формулы I, или его фармацевтически приемлемой соли или сложного эфира, или фармацевтической композиции, включающей соединение или его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир:
где:
Cy1 и Cy2, каждый независимо, представляют собой необязательно замещенное циклоалкильное кольцо (например, C3-7 циклоалкильное кольцо), необязательно замещенное гетероциклическое кольцо (например, 4-7-членное гетероциклическое кольцо), необязательно замещенное арильное кольцо (например, C6-10 арильное кольцо), или необязательно замещенное гетероароматическое кольцо (например, 5-10-членное гетероароматическое кольцо);
L и L’, каждый независимо, отсутствуют или представляют собой линкер;
L2 отсутствует, представляет собой необязательно замещенный C1-6 алкилен, необязательно замещенный C1-6 гетероалкилен, необязательно замещенный C2-6 алкенилен, необязательно замещенный C2-6 алкинилен, необязательно замещенный C3-6 циклоалкилен, необязательно замещенный арилен, необязательно замещенный гетероарилен или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклилен,
W представляет собой -OR1; -COR2; -COOR1a; -OCOOR1a; -NR3R4; -CONR3aR4a; -OCONR3bR4b; -SO2NR3cR4c; -OSO2NR3dR4d; -SR5; -SO2R5a; -OCOR2a; -OSO2R5a или 
,
где:
R1 и R1a каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный алкил, необязательно замещенный алкенил, необязательно замещенный алкинил, необязательно замещенный циклоалкил, необязательно замещенный арил, необязательно замещенный гетероарил или необязательно замещенный гетероциклил;
R3 и R4 каждый независимо представляет собой водород, -COR2b, -SO2R5b, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил, или R3 и R4 вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил;
R2, R2a, R2b, R5, R5a и R5b каждый независимо представляет собой водород, -OH, -NR3eR4e, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; и
R3a, R3b, R3c, R3d, R3e, R4a, R4b, R4c, R4d и R4e каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или R3a и R4a, R3b и R4b, R3c и R4c, R3d и R4d, или R3e и R4e, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил.
Вариант осуществления B2. Способ по варианту осуществления B1, где в формуле I, по меньшей мере один из Cy1 и Cy2 представляет собой необязательно замещенное C6-10 арильное кольцо или необязательно замещенное 5-10-членное гетероароматическое кольцо.
Вариант осуществления B3. Способ по варианту осуществления B1, где соединение формулы I имеет формулу I-1:
,
где Ar1 и Ar2, каждый, независимо представляют собой необязательно замещенное C6-10 арильное кольцо или необязательно замещенное 5-10-членное гетероароматическое кольцо.
Вариант осуществления B4. Способ по варианту осуществления B3, где Ar1 и Ar2 в формуле I-1, каждый, независимо представляют собой необязательно замещенное фенильное кольцо или необязательно замещенное 5- или 6-членное гетероароматическое кольцо.
Вариант осуществления B5. Способ по варианту осуществления B3, где Ar1 и Ar2 в формуле I-1, каждый, независимо представляют собой необязательно замещенное фенильное кольцо, необязательно замещенное тиенильное кольцо, необязательно замещенное фуранильное кольцо, необязательно замещенное пиридильное кольцо, или необязательно замещенное пиримидинильное кольцо.
Вариант осуществления B6. Способ по варианту осуществления B1, где соединение формулы I имеет формулу I-2:
,
где:
m имеет значение 0, 1, 2, или 3,
R10 в каждом случае независимо представляет собой галоген, -L2’-W’, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или два смежных R10, или один R10 и L или L’, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное циклоалкильное, гетероциклильное, арильное или гетероарильное кольцо;
где L2’ и W’ имеют определение L2 и W в варианте осуществления B1, соответственно, и -L2’-W’ в каждом случае выбирается независимо.
Вариант осуществления B7. Способ по варианту осуществления B6, где Cy1 в формуле I-2 представляет собой необязательно замещенное фенильное кольцо, необязательно замещенное тиенильное кольцо, необязательно замещенное фуранильное кольцо, необязательно замещенное пиридильное кольцо, или необязательно замещенное пиримидинильное кольцо.
Вариант осуществления B8. Способ по варианту осуществления B6, где Cy1 в формуле I-2 представляет собой необязательно замещенное C3-6 циклоалкильное кольцо или необязательно замещенное 4-7 гетероциклическое кольцо с 1 или 2 кольцевыми гетероатомами, независимо выбранными из N, O, и S.
Вариант осуществления B9. Способ по варианту осуществления B6, где соединение формулы I-2 имеет формулу I-3:
,
где:
n имеет значение 0, 1, 2, или 3,
R11 в каждом случае независимо представляет собой галоген, -L2’-W’, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или два смежных R11, или один R11 и L или L’, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное циклоалкильное, гетероциклильное, арильное или гетероарильное кольцо;
где L2’ и W’ имеют определение L2 и W в варианте осуществления B1, соответственно, и -L2’-W’ в каждом случае выбирается независимо.
Вариант осуществления B10. Способ по любому из вариантов осуществления B1-9, где L и L’ в формуле I, каждый независимо, отсутствуют, представляют собой -C(O)-, необязательно замещенный C1-4 алкилен, необязательно замещенный C2-4 алкенилен, -O-, -S-, -NR100-, -S(O)-, -SO2-, -X1-G1-, -X2-G2-X2a- или -CR101R102-,
где:
X1, X2 и X2a независимо представляют собой необязательно замещенный C1-4 алкилен, необязательно замещенный C2-4 алкенилен, -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-;
G1 и G2 независимо представляют собой необязательно замещенный C1-4 алкилен, необязательно замещенный C2-4 алкенилен, -C(O)-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-;
при условии, что -X1-G1- или -X2-G2-X2a- не содержит связи O-N, S-S, S-N (кроме SO2-N) или -C(O)-S;
R100 и R100a каждый независимо представляют собой неподеленную пару (для данного случая), водород, COR2c, -SO2R5c, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или R100 или R100a образует необязательно замещенное гетероциклическое или гетероарильное кольцо с группой R10 или R11;
R101, R101a, R102, и R102a каждый независимо представляет собой водород, -OH, галоген, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенную аминогруппу, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил, или R101 и R102, или R101a и R102a, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное 3-7-членное циклоалкильное или гетероциклильное кольцо; или один из R101 и R102, или один из R101a и R102a образует необязательно замещенное циклоалкильное или гетероциклильное кольцо вместе с группой R10 или R11; и
R2c и R5c каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил.
Вариант осуществления B11. Способ по варианту осуществления B10, где L и L’ в формуле I, каждый независимо, отсутствуют, представляют собой -O-, -C(O)-, -S-, -NR100-, -S(O)-, -SO2- или -CR101R102-.
Вариант осуществления B12. Способ по варианту осуществления B10, где соединение формулы I имеет формулу согласно любому из I-4 - I-5:
,
где:
X3, X4 и X5, каждый независимо, отсутствуют, представляют собой -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-; и
R10, R11, R100a, R101a, R102a, W, L2, m и n определены выше.
Вариант осуществления B13. Способ по любому из вариантов осуществления B1-12, где L2 в формуле I отсутствует.
Вариант осуществления B14. Способ по любому из вариантов осуществления B1-12, где L2 и в каждом случае L2’ в формуле I, независимо, отсутствуют, представляют собой C1-4 алкилен, C2-4 алкенилен, C2-4 алкинилен или C1-4 гетероалкилен.
Вариант осуществления B15. Способ по любому из вариантов осуществления B1-14, где W и в каждом случае W’ в формуле I независимо представляют собой -OH, -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(C1-4 алкил), -SO2NH(C1-4 алканоил), -COOH, 
, -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил), -OC(O)NH2, -OC(O)NH(C1-4 алкил)-, -O-(CO)-(C1-4 алкил), -O-(C1-4 алкил), где каждый из C1-4 алкила независимо необязательно замещен 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора.
Вариант осуществления B16. Способ по любому из вариантов осуществления B1-15, где W в формуле I представляет собой -OH, -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(Ацетил), -COOH, 
или -O-C(O)-CH3.
Вариант осуществления B17. Способ по любому из вариантов осуществления B12-16, где соединение имеет формулу I-4 или I-5,
где:
L2 и в каждом случае L2’ отсутствуют,
W и в каждом случае W’ независимо представляют собой -OH, -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(C1-4 алкил), -SO2NH(C1-4 алканоил), -COOH, 
, -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил), -OC(O)NH2, , -OC(O)NH(C1-4 алкил)-, -O-(CO)-(C1-4 алкил), -O-(C1-4 алкил), где каждый из C1-4 алкила независимо необязательно замещен 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора;
каждый из R10 и R11 в каждом случае независимо представляет собой F; Cl; -OH; -NH2; -SO2NH2; -SO2NH(C1-4 алкил); -SO2NH(C1-4 алканоил); -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил); -COOH; 
; -OC(O)NH2; -OC(O)NH(C1-4 алкил)-; -O-(CO)-(C1-4 алкил); C1-4 алкил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора; C2-6 алкенил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора; C2-6 алкинил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора; C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила и фтора; C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила и фтора; или C1-4 алкокси, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2, и фтора; и m имеет значение 0, 1, или 2, и n имеет значение 0, 1, 2, или 3.
Вариант осуществления B18. Способ по варианту осуществления B17, где соединение имеет формулу I-4, где X3 и X4, каждый независимо, представляют собой -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a- или -SO2-.
Вариант осуществления B19. Способ по варианту осуществления B17, где соединение имеет формулу I-5, где X5 представляет собой -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a- или -SO2-.
Вариант осуществления B20. Способ по варианту осуществления B18 или 19, где соединение имеет формулу I-4 или I-5, где R100a представляет собой водород или необязательно замещенный C1-4 алкил.
Вариант осуществления B21. Способ по любому из вариантов осуществления B1-20, где соединение формулы I, или его фармацевтически приемлемая соль или сложный эфир, находится в выделенной или по существу очищенной форме.
Вариант осуществления B22. Способ лечения или профилактики возрастной дегенерации желтого пятна (AMD) у субъекта, нуждающегося в этом, включающий введение субъекту терапевтически эффективного количества соединения формулы II, или его фармацевтически приемлемой соли или сложного эфира, или фармацевтической композиции, включающей соединение или его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир:
где:
Cy10 и Cy11, каждый независимо, представляют собой необязательно замещенное циклоалкильное кольцо (например, C3-7 циклоалкильное кольцо), необязательно замещенное гетероциклическое кольцо (например, 4-7-членное гетероциклическое кольцо), необязательно замещенное арильное кольцо (например, C6-10 арильное кольцо), необязательно замещенное гетероароматическое кольцо (например, 5-10-членное гетероароматическое кольцо), или необязательно замещенную кольцевую структуру, содержащую циклоалкильное кольцо или гетероциклическое кольцо, и арильное или гетероарильное кольцо, где кольцевая структура может быть конденсированным кольцом;
L10 отсутствует или представляет собой линкер;
L11 отсутствует, представляет собой необязательно замещенный C1-6 алкилен, необязательно замещенный C1-6 гетероалкилен, необязательно замещенный C2-6 алкенилен, необязательно замещенный C2-6 алкинилен, необязательно замещенный C3-6 циклоалкилен, необязательно замещенный арилен, необязательно замещенный гетероарилен или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклилен;
W10 представляет собой -OR1; -COOR1a; -OCOOR1a; -COR2; -NR3R4; -CONR3aR4a; -OCONR3bR4b; -SO2NR3cR4c; -OSO2NR3dR4d; -SR5; -SO2R5a; -OCOR2a; -OSO2R5a или 
,
где:
R1 и R1a каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный алкил, необязательно замещенный алкенил, необязательно замещенный алкинил, необязательно замещенный циклоалкил, необязательно замещенный арил, необязательно замещенный гетероарил или необязательно замещенный гетероциклил;
R3 и R4 каждый независимо представляет собой водород, -COR2b, -SO2R5b, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил, или R3 и R4 вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил;
R2, R2a, R2b, R5, R5a и R5b каждый независимо представляет собой водород, -OH, -NR3eR4e, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; и
R3a, R3b, R3c, R3d, R3e, R4a, R4b, R4c, R4d и R4e каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или R3a и R4a, R3b и R4b, R3c и R4c, R3d и R4d, или R3e и R4e, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил.
Вариант осуществления B23. Способ по варианту осуществления B22, где в формуле II, по меньшей мере один из Cy10 и Cy11 представляет собой необязательно замещенное C6-10 арильное кольцо, или необязательно замещенное 5-10-членное гетероарильное кольцо.
Вариант осуществления B24. Способ по варианту осуществления B22, где соединение формулы II имеет формулу II-1:
,
где Ar10 и Ar11, каждый независимо, представляют собой необязательно замещенный C6-10 арильное кольцо, или необязательно замещенное 5-10-членное гетероарильное кольцо.
Вариант осуществления B25. Способ по варианту осуществления B24, где Ar10 и Ar11 в формуле II-1, каждый, независимо представляют собой необязательно замещенное фенильное кольцо или необязательно замещенное 5- или 6-членное гетероарильное кольцо.
Вариант осуществления B26. Способ по варианту осуществления B24, где Ar10 и Ar11 в формуле II-1, каждый, независимо представляют собой необязательно замещенное фенильное кольцо, необязательно замещенное тиенильное кольцо, необязательно замещенное фуранильное кольцо, необязательно замещенное пиридильное кольцо или необязательно замещенное пиримидинильное кольцо.
Вариант осуществления B27. Способ по варианту осуществления B24, где один из Ar10 и Ar11 в формуле II-1 представляет собой бициклическое арильное или бициклическое гетероарильное кольцо, каждое из которых необязательно замещено.
Вариант осуществления B28. Способ по варианту осуществления B24, где соединение формулы II имеет формулу II-2:
,
где m имеет значение 0, 1, 2, или 3,
R20 в каждом случае независимо представляет собой галоген, -L11’-W10’, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил;
или два смежных R20, или один R20 и L10 или L11, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное циклоалкильное, гетероциклильное, арильное или гетероарильное кольцо;
где L11’ и W10’ имеют определение L11 и W10 в варианте осуществления B26, соответственно, и -L11’-W10’ в каждом случае выбирается независимо.
Вариант осуществления B29. Способ по варианту осуществления B22, где соединение формулы II имеет формулу II-3:
,
где:
Ar10 представляет собой необязательно замещенное C6-10 арильное кольцо или необязательно замещенное 5-10-членное гетероарильное кольцо;
m имеет значение 0, 1, 2, или 3,
R20 в каждом случае независимо представляет собой галоген, -L11’-W10’, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или два смежных R20, или один R20 и L10 или L11, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное циклоалкильное, гетероциклильное, арильное или гетероарильное кольцо;
где L11’ и W10’ имеют определение L11 и W10 в варианте осуществления B26, соответственно, и -L11’-W10’ в каждом случае выбирается независимо; и
кольцо B представляет собой 4-7-членное циклоалкильное кольцо, 4-7-членное гетероциклическое кольцо, фенильное кольцо, 5- или 6-членное гетероарильное кольцо, каждое из которых необязательно замещено.
Вариант осуществления B30. Способ по варианту осуществления B29, где соединение формулы II имеет формулу II-4:
,
где:
n имеет значение 0 или 1,
R21 в каждом случае независимо представляет собой галоген, -L11’-W10’, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил;
где L11’ и W10’ имеют определение L11 и W10 в варианте осуществления B26, соответственно, и -L11’-W10’ в каждом случае выбирается независимо;
X10 и X11, каждый независимо, отсутствуют, представляют собой -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-, в зависимости от валентности;
где R100a представляет собой неподеленную пару (когда применимо), водород, COR2c, -SO2R5c, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или R100a образует необязательно замещенное гетероциклическое или гетероарильное кольцо с группой R20 или R21;
R101a и R102a, когда присутствуют, каждый независимо представляют собой водород, -OH, галоген; необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенную аминогруппу, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил, или R101a и R102a, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное 3-7-членное циклоалкильное или гетероциклильное кольцо; или один из R101a и R102a образует необязательно замещенное циклоалкильное или гетероциклильное кольцо вместе с группой R20 или R21; и
R2c и R5c каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил;
или R20 или R21 и L10, X10 или X11, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное циклоалкильное, гетероциклильное, арильное или гетероарильное кольцо.
Вариант осуществления B31. Способ по варианту осуществления B30, где соединение имеет формулу II-5:
Вариант осуществления B32. Способ по любому из вариантов осуществления B22-31, где L10 в формуле II отсутствует, представляет собой -C(O)-, необязательно замещенный C1-4 алкилен, необязательно замещенный C2-4 алкенилен, необязательно замещенный C3-6 циклоалкилен, необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклилен, необязательно замещенный фенилен, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарилен, -O-, -S-, -NR100-, -S(O)-, -SO2-, -X1-G1-, -X2-G2-X2a-, -X12-G10-, -X13-G11-X13a-, или -CR101R102-,
где:
X1, X2 и X2a независимо представляют собой необязательно замещенный C1-4 алкилен, необязательно замещенный C2-4 алкенилен, необязательно замещенный C3-6 циклоалкилен, необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклилен, необязательно замещенный фенилен, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарилен, -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-;
G1 и G2 независимо представляют собой необязательно замещенный C1-4 алкилен, необязательно замещенный C2-4 алкенилен, необязательно замещенный C3-6 циклоалкилен, необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклилен, необязательно замещенный фенилен, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарилен, -C(O)-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-;
при условии, что -X1-G1- или -X2-G2-X2a- не содержит связь O-N, S-S, S-N (кроме связи SO2-N) или -C(O)-S;
X12, X13 и X13a независимо представляют собой необязательно замещенный C1-4 алкилен, необязательно замещенный C2-4 алкенилен, необязательно замещенный C3-6 циклоалкилен, необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклилен, необязательно замещенный фенилен, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарилен, -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-;
и G10 и G11 независимо представляют собой -X1-G1- или -X2-G2-X2a-;
при условии, что -X12-G10- или -X13-G11-X13a- не содержит связь O-O, O-N, S-S, S-N (кроме связи SO2-N), или -C(O)-S или трех (или более) последовательных гетероатомов, за исключением O-SO2-O, O-SO2-N и N-SO2-N;
R100 и R100a каждый независимо представляют собой неподеленную пару (для данного случая), водород, COR2c, -SO2R5c, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил,
R101, R101a, R102 и R102a каждый независимо представляет собой водород, -OH, галоген; необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенную аминогруппу, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил, или R101 и R102, или R101a и R102a, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное 3-7-членное циклоалкильное или гетероциклильное кольцо.
Вариант осуществления B33. Способ по варианту осуществления B30, где соединение имеет формулу II-4, и L10 отсутствует.
Вариант осуществления B34. Способ по варианту осуществления B32, где L10 в формуле II отсутствует, представляет собой -O-, -C(O)-, -S-, -NR100-, -S(O)-, -SO2- или -CR101R102-.
Вариант осуществления B35. Способ по варианту осуществления B32, где L10 в формуле II представляет собой -X1-G1- или -X2-G2-X2a-
где:
X1, X2, и X2a независимо представляют собой -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-; и
G1 и G2 независимо представляют собой -C(O)-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-.
Вариант осуществления B36. Способ по варианту осуществления B32, где L10 в формуле II представляет собой -X12-G10-,
где:
X12 представляет собой необязательно замещенный C2-4 алкенилен, и G10 представляет собой -X1-G1- или -X2-G2-X2a-;
где:
X1, X2 и X2a независимо представляют собой -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-; и
G1 и G2 независимо представляют собой -C(O)-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-.
Вариант осуществления B37. Способ по варианту осуществления B36, где X12 представляет собой 
.
Вариант осуществления B38. Способ по варианту осуществления B32, где L10 в формуле II представляет собой 
или 
.
Вариант осуществления B39. Способ по варианту осуществления B28, где соединение имеет формулу II-6 или II-7:
, или 
,
где:
p имеет значение 0, 1, 2, 3, или 4,
R22 в каждом случае независимо представляет собой галоген, -L11’-W10’, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или два смежных R22 вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное циклоалкильное, гетероциклильное, арильное или гетероарильное кольцо;
где L11’ и W10’ имеют определение L11 и W10 в варианте осуществления B26, соответственно, и -L11’-W10’ в каждом случае выбирается независимо.
Вариант осуществления B40. Способ по любому из вариантов осуществления B22-39, где L11 и каждый L11’ в формуле II, независимо, отсутствуют, представляют собой, C1-4 алкилен, C2-4 алкенилен, C2-4 алкинилен или C1-4 гетероалкилен.
Вариант осуществления B41. Способ по любому из вариантов осуществления B22-40, где W10 и каждый W10’ в формуле II независимо представляют собой -OH, -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(C1-4 алкил), -SO2NH(C1-4 алканоил), -COOH, 
, -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил), -OC(O)NH2, , -OC(O)NH(C1-4 алкил)-, -O-(CO)-(C1-4 алкил), -O-(C1-4 алкил), где каждый из C1-4 алкила независимо необязательно замещен 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора.
Вариант осуществления B42. Способ по любому из вариантов осуществления B22-41, где W10 в формуле II представляет собой -OH, -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(Ацетил), -OMe, -COOH, 
или -O-C(O)-CH3.
Вариант осуществления B43. Способ по варианту осуществления B28, где соединение имеет формулу согласно любой из II-8 - II-10:
,
или
,
где m имеет значение 1 или 2, p имеет значение 1, 2, или 3,
каждый из R20 и R22 в каждом случае независимо представляет собой F; Cl; -OH; -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(C1-4 алкил), -SO2NH(C1-4 алканоил), -COOH; 
; -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил), -OC(O)NH2; -OC(O)NH(C1-4 алкил)-; -O-(CO)-(C1-4 алкил); -O-(C1-6 алкил); -O-(C2-6 алкенил); C1-6 алкил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-6 алкокси, -OH, -NH2, и фтора; или C2-6 алкенил, необязательно замещенный 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-6 алкокси, -OH, -NH2 и фтора.
Вариант осуществления B44. Способ по варианту осуществления B39-43, где структурная единица 
выбрана из
Вариант осуществления B45. Способ по варианту осуществления B22, где соединение представляет собой
или 
Вариант осуществления B46. Способ по варианту осуществления B22, где соединение представляет собой
Вариант осуществления B47. Способ по любому из вариантов осуществления B22-46, где соединение формулы II, или его фармацевтически приемлемая соль или сложный эфир, находится в выделенной или по существу очищенной форме.
Вариант осуществления B48. Способ лечения или профилактики возрастной дегенерации желтого пятна (AMD) у субъекта, нуждающегося в этом, включающий введение субъекту терапевтически эффективного количества соединения формулы III, или его фармацевтически приемлемой соли или сложного эфира, или фармацевтической композиции, включающей соединение, или его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир:
,
где Ar20 представляет собой необязательно замещенное арильное кольцо (например, C6-10 арильное кольцо), или необязательно замещенное гетероарильное кольцо (например, 5-10-членное гетероарильное кольцо);
L20 отсутствует, представляет собой необязательно замещенный C1-6 алкилен, необязательно замещенный C1-6 гетероалкилен, необязательно замещенный C2-6 алкенилен, необязательно замещенный C2-6 алкинилен, необязательно замещенный C3-6 циклоалкилен, необязательно замещенный арилен, необязательно замещенный гетероарилен или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклилен,
W20 представляет собой -OR1; -COR2; -COOR1a; -OCOOR1a; -NR3R4; -CONR3aR4a; -OCONR3bR4b; -SO2NR3cR4c; -OSO2NR3dR4d; -SR5; -SO2R5a; -OCOR2a; -OSO2R5a; или 
,
где:
R1 и R1a каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный алкил, необязательно замещенный алкенил, необязательно замещенный алкинил, необязательно замещенный циклоалкил, необязательно замещенный арил, необязательно замещенный гетероарил или необязательно замещенный гетероциклил;
R3 и R4 каждый независимо представляет собой водород, -COR2b, -SO2R5b, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил, или R3 и R4 вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил;
R2, R2a, R2b, R5, R5a и R5b каждый независимо представляет собой водород, -OH, -NR3eR4e, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; и
R3a, R3b, R3c, R3d, R3e, R4a, R4b, R4c, R4d и R4e каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или R3a и R4a, R3b и R4b, R3c и R4c, R3d и R4d, или R3e и R4e, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил.
Вариант осуществления B49. Способ по варианту осуществления B48, где Ar20 в формуле III представляет собой необязательно замещенное фенильное кольцо или необязательно замещенное 5- или 6-членное гетероарильное кольцо.
Вариант осуществления B50. Способ по варианту осуществления B48, где Ar20 в формуле III представляет собой необязательно замещенное фенильное кольцо, необязательно замещенное тиенильное кольцо, необязательно замещенное фуранильное кольцо, необязательно замещенное пиридильное кольцо или необязательно замещенное пиримидинильное кольцо.
Вариант осуществления B51. Способ по варианту осуществления B48, где Ar20 в формуле III представляет собой бициклическое арильное или бициклическое гетероарильное кольцо, каждое из которых необязательно замещено.
Вариант осуществления B52. Способ по варианту осуществления B48, где соединение формулы III имеет формулу III-1, III-2 или III-3:
,
где m имеет значение 0, 1, 2, или 3; n имеет значение 0, 1, 2, или 3;
каждый из R30 и R31 в каждом случае независимо представляет собой галоген, -L20’-W20’, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил;
где L20’ и W20’ имеют определение L20 и W20 в варианте осуществления B53, соответственно, и -L20’-W20’ в каждом случае выбирается независимо;
кольцо B представляет собой 4-7-членное циклоалкильное кольцо, 4-7-членное гетероциклическое кольцо, фенильное кольцо, 5- или 6-членное гетероарильное кольцо, каждое из которых необязательно замещено 1-3 независимо выбранными R31;
X20 и X21, каждый независимо, отсутствуют, представляют собой -O-, -C(O)-, -S-, -NR100a-, -S(O)-, -SO2- или -CR101aR102a-, в зависимости от валентности;
где R100a представляет собой неподеленную пару (когда применимо), водород, COR2c, -SO2R5c, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил,
R101a и R102a каждый независимо представляет собой водород, -OH, галоген; необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенную аминогруппу, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил, или R101a и R102a, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное 3-7-членное циклоалкильное или гетероциклильное кольцо; и
R2c и R5c каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил;
или два смежных R30 или два смежных R31, или R30 или R31 и X20 или X21, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное циклоалкильное, гетероциклильное, арильное или гетероарильное кольцо.
Вариант осуществления B53. Способ по любому из вариантов осуществления B48-52, где L20 в формуле III отсутствует.
Вариант осуществления B54. Способ по любому из вариантов осуществления B48-52, где L20 и каждый L20’ в формуле III, независимо, отсутствуют, представляют собой, C1-4 алкилен, C2-4 алкенилен, C2-4 алкинилен или C1-4 гетероалкилен.
Вариант осуществления B55. Способ по любому из вариантов осуществления B48-54, где W20 в каждом случае W20’ в формуле III независимо представляют собой -OH, -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(C1-4 алкил), -SO2NH(C1-4 алканоил), -COOH, 
, -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил),-OC(O)NH2, , -OC(O)NH(C1-4 алкил)-, -O-(CO)-(C1-4 алкил), -O-(C1-4 алкил), где каждый из C1-4 алкила независимо необязательно замещен 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора.
Вариант осуществления B56. Способ по любому из вариантов осуществления B48-55, где W20 в формуле III представляет собой -OH, , -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(Ацетил), -COOH, 
, -C(O)-(O-C8 алкил), или -O-C(O)-CH3.
Вариант осуществления B57. Способ по любому из вариантов осуществления B52-56, где каждый из R30 и R31 в каждом случае независимо представляет собой -OH, C2-6 алкенил, -O-(C1-4 алкил), -COOH или -C(O)(O-C1-10 алкил).
Вариант осуществления B58. Способ по любому из вариантов осуществления B52-56, где каждый из R30 и R31 в каждом случае представляет собой -OH или -OMe.
Вариант осуществления B59. Способ по любому из вариантов осуществления B52-58, где, когда применимо, m имеет значение 2 или 3.
Вариант осуществления B60. Способ по любому из вариантов осуществления B52-58, где, когда применимо, n имеет значение 1, 2 или 3.
Вариант осуществления B61. Способ по варианту осуществления B48, где соединение представляет собой
или
Вариант осуществления B62. Способ по любому из вариантов осуществления B48-61, где соединение формулы III, или его фармацевтически приемлемая соль или сложный эфир, находится в выделенной или по существу очищенной форме.
Вариант осуществления B63. Способ лечения или профилактики возрастной дегенерации желтого пятна (AMD) у субъекта, нуждающегося в этом, включающий введение субъекту терапевтически эффективного количества соединения формулы IV-1 или IV-2, или его фармацевтически приемлемой соли или сложного эфира, или фармацевтической композиции, включающей соединение или его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир:
,
где:
R40 представляет собой водород; -COR2; -COOR1a; -SO2R5a; необязательно замещенный алкил, необязательно замещенный алкенил, необязательно замещенный алкинил, необязательно замещенный циклоалкил, необязательно замещенный арил, необязательно замещенный гетероарил или необязательно замещенный гетероциклил;
R41 представляет собой -OR1; -OCOOR1a; -OCONR3bR4b; -OCOR2a; или -OSO2R5a; n имеет значение 0 или 1;
R42, R43 и R44 каждый независимо представляет собой водород, -OR1, OCOR2a; или -OSO2R5a;
L30 отсутствует или представляет собой метилен,
W30 представляет собой -OR1; -COR2; -COOR1a; -OCOOR1a; -NR3R4; -CONR3aR4a; -OCONR3bR4b; -OSO2NR3dR4d; -OCOR2a; или -OSO2R5a
где:
R1 и R1a каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный алкил, необязательно замещенный алкенил, необязательно замещенный алкинил, необязательно замещенный циклоалкил, необязательно замещенный арил, необязательно замещенный гетероарил или необязательно замещенный гетероциклил;
R3 и R4 каждый независимо представляет собой водород, -COR2b, -SO2R5b, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил, или R3 и R4 вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил;
R2, R2a, R2b, R5, R5a и R5b каждый независимо представляет собой водород, -OH, -NR3eR4e, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; и
R3a, R3b, R3c, R3d, R3e, R4a, R4b, R4c, R4d и R4e каждый независимо представляет собой водород, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C1-6 алкокси, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенный фенил; необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил; или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или R3a и R4a, R3b и R4b, R3c и R4c, R3d и R4d, или R3e и R4e, вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил.
Вариант осуществления B64. Способ по варианту осуществления B63, где соединение формулы IV-1 или IV-2 имеет формулу в соответствии с одной из формул IV-3 - IV-6:
или 
,
где R45 представляет собой водород или метил.
Вариант осуществления B65. Способ по варианту осуществления B63 или 64, где R40 представляет собой водород, C1-4 алкил, или C1-4 алканоил.
Вариант осуществления B66. Способ по любому из вариантов осуществления B63-65, где L30 отсутствует или представляет собой CH2.
Вариант осуществления B67. Способ по любому из вариантов осуществления B63-66, где W30 представляет собой -OH, -NH2, -OSO2NH2, -COOH, -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил), -OC(O)NH2, -OC(O)NH(C1-4 алкил)-, -O-(CO)-(C1-4 алкил), -O-(C1-4 алкил), где каждый из C1-4 алкила независимо необязательно замещен 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора.
Вариант осуществления B68. Способ по любому из вариантов осуществления B63-67, где W30 представляет собой -OH, -NH2, -OSO2NH2, -C(O)-(O-C8 алкил), -COOH, or -OC(O)NH2.
Вариант осуществления B69. Способ по варианту осуществления B63, где соединение имеет следующую формулу:
Вариант осуществления B70. Способ лечения или профилактики возрастной дегенерации желтого пятна (AMD) у субъекта, нуждающегося в этом, включающий введение субъекту терапевтически эффективного количества гликозида или его фармацевтически приемлемой соли или сложного эфира, или фармацевтической композиции, включающей гликозид или его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир, где агликон гликозида представляет собой фенольное соединение, флавоноид, кумарин, бензойную кислоту или стерол.
Вариант осуществления B71. Способ по варианту осуществления B70, где гликозид представляет собой глюкозид.
Вариант осуществления B72. Способ по варианту осуществления B70, где гликозид представляет собой амфифильный гликозид.
Вариант осуществления B73. Способ по варианту осуществления B70, где гликозид представляет собой сапонин.
Вариант осуществления B74. Способ по варианту осуществления B70, где гликозид имеет формулу V:
,
где каждый R50 независимо представляет собой водород, -L50-D, кислород-защитную группу или остаток сахара;
L50 отсутствует или представляет собой -C(O)-;
D представляет собой необязательно замещенный арил (например, C6-10 арил), необязательно замещенный гетероарил (например, 5-14-членный гетероарил), необязательно замещенное конденсированное кольцо, содержащее два или более колец, независимо выбранных из арила, гетероарила, циклоалкила и гетероциклила (например, 8-14-членный (например, бензоконденсированный циклоалкил/гетероциклил, пиридоконденсированный циклоалкил/гетероциклил) или стероидный остаток, имеющий формулу V-A:
где 
может соединяться с формулой V-A через стероидный каркас или любую группу (группы) R51, в зависимости от валентности,
где R51 в каждом случае независимо представляет собой необязательно замещенный алкил, необязательно замещенный алкенил, необязательно замещенный алкинил, -OH, необязательно замещенный кислород-защитной группой, оксо, галоген, необязательно замещенный циклоалкил, необязательно замещенный алкокси, необязательно замещенный циклоалкокси, необязательно замещенную аминогруппу, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный гетероарил, или необязательно замещенный гетероциклил, или две группы R51 вместе с атомами, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное циклоалкильное, гетероциклильное, арильное или гетероарильное кольцо;
m представляет собой целое число от 1 до 8; и
где -L50-D в каждом случае выбирается независимо.
Вариант осуществления B75. Способ по варианту осуществления B74, где каждый R50 представляет собой водород.
Вариант осуществления B76. Способ по варианту осуществления B74, где от одного до четырех R50 представляют собой независимо выбранный -L50-D.
Вариант осуществления B77. Способ по любому из вариантов осуществления B74-76, где L50 в каждом случае отсутствует.
Вариант осуществления B78. Способ по любому из вариантов осуществления B74-76, где L50 в каждом случае представляет собой -C(O)-.
Вариант осуществления B79. Способ по любому из вариантов осуществления B74-78, где D представляет собой необязательно замещенное кольцо, выбранное из
,
где
R100a представляет собой неподеленную пару (когда применимо), водород, азотзащитную группу, необязательно замещенный C1-6 алкил, необязательно замещенный C2-6 алкенил, необязательно замещенный C2-6 алкинил, необязательно замещенный C3-6 циклоалкил, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный 5- или 6-членный гетероарил, или необязательно замещенный 4-7-членный гетероциклил; или R100a образует необязательно замещенное гетероциклическое или гетероарильное кольцо с фенильным кольцом;
где 
может соединяться с D через любое из доступных положений, и
каждая из кольцевых систем D необязательно замещена 1-5 заместителями, каждый независимо выбран из -OH, -COOH, -C(O)(O-C1-10 алкил), -C(O)(O-C2-10 алкенил), -OC(O)NH2, -OC(O)NH(C1-4 алкил)-, -O-(CO)-(C1-4 алкил), -NH2, -SO2NH2, -SO2NH(C1-4 алкил), -SO2NH(C1-4 алканоил), галогена, необязательно замещенного C1-6 алкила, необязательно замещенного C2-6 алкенила, необязательно замещенного C2-6 алкинила, необязательно замещенного C3-6 циклоалкила, необязательно замещенного C1-6 алкокси, необязательно замещенного C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенной аминогруппы, необязательно замещенного фенила, необязательно замещенного 5- или 6-членного гетероарила, или необязательно замещенного 4-7-членного гетероциклила.
Вариант осуществления B80. Способ по варианту осуществления B79, где каждая из кольцевых систем D необязательно замещена 1-5 заместителями, каждый независимо выбран из F; Cl; -OH; -COOH; -C(O)(O-C1-10 алкил); -C(O)(O-C2-10 алкенил); -OC(O)NH2; -OC(O)NH(C1-4 алкил)-; -O-(CO)-(C1-4 алкил); -NH2; -SO2NH2; -SO2NH(C1-4 алкил); -SO2NH(C1-4 алканоил); C1-4 алкила, необязательно замещенного 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора; C2-6 алкенила, необязательно замещенного 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора; C2-6 алкинила, необязательно замещенного 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2 и фтора; C3-6 циклоалкила, необязательно замещенного 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила и фтора; C3-6 циклоалкокси, необязательно замещенного 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила и фтора; или C1-4 алкокси, необязательно замещенного 1-3 заместителями, независимо выбранными из C1-4 алкила, C1-4 алкокси, -OH, -NH2, и фтора.
Вариант осуществления B81. Способ по варианту осуществления B79, где D выбран из:
,
где каждая фенольная группа ОН необязательно связана с сахаром через гликозидную связь.
Вариант осуществления B82. Способ по любому из вариантов осуществления B74-78, где D представляет собой
,
где R52 представляет собой необязательно замещенный алкил или необязательно замещенный алкенил,
где каждая из оставшихся -ОН-групп в D необязательно связана с сахаром через гликозидную связь.
Вариант осуществления B83. Способ по варианту осуществления B82, где R52 представляет собой 
.
Вариант осуществления B84. Способ по любому из вариантов осуществления B74 и 76-83, где один или несколько (например, 1 или 2) R50 представляет собой остаток сахара, который соединяется с остатком формулы V через гликозидную связь.
Вариант осуществления B85. Способ по варианту осуществления B84, где остаток сахара представляет собой остаток глюкозы или остаток рамнозы.
Вариант осуществления B86. Способ по варианту осуществления B70, где гликозид представляет собой соединение, выбранное из:
, и 
.
Вариант осуществления B87. Способ лечения или профилактики возрастной дегенерации желтого пятна (AMD) у субъекта, нуждающегося в этом, включающий введение субъекту терапевтически эффективного количества соединения, выбранного из соединений 1-8, или его фармацевтически приемлемой соли или сложного эфира, или фармацевтической композиции, включающей соединение или его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир:
7, и 8.
Вариант осуществления B88. Способ по варианту осуществления B87, где соединение или фармацевтическая композиция, вводимые субъекту, не содержат или практически не содержат по меньшей мере одно из соединений, выбранных из соединений 1-8, или его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир.
Вариант осуществления B89. Способ по варианту осуществления B87, где вводимое соединение находится в выделенной форме или по существу в чистой форме.
Вариант осуществления B90. Способ по варианту осуществления B87, где вводимое соединение получено из синтетического источника.
Вариант осуществления B91. Способ по любому из вариантов осуществления B1-90, дополнительно включающий идентификацию или, уже идентифицированного, субъекта как инфицированного, например, во внутриглазном пространстве, микроорганизмом.
Вариант осуществления B92. Способ по варианту осуществления B91, где микроорганизм включает Bacillus megaterium.
Вариант осуществления B93. Способ по варианту осуществления B91, где микроорганизм включает один или несколько организмов, выбранных из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, и Xanthomonas oryzae.
Вариант осуществления B94. Способ по любому из вариантов осуществления B91-93, где соединение или его фармацевтически приемлемая соль или сложный эфир, или фармацевтическая композиция вводится субъекту в количестве, эффективном для уничтожения или ингибирования роста микроорганизмов в глазу (например, внутриглазное пространство), крови и/или желудочно-кишечном тракте, например, кишечнике субъекта.
Вариант осуществления B95. Способ по любому из вариантов осуществления B91-94, где фармацевтическую композицию вводят перорально.
Вариант осуществления B96. Способ по любому из вариантов осуществления B91-95, где фармацевтическую композицию вводят местно, интравитреально, внутримышечно, подкожно или внутривенно.
Вариант осуществления B97. Способ уничтожения или ингибирования роста микроорганизма, такого как Bacillus megaterium, лечения инфекции (например, глазной инфекции, например, во внутриглазном пространстве), связанной с микроорганизмом, и/или лечения или профилактики возрастной дегенерации желтого пятна (AMD) у субъекта, нуждающегося в этом, включающий введение субъекту эффективного количества антибиотика, такого как антибиотик, выбранный из амикацина, амоксициллина, ампициллина, арсфенамина, азитромицина, азлоциллина, азтреонама, бацитрацина, капреомицина, карбенициллина, цефаклора, цефадроксила, цефалексина, цефалотина, цефамандола, цефазолина, цефдинира, цефдиторена, цефиксима, цефоперазона, цефотаксима, цефокситина, цефподоксима, цефпрозила, цефтазидима, цефтибутена, цефтизоксима, цефтриаксона, цефуроксима, хлорамфеникола, циластатина, кларитромицина, клавуланата, клиндамицина, клофазимина, клоксациллина, колистина, циклосерина, дальфопристина, дапсона, даптомицина, диклоксациллина, диритромицина, дорипенема, доксициклина, эритромицина, этамбутола, этионамида, флуклоксациллина, фосфомицина, фуразолидона, фузидовой кислоты, гентамицина, имипенема, изониазида, канамицина, линкомицина, линезолида, лоракарбефа, мафенида, меропенема, метициллина, метронидазола, мезлоциллина, миноциклина, мупироцина, нафциллина, неомицина, нетилмицина, нитрофурантоина, оксациллина, окситетрациклина, паромомицина, пенициллина G, пенициллина V, пиперациллина, платенсимицина, полимиксина B, пиразинамида, квинупристина, рапамицина, рифабутина, рифампицина, рифампина, рифапентина, рифаксимина, рокситромицина, сульфадиазина серебра, спектиномицина, стрептомицина, сульбактама, сульфацетамида, сульфадиазина, сульфаметизола, сульфаметоксазола, сульфанилимида, сульфасалазина, сульфизоксазола, тазобактама, тейкопланина, телаванцина, телитромицина, темоциллина, тетрациклина, тиамфеникола, тикарциллина, тигециклина, тинидазола, тобрамицина, триметоприма, тролеандомицин ванкомицина, эноксацина, ломефлоксацина, налидиксовой кислоты, ципрофлоксацина, левофлоксацина, гатифлоксацина, моксифлоксацина, офлоксацина, норфлоксацина, цефотетана, цефоницида, цефрадина, цефапирина, цефалотина, цефметазола, цефотаксима, моксалактама, цефепима, цефтаролин фозамила, цефтобипрола, далбаванцина, демеклоциклина, метациклина, эртапенема, фидаксомицина, гелданамицина, гербимицина, позизолида, радезолида, торезолида, оритаванцина, спирамицина, сульфадиметоксина, сульфонамидохризоидина, гемифлоксацин надифлоксацин тровафлоксацин грепафлоксацин спарфлоксацин темафлоксацина, теиксобактина, малацидина, и их комбинаций, или его фармацевтически приемлемой соли.
Вариант осуществления B98. Способ по варианту осуществления B97, дополнительно включающий идентификацию, или уже идентифицированного, субъекта как инфицированного, например, во внутриглазном пространстве, микроорганизмом, выбранным из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, и Xanthomonas oryzae.
Вариант осуществления B99. Способ по варианту осуществления B98, где микроорганизм включает Bacillus megaterium.
Вариант осуществления B100. Способ по варианту осуществления B97 или 98, где антибиотик или его фармацевтически приемлемую соль вводят субъекту в количестве, эффективном для уничтожения или ингибирования роста микроорганизма в глазу (например, внутриглазное пространство), крови и/или желудочно-кишечном тракте, например кишечнике субъекта.
Вариант осуществления B101. Способ уничтожения или ингибирования роста микроорганизма, такого как Bacillus megaterium, лечения инфекции (например, глазной инфекции, например, во внутриглазном пространстве), связанной с микроорганизмом, и/или лечения или профилактики возрастной дегенерации желтого пятна (AMD) у субъекта, нуждающегося в этом, включающий введение субъекту терапевтически эффективного количества экстракта одного или нескольких TCM, выбранных из солодки (например, Glycyrrhiza uralensis), корня белого пиона (например, Cynanchum otophyllum), форзиции (например, Forsythia suspense), плодов померанца (например, Citrus aurantium L.), ремании клейкой (например, Rehmannia glutinosa Libosch), кожуры мандарина (например, Citrus reticulata Blanco), и женьшеня ложного (например, Panax notoginseng).
Вариант осуществления B102. Способ по варианту осуществления B101, дополнительно включающий идентификацию, или уже идентифицированного, субъекта как инфицированного, например, во внутриглазном пространстве, микроорганизмом, выбранным из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, и Xanthomonas oryzae.
Вариант осуществления B103. Способ по варианту осуществления B102, где микроорганизм включает Bacillus megaterium.
Вариант осуществления B104. Способ по варианту осуществления B101 или 102, где экстракт вводят субъекту в количестве, эффективном для уничтожения или ингибирования роста микроорганизмов в глазу (например, внутриглазное пространство), крови и/или желудочно-кишечном тракте, таком как кишечник субъекта.
Дополнительные иллюстративные варианты осуществления C1-C133
Настоящее изобретение также предоставляет следующие дополнительные иллюстративные варианты осуществления C1-C133.
Вариант осуществления C1. Способ скрининга, включающий:
a) культивирование микроорганизма в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения;
b) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и, необязательно,
c) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые ингибируют рост микроорганизма по сравнению с контролем,
где микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве (например, водянистая влага в передней камере, подвешивающая связка, цилиарное тело, цилиарное тело и мышца, стекловидное тело в задней камере, сетчатка, хориоидея, зрительный нерв, хрусталик или радужка) у субъекта, страдающего глазным заболеванием, по сравнению со здоровым субъектом, где глазное заболевание выбрано из возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), болезни Бехчета (BD), катаракты (Cat), эндофтальмита (EOS), глаукомы (GLA), синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), и их комбинаций.
Вариант осуществления C2. Способ скрининга по варианту осуществления C1, где микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве (например, водянистая влага, стекловидное тело, мягкие друзы) у субъекта, страдающего возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), по сравнению со здоровым субъектом.
Вариант осуществления C3. Способ скрининга по варианту осуществления C1 или 2, где микроорганизм включает один или несколько видов, выбранных из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, и Xanthomonas oryzae.
Вариант осуществления C4. Способ скрининга по любому из вариантов осуществления C1-3, где микроорганизм включает Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida.
Вариант осуществления C5. Способ скрининга по любому из вариантов осуществления C1-3, где микроорганизм представляет собой по существу биологически чистую популяцию Bacillus megaterium.
Вариант осуществления C6. Способ скрининга по любому из вариантов осуществления C1-2, где микроорганизм включает смесь видов микробов, по существу аналогичных тем, которые наблюдаются в водянистой влаге, стекловидном теле и/или мягких друзах субъекта, страдающего возрастной дегенерации желтого пятна.
Вариант осуществления C7. Способ скрининга по любому из вариантов осуществления C1-2, где микроорганизм получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна.
Вариант осуществления C8. Способ скрининга по варианту осуществления C1, где микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего болезнью Бехчета (BD), по сравнению со здоровым субъектом.
Вариант осуществления C9. Способ скрининга по варианту осуществления C1 или 8, где микроорганизм включает один или несколько видов, выбранных из Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, и Meiothermus silvanus(D).
Вариант осуществления C10. Способ скрининга по варианту осуществления C1 или 8, где микроорганизм включает смесь видов микробов, по существу аналогичных тем, которые наблюдаются в водянистой влаге и/или стекловидном теле субъекта, страдающего болезнью Бехчета (BD).
Вариант осуществления C11. Способ скрининга по варианту осуществления C1 или 8, где микроорганизм получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего болезнью Бехчета (BD).
Вариант осуществления C12. Способ скрининга по варианту осуществления C1, где микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего катарактой, по сравнению со здоровым субъектом.
Вариант осуществления C13. Способ скрининга по варианту осуществления C1 или 12, где микроорганизм включает один или несколько видов, выбранных из Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti и Acidovorax ebreus.
Вариант осуществления C14. Способ скрининга по варианту осуществления C1 или 12, где микроорганизм включает смесь видов микробов, по существу аналогичных тем, которые наблюдаются в водянистой влаге и/или стекловидном теле субъекта, страдающего Cat.
Вариант осуществления C15. Способ скрининга по варианту осуществления C1 или 12, где микроорганизм получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего Cat.
Вариант осуществления C16. Способ скрининга по варианту осуществления C1, где микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего GLA, по сравнению со здоровым субъектом.
Вариант осуществления C17. Способ скрининга по варианту осуществления C1 или 16, где микроорганизм включает один или несколько видов, выбранных из Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants, и Serratia marcescens.
Вариант осуществления C18. Способ скрининга по варианту осуществления C1 или 16, где микроорганизм включает смесь видов микробов, по существу аналогичных тем, которые наблюдаются в водянистой влаге и/или стекловидном теле субъекта, страдающего GLA.
Вариант осуществления C19. Способ скрининга по варианту осуществления C1 или 16, где микроорганизм получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего GLA.
Вариант осуществления C20. Способ скрининга по варианту осуществления C1, где микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего VKH, по сравнению со здоровым субъектом.
Вариант осуществления C21. Способ скрининга по варианту осуществления C1 или 20, где микроорганизм включает один или несколько видов, выбранных из Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, и Finegoldia magna.
Вариант осуществления C22. Способ скрининга по варианту осуществления C1 or 20, где микроорганизм включает смесь видов микробов, по существу аналогичных тем, которые наблюдаются в водянистой влаге и/или стекловидном теле субъекта, страдающего VKH.
Вариант осуществления C23. Способ скрининга по варианту осуществления C1 или 20, где микроорганизм получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего VKH.
Вариант осуществления C24. Способ скрининга по любому из вариантов осуществления C1-23, где подвергают скринингу множество тестируемых соединений, и где множество тестируемых соединений включает по меньшей мере одно тестируемое соединение, которое не является известным антибиотиком широкого спектра действия или известным антибиотиком, обладающим эффективностью против одного или нескольких видов микроорганизмов.
Вариант осуществления C25. Способ скрининга по варианту осуществления C24, где множество тестируемых соединений включает по меньшей мере одно тестируемое соединение, которое не является ампициллином, ванкомицином, неомицином, метронидазолом, или тетрациклином.
Вариант осуществления C26. Способ скрининга по любому из вариантов осуществления C1-23, где тестируемое соединение не является известным антибиотиком широкого спектра действия или известным антибиотиком, обладающим эффективностью против одного или нескольких видов микроорганизмов.
Вариант осуществления C27. Способ скрининга по варианту осуществления C26, где тестируемое соединение не представляет собой ампициллин, ванкомицин, неомицин, метронидазол или тетрациклин.
Вариант осуществления C28. Способ скрининга по любому из вариантов осуществления C1-27, где идентификация включает идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые предотвращают видимый рост микроорганизма при максимальной тестируемой концентрации или ниже.
Вариант осуществления C29. Способ скрининга по любому из вариантов осуществления C1-27, где идентификация включает идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые предотвращают образование видимых колоний микроорганизма при максимальной тестируемой концентрации или ниже.
Вариант осуществления C30. Способ скрининга по любому из вариантов осуществления C1-29, дополнительно включающий: d) определение одного или нескольких видов микробов или уже определенные один или несколько видов микробов, как присутствующих в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего глазным заболеванием, по сравнению со здоровым субъектом, где глазное заболевание выбрано из возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), болезни Бехчета (BD), катаракты (Cat), эндофтальмита (EOS), глаукомы (GLA), синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), и их комбинаций.
Вариант осуществления C31. Способ скрининга, включающий:
a) определение одного или нескольких видов микробов или уже определенные один или несколько видов микробов, как присутствующих в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), по сравнению со здоровым субъектом;
b) культивирование микроорганизма, включающего по меньшей мере один из видов микробов в повышенном количестве, в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения;
c) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; и, необязательно,
d) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые ингибируют рост микроорганизма по сравнению с контролем.
Вариант осуществления C32. Способ скрининга по варианту осуществления C31, где микроорганизм включает смесь видов микробов, по существу аналогичных тем, которые наблюдаются в водянистой влаге, стекловидном теле и/или мягких друзах субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна.
Вариант осуществления C33. Способ скрининга по любому из вариантов осуществления C31-32, где микроорганизм получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна.
Вариант осуществления C34. Способ скрининга по любому из вариантов осуществления C1-33, где субъект является человеком-субъектом.
Вариант осуществления C35. Способ получения животной модели, включающий введение микроорганизма и/или инактивированного белка из него во внутриглазное пространство глаза животного, где микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего глазным заболеванием, по сравнению со здоровым субъектом, где глазное заболевание выбрано из катаракты (Cat), возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), глаукомы (GLA), болезни Бехчета (BD), синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), эндофтальмита (EOS), и их комбинаций, и где введение вызывает один или несколько симптомов глазного заболевания.
Вариант осуществления C36. Способ по варианту осуществления C35, где микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), по сравнению со здоровым субъектом.
Вариант осуществления C37. Способ по варианту осуществления C35 или 36, где микроорганизм включает один или несколько видов, выбранных из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, и Xanthomonas oryzae.
Вариант осуществления C38. Способ по любому из вариантов осуществления C35-37, где микроорганизм включает Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida.
Вариант осуществления C39. Способ по любому из вариантов осуществления C35-38, где микроорганизм представляет собой по существу биологически чистую популяцию Bacillus megaterium.
Вариант осуществления C40. Способ по любому из вариантов осуществления C35-36, где микроорганизм включает смесь видов микробов, по существу аналогичных тем, которые наблюдаются в водянистой влаге, стекловидном теле и/или мягких друзах субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна.
Вариант осуществления C41. Способ по любому из вариантов осуществления C35-36, где микроорганизм получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна.
Вариант осуществления C42. Способ по любому из вариантов осуществления C35-41, где животное представляет собой примата, не относящегося к человеку (например, обезьяна).
Вариант осуществления C43. Способ по любому из вариантов осуществления C35-41, где животное не является макакой.
Вариант осуществления C44. Способ по любому из вариантов осуществления C36-43, где микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят в субретинальное пространство животного.
Вариант осуществления C45. Способ по любому из вариантов осуществления C36-44, где микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят для индуцирования друзеноидного поражения, например, на тканях сетчатки у животного.
Вариант осуществления C46. Способ по любому из вариантов осуществления C36-45, где микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят для индуцирования узелков, подобных друзам, например, под слоем пигментного эпителия сетчатки в глазу животного.
Вариант осуществления C47. Способ по любому из вариантов осуществления C36-46, где микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят для индуцирования пироптоза, например, клеток пигментного эпителия сетчатки в глазу животного.
Вариант осуществления C48. Способ по любому из вариантов осуществления C36-47, где микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят для индуцирования активации системы комплемента и/или воспаления в глазу животного, например, с повышенной экспрессией белков C5A, CFH, CASPASE1 и NLRP3.
Вариант осуществления C49. Способ по любому из вариантов осуществления C36-48, где микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят для индуцирования секреции активного IL-1β и/или IL-18, например, клетками пигментного эпителия сетчатки в глазу животного.
Вариант осуществления C50. Животная модель, полученная способом по любому из вариантов осуществления C35-49.
Вариант осуществления C51. Способ скрининга, включающий:
a) введение тестируемого соединения животной модели по варианту осуществления C50;
b) определение степени тяжести одного или нескольких симптомов глазного заболевания после введения; и, необязательно,
c) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые облегчают, по меньшей мере, один из симптомов по сравнению с контролем.
Вариант осуществления C52. Способ скрининга по варианту осуществления C51, где тестируемое соединение вводят перорально, местно, интравитреально, внутримышечно, подкожно или внутривенно.
Вариант осуществления C53. Способ скрининга по варианту осуществления C51 или 52, где идентификация включает идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые по сравнению с контролем a) уменьшают друзеноидное поражение, например, на тканях сетчатки у животного; b) уменьшают узелки, подобные друзам, например, под слоем пигментного эпителия сетчатки в глазу животного; c) уменьшают пироптоз клеток пигментного эпителия сетчатки в глазу животного; d) уменьшают активацию системы комплемента и/или воспаление в глазу животного, например, уменьшают экспрессию белков C5A, CFH, CASPASE1 и NLRP3; e) уменьшают секрецию активного IL-1β и/или IL-18 клетками пигментного эпителия сетчатки в глазу животного; или f) любая комбинация a)-e).
Вариант осуществления C54. Способ скрининга по любому из вариантов осуществления C51-53, где идентификация включает идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые по сравнению с контролем уничтожают или подавляют рост микроорганизма в глазу (например, внутриглазном пространстве или полости), крови и/или желудочно-кишечном тракте, таком как кишечник животной модели.
Вариант осуществления C55. Способ скрининга по любому из вариантов осуществления C51-54, где тестируемое соединение предварительно определено как эффективное для ингибирования роста микроорганизма.
Вариант осуществления C56. Терапевтические средства-кандидаты, идентифицированные любым из способов скрининга вариантов осуществления C1-34 и вариантов осуществления C51-55.
Вариант осуществления C57. Способ лечения или профилактики AMD, включающий: 1) идентификацию, или уже идентифицированного, субъекта как инфицированного одним или несколькими видами, выбранными из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, и Xanthomonas oryzae, например, во внутриглазном пространстве, и 2) введение субъекту эффективного количества антибиотика.
Вариант осуществления C58. Способ лечения или профилактики AMD, включающий: 1) выбор субъекта, инфицированного одним или несколькими видами, выбранными из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, и Xanthomonas oryzae, например, во внутриглазном пространстве, и 2) введение субъекту эффективного количества антибиотика.
Вариант осуществления C59. Способ лечения симптома друзы (например, мягкой друзы) у субъекта, нуждающегося в этом, включающий введение субъекту эффективного количества антибиотика.
Вариант осуществления C60. Способ уменьшения друзеноидного поражения, узелков, подобных друзам, пироптоза клеток пигментного эпителия сетчатки глаза; активации системы комплемента и/или воспаление в глазу, и/или секреции активного IL-1β и/или IL-18 клетками пигментного эпителия сетчатки в глазу у субъекта, нуждающегося в этом, включающий введение субъекту эффективного количества антибиотика.
Вариант осуществления C61. Способ по варианту осуществления C59 или 60, где субъект страдает AMD (например, сухой AMD или влажной AMD).
Вариант осуществления C62. Способ по варианту осуществления C59 или 60, где у субъекта имеются мягкие друзы, отложенные между пигментным эпителием сетчатки (RPE) и мембраной Бруха; и/или пигментные изменения сетчатки в макуле.
Вариант осуществления C63. Способ по варианту осуществления C59 или 60, где субъект инфицирован во внутриглазном пространстве одним или несколькими видами, присутствующими в повышенном количестве во внутриглазном пространстве пациента с AMD, по сравнению со здоровым субъектом.
Вариант осуществления C64. Способ по варианту осуществления C59 или 60, где субъект инфицирован во внутриглазном пространстве одним или несколькими видами, выбранными из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, и Xanthomonas oryzae.
Вариант осуществления C65. Способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность лечения или профилактики глазного заболевания, включающий:
получение образца, взятого из водянистой влаги или стекловидного тела субъекта, выбранного из субъекта, страдающего глазным заболеванием, члена семьи или близкого генетического родственника субъекта, страдающего глазным заболеванием, или скончавшегося субъекта, который, как известно, страдал глазным заболеванием;
культивирование одного или нескольких организмов в образце в условиях, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур;
добавление соединения или комбинации соединений к одной или нескольким культурам; и
определение уменьшает ли соединение или комбинация соединений рост или уменьшает популяцию одной или нескольких культур.
Вариант осуществления C66. Способ по варианту осуществления C65, где глазное заболевание выбрано из группы, состоящей из возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), болезни Бехчета (BD), катаракты (Cat), эндофтальмита (EOS), глаукомы (GLA), синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), и их комбинаций.
Вариант осуществления C67. Способ по варианту осуществления C65, где глазное заболевание представляет собой AMD.
Вариант осуществления C68. Способ по любому из вариантов осуществления C65-67, где культивирование включает культивирование одного или нескольких организмов в жидкой среде с отварным мясом.
Вариант осуществления C69. Способ по любому из вариантов осуществления C65-68, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus(D), Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants, Serratia marcescens, Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna, и их комбинаций.
Вариант осуществления C70. Способ по любому из вариантов осуществления C65-68, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, и их комбинаций.
Вариант осуществления C71. Способ по любому из вариантов осуществления C65-70, дополнительно включающий идентификацию, основанную на определении соединения или комбинации соединений, которые уменьшают рост или уменьшают популяцию одной или нескольких культур in vitro.
Вариант осуществления C72. Способ по любому из вариантов осуществления C65-71, где соединение или комбинация соединений представляет собой один или несколько антибиотиков.
Вариант осуществления C73. Способ по любому из вариантов осуществления C65-71, где соединение или комбинация соединений представляет собой экстракт или фракцию одного или нескольких из Calcined ancient ink, Salvia Miltiorrhiza, Arnebiaeuchroma, Radix Isatidis, Houttuynia, Honeysuckle, Rhizoma Coptis, Scutellaria, Dandelion, Purslane, Hawthorn, Isatidis Folium, Fructus Forsythiae, Herba Artemisiae Capillaris, Andrographis Paniculata Nees, Radix Bupleuri, Rhubarb, Euphorbia Humifusa, Stemonae, Garlic, Cortex Phellodendri, Eucommia, Cortex Fraxini, Fructus Cnidii, Galla Chinensis, viola yedoensis makino, Fructus Mume, Radix Glycyrrhizae, Pericarpium Granati, Schisandra chinensis, Spina Gleditsiae, Terminalia Chebula, Sophora flavescens, Cortex Pseudolaricis, Epimedium, и Artemisia apiacea Hance.
Вариант осуществления C74. Способ по варианту осуществления C72, где соединение или комбинация соединений представляет собой комбинацию соединений и дополнительно включает экстракт или фракцию одного или нескольких из Calcined ancient ink, Salvia Miltiorrhiza, Arnebiaeuchroma, Radix Isatidis, Houttuynia, Honeysuckle, Rhizoma Coptis, Scutellaria, Dandelion, Purslane, Hawthorn, Isatidis Folium, Fructus Forsythiae, Herba Artemisiae Capillaris, Andrographis Paniculata Nees, Radix Bupleuri, Rhubarb, Euphorbia Humifusa, Stemonae, Garlic, Cortex Phellodendri, Eucommia, Cortex Fraxini, Fructus Cnidii, Galla Chinensis, viola yedoensis makino, Fructus Mume, Radix Glycyrrhizae, Pericarpium Granati, Schisandra chinensis, Spina Gleditsiae, Terminalia Chebula, Sophora flavescens, Cortex Pseudolaricis, Epimedium, и Artemisia apiacea Hance.
Вариант осуществления C75. Способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность лечения или профилактики глазного заболевания, включающий:
культивирование одного или нескольких организмов в условиях, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus(D), Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants, Serratia marcescens, Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna, и их комбинаций;
добавление соединения или комбинации соединений к одной или нескольким культурам; и
определение уменьшает ли соединение или комбинация соединений рост или уменьшает популяцию одной или нескольких культур.
Вариант осуществления C76. Способ по варианту осуществления C75, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, и их комбинаций.
Вариант осуществления C77. Способ по любому из вариантов осуществления C75-76, где глазное заболевание выбрано из группы, состоящей из возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), болезни Бехчета (BD), катаракты (Cat), эндофтальмита (EOS), глаукомы (GLA), синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), и их комбинаций.
Вариант осуществления C78. Способ по варианту осуществления C77, где глазное заболевание представляет собой AMD.
Вариант осуществления C79. Способ по любому из вариантов осуществления C75-78, где культивирование включает культивирование одного или нескольких организмов в жидкой среде с отварным мясом.
Вариант осуществления C80. Способ по любому из вариантов осуществления C75-79, дополнительно включающий идентификацию, основанную на определении соединения или комбинации соединений, которые уменьшают рост или уменьшают популяцию одной или нескольких культур in vitro.
Вариант осуществления C81. Способ по любому из вариантов осуществления C75-80, где соединение или комбинация соединений представляет собой один или несколько антибиотиков.
Вариант осуществления C82. Способ по любому из вариантов осуществления C75-80, где соединение или комбинация соединений представляет собой экстракт или фракцию одного или нескольких из Calcined ancient ink, Salvia Miltiorrhiza, Arnebiaeuchroma, Radix Isatidis, Houttuynia, Honeysuckle, Rhizoma Coptis, Scutellaria, Dandelion, Purslane, Hawthorn, Isatidis Folium, Fructus Forsythiae, Herba Artemisiae Capillaris, Andrographis Paniculata Nees, Radix Bupleuri, Rhubarb, Euphorbia Humifusa, Stemonae, Garlic, Cortex Phellodendri, Eucommia, Cortex Fraxini, Fructus Cnidii, Galla Chinensis, viola yedoensis makino, Fructus Mume, Radix Glycyrrhizae, Pericarpium Granati, Schisandra chinensis, Spina Gleditsiae, Terminalia Chebula, Sophora flavescens, Cortex Pseudolaricis, Epimedium, и Artemisia apiacea Hance.
Вариант осуществления C83. Способ по варианту осуществления C81, где соединение или комбинация соединений представляет собой комбинацию соединений и дополнительно включает экстракт или фракцию одного или нескольких из Calcined ancient ink, Salvia Miltiorrhiza, Arnebiaeuchroma, Radix Isatidis, Houttuynia, Honeysuckle, Rhizoma Coptis, Scutellaria, Dandelion, Purslane, Hawthorn, Isatidis Folium, Fructus Forsythiae, Herba Artemisiae Capillaris, Andrographis Paniculata Nees, Radix Bupleuri, Rhubarb, Euphorbia Humifusa, Stemonae, Garlic, Cortex Phellodendri, Eucommia, Cortex Fraxini, Fructus Cnidii, Galla Chinensis, viola yedoensis makino, Fructus Mume, Radix Glycyrrhizae, Pericarpium Granati, Schisandra chinensis, Spina Gleditsiae, Terminalia Chebula, Sophora flavescens, Cortex Pseudolaricis, Epimedium, и Artemisia apiacea Hance.
Вариант осуществления C84. Способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность лечения или профилактики глазного заболевания, включающий:
получение образца, взятого из водянистой влаги или стекловидного тела субъекта, выбранного из субъекта, страдающего глазным заболеванием, члена семьи или близкого генетического родственника субъекта, страдающего глазным заболеванием, или скончавшегося субъекта, который, как известно, страдал глазным заболеванием;
культивирование одного или нескольких организмов в образце в условиях, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур; получение раствора одного или нескольких инактивированных белков, полученных из одной или нескольких культур; смешивание соединения или комбинации соединений с раствором одного или нескольких инактивированных белков; и определение связывается ли соединение или комбинация соединений с одним или несколькими инактивированными белками.
Вариант осуществления C85. Способ по варианту осуществления C84, где глазное заболевание выбрано из группы, состоящей из возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), болезни Бехчета (BD), катаракты (Cat), эндофтальмита (EOS), глаукомы (GLA), синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), и их комбинаций.
Вариант осуществления C86. Способ по варианту осуществления C84, где глазное заболевание представляет собой AMD.
Вариант осуществления C87. Способ по любому из вариантов осуществления C84-86, где культивирование включает культивирование одного или нескольких организмов в жидкой среде с отварным мясом.
Вариант осуществления C88. Способ по любому из вариантов осуществления C84-87, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus(D), Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants, Serratia marcescens, Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna, и их комбинаций.
Вариант осуществления C89. Способ по любому из вариантов осуществления C84-87, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, и их комбинаций.
Вариант осуществления C90. Способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность лечения глазного заболевания, включающий:
получение образца, взятого из водянистой влаги или стекловидного тела субъекта, выбранного из субъекта, страдающего глазным заболеванием, члена семьи или близкого генетического родственника субъекта, страдающего глазным заболеванием, или скончавшегося субъекта, который, как известно, страдал глазным заболеванием; культивирование одного или нескольких организмов в образце в условиях, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур; получение раствора одного или нескольких инактивированных белков, полученных из одной или нескольких культур; введение одного или нескольких инактивированных белков в модель воспаления у млекопитающего; введение соединения или комбинации соединений в модель воспаления у млекопитающего; и определение снижает ли соединение или комбинация соединений воспалительную активность в модели.
Вариант осуществления C91. Способ по варианту осуществления C90, где глазное заболевание выбрано из группы, состоящей из возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), болезни Бехчета (BD), катаракты (Cat), эндофтальмита (EOS), глаукомы (GLA), синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), и их комбинаций.
Вариант осуществления C92. Способ по варианту осуществления C90, где глазное заболевание представляет собой AMD.
Вариант осуществления C93. Способ по любому из вариантов осуществления C90-92, где культивирование включает культивирование одного или нескольких организмов в жидкой среде с отварным мясом.
Вариант осуществления C94. Способ по любому из вариантов осуществления C90-93, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus(D), Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants, Serratia marcescens, Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna, и их комбинаций.
Вариант осуществления C95. Способ по любому из вариантов осуществления C90-94, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, и их комбинаций.
Вариант осуществления C96. Способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность лечения или профилактики глазного заболевания, включающий:
культивирование одного или нескольких организмов в условиях, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus(D), Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants, Serratia marcescens, Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna, и их комбинаций;
получение раствора одного или нескольких инактивированных белков, полученных из одной или нескольких культур;
смешивание соединения или комбинации соединений с раствором одного или нескольких инактивированных белков;
и определение связывается ли соединение или комбинация соединений с одним или несколькими инактивированными белками.
Вариант осуществления C97. Способ по варианту осуществления C96, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, и их комбинаций.
Вариант осуществления C98. Способ по любому из вариантов осуществления C96-97, где глазное заболевание выбрано из группы, состоящей из возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), болезни Бехчета (BD), катаракты (Cat), эндофтальмита (EOS), глаукомы (GLA), синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), и их комбинаций.
Вариант осуществления C99. Способ по варианту осуществления C98, где глазное заболевание представляет собой AMD.
Вариант осуществления C100. Способ по любому из вариантов осуществления C96-99, где культивирование включает культивирование одного или нескольких организмов в жидкой среде с отварным мясом.
Вариант осуществления C101. Способ по любому из вариантов осуществления C96-100, дополнительно включающий идентификацию, основанную на определении соединения или комбинации соединений, которые связывают один или несколько инактивированных белков in vitro.
Вариант осуществления C102. Способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность лечения или профилактики глазного заболевания, включающий:
культивирование одного или нескольких организмов в условиях, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus(D), Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants, Serratia marcescens, Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna, и их комбинаций;
получение раствора одного или нескольких инактивированных белков, полученных из одной или нескольких культур;
введение одного или нескольких инактивированных белков в модель воспаления у млекопитающего;
введение соединения или комбинации соединений в модель воспаления у млекопитающего; и
определение снижает ли соединение или комбинация соединений воспалительную активность в модели.
Вариант осуществления C103. Способ по варианту осуществления C102, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, и их комбинаций.
Вариант осуществления C104. Способ по любому из вариантов осуществления C102-103, где глазное заболевание выбрано из группы, состоящей из возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), болезни Бехчета (BD), катаракты (Cat), эндофтальмита (EOS), глаукомы (GLA), синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), и их комбинаций.
Вариант осуществления C105. Способ по варианту осуществления C104, где глазное заболевание представляет собой AMD.
Вариант осуществления C106. Способ по любому из вариантов осуществления C102-105, где культивирование включает культивирование одного или нескольких организмов в жидкой среде с отварным мясом.
Вариант осуществления C107. Способ по любому из вариантов осуществления C102-106, дополнительно включающий идентификацию, основанную на определении соединения или комбинации соединений, которые уменьшают рост или уменьшают популяцию одной или нескольких культур in vitro.
Вариант осуществления C108. Способ по любому из вариантов осуществления C102-107, где соединение или комбинация соединений представляет собой одно или несколько противовоспалительных соединений.
Вариант осуществления C109. Способ по любому из вариантов осуществления C102-107, где соединение или комбинация соединений представляет собой экстракт или фракцию одного или нескольких из Calcined ancient ink, Salvia Miltiorrhiza, Arnebiaeuchroma, Radix Isatidis, Houttuynia, Honeysuckle, Rhizoma Coptis, Scutellaria, Dandelion, Purslane, Hawthorn, Isatidis Folium, Fructus Forsythiae, Herba Artemisiae Capillaris, Andrographis Paniculata Nees, Radix Bupleuri, Rhubarb, Euphorbia Humifusa, Stemonae, Garlic, Cortex Phellodendri, Eucommia, Cortex Fraxini, Fructus Cnidii, Galla Chinensis, viola yedoensis makino, Fructus Mume, Radix Glycyrrhizae, Pericarpium Granati, Schisandra chinensis, Spina Gleditsiae, Terminalia Chebula, Sophora flavescens, Cortex Pseudolaricis, Epimedium, и Artemisia apiacea Hance.
Вариант осуществления C110. Способ по варианту осуществления C108, где соединение или комбинация соединений представляет собой комбинацию соединений и дополнительно включает экстракт или фракцию одного или нескольких из Calcined ancient ink, Salvia Miltiorrhiza, Arnebiaeuchroma, Radix Isatidis, Houttuynia, Honeysuckle, Rhizoma Coptis, Scutellaria, Dandelion, Purslane, Hawthorn, Isatidis Folium, Fructus Forsythiae, Herba Artemisiae Capillaris, Andrographis Paniculata Nees, Radix Bupleuri, Rhubarb, Euphorbia Humifusa, Stemonae, Garlic, Cortex Phellodendri, Eucommia, Cortex Fraxini, Fructus Cnidii, Galla Chinensis, viola yedoensis makino, Fructus Mume, Radix Glycyrrhizae, Pericarpium Granati, Schisandra chinensis, Spina Gleditsiae, Terminalia Chebula, Sophora flavescens, Cortex Pseudolaricis, Epimedium и Artemisia apiacea Hance.
Вариант осуществления C111. Способ получения модели глазного заболевания у млекопитающего, включающий:
введение одного или нескольких микроорганизмов и/или одного или нескольких инактивированных белков одного или нескольких микроорганизмов в глаз млекопитающего, тем самым создавая модель у млекопитающего.
Вариант осуществления C112. Способ по варианту осуществления C111, дополнительно включающий мониторинг развития и прогрессирования одного или нескольких маркеров глазного заболевания.
Вариант осуществления C113. Способ по варианту осуществления C112, где глазное заболевание выбрано из группы, состоящей из возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), болезни Бехчета (BD), катаракты (Cat), эндофтальмита (EOS), глаукомы (GLA), синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), и их комбинаций.
Вариант осуществления C114. Способ по варианту осуществления C112, где глазное заболевание представляет собой AMD.
Вариант осуществления C115. Способ по варианту осуществления C114, дополнительно включающий обеспечение прохождения достаточного времени после введения одного или нескольких микроорганизмов и/или одного или нескольких инактивированных белков одного или нескольких микроорганизмов, для развития у млекопитающего друзеноидных поражений.
Вариант осуществления C116. Способ по любому из вариантов осуществления C112-115, где мониторинг развития и прогрессирования одного или нескольких маркеров глазного заболевания включает мониторинг воспалительной реакции глаза у млекопитающего.
Вариант осуществления C117. Способ по любому из вариантов осуществления C114-115, где мониторинг развития и прогрессирования одного или нескольких маркеров глазного заболевания включает мониторинг формирования или прогрессирования друзеноидных поражений.
Вариант осуществления C118. Способ по любому из вариантов осуществления C112-117, где введение одного или нескольких микроорганизмов и/или одного или нескольких инактивированных белков одного или нескольких микроорганизмов включает внутриглазную инъекцию одного или нескольких микроорганизмов и/или одного или нескольких инактивированных белков одного или нескольких микроорганизмов.
Вариант осуществления C119. Способ по варианту осуществления C118, где внутриглазная инъекция включает инъекцию в стекловидное тело или водянистую влагу млекопитающего.
Вариант осуществления C120. Способ по любому из вариантов осуществления C112-119, где млекопитающее представляет собой примата, не относящегося к человеку.
Вариант осуществления C121. Способ по варианту осуществления C120, где млекопитающее представляет собой макаку.
Вариант осуществления C122. Способ по варианту осуществления C120, где млекопитающее представляет собой примата, не относящегося к человеку, отличного от макаки.
Вариант осуществления C123. Способ по любому из вариантов осуществления C112-122, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, Sphingomonas wittichii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Lactobacillus crispatus, Burkholderia multivorans, Lactobacillus delbrueckii, Meiothermus silvanus(D), Pseudomonas mendocina, Kytococcus sedentarius, Alicycliphilus denitrificans, Achromobacter xylosoxidans, Sphingobium japonicum, Mycobacterium abscessus, Arthrobacter aurescens, Prevotella dentalis, Sinorhizobium meliloti, Acidovorax ebreus, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Comamonas testosteroni, Mycobacterium kansasii, Bacillus thuringiensis, Citrobacter koseri, Dyadobacter fermentants, Serratia marcescens, Escherichia coli, Micrococcus luteus, Bacillus subtilis, Corynebacterium aurimucosum, Finegoldia magna, и их комбинаций.
Вариант осуществления C124. Способ по любому из вариантов осуществления C112-122, где один или несколько организмов выбраны из группы, состоящей из Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Pseudomonas putida, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Lactobacillus reuteri, Gardnerella vaginalis, Enterococcus faecium, Cytophaga hutchinsonii, Bacillus licheniformis, Xanthomonas oryzae, и их комбинаций.
Вариант осуществления C125. Способ скрининга соединения или комбинации соединений на эффективность лечения или профилактики глазного заболевания, включающий:
введение соединения или комбинации соединений модели млекопитающего по любому из вариантов осуществления C112-124; и определение является ли соединение или комбинация соединений эффективным для уменьшения или предотвращения одного или нескольких симптомов глазного заболевания.
Вариант осуществления C126. Способ по варианту осуществления C125, где глазное заболевание выбрано из группы, состоящей из возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), болезни Бехчета (BD), катаракты (Cat), эндофтальмита (EOS), глаукомы (GLA), синдрома Фогта-Коянаги-Харада (VKH), и их комбинаций.
Вариант осуществления C127. Способ по варианту осуществления C125, где глазное заболевание представляет собой AMD.
Вариант осуществления C128. Способ по варианту осуществления C127, где введение соединения или комбинации соединений происходит после образования друзеноидных поражений в модели на млекопитающем.
Вариант осуществления C129. Способ по любому из вариантов осуществления C125-128, где соединение или комбинация соединений представляет собой одно или несколько соединений комбинации соединений, идентифицированных согласно любому из вариантов осуществления C71, 80, 101 и 107.
Вариант осуществления C130. Способ по любому из вариантов осуществления C125-129, где соединение или комбинация соединений выбраны из группы, состоящей из одного или нескольких антибиотиков; одного или нескольких противовоспалительных соединений; экстракта или фракции одного или нескольких из Calcined ancient ink, Salvia Miltiorrhiza, Arnebiaeuchroma, Radix Isatidis, Houttuynia, Honeysuckle, Rhizoma Coptis, Scutellaria, Dandelion, Purslane, Hawthorn, Isatidis Folium, Fructus Forsythiae, Herba Artemisiae Capillaris, Andrographis Paniculata Nees, Radix Bupleuri, Rhubarb, Euphorbia Humifusa, Stemonae, Garlic, Cortex Phellodendri, Eucommia, Cortex Fraxini, Fructus Cnidii, Galla Chinensis, viola yedoensis makino, Fructus Mume, Radix Glycyrrhizae, Pericarpium Granati, Schisandra chinensis, Spina Gleditsiae, Terminalia Chebula, Sophora flavescens, Cortex Pseudolaricis, Epimedium, и Artemisia apiacea Hance; и их комбинаций.
Вариант осуществления C131. Способ по любому из вариантов осуществления C125-130, где введение включает инъекцию соединения или комбинации соединений в глаз модели на млекопитающем.
Вариант осуществления C132. Способ по варианту осуществления C131, где инъекция включает внутриглазную инъекцию.
Вариант осуществления C133. Способ по любому из вариантов осуществления C125-132, где один или несколько симптомов выбраны из группы, состоящей из образования друзеноидных поражений, роста микробов или микробиологической нагрузки, продукции молекулы воспаления или маркера, и их комбинаций.
Определения
Подразумевается, что соответствующие валентности поддерживаются для всех фрагментов и их комбинаций.
Также подразумевается, что конкретный вариант осуществления переменной части в настоящем документе может быть таким же или отличаться от другого конкретного варианта осуществления, имеющего тот же идентификатор.
Подходящие группы для переменных в соединениях формулы I, II, III, IV-1, IV-2, V или любых их подформулах, когда применимо, выбираются независимо. Описанные варианты осуществления настоящего изобретения можно комбинировать. Такая комбинация предусмотрена и входит в объем настоящего изобретения. Например, определения одной из переменных могут быть объединены с любым из определений любых других переменных в формуле I, II, III, IV-1, IV-2, V или любых их подформулах.
Определения конкретных функциональных групп и химических терминов описаны более подробно ниже. Химические элементы идентифицируют в соответствии с Периодической таблицей элементов, версия CAS, Handbook of Chemistry and Physics, 75th Ed., inside cover, и конкретные функциональные группы обычно определяются, как описано в настоящем документе. Кроме того, общие принципы органической химии, а также конкретные функциональные группы и реакционная способность описаны в Thomas Sorrell, Organic Chemistry, University Science Books, Sausalito, 1999; Smith and March, March’s Advanced Organic Chemistry, 5th Edition, John Wiley & Sons, Inc., New York, 2001; Larock, Comprehensive Organic Transformations, VCH Publishers, Inc., New York, 1989; и Carruthers, Some Modern Methods of Organic Synthesis, 3rd Edition, Cambridge University Press, Cambridge, 1987. Описание не предназначено для ограничения каким-либо образом примерным перечислением заместителей, описанных в настоящем документе.
Соединения, описанные в настоящем документе, могут включать один или несколько асимметричных центров и, таким образом, могут существовать в различных изомерных формах, например, энантиомеры и/или диастереомеры. Например, соединения, описанные в настоящем документе, могут быть в форме отдельного энантиомера, диастереомера или геометрического изомера или могут быть в форме смеси стереоизомеров, включая рацемические смеси и смеси, обогащенные одним или несколькими стереоизомерами. Изомеры могут быть выделены из смесей способами, известными специалистам в данной области, включая хиральную высокоэффективную жидкостную хроматографию (ВЭЖХ) и образование и кристаллизацию хиральных солей; или предпочтительные изомеры могут быть получены асимметрическим синтезом. См. например, Jacques et al., Enantiomers, Racemates and Resolutions (Wiley Interscience, New York, 1981); Wilen et al., Tetrahedron 33:2725 (1977); Eliel, Stereochemistry of Carbon Compounds (McGraw-Hill, NY, 1962); и Wilen, Tables of Resolving Agents and Optical Resolutions p. 268 (E.L. Eliel, Ed., Univ. of Notre Dame Press, Notre Dame, IN 1972). Раскрытие дополнительно включает соединения, описанные в настоящем документе, как отдельные изомеры, по существу не содержащие других изомеров, и, альтернативно, как смеси различных изомеров, включая рацемические смеси.
Используемый в настоящем документе термин «соединение(я) по настоящему изобретению» относится к любому из соединений, описанных в документе в разделе «Соединения», таким как соединения формулы I, II, III, IV-1, IV-2, V, любые их подформулы или любое одно или несколько из соединений 1-8, его соединение(я), меченное изотопами (такое как дейтерированный аналог, в котором один из атомов водорода замещен атомом дейтерия с составом, превышающим природный состав), их возможные стереоизомеры (включая диастереоизомеры, энантиомеры и рацемические смеси), их геометрические изомеры, их таутомеры, их конформационные изомеры, их возможные цвиттерионы, их сложные эфиры (такие как фармацевтически приемлемые сложные эфиры) и/или их фармацевтически приемлемые соли (например, соль присоединения кислоты, такая как соль HCl, или соль присоединения основания, такая как соль Na). Соединение(я) по настоящему изобретения не ограничено какими-либо конкретными формами твердого состояния, например, оно может быть в аморфной форме или полиморфной форме. Гидраты и сольваты соединений по настоящему изобретению считаются композициями по настоящему изобретению, в которых соединение(я) находится в ассоциации с водой или растворителем, соответственно.
Используемые в настоящем документе фразы «введение» соединения, «вводимое» соединения или другие их варианты означают предоставление соединения или пролекарства (например, сложноэфирного пролекарства) соединения индивиду, нуждающемуся в лечении.
Используемый в настоящем документе термин «алкил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к алифатическому углеводороду с прямой или разветвленной цепью. В некоторых вариантах осуществления, алкил, который может включать от одного до двенадцати атомов углерода (т.е. C1-12 алкил) или указанное число атомов углерода (т.е. C1 алкил, такой как метил, C2 алкил, такой как этил, C3 алкил, такой как пропил или изопропил, и т.п.). В одном варианте осуществления алкильная группа представляет собой C1-10 алкильную группу с прямой цепью. В другом варианте осуществления алкильная группа представляет собой C3-10 алкильную группу с разветвленной цепью. В другом варианте осуществления алкильная группа представляет собой C1-6 алкильную группу с прямой цепью. В другом варианте осуществления алкильная группа представляет собой C3-6 алкильную группу с разветвленной цепью. В другом варианте осуществления алкильная группа представляет собой C1-4 алкильную группу с прямой цепью. Неограничивающие примеры C1-4 алкильных групп включают метил, этил, пропил, изопропил, бутил, втор-бутил, трет-бутил и изобутил.
Используемый в настоящем документе термин «циклоалкил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к насыщенным и частично ненасыщенным (содержащим одну или две двойные связи) циклическим алифатическим углеводородам, содержащим от одного до трех колец, имеющих от трех до двенадцати атомов углерода (т.е. C3-12 циклоалкил) или указанное количество атомов углерода. В одном варианте осуществления циклоалкильная группа имеет два кольца. В одном варианте осуществления циклоалкильная группа имеет одно кольцо. В другом варианте осуществления, циклоалкильная группа представляет собой C3-8 циклоалкильную группу. В другом варианте осуществления, циклоалкильная группа представляет собой C3-6 циклоалкильную группу. «Циклоалкил» также включает кольцевые системы, где циклоалкильное кольцо, как определено выше, конденсировано с одной или несколькими арильными или гетероарильными группами, где точка присоединения находится на циклоалкильном кольце, и в таких случаях количество атомов углерода продолжает обозначать количество атомов углерода в циклоалкильной кольцевой системе. Неограничивающие примеры циклоалкильных групп включают циклопропил, циклобутил, циклопентил, циклогексил, циклогептил, циклооктил, норборнил, декалин, адамантил, циклопентенил и циклогексенил.
Используемый в настоящем документе термин «алкенил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к алкильной группе, как определено выше, содержащей одну, две или три двойные связи углерод-углерод. В одном варианте осуществления, алкенильная группа представляет собой C2-6 алкенильную группу. В другом варианте осуществления, алкенильная группа представляет собой C2-4 алкенильную группу. Неограничивающие примеры алкенильных групп включают этенил, пропенил, изопропенил, бутенил, втор-бутенил, пентенил и гексенил.
Используемый в настоящем документе термин «алкинил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к алкильной группе, как определено выше, содержащей от одной до трех тройных связей углерод-углерод. В одном варианте осуществления, алкинил имеет одну тройную связь углерод-углерод. В одном варианте осуществления, алкинильная группа представляет собой C2-6 алкинильную группу. В другом варианте осуществления, алкинильная группа представляет собой C2-4 алкинильную группу. Неограничивающие иллюстративные алкинильные группы включают группы этинил, пропинил, бутинил, 2-бутинил, пентинил и гексинил.
Используемый в настоящем документе термин «гетероалкил» сам по себе или в сочетании с другим термином означает, если не указано иное, стабильную алкильную группу с прямой или разветвленной цепью, предпочтительно имеющую от 2 до 14 атомов углерода, более предпочтительно от 2 до 10 атомов углерода в цепь, один или несколько из которых были заменены гетероатомом, выбранным из S, O, P и N, и где атомы азота, фосфина и серы необязательно могут быть окислены, и гетероатом азота необязательно может быть кватернизован. Гетероатомы S, O, P и N могут быть помещены в любом положение внутри гетероалкильной группы или в положение, в котором алкильная группа присоединена к остальной молекуле. Примеры включают, но не ограничиваются ими, -CH2-CH2-O-CH3, -CH2-CH2-NH-CH3, -CH2-CH2-N(CH3)-CH3, -CH2-S-CH2-CH3, -CH2-CH2, -S(O)-CH3, -CH2-CH2-S(O)2-CH3, O-CH3 и -O-CH2-CH3. Подобным образом, термин «гетероалкилен» сам по себе или как часть другого заместителя означает двухвалентный радикал, производный от гетероалкила, как проиллюстрировано, но не ограничиваясь, -CH2-CH2-O-CH2-CH2- и -O-CH2-CH2-NH-CH2-. Для гетероалкиленовых групп гетероатомы также могут занимать один или оба конца цепи (например, алкиленокси, алкилендиокси, алкиленамино, алкилендиамино и т.п.). Более того, для алкиленовых и гетероалкиленовых связывающих групп ориентация связывающей группы не обозначена направлением, в котором записана формула связывающей группы. Следует понимать, что там, где указан "гетероалкил", за которым следует перечисление конкретных гетероалкильных групп, таких как -NR'R" или тому подобное, следует понимать, что термины гетероалкил и -NR'R" не являются избыточными или взаимоисключающими. Напротив, конкретные гетероалкильные группы перечисляются для большей ясности. Таким образом, термин "гетероалкил" не следует интерпретировать в настоящем описании как исключающий определенные гетероалкильные группы, такие как -NR'R" или тому подобные.
Используемый в настоящем документе термин «алкокси», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к радикалу формулы ORa1, где Ra1 представляет собой алкил.
Используемый в настоящем документе термин "циклоалкокси", используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к радикалу формулы ORa1, где Ra1 представляет собой циклоалкил.
Используемый в настоящем документе термин "алканоил", используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к -C(O)Ra1, где Ra1 представляет собой водород или алкил. Например, C1 алканоил относится к -C(O)H, C2 алканоил относится к -C(O)CH3.
Используемый в настоящем документе термин «арил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к моноциклической, бициклической или трициклической ароматической кольцевой системе, имеющей от шести до четырнадцати атомов углерода (т.е. C6-14 арил). “Арил” также включает кольцевые системы, в которых арильное кольцо, как определено выше, конденсировано с одной или несколькими циклоалкильными или гетероциклильными группами, где радикал или точка присоединения находится на арильном кольце, и в таких случаях число атомов углерода продолжает обозначать число атомов углерода в арильной кольцевой системе. В вариантах осуществления настоящего изобретения арильное кольцо может быть обозначено как соединяющееся с двумя группами или ариленом, например, в A-арил-B. В таких случаях две точки присединения могут быть независимо выбраны из любого из доступных положений.
Используемый в настоящем документе термин «гетероарил» или «гетероароматический» относится к моноциклическим, бициклическим или трициклическим ароматическим кольцевым системам, имеющим от 5 до 14 кольцевых атомов (т.е. 5-14-членный гетероарил) и 1, 2, 3 или 4 гетероатома, независимо выбранные из кислорода, азота и серы. В одном варианте осуществления, гетероарил имеет один гетероатом, например, один атом азота. В другом варианте осуществления, гетероарил имеет 6 кольцевых атомов, например пиридил. В одном варианте осуществления, гетероарил представляет собой бициклический гетероарил, имеющий от 8 до 10 кольцевых атомов, например, бициклический гетероарил, имеющий 1, 2 или 3 кольцевых атомов азота, такой как хинолил. Используемый в настоящем документе термин «гетероарил» также включает возможные N-оксиды. «Гетероарил» включает кольцевые системы, в которых гетероарильное кольцо, как определено выше, конденсировано с одной или несколькими циклоалкильными или гетероциклильными группами, где точка присоединения находится на гетероарильном кольце, и в таких случаях количество членов кольца продолжает обозначать группу количество членов кольца в гетероарильной кольцевой системе. «Гетероарил» также включает кольцевые системы, где гетероарильное кольцо, как определено выше, конденсировано с одной или несколькими арильными группами, где точка присоединения находится либо на арильном, либо в гетероарильном кольце, и в таких случаях количество членов кольца обозначает количество членов кольца в конденсированной (арил/гетероарильной) кольцевой системе. В вариантах осуществления настоящего изобретения гетероарильное кольцо может быть обозначено как соединяющееся с двумя группами, или гетероарилен, такой как в A-гетероарил-B. В таких случаях две точки присоединения могут быть независимо выбраны из любого из доступных положений.
Используемый в настоящем документе термин «гетероцикл» или «гетероциклил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к насыщенным и частично ненасыщенным (например, содержащим одну или две двойные связи) циклическим группам, содержащим одно, два или три кольца, имеющих от трех до четырнадцати членов кольца (т.е. от 3-14-членный гетероцикл) и по меньшей мере один гетероатом. Каждый гетероатом независимо выбран из группы, состоящей из кислорода, серы, включая сульфоксид и сульфон, и/или атомов азота, которые могут быть кватернизованы. Термин «гетероциклил» включает циклические уреидогруппы, такие как имидазолидинил-2-он, циклические амидные группы, такие как β-лактам, γ-лактам, δ-лактам и ε-лактам, и циклические карбаматные группы, такие как оксазолидинил-2-он. В одном варианте осуществления, гетероциклильная группа представляет собой 4-, 5-, 6-, 7- или 8-членную циклическую группу, содержащую одно кольцо и один или два атома кислорода и/или азота. Гетероциклил может быть необязательно связан с остальной частью молекулы через атом углерода или азота. Гетероциклильная группа может быть либо моноциклической («моноциклический гетероциклил»), либо конденсированной, мостиковой или спиро-кольцевой системой, такой как бициклическая система («бициклический гетероциклил»), и может быть насыщенной или может быть частично ненасыщенной. Гетероциклильные бициклические кольцевые системы могут включать один или несколько гетероатомов в одном или обоих кольцах. «Гетероциклил» также включает кольцевые системы, в которых гетероциклическое кольцо, как определено выше, конденсировано с одной или несколькими циклоалкильными группами, в которых точка присоединения находится на циклоалкильном или на гетероциклическом кольце, или кольцевые системы, в которых гетероциклическое кольцо, как определено выше, соединено с одной или более арильными или гетероарильными группами, в которых точка присоединения находится на гетероциклическом кольце, и в таких случаях количество членов кольца обозначает количество членов кольца в гетероциклической кольцевой системе.
«Необязательно замещенная» группа, такая как необязательно замещенный алкил, необязательно замещенный алкенил, необязательно замещенный алкинил, необязательно замещенный циклоалкил, необязательно замещенный гетероциклил, необязательно замещенный арил и необязательно замещенный гетероарил, относится к соответствующей группе, которая является незамещенной или замещенной. В общем, термин «замещенный» означает, что по меньшей мере один водород, присутствующий в группе (например, атом углерода или азота), замещен допустимым заместителем, например заместителем, который после замещения приводит к стабильному соединению, например, соединение, которое не претерпевает самопроизвольного превращения, такого как перегруппировка, циклизация, элиминирование или другие реакции. Если не указано иное, «замещенная» группа имеет заместитель в одном или нескольких замещаемых положениях группы, и когда более чем одно положение в любой данной структуре замещено, заместитель может быть одинаковым или различным в каждом положении. Как правило, при замещении необязательно замещенные группы могут быть замещены 1-5 заместителями. Заместители могут быть заместителем при атоме углерода, заместителем при атоме азота, заместителем при атоме кислорода или заместителем при атоме серы, когда применимо. Два из необязательных заместителей могут соединяться с образованием необязательно замещенного циклоалкильного, гетероцилильного, арильного или гетероарильного кольца. Замещение может происходить у любого доступного атома углерода, кислорода или азота и может образовывать спироцикл. Когда бициклическая или полициклическая кольцевая структура обозначается как связанная с двумя группами, каждая точка присоединения может быть независимо выбрана из любых доступных положений на любом из колец. Обычно замещение в настоящем документе не приводит к связи O-O, O-N, S-S, S-N (кроме связи SO2-N), гетероатом-галоген, связи гетероатом-CN, связи -C(O)-S или трех или более последовательных гетероатомов, за исключением O-SO2-O, O-SO2-N и N-SO2-N, за исключением того, что некоторые из таких связей или соединений могут быть разрешены, если в стабильной ароматической системе.
В любом из вариантов осуществления, описанных в настоящем документе, если не указано иное, «необязательно замещенная» неароматическая группа может быть незамещенной или замещенной 1, 2 или 3 заместителями, независимо выбранными из F, Cl, -OH, оксо (как применимо), C1-4 алкила, C1-4 алкокси, C3-6 циклоалкила, C3-6 циклоалкокси, фенила, 5- или 6-членного гетероарила, содержащего 1 или 2 кольцевых гетероатома, независимо выбранных из O, S и N, 4-7-членного гетероциклила, содержащего 1 или 2 кольцевых гетероатома, независимо выбранных из O, S и N, где каждый из алкила, алкокси, циклоалкила, циклоалкоксифенила, гетероарила и гетероциклила необязательно замещен 1, 2 или 3 заместителями, независимо выбранными из F, -OH, оксо (когда применимо), C1-4 алкила и C1-4 алкокси. В любом из вариантов осуществления, описанных в настоящем документе, если не указано иное, «необязательно замещенная» ароматическая группа (включая арильные и гетероарильные группы) может быть незамещенной или замещенной 1, 2 или 3 заместителями, независимо выбранными из F, Cl, -OH, -CN, C1-4 алкила, C1-4 алкокси, C3-6 циклоалкила, C3-6 циклоалкокси, фенила, 5- или 6-членного гетероарила, содержащего 1 или 2 кольцевых гетероатома, независимо выбранных из O, S и N, 4-7-членного гетероциклила, содержащего 1 или 2 кольцевых гетероатома, независимо выбранных из O, S и N, где каждый из алкила, алкокси, циклоалкила, циклоалкоксифенила, гетероарила и гетероциклила необязательно замещен 1, 2 или 3 заместителями, независимо выбранными из F, -OH, оксо (когда применимо), C1-4 алкила и C1-4 алкокси.
Примеры заместителей атома углерода включают, но не ограничиваются ими, галоген, -CN, -NO2, -N3, -SO2H, -SO3H, -OH, -ORaa, -ON(Rbb)2, -N(Rbb)2, -N(Rbb)3+X-, -N(ORcc)Rbb, -SH, -SRaa, -SSRcc, -C(=O)Raa, -CO2H, -CHO, -C(ORcc)2, -CO2Raa, -OC(=O)Raa, -OCO2Raa, -C(=O)N(Rbb)2, -OC(=O)N(Rbb)2, -NRbbC(=O)Raa, -NRbbCO2Raa, -NRbbC(=O)N(Rbb)2, -C(=NRbb)Raa, -C(=NRbb)ORaa, -OC(=NRbb)Raa, -OC(=NRbb)ORaa, -C(=NRbb)N(Rbb)2, -OC(=NRbb)N(Rbb)2, -NRbbC(=NRbb)N(Rbb)2, -C(=O)NRbbSO2Raa, -NRbbSO2Raa, -SO2N(Rbb)2, -SO2Raa, -SO2ORaa, -OSO2Raa, -S(=O)Raa, -OS(=O)Raa, -Si(Raa)3, -OSi(Raa)3 -C(=S)N(Rbb)2, -C(=O)SRaa, -C(=S)SRaa, -SC(=S)SRaa, -SC(=O)SRaa, -OC(=O)SRaa, -SC(=O)ORaa, -SC(=O)Raa,-P(=O)(Raa)2, −P(=O)(ORcc)2, -OP(=O)(Raa)2, -OP(=O)(ORcc)2, -P(=O)(N(Rbb)2)2, -OP(=O)(N(Rbb)2)2, −NRbbP(=O)(Raa)2, -NRbbP(=O)(ORcc)2, -NRbbP(=O)(N(Rbb)2)2, -P(Rcc)2, −P(ORcc)2, -P(Rcc)3+X−, −P(ORcc)3+X−, −P(Rcc)4, −P(ORcc)4, -OP(Rcc)2, -OP(Rcc)3+X−, −OP(ORcc)2, −OP(ORcc)3+X−, −OP(Rcc)4, −OP(ORcc)4, -B(Raa)2, -B(ORcc)2, -BRaa(ORcc), C1-10 алкил, C1-10 галогеналкил, C2-10 алкенил, C2-10 алкинил, C3-10 циклоалкил, 3-14-членный гетероциклил, C6-14 арил, и 5-14-членный гетероарил, где каждый алкил, алкенил, алкинил, циклоалкил, гетероциклил, арил и гетероарил независимо замещен 0, 1, 2, 3, 4 или 5 группами Rdd; где X− представляет собой противоион;
или два геминальных водорода на атоме углерода заменены группой =O, =S, =NN(Rbb)2, =NNRbbC(=O)Raa, =NNRbbC(=O)ORaa, =NNRbbS(=O)2Raa, =NRbb или =NORcc;
каждый Raa независимо выбран из C1-10 алкила, C1-10 галогеналкила, C2-10 алкенила, C2-10 алкинила, C3-10 циклоалкила, 3-14-членного гетероциклила, C6-14 арила и 5-14-членного гетероарила, или две группы Raa соединены с образованием 3-14-членного гетероциклильного или 5-14-членного гетероарильного кольца, где каждый алкил, алкенил, алкинил, циклоалкил, гетероциклил, арил и гетероарил независимо замещен 0, 1, 2, 3, 4 или 5 группами Rdd;
каждый Rbb независимо выбран из водорода, -OH, -ORaa, -N(Rcc)2, -CN, -C(=O)Raa, -C(=O)N(Rcc)2, -CO2Raa, -SO2Raa, -C(=NRcc)ORaa, -C(=NRcc)N(Rcc)2, -SO2N(Rcc)2, -SO2Rcc, -SO2ORcc, -SORaa, -C(=S)N(Rcc)2, -C(=O)SRcc, -C(=S)SRcc, -P(=O)(Raa)2, −P(=O)(ORcc)2, -P(=O)(N(Rcc)2)2, C1-10 алкила, C1-10 галогеналкила, C2-10 алкенила, C2-10 алкинила, C3-10 циклоалкила, 3-14-членного гетероциклила, C6-14 арила, и 5-14-членного гетероарила, или две группы Rbb соединены с образованием 3-14-членного гетероциклильного или 5-14-членного гетероарильного кольца, где каждый алкил, алкенил, алкинил, циклоалкил, гетероциклил, арил и гетероарил независимо замещен 0, 1, 2, 3, 4 или 5 группами Rdd; где X− представляет собой противоион;
каждый Rcc независимо выбран из водорода, C1-10 алкила, C1-10 галогеналкила, C2-10 алкенила, C2-10 алкинила, C3-10 циклоалкила, 3-14-членного гетероциклила, C6-14 арила, и 5-14-членного гетероарила, или две группы Rcc соединены с образованием 3-14-членного гетероциклильного или 5-14-членного гетероарильного кольца, где каждый алкил, алкенил, алкинил, циклоалкил, гетероциклил, арил и гетероарил независимо замещен 0, 1, 2, 3, 4 или 5 группами Rdd;
каждый Rdd независимо выбран из галогена, -CN, -NO2, -N3, -SO2H, -SO3H, -OH, -ORee, -ON(Rff)2, -N(Rff)2, -N(Rff)3+X-, -N(ORee)Rff, -SH, -SRee, -SSRee, -C(=O)Ree, -CO2H, -CO2Ree, -OC(=O)Ree, -OCO2Ree, -C(=O)N(Rff)2, -OC(=O)N(Rff)2, -NRffC(=O)Ree, -NRffCO2Ree, -NRffC(=O)N(Rff)2, -C(=NRff)ORee, -OC(=NRff)Ree, -OC(=NRff)ORee, -C(=NRff)N(Rff)2, -OC(=NRff)N(Rff)2, -NRffC(=NRff)N(Rff)2,-NRffSO2Ree, -SO2N(Rff)2, -SO2Ree, -SO2ORee, -OSO2Ree, -S(=O)Ree, -Si(Ree)3, -OSi(Ree)3, -C(=S)N(Rff)2, -C(=O)SRee, -C(=S)SRee, -SC(=S)SRee, -P(=O)(ORee)2, -P(=O)(Ree)2, -OP(=O)(Ree)2, -OP(=O)(ORee)2, C1-6 алкила, C1-6 галогеналкила, C2-6 алкенила, C2-6 алкинила, C3-10 циклоалкила, 3-10-членного гетероциклила, C6-10 арила, 5-10-членного гетероарила, где каждый алкил, алкенил, алкинил, циклоалкил, гетероциклил, арил и гетероарил независимо замещен 0, 1, 2, 3, 4 или 5 группами Rgg, или два геминальных заместителя Rdd могут быть соединены для образования =O или =S; где X− представляет собой противоион;
каждый Ree независимо выбран из C1-6 алкила, C1-6 галогеналкила, C2-6 алкенила, C2-6 алкинила, C3-10 циклоалкила, C6-10 арила, 3-10-членного гетероциклила, и 3-10-членного гетероарила, где каждый алкил, алкенил, алкинил, циклоалкил, гетероциклил, арил и гетероарил независимо замещен 0, 1, 2, 3, 4 или 5 группами Rgg;
каждый Rff независимо выбран из водорода, C1-6 алкила, C1-6 галогеналкила, C2-6 алкенила, C2-6 алкинила, C3-10 циклоалкила, 3-10-членного гетероциклила, C6-10 арила и 5-10-членного гетероарила, или две группы Rff соединены с образованием 3-14-членного гетероциклильного или 5-14-членного гетероарильного кольца, где каждый алкил, алкенил, алкинил, циклоалкил, гетероциклил, арил и гетероарил независимо замещен 0, 1, 2, 3, 4 или 5 группами Rgg; и
каждый Rgg независимо представляет собой, галоген, -CN, -NO2, -N3, -SO2H, -SO3H, -OH, -OC1-6 алкил, -ON(C1-6 алкил)2, -N(C1-6 алкил)2, -N(C1-6 алкил)3+X-, -NH(C1-6 алкил)2+X-, -NH2(C1-6 алкил) +X-, -NH3+X-, -N(OC1-6 алкил)(C1-6 алкил), -N(OH)(C1-6 алкил), -NH(OH), -SH, -SC1-6 алкил, -SS(C1-6 алкил), -C(=O)(C1-6 алкил), -CO2H, -CO2(C1-6 алкил), -OC(=O)(C1-6 алкил), -OCO2(C1-6 алкил), -C(=O)NH2, -C(=O)N(C1-6 алкил)2, -OC(=O)NH(C1-6 алкил), -NHC(=O)( C1-6 алкил), -N(C1-6 алкил)C(=O)( C1-6 алкил), -NHCO2(C1-6 алкил), -NHC(=O)N(C1-6 алкил)2, -NHC(=O)NH(C1-6 алкил), -NHC(=O)NH2, -C(=NH)O(C1-6 алкил),-OC(=NH)(C1-6 алкил), -OC(=NH)OC1-6 алкил, -C(=NH)N(C1-6 алкил)2, -C(=NH)NH(C1-6 алкил), -C(=NH)NH2, -OC(=NH)N(C1-6 алкил)2, -OC(NH)NH(C1-6 алкил), -OC(NH)NH2, -NHC(NH)N(C1-6 алкил)2, -NHC(=NH)NH2, -NHSO2(C1-6 алкил), -SO2N(C1-6 алкил)2, -SO2NH(C1-6 алкил), -SO2NH2,-SO2C1-6 алкил, -SO2OC1-6 алкил, -OSO2C1-6 алкил, -SOC1-6 алкил, -Si(C1-6 алкил)3, -OSi(C1-6 алкил)3 -C(=S)N(C1-6 алкил)2, C(=S)NH(C1-6 алкил), C(=S)NH2, -C(=O)S(C1-6 алкил), -C(=S)SC1-6 алкил, -SC(=S)SC1-6 алкил, -P(=O)(OC1-6 алкил)2, -P(=O)(C1-6 алкил)2, -OP(=O)(C1-6 алкил)2, -OP(=O)(OC1-6 алкил)2, C1-6 алкил, C1-6 галогеналкил, C2-6 алкенил, C2-6 алкинил, C3-10 циклоалкил, C6-10 арил, 3-10-членный гетероциклил, 5-10-членный гетероарил; или два геминальных заместителя Rgg могут быть соединены для образования =O или =S; где X- представляет собой противоион.
«Противоион» или «анионный противоион» представляет собой отрицательно заряженную группу, связанную с положительно заряженной группой для поддержания электронной нейтральности.
«Гало» или «галоген» относится к фтору (фтор, -F), хлору (хлор, -Cl), брому (бром, -Br) или йоду (йод, -I).
«Ацил» относится к фрагменту, выбранному из группы, состоящей из -C(=O)Raa,-CHO, -CO2Raa, -C(=O)N(Rbb)2, -C(=NRbb)Raa, -C(=NRbb)ORaa, -C(=NRbb)N(Rbb)2, -C(=O)NRbbSO2Raa, -C(=S)N(Rbb)2, -C(=O)SRaa, или -C(=S)SRaa, где Raa и Rbb имеют значения, указанные в настоящем описании.
Атомы азота могут быть замещенными или незамещенными, в зависимости от валентности и включают первичные, вторичные, третичные и четвертичные атомы азота. Примеры заместителей атома азота включают, но не ограничиваются ими, водород, -OH, -ORaa, -N(Rcc)2, -CN, -C(=O)Raa, -C(=O)N(Rcc)2, -CO2Raa, -SO2Raa, -C(=NRbb)Raa, -C(=NRcc)ORaa, -C(=NRcc)N(Rcc)2, -SO2N(Rcc)2, -SO2Rcc, -SO2ORcc, -SORaa, -C(=S)N(Rcc)2, -C(=O)SRcc, -C(=S)SRcc, -P(=O)(ORcc)2, -P(=O)(Raa)2,-P(=O)(N(Rcc)2)2, C1-10 алкил, C1-10 галогеналкил, C2-10 алкенил, C2-10 алкинил, C3-10 циклоалкил, 3-14-членный гетероциклил, C6-14 арил, и 5-14-членный гетероарил, или две группы Rcc, соединенные с атомом азота, соединены с образованием 3-14-членного гетероциклильного или 5-14-членного гетероарильного кольца, где каждый алкил, алкенил, алкинил, циклоалкил, гетероциклил, арил и гетероарил независимо замещен 0, 1, 2, 3, 4 или 5 группами Rdd, и где Raa, Rbb, Rcc, и Rdd имеют значение, как определено выше.
В некоторых вариантах осуществления заместитель, присутствующий на атоме азота, представляет собой азотзащитную группу. Азотзащитные группы включают, но не ограничиваются ими, -OH, -ORaa, -N(Rcc)2, -C(=O)Raa, -C(=O)N(Rcc)2, -CO2Raa, -SO2Raa, -C(=NRcc)Raa, -C(=NRcc)ORaa, -C(=NRcc)N(Rcc)2, -SO2N(Rcc)2, -SO2Rcc, -SO2ORcc, -SORaa, -C(=S)N(Rcc)2, -C(=O)SRcc, -C(=S)SRcc, C1-10 алкил, ар-C1-10 алкил, гетероар-C1-10 алкил, C2-10 алкенил, C2-10 алкинил, C3-10 циклоалкил, 3-14-членный гетероциклил, C6-14 арил, и 5-14-членные гетероарильные группы, где каждый алкил, алкенил, алкинил, циклоалкил, гетероциклил, аралкил, арил и гетероарил независимо замещен 0, 1, 2, 3, 4 или 5 группами Rdd, и где Raa, Rbb, Rcc и Rdd имеют значения, как определено в настоящем документе. Азотзащитные группы хорошо известны в данной области техники и включают группы, подробно описанные в Protective Groups in Organic Synthesis, T.W. Greene and P.G.M. Wuts, 3rd edition, John Wiley & Sons, 1999, включенном в настоящее описание посредством ссылки.
Примеры заместителей атомов кислорода включают, но не ограничиваются ими, -Raa, -C(=O)SRaa, -C(=O)Raa, -CO2Raa, -C(=O)N(Rbb)2, -C(=NRbb)Raa, -C(=NRbb)ORaa, -C(=NRbb)N(Rbb)2, -S(=O)Raa, -SO2Raa, -Si(Raa)3, -P(Rcc)2, -P(Rcc)3+X−, −P(ORcc)2, −P(ORcc)3+X−, -P(=O)(Raa)2,-P(=O)(ORcc)2, и -P(=O)(N(Rbb)2)2, где X−, Raa, Rbb и Rcc имеют значения, как определено в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления заместитель атома кислорода, присутствующий на атоме кислорода, представляет собой кислородзащитную группу. Кислородзащитные группы хорошо известны в данной области техники и включают группы, подробно описанные в Protective Groups in Organic Synthesis, T.W. Greene and P.G.M. Wuts, 3rd edition, John Wiley & Sons, 1999, включенном в настоящее описание посредством ссылки.
Термин «фармацевтически приемлемая соль» относится к таким солям, которые с медицинской точки зрения подходят для применения в контакте с тканями человека и низших животных без чрезмерной токсичности, раздражения, аллергической реакции и тому подобного, и имеют разумное соотношение польза/риск. Фармацевтически приемлемые соли хорошо известны в данной области техники. Термин «фармацевтически приемлемый сложный эфир» следует понимать аналогичным образом.
Используемые в настоящем описании термины «лечить», «лечение», и тому подобное относятся к элиминированию, уменьшению или облегчению заболевания или состояния и/или симптомов, связанных с ними. Хотя это и не исключено, лечение заболевания или состояния не требует полного элиминирования заболевания, состояния или симптомов, связанных с ними. Используемые в настоящем описании термины «лечить», «лечение» и тому подобное могут включать «профилактическое лечение», которое относится к снижению вероятности повторного развития заболевания или состояния или рецидива ранее контролируемого заболевание или состояние у субъекта, который не болен, но находится в группе риска или предрасположен к повторному развитию заболевания или состояния или рецидиву заболевания или состояния. Термин «лечить» и синонимы предполагают введение терапевтически эффективного количества соединения, описанного в настоящем документе, субъекту, нуждающемуся в таком лечении.
Термины «ингибирование», «подавление» или «ингибировать» относятся к способности соединения уменьшать, замедлять, останавливать или предотвращать активность конкретного биологического процесса (например, рост бактерий по сравнению с носителем).
Термин «субъект» (альтернативно называемый в настоящем документе «пациент») в контексте настоящего описания относится к животному, предпочтительно млекопитающему, наиболее предпочтительно человеку, которое было объектом лечения, наблюдения или эксперимента. В некоторых вариантах осуществления, субъектом может быть позвоночное животное, такое как собака, кошка, лошадь или обезьяна.
Соединения по настоящему изобретению могут существовать в меченой изотопом или обогащенной изотопом форме, содержащей один или несколько атомов, имеющих атомную массу или массовое число, отличное от атомной массы или массового числа, наиболее часто встречающихся в природе. Изотопы могут быть радиоактивными или нерадиоактивными изотопами. Изотопы атомов, таких как водород, углерод, фосфор, сера, фтор, хлор и йод, включают, но не ограничиваются ими, 2H, 3H, 13C, 14C, 15N, 18O, 32P, 35S, 18F, 36Cl, и 125I. Соединения, содержащие другие изотопы этих и/или других атомов, входят в объем настоящего изобретения.
Если прямо не указано иное, комбинации заместителей и/или переменных допустимы, только если такие комбинации разрешены химически и приводят к стабильному соединению. «Стабильное» соединение представляет собой соединение, которое может быть получено и выделено и чья структура и свойства остаются или могут оставаться практически неизменными в течение периода времени, достаточного для использования соединения для целей, описанных в настоящем документе (например, терапевтическое введение субъекту).
Примеры
Пример 1. Получение бактериальной культуры
Бактериальную культуральную среду (HuanKai Microbial, Guangzhou, China), содержащую 5 г пептона, 3 г мясного экстракта, 5 г NaCl, 15 г агара и 5 мг MnSO4 5 в 1 л ddH2O (pH=7,2), получали в конической колбе (Drtech, Guangzhou, China) и стерилизовали в автоклаве (HIRAYAMA, HEV-50, Japan) при 121°C в течение 30 мин. Bacillus megaterium (всего 1*107 на культуру) культивировали в инкубаторе (HettCube 200, Germany) при 37°C в течение 24 ч.
Пример 2. Бактериальная культура для скрининга лекарственного средства
Для исследования, могут ли антибиотики контролировать рост Bacillus megaterium in vitro и in vivo, авторы изобретения сначала провели скрининговый тест на чувствительность к антибиотикам в чашках Петри, которые получали в примере 1. Чувствительность Bacillus megaterium к нескольким основным антимикробным средствам, включая ампициллин, ванкомицин, неомицин, метронидазол и тетрациклин, исследовали с использованием способа минимальной ингибирующей концентрации (MIC). Ампициллин, ванкомицин, неомицин, метронидазол и тетрациклин (приобретенные у Sigma, США) в различных концентрациях (10-1, 10-2, 10-3, 10-4, 10-5 мг/мл) добавляли в охлажденную среду. Как показано на фиг. 1 ниже, Bacillus megaterium был наиболее чувствителен к неомицину, в то время как метронидазол был в 10000 раз менее эффективен в контроле роста Bacillus megaterium.
Пример 3. Система внутриглазных бактериальных культур для скрининга лекарственного средства
Каждую культуру получали в стеклянной пробирке на 15 мл (приобретенной у Drtech Inc., Guangzhou China) с 6 мл среды с отварным мясом, стерилизованными сухими говяжьими гранулами и 1,5 мл жидкого парафинового воска (приобретенного у Huankai Microbial Inc., Guangzhou, China) сверху. Затем все пробирки стерилизовали при 121°C в течение 30 минут в приборе HEV-to Autoclave (HIRAYAMA, Japan). Внутриглазную жидкость или жидкость стекловидного тела, с лекарственным средством для скрининга или без него, вводили в вышеуказанную пробирку в стерилизованном боксе для культивирования клеток и герметизировали, после чего культивировали при встряхивании (200 об/мин) при 37°C в течение 72 часов в инкубаторе ZQTY-70F (Zhichu Instrument Co., Ltd, Shanghai, China). Запечатанные воском пробирки, содержащие культуральную среду, прошли процедуру инкубации, но не содержали образцов водянистой влаги или стекловидного тела, служивших в качестве отрицательного контроля.
Культуры с использованием жидкой среды с отварным мясом (фиг. 2) оказались положительными для бактерий. Таким образом, эта система культивирования может быть использована для скрининга чувствительности к лекарственным средствам, и культуры могут быть визуализированы с использованием стандартного светового микроскопа (фиг. 3).
Пример 4. Интравитреальная бактериальная инфекция у макак для скрининга лекарственного средства
Bacillus megaterium BNCC190686 и Propionibacterium acnes BNCC336649 сначала культивировали в течение ночи при 37°С на чашках с агаром в соответствии со стандартными протоколами, предоставленными производителем. Затем бактериальные культуры промывали в PBS и ресуспендировали в виде растворов 1х106 КОЕ/мкл и дополнительно разбавляли в PBS в виде растворов для инъекций.
Авторы изобретения выбрали макаку-примат, не являющегося человеком (Macaca fascicularis), в качестве своей модельной системы, учитывая анатомию глаза и внутриглазную среду, общие для человека и макака. Макак успокаивали путем внутримышечной инъекции смеси тилетамина гидрохлорида (2,5 мг/кг) и золазепама гидрохлорида (2,5 мг/кг). После местной анестезии (0,5% пропаракаина гидрохлорид) глаза немедленно визуализировали in vivo с помощью светового микроскопа. Затем зрачки расширяли с помощью 0,5% тропикамида и 0,5% фенилэфрина для получения фотографий глазного дна. Интравитреальное введение бактериальных растворов (1000 КОЕ [колониеобразующих единиц] в объеме 50 мкл) или бактериальных белков, инактивированных ультразвуком (из 1000 КОЕ бактерий), осуществляли с помощью шприца на 1 мл и иглы 30 размера после дезинфекции поверхности глаза с помощью 5% раствора PVI. Макаки были случайным образом разделены на четыре группы.
Группа 1: Правый (OD) и левый (OS) глаза макак инокулировали P. acnes и B. megaterium, соответственно.
Группа 2: Правый (OD) и левый (OS) глаза макак инокулировали белками, инактивированными ультразвуком, P. acnes и B. megaterium, соответственно.
Группа 3: Правый (OD) и левый (OS) глаза макак инокулировали P. acnes и Pseudomonas putida, соответственно.
Группа 4: Правый (OD) и левый (OS) глаза макак инокулировали белками, инактивированными ультразвуком, P. acnes и Pseudomonas putida, соответственно.
Всех макак обследовали с помощью щелевой лампы и глазного дна в течение 3 дней после инъекции. Степень тяжести эндофтальмита оценивали согласно ранее описанному стандарту (Peyman GA, Paque JT, Meisels HI, Bennett TO. Postoperative endophthalmitis: a comparison of methods for treatment and prophlaxis with gentamicin. Ophthalmic Surg 1975;6:45-55). Макак подвергали эвтаназии через 3 дня после инокуляции, и оба глазных яблока энуклеировали для гистопатологического анализа, анализа внутриглазных цитокинов и бактериального анализа. Глазные яблоки фиксировали в 4% параформальдегиде в течение 48 ч и затем заливали парафином. Срезы нарезали на микротоме толщиной 5 мкм и окрашивали гематоксилином и эозином (H&E).
Авторы изобретения проверили, способны ли Bacillus megaterium и Pseudomonas putida индуцировать воспаление in vivo. Как показано на фиг. 4-5, интравитреальная инфекция живых P. acnes не вызывала значительного внутриглазного воспаления. Также инъекция инактивированных ультразвуком белков P. acnes не индуцировала значительного внутриглазного воспаления. И наоборот, инфицирование живых Bacillus megaterium (фиг. 4) и Pseudomonas putida (фиг. 5) и их белков в глаз привело к внутриглазному воспалению.
Для скрининга лекарственного средства для лечения или профилактики эндофтальмита, вызванного Bacillus megaterium или Pseudomonas putida, в глаза макака с внутриглазным воспалением вводили эффективное количество бацитрацина, грамицидина, полимиксина или низина, а затем восстанавливали поверхность глаза и глазное дно макаки визуализировали с помощью светового микроскопа.
Пример 5 Анализ субретинальной бактериальной инфекции у макак для скрининга лекарственного средства
Макак успокаивали путем внутримышечной инъекции смеси тилетамина гидрохлорида (2,5 мг/кг) и золазепама гидрохлорида (2,5 мг/кг). После введения местной анестезии (0,5% пропаракаина гидрохлорид) глаза немедленно визуализировали in vivo с помощью светового микроскопа. Затем зрачки расширяли с помощью 0,5% тропикамида и 0,5% фенилэфрина для получения фотографий глазного дна. Как показано на фиг. 6, затем канюлю для передней камеры калибра 35 вводили через склеротомию и продвигали через стекловидное тело. Под микроскопическим контролем 20 мкл PBS (с бактериями или без них) вводили в субретинальное пространство между фоторецепторами и RPE (пигментный эпителий сетчатки) с помощью шприца NanoFil Nanofil-100 для микроинъекции (World Precision Instruments, USA). Все процедуры проводили стерильными инструментами. Макак подвергали эвтаназии через 47 дней после инокуляции и глазное яблоко энуклеировали для гистологического анализа. Глазные яблоки фиксировали в 4% параформальдегиде в течение 48 ч и затем заливали парафином. Срезы нарезали на микротоме толщиной 6 мкм и окрашивали H&E.
Авторы изобретения исследовали, приводит ли субретинальная инокуляция культур AH и VH, а также культивируемых отдельных видов B. megaterium к AMD-подобной патологии у макак. Около 20 КОЕ бактерий (в 20 мкл PBS) из AH, VH и B. megaterium культур вводили субретинально, и PBS использовали в качестве контроля (проиллюстрировано на фиг. 6). Исследование глазного дна глаза макак проводили до (День 0) и после бактериальной инокуляции на на День 1, День 3, День 35 (данные не показаны), а также на День 47. Как показано на фиг. 7, инъекция PBS оставила только видимый рубец на сетчатке, в то время как все бактериальные инокуляции привели к друзеноидным поражениям на тканях сетчатки.
Затем авторы изобретения использовали модель субретинальной инокуляции Bacillus megaterium, чтобы проверить, могут ли антибиотики изменить индуцируемую бактериями друзеноидную патологию в тканях сетчатки обезьяны. Хотя неомицин продемонстрировал лучшую активность in vitro, контролирующую распространение Bacillus megaterium, внутриглазное введение неомицина у обезьян индуцировало серьезные глазные осложнения, включая офтальматрофию (данные не показаны). С другой стороны, интравитреальное введение ванкомицина (0,5 мг, одна инъекция на День 2 после бактериальной инокуляции) привело к уменьшению размера друзеноидного поражения в ткани сетчатки, как показано справа на фиг. 8, по сравнению с поражением, показанным слева на фиг. 8. Эти данные означают, что ванкомицин может ингибировать рост Bacillus megaterium in vitro и in vivo, поэтому его можно использовать для лечения возрастной дегенерации желтого пятна.
Пример 6 Специфический для заболевания внутриглазной микробиом может характеризовать глазные проявления
Поскольку все человеческие глаза, которые авторы изобретения тестировали, имеют внутриглазную микробиоту, авторы изобретения затем исследовали, может ли внутриглазный микробиом, специфичный для конкретного заболевания, характеризовать глазные проявления.
Пациенты для исследования: 41 катаракта, 20 AMD, 18 глаукома, 9 BD, 9 VKH, и 8 EOS.
Методы исследования:
(1) Взятие образца водянистой влаги и экстракция ДНК из образца водянистой влаги;
1) Трехкратное орошение конъюнктивального мешка пациента 0,9% раствором натрия хлорида;
2) Мидриаз с применением атропина;
3) Нанесение раствора офлоксацина на глаза пациента на 30 секунд для дезинфекции;
4) Трехкратное орошение конъюнктивального мешка пациента раствором тобрамицина для стерилизации;
5) Взятие образца водянистой влаги и экстракция ДНК из образца водянистой влаги,
(2) Обнаружение ДНК, экстрагированной из образцов водянистой влаги, методом метагеномного секвенирования.
Результаты: Все человеческие глаза, которые тестировали авторы избретения, имеют внутриглазную микробиоту, фиг. 9 представляет собой график анализа LefSe видов бактерий, которые присутствовали в высоком количестве в глазах пациентов с различными заболеваниями, как показано на фиг. 9, пациенты с различными заболеваниями имеют разные виды бактерий. Несмотря на значительную индивидуальность, представленную внутриглазным микробиомом, авторы избретения смогли идентифицировать характерные виды бактерий с помощью LDA Effect Size (LefSe)2 для каждой группы глазных заболеваний, которую авторы избретения тестировали.
Пример 7. Bacillus megaterium присутствует в повышенном количестве в мягких друзах пациентов с AMD
Как подробно описано в заявке PCT No. PCT/CN2018/112022, анализ метагеномного секвенирования проводили на образцах водянистой влаги от 41 пациента с катарактой (Cat), 20 пациентов с AMD, 18 пациентов с глаукомой (GLA), 9 пациентов с болезнью Бехчета (BD), 9 пациентов с синдромом Фогта-Коянаги-Харада (VKH) и 8 пациентов с эндофтальмитом (EOS). Результаты кратко обсуждаются ниже.
Вкратце, с помощью метагеномного анализа 14 видов бактерий были идентифицированы как присутствующие в повышенном количестве в AH у пациентов с AMD. См. Таблицу 1 ниже:
Таблица 1
В то время как P. acnes оказался наиболее распространенным микроорганизмом в AH у пациентов с AMD, Bacillus licheniformis (B. licheniformis) и Bacillus megaterium (B. megaterium) были наиболее богатыми видами среди 14 видов, специфичных для AMD, в образцах AH AMD (таблица 1). Затем авторы изобретения провели ПЦР-анализ, чтобы выяснить, можно ли обнаружить 14 AMD-специфичных бактерий в тканях твердых или мягких друзов по сравнению с тканями сетчатки без друзов из 6 архивных слайдов глаз пациентов с AMD. Результаты авторов изобретения показали, что можно обнаружить только 8 бактерий, среди которых P. acnes был самым распространенным видом, и B. megaterium был единственным видом, который присутствовал в повышенном количестве в мягких друзах. Интересно, что относительное количество P. acnes сопоставимо в пораженных тканях с твердыми друзами, мягкими друзами и сухим AMD по сравнению с тканями сетчатки без поражения, без друзов. Относительное количество B. megaterium было увеличено примерно в 18 раз в мягких друзах по сравнению с тканями без друзов/без повреждений. Эти данные говорят о возможной роли B. megaterium в формировании друз и патогенезе AMD.
Пример 8. Bacillus megaterium индуцирует активацию комплемента, пироптоз клеток RPE in vitro и индуцирует у макак друзеноидные поражения
Также подробно описано в заявке PCT No. PCT/CN2018/112022, авторы настоящего изобретения показали, что Bacillus megaterium может индуцировать активацию комплемента, пироптоз клеток RPE in vitro и может индуцировать друзеноидные поражения у макак. Вкратце, изобретатели обнаружили, что инфекция in vitro B. megaterium, но не P. acnes, приводит к секреции активных IL-1β и IL-18 клетками RPE, что предполагает, что инфекция B. megaterium может приводить к воспалению, опосредованному RPE.
Кроме того, было продемонстрировано, что B. megaterium существует как в AH, так и в тканях сетчатки. Авторы изобретения собрали образцы AH и стекловидного тела (VH) у пациентов с AMD и смогли обнаружить ДНК B. megaterium как в некультивируемых, так и в культивируемых образцах. Авторы изобретения дополнительно исследовали, приводит ли субретинальная инокуляция культур AH и VH, содержащих B. megaterium, а также культивируемых отдельных видов B. megaterium к AMD-подобной патологии у макак. Вкратце, около 20 КОЕ бактерий (в 20 мкл PBS) из культур AH, VH и B. megaterium вводили субретинально и PBS использовали в качестве контроля. Исследование глазного дна глаза макак проводили до (День 0) и после бактериальной инокуляции на День 1, День 3, День 35, а также День 47. Инъекция PBS оставила только видимый рубец на сетчатке, в то время как все бактериальные инокуляции привели к друзеноидным поражениям на тканях сетчатки. Под слоем RPE также были видны узелки, похожие на друзы. Флуоресцентная гибридизация in situ также приводит к обнаружению B. megaterium в друзеноидах, но не в нормальных тканях после инокуляции. Повышение экспрессии белков C5A, CFH, CASPASE1 и NLRP3 также было обнаружено в пораженных друзеноидом и пара-пораженных тканях, инфицированных B. megaterium, по сравнению с неинфицированной нормальной сетчаткой у макак. Взятые вместе, данные демонстрируют, что инфекция B. megaterium может активировать систему комплемента и индуцировать друзеноидную патологию in vivo.
Пример 9. Тест антибиотиков в отношении лечения AMD путем подавления роста микробиоты
Способ
Тестирование на чувствительность к антибиотикам
Бактериальную культуральную среду (HuanKai Microbial, Guangzhou, China), содержащую 5 г пептона, 3 г мясного экстракта, 5 г NaCl, 15 г агара, и 5 мг MnSO4 5 в 1 л ddH2O (pH=7,2), получали в конической колбе (Drtech, Guangzhou, China) и стерилизовали в автоклаве (HIRAYAMA, HEV-50, Japan) при 121°C в течение 30 мин. В охлажденную среду добавляли антибиотики (ампициллин, ванкомицин, неомицин, метронидазол, и тетрациклин, приобретенные у Sigma, США) в различных концентрациях. Bacillus megaterium (всего 1*107 на культуру) культивировали в инкубаторе (HettCube 200, Germany) при 37°C в течение 24 ч.
Результат
Для исследования, могут ли антибиотики контролировать рост Bacillus megaterium in vitro и in vivo, проводили скрининговый тест на чувствительность к антибиотикам в чашках Петри. Чувствительность Bacillus megaterium к нескольким основным антимикробным средствам, включая ампициллин, ванкомицин, неомицин, метронидазол, и тетрациклин, исследовали с использованием способа минимальной ингибирующей концентрации (MIC). Как показано на фиг. 1 ниже, Bacillus megaterium был наиболее чувствителен к неомицину, в то время как метронидазол был в 10000 раз менее эффективен в контроле роста Bacillus megaterium.
Затем использовали модель субретинальной инокуляции Bacillus megaterium, чтобы проверить, могут ли антибиотики изменить индуцируемую бактериями друзеноидную патологию в тканях сетчатки обезьяны. Хотя неомицин продемонстрировал лучшую активность in vitro, контролирующую распространение Bacillus megaterium, внутриглазное введение неомицина у обезьян индуцировало серьезные глазные осложнения, включая офтальматрофию (данные не показаны). С другой стороны, интравитреальное введение ванкомицина (0,5 мг, одна инъекция на День 2 после бактериальной инокуляции) привело к уменьшению размера друзеноидного поражения в ткани сетчатки по сравнению с показанным поражением, см. фиг. 8. Эти данные свидетельствуют о том, что ванкомицин способен ингибировать рост Bacillus megaterium in vitro и in vivo, поэтому его можно использовать для лечения возрастной дегенерации желтого пятна.
Пример 10. Скрининг in vitro соединений, которые могут ингибировать рост микробиоты
Для исследования, может ли определенная традиционная китайская медицина (TCM) контролировать рост Bacillus megaterium in vitro и in vivo, проводили скрининговый тест на чувствительность к антибиотикам в чашках Петри. Исследовали чувствительность Bacillus megaterium к различным компонентам из различных TCM, включая солодку (Glycyrrhiza uralensis), корень белого пиона (Cynanchum otophyllum), форзицию (Forsythia suspense), плоды померанца (Citrus aurantium L.), реманию клейкую (Rehmannia glutinosa Libosch), кожуру мандарина (Citrus reticulata Blanco), и женьшень ложный (Panax notoginseng). Экстракт из этих TCM протестировали на положительный результат в отношении уничтожения или ингибирования роста Bacillus megaterium.
Процедура скрининга TCM показана ниже.
100 г TCM замачивали в 300 мл воды примерно на 30 минут, затем кипятили на огне, медленно кипятили в течение 20-40 минут и концентрировали примерно до 100 мл.
Получение буфера для роста бактерий (Sigma-Aldrich, USA): пептон 5,0 г, 3,0 г мясного экстракта, NaCl 5,0 г, агар 15,0 г и дистиллированная вода 1,0 л, pH 7,0. Пять миллиграмм MnSO4·H2O добавляли к культуре Bacillus для облегчения образования спор. Буфер помещали в автоклав (HIRAYAMA, HEV-50, Japan) на 30 минут при 120°C, затем охлаждали до 40-50°C.
Один миллилитр раствора TCM добавляли к 15 мл буфера для роста, перемешивали и вводили в чашку для культивирования, и оставляли в боксе clean bench для отверждения.
100 мкл суспензии Bacillus megaterium (концентрация: 1×106/мл) добавляли в чашку и равномерно распределяли с помощью стерилизованного шпателя, затем помещали в инкубатор при 37°C (HettCube 200, Germany) на 24 ч.
Наблюдали рост флоры на чашке.
TCM с антибактериальной функцией подвергали скринингу в экспериментах до начала исследования, включая солодку, корень белого пиона, форзицию, плоды померанца, реманию клейкую, кожуру мандарина и женьшень ложный.
Следуя аналогичным процедурам скрининга, также были подвергнуты скринингу различные коммерчески доступные компоненты TCM (каждый содержит одно химическое соединение). Соединения 1-8, указанные ниже, оказались наиболее активными в уничтожении или ингибировании роста Bacillus megaterium. В тестируемой концентрации каждое из соединений 1-8 эффективно уничтожает и ингибирует рост Bacillus megaterium в чашках Петри. Другие тестируемые соединения не уничтожали и не подавляли рост Bacillus megaterium в чашках Петри при тестируемой концентрации.
и 
Экспериментальная процедура:
Растворение компонентов: В боксе clean bench компоненты TCM (каждый содержит одно химическое соединение) растворяли встряхиванием в дистиллированной воде до концентрации 20 г/л и оставляли на ночь при комнатной температуре.
Получение буфера для роста бактерий (Sigma-Aldrich, USA)
На чашки помещали 15 мл буфера и автоклавировали в течение 30 минут при 120°C.
После стерилизации культуральной чашки и охлаждения приблизительно до 50°С добавляли по 10 мкл каждого компонента и смесь выдерживали и отверждали. Бактерии помещали в центр и инкубировали при 37°C в течение ночи.
Наблюдали рост флоры на чашке. На фиг. 10 показаны изображения чашек для соединений 1-8.
Следует иметь в виду, что раздел Подробное описание, а не разделы Сущность изобретения и Реферат, предназначен для использования для интерпретации формулы изобретения. В разделах Сущность изобретения и Реферат могут быть приведены один или несколько, но не все иллюстративные варианты осуществления настоящего изобретения, предусмотренные автором(-ами) изобретения, и, таким образом, они не предназначены для ограничения настоящего изобретения и прилагаемой формулы изобретения каким-либо образом.
Настоящее изобретение было описано выше с помощью функциональных составляющих блоков, иллюстрирующих реализацию установленных функций и их взаимосвязей. Границы этих функциональных составляющих блоков были определены в настоящем документе произвольно для удобства описания. Альтернативные границы могут быть определены при условии, если установленные функции и их взаимосвязи осуществляются должным образом.
Что касается аспектов изобретения, описанных как род объектов, все отдельные виды индивидуально рассматриваются как отдельные аспекты изобретения. Если аспекты изобретения описаны как «содержащие» признак, варианты осуществления также рассматриваются как «состоящие из» или «состоящие по существу из» признака.
Вышеприведенное описание конкретных вариантов осуществления настолько полно раскрывает общий характер изобретения, что другие могут, применяя знания в пределах квалификации в данной области, легко модифицировать и/или приспосабливать к различным вариантам применения такие конкретные варианты осуществления, без неуместного экспериментирования, не выходя за рамки общей концепции настоящего изобретения. Поэтому, такие видоизменения и модификации предназначены для того, чтобы находиться в рамках смысла и диапазона эквивалентов раскрытых вариантов осуществления, основываясь на знании и руководствах, предоставленных в настоящем документе. Предполагается, что использованная фразеология или терминология служит для цели описания, а не для ограничения, так чтобы терминология или фразеология настоящего описания интерпретировалась квалифицированным специалистом в свете представленных знаний и руководств.
Широта и объем настоящего изобретения не должны ограничиваться любым из вышеописанных иллюстративных вариантов осуществления. Все различные аспекты, варианты осуществления и возможные варианты, описанные в настоящем документе, могут быть объединены в любых без исключения вариациях.
Все публикации, патенты и заявки на патенты, упомянутые в настоящем описании, включены в настоящий документ посредством ссылки в той же степени, как если бы каждая отдельная публикация, патент или заявка на патент были специально и индивидуально указаны для включения посредством ссылки. В той степени, в которой любое значение или определение термина в этом документе противоречит любому значению или определению того же термина в документе, включенном посредством ссылки, значение или определение, присвоенное этому термину в этом документе, имеет приоритет.
| название | год | авторы | номер документа |
|---|---|---|---|
| МАКРОЦИКЛИЧЕСКИЕ АНТИБИОТИКИ ШИРОКОГО СПЕКТРА ДЕЙСТВИЯ | 2016 |
|
RU2761476C2 |
| ОКСАЗОЛИДИНОНОВЫЕ СОЕДИНЕНИЯ И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ В КАЧЕСТВЕ ПРОТИВОБАКТЕРИАЛЬНЫХ СРЕДСТВ | 2016 |
|
RU2794494C2 |
| СПОСОБЫ УСИЛЕНИЯ СТАБИЛИЗАЦИИ ИНДУЦИРУЕМОГО ГИПОКСИЕЙ ФАКТОРА-1 АЛЬФА | 2010 |
|
RU2521251C2 |
| БЕНЗО[b]ТИОФЕНОВЫЕ АГОНИСТЫ STING ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ РАКА | 2018 |
|
RU2771811C2 |
| НЕЙРОАКТИВНЫЕ СОЕДИНЕНИЯ И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ | 2015 |
|
RU2764702C2 |
| ПРОИЗВОДНЫЕ БОРОНОВОЙ КИСЛОТЫ И ИХ ТЕРАПЕВТИЧЕСКИЕ ПРИМЕНЕНИЯ | 2017 |
|
RU2773346C2 |
| ЦИАНОТИЕНОТРИАЗОЛОДИАЗЕПИНЫ И ПУТИ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ | 2016 |
|
RU2750164C2 |
| ПРОИЗВОДНЫЕ ПАНТОТЕНАТА ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ НЕВРОЛОГИЧЕСКИХ ЗАБОЛЕВАНИЙ | 2013 |
|
RU2653497C2 |
| Ингибиторы цитохрома 11В2 человека | 2022 |
|
RU2800378C1 |
| НОВЫЕ ПЕПТИДНЫЕ ПРОИЗВОДНЫЕ И ИХ ПРИМЕНЕНИЯ | 2015 |
|
RU2699572C2 |
Группа изобретений относится к биотехнологии. Предложены способы скрининга для идентификации терапевтических средств-кандидатов для лечения субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна (AMD) (варианты). Способы включают культивирование микроорганизма в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения либо определение одного или нескольких видов микробов, или уже определенные один или несколько видов микробов, где микроорганизм выбран из Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida, как присутствующие в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, и их культивирование в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения; при этом когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизма по сравнению с контролем при его максимальной тестируемой концентрации или ниже, или уменьшает друзеноидное поражение на тканях сетчатки у животного; уменьшает узелки, подобные друзам, под слоем пигментного эпителия сетчатки в глазу животного; уменьшает пироптоз клеток пигментного эпителия сетчатки в глазу животного; уменьшает активацию системы комплемента и/или воспаление в глазу животного, уменьшает экспрессию белков C5A, CFH, CASPASE1 и NLRP3; уменьшает секрецию активного IL-1β и/или IL-18 клетками пигментного эпителия сетчатки в глазу животного; или любую из перечисленных комбинаций, - такое тестируемое соединение может быть идентифицировано, как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики AMD. Изобретения обеспечивают расширение арсенала терапевтических средств-кандидатов для лечения или профилактики глазных заболеваний, таких как AMD. 6 н. и 49 з.п. ф-лы, 10 ил., 1 табл., 10 пр.
1. Способ скрининга для идентификации терапевтических средств-кандидатов для AMD, включающий:
a) культивирование микроорганизма в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения;
b) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения;
когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизма по сравнению с контролем при его максимальной тестируемой концентрации или ниже, оно может быть идентифицировано как кандидат в терапевтические средства,
где микроорганизм включает вид, который присутствует в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), по сравнению со здоровым субъектом, где микроорганизм выбран из Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida.
2. Способ скрининга по п.1, дополнительно включающий:
c) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые ингибируют рост микроорганизма по сравнению с контролем.
3. Способ скрининга по п.1, где внутриглазное пространство выбрано из следующего водянистая влага в передней камере, подвешивающая связка, цилиарное тело, цилиарное тело и мышца, стекловидное тело в задней камере, сетчатка, хориоидея, зрительный нерв, хрусталик или радужка.
4. Способ скрининга по п. 1, где микроорганизм включает смесь видов микробов, по существу аналогичных тем, которые наблюдаются в водянистой влаге, стекловидном теле и/или мягких друзах субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна.
5. Способ скрининга по п. 1, где микроорганизм получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна.
6. Способ скрининга по любому из пп. 1-5, где множество тестируемых соединений подвергают скринингу, и где множество тестируемых соединений включает по меньшей мере одно тестируемое соединение, которое не является известным антибиотиком широкого спектра действия или известным антибиотиком, обладающим эффективностью против одного или нескольких видов микроорганизмов.
7. Способ скрининга по п. 6, где тестируемое соединение не представляет собой ампициллин, ванкомицин, неомицин, метронидазол или тетрациклин.
8. Способ скрининга по любому из пп. 1-5, где тестируемое соединение выбрано из соединений 2-8 или их фармацевтически приемлемых солей или сложных эфиров, или фармацевтической композиции, содержащей соединение или его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир, где соединения 2-8 имеют следующую химическую структуру:
9. Способ скрининга по любому из пп. 1-8, где идентификация включает идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые предотвращают видимый рост микроорганизма при максимальной тестируемой концентрации или ниже.
10. Способ скрининга по любому из пп. 1-8, где идентификация включает идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые предотвращают образование видимых колоний микроорганизма при максимальной тестируемой концентрации или ниже.
11. Способ скрининга по п.8, где соединение или его фармацевтически приемлемая соль или сложный эфир, или фармацевтическую композицию вводят субъекту в количестве, эффективном для уничтожения или ингибирования роста микроорганизма во внутриглазном пространстве, крови и/или желудочно-кишечном тракте субъекта.
12. Способ скрининга по п.11, где фармацевтическую композицию вводят перорально, местно, интравитреально, внутримышечно, подкожно или внутривенно.
13. Способ скрининга для идентификации терапевтических средств-кандидатов для AMD, включающий:
a) определение одного или нескольких видов микробов или уже определенные один или несколько видов микробов как присутствующих в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), по сравнению со здоровым субъектом;
b) культивирование микроорганизма, включающего по меньшей мере один из видов микробов в повышенном количестве, в подходящей культуральной среде в присутствии тестируемого соединения;
c) измерение роста микроорганизма в культуральной среде в присутствии тестируемого соединения;
когда тестируемое соединение ингибирует рост микроорганизма по сравнению с контролем при его максимальной тестируемой концентрации или ниже, оно может быть идентифицировано как кандидат в терапевтические средства,
где микроорганизм включает смесь видов микробов, по существу аналогичных тем, которые наблюдаются в водянистой влаге, стекловидном теле и/или мягких друзах субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна,
где микроорганизм выбран из Pseudomonas putida и/или Bacillus megaterium.
14. Способ скрининга по п. 13, дополнительно включающий:
d) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые ингибируют рост микроорганизма по сравнению с контролем.
15. Способ скрининга по любому из пп. 1-14, где субъект является человеком-субъектом.
16. Способ скрининга для идентификации терапевтических средств-кандидатов для AMD, включающий:
a) введение тестируемого соединения животной модели;
b) определение степени тяжести одного или нескольких симптомов глазного заболевания после введения;
где животную модель получают путем введения микроорганизма и/или инактивированного белка из него во внутриглазное пространство глаза животного, при этом микроорганизм содержит виды, которые присутствуют в повышенном количестве во внутриглазном пространстве у субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна (AMD) по сравнению со здоровым субъектом,
где микроорганизм выбран из Bacillus megaterium и/или Pseudomonas putida;
где идентификация включает идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые, по сравнению с контролем,
a) уменьшают друзеноидное поражение на тканях сетчатки у животного;
b) уменьшают узелки, подобные друзам, под слоем пигментного эпителия сетчатки в глазу животного;
c) уменьшают пироптоз клеток пигментного эпителия сетчатки в глазу животного;
d) уменьшают активацию системы комплемента и/или воспаление в глазу животного, уменьшают экспрессию белков C5A, CFH, CASPASE1 и NLRP3;
e) уменьшают секрецию активного IL-1β и/или IL-1β клетками пигментного эпителия сетчатки в глазу животного; или
f) любую комбинацию a)-e), и
такое тестируемое соединение может быть идентифицировано как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики AMD.
17. Способ по п. 16, дополнительно включающий
c) идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые облегчают, по меньшей мере, один из симптомов по сравнению с контролем.
18. Способ по п. 16, где микроорганизм включает смесь видов микробов, по существу аналогичных тем, которые наблюдаются в водянистой влаге, стекловидном теле и/или мягких друзах субъекта, страдающего возрастной дегенерации желтого пятна.
19. Способ по п. 16, где микроорганизм получен, частично или полностью, из водянистой влаги и/или стекловидного тела субъекта, страдающего возрастной дегенерацией желтого пятна.
20. Способ по любому из пп. 16-19, где животное представляет собой примата, не относящегося к человеку.
21. Способ скрининга по п.20, где приматом, не относящимся к человеку, является обезьяна.
22. Способ по любому из пп. 16-19, где животное не является макакой.
23. Способ по любому из пп. 16-22, где микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят в субретинальное пространство животного.
24. Способ по любому из пп. 16-22, где микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят для индуцирования друзеноидного поражения у животного.
25. Способ по п. 24, где микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят для индуцирования друзеноидного поражения на тканях сетчатки у животного.
26. Способ по любому из пп. 16-22, где микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят для индуцирования узелков, подобных друзам в глазу животного.
27. Способ по п. 26, где микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят для индуцирования узелков, подобных друзам под слоем пигментного эпителия сетчатки в глазу животного.
28. Способ по любому из пп. 16-27, где микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят для индуцирования пироптоза в глазу животного.
29. Способ по п. 28, где микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят для индуцирования пироптоза клеток пигментного эпителия сетчатки в глазу животного.
30. Способ по любому из пп. 16-29, где микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят для индуцирования активации системы комплемента и/или воспаления в глазу животного.
31. Способ по п. 30, где микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят для индуцирования активации системы комплемента и/или воспаления в глазу животного с повышенной экспрессией белков C5A, CFH, CASPASE1 и NLRP3.
32. Способ по любому из пп. 16-31, где микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят для индуцирования секреции активного IL-1β и/или IL-1β в глазу животного.
33. Способ по п. 32, где микроорганизм и/или инактивированный белок из него вводят для индуцирования секреции активного IL-1β и/или IL-1β клетками пигментного эпителия сетчатки в глазу животного.
34. Способ скрининга по любому из пп. 16-33, где тестируемое соединение вводят перорально, местно, интравитреально, внутримышечно, подкожно или внутривенно.
35. Способ скрининга по любому из пп. 16-34, где идентификация включает идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые по сравнению с контролем уничтожают или подавляют рост микроорганизма в глазу, крови и/или желудочно-кишечном тракте животной модели.
36. Способ скрининга по п. 35, где идентификация включает идентификацию терапевтических средств-кандидатов, которые по сравнению с контролем уничтожают или подавляют рост микроорганизма во внутриглазном пространстве или полости животной модели.
37. Способ скрининга по любому из пп.16-36, где тестируемое соединение предварительно определено как эффективное для ингибирования роста микроорганизма.
38. Способ скрининга по п.37, где тестируемое соединение выбрано из соединений 2-8 или их фармацевтически приемлемых солей или сложных эфиров, или фармацевтической композиции, содержащей соединение или его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир, где соединения 2-8 имеют следующее химическое строение:
39. Способ скрининга соединения на эффективность лечения или профилактики глазного заболевания, включающий:
получение образца, взятого из водянистой влаги или стекловидного тела субъекта, выбранного из субъекта, страдающего глазным заболеванием, члена семьи или близкого генетического родственника субъекта, страдающего глазным заболеванием, или скончавшегося субъекта, который, как известно, страдал глазным заболеванием;
культивирование одного или нескольких организмов в образце в условиях, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур;
добавление соединения к одной или нескольким культурам; и
определение, уменьшает ли соединение рост или уменьшает популяцию одной или нескольких культур,
где глазное заболевание представляет собой возрастную дегенерацию желтого пятна (AMD),
где один или несколько организмов выбраны из Pseudomonas putida и/или Bacillus megaterium.
40. Способ по п. 39, дополнительно включающий идентификацию, основанную на определении соединения, которое уменьшает рост или уменьшает популяцию одной или нескольких культур in vitro.
41. Способ скрининга соединения на эффективность лечения или профилактики возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), включающий:
культивирование одного или нескольких организмов в условиях, имитирующих внутриглазное пространство человека, или в среде с отварным мясом для получения одной или нескольких культур, где один или несколько организмов выбраны из Pseudomonas putida и/или Bacillus megaterium;
добавление соединения к одной или нескольким культурам; и
определение, уменьшает ли соединение рост или уменьшает популяцию одной или нескольких культур.
42. Способ по п. 41, дополнительно включающий идентификацию, основанную на определении соединения, которое уменьшает рост или уменьшает популяцию одной или нескольких культур in vitro.
43. Способ скрининга соединения на эффективность в лечении или профилактики возрастной дегенерации желтого пятна (AMD), включающий:
введение соединения модели млекопитающего; и определение является ли соединение эффективным для уменьшения или предотвращения одного или нескольких симптомов AMD,
где модель млекопитающего создается путем введения одного или нескольких микроорганизмов и/или одного или нескольких инактивированных белков одного или нескольких микроорганизмов в глаз млекопитающего,
где один или несколько организмов выбраны из Pseudomonas putida и/или Bacillus megaterium,
где введение соединения по сравнению с контролем
a) уменьшает друзеноидное поражение на тканях сетчатки у животного;
b) уменьшает узелки, подобные друзам, под слоем пигментного эпителия сетчатки в глазу животного;
c) уменьшает пироптоз клеток пигментного эпителия сетчатки в глазу животного;
d) уменьшает активацию системы комплемента и/или воспаление в глазу животного, уменьшает экспрессию белков C5A, CFH, CASPASE1 и NLRP3;
e) уменьшает секрецию активного IL-1β и/или IL-1β клетками пигментного эпителия сетчатки в глазу животного; или
f) любую комбинацию a)-e), и
такое тестируемое соединение может быть идентифицировано как терапевтическое средство-кандидат для лечения или профилактики AMD.
44. Способ по п. 43, дополнительно включающий мониторинг развития и прогрессирования одного или нескольких маркеров AMD.
45. Способ по п. 43 или 44, дополнительно включающий обеспечение прохождения достаточного времени после введения одного или нескольких микроорганизмов и/или одного или нескольких инактивированных белков одного или нескольких микроорганизмов для развития у млекопитающего друзеноидных поражений.
46. Способ по п. 44 или 45, где мониторинг развития и прогрессирования одного или нескольких маркеров глазного заболевания включает мониторинг глазной воспалительной реакции у млекопитающего.
47. Способ по любому из пп. 44-46, где мониторинг развития и прогрессирования одного или нескольких маркеров глазного заболевания включает мониторинг формирования или прогрессирования друзеноидных поражений.
48. Способ по любому из пп. 45-47, где введение одного или нескольких микроорганизмов и/или одного или нескольких инактивированных белков одного или нескольких микроорганизмов включает внутриглазную инъекцию одного или нескольких микроорганизмов и/или одного или нескольких инактивированных белков одного или нескольких микроорганизмов.
49. Способ по любому из пп. 43-48, где млекопитающее представляет собой примата, не относящегося к человеку.
50. Способ по п. 49, где млекопитающее представляет собой макаку.
51. Способ по любому из пп. 43-50, где введение соединения происходит после образования друзеноидных поражений в модели на млекопитающем.
52. Способ по любому из пп.43-51, где введение включает инъекцию соединения в глаз модели на млекопитающем.
53. Способ по п. 52, где инъекция включает внутриглазную инъекцию.
54. Способ по любому из пп.43-53, где один или несколько симптомов выбраны из группы, состоящей из образования друзеноидных поражений, роста микробов или микробиологической нагрузки, продукции молекулы воспаления или маркера, и их комбинаций.
55. Способ по любому из пп.39-54, где соединение выбрано из соединений 2-8 или их фармацевтически приемлемых солей или сложных эфиров, или фармацевтической композиции, содержащей соединение или его фармацевтически приемлемую соль или сложный эфир, где соединения 2-8 имеют следующую химическую структуру:
| XIAOFENG WEN et al | |||
| "Epigenetics, microbiota, and intraocular inflammation: new paradigms of immune regulation in the eye"; Progress in retinal and eye research", 2018, N 64, p.84-95 | |||
| Автомобиль-сани, движущиеся на полозьях посредством устанавливающихся по высоте колес с шинами | 1924 |
|
SU2017A1 |
| JP 0006036193 B2, 30.11.2016 | |||
| Устройство для измерения скорости и направления движения объекта | 1986 |
|
SU1436074A1 |
| Способ защиты переносных электрических установок от опасностей, связанных с заземлением одной из фаз | 1924 |
|
SU2014A1 |
| RU 2001105983 A, 20.01.2003. | |||
