РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК РВТN II, ОПРЕДЕЛЯЮЩАЯ СИНТЕЗ КРИСТАЛЛИЧЕСКОГО ИНСЕКТИЦИДНОГО ДЕЛЬТА-ЭНДОТОКСИНА CRY IIIA-ТИПА, СПОСОБ ЕЕ КОНСТРУИРОВАНИЯ И ШТАММ БАКТЕРИЙ PSEUDOMONAS PUTIDA, СОДЕРЖАЩИЙ РЕКОМБИНАНТНУЮ ПЛАЗМИДУ ДНК РВТN II-ПРОДУЦЕНТ КРИСТАЛЛИЧЕСКОГО ИНСЕКТИЦИДНОГО ДЕЛЬТА-ЭНДОТОКСИНА CRY IIIA-ТИПА, АКТИВНОГО ПРОТИВ НАСЕКОМЫХ ОТРЯДА COLEOPTERA Российский патент 1998 года по МПК C12N15/32 C12N15/78 C12N15/32 C12R1/40 A01N63/00 C12N1/20 

Описание патента на изобретение RU2103363C1

Изобретение относится к области биотехнологии и, в частности к генетической инженерии и может быть использовано в производстве препаратов против колорадского жука и других насекомых отряда Coleoptera.

Известен штамм бактерий Bacillus thuringiensis - продуцент дельтаэндотоксина Cry IIIA - типа против колорадского жука (SU патент N 1814520 кл. A 01 N 63/00).

Однако данный штамм имеет те же недостатки, что и другие природные штаммы Bacillus thuringiensis.

Биоинсектициды, создаваемые на их основе содержат жизнеспособные споры и кристаллические включения токсина, освобождающиеся при лизисе спорулирующих клеток. Токсин в таких препаратах быстро разрушается под воздействием природных факторов, а внесение в окружающую среду значительных количеств спор может в конечном счете негативно влиять на экологическую обстановку.

Известны штаммы Bacillus thuringiensis, синтезирующие белки, токсичные против насекомых отряда Coleoptera и известны последовательности этих токсинов и кодирующих их генов (ЕР N 0498537 A 2, C 12 N 15/32, 1992 и заявка PCT WO 91/14778, c 12 N 15/32, 1991). В цитируемых документах предлагаются возможные способы использования данных штаммов, генов дельта-эндотоксинов и кодируемых ими продуктов, включая конструирование новых рекомбинантных микроорганизмов.

Однако в этих источниках не содержится подробной информации о способах конструирования новых штаммов и их характеристиках. Кроме того, данные гены кодируют токсины, отличные от токсина Cry IIIA - типа, продуцируемого заявляемым штаммом P. putida.

Mycogen Corporation осуществляет разработку и испытание инкапсулированных биопестицидов на основе убитых клеток Pseudomonas fluoresoens, в том числе клеток с Cry IIIA - белком. Однако конкретные данные относительно системы регуляции и уровня экспрессии клонированных Cry-генов в рекомбинантных штаммах псевдомонад не сообщаются.

(Feitelson J. , Payne J., Kim L.// Bio/ Technol., 1992, v.10, p. 271 - 275).

Однако конкретные данные относительно системы регуляции и уровня экспрессии клонированного cry-гена в рекомбинантных штаммах псевдомонад, не сообщаются.

Задача предлагаемого изобретения - конструирование рекомбинантной плазмидной ДНК, кодирующей синтез инсектицидного белка и создание штамма Pseudomonas putida - продуцента кристаллического дельта-эндотоксина, активного против колорадского жука и других насекомых отряда Coleoptera.

Создана плазмида pBTN11, кодирующая дельта - эндотоксин Cry IIIA -типа и способная поддерживаться в клетках различных грамотрицательных бактерий, состоящая из следующих элементов:
полной последовательности сконструированной векторной плазмиды pBTN4 (размер 14,8 т.п.н.) с широким кругом бактериальных хозяев;
полной последовательности HindIII-фрагмента ДНК B.thuringiensis subsp. tenebrionis (размер 3,0 т.п.н.) и содержит:
интактный ген дельта-эндотоксина B.thuringiensis subsp. tenebrionis;
ген устойчивости к канамицину (Kmr);
гены, ответственные за мобилизацию плазмиды при конъюгативном переносе (oriT, mob);
промотор гена cryIA(b) B. thuringiensis subsp. berliner 1715;
промотор Pm оперона мета-пути деградации ароматических углеводородов плазмиды pWWO;
ген xylS, участвующий в позитивной регуляции этого оперона;
сайты расщепления эндонуклеазой PstI с координатами 0; 5,3; 5,7, 7,1 и 17,8 т.п.н.;
сайты расщепления эндонуклеазой HindIII с координатами 2,4, 6,5 и 9,5 т. п.н.;
сайты расщепления эндонуклеазой BamHI с координатами 3,2; 4,8 и 6,0 т.п. н.;
сайты расщепления эндонуклеазой BglII с координатами 3,6 и 9,4 т.п.н.;
сайты расщепления эндонуклеазой EcoRI с координатами 6,0; 8,1; 8,8 и 9,8 т.п.н.;
Размер плазмиды pBTN11 равен 17,8 т.п.н.

Способ конструирования плазмиды pBTN11, кодирующей синтез Coleoptera-специфического эндотоксина, заключающейся том, что ДНК плазмиды pBTO22, несущей ген cryIA(b) B. thuringiensis subsp. berliner 1715, расщепляют эндонуклеазой Clal, смешивают с ДНК плазмиды pC194, подвергнутой частичному гидролизу Taql, фрагменты ДНК соединяют с помощью ДНК-лигазы и полученной смесью трансформируют клетки Escherichia coli и трансформанты высевают на агаризованную среду, содержащую ампициллин (Ap) и хлорамфеникол (Cm), и из клеток устойчивых к Am и Cm клонов выделяют ДНК плазмиды pBTO3, в структуре которой меньший Clal-фрагмент плазмиды pBTO22 заменен на фрагмент pC194, состоящий из трех Taql (A, D и E) фрагментов, ДНК плазмиды pBTO3 и экспрессирующего вектора с широким кругом бактериальных хозяев - плазмиды pNM185 - гидролизуют EcoRI, продукты гидролиза соединяют с помощью ДНК-лигазы и после трансформации клеток E.coli клоны, содержащие гибридную плазмиду, отбирают по устойчивости к канамицину и хлорамфениколу, отобранные клоны проверяют на отсутствие индуцируемой 3-метилбеназоатом (0,5 - 1 мМ) устойчивости к стрептомицину и из полученных клонов выделяют ДНК плазмиды pBTN3, в структуре которой ориентации промоторов Pm и cryIA(b) - гена совпадают, ДНК плазмиды pBTN3 подвергают частичному гидролизу эндонуклеазой ClaI и обрабатывают ДНК-лигазой фага T4, полученным препаратом трансформируют клетки E.coli и отбирают клоны, устойчивые к канамицину, но неспособные расти на среде с хлорамфениколом, из этих клонов выделяют ДНК плазмиды pBTN4, затем ДНК плазмиды pUC19 и B. thuringiensis subsp. tenebriones расщепляют HindIII, образовавшиеся фрагменты лигируют, трансформируют лигазной смесью клетки E.coli JM103 и отбирают бесцветные колонии на среде Мак-Конки с ампициллином, отобранные клоны проверяют на наличие последовательностей ДНК, гомологичных соответствующим последовательностям cryIIIA-гена B. thuringiensis subsp. tenebrionis, из клонов, содержащих эти последовательности, выделяют ДНК плазмиды PBTT51 с cryIIIA-геном, смесью ДНК pBTT51 и pBTN4, последовательно обработанной эндонуклеазой HindIII и ДНК-лигазой, трансформируют клетки E.coli, отбирают устойчивые к канамицину клоны, проверяют их на индуцируемую 3-метилбеназоатом устойчивость к стрептомицину, и из клеток чувствительных к стрептомицину клонов выделяют плазмиду pBTN11, содержащую HindIII-фрагмент c cryIIIA-геном в прямой ориентации к промотору Pm.

Создан штамм:
Pseudomonas putida IPM-36, содержащий рекомбинантную плазмиду ДНК pBTNII - продуцент кристаллического инсектицидного дельта-эндотоксина Cry IIIA - типа, активного против насекомых отряда Coleoptera. Штамм депонирован в Центральной коллекции микроорганизмов Российского акционерного общества "Биопрепарат", регистрационный номер - ЦКМ В - 63 И
Штамм P.putida IPM-36 получен в результате трансформации плазмиды pBTN11 в клетки штамма E.coli S17 - 1 и последующего конъюгационного переноса этой плазмиды из E.coli S17-1 (pBTN11) в клетки штамма P. putida BS1356.

Полученный штамм характеризуется следующими признаками.

Культурно-морфологические признаки.

Клетки палочковидные, размером (2,0 - 3,2) х (0,7 - 0,9) мкм, подвижные, перетрихи, грамотрицательные, спор не образуют. (Размеры клеток даны для односуточной культуры, выращенной на МПА при 30oC.)
Штамм хорошо растет на следующих средах: МПБ (мясопептонный бульон), LB (триптон - 10 г/л, дрожжевой экстракт - 5 г/л, хлористый натрий - 10 г/л, pH 7,2), Кинга B (пептон - 20 г/л, глицерин - 10 мл/л, MgSO4 x 7H2O - 1,5 г/л), питательном агаре на основе гидролизата кильки (ДИПС, г. Махачкала) - 35 г/л, на минимальной синтетической среде M9 следующего состава: K2HPO4 - 7 г/л; KH2PO4 - 3 г/л; NH4Cl - 1 г/л; глюкоза - 1 г/л.

На мясо-пептонном агаре колонии гладкие, блестящие, с ровными краями. В мясо-пептонном бульоне наблюдается помутнение, осадок и желто-зеленый флуоресцирующий пигмент.

На стандартных средах Кинга продуцирует желто-зеленый флуоресцирующий пигмент, феназиновые пигменты не образует.

Физиолого-биохимические признаки.

Облигатный аэроб, температурный оптимум роста 28-30oC, не растет при 42oC, оптимум pH 6,8 - 7,6.

Нитраты редуцирует, молоко не пептонизирует, не использует в качестве источников углерода трегалозу, и д-коилозу, утилизирует этиловый спирт.

Ассимилирует аммонийный и нитратный азот. В качестве источника углерода использует д-глюкозу, д-фруктозу, сахарозу, мальтозу, лактозу, ацетат, пропинат, бутират, сукцинат, пируват, фумарат, бензоат, лактат, цитрат, катехол, протокатехоат.

Оксидазная реакция положительная.

Аргининдегидролаза присутствует.

Устойчивость к антибиотикам.

Проявляет устойчивость к канамицину (50-100 мкг/мл) и стрептомицину (200 мкг/мл), обусловленную присутствием плазмиды pBTN11, а также устойчивость к ампициллину (500 мкг/мл).

Условия хранения штамма.

Штамм может храниться в лиофильно-высушенном состоянии или в 0,6%-агаризованной среде (Nutrient Broth (Difco) - 4 г/л, NaCl - 5 г/л, агар - 6 г/л, pH 6,8) под вазелиновым маслом.

Штамм не патогенен для теплокровных животных.

Полученный штамм Pseudomonas putida IPM-36- продуцент дельта-эндотоксина обладает следующими преимуществами перед B. thuringiensis:
возможность защиты энтомотоксина от действия факторов внешней среды клеточной стенкой продуцента в связи с его внутриклеточной локализацией;
уменьшение возможных отрицательных последствий для окружающей среды при использовании препаратов на основе инактивированных вегетативных клеток по сравнению с препаратами, содержащими кристаллы и споры;
повышение продуктивности и технологичности при производстве.

На фиг. 1 представлена схема получения векторной плазмиды pBTN4; на фиг. 2 - карта плазмиды pBTN11; на фиг. 3 - клетки P. putida IPM-36 с внутриклеточными включениями энтомоцидного белка.

Пример 1. Конструирование рекомбинантной плазмиды pBTN11.

Выделяют плазмидные ДНК из клеток E.coli и Bacillus cereus с последующей очисткой в градиенте плотности хлористого цезия в присутствии бромистого этидия.

ДНК плазмиды pBTO22 гидролизуют рестрикционой эндонуклеазой ClaI при 37oC в буфере A (10 мм трис-HCl, pH 7,5, 10 мМ MgCl2, 1 мМ дитиотрейтол). ДНК плазмиды pC194 подвергают частичному расщеплению рестриктазой Taql при 65oC в том же буфере. В инкубационную смесь вносят 5 М раствор NaCl до конечной концентрации 0,1 М, ДНК осаждают добавлением двух объемов этанола и растворяют в буфере ТЕ (10 мМ трис-HCl, pH 7,4, 1 мМ ЭДТА, pH 8,0).

Гидролизаты ДНК pBTO22 и pC194 смешивают в соотношении 1:5, добавляют буфер для лигирования (конечная концентрация - 66 мМ трис-HCl, pH 7,5, 5 мМ MgCl2, 5 мМ дитиотрейтол, 1 мМ АТФ) и ДНК-лигазу фага Т4 (1 ед/мкг ДНК). Концентрация ДНК составляет 50-100 мкг/мл, объем инкубационной смеси - 50 мкл. Реакцию проводят при 8oC в течение ночи. Полноту гидролиза и лигирования ДНК контролируют с помощью электрофореза в геле 0,7% агарозы.

Для получения компетентных клеток, культуру клеток Escherichia coli DH5 α выращивают в среде LB при 37oC до середины логарифмической фазы роста. Клетки осаждают центрифугированием. (Эту и дальнейшие операции проводят при 2-4oC). Осадок ресуспендируют в 1/2 первоначального объема 10 мМ раствора CaCl2, выдерживают 20 мин и после центрифугирования ресуспендируют в 1/50 первоначального объема 50 мМ CaCl2. Через 12-24 ч хранения при 2-4oC 0,2 мл суспензии смешивают с 10 мкл раствора лигированной ДНК (10-50 мкг/мл) и инкубируют 30-60 мин на льду. Трансформационную смесь переносят на 2 мин в водяную баню при 42oC, добавляют к суспензии 1 мл LB, инкубируют 1 ч при 37oC и высевают на агаризованную среду LB с хлорамфениколом (5 мкг/мл).

Чашки инкубируют при 37oC в течение 20-24 ч, выросшие колонии отбирают, из полученных клонов выделяют плазмидные ДНК и проводят рестрикционный анализ выделенных плазмид. Рекомбинантную плазмиду, в которой ClaI-фрагмент cryIA(b) гена в плазмиде pBTO22 заменен на фрагмент ДНК pC194, состоящий из трех TaqI (A, D и E) фрагментов, с прямой ориентацией гена хлорамфениколрезистентности (CAT) по отношению к промотору cryIA(b) детерминанта, обозначают как pBTO3.

ДНК плазмид pBTO3 и pNM185 (по 2 мкг) смешивают и обрабатывают эндонуклеазой EcoRI в 50 мкл буфера B (10 мМ трис-HCl, pH 7,5, 50 мМ NaCl, 10 мМ MgCl2, 1 мМ дитиотрейтол). Лигирование продуктов гидролиза, получение компетентных клеток E. coli DH5lgЛК50 = lgCм-σ(ΣL-0,5), и трансформацию этих клеток рекомбинантными молекулами ДНК проводят как описано выше. Суспензию трансформированных клеток высевают на агаризованную среду LB с канамицином (50 мкг/мл) и хлорамфениколом (5 мкг/мл).

Выросшие колонии перекалывают, дублируя чашки с этой средой и средой LB, содержащей канамицин (50 мкг/мл), хлорамфеникол (5 мкг/мл), стрептомицин (100 мкг/мл) и 3-метилбензоат (68 мкг/мл), и после выращивания в течение 20-24 ч при 30oC отбирают колонии клонов, способных к росту только на среде без стрептомицина. Из клеток этих клонов выделяют плазмидные ДНК и проводят рестрикционный анализ. Плазмиду, в которой ориентация промотора Pm и cryIA(b) гена совпадают, обозначают как pBTN3.

ДНК плазмиды pBTN3 подвергают частичному гидролизу рестриктазой ClaI, обрабатывают ДНК-лигазой и трансформируют компетентные клетки E. coli DH5σ как описано выше. Клетки трансформантов высевают на агаризованную среду LB с канамицином (50 мкг/мл), и выросшие колонии перекалывают, дублируя чашки с этой средой и средой, содержащей канамицин (50 мкг/мл) и хлорамфеникол (5 мкг/мл).

Из колоний клонов, не способных к росту на среде с хлорамфениколом, выделяют плазмидные ДНК и анализируют их структуру.

Плазмиду, представляющую собой укороченный вариант плазмиды pBTN3 с делецией ClaI-фрагмента, содержащего ген CAT, обозначают как pBTN4.

Из клеток штамма Bacillus thuringiensis subsp. tenebrionis, синтезирующего энтомоцидный белок против личинок колорадского жука, выделяют ДНК. Бактерии выращивают в 1 л среды LB до поздней логарифмической фазы роста при 30oC, клетки собирают центрифугированием, суспендируют в 50 мл TES-буфера (0,01 М Трис-HCl, pH 8,0, 0,001 М ЭДТА, 0,1 М NaCl) и добавляют 5 мл раствора лизоцима (20 мг/мл). Суспензию клеток инкубируют при 37oC в течение 30 мин, затем добавляют 3 мл 20% раствора додецилсульфата натрия. Лизат экстрагируют дважды равным объемом смеси хлороформа и изоамилового спирта (24: 1). Препарат ДНК обрабатывают РНК-азой (конечная концентрация 50 мкг/мл) в течение 1 ч при 37oC и осаждают этанолом. Чистоту и концентрацию препаратов ДНК определяют спектрофотометрически. Затем смешивают 0,1 мкг ДНК pUC19, выделенной из клеток Escherichia coli, и 2 мкг ДНК B. thuringiensis subsp. tenebrionis и гидролизуют рестриктазой HindIII (10 ед) в 50 мкл буфера Б, как указано выше для фермента EcoRI, при 37oC в течение 2 ч. Полученные фрагменты ДНК осаждают спиртом, перерастворяют, лигируют и трансформируют компетентные клетки E. coli JM103, как описано выше. Клетки высевают на среду МакКонки (Difco) с ампициллином и отбирают бесцветные колонии.

Из клеток отобранных колоний выделяют плазмидные ДНК и, используя эти ДНК в качестве матриц, проводят полимеразную цепную реакцию (ПЦР). Праймерами в ПЦР служат олигодезоксинуклеотиды, имеющие следующую структуру: 5' - GGTTCCAACCAGGATATT - 3' и 5' - CAGACCGCAAGATTTGAT - 3'. Первый соответствуют фрагменту cryIIIA - гена B. thuringiensis subsp. tenebrionis с 1034 по 1051 нуклеотид и второй комплементарен последовательности этого детерминанта с 1215 по 1232 нуклеотид. Последовательности ДНК, исследуемые на наличие детерминанта Coleoptera-специфического инсектицидного белка, амплифицируют in vitro с помощью полимеразной цепной реакции в 50 мкл реакционной смеси, содержащей ДНК (около 10 нг), праймеры (концентрация каждого праймера - 0,3 мкм), 60 мМ трис-HCl, 16 мМ (NH4SO4, 1,5 мМ MgCl2, 1 мМ дитиотрейтол, 0,01% тритона X-100, 0,01% Твин-20, бычий сывороточный альбумин (0,1 мг/мл), смесь дезоксинуклеозидтрифосфатов (дАТФ, дГТФ, дЦТФ и дТТФ - по 0,2 мМ) и 2 ед. Tth-полимеразы; pH смеси - 8,8 при 25oC. Реакцию амплификации проводят под вазелиновым маслом в течение 30 циклов: 94oC - 1 мин, 45oC - 2 мин и 67oC - 2 мин.

Продукты ПЦР разделяют с помощью электрофореза в геле 2,5% агарозы и отбирают клоны, содержащие плазмиды, являющиеся матрицей для синтеза фрагментов ДНК размером около 0,2 т.п.н. при использовании в ПЦР, представленных выше праймеров. Плазмиду, в структуре которой ген дельта-эндотоксина входит в состав HindIII-фрагмента размером около 3 т.п.н. и находится в прямой ориентации по отношению к lac-промотору, обозначают как pBTT51.

ДНК плазмид pBTT51 и pBTN4 смешивают в соотношении 10:1 (общее количество - 2 мкг) гидролизуют эндонуклеазой HindIII, полученные фрагменты объединяют с помощью ДНК-лигазы фага T4 и трансформируют рекомбинантными молекулами ДНК CaCl2-обработанные клетки E. coli DH5ΣL как описано выше. Трансформированные клетки высевают на агаризованную среду LB с канамицином (50 мкг/мл) и выросшие через 20-24 ч инкубации при 37oC колонии перекалывают, дублируя, на чашки с этой средой и средой, содержащей дополнительно стрептомицин (100 мкг/мл) и 3-метилбензоат (68 мкг/мл). Чашки инкубируют при 30oC в течение 20-24 ч. Из клеток трансформантов, не способных к росту на среде с стрептомицином и 3-метилбензоатом, выделяют плазмидные ДНК и проводят рестрикционный анализ выделенных ДНК. Плазмиду, содержащую HindIII-фрагмент с геном энтомотоксина в прямой ориентации к промотору Pm обозначают как pBTN11.

Схема конструирования векторной плазмиды pBTN4 и карта плазмиды pBTN11 представлены на фиг. 1 и 2.

Пример 2. Получение штамма-продуцента.

Для получения на основе штамма Pseudomonas putida BS1356 продуцента, способного к индуцированному синтезу энтомоцидного белка в виде "телец включения" конструируют донорный штамм E. coli S17-1 (pBTN11), из которого плазмида pBTN11 может быть передана путем конъюгации в клетки различных грамотрицательных бактерий. В состав генома E. coli S17-1 входят гены tra-системы плазмиды RP4 с этой целью ДНК плазмиды pBTN11 трансформируют компетентные клетки E. coli S17-1, полученные как описано в примере 1. Отбор трансформантов проводят на агаризованной среде LB, содержащей канамицин (50 мкг/мл).

Скрещиваемые штаммы E. coli S17-1 (pBTN11) и P. putida BS1356 выращивают в течение ночи при 30oC. Культуры донора и реципиента смешивают в соотношении 1:10 (общий объем 1 мл). Суспензию клеток фильтруют через нитроцеллюлозный фильтр (средний диаметр пор - 0,45 мкм, диаметр фильтра - 25 мм) и фильтр помещают на поверхность агаризованной среды LB. Инкубацию проводят 16 - 20 ч при 30oC, затем клетки смывают с фильтра 1 мл 0,9% раствора NaCl и для отбора трансконъюгантов высевают на чашки со средой, содержащей канамицин (50 мкг/мл) и ампициллин (200 мкг/мл).

В клетках трансконъюгантов определяют продукцию дельта-эндотоксина с помощью твердофазного иммуноферментного анализа (ИФА). Для построения калибровочной кривой в ИФА используют очищенный препарат кристаллического белка B. thuringiensis subsp. tenebrionis. Результаты выражают в процентах от общего содержания клеточного белка, растворимого в 0,1 М NaOH, определяемого по Лоури. В качестве стандартов используют серию разведений кристаллического белка B. thuringiensis subsp. tenebrionis и бычьего сывороточного альбумина.

Пример 3. Для получения дельта-эндотоксина свежую 16 ч ночную культуру штамма P. putida IPM-36, полученную инкубированием в среде LB при 30oC разводят в 100 раз в среде LB с канамицином (25 мкг/мл), растят в течение 4 ч при 30oC, добавляют 0,5 мМ индуктора 3-метилбенарата и продолжают инкубировать в тех же условиях еще 16 ч. Количество дельта-эндотоксина, синтезируемого клетками штамма P. putida IPM-36 в указанных выше условиях составляет 500-700 мг/л или 62% от общего растворимого клеточного белка. Дельта-эндотоксин локализуется в клетках в виде "телец-включения" (фиг. 3).

Пример 4. Оценку инсектицидной активности штамма P. putida IPM-36 проводят на личинках колорадского жука (Leptinotarsa decemlineata) первого или второго возраста, отродившихся из одной природной популяции.

Бактериальную культуру разводят в 5 раз 0,9% NaCl и готовят серию из пяти разведений культуры с шагом 5. В качестве положительного контроля используют серию разведений споро-кристаллической смеси B. thuringiensis subsp. tenebrionis, которую получают инкубированием этой бациллы при 30oC сначала в среде LB в течении 16 ч, а затем, после разведения в 40 раз, в среде NB или другой среде для споруляции еще в течении 48 ч. В приготовленные суспензии опускают листья картофеля примерно одного размера, вынимают, дают им высохнуть при 20oC и помещают в чашки Петри. В качестве отрицательного контроля используют раствор 0,9% NaCl. На каждое разведение используют по 10 личинок жука и по 2-5 листьев картофеля. Учет гибели личинок проводят через 3 сут инкубирования в термостате при температуре 21oC и фотопериоде 18 ч.

Биологическую активность штаммов, выраженную в ЛК50, вычисляют по формуле Кербера в процентах концентрации культуральной жидкости (КЖ) в суспензии:
α,
где Cм - максимальная из испытанных концентраций;
ΣL - логарифм отношения каждой предыдущей концентрации к последующей (логарифм кратности разведения);
σ - сумма значений L (доли погибших личинок от числа испытуемых), найденных для всех концентраций с учетом поправки на гибель в контроле по методу Аббота:
L = (pо - pk) : (1-pk),
где pо - доля погибших личинок при испытании культуры;
pk - доля погибших личинок в контрольном опыте.

Штамм P. putida IPM-36 по своей инсектицидной активности (ЛК50 равна 0,13% КЖ) не уступает штамму Bacillus thuringiensis subsp. tenebrionis (ЛК50=0,48% КЖ) и даже превосходит его.

Предлагаемое изобретение позволяет получить новые энтомопатогены на основе грамотрицательных бактерий, в том числе микроорганизмов, колонизирующих растения, и, в частности псевдомонад, широко представленных в эпифитной микрофлоре. Использование таких штаммов, благодаря их высокой колонизирующей активности и внутриклеточной локализации инсектицидного белка, предохраняющей его от действия повреждающих факторов внешней среды, позволяет снизить количество вносимого энтомоцидного препарата и уменьшить число обработок.

Положительный эффект предлагаемого изобретения достигается за счет свойств сконструированной новым способом плазмиды pBTN11, наличию в ее структуре детерминанта инсектицидного белка CryIIIA-типа и генетических элементов, определяющих ее способность к передаче путем мобилизации широкому кругу грамотрицательных бактерий, автономной репликации и поддержанию в клетках этих микроорганизмов.

Возможность индуцированного синтеза целевого продукта, благодаря включению его детерминанта под контроль промотора Pm, позволяет также использовать штаммы Pseudomonas spp. , в том числе предлагаемый штамм P. putida IPM-36, для создания энтомоцидных препаратов против колорадского жука и ряда других насекомых отряда Coleoptera на основе инактивированных клеток бактерий, содержащих большое количество энтомоцидного белка в виде внутриклеточных включений. Уровень продукции дельта-эндотоксина в клетках P. putida IPM-36 достигает 62% от общего клеточного белка при сохранении его биологической активности (ЛК50 препаратов дельта-эндотоксина, синтезированных в клетках P. putida IPM-36 и B. thuringiensis subsp. tenebrionis равны соответственно 0,13% КЖ и 0,48% КЖ). Существующие способы фиксации бактериальных клеток могут сохранять интактной клеточную оболочку, защищающую энтомоцидный белок от действия внешних факторов.

Другими положительными свойствами предлагаемого штамма P. putida IPM-36 по сравнению с известными продуцентами энтомотоксинов - штаммами Bacillus thuringiensis - являются возможность получения целевого продукта за более короткий период времени (16 - 20 и 40 - 48 ч соответственно), существование для псевдомонад более дешевых питательных сред и технологий их выращивания, с выходом биомассы, значительно превышающим продуктивность культур Bacillus thuriensis.

Похожие патенты RU2103363C1

название год авторы номер документа
РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНКРTV241, СПОСОБ КОНСТРУИРОВАНИЯ РЕКОМБИНАНТНОЙ ПЛАЗМИДНОЙ ДНКРTV241, СПОСОБ КОНСТРУИРОВАНИЯ ПЛАЗМИДЫ, СОДЕРЖАЩЕЙ ГЕН CRY III A В СОСТАВЕ ТРАНСПОЗОНА TN917CAT, ШТАММ БАКТЕРИЙ BACILLUS THURINGIENSIS SUBSP. THURINGIENSIS, АКТИВНЫЙ ПРОТИВ КОЛОРАДСКОГО ЖУКА 1995
  • Добрица А.П.
RU2125091C1
РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК, КОДИРУЮЩАЯ СИНТЕЗ ДЕЛЬТА-ЭНДОТОКСИНА Cry IIIA, И ШТАММ BACILLUS THURINGIENSIS SSP. KURSTAKI, ПОЛУЧЕННЫЙ НА ОСНОВЕ РЕКОМБИНАНТНОЙ ПЛАЗМИДНОЙ ДНК 2004
  • Тюрин Сергей Ананьевич
  • Носков Кирилл Анатольевич
  • Вейко Владимир Петрович
  • Мешков Юрий Иванович
  • Яковлева Инна Николаевна
  • Дебабов Владимир Георгиевич
RU2278161C1
ШТАММ BACILLUS THURINGIENSIS SUBSP.KURSTAKI IPM-46, АКТИВНЫЙ ПРОТИВ НАСЕКОМЫХ ИЗ ОТРЯДОВ COLEOPTERA И LEPIDOPTERA 1999
  • Добрица А.П.
  • Гайтан В.И.
  • Лосева О.И.
  • Наумов А.Н.
RU2167528C1
РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК PRO PF 5, ОПРЕДЕЛЯЮЩАЯ СИНТЕЗ КАПСУЛЬНОГО АНТИГЕНА FI ВОЗБУДИТЕЛЯ ЧУМЫ И ПРОТЕКТИВНОГО АНТИГЕНА ВОЗБУДИТЕЛЯ СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ, И СПОСОБ КОНСТРУИРОВАНИЯ РЕКОМБИНАНТНОЙ ПЛАЗМИДНОЙ ДНК PRO PF5 1995
  • Алимов А.П.
  • Павлов В.М.
RU2110575C1
ИНКАПСУЛИРОВАННЫЙ БИОПРЕПАРАТ ДЛЯ БОРЬБЫ С КОЛОРАДСКИМ ЖУКОМ И ДРУГИМИ ЖЕСТКОКРЫЛЫМИ НАСЕКОМЫМИ-ВРЕДИТЕЛЯМИ 2001
  • Добрица А.П.
  • Корецкая Н.Г.
  • Дербышев В.В.
  • Жиглецова С.К.
  • Чубатова С.А.
  • Бечина Е.М.
RU2201679C2
РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК РТТG КM2, КОДИРУЮЩАЯ СИНТЕЗ РЕКОМБИНАНТНОГО ИММУННОГО ИНТЕРФЕРОНА ЧЕЛОВЕКА, ШТАММ ESCHERICHIA COLI T3G - ПРОДУЦЕНТ РЕКОМБИНАНТНОГО ИММУННОГО ИНТЕРФЕРОНА ЧЕЛОВЕКА И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ РЕКОМБИНАНТНОГО ИММУННОГО ИНТЕРФЕРОНА ЧЕЛОВЕКА 1996
  • Черепанов П.А.
  • Павлов В.М.
  • Федюкин В.С.
  • Шматченко Н.А.
  • Асташкина Г.Ф.
  • Воротникова И.И.
  • Гавриков В.Г.
  • Байдусь А.Н.
  • Михайлова Т.Г.
  • Денисов Л.А.
  • Ураков Н.Н.
  • Степанов А.В.
RU2097428C1
Векторная плазмидная ДНК poLYA15, предназначенная для клонирования чужеродных генов в клетках ЕSснеRIснIа coLI и BacILLUS SPP., и способ его конструирования 1987
  • Шевченко Д.В.
  • Добрица А.П.
SU1476896A1
РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК РДТИ 23, СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ РЕКОМБИНАНТНОЙ ПЛАЗМИДНОЙ ДНК РДТИ 23 И ШТАММ БАКТЕРИЙ ESCHERICHIA COLI, СОДЕРЖАЩИЙ РЕКОМБИНАНТНУЮ ПЛАЗМИДНУЮ ДНК РДТИ 23 - ПРОДУЦЕНТ СЛИТОГО БЕЛКА ДТИЛ 2 1993
  • Шемякин И.Г.
  • Анисимова В.А.
  • Митрофанова Г.Н.
RU2077585C1
РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК PTHY 315, КОДИРУЮЩАЯ ГИБРИДНЫЙ БЕЛОК α -ФАКТОР НЕКРОЗА ОПУХОЛИ -ТИМОЗИН a 1992
  • Шмелев В.А.
  • Коробко В.Г.
RU2077586C1
РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pSS5, КОДИРУЮЩАЯ СИНТЕЗ РЕКОМБИНАНТНОГО ЧЕЛОВЕЧЕСКОГО АЛЬФА-2b ИНТЕРФЕРОНА, ШТАММ ESCHERICHIA COLI SS5 - ПРОДУЦЕНТ РЕКОМБИНАНТНОГО ЧЕЛОВЕЧЕСКОГО АЛЬФА-2b ИНТЕРФЕРОНА И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ИНТЕРФЕРОНА АЛЬФА-2b 1999
  • Черепанов П.А.
  • Михайлова Т.Г.
  • Черепанов П.П.
  • Мартиненко Дмитрий Леонидович
  • Шевчук Александр Анатольевич
  • Федюкин В.С.
  • Николаев Т.М.
  • Толкачев Б.Б.
  • Свентицкий Е.Н.
  • Ураков Н.Н.
  • Калинин Ю.Т.
  • Денисов Л.А.
  • Тяготин Ю.В.
  • Мартюшин С.В.
  • Ищенко А.М.
  • Трофимов А.В.
  • Полякова Е.А.
  • Батарин В.И.
  • Шалаева О.Н.
  • Лисицкая В.И.
RU2165455C1

Иллюстрации к изобретению RU 2 103 363 C1

Реферат патента 1998 года РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК РВТN II, ОПРЕДЕЛЯЮЩАЯ СИНТЕЗ КРИСТАЛЛИЧЕСКОГО ИНСЕКТИЦИДНОГО ДЕЛЬТА-ЭНДОТОКСИНА CRY IIIA-ТИПА, СПОСОБ ЕЕ КОНСТРУИРОВАНИЯ И ШТАММ БАКТЕРИЙ PSEUDOMONAS PUTIDA, СОДЕРЖАЩИЙ РЕКОМБИНАНТНУЮ ПЛАЗМИДУ ДНК РВТN II-ПРОДУЦЕНТ КРИСТАЛЛИЧЕСКОГО ИНСЕКТИЦИДНОГО ДЕЛЬТА-ЭНДОТОКСИНА CRY IIIA-ТИПА, АКТИВНОГО ПРОТИВ НАСЕКОМЫХ ОТРЯДА COLEOPTERA

Использование: биотехнология, получение средств защиты растений в отношении жесткокрылых насекомых на основе рекомбинантных грамотрицательных бактерий. Сущность изобретения: Сконструирована рекомбинантная плазмидная ДНК pBT N 11, определяющая синтез кристаллического инсектицидного дельта-эндотоксина Cry IIIA - типа и на ее основе получен штамм бактерий Psendomonas putida, содержащий вышеуказанную плазмиду, продуцирующий дельта-эндотоксин Cry IIIA - типа, активный в отношении насекомых отряда Coleoptera. 3 с.п. ф-лы, 3 ил.

Формула изобретения RU 2 103 363 C1

1. Рекомбинантная плазмидная ДНК рВТN11, определяющая синтез кристаллического инсектицидного дельта-эндотоксина Cry IIIA-типа и способная поддерживаться в клетках различных грамотрицательных бактерий, имеет размер 17,8 т. п. н. и состоит из следующих элементов: полной последовательности (размер N 14 т. п. н. ) расщепленной по EcoRI-сайту плазмиды pNM 185 с широким кругом бактериальных хозяев; полных последовательностей двух EcoRI - ClaI-фрагментов плазмиды рpBТ022 (размеры фрагментов 0,2 и 0,3 т.п.н.); полных последовательностей двух Tag I-фрагментов плазмиды pC194 (размеры фрагментов 0,16 и 0,08 т.п.н.); полной последовательности Hind III фрагмента ДНК B.thuringiensis subsp. tenebrionis (размер 3 т.п.н.) и содержит интактный ген дельта-эндотоксина B.thuringiensis subsp. tenebriones; промотор гена Cry IA (b) B.thuringiensis subsp. berliner 1715; промотор Pm оперона мета-пути деградации ароматических углеводородов TOL плазмиды pWWO; ген xylS, участвующий в позитивной регуляции этого оперона; ген устойчивости к канамицину (Kmr); ген устойчивости к стрептомицину (Smr); гены, ответственные за мобилизацию плазмиды для конъюгации (OriT и mob); сайты расщепления эндонуклеазой PstI с координатами 0; 5,3; 5,7 и 7,1 т.п.н. сайты расщепления эндонуклеазой Hind III с координатами 2,4; 6,5 и 9,5 т.п.н. сайты расщепления эндонуклеазой Bam MI с координатами 3,2; 4,8 и 6,0 т.п.н. сайты расщепления эндонуклеазой Bgl 11 с координатами 3,6 и 9,4 т.п.н. сайты расщепления эндонуклеазой EcoR I с координатами 6,0; 8,1; 8,8 и 9,8 т.п.н. 2. Способ конструирования плазмиды pBTN11, заключающийся в том, что ДНК плазмиды pBТ022, несущей Cry IA (b) ген B.thuringiensis subsp. berliner 1715, расщепляют эндонуклеазой Cla I, полученные фрагменты соединяют с помощью ДНК-лигазы с фрагментами ДНК плазмиды pC194, подвергнутой частичному гидролизу Tag I, и смесью рекомбинантных молекул трансформируют клетки E.coli, трансформанты высевают на среду, содержащую ампициллин и хлорамфеникол, и из клеток клонов, устойчивых к данной комбинации антибиотиков, выделяют ДНК плазмиды pBТОЗ, в структуре которой меньше Cla I фрагмент плазмиды pBТ022 замещен на фрагмент pC194, состоящий из трех Tag I (A, D и E)B фрагментов, ДНК плазмиды pBТ03 и экспрессирующего вектора с широким кругом бактериальных хозяев плазмиды pNM185 гидролизуют EcoR I, продукты гидролиза соединяют с помощью ДНК-лигазы и после трансформации клеток E.coli клоны, содержащие гибридную плазмиду, отбирают по устойчивости к канамицину и хлорамфениколу, отобранные клоны проверяют на отсутствие индуцируемой 3-метилбензоатом устойчивости к стрептомицину и из полученных клонов выделяют ДНК плазмиды pBTN3, в структуре которой ориентации промоторов Pm и Cly IA (b)-гена совпадают, ДНК плазмиды pBТN3 подвергают частичному гидролизу эндонуклеазой Cla I и обрабатывают ДНК-лигазой, полученными препаратами трансформируют клетки E. coli и отбирают клоны, устойчивые к канамицину, но не способные расти на среде с хлорамфениколом, из этих клонов выделяют ДНК плазмиды pBТN4, затем смесь ДНК плазмиды pИС 19 и B.thuringiensis subsp. tenebrionis расщепляют эндонуклеазой Hind III, лигируют, трансформируют лигазной смесью клетки E.coli JМ103 и отбирают бесцветные колонии на среде, позволяющей дифференцировать Lac+ и Lac--колонии и содержащей ампициллин, отобранные клоны проверяют на наличие последовательностей ДНК, гомологичных соответствующим последовательностям Cly IIIA гена B.thuringiensis subsp. tenebrionis с помощью полимеразной цепной реакции, из клонов, содержащих эти последовательности, выделяют ДНК плазмиды pBТТ51, содержащей 3 т.п.н. - фрагмент ДНК B. thuringiensis subsp. tenebrionis с Cry IIIA-геном, смесью ДНК pBТN4 и pBТТ51, последовательно обработанной эндонуклеазой Hind III и ДНК-лигазой, трансформируют клетки E. coli, отбирают устойчивые к канамицину клоны, проверяют их на индуцируемую 3-метилбензоатом устойчивость к стрептомицину и из клеток, чувствительных к стрептомицину клонов, выделяют плазмиду pBТN11, содержащую Hind III фрагмент с Cry IIIA-геном в прямой ориентации к промотору Pm. 3. Штамм бактерий Pseudomonas putida IPM-36, содержащий рекомбинантную плазмиду ДНК pBТN11 продуцент кристаллического инсектицидного дельта-эндотоксина Cry IIIA-типа, активного против насекомых отряда Coleoptera.

Документы, цитированные в отчете о поиске Патент 1998 года RU2103363C1

EP, патент, 0498537, кл
Способ гальванического снятия позолоты с серебряных изделий без заметного изменения их формы 1923
  • Бердников М.И.
SU12A1
Огнетушитель 0
  • Александров И.Я.
SU91A1
Способ гальванического снятия позолоты с серебряных изделий без заметного изменения их формы 1923
  • Бердников М.И.
SU12A1

RU 2 103 363 C1

Авторы

Добрица А.П.

Корецкая Н.Г.

Кочетков В.В.

Светоч О.Е.

Лосева О.И.

Даты

1998-01-27Публикация

1995-11-23Подача