КОМПОЗИЦИИ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ И СПОСОБЫ С НИМИ Российский патент 2023 года по МПК C07C317/28 C07D295/88 C12N15/11 C12N15/113 C12Q1/68 

Перекрестная ссылка на родственные заявки

[0001] Настоящая заявка испрашивает приоритет на основании предварительных заявок на патент США №62/239839, поданной 9 октября 2015 года, №62/331961, поданной 4 мая 2016 года, и №62/331966, поданной 4 мая 2016 года, содержание каждой из которых включено в настоящую заявку во всей полноте посредством ссылки.

Уровень техники

[0002] Олигонуклеотиды подходят для применения в терапевтических, диагностических, исследовательских целях и в качестве наноматериалов. Использование природных нуклеиновых кислот (например, немодифицированных ДНК или РНК) в терапевтических целях может быть ограничено, например, из-за их неустойчивости к действию вне- и внутриклеточных нуклеаз и/или недостаточной способности проникать в клетки и распределяться в них. Существует потребность в новых и улучшенных олигонуклеотидах и композициях олигонуклеотидов, таких как, например, новые антисмысловые олигонуклеотиды и олигонуклеотиды миРНК и композиции олигонуклеотидов.

Краткое описание

[0003] Среди прочего, настоящее раскрытие охватывает признание того факта, что такие структурные элементы олигонуклеотидов, как последовательность оснований, химические модификации (например, модификации сахара, основания и/или межнуклеотидных связей и их профилей) и/или стереохимия (например, стереохимия хиральных центров остова (хиральные межнуклеотидные связи) и/или их профили) могут оказывать значительное влияние на свойства олигонуклеотидов, например, активность, токсичность, например, что может быть обусловлено характеристиками связывания белка, стабильностью, изменяющими сплайсинг способностями и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что композиции олигонуклеотидов, содержащие олигонуклеотиды с контролируемыми структурными элементами, например, контролируемыми химическими модификациями и/или контролируемыми стереохимическими профилями остова, обеспечивают неожиданные свойства, включающие, без ограничения, определенную активность, токсичность и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что олигонуклеотидные свойства, например, активность, токсичность и т.д., могут модулироваться химическими модификациями (например, модификациями сахаров, оснований, межнуклеотидных связей и т.д.), хиральными структурами (например, стереохимией хиральных межнуклеотидных связей и их профилей и т.д.) и/или их комбинациями.

[0004] В частности, согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции и способы изменения сплайсинга транскриптов. Сплайсинг транскрипта, такого как пре-мРНК, представляет собой важную стадию для того, чтобы транскрипт выполнял свои биологические функции у многих высших эукариот. Дефекты и/или недостаточность в процессе сплайсинга могут влиять на биологические функции и/или иметь патологические последствия. Например, многие генетические заболевания человека вызваны мутациями, которые вызывают дефекты сплайсинга, и многие заболевания связаны с дефектами сплайсинга, которые не связаны с явными мутациями. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие признает тот факт, что нацеливающий сплайсинг, особенно посредством композиций, содержащих олигонуклеотиды, имеющие химические модификации и/или стереохимические профили, описанные в настоящем описании, может эффективно корректировать связанный с заболеванием аберрантный сплайсинг и/или вводить и/или усиливать выгодный сплайсинг, который приводит к желаемым продуктам, например, мРНК, белкам и т.д., которые могут исправлять, восстанавливать или добавлять новые желаемые биологические функции. Например, согласно некоторым вариантам осуществления включение мутантного экзона 51 DMD может вызывать сдвиг рамки считывания, преждевременное срабатывание стоп-кодона и/или делецию одного или более последующих экзонов. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции и способы эффективного пропускания экзона 51 DMD для восстановления рамки считывания, так что может быть получен более короткий, но частично функциональный дистрофии. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции и способы эффективного пропускания мутантного экзона 51 DMD для восстановления рамки считывания, так что может быть получен более короткий, но частично функциональный дистрофии. Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренные композиции и способы могут изменять сплайсинг транскрипта для эффективного снижения уровней нежелательных продуктов сплайсинга. Например, согласно некоторым вариантам осуществления, путем пропускания одного или нескольких экзонов пре-мРНК с образованием мРНК со сдвигом рамки считывания и/или преждевременным срабатыванием терминального кодона, предусмотренные композиции и способы эффективно подвергают ген нокдауну; согласно некоторым вариантам осуществления такой ген представляет собой мутантный ген. Специалисту в настоящей области техники понятно, что предусмотренные технологии (олигонуклеотиды, композиции, способы и т.д.) можно также использовать для пропускания экзонов других экзонов DMD или одного или более экзонов других транскриптов, например, описанных в патенте США №7534879 и включенного в настоящий документ посредством ссылки в соответствии с настоящим раскрытием для лечения заболевания и/или состояния.

[0005] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие охватывает признание того факта, что химические модификации, стереохимия и их комбинации могут быть использованы для улучшения свойств композиций олигонуклеотидов, включая, без ограничения, их возможности модулировать сплайсинг транскриптов. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает химические модификации и их профили, используемые для улучшения сплайсинга транскриптов олигонуклеотидами.

[0006] Помимо всего прочего, настоящее раскрытие демонстрирует, что стереохимию можно использовать для модуляции сплайсинга транскриптов с помощью композиций олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает комбинации химических модификаций и стереохимии для улучшения свойств олигонуклеотидов, например, их способности изменять сплайсинг транскриптов. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, которые по сравнению с эталонным условием (например, отсутствием композиции, наличием эталонной композиции (например, стереослучайной композиции олигонуклеотидов, имеющих одну и ту же последовательность оснований, одни и те же химические модификации и т.д., композицией олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью другого стереоизомера и т.д.) и их комбинации) обеспечивают измененный сплайсинг, который может доставлять один или более желаемых биологических эффектов, например, увеличивать производство желаемых белков, нокдаун гена посредством производства мРНК с мутациями со сдвигом рамки считывания и/или преждевременным срабатыванием терминальных кодонов, нокдаун гена, экспрессирующего мРНК с мутацией со сдвигом рамки считывания и/или преждевременным срабатыванием терминального кодона и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления по сравнению с эталонным условием предложенные композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью являются неожиданно эффективными. Согласно некоторым вариантам осуществления желаемые биологические эффекты (например, измеренные посредством повышенного содержания желаемой мРНК, белков и т.д., уменьшенного содержания нежелательной мРНК, белков и т.д.) могут быть увеличены более чем в 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50 или 100 раз.

[0007] Настоящее раскрытие признает проблемы обеспечения композиций олигонуклеотидов с низкой токсичностью и способов их применения. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов и способы со сниженной токсичностью. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов и способы со сниженными иммунными ответами. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие признает тот факт, что различные токсичности, вызванные олигонуклеотидами, связаны с активацией комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов и способы со сниженной активацией комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов и способы со сниженной активацией комплемента через альтернативный путь. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов и способы со сниженной активацией комплемента через классический путь. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов и способы со сниженным индуцированным лекарственными средствами повреждением сосудов. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов и способы со сниженным воспалением места инъекции. Согласно некоторым вариантам осуществления сниженная токсичность может быть оценена с помощью одного или нескольких анализов, широко известных и практикуемых специалистом в настоящей области техники, например, оценки содержания полного активационного продукта, связывания белка и т.д., как описано в настоящем документе.

[0008] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотиды с усиленным антагонизмом активности hTLR9. Согласно некоторым вариантам осуществления некоторые заболевания, например, DMD, связаны с воспалением, например, в мышечных тканях. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные технологии (например, олигонуклеотиды, композиции, способы и т.д.) предусматривают как белки с повышенной активностью (например, посредством пропускания экзонов мутантного экзона 51 (или других экзонов в зависимости от генотипов) DMD), так и антагонистов активностей hTLR9, которые могут быть применимы для одного или более состояний и/или заболеваний, связанных с воспалением. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды и/или их композиции обеспечивают как способности пропускания экзонов, так и активность антагонистов hTLR9. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды, содержащие один или более липидных фрагментов (например, олигонуклеотидов, конъюгированных с липидами), обеспечивают неожиданно высокую эффективность пропускания экзонов и активности антагонистов hTLR9. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащая предопределенный уровень олигонуклеотида, содержащего один или более липидных фрагментов (например, олигонуклеотидов, конъюгированных с липидами), обеспечивает неожиданно высокую эффективность пропускания экзонов и активность антагонистов hTLR9.

[0009] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что свойства олигонуклеотидов, например, активность, токсичность и т.д., могут быть модулированы с помощью химических модификаций. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотидную композицию, содержащую первое множество олигонуклеотидов, которые имеют общую последовательность оснований и содержат один или более модифицированных фрагментов сахара, одну или более природных фосфатных связей или их комбинации. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, которые характеризуются общей последовательностью оснований, содержат одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и содержат один или более модифицированных фрагментов сахара, одну или более природных фосфатных связей или их комбинации. Например, согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, которые характеризуются общей последовательностью оснований и содержат один или более модифицированных фрагментов сахара; согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, которые характеризуются общей последовательностью оснований и содержат один или более модифицированных фрагментов сахара и одну или более природных фосфатных связей; согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, которые характеризуются общей последовательностью оснований и содержат один или более модифицированных фрагментов сахара и одну или более модифицированных межнуклеотидных связей; согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, которые характеризуются общей последовательностью оснований и содержат один или более модифицированных фрагментов сахара, одну или более природных фосфатных связей и одну или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов содержит первое множество олигонуклеотидов, которые характеризуются контролируемой хиральностью на этом уровне первого множества олигонуклеотидов, а олигонуклеотиды первого множества характеризуются общей стереохимической конфигурацией при одной или более хиральных межнуклеотидных связей. Например, согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества характеризуются общей стереохимической конфигурацией в 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 45, 50 или более хиральных межнуклеотидных связей, каждая из которых независимо представляет собой конфигурацию Rp или Sp; согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества характеризуются общей стереохимической конфигурацией при каждой хиральной межнуклеотидной связи. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная межнуклеотидная связь, где предопределенный уровень олигонуклеотидов композиции характеризуется общей стереохимической конфигурацией (независимо Rp или Sp), называется межнуклеотидной связью с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления предопределенный уровень олигонуклеотидов предложенной композиции, например, первого множества олигонуклеотидов некоторых иллюстративных композиций, содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 45, 50 или более межнуклеотидных связей с контролируемой хиральностью; согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 5 межнуклеотидных связей характеризуются контролируемой хиральностью; согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 10 межнуклеотидных связей характеризуются контролируемой хиральностью; согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 10 межнуклеотидных связей характеризуются контролируемой хиральностью; согласно некоторым вариантам осуществления каждая хиральная межнуклеотидная связь характеризуется контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества характеризуются структурой крыло-сердцевина-крыло. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит одну или более модифицированных фосфатных связей и не содержит природные фосфатные связи, а сердцевина содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит одну или более природных фосфатных связей и необязательно одну или более модифицированных межнуклеотидных связей, а сердцевина содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и необязательно одну или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит одну или более природных фосфатных связей и одну или более модифицированных межнуклеотидных связей, а сердцевина содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит одну или более природных фосфатных связей и одну или более модифицированных межнуклеотидных связей, а сердцевина содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и не содержит природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит модифицированные фрагменты сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой фосфоротиоат. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой замещенный фосфоротиоат. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I, описанную в настоящем раскрытии. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный фрагмент сахара является 2'-модифицированным. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-R¹. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-F. Как описано более подробно, предложенные олигонуклеотиды могут содержать более одного типа модификаций сахара; согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат как модификации 2'-F, так и 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат как модификации 2'-F, так и 2'-ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат как модификации 2'-F, так и 2'-ОМе, и как фосфоротиоатные, так и природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая хиральная межнуклеотидная связь, например фосфоротиоатная связь, характеризуется контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления такие предложенные композиции характеризуются более низкой токсичностью. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции характеризуются более низкой активацией комплемента.

[0010] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов с улучшенными профилями связывания белка, например, со сниженным связыванием с вредным белком и/или с улучшенным связыванием с полезным белком. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к способам улучшения доставки композиций олигонуклеотидов, предусматривающим предоставление композиций олигонуклеотидов с улучшенным профилем связывания белка. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что связывание белка композициями олигонуклеотидов может модулироваться посредством химических модификаций, стереохимии или их комбинаций. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка с помощью композиций олигонуклеотидов может модулироваться путем введения модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления увеличенный процент модифицированных межнуклеотидных связей обеспечивает усиленное связывание олигонуклеотидов с определенными белками. Согласно некоторым вариантам осуществления замена одной или более модифицированных межнуклеотидных связей природными фосфатными связями обеспечивает сниженное связывание с определенными белками. Согласно некоторым вариантам осуществления замена одной или более природных фосфатных связей модифицированными межнуклеотидными связями обеспечивает повышенное связывание с определенными белками. Согласно некоторым вариантам осуществления некоторые химические модификации обеспечивают повышенное связывание с определенными белками. Согласно некоторым вариантам осуществления некоторые химические модификации обеспечивают сниженное связывание с некоторыми белками. Согласно некоторым вариантам осуществления различные химические модификации того же типа обеспечивают различное связывание белка. Например, согласно некоторым вариантам осуществления 2'-МОЕ обеспечивает сниженное связывание белка по сравнению с 2'-ОМе (по меньшей мере в определенных контекстах - например, последовательности, стереохимии и т.д.).

[0011] Помимо всего прочего, настоящее раскрытие включает признание того факта, что стереослучайные олигонуклеотидные препараты содержат множество отдельных химических объектов, которые отличаются друг от друга, например, стерео химической структурой отдельных хиральных центров остова в олигонуклеотидной цепи. Без контроля стереохимии хиральных центров остова стереослучайные олигонуклеотидные препараты обеспечивают неконтролируемые композиции, содержащие неопределенные уровни олигонуклеотидных стереоизомеров. Несмотря на то, что эти стереоизомеры могут иметь одну и ту же последовательность оснований и/или химические модификации, они представляют собой различные химические объекты, по меньшей мере из-за их различной стереохимии остова, и они могут характеризоваться, как показано в настоящем документе, различными свойствами, например, активностями, токсичностями, распределением и т.д. Помимо всего прочего, настоящее раскрытие предусматривает композиции с контролируемой хиральностью, которые представляют собой или содержат конкретные стереоизомеры представляющих интерес олигонуклеотидов; в отличие от композиций с неконтролируемой хиральностью, композиции с контролируемой хиральностью содержат предопределенные уровни конкретных стереоизомеров олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления конкретный стереоизомер может быть определен, например, по его последовательности оснований, его длине, его профилю связей остова, а также по его профилю хиральных центров остова. Как понятно в данной области техники, согласно некоторым вариантам осуществления последовательность оснований может относиться к статусу идентичности и/или модификации нуклеозидных остатков (например, компонентов сахара и/или оснований по отношению к стандартным встречающимся в природе нуклеотидам, таким как аденин, цитозин, гуанозин, тимин и урацил) в олигонуклеотиде, и/или к характеру гибридизации (т.е. способности гибридизоваться с конкретными комплементарными остатками) таких остатков. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что улучшения свойств (например, улучшенная активность, более низкая токсичность и т.д.), достигаемые путем включения и/или размещения конкретных хиральных структур внутри олигонуклеотида, могут быть сопоставимы или быть даже лучше, чем те, которые достигаются посредством использования конкретных химических модификаций, например, связей остова, модификаций остатков и т.д. (например, путем использования определенных типов модифицированных фосфатов (например, фосфоротиоата, замещенного фосфоротиоата и т.д.), модификаций сахара (например, 2'-модификаций и т.д.) и/или модификаций оснований (например, метилирования и т.д.)). Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащие определенные химические модификации (например, 2'-F, 2'-OMe, фосфоротиоатные межнуклеотидные связи, конъюгацию липидов и т.д.) демонстрируют неожиданно высокую эффективность пропускания экзонов.

[0012] Помимо всего прочего, настоящее раскрытие демонстрирует, что стереохимию можно использовать для модуляции токсичности композиций олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие представляет собой композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, которые характеризуются более низкой токсичностью по сравнению с соответствующей стереослучайно и (или с неконтролируемой хиральностью) олигонуклеотидной композицией олигонуклеотидов, характеризующихся одинаковой последовательностью оснований и химическими модификациями. Согласно некоторым вариантам осуществления композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотидов, содержащих больше хиральных межнуклеотидных связей с конфигурацией Rp, характеризуются более низкой токсичностью. Согласно некоторым вариантам осуществления композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотидов, содержащих единственную хиральную межнуклеотидную связь с конфигурацией Rp, обладают повышенной токсичностью по сравнению с другими олигонуклеотидными композициями с контролируемой хиральностью и/или соответствующей стереослучайной олигонуклеотидной композицией олигонуклеотидов, характеризующихся одинаковой последовательностью оснований и химическими модификациями. Согласно некоторым вариантам осуществления единственная хиральная межнуклеотидная связь с конфигурацией Rp находится в середине последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотидов, которые содержат одну или более хиральных межнуклеотидных связей с конфигурацией Rp на 5'- и/или 3'-конце, обеспечивают меньшую токсичность. Согласно некоторым вариантам осуществления композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотидов, которые содержат одну или более природных фосфатных связей на 5'- и/или 3'-конце, обеспечивают меньшую токсичность. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная межнуклеотидная связь представляет собой фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная межнуклеотидная связь представляет собой замещенную фосфоротиоатную связь.

[0013] Помимо всего прочего, настоящее раскрытие предусматривает, что Согласно некоторым вариантам осуществления свойства (например, активность, токсичность, распределение, фармакокинетика и т.д.) олигонуклеотида могут корректироваться путем оптимизации его профиля хиральных центров остова, необязательно в сочетании с корректировкой/оптимизацией одной или более других характеристик (например, химических модификаций, профилей модификаций, таких как профиля связей, профиля модификаций нуклеозидов и т.д.) олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает, что согласно некоторым вариантам осуществления свойства (например, активность, токсичность и т.д.) олигонуклеотида могут корректироваться путем оптимизации его профиля хиральных центров остова, необязательно в сочетании с корректировкой/оптимизацией одной или более других характеристик (например, химических модификаций, профилей модификаций, таких как профиль связей, профиль модификаций нуклеозидов и т.д.) олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие признает и демонстрирует, что химические модификации, такие как модификации нуклеозидов и межнуклеотидных связей, могут обеспечить улучшенные свойства. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что комбинации химических модификаций и стереохимии могут обеспечить неожиданные, значительно улучшенные свойства (например, активности, токсичности, распределение, фармакокинетика и т.д.). Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что комбинации химических модификаций и стереохимии могут обеспечить неожиданные, значительно улучшенные свойства (например, активность, токсичность, распределение, фармакокинетика и т.д.). Согласно некоторым вариантам осуществления химические комбинации, такие как модификации сахаров, оснований и/или межнуклеотидных связей, объединяются со стереохимическими профилями, чтобы обеспечить олигонуклеотиды и их композиции с удивительно улучшенными свойствами, включающими в себя низкую токсичность, лучший профиль связывания белка и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов, содержащая первое множество олигонуклеотидов, характеризуется контролируемой хиральностью, а олигонуклеотиды первого множества содержат комбинацию 2'-модификации одного или более фрагментов сахара, одной или более природных фосфатных связей и одной или более хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов, содержащая первое множество олигонуклеотидов, характеризуется контролируемой хиральностью, а олигонуклеотиды первого множества содержат комбинацию 2'-модификации одного или более фрагментов сахара, одной или более природных фосфатных связей, одной или более хиральных межнуклеотидных связей, причем 5'- и/или 3'-концевые межнуклеотидные связи являются хиральными. Согласно некоторым вариантам осуществления как 5'-, так и 3'-концевые межнуклеотидные связи характеризуются хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления как 5'-, так и 3'-концевые межнуклеотидные связи характеризуются хиральностью и конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов, содержащая первое множество олигонуклеотидов, характеризуется контролируемой хиральностью, а олигонуклеотиды первого множества содержат комбинацию 2'-модификации одного или более фрагментов сахара, одной или более природных фосфатных связей, одной или более хиральных межнуклеотидных связей, и профилем стереохимии (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m или (Sp)t(Rp)n(Sp)m, где m>2. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная межнуклеотидная связь представляет собой фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная межнуклеотидная связь представляет собой замещенную фосфоротиоатную связь.

[0014] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат крыло и область сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды характеризуются структурой крыло-сердцевина-крыло, причем область сердцевины содержит один или более фрагментов сахара и/или межнуклеотидных связей не в областях крыльев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды характеризуются структурой крыло-сердцевина-крыло, причем область сердцевины содержит один или более фрагментов сахара и межнуклеотидных связей не в областях крыльев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды характеризуются структурой крыло-сердцевина-крыло, причем область сердцевины содержит один или более фрагментов сахара не в областях крыльев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды характеризуются структурой крыло-сердцевина-крыло, причем область сердцевины содержит одну или более межнуклеотидных связей не в областях крыльев. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит модифицированный фрагмент сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый фрагмент сахара в области сердцевины модифицируется. Иллюстративные модификации сахара широко известны в настоящей области техники, включая в себя, без ограничения, описанные в настоящем раскрытии. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь, которая характеризуется контролируемой хиральностью (например, фосфоротиоатом в конфигурации Sp или Rp), и по меньшей мере одну межнуклеотидную связь, которая не является хиральной (например, фосфодиэфир или фосфородитиоат). Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь, которая представляет собой фосфоротиоат с контролируемой хиральностью в конфигурации Sp и по меньшей мере одну межнуклеотидную связь, которая не является хиральной (например, фосфодиэфир или фосфоротиотиоат). Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла не содержит модифицированные фрагменты сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит одну или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь после нуклеозида сердцевины представляет собой природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь, которая характеризуется контролируемой хиральностью (например, фосфоротиоат в конфигурации Sp или Rp), и по меньшей мере одну межнуклеотидную связь, которая не является хиральной (например, фосфодиэфир или фосфоротиотиоат). Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь, которая представляет собой фосфоротиоат с контролируемой хиральностью в конфигурации Sp, и по меньшей мере одну межнуклеотидную связь, которая не является хиральной (например, фосфодиэфир или фосфородитиоат). Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь после нуклеозида сердцевины представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь. Например, смотрите WV-1111. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь, которая характеризуется контролируемой хиральностью (например, фосфоротиоат в конфигурации Sp или Rp), и по меньшей мере одну межнуклеотидную связь, которая не является хиральной в фосфоре связи (например, фосфодиэфир или фосфородитиоат). Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь, которая представляет собой фосфоротиоатом с контролируемой хиральностью в конфигурации Sp, и по меньшей мере одну межнуклеотидную связь, которая не является хиральной в фосфоре связи (например, фосфодиэфир или фосфородитиоат).

[0015] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой блокмеры. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой альтмеры. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой альтмеры, содержащие чередующиеся блоки. Согласно некоторым вариантам осуществления блокмер или альтмер могут быть определены химическими модификациями (включая в себя присутствие или отсутствие), например, модификациями оснований, модификациями сахара, модификациями межнуклеотидных связей, стереохимией и т.д.

[0016] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат блоки, содержащие различные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат блоки, содержащие модифицированные межнуклеотидные связи и природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат блоки, содержащие различные модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат чередующиеся блоки, содержащие различные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат чередующиеся блоки, содержащие модифицированные межнуклеотидные связи и природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат чередующиеся блоки, содержащие различные модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления блок, содержащий модифицированные межнуклеотидные связи, характеризуется профилем хиральных центров остова, как описано в настоящем документе. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый блок, содержащий модифицированные межнуклеотидные связи, характеризуется одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления блоки, содержащие модифицированные межнуклеотидные связи, характеризуются разными профилями хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления блоки, содержащие модифицированные межнуклеотидные связи, характеризуются разной длиной и/или модификациями. Согласно некоторым вариантам осуществления блоки, содержащие модифицированные межнуклеотидные связи, характеризуются одинаковой длиной и/или модификациями. Согласно некоторым вариантам осуществления блоки, содержащие модифицированные межнуклеотидные связи, характеризуются одинаковой длиной. Согласно некоторым вариантам осуществления блоки, содержащие модифицированные межнуклеотидные связи, характеризуются одинаковыми межнуклеотидными связями. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат первый блок на 5'-конце (5'-блок) и второй блок на 3'-конце (3'-блок), каждый из которых независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из 5'- и 3'-блоков независимо содержит 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-блок содержит 4 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-блок содержит 5 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-блок содержит 6 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-блок содержит 7 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-блок содержит 4 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-блок содержит 5 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-блок содержит 6 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-блок содержит 7 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из 5'- и 3'-блоков независимо содержит по меньшей мере 4 модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из 5'- и 3'-блоков независимо содержит по меньшей мере 5 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из 5'- и 3'-блоков независимо содержит по меньшей мере 6 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из 5'- и 3'-блоков независимо содержит по меньшей мере 7 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированные межнуклеотидные связи внутри блока являются последовательными. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая связь 5'-блока представляет собой независимо модифицированную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая связь 5'-блока представляет собой независимо фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая связь 5'-блока независимо характеризуется контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая связь 5'-блока характеризуется конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая связь 3'-блока представляет собой независимо модифицированную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая связь 3'-блока независимо представляет собой фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая связь 3'-блока независимо характеризуется контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая связь 3'-блока характеризуется конфигурацией Sp.

[0017] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат блоки, содержащие модификации сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат один или более блоков, содержащих одну или более модификаций 2'-F (блоки 2'-F). Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат блоки; содержащие последовательные модификации 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления блок содержит 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более последовательных модификаций 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления блок содержит 4 или более модификаций 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления блок содержит 5 или более модификаций 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления блок содержит 6 или более модификаций 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления блок содержит 7 или более модификаций 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат один или более блоков, содержащих одну или более модификаций 2'-OR¹ (блоки 2'-OR¹). Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат как блоки 2'-F, так и 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат чередующиеся блоки 2'-F и 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат первый блок 2'-F на 5'-конце и второй блок 2'-F на 3'-конце, каждый из которых независимо содержит 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более последовательных модификаций 2'-F; согласно некоторым вариантам осуществления каждый из которых независимо содержит 4 или более модификаций 2'-F; согласно некоторым вариантам осуществления каждый из которых независимо содержит 5 или более модификаций 2'-F; согласно некоторым вариантам осуществления каждый из которых независимо содержит 6 или более модификаций 2'-F; согласно некоторым вариантам осуществления каждый из которых независимо содержит 7 или более модификаций 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат 5'-блок, причем каждый фрагмент сахара 5'-блока содержит модификацию 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат 3'-блок, причем каждый фрагмент сахара 3'-блока содержит модификацию 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления такие предложенные олигонуклеотиды содержат один или более блоков 2'-OR¹ и необязательно один или более блоков 2'-F между 5'- и 3'-блоками 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления такие предложенные олигонуклеотиды содержат один или более блоков 2'-OR¹ и один или более блоков 2'-F между 5'- и 3'-блоками 2'-F (например, WV-3407, WV-3408, и т.д.).

[0018] Согласно некоторым вариантам осуществления блок представляет собой блок стереохимии. Согласно некоторым вариантам осуществления блок представляет собой блок Rp, в котором каждая межнуклеотидная связь блока характеризуется конфигурацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-блок представляет собой блок Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-блок представляет собой блок Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления блок представляет собой блок Sp, в котором каждая межнуклеотидная связь блока характеризуется конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-блок представляет собой блок Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-блок представляет собой блок Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат как Rp, так и Sp блоки. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат один или более блоков Rp, но не содержат блоки Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат один или более блоков Sp, но не содержат блоки Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат один или более блоков РО, в котором каждая межнуклеотидная связь представляет собой природную фосфатную связь.

[0019] Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-блок представляет собой блок Sp, в котором каждый фрагмент сахара содержит модификацию 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-блок представляет собой блок Sp, в котором каждая из межнуклеотидных связей представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь и каждый фрагмент сахара содержит модификацию 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-блок представляет собой блок Sp, в котором каждая из межнуклеотидных связей представляет собой фосфоротиоатную связь и каждый фрагмент сахара содержит модификацию 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-блок содержит 4 или более нуклеозидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-блок содержит 5 или более нуклеозидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-блок содержит 6 или более нуклеозидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-блок содержит 7 или более нуклеозидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-блок представляет собой блок Sp, в котором каждый фрагмент сахара содержит модификацию 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-блок представляет собой блок Sp, в котором каждая из межнуклеотидных связей представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь и каждый фрагмент сахара содержит модификацию 2'-F.

Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-блок представляет собой блок Sp, в котором каждая из межнуклеотидных связей представляет собой фосфоротиоатную связь и каждый фрагмент сахара содержит модификацию 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-блок содержит 4 или более нуклеозидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-блок содержит 5 или более нуклеозидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-блок содержит 6 или более нуклеозидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-блок содержит 7 или более нуклеозидных звеньев.

[0020] Согласно некоторым вариантам осуществления за типом нуклеозида в области или олигонуклеотиде следует специфический тип межнуклеотидной связи, например, природная фосфатная связь; модифицированная межнуклеотидная связь, хиральная межнуклеотидная связь конфигурации Rp, хиральная межнуклеотидная связь конфигурации Sp и др. Согласно некоторым вариантам осуществления за А следует Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления за А следует Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления за А следует природная фосфатная связь (РО). Согласно некоторым вариантам осуществления за U следует Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления за U следует Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления за U следует природная фосфатная связь (РО). Согласно некоторым вариантам осуществления за С следует Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления за С следует Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления за С следует природная фосфатная связь (РО). Согласно некоторым вариантам осуществления за G следует Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления за G следует Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления за G следует природная фосфатная связь (РО). Согласно некоторым вариантам осуществления за С и U следует Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления за С и U следует Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления за С и U следует природная фосфатная связь (РО). Согласно некоторым вариантам осуществления за А и G следует Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления за А и G следует Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления за А и G следует природная фосфатная связь (РО). Например, смотрите WV-1111, WV-1112, WV-XXX1 ит.д.

[0021] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат чередующиеся блоки, содержащие модифицированные фрагменты сахара и немодифицированные фрагменты сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированные фрагменты сахара содержат 2'-модификации. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат чередующиеся модифицированные 2'-ОМе фрагменты сахара и немодифицированные фрагменты сахара. Например, смотрите WV-1112, WV-1113 и т.д.

[0022] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат чередующиеся блоки, содержащие различные модифицированные фрагменты сахара и/или немодифицированные фрагменты сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат чередующиеся блоки, содержащие различные модифицированные фрагменты сахара и немодифицированные фрагменты сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат чередующиеся блоки, содержащие различные модифицированные фрагменты сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат чередующиеся блоки, содержащие различные модифицированные фрагменты сахара, причем модифицированные фрагменты сахара содержат разные 2'-модификации. Например, согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид содержит чередующиеся блоки, содержащие 2'-ОМе и 2'-F, соответственно. Например, смотрите WV-1712, WV1713, WV-1714 и т.д.

[0023] Согласно некоторым вариантам осуществления тип нуклеозида в области или олигонуклеотиде модифицируют, необязательно посредством другой модификации по отношению к другому типу нуклеозида. Согласно некоторым вариантам осуществления тип нуклеозида в области или олигонуклеотиде модифицируют посредством другой модификации по отношению к другому типу нуклеозида. Например, согласно некоторым вариантам осуществления пиримидиновый нуклеозид содержит модификацию 2'-F, а пуриновый нуклеозид содержит модификацию 2'-ОМе. Согласно некоторым другим вариантам осуществления пиримидиновый нуклеозид содержит модификацию 2'-ОМе, а пуриновый нуклеозид содержит модификацию 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления G и С характеризуются одним типом модификации сахара, а А и U характеризуются другим типом модификации сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления G и С содержат модификацию 2'-ОМе, а А и U содержат модификацию 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления G и С содержат модификацию 2'-F, а А и U содержат модификацию 2'-ОМе.

[0024] Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь после немодифицированного фрагмента сахара представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь после немодифицированного фрагмента сахара представляет собой фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь после немодифицированного фрагмента сахара представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь после немодифицированного фрагмента сахара представляет собой фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь после модифицированного фрагмента сахара представляет собой природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь после модифицированного фрагмента сахара представляет собой природную фосфатную связь. Например, смотрите WV-1111, WV1112 и т.д.

[0025] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат один или более модифицированных фрагментов сахара 2'-F, 3'-межнуклеотидные связи которых представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой фосфоротиоат. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь характеризуется контролируемой хиральностью и конфигурацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь характеризуется контролируемой хиральностью и конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат один или более 2'-OR¹ модифицированных фрагментов сахара, 3'-межнуклеотидные связи которых представляют собой природные фосфатные связи.

[0026] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль хиральных центров остова содержит повторение звеньев (Sp)m(Rp)n, (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m или (Sp)t(Rp)n(Sp)m. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющееся звено представляет собой (Sp)m(Rp)n. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющееся звено представляет собой SpRp. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющееся звено представляет собой SpSpRp. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющееся звено представляет собой SpRpRp. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющееся звено представляет собой RpRpSp. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющееся звено представляет собой (Rp)n(Sp)m. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющееся звено представляет собой (Np)t(Rp)n(Sp)m. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющееся звено представляет собой (Sp)t(Rp)n(Sp)m.

[0027] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль хиральных центров остова содержит (Rp/Sp)-(полностью Rp или полностью Sp)-(Rp/Sp). Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль хиральных центров остова содержит (Rp)-(полностью Sp)-(Rp). Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль хиральных центров остова содержит (Sp)-(полностью Sp)-(Sp). Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль хиральных центров остова содержит (Sp)-(полностью Rp)-(Sp). Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль хиральных центров остова содержит (Rp/Sp)-(повторяющиеся (Sp)m(Rp)n)-(Rp/Sp). Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль хиральных центров остова содержит (Rp/Sp)-(повторяющиеся SpSpRp)-(Rp/Sp).

[0028] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль хиральных центров остова представляет собой (Rp/Sp)-(полностью Rp или полностью Sp)-(Rp/Sp). Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль хиральных центров остова представляет собой (Sp)-(полностью Sp)-(Sp). Согласно некоторым вариантам осуществления каждая хиральная межнуклеотидная связь представляет собой Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль хиральных центров остова представляет собой (Rp)-(полностью Sp)-(Rp). Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль хиральных центров остова представляет собой (Sp)-(полностью Rp)-(Sp). Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль хиральных центров остова представляет собой (Rp/Sp)-(повторяющиеся (Sp)m(Rp)n)-(Rp/Sp). Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль хиральных центров остова представляет собой (Rp/Sp)-(повторяющиеся SpSpRp)-(Rp/Sp).

[0029] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов, характеризующиеся низкой токсичностью. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов, характеризующиеся улучшенным профилем связывания с белком. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов, характеризующиеся улучшенным связыванием с альбумином. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции обладают низкой токсичностью и улучшенным связыванием с некоторыми желаемыми белками. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции обладают низкой токсичностью и улучшенным связыванием с некоторыми желаемыми белками. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции олигонуклеотидов в то же время обеспечивают такой же уровень, или значительно улучшенный, стабильности и/или активности, например, лучший профиль целевого расщепления, лучшую эффективность целевого расщепления, лучшую целевую специфичность и т.д.

[0030] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, которые:

1) характеризуются одинаковой последовательностью оснований, комплементарной целевой последовательности в транскрипте; а также

2) содержат один или более модифицированных фрагментов сахара и модифицированных межнуклеотидных связей.

[0031] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов характеризуется тем, что когда она контактирует с транскриптом в системе сплайсинга транскриптов, сплайсинг транскрипта изменяется относительно наблюдаемого в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинаций.

[0032] Согласно некоторым вариантам осуществления эталонное условие представляет собой отсутствие композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонное условие представляет собой наличие эталонной композиции. Иллюстративные эталонные композиции, содержащие эталонное множество олигонуклеотидов, подробно описаны в настоящем раскрытии. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонного множества содержат различные структурные элементы (химические модификации, стереохимию и т.д.) по сравнению с олигонуклеотидами первого множества в предложенной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой стереослучайный препарат олигонуклеотидов, характеризующихся одинаковыми химическими модификациями. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой смесь стереоизомеров, в то время как предложенная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью одного стереоизомера. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонного множества содержат такую же последовательность оснований, что и олигонуклеотид первого множества в предложенной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонного множества содержат те же самые химические модификации, что и олигонуклеотид первого множества в предложенной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонного множества характеризуются одинаковыми модификациями сахара, что и олигонуклеотид первого множества в предложенной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонного множества характеризуются теми же основными модификациями, что и олигонуклеотид первого множества в предложенной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонного множества характеризуются одинаковой модификацией межнуклеотидных связей, что и олигонуклеотид первого множества в предложенной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонного множества характеризуются одинаковой стереохимией, что и олигонуклеотид первого множества в предложенной композиции, но различными химическими модификациями, например, модификацией оснований, модификацией сахара, модификациями межнуклеотидных связей и т.д.

[0033] Примеры систем сплайсинга широко известны в настоящей области техники. Согласно некоторым вариантам осуществления система сплайсинга представляет собой систему in vivo или in vitro, включающую в себя компоненты, достаточные для обеспечения сплайсинга соответствующего целевого транскрипта. Согласно некоторым вариантам осуществления система сплайсинга представляет собой или содержит сплайсосому (например, белок и/или РНК-компоненты). Согласно некоторым вариантам осуществления система сплайсинга представляет собой или содержит мембрану органелл (например, ядерную мембрану) и/или органеллу (например, ядро). Согласно некоторым вариантам осуществления система сплайсинга представляет собой или содержит клетку или ее популяцию. Согласно некоторым вариантам осуществления система сплайсинга представляет собой или содержит ткань. Согласно некоторым вариантам осуществления система сплайсинга представляет собой или содержит организм, например, животное, например, млекопитающее, такое как мышь, крыса, обезьяна, человек и т.д.

[0034] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, которые:

1) характеризуются одинаковой последовательностью оснований, комплементарной целевой последовательности в транскрипте; а также

2) содержат один или более модифицированных фрагментов сахара и модифицированных межнуклеотидных связей,

причем композиция олигонуклеотидов характеризуется тем, что, когда она контактирует с транскриптом в системе сплайсинга транскриптов, сплайсинг транскрипта изменяется относительно наблюдаемого в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинации.

[0035] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов определенного типа олигонуклеотидов, определяемого:

1) последовательностью оснований;

2) профилем связей остова;

3) профилем хиральных центров остова; а также

4) профилем модификаций фосфора остова.

[0036] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов определенного типа олигонуклеотидов, определяемого:

1) последовательностью оснований;

2) профилем связей остова;

3) профилем хиральных центров остова; а также

4) профилем модификаций фосфора остова,

причем композиция характеризуется контролируемой хиральностью в том отношении; что она обогащена относительно по существу рацемического препарата олигонуклеотидов, характеризующихся одной и той же последовательностью оснований, олигонуклеотидами конкретного типа олигонуклеотида;

причем композиция олигонуклеотидов характеризуется тем, что, когда она контактирует с транскриптом в системе сплайсинга транскриптов, сплайсинг транскрипта изменяется относительно наблюдаемого в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинации.

[0037] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих одну или более областей крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества характеризуются одинаковой последовательностью оснований; а также

каждая область крыла независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и, необязательно, одну или более природных фосфатных связей, и область сердцевины независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей; или

каждая область крыла независимо содержит один или более модифицированных фрагментов сахара, а область сердцевины содержит один или более не модифицированных фрагментов сахара.

[0038] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих одну или более областей крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества характеризуются одинаковой последовательностью оснований;

каждая область крыла независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и, необязательно, одну или более природных фосфатных связей; а также

область сердцевины независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[0039] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих одну или более областей крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества характеризуются одинаковой последовательностью оснований;

каждая область крыла независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей; а также

область сердцевины независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[0040] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих две области крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества характеризуются одинаковой последовательностью оснований;

каждая область крыла независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей; а также

область сердцевины независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[0041] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих две области крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества характеризуются одинаковой последовательностью оснований;

каждая область крыла независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей;

область крыла к 5'-концу области сердцевины содержит по меньшей мере одну модифицированную межнуклеотидную связь, за которой следует природная фосфатная связь в крыле; а также

область крыла к 3'-концу области сердцевины содержит по меньшей мере одну модифицированную межнуклеотидную связь, которая следует за природной фосфатной связью в крыле;

область сердцевины независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[0042] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих область крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества характеризуются одинаковой последовательностью оснований;

область крыла составляет в длину два или более оснований и содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей;

область крыла относится к 5'-концу области сердцевины и содержит природную фосфатную связь между двумя нуклеозидами на своем 3'-конце или область крыла к 3'-концу области сердцевины и содержит природную фосфатную связь между двумя нуклеозидами на своем 5'-конце; а также

область сердцевины независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[0043] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих две области крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества характеризуются одинаковой последовательностью оснований;

каждая область крыла независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей;

область крыла к 5'-концу области сердцевины содержит природную фосфатную связь между двумя нуклеозидами на своем 3'-конце;

область крыла к 3'-концу области сердцевины содержит природную фосфатную связь между двумя нуклеозидами на своем 5'-конце; а также

область сердцевины независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[0044] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих одну или более областей крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества характеризуются одинаковой последовательностью оснований; а также

каждая область крыла независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и, необязательно, одну или более природных фосфатных связей, и область сердцевины независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей; а также

каждая область крыла независимо содержит один или более модифицированных фрагментов сахара, а область сердцевины содержит один или более немодифицированных фрагментов сахара.

[0045] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих одну или более областей крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества характеризуются одинаковой последовательностью оснований; а также

каждая область крыла независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей, а область сердцевины независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей; а также

каждая область крыла независимо содержит один или более модифицированных фрагментов сахара, а область сердцевины содержит один или более немодифицированных фрагментов сахара.

[0046] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, которые:

1) характеризуются одинаковой последовательностью оснований; а также

2) содержат одну или более областей крыла и область сердцевины;

причем:

каждая область крыла содержит по меньшей мере один модифицированный фрагмент сахара; а также

каждая область сердцевины содержит по меньшей мере один немодифицированный фрагмент сахара.

[0047] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащая олигонуклеотиды, определяемые наличием:

1) одинаковой последовательности оснований и длины;

2) одинакового профиля связей остова, а также

3) одинакового профиля хиральных центров остова, причем композиция представляет собой по существу чистый препарат единственного олигонуклеотида в том отношении, что предопределенный уровень олигонуклеотидов в композиции характеризуется одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова.

[0048] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащая олигонуклеотиды определенного типа олигонуклеотида, характеризующегося:

1) одинаковой последовательностью оснований и длиной;

2) одинаковым профилем связей остова, а также

3) одинаковым профилем хиральных центров остова,

причем композиция характеризуется контролируемой хиральностью в том отношении, что она обогащена относительно по существу рацемического препарата олигонуклеотидов, характеризующихся одной и той же последовательность оснований и длиной, олигонуклеотидами определенного типа олигонуклеотида.

[0049] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащая олигонуклеотиды определенного типа олигонуклеотида, характеризующегося:

1) одинаковой последовательностью оснований и длиной;

2) одинаковым профилем связей остова, а также

3) одинаковым профилем хиральных центров остова, причем композиция представляет собой по существу чистый препарат одного олигонуклеотида, в котором по меньшей мере примерно 10% олигонуклеотидов в композиции характеризуется одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова.

[0050] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащая предопределенный уровень олигонуклеотидов, которые содержат одну или более областей крыла и общую область сердцевины, причем:

каждая область крыла независимо составляет в длину два или более оснований и независимо и необязательно содержит одну или более хиральных межнуклеотидных связей;

область сердцевины независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более хиральных межнуклеотидных связей, а общая область сердцевины характеризуется:

1) одинаковой последовательностью оснований и длиной;

2) одинаковым профилем связей остова, а также

3) одинаковым профилем хиральных центров остова.

[0051] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих две области крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества характеризуются одинаковой последовательностью оснований;

каждая область крыла независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более модифицированных остатков сахара;

область сердцевины независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более природных фосфатных связей.

[0052] Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла предложенных олигонуклеотидов независимо содержит 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 3 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 4 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 5 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 6 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 7 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый фрагмент сахара в крыле модифицируется. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация представляет собой 2'-модификацию. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация представляет собой 2'-модификацию. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация представляет собой 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация представляет собой 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация представляет собой 2'-ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация представляет собой 2'-ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация представляет собой 2'-МОЕ. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация представляет собой 2'-МОЕ. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация представляет собой модификацию сахара LNA. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация представляет собой модификацию сахара LNA. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь в крыле представляет собой хиральную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь в крыле представляет собой хиральную межнуклеотидную связь в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная межнуклеотидная связь представляет собой фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит одну или более природных фосфатных связей и одну или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит одну или более природных фосфатных связей и одну или более хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит одну или более природных фосфатных связей и одну или более хиральных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит одну или более природных фосфатных связей и одну или более фосфоротиоатных связей в конфигурации Sp.

[0053] Согласно некоторым вариантам осуществления уровень олигонуклеотидов, такой как уровень множества олигонуклеотидов (например, первого множества олигонуклеотидов, эталонного множества олигонуклеотидов и т.д.), в предложенных композициях предопределен. Например, как понятно специалисту в настоящей области техники, предложенные композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью из множества олигонуклеотидов, например, первого множества олигонуклеотидов, содержат предопределенный уровень такого множества олигонуклеотидов.

[0054] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды характеризуются последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды характеризуются последовательностью оснований, содержащей UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, и длиной до 30 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды характеризуются последовательностью оснований, содержащей UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, и длиной до 40 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды характеризуются последовательностью оснований, содержащей UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, и длиной до 50 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды характеризуются последовательностью оснований, содержащей по меньшей мере 15 смежных оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, и длиной до 30 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды характеризуются последовательностью оснований, содержащей по меньшей мере 15 смежных оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, и длиной до 40 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды характеризуются последовательностью оснований, содержащей по меньшей мере 15 смежных оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, и длиной до 50 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды характеризуются последовательностью оснований, содержащей последовательность, имеющую не более 5 несоответствий с последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, и длиной до 30 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды характеризуются последовательностью оснований, содержащей последовательность, имеющую не более 5 несоответствий с последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, и длиной до 40 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды характеризуются последовательностью оснований, содержащей последовательность, имеющую не более 5 несоответствий с последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, и длиной до 50 оснований.

[0055] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований множества олигонуклеотидов представляет собой UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, a олигонуклеотиды составляют в длину до 30 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, а олигонуклеотиды составляют в длину до 40 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, a олигонуклеотиды составляют в длину до 50 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит по меньшей мере 15 смежных оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, а олигонуклеотиды составляют в длину до 30 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит по меньшей мере 15 смежных оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, а олигонуклеотиды составляют в длину до 40 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит по меньшей мере 15 смежных оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, а олигонуклеотиды составляют в длину до 50 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, имеющую не более 5 несоответствий с последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, a олигонуклеотиды составляют в длину до 30 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, имеющую не более 5 несоответствий с последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, а олигонуклеотиды составляют в длину до 40 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, имеющую не более 5 несоответствий с последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, a олигонуклеотиды составляют в длину до 50 оснований.

[0056] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований множества олигонуклеотидов представляет собой UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 30 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, а олигонуклеотиды составляют в длину до 40 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 50 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит по меньшей мере 15 смежных оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 30 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит по меньшей мере 15 смежных оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 40 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит по меньшей мере 15 смежных оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 50 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, имеющую не более 5 несоответствий с последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 30 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, имеющую не более 5 несоответствий с последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 40 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, имеющую не более 5 несоответствий с последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 50 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью.

[0057] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью, который представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp.Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 30 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью, который представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 40 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью, который представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 50 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью, который представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит по меньшей мере 15 смежных оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 30 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью, который представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит по меньшей мере 15 смежных оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 40 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью, который представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит по меньшей мере 15 смежных оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 50 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью, который представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, имеющую не более 5 несоответствий с последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 30 оснований; а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью, который представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, имеющую не более 5 несоответствий с последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 40 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью, который представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, имеющую не более 5 несоответствий с последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 50 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере один центр с контролируемой хиральностью, который представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp.

[0058] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, a одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере три центра с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 30 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере три центра с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 40 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере три центра с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 50 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере три центра с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит по меньшей мере 15 смежных оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 30 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере три центра с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит по меньшей мере 15 смежных оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 40 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере три центра с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит по меньшей мере 15 смежных оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 50 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере три центра с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, имеющую не более 5 несовпадений с последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 30 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере три центра с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, имеющую не более 5 несоответствий с последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 40 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере три центра с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, имеющую не более 5 несоответствий с последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 50 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере три центра с контролируемой хиральностью.

[0059] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, a одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере пять центров с контролируемой хиральностью, каждый из которых представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 30 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере пять центров с контролируемой хиральностью, каждый из которых представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 40 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере пять центров с контролируемой хиральностью, каждый из которых представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 50 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере пять центров с контролируемой хиральностью, каждый из которых представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит по меньшей мере 15 смежных оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 30 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере пять центров с контролируемой хиральностью, каждый из которых представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит по меньшей мере 15 смежных оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 40 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере пять центров с контролируемой хиральностью, каждый из которых представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит по меньшей мере 15 смежных оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 50 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере пять центров с контролируемой хиральностью, каждый из которых представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, имеющую не более 5 несоответствий с последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 30 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере пять центров с контролируемой хиральностью, каждый из которых представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, имеющую не более 5 несоответствий с последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 40 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере пять центров с контролируемой хиральностью, каждый из которых представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, имеющую не более 5 несоответствий с последовательностью оснований UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, олигонуклеотиды составляют в длину до 50 оснований, а одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере пять центров с контролируемой хиральностью, каждый из которых представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления несоответствие представляет собой разницу между последовательностью оснований или длиной, когда две последовательности максимально выровнены и сравниваются. В качестве неограничивающего примера несоответствие подсчитывается, если существует разница между основанием в определенном положении в одной последовательности и основанием в соответствующем положении в другой последовательности. Таким образом, несоответствие подсчитывается, например, если положение в одной последовательности содержит конкретное основание (например, А), а соответствующее положение в другой последовательности содержит другое основание (например, G, С или U). Несоответствие также подсчитывается, например, если положение в одной последовательности содержит основание (например. А), а соответствующее положение в другой последовательности не содержит основания (например, это положение представляет собой нуклеотид с удаленным азотистым основанием, который содержит фосфат-сахарный остов без основания) или это положение пропущено. Разрыв в одной цепи в любой последовательности (или в смысловой или в антисмысловой цепи) не может считаться несоответствием, например, никакое несоответствие не считается, если одна последовательность содержит последовательность 5'-AG-3', а другая последовательность содержит последовательность 5'-AG-3' с разрывом в одной цепи между А и G. Модификация оснований, как правило, не считается несоответствием, например, если одна последовательность содержит С, а другая последовательность содержит модифицированный С (например, с 2'-модификацией) в одном и том же положении, несоответствие не может быть подсчитано.

[0060] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит SSS, SSSS, SSSSS, SSSSSS, SSSSSSS, SOS, SSOSS, SSSOSSS, SSSSOSSSS, SSSSSOSSSSS, SSSSSSOSSSSSS, SSSSSSSOSSSSSSS, SSSSSSSSOSSSSSSSS, SSSSSSSSSOSSSSSSSSS, SOSOSOSOS, SSOSOSOSOSS, SSSOSOSOSOSSS, SSSSOSOSOSOSSSS, SSSSSOSOSOSOSSSSS, SSSSSSOSOSOSOSSSSSS, SOSOSSOOS, SSOSOSSOOSS, SSSOSOSSOOSSS, SSSSOSOSSOOSSSS, SSSSSOSOSSOOSSSSS, SSSSSSOSOSSOOSSSSSS, SOSOOSOOS, SSOSOOSOOSS, SSSOSOOSOOSSS, SSSSOSOOSOOSSSS, SSSSSOSOOSOOSSSSS, SSSSSSOSOOSOOSSSSSS, SOSOSSOOS, SSOSOSSOOSO, SSSOSOSSOOSOS, SSSSOSOSSOOSOSS, SSSSSOSOSSOOSOSSS, SSSSSSOSOSSOOSOSSSS, sosoosooso, ssosoosoosos, sssosoosoosos, ssssosoosoososs, sssssosoosoososss, ssssssosoosoosossss, ssosossoo, sssosossoos, ssssosossoos, sssssosossooss, ssssssosossoosss, ossssssosossoosss, oossssssosossoos, oossssssosossooss, oossssssosossoosss, oossssssosossoossss, oossssssosossoosssss или OOSSSSSSOSOSSOOSSSSSS, где О представляет собой нехиральный центр, a S представляет собой хиральный центр в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова выбирается из: SSS, SSSS, SSSSS, SSSSSS, SSSSSSS, SOS, SSOSS, SSSOSSS, SSSSOSSSS, SSSSSOSSSSS, SSSSSSOSSSSSS, SSSSSSSOSSSSSSS, SSSSSSSSOSSSSSSSS, SSSSSSSSSOSSSSSSSSS, SOSOSOSOS, SSOSOSOSOSS, SSSOSOSOSOSSS, SSSSOSOSOSOSSSS, SSSSSOSOSOSOSSSSS, SSSSSSOSOSOSOSSSSSS, SOSOSSOOS, SSOSOSSOOSS, SSSOSOSSOOSSS, SSSSOSOSSOOSSSS, SSSSSOSOSSOOSSSSS, SSSSSSOSOSSOOSSSSSS, SOSOOSOOS, SSOSOOSOOSS, SSSOSOOSOOSSS, SSSSOSOOSOOSSSS, SSSSSOSOOSOOSSSSS, SSSSSSOSOOSOOSSSSSS, SOSOSSOOS, SSOSOSSOOSO, SSSOSOSSOOSOS, SSSSOSOSSOOSOSS, SSSSSOSOSSOOSOSSS, SSSSSSOSOSSOOSOSSSS, SOSOOSOOSO, SSOSOOSOOSOS, SSSOSOOSOOSOS, SSSSOSOOSOOSOSS, SSSSSOSOOSOOSOSSS, SSSSSSOSOOSOOSOSSSS, SSOSOSSOO, SSSOSOSSOOS, SSSSOSOSSOOS, SSSSSOSOSSOOSS, SSSSSSOSOSSOOSSS, OSSSSSSOSOSSOOSSS, OOSSSSSSOSOSSOOS, OOSSSSSSOSOSSOOSS, oossssssosossoosss, oossssssosossoossss, oossssssosossoosssss и OOSSSSSSOSOSSOOSSSSSS, где О представляет собой нехиральный центр, а S представляет собой хиральный центр в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления нехиральный центр представляет собой фосфодиэфир (природная фосфатная связь). Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный центр в конфигурации Sp представляет собой фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp.

[0061] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 10 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 11 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 12 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 13 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 14 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 15 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 16 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 17 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 18 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 19 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит не более чем 19 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит не более чем 18 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит не более чем 17 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит не более чем 16 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит не более чем 15 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит не более чем 14 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит от 14 до 18 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит от 13 до 19 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит от 12 до 20 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит от 11 до 21 модифицированной межнуклеотидной связи. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит 0 фосфодиэфиров. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит 1 фосфодиэфир. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит 2 фосфодиэфира. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит 3 фосфодиэфира. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит 4 фосфодиэфира. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит 5 фосфодиэфиров. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит 6 фосфодиэфиров. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит 7 фосфодиэфиров. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит от 0 до 7 фосфодиэфиров. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит от 1 до 6 фосфодиэфиров. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит от 2 до 5 фосфодиэфиров. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит от 3 до 4 фосфодиэфиров. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит от 1 до 6 фосфодиэфиров и от 13 до 19 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления фосфодиэфиры являются необязательно смежными или несмежными. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированные межнуклеотидные связи необязательно являются необязательно смежными или несмежными.

[0062] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 10 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 11 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 12 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 13 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 14 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 15 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 16 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 17 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 18 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит по меньшей мере 19 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит не более чем 19 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит не более чем 18 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит не более чем 17 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит не более чем 16 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит не более чем 15 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит не более чем 14 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит от 14 до 18 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит от 13 до 19 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит от 12 до 20 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит от 11 до 21 фосфоротиоатной связи. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит 0 фосфодиэфиров. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит 1 фосфодиэфир. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит 2 фосфодиэфира. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит 3 фосфодиэфира. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит 4 фосфодиэфира. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит 5 фосфодиэфиров. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит 6 фосфодиэфиров. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит 7 фосфодиэфиров. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит от 0 до 7 фосфодиэфиров. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит от 1 до 6 фосфодиэфиров. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит от 2 до 5 фосфодиэфиров. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит от 3 до 4 фосфодиэфиров. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль связей остова содержит от 1 до 6 фосфодиэфиров и от 13 до 19 фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления фосфодиэфиры являются необязательно смежными или несмежными. Согласно некоторым вариантам осуществления фосфоротиоатные связи являются необязательно смежными или несмежными.

[0063] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 5 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 6 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 7 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 8 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 9 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 10 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 11 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 12 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 13 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 14 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 15 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 16 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 17 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 18 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 19 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит не более чем 8 межнуклеотидных связей в конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит не более чем 7 межнуклеотидных связей в конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит не более чем 6 межнуклеотидных связей в конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит не более чем 5 межнуклеотидных связей в конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит не более чем 4 межнуклеотидные связи в конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит не более чем 3 межнуклеотидные связи в конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит не более чем 2 межнуклеотидные связи в конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит не более чем 1 межнуклеотидную связь в конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит не более чем 8 межнуклеотидных связей, которые не являются хиральными (в качестве неограничивающего примера, фосфодиэфир). Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит не более чем 7 межнуклеотидных связей, которые не являются хиральными. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит не более чем 6 межнуклеотидных связей, которые не являются хиральными. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит не более чем 5 межнуклеотидных связей, которые не являются хиральными. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит не более чем 4 межнуклеотидные связи, которые не являются хиральными. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит не более чем 3 межнуклеотидные связи, которые не являются хиральными. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит не более чем 2 межнуклеотидные связи, которые не являются хиральными. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит не более чем 1 межнуклеотидную связь, которая не является хиральной. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 10 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp и не более чем 8 межнуклеотидных связей, которые не являются хиральными. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 11 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp и не более чем 7 межнуклеотидных связей, которые не являются хиральными. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 12 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp и не более чем 6 межнуклеотидных связей, которые не являются хиральными. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 13 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp и не более чем 6 межнуклеотидных связей, которые не являются хиральными. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 14 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp и не более чем 5 межнуклеотидных связей, которые не являются хиральными. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит по меньшей мере 15 межнуклеотидных связей в конфигурации Sp и не более чем 4 межнуклеотидные связи, которые не являются хиральными. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидные связи в конфигурации Sp являются необязательно смежными или несмежными. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидные связи в конфигурации Rp являются необязательно смежными или несмежными. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидные связи, которые не являются хиральными, являются необязательно смежными или несмежными.

[0064] Крыло и сердцевина могут быть определены любыми структурными элементами. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло и сердцевина определяются модификациями нуклеозидов, причем крыло содержит нуклеозидную модификацию, которая не содержит области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды в предложенных композициях характеризуются структурой крыло-сердцевина с нуклеозидной модификацией. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды в предложенных композициях характеризуются структурой сердцевина-крыло с нуклеозидной модификацией. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды в предложенных композициях характеризуются структурой крыло-сердцевина-крыло с нуклеозидной модификацией. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло и сердцевина определяются модификациями фрагментов сахаров. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло и сердцевина определяются модификациями фрагментов оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый фрагмент сахара в области крыла характеризуется такой же 2'-модификацией, которая не находится в области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый фрагмент сахара в области крыла характеризуется такой же 2'-модификацией, которая отличается от любых модификаций сахара в области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый фрагмент сахара в области крыла содержит одинаковую 2'-модификацию, а область сердцевины не содержит 2'-модификаций. Согласно некоторым вариантам осуществления, когда присутствуют два или более крыла, каждый фрагмент сахара в области крыла содержит одинаковую 2'-модификацию, но общая 2'-модификация в области первого крыла может быть либо такой же, как общая 2'-модификация во второй области крыла, либо отличной от нее. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло и сердцевина определяются по профилю межнуклеотидных связей остова. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит тип межнуклеотидной связи и/или профиль межнуклеотидных связей, которые не встречаются в сердцевине. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит как модифицированную межнуклеотидную связь, так и природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь на 5'-конце крыла к 5'-концу области сердцевины представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь на 3'-конце крыла к 3'-концу области сердцевины представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой хиральную межнуклеотидную связь.

[0065] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит по меньшей мере 3 модификации 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит по меньшей мере 4 модификации 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит по меньшей мере 5 модификаций 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит по меньшей мере 6 модификаций 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит по меньшей мере 3 последовательных модификации 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит по меньшей мере 4 последовательных модификации 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит по меньшей мере 5 последовательных модификаций 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит по меньшей мере 6 последовательных модификаций 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь каждого нуклеотидного звена, содержащего одну из последовательных модификаций 2'-F, представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь каждого нуклеотидного звена, содержащего одну из последовательных модификаций 2'-F, независимо представляет собой хиральную межнуклеотидную связь в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь каждого нуклеотидного звена, содержащего одну из последовательных модификаций 2'-F, представляет собой фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит две или более из следующего: модификация 2'-F, модификация 2'-OR¹ или 2'-ОН. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит две или более из следующего: модификация 2'-F, модификация 2'-ОМе или 2'-ОН. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 1 модификацию 2'-ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 2 модификации 2'-ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 3 модификации 2'-ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 2 модификации 2'-ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 4 модификации 2'-ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 1 модификацию 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 2 модификации 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 3 модификации 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 2 модификации 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 4 модификации 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 1 модификацию 2'-F и по меньшей мере 1 модификацию 2'-ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 1 модификацию 2'-F и по меньшей мере 2 модификации 2'-ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 2 модификации 2'-F и по меньшей мере 1 модификацию 2'-ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 2 модификации 2'-F и по меньшей мере 2 модификации 2'-ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления модификации 2'-F в сердцевине и/или крыле являются смежными или несмежными. Согласно некоторым вариантам осуществления модификации 2'-ОМе в сердцевине и/или крыле являются смежными или несмежными. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-ОН в сердцевине и/или крыле являются смежными или несмежными. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит одну или более природных фосфатных связей.

[0066] Согласно некоторым вариантам осуществления каждое крыло содержит по меньшей мере одну хиральную межнуклеотидную связь и по меньшей мере одну природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждое крыло содержит по меньшей мере один модифицированный фрагмент сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления фрагмент сахара каждого крыла модифицирован. Согласно некоторым вариантам осуществления фрагмент сахара крыла модифицируется посредством модификации, отсутствующей в области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления только область крыла содержит модифицированные межнуклеотидные связи на одном или обоих своих концах. Согласно некоторым вариантам осуществления только область крыла содержит модифицированную межнуклеотидную связь на своем 5'-конце. Согласно некоторым вариантам осуществления только область крыла содержит модифицированную межнуклеотидную связь на своем 3'-конце. Согласно некоторым вариантам осуществления только область крыла содержит модифицированные межнуклеотидные связи на своих 5'- и 3'-концах. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло находится на 5'-конце сердцевины, и крыло содержит только модифицированную межнуклеотидную связь на своем 5'-конце. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло находится на 5'-конце сердцевины, и крыло содержит только модифицированную межнуклеотидную связь на своем 3'-конце. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло находится на 5'-конце сердцевины, и крыло содержит только модифицированные межнуклеотидные связи как на своем 5'-, так и на 3'-конце. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло находится на 3'-конце сердцевины, и крыло содержит только модифицированную межнуклеотидную связь на своем 5'-конце. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло находится на 3'-конце сердцевины, и только крыло содержит модифицированную межнуклеотидную связь на своем 3'-конце. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло находится на 3'-конце сердцевины, и содержит только модифицированные межнуклеотидные связи как на своем 5'-, так и на 3'-конце.

[0067] Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь в области сердцевины модифицируется. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь в области сердцевины является хиральной. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит профиль хиральных центров остова (Sp)m(Rp)n, (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m или (Sp)t(Rp)n(Sp)m. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова области сердцевины представляет собой (Sp)m(Rp)n, (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m или (Sp)t(Rp)n(Sp)m. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит профиль хиральных центров остова (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m или (Sp)t(Rp)n(Sp)m, где m>2. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова области сердцевины представляет собой (Sp)m(Rp)n, (Rp)n(Sp)m., (Np)t(Rp)n(Sp)m или (Sp)t(Rp)n(Sp)m, где m>2. Среди прочего, согласно некоторым вариантам осуществления такие профили могут обеспечивать или улучшать контролируемое расщепление целевой последовательности, например, последовательности РНК.

[0068] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит по меньшей мере 4 фосфоротиоата (фосфоротиоатные связи). Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит по меньшей мере 5 фосфоротиоатов. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит по меньшей мере 6 фосфоротиоатов. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 2 фосфоротиоата. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 3 фосфоротиоата. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 4 фосфоротиоата. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 5 фосфоротиоатов. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 6 фосфоротиоатов. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 2 фосфодиэфира (природные фосфатные связи). Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 3 фосфодиэфира. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 4 фосфодиэфира. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 5 фосфодиэфиров. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 6 фосфодиэфиров. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 1 фосфодиэфир и по меньшей мере 1 фосфоротиоат. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 1 фосфодиэфир и по меньшей мере 2 фосфоротиоата. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 2 фосфодиэфира и по меньшей мере 1 фосфоротиоат. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 2 фосфодиэфира и по меньшей мере 2 фосфоротиоата. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 2 фосфодиэфира и по меньшей мере 3 фосфоротиоата. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 3 фосфодиэфира и по меньшей мере 2 фосфоротиоата. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 3 фосфодиэфира и по меньшей мере 3 фосфоротиоата. Согласно некоторым вариантам осуществления фосфодиэфиры в сердцевине и/или одном или обоих крыльях являются необязательно смежными или не смежными. Согласно некоторым вариантам осуществления фосфоротиоаты в сердцевине и/или одном или обоих крыльях являются необязательно смежными или не смежными.

[0069] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды в предложенных композициях характеризуются одинаковым профилем модификаций фосфора остова. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов, которая характеризуется контролируемой хиральностью в том отношении, что композиция содержит предопределенный уровень олигонуклеотидов отдельного типа олигонуклеотидов, причем тип олигонуклеотида определяется:

1) последовательностью оснований;

2) профилем связей остова;

3) профилем хиральных центров остова, а также

4) профилем модификаций фосфора остова.

[0070] Как отмечено выше и понятно в настоящей области техники, согласно некоторым вариантам осуществления последовательность оснований олигонуклеотида может относиться к статусу идентичности и/или модификации нуклеозидных остатков (например, компонентов сахаров и/или оснований по отношению к стандартным встречающимся в природе нуклеотидам, таким как аденин, цитозин, гуанозин, тимин и урацил) в олигонуклеотиде и/или характере гибридизации (т.е. способности гибридизоваться с конкретными комплементарными остатками) таких остатков.

[0071] Согласно некоторым вариантам осуществления определенный тип олигонуклеотидов может быть определен посредством

1А) идентичности оснований;

1В) профиля модификации оснований;

1C) профиля модификации сахара;

2) профиля связей остова;

3) профиля хиральных центров остова, а также

4) профиля модификаций фосфора остова.

Таким образом, согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды определенного типа могут совместно характеризоваться наличием идентичных оснований, но отличаться по своему профилю модификаций оснований и/или модификаций сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды определенного типа могут характеризоваться наличием идентичных оснований и профиля модификаций оснований (включая, например, отсутствие модификации оснований), но различаться по профилю модификаций сахаров.

[0072] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды определенного типа химически идентичны в том плане, что они характеризуются одной и той же последовательностью оснований (включая длину), одним и тем же профилем химических модификаций фрагментов сахаров и оснований, одним и тем же профилем связей остова (например, профилем природных фосфатных связей, фосфоротиоатных связей, фосфоротиоатных триэфирных связей и их комбинаций), одним и тем же профилем хиральных центров остова (например, профилем стереохимии (Rp/Sp) хиральных межнуклеотидных связей) и одним и тем же профилем модификаций фосфора остова (например, профилем модификаций на межнуклеотидном атоме фосфора, таком как -S- и -L-R¹ формулы I).

[0073] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотидные композиции с контролируемой хиральностью олигонуклеотидов, содержащих множество (например, более чем 5, 6, 7, 8, 9 или 10) межнуклеотидных связей, и, в частности, олигонуклеотидов, содержащих множество (например, более чем 5, 6, 7, 8, 9 или 10) хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления в стереослучайном или рацемическом препарате олигонуклеотидов по меньшей мере одна хиральная межнуклеотидная связь образуется с диастереоселективностью менее чем 90:10, 95:5, 96:4, 97:3 или 98:2. Согласно некоторым вариантам осуществления для стереоселективного препарата олигонуклеотидов или препарата олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью каждая хиральная межнуклеотидная связь образуется с диастереоселективностью более чем 90:10, 95:5, 96:4, 97:3 или 98:2. Согласно некоторым вариантам осуществления для стереоселективного препарата олигонуклеотидов или препарата олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью каждая хиральная межнуклеотидная связь образуется с диастереоселективностью более чем 95:5. Согласно некоторым вариантам осуществления для стереоселективного препарата олигонуклеотидов или препарата олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью каждая хиральная межнуклеотидная связь образуется с диастереоселективностью более чем 96:4. Согласно некоторым вариантам осуществления для стереоселективного препарата олигонуклеотидов или препарата олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью каждая хиральная межнуклеотидная связь образуется с диастереоселективностью более чем 97:3. Согласно некоторым вариантам осуществления для стереоселективного препарата олигонуклеотидов или препарата олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью каждая хиральная межнуклеотидная связь образуется с диастереоселективностью более чем 98:2. Согласно некоторым вариантам осуществления для стереоселективного препарата олигонуклеотидов или препарата олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью каждая хиральная межнуклеотидная связь образуется с диастереоселективностью более чем 99:1. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность хиральной межнуклеотидной связи в олигонуклеотиде может быть измерена посредством модельной реакции, например, образования димера при практически одинаковых или сопоставимых условиях, причем димер содержит такую же межнуклеотидную связь, что и хиральная межнуклеотидная связь, 5'-нуклеозид димера является таким же, как нуклеозид на 5'-конце хиральной межнуклеотидной связи, и 3'-нуклеозид димера является таким же, как нуклеозид на 3'-конце хиральной межнуклеотидной связи.

[0074] Помимо всего прочего, настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов и технологии для оптимизации свойств, например, активности, токсичности и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способы снижения токсичности олигонуклеотидов и их композиций. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее изобретение предусматривает способы снижения иммунного ответа, связанные с введением олигонуклеотидов и их композиций (т.е. введения композиций олигонуклеотидов, так что нежелательные иммунные ответы на олигонуклеотиды в композициях уменьшаются, например, по сравнению с теми, которые наблюдаются с эталонной композицией нуклеотидов сравнимой или идентичной нуклеотидной последовательности). Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способы снижения активации комплемента, связанные с введением олигонуклеотидов и их композиций. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способы улучшения профиля связывания белков олигонуклеотидов и их композиций. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способы усиления связывания с определенными белками олигонуклеотидов и их композиций. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способы увеличения связывания с определенными белками олигонуклеотидов и их композиций. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способы усиления доставки олигонуклеотидов и их композиций. Среди прочего, настоящее раскрытие охватывает признание того, что оптимальная доставка олигонуклеотидов к их мишеням согласно некоторым вариантам осуществления предусматривает баланс олигонуклеотидов, связывающихся с определенными белками, так что олигонуклеотиды можно транспортировать в нужные места и высвобождать олигонуклеотиды, так что олигонуклеотиды могут быть надлежащим образом высвобождены из определенных белков для выполнения своих желаемых функций, например, гибридизации со своими мишенями, расщепления своих мишеней, ингибирования трансляции, модуляции процессинга транскрипта и т.д. Как показано в качестве примера в настоящем раскрытии, настоящее раскрытие признает, среди прочего, что улучшение свойств олигонуклеотидов может быть достигнуто посредством химических модификаций и/или стереохимии.

[0075] Как описано в настоящем документе, предложенные композиции и способы способны изменять сплайсинг транскриптов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции и способы обеспечивают улучшенные профили сплайсинга транскриптов по сравнению с эталонными условиями, выбранными из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинаций. Улучшение может представлять собой улучшение любых желаемых биологических функций. Согласно некоторым вариантам осуществления, например, в DMD, улучшение заключается в производстве мРНК, из которой производится белок дистрофина с улучшенной биологической активностью. Согласно некоторым другим вариантам осуществления, например, улучшение представляет собой понижающую регуляцию STAT3, HNRNPH1 и/или KDR для уменьшения прогрессирования опухоли, злокачественности и ангиогенеза посредством усиленного индуцированного сплайсингом нонсенс-опосредованного распада (DSD-NMD).

[0076] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ изменения сплайсинга целевого транскрипта, предусматривающий введение композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов, причем сплайсинг целевого транскрипта изменяется относительно эталонных условий, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинаций.

[0077] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ получения набора сплайсированных продуктов из целевого транскрипта, причем способ предусматривает стадии:

контактирования системы сплайсинга, содержащей целевой транскрипт, с композицией олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, в количестве, в течение времени и в условиях, достаточных для создания набора сплайсированных продуктов, который отличается от набора, полученного в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинаций.

[0078] Как широко известно в настоящей области техники, многие заболевания и/или состояния связаны со сплайсингом транскриптов. Например, смотрите Garcia-Blanco, et al., Alternative splicing in disease and therapy, Nat. Biotechnol. 2004 May; 22(5):535-46; Wang, et al., Splicing in disease: disruption of the splicing code and the decoding machinery, Nat. Rev. Genet. 2007 Oct; 8(10):749-61; Havens, et al.. Targeting RNA splicing for disease therapy, Wiley Interdiscip. Rev. RNA. 2013 May-Jun; 4(3):247-66. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции и способы лечения или профилактики заболеваний.

[0079] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ лечения или профилактики заболевания, предусматривающий введение субъекту композиции олигонуклеотидов, описанной в настоящем документе.

[0080] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ лечения или профилактики заболевания, предусматривающий введение субъекту композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, которые:

1) характеризуются одинаковой последовательностью оснований, комплементарной целевой последовательности в транскрипте; а также

2) содержат один или более модифицированных фрагментов сахара и модифицированных межнуклеотидных связей,

композиция олигонуклеотидов характеризуется тем, что при контакте с транскриптом в системе сплайсинга транскриптов, сплайсинг транскрипта изменяется относительно наблюдаемого в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинации.

[0081] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ лечения или профилактики заболевания, предусматривающий введение субъекту композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов определенного типа олигонуклеотидов, определяемого посредством:

1) последовательности оснований;

2) профиля связей остова;

3) профиля хиральных центров остова; а также

4) профиля модификаций фосфора остова,

причем композиция характеризуется контролируемой хиральностью в том отношении, что она обогащена относительно по существу рацемического препарата олигонуклеотидов, характеризующихся одной и той же последовательностью оснований, олигонуклеотидами конкретного типа олигонуклеотидов, причем:

композиция олигонуклеотидов характеризуется тем, что, когда она контактирует с транскриптом в системе сплайсинга транскриптов, сплайсинг транскрипта изменяется относительно наблюдаемого в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинации.

[0082] Согласно некоторым вариантам осуществления заболевание представляет собой заболевание, при котором после введения предложенной композиции один или более сплайсированных транскриптов исправляют, восстанавливают или вводят новую полезную функцию. Например, в DMD после пропускания одного или более экзонов функции дистрофина могут быть восстановлены или частично восстановлены с помощью усеченной, но (частично) активной версии. Согласно некоторым вариантам осуществления заболевание представляет собой заболевание, при котором после введения предложенной композиции один или более сплайсированных транскриптов восстанавливаются, ген эффективно подвергается нокдауну путем изменения сплайсинга транскрипта гена.

[0083] Согласно некоторым вариантам осуществления заболевание представляет собой мышечную дистрофию Дюшенна. Согласно некоторым вариантам осуществления заболевание представляет собой спинальную мышечную атрофию. Согласно некоторым вариантам осуществления заболевание представляет собой злокачественную опухоль.

[0084] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ лечения заболевания путем введения композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов, характеризующихся наличием одинаковой последовательности оснований, содержащей одинаковую последовательность оснований, нуклеотидная последовательность которой комплементарна целевой последовательности в целевом транскрипте,

улучшение, которое предусматривает применение в качестве олигонуклеотидной композиции стереоконтролируемой олигонуклеотидной композиции, характеризующейся тем, что при контакте с транскриптом в системе сплайсинга транскриптов сплайсинг транскрипта изменяется относительно наблюдаемого в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинаций.

[0085] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ лечения заболевания путем введения композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов, характеризующихся наличием одинаковой последовательности оснований, содержащей одинаковую последовательность оснований, нуклеотидная последовательность которой комплементарна целевой последовательности в целевом транскрипте,

улучшение, которое предусматривает применение в качестве олигонуклеотидной композиции стереоконтролируемой олигонуклеотидной композиции, характеризующейся тем, что при контакте с транскриптом в системе сплайсинга транскриптов сплайсинг транскрипта изменяется относительно наблюдаемого в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинаций.

[0086] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность содержит последовательность, выбранную из таблицы А1. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность представляет собой последовательность, выбранную из таблицы А1.

[0087] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ введения олигонуклеотидной композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов, имеющих общую нуклеотидную последовательность, улучшение, которое предусматривает:

введение олигонуклеотидной композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов, которое характеризуется контролируемой хиральностью и которое характеризуется сниженной токсичностью относительно эталонной композиции олигонуклеотидов той же общей нуклеотидной последовательности.

[0088] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ введения олигонуклеотидной композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов, имеющих общую нуклеотидную последовательность, улучшение, которое предусматривает:

введение олигонуклеотидной композиции, в которой каждый олигонуклеотид во множестве содержит один или более модифицированных фрагментов сахара, и композиция характеризуется сниженной токсичностью относительно эталонной композиции олигонуклеотидов той же общей нуклеотидной последовательности, но не содержит по меньшей мере один из одного или более модифицированных фрагментов сахара.

[0089] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ введения олигонуклеотидной композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов, имеющих общую нуклеотидную последовательность, улучшение, которое предусматривает:

введение композиции олигонуклеотидов, в которой каждый олигонуклеотид во множестве включает в себя одну или более природных фосфатных связей и одну или более модифицированных фосфатных связей;

причем композиция олигонуклеотидов характеризуется пониженной токсичностью при исследовании по меньшей мере в одном анализе, которая наблюдается с сопоставимой в остальном эталонной композицией, олигонуклеотиды которой не содержат природных фосфатных связей.

[0090] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ введения олигонуклеотидной композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов, имеющих общую нуклеотидную последовательность, улучшение, которое предусматривает:

введение олигонуклеотидной композиции, в которой каждый олигонуклеотид во множестве содержит один или более модифицированных фрагментов сахара, и композиция характеризуется сниженной токсичностью относительно эталонной композиции олигонуклеотидов той же общей нуклеотидной последовательности, но не содержит по меньшей мере одного из одного или нескольких модифицированных фрагментов сахара.

[0091] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ, предусматривающий стадии введения субъекту композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, каждый из которых имеет одинаковую последовательность оснований и содержит модифицированный фрагмент сахара, причем композиция олигонуклеотидов характеризуется сниженной токсичностью при исследовании по меньшей мере в одном анализе, которая наблюдается с сопоставимой в остальном эталонной композицией, которая содержит эталонное множество олигонуклеотидов, которые содержат такую же одинаковую последовательность оснований, но не содержат модифицированных фрагментов сахара.

[0092] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ, предусматривающий стадии введения субъекту композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, каждый из которых имеет одинаковую последовательность оснований и содержит одну или более природных фосфатных связей и одну или более модифицированных фосфатных связей, причем композиция олигонуклеотидов характеризуется сниженной токсичностью при исследовании по меньшей мере в одном анализе, которая наблюдается с сопоставимой в остальном эталонной композицией, которая содержит эталонное множество олигонуклеотидов, которые содержат такую же одинаковую последовательность оснований, но не содержат природных фосфатных связей.

[0093] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ, предусматривающий стадии введения композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью субъекту, причем композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью характеризуется сниженной токсичностью при исследовании по меньшей мере в одном анализе, которая наблюдается с сопоставимой в остальном эталонной композицией, которая включает в себя другую композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью или стереослучайную композицию олигонуклеотидов, содержащую олигонуклеотиды, имеющие одну и ту же последовательность оснований.

[0094] Согласно некоторым вариантам осуществления сниженная токсичность представляет собой или предусматривает сниженную активацию комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления сниженная токсичность предусматривает сниженную активацию комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления сниженная токсичность представляет собой или предусматривает сниженную активацию комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления сниженная токсичность предусматривает сниженную активацию комплемента через альтернативный путь.

[0095] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды могут вызывать провоспалительные реакции. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции и способы уменьшения воспаления. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции и способы снижения провоспалительных реакций. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способы снижения воспаления в месте инъекции с использованием предложенных композиций. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способы снижения вызванного лекарственным средством сосудистого повреждения с использованием предложенных композиций.

[0096] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ, предусматривающий введение композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов, причем эта композиция проявляет уменьшенное воспаление в месте инъекции по сравнению с эталонной композицией, содержащей множество олигонуклеотидов, каждый из которых также имеет одинаковую последовательность оснований, но которая структурно отличается от олигонуклеотидов первого множества тем, что:

отдельные олигонуклеотиды в эталонном множестве отличаются друг от друга стерео химической структурой; и/или

по меньшей мере некоторые олигонуклеотиды в эталонном множестве имеют структуру, отличную от структуры, представленной множеством олигонуклеотидов композиции; и/или

по меньшей мере некоторые олигонуклеотиды в эталонном множестве не содержат область крыла и область сердцевины.

[0097] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ введения композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, имеющих общую нуклеотидную последовательность, улучшение, которое предусматривает:

введение олигонуклеотида, содержащего первое множество олигонуклеотидов, которое характеризуется уменьшением воспаления места инъекции относительно эталонной композиции олигонуклеотидов той же общей нуклеотидной последовательности.

[0098] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ, предусматривающий введение композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов, причем композиция проявляет измененное связывание белков по сравнению с эталонной композицией, содержащей множество олигонуклеотидов, каждый из которых также имеет одинаковую последовательность, но которая структурно отличается от олигонуклеотидов первого множества тем, что:

отдельные олигонуклеотиды в эталонном множестве отличаются друг от друга стерео химической структурой; и/или

по меньшей мере некоторые олигонуклеотиды в эталонном множестве имеют структуру, отличную от структуры, представленной множеством олигонуклеотидов композиции; и/или

по меньшей мере некоторые олигонуклеотиды в эталонном множестве не содержат область крыла и область сердцевины.

[0099] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ введения композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, имеющих общую нуклеотидную последовательность, улучшение, которое предусматривает:

введение композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, которое характеризуется измененным связыванием белков относительно эталонной композиции олигонуклеотидов той же общей нуклеотидной последовательности.

[00100] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ, предусматривающий введение композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов, причем композиция проявляет улучшенную доставку по сравнению с эталонной композицией, содержащей множество олигонуклеотидов, каждый из которых также имеет одинаковую последовательность оснований, но который структурно отличается от олигонуклеотидов первого множества тем, что:

отдельные олигонуклеотиды в эталонном множестве отличаются друг от друга стерео химической структурой и/или

по меньшей мере некоторые олигонуклеотиды в эталонном множестве характеризуются структурой, отличной от структуры, представленной множеством олигонуклеотидов композиции; и/или

по меньшей мере некоторые олигонуклеотиды в эталонном множестве не содержат область крыла и область сердцевины.

[00101] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ введения композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, имеющих общую нуклеотидную последовательность, улучшение, которое предусматривает:

введение олигонуклеотида, содержащего первое множество олигонуклеотидов, которое характеризуется улучшенной доставкой относительно эталонной композиции олигонуклеотидов той же общей нуклеотидной последовательности.

[00102] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию, содержащую композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, выбранную из: WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, WV-2537, WV-2580, WV-2587, WV-2547, WV-3047, WV-3472, WV-3473, WV-3507, WV-3508, WV-3509, WV-3510, WV-3511, WV-3512, WV-3513, WV-3514, WV-3515, WV-3545 и WV-3546. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию, содержащую композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, выбранную из: WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528 и WV-2530. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, WV-2530, WV-2531, WV-2578, WV-2580, WV-2587, WV-3047, WV-3152, WV-3472, WV-3473, WV-3507, WV-3508, WV-3509, WV-3510, WV-3511, WV-3512, WV-3513, WV-3514, WV-3515, WV-3545 или WV-3546. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-887. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-892. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-896. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-1714. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2444. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2445. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2526. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2527. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2528. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2530. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2531. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2578. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2580. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2587. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3047. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3152. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3472. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3473. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3507. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3508. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3509. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3510. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3511. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3512. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3513. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3514. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3515. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3545. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3546. Как понятно специалисту в настоящей области техники, такие композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержат предопределенные уровни WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, WV-2530, WV-2531, WV-2578, WV-2580, WV-2587, WV-3047, WV-3152, WV-3472, WV-3473, WV-3507, WV-3508, WV-3509, WV-3510, WV-3511, WV-3512, WV-3513, WV-3514, WV-3515, WV-3545 или WV-3546.

[00103] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию, содержащую композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, выбранного из: WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, WV-2530, WV-2531, WV-2578, WV-2580, WV-2587, WV-3047, WV-3152, WV-3472, WV-3473, WV-3507, WV-3508, WV-3509, WV-3510, WV-3511, WV-3512, WV-3513, WV-3514, WV-3515, WV-3545 и WV-3546. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию, содержащую композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, выбранного из: WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528 и WV-2530.

[00104] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-887. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-892. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-896. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-1714. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2444. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2445. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2526. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2527. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2528. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2530. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-887. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-892. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-896. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-1714. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2444. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2445. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2526. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2527. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2528. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2530. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2531. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2578. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2580. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2587. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3047. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3152. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3472. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3473. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3507. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3508. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3509. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3510. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3511. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3512. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3513. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3514. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3515. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3545. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3546.

[00105] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-887, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-892, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-896, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-1714, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2444, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2445, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2526, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2527, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2528, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2530, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2531, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2578, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2580, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2587, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3047, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3152, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3472, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3473, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3507, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3508, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3509, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3510, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3511, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3512, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3513, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3514, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3515, причем композиция дополнительно содержит липид.

[00106] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-887, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-892, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-896, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-1714, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2444, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2445, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2526, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2527, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2528, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2530, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2531, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2578, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2580, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2587, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3047, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3152, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3472, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3473, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3507, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3508, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3509, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3510, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3511, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3512, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3513, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3514, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3515, конъюгированную с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотида, выбранного из любой из Таблиц. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотида, выбранного из любой из Таблиц, причем олигонуклеотид конъюгирован с липидом.

[00107] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид составляет в длину не более 25 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид составляет в длину не более 30 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид составляет в длину не более 35 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид составляет в длину не более 40 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид составляет в длину не более 45 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид составляет в длину не более 50 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид составляет в длину не более 55 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид составляет в длину не более 60 оснований.

[00108] Согласно некоторым вариантам осуществления липид представляет собой жирную кислоту. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид конъюгирован с жирной кислотой. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 10 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 11 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 12 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 13 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 14 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 15 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 16 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 17 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 18 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 19 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 20 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 21 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 22 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 23 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 24 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 25 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 26 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 27 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 28 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 29 или более атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления жирная кислота содержит 30 или более атомов углерода.

[00109] Согласно некоторым вариантам осуществления липид представляет собой стеариновую кислоту или турбинаровую кислоту. Согласно некоторым вариантам осуществления липид представляет собой стеариновую кислоту. Согласно некоторым вариантам осуществления липид представляет собой турбинаровую кислоту.

[00110] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную C₁₀-C₈₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, в которой одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-С₆алкилена, C₁-С₆алкенилена, -C≡C-, C₁-С₆гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и -С(O)O-, где каждая переменная независимо является такой, как определено и описано в настоящем документе.

[00111] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

[00112] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

[00113] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более C_1-4алифатическими группами.

[00114] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, в которой одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-С₆алкилена, C₁-С₆алкенилена, -C≡C-, C₁-С₆гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и -С(O)O-, где каждая переменная независимо является такой, как определено и описано в настоящем документе.

[00115] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

[00116] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

[00117] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-4алифатическими группами.

[00118] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную C₁₀-C₄₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, в которой одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-С₆алкилена, C₁-С₆алкенилена, -C≡C-, C₁-С₆гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, C(O)S, -OC(O)- и -С(O)O-, где каждая переменная независимо является такой, как определено и описано в настоящем документе.

[00119] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

[00120] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

[00121] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-4алифатическими группами.

[00122] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит незамещенную С₁₀-C₈₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

[00123] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит не более одной необязательно замещенной С₁₀-С₆₀линейной, насыщенной или частично ненасыщенной алифатической цепи.

[00124] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит две или более необязательно замещенных С₁₀-С₆₀линейных, насыщенных или частично ненасыщенных алифатических цепи.

[00125] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит незамещенную С₁₀-С₆₀линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

[00126] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит не более одной необязательно замещенной С₁₀-С₆₀линейной, насыщенной или частично ненасыщенной алифатической цепи.

[00127] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит две или более необязательно замещенных С₁₀-С₆₀линейных, насыщенных или частично ненасыщенных алифатических цепей.

[00128] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит незамещенную С₁₀-С₄₀линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

[00129] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит не более одной необязательно замещенной С₁₀-С₆₀линейной, насыщенной или частично ненасыщенной алифатической цепи.

[00130] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит две или более необязательно замещенных C₁₀-С₆₀линейных, насыщенных или частично ненасыщенных алифатических цепей.

[00131] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-С₄₀линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

[00132] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-С₄₀линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-4алифатическими группами.

[00133] Согласно некоторым вариантам осуществления липид выбирают из группы, состоящей из лауриновой кислоты, миристиновой кислоты, пальмитиновой кислоты, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, докозагексаеновой кислоты (ДГК или цис-ДГК), турбинаровой кислоты и дилинолеила.

[00134] Согласно некоторым вариантам осуществления липид не конъюгирован с олигонуклеотидом.

[00135] Согласно некоторым вариантам осуществления липид конъюгирован с олигонуклеотидом.

[00136] Согласно некоторым вариантам осуществления липид конъюгирован с олигонуклеотидом посредством линкера. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер имеет структуру -L-. Согласно некоторым вариантам осуществления конъюгат имеет структуру A^c-[-L^LD-(R^LD)_a]_b.

[00137] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую множество олигонуклеотидов, имеющих структуру:

A^c-[-L^LD-(R^LD)_a]_b или [(A^c)_a-L^LD]_b-R^LD,

в которой:

A^c представляет собой олигонуклеотидную цепь ([Н]_b-A^c представляет собой олигонуклеотид);

а составляет 1-1000;

b составляет 1-1000;

каждый L^LD независимо представляет собой линкерный фрагмент; а также каждый R^LD представляет собой независимо липидный фрагмент или целевой компонент.

[00138] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую множество олигонуклеотидов, имеющих структуру:

A^c-[-L^LD-(R^LD)_a]_b или [(A^c)_a-L^LD]_b-R^LD,

в которой:

A^c представляет собой олигонуклеотидную цепь ([Н]_b-A^c представляет собой олигонуклеотид);

а составляет 1-1000;

b составляет 1-1000;

каждый L^LD независимо представляет собой ковалентную связь или необязательно замещенную C₁-C₈₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, в которой одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены T^LD или необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-С₆алкилена, C₁-С₆алкенилена, -C≡C-, C₁-С₆гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, SC(O), -C(O)S-, -OC(O)- и -С(O)O-; каждый R^LD независимо представляет собой необязательно замещенную C₁-C₈₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, в которой одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо замещены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-С₆алкилена, C₁-С₆алкенилена, -C≡C-, C₁-С₆гетероалифатического фрагмента, C(R')₂-, -Су-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и -С(O)O-; T^LD имеет структуру:

W представляет собой О, S или Se;

каждый из X, Y и Z независимо представляет собой -O-, -S-, -N(-L-R¹)- или L;

L представляет собой ковалентную связь или необязательно замещенный линейный или разветвленный C₁-С₁₀алкилен, где одно или более метиленовых звеньев L необязательно и независимо замещены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-С₆алкилена, C₁-С₆алкенилена, -С≡С-, C₁-С₆гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')- -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O) и -С(O)O;

R¹ представляет собой галоген, R или необязательно замещенную C₁-C₅₀алифатическую группу, в которой одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо замещены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-С₆алкилена, C₁-C₆алкенилена, -С≡С-, C₁-С₆гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, S(O), -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и -С(O)O-каждый R' независимо представляет собой R, -C(O)R, -CO₂R или -SO₂R или:

два R' берутся вместе с их промежуточными атомами с образованием необязательно замещенного арильного, карбоциклического, гетероциклического или гетероарильного кольца;

Су представляет собой необязательно замещенное двухвалентное кольцо, выбранное из фенилена, карбоциклилена, арилена, гетероарилена и гетероциклилена; а также каждый R независимо представляет собой водород или необязательно замещенную группу, выбранную из алифатической, карбоциклильной, арильной, гетероар ильной и гетероциклильной C₁-С₆.

[00139] Согласно некоторым вариантам осуществления [Н]_b-А^с (где b составляет 1-1000) представляет собой олигонуклеотид из любой из Таблиц. Согласно некоторым вариантам осуществления [Н]_b-А^с представляет собой олигонуклеотид из Таблицы 2. Согласно некоторым вариантам осуществления [Н]_b-А^с представляет собой олигонуклеотид из Таблицы 3. Согласно некоторым вариантам осуществления [Н]_b-А^с представляет собой олигонуклеотид из Таблицы 4 Согласно некоторым вариантам осуществления [Н]_b-А^с представляет собой олигонуклеотид из Таблицы 4, не содержащий липидных фрагментов.

[00140] Согласно некоторым вариантам осуществления Р в T^LD представляет собой Р*. Согласно некоторым вариантам осуществления конъюгат имеет структуру [(A^c)_a-L^LD]_b-R^LD. Согласно некоторым вариантам осуществления конъюгат имеет структуру (A^c)_a-L^LD-R^LD. Согласно некоторым вариантам осуществления а составляет от 1 до 100. Согласно некоторым вариантам осуществления а составляет от 1 до 50. Согласно некоторым вариантам осуществления а составляет от 1 до 40. Согласно некоторым вариантам осуществления а составляет от 1 до 30. Согласно некоторым вариантам осуществления а составляет от 1 до 20. Согласно некоторым вариантам осуществления а составляет от 1 до 15. Согласно некоторым вариантам осуществления а составляет от 1 до 10. Согласно некоторым вариантам осуществления а составляет от 1 до 9. Согласно некоторым вариантам осуществления а составляет от 1 до 8. Согласно некоторым вариантам осуществления а составляет от 1 до 7. Согласно некоторым вариантам осуществления а составляет от 1 до 6. Согласно некоторым вариантам осуществления а составляет от 1 до 5. Согласно некоторым вариантам осуществления а составляет от 1 до 4. Согласно некоторым вариантам осуществления а составляет от 1 до 3. Согласно некоторым вариантам осуществления а составляет от 1 до 2. Согласно некоторым вариантам осуществления а равно 1. Согласно некоторым вариантам осуществления а равно 2. Согласно некоторым вариантам осуществления а равно 3. Согласно некоторым вариантам осуществления а равно 4. Согласно некоторым вариантам осуществления а равно 5. Согласно некоторым вариантам осуществления а равно 6. Согласно некоторым вариантам осуществления а равно 7. Согласно некоторым вариантам осуществления а равно 8. Согласно некоторым вариантам осуществления а равно 9. Согласно некоторым вариантам осуществления а равно 10. Согласно некоторым вариантам осуществления а больше чем 10. Согласно некоторым вариантам осуществления b составляет 1-100. Согласно некоторым вариантам осуществления b составляет от 1 до 50. Согласно некоторым вариантам осуществления b составляет от 1 до 40. Согласно некоторым вариантам осуществления b составляет от 1 до 30. Согласно некоторым вариантам осуществления b составляет от 1 до 20. Согласно некоторым вариантам осуществления b составляет от 1 до 15. Согласно некоторым вариантам осуществления b составляет от 1 до 10. Согласно некоторым вариантам осуществления b составляет от 1 до 9. Согласно некоторым вариантам осуществления b составляет от 1 до 8. Согласно некоторым вариантам осуществления b составляет от 1 до 7. Согласно некоторым вариантам осуществления b составляет от 1 до 6. Согласно некоторым вариантам осуществления b составляет от 1 до 5. Согласно некоторым вариантам осуществления b составляет от 1 до 4. Согласно некоторым вариантам осуществления b составляет от 1 до 3. Согласно некоторым вариантам осуществления b составляет от 1 до 2. Согласно некоторым вариантам осуществления b равно 1. Согласно некоторым вариантам осуществления b равно 2. Согласно некоторым вариантам осуществления b равно 3. Согласно некоторым вариантам осуществления b равно 4. Согласно некоторым вариантам осуществления b равно 5. Согласно некоторым вариантам осуществления b равно 6. Согласно некоторым вариантам осуществления b равно 7. Согласно некоторым вариантам осуществления b равно 8. Согласно некоторым вариантам осуществления b равно 9. Согласно некоторым вариантам осуществления b равно 10. Согласно некоторым вариантам осуществления b больше чем 10. Согласно некоторым вариантам осуществления конъюгат имеет структуру A^c-L^LD-R^LD. Согласно некоторым вариантам осуществления A^c конъюгируют через один или более из его фрагментов сахара, оснований и/или межнуклеотидной связи. Согласно некоторым вариантам осуществления A^c конъюгируют через его 5'-ОН (5'-O-). Согласно некоторым вариантам осуществления A^c конъюгируют через его 3'-ОН (3'-O-). Согласно некоторым вариантам осуществления перед конъюгацией A^c-(H)_b (b представляет собой целое число от 1 до 1000 в зависимости от валентности A^c представляет собой олигонуклеотид, как описано в настоящем документе, например, один из описанных в любой из Таблиц. Согласно некоторым вариантам осуществления L^LD представляет собой -L-. Согласно некоторым вариантам осуществления L^LD содержит фосфоротиоатную группу. Согласно некоторым вариантам осуществления L^LD представляет собой C(O)NH-(СН₂)₆-OP(=O)(S^-)-О-. Согласно некоторым вариантам осуществления конец -C(O)NH соединен с R^LD, а конец -О- соединен с олигонуклеотидом, например, через 5'-или 3'-конец. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С10, C15, C16, C17, C18, C19, C20, C21, C22, C23, C24 или C25 no C20, C21, С22, С23, С24, С25, С26, С27, С28, С29, С30, С35, С40, С45, С50, С60, С70 или C8 алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С_10-80алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С_20-80алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С_10-70алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную C_20-70алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С_10-60алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С_20-60алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С_10-50алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную C_20-50алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С_10-40алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную C_20-40алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С_10-30алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С_20-30алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой незамещенную C10, C15, C16, C17, C18, C19, C20, C21, C22, C23, C24, или от C25 до С20, C21, C22, С23, С24, С25, С26, С27, С28, С29, С30, С35, С40, С45, С50, С60, С70 или C80 алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой незамещенную С_10-80алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой незамещенную C_20-80алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой незамещенную С_10-70алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой незамещенную С_20-70алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой незамещенную С_10-60алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой незамещенную С_20-60алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой незамещенную С_10-50алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой незамещенную C_20-50алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой незамещенную С_10-40 алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой незамещенную C_20-40алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой незамещенную С_10-30алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой незамещенную С_20-30алифатическую группу.

[00141] Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой любую из предшествующих композиций, дополнительно содержащую один или более дополнительных компонентов.

[00142] Согласно некоторым вариантам осуществления конъюгирование липида с олигонуклеотидом улучшает по меньшей мере одно свойство олигонуклеотида. В некоторых вариантах улучшенные свойства включают в себя повышенную активность (например, повышенную способность индуцировать желаемое пропускание вредного экзона), сниженную токсичность и/или улучшенное распределения в ткани. Согласно некоторым вариантам осуществления ткань представляет собой мышечную ткань. Согласно некоторым вариантам осуществления ткань представляет собой скелетную мышцу, икроножную мышцу, трехглавую мышцу, сердце или диафрагму. Согласно некоторым вариантам осуществления улучшенные свойства включают в себя сниженную агонистическую активность hTLR9. Согласно некоторым вариантам осуществления улучшенные свойства включают в себя антагонистическую активность hTLR9. Согласно некоторым вариантам осуществления улучшенные свойства включают в себя повышенную антагонистическую активность hTLR9.

[00143] В общем, свойства описанных в настоящем документе композиций олигонуклеотидов могут быть оценены с использованием любого подходящего анализа. Относительные свойства токсичности и/или связывания белков для разных композиций (например, стереоконтролируемых против не стереоконтролируемых и/или разных стереоконтролируемых композиций), как правило, желательно определять в одном и том же анализе, согласно некоторым вариантам осуществления, по существу, одновременно и Согласно некоторым вариантам осуществления со ссылкой на предыдущие результаты.

[00144] Специалистам в данной области техники будет известно и/или им будет легко разработать соответствующие анализы для конкретных композиций олигонуклеотидов. Настоящее раскрытие предусматривает описания некоторых конкретных анализов, например, которые могут быть применимы при оценке одной или более характеристик поведения композиции олигонуклеотидов, например, активации комплемента, воспаления места инъекции, связывания белков и т.д.

[00145] Например, некоторые анализы, которые могут быть применимы при оценке свойств токсичности и/или связывания белков композиций олигонуклеотидов, могут включать в себя любой анализ, описанный и/или приведенный в настоящем документе в качестве примера.

ОПРЕДЕЛЕНИЯ

[00146] Алифатический: Термин «алифатический» или «алифатическая группа», используемый в настоящем описании, обозначает линейную (т.е. неразветвленную) или разветвленную замещенную или незамещенную углеводородную цепь, которая является полностью насыщенной или содержит один или более ненасыщенных участков, или моноциклический углеводород или бициклический или полициклический углеводород, который является полностью насыщенным или содержит один или более ненасыщенных участков, но не является ароматическим (его также называют в настоящем описании «карбоцикл», «циклоалифатический» или «циклоалкил»), и имеет одну точку присоединения к остатку молекулы. Согласно некоторым вариантам осуществления алифатические группы содержат 1-50 алифатических атомов углерода. Если не указано иное, алифатические группы содержат 1-10 алифатических атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления алифатические группы содержат 1-6 алифатических атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления алифатические группы содержат 1-5 алифатических атомов углерода. Согласно другим вариантам осуществления алифатические группы содержат 1-4 алифатических атомов углерода. Согласно другим вариантам осуществления и алифатические группы содержат 1-3 алифатических атомов углерода, а согласно другим вариантам осуществления алифатические группы содержат 1-2 алифатических атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления «циклоалифатический» (или «карбоцикл» или «циклоалкил») относится к моноциклическому или бициклическому С₃-С₁₀углеводороду, который является полностью насыщенным или содержит один или более ненасыщенных участков, но не является ароматическим, и имеет одну точку присоединения к остатку молекулы. Согласно некоторым вариантам осуществления «циклоалифатический» (или «карбоцикл» или «циклоалкил») относится к моноциклическому С₃-С₆углеводороду, который является полностью насыщенным или содержит один или более ненасыщенных участков, но не является ароматическим, и имеет одну точку присоединения к остатку молекулы. Подходящие алифатические группы включают, но не ограничиваются ими, линейные или разветвленные замещенные или незамещенные алкильные, алкенильные, алкинильные группы и их гибриды, такие как (циклоалкил)алкил, (циклоалкенил)алкил или (циклоалкил)алкенил.

[00147] Алкилен: Термин «алкилен» относится к двухвалентной алкильной группе. «Алкиленовая цепь» представляет собой полиметиленовую группу, т.е. -(СН₂)_n-, где n представляет собой положительное целое число предпочтительно от 1 до 6, от 1 до 4, от 1 до 3, от 1 до 2 или от 2 до 3. Замещенная алкиленовая цепь представляет собой полиметиленовую группу, в которой один или более метиленовых атомов водорода заменены на заместитель. Подходящие заместители включают те, что описаны далее для замещенной алифатической группы.

[00148] Алкенилен: Термин «алкенилен» относится к двухвалентной алкенильной группе. Замещенная алкениленовая цепь представляет собой полиметиленовую группу, содержащую по меньшей мере одну двойную связь, в которой один или более атомов водорода заменены на заместитель. Подходящие заместители включают те, что описаны далее для замещенной алифатической группы.

[00149] Животное: При использовании в настоящем описании термин «животное» относится к любому представителю царства животных. Согласно некоторым вариантам осуществления «животное» относится к человеку на любой стадии развития. Согласно некоторым вариантам осуществления «животное» относится к животным, отличным от человека, на любой стадии развития. Согласно определенным вариантам осуществления животное, отличное от человека, представляет собой млекопитающее (например, грызуна, мышь, крысу, кролика, обезьяну, собаку, кошку, овцу, крупный рогатый скот, примата и/или свинью). Согласно некоторым вариантам осуществления животные включают, но не ограничиваются ими, млекопитающих, птиц, рептилий, амфибий, рыб и/или червей. Согласно некоторым вариантам осуществления животное может представлять собой трансгенное животное, животное, выращенное методами генной инженерии, и/или клон.

[00150] Примерно: Предполагается, что в настоящем описании термины «примерно» или «примерно», используемые в отношении числового значения, включают числовые значения, которые не выходят за рамки 5%, 10%, 15% или 20% диапазона в обе стороны (более или менее) от указанного числового значения, если не указанное иное, или если из контекста не очевидно иное (за исключением тех случаев, когда указанное числовое значение будет составлять менее 0% или более 100% от необязательного значения). Согласно некоторым вариантам осуществления использование термина «примерно» в отношении дозировок обозначает ±5 мг/кг/день.

[00151] Арил: Термин «арил», используемый отдельно или в составе более крупного фрагмента, такого как «аралкил», «аралкокси» или «арилоксиалкил», относится к моноциклическим и бициклическим системам колец, содержащим всего от пяти до четырнадцати членов в кольце, где по меньшей мере одно кольцо в системе является ароматическим, и каждое кольцо в системе содержит от трех до семи членов в кольце. Термин «арил» можно использовать взаимозаменяемо с термином «арильное кольцо». Согласно определенным вариантам осуществления настоящего раскрытия «арил» относится к ароматической системе колец, включая, но не ограничиваясь ими, фенил, бифенил, нафтил, антрацил и т.д., которая может содержать один или более заместителей. Также в объем термина «арил», используемого в настоящем описании, включена группа, в которой ароматическое кольцо конденсировано с одним или более неароматическими кольцами, такая как инданил, фталимидил, нафтимидил, фенантридинил или тетрагидронафтил и т.д.

[00152] Характеристический фрагмент: При использовании в настоящем описании фраза «характеристический фрагмент» белка или полипептида представляет собой фрагмент, содержащий непрерывную последовательность аминокислот или набор непрерывных последовательностей аминокислот, которые вместе характеризуют белок или полипептид. Каждая непрерывная последовательность, в целом, содержит по меньшей мере две аминокислоты. Кроме того, специалистам в данной области техники должно быть понятно, что для определения характеристик белка, как правило, требуется по меньшей мере 5, 10, 15, 20 или более аминокислот. В целом, характеристический фрагмент представляет собой фрагмент, который помимо идентичной последовательности, указанной выше, наделяет важный неизмененный белок по меньшей мере одной функциональной характеристикой.

[00153] Характеристическая последовательность: «Характеристическая последовательность» представляет собой последовательность, которая содержится во всех членах семейства полипептидов или нуклеиновых кислот; и при помощи которой специалисты в данной области техники могут определять члены семейства.

[00154] Характеристический структурный элемент: Термин «характеристический структурный элемент» относится к отличительному структурному фрагменту (например, к структуре ядра, набору присоединенных фрагментов, элементу последовательности и т.д.), содержащемуся во всех членах семейства полипептидов, небольших молекул или нуклеиновых кислот, при помощи которого специалисты в данной области техники могут определять члены семейства.

[00155] Сравнимый: Термин «сравнимый» используют в настоящей заявке для описания двух (или более) наборов состояний или условий, которые достаточно похожи друг на друга, что позволяет проводить сравнение полученных результатов или наблюдаемых явлений. Согласно некоторым вариантам осуществления сравнимые наборы состояний или условий характеризуются совокупностью по существу одинаковых отличительных признаков и одним отличающимся отличительным признаком или незначительным количеством отличительных признаков. Специалистам в данной области техники должно быть понятно, что набор состояний сравним с другим набором, если характеризуется достаточным количеством и типом по существу одинаковых отличительных признаков, что позволяет сделать обоснованный вывод о том, что различия полученных результатов или наблюдаемых явлений для различных наборов состояний или условия вызваны или определены различиями отличающихся отличительных признаков.

[00156] Схема дозирования: При использовании в настоящем описании «схема дозирования» или «схема лечения» относятся к набору стандартных доз (как правило, более одной дозы), которые вводят по отдельности субъекту, как правило, с временными интервалами. Согласно некоторым вариантам осуществления данный терапевтический агент имеет рекомендуемую схему дозирования, в которую включены одна или более доз. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает совокупность доз, которые вводят отдельно друг от друга с одинаковыми временными интервалами; Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает совокупность доз и по меньшей мере два различных временных интервала между введением отдельных доз. Согласно некоторым вариантам осуществления все дозы, вводимые согласно схеме дозирования, содержат одинаковое стандартное дозируемое количество. Согласно некоторым вариантам осуществления различные дозы, вводимые согласно схеме дозирования, содержат различные количества. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает первую дозу, содержащую первое дозируемое количество, и одну или более дополнительных доз, содержащих второе дозируемое количество, отличающееся от первого дозируемого количества. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает первую дозу, содержащую первое дозируемое количество, а затем одну или более дополнительных доз, содержащих второе дозируемое количество, равное первому дозируемому количеству.

[00157] Эквивалентные агенты: Специалистам в данной области техники после изучения настоящего описанию будет понятно, что объем подходящих агентов в контексте настоящего раскрытия не ограничен теми, что конкретно указаны или предложены в настоящем описании. В частности специалистам в данной области техники должно быть понятно, что активные агенты, как правило, имеют структуру, состоящую из ядра и присоединенных фрагментов, кроме того, должно быть понятно, что небольшие изменения указанного ядра и/или присоединенных фрагментов существенно не изменяют активность агента. Например, согласно некоторым вариантам осуществления замещение одного или более присоединенных фрагментов на группы со сравнимой трехмерной структурой и/или химическими характеристиками, может приводить к получению замещенного соединения или фрагмента, эквивалентного исходному соединению или фрагменту сравнения. Согласно некоторым вариантам осуществления добавление или удаление одного или более присоединенных фрагментов может приводить к получению замещенного соединения, эквивалентного исходному соединению сравнения. Согласно некоторым вариантам осуществления изменение структуры ядра, например, путем добавления или удаления небольшого числа связей (как правило, не более чем 5, 4, 3, 2 или 1 связи, а часто только одной простой связи) может приводить к получению замещенного соединения, эквивалентного исходному соединению сравнения. Согласно многим вариантам осуществления эквивалентные соединения можно получать при помощи способов, проиллюстрированных на общих схемах реакций, например таких как те, что приведены далее, или при помощи их модификаций с использованием легкодоступных исходных веществ, реагентов и традиционных или предложенных способов синтеза. В указанных взаимодействиях также можно использовать варианты, которые известны, как таковые, но не указаны в настоящем описании.

[00158] Эквивалентная дозировка: Термин «эквивалентная дозировка» используют в настоящем описании для сравнения дозировок различных фармацевтически активных агентов, которые приводят к одинаковому биологическому результату. Согласно настоящему раскрытию дозировки двух различных агентов считают «эквивалентными» друг другу, если после их введения достигают сравнимого уровня или степени биологического результата. Согласно некоторым вариантам осуществления эквивалентные дозировки различных фармацевтических агентов для применения согласно настоящему раскрытию определяют при помощи исследований in vitro и/или in vivo, описанных в настоящей заявке. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более агентов, активирующих лизосомы, для применения согласно настоящему раскрытию используют в дозе, эквивалентной дозе агента сравнения, активирующего лизосомы; в некоторых из указанных вариантов осуществления агент сравнения, активирующий лизосомы, подходящий для указанных задач, выбран из группы, состоящей из аллостерических активаторов, состоящих из небольших молекул (например, пиразолпиримидинов), иммуносахаров (например, изофагомина), антиоксидантов (например, н-ацетилцистеина) и регуляторов миграции клеток (например, полипептида Rab1a).

[00159] Гетероалифатический: Термин «гетероалифатический» относится к алифатической группе, где одно или более звеньев, выбранных из С, СН, CH₂ или СН₃, независимо заменены на гетероатом. Согласно некоторым вариантам осуществления гетероалифатическая группа представляет собой гетероалкил. Согласно некоторым вариантам осуществления гетероалифатическая группа представляет собой гетероалкенил.

[00160] Гетероарил: Термины «гетероарил» и «гетероар-«, используемые по отдельности или в составе более крупного фрагмента, например, «гетероаралкил» или «гетероаралкокси», относятся к группам, содержащим от 5 до 10 атомов в кольце, предпочтительно 5, 6 или 9 атомов в кольце; содержащим 6, 10 или 14 π-электронов, распределенных по циклической матрице; и содержащим помимо атомов углерода от одного до пяти гетероатомов. Термин «гетероатом» относится к азоту, кислороду или сере и включает любую окисленную форму азота или серы и любую четвертичную форму основного атома азота. Гетероар ильные группы включают без ограничений тиенил, фуранил, пирролил, имидазолил, пиразолил, триазолил, тетразолил, оксазолил, изоксазолил, оксадиазолил, тиазолил, изотиазолил, тиадиазолил, пиридил, пиридазинил, пиримидинил, пиразинил, индолизинил, пуринил, нафтиридинил и птеридинил. Термины «гетероарил» и «гетероар-», используемые в настоящем описании, также включают группы, в которых гетероароматическое кольцо конденсировано с одним или более арильными, циклоалифатическими и гетероциклильными кольцами, где радикал или место присоединения находится при гетероароматическом кольце. Неограничивающие примеры включают индолил, изоиндолил, бензотиенил, бензофуранил, дибензофуранил, индазолил, бензимидазолил, бензтиазолил, хинолил, изохинолил, циннолинил, фталазинил, хиназолинил, хиноксалинил, 4H-хинолизинил, карбазолил, акридинил, феназинил, фенотиазинил, феноксазинил, тетрагидрохинолинил, тетрагидроизохинолинил и пиридо[2,3-b]-1,4-оксазин-3(4Н)-он. Гетероарильная группа может быть моно- или бициклической. Термин «гетероарил» можно использовать взаимозаменяемо с терминами «гетероарильное кольцо», «гетероарильная группа» или «гетероароматический», любой из указанных терминов включает необязательно замещенные кольца. Термин «гетеро ар алкил» относится к алкильной группе; замещенной гетероарилом, где алкильный и гетероар ильный фрагменты независимо необязательно замещены.

[00161] Гетероатом: Термин «гетероатом» обозначает один или более атомов, выбранных из кислорода, серы, азота, фосфора или кремния (включая любую окисленную форму азота, серы, фосфора или кремния; четвертичную форму любого основного атома азота; или атом азота гетероциклического кольца, который может иметь заместители, например, N (как в 3,4-дигидро-2H-пирролиле), NH (как в пирролидиниле) или NR⁺ (как в N-замещенном пирролидиниле)).

[00162] Гетероцикл: Используемые в настоящем описании термины «гетероцикл», «гетеро циклил», «гетероциклический радикал» и «гетероциклическое кольцо», которые используют взаимозаменяемо, относятся к 3-7-членному моноциклическому или 7-10-членному бициклическому гетероциклическому фрагменту, который является насыщенным или частично ненасыщенным, и содержит помимо атомов углерода один или более, предпочтительно от одного до четырех гетероатомов, таких как определено выше. При использовании для описания атома кольца в гетероцикле термин «азот» включает замещенный атом азота. Например, в насыщенном или частично ненасыщенном кольце, содержащем 0-3 гетероатомов, выбранных из кислорода, серы или азота, атом азота может представлять собой N (как в 3,4-дигидро-2H-пирролиле), NH (как в пирролидиниле) или ⁺NR (как в N-замещенном пирролидиниле).

[00163] Гетероциклическое кольцо может быть присоединено к соседней группе через любой гетероатом или атом углерода, что приводит к образованию стабильной структуры, любой из атомов в кольце может быть необязательно замещен. Примеры указанных насыщенных или частично ненасыщенных гетероциклических радикалов включают без ограничений тетрагидрофуранил, тетрагидротио фенил, пирролидинил, пиперидинил, пирролинил, тетрагидрохинолинил, тетрагидроизохинолинил, декагидрохинолинил, оксазолидинил, пиперазинил, диоксанил, диоксоланил, диазепинил, оксазепинил, тиазепинил, морфолинил и хинуклидинил. Термины «гетероцикл», «гетероциклил», «гетероциклильное кольцо», «гетероциклическая группа», «гетероциклический фрагмент» и «гетероциклический радикал», которые используют в настоящем описании взаимозаменяемо, также включают группы, в которых гетероциклическое кольцо конденсировано с одним или более арильными, гетероарильными или циклоалифатическими кольцами, такие как индолинил, 3Н-индолил, хроманил, фенантридинил или тетрагидрохинолинил, где радикал или место присоединения находится при гетероциклильном кольце. Гетероциклильная группа может быть моно- или бициклической. Термин «гетероциклилалкил» относится к алкильной группе, замещенной гетероциклилом, где алкильный и гетероциклильный фрагменты независимо необязательно замещены.

[00164] Интраперитонеальный: Фразы «интраперитонеальное введение» и «вводимый интраперитонеально», используемые в настоящем описании, имеют общепринятое в данной области техники значение и относятся к введению соединения или композиции в брюшную полость субъекта.

[00165] In vitro: Используемый в настоящем описании термин «in vitro» относится к явлениям, происходящим в искусственной среде, например, в пробирке для исследований или в реакционном сосуде, в клеточной культуре и т.д., но не в организме (например, животного, растения и/или микроорганизма).

[00166] In vivo: Используемый в настоящем описании термин «in vivo» относится к явлениям, происходящим в организме (например, животного, растения и/или микроорганизма).

[00167] Низший алкил: Термин «низший алкил» относится к C_1-4линейной или разветвленной алкильной группе. Примерами низших алкильных групп являются метил, этил, пропил, изопропил, бутил, изобутил и трет-бутил.

[00168] Низший галогеналкил: Термин «низший галогеналкил» относится к C_1-4линейной или разветвленной алкильной группе, замещенной одним или более атомами галогенов.

[00169] Необязательно замещенный: Согласно настоящему описанию соединения согласно настоящему раскрытию могут содержать «необязательно замещенные» фрагменты. В целом, термин «замещенный», используемый совместно с предшествующим термином «необязательно» или без него, означает, что один или более атомов водорода в указанном фрагменте заменены на подходящий заместитель. Если не указано иное, «необязательно замещенная» группа может содержать подходящий заместитель при каждом положении группы, которое может иметь заместители, и если в какой-либо данной структуре более одного положения могут быть замещены более чем одним заместителем, выбранным из указанных групп, то заместители при каждом положении могут быть одинаковыми или различными. Комбинации заместителей, подразумеваемые в настоящем раскрытии, предпочтительно представляют собой такие комбинации, которые приводят к образованию стабильных или химически разрешенных соединений. Термин «стабильный», используемый в настоящем описании, относится к соединениям, которые по существу не изменяются после воздействия в условиях получения, детектирования, а согласно определенным вариантам осуществления выделения, очистки и использования для одной или более задач, предложенных в настоящем описании.

[00170] Подходящие одновалентные заместители при атоме углерода, который может иметь заместители, в «необязательно замещенной» группе независимо представляют собой галоген; -(СН₂)_0-4R°; -(CH₂)_0-4OR°; -O(СН₂)_0-4R°, -O-(CH₂)_0-4C(O)OR°; -(CH₂)_0-4CH(OR°)₂; -(CH₂)_0-4SR°; -(CH₂)_0-4Ph, который может быть замещен R°; -(CH₂)_0-4O(CH₂)_0-1Ph, который может быть замещен R°; -CH=CHPh, который может быть замещен R°; -(СН₂)_0-4O(СН₂)_0-1-пиридил, который может быть замещен R°; -NO₂; -CN; -N₃; -(CH₂)_0-4N(R°)₂; -(CH₂)_0-4N(R°)C(O)R°; -N(R°)C(S)R°; -(CH₂)_0-4N(R°)C(O)NR°₂; -N(R°)C(S)NR°₂; -(CH₂)_0-4N(R°)C(O)OR°; -N(R°)N(R°)C(O)R°; -N(R°)N(R°)C(O)NR°₂;-N(R°)N(R°)C(O)OR°; -(CH₂)_0-4C(O)R°; -C(S)R°; -(CH₂)_0-4C(O)OR°; -(CH₂)_0-4C(O)SR°; -(CH₂)_0-4C(O)OSiR°₃; -(CH₂)_0-4OC(O)R°; -OC(O)(CH₂)_0-4SR-, SC(S)SR°; -(CH₂)_0-4SC(O)R°; -(CH₂)_0-4C(O)NR°₂; -C(S)NR°₂; -C(S)SR°; -SC(S)SR°, -(CH₂)_0-4OC(O)NR°₂; -C(O)N(OR°)R°; -C(O)C(O)R°; -C(O)CH₂C(O)R°; -C(NOR°)R°; -(CH₂)_0-4SSR°; -(CH₂)_0-4S(O)2R°; -(CH₂)_0-4S(O)₂OR°; -(CH₂)_0-4OS(O)₂R°; -S(O)₂NR°2; -(CH₂)_0-4S(O)R°; -N(R°)S(O)₂NR°₂; -N(R°)S(O)₂R°; -N(OR°)R°; -C(NH)NR°₂; -P(O)₂R°; -P(O)R°₂; -OP(O)R°₂; -OP(O)(OR°)₂; -SiR°₃; -(C_1-4линейный или разветвленный алкилен)O-N(R°)₂; или -(C_1-4линейный или разветвленный алкилен)С(O)O-N(R°)₂, где каждый R° может быть замещен, как определено ниже, и независимо представляет собой водород, C_1-6алифатическую группу, -CH₂Ph, -O(СН₂)_0-1Ph, -СН₂-(5-6-членное гетероарильное кольцо) или 5-6-членное насыщенное, частично ненасыщенное или арильное кольцо, содержащее 0-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы, или, несмотря на приведенное выше определение, два независимых R° совместно с соседним(и) атомом(ами) образуют 3-12-членное насыщенное, частично ненасыщенное или арильное моно- или бициклическое кольцо, содержащее 0-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы, которое может быть замещено, как определено ниже.

[00171] Подходящие одновалентные заместители при R° (или при кольце, полученном в результате объединения двух независимых R° совместно с соседними атомами) независимо представляют собой галоген, -(CH₂)_0-2R^•, -(галоген-R^•), -(СН₂)_0-2OH, -(CH₂)_0-2OR^•, -(CH₂)_0-2CH(OR^•)₂; -O(галоген-R^•), -CN, -N₃, -(CH₂)_0-2C(O)R^•, -(СН₂)_0-2С(O)ОН, -(CH₂)_0-2C(O)OR^•, -(CH₂)_0-2SR^•, -(CH₂)_0-2SH, -(CH₂)_0-2NH₂, -(CH₂)_0-2NHR^•, -(CH₂)_0-2NR^•₂, -NO₂, -SiR^•₃, -OSiR^•₃, -C(O)SR^•, -(C_1-4линейный или разветвленный алкилен)С(O)OR^• или -SSR^•, где каждый R^• является незамещенным, или если используется с предшествующим определением «галоген-», замещен только одним или более атомами галогенов, и независимо выбран из C_1-4алифатической группы, -CH₂Ph, -O(CH₂)_0-1Ph или 5-6-членного насыщенного, частично ненасыщенного или арильного кольца, содержащего 0-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Подходящие двухвалентные заместители при насыщенном атоме углерода в R° включают =О и =S.

[00172] Подходящие двухвалентные заместители при насыщенном атоме углерода в «необязательно замещенной» группе включают следующие: =О, =S, =NNR*₂, =NNHC(O)R*, =NNHC(O)OR*, =NNHS(O)₂R*, =NR*, =NOR*, -O(С(R*₂))_2-3O- или -S(C(R*₂))_2-3S-, где в каждом независимом случае R* выбран из водорода, C_1-6алифатической группы, которая может быть замещена, как определено ниже, или незамещенного 5-6-членного насыщенного, частично ненасыщенного или арильного кольца, содержащего 0-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Подходящие двухвалентные заместители, связанные с вицинальными атомами углерода, которые могут иметь заместители, в «необязательно замещенной» группе включают: -O(CR*₂)_2-3О-, где в каждом независимом случае R* выбран из водорода, C_1-6алифатической группы, которая может быть замещена, как определено ниже, или незамещенного 5-6-членного насыщенного, частично ненасыщенного или арильного кольца, содержащего 0-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы.

[00173] Подходящие заместители при алифатической группе в R* включают галоген, -R^•, -(галоген-R^•), -ОН, -OR^•, -O(галоген-R^•), -CN, -С(O)ОН, -C(O)OR^•, -NH₂, -NHR^•, -NR^•₂ или -NO₂, где каждый R^• является незамещенным, или если ему предшествует определение «галоген», замещен только одним или более атомами галогенов, и независимо представляет собой С_1-4алифатическую группу, -CH₂Ph, -O(CH₂)_0-1Ph или 5-6-членное насыщенное, частично ненасыщенное или арильное кольцо, содержащее 0-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы.

[00174] Подходящие заместители при атоме азота, который может иметь заместители, в «необязательно замещенной» группе включают -R^†, -NR^†₂, -C(O)R^†, -C(O)OR^†, -C(O)C(O)R^†, -C(O)CH₂C(O)R^†, -S(O)₂R^†, -S(O)₂NR^†₂, -C(S)NR^†₂, -C(NH)NR^†₂ или -N(R^†)S(O)₂R^†; где каждый R^† независимо представляет собой водород, C_1-6алифатическую группу, которая может быть замещена, как определено ниже, незамещенный -OPh или незамещенное 5-6-членное насыщенное, частично ненасыщенное или арильное кольцо, содержащее 0-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы, или, несмотря на приведенное выше определение, два независимых R^† совместно с соседним(и) атомом(ами) образуют незамещенное 3-12-членное насыщенное, частично ненасыщенное или арильное моно- или бициклическое кольцо, содержащее 0-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы.

[00175] Подходящие заместители при алифатической группе в R^† независимо представляют собой галоген, -R^•, -(галоген-R^•), -ОН, -OR^•, -O(галоген-R^•), -CN, -С(O)ОН, -C(O)OR^•, -NH₂, -NHR^•, -NR^•₂ или -NO₂, где каждый R^• является незамещенным или, если ему предшествует определение «галоген», замещен только одним или более атомами галогенов, и независимо представляет собой C_1-4алифатическую группу, -CH₂Ph, -O(CH₂)_0-1Ph или 5-6-членное насыщенное, частично ненасыщенное или арильное кольцо, содержащее 0-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы.

[00176] Пероралъный: Фразы «пероральное введение» или «вводимый перорально», используемые в настоящем описании, имеют общепринятое в данной области техники определение и относятся к введению соединения или композиции через рот.

[00177] Парентеральный: Фразы «парентеральное введение» и «вводимый парентерально», используемые в настоящем описании, имеют общепринятое в данной области техники значение и относятся к способам введения, отличным от энтерального и местного введения, которые, как правило, проводят путем инъекции, и включают без ограничений внутривенную, внутримышечную, внутриартериальную, интратекальную, внутрикапсульную, интраорбитальную, внутрисердечную, интрадермальную, интраперитонеальную, транстрахеальную, подкожную, внутрикожную, внутрисуставную, субкапсулярную, субарахноидальную, спинномозговую и интрастернальную инъекцию и инфузию.

[00178] Частично ненасыщенный: Используемый в настоящем описании термин «частично ненасыщенный» относится к кольцевому фрагменту, содержащему по меньшей мере одну двойную или тройную связь. Предполагается, что термин «частично ненасыщенный» охватывает кольца, содержащие несколько ненасыщенных участков, но не включает арильные или гетероарильные фрагменты, такие как определено в настоящем описании.

[00179] Фармацевтическая композиция: Используемый в настоящем описании термин «фармацевтическая композиция» относится к активному агенту, введенному в состав совместно с одним или более фармацевтически приемлемыми носителями. Согласно некоторым вариантам осуществления активный агент присутствует в стандартном дозируемом количестве, подходящем для введения согласно схеме лечения, при котором существует статистически значимая вероятность достижения предварительно определенного терапевтического действия после введения целевой популяции. Согласно некоторым вариантам осуществления фармацевтические композиции могут быть специально предназначены для введения в твердой или жидкой форме, включая формы, предназначенные: для перорального введения, например, жидкие лекарственные формы для перорального введения (водные или неводные растворы или суспензии), таблетки, например, предназначенные для трансбуккального, подъязычного и системного всасывания, болюсы, порошки, гранулы, пасты для нанесения на язык; для парентерального введения, например, путем подкожной, внутримышечной, внутривенной или эпидуральной инъекции, например, в виде стерильного раствора или суспензии или состава с замедленным высвобождением; для местного введения, например, в виде крема, мази или пластыря с контролируемым высвобождением или спрея, наносимого на кожу, в легкие или полость рта; для внутривагинального или ректального введения, например, в виде суппозитория, крема или пены; для подъязычного введения; введения в глаза; чрескожного введения; или введения в нос, легкие и через другие слизистые поверхности.

[00180] Фармацевтически приемлемый: Используемая в настоящем описании фраза «фармацевтически приемлемый» относится к соединениям, веществам, композициям и/или лекарственным формам, которые по результатам тщательного медицинского обследования подходят для применения в контакте с тканями человека и животных, не вызывая избыточную токсичность, раздражение, аллергический ответ или иную проблему или осложнение, и имеют приемлемое отношение польза/риск.

[00181] Фармацевтически приемлемый носитель: Используемый в настоящем описании термин «фармацевтически приемлемый носитель» обозначает фармацевтически приемлемое вещество, композицию или носитель, такое как жидкий или твердый наполнитель, разбавитель, вспомогательное вещество или вещество для инкапсулирования растворителя, участвующее в переносе или транспортировке целевого соединения из одного органа или фрагмента организма в другой орган или фрагмент организма. Каждый носитель должен быть «приемлемым» с точки зрения совместимости с другими ингредиентами состава и безвредности для пациента. Некоторые примеры веществ, которые можно применять в качестве фармацевтически приемлемых носителей, включают: сахара, такие как лактоза, глюкоза и сахароза; крахмалы, такие как кукурузный крахмал и картофельный крахмал; целлюлозу и ее производные, такие как карбоксиметилцеллюлоза натрия, этилцеллюлоза и ацетат целлюлозы; порошковую трагакантовую камедь; солод; желатин; тальк; вспомогательные вещества, такие как масло какао и воски для суппозиториев; масла, такие как арахисовое масло, хлопковое масло, сафлоровое масло, кунжутное масло, оливковое масло, кукурузное масло и соевое масло; гликоли, такие как пропиленгликоль; полиолы, такие как глицерин, сорбит, маннит и полиэтиленгликоль; сложные эфиры, такие как этилолеат и этиллаурат; агар; буферные агенты, такие как гидроксид магния и гидроксид алюминия; альгиновую кислоту; апирогенную воду; изотонический солевой раствор; раствор Рингера; этиловый спирт; рН-буферные растворы; сложные полиэфиры, поликарбонаты и/или полиангидриды; и другие нетоксичные совместимые вещества, применяемые в фармацевтических составах.

[00182] Фармацевтически приемлемая соль: Термин «фармацевтически приемлемая соль», используемый в настоящем описании, относится к солям указанных соединений, подходящим для применения в области фармацевтики, т.е. к солям, которые по результатам тщательного медицинского обследования подходят для применения в контакте с тканями человека и низших животных, не вызывая нежелательную токсичность, раздражение, аллергический ответ и т.д., и имеют приемлемое отношение польза/риск. Фармацевтически приемлемые соли хорошо известны в данной области техники. Например, фармацевтически приемлемые соли подробно описаны в S.M. Berge, et al., J. Pharmaceutical Sciences, 66: 1-19 (1977). Согласно некоторым вариантам осуществления фармацевтически приемлемые соли включают, но не ограничиваются ими, соли присоединения нетоксичной кислоты, которые представляют собой соли аминогруппы, полученные с использованием неорганических кислот, таких как хлороводородная кислота, бромоводородная кислота, фосфорная кислота, серная кислота и перхлорная кислота, или органических кислот, таких как уксусная кислота, малеиновая кислота, винная кислота, лимонная кислота, янтарная кислота или малоновая кислота, или при помощи других способов, используемых в данной области техники, таких как ионообмен. Согласно некоторым вариантам осуществления фармацевтически приемлемые соли включают, но не ограничиваются ими, адипат, альгинат, аскорбат, аспартат, бензолсульфонат, бензоат, бисульфат, борат, бутират, камфорат, камфорсульфонат, цитрат, циклопентанпропионат, диглюконат, додецилсульфат, этансульфонат, формиат, фумарат, глюкогептонат, глицерофосфат, глюконат, гемисульфат, гептаноат, гексаноат, гидроиодид, 2-гидроксиэтансульфонат, лактобионат, лактат, лаурат, лаурилсульфат, малат, малеат, малонат, метансульфонат, 2-нафталинсульфонат, никотинат, нитрат, олеат, оксалат, пальмитат, памоат, пектинат, персульфат, 3-фенилпропионат, фосфат, пикрат, пивалат, пропионат, стеарат, сукцинат, сульфат, тартрат, тиоцианат, n-толуолсульфонат, ундеканоат, валератную соль и т.д. Типовые соли щелочных или щелочноземельных металлов включают соли натрия, лития, калия, кальция, магния и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления фармацевтически приемлемые соли содержат, если это необязательно, нетоксичные катионы аммония, четвертичного аммония и аминов, полученные с использованием противоионов, таких как галогенид, гидроксид, карбоксилат, сульфат, фосфат, нитрат, алкил, содержащий от 1 до 6 атомов углерода, сульфонат и арилсульфонат.

[00183] Пролекарство: В целом, «пролекарство» при использовании в настоящем описании имеет значение, общепринятое в данной области техники, и представляет собой фрагмент, который после введения в организм подвергается метаболизму в организме для доставки указанного активного (например, терапевтического или диагностического) агента. Как правило, указанный метаболизм включает удаление по меньшей мере одного «фрагмента пролекарства», в результате чего образуется активный агент. В данной области техники известны различные формы «пролекарств». Примеры указанных фрагментов пролекарств см. в:

a) Design of Prodrugs, под ред. Н. Bundgaard, (Elsevier, 1985) и Methods in Enzymology, 42:309-396, под ред. K. Widder, et al. (Academic Press, 1985);

b) Prodrugs and Targeted Delivery, под ред. J. Rautio (Wiley, 2011);

c) A Textbook of Drug Design and Development, под ред. Krogsgaard-Larsen;

d) Bundgaard, Глава 5 «Design and Application of Prodrugs», Н. Bundgaard, p.113-191 (1991);

e) Bundgaard, Advanced Drug Delivery Reviews, 8:1-38 (1992);

f) Bundgaard, et al., Journal of Pharmaceutical Sciences, 77:285 (1988); и

g) Kakeya, et al., Chem. Pharm. Bull., 32:692 (1984)

[00184] Как и в случае других соединений, описанных в настоящей заявке, пролекарства могут быть обеспечены в любой из ряда форм, например, в кристаллической форме, форме соли и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления пролекарства обеспечены в виде фармацевтически приемлемых солей.

[00185] Защитная группа: Термин «защитная группа», используемый в настоящем описании, хорошо известен в данной области техники и включает группы, подробно описанные в Protecting Groups in Organic Synthesis, Т. W. Greene and P. G. M. Wuts, 3^rd edition, John Wiley & Sons, 1999, содержание которой включено в настоящую заявку во всей полноте посредством ссылки. Также включены защитные группы, специально предназначенные для химии нуклеозидов и нуклеотидов, описанные в Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry, под ред. Serge L. Beaucage et al. 06/2012, где содержание Главы 2 включено в настоящую заявку во всей полноте посредством ссылки. Подходящие аминозащитные группы включают метилкарбамат, этилкарбамат, 9-флуоренилметилкарбамат (Fmoc), 9-(2-сульфо)флуоренилметилкарбамат, 9-(2,7-дибром)флуоренилметилкарбамат, 2,7-ди-трет-бутил-[9-(10,10-диоксо-10,10,10,10-тетрагидротиоксантил)]метилкарбамат (DBD-Tmoc), 4-метоксифенацилкарбамат (Phenoc), 2,2,2-трихлорэтилкарбамат (Troc), 2-триметилсилилэтилкарбамат (Теос), 2-фенилэтилкарбамат (hZ), 1-(1-адамантил)-1-метилэтилкарбамат (Adpoc), 1,1-диметил-2-галогенэтилкарбамаг, 1,1-диметил-2,2-дибромэтилкарбамат (DB-t-BOC), 1,1-диметил-2,2,2-трихлорэтилкарбамат (ТСВОС), 1-метил-1-(4-бифенил)этилкарбамат (Врос), 1-(3,5-ди-трет-2-бутилфенил)-1-метилэтилкарбамат (t-Bumeoc), 2-(2'- и 4'-пиридил)этилкарбамат (Руос), 2-(N,N-дициклогексилкарбоксамидо)этилкарбамат, трет-бутилкарбамат (ВОС); 1-адамантилкарбамат (Adoc), винилкарбамат (Voc), аллилкарбамат (Alloc), 1-изопропилаллилкарбамат (Ipaoc), циннамилкарбамат (Coc), 4-нитроциннамилкарбамат (Noc), 8-хинолилкарбамат, N-гидроксипиперидинилкарбамат, алкилдитиокарбамат, бензилкарбамат (Cbz), n-метоксибензилкарбамат (Moz), n-нитробензилкарбамат, n-бромбензилкарбамат, n-хлорбензилкарбамат, 2,4-дихлор бензилкарбамат, 4-метилсульфинилбензилкарбамат (Msz), 9-антрилметилкарбамат, дифенилметилкарбамат, 2-метилтиоэтилкарбамат, 2-метилсульфонилэтилкарбамат, 2-(n-толуолсульфонил)этилкарбамат, [2-(1,3-дитианил)]метилкарбамат (Dmoc), 4-метилтиофенилкарбамат (Mtpc), 2,4-диметилтиофенилкарбамат (Bmpc), 2-фосфониоэтилкарбамат (Реос), 2-трифенилфосфониоизопропилкарбамат (Ррос), 1,1-диметил-2-цианоэтилкарбамат, m-хлор-n-ацилоксибензилкарбамат, n-(дигидроксиборил)бензилкарбамат, 5-бензизоксазолилметилкарбамат, 2-(трифторметил)-6-хромонилметилкарбамат (Tcroc), m-нитрофенилкарбамат, 3,5-диметоксибензилкарбамат, o-нитробензилкарбамат, 3,4-диметокси-6-нитробензилкарбамат, фенил(o-нитрофенил)метилкарбамат, производное фенотиазинил-(10)-карбонила, производное N'-n-толуолсульфониламинокарбонила, производное N'-фениламинотиокарбонила, трет-амилкарбамат, 5-бензилтиокарбамат, n-цианобензилкарбамат, циклобутилкарбамат, циклогексилкарбамат, циклопентилкарбамат, циклопропилметилкарбамат, n-децилоксибензилкарбамат, 2,2-диметоксикарбонилвинилкарбамат, o-(N,N-диметилкарбоксамидо)бензилкарбамат, 1,1-диметил-3-(N,N-диметилкарбоксамидо)пропилкарбамат, 1,1 -диметилпропинилкарбамат, ди(2-пиридил)метилкарбамат, 2-фуранилметилкарбамат, 2-йодэтилкарбамат, изоборнилкарбамат, изобутилкарбамат, изоникотинилкарбамат, n-(n'-метоксифенилазо)бензилкарбамат, 1-метилциклобутилкарбамат, 1-метилниклогексилкарбамат, 1-метил-1-циклопропилметилкарбамат, 1-метил-1-(3,5-диметоксифенил)этилкарбамат, 1-метил-1 -(т-фенилазофенил)этилкарбамат, 1 -метил-1 -фенилэтилкарбамат, 1-метил-1-(4-пиридил)этилкарбамат, фенилкарбамат, n-(фенилазо)бензилкарбамат, 2,4,6-три-трет-бутилфенилкарбамат, 4-(триметиламмоний)бензилкарбамат, 2,4,6-триметилбензилкарбамат, формамид, ацетамид, хлорацетамид, трихлорацетамид, трифторацетамид, фенилацетамид, 3-фенилпропанамид, пиколинамид, 3-пиридилкарбоксамид, производное N-бензоилфенилаланина, бензамид, n-фенилбензамид, о-нитрофенилацетамид, о-нитрофеноксиацетамид, ацетоацетамид, (N'-дитиобензилоксикарбониламино)ацетамид, 3-(n-гидроксифенил)пропанамид, 3-(о-нитрофенил)пропанамид, 2-метил-2-(о-нитрофенокси)пропанамид, 2-метил-2-(о-фенилазофенокси)пропанамид, 4-хлорбутанамид, 3-метил-3-нитробутанамид, о-нитроциннамид, производное N-ацетилметионина, о-нитробензамид, о-(бензоилоксиметил)бензамид, 4,5-дифенил-3-оксазолин-2-он, N-фталимид, N-дитиасукцинимид (Dts), N-2,3-дифенилмалеимид, N-2,5-диметилпиррол, аддукт N-1,1,4,4-тетраметилдисилилазациклопентана (STABASE), 5-замещенный 1,3-диметил-1,3,5-триазациклогексан-2-он, 5-замещенный 1,3-дибензил-1,3,5-триазациклогексан-2-он, 1-замещенный 3,5-динитро-4-пиридон, N-метиламин, N-аллиламин, N-[2-(триметилсилил)этокси]метиламин (SEM), N-3-ацетоксипропиламин, N-(1-изопропил-4-нитро-2-оксо-3-пирролин-3-ил)амин, четвертичные аммонийные соли, N-бензиламин, N-ди-(4-метоксифенил)метиламин, N-5-дибензосубериламин, N-трифенилметиламин (Tr), N-[(4-метоксифенил)дифенилметил]амин (MMTr), N-9-фенилфлуорениламин (PhF), N-2,7-дихлор-9-флуоренилметиленамин, N-ферроценилметиламино (Fcm), N'-оксид N-2-пиколиламина, N-1,1-диметилтиометиленамин, N-бензилиденамин, N-n-метоксибензилиденамин, N-дифенилметиленамин, N-[(2-пиридил)мезитил]метиленамин, N-(N',N'-диметиламинометилен)амин, N,N'-изопропилиденамин, N-n-нитробензилиденамин, N-салицилиденамин, N-5-хлорсалицилиденамин, N-(5-хлор-2-гидроксифенил)фенилметиленамин, N-циклогексилиденамин, N-(5,5-диметил-3-оксо-1-циклогексенил)амин, производное N-борана, производное N-дифенилбориновой кислоты, N-[фенил(пентакарбонилхром- или вольфрам)карбонил]амин, хелат N-меди, хелат N-цинка, N-нитроамин, N-нитрозамин, N-оксид амина, дифенилфосфинамид (Dpp), диметилтиофосфинамид (Mpt), дифенилтиофосфинамид (Ppt), диалкилфосфорамидаты, дибензилфосфорамидат, дифенилфосфорамидат, бензолсульфенамид, о-нитробензолсульфенамид (Nps), 2,4-динитробензолсульфенамид, пентахлорбензосульфенамид, 2-нитро-4-метоксибензолсульфенамид, трифенилметилсульфенамид, 3-нитропиридинсульфенамид (Npys), n-толуолсульфонамид (Ts), бензолсульфонамид, 2,3,6-триметил-4-метоксибензолсульфонамид (Mtr), 2,4,6-триметоксибензолсульфонамид (Mtb), 2,6-диметил-4-метоксибензолсульфонамид (Pme), 2,3,5,6-тетраметил-4-метоксибензолсульфонамид (Mte), 4-метоксибензолсульфонамид (Mbs), 2,4,6-триметилбензолсульфонамид (Mts), 2,6-диметокси-4-метилбензолсульфонамид (iMds), 2,2,5,7,8-пентаметилхроман-6-сульфонамид (Pmc), метансульфонамид (Ms), β-триметилсилилэтансульфонамид (SES), 9-антраценсульфонамид, 4-(4',8'-диметоксинафтилметил)бензолсульфонамид (DNMBS), бензилсульфонамид, трифторметилсульфонамид и фенацилсульфонамид.

[00186] Подходящие защищенные карбоновые кислоты дополнительно включают, но не ограничиваются ими, силил-, алкил-, алкенил-, арил- и арилалкил-защищенные карбоновые кислоты. Примеры подходящих силильных групп включают триметилсилил, триэтилсилил, трет-бутилдиметилсилил, трет-бутилдифенилсилил, триизопропилсилил и т.д. Примеры подходящих алкильных групп включают метил, бензил, п-метоксибензил, 3,4-диметоксибензил, тритил, трет-бутил, тетрагидропиран-2-ил. Примеры подходящих алкенильных групп включают аллил. Примеры подходящих арильных групп включают необязательно замещенный фенил, бифенил или нафтил. Примеры подходящих аралкильных групп включают необязательно замещенный бензил (например, п-метоксибензил (МРМ), 3,4-диметоксибензил, О-нитробензил, п-нитробензил, п-галогенбензил, 2,6-дихлорбензил, п-цианобензил) и 2- и 4-пиколил.

[00187] Подходящие гидроксил-защитные группы включают метил, метоксиметил (MOM), метилтиометил (МТМ), трет-буталтиометил, (фенилдиметилсилил)метоксиметил (SMOM), бензилоксиметил (ВОМ), n-метоксибензилоксиметил (РМВМ), (4-метоксифенокси)метил (р-АОМ), гваяколметил (GUM), трет-бутоксиметил, 4-пентенилоксиметил (РОМ), силоксиметил, 2-метоксиэтоксиметил (MEM), 2,2,2-трихлорэтоксиметил, бис(2-хлорэтокси)метил, 2-(триметилсилил)этоксиметил (SEMOR), тетрагидропиранил (ТНР), 3-бромтетрагидропиранил, тетрагидротиопиранил, 1-метоксициклогексил, 4-метокситетрагидропиранил (МТНР), 4-метокситетрагидротиопиранил, S,S-диоксид 4-метокситетрагидротиопиранила, 1-[(2-хлор-4-метил)фенил]-4-метоксипиридин-4-ил (СТМР), 1,4-диоксан-2-ил, тетрагидрофуранил, тетрагидротиофуранил, 2,3,3а,4,5,6,7,7а-октагидро-7,8,8-триметил-4,7-метанобензофуран-2-ил, 1-этоксиэтил, 1-(2-хлорэтокси)этил, 1-метил-1-метоксиэтил, 1-метил-1-бензилоксиэтил, 1-метил-1-бензилокси-2-фторэтил, 2,2,2-трихлорэтил, 2-триметилсилилэтил, 2-(фенилселенил)этил, трет-бутил, аллил, n-хлорфенил, n-метоксифенил, 2,4-динитрофенил, бензил, n-метоксибензил, 3,4-диметоксибензил, о-нитробензил, n-нитробензил, n-галогенбензил, 2,6-дихлорбензил, n-цианобензил, n-фенилбензил, 2-пиколил, 4-пиколил, N-оксид, 3-метил-2-пиколила, дифенилметил, n,n'-динитробензгидрил, 5-дибензосуберил, трифенилметил, α-нафтилдифенилметил, n-метоксифенилдифенилметил, ди(n-метоксифенил)фенилметил, три(n-метоксифенил)метил, 4-(4'-бромфенацилоксифенил)дифенилметил, 4,4',4''-трис(4,5-дихлорфталимидофенил)метил, 4,4',4''-трис(левулиноилоксифенил)метил, 4,4',4''-трис(бензоилоксифенил)метил, 3-(имидазол-1-ил)-бис(4',4''-диметоксифенил)метил, 1,1-бис(4-метоксифенил)-1'-пиренилметил, 9-антрил, 9-(9-фенил)ксантенил, 9-(9-фенил-10-оксо)антрил, 1,3-бензодитиолан-2-ил, S,S-диоксид бензиодиазолила, триметилсилил (TMS), триэтилсилил (TES), триизопропилсилил (TIPS), диметилизопропилсилил (IPDMS), диэтилизопропилсилил (DEIPS), диметилгексилсилил, трет-бутилдиметилсилил (TBDMS), трет-бутилдифенилсилил (TBDPS), трибензилсилил, три-n-ксилилсилил, трифенилсилил, дифенилметилсилил (DPMS), трет-бутилметоксифенилсилил (TBMPS), формиат, бензоилформиат, ацетат, хлорацетат, дихлорацетат, трихлор ацетат, трифторацетат, метоксиацетат, трифенилметоксиацетат, феноксиацетат, n-хлорфеноксиацетат, 3-фенилпропионат, 4-оксопентаноат (левулинат), 4,4-(этилендитио)пентаноат (левулиноилдитиоацеталь), пивалоат, адамантоат, кротонат, 4-метоксикротонат, бензоат, n-фенилбензоат, 2,4,6-триметилбензоат (мезитоат), алкилметилкарбонат, 9-флуоренилметилкарбонат (Fmoc), алкилэтилкарбонат, алкил-2,2,2-трихлорэтилкарбонат (Troc), 2-(триметилсилил)этилкарбонат (TMSEC), 2-(фенилсульфонил)этилкарбонат (Psec), 2-(трифенилфосфонио)этилкарбонат (Реос), алкилизобутилкарбонат, алкилвинилкарбонат, алкилаллилкарбонат, алкил-n-нитрофенилкарбонат, алкилбензилкарбонат, алкил-n-метоксибензилкарбонат, алкил-3,4-диметоксибензилкарбонат, алкил-о-нитробензилкарбонат, алкил-n-нитробензилкарбонат, алкил-S-бензилтиокарбонат, 4-этокси-1-нафтилкарбонат, метилдитиокарбонат, 2-йодбензоат, 4-азидобутират, 4-нитро-4-метилпентаноат, о-(дибромметил)бензоат, 2-формилбензолсульфонат, 2-(метилтиометокси)этил, 4-(метилтиометокси)бутират, 2-(метилтиометоксиметил)бензоат, 2,6-дихлор-4-метилфеноксиацетат, 2,6-дихлор-4-(1,1,3,3-тетраметилбутил)феноксиацетат, 2,4-бис(1,1-диметилпропил)феноксиацетат, хлордифенилацетат, изобутират, моносукцинат, (E)-2-метил-2-бутеноат, o-(метоксикарбонил)бензоат, α-нафтоат, нитрат, алкил-N,N,N',N'-тетраметилфосфордиамидат, алкил-N-фенилкарбамат, борат, диметилфосфинотиоил, алкил-2,4-динитрофенилсульфенат, сульфат, метансульфонат (мезилат), бензилсульфонат и тозилат (Ts). Защитные группы для защиты 1,2- или 1,3-диолов включают метиленацеталь, этилиденацеталь, 1-трет-бутилэтилиденкеталь, 1-фенилэтилиденкеталь, (4-метоксифенил)этилиденацеталь, 2,2,2-трихлорэтилиденацеталь, ацетонид, циклопентилиденкеталь, циклогексилиденкеталь, циклогептилиденкеталь, бензилиденацеталь, n-метоксибензилиденацеталь, 2,4-диметоксибензилиденкеталь, 3,4-диметоксибензилиденацеталь, 2-нитробензилиденацеталь, метоксиметиленацеталь, этоксиметиленацеталь, сложный ортоэфир диметоксиметилена, сложный ортоэфир 1-метоксиэтилидена, сложный ортоэфир 1-этоксиэтилидена, сложный ортоэфир 1,2-диметоксиэтилидена, сложный ортоэфир α-метоксибензилидена, производное 1-(N,N-диметиламино)этилидена, производное α-(N,N'-диметиламино)бензилидена, сложный ортоэфир 2-оксациклопентилидена, ди-трет-бутилсилиленовую группу (DTBS), производное 1,3-(1,1,3,3-тетраизопропилдисилоксанилидена) (TIPDS), производное тетра-трет-бутоксидисилоксан-1,3-диилидена (TBDS), циклические карбонаты, циклические боронаты, этилборонат и фенилборонат.

[00188] Согласно некоторым вариантам осуществления гидроксилзащитная группа представляет собой ацетил, трет-бутил, трет-бутоксиметил, метоксиметил, тетрагидропиранил, 1-этоксиэтил, 1-(2-хлорэтокси)этил, 2-триметилсилилэтил, п-хлорфенил, 2,4-динитрофенил, бензил, бензоил, п-фенилбензоил, 2,6-дихлорбензил, дифенилметил, п-нитробензил, трифенилметил (тритил), 4,4'-диметокситритил, триметилсилил, триэтилсилил, трет-бутилдиметилсилил, трет-бутилдифенилсилил, трифенилсилил, триизопропилсилил, бензоилформиат, хлорацетил, трихлорацетил, трифторацетил, пивалоил, 9-флуоренилметилкарбонат, мезилат, тозилат, трифлат, тритил, монометокситритил (MMTr), 4,4'-диметокситритил (DMTr) и 4,4',4''-триметокситритил (TMTr), 2-цианоэтил (СЕ или Cne), 2-(триметилсилил)этил (TSE), 2-(2-нитрофенил)этил, 2-(4-цианофенил)этил, 2-(4-нитрофенил)этил (NPE), 2-(4-нитрофенилсульфонил)этил, 3,5-дихлорфенил, 2,4-диметилфенил, 2-нитрофенил, 4-нитрофенил, 2,4,6-триметилфенил, 2-(2-нитрофенил)этил, бутилтиокарбонил, 4,4',4''-трис(бензоилокси)гритил, дифенилкарбамоил, левулинил, 2-(дибромметил)бензоил (Dbmb), 2-(изопропилтиометоксиметил)бензоил (Ptmt), 9-фенилксантен-9-ил (пиксил) или 9-(п-метоксифенил)ксантин-9-ил (МОХ). Согласно некоторым вариантам осуществления каждая из гидроксил-защитных групп независимо выбрана из ацетила, бензила, трет-бутилдиметилсилила, трет-бутилдифенилсилила и 4,4'-диметокситритила. Согласно некоторым вариантам осуществления гидроксил-защитная группа выбрана из группы, состоящей из тритила, монометокситритила и 4,4'-диметокситритильной группы.

[00189] Согласно некоторым вариантам осуществления фосфорсодержащая группа представляет собой группу, присоединенную к межнуклеотидной фосфорсодержащей связи во время синтеза олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления фосфорсодержащая защитная группа присоединена к атому серы межнуклеотидной фосфоротиоатной связи. Согласно некоторым вариантам осуществления фосфорсодержащая защитная группа присоединена к атому кислорода межнуклеотидной фосфоротиоатной связи. Согласно некоторым вариантам осуществления фосфорсодержащая защитная группа присоединена к атому кислорода межнуклеотидной фосфатной связи. Согласно некоторым вариантам осуществления фосфорсодержащая защитная группа представляет собой 2-цианоэтил (СЕ или Cne), 2-триметилсилилэтил, 2-нитроэтил, 2-сульфонилэтил, метил, бензил, о-нитробензил, 2-(n-нитрофенил)этил (NPE или Npe), 2-фенилэтил, 3-(N-трет-бутилкарбоксамидо)-1-пропил, 4-оксопентил, 4-метилтио-1-бутил, 2-циано-1,1-диметилэтил, 4-N-метиламинобутил, 3-(2-пиридил)-1-пропил, 2-[N-метил-N-(2-пиридил)]аминоэтил, 2-(N-формил,N-метил)аминоэтил, 4-[N-метил-N-(2,2,2-трифторацетил)амино]бутил.

[00190] Белок: Используемый в настоящем описании термин «белок» относится к полипептиду (т.е. к последовательности по меньшей мере двух аминокислот, связанных друг с другом пептидными связями). Согласно некоторым вариантам осуществления белки включают только природные аминокислоты. Согласно некоторым вариантам осуществления белки включают одну или более аминокислот, не содержащихся в природе (например, фрагментов, образующих одну или более пептидных связей с соседними аминокислотами). Согласно некоторым вариантам осуществления один или более остатков в белковой цепи содержит фрагмент, отличный от аминокислоты (например, гликан и т.д.). Согласно некоторым вариантам осуществления белок содержит более одной полипептидной цепи, например, связанных при помощи одной или более дисульфидных связей или ассоциированных другим образом. Согласно некоторым вариантам осуществления белки содержат L-аминокислоты, D-аминокислоты или оба вида аминокислот; Согласно некоторым вариантам осуществления белки содержат одну или более модификаций или аналогов аминокислот, известных в данной области техники. Подходящие модификации включают, например, ацетилирование, амидирование, метилирование терминальной группы и т.д. Термин «пептид», в целом, используют для описания полипептида, имеющего длину менее чем примерно 100 аминокислот, менее чем примерно 50 аминокислот, менее 20 аминокислот или менее 10 аминокислот. Согласно некоторым вариантам осуществления белки представляют собой антитела, фрагменты антител, биологически активные фрагменты антител и/или характеристические фрагменты антител.

[00191] Образец: Используемый в настоящем описании термин «образец» представляет собой специфический организм или полученный из него материал. Согласно некоторым вариантам осуществления образец представляет собой биологический образец, полученный или выделенный из исследуемого источника, описанного в настоящей заявке. Согласно некоторым вариантам осуществления исследуемый источник включает организм, такой как животное или человек. Согласно некоторым вариантам осуществления биологический образец содержит биологическую ткань или жидкую среду. Согласно некоторым вариантам осуществления биологический образец представляет собой или содержит: костный мозг; кровь; кровяные клетки; асциты; образцы ткани или тонкоигольной биопсии; биологические жидкости, содержащие клетки; свободные нуклеиновые кислоты; мокроту; слюну; мочу; спинномозговую жидкость, перитонеальную жидкость; плевральную жидкость; кал; лимфу; гинекологические жидкости; мазки с кожи; вагинальные мазки; мазки из полости рта; мазки из носа; промывки или лаважи, такие как дуктальный лаваж или бронхоальвеолярный лаваж; пунктаты; соскобы; образцы костного мозга; образцы биопсии тканей; хирургические образцы; кал, другие биологические жидкости, секреты и/или выделения; и/или содержащиеся в них клетки и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления биологический образец представляет собой или содержит клетки, полученные у индивидуума. Согласно некоторым вариантам осуществления образец представляет собой «первичный образец», полученный непосредственно из исследуемого источника при помощи подходящего способа. Например, согласно некоторым вариантам осуществления первичный биологический образец получают при помощи способов, выбранных из группы, состоящей из биопсии (например, тонкоигольной аспирационной биопсии или биопсии ткани), хирургии, отбора биологической жидкости (например, крови, лимфы, кала и т.д.) и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления, что будет очевидно из контекста, термин «образец» относится к препарату, полученному путем обработки (например, путем удаления одного или более компонентов и/или путем добавления одного или более агентов) первичного образца. Например, используют фильтрование через полупроницаемую мембрану. Указанный «обработанный образец» может содержать, например, нуклеиновые кислоты или белки, экстрагированные из образца, или полученные путем обработки первичного образца при помощи способов, таких как амплификация или обратная транскрипция мРНК, выделение и/или очистка определенных компонентов и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления образец представляет собой организм. Согласно некоторым вариантам осуществления образец представляет собой растение. Согласно некоторым вариантам осуществления образец представляет собой животное. Согласно некоторым вариантам осуществления образец представляет собой человека. Согласно некоторым вариантам осуществления образец представляет собой отличный от человеческого организм.

[00192] Стереохимически изомерные формы: Фраза «стереохимически изомерные формы», используемая в настоящем описании, относится к различным соединениям, полученным из одинаковых атомов, связанных при помощи одной последовательности связей, но имеющих различные трехмерные структуры, которые не являются взаимозаменяемыми. Согласно некоторым вариантам осуществления раскрытия предложенные химические композиции могут представлять собой или содержать чистые препараты отдельных стереохимически изомерных форм соединения; Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные химические композиции могут представлять собой или содержать смеси двух или более стереохимически изомерных форм соединения. Согласно определенным вариантам осуществления указанные смеси содержат равные количества различных стереохимически изомерных форм; согласно определенным вариантам осуществления указанные смеси содержат различные количества по меньшей мере двух различных стереохимически изомерных форм. Согласно некоторым вариантам осуществления химическая композиция может содержать все диастереомеры и/или энантиомеры соединения. Согласно некоторым вариантам осуществления химическая композиция может содержать не все диастереомеры и/или энантиомеры соединения. Согласно некоторым вариантам осуществления, если конкретный энантиомер соединения согласно настоящему раскрытию является желательным, его можно получать, например, при помощи асимметрического синтеза, или путем превращения с использованием хирального вспомогательного вещества, где разделяют полученную диастереомерную смесь и проводят отщепление вспомогательной группы с получением чистых целевых энантиомеров. В качестве альтернативы, если молекула содержит основную функциональную группу, такую как аминогруппа, получают диастереомерные соли с использованием подходящей оптически-активной кислоты и проводят разделение, например, путем фракционной кристаллизации.

[00193] Субъект: Используемый в настоящем описании термин «субъект» или «исследуемый субъект» относится к любому организму, которому вводят предложенное соединение или композицию согласно настоящему раскрытию, например, в экспериментальных, диагностических, профилактических и/или терапевтических целях. Типовые субъекты включают животных (например, млекопитающих, таких как мыши, крысы, кролики, приматы, отличные от человека, и человек; насекомых; червей и т.д.) и растения. Согласно некоторым вариантам осуществления субъект может страдать и/или быть подверженным заболеванию, нарушению и/или состоянию.

[00194] По существу: Используемый в настоящем описании термин «по существу» относится к качественному описанию, заключающемуся в проявлении полного или практически полного уровня или степени рассматриваемой характеристики или свойства. Специалистам в области биологии будет понятно, что биологические и химические явления редко, если это вообще когда-либо происходит, проходят до конца и/или протекают полностью или обеспечивают абсолютный результат или его полное отсутствие. Термин «по существу», таким образом, используют в настоящем описании для учета необязательной незавершенности, присущей многим биологическим и/или химическим явлениям.

[00195] Страдающий от: У индивидуума, который «страдает от» заболевания, нарушения и/или состояния, были диагностированы и/или проявились один или более симптомов заболевания, нарушения и/или состояния.

[00196] Подверженный: Индивидуум, который «подвержен» заболеванию, нарушению и/или состоянию, представляет собой индивидуума, у которого существует повышенный риск развития заболевания, нарушения и/или состояния по сравнению с обычным членом общества. Согласно некоторым вариантам осуществления у индивидуума, который подвержен заболеванию, нарушению и/или состоянию, заболевание, нарушение и/или состояние может быть и не диагностировано. Согласно некоторым вариантам осуществления у индивидуума, который подвержен заболеванию, нарушению и/или состоянию, могут проявляться симптомы заболевания, нарушения и/или состояния. Согласно некоторым вариантам осуществления у индивидуума, который подвержен заболеванию, нарушению и/или состоянию, могут отсутствовать симптомы заболевания, нарушения и/или состояния. Согласно некоторым вариантам осуществления у индивидуума, который подвержен заболеванию, нарушению и/или состоянию, развивается заболевание, нарушение и/или состояние. Согласно некоторым вариантам осуществления у индивидуума, который подвержен заболеванию, нарушению и/или состоянию, не развивается заболевание, нарушение и/или состояние.

[00197] Системный: Фразы «системное введение», «вводимый системно», «периферическое введение» и «вводимый периферически», используемые в настоящем описании, имеют общепринятое значение и относятся к введению соединения или композиции, при котором они попадают в организм потребителя.

[00198] Таутомерные формы: Фразу «таутомерные формы» согласно настоящей заявке используют для описания различных изомерных форм органических соединений, которые могут легко превращаться друг в друга. Таутомеры могут быть охарактеризованы формальной миграцией атома водорода или протона, сопровождающейся смещением простой связи и соседней двойной связи. Согласно некоторым вариантам осуществления таутомеры могут возникать в результате прототропной таутомерии (т.е. перемещения протона). Согласно некоторым вариантам осуществления таутомеры могут возникать в результате валентной таутомерии (т.е. быстрого перераспределения связывающих электронов). Предполагается, что все указанные таутомерные формы включены в объем настоящего раскрытия. Согласно некоторым вариантам осуществления таутомерные формы соединения существуют в мольном равновесии друг с другом, и поэтому попытки получения отдельных веществ приводят к образованию смеси. Согласно некоторым вариантам осуществления таутомерные формы соединения представляют собой соединения, которые можно разделять и выделять. Согласно некоторым вариантам осуществления раскрытия можно обеспечивать химические композиции, которые представляют собой или содержат чистые препараты отдельной таутомерией формы соединения. Согласно некоторым вариантам осуществления раскрытия можно обеспечивать химические композиции в виде смесей двух или более таутомерных форм соединения. Согласно определенным вариантам осуществления указанные смеси содержат равные количества различных таутомерных форм; согласно определенным вариантам осуществления указанные смеси содержат разные количества по меньшей мере двух различных таутомерных форм соединения. Согласно некоторым вариантам осуществления раскрытия химические композиции могут содержать все таутомерные формы соединения. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения химические композиции могут содержать не все таутомерные формы соединения. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения химические композиции могут содержать одну или более таутомерных форм соединения в количествах, различающихся в разные моменты времени из-за взаимного превращения. Согласно некоторым вариантам осуществления раскрытия таутомерия представляет собой кето-енольную таутомерию. Специалистам в области химии должно быть понятно, что кето-енольный таутомер можно «захватывать» (т.е. химически модифицировать таким образом, чтобы он оставался в «енольной» форме) при помощи любого подходящего реагента, известного в области химии, для обеспечения енольного производного, которое впоследствии можно выделять при помощи одного или более подходящих способов, известных в данной области техники. Если не указано иное, настоящее раскрытие охватывает все таутомерные формы важных соединений, как в чистом виде, так и в виде смесей друг с другом.

[00199] Терапевтический агент: Используемая в настоящем описании фраза «терапевтический агент» относится к любому агенту, который после введения субъекту, оказывает терапевтическое действие и/или обеспечивает желаемое биологическое и/или фармакологическое действие. Согласно некоторым вариантам осуществления терапевтический агент представляет собой любое вещество, которое можно применять для облегчения, ослабления, снижения, подавления, предотвращения, задержки проявления, снижения степени тяжести и/или уменьшения проявления одного или более симптомов или отличительных признаков заболевания, нарушения и/или состояния.

[00200] Терапевтически эффективное количество: Используемый в настоящем описании термин «терапевтически эффективное количество» обозначает количество вещества (например, терапевтического агента, композиции и/или состава), обеспечивающее желаемый биологический ответ после введения согласно схеме лечения. Согласно некоторым вариантам осуществления терапевтически эффективное количество вещества представляет собой количество, которое после введения субъекту, страдающему или подверженному заболеванию, нарушению и/или состоянию, является достаточным для лечения, диагностики, предотвращения и/или задержки проявления заболевания, нарушения и/или состояния. Специалистам в данной области техники должно быть понятно, что эффективное количество вещества может быть различным в зависимости от таких факторов, как желаемый биологический конечный результат, доставляемое вещество, целевая клетка или ткань и т.д. Например, количество соединения в составе, которое является эффективным для лечения заболевания, нарушения и/или состояния, представляет собой количество, которое облегчает, ослабляет, снижает, подавляет, предотвращает, задерживает проявление, снижает тяжесть и/или снижает частоту проявления одного или более симптомов или отличительных признаков заболевания, нарушения и/или состояния. Согласно некоторым вариантам осуществления терапевтически эффективное количество вводят в виде одной дозы; Согласно некоторым вариантам осуществления для доставки терапевтически эффективного количества требуется несколько стандартных доз.

[00201] Лечение: Используемый в настоящем описании термин «лечить», «лечение» или «излечить» относится к способу, используемому для частичного или полного облегчения, ослабления, снижения, подавления, предотвращения, задержки проявления, снижения степени тяжести и/или уменьшения частоты проявления одного или более симптомов или отличительных признаков заболевания, нарушения и/или состояния. Лечение можно проводить субъекту, у которого отсутствуют признаки заболевания, нарушения и/или состояния. Согласно некоторым вариантам осуществления лечение можно проводить субъекту, у которого присутствуют только ранние признаки заболевания, нарушения и/или состояния, например, для уменьшения риска развития патологии, связанной с заболеванием, нарушением и/или состоянием.

[00202] Ненасыщенный: Термин «ненасыщенный», используемый в настоящем описании, означает, что фрагмент содержит один или более ненасыщенных участков.

[00203] Стандартная доза: Выражение «стандартная доза», используемое в настоящем описании, относится к количеству, вводимому в виде одной дозы, и/или к физически дискретной частице, содержащей фармацевтическую композицию. Согласно многим вариантам осуществления стандартная доза содержит предварительно определенное количество активного агента. Согласно некоторым вариантам осуществления стандартная доза содержит полную дозу агента. Согласно некоторым вариантам осуществления для обеспечения полной дозы вводят более чем одну стандартную дозу. Согласно некоторым вариантам осуществления для достижения предполагаемого действия требуется или предполагается введение нескольких стандартных доз. Стандартная доза, например, может содержаться в объеме жидкости (например, приемлемого носителя), содержащем предварительно определенное количество одного или более терапевтических агентов, предварительно определенное количество одного или более терапевтических агентов в твердом виде, состав с замедленным высвобождением или устройство доставки лекарственного агента, содержащее предварительно определенное количество одного или более терапевтических агентов, и т.д. Следует понимать, что стандартная доза может содержаться в составе, содержащем ряд компонентов помимо терапевтического(их) агента(ов). Например, согласно приведенному ниже описанию могут содержаться приемлемые носители (например, фармацевтически приемлемые носители), разбавители, стабилизаторы, буферы, консерванты и т.д. Специалистам в данной области техники должно быть понятно, что согласно многим вариантам осуществления общая подходящая дневная дозировка конкретного терапевтического агента может содержать часть или совокупность стандартных доз и может определяться, например, лечащим врачом, по результатам тщательного медицинского обследования. Согласно некоторым вариантам осуществления конкретная эффективная дозировка для любого конкретного субъекта или организма может зависеть от ряда факторов, включая нарушение, подвергающееся лечению, и тяжесть нарушения; активность конкретного используемого активного соединения; конкретную используемую композицию; возраст, массу тела, общее состояние здоровья, пол и рацион субъекта; время введения и скорость выведения конкретного используемого активного соединения; продолжительность лечения; лекарственные агенты и/или дополнительные способы лечения, используемые в комбинации или совместно с конкретным(и) используемым(и) соединением(ями), и схожие факторы, хорошо известные в области медицины.

[00204] Дикий тип: Используемый в настоящем описании термин «дикий тип» имеет общепринятое значение и относится к элементу, имеющему структуру и/или активность такую же, что существует в природе в «нормальном» (в противоположность мутантному, подверженному болезни, измененному и т.д.) состоянии или контексте. Специалистам в данной области техники должно быть понятно, что гены и полипептиды дикого типа часто существуют во множестве различных форм (например, аллелей).

[00205] Нуклеиновая кислота: Термин «нуклеиновая кислота» включает любые нуклеотиды, их аналоги и полимеры. Термин «полинуклеотид», используемый в настоящем описании, относится к полимерной форме нуклеотидов любой длины, как к рибонуклеотидам (РНК), так и к дезоксирибонуклеотидам (ДНК). Указанные термины относятся к первичной структуре молекул и, таким образом, включают двух- и одноцепочечные ДНК и двух- и одноцепочечные РНК. Указанные термины включают в качестве эквивалентов аналоги РНК или ДНК, полученные из аналогов нуклеотидов и модифицированных полинуклеотидов, включая, но не ограничиваясь ими, метилиро ванные, защищенные и/или кэппированные нуклеотиды или полинуклеотиды. Термины охватывают поли- или олигорибонуклеотиды (РНК) или поли- или олигодезоксир ибо нуклеотиды (ДНК); РНК или ДНК, полученные из N-гликозидов или С-гликозидов нуклеиновых оснований и/или модифицированных нуклеиновых оснований; нуклеиновые кислоты, полученные из сахаров и/или модифицированных сахаров; и нуклеиновые кислоты, полученные из фосфатных мостиковых групп и/или модифицированных мостиковых групп с атомом фосфора (также называемых в настоящем описании «межнуклеотидные связи»). Термин охватывает нуклеиновые кислоты, содержащие любые комбинации нуклеиновых оснований, модифицированных нуклеиновых оснований, сахаров, модифицированных сахаров, фосфатных мостиковых групп или мостиковых групп с модифицированным атомом фосфора. Примеры включают, но не ограничиваются ими, нуклеиновые кислоты, содержащие фрагменты рибозы, нуклеиновые кислоты, содержащие фрагменты дезоксирибозы, нуклеиновые кислоты, содержащие фрагменты рибозы и дезоксирибозы, нуклеиновые кислоты, содержащие фрагменты рибозы и модифицированной рибозы. Префикс поли- относится к нуклеиновой кислоте, содержащей от 2 до примерно 10000 мономерных нуклеотидных звеньев, а префикс олиго- относится к нуклеиновой кислоте, содержащей от 2 до примерно 200 мономерных нуклеотидных звеньев.

[00206] Нуклеотид: Термин «нуклеотид», используемый в настоящем описании, относится к мономерному звену полинуклеотида, которое состоит из гетероциклического основания, сахара и одной или более фосфатных групп или фосфорсодержащих межнуклеотидных связей. Природные основания (гуанин (G), аденин (А), цитозин (С), тимин (Т) и урацил (U)) являются производными пурина или пиримидина, несмотря на это, следует понимать, что включены природные и не существующие в природе аналоги оснований. Природными сахарами являются пентоза (пятичленный сахар), дезоксирибоза (из которой образуется ДНК) или рибоза (из которой образуется РНК), несмотря на это, следует понимать, что включены природные и не существующие в природе аналоги сахаров. Нуклеотиды связаны посредством межнуклеотидных связей с образованием нуклеиновых кислот или полинуклеотидов. В данной области техники известно множество межнуклеотидных связей (включая, но не ограничиваясь ими, фосфаты, фосфоротиоаты, боранофосфаты и т.д.). Искусственные нуклеиновые кислоты включают ПНК (пептидонуклеиновые кислоты), фосфотриэфиры, фосфоротионаты, H-фосфонаты, фосфорамидаты, боранофосфаты, метилфосфонаты, фосфоноацетаты, тиофосфоноацетаты и другие варианты фосфатного остова естественных нуклеиновых кислот, таких как те, что описаны в настоящей заявке.

[00207] Нуклеозид: Термин «нуклеозид» относится к фрагменту, где нуклеиновое основание или модифицированное нуклеиновое основание ковалентно связано с сахаром или модифицированным сахаром.

[00208] Сахар: Термин «сахар» относится к моносахариду в закрытой и/или открытой форме. Сахара включают, но не ограничиваются ими, рибозу, дезоксирибозу, пентофуранозу, пентопиранозу и гексопиранозу. Используемый в настоящем описании термин также охватывает структурные аналоги, используемые вместо традиционных фрагментов сахаров, такие как гликоль, полимер которого образует остов аналога нуклеиновой кислоты, гликольнуклеиновую кислоту (ГлНК).

[00209] Модифицированный сахар: Термин «модифицированный сахар» относится к фрагменту, который может заменять сахар. В модифицированном сахаре имитируются пространственное расположение, электронные свойства или некоторые другие физико-химические свойства сахара.

[00210] Нуклеиновое основание: Термин «нуклеиновое основание» относится к фрагментам нуклеиновых кислот, участвующим в образовании водородных связей, которые связывают одну последовательность нуклеиновых кислот с другой комплементарной последовательностью последовательно-специфическим образом. Наиболее распространенными природными нуклеиновыми основаниями являются аденин (А), гуанин (G), урацил (U), цитозин (С) и тимин (Т). Согласно некоторым вариантам осуществления природные нуклеиновые основания представляют собой модифицированный аденин, гуанин, урацил, цитозин или тимин. Согласно некоторым вариантам осуществления природные нуклеиновые основания представляют собой метилиро ванный аденин, гуанин, урацил, цитозин или тимин. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеиновое основание нуклеиновое основание представляет собой «модифицированное нуклеиновое основание», например, нуклеиновое основание, отличающееся от аденина (А), гуанина (G), урацила (U), цитозина (С) и тимина (Т). Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированные нуклеиновые основания представляют собой метилированный аденин, гуанин, урацил, цитозин или тимин. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированное нуклеиновое основание имитирует пространственное расположение, электронные свойства или некоторые другие физико-химические свойства нуклеиновых оснований и сохраняет свойство образования водородных связей, которые соединяют одну последовательность нуклеиновых кислот с другой последовательно-специфическим образом. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированное нуклеиновое основание может образовывать пару со всеми пятью природными основаниями (урацилом, тимином, аденином, цитозином или гуанином), по существу не влияя на характеристики плавления, распознавание внутриклеточными ферментами или активность дуплекса олигонуклеотидов.

[00211] Хиральный лиганд: Термин «хиральный лиганд» или «хиральное вспомогательное вещество» относится к фрагменту, который является хиральным и который можно использовать для взаимодействия, в результате чего взаимодействие можно проводить с определенной стереоселективностью.

[00212] Агент конденсации: При реакции конденсации термин «агент конденсации» относится к реагенту, который активирует менее активный участок и делает его более чувствительным к воздействию другого реагента. Согласно некоторым вариантам осуществления указанный другой реагент представляет собой нуклеофил.

[00213] Блокирующая группа: Термин «блокирующая группа» относится к группе, которая маскирует активность функциональной группы. Впоследствии можно удалять маскировку функциональной группы путем удаления блокирующей группы. Согласно некоторым вариантам осуществления блокирующая группа представляет собой защитную группу.

[00214] Фрагмент: Термин «фрагмент» относится к специфичному сегменту или функциональной группе молекулы. Химические фрагменты часто представляют собой известные химические частицы, встроенные или присоединенные к молекуле.

[00215] Твердая подложка: Термин «твердая подложка» относится к любой подложке, которая позволяет проводить синтез нуклеиновых кислот. Согласно некоторым вариантам осуществления термин относится к стеклу или полимеру, которые не растворимы в среде, используемой на стадиях взаимодействия, проводимых для синтеза нуклеиновых кислот, и которые модифицированы таким образом, что содержат реакционно-способные группы. Согласно некоторым вариантам осуществления твердая подложка представляет собой полистирол с высокой степенью перекрестной сшивки (НСР) или стекло с контролируемым размером пор (CPG). Согласно некоторым вариантам осуществления твердая подложка представляет собой стекло с контролируемым размером пор (CPG). Согласно некоторым вариантам осуществления твердая подложка представляет собой гибридную подложку, состоящую из стекла с контролируемым размером пор (CPG) и полистирола с высокой степенью перекрестной сшивки (НСР).

[00216] Линкерный фрагмент: Термин «линкерный фрагмент» относится к любому фрагменту, необязательно расположенному между терминальным нуклеозидом и твердой подложкой или между терминальным нуклеозидом и другим нуклеозидом, нуклеотидом или нуклеиновой кислотой.

[00217] Молекула ДНК: «Молекула ДНК» относится к полимерной форме дезоксирибонуклеотидов (аденина, гуанина, тимина или цитозина) в виде одной нити или двухцепочечной спирали. Указанный термин относится только к первичной и вторичной структуре молекулы и не ограничивает их любыми конкретными третичными формами. Таким образом, указанный термин включает двухцепочечную ДНК, содержащуюся помимо прочего в линейных молекулах ДНК (например, в рестрикционных фрагментах), вирусах, плазмидах и хромосомах. При обсуждении структуры конкретных молекул двухцепочечных ДНК последовательности можно описывать в настоящей заявке согласно общепринятым правилам, где приведена только последовательность в направлении от 5' до 3' вдоль нетранскрибируемой цепи ДНК (т.е. цепи, имеющей последовательность, гомологичную мРНК).

[00218] Кодирующая последовательность: «Кодирующая последовательность» или «кодирующая область» ДНК представляет собой последовательность двухцепочечной ДНК, которая транскрибируется и транслируется в полипептид in vivo после воздействия соответствующих последовательностей, контролирующих экспрессию. Границы кодирующей последовательности («открытая рамка считывания» или «ОРС») определяются стартовым кодоном при 5'-(амино)-конце и стоп-кодоном трансляции при 3'-(карбоксильном) конце. Кодирующая последовательность может включать, но не ограничивается ими; прокариотические последовательности, кДНК эукариотической мРНК, геномные последовательности ДНК из ДНК эукариотов (например, млекопитающих) и синтетические последовательности ДНК. Сигнал полиаденилирования и последовательность терминации транскрипции, как правило, расположены в положении 3' кодирующей последовательности. Термин «некодирующая последовательность» или «некодирующая область» относится к областям последовательностей полинуклеотидов, которые не транслируются в аминокислоты (например, 5' и 3' нетранслируемые области).

[00219] Рамка считывания: Термин «рамка считывания» относится к одной из шести возможных рамок считывания, где в каждом направлении молекулы двухцепочечной ДНК расположены по три рамки. Используемая рамка считывания определяет кодоны, которые используются для кодирования аминокислот в кодирующей последовательности молекулы ДНК.

[00220] Антисмысловой: При использовании в настоящем описании молекула «антисмысловой» нуклеиновой кислоты содержит последовательность нуклеотидов, которая является комплементарной со «смысловой» нуклеиновой кислотой, кодирующей белок, например, комплементарной с кодирующей цепью молекулы двухцепочечной ДНК, комплементарной с последовательностью мРНК или комплементарной с кодирующей цепью гена. Соответственно, молекула антисмысловой нуклеиновой кислоты может быть ассоциирована посредством водородных связей с молекулой смысловой нуклеиновой кислоты.

[00221] Положение качелей: Используемое в настоящем описании «положение качелей» относится к третьему положению кодона. Мутации молекулы ДНК в положении качелей кодона Согласно некоторым вариантам осуществления приводят к молчащим или консервативным мутациям уровня аминокислот. Например, существуют четыре кодона, кодирующих глицин, т.е. GGU, GGC, GGA и GGG, таким образом, мутация в положении качелей нуклеотида с заменой на любой другой нуклеотид, выбранный из A, U, С и G, не приводит к изменению уровня аминокислот кодируемого белка и, таким образом, является молчащим замещением.

[00222] Молчащее замещение: «Молчащее замещение» или «молчащая мутация» представляют собой мутацию, при которой происходит модификация нуклеотида в кодоне, но это не приводит к изменению остатка аминокислот, кодируемого кодоном. Примеры включают мутации в третьем положении кодона, а также в первом положении определенных кодонов, таких как кодон «CGG», который в результате мутации в AGG все равно кодирует Arg.

[00223] Ген: Термины «ген», «рекомбинантный ген» и «генетический конструкт», используемые в настоящем описании, относятся к молекуле ДНК или фрагменту молекулы ДНК, который кодирует белок или его фрагмент. Молекула ДНК может содержать открытую рамку считывания, кодирующую белок (последовательности экзонов), и может дополнительно содержать последовательности интронов. Термин «интрон», используемый в настоящем описании, относится к последовательности ДНК, присутствующей в данном гене, которая не транслируется в белок, и расположена в некоторых, но не во всех случаях, между экзонами. Ген желательно может быть функционально связан (или может содержать) с одним или более промоторами, усилителями, репрессорами и/или другими регуляторными последовательностями для модуляции активности или экспрессии гена, что хорошо известно в данной области техники.

[00224] Комплементарная ДНК: Используемая в настоящем описании «комплементарная ДНК» или «кДНК» включает рекомбинантные полинуклеотиды, синтезируемые в результате обратной транскрипции мРНК, из которых удалены промежуточные последовательности (интроны).

[00225] Гомология: «Гомология» или «идентичность» или «сходство» относятся к сходству последовательностей двух молекул нуклеиновых кислот. Гомологию и идентичность можно определять путем сравнения положений в каждой последовательности, которые можно согласованно выравнивать для сравнения. Если эквивалентные положения в сравниваемых последовательностях заняты одинаковым основанием, то молекулы являются идентичными по этому положению; если эквивалентные участки заняты одинаковыми или схожими остатками нуклеиновых кислот (например, имеющими схожую стерическую и/или электронную природу), то молекулы можно называть гомологичными (схожими) по этому положению. Выражение гомологии/сходства или идентичности в процентах относится к зависимости числа идентичных или схожих нуклеиновых кислот в общих положениях сравниваемых последовательностей. Последовательность, которая является «неродственной» или «негомологичной», является менее чем на 40% идентичной, менее чем на 35% идентичной, менее чем на 30% идентичной или менее чем на 25% идентичной с последовательностью, описанной в настоящей заявке. При сравнении двух последовательностей отсутствие остатков (аминокислот или нуклеиновых кислот) или наличие дополнительных остатков также уменьшает идентичность или гомологию/сходство.

[00226] Согласно некоторым вариантам осуществления термин «гомология» описывает полученный математически результат сравнения сходства последовательностей, который используют для выявления генов со схожими функциями или мотивами. Последовательности нуклеиновых кислот, описанные в настоящей заявке, можно использовать в качестве «искомой последовательности» для проведения исследования для сравнения с общими базами данных, например, для выявления других членов семейства, родственных последовательностей или гомологов. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные исследования можно проводить при помощи программного обеспечения NBLAST и XBLAST (версия 2.0), Altschul, et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:403-10. Согласно некоторым вариантам осуществления исследования нуклеотидов BLAST можно проводить при помощи программы NBLAST, показатель (score) = 100, длина слова = 12, для получения последовательностей нуклеотидов, гомологичных молекулам нуклеиновых кислот согласно настоящему раскрытию. Согласно некоторым вариантам осуществления для получения выравнивания с пробелами для сравнения можно использовать Gapped BLAST согласно описанию Altschul et al., (1997) Nucleic Acids Res. 25(17):3389-3402. При использовании программ BLAST и Gapped BLAST можно использовать базовые параметры соответствующих программ (например, XBLAST и BLAST) (см. www.ncbi.nlm.nih.gov).

[00227] Идентичность: Используемый в настоящем описании термин «идентичность» обозначает долю идентичных остатков нуклеотидов в процентах в соответствующих положениях двух или более последовательностей при выравнивании последовательностей для максимального совпадения последовательностей, т.е. с учетом пробелом и вставок. Идентичность можно легко рассчитывать при помощи известных способов, включая, но не ограничиваясь ими, способы, описанные в (Computational Molecular Biology, Lesk, A. M., ed., Oxford University Press, New York, 1988; Biocomputing: Informatics and Genome Projects, Smith, D. W., ed., Academic Press, New York, 1993; Computer Analysis of Sequence Data, Part I, Griffin, A. M., and Griffin, H. G., eds., Humana Press, New Jersey, 1994; Sequence Analysis in Molecular Biology, von Heinje, G., Academic Press, 1987; и Sequence Analysis Primer, Gribskov, M. and Devereux, J., eds., M Stockton Press, New York, 1991; и Carillo, H., and Lipman, D., SIAM J. Applied Math., 48: 1073 (1988)). Способы определения идентичности разработаны для определения максимального соответствия между исследуемыми последовательностями. Кроме того, способы определения идентичности систематизированы в компьютерных программах, имеющих открытый доступ. Способы определения идентичности между двумя последовательностями при помощи компьютерных программ включают, но не ограничиваются ими, пакет программного обеспечения GCG (Devereux, J., et al., Nucleic Acids Research 12(1): 387 (1984)), BLASTP, BLASTN и FASTA (Altschul, S. F. et al., J. Molec. Biol. 215: 403-410 (1990) и Altschul et al. Nuc. Acids Res. 25: 3389-3402 (1997)). Программа BLAST X, доступная в NCBI и в других источниках (BLAST Manual, Altschul, S., et al., NCBI NLM NIH Bethesda, Md. 20894; Altschul, S., et al., J. Mol. Biol. 215: 403-410 (1990), находится в открытом доступе. Для определения идентичности также можно использовать хорошо известный алгоритм Смита-Ватермана.

[00228] Гетерологичный: «Гетерологичная» область последовательности ДНК представляет собой распознаваемый сегмент ДНК в составе более крупной последовательности ДНК, который обычно не связан с более крупной последовательностью. Таким образом, если гетер ологичная область кодирует ген млекопитающего, то ген обычно может содержать фланкирующую ДНК, которая отсутствует в геномной ДНК млекопитающего из генома исходного организма. Другим примером гетерологичной кодирующей последовательности является последовательность, где кодирующая последовательность, как таковая, отсутствует в естественных условиях (например, кДНК, где геномная кодирующая последовательность содержит интроны или синтетические последовательности, содержащие кодоны или мотивы, отличающиеся от немодифицированного гена). Изменения аллелей или естественные мутационные события не приводят к образованию гетерологичных областей ДНК, таких как определено в настоящем описании.

[00229] Транзиционная мутация: Термин «транзиционные мутации» относится к изменениям оснований в последовательности ДНК, при которых пиримидин (в цитидине (С) или тимидине (Т)) заменен на другой пиримидин, или пурин (в аденозине (А) или гуанозине (G)) заменен на другой пурин.

[00230] Трансверсионная мутация: Термин «трансверсионные мутации» относится к изменениям оснований в последовательности ДНК, при которых пиримидин (в цитидине (С) или тимидине (Т)) заменен на пурин, или пурин (в аденозине (А) или гуанозине (G)) заменен на пиримидин.

[00231] Олигонуклеотид: Термин «олигонуклеотид» относится к полимеру или олигомеру, состоящему из мономерных нуклеотидов, содержащему любую комбинацию нуклеиновых оснований, модифицированных нуклеиновых оснований, сахаров, модифицированных сахаров, фосфатных мостиковых групп или мостиковых групп с модифицированным атомом фосфора (также называемых в настоящем описании «межнуклеотидные связи», которые дополнительно определены в настоящем описании).

[00232] Олигонуклеотиды могут быть одноцепочечными или двухцепочечными. Используемый в настоящем описании термин «цепь олигонуклеотида» охватывает одноцепочечный олигонуклеотид. Одноцепочечный олигонуклеотид может содержать двухцепочечные области, а двухцепочечный олигонуклеотид может содержать одноцепочечные области. Примеры олигонуклеотид о в включают, но не ограничиваются ими, структурные гены, гены, содержащие контрольные и терминальные области, самовоспроизводящиеся системы, такие как вирусная или плазмидная ДНК, одноцепочечные и двухцепочечные миРНК и другие агенты РНК-интерференции (агенты РНКи или агенты иРНК), кшРНК, антисмысловые олигонуклеотиды, рибозимы, микроРНК, имитаторы микроРНК, супермиры, аптамеры, антимиры, антагомиры, адаптеры UI, триплекс-образующие олигонуклеотиды, G-квадруплексные олигонуклеотиды, активаторы РНК, иммуностимулирующие олигонуклеотиды и олигонуклеотиды-«ловушки».

[00233] Двухцепочечные и одноцепочечные олигонуклеотиды, которые являются эффективными для инициирования РНК-интерференции, также называют в настоящем описании миРНК, агент РНКи или агент иРНК. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные олигонуклеотиды, вызывающие РНК-интерференцию, ассоциированы с цитоплазматическим мультибелковым комплексом, известным как индуцируемый РНКи комплекс сайленсинга (RISC). Согласно многим вариантам осуществления одноцепочечные и двухцепочечные агенты РНКи имеют достаточно длинные цепи, и они могут отщепляться под действием эндогенной молекулы, например, дайсера, с получением небольших олигонуклеотидов, которые могут быть задействованы в механизме RISC и участвуют в RISC-опосредованном расщеплении целевой последовательности, например, целевой мРНК.

[00234] Олигонуклеотиды согласно настоящему раскрытию могут иметь различную длину. Согласно конкретным вариантам осуществления длина олигонуклеотидов может находиться в диапазоне от примерно 2 до примерно 200 нуклеотидов. Согласно различным схожим вариантам осуществления одноцепочечные, двухцепочечные и трехцепочечные олигонуклеотиды могут иметь длину в диапазоне от примерно 4 до примерно 10 нуклеотидов, от примерно 10 до примерно 50 нуклеотидов, от примерно 20 до примерно 50 нуклеотидов, от примерно 15 до примерно 30 нуклеотидов, от примерно 20 до примерно 30 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет от примерно 9 до примерно 39 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 4 нуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 5 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 6 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 7 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 8 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 9 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 10 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 11 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 12 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 15 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 20 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 25 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 30 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид представляет собой дуплекс комплементарных цепей, имеющих длину по меньшей мере 18 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид представляет собой дуплекс комплементарных цепей, имеющих длину по меньшей мере 21 нуклеотидов.

[00235] Межнуклеотидная связь: Используемая в настоящем описании фраза «межнуклеотидная связь», в целом, относится к фосфорсодержащей связи между нуклеотидными звеньями в олигонуклеотиде, и его используют взаимозаменяемо с терминами «межсахарная связь» и «мостиковая группа с атомом фосфора», используемыми выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь представляет собой фосфодиэфирную связь, содержащуюся в природных молекулах ДНК и РНК. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь представляет собой «модифицированную межнуклеотидную связь», где каждый атом кислорода в фосфодиэфирной связи необязательно и независимо заменен на органический или неорганический фрагмент. Согласно некоторым вариантам осуществления указанный органический или неорганический фрагмент выбран из =S, =Se, =NR', -SR', -SeR', -N(R')₂, В(R')₃, -S-, -Se- и -N(R')-, где каждый R' независимо является таким, как определено и описано далее, но не ограничивается ими. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь представляет собой фосфотриэфирную связь, фосфоротиоатную сложную диэфирную связь () или модифицированную фосфоротиоатную сложную триэфирную связь. Специалистам в данной области техники должно быть понятно, что межнуклеотидная связь может существовать в виде аниона или катиона при данном рН за счет наличия кислотных или основных фрагментов в связи.

[00236] Если не указано иное, при использовании в последовательности олигонуклеотида каждый из s, s1, s2, s3, s4, s5, s6 и s7 независимо представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь, проиллюстрированную ниже.

[00237] Например, (Rp,Sp)-ATsCs1GA содержит 1) фосфоротиоатную межнуклеотидную связь () между Т и С; и 2) фосфоротиоатную сложную триэфирную межнуклеотидную связь, имеющую структуру , между С и G. Если не указано иное, то обозначения Rp/Sp, указанные перед последовательностью олигонуклеотида, описывают конфигурации хиральных атомов фосфора связи в межнуклеотидных связейах в направлении от положения 5' до 3' в последовательности олигонуклеотидов. Например, в (Rp,Sp)-ATsCs1GA атом фосфора в «s»-связи между Т и С имеет конфигурацию Rp, а атом фосфора в «s1» связи между С и G имеет конфигурацию Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления «полностью-(Rp)» или «полностью-(Sp)» используют для указания того, что все хиральные атомы фосфора в связейах олигонуклеотида имеют одинаковую Rp- или Sp-конфигурацию, соответственно. Например, полностью-(Rp)-GsCsCsTsCsAsGsTsCsTsGsCsTsTsCsGsCsAsCsC означает, что все хиральные атомы фосфора в связи олигонуклеотида имеют Rp-конфигурацию; полностью-(Sp)-GsCsCsTsCsAsGsTsCsTsGsCsTsTsCsGsCsAsCsC означает, что все хиральные атомы фосфора в связи олигонуклеотида имеют Sp-конфигурацию.

[00238] Тип олигонуклеотида: Согласно настоящему описанию фразу «тип олигонуклеотида» используют для определения олигонуклеотида, который имеет определенную последовательность оснований, профиль связей остова (т.е. профиль типов межнуклеотидных связей, например, фосфата, фосфоротиоата и т.д.), профиль хиральных центров остова (т.е. профиль стереохимии атомов фосфора связи (Rp/Sp)) и профиль модификаций атомов фосфора в остове (например, профиль групп «-XLR¹» в формуле I). Олигонуклеотиды обозначенного единого «типа» имеют идентичную структуру друг с другом.

[00239] Специалистам в данной области техники должно быть понятно, что способы синтеза согласно настоящему раскрытию обеспечивают уровень контроля во время синтеза цепи олигонуклеотида, при котором каждое нуклеотидное звено, входящее в состав цепи олигонуклеотида, может быть разработано и/или выбрано заранее таким образом, чтобы оно имело конкретную стереохимию атома фосфора связи и/или конкретную модификацию атома фосфора связи и/или содержало конкретное основание и/или конкретный сахар. Согласно некоторым вариантам осуществления цепь олигонуклеотида подбирают и/или выбирают заранее таким образом; чтобы она имела конкретную комбинацию атомов фосфора в связях, которые являются стереоцентрами. Согласно некоторым вариантам осуществления цепь олигонуклеотида подбирают и/или выбирают таким образом, чтобы она имела определенную комбинацию модификаций атомов фосфора связи. Согласно некоторым вариантам осуществления цепь олигонуклеотида подбирают и/или выбирают таким образом, чтобы она содержала определенную комбинацию оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления цепь олигонуклеотида подбирают и/или выбирают таким образом, чтобы она имела конкретную комбинацию одной или более приведенных выше структурных характеристик. В настоящем раскрытии предложены композиции, содержащие или состоящие из совокупности молекул олигонуклеотидов (например, композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью). Согласно некоторым вариантам осуществления все указанные молекулы принадлежат к одному типу (т.е. имеют идентичную структуру друг с другом). Согласно многим вариантам осуществления, тем не менее, предложенные композиции содержат совокупность олигонуклеотидов различных типов, как правило, в предварительно определенных относительных количествах.

[00240] Хиралъный контроль: Используемый в настоящем описании «хиральный контроль» относится к способности контролировать стереохимию каждого хирального атома фосфора связи в цепи олигонуклеотида. Фраза «олигонуклеотид с контролируемой хиральностью» относится к олигонуклеотиду, который существует в единственной диастереомерной форме, если рассматривать хиральные атомы фосфора связи.

[00241] Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью: Используемая в настоящем описании фраза «композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью» относится к композиции олигонуклеотидов, которая содержит предварительно определенное количество отдельных типов олигонуклеотидов. Например, согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержит один тип олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержит более одного типа олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержит смесь нескольких типов олигонуклеотидов. Примеры композиций олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью дополнительно описаны в настоящей заявке.

[00242] Хирально-чистый: Согласно настоящему описанию фразу «хирально-чистый» используют для описания композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой все олигонуклеотиды существуют в единственной диастереомерной форме, если рассматривать атомы фосфора связи.

[00243] Хиралъно-однородный: Согласно настоящему описанию фразу «хирально-однородный» используют для описания молекулы или типа олигонуклеотида, в которых все нуклеотидные звенья имеют одинаковую стереохимию атомов фосфора связи. Например, олигонуклеотид, в котором все нуклеотидные звенья имеют Rp-стереохимию атомов фосфора связи, является хирально-однородным. Аналогично, олигонуклеотид, в котором все нуклеотидные звенья имеют Sp-стереохимию атомов фосфора связи, является хирально-однородным.

[00244] Предварительно определенный: Предварительно определенный понимают как целенаправленно выбранный, например, в противоположность случайным образом происходящему или достигаемому. Специалистам в данной области техники после изучения настоящего описания должно быть понятно, что в настоящем раскрытии предложены новые и неожиданные технологии, которые позволяют выбирать определенные типы олигонуклеотидов для получения и/или введения в предложенные композиции, а также позволяют получать контролируемым образом точно выбранные конкретные типы необязательно в выбранных определенных относительных количествах, и, таким образом, получают предложенные композиции. Указанные предложенные композиции являются «предварительно определенными» согласно настоящему описанию. Композиции, которые могут содержать определенные отдельные типы олигонуклеотидов, которые необходимо получать при помощи способа, в котором нельзя контролировать получение конкретного типа олигонуклеотида, не являются «предварительно определенными» композициями. Согласно некоторым вариантам осуществления предварительно определенная композиция представляет собой композицию, которую можно целенаправленно получать повторно (например, при помощи повторяемого контролируемого способа).

[00245] Атом фосфора связи: Согласно определению, приведенному в настоящем описании, фразу «атом фосфора связи» используют для указания на то, что конкретный указанный атом фосфора представляет собой атом фосфора, содержащийся в межнуклеотидной связи, где атом фосфора соответствует атому фосфора фосфодиэфира межнуклеотидной связи, которая присутствует в природных ДНК и РНК. Согласно некоторым вариантам осуществления атом фосфора связи содержится в модифицированной межнуклеотидной линкерной группе, где каждый атом кислорода фосфодиэфирной связи необязательно и независимо заменен на органический или неорганический фрагмент. Согласно некоторым вариантам осуществления атом фосфора связи представляет собой Р* в формуле I. Согласно некоторым вариантам осуществления атом фосфора связи является хиральным. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный атом фосфора связи представляет собой Р* в формуле I.

[00246] Модификация Р: При использовании в настоящем описании термин «модификация Р» относится к любой модификации атома фосфора связи, отличной от стереохимической модификации. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация Р включает присоединение, замещение или удаление присоединенного фрагмента, ковалентным образом связанного с атомом фосфора связи. Согласно некоторым вариантам осуществления «модификация Р» представляет собой -X-L-R¹, где каждый из X, L и R¹ независимо является таким, как определено и описано далее в настоящем описании.

[00247] Блокмер: Термин «блокмер», используемый в настоящем описании, относится к цепи олигонуклеотида, в которой профиль структурных признаков, характеризующий каждое отдельное нуклеотидное звено, характеризуется наличием по меньшей мере двух расположенных последовательно нуклеотидных звеньев, имеющих общий структурный признак атома фосфора межнуклеотидной связи. Под общим структурным признаком понимают одинаковую стереохимию атомов фосфора или одинаковую модификацию атомов фосфора связи. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере два расположенных последовательно нуклеотидных звена, имеющих общий структурный признак атома фосфора межнуклеотидной связи, называют «блоком».

[00248] Согласно некоторым вариантам осуществления блокмер представляет собой «стереоблокмер», например, по меньшей мере два расположенных последовательно нуклеотидных звена имеют одинаковую стереохимию атомов фосфора связи. Указанные по меньшей мере два расположенных последовательно нуклеотидных звена образуют «стереоблок». Например, (Sp,Sp)-ATsCs1GA представляет собой стереоблокмер, так как два расположенных последовательно нуклеотидных звена, Ts и Cs1, имеют одинаковую стереохимию атомов фосфора связей (Sp в обоих случаях). В том же олигонуклеотиде (Sp,Sp)-ATsCs1GA TsCs1 образует блок, который представляет собой стереоблок.

[00249] Согласно некоторым вариантам осуществления блокмер представляет собой «блокмер с модификацией Р», например, по меньшей мере два расположенных последовательно нуклеотидных звена имеют одинаковую модификацию атомов фосфора связей. Указанные по меньшей мере два расположенных последовательно нуклеотидных звена образуют «блок с модификацией Р». Например, (Rp,Sp)-ATsCsGA представляет собой блокмер с модификацией Р, так как по меньшей мере два расположенных последовательно нуклеотидных звена, Ts и Cs, имеют одинаковую модификацию Р (т.е. оба атома присутствуют в виде фосфоротиоатного сложного диэфира). В том же олигонуклеотиде (Rp,Sp)-ATsCsGA TsCs образует блок, который представляет собой блок с модификацией Р.

[00250] Согласно некоторым вариантам осуществления блокмер представляет собой «блокмер с одинаковыми связями», например, по меньшей мере два расположенных последовательно нуклеотидных звена имеют одинаковую стереохимию и модификации атомов фосфора связей. По меньшей мере два расположенных последовательно нуклеотидных звена образуют «блок с одинаковыми связями». Например, (Rp,Rp)-ATsCsGA представляет собой блокмер с одинаковыми связями, так как по меньшей мере два расположенных последовательно нуклеотидных звена, Ts и Cs, имеют одинаковую стереохимию (Rp в обоих случаях) и модификацию Р (фосфоротиоат в обоих случаях). В том же олигонуклеотиде (Rp,Rp)-ATsCsGATsCs образует блок, который представляет собой блок с одинаковыми связями.

[00251] Согласно некоторым вариантам осуществления блокмер содержит один или более блоков, независимо выбранных из стереоблока, блока с модификацией Р и блока с одинаковыми связями. Согласно некоторым вариантам осуществления блокмер представляет собой стереоблокмер, если рассматривать один блок, и/или блокмер с модификацией Р, если рассматривать другой блок, и/или блокмер с одинаковыми связями, если рассматривать еще один блок. Например, (Rp,Rp,Rp,Rp,Rp,Sp,Sp,Sp)-AAsTsCsGsAs1Ts1Cs1Gs1ATCG представляет собой стереоблокмер, если рассматривать стереоблок AsTsCsGsAs1 (все атомы фосфора связей имеют Rp-конфигурацию) или Ts1Cs1Gs1 (все атомы фосфора связей имеют Sp-конфигурацию), блокмер с модификацией Р, если рассматривать блок с модификацией Р AsTsCsGs (все связи s) или As1Ts1Cs1Gs1 (все связи s1) или блокмер с одинаковыми связями, если рассматривать блок с одинаковыми связями AsTsCsGs (все атомы фосфора связей имеют Rp-конфигурацию и все связи s) или Ts1Cs1Gs1 (все атомы фосфора связей имеют Sp-конфигурацию и все связи s1).

[00252] Альтмер: Термин «альтмер», используемый в настоящем описании, относится к цепи олигонуклеотида, в которой профиль структурных признаков, характеризующий каждое отдельное нуклеотидное звено, характеризуется тем, что никакие два расположенные последовательно нуклеотидные звена в цепи олигонуклеотидов не имеют общий конкретный структурный признак атомов фосфора межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления альтмер составлен таким образом, что имеет повторяющийся профиль. Согласно некоторым вариантам осуществления альтмер составлен таким образом, что не имеет повторяющийся профиль.

[00253] Согласно некоторым вариантам осуществления альтмер представляет собой «стереоальтмер», например, никакие два расположенные последовательно нуклеотидные звена не имеют одинаковую стереохимию атомов фосфора связей. Например, (Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp)-GsCsCsTsCsAsGsTsCsTsGsCsTsTsCsGsCsAsCsC.

[00254] Согласно некоторым вариантам осуществления альтмер представляет собой «альтмер с модификацией Р», например, никакие два расположенные последовательно нуклеотидные звена не имеют одинаковую модификацию атомов фосфора связей. Например, полностью-(Sp)-CAs1GsT, где каждый атом фосфора связей имеет отличающуюся модификацию Р по сравнению с другими атомами фосфора.

[00255] Согласно некоторым вариантам осуществления альтмер представляет собой «альтмер с различными чередующимися связями», например, никакие два расположенные последовательно нуклеотидные звена не имеют одинаковую стереохимию или модификацию атомов фосфора связей. Например, (Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Rp)-GsCs1CsTs1CsAs1GsTs1CsTs1GsCs1TsTs2CsGs3CsAs4CsC.

[00256] Унимер: Термин «унимер», используемый в настоящем описании, относится к цепи олигонуклеотида, в которой профиль структурных признаков, характеризующий каждое отдельное нуклеотидное звено, является таким, что все нуклеотидные звенья в цепи имеют по меньшей мере один общий структурный признак атома фосфора межнуклеотидной связи. Под общим структурным признаком понимают одинаковую стереохимию атомов фосфора связей или одинаковую модификацию атомов фосфора связей.

[00257] Согласно некоторым вариантам осуществления унимер представляет собой «стереоунимер», например, все нуклеотидные звенья имеют одинаковую стереохимию атомов фосфора связей. Например, полностью-(Sp)-CsAs1GsT, где все связи содержат атом фосфора в Sp-конфигурации.

[00258] Согласно некоторым вариантам осуществления унимер представляет собой «унимер с модификацией Р», например, все нуклеотидные звенья имеют одинаковую модификацию атомов фосфора связи. Например, (Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp,Sp,Rp)-GsCsCsTsCsAsGsTsCsTsGsCsTsTsCsGsCsAsCsC, где все межнуклеотидные связи представляют собой фосфоротиоатные сложные диэфиры.

[00259] Согласно некоторым вариантам осуществления унимер представляет собой «унимер с одинаковыми связями», например, все нуклеотидные звенья имеют одинаковую стереохимию и одинаковые модификации атомов фосфора связей. Например, полностью-(Sp)-GsCsCsTsCsAsGsTsCsTsGsCsTsTsCsGsCsAsCsC, где все межнуклеотидные связи представляют собой фосфоротиоатный сложный диэфир, содержащий атом фосфора в Sp-конфигурации.

[00260] Гэпмер: Используемый в настоящем описании термин «гэпмер» относится к цепи олигонуклеотида, характеризующейся тем, что по меньшей мере одна межнуклеотидная фосфорсодержащая связь в цепи олигонуклеотида представляет собой фосфатную сложную диэфирную связь, например, такую как содержится в природных ДНК или РНК. Согласно некоторым вариантам осуществления более чем одна межнуклеотидная фосфорсодержащая связь цепи олигонуклеотида представляет собой фосфатную сложную диэфирную связь, такую как содержится в природных ДНК или РНК. Например, полностью-(Sp)-CAs1GsT, где межнуклеотидная связь между С и А представляет собой фосфатную сложную диэфирную связь.

[00261] Скипмер: Используемый в настоящем описании термин «скипмер» относится к типу гэпмера, в котором каждая вторая межнуклеотидная фосфорсодержащая связь в цепи олигонуклеотида представляет собой фосфатную сложную диэфирную связь, например, такую как содержится в природных ДНК или РНК, и каждая вторая межнуклеотидная фосфорсодержащая связь в цепи олигонуклеотида представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь. Например, полностью (Sp)-AsTCs1GAs2TCs3G.

[00262] Для задач настоящего раскрытия химические элементы указаны в соответствии с Периодической таблицей элементов, версия CAS, Handbook of Chemistry and Physics, 67th Ed., 1986-87, форзац.

[00263] Способы и структуры, описанные в настоящей заявке, относящиеся к соединениям и композициям согласно настоящему раскрытию, также применимы к фармацевтически приемлемым солям присоединения кислоты или основания, а также ко всем стереоизомерным формам указанных соединений и композиций.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ЧЕРТЕЖЕЙ

[00264] Фигура 1. На фиг. 1 показана относительная активность олигонуклеотидов, индуцирующих пропускание экзона 51 в фибробластах, полученных от DMD пациента-человека, которые характеризуются делецией Δ48-50 (клетки DMD с del48-50). Результат нормировали к случайному WV-942. Используемый анализ Taqman специфически обнаруживает транскрипт DMD с пропущенным экзоном 51.

[00265] Фигура 2. На фиг. 2 показана относительная активность олигонуклеотидов, индуцирующих пропускание экзона 51 в фибробластах, полученных от DMD пациента-человека, которые характеризуются делецией Δ48-50. Результат нормировали к необработанному контролю. Используемый анализ Taqman специфически обнаруживает транскрипт DMD с пропущенным экзоном 51.

[00266] Фигуры 3A-3F. На фиг. 3A-3F показана экспрессия мышечных маркеров дифференцировки относительно необработанных контролей в дифференцированных фибробластах DMD человека с лечением олигонуклеотидами или без него. Использовали анализы Taqman, специфичные для DMD, DES, MYOD1, MYOG, MYH1 и RYR1.

[00267] Фигура 4. Пример временной динамики активации комплемента С3а. Концентрация олигонуклеотида: 330 мкг/мл; 37°С.

[00268] Фигура 5. Пример временной динамики активации комплемента Bb. Концентрация олигонуклеотида: 330 мкг/мл; 37°С.

[00269] Фигура 6. Пример связывания альбумина.

[00270] Фигуры 7А и 7В. Последовательности и химия различных олигонуклеотидов: WV395 и WV884 - WV897. Суффиксы .01 и .02 указывают номера партии. К ним относятся стереочистые (хирально-чистые) олигонуклеотиды или композиции олигонуклеотидов, включая в себя модификации 2'-ОМе.

[00271] Фигуры 8А и 8В. Способность различных олигонуклеотидов индуцировать пропускание экзона 51 дистрофина человека. 8В представляет собой компиляцию данных, включая три или более повторений. Контроли: WV-942, WV-1714 и необработанные; концентрация: 10 мкМ; продолжительность: 4 дня в среде дифференциации; воздействие осуществляли посредством гимнозиса (без трансфекционного реагента); клетки: Del 48-50 [первичные человеческие миобласты от пациента с (делецией экзона дистрофина 48-50), DL 589.2 (деления экзона дистрофина 51-55)].

[00272] Фигуры 9А и 9В. Композиции PS (фосфоротиоатов) и 2'-F на крыльях различных олигонуклеотидов, включая в себя с WV-2095 по WV-2109. С WV-2106 по WV-2109 представляют собой гемимеры.

[00273] Фигуры 10А и 10В. Способность различных олигонуклеотидов индуцировать пропуски экзона 51 дистрофина. На фиг. 10В показаны дополнительные данные для WV-1714. WV-1683, отрицательный контроль в этом эксперименте, нацелен на экзон 23 мыши.

[00274] Фигуры 11А и 11В. Последовательность и химия различных олигонуклеотидов, WV-1108 и с WV-2381 по WV-2395. Они содержат PS (фосфоротиоаты) в крыльях и РО (фосфодиэфиры) в сердцевине.

[00275] Фигура 12. Способность различных олигонуклеотидов индуцировать пропускание экзона 51 дистрофина. Контроли: WV-942 (дрисаперсен, стереослучайный) и необработанные; концентрация: 10 мкМ; продолжительность: 4 дня в среде дифференциации; клетки: Del 48-50; воздействие осуществляли посредством гимнозиса (без трансфекционного реагента).

[00276] Фигуры 13А и 13 В. Последовательности и химия различных олигонуклеотидов, с WV-2366 по WV-2370. Они содержат фосфоротиоаты в конформации Sp в крыльях и РО (фосфодиэфиры) в сердцевине.

[00277] Фигура 14. Способность различных олигонуклеотидов индуцировать пропускание экзона 51 дистрофина. Контроли: WV-942 и необработанные; концентрация: 10 мкМ; продолжительность: 4 дня в среде дифференциации; клетки: Del 48-50; воздействие осуществляли посредством гимнозиса (без трансфекционного реагента).

[00278] Фигура 15. Последовательности и химия различных олигонуклеотидов, которые представляют собой 20-меры или 25-меры, включая в себя с WV-2313 по WV-2320 и с WV-2223 по WV-2230.

[00279] Фигура 16. Расположение последовательностей различных олигонуклеотидов, которые представляют собой 20-меры или 25-меры, включая в себя с WV-2313 по WV-2320 и с WV-2223 по WV-2230, относительно последовательностей дистрофина человека (Н) и мыши (М).

[00280] Фигура 17. Способность различных олигонуклеотидов индуцировать пропускание экзона 51 дистрофина. Контроли: WV-942 и необработанные; концентрация: 10 мкМ; продолжительность: 4 дня в среде дифференциации; клетки: Del 48-50; воздействие осуществляли посредством гимнозиса (без трансфекционного реагента).

[00281] Фигура 18. Пропускание экзона, опосредованное активным соединением, олигонуклеотидом WV-942, доставляемым посредством гимнозиса (без конъюгации с липидом) или конъюгированным с липидом (смотрите таблицу 5).

[00282] Фигура 19. Фармакокинетические данные (PK) in vivo, связанные с доставкой олигонуклеотида WV-942; доставленного посредством гимнозиса (без конъюгации с липидом), или конъюгированного с липидом, в ткани икроножной, сердечной и четырехглавой мышц. Исследованные изделия приведены в таблице 4. Слева направо: WV-942, WV-2588, WV-2581, WV-2582, WV-2584, WV-2585, WV-2586 и WV-2587.

[00283] Фигура 20. Фармакокинетические данные (PK) in vivo, связанные с доставкой WV-942, доставленного посредством гимнозиса (без конъюгации с липидом), или конъюгированного с липидом, в ткани икроножной, сердечной и четырехглавой мышц и мышечной ткани диафрагмы. Слева направо: WV-942, WV-2588, WV-2581, WV-2582, WV-2584, WV-2585, WV-2586 и WV-2587.

[00284] Фигура 21. Стандартные кривые для конъюгатов липидов в разных тканях (четырехглавая мышца и диафрагма).

[00285] Фигура 22. Стандартные кривые для конъюгатов липидов в разных тканях (сердечная и икроножная мышца).

[00286] Фигура 23. Иллюстративные структуры липидов и линкеров для конъюгации с активным соединением. Сокращение: Олиго: иллюстративный олигонуклеотид.

[00287] Фигура 24. На фиг. 24 показана эффективность стереочистых олигонуклеотидов с крыльями 2'-F и сердцевинами РО или Rp в пропускании экзона 51 дистрофина человека в сравнении с WV-942 (дрисаперсен). Концентрация составляла 10 мкМ, воздействие посредством гимнозиса.

[00288] Фигура 25. На фиг. 25 показана эффективность стереочистых олигонуклеотидов в пропускании экзона 51 дистрофина человека в сравнении с WV-942. Представлены данные для двух разных доз, 3 мкМ и 10 мкМ. В левом нижнем углу расположены стереослучайные олигонуклеотиды с различными профилями модификаций 2'-F и 2'-ОМе. В правом нижнем углу находятся стереочистые олигонуклеотиды.

[00289] Фигура 26. На фиг. 26 показана эффективность различных олигонуклеотидов; показаны изменения в разы по сравнению с WV-942. Представлены данные для двух разных доз, 3 мкМ и 10 мкМ.

[00290] Фигуры 27А-27О. На фиг. 27А-27О показаны данные жидкостной хроматографии и масс-спектрометрии для олигонуклеотидов: WV887, WV892, WV896, WV1714, WV2444, WV2445, WV2526, WV2527, WV2528 и WV2530. Суффиксы (01), (02),.01 и.02 указывают номера партий.

[00291] Фигура 28. На фиг. 28 показана иллюстративная эффективность пропускания некоторых предложенных композиций олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью в пропускании экзона 51 дистрофина человека по сравнению с WV-942. Представлены данные для трех разных доз, 1 мкМ, 3 мкМ и 10 мкМ. Эффективность пропускания, как правило, увеличивается с увеличением концентрации. Воздействие осуществляли посредством гимнозиса (без трансфекционного реагента).

[00292] Фигура 29. На фиг. 29 показана иллюстративная эффективность пропускания некоторых предложенных композиций олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью в пропускании экзона 51 дистрофина человека по сравнению с WV-942. Представлены данные для разных доз от 0,3 до 30 мкМ. Эффективность пропускания, как правило, увеличивается с увеличением концентрации. WV-3445 (WV-3473, конъюгированный со стеариновой кислотой посредством РО и линкера С6-амино) и WV-3546 (WV-3473, конъюгированный с турбинаровой кислотой посредством РО и линкера С6-амино), оба из которых содержат конъюгаты олигонуклеотид-липид, продемонстрировали более высокую эффективность. Воздействие осуществляли посредством гимнозиса (без трансфекционного реагента). Эксперимент проводили в трех повторах, показаны усредненные данные.

[00293] Фигура 30. На фиг. 30 показано, что несколько иллюстративных олигонуклеотидов не обладают агонистической активностью hTLR9 в исследуемых условиях. Эксперимент проводили в трех повторах, показаны усредненные данные.

[00294] Фигура 31. На фиг. 31 показано, что различные предложенные олигонуклеотиды могут противодействовать агонистической активности hTLR9 олигонуклеотида ODN2006 (и вызывать антагонизм hTLR9). Как показано, конъюгаты липидов (например, стеариновой кислоты (WV-3545) или турбинаровой кислоты (WV-3546)) и олигонуклеотидов (например, WV-3473 (WV-3545 и WV-3546)) значительно увеличивают антагонистическую активность hTLR9. Концентрацию агонистического олигонуклеотида ODN2006 поддерживали постоянной при 0,3 мкМ. Каждый олигонуклеотид исследовали в уменьшающихся концентрациях: 5, 2,5, 1,25, 0,6, 0,3, 0,15 и 0,075 мкМ (слева направо). Воздействие осуществляли посредством гимнозиса (без трансфекционного реагента). Эксперимент проводили в трех повторах, показаны усредненные данные.

[00295] Фигура 32. На фиг. 32 показано, что различные олигонуклеотиды могут противодействовать агонистической активности hTLR9 олигонуклеотида ODN2006 (и вызывать антагонизм hTLR9). Как показано, конъюгаты липидов (например, стеариновой кислоты (WV-3545) или турбинаровой кислоты (WV-3546)) и олигонуклеотидов (например, WV-3473 (WV-3545 и WV-3546)) значительно увеличивают антагонистическую активность hTLR9. neg: отрицательный контроль (только буфер). ODN2006c: агонистический контроль, в котором последовательность CpG заменяется на GpC. PMO: этеплирсен. Концентрация агонистического олигонуклеотида ODN2006 поддерживалась постоянной при 0,3 мкМ. Каждый олигонуклеотид исследовали в уменьшающихся концентрациях: 5, 2,5, 1,25, 0,6, 0,3, 0,15 и 0,075 мкМ (слева направо). Воздействие осуществляли посредством гимнозиса (без трансфекционного реагента). Эксперимент проводили в трех повторах, показаны усредненные данные.

[00296] Фигура 33. На фиг. 33 показана иллюстративная эффективность пропускания некоторых предложенных композиций олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью в пропускании экзона 51 дистрофина человека по сравнению с WV-942 и PMO (этеплирсен). Эффективность пропускания, как правило, увеличивается с увеличением концентрации. Представлены данные для разных доз от 0,1 мкМ до 10 мкМ. Использовали клетки DMD del48-50. Воздействие осуществляли посредством гимнозиса (без трансфекционного реагента).

[00297] Фигура 34. На фиг. 34 показана иллюстративная эффективность пропускания некоторых предложенных композиций олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью в пропускании экзона 51 дистрофина человека по сравнению с WV-942 и PMO (этеплирсен). Эффективность пропускания, как правило, увеличивается с увеличением концентрации. Представлены данные для трех разных доз, 1 мкМ, 3 мкМ и 10 мкМ. Использовали клетки DMD del48-50. Воздействие осуществляли посредством гимнозиса (без трансфекционного реагента), neg: отрицательный контроль.

[00298] Фигура 35. На фиг. 35 показана иллюстративная эффективность пропускания некоторых предложенных композиций олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью в пропускании экзона 51 дистрофина человека. Эффективность пропускания, как правило, увеличивается с увеличением концентрации. Представлены данные для четырех разных доз, 1 мкМ, 3 мкМ, 10 мкМ и 10 мкМ. Использовали клетки DMD del48-50. Воздействие осуществляли посредством гимнозиса (без трансфекционного реагента).

[00299] Фигура 36. На фиг. 36 показана иллюстративная эффективность пропускания некоторых предложенных композиций олигонуклеотидов в пропускании экзона 51 дистрофина человека по сравнению с WV-942. Представлены данные для дозы 10 мкМ. Воздействие осуществляли посредством гимнозиса (без трансфекционного реагента). Использовали клетки DMD del48-50.

[00300] Фигура 37. На фиг. 37 показана иллюстративная эффективность пропускания некоторых предложенных композиций олигонуклеотидов в пропускании экзона 51 дистрофина человека по сравнению с WV-942. Представлены данные для двух доз, 3 мкМ (правая колонка) и 10 мкМ (левая колонка). Воздействие осуществляли посредством гимнозиса (без трансфекционного реагента). В исследованных условиях конъюгация с липидом увеличивала эффективность пропускания.

[00301] Фигуры 38A-38D. На фиг. 38A-38D показано иллюстративное распределение олигонуклеотидов в различных мышечных тканях: икроножной (фиг. 38А); трехглавой (фиг. 38 В); сердце (фиг. 38С) и диафрагме (фиг. 38D).

ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ НЕКОТОРЫХ ВАРИАНТОВ ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ

[00302] Синтетические олигонуклеотиды обеспечивают подходящие молекулярные инструменты для широкого ряда применений. Например, олигонуклеотиды подходят для терапевтических, диагностических, исследовательских применений и в качестве новых наноматериалов. Использование природных нуклеиновых кислот (например, немодифицированной ДНК или РНК) ограничено, например, их чувствительностью к действию эндо- и экзонуклеаз. Таким образом, для устранения указанных недостатков были разработаны различные синтетические аналоги. Они включают синтетические олигонуклеотиды, содержащие химическую модификацию, например, модификации оснований, модификации сахара, модификации остова и т.д., которые, среди прочего, делают эти молекулы менее восприимчивыми к деградации и улучшают другие свойства олигонуклеотидов. Химические модификации также могут приводить к определенным нежелательным эффектам, таким как повышенная токсичность и т.д. С точки зрения структуры модификации межнуклеотидных фосфатных связей делают указанные группы хиральными, и на определенные свойства олигонуклеотидов могут влиять конфигурации атомов фосфора, которые образуют остов олигонуклеотидов. Например, в исследованиях in vitro было показано, что на свойства антисмысловых нуклеотидов, такие как аффинность связывания, последовательно-специфическое связывание с комплементарной РНК, стабильность к действию нуклеаз, может влиять помимо прочего хиральность остова (например, конфигурации атомов фосфора).

[00303] Помимо всего прочего, настоящее раскрытие охватывает признание того факта, что структурные элементы олигонуклеотидов, такие как последовательность оснований, химические модификации (например, модификации сахара, основания и/или межнуклеотидных связей и их профили) и/или стереохимия (например, стереохимия хиральных центров остова (хиральных межнуклеотидных связей) и/или их профилей) могут оказывать значительное влияние на свойства, например, активность, токсичность, например, что может быть опосредовано характеристиками связывания белка, стабильностью, изменяющими сплайсинг способностями и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотидные свойства могут корректироваться путем оптимизации химических модификаций (модификаций основания, сахара и/или межнуклеотидной связи) и/или стереохимии (профиля хиральных центров остова).

[00304] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что композиции олигонуклеотидов, содержащие олигонуклеотиды с контролируемыми структурными элементами, например, профилями контролируемой химической модификации и/или контролируемой стереохимии остова, обеспечивают неожиданные свойства, включая, но не ограничиваясь ими, описанные в настоящем документе. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции, содержащие олигонуклеотиды, имеющие химические модификации (например, модификации оснований, модификацию сахара, модификации межнуклеотидных связей и т.д.), обладают улучшенными свойствами, такими как улучшенные изменяющие сплайсинг способности, более низкая токсичность или улучшенный профиль связывания с белками и/или улучшенная доставка и т.д. В частности, согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции и способы изменения сплайсинга транскриптов. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции и способы улучшения сплайсинга транскриптов. Согласно некоторым вариантам осуществления измененный сплайсинг транскриптов с помощью предложенных композиций и способов предусматривает производство продуктов, имеющих желаемые и/или улучшенные биологические функции, и/или нокдаун нежелательного продукта, например, путем модификации продуктов сплайсинга, так что нежелательные биологические функции могут быть подавлены или удалены.

[00305] Согласно некоторым вариантам осуществления транскрипт представляет собой пре-мРНК. Согласно некоторым вариантам осуществления продукт сплайсинга представляет собой зрелую РНК. Согласно некоторым вариантам осуществления продукт сплайсинга представляет собой мРНК. Согласно некоторым вариантам осуществления изменение предусматривает пропускание одного или более экзонов. Согласно некоторым вариантам осуществления сплайсинг транскрипта улучшается тем, что пропускание экзонов увеличивает уровни мРНК и белков, которые улучшают полезные активности по сравнению с отсутствием пропускания экзона. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон, вызывающий сдвиг рамки считывания, пропускается. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон, содержащий нежелательную мутацию, пропускается. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон, содержащий преждевременный терминальный кодон, пропускается. Нежелательная мутация может представлять собой мутацию, вызывающую изменения в белковых последовательностях; это также может быть молчащая мутация. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон, содержащий нежелательный SNP, пропускается.

[00306] Согласно некоторым вариантам осуществления сплайсинг транскрипта улучшается тем, что пропускание экзонов снижает уровни мРНК и белков, которые имеют нежелательные активности по сравнению с отсутствием пропускания экзона. Согласно некоторым вариантам осуществления мишень подвергается нокдауну с помощью пропускания экзона, который, посредством пропуска одного или более экзонов, вызывает мутации преждевременных срабатываний стоп-кодонов и/или сдвига рамки считывания.

[00307] Коррекция рамки считывания достигается путем пропускания одного или двух экзонов, фланкирующих делецию, путем пропускания экзонов внутри рамки считывания, содержащих нонсенс мутацию, или путем пропускания дублированных экзонов.

[00308] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции и способы сокращения некоторых нежелательных повторов, таких как повтор CAG (смотрите, например, Evers, et al.. Targeting several CAG expansion diseases by a single antisense oligonucleotide, PLoS One. 2011;6(9):e24308. doi: 10.1371/journal.pone.0024308; Mulders, et al., Triplet-repeat oligonucleotide-mediated reversal of RNA toxicity in myotonic dystrophy, Proc Nati Acad Sci USA. 2009 Aug 18;106(33): 13915-20; etc.) путем изменения сплайсинга, например, пропускания экзонов. Иллюстративные мишени включают, но не ограничиваются ими, НТТ, ATXN3, DMPK, CNBP, AR, C90RF72 (мишень для семейной лобно-височной деменции и бокового амиотрофического склероза) и те, которые перечислены ниже:

[00309] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды в предложенных композициях, например, олигонуклеотиды первого множества, содержат модификации оснований, модификации сахара и/или модификации межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат модификации оснований и модификации сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат модификации оснований и модификации межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат модификации сахара и межнуклеотидные модификации. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции содержат модификации оснований, модификации сахара и модификации межнуклеотидных связей. Иллюстративные химические модификации, такие как модификации оснований, модификации сахара, модификации межнуклеотидных связей и т.д., широко известны в настоящей области техники, включая, но не ограничиваясь ими, описанные в настоящем документе. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированное основание представляет собой замещенные А, Т, С, G или U. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация сахара представляет собой 2'-модификацию. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой модификацию 2-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-OR¹, где R¹ представляет собой необязательно замещенный алкил. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-МОЕ. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный фрагмент сахара представляет собой мостиковое бициклическое или полициклическое кольцо. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный фрагмент сахара представляет собой мостиковое бициклическое или полициклическое кольцо, имеющее 5-20 кольцевых атомов, причем один или более кольцевых атомов представляют собой необязательно и независимо гетероатомы. Иллюстративные кольцевые структуры широко известны в настоящей области техники, такие как обнаруженные в BNA, LNA и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат как одну, так и несколько модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды, содержащие как модифицированную межнуклеотидную связь, так и природную фосфатную связь и их композиции, обеспечивают улучшенные свойства, например, активность и токсичность и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой хиральную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой замещенную фосфоротиоатную связь.

[00310] Кроме всего прочего, настоящее изобретение охватывает признание того, что препараты стереослучайных олигонуклеотидов содержат множество различных химических объектов, которые отличаются друг от друга, например, по стереохимической структуре отдельных хиральных центров остова в олигонуклеотидной цепи. Без контроля стереохимии хиральных центров остова препараты стереослучайных олигонуклеотидов обеспечивают неконтролируемые композиции, содержащие неопределенные уровни олигонуклеотидных стереоизомеров. Несмотря на то, что эти стереоизомеры могут характеризоваться одной и той же последовательностью оснований, они представляют собой различные химические объекты по меньшей мере из-за их различной стереохимии остова, и они могут характеризоваться, как показано в настоящем документе, различными свойствами, например, активностями, токсичностями и т.д. Помимо всего прочего, настоящее изобретение предусматривает новые композиции, которые представляют собой или содержат конкретные стереоизомеры представляющих интерес олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления конкретный стереоизомер может быть определен, например, посредством его последовательности оснований, его длины, профиля связей остова и профиля хиральных центров остова. Как понятно в данной области техники, согласно некоторым вариантам осуществления последовательность оснований может относиться к статусу идентичности и/или модификации нуклеозидных остатков (например, компонентов сахара и/или оснований по отношению к стандартным природным нуклеотидам, таким как аденин, цитозин, гуанозин, тимин и урацил) в олигонуклеотиде и/или характеру гибридизации (т.е. способности гибридизоваться с конкретными комплементарными остатками) таких остатков. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды в предложенных композициях содержат модификации сахара, например, 2'-модификации, например, в области крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды в предложенных композициях содержат область в середине, например, области сердцевины, которая не содержит модификаций сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предусмотрена композиция олигонуклеотидов, содержащая предварительно определенный уровень олигонуклеотидов отдельного типа олигонуклеотидов, которые являются химически идентичными, например, они характеризуются одной и той же последовательностью оснований, одним и тем же профилем нуклеозидных модификаций (модификаций сахара и оснований, если таковые имеются), одним и тем же профилем хиральных центров остова и одним и тем же профилем модификаций фосфора остова. Настоящее раскрытие демонстрирует, среди прочего, что отдельные стереоизомеры конкретного олигонуклеотида могут демонстрировать различную стабильность и/или активность (например, функциональные и/или токсические свойства) друг от друга. Согласно некоторым вариантам осуществления соответствующие улучшения, достигаемые посредством включения и/или локализации конкретных хиральных структур в олигонуклеотиде, могут быть сопоставимы или даже лучше, чем те, которые достигаются посредством использования конкретных связей остова, модификаций остатков и т.д. (например, путем использования определенных типов модифицированных фосфатов [например, фосфоротиоата, замещенного фосфоротиоата и т.д.], модификаций сахара [например, 2'-модификаций и т.д.] и/или модификаций оснований [например, метилирования и т.д.]. Среди прочего, настоящее раскрытие признает, что согласно некоторым вариантам осуществления свойства (например, активность, токсичность и т.д.) олигонуклеотида могут быть скорректированы путем оптимизации его профиля хиральных центров остова, необязательно в сочетании с корректировкой/оптимизацией одной или более других особенностей (например, профиль связей, профиль модификации нуклеозидов и т.д.) олигонуклеотида. Как иллюстрируется различными примерами в настоящем описании, предложенные композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью могут демонстрировать улучшенные свойства, такие как более низкая токсичность, улучшенный профиль связывания белка, улучшенная доставка и т.д.

[00311] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат повышенные уровни одного или более изотопов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой меченные, например, одним или более изотопами одного или более элементов, например, водорода, углерода, азота и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды в предложенных композициях, например, олигонуклеотиды первого множества, содержат модификации оснований, модификации сахара и/или модификации межнуклеотидных связей, причем олигонуклеотиды содержат обогащенный уровень дейтерия. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой меченные дейтерием (заменяющим -¹Н на -²Н) в одном или более положениях. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более ¹H олигонуклеотида или любого фрагмента, конъюгированного с олигонуклеотидом (например, нацеливающего фрагмента, липида и т.д.), замещают на ²H. Такие олигонуклеотиды могут быть использованы в любой композиции или способе, описанном в настоящем документе.

[00312] Согласно некоторым вариантам осуществления свойства олигонуклеотидов можно корректировать путем оптимизации стереохимии (профиль хиральных центров остова) и химических модификаций (модификации основания, сахара и/или межнуклеотидной связи). Среди прочего, настоящее раскрытие демонстрирует, что стереохимия может дополнительно улучшать свойства олигонуклеотидов, содержащих химические модификации. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов, в которых олигонуклеотиды содержат модификации нуклеозидов, хиральные межнуклеотидные связи и природные фосфатные связи. Например, WV-1092 (mG*SmGmCmAmC*SA*SA*SG*SG*SG*SC*SA*SC*RA*SG*SmAmCmUmU*SmC) содержит модификации 2'-ОМе, фосфатные и фосфоротиоатные связи в областях 5'- и 3'-крыльев и фосфоротиоатные связи в своей области сердцевины.

[00313] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов, которые неожиданно значительно улучшают свойства олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции олигонуклеотидов обеспечивают неожиданно низкую токсичность. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции олигонуклеотидов обеспечивают неожиданно улучшенный профиль связывания с белком. Согласно некоторым вариантам осуществления композиции олигонуклеотидов обеспечивают неожиданно улучшенную доставку. Согласно некоторым вариантам осуществления определенное улучшение свойств, такое как более низкая токсичность, улучшенный профиль связывания с белком и/или улучшенная доставка и т.д., достигается без ущерба для других свойств, например, активности, специфичности и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции обеспечивают более низкую токсичность, улучшенный профиль связывания с белком и/или улучшенную доставку, а также улучшенную активность, стабильность и/или специфичность (например, специфичность к мишени, специфичность к сайту расщепления и т.д.). Иллюстративные улучшенные активности (например, повышенные скорости расщепления, повышенная специфичность к мишени, специфичность к сайту расщепления и т.д.) включают, но не ограничиваются ими, описанные в WO/2014/012081 и WO/2015/107425.

[00314] Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова обеспечивает повышенную стабильность. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова обеспечивает неожиданно повышенную активность. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова обеспечивает повышенную стабильность и активность. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова обеспечивает удивительно низкую токсичность. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова обеспечивает неожиданно низкий иммунный ответ. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова обеспечивает неожиданно низкую активацию комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова обеспечивает неожиданно низкую активацию комплемента через альтернативный путь. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова обеспечивает удивительно улучшенный профиль связывания с белком. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова обеспечивает неожиданно повышенное связывание с некоторыми белками. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова обеспечивает неожиданно улучшенную доставку. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова содержит или представляет собой (Sp)m(Rp)n, (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m или (Sp)t(Rp)n(Sp)m. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова содержит или представляет собой (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m или (Sp)t(Rp)n(Sp)m, где m>2. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова содержит или представляет собой (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m или (Sp)t(Rp)n(Sp)m, где n равно 1, t>1 и m>2. Согласно некоторым вариантам осуществления m>3. Согласно некоторым вариантам осуществления m>4.

[00315] Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова содержит одну или более ахиральных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие признает тот факт, что такие химические модификации, как модификации нуклеозидов и межнуклеотидных связей, могут обеспечить улучшенные свойства. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что комбинации химических модификаций и стереохимии могут обеспечить неожиданные, значительно улучшенные свойства (например, биоактивность, селективность и т.д.). Согласно некоторым вариантам осуществления химические комбинации, такие как модификации сахаров, оснований и/или межнуклеотидных связей, объединены с профилями стереохимии, например, (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m или (Sp)t(Rp)n(Sp)m, для получения олигонуклеотидов и их композиций с удивительно улучшенными свойствами. Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренная композиция олигонуклеотидов представляет собой композицию с контролируемой хиральностью и содержит комбинацию 2'-модификации одного или более фрагментов сахара, одной или более природных фосфатных связей, одной или более фосфоротиоатных связей и профиля стереохимии (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m или (Sp)t(Rp)n(Sp)m, где m>2. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 1, t>1 и m>2. Согласно некоторым вариантам осуществления m>3. Согласно некоторым вариантам осуществления m>4. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова содержит или представляет собой (Rp)n(Sp)m, (Sp)t(Rp)n, (Np)t(Rp)n(Sp)m, (Sp)t(Sp)m или (Sp)t(Rp)n(Sp)m. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова содержит или представляет собой (Rp)n(Sp)m, (Sp)t(Rp)n, (Np)t(Rp)n(Sp)m или (Sp)t(Rp)n(Sp)m, и олигонуклеотиды содержат одну или более 2'-модификаций, как описано в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова содержит или представляет собой (Rp)n(Sp)m, (Sp)t(Rp)n, (Np)t(Rp)n(Sp)m или (Sp)t(Rp)n(Sp)m, и олигонуклеотиды содержат одну или более модификаций 2'-F, как описано в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова содержит или представляет собой (Rp)n(Sp)m, (Sp)t(Rp)n, (Np)t(Rp)n(Sp)m или (Sp)t(Rp)n(Sp)m, и олигонуклеотиды содержат одну или более модификаций 2'-OR, как описано в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова содержит или представляет собой (Rp)n(Sp)m. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова содержит или представляет собой (Sp)t(Rp)n. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова содержит или представляет собой (Np)t(Rp)n(Sp)m. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова содержит или представляет собой (Sp)t(Sp)m, необязательно с n ахиральными фосфатными диэфирными межнуклеотидными связями и/или стереослучайными (с неконтролируемой хиральностью) хиральными межнуклеотидными связями между частью, содержащей (Sp)t, и частью, содержащей (Sp)m. Согласно некоторым вариантам осуществления между ними существуют n ахиральных фосфатных диэфирных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления между ними существует n стереослучайных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хиральных центров остова содержит или представляет собой (Sp)t(Rp)n(Sp)m. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из t и m независимо больше чем 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из t и m независимо больше чем 1. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из t и m независимо больше чем 2. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из t и m независимо больше чем 2. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из t и m независимо больше чем 3. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из t и m независимо больше чем 4. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из t и m независимо больше чем 5. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из t и m независимо больше чем 6. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из t и m независимо больше чем 7. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из t и m независимо больше чем 8. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из t и m независимо больше чем 9. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из t и m независимо больше чем 10. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из t и m независимо больше чем 11. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из t и m независимо больше чем 12. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из t и m независимо больше чем 13. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из t и m независимо больше чем 14. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из t и m независимо больше чем 15. Согласно некоторым вариантам осуществления t больше чем 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20. Согласно некоторым вариантам осуществления t больше чем 1. Согласно некоторым вариантам осуществления t больше чем 2. Согласно некоторым вариантам осуществления t больше чем 2. Согласно некоторым вариантам осуществления t больше чем 3. Согласно некоторым вариантам осуществления t больше чем 4. Согласно некоторым вариантам осуществления t больше чем 5. Согласно некоторым вариантам осуществления t больше чем 6. Согласно некоторым вариантам осуществления t больше чем 7. Согласно некоторым вариантам осуществления t больше чем 8. Согласно некоторым вариантам осуществления t больше чем 9. Согласно некоторым вариантам осуществления t больше чем 10. Согласно некоторым вариантам осуществления t больше чем 11. Согласно некоторым вариантам осуществления t больше чем 12. Согласно некоторым вариантам осуществления t больше чем 13. Согласно некоторым вариантам осуществления t больше чем 14. Согласно некоторым вариантам осуществления t больше чем 15. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 1. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 2. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 2. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 3. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 4. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 5. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 6. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 7. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 8. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 9. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 10. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 11. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 12. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 13. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 14. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 15. Согласно некоторым вариантам осуществления m больше чем 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20. Согласно некоторым вариантам осуществления m больше чем 1. Согласно некоторым вариантам осуществления m больше чем 2. Согласно некоторым вариантам осуществления m больше чем 2. Согласно некоторым вариантам осуществления m больше чем 3. Согласно некоторым вариантам осуществления m больше чем 4. Согласно некоторым вариантам осуществления m больше чем 5. Согласно некоторым вариантам осуществления m больше чем 6. Согласно некоторым вариантам осуществления m больше чем 7. Согласно некоторым вариантам осуществления m больше чем 8. Согласно некоторым вариантам осуществления m больше чем 9. Согласно некоторым вариантам осуществления m больше чем 10. Согласно некоторым вариантам осуществления m больше чем 11. Согласно некоторым вариантам осуществления m больше чем 12. Согласно некоторым вариантам осуществления m больше чем 13. Согласно некоторым вариантам осуществления m больше чем 14. Согласно некоторым вариантам осуществления m больше чем 15. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 1. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 2. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 3. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 4. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 5. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 6. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 7. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 8. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 9. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 10. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 11. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 12. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 13. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 14. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 15. Согласно некоторым вариантам осуществления t=m. Согласно некоторым вариантам осуществления n больше чем 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20. Согласно некоторым вариантам осуществления n больше чем 1. Согласно некоторым вариантам осуществления n больше чем 2. Согласно некоторым вариантам осуществления n больше чем 2. Согласно некоторым вариантам осуществления n больше чем 3. Согласно некоторым вариантам осуществления n больше чем 4. Согласно некоторым вариантам осуществления n больше чем 5. Согласно некоторым вариантам осуществления n больше чем 6. Согласно некоторым вариантам осуществления n больше чем 7. Согласно некоторым вариантам осуществления n больше чем 8. Согласно некоторым вариантам осуществления n больше чем 9. Согласно некоторым вариантам осуществления n больше чем 10. Согласно некоторым вариантам осуществления n больше чем 11. Согласно некоторым вариантам осуществления n больше чем 12. Согласно некоторым вариантам осуществления n больше чем 13. Согласно некоторым вариантам осуществления n больше чем 14. Согласно некоторым вариантам осуществления n больше чем 15. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 1. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 2. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 3. В Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 4. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 5. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 6. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 7. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 8. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 9. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 10. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 11. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 12. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 13. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 14. Согласно некоторым вариантам осуществления n составляет 15.

[00316] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова содержит где О представляет собой нехиральную межнуклеотидную связь и S представляет собой хиральную межнуклеотидную связь конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления нехиральный центр представляет собой фосфодиэфирную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный центр в конфигурации Sp представляет собой фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковый профиль хиральных центров остова выбирают из:

где О представляет собой нехиральную межнуклеотидную связь и S представляет собой хиралыгую межнуклеотидную связь конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления нехиральный центр представляет собой фосфодиэфирную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный центр в конфигурации Sp представляет собой фосфоротиоатную связь.

[00317] Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область предложенных олигонуклеотидов, например 5'-крыла, содержит стереохимический профиль S, SS, SSS, SSSS, SSSSS, SSSSSS или SSSSSS. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSS. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSS. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSS. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSSS. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSSSS. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый S представляет собой фосфоротиоатную межнуклеотидную связь конфигурации Sp.Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область предложенных олигонуклеотидов, например 5'-крыла, содержит стереохимический профиль S, SS, SSS, SSSS, SSSSS, SSSSSS или SSSSSS, где первый S представляет собой первую (5'-концевую) межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSSSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый S представляет собой фосфоротиоатную межнуклеотидную связь конформации Sp.Согласно некоторым вариантам осуществления одно или более нуклеотидных звеньев, содержащих межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой области, независимо представляют собой -F. Согласно некоторым вариантам осуществления каждое нуклеотидное звено, содержащее межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой области, независимо содержит -F. Согласно некоторым вариантам осуществления одно или более нуклеотидных звеньев, содержащих межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой области, независимо содержат модификацию сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждое нуклеотидное звено, содержащее межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой области, независимо содержит модификацию сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая 2'-модификация является одинаковой. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация сахара представляет собой 2'-модификацию. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область предложенных олигонуклеотидов, например 3'-крыла, содержит стереохимический профиль S, SS, SSS, SSSS, SSSSS, SSSSSS или SSSSSS. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSS. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSS. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSS. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSSS. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSSSS. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый S представляет собой фосфоротиоатную межнуклеотидную связь конфигурации Sp.Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область предложенных олигонуклеотидов, например 3'-крыла, содержит стереохимический профиль S, SS, SSS, SSSS, SSSSS, SSSSSS или SSSSSS, где последний S представляет собой последнюю (3'-концевую) межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSS, где последний S представляет собой последнюю межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSS, где последний S представляет собой последнюю межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSS, где последний S представляет собой последнюю межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSSS, где последний S представляет собой последнюю межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSSSS, где последний S представляет собой последнюю межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый S представляет собой фосфоротиоатную межнуклеотидную связь конфигурации Sp.Согласно некоторым вариантам осуществления одно или более нуклеотидных звеньев, содержащих межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 3'-концевой области, независимо содержат -F. Согласно некоторым вариантам осуществления каждое нуклеотидное звено, содержащее межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 3'-концевой области, независимо содержит -F. Согласно некоторым вариантам осуществления одно или более нуклеотидных звеньев, содержащих межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 3'-концевой области, независимо содержат модификацию сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждое нуклеотидное звено, содержащее межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 3'-концевой области, независимо содержит модификацию сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая 2'-модификация является одинаковой. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация сахара представляет собой 2'-модификацию. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат как 5'-концевую область, например 5'-крыло, так и 3'-концевую область, например 3'-концевое крыло, как описано в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SS, где одно или более нуклеотидных звеньев, содержащих межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или 3'-концевой области, содержит -F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SS, где одно или более нуклеотидных звеньев, содержащих межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или 3'-концевой области, содержит модификацию сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SS, где каждое нуклеотидное звено, содержащее межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или 3'-концевой области, содержит -F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SS, где каждое нуклеотидное звено, содержащее межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или 3'-концевой области, содержит модификацию сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSS, где одно или более нуклеотидных звеньев, содержащих межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или 3'-концевой области, содержит -F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSS, где одно или более нуклеотидных звеньев, содержащих межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или 3'-концевой области, содержит модификацию сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSS, где каждое нуклеотидное звено, содержащее межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или 3'-концевой области, содержит -F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSS, где каждое нуклеотидное звено, содержащее межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или З'-концевой области, содержит модификацию сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSS, где одно или более нуклеотидных звеньев, содержащих межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или 3'-концевой области, содержит -F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSS, где одно или более нуклеотидных звеньев, содержащих межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или 3'-концевой области, содержит модификацию сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSS, где каждое нуклеотидное звено, содержащее межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5 '-концевой или 3'-концевой области, содержит -F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSS, где каждое нуклеотидное звено, содержащее межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или 3'-концевой области, содержит модификацию сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSS, где одно или более нуклеотидных звеньев, содержащих межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или 3'-концевой области, содержит -F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSS, где одно или более нуклеотидных звеньев, содержащих межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или 3'-концевой области, содержит модификацию сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSS, где каждое нуклеотидное звено, содержащее межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или 3'-концевой области, содержит -F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSS, где каждое нуклеотидное звено, содержащее межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или 3'-концевой области, содержит модификацию сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSSSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSSSS, где одно или более нуклеотидных звеньев, содержащих межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или 3'-концевой области, содержит -F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSSSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSSSS, где одно или более нуклеотидных звеньев, содержащих межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или 3'-концевой области, содержит модификацию сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSSSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSSSS, где каждое нуклеотидное звено, содержащее межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или 3'-концевой области, содержит -F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSSSS, где первый S представляет собой первую межнуклеотидную связь предложенного олигонуклеотида, 3'-концевая область содержит стереохимический профиль SSSSSSS, где каждое нуклеотидное звено, содержащее межнуклеотидную связь конфигурации Sp в 5'-концевой или 3'-концевой области, содержит модификацию сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды дополнительно содержат среднюю область между 5'-концевыми и 3'-концевыми областями, например, область сердцевины, которая содержит одну или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды дополнительно содержат среднюю область между 5'-концевыми и 3'-концевыми областями, например, область сердцевины, которая содержит одну или более природных фосфатных связей и одну или более межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления средняя область содержит один или более фрагментов сахара, причем каждый фрагмент сахара независимо содержит модификацию 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления средняя область содержит один или более фрагментов сахара, не содержащих модификацию 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления средняя область содержит одну или более межнуклеотидных связей конфигурации Sp.Согласно некоторым вариантам осуществления средняя область содержит одну или более межнуклеотидных связей конфигурации Sp и одну или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления средняя область содержит одну или более межнуклеотидных связей конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления средняя область содержит одну или более межнуклеотидных связей конфигурации Rp и одну или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления средняя область содержит одну или более межнуклеотидных связей конфигурации Rp и одну или более межнуклеотидных связей конфигурации Sp.

[00318] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат одно или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области, например 5'-крыло. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат два или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат три или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат четыре или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат пять или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат шесть или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат семь или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат восемь или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат девять или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат десять или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат два или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат три или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат четыре или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат пять или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат шесть или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат семь или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат восемь или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат девять или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат десять или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат два или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области, причем первое нуклеотидное звено последовательных нуклеотидных звеньев представляет собой первое нуклеотидное звено олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат три или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области, причем первое нуклеотидное звено последовательных нуклеотидных звеньев представляет собой первое нуклеотидное звено олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат четыре или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области, причем первое нуклеотидное звено последовательных нуклеотидных звеньев представляет собой первое нуклеотидное звено олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат пять или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области, причем первое нуклеотидное звено последовательных нуклеотидных звеньев представляет собой первое нуклеотидное звено олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат шесть или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области, причем первое нуклеотидное звено последовательных нуклеотидных звеньев представляет собой первое нуклеотидное звено олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат семь или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области, причем первое нуклеотидное звено последовательных нуклеотидных звеньев представляет собой первое нуклеотидное звено олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат восемь или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области, причем первое нуклеотидное звено последовательных нуклеотидных звеньев представляет собой первое нуклеотидное звено олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат девять или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области, причем первое нуклеотидное звено последовательных нуклеотидных звеньев представляет собой первое нуклеотидное звено олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат десять или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 5'-концевой области, причем первое нуклеотидное звено последовательных нуклеотидных звеньев представляет собой первое нуклеотидное звено олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат одно или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области, например, 3'-крыло. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат два или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат три или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат четыре или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат пять или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат шесть или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат семь или более нуклеотидных звеньев, содержащих 3'-крыло. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат два или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат девять или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат десять или более нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат два или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат три или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат четыре или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат пять или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат шесть или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат семь или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат восемь или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат девять или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат десять или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат два или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области, причем последнее нуклеотидное звено последовательных нуклеотидных звеньев представляет собой последнее нуклеотидное звено олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат три или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области, причем последнее нуклеотидное звено последовательных нуклеотидных звеньев представляет собой последнее нуклеотидное звено олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат четыре или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области, причем последнее нуклеотидное звено последовательных нуклеотидных звеньев представляет собой последнее нуклеотидное звено олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат пять или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области, причем последнее нуклеотидное звено последовательных нуклеотидных звеньев представляет собой последнее нуклеотидное звено олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат шесть или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области, причем последнее нуклеотидное звено последовательных нуклеотидных звеньев представляет собой последнее нуклеотидное звено олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат семь или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области, причем последнее нуклеотидное звено последовательных нуклеотидных звеньев представляет собой последнее нуклеотидное звено олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат восемь или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области, причем последнее нуклеотидное звено последовательных нуклеотидных звеньев представляет собой последнее нуклеотидное звено олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат девять или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области, причем последнее нуклеотидное звено последовательных нуклеотидных звеньев представляет собой последнее нуклеотидное звено олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат десять или более последовательных нуклеотидных звеньев, содержащих -F в 3'-концевой области, причем последнее нуклеотидное звено последовательных нуклеотидных звеньев представляет собой последнее нуклеотидное звено олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеотидное звено, содержащее -F, содержит фрагмент сахара, содержащий -F. Согласно некоторым вариантам осуществления каждое нуклеотидное звено, содержащее -F, содержит фрагмент сахара, содержащий -F. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеотидное звено, содержащее -F, содержит модифицированный фрагмент сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления каждое нуклеотидное звено, содержащее -F, содержит модифицированный фрагмент сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат как 5'-концевые, так и 3'-концевые области, как описано в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат одну или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат одну или более хиральных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат одну или более хиральных модифицированных межнуклеотидных связей с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат одну или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой фосфоротиоатную связь.

[00319] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды могут связываться с транскриптом и изменять профиль сплайсинга транскрипта. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды обеспечивают экзоновое пропускание экзона с эффективностью выше, чем сопоставимый олигонуклеотид, в одном или более подходящих условиях, например, как описано на фиг. 35, 36, 37, 38 и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренная эффективность пропускания составляет по меньшей мере 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 100%, 110%, 120%, 130%, 140%, 150% 160%, 170%, 180%, 190% и более или больше чем в 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 30, 40, 50 или более раз, чем у сопоставимого олигонуклеотида в одном или более подходящих условиях, например, как описано на фиг.35, 36, 37, 38 и т.д.

[00320] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что модификации 2'-F, среди прочего, могут улучшить эффективность пропускания экзонов. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что межнуклеотидные связи конфигурации Sp, среди прочего, на 5'- и 3'-концах могут улучшить стабильность олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что, среди прочего, природные фосфатные связи и/или межнуклеотидные связи конфигурации Rp могут улучшать удаление олигонуклеотидов из системы. Как сможет оценить специалист в настоящей области техники, различные анализы, известные в настоящей области техники, могут быть использованы для оценки таких свойств в соответствии с настоящим изобретением.

[00321] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований множества олигонуклеотидов содержит или состоит из последовательности оснований а множество олигонуклеотидов имеет одинаковый профиль хиральных центров остова, содержащих

где О представляет собой нехиральную межнуклеотидную связь, a S представляет собой межнуклеотидную связь конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления множество олигонуклеотидов имеют одинаковую последовательность оснований, содержащую или состоящую из последовательности оснований или 15 смежных оснований составляют в длину 40 оснований или менее, характеризуются одинаковым профилем хиральных центров остова, содержащих SSSS, причем S представляет собой фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp, и дополнительно содержат одно или более из следующего: фосфоротиоат в конфигурации Rp, фосфодиэфир или фосфородитиоат. Согласно некоторым вариантам осуществления множество олигонуклеотидов имеют одинаковую последовательность оснований олигонуклеотида, содержащую или состоящую из последовательности оснований или 15 смежных оснований составляют в длину 40 оснований или менее, характеризуются одинаковым профилем хиральных центров остова, содержащих последовательность SSSS, причем S представляет собой фосфоротиоат в конфигурации Sp, и дополнительно содержат одно или более из следующего: фосфоротиоат в конфигурации Rp, фосфодиэфир или фосфородитиоат. Согласно некоторым вариантам осуществления множество олигонуклеотидов имеют одинаковую последовательность оснований олигонуклеотида, содержащую или состоящую из последовательности оснований или 15 смежных оснований составляют в длину 40 оснований или менее, характеризуются одинаковым профилем хиральных центров остова, содержащих 4 фосфоротиоата в конфигурации Sp, причем 4 фосфоротиоата в конфигурации Sp могут быть смежными или несмежными и дополнительно содержать одно или более из следующего: фосфоротиоат в конфигурации Rp, фосфодиэфир или фосфородитиоат. Согласно некоторым вариантам осуществления множество олигонуклеотидов имеют одинаковую последовательность оснований олигонуклеотида, содержащую или состоящую из последовательности оснований или 15 смежных оснований составляют в длину 40 оснований или менее, характеризуются одинаковым профилем хиральных центров остова, содержащих 5 фосфоротиоатов в конфигурации Sp, причем 5 фосфоротиоатов в конфигурации Sp могут быть смежными или несмежными и дополнительно содержать 2 или более из следующего: фосфоротиоат в конфигурации Rp, фосфодиэфир или фосфородитиоат.

[00322] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат один или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат один или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 2 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 3 или более модифицированных фрагмента сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 4 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 5 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 6 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 7 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 8 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 9 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 10 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 11 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 12 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 13 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 14 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 15 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 15 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 16 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 17 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 18 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 19 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 20 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 21 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 22 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 23 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 24 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 25 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 30 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-МОЕ. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой модификацию сахара LNA. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация сахара независимо представляет собой 2'-модификацию. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация сахара представляет собой независимо 2'-OR¹ или 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация сахара представляет собой независимо 2'-OR¹ или 2'-F, причем R¹ представляет собой необязательно замещенный C_1-6 алкил. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация сахара независимо представляет собой 2'-OR¹ или 2'-F, причем по меньшей мере одна представляет собой 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация сахара представляет собой независимо 2'-OR¹ или 2'-F, причем R¹ представляет собой необязательно замещенный C_1-6 алкил и причем по меньшей мере одна представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация сахара представляет собой независимо 2'-OR¹ или 2'-F, причем по меньшей мере одна представляет собой 2'-F и по меньшей мере одна представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация сахара представляет собой независимо 2'-OR¹ или 2'-F, причем R¹ представляет собой необязательно замещенный C_1-6 алкил и причем по меньшей мере одна представляет собой 2'-F и по меньшей мере одна представляет собой 2'-OR¹.

[00323] Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированы 5% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 10% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 15% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 20% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 25% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 30% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 35% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 40% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 45% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 50% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 55% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 60% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 65% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 70% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 75% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 80% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 85% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 90% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 95% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицирован каждый фрагмент сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-МОЕ. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой модификацию сахара LNA. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация сахара независимо представляет собой 2'-модификацию. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация сахара представляет собой независимо 2'-OR¹ или 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация сахара представляет собой независимо 2'-OR¹ или 2'-F, причем R¹ представляет собой необязательно замещенный C_1-6 алкил. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация сахара независимо представляет собой 2'-OR¹ или 2'-F, причем по меньшей мере одна представляет собой 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация сахара представляет собой независимо 2'-OR¹ или 2'-F, причем R¹ представляет собой необязательно замещенный C_1-6 алкил и причем по меньшей мере одна представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация сахара представляет собой независимо 2'-OR¹ или 2'-F, причем по меньшей мере одна представляет собой 2'-F и по меньшей мере одна представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модификация сахара представляет собой независимо 2'-OR¹ или 2'-F, причем R¹ представляет собой необязательно замещенный C_1-6 алкил и причем по меньшей мере одна представляет собой 2'-F и по меньшей мере одна представляет собой 2'-OR¹.

[00324] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат один или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат два или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат три или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат четыре или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат пять или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат шесть или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат семь или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат восемь или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат девять или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат десять или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 11 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 12 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 13 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 14 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 15 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 16 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 17 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 18 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 19 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 20 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 21 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 22 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 23 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 24 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 25 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 30 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 35 или более 2'-F.

[00325] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат один 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат два 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат три 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат четыре 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат пять 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат шесть 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат семь 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат восемь 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат девять 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат десять 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 11 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 12 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 13 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 14 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 15 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 16 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 17 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 18 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 19 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 20 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 21 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 22 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 23 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 24 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 25 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 30 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 35 2'-F.

[00326] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат один или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат два или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат три или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат четыре или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат пять или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат шесть или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат семь или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат восемь или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат девять или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат десять или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 11 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 12 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 13 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 14 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 15 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 16 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 17 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 18 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 19 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 20 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 21 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 22 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 23 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 24 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 25 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 30 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 35 или более последовательных 2'-F.

[00327] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат один последовательный 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат два последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат три последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат четыре последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат пять последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат шесть последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат семь последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат восемь последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат девять последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат десять последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 11 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 12 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 13 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 14 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 15 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 16 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 17 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 18 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 19 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 20 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 21 последовательный 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 22 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 23 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 24 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 25 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 30 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 35 последовательных 2'-F.

[00328] Согласно некоторым вариантам осуществления после нуклеозида, содержащего 2'-модификацию, следует модифицированная межнуклеотидная связь. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеозиду, содержащему 2'-модификацию, предшествует модифицированная межнуклеотидная связь. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой хиральную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой фосфоротиоат. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная межнуклеотидная связь представляет собой конфигурацию Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления за нуклеозидом, содержащим 2'-модификацию, следует хиральная межнуклеотидная связь в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления за нуклеозидом, содержащим 2'-F, следует хиральная межнуклеотидная связь в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеозиду, содержащему 2'-модификацию, предшествует хиральная межнуклеотидная связь в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеозиду, содержащему 2'-F, предшествует хиральная межнуклеотидная связь в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная межнуклеотидная связь представляет собой конфигурацию Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления за нуклеозидом, содержащим 2'-модификацию, следует хиральная межнуклеотидная связь в конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления за нуклеозидом, содержащим 2'-F, следует хиральная межнуклеотидная связь в конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеозиду, содержащему 2'-модификацию, предшествует хиральная межнуклеотидная связь в конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеозиду, содержащему 2'-F, предшествует хиральная межнуклеотидная связь в конфигурации Rp.

[00329] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат чередующиеся модифицированные 2'-F фрагменты сахара и модифицированные 2'-OR¹ фрагменты сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат чередующиеся модифицированные 2'-F фрагменты сахара и модифицированные 2'-ОМе фрагменты сахара, например, [(2'-F)(2'-OMe)]x, [(2'-OMe)(2'-F)]x и т.д., где х составляет от 1 до 50. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат по меньшей мере две пары чередующихся модификаций 2'-F и 2'-ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат чередующиеся фосфодиэфирные и фосфор о тиоатные межнуклеотидные связи, например, [(PO)(PS)]x, [(PS)(PO)]x и т.д., где х составляет от 1 до 50. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат по меньшей мере две пары чередующихся фосфодиэфирных и фосфоротиоатных межнуклеотидных связей.

[00330] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат одну или более природных фосфатных связей и одну или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[00331] Предложенные олигонуклеотиды могут содержать различное число природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды не содержат природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат одну природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 2 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 3 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 4 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 5 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 6 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 7 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 8 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 9 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 10 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 15 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 20 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 25 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 30 или более природных фосфатных связей.

[00332] Согласно некоторым вариантам осуществления 5% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 10% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 15% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 20% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 25% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 30% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 35% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 40% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 45% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 50% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 55% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 60% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 65% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 70% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 75% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 80% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 85% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 90% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 95% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь области крыла представляет собой природную фосфатную связь.

[00333] Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 2 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 3 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 4 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 5 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 6 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 7 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 8 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 9 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 10 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 11 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 12 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 13 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 14 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 15 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 2 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 3 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 4 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 5 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 6 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 7 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 8 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 9 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 11 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 12 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 13 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 14 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 15 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь в области сердцевины независимо представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь.

[00334] Согласно некоторым вариантам осуществления 5% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 10% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 15% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 20% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 25% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 30% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 35% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 40% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 45% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 50% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 55% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 60% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 65% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 70% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 75% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 80% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 85% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 90% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 95% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь области сердцевины представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь.

[00335] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества характеризуются одинаковой последовательностью оснований; а также

олигонуклеотиды первого множества содержат один или более модифицированных фрагментов сахара или содержат одну или более природных фосфатных связей и одну или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[00336] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат один или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат один или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 2 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 3 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 4 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 5 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 6 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 7 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 8 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 9 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 10 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 15 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 20 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 25 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 30 или более модифицированных фрагментов сахара.

[00337] Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 5% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 10% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 15% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 20% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 25% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 30% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 35% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 40% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 45% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 50% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 55% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 60% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 65% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 70% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 75% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 80% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 85% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 90% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицировано 95% или более фрагментов сахара предложенных олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицирован каждый фрагмент сахара предложенных олигонуклеотидов.

[00338] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат один или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат два или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат три или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат четыре или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат пять или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат шесть или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат семь или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат восемь или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат девять или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат десять или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 11 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 12 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 13 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 14 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 15 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 16 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 17 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 18 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 19 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 20 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 21 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 22 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 23 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 24 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 25 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 30 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 35 или более 2'-F.

[00339] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат один 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат два 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат три 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат четыре 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат пять 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат шесть 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат семь 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат восемь 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат девять 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат десять 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 11 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 12 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 13 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 14 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 15 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 16 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 17 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 18 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 19 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 20 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 21 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 22 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 23 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 24 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 25 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 30 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 35 2'-F.

[00340] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат один или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат два или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат три или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат четыре или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат пять или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат шесть или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат семь или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат восемь или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат девять или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат десять или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 11 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 12 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 13 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 14 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 15 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 16 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 17 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 18 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 19 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 20 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 21 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 22 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 23 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 24 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 25 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 30 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 35 или более последовательных 2'-F.

[00341] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат один последовательный 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат два последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат три последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат четыре последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат пять последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат шесть последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат семь последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат восемь последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат девять последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат десять последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 11 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 12 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 13 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 14 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 15 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 16 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 17 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 18 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 19 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 20 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 21 последовательную 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 22 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 23 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 24 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 25 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 30 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 35 последовательных 2'-F.

[00342] Согласно некоторым вариантам осуществления за нуклеозидом, содержащим 2'-модификацию, следует модифицированная межнуклеотидная связь. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеозиду, содержащему 2'-модификацию, предшествует модифицированная межнуклеотидная связь. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой хиральную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой фосфоротиоат. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная межнуклеотидная связь представляет собой конфигурацию Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления за нуклеозидом, содержащим 2'-модификацию, следует хиральная межнуклеотидная связь в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления за нуклеозидом, содержащим 2'-F, следует хиральная межнуклеотидная связь в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеозиду, содержащему 2'-модификацию, предшествует хиральная межнуклеотидная связь в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеозиду, содержащему 2'-F, предшествует хиральная межнуклеотидная связь в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная межнуклеотидная связь представляет собой конфигурацию Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления за нуклеозидом, содержащим 2'-модификацию, следует хиральная межнуклеотидная связь в конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления за нуклеозидом, содержащим 2'-F, следует хиральная межнуклеотидная связь в конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеозиду, содержащему 2'-модификацию, предшествует хиральная межнуклеотидная связь в конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеозиду, содержащему 2'-F, предшествует хиральная межнуклеотидная связь в конфигурации Rp.

[00343] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат одну или более природных фосфатных связей и одну или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[00344] Предложенные олигонуклеотиды могут содержать различное число природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды не содержат природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат одну природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 2 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 3 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 4 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 5 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 6 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 7 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 8 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 9 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 10 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 15 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 20 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 25 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 30 или более природных фосфатных связей.

[00345] Согласно некоторым вариантам осуществления 5% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 10% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 15% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 20% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 25% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 30% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 35% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 40% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 45% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 50% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 55% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 60% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 65% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 70% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 75% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 80% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 85% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 90% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 95% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи.

[00346] Предложенные олигонуклеотиды могут содержать различные количества модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат одну модифицированную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 2 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 3 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 4 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 5 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 6 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 7 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 8 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 9 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 10 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 15 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 20 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 25 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 30 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[00347] Согласно некоторым вариантам осуществления 5% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 10% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 15% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 20% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 25% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 30% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 35% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 40% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 45% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 50% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 55% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 60% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 65% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 70% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 75% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 80% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 85% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 90% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 95% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь предложенных олигонуклеотидов представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь.

[00348] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем 25 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем 20 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем 15 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем 10 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем 9 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем 8 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем 7 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем 6 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем 5 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем 4 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более трех последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более двух последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем 25 немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем 20 немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем 15 немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем 10 немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем 5 немодифицированных фрагментов сахара.

[00349] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 95% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 90% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 85% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 80% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 70% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 60% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 50% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 40% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 30% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 20% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 10% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 5% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 15 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 10 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 9 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 8 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 7 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 6 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 5 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 4 последовательных немодифицированных фрагмента сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно три последовательных немодифицированных фрагмента сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно два последовательных немодифицированных фрагмента сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 25 немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 20 немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 15 немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 10 немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 5 немодифициро ванных фрагментов сахара.

[00350] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 95% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 90% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 85% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 80% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 70% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 60% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 50% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 40% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 30% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 20% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 10% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более чем примерно 5% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый фрагмент сахара олигонуклеотидов первого множества модифицируется независимо.

[00351] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции изменяют сплайсинг транскриптов, так что нежелательная мишень и/или биологическая функция подавляются. Согласно некоторым вариантам осуществления в таких случаях предложенная композиция также может индуцировать расщепление транскрипта после гибридизации.

[00352] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции изменяют сплайсинг транскриптов, так что желаемая мишень и/или биологическая функция усиливается. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции путем включения химических модификаций, стереохимии и/или их комбинаций эффективно подавляют или предотвращают расщепление целевого транскрипта после контакта.

[00353] Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит один или более модифицированных фрагментов сахара и модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит два или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит три или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит четыре или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит пять или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит десять или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит примерно 15 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит примерно 20 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит примерно 25 или более модифицированных фрагментов сахара.

[00354] Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 5% фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 10% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 20% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 30% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 40% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 50% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 60% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 70% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 80% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 85% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 90% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 95% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара.

[00355] Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 25 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 20 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 15 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 10 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 9 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 8 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 7 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 6 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 5 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 4 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно три последовательных немодифицированных фрагмента сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 2 последовательных немодифицированных фрагмента сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 25 немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 20 немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 15 немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 10 немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 5 немодифицированных фрагментов сахара.

[00356] Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 95% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 90% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 85% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 80% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 70% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 60% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 50% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 40% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 30% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 20% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 10% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 5% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 15 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 10 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 9 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 8 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 7 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 6 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 5 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 4 последовательных немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно три последовательных немодифицированных фрагмента сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 2 последовательных немодифицированных фрагмента сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 25 немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 20 немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 15 немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 10 немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 5 немодифицированных фрагментов сахара.

[00357] Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 95% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 90% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 85% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 80% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 70% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 60% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 50% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 40% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 30% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 20% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 10% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 5% немодифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый фрагмент сахара олигонуклеотидов первого множества модифицируется независимо.

[00358] Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит две или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит три или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит четыре или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит пять или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит десять или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит примерно 15 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит примерно 20 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит примерно 25 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[00359] Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 5% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 10% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 20% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 30% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 40% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 50% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 60% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 70% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 80% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 85% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 90% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления примерно 95% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи.

[00360] Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 25 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 20 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 15 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 10 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 9 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 8 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 7 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 6 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 5 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 4 последовательные природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 3 последовательные природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 2 последовательные природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 25 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 20 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 15 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 10 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 5 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 95% природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 90% природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 85% природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 80% природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 70% природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 60% природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 50% природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 40% природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 30% природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 20% природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 10% природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 5% природных фосфатных связей.

[00361] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества не содержат нуклеотид ДНК. Нуклеотид ДНК представляет собой нуклеотид, в котором фрагмент сахара представляет собой немодифицированный фрагмент сахара ДНК, а межнуклеотидная связь представляет собой природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 2 нуклеотида ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 3 нуклеотида ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 4 нуклеотида ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 5 нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 6 нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 7 нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 8 нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 9 нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 10 нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 11 нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 12 нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 13 нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 14 нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 15 нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 20 нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 25 нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 30 нуклеотидов ДНК.

[00362] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 2 последовательных нуклеотида ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 3 последовательных нуклеотида ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 4 последовательных нуклеотида ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 5 последовательных нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 6 последовательных нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 7 последовательных нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 8 последовательных нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 9 последовательных нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 10 последовательных нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 11 последовательных нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 12 последовательных нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 13 последовательных нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 14 последовательных нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 15 последовательных нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 20 последовательных нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 25 последовательных нуклеотидов ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат не более чем 30 последовательных нуклеотидов ДНК. [00363] Согласно некоторым вариантам осуществления, по сравнению с эталонным условием, предложенные композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью являются неожиданно эффективными. Согласно некоторым вариантам осуществления желаемые биологические эффекты (например, измеренные посредством повышенных уровней желательной мРНК, белков и т.д., сниженных уровней нежелательной мРНК, белков и т.д.) могут быть увеличены более чем в 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50 или 100 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления изменение измеряется посредством повышения уровня желательной мРНК по сравнению с эталонным условием. Согласно некоторым вариантам осуществления изменение измеряется посредством уменьшения уровня нежелательной мРНК по сравнению с эталонным условием. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонное условие представляет собой отсутствие лечения олигонуклеотидом. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонное условие представляет собой стереослучайную композицию олигонуклеотидов, имеющих одну и ту же последовательность оснований и химические модификации.

[00364] Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 2 раза. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 3 раза. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 4 раза. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 5 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 6 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 7 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 8 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 9 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 10 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 11 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 12 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 13 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 14 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 15 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 20 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 25 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 30 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 35 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 40 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 45 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 50 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 60 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 70 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 80 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 90 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 100 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 200 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный биологический эффект усиливается более чем в 500 раз.

[00365] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат две области крыла и одну область сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат структуру 5'-крыло-сердцевина-крыло-3'. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат гэпмерную структуру 5'-крыло-сердцевина-крыло-3'. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла идентичны. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла различны. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла идентичны по химическим модификациям. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла идентичны по 2'-модификациям. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла идентичны по модификациям межнуклеотидной связи. Согласно некоторым вариантам осуществления две области идентичны по профилю хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла идентичны по профилю связей остова. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла идентичны по профилю типов связей остова. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла идентичны по профилю модификаций фосфора остова.

[00366] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат области одного крыла и одной сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат гемимерную структуру 5'-крыло-сердцевина-3'. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой гемимерную структуру 5'-крыло-сердцевина-3'. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат гемимерную структуру 5'-сердцевина-крыло-3'. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой гемимерную структуру 5 '-сердцевина-крыло-3'.

[00367] Область крыла может отличаться от области сердцевины тем, что область крыла содержит другую структурную особенность, чем область сердцевины. Например, согласно некоторым вариантам осуществления область крыла отличается от области сердцевины тем, что они характеризуются различными модификациями сахара, модификациями оснований, межнуклеотидными связями, стереохимией межнуклеотидных связей и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла отличается от области сердцевины тем, что они характеризуются разными 2'-модификацими сахаров.

[00368] Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью крыла и областью сердцевины считается частью области крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью 5'-крыла и областью сердцевины считается частью области крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью 3'-крыла и областью сердцевины считается частью области крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью крыла и областью сердцевины считается частью области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью 5'-крыла и областью сердцевины считается частью области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью 3'-крыла и областью сердцевины считается частью области сердцевины.

[00369] Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью крыла и областью сердцевины считается частью области крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью 5'-крыла и областью сердцевины считается частью области крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью 3'-крыла и областью сердцевины считается частью области крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью крыла и областью сердцевины считается частью области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью 5'-крыла и областью сердцевины считается частью области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью 3'-крыла и областью сердцевины считается частью области сердцевины.

[00370] Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 2 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 3 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 4 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 5 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 6 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 7 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 8 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 9 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 10 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 11 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 12 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 13 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 14 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 15 или более нуклеозидов.

[00371] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат два крыла и одну область сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат структуру 5'-крыло-сердцевина-крыло-3'. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой гэпмерную структуру 5'-крыло-сердцевина-крыло-3'. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла идентичны. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла различны. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла идентичны по химическим модификациям. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла идентичны по 2'-модификациям. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла идентичны по модификациям межнуклеотидной связи. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла идентичны по профилю хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла идентичны по профилю связей остова. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла идентичны по профилю типов связей остова. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла идентичны по профилю модификаций фосфора остова.

[00372] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат области одного крыла и одной сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат гемимерную структуру 5'-крыло-сердцевина-3'. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой гемимерную структуру 5'-крыло-сер дцевина-3'. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат гемимерную структуру 5'-сердцевина-крыло-3'. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой гемимерную структуру 5'-сердцевина-крыло-3'.

[00373] Область крыла может отличаться от области сердцевины тем, что область крыла содержит другую структурную особенность, чем область сердцевины. Например, согласно некоторым вариантам осуществления область крыла отличается от области сердцевины тем, что они характеризуются различными модификациями сахара, модификациями оснований, межнуклеотидными связями, стереохимией межнуклеотидных связей и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла отличается от области сердцевины тем, что они характеризуются разными 2'-модификацими сахаров.

[00374] Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью крыла и областью сердцевины считается частью области крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью 5'-крыла и областью сердцевины считается частью области крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью 3'-крыла и областью сердцевины считается частью области крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью крыла и областью сердцевины считается частью области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью 5'-крыла и областью сердцевины считается частью области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью 3'-крыла и областью сердцевины считается частью области сердцевины.

[00375] Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью крыла и областью сердцевины считается частью области крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью 5'-крыла и областью сердцевины считается частью области крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью 3'-крыла и областью сердцевины считается частью области крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью крыла и областью сердцевины считается частью области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью 5'-крыла и областью сердцевины считается частью области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь между областью 3'-крыла и областью сердцевины считается частью области сердцевины.

[00376] Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 2 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 3 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 4 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 5 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 6 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 7 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 8 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 9 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 10 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 11 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 12 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 13 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 14 или более нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 15 или более нуклеозидов.

[00377] Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 2 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 3 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 4 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 5 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 6 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 7 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 8 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 9 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 10 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 11 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 12 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 13 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 14 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 15 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[00378] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, которые:

1) имеют одинаковую последовательность оснований, комплементарную целевой последовательности в транскрипте; а также

2) содержат один или более модифицированных фрагментов сахара и модифицированных межнуклеотидных связей.

[00379] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов характеризуется тем, что при контакте с транскриптом в системе сплайсинга транскриптов сплайсинг транскрипта изменяется относительно наблюдаемого в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинаций.

[00380] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов определенного типа олигонуклеотидов, определяемого:

1) последовательностью оснований;

2) профилем связей остова;

3) профилем хиральных центров остова; а также

4) профилем модификаций фосфора остова,

причем композиция характеризуется контролируемой хиральностью в том отношении, что она обогащена относительно по существу рацемического препарата олигонуклеотидов, имеющих одну и ту же последовательность оснований, олигонуклеотидами конкретного типа олигонуклеотида,

композиция олигонуклеотидов характеризуется тем, что, когда она контактирует с транскриптом в системе сплайсинга транскриптов, сплайсинг транскрипта изменяется относительно наблюдаемого в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинации.

[00381] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих одну или более областей крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований; а также

каждая область крыла независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и, необязательно, одну или более природных фосфатных связей, а область сердцевины независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей; или

каждая область крыла независимо содержит один или более модифицированных фрагментов сахара, а область сердцевины содержит один или более немодифицированных фрагментов сахара.

[00382] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих одну или более областей крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований; а также

каждая область крыла независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и необязательно одну или более природных фосфатных связей, а область сердцевины независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[00383] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих одну или более областей крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований; а также

каждая область крыла независимо содержит один или более модифицированных фрагментов сахара, а область сердцевины содержит один или более немодифицированных фрагментов сахара.

[00384] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих одну или более областей крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований; а также

каждая область крыла независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и, необязательно, одну или более природных фосфатных связей, а область сердцевины независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей; а также

каждая область крыла независимо содержит один или более модифицированных фрагментов сахара, а область сердцевины содержит один или более немодифицированных фрагментов сахара.

[00385] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих одну или более областей крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований; а также

каждая область крыла независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей, а область сердцевины независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей; а также

каждая область крыла независимо содержит один или более модифицированных фрагментов сахара, а область сердцевины содержит один или более немодифицированных фрагментов сахара.

[00386] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих одну или более областей крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

каждая область крыла независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и, необязательно, одну или более природных фосфатных связей; а также

область сердцевины независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[00387] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих одну или более областей крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

каждая область крыла независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей; а также

область сердцевины независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[00388] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих две области крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

каждая область крыла независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей; а также

область сердцевины независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[00389] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих две области крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

каждая область крыла независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей;

область крыла к 5'-концу области сердцевины содержит по меньшей мере одну модифицированную межнуклеотидную связь, за которой следует природная фосфатная связь в крыле; а также

область крыла к 3'-концу области сердцевины содержит по меньшей мере одну модифицированную межнуклеотидную связь, предшествующую природной фосфатной связи в крыле;

область сердцевины независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[00390] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих область крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

область крыла составляет в длину два или более оснований и содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей;

область крыла относится к 5'-концу области сердцевины и содержит модифицированную межнуклеотидную связь между двумя нуклеозидами на своем 3'-конце или область крыла относится к 3'-концу области сердцевины и содержит модифицированную межнуклеотидную связь между двумя нуклеозидами на своем 5'-конце; а также

область сердцевины независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[00391] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, содержащих две области крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

каждая область крыла независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей;

область крыла к 5'-концу области сердцевины содержит модифицированную межнуклеотидную связь между двумя нуклеозидами на своем 3'-конце;

область крыла к 3'-концу области сердцевины содержит модифицированную межнуклеотидную связь между двумя нуклеозидами на своем 5'-конце; а также

область сердцевины независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[00392] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

[00393] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

[00394] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2' -F модифицированные фрагменты сахара.

[00395] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F модифицированные фрагменты сахара, и 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

[00396] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F модифицированные фрагменты сахара, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более модифицированных межнуклеотидных связей и 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более природных фосфатных связей.

[00397] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F модифицированных остатков сахара и 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более модифицированных межнуклеотидных связей с контролируемой хиральностью.

[00398] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащую первое множество олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'- -F модифицированные фрагменты сахара, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более модифицированных межнуклеотидных связей с контролируемой хиральностью и 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более природных фосфатных связей.

[00399] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащую предварительно определенный уровень первого множества олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 5'-концеую область, содержащую 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F модифицированные фрагменты сахара, и 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более модифицированных межнуклеотидных связей и, необязательно, 3'-концевую область, содержащую 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F модифицированные фрагменты сахара.

[00400] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащую предварительно определенный уровень первого множества олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 5'-концевую область, содержащую 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F модифицированные фрагменты сахара, и 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более модифицированных межнуклеотидных связей, и 3'-концевую область, содержащую 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F модифицированные фрагменты сахара.

[00401] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащую предварительно определенный уровень первого множества олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 5'-концевую область, содержащую 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F модифицированные фрагменты сахара, причем первое нуклеозидное звено последовательных нуклеозидных звеньев представляет собой первое нуклеозидное звено олигонуклеотида, и 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более модифицированных межнуклеотидных связей, и 3'-концевую область, содержащую 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2' -F модифицированные фрагменты сахара, причем последнее нуклеозидное звено последовательных нуклеозидных звеньев представляет собой последнее нуклеозидное звено олигонуклеотида.

[00402] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащую первое множество олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F модифицированные фрагменты сахара, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более модифицированных межнуклеотидных связей, и 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более природных фосфатных связей.

[00403] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащую предварительно определенный уровень первого множества олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 5'-концевую область, содержащую 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F модифицированные фрагменты сахара, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более модифицированных межнуклеотидных связей, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более природных фосфатных связей, и 3'-концевую область, содержащую 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F модифицированные фрагменты сахара.

[00404] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащую предварительно определенный уровень первого множества олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 5'-концевую область, содержащую 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F модифицированные фрагменты сахара, причем первое нуклеозидное звено последовательных нуклеозидных звеньев представляют собой первое нуклеозидное звено олигонуклеотида, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более модифицированных межнуклеотидных связей, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более природных фосфатных связей, и 3'-концевую область, содержащую 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F модифицированные фрагменты сахара, причем последнее нуклеозидное звено последовательных нуклеозидных звеньев представляет собой последнее нуклеозидное звено олигонуклеотида.

[00405] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащую предварительно определенный уровень первого множества олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 5'-концевую область, содержащую 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F модифицированные фрагменты сахара, причем первое нуклеозидное звено последовательных нуклеозидных звеньев представляет собой первое нуклеозидное звено олигонуклеотида, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более модифицированных межнуклеотидных связей, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более природных фосфатных связей, 3'-концевую область, содержащую 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F модифицированные фрагменты сахара, причем последнее нуклеозидное звено последовательных нуклеозидных звеньев представляет собой последнее нуклеозидное звено олигонуклеотида, и 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более фрагментов сахара, содержащих модификации 2'-OR¹, где R¹ необязательно замещен C_1-6 алифатической группой.

[00406] Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит 2 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит 3 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит 4 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит 5 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит 6 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит 7 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит 8 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит 9 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит 10 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит 2 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит 3 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит 4 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит 5 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит 6 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит 7 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит 8 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит 9 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит 10 или более последовательных нуклеозидных звеньев, содержащих 2'-F.

[00407] Согласно некоторым вариантам осуществления каждое из последовательных нуклеозидных звеньев независимо предшествует модифицированной межнуклеотидной связи и/или следует за ней. Согласно некоторым вариантам осуществления каждое из последовательных нуклеозидных звеньев независимо предшествует фосфоротиоатной связи и/или следует за ней. Согласно некоторым вариантам осуществления каждое из последовательных нуклеозидных звеньев независимо предшествует модифицированной межнуклеотидной связи с контролируемой хиральностью и/или следует за ней. Согласно некоторым вариантам осуществления каждое из последовательных нуклеозидных звеньев независимо предшествует фосфоротиоатной связи с контролируемой хиральностью и/или следует за ней. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I-а.

[00408] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащую предварительно определенный уровень первого множества олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 5'-концевую область, содержащую 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp, 3'-концевую область, содержащую 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp, и среднюю область между областью 5'-конца и 3'-областью, содержащую 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более природных фосфатных связей.

[00409] Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит 2 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит 3 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит 4 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит 5 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит 6 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит 7 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит 8 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит 9 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-концевая область содержит 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит 2 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит 3 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит 4 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит 5 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит 6 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит 7 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит 8 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит 9 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-концевая область содержит 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp.

[00410] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащую предварительно определенный уровень первого множества олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 5'-концевую область, содержащую 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp, 3'-концевую область, содержащую 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp, и среднюю область между 5'-концевой областью и 3'-областью, содержащей 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более природных фосфатных связей.

[00411] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащую предварительно определенный уровень первого множества олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 5'-концевую область, содержащую 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp, 3'-концевую область, содержащую 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp, и среднюю область между 5'-концевой областью и 3'-областью, содержащей 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более природных фосфатных связей.

[00412] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащую предварительно определенный уровень первого множества олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 5'-концевую область, содержащую 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp, 3'-концевую область, содержащую 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp, и среднюю область между 5'-концевой областью и 3'-областью, содержащей 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более природных фосфатных связей.

[00413] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащую предварительно определенный уровень первого множества олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 5'-концевую область, содержащую 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp, 3'-концевую область, содержащую 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp, и средней области между 5'-концевой областью и 3'-областью, содержащей 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более природных фосфатных связей.

[00414] Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I-а.

[00415] Как показано в настоящем раскрытии, согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов характеризуется тем, что при контакте с транскриптом в системе сплайсинга транскриптов сплайсинг транскрипта изменяется относительно наблюдаемого в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинаций. Согласно некоторым вариантам осуществления желаемый продукт сплайсинга увеличивается на 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 100% или в 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 200, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900, 1000 раз или более. Согласно некоторым вариантам осуществления желательный эталонный сплайсинг отсутствует (например, не может быть надежно обнаружен с помощью количественной ПЦР) в эталонных условиях. Согласно некоторым вариантам осуществления, как показано в настоящем раскрытии, предварительно определяют уровни множества олигонуклеотидов, например, первого множества олигонуклеотидов, в предложенных композициях.

[00416] Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотрена композиция олигонуклеотидов, содержащая первое множество олигонуклеотидов, каждый из которых имеет структуру:

5'-[Nu⁵]_z1-[Nu^m]_z2-[Nu³]_z3-3',

где:

каждый Nu⁵ независимо представляет собой нуклеотидное звено и по меньшей мере один представляет собой Nu^S или Nu^F;

каждый Nu³ независимо представляет собой нуклеотидное звено и по меньшей мере один представляет собой Nu^S или Nu^F;

каждый Nu^S независимо представляет собой нуклеотидное звено, содержащее модифицированную межнуклеотидную связь;

каждый Nu^F независимо представляет собой нуклеотидное звено, содержащее F;

каждый из z1, z2 и z3 независимо равен 0-100, причем по меньшей мере один из z1, z2 и z3 не равен 0; а также

каждый Nu^m независимо представляет собой нуклеотидное звено.

[00417] Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотрена композиция олигонуклеотидов, содержащая первое множество олигонуклеотидов, каждый из которых имеет структуру:

5'-[Nu⁵]_z1-[Nu^m]_z2-[Nu³]_z3-3',

где:

каждый Nu⁵ независимо представляет собой нуклеотидное звено и по меньшей мере один представляет собой Nu^S или Nu^F;

каждый Nu³ независимо представляет собой нуклеотидное звено и по меньшей мере один представляет собой Nu^S или Nu^F;

каждый Nu^S независимо представляет собой нуклеотидное звено, содержащее модифицированную межнуклеотидную связь;

каждый Nu^F независимо представляет собой нуклеотидное звено, содержащее F;

каждый из z1, z2 и z3 независимо равен 0-100, причем по меньшей мере один из z1, z2 и z3 не равен 0;

каждый Nu^m независимо представляет собой нуклеотидное звено; а также

первое множество олигонуклеотидов структурно идентично.

[00418] Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотрена композиция олигонуклеотидов, содержащая первое множество олигонуклеотидов, каждый из которых имеет структуру:

5'-[Nu^S]_z1-[Nu^m]_z2-[Nu^S]_z3-3',

где:

каждый Nu^S независимо представляет собой нуклеотидное звено, содержащее модифицированную межнуклеотидную связь;

каждый из z1, z2 и z3 независимо равен 0-100, причем по меньшей мере один из z1, z2 и z3 не равен 0; а также

каждый Nu^m независимо представляет собой нуклеотидное звено.

[00419] Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотрена композиция олигонуклеотидов, содержащая первое множество олигонуклеотидов, каждый из которых имеет структуру:

5'-[Nu^S]_z1-[Nu^m]_z2-[Nu^S]_z3-3',

где:

каждый Nu^S независимо представляет собой нуклеотидное звено, содержащее модифицированную межнуклеотидную связь;

каждый из z1, z2 и z3 независимо равен 0-100, причем по меньшей мере один из z1, z2 и z3 не равен 0;

каждый Nu^m независимо представляет собой нуклеотидное звено; а также

первое множество олигонуклеотидов структурно идентично.

[00420] Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотрена композиция олигонуклеотидов, содержащая первое множество олигонуклеотидов, каждый из которых имеет структуру:

5'-[Nu^F]_z1-[Nu^m]_z2-[Nu^F]_z3-3',

где:

каждый Nu^F независимо представляет собой нуклеотидное звено, содержащее F;

каждый из z1, z2 и z3 независимо равен 0-100, причем по меньшей мере один из z1, z2 и z3 не равен 0; а также

каждый Nu^m независимо представляет собой нуклеотидное звено.

[00421] Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотрена композиция олигонуклеотидов, содержащая первое множество олигонуклеотидов, каждый из которых имеет структуру:

5'-[Nu^F]_z1-[Nu^m]_z2-[Nu^F]_z3-3',

где:

каждый Nu^F независимо представляет собой нуклеотидное звено, содержащее -F;

каждый из z1, z2 и z3 независимо равен 0-100, причем по меньшей мере один из z1, z2 и z3 не равен 0;

каждый Nu^m независимо представляет собой нуклеотидное звено; а также

первое множество олигонуклеотидов структурно идентично.

[00422] Согласно некоторым вариантам осуществления А^с представляет собой -5'-[Nu⁵]_z1-[Nu^m]_z2-[Nu³]_z3-3'. Согласно некоторым вариантам осуществления А^с представляет собой -5'-[Nu^S]_z1-[Nu^m]_z2-[Nu^S]_z3-3'. Согласно некоторым вариантам осуществления А^с представляет собой -5'-[Nu^F]_z1-[Nu^m]_z2-[Nu^F]_z3-3'.

[00423] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu⁵ представляет собой Nu^S. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu³ представляет собой Nu^S. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu⁵ представляет собой Nu^S и по меньшей мере один Nu³ представляет собой Nu^S. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый Nu⁵ и Nu³ независимо представляет собой Nu^S. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu⁵ представляет собой Nu^F. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu³ представляет собой Nu^F. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu⁵ представляет собой Nu^F и по меньшей мере один Nu³ представляет собой Nu^F. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый Nu⁵ и Nu³ независимо представляет собой Nu^F.

[00424] Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^S содержит модифицированную межнуклеотидную связь, имеющую структуру формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^S содержит модифицированную межнуклеотидную связь, имеющую структуру формулы I-а. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь характеризуется контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь характеризуется контролируемой хиральностью и конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модифицированная межнуклеотидная связь характеризуется контролируемой хиральностью и конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь характеризуется контролируемой хиральностью и конфигурацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая модифицированная межнуклеотидная связь характеризуется контролируемой хиральностью и конфигурацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый Nu^S содержит фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый Nu^S содержит фосфоротиоатную связь с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый Nu^S содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый Nu^S содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Rp с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^S содержит -F. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^S содержит фрагмент сахара, содержащий -F. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^S содержит фрагмент сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый Nu^S содержит фрагмент сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^S содержит модифицированный фрагмент сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^S содержит 2'-модифицированный фрагмент сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^S содержит 2'-R¹ модифицированный фрагмент сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^S содержит 2'-OR¹ модифицированный фрагмент сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^S содержит 2'-OR¹ модифицированный фрагмент сахара, где R¹ представляет собой необязательно замещенную C_1-6 алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^S содержит модифицированный фрагмент сахара 2'-МОЕ. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^S содержит модифицированный фрагмент сахара 2'-ОМе.

[00425] Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^F содержит фрагмент сахара, содержащий -F. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^F содержит фрагмент сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый Nu^F содержит фрагмент сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^F содержит модифицированную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^F содержит модифицированную межнуклеотидную связь формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^F содержит модифицированную межнуклеотидную связь, имеющую структуру формулы I-а. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^F содержит модифицированную межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^F содержит модифицированную межнуклеотидную связь в конфигурации Sp с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^F содержит фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^F содержит фосфоротиоатную связь с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^F содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^F представляет собой 2'-F фосфоротиоатное звено. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^F представляет собой 2'-F фосфоротиоатное звено с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^F представляет собой 2'-F фосфоротиоатное звено в конфигурации Sp с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый Nu^F представляет собой 2'-F фосфоротиоатное звено в конфигурации Sp с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I-а.

[00426] Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^m содержит модифицированный фрагмент сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^m содержит 2'-модифицированный фрагмент сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^m содержит модифицированный фрагмент сахара 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^m содержит модифицированный фрагмент сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu^m содержит модифицированный фрагмент сахара 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu^m содержит модифицированный фрагмент сахара 2'-OR¹, где R¹ представляет собой необязательно замещенный C_1-6 алкил. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu^m содержит модифицированный фрагмент сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu^m содержит модифицированный фрагмент сахара 2'-OR¹ и по меньшей мере один Nu^m содержит модифицированный фрагмент сахара 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu^m содержит модифицированный фрагмент сахара 2'-OR¹ и по меньшей мере один Nu^m содержит модифицированный фрагмент сахара 2'-F, где R¹ представляет собой необязательно замещенную C_1-6 алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu^m содержит модифицированный фрагмент сахара 2'-ОМе и по меньшей мере один Nu^m содержит модифицированный фрагмент сахара 2'-F.

[00427] Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^m содержит природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^m содержит модифицированную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^m содержит фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^m содержит модифицированную межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^m содержит модифицированную межнуклеотидную связь в конфигурации Sp с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^m содержит модифицированную межнуклеотидную связь в конфигурации Rp с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^m содержит фосфоротиоатную связь с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^m содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления Nu^m содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Rp с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu^m содержит природную фосфатную связь и по меньшей мере один Nu^m содержит модифицированную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu^m содержит природную фосфатную связь и по меньшей мере один Nu^m содержит модифицированную межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu^m содержит природную фосфатную связь и по меньшей мере один Nu^m содержит межнуклеотидную связь в конфигурации Sp с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu^m содержит природную фосфатную связь и по меньшей мере один Nu^m содержит модифицированную межнуклеотидную связь в конфигурации Rp с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu^m содержит природную фосфатную связь и по меньшей мере один Nu^m содержит фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu^m содержит природную фосфатную связь и по меньшей мере один Nu^m содержит фосфоротиоатную связь с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu^m содержит природную фосфатную связь и по меньшей мере один Nu^m содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Nu^m содержит природную фосфатную связь и по меньшей мере один Nu^m содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Rp с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I-а.

[00428] Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из Nu^S, Nu^F и Nu^m независимо имеет структуру где B^Nu представляет собой необязательно замещенное нуклеотидное основание; каждый R^Nu независимо представляет собой R¹, R', -L-R¹ или -L-R', где каждый из R¹, R' и L независимо является таким, как определено и описано; L^Nu5 представляет собой ковалентную связь или, если на 5'-конце олигонуклеотида, R^Nu; и L^Nu3 представляет собой межнуклеотидную связь, имеющую структуру формулы I или, если на 3'-конце олигонуклеотида, R^Nu. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из Nu^S, Nu^F и Nu^m независимо имеет структуру Согласно некоторым вариантам осуществления B^Nu представляет собой необязательно замещенные А, Т, С, G и U. Согласно некоторым вариантам осуществления две группы R^Nu берутся вместе со своими промежуточными атомами для образования кольцевой системы. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-R^Nu представляет собой 2'-OR¹, согласно некоторым вариантам осуществления 2'-ОМе, 2'-МОЕ и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-R^Nu представляет собой 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления L^Nu5 представляет собой ковалентную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления L^Nu5 представляет собой 5'-ОН или защищенный 5'-ОН. Согласно некоторым вариантам осуществления L^Nu3 имеет структуру формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления L^Nu3 представляет собой 3'-ОН или защищенный 3'-ОН.

[00429] Согласно некоторым вариантам осуществления z1 не равно 0. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 не равно 0. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 и z3 не равны нулю. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма z1, z2 и z3 равна 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 50 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма z1, z2 и z3 равна 15 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма z1, z2 и z3 равна 16 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма z1, z2 и z3 равна 17 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма z1, z2 и z3 равна 18 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма z1, z2 и z3 равна 19 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма z1, z2 и z3 равна 20 или более.

[00430] Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 0. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 1. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 2. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 3. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 4. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 5. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 6. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 7. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 8. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 9. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 10. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 1 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 2 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 3 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 4 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 5 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 6 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 7 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 8 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 9 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно 10 или более.

[00431] Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 0. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 1. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 2. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 3. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 4. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 5 Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 6. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 7. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 8. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 9. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 10. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 1 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 2 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 3 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 4 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 5 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 6 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 7 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 8 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 9 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z2 равно 10 или более.

[00432] Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 0. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 1. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 2. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 3. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 4. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 5 Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 6. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 7. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 8. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 9. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 10. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 1 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 2 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 3 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 4 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 5 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 6 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 7 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 8 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 9 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z3 равно 10 или более.

[00433] Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из z1 и z3 равен независимо 2 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из z1 и z3 равен независимо 3 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из z1 и z3 равен независимо 4 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из z1 и z3 равен независимо 5 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из z1 и z3 равен независимо 6 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из z1 и z3 равен независимо 7 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из z1 и z3 равен независимо 8 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из z1 и z3 равен независимо 9 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из z1 и z3 равен независимо 10 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления z1 равно z3.

[00434] Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu⁵]_z1 представляет собой 5'-крыло. Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu^S]_z1 представляет собой 5'-крыло. Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu^F]_z1 представляет собой 5'-крыло. Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu^m]_z2 представляет собой сердцевину. Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu³]_z3 представляет собой 3'-крыло. Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu^S]_z3 представляет собой 3'-крыло. Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu^F]_z3 представляет собой 3'-крыло. Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu⁵]_z1 представляет собой 5'-крыло, [Nu^m]_z2 представляет собой сердцевину, a [Nu³]_z3 представляет собой 5'-крыло. Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu^S]_z1 представляет собой 5'-крыло, [Nu^m]_z2 представляет собой сердцевину, a [Nu^S]_z3 представляет собой 5'-крыло. Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu^F]_z1 представляет собой 5'-крыло, [Nu^m]_z2 представляет собой сердцевину, a [Nu^F]_z3 представляет собой 5'-крыло.

[00435] Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu⁵]_z1 представляет собой 5'-концевую область. Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu^S]_z1 представляет собой 5'-концевую область. Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu^F]_z1 представляет собой 5'-концевую область. Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu^m]_z2 представляет собой среднюю область. Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu³]_z3 представляет собой 3'-концевую область. Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu^S]_z3 представляет собой 3'-концевую область. Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu^F]_z3 представляет собой 3'-концевую область. Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu⁵]_z1 представляет собой 5'-концевую область, [Nu^m]_z2 представляет собой среднюю область, a [Nu³]_z3 представляет собой 3'-концевую область. Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu^S]_z1 представляет собой 5'-концевую область, [Nu^m]_z2 представляет собой среднюю область, a [Nu^S]_z3 представляет собой 5'-концевую область. Согласно некоторым вариантам осуществления [Nu^F]_z1 представляет собой 5'-концевую область, [Nu^m]_z2 представляет собой среднюю область, a [Nu^F]_z3 представляет собой 5'-концевую область.

[00436] Иллюстративная композиция представляет собой WV-1497 (mG*mGmCmAmC*A*A*G*G*G*C*A*C*A*G*mAmCmUmU*mC), где область сердцевины представляет собой *A*A*G*G*G*C*A*C*A*G*, область крыла к 5'-концу области сердцевины представляет собой mG*mGmCmAmC, а область крыла к 3'-концу области сердцевины представляет собой mAmCmUmU*mC. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит модифицированную межнуклеотидную связь между двумя нуклеозидами на своем 3'-конце. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла к 5'-концу области сердцевины содержит модифицированную межнуклеотидную связь между двумя нуклеозидами на своем 3'-конце. Например, в WV-1497 mG*mGmCmAmC представляет собой крыло к 5'-концу области сердцевины (*A*A*G*G*G*C*A*C*A*G*) и содержит модифицированную межнуклеотидную связь между двумя нуклеозидами на своем 3'-конце (mG*mOmCmAmC). Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит модифицированную межнуклеотидную связь между двумя нуклеозидами на своем 5'-конце. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла к 3'-концу области сердцевины содержит модифицированную межнуклеотидную связь между двумя нуклеозидами на своем 5'-конце. Например, в WV-1497 mAmCmUmU*mC представляет собой крыло к 3'-концу области сердцевины (*A*A*G*G*G*C*A*C*A*G*) и содержит модифицированную межнуклеотидную связь между двумя нуклеозидами на своем 3'-конце (mAmCmUmU *mC). WV-3507 представляет собой иллюстративный олигонуклеотид, содержащий 5'-концевую и 3'-концевую области (также можно рассматривать кольца для WV-3507), содержащие последовательные фосфоротиоатные нуклеотидные звенья в конфигурации Sp 2'-F и среднюю область (также можно рассматривать как область сердцевины для WV-3507), содержащую природные фосфатные связи и модификации сахара 2'-ОМе.

[00437] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества имеют две области крыла и одну сердцевину. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла идентичны. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла различны.

[00438] Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 2 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 3 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 4 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 5 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 6 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 7 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 8 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 9 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 10 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 11 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 12 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 13 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 14 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 15 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 2 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная межнуклеотидная связь или модифицированная межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная межнуклеотидная связь или модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой фосфоротиоат. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая хиральная межнуклеотидная связь или модифицированная межнуклеотидная связь независимо имеют структуру формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая хиральная межнуклеотидная связь или модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой фосфоротиоат. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 3 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 4 более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 5 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 6 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 7 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 8 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 9 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 11 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 12 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 13 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 14 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 15 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь в области крыла представляет собой независимо модифицированную межнуклеотидную связь.

[00439] Согласно некоторым вариантам осуществления 5% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 10% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 15% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 20% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 25% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 30% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 35% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 40% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 45% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 50% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 55% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 60% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 65% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 70% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 75% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 80% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 85% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 90% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 95% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь области крыла представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь.

[00440] Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 2 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 3 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 4 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 5 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 6 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 7 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 8 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 9 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 10 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 11 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 12 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 13 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 14 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 15 или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 2 или более последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 3 или более последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 4 или более последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 5 или более последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 6 или более последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 7 или более последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 8 или более последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 9 или более последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 10 или более последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 11 или более последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 12 или более последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 13 или более последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 14 или более последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 15 или более последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь в области крыла представляет собой независимо природную фосфатную связь.

[00441] Согласно некоторым вариантам осуществления 5% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 10% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 15% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 20% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 25% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 30% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 35% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 40% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 45% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 50% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 55% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 60% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 65% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 70% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 75% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 80% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 85% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 90% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 95% или более межнуклеотидных связей области крыла представляют собой природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь области крыла представляет собой природную фосфатную связь.

[00442] Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 2 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 3 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 4 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 5 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 6 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 7 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 8 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 9 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 10 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 11 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 12 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 13 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 14 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 15 или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 2 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 3 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 4 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 5 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 6 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 7 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 8 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 9 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 11 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 12 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 13 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 14 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит 15 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь в области сердцевины независимо представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь.

[00443] Согласно некоторым вариантам осуществления 5% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 10% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 15% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 20% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 25% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 30% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 35% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 40% или более межнуклеотидных связей предложенных олигонуклеотидов представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 45% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 50% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 55% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 60% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 65% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 70% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 75% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 80% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 85% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 90% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 95% или более межнуклеотидных связей области сердцевины представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь сердцевины представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь.

[00444] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащая первое множество олигонуклеотидов, определяемое наличием:

1) одинаковой последовательности оснований и длиной;

2) одинаковым профилем связей остова; а также

3) одинаковым профилем хиральных центров остова, причем композиция представляет собой по существу чистый препарат одного олигонуклеотида в том отношении, что предварительно определенный уровень олигонуклеотидов в композиции характеризуется одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова.

[00445] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований и длина могут упоминаться как одинаковая последовательность оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды, имеющие одинаковую последовательность оснований, могут иметь одинаковый профиль модификаций нуклеозидов, например, модификаций сахара, модификаций оснований и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль модификаций нуклеозидов может быть представлен комбинацией положений и модификаций. Например, для WV-1092 профиль нуклеозидной связи представляет собой 5×2'-ОМе (модификация 2'-ОМе на фрагментах сахара)-ДНК (нет 2'-модификаций на фрагменте сахара)-5×2'-ОМе от 5'-конца к 3'-концу. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль связей остова содержит положения и типы (например, фосфат, фосфоротиоат, замещенный фосфоротиоат и т.д.) каждой межнуклеотидной связи. Например, для WV-1092 профиль связей остова представляет собой 1×PS (фосфоротиоат)-3×РО (фосфат)-11×PS-3×РО-1×PS. Профиль хиральных центров остова олигонуклеотида может быть обозначена комбинацией стереохимии фосфоров связей (Rp/Sp) от 5' к 3'. Например, WV-1092 характеризуется профилем 1S-3PO (фосфат)-88-1R-2S-3РО-18. Согласно некоторым вариантам осуществления все нехиральные связи (например, РО) могут быть опущены. Как проиллюстрировано выше, положения нехиральных связей могут быть получены, например, из профиля связей остова.

[00446] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащая первое множество олигонуклеотидов определенного типа олигонуклеотидов, характеризующегося:

1) одинаковой последовательности оснований и длиной;

2) одинаковым профилем связей остова; а также

3) одинаковым профилем хиральных центров остова;

причем композиция характеризуется контролируемой хиральностью, поскольку она обогащена относительно по существу рацемического препарата олигонуклеотидов, характеризующихся одной и той же последовательностью оснований и длиной, олигонуклеотидами конкретного типа олигонуклеотида.

[00447] Как понятно специалисту в настоящей области техники, стерео случайное или рацемическое получение олигонуклеотидов осуществляют путем не стерео селективного и/или низкостероселективного сочетания нуклеотидных мономеров, как правило, без применения каких-либо хиральных вспомогательных веществ, реагентов хиральной модификации и/или хиральных катализаторов. Согласно некоторым вариантам осуществления при по существу рацемическом (или с неконтролируемой хиральностью) получении олигонуклеотидов все или большинство стадий связывания не регулируются с помощью хирального контроля, так как стадии связывания не проводятся специально для обеспечения повышенной стерео селективности. Примером по существу рацемического получения олигонуклеотидов является получение фосфоротиоатных олигонуклеотидов посредством сульфуриновых фосфитных триэфиров из обычно используемого фосфорамидитного олигонуклеотидного синтеза с дисульфидом третэтилтиурама или (TETD) или 3Н-1,2-бензодитиол-3-он-1,1-диоксидом (BDTD), хорошо известный в настоящей области техники. Согласно некоторым вариантам осуществления по существу рацемическое получение олигонуклеотидов обеспечивает по существу рацемические композиции олигонуклеотидов (или композиции олигонуклеотидов с неконтролируемой хиральностью). Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере одно соединение нуклеотидного мономера характеризуется диастереоселективностью ниже чем примерно 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2 или 99:1. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере два соединения нуклеотидного мономера характеризуется диастереоселективностью ниже чем примерно 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2 или 99:1. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере три соединения нуклеотидного мономера характеризуется диастереоселективностью ниже чем примерно 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2 или 99:1. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере четыре соединения нуклеотидного мономера характеризуется диастереоселективностью ниже чем примерно 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2 или 99:1. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере пять соединений нуклеотидного мономера характеризуется диастереоселективностью ниже чем примерно 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2 или 99:1. Согласно некоторым вариантам осуществления каждое соединение нуклеотидного мономера независимо характеризуется диастереоселективностью ниже чем примерно 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2 или 99:1. Согласно некоторым вариантам осуществления в стереослучайных или рацемических препаратах по меньшей мере одна межнуклеотидная связь характеризуется диастереоселективностью ниже чем примерно 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2 или 99:1. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере две межнуклеотидные связи характеризуются диастереоселективностью ниже чем примерно 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2 или 99:1. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере три межнуклеотидных связей характеризуются диастереоселективностью ниже чем примерно 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2 или 99:1. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере четыре межнуклеотидных связей характеризуются диастереоселективностью ниже чем примерно 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2 или 99:1. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере пять межнуклеотидных связей характеризуются диастереоселективностью ниже чем примерно 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2 или 99:1. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь независимо характеризуется диастереоселективностью ниже чем примерно 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2, или 99:1. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность ниже чем примерно 60:40. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность ниже чем примерно 70:30. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность ниже чем примерно 80:20. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность ниже чем примерно 90:10. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность ниже чем примерно 91:9. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность ниже чем примерно 92:8. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность ниже чем примерно 93:7. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность ниже чем примерно 94:6. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность ниже чем примерно 95:5. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность ниже чем примерно 96:4. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность ниже чем примерно 97:3. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность ниже примерно 98:2. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность ниже чем примерно 99:1. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере одно соединение характеризуется диастереоселективностью ниже чем примерно 90:10. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере два соединения характеризуются диастереоселективностью ниже чем примерно 90:10. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере три соединения характеризуются диастереоселективностью ниже чем примерно 90:10. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере четыре соединения характеризуются диастереоселективностью ниже чем примерно 90:10. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере пять соединений характеризуются диастереоселективностью ниже чем примерно 90:10. Согласно некоторым вариантам осуществления каждое соединение независимо характеризуется диастереоселективностью ниже чем примерно 90:10. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере одна межнуклеотидная связь характеризуется диастереоселективностью ниже чем примерно 90:10. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере две межнуклеотидные связи характеризуются диастереоселективностью ниже чем примерно 90:10. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере три межнуклеотидные связи характеризуются диастереоселективностью ниже чем примерно 90:10. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере четыре межнуклеотидные связи характеризуются диастереоселективностью ниже чем примерно 90:10. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере пять межнуклеотидных связей характеризуются диастереоселективностью ниже чем примерно 90:10. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь независимо характеризуется диастереоселективностью ниже чем примерно 90:10.

[00448] Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь с контролируемой хиральностью, такая как в олигонуклеотидах композиций олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, характеризуется диастереоселективностью 90:10 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь с контролируемой хиральностью, такая как в олигонуклеотидах композиций олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, характеризуется диастереоселективностью 90:10 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность составляет 91:9 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность составляет 92:8 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность составляет 97:3 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность составляет 94:6 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность составляет 95:5 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность составляет 96:4 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность составляет 97:3 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность составляет 98:2 или более. Согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность составляет 99:1 или более.

[00449] Как понятно специалисту в настоящей области техники, согласно некоторым вариантам осуществления диастереоселективность связывания или связи может быть оценена посредством диастереоселективности образования димера в тех же или сопоставимых условиях, где димер имеет те же самые 5'- и 3'-нуклеозиды и межнуклеотидные связи. Например, диастереоселективность подчеркнутого соединения или связи в WV-1092 mG*SmGmCmAmC*SA*SA*SG*SG*S G*SC*SA*SC*RA*SG*SmAmCmUmU*SmC можно оценить из соединения двух G-фрагментов в таких же или сопоставимых условиях, например, мономеры, хиральные вспомогательные вещества, растворители, активаторы, температуры и т.д.

[00450] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые), содержащие первое множество олигонуклеотидов, определяемых наличием:

1) одинаковой последовательности оснований и длины;

2) одинакового профиля связей остова, а также

3) одинакового профиля хиральных центров остова, причем эта композиция представляет собой по существу чистый препарат одного олигонуклеотида в том отношении, что по меньшей мере примерно 10% олигонуклеотидов в композиции имеют одинаковую последовательность основания и длину, одинаковый профиль связей остова и одинаковый профиль хиральных центров остова.

[00451] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью первого множества олигонуклеотидов в том отношении, что композиция обогащена по сравнению с по существу рацемическим препаратом тех же олигонуклеотидов, олигонуклеотидами одного типа олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью первого множества олигонуклеотидов в том отношении, что композиция обогащена по сравнению с по существу рацемическим препаратом тех же олигонуклеотидов, олигонуклеотидами одного типа олигонуклеотидов, которые совместно характеризуются:

1) одинаковой последовательностью оснований и длиной;

2) одинаковым профилем связей остова, а также

3) одинаковым профилем хиральных центров остова.

[00452] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащая первое множество олигонуклеотидов определенного типа олигонуклеотида, характеризующегося:

1) одинаковой последовательностью оснований и длиной;

2) одинаковым профилем связей остова, а также

3) одинаковым профилем хиральных центров остова,

причем композиция характеризуется контролируемой хиральностью в том отношении, что она обогащена относительно по существу рацемического препарата олигонуклеотидов, имеющих одну и ту же последовательность оснований и длину, олигонуклеотидами определенного типа олигонуклеотида.

[00453] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды, характеризующиеся одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова, имеют одинаковый профиль модификаций фосфора остова и одинаковый профиль модификаций оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды, характеризующиеся одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова, имеют одинаковый профиль модификаций нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды, характеризующиеся одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова, имеют идентичные структуры.

[00454] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды типа олигонуклеотида характеризуются одинаковым профилем модификаций фосфора и одинаковым профилем модификаций сахара остова. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды типа олигонуклеотида характеризуются одинаковым профилем модификаций фосфора и одинаковым профилем модификаций оснований остова. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды типа олигонуклеотида характеризуются одинаковым профилем модификаций фосфора и одинаковым профилем модификаций нуклеозидов остова. В некоторых вариантах олигонуклеотиды типа олигонуклеотида являются идентичными.

[00455] Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой по существу чистый препарат типа олигонуклеотида в том отношении, что олигонуклеотиды в композиции, которые не являются типа олигонуклеотида, представляют собой загрязненную форму процесса подготовки указанного типа олигонуклеотида, в некоторых случаях, после определенных процедур очистки.

[00456] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 20% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 25% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 30% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 35% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 40% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 45% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 50% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 55% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 60% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 65% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 70% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 75% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 80% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 85% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 90% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 92% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 94% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 95% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления более чем примерно 99% олигонуклеотидов в композиции характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова. Согласно некоторым вариантам осуществления чистота композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотида может быть выражена как процент олигонуклеотидов в композиции, которые характеризуются одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова.

[00457] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды, характеризующиеся одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова, имеют одинаковый профиль модификаций фосфора остова. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды, характеризующиеся одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова, имеют одинаковый профиль модификаций фосфора остова и одинаковый профиль модификаций нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды, характеризующиеся одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова, имеют одинаковый профиль модификаций фосфора остова и одинаковый профиль модификаций сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды, характеризующиеся одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова, имеют одинаковый профиль модификаций фосфора остова и одинаковый профиль модификаций оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды, характеризующиеся одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова, имеют одинаковый профиль модификаций фосфора остова и одинаковый профиль модификаций нуклеозидов. В некоторых вариантах олигонуклеотиды, характеризующиеся одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова, идентичны.

[00458] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды в предложенных композициях характеризуются одинаковым профилем модификаций фосфора остова. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований типа олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов, которая характеризуется контролируемой хиральностью в том отношении, что композиция содержит предварительно определенный уровень первого множества олигонуклеотидов отдельного типа олигонуклеотида, причем тип олигонуклеотидов определяется:

1) последовательностью оснований;

2) профилем связей остова;

3) профилем хиральных центров остова; а также

4) профилем модификаций фосфора остова.

[00459] Как отмечено выше и понятно в данной области техники, согласно некоторым вариантам осуществления последовательность оснований олигонуклеотида может относиться к статусу идентичности и/или модификации нуклеозидных остатков (например, компонентов сахара и/или оснований относительно стандартных природных нуклеотидов, таких как аденин, цитозин, гуанозин, тимин и урацил) в олигонуклеотиде и/или к характеру гибридизации (т.е. способности гибридизоваться с конкретными комплементарными остатками) таких остатков.

[00460] Согласно некоторым вариантам осуществления определенный тип олигонуклеотида может быть определен посредством

1А) идентичности оснований;

1B) профиля модификации оснований;

1C) профиля модификации сахара;

2) профиля связей остова;

3) профиля хиральных центров остова; а также

4) профиля модификаций фосфора остова.

Таким образом, согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды определенного типа могут характеризоваться идентичными основаниями, но отличаться по своему профилю модификаций оснований и/или модификаций сахаров. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды определенного типа могут характеризоваться идентичными основаниями и профилем модификаций оснований (включая, например, отсутствие модификации оснований), но различаться по профилю модификаций сахаров.

[00461] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды определенного типа идентичны в том отношении, что они имеют одну и ту же последовательность оснований (включая длину), один и тот же профиль химических модификаций фрагментов сахара и оснований, один и тот же профиль связей остова (например, профиль природных фосфатных связей, фосфоротиоатных связей, фосфоротиоатных триэфирных связей и их комбинации), один и тот же профиль хиральных центров остова (например, профиль стереохимии (Rp/Sp) хиральных межнуклеотидных связей) и один и тот же профиль модификаций фосфора остова (например, профиль модификаций на межнуклеотидном атоме фосфора, такой как -S- и -L-R¹ формулы I).

[00462] Согласно некоторым вариантам осуществления чистота композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотида выражается как процент олигонуклеотидов в композиции, которые относятся к типу олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 10% олигонуклеотидов в композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляют собой одинаковый тип олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 20% олигонуклеотидов в композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляют собой одинаковый тип олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 30% олигонуклеотидов в композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляют собой одинаковый тип олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 40% олигонуклеотидов в композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляют собой одинаковый тип олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 50% олигонуклеотидов в композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляют собой одинаковый тип олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 60% олигонуклеотидов в композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляют собой одинаковый тип олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 70% олигонуклеотидов в композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляют собой одинаковый тип олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 80% олигонуклеотидов в композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляют собой одинаковый тип олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 90% олигонуклеотидов в композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляют собой одинаковый тип олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 92% олигонуклеотидов в композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляют собой одинаковый тип олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 94% олигонуклеотидов в композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляют собой одинаковый тип олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 95% олигонуклеотидов в композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляют собой одинаковый тип олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 96% олигонуклеотидов в композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляют собой одинаковый тип олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 97% олигонуклеотидов в композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляют собой одинаковый тип олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 98% олигонуклеотидов в композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляют собой одинаковый тип олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 99% олигонуклеотидов в композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляют собой одинаковый тип олигонуклеотидов.

[00463] Согласно некоторым вариантам осуществления чистоту композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью можно задавать с помощью стерео селективности каждой стадии связывания в процессе ее получения. Согласно некоторым вариантам осуществления стадия связывания характеризуется стерео селективностью (например, диастерео селективностью), составляющей 60% (60% новой межнуклеотидной связи, образованной на стадии связывания, характеризуется предполагаемой стереохимией). После такой стадии связывания новая образованная межнуклеотидная связь может характеризоваться чистотой 60%. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая стадия связывания характеризуется стерео селективностью, составляющей по меньшей мере 60%. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая стадия связывания характеризуется стерео селективностью, составляющей по меньшей мере 70%. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая стадия связывания характеризуется стерео селективностью, составляющей по меньшей мере 80%. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая стадия связывания характеризуется стерео селективностью, составляющей по меньшей мере 85%. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая стадия связывания характеризуется стерео селективностью, составляющей по меньшей мере 90%. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая стадия связывания характеризуется стерео селективностью, составляющей по меньшей мере 91%. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая стадия связывания характеризуется стерео селективностью, составляющей по меньшей мере 92%. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая стадия связывания характеризуется стерео селективностью, составляющей по меньшей мере 93%. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая стадия связывания характеризуется стерео селективностью, составляющей по меньшей мере 94%. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая стадия связывания характеризуется стерео селективностью, составляющей по меньшей мере 95%. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая стадия связывания характеризуется стерео селективностью, составляющей по меньшей мере 96%. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая стадия связывания характеризуется стерео селективностью, составляющей по меньшей мере 97%. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая стадия связывания характеризуется стерео селективностью, составляющей по меньшей мере 98%. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая стадия связывания характеризуется стерео селективностью, составляющей по меньшей мере 99%. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая стадия связывания характеризуется стерео селективностью, составляющей по меньшей мере 99,5%. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая стадия связывания характеризуется стерео селективностью, составляющей практически 100%. Согласно некоторым вариантам осуществления стадия связывания характеризуется стереоселективностью, составляющей практически 100%, в том отношении, что весь обнаруживаемый продукт после стадии связывания аналитическим способом (например, ЯМР, ВЭЖХ и т.д.), характеризуется предполагаемой стереоселективностью. Согласно некоторым вариантам осуществления стерео селективность хиральной межнуклеотидной связи в олигонуклеотиде может быть измерена с помощью модельной реакции, например, образования димера при практически одинаковых или сопоставимых условиях, в которых димер имеет такую же межнуклеотидную связь, как хиральная межнуклеотидная связь, 5'-нуклеозид димера является таким же, как нуклеозид к 5'-концу хиральной межнуклеотидной связи, а 3'-нуклеозид димера является таким же, как нуклеозид к 3'-концу хиральной межнуклеотидной связи (например, для fU*SfU*SfC*SfU через димер fU*SfC). Как понятно специалисту в настоящей области техники, процент олигонуклеотидов конкретного типа, имеющего n межнуклеотидных связей в препарате, может быть рассчитан как SE¹*SE²*SE³*…SEⁿ, где SE¹, SE², SE³, …, SEⁿ представляет собой независимо стереоселективность 1-й, 2-й, 3-й, … и n-й хиральной межнуклеотидной связи.

[00464] Согласно некоторым вариантам осуществления в предложенных композициях по меньшей мере 0,5%, 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90% 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 97% или 99% олигонуклеотидов, которые характеризуются последовательностью оснований конкретного типа олигонуклеотидов (определенного 1) последовательностью оснований; 2) профилем связей остова; 3) профилем хиральных центров остова и 4) профилем модификаций фосфора остова), представляют собой олигонуклеотиды конкретного типа олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 0,5%, 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 97% или 99% олигонуклеотидов, которые характеризуются последовательностью оснований, профилем связей остова и профилем модификаций фосфора остова конкретного типа олигонуклеотидов, представляют собой олигонуклеотиды конкретного типа олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 0,5%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 1%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 2%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 3%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 4%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 5%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 6%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 7%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 8%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 9%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 10%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 20%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 30%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 40%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 50%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 60%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 70%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 75%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 80%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 81%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 82%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 83%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 84%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 85%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 86%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 87%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 88%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 89%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 90%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 91%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 92%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 93%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 94%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 95%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 96%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 97%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 98%. Согласно некоторым вариантам осуществления процент составляет по меньшей мере 99%.

[00465] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды определенного типа в композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью обогащены по меньшей мере в 5 раз (олигонуклеотиды конкретного типа имеют фракцию 5*(1/2ⁿ) олигонуклеотидов, которые характеризуются последовательностью оснований, профилем связей остова и профилем модификаций фосфора остова конкретного типа олигонуклеотидов, где n представляет собой число хиральных межнуклеотидных связей; или олигонуклеотиды, которые характеризуются последовательностью оснований, профилем связей остова и профилем модификаций фосфора остова конкретного типа олигонуклеотидов, но не относятся к конкретному типу олигонуклеотидов, представляют собой не более чем [1-(1/2ⁿ)]/5 олигонуклеотидов, которые характеризуются последовательностью оснований, профилем связей остова и профилем модификаций фосфора остова конкретного типа олигонуклеотидов) по сравнению со стереослучайным препаратом олигонуклеотидов (олигонуклеотиды конкретного типа, как правило, считаются имеющими фракцию 1/2ⁿ олигонуклеотидов, которые характеризуются последовательностью оснований, профилем связей остова и профилем модификаций фосфора остова конкретного типа олигонуклеотидов, где n представляет собой число хиральных межнуклеотидных связей, и олигонуклеотиды, которые характеризуются последовательностью оснований, профилем связей остова и профилем модификаций фосфора остова конкретного типа олигонуклеотидов, но не относятся к конкретному типу олигонуклеотидов, как правило, считаются имеющими фракцию [1-(1/2ⁿ)] олигонуклеотидов, которые характеризуются последовательностью оснований, профилем связей остова и профилем модификаций фосфора остова конкретного типа олигонуклеотидов). Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 20 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 30 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 40 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 50 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 60 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 70 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 80 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 90 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 100 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 200 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 300 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 400 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 500 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 600 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 700 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 800 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 900 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 1000 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 2000 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 4000 раз. В некоторых вариантах обогащения больше по меньшей мере в 8000 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 10000 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение больше по меньшей мере в 20000 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащения составляет по меньшей мере (1,5)ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере (1,6)ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере (1,7)ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере (1,1)ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере (1,8)ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере (1,9)ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере 2ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере 3ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере 4ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере 5ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере 6ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере 7ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере 8ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере 9ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере 10ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере 15ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере 20ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере 25ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере 30ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере 40ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере 50ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение составляет по меньшей мере 100ⁿ. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение измеряют путем увеличения доли олигонуклеотидов конкретного типа олигонуклеотидов в олигонуклеотидах, которые характеризуются последовательностью оснований, профилем связей остова и профилем модификаций фосфора остова конкретного типа олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления обогащение измеряется уменьшением фракции олигонуклеотидов, которые характеризуются последовательностью оснований, профилем связей остова и профилем модификаций фосфора остова конкретного типа олигонуклеотидов, но не относятся к конкретному типу олигонуклеотидов в олигонуклеотидах, которые характеризуются последовательностью оснований, профилем связей остова и профилем модификаций фосфора остова конкретного типа олигонуклеотидов.

[00466] Помимо всего прочего, настоящее раскрытие признает тот факт, что комбинации структурных элементов олигонуклеотидов (например, профилей химических модификаций, связей остова, хиральных центров остова и/или модификаций фосфора остова) могут обеспечить удивительно улучшенные свойства, такие как биоактивность.

[00467] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, содержащая предварительно определенный уровень первого множества олигонуклеотидов, которые содержат одну или более областей крыла и одинаковую область сердцевины, причем:

каждая область крыла независимо составляет в длину два или более оснований и независимо и необязательно содержит одну или более хиральных межнуклеотидных связей;

область сердцевины независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более хиральных межнуклеотидных связей, а одинаковая область сердцевины характеризуется:

1) одинаковой последовательностью оснований и длиной;

2) одинаковым профилем связей остова, а также

3) одинаковым профилем хиральных центров остова, причем липиды необязательно и независимо конъюгированы с одним или более олигонуклеотидами из множества.

[00468] Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит структурную особенность, которая не находится в области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло и сердцевина могут быть определены любыми структурными элементами, например, модификациями оснований (например, метилированные/неметилированные, метилирование в положении 1/метилирование в положении 2 и т.д.), модификациями сахара (например, модифицированный/немодифицированный, 2'-модификация/другой тип модификации, один тип 2'-модификации/другой тип 2'-модификации и т.д.), типами связей остова (например, фосфат/фосфоротиоат, фосфоротиоат/замещенный фосфоротиоат и т.д.), стереохимией хирального центра остова (например, все Sp/все Rp, (SpRp) повторы/все Rp и т.д.), типами модификаций фосфора остова (например, s1/s2, s1/s3 и т.д.) и т.д.

[00469] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло и сердцевина определяются модификациями нуклеозидов, причем крыло содержит модификацию нуклеозидов, которую не содержит область сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло и сердцевина определяются модификациями сахара, причем крыло содержит модификацию сахара, которую не содержит область сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация сахара представляет собой 2'-модификацию. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация сахара представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация сахара представляет собой 2'-МОЕ. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация сахара представляет собой 2'-ОМе. Дополнительно примеры модификаций сахара описаны в настоящем раскрытии. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло и сердцевина определяются межнуклеотидными связями, причем крыло содержит тип межнуклеотидной связи (например, природная фосфатная связь, тип модифицированной межнуклеотидной связи и т.д.), который область сердцевины не содержит. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло и сердцевина определяются межнуклеотидными связями, причем крыло имеет профиль связей остова, который отличается от такового сердцевины.

[00470] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды в предложенных композициях содержат структуру крыло-сердцевина (гемимер). Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды в предложенных композициях содержат структуру крыло-сердцевина модификаций нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды в предложенных композициях содержат структуру сердце вина-крыло (другой тип гемимера). Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды в предложенных композициях содержат структуру сердцевина-крыло нуклеозидных модификаций. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды в предложенных композициях имеют структуру крыло-сердцевина-крыло (гэпмер). Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды в предложенных композициях имеют структуру крыло-сердцевина-крыло нуклеозидных модификаций. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло и сердцевина определяются модификациями сахарных фрагментов. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло и сердцевина определяются модификациями фрагментов оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый фрагмент сахара в области крыла характеризуется одинаковой 2'-модификацией, которая не находится в области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый фрагмент сахара в области крыла характеризуется одинаковой 2'-модификацией, которая отличается от любых модификаций сахара в области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины не содержит модификации сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый фрагмент сахара в области крыла характеризуется одинаковой 2'-модификацией, а область сердцевины не содержит 2'-модификаций. Согласно некоторым вариантам осуществления, когда присутствуют два или более крыльев, каждое крыло определяется его собственными модификациями. Согласно некоторым вариантам осуществления каждое крыло содержит свою собственную характерную модификацию сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждое крыло содержит одинаковую характерную модификацию сахара, отличающую его от сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый фрагмент сахара крыла характеризуется одинаковой модификацией. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый фрагмент сахара крыла характеризуется одинаковой 2'-модификацией. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый фрагмент сахара в области крыла характеризуется одинаковой 2'-модификацией, но одинаковая 2'-модификация в первой области крыла может быть либо такой же, либо отличной от одинаковой 2'-модификации во второй области крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый фрагмент сахара в области крыла характеризуется одинаковой 2'-модификацией, а одинаковая 2'-модификация в первой области крыла такая же, как и одинаковая 2'-модификация во второй области крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый фрагмент сахара в области крыла характеризуется одинаковой 2'-модификацией, а одинаковая 2'-модификация в первой области крыла отличается от одинаковой 2'-модификации во второй области крыла.

[00471] Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) представляют собой антисмысловые олигонуклеотиды (например, chiromersen). Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) представляют собой олигонуклеотиды-миРНК. Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой композицию из олигонуклеотидов, которые могут представлять собой антисмысловой олигонуклеотид, антагомир, микроРНК, пре-микроРНК, антимир, супермир, рибозим, U1 адаптор, активатор РНК, агент РНК-интерференции, олигонуклеотид-«ловушка», образующий триплекс олигонуклеотид, аптамер или адъювант. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой антисмысловые олигонуклеотиды. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой олигонуклеотиды-антагомир. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой олигонуклеотиды-микроРНК. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой олигонуклеотиды-микроРНК. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой олигонуклеотиды антимир. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой олигонуклеотиды супермир. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой олигонуклеотиды-рибозимы. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой олигонуклеотиды U1 адапторы. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой олигонуклеотиды-активаторы РНК. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой олигонуклеотиды-агенты РНК-интерференции. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой олигонуклеотиды-«ловушки». Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой образующие триплекс олигонуклеотиды. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой олигонуклеотиды-аптамеры. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой адъювантные олигонуклеотиды.

[00472] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) представляют собой олигонуклеотиды, которые включают одну или более модифицированных связей, оснований и/или сахаров остова.

[00473] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит одну или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит две или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит три или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит четыре или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит пять или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8,9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 или 25 хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 5 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 6 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 7 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 8 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 9 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 10 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 11 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 12 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 13 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 14 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 15 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 16 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 17 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 18 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 19 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 20 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 21 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 22 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 23 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 24 или более хиральных модифицированных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный тип олигонуклеотида содержит 25 или более хиральных модифицированных фосфатных связей.

[00474] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 100% хиральных модифицированных фосфатных связей. Примеры хиральных модифицированных фосфатных связей описаны выше и в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 100% хиральных модифицированных фосфатных связей в конфигурации Sp.

[00475] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) характеризуются стереохимической чистотой, составляющей более чем примерно 80%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) характеризуются стереохимической чистотой, составляющей более чем примерно 85%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) характеризуются стереохимической чистотой, составляющей более чем примерно 90%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) характеризуются стереохимической чистотой, составляющей более чем примерно 91%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) характеризуются стереохимической чистотой, составляющей более чем примерно 92%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) характеризуются стереохимической чистотой, составляющей более чем примерно 93%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) характеризуются стереохимической чистотой, составляющей более чем примерно 94%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) характеризуются стереохимической чистотой, составляющей более чем примерно 95%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) характеризуются стереохимической чистотой, составляющей более чем примерно 96%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) характеризуются стереохимической чистотой, составляющей более чем примерно 97%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) характеризуются стереохимической чистотой, составляющей более чем примерно 98%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) характеризуются стереохимической чистотой, составляющей более чем примерно 99%.

[00476] Согласно некоторым вариантам осуществления такая предусмотренная чистота может быть благодаря одной или более хиральным межнуклеотидным линкерным группам, так как композиция характеризуется частичной контролируемой хиральностью.

[00477] Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная модифицированная фосфатная связь представляет собой хиральную фосфоротиоатную связь, т.е. фосфоротиоатную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 100% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления все хиральные модифицированные фосфатные связи представляют собой хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80 или 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 10% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 20% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 30% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 40% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 50% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 60% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 70% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 80% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 95% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Sp.

[00478] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80 или 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 10% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 20% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 30% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 40% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 50% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 60% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 70% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 80% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 95% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp.

[00479] Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, или 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 10% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 20% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 30% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 40% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 50% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 60% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 70% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 80% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 95% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей предложенного олигонуклеотида характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит только одну хиральную фосфоротиоатную межнуклеотидную связь в конформации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит только одну хиральную фосфоротиоатную межнуклеотидную связь в конформации Rp, причем все межнуклеотидные связи представляют собой хиральные фосфор отиоатные межнуклеотидные связи.

[00480] Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная фосфоротиоатная межнуклеотидная связь представляет собой хиральную фосфоротиоатную диэфирную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая хиральная фосфоротиоатная межнуклеотидная связь независимо представляет собой хиральную фосфоротиоатную диэфирную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь независимо представляет собой хиральную фосфоротиоатную диэфирную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь независимо представляет собой хиральную фосфоротиоатную диэфирную связь и только одна характеризуется Rp-конфигурацией.

[00481] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, которые содержат одно или более модифицированных оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, которые не содержат модифицированных оснований. Примеры модифицированных оснований описаны выше и в настоящем описании.

[00482] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере одну природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере две природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере три природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере четыре природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере пять природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере шесть природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере семь природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере восемь природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере девять природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере десять природных фосфатных связей.

[00483] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат одну природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат две природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат три природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат четыре природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат пять природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат шесть природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат семь природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат восемь природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат девять природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат десять природных фосфатных связей.

[00484] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере две последовательные природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере три последовательные природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере четыре последовательные природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере пять последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере шесть последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере семь последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере восемь последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере девять последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат по меньшей мере десять последовательных природных фосфатных связей.

[00485] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат две последовательные природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат три последовательные природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат четыре последовательные природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат пять последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат шесть последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат семь последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат восемь последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат девять последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенных композиций содержат десять последовательных природных фосфатных связей.

[00486] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 8 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 9 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 10 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 11 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 12 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 13 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 14 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 15 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 16 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 17 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 18 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 19 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 20 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 21 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 22 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 23 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 24 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 25 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные препараты с контролируемой хиральностью (и/или стереохимически чистые) состоят из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований по меньшей мере из 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70 или 75 оснований.

[00487] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции содержат олигонуклеотиды, содержащие один или более остатков, которые модифицированы в фрагменте сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции содержат олигонуклеотиды, содержащие один или более остатков, которые модифицированы в положении 2' фрагмента сахара (модификация, называемая в настоящем описании как «2'-модификация»). Примеры таких модификаций описаны выше и в настоящем описании и включают, но не ограничиваются ими, 2'-ОМе, 2'-МОЕ, 2'-LNA, 2'-F, FRNA, FANA, S-cEt и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции содержат олигонуклеотиды, содержащие один или более остатков, которые представляют собой 2'-модифицированные. Например, согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат один или более остатков, которые представляют собой 2'-O-метоксиэтил-(2'-МО)-модифициро ванные остатки. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции содержат олигонуклеотиды, которые не содержат никаких 2'-модификаций. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции содержат олигонуклеотиды, которые не содержат какие-либо остатки 2'-МОЕ. То есть Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды не являются МОЕ-модифицированными. Дополнительные примеры модификации сахара описаны в настоящем описании.

[00488] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат общий мотив крыло-сердцевина или сердцевина-крыло (гемимер, также представленный в настоящем описании в общем виде как X-Y- или Y-X, соответственно. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат общий мотив крыло-сердцевина-крыло (гэпмер, также представленный в настоящем описании в общем виде как X-Y-X). Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит один или более остатков, имеющих определенную модификацию, причем такая модификация отсутствует в сердцевинной части «Y». Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит один или более остатков, имеющих конкретную нуклеозидную модификацию, причем эта модификация отсутствует в сердцевинной части «Y». Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит один или более остатков, имеющих конкретную модификацию оснований, причем эта модификация отсутствует в сердцевинной части «Y». Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит один или более остатков, имеющих конкретную модификацию сахара, причем эта модификация отсутствует в сердцевинной части «Y». Примеры модификаций сахара широко известны в данной области техники. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация сахара представляет собой модификацию, выбранную из тех модификаций, которые описаны в US 9006198, причем модификации сахара включены в настоящее описание посредством ссылок. Дополнительные примеры модификаций сахара описаны в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления каждое крыло содержит один или более остатков, имеющих 2'-модификацию, которая не присутствует в сердцевинной части. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-OR¹, где R¹ является таким, как определено и описано в настоящем раскрытии.

[00489] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат мотив крыло-сердцевина, представленный как X-Y, или мотив сердцевина-крыло, представленный как Y-X, в котором остатки в части «X» представляют собой остатки с модифицированным сахаром определенного типа и остатки в сердцевинной части «Y» не представляют собой остатки с модифицированным сахаром такого же определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат мотив крыло-сердцевина-крыло, представленный как X-Y-X, в котором остатки в каждой части «X» представляют собой остатки с модифицированным сахаром определенного типа и остатки в сердцевинной части «Y» не представляют собой остатки с модифицированным сахаром такого же типа. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат мотив крыло-сердцевина, представленный как X-Y, или мотив сердцевина-крыло, представленный как Y-X, в котором остатки в части «X» представляют собой 2'-модифицированные остатки определенного типа и остатки в сердцевинной части «Y» не представляют собой 2'-модифицированные остатки такого же определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат мотив крыло-сердцевина, представленный как X-Y, в котором остатки в части «X» представляют собой 2'-модифицированные остатки определенного типа и остатки в сердцевинной части «Y» не представляют собой 2'-модифицированные остатки того же определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат мотив сердцевина-крыло, представленный как Y-X, в котором остатки в части «X» представляют собой 2'-модифицированные остатки определенного типа и остатки в сердцевинной части «Y» не представляют собой 2'-модифицированные остатки того же определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат мотив крыло-сердцевина-крыло, представленный как X-Y-X, в котором остатки в каждой части «X» представляют собой 2'-модифицированные остатки определенного типа и остатки в сердцевинной части «Y» не представляют собой 2'-модифицированные остатки такого же определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат мотив крыло-сердцевина, представленный как X-Y, в котором остатки в части «X» представляют собой 2'-модифицированные остатки определенного типа и остатки в сердцевинной части «Y» представляют собой 2'-дезоксирибонуклеозид. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат мотив сердцевина-крыло, представленный как Y-X, в котором остатки в части «X» представляют собой 2'-модифицированные остатки определенного типа и остатки в сердцевинной части «Y» представляют собой 2'-дезоксирибонуклеозид. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат мотив крыло-сердцевина-крыло, представленный как X-Y-X, в котором остатки в каждой части «X» представляют собой 2'-модифицированные остатки определенного типа и остатки в сердцевинной части «Y» представляют собой 2'-дезоксирибонуклеозид. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат мотив крыло-сердцевина-крыло, представленный как X-Y-X, в котором остатки в каждой части «X» представляют собой 2'-модифицированные остатки определенного типа и остатки в сердцевинной части «Y» представляют собой 2'-дезоксирибонуклеозид. Например, согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат мотив крыло-сердцевина-крыло, представленный в виде X-Y-X, в котором остатки в каждой части «X» представляют собой 2'-МОЕ-модифицированные остатки и остатки в сердцевинной части «Y» не представляют собой 2'-МОЕ-модифицированные остатки. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат мотив крыло-сердцевина-крыло, представленный как X-Y-X, в котором остатки в каждой части «X» представляют собой 2'-МОЕ-модифицированные остатки и остатки в сердцевинной части «Y» представляют собой 2'-дезоксирибонуклеозид. Специалисту в соответствующих областях техники будет понятно, что все такие описанные выше и в данном описании 2'-модификации рассматриваются в контексте таких мотивов X-Y, Y-X и/или X-Y-X.

[00490] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину одно или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину два или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину три или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину четыре или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину пять или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину шесть или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину семь или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину восемь или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину девять или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину десять или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 11 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 12 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 13 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 14 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 15 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 16 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 17 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 18 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 19 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину десять или более оснований.

[00491] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину одно основание. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину два основания. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину три основания. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину четыре основания. В некоторых вариантах крыло составляет в длину пять оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину шесть оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину семь оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину восемь оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину девять оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 10 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 11 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 12 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 13 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 14 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 15 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 16 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 17 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 18 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину 19 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло составляет в длину десять оснований.

[00492] В некоторых вариантах крыло содержит одну или более хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит одну или более связей с природными фосфатами. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит одну или более хиральных межнуклеотидных связей и одну или более связей с природными фосфатами. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит одну или более хиральных межнуклеотидных связей и две или более связей с природными фосфатами. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит одну или более хиральных межнуклеотидных связей и две или более связей с природными фосфатами, причем две или более связи с природными фосфатами являются последовательными. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло не содержит хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая связь крыла представляет собой связь с природным фосфатом. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло не содержит связей с фосфатами. Согласно некоторым вариантам осуществления каждое крыло независимо представляет собой хиральную межнуклеотидную связь.

[00493] Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит одну или более хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит одну или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит одну или более хиральных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит одну или более хиральных межнуклеотидных связей и две или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит одну или более хиральных межнуклеотидных связей и две или более природных фосфатных связей, причем две или более природных фосфатных связей являются последовательными.

[00494] Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере одну хиральную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере две хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере три хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере четыре хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере пять хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере шесть хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере семь хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере восемь хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере девять хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере десять хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 11 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 12 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 13 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 14 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 15 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 16 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 17 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 18 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 19 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 20 хиральных межнуклеотидных связей.

[00495] Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит одну хиральную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит две хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит три хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит четыре хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит пять хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит шесть хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит семь хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждое крыло независимо содержит восемь хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит девять хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит десять хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 11 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 12 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 13 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 14 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 15 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 16 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 17 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 18 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 19 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 20 хиральных межнуклеотидных связей.

[00496] Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере одну последовательную природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере две последовательные хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере три последовательные хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере четыре последовательные хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере пять последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере шесть последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере семь последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере восемь последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере девять последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере десять последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 11 последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 12 последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 13 последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 14 последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 15 последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 16 последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 17 последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 18 последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 19 последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 20 последовательных хиральных межнуклеотидных связей.

[00497] Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит одну последовательную природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит две последовательные хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит три последовательные хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит четыре последовательные хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит пять последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит шесть последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит семь последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит восемь последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит девять последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит десять последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 11 последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 12 последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 13 последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 14 последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 15 последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 16 последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 17 последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 18 последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 19 последовательных хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 20 последовательных хиральных межнуклеотидных связей.

[00498] Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере одну природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере две природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере три природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере четыре природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере пять природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере шесть природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере семь природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере восемь природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере девять природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере десять природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 11 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 12 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 13 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 14 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 15 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 16 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 17 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 18 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 19 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 20 природных фосфатных связей.

[00499] Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит одну природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит две природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит три природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит четыре природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит пять природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит шесть природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит семь природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит восемь природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит девять природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит десять природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 11 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 12 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 13 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 14 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 15 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 16 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 17 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 18 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 19 природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 20 природных фосфатных связей.

[00500] Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере одну последовательную природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере две последовательные природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере три последовательные природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере четыре последовательные природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере пять последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере шесть последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере семь последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере восемь последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере девять последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере десять последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 11 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 12 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 13 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 14 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 15 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 16 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 17 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 18 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 19 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит по меньшей мере 20 последовательных природных фосфатных связей.

[00501] Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит одну последовательную природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит две последовательные природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит три последовательные природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит четыре последовательные природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит пять последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит шесть последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит семь последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит восемь последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит девять последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит десять последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 11 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 12 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 13 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 14 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 15 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 16 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 17 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 18 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 19 последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла независимо содержит 20 последовательных природных фосфатных связей.

[00502] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло относится к 5'-концу сердцевины (крыло 5'-конца). Согласно некоторым вариантам осуществления крыло относится к 3'-концу сердцевины (крыло 3'-конца). Например, в WV-1092 (mG*SmGmCmAmCftSAftSAftSG*SGftSGftSC*SA*SCftRA*SG*SmAmCmUmU*SmC) mG*SmGmCmAmC представляет собой крыло 5'-конца, *SA*SA*SG*SG*SG*SC*SA*SC*RA*SG*S представляет собой сердцевину, а mAmCmUmU*SmC представляет собой крыло 3'-конца.

[00503] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 5'-конца содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 3'-конца содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждое крыло независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных межнуклеотидных связей. Например, WV-1092 содержит крыло 5'-конца, содержащее одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных межнуклеотидных связей, а крыло 3'-конца содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных межнуклеотидных связей.

[00504] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 5'-конца содержит модифицированную межнуклеотидную связь, имеющую одну или более природных фосфатных связей, соединяющих два или более нуклеозидов после (к 3'-концу) модифицированной межнуклеотидной связи в крыле 5'-конца. Например, крыло 5'-конца mG*SmGmCmAmC содержит модифицированную межнуклеотидную связь (mG*SmG). которая имеет три природные фосфатные связи, соединяющие четыре нуклеозида (mGmCmAmC) после модифицированной межнуклеотидной связи в крыле 5'-конца. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 5'-конца содержит модифицированные межнуклеотидные связи, за которыми следуют одна или более природных фосфатных связей и/или одна или более модифицированных межнуклеотидных связей, за которыми следуют одна или более природных фосфатных связей в крыле 5'-конца (например, mG*SmG и mG*SmC в mG*SmG*SmCmAmC). Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 5'-конца содержит модифицированные межнуклеотидные связи, за которыми следуют одна или более природных фосфатных связей в крыле 5'-конца. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 5'-конца содержит модифицированные межнуклеотидные связи, за которыми следуют одна или более последовательных природных фосфатных связей в крыле 5'-конца. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 5'-конца содержит природную фосфатную связь между двумя нуклеозидами на своем 3'-конце. Например, крыло 5'-конца mG*SmGmCmAmC имеет природную фосфатную связь между двумя нуклеозидами на своем 3'-конце (mG*SmGmCmAmC).

[00505] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 3'-конца содержит модифицированную межнуклеотидную связь, имеющую одну или более природных фосфатных связей, соединяющих два или более нуклеозидов перед (к 5'-концу) модифицированной межнуклеотидной связью в крыле 3'-конца. Например, крыло 3-конца mAmCmUmU*SmC содержит модифицированную межнуклеотидную связь (mU*SmC), которая имеет три природные фосфатные связи, соединяющие четыре нуклеозида (mAmCmUmU) перед модифицированной межнуклеотидной связью в крыле 3'-конца. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 3'-конца содержит модифицированные межнуклеотидные связи, которым предшествует одна или более природных фосфатных связей и/или одна или более модифицированных межнуклеотидных связей, которым предшествует одна или более природных фосфатных связей в крыле 3'-конца (например, mU*SmU и mU*SmC в mAmCmU*SmU*SmC). Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 3'-конца содержит модифицированные межнуклеотидные связи, которым предшествует одна или более природных фосфатных связей в крыле 3'-конца. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 3'-конца содержит модифицированные межнуклеотидные связи, которым предшествует одна или более последовательных природных фосфатных связей в крыле 3'-конца. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 3'-конца содержит природную фосфатную связь между двумя нуклеозидами на своем 5'-конце. Например, крыло 3'-конца, имеющее структуру mAmCmUmU*SmC, имеет природную фосфатную связь между двумя нуклеозидами на своем 5'-конце (mAmCmUmU*SmC).

[00506] Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой один. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой два. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой три. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой четыре. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой пять. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой шесть. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой семь. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой восемь. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой девять. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой десять. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой по меньшей мере один. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой по меньшей мере два. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой по меньшей мере три. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой по меньшей мере четыре. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой по меньшей мере пять. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой по меньшей мере шесть. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой по меньшей мере семь. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой по меньшей мере восемь. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой по меньшей мере девять. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более представляет собой по меньшей мере десять.

[00507] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит только одну хиральную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 5'-конца содержит только одну хиральную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 5'-конца содержит только одну хиральную межнуклеотидную связь на 5'-конце крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 5'-конца содержит только одну хиральную межнуклеотидную связь на 5'-конце крыла, а хиральная межнуклеотидная связь представляет собой Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 5'-конца содержит только одну хиральную межнуклеотидную связь на 5'-конце крыла, а хиральная межнуклеотидная связь представляет собой Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 3'-конца содержит только одну хиральную межнуклеотидную связь на 3'-конце крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 3'-конца содержит только одну хиральную межнуклеотидную связь на 3'-конце крыла, а хиральная межнуклеотидная связь представляет собой Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло 3'-конца содержит только одну хиральную межнуклеотидную связь на 3'-конце крыла, а хиральная межнуклеотидная связь представляет собой Sp.

[00508] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит две или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления все фосфатные связи внутри крыла являются последовательными, и нет никаких нефосфатных связей между любыми двумя фосфатными связями внутри крыла.

[00509] Согласно некоторым вариантам осуществления связь, соединяющая крыло и сердцевину, рассматривается как часть сердцевины при описании связей, например, химии связей, стереохимии связей и т.д. Например, в WV-1092 mG*SmGmCmAmC*SA*SA*SG*SG*SG*SC*S A*SC*RA*SG^*SmAmCmUmU*SmC, подчеркнутые связи могут рассматриваться как часть сердцевины (жирные), его 5'-крыло (содержащее 2'-ОМе на остатках сахара) имеет одну единственную фосфоротиоатную связь Sp на своем 5'-конце, его 3'-крыло (содержащее 2'-ОМе на остатках сахара) имеет одну фосфоротиоатную связь Sp на своем 3'-конце, и его сердцевина не содержит 2'-модификаций на сахаре).

[00510] Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой модифицированную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой связь, характеризующуюся структурой формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации представляет собой фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой замещенную фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой фосфоротиоатную триэфирную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая 5'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой модифицированную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая 5'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой связь, характеризующуюся структурой формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая 5'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая 5'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой замещенную фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая 5'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой фосфоротиоатную триэфирную связь.

[00511] Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой модифицированную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой связь, характеризующуюся структурой формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой замещенную фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой фосфоротиоатную триэфирную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая 3'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой модифицированную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая 3'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой связь, характеризующуюся структурой формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая 3'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая 3'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой замещенную фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая 3'-межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой фосфоротиоатную триэфирную связь.

[00512] Согласно некоторым вариантам осуществления обе межнуклеотидные связи, связанные с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляют собой модифицированные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления обе межнуклеотидные связи, связанные с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляют собой связи, характеризующиеся структурой формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления обе межнуклеотидные связи, связанные с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляют собой фосфоротиоатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления обе межнуклеотидные связи, связанные с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляют собой замещенные фосфоротиоатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления обе межнуклеотидные связи, связанные с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляют собой фосфоротиоатные триэфирные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой модифицированную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой связь, характеризующуюся структурой формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой замещенную фосфоротиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь, связанная с фрагментом сахара без 2'-модификации, представляет собой фосфоротиоатную триэфирную связь.

[00513] Согласно некоторым вариантам осуществления фрагмент сахара без 2'-модификации представляет собой фрагмент сахара, обнаруженный в природном нуклеозиде ДНК.

[00514] Согласно некоторым вариантам осуществления для структуры крыло-сердцевина-крыло крыло 5'-конца содержит только одну хиральную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления для структуры крыло-сердцевина-крыло крыло 5'-конца содержит только одну хиральную межнуклеотидную связь на 5'-конце крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления для структуры крыло-сердцевина-крыло крыло 3'-конца содержит только одну хиральную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления для структуры крыло-сердцевина-крыло крыло 3'-конца содержит только одну хиральную межнуклеотидную связь на 3'-конце крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления для структуры крыло-сердцевина-крыло каждое крыло содержит только одну хиральную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления для структуры крыло-сердцевина-крыло каждое крыло содержит только одну хиральную межнуклеотидную связь, в которой крыло 5'-конца содержит только одну хиральную межнуклеотидную связь на своем 5'-конце; и крыло 3'-конца содержит только одну хиральную межнуклеотидную связь на своем 3'-конце. Согласно некоторым вариантам осуществления единственная хиральная межнуклеотидная связь в 5'-крыле представляет собой Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления единственная хиральная межнуклеотидная связь в 5'-крыле представляет собой Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления единственная хиральная межнуклеотидная связь в 3'-крыле представляет собой Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления единственная хиральная межнуклеотидная связь в 3'-крыле представляет собой Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления единственная хиральная межнуклеотидная связь как в 5'-, так и в 3'-крыльях представляет собой Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления единственная хиральная межнуклеотидная связь как в 5'-, так и в 3'-крыльях представляет собой Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления единственная хиральная межнуклеотидная связь в S'-крыле представляет собой Sp, и единственная хиральная межнуклеотидная связь в 3'-крыле представляет собой Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления единственная хиральная межнуклеотидная связь в 5'-крыле представляет собой Rp, и единственная хиральная межнуклеотидная связь в 3'-крыле представляет собой Sp.

[00515] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит две хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит только две хиральные межнуклеотидные связи и одну или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит только две хиральные межнуклеотидные связи и две или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит только две хиральные межнуклеотидные связи и две или более последовательных природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит только две хиральные межнуклеотидные связи и две последовательные природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит только две хиральные межнуклеотидные связи и три последовательные природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-крыло (к сердцевине) содержит только две хиральные межнуклеотидные связи, одну на своем 5'-конце и другую на своем 3'-конце, с одной или более природными фосфатными связями между ними. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-крыло (к сердцевине) содержит только две хиральные межнуклеотидные связи, одну на своем 5'-конце и другую на своем 3'-конце, с двумя или более природными фосфатными связями между ними. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-крыло (к сердцевине) содержит только две хиральные межнуклеотидные связи, одну на своем 3'-конце и другую на своем 3'-конце, с одной или несколькими природными фосфатными связями между ними. Согласно некоторым вариантам осуществления 3'-крыло (к сердцевине) содержит только две хиральные межнуклеотидные связи, одну на своем 3'-конце и другую на своем 3'-конце, с двумя или более природными фосфатными связями между ними.

[00516] Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-крыло содержит только две хиральные межнуклеотидные связи, одну на своем 5'-конце и другую на своем 3'-конце, с одной или более природными фосфатными связями между ними, и 3'-крыло содержит только одну межнуклеотидную связь на своем 3'-конце. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-крыло (к сердцевине) содержит только две хиральные межнуклеотидные связи, одну на своем 5'-конце и другую на своем 3'-конце, с двумя или более природными фосфатными связями между ними, и 3'-крыло содержит только одну межнуклеотидную связь на своем 3'-конце. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая хиральная межнуклеотидная связь независимо имеет свою собственную стереохимию. Согласно некоторым вариантам осуществления обе хиральные межнуклеотидные связи в 5'-крыле имеют одинаковую стереохимию. Согласно некоторым вариантам осуществления обе хиральные межнуклеотидные связи в 5'-крыле имеют разную стереохимию. Согласно некоторым вариантам осуществления обе хиральные межнуклеотидные связи в 5'-крыле характеризуются конфигурацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления обе хиральные межнуклеотидные связи в 5'-крыле характеризуются конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральные межнуклеотидные связи в 5'- и 3'-крыльях имеют одинаковую стереохимию. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральные межнуклеотидные связи в 5'- и 3'-крыльях характеризуются конфигурацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральные межнуклеотидные связи в 5'- и 3'-крыльях характеризуются конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральные межнуклеотидные связи в 5'- и 3'-крыльях имеют различную стереохимию.

[00517] Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная модифицированная фосфатная связь представляет собой хиральную фосфоротиоатную связь, т.е. фосфоротиоатную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит по меньшей мере 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 100% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления все хиральные модифицированные фосфатные связи представляют собой хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% или 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 10% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 20% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 30% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 40% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 50% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 60% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 70% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 80% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 95% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp.

[00518] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 1 хиральная фосфоротиоатная межнуклеотидная связь области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно две хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 3 хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 4 хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 5 хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 6 хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 7 хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 8 хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 9 хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp.

[00519] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно две последовательные хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 3 последовательные хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 4 последовательные хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 5 последовательных хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 6 последовательных хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 7 последовательных хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 8 последовательных хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 9 последовательных хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Sp.

[00520] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% или 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 10% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 20% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 30% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 40% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 50% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 60% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 70% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 80% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 95% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp.

[00521] Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% или 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 10% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 20% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 30% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 40% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 50% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 60% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 70% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 80% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 95% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла имеет только одну хиральную фосфоротиоатную межнуклеотидную связь конформации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла имеет только одну хиральную фосфоротиоатную межнуклеотидную связь конформации Rp, причем все межнуклеотидные связи представляют собой хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи.

[00522] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 1 хиральная фосфоротиоатная межнуклеотидная связь области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно две хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 3 хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 4 хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 5 хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 6 хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 7 хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 8 хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 9 хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp.

[00523] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно две последовательные хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно три последовательные хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 4 последовательные хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 5 последовательных хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 6 последовательных хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 7 последовательных хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 8 последовательных хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 9 последовательных хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp.

[00524] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит один или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит два или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит три или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит четыре или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит пять или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит шесть или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит семь или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит восемь или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит девять или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит десять или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 11 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 12 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 13 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 14 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 15 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 16 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 17 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 18 или более модифицированных фрагментов сахара. В некоторых вариантах крыло содержит 19 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 20 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 21 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 22 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 23 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 24 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 25 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 30 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 35 или более модифицированных фрагментов сахара.

[00525] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит один или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит два или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. В некоторых вариантах крыло содержит три или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит четыре или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит пять или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит шесть или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит семь или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит восемь или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит девять или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит десять или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 11 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 12 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 13 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 14 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 15 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 16 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 17 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 18 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 19 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 20 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 21 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 22 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 23 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 24 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 25 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 30 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 35 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара.

[00526] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит один или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит два или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит три или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит четыре или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит пять или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит шесть или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит семь или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит восемь или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит девять или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит десять или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 11 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 12 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 13 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 14 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 15 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 16 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 17 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 18 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 19 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 20 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 21 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 22 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 23 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 24 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 25 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 30 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 35 или более 2'-F.

[00527] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит один 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит два 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит три 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит четыре 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит пять 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит шесть 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит семь 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит восемь 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит девять 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит десять 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 11 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 12 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 13 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 14 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 15 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 16 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 17 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 18 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 19 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 20 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 21 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 22 2'-F. В некоторых вариантах крыло содержит 23 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 24 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 25 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 30 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 35 2'-F.

[00528] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит один или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит два или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит три или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит четыре или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит пять или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит шесть или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит семь или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит восемь или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит девять или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит десять или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 11 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 12 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 13 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 14 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 15 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 16 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 17 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 18 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 19 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 20 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 21 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 22 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 23 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 24 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 25 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 30 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 35 или более последовательных 2'-F.

[00529] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит один последовательный 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит два последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит три последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит четыре последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит пять последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит шесть последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит семь последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит восемь последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит девять последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит десять последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 11 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 12 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 13 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 14 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 15 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 16 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 17 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 18 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 19 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 20 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 21 последовательный 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 22 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 23 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 24 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 25 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 30 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 35 последовательных 2'-F.

[00530] Согласно некоторым вариантам осуществления исследования in vitro, проведенные с предложенными олигонуклеотидами, проводились с включением нуклеиновых кислот в клетки посредством гимнозиса (без трансфекционного реагента). Согласно некоторым вариантам осуществления экспериментальные данные показали, что эффекты 2'-модификаций не зависят от способа введения олигонуклеотидов в клетки. Согласно некоторым вариантам осуществления, например, некоторые олигонуклеотиды, которые были полностью модифицированы 2'-F, имели более высокую эффективность при трансфекции (с трансфекционным реагентом), особенно при низких концентрациях.

[00531] Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину одно или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину одно или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину два или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину три или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину четыре или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину пять или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину шесть или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину семь или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину восемь или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину девять или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину десять или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 11 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 12 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 13 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 14 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 15 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 16 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 17 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 18 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 19 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 20 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину более 20 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 2 основания. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 3 основания. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 4 основания. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 5 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 6 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 7 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 8 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 9 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 10 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 11 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 12 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 13 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 14 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 15 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 16 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 17 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 18 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 19 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины составляет в длину 20 оснований.

[00532] Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит одну или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина не содержит природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая связь сердцевины представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь.

[00533] Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере одну природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере две природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере три природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере четыре природные фосфатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере пять природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере шесть природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере семь природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере восемь природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере девять природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере десять природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере две модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере три модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере четыре модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере пять модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере шесть модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере семь модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере восемь модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере девять модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере десять модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 11 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 12 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 13 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 14 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 15 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 16 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 17 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 18 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 19 модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 20 модифицированных межнуклеотидных связей.

[00534] Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит одну или более хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит одну или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина независимо содержит одну или более хиральных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина не содержит природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая связь сердцевины представляет собой хиральную межнуклеотидную связь.

[00535] Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере одну природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере две хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере три хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере четыре хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере пять хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере шесть хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере семь хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере восемь хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере девять хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере десять хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 11 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 12 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 13 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 14 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 15 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 16 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 17 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 18 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 19 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит по меньшей мере 20 хиральных межнуклеотидных связей.

[00536] Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит одну природную фосфатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит две хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит три хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит четыре хиральные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит пять хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит шесть хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит семь хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит восемь хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит девять хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит десять хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 11 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 12 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 13 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 14 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 15 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 16 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 17 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 18 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 19 хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 20 хиральных межнуклеотидных связей.

[00537] Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащим (Sp)_m(Rp)_n, (Rp)_n(Sp)_m, (Np)_t(Np)_n(Sp)_m или (Sp)_t(Rp)_n(Sp)_m, где каждый из m, n, t и Np независимо является таким, как определено и описано в настоящем раскрытии. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащим (Sp)_m(Rp)_n, (Np)_n(Sp)_m, (Np)_t(Np)_n(Sp)_m или (Sp)_t(Np)_n(Sp)_m. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащим (Sp)_m(Rp)_n. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащим (Sp)_m(Np)_n, где m>2 и n равно 1. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащим (Rp)_n(Sp)_m. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащим (Rp)_n(Sp)_m, где m>2 и n равно 1. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащим (Np)_t(Rp)_n(Sp)_m. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащим (Np)_t(Np)_n(Sp)_m, где m>2 и n равно 1. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащим (Np)_t(Rp)_n(Sp)_m, где t>2, m>2 и n равно 1. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащим (Sp)_t(Rp)_n(Sp)_m. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащим (Sp)_t(Np)_n(Sp)_m, где m>2 и n равно 1. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащим (Sp)_t(Np)_n(Sp)_m, где t>2, m>2 и n равно 1. Среди прочего, настоящее раскрытие демонстрирует, что Согласно некоторым вариантам осуществления такие профили могут обеспечивать и/или усиливать контролируемое расщепление, улучшенную скорость расщепления, селективность и т.д. целевой последовательности, например, последовательности РНК. Примеры профилей хиральных центров остова описаны в настоящем раскрытии.

[00538] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 60% хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 65% хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 66% хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 67% хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 70% хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 75% хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 80% хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 85% хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 90% хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 95% хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуются конформацией Sp.

[00539] Согласно некоторым вариантам осуществления каждая хиральная межнуклеотидная связь в области сердцевины характеризуются конформацией Sp.

[00540] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 1 межнуклеотидная связь области сердцевины характеризуется конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 2 межнуклеотидные связи области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 3 межнуклеотидные связи области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 4 межнуклеотидные связи области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 5 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 6 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 7 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 8 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 9 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 10 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 11 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 12 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 13 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 14 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 15 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 16 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 17 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 18 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 19 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 20 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 21 межнуклеотидная связь области сердцевины характеризуется конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере две межнуклеотидные связи области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидные связи конформации Sp являются последовательными.

[00541] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 60% хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 65% хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 66% хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 67% хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 70% хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 75% хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 80% хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 85% хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления некоторые хиральные межнуклеотидные связи в области сердцевины характеризуются конформацией Rp.

[00542] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 1 межнуклеотидная связь области сердцевины характеризуется конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере две межнуклеотидные связи области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере три межнуклеотидные связи области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере четыре межнуклеотидные связи области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 5 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 6 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 7 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 8 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 9 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 10 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 11 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 12 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 13 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 14 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 15 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 16 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 17 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 18 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 19 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 20 межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 21 межнуклеотидная связь области сердцевины характеризуется конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере две межнуклеотидные связи области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидные связи конформации Rp являются последовательными.

[00543] Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит один или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит два или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит три или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит четыре или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит пять или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит шесть или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит семь или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит восемь или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит девять или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит десять или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 11 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 12 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 13 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 14 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 15 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 16 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 17 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 18 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 19 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 20 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 21 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 22 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 23 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 24 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 25 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 30 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 35 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-ОМе.

[00544] Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит один или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит два или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит три или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит четыре или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит пять или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит шесть или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит семь или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит восемь или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит девять или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит десять или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 11 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 12 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 13 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 14 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 15 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 16 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 17 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 18 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 19 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 20 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 21 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 22 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 23 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 24 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 25 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 30 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления сердцевина содержит 35 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-OR1. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-ОМе.

[00545] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 1 хиральная фосфоротиоатная межнуклеотидная связь области крыла характеризуется конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 2 хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 3 хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 4 хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 5 хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 6 хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 7 хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 8 хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 9 хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp.

[00546] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно две последовательные хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно три последовательные хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 4 последовательные хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 5 последовательных хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 6 последовательных хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 7 последовательных хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 8 последовательных хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 9 последовательных хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области крыла характеризуются конформацией Rp.

[00547] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит один или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит два или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит три или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит четыре или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит пять или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит шесть или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит семь или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит восемь или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит девять или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит десять или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 11 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 12 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 13 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 14 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 15 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 16 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 17 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 18 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 19 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 20 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 21 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 22 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 23 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 24 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 25 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 30 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 35 или более модифицированных фрагментов сахара.

[00548] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит один или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит два или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит три или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит четыре или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит пять или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит шесть или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит семь или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит восемь или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит девять или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит десять или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 11 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 12 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 13 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 14 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 15 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 16 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 17 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 18 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 19 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 20 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 21 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 22 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 23 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 24 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 25 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 30 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 35 или более 2'-модифицированных фрагментов сахара.

[00549] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит один или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит два или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит три или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит четыре или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит пять или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит шесть или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит семь или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит восемь или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит девять или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит десять или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 11 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 12 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 13 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 14 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 15 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 16 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 17 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 18 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 19 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 20 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 21 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 22 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 23 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 24 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 25 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 30 или более 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 35 или более 2'-F.

[00550] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит один 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит два 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит три 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит четыре 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит пять 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит шесть 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит семь 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит восемь 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит девять 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит десять 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 11 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 12 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 13 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 14 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 15 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 16 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 17 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 18 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 19 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 20 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 21 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 22 2'-F. В некоторых вариантах крыло содержит 23 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 24 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 25 2'-F. В некоторых вариантах крыло содержит 30 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 35 2'-F.

[00551] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит один или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит два или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит три или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит четыре или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит пять или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит шесть или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит семь или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит восемь или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит девять или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит десять или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 11 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 12 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 13 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 14 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 15 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 16 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 17 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 18 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 19 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 20 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 21 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 22 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 23 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 24 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 25 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 30 или более последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 35 или более последовательных 2'-F.

[00552] Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит один последовательный 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит два последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит три последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит четыре последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит пять последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит шесть последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит семь последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит восемь последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит девять последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит десять последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 11 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 12 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 13 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 14 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 15 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 16 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 17 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 18 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 19 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 20 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 21 последовательный 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 22 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 23 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 24 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 25 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 30 последовательных 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления крыло содержит 35 последовательных 2'-F.

[00553] Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло (т.е. X-Y-X) представлен в цифровой форме как, например, 5-10-4, что означает, что крыло к 5'-концу сердцевины составляет 5 оснований в длину, область сердцевины составляет 10 оснований в длину, а область крыла к 3'-концу сердцевины составляет 4 основания в длину. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой любой из, например, 2-16-2, 3-14-3, 4-12-4, 5-10-5, 2-9-6, 3-9-3, 3-9-4, 3-9-5, 4- 7-4, 4-9-3, 4-9-4, 4-9-5, 4-10-5, 4-11-4, 4-11-5, 5-7-5, 5-8- 6, 8-7-5, 7-7-6, 5-9-3, 5-9-5, 5-10-4, 5-10-5, 6-7-6, 6-8-5 и 6-9-2 и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой 5-10-5. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой 7-7-6. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой 8-7-5.

[00554] Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина представляет собой 5-15, 6-14, 7-13, 8-12, 9-12 и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив сердцевина-крыло представляет собой 5-15, 6-14, 7-13, 8-12, 9-12 и т.д.

[00555] Согласно некоторым вариантам осуществления все межнуклеотидные связи предложенных олигонуклеотидов таких мотивов крыло-сердцевина-крыло (т.е. X-Y-X) являются хиральными связями с модифицированными фосфатами. Согласно некоторым вариантам осуществления все межнуклеотидные связи предложенных олигонуклеотидов таких мотивов крыло-сердцевина-крыло (т.е. X-Y-X) являются хиральными фосфоротиоатными межнуклеотидными связями. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральные межнуклеотидные связи предложенных олигонуклеотидов таких мотивов крыло-сердцевина-крыло составляют по меньшей мере примерно 10, 20, 30, 40, 50, 50, 70, 80 или 90% хиральных межнуклеотидных связей с модифицированными фосфатами. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральные межнуклеотидные связи предложенных олигонуклеотидов таких мотивов крыло-сердцевина-крыло составляют по меньшей мере примерно 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80 или 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральные межнуклеотидные связи предложенных олигонуклеотидов таких мотивов крыло-сердцевина-крыло составляют по меньшей мере примерно 10, 20, 30, 40, 50, 50, 70, 80 или 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей конформации Sp.

[00556] Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла мотива крыло-сердцевина-крыло необязательно содержит хиральные межнуклеотидные связи с модифицированными фосфатами. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла мотива крыло-сердцевина-крыло необязательно содержит хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла мотива крыло-сердцевина-крыло содержит хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла мотива крыло-сердцевина-крыло характеризуются одинаковой стереохимией межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления две области крыла мотива крыло-сердцевина-крыло характеризуются разной стереохимией межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая межнуклеотидная связь в крыльях независимо представляет собой хиральную межнуклеотидную связь.

[00557] Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло необязательно содержит хиральные межнуклеотидные связи с модифицированными фосфатами. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло необязательно содержит хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит повторяющийся профиль стереохимии межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит повторяющийся профиль стереохимии межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит повторяющийся профиль стереохимии межнуклеотидных связей, причем повторяющийся профиль представляет собой (Sp)_mRp или Rp(Sp)_m, где m представляет собой 1-50. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит повторяющийся профиль стереохимии межнуклеотидных связей, причем повторяющийся профиль представляет собой (Sp)_mRp или Rp(Sp)_m, где m представляет собой 1-50. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит повторяющийся профиль стереохимии межнуклеотидных связей, причем повторяющийся профиль представляет собой (Sp)_mRp, где m представляет собой 1-50. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит повторяющийся профиль стереохимии межнуклеотидных связей, причем повторяющийся профиль представляет собой Rp(Sp)_m, где m представляет собой 1-50. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит повторяющийся профиль стереохимии межнуклеотидных связей, причем повторяющийся профиль представляет собой (Sp)_mRp или Rp(Sp)_m, где m представляет собой 1-50. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит повторяющийся профиль стереохимии межнуклеотидных связей, причем повторяющийся профиль представляет собой (Sp)_mRp, где m представляет собой 1-50. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит повторяющийся профиль стереохимии межнуклеотидных связей, причем повторяющийся профиль представляет собой Rp(Sp)_m, где m представляет собой 1-50. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит повторяющийся профиль стереохимии межнуклеотидных связей, причем повторяющийся профиль представляет собой мотив, содержащий по меньшей мере 33% межнуклеотидных связей в конформации S. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит повторяющийся профиль стереохимии межнуклеотидных связей, причем повторяющийся профиль представляет собой мотив, содержащий по меньшей мере 50% межнуклеотидных связей в конформации S. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит повторяющийся профиль стереохимии межнуклеотидных связей, причем повторяющийся профиль представляет собой мотив, содержащий по меньшей мере 66% межнуклеотидных связей в конформации S. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит повторяющийся профиль стереохимии межнуклеотидных связей, причем повторяющийся профиль представляет собой повторяющийся триплетный мотив, выбранный из RpRpSp и SpSpRp. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит повторяющийся профиль стереохимии межнуклеотидных связей, причем повторяющийся профиль представляет собой повторяющийся RpRpSp. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит повторяющийся профиль стереохимии межнуклеотидных связей, причем повторяющийся профиль представляет собой повторяющийся SpSpRp.

[00558] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова в области сердцевины содержит (Sp)_mRp или Rp(Sp)_m. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова в области сердцевины содержит Rp(Sp)_m. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова в области сердцевины содержит (Sp)_mRp. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 2. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова в области сердцевины содержит Rp(Sp)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова в области сердцевины содержит (Sp)₂Rp(Sp)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова в области сердцевины содержит (Np)₂Rp(Sp)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова в области сердцевины содержит RpSpRp(Sp)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова в области сердцевины содержит SpRpRp(Sp)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова в области сердцевины содержит (Sp)₂Rp.

[00559] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова содержит (Sp)_mRp или Rp(Sp)_m. предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова содержит Rp(Sp)_m. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова содержит (Sp)_mRp. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 2. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова содержит Rp(Sp)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова содержит (Sp)₂Rp(Sp)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова содержит (Rp)₂Rp(Sp)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова содержит RpSpRp(Sp)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова содержит SpNpRp(Sp)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова содержит (Sp)₂Rp.

[00560] Как определено в данном описании m равно 1-50. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 1. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 2-50. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 3, 4, 5, 6, 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 4, 5, 6, 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 5, 6, 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 6, 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 2. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 3. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 4. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 5. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 6. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 7. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 8. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 9. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 10. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 11. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 12. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 13. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 14. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 15. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 16. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 17. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 18. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 19. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 20. Согласно некоторым вариантам осуществления, m равно 21. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 22. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 23. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 24. Согласно некоторым вариантам осуществления m равно 25. Согласно некоторым вариантам осуществления m больше чем 25.

[00561] Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющийся профиль представляет собой (Sp)_m(Rp)_n, причем n представляет собой независимо 1-10 и m составляет независимо, как это определено выше и описано в данном описании. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова содержит (Sp)_m(Rp)_n. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова в области сердцевины содержит (Sp)_m(Rp)_n. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющийся профиль представляет собой (Rp)_n(Sp)_m, где n равно 1-10, и m составляет независимо, как определено выше и описано в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова содержит (Rp)_n(Sp)_m. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова в области сердцевины содержит (Rp)_n(Sp)_m. Согласно некоторым вариантам осуществления (Rp)_n(Sp)_m представляет собой (Rp)(Sp)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_n(-Rp)_m представляет собой (Sp)₂(Rp).

[00562] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова содержит (Sp)_m(Np)_n(Sp)_t. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющийся профиль представляет собой (Sp)_m(Rp)_n(Sp)_t, где n равно 1-10, t равно 1-50 и m является таким, как определено выше и описано в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова в области сердцевины содержит (Sp)_m(Rp)_n(Sp)_t. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющийся профиль представляет собой (Sp)_t(Np)_n(Sp)_m, где n равно 1-10, t равно 1-50, a m является таким, как определено выше и описано в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова содержит (Sp)_t(Rp)_n(Sp)_m. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова в области сердцевины содержит (Sp)_t(Rp)_n(Sp)_m.

[00563] Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющийся профиль представляет собой (Np)_t(Np)_n(Sp)_m, где n равно 1-10, t равно 1-50, Np независимо представляет собой Rp или Sp, a m является таким, как определено выше и описано в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова содержит (Np)_t(Np)_n(Sp)_m. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова в области сердцевины содержит ((Np)_t(Np)_n(Sp)_m. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющийся профиль представляет собой (Np)_m(Rp)_n(Sp)_t, где n равно 1-10, t равно 1-50, Np независимо представляет собой Rp или Sp, a m является таким, как определено выше и описано в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова содержит (Np)_m(Rp)_n(Sp)_t. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, чей профиль хиральных центров остова в области сердцевины содержит (Np)_m(Rp)_n(Sp)_t. Согласно некоторым вариантам осуществления Np представляет собой Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления Np представляет собой Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления все Np одинаковы. Согласно некоторым вариантам осуществления все Np представляют собой Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один Np отличается от другого Np. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 2.

[00564] Как определено в данном описании, n равно 1-10. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 1,2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 1. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 3, 4, 5, 6, 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 4, 5, 6, 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 5, 6, 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления n 6, 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления n 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 1. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 2. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 3. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 4. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 5. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 6. Согласно некоторым вариантам осуществления n 7. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 8. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 9. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 10.

[00565] Как определено в данном описании, t равно 1-50. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 1. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 2-50. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 3, 4, 5, 6, 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 4, 5, 6, 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 5, 6, 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 6, 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 7 или 8. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 2. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 3. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 4. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 5. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 6. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 7. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 8. Согласно некоторым вариантам осуществления, t равно 9. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 10. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 11. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 12. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 13. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 14. Согласно некоторым вариантам осуществления t является 15. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 16. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 17. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 18. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 19. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 20. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 21. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 22. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 23. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 24. Согласно некоторым вариантам осуществления t равно 25. Согласно некоторым вариантам осуществления t больше чем 25.

[00566] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 2. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 3. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 4. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 5. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 6. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 7. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 8. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 9. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 10. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 11. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 12. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 13. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 14. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 15. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 16. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 17. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 18. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 19. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 20. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 21. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 22. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 23. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 24. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один из m и t больше чем 25.

[00567] Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из m и t больше чем 2. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из m и t больше чем 3. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из m и t больше чем 4. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из m и t больше чем 5. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из m и t больше чем 6. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из m и t больше чем 7. Согласно некоторым вариантам осуществления, каждый из m и t больше чем 8. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из m и t больше чем 9. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из m и t больше чем 10. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из m и t больше чем 11. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из m и t больше чем 12. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из m и t больше чем 13. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из m и t больше чем 14. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из m и t больше чем 15. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из m и t больше чем 16. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из m и t больше чем 17. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из m и t больше чем 18. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из m и t больше чем 19. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из m и t больше чем 20.

[00568] Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 3. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 4. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 5. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 6. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 7. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 8. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 9. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 10. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 11. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 12. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 13. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 14. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 15. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 16. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 17. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 18. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 19. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 20. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 21. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 22. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 23. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 24. Согласно некоторым вариантам осуществления сумма m и t больше чем 25.

[00569] Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 1 и по меньшей мере один из m и t больше чем 1. Согласно некоторым вариантам осуществления n равно 1 и каждый из m и t независимо больше чем 1. Согласно некоторым вариантам осуществления m>n и t>n. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_m(Np)_n(Sp)_t представляет собой (Sp)₂Rp(Sp)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_t(Np)_n(Sp)_m представляет собой (Sp)_t(Rp)_n(Sp)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_t(Np)_n(Sp)_m представляет собой SpRp(Sp)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления (Np)_t(Rp)_n(Sp)_m представляет собой (Np)_tRp(Sp)_m. Согласно некоторым вариантам осуществления (Np)_t(Np)_n(Sp)_m представляет собой (Np)₂Rp(Sp)_m. Согласно некоторым вариантам осуществления (Np)_t(Np)_n(Sp)_m представляет собой (Rp)₂Rp(Sp)_m. Согласно некоторым вариантам осуществления (Np)_t(Np)_n(Sp)_m представляет собой (Sp)₂Rp(Sp)_m. Согласно некоторым вариантам осуществления (Np)_t(Np)_n(Sp)_m представляет собой RpSpRp(Sp)_m. Согласно некоторым вариантам осуществления (Np)_t(Np)_n(Sp)m представляет собой SpNpRp(Sp)_m.

[00570] Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_t(Np)_n(Sp)_m представляет собой SpRpSpSp. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_t(Np)_n(Sp)_m представляет собой (Sp)_t(Np)_n(Sp)_m. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_t(Rp)_n(Sp)_m представляет собой (Sp)₃Rp(Sp)₃. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_t(Np)_n(Sp)_m представляет собой (Sp)₄Rp(Sp)₄. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_t(Rp)_n(Sp)_m представляет собой (Sp)_tRp(Sp)_s. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_t(Rp)_n(Sp)_m представляет собой SpRp(Sp)₅. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_t(Rp)_n(Sp)_m представляет собой (Sp)₂Rp(Sp)₅. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_t(Rp)_n(Sp)_m представляет собой (Sp)₃Rp(Sp)₅. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_t(Np)_n(Sp)_m представляет собой (Sp)₄Rp(Sp)₅. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_t(Rp)_n(Sp)_m представляет собой (Sp)₅Rp(Sp)₅.

[00571] Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_m(Rp)_n(Sp)_t представляет собой (Sp)₂Rp(Sp)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_t(Rp)_n(Sp)_m представляет собой (Sp)₃Rp(Sp)₃. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_m(Np)_n(Sp)_t представляет собой (Sp)₄Rp(Sp)₄. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_t(Rp)_n(Sp)_m представляет собой (Sp)_mRp(Sp)₅. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_t(Rp)_n(Sp)_m представляет собой (Sp)₂Rp(Sp)₅. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_t(Rp)_n(Sp)_m представляет собой (Sp)₃Rp(Sp)₅. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_t(Rp)_n(Sp)_m представляет собой (Sp)₄Rp(Sp)₅. Согласно некоторым вариантам осуществления (Sp)_t(Rp)_n(Sp)_m представляет собой (Sp)-Rp(Sp)₅.

[00572] Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит по меньшей мере одну фосфоротиоатную межнуклеотидную связь конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит по меньшей мере одну фосфоротиоатную межнуклеотидную связь конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит только одну фосфоротиоатную межнуклеотидную связь конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив области сердцевины содержит по меньшей мере две межнуклеотидные связи конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит по меньшей мере две межнуклеотидные связи конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит по меньшей мере две фосфоротиоатные межнуклеотидные связи конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит по меньшей мере три межнуклеотидные связи конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит по меньшей мере три межнуклеотидные связи конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит по меньшей мере три фосфоротиоатные межнуклеотидные связи конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит по меньшей мере три фосфоротиоатные межнуклеотидные связи конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит по меньшей мере 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 межнуклеотидных связей конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины мотива крыло-сердцевина-крыло содержит по меньшей мере 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 межнуклеотидных связей конфигурации Rp.Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит по меньшей мере 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 фосфоротиоатных межнуклеотидных связей конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит по меньшей мере 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 фосфоротиоатных межнуклеотидных связей конфигурации Rp.

[00573] Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 2'-модификации фрагментов сахара, которые отличаются от области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит те же типы 2'-модификаций, которые отличаются от области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит 2'-F, который отсутствует в области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит профиль 2'-F, который отсутствует в области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит уровень 2'-F, который отличается от области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления уровень является абсолютным, как измерено посредством процента модификаций 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления уровень является относительным, как измерено посредством процента модификаций 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла отличается от области сердцевины тем, что она содержит меньше 2'-модификаций, представленных в области сердцевины, как измерено числом и/или процентом таких 2'-модификаций. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит меньше модификаций 2'-OR1 в области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла содержит меньше модификаций 2'-ОМе в области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления область крыла отличается от области сердцевины тем, что она содержит меньше немодифицированных фрагментов сахара, представленных в области сердцевины, как измерено посредством числа и/или процента таких 2'-модификаций.

[00574] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат две или более областей крыла и область сердцевины, например, предложенные олигонуклеотиды могут содержать структуру крыло-сердцевина-крыло. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла содержит 2'-модификации фрагментов сахара, которые отличаются от области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла содержит тот же тип 2'-модификаций, которые отличаются от области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла содержит 2'-F, который отсутствует в области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла содержит профиль 2'-F, который отсутствует в области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла содержит уровень 2'-F, который отличается от области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления уровень является абсолютным, как измерено числом модификаций 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления уровень является относительным, как измерено процентом модификаций 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла отличается от области сердцевины тем, что она содержит меньше 2'-модификаций, представленных в области сердцевины, как измерено числом и/или процентом таких 2'-модификаций. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла содержит меньше модификаций 2'-OR¹ в области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла содержит меньше модификаций 2'-ОМе в области сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая область крыла отличается от области сердцевины тем, что она содержит меньше немодифицированных фрагментов сахара, представленных в области сердцевины, как измерено числом и/или процентом таких 2'-модификаций.

[00575] Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой мотив 5-10-5, в котором остатки в каждой области крыла представляют собой 2'-модифицированные остатки. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой мотив 5-10-5, в котором остатки в каждой области крыла представляют собой 2'-OR¹-модифицированные остатки. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой мотив 5-10-5, в котором остатки в каждой области крыла представляют собой 2'-МОЕ-модифицированные остатки. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой мотив 5-10-5, в котором остатки в каждой области крыла представляют собой 2'-Р-модифицированные остатки. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой мотив 5-10-5, в котором остатки в каждой области крыла представляют собой 2'-ОМе-модифицированные остатки. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой мотив 5-10-5, в котором остатки в области сердцевины представляют собой остатки 2'-дезоксирибонуклеозида. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой мотив 5-10-5, в котором все межнуклеозидные связи представляют собой фосфоротиоатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой мотив 5-10-5, в котором все межнуклеотидные связи представляют собой хиральные фосфоротиоатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой мотив 5-10-5, в котором остатки в каждой области крыла представляет собой 2'-модифицированные остатки, остатки в области сердцевины представляют собой 2'-дезоксирибонуклеозидные остатки и все межнуклеотидные связи в области сердцевины представляет собой хиральные фосфоротиоатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой мотив 5-10-5, в котором остатки в каждой области крыла представляет собой 2'-OR¹-модифицированные остатки, остатки в области сердцевины представляют собой 2'-дезоксирибонуклеозидные остатки и все межнуклеотидные связи в области сердцевины представляют собой хиральные фосфоротиоатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой мотив 5-10-5, в котором остатки в каждой области крыла представляют собой 2'-МОЕ-модифицированные остатки, остатки в области сердцевины представляют собой 2'-дезоксирибонуклеозидные остатки и все межнуклеотидные связи в области сердцевины представляют собой хиральные фосфоротиоатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой мотив 5-10-5, в котором остатки в каждой области крыла представляет собой 2'-ОМе-модифицированные остатки, остатки в области сердцевины представляют собой 2'-дезоксирибонуклеозидные остатки и все межнуклеотидные связи в области сердцевины представляют собой хиральные фосфоротиоатные связи.

[00576] Согласно некоторым вариантам осуществления остатки в области крыла «X» не представляют собой 2'-МОЕ-модифицированные остатки. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина представляет собой мотив, в котором остатки в области крыла «X» не представляют собой 2'-МОЕ-модифицированные остатки. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив сердцевина-крыло представляет собой мотив, в котором остатки в области крыла «X» не представляют собой 2'-МОЕ-модифицированные остатки. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой мотив, в котором остатки в каждой области крыла «X» не представляют собой 2'-МОЕ-модифицированные остатки. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой мотив 5-10-5, в котором остатки в каждой области крыла «X» представляют собой не 2'-МОЕ-модифицированные остатки. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой мотив 5-10-5, в котором остатки в каждой области сердцевины «Y» представляют собой остатки 2'-дезоксирибонуклеозида. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой мотив 5-10-5, в котором все межнуклеозидные связи представляют собой фосфоротиоатные межнуклеозидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой мотив 5-10-5, в котором все межнуклеозидные связи представляют собой хиральные фосфоротиоатные межнуклеозидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления мотив крыло-сердцевина-крыло представляет собой мотив 5-10-5, в котором остатки в каждой области крыла «X» представляют собой не 2'-МОЕ-модифицированные остатки, остатки в каждой области сердцевины «Y» представляют собой остатки 2'-дезоксирибонуклеозида и все межнуклеозидные связи представляют собой хиральные фосфоротиоатные межнуклеозидные связи.

[00577] Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная модифицированная фосфатная связь представляет собой хиральную фосфоротиоатную связь, т.е. фосфоротиоатную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит по меньшей мере 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 100% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления все хиральные модифицированные фосфатные связи представляют собой хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% или 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 10% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 20% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 30% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 40% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 50% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 60% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 70% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 80% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 95% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Sp.

[00578] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% или 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 10% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 20% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 30% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 40% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 50% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 60% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 70% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 80% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 95% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp.

[00579] Согласно некоторым вариантам осуществления менее 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% или 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 10% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 20% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 30% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем 40% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 50% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 60% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 70% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 80% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 90% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления менее чем примерно 95% хиральных фосфоротиоатных межнуклеотидных связей области сердцевины характеризуются конформацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит только одну хиральную фосфоротиоатную межнуклеотидную связь конформации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления область сердцевины содержит только одну хиральную фосфоротиоатную межнуклеотидную связь конформации Rp, причем все межнуклеотидные связи представляют собой хиральные фосфоротиоатные межнуклеотидные связи.

[00580] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой блокмеры. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой альтмеры. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой альтмеры, содержащие чередующиеся блоки. Согласно некоторым вариантам осуществления блокмер или альтмер могут быть определены с помощью химических модификаций (включая наличие или отсутствие), например, модификаций оснований, модификации сахара, модификаций межнуклеотидных связей, стереохимии и т.д. Примеры химических модификаций, стереохимии и профилей для блока и/или чередующегося звена включают, но не ограничиваются ими, описанные в настоящем раскрытии, такие как описанные для крыла, сердцевины, олигонуклеотида и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления блокмер содержит профиль ..SS..RR..SS..RR... Согласно некоторым вариантам осуществления альтмер содержит профиль SRSRSRSR.

[00581] Согласно некоторым вариантам осуществления профиль хирального центра остова, например, крыла, сердцевины, блока, содержит один или более (Np)p(Sp)x(Np)q(Sp)y, причем каждый из р, х, q, у независимо равен 0-50, p+q>0 и x+y>0.

[00582] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль хиральных центров остова содержит повторяющиеся звенья (Sp)m(Np)n, (Np)n(Sp)m, (Np)t(Np)n(Sp)m или (Sp)t(Np)n(Sp)m. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющееся звено представляет собой (Sp)m(Np)n. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющееся звено представляет собой SpRp. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющееся звено представляет собой SpSpRp. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющееся звено представляет собой SpRpRp. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющееся звено представляет собой RpRpSp. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющееся звено представляет собой (Rp)n(Sp)m. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющееся звено представляет собой (Np)t(Np)n(Sp)m. Согласно некоторым вариантам осуществления повторяющееся звено представляет собой (Sp)t(Np)n(Sp)m.

[00583] Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова содержит (Rp/Sp)х-(полностью Rp или полностью Sp)-(Rp/Sp)y. Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова содержит (Rp/Sp)-(полностью Rp или полностью Sp)-(Rp/Sp). Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова содержит (Sp)х-(полностью Sp)-(Np)y. Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова содержит (Rp)-(полностью Sp)-(Rp). Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова содержит (Sp)х-(полностью Np)-(Sp)y. Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова содержит ((Sp))-(полностью Rp)-(Sp). Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова содержит (Rp/Sp)х-(повторяющийся (Sp)m(Rp)n)-(Rp/Sp)y. Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова содержит (Sp/Rp)-(повторяющийся (Sp)m(Rp)n)-(Rp/Sp). Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова содержит (Rp/Sp)х-(повторяющийся SpSpRp)-(Rp/Sp)y. Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова содержит (Rp/Sp)-(повторяющийся SpSpRp)-(Rp/Sp).

[00584] Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова представляет собой (Rp/Sp)х-(полностью Rp или полностью Sp)-(Rp/Sp)y. Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова представляет собой (Rp/Sp)-(полностью Rp или полностью Sp)-(Rp/Sp). Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова представляет собой (Rp)х-(полностью Sp)-(Np)y. Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова представляет собой (Rp)-(полностью Sp)-(Np). Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова представляет собой (Sp)х-(полностью Np)-(Sp)y. Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова представляет собой (Sp)-(полностью Rp)-(Sp). Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный образец хиральных центров остова представляет собой (Rp/Sp)х-(повторяющийся (Sp)m(Np)n)-(Rp/Sp)y. Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова представляет собой (Rp/Sp)-(повторяющийся (Sp)m(Rp)n)-(Rp/Sp). Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова представляет собой (Rp/Sp)х-(повторяющийся SpSpRp)-(Rp/Sp)y. Согласно некоторым вариантам осуществления предусмотренный профиль хиральных центров остова представляет собой (Rp/Sp)-(повторяющийся SpSpNp)-(Rp/Sp).

[00585] Специалисту в данной области техники понятно, что различные области целевого транскрипта могут быть нацелены с помощью предложенных композиций и способов. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность оснований предложенных олигонуклеотидов содержит последовательность интрона. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность оснований предложенных олигонуклеотидов содержит последовательность экзона. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность оснований предложенных олигонуклеотидов содержит последовательность интрона и экзона. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность оснований предложенных олигонуклеотидов содержит последовательность, охватывающую сайт сплайсинга. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность оснований предложенных олигонуклеотидов, содержит последовательность, обнаруженную в 5'-сайте сплайсинга, последовательности точки ветвления (BPS), полипиримидиновом тракта (ру tact), 3'-сайте сплайсинга, интронном сайленсере сплайсинга (ISS), экзонном сайленсере сплайсинга (ESS), интронном энхансере сплайсинга (ISE) и/или экзонном энхансере сплайсинга, или содержащую их. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность оснований предложенных олигонуклеотидов представляет собой интронную последовательностью. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность оснований предложенных олигонуклеотидов представляет собой экзонную последовательность. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность оснований предложенных олигонуклеотидов представляет собой последовательность, охватывающую сайт сплайсинга. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность оснований предложенных олигонуклеотидов представляет собой последовательность, обнаруженную в 5'-сайте сплайсинга, последовательности точки ветвления (BPS), полипиримидиновом тракте (ру tact), 3'-сайте сплайсинга, интронном сайленсере сплайсинга (ISS), экзонном сайленсере сплайсинга (ESS), интронном энхансере сплайсинга (ISE) и/или экзонном энхансере сплайсинга, или содержащую их. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность оснований предложенных олигонуклеотидов представляет собой последовательность, обнаруженную в последовательности точки ветвления (BPS), полипиримидиновом тракте (ру tact), интронном сайленсере сплайсинга (ISS), экзонном сайленсере сплайсинга (ESS), интронном энхансере сплайсинга (ISE) и/или экзонном энхансере сплайсинга.

[00586] Как понятно специалисту в данной области техники предложенные олигонуклеотиды и композиции, среди прочего, могут нацеливаться на большое количество полимеров нуклеиновых кислот. Например, согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды и композиции могут нацеливаться на транскрипт последовательности нуклеиновой кислоты, причем одинаковая последовательность оснований олигонуклеотидов (например, последовательность оснований типа олигонуклеотидов) содержит или представляет собой последовательность, комплементарную последовательности транскрипта. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, комплементарную последовательности мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность, комплементарную последовательности мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, которая на 100% комплементарна последовательности мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, которая на 100% комплементарна последовательности мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность, которая на 100% комплементарна последовательности мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований в сердцевине содержит или представляет собой последовательность, комплементарную последовательности мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований в сердцевине содержит последовательность, комплементарную последовательности мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований в сердцевине представляет собой последовательность, которая на 100% комплементарна последовательности мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований в сердцевине содержит или представляет собой последовательность, которая на 100% комплементарна последовательности мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований в сердцевине содержит последовательность, которая на 100% комплементарна последовательности мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований в сердцевине содержит последовательность, которая на 100% комплементарна последовательности мишени.

[00587] Согласно некоторым вариантам осуществления, как описано в настоящем описании предложенные олигонуклеотиды и композиции могут обеспечивать новые профили расщепления, более высокую скорость расщепления, более высокую степень расщепления, более высокую селективность селекции и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции могут избирательно подавлять (например, расщеплять) транскрипт из целевой последовательности нуклеиновой кислоты, которая имеет одну или более подобных последовательностей, существующую внутри субъекта или популяции, каждая из мишеней и аналогичных последовательностей содержит специфический нуклеотидный характеристический элемент последовательности, который определяет целевую последовательность по отношению к аналогичным последовательностям. Согласно некоторым вариантам осуществления, например, целевая последовательность представляет собой аллель дикого типа или копию гена, и аналогичная последовательность представляет собой последовательность, имеющую очень сходную последовательность оснований, например, последовательность с SNP, мутациями и т.д.; Согласно некоторым вариантам осуществления характеристический элемент последовательности определяет эту целевую последовательность относительно аналогичной последовательности: например, когда целевая последовательность представляет собой вызывающий болезнь Хантингтона аллель с Т в rs362307 (U в соответствующей РНК, С для не вызывающего заболевание аллеля), характеристическая последовательность содержит этот SNP.

[00588] Согласно некоторым вариантам осуществления аналогичная последовательность характеризуется гомологией последовательности, составляющей более чем 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% по отношению к целевой последовательностью. Согласно некоторым вариантам осуществления целевая последовательность представляет собой вызывающую заболевание копию последовательности нуклеиновой кислоты, содержащую одну или более мутаций и/или SNP, и аналогичная последовательность представляет собой копию, не вызывающую заболевания (дикого типа). Согласно некоторым вариантам осуществления целевая последовательность содержит мутацию, причем аналогичная последовательность представляет собой соответствующую последовательности дикого типа. Согласно некоторым вариантам осуществления целевая последовательность представляет собой мутантный аллель, тогда как аналогичная последовательность представляет собой аллель дикого типа. Согласно некоторым вариантам осуществления целевая последовательность содержит SNP, который связан с вызывающим заболевание аллелем, тогда как аналогичная последовательность содержит тот же SNP, который не связан с вызывающим заболевание аллелем. Согласно некоторым вариантам осуществления область целевой последовательности, которая комплементарна одинаковой последовательности оснований предложенной композиции олигонуклеотидов, характеризуется гомологией, составляющей более чем 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% по отношению к соответствующей области аналогичной последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления область целевой последовательности, которая комплементарна одинаковой последовательности оснований предложенной композиции олигонуклеотидов, отличается от соответствующей области аналогичной последовательности менее чем на 5, менее чем на 4, менее чем на 3, менее чем на 2 или только на 1 пару оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления область целевой последовательности, которая комплементарна одинаковой последовательности оснований предложенной композиции олигонуклеотидов, отличается от соответствующей области аналогичной последовательности только в сайте мутации или сайте SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления область целевой последовательности, которая комплементарна одинаковой последовательности оснований предложенной композиции олигонуклеотидов, отличается от соответствующей области аналогичной последовательности только в сайте мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления область целевой последовательности, которая комплементарна одинаковой последовательности оснований предложенной композиции олигонуклеотидов, отличается от соответствующей области аналогичной последовательности только в сайте SNP.

[00589] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, комплементарную характеристическому элементу последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, комплементарную характеристическому элементу последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность, комплементарную характеристическому элементу последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, которая на 100% комплементарна характеристическому элементу последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, которая на 100% комплементарна характеристическому элементу последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность, которая на 100% комплементарна характеристическому элементу последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований в сердцевине содержит или представляет собой последовательность, комплементарную характеристическому элементу последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований в сердцевине содержит последовательность, комплементарную характеристическому элементу последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований в сердцевине представляет собой последовательность, комплементарную характеристическому элементу последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований в сердцевине содержит или представляет собой последовательность, которая на 100% комплементарна характеристическому элементу последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований в сердцевине содержит последовательность, которая на 100% комплементарна характеристическому элементу последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований в сердцевине представляет собой последовательность, которая на 100% комплементарна характеристическому элементу последовательности.

[00590] Согласно некоторым вариантам осуществления характеристический элемент последовательности содержит или представляет собой мутацию. Согласно некоторым вариантам осуществления характеристический элемент последовательности содержит мутацию. Согласно некоторым вариантам осуществления характеристический элемент последовательности представляет собой мутацию. Согласно некоторым вариантам осуществления характеристический элемент последовательности содержит или представляет собой точечную мутацию. Согласно некоторым вариантам осуществления характеристический элемент последовательности содержит точечную мутацию. Согласно некоторым вариантам осуществления характеристический элемент последовательности представляет собой точечную мутацию. Согласно некоторым вариантам осуществления характеристический элемент последовательности содержит или представляет собой SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления характеристический элемент последовательности содержит SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления характеристический элемент последовательности представляет собой SNP.

[00591] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований на 100% соответствует целевой последовательности, которая не на 100% соответствует аналогичной последовательности целевой последовательности. Например, согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований соответствует мутации в вызывающей заболевание копии или аллеле целевой последовательности нуклеиновой кислоты, но не соответствует не вызывающей заболевание копии или аллелю в сайте мутации; согласно некоторым другим вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований соответствует SNP в вызывающем заболевание аллеле целевой последовательности нуклеиновой кислоты, но не соответствует не вызывающему заболеванию аллелю в соответствующем сайте. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований в сердцевине на 100% соответствует целевой последовательности, которая не на 100% соответствует аналогичной последовательности целевой последовательности. Например, в WV-1092 его одинаковая последовательность оснований (и его одинаковая последовательность оснований в его сердцевине) соответствует вызывающему заболевание U, но не невызывающему заболевание (дикого типа) С в rs362307.

[00592] Помимо прочего, настоящее раскрытие признает тот факт, что последовательность оснований может оказывать влияние на свойства олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность оснований может оказывать влияние на профиль расщепления мишени, когда олигонуклеотиды, имеющие последовательность оснований, используются для подавления мишени, например, через путь, включающий РНКазу Н: например, структурно подобные (все фосфоротиоатные связи, все стереослучайные) олигонуклеотиды имеют разные последовательности, могут иметь разные профили расщепления. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований нестереослучайных композиций олигонуклеотидов (например, определенных композиций олигонуклеотидов, представленных в настоящем описании) представляет собой последовательность оснований, которая при применении к композиции олигонуклеотидов ДНК (например, ONT-415) или стереослучайной композиции олигонуклеотидов со всеми фосфоротиоатными связями (например, WV-905), профиль расщепления ДНК (профиль расщепления ДНК) и/или стереослучайная композиция со всеми фосфоротиоатными связями (стереослучайный профиль расщепленная) имеет сайт расщепления внутри или вблизи характеристического элемента последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления внутри или вблизи находится в последовательности, комплементарной области сердцевины одинаковой последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления внутри или вблизи находится в последовательности, которая на 100% комплементарна области сердцевины одинаковой последовательности.

[00593] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований, которая содержит сайт расщепления внутри или вблизи характеристического элемента последовательности в своем профиле расщепления ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований, которая содержит сайт расщепления внутри характеристического элемента последовательности в своем профиле расщепления ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований, которая содержит сайт расщепления вблизи характеристического элемента последовательности в своем профиле расщепления ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований, которая содержит сайт расщепления вблизи мутации или SNP характеристического элемента последовательности в своем профиле расщепления ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований, которая содержит сайт расщепления вблизи мутации в своем профиле расщепления ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований, которая содержит сайт расщепления вблизи SNP в своем профиле расщепления ДНК.

[00594] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований, которая содержит сайт расщепления внутри или вблизи характеристического элемента последовательности в своем стереослучайном профиле расщепления. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований, которая содержит сайт расщепления в пределах характеристического элемента последовательности в своем стереослучайном профиле расщепления. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований, которая содержит сайт расщепления вблизи характеристического элемента последовательности в своем стереослучайном профиле расщепления. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований, которая содержит сайт расщепления вблизи мутации или SNP характеристического элемента последовательности в своем стерео случайном профиле расщепления. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований, которая содержит сайт расщепления вблизи мутации в своем стереослучайном профиле расщепления. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований, которая содержит сайт расщепления вблизи SNP в своем стереослучайном профиле расщепления.

[00595] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований, которая содержит сайт расщепления вблизи мутации характеристического элемента последовательности в своей ДНК и/или стереослучайном профиле расщепления. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований, которая содержит сайт расщепления вблизи мутации в своей ДНК и/или стереослучайном профиле расщепления. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований, которая содержит сайт расщепления вблизи мутации в своем профиле расщепления ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи мутации находится в мутации, то есть сайт расщепления находится в межнуклеотидной связи мутированного нуклеотида (например, если мутация находится в А в целевой последовательности GGGACGTCTT, расщепление происходит между А и С). Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 межнуклеотидных связях от мутации, где 0 означает расщепление в сайте мутации (например, если мутация находится в точке А в целевой последовательности GGGACGTCTT, расщепление происходит между А и С для 0 межнуклеотидных связей, сайта расщепления в 1 линкерной группе от мутации находится между G и А к 5'-концу от мутации или между С и G к 3'-концу от мутации). Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3, 4 или 5 межнуклеотидных связях от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3, 4 или 5 межнуклеотидных связях к 5'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3, 4 или 5 межнуклеотидных связях к 3'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3, 4 или 5 межнуклеотидных связях от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3, 4 или 5 межнуклеотидных связях к 5'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3, 4 или 5 межнуклеотидных связях к 3 '-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3 или 4 межнуклеотидных связях от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3 или 4 межнуклеотидных связях к 5'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3 или 4 межнуклеотидных связях к 3'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2 или 3 межнуклеотидных связях от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2 или 3 межнуклеотидных связях к 5'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2 или 3 межнуклеотидных связях к 3'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1 или 2 межнуклеотидных связях от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1 или 2 межнуклеотидных связях к 5'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1 или 2 межнуклеотидных связях к 3'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0 или 1 межнуклеотидной связи от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0 или 1 межнуклеотидной связи к 5'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0 или 1 межнуклеотидной связи к 3'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0 связей от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в одной межнуклеотидной связи от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в одной межнуклеотидной м к 5'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в одной межнуклеотидной связи к 3'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в двух межнуклеотидных связях от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в двух межнуклеотидных связях к 5'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в двух межнуклеотидных связях к 3'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в трех межнуклеотидных связях от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в трех межнуклеотидных связях к 5'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в трех межнуклеотидных связях к 3'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в четырех межнуклеотидных связях от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в четырех межнуклеотидных связях к 5'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в четырех межнуклеотидных связях к 3'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в пяти межнуклеотидных связях от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в пяти межнуклеотидных связях к 5'-концу от мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в пяти межнуклеотидных связях к 3'-концу от мутации.

[00596] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований, которая содержит сайт расщепления вблизи SNP характеристического элемента последовательности в своей ДНК и/или стереослучайном профиле расщепления. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований, которая содержит сайт расщепления вблизи SNP в своей ДНК и/или стереослучайном профиле расщепления. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность оснований, которая содержит сайт расщепления вблизи SNP в своем профиле расщепления ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи SNP находится в SNP, то есть сайт расщепления находится в межнуклеотидной связи нуклеотида в SNP (например, для мишени WV-905, G*G*C*A*C*A*A*G*G*G*C*A*C*A*G*A*C*T*T*C, который содержит rUrUrUrGrGrArArGrUrCrUrGrUrGrCrCrCrUrUrGrUrGrCrCrC (rs362307 выделен жирным шрифтом), расщепление находится между выделенным жирным шрифтом rU и подчеркнутым rG сразу после него). Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 межнуклеотидных связях от SNP, где 0 означает расщепление в SNP (например, для мишени WV-905, G*G*C* A*C*A*A*G*G*G*C*A*C*A*G*A*C*T*T*C, который содержит rUrUrUrGrGrArArGrUrCrUrGrUrGrCrCrCrUrUrGrUrGrCrCrC (rs362307 выделен жирным шрифтом), расщепление находится между выделенным жирным rU и подчеркнутым rG сразу после него для 0 межнуклеотидных связей, сайт расщепления в 1 межнуклеотидной линкерной группе от SNP находится между rG и rU к 5'-концу от SNP (подчеркнуто: rUrUrUrGrGrArArGrUrCrUrGrUrGrCrCrCrUrUrGrUrGrCrCrC) или между rG и гС к 3'-концу SNP (подчеркнуто: rUrUrUrGrGrArArGrUrCrUrGrUrGrCrCrCrUrUrGrUrGrCrCrC)). Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3, 4 или 5 межнуклеотидных связях от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3, 4 или 5 межнуклеотидных связях к 5'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3, 4 или 5 межнуклеотидных связях к 3'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3, 4 или 5 межнуклеотидных связях от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3, 4 или 5 межнуклеотидных связях к 5'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3, 4 или 5 межнуклеотидных связях к 3'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3 или 4 межнуклеотидных связм от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2, 3 или 4 межнуклеотидных связях к 5'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления 0, 1, 2, 3 или 4 межнуклеотидных связей к 3'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2 или 3 межнуклеотидных связях от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1, 2 или 3 межнуклеотидных связях к 5'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1,2 или 3 межнуклеотидных связях к 3'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1 или 2 межнуклеотидных связях от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1 или 2 межнуклеотидных связях к 5'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0, 1 или 2 межнуклеотидных связях к 3'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0 или 1 межнуклеотидной связи от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0 или 1 межнуклеотидной связик 5'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0 или 1 межнуклеотидной связи к 3'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в 0 межнуклеотидных связей от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в одной межнуклеотидной связи от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в одной межнуклеотидной связи к 5'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в одной межнуклеотидной связи к 3'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в двух межнуклеотидных связейах от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в двух межнуклеотидных связейах к 5'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в двух межнуклеотидных связейах к 3'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в трех межнуклеотидных связейах от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в трех межнуклеотидных связейах к 5'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в трех межнуклеотидных связейах к 3'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в четырех межнуклеотидных связейах от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в четырех межнуклеотидных связейах к 5'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в четырех межнуклеотидных связейах к 3'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в пяти межнуклеотидных связейах от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в пяти межнуклеотидных связейах к 5'-концу от SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи представляет собой сайт расщепления в пяти межнуклеотидных связейах к 3'-концу от SNP. Например, стереослучайный профиль расщепления последовательности WV-905 содержит сайты расщепления в SNP (между CUGU и GCCC), в двух межнуклеотидных связейах (между GUCU и GUGC и между GUGC и CCUU), в трех межнуклеотидных связейах (между UGCC и CUUG); в четырех межнуклеотидных связейах (между GCCC и UUGU и AAGU и CUGU) и пяти межнуклеотидных связейах (между CCCU и UGUG).

[00597] Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления внутри или вблизи характеристического элемента последовательности, например, вблизи мутации, SNP и т.д., представляет собой основной сайт расщепления ДНК и/или стерео случайно го профиля расщепления. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления внутри или вблизи характеристического элемента последовательности представляет собой основной сайт расщепления профиля расщепления ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления внутри или вблизи характеристического элемента последовательности представляет собой основной сайт расщепления стереослучайного профиля расщепления. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи мутации представляет собой основной сайт расщепления профиля расщепления ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи мутации представляет собой основной сайт расщепления стереослучайного профиля расщепления. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи SNP представляет собой основной сайт расщепления профиля расщепления ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления сайт расщепления вблизи SNP представляет собой основной сайт расщепления стереослучайного профиля расщепления. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления находится в последовательности, комплементарной области сердцевины одинаковой последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления находится в последовательности, которая на 100% комплементарна области сердцевины одинаковой последовательности.

[00598] Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, содержащий наибольшее или второе, третье, четвертое или пятое наибольшее расщепление. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, содержащий наибольшее или второе, третье или четвертое наибольшее расщепление. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, содержащий наибольшее или второе или третье наибольшее расщепление. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, содержащий наибольшее или второе наибольшее расщепление. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, содержащий наибольшее расщепление. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, содержащий второе наибольшее расщепление. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, содержащий третье наибольшее расщепление. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, содержащий четвертое наибольшее расщепление. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, содержащий пятое наибольшее расщепление.

[00599] Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55% 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 5% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 10% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 15% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 20% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 25% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 30% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 35% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 40% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 45% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 50% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 55% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 60% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 65% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 70% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 75% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 80% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 85% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 90% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 91% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 92% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более 93% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 94% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 95% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 96% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 97% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 98% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит более чем 99% расщеплений. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором происходит 100% расщеплений.

[00600] Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55% 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 5% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 10% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 15% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 20% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 25% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 30% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 35% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 40% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 45% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 50% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 55% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 60% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 65% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 70% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 75% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 80% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 85% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 90% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 91% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 92% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 93% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 94% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 95% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 96% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 97% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 98% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется более чем 99% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления основной сайт расщепления представляет собой сайт, в котором расщепляется 100% мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль расщепления может не иметь основного сайта расщепления, так как ни один сайт не достигает абсолютного порогового уровня расщепления.

[00601] Как понятно специалисту в данной области техники, предложенные композиции олигонуклеотидов и способы характеризуются различными применениями, известными специалисту в данной области техники. Способы оценки предложенных композиций, а также их свойств и применений также широко известны и практикуются специалистом в данной области техники. Примеры свойств, применений и/или способов включают, но не ограничиваются ими, описанные в WO/2014/012081 и WO/2015/107425.

[00602] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, комплементарную последовательности нуклеиновой кислоты. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, которая на 100% комплементарна последовательности нуклеиновой кислоты. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, комплементарную вызывающей заболевание последовательности нуклеиновой кислоты. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, которая на 100% комплементарна вызывающей заболевание последовательности нуклеиновой кислоты. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, комплементарную характеристическому элементу последовательности вызывающей заболевание последовательности нуклеиновой кислоты, причем характеристические последовательности отличают вызывающую заболевание последовательность нуклеиновой кислоты от не вызывающей заболевание последовательности нуклеиновой кислоты. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, которая на 100% комплементарна характеристическому элементу последовательности вызывающей заболевание последовательности нуклеиновой кислоты, причем характеристические последовательности отличают вызывающую заболевание последовательность нуклеиновой кислоты от не вызывающей заболевание последовательности нуклеиновой кислоты. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, комплементарную связанной с заболеванием последовательности нуклеиновой кислоты. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, которая на 100%, комплементарна связанной с заболеванием последовательности нуклеиновой кислоты. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, комплементарную характеристическому элементу последовательности связанной с заболеванием последовательности нуклеиновой кислоты, причем характеристические последовательности отличают связанную с заболеванием последовательность нуклеиновой кислоты от не связанной с заболеванием последовательности нуклеиновой кислоты. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, которая на 100% комплементарна характеристическому элементу последовательности связанной с заболеванием последовательности нуклеиновой кислоты, причем характеристические последовательности отличают связанную с заболеванием последовательность нуклеиновой кислоты от не связанной с заболеванием последовательности нуклеиновой кислоты.

[00603] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, комплементарную гену. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, которая на 100% комплементарна гену. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, комплементарную характеристическому элементу последовательности гена, причем характеристические последовательности отличают ген от аналогичной последовательности, характеризующейся общей гомологией с геном. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, которая на 100% комплементарна характеристическому элементу последовательности гена, характеристические последовательности отличают ген от аналогичной последовательности, характеризующейся общей гомологией с геном. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, комплементарную характеристическому элементу последовательности целевого гена, причем характеристические последовательности содержат мутацию, которая не обнаружена в других копиях гена, например, копии гена дикого типа, другой мутантной копии гена и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, которая на 100% комплементарна характеристическому элементу последовательности целевого гена, причем характеристические последовательности содержат мутацию, которая не обнаружена в других копиях этого гена, например, копии гена дикого типа, другой мутантной копии гена и т.д.

[00604] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, комплементарную последовательности, содержащей SNP. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит или представляет собой последовательность, комплементарную последовательности, содержащей SNP, и одинаковая последовательность оснований на 100% комплементарна SNP, который связан с заболеванием. Например, согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований на 100% комплементарна SNP, связанному со связанным с болезнью Хантингтона (или вызывающим ее) аллелем. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой последовательность WV-1092, которая на 100% комплементарна вызывающему заболевание аллелю, у многих пациентов с болезнью Хантингтона в rs362307. Согласно некоторым вариантам осуществления SNP представляет собой rs362307. Согласно некоторым вариантам осуществления SNP представляет собой rs7685686. Согласно некоторым вариантам осуществления SNP представляет собой rs362268. Согласно некоторым вариантам осуществления SNP представляет собой rs362306. Согласно некоторым вариантам осуществления другим примером сайта SNP может быть любой из сайтов хантингтин, раскрытых в настоящем раскрытии.

[00605] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, обнаруженную в UCAAGGAAGAUGGCAUUUU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, обнаруженную в UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, причем последовательность, обнаруженная в UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, содержит по меньшей мере 15 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более U заменены на Т или наоборот в одинаковой последовательности оснований.

[00606] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, обнаруженную в GCCTCAGTCTGCTTCGCACC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, обнаруженную в GCCTCAGTCTGCTTCGCACC, причем последовательность, обнаруженная в GCCTCAGTCTGCTTCGCACC, содержит по меньшей мере 15 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой GCCTCAGTCTGCTTCGCACC.

[00607] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, обнаруженную в GAGCAGCTGCAACCTGGCAA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, обнаруженную в GAGCAGCTGCAACCTGGCAA, причем последовательность, обнаруженная в GAGCAGCTGCAACCTGGCAA, содержит по меньшей мере 15 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой GAGCAGCTGCAACCTGGCAA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой GGGCACAAGGGCACAGACTT. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой GAGCAGCTGCAACCTGGCAA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой GCACAAGGGCACAGACTTCC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой CACAAGGGCACAGACTTCCA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой ACAAGGGCACAGACTTCCAA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой CAAGGGCACAGACTTCCAAA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, обнаруженную в GAGCAGCTGCAACCTGGCAA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, обнаруженную в GAGCAGCTGCAACCTGGCAA, причем последовательность, обнаруженная в GAGCAGCTGCAACCTGGCAA, содержит по меньшей мере 15 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой GAGCAGCTGCAACCTGGCAA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой GAGCAGCTGCAACCTGGCAA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой AGCAGCTGCAACCTGGCAAC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой GCAGCTGCAACCTGGCAACA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой CAGCTGCAACCTGGCAACAA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой AGCTGCAACCTGGCAACAAC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой GCTGCAACCTGGCAACAACC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, содержащуюся в GGGCCAACAGCCAGCCTGCA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, обнаруженную в GGGCCAACAGCCAGCCTGCA, причем последовательность, обнаруженная в GGGCCAACAGCCAGCCTGCA, содержит по меньшей мере 15 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой GGGCCAACAGCCAGCCTGCA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой GGGCCAACAGCCAGCCTGCA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой GGCCAACAGCCAGCCTGCAG. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой GCCAACAGCCAGCCTGCAGG. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой CCAACAGCCAGCCTGCAGGA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой CAACAGCCAGCCTGCAGGAG. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой AACAGCCAGCCTGCAGGAGG. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, обнаруженную в ATTAATAAATTGTCATCACC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит последовательность, обнаруженную в ATTAATAAATTGTCATCACC, причем последовательность, обнаруженная в ATTAATAAATTGTCATCACC, содержит по меньшей мере 15 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой ATTAATAAATTGTCATCACC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой ATTAATAAATTGTCATCACC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGCA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит CAAGGAAGAUGGCAU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит AAGGAAGAUGGCAUU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит AGGAAGAUGGCAUUU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит GGAAGAUGGCAUUUC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит GAAGAUGGCAUUUCU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит CAAGGAAGAUGGCAUUUCU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUUC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит CAAGGAAGAUGGCAUUUC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит AAGGAAGAUGGCAUUUCU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит AAGGAAGAUGGCAUUU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит CAAGGAAGAUGGCAUUU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит AAGGAAGAUGGCAUUUC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой UCAAGGAAGAUGGCA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой AAGGAAGAUGGCAUU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой CAAGGAAGAUGGCAU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой AGGAAGAUGGCAUUU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой GGAAGAUGGCAUUUC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой GAAGAUGGCAUUUCU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой CAAGGAAGAUGGCAUUUC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой AAGGAAGAUGGCAUUUCU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой AAGGAAGAUGGCAUUU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой CAAGGAAGAUGGCAUUU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой AAGGAAGAUGGCAUUUC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит AGGAAGAUGGCAUU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит UCAAGGAAGAUGGC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит CAAGGAAGAUGGCA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит AAGGAAGAUGGCAU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит GGAAGAUGGCAUUU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит GAAGAUGGCAUUUC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований содержит AAGAUGGCAUUUCU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой AGGAAGAUGGCAUU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой UCAAGGAAGAUGGC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой CAAGGAAGAUGGCA. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой AAGGAAGAUGGCAU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой GGAAGAUGGCAUUU. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой GAAGAUGGCAUUUC. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность оснований представляет собой AAGAUGGCAUUUU.

[00608] Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная межнуклеотидная связь характеризуется структурой формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральная межнуклеотидная связь является фосфоротиоатной. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая хиральная межнуклеотидная связь в одном олигонуклеотиде предложенной композиции независимо характеризуется структурой формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления каждая хиральная межнуклеотидная связь в одном олигонуклеотиде предложенной композиции является фосфоротиоатной.

[00609] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды по настоящему раскрытию содержат один или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды по настоящему раскрытию содержат один или более модифицированных фрагментов оснований. Как известно специалисту в данной области техники и описано в раскрытии, могут быть введены различные модификации в сахар и/или фрагмент.Например, согласно некоторым вариантам осуществления модификация представляет собой модификацию, описанную в US 9006198 и публикациях международной заявки WO 2014/012081 и WO/2015/107425, модификации сахара и основания, каждая из которых включена в настоящее описание посредством ссылки.

[00610] Согласно некоторым вариантам осуществления модификация сахара представляет собой 2'-модификацию. Как правило, используемые 2'-модификации включают, но не ограничиваются ими, 2'-OR¹, где R¹ представляет собой не водород. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация представляет собой 2'-OR, где R представляет собой необязательно замещенную алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация представляет собой 2'-ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация представляет собой 2'-O-МОЕ. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее изобретение демонстрирует, что включение и/или положение конкретных хирально чистых межнуклеотидных связей может обеспечивать повышение стабильности, сравнимое с тем, которое достигается за счет использования модифицированных связей, оснований и/или сахаров остова, или быть лучше него. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный единственный олигонуклеотид предложенной композиции не имеет модификаций на сахарах. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный единственный олигонуклеотид предложенной композиции не имеет модификаций на 2'-положениях сахаров (т.е. две группы в 2'-положении представляют собой либо -Н/-Н, либо -Н/-ОН). Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный единственный олигонуклеотид предложенной композиции не имеет каких-либо модификаций 2'-МОЕ.

[00611] Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой -О-L или -L-, который соединяет 2'-углерод фрагмента сахара с другим углеродом фрагмента сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой -О-L или -L-, который соединяет 2'-углерод фрагмента сахара с 4'-углеродом фрагмента сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой S-cEt. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный фрагмент сахара представляет собой фрагмент LNA.

[00612] Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой -F. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой FANA. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой FRNA.

[00613] Согласно некоторым вариантам осуществления модификация сахара представляет собой 5'-модификацию, например, R-5'-Me, S-5'-Me и т.д.

[00614] Согласно некоторым вариантам осуществления модификация сахара изменяет размер сахарного кольца. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация сахара представляет собой фрагмент сахара в ФГНК.

[00615] Согласно некоторым вариантам осуществления модификация сахара заменяет фрагмент сахара другим циклическим или ациклическим фрагментом. Примеры таких фрагментов широко известны в данной области техники, включая, но не ограничиваясь ими, те, которые используются в морфолино (необязательно с его фосфородиамидатной связью), гликолевые нуклеиновые кислоты и т.д.

[00616] Согласно некоторым вариантам осуществления у единственного олигонуклеотида в предложенной композиции по меньшей мере примерно 25% межнуклеотидных связей характеризуются конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления у единственного олигонуклеотида в предложенной композиции по меньшей мере примерно 30% межнуклеотидных связей характеризуются конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления у единственного олигонуклеотида в предложенной композиции по меньшей мере примерно 35% межнуклеотидных связей характеризуются конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления у единственного олигонуклеотида в предложенной композиции по меньшей мере примерно 40% межнуклеотидных связей характеризуются конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления один олигонуклеотид в представленной композиции, имеет, по меньшей мере примерно 45% его межнуклеотидных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления у единственного олигонуклеотида в предложенной композиции по меньшей мере примерно 50% межнуклеотидных связей характеризуются конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления у единственного олигонуклеотида в предложенной композиции по меньшей мере примерно 55% межнуклеотидных связей характеризуются конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления у единственного олигонуклеотида в предложенной композиции по меньшей мере примерно 60% межнуклеотидных связей характеризуются конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления у единственного олигонуклеотида в предложенной композиции по меньшей мере примерно 65% межнуклеотидных связей характеризуются конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления у единственного олигонуклеотида в предложенной композиции по меньшей мере примерно 70% межнуклеотидных связей характеризуются конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления у единственного олигонуклеотида в предложенной композиции по меньшей мере примерно 75% межнуклеотидных связей характеризуются конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления у единственного олигонуклеотида в предложенной композиции по меньшей мере примерно 80% межнуклеотидных связей характеризуются конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления у единственного олигонуклеотида в предложенной композиции по меньшей мере примерно 85% межнуклеотидных связей характеризуются конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления у единственного олигонуклеотида в предложенной композиции по меньшей мере примерно 90% межнуклеотидных связей характеризуются конфигурацией Sp.

[00617] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды в предложенной композиции не представляет собой олигонуклеотид, выбранный из: T_kT_k^mC_kAGT^mCATGA^mCT_kT^mC_k^mC_k, где каждый нуклеозид, после которого следует нижний индекс 'k' обозначает (S)-cEt модификацию, R представляет собой фосфоротиоатную связь в конфигурации Rp, S представляет собой фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp, каждый ^mC представляет собой 5-метилцитозин-модифицированный нуклеозид и все межнуклеозидные связи представляют собой фосфоротиоаты (PS) с профилями стереохимии выбранными из RSSSRSRRRS, RSSSSSSSSS, SRRSRSSSSR, SRSRSSRSSR, RRRSSSRSSS, RRRSRSSRSR, RRSSSRSRSR, SRSSSRSSSS, SSRRSSRSRS, SSSSSSRRSS, RRRSSRRRSR, RRRRSSSSRS, SRRSRRRRRR, RSSRSSRRRR, RSRRSRRSRR, RRSRSSRSRS, SSRRRRRSRR, RSRRSRSSSR, RRSSRSRRRR, RRSRSRRSSS, RRSRSSSRRR, RSRRRRSRSR, SSRSSSRRRS, RSSRSRSRSR, RSRSRSSRSS, RRRSSRRSRS, SRRSSRRSRS, RRRRSRSRRR, SSSSRRRRSR, RRRRRRRRRR и SSSSSSSSSS.

[00618] Согласно некоторым вариантам осуществления единственный олигонуклеотид в предложенной композиции не представляет собой олигонуклеотид, выбранный из: T_kT_k^mC_kAGT^mCATGA^mCT_kT^mC_k^mC_k, где каждый нуклеозид, после которого следует нижний индекс 'k' обозначает (S)-cEt модификацию, R представляет собой фосфоротиоатную связь в конфигурации Rp, S представляет собой фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp, каждый ^mC представляет собой 5-метилцитозин-модифицированный нуклеозид и все межнуклеозидные связи сердцевины представляют собой фосфоротиоаты (PS) с профилями стереохимии выбранными из: RSSSRSRRRS, RSSSSSSSSS, SRRSRSSSSR, SRSRSSRSSR, RRRSSSRSSS, RRRSRSSRSR, RRSSSRSRSR, SRSSSRSSSS, SSRRSSRSRS, SSSSSSRRSS, RRRSSRRRSR, RRRRSSSSRS, SRRSRRRRRR, RSSRSSRRRR, RSRRSRRSRR, RRSRSSRSRS, SSRRRRRSRR, RSRRSRSSSR, RRSSRSRRRR, RRSRSRRSSS, RRSRSSSRRR, RSRRRRSRSR, SSRSSSRRRS, RSSRSRSRSR, RSRSRSSRSS, RRRSSRRSRS, SRRSSRRSRS, RRRRSRSRRR, SSSSRRRRSR, RRRRRRRRRR и SSSSSSSSSS.

Олигопуклеотиды с контролируемой хиралъностъю и композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиралъностъю

[00619] В настоящем раскрытии предложены олигонуклеотиды с контролируемой хиральностью и композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, которые имеют высокую чистоту и высокую диастереомерную чистоту. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложены олигонуклеотиды с контролируемой хиральностью и композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, имеющие высокую чистоту. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложены олигонуклеотиды с контролируемой хиральностью и композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, имеющие высокую диастереомерную чистоту.

[00620] Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой по существу чистый препарат типа олигонуклеотида в том отношении, что олигонуклеотиды в композиции, которые не представляют собой тип олигонуклеотидов, являются примесными формами процесса подготовки указанного типа олигонуклеотида, в некоторых случаях, после определенных процедур очистки.

[00621] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложены олигонуклеотиды, содержащие одну или более диастереомерно чистых межнуклеотидных связей, если рассматривать хиральные атомы фосфора связей. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложены олигонуклеотиды, содержащие одну или более диастереомерно чистых межнуклеотидных связей, имеющих структуру формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложены олигонуклеотиды, содержащие одну или более диастереомерно чистых межнуклеотидных связей, если рассматривать хиральные атомы фосфора, и одну или более фосфатных сложных диэфирных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложены олигонуклеотиды, содержащие одну или более диастереомерно чистых межнуклеотидных связей, имеющих структуру формулы I, и одну или более фосфатных сложных диэфирных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложены олигонуклеотиды, содержащие одну или более диастереомерно чистых межнуклеотидных связей, имеющих структуру формулы I-c, и одну или более фосфатных сложных диэфирных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные олигонуклеотиды получают при помощи стереоселективного способа синтеза олигонуклеотидов, описанного в настоящей заявке, для образования предварительно выбранных диастереомерно чистых межнуклеотидных связей, если рассматривать хиральные атомы фосфора связи. Например, в одном примере олигонуклеотида (Rp/Sp,Rp/Sp,Rp/Sp,Rp,Rp,Sp,Sp,Sp,Sp,SpSp,Sp,Sp,Sp,Rp,Rp,Rp,RpRp)-d[GsCsCsTsCsAsGsTsCsTsGsCsTsTsCsGs1Cs1As1CsC] первые три межнуклеотидные связи получены при помощи традиционного способа синтеза олигонуклеотидов, а диастереомерно чистые межнуклеотидные связи получены при помощи стереохимического контроля согласно описанию настоящей заявки. Примеры межнуклеотидных связей, включая те, что имеют структуру формулы I, дополнительно описаны далее.

[00622] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, причем по меньшей мере две отдельные межнуклеотидные связи в олигонуклеотиде имеют различную стереохимию и/или различные модификации Р по сравнению друг с другом. Согласно определенным вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, причем по меньшей мере две отдельные межнуклеотидные связи в олигонуклеотиде имеют различные модификации Р по сравнению друг с другом. Согласно определенным вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, причем по меньшей мере две отдельные межнуклеотидные связи в олигонуклеотиде имеют различные модификации Р по сравнению друг с другом и причем олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере одну фосфатную сложную диэфирную межнуклеотидную связь. Согласно определенным вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, причем по меньшей мере две отдельные межнуклеотидные связи в олигонуклеотиде имеют различные модификации Р по сравнению друг с другом, и причем олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере одну фосфатную сложную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере одну фосфоротиоатную сложную диэфирную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие представляет собой олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, причем по меньшей мере две из отдельных межнуклеотидных связей внутри олигонуклеотида имеют разные модификации Р относительно друг друга и причем олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере одну фосфоротиоатную сложную триэфирную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие представляет собой олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, причем по меньшей мере две из отдельных межнуклеотидных связей внутри олигонуклеотида имеют разные модификации Р относительно друг друга и причем олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере одну фосфатную сложную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере одну фосфоротиоатную сложную триэфирную межнуклеотидную связь.

[00623] Согласно определенным вариантам осуществления модифицированные межнуклеотидные связи независимо имеют структуру формулы I:

где каждая переменная такая, как определено и описано далее. Согласно некоторым вариантам осуществления связь формулы I представляет собой хиральную. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий одну или более модифицированных межнуклеотидных связей формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий одну или более модифицированных межнуклеотидных связей формулы I, и где отдельные межнуклеотидные связи формулы I в олигонуклеотиде содержат различные модификации Р по сравнению друг с другом. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий одну или более модифицированных межнуклеотидных связей формулы I, и где отдельные межнуклеотидные связи формулы I в олигонуклеотиде содержат различные группы X-L-R¹ относительно друг друга. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий одну или более модифицированных межнуклеотидных связей формулы I, и где отдельные межнуклеотидные связи формулы I в олигонуклеотиде содержат различные X относительно друг друга. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий одну или более модифицированных межнуклеотидных связей формулы I, и где отдельные межнуклеотидные связи формулы I в олигонуклеотиде содержат различные -L-R¹ относительно друг друга. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой олигонуклеотид в предложенной композиции, которая относится к определенному типу олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой олигонуклеотид в предложенной композиции, которая характеризуется одинаковой последовательностью оснований и длиной, одинаковым профилем связей остова и одинаковым профилем хиральных центров остова.

[00624] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой олигонуклеотид в композиции с контролируемой хиральностью, которая относится к конкретному типу олигонуклеотида, и олигонуклеотид с контролируемой хиральностью относится к типу. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой олигонуклеотид в предложенной композиции, который содержит предварительно определенный уровень множества олигонуклеотидов, которые характеризуются наличием одинаковой последовательности оснований, одинакового профиля связей остова и одинакового профиля хиральных центров остова, и олигонуклеотид с контролируемой хиральностью характеризуются наличием одинаковой последовательности оснований, одинакового профиля связей остова и одинакового профиля хиральных центров остова.

[00625] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем изобретении предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, где по меньшей мере две отдельные межнуклеотидные связи в олигонуклеотиде имеют различную стереохимию и/или различные модификации Р по сравнению друг с другом. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, где по меньшей мере две отдельные межнуклеотидные связи в олигонуклеотиде имеют различную стереохимию по сравнению друг с другом, и по меньшей мере фрагмент структуры олигонуклеотида с контролируемой хиральностью характеризуется повторяющимся профилем групп с чередующейся стереохимией.

[00626] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, где по меньшей мере две отдельные межнуклеотидные связи в олигонуклеотиде имеют различные модификации Р по сравнению друг с другом за счет того, что они содержат различные атомы X во фрагментах -XLR¹, и/или они содержат различные группы L во фрагментах -XLR¹, и/или они содержат различные атомы R¹ во фрагментах -XLR¹.

[00627] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, где по меньшей мере две отдельные межнуклеотидные связи в олигонуклеотиде имеют различную стереохимию и/или различные модификации Р по сравнению друг с другом, и олигонуклеотид имеет структуру, представленную следующей формулой:

[S^Bn1R^Bn2S^Bn3R^Bn4…S^BnxR^Bny]

где:

каждый R^B независимо представляет собой блок нуклеотидных звеньев, имеющих R-конфигурацию атомов фосфора связи;

каждый S^B независимо представляет собой блок нуклеотидных звеньев, имеющих S-конфигурацию атомов фосфора связи;

каждый из n1-ny равен нулю или представляет собой целое число при условии, что по меньшей мере один нечетный n и по меньшей мере один четный n должен быть отличным от нуля, то есть олигонуклеотид содержит по меньшей мере две отдельные межнуклеотидные связи с различной стереохимией по сравнению друг с другом; и

где сумма n1-ny составляет от 2 до 200, а Согласно некоторым вариантам осуществления находится в диапазоне от нижнего предела, выбранного из группы, состоящей из 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 или более, до верхнего предела, выбранного из группы, состоящей из 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180, 190 и 200, где верхний предел выше нижнего предела.

[00628] Согласно некоторым из указанных вариантов осуществления все n имеют одинаковые значения; согласно некоторым вариантам осуществления каждый четный n имеет такое же значение, что и другие четные n; согласно некоторым вариантам осуществления каждый нечетный n имеет такое же значение, что и другие нечетные n; согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере два четных n имеют значения, отличающиеся друг от друга; согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере два нечетных n имеют значения, отличающиеся друг от друга.

[00629] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере два соседние n равны друг другу, то есть предложенный олигонуклеотид содержит соседние блоки с S-стереохимией связей и R-стереохимией связей равной длины. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат повторяющиеся блоки с S- и R-стереохимией связей равной длины. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат повторяющиеся блоки с S- и R-стереохимией связей, где по меньшей мере два указанных блока имеют длины, отличающиеся друг от друга; в некоторых из указанных вариантов осуществления каждый блок с S-стереохимией имеет одинаковую длину, которая отличается от каждого блока с R-стереохимией, которые необязательно могут иметь одинаковую длину друг с другом.

[00630] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере два n, отделенные друг от друга, равны друг другу, то есть предложенный олигонуклеотид содержит по меньшей мере два блока связей с первой стереохимией, имеющие равную длину друг с другом и разделенные блоком связей с другой стереохимией, где разделительный блок может иметь одинаковую длину или различную длину с блоками, имеющими первую стереохимию.

[00631] Согласно некоторым вариантам осуществления n блоков связей, расположенных на концах предложенного олигонуклеотида, имеют одинаковые значения. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат терминальные блоки с одинаковой стереохимией связей. В некоторых из указанных вариантов осуществления терминальные блоки отделены друг от друга центральным блоком, имеющим другую стереохимию связей.

[00632] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид формулы [S^Bn1R^Bn2S^Bn3R^Bn4…S^BnxR^Bny] представляет собой стереоблокмер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид формулы [S^Bn1R^Bn2S^Bn3R^Bn4…S^BnxR^Bny] представляет собой стереоскипмер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид формулы [S^Bn1R^Bn2S^Bn3R^Bn4…S^BnxR^Bny] представляет собой стереоальтмер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид формулы [S^Bn1R^Bn2S^Bn3R^Bn4…S^BnxR^Bny] представляет собой гэпмер.

[00633] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид формулы [S^Bn1R^Bn2S^Bn3R^Bn4…S^BnxR^Bny] имеет любой из описанных выше профилей и дополнительно имеет профиль модификации Р. Например, согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид формулы [S^Bn1R^Bn2S^Bn3R^Bn4…S^BnxR^Bny] представляет собой стереоскипмер и скипмер с модификацией Р. Согласно некоторым вариантам осуществления предложены олигонуклеотид формулы [S^Bn1R^Bn2S^Bn3R^Bn4…S^BnxR^Bny] представляет собой стереоблокмер и альтмер с модификацией Р. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид формулы [S^Bn1R^Bn2S^Bn3R^Bn4…S^BnxR^Bny] представляет собой стереоальтмер и блокмер с модификацией Р.

[00634] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид формулы [S^Bn1R^Bn2S^Bn3R^Bn4…S^BnxR^Bny] представляет собой олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий одну или более модифицированных межнуклеотидных связей, независимо имеющих структуру формулы I:

где:

Р* представляет собой асимметрический атом фосфора и имеет Rp или Sp-конфигурацию;

W представляет собой О, S или Se;

каждый из X, Y и Z независимо представляет собой -О-, -S-, -N(-L-R¹)- или L;

L представляет собой ковалентную связь или необязательно замещенный линейный или разветвленный C₁-С₁₀ алкилен, где одно или более метиленовых звеньев в L необязательно и независимо заменены на необязательно замещенную группу, выбранную из C₁-С₆ алкилена, C₁-C₆ алкенилена, -С≡С-, C₁-С₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и -C(O)O-;

R¹ представляет собой галоген, R или необязательно замещенную С₁-С₅₀ алифатическую группу, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и необязательно заменены на необязательно замещенную группу, выбранную из C₁-С₆ алкилена, C₁-С₆ алкенилена, -С≡С-, C₁-C₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и -C(O)O-;

каждый R' независимо представляет собой -R, -C(O)R, -CO₂R или -SO₂R, или:

два R' взятые вместе со своими промежуточными атомами для образования необязательно замещенного арила, карбоциклического, гетероциклического или гетероарильного кольца;

-Су- представляет собой необязательно замещенное двухвалентное кольцо, выбранное из фенилена, карбоциклилена, арилена, гетероарилена или гетероциклилена;

каждый R независимо представляет собой водород или необязательно замещенную группу, выбранную из C₁-C₆ алифатической группы, карбоциклила, арила, гетероарила или гетероциклила; и

каждый независимо представляет собой место присоединения к нуклеозиду.

[00635] Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой ковалентную связь или необязательно замещенный линейный или разветвленный C₁-C₁₀ алкилен, где одно или более метиленовых звеньев в L необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-C₆ алкилен, C₁-С₆ алкенилен, -С≡С-, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и -C(O)O-;

R¹ представляет собой галоген, R или необязательно замещенную С₁-С₅₀ алифатическую группу, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и необязательно заменены на необязательно замещенный C₁-C₆ алкилен, C₁-С₆ алкенилен, С=С s C₁-С₆ гетер о алифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и -C(O)O-;

каждый R' независимо представляет собой -R, -C(O)R, -CO₂R или -SO₂R, или:

два R' при одном атоме азота объединены с соседними атомами с образованием необязательно замещенного гетероциклического или гетероарильного кольца, или

два R' при одном атоме углерода объединены с соседними атомами с образованием необязательно замещенного арильного, карбоциклического, гетероциклического или гетероарильного кольца;

-Су- представляет собой необязательно замещенное двухвалентное кольцо, выбранное из фенилена, карбоциклилена, арилена, гетероарилена или гетероциклилена;

каждый R независимо представляет собой водород или необязательно замещенную группу, выбранную из C₁-C₆ алифатической группы, фенила, карбоциклила, арила, гетероарила или гетероциклила; и

каждый независимо представляет собой место присоединения к нуклеозиду. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит одну или более межнуклеотидных связей с модифицированным атомом фосфора. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит, например, фосфоротиоатную или фосфоротиоатную сложную триэфирную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит фосфоротиоатную сложную триэфирную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере две фосфоротиоатные сложные триэфирные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере три фосфоротиоатные сложные триэфирные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере четыре фосфоротиоатные сложные триэфирные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере пять фосфоротиоатных сложных триэфирных связей. Примеры таких модифицированных межнуклеотидных фосфорсодержащих связей дополнительно описаны в настоящей заявке.

[00636] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит различные межнуклеотидные фосфорсодержащие связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере одну фосфатную сложную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере одну модифицированную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере одну фосфатную сложную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере одну фосфоротиоатную сложную триэфирную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере одну фосфатную сложную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере две фосфоротиоатные сложные триэфирные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере одну фосфатную сложную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере три фосфоротиоатные сложные триэфирные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере одну фосфатную сложную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере четыре фосфоротиоатные сложные триэфирные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере одну фосфатную сложную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере пять фосфоротиоатных сложных триэфирных связей. Примеры таких модифицированных межнуклеотидных фосфорсодержащих связей дополнительно описаны в настоящей заявке.

[00637] Согласно некоторым вариантам осуществления фосфоротиоатная сложная триэфирная связь содержит хиральное вспомогательное вещество, которое, например, используют для контроля стереоселективности взаимодействия. Согласно некоторым вариантам осуществления фосфоротиоатная сложная триэфирная связь не содержит хиральное вспомогательное вещество. Согласно некоторым вариантам осуществления фосфоротиоатную сложную триэфирную связь намеренно сохраняют до и/или во время введения субъекту.

[00638] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью связан с твердой подложкой. Согласно некоторым вариантам осуществления проводят отщепление олигонуклеотида с контролируемой хиральностью от твердой подложки.

[00639] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере одну фосфатную сложную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере две расположенные последовательно модифицированные межнуклеотидные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере одну фосфатную сложную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере две расположенные последовательно фосфоротиоатные сложные триэфирные межнуклеотидные связи.

[00640] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой блокмер. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой стереоблокмер. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой блокмер с модификацией Р. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой блокмер с одинаковыми связями.

[00641] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой альтмер. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой стереоальтмер. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой альтмер с модификацией Р. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой альтмер с различными чередующимися связями.

[00642] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой унимер. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой стереоунимер. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой унимер с модификацией Р. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой унимер с одинаковыми связями.

[00643] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой гэпмер.

[00644] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой скипмер.

[00645] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложены олигонуклеотиды, содержащие одну или более модифицированных межнуклеотидных связей, независимо имеющих структуру формулы I:

где:

Р* представляет собой асимметрический атом фосфора и имеет Rp- или Sp-конфигурацию;

W представляет собой О, S или Se;

каждый из X, Y и Z независимо представляет собой -О-, -S-, -N(-L-R¹)- или L;

L представляет собой ковалентную связь или необязательно замещенный линейный или разветвленный C₁-С₁₀ алкилен, где одно или более метиленовых звеньев в L необязательно и независимо заменены на необязательно замещенную группу, выбранную из C₁-С₆ алкилена, C₁-C₆ алкенилена, -С≡С-, C₁-C₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и -C(O)O-;

R¹ представляет собой галоген, R или необязательно замещенную С₁-С₅₀ алифатическую группу, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и необязательно заменены на необязательно замещенную группу, выбранную из C₁-C₆ алкилена, C₁-C₆ алкенилена, -С≡С-, C₁-C₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и -C(O)O-;

каждый R' независимо представляет собой -R, -C(O)R, -CO₂R или -SO₂R, или:

два R' взятые вместе со своими промежуточными атомами для образования необязательно замещенного арила, карбоциклического, гетероциклического или гетероарильного кольца;

-Су- представляет собой необязательно замещенное двухвалентное кольцо, выбранное из фенилена, карбоциклилена, арилена, гетероарилена или гетероциклилена;

каждый R независимо представляет собой водород или необязательно замещенную группу, выбранную из C₁-C₆ алифатической группы, карбоциклила, арила, гетероарила или гетероциклила; и

каждый независимо представляет собой место присоединения к нуклеозиду.

[00646] Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой ковалентную связь или необязательно замещенный линейный или разветвленный C₁-С₁₀ алкилен, где одно или более метиленовых звеньев в L необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-C₆ алкилен, C₁-С₆ алкенилен, -С≡С-, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и -C(O)O-;

R¹ представляет собой галоген, R или необязательно замещенную С₁-С₅₀ алифатическую группу, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и необязательно заменены на необязательно замещенный C₁-C₆ алкилен, C₁-С₆ алкенилен, -С≡С-, C₁-С₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и-C(O)O-;

каждый R' независимо представляет собой -R, -C(O)R, -CO₂R или -SO₂R, или:

два R' при одном атоме азота объединены с соседними атомами с образованием необязательно замещенного гетероциклического или гетероарильного кольца, или

два R' при одном атоме углерода объединены с соседними атомами с образованием необязательно замещенного арильного, карбоциклического, гетероциклического или гетероарильного кольца;

-Су- представляет собой необязательно замещенное двухвалентное кольцо, выбранное из фенилена, карбоциклилена, арилена, гетероарилена или гетероциклилена;

каждый R независимо представляет собой водород или необязательно замещенную группу, выбранную из C₁-C₆ алифатической группы, фенила, карбоциклила, арила, гетероарила или гетероциклила; и

каждый независимо представляет собой место присоединения к нуклеозиду.

[00647] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных фосфорных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит, например, фосфоротиоатную или фосфоротиоатную триэфирную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит фосфоротиоатную триэфирную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере две фосфоротиоатные триэфирные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере три фосфоротиоатные триэфирные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере четыре фосфоротиоатные триэфирные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере пять фосфоротиоатных триэфирных связей. Иллюстративные модифицированные межнуклеотидные фосфорные связи описаны в настоящем описании далее. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит различные межнуклеотидные фосфорные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере одну фосфатную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере одну модифицированную межнуклеотидную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере одну фосфатную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере одну фосфоротиоатную триэфирную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере одну фосфатную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере две фосфоротиоатные триэфирные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере одну фосфатную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере три фосфоротиоатные триэфирные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере одну фосфатную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере четыре фосфоротиоатные триэфирные связи.

[00648] Согласно некоторым вариантам осуществления Р* представляет собой асимметрический атом фосфора и характеризуется конфигурацией Rp или Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления Р* представляет собой Rp. Согласно другим вариантам осуществления Р* представляет собой Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид содержит одну или более межнуклеотидных связей формулы I, где каждый Р* независимо характеризуется конфигурацией Rp или Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид содержит одну или более межнуклеотидных связей формулы I, где каждый Р* независимо представляет собой Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид содержит одну или более межнуклеотидных связей формулы I, где каждый Р* независимо представляет собой Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь формулы I, где Р* представляет собой Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь формулы I, где Р* представляет собой Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь формулы I, где Р* представляет собой Rp, и по меньшей мере одну межнуклеотидную связь формулы I, где Р* представляет собой Sp.

[00649] Согласно некоторым вариантам осуществления W представляет собой О, S или Se. Согласно некоторым вариантам осуществления W представляет собой О. Согласно некоторым вариантам осуществления W представляет собой S. Согласно некоторым вариантам осуществления W представляет собой Se. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь формулы I, где W представляет собой О. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь формулы I, где W представляет собой S. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь формулы I, где W представляет собой Se.

[00650] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь формулы I, где W представляет собой О. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь формулы I, где W представляет собой S.

[00651] Согласно некоторым вариантам осуществления каждый R независимо представляет собой водород или необязательно замещенную группу, выбранную из C₁-С₆ алифатической группы, фенила, карбоциклила, арила, гетероарила или гетероциклила.

[00652] Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой водород. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из C₁-C₆ алифатической группы, фенила, карбоциклила, арила, гетероарила или гетероциклила.

[00653] Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенную C₁-С₆ алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный C₁-С₆ алкил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный линейный или разветвленный гексил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный линейный или разветвленный пентил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный линейный или разветвленный бутил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный линейный или разветвленный пропил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный этил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный метил.

[00654] Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный фенил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой замещенный фенил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой фенил.

[00655] Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный карбоциклил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный С₃-С₁₀ карбоциклил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный моноциклический карбоциклил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный циклогептил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный циклогексил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный циклопентил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный циклобутил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный циклопропил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный бициклический карбоциклил.

[00656] Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный арил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное бициклическое арильное кольцо.

[00657] Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный гетероарил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-6-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 гетероатомов, независимо выбранных из азота, серы или кислорода. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой замещенное 5-6-членное мо но циклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой незамещенное 5-6-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 гетероатомов, независимо выбранных из азота, серы или кислорода.

[00658] Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы.

[00659] Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1 гетероатом, выбранный из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R выбран из пирролила, фуранила или тиенила.

[00660] Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное гетероарильное кольцо, содержащее 2 гетероатома, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно определенным вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1 атом азота и дополнительный гетероатом, выбранный из серы или кислорода. Примеры групп R включают необязательно замещенный пиразолил, имидазолил, тиазолил, изотиазолил, оксазолил и изоксазолил.

[00661] Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой 6-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 атомов азота. Согласно другим вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1-2 атомов азота. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное гетероарильное кольцо, содержащее 2 атома азота. Согласно определенным вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1 атом азота. Примеры групп R включают необязательно замещенный пиридинил, пиримидинил, пиразинил, пиридазинил, триазинил или тетразинил.

[00662] Согласно определенным вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 8-10-членное бициклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно другим вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-2 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно определенным вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1 гетероатом, независимо выбранный из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный индолил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный азабицикло[3.2.1]октанил. Согласно определенным вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 2 гетероатома, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный азаиндолил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный бензимидазолил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный бензотиазолил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный бензоксазолил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный индазолил. Согласно определенным вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 3 гетероатома, независимо выбранных из азота, кислорода или серы.

[00663] Согласно определенным вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-2 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно другим вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1 гетероатом, независимо выбранный из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный хинолинил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный изохинолинил. Согласно одному из аспектов R представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 2 гетероатома, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой хиназолин или хиноксалин.

[00664] Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный гетероциклил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 3-7-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой замещенное 3-7-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой незамещенное 3-7-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы.

[00665] Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный гетероциклил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 2 гетероатома, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 2 атома кислорода.

[00666] Согласно определенным вариантам осуществления R представляет собой 3-7-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно определенным вариантам осуществления R представляет собой оксиранил, оксетанил, тетрагидрофуранил, тетрагидропиранил, оксепанил, азиридинил, азетидинил, пирролидинил, пиперидинил, азепанил, тииранил, тиетанил, тетрагидротио фенил, тетрагидротиопиранил, тиепанил, диоксоланил, оксатиоланил, оксазолидинил, имидазолидинил, тиазолидинил, дитиоланил, диоксанил, морфолинил, оксатианил, пиперазинил, тиоморфолинил, дитианил, диоксепанил, оксазепанил, оксатиепанил, дитиепанил, диазепанил, дигидрофуранонил, тетрагидропиранонил, оксепанонил, пирролидинонил, пиперидинонил, азепанонил, дигидротиофенонил, тетрагидротиопиранонил, тиепанонил, оксазолидинонил, оксазинанонил, оксазепанонил, диоксоланонил, диоксанонил, диоксепанонил, оксатиолинонил, оксатианонил, оксатиепанонил, тиазолидинонил, тиазинанонил, тиазепанонил, имидазолидинонил, тетрагидропиримидинонил, диазепанонил, имидазолидиндионил, оксазолидиндионил, тиазолидиндионил, диоксоландионил, оксатиоландионил, пиперазиндионил, морфолиндионил, тиоморфолиндионил, тетрагидропиранил, тетрагидрофуранил, морфолинил, тиоморфолинил, пиперидинил, пиперазинил, пирролидинил, тетрагидротиофенил или тетрагидротиопиранил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы.

[00667] Согласно определенным вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-6-членное частично ненасыщенное моноциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно определенным вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный тетрагидропиридинил, дигидротиазолил, дигидрооксазолил или оксазолинильную группу.

[00668] Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенное 8-10-членное бициклическое насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный индолинил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный изоиндолинил. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный 1,2,3,4-тетрагидрохинолин. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой необязательно замещенный 1,2,3,4-тетрагидроизохинолин.

[00669] Согласно некоторым вариантам осуществления каждый R' независимо представляет собой -R, -C(O)R, -CO₂R или -SO₂R, или:

два R' при одном атоме азота объединены с соседними атомами с образованием необязательно замещенного гетероциклического или гетероарильного кольца, или

два R' при одном атоме углерода объединены с соседними атомами с образованием необязательно замещенного арильного, карбоциклического, гетероциклического или гетероарильного кольца.

[00670] Согласно некоторым вариантам осуществления R' представляет собой -R, -C(O)R, -CO₂R или -SO₂R, где R такой, как определено и описано выше.

[00671] Согласно некоторым вариантам осуществления R' представляет собой -R, где R такой, как определено и описано выше. Согласно некоторым вариантам осуществления R' представляет собой водород.

[00672] Согласно некоторым вариантам осуществления R' представляет собой -C(O)R, где R такой, как определено и описано выше. Согласно некоторым вариантам осуществления R' представляет собой -CO₂R, где R такой, как определено и описано выше. Согласно некоторым вариантам осуществления R' представляет собой -SO₂R, где R такой, как определено и описано выше.

[00673] Согласно некоторым вариантам осуществления два R' при одном атоме азота объединены с соседними атомами с образованием необязательно замещенного гетероциклического или гетероарильного кольца. Согласно некоторым вариантам осуществления два R' при одном атоме углерода объединены с соседними атомами с образованием необязательно замещенного арильного, карбоциклического, гетероциклического или гетероарильного кольца.

[00674] Согласно некоторым вариантам осуществления -Су- представляет собой необязательно замещенное двухвалентное кольцо, выбранное из фенилена, карбоциклилена, арилена, гетероарилена или гетероциклилена.

[00675] Согласно некоторым вариантам осуществления Су представляет собой необязательно замещенный фенилен. Согласно некоторым вариантам осуществления Су представляет собой необязательно замещенный карбоциклилен. Согласно некоторым вариантам осуществления -Су- представляет собой необязательно замещенный арилен. Согласно некоторым вариантам осуществления -Су- представляет собой необязательно замещенный гетероарилен. Согласно некоторым вариантам осуществления -Су- представляет собой необязательно замещенный гетероциклилен.

[00676] Согласно некоторым вариантам осуществления каждый из X, Y и Z независимо представляет собой -О-, -S-, -N(-L-R¹)- или L, где каждый из L и R¹ независимо является таким, как определено выше и описано далее.

[00677] Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой -О-. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой -S-. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой -О- или -S-. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь формулы I, где X представляет собой -О-. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь формулы I, где X представляет собой -S-. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь формулы I, где X представляет собой -О- и по меньшей мере одну межнуклеотидную связь формулы I, где X представляет собой -S-. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь формулы I, где X представляет собой -О- и по меньшей мере одну межнуклеотидную связь формулы I, где X представляет собой -S-, и по меньшей мере одну межнуклеотидную связь формулы I, где L представляет собой необязательно замещенный линейный или разветвленный C₁-С₁₀ алкилен, причем одно или более метиленовых звеньев в L необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-C₆ алкилен, C₁-C₆ алкенилен, -С≡С-, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- или -C(O)O-.

[00678] Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой -N(-L-R¹)-. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой -N(R¹)-. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой -N(R')-. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой -N(R)-. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой -NH-.

[00679] Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой L. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой ковалентную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой необязательно замещенный линейный или разветвленный C₁-С₁₀ алкилен, где одно или более метиленовых звеньев в L необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-С₆ алкилен, C₁-C₆ алкенилен, -С≡С-, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- или -C(O)O-. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой необязательно замещенный C₁-С₁₀ алкилен или C₁-С₁₀ алкенилен. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой метилен.

[00680] Согласно некоторым вариантам осуществления Y представляет собой -О-. Согласно некоторым вариантам осуществления Y представляет собой -S-.

[00681] Согласно некоторым вариантам осуществления Y представляет собой -N(-L-R¹)-. Согласно некоторым вариантам осуществления Y представляет собой -N(R¹)-. Согласно некоторым вариантам осуществления Y представляет собой -N(R')-. Согласно некоторым вариантам осуществления Y представляет собой -N(R)-. Согласно некоторым вариантам осуществления Y представляет собой -NH-.

[00682] Согласно некоторым вариантам осуществления Y представляет собой L. Согласно некоторым вариантам осуществления Y представляет собой ковалентную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления Y представляет собой необязательно замещенный линейный или разветвленный C₁-С₁₀ алкилен, где одно или более метиленовых звеньев в L необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-С₆ алкилен, C₁-C₆ алкенилен, -С≡С-, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- или -C(O)O-. Согласно некоторым вариантам осуществления Y представляет собой необязательно замещенный C₁-С₁₀ алкилен или C₁-С₁₀ алкенилен. Согласно некоторым вариантам осуществления Y представляет собой метилен.

[00683] Согласно некоторым вариантам осуществления Z представляет собой -О-. Согласно некоторым вариантам осуществления Z представляет собой -S-.

[00684] Согласно некоторым вариантам осуществления Z представляет собой -N(-L-R¹)-. Согласно некоторым вариантам осуществления Z представляет собой -N(R¹)-. Согласно некоторым вариантам осуществления Z представляет собой -N(R')-. Согласно некоторым вариантам осуществления Z представляет собой -N(R)-. Согласно некоторым вариантам осуществления Z представляет собой -NH-.

[00685] Согласно некоторым вариантам осуществления Z представляет собой L. Согласно некоторым вариантам осуществления Z представляет собой ковалентную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления Z представляет собой необязательно замещенный линейный или разветвленный C₁-С₁₀ алкилен, где одно или более метиленовых звеньев в L необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-C₆ алкилен, C₁-C₆ алкенилен, -С≡С-, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- или -C(O)O-. Согласно некоторым вариантам осуществления Z представляет собой необязательно замещенный C₁-С₁₀ алкилен или C₁-С₁₀ алкенилен. Согласно некоторым вариантам осуществления Z представляет собой метилен.

[00686] Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой ковалентную связь или необязательно замещенный линейный или разветвленный C₁-С₁₀ алкилен, где одно или более метиленовых звеньев в L необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-С₆ алкилен, C₁-С₆ алкенилен, -С≡С-, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, N(R')C(O)O, -OC(O)N(R')-, S(O), -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- или -C(O)O-.

[00687] Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой ковалентную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой необязательно замещенный линейный или разветвленный C₁-С₁₀ алкилен, где одно или более метиленовых звеньев в L необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-С₆ алкилен, C₁-С₆ алкенилен, -С≡С-, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- или -C(O)O-.

[00688] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру -L¹-V-, где:

L¹ представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из

C₁-C₆ алкилена, C₁-C₆ алкенилена, карбоциклилена, арилена, C₁-С₆ гетероалкилена, гетероциклилена и гетероарилена;

V выбран из -О-, -S-, -NR'-, -C(R')₂, -S-S-, -B-S-S-C-, или необязательно замещенной группы, выбранной из C₁-C₆ алкилена, арилена, C₁-C₆ гетероалкилена, гетероциклилена и гетероарилена;

А представляет собой =O, =S, =NR' или =C(R')₂;

каждый из В и С независимо представляет собой -О-, -S-, -NR'-, -C(R')₂- или необязательно замещенную группу, выбранную из C₁-С₆ алкилена, карбоциклилена, арилена, гетероциклилена или гетероарилена; и

каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00689] Согласно некоторым вариантам осуществления L¹ представляет собой

[00690] Согласно некоторым вариантам осуществления L¹ представляет собой

где кольцо Су' представляет собой необязательно замещенный арилен, карбоциклилен, гетероарилен или гетероциклилен. Согласно некоторым вариантам осуществления L¹ представляет собой необязательно замещенный Согласно некоторым вариантам осуществления L¹ представляет собой

[00691] Согласно некоторым вариантам осуществления L¹ соединен с X. Согласно некоторым вариантам осуществления L¹ представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из

а атом серы соединен с V. Согласно некоторым вариантам осуществления L¹ представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из а атом углерода соединен с X.

[00692] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

Е представляет собой -О-, -S-, -NR'- или -C(R')₂-;

представляет собой простую или двойную связь;

два R^L1 объединены с двумя атомами углерода, с которыми они связаны, с образованием необязательно замещенного арильного, карбоциклического, гетероарильного или гетероциклического кольца; и каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00693] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

G представляет собой -О-, -S- или -NR';

представляет собой простую или двойную связь; и

два R^L1 совместно с двумя атомами углерода, с которыми они связаны, образуют необязательно замещенное арильное, С₃-С₁₀ карбоциклическое, гетероарильное или гетероциклическое кольцо.

[00694] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

Е представляет собой -О-, -S-, -NR'- или -C(R')₂-;

D представляет собой =N-,=C(F)-, =С(Cl)-, =C(Br)-, =C(I), =C(CN)-, =C(NO₂)-, =C(CO₂-(C₁-C₆ алифатическая группа))- или =С(CF₃)-; и

каждый R' является независимо таким, как определено выше в настоящем описании.

[00695] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

G представляет собой -О-, -S- или -NR';

D представляет собой =N-, =C(F)-, =С(Cl)-, =C(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO₂)-, =C(CO₂-(C₁-C₆ алифатическая группа))- или =C(CF₃)-.

[00696] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

Е представляет собой -О-, -S-, -NR'- или -C(R')₂-;

D представляет собой =N-, =C(F)-, =С(Cl)-, =С(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO₂)-, =C(CO₂-(C₁-C₆ алифатическая группа))- или =С(CF₃)-', и

каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00697] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

G представляет собой -О-, -S- или -NR';

D представляет собой =N-, =C(F)-, =С(Cl)-, =С(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO₂)-, =C(CO₂-(C₁-C₆ алифатическая группа))- или =C(CF₃)-.

[00698] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

Е представляет собой -О-, -S-, -NR'- или -C(R')₂-;

представляет собой простую или двойную связь;

два R^L1 объединены с двумя атомами углерода, с которыми они связаны, с образованием необязательно замещенного арильного, С₃-С₁₀ карбоциклического, гетероарильного или гетероциклического кольца;

и каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00699] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

G представляет собой -О-, -S- или -NR';

представляет собой простую или двойную связь;

два R^L1 объединены с двумя атомами углерода, с которыми они связаны, с образованием необязательно замещенного арильного, С₃-С₁₀ карбоциклического, гетероарильного или гетероциклического кольца;

и каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00700] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

Е представляет собой -О-, -S-, -NR'- или -C(R')₂-;

D представляет собой =N-, =C(F)-, =С(Cl)-, =С(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO₂)-, =C(CO₂-(C₁-C₆ алифатическая группа))- или =С(CF₃)-; и

каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00701] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

G представляет собой -О-, -S- или -NR';

D представляет собой =N-, =C(F)-, =С(Cl)-, =С(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO₂)-, =C(CO₂-(C₁-C₆ алифатическая группа))- или =C(CF₃)-; и

каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00702] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

Е представляет собой -О-, -S-, -NR'- или -C(R')₂-;

D представляет собой =N-, =C(F)-, =С(Cl)-, =С(Br)-, =С(I)-, =C(CN)-, =C(NO₂)-, =C(CO₂-(C₁-C₆ алифатическая группа))- или =С(CF₃)-; и

каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00703] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

G представляет собой -О-, -S- или -NR';

D представляет собой =N-, =C(F)-, =С(Cl)-, =С(Br)-, =С(I)-, =C(CN)-, =C(NO₂)-, =C(CO₂-(C₁-C₆ алифатическая группа))- или =C(CF₃)-; и

каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00704] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

Е представляет собой -О-, -S-, -NR'- или -C(R')₂-;

представляет собой простую или двойную связь; два R^L1 объединены с двумя атомами углерода, с которыми они связаны, с образованием необязательно замещенного арильного, С₃-С₁₀ карбоциклического, гетероарильного или гетероциклического кольца; и каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00705] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

G представляет собой -О-, -S- или -NR';

представляет собой простую или двойную связь;

два R^L1 объединены с двумя атомами углерода, с которыми они связаны, с образованием необязательно замещенного арильного, С₃-С₁₀ карбоциклического, гетероарильного или гетероциклического кольца; и каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00706] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

Е представляет собой -О-, -S-, -NR'- или -C(R')₂-;

D представляет собой =N-, =C(F)-, =С(Cl)-, =C(Br)-, =C(I), =C(CN)-, =C(NO₂)-, =C(CO₂-(C₁-C₆ алифатическая группа))- или =С(CF₃)-; и

каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00707] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

G представляет собой -О-, -S- или -NR';

D представляет собой =N-, =C(F)-, =С(Cl)-, =С(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO₂)-, =C(CO₂-(Ci-G5 алифатическая группа))- или =С(CF₃)-; и

R' является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00708] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

Е представляет собой -О-, -S-, -NR'- или C(R')₂;

D представляет собой =N-, =C(F)-, =С(Cl)-, =С(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO₂)-, =C(CO₂-(C₁-C₆ алифатическая группа))- или =С(CF₃)-; и

каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00709] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

G представляет собой -О-, -S- или -NR';

D представляет собой =N-, =C(F)-, =С(Cl)-, =С(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO₂)-, =C(CO₂-(C₁-C₆ алифатическая группа))- или =С(CF₃)-; и

R' является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00710] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где фенильное кольцо является необязательно замещенным. Согласно некоторым вариантам осуществления фенильное кольцо является незамещенным. Согласно некоторым вариантам осуществления фенильное кольцо является замещенным.

[00711] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где фенильное кольцо является необязательно замещенным. Согласно некоторым вариантам осуществления фенильное кольцо является незамещенным. Согласно некоторым вариантам осуществления фенильное кольцо является замещенным.

[00712] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

представляет собой простую или двойную связь; и

два R^L1 объединены с двумя атомами углерода, с которыми они связаны, с образованием необязательно замещенного арильного, С₃-С₁₀ карбоциклического, гетероарильного или гетероциклического кольца.

[00713] Согласно некоторым вариантам осуществления L имеет структуру:

где:

G представляет собой -О-, -S- или -NR';

представляет собой простую или двойную связь; и

два R^L1 объединены с двумя атомами углерода, с которыми они связаны, с образованием необязательно замещенного арильного, С₃-С₁₀ карбоциклического, гетероарильного или гетероциклического кольца.

[00714] Согласно некоторым вариантам осуществления Е представляет собой -О-, -S-, -NR'- или -C(R')₂-, где каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления Е представляет собой -О-, -S- или -NR'-. Согласно некоторым вариантам осуществления Е представляет собой -О-, -S- или -NH-. Согласно некоторым вариантам осуществления Е представляет собой -О-. Согласно некоторым вариантам осуществления Е представляет собой -S-. Согласно некоторым вариантам осуществления Е представляет собой -NH-.

[00715] Согласно некоторым вариантам осуществления G представляет собой -О-, -S- или -NR', где каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления G представляет собой -О-, -S- или NH-. Согласно некоторым вариантам осуществления G представляет собой -О-. Согласно некоторым вариантам осуществления G представляет собой -S-. Согласно некоторым вариантам осуществления G представляет собой -NH-.

[00716] Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой -L³-G-, где:

L³ представляет собой необязательно замещенный С₁-С₅ алкилен или алкенилен, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на -О-, -S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -S(O)-, -S(O)₂- или и

каждый из G, R' и кольца Су' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00717] Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой -L³-S-, где L³ является таким, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой -L³-О, где L³ является таким, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой -L³-N(R')-, где каждый из L³ и R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой L³ NH, где каждый из L³ и R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00718] Согласно некоторым вариантам осуществления L³ представляет собой необязательно замещенный С₅ алкилен или алкенилен, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на -О-, S, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -S(O)-, -S(O)₂- или а каждый из R' и кольца Су' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления L³ представляет собой необязательно замещенный С₅ алкилен. Согласно некоторым вариантам осуществления -L³-G- представляет собой

[00719] Согласно некоторым вариантам осуществления L³ представляет собой необязательно замещенный С₄ алкилен или алкенилен, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на -О-, -S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -S(O)-, -S(O)₂- или а каждый из R' и Су' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00720] Согласно некоторым вариантам осуществления -L³-G- представляет собой

[00721] Согласно некоторым вариантам осуществления L³ представляет собой необязательно замещенный С₃ алкилен или алкенилен, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на -О-, -S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -S(O)-, -S(O)₂- или и каждый из R' и Су' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00722] Согласно некоторым вариантам осуществления -L³-G- представляет собой

[00723] Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой

[00724] Согласно некоторым вариантам осуществления L³ представляет собой необязательно замещенный С₂ алкилен или алкенилен, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на -О-, -S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -S(O)-, -S(O)₂- или и каждый из R' и Су' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00725] Согласно некоторым вариантам осуществления -L³-G- представляет собой где каждый из G и Су' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой

[00726] Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой -L⁴-G-, где L⁴ представляет собой необязательно замещенный C₁-С₂ алкилен; и G является таким, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой -L⁴-G-, где L⁴ представляет собой необязательно замещенный С₁-С₂ алкилен; G является таким, как определено выше в настоящем описании; и G соединен с R¹. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой -L⁴-G-, где L⁴ представляет собой необязательно замещенный метилен; G является таким, как определено выше в настоящем описании; и G соединен с R¹. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой -L⁴-G-, где L⁴ представляет собой метилен; G является таким, как определено выше в настоящем описании; и G соединен с R¹. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой -L⁴-G-, где L⁴ представляет собой необязательно замещенный -(СН₂)₂-; G является таким, как определено выше в настоящем описании; и G соединен с R¹. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой -L⁴-G-, где L⁴ представляет собой -(СН₂)₂-; G является таким, как определено выше в настоящем описании; и G соединен с R¹.

[00727] Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой где G является таким, как определено выше в настоящем описании, и G соединен с R¹. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой где G является таким, как определено выше в настоящем описании, и G соединен с R¹. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой где G является таким, как определено выше в настоящем описании, и G соединен с R¹. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой где атом серы соединен с R¹. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой где атом кислорода соединен с R¹.

[00728] Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой где G является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00729] Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой -S-R^L3- или -S-C(O)-R^L3-, где R^L3 представляет собой необязательно замещенный линейный или разветвленный C₁-С₉ алкилен, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-C₆ алкилен, C₁-C₆ алкенилен, -С≡С-, -C(R')₂, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, С(О), -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S, -OC(O)- или -C(O)O-, где каждый из R' и -Су- независимо является таким, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой -S-R^L3- или -S-C(O)-R^L3-, где R^L3 представляет собой необязательно замещенный C₁-C₆ алкилен. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой -S-R^L3- или -S-C(O)-R^L3-, где R^L3 представляет собой необязательно замещенный C₁-C₆ алкенилен. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой -S-R^L3- или -S-C(O)-R^L3-, где R^L3 представляет собой необязательно замещенный C₁-C₆ алкилен, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-С₆ алкенилен, арилен или гетероарилен. Согласно некоторым вариантам осуществления R^L3 представляет собой необязательно замещенный -S-(C₁-C₆ алкенилен)-, -S-(C₁-C₆ алкилен)-, -S-(C₁-C₆ алкилен)-арилен-(С₁-С₆ алкилен)-, -S-CO-арилен-(C₁-C₆ алкилен) или -S-СО-(C₁-C₆ алкилен)-арилен-(С₁-С₆ алкилен)-.

[00730] Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой

[00731] Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления

[00732] Согласно некоторым вариантам осуществления атом серы в вариантах осуществления L, описанных выше в настоящей заявке, соединен с X. Согласно некоторым вариантам осуществления атом серы в вариантах осуществления L, описанных выше в настоящей заявке, соединен с R¹.

[00733] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой галоген, R или необязательно замещенную С₁-С₅₀ алифатическую группу, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-C₆ алкилен, C₁-C₆ алкенилен, -С≡С-, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- или -C(O)O-, где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой галоген, R или необязательно замещенную C₁-С₁₀ алифатическую группу, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-С₆ алкилен, C₁-C₆ алкенилен, -С≡С-, -C(R')₂, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- или -C(O)O-, где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00734] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой водород. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой галоген. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой -F. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой -Cl. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой -Br. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой -I.

[00735] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой R, где R такой, как определено выше в настоящем описании.

[00736] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой водород. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из С₁-С₅₀ алифатической группы, фенила, карбоциклила, арила, гетероарила или гетероциклила.

[00737] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенную С₁-С₅₀ алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенную C₁-С₁₀ алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенную C₁-C₆ алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный C₁-С₆ алкил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный линейный или разветвленный гексил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный линейный или разветвленный пентил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный линейный или разветвленный бутил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный линейный или разветвленный пропил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный этил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный метил.

[00738] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный фенил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой замещенный фенил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой фенил.

[00739] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный карбоциклил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный С₃-С₁₀ карбоциклил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный моноциклический карбоциклил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный циклогептил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный циклогексил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный циклопентил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный циклобутил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный циклопропил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный бициклический карбоциклил.

[00740] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный C₁-С₅₀ полициклический углеводород. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный С₁-С₅₀ полициклический углеводород, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-С₆ алкилен, C₁-C₆ алкенилен, -С≡С-, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- или -C(O)O-, причем каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный

[00741] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенную С₁-С₅₀ алифатическую группу, содержащую один или более необязательно замещенных фрагментов полициклических углеводородов. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенную С₁-С₅₀ алифатическую группу, содержащую один или более необязательно замещенных фрагментов полициклических углеводородов, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-C₆ алкилен, C₁-C₆ алкенилен, -С≡С-, -C(R')₂, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- или -C(O)O-, причем каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенную С₁-С₅₀ алифатическую группу, содержащую один или более необязательно замещенных

Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой

[00742] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный арил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное бициклическое арильное кольцо.

[00743] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный гетероарил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 5-6-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 гетероатомов, независимо выбранных из азота, серы или кислорода. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой замещенное 5-6-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой незамещенное 5-6-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 гетероатомов, независимо выбранных из азота, серы или кислорода.

[00744] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 5-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 6-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы.

[00745] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 5-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1 гетероатом, выбранный из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ выбран из пирролила, фуранила или тиенила.

[00746] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 5-членное гетероарильное кольцо, содержащее 2 гетероатома, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно определенным вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 5-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1 атом азота и дополнительный гетероатом, выбранный из серы или кислорода. Примеры групп R¹ включают необязательно замещенный пиразолил, имидазолил, тиазолил, изотиазолил, оксазолил и изоксазолил.

[00747] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой 6-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 атомов азота. Согласно другим вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 6-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1-2 атомов азота. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 6-членное гетероарильное кольцо, содержащее 2 атома азота. Согласно определенным вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 6-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1 атом азота. Примеры групп R¹ включают необязательно замещенный пиридинил, пиримидинил, пиразинил, пиридазинил, триазинил или тетразинил.

[00748] Согласно определенным вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 8-10-членное бициклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно другим вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-2 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно определенным вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1 гетероатом, независимо выбранный из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный индолил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный азабицикло[3.2.1]октанил. Согласно определенным вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 2 гетероатома, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный азаиндолил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный бензимидазолил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный бензотиазолил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный бензоксазолил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный индазолил. Согласно определенным вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 3 гетероатома, независимо выбранных из азота, кислорода или серы.

[00749] Согласно определенным вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-2 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно другим вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1 гетероатом, независимо выбранный из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный хинолинил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный изохинолинил. Согласно одному из аспектов R¹ представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 2 гетероатома, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой хиназолин или хиноксалин.

[00750] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный гетероциклил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 3-7-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой замещенное 3-7-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой незамещенное 3-7-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы.

[00751] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный гетероциклил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 6-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 6-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 2 гетероатома, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 6-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 2 атома кислорода.

[00752] Согласно определенным вариантам осуществления R¹ представляет собой 3-7-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно определенным вариантам осуществления R¹ представляет собой оксиранил, оксетанил, тетрагидрофуранил, тетрагидропиранил, оксепанил, азиридинил, азетидинил, пирролидинил, пиперидинил, азепанил, тииранил, тиетанил, тетрагидротио фенил, тетрагидротиопиранил, тиепанил, диоксоланил, оксатиоланил, оксазолидинил, имидазолидинил, тиазолидинил, дитиоланил, диоксанил, морфолинил, оксатианил, пиперазинил, тио морфолинил, дитианил, диоксепанил, оксазепанил, оксатиепанил, дитиепанил, диазепанил, дигидрофуранонил, тетрагидропиранонил, оксепанонил, пирролидинонил, пиперидинонил, азепанонил, дигидротиофенонил, тетрагидротиопиранонил, тиепанонил, оксазолидинонил, оксазинанонил, оксазепанонил, диоксоланонил, диоксанонил, диоксепанонил, оксатиолинонил, оксатианонил, оксатиепанонил, тиазолидинонил, тиазинанонил, тиазепанонил, имидазолидинонил, тетрагидропиримидинонил, диазепанонил, имидазолидиндионил, оксазолидиндионил, тиазолидиндионил, диоксоландионил, оксатиоландионил, пиперазиндионил, морфолиндионил, тиоморфолиндионил, тетрагидропиранил, тетрагидрофуранил, морфолинил, тио морфолинил, пиперидинил, пиперазинил, пирролидинил, тетрагидротиофенил или тетрагидротиопиранил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 5-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы.

[00753] Согласно определенным вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 5-6-членное частично ненасыщенное моноциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно определенным вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный тетрагидр о пиридинил, дигидротиазолил, дигидрооксазолил или оксазолинильную группу.

[00754] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенное 8-10-членное бициклическое насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный индолинил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный изоиндолинил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный 1,2,3,4-тетрагидрохинолин. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный 1,2,3,4-тетрагидроизохинолин.

[00755] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенную C₁-С₁₀ алифатическую группу, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-С₆ алкилен, C₁-C₆ алкенилен, -С≡С-, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- или -C(O)O-, причем каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенную C₁-С₁₀ алифатическую группу, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -OC(O)- или -C(O)O-, причем каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенную C₁-С₁₀ алифатическую группу, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -ОС(О)- или -С(O)O- причем каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00756] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой

[00757] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой СН₃-,

[00758] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ содержит терминальный необязательно замещенный фрагмент -(СН₂)₂-, соединенный с L. Примеры таких групп R¹ изображены ниже:

[00759] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ содержит терминальный необязательно замещенный фрагмент -(СН₂)-, соединенный с L. Примеры таких групп R¹ изображены ниже:

[00760] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой -S-R^L2, где R^L2 представляет собой необязательно замещенную С₁-С₉ алифатическую группу, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-C₆ алкилен, C₁-С₆ алкенилен, -С≡С-, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- или -C(O)O-, а каждый из R' и -Су- независимо является таким, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой -S-R^L2, где атом серы соединен с атомом серы в группе L.

[00761] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой -C(O)-R^L2, где R^L2 представляет собой необязательно замещенную С₁-С₉ алифатическую группу, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-C₆ алкилен, C₁-С₆ алкенилен, -С≡С-, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- или -C(O)O-, а каждый из R' и -Су- независимо является таким, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой -С(О)-R^L2, где карбонильная группа соединена с G в группе L. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой -C(O)-R^L2, где карбонильная группа соединена с атомом серы в группе L.

[00762] Согласно некоторым вариантам осуществления R^L2 представляет собой необязательно замещенную С₁-С₉ алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления R^L2 представляет собой необязательно замещенный С₁-С₉ алкил. Согласно некоторым вариантам осуществления R^L2 представляет собой необязательно замещенный C₁-С₉ алкенил. Согласно некоторым вариантам осуществления R^L2 представляет собой необязательно замещенный С₁-С₉ алкинил. Согласно некоторым вариантам осуществления R^L2 представляет собой необязательно замещенную С₁-С₉ алифатическую группу, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на -Су- или -С(O)-. Согласно некоторым вариантам осуществления R^L2 представляет собой необязательно замещенную С₁-С₉ алифатическую группу, где одном или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на -Су-. Согласно некоторым вариантам осуществления R^L2 представляет собой необязательно замещенную С₁-С₉ алифатическую группу, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный гетероциклилен. Согласно некоторым вариантам осуществления R^L2 представляет собой необязательно замещенную С₁-С₉ алифатическую группу, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный арилен. Согласно некоторым вариантам осуществления R^L2 представляет собой необязательно замещенную С₁-С₉ алифатическую группу, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный гетероарилен. Согласно некоторым вариантам осуществления R^L2 представляет собой необязательно замещенную С₁-С₉ алифатическую группу, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный С₃-С₁₀ карбоциклилен. Согласно некоторым вариантам осуществления R^L2 представляет собой необязательно замещенную С₁-С₉ алифатическую группу, где два метиленовых звена необязательно и независимо заменены на -Су- или -С(О)-. Согласно некоторым вариантам осуществления R^L2 представляет собой необязательно замещенную С₁-С₉ алифатическую группу, где два метиленовых звена необязательно и независимо заменены на -Су- или -С(О)-. Примеры групп R^L2 изображены ниже:

[00763] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой водород или необязательно замещенную группу, выбранную из -S-(C₁-C₁₀ алифатическая группа), C₁-С₁₀ алифатической группы, арила, C₁-С₆ гетероалкила, гетероарила и гетероциклила. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой

или -S-(C₁-C₁₀ алифатическая группа). Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой

[00764] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из -S-(C₁-C₆ алифатическая группа), C₁-С₁₀ алифатической группы, C₁-С₆ гетероалифатической группы арила, гетероциклила и гетероарила.

[00765] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой

[00766] Согласно некоторым вариантам осуществления атом серы в вариантах осуществления R¹, описанных выше в настоящей заявке, соединен с атомом серы, фрагментом G, Е или -С(О)- в вариантах осуществления L, описанных выше в настоящей заявке. Согласно некоторым вариантам осуществления фрагмент -С(О)- в вариантах осуществления R¹, описанных выше в настоящей заявке, соединен с атомом серы, фрагментом G, Е или -С(О)- в вариантах осуществления L, описанных выше в настоящей заявке.

[00767] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- представляет собой любую комбинацию вариантов осуществления L и вариантов осуществления R¹, определенных выше в настоящем описании.

[00768] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- представляет собой -L³-G-R¹, где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00769] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- представляет собой -L⁴-G-R¹, где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00770] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- представляет собой -L³-G-S-R^L2, где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00771] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- представляет собой -L³-G С(О)-R^L2, где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00772] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- представляет собой где R^L2 представляет собой необязательно замещенную С₁-С₉ алифатическую группу, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-С₆ алкилен, C₁-С₆ алкенилен, -С≡С-, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- или -C(O)O-, а каждый G независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00773] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ представляет собой -R^L3-S-S-R^L2, где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ представляет собой -R^L3-C(O)-S-S-R^L2, где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00774] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00775] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00776] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00777] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00778] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00779] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00780] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00781] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00782] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00783] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00784] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00785] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00786] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00787] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00788] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00789] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00790] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00791] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00792] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00793] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00794] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00795] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ имеет структуру:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00796] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- имеет структуру:

где:

фенильное кольцо является необязательно замещенным, и

каждый из R¹ и X независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00797] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- представляет собой

[00798] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- представляет собой:

[00799] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ представляет собой: СН₃-,

Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ представляет собой:

[00800] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- содержит терминальный необязательно замещенный фрагмент -(СН₂)₂-, соединенный с X. Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ содержит терминальный фрагмент -(СН₂)₂-, соединенный с X. Примеры таких фрагментов -L-R¹- изображены ниже:

[00801] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- содержит терминальный необязательно замещенный фрагмент -(СН₂)-, соединенный с X. Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹- содержит терминальный фрагмент -(СН₂)-, соединенный с X. Примеры таких фрагментов -L-R¹- изображены ниже:

[00802] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ представляет собой

[00803] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ представляет собой СН₃-,

а X представляет собой -S-.

[00804] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ представляет собой СН₃-,

X представляет собой -S-, W представляет собой О, Y представляет собой -О-, и Z представляет собой -О-.

[00805] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой

или -S-(C₁-С₁₀ алифатическая группа).

[00806] Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой

[00807] Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой -О- или -S-, a R¹ представляет собой или -S-(C₁-C₁₀ алифатическая группа).

[00808] Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой -О- или -S-, a R¹ представляет собой

-S-(C₁-C₁₀ алифатическая группа) или -S-(C₁-C₅₀ алифатическая группа).

[00809] Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой ковалентную связь, и -L-R¹ представляет собой R¹.

[00810] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ не является водородом.

[00811] Согласно некоторым вариантам осуществления -X-L-R¹ представляет собой R¹, который представляет собой

-S-(C₁-C₁₀ алифатическая группа) или -S-(C₁-C₅₀ алифатическая группа).

[00812] Согласно некоторым вариантам осуществления -X-L-R¹ имеет структуру где фрагмент является необязательно замещенным.

Согласно некоторым вариантам осуществления -X-L-R¹ представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления -X-L-R¹ представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления -X-L-R¹ представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления -X-L-R¹ имеет структуру где X' представляет собой О или S, Y' представляет собой -О-, -S- или -NR'-, а фрагмент является необязательно замещенным. Согласно некоторым вариантам осуществления Y' представляет собой -О-, -S- или -NH-. Согласно некоторым вариантам осуществления представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления -X-L-R¹ имеет структуру где X' представляет собой О или S, а фрагмент является необязательно замещенным. Согласно некоторым вариантам осуществления представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления -X-L-R¹ представляет собой где является необязательно замещенным. Согласно некоторым вариантам осуществления -X-L-R¹ представляет собой где является замещенным. Согласно некоторым вариантам осуществления -X-L-R¹ представляет собой где является незамещенным.

[00813] Согласно некоторым вариантам осуществления -X-L-R¹ представляет собой R¹-C(O)-S-L^x-S-, где L^x представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из Согласно некоторым вариантам осуществления L^x представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления -X-L-R¹ представляет собой (CH₃)₃C-S-S-L^x-S-. Согласно некоторым вариантам осуществления -X-L-R¹ представляет собой R¹-C(=X')-Y'-C(R)₂-S-L^x-S-. Согласно некоторым вариантам осуществления -X-L-R¹ представляет собой R-C(=X')-Y'-CH₂-S-LX-S-. Согласно некоторым вариантам осуществления -X-L-R¹ представляет собой

[00814] Специалистам в данной области техники должно быть понятно, что многие группы -X-L-R¹, описанные в настоящей заявке, можно отщеплять и превращать в -X^-после введения субъекту. Согласно некоторым вариантам осуществления -X-L-R¹ является отщепляемой. Согласно некоторым вариантам осуществления -X-L-R¹ представляет собой -S-L-R¹ и превращается в -S^- после введения субъекту. Согласно некоторым вариантам осуществления конверсия промотируется ферментом субъекта. Специалистам в данной области техники должно быть понятно, что способы определения необязательного превращения группы -S-L-R¹ в -S^- после введения хорошо известны и широко применяются в данной области техники, включая те, что используют для исследования метаболизма и фармакокинетики лекарственных агентов.

[00815] Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь, имеющая структуру формулы I, представляет собой

[00816] Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь формулы I имеет структуру формулы I-а:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00817] Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь формулы I имеет структуру формулы I-b:

где каждая переменная независимо является такой, как определено выше в настоящем описании.

[00818] Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь формулы I представляет собой фосфоротиоатную сложную триэфирную связь, имеющую структуру формулы I-c:

где:

Р* представляет собой асимметрический атом фосфора и имеет Rp- или Sp- конфигурацию;

L представляет собой ковалентную связь или необязательно замещенный линейный или разветвленный C₁-С₁₀ алкилен, где одно или более метиленовых звеньев в L необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-C₆ алкилен, C₁-С₆ алкенилен, -С≡С-, C(R')₂- -Су-, О, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂- -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- или -C(O)O-;

R¹ представляет собой галоген, R или необязательно замещенную С₁-С₅₀ алифатическую группу, где одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-С₆ алкилен, C₁-С₆ алкенилен, -С≡С-, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- или -C(O)O-;

каждый R' независимо представляет собой -R, -C(O)R, -CO₂R или -SO₂R, или:

два R' при одном атоме азота объединены с соседними атомами с образованием необязательно замещенного гетероциклического или гетероарильного кольца, или

два R' при одном атоме углерода объединены с соседними атомами с образованием необязательно замещенного арильного, карбоциклического, гетероциклического или гетероарильного кольца;

-Су- представляет собой необязательно замещенное двухвалентное кольцо, выбранное из фенилена, карбоциклилена, арилена, гетероарилена или гетероциклилена;

каждый R независимо представляет собой водород или необязательно замещенную группу, выбранную из C₁-С₆ алифатической группы, фенила, карбоциклила, арила, гетероарила или гетероциклила;

каждый независимо представляет собой место присоединения к нуклеозиду; и

R¹ не является Н, если L представляет собой ковалентную связь.

[00819] Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь, имеющая структуру формулы I, представляет собой

[00820] Согласно некоторым вариантам осуществления межнуклеотидная связь, имеющая структуру формулы I-c, представляет собой

[00821] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий одну или более фосфатных сложных диэфирных связей и одну или более модифицированных межнуклеотидных связей, имеющих формулу I-a, I-b или I-c.

[00822] Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь имеет структуру I. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь имеет структуру I-а. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь имеет структуру I-b. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь имеет структуру I-c.

[00823] Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой фосфоротиоат. Примеры межнуклеотидных связей, имеющих структуру формулы I, широко известны в настоящей области техники, включая, но не ограничиваясь ими, описанные в US 20110294124, US 20120316224, US 20140194610, US 20150211006, US 20150197540, WO 2015107425, PCT/US 2016/043542 и PCT/US 2016/043598, каждый из которых включен в настоящий документ посредством ссылки.

[00824] Неограничивающие примеры межнуклеотидных связей также включают те, которые описаны в данной области техники, включая, но не ограничиваясь ими, те, которые описаны в любом из: Gryaznov, S.; Chen, J.-K. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 3143, Jones et al. J. Org. Chem. 1993, 58, 2983, Koshkin et al. 1998 Tetrahedron 54: 3607-3630, Lauritsen et al. 2002 Chem. Comm. 5: 530-531, Lauritsen et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 13: 253-256, Mesmaeker et al. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1994, 33, 226, Petersen et al. 2003 TRENDS Biotech. 21: 74-81, Schultz et al. 1996 Nucleic Acids Res. 24: 2966, Ts'o et al. Ann. N.Y. Acad. Sci. 1988, 507, 220 и Vasseur et al. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4006.

[00825] Олигонуклеотиды предусмотренных технологий могут характеризоваться разной длиной. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 40, 50 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 40, 50 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 40, 50 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 15 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 16 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 17 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат 18 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 19 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 20 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 21 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 22 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 23 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 24 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 25 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 26 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 27 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 28 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 29 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 30 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 40 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 50 или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой 15-мер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой 16-мер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой 17-мер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой 18-мер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой 19-мер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой 20-мер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой 21-мер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой 22-мер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой 23-мер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют сбой 24-мер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой 25-мер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой 26-мер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой 27-мер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой 28-мер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой 29-мер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой 30-мер.

[00826] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий по меньшей мере одну фосфатную сложную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере одну фосфоротиоатную сложную триэфирную связь, имеющую структуру формулы I-c. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий по меньшей мере одну фосфатную сложную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере две фосфоротиоатные сложные триэфирные связи, имеющие структуру формулы I-c. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий по меньшей мере одну фосфатную сложную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере три фосфоротиоатные сложные триэфирные связи, имеющие структуру формулы I-c. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий по меньшей мере одну фосфатную сложную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере четыре фосфоротиоатные сложные триэфирные связи, имеющие структуру формулы I-c. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий по меньшей мере одну фосфатную сложную диэфирную межнуклеотидную связь и по меньшей мере пять фосфоротиоатных сложных триэфирных связей, имеющих структуру формулы I-c.

[00827] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в UCAAGGAAGAUGGCAUUUU. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, причем один или более U заменены на Т. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, причем указанная последовательность более чем на 50% идентична UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, причем указанная последовательность более чем на 60% идентична UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, причем указанная последовательность более чем на 70% идентична UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, причем указанная последовательность более чем на 80% идентична UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, причем указанная последовательность более чем на 90% идентична UCAAGGAAGAUGGCAUUUU. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, причем указанная последовательность более чем на 95% идентична UCAAGGAAGAUGGCAUUUU. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность UCAAGGAAGAUGGCAUUUU. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU, причем олигонуклеотиды характеризуются профилем связей остова, профилем хиральных центров остова и/или профилем модификаций фосфора остова, описанными в настоящем описании.

[00828] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в GGCACAAGGGCACAGACTTC. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем один или более Т замещены U. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем указанная последовательность более чем на 50% идентична GGCACAAGGGCACAGACTTC. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем указанная последовательность более чем на 60% идентична GGCACAAGGGCACAGACTTC. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем указанная последовательность более чем на 70% идентична GGCACAAGGGCACAGACTTC. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем указанная последовательность более чем на 80% идентична GGCACAAGGGCACAGACTTC. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем указанная последовательность более чем на 90% идентична GGCACAAGGGCACAGACTTC. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем указанная последовательность более чем на 95% идентична GGCACAAGGGCACAGACTTC. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC.

[00829] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем по меньшей мере одна межнуклеотидная связь содержит хиральный атом фосфора связи. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем по меньшей мере одна межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем каждая межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем по меньшей мере одна межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I-c. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем каждая межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I-c. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем по меньшей мере одна межнуклеотидная связь представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность, присутствующую в GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем каждая межнуклеотидная связь представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем по меньшей мере одна межнуклеотидная связь представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем каждая межнуклеотидная связь представляет собой

[00830] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем по меньшей мере одна межнуклеотидная связь содержит хиральный атом фосфора связи. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем по меньшей мере одна межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем каждая межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем по меньшей мере одна межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I-c. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем каждая межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I-c. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем по меньшей мере одна межнуклеотидная связь представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем каждая межнуклеотидная связь представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем по меньшей мере одна межнуклеотидная связь представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, содержащий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем каждая межнуклеотидная связь представляет собой

[00831] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем по меньшей мере одна межнуклеотидная связь содержит хиральный атом фосфора связи. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем по меньшей мере одна межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем каждая межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем по меньшей мере одна межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I-c. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем каждая межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I-c. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем по меньшей мере одна межнуклеотидная связь представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем каждая межнуклеотидная связь представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем по меньшей мере одна межнуклеотидная связь представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем каждая межнуклеотидная связь представляет собой

[00832] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем по меньшей мере один атом фосфора связи характеризуется конфигурацией Rp. Специалистам в данной области техники должно быть понятно, что согласно определенным вариантам осуществления, где олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит последовательность РНК, каждый Т независимо и необязательно заменен на U. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем каждый атом фосфора связи характеризуется конфигурацией Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем по меньшей мере один атом фосфора связи характеризуется конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем каждый атом фосфора связи характеризуется конфигурацией Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем олигонуклеотид представляет собой блокмер. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем олигонуклеотид представляет собой стерео блокмер. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем олигонуклеотид представляет собой блокмер с модификацией Р. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем олигонуклеотид представляет собой блокмер с одинаковыми связями. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем олигонуклеотид представляет собой альтмер. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем олигонуклеотид представляет собой стереоальтмер. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем олигонуклеотид представляет собой альтмер с модификацией Р. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем олигонуклеотид представляет собой альтмер с различными чередующимися связями. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем олигонуклеотид представляет собой унимер. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем олигонуклеотид представляет собой стереоунимер. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем олигонуклеотид представляет собой унимер с модификацией Р. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем олигонуклеотид представляет собой унимер с одинаковыми связями. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем олигонуклеотид представляет собой гэпмер. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем олигонуклеотид представляет собой скипмер.

[00833] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем каждый цитозин необязательно и независимо заменен на 5-метилцитозин. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем по меньшей мере один цитозин необязательно и независимо заменен на 5-метилцитозин. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем изобретении предложен олигонуклеотид с контролируемой хиральностью, имеющий последовательность GGCACAAGGGCACAGACTTC, причем каждый цитозин необязательно и независимо заменен 5-метилцитозином.

[00834] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью подобран таким образом, что один или более нуклеотидов содержит модификацию фосфора, подверженную «самовысвобождению» при определенных условиях. То есть, конкретная модификация фосфора выполнена таким образом, что в определенных условиях происходит ее самоотщепление от олигонуклеотида с обеспечением, например, фосфатного сложного диэфира, такого как присутствует в природной ДНК или РНК. Согласно некоторым вариантам осуществления указанная модификация фосфора имеет структуру -O-L-R¹, где каждый из L и R¹ независимо является таким, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления самовысвобождаемая группа содержит морфолиногруппу. Согласно некоторым вариантам осуществления самовысвобождаемая группа характеризуется способностью доставлять агент к межнуклеотидной фосфорсодержащей связи, где агент способствует дополнительной модификации атома фосфора, такой как, например, десульфирование. Согласно некоторым вариантам осуществления агент представляет собой воду, а дополнительная модификация представляет собой гидролиз с образованием фосфатного сложного диэфира, такого как содержится в природной ДНК или РНК.

[00835] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью подобран таким образом, что конечные фармацевтические свойства улучшены за счет одной или более конкретных модификаций атома фосфора. В данной области техники существуют убедительные доказательства того, что определенные олигонуклеотиды быстро разлагаются под действием нуклеаз и слабо подвержены клеточному захвату через цитоплазматическую мембрану клетки (Poijarvi-Virta et al., Curr. Med. Chem. (2006), 13(28); 3441-65; Wagner et al, Med. Res. Rev. (2000), 20(6):417-51; Peyrottes et al., Mini Rev. Med. Chem. (2004), 4(4):395-408; Gosselin et al., (1996), 43(1): 196-208; Bologna et al., (2002), Antisense & Nucleic Acid Drug Development 12:33-41). Например, в Vives et al., (Nucleic Acids Research (1999), 27(20):4071-76) обнаружили, что трет-бутил-SATE-проолигонуклеотиды имели значительно увеличенную клеточную проницаемость по сравнению с исходным олигонуклеотидом.

[00836] Согласно некоторым вариантам осуществления модификация атома фосфора связи характеризуется способностью превращаться в фосфатный сложный диэфир, такой как содержится в природных ДНК или РНК, под действием одного или более ферментов, выбранных из эстераз, нуклеаз и/или цитохрома Р450, включая, но не ограничиваясь ими, те, что приведены ниже в таблице 1.

[00837] Согласно некоторым вариантам осуществления модификация атома фосфора приводит к тому, что фрагмент с модификацией Р характеризуется тем, что он выступает в качестве пролекарства, например, фрагмент с модификацией Р до своего удаления способствует доставке олигонуклеотида к желаемому участку. Например, согласно некоторым вариантам осуществления фрагмент с модификацией Р образуется в результате пегилирования атома фосфора связи. Специалистам в данной области техники должно быть понятно, что подходят ПЭГ с различной длиной цепи, и выбор длины цепи отчасти обусловлен результатом, который предположительно должно обеспечивать пегилирование. Например, согласно некоторым вариантам осуществления пегилирование проводят для уменьшения захвата RES и увеличения продолжительности циркуляции олигонуклеотида in vivo.

[00838] Согласно некоторым вариантам осуществления пегилирующий агент для применения согласно настоящему раскрытию имеет молекулярную массу от примерно 300 г/моль до примерно 100000 г/моль. Согласно некоторым вариантам осуществления пегилирующий агент имеет молекулярную массу от примерно 300 г/моль до примерно 10000 г/моль. Согласно некоторым вариантам осуществления пегилирующий агент имеет молекулярную массу от примерно 300 г/моль до примерно 5000 г/моль. Согласно некоторым вариантам осуществления пегилирующий агент имеет молекулярную массу примерно 500 г/моль. Согласно некоторым вариантам осуществления пегилирующий агент имеет молекулярную массу примерно 1000 г/моль. Согласно некоторым вариантам осуществления пегилирующий агент имеет молекулярную массу примерно 3000 г/моль. Согласно некоторым вариантам осуществления пегилирующий агент имеет молекулярную массу примерно 5000 г/моль.

[00839] Согласно некоторым вариантам осуществления пегилирующий агент представляет собой ПЭГ500. Согласно определенным вариантам осуществления пегилирующий агент представляет собой ПЭГ1000. Согласно определенным вариантам осуществления пегилирующий агент представляет собой ПЭГ3000. Согласно определенным вариантам осуществления пегилирующий агент представляет собой ПЭГ5000.

[00840] Согласно некоторым вариантам осуществления фрагмент с модификацией Р характеризуется тем, что он выступает в качестве усилителя ФК (фармакокинетики), например, липидов, пегилированных липидов и т.д.

[00841] Согласно некоторым вариантам осуществления фрагмент с модификацией Р характеризуется тем, что он выступает в качестве агента, промотирующего поступление в клетки и/или уклонение от эндосомы, такого как мембраноразрушающий липид или пептид.

[00842] Согласно некоторым вариантам осуществления фрагмент с модификацией Р характеризуется тем, что он действует в качестве агента направленного действия. Согласно некоторым вариантам осуществления фрагмент с модификацией Р представляет собой или содержит агент направленного действия. Фраза «агент направленного действия», используемая в настоящем описании, представляет собой группу, которая связывается с указанным полезным агентом (например, с олигонуклеотидом или композицией олигонуклеотидов), а также взаимодействует с указанной мишенью, в результате чего указанный полезный агент, ассоциированный с агентом направленного действия, при прочих сравнимых условиях доставляется к указанной мишени в существенно более высокой степени по сравнению тем случаем, когда указанный полезный агент не ассоциирован с агентом направленного действия. Агент направленного действия может представлять собой или содержать любой из различных химических фрагментов, включая, например, фрагменты небольших молекул, нуклеиновые кислоты, полипептиды, углеводы и т.д. Агенты направленного действия дополнительно описаны в Adarsh et al., "Organelle Specific Targeted Drug Delivery - A Review," International Journal of Research in Pharmaceutical and Biomedical Sciences, 2011, p. 895.

[00843] Примеры таких агентов направленного действия включают, но не ограничиваются ими, белки (например, трансферрин), олигопептиды (например, циклические и ациклические RGD-содержащие олигопептиды), антитела (моноклональные и поликлональные антитела, например, антитела IgG, IgA, IgM, IgD, IgE), сахара/углеводы (например, моносахариды и/или олигосахариды (маннозу, манноза-6-фосфат, галактозу и т.д.)), витамины (например, фолат) или другие небольшие биомолекулы. Согласно некоторым вариантам осуществления фрагмент направленного действия представляет собой молекулу стероида (например, желчных кислот, включая холевую кислоту, дезоксихолевую кислоту, дегидрохолевую кислоту; кортизон; дигоксигенин; тестостерон; холестерин; катионные стероиды, такие как кортизон, содержащий триметиламинометилгидразидную группу, присоединенную посредством двойной связи к положению 3 кольца кортизона и т.д.). Согласно некоторым вариантам осуществления фрагмент направленного действия представляет собой липофильную молекулу (например, алициклические углеводороды, насыщенные и ненасыщенные жирные кислоты, воски, терпены и полиалициклические углеводороды, такие как адамантин и бакминстерфуллерены). Согласно некоторым вариантам осуществления липофильная молекула представляет собой терпеноид, такой как витамин А, ретиноевую кислоту, ретиналь или дегидроретиналь. Согласно некоторым вариантам осуществления фрагмент направленного действия представляет собой пептид.

[00844] Согласно некоторым вариантам осуществления фрагмент с модификацией Р представляет собой агент направленного действия формулы -X-L-R¹, где каждый из X, L и R¹ является таким, как определено выше для формулы I.

[00845] Согласно некоторым вариантам осуществления фрагмент с модификацией Р характеризуется тем, что он способствует специфической доставке в клетки.

[00846] Согласно некоторым вариантам осуществления фрагмент с модификацией Р характеризуется тем, что он попадает в одну или более описанных выше категорий. Например, согласно некоторым вариантам осуществления фрагмент с модификацией Р выступает в качестве усилителя ФК и лиганда направленного действия. Согласно некоторым вариантам осуществления фрагмент с модификацией Р выступает в качестве пролекарства и агента уклонения от эндосомы. Специалистам в данной области техники должно быть понятно, что возможны различные другие указанные комбинации, и они охвачены настоящим раскрытием.

[00847] Согласно некоторым вариантам осуществления карбоциклильная, арильная, гетероарильная или гетероциклильная группа или ее двухвалентная или поливалентная группа представляет собой С₃-С₃₀ карбоциклильную, арильную, гетероарильную или гетероциклильную группу или ее двухвалентную и/или поливалентную группу.

Нуклеиновые основания

[00848] Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеиновое основание, содержащееся в предложенном олигонуклеотиде, представляет собой природное нуклеиновое основание или модифицированное нуклеиновое основание, полученное из природного нуклеинового основания. Примеры включают, но не ограничиваются ими, урацил, тимин, аденин, цитозин и гуанин, где соответствующие аминогруппы защищены ацилзащитными группами, 2-фторурацил, 2-фторцитозин, 5-бромурацил, 5-йодурацил, 2,6-диаминопурин, азацитозин, аналоги пиримидина, такие как псевдоизоцитозин и псевдоурацил, и другие модифицированные нуклеиновые основания, такие как 8-замещенные пурины, ксантин или гипоксантин (два последние являются природными продуктами разложения). Примеры модифицированных нуклеиновых оснований предложены в Chiu and Rana, RNA, 2003, 9, 1034-1048, Limbach et al. Nucleic Acids Research, 1994, 22, 2183-2196, и Revankar and Rao, Comprehensive Natural Products Chemistry, vol. 7, 313. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированное нуклеиновое основание представляет собой замещенный урацил, тимин, аденин, цитозин или гуанин. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированное нуклеиновое основание представляет собой функциональное замещение, например, в отношении водородной связи и/или спаривания оснований, урацила, тимина, аденина, цитозина или гуанина. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеиновое основание представляет собой необязательно замещенный урацил, тимин, аденин, цитозин, 5-метилцитозин или гуанин. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеиновое основание представляет собой урацил, тимин, аденин, цитозин, 5-метилцитозин или гуанин.

[00849] Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированное основание представляет собой необязательно замещенный аденин, цитозин, гуанин, тимин или урацил. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированное нуклеиновое основание представляет собой независимо аденин, цитозин, гуанин, тимин или урацил, модифицированный одной или несколькими модификациями, посредством которых:

(1) нуклеиновое основание модифицируется одной или более необязательно замещенными группами, независимо выбранными из ацила, галогена, амино, азида, алкила, алкенила, алкинила, арила, гетероалкила, гетероалкенила, гетероалкинила, гетероциклила, гетероарила, карбоксила, гидроксила, биотина, авидина, стрептавидина, замещенного силила и их комбинации;

(2) один или более атомов нуклеинового основания независимо заменены другим атомом, выбранным из углерода, азота или серы;

(3) одна или более двойных связей в нуклеиновом основании независимо гидрогенизованы; или

(4) одно или более арильных или гетероарильных колец независимо вводят в нуклеиновое основание.

[00850] Соединения, приведенные на следующих общих формулах, также рассматривают как модифицированные нуклеиновые основания:

где R⁸ представляет собой необязательно замещенную линейную или разветвленную группу, выбранную из алифатической группы, арила, аралкила, арилоксиалкила, карбоциклила, гетероциклила или гетероарильной группы, содержащую от 1 до 15 атомов углерода, включая исключительно в качестве примеров метил, изопропил, фенил, бензил или феноксиметильную группу; а каждый из R⁹ и R¹⁰ независимо представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из линейной или разветвленной алифатической группы, карбоциклила, арила, гетероциклила и гетероарила.

[00851] Модифицированные нуклеиновые основания также включают увеличенные нуклеиновые основания, в которых добавлены одно или более арильных колец, таких как фенильные кольца. Замены нуклеиновых оснований, описанные в каталоге Glen Research (www.glenresearch.com); Krueger AT et at, Асе. Chem. Res., 2007, 40, 141-150; Kool, ET, Acc. Chem. Res., 2002, 35, 936-943; Benner S.A., et at, Nat. Rev. Genet., 2005, 6, 553-543; Romesberg, F.E., et at, Curr. Opin. Chem. Biol., 2003, 7, 723-733; Hirao, L, Curr. Opin. Chem. Biol., 2006, 10, 622-627, рассматривают как подходящие для синтеза нуклеиновых кислот, описанных в настоящей заявке. Некоторые примеры указанных увеличенных нуклеиновых оснований показаны ниже:

[00852] В настоящем описании модифицированные нуклеиновые основания также охватывают структуры, которые не являются общепринятыми нуклеиновыми основаниями, но представляют собой другие фрагменты, включая, но не ограничиваясь ими, кольцевые производные коррина или порфирина. Заменители оснований, представляющие собой производные порфирина, описаны в Morales-Rojas, Н and Kool, ЕТ, Org. Lett., 2002, 4, 4377-4380. Ниже показан пример кольцевого производного порфирина, которое можно использовать в качестве заменителя основания:

[00853] Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированные нуклеиновые основания имеют любую из следующих необязательно замещенных структур:

[00854] Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированное нуклеиновое основание является флуоресцентным. Примеры таких флуоресцентных модифицированных нуклеиновых оснований включают фенантрен, пирен, стильбен, изоксантин, изозантоптерин, терфенил, тертиофен, бензотертиофен, кумарин, лумазин, связанный стильбен, бензоурацил и нафтоурацил, как показано ниже:

[00855] Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированное нуклеиновое основание является незамещенным. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированное нуклеиновое основание является замещенным. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированное нуклеиновое основание является замещенным, то есть оно содержит, например, гетероатомы, алкильные группы или линкерные фрагменты, присоединенные к флуоресцентным фрагментам, фрагментам биотина или авидина, или к другому белку или пептиду. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированное нуклеиновое основание представляет собой «универсальное основание», которое не является нуклеиновым основанием в его общепринятом значении, но имеет функции, схожие с нуклеиновым основанием. Одним из типовых примеров указанного универсального основания является 3-нитропиррол.

[00856] Согласно некоторым вариантам осуществления в способе, предложенном в настоящем описании, также можно применять другие нуклеозиды, включая нуклеозиды, содержащие модифицированные нуклеиновые основания или нуклеиновые основания, ковалентно связанные с модифицированными сахарами. Некоторые примеры нуклеозидов, содержащих модифицированные нуклеиновые основания, включают 4-ацетилцитидин; 5-(карбоксигидроксилметил)уридин; 2'-O-метилцитидин; 5-карбоксиметиламинометил-2-тиоуридин; 5-карбоксиметиламинометилуридин; дигидроуридин; 2'-O-метилпсевдоуридин; бета,D-галактозилквеуозин; 2'-О-метилгуанозин; N⁶-изопентиладенозин; 1-метиладенозин; 1-метилпсевдоуридин; 1-метилгуанозин; 1-метилинозин; 2,2-диметилгуанозин; 2-метиладенозин; 2-метилгуанозин; N⁷-метилгуанозин; 3-метилцитидин; 5-метилцитидин; 5-гидроксиметилцитидин; 5-формилцитозин; 5-карбоксилцитозин; N⁶-метиладенозин; 7-метилгуанозин; 5-метиламиноэтилуридин; 5-метоксиаминометил-2-тиоуридин; бета,D-маннозилквеуозин; 5-метоксикарбонилметилуридин; 5-метоксиуридин; 2-метилтио-N⁶-изопентениладенозин; N-((9-бета,D-рибофуранозил-2-метилтиопурин-6-ил)карбамоил)треонин; N-((9-бета,D-рибофуранозилпурин-6-ил)-N-метилкарбамоил)треонин; метиловый эфир уридин-5-оксиуксусной кислоты; уридин-5-оксиуксусную кислоту (v); псевдоуридин; квеуозин; 2-тиоцтидин; 5-метил-2-тиоуридин; 2-тиоуридин; 4-тиоуридин; 5-метилуридин; 2'-O-метил-5-метилуридин; и 2'-O-метилуридин.

[00857] Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеозиды включают 6'-модифицированные бициклические аналоги нуклеозидов, которые имеют (R)- или (S)-конфигурацию положения 6', и включают аналоги, описанные в патенте США №7399845. Согласно другим вариантам осуществления нуклеозиды включают 5'-модифицированные аналоги нуклеозидов, которые имеют (R)- или (S)-конфигурацию положения 5', и включают аналоги, описанные в опубликованной заявке на патент США №20070287831.

[00858] Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеиновое основание или модифицированное нуклеиновое основание содержит один или более фрагментов, связывающихся с биомолекулами, таких как, например, антитела, фрагменты антител, биотин, авидин, стрептавидин, лиганды рецепторов или хелатообразующие фрагменты. Согласно другим вариантам осуществления нуклеиновое основание или модифицированное нуклеиновое основание представляет собой 5-бромурацил, 5-йодурацил или 2,6-диаминопурин. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеиновое основание или модифицированное нуклеиновое основание модифицируют путем замещения флуоресцентным фрагментом или фрагментом, связывающимся в биомолекулами. Согласно некоторым вариантам осуществления заместитель нуклеинового основания или модифицированного нуклеинового основания представляет собой флуоресцентный фрагмент. Согласно некоторым вариантам осуществления заместитель нуклеинового основания или модифицированного нуклеинового основания представляет собой биотин или авидин.

[00859] Типовые патенты США, в которых предложено получение определенных модифицированных нуклеиновых оснований из числа тех, что указаны выше, а также других модифицированных нуклеиновых оснований, включают, но не ограничиваются ими, указанный выше патент США №3687808, а также патенты США №4845205; 513030; 5134066; 5175273; 5367066; 5432272; 5457187; 5457191; 5459255; 5484908; 5502177; 5525711; 5552540; 5587469; 5594121, 5596091; 5614617; 5681941; 5750692; 6015886; 6147200; 6166197; 6222025; 6235887; 6380368; 6528640; 6639062; 6617438; 7045610; 7427672; и 7495088, модифицированные нуклеиновые основания, сахара и межнуклеотидные связи, каждый из которых включен посредством ссылки.

[00860] Согласно некоторым вариантам осуществления основание необязательно замещено А, Т, С, G или U, где один или более -NH₂ независимо и необязательно замещены С(-L-R¹)₃, один или более -NH- независимо и необязательно замещены -C(-L-R¹)₂-, один или более =N- независимо и необязательно замещены -C(-L-R¹)-, один или более =СН- независимо и необязательно замещены =N- и один или более =O независимо и необязательно замещены =S, =N(-L-R¹) или =C(-L-R¹)₂, где два или более -L-R₁ необязательно взяты вместе с их промежуточными атомами с образованием 3-30-членного бициклического или полициклического кольца, имеющего 0-10 гетероатомных кольцевых атомов. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированное основание представляет собой необязательно замещенное А, Т, С, G или U, где один или более -NH₂ независимо и необязательно замещены -C(-L-R¹)₃, один или более -NH-независимо и необязательно замещены С(-L-R¹)₂-, один или более =N- независимо и необязательно замещены -C(-L-R¹)-, один или более =СН- независимо и необязательно замещены =N- и один или более =O независимо и необязательно замещены =S, =N(-L-R¹) или =С(-L-R¹)₂, где два или более -L-R₁ необязательно взяты вместе с их промежуточными атомами с образованием 3-30-членного бициклического или полициклического кольца, имеющего 0-10 гетероатомных кольцевых атомов, причем модифицированное основание отличается от природного А, Т, С, G и U. Согласно некоторым вариантам осуществления основание необязательно замещено А, Т, С, G или U. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированное основание замещено А, Т, С, G или U, где модифицированное основание отличается от природного А, Т, С, G и U.

[00861] Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный нуклеотид или нуклеотидный аналог представляет собой любой модифицированный нуклеотид или нуклеотидный аналог, описанный в любом из: Gryaznov, S; Chen, J.-K. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 3143; Hendrix et al. 1997 Chem. Eur. J. 3: 110; Hyrup et al. 1996 Bioorg. Med. Chem. 4: 5; Jepsen et al. 2004 Oligo. 14: 130-146; Jones et al. J. Org. Chem. 1993, 58, 2983; Koizumi et al. 2003 Nuc. Acids Res. 12: 3267-3273; Koshkin et al. 1998 Tetrahedron 54: 3607-3630; Kumar et al. 1998 Bioo. Med. Chem. Let. 8: 2219-2222; Lauritsen et al. 2002 Chem. Comm. 5: 530-531; Lauritsen et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 13: 253-256; Mesmaeker et al. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1994, 33, 226; Morita et al. 2001 Nucl. Acids Res. Supp.1: 241-242; Morita et al. 2002 Bioo. Med. Chem. Lett. 12: 73-76; Morita et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 2211-2226; Nielsen et al. 1997 Chem. Soc. Rev. 73; Nielsen et al. 1997 J. Chem. Soc. Perkins Transl. 1: 3423-3433; Obika et al. 1997 Tetrahedron Lett. 38 (50): 8735-8; Obika et al. 1998 Tetrahedron Lett. 39: 5401-5404; Pallan et al. 2012 Chem. Comm. 48: 8195-8197; Petersen et al. 2003 TRENDS Biotech. 21: 74-81; Rajwanshi et al. 1999 Chem. Commun. 1395-1396; Schultz et al. 1996 Nucleic Acids Res. 24: 2966; Seth et al. 2009 J. Med. Chem. 52: 10-13; Seth et al. 2010 J. Med. Chem. 53: 8309-8318; Seth et al. 2010 J. Org. Chem. 75: 1569-1581; Seth et al. 2012 Bioo. Med. Chem. Lett. 22: 296-299; Seth et al. 2012 Mol. Ther-Nuc. Acids. 1, e47; Seth, Punit P; Siwkowski, Andrew; Allerson, Charles R; Vasquez, Guillermo; Lee, Sam; Prakash, Thazha P; Kinberger, Garth; Migawa, Michael T; Gaus, Hans; Bhat, Balkrishen; et al. From Nucleic Acids Symposium Series (2008), 52(1), 553-554; Singh et al. 1998 Chem. Comm. 1247-1248; Singh et al. 1998 J. Org. Chem. 63: 10035-39; Singh et al. 1998 J. Org. Chem. 63: 6078-6079; Sorensen 2003 Chem. Comm. 2130-2131; Ts'o et al. Ann. N.Y. Acad. Sci. 1988, 507, 220; Van Aerschot et al. 1995 Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 34: 1338; Vasseur et al. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4006; публикациях международных заявок WO 20070900071; WO 20070900071 или WO 2016/079181.

[00862] Примеры нуклеотидов также описаны в US 20110294124, US 20120316224, US 20140194610, US 20150211006, US 20150197540, WO 2015107425, PCT/US 2016/043542 и PCT/US 2016/043598, каждый из которых включен в настоящий документ посредством ссылки.

Сахара

[00863] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат один или более модифицированных фрагментов сахара, расположенных вблизи природных фрагментов сахара.

[00864] Наиболее распространенные природные нуклеотиды состоят из сахаров группы рибоз, связанных с нуклеиновыми основаниями аденозином (А), цитозином (С), гуанином (G) и тимином (Т) или урацилом (U). Также предложены модифицированные нуклеотиды, где фосфатная группа или атом фосфора связи в нуклеотидах могут быть присоединены к различным положениям сахара или модифицированного сахара. В качестве неограничивающих примеров фосфатная группа или атом фосфора связи может быть присоединен к 2', 3', 4' или 5'-гидроксильному фрагменту сахара или модифицированного сахара. Нуклеотиды, содержащие модифицированные нуклеиновые основания, такие как описано в настоящей заявке, также предполагаются в контексте настоящего описания. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеотиды или модифицированные нуклеотиды, содержащие незащищенный фрагмент -ОН, применяют согласно способам согласно настоящему раскрытию.

[00865] В состав предложенного олигонуклеотида могут входить и другие модифицированные сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный сахар содержит один или более заместителей при положении 2', включая любой из следующих: F; -CF₃, -CN, N₃, -NO, NO₂, -OR', -SR' или N(R')₂, где каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании; -O-(C₁-C₁₀ алкил), -S-(C₁-С₁₀ алкил), -NH-(C₁-C₁₀ алкил) или -N(C₁-C₁₀ алкил)₂; -O-(С₂-С₁₀ алкенил), -S-(C₂-C₁₀ алкенил), -NH-(C₂-C₁₀ алкенил) или -N(C₂-C₁₀ алкенил)₂; -О-(С₂-С₁₀ алкинил), -S-(C₂-C₁₀ алкинил), -NH-(C₂-C₁₀ алкинил) или -N(C₂-C₁₀ алкинил)₂; или -O-(C₁-C₁₀ алкилен)-O-(С₁-С₁₀ алкил), -O-(C₁-C₁₀ алкилен)-NH-(C₁-C₁₀ алкил) или -O-(C₁-C₁₀ алкилен)-NH(С₁-С₁₀ алкил)₂, -NH-(C₁-C₁₀ алкилен)-O-(С₁-С₁₀ алкил) или -N(C₁-C₁₀ алкил)-(C₁-C₁₀ алкилен)-O-(С₁-С₁₀ алкил), где алкил, алкилен, алкенил и алкинил могут быть замещенными или незамещенными. Примеры заместителей включают, но не ограничиваются ими, -O(СН₂)_nOCH₃ и -O(CH₂)_nNH₂, где n равен от 1 до примерно 10, МОЕ, DMAOE, DMAEOE. Также в настоящем описании предложены модифицированные сахара, описанные в международной заявке на патент WO 2001/088198; и Martin et al., Helv. Chim. Acta, 1995, 78, 486-504. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный сахар содержит одну или более групп, выбранных из замещенной силильной группы, РНК-отщепляющей группы, репортерной группы, флуоресцентной метки, интеркалятора, группы, улучшающей фармакодинамические свойства нуклеиновой кислоты, или других заместителей, имеющих схожие свойства. Согласно некоторым вариантам осуществления модификации проводят по одному или более положениям, выбранным из положений 2', 3', 4', 5' или 6' сахара или модифицированного сахара, включая положение 3' сахара при 3'-терминальном нуклеотиде или положение 5' при 5'-терминальном нуклеотиде. Согласно некоторым вариантам осуществления РНК содержит сахар, который имеет в положении 2' 2'-ОН или 2-OR¹, где OR¹ представляет собой необязательно замещенный алкил, включая 2' ОМе.

[00866] Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-F.

[00867] Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-ОН рибозы заменена на заместитель, включая любой из следующих: -Н, -F; -CF₃, -CN, -N₃, -NO, -NO₂, -OR', -SR' или -N(R')₂, где каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящей заявке; -O-(C₁-C₁₀ алкил), -S-(C₁-C₁₀ алкил), -NH-(C₁-C₁₀ алкил) или -N(C₁-С₁₀ алкил)₂; -O-(С₂-С₁₀ алкенил), -S-(C₂-C₁₀ алкенил), -NH-(C₂-C₁₀ алкенил) или -N(C₂-С₁₀ алкенил)₂; -O-(С₂-С₁₀ алкинил), -S-(С₂-С₁₀ алкинил), -NH-(C₂-C₁₀ алкинил) или -N(C₂-C₁₀ алкинил)₂; или -О-(C₁-С₁₀ алкилен)-О-(С₁-С₁₀ алкил), -O-(C₁-C₁₀ алкилен)-NH-(C₁-C₁₀ алкил) или -O-(C₁-C₁₀ алкилен)-NH(С₁-С₁₀ алкил)₂, -NH-(C₁-C₁₀ алкилен)-O-(C₁-C₁₀ алкил) или -N(C₁-С₁₀ алкил)-(C₁-C₁₀ алкилен)-O-(С₁-С₁₀ алкил), где алкил, алкилен, алкенил и алкинил могут быть замещенными или незамещенными. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-ОН заменен на -Н (дезоксирибоза). Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-ОН заменен на -F. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-ОН заменен на -OR'. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-ОН заменен на -ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-ОН заменен на -ОСН₂СН₂ОМе.

[00868] Модифицированные сахара также включают закрытые нуклеиновые кислоты (ЗНК). Согласно некоторым вариантам осуществления два заместителя на атомах углерода сахара, взятые вместе, образуют двухвалентный фрагмент. Согласно некоторым вариантам осуществления два заместителя находятся на двух разных атомах углерода сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления образуемый двухвалентный фрагмент имеет структуру -L-, как определено в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления -L- представляет собой -О-СН₂-, где -СН₂- представляет собой необязательно замещенный. Согласно некоторым вариантам осуществления -L- представляет собой -О-СН₂-. Согласно некоторым вариантам осуществления -L- представляет собой -O-CH(Et)-. Согласно некоторым вариантам осуществления -L- находится между С2 и С4 фрагмента сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления закрытая нуклеиновая кислота имеет структуру, указанную ниже. Ниже указана структуру закрытой нуклеиновой кислоты, где Ва представляет собой нуклеиновое основание или модифицированное нуклеиновое основание, такое как описано в настоящей заявке, a R^2s представляет собой -ОСН₂С4'-.

[00869] Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный сахар представляет собой ЭНК, такие как те, что описаны, например, в Seth et al., J Am Chem Soc. 2010 October 27; 132(42): 14942-14950. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный сахар представляет собой любой сахар, присутствующий в КНК (ксенонуклеиновой кислоте), например, арабинозу, ангидрогексит, треозу, 2'-фторарабинозу или циклогексен.

[00870] Модифицированные сахара включают имитаторы сахаров, такие как цикло бутильные или циклопентильные фрагменты, содержащиеся вместо пентофуранозильного фрагмента сахара. Типовые патенты США, в которых предложено получение сахаров с указанными модифицированными структурами, включают, но не ограничиваются ими, патенты США №4981957; 5118800; 5319080; и 5359044. Некоторые предложенные модифицированные сахара включают сахара, где атом кислорода в рибозном кольце заменен на атомы азота, серы, селена или углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный сахар представляет собой модифицированную рибозу, где атом кислорода в рибозном кольце заменен на атом азота, а атом азота необязательно замещен алкильной группой (например, метилом, этилом, изопропилом и т.д.).

[00871] Неограничивающие примеры модифицированных сахаров включают глицерин, из которого получают аналоги глицериннуклеиновых кислот (ГНК). Один из примеров аналогов ГНК показан ниже и описан в Zhang, R et al., J. Am. Chem. Soc., 2008, 130, 5846-5847; Zhang L, et al., J. Am. Chem. Soc., 2005, 127, 4174-4175 и Tsai CH et al., PNAS, 2007, 14598-14603 (X=O^-):

[00872] Другой пример аналога производного ТНК, пластичной нуклеиновой кислоты (flexible nucleic acid, FNA), основанный на смеси ацетальаминаля формилглицерина, описан в Joyce GF et al., PNAS, 1987, 84, 4398-4402 и Heuberger BD and Switzer C, Am. Chem. Soc., 2008, 130, 412-413, и показан ниже:

[00873] Дополнительные неограничивающие примеры модифицированных сахаров включают гексопиранозильные (от 6' до 4'), пентопиранозильные (от 4' до 2'), пентопиранозильные (от 4' до 3') или тетрофуранозильные (от 3' до 2') сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления гексопиранозильный (от 6' до 4') сахар имеет любую из следующих формул:

где X^s соответствует группе с модификацией Р «-XLR¹», описанной в настоящей заявке, а Ba такой, как определено в настоящем описании.

[00874] Согласно некоторым вариантам осуществления пентопиранозильный (от 4' до 2') сахар имеет любую из следующих формул:

где X^s соответствует группе с модификацией Р «-XLR¹», описанной в настоящей заявке, а Ва такой, как определено в настоящем описании.

[00875] Согласно некоторым вариантам осуществления пентопиранозильный (от 4' до 3') сахар имеет любую из следующих формул:

где X^s соответствует группе с модификацией Р «-XLR¹», описанной в настоящей заявке, а Ва такой, как определено в настоящем описании.

[00876] Согласно некоторым вариантам осуществления тетрофуранозильный (от 3' до 2') сахар имеет любую из следующих формул:

где X^s соответствует группе с модификацией Р «-XLR¹», описанной в настоящей заявке, а Ва такой, как определено в настоящем описании.

[00877] Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный сахар имеет любую из следующих формул:

где X^s соответствует группе с модификацией Р «-XLR¹», описанной в настоящей заявке, а Ва такой, как определено в настоящем описании.

[00878] Согласно некоторым вариантам осуществления одна или более гидроксильных групп во фрагменте сахара необязательно и независимо заменена на галоген, R', -N(R')₂, -OR' или -SR', где каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании.

[00879] Согласно некоторым вариантам осуществления имитатор сахара является таким, как проиллюстрировано далее; где X^s соответствует группе с модификацией Р «-XLR¹», описанной в настоящей заявке, Ва такой, как определено в настоящем описании, а X¹ выбран из -S-, -Se-, -СН₂-, -NMe-, -NEt- или -NiPr-.

[00880] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50% или более (например, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или более) сахаров в композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, включительно, являются модифицированными. Согласно некоторым вариантам осуществления только пуриновые остатки являются модифицированными (например, примерно 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50% или более [например, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или более] пуриновых остатков являются модифицированными). Согласно некоторым вариантам осуществления только пиримидиновые остатки являются модифицированными (например, примерно 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50% или более [например, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или более] пиримидиновых остатков являются модифицированными). Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированными являются и пуриновые и пиримидиновые остатки.

[00881] Модифицированные сахара и имитаторы сахаров можно получать при помощи способов, известных в данной области техники, включая, но не ограничиваясь ими: A. Eschenmoser, Science (1999), 284:2118; М. Bohringer et al, Helv. Chim. Acta (1992), 75:1416-1477; M. Egli et al, J. Am. Chem. Soc. (2006), 128(33): 10847-56; A. Eschenmoser в Chemical Synthesis: Gnosis to Prognosis, C. Chatgilialoglu and V. Sniekus, Ed., (Kluwer Academic, Netherlands, 1996), p. 293; K.-U. Schoning et al, Science (2000), 290:1347-1351; A. Eschenmoser et al, Helv. Chim. Acta (1992), 75:218; J. Hunziker et al, Helv. Chim. Acta (1993), 76:259; G. Otting et al, Helv. Chim. Acta (1993), 76:2701; K. Groebke et al, Helv. Chim. Acta (1998), 81:375; и A. Eschenmoser, Science (1999), 284:2118. Модификации положения 2' можно найти в Verma, S. et al. Annu. Rev. Biochem. 1998, 67, 99-134 и по ссылкам, указанным в данном документе. Конкретные модификации рибозы можно найти по следующим ссылкам: 2'-фтор- (Kawasaki et. al., J. Med. Chem., 1993, 36, 831- 841), 2'-MOE (Martin, P. Helv. Chim. Acta 1996, 79, 1930-1938), «ЗНК» (Wengel, J. Acc. Chem. Res. 1999, 32, 301-310). Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный сахар представляет собой любой из тех, что описаны в опубликованной международной заявке на патент РСТ WO 2012/030683, содержание которой включено в настоящую заявку посредством ссылки, и/или изображены в настоящей заявке. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный сахар представляет собой любой модифицированный сахар, описанный любой из следующих публикаций: Gryaznov, S; Chen, J.-K.J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 3143; Hendrix et al. 1997 Chem. Eur. J. 3: 110; Hyrup et al. 1996 Bioorg. Med. Chem. 4: 5; Jepsen et al. 2004 Oligo. 14: 130-146; Jones et al. J. Org. Chem. 1993, 58, 2983; Koizumi et al. 2003 Nuc. Acids Res. 12: 3267-3273; Koshkin etal. 1998 Tetrahedron 54: 3607-3630; Kumar et al. 1998 Bioo. Med. Chem. Let. 8: 2219-2222; Lauritsen et al. 2002 Chem. Comm. 5: 530-531; Lauritsen et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 13: 253-256; Mesmaeker et al. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1994, 33, 226; Morita et al. 2001 Nucl. Acids Res. Supp.1: 241-242; Morita et al. 2002 Bioo. Med. Chem. Lett. 12: 73-76; Morita et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 2211-2226; Nielsen et al. 1997 Chem. Soc. Rev. 73; Nielsen et al. 1997 J. Chem. Soc. Perkins Transl. 1: 3423-3433; Obikaetal. 1997 Tetrahedron Lett. 38 (50): 8735-8; Obika et al. 1998 Tetrahedron Lett. 39: 5401-5404; Pallan et al. 2012 Chem. Comm. 48: 8195-8197; Petersen et al. 2003 TRENDS Biotech. 21: 74-81; Rajwanshi et al. 1999 Chem. Commun. 1395-1396; Schultz et al. 1996 Nucleic Acids Res. 24: 2966; Seth et al. 2009 J. Med. Chem. 52: 10-13; Seth et al. 2010 J. Med. Chem. 53: 8309-8318; Seth et al. 2010 J. Org. Chem. 75: 1569-1581; Seth et al. 2012 Bioo. Med. Chem. Lett. 22: 296-299; Seth et al. 2012 Mol. Ther-Nuc. Acids. 1, e47; Seth, Punit P; Siwkowski, Andrew; Allerson, Charles R; Vasquez, Guillermo; Lee, Sam; Prakash, Thazha P; Kinberger, Garth; Migawa, Michael T; Gaus, Hans; Bhat, Balkrishen; et al. From Nucleic Acids Symposium Series (2008), 52(1), 553-554; Singh et al. 1998 Chem. Comm. 1247-1248; Singh et al. 1998 J. Org. Chem. 63: 10035-39; Singh et al. 1998 J. Org. Chem. 63: 6078-6079; Sorensen 2003 Chem. Comm. 2130-2131; Ts'o et al. Ann. N.Y. Acad. Sci. 1988, 507, 220; Van Aerschot et al. 1995 Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 34: 1338; Vasseur et al. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4006; публикациях международных заявкок WO 20070900071; WO 20070900071 или WO 2016/079181.

[00882] Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный фрагмент сахара представляет собой необязательно замещенный фрагмент пентозы или гексозы. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный фрагмент сахара представляет собой необязательно замещенный фрагмент пентозы. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный фрагмент сахара представляет собой необязательно замещенный фрагмент гексозы. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный фрагмент сахара представляет собой необязательно замещенный фрагмент рибозы или гексита. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный фрагмент сахара представляет собой необязательно замещенный фрагмент рибозы. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный фрагмент сахара представляет собой необязательно замещенный фрагмент гексита.

[00883] Согласно некоторым вариантам осуществления пример модифицированной межнуклеотидной связи и/или сахара выбран из, например, в:

Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой R, как определено и описано. Согласно некоторым вариантам осуществления R² представляет собой R. Согласно некоторым вариантам осуществления Re представляет R. Согласно некоторым вариантам осуществления R^e представляет собой Н, CH₃, Bn, COCF₃, бензоил, бензил, пирен-1-илкарбонил, пирен-1-илметил, 2-аминоэтил. Согласно некоторым вариантам осуществления пример модифицированной межнуклеотидной связи и/или сахара выбирают из примеров, описанных в Ts'o et al. Ann. N.Y. Acad. Sci. 1988, 507, 220; Gryaznov, S.; Chen, J.-K. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 3143; Mesmaeker et al. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1994, 33, 226; Jones et al. J. Org. Chem. 1993. 58, 2983; Vasseur et al. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4006; Van Aerschot et al. 1995 Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 34: 1338; Hendrix et al. 1997 Chem. Eur. J. 3: 110; Koshkin et al. 1998 Tetrahedron 54: 3607-3630; Hyrup et al. 1996 Bioorg. Med. Chem. 4: 5; Nielsen et al. 1997 Chem. Soc. Rev. 73; Schultz et al. 1996 Nucleic Acids Res. 24: 2966; Obika et al. 1997 Tetrahedron Lett. 38 (50): 8735-8; Obika et al. 1998 Tetrahedron Lett. 39: 5401-5404; Singh et al. 1998 Chem. Comm. 1247-1248; Kumar et al. 1998 Bioo. Med. Chem. Let. 8: 2219-2222; Nielsen et al. 1997 J. Chem. Soc. Perkins Transl. 1: 3423-3433; Singh et al. 1998 J. Org. Chem. 63: 6078-6079; Seth et al. 2010 J. Org. Chem. 75: 1569-1581; Singh et al. 1998 J. Org. Chem. 63: 10035-39; Sorensen 2003 Chem. Comm. 2130-2131; Petersen et al. 2003 TRENDS Biotech. 21: 74-81; Rajwanshi et al. 1999 Chem. Commun. 1395-1396; Jepsen et al. 2004 Oligo. 14: 130-146; Morita et al. 2001 Nucl. Acids Res. Supp.1: 241-242; Morita et al. 2002 Bioo. Med. Chem. Lett. 12: 73-76; Morita et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 2211-2226; Koizumi et al. 2003 Nuc. Acids Res. 12: 3267-3273; Lauritsen et al. 2002 Chem. Comm. 5: 530-531; Lauritsen et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 13: 253-256; WO 20070900071; Seth et al., Nucleic Acids Symposium Series (2008), 52(1), 553-554; Seth et al. 2009 J. Med. Chem. 52: 10-13; Seth et al. 2012 Mol. Ther-Nuc. Acids. 1, e47; Pallan et al. 2012 Chem. Comm. 48: 8195-8197; Seth et al. 2010 J. Med. Chem. 53: 8309-8318; Seth et al. 2012 Bioo. Med. Chem. Lett. 22: 296-299; публикации международной заявки WO 2016/079181; патентах США US 6326199; US 6066500 и US 6,440,739, модификации оснований и сахаров каждого включены в настоящее описание посредством ссылки.

Олигонуклеотиды

[00884] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем изобретении предложены олигонуклеотиды с контролируемой хиральностью и композиции олигонуклеотидов. Например, согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция содержит предварительно определенное количество одного или более нуклеотидов отдельного типа, где тип олигонуклеотида определяется: 1) последовательностью оснований; 2) профилем связей остова; 3) профилем хиральных центров остова; и 4) профилем Р-модификаций остова. Согласно некоторым вариантам осуществления определенный тип олигонуклеотидов может быть определен с помощью 1А) идентификации оснований; 1В) профиля модификации оснований; 1С) профиля модификации сахара; 2) профиля связей остова; 3) профиля хиральных центров остова и 4) профиля модификаций Р остова. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды того же типа олигонуклеотида являются идентичными.

[00885] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой унимер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой унимер с модификацией Р. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой стереоунимер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой стереоунимер с Rp-конфигурацией. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой стереоунимер с Sp-конфигурацией.

[00886] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой альтмер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой альтмер с модификацией Р. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой стереоальтмер.

[00887] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой блокмер. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой блокмер с модификацией Р. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой стереоблокмер.

[00888] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой гэпмер.

[00889] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой скипмер.

[00890] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой гемимер. Согласно некоторым вариантам осуществления гемимер представляет собой олигонуклеотид, в котором 5'-конец или 3'-конец имеет последовательность, которая обладает особенностью структуры, которой нет у остальной части олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-конец или 3'-конец имеет или содержит от 2 до 20 нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления структурной особенностью является модификация оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления структурной особенностью является модификация сахаров. Согласно некоторым вариантам осуществления структурной особенностью является Р-модификации. Согласно некоторым вариантам осуществления структурной особенностью является стереохимия хиральной межнуклеотидной связи. Согласно некоторым вариантам осуществления структурной особенностью является или она содержит модификацию оснований, модификацию сахаров, Р-модификацию или стереохимию хиральной межнуклеотидной связи или их комбинации. Согласно некоторым вариантам осуществления гемимер представляет собой олигонуклеотид, в котором каждый фрагмент сахара 5'-концевой последовательности имеет одинаковую модификацию. Согласно некоторым вариантам осуществления гемимер представляет собой олигонуклеотид, в котором каждый фрагмент сахара 3'-концевой последовательности имеет одинаковую модификацию. Согласно некоторым вариантам осуществления общая модификация сахара 5'- или 3'-концевой последовательности не разделяется другими остатками сахара в олигонуклеотиде. Согласно некоторым вариантам осуществления иллюстративный гемимер представляет собой олигонуклеотид, содержащий последовательность замещенных или незамещенных нуклеозидов с модифицированным 2'-O-алкилом сахара, нуклеозидов с модифицированным бициклическим сахаром, бета-D-рибонуклеозиды или бета-D-дезоксирибонуклеозиды (например, 2'-МОЕ-модифицированные нуклеозиды и нуклеозиды с модифицированным бициклическим сахаром LNA™ и ENA™) на одном конце, и последовательность нуклеозидов с отличным фрагментом сахара (например, замещенных или незамещенных нуклеозидов с модифицированным 2'-O-алкилом сахара, нуклеозидов с модифицированным бициклическим сахаром или природного нуклеозида) на другом конце. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой комбинацию одного или более из унимера, альтмеров, блокмера, гэпмера, гемимера и скипмера. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой комбинацию одной или более разновидностей, выбранных из унимера, альтмера, блокмера, гэпмера и скипмера. Например, согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид является альтмером и гэпмером. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный нуклеотид является гэпмером и скипмером. Специалистам в области химии и химического синтеза будет понятно, что доступны различные другие комбинации профилей, и они ограничены только коммерческой доступностью и/или возможностью использования в синтезе различных составляющих, требуемых для синтеза предложенного олигонуклеотида согласно способам согласно настоящему раскрытию. Согласно некоторым вариантам осуществления структура гемимера обеспечивает выгодные преимущества. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой 5'-гемимеры, которые содержат модифицированные сахарные фрагменты в 5'-концевой последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления структура гемимера обеспечивает выгодные преимущества, как проиллюстрировано на фиг. 29. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды представляют собой 5'-гемимеры, которые содержат модифицированные 2'-сахарные фрагменты в 5'-концевой последовательности.

[00891] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит один или более необязательно замещенных нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит один или более модифицированных нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит один или более необязательно замещенных нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит один или более модифицированных нуклеозидов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит одну или более необязательно замещенных ЗНК.

[00892] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит одно или более необязательно замещенных нуклеиновых оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит одно или более необязательно замещенных природных нуклеиновых оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит одно или более необязательно замещенных модифицированных нуклеиновых оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит один или более 5-метилцитидинов; 5-гидроксиметилцитидинов, 5-формилцитозинов или 5-карбоксилцитозинов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит один или более 5-метилцитидинов.

[00893] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит один или более необязательно замещенных сахаров. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит один или более необязательно замещенных сахаров, присутствующих в природных ДНК или РНК. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит одну или более необязательно замещенных рибоз или дезоксирибоз. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит одну или более необязательно замещенных рибоз или дезоксирибоз, где одна или более гидроксильных групп во фрагменте рибозы или дезоксирибозы необязательно и независимо заменены на галоген, R', -N(R')₂, -OR' или -SR', где каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит одну или более необязательно замещенных дезоксирибоз, где положение 2' дезоксирибозы необязательно и независимо замещено галогеном, R', N(R')₂, OR' или SR', причем каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит одну или более необязательно замещенных дезоксирибоз, где положение 2' дезоксирибозы необязательно и независимо замещено галогеном. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит одну или более необязательно замещенных дезоксирибоз, где положение 2' дезоксирибозы необязательно и независимо замещено одним или более -F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит одну или более необязательно замещенных дезоксирибоз, где положение 2' в дезоксирибозе необязательно и независимо замещено OR', причем каждый R' независимо является таким, как определено выше в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит одну или более необязательно замещенных дезоксирибоз, где положение 2' в дезоксирибозе необязательно и независимо замещено OR', причем каждый R' независимо представляет собой необязательно замещенную C₁-C₆ алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит одну или более необязательно замещенных дезоксирибоз, где положение 2' в дезоксирибозе необязательно и независимо замещено OR', причем каждый R' независимо представляет собой необязательно замещенный C₁-С₆ алкил. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит одну или более необязательно замещенных дезоксирибоз, где положение 2' в дезоксирибозе необязательно и независимо замещено -ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит одну или более необязательно замещенных дезоксирибоз, где положение 2' в дезоксирибозе необязательно и независимо замещено -О-метоксиэтилом.

[00894] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой одноцепочечный олигонуклеотид.

[00895] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой гибридизованную цепь олигонуклеотида. Согласно определенным вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой частично гибридизованную цепь олигонуклеотида. Согласно определенным вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой полностью гибридизованную цепь олигонуклеотида. Согласно определенным вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой двухцепочечный олигонуклеотид. Согласно определенным вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой трехцепочечный олигонуклеотид (например, триплекс).

[00896] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид является химерным. Например, согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой химеру ДНК-РНК, химеру ДНК-ЗНК и т.д.

[00897] Согласно некоторым вариантам осуществления любую и структур, содержащих нуклеотид, приведенный в WO 2012/030683, можно модифицировать в соответствии со способами согласно настоящему раскрытию для обеспечения их хирально-контролируемых вариантов. Например, согласно некоторым вариантам осуществления хирально-контролируемые варианты содержат стереохимическую модификацию любого одного или более атомов фосфора связей и/или модификацию Р любого одного или более атомов фосфора связей. Например, согласно некоторым вариантам осуществления предварительно выбирают нуклеотидное звено олигонуклеотида, предложенного в WO 2012/030683, для проведения стереохимической модификации атома фосфора связи указанного нуклеотидного звена и/или для модификации Р атома фосфора связи указанного нуклеотидного звена. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет любую из структур, изображенных на фигурах. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью является вариантом (например, модифицированным вариантом) любой из структур, изображенных на фигурах. Описание заявки WO 2012/030683 включено в настоящую заявку во всей полноте посредством ссылки.

[00898] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой терапевтический агент.

[00899] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой антисмысловой олигонуклеотид.

[00900] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой антигенный олигонуклеотид.

[00901] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой олигонуклеотид-«ловушку».

[00902] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой часть ДНК-вакцины.

[00903] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой иммуномодулирующий олигонуклеотид, например, иммуностимулирующий олигонуклеотид и иммуноподавляющий олигонуклеотид.

[00904] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид является адъювантом.

[00905] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой аптамер.

[00906] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой рибозим.

[00907] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой дезоксирибозим (ДНК-зимы или ферменты ДНК).

[00908] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой миРНК.

[00909] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой микроРНК или мкРНК.

[00910] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой нкРНК (некодирующую РНК), включая длинноцепочечные некодирующие РНК (дл.-нкRNA) и короткоцепочечные некодирующие РНК, такие как пив и-взаимодействующие РНК (пиРНК).

[00911] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид является комплементарным структурной РНК, например, тРНК.

[00912] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой аналог нуклеиновой кислоты, например, ГНК, ЗНК, ПНК, ТНК и морфолино.

[00913] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой пролекарство с модификацией Р.

[00914] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид представляет собой праймер. Согласно некоторым вариантам осуществления праймеры предназначены для применения в полимеразных цепных реакциях (т.е. ПНР) для амплификации нуклеиновых кислот. Согласно некоторым вариантам осуществления праймер предназначен для применения в любых известных вариантах ПЦР, таких как ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) и ПЦР в реальном времени (РВ-ПЦР).

[00915] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид характеризуется способностью модулировать активацию РНКазы Н. Например, согласно некоторым вариантам осуществления активация РНКазы Н модулируется за счет наличия стереоконтролируемых фосфоротиоатных аналогов нуклеиновых кислот, где природные ДНК/РНК являются в равной или более высокой степени чувствительными по сравнению с Rp-стереоизомером, который в свою очередь является более чувствительным по сравнению с соответствующим Sp-стереоизомером.

[00916] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид характеризуется способностью косвенным образом или напрямую увеличивать или уменьшать активность белка или ингибировать или промотировать экспрессию белка. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид характеризуется тем, что он подходит для контролирования пролиферации клеток, репликации вируса и/или других клеточных сигнальных процессов.

[00917] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 200 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 180 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 160 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 140 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 120 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 100 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 90 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 80 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 70 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 60 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 50 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 40 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 30 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 29 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 28 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 27 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 26 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 25 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 24 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 23 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 22 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 21 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 2 до примерно 20 нуклеотидных звеньев.

[00918] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 200 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 180 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 160 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 140 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 120 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 100 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 90 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 80 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 70 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 60 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 50 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 40 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 30 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 29 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 28 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 27 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 26 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 25 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 24 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 23 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 22 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 21 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 4 до примерно 20 нуклеотидных звеньев.

[00919] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 5 до примерно 10 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 10 до примерно 30 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину от примерно 15 до примерно 25 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину более чем примерно 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 или 25 нуклеотидных звеньев.

[00920] Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 2 нуклеотидных звена. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 3 нуклеотидных звена. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 4 нуклеотидных звена. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 5 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 6 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 7 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 8 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 9 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 10 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 11 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 12 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 13 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 14 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 15 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 16 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 17 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 18 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 19 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 20 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 21 нуклеотидное звено. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 22 нуклеотидных звена. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 23 нуклеотидных звена. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 24 нуклеотидных звена. Согласно некоторым вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 25 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым другим вариантам осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 30 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым другим вариантам осуществления олигонуклеотид представляет собой дуплекс комплементарных цепей, длина которых составляет по меньшей мере 18 нуклеотидных звеньев. Согласно некоторым другим вариантам осуществления олигонуклеотид представляет собой дуплекс комплементарных цепей, длина которых составляет по меньшей мере 21 нуклеотидное звено.

[00921] Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-конец и/или 3'-конец предложенного олигонуклеотида является модифицированным. Согласно некоторым вариантам осуществления 5'-конец и/или 3'-конец предложенного олигонуклеотида модифицирован терминальным концевым фрагментом. Указанные типовые модификации, включая терминальные концевые фрагменты, подробно описаны в настоящей заявке и в уровне техники, включая, например, модификации, описанные в опубликованной заявке на патент США №2009/0023675 А1.

[00922] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды типа олигонуклеотида, характеризующегося: 1) одинаковой последовательностью оснований и длиной; 2) одинаковым профилем связей остова; а также 3) одинаковым профилем хиральных центров остова, имеют одинаковую химическую структуру. Например, они имеют ту же последовательность оснований, такой же профиль нуклеозидных модификаций, такой же профиль связей остова (т.е. профиль типов межнуклеотидных связей, например, фосфатные, фосфоротиоатные и т.д.), такой же профиль хиральных центров остова (т.е. профиль стереохимии фосфора связи (Rp/Sp)) и такой же профиль модификаций фосфора остова (например, профиль групп "-XLR¹" в формуле I).

Иллюстративные олигонуклеотиды и композиции

[00923] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотиды и/или композиции олигонуклеотидов, которые применимы для различных целей, известных в настоящей области техники. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов с улучшенными свойствами, например активностью, токсичностью и т.д. Неограничивающие примеры композиций перечислены ниже:

[00924] Согласно некоторым вариантам осуществления * обозначает только стерео случайную фосфоротиоатную связь; *S представляет собой фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp; *R представляет собой фосфоротиоатную связь в конфигурации Rp; все немеченные связи представляют собой природную фосфатную связь; m, предшествующий основанию, представляет собой 2'-ОМе; ео после основания представляет 2 '-МОЕ.

Сокращения:

5Сео: 5-метил-2'-метоксиэтил С

С6:С6-амино-линкер (L001, -NH-(СН₂)₆-, где -NH- соединен с Mod (через -С(О)-) или -Н, и -(СН₂)₆ соединен с 5'-концом олигонуклеотидной цепи через, например, фосфодиэфир (представленный в таблице как О или РО), фосфоротиоат (представленный в таблице как *, если фосфоротиоат не характеризуется контролируемой хиральностью; *S, S или % если он характеризуется контролируемой хиральностью и конфигурацией % и *R, R или % если он характеризуется контролируемой хиральностью и конфигурацией Rp), или фоефородитиоат (представленный в таблице как PS2 или:). Также может упоминаться как С6-линкер или С6-амин-линкер)

ео: 2'-МОЕ

Экзон: экзон дистрофина

F, f: 2'-F

Лауриновый (в Mod013), миристиновый (в Mod014), пальмитиновый (в Mod005), стеариновый (в Mod015), олеиновый (в Mod016), линолевый (в Mod017), альфа-линоленовый (в Mod018), гамма-линоленовый (в Mod019), ДГК (в Mod006), турбинаровый (в Mod020), дилинолевый (в Mod021), TriGlcNAc (в Mod024), триальфаманноза (в Mod026), моносульфонамид (в Mod027), трисульфонамид (в Mod029), лауриновый (в Mod030), миристиновый (в Mod031), пальмитиновый (в Mod032) и стеариновый (в Mod033): лауриновая кислота (для Mod013), миристиновая кислота (для Mod014), пальмитиновая кислота (для Mod005), стеариновая кислота (для Mod015), олеиновая кислота (для Mod016), линолевая кислота (для Mod017), альфа-линоленовая кислота (для Mod018), гамма-линоленовая кислота (для Mod019), докозагексаеновая кислота (для Mod006), турбинаровая кислота (для Mod020), спирт для дилинолеила (для Mod021), кислота для TriGlcNAc (для Mod024), кислота для триальфаманнозы (для Mod026), кислота для моносульфонамида (для Mod027), кислота для трисульфонамида (для Mod029), лауриловый спирт (для Mod030), миристиловый спирт (для Mod031), пальмитиловый спирт (для Mod032) и стеариловый спирт (для Mod033), соответственно, конъюгированные с олигонуклеотидными цепями через амидные группы, С6-амино-линкер, фосфодиэфирная связь (РО) и/или фосфоротиоатная связь (PS): Mod013 (лауриновая кислота с С6-амино-линкер и РО или PS), Mod014 (миристиновая кислота с С6-амино-линкером и РО или PS), Mod005 (пальмитиновая кислота с С6-амино-линкером и РО или PS), Mod015 (стеариновая кислота с С6-амино-линкером и РО или PS), Mod016 (олеиновая кислота с С6-амино-линкером и РО или PS), Mod017 (линолевая кислота с С6-амино-линкером и РО или PS), Mod018 (альфа-линоленовая кислота с С6-амино-линкером и РО или PS), Mod019 (гамма-линоленовая кислота с С6-амино-линкером и РО или PS), Mod006 (DHA с С6-амино-линкером и РО или PS), Mod020 (турбинаровая кислота с С6-амино-линкером и РО или PS), Mod021 (спирт (смотрите ниже) с РО или PS), Mod024 (кислота (смотрите ниже) с С6-амино-линкером и РО или PS), Mod026 (кислота (смотрите ниже) с С6-амино-линкером и РО или PS), Mod027 (кислота (смотрите ниже) с Сб-амино-линкером и РО или PS), Mod029 (кислота (смотрите ниже) с С6-амино-линкером и РО или PS), Mod030 (лауриловый спирт с РО или PS), Mod031 (миристиловый спирт с РО или PS). Mod032 (пальмитиловый спирт с РО или PS) и Mod033 (стеариловый спирт с РО или PS) с РО или PS для каждого олигонуклеотида, указанного в таблице (например, лауриновая кислота WV-3473 конъюгирована с олигонуклеотидной цепью WV-3473 через амидную группу, С6 и РО: Mod013L001fU*SfC*SfA*SfA*SfG*SfG*SmAfA*SmGmA*SfU*SmGmGfC*SfA*SfU*SfU*SfU*SfC*SfU (описание), OOSSSSSSOSOSSOOSSSSSS (стереохимия) и/или WV-3473, лауриновая кислота, С6 РО линкер (примечания);

Стеариловый спирт WV-3557, конъюгированный с олигонуклеотидной цепью WV-3473 через PS:

Моа033 fU*SfC*SfA*SfA*SfG*SfG*SmAfA*SmGmA*SfU*SmGmGfC*SfA*SfU*SfU*SfU*SfC*SfU (описание), XSSSSSSOSOSSOOSSSSSS (стереохимия) и/или WV-3473, стеариновый PS (примечания); а также

Стеариновая кислота WV-4106, конъюгированная с олигонуклеотидной цепью WV-3473 через амидную группу, С6 и PS:

Mod015L001fU*SfC*SfA*SfA*SfG*SfG*SmAfA*SmGmA*SfU*SmGmGfC*SfA*SfU*SfU*SfU*SfC*SfU (описание), OXSSSSSSOSOSSOOSSSSSS (стереохимия) и/или WV-3473, C6 PS линкер, стеариновая кислота (примечания)).

Фрагменты для конъюгации и иллюстративные реагенты (многие из которых были ранее известны и являются коммерчески доступными или могут быть легко получены с использованием известных технологий в соответствии с настоящим раскрытием, например, лауриновая кислота (для Mod013), миристиновая кислота (для Mod014), пальмитиновая кислота (для Mod015), стеариновая кислота (для Mod015), олеиновая кислота (для Mod016), линолевая кислота (для Mod017), альфа-линоленовая кислота (для Mod018), гамма-линоленовая кислота (для Mod019), докозагексаеновая кислота (для Mod006), турбинаровая кислота (для Mod020), спирт для дилинолеила (для Mod021), лауриловый спирт (для Mod030), миристиловый спирт (для Mod031), пальмитиловый спирт (для Mod032), стеариловый спирт (для Mod033) и т.д.), перечислены ниже, т: 2'-ОМе

NA: Не применимо; этот термин, как правило, используется для отрицательных контролей ОМе: 2'-ОМе

О, РО: фосфодиэфир (фосфат) или при использовании с Mod и L001, -С(О)-(соединяющий Mod и L001, например, Moa013L001fU*SfC*SfA*SfA*SfG*SfG*SmAfA*SmGmA*SfU*SmGmGfC*SfA*SfU*SfU*SfU*SfC*SfU (описание), OOSSSSSSOSOSSOOSSSSSS (стереохимия) и/или WV-3473, лауриновая кислота, С6 РО линкер (примечания). Следует обратить внимание, что вторая О OOSSSSSSOSOSSOOSSSSSS (стереохимия) представляет собой фосфодиэфирную связь, соединяющую L001 и 5'-О- олигонуклеотидной цепи: Mod013L001fU*SfC*SfA*SfA*SfG*SfG*SmAfA*SmGmA*SfU*SmGmGfC*SfA*SfU*SfU*SfU*SfC*SfU)

*, PS: фосфоротиоат

PS2,:: фосфородитиоат (например, WV-3078, где двоеточие (:) обозначает фосфородитиоат)

*R, R, Rp: фосфоротиоат в конформации Rp

*S, S, Sp: фосфоротиоат в конформации Sp

WV, W V-: WV-

X: стереослучайный фосфоротиоат

Иллюстративные фрагменты (например, липидные фрагменты, нацеливающие компоненты и т.д.) и иллюстративные реагенты получения (например, кислоты, спирты и т.д.) для конъюгации для получения предложенных олигонуклеотидов, например, иллюстративных олигонуклеотидов в таблицах 1-4, содержащих такие фрагменты, в соответствии с настоящим раскрытием, включают в себя следующее: Mod005 (с -С(О)- в соединении с -NH- в L001) и пальмитиновая кислота

Mod005L001 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи)

X = О или S

Mod006 (с -С(O)- в соединении с -NH- в L001) и ДГК

Mod006L001 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи)

X = О или S

Mod013 (с -С(O)- в соединении с -NH- в L001) и лауриновая кислота

Mod013L001 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи)

X = О или S

Mod014 (с -С(О)- в соединении с -NH- в L001) и миристиновая кислота

Mod014L001 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи)

X = О или S

Mod015 (с -С(О)- в соединении с -NH- в L001) и стеариновая кислота

Mod015L001 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи)

X = О или S

Mod016 (с С(О) в соединении с -NH- в L001) и олеиновая кислота

Mod016L001 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи)

X = О или S

Mod017 (с -С(О)- в соединении с -NH- в L001) и линоленовая кислота

Mod017L001 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи)

X = О или S

Mod018 (с -С(О)- в соединении с -NH- в L001) и альфа-линоленовая кислота

Mod018L001 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи)

X = О или S

Mod019 (с -С(O)- в соединении с -NH- в L001) и гамма-линоленовая кислота

Mod019L001 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи)

X = О или S

Mod020 (с -С(О)- в соединении с -NH- в L001) и турбинаровая кислота

Mod020L001 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи)

X = О или S

Mod021 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи) и спирт

Mod024 (с -С(О)- в соединении с -NH- в L001) и кислота

Mod024L001 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи)

Mod026 (с -С(О)- в соединении с -NH- в L001) и кислота

Mod026L001 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи)

Mod027 (с -С(O)- в соединении с -NH- в L001) и кислота

Mod027L001 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи)

X = О или S

Mod029 (с -С(О)- в соединении с -NH- в L001) и кислота

Mod029L001 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи)

Mod030 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи) и лауриловый спирт

Mod031 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи) и миристиловый спирт

Mod032 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи) и пальмитиловый спирт

Mod033 (с РО или PS в соединении с -О- 5'-конца олигонуклеотидной цепи) и стеариловый спирт

[00925] Согласно некоторым вариантам осуществления для Mod024 и/или Mod026, гидроксильные группы необязательно защищены в виде АсО перед и/или во время конъюгации с олигонуклеотидной цепью, и с гидроксильных групп снимается защита, например, во время расщепления и/или удаления защитной группы олигонуклеотида:

[00926] Заявитель отмечает, что выше в таблице представлены иллюстративные способы представления структур предложенных олигонуклеотидов, например, WV-3546 (Mod020L001fU*SfC*SfA*SfA*SfG*SfG*SmAfA*SmGmA*SfU*SmGmGfC*SfA*SfU*SfU*SfU*SfC*SfU) может быть представлен как липидный фрагмент (Mod020, соединенный через -С(О)- (OOSSSSSSOSOSSOOSSSSSS) с -NH- в -NH-(CH₂)₆-, где -(СН₂)₆- соединен с 5'-концом олигонуклеотидной цепи через фосфодиэфирную связь (OOSSSSSSOSOSSOOSSSSSS). Специалисту в настоящей области техники понятно, что предложенный олигонуклеотид может быть представлен в виде комбинаций липида, линкера и звеньев олигонуклеотидных цепей различными способами, причем комбинация звеньев обеспечивает один и тот же олигонуклеотид. Например, можно считать, что WV-3546 характеризуется структурой A^c-[-L^LD-(R^LD)a]b, где а равно 1, b равно 1 и он содержит липидный фрагмент R^LD связанный с частью его олигонуклеотидной цепи (А^с) через линкер L^LD в С(О) NH (СН₂)₆-ОР(=О)(ОН) О - причем С(О) соединен с R^LD, и О соединен с А^с (в виде 5'-О- олигонуклеотидной цепи); один из многих альтернативных путей заключается в том, что R^LD , и L^LD представляет собой NH (СН₂)₆ ОР(=O)(ОН) О, причем NH соединен с RLD, и О соединен с А^с (в виде 5'-О- олигонуклеотидной цепи).

[00927] Олигонуклеотиды получали и характеризовали с использованием различных способов в соответствии с настоящим раскрытием. Примеры данных МС представлены ниже:

[00928] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, представленного в таблице 2. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, представленного в таблице 2А-2Е. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью типа олигонуклеотидов, представленного в таблице 2В-2Е. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция представляет собой WV-1092. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция представляет собой WV-888. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция представляет собой WV-892. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция представляет собой WV-942. Согласно некоторым вариантам осуществления первое множество олигонуклеотидов представляет собой множество олигонуклеотидов в таблице 2. Согласно некоторым вариантам осуществления первое множество олигонуклеотидов представляет собой множество олигонуклеотидов в таблице 2А-2Е. Согласно некоторым вариантам осуществления первое множество олигонуклеотидов представляет собой множество олигонуклеотидов в таблице 2В-2Е. Согласно некоторым вариантам осуществления первое множество олигонуклеотидов представляет собой множество WV-1092. Согласно некоторым вариантам осуществления первое множество олигонуклеотидов представляет собой множество WV-888. Согласно некоторым вариантам осуществления первое множество олигонуклеотидов представляет собой множество WV-892. Согласно некоторым вариантам осуществления первое множество олигонуклеотидов представляет собой множество WV-896. Согласно некоторым вариантам осуществления первое множество олигонуклеотидов представляет собой множество олигонуклеотидов в таблице 4.

[00929] Согласно некоторым вариантам осуществления профиль химических модификаций содержит профиль, выбранный из таблицы 3. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль стереохимии содержит профиль, выбранный из таблицы 3. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль стереохимии содержит профиль, выбранный из таблицы 3, где числа (как правило, нижний индекс) независимо и необязательно изменяются. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль химической модификации содержит профиль, выбранный из таблицы 3А-3Е. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль химической модификации содержит профиль, выбранный из таблицы 3В-3Е. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль стереохимии содержит профиль, выбранный из таблицы 3А-3Е. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль стереохимии содержит профиль, выбранный из таблицы 3В-3Е. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль стереохимии содержит профиль, выбранный из таблицы 3А-3Е, где числа (как правило, нижний индекс) независимо и необязательно изменяются. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль стереохимии содержит профиль, выбранный из таблицы 3В-3Е, где числа (как правило, нижний индекс) независимо и необязательно изменяются.

[00930] Согласно некоторым вариантам осуществления профиль химической модификации выбирают из таблицы 3. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль стереохимии выбирают из таблицы 3. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль стереохимии выбирают из таблицы 3, причем числа (как правило, нижний индекс) независимо и необязательно изменяются. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль химической модификации выбирают из таблицы 3А-3Е. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль химической модификации выбирают из таблицы 3В-3Е. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль стереохимии выбирают из таблицы 3А-3Е. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль стереохимии выбирают из таблицы 3В-3Е. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль стереохимии выбирают из таблицы 3А-3Е, причем числа (как правило, нижний индекс) независимо и необязательно изменяются. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль стереохимии выбирают из таблицы 3В-3Е, причем числа (как правило, нижний индекс) независимо и необязательно изменяются.

[00931] Согласно некоторым вариантам осуществления профиль химической модификации выбирают из таблицы 4. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль стереохимии выбирают из таблицы 4. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль стереохимии выбирают из таблицы 4, причем числа (как правило, нижний индекс) независимо и необязательно изменяются. Согласно некоторым вариантам осуществления профиль химической модификации выбирают из таблицы 4. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль стереохимии выбирают из таблицы 4. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный профиль стереохимии выбирают из таблицы 4, причем числа (как правило, нижний индекс) независимо и необязательно изменяются.

[00932] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотида, представленного в таблицах 2-4. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотида, представленного в таблице 2. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотида, представленного в таблице 3. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотида, представленного в таблице 4. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции или способу, относящимся к любому олигонуклеотиду, представленному в таблицах 2-4. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции или способу, относящимся к любому олигонуклеотиду, представленному в таблице 2. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции или способу, относящимся к любому олигонуклеотиду, представленному в таблице 3. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции или способу, относящимся к любому олигонуклеотиду, представленному в таблице 4. Согласно некоторым вариантам осуществления активное соединение представляет собой любой олигонуклеотид, представленный в таблицах 2-4. Согласно некоторым вариантам осуществления активное соединение представляет собой любой олигонуклеотид, представленный в таблице 2. Согласно некоторым вариантам осуществления активное соединение представляет собой любой олигонуклеотид, представленный в таблице 3. Согласно некоторым вариантам осуществления активное соединение представляет собой любой олигонуклеотид, представленный в таблице 4. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция содержит предварительно определенный уровень олигонуклеотида, представленного в таблицах 2-4. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция содержит предварительно определенный уровень олигонуклеотида, представленного в таблице 2. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция содержит предварительно определенный уровень олигонуклеотида, представленного в таблице 3. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция содержит предварительно определенный уровень олигонуклеотида, представленного в таблице 4. Согласно некоторым вариантам осуществления были продемонстрированы иллюстративные свойства предложенных олигонуклеотидов, например, на фиг.1-38 и т.д.

[00933] Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблицах 2-4. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблице 2. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблице 3. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблице 4. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию или способ, относящийся к любому олигонуклеотиду, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблицах 2-4. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию или способ, относящийся к любому олигонуклеотиду, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблице 2. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию или способ, относящийся к любому олигонуклеотиду, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблице 3. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию или способ, относящийся к любому олигонуклеотиду, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблице 4. Согласно некоторым вариантам осуществления активное соединение представляет собой любой олигонуклеотид, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблицах 2-4. Согласно некоторым вариантам осуществления активное соединение представляет собой любой олигонуклеотид, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблице 2. Согласно некоторым вариантам осуществления активное соединение представляет собой любой олигонуклеотид, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблице 3. Согласно некоторым вариантам осуществления активное соединение представляет собой любой олигонуклеотид, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблице 4. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность олигонуклеотида включает любое одно или более из следующего: последовательность оснований (включая длину); профиль химических модификаций фрагментов сахара и оснований; профиль связей остова; профиль природных фосфатных связей, фосфоротиоатных связей, фосфоротиоатных триэфирных связей и их комбинации; профиль хиральных центров остова; профиль стереохимии (Rp/Sp) хиральных межнуклеотидных связей; профиль модификаций фосфора остова; профиль модификаций на межнуклеотидном атоме фосфора, такой как -S^- и -L-R¹ формулы I.

[00934] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложены композиции, содержащие или состоящие из совокупности предложенных олигонуклеотидов (например, композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью). Согласно некоторым вариантам осуществления все указанные предложенные олигонуклеотиды имеют один тип, т.е. имеют одинаковую последовательность оснований, профиль связей остова (т.е. профиль межнуклеотидных связей, например, фосфатов, фосфоротиоатов и т.д.), профиль хиральных центров остова (т.е. профиль стереохимии атомов фосфора связей (Rp/Sp)) и профиль модификаций атомов фосфора остова (например, профиль групп «-XLR¹» формулы I). Согласно некоторым вариантам осуществления все олигонуклеотиды одного и того же типа являются идентичными. Согласно многим вариантам осуществления, тем не менее, предложенные композиции содержат совокупность типов олигонуклеотидов, как правило, в предварительно определенных относительных количествах.

[00935] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержит комбинацию одного или более предложенных типов олигонуклеотидов. Специалистам в области химии и медицины будет понятно, что выбор и количество каждого из одного или более типов предложенных нуклеотидов в предложенной композиции зависит от предполагаемого применения указанной композиции. То есть, специалисты в данной области техники смогут подбирать предложенную хирально-контролируемую композицию олигонуклеотидов таким образом, чтобы количества и типы предложенных олигонуклеотидов, содержащихся в указанной композиции, образовывали композицию, которая в целом обладала бы определенными желаемыми характеристиками (например, желаемыми с точки зрения биологии, лечения и т.д.).

[00936] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержит комбинацию двух или более предложенных типов олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержит комбинацию трех или более предложенных типов олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержит комбинацию четырех или более предложенных типов олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержит комбинацию пяти или более предложенных типов олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержит комбинацию шести или более предложенных типов олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержит комбинацию семи или более предложенных типов олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержит комбинацию восьми или более предложенных типов олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержит комбинацию девяти или более предложенных типов олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержит комбинацию десяти или более предложенных типов олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержит комбинацию пятнадцати или более предложенных типов олигонуклеотидов.

[00937] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой комбинацию количества хирально-однородного мипомерсена с конфигурацией Rp и количества хирально-однородного мипомерсена Sp-конфигурацией.

[00938] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой комбинацию количества хирально-однородного мипомерсена с конфигурацией Rp, количества хирально-однородного мипомерсена с конфигурацией Sp и количества одной или более хирально-чистых диастереомерных форм мипомерсена.

[00939] Согласно некоторым вариантам осуществления указанный тип олигонуклеотидов выбирают из тех, которые описаны в WO/2014/012081 и WO/2015/107425, олигонуклеотидов, типов олигонуклеотидов, композиций олигонуклеотидов и их способы, каждый из которых включен в настоящее описание посредством ссылки. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержит олигонуклеотиды типа олигонуклеотид а, выбранного из описанных в WO/2014/012081 и WO/2015/107425.

[00940] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции, содержащей композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности любой композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, раскрытой в настоящем описании.

[00941] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции, содержащей композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности любой композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, раскрытой в таблице 2-4. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции, содержащей композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности любой композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, раскрытой в таблице 2. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции, содержащей композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности любой композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, раскрытой в таблице 3. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию, содержащую композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности любой композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, раскрытой в таблице 4.

[00942] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблицах 2-4. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблице 2. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблице 3. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблице 4. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции или способу, относящимся к любому олигонуклеотиду, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблицах 2-4. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции или способу, относящимся к любому олигонуклеотиду, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблице 2. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции или способу, относящимся к любому олигонуклеотиду, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблице 3. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции или способу, относящимся к любому олигонуклеотиду, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблице 4. Согласно некоторым вариантам осуществления активное соединение представляет собой любой олигонуклеотид, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблицах 2-4. Согласно некоторым вариантам осуществления активное соединение представляет собой любой олигонуклеотид, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблице 2. Согласно некоторым вариантам осуществления активное соединение представляет собой любой олигонуклеотид, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблице 3. Согласно некоторым вариантам осуществления активное соединение представляет собой любой олигонуклеотид, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, представленного в таблице 4. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность олигонуклеотида включает любое одно или более из следующего: последовательность оснований (включая длину); профиль химических модификаций фрагментов сахара и оснований; профиль связей остова; профиль природных фосфатных связей, фосфоротиоатных связей, фосфоротиоатных триэфирных связей и их комбинации; профиль хиральных центров остова; профиль стереохимии (Rp/Sp) хиральных межнуклеотидных связей; профиль модификаций фосфора остова; профиль модификаций на межнуклеотидном атоме фосфора, такой как -S^- и -L-R¹ формулы I.

[00943] В некоторых экспериментах, предложенные олигонуклеотиды обеспечивают неожиданно высокую активность, например, по сравнению с данными дрисаперсена и/или этеплирсена. Например, композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528 и WV-2530 и многие другие продемонстрировали превосходную способность, согласно некоторым вариантам осуществления в несколько раз выше, для опосредования пропускания экзона в дистрофине по сравнению с дрисаперсеном и/или этеплирсеном, как показано в настоящем описании, например, на разных фигурах и т.д.

[00944] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции, содержащей композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, выбранную из: WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, WV-2530, WV-2531, WV-2578, WV-2580, WV-2587, WV-3047, WV-3152, WV-3472, WV-3473, WV-3507, WV-3508, WV-3509, WV-3510, WV-3511, WV-3512, WV-3513, WV-3514, WV-3515, WV-3545 и WV-3546. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции, содержащей композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, выбранного из: WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, WV-2530, WV-2531, WV-2578, WV-2580, WV-2587, WV-3047, WV-3152, WV -3472, WV-3473, WV-357, WV-3510, WV-3510, WV-3510, WV-3510, WV-3510, WV-3511, WV-3515, WV-3545 и WV-3546.

[00945] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-887. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-892. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-896. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-1714. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотид а содержит последовательность WV-2444. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2445. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2526. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2527. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2528. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2530. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2531. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2578. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2580. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2587. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3047. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3152. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3472. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3473. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3507. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3508. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3509. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3510. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3511. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3512. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3513. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3514. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3515. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3545. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3546.

[00946] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид составляет в длину не более 25 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид составляет в длину не более 30 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид составляет в длину не более 35 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид составляет в длину не более 40 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид составляет в длину не более 45 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид составляет в длину не более 50 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид составляет в длину не более 55 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид составляет в длину не более 60 оснований.

[00947] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-887. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-892. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-896. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-1714. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2444. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2445. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2526. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2527. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2528. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2530. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2531. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2578. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2580. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2587. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3047. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3152. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3472. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3473. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3507. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3508. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3509. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3510. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3511. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3512. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3513. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3514. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3515. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3545. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3546.

[00948] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-887, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-892, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-896, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-1714, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2444, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2445, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2526, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2527, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2528, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2530, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2531, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2578, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2580, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2587, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3047, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3152, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3472, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3473, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3507, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3508, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3509, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3510, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3511, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3512, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3513, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3514, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3515, причем композиция дополнительно содержит липид. Согласно некоторым вариантам осуществления липид представляет собой стеариновую кислоту или турбинаровую кислоту. Согласно некоторым вариантам осуществления липид конъюгирован с олигонуклеотидом.

[00949] Согласно некоторым вариантам осуществления конъюгирование липида с олигонуклеотидом улучшает по меньшей мере одно свойство олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления свойство представляет собой увеличенную активность (например, повышенную способность индуцировать желаемое пропускание вредного экзона), снижение токсичности или улучшение распределения в ткани. Согласно некоторым вариантам осуществления конъюгация липидов улучшает активность. Согласно некоторым вариантам осуществления конъюгация с липидом снижает токсичность. Согласно некоторым вариантам осуществления конъюгация с липидом снижает активность агониста hTLR9. Согласно некоторым вариантам осуществления конъюгация с липидом увеличивает активность антагониста hTLR9. Согласно некоторым вариантам осуществления конъюгация с липидом улучшает доставку в одну или более тканей-мишеней. Согласно некоторым вариантам осуществления ткань представляет собой мышечную ткань. Согласно некоторым вариантам осуществления ткань представляет собой скелетную мышцу, икроножную мышцу, трехглавую мышцу, сердце или диафрагму.

[00950] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину не более 25 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину не более 30 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину не более 35 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину не более 40 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину не более 45 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину не более 50 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину не более 55 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид составляет в длину не более 60 оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления U заменяется на Т или наоборот.

[00951] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-C₈₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, причем одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-С₆ алкилена, C₁-С₆ алкенилена, , C₁-C₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R'), -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и C(O)O-, причем каждая переменная независимо является такой, как определено и описано в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь С₁₀-С₆₀, необязательно замещенную одной или более С_1-4 алифатическими группами. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-С₆ алкилена, C₁-С₆ алкенилена, С₁-С₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O), C(O)S, OC(O) и -C(O)O, причем каждая переменная независимо является такой, как определено и описано в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь С₁₀-С₆₀, необязательно замещенную одной или более С_1-4 алифатическими группами. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-С₆ алкилена, C₁-С₆ алкенилена, С₁-С₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')- -C(O)N(R)-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R)-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и C(O)O-, причем каждая переменная независимо является такой, как определено и описано в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-4 алифатическими группами. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит незамещенную С₁₀-C₈₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит не более одной необязательно замещенной С₁₀-С₆₀ линейной, насыщенной или частично ненасыщенной алифатической цепи. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит две или более необязательно замещенных С₁₀-С₆₀ линейных, насыщенных или частично ненасыщенных алифатических цепей. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит незамещенную С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит не более одной необязательно замещенной С₁₀-С₆₀ линейной, насыщенной или частично ненасыщенной алифатической цепи. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит две или более необязательно замещенных С₁₀-С₆₀ линейных, насыщенных или частично ненасыщенных алифатических цепей. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит незамещенную С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит не более одной необязательно замещенной С₁₀-С₆₀ линейной, насыщенной или частично ненасыщенной алифатической цепи. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит две или более необязательно замещенных С₁₀-С₆₀ линейных, насыщенных или частично ненасыщенных алифатических цепей. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-4 алифатическими группами. Согласно различным вариантам осуществления липид выбирают из группы, состоящей из лауриновой кислоты, миристиновой кислоты, пальмитиновой кислоты, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, докозагексаеновой кислоты (цис-ДГК), турбинаровой кислоты и дилинолеила. Согласно некоторым вариантам осуществления липид не конъюгирован с олигонуклеотидом. Согласно некоторым вариантам осуществления липид конъюгирован с олигонуклеотидом.

[00952] Согласно некоторым вариантам осуществления конъюгация липида с олигонуклеотидом неожиданно улучшает по меньшей мере одно свойство олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления свойство представляет собой увеличенную активность (например, повышенную способность индуцировать желаемое пропускание вредного экзона), снижение токсичности или улучшенное распределение в ткани. Согласно некоторым вариантам осуществления ткань представляет собой мышечную ткань. Согласно некоторым вариантам осуществления ткань представляет собой скелетную мышцу, икроножную мышцу, трехглавую мышцу, сердце или диафрагму. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды, содержащие липидные фрагменты, образуют, например, мицеллы. Согласно некоторым вариантам осуществления демонстрируются примеры улучшенных свойств, например, на одной или более фигурах.

[00953] Согласно некоторым вариантам осуществления при анализе иллюстративных олигонуклеотидов у мышей исследуемые олигонуклеотиды (например, WV-3473, WV-3545, WV-3546, WV-942 и т.д.) вводят внутривенно через хвостовую вену у самцов мышей C57BL/10ScSndmdmdx (возрастом 4-5 недель) в исследуемых количествах, например, 10 мг/кг, 30 мг/кг и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления ткани собирают в исследуемые сроки, например, в дни, например, 2, 7 и/или 14 и т.д., после инъекции, согласно некоторым вариантам осуществления, свежезамороженные в жидком азоте и хранящиеся при -80°С до анализа.

[00954] Для оценки уровней олигонуклеотидов в соответствии с настоящим раскрытием могут быть использованы различные анализы. Согласно некоторым вариантам осуществления гибридный ELISA используется для количественного определения уровней олигонуклеотидов в тканях с использованием серийного разведения исследуемого изделия в качестве стандартной кривой: например, в иллюстративной процедуре активированный малеиновым ангидридом 96-луночный планшет (Pierce 15110) покрывали зондом захвата в количестве 50 мкл в концентрации 500 нМ в 2,5% NaHCO3 (Gibco, 25080-094) в течение 2 часов при 37°С. Затем планшет промывали 3 раза PBST (PBS+0,1% Tween-20) и блокировали 5% обезжиренным молоком-PBST при 37°С в течение 1 часа. Исследуемый олигонуклеотид серийно разводили в матрицу. Этот стандарт вместе с оригинальными образцами разбавляли буфером для лизиса (4 М гуанидина, 0,33% N-лаурил-саркозин, 25 мМ цитрат натрия, 10 мМ DTT), так что количество олигонуклеотидов во всех образцах составляло менее чем 100 нг/мл. 20 мкл разбавленных образцов смешивали с 180 мкл 333 нМ зонда обнаружения, разбавленного в PBST, затем денатурировали в приборе ПЦР (65°С, 10 мин, 95°С, 15 мин, 4°С). 50 мкл денатурированных образцов распределяли на блокированном планшете ELISA в трех повторах и инкубировали в течение ночи при 4°С. После 3-х промывок PBST, добавляли 1:2000 стрептавидин-АР в PBST, 50 мкл на лунку, и инкубировали при комнатной температуре в течение 1 часа. После интенсивной промывки с PBST добавляли 100 мл AttoPhos (Promega SI000), инкубировали при комнатной температуре в темноте в течение 10 мин и считывали на канале флуоресценции планшетного ридера (Molecular Device. М5): длина волны излучения 435 нм, длина волны поглощения 555 им. Олигонуклеотиды в образцах рассчитывали по стандартной кривой с помощью 4-параметрической регрессии.

[00955] Как описано и продемонстрировано в настоящем раскрытии, согласно некоторым вариантам осуществления конъюгация липидов улучшает доставку в ткань. Согласно некоторым вариантам осуществления конъюгация липидов улучшает доставку к мышцам. Согласно некоторым вариантам осуществления конъюгация липидов предусматривает конъюгацию с жирной кислотой. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды конъюгируют с турбинаровой кислотой. Согласно некоторым вариантам осуществления конъюгация с турбинаровой кислотой особенно эффективна для улучшения доставки олигонуклеотида в мышцы.

[00956] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды, например, WV-3473, являются стабильными как в гомогенатах плазмы, так и в тканях.

Примеры способов получения олигонуклеотидов и композиций

[00957] Способы получения предложенных олигонуклеотидов и композиций олигонуклеотидов широко известны в настоящей области техники, включая, но не ограничиваясь ими, способы, описанные в публикациях международных заявок WO/2010/064146, WO/2011/005761, WO/2013/012758, WO/2014/010250, US2013/0178612, WO/2014/012081, WO/2015/107425, PCT/US2016/043542 и PCT/US2016/043598, способы и реагенты каждой из которых включены в настоящий документ посредством ссылки.

[00958] Помимо всего прочего, в настоящем раскрытии предложены способы получения олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью и композиций с контролируемой хиральностью, содержащих один или более конкретных типов нуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления фраза «тип олигонуклеотида», используемая в настоящем описании, определяет олигонуклеотид, который имеет определенную последовательность оснований, профиль связей остова, профиль хиральных центров остова и профиль модификаций атомов фосфора остова (например, групп «-XLR¹»). Олигонуклеотиды одного общего указанного «типа» имеют идентичную структуру друг с другом, если рассматривать последовательность оснований, профиль связей остова, профиль хиральных центров остова и профиль модификаций атомов фосфора остова. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды типа олигонуклеотида являются идентичными.

[00959] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью согласно настоящему раскрытию имеет свойства, отличные от соответствующей стереослучайной смеси олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет липофильность, отличающуюся от стереослучайной смеси олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет отличающееся время удерживания ВЭЖХ. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью может иметь пик времени удерживания, значительно отличающийся от соответствующей стерео случайной смеси олигонуклеотидов. Во время очистки олигонуклеотидов путем ВЭЖХ, традиционно используемой в уровне техники, происходит потеря большей части, если не всех, определенных олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью. Во время очистки олигонуклеотидов путем ВЭЖХ, традиционно используемой в уровне техники, происходит потеря большей части, если не всех, определенных олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью. Одним из последствий является то, что определенные диастереомеры, входящие в состав стереослучайной смеси олигонуклеотидов (определенные олигонуклеотиды с контролируемой хиральностью), необязательно испытывать в исследованиях. Другим следствием является то, что в зависимости от партии из-за неизбежных инструментальных и субъективных погрешностей предполагаемый «чистый» стереослучайный олигонуклеотид будет иметь состав, отличающийся от состава диастереомеров в композиции, и их относительные и абсолютные количества будут различаться в зависимости от партии. В олигонуклеотидах с контролируемой хиральностью и хирально-контролируемых композициях олигонуклеотидов, предложенных в настоящем раскрытии, эта проблема решена, так как олигонуклеотид с контролируемой хиральностью синтезируют при помощи хирально-контролируемого способа в виде единственного диастереомера, а композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержит предварительно определенные количества одного или более отдельных типов олигонуклеотидов.

[00960] Специалистам в данной области техники должно быть понятно, что способы синтеза согласно настоящему раскрытию обеспечивают уровень контроля во время синтеза предложенного олигонуклеотида, при котором каждое нуклеотидное звено олигонуклеотида может быть разработано и/или выбрано заранее таким образом, чтобы оно имело конкретную стереохимию атома фосфора связи и/или конкретную модификацию атома фосфора связи и/или содержало конкретное основание и/или конкретный сахар. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид разработан и/или выбран заранее таким образом, чтобы он имел определенную комбинацию атомов фосфора связей, которые являются стереоцентрами межнуклеотидных связей.

[00961] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид, полученный при помощи способов согласно настоящему раскрытию, разработан и/или выбран таким образом, чтобы он имел определенную комбинацию модификаций атомов фосфора связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид, полученный при помощи способов согласно настоящему раскрытию, разработан и/или выбран таким образом, чтобы он имел определенную комбинацию оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид, полученный при помощи способов согласно настоящему раскрытию, разработан и/или выбран таким образом, чтобы он имел определенную комбинацию сахаров. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид, полученный при помощи способов согласно настоящему раскрытию, разработан и/или выбран таким образом, чтобы он имел определенную комбинацию одной или более приведенных выше структурных характеристик.

[00962] Способы согласно настоящему раскрытию обеспечивают высокую степень хирального контроля. Например, способы согласно настоящему раскрытию способствуют контролированию стереохимической конфигурации каждого отдельного атома фосфора связей в предложенном олигонуклеотиде. Согласно некоторым вариантам осуществления способы согласно настоящему раскрытию обеспечивают олигонуклеотид, содержащий одну или более модифицированных межнуклеотидных связей, независимо имеющих структуру формулы I.

[00963] Согласно некоторым вариантам осуществления способы согласно настоящему раскрытию обеспечивают олигонуклеотид, который является унимером мипомерсена. Согласно некоторым вариантам осуществления способы согласно настоящему раскрытию обеспечивают олигонуклеотид, который является унимером мипомерсена конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления способы согласно настоящему раскрытию обеспечивают олигонуклеотид, который является унимером мипомерсена конфигурации Sp.

[00964] Согласно некоторым вариантам осуществления способы согласно настоящему раскрытию обеспечивают композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, т.е. композицию олигонуклеотидов, содержащую предварительно определенные количества отдельных типов олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержит один тип олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция с контролируемой хиральностью содержит более одного типа олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержит совокупность типов олигонуклеотидов. Примеры композиций олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, полученные согласно настоящему раскрытию, описаны в настоящей заявке.

[00965] Согласно некоторым вариантам осуществления способы согласно настоящему раскрытию обеспечивают хирально-чистые композиции мипомерсена, если рассматривать конфигурацию атомов фосфора связей. То есть, согласно некоторым вариантам осуществления способы согласно настоящему раскрытию обеспечивают композиции мипомерсена, где мипомерсен присутствует в композиции в виде единственного диастереомера, если рассматривать конфигурацию атомов фосфора связей.

[00966] Согласно некоторым вариантам осуществления способы согласно настоящему раскрытию обеспечивают хирально-однородные композиции мипомерсена. если рассматривать конфигурацию атомов фосфора связей. То есть, согласно некоторым вариантам осуществления способы согласно настоящему раскрытию обеспечивают композиции мипомерсена, в которых все нуклеотидные звенья имеют одинаковую стереохимию, если рассматривать конфигурацию атомов фосфора связей, например, все нуклеотидные звенья имеют конфигурацию Rp атомов фосфора связей, или все нуклеотидные звенья имеют конфигурацию Sp атомов фосфора связей.

[00967] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более 50%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 55%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 60%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 65%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 70%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 75%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 80%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 85%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 90%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 91%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 92%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 93%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 94%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 95%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 96%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 97%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 98%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 99%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 99,5%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 99,6%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 99,7%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 99,8%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту более чем примерно 99,9%. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет чистоту по меньшей мере примерно 99%.

[00968] Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью разработана таким образом, чтобы она содержала один тип олигонуклеотидов. Согласно определенным вариантам осуществления имеют диастереомерную чистоту примерно 50%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композицию имеют диастереомерную чистоту примерно 50%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 50%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 55%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 60%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 65%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 70%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 75%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 80%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 85%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 90%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 91%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 92%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 93%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 94%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 95%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 96%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 97%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 98%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 99%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 99,5%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 99,6%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 99,7%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 99,8%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композиции имеют диастереомерную чистоту примерно 99,9%. Согласно некоторым вариантам осуществления указанные композицию имеют диастереомерную чистоту по меньшей мере примерно 99%.

[00969] Среди прочего, настоящее раскрытие признает проблему стерео селективно го (а не стерео случайно го или рацемического) получения олигонуклеотидов. Среди прочего, настоящее раскрытие предусматривает способы и реагенты для стереоселективного получения олигонуклеотидов, содержащих множество (например, более 5, 6, 7, 8, 9 или 10) межнуклеотидных связей и, в частности, для олигонуклеотидов, содержащих множество (например, более чем 5, 6, 7, 8, 9 или 10) хиральных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления при стерео случайном или рацемическом получении олигонуклеотидов образуется по меньшей мере одна хиральная межнуклеотидная связь с диастереоселективностью менее чем 90:10, 95:5, 96:4, 97:3 или 98:2. Согласно некоторым вариантам осуществления при стерео селективном или хирально-контролируемом получении олигонуклеотидов каждая хиральная межнуклеотидная связь образуется с диастереоселективностью более чем 90:10, 95:5, 96:4, 97:3 или 98:2. Согласно некоторым вариантам осуществления при стерео селективном или хирально-контролируемом получении олигонуклеотидов каждая хиральная межнуклеотидная связь образуется с диастереоселективностью более чем 95:5. Согласно некоторым вариантам осуществления при стерео селективном или хирально-контролируемом получении олигонуклеотидов каждая хиральная межнуклеотидная связь образуется с диастереоселективностью более чем 96:4. Согласно некоторым вариантам осуществления при стереоселективном или хирально-контролируемом получении олигонуклеотидов каждая хиральная межнуклеотидная связь образуется с диастереоселективностью более чем 97:3. Согласно некоторым вариантам осуществления при стереоселективном или хирально-контролируемом получении олигонуклеотидов каждая хиральная межнуклеотидная связь образуется с диастереоселективностью более чем 98:2. Согласно некоторым вариантам осуществления при стереоселективном или хирально-контролируемом получении олигонуклеотидов каждая хиральная межнуклеотидная связь образуется с диастереоселективностью более чем 99:1. Согласно некоторым вариантам осуществления диастерео селективность хиральной межнуклеотидной связи в олигонуклеотиде может быть измерена посредством модельной реакции, например, образования димера при практически одинаковых или сопоставимых условиях, в которых димер имеет одинаковую межнуклеотидную связь как хиральную межнуклеотидную связь, 5'-нуклеозид димера является таким же, как нуклеозид к 5'-концу хиральной межнуклеотидной связи, и 3'-нуклеозид димера является таким же, как нуклеозид к 3'-концу хиральной межнуклеотидной связи.

[00970] Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляет собой композицию, разработанную таким образом, чтобы она содержала несколько типов олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления способы согласно настоящему раскрытию обеспечивают получение библиотеки олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, то есть предварительно выбранное количество любых одного или более типов олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью можно смешивать с любыми одним или более типами олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью для получения композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления предварительно выбранное количество типа олигонуклеотида представляет собой композицию, имеющую любое из описанных выше значений диастереомерной чистоты.

[00971] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложены способы получения олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, включающие стадии:

(1) сочетания;

(2) введения блокирующей группы;

(3) модификации;

(4) удаления блокирующей группы; и

(5) повторения стадий (1) - (4) до достижения желаемой длины.

[00972] При описании предложенных способов слово «цикл» имеет общепринятое значение, известное специалистам в данной области техники. Согласно некоторым вариантам осуществления одну последовательность стадий (1)-(4) называют циклом.

[00973] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложены способы получения композиций олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, включающие стадии:

(a) обеспечения количества первого олигонуклеотида с контролируемой хиральностью; и

(b) необязательно обеспечения количества одного или более дополнительных олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью.

[00974] Согласно некоторым вариантам осуществления первый олигонуклеотид с контролируемой хиральностью представляет собой олигонуклеотид, имеющий тип, такой как описано в настоящей заявке. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более дополнительных олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью представляют собой один или более олигонуклеотидов, имеющих типы, такие как описано в настоящей заявке.

[00975] Специалистам в соответствующих областях химии и синтеза должна быть понятна степень универсальности и контролирования структурных изменений и стерео химической конфигурации предложенного олигонуклеотида, синтезированного при помощи способов согласно настоящему раскрытию. Например, после завершения первого цикла можно проводить последующий цикл с применением нуклеотидного звена, отдельно выбранного для указанного последующего цикла, которое Согласно некоторым вариантам осуществления содержит нуклеиновое основание и/или сахар, отличающиеся от нуклеинового основания и/или сахара, применяемого в первом цикле. Аналогично, хиральное вспомогательное вещество, применяемое на стадии сочетания в последующем цикле, может отличаться от хирального вспомогательного вещества, применяемого в первом цикле, то есть второй цикл обеспечивает получение фосфорсодержащей связи, имеющей отличающуюся стерео химическую конфигурацию. Согласно некоторым вариантам осуществления стереохимию атомов фосфора связей новой межнуклеотидной связи контролируют путем применения стереохимически чистых фосфорамидитов. Кроме того, агент модификации, применяемый на стадии модификации в последующем цикле, может отличаться от агента модификации, применяемого в первом или предшествующем цикле. Суммарное действие от указанного подхода с многократным встраиванием звеньев заключается в том, что в каждом компоненте предложенного олигонуклеотида можно с высокой степенью настраивать структуру и конфигурацию. Дополнительным преимуществом этого подхода является то, что стадия введения блокирующей группы минимизирует образование примесей «n-1», которые в иных случаях значительно затрудняют выделение предложенного олигонуклеотида, в частности олигонуклеотидов, имеющих большую длину.

[00976] Согласно некоторым вариантам осуществления иллюстративный цикл способа получения олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью проиллюстрирован в иллюстративных схемах, описанных в настоящем раскрытии. Согласно некоторым вариантам осуществления цикл способа получения олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью проиллюстрирован на схеме I. Согласно некоторым вариантам осуществления представляет собой твердую подложку, и необязательно фрагмент растущего олигонуклеотида с контролируемой хиральностью присоединен к твердой подложке. Предложенное хиральное вспомогательное вещество имеет структуру формулы 3-I:

которая дополнительно описана ниже. «Сар» представляет собой любой химический фрагмент, присоединенный к атому азота на стадии введения блокирующей группы, а Согласно некоторым вариантам осуществления представляет собой аминозащитную группу. Специалисты в данной области техники понимают, что в после начала первого цикла к твердой подложке может быть присоединен только один нуклеозид, и цикл необязательно можно завершать до удаления блокирующей группы. Специалистам в данной области техники должно быть понятно, что B^PRO представляет собой защищенное основание, применяемое в синтезе олигонуклеотида. Каждая стадия цикла, изображенного на схеме I, дополнительно описана далее.

Схема I. Синтез олигонуклеотида с контролируемой хиральностью.

Синтез на твердой подложке

[00977] Согласно некоторым вариантам осуществления синтез предложенного олигонуклеотида проводят на твердой фазе. Согласно некоторым вариантам осуществления реакционно-способные группы, присутствующие в твердой подложке, защищены. Согласно некоторым вариантам осуществления реакционно-способные группы, присутствующие в твердой подложке, являются незащищенными. Во время синтеза олигонуклеотида твердую подложку обрабатывают различными реагентами в нескольких циклах синтеза для обеспечения постепенного увеличения растущей цепи олигонуклеотида за счет отдельных нуклеотидных звеньев. Нуклеозидное звено, расположенное в конце цепи, которое непосредственно связано с твердой подложкой, называют в настоящем описании «первым нуклеозидом». Первый нуклеозид связан с твердой подложкой посредством линкерного фрагмента, т.е. бирадикала, содержащего ковалентные связи между CPG, полимером или другой твердой подложкой и нуклеозидом. Линкерная группа не вступает во взаимодействия во время циклов синтеза, проводимых для построения цепи олигонуклеотида, и ее отщепляют после построения цепи для отделения олигонуклеотида от подложки.

[00978] Твердые подложки для твердофазного синтеза нуклеиновых кислот включают подложки, описанные, например, в патентах США №4659774, 5141813, 4458066; в патентах США №4415732, 4458066, 4500707, 4668777, 4973679 и 5132418 (автор Карутерс (Caruthers)); в патентах США №5047524, 5262530 (авторы Андрус (Andrus) с соавторами); и в патенте США №4725677 (замененный RE34069) (автор Костер (Koster)). Согласно некоторым вариантам осуществления твердая фаза представляет собой подложку органического полимера. Согласно некоторым вариантам осуществления твердая фаза представляет собой подложку неорганического полимера. Согласно некоторым вариантам осуществления подложка органического полимера представляет собой полистирол, аминометилполистирол, привитой сополимер полиэтиленгликоля-полистирола, полиакрил амид, полиметакрилат, поливиниловый спирт, полимер с высокой степенью перекрестной сшивки (НРС) или другие синтетические полимеры, углеводы, такие как целлюлоза и крахмал или другие полимерные углеводы, или другие органические полимеры и сополимеры, композиционные материалы или комбинация приведенных выше неорганических или органических веществ. Согласно некоторым вариантам осуществления подложка неорганического полимера представляет собой оксид кремния, оксид алюминия, полимерное стекло с контролируемым размером пор (англ. controlled polyglass, CPG), которое представляет собой подложку силикагеля или аминопропил-CPG. Другие подходящие твердые подложки включают фтористые твердые подложки (см., например, международную заявку на патент WO/2005/070859), твердые подложки стекла с контролируемым размером пор (CPG), содержащего длинноцепочечный алкиламин (LCAA) (см., например, S. P. Adams, К. S. Kavka, Е. J. Wykes, S. В. Holder and G. R. Galluppi, J. Am. Chem. Soc, 1983, 105, 661-663; G. R. Gough, M. J. Bruden and P. T. Gilham, Tetrahedron Lett., 1981, 22, 4177-4180). Мембранные подложки и полимерные мембраны (см., например, Innovation and Perspectives in Solid Phase Synthesis, Peptides, Proteins and Nucleic Acids, ch 21 pp 157-162, 1994, Ed. Roger Epton и патент США №4923901) также подходят для синтеза нуклеиновых кислот. В полученную мембрану можно вводить химические функциональные группы для применения в синтезе нуклеиновых кислот. Помимо присоединения функциональной группы к мембране Согласно некоторым вариантам осуществления также применяют линкерную или разделительную группу, присоединенную к мембране, для минимизации стерических затруднений между мембраной и синтезируемой цепью.

[00979] Другие подходящие твердые подложки включают те, что хорошо известны в данной области техники и подходят для применения в твердофазных методиках, включая, например, стекло, реализуемое как подложка PrimerTM 200, стекло с контролируемым размером пор (CPG), оксалилсодержащее стекло с контролируемым размером пор (см.. например, Alul, et at., Nucleic Acids Research, 1991, 19, 1527), подложка TentaGel -подложка-производное аминополиэтиленгликоля (см., например, Wright, et al., Tetrahedron Lett., 1993, 34, 3373), и Poros - сополимер полистирола/дивинилбензола.

[00980] Было продемонстрировано применение поверхностно-активированных полимеров для использования в синтезе природных и модифицированных нуклеиновых кислот и белков на некоторых твердых подложках. Вещество твердой подложки может представлять собой любой полимер, имеющий подходящую однородную пористость, достаточное содержание аминогрупп и подходящую универсальность для возможности проведения любых операцию присоединения без потери целостности. Примеры подходящих выбранных веществ включают нейлон, полипропилен, сложный полиэфир, политетрафторэтилен, полистирол, поликарбонат и нитроцеллюлозу. В качестве твердой подложки в зависимости от решения изобретателя можно использовать и другие вещества. Если рассматривать некоторые решения, то можно выбирать металл с покрытием, в частности золото или платину (см., например, опубликованную заявку на патент США №20010055761). В одном из вариантов осуществления синтеза олигонуклеотида, например, нуклеозид прикрепляют к твердой подложке, функционализированной гидроксильными или амино-остатками. В качестве альтернативы проводят превращение твердой подложки для обеспечения лабильной к действию кислот триалкокситритильной группы, такой как триметокситритильная группа (ТМТ). Не желая быть связанными теорией, ожидают, что наличие триалкокситритильной защитной группы позволяет проводить начальное детритилирование в условиях, обычно используемых в ДНК-синтезаторах. Для ускоренного высвобождения олигонуклеотидного материала в раствор водного аммиака в подложку необязательно вводят дигликолатную линкерную группу.

[00981] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид в качестве альтернативы синтезируют в направлении от 5' к 3'. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеиновую кислоту присоединяют к твердой подложке через 5'-конец растущей нуклеиновой кислоты, т.е. с использованием 5'-нуклеозидфосфорамидатов или ферментной реакции (например, лигирования и полимеризации с использованием нуклеозид-5'-трифосфатов), таким образом, для взаимодействия предоставлена 3'-группа. Если рассматривать синтез в направлении от 5' к 3', то многократно повторяющиеся стадии согласно настоящему раскрытию остаются неизменными (т.е. введение блокирующих групп и модификация хиральных атомов фосфора).

Линкерный фрагмент

[00982] Линкерный фрагмент или линкер необязательно используют для связывания твердой подложки с соединением, содержащим свободный нуклеофильный фрагмент.Известны подходящие линкеры, такие как короткоцепочечные молекулы, которые используют для соединения твердой подложки с функциональными группами (например, с гидроксильными группами) молекул исходных нуклеозидов в способах твердофазного синтеза. Согласно некоторым вариантам осуществления линкерный фрагмент представляет собой линкер моноамида янтарной кислоты или сукцинатный линкер (-СО-СН₂-СН₂-СО-) или оксалиловый линкер (-СО-СО-). Согласно некоторым вариантам осуществления линкерный фрагмент и нуклеозид связаны друг с другом посредством сложноэфирной связи. Согласно некоторым вариантам осуществления линкерный фрагмент и нуклеозид связаны друг с другом посредством амидной связи. Согласно некоторым вариантам осуществления линкерный фрагмент связывает нуклеозид с другим нуклеотидом или нуклеиновой кислотой. Подходящие линкеры предложены, например, в Oligonucleotides And Analogues A Practical Approach, Ekstein, F. Ed., IRL Press, N.Y., 1991, Chapter 1 и в Solid-Phase Supports for Oligonucleotide Synthesis, Pon, R. Т., Curr. Prot. Nucleic Acid Chem., 2000, 3.1.1-3.1.28.

[00983] Линкерный фрагмент используют для связывания соединения, содержащего свободный нуклеофильный фрагмент, с другим нуклеозидом, нуклеотидом или нуклеиновой кислотой. Согласно некоторым вариантам осуществления линкерный фрагмент представляет собой фосфодиэфирную линкерную группу. Согласно некоторым вариантам осуществления линкерный фрагмент представляет собой H-фосфонатный фрагмент. Согласно некоторым вариантам осуществления линкерный фрагмент представляет собой модифицированную фосфорсодержащую линкерную группу, такую как описано в настоящей заявке. Согласно некоторым вариантам осуществления для присоединения олигонуклеотида к твердой подложке применяют универсальный линкер (UnyLinker) (Ravikumar et al., Org. Process Res. Dev., 2008, 12 (3), 399-410). Согласно некоторым вариантам осуществления применяют другие универсальные линкеры (Pon, R. Т., Curr. Prot. Nucleic Acid Chem., 2000, 3.1.1-3.1.28). Согласно некоторым вариантам осуществления применяют различные ортогональные линкеры (такие как дисульфидные линкеры) (Pon, R. Т., Curr. Prot. Nucleic Acid Chem., 2000, 3.1.1-3.1.28).

[00984] Помимо всего прочего, настоящее раскрытие признает, что линкер может быть выбран или разработан так, чтобы быть совместимым с набором условий реакции, используемых для синтеза олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления во избежание деградации олигонуклеотидов и во избежание десульфирования вспомогательные группы избирательно удаляются перед удалением защитной группы. Согласно некоторым вариантам осуществления группа DPSE может избирательно удаляться ионами F^-. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие обеспечивает линкеры, которые стабильны в условиях удаления защитной группы DPSE, например 0,1 М TBAF в MeCN, 0,5 М HF-Et₃N в ТГФ или MeCN и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный линкер представляет собой линкер SP. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что линкер SP стабилен в условиях удаления защитной группы DPSE, например 0,1 М TBAF в MeCN, 0,5 М HF-Et₃N в ТГФ или MeCN и т.д.; они также стабильны, например, в безводных основных условиях, таких как 1М DBU в MeCN.

[00985] Согласно некоторым вариантам осуществления иллюстративный линкер представляет собой:

Согласно некоторым вариантам осуществления сукциниловый линкер, линкер Q или оксалиловый линкер нестабильны в отношении одного или нескольких условий удаления защитной группы DPSE с использованием F^-.

Общие условия - растворители для синтеза

[00986] Синтез предложенных олигонуклеотидов, в целом, проводят в апротонных органических растворителях. Согласно некоторым вариантам осуществления растворитель представляет собой нитрилсодержащий растворитель, такой как, например, ацетонитрил. Согласно некоторым вариантам осуществления растворитель представляет собой основный аминосодержащий растворитель, такой как, например, пиридин. Согласно некоторым вариантам осуществления растворитель представляет собой эфирный растворитель, такой как, например, тетрагидрофуран. Согласно некоторым вариантам осуществления растворитель представляет собой галогенированный углеводород, такой как, например, дихлорметан. Согласно некоторым вариантам осуществления применяют смесь растворителей. Согласно определенным вариантам осуществления растворитель представляет собой смесь любого одного или более описанных выше классов растворителей.

[00987] Согласно некоторым вариантам осуществления, если апротонный органический растворитель не является основным, то на стадии взаимодействия используют основание. Согласно некоторым вариантам осуществления, если присутствует основание, то оно представляет собой основный амин, такой как, например, пиридин, хинолин или N,N-диметил анилин. Иллюстративные другие основные амины включают пирролидин, пиперидин, N-метилпирролидин, пиридин, хинолин, N,N-диметиламинопиридин (DMAP) или N,N-диметиланилин.

[00988] Согласно некоторым вариантам осуществления основание отличается от основного амина.

[00989] Согласно некоторым вариантам осуществления апротонный органический растворитель является безводным. Согласно некоторым вариантам осуществления безводный апротонный органический растворитель является свежеперегнанным. Согласно некоторым вариантам осуществления свежеперегнанный безводный апротонный растворитель представляет собой основный аминосодержащий растворитель, такой как. например, пиридин. Согласно некоторым вариантам осуществления свежеперегнанный безводный апротонный органический растворитель представляет собой эфирный растворитель, такой как, например, тетрагидрофуран. Согласно некоторым вариантам осуществления свежеперегнанный безводный апротонный органический растворитель представляет собой нитрилсодержащий растворитель, такой как, например, ацетонитрил.

Хиралъный реагент/хиралъное вспомогательное вещество

[00990] Согласно некоторым вариантам осуществления хиральные реагенты используются для обеспечения стереоселективности при производстве олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью. Многие различные хиральные реагенты, также упомянутые специалистами в данной области техники и в настоящем описании как хиральные вспомогательные вещества, могут быть использованы в соответствии со способами настоящего раскрытия. Примеры таких хиральных реагентов описаны в настоящем описании и в Wada I, II и III, указанных выше. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент представляет собой таковой, как описан так, как описано Wada I. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент для использования в соответствии со способами настоящего изобретения относится к формуле 3-I ниже:

где W¹ и W² представляют собой любые из -О-, -S- или -NG⁵-, U₁ и U₃, представляют собой атомы углерода, которые связаны с U₂, если они присутствуют, или друг с другом, если r равно 0, посредством одной, двойной или тройной связи. U₂ представляет собой -С-, -CG⁸-, -CG⁸G⁸-, -NG⁸-, -N-, -О- или -S-, где r представляет собой целое число от 0 до 5 и не более двух гетероатомов являются смежными. Когда любой из U₂ представляет собой С, тройная связь должна быть образована между вторым U₂, который представляет собой С, или одним из U₁ или U₃. Аналогичным образом, когда любой из U₂ представляет собой CG⁸, образуется двойная связь между вторым U₂, который представляет собой -CG⁸- или -N-, или одним из U₁ или U₃.

[00991] Согласно некоторым вариантам осуществления -U₁(G³G⁴)-(U₂)_r-U₃(G¹G²) представляет собой -CG³G⁴-CG¹G²-. Согласно некоторым вариантам осуществления -U₁-(U₂)_r-U₃- представляет собой -CG³=CG¹-. Согласно некоторым вариантам осуществления -U₁-(U₂)_r-U₃- представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления -U₁-(U₂)_r-U₃- представляет собой -CG³=CG⁸-CG¹G²-. Согласно некоторым вариантам осуществления -U₁-(U₂)_r-U₃- представляет -CG³G⁴-O-CG¹G²-. Согласно некоторым вариантам осуществления -U₁-(U₂)_r-U₃- представляет -CG³G⁴-NG⁸-CG¹G²-. Согласно некоторым вариантам осуществления -U₁-(U₂)_r-U₃- представляет -CG³G⁴-N-CG²-. Согласно некоторым вариантам осуществления -U₁-(U₂)_r-U₃- представляет -CG³G⁴-N=CG⁸-CG¹G²-.

[00992] Как определено в настоящем описании, G¹, G², G³, G⁴, G⁵ и G⁸ независимо представляют собой водород или необязательно замещенную группу, выбранную из алкила, аралкила, циклоалкила, циклоалкилалкила, гетероциклила, гетероарила и арила; или два из G¹, G², G³, G⁴ и G⁵ представляют собой G⁶ (взятые вместе с образованием необязательно замещенного, насыщенного, частично ненасыщенного или ненасыщенного карбоциклического или гетероатомсодержащего кольца до примерно 20 кольцевых атомов, которое представляет собой моноциклическое или полициклическое, и представляет собой конденсированное или неконденсированное). Согласно некоторым вариантам осуществления образованное таким образом кольцо замещено фрагментами оксо, тиоксо, алкила, алкенила, алкинила, гетероарила или арила. Согласно некоторым вариантам осуществления, когда кольцо, образованное путем взятия двух G⁶ вместе, замещено, оно замещено фрагментом, который является достаточно объемным для обеспечения стереоселективности во время реакции.

[00993] Согласно некоторым вариантам осуществления кольцо, образованное путем взятия двух из G⁶ вместе, представляет собой необязательно замещенный циклопентил, пирролил, циклопропил, циклогексенил, циклопентенил, тетрагидропиранил или пиперазинил. Согласно некоторым вариантам осуществления кольцо, образованное путем взятия двух из G⁶ вместе, представляет собой необязательно замещенный циклопентил, пирролил, циклопропил, циклогексенил, циклопентенил, тетрагидропиранил, пирролидинил или пиперазинил.

[00994] Согласно некоторым вариантам осуществления G¹ представляет собой необязательно замещенный фенил. Согласно некоторым вариантам осуществления G¹ представляет собой фенил. Согласно некоторым вариантам осуществления G² представляет собой метил или водород. Согласно некоторым вариантам осуществления G¹ представляет собой необязательно замещенный фенил и G² представляет собой метил. Согласно некоторым вариантам осуществления G¹ представляет собой фенил и G² представляет собой метил.

[00995] Согласно некоторым вариантам осуществления r равно 0.

[00996] Согласно некоторым вариантам осуществления W¹ представляет собой -NG⁵-. Согласно некоторым вариантам осуществления один из G³ и G⁴ взят вместе с G⁵ с образованием необязательно замещенного пирролидинилового кольца. Согласно некоторым вариантам осуществления один из G³ и G⁴ взят вместе с G⁵ с образованием пирролидинилового кольца.

[00997] Согласно некоторым вариантам осуществления W² представляет собой -О-.

[00998] Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент представляет собой соединение формулы 3-АА:

где каждая переменная представляет собой независимо таковую, как определено выше и описано в настоящем описании.

[00999] Согласно некоторым вариантам осуществления формулы 3АА W¹ и W² независимо представляют собой -NG⁵-, -О- или -S-; G¹, G², G³, G⁴ и G⁵ независимо представляют собой водород или необязательно замещенную группу, выбранную из алкила, аралкила, циклоалкила, циклоалкилалкила, гетеро циклила, гетероарила или ар ила; или два из G¹, G², G³, G⁴ и G⁵ представляют собой G⁶ (взятые вместе с образованием необязательно замещенного насыщенного, частично ненасыщенного или ненасыщенного карбоциклического или гетероатомсодержащего кольца до примерно 20 атомов в кольце, которое представляет собой моноциклическое или полициклическое, и представляет собой конденсированное или неконденсированное), и не более четырех из G¹, G², G³, G⁴ и G⁵ представляют собой G⁶. Аналогично соединениям формулы 3-1 любой из G¹, G², G³, G⁴ или G⁵ необязательно замещен фрагментами оксо, тиоксо, алкила, алкенила, алкинила, гетероарила или арила. Согласно некоторым вариантам осуществления такая замена индуцирует стереоселективность в производстве олигонуклеотида с контролируемой хиральностью.

[001000] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный хиральный реагент имеет структуру Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный хиральный реагент имеет структуру Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный хиральный реагент имеет структуру Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный хиральный реагент имеет структуру Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный хиральный реагент имеет структуру Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный хиральный реагент имеет структуру Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный хиральный реагент имеет структуру Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный хиральный реагент имеет структуру

[001001] Согласно некоторым вариантам осуществления W¹ представляет собой -NG⁵, W² представляет собой О, каждый из G¹ и G³ независимо представляет собой водород или необязательно замещенную группу, выбранную из алифатического, гетероциклильного, гетер о ар ильного и арильного С_1-10, G² представляет собой -C(R)₂Si(R)₃, a G⁴ и G⁵ взятые вместе с образованием необязательно замещенного насыщенного, частично ненасыщенного или ненасыщенного гетероатомсодержащего кольца до примерно 20 кольцевых атомов, которое является моноциклическим или полициклическим, конденсированным или неконденсированным. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый R независимо представляет собой водород или необязательно замещенную группу, выбранную из алифатического, карбоциклильного, арильного, гетероарильного и гетероциклильного C₁-С₆. Согласно некоторым вариантам осуществления G² представляет собой -C(R)₂Si(R)₃, где -C(R)₂- представляет собой необязательно замещенный -СН₂-, и каждый R в -Si(R)₃ независимо представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из алифатического, гетероциклильного. гетероарильного и арильного C_1-10. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один R-Si(R)₃ независимо представляет собой необязательно замещенный С_1-10 алкил. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один R Si(R)₃ независимо представляет собой необязательно замещенный фенил. Согласно некоторым вариантам осуществления один R-Si(R)₃ независимо представляет собой необязательно замещенный фенил, и каждый из двух других R независимо представляет собой необязательно замещенный С_1-10 алкил. Согласно некоторым вариантам осуществления один R Si(R)₃ независимо представляет собой необязательно замещенный С_1-10 алкил, и каждый из двух других R независимо представляет собой необязательно замещенный фенил. Согласно некоторым вариантам осуществления G² необязательно замещен -CH₂Si(Ph)(Me)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления G² необязательно замещен -CH₂Si(Me)(Ph)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления G² представляет собой CH₂Si(Me)(Ph)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления G⁴ и G⁵ берут вместе с образованием необязательно замещенного насыщенного 5-6-членного кольца, содержащего один атом азота (к которому присоединен G⁵). Согласно некоторым вариантам осуществления G⁴ и G⁵ берут вместе с образованием необязательно замещенного насыщенного 5-членного кольца, содержащего один атом азота. Согласно некоторым вариантам осуществления G¹ представляет собой водород. Согласно некоторым вариантам осуществления G³ представляет собой водород. Согласно некоторым вариантам осуществления как G¹, так и G³ представляют собой водород.

[001002] Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент имеет одну из следующих формул:

[001003] Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент представляет собой аминоспирт. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент представляет собой аминотиол. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент представляет собой аминофенол. В некоторых вариантах хиральный реагент представляет собой (S)- и (R)-2-метиламино-1-фенилэтанол, (1R,2S)-эфедрин или (1R,2S)-2-метиламино-1,2-дифенилэтанол.

[001004] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящего раскрытия хиральный реагент представляет собой соединение одной из следующих формул:

[001005] Как показано в настоящем описании, при использовании для получения хиральной межнуклеотидной связи, чтобы получить стереоселективность, как правило, используют стереохимически чистые хиральные реагенты. Среди прочего, настоящее раскрытие предусматривает стереохимически чистые хиральные реагенты, включая те, которые имеют описанные структуры.

[001006] Выбор хирального реагента, например изомера, представленного формулой Q, или его стереоизомера, формулы R, позволяет осуществлять специфический контроль хиральности при атоме фосфора связи. Таким образом, в каждом синтетическом цикле может быть выбрана конфигурация Rp или Sp, позволяющая контролировать общую трехмерную структуру олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет все стереоцентры Rp.Согласно некоторым вариантам осуществления настоящего раскрытия олигонуклеотид с контролируемой хиральностью имеет все стереоцентры Sp.Согласно некоторым вариантам осуществления настоящего раскрытия каждый атом фосфора связи в олигонуклеотиде с контролируемой хиральностью независимо представляет собой Rp или Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящего раскрытия каждый атом фосфора связи в олигонуклеотиде с контролируемой хиральностью независимо представляет собой Rp или Sp, и по меньшей мере один представляет собой Rp и по меньшей мере один представляет собой Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления выбор центров Rp и Sp производится для придания конкретной трехмерной суперструктуры олигонуклеотиду с контролируемой хиральностью. Примеры таких выборок описаны в настоящем описании более подробно.

[001007] Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент для использования в соответствии с настоящим раскрытием выбирается для его способности к удалению на конкретной стадии вышеописанного цикла. Например, согласно некоторым вариантам осуществления желательно удалить хиральный реагент на этапе модификации атома фосфора связи. Согласно некоторым вариантам осуществления желательно удалить хиральный реагент перед стадией модификации атома фосфора связи. Согласно некоторым вариантам осуществления желательно удалить хиральный реагент после стадии модификации атома фосфора связи. Согласно некоторым вариантам осуществления желательно удалить хиральный реагент после первой стадии связывания, но до того, как произошла вторая стадия связывания, так что хиральный реагент отсутствует на растущем олигонуклеотиде во время второго связывания (а также для дополнительных последующих стадий связывания). Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент удаляется во время реакции «деблокирования», которая возникает после модификации атома фосфора связи, но до начала последующего цикла. Примеры способов и реагентов для удаления описаны в настоящем описании.

[001008] Согласно некоторым вариантам осуществления удаление хирального вспомогательного вещества достигается при выполнении стадии модификации и/или удаления блокирующей группы, как показано на схеме I. Может быть полезно сочетать удаление хирального вспомогательного вещества вместе с другими преобразованиями, такими как модификация и удаление блокирующей группы. Специалисту в данной области техники было бы понятно, что сохраненные стадии/трансформация могут улучшить общую эффективность синтеза, например, в отношении выхода и чистоты продукта, особенно для более длинных олигонуклеотидов. Один пример, в котором хиральное вспомогательное вещество удаляется во время модификации и/или удаления блокирующей группы, проиллюстрирован на схеме I.

[001009] Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент для использования в соответствии со способами настоящего раскрытия отличается тем, что он является удаляемым при определенных условиях. Например, согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент выбирают по его способности удаляться в кислых условиях. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент выбирают по его способности удаляться в слабокислых условиях. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент выбирают по его способности удаляться посредством реакции элиминации Е1 (например, удаление происходит посредством образования промежуточного катиона на хиральном реагенте в кислых условиях, заставляя хиральный реагент отщепляться от олигонуклеотида). Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент характеризуется тем, что он имеет структуру, которая признана способной обеспечивать или облегчать реакцию элиминации Е1. Специалисты в соответствующих областях техники оценят, какие структуры будут рассматриваться как подверженные таким реакциям ликвидации.

[001010] Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент выбирают по его способности удаляться нуклеофилом. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент выбирают по его способности удаляться аминовым нуклеофилом. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент выбирают по его способности удаляться нуклеофилом, отличным от амина.

[001011] Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент выбирают по его способности удаляться основанием. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент выбирают по его способности удаляться амином. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент выбирают по его способности удаляться основанием, отличным от амина.

[001012] Дополнительные хиральные вспомогательные вещества и их использование можно найти, например, в Wada I (JP4348077; WO 2005/014609; WO 2005/092909), Wada II (WO 2010/064146), Wada III (WO 2012/039448), Chiral Control (WO 2010/064146), etc.

Активация

[001013] Ахиральный H-фосфонатный фрагмент обрабатывают первым активирующим реагентом с образованием первого промежуточного вещества. В одном из вариантов осуществления первый активирующий реагент добавляют в реакционную смесь на стадии конденсации. Применение первого активирующего реагента зависит от условий взаимодействия, таких как растворители, используемые для взаимодействия. Примерами первого активирующего реагента являются фосген, трихлорметилхлорформиат, бис(трихлорметил)карбонат (ВТС), оксалилхлорид, Ph₃PCl₂, (PhO)₃PCl₂, N,N'-бис(2-оксо-3-оксазолидинил)фосфинхлорид (BopCl), гексафторфосфат 1,3-диметил-2-(3-нитро-1,2,4-триазол-1-ил)-2-пирролидин-1-ил-1,3,2-диазафосфолидиния (MNTP) или гексафторфосфат 3-нитро-1,2,4-триазол-1-ил-трис(пирролидин-1-ил)фосфония (PyNTP).

[001014] Примером ахирального H-фосфонатного фрагмента является соединение, показанное на приведенной выше схеме. DBU представляет собой 1,8-диазабицикло[5.4.0]ундец-7-ен. H⁺DBU может представлять собой, например, ион аммония, ион алкиламмония, ион гетероароматического иминия или ион гетероциклического иминия, каждый из которых может быть первичным, вторичным, третичным или четвертичным, или одновалентный ион металла.

Взаимодействие с хиралъным реагентом

[001015] После первой стадии активации активированные ахиральный Н-фосфонатный фрагмент подвергают взаимодействию с хиральным реагентом, представленным формулой (Z-I) или (Z-I') с образованием хирального промежуточного вещества формулы (Z-Va), (Z-Vb), (Z-Va') или (Z-Vb').

Стадия стереоспецифической конденсации

[001016] Хиральное промежуточное вещество формулы (Z-Va), (Z-Vb), (Z-Va') или (Z-Vb') обрабатывают вторым активирующим реагентом и нуклеозидом с образованием промежуточного вещества конденсации. Нуклеозид может быть обеспечен на твердой подложке. Примерами второго активирующего реагента являются 4,5-дицианоимидазол (DCI), 4,5-дихлоримидазол, трифлат 1-фенилимидазолия (PhlMT), трифлат бензимидазолия (BIT), бензтриазол, 3-нитро-1,2,4-триазол (NT), тетразол, 5-этилтиотетразол (ЕТТ), 5-бензилтиотетразол (ВТТ), 5-(4-нитрофенил)тетразол, трифлатN-цианометилпирролидиния (СМРТ), трифлат V-цианометилпиперидиния, трифлат N-цианометилдиметиламмония Хиральное промежуточное вещество формулы Z-Va ((Z-Vb), (Z-Va') или (Z-Vb')) можно выделять в качестве мономера. Как правило, хиральное промежуточное вещество Z-Va ((Z-Vb), (Z-Va') или (Z-Vb')) не выделяют и используют для взаимодействия с нуклеозидом или модифицированным нуклеозидом в том же сосуде для обеспечения хирального фосфитного соединения, промежуточного вещества конденсации. Согласно другим вариантам осуществления, если способ проводят как твердофазный синтез, твердую подложку, содержащую соединение, отфильтровывают от побочных продуктов, примесей и/или реагентов.

Стадия введения блокирующей группы

[001017] Если конечная нуклеиновая кислота имеет размер крупнее димера, то в непрореагировавший фрагмент -ОН вводят блокирующую группу, и хиральную вспомогательную группу в соединении также можно маскировать блокирующей группой с образованием промежуточного вещества конденсации с блокирующими группами. Если конечная нуклеиновая кислота представляет собой димер, то стадия введения блокирующей группы является необязательной.

Стадия модификации

[001018] Соединение модифицируют путем взаимодействия с электрофилом. Промежуточное вещество конденсации с блокирующими группами можно обрабатывать на стадии модификации. Согласно некоторым вариантам осуществления стадию модификации проводят с применением серосодержащего электрофила, селеносодержащего электрофила или борирующего агента. Примерами стадий модификации являются стадии окисления и сульфирования.

[001019] Согласно некоторым вариантам осуществления способа серосодержащий электрофил представляет собой соединение, имеющее одну из следующих формул:

S₈ (формула Z-B), Z^z1-S-S-Z^z2 или Z^z1-S-V^z-Z^z2;

где Z^z1 и Z^z2 независимо представляют собой алкил, аминоалкил, циклоалкил, гетероцикл, циклоалкилалкил, гетероциклоалкил, арил, гетероарил, алкилокси, арилокси, гетероарилокси, ацил, амид, имид или тиокарбонил, или Z^z1 и Z^z2 объединены с образованием 3-8-членного алициклического или гетероциклического кольца, которое может быть замещенным или незамещенным; V^z представляет собой SO₂, О или NR^f; a R^f представляет собой водород, алкил, алкенил, алкинил или арил.

[001020] Согласно некоторым вариантам осуществления способа серосодержащий электрофил представляет собой соединение следующих формул Z-A, Z-B, Z-C, Z-D, Z-E или Z-F:

Согласно некоторым вариантам осуществления реагент сульфирования представляет собой 3-фенил-1,2,4-дитиазолин-5-он

[001021] Согласно некоторым вариантам осуществления селеносодержащий электрофил представляет собой соединение, имеющее одну из следующих формул:

Se (формула Z-G), Z^z3-Se-Se-Z^z4 или Z^z3-Se-V^z-Z^z4;

где Z^z3 и Z^z4 независимо представляют собой алкил, аминоалкил, циклоалкил, гетероцикл, циклоалкилалкил, гетероциклоалкил, арил, гетероарил, алкилокси, арилокси, гетероарилокси, ацил, амид, имид или тиокарбонил, или Z^z3 и Z^z4 объединены с образованием 3-8-членного алициклического или гетероциклического кольца, которое может быть замещенным или незамещенным; V^z представляет собой SO₂, S, О или NR^f; а R^f представляет собой водород, алкил, алкенил, алкинил или арил.

[001022] Согласно некоторым вариантам осуществления селеносодержащий электрофил представляет собой соединение формулы Z-G, Z-H, Z-I, Z-J, Z-K или Z-L.

[001023] Согласно некоторым вариантам осуществления борирующий агент представляет собой боран-N,N-диизопропилэтиламин (ВН₃-DIPEA), боран-пиридин (ВН₃-Ру), боран-2-хлорпиридин (ВН₃-СРу), боран-анилин (ВН₃-An), боран-тетрагидрофуран (ВН₃-ТГФ) или боран диметилсульфид (ВН₃-Me₂s).

[001024] Согласно некоторым вариантам осуществления после стадии модификации хиральная вспомогательная группа отпадает от растущей олигонуклеотидной цепи. Согласно некоторым вариантам осуществления после стадии модификации хиральная вспомогательная группа остается связанной с межнуклеотидным атомом фосфора.

[001025] Согласно некоторым вариантам осуществления способа стадия модификации представляет собой стадию окисления. Согласно некоторым вариантам осуществления способа стадия модификации представляет собой стадию окисления, при котором используют условия, схожие с теми, что описаны выше в настоящей заявке. Согласно некоторым вариантам осуществления стадия окисления является такой, как описано, например, в заявке на патент Японии 2010-265304 А и международной заявке на патент WO2010/064146.

Цикл роста цепи и стадия удаления защитной группы

[001026] Для удаления блокирующей группы при 5'-конце растущей цепи нуклеиновой кислоты и обеспечения соединения проводят «деблокировку» промежуточного вещества конденсации с блокирующими группами. Соединение необязательно повторно используют в цикле роста цепи для получения промежуточного вещества конденсации, промежуточного вещества конденсации с блокирующими группами, модифицированного промежуточного вещества конденсации с блокирующими группами и модифицированного промежуточного вещества с блокирующими группами и удаленной защитной группой в положении 5'. После проведения одного цикла роста цепи проводят дополнительное удаление блокирующих групп в модифицированном промежуточном веществе с блокирующими группами и удаленной защитной группой в положении 5' путем удаления хирального вспомогательного лиганда и других защитных групп, например, защитных групп нуклеинового основания, модифицированного нуклеинового основания, сахара и модифицированного сахара, для обеспечения нуклеиновой кислоты. Согласно другим вариантам осуществления нуклеозид, содержащий фрагмент 5'-ОН, представляет собой промежуточное вещество, полученное в предшествующем цикле роста цепи, как описано в настоящей заявке. Согласно другим вариантам осуществления нуклеозид, содержащий фрагмент 5'-ОН, представляет собой промежуточное вещество, полученное при помощи другого известного способа синтеза нуклеиновой кислоты. Согласно тем вариантам осуществления, где применяют твердую подложку, затем проводят отщепление нуклеиновой кислоты с модифицированным атомом фосфора от твердой подложки. Согласно определенным вариантам осуществления нуклеиновые кислоты остаются присоединенными к твердой подложке для проведения очистки, а после очистки их отщепляют от твердой подложки.

[001027] Согласно другим вариантам осуществления нуклеозид, содержащий фрагмент 5'-ОН, представляет собой промежуточное вещество, полученное при помощи другого известного способа синтеза нуклеиновой кислоты. Согласно другим вариантам осуществления нуклеозид, содержащий фрагмент 5'-ОН, представляет собой промежуточное вещество, полученное при помощи другого известного способа нуклеиновой кислоты, такого как описано в настоящей заявке. Согласно другим вариантам осуществления нуклеозид, содержащий фрагмент 5'-ОН, представляет собой промежуточное вещество, полученное при помощи другого известного способа синтеза нуклеиновой кислоты, включающего один или более циклов, проиллюстрированных на схеме I. Согласно другим вариантам осуществления нуклеозид, содержащий фрагмент 5'-ОН, представляет собой промежуточное вещество, полученное при помощи другого известного способа синтеза нуклеиновой кислоты, включающего один или более циклов, проиллюстрированных на схеме I-b, I-c или I-d.

[001028] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложены способы синтеза олигонуклеотидов, в которых применяют стабильные и коммерчески доступные вещества в качестве исходных веществ. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложены способы синтеза олигонуклеотидов для получения стерео контролируемых производных олигонуклеотидов с модифицированным атомом фосфора с применением ахирального исходного вещества.

[001029] Согласно некоторым вариантам осуществления способ согласно настоящему раскрытию не приводит к разложению на стадиях удаления защитных групп. Кроме того, способ не требует применения специальных блокирующих агентов для получения производных олигонуклеотидов с модифицированным атомом фосфора.

Реагент конденсации

[001030] Реагенты конденсации (C_R), подходящие в соответствии со способами согласно настоящему изобретению, имеют любую из следующих общих формул:

где Z¹, Z², Z³, Z⁴, Z⁵, Z⁶, Z⁷, Z⁸ и Z⁹ независимо представляют собой необязательно замещенную группу, выбранную из алкила, аминоалкила, циклоалкила, гетероцикла, циклоалкилалкила, гетероциклоалкила, арила, гетероарила, алкилокси, арилокси или гетероарилокси, или любые из Z² и Z³, Z⁵ и Z⁶, Z⁷ и Z⁸, Z⁸ и Z⁹, Z⁹ и Z⁷ или Z⁷ и Z⁸ и Z⁹ объединены с образованием 3-20-членного алициклического или гетероциклического кольца; Q^- представляет собой анион; a LG представляет собой уходящую группу.

[001031] Согласно некоторым вариантам осуществления противоион в реагенте конденсации C_R представляет собой Cl^-, Br^-, BF₄^-, PF₆^-, TfO^-, Tf₂N^-, AsF₆^-, ClO₄^- или SbF₆^-, где Tf представляет собой CF₃SO₂. Согласно некоторым вариантам осуществления уходящая группа в реагенте конденсации C_R представляет собой F, Cl, Br, I, 3-нитро-1,2,4-триазол, имидазол, алкилтриазол, тетразол, пентафторбензол или 1-гидроксибензотриазол.

[001032] Примеры реагентов конденсации, применяемых в соответствии со способами согласно настоящему раскрытию включают, но не ограничиваются ими, пентафторбензоилхлорид, карбонилдиимидазол (CDI), 1-мезитиленсульфонил-3-нитротриазол (MSNT), гидрохлорид 1-этил-3-(3'-диметиламинопропил)карбодиимида (EDCI-HCl), гексафторфосфат бензотриазол-1-илокси-трис(диметиламино)фосфония (РуВОР), хлорид N,N'-бис(2-оксо-3-оксазолидин)фосфина (BopCl), гексафторфосфат 2-(1H-7-азабензотриазол-1-ил)-1,1,3,3-тетраметилурония (HATU) и гексафторфосфат О-бензотриазол-N,N,N',N'-тетраметилурония (HBTU), DIPCDI; бромид N,N'-бис(2-оксо-3-оксазолидинил)фосфина (BopBr), гексафторфосфат 1,3-диметил-2-(3-нитро-1,2,4-триазол-1-ил)-2-пирролидин-1-ил-1,3,2-диазафосфолидиния (MNTP), гексафторфосфат 3-нитро-1,2,4-триазол-1-ил-трис(пирролидин-1-ил)фосфония (PyNTP), гексафторфосфат бромтрипирролидинофосфония (PyBrOP); тетрафтор борат O-(бензотриазол-1-ил)-N,N,N',N'-тетраметилурония (TBTU); и гексафторфосфат тетраметилфторформамидиния (TFFH). Согласно определенным вариантам осуществления противоион в реагенте конденсации C_R представляет собой Cl^-, Br^-, BF₄^-, PF₆^-, TfO^-, Tf₂N^-, AsF₆^-, ClO₄^- или SbF₆^-, где Tf представляет собой CF₃SO₂.

[001033] Согласно некоторым вариантам осуществления реагент конденсации представляет собой 1-(2,4,6-триизопропилбензолсульфонил)-5-(пиридин-2-ил)тетразолид, пивалоилхлорид, гексафторфосфат бромтриспирролидинофосфония, хлорид N,N'-бис(2-оксо-3-оксазолидинил)фосфина (BopCl) или 2-хлор-5,5-диметил-2-оксо-1,3,2-диоксафосфинат. Согласно некоторым вариантам осуществления реагент конденсации представляет собой хлорид N,N'-бис(2-оксо-3-оксазолидинил)фосфина (BopCl). Согласно некоторым вариантам осуществления реагент конденсации выбран из тех, что описаны в международной заявке на патент WO/2006/066260).

[001034] Согласно некоторым вариантам осуществления реагент конденсации представляет собой гексафторфосфат 1,3-диметил-2-(3-нитро-1,2,4-триазол-1-ил)-2-пирролидин-1-ил-1,3,2-диазафосфолидиния (MNTP) или гексафторфосфат 3-нитро-1,2,4-триазол-1-ил-трис(пирролидин-1-ил)фосфония (PyNTP):

Выбор основания и сахара для неклеозидного партнера по реакции сочетания

[001035] Согласно настоящему описанию нуклеозидные партнеры по реакции сочетания для применения в соответствии со способами согласно настоящему раскрытию могут быть одинаковыми или могут отличаться друг от друга. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеозидные партнеры по реакции сочетания для применения в синтезе предложенного олигонуклеотида имеют одинаковую структуру и/или стереохимическую конфигурацию друг с другом. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый нуклеозидный партнер по реакции сочетания для применения в синтезе предложенного олигонуклеотида имеет структуру и/или стереохимическую конфигурацию, отличающуюся от определенных других нуклеозидных партнеров по реакции сочетания в олигонуклеотиде. Примеры нуклеиновых оснований и сахаров для применения в соответствии со способами согласно настоящему раскрытию описаны в настоящей заявке. Специалистам в родственных областях химии и синтеза будет понятно, что любая комбинация нуклеиновых оснований и сахаров, описанных в настоящей заявке, предложена для применения в соответствии со способами согласно настоящему раскрытию.

Стадия сочетания:

[001036] Примеры способов сочетания и хиральные реагенты и реагенты конденсации для применения согласно настоящему изобретению приведены, помимо прочего, в Wada I (патент Японии 4348077; международные заявки на патент WO 2005/014609; WO 2005/092909), Wada II (WO 2010/064146), Wada III (WO 2012/039448) и хиральный контроль (международная заявка на патент WO 2010/064146). Хиральные нуклеозидные партнеры по реакции сочетания для применения согласно настоящему раскрытию также называют в настоящем описании «амидиты Wada». Согласно некоторым вариантам осуществления партнер по реакции сочетания имеет структуру где B^PRO представляет собой защищенное нуклеиновое основание. Согласно некоторым вариантам осуществления партнер по реакции сочетания имеет структуру где B^PRO представляет собой защищенное нуклеиновое основание. Согласно некоторым вариантам осуществления партнер по реакции сочетания имеет структуру где B^PRO представляет собой защищенное нуклеиновое основание, и R¹ такой, как определено и описано в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления партнер по реакции сочетания имеет структуру где B^PRO представляет собой защищенное нуклеиновое основание, и R¹ такой, как определено и описано в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой необязательно замещенный С_1-6 алкил. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой Me.

[001037] Пример хиральных фосфорамидитов в качестве партнера по реакции сочетания изображен ниже:

Дополнительные примеры описаны в Хиральном контроле (международная заявка на патент WO 2010/064146).

[001038] Один из способов, применяемых для синтеза партнера по реакции сочетания, изображен ниже на схеме II.

Схема II. Пример способа синтеза партнера по реакции сочетания.

[001039] Согласно некоторым вариантам осуществления стадия сочетания включает взаимодействие свободной гидроксильной группы нуклеотидного звена олигонуклеотида с нуклеозидным партнером по реакции сочетания в условиях, подходящих для протекания сочетания. Согласно некоторым вариантам осуществления стадии сочетания предшествует стадия удаления блокирующей группы. Например, согласно некоторым вариантам осуществления 5'-гидроксильная группа растущего олигонуклеотида заблокирована (т.е. является защищенной), и для последующего взаимодействия с нуклеозидным партнером по реакции сочетания необходимо удаление блокирующей группы.

[001040] После удаления блокирующей группы соответствующей гидроксильной группы растущего олигонуклеотида подложку промывают и сушат для последующей доставки раствора, содержащего хиральный реагент, и раствора, содержащего активатор. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный реагент и активатор доставляют одновременно. Согласно некоторым вариантам осуществления совместная доставка включает доставку количества хирального реагента в растворе (например, в растворе фосфорамидита) и количества активатора в растворе (например, в растворе СМРТ) в полярном апротонном растворителе, таком как нитрилсодержащий растворитель (например, ацетонитрил).

[001041] Согласно некоторым вариантам осуществления стадия сочетания обеспечивает композицию неочищенного продукта, в которой хиральный фосфитный продукт содержится в диастереомерном избытке >95%. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный фосфитный продукт содержится в диастереомерном избытке >96%. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный фосфитный продукт содержится в диастереомерном избытке >97%. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный фосфитный продукт содержится в диастереомерном избытке >98%. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральный фосфитный продукт содержится в диастереомерном избытке >99%.

Стадия введения блокирующей группы:

[001042] Предложенные способы получения олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью включают стадию введения блокирующей группы. Согласно некоторым вариантам осуществления стадия введения блокирующей группы включает единственную стадию. Согласно некоторым вариантам осуществления стадия введения блокирующей группы включает две стадии. Согласно некоторым вариантам осуществления стадия введения блокирующей группы включает более двух стадий.

[001043] Согласно некоторым вариантам осуществления стадия введения блокирующей группы включает стадии введения блокирующей группы к свободному амину хирального вспомогательного вещества и введения блокирующей группы к любым оставшимся непрореагировавшим 5'-гидроксильным группам. Согласно некоторым вариантам осуществления свободный амин хирального вспомогательного вещества и непрореагировавшие 5'-гидроксильные группы защищают при помощи одинаковых блокирующих групп. Согласно некоторым вариантам осуществления свободный амин хирального вспомогательного вещества и непрореагировавшие 5'-гидроксильные группы защищают при помощи различных блокирующих групп. Согласно определенным вариантам осуществления введение различных блокирующих групп обеспечивает селективное удаление одной блокирующей группы, но не другой, во время синтеза олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления введение обеих блокирующих групп проводят одновременно. Согласно некоторым вариантам осуществления введение обеих блокирующих групп проводят последовательно.

[001044] Согласно определенным вариантам осуществления введение блокирующей группы, которое проводят последовательно, включает первую стадию введения блокирующей группы свободного амина и последующую вторую стадию введения блокирующей группы свободной 5'-гидр оке ильной группы, где блокировку свободного амина и 5'-гидроксильной группы проводят с использованием одинаковых блокирующих групп. Например, согласно некоторым вариантам осуществления блокировку свободного амина хирального вспомогательного вещества проводят с использованием ангидрида (например, ангидрида феноксиуксусной кислоты, т.е. Рас₂О), а затем при помощи того же ангидрида проводят блокировку 5'-гидроксильной группы. Согласно определенным вариантам осуществления блокировку 5'-гидроксильной группы проводят с использованием того же ангидрида, но в отличающихся условиях (например, в присутствии одного или более дополнительных реагентов). Согласно некоторым вариантам осуществления введение блокирующей группы 5'-гидроксильной группы проводят в присутствии основного амина в эфирном растворителе (например, NMI (N-метилимидазол) в ТГФ). Фразу «блокирующая группа» используют в настоящем описании взаимозаменяемо с фразами «защитная группа» и «группа блокировки».

[001045] Согласно некоторым вариантам осуществления блокирующая группа амина характеризуется тем, что она эффективно блокирует амин и, таким образом, предотвращает перегруппировку и/или разложение промежуточных фосфитных частиц. Согласно некоторым вариантам осуществления блокирующую группу выбирают с учетом возможности защиты амина хирального вспомогательного вещества для предотвращения внутримолекулярного отщепления межнуклеотидной связи по атому фосфора.

[001046] Согласно некоторым вариантам осуществления блокирующая группа 5'-гидроксильной группы характеризуется тем, что она эффективно блокирует гидроксильную группу и, таким образом, предотвращает получение «шортмеров» (англ. «shortmer»), например, примесей «n-m» (тип представляют собой целые числа, причем m<n; n представляет собой количество оснований в целевом олигонуклеотиде), образующихся в результате взаимодействия с участием цепи олигонуклеотида, которая не вступает во взаимодействие во время первого цикла, но вступает во взаимодействие в одном или более последующих циклах. Наличие указанных шортмеров, в частности «n-1» отрицательно влияет на чистоту неочищенного олигонуклеотида и делает трудоемкой и в целом низкоэффективной конечную очистку олигонуклеотида.

[001047] Согласно некоторым вариантам осуществления конкретную блокирующую группу выбирают с учетом способности опосредовать взаимодействия определенного типа в определенных условиях. Например, согласно некоторым вариантам осуществления блокирующую группу выбирают с учетом способности опосредовать реакцию элиминирования Е1, где происходит отщепление блокирующей группы и/или вспомогательного вещества от растущего олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления блокирующую группу выбирают с учетом способности опосредовать реакцию элиминирования Е2, где происходит отщепление блокирующей группы и/или вспомогательного вещества от растущего олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления блокирующую группу выбирают с учетом способности опосредовать реакцию β-элиминирования, где происходит отщепление блокирующей группы и/или вспомогательного вещества от растущего олигонуклеотида.

Стадия модификации:

[001048] Согласно настоящему описанию фразы «стадия модификации», «модифицирующая стадия» и «стадия модификации Р», которые используют взаимозаменяемо, относятся в целом к любой одной или более стадиям, применяемым для встраивания модифицированной межнуклеотидной связи. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированная межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I. Стадию модификации Р согласно настоящему раскрытию проводят во время получения предложенного олигонуклеотида, но не после завершения получения предложенного олигонуклеотида. Таким образом, можно модифицировать атом фосфора связи каждого нуклеотидного звена предложенного олигонуклеотида по отдельности во время цикла встраивания нуклеотидного звена.

[001049] Согласно некоторым вариантам осуществления подходящий реагент модификации Р представляет собой серосодержащий электрофил, селеносодержащий электрофил, кислородсодержащий электрофил, борирующий реагент или азидный реагент.

[001050] Например, согласно некоторым вариантам осуществления селеносодержащий реагент представляет собой элементный селен, соль селена или замещенный диселенид. Согласно некоторым вариантам осуществления кислородсодержащий электрофил представляет собой элементный кислород, пероксид или замещенный пероксид. Согласно некоторым вариантам осуществления борирующий агент представляет собой боран-амин (например, N,N-диизопропилэтиламин (ВН₃⋅DIPEA), боран-пиридин (ВН₃⋅Ру), боран-2-хлорпиридин (ВН₃⋅СРу), боран-анилин (ВН₃⋅An)), реагент боран-простой эфир (например, боран-тетрагидрофуран (ВН₃⋅ТГФ)), реагент боран-диалкилсульфид (например, ВН₃⋅Me₂S), анилин-цианоборан или трифенилфосфин-карбоалкоксиборан. Согласно некоторым вариантам осуществления азидный реагент содержит азидную группу, которую впоследствии можно восстанавливать до аминогруппы.

[001051] Согласно некоторым вариантам осуществления реагент модификации Р представляет собой реагент сульфирования, такой как описано в настоящей заявке. Согласно некоторым вариантам осуществления стадия модификации включает сульфирование атома фосфора для обеспечения фосфоротиоатной связи или фосфоротиоатной сложной триэфирной связи. Согласно некоторым вариантам осуществления стадия модификации обеспечивает олигонуклеотид, содержащий межнуклеотидные связи формулы I.

[001052] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложены реагенты сульфирования и способы их получения и применения. [001053] Согласно некоторым вариантам осуществления указанные реагенты сульфирования представляют собой тиосульфонатные реагенты. Согласно некоторым вариантам осуществления тиосульфонатный реагент имеет структуру формулы S-I:

где:

R^s1 представляет собой R и

каждый из R, L и R¹ независимо является таким, как определено и описано выше в настоящей заявке.

[001054] Согласно некоторым вариантам осуществления реагент сульфирования представляет собой бис(тиосульфонатный) реагент. Согласно некоторым вариантам осуществления бис(тиосульфонатный) реагент имеет структуру формулы S-II:

где каждый из R^s1 и L независимо является таким, как определено и описано выше в настоящей заявке.

[001055] Согласно приведенному выше общему определению R^s1 представляет собой R, где R является таким, как определено и описано выше в настоящей заявке. Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1 представляет собой необязательно замещенную алифатическую группу, арил, гетероциклил или гетероарил. Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1 представляет собой необязательно замещенный алкил. Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1 представляет собой необязательно замещенный алкил. Согласно некоторым вариантам осуществления R ^s1 представляет собой метил. Согласно некоторым вариантам осуществления R ^s1 представляет собой цианометил. Согласно некоторым вариантам осуществления R ^s1 представляет собой нитрометил. Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1 представляет собой необязательно замещенный арил. Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1 представляет собой необязательно замещенный фенил. Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1 представляет собой фенил. Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1 представляет собой n-нитрофенил. Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1 представляет собой n-метилфенил. Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1 представляет собой n-хлорфенил. Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1 представляет собой о-хлорфенил. Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1 представляет собой 2,4,6-трихлорфенил. Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1 представляет собой пентафторфенил. Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1 представляет собой необязательно замещенный гетероциклил. Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1 представляет собой необязательно замещенный гетероарил.

[001056] Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1-S(O)₂S- представляет собой (MTS). Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1-S(O)₂S- представляет собой (TTS). Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1-S(O)₂S- представляет собой (NChPheTS). Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1-S(O)₂S- представляет собой (р-ClPheTS). Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1-S(O)₂S- представляет собой (o-ClPheTS). Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1-S(O)₂S- представляет собой (2,4,6-TriClPheTS). Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1-S(O)₂S- представляет собой (PheTS). Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1-S(O)₂S- представляет собой (PFPheTS). Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1-S(O)₂S- представляет собой (a-CNMTS). Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1-S(O)₂S- представляет собой (a-NO₂MTS). Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1-S(O)₂S- представляет собой (a-CF₃MTS). Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1-S(O)₂S- представляет собой (а-CF₃TS). Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1-S(O)₂S- представляет собой (a-CHF₂TS). Согласно некоторым вариантам осуществления R^s1-S(O)₂S- представляет собой (a-CH₂FTS).

[001057] Согласно некоторым вариантам осуществления реагент сульфирования имеет структуру S-I или S-II, где L представляет собой -S-R^L3- или -S-C(O)-R^L3-. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой -S-R^L3- или -S-C(O)-R^L3-, где R^L3 представляет собой необязательно замещенный C₁-С₆ алкилен. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой -S-R^L3- или -S-C(O)-R^L3-, где R^L3 представляет собой необязательно замещенный C₁-С₆ алкенилен. Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой -S-R^L3- или -S-C(O)-R^L3-, где R^L3 представляет собой необязательно замещенный C₁-С₆ алкилен, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на необязательно замещенный C₁-C₆ алкенилен, арилен или гетероарилен. Согласно некоторым вариантам осуществления R^L3 представляет собой необязательно замещенный -S-(C₁-C₆ алкенилен)-, -S-(C₁-C₆ алкинилен)-, -S-(C₁-С₆ алкилен)-арилен-(С₁-С₆ алкилен)-, -S-СО-арилен-(С₁-С₆ алкилен)- или -S-CO-(C₁-С₆ алкилен)-арилен-(С₁-С₆ алкилен)-. Согласно некоторым вариантам осуществления реагент сульфирования имеет структуру S-I или S-II, где L представляет собой -S-R^L3- или -S-C(O)-R^L3-, а атом серы присоединен к R¹.

[001058] Согласно некоторым вариантам осуществления реагент сульфирования имеет структуру S-I или S-II, где L представляет собой алкилен, алкенилен, арилен или гетероарилен.

[001059] Согласно некоторым вариантам осуществления реагент сульфирования имеет структуру S-I или S-II, где L представляет собой или Согласно некоторым вариантам осуществления L представляет собой где атом серы соединен с R¹. Согласно некоторым вариантам осуществления реагент сульфирования имеет структуру S-I или S-II, где R¹ представляет собой или Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой или где атом серы соединен с L. Согласно некоторым вариантам осуществления реагент сульфирования имеет структуру S-I или S-II, где L представляет собой причем атом серы соединен с R¹; a R¹ представляет собой причем атом серы соединен с L.

[001060] Согласно некоторым вариантам осуществления реагент сульфирования имеет структуру S-I или S-II, где R¹ представляет собой -S-R^L2, причем R^L2 является таким, как определено выше и описано в настоящей заявке. Согласно некоторым вариантам осуществления R^L2 представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из -S-(C₁-С₆ алкилен) гетероциклила, -S-(C₁-C₆ алкенилен) гетероциклила, -S-(C₁-C₆ алкилен)-N(R')₂, -S-(C₁-C₆ алкилен)-N(R')₃, где каждый R' является таким, как определено выше и описано в настоящей заявке.

[001061] Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ представляет собой -R^L3-S-S-R^L2, где каждая переменная независимо является такой, как определено выше и описано в настоящей заявке. Согласно некоторым вариантам осуществления -L-R¹ представляет собой -R^L3-C(O)-S-S-R^L2, где каждая переменная независимо является такой, как определено выше и описано в настоящей заявке.

[001062] Примеры бис(тиосульфонатных) реагентов формулы S-II изображены ниже:

Согласно некоторым вариантам осуществления реагент сульфирования представляет собой соединение, имеющее одну из следующих формул:

S₈, R^s2-S-S-R^s3 или R^s2-S-X^s-R^s3,

где:

каждый из R^s2 и R^s3 независимо представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из алифатической группы, аминоалкила, карбоциклила, гетероциклила, гетероциклоалкила, арила, гетероарила, алкилокси, арилокси, гетероарилокси, ацила, амида, имида или тиокарбонила; или

R^s2 и R^s3 объединены с атомами, к которым они присоединены, с образованием необязательно замещенного гетероциклического или гетероарильного кольца;

X^s представляет собой -S(O)₂-, -О- или -N(R')- и

R' является таким, как определено и описано выше в настоящей заявке.

[001063] Согласно некоторым вариантам осуществления реагент сульфирования представляет собой S₈, Согласно некоторым вариантам осуществления реагент сульфирования представляет собой S₈, Согласно некоторым вариантам осуществления реагент сульфирования представляет собой

[001064] Примеры реагентов сульфирования изображены ниже:

[001065] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный реагент сульфирования применяют для модификации Н-фосфоната. Например, согласно некоторым вариантам осуществления Н-фосфонатный олигонуклеотид синтезируют, например, при помощи способов, описанных в Wada I или Wada II, и модифицируют с применением реагента сульфирования формулы S-I или S-II:

где каждый из R^s1, L и R¹ являются такими, как описано и определено выше в настоящей заявке.

[001066] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложен способ синтеза фосфоротиоатного сложного триэфира, включающий стадии:

i) взаимодействия Н-фосфоната со структурой:

где каждый из W, Y и Z является таким, как описано и определено выше в настоящей заявке, с силилирующим агентом для обеспечения силилоксифосфоната; и

ii) взаимодействия силилоксифосфоната с реагентом сульфирования со структурой S-I или S-II:

для обеспечения фосфоротиоатного сложного триэфира.

[001067] Согласно некоторым вариантам осуществления для модификации межнуклеотидной связи применяют селеносодержащий электрофил вместо реагента сульфирования. Согласно некоторым вариантам осуществления селеносодержащий электрофил представляет собой соединение, имеющее одну из следующих формул:

Se, R^s2-Se-Se-R^s3 или R^s2-Se-X^s-R^s3,

где:

каждый из R^s2 и R^s3 независимо представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из алифатической группы, аминоалкила, карбоциклила, гетероциклила, гетероциклоалкила, арила, гетероарила, алкилокси, арилокси, гетероарилокси, ацила, амида, имида или тиокарбонила; или

R^s2 и R^s3 объединены с атомами, к которым они присоединены, с образованием необязательно замещенного гетероциклического или гетероарильного кольца;

X^s представляет собой -S(O)₂-, -О- или -N(R')-; и

R' является таким, как определено и описано выше в настоящей заявке.

[001068] Согласно другим вариантам осуществления селеносодержащий электрофил представляет собой соединение, выбранное из Se, KSeCN, Согласно некоторым вариантам осуществления селеносодержащий электрофил представляет собой Se или

[001069] Согласно некоторым вариантам осуществления реагент сульфирования для применения согласно настоящему раскрытию характеризуется тем, что фрагмент, переносимый на атом фосфора во время сульфирования, представляет собой замещенный атом серы (например, -SR), но не просто атом серы (например, -S^- или =S).

[001070] Согласно некоторым вариантам осуществления реагент сульфирования для применения согласно настоящему раскрытию характеризуется тем, что активность реагента можно регулировать путем модификации реагента определенными электроно акцепторными или до норны ми группами.

[001071] Согласно некоторым вариантам осуществления реагент сульфирования для применения согласно настоящему раскрытию характеризуется тем, что он является кристаллическим. Согласно некоторым вариантам осуществления реагент сульфирования для применения согласно настоящему раскрытию характеризуется тем, что он имеет высокую степень кристалличности. Согласно определенным вариантам осуществления реагент сульфирования для применения согласно настоящему раскрытию характеризуется простотой очистки реагента, например, путем кристаллизации. Согласно определенным вариантам осуществления реагент сульфирования для применения согласно настоящему раскрытию характеризуется тем, что он по существу не содержит серосодержащие примеси. Согласно некоторым вариантам осуществления реагенты сульфирования, которые по существу не содержат серосодержащие примеси, имеют увеличенную эффективность.

[001072] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит одну или более фосфатных сложных диэфирных связей. Для синтеза указанных олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью одну или более стадий модификации необязательно заменяют на стадию окисления для встраивания соответствующих фосфатных сложных диэфирных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления стадию окисления проводят аналогично традиционным способам синтеза олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления стадия окисления включает применение I₂. Согласно некоторым вариантам осуществления стадия окисления включает применение I₂ и пиридина. Согласно некоторым вариантам осуществления стадия окисления включает применение 0,02М I₂ в системе сорастворителей ТГФ/пиридин/вода (70:20:10 (об./об./об.)). Пример цикла изображен на схеме I-c.

[001073] Согласно некоторым вариантам осуществления фосфоротиоат непосредственно образуется путем сульфирования с помощью реагентов для сульфирования, например, 3-фенил-1,2,4-дитиазолин-5-она. Согласно некоторым вариантам осуществления после непосредственной вставки фосфоротиоата, хиральная вспомогательная группа остается присоединенной к межнуклеотидному атому фосфора. Согласно некоторым вариантам осуществления требуется дополнительная стадия удаления защитной группы для удаления хирального вспомогательного вещества (например, для хирального вспомогательного агента типа DPSE, с использованием TBAF, HF-Et3N и т.д.).

[001074] Согласно некоторым вариантам осуществления предшественник фосфоротиоата применяют для синтеза олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащих фосфоротиоатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления указанный предшественник фосфоротиоата представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления превращают в фосфоротиоатные сложные диэфирные связи при помощи стандартных способов удаления защитных групп/высвобождения после завершения цикла. Примеры дополнительно изображены ниже.

[001075] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит одну или более фосфатных сложных диэфирных связей и одну или более фосфоротиоатных сложных диэфирных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит одну или более фосфатных сложных диэфирных связей и одну или более фосфоротиоатных сложных диэфирных связей, где по меньшей мере одну фосфатную сложную диэфирную связь встраивают после всех фосфоротиоатных сложных диэфирных связей при способе синтеза в направлении от 3' до 5'. Для синтеза указанных олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью Согласно некоторым вариантам осуществления одну или более стадий модификации необязательно заменяют на стадию окисления для встраивания соответствующих фосфатных сложных диэфирных связей, а на место каждой будущей фосфоротиоатной сложной диэфирной связи встраивают предшественник фосфоротиоата. Согласно некоторым вариантам осуществления предшественник фосфоротиоата превращают в фосфоротиоатную сложную диэфирную связь после достижения желаемой длины олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления на стадии удаления защитной группы/высвобождения, проводимой в рамках цикла или после его завершения, происходит превращение предшественников фосфоротиоатов в фосфоротиоатные сложные диэфирные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления предшественник фосфоротиоата характеризуется тем, что его можно удалять по пути бета-отщепления. Согласно некоторым вариантам осуществления предшественник фосфоротиоата представляет собой Специалистам в данной области техники понятно, что одним из преимуществ применения предшественника фосфоротиоата, например, в способе синтеза является то, что является более стабильным по сравнению с фосфоротиоатом в определенных условиях.

[001076] Согласно некоторым вариантам осуществления предшественник фосфоротиоата представляет собой фосфорзащитную группу, такую как описано в настоящей заявке, например, 2-цианоэтил (СЕ или Cne), 2-триметилсилилэтил, 2-нитроэтил, 2-сульфонилэтил, метил, бензил, о-нитробензил, 2-(n-нитрофенил)этил (NPE или Npe), 2-фенилэтил, 3-(N-трет-бутилкарбоксамидо)-1-пропил, 4-оксопентил, 4-метилтио-1-бутил, 2-циано-1,1-диметилэтил, 4-N-метиламинобутил, 3-(2-пиридил)-1-пропил, 2-[N-метил-N-(2-пиридил)]аминоэтил, 2-(N-формил,N-метил)аминоэтил, 4-[N-метил-N-(2,2,2-трифторацетил)амино]бутил. Примеры дополнительно приведены ниже.

[001077] Как отмечалось выше, согласно некоторым вариантам осуществления сульфирования проводят в условиях, при которых происходит отщепление хирального реагента от растущего олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления сульфирования проводят в условиях, при которых не происходит отщепление хирального реагента от растущего олигонуклеотида.

[001078] Согласно некоторым вариантам осуществления реагент сульфирования растворяют в подходящем растворителе и доставляют в колонку. Согласно определенным вариантам осуществления растворитель представляет собой полярный апротонный растворитель, такой как нитрилсодержащий растворитель. Согласно некоторым вариантам осуществления растворитель представляет собой ацетонитрил. Согласно некоторым вариантам осуществления раствор реагента сульфирования получают путем смешения реагента сульфирования (например, тиосульфонатного производного, такого как описано в настоящей заявке) и BSTFA (N,O-бис-триметилснлилтрифторацетамида) в нитрилсодержащем растворителе (например, в ацетонитриле). Согласно некоторым вариантам осуществления BSTFA не включают в состав смеси. Например, авторы настоящего изобретения обнаружили, что реагенты сульфирования общей формулы R^s2-S-S(O)₂-R^s3, имеющие относительно более высокую реакционную способность, часто можно эффективно использовать в реакциях сульфирования без использования BSTFA. Исключительно в качестве примера авторы настоящего изобретения продемонстрировали, что если R^s2 представляет собой n-нитрофенил, a R^s3 представляет собой метил, то BSTFA не требуется. С учетом настоящего описания специалисты в данной области техники с легкостью смогут определять другие ситуации и/или реагенты сульфирования, для которых не требуется BSTFA.

[001079] Согласно некоторым вариантам осуществления стадию сульфирования проводят при комнатной температуре. Согласно некоторым вариантам осуществления стадию сульфирования проводят при более низких температурах, таких как примерно 0°С, примерно 5°С, примерно 10°С или примерно 15°С. Согласно некоторым вариантам осуществления стадию сульфирования проводят при повышенных температурах, составляющих более чем примерно 20°С.

[001080] Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение периода времени от примерно 1 минуты до примерно 120 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение периода времени от примерно 1 минуты до примерно 90 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение периода времени от примерно 1 минуты до примерно 60 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение периода времени от примерно 1 минуты до примерно 30 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение периода времени от примерно 1 минуты до примерно 25 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение периода времени от примерно 1 минуты до примерно 20 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение периода времени от примерно 1 минуты до примерно 15 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение периода времени от примерно 1 минуты до примерно 10 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение периода времени от примерно 5 минут до примерно 60 минут.

[001081] Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение примерно 5 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение примерно 10 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение примерно 15 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение примерно 20 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение примерно 25 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение примерно 30 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение примерно 35 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение примерно 40 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение примерно 45 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение примерно 50 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение примерно 55 минут. Согласно некоторым вариантам осуществления реакцию сульфирования проводят в течение примерно 60 минут.

[001082] Неожиданно было обнаружено, что определенные продукты, модифицированные путем сульфирования, полученные в соответствии со способами согласно настоящему раскрытию, обладают неожиданной стабильностью. Согласно некоторым вариантам осуществления продукты с неожиданной стабильностью представляют собой фосфоротиоатные сложные триэфиры. Согласно некоторым вариантам осуществления продукты с неожиданной стабильностью представляют собой олигонуклеотиды с контролируемой хиральностью, содержащие одну или более межнуклеотидных связей, имеющих структуру формулы I-c.

[001083] Специалистам в родственных областях техники должно быть понятно, что способы сульфирования, описанные в настоящей заявке, и реагенты сульфирования, описанные в настоящей заявке, также подходят с точки зрения модификации Н-фосфонатных олигонуклеотидов, таких как те, что описаны в заявке Wada II (WO 2010/064146).

[001084] Согласно некоторым вариантам осуществления реакция сульфирования на каждой стадии имеет эффективность сульфирования по меньшей мере примерно 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97% или 98%. Согласно некоторым вариантам осуществления реакция сульфирования обеспечивает неочищенную композицию динуклеотидного продукта, имеющую чистоту по меньшей мере 98%. Согласно некоторым вариантам осуществления реакция сульфирования обеспечивает композицию неочищенного тетрануклеотидного продукта, имеющего чистоту по меньшей мере 90%. Согласно некоторым вариантам осуществления реакция сульфирования обеспечивает композицию неочищенного додекануклеотидного продукта, имеющего чистоту по меньшей мере 70%. Согласно некоторым вариантам осуществления реакция сульфирования обеспечивает композицию неочищенного икозануклеотидного продукта, имеющего чистоту по меньшей мере 50%.

[001085] После завершения стадии модификации атома фосфора связи олигонуклеотид подвергают обработке на другой стадии удаления блокирующей группы перед введением в повторный цикл. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральное вспомогательное вещество остается в неизменном виде после сульфирования, а удаление блокирующей группы проводят на последующей стадии удаления блокирующей группы, которую обязательно проводят перед повторным введением в цикл. Способ удаления блокирующей группы, сочетания, введения блокирующей группы и модификации используют повторно до достижения желаемой длины растущего олигонуклеотида, после чего олигонуклеотид можно немедленно отщеплять от твердой подложки или оставлять на подложке для очистки, а после этого отщеплять. Согласно некоторым вариантам осуществления при одном или более нуклеотидных основаниях содержатся одна или более защитных групп, а отщепление олигонуклеотида от подложки и удаление защитных групп в основаниях проводят на одной стадии. Согласно некоторым вариантам осуществления при одном или более нуклеотидных основаниях содержатся одна или более защитных групп, а отщепление олигонуклеотида от подложки и удаление защитных групп в основаниях проводят более чем за одну стадию. Согласно некоторым вариантам осуществления удаление защитных групп и отщепление от подложки проводят в основных условиях с использованием, например, одного или более основных аминов. Согласно определенным вариантам осуществления один или более основных аминов содержат пропиламин. Согласно определенным вариантам осуществления один или более основных аминов содержат пиридин.

[001086] Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление от подложки и/или удаление защитных групп проводят при повышенной температуре от примерно 30°С до примерно 90°С. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление от подложки и/или удаление защитных групп проводят при повышенной температуре от примерно 40°С до примерно 80°С. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление от подложки и/или удаление защитных групп проводят при повышенной температуре от примерно 50°С до примерно 70°С. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление от подложки и/или удаление защитных групп проводят при повышенной температуре, составляющей примерно 60°С. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление от подложки и/или удаление защитных групп проводят при температуре окружающей среды.

[001087] Примеры способов очистки описаны в настоящей заявке и/или известны в родственных областях техники.

[001088] Следует отметить, что удаление хирального вспомогательного вещества от растущего олигонуклеотида во время каждого цикла является эффективным по меньшей мере по следующим причинам: (1) отсутствует необходимость удаления вспомогательного вещества на отдельной стадии по завершении синтеза олигонуклеотидов, когда к атому фосфора прикрепляют необязательно чувствительные функциональные группы; и (2) предотвращается получение нестабильных промежуточных веществ, содержащих фосфор и вспомогательную группу, подверженных протеканию побочных реакций и/или отрицательно влияющих на химизм последующих процессов. Таким образом, удаление хирального вспомогательного вещества во время каждого цикла увеличивает эффективность синтеза в целом.

[001089] Несмотря на то, что выше описана стадия удаления блокирующей группы в рамках цикла, дополнительные общие способы приведены ниже.

Стадия удаления блокирующих групп

[001090] Согласно некоторым вариантам осуществления стадии сочетания предшествует стадия удаления блокирующей группы. Например, согласно некоторым вариантам осуществления 5'-гидроксильная группа растущего олигонуклеотида является заблокированной (т.е. защищенной), и для проведения последующего взаимодействия с нуклеозидным партнером по реакции сочетания необходимо удалять блокирующую группу.

[001091] Согласно некоторым вариантам осуществления для удаления блокирующей группы используют подкисление. Согласно некоторым вариантам осуществления кислота представляет собой кислоту Бренстеда или кислоту Льюиса. Подходящими кислотами Бренстеда являются карбоновые кислоты, алкилсульфокислоты, арилсульфокислоты, фосфорную кислоту и ее производные, фосфоновую кислоту и ее производные, алкилфосфоновые кислоты и их производные, арилфосфоновые кислоты и их производные, фосфиновую кислоту, диалкилфосфиновые кислоты и диарилфосфиновые кислоты, которые имеют значение рКа (при 25°С в воде) от -0,6 (трифторуксусная кислота) до 4,76 (уксусная кислота) в органическом растворителе или воде (в случае 80% уксусной кислоты). Концентрация кислоты (от 1 до 80%), применяемой на стадии подкисления, зависит от кислотности кислоты. Необходимо учитывать силу кислоту, так как сильнокислотные условия приводят к депуринизации/депиримидинации, при которых происходит отщепление пуринильных или пиримидинильных оснований от кольца рибозы или кольца другого сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления кислота выбрана из R^a1COOH, R^a1SO₃H, R^a3SO₃H, где каждый из R^a1 и R^a2 независимо представляет собой водород или необязательно замещенный алкил или арил, a R^a3 представляет собой необязательно замещенный алкил или арил.

[001092] Согласно некоторым вариантам осуществления подкисление проводят с использованием кислоты Льюиса в органическом растворителе. Примеры таких подходящих кислот Льюиса представляют собой Zn(X^a)₂, где Х^а представляет собой Cl, Br, I или CF₃SO₃.

[001093] Согласно некоторым вариантам осуществления стадия подкисления включает добавление количества кислоты Бренстеда или кислоты Льюиса, которое является эффективным для удаления блокирующей группы, но не удаления пуриновых фрагментов в промежуточном веществе конденсации.

[001094] Кислоты, подходящие для стадии подкисления, также включают, но не ограничиваются ими, 10% фосфорную кислоту в органическом растворителе, 10% хлороводородную кислоту в органическом растворителе, 1% трифторуксусную кислоту в органическом растворителе, 3% дихлоруксусную кислоту или трихлоруксусную кислоту в органическом растворителе или 80% уксусную кислоту в воде. Концентрацию любой кислоты Бренстеда или Льюиса, используемой на указанной стадии, выбирают таким образом, чтобы концентрация кислоты не превышала концентрацию, обеспечивающую отщепление нуклеинового основания от фрагмента сахара.

[001095] Согласно некоторым вариантам осуществления подкисление включает добавление 1% трифторуксусной кислоты в органическом растворителе. Согласно некоторым вариантам осуществления подкисление включает добавление трифторуксусной кислоты с концентрацией от примерно 0,1% до примерно 8% в органическом растворителе. Согласно некоторым вариантам осуществления подкисление включает добавление 3% дихлоруксусной кислоты или трихлоруксусной кислоты в органическом растворителе. Согласно некоторым вариантам осуществления подкисление включает добавление дихлоруксусной или трихлоруксусной кислоты в концентрации от примерно 0,1% до примерно 10% в органическом растворителе. Согласно некоторым вариантам осуществления подкисление включает добавление 3% трихлоруксусной кислоты в органическом растворителе. Согласно некоторым вариантам осуществления подкисление включает добавление трихлоруксусной кислоты в концентрации от примерно 0,1% до примерно 10% в органическом растворителе. Согласно некоторым вариантам осуществления подкисление включает добавление 80% уксусной кислоты в воде. Согласно некоторым вариантам осуществления подкисление включает добавление уксусной кислоты в концентрации от примерно 50% до примерно 90% или от примерно 50% до примерно 80%, от примерно 50% до примерно 70%, от примерно 50% до примерно 60%, от примерно 70% до примерно 90% в воде. Согласно некоторым вариантам осуществления подкисление включает дополнительное добавление катионных очистителей в кислотный растворитель. Согласно определенным вариантам осуществления катионные очистители могут представлять собой триэтилсилан или триизопропилсилан. Согласно некоторым вариантам осуществления блокирующую группу удаляют путем подкисления, включающего добавление 1% трифторуксусной кислоты в органическом растворителе. Согласно некоторым вариантам осуществления блокирующую группу удаляют путем подкисления, включающего добавление 3% дихлоруксусной кислоты в органическом растворителе. Согласно некоторым вариантам осуществления блокирующую группу удаляют путем подкисления, включающего добавление 3% трихлоруксусной кислоты в органическом растворителе. Согласно некоторым вариантам осуществления блокирующую группу удаляют путем подкисления, включающего добавление 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане.

[001096] Согласно определенным вариантам осуществления способы согласно настоящему раскрытию проводят в синтезаторе, а стадия удаления блокирующей группы гидроксильной группы растущего олигонуклеотида включает доставку количества растворителя в колонку синтезатора, где колонка содержит твердую подложку, к которой присоединен олигонуклеотид. Согласно некоторым вариантам осуществления растворитель представляет собой галогенированный растворитель (например, дихлорметан). Согласно определенным вариантам осуществления растворитель содержит количество кислоты. Согласно некоторым вариантам осуществления растворитель содержит количество органической кислоты, такой как, например, трихлоруксусная кислота. Согласно определенным вариантам осуществления кислота содержится в количестве от примерно 1% до примерно 20% (масс./об.). Согласно определенным вариантам осуществления кислота содержится в количестве от примерно 1% до примерно 10% (масс./об.). Согласно определенным вариантам осуществления кислота содержится в количестве от примерно 1% до примерно 5% (масс./об.). Согласно определенным вариантам осуществления кислота содержится в количестве от примерно 1 до примерно 3% (масс./об.). Согласно определенным вариантам осуществления кислота содержится в количестве примерно 3% (масс./об.). Способы удаления блокирующей группы гидроксильной группы дополнительно описаны в настоящей заявке. Согласно некоторым вариантам осуществления кислота содержится в дихлорметане в концентрации 3% (масс./об.).

[001097] Согласно некоторым вариантам осуществления хиральное вспомогательное вещество удаляют перед проведением стадии удаления блокирующей группы. Согласно некоторым вариантам осуществления хиральное вспомогательное вещество удаляют на стадии удаления блокирующей группы.

[001098] Согласно некоторым вариантам осуществления цикл завершают до проведения стадии удаления блокирующей группы. Согласно некоторым вариантам осуществления цикл завершают после стадии удаления блокирующей группы.

Общие условия удаления блокирующей группы/защитной группы

[001099] Функциональные группы, такие как гидроксильные или амино-фрагменты, расположенные при нуклеиновых основаниях или фрагментах сахаров, традиционно защищают во время синтеза с использованием блокирующих (защитных) групп (фрагментов), а затем удаляют блокирующих группы. В целом, блокирующая группа делает химическую функциональную группу молекулы инертной к определенным условиям взаимодействия, и впоследствии ее можно удалять от указанной функциональной группы, не нанося существенных повреждений остатку молекулы (см., например, Green and Wuts, Protective Groups in Organic Synthesis, 2nd Ed., John Wiley & Sons, New York, 1991). Например, аминогруппы можно блокировать с использованием групп, блокирующих азот, таких как фталимидо, 9-флуоренилметоксикарбонил (FMOC), трифенилметилсульфенил, t-BOC, 4,4'-диметокситритил (DMTr), 4-метокситритил (MMTr), 9-фенилксантин-9-ил (пиксил), тритил (Tr) или 9-(n-метоксифенил)ксантин-9-ил (МОХ). Карбоксильные группы можно защищать в виде ацетильных групп. Гидроксигруппы можно защищать с использованием групп, таких как тетрагидропиранил (ТНР), трет-бутилдиметилсилил (TBDMS), 1-[(2-хлор-4-метил)фенил]-4-метоксипиперидин-4-ил (Ctmp), 1-(2-фторфенил)-4-метоксипиперидин-4-ил (Fpmp), 1-(2-хлорэтокси)этил, 3-метокси-1,5-дикарбометоксипентан-3-ил (MDP), бис(2-ацетоксиэтокси)метил (АСЕ), триизопропилсилилоксиметил (ТОМ), 1-(2-цианоэтокси)этил (СЕЕ), 2-цианоэтоксиметил (СЕМ), [4-(N-дихлорацетил-N-метиламино)бензилокси]метил, 2-цианоэтил (CN), пивало илоксиметил (PivOM), левунилоксиметил (ALE). Существует описание и других типовых гидроксил-блокирующих групп (см., например, Beaucage et al., Tetrahedron, 1992, 46, 2223). Согласно некоторым вариантам осуществления гидроксил-блокирующие группы представляют собой группы, лабильные к действию кислот, такие как тритил, монометокситритил, диметокситритил, триметокситритил, 9-фенилксантин-9-ил (пиксил) и 9-(п-метоксифенил)ксантин-9-ил (МОХ). Химические функциональные группы также можно блокировать за счет введения их в виде предшественников. Таким образом, азидогруппу можно рассматривать как блокированную форму амина, так как азидогруппа легко превращается в амин. Известны и другие типовые защитные группы, применяемые при синтезе нуклеиновых кислот (см., например, Agrawal et al., Protocols for Oligonucleotide Conjugates, Eds., Humana Press, New Jersey, 1994, Vol.26, pp.1-72).

[001100] Известно применение различных способов для удаления блокирующих групп нуклеиновых кислот.Согласно некоторым вариантам осуществления удаляют все блокирующие группы. Согласно некоторым вариантам осуществления удаляют часть блокирующих групп.Согласно некоторым вариантам осуществления условия взаимодействия регулируют для селективного удаления определенных блокирующих групп.

[001101] Согласно некоторым вариантам осуществления блокирующие группы нуклеиновых оснований, если они присутствуют, можно отщеплять с использованием кислотного реагента после получения предложенного олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления блокирующие группы нуклеиновых оснований, если они присутствуют, можно отщеплять в условиях, которые не являются ни кислотными, ни основными, например, их можно отщеплять с использованием фторидных солей или комплексов фтороводородной кислоты. Согласно некоторым вариантам осуществления блокирующие группы нуклеиновых оснований, если они присутствуют, можно отщеплять в присутствии основания или основного растворителя после получения предложенного олигонуклеотида. Согласно определенным вариантам осуществления одна или более блокирующих групп нуклеинового основания характеризуются тем, что их можно отщеплять в присутствии основания или основного растворителя после получения предложенного олигомера, но они являются стабильными в определенных условиях на одной или более стадиях удаления защитных групп, проводимых ранее при получении предложенного олигонуклеотида.

[001102] Согласно некоторым вариантам осуществления блокирующие группы нуклеиновых оснований не требуются. Согласно некоторым вариантам осуществления блокирующие группы нуклеиновых оснований требуются. Согласно некоторым вариантам осуществления для определенных нуклеиновых оснований требуются одна или более блокирующих групп, тогда как для других нуклеиновых оснований одна или более блокирующих групп не требуются.

[001103] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид отщепляют от твердой подложки после синтеза. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление от твердой подложки включает применение пропиламина. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление от твердой подложки включает применение пропиламина в пиридине. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление от твердой подложки включает применение 20% пропиламина в пиридине. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление от твердой подложки включает применение пропиламина в безводном пиридине. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление от твердой подложки включает применение 20% пропиламина в безводном пиридине. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление от твердой подложки включает применение полярного апротонного растворителя, такого как ацетонитрил, NMP, ДМСО, сульфон и/или лутидин. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление от твердой подложки включает применение растворителя, например, полярного апротонного растворителя, и одного или более первичных аминов (например, С_1-10 амина) и/или одного или более соединений, выбранных из метоксиламина, гидразина и чистого безводного аммиака.

[001104] Согласно некоторым вариантам осуществления удаление защитных групп олигонуклеотида включает применение пропиламина. Согласно некоторым вариантам осуществления удаление защитных групп олигонуклеотида включает применение пропиламина в пиридине. Согласно некоторым вариантам осуществления удаление защитных групп олигонуклеотида включает применение 20% пропиламина в пиридине. Согласно некоторым вариантам осуществления удаление защитных групп олигонуклеотида включает применение пропиламина в безводном пиридине. Согласно некоторым вариантам осуществления удаление защитных групп олигонуклеотида включает применение 20% пропиламина в безводном пиридине.

[001105] Согласно некоторым вариантам осуществления удаление защитных групп олигонуклеотида проводят во время отщепления.

[001106] Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят примерно при комнатной температуре. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят при повышенной температуре. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят при температуре более чем примерно 30°С, 40°С, 50°С, 60°С, 70°С, 80°С, 90°С или 100°С. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят при температуре примерно 30°С, 40°С, 50°С, 60°С, 70°С, 80°С, 90°С или 100°С. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят при температуре примерно 40-80°С. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят при температуре примерно 50-70°С. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят примерно при 60°С.

[001107] Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят в течение более чем 0,1 часа, 1 часа, 2 часов, 5 часов, 10 часов, 15 часов, 20 часов, 24 часов, 30 часов или 40 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят в течение примерно 0,1-5 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят в течение примерно 3-10 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят в течение примерно 5-15 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят в течение примерно 10-20 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят в течение примерно 15-25 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят в течение примерно 20-40 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят в течение примерно 2 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят в течение примерно 5 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят в течение примерно 10 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят в течение примерно 15 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят в течение примерно 18 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят в течение примерно 24 часов.

[001108] Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят при комнатной температуре в течение более чем 0,1 часа, 1 часа, 2 часов, 5 часов, 10 часов, 15 часов, 20 часов, 24 часов, 30 часов или 40 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят при комнатной температуре в течение 5-48 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят при комнатной температуре в течение примерно 10-24 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят при комнатной температуре в течение 18 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят при повышенной температуре в течение более чем 0,1 часа, 1 часа, 2 часов, 5 часов, 10 часов, 15 часов, 20 часов, 24 часов, 30 часов или 40 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят при повышенной температуре в течение 0,5-5 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят примерно при 60°С в течение примерно 0,5-5 часов. Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида проводят примерно при 60°С в течение примерно 2 часов.

[001109] Согласно некоторым вариантам осуществления отщепление олигонуклеотида от твердой подложки или удаление защитных групп олигонуклеотида включает применение пропиламина, и его проводят при комнатной температуре или при повышенной температуре в течение более чем 0,1 часа, 1 часа, 2 часов, 5 часов, 10 часов, 15 часов, 20 часов, 24 часов, 30 часов или 40 часов. Примерами условий являются 20% пропиламин в пиридине при комнатной температуре в течение примерно 18 часов и 20% пропиламин в пиридине при 60°С в течение примерно 18 часов.

[001110] Согласно некоторым вариантам осуществления перед отщеплением от твердой подложки проводят стадию удаления хиральной вспомогательной группы, если она все еще присоединена к межнуклеотидному атому фосфора. Согласно некоторым вариантам осуществления, например, одна или более хиральных вспомогательных групп типа DPSE остаются присоединенными к межнуклеотидным атомам фосфора в течение цикла синтеза олигонуклеотидов. Подходящие условия для удаления оставшихся хиральных вспомогательных групп широко известны в данной области техники, например, описаны в Wada I, Wada II, Wada III, Хиральном контроле и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления условием для удаления хирального вспомогательного вещества типа DPSE является TBAF или HF-Et₃N, например, 0,1 М TBAF в MeCN, 0,5 М HF-Et₃N в ТГФ или MeCN и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие признает, что связь может быть отщеплена во время процесса удаления хиральной вспомогательной группы. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает связи, такие как связь SP, которая обеспечивает лучшую стабильность при удалении хиральной вспомогательной группы. Среди прочего, некоторые связи, предложенные настоящим раскрытием, обеспечивают улучшенный выход и/или чистоту.

[001111] Согласно некоторым вариантам осуществления активатор представляет собой активатор «Wada», т.е. активатор представляет собой любой активатор, описанный в документах Wada I, II или III, приведенных выше.

[001112] Примеры активирующих групп изображены далее:

Согласно некоторым вариантам осуществления активирующие группы выбирают из

[001113] Согласно некоторым вариантам осуществления пример цикла изображен на схеме I-b.

Схема I-b. Встраивание фосфоротиоатных связей.

[001114] Согласно некоторым вариантам осуществления пример цикла проиллюстрирован на схеме I-c.

Схема I-c. Встраивание фосфатных сложных диэфирных и модифицированных межнуклеотидных связей в олигонуклеотид с контролируемой хиральностью.

[001115] На схеме I-c олигонуклеотид (или нуклеотид или олигонуклеотид с модифицированными межнуклеотидными связями) на твердой подложке (С-1) подвергают сочетанию с фосфорамидитом С-2. После сочетания и введения блокирующей группы проводят стадию окисления. После удаления блокирующей группы получают фосфатную сложную диэфирную связь. Продукт цикла С-3 можно повторно использовать в цикле С для введения дополнительных фосфатных сложных диэфирных связей или в других циклах для встраивания других типов межнуклеотидных связей, или можно завершать цикл.

[001116] Согласно некоторым вариантам осуществления вместо С-2 на схеме 1-е можно использовать фосфорамидит, который не является хирально-чистым. Согласно некоторым вариантам осуществления применяют β-цианоэтилфосфорамидиты, защищенные DMTr. Согласно некоторым вариантам осуществления применяемый фосфорамидит имеет структуру

[001117] Согласно некоторым вариантам осуществления применение предшественника фосфоротиоатного сложного диэфира увеличивает стабильность олигонуклеотида во время синтеза. Согласно некоторым вариантам осуществления применение предшественника фосфоротиоатного сложного диэфира увеличивает эффективность синтеза олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления применение предшественника фосфоротиоатного сложного диэфира увеличивает выход синтеза олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления применение предшественника фосфоротиоатного сложного диэфира увеличивает чистоту продукта синтеза олигонуклеотида с контролируемой хиральностью.

[001118] Согласно некоторым вариантам осуществления предшественник фосфоротиоатного сложного диэфира, применяемый в указанных выше способах, представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления превращают в фосфоротиоатную сложную диэфирную связь во время удаления защитных групп/высвобождения. Согласно некоторым вариантам осуществления пример цикла изображен на схеме I-d. Дополнительные примеры изображены ниже.

Схема I-d. Предшественник фосфоротиоатного сложного диэфира в синтезе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью.

[001119] Как проиллюстрировано на схеме I-d, фосфоротиоатные и фосфатные сложные диэфирные связи можно вводить в один олигонуклеотид с контролируемой хиральностью. Специалистам в данной области техники должно быть понятно, что предложенные способы не требуют последовательного расположения фосфоротиоатного сложного диэфира и фосфатного сложного диэфира - между ними можно встраивать и другие межнуклеотидные связи с использованием цикла, такого как описано выше. На схеме I-d предшественники фосфоротиоатных сложных диэфиров, встраивают вместо фосфоротиоатных сложных диэфирных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления указанная замена обеспечивала увеличенную эффективность синтеза на определенных стадиях, например, на стадии окисления. Согласно некоторым вариантам осуществления применение предшественников фосфоротиоатных сложных диэфиров, в целом, увеличивает стабильность олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью во время синтеза и/или при хранении. После завершения цикла во время удаления защитных групп/высвобождения предшественник фосфоротиоатного сложного диэфира превращают в фосфоротиоатную сложную диэфирную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления эффективным является применение предшественника фосфоротиоатного сложного диэфира, даже если в олигонуклеотиде с контролируемой хиральностью отсутствуют фосфатные сложные диэфирные связи, или во время синтеза не требуется стадия окисления.

[001120] Как и на схеме 1-е, согласно некоторым вариантам осуществления фосфорамидит, который не является хирально-чистым, можно применять в циклах, включающих стадии окисления. Согласно некоторым вариантам осуществления применяют β-цианоэтилфосфорамидиты, защищенные DMTr. Согласно некоторым вариантам осуществления применяемый фосфорамидит имеет структуру

[001121] Согласно некоторым вариантам осуществления способы согласно настоящему изобретению обеспечивают композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, обогащенные олигонуклеотидом определенного типа.

[001122] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 10% предложенной неочищенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 20% предложенной неочищенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 30% предложенной неочищенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 40% предложенной неочищенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 50% предложенной неочищенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 60% предложенной неочищенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 70% предложенной неочищенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 80% предложенной неочищенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 90% предложенной неочищенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 95% предложенной неочищенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа.

[001123] Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 1% предложенной композиции представляет собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 2% предложенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 3% предложенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 4% предложенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 5% предложенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 10% предложенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 20% предложенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 30% предложенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 40% предложенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 50% предложенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 60% предложенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 70% предложенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 80% предложенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 90% предложенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере примерно 95% предложенной композиции представляют собой олигонуклеотид определенного типа.

[001124] Согласно некоторым вариантам осуществления пример цикла изображен на схеме 1-е ниже.

Схема 1-е. Пример цикла с использованием хирального вспомогательного вещества PhMe.

[001125] Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой Н или 2'-модификацию. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой Н или -OR¹, где R¹ не представляет собой водород. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой Н или -OR¹, где R¹ представляет собой необязательно замещенный C_1-6 алкил. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой Н. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой -ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой -ОСН₂СН₂ОСН₃. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой -F.

[001126] Согласно некоторым вариантам осуществления пример цикла изображен на схеме I-f.

Схема 1-е. Пример цикла с использованием хирального вспомогательного вещества DPSE.

[001127] Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой Н или 2'-модификацию. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой Н или -OR¹, где R¹ не представляет собой водород. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой Н или -OR¹, где R¹ представляет собой необязательно замещенный C_1-6 алкил. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой Н. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой -ОМе. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой -ОСН₂СН₂ОСН₃. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой -F.

[001128] Специалисту в данной области техники понятно, что различные типы циклов могут быть объединены для обеспечения полного контроля за химическими модификациями и стереохимией олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления, например, способ синтеза олигонуклеотидов может содержать один или более циклов A-F. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный способ содержит по меньшей мере один цикл с использованием хирального вспомогательного вещества типа DPSE.

[001129] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие содержит способы получения предложенных олигонуклеотидов и композиций олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложены способы, предусматривающие предоставление предложенного хирального реагента, имеющего структуру где W¹ представляет собой -NG⁵, W² представляет собой О, каждый из G¹ и G³ независимо представляет собой водород или необязательно замещенную группу, выбранную из алифатического, гетероциклильного, гетероарильного и арильного С_1-10, G² представляет собой -C(R)₂Si(R)₃ и G⁴ и G⁵, взятые вместе, образуют необязательно замещенное насыщенное, частично ненасыщенное или ненасыщенное гетероатомсодержащее кольцо до примерно 20 кольцевых атомов, которое является моноциклическим или полициклическим, конденсированным или неконденсированным, где каждый R независимо представляет собой водород или необязательно замещенную группу выбранную из алифатического, карбоциклильного, арильного, гетероарильного и гетероциклильного C₁-С₆. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный

хиральный реагент имеет структуру или Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные способы предусматривают получение фосфорамидита, содержащего фрагмент из хирального реагента, имеющего структуру или где -W¹H и -W²H, или гидроксильные и аминогруппы, образуют связи с атомом фосфора фосфорамидита. Согласно некоторым вариантам осуществления -W¹H и -W²H или гидроксильные и аминогруппы образуют связи с атомом фосфора фосфорамидита, например, в . Согласно некоторым вариантам осуществления фосфорамидит имеет структуру

Согласно некоторым вариантам

осуществления R представляет собой группу защиты. Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой DMTr. Согласно некоторым вариантам осуществления G² представляет собой -C(R)₂Si(R)₃, где -C(R)₂ представляет собой необязательно замещенный -СН₂-, и каждый R в -Si(R)₃ независимо представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из алифатического С_1-10, гетероциклила, гетероарила и арила. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один R-Si(R)₃ независимо представляет собой необязательно замещенный С_1-10 алкил. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере один R-Si(R)₃ независимо представляет собой необязательно замещенный фенил. Согласно некоторым вариантам осуществления один R-Si(R)₃ независимо представляет собой необязательно замещенный фенил, и каждый из двух других R независимо представляет собой необязательно замещенный С_1-10 алкил. Согласно некоторым вариантам осуществления один R-Si(R)₃ независимо представляет собой необязательно замещенный С_1-10 алкил, и каждый из двух других R независимо представляет собой необязательно замещенный фенил. Согласно некоторым вариантам осуществления G² представляет собой необязательно замещенный -CH₂Si(Ph)(Me)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления G² представляет собой необязательно замещенный -CH₂Si(Me)(Ph)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления G² представляет собой -CH₂Si(Me)(Ph)₂. Согласно некоторым вариантам осуществления G⁴ и G⁵ берут вместе с образованием необязательно замещенного насыщенного 5-6-членного кольца, содержащего один атом азота (к которому присоединен G⁵). Согласно некоторым вариантам осуществления G⁴ и G⁵ берут вместе с образованием необязательно замещенного насыщенного 5-членного кольца, содержащего один атом азота. Согласно некоторым вариантам осуществления G¹ представляет собой водород. Согласно некоторым вариантам осуществления G³ представляет собой водород. Согласно некоторым вариантам осуществления как G¹, так и G³ представляют собой водород. Согласно некоторым вариантам осуществления как G¹, так и G³ представляют собой водород, G² представляет собой -C(R)₂Si(R)₃, где -C(R)₂ представляет собой необязательно замещенный -СН₂-, и каждый R-Si(R)₃ представляет собой независимо, необязательно замещенную группу, выбранную из алифатического C_1-10, гетероциклила, гетероарила и арила, и G⁴ и G⁵, взятые вместе с образованием необязательно замещенного насыщенного 5-членного кольца, содержащего один атом азота. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный способ дополнительно предусматривает обеспечение фтор со держащего реагента. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный фторсодержащий реагент удаляет хиральный реагент или продукт, образованный из хирального реагента, из олигонуклеотидов после синтеза. В соответствии с настоящим изобретением могут использоваться различные известные фторсодержащие реагенты, включая источники F^-, для удаления групп -SiR₃, например, TBAF, HF₃-Et₃N и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления фторсодержащий реагент обеспечивает лучшие результаты, например, более короткое время обработки, более низкую температуру, меньшее десульфирование и т.д. по сравнению с традиционными способами, такими как концентрированный аммиак. Согласно некоторым вариантам осуществления для определенного фторсодержащего реагента настоящее раскрытие обеспечивает связи для улучшения результатов, например, меньшего отщепление олигонуклеотидов от подложки во время удаления хирального реагента (или продукта, образовавшегося из него во время синтеза олигонуклеотидов). Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная связь представляет собой связь SP. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие показало, что может быть использован комплекс HF-основания, такой как HF-NR₃, для контроля отщепления во время удаления хирального реагента (или продукта, образованного из него во время синтеза олигонуклеотидов). Согласно некоторым вариантам осуществления HF-NR₃ представляет собой HF-NEt₃. Согласно некоторым вариантам осуществления HF-NR₃ позволяет использовать традиционные связи, например, сукцинильную линкерную группу.

[001130] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ производства композиции олигонуклеотидов, направленной на выбранную целевую последовательность, причем способ предусматривает производство предложенной композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, каждый из которых имеет последовательность оснований, комплементарную целевой последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный способ дополнительно предусматривает предоставление фармацевтически приемлемого носителя.

[001131] Как понятно специалисту в настоящей области техники, предложенные олигонуклеотиды также могут быть получены посредством известного синтеза фазы раствора с использованием предложенных реагентов и способов в соответствии с настоящим раскрытием.

Биологические применения и иллюстративное использование

[001132] Как описано в настоящем описании, предложенные композиции и способы способны изменять сплайсинг транскриптов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции и способы обеспечивают улучшенные профили сплайсинга транскриптов по сравнению с эталонным профилем, который представляет собой профиль из эталонного состояния, выбранного из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинаций. Улучшение может представлять собой улучшение любых желаемых биологических функций. Согласно некоторым вариантам осуществления, например, в DMD, улучшение представляет собой получение мРНК, из которой образуется белок дистрофина с улучшенной биологической активностью. Согласно некоторым другим вариантам осуществления, например, улучшение представляет собой понижающую регуляцию STAT3, HNRNPH1 и/или KDR для смягчения прогрессирования опухоли, злокачественности и ангиогенеза посредством усиленного сплайсинг-индуцированного нонсенс опосредованного распада (DSD-NMD).

[001133] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ изменения сплайсинга целевого транскрипта, предусматривающий введение композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов, причем сплайсинг целевого транскрипта изменяется относительно эталонных условий, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинаций.

[001134] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ получения набора сплайсированных продуктов из целевого транскрипта, причем способ предусматривает стадии:

контактирование системы сплайсинга, содержащей целевой транскрипт, с олигонуклеотидной композицией, содержащей первое множество олигонуклеотидов, в количестве, в течение времени и в условиях, достаточных для создания набора сплайсированных продуктов, который отличается от набора, полученного в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинаций.

[001135] Как широко известно в настоящей области техники, многие заболевания и/или состояния связаны со сплайсингом транскриптов. Например, смотрите Garcia-Blanco, et al, Alternative splicing in disease and therapy, Nat Biotechnol. 2004 May; 22(5):535-46; Wang, et al, Splicing in disease: disruption of the splicing code and the decoding machinery, Nat Rev Genet. 2007 Oct;8(10):749-61; Havens, et al, Targeting RNA splicing for disease therapy, Wiley Interdiscip Rev RNA. 2013 May-Jun;4(3):247-66; Perez, et al., Antisense mediated splicing modulation for inherited metabolic diseases: challenges for delivery, Nucleic Acid Ther. 2014 Feb; 24(1):48-56 и т.д. Дополнительные иллюстративные мишени и/или заболевания описаны в Xiong, et al., The human splicing code reveals new insights into the genetic determinants of disease, Science. 2015 Jan 9; 347(6218): 1254806. doi: 10.1126/science. 1254806. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции и способы лечения или профилактики заболеваний, включая, но не ограничиваясь ими, описанные в ссылках, приведенных в настоящем раскрытии.

[001136] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ лечения или профилактики заболевания, предусматривающий введение субъекту композиции олигонуклеотидов, описанной в настоящем описании.

[001137] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ лечения или профилактики заболевания, предусматривающий введение субъекту композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, которые:

1) имеют одинаковую последовательность оснований, комплементарную целевой последовательности в транскрипте; а также

2) содержат один или более модифицированных фрагментов сахара и модифицированных межнуклеотидных связей,

композиция олигонуклеотидов характеризуется тем, что, когда она контактирует с транскриптом в системе сплайсинга транскриптов, сплайсинг транскрипта изменяется относительно наблюдаемого в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинации.

[001138] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ лечения или профилактики заболевания, предусматривающий введение субъекту композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов определенного типа олигонуклеотидов, определяемого:

1) последовательностью оснований;

2) профилем связей остова;

3) профилем хиральных центров остова; а также

4) профилем модификаций фосфора остова,

причем композиция характеризуется контролируемой хиральностью, поскольку она обогащена относительно по существу рацемического препарата олигонуклеотидов, имеющих одну и ту же последовательность оснований, олигонуклеотидами конкретного типа олигонуклеотидов, причем:

композиция олигонуклеотидов характеризуется тем, что, когда она контактирует с транскриптом в системе сплайсинга транскриптов, сплайсинг транскрипта изменяется относительно наблюдаемого в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинации.

[001139] Согласно некоторым вариантам осуществления заболевание представляет собой заболевание, в котором после введения предложенной композиции один или более сплайсированных транскриптов исправляют, восстанавливают или вводят новую полезную функцию. Например, в DMD после пропуска одного или более экзонов функции дистрофина могут быть восстановлены или частично восстановлены с помощью усеченной, но (частично) активной версии. Другие примеры включают, но не ограничиваются ими, перечисленные в таблице ES1, ES2 или ES3. Согласно некоторым вариантам осуществления мишень представляет собой ту, которая указана в таблице ES3 с названием «Корректировка сплайсинга аберрантов».

[001140] Согласно некоторым вариантам осуществления заболевание представляет собой заболевание, в котором после введения предложенной композиции один или более сплайсированных транскриптов восстанавливаются, ген эффективно подвергается нокдауну путем изменения сплайсинга транскрипта гена. Примеры включают, но не ограничиваются перечисленными в таблице ES1, ES2 или ES3. Согласно некоторым вариантам осуществления мишень представляет собой ту, которая указана в таблице ES3 с названием «Нокдаун вредной экспрессии гена».

[001141] Согласно некоторым вариантам осуществления заболевание представляет собой мышечную дистрофию Дюшенна. Согласно некоторым вариантам осуществления заболевание представляет собой спинальную мышечную атрофию. Согласно некоторым вариантам осуществления заболевание представляет собой злокачественную опухоль.

[001142] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ лечения заболевания путем введения композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов, характеризующихся наличием одинаковой последовательности оснований, содержащей одинаковую последовательность оснований, нуклеотидная последовательность которой комплементарна целевой последовательности в целевом транскрипте.

улучшение, которое предусматривает применение в качестве композиции олигонуклеотидов стереоконтролируемой композиции олигонуклеотидов, отличающейся тем, что при контакте с транскриптом в системе сплайсинга транскриптов сплайсинг транскрипта изменяется относительно наблюдаемого в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинаций.

[001143] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ лечения заболевания путем введения композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов, характеризующихся наличием одинаковой последовательности оснований, содержащей одинаковую последовательность оснований, нуклеотидная последовательность которой комплементарна целевой последовательности в целевом транскрипте.

улучшение, которое предусматривает применение в качестве композиции олигонуклеотидов стереоконтролируемой композиции олигонуклеотидов, характеризующейся тем, что при контакте с транскриптом в системе сплайсинга транскритов сплайсинг транскрипта изменяется относительно наблюдаемого в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия контрольной композиции и их комбинаций.

[001144] Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность множества олигонуклеотидов содержит последовательность, выбранную из таблицы ES1. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность представляет собой последовательность, выбранную из таблицы ES1. Согласно некоторым вариантам осуществления одинаковая последовательность представляет собой последовательность, которая представляет собой транскрипт любого из генов, выбранных из таблицы ES1, ES2 и ES3.

[001145] Примеры заболеваний, которые можно лечить, включают, но не ограничиваются ими, те, которые описаны в таблицах ES2 и ES3. Согласно некоторым вариантам осуществления заболевание представляет собой мышечную дистрофию Дюшенна. Согласно некоторым вариантам осуществления заболевание представляет собой спинальную мышечную атрофию. Согласно некоторым вариантам осуществления заболевание представляет собой злокачественную опухоль.

[001146] Для мышечной дистрофии Дюшенна примеры мутаций и/или подходящих экзонов DMD для пропусков широко известны в настоящей области техники, включая, но не ограничиваясь ими, те, которые описаны в патенте США №8759507, патенте США №8486907, и ссылке, упомянутой в нем. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более пропущенных экзонов выбраны из экзонов 2, 29, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51 и 53. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон 2 в DMD пропускается. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон 29 в DMD пропускается. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон 40 в DMD пропускается. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон 41 в DMD пропускается. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон 42 в DMD пропускается. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон 43 в DMD пропускается. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон 44 в DMD пропускается. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон 45 в DMD пропускается. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон 46 в DMD пропускается. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон 47 в DMD пропускается. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон 48 в DMD пропускается. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон 49 в DMD пропускается. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон 50 в DMD пропускается. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон 51 в DMD пропускается. Согласно некоторым вариантам осуществления экзон 53 в DMD пропускается. Согласно некоторым вариантам осуществления пропущенный экзон представляет собой любой экзон, включение которого уменьшает желаемую функцию DMD. Согласно некоторым вариантам осуществления пропущенный экзон представляет собой любой экзон, пропускание которого усиливает желаемую функцию DMD.

[001147] Согласно некоторым вариантам осуществления для пропуска экзона транскрипта DMD или для лечения DMD последовательность предложенного множества олигонуклеотидов содержит последовательность DMD, выбранную из таблицы ES1. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность содержит одну из SEQ ID NO: 1-30 патента США №8759507. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность содержит одну из SEQ ID NO: 1-211 в патенте США №8486907. Согласно некоторым вариантам осуществления для пропуска экзона транскрипта DMD или для лечения DMD последовательность предложенного множества олигонуклеотидов представляет собой последовательность DMD, выбранную из таблицы ES1. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность представляет собой последовательность SEQ ID NO: 1-30 патента США №8759507. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность представляет собой последовательность SEQ ID NO: 1-211 в патенте США №8486907. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность представляет собой UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность содержит CTCCAACATCAAGGAAGATGGCATTTCTAG. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность представляет собой CTCCAACATCAAGGAAGATGGCATTTCTAG. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность выбирают из таблицы 2В. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность выбирают из таблицы 2С. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность выбирают из таблицы 2D. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность выбирают из таблицы 2Е. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательность представляет собой последовательность, описанную в публикации Kemaladewi, et at, Dual exon skipping in myostatin and dystrophin for Duchenne muscular dystrophy, BMC Med Genomics. 2011 Apr 20;4:36. doi: 10.1186/1755-8794-4-36 или Malerba et at, Dual Myostatin and Dystrophin Exon Skipping by Morpholino Nucleic Acid Oligomers Conjugated to a Cell-penetrating Peptide Is a Promising Therapeutic Strategy for the Treatment of Duchenne Muscular Dystrophy, Mol Ther Nucleic Acids. 2012 Dec 18; 1:e62. doi: 10.1038/mtna.2012.54.

[001148] Согласно некоторым вариантам осуществления лечение заболеваний предусматривает нокдаун функции гена путем изменения сплайсинга его транскрита. Иллюстративные заболевания и целевые гены включают, но не ограничиваются ими, перечисленные в таблице ES3, особенно те, которые озаглавлены «Нокдаун экспрессии вредных генов».

[001149] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов вводится в дозе и/или с частотой ниже чем сопоставимая в остальном эталонная композиция олигонуклеотидов с сопоставимым влиянием на изменение сплайсинга целевого транскрипта. Согласно некоторым вариантам осуществления стереоконтролируемая композиция олигонуклеотидов вводится в дозе и/или с частотой ниже чем сопоставимая в остальном стерео случайная композиции олигонуклеотидов с сопоставимым эффектом на изменение сплайсинга целевого транскрипта. Если желательно, предложенную композицию можно также вводить в более высокой дозе/с более высокой частотой из-за ее меньшей токсичности.

[001150] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие признает, что свойства, например, активности, токсичности и т.д. олигонуклеотидов и их композиций могут быть оптимизированы с помощью химических модификаций и/или стереохимии. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способы оптимизации свойств олигонуклеотидов посредством химических модификаций и стереохимии. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотиды и их композиции и способы с низкой токсичностью. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотиды и их композиции и способы с низкой токсичностью и повышенной активностью (например, эффективностью ингибирования мишеней, специфичностью, скоростью расщепления, профилем расщепления и т.д.). Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотиды и их композиции и способы с улучшенным профилем связывания с белком. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотиды и их композиции и способы с улучшенным профилем связывания с белком и повышенными активностями. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотиды и их композиции и способы с улучшенной доставкой и повышенной активностью.

[001151] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды, композиции и способы характеризуются низкой токсичностью, например, по сравнению с эталонной композицией. Как широко известно в настоящей области техники, олигонуклеотиды могут индуцировать токсичность при введении, например, в клетки, ткани, организм и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды могут индуцировать нежелательный иммунный ответ. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид может индуцировать активацию комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды могут индуцировать активацию альтернативного пути комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды могут индуцировать воспаление. Среди прочего, система комплемента обладает сильной цитолитической активностью, которая может повреждать клетки и поэтому должна модулироваться для уменьшения потенциальных повреждений. Согласно некоторым вариантам осуществления индуцированное олигонуклеотидом сосудистое повреждение представляет собой повторяющуюся проблему при разработке олигонуклеотидов, например, для фармацевтического применения. Согласно некоторым вариантам осуществления первичный источник воспаления, когда вводят высокие дозы олигонуклеотидов, включает активацию альтернативного каскада комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента представляет собой общую проблему, связанную с фосфоротиоатсодержащими олигонуклеотидами, и существует также потенциал некоторых последовательностей фосфоротиоатов для индукции активации врожденных иммунных клеток. Согласно некоторым вариантам осуществления высвобождение цитокина связано с введением олигонуклеотидов. Например, согласно некоторым вариантам осуществления наблюдается увеличение количества интерлейкина-6 (IL-6), моноцитарного хемоаттрактантного белка (МСР-1) и/или интерлейкина-12 (IL-12). Смотрите, например, Frazier, Antisense Oligonucleotide Therapies: The Promise and the Challenges from a Toxicologic Pathologist's Perspective. Toxicol Pathol., 43: 78-89, 2015 и Engelhardt, et al., Scientific and Regulatory Policy Committee Points-to-consider Paper: Drug-induced Vascular Injury Associated with Nonsmall Molecule Therapeutics in Preclinical Development: Part 2. Antisense Oligonucleotides. Toxicol Pathol. 43: 935-944, 2015.

[001152] Путем контроля химических модификаций и/или стереохимии настоящее раскрытие обеспечивает улучшенные композиции олигонуклеотидов и способы. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат химические модификации. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат модификации оснований, модификации Сахаров, модификации межнуклеотидных связей или любые их комбинации. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат модификации оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат модификации сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат 2'-модификации на фрагментах сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что 2'-модификации могут снижать токсичность. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и одну или более природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что включение одной или более природных фосфатных связей в олигонуклеотиды, содержащие одну или более модифицированных межнуклеотидных связей, может снизить токсичность. Природная фосфатная связь может быть включена в различные положения олигонуклеотид а. Согласно некоторым вариантам осуществления природная фосфатная связь включена в область крыла или область, близкую к 5'- или 3'-концу. Согласно некоторым вариантам осуществления природная фосфатная связь включена в середину олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления природная фосфатная связь включена в область сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что стереохимия, как отдельно, так и в сочетании с химическими модификациями, может модулировать токсичность. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что стереохимия, как самостоятельно, так и в сочетании с химическими модификациями, может модулировать иммунный ответ. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что стереохимия, как отдельно, так и в сочетании с химическими модификациями, может модулировать активацию комплемента. Неожиданно было обнаружено, что композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью отдельного стереоизомера может иметь резко отличающийся профиль токсичности, например, активацию комплемента, по сравнению с соответствующей стереослучайной композицией и/или композицией олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью другого отдельного стереоизомера. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие демонстрирует, что стереохимия, как самостоятельно, так и в сочетании с химическими модификациями, может модулировать активацию комплемента через альтернативный путь. В настоящем раскрытии подробно описаны иллюстративные химические модификации, стереохимия и их профили, которые могут быть использованы в комбинациях. Иллюстративные композиции и способы также широко описаны в настоящем раскрытии. Специалисту в настоящей области техники будет понятно, что описанные в настоящем описании способы и композиции могут быть использованы как для увеличения, так и уменьшения иммунных ответов, включая активацию комплемента, относительно эталонной композиции.

[001153] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ введения композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, имеющих общую нуклеотидную последовательность, улучшение, которое предусматривает:

введение предложенной композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, которое характеризуется пониженной токсичностью относительно эталонной композиции олигонуклеотидов той же общей нуклеотидной последовательности.

[001154] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ введения композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, имеющих общую нуклеотидную последовательность, улучшение, которое предусматривает:

введение композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, которое характеризуется контролируемой хиральностью и которое характеризуется пониженной токсичностью относительно эталонной композиции олигонуклеотидов той же общей нуклеотидной последовательности.

[001155] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ введения композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, имеющих общую нуклеотидную последовательность, улучшение, которое предусматривает:

введение композиции олигонуклеотидов, в которой каждый олигонуклеотид во множестве содержит один или более модифицированных фрагментов сахара, и композиция характеризуется пониженной токсичностью относительно эталонной композиции олигонуклеотидов той же общей нуклеотидной последовательности, но не содержит по меньшей мере один из одного или более модифицированных фрагментов сахара.

[001156] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ введения композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, имеющих общую нуклеотидную последовательность, улучшение, которое предусматривает:

введение композиции олигонуклеотидов, в которой каждый олигонуклеотид во множестве включает одну или более природных фосфатных связей и одну или более модифицированных фосфатных связей;

причем композиция олигонуклеотидов характеризуется пониженной токсичностью при исследовании по меньшей мере в одном анализе, который наблюдается с сопоставимой в остальном эталонной композицией, олигонуклеотиды которой содержат меньше природных фосфатных связей.

[001157] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ введения композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, имеющих общую нуклеотидную последовательность, улучшение, которое предусматривает:

введение композиции олигонуклеотидов, в которой каждый олигонуклеотид во множестве включает одну или более природных фосфатных связей и одну или более модифицированных фосфатных связей;

причем композиция олигонуклеотидов характеризуется пониженной токсичностью при исследовании по меньшей мере в одном анализе, который наблюдается с сопоставимой в остальном эталонной композицией, олигонуклеотиды которой не содержат природных фосфатных связей.

[001158] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ введения композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, имеющих общую нуклеотидную последовательность, улучшение, которое предусматривает:

введение композиции олигонуклеотидов, в которой каждый олигонуклеотид во множестве содержит один или более модифицированных фрагментов сахара, и композиция характеризуется пониженной токсичностью относительно эталонной композиции олигонуклеотидов той же общей нуклеотидной последовательности, но не содержит по меньшей мере одного из одного или более модифицированных фрагментов сахара.

[001159] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ, предусматривающий стадии введения субъекту композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, каждый из которых характеризуется одинаковой последовательностью оснований и содержит модифицированный фрагмент сахара, причем композиция олигонуклеотидов характеризуется сниженной токсичностью при исследовании по меньшей мере в одном анализе, который наблюдается с сопоставимой в остальном эталонной композицией, которая содержит эталонное множество олигонуклеотидов, которые характеризуются одинаковой общей последовательностью оснований, но не имеют модифицированных фрагментов сахара.

[001160] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ, предусматривающий стадии введения субъекту композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, каждый из которых характеризуется общей последовательностью оснований и содержит одну или более природных фосфатных связей и одну или более модифицированных фосфатных связей, причем композиция олигонуклеотидов характеризуется пониженной токсичностью при исследовании по меньшей мере в одном анализе, который наблюдается с сопоставимой в остальном эталонной композицией, которая содержит эталонное множество олигонуклеотидов, которые имеют одинаковую общую последовательность оснований, но не имеют природных фосфатных связей.

[001161] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ, предусматривающий стадии введения композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью субъекту, причем композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью характеризуется пониженной токсичностью при исследовании по меньшей мере в одном анализе, который наблюдается с сопоставимой в остальном эталонной композицией, которая включает в себя другую композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью или стерео случайную композицию олигонуклеотидов, содержащую олигонуклеотиды, имеющие такую же последовательность оснований.

[001162] Согласно некоторым вариантам осуществления сниженная токсичность представляет собой или предусматривает сниженную активацию комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления сниженная токсичность включает активацию восстановленного комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления сниженная токсичность представляет собой или предусматривает сниженную активацию комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления сниженная токсичность предусматривает сниженную активацию комплемента через альтернативный путь. Согласно некоторым вариантам осуществления токсичность может быть оценена посредством измерения уровней активации комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления измененная активация комплемента наблюдается в анализе, который обнаруживает белок, уровень которого изменяется при активации комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления измененная активация комплемента наблюдается в анализе, который обнаруживает наличие, абсолютный уровень и/или относительные уровни одного или более продуктов, связанных с полной активацией. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента наблюдается в сыворотке. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента наблюдается в сыворотке человека. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента наблюдается в сыворотке приматов. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента наблюдается в сыворотке обезьян.

[001163] Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 60 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 50 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 40 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 30 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 25 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 20 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 15 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 10 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 9 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 8 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 7 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 6 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 5 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 4 минуты после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 3 минуты после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 2 минуты после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 1 минуту после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 30 секунд после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 20 секунд после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 10 секунд после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют не более чем через 5 секунд после введения олигонуклеотидов.

[001164] Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют через 5 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют через 10 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют через 15 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют через 20 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют через 25 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют через 30 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют через 35 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют через 40 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют через 45 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют через 50 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют через 55 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют через 60 минут после введения олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления активацию комплемента измеряют в нескольких временных точках после введения олигонуклеотидов, например, в двух или более временных точках, выбранных из 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 70, 80, 90, 100, ПО и 120 минут после введения олигонуклеотидов.

[001165] Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 5%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 10%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 15%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 20%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 25%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 30%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 35%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 40%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 45%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 50%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 55%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 60%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 65%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 70%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 75%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 80%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 85%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 90%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 95%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 96%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 97%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 98%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена по меньшей мере на 99%. Согласно некоторым вариантам осуществления активация комплемента снижена до того же уровня отрицательного контроля, например, воды, буфера, не вызывающего активацию комплемента и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды, композиции и способы снижают воспламенение места инъекции. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды, композиции и способы снижают индуцированное повреждение сосудов.

[001166] Маркеры, которые могут быть использованы для оценки токсичности, широко известны в настоящей области техники, например, СН50 (полный комплемент), продукты расщепления комплемента (например, Bb, С3а, С5а и т.д.), МСР-1 и CRP, фибриноген, гаптоглобин, глобулин, протеинурия, альбуминурия, ангиопоэтин-2, эндотелии-1, эсеелин, тромбоспондин-1, фактор роста эндотелия сосудов альфа, кальпонин-1, ингибитор ткани металлопротеиназы 1, липокалин 2, индуцированный цитокином хемоаттрактант нейтрофилов 1, альфа-1 кислотный гликопротеин 1, общий оксид азота, фактор фон Виллебранда, молекула межклеточной адгезии (ICAM), молекула клеточной адгезии сосудов-1 (VCAM-1), интерлейкины, моноцитарный хемотаксический белок-1, сывороточный амилоид A, CRP, фибриноген, ингибитор активатора плазминогена 1, кавеолин, матриксные металлопротеиназы (ММР-1, ММР-3 и ММР-9). фактор роста эндотелия сосудов, тромбомодулин, Е-селектин, Р-селектин, анализ путей комплемента и другие воспалительные маркеры (то есть CRP, МСР-1, ММР-3 и/или другие цитокины или хемокины), маркеры эндотелиальной активации (например, VCAM) и т.д. Например, смотрите Frazier, Antisense Oligonucleotide Therapies: The Promise and the Challenges from a Toxicologic Pathologist's Perspective. Toxicol Pathol., 43: 78-89, 2015; Engelhardt, et al, Scientific and Regulatory Policy Committee Points-to-consider Paper: Drug-induced Vascular Injury Associated with Nonsmall Molecule Therapeutics in Preclinical Development: Part 2. Antisense Oligonucleotides. Toxicol Pathol. 43: 935-944, 2015 и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления маркер представляет собой белок в пути комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления маркер представляет собой белок в альтернативном пути комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления маркер представляет собой белок, полученный во время полной активации. Согласно некоторым вариантам осуществления маркер представляет собой белок, полученный во время полной активации через альтернативный путь. Согласно некоторым вариантам осуществления маркер выбирают из С3а, Bb, С4а, С5а, C5b, С6, С7, С8 и С9. Согласно некоторым вариантам осуществления маркер выбирают из С4а, С5а, C5b, С6, С7, С8 и С9. Согласно некоторым вариантам осуществления маркер выбирают из С3а, С4а, С5а и Bb. Согласно некоторым вариантам осуществления маркер представляет собой С3а или Bb. Согласно некоторым вариантам осуществления маркер представляет собой C3a. Согласно некоторым вариантам осуществления маркер представляет собой Bb.

[001167] Примеры анализов широко известны в настоящей области техники, включая, но не ограничиваясь ими, описанные в настоящем раскрытии и US2002/0082227; Frazier, Antisense Oligonucleotide Therapies: The Promise and the Challenges from a Toxicologic Pathologist's Perspective. Toxicol Pathol., 43: 78-89, 2015; Engelhardt, et al., Scientific and Regulatory Policy Committee Points-to-consider Paper: Drug-induced Vascular Injury Associated with Nonsmall Molecule Therapeutics in Preclinical Development: Part 2. Antisense Oligonucleotides. Toxicol Pathol. 43: 935-944, 2015 и т.п.

[001168] Настоящее раскрытие демонстрирует, что композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью отдельных стерео изо мер о в могут иметь разные профили активации комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотидов, имеющие все фосфоротиоатные связи и одну конфигурацию Rp в середине, могут демонстрировать относительно высокую активацию комплемента. Как предусмотрено в настоящем раскрытии, различные способы могут быть использованы для снижения относительно высокой активации комплемента этих олигонуклеотидов, включая, но не ограничиваясь этим, введение одной или более природных фосфатных связей. Примеры смотрите на фиг. 4 и 5.

[001169] Благодаря своим улучшенным свойствам, например, низкой токсичности, высокой активности и т.д., предложенные олигонуклеотиды и их композиции особенно применимы для лечения различных заболеваний. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды, композиции и/или способы особенно применимы для уменьшения мишени, вовлеченной в систему комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды, композиции и/или способы особенно применимы для снижения активации комплемента путем снижения уровней мишени в системе комплемента, поскольку сами предложенные олигонуклеотиды, композиции и/или способы только индуцируют низкую, если таковая имеется, активацию комплемента по сравнению с эталонными олигонуклеотидами, композициями и/или их способами. Согласно некоторым вариантам осуществления мишень, вовлеченная в систему комплемента, представляет собой C1, C1a, C1r, C1s, C1q, MASP-1, MASP-2, С3, С3-конвертазу, С3а, C3b, C3aR, C4b, C5, C5a, C5aR, фактор В, фактор D, тромбин, плазмин, калликреин или фактор XIIa. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды, композиции и/или способы могут обеспечить улучшенное лечение связанных заболеваний, таких как нейровоспаление и нейродегенерация, мышечное воспаление, демиелинизация, васкулит и нефрит. Согласно некоторым вариантам осуществления заболевание представляет собой редкое заболевание, связанное с комплементом; например, смотрите Reis et at, Applying complement therapeutics to rare diseases, Clinical Immunology (2015), doi: 10.1016/j.clim.2015.08.009. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов, нацеленных на С5. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция представляет собой композицию киРНК, нацеленную на С5. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композицию олигонуклеотидов, нацеленную на фактор В. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции и способы, нацеленные на фактор В, для лечения волчаночного нефрита. Примеры последовательностей оснований для нацеленного воздействия на фактор В включают, но не ограничиваются ими, описанные в Grossman et al. Inhibition of the alternative complement pathway by antisense oligonucleotides targeting complement factor В improves lupus nephritis in mice. Immunobiology. 2015 Aug 10. pii: S0171-2985(15)30041-3. doi: 10.1016/j.imbio.2015.08.001.

[001170] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способы модулирования связывающих белок свойств олигонуклеотидов, например, путем корректирования химических модификаций и/или стереохимии олигонуклеотидов. Иллюстративные химические модификации, стереохимия и их комбинации подробно описаны в настоящем раскрытии. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотиды и их композиции с улучшенным профилем связывания с белками.

[001171] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ, предусматривающий введение композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов, причем композиция проявляет измененное связывание белков по сравнению с эталонной композицией, содержащей множество олигонуклеотидов, каждый из которых также имеет общую последовательность оснований, но которая структурно отличается от олигонуклеотидов первого множества в том, что:

отдельные олигонуклеотиды в эталонном множестве отличаются друг от друга стерео химической структурой; и/или

по меньшей мере некоторые олигонуклеотиды в эталонном множестве имеют структуру, отличную от структуры, представленной множеством олигонуклеотидов композиции; и/ил и

по меньшей мере некоторые олигонуклеотиды в эталонном множестве не содержит область крыла и область сердцевины.

[001172] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ введения композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, имеющих общую нуклеотидную последовательность, улучшение, которое предусматривает:

введение композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, которое характеризуется измененным связыванием белков относительно эталонной композиции олигонуклеотидов той же общей нуклеотидной последовательности.

[001173] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды и композиции увеличивают связывание полезных белков. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды и композиции уменьшают связывание вредных белков. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды и композиции увеличивают связывание полезных белков и уменьшают связывание вредных белков.

[001174] Согласно некоторым вариантам осуществления улучшенный профиль связывания с белком снижает токсичность и улучшает активность предложенных олигонуклеотидов и композиций. Согласно некоторым вариантам осуществления сниженное связывание с отрицательными регуляторами путей комплемента способствует снижению активации комплемента. Согласно некоторым вариантам осуществления сниженное связывание с определенными белками связано с меньшей токсичностью и/или улучшенной активностью. Согласно некоторым вариантам осуществления усиленное связывание с определенными белками способствует снижению токсичности и/или улучшению активности.

[001175] Связывание с различными белками, например, белками сыворотки, связывающими гепаринсульфат белками, внутриклеточными белками и т.д., олигонуклеотидами можно модулировать с использованием олигонуклеотидов, композиций и способов, представленных в настоящем раскрытии. Иллюстративные белки включают, но не ограничиваются ими, альбумин, фактор комплемента Н, фактор IX, АроЕ, тромбин, фактор Villa, кофактор гепарина II, альфа-2 макроглобулин, фактор роста фибробластов 1, фактор роста фибробластов 2, фактор роста/рессеивающий фактор гепатоцитов, сосудистый эндотелиальный фактор роста, группа белков высокой подвижности В1, циклофилин В, IL-8 (CXCL8), фактор тромбоцитов 4 (CXCL4), стромальный клеточный фактор-1 (CXCL12), моноцитарный белок-хемоаттрактант 1 (CCL2), рецептор фактора роста фибробластов 1, нейропилин-1, рецептор для конечного продукта усиленного гликозилирования, рецепторный белок тирозинфосфатаза Sigma. Slit-2, ROBO1, тромбин, антитромбин, ингибитор белка С, белок-предшественник амилоида 1, тромбоспондин-1, аннексии А2, PDGF ВВ, PC4/Sub1, RNF163/ZNF9, Ku70, Ku80, TCP1-альфа, TCP1-бета, TCP1-эпсилон, TCP1-гамма, TCP1-тета, TCP1-дельта, HSP90-AA1, HSP90-AB, HSP70-5/GRP78, HSPA1L, HSC70, АСТВ, TBBB2C, виментин, CArG, DHX30, EIF2S2, EIF4H, GRSF1, hnRNP D1L, hnRNPAl, hnRNPA2, hnRNPHl, hnRNPK, hnRNPQ, hnRNPU, hnRNPUL, ILF2, ILF3, KHSRP, La/SSB, NCL, NPM1, P54nrb, PSF, PSPC1, RHA, YBX1, ACLY, VARS, ANXA2, NDKA, тимидилаткиназа, JKBP1 дельта 6, SHMT2, LRPPRC, NARS, ATAD3A, KCTD12, CD4, GP120, aMb2 (Mac-1), VDAC-1, домен Ago2 PAZ, RAGE, AIM2, DHX36, DHX9, DDX41, IFI16, RIG-1, MDA5, LRRFIP1. DLM-1/ZBP1, TREX1, ламинин и фибронектин. Согласно некоторым вариантам осуществления множество олигонуклеотидов или композиция олигонуклеотидов может одновременно модулировать связывание с несколькими белками, включая поддержание одинаковых уровней связывания с одной группой белков, снижение уровней связывания с другой группой белков и/или увеличение уровня связывания с еще одной группой белков. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды, композиции и способы обеспечивают повышенное связывание с одним или более сывороточными белками. Согласно некоторым вариантам осуществления сывороточный белок представляет собой альбумин. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды, композиции и способы обеспечивают сниженное связывание с одним или более связывающими гепаринсульфат белками. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды, композиции и способы обеспечивают сниженное связывание с одним или более факторами Н.

[001176] Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка снижается более чем на 10%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка снижается более чем на 20%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка снижается более чем на 30%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка снижается более чем на 40%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка снижается более чем на 50%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка снижается более чем на 60%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка снижается более чем на 70%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка снижается более чем на 75%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка снижается более чем на 80%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка снижается более чем на 85%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка снижается более чем на 90%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка снижается более чем на 91%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка снижается более чем на 92%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка снижается более чем на 93%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка снижается более чем на 94%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка снижается более чем на 95%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка уменьшается более чем на 96%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка уменьшается более чем на 97%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка снижается более чем на 98%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка снижается более чем на 99%.

[001177] Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем на 10%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем на 20%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем на 30%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем на 40%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем на 50%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем на 60%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем на 70%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем на 80%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем на 90%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем на 100%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем на 150%. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 2 раза. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 3 раза. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 4 раза. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 5 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 6 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 7 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 8 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 9 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 10 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 15 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 20 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 25 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 30 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 35 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 40 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 45 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 50 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 60 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 70 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 80 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 90 раз. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка увеличивается более чем в 100 раз.

[001178] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает анализ для оценки связывания белка. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка может быть оценено путем связывания с альбумином. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка может быть оценено путем связывания с BSA. Согласно некоторым вариантам осуществления связывание белка может быть оценено in vitro. Дополнительные подходящие анализы широко известны в настоящей области техники.

[001179] Химические модификации, стереохимия и их комбинации, которые могут улучшать профили связывания белка, подробно описаны в настоящем раскрытии. Согласно некоторым вариантам осуществления более модифицированные межнуклеотидные связи могут усилить связывание белка. Согласно некоторым вариантам осуществления большее количество фосфоротиоатных связей может усилить связывание белка. Согласно некоторым вариантам осуществления меньшее количество модифицированных межнуклеотидных связей может уменьшить связывание белка. Согласно некоторым вариантам осуществления меньшее количество фосфоротиоатных связей может уменьшить связывание белка. Согласно некоторым вариантам осуществления большее количество хиральных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp увеличивает связывание белка. Согласно некоторым вариантам осуществления меньшее количество хиральных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp уменьшает связывание белка. Согласно некоторым вариантам осуществления большее количество модифицированных оснований увеличивает связывание белка. Согласно некоторым вариантам осуществления меньшее количество модифицированных оснований уменьшает связывание белка. Согласно некоторым вариантам осуществления один тип модификаций сахара может увеличить связывание белка по сравнению с другим. Согласно некоторым вариантам осуществления увеличенное содержание 2'-МОЕ уменьшает связывание белка по сравнению с 2'-ОМе. Настоящее раскрытие предусматривает многочисленные комбинации химических модификаций и/или профилей стереохимии для улучшения профилей связывания с белками. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает многочисленные комбинации химических модификаций и/или профилей стереохимии для улучшения профилей связывания с белками, в то же время обеспечивая более низкую токсичность и/или лучшую активность. Примеры олигонуклеотидов и композиций, обладающих этими модификациями, стереохимией или их комбинациями, описаны в настоящем описании в настоящем раскрытии.

[001180] Улучшенный профиль связывания с белком может быть выгодным для доставка олигонуклеотидов к мишеням. Согласно некоторым вариантам осуществления улучшенные свойства связывания с определенными белками облегчают транспортировку олигонуклеотидов в целевые клетки, ткани, органы или организм. Согласно некоторым вариантам осуществления улучшенные свойства связывания с определенными белками способствуют высвобождению олигонуклеотидов из белков и других молекул, так что они могут выполнять свои биологические функции, включая гибридизацию с целевыми последовательностями нуклеиновых кислот, ингибирование функций целевых последовательностей нуклеиновых кислот, расщепление целевых последовательностей нуклеиновых кислот и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды, композиции и способы обеспечивают улучшенный захват олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды, композиции и способы обеспечивают улучшенный захват олигонуклеотидов.

[001181] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ, предусматривающий введение композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов, причем эта композиция демонстрирует улучшенную доставку по сравнению с эталонной композицией, содержащей множество олигонуклеотидов, каждый из которых также имеет общую последовательность оснований, но который структурно отличается от олигонуклеотидов первого множества тем, что:

отдельные олигонуклеотиды в эталонном множестве отличаются друг от друга стерео химической структурой; и/или

по меньшей мере некоторые олигонуклеотиды в эталонном множестве имеют структуру, отличную от структуры, представленной множеством олигонуклеотидов композиции; и/ил и

по меньшей мере некоторые олигонуклеотиды в контрольном множестве не содержат область крыла и область сердцевины.

[001182] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ введения композиции олигонуклеотидов, содержащей первое множество олигонуклеотидов, имеющих общую нуклеотидную последовательность, улучшение, которое предусматривает:

введение олигонуклеотида, содержащего первое множество олигонуклеотидов, которое характеризуется улучшенной доставкой относительно эталонной композиции олигонуклеотидов той же общей нуклеотидной последовательности.

[001183] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды, композиции и способы обеспечивают улучшенную системную доставку. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды, композиции и способы обеспечивают улучшенную цитоплазматическую доставку. Согласно некоторым вариантам осуществления улучшенная доставка осуществляется к популяции клеток. Согласно некоторым вариантам осуществления улучшенная доставка осуществляется к ткани. Согласно некоторым вариантам осуществления улучшенная доставка осуществляется к органу. Согласно некоторым вариантам осуществления улучшенная доставка осуществляется к организму. Иллюстративные структурные элементы (например, химические модификации, стереохимия, их комбинации и т.д.), олигонуклеотиды, композиции и способы, которые обеспечивают улучшенную доставку, подробно описаны в настоящем раскрытии.

[001184] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способы снижения уровня целевой нуклеиновой кислоты в клетке, ткани и/или организме без низкой токсичности путем контактирования с предложенной композицией настоящего раскрытия. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способы снижения уровня целевой нуклеиновой кислоты в клетке, ткани и/или организме без снижения токсичности по сравнению с эталонной композицией путем контактирования с предложенной композицией настоящего раскрытия. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способы снижения уровня целевой нуклеиновой кислоты в клетке, ткани и/или организме без существенной активации комплемента путем контактирования с предложенной композицией настоящего раскрытия. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способы снижения уровня целевой нуклеиновой кислоты в активации комплемента клетки, ткани и/или организма по сравнению с эталонной композицией путем контактирования с предоставленной композицией этого раскрытия.

[001185] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способы идентификации и/или характеристики композиции олигонуклеотидов с улучшенными свойствами, например, токсичностью, активностью и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способы идентификации и/или характеристики композиции олигонуклеотидов с меньшей токсичностью по сравнению с эталонной композицией. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие обеспечивает способы идентификации и/или характеристики композиции олигонуклеотидов с улучшенными профилями связывания белка по сравнению с эталонной композицией.

[001186] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ идентификации и/или характеристики композиции олигонуклеотидов, причем способ предусматривает стадии:

обеспечения по меньшей мере одной композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов; а также

оценки токсичности относительно эталонной композиции.

[001187] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ идентификации и/или характеристики композиции олигонуклеотидов, причем способ предусматривает стадии:

обеспечения по меньшей мере одной композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов; а также

оценки активации комплемента относительно эталонной композиции.

[001188] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ идентификации и/или характеристики композиции олигонуклеотидов, причем способ предусматривает стадии:

обеспечения по меньшей мере одной композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов; а также

оценки профиля связывания белка относительно эталонной композиции.

[001189] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ идентификации и/или характеристики композиции олигонуклеотидов, причем способ предусматривает стадии:

обеспечения по меньшей мере одной композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов; а также

оценки доставки относительно эталонной композиции.

[001190] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способ идентификации и/или характеристики композиции олигонуклеотидов, причем способ предусматривает стадии:

обеспечения по меньшей мере одной композиции, содержащей первое множество олигонуклеотидов; а также

оценки захвата клетками относительно эталонной композиции.

[001191] Согласно некоторым вариантам осуществления свойства предложенных композиций олигонуклеотидов сравнивают с эталонной композицией олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция олигонуклеотидов содержит эталонное множество олигонуклеотидов.

[001192] Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция олигонуклеотидов представляет собой стереослучайную композицию олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция олигонуклеотидов представляет собой стереослучайную композицию олигонуклеотидов, в которой все межнуклеотидные связи являются фосфоротиоатными. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция олигонуклеотидов представляет собой композицию олигонуклеотидов ДНК со всеми фосфатными связями.

[001193] Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов, имеющих одну и ту же последовательность оснований и одни и те же химические модификации. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов, имеющих одну и ту же последовательность оснований и один и тот же профиль химических модификаций. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой хирально неконтролируемую (или стереослучайную) композицию олигонуклеотидов, имеющих одну и ту же последовательность оснований и химические модификации.

[001194] Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов, имеющих одну и ту же последовательность оснований, но различные химические модификации. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов, имеющих одну и ту же последовательность оснований, модификации оснований, модификации межнуклеотидных связей, но различные модификации сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция содержит меньшее количество 2'-модифицированных модификаций сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов, имеющих одну и ту же последовательность оснований, модификации оснований, модификации сахара, но различные модификации межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция содержит большее количество межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция содержит меньшее количество природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция содержит олигонуклеотиды, не имеющие природных фосфатных связей.

[001195] Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию, содержащую эталонное множество олигонуклеотидов, причем отдельные олигонуклеотиды в эталонном множестве отличаются друг от друга стереохимической структурой. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию, содержащую эталонное множество олигонуклеотидов, причем по меньшей мере некоторые олигонуклеотиды в эталонном множестве имеют структуру, отличную от структуры, представленной множеством олигонуклеотидов композиции, в сравнении с эталонной композицией. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию, содержащую эталонное множество олигонуклеотидов, причем по меньшей мере некоторые олигонуклеотиды в эталонном множестве не содержат область крыла и область сердцевины.

[001196] Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция олигонуклеотидов содержит эталонное множество олигонуклеотидов, имеющих одну и ту же общую нуклеотидную последовательность, но не имеющих по меньшей мере одного из одного или более модифицированных фрагментов сахара в олигонуклеотидах композиции олигонуклеотидов в сравнении с эталонной композицией. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция олигонуклеотидов содержит эталонное множество олигонуклеотидов, имеющих одну и ту же общую нуклеотидную последовательность, но не имеющих модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция олигонуклеотидов содержит эталонное множество олигонуклеотидов, имеющих одну и ту же общую нуклеотидную последовательность, но не содержащих природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотидов, имеющих одинаковые профили химических модификаций. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью другого стереоизомера.

[001197] Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция олигонуклеотидов предложенной композиции олигонуклеотидов представляет собой сопоставимое отсутствие композиции липидов в предложенной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция олигонуклеотидов представляет собой стереослучайную композицию олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция олигонуклеотидов представляет собой стереослучайную композицию олигонуклеотидов, из которых все межнуклеотидные связи являются фосфоротиоатными. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция олигонуклеотидов представляет собой композицию олигонуклеотидов ДНК со всеми фосфатными связями. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований и одинаковые химические модификации. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований и одинаковый профиль химических модификаций. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой хирально неконтролируемую (или стереослучайную) композицию олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований и химические модификации. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований, но с различными химическими модификациями. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований, модификации оснований, модификации межнуклеотидных связей, но различные модификации сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция содержит меньшее количество 2'-модифицированных модификаций сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований, модификации оснований, модификации сахара, но различные модификации межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция имеет больше межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция имеет меньше природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция содержит олигонуклеотиды, не имеющие природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию, содержащую эталонное множество олигонуклеотидов, причем отдельные олигонуклеотиды в эталонном множестве отличаются друг от друга стереохимической структурой. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию, содержащую эталонное множество олигонуклеотидов, причем по меньшей мере некоторые олигонуклеотиды в эталонном множестве имеют структуру, отличную от структуры, представленной множеством олигонуклеотидов композиции, по сравнению с эталонной композицией. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию, содержащую эталонное множество олигонуклеотидов, причем по меньшей мере некоторые олигонуклеотиды в эталонном множестве не содержат область крыла и область сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция олигонуклеотидов содержит эталонное множество олигонуклеотидов, имеющих одинаковую общую нуклеотидную последовательность, но не имеющих по меньшей мере одного из одного или более модифицированных фрагментов сахара в олигонуклеотидах композиции олигонуклеотидов по сравнению с эталонной композицией. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция олигонуклеотидов содержит эталонное множество олигонуклеотидов, имеющих одинаковую общую нуклеотидную последовательность, но не имеющих модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция олигонуклеотидов содержит эталонное множество олигонуклеотидов, имеющих одинаковую общую нуклеотидную последовательность, но не содержащих природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотидов, имеющих одинаковые профили химических модификаций. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью другого стереоизомера.

[001198] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат один или более структурных элементов (например, модификаций, стереохимии, профилей и т.д.), которые не все содержат олигонуклеотиды эталонного множества. Такие структурные элементы могут быть любыми, описанными в настоящем раскрытии.

[001199] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат больше фосфоротиоатных связей, чем олигонуклеотиды эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат больше фосфоротиоатных связей, чем олигонуклеотиды эталонной композиции в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат больше фосфоротиоатных связей, чем олигонуклеотиды эталонной композиции в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат больше фосфоротиоатных связей в области крыла, чем соответствующая область олигонуклеотидов эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат больше фосфоротиоатных связей в каждой области крыла, чем соответствующие области в олигонуклеотидах эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат больше хиральных межнуклеотидных связей в конфигурации Sp, чем олигонуклеотиды эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат больше фосфоротиоатных связей в конфигурации Sp, чем олигонуклеотиды эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат больше фосфоротиоатных связей в конфигурации Sp, чем олигонуклеотиды эталонной композиции в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат больше фосфоротиоатных связей в конфигурации Sp, чем олигонуклеотиды эталонной композиции в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат больше фосфоротиоатных связей в конфигурации Sp в области крыла, чем олигонуклеотиды эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат больше фосфоротиоатных связей в конфигурации Sp в каждой области крыла, чем олигонуклеотиды эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат больше модифицированных оснований, чем олигонуклеотиды эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат больше метилированных оснований, чем олигонуклеотиды эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат больше метилированных оснований, чем олигонуклеотиды эталонной композиции в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат больше метилированных оснований, чем олигонуклеотиды эталонной композиции в 3'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат больше метилированных оснований в области крыла, чем олигонуклеотиды эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат больше метилированных оснований в каждой области крыла, чем олигонуклеотиды эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат меньше модификаций 2'-МОЕ, чем олигонуклеотиды эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат меньше модификаций 2'-МОЕ, чем олигонуклеотиды эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат меньше модификаций 2'-МОЕ, чем олигонуклеотиды эталонной композиции в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат меньше модификаций 2'-МОЕ, чем олигонуклеотиды эталонной композиции на 3'-конце. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат меньше модификаций 2'-МОЕ в области крыла, чем олигонуклеотиды эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат меньше модификаций 2'-МОЕ в каждой области крыла, чем олигонуклеотиды эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления отдельные олигонуклеотиды в эталонном множестве отличаются друг от друга стереохимической структурой. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере некоторые олигонуклеотиды в эталонном множестве имеют структуру, отличную от структуры, представленной множеством олигонуклеотидов композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере некоторые олигонуклеотиды в эталонном множестве не содержат область крыла и область сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой по существу рацемический препарат олигонуклеотидов, которые характеризуются наличием одинаковой последовательности оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью другого типа олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат больше фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат только фосфоротиоатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат меньше модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат меньше модифицированных фрагментов сахара, причем модификация представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат больше модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат больше модифицированных фрагментов сахара, модификация представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат меньше фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат крыло и содержат меньшее количество фосфоротиоатных связей в крыле. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат меньше фосфоротиоатных связей в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат крыло и содержат меньше фосфоротиоатных связей в конфигурации Sp в крыле. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат больше фосфоротиоатных связей в конфигурации Rp. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат крыло и содержат больше фосфоротиоатных связей в конфигурации Rp в крыле. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат меньше метилированных оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат больше 2'-МОЕ-модификаций. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат меньше природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат меньше природных фосфатных связей на 5'- и/или 3'-конце. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат меньше природных фосфатных связей в области, соответствующей крылу олигонуклеотидов первого множества. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат природные фосфатные связи в крыле, а олигонуклеотиды эталонной композиции содержат меньше природных фосфатных связей в соответствующей области крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат природные фосфатные связи в крыле, а олигонуклеотиды эталонной композиции содержат модифицированные межнуклеотидные связи в одном или более положениях таких природных фосфатных связей в крыле. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат природные фосфатные связи в крыле, а олигонуклеотиды эталонной композиции содержат фосфоротиоатные связи в одном или более таких положениях природных фосфатных связей в крыле. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции не содержат природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции не содержат структуру крыло-сердцевина-крыло. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат 5'-концевую область крыла, содержащую природную фосфатную связь между двумя нуклеозидами на своем 3'-конце, и олигонуклеотиды эталонного множества не содержат природную фосфатную связь в том же положении. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды первого множества содержат 3'-концевую область крыла, содержащую природную фосфатную связь между двумя нуклеозидами на своем 5'-конце, и олигонуклеотиды эталонного множества не содержат природную фосфатную связь в том же положении. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенной композиции содержат меньше модификаций 2'-МОЕ, чем олигонуклеотиды эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенной композиции содержат меньше модификаций 2'-МОЕ, чем олигонуклеотиды эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенной композиции содержат меньше модификаций 2'-МОЕ, чем олигонуклеотиды эталонной композиции в 5'-концевой области. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенной композиции содержат меньше модификаций 2'-МОЕ. чем олигонуклеотиды эталонной композиции на 3'-конце. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенной композиции содержат меньше модификаций 2'-МОЕ в области крыла, чем олигонуклеотиды эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенной композиции содержат меньше модификаций 2'-МОЕ в каждой области крыла, чем олигонуклеотиды эталонной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления отдельные олигонуклеотиды в эталонном множестве отличаются друг от друга стереохимической структурой. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере некоторые олигонуклеотиды в эталонном множестве имеют структуру, отличную от структуры, представленной множеством олигонуклеотидов композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере некоторые олигонуклеотиды в эталонном множестве не содержат область крыла и область сердцевины. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой по существу рацемический препарат олигонуклеотидов, которые характеризуются наличием одинаковой последовательности оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью другого типа олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат больше фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат только фосфоротиоатные связи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат меньше модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат меньше модифицированных фрагментов сахара, причем модификация представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат больше модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат больше модифицированных фрагментов сахара, модификация представляет собой 2'-OR¹. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат меньше фосфоротиоатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат крыло и содержат меньшее количество фосфоротиоатных связей в крыле. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат меньше фосфоротиоатных связей в конфигурации Sp.Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат крыло и содержат меньше фосфоротиоатных связей в конфигурации Sp в крыле. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат больше фосфоротиоатных связей в конфигурации Rp.Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат крыло и содержат больше фосфоротиоатных связей в конфигурации Rp в крыле. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат меньше метилированных оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат больше модификаций 2'-МОЕ. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат меньше природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат меньше природных фосфатных связей на 5'- и/или 3'-конце. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции содержат меньше природных фосфатных связей в области, соответствующей крылу олигонуклеотидов первого множества. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенной композиции содержат природные фосфатные связи в крыле, а олигонуклеотиды эталонной композиции содержат меньше природных фосфатных связей в соответствующей области крыла. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенной композиции содержат природные фосфатные связи в крыле, а олигонуклеотиды эталонной композиции содержат модифицированные межнуклеотидные связи в одном или более таких положениях природных фосфатных связей в крыле. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенной композиции содержат природные фосфатные связисвязи в крыле, а олигонуклеотиды эталонной композиции содержат фосфоротиоатные связи в одном или более таких положениях природных фосфатных связей в крыле. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции не содержат природных фосфатных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонной композиции не содержат структуру крыло-сердцевина-крыло. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенной композиции содержат 5'-концевую область крыла, содержащую природную фосфатную связь между двумя нуклеозидами на своем 3'-конце, и олигонуклеотиды эталонного множества не содержат природной фосфатной связи в том же положении. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенной композиции содержат З'-концевую область крыла, содержащую природную фосфатную связь между двумя нуклеозидами на своем 5'-конце, и олигонуклеотиды эталонного множества не содержат природную фосфатную связь в том же положении. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонного множества содержат меньше нуклеотидных единиц, содержащих -F. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонного множества содержат меньше 2'-F модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды эталонного множества содержат меньше модифицированных межнуклеотидных связей с контролируемой хиральностью.

[001200] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержат олигонуклеотиды одного типа олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержат олигонуклеотиды только одного типа олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью имеют олигонуклеотиды только одного типа олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержат олигонуклеотиды двух или более типов олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления с использованием таких композиций предложенные способы могут предназначаться для более чем одной мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащая два или более типа олигонуклеотида, направленно воздействует на две или более мишени. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, содержащая два или более типа олигонуклеотида, направленно воздействует на два или более несовпадения. Согласно некоторым вариантам осуществления единственный тип олигонуклеотида направленно воздействует на две или более мишени, например, мутации. Согласно некоторым вариантам осуществления целевая область олигонуклеотидов одного типа олигонуклеотида содержит два или более «целевых сайтов», таких как две мутации или SNP.

[001201] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды в предложенной композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью необязательно содержат модифицированные основания или сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью не содержит модифицированные основания или сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью не содержит каких-либо модифицированных оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды в предложенной композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержат модифицированные основания и сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды в предложенной композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержат модифицированное основание. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды в предложенной композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержат модифицированный сахар. Модифицированные основания и сахара для олигонуклеотидов широко известны в данной области техники, включая без ограничения те, которые описаны в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированное основание представляет собой 5-mC. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированный сахар представляет собой 2'-модифицированный сахар. Подходящие 2'-модификации олигонуклеотидных Сахаров широко известны специалисту в данной области техники. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификации включают без ограничения 2'-OR¹, где R¹ представляет собой не водород. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-OR¹, где R¹ представляет собой необязательно замещенную C_1-6 алифатическую группу. Согласно некоторым вариантам осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-МОЕ. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация представляет собой 2'-галоген. Согласно некоторым вариантам осуществления модификация представляет собой 2'-F. Согласно некоторым вариантам осуществления модифицированные основания или сахара могут дополнительно повышать активность, стабильность и/или селективность композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, чей общий профиль хиральных центров остова обеспечивает неожиданную активность, стабильность и/или селективность.

[001202] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью не содержит модифицированных сахаров. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью не содержит каких-либо 2'-модифицированных сахаров. Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии неожиданно было обнаружено, что при использовании композиций олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью модифицированные сахара не нужны для стабильности, активности и/или контроля профилей расщепления. Кроме того, согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии неожиданно было обнаружено, что композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью без модифицированных сахаров обеспечивают лучшие свойства с точки зрения стабильности, активности, оборота и/или контроля профилей расщепления. Например, согласно некоторым вариантам осуществления неожиданно было обнаружено, что композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотидов, не имеющих модифицированные сахара, диссоциируют гораздо быстрее из продуктов расщепления и обеспечивают значительно ускоренный оборот, чем композиции олигонуклеотидов с модифицированными сахарами.

[001203] Как подробно обсуждается в настоящем раскрытии, в настоящем изобретении помимо прочего предложена композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, это означает, что композиция содержит множество олигонуклеотидов по меньшей мере одного типа. Каждая молекула олигонуклеотида определенного «типа» состоит из предварительно выбранных (например, предварительно определенных) структурных элементов, включая: (1) последовательность оснований; (2) профиль связей остова; (3) профиль хиральных центров остова; и (4) профиль фрагментов остова с модификацией Р. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции олигонуклеотидов содержат олигонуклеотиды, полученные при помощи единственного способа синтеза. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции содержат олигонуклеотиды, имеющие более одной хиральной конфигурации в одной молекуле олигонуклеотида (например, если различные остатки олигонуклеотида имеют различную стереохимию); согласно некоторым указанным вариантам осуществления указанные олигонуклеотиды можно получать при помощи единственного способа синтеза, и для получения отдельных молекул олигонуклеотидов, имеющих более одной хиральной конфигурации, не требуются вторичные стадии конъюгации.

[001204] Композиции олигонуклеотидов, предложенные в настоящем описании, можно применять в качестве агентов для модуляции различных клеточных процессов и механизмов, включая, но не ограничиваясь ими, транскрипцию, трансляцию, иммунные ответы, эпигенетику и т.д. Кроме того, композиции олигонуклеотидов, предложенные в настоящем описании, можно применять в качестве реагентов для исследовательских и/или диагностических задач. Специалистам в данной области техники будет очевидно, что описание настоящего изобретения не ограничено конкретным применением, но изобретение можно применять в любых ситуациях, где желательно применение синтетических олигонуклеотидов. Помимо прочего предложенные композиции подходят для различных терапевтических, диагностических, сельскохозяйственных и/или исследовательских применений.

[001205] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции олигонуклеотидов содержат олигонуклеотиды и/или их остатки, содержащие одну или более структурных модификаций, таких как подробно описано в настоящей заявке. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции олигонуклеотидов содержат олигонуклеотиды, содержащие один или более аналогов нуклеиновых кислот. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции олигонуклеотидов содержат олигонуклеотиды, содержащие одну или более искусственных нуклеиновых кислот или их остатков, включая, но не ограничиваясь ими: пептидонуклеиновую кислоту (ПНК), морфолино и закрытую нуклеиновую кислоту (ЗНК), гликоль-нуклеиновую кислоту (ГНК), треозо-нуклеиновую кислоту (ТНК), ксенонуклеиновые кислоты (КНК) и любую их комбинацию.

[001206] Согласно любым вариантам осуществления настоящее раскрытие подходит для модуляции экспрессии генов, иммунного ответа на основе олигонуклеотидов и т.д. Соответственно, вместо традиционных стереослучайных или не являющихся хирально-чистыми олигонуклеотидов можно применять стереоопределенные композиции олигонуклеотидов согласно настоящему раскрытию, которые содержат олигонуклеотиды предварительно определенного типа (т.е. которые являются хирально-контролируемыми и необязательно хирально-чистыми). Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции обладают улучшенным предполагаемым действием и/или пониженными нежелательными побочными эффектами. Определенные варианты осуществления биологических и клинических/терапевтических применений согласно настоящему раскрытию подробно обсуждают ниже.

[001207] Для введения предложенных композиций олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью можно применять различные схемы дозирования. Согласно некоторым вариантам осуществления вводят несколько стандартных доз, разделенных периодами времени. Согласно некоторым вариантам осуществления данная композиция имеет рекомендованную схему дозирования, которая может включать одну или более доз. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает совокупность доз, введение каждой из которых отделено от введения другой дозы периодами времени одинаковой продолжительности; Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает совокупность доз, а введение отдельных доз разделяют по меньшей мере два различных периода времени. Согласно некоторым вариантам осуществления все дозы, входящие в схему дозирования, содержат одинаковое дозируемое количество. Согласно некоторым вариантам осуществления различные дозы, входящие в схему дозирования, содержат различные количества. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает первую дозу, содержащую первое дозируемое количество, а затем одну или более дополнительных доз, содержащих второе дозируемое количество, отличающееся от первого дозируемого количества. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает первую дозу, содержащую первое дозируемое количество, а затем одну или более дополнительных доз, содержащих второе (или последующее) дозируемое количество, которое является одинаковым или отличается от первого дозируемого (или предшествующего дозируемого) количества. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает введение по меньшей мере одной стандартной дозы в течение по меньшей мере одного дня. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает введение более чем одной дозы в течение периода времени, составляющего по меньшей мере один день, а иногда более одного дня. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает введение нескольких доз в течение периода времени, составляющего по меньшей мере неделю. Согласно некоторым вариантам осуществления период времени составляет по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40 или более (например, примерно 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100 или более) недель. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает введение одной дозы в неделю в течение более чем одной недели. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает введение одной дозы в неделю в течение 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40 или более (например, примерно 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100 или более) недель. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает введение одной дозы каждые две недели в течение более чем двух недель. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает введение одной дозы каждые две недели в течение 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40 или более (например, примерно 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100 или более) недель. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает введение одной дозы в месяц в течение одного месяца. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает введение одной дозы в месяц в течение более чем одного месяца. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает введение одной дозы в месяц в течение 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12 или более месяцев. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает введение одной дозы в неделю в течение примерно 10 недель. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает введение одной дозы в неделю в течение примерно 20 недель. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает введение одной дозы в неделю в течение примерно 30 недель. Согласно некоторым вариантам осуществления схема дозирования включает введение одной дозы в неделю в течение 26 недель. Согласно некоторым вариантам осуществления хирально-контролируемую композицию олигонуклеотида вводят согласно схеме дозирования, отличающейся от схемы, в которой применяют хирально-неконтролируемую (например, стереослучайную) композицию олигонуклеотидов, имеющих такие же последовательности, и/или другую хирально-контролируемую композицию олигонуклеотидов, имеющих такие же последовательности. Согласно некоторым вариантам осуществления хирально-контролируемую композицию олигонуклеотидов вводят согласно схеме дозирования, которая сокращена по сравнению со схемой, в которой применяют хирально-неконтролируемую (например, стереослучайную) композицию олигонуклеотидов, имеющих такие же последовательности, то есть она обеспечивает пониженный уровень общего воздействия в данный промежуток времени, включает использование одной или более уменьшенных стандартных доз и/или включает уменьшение количества доз, вводимых за данный промежуток времени. Согласно некоторым вариантам осуществления хирально-контролируемую композицию олигонуклеотидов вводят согласно схеме дозирования, которая является более продолжительной по сравнению со схемой, в которой применяют хирально-неконтролируемую (например, стереослучайную) композицию олигонуклеотидов, имеющих такие же последовательности. Не желая быть ограниченными теорией, авторы настоящего изобретения отмечают, что Согласно некоторым вариантам осуществления сокращение схемы дозирования и/или увеличение интервалов между введением доз могут быть обусловлены улучшенной стабильностью, биодоступностью и/или эффективностью композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью имеет более продолжительную схему дозирования по сравнению с соответствующей хирально-неконтролируемой композицией олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью имеет уменьшенные интервалы между введением по меньшей мере двух доз по сравнению с соответствующей хирально-неконтролируемой композицией олигонуклеотидов. Не желая быть ограниченными теорией, авторы настоящего изобретения отмечают, что Согласно некоторым вариантам осуществления увеличение продолжительности схемы дозирования и/или сокращение интервалов между введением доз могут быть обусловлены улучшенной безопасностью композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью.

[001208] Согласно некоторым вариантам осуществления со своей низкой токсичностью предложенные олигонуклеотиды и композиции могут вводиться в более высоких дозах и/или с более высокой частотой. Согласно некоторым вариантам осуществления со своей улучшенной доставкой (и другими свойствами) предложенные композиции могут вводиться в более низких дозах и/или с более низкой частотой для достижения биологических эффектов, например, клинической эффективности.

[001209] Одна доза может содержать различные количества олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления однократная дозировка может содержать различные количества олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, подходящие согласно настоящей заявке. Согласно некоторым вариантам осуществления однократная дозировка содержит примерно 1, 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 210, 220, 230, 240, 250, 260, 270, 280, 290, 300 или более (например, 350, 400, 450, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более) мг олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления однократная дозировка содержит примерно 1 мг олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления однократная дозировка содержит примерно 5 мг олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления однократная дозировка содержит примерно 10 мг олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления однократная дозировка содержит примерно 15 мг олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления однократная дозировка содержит примерно 20 мг олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления однократная дозировка содержит примерно 50 мг олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления однократная дозировка содержит примерно 100 мг олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления однократная дозировка содержит примерно 150 мг олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления однократная дозировка содержит примерно 200 мг олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления однократная дозировка содержит примерно 250 мг олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления однократная дозировка содержит примерно 300 мг олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью вводят с использованием более низких количеств, содержащихся в одной дозе, и/или более низкой общей дозировки по сравнению с хирально-неконтролируемым олигонуклеотидом. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью вводят с использованием более низких количеств, содержащихся в одной дозе, и/или более низкой общей дозировки по сравнению с хирально-неконтролируемым олигонуклеотидом благодаря улучшенной эффективности. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью вводят с использованием более высоких количеств, содержащихся в одной дозе, и/или более высокой общей дозировки по сравнению с хирально-неконтролируемым олигонуклеотидом. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью вводят с использованием более высоких количеств, содержащихся в одной дозе, и/или более высокой общей дозировки по сравнению с хирально-неконтролируемым олигонуклеотидом благодаря улучшенной безопасности.

Биологически активные олигонуклеотиды

[001210] Предложенная композиция олигонуклеотидов, применяемая согласно настоящему описанию, может содержать одноцепочечные олигонуклеотиды и/или олигонуклеотиды, состоящие из нескольких цепей. Согласно некоторым вариантам осуществления одноцепочечные олигонуклеотиды содержат самокомплементарные фрагменты, которые могут гибридизоваться в соответствующих условиях, то есть при использовании даже одноцепочечные олигонуклеотиды могут иметь по меньшей мере отчасти характеристики двойной цепи. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид, содержащийся в предложенной композиции, является одноцепочечным, двухцепочечным или трехцепочечным. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид, содержащийся в предложенной композиции, содержит одноцепочечный фрагмент и фрагмент, содержащий несколько цепей олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления, как отмечалось выше, отдельные одноцепочечные олигонуклеотиды могут содержать двухцепочечные фрагменты и одноцепочечные фрагменты.

[001211] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции содержат один или более олигонуклеотидов, которые являются полностью или частично комплементарными с цепями: структурных генов, генов, содержащих контрольные и терминальные области, и/или самовоспроизводящихся систем, таких как вирусная или плазмидная ДНК. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции содержат один или более олигонуклеотидов, представляющих собой или действующих как миРНК и другие агенты РНК-интерференции (агенты РНКи или агенты иРНК), кшРНК, антисмысловые олигонуклеотиды, самоотщепляемые РНК, рибозимы, их фрагменты и/или варианты (такие как пептидилтрансфераза 23 S рРНК, РНКаза Р, интроны группы I и группы II, разветвленные рибозимы GIR1, лидзим, рибозимы со шпилечными структурами, рибозимы со структурой «головка молотка», рибозимы HDV, рибозим млекопитающих СРЕВЗ, рибозимы VS, рибозимы glmS, рибозим СоТС и т.д.), микроРНК, имитаторы микроРНК, супермиры, аптамеры, антимиры, антагомиры, адаптеры UI, триплекс-образующие олигонуклеотиды, активаторы РНК, длинноцепочечные некодирующие РНК, короткоцепочечные некодирующие РНК (например, пиРНК), имму но модулирующие олигонуклеотиды (такие как иммуностимулирующие олигонуклеотиды, иммуноподавляющие олигонуклеотиды), ГНК, ЗНК, ЭНК, ПНК, ТНК, морфолино, G-квадруплексы (РНК и ДНК), противовирусные олигонуклеотиды и олигонуклеотиды-«ловушки».

[001212] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции содержат один или более гибридных (например, химерных) олигонуклеотидов. В контексте настоящего описания термин «гибрид» в целом относится к смешанным структурным компонентам олигонуклеотидов. Гибридные олигонуклеотиды могут относиться, например, к (1) молекуле олигонуклеотида, содержащей нуклеотиды смешанных классов, например, части ДНК и части РНК в одной молекуле (например, ДНК-РНК); (2) комплементарным парам нуклеиновых кислот различных классов, то есть происходит внутримолекулярное или межмолекулярное спаривание оснований ДНК:РНК; или к обоим указанным типам; или (3) олигонуклеотиду, содержащему два или более видов остовов или межнуклеотидных связей.

[001213] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции содержат один или более олигонуклеотидов, содержащих более одного класса остатков нуклеиновых кислот в одной молекуле. Например, в любом из вариантов осуществления, описанных в настоящей заявке, олигонуклеотид может содержать фрагмент ДНК и фрагмент РНК. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид может содержать немодифицированный фрагмент и модифицированный фрагмент.

[001214] Предложенные композиции олигонуклеотидов могут содержать олигонуклеотиды, содержащие любую из различных модификаций, например, таких как описано в настоящей заявке. Согласно некоторым вариантам осуществления конкретные модификации выбирают, например, с учетом предполагаемого применения. Согласно некоторым вариантам осуществления желательно модифицировать одну или обе цепи двухцепочечного олигонуклеотида (или двухцепочечного фрагмента одноцепочечного олигонуклеотида). Согласно некоторым вариантам осуществления две цепи (или фрагмента) содержат различные модификации. Согласно некоторым вариантам осуществления две цепи содержат одинаковые модификации. Специалистам в данной области техники будет понятно, что уровень и тип модификаций, обеспечиваемые при помощи способов согласно настоящему раскрытию, позволяют проводить разнообразные перестановки модификаций. Примеры таких модификаций описаны в настоящей заявке и не являются ограничивающими.

[001215] Фраза «антисмысловая цепь», используемая в настоящем описании, относится к олигонуклеотиду, который является по существу или на 100% комплементарным данной целевой последовательности. Фраза «антисмысловая цепь» включает антисмысловой фрагмент обоих олигонуклеотидов, полученных из двух отдельных цепей, а также одномолекулярные олигонуклеотиды, в которых могут образовываться шпилечные структуры или структуры типа «гантель». Термины «антисмысловая цепь» и «направляющая цепь» используют в настоящем описании взаимозаменяемо.

[001216] Фраза «смысловая цепь» относится к олигонуклеотиду, имеющему последовательность нуклеозидов, которая является полностью или частично одинаковой с целевой последовательностью, такому как информационная РНК или последовательность ДНК. Термины «смысловая цепь» и «сопровождающая цепь» используют в настоящем описании взаимозаменяемо.

[001217] Под «целевой последовательностью» понимают любую последовательность нуклеиновой кислоты, экспрессию или активность которой необходимо модулировать. Целевая нуклеиновая кислота может представлять собой ДНК или РНК, такую как эндогенная ДНК или РНК, вирусная ДНК или РНК или другие РНК, кодируемые геном, вирусом, бактерией, грибком, млекопитающим или растением. Согласно некоторым вариантам осуществления целевая последовательность связана с заболеванием или нарушением. Как проиллюстрировано в настоящем раскрытии, согласно некоторым вариантам осуществления целевая последовательность представляет собой или содержит часть гена DMD; согласно некоторым вариантам осуществления целевая последовательность представляет собой или содержит часть пре-мРНК DMD; согласно некоторым вариантам осуществления целевая последовательность представляет собой или содержит часть мРНК DMD; согласно некоторым вариантам осуществления целевая последовательность представляет собой часть гена DMD; согласно некоторым вариантам осуществления целевая последовательность представляет собой часть пре-мРНК DMD и согласно некоторым вариантам осуществления целевая последовательность представляет собой часть мРНК DMD. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды гибридизуются с целевой последовательностью.

[001218] Под «специфической гибридизацией» или «комплементарностью» подразумевают, что нуклеиновая кислота может образовывать водородную(ые) связь(и) с другой последовательностью нуклеиновой кислоты по традиционной модели Уотсона-Крика или другому нетрадиционному механизму. Если рассматривать молекулы нуклеиновых кислот согласно настоящему раскрытию, то свободная энергия связывания молекулы нуклеиновой кислоты с комплементарной последовательностью является достаточной для осуществления важной функции нуклеиновой кислоты, например, активности РНКи. Определение свободной энергии связывания для молекул нуклеиновых кислот хорошо известно в данной области техники (смотрите, например, Turner et al, 1987, CSH Symp.Quant. Biol. LIT pp.123-133; Freier et al., 1986, Proc. Nat. Acad. Sci. USA 83:9373-9377; Turner et al., 1987, J. Am. Chem. Soc. 109:3783-3785). [001219] Комплементарность в процентах указывает на содержание в процентах сопряженных остатков в молекулы нуклеиновой кислоты, которые могут образовывать водородные связи (например, пары оснований Уотсона-Крика) с последовательностью второй нуклеиновой кислоты (например, 5, 6, 7, 8, 9, 10 из 10 соответствуют 50%, 60%, 70%, 80%, 90% и 100% комплементарности). «Полная комплементарность» или «100% комплементарность» обозначают, что все сопряженные остатки последовательности нуклеиновой кислоты образуют водородные связи с таким же числом сопряженных остатков последовательности второй нуклеиновой кислоты. Неполная комплементарность относится к ситуации, при которой некоторые, но не все нуклеозидные звенья двух цепей могут образовывать водородные связи друг с другом. «Существенная комплементарность» относится к цепям полинуклеотидов, имеющих комплементарность 90% или более, за исключением фрагментов цепей полинуклеотидов, таких как «липкие» концы, которые специально выбирают таким образом, чтобы они были некомплементарными. Специфическое связывание требует значительной степени комплементарности для предотвращения неспецифического связывания олигомерного соединения с последовательностями, не являющимися целевыми, в условиях, при которых желательно специфическое связывание, например, в физиологических условиях в случае исследований in vivo или терапевтического лечения, а в случае исследований in vitro в условиях, при которых проводят исследование. Согласно некоторым вариантам осуществления последовательности, не являющиеся целевыми, отличаются от соответствующих целевых последовательностей по меньшей мере на 5 нуклеотидов.

[001220] При использовании в качестве терапевтического агента предложенный олигонуклеотид вводят в виде фармацевтической композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления фармацевтическая композиция содержит терапевтически эффективное количество предложенного олигонуклеотида или его фармацевтически приемлемой соли и по меньшей мере один фармацевтически приемлемый неактивный ингредиент, выбранный из фармацевтически приемлемых разбавителей, фармацевтически приемлемых вспомогательных веществ и фармацевтически приемлемых носителей. Согласно другому варианту осуществления фармацевтическая композиция предназначена для внутривенной инъекции, перорального введения, трансбуккального введения, ингаляции, интраназального введения, местного введения, введения в глаза или введения уши. Согласно другим вариантам осуществления фармацевтическая композиция представляет собой таблетку, пилюлю, капсулу, жидкость, ингалируемый препарат, раствор для назального спрея, суппозиторий, суспензию, гель, коллоид, дисперсию, суспензию, раствор, эмульсию, мазь, лосьон, глазные капли, ушные капли.

Фармацевтические композиции

[001221] При использовании в качестве терапевтического агента предложенный олигонуклеотид или композицию олигонуклеотидов, описанную в настоящей заявке, вводят в виде фармацевтической композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления фармацевтическая композиция содержит терапевтически эффективное количество предложенных олигонуклеотидов или их фармацевтически приемлемых солей и по меньшей мере один фармацевтически приемлемый неактивный ингредиент, выбранный из фармацевтически приемлемых разбавителей, фармацевтически приемлемых вспомогательных веществ и фармацевтически приемлемых носителей. Согласно некоторым вариантам осуществления в предложенных композициях предложенные олигонуклеотиды могут существовать в виде солей, предпочтительно фармацевтически приемлемых солей, например, солей натрия, аммониевых солей и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления соль предложенного олигонуклеотида содержит два или более катиона, например, согласно некоторым вариантам осуществления вплоть до количества отрицательно заряженных кислых групп (например, фосфата, фосфоротиоата и т.д.) в олигонуклеотиде. Согласно некоторым вариантам осуществления фармацевтическая композиция предназначена для внутривенной инъекции, перорального введения, трансбуккального введения, ингаляции, интраназального введения, местного введения, введения в глаза или в уши. Согласно некоторым вариантам осуществления фармацевтическая композиция представляет собой таблетку, пилюлю, капсулу, жидкость, ингалируемый препарат, раствор для распыления в нос, суппозиторий, суспензию, гель, коллоид, дисперсию, суспензию, раствор, эмульсию, мазь, лосьон, глазные капли или ушные капли.

[001222] Согласно некоторым вариантам осуществления в настоящем раскрытии предложена фармацевтическая композиция, содержащая олигонуклеотид с контролируемой хиральностью или содержащую его композицию в смеси с фармацевтически приемлемым вспомогательным веществом. Специалистам в данной области техники должно быть понятно, что фармацевтические композиции содержат фармацевтически приемлемые соли олигонуклеотида с контролируемой хиральностью или содержащую его композицию, описанную выше.

[001223] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает технологии (например, композиции, способы и т.д.) для комбинированной терапии, например, с другими терапевтическими агентами и/или медицинскими процедурами. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды и/или композиции могут использоваться вместе с одним или более другими терапевтическими агентами. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции содержат предложенные олигонуклеотиды и один или более других терапевтических агентов. Согласно некоторым вариантам осуществления один или более других терапевтических агентов могут иметь одну или более различных мишеней и/или один или более различных механизмов по отношению к мишеням по сравнению с предложенными олигонуклеотидами в композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления терапевтический агент представляет собой олигонуклеотид. Согласно некоторым вариантам осуществления терапевтический агент представляет собой низкомолекулярное лекарственное средство. Согласно некоторым вариантам осуществления терапевтический агент представляет собой белок. Согласно некоторым вариантам осуществления терапевтический агент представляет собой антитело. Ряд терапевтических агентов может быть использован в соответствии с настоящим изобретением. Например, олигонуклеотиды для DMD могут быть использованы вместе с одним или более терапевтическими агентами, которые модулируют продукцию атрофина (модуляторы атрофина). Согласно некоторым вариантам осуществления модулятор атрофина способствует производству атрофина. Согласно некоторым вариантам осуществления модулятор атрофина представляет собой эзутромид. Согласно некоторым вариантам осуществления модулятор атрофина представляет собой или его фармацевтически приемлемую соль. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды или их композиции вводят до, одновременно или после одного или более других терапевтических агентов и/или медицинских процедур. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды или их композиции вводят одновременно с одним или более другими терапевтическими агентами и/или медицинскими процедурами. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды или их композиции вводят перед одним или более другими терапевтическими агентами и/или медицинскими процедурами. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды или их композиции вводят после одного или более других терапевтических агентов и/или медицинских процедур. Согласно некоторым вариантам осуществления композиции содержат один или более других терапевтических агентов.

[001224] Для доставки нуклеиновых кислот можно применять различные супрамолекулярные наноносители. Примеры наноносителей включают, но не ограничиваются ими, липосомы, комплексы катионных полимеров и различные полимеры. Образование комплексов нуклеиновых кислот с различными поликатионами является другим подходом для внутриклеточной доставки; этот подход включает использованием пегилированных поликатионов, комплексов полиэтиленимина (ПЭИ), катионные блоксополимеры и дендримеры. Некоторые катионные наноносители, включая ПЭИ и полиамидоамин-дендримеры, способствуют высвобождению содержимого из эндосом. Другие подходы включают использование полимерных наночастиц, полимерных мицелл, квантовых точек и липоплексов. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид конъюгирован с другой молекулой.

[001225] Помимо иллюстративных стратегий доставки, описанных в настоящей заявке, известны дополнительные стратегии доставки нуклеиновых кислот.

[001226] Для терапевтических и/или диагностических применений соединения согласно настоящему раскрытию соединения могут быть введены в составы, подходящие для различных способов введения, включая системное и местное или локализованное введение. Способы и составы, в целом, можно найти в Remington, The Science and Practice of Pharmacy, (20th ed. 2000).

[001227] Предложенные олигонуклеотиды и содержащие их композиции являются эффективными в широком диапазоне дозировок. Например, при лечении взрослого человека примерами дозировок, которые можно применять, являются дозировки от примерно 0,01 до примерно 1000 мг, от примерно 0,5 до примерно 100 мг, от примерно 1 до примерно 50 мг в день и от примерно 5 до примерно 100 мг в день. Точная дозировка зависит от способа введения, формы, в которой вводят соединение, субъекта, подвергающегося лечению, массы тела субъекта, подвергающегося лечению, и предпочтения и опыта лечащего врача.

[001228] Фармацевтически приемлемые соли, в целом, хорошо известны специалистам в данной области техники и могут включать в качестве примера, но не ограничения, ацетат, бензолсульфонат, безилат, бензоат, бикарбонат, битартрат, бромид, эдетат кальция, камзилат, карбонат, цитрат, эдетат, эдизилат, эстолат, эзилат, фумарат, глюцептат, глюконат, глутамат, гликолиларсанилат, гексилрезорцинат, гидрабамин, гидробромид, гидрохлорид, гидроксинафтоат, йодид, изетионат, лактат, лактобионат, манат, малеат, манделат, мезилат, мукат, нафзилат, нитрат, памоат (эмбонат), пантотенат, фосфат/дифосфат, полигалактуронат, салицилат, стеарат, субацетат, сукцинат, сульфат, таннат, тартрат или теоклат. Другие фармацевтически приемлемые соли можно найти, например, в Remington, The Science and Practice of Pharmacy (20th ed. 2000). Предпочтительные фармацевтически приемлемые соли включают, например, ацетат, бензоат, бромид, карбонат, цитрат, глюконат, гидробромид, гидрохлорид, малеат, мезилат, нафзилат, памоат (эмбонат), фосфат, салицилат, сукцинат, сульфат или тартрат.

[001229] Специалисту в настоящей области техники должно быть понятно, что олигонуклеотиды могут быть составлены в виде ряда солей, например, для фармацевтических целей. Согласно некоторым вариантам осуществления соль представляет собой соль катиона металла и/или соль аммония. Согласно некоторым вариантам осуществления соль представляет собой соль катиона металла олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления соль представляет собой аммониевую соль олигонуклеотида. Типичные соли щелочных или щелочноземельных металлов включают соли натрия, лития, калия, кальция, магния и т.п. Согласно некоторым вариантам осуществления соль представляет собой натриевую соль олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления фармацевтически приемлемые соли включают, при необходимости, нетоксичные аммониевые, четвертичные аммониевые и аминные катионы, образованные с такими противоионами, как гидроксид, карбоксилат, сульфат, фосфат, нитрат, сульфонат, фосфоротиоат и т.д., которые могут находиться в предложенных олигонуклеотидах. Специалисту в настоящей области техники должно быть понятно, что соль олигонуклеотида может содержать более одного катиона, например, ионы натрия, так как в олигонуклеотиде может быть более одного аниона.

[001230] В зависимости от конкретных состояний, подвергающихся лечению, указанные агенты можно вводить в состав жидких или твердых лекарственных форм и вводить системно или местно. Агенты можно доставлять, например, в форме с регулируемым по времени или замедленным высвобождением, что известно специалистам в данной области техники. Способы получения составов и введения можно найти в Remington, The Science and Practice of Pharmacy (20th ed. 2000). Подходящие способы введения могут включать пероральное, трансбуккальное, введение путем ингалируемого спрея, подъязычное, ректальное, трансдермальное, внутривагинальное, чресслизистое. интраназальное или энтеральное введение; парентеральную доставку, включая внутримышечные, подкожные, внутрикостные инъекции, а также интратекальные, прямые внутрижелудочковые, внутривенные, внутрисуставные, интрастернальные, интрасиновиальные, внутрипеченочные, внутриочаговые, интракраниальные, интраперитонеальные, интраназальные или внутриглазные инъекции или другие способы доставки.

[001231] В случае инъекций агенты согласно настоящему раскрытию можно вводить в состав и разбавлять в водных растворах, таких как физиологически совместимые буферы, такие как раствор Хэнка, раствор Рингера или физиологический солевой буфер. В случае чресслизистого введения в составе используют агенты, увеличивающие проницаемость через барьер, через который необходимо проникать. Указанные агенты, увеличивающие проницаемость, в целом известны в данной области техники.

[001232] Применение фармацевтически приемлемых инертных носителей для получения составов, содержащих соединения, предложенные в настоящем раскрытии для осуществления настоящего раскрытия, в дозировках, подходящих для системного введения, включено в объем изобретения. При надлежащем выборе носителя и подходящего способа получения композиции согласно настоящему раскрытию, в частности те, что получены в виде растворов, можно вводить парентерально, например, путем внутривенной инъекции.

[001233] Соединения можно легко вводить в составы с использованием фармацевтически приемлемых носителей, хорошо известных в данной области техники, в дозировках, подходящих для перорального введения. Указанные носители позволяет вводить соединения согласно настоящему раскрытию в состав таблеток, пилюль, капсул, жидкостей, гелей, сиропов, взвесей, суспензий и т.д., которые субъект (например, пациент), подвергающийся лечению, принимает внутрь при помощи перорального способа.

[001234] В случае интраназальной доставки или доставки путем ингаляции агенты согласно настоящему раскрытию также можно вводить в составы при помощи способов, известных специалистам в данной области техники, включая, но не ограничиваясь ими, например, использование веществ, увеличивающих растворимость, разбавляющих или диспергирующих веществ, таких как солевой раствор, консервантов, таких как бензиловый спирт, усилителей всасываемости и фторуглеродов.

[001235] Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды и композиции доставляют в ЦНС. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды и композиции доставляют в спинномозговую жидкость. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды и композиции вводят в паренхиму головного мозга. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды и композиции доставляют животному/субъекту путем интратекального введения или интрацеребровентрикулярного введения. Широкое распространение описанных в настоящем описании олигонуклеотидов и композиций в центральной нервной системе может быть достигнуто с помощью интрапаренхиматозного введения, интратекального введения или интрацеребровентрикулярного введения.

[001236] Согласно некоторым вариантам осуществления парентеральное введение осуществляют путем инъекции, например, с помощью шприца, насоса и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления инъекция представляет собой болюсную инъекцию. Согласно некоторым вариантам осуществления инъекцию вводят непосредственно в ткань, такую как стриатум, каудат, кора, гиппокамп и мозжечок.

[001237] Согласно некоторым вариантам осуществления способы специфической локализации фармацевтического агента, такие как болюсная инъекция, снижают среднюю эффективную концентрацию (ЕС50) в 20, 25, 30, 35, 40, 45 или 50. Согласно некоторым вариантам осуществления фармацевтический агент в антисмысловом соединении является таковым, как описано далее. Согласно определенным вариантам осуществления целевая ткань представляет собой ткань головного мозга. Согласно некоторым вариантам осуществления целевая ткань представляет собой стриарную ткань. Согласно некоторым вариантам осуществления желательно уменьшение ЕС50, поскольку оно уменьшает дозу, необходимую для достижения фармакологического результата у нуждающегося в этом пациента.

[001238] Согласно некоторым вариантам осуществления антисмысловой олигонуклеотид вводят посредством инъекции или инфузии один раз в месяц, каждые два месяца, каждые 90 дней, каждые 3 месяца, каждые 6 месяцев, два раза в год или один раз в год.

[001239] Фармацевтические композиции, подходящие для применения согласно настоящему раскрытию, включают композиции, где активные ингредиенты содержатся в количестве, которое является эффективным для достижения предполагаемой цели. Определение эффективных количеств, в частности с учетом приведенного подробного описания находится в рамках компетенции специалистов в данной области техники.

[001240] Помимо активных ингредиентов указанные фармацевтические композиции могут содержать подходящие фармацевтически приемлемые носители, включая вспомогательные вещества и добавки, которые способствуют введению активного соединения в препараты, которые можно применять в области фармацевтики. Препараты, предназначенные для перорального введения, могут быть в виде таблеток, драже, капсул или растворов.

[001241] Фармацевтические препараты для перорального применения можно получать путем объединения активного соединения и твердых вспомогательных веществ, необязательно измельчения полученной смеси и обработки смеси гранул после добавления подходящих добавок, если это желательно, с получением таблеток или ядер драже. Подходящими вспомогательными веществами в частности являются наполнители, такие как сахара, включая лактозу, сахарозу, маннит или сорбит; препараты целлюлозы, например, кукурузный крахмал, пшеничный крахмал, рисовый крахмал, картофельный крахмал, желатин, трагакантовая камедь, метилцеллюлоза, гидроксипропилметилцеллюлоза, карбоксиметилцеллюлоза (КМЦ) натрия и/или поливинилпирролидон (PVP; повидон). При желании можно добавлять разрыхлители, такие как перекрестно-сшитый поливинилпирролидон, агар или альгиновая кислота или ее соль, такая как альгинат натрия.

[001242] Ядра драже обеспечены подходящими оболочками. Для этого можно использовать концентрированные растворы сахаров, которые необязательно могут содержать аравийскую камедь, тальк, поливинилпирролидон, гель карбопол, полиэтиленгликоль (ПЭГ) и/или диоксид титана, растворы лаков и подходящие органические растворители или смеси растворителей. Для распознавания или определения различных комбинаций доз активного соединения в таблетки или оболочки драже можно добавлять красители или пигменты.

[001243] Фармацевтические препараты, которые можно использовать перорально, включают твердые капсулы, полученные из желатина, а также мягкие закрытые капсулы, полученные из желатина и пластификатора, такого как глицерин или сорбит. Твердые капсулы могут содержать активные ингредиенты в смеси с наполнителем, таким как лактоза, связывающими веществами, такими как крахмалы, и/или смазывающими веществами, такими как тальк или стеарат магния, и, необязательно, со стабилизаторами. В мягких капсулах активное соединение может быть растворено или суспендировано в подходящих жидкостях, таких как жирные масла, жидкий парафин или жидкие полиэтиленгликоли (ПЭГ). Кроме того, можно добавлять стабилизаторы.

[001244] Композицию можно получить путем объединения активного соединения с липидом. Согласно некоторым вариантам осуществления липид конъюгируют с активным соединением. Согласно некоторым вариантам осуществления липид не конъюгируют с активным соединением. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-4 алифатическими группами. Согласно различным вариантам осуществления липид выбирают из группы, состоящей из лауриновой кислоты, миристиновой кислоты, пальмитиновой кислоты, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, докозагексаеновой кислоты (цис-ДГК), турбинаровой кислоты и дилинолеила. Согласно некоторым вариантам осуществления липид имеет структуру любого из:

Согласно различным вариантам осуществления активное соединение представляет собой любой олигонуклеотид или другую нуклеиновую кислоту, описанную в настоящем описании. Согласно различным вариантам осуществления активное соединение представляет собой олигонуклеотид, способный опосредовать пропуски экзона в дистрофине. Согласно различным вариантам осуществления активное соединение представляет собой олигонуклеотид, способный опосредовать пропуск экзона 51 в дистрофине. Согласно различным вариантам осуществления активное соединение представляет собой нуклеиновую кислоту последовательности, содержащей или состоящей из любой последовательности любой нуклеиновой кислоты, указанной в таблицах 2-4. Согласно различным вариантам осуществления активное соединение представляет собой нуклеиновую кислоту последовательности, содержащей или состоящей из любой последовательности любой нуклеиновой кислоты, указанной в таблице 2. Согласно различным вариантам осуществления активное соединение представляет собой нуклеиновую кислоту последовательности, содержащей или состоящей из любой последовательности любой нуклеиновой кислоты, указанной в таблице 3. Согласно различным вариантам осуществления активное соединение представляет собой нуклеиновую кислоту последовательности, содержащей или состоящей из любой последовательности любой нуклеиновой кислоты, указанной в таблице 4. Согласно различным вариантам осуществления композиция содержит липид и активный соединение и дополнительно содержит другой компонент, выбранный из: другого липида и целевого соединения или фрагмента. Согласно некоторым вариантам осуществления липид включает, не ограничиваясь ими: аминолипид; амфипатический липид; анионный липид; аполипопротеин; катионный липид; низкомолекулярный катионный липид; катионный липид, такой как CLinDMA и DLinDMA; ионизируемый катионный липид; маскирующий компонент; вспомогательный липид; липопептид; нейтральный липид; нейтральный цвиттерионный липид; гидрофобную малую молекулу; гидрофобный витамин; ПЭГ-липид; незаряженный липид, модифицированный одним или несколькими гидрофильными полимерами; фосфолипиды; такой фосфолипид, как 1,2-диолеоил-sn-глицеро-3-фосфоэтаноламин; липид-невидимку; стерол; холестерин и нацеливающий липид; и любой другой липид, описанный в настоящем описании или описанный в настоящей области техники. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция содержит липид и часть другого липида, способного опосредовать по меньшей мере одну функцию другого липида. Согласно некоторым вариантам осуществления целевое соединение или фрагмент способны нацеливать соединение (например, композицию, содержащую липид и активное соединение) на конкретную клетку или ткань или подмножество клеток или тканей. Согласно некоторым вариантам осуществления нацеливающий фрагмент предназначен для получения выгоды от клеточной или тканеспецифической экспрессии конкретных мишеней, рецепторов, белков или других субклеточных компонентов. Согласно некоторым вариантам осуществления целевой фрагмент представляет собой лиганд (например, небольшую молекулу, антитело, пептид, белок, углевод, аптамер и т.д.), который нацеливает композицию на клетку или ткань и/или связывается с мишенью, рецептором, белком или другим субклеточным компонентом.

[001245] Как показано на фиг. 20, некоторые иллюстративные липиды для применения при получении композиции для доставки активного соединения делают возможной (например, не предотвращают или не мешают) функцию активного соединения. Неограничивающие примеры липидов включают лауриновую кислоту, миристиновую кислоту, пальмитиновую кислоту, стеариновую кислоту, олеиновую кислоту, линолевую кислоту, альфа-линоленовую кислоту, гамма-линоленовую кислоту, докозагексаеновую кислоту (цис-ДГК), турбинаровую кислоту и дилинолеил.

[001246] Активное соединение, олигонуклеотид WV-942, исследовали на его биологическую активность в миобластах DMD человека (мышечная дистрофия Дюшенна). В отсутствие пропускания экзона 51 белок сильно усекается из-за мутации со сдвигом рамки считывания, приводящей к преждевременному срабатыванию стоп-кодона. Олигонуклеотид WV-942, который имеет последовательность и химическую сущность, идентичную дрисаперсену, также известный как киндриса, PRO051 и GSK2402968, предназначен для пропуска экзона 51, что позволяет получать корректный в отношении рамки считывания транскрипт дистрофина, который не имеет экзона 51. Как показано в настоящем раскрытии, предложенные олигонуклеотиды могут обеспечить неожиданно большую эффективность пропускания по сравнению с WV-942.

[001247] Как описано в настоящем раскрытии, конъюгация липидов, такая как конъюгация с жирными кислотами, может улучшить одно или более свойств олигонуклеотидов. В иллюстративном эксперименте клетки миобласта обрабатывали голым WV-942 (не конъюгированным с любым липидом) или WV-942, конъюгированным с любым из нескольких липидов: лауриновой кислотой, миристиновой кислотой, пальмитиновой кислотой, стеариновой кислотой, олеиновой кислотой, линолевой кислотой, альфа-линоленовой кислотой, гамма-линоленовой кислотой, докозагексаеновой кислотой (цис-ДГК), турбинаровой кислотой и дилинолеилом (приведенными ниже в таблице 5).

[001249] Согласно некоторым вариантам осуществления иллюстративные результаты показывают, что получение композиции, содержащей активное соединение WV-942 и любой из нескольких липидов (лауриновая кислота, миристиновая кислота, пальмитиновая кислота, стеариновая кислота, олеиновая кислота, линолевая кислота, альфа-линоленовая кислота, гамма-линоленовая кислота, докозагексаеновая кислота (цис-ДГК), турбинаровая кислота и дилинолеил), не препятствовало биологической активности агента; фактически, в ряде случаев при добавлении липидов биологическая активность увеличивалась в несколько раз.

[001250] На фиг. 29 и 37 представлены дополнительные иллюстративные данные, показывающие, что конъюгация с липидами может повысить эффективность пропускания. На фиг. 29 показано, что повышенная эффективность пропускания достигается, когда стереочистый олигонуклеотид WV-3473 конъюгируют со стеариновой кислотой (для получения WV-3545) или турбинаровой кислотой (для получения WV-3546). WV-3473 представляет собой , где S* представляет собой фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp, f представляет собой 2'-F, a m представляет собой 2'-ОМе, с фосфодиэфирной связью, где не указано никаких межнуклеотидных связей; WV-3545 представляет собой

который идентичен WV-3473, за исключением того, что Mod015L001 представляет собой стеариновую кислоту с С6 РО линкером; WV-3546 представляет собой который идентичен WV-3473, за исключением того, что Mod020L001 представляет собой турбинаровую кислоту с С6 РО линкером. На фиг. 37 показано, что конъюгация с липидом увеличивает эффективность пропускания WV-942 (дрисаперсен). От WV-2578 до WV-2587 представляют собой WV-942, конъюгированный с различными липидами (в настоящем описании, жирными кислотами): лауриновая кислота, миристиновая кислота, пальмитиновая кислота, стеариновая кислота, олеиновая кислота, линолевая кислота, альфа-линоленовая кислота, гамма-линоленовая кислота, ДГК и турбинаровая кислота, соответственно.

[001251] Согласно некоторым вариантам осуществления композиция для доставки активного соединения способна при желании нацеливать активное соединение на определенные клетки или ткани. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция для доставки активного соединения способна нацеливать активное соединение на мышечную клетку или ткань. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композициям и способам, связанным с доставкой активных соединений, причем композиции содержат активное соединение с липидом. Согласно различным вариантам осуществления в отношении мышечной клетки или ткани, липид выбран из: лауриновой кислоты, миристиновой кислоты, пальмитиновой кислоты, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, докозагексаеновой кислоты (цис-ДГК), турбинаровой кислоты и дилинолеила. Как показано на фиг. 19-23, получали иллюстративные композиции, содержащие активное соединение (WV-942) и липид, и эти композиции были способны доставлять активное соединение в целевые клетки и ткани, например, мышечные клетки и ткани. Применяемые иллюстративные липиды представляют собой стеариновую кислоту, олеиновую кислоту, альфа-линоленовую кислоту, гамма-линоленовую кислоту, цис-ДГК, турбинаровую кислоту и дилинолеиловую кислоту. На этих фигурах «ТЕШ» указывает, что конкретная композиция была эффективна для доставки, но численные результаты были вне стандартного диапазона, и, таким образом, конечные результаты еще предстоит определить; однако композиции, обозначенные как «TBD» на фигурах, были эффективны при доставке активного соединения.

[001252] Как показано на фиг. 19: композиция, содержащая активное соединение и любую из: стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, цис-ДГК или турбинаровой кислоты, способна доставлять активное соединение в ткань икроножной мышцы. Композиция, содержащая активное соединение и любую из: стеариновой кислоты, альфа-линоленовой, гамма-линоленовой, цис-ДГК или турбинаровой кислоты, способна доставлять активное соединение в ткань сердечной мышцы. Композиция, содержащая активное соединение и любую из: стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, цис-ДГК или турбинаровой кислоты, способна доставлять активное соединение в четырехглавую мышцу. Как показано на фиг. 20: композиция, содержащая активное соединение и любую из: стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, цис-ДГК или турбинаровой кислоты, способна доставлять активное соединение в ткань икроножной мышцы. Композиция, содержащая активное соединение и любую из: стеариновой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, цис-ДГК или турбинаровой кислоты, способна доставлять активное соединение в ткань сердечной мышцы. Композиция, содержащая активное соединение и любую из: дилинолеила, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, цис-ДГК или турбинаровой кислоты, способна доставлять активное соединение в ткань мышцы диафрагмы.

[001253] Таким образом: композиция, содержащая липид, выбранный из: лауриновой кислоты, миристиновой кислоты, пальмитиновой кислоты, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, докозагексаеновой кислоты (цис-ДГК), турбинаровой кислоты и дилинолеила, и активное соединение, способна доставлять активное соединение во внепеченочные клетки и ткани, например, мышечные клетки и ткани.

[001254] В зависимости от конкретного состояния или патологического состояния, подвергающегося лечению или предотвращению, совместно с олигонуклеотидами согласно настоящему раскрытию можно вводить дополнительные терапевтические агенты, которые обычно вводят для лечения или предотвращения указанного состояния. Например, для лечения пролиферативных заболеваний и рака химиотерапевтические агенты или другие антипролиферативные агенты можно объединять с олигонуклеотидами согласно настоящему раскрытию. Примеры известных химиотерапевтических агентов включают, но не ограничиваются ими, адриамицин, дексаметазон, винкристин, циклофосфамид, фторурацил, топотекан, таксол, интерфероны и производные платины.

Липиды

[001255] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции олигонуклеотидов дополнительно содержат один или более липидов. Согласно некоторым вариантам осуществления конъюгация предложенных олигонуклеотидов с липидами может опосредовать неожиданные, значительно улучшенные свойства (например, активность, токсичность, распределение, фармакокинетику и т.д.). Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды имеют структуру A^c-[-L^LD-(R^LD)_a]_b. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды имеют структуру [(A^c)_a-L^LD]_b-R^LD. Согласно некоторым вариантам осуществления L^LD, R^LD, комбинации L^LD и R^LD или -[-L^LD-(R^LD)_a]_b содержат один или более липидных фрагментов.

[001256] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды не опосредуют иммунный ответ. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды не обладают агонистической активностью hTLR9, например, в условиях, показанных на фиг. 30. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды обладают антагонистической активностью hTLR9. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды противодействуют агонистической активности hTLR9, например, в условиях, показанных на фиг. 31. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотиды, конъюгированные с липидами, причем конъюгаты демонстрируют неожиданно высокую антагонистическую активность hTLR9 по сравнению с теми же неконъюгированными олигонуклеотидами. Например, олигонуклеотиды WV-3545 и WV-3546, которые содержат WV-3473, конъюгированный со стеариновой кислотой (WV-3545) или турбинаровой кислотой (WV-3473), продемонстрировали удивительно высокую активность в отношении антагонизма агонистической активности hTLR9 ODN2006, значительно выше, чем неконъюгированный WV-3473. Смотрите, например, фиг. 30-32.

[001257] Согласно некоторым вариантам осуществления конъюгация липида с предложенным олигонуклеотидом улучшает распределение и/или фармакокинетику. Согласно некоторым вариантам осуществления конъюгация липида с предложенным олигонуклеотидом улучшает одно или более измерений фармакокинетики, выбранных из: Cmax, пиковой концентрации в плазме лекарственного средства после введения; tmax, время достижения Cmax, Cmin, самая низкая (остаточная) концентрация, которой достигает лекарственное средство до следующей дозы; период полувыведения, время, необходимое для того, чтобы концентрации лекарственного средства достигла половины его первоначального значения; константа скорости элиминации, скорость, с которой лекарственное средство удаляется из организма; площадь под кривой, интеграл кривой концентрации-времени (после разовой дозы или в устойчивом состоянии); и клиренс, объем плазмы, очищенной от лекарственного средства в единицу времени. Без ограничения какой-либо конкретной теорией, настоящее раскрытие отмечает, что оптимизацию фармакокинетической характеристики, такой как период полувыведения, можно отличить от максимизации. Согласно некоторым вариантам осуществления, в целом, может быть желательным, чтобы конкретное лекарственное средство имело период полураспада, достаточный для осуществления его желаемой функции, но достаточно короткий, чтобы минимизировать эффекты нецелевого воздействия и другую токсичность. Согласно некоторым вариантам осуществления оптимизированный период полураспада достаточно велик, чтобы обеспечить активность при минимизации токсичности; длительный или максимальный период полураспада может быть нежелательным. Помимо всего прочего настоящее раскрытие показывает, что конъюгация с липидом может улучшить период полувыведения биологически активного агента. На фиг. 38A-38D показано распределение олигонуклеотидов (включая некоторые конъюгированные с липидом) в различных мышечных тканях. Исследуемые мышцы включают: икроножную мышцу (фиг. 38А); трехглавую мышцу (фиг. 38В); сердце (фиг. 38С) и диафрагму (фиг. 38D). Контрольный олигонуклеотид WV-942 эквивалентен дрисаперсену, который характеризуется нежелательным периодом полувыведения, что может приводить к токсичности. Исследуемый олигонуклеотид WV-3473 вводили животным голым или конъюгированным с липидом (стеариновой кислотой, WV-3545; или турбинаровой кислотой, WV-3546). В некоторых анализах конъюгация с липидом улучшала период полувыведения олигонуклеотида, без удлинения его до нежелательного. Смотрите, например, фиг. 38С, на которой показано, что конъюгация как стеариновой кислоты, так и турбинаровой кислоты с олигонуклеотидом, который вводили в дозе 38 мг/кг, улучшала распределение в ткани сердца, особенно в день 3 и 8, но не увеличивала ее до уровня WV-942, который характеризуется нежелательно длинным периодом полувыведения.

[001258] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции олигонуклеотидов дополнительно содержат один или более липидов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции олигонуклеотидов дополнительно содержат одну или более жирных кислот. Согласно некоторым вариантам осуществления липиды конъюгируют с предложенными олигонуклеотидами в композициях. Согласно некоторым вариантам осуществления два или более одинаковых или разных липидов могут быть конъюгированы с одним олигонуклеотидом посредством одинаковой или разной химии и/или положения. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция может содержать описанный в настоящем описании олигонуклеотид (в качестве неограничивающих примеров, композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью или композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит, состоит из или представляет собой последовательность любого описанного в настоящем описании олигонуклеотида, или композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит, состоит из или представляет собой последовательность любого олигонуклеотида, описанного в таблице 8 или любой другой таблице в настоящем описании и т.д.) и липид. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид содержит последовательность оснований, профиль связей остова, профиль хиральных центров остова и/или профиль химических модификаций (например, модификаций основания, модификаций сахара и т.д.) любого описанного в настоящем описании олигонуклеотида и конъюгирован к липиду. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция содержит описанный в настоящем описании олигонуклеотид и липид, причем липид конъюгирован с олигонуклеотидом.

[001259] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композиции, содержащей олигонуклеотид и липид. Многие липиды могут быть использованы в предусмотренных технологиях в соответствии с настоящим раскрытием.

[001260] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит группу R^LD, причем R^LD представляет собой необязательно замещенную С₁₀-C₈₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, в которой одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-C₆ алкилена, C₁-C₆ алкенилена, -С≡С-, C₁-С₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂, -Су-, О, -S-, -S-S-, -N(R'), -С(О), -C(S), -C(NR'), C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и C(O)O- где: каждый R' независимо представляет собой -R, C(O)R, CO₂R или -SO₂R, или:

два R' берутся вместе с их промежуточными атомами с образованием необязательно замещенного арильного, карбоциклического, гетероциклического или гетероарильного кольца;

-Су- представляет собой необязательно замещенное двухвалентное кольцо, выбранное из карбоциклилена, арилена, гетероарилена и гетероциклилена; а также

каждый R независимо представляет собой водород или необязательно замещенную группу, выбранную из алифатического, фенильного, карбоциклильного, арильного, гетероарильного или гетероциклильного C₁-С₆.

[001261] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит группу R^LD, причем R^LD представляет собой необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, в которой одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-C₆ алкилена, C₁-С₆ алкенилена, -С≡С-, C₁-С₆ гетероалифатического фрагмента, C(R')₂- -Су-, -О-, -S-, -S-S-, N(R')-, С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и -C(O)O-, где: каждый R' независимо представляет собой -R, C(O)R, CO₂R или -SO₂R, или:

два R' берутся вместе с их промежуточными атомами с образованием необязательно замещенного арильного, карбоциклического, гетероциклического или гетероарильного кольца;

-Су- представляет собой необязательно замещенное двухвалентное кольцо, выбранное из карбоциклилена, арилена, гетероарилена и гетероциклилена; а также

каждый R независимо представляет собой водород или необязательно замещенную группу, выбранную из алифатического, фенильного, карбоциклильного, арильного, гетероарильного или гетероциклильного C₁-C₆.

[001262] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит группу R^LD, причем R^LD представляет собой необязательно замещенную С₁₀-С₄₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, в которой одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-C₆ алкилена, C₁-C₆ алкенилена, -С≡С-, C₁-С_б гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂, -Су-, О, -S-, -S-S-, -N(R'), -С(О), -C(S), -C(NR'), -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и C(O)O- где: каждый R' независимо представляет собой -R, C(O)R, CO₂R или -SO₂R, или:

два R' берутся вместе с их промежуточными атомами с образованием необязательно замещенного арильного, карбоциклического, гетероциклического или гетероарильного кольца;

-Су- представляет собой необязательно замещенное двухвалентное кольцо, выбранное из карбоциклилена, арилена, гетероарилена и гетероциклилена; а также

каждый R независимо представляет собой водород или необязательно замещенную группу, выбранную из алифатического, фенильного, карбоциклильного, арильного, гетероарильного или гетероциклильного C₁-С₆.

[001263] Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С₁₀-C₈₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо замещены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-С₆ алкилена, C₁-С₆ алкенилена, -С≡С-, С₁-С₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂- и -Су-. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо замещены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-С₆ алкилена, C₁-C₆ алкенилена, -С≡С-, -C₁-С₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂- и -Су-. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой углеводородную группу, состоящую из атомов углерода и водорода.

[001264] Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо замещены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-С₆ алкилена, C₁-C₆ алкенилена, -C≡C-, C₁-С₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂- и -Су-. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо замещены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-C₆ алкилена, C₁-С₆ алкенилена, -C≡C-, C₁-С₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂- и -Су-. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой углеводородную группу, состоящую из атомов углерода и водорода.

[001265] Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С₁₀-С₄₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо замещены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-С₆ алкилена, С₁-С₆ алкенилена, -С≡С-, C₁-C₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂- и -Су-. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо замещены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-C₆ алкилена, C₁-С₆ алкенилена, -C≡C-, C₁-C₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂- и -Су-. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой углеводородную группу, состоящую из атомов углерода и водорода.

[001266] Алифатическая группа R^LD может характеризоваться разной подходящей длиной. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₀-C₈₀. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₀-С₇₅. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₀-С₇₀. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₀-С₆₅. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₀-С₆₀. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₀-С₅₀. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₀-С₄₀. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₀-С₃₅. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₀-С₃₀. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₀-С₂₅. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₀-С₂₄. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₀-С₂₃. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₀-С₂₂. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₀-С₂₁. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₂-С₂₂. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₃-С₂₂. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₄-С₂₂. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₅-С₂₂. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₆-С₂₂. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₇-С₂₂. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₈-С₂₂. Согласно некоторым вариантам осуществления она представляет собой С₁₀-С₂₀. Согласно некоторым вариантам осуществления нижний конец диапазона представляет собой С₁₀, С₁₁, С₁₂, С₁₃, С₁₄, С₁₅, C₁₆, С₁₇ или C₁₈. Согласно некоторым вариантам осуществления высший конец диапазона представляет собой C₁₈, С₁₉, С₂₀, С₂₁, С₂₂, С₂₃, С₂₄, С₂₅, С₂₆, С₂₇, С₂₈, С₂₉, С₃₀, С₃₅, С₄₀, С₄₅, С₅₀, С₅₅ или С₆₀. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₁₀. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₁₁. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₁₂. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₁₃. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₁₄. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₁₅. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой C₁₆. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₁₇. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой C₁₈. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₁₉. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₂₀. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₂₁. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₂₂. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С_23. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₂₄. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₂₅. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₃₀. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₃₅. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₄₀. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₄₅. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С50. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₅₅. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой С₆₀.

[001267] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит не более одной группы R^LD. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит две или более группы R^LD.

[001268] Согласно некоторым вариантам осуществления липид конъюгирован с биологически активным агентом, необязательно через связь, в виде фрагмента, содержащего группу R^LD. Согласно некоторым вариантам осуществления липид конъюгирован с биологически активным агентом, необязательно через связь, в виде фрагмента, содержащего не более одной группы R^LD. Согласно некоторым вариантам осуществления липид конъюгирован с биологически активным агентом, необязательно через связь, в качестве группы R^LD. Согласно некоторым вариантам осуществления липид конъюгирован с биологически активным агентом, необязательно через связь, в виде фрагмента, содержащего две или более группы R^LD.

[001269] Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С₁₀-С₄₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₄₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

[001270] Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

[001271] Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-4 алифатическими группами. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-4алифатическими группами. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-2 алифатическими группами. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-2 алифатическими группами. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более метальными группами. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более метальными группами.

[001272] Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой незамещенную С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит незамещенную линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь С₁₀-С₄₀.

[001273] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит не более одной необязательно замещенной С₁₀-С₄₀ линейной, насыщенной или частично ненасыщенной алифатической цепи. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит две или более необязательно замещенных С₁₀-С₄₀ линейных, насыщенных или частично ненасыщенных алифатических цепей.

[001274] Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С₁₀-С₄₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₄₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

[001275] Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

[001276] Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-4 алифатическими группами. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-4 алифатическими группами. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-2 алифатическими группами. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-2 алифатическими группами. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более метальными группами. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более метальными группами.

[001277] Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой незамещенную С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит незамещенную С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

[001278] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит не более одной необязательно замещенной С₁₀-С₆₀ линейной, насыщенной или частично ненасыщенной алифатической цепи. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит две или более необязательно замещенных С₁₀-С₆₀ линейных, насыщенных или частично ненасыщенных алифатических цепей.

[001279] Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С₁₀-С₈₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-C₈₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

[001280] Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой необязательно замещенную С₁₀-С₈₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₈₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

[001281] Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой С₁₀-C₈₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-4 алифатическими группами. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-C₈₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более C_1-4 алифатическими группами. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой С₁₀-C₈₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-2 алифатическими группами. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-C₈₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-2 алифатическими группами. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой С₁₀-C₈₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более метальными группами. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-C₈₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более метальными группами.

[001282] Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой незамещенную С₁₀-C₈₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит незамещенную С₁₀-C₈₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

[001283] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит не более одной необязательно замещенной С₁₀-C₈₀ линейной, насыщенной или частично ненасыщенной алифатической цепи. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит две или более необязательно замещенных С₁₀-C₈₀ линейных, насыщенных или частично ненасыщенных алифатических цепей.

[001284] Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит Сю насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит Сю частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит Си насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит Си частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит Си насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₁₂ частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₁₃ насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₁₃ частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₁₄ насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₁₄ частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₁₅ насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₁₅ частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит C₁₆ насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит C₁₆ частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₁₇ насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₁₇ частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит C₁₈ насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₁₈ частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₁₉ насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₁₉ частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₀ насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₀ частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₁ насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₁ частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₂ насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₂ частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₃ насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₃ частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₄ насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₄ частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₅ насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₅ частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₆ насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₆ частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₇ насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₇ частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₈ насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₈ частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₉ насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₂₉ частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит С₃₀ насыщенную линейную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой или содержит 6с частично ненасыщенную линейную алифатическую цепь.

[001285] Согласно некоторым вариантам осуществления липид имеет структуру R^LD-ОН. Согласно некоторым вариантам осуществления липид имеет структуру R^LD-C(O)OH. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой

Иллюстративные олигонуклеотиды, содержащие такие группы RD, представлены, например, в таблице 4. Согласно некоторым вариантам осуществления липид представляет собой лауриновую кислоту, миристиновую кислоту, пальмитиновую кислоту, стеариновую кислоту, олеиновую кислоту, линолевую кислоту, альфа-линоленовую кислоту, гамма-линоленовую кислоту, докозагексаеновую кислоту (ДГК или цис-ДГК), турбинаровую кислоту, арахидоновую кислоту и дилинолеил. Согласно некоторым вариантам осуществления липид представляет собой лауриновую кислоту, миристиновую кислоту, пальмитиновую кислоту, стеариновую кислоту, олеиновую кислоту, линолевую кислоту, альфа-линоленовую кислоту, гамма-линоленовую кислоту, докозагексаеновую кислоту (DHA или цис-DHA). Согласно некоторым вариантам осуществления липид имеет структуру:

Иллюстративные олигонуклеотиды, содержащие конъюгацию с такими липидами, представлены, например, в таблице 4.

[001286] Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит или состоит из любой из: по меньшей мере частично гидрофобной или амфифильной молекулы, фосфолипида, триглицерида, диглицерида, моноглицерида, жирорастворимого витамина, стерола, жира и воска. Согласно некоторым вариантам осуществления липид представляет собой любой из: жирной кислоты, глицеролипида, глицерофосфолипида, сфинголипида, стеринового липида, пренолового липида, сахаролипида, поликетида и другой молекулы. [001287] Липиды могут быть включены в предусмотренные технологии посредством многих типов способов в соответствии с настоящим раскрытием. Согласно некоторым вариантам осуществления липиды физически смешиваются с предложенными олигонуклеотидами для образования предложенных композиций. Согласно некоторым вариантам осуществления липиды химически конъюгируют с олигонуклеотидами.

[001288] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции содержат два или более липидов. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат два или более конъюгированных липидов. Согласно некоторым вариантам осуществления два или более ко нъюгиро ванных липидов являются одинаковыми. Согласно некоторым вариантам осуществления два или более конъюгированных липидов являются различными. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более одного липида. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенной композиции содержат различные типы конъюгированных липидов. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенной композиции содержат липиды того же типа.

[001289] Липиды могут быть конъюгированы с олигонуклеотидами необязательно через линкерные группы. В соответствии с настоящим раскрытием могут использоваться различные типы линкерных групп в данной области техники. Согласно некоторым вариантам осуществления линкерная группа содержит фосфатную группу, которая может, например, использоваться для конъюгирования липидов с помощью химии, аналогичной той, которая используется для синтеза олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления линкерная группа содержит амид, сложный эфир или эфирную группу.

[001290] Согласно некоторым вариантам осуществления линкер имеет структуру -L^LD-. Согласно некоторым вариантам осуществления L^LD представляет собой T^LD, имеющий структуру , где каждая переменная представляет собой независимо таковую, как определено и описано. Согласно некоторым вариантам осуществления T^LD имеет структуру формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления T^LD с 5'-О- олигонуклеотидной цепи образуют фосфоротиоатную связь (-OP(O)(S^-)O-). Согласно некоторым вариантам осуществления T^LD с 5'-O-олигонуклеотидной цепи образуют фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp. Согласно некоторым вариантам осуществления T^LD с 5'-О- олигонуклеотидной цепи образуют фосфоротиоатную связь в конфигурации Rp.Согласно некоторым вариантам осуществления T^LD с 5'-О- олигонуклеотидной цепи образуют фосфатную связь (-ОР(O)(O^-)O-). Согласно некоторым вариантам осуществления T^LD с 5'-O-олигонуклеотидной цепи образуют фосфородитиоатную связь. Согласно некоторым вариантам осуществления L^LD представляет собой -L-T^LD. Согласно некоторым вариантам осуществления Y соединяется с -L-, и -Z- представляет собой ковалентную связь, так что Р непосредственно соединяется с гидроксильной группой олигонуклеотидной цепи. Согласно некоторым вариантам осуществления Р соединяется с 5'-концевым гидроксилом (5'-О-) с образованием фосфатной группы (природной фосфатной связи) или фосфоротиоатной группы (фосфоротиоатной связи). Согласно некоторым вариантам осуществления фосфоротиоатная связь характеризуется контролируемой хиральностью и может представлять собой конфигурацию Rp или Sp.Если не указано иное, хиральные центры в линкерах (например, Р в T^LD) могут быть стереослучайными или характеризоваться контролируемой хиральностью, и они не считаются частью хиральных центров остова, например, для определения того, характеризуется ли композиция контролируемой хиральностью. Согласно некоторым вариантам осуществления L^LD представляет собой -NH-(СН₂)₆-T^LD-. Согласно некоторым вариантам осуществления L^LD представляет собой -C(O)-NH-(CH₂)₆-T^LD-.

[001291] Согласно некоторым вариантам осуществления линкер имеет структуру L. Согласно некоторым вариантам осуществления после конъюгации с олигонуклеотидами липид образует фрагмент, имеющий структуру -L-R^LD, причем каждый из L и R^LD независимо является таким, как определено и описано в настоящем описании.

[001292] Согласно некоторым вариантам осуществления -L- содержит двухвалентную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления -L- содержит фосфатную группу. Согласно некоторым вариантам осуществления L содержит фосфоротиоатную группу. Согласно некоторым вариантам осуществления -L-имеет структуру -C(O)NH-(CH₂)₆-OP(=O)(S-)-. Согласно некоторым вариантам осуществления -L- имеет структуру -C(O)NH-(CH₂)₆-OP(=O)(O-)-.

[001293] Липиды, необязательно через линкеры, могут быть конъюгированы с олигонуклеотидами в различных подходящих местах. Согласно некоторым вариантам осуществления липиды конъюгируют через группу 5'-ОН. Согласно некоторым вариантам осуществления липиды конъюгируют через группу 3'-ОН. Согласно некоторым вариантам осуществления липиды конъюгируют через один или более фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления липиды конъюгируют через одно или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления липиды включены через одну или более межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид может содержать несколько конъюгированных липидов, которые независимо конъюгированы через его 5'-ОН, 3'-ОН, сахарные фрагменты, фрагменты оснований и/или межнуклеотидные связи.

[001294] Согласно некоторым вариантам осуществления линкер представляет собой фрагмент, который соединяет две части композиции; в качестве неограничивающего примера, линкер физически соединяет активное соединение с липидом. Неограничивающие примеры подходящих линкеров включают: незаряженный линкер; заряженный линкер; содержащий алкил линкер; содержащий фосфат линкер; разветвленный линкер; неразветвленный линкер; линкер, содержащий по меньшей мере одну группу расщепления; линкер, содержащий по меньшей мере одну группу редокс-расщепления; линкер, содержащий по меньшей мере одну группу расщепления на основе фосфата; линкер, содержащий по меньшей мере одну группу расщепления кислотой; линкер, содержащий по меньшей мере одну группу расщепления на основе сложного эфира; линкер, содержащий по меньшей мере одну группу расщепления на основе пептидов.

[001295] Согласно некоторым вариантам осуществления липид конъюгируют с активным соединением необязательно через фрагмент линкерной группы. Специалисту в данной области техники будет понятно, что могут быть использованы различные технологии для конъюгации липидов с активным соединением в соответствии с настоящим раскрытием. Например, для липидов, содержащих карбоксильные группы, такие липиды могут быть конъюгированы через карбоксильные группы. Согласно некоторым вариантам осуществления липид конъюгируют через линкерную группу, имеющую структуру -L-, где L является такой, как определено и описано в формуле I. Согласно некоторым вариантам осуществления L содержит сложный диэфир фосфата или модифицированный сложный диэфир фосфата. Согласно некоторым вариантам осуществления соединение, образованное липидной конъюгацией, имеет структуру (R^LDL)_x (активное соединение), где х равно 1 или целому числу, превышающему 1, и каждый из R^LD и L независимо является таким, как определено и описано в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления х равен 1. Согласно некоторым вариантам осуществления х больше 1. Согласно некоторым вариантам осуществления х составляет 1-50. Согласно некоторым вариантам осуществления активное соединение представляет собой олигонуклеотид. Например, согласно некоторым вариантам осуществления конъюгат имеет следующие структуры:

[001296] Согласно некоторым вариантам осуществления линкер выбирают из: незаряженного линкера; заряженного линкера; содержащего алкил линкера; содержащего фосфат линкера; разветвленного линкера; неразветвленного линкера; линкера, содержащего по меньшей мере одну группу расщепления; линкера, содержащего по меньшей мере одну группу редокс-расщепления; линкера, содержащего по меньшей мере одну группу расщепления на основе фосфата; линкера, содержащего по меньшей мере одну группу расщепления кислотой; линкера, содержащего по меньшей мере одну группу расщепления на основе сложного эфира, и линкера, содержащего по меньшей мере одну группу расщепления на основе пептидов. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер имеет структуру -L^LD-. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер имеет структуру -L-. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер содержит связь формулы I. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер представляет собой -C(O)NH-(CH₂)₆-L^I-, где L^I имеет структуру формулы I, как описано в настоящем описании. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер представляет собой -C(O)NH-(CH₂)₆-O-P(=O)(SR¹)-O-. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой -Н, а линкер представляет собой -C(O)NH-(CH₂)₆-O-P(=O)(SH)-O-, в некоторых условиях, например, с определенным значением рН, -C(O)NH-(CH₂)₆-O-P(=O)(S-)-O-. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер представляет собой -C(O)NH-(CH₂)₆-O-P(=S)(SR¹)-O-. Согласно некоторым вариантам осуществления R¹ представляет собой -Н, а линкер представляет собой C(O)NH (СН₂)₆-О-P(=S)(SH)-О-, в некоторых условиях, например, с определенным значением рН, -C(O)NH-(CH₂)₆-O-P(=S)(S)-O-. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер представляет собой -C(O)NH-(CH₂)₆-O-P(=S)(OR¹)-O-, где R¹ представляет собой -CH₂CH₂CN. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер представляет собой -C(O)NH-(CH₂)₆-O-P(=S)(SR¹)-O-, где R¹ представляет собой CH₂CH₂CN. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид связан с линкером и образует структуру Н-линкер-олигонуклеотид. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный олигонуклеотид конъюгирован с липидом и образует структуру липид-линкер-олигонуклеотид, например, R^LD-L^LD-олигонуклеотид. Согласно некоторым вариантам осуществления конец -О-линкера соединен с олигонуклеотидом. Согласно некоторым вариантам осуществления конец О линкера соединен с 5'-концом олигонуклеотида (-О- представляет собой кислород в 5'-ОН).

[001297] Согласно некоторым вариантам осуществления линкер содержит РО (фосфодиэфирную связь), PS (фосфоротиоатную связь) или PS2 (фосфородитиоатную связь). Ниже приведен неограничивающий пример, включающий в себя PS-линкер. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер представляет собой -О-Р(O)(ОН)-О- [фосфодиэфир], -О-P(O)(SH)-О-[фосфоротиоат] или -O-P(S)(SH)-O- [фосфордитиоат]. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер содержит С6-аминогруппу -NH-(СН₂)₆), которая проиллюстрирована ниже. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер содержит С6-амино, связанный с РО, PS или PS2. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер представляет собой С6-аминогруппу, связанную с РО, PS или PS2. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер, например, L^LD или L, представляет собой -С(О-NH-(СН₂)_6- -Р(O)(ОН)-. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер, например L^LD или L, представляет собой -C(O)-NH-(СН₂)₆-Р(O)(ОН)-, причем -С(О)-связан с липидным фрагментом и -Р(O)(ОН)- соединен с олигонуклеотидной цепью. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер, например, L^LD или L, представляет собой -C(O)-NH-(СН₂)₆-Р(O)(ОН)-, причем -С(O)- связан с липидным фрагментом и -Р(O)(ОН)- связан с 5'-О-олигонуклеотидной цепи. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер, например, L^LD или L, представляет собой -C(O)-NH-(СН₂)₆-Р(O)(ОН)-, причем -С(O)- связан с липидным фрагментом и -Р(O)(ОН)- связан с 3'-О-олигонуклеотидной цепи. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер, например, L^LD или L, представляет собой -C(O)-NH-(CH₂)₆-P(O)(SH)-. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер, например, L^LD или L, представляет собой -C(O)-NH-(CH₂)₆-P(O)(SH)-, причем -С(О)- связан с липидным фрагментом и -P(O)(SH)- связан с олигонуклеотидной цепью. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер, например, L^LD или L, представляет собой -C(O)-NH-(CH₂)₆-P(O)(SH)-, причем -С(О)- связан с липидным фрагментом и -P(O)(SH)- связан с 5'-О-олигонуклеотидной цепи. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер, например, L^LD или L, представляет собой -C(O)-NH-(CH₂)₆-P(O)(SH)-, где -С(О)- связан с липидным фрагментом и -P(O)(SH)-связан с 3'-О- олигонуклеотидной цепи. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер, например, L^LD или L, представляет собой -C(O)-NH-(CH₂)₆-P(S)(SH)-. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер, например, L^LD или L, представляет собой -C(O)-NH-(CH₂)₆-P(S)(SH)-, причем -С(O)- связан с липидным фрагментом и P(S)(SH) связан с олигонуклеотидной цепью. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер, например, L^LD или L, представляет собой -C(O)-NH-(CH₂)₆-P(S)(SH)-, причем -С(О)- связан с липидным фрагментом и -P(S)(SH)- связан с 5'-О- олигонуклеотидной цепи. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер, например, L^LD или L, представляет собой -C(O)-NH-(CH₂)₆-P(S)(SH)-, причем -С(О)- связан с липидным фрагментом и -P(S)(SH)- связан с 3'-О- олигонуклеотидной цепи. Как будет понятно специалисту в настоящей области техники при определенных значениях рН -Р(O)(ОН)-, -P(O)(SH)-, -P(S)(SH)- могут существовать в виде Р(O)(O^-), -P(O)(S^-)-, -P(S)(S-)-, соответственно. Согласно некоторым вариантам осуществления липидный фрагмент представляет собой R^LD.

[001298] Различные химические вещества и линкеры могут быть использованы для конъюгации в соответствии с настоящим раскрытием. Например, липиды, нацеливающие компоненты и т.д. могут быть конъюгированы с олигонуклеотидами через линкеры с использованием химических веществ, как описано ниже, либо на твердой фазе, либо в растворе для получения определенных предусмотренных олигонуклеотидов, например, описанных в таблице 4 (WV-2538, WV-2733, WV-2734, от WV-2578 до WV-2588, WV-2807, WV-2808, от WV-3022 до WV-3027, от WV-3029 до WV-3038, от WV-3084 до WV-3089, от WV-3357 до WV-3366, WV-3517, WV-3520, от WV-3543 до WV-3560, WV-3753, WV-3754, WV-3820, WV-3821, WV-3855, WV-3856, WV-3976, WV-3977, WV-3979, WV-3980, WV-4106, WV-4107 и т.д.):

[001299] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композициям и способам, относящимся к композиции, содержащей олигонуклеотид и липид, содержащий С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, причем липид конъюгирован с биологически активным агентом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композициям и способам, относящимся к композиции, содержащей олигонуклеотид и липид, содержащий С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-4 алифатическими группами, причем липид конъюгирован с биологически активным агентом.

[001300] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композициям и способам, относящимся к композиции, содержащей олигонуклеотид и липид, содержащий С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, причем липид не конъюгирован с биологически активным агентом. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композициям и способам, относящимся к композиции, содержащей олигонуклеотид и липид, содержащий С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-4 алифатическими группами, причем липид не конъюгирован с биологически активным агентом.

[001301] Согласно некоторым вариантам осуществления композиция содержит олигонуклеотид и липид, выбранный из: лауриновой кислоты, миристиновой кислоты, пальмитиновой кислоты, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, докозагексаеновой кислоты (цис-ДГК), турбинаровой кислоты, арахидоновой кислоты и дилинолеила, причем липид не конъюгирован с биологически активным агентом. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция содержит олигонуклеотид и липид, выбранный из: лауриновой кислоты, миристиновой кислоты, пальмитиновой кислоты, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, докозагексаеновой кислоты (цис-ДГК), турбинаровой кислоты и дилинолеила, причем липид не конъюгирован с биологически активным агентом.

[001302] Согласно некоторым вариантам осуществления композиция содержит олигонуклеотид и липид, выбранный из: лауриновой кислоты, миристиновой кислоты, пальмитиновой кислоты, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, докозагексаеновой кислоты (цис-ДГК), турбинаровой кислоты, арахидоновой кислоты и дилинолеила, причем липид конъюгирован с биологически активным агентом. Согласно некоторым вариантам осуществления композиция содержит олигонуклеотид и липид, выбранный из: лауриновой кислоты, миристиновой кислоты, пальмитиновой кислоты, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, докозагексаеновой кислоты (цис-ДГК), турбинаровой кислоты и дилинолеила, причем липид конъюгирован с биологически активным агентом.

[001303] Согласно некоторым вариантам осуществления композиция содержит олигонуклеотид и липид, выбранный из: лауриновой кислоты, миристиновой кислоты, пальмитиновой кислоты, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, докозагексаеновой кислоты (цис-ДГК), турбинаровой кислоты, арахидоновой кислоты и дилинолеила, причем липид непосредственно конъюгирован с биологически активным агентом (без линкера, расположенного между липидом и биологически активным агентом). Согласно некоторым вариантам осуществления композиция содержит олигонуклеотид и липид, выбранный из: лауриновой кислоты, миристиновой кислоты, пальмитиновой кислоты, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, докозагексаеновой кислоты (цис-ДГК), турбинаровой кислоты и дилинолеила, где липид непосредственно конъюгирован с биологически активным агентом (без линкера, расположенного между липидом и биологически активным агентом).

[001304] Согласно некоторым вариантам осуществления композиция содержит олигонуклеотид и липид, выбранный из: лауриновой кислоты, миристиновой кислоты, пальмитиновой кислоты, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, докозагексаеновой кислоты (цис-ДГК), турбинаровой кислоты, арахидоновой кислоты и дилинолеила, причем липид опосредованно конъюгирован с биологически активным агентом (с линкером, расположенным между липидом и биологически активным агентом). Согласно некоторым вариантам осуществления композиция содержит олигонуклеотид и липид, выбранный из: лауриновой кислоты, миристиновой кислоты, пальмитиновой кислоты, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, докозагексаеновой кислоты (цис-ДГК), турбинаровой кислоты и дилинолеила, причем липид опосредованно конъюгирован с биологически активным агентом (с линкером, расположенным между липидом и биологически активным агентом).

[001305] Линкер представляет собой фрагмент, который соединяет две части композиции; в качестве неограничивающего примера, линкер физически связывает олигонуклеотид с липидом. Неограничивающие примеры подходящих линкеров включают: незаряженный линкер; заряженный линкер; содержащий алкил линкер; содержащий фосфат линкер; разветвленный линкер; неразветвленный линкер; линкер, содержащий по меньшей мере одну группу расщепления; линкер, содержащий по меньшей мере одну группу редокс-расщепления; линкер, содержащий по меньшей мере одну группу расщепления на основе фосфата; линкер, содержащий по меньшей мере одну группу расщепления кислотой; линкер, содержащий по меньшей мере одну группу расщепления на основе сложного эфира, и линкер, содержащий по меньшей мере одну группу расщепления на основе пептидов. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер представляет собой незаряженный линкер или заряженный линкер. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер содержит алкил.

[001306] Согласно некоторым вариантам осуществления линкер содержит фосфат.Согласно различным вариантам осуществления фосфат также может быть модифицирован путем замены мостикового кислорода (то есть кислорода, который связывает фосфат с нуклеозидом) на азот (мостиковые фосфорамидаты), серу (мостиковые фосфоротиоаты) и углерод (мостиковые метиленфосфонаты). Замена может происходить либо в любом связующем кислороде, либо в обоих связующих кислородах. Согласно некоторым вариантам осуществления мостиковый кислород представляет собой 3'-кислород нуклеозида, происходит замена углеродом. Согласно некоторым вариантам осуществления мостиковый кислород представляет собой 5'-кислород нуклеозида, происходит замена азотом. Согласно различным вариантам осуществления линкер, содержащий фосфат, содержит любой один или более из: фосфородитиоата, фосфорамидата, боранофосфоната или соединения формулы (I): (I), где R³ выбран из ОН, SH, NH₂, ВН₃, СН₃, C_1-6 алкила, С_6-10 арила, C_1-6 алкокси и С_6-10 арилокси, где C_1-6 алкил и С_6-10 арил являются незамещенными или необязательно независимо замещены 1-3 группами, независимо выбранными из галогена, гидроксила и NH₂; и R⁴ выбран из О, S, NH или СН₂.

[001307] Согласно некоторым вариантам осуществления линкер содержит прямую связь или атом, такой как кислород или серу, звено, такое как NR¹, С(О), C(O)NH, SO, SO₂, SO₂NH, или цепь атомов, например, замещенный или незамещенный алкил, замещенный или незамещенный алкенил, замещенный или незамещенный алкинил, арилалкил, арилалкенил, арилалкинил, гетероарилалкил, гетероарилалкенил. гетероарилалкинил, гетероциклилалкил, гетероциклилалкенил, гетероциклилалкинил, арил, гетероарил, гетероциклил, циклоалкил, циклоалкенил, алкиларилалкил. алкиларилалкенил, арилалкилалкинил, алкениларилалкил, алкениларилалкенил, алкениларилалкинил, алкиниларилалкил, алкиниларилалкенил, алкиниларилалкинил, алкилгетероарилалкил, алкилгетероарилалкенил, алкилгетероарилалкинил, алкенилгетероарилалкил, алкенилгетероарилалкенил, алкенилгетероарилалкинил, алкинилгетероарилалкил, алкинил гетероарилалкенил, алкинилгетероарилалкинил. алкилгетероцилилалкил, алкилгетероцилклилалкенил, алкилгетероцилклилалкинил. алкенилгетероциклилалкил, алкенилгетероциклилалкенил, алкенилгетероциклилалкинил, алкинилгетероциклилалкил, алкинилгетероциклилалкенил, алкинилгетероциклилалкинил, алкиларил, алкениларил, алкиниларил, алкилгетероарил, алкенилгетероарил, алкинилгероарил, где один или более метиленов могут прерываться или заканчиваться О, S, S(O), SO₂, N(R₁)₂, С(О), расщепляемой связывающей группой, замещенным или незамещенным арилом, замещенным или незамещенным гетероарилом, замещенной или незамещенной гетероциклической группой; где R¹ представляет собой водород, ацил, алифатическую или замещенную алифатическую группу.

[001308] Согласно некоторым вариантам осуществления линкер представляет собой разветвленный линкер. Согласно некоторым вариантам осуществления точка разветвления разветвленной линкера может быть по меньшей мере трехвалентной, но может представлять собой четырехвалентный, пятивалентный или шестивалентный атом или группу, представляющую такую множественную валентность. Согласно некоторым вариантам осуществления точка разветвления представляет собой -N, -N(Q)-C, -О-С, -S-C, -SS-C, -C(O)N(Q)-C, -OC(O)N(Q)-C, -N(Q)C(O)-C или -N(Q)C(O)O-C; где Q независимо представляет собой для каждого случая Н или необязательно замещенный алкил. Согласно другому варианту осуществления точка разветвления представляет собой глицерин или производное глицерина.

[001309] В одном варианте осуществления линкер содержит по меньшей мере одну отщепляемую связывающую группу.

[001310] В качестве неограничивающего примера отщепляемая связывающая группа может быть достаточно стабильной вне клетки, но после входа в целевую клетку расщепляться для высвобождения двух частей, которые линкер удерживает вместе. В качестве неограничивающего примера отщепляемая связывающая группа расщепляется по меньшей мере в 10 раз или более, по меньшей мере в 100 раз быстрее в клетке-мишени или при первом эталонном условии (которое может быть выбрано, например, для имитации или представления внутриклеточных состояний), чем в крови субъекта, или при втором эталонном условии (которое может, например, быть выбрано для имитации или представления условий, обнаруженных в крови или сыворотке). Отщепляемые связывающие группы чувствительны к агентам отщепления, например, рН, окислительно-восстановительному потенциалу или наличию деградирующих молекул. Как правило, отщепляющие агенты более распространены или их содержание или активность внутри клеток выше, чем в сыворотке или крови. Примеры таких деградирующих агентов включают: окислительно-восстановительные агенты, которые выбраны для конкретных субстратов или которые не имеют субстратной специфичности, включая, например, окислительные или восстановительные ферменты или восстановительные агенты, такие как меркаптаны, присутствующие в клетках, которые могут разрушать редокс-расщепляемую связывающую группу посредством восстановления; эстеразы; эндосомы или агенты, которые могут образовывать кислотную среду, например, те, которые приводят к рН 5 или ниже; ферменты, которые могут гидролизовать или деградировать связывающую кислоту связывающую группу, действуя как общая кислота, пептидазы (которые могут быть субстратными) и фосфатазы.

[001311] В качестве неограничивающего примера отщепляемая связывающая группа, такая как дисульфидная связь, может быть восприимчива к рН. рН сыворотки человека составляет 7,4, тогда как среднее внутриклеточное значение рН несколько ниже, в пределах от примерно 7,1-7,3. Эндосомы имеют более кислое значение рН в диапазоне 5,5-6,0, а лизосомы имеют еще более кислое значение рН примерно 5,0. Некоторые линкеры будут иметь отщепляемую связывающую группу, которая отщепляется при желаемом значении рН, тем самым высвобождая катионный липид из лиганда внутри клетки или в желаемый компартмент клетки.

[001312] В качестве неограничивающего примера линкер может включать отщепляемую связывающую группу, которая расщепляется конкретным ферментом. Тип отщепляемой связывающей группы, включенной в линкер, может зависеть от целевой клетки. Например, лиганды, нацеленно воздействующие на печень, могут быть связаны с катионными липидами через линкерную группу, которая включает сложноэфирную группу. Клетки печени богаты эстеразами, поэтому линкер будет расщепляться более эффективно в клетках печени, чем в типах клеток, которые не богаты эстеразой. Другие типы клеток, богатые эстеразами, включают клетки легкого, почечную кору и яички.

[001313] В качестве неограничивающего примера линкер может содержать пептидную связь, которая может быть использована при нацеливании на типы клеток, богатые пептидазами, такие как клетки печени и синовиоциты.

[001314] В качестве неограничивающего примера пригодность потенциальной отщепляемой связывающей группы может быть оценена путем тестирования способности деградирующего агента (или условия) расщеплять потенциальную связывающую группу. Также желательно проверить потенциальную отщепляемую связывающую группу на способности противостоять расщеплению в крови или при контакте с другой нецелевой тканью. Таким образом, можно определить относительную восприимчивость к расщеплению между первым и вторым условиями, где первое выбрано, чтобы указывать на расщепление в клетке-мишени, а второе выбрано, чтобы указывать на расщепление в других тканях или биологических жидкостях, например, крови или сыворотке. Оценки могут проводиться в бесклеточных системах, в клетках, в культуре клеток, в культуре органов или тканей или у всех животных. Может быть полезно сделать первоначальные оценки в условиях отсутствия клеток или культуры и подтвердить путем дальнейших оценок у всех животных. В качестве неограничивающего примера полезные соединения-кандидаты расщепляются по меньшей мере в 2, 4, 10 или 100 раз быстрее в клетке (или в условиях in vitro, выбранных для имитации внутриклеточных состояний) по сравнению с кровью или сывороткой (или в условиях in vitro, выбранных для имитации внеклеточных состояний).

[001315] Согласно некоторым вариантам осуществления линкер содержит окислительно-восстановительную отщепляемую связывающую группу. В качестве неограничивающего примера один класс отщепляемых связывающих групп представляет собой окислительно-восстановительные отщепляемые связывающие группы, которые расщепляются при восстановлении или окислении. Неограничивающим примером восстановительно отщепляемой связывающей группы является дисульфидная связывающая группа (-S-S-). Чтобы определить, является ли потенциальная отщепляемая связывающая группа подходящей «восстановительной отщепляемой связывающей группой» или, например, пригодна для использования с конкретным фрагментом олигонуклеотида и конкретным агентом нацеливания, можно рассмотреть способы, описанные в настоящем описании. В качестве неограничивающего примера кандидат может быть оценен путем инкубации с дитиотреитолом (DTT) или другим восстановителем с использованием реагентов, известных в данной области техники, которые имитируют скорость расщепления, которая будет наблюдаться в клетке, например, целевой клетке. Кандидаты также могут быть оценены в условиях, выбранных для имитации условий крови или сыворотки. В качестве неограничивающего примера соединения-кандидаты расщепляются не более чем на 10% в крови. В качестве неограничивающего примера применимые потенциальные соединения деградируют по меньшей мере в 2, 4, 10 или 100 раз быстрее в клетке (или в условиях in vitro, выбранных для имитации внутриклеточных состояний) по сравнению с кровью (или в условиях in vitro, выбранных для имитации внеклеточных условий). Скорость расщепления потенциальных соединений может быть определена с использованием стандартных анализов кинетики ферментов в условиях, выбранных для имитации внутриклеточных сред, и по сравнению с условиями, выбранными для имитации внеклеточных сред.

[001316] Согласно некоторым вариантам осуществления линкер, содержащий отщепляемые связывающие группы на основе фосфата, расщепляется агентами, которые деградируют или гидролизуют фосфатную группу. Примером агента, который расщепляет фосфатные группы в клетках, являются ферменты, такие как фосфатазы в клетках. Примерами связующих групп на основе фосфата являются -O-P(O)(ORk)-O-, -O-P(S)(ORk)-O-, -O-P(S)(SRk)-O-, -S-P(O)(ORk)-O-, -O-P(O)(ORk)-S-, -S-P(O)(ORk)-S-, -O-P(S)(ORk)-S- -S-P(S)(ORk)-O-, -O-P(O)(Rk)-O-, -O-P(S)(Rk)-O-, -S-P(O)(Rk)-O-, -S-P(S)(Rk)-O-, -S-P(O)(Rk)-S-, -O-P(S)(Rk)-S-. Дополнительными нелимитирующими примерами являются О-Р(O)(ОН) О, -O-P(S)(OH)-O-, -O-P(S)(SH)-O-, -S-P(O)(OH)-O-, -O-P(O)(OH)-S-, -S-P(O)(OH)-S-, -O-P(S)(OH)-S-, -S-P(S)(OH)-O-, -O-P(O)(H)-O-, -O-P(S)(H)-O-, -S-P(O)(H)-O-, -S-P(S)(H)-O-, -S-P(O)(H)-S-, -O-P(S)(H)-S. Дополнительными нелимитирующим примером является -O-Р(O)(ОН)-O-. Согласно различным вариантам осуществления Rk представляет собой любой из: ОН, SH, NH₂, ВН₃, СН₃, С_1-6 алкила, С_6-10 арила, C_1-6 алкокси и С_6-10 арилокси, где C_1-6 алкил и С_6-10 арил являются незамещенными или необязательно независимо замещены 1-3 группами, независимо выбранными из галогена, гидроксила и NH₂; и R⁴ выбран из О, S, NH или СН₂.

[001317] Согласно некоторым вариантам осуществления линкер содержит кислотные отщепляемые связывающие группы, которые являются связывающими группами, расщепляемыми в кислых условиях. В качестве неограничивающего примера кислотные расщепляемые связывающие группы расщепляются в кислой среде с рН примерно 6,5 или ниже (например, примерно 6,0, 5,5, 5,0 или ниже) или такими агентами, как ферменты, которые могут действовать как общая кислота. В клетке специфические органеллы с низким рН, такие как эндосомы и лизосомы, могут обеспечить среду расщепления для кислотных отщепляемых связывающих групп. Примеры кислотных отщепляемых связывающих групп включают, но не ограничиваются ими, гидразоны, сложные эфиры и сложные эфиры аминокислот. Кислотные отщепляемые группы могут иметь общую формулу -C=NN-, С(O)O или -ОС(О). В дополнительном неограничивающем примере, когда углерод, присоединенный к кислороду сложного эфира (алкоксигруппа), представляет собой арильную группу, замещенную алкильную группу или третичную алкильную группу, такую как диметилпентил или трет-бутил.

[001318] Согласно некоторым вариантам осуществления линкер содержит связывающие группы на основе сложного эфира. В качестве неограничивающего примера отщепляемые связывающие группы на основе сложного эфира расщепляются ферментами, такими как эстеразы и амидазы в клетках. Примеры отщепляемых связывающих групп на основе сложного эфира включают, но не ограничиваются ими, сложные эфиры алкиленовых, алкениленовых и алкиниленовых групп. Сложноэфирные отщепляемые связывающие группы имеют общую формулу С(O)O или ОС(О). Эти кандидаты могут быть оценены с использованием способов, аналогичных описанным выше.

[001319] Согласно некоторым вариантам осуществления линкер содержит отщепляемую группу на основе пептида. Отщепляемые связывающие группы на основе пептида расщепляются ферментами, такими как пептидазы и протеазы в клетках. Отщепляемые связывающие группы на основе пептидов представляют собой пептидные связи, образованные между аминокислотами с получением олигопептидов (например, дипептидов, трипептидов и т.д.) и полипептидов. В качестве неограничивающего примера, отщепляемые группы на основе пептидов не включают амидную группу (-C(O)NH-). Амидная группа может быть образована между любым алкиленом, алкениленом или алкиниленом. Пептидная связь представляет собой особый тип амидной связи, образованной между аминокислотами с образованием пептидов и белков. В качестве неограничивающего примера отщепляемая группа на основе пептида может быть ограничена пептидной связью (то есть амидной связью), образованной между аминокислотами, дающими пептиды и белки, и не включает всю амидную функциональную группу. В качестве неограничивающего примера, отщепляемые связывающие группы на основе пептидов могут иметь общую формулу NHCHR^AC(O)NHCHR^BC(O), где R^A и R^B представляют собой R-группы двух соседних аминокислот. Эти кандидаты могут быть оценены с использованием способов, аналогичных описанным выше.

[001320] Может быть использована любой линкер, описанный в данной области техники, в том числе в качестве неограничивающих примеров, описанных в заявке на патент США №20150265708.

[001321] Согласно некоторым вариантам осуществления липид конъюгируют с олигонуклеотидом, используя любой способ, известный в данной области техники в соответствии с настоящим раскрытием.

[001322] Неограничивающие примеры способов конъюгирования липида с олигонуклеотидом приведены в примерах. Например, липид (например, стеариновая кислота или турбинаровая кислота) может быть конъюгирован с олигонуклеотидом (например, WV-3473) с использованием С6 РО линкера с получением , где Mod015L001 основан на стеариновой кислоте и С6 РО линкере; и где Mod020L001 основан на турбинаровой кислоте и С6 РО линкере; ' где Mod015L001 основан на стеариновой кислоте и С6 РО линкере; и WV-3559, , где Mod020L001 основан на турбинаровой кислоте и С6 РО линкере. Эти олигонуклеотиды были эффективны в различных анализах in vitro.

Нацеливающие компоненты

[001323] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция дополнительно содержит нацеливающий компонент или фрагмент. Нацеливающий компонент может быть либо конъюгирован, либо не конъюгирован с липидом или биологически активным агентом. Согласно некоторым вариантам осуществления нацеливающий компонент конъюгирован с биологически активным агентом. Согласно некоторым вариантам осуществления биологически активный агент конъюгирован как с липидом, так и с нацеливающим компонентом. Как описано в настоящем описании, согласно некоторым вариантам осуществления биологически активный агент представляет собой предложенный олигонуклеотид. Таким образом, согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция олигонуклеотидов дополнительно содержит помимо липида и олигонуклеотидов, нацеливающие элементы. В соответствии с настоящим раскрытием могут использоваться различные нацеливающие компоненты, например, липиды, антитела, пептиды, углеводы и т.д. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды имеют структуру A^c-[-L^LD-(R^LD)_a]_b. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды имеют структуру [(A^c)_a-L^LD]_b-R^LD. Согласно некоторым вариантам осуществления L^LD, R^LD, комбинации L^LD и R^LD или -[-L^LD-(R^LD)_a]_b содержат один или более нацеливающих компонентов.

[001324] Нацеливающие компоненты могут быть включены в предусмотренные технологии посредством многих типов способов в соответствии с настоящим раскрытием. Согласно некоторым вариантам осуществления нацеливающие компоненты физически смешивают с предложенными олигонуклеотидами для образования предложенных композиций. Согласно некоторым вариантам осуществления нацеливающие компоненты химически конъюгируют с олигонуклеотидами.

[001325] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции содержат два или более нацеливающих компонента. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды содержат два или более конъюгированных нацеливающих компонента. Согласно некоторым вариантам осуществления два или более конъюгированных нацеливающих компонентов являются одинаковыми. Согласно некоторым вариантам осуществления два или более конъюгированных нацеливающих компонентов различны. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные олигонуклеотиды содержат не более одного нацеливающего компонента. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенной композиции содержат различные типы конъюгированных нацеливающих компонентов. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотиды предложенной композиции содержат нацеливающие компоненты того же типа.

[001326] Нацеливающие компоненты могут быть конъюгированы с олигонуклеотидами необязательно через линкерные группы. В соответствии с настоящим раскрытием могут использоваться различные типы линкеров в данной области техники. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер содержит фосфатную группу, которая может, например, использоваться для конъюгации нацеливающих компонентов посредством химии, аналогичной той, которая используется для синтеза олигонуклеотидов. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер содержит амидную, сложноэфирную или эфирную группу. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер имеет структуру -L-. Нацеливающие компоненты могут быть конъюгированы с помощью одного или более линкеров по сравнению с липидами.

[001327] Нацеливающие компоненты, необязательно через линкеры, могут быть конъюгированы с олигонуклеотидами в различных подходящих местоположениях. Согласно некоторым вариантам осуществления нацеливающие компоненты конъюгируют через 5'-ОН-группу. Согласно некоторым вариантам осуществления нацеливающие компоненты конъюгируют через 3'-ОН-группу. Согласно некоторым вариантам осуществления нацеливающие компоненты конъюгируют через один или более фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления нацеливающие компоненты конъюгируют через одно или более оснований. Согласно некоторым вариантам осуществления нацеливающие компоненты включают через одну или более межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления олигонуклеотид может содержать многочисленные конъюгированные нацеливающие компоненты, которые независимо конъюгированы через его 5'-ОН, 3'-ОН, фрагменты сахара, фрагменты оснований и/или межнуклеотидные связи. Нацеливающие компоненты и липиды могут быть конъюгированы либо в том же, соседнем и/или отделенном местоположениях. Согласно некоторым вариантам осуществления нацеливающий компонент конъюгирует на одном конце олигонуклеотида. а липид конъюгирует на другом конце.

[001328] Согласно некоторым вариантам осуществления нацеливающий компонент взаимодействует с белком на поверхности целевых клеток. Согласно некоторым вариантам осуществления такое взаимодействие облегчает интернализацию в целевые клетки. Согласно некоторым вариантам осуществления нацеливающий компонент содержит фрагмент сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления нацеливающий компонент содержит полипептидный фрагмент. Согласно некоторым вариантам осуществления нацеливающий компонент содержит антитело. Согласно некоторым вариантам осуществления нацеливающий компонент представляет собой антитело. Согласно некоторым вариантам осуществления нацеливающий компонент содержит ингибитор. Согласно некоторым вариантам осуществления нацеливающий компонент представляет собой фрагмент из низкомолекулярного ингибитора. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор представляет собой ингибитор белка на поверхности целевых клеток. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор представляет собой ингибитор карбоангидразы. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор представляет собой ингибитор карбоангидразы, который экспрессируется на поверхности целевых клеток. Согласно некоторым вариантам осуществления карбоангидраза представляет собой I, II, III, IV, V, VI, VII, VIII, IX, X, XI, XII, XIII, XIV, XV или XVI. Согласно некоторым вариантам осуществления карбоангидраза представляет собой мембраносвязанную. Согласно некоторым вариантам осуществления карбоангидраза представляет собой IV, IX, XII или XIV. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор представляет собой ингибитор для IV, IX, XII и/или XIV. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор представляет собой ингибитор карбоангидразы III. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор представляет собой ингибитор карбоангидразы IV. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор представляет собой ингибитор карбоангидразы IX. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор представляет собой ингибитор карбоангидразы XII. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор представляет собой ингибитор карбоангидразы XIV. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор содержит или представляет собой сульфонамид (например, описанные в Supuran, СТ. Nature Rev Drug Discover 2008, 7, 168-181, причем сульфонамиды включены в настоящий документ посредством ссылки). Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор представляет собой сульфонамид. Согласно некоторым вариантам осуществления целевые клетки представляют собой мышечные клетки.

[001329] Согласно некоторым вариантам осуществления нацеливающий компонент представляет собой R^LD, как определено и описано в настоящем раскрытии. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотиды, содержащие R^LD. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотидные композиции, содержащие олигонуклеотиды, содержащие R^LD. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает олигонуклеотидные композиции, содержащие первое множество олигонуклеотидов, содержащих R^LD. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотидов, содержащих R^LD. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD содержит или представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD содержит или представляет собой . Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD содержит или представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD содержит или представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD содержит или представляет собой

Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD содержит или представляет собой

Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD содержит или представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD содержит или представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD содержит или представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD содержит или представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD содержит или представляет собой . Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD содержит или представляет собой

. Согласно некоторым вариантам осуществления RLU содержит или представляет собой

. Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD содержит или представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD содержит или представляет собой

Согласно некоторым вариантам осуществления R^LD представляет собой нацеливающий компонент, который содержит или представляет собой липидный фрагмент. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой О. Согласно некоторым вариантам осуществления X представляет собой S.

[001330] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает технологии (например, реагенты, способы и т.д.) для конъюгации различных фрагментов с олигонуклеотидными цепями. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает технологии конъюгации нацеливающего компонента с олигонуклеотидными цепями. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает кислоты, содержащие нацеливающие компоненты для конъюгации, например, R^LD-COOH. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает линкеры для конъюгации, например, L^LD. Специалисту в настоящей области техники понятно, что многие известные и широко применимые технологии могут быть использованы для конъюгации с олигонуклеотидными цепями в соответствии с настоящим раскрытием. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная кислота представляет собой

Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная кислота представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная кислота представляет собой . Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная кислота представляет собой Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная кислота представляет собой жирную кислоту, которая может обеспечить липидный фрагмент в качестве нацеливающего компонента. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способы и реагенты для получения таких кислот.

[001331] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные соединения, например, реагенты, продукты (например, олигонуклеотиды, амидиты и т.д.) и т.д. являются чистыми по меньшей мере на 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%), 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 97% или 99%. Согласно некоторым вариантам осуществления чистота составляет по меньшей мере 50%. Согласно некоторым вариантам осуществления чистота составляет по меньшей мере 75%. Согласно некоторым вариантам осуществления чистота составляет по меньшей мере 80%. Согласно некоторым вариантам осуществления чистота составляет по меньшей мере 85%. Согласно некоторым вариантам осуществления чистота составляет по меньшей мере 90%. Согласно некоторым вариантам осуществления чистота составляет по меньшей мере 95%. Согласно некоторым вариантам осуществления чистота составляет по меньшей мере 96%. Согласно некоторым вариантам осуществления чистота составляет по меньшей мере 97%. Согласно некоторым вариантам осуществления чистота составляет по меньшей мере 98%. Согласно некоторым вариантам осуществления чистота составляет по меньшей мере 99%.

Иллюстративное применение

[001332] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие охватывает применение композиции, содержащей липид и биологически активный агент. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает способы доставки биологически активного агента к целевому положению, предусматривающие введение предложенной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный способ доставляет биологически активный агент в клетку. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный способ доставляет биологически активный агент в мышечную клетку. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный способ доставляет биологически активный агент в клетку внутри ткани. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный способ доставляет биологически активный агент в клетку внутри органа. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный способ доставляет биологически активный агент в клетку внутри субъекта, предусматривающий введение субъекту предложенной композиции. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный способ доставляет биологически активный агент в цитоплазму. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенный способ доставляет биологически активный агент в ядро.

[001333] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к способам, связанным с доставкой биологически активного агента в мышечную клетку или ткань или мышечную клетку или ткань у млекопитающего (например, человека), причем способ относится к применению композиции, содержащей биологический агент и липид, а любой один или более дополнительных компонентов выбирают из: полинуклеотида, красителя, интеркалирующего агента (например, акридина), сшивающего агента (например, псоралена или митомицина С), порфирина (например, ТРРС4, тексафирина или сапфирина), полициклического ароматического углеводорода (например, феназина или дигидрофеназина), искусственной эндонуклеазы, хелатирующего агента, ЭДТА, алкилирующего агента, фосфата, амино, меркапто, ПЭГ (например, ПЭГ-40К), MPEG, [МРЕО]₂, полиамино, алкила, замещенного алкила, меченного радиоактивным изотопом маркера, фермента, гаптена (например, биотина), посредника транспорта/абсорбции (например, аспирина, витамина Е или фолиевой кислоты), синтетической рибонуклеазы, белка, например, гликопротеина или пептида, например, молекулы, имеющей специфическое сродство к со-лиганду, или антитела, например, антитела, гормона, гормонального рецептора, вещества непептидной природы, липида, лектина, углевода, витамина, кофактора или лекарства. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композициям или способам, относящимся к композиции, содержащей биологически активный агент и липид, содержащий С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к композициям или способам, относящимся к композиции, содержащей биологически активный агент и липид, содержащий С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-4 алифатическими группами. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает композиции олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью и липид, выбранный из группы, состоящей из лауриновой кислоты, миристиновой кислоты, пальмитиновой кислоты, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, докозагексаеновой кислоты (цис-ДГК), турбинаровой кислоты и дилинолеила, причем композиция подходит для доставки олигонуклеотида в мышечную клетку или ткань или мышечную клетку или ткань у млекопитающего (например, человека). Согласно некоторым вариантам осуществления биологически активный агент представляет собой олигонуклеотид, содержащий одну или более хиральных межнуклеотидных связей, а предложенная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотида. Согласно некоторым вариантам осуществления биологически активный агент представляет собой олигонуклеотид, содержащий одну или более хиральных межнуклеотидных связей, а предложенная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов с неконтролируемой хиральностью олигонуклеотида.

[001334] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к способу доставки биологически активного агента в клетку или ткань, причем способ предусматривает стадии: обеспечения композиции, содержащей биологически активный агент и липид; и контактирования клетки или ткани с композицией; согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к способу введения биологически активного агента субъекту, причем способ предусматривает стадии: обеспечения композиции, содержащей биологически активный агент и липид; и введения композиции субъекту. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь. Согласно некоторым вариантам осуществления липид содержит С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-4 алифатическими группами. Согласно различным вариантам осуществления липид выбирают из группы, состоящей из лауриновой кислоты, миристиновой кислоты, пальмитиновой кислоты, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, докозагексаеновой кислоты (цис-ДГК), турбинаровой кислоты и дилинолеила. Согласно некоторым вариантам осуществления биологически активный агент выбирают из группы, состоящей из: небольшой молекулы, пептида, белка, компонента системы CRISPR-Cas, углевода, терапевтического агента, химиотерапевтического агента, вакцины, нуклеиновой кислоты и липида. Согласно некоторым вариантам осуществления нуклеиновая кислота представляет собой олигонуклеотид, антисмысловой олигонуклеотид, агент РНК интерференции, микроРНК, иммуномодулирующую нуклеиновую кислоту, аптамер, Piwi-взаимодействующую РНК (пиРНК), малую ядрышковую РНК (snoRNA), рибозим, мРНК, IncRNA, ncRNA, антигомир (например, антагонист к микроРНК, IncRNA, ncRNA или другой нуклеиновой кислоте), плазмиду, вектор или его часть. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенная композиция представляет собой композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью нуклеиновой кислоты, которая содержит одну или более хиральных межнуклеотидных связей. Согласно различным вариантам осуществления внепеченочная клетка или ткань представляют собой мышечную клетку или ткань. Согласно различным вариантам осуществления связанное с мышцами нарушение представляет собой саркопению, нарушение движения мышц, связанное с мышечной дистрофией нарушение, дегенерацию мышц, мышечную слабость, мышечную дистрофию, мышечную дистрофию Дюшенна, сердечную недостаточность, нарушение дыхания, вызванную недоеданием дегенерацию скелетных мышц и связанное с мышцами заболевание, связанное с нарушением инсулинозависимой сигнализации, амиотрофический боковой склероз, атрофию спинного мозга и повреждение спинного мозга, ишемическое мышечное заболевание. Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие относится к способу введения нуклеиновой кислоты (в качестве неограничивающего примера, олигонуклеотида или стереоопределенного олигонуклеотида) в мышечную клетку или ткань у субъекта, причем субъект страдает от связанного с мышцами заболевания или нарушения, причем способ предусматривает стадии: обеспечения композиции, содержащей липид и нуклеиновую кислоту, и введения терапевтически эффективного количества композиции субъекту.

[001335] Согласно некоторым вариантам осуществления биологически активный агент представляет собой олигонуклеотид, последовательность которого представляет собой или содержит элемент, который по существу комплементарен целевому элементу в клеточной нуклеиновой кислоте. Согласно некоторым вариантам осуществления целевой элемент представляет собой или содержит элемент последовательности, который связан с мышечным заболеванием, нарушением или состоянием. Согласно некоторым вариантам осуществления мышечное заболевание, нарушение или состояние представляет собой DMD. Согласно некоторым вариантам осуществления клеточная нуклеиновая кислота представляет собой или содержит транскрипт. Согласно некоторым вариантам осуществления клеточная нуклеиновая кислота представляет собой или содержит первичный транскрипт. Согласно некоторым вариантам осуществления клеточная нуклеиновая кислота представляет собой или содержит геномную нуклеиновую кислоту. Настоящее раскрытие охватывает признание того факта, что некоторые липиды и другие соединения применимы для доставки биологически активных агентов в клетки и ткани, например, у млекопитающего или человека. Многие технологии доставки таких агентов могут страдать от невозможности нацеливания на нужные клетки или ткани.

[001336] Доставка биологически активных веществ в ткани за пределами печени остается сложной. Juliano сообщил, что, несмотря на достижения на клиническом уровне, эффективная доставка олигонуклеотидов in vivo остается серьезной проблемой, особенно во внепеченочные участки. Juliano 2016 Nucl. Acids Res. Doi: 10.1093/nar/gkw236. Lou также сообщил, что доставка миРНК в органы за пределами печени остается самым большим препятствием для применения этой технологии для лечения множества заболеваний. Lou 2014 SciBX 7(48); doi:10.1038/scibx.2014.1394.

[001337] Настоящее раскрытие охватывает некоторые удивительные результаты, включая в себя то, что некоторые липиды и другие соединения особенно эффективны при доставке биологически активных агентов к конкретным клеткам и тканям, включая клетки и ткани вне печени, включая в качестве неограничивающих примеров мышечные клетки и ткани.

[001338] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции изменяют сплайсинг транскриптов, так что нежелательная мишень и/или биологическая функция подавляются. Согласно некоторым вариантам осуществления в таких случаях предложенная композиция также может индуцировать расщепление транскрипта после гибридизации.

[001339] Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции изменяют сплайсинг транскриптов таким образом, что желаемая целевая и/или биологическая функция усиливаются. Согласно некоторым вариантам осуществления предложенные композиции путем включения химических модификаций, стереохимии и/или их комбинаций эффективно подавляют или предотвращают расщепление целевого транскрипта после контакта.

[001340] Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид из множества содержит один или более модифицированных фрагментов сахара и модифицированных межнуклеотидных связей. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид из множества содержит два или более модифицированных фрагмента сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид из множества содержит три или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид из множества содержит четыре или более модифицированных фрагмента сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид из множества содержит пять или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид из множества содержит десять или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид из множества содержит примерно 15 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид из множества содержит примерно 20 или более модифицированных фрагментов сахара. Согласно некоторым вариантам осуществления каждый олигонуклеотид из множества содержит примерно 25 или более модифицированных фрагментов сахара.

Иллюстративные варианты осуществления

[001341] Согласно некоторым вариантам осуществления настоящее раскрытие предусматривает следующие иллюстративные варианты осуществления:

1. Композиция олигонуклеотидов, содержащая первое множество олигонуклеотидов, в которой:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 5'-концевую область, содержащую 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей, 3'-концевую область, содержащую 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей, и среднюю область между 5'-концевой областью и 3'-областью, содержащей 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более природных фосфатных связей.

2. Композиция олигонуклеотидов, содержащая первое множество олигонуклеотидов, в которой:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат 5'-концевую область, содержащую 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей, 3'-концевую область, содержащую 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей, и среднюю область между 5'-концевой областью и 3'-областью, содержащей 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более межнуклеотидных связей в конфигурации Rp.

3. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, причем композиция содержит первое множество олигонуклеотидов, каждый из которых имеет структуру:

где:

каждый Nu⁵ независимо представляет собой нуклеотидное звено, и по меньшей мере один представляет собой Nu^S или Nu^F;

каждый Nu³ независимо представляет собой нуклеотидное звено, и по меньшей мере один представляет собой Nu^S или Nu^F;

каждый Nu^S независимо представляет собой нуклеотидное звено, содержащее модифицированную межнуклеотидную связь;

каждый Nu^F независимо представляет собой нуклеотидное звено, содержащее -F;

каждый из z1, z2 и z3 независимо равен 0-100, причем по меньшей мере один из z1, z2 и z3 не равен 0;

каждый Nu^m независимо представляет собой нуклеотидное звено; а также

где по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 последовательных Nu⁵ и по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 последовательных Nu³ представляют собой Nu^S и по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 Nu^m содержат природную фосфатную связь или межнуклеотидную связь в конфигурации Rp.

4. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, причем композиция содержит первое множество олигонуклеотидов, каждый из которых имеет структуру

5. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой первая из 5'-концевых модифицированных межнуклеотидных связей представляет собой первую межнуклеотидную связь олигонуклеотида.

6. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой последняя из 3'-концевых модифицированных межнуклеотидных связей представляет собой последнюю межнуклеотидную связь олигонуклеотида.

7. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 5'-конец содержит 2 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей.

8. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 5'-конец содержит 3 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей.

9. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 5'-конец содержит 4 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей.

10. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 5'-конец содержит 5 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей.

11. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 5'-конец содержит 6 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей.

12. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 5'-конец содержит 7 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей.

13. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 5'-конец содержит 8 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей.

14. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 3'-конец содержит 2 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей.

15. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 3'-конец содержит 3 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей.

16. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 5'-конец содержит 4 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей.

17. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 5'-конец содержит 5 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей.

18. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 5'-конец содержит 6 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей.

19. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 5'-конец содержит 7 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей.

20. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 5'-конец содержит 8 или более последовательных модифицированных межнуклеотидных связей.

21. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая из 5'- и 3'-концевых последовательно модифицированных межнуклеотидных связей независимо имеет структуру формулы I.

22. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая из 5'-концевых модифицированных межнуклеотидных связей представляет собой фосфоротиоат.

23. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая из 3'-концевых модифицированных межнуклеотидных связей представляет собой фосфоротиоат.

24. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая из 5'-концевых модифицированных межнуклеотидных связей характеризуется конфигурацией Sp.

25. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая из 3'-концевых модифицированных межнуклеотидных связей характеризуется конфигурацией Sp.

26. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 1 или более природных фосфатных связей.

27. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 2 или более природных фосфатных связей.

28. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 3 или более природных фосфатных связей.

29. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 4 или более природных фосфатных связей.

30. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 5 или более природных фосфатных связей.

31. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 6 или более природных фосфатных связей.

32. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 7 или более природных фосфатных связей.

33. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 8 или более природных фосфатных связей.

34. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 1 или более межнуклеотидных связей в конфигурации Rp.

35. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 2 или более межнуклеотидных связей в конфигурации Rp.

36. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 3 или более межнуклеотидных связей в конфигурации Rp.

37. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 4 или более межнуклеотидных связей в конфигурации Rp.

38. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 5 или более межнуклеотидных связей в конфигурации Rp.

39. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 6 или более межнуклеотидных связей в конфигурации Rp.

40. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 7 или более межнуклеотидных связей в конфигурации Rp.

41. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 8 или более межнуклеотидных связей в конфигурации Rp.

42. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 1 или более межнуклеотидных связей в конфигурации Sp.

43. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 2 или более межнуклеотидных связей в конфигурации Sp.

44. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 3 или более межнуклеотидных связей в конфигурации Sp.

45. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 4 или более межнуклеотидных связей в конфигурации Sp.

46. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 5 или более межнуклеотидных связей в конфигурации Sp.

47. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 6 или более межнуклеотидных связей в конфигурации Sp.

48. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 7 или более межнуклеотидных связей в конфигурации Sp.

49. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит 8 или более межнуклеотидных связей в конфигурации Sp.

50. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества независимо содержит нуклеотидное звено, содержащее -F.

51. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит 1 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

52. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит 2 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

53. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит 3 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

54. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит 4 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

55. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит 5 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

56. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит 6 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

57. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит 8 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

58. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит 9 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

59. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит 10 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

60. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой нуклеотидное звено, содержащее 5'-концевую последовательную модифицированную межнуклеотидную связь, содержит нуклеозидное звено, содержащее -F.

61. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое нуклеотидное звено, содержащее 5'-концевую последовательную модифицированную межнуклеотидную связь, независимо содержит нуклеозидное звено, содержащее -F.

62. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой нуклеотидное звено, содержащее 3'-концевую последовательную модифицированную межнуклеотидную связь, содержит нуклеозидное звено, содержащее -F.

63. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое нуклеотидное звено, содержащее 3'-концевую последовательную модифицированную межнуклеотидную связь, независимо содержит нуклеозидное звено, содержащее -F.

64. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой средняя область содержит одно или более нуклеотидных звеньев, содержащих нуклеозидные звенья, содержащие -F.

65. Композиция по варианту осуществления 64, в которой одно или более нуклеотидных звеньев содержат природную фосфатную связь.

66. Композиция по варианту осуществления 64 или 65, в которой одно или более нуклеотидных звеньев содержат модифицированную межнуклеотидную связь.

67. Композиция олигонуклеотидов, содержащая первое множество олигонуклеотидов, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

олигонуклеотиды первого множества содержат одно или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

68. Композиция по варианту осуществления 67, в которой композиция содержит первое множество олигонуклеотидов, каждый из которых имеет структуру:

5'-[Nu⁵]_z1-[Nu^m]_z2-[Nu³]_z3-3',

где:

каждый Nu⁵ независимо представляет собой нуклеотидное звено и по меньшей мере один представляет собой Nu^S или Nu^F;

каждый Nu³ независимо представляет собой нуклеотидное звено и по меньшей мере один представляет собой Nu^S или Nu^F;

каждый Nu^S независимо представляет собой нуклеотидное звено, содержащее модифицированную межнуклеотидную связь;

каждый Nu^F независимо представляет собой нуклеотидное звено, содержащее -F;

каждый из z1, z2 и z3 независимо равен 0-100, причем по меньшей мере один из z1, z2 и z3 не равен 0;

каждый Nu^m независимо представляет собой нуклеотидное звено; а также

где по меньшей мере один из Nu⁵, Nu³ и Nu^m представляет собой Nu^F.

69. Композиция по варианту осуществления 68, в которой по меньшей мере один Nu⁵ и по меньшей мере один Nu³ представляет собой Nu^F.

70. Композиция по любому из вариантов осуществления 67-69, в которой композиция содержит первое множество олигонуклеотидов, каждый из которых имеет структуру 5'[Nu^F]_z1-[Nu^m]_z2-[Nu^F]z3-3'.

71. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый Nu^S независимо содержит модифицированную межнуклеотидную связь, имеющую структуру формулы I.

72. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый Nu^S содержит фосфоротиоатную связь.

73. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый Nu^F содержит модифицированную межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью.

74. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый Nu^F содержит модифицированную межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью в конфигурации Sp.

75. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый Nu^S содержит модифицированный фрагмент сахара.

76. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый Nu^S содержит 2'-F-фрагмент сахара.

77. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый Nu^F содержит 2'-F-фрагмент сахара.

78. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый Nu^F содержит модифицированную межнуклеотидную связь формулы I.

79. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый Nu^F содержит фосфоротиоатную связь.

80. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый Nu^F содержит модифицированную межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью.

81. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый Nu^F содержит модифицированную межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью в конфигурации Sp.

82. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере один Nu^m содержит модифицированный 2'-F-фрагмент сахара.

83. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере один Nu^m содержит 2'-OR¹ модифицированный фрагмент сахара, где R¹ представляет собой необязательно замещенный C_1-6 алкил.

84. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере один Nu^m содержит природную фосфатную связь.

85. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере один Nu^m содержит модифицированную межнуклеотидную связь.

86. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере один Nu^m содержит модифицированную межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью в конфигурации Sp.

87. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере один Nu^m содержит модифицированную межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью в конфигурации Rp.

88. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере один Nu^m содержит 2'-OR¹ модифицированный фрагмент сахара, где R¹ представляет собой необязательно замещенный C_1-6 алкил и природную фосфатную связь.

89. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере один Nu^m содержит модифицированный фрагмент сахара 2'-F и модифицированную межнуклеотидную связь.

90. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере один Nu^m содержит модифицированный фрагмент сахара 2'-F и модифицированную межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью в конфигурации Sp.

91. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере один Num содержит модифицированный фрагмент сахара 2'-F и модифицированную межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью в конфигурации Rp.

92. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый из Nu^S, Nu^F и Nu^m независимо имеет структуру:

где:

B^Nu представляет собой необязательно замещенную нуклеотидную группу;

каждый R^Nu независимо представляет собой R¹, R', -L-R¹ или -L-R', где каждый из R¹, R' и L независимо является таким, как определено и описано;

L^Nu5 представляет собой ковалентную связь, или, если на 5'-конце олигонуклеотида, RNu; а также

L^Nu3 представляет собой межнуклеотидную связь, имеющую структуру формулы I, или, если на 3'-конце олигонуклеотида, R^Nu.

93. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый из Nu^S, Nu^F и Nu^m независимо имеет структуру:

94. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой B^Nu представляет собой необязательно замещенные А, Т, С, G и U;

95. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой в 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более из Nu^S, Nu^F и Nu^m две группы R^Nu взяты вместе с их взаимодействующих атомов с образованием кольцевой системы.

96. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой в 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более из Nu^S, Nu^F и Nu^m, 2'-R^Nu представляет собой 2'-OR¹.

97. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой в 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более из Nu^S, Nu^F и Nu^m, 2'-R^Nu представляет собой 2'-F.

98. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой L^Nu5 представляет собой 5'-ОН, защищенную 5' ОН или О или ковалентную связь.

99. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой L^Nu3 имеет структуру формулы I, 3'-ОН или защищенной 3'-ОН.

100. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой сумма z1, z2 и z3 составляет 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21,22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 50 или более.

101. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой zl составляет 4 или более.

102. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой zl составляет 5 или более.

103. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой zl составляет 6 или более.

104. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой z2 составляет 4 или более.

105. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой z2 составляет 5 или более.

106. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой z2 составляет 6 или более.

107. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой z3 составляет 4 или более.

108. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой z3 составляет 5 или более.

109. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой z3 составляет 6 или более.

110. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой z1 равно z3.

111. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой [Nu⁵]_z1, [Nu^S]_z1 или [Nu^F]× представляет собой 5'-крыло или 5'-концевую область.

112. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой [Nu⁵]_z3, [Nu^S]_z3 или [Nu^F]_z3 представляет собой 3'-крыло или 3'-концевую область.

113. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой Nu^m]_z2 представляет собой сердцевину или среднюю область.

114. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 2 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

115. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 3 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

116. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 4 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

117. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 5 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

118. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 6 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

119. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 7 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

120. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 8 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

121. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 9 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

122. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 10 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

123. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый из первого множества олигонуклеотидов содержит 5'-концевую область, содержащую 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более нуклеозидных звеньев, содержащих F.

124. Композиция по любому из предыдущих вариантов, в которой каждый из первого множества олигонуклеотидов содержит 5'-концевую область, содержащую 2 или более нуклеозидных звеньев, содержащих F.

125. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый из первого множества олигонуклеотидов содержит 5'-концевую область, содержащую 3 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

126. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый из первого множества олигонуклеотидов содержит 5'-концевую область, содержащую 4 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

127. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый из первого множества олигонуклеотидов содержит 5'-концевую область, содержащую 5 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

128. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый из первого множества олигонуклеотидов содержит 5'-концевую область, содержащую 6 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

129. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый из первого множества олигонуклеотидов содержит 5'-концевую область, содержащую 7 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

130. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый из первого множества олигонуклеотидов содержит 5'-концевую область, содержащую 8 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

131. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой первое нуклеозидное звено последовательных нуклеозидных звеньев 5'-конца представляет собой первое нуклеозидное звено олигонуклеотида.

132. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый из первого множества олигонуклеотидов содержит 3'-концевую область, содержащую 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более нуклеозидных звеньев, каждое из которых содержит -F.

133. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый из первого множества олигонуклеотидов содержит 3'-концевую область, содержащую 2 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

134. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый из первого множества олигонуклеотидов содержит 3'-концевую область, содержащую 3 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

135. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый из первого множества олигонуклеотидов содержит 3'-концевую область, содержащую 4 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

136. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый из первого множества олигонуклеотидов содержит 3'-концевую область, содержащую 5 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

137. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый из первого множества олигонуклеотидов содержит 3'-концевую область, содержащую 6 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

138. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый из первого множества олигонуклеотидов содержит 3'-концевую область, содержащую 7 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

139. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый из первого множества олигонуклеотидов содержит 3'-концевую область, содержащую 8 или более нуклеозидных звеньев, содержащих -F.

140. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой последнее нуклеозидное звено 3'-концевых последовательных нуклеозидных звеньев представляет собой последнее нуклеозидное звено олигонуклеотида.

141. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой нуклеозидные звенья, содержащие -F, являются последовательными.

142. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой нуклеозидное звено, содержащее -F, содержит 2'-F модифицированные фрагменты сахара.

143. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой нуклеотидное звено, содержащее F, содержит модифицированную межнуклеотидную связь.

144. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое нуклеотидное звено, содержащее F, если оно содержит межнуклеотидную связь, содержит модифицированную межнуклеотидную связь.

145. Композиция по любому из вариантов осуществления 143-144, в которой модифицированная межнуклеотидная связь является хиральной.

146. Композиция по любому из вариантов осуществления 143-144, в которой модифицированная межнуклеотидная связь характеризуется контролируемой хиральностью.

147. Композиция по любому из вариантов осуществления 143-146, в которой модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой фосфоротиоатную связь.

148. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 2 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

149. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 3 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

150. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 4 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

151. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 5 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

152. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 6 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

153. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 7 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

154. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 8 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

155. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 9 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

156. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 10 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

157. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 11 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

158. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 12 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

159. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 13 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

160. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 14 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

161. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 15 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

162. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 16 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

163. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 17 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

164. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 18 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

165. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 19 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

166. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 20 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

167. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 2 или более природных фосфатных связей.

168. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 3 или более природных фосфатных связей.

169. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 4 или более природных фосфатных связей.

170. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 5 или более природных фосфатных связей.

171. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат 6 или более природных фосфатных связей.

172. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая модифицированная межнуклеотидная связь независимо имеет структуру формулы I.

173. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой фосфоротиоатную связь.

174. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая хиральная модифицированная межнуклеотидная связь первого множества олигонуклеотидов независимо характеризуется контролируемой хиральностью.

175. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой композиция характеризуется контролируемой хиральностью в том отношении, что олигонуклеотиды первого множества имеют один и тот же тип олигонуклеотидов, определяемый:

1) последовательностью оснований;

2) профилем связей остова;

3) профилем хиральных центров остова; а также

4) профилем модификаций фосфора остова.

176. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды содержат одну или более модификаций сахара 2'-OR¹.

177. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды содержат две или более модификаций сахара 2'-OR¹.

178. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды содержат три или более модификаций сахара 2'-OR¹.

179. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды содержат четыре или более модификаций сахара 2'-OR¹.

180. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды содержат пять или более модификаций сахара 2'-OR¹.

181. Композиция по любому из вариантов осуществления 176-180, в которой R¹ представляет собой необязательно замещенную C_1-6 алифатическую группу.

182. Композиция по любому из вариантов осуществления 176-180, в которой R¹ представляет собой метил.

183. Композиция по любому из вариантов осуществления 176-182, в которой нуклеотидное звено, содержащее модификации сахара 2'-OR¹, имеет природную фосфатную связь.

184. Композиция по любому из вариантов осуществления 176-183, в которой каждое нуклеотидное звено, содержащее модификации сахара 2'-OR¹, имеет природную фосфатную связь.

185. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды гибридизуются с целевой последовательностью в транскрипте.

186. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой последовательность оснований комплементарна целевой последовательности в транскрипте.

187. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой композиция олигонуклеотидов характеризуется тем, что когда она контактирует с транскриптом в системе сплайсинга транскриптов, сплайсинг транскрипта изменяется относительно наблюдаемого в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинаций.

188. Композиция олигонуклеотидов, содержащая первое множество олигонуклеотидов, которые:

1) имеют одинаковую последовательность оснований, комплементарную целевой последовательности в транскрипте; а также

2) содержат один или более модифицированных фрагментов сахара и модифицированных межнуклеотидных связей,

композиция олигонуклеотидов характеризуется тем, что, когда она контактирует с транскриптом в системе сплайсинга транскриптов, сплайсинг транскрипта изменяется относительно наблюдаемого в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинации.

189. Композиция олигонуклеотидов, содержащая первое множество олигонуклеотидов определенного типа олигонуклеотидов, определяемых:

1) последовательностью оснований;

2) профилем связей остова;

3) профилем хиральных центров остова; а также

4) профилем модификаций фосфора остова,

причем композиция характеризуется контролируемой хиральностью в том отношении, что она обогащена относительно по существу рацемического препарата олигонуклеотидов, имеющих одну и ту же последовательность оснований, олигонуклеотидами конкретного типа олигонуклеотидов, причем:

композиция олигонуклеотидов характеризуется тем, что, когда она контактирует с транскриптом в системе сплайсинга транскриптов, сплайсинг транскрипта изменяется относительно наблюдаемого в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинации.

190. Композиция олигонуклеотидов по варианту осуществления 188 или 189, в которой уровень первого множества олигонуклеотидов предопределен.

191. Композиция олигонуклеотидов по варианту осуществления 2, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит один или более модифицированных фрагментов сахара и модифицированных межнуклеотидных связей.

192. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит два или более модифицированных фрагмента сахара.

193. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит три или более модифицированных фрагментов сахара.

194. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит четыре или более модифицированных фрагментов сахара.

195. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит пять или более модифицированных фрагментов сахара.

196. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит десять или более модифицированных фрагментов сахара.

197. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит примерно 15 или более модифицированных фрагментов сахара.

198. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит примерно 20 или более модифицированных фрагментов сахара.

199. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит примерно 25 или более модифицированных фрагментов сахара.

200. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 5% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара.

201. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 10% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара.

202. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 20% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара.

203. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 30% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара.

204. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 40% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара.

205. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 50% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара.

206. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 60% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара.

207. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 70% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара.

208. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 80% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара.

209. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 85% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара.

210. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 90% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара.

211. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 95% или более фрагментов сахара в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные фрагменты сахара.

212. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 25 последовательных немодифицированных фрагментов сахара.

213. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 20 последовательных немодифицированных фрагментов сахара.

214. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 15 последовательных немодифицированных фрагментов сахара.

215. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 10 последовательных немодифицированных фрагментов сахара.

216. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 9 последовательных немодифицированных фрагментов сахара.

217. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 8 последовательных немодифицированных фрагментов сахара.

218. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 7 последовательных немодифицированных фрагментов сахара.

219. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 6 последовательных немодифицированных фрагментов сахара.

220. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 5 последовательных немодифицированных фрагментов сахара.

221. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 4 последовательных немодифицированных фрагментов сахара.

222. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 3 последовательных немодифицированных фрагментов сахара.

223. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 2 последовательных немодифицированных фрагментов сахара.

224. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 25 немодифицированных фрагментов сахара.

225. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 20 немодифицированных фрагментов сахара.

226. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 15 немодифицированных фрагментов сахара.

227. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 10 немодифицированных фрагментов сахара.

228. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 5 немодифициро ванных фрагментов сахара.

229. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 95% ^модифицированных фрагментов сахара.

230. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 90% немодифицированных фрагментов сахара.

231. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 85% немодифицированных фрагментов сахара.

232. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 80% немодифицированных фрагментов сахара.

233. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 70% немодифицированных фрагментов сахара.

234. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 60% немодифицированных фрагментов сахара.

235. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 50% немодифицированных фрагментов сахара.

236. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 40% немодифицированных фрагментов сахара.

237. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 30% немодифицированных фрагментов сахара.

238. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 20% немодифицированных фрагментов сахара.

239. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 10% немодифицированных фрагментов сахара.

240. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 5% немодифицированных фрагментов сахара.

241. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит модификацию бициклического сахара.

242. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит модификацию бициклического сахара, имеющую мостик -L- или -О-L, соединяющий два кольцевых атома углерода.

243. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит модификацию бициклического сахара, имеющую мостик 4'-СН(СН₃)-O-2'.

244. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит фрагмент морфолино.

245. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотид первого множества представляет собой олигонуклеотид морфолино.

246. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-243, в которой модифицированный фрагмент сахара имеет 2'-модификацию.

247. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-243, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию, причем 2'-модификация представляет собой 2'-OR¹.

248. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-243, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию, причем 2'-модификация представляет собой 2'-OR¹, причем R¹ представляет собой необязательно замещенный C_1-6 алкил.

249. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-243, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию, причем 2'-модификация представляет собой 2'-МОЕ.

250. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-243, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию, причем 2'-модификация представляет собой 2'-ОМе.

251. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-243, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию, причем 2'-модификация представляет собой S-cEt.

252. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-243, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию, причем 2'-модификация представляет собой FANA.

253. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-243, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию, причем 2'-модификация представляет собой FRNA.

254. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-243, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию, причем 2'-модификация представляет собой 2'-F.

255. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-243, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию, а 2'-модификация представляет собой 2'-OR¹ или 2'-F, причем R¹ не представляет собой водород.

256. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-243, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию, а 2'-модификация представляет собой 2'-OR¹ или 2'-F, причем R¹ не представляет собой необязательно замещенный C_1-6-алкил.

257. Композиция по любому из вариантов осуществления 255-256, в которой 2'-OR¹ представляет собой 2'-ОМе.

258. Композиция по любому из вариантов осуществления 255-257, в которой 2'-модификация представляет собой 2'-F.

259. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит две или более модификаций сахара.

260. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит три или более модификаций сахара.

261. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой модификации сахара являются последовательными.

262. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый фрагмент сахара олигонуклеотидов первого множества независимо модифицируется.

263. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит две или более модифицированных межнуклеотидных связей.

264. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит три или более модифицированных межнуклеотидных связей.

265. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит четыре или более модифицированных межнуклеотидных связей.

266. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит пять или более модифицированных межнуклеотидных связей.

267. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит десять или более модифицированных межнуклеотидных связей.

268. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит примерно 15 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

269. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит примерно 20 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

270. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит примерно 25 или более модифицированных межнуклеотидных связей.

271. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 5% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи.

272. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 10% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи.

273. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 20% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи.

274. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 30% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи.

275. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 40% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи.

276. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 50% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи.

277. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 60% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи.

278. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 70% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи.

279. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 80% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи.

280. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 85% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи.

281. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 90% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи.

282. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой примерно 95% межнуклеотидных связей в каждом олигонуклеотиде первого множества представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи.

283. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 25 последовательных природных фосфатных связей.

284. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 20 последовательных природных фосфатных связей.

285. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 15 последовательных природных фосфатных связей.

286. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 10 последовательных природных фосфатных связей.

287. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 9 последовательных природных фосфатных связей.

288. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 8 последовательных природных фосфатных связей.

289. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 7 последовательных природных фосфатных связей.

290. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 6 последовательных природных фосфатных связей.

291. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 5 последовательных природных фосфатных связей.

292. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 4 последовательные природные фосфатные связи.

293. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 3 последовательные природные фосфатные связи.

294. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 2 последовательные природные фосфатные связи.

295. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 10 последовательных нуклеотидов ДНК.

296. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 9 последовательных нуклеотидов ДНК.

297. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 8 последовательных нуклеотидов ДНК.

298. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 7 последовательных нуклеотидов ДНК.

299. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 6 последовательных нуклеотидов ДНК.

300. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 5 последовательных нуклеотидов ДНК.

301. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 4 последовательных нуклеотида ДНК.

302. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 3 последовательных нуклеотида ДНК.

303. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 2 последовательных нуклеотида ДНК.

304. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 25 природных фосфатных связей.

305. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 20 природных фосфатных связей.

306. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 15 природных фосфатных связей.

307. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 10 природных фосфатных связей.

308. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 5 природных фосфатных связей.

309. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 25 нуклеотидов ДНК.

310. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 20 нуклеотидов ДНК.

311. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 15 нуклеотидов ДНК.

312. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 10 нуклеотидов ДНК.

313. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 5 нуклеотидов ДНК.

314. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 95% природных фосфатных связей.

315. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 90% природных фосфатных связей.

316. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 85% природных фосфатных связей.

317. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 80% природных фосфатных связей.

318. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 70% природных фосфатных связей.

319. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 60% природных фосфатных связей.

320. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 50% природных фосфатных связей.

321. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 40% природных фосфатных связей.

322. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 30% природных фосфатных связей.

323. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 20% природных фосфатных связей.

324. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 10% природных фосфатных связей.

325. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества содержит не более чем примерно 5% природных фосфатных связей.

326. Композиция олигонуклеотидов, содержащая первое множество олигонуклеотидов, содержащих одну или более областей крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований; а также

каждая область крыла независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и, необязательно, одну или более природных фосфатных связей, и область сердцевины независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей; или

каждая область крыла независимо содержит один или более модифицированных фрагментов сахара, а область сердцевины содержит один или более немодифицированных фрагментов сахара.

327. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды содержат одну или более областей крыла и область сердцевины, причем:

олигонуклеотиды первого множества имеют одинаковую последовательность оснований;

каждое крыло независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей и. необязательно, одну или более природных фосфатных связей; а также

область сердцевины независимо составляет в длину два или более оснований и независимо содержит одну или более модифицированных межнуклеотидных связей.

328. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло имеет тот же или более низкий процент модифицированных межнуклеотидных связей, чем сердцевина.

329. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо имеет тот же или более низкий процент модифицированных межнуклеотидных связей, чем сердцевина.

330. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло имеет более низкий процент модифицированных межнуклеотидных связей, которые представляют собой сердцевину.

331. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит одну или более природных фосфатных связей.

332. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит одну или более природных фосфатных связей.

333. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло к 5'-концу сердцевины имеет модифицированную межнуклеотидную связь на своем 5'-конце.

334. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло к 3'-концу сердцевины имеет модифицированную межнуклеотидную связь на своем 3'-конце.

335. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит модифицированную межнуклеотидную связь, за которой следуют одна или более природных фосфатных связей в крыле.

336. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло к 5'-концу сердцевины содержит модифицированную межнуклеотидную связь, за которой следуют одна или более природных фосфатных связей в крыле.

337. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло к 5'-концу сердцевины содержит модифицированную межнуклеотидную связь, за которой следуют две или более последовательных природных фосфатных связей в крыле.

338. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит модифицированную межнуклеотидную связь, которой предшествует одна или более природных фосфатных связей в крыле.

339. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло к 3'-концу сердцевины содержит модифицированную межнуклеотидную связь, которой предшествует одна или более природных фосфатных связей в крыле.

340. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло к 3'-концу сердцевины содержит модифицированную межнуклеотидную связь, предшествующую двум или более последовательным природным фосфатным линкерным группам в крыле.

341. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло относится к 5'-концу сердцевины и содержит природную фосфатную связь между двумя нуклеозидами на своем 3'-конце.

342. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло относится к 3'-концу сердцевины и содержит природную фосфатную связь между двумя нуклеозидами на своем 5'-конце;

343. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой первое множество содержит по меньшей мере примерно 10% олигонуклеотидов в композиции.

344. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой первое множество содержит по меньшей мере примерно 20% олигонуклеотидов в композиции.

345. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой первое множество содержит по меньшей мере примерно 30% олигонуклеотидов в композиции.

346. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой первое множество содержит по меньшей мере примерно 60% олигонуклеотидов в композиции.

347. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой первое множество содержит по меньшей мере примерно 70% олигонуклеотидов в композиции.

348. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой первое множество содержит по меньшей мере примерно 80% олигонуклеотидов в композиции.

349. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой первое множество содержит по меньшей мере примерно 85% олигонуклеотидов в композиции.

350. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой первое множество содержит по меньшей мере примерно 90% олигонуклеотидов в композиции.

351. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой первое множество содержит по меньшей мере примерно 95% олигонуклеотидов в композиции.

352. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, содержащая первое множество олигонуклеотидов определенного типа олигонуклеотидов, определяемого:

1) последовательностью оснований;

2) профилем связей остова;

3) профилем хиральных центров остова; а также

4) профилем модификаций фосфора остова.

353. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, причем композиция содержит первое множество олигонуклеотидов определенного типа олигонуклеотидов, причем олигонуклеотиды определенного типа олигонуклеотидов имеют одинаковый профиль модификаций оснований и профиль модификаций сахара.

354. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, причем композиция содержит первое множество олигонуклеотидов определенного типа олигонуклеотидов, причем олигонуклеотиды определенного типа олигонуклеотидов структурно идентичны.

355. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой первое множество олигонуклеотидов содержит две области крыла и область сердцевины.

356. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой первое множество олигонуклеотидов содержит не более чем две области крыла и не более чем одну область сердцевины.

357. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой первое множество олигонуклеотидов имеет структуру крыло-сердцевина.

358. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой первое множество олигонуклеотидов представляет собой гэпмеры, имеющие структуру крыло-сердце вина.

359. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-282, в которой первое множество олигонуклеотидов содержит не более одной области крыла и не более одной области сердцевины.

360. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-282, в которой первое множество олигонуклеотидов представляет собой гемимеры, имеющие структуру крыло-сердцевина.

361. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-282, в которой первое множество олигонуклеотидов представляет собой гемимеры, имеющие структуру сердцевины.

362. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит хиральную межнуклеотидную связь.

363. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 20% хиральных межнуклеотидных связей.

364. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит хиральную межнуклеотидную связь.

365. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 20% хиральных межнуклеотидных связей.

366. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-326 и 359-363, в которой крыло к 5'-концу сердцевины содержит хиральную межнуклеотидную связь на 5'-конце крыла.

367. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-326 и 359-363, в которой крыло к 3'-концу сердцевины содержит хиральную межнуклеотидную связь на 3'-конце крыла.

368. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло имеет только одну хиральную межнуклеотидную связь, и каждая из других межнуклеотидных связей крыла представляет собой природную фосфатную связь

369. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой хиральная межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I.

370. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой хиральная межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I и в которой X представляет собой S, a Y и Z представляют собой О.

371. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой хиральная межнуклеотидная связь представляет собой фосфоротиоатную связь.

372. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой хиральная межнуклеотидная связь характеризуется конфигурацией Sp.

373. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая хиральная межнуклеотидная связь характеризуется конфигурацией Sp.

374. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-372, в которой хиральная межнуклеотидная связь характеризуется конфигурацией Rp.

375. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-371, в которой каждая хиральная межнуклеотидная связь характеризуется конфигурацией Rp.

376. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-374, в которой крыло содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp.

377. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-374, в которой каждое крыло независимо содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp.

378. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-360, 362-374 и 376-377, в которой крыло относится к 5'-концу сердцевины и крыло содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp.

379. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-360, 362-374 и 376-378, в которой крыло относится к 5'-концу сердцевины и крыло содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp на 5'-конце крыла.

380. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-360, 362-374 и 376-379, в которой крыло относится к 5'-концу сердцевины, крыло содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp на 5'-конце крыла и каждая из других межнуклеотидных связей крыла представляет собой природную фосфатную связь

381. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-359, 361-374 и 376-377, в которой крыло относится к 3'-концу сердцевины и крыло содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp на 3'-конце крыла.

382. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-359, 361-374, 376-377 и 381, в которой крыло относится к 3'-концу сердцевины и крыло содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp на 3'-конце крыла.

383. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-359, 361-374, 376-377 и 381-382, в которой одно крыло относится к 3'-концу общей сердцевины, крыло содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp на 3'-конце крыла и каждая из других межнуклеотидных связей крыла представляет собой природную фосфатную связь

384. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-372 и 374-383, в которой крыло содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Rp.

385. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-372 и 374-383, в которой каждое крыло независимо содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Rp.

386. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-360, 362-372 и 374-385, в которой крыло относится к 5'-концу сердцевины и крыло содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Rp.

387. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-360, 362-372 и 374-386, в которой крыло относится к 5'-концу сердцевины и крыло содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Rp на 5'-конце крыло.

388. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-360, 362-372 и 374-387, в которой крыло относится к 5'-концу сердцевины, крыло содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Rp на 5'-конце крыла и каждая из других межнуклеотидных связей крыла представляет собой природную фосфатную связь

389. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-359, 361-372 и 374-385, в которой крыло относится к 3'-концу сердцевины и крыло содержит фосфоротиоат в конфигурации Rp.

390. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-359, 361-372 и 374-385, в которой крыло относится к 3'-концу сердцевины и крыло содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Rp на 3'-конце крыла.

391. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-359, 361-372 и 374-385, в которой одно крыло относится к 3'-концу общей сердцевины, крыло содержит фосфоротиоатную связь в конфигурации Rp на 3'-конце крыла и каждая из других межнуклеотидных связей крыла представляет собой природную фосфатную связь

392. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-371, в которой крыло относится к 5'-концу сердцевины, а его 5'-концевая межнуклеотидная связь представляет собой хиральную межнуклеотидную связь.

393. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-371, в которой крыло относится к 5'-концу сердцевины, а его 5'-концевая межнуклеотидная связь представляет собой хиральную межнуклеотидную связь в конфигурации Sp.

394. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-371, в которой крыло относится к 5'-концу сердцевины, а его 5'-концевая межнуклеотидная связь представляет собой хиральную межнуклеотидную связь в конфигурации Rp.

395. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-371 и 392-394, в которой крыло относится к 3'-концу сердцевины, а его 3'-концевая межнуклеотидная связь представляет собой хиральную межнуклеотидную связь.

396. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-371 и 392-394, в которой крыло относится к 3'-концу сердцевины, а его 3'-концевая межнуклеотидная связь представляет собой хиральную межнуклеотидную связь в конфигурации Sp.

397. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-371 и 392-394, в которой крыло относится к 3'-концу сердцевины, а его 3'-концевая межнуклеотидная связь представляет собой хиральную межнуклеотидную связь в конфигурации Rp.

398. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло независимо содержит природную фосфатную связь

399. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло независимо содержит две или более природных фосфатных связей

400. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло независимо содержит две или более природных фосфатных связей, и все природные фосфатные связисвязи внутри крыла являются последовательными.

401. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит природную фосфатную связь

402. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит две или более природных фосфатных связей.

403. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит три или более природных фосфатных связей.

404. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит четыре или более природных фосфатных связей.

405. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит пять или более природных фосфатных связей.

406. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит две или более природных фосфатных связей, и все природные фосфатные связисвязи внутри крыла являются последовательными.

407. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит три или более природных фосфатных связей, и все природные фосфатные связисвязи внутри крыла являются последовательными.

408. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит четыре или более природных фосфатных связей, и все природные фосфатные связисвязи внутри крыла являются последовательными.

409. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит пять или более природных фосфатных связей, и все природные фосфатные связисвязи внутри крыла являются последовательными.

410. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 5% межнуклеотидных связей в крыле представляют собой природные фосфатные связи.

411. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 10% межнуклеотидных связей в крыле представляют собой природные фосфатные связи.

412. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 20% межнуклеотидных связей в крыле представляют собой природные фосфатные связи.

413. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 30% межнуклеотидных связей в крыле представляют собой природные фосфатные связи.

414. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 40% межнуклеотидных связей в крыле представляют собой природные фосфатные связи.

415. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 50% межнуклеотидных связей в крыле представляют собой природные фосфатные связи.

416. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 60% межнуклеотидных связей в крыле представляют собой природные фосфатные связи.

417. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 70% межнуклеотидных связей в крыле представляют собой природные фосфатные связи.

418. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 80% межнуклеотидных связей в крыле представляют собой природные фосфатные связи.

419. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 90% межнуклеотидных связей в крыле представляют собой природные фосфатные связи.

420. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 95% межнуклеотидных связей в крыле представляют собой природные фосфатные связи.

421. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 5% межнуклеотидных связей в каждом крыле представляют собой независимо природные фосфатные связи.

422. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 10% межнуклеотидных связей в каждом крыле представляют собой независимо природные фосфатные связи.

423. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 20% межнуклеотидных связей в каждом крыле представляют собой независимо природные фосфатные связи.

424. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 30% межнуклеотидных связей в каждом крыле представляют собой независимо природные фосфатные связи.

425. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 40% межнуклеотидных связей в каждом крыле представляют собой независимо природные фосфатные связи.

426. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 50% межнуклеотидных связей в каждом крыле представляют собой независимо природные фосфатные связи.

427. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 60% межнуклеотидных связей в каждом крыле представляют собой независимо природные фосфатные связи.

428. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 70% межнуклеотидных связей в каждом крыле представляют собой независимо природные фосфатные связи.

429. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 80% межнуклеотидных связей в каждом крыле представляют собой независимо природные фосфатные связи.

430. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 90% межнуклеотидных связей в каждом крыле представляют собой независимо природные фосфатные связи.

431. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере 95% межнуклеотидных связей в каждом крыле представляют собой независимо природные фосфатные связи.

432. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 15 модифицированных фосфатных связей.

433. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 10 модифицированных фосфатных связей.

434. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 9 модифицированных фосфатных связей.

435. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 8 модифицированных фосфатных связей.

436. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 7 модифицированных фосфатных связей.

437. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 6 модифицированных фосфатных связей.

438. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 5 модифицированных фосфатных связей.

439. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 4 модифицированные фосфатные связи.

440. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 3 модифицированные фосфатные связи.

441. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 2 модифицированные фосфатные связи.

442. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 1 модифицированную фосфатную связь.

443. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 15 модифицированных фосфатных связей.

444. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 10 модифицированных фосфатных связей.

445. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 9 модифицированных фосфатных связей.

446. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 8 модифицированных фосфатных связей.

447. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 7 модифицированных фосфатных связей.

448. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 6 модифицированных фосфатных связей.

449. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 5 модифицированных фосфатных связей.

450. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 4 модифицированные фосфатные связи.

451. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 3 модифицированные фосфатные связи.

452. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 2 модифицированные фосфатные связи.

453. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 1 модифицированную фосфатную связь.

454. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит менее чем 100% модифицированных фосфатных связей.

455. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 95% модифицированных фосфатных связей.

456. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 90% модифицированных фосфатных связей.

457. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 80% модифицированных фосфатных связей.

458. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 70% модифицированных фосфатных связей.

459. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 60% модифицированных фосфатных связей.

460. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 50% модифицированных фосфатных связей.

461. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 40% модифицированных фосфатных связей.

462. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 30% модифицированных фосфатных связей.

463. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 20% модифицированных фосфатных связей.

464. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит не более чем 10% модифицированных фосфатных связей.

465. Композиция по любому из предыдущих вариантов, в которой каждое крыло независимо содержит менее чем 100% модифицированных фосфатных связей.

466. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 95% модифицированных фосфатных связей.

467. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 90% модифицированных фосфатных связей.

468. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 80% модифицированных фосфатных связей.

469. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 70% модифицированных фосфатных связей.

470. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 60% модифицированных фосфатных связей.

471. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 50% модифицированных фосфатных связей.

472. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 40% модифицированных фосфатных связей.

473. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 30% модифицированных фосфатных связей.

474. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 20% модифицированных фосфатных связей.

475. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит не более чем 10% модифицированных фосфатных связей.

476. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой межнуклеотидная связь области крыла независимо выбрана из природной фосфатной связи и модифицированной фосфатной связи, имеющей структуру формулы I.

477. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой межнуклеотидная связь области крыла независимо выбрана из природной фосфатной связи и фосфоротиоатной связи.

478. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-361, в которой каждая межнуклеотидная связь внутри крыла представляет собой природную фосфатную связь.

479. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-361, в которой каждая межнуклеотидная связь внутри каждого крыла представляет собой природную фосфатную связь.

480. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-361, в которой каждая межнуклеотидная связь внутри крыла представляет собой хиральную межнуклеотидную связь.

481. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-361, в которой каждая межнуклеотидная связь внутри каждого крыла представляет собой хиральную межнуклеотидную связь.

482. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло составляет в длину три или более оснований.

483. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой одно крыло составляет в длину четыре или более оснований.

484. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой одно крыло составляет в длину пять или более оснований.

485. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой одно крыло составляет в длину шесть или более оснований.

486. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой одно крыло составляет в длину семь или более оснований.

487. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой одно крыло составляет в длину восемь или более оснований.

488. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой одно крыло составляет в длину девять или более оснований.

489. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой одно крыло составляет в длину десять или более оснований.

490. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо составляет в длину три или более оснований.

491. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо составляет в длину четыре или более оснований.

492. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо составляет в длину пять или более оснований.

493. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо составляет в длину шесть или более оснований.

494. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо составляет в длину семь или более оснований.

495. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо составляет в длину восемь или более оснований.

496. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо составляет в длину девять или более оснований.

497. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо составляет в длину десять или более оснований.

498. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-482, в которой крыло составляет в длину три оснований.

499. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-482, в которой крыло составляет в длину четыре основания.

500. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-482, в которой крыло составляет в длину пять оснований.

501. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-482, в которой крыло составляет в длину шесть оснований.

502. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-482, в которой крыло составляет в длину семь оснований.

503. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-482, в которой крыло составляет в длину восемь оснований.

504. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-482, в которой крыло составляет в длину девять оснований.

505. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-482, в которой крыло составляет в длину десять оснований.

506. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-482, в которой крыло составляет в длину 11 оснований.

507. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-482, в которой крыло составляет в длину 12 оснований.

508. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-482, в которой крыло составляет в длину 13 оснований.

509. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-482, в которой крыло составляет в длину 14 оснований.

510. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-482, в которой крыло составляет в длину 15 оснований.

511. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-482, в которой каждое крыло имеет одинаковую длину.

512. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло определяется модификациями сахара относительно сердцевины.

513. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждое крыло независимо содержит модифицированный фрагмент сахара.

514. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый фрагмент сахара крыла представляет собой независимо модифицированный фрагмент сахара.

515. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит высокоаффинную модификацию сахара.

516. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой модифицированный фрагмент сахара имеет 2'-модификацию.

517. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит модификацию бициклического сахара.

518. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит модификацию бициклического сахара, имеющую мостик -L- или -O-L-, соединяющий два кольцевых атома углерода.

519. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит бициклическую модификацию сахара, имеющую мостик 4'-СН(СН₃)-O-2'.

520. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-516, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию, причем 2'-модификация представляет собой 2'-OR¹.

521. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-516, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию, в которой 2'-модификация представляет собой 2'-OR¹, где R¹ представляет собой необязательно замещенный C_1-6 алкил.

522. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-516, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию, где 2'-модификация представляет собой 2'- МОЕ.

523. Композиция любого из вариантов осуществления 1-516, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию, где 2'-модификация представляет собой 2'-ОМе.

524. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-519, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию, где 2'-модификация представляет собой S-cEt.

525. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-516, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию, где 2'-модификация представляет собой FANA.

526. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-516, в которой модифицированный фрагмент сахара содержит 2'-модификацию, где 2'-модификация представляет собой FRNA.

527. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-515, в которой модифицированный фрагмент сахара имеет 5'-модификацию.

528. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-515, в которой модифицированный фрагмент сахара представляет собой R-5 '-Ме-ДНК.

529. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-515, в которой модифицированный фрагмент сахара представляет собой S-5'-Ме-ДНК.

530. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-515, в которой модифицированный фрагмент сахара представляет собой FRNA.

531. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый фрагмент сахара крыла модифицирован.

532. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой все модифицированные фрагменты сахара крыла внутри крыла имеют одинаковую модификацию.

533. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой все модифицированные фрагменты сахара крыла имеют одинаковую модификацию.

534. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-531, в которой по меньшей мере один модифицированный фрагмент сахара крыла отличается от другого модифицированного фрагмента сахара крыла.

535. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит модифицированное основание.

536. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой крыло содержит 2S-dT.

537. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой область сердцевины составляет в длину пять или более оснований.

538. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой область сердцевины составляет в длину шесть или более оснований.

539. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой область сердцевины составляет в длину семь или более оснований.

540. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой область сердцевины составляет в длину восемь или более оснований.

541. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой область сердцевины составляет в длину девять или более оснований.

542. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой область сердцевины составляет в длину десять или более оснований.

543. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой область сердцевины составляет в длину 11 или более оснований.

544. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой область сердцевины составляет в длину 12 или более оснований.

545. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой область сердцевины составляет в длину 13 или более оснований.

546. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой область сердцевины составляет в длину 14 или более оснований.

547. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой область сердцевины составляет в длину 15 или более оснований.

548. Композиция по любому из 1-536, в которой область сердцевины составляет в длину пять оснований.

549. Композиция по любому из 1-536, в которой область сердцевины составляет в длину шесть оснований.

550. Композиция по любому из 1-536, в которой область сердцевины составляет в длину семь оснований.

551. Композиция по любому из 1-536, в которой область сердцевины составляет в длину восемь оснований.

552. Композиция по любому из 1-536, в которой область сердцевины составляет в длину девять оснований.

553. Композиция по любому из 1-536, в которой область сердцевины составляет в длину десять оснований.

554. Композиция по любому из 1-536, в которой область сердцевины составляет в длину 11 оснований.

555. Композиция по любому из 1-536, в которой область сердцевины составляет в длину 12 оснований.

556. Композиция по любому из 1-536, в которой область сердцевины составляет в длину 13 оснований.

557. Композиция по любому из 1-536, в которой область сердцевины составляет в длину 14 оснований.

558. Композиция по любому из 1-536, в которой область сердцевины составляет в длину 15 оснований.

559. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой область сердцевины не имеет 2'-модификации.

560. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый фрагмент сахара сердцевины не модифицирован.

561. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый фрагмент сахара области сердцевины представляет собой фрагмент сахара природной ДНК.

562. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой область сердцевины содержит хиральную межнуклеотидную связь.

563. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая межнуклеотидная связь области сердцевины представляет собой хиральную межнуклеотидную связь.

564. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая межнуклеотидная связь области сердцевины представляет собой хиральную межнуклеотидную связь, имеющую структуру формулы I.

565. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая межнуклеотидная связь области сердцевины представляет собой хиральную межнуклеотидную связь, имеющую структуру формулы I, и где X представляет собой S, a Y и Z представляют собой О.

566. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая межнуклеотидная связь области сердцевины представляет собой хиральную межнуклеотидную связь, имеющую структуру формулы I, и где один -L-R¹ не представляет собой -Н.

567. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-565, в которой каждая межнуклеотидная связь области сердцевины представляет собой фосфоротиоатную связь.

568. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, который содержит (Sp)m(Rp)n, где m равно 1-50, а n равно 1-10.

569. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, который содержит (Sp)m(Rp)n, где m равно 1-50, n равно 1-10 и m>n.

570. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, который содержит (Sp)m(Rp)n, где m равно 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 и n равно 1.

571. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-567, в которой область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащим (Rp)n(Sp)m, где m равно 1-50, а n равно 1-10.

572. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-567 и 571, в которой область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащим Rp(Sp)m, где m равно 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8.

573. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-567 и 571-572, в которой область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащим Rp(Sp)₂.

574. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-567, в которой область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащим (Np)t(Rp)n(Sp)m, где t равно 1-10, n равно 1-10, m равно 1-50, и каждый Np независим от Rp или Sp.

575. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-567 и 574, в которой область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащим (Sp)t(Rp)a(Sp)m, где t равно 1-10, n равно 1-10, m равно 1-50.

576. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-567 и 574-575, где n равно 1.

577. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-567 и 574-576, где t равно 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8.

578. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-567 и 574-577, где m равно 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8.

579. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-567 и 574-578, в которой по меньшей мере один из t и m больше 5.

580. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащих SpSpRpSpSp.

581. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 50% или более хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины имеют конфигурацию Sp.

582. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 60% или более хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины имеют конфигурацию Sp.

583. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 70% или более хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины имеют конфигурацию Sp.

584. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 80% или более хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины имеют конфигурацию Sp.

585. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 90% или более хиральных межнуклеотидных связей в области сердцевины имеют конфигурацию Sp.

586. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая межнуклеотидная связь в области сердцевины является хиральной, область сердцевины имеет только одну конфигурацию Rp, а каждая из других межнуклеотидных связей в области сердцевины характеризуется конфигурацией Sp.

587. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый фрагмент основания в сердцевине не модифицирован.

588. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-586, в которой область сердцевины содержит модифицированное основание.

589. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-586, в которой область сердцевины содержит модифицированное основание, причем модифицированное основание представляет собой замещенные А, Т, С или G.

590. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-587, в которой каждый фрагмент основания в области сердцевины независимо выбран из А, Т, С и G.

591. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-586, в которой область сердцевины представляет собой последовательность ДНК, фосфатные связи которой независимо заменены фосфоротиоатными связями.

592. Композиция по любому из вариантов осуществления 326-591, в которой область 5'-крыла представляет собой 5'-концевую область по любому из вариантов осуществления 1-325.

593. Композиция по любому из вариантов осуществления 326-592, в которой область 3'-крыла представляет собой 3'-концевую область по любому из вариантов осуществления 1-325.

594. Композиция по любому из вариантов осуществления 326-593, в которой область сердцевины представляет собой среднюю область по любому из вариантов осуществления 1-325.

595. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-325, в которой 5'-концевая область представляет собой область 5'-крыла по любому из вариантов осуществления 326-591.

596. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-325 и 595, в которой 3'-концевая область представляет собой область 3'-крыла по любому из вариантов осуществления 326-591.

597. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-325 и 595-596, в которой средняя область представляет собой область сердцевины по любому из вариантов осуществления 326-591.

598. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды являются одноцепочечными.

599. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды представляют собой антисмысловой олигонуклеотид, антагомир, микроРНК, пре-микроРНК, антимир, супермир, рибозим, U1 адаптор, активатор РНК, агент РНК-интерференции, олигонуклеотид-«ловушка», образующий триплекс олигонуклеотид, аптамер или адъювант.

600. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды представляют собой антисмысловые олигонуклеотиды.

601. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину более чем 10 оснований.

602. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину более чем 11 оснований.

603. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину более чем 12 оснований.

604. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину более чем 13 оснований.

605. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину более чем 14 оснований.

606. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину более чем 15 оснований.

607. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину более чем 16 оснований.

608. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину более чем 17 оснований.

609. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину более чем 18 оснований.

610. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину более чем 19 оснований.

611. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину более чем 20 оснований.

612. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину более чем 21 основание.

613. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину более чем 22 основания.

614. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину более чем 23 основания.

615. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину более чем 24 основания.

616. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину более 25 оснований.

617. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину менее чем примерно 200 оснований.

618. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину менее чем примерно 150 оснований.

619. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину менее чем примерно 100 оснований.

620. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину менее чем примерно 50 оснований.

621. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину менее чем примерно 40 оснований.

622. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину менее чем примерно 30 оснований.

623. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину 10 оснований.

624. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину 11 оснований.

625. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину 12 оснований.

626. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину 13 оснований.

627. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину 14 оснований.

628. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину 15 оснований.

629. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину 16 оснований.

630. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину 17 оснований.

631. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину 18 оснований.

632. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину 19 оснований.

633. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину 20 оснований.

634. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину 21 основание.

635. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину 22 основания.

636. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину 23 основания.

637. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину 24 основания.

638. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды составляют в длину 25 оснований.

639. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества характеризуются профилем хирального центра остова, содержащим (Sp)m, где m равно 1-50.

640. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества характеризуются профилем хирального центра остова, содержащим один или более (Rp)p(Sp)x(Rp)q(Sp)y, где каждый из р, х, q, у равен независимо 0-50, p+q>0 и x+y>0.

641. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества характеризуются профилем хирального центра остова, содержащим (Sp)m(Rp)n, где m равно 1-50, а n равно 1-10.

642. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества характеризуются профилем хирального центра остова, содержащим один или более (Sp)m(Rp)n, где m равно 1-50, n равно 1-10, m>n.

643. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества характеризуются профилем хирального центра остова, содержащим один или более (Sp)m(Rp)n, где m равно 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8, а n равно 1.

644. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества характеризуются профилем хирального центра остова, содержащим один или более (Sp)m(Rp)n, где m равно 2 и n равно 1.

645. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-640, в которой олигонуклеотиды первого множества характеризуются профилем хиральных центров остова, содержащим один или более (Rp)n(Sp)m, где m равно 1-50 и n равно 1-10.

646. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-640 и 645, в которой олигонуклеотиды первого множества характеризуются профилем хиральных центров остова, содержащим Rp(Sp)m, где m равно 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8.

647. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-640 и 645-646, в которой олигонуклеотиды первого множества характеризуются профилем хиральных центров остова, содержащим Rp(Sp)₂.

648. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-640, в которой олигонуклеотиды первого множества характеризуются профилем хиральных центров остова, содержащим (Np)t(Rp)n(Sp)m, где t равно 1-10, n равно 1-10, m равно 1-50 и каждый Np представляет собой независимо Rp или Sp.

649. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-640 и 648, в которой олигонуклеотиды первого множества характеризуются профилем хиральных центров остова, содержащим (Sp)t(Rp)n(Sp)m, где t равно 1-10, n 1-10, m равно 1-50.

650. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-649, в которой n равно 1.

651. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-640 и 648-649, в которой t равно 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8.

652. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-650, в которой m равно 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8.

653. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-640 и 649-651, в которой по меньшей мере один из t и m больше 5.

654. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой m больше чем 3.

655. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой m больше чем 4.

656. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой m больше чем 5.

657. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой m больше чем 6.

658. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой m больше чем 7.

659. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой m больше чем 8.

660. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой m больше чем 9.

661. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой m больше чем 10.

662. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой область сердцевины характеризуется профилем хиральных центров остова, содержащим SpSpRpSpSp.

663. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, содержащая один или более (Sp)m(Rp)n.

664. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, содержащая два или более чередующихся (Sp)m(Rp)n.

665. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, содержащая два или более чередующихся (Sp)₂(Rp).

666. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 50% или более хиральных межнуклеотидных связей в олигонуклеотидах первого множества имеют конфигурацию Sp.

667. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 60% или более хиральных межнуклеотидных связей в олигонуклеотидах первого множества имеют конфигурацию Sp.

668. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 70% или более хиральных межнуклеотидных связей в олигонуклеотидах первого множества имеют конфигурацию Sp.

669. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 80% или более хиральных межнуклеотидных связей в олигонуклеотидах первого множества имеют конфигурацию Sp.

670. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 90% или более хиральных межнуклеотидных связей в олигонуклеотидах первого множества имеют конфигурацию Sp.

671. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая межнуклеотидная связь в олигонуклеотидах первого множества является хиральной, область сердцевины имеет только одну конфигурацию Rp и каждая из других межнуклеотидных связей в олигонуклеотидах первого множества характеризуется ко нфигур ацией Sp.

672. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 5'-концевая межнуклеотидная связь имеет конфигурацию Rp.

673. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-673, в которой 5'-концевая межнуклеотидная связь имеет конфигурацию Sp.

674. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой 3'-концевая межнуклеотидная связь имеет конфигурацию Sp.

675. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-674, в которой 3'-концевая межнуклеотидная связь имеет конфигурацию Sp.

676. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества представляют собой блокмеры.

677. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества представляют собой альтмеры.

678. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой тип олигонуклеотида представляет собой не (Sp, Sp, Rp, Sp, Sp, Rp, Sp, Sp, Rp, Sp, Sp)-d[5mCs1As1Gs1Ts15mCs1Ts1Gs15mCs1Ts1Ts15mCs1G] или (Rp, Rp, Rp, Rp, Rp, Sp, Sp, Rp, Sp, Sp, Rp, Sp, Sp, Rp, Rp, Rp, Rp, Rp, Rp)-Gs5mCs5mCsTs5mCsAsGsTs5mCsTsGs5mCsTsTs5mCsGs5mCsAs5mCs5mC (5R-(SSR)3-5R), где подчеркнутые нуклеотиды являются 2'-МОЕ модифицированными.

679. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотид представляет собой не олигонуклеотид, выбранный из: (Sp, Sp, Rp, Sp, Sp, Rp, Sp, Sp, Rp, Sp, Sp)-d[5mCs1As1Gs1Ts15mCs1Ts1Gs15mCs1Ts1Ts15mCs1G] или (Rp, Rp, Rp, Rp, Rp, Sp, Sp, Rp, Sp, Sp, Rp, Sp, Sp, Rp, Rp, Rp, Rp, Rp, Rp)-Gs5mCs5mCsTs5mCsAsGsTs5mCsTsGs5mCsTsTs5mCsGs5mCsAs5mCs5mC (5R-(SSR)3-5R), где подчеркнутые нуклеотиды являются 2'-МОЕ модифицированными.

680. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотид не представляет собой олигонуклеотид, выбранный из:

где строчные буквы представляют собой остатки 2'-ОМе РНК; заглавные буквы представляют собой остатки 2'-ОН РНК и "s" обозначает фосфоротиоатный фрагмент; а также

где строчные буквы представляют собой остатки 2'-ОМе РНК; заглавные буквы представляют собой остатки РНК, d = остатки 2'-дезокси и "s" обозначает фосфоротиоатный фрагмент; а также

где строчные буквы представляют собой остатки 2'-ОМе РНК; заглавные буквы представляют собой остатки РНК, d = остатки 2'-дезокси и "s" обозначает фосфоротиоатный фрагмент; а также

где строчные буквы представляют собой остатки 2'-ОМе РНК; заглавные буквы представляют собой остатки 2'-F РНК, d = остатки 2'-дезокси и "s" обозначает фосфоротиоатный фрагмент; а также

681. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотид не представляет собой олигонуклеотид, выбранный из:

682. d(A_RC_SA_RC_SA_RC_SA_RC_SA_RC], d[C_SC_SC_SC_RC_RC_SC_SC_SC_SC], d[C_SC_SC_SC_SC_SC_SC_RC_RC_SC] и d[C_SC_SC_SC_SC_SC_RC_RC_SC_SC], где R представляет собой фосфоротиоатную связь в конфигурации Rp и S представляет собой фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp.

683. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотид не представляет собой олигонуклеотид, выбранный из: GGA_RT_SG_RT_ST_R^mC_STCGA, GGA_RT_RG_ST_ST_R^mC_RTCGA, GGA_ST_SG_RT_RT_S^mC_STCGA, где R представляет собой фосфоротиоатную связь в конфигурации Rp, S представляет собой фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp, все другие связи представляют собой РО, и каждый ^mC представляет собой 5-метилцитозин-модифицированный нуклеозид.

684. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотид не представляет собой олигонуклеотид, выбранный из: T_kT_k^mC_kAGT^mCATGA^mCT_kT^mC_k^mC_k, где каждый нуклеозид с последующим нижним индексом 'к' указывает на (S)-cEt модификацию, R представляет собой фосфоротиоатную связь в конфигурации Rp и S представляет собой фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp, каждая ^mC представляет собой 5-метилцитозин-модифицированный нуклеозид и все межнуклеотидные связи являются фосфоротиоатными (PS) с профилями стереохимии, выбранными из RSSSRSRRRS, RSSSSSSSSS, SRRSRSSSSR, SRSRSSRSSR, RRRSSSRSSS, RRRSRSSRSR, RRSSSRSRSR, SRSSSRSSSS, SSRRSSRSRS, SSSSSSRRSS, RRRSSRRRSR, RRRRSSSSRS, SRRSRRRRRR, RSSRSSRRRR, RSRRSRRSRR, RRSRSSRSRS, SSRRRRRSRR, RSRRSRSSSR, RRSSRSRRRR, RRSRSRRSSS, RRSRSSSRRR, RSRRRRSRSR, SSRSSSRRRS, RSSRSRSRSR, RSRSRSSRSS, RRRSSRRSRS, SRRSSRRSRS, RRRRSRSRRR, SSSSRRRRSR, RRRRRRRRRR и SSSSSSSSSS.

685. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотид не представляет собой олигонуклеотид, выбранный из: T_kT_k^mC_kAGT^mCATGA^mCTT_k^mCk^mC_k, где каждый нуклеозид с последующим нижним индексом 'k' указывает на (S)-cEt модификацию, R представляет собой фосфоротиоатную связь в конфигурации Rp и S представляет собой фосфоротиоатную связь в конфигурации Sp, каждый ^mC представляет собой 5-метилцитозин-модифицированный нуклеозид и все межнуклеотидные связи в подчеркнутой сердцевине являются фосфоротиоатными (PS) с профилями стереохимии, выбранными из RSSSRSRRRS, RSSSSSSSSS, SRRSRSSSSR, SRSRSSRSSR, RRRSSSRSSS, RRRSRSSRSR, RRSSSRSRSR, SRSSSRSSSS, SSRRSSRSRS, SSSSSSRRSS, RRRSSRRRSR, RRRRSSSSRS, SRRSRRRRRR, RSSRSSRRRR, RSRRSRRSRR, RRSRSSRSRS, SSRRRRRSRR, RSRRSRSSSR, RRSSRSRRRR, RRSRSRRSSS, RRSRSSSRRR, RSRRRRSRSR, SSRSSSRRRS, RSSRSRSRSR, RSRSRSSRSS, RRRSSRRSRS, SRRSSRRSRS, RRRRSRSRRR, SSSSRRRRSR, RRRRRRRRRR и SSSSSSSSSS.

686. Композиция по варианту осуществления 684 или 685, в которой каждый фосфоротиоатный фрагмент каждого нуклеотида, содержащий модификацию (S)-cEt, является стереослучайным.

687. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат две или более природных фосфатных связей.

688. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат три или более природных фосфатных связей.

689. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат четыре или более природных фосфатных связей.

690. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат пять или более природных фосфатных связей.

691. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат шесть или более природных фосфатных связей.

692. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат семь или более природных фосфатных связей.

693. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат восемь или более природных фосфатных связей.

694. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат девять или более природных фосфатных связей.

695. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат десять или более природных фосфатных связей.

696. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат две или более модифицированных фосфатных связей.

697. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат три или более модифицированных фосфатных связей.

698. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат четыре или более модифицированных фосфатных связей.

699. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат пять или более модифицированных фосфатных связей.

700. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат шесть или более модифицированных фосфатных связей.

701. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат семь или более модифицированных фосфатных связей.

702. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат восемь или более модифицированных фосфатных связей.

703. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат девять или более модифицированных фосфатных связей.

704. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат десять или более модифицированных фосфатных связей.

705. Композиция по любому из вариантов осуществления 696-704, в которой каждая модифицированная фосфатная связь представляет собой фосфоротиоатную связь.

706. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой первое множество олигонуклеотидов содержит модифицированное основание.

707. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой первое множество олигонуклеотидов содержит модифицированное основание, причем модифицированное основание представляет собой замещенные А, Т, С, U или G.

708. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый фрагмент основания в олигонуклеотиде первого множества независимо выбран из А, Т, С, U, 5-МеС и G.

709. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой по меньшей мере одна хиральная межнуклеотидная связь образована с диастереомерной селективностью более чем 90:10.

710. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая хиральная межнуклеотидная связь образована с диастереомерной селективностью более чем 90:10.

711. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая хиральная межнуклеотидная связь образована с диастереомерной селективностью более чем 95:5.

712. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая хиральная межнуклеотидная связь образована с диастереомерной селективностью более чем 96:4.

713. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая хиральная межнуклеотидная связь образована с диастереомерной селективностью более чем 97:3.

714. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая хиральная межнуклеотидная связь образована с диастереомерной селективностью более чем 98:2.

715. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждая хиральная межнуклеотидная связь образована с диастерео мерной селективностью более чем 98:2.

716. Композиция по любому из вариантов осуществления 710-715, в которой диастереомерную селективность для образования хиральной межнуклеотидной связи измеряют путем образования димерного олигонуклеотида, содержащего хиральную межнуклеотидную связь и нуклеозиды с обеих сторон от нее.

717. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой последовательность оснований олигонуклеотидов первого множества представляет собой или содержит последовательность, выбранную из таблицы ES3.

718. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой последовательность оснований олигонуклеотидов первого множества представляет собой или содержит последовательность, выбранную из таблицы ES1.

719. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой последовательность оснований олигонуклеотидов первого множества представляет собой или содержит последовательность, выбранную из таблиц 1-4.

720. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой последовательность оснований олигонуклеотидов первого множества представляет собой или содержит UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU.

721. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой последовательность оснований олигонуклеотидов первого множества представляет собой или содержит последовательность, комплементарную последовательности в пре-мРНК дистрофина, причем последовательность содержит 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 или 25 нуклеотидов.

722. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, причем композиция олигонуклеотидов характеризуется тем, что при контакте с транскриптом в системе сплайсинга транскриптов сплайсинг транскрипта изменяется относительно наблюдаемого в эталонных условиях, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, наличия эталонной композиции и их комбинаций, причем транскрипт представляет собой пре-мРНК, а продукт сплайсинга представляет собой мРНК.

723. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой изменяются относительные уровни одного или более продуктов сплайсинга.

724. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой уровни одного или более продуктов сплайсинга увеличиваются.

725. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой уровни одного или более продуктов сплайсинга уменьшаются.

726. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой уровень и/или активность полипептида, кодируемого транскриптом, уменьшается по сравнению с уровнем, наблюдаемым в эталонных условиях.

727. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой уровень усеченной формы полипептида, кодируемого транскриптом, увеличивается.

728. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой уровень усеченной формы полипептида, кодируемого транскриптом, уменьшается.

729. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой уровень удлиненной формы полипептида, кодируемого транскриптом, увеличивается.

730. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой уровень удлиненной формы полипептида, кодируемого транскриптом, уменьшается.

731. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой модифицированы относительные и/или абсолютные уровни двух или более различных сплайсированных форм полипептида, кодируемого транскриптом.

732. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой одинаковая последовательность оснований олигонуклеотидов первого множества представляет собой или содержит последовательность, обнаруженную в интроне целевого транскрипта.

733. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой одинаковая последовательность оснований олигонуклеотидов первого множества представляет собой последовательность, обнаруженную в интроне целевого транскрипта.

734. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой одинаковая последовательность оснований олигонуклеотидов первого множества представляет собой или содержит последовательность, обнаруженную в экзоне целевого транскрипта.

735. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-732, в которой одинаковая последовательность оснований олигонуклеотидов первого множества представляет собой последовательность, обнаруженную в экзоне целевого транскрипта.

736. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой одинаковая последовательность оснований олигонуклеотидов первого множества представляет собой или содержит последовательность, содержащую сайт сплайсинга целевого транскрипта.

737. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-732, в которой одинаковая последовательность оснований олигонуклеотидов первого множества представляет собой последовательность, содержащую сайт сплайсинга целевого транскрипта.

738. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой целевой транскрипт представляет собой пре-мРНК дистрофина.

739. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой целевой транскрипт представляет собой пре-мРНК дистрофина, и олигонуклеотиды первого множества увеличивают уровень продукта сплайсинга пре-мРНК дистрофина, причем экзон пропускается.

740. Композиция по варианту осуществления 739, в которой экзоны 51, 53, 45, 50, 44, 52, 55 или 8 пропускаются.

741. Композиция по варианту осуществления 739, в которой экзон 51 пропускается.

742. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-737, в которой целевой транскрипт представляет собой пре-мРНК MSTN.

743. Композиция по варианту осуществления 742, в которой целевой транскрипт представляет собой мРНК MSTN, и олигонуклеотиды первого множества увеличивают уровень продукта сплайсинга пре-мРНК MSTN, причем экзон пропускается.

744. Композиция по варианту осуществления 743, в которой экзон 2 MSTN пропускается.

745. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества имеют предварительно определенный уровень и содержат одну или более межнуклеотидных связей с контролируемой хиральностью, а эталонное условие представляет собой отсутствие композиции.

746. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества имеют предварительно определенный уровень и содержат одну или более межнуклеотидных связей с контролируемой хиральностью, а эталонное условие представляет собой отсутствие композиции и наличие эталонной композиции.

747. Композиция по варианту осуществления 746, в которой эталонная композиция содержит эталонное множество олигонуклеотидов, причем олигонуклеотиды эталонного множества отличаются от олигонуклеотидов первого множества только тем, что олигонуклеотиды эталонного множества не содержат межнуклеотидных связей с контролируемой хиральностью.

748. Композиция по любому из вариантов осуществления 745-746, в которой композиция характеризуется контролируемой хиральностью.

749. Композиция по любому из вариантов осуществления 745-746, в которой композиция характеризуется контролируемой хиральностью, и эталонная композиция отличается от композиции только тем, что эталонная композиция не характеризуется контролируемой хиральностью.

750. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат профиль модификации оснований олигонуклеотида, выбранного из таблиц 1-4.

751. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат профиль модификации сахара олигонуклеотида, выбранного из таблиц 1-4.

752. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат профиль модификации межнуклеотидной связи олигонуклеотида, выбранного из таблиц 1-4.

753. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества содержат профиль стереохимии межнуклеотидной связи олигонуклеотида, выбранного из таблиц 1-4.

754. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, дополнительно содержащая один или более липидов.

755. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, дополнительно содержащая один или более липидов, причем по меньшей мере один липид конъюгирован с олигонуклеотидом.

756. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой один или более олигонуклеотидов первого множества конъюгированы с одним или более липидами.

757. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой каждый олигонуклеотид первого множества независимо конъюгирован с одним или более липидами.

758. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой олигонуклеотиды первого множества представляют собой олигонуклеотиды WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, WV-2530, WV-2531, WV-2578, WV-2580, WV-2587, WV-3047, WV-3152, WV-3472, WV-3473, WV-3507, WV-3508, WV-3509, WV-3510, WV-3511, WV-3512, WV-3513, WV-3514, WV-3515, WV-3545 или WV-3546.

759. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-887.

760. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-892.

761. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-896.

762. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-1714.

763. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2444.

764. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2445.

765. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2526.

766. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2527.

767. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2528.

768. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2530.

769. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2531.

770. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2578.

771. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2580.

772. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-2587.

773. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3047.

774. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3152.

775. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3472.

776. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3473.

777. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3507.

778. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3508.

779. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3509.

780. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3510.

781. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3511.

782. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3512.

783. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3513.

784. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3514.

785. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3515.

786. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3545.

787. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью WV-3546.

788. Композиция, содержащая композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотида, выбранного из: WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, WV-2530, WV-2531, WV-2578, WV-2580, WV-2587, WV-3047, WV-3152, WV-3472, WV-3473, WV-3507, WV-3508, WV-3509, WV-3510, WV-3511, WV-3512, WV-3513, WV-3514, WV-3515, WV-3545 и WV-3546.

789. Композиция, содержащая композицию олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью олигонуклеотида, причем последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности олигонуклеотида, выбранного из: WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, WV-2530, WV-2531, WV-2578, WV-2580, WV-2587, WV-3047, WV-3152, WV-3472, WV-3473, WV-3507, WV-3508, WV-3509, WV-3510, WV-3511, WV-3512, WV-3513, WV-3514, WV-3515, WV-3545 и WV-3546.

790. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-887.

791. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-892.

792. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-896.

793. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-1714.

794. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2444.

795. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2445.

796. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2526.

797. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2527.

798. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2528.

799. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-2530.

800. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит последовательность WV-2531.

801. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит последовательность WV-2578.

802. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит последовательность WV-2580.

803. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит последовательность WV-2587.

804. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит последовательность WV-3047.

805. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит последовательность WV-3152.

806. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит последовательность WV-3472.

807. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит последовательность WV-3473.

808. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит последовательность WV-3507.

809. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит последовательность WV-3508.

810. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит последовательность WV-3509.

811. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит последовательность WV-3510.

812. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит последовательность WV-3511.

813. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит последовательность WV-3512.

814. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит последовательность WV-3513.

815. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит последовательность WV-3514.

816. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит последовательность WV-3515.

817. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3545.

818. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит последовательность WV-3546.

819. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-887.

820. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-892.

821. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-896.

822. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-1714.

823. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2444.

824. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2445.

825. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2526.

826. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2527.

827. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2528.

828. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2530.

829. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2531.

830. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2578.

831. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2580.

832. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-2587.

833. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3047.

834. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3152.

835. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3472.

836. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3473.

837. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3507.

838. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3508.

839. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3509.

840. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3510.

841. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3511.

842. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3512.

843. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3513.

844. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3514.

845. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3515.

846. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3545.

847. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида состоит из последовательности WV-3546.

848. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-887, причем композиция дополнительно содержит липид.

849. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-892, причем композиция дополнительно содержит липид.

850. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит или состоит из последовательности WV-896, причем композиция дополнительно содержит липид.

851. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит или состоит из последовательности WV-1714, причем композиция дополнительно содержит липид.

852. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит или состоит из последовательности WV-2444, причем композиция дополнительно содержит липид.

853. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит или состоит из последовательности WV-2445, причем композиция дополнительно содержит липид.

854. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит или состоит из последовательности WV-2526, причем композиция дополнительно содержит липид.

855. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит или состоит из последовательности WV-2527, причем композиция дополнительно содержит липид.

856. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит или состоит из последовательности WV-2528, причем композиция дополнительно содержит липид.

857. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит или состоит из последовательности WV-2530, причем композиция дополнительно содержит липид.

858. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит или состоит из последовательности WV-2531, причем композиция дополнительно содержит липид.

859. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит или состоит из последовательности WV-2578, причем композиция дополнительно содержит липид.

860. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит или состоит из последовательности WV-2580, причем композиция дополнительно содержит липид.

861. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-2587, причем композиция дополнительно содержит липид.

862. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3047, причем композиция дополнительно содержит липид.

863. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3152, причем композиция дополнительно содержит липид.

864. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3472, причем композиция дополнительно содержит липид.

865. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3473, причем композиция дополнительно содержит липид.

866. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3507, причем композиция дополнительно содержит липид.

867. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3508, причем композиция дополнительно содержит липид.

868. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3509, причем композиция дополнительно содержит липид.

869. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3510, причем композиция дополнительно содержит липид.

870. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3511, причем композиция дополнительно содержит липид.

871. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотида содержит или состоит из последовательности WV-3512, причем композиция дополнительно содержит липид.

872. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит или состоит из последовательности WV-3513, причем композиция дополнительно содержит липид.

873. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит или состоит из последовательности WV-3514, причем композиция дополнительно содержит л ипид.

874. Композиция олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в которой последовательность олигонуклеотид а содержит или состоит из последовательности WV-3515, причем композиция дополнительно содержит л ипид.

875. Композиция олигонуклеотидов по любому из вариантов осуществления 789-874, в которой последовательность олигонуклеотида включает в себя любое одно или более из следующего: последовательность оснований (включая длину), профиль химических модификаций фрагментов сахара и оснований, профиль связей остова (например, профиль природных фосфатных связей, фосфоротиоатных связей, фосфоротиоатных триэфирных связей и их комбинации), профиль хиральных центров остова (например, профиль стереохимии (Rp/Sp) хиральных межнуклеотидных связей) и профиль модификаций фосфора остова (например, профиль модификаций межнуклеотидного атома фосфора, такой как -S- и -L-R¹ формулы I).

876. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, причем липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₈₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-C₆ алкилена, C₁-C₆ алкенилена, -С≡С-; C₁-C₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂- -Су-, -О- -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)- -C(S)- -C(NR')- -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R'), -N(R)C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R'-), -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')- -N(R')S(O)₂- -SC(O)-, -C(O)S- -OC(O)- и -C(O)O- где каждая переменная является независимо таковой, как определено и описано в настоящем описании.

877. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит необязательно замещенную С₁₀-C₈₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

878. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₈₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

879. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит С₁₀-C₈₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-4 алифатическими группами.

880. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, причем липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-C₆ алкилена, C₁-C₆ алкенилена, -C≡С-, C₁-C₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -О- -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)- -C(NR')- -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R'), -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O- -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и -C(O)O-, где каждая переменная является независимо таковой, как определено и описано в настоящем описании.

881. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

882. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

883. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более C_1-4 алифатическими группами.

884. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, причем липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₄₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-C₆ алкилена, C₁-C₆ алкенилена, -С≡С-; C₁-C₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂- -Су-, -О- -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)- -C(S)- -C(NR')- -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R'), -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O- -OC(O)N(R')-, -S(O)- -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂- -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и -C(O)O-, где каждая переменная является независимо таковой, как определено и описано в настоящем описании.

885. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₄₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

886. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит необязательно замещенную С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

887. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-4 алифатическими группами.

888. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит незамещенную С₁₀-С₈₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

889. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит не более одной необязательно замещенной С₁₀-С₆₀ линейной, насыщенной или частично ненасыщенной алифатической цепи.

890. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит две или более необязательно замещенных С₁₀-С₆₀ линейных, насыщенных или частично ненасыщенных алифатических цепей.

891. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит незамещенную С₁₀-С₆₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

892. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит не более одной необязательно замещенной С₁₀-С₆₀ линейной, насыщенной или частично ненасыщенной алифатической цепи.

893. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-891, в которой липид содержит две или более необязательно замещенных С₁₀-С₆₀ линейных, насыщенных или частично ненасыщенных алифатических цепей.

894. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит незамещенную С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

895. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит не более одной необязательно замещенной С₁₀-С₄₀ линейной, насыщенной или частично ненасыщенной алифатической цепи.

896. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-894, в которой липид содержит две или более необязательно замещенных С₁₀-С₆₀ линейных, насыщенных или частично ненасыщенных алифатических цепей.

897. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

898. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или более С_1-4 алифатическими группами.

899. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид содержит незамещенную С₁₀-С₄₀ линейную, насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую цепь.

900. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид имеет структуру R^LD-COOH или R^LD-OH.

901. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид выбран из группы, состоящей из лауриновой кислоты, миристиновой кислоты, пальмитиновой кислоты, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, докозагексаеновой кислоты (цис-ДГК), турбинаровой кислоты и дилинолеила.

902. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид не конъюгирован с олигонуклеотидом.

903. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид конъюгирован с олигонуклеотидом.

904. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид конъюгирован с олигонуклеотидом посредством линкера.

905. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид конъюгирован с олигонуклеотидом посредством линкера, причем линкер представляет собой -L^LD-.

906. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид конъюгирован с олигонуклеотидом посредством линкера, причем линкер представляет собой -NH-(CH₂)₆-.

907. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид конъюгирован с олигонуклеотидом посредством линкера, причем линкер представляет собой -С(О)-NH-(СН₂)₆-Р(O)(O^-)-.

908. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, в которой липид конъюгирован с олигонуклеотидом посредством линкера, причем линкер представляет собой -С(О)-NH-(СН₂)₆-P(O)(S^-)-.

909. Композиция по варианту осуществления 907 или 908, в которой липид представляет собой жирную кислоту, которая связана с линкером посредством образования амидной группы -C(O)-NH-, а олигонуклеотид связан с линкером посредством образования фосфатной или фосфоротиоатной связи между его 5'-ОН или 3'-ОН с -Р(O)(O^-)- или -P(O)(S^-)- линкера.

910. Композиция по варианту осуществления 907 или 908, в которой липид представляет собой жирную кислоту, которая связана с линкером посредством образования амидной группы -С(О)-NH-, а олигонуклеотид связан с линкером посредством образования фосфатной или фосфоротиоатной связи между его 5'-ОН с -Р(O)(O^-)- или -P(O)(S^-)- линкера.

911. Композиция по варианту осуществления 907 или 908, в которой липид представляет собой жирную кислоту, которая связана с линкером посредством образования амидной группы -C(O)-NH-, а олигонуклеотид связан с линкером посредством образования фосфатной или фосфоротиоатной связи между его 3'-ОН с -Р(O)(O^-)- или -P(O)(S^-)- линкера.

912. Композиция по любому из предшествующих вариантов осуществления, дополнительно содержащая один или более нацеливающих компонентов.

913. Композиция олигонуклеотидов, содержащая множество олигонуклеотидов, имеющих структуру:

где:

А^с представляет собой олигонуклеотидную цепь ([Н]_b-А^с представляет собой олигонуклеотид);

а равно 1-1000;

b равно 1-1000;

каждый L^LD независимо представляет собой линкерный фрагмент; а также

каждый R^LD представляет собой независимо липидный фрагмент или нацеливающий компонент.

914. Композиция олигонуклеотидов, содержащая множество олигонуклеотидов, имеющих структуру:

где:

А^с представляет собой олигонуклеотидную цепь [Н]_b-А^с представляет собой олигонуклеотид);

а равно 1-1000;

b равно 1-1000;

каждый L^LD независимо представляет собой ковалентную связь или необязательно замещенную C₁-C₈₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены T^LD или необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-C₆ алкилена, С₁-С₆ алкенилена, -С≡С-, C₁-C₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')- -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и -C(O)O-;

каждый R^LD независимо представляет собой необязательно замещенную C₁-C₈₀ насыщенную или частично ненасыщенную алифатическую группу, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо замещены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-C₆ алкилена, C₁-С₆ алкенилена, -С≡C-; C₁-С₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)₂N(R')- -N(R')S(O)₂-, -SC(O), -C(O)S-, -OC(O)- и -C(O)O-;

T^LD имеет структуру:

W представляет собой О, S или Se;

каждый из X, Y и Z независимо представляет собой -О-, -S-, -N-(-L-R¹)- или L;

L представляет собой ковалентную связь или необязательно замещенный линейный или разветвленный C₁-С₁₀ алкилен, причем одно или более метиленовых звеньев L необязательно и независимо замещены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-С₆ алкилена, C₁-C₆ алкенилена, -C≡C-, C₁-С₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S- -OC(O)- и -C(O)O-;

R¹ представляет собой галоген, R или необязательно замещенную С₁-С₅₀ алифатическую группу, причем одно или более метиленовых звеньев необязательно и независимо замещены необязательно замещенной группой, выбранной из C₁-C₆ алкилена, C₁-С₆ алкенилена, -С≡С-, C₁-C₆ гетероалифатического фрагмента, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')- -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)₂N(R')-, -N(R')S(O)₂-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- и -C(O)O-;

каждый R' независимо представляет собой R, -C(O)R, -CO₂R или SO₂R или:

два R' берутся вместе со своими промежуточными атомами с образованием необязательно замещенного арильного, карбоциклического, гетероциклического или гетероарильного кольца;

-Су- представляет собой необязательно замещенное двухвалентное кольцо, выбранное из фенилена, карбоциклилена, арилена, гетероарилена и гетероциклилена; а также

каждый R независимо представляет собой водород или необязательно замещенную группу, выбранную из алифатического, карбоциклильного, арильного, гетероарильного и гетероциклильного C₁-C₆.

915. Композиция по любому из вариантов осуществления 1-912, причем композиция представляет собой композицию по любому из вариантов осуществления 913-914.

916. Композиция по любому из вариантов осуществления 913-915, в которой олигонуклеотид или олигонуклеотиды имеют структуру A^c-[-L^LD-(R^LD)_a]_b.

917. Композиция по любому из вариантов осуществления 913-915, в которой олигонуклеотид или олигонуклеотиды имеют структуру [(A^c)_a-L^LD]_b-R^LD.

918. Композиция по любому из вариантов осуществления 913-917, в которой L^LD, R^LD, комбинации L^LD и R^LD или -[-L^LD-(R^LD)_a]_b содержит один или более липидных фрагментов.

919. Композиция по любому из вариантов осуществления 913-917, в которой -[-L^LD-(R^LD)_a]_b содержит один или более липидных фрагментов.

920. Композиция по любому из вариантов осуществления 913-918, в которой R^LD содержит один или более липидных фрагментов.

921. Композиция по любому из вариантов осуществления 913-917, в которой L^LD, R^LD, комбинации L^LD и R^LD или -[-L^LD-(R^LD)_a]_b содержат один или более нацеливающих компонентов.

922. Композиция по любому из вариантов осуществления 913-917, в которой -[-L^LD-(R^LD)_a]_b содержит один или более нацеливающих компонентов.

923. Композиция по любому из вариантов осуществления 913-918, в которой R^LD содержит один или более нацеливающих компонентов.

924. Композиция по любому из вариантов осуществления 913-923, в которой b равно 1.

925. Композиция по любому из вариантов осуществления 913-924, в которой а равно 1.

926. Композиция по любому из вариантов осуществления 913-925, в которой А^с содержит один или более модифицированных фрагментов оснований, сахара или межнуклеотидных связей.

927. Композиция по любому из вариантов осуществления 913-925, в которой А^с содержит одну или более хиральных межнуклеотидных связей.

928. Композиция по любому из вариантов осуществления 913-925, в которой А^с содержит одну или более хиральных межнуклеотидных связей, и каждая хиральная межнуклеотидная связь А^с характеризуется контролируемой хиральностью.

929. Композиция по любому из вариантов осуществления 913-925, в которой олигонуклеотиды, имеющие структуру A^c-[-L^LD-(R^LD)_a]_b или [(A^c)_a-L^LD]_b-R^LD, относятся к определенному типу определяемому 1) последовательностью оснований; 2) профилем связей остова; 3) профилем хиральных центров остова и 4) профилем модификаций фосфора остова А^с.