СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ АНТИТЕЛ В СЫВОРОТКЕ КРОВИ, АССОЦИИРОВАННЫХ С АУТОИММУННЫМИ ЭНДОКРИННЫМИ И КОМОРБИДНЫМИ ПАТОЛОГИЯМИ, НА ГИДРОГЕЛЕВОМ БИОЧИПЕ Российский патент 2024 года по МПК G01N33/53 

Описание патента на изобретение RU2816512C1

Область техники, к которой относится изобретение

Изобретение относится к молекулярной биологии, иммунологии, эндокринологии и может быть использовано в клинической лабораторной диагностике для выявления антител в сыворотке крови, характерных для аутоиммунных эндокринопатий, таких как аутоиммунные формы нарушения углеводного обмена (сахарный диабет 1 типа и др.), аутоиммунный тиреоидит, гипергонадотропный гипогонадизм аутоиммунной природы, аутоиммунная надпочечниковая недостаточность, гипопаратиреоз аутоиммунной природы, аутоиммунный полигландулярный синдром 1 типа, а также антител, характеризующих развитие коморбидных патологий, включая аутоиммунный гастрит, витилиго, алопецию, целиакию. Способ основан на проведении мультиплексного иммуноанализа с использованием гидрогелевого биочипа с иммобилизованными белками - антигенами, специфичными к антителам - иммуноглобулинам класса G, ассоциированными с развитием аутоиммунных эндокринных и коморбидных патологий.

Уровень техники

Доля больных с патологией эндокринной системы постоянно увеличивается во всех экономически развитых странах мира. Ведущее место в структуре всех эндокринных заболеваний занимает сахарный диабет (СД), являющийся на сегодняшний день одним из самых опасных вызовов мировому сообществу и важным приоритетом национальных систем здравоохранения. Особую роль в структуре эндокринных заболеваний занимают аутоиммунные эндокринопатий (АЭ) и, в первую очередь, СД 1-го типа - наиболее распространенная АЭ в педиатрии, при которой более 80% случаев заболевания диагностируют в возрасте до 18 лет (American Diabetes Asssociation, 2020, Annual report, https://diabetes.org/sites/default/files/202l-08/ADA-2020-AnnualReport-FINAL.pdf). У детей СД 1-го типа характеризуется выраженной лабильностью гликемии, трудностями в достижении компенсации углеводного обмена, склонностью к развитию других аутоиммунных патологий на фоне повышенной реактивности иммунной системы.

Коморбидность аутоиммунных заболеваний эндокринной системы представляет серьезную проблему для компенсации, поскольку в данном случае резко повышается вероятность мультиорганного поражения. При этом интервал между клиническим дебютом отдельных компонентов АЭ может составить много лет. Таким образом, у пациентов с АЭ важно спрогнозировать развитие других эндокринопатий с помощью исследования иммунологических маркеров - антител к тканям органов-мишеней, которые могут выявляться за несколько лет до появления ранних специфических симптомов заболевания.

Пациенты с наиболее частыми в структуре эндокринных аутоиммунных заболеваний патологиями, такими как сахарный диабет 1 типа (СД1) и аутоиммунные заболевания щитовидной железы (АЗЩЖ), в частности, аутоиммунный тиреоидит (АИТ), подвержены более высокому риску развития других аутоиммунных заболеваний. При этом у 10-40% пациентов с АИТ выявляют аутоиммунный гастрит, в тоже время у примерно 40% пациентов с аутоиммунным гастритом также выявляют АИТ (Cellini et al. Hashimoto's Thyroiditis and Autoimmune Gastritis. Front Endocrinol. 2017. 8:92. doi: 10.3389/fendo.2017.00092). АЗЩЖ могут сосуществовать с другими органоспецифическими аутоиммунными заболеваниями, такими как целиакия (Freeman HJ. Endocrine manifestations in celiac disease. World J Gastroenterol. 2016. 22(38): 8472-8479. doi: 10.3748/wjg.v22.i38.8472) и СД1 (Kakleas et al. Associated autoimmune diseases in children and adolescents with type 1 diabetes mellitus (T1DM). Autoimmun Rev. 2015. 14(9):781-97. doi: 10.1016/j.autrev.2015.05.002). Отмечается также ассоциация АЗЩЖ и СД1 с витилиго - распространенным полигенным аутоиммунным заболеванием, при котором в результате гибели меланоцитов образуются очаги депигментации на коже и/или слизистых оболочках (Трошина с соавт. Распространенность аутоиммунных эндокринных заболеваний у больных витилиго. Терапевтический архив. 2020. 92(10): 88-96).

В свою очередь, СД1 часто ассоциирован с другими органоспецифическими аутоиммунными заболеваниями. На момент постановки диагноза СД1 пациентам рекомендуется обследование на наличие аутоантител, ассоциированных с АЗЩЖ, аутоиммунным гастритом, целиакией, аутоиммунной надпочечниковой недостаточностью (болезнью Аддисона) и другими аутоиммунными заболеваниями. Поскольку ассоциированный аутоиммунитет может развиться в любое время в течение болезни, все пациенты с СД1 должны ежегодно/раз в два года проходить скрининг на наличие соответствующих аутоантител, независимо от предшествующего отрицательного результата тестирования (Kakleas et al. Associated autoimmune diseases in children and adolescents with type 1 diabetes mellitus (T1DM). Autoimmun Rev. 2015. 14(9):781-97. doi: 10.1016/j.autrev.2015.05.02).

В настоящее время не существует простого и недорогого теста для выявления всего спектра аутоиммунных эндокринопатий и коморбидных заболеваний. Отсутствие возможности выявления в одном анализе ряда аутоантител при традиционном подходе к лабораторному тестированию (твердофазные иммунометрические методы, непрямая реакция иммунофлюоресценции) привело к возникновению альтернативного мультиплексного подхода к выявлению коморбидных состояний. Тем не менее, на сегодняшний день число работ, направленных на создание мультиплексного метода для скрининга биомаркеров, ассоциированных с АЭ, весьма ограничено. Существуют отдельные работы по мультиплексному анализу применительно к скринингу биомаркеров СД1 и ряд работ, направленных на поиск новых аутоантител (Amoroso et al. 3 Screen islet cell autoantibody ELISA: A sensitive and specific ELISA for the combined measurement of autoantibodies to GAD65, to IA-2 and to ZnT8. Clin Chim Acta. 2016. 462: 60-64. doi: 10.1016/j.cca.2016.08.013; Bian et al. Tracking the Antibody Immunome in Type 1 Diabetes Using Protein Arrays. J Proteome Res. 2017. 16(l):195-203. doi: 10.1021/acs.jproteome). В патенте CN1448724A "Type 1 diabetes related antigen-antibody simultaneous detection egg white slice", заявлен способ одновременного обнаружения антигенов и антител, соответствующих СД1, с помощью микрочипа, содержащего белки, закрепленные на твердой подложке, в том числе антиген вируса эпидемического паротита, В4 антиген вируса Коксаки, антиген краснухи, антиген респираторно-кишечного вируса, тиреоглобулин (Tg), тиреопероксидаза (ТРО), рецептор тиреоидного гормона, антиген микросомальной фракции щитовидной железы, островковые клетки поджелудочной железы (ICA), инсулин (IAA), декарбоксилазу глютаминовой кислоты (GAD), тирозинфосфатазу (IA2), поверхностный антиген островковых клеток, рецептор инсулина, Н-карбоксипептидаза, IA-2β, антитело против клубочковой базальной мембраны. Однако описанные методы предназначены для выявления СД1 и не содержат аутоантигенов, специфичных для других АЭ и коморбидных заболеваний.

Следует отметить ряд работ, направленных на создание мультиплексных ИФА-тестов для диагностики ряда аутоиммунных эндокринопатий и сопутствующих патологий, в частности тест-система для доклинической диагностики СД1 и целиакии, направленная на выявление аутоантител к IAA, GAD, IA2 и тканевой трансглутаминазе (TGA) (Zhao et al. A multiplex assay combining insulin, GAD, IA-2 and transglutaminase autoantibodies to facilitate screening for pre-type 1 diabetes and celiac disease. J Immunol Methods. 2016. 430: 28-32. doi: 10.1016/j.jim.2016.01.011). Метод основан на проведении конкурентного анализа аутоантител к иммобилизованным в лунке иммунологического планшета через специфической линкер антигенам. При инкубации образца биспецифичные аутоантитела из сыворотки крови связываются одновременно с иммобилизованным аутоантигенами и с добавленным в реакционную смесь аутоантигенами, меченными SULFO-TAG® (Meso Scale Diagnostics, LLC, США). После валидации (Не et al. Large-Scale Screening in General Population Children for Celiac Disease with a Multiplex Electrochemiluminescence (ECL) Assay. J Immunol Res. 2020. 2020: 8897656. doi: 10.1155/2020/8897656), метод был успешно применен в масштабном исследовании «Autoimmunity Study in Kids» (ASK), предназначенном для обследования детей с целью скрининга СД1 и целиакии в общей популяции штата Колорадо, США (Stahl et al. Mass Screening for Celiac Disease: The Autoimmunity Screening for Kids Study. Am J Gastroenterol. 2021. 116 (1): 180-187. doi: 10.14309/ajg.0000000000000751). Метод был также расширен для одновременного скрининга СД1 и нескольких соответствующих аутоиммунных заболеваний, включая целиакию, аутоиммунный полигландулярный синдром 1 типа (АПС-1) и АЗЩЖ и валидирован на образцах пациентов (n=1026) и здоровых доноров (n=1022). Анализ включал определение семи аутоантител против GAD, IAA, IA2, TGA, тиреопероксидазе (ТРО), тиреоглобулину (Tg), интерферону альфа (IFNα) (Gu et al. High-throughput multiplexed autoantibody detection to screen type 1 diabetes and multiple autoimmune diseases simultaneously. EBioMedicine. 2019. 47: 365-372. doi: 10.1016/j.ebiom.2019.08.036). Масштабная валидации метода с использованием большой когорты пациентов с СД1 и здоровых людей соответствующего возраста была продолжена в работе Jia et al. (A High-Throughput Electrochemiluminescence 7-Plex Assay Simultaneously Screening for Type 1 Diabetes and Multiple Autoimmune Diseases. J Vis Exp. 2020. 29(159). doi: 10.3791/61160). Несмотря на хорошие специфичность и чувствительность разработанного метода, сравнимыми с радиоиммунным анализом (РИА), данный метод имеет ограничения для дальнейшего развития, поскольку основан на применении стандартных ИФА-планшетов и ограничен по возможному числу иммобилизуемых аутоантигенов (максимум 4 на дне 384-луночного планшета или 10 на дне 96-луночного планшета). Кроме того, созданный метод не выявляет биомаркеры развития других АЭ, таких как аутоиммунная надпочечниковая недостаточность (болезнь Аддисона), гипергонадотропный гипогонадизм и гипопаратиреоз аутоиммунной природы, а также коморбидных патологий (алопеция, витилиго, аутоиммунный гастрит и др.).

Из уровня техники известно множество способов, основанных на использовании биологических микрочипов (биочипов) для выявления аутоантител (например, CN1338633A "Protein chip for diagnosing autoimmune diseases", US 20050260770 A1 "Antigen array and diagnostic uses thereof, US6159748A "Evaluation of autoimmune diseases using a multiple parameter latex bead suspension and flow cytometry", CN1866013A "Liquid phase chip for parallel detection of autoantibodies, preparation method and application thereof, CN1338633A "Protein chip for diagnosing autoimmune diseases", US20050260770A1 "Antigen array and diagnostic uses thereof). Однако в настоящее время ни один из заявленных способов не предназначен для выявления аутоантител, характерных для широкого спектра аутоиммунных эндокринопатий и коморбидных заболеваний.

ФГБУ «НМИЦ эндокринологии» Минздрава России и Институтом молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук (ИМБ РАН) разработан метод мультиплексного иммуноанализа на основе гидрогелевого биочипа для одновременного выявления аутоантител, характеризующих АПС-1. Метод предназначен для одновременной детекции органоспецифичных аутоантител и аутоантител к интерферонам (IFN-ω, IFN-α-2a) и интерлейкину IL-22 (Дедов с соавт.Способ выявления аутоантител в сыворотке крови, ассоциированных с аутоиммунным полигландулярным синдромом 1 типа, на гидрогелевом биочипе. Патент РФ №2781976. Заявка на патент РФ 2021106134, опубл. 12.09.2022 г., приоритет от 10.03.2021 г.). Установлено, что для АПС 1 типа характерно наличие по крайней мере двух специфических аутоантител к цитокинам, при этом у 16 из 18 пациентов с АПС-1 был выявлен характерный триплет аутоантител (IFN-ω+IFN-α-2a+IL-22). Совпадение результатов, полученных на биочипе, с методом ИФА, при выявлении органоспецифичных аутоантител у пациентов как с изолированными, так и с множественными эндокринопатиями, составило от 89,9% до 97,6% (Savvateeva et al. Multiplex Autoantibody Detection in Patients with Autoimmune Polyglandular Syndromes. Int J Mol Sci. 2021. 22(11): 5502. doi: 10.3390/ijms22115502). Однако созданный метод позволяет выявлять только биомаркеры развития АПС-1, не обеспечивая анализ антител, характеризующих другие АЭ.

Из анализа уровня техники можно сделать вывод, что в настоящее время существует необходимость разработки способа обнаружения антител, ассоциированных с аутоиммунными эндокринными патологиями и коморбидными заболеваниями, который выгодно отличался бы от известных способов возможностью одновременного выявления широкого спектра антител, а также отличался простотой и быстротой проведения анализа.

Раскрытие сущности изобретения

В результате проведенных обширных научных исследований авторы настоящего изобретения обнаружили, что задача разработки способа выявления антител в сыворотке крови, ассоциированных с аутоиммунными эндокринными и коморбидными патологиями, может быть успешно решена путем использования биологических микрочипов (биочипов), в элементах которых иммобилизованы антигены белковой природы, специфичные для различных аутоиммунных эндокринопатий и коморбидных заболеваний. Заявленный способ выгодно отличается от известных из уровня техники способов возможностью одновременного обнаружения в сыворотке крови до 26 антител (иммуноглобулинов класса G), характерных для развития аутоиммунных форм нарушения углеводного обмена (сахарный диабет 1 типа, латентный диабет взрослых (LADA), инсулиновый аутоиммунный синдром, инсулинорезистентность типа В), аутоиммунного тиреоидита, аутоиммунной надпочечниковой недостаточности, гипергонадотропного гипогонадизма аутоиммунной природы, гипопаратиреоза аутоиммунной природы, аутоиммунного полигландулярного синдрома 1 типа, аутоиммунного гастрита, алопеции, витилиго, целиакии. Метод не требует дорогостоящего оборудования и высококвалифицированного персонала. Данные, полученные с помощью метода мультиплексного иммуноанализа на биочипах, могут быть использованы для обследования пациентов учреждений эндокринологического профиля и лиц из групп риска, например, имеющих в семейном анамнезе соответствующих больных, с целью прогноза развития других аутоиммунных эндокринопатий и коморбидных заболеваний посредством обнаружения аутоантител к тканям органов-мишеней, которые могут выявляться за несколько лет до появления ранних специфических симптомов заболевания.

В своем первом аспекте данное изобретение обеспечивает способ выявления антител в сыворотке крови, ассоциированных с аутоиммунными эндокринными и коморбидными патологиями, на гидрогелевом биочипе. Способ предусматривает следующие стадии:

а) обеспечение биочипа, представляющего собой матрицу элементов, в которых иммобилизованы белки, каждый белок в четырех повторах, в том числе: антигены, специфичные для аутоиммунных форм нарушения углеводного обмена, таких как сахарный диабет 1 типа, включая декарбоксилазу глютаминовой кислоты, инсулин, проинсулин, рецептор инсулина, транспортер цинка 8, тирозинфосфатазу, антиген островковых клеток поджелудочной железы, антигены, специфичные для аутоиммунного тиреоидита, включая тиреопероксидазу, тиреоглобулин, натрий-йодный симпортер, антиген - 21-гидроксилаза, специфичная для аутоиммунной надпочечниковой недостаточности, антиген - рецептор фолликулостимулирующего гормона, специфичный для гипергонадотропного гипогонадизма аутоиммунной природы, антигены, вовлеченные в развитие аутоиммунной надпочечниковой недостаточности и/или гипергонадотропного гипогонадизма аутоиммунной природы, включая 3β-гидроксистероиддегидрогеназу, 17-гидроксилазу, фермент расщепления боковой цепи холестерина, антиген - белок 5, содержащий богатый лейцином NACHT-повтор, специфичный для гипопаратиреоза аутоиммунной природы, антигены, специфичные для аутоиммунного полигландулярного синдрома 1 типа, включая интерферон омега, интерферон альфа-2-a, интерлейкин 22, антигены, специфичные для аутоиммунного гастрита, включая внутренний фактор Кастла и альфа-субъединицу Н+/К+-АТФазы париетальных клеток желудка, антигены, специфичные для алопеции, включая трихогиалин и кератин 16, антигены, вовлеченные в развитие витилиго и/или алопеции, включая тирозиназу и дофахром-таутомеразу, антиген - трансглютаминаза 2, характерная для развития целиакии, контрольных элементов, содержащих человеческие иммуноглобулины класса G, и группы контрольных элементов, не содержащих иммобилизованных белков;

б) взаимодействие образца сыворотки крови человека с элементами биочипа с образованием специфичных бинарных иммунных комплексов антигенов, иммобилизованных в элементах биочипа, с антителами, находящимися в образце сыворотки крови;

в) детекцию образовавшихся иммунных комплексов с использованием флуоресцентно-меченных антивидовых антител против иммуноглобулинов человека класса G с образованием тройного комплекса «иммобилизованный антиген - антитело -антивидовое флуоресцентно-меченное антитело»;

г) регистрацию флуоресцентной картины биочипа и определение значений флуоресцентных сигналов элементов биочипа, в которых на стадии (в) образовались тройные комплексы, и контрольных элементов, не содержащих иммобилизованных белков, с использованием анализатора флуоресценции и программного обеспечения, с последующей интерпретацией, при которой антитела, ассоциированные с развитием сахарного диабета 1 типа, выявляют в случае, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих одинаковые антигены, включая декарбоксилазу глютаминовой кислоты, инсулин, проинсулин, рецептор инсулина, транспортер цинка 8, тирозинфосфатазу, антиген островковых клеток поджелудочной железы, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с развитием аутоиммунного тиреоидита, выявляют в случае, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих одинаковые антигены, включая тиреопероксидазу, тиреоглобулин, натрий-йодный симпортер, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с развитием аутоиммунной надпочечниковой недостаточности, выявляют, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих 21-гидроксилазу, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с развитием гипергонадотропного гипогонадизма аутоиммунной природы, выявляют, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих рецептор фолликулостимулирующего гормона, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с развитием аутоиммунной надпочечниковой недостаточности и/или гипергонадотропного гипогонадизма аутоиммунной природы, выявляют в случае, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих одинаковые антигены, включая 3β-гидроксистероиддегидрогеназу, 17-гидроксилазу, фермент расщепления боковой цепи холестерина, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с развитием гипопаратиреоза аутоиммунной природы, выявляют, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов с иммобилизованным белком 5, содержащем богатый лейцином NACHT-повтор, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с аутоиммунным полигландулярным синдромом 1 типа, выявляют в случае, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих одинаковые антигены, включая интерферон омега, интерферон альфа-2-a и интерлейкин 22, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, для двух и более белков превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с развитием аутоиммунного гастрита, выявляют в случае, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих одинаковые антигены, включая внутренний фактор Кастла и альфа-субъединицу Н+/К+-АТФазы париетальных клеток желудка, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с развитием алопеции, выявляют в случае, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих одинаковые антигены, включая трихогиалин и кератин 16, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с развитием витилиго и/или алопеции, выявляют в случае, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих одинаковые антигены, включая тирозиназу и дофахром-таутомеразу, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с развитием целиакии, выявляют, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих 2 трансглютаминазу 2, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение.

В одном из воплощений способ характеризуется тем, что биочип представляет собой подложку с гидрогелевыми элементами, полученными способом химической или фотоиндуцируемой сополимеризации, и содержащими иммобилизованные белки - антигены.

Далее изобретение будет раскрыто подробнее со ссылками на фигуры, которые приводятся исключительно с целью иллюстрации и пояснения сущности заявленного изобретения, но которые не предназначены для ограничения объема притязаний.

Краткое описание фигур и таблиц

Фигура 1. Схема размещения элементов биочипа для выявления антител, ассоциированных с аутоиммунными эндокринопатиями и коморбидными патологиями. Элементы биочипа представлены в виде кругов. Каждый из 26 иммобилизованных белков - антигенов, специфичных к антителу, характеризующему развитие АЭ и коморбидных патологий, иммобилизован в четырех повторяющихся элементах. Биочип также включает 4 элемента, обозначенных 'М', содержащих флуоресцентный маркер для обработки сигналов элементов биочипа после проведения анализа. Группа из восьми элементов 'PBS', не содержащих иммобилизованных белков, предназначена для вычисления значения фонового сигнала. Получение флуоресцентных сигналов от контрольных элементов биочипа 'human IgG' (два элемента), включающих иммуноглобулины класса G человека, является необходимым условием для контроля соблюдения условий проведения анализа, исключения грубых мануальных ошибок, а также контроля сохранности способности детектирующих антител узнавать свою мишень.

Фигура 2. Флуоресцентное изображение биочипа (А) и гистограмма результирующих сигналов элементов биочипа (Б) после анализа образца сыворотки крови пациента с аутоиммунным полигландулярным синдромом 1 типа, аутоиммунной надпочечниковой недостаточностью, гипергонадотропным гипогонадизмом аутоиммунной природы и аутоиммунным гастритом.

Фигура 3. Флуоресцентное изображение биочипа (А) и гистограмма результирующих сигналов элементов биочипа (Б) после анализа образца сыворотки крови пациента с сахарным диабетом 1 типа, аутоиммунным тиреоидитом и витилиго.

Фигура 4. Флуоресцентное изображение биочипа (А) и гистограмма результирующих сигналов элементов биочипа (Б) после анализа образца сыворотки крови пациента с сахарным диабетом 1 типа, аутоиммунной надпочечниковой недостаточностью, аутоиммунным гастритом и витилиго.

Фигура 5. Флуоресцентное изображение биочипа (А) и гистограмма результирующих сигналов элементов биочипа (Б) после анализа образца сыворотки крови пациента с аутоиммунным тиреоидитом и алопецией.

Фигура 6. Флуоресцентное изображение биочипа (А) и гистограмма результирующих сигналов элементов биочипа (Б) после анализа образца сыворотки крови пациента с сахарным диабетом 1 типа и витилиго.

Фигура 7. Флуоресцентное изображение биочипа (А) и гистограмма результирующих сигналов элементов биочипа (Б) после анализа образца сыворотки крови здорового донора.

Таблица 1. Перечень антигенов, иммобилизованных на гидрогелевом биочипе, с указанием соответствующей характерной патологии

Осуществление изобретения

Целью изобретения являлось создание способа одновременного выявления антител в сыворотке крови, ассоциированных с аутоиммунными эндокринными патологиями и коморбидными заболеваниями. Способ основан на проведении мультиплексного иммуноанализа образца сыворотоки крови на гидрогелевом биочипе. Биочип для осуществления заявляемого способа представляет собой матрицу трехмерных гидрогелевых элементов на подложке из стекла или пластика с иммобилизованными антигенами белковой природы. Биочип включает 26 антигенов, в том числе декарбоксилазу глютаминовой кислоты (GAD65), инсулин (INS), проинсулин (proINS), рецептор инсулина (IR/CD220), транспортер цинка 8 (ZnT8), тирозинфосфатазу (ICA512), антиген островковых клеток поджелудочной железы (ICA-1), тиреопероксидазу (ТРО), тиреоглобулин (Tg), натрий-йодный симпортер (NIS), 21-гидроксилазу (21-ОН), рецептор фолликулостимулирующего гормона (FSHR), 3β-гидроксистероиддегидрогеназу (3βHSD), 17-гидроксилазу (17-ОН), фермент расщепления боковой цепи холестерина (P450scc), белок 5, содержащий богатый лейцином NACHT-повтор (NALP5), интерферон омега (IFN-ω), интерферон альфа-2-a (IFN-α-2a), интерлейкин 22 (IL-22), внутренний фактор Кастла (GIF), альфа-субъединицу Н+/К+-АТФазы париетальных клеток желудка (АТР4А), трихогиалин (ТСНН), кератин 16 (KRT16), тирозиназу (TYR), дофахром-таутомеразу (TYRP2), трансглютаминазу 2 (TGM2) (Таблица 1). Схема биочипа представлена на Фигуре 1. Каждый антиген иммобилизован в четырех одинаковых гидрогелевых элементах, повторы используются для повышения воспроизводимости анализа.

Технология гидрогелевых биочипов разработана в ИМБ РАН и основана на одновременном формировании гидрогелевых ячеек с иммобилизацией молекулярных зондов (Gryadunov et al. The EIMB hydrogel microarrays technology: thirty years later. Acta Naturae. 2018. 10(4): 4-18, doi: 10.32607/20758251-2018-10-4-4-18). Макропористая структура гидрогелевых элементов формируется за счет сополимеризации мономера -производного метакриловой кислоты, бифункционального кроссшивающего агента и иммобилизуемых молекул. При этом белковые молекулы не нуждаются в дополнительной модификации поскольку имеют в своей структуре соответствующие функциональные группы аминокислот (N-концевые аминогруппы, е-аминогруппы лизинов, сульфгидрильные группы цистеинов и др.). Для белков подобраны условия полимеризации (длина волны при фотополимеризации, температура), позволяющие максимально сохранить их исходную биологическую активность. Иммобилизуемые молекулярные зонды равномерно распределены по всему объему ячейки. За счет развитой поверхности гидрогеля молекулярные зонды иммобилизованы с достаточной плотностью иммобилизации, однако, на значительном удалении друг от друга для нивелирования стерических эффектов. Структура геля предотвращает контакт зондов с гидрофобной подложкой, и обеспечивает водное окружение иммобилизованных биомолекул. Таким образом, иммобилизация белков в геле стабилизирует их нативную структуру и биологическую активность, в противоположность двумерным носителям, которые не обеспечивают водное окружение для молекул белков. Данный метод подходит для иммобилизации белковых молекул и по своим характеристикам выгодно отличается от классических методов планарной иммобилизации (Rubina AY, Kolchinsky A, Makarov АА, Zasedatelev AS. Why 3-D? Gel-based microarrays in proteomics. Proteomics. 2008. 8(4): 817-831. doi: 10.1002/pmic.200700629). Ячейки с иммобилизованными белками располагаются упорядоченными рядами на специально подготовленных подложках. Контроль качества нанесения осуществляется с помощью специализированной оптики и компьютерного анализа изображения.

Для выявления антител гидрогелевый биочип, содержащий иммобилизованные антигены, сначала инкубируют с анализируемой пробой, а затем с флуоресцентно-меченным вторичным антивидовым антителом против иммуноглобулинов человека класса G (IgG) и, наконец, регистрируют и проводят интерпретацию флуоресцентного изображения биочипа. Анализируемый образец представляет собой сыворотку крови человека, предварительно разведенную в 100 раз буфером 100 мМ Трис-HCl с 0.1% Triton Х-100. Во время инкубации ячеек биочипа с пробой происходит образование бинарных комплексов «иммобилизованный антиген - специфическое антитело». Инкубацию с образцом проводят при 37°С в течение ночи, поскольку было установлено, что через 16 часов инкубации на гидрогелевом биочипе процесс формирования бинарных комплексов «антиген-антитело» выходит на насыщение (Rubina AY, Kolchinsky А, Makarov AA, Zasedatelev AS. Why 3-D? Gel-based microarrays in proteomics. Proteomics. 2008. 8(4): 817-831. doi: 10.1002/pmic.200700629). После отмывки непрореагировавших компонентов реакции связавшиеся с иммобилизованными антигенами антитела детектируют вторичными антивидовыми флуоресцентно-меченными антителами. Экспериментально было установлено, что оптимальная рабочая концентрация детектирующих антивидовых антител составляет 5 мкг/мл при 37°, время инкубации 30 мин. Во время инкубации ячеек биочипа с антивидовыми флуоресцентно-меченными антителами происходит образование тройных комплексов «иммобилизованный антиген - специфическое антитело - антивидовое флуоресцентно-меченное антитело». После финальной отмывки проводят регистрацию флуоресцентных изображений биочипов, используя анализатор флуоресценции микрочипов со специальным программным обеспечением, позволяющим вычислить значения флуоресцентного сигнала каждого элемента биочипа (Lysov et al. Microarray analyzer based on wide field fluorescent microscopy with laser illumination and a device for speckle suppression. Biomed Opt Express. 2017 8(11): 4798-4810. doi: 10.1364/BOE.8.004798).

Интерпретацию результатов выполняют посредством сравнения интенсивностей сигналов элементов с иммобилизованными антигенами и интенсивностей сигналов элементов контрольной группы, не содержащих белков. Для каждой функциональной группы элементов n, содержащих одинаковые иммобилизованные антигены, результирующее значение сигнала In рассчитывают как медиану значений от четырех соответствующих элементов. В группе из восьми элементов 'PBS', не содержащих иммобилизованных белков, результирующее значение сигнала Iref рассчитывают как медиану значений от соответствующих сигналов элементов. Наличие антитела в сыворотке крови определяют в случае, если отношение результирующего сигнала In к результирующему сигналу Iref превышает пороговое значение. Ранее, при анализе аутоантител, ассоциированных с АПС-1, экспериментально были установлены и валидированы пороговые значения сигналов элементов биочипа, характеризующие наличие аутоантител в сыворотке крови (Savvateeva et al. Multiplex Autoantibody Detection in Patients with Autoimmune Polyglandular Syndromes. Int J Mol Sci. 2021. 22(11): 5502. doi: 10.3390/ijms22115502; Nuralieva et al. Diagnostic Accuracy of Methods for Detection of Antibodies against Type I Interferons in Patients with Endocrine Disorders. J Pers Med. 2022; 12(12): 1948. doi: 10.3390/jpm12121948). В настоящем изобретении используют пороговые значения In/Iref≥5,0 для IFN-ω, IFN-α-2a, IL-22 и In/Iref≥2,0 для остальных иммобилизованных антигенов.

Заявленный способ обеспечивает возможность скрининга образцов крови от пациентов и лиц из групп риска на наличие 26 антител, ассоциированных с различием аутоиммунных эндокринопатий и коморбидных заболеваний. Способ позволит существенно упростить и удешевить диагностику аутоиммунных эндокринопатий, в том числе, в случаях неполной или скрытой клинической манифестации компонентов коморбидных состояний.

Далее изобретение будет проиллюстрировано примерами, которые предназначены для обеспечения лучшего понимания сущности заявленного изобретения, но не должны рассматриваться как ограничивающие данное изобретение.

Пример 1. Выявление антител в образце сыворотки крови пациента с диагностированным аутоиммунным полигландулярным синдромом 1 типа, аутоиммунной надпочечниковой недостаточностью, гипергонадотропным гипогонадизмом аутоиммунной природы и аутоиммунным гастритом.

Гидрогелевые биочипы изготавливают методом сополимеризационной иммобилизации по ранее разработанной методике (Savvateeva et al. Multiplex Autoantibody Detection in Patients with Autoimmune Polyglandular Syndromes. Int J Mol Sci. 2021. 22(11): 5502. doi: 10.3390/ijms22115502).

Для проведения анализа образец сыворотки крови пациента разводят 1:100 буфером 100 мМ Трис-HCl с 0.1% Triton Х-100. 120 мкл смеси вносят в реакционную камеру биочипа. После инкубации с образцом в течение ночи при 37°С, промежуточной отмывки (PBS с 0,01% Tween 20, 20 мин), споласкивания и высушивания, биочипы проявляют флуоресцентно-меченными антивидовыми антителами (5 мкг/мл; F(ab')2-Goat anti-Human IgG-Cy5; 50 мкл) в буфере PBS с 0,14% поливинилового спирта (50 кДа) и 0,14% поливинилпирролидона (360 кДа). После инкубации (30 мин, 37°С) биочипы отмывают (PBS с 0,01% Tween 20, 30 мин), споласкивают, высушивают центрифугированием. Регистрацию флуоресцентных изображений биочипов проводят с помощью универсального аппаратно-программного комплекса для анализа биочипов (ООО «БИОЧИП-ИМБ», Россия). Вычисление флуоресцентных сигналов осуществляют с помощью программного обеспечения Image Assay (ИМБ РАН).

Фигура 2А иллюстрирует флуоресцентное изображение биочипа после проведения анализа образца сыворотки крови пациента с диагностированным АПС-1, аутоиммунной надпочечниковой недостаточностью, гипергонадотропным гипогонадизмом аутоиммунной природы и аутоиммунным гастритом. Гистограмма нормированных результирующих сигналов элементов биочипа представлена на Фигуре 2Б. В соответствии с алгоритмом интерпретации результатов выявляют превышение пороговых значений для следующих групп элементов: IIFN-ω/Iref≥5,0; IIFN-α-2a/Iref≥5,0; IIL-22/Iref≥5,0, что свидетельствует о присутствии в образце от пациента соответствующих специфичных для АПС-1 аутоантител к IFN-ω, IFN-α-2a, IL-22. В других группах значение результирующих сигналов In/Iref≥2,0 получено для 21-ОН, свидетельствующее о наличии антител к 21-гидролазе, маркеру развития аутоиммунной надпочечниковой недостаточности; для FSHR, свидетельствующее о наличии антител к рецептору фолликулостимулирующего гормона, как маркера развития гипергонадотропного гипогонадизма; для GIF, свидетельствующее о наличии антител к внутреннему фактору Кастла, как маркера развития аутоиммунного гастрита. Кроме того, соотношение In/Iref≥2,0 было также зарегистрировано для групп элементов Tg, ТРО и GAD65, свидетельствующее о наличии антител к тиреоглобулину, тиреопероксидазе и декарбоксилазе глютаминовой кислоты. Однако присутствие таких аутоантител в образцах сыворотки крови больных АПС-1 описано ранее (Savvateeva et al. Multiplex Autoantibody Detection in Patients with Autoimmune Polyglandular Syndromes. Int J Mol Sci. 2021. 22(11):J502. doi: 10.3390/ijms22115502) и не влияет на специфичность анализа. Во всех других группах результирующие значения сигналов не превышали пороговые значения.

Диагноз «АПС-1» пациента был также подтвержден методом секвенирования гена AIRE с обнаружением R257X/c.821delG как описано ранее (Yukina et al. Novel gene mutations regulating immune responses in autoimmune polyglandular syndrome with an atypical course. Journal of the Endocrine Society. 2021. doi:10.1210/jendso/bvab077).

Наличие в исследуемом образце сыворотки крови антител к IFN-α-2a было подтверждено с использованием референсного набора «Human Anti-IFN alpha ELISA kit» (Thermo Fisher, кат. № BMS217); наличие антител к IFN-ω - с использованием референсного набора «Human anti-Interferon Omega-1 ELISA kit anti-IFN-ω1» (BlueGene кат. № E01A4288); наличие антител к 21-ОН - с использованием референсного набора «Human anti cytochrome Р450с21/21 hydroxylase antibody ELISA kit» (BlueGene, кат. № Е01А2059); наличие антител к внутреннему фактору Кастла (GIF) - с использованием соответствующего референсного ИФА-набора (Orgentec, кат. №416-6470); наличие антител к GAD65 - с использованием референсного ИФА-набора (Biomerica, кат. №7009); наличие антител к ТРО - с использованием соответствующего референсного ИФА-набора (Orgentec, кат. №416-5030); наличие антител к Tg - с использованием соответствующего референсного ИФА-набора (Orgentec, кат. №416-5020).

Таким образом, результаты анализа на биочипе по выявлению антител в сыворотке крови пациента с рядом аутоиммунных эндокринопатий и коморбидным заболеванием -аутоиммунным гастритом полностью совпали с результатами референсных тестов.

Пример 2. Выявление антител в образце сыворотки крови пациента с сахарным диабетом 1 типа, аутоиммунным тиреоидитом и витилиго.

Изготовление гидрогелевых биочипов и анализ образца сыворотки крови пациента проводят, как описано в Примере 1.

Фигура 3А иллюстрирует флуоресцентное изображение биочипа после проведения анализа образца сыворотки крови пациента с диагностированным СД1, АИТ и витилиго. Гистограмма нормированных результирующих сигналов элементов биочипа представлена на Фигуре 3Б. В соответствии с алгоритмом интерпретации результатов выявляют превышение пороговых значений для группы элементов IICA-1/Iref≥2,0, что свидетельствует о присутствии в образце от пациента соответствующих специфичных для СД1 антител к антигену островковых клеток поджелудочной железы. Превышение пороговых значений зарегистрировано также для групп элементов ITPO/Iref≥2,0 и ITg/Iref≥2,0, свидетельствующее о наличии антител к тиреоглобулину и тиреопероксидазе, характерных для аутоиммунного тиреоидита. Наконец, превышение пороговых значений зарегистрировано также для групп элементов ITYR/Iref≥2,0 и ITYRP2/Iref≥2,0, свидетельствующее о наличии антител к тирозиназе и дофахром-таутомеразе, характерных для витилиго. Во всех других группах результирующие значения сигналов не превышали пороговые значения.

Наличие в исследуемом образце сыворотки крови антител к ICA-1 было подтверждено с использованием соответствующего референсного набора «GAD1/2 Antibody» (Biomerica, кат. №7010); наличие антител к ТРО - с использованием соответствующего референсного ИФА-набора (Orgentec, кат. №416-5030); наличие антител к Tg - с использованием соответствующего референсного ИФА-набора (Orgentec, кат. №416-5020); наличие антител к тирозиназе (TYR) - с использованием референсного набора «Human Anti-Tyrosinase antibody ELISA kit anti-TYR» (BlueGene кат. № E01A4289); наличие антител к дофахром-таутомеразе (TYRP2) - с использованием референсного набора «Human Anti-Dopachrome Tautomerase antibody ELISA kit anti-DCT» (BlueGene, кат. №Е01А4291).

Таким образом, результаты анализа на биочипе по выявлению антител в сыворотке крови пациента с сахарным диабетом 1 типа, аутоиммунным тиреоидитом и коморбидным заболеванием - витилиго полностью совпали с результатами референсных тестов.

Пример 3. Выявление антител в образце сыворотки крови пациента с сахарным диабетом 1 типа, аутоиммунной надпочечниковой недостаточностью, аутоиммунным гастритом и витилиго.

Изготовление гидрогелевых биочипов и анализ образца сыворотки крови пациента проводят, как описано в Примере 1.

Фигура 4А иллюстрирует флуоресцентное изображение биочипа после проведения анализа образца сыворотки крови пациента с диагностированным СД1, аутоиммунной надпочечниковой недостаточностью, аутоиммунным гастритом и витилиго. Гистограмма нормированных результирующих сигналов элементов биочипа представлена на Фигуре 4Б. В соответствии с алгоритмом интерпретации результатов выявляют превышение пороговых значений для группы элементов IGAD65/Iref≥2,0, что свидетельствует о присутствии в образце от пациента соответствующих характерных для СД1 антител к декарбоксилазе глютаминовой кислоты. Превышение пороговых значений зарегистрировано также для групп элементов I21-OH/Iref≥2,0 и IP450scc/Iref≥2,0, свидетельствующее о наличии антител к 21-гидроксилазе и ферменту расщепления боковой цепи холестерина, характерных для аутоиммунной надпочечниковой недостаточности. Превышение пороговых значений зарегистрировано также для группы IGIF/Iref≥2,0, свидетельствующее о наличии антител к внутреннему фактору Кастла, как маркера развития аутоиммунного гастрита. Наконец, превышение пороговых значений зарегистрировано также для групп элементов ITYR/Iref≥2,0 и ITYRP2/Iref≥2,0, свидетельствующее о наличии антител к тирозиназе и дофахром-таутомеразе, характерных для витилиго. Во всех других группах результирующие значения сигналов не превышали пороговые значения.

Наличие в исследуемом образце сыворотки крови антител к GAD65 было подтверждено с использованием референсного ИФА-набора (Biomerica, кат. №7009); наличие антител к 21-ОН - с использованием референсного набора «Human anti cytochrome Р450с21/21 hydroxylase antibody ELISA kite (BlueGene, кат. №E01A2059); наличие антител к внутреннему фактору Кастла (GIF) - с использованием соответствующего референсного ИФА-набора (Orgentec, кат. №416-6470); наличие антител к тирозиназе (TYR) - с использованием референсного набора «Human Anti-Tyrosinase antibody ELISA kit anti-TYR» (BlueGene кат. №E01A4289); наличие антител к дофахром-таутомеразе (TYRP2) - с использованием референсного набора «Human Anti-Dopachrome Tautomerase antibody ELISA kit anti-DCT» (BlueGene, кат. №E01A4291).

Таким образом, результаты анализа на биочипе по выявлению антител в сыворотке крови пациента с сахарным диабетом 1 типа, аутоиммунной надпочечниковой недостаточностью, аутоиммунным гастритом и витилиго полностью совпали с результатами референсных тестов.

Пример 4. Выявление антител в образце сыворотки крови пациента с аутоиммунным тиреоидитом и алопецией.

Изготовление гидрогелевых биочипов и анализ образца сыворотки крови пациента проводят, как описано в Примере 1.

Фигура 5А иллюстрирует флуоресцентное изображение биочипа после проведения анализа образца сыворотки крови пациента с диагностированным аутоиммунным тиреоидитом и алопецией. Гистограмма нормированных результирующих сигналов элементов биочипа представлена на Фигуре 5Б. В соответствии с алгоритмом интерпретации результатов выявляют превышение пороговых значений для группы элементов ITPO/Iref≥2,0, что свидетельствует о присутствии в образце от пациента соответствующих характерных для аутоиммунного тиреоидита антител к тиреопероксидазе. Превышение пороговых значений зарегистрировано также для группы элементов ITCHH/Iref≥2,0, свидетельствующее о наличии антител к трихогиалину, характерных для алопеции. Во всех других группах результирующие значения сигналов не превышали пороговые значения.

Наличие в исследуемом образце сыворотки крови антител к ТРО было подтверждено с использованием соответствующего референсного ИФА-набора (Orgentec, кат. №416-5030); наличие антител к трихогиалину - с использованием референсного набора «Human Anti-Trichohyalin antibody ELISA kit anti-ТСНН» (BlueGene, кат. №E01A4290).

Таким образом, результаты анализа на биочипе по выявлению антител в сыворотке крови пациента с аутоиммунным тиреоидитом и алопецией полностью совпали с результатами референсных тестов.

Пример 5. Выявление антител в образце сыворотки крови пациента с сахарным диабетом 1 типа и витилиго.

Изготовление гидрогелевых биочипов и анализ образца сыворотки крови пациента проводят, как описано в Примере 1.

Фигура 6А иллюстрирует флуоресцентное изображение биочипа после проведения анализа образца сыворотки крови пациента с диагностированным СД1 и витилиго. Гистограмма нормированных результирующих сигналов элементов биочипа представлена на Фигуре 6Б. В соответствии с алгоритмом интерпретации результатов выявляют превышение пороговых значений для группы элементов IGAD65/Iref≥2,0, что свидетельствует о присутствии в образце от пациента соответствующих специфичных для СД1 антител к декарбоксилазе глютаминовой кислоты. Превышение пороговых значений зарегистрировано также для групп элементов ITYR/Iref≥2,0 и ITYRP2/Iref≥2,0, свидетельствующее о наличии антител к тирозиназе и дофахром-таутомеразе, характерных для витилиго. Во всех других группах результирующие значения сигналов не превышали пороговые значения.

Наличие в исследуемом образце сыворотки крови антител к GAD65 было подтверждено с использованием референсного ИФА-набора (Biomerica, кат. №7009); наличие антител к тирозиназе (TYR) - с использованием референсного набора «Human Anti-Tyrosinase antibody ELISA kit anti-TYR» (BlueGene кат. №E01A4289); наличие антител к дофахром-таутомеразе (TYRP2) - с использованием референсного набора «Human Anti-Dopachrome Tautomerase antibody ELISA kit anti-DCT» (BlueGene, кат. №E01A4291).

Таким образом, результаты анализа на биочипе по выявлению антител в сыворотке крови пациента с сахарным диабетом 1 типа и коморбидным заболеванием - витилиго полностью совпали с результатами референсных тестов.

Пример 6. Выявление антител в образце сыворотки крови здорового донора.

Изготовление гидрогелевых биочипов и анализ образца сыворотки крови пациента проводят, как описано в Примере 1.

Фигура 7А иллюстрирует флуоресцентное изображение биочипа после проведения анализа образца сыворотки крови от здорового донора. Гистограмма нормированных результирующих сигналов элементов биочипа представлена на Фигуре 7Б. В соответствии с алгоритмом интерпретации, ни в одной из групп элементов с иммобилизованными антигенами, результирующие значения сигналов не превышали пороговые значения. Отсутствие сигналов на чипе свидетельствует об отсутствии соответствующих антител в крови здорового донора и о специфичности разработанного способа.

Таким образом, представленное изобретение позволяет выявлять в образце сыворотки крови до 26 антител (иммуноглобулинов класса G), характерных для развития аутоиммунных форм нарушения углеводного обмена (сахарный диабет 1 типа, латентный диабет взрослых (LADA), инсулиновый аутоиммунный синдром, инсулинорезистентность типа В), аутоиммунного тиреоидита, аутоиммунной надпочечниковой недостаточности, гипергонадотропного гипогонадизма аутоиммунной природы, гипопаратиреоза аутоиммунной природы, аутоиммунного полигландулярного синдрома 1 типа, аутоиммунного гастрита, алопеции, витилиго, целиакии. Данные, полученные с помощью метода мультиплексного иммуноанализа на биочипах, могут быть использованы для обследования пациентов учреждений эндокринологического профиля и лиц из групп риска, например, имеющих в семейном анамнезе соответствующих больных, с целью прогноза развития других аутоиммунных эндокринопатий и коморбидных заболеваний посредством обнаружения антител (аутоантител) к тканям органов-мишеней, которые могут выявляться за несколько лет до появления ранних специфических симптомов заболевания.

Все патенты, публикации, научные статьи, и другие документы, и материалы, цитируемые или упоминаемые здесь, включены в настоящее описание путем отсылки в такой степени, как если бы каждый из этих документов был включен путем отсылки индивидуально или приведен здесь в его полном виде.

Хотя предпочтительные воплощения настоящего изобретения и их преимущества были подробно описаны выше, специалист в данной области сможет внести различные изменения, дополнения, не выходя при этом за рамки данного изобретения, которые определяются прилагаемой ниже формулой изобретения.

Похожие патенты RU2816512C1

название год авторы номер документа
СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ АУТОАНТИТЕЛ В СЫВОРОТКЕ КРОВИ, АССОЦИИРОВАННЫХ С АУТОИММУННЫМ ПОЛИГЛАНДУЛЯРНЫМ СИНДРОМОМ I ТИПА, НА ГИДРОГЕЛЕВОМ БИОЧИПЕ 2021
  • Дедов Иван Иванович
  • Мокрышева Наталья Георгиевна
  • Мельниченко Галина Афанасьевна
  • Трошина Екатерина Анатольевна
  • Грядунов Дмитрий Александрович
  • Юкина Марина Юрьевна
  • Савватеева Елена Николаевна
  • Нуралиева Нурана Фейзуллаевна
  • Филиппова Марина Александровна
RU2781976C2
СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ИНДЕКСА АВИДНОСТИ АУТОАНТИТЕЛ В СЫВОРОТКЕ КРОВИ ЧЕЛОВЕКА НА ГИДРОГЕЛЕВЫХ БИОЧИПАХ 2023
  • Савватеева Елена Николаевна
  • Грядунов Дмитрий Александрович
  • Кулагина Елена Валерьевна
  • Соколова Вера Вадимовна
RU2818115C1
СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ АНТИТЕЛ - ИММУНОГЛОБУЛИНОВ КЛАССА G В СЫВОРОТКЕ КРОВИ К ВОЗБУДИТЕЛЯМ ТЯЖЕЛЫХ ОСТРЫХ РЕСПИРАТОРНЫХ ВИРУСНЫХ ИНФЕКЦИЙ, ВКЛЮЧАЯ SARS-COV-2, С ОДНОВРЕМЕННЫМ ПРОГНОЗОМ ТЯЖЕСТИ ПРОТЕКАНИЯ КОРОНАВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ COVID-19, НА ГИДРОГЕЛЕВОМ БИОЧИПЕ 2020
  • Валуев-Эллистон Владимир Треворович
  • Грядунов Дмитрий Александрович
  • Иванов Александр Владимирович
  • Лейнсоо Арво Тоомасович
  • Савватеева Елена Николаевна
  • Филиппова Марина Александровна
RU2746815C1
Биологический микрочип для обнаружения опухолевых экзосом в сыворотке крови человека для диагностики колоректального рака 2016
  • Бутвиловская Вероника Игоревна
  • Савватеева Елена Николаевна
  • Тихонов Алексей Александрович
  • Цыбульская Мария Вадимовна
  • Рубина Алла Юрьевна
RU2682721C2
Способ диагностики/скрининга колоректального рака, основанный на одновременном количественном определении онкомаркеров белковой природы, антител к гликанам, иммуноглобулинов G, А и М в крови человека на биологическом микрочипе 2015
  • Бутвиловская Вероника Игоревна
  • Поплетаева Софья Борисовна
  • Чечеткин Владимир Романович
  • Рубина Алла Юрьевна
  • Савватеева Елена Николаевна
  • Цыбульская Мария Вадимовна
  • Волошин Сергей Александрович
  • Тихонов Алексей Александрович
RU2625018C2
МНОГОПАРАМЕТРИЧЕСКАЯ ДИАГНОСТИЧЕСКАЯ ТЕСТ-СИСТЕМА, ПРЕДНАЗНАЧЕННАЯ ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ И МОНИТОРИНГА ТЕРАПИИ РАКА МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ И РАКА ЯИЧНИКОВ, И СПОСОБ ПРОВЕДЕНИЯ АНАЛИЗА С ЕЕ ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ 2014
  • Зубцова Жанна Исхаковна
  • Савватеева Елена Николаевна
  • Стомахин Андрей Александрович
  • Цыбульская Мария Вадимовна
  • Рубина Алла Юрьевна
RU2599890C2
СПОСОБ ОБРАБОТКИ ОБРАЗЦА КРОВИ ПРИ ПРОВЕДЕНИИ ИММУНОЛОГИЧЕСКОГО АНАЛИЗА АЛЛЕРГЕН-СПЕЦИФИЧЕСКИХ И ОБЩИХ ИММУНОГЛОБУЛИНОВ Е 2012
  • Рубина Алла Юрьевна
  • Фейзханова Гузель Усмановна
  • Филиппова Марина Александровна
  • Дементьева Екатерина Игоревна
  • Талибов Владимир Олегович
  • Бутвиловская Вероника Игоревна
  • Коротков Андрей Марксович
  • Стомахин Андрей Александрович
RU2568242C2
СПОСОБ ВЫБОРА ТАКТИКИ МЕДИКАМЕНТОЗНОГО ЛЕЧЕНИЯ НЕДИАБЕТИЧЕСКОЙ ГИПОГЛИКЕМИИ (НДГ) 2019
  • Дедов Иван Иванович
  • Мокрышева Наталья Георгиевна
  • Мельниченко Галина Афанасьевна
  • Трошина Екатерина Анатольевна
  • Юкина Марина Юрьевна
  • Нуралиева Нурана Фейзуллаевна
RU2732687C1
ТЕСТ-СИСТЕМА ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ОСТРЫХ РЕСПИРАТОРНЫХ ВИРУСНЫХ ИНФЕКЦИЙ 2019
  • Клотченко Сергей Анатольевич
  • Васин Андрей Владимирович
  • Плотникова Марина Александровна
  • Тараскин Александр Сергеевич
  • Ложков Алексей Александрович
  • Гюлиханданова Наталия Евгеньевна
  • Елпаева Екатерина Сергеевна
  • Грядунов Дмитрий Александрович
  • Филиппова Марина Александровна
  • Савватеева Елена Николаевна
RU2733379C1
СПОСОБ ДИАГНОСТИКИ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ОСТРЫХ РЕСПИРАТОРНЫХ ВИРУСНЫХ ИНФЕКЦИЙ 2019
  • Клотченко Сергей Анатольевич
  • Васин Андрей Владимирович
  • Плотникова Марина Александровна
  • Тараскин Александр Сергеевич
  • Ложков Алексей Александрович
  • Гюлиханданова Наталия Евгеньевна
  • Елпаева Екатерина Сергеевна
  • Грядунов Дмитрий Александрович
  • Филиппова Марина Александровна
  • Савватеева Елена Николаевна
RU2726797C1

Иллюстрации к изобретению RU 2 816 512 C1

Реферат патента 2024 года СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ АНТИТЕЛ В СЫВОРОТКЕ КРОВИ, АССОЦИИРОВАННЫХ С АУТОИММУННЫМИ ЭНДОКРИННЫМИ И КОМОРБИДНЫМИ ПАТОЛОГИЯМИ, НА ГИДРОГЕЛЕВОМ БИОЧИПЕ

Изобретение относится к молекулярной биологии, иммунологии, эндокринологии и может быть использовано в клинической лабораторной диагностике для выявления антител - иммуноглобулинов класса G в сыворотке крови, характерных для аутоиммунных эндокринопатий, таких как аутоиммунные формы нарушения углеводного обмена (сахарный диабет 1 типа и др.), аутоиммунный тиреоидит, гипергонадотропный гипогонадизм аутоиммунной природы, аутоиммунная надпочечниковая недостаточность, гипопаратиреоз аутоиммунной природы, аутоиммунный полигландулярный синдром 1 типа, а также антител, характеризующих развитие коморбидных патологий, включая аутоиммунный гастрит, витилиго, алопецию, целиакию. Способ включает обеспечение гидрогелевого биочипа с иммобилизованными антигенами, такими как декарбоксилаза глютаминовой кислоты, инсулин, проинсулин, рецептор инсулина, транспортер цинка 8, тирозинфосфатаза, антиген островковых клеток поджелудочной железы, тиреопероксидаза, тиреоглобулин, натрий-йодный симпортер, 21-гидроксилаза, рецептор фолликулостимулирующего гормона, 3β-гидроксистероиддегидрогеназа, 17-гидроксилаза, фермент расщепления боковой цепи холестерина, белок 5, содержащий богатый лейцином NACHT-повтор, интерферон омега, интерферон альфа-2-a, интерлейкин 22, внутренний фактор Кастла, альфа-субъединица Н+/К+-АТФазы париетальных клеток желудка, трихогиалин, кератин 16, тирозиназа, дофахром-таутомераза, трансглютаминаза 2. Способ также включает взаимодействие образца сыворотки крови человека с элементами биочипа с образованием специфичных бинарных иммунных комплексов антигенов, иммобилизованных в элементах биочипа, с антителами, находящимися в образце сыворотки крови, детекцию образовавшихся иммунных комплексов, регистрацию и интерпретацию результатов анализа на биочипе. Изобретение позволяет повысить эффективность способа выявления антител в сыворотке крови, ассоциированных с аутоиммунными эндокринными и коморбидными патологиями, на гидрогелевом биочипе. 1 з.п. ф-лы, 7 ил., 6 пр.

Формула изобретения RU 2 816 512 C1

1. Способ выявления антител в сыворотке крови, ассоциированных с аутоиммунными эндокринными и коморбидными патологиями, на гидрогелевом биочипе, включающий:

а) обеспечение биочипа, представляющего собой матрицу элементов, в которых иммобилизованы белки, каждый белок в четырех повторах, в том числе: антигены, специфичные для аутоиммунных форм нарушения углеводного обмена, таких как сахарный диабет 1 типа, включая декарбоксилазу глютаминовой кислоты, инсулин, проинсулин, рецептор инсулина, транспортер цинка 8, тирозинфосфатазу, антиген островковых клеток поджелудочной железы, антигены, специфичные для аутоиммунного тиреоидита, включая тиреопероксидазу, тиреоглобулин, натрий-йодный симпортер, антиген - 21-гидроксилаза, специфичная для аутоиммунной надпочечниковой недостаточности, антиген - рецептор фолликулостимулирующего гормона, специфичный для гипергонадотропного гипогонадизма аутоиммунной природы, антигены, вовлеченные в развитие аутоиммунной надпочечниковой недостаточности и/или гипергонадотропного гипогонадизма аутоиммунной природы, включая 3β-гидроксистероиддегидрогеназу, 17-гидроксилазу, фермент расщепления боковой цепи холестерина, белок 5, содержащий богатый лейцином NACHT-повтор, специфичный для гипопаратиреоза аутоиммунной природы, антигены, специфичные для аутоиммунного полигландулярного синдрома 1 типа, включая интерферон омега, интерферон альфа-2-a, интерлейкин 22, антигены, специфичные для аутоиммунного гастрита, включая внутренний фактор Кастла и альфа-субъединицу Н+/К+-АТФазы париетальных клеток желудка, антигены, специфичные для алопеции, включая трихогиалин и кератин 16, антигены, вовлеченные в развитие витилиго и/или алопеции, включая тирозиназу и дофахром-таутомеразу, антиген - трансглютаминаза 2, характерная для развития целиакии, контрольных элементов, содержащих человеческие иммуноглобулины класса G, и группы контрольных элементов, не содержащих иммобилизованных белков;

б) взаимодействие образца сыворотки крови человека с элементами биочипа с образованием специфичных бинарных иммунных комплексов антигенов, иммобилизованных в элементах биочипа, с антителами, находящимися в образце сыворотки крови;

в) детекцию образовавшихся иммунных комплексов с использованием флуоресцентно-меченных антивидовых антител против иммуноглобулинов человека класса G с образованием тройного комплекса «иммобилизованный антиген - антитело - антивидовое флуоресцентно-меченное антитело»;

г) регистрацию флуоресцентной картины биочипа и определение значений флуоресцентных сигналов элементов биочипа, в которых на стадии (в) образовались тройные комплексы, и контрольных элементов, не содержащих иммобилизованных белков, с использованием анализатора флуоресценции и программного обеспечения, с последующей интерпретацией, при которой антитела, ассоциированные с развитием сахарного диабета 1 типа, выявляют в случае, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих одинаковые антигены, включая декарбоксилазу глютаминовой кислоты, инсулин, проинсулин, рецептор инсулина, транспортер цинка 8, тирозинфосфатазу, антиген островковых клеток поджелудочной железы, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с развитием аутоиммунного тиреоидита, выявляют в случае, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих одинаковые антигены, включая тиреопероксидазу, тиреоглобулин, натрий-йодный симпортер, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с развитием аутоиммунной надпочечниковой недостаточности, выявляют, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих 21-гидроксилазу, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с развитием гипергонадотропного гипогонадизма аутоиммунной природы, выявляют, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих рецептор фолликулостимулирующего гормона, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с развитием аутоиммунной надпочечниковой недостаточности и/или гипергонадотропного гипогонадизма аутоиммунной природы, выявляют в случае, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих одинаковые антигены, включая 3β-гидроксистероиддегидрогеназу, 17-гидроксилазу, фермент расщепления боковой цепи холестерина, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с развитием гипопаратиреоза аутоиммунной природы, выявляют, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов с иммобилизованным белком 5, содержащим богатый лейцином NACHT-повтор, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с аутоиммунным полигландулярным синдромом 1 типа, выявляют в случае, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих одинаковые антигены, включая интерферон омега, интерферон альфа-2-a и интерлейкин 22, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, для двух и более белков превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с развитием аутоиммунного гастрита, выявляют в случае, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих одинаковые антигены, включая внутренний фактор Кастла и альфа-субъединицу Н+/К+-АТФазы париетальных клеток желудка, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с развитием алопеции, выявляют в случае, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих одинаковые антигены, включая трихогиалин и кератин 16, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с развитием витилиго и/или алопеции, выявляют в случае, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих одинаковые антигены, включая тирозиназу и дофахром-таутомеразу, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение, антитела, ассоциированные с развитием целиакии, выявляют, если отношение результирующего сигнала, полученного как медиана значений сигналов четырех элементов, содержащих 2 трансглютаминазу 2, к результирующему сигналу в виде медианы значений контрольных элементов, превышает пороговое значение.

2. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что биочип представляет собой подложку с гидрогелевыми элементами, полученными способом химической или фотоиндуцируемой сополимеризации.

Документы, цитированные в отчете о поиске Патент 2024 года RU2816512C1

СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ АУТОАНТИТЕЛ В СЫВОРОТКЕ КРОВИ, АССОЦИИРОВАННЫХ С АУТОИММУННЫМ ПОЛИГЛАНДУЛЯРНЫМ СИНДРОМОМ I ТИПА, НА ГИДРОГЕЛЕВОМ БИОЧИПЕ 2021
  • Дедов Иван Иванович
  • Мокрышева Наталья Георгиевна
  • Мельниченко Галина Афанасьевна
  • Трошина Екатерина Анатольевна
  • Грядунов Дмитрий Александрович
  • Юкина Марина Юрьевна
  • Савватеева Елена Николаевна
  • Нуралиева Нурана Фейзуллаевна
  • Филиппова Марина Александровна
RU2781976C2
Способ определения антител в сыворотке крови 1991
  • Бабкина Софья Сауловна
  • Медянцева Эльвина Павловна
  • Будников Герман Константинович
  • Вертлиб Маргарита Гиршевна
  • Ибрагимова Надежда Николаевна
  • Винтер Виктор Георгиевич
SU1832198A1
CN 1338633 A, 06.03.2002
US 6159748 A1, 12.12.2000
Savvateeva E.N., Yukina M.Y., Nuralieva N.F., Filippova M.A., Gryadunov D.A., Troshina E.A
Multiplex Autoantibody Detection in Patients with Autoimmune Polyglandular Syndromes
Int J Mol Sci
Способ регенерирования сульфо-кислот, употребленных при гидролизе жиров 1924
  • Петров Г.С.
SU2021A1
doi:

RU 2 816 512 C1

Авторы

Грядунов Дмитрий Александрович

Кулагина Елена Валерьевна

Савватеева Елена Николаевна

Филиппова Марина Александровна

Соколова Вера Вадимовна

Гаврилов Никита Сергеевич

Мальченко Максим Юрьевич

Дедов Иван Иванович

Мокрышева Наталья Георгиевна

Мельниченко Галина Афанасьевна

Трошина Екатерина Анатольевна

Юкина Марина Юрьевна

Нуралиева Нурана Фейзуллаевна

Исаева Мария Петровна

Даты

2024-04-01Публикация

2022-11-02Подача