КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ ТОЧЕЧНЫХ ЦИФРОВЫХ ИЗОБРАЖЕНИЙ ГИСТОЛОГИЧЕСКИХ ПРЕПАРАТОВ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ КОНЦЕНТРАЦИИ ГИСТАМИНА В БИОЛОГИЧЕСКИХ СТРУКТУРАХ Российский патент 2010 года по МПК A61B5/00 G01N33/52 G01N21/64 

Описание патента на изобретение RU2392845C2

Компьютерный анализ точечных цифровых изображений гистологических препаратов для определения концентрации гистамина в биологических структурах

Изобретение относится к медицине, а именно к морфологии и гистохимии.

Для гистохимического выявления гистамина используется метод Кросса-Эвена-Роста с орто-фталиевым альдегидом (Cross, S.W.D. A study of the methods available for the cytochemical localization of histamine by fluorescence induced with o-phthalaldehyde or acetaldehyde / S.W.D. Cross, S.W.B. Ewen, F.W.D. Rost // Histochem. J. - 1971. - Vol.3. - P.471-476).

Впоследствии препарат подвергается цитоспектрофлуометрии при помощи фотометрической люминесцентной электронной насадки ФМЭЛ-1А для определения в условных единицах регистрирующего прибора концентрации гистамина в биологических структурах. Для определения интенсивности люминесценции гистамина в исследуемых объектах по традиционной методике используется интерференционный светофильтр №7 фотометрической люминесцентной насадки ФМЭЛ-1А (максимальная длина пропускаемой волны 503±14 нм). Световой поток люминесценции от изучаемого участка поля зрения отсекается автоматически аппаратным зондом. ФЭУ преобразует светопоток от флуоресценции гистамина в силу тока, которая вызывает отклонение стрелки стандартного измерительного прибора, что пропорционально концентрации гистамина под зондом.

Запись полученных данных производится вручную, ориентируясь на показания стрелки измерительного прибора.

Цель фотографирования ограничивается качественным анализом полученных снимков.

В качестве объектов для исследования концентрации гистамина таким методом часто являются тучные клетки (Бочкарев В.А. Сравнение гистохимических свойств различных популяций (перитонеальных и мезентериальных) тучных клеток в условиях дисбаланса биогенных аминов: дисс.… канд. мед. наук. - Чебоксары, 1987. - 158 с.; Бочкарева А.Г. Влияние болевого стресса и КВЧ-поля на морфофункциональное состояние селезенки крыс: дисс.… канд. биол. наук. - Чебоксары, 2002. - 155 с.; Гунин А.Г. Содержание гистамина и функциональная активность альвеолярных макрофагов / А.Г Гунин, Д.С.Гордон, И.Р.Вазина // Иммунология. - 1990. - №6. - С.12-13.; Диндяев С.В., Виноградов С.Ю. Биогенные амины крови и перитонеальной жидкости крыс в процессе полового цикла // Курский научно-практический вестник «Человек и его здоровье». - 2006. - №3. - С.5-10.; Любовцева Л.А. Локализация гистамина в структурах вилочковой железы в норме и условиях эксперимента у лабораторных животных: автореф. дисс.… канд. биол. наук. - М., 1980. - 23 с.).

Последовательность операций при традиционном способе определения концентрации гистамина в биологических структурах:

1. включить регистрирующий прибор за 30-40 минут до начала работы;

2. за 20-30 минут до начала цитоспектрофлуорометрии включить блок питания микроскопа, зажечь ртутную лампу ДРШ-250;

3. выставить напряжение, подаваемое на ФЭУ ФМЭЛа - 2200 В (следить, чтобы оно было постоянным);

4. калибровка регистрирующего прибора;

5. контрольный замер эталона из уранового стекла ЖС-19 при всегда определенной чувствительности регистрирующего прибора зондами при интерференционном фильтре «0» до эталонной цифры.

Таким образом, недостатками определения интенсивности светового потока от микропрепарата с целью определения концентрации гистамина в микроструктурах с использованием микроскопа ЛЮМАМ И2 с фотометрической установкой - ФМЭЛ-1А и регистрационным стрелочным прибором являются:

1. Высокая стоимость самой установки.

2. Необходимость постоянной текущей калибровки регистрирующего прибора для каждого препарата.

3. Перманентное отклонение стрелки регистрирующего прибора от истинного значения в результате инерционности его конструкции и нестабильности напряжения в сети.

4. Недолговечность гистохимического препарата (24-48 часов), а следовательно, невозможность архивировать первичную информацию, то есть наблюдаемое изображение.

5. Работа постоянно сопровождается образованием озона, источником которого является ртутная лампа ЛЮМАМа ДРШ-250.

6. Необходимость работать в темном помещении.

7. Длительность фотометрии приводит к усталости зрительного анализатора.

8. Невозможность ввиду всего вышеперечисленного проводить пролонгированный анализ.

Технический результат предлагаемого способа заключается в том, что для количественного определения концентрации гистамина в биологических структурах используется цифровая фотография с последующим компьютерным анализом яркости участка цифрового изображения, соответствующего аппаратному зонду по форме и размерам, исходя из определения средней яркости участка цифрового изображения в условных единицах яркости от 0 до 255 при помощи стандартных компьютерных программ.

Описание сущности предлагаемого способа:

Мы поставили цель заменить существующий метод количественного определения концентрации гистамина в микроструктурах гистологических препаратов, обработанных по методу Кросса посредством регистрации интенсивности светового потока от флуоресцирующих структур на волне 515-520 нм при помощи ФМЭЛ, на метод, использующий компьютерный анализ яркости участка цифрового изображения, соответствующей зонду по форме и размерам с помощью стандартных компьютерных программ. Это решение было вызвано тем, что флуоресценция препарата при данном методе обработки может быть вызвана или наличием гистамина в изучаемых структурах, или аутолюминесценцией структур. Последнюю можно исключить при соблюдении при помощи стандартной для этого метода постановки контрольной пробы - определения флюоресценции препарата без обработки реагентом.

Для получения цифровых изображений нами при помощи фотоаппарата Canon Power Shot, 32 Mega Pixels без вспышки, в режиме "Листва", позволяющем сохранить яркость светлых тонов, проводилось фотографирование обработанных по методу Кросса (на гистамин) тучных клеток перитонеальной жидкости крыс-самок. В результате был создан архив jpeg иображений размером 2048 на 1536 пикселей. Одновременно с этим посредством зонда 0,5 ФМЭЛа и регистрационного прибора в тех же самых клетках, которые подвергались микрофотографии, определялась концентрация гистамина на волне 515-520 нм. Позднее с каждым цифровым изображением тучной клетки была соотнесена зарегистрированная стандартным методом в этой же тучной клетке концентрация гистамина.

Для симуляции реального зонда ФМЭЛ используемого размера при помощи стандартных программных средств была использована круглая маска 60 на 60 пикселей (она выступала в роли виртуального, т.е. воссоздаваемого программными средствами компьютера, зонда), которая «отсекала» те участки изображения, с которых не производилась регистрация светопотока. Данная программная возможность реализована в целом ряде графических программ. Нами была использована Corel PHOTO-PAINT 10. После этого посредством меню «гистограмма» нами определялись характеристики интенсивности суммарной яркости изображения в пределах маски.

Для демонстрации сущности предлагаемого метода приведены фотографии перитонеальных тучных клеток с низким и высоким содержанием гистамина (фото 1, 3). Изображения рабочего окна программы в момент замера средней яркости участка под маской для этих же тучных клеток (фото 2, 4). Тучная клетка на фото 1, 3 визуально менее яркая, при традиционной методике данные о концентрации гистамина - 0,8 условных единиц, данные, полученные по предлагаемой методике (средняя яркость изображения под маской), - 22,97 условной единицы. Тучная клетка на фото 2, 4 визуально более яркая, при традиционной методике данные о концентрации гистамина - 7,2 условной единицы, данные, полученные по предлагаемой методике (средняя яркость изображения под маской), - 74,41 условной единицы.

Для количественного доказательства эквивалентности традиционной и предлагаемой методик нами был применен однофакторный дисперсионный анализ. Его применение связано тем, что на суммарную яркость микропрепарата в маске кроме непосредственной интенсивности света оказывают влияние еще и инструментальные особенности фотоаппарата и невозможность точного наложения маски на зону, измеряемую зондом (выполняется вручную). Поэтому нужно было узнать ту долю, которую вносит интенсивность светопотока от флуоресцирующих гистаминсодержащих структур в суммарную яркость этих структур на цифровом изображении. Данную информацию дает однофакторный дисперсионный анализ, для проведения которого необходимо подтвердить нормальный закон распределения изучаемых признаков.

Для этого был использован критерий Колмогорова, который для массива первичных данных о распределении концентрации гистамина, полученных традиционным способом, составил 0,228, а для массива первичных данных о распределении концентрации гистамина, полученных предлагаемым способом, 0,912 (критическое значение, при котором распределение нельзя считать нормальным 0,05 и меньше).

Знание о нормальном характере распределения первичных данных позволило нам воспользоваться однофакторным дисперсионным анализом (см.таблицу), согласно которому действительно имеется влияние данных, полученных традиционным способом, на данные, полученные экспериментальным способом (Ф=60,6 при Ф критическом = 2,3). При этом сила влияния находится в пределах от 86-80% (р<0,05), в среднем 83% от суммарного влияния всех факторов. Если учесть, что данные, полученные традиционным способом, эквивалентны концентрации гистамина в биологических структурах, то концентрация гистамина на 83% определяет яркость этих структур на цифровом изображении. Это достаточно высокий показатель, если учесть, что абсолютно точно воспроизвести измеряемую зондом зону при помощи маски не представляется возможным.

Таким образом, определение интенсивности светопотока на волне 515-520 нм от флуоресцирующего препарата, обработанного по методу Кросса (на гистамин), можно адекватно заменить компьютерной оценкой яркости участка изображения микрообъекта, что позволяет стандартными средствами цифровой фотографии и программной обработки данных оценить интенсивность флуоресенции на волне 515-520 нм, а следовательно, определить концентрацию гистамина в биологических объектах.

Данные, полученные традиционным и предлагаемым способом, а также промежуточные данные для однофакторного дисперсионного анализа приведены в таблице.

Таблица Группа (интервал) Традиционный способ (сила тока) Предлагаемый способ (средняя яркость участка изображения) Среднее по группам для предлагаемого способа 1-1,99 1,1 34,25 40,35 1,2 30,29 1,3 43,83 1,4 38,25 1,4 51,47 1,4 30,44 1,4 48,18 1,5 41,37 1,5 41,18 1,6 53,19 1,6 35,89 1,6 48,85 1,6 35,28 1,6 32 1,7 23,19 1,75 39,09 1,8 39,83 1,9 49,53 1,9 50,54 2-2,99 2 74,04 54,006 2 48,23 2,1 47,92 2,1 28,46 2,2 37,08 2,2 82,98 2,2 49,44 2,3 63,53 2,35 36,77 2,35 36,59 2,4 44,88 2,5 87,55 2,5 46,57 2,6 57,37 2,7 52,99 2,7 55,95 2,7 58,2 2,8 49,93 2,8 73,05 2,9 48,59

3-3,99 3 75,59 65,48529 3,1 62,09 3,2 71,21 3,2 31,83 3,2 46,8 3,2 60,89 3,2 56,39 3,3 68,72 3,5 67,53 3,6 42,48 3,6 100,76 3,6 82,32 3,8 54,97 3,8 61,56 3,8 60,28 3,9 73,5 3,9 96,33 4-4,99 4 59,9 72,00462 4,3 61,04 4,5 55,7 4,5 68,02 4,6 90,06 4,6 57,35 4,7 81,76 4,7 112,66 4,8 66,26 4,8 55,26 4,8 79,28 4,85 77,28 4,87 71,49 5-5,99 5,4 55,04 73,66889 5,5 86,94 5,5 91,84 5,6 59,06 5,6 77,94 5,7 95,09 5,7 51,63 5,8 72,71 5,8 72,77 6-6,99 6 79,79 76,6575 6,2 73,99 6,2 95,91 6,2 75,27 6,2 55,14 6,2 55 6,6 81,04 6,7 97,12 7-7,99 7,1 94,48 95,655 7,2 74,7 7,4 81,09 7,4 132,35 8-8,99 8,2 89,86 100,75 8,6 98,24 8,8 114,15 ИТОГО Среднее 62,98097 Дисперсия 476,3596 396,8167 Количество замеров 93 Количество групп 8 F (значение преобразования Фишера для доверительной вероятности 0,05) 2,3 Ф (достоверность влияния) 60,57717 Ф>F, влияние достоверно Сила влияния (Доля влияния от воздействие всех факторов. Влияние всех факторов - 1) 0,833019 (83%) Доверительный интервал для показателя силы влияния с вероятностью 0,05 0,801391-0,86464723 (80-86%)

Похожие патенты RU2392845C2

название год авторы номер документа
СПОСОБ ОЦЕНКИ УРОВНЯ ГИСТАМИНА В ЭПИТЕЛИАЛЬНЫХ КЛЕТКАХ ЭНДОМЕТРИЯ МАТКИ КРЫС В ПРОЦЕССЕ ПОЛОВОГО ЦИКЛА 2008
  • Диндяев Сергей Валерьевич
  • Виноградов Сергей Юрьевич
RU2392622C2
УСТРОЙСТВО ДЛЯ ВНУТРИМАТОЧНОЙ КОНТРАЦЕПЦИИ 2000
  • Герасимова Л.И.
  • Кузнецов Ю.П.
  • Новиков Н.Д.
  • Арзуманян Т.Г.
RU2164790C1
СПОСОБ ОБУЧЕНИЯ И УСВОЕНИЯ УЧЕБНОГО МАТЕРИАЛА 2008
  • Никитаев Валентин Григорьевич
  • Проничев Александр Николаевич
  • Бердникович Елена Юрьевна
  • Чистов Кирилл Сергеевич
  • Гончаренко Ирина Ивановна
  • Зайцев Сергей Михайлович
RU2413298C2
СПОСОБ КОЛИЧЕСТВЕННОЙ ОЦЕНКИ УРОВНЯ ЭКСПРЕССИИ КАТЕХОЛАМИН- И СЕРОТОНИН-РЕЦЕПТОРНЫХ КОМПЛЕКСОВ НА ПОВЕРХНОСТИ ЛЕЙКОЦИТОВ 2007
  • Сарап Павел Владимирович
  • Винник Юрий Семенович
  • Миноранская Наталья Сергеевна
  • Чихачев Евгений Александрович
  • Чижикова Елена Викторовна
RU2377565C2
Способ применения тромбина и активированного протеина С в качестве антивоспалительных средств 2020
  • Голяко Иван Александрович
  • Астахова Екатерина Андреевна
  • Горбачева Любовь Руфэльевна
RU2780490C2
СПОСОБ НЕЙРОПРОТЕКЦИИ В ЭКСПЕРИМЕНТЕ 2015
  • Сидорова Мария Владимировна
  • Киселева Екатерина Владимировна
  • Горбачева Любовь Руфэльевна
  • Струкова Светлана Михайловна
  • Мойсенович Михаил Михайлович
  • Агапов Игорь Иванович
  • Гончаренко Анна Владимировна
  • Архипова Анастасия Юрьевна
  • Котлярова Мария Сергеевна
  • Рамонова Алла Аликовна
RU2616509C1
Флуориметрический анализатор биологических микрочипов 2016
  • Лысов Юрий Петрович
  • Барский Виктор Евгеньевич
  • Юрасов Дмитрий Александрович
  • Юрасов Роман Александрович
  • Черепанов Алексей Игоревич
  • Мамаев Дмитрий Дмитриевич
  • Егоров Егор Евгеньевич
  • Чудинов Александр Васильевич
  • Смолдовская Ольга Валерьевна
  • Рубина Алла Юрьевна
  • Заседателев Александр Сергеевич
RU2679605C2
КОМПЛЕКСНЫЙ АНТИБАКТЕРИАЛЬНЫЙ ПРЕПАРАТ ДЛЯ ЖИВОТНЫХ 2014
  • Михайлов Виктор Васильевич
  • Енгашев Сергей Владимирович
  • Данилевская Наталья Владимировна
  • Тухфатова Регина Фановна
RU2554797C1
СРЕДСТВО, ОБЛАДАЮЩЕЕ НЕЙРОПРОТЕКТОРНЫМИ СВОЙСТВАМИ В ЭКСПЕРИМЕНТЕ И СПОСОБ ЕГО ПОЛУЧЕНИЯ 2015
  • Сидорова Мария Владимировна
  • Киселева Екатерина Владимировна
  • Горбачева Любовь Руфэльевна
  • Струкова Светлана Михайловна
  • Мойсенович Михаил Михайлович
  • Агапов Игорь Иванович
  • Гончаренко Анна Владимировна
  • Архипова Анастасия Юрьевна
  • Котлярова Мария Сергеевна
  • Рамонова Алла Аликовна
RU2614694C1
СРЕДСТВО, СТИМУЛИРУЮЩЕЕ КЛЕТОЧНЫЙ ИММУНИТЕТ МЛЕКОПИТАЮЩИХ 2009
  • Аминин Дмитрий Львович
  • Сильченко Александра Сергеевна
  • Авилов Сергей Анатольевич
  • Калинин Владимир Иванович
  • Стоник Валентин Аронович
RU2415863C1

Иллюстрации к изобретению RU 2 392 845 C2

Реферат патента 2010 года КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ ТОЧЕЧНЫХ ЦИФРОВЫХ ИЗОБРАЖЕНИЙ ГИСТОЛОГИЧЕСКИХ ПРЕПАРАТОВ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ КОНЦЕНТРАЦИИ ГИСТАМИНА В БИОЛОГИЧЕСКИХ СТРУКТУРАХ

Изобретение относится к медицине, а именно к морфологии и гистохимии. Компьютерный анализ проводят путем фотографирования гистологических препаратов, обработанных по методу Кросса-Эвена-Роста с орто-фталиевым альдегидом и оценки фотографий, при этом используют цифровую фотографию, а концентрацию гистамина программно определяют по средней яркости участка цифрового изображения в условных единицах яркости от 0 до 255 посредством графических редакторов. Использование изобретения позволяет расширить арсенал способов определения концентрации гистамина в биологических структурах. 4 ил.

Формула изобретения RU 2 392 845 C2

Способ определения концентрации гистамина в биологических структурах путем фотографирования гистологических препаратов, обработанных по методу Кросса-Эвена-Роста с орто-фталиевым альдегидом и оценки фотографий, отличающийся тем, что используют цифровую фотографию, а концентрацию гистамина программно определяют по средней яркости участка цифрового изображения в условных единицах яркости от 0 до 255 посредством графических редакторов.

Документы, цитированные в отчете о поиске Патент 2010 года RU2392845C2

Cross, S.W.D
A study of the methods available for the cytochemical localization of histamine by fluorescence induced with o-phthalaldehyde or acetaldehyde / S.W.D
Cross, S.W.B
Ewen, F.W.D
Rost // Histochem
J
Устройство станционной централизации и блокировочной сигнализации 1915
  • Романовский Я.К.
SU1971A1
Переносная печь для варки пищи и отопления в окопах, походных помещениях и т.п. 1921
  • Богач Б.И.
SU3A1
КОЛЕНЧАТО-РЫЧАЖНЫЙ ПРЕСС ДЛЯ ЦЕМЕНТНЫХ ЧЕРЕПИЦ, ПЛИТОК И Т.П. С МНОГОКРАТНЫМ НАЖАТИЕМ НА ФОРМУЕМУЮ МАССУ 1922
  • Смирнов М.Н.
SU471A1
Аппарат для очищения воды при помощи химических реактивов 1917
  • Гордон И.Д.
SU2A1
Регистрационное

RU 2 392 845 C2

Авторы

Виноградов Сергей Юрьевич

Криштоп Владимир Владимирович

Диндяев Сергей Валерьевич

Даты

2010-06-27Публикация

2007-10-23Подача