СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ГЕКСАХЛОРФЛУОРЕСЦЕИН-МЕЧЕНЫХ ОЛИГОДЕЗОКСИРИБОНУКЛЕОТИДОВ Российский патент 2012 года по МПК C12N15/00 C12N15/11 

Описание патента на изобретение RU2463347C2

Предлагаемое изобретение относится к области синтеза флуоресцентно-меченых олигонуклеотидов. Последние находят применение в молекулярной биологии и медицинской диагностике, в частности в ДНК-анализах, где используется полимеразная цепная реакция в режиме реального времени (РВ-ПЦР, или Real Time PCR). Разработка доступного и эффективного метода получения особо чистых гексахлорфлуоресцеин-меченых олигонуклеотидов важна для количественной РВ-ПЦР, а также для ее мультиплексного варианта, когда в ходе одной ПЦР детектируеся наличие нескольких участков ДНК.

Уровень технического состояния.

Флуоресцентно-меченые олигонуклеотиды в настоящее время повсеместно используются в молекулярной биологии и медицинской диагностике [1, 2]. Большинство методов их синтеза предусматривает введение меток в процессе сборки нуклеотидной цепи на твердой фазе. При этом флуорофор должен подвергаться всем последующим процедурам, а именно окислению и деблокированию, и может быть модифицирован в ходе этих процессов.

Существует широко принятое мнение, что тщательно синтезированные ДНК-зонды для РВ-ПЦР не нуждаются в серьезной очистке [3]. Гексахлорфлуоресцеиновая (HEX-) метка широко используется в ПЦР-анализах, включая количественные и мультиплексные. Результаты РВ-ПЦР регистрируются в виде кривых накопления флуоресцентного сигнала, по которым рассчитывается наличие и количество наработанного в ходе ПЦР ампликона и, следовательно, наличие и содержание в тестируемом образце искомого участка ДНК. Известно, на примере одного из НЕХ-зондов строения HEX-38-мep-BHQ2, далее обозначенного как Н38В, что форма и результирующая интенсивность флуоресценции ("end point") кривых накопления существенно зависят от способа очистки зонда (гель-электрофорез, обращенно-фазовый картридж или ВЭЖХ) (Фиг.1, [4]). Известно, что в ходе выполнения стандартного протокола синтеза олигонуклеотидов, а именно на стадии аммонолиза (обработки концентрированным водным аммиаком) НЕХ-метка, в зависимости от температуры и продолжительности процесса, на 20-60% трансформируется в остаток замещенного акридина, что изменяет флуоресцентные свойства зонда (Фиг.2, [5]). Примесь акридинпроизводного полноразмерного олигонуклеотида существенно снижает чувствительность РВ-ПЦР-анализа и может в мультиплексном варианте давать ложноположительные результаты по флуоресцеин- (например, (6)-FAM-) содержащему зонду из-за существенного перекрывания областей флуоресценции этих меток (Фиг.3). Известно, что наибольшие выходы НЕХ-олигонуклеотидов, полученных твердофазным синтезом, достигались после удаления защитных групп действием концентрированного раствора аммиака при комнатной температуре за 24 ч или при 50°С за 5 ч, с последующим ВЭЖХ-выделением целевых олигомеров [5], см. также Фиг.4, профили А.

Однако методом ВЭЖХ не всегда успешно можно отделить примеси акридинсодержащих олигонуклеотидов. В ряде случаев не удается подобрать идеальные параметры ВЭЖХ, пики целевого и побочного олигонуклеотидов перекрываются (Фиг.5, профиль А). В результате или целевой НЕХ-олигонуклеотид содержит значительное количество примеси, или его выход снижается на величины вплоть до 50%.

Иногда используются так называемые вырожденные ПЦР-зонды, т.е. содержащие смесь нуклеотидов, от двух до четырех, по одному или нескольким положениям в последовательности. Понятно, что в таких случаях целевой продукт на хроматограмме проявляется в виде нескольких пиков и отделение акридинсодержащей примеси практически невозможно.

Необходимо отметить, что наличие упомянутой примеси в НЕХ-меченом олигонуклеотиде трудно оценить с помощью электрофореза в ПААГ. Из-за разницы в молекулярных массах всего в 1 Да это практически невозможно осуществить и масс-спектрометрическими методами.

Для синтеза меченых олигонуклеотидов авторы использовали твердофазный фосфорамидитный метод, требующий наименьших временных затрат. Тем не менее, очевидно, что при наращивании олигонуклеотидной последовательности другими методами (фосфодиэфирным или Н-фосфонатным), предусматривающими аммонолиз на последней химической стадии процесса, неизбежно образование акридиновых производных.

В научной литературе до публикации [5] трансформация НЕХ-метки водным аммиаком описана не была и, соответственно, не было никаких рекомендаций по ее устранению.

Раскрытие изобретения и технический результат

Техническим результатом настоящего изобретения является разработка способа получения гексахлорфлуоресцеин-меченых олигодезоксирибонуклеотидов, предусматривающего на стадии деблокирования практически полное устранение образования акридинсодержащих примесей. Это существенно облегчает отбор фракций при ВЭЖХ-очистке НЕХ-меченых олигонуклеотидов.

Использование предлагаемого способа приводит к увеличению выходов целевых НЕХ-олигонуклеотидов не менее чем на 25% и к гарантированному отсутствию примесей акридинпроизводных в полученных образцах. Все это обеспечивает максимально точные и воспроизводимые результаты РВ-ПЦР, в том числе и ее мультиплексных вариантов.

Технический результат достигается тем, что для постсинтетической обработки НЕХ-производных олигонуклеотидов вместо концентрированного водного аммиака применяются смеси концентрированного водного аммиака с трет-бутиламином в объемном соотношении от 2:1 до 5:1.

Удаление защитных групп концентрированным водным раствором аммиака проводят при комнатной температуре в течение 21-24 ч.

Описание чертежей

На Фиг.1. показана зависимость формы кривых накопления флуоресцентного сигнала в процессе проведения РВ-ПЦР анализа - с использованием олигонуклеотидного зонда Н38В - от способа очистки последнего. Очевидно преимущество зонда, выделенного с помощью ВЭЖХ.

На Фиг.2. приведена химическая схема трансформации гексахлорфлуоресцеиновой группировки в производное акридина водным аммиаком и различия во флуоресцентных свойствах соответствующих олигонуклеотидов.

Фиг.3. иллюстрирует перекрывание спектров флуоресценции негалогенированной флуоресцеиновой и гексахлоракридиновой меток на примере модельных олигонуклеотидов.

На Фиг.4. показаны фрагменты ВЭЖХ-профилей препаративного выделения зондов Н38В и Н37В после стандартного аммонолиза и после деблокирования по заявляемому способу. Очевидно, что заявляемый способ обеспечивает более высокие выходы НЕХ-содержащих зондов.

На Фиг.5. фрагменты ВЭЖХ-профилей препаративной хроматографии иллюстрируют неэффективное разделение реакционных смесей синтеза НЕХ-содержащих олигонуклеотидов Н23В и Н24, полученных после удаления защитных групп по стандартной методике. Заявляемый способ обеспечивает существенно более высокие выходы зондов за счет отсутствия акридиновых производных.

Фиг.6. доказывает с помощью аналитической ВЭЖХ, что зонд Н38В, полученный по заявляемому способу, не уступает по качеству зонду, полученному по стандартной методике.

Фиг.7. иллюстрирует, что в процессе РВ-ПЦР зонд Н37В, полученный по заявляемому способу, не уступает по качеству зонду, полученному по стандартной методике.

Ниже приведены примеры реализации изобретения.

Примеры 1-2 описывают получение модельного олигонуклеотида состава 5′-НЕХ-Т10 по стандартному протоколу и заявляемому способу и подтверждают увеличение выхода этого олигонуклеотида при реализации изобретения.

Примеры 3.1 и 3.2 описывают получение олигонуклеотидов Н38В и Н37В, хорошо отделяемых с помощью ВЭЖХ от примесей акридиновых производных, по стандартному протоколу и заявляемому способу.

Примеры 4.1 и 4.2 описывают получение олигонуклеотидов Н24 и Н23В составов 5′-НЕХ-24-мер и 5′-HEX-23-мep-BHQ2 соответственно, плохо отделяемых с помощью ВЭЖХ от примесей акридиновых производных, по стандартному протоколу и заявляемому способу.

В итоге Примеры 1-4 подтверждают увеличение выходов НЕХ-меченых олигонуклеотидов при реализации изобретения на 25-55%.

Аналитическая ВЭЖХ показала, что полученные по заявляемому способу препараты НЕХ-меченых олигонуклеотидов не уступают по чистоте препаратам тех же олигомеров, полученных по стандартному протоколу (Фиг.6).

Калибровочные опыты РВ-ПЦР показали, что зонды Н38В и Н37В, полученные по заявляемому способу, дают нормальные и хорошо воспроизводимые кривые накопления с фоновыми величинами флуоресценции даже несколько меньшими, чем при использовании этих же зондов, полученных по стандартному протоколу (Фиг.7).

Следовательно, в заявляемом способе предлагается технологически несложный способ получения гексахлорфлуоресцеинсодержащих олигонуклеотидов, обеспечивающий их существенно более высокие выходы и более надежные результаты при их использовании в качестве зондов для ПЦР в режиме реального времени, по сравнению с теми же олигонуклеотидами, полученными по стандартному протоколу.

Примеры реализации изобретения

Олигонуклеотиды были получены твердофазным амидофосфитным методом на автоматическом синтезаторе ДНК АСМ 800 ("Биоссет", Россия) с использованием стандартных коммерческих нуклеозид-амидофосфитов, флуорофорсодержащего амидофосфита 5′-HEX-amidite, стандартных нуклеозидсодержащих носителей и гасительсодержащего носителя 3′-BHQ-2 CPG (все реагенты - Glen Research, США). Количества носителей составляли 9±0,5 мг/синтез.

ВЭЖХ проводили на хроматографе Agilent Chemstation 1100 Series на колонке Macherey-Nagel Nucleosil 300 С18, 4.6×250 мм, вымывая олигонуклеотиды градиентом ацетонитрила в 0,1 М ацетате аммония при 45-50°С. Детекцию осуществляли при 260 нм в аналитическом режиме и при 285 нм в препаративном режиме.

Спектры флуоресцентной эмиссии получали в процессе ВЭЖХ, используя матричный флуоресцентный детектор Agilent 1100 Series G1321A.

УФ-спектры записывали на УФ-спектрофотометре ND-1000 (NanoDrop Technologies, США), а в процессе ВЭЖХ - с помощью матричного UV-VIS детектора Agilent 1100 Series G1315B.

Количество олигонуклеотидов выражали общепринятым способом, в оптических единицах (о.е.), измеренных по величине поглощения при 260 нм.

Масс-спектры получены на MALDI TOF масс-спектрометрах UltraFlex и MicroFlex (Bruker, Германия), с использованием стандартной мишени - MSP target polished steel (Bruker, Германия). Для приготовления матрицы применяли 3-гидроксипиколиновую кислоту (Fluka, США).

РВ-ПЦР образцов ДНК проводили по методике [4].

Пример 1. Синтез олигонуклеотида 5′-НЕХ-Т10 по стандартному протоколу.

Олигонуклеотид состава 5′-НЕХ-Т10 синтезировали в автоматическом режиме. По окончании синтеза носитель промывали ацетонитрилом, высушивали в токе воздуха, заливали концентрированным раствором аммиака и выдерживали в герметично закрытой пробирке, в соответствии с рекомендациями производителя 5′-HEX-amidite, 24 ч при комнатной температуре. Постаммонолизную смесь после удаления аммиака в вакууме разделяли методом ВЭЖХ. Усредненные на один синтез (всего - 4 синтеза) выходы составили: 6.64 о.е. для 5′-НЕХ-Т10 и 1,47 о.е. для акридиновой примеси.

Пример 2. Синтез олигонуклеотида 5′-НЕХ-Т10 по заявляемому способу.

Протокол отличается от описанного в Примере 1 тем, что носитель после высушивания заливали смесью концентрированного раствора аммиака и трет-бутиламина (2:1 по объемам) и выдерживали 24 ч здесь и далее при комнатной температуре. После ВЭЖХ-очистки усредненный на один синтез (всего - 8 синтезов) выход 5′-НЕХ-Т10 составил 8.4 о.е. или 126% от выхода 5′-НЕХ-Т10, полученного согласно Примеру 1.

Пример 3. Синтез олигонуклеотиов Н38В и Н37В.

Пример 3.1. Синтез по стандартному протоколу.

Олигонуклеотиды Н38В и Н37В составов НЕХ-38мер-ВНQ2 и HEX-37мep-BHQ2 соответственно получали в условиях Примера 1. После ВЭЖХ-очистки (Фиг.4А) усредненный на один синтез (всего - 16 синтезов) выход Н38В составил 5,7 о.е., выход Н37В, усредненный на 1 синтез из 8, составил 5,8 о.е. Выходы побочных полноразмерных акридиновых производных на один синтез для Н38В и Н37В составили около 1,7 о.е.

Пример 3.2. Синтез по заявляемому способу.

Олигонуклеотиды Н38В и Н37В получали в условиях Примера 2, используя смесь концентрированного раствора аммиака и трет-бутиламина (3:1 по объемам для Н38В и 4:1 по объемам для Н37В, 22 ч). После ВЭЖХ-очистки (Фиг.4Б) усредненный на один синтез (всего - 24 синтеза) выход Н38В составил 7,7 о.е. или 135% от выхода Н38В, полученного согласно Примеру 3.1. Выход Н37В, усредненный на 1 синтез из 8, составил 7,9 о.е. или 136% от выхода Н38В, полученного согласно Примеру 3.1.

Пример 4. Синтез олигонуклеотиов Н24 и Н23В.

Чистоту отбираемых фракций контролировали, наблюдая УФ-спектры элюата (Фиг.5).

Пример 4.1. Синтез по стандартному протоколу.

Олигонуклеотиды Н23В и Н24 составов HEX-23мep-BHQ2 и НЕХ-24мер соответственно получали в условиях Примера 1. После ВЭЖХ-очистки (Фиг.5А) усредненный на один синтез (всего - 4 синтеза) выход Н24 составил 7,0 о.е., выход Н23В, усредненный на 1 синтез из 4, составил 4,8 о.е. Акридиновые производные не удалось получить в чистом виде, поэтому их выходы не определялись.

Пример 4.2. Синтез по заявляемому способу.

Олигонуклеотиды Н24 и Н23В получали в условиях Примера 2, используя смесь концентрированного раствора аммиака и трет-бутиламина (5:1 по объемам, 21 ч). После ВЭЖХ-очистки (Фиг.5Б) усредненный на один синтез (всего - 4 синтеза) выход Н24 составил 11.1 о.е. или 159% от выхода Н24, полученного согласно Примеру 4.1. Выход Н23В, усредненный на 1 синтез из 4, составил 7,3 о.е. или 152% от выхода Н23В, полученного согласно Примеру 4.1.

ЛИТЕРАТУРА

1. Li Y., Zhou X., and Ye D. Molecular beacons: an optimal multifunctional biological probe // Biochem. Biophys. Res. Communs. 2008. V. 373. P.457-61.

2. Marras S. A., Tyagi S., and Kramer F. R. Real-time assays with molecular beacons and other fluorescent nucleic acid hybridization probes // Clin. Chim. Acta. 2006. V.363. P.48-60.

3. Yeung А.Т., Holloway В.P., Adams P.S., and Shipley G.L. Evaluation of dual-labeled fluorescent DNA probe purity versus performance in real-time PCR // Biotechniques. 2004. V.36. P.266-270, 272, 274-276.

4. Татаринова О.Н., Лукьянова Т.Н., Зайцева М.А, Веремеев К.Ю., Карпов В.А., Чувилин А.Н., Петрунин Д.Д., Позмогова Г.Е. Влияние способов очистки олигодезоксирибонуклеотидных зондов на эффективность генодиагностики методом PCR в режиме реального времени // Бюлл. эксперим. биол. и мед. 2008. Т.145. №3. С.275-280.

5. Chuvilin A.N., Serebryakova M.V., Smimov I.P., Pozmogova G.E. Byproduct with Altered Fluorescent Properties Is Formed during Standard Deprotection Step of Hexachlorofluorescein Labeled Oligonucleotides // Bioconjugate Chem. 2009. V.20. N 8. P.1441-1443.

Подписи к чертежам

Фиг.1. Зависимость формы кривых накопления флуоресцентного сигнала зонда Н38В от способа очистки последнего. Зонд был очищен с помощью: 1 - электрофореза, 2 - обращенно-фазового картриджа, 3 - ВЭЖХ (взято из [4]).

Фиг.2. Схема трансформации гексахлорфлуоресцеиновой группировки (А) в производное акридина (Б) водным аммиаком (вверху). Флуоресцентные спектры эмиссии соответствующих производных на примере зонда Н38В (внизу). В данном случае R=-(СН2)6-ОР(O)(ОН)-O-олигонуклеотид.

Фиг.3. Спектры флуоресценции (6)-FAM и НЕХ-меток олигонуклеотидов (6)-FAM-T10 (А) и акридинового производного Т10, побочного продукта аммонолиза при получении HEX-T10 (Б).

Фиг.4. Фрагменты ВЭЖХ-профилей препаративного выделения зондов Н38В (панель 1) и Н37В (панель 2):

А) после стандартного аммонолиза;

Б) по заявляемому способу действием смеси концентрированного водного аммиака с трет-бутиламином (при объемных соотношениях 2:1 для Н38В и 3:1 для Н37В).

Здесь и далее пометкой "HEX" обозначены зоны собираемых фракций чистых НЕХ-производных. Зоны здесь и на Фиг.5 размечены на основании УФ-спектров, снимаемых в процессе ВЭЖХ.

Фиг.5. Фрагменты ВЭЖХ-профилей препаративной ВЭЖХ плохо отделяемых НЕХ-содержащих олигонуклеотидов Н23В состава HEX-23мep-BHQ2 (панель 1) и Н24 состава НЕХ-24 мер (панель 2), полученных после удаления защитных групп по стандартной методике (А) и заявляемому способу (Б). "Acr" - зона, где присутствует акридинпроизводное, "BHQ2" - зона, где преобладают нефлуоресцентные производные гасителя.

Фиг.6. Аналитическая ВЭЖХ хроматографически очищенных препаратов зонда Н38В, полученных по стандартной методике (А) и заявляемому способу (Б).

Фиг.7. Кривые накопления, записанные в процессе РВ-ПЦР с использованием ВЭЖХ-очищенного зонда Н37В, полученного по стандартному протоколу (А) и по заявляемому способу (Б).

Похожие патенты RU2463347C2

название год авторы номер документа
СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ УДАЛЯЕМЫХ ВОДОНЕРАСТВОРИМЫХ ИОНООБМЕННЫХ ПОКРЫТИЙ НА МАЛДИ МИШЕНЯХ И ИХ ПРИМЕНЕНИЕ ДЛЯ МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЧЕСКОГО АНАЛИЗА 2010
  • Смирнов Игорь Павлович
  • Позмогова Галина Евгеньевна
  • Говорун Вадим Маркович
RU2475543C2
СПОСОБ НЕКОВАЛЕНТНОЙ ФИКСАЦИИ ОЛИГОДЕЗОКСИРИБОНУКЛЕОТИДОВ НА ВНЕШНЕЙ ПОВЕРХНОСТИ ЖИВЫХ КЛЕТОК 2007
  • Позмогова Галина Евгеньевна
  • Чувилин Андрей Николаевич
  • Зайцева Марина Алексеевна
  • Борисенко Григорий Геннадиевич
RU2394916C2
ПЕПТИДНЫЙ ВЕКТОР, СПОСОБ ЕГО ПОЛУЧЕНИЯ, НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ, РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК И ШТАММ ESCHERICHIA COLI B-8389 ВКПМ ДЛЯ ЕГО ПОЛУЧЕНИЯ, СПОСОБ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ МОДИФИКАЦИИ КЛЕТОК МЛЕКОПИТАЮЩИХ И ЧЕЛОВЕКА 2003
  • Позмогова Г.Е.
  • Чувилин А.Н.
  • Посыпанова Г.А.
  • Шульга А.А.
  • Эльдаров М.А.
  • Ермолюк Я.С.
  • Северин Е.С.
  • Кирпичников М.П.
  • Скрябин К.Г.
RU2248983C1
Способ получения рН-чувствительных разветвленных узлов ДНК-наноконструкций 2015
  • Позмогова Галина Евгеньевна
  • Клинов Дмитрий Владимирович
  • Протопопова Анна Дмитриевна
  • Варижук Анна Михайловна
  • Баринов Николай Александрович
RU2649369C2
Способ выявления и генотипирования РНК вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней 2018
  • Баннов Василий Александрович
  • Черных Олег Юрьевич
  • Малышев Денис Владиславович
  • Котельникова Александра Андреевна
  • Дунин Иван Михайлович
  • Дробин Юрий Дмитриевич
  • Амерханов Харон Адиевич
  • Донник Ирина Михайловна
  • Дорожкин Василий Иванович
  • Лысенко Александр Анатолиевич
  • Племяшов Кирилл Владимирович
  • Кривонос Роман Анатольевич
  • Шевкопляс Владимир Николаевич
  • Бахарев Алексей Александрович
  • Кощаев Андрей Георгиевич
  • Коломиец Сергей Николаевич
  • Дайбова Любовь Анатольевна
  • Кривоногова Анна Сергеевна
RU2703394C1
Тест-система для выявления ДНК возбудителя моракселлеза KPC (Moraxella bovis) в биологическом материале животных и кормах с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени 2023
  • Черных Олег Юрьевич
  • Баннов Василий Александрович
  • Донник Ирина Михайловна
  • Василевич Федор Иванович
  • Решетникова Дарья Геннадиевна
  • Кощаев Андрей Георгиевич
  • Кривонос Роман Анатольевич
  • Белоусов Василий Иванович
  • Шевченко Александр Алексеевич
  • Шевченко Людмила Васильевна
  • Семененко Марина Петровна
  • Забашта Сергей Николаевич
  • Дмитрив Николай Иванович
  • Яковенко Павел Павлович
  • Коба Игорь Сергеевич
RU2819044C1
СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ОЛИГОМЕРОВ ПЕПТИДНО-НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ, СОДЕРЖАЩИХ КАРБОКСИЭТИЛЬНЫЙ ЗАМЕСТИТЕЛЬ В α- ИЛИ γ-ПОЛОЖЕНИИ БОКОВОЙ ЦЕПИ 2015
  • Танкевич Мария Васильевна
  • Кириллова Юлия Геннадьевна
  • Деженков Андрей Владимирович
  • Варижук Анна Михайловна
  • Смирнов Игорь Павлович
  • Чувилин Андрей Николаевич
  • Позмогова Галина Евгеньевна
RU2604732C1
Тест-система для выявления и генотипирования РНК вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней 2018
  • Черных Олег Юрьевич
  • Котельникова Александра Андреевна
  • Баннов Василий Александрович
  • Малышев Денис Владиславович
  • Дробин Юрий Дмитриевич
  • Донник Ирина Михайловна
  • Стекольников Анатолий Александрович
  • Уша Борис Вениаминович
  • Лысенко Александр Анатолиевич
  • Морозов Виталий Юрьевич
  • Кривонос Роман Анатольевич
  • Исаева Альбина Геннадиевна
  • Шевкопляс Владимир Николаевич
  • Кощаев Андрей Георгиевич
  • Барашкин Михаил Иванович
  • Дайбова Любовь Анатольевна
  • Кузьминова Елена Васильевна
  • Винокурова Диана Петровна
RU2703401C1
Способ выявления генома возбудителя вируса парагриппа 3 типа у крупного рогатого скота 2018
  • Черных Олег Юрьевич
  • Сочнев Василий Васильевич
  • Баннов Василий Александрович
  • Малышев Денис Владиславович
  • Дробин Юрий Дмитриевич
  • Донник Ирина Михайловна
  • Иванов Аркадий Васильевич
  • Лысенко Александр Анатольевич
  • Кривонос Роман Анатольевич
  • Шевкопляс Владимир Николаевич
  • Кощаев Андрей Георгиевич
  • Калошкина Инна Муратовна
  • Кулакова Анна Леонидовна
RU2696069C2
Тест-система для выявления ДНК возбудителя криптоспоридиоза (Cryptosporidiosis) в биологическом материале животных и кормах с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени 2021
  • Черных Олег Юрьевич
  • Баннов Василий Александрович
  • Малышев Денис Владиславович
  • Донник Ирина Михайловна
  • Василевич Федор Иванович
  • Кощаев Андрей Георгиевич
  • Кривонос Роман Анатольевич
  • Пономарева Ольга Ивановна
  • Лысенко Александр Анатолиевич
  • Белоусов Василий Иванович
  • Дайбова Любовь Анатольевна
  • Дмитрив Николай Иванович
RU2785381C1

Иллюстрации к изобретению RU 2 463 347 C2

Реферат патента 2012 года СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ГЕКСАХЛОРФЛУОРЕСЦЕИН-МЕЧЕНЫХ ОЛИГОДЕЗОКСИРИБОНУКЛЕОТИДОВ

Изобретение относится к области биотехнологии и касается способа получения гексахлорфлуоресцеин-меченых олигодезоксирибонуклеотидов. Охарактеризованный способ предусматривает один из стандартных методов синтеза олигодезоксирибонуклеотидной последовательности, введение в нее гексахлорфлуоресцеинсодержащего модификатора, последующее удаление защитных групп концентрированным водным раствором аммиака, содержащего трет-бутиламин в объемном соотношении от 2:1 до 5:1, при комнатной температуре в течение 21-24 часов и выделение целевого продукта одним из стандартных методов. Представленный способ позволяет получить более высокий выход гексахлорфлуоресцеин-меченых олигонуклеотидов в отсутствии в полученных образцах примесей акридин-производных независимо от способа выделения целевых олигомеров. 7 ил., 4 пр.

Формула изобретения RU 2 463 347 C2

Способ получения гексахлорфлуоресцеин-меченых олигодезоксирибонуклеотидов, предусматривающий один из стандартных методов синтеза олигодезоксирибонуклеотидной последовательности, введение в нее гексахлорфлуоресцеинсодержащего модификатора, последующее удаление защитных групп концентрированным водным раствором аммиака при комнатной температуре в течение 21-24 ч и выделение целевого продукта одним из стандартных методов, отличающийся тем, что водный раствор аммиака содержит трет-бутиламин в объемном соотношении от 2:1 до 5:1.

Документы, цитированные в отчете о поиске Патент 2012 года RU2463347C2

ПОЗМОГОВА Г.Е
Искусственные ДНК-содержащие супрамолекулярные комплексы
Автореф
дисс
- М., 2008
ТАТАРИНОВА О.Н
и др
Влияние способов очистки олигодезоксирибонуклеотидных зондов на эффективность генодиагностики методом ПЦР в режиме реального времени
Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2008, т.145, №3, с.280-284
CHUVILIN

RU 2 463 347 C2

Авторы

Чувилин Андрей Николаевич

Позмогова Галина Евгеньевна

Смирнов Игорь Павлович

Говорун Вадим Маркович

Даты

2012-10-10Публикация

2010-05-28Подача