Пептид, обладающий способностью ингибировать миграцию клеток, стимулированную белком TARC Российский патент 2017 года по МПК C07K7/08 A61K38/10 A61P35/00 A61P37/00 

Описание патента на изобретение RU2629198C1

Изобретение относится к биологически активным пептидам, способным ингибировать подвижность клеток, стимулированную хемокином TARC. Предложен пептид формулы H-Gly-Ala-Ile-Pro-Leu-Arg-Lys-Leu-Lys-Thr-Trp-Tyr-ОН. Заявленный пептид может использоваться в иммунологии для лечения аллергических заболеваний и в онкологии для повышения эффективности противоопухолевой терапии лейкозов.

Хемокины - это группа структурно родственных белков небольшого размера (8-12 кДа). Они представляют собой цитокины, индуцирующие миграцию лейкоцитов в лимфатические органы и очаги воспаления, контролирующие активацию и дифференцировку клеток. Действие хемокинов осуществляется через специфические мембранные рецепторы.

TARC - тимусом и активацией регулируемый хемокин (thymus- and activation-regulated chemokine, или CCL17) относится к подсемейству СС или β-хемокинов, в структуре которых два остатка цистеина расположены рядом (-с-с-) [1]. TARC специфически связывается с рецептором CCR4. Основную популяцию CCR4 + клеток в норме составляют Т-хелперные клетки, обеспечивающие гуморальный иммунный ответ на антигены (Т-хелперы 2 типа) [2-4].

Известно, что Т-хелперы 2 типа играют важную роль в развитии иммунных патологий, таких как аллергии и аутоиммунные расстройства [5]. Было показано значительное увеличение содержания в крови хемокина TARC при атопическом дерматите [6, 7], астме [8] и аллергическом рините [9].

Высокая экспрессия рецептора CCR4 выявлена в клетках Т-клеточной лимфомы/лейкоза взрослых и Т-клеточной лимфомы кожи [10, 11]. Показано, что поражения кожных покровов, характерные для этих неоплазий, обусловлены CCR4-зависимой миграцией опухолевых клеток в дерму.

Все эти факты указывают на необходимость разработки терапевтических подходов, основанных на ингибировании взаимодействия рецептора CCR4 с его лигандом. Некоторые шаги в этом направлении уже предприняты. Разработано несколько химических антагонистов CCR4 различной структуры и получены моноклональные антитела против рецептора CCR4, которые показали достаточно высокую противовоспалительную и противоопухолевую активность в доклинических испытаниях [12, 13]. Однако использование химических антагонистов в клинике может быть сопряжено с такими проблемами, как: низкая эффективность, токсичность, трудности в оценке фармакокинетических характеристик и метаболизма.

В связи с этим представляется целесообразным получение антагониста рецептора CCR4 с минимальным побочным действием. В качестве такого вещества может быть использован пептидный фрагмент TARC человека, обладающий антагонистическими по отношению к TARC свойствами.

Задачей настоящего изобретения является синтез пептидов, лишенных побочных реакций, ингибирующих TARC-опосредованную миграцию лимфоидных клеток.

Поставленная задача решается путем синтеза пептида формулы: TARC 17-28 - H-Gly-Ala-Ile-Pro-Leu-Arg-Lys-Leu-Lys-Thr-Trp-Tyr-OH. Заявляемый пептид содержит 12 аминокислотных остатков. Синтез заявляемого пептида осуществляется твердофазным способом с помощью Fmoc-технологии, что в настоящее время с учетом длины пептида является рутинной задачей. Очистка пептида осуществляется путем обычной одностадийной высокоэффективной жидкостной хроматографией (ВЭЖХ). Все это делает получение заявляемого антагониста значительно проще и дешевле, чем получение «гуманизированных» антител.

Неочевидность изобретения обусловлена тем, что поставленная задача решается путем синтеза пептида последовательности 17-28 TARC, хотя из литературы не известно ни одного фрагмента этого белка, способного ингибировать TARC-стимулированную миграцию лимфоидных клеток. Таким образом, из литературных данных не следовало, что поиск пептидного ингибитора TARC-стимулированной подвижности лимфоидных клеток среди фрагментов молекулы может привести к желаемым результатам. Заявляемый пептид не обладает иммуногенным и токсическим действием, поскольку является низкомолекулярным фрагментом эндогенного хемокина TARC.

Синтез заявляемого пептида осуществляется по стандартной технологии пептидного синтеза на твердой фазе с применением наиболее современной Fmoc-(9-флуоренилметоксикарбонил)-технологии [14]. В качестве нерастворимого носителя использовали сополимер стирола с 1% дивинилбензола с кислотолабильной якорной группой. Для блокирования функциональных групп боковых цепей аминокислот применяли следующие защиты: трет-бутильную для гидроксильных групп треонина и тирозина; трет-бутилоксикарбонильную (Boc) - защиту для ε-аминогруппы лизина и индольного кольца триптофана; 2,2,5,7,8-пентаметилхроман-6-сульфонильную (Pmc) - защиту для гуанидиновой функции аргинина. Пептидную цепь наращивали по одной аминокислоте, начиная синтез с С-конца. Для создания амидных связей использовали 2-(1Н-бензотриазол-1-ил)-1,1,3,3-тетраметилурония тетрафторборат (TBTU) в присутствии 2-х эквивалентов N-метилморфолина.

Для заключительного деблокирования и отщепления пептидов от носителя применяли трифторуксусную кислоту со скэвенджерами. Сырой продукт твердофазного синтеза очищали с использованием препаративной высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ).

Пример 1. Синтез додекапептида H-Gly-Ala-Ile-Pro-Leu-Arg-Lys-Leu-Lys-Thr-Trp-Tyr-OH, соответствующего последовательности 17-28 тимус-ассоциированного регуляторного хемокина (TARC)

В работе использовали производные L-аминокислот фирмы Bachem (Швейцария), TBTU, TIBS (триизобутилсилан) фирмы Fluka (Швейцария). Для синтеза применяли диметилацетамид, дихлорметан (DCM), 4-метилпиперидин и трифторуксусную кислоту фирмы Fluka (Швейцария).

Аналитическую и препаративную ВЭЖХ проводили на приборе Gilson (Франция), использовали ацетонитрил фирмы Panreac (Испания).

Аналитическую ВЭЖХ проводили на колонке Диасфер 110-С18 (Россия). В качестве элюентов использовали: буфер А - 0.1% ТФА, буфер Б - 80% ацетонитрила в буфере А, элюция градиентом буфера Б от 20 до 80% за 30 мин со скоростью 1 мл/мин; детекция при 220 нм. Препаративную ВЭЖХ проводили на колонке Диасорб С16 130Т (25×250 мм), размер частиц сорбента 10 мкм. В качестве элюентов использовали буфер А -- 0.1% ТФА, буфер Б - 80% ацетонитрила в буфере А. Элюцию проводили градиентом 0.5% в минуту буфера Б в буфере А от 100% буфера А со скоростью 10 мл/мин. Пептиды детектировали при длине волны 220 нм.

1Н-ЯМР-спектры снимали на спектрометре WH-500 Bruker 500 МГц (Германия) в DMSO-d6 (дейтерированный диметилсульфоксид) при 300K, концентрация пептидов составляла 2-3 мг/мл, химические сдвиги измерялись относительно тетраметилсилана. Масс-спектры регистрировали на приборе VISION 2000, (Termobioanalysis corp., Finnigan, США), снабженном импульсным азотным лазером класса 3В с длиной волны излучения 337 нм, методом MALDI с использованием 2,4,6-тригидроксиацетофеноновой матрицы.

Синтез пептидного фрагмента хемокина TARC осуществляли по стандартной технологии синтеза на твердой фазе с использованием Fmoc-методологии. В качестве полимерного носителя использовали Fmoc-аминоацил-полимер Ванга - сополимер стирола с 1% дивинилбензола с гидроксиметилфеноксиметильной якорной группой, с размером частиц 200-400 меш фирмы Bachem (Швейцария). Содержание стартовой аминокислоты составляло 0.7 ммоль/г аминоацилполимера.

Синтез проводили на автоматическом пептидном синтезаторе Tribute-UV фирмы Protein Technologies (США) по стандартной программе для однократной конденсации 0.5 ммоль Fmoc-аминокислоты. Использовали 4-кратный избыток Fmoc-защищенных аминокислот по отношению к содержанию аминогрупп в полимере. Синтез проводили с С-конца в соответствии с протоколом автоматического синтезатора для конденсации методом TBTU/NMM (2-(1Н-бензотриазол-1-ил)-1,1,3,3-тетраметилурония тетрафторборат / N-метилморфолин). Для деблокирования α-аминогрупп в процессе твердофазного синтеза (ТФС) использовали раствор 10% 4-MePip и 2% DBU (1,8-диазабицикло[5.4.0]ундец-7-ен) в DMA (N,N-диметилацетамид).

Протокол твердофазного синтеза

По окончании ТФС пептидилполимер переносили из реактора на фильтр Шотта и промывали DMA (3×10 мл), DCM (3×10 мл), сушили на воздухе.

Заключительное деблокирование и отщепление пептида от полимера проводили в одну стадию путем обработки соответствующего пептидилполимера 10 мл смеси 95% TFA, 2.5% деионизованной воды, 2.5% TIBS в течение 1.5 ч. Затем полимер отфильтровывали, промывали 2×2 мл деблокирующей смесью, фильтрат упаривали и к остатку прибавляли сухой диэтиловый эфир. Осадок отфильтровывали, промывали DCM (3×3 мл), эфиром (3×5 мл), сушили в вакуум-эксикаторе. Сырой продукт ТФС содержал, по данным ВЭЖХ, около 80% основного вещества. Очистку полученного соединения проводили методом препаративной ВЭЖХ.

Структуру полученного соединения подтверждали данными 1H-ЯМР- спектроскопии и масс-спектрометрии в указанных выше условиях. Выход синтезированного фрагмента TARC 17-28 в расчете на стартовую аминокислоту, присоединенную к полимеру, составил 46.2%. Данные масс-спектрометрии: найдено m/z=1446.16, вычислено М=1445.79. Данные аналитической ВЭЖХ: время удерживания пептида (Rt) - 12.7 мин, чистота - 96.1%

Пример 2

Тестирование синтезированного пептида проводилось по оценке его влияния на миграцию клеток Т-лимфобластного лейкоза линии CEM.NKR, стимулированную TARC. Клетки были любезно предоставлены зав. лаб. иммунологии и клеточной биотехнологии РНПЦ эпидемиологии и микробиологии МЗ Республики Беларусь д.м.н. Гончаровым А.Е. Клетки культивировали в среде RPMI-1640 с добавлением 10% сыворотки плода коровы, 2 мМ глутамина, по 100 Ед/мл пенициллина и стрептомицина (все реактивы фирмы Invitrogen). Экспрессия клетками рецепторов CCR4 была подтверждена с помощью прямой иммунофлуоресценции (окрашивание антителами к CCR4, меченными фикоэритрином, eBioscience) и проточной цитометрии.

Миграционный ответ клеток оценивали в системе Трансвелл с диаметром пор 8 мкм для 24-луночных планшетов (Corning, NY). Для проведения эксперимента использовали среду RPMI-1640 с добавлением 1% сыворотки плода коровы. В нижнюю часть системы Трансвелл вносили 5 нМ раствор хемокина TARC (R&D Systems) в среде, либо среду без TARC (контроль). Пептид вносили в нижнюю часть системы Трансвелл до конечной концентрации 100 мкМ. 100 мкл суспензии клеток (10 млн/мл) помещали в верхнюю часть системы. Планшеты инкубировали в атмосфере 5% CO2 при 37°С в течение 18 часов. Клетки, промигрировавшие в нижнюю часть системы Трансвелл, подсчитывали в камере Горяева. Количество промигрировавших клеток выражали в относительных единицах (О.Е.), принимая за 1 О.Е. уровень спонтанной миграции клеток в контрольных образцах.

Для межгрупповых сравнений использовали U-критерий Манна-Уитни. Данные выражали как медиана (25; 75 процентили). Для обработки данных использовали программный пакет Statistica 7. Различия считали статистически значимыми при p<0,05.

В использованной модельной системе TARC стимулировал миграцию лимфоидных клеток. Количество клеток в нижней части Трансвелл было в 7-8 раз выше по сравнению с контролем. Полученный пептидный фрагмент хемокина TARC подавлял миграцию, индуцированную TARC, примерно в 2 раза, но не оказывал влияния на спонтанную подвижность клеток. Указанный пептид не оказывал влияния на миграцию клеток, стимулированную другими хемокинами, в частности, SDF-1 (данные не представлены).

На фиг. 1. показано влияние пептида H-Gly-Ala-Ile-Pro-Leu-Arg-Lys-Leu-Lys-Thr-Trp-Tyr-OH на миграцию клеток Т-лимфобластного лейкоза линии CEM.NKR, стимулированную хемокином TARC. Вдоль оси X расположены точки эксперимента. В верхнюю часть системы Трансвелл вносили суспензию клеток в среде RPMI-1640 с добавлением 1% сыворотки плода коровы. В нижнюю часть: такую же среду (контроль) (точка 1); хемокин TARC (5 нМ) (2); хемокин TARC (5 нМ) и пептид H-Gly-Ala-Ile-Pro-Leu-Arg-Lys-Leu-Lys-Thr-Trp-Tyr-OH (100 мкМ) (3); пептид H-Gly-Ala-Ile-Pro-Leu-Arg-Lys-Leu-Lys-Thr-Trp-Tyr-OH (100 мкМ) (4). По оси Y приведено количество промигрировавших клеток, выраженное в относительных единицах (О.Е.) 1 О.Е. - количество промигрировавших клеток в контрольных образцах.

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Imai Т., Yoshida Т., Baba М., Nishimura М., Kakizaki М., Yoshie О. // J. Biol. Chem. 1996. V. 271. P. 21514-21521.

2. Bonecchi R., Bianchi G., Bordignon P.P., D'Ambrosio D., Lang R., Borsatti A., Sozzani S., Allavena P., Gray P.A., Mantovani A., Sinigaglia F. // J. Exp. Med. 1998. V. 187. P. 129-134.

3. Sallusto F., Lenig D., Mackay C.R., Lanzavecchia A. // J. Exp. Med. 1998. V. 187. P. 875-883.

4. Imai Т., Nagira M., Takagi S., Kakizaki M., Nishimura M., Wang J., Gray P.W., Matsushima K., Yoshie O. // Int. Immunol. 1999. V. 11. P. 81-88.

5. Mosmann T.R., Sad S. // Immunol. Today. 1996. V. 17. P. 138-146.

6. Fujisawa, Т., Fujisawa, R., Kato, Y., Nakayama Т., Morita A., Katsumata PL, Nishimori H., Iguchi K., Kamiya H., Gray P.W., Chantry D., Suzuki R., Yoshie O. // J. Allergy Clin. Immunol. 2002. V. 110. P. 139-146.

7. Horikawa, Т., Nakayama, Т., Hikita, I., Yoshie O. // Int. Immunol. 2002. V. 14. P. 767-773.

8. Sekiya Т., Yamada H., Yamaguchi M., Ishii A., Yamamoto K., Morita A., Sano Y., Yoshie O., Matsushima K., Hirai K. // Allergy. 2002. V.57. P. 173-177.

9. Campbell, J.D., Stinson, M.J., Simons, F.E., HayGlass, K.T. // Int. Immunol. 2002. V. 14. P. 1255-1262.

10. Yoshie O, Fujisawa R, Nakayama T, Harasawa H., Tago H., Izawa D., Hieshima K., Tatsumi Y., Matsushima K., Hasegawa H., Kanamaru A., Kamihira S., Yamada Y. // Blood. 2002. V. 99. P. 1505-1511.

11. Ferenczi K., Fuhlbrigge R.C., Pinkus J., Pinkus G.S., Kupper T.S. // J. Invest. Dermatol. 2002. V. 119. P. 1405-1410.

12. Pease J.E. and Horuk R. // Expert Opin. Drug Discov. 2014. V. 9. P. 467-483.

13. Niwa, R., Shoji-Hosaka, E., Sakurada, Shinkawa Т., Uchida K., Nakamura K., Matsushima K., Ueda R., Hanai N., Shitara K. // Cancer Res. 2004. V. 64. P. 2127-2133.

14. Fmoc solid phase peptide synthesis. 2001. Ed. Chan, W.C., White, P.D. Oxford University Press, New York, USA. 346 p.

Похожие патенты RU2629198C1

название год авторы номер документа
ХИМЕРНЫЙ ЦИТОКИНОВЫЙ РЕЦЕПТОР 2016
  • Пюле, Мартин
  • Кордоба, Шон
  • Риги, Маттео
  • Силлибурн, Джеймс
  • Онуоха, Симоби
  • Томас, Саймон
RU2826122C1
МУЛЬТИРЕЦЕПТОРНЫЙ АГОНИСТ И ЕГО МЕДИЦИНСКОЕ ПРИМЕНЕНИЕ 2020
  • У Фанчжоу
  • Ван Лэй
  • Лю Сяо
  • У Жань
  • Хуа Хайцин
  • Бао Жуди
  • Ван Сяолэй
RU2816492C2
ПРОИЗВОДНЫЕ МАЙТАНЗИНОИДА С САМОРАСЩЕПЛЯЮЩИМИСЯ ПЕПТИДНЫМИ ЛИНКЕРАМИ И ИХ КОНЪЮГАТЫ 2018
  • Уиддисон, Уэйн, К.
RU2765098C2
АНТИТЕЛА, НАПРАВЛЕННЫЕ НА CD127 2015
  • Пуарье Николя
  • Мари Каролин
  • Ванхов Бернард
RU2734076C2
КОМПОЗИЦИИ ИММУНОГЕННЫХ/ТЕРАПЕВТИЧЕСКИХ ГЛИКОКОНЪЮГАТОВ И ИХ ПРИМЕНЕНИЯ 2015
  • Хсиех Их Хуан
  • Чэнь И-Цзюй
  • Ли Вэй-Хань
  • Ван Нань-Хсуань
  • Юй Чэн-Дер Тони
RU2720295C2
Антитела к TSLP человека и их применение 2021
  • Чжан Сюэпин
  • Лю Чжиган
  • Чжоу Сяовэй
  • Ху Цзюньцзе
  • Хао Сяобо
  • Лю Юйлань
RU2825460C1
IL-17A-СВЯЗЫВАЮЩИЕ ПЕПТИДЫ И ИХ ПРИМЕНЕНИЕ В МЕДИЦИНЕ 2019
  • Аллегретти, Марчелло
  • Арамини, Андреа
  • Беккари, Андреа
  • Гемеи, Марика
  • Мантелли, Флавио
RU2798229C2
СПОСОБЫ КУЛЬТИВИРОВАНИЯ КЛЕТОК И НАБОРЫ И УСТРОЙСТВО ДЛЯ НИХ 2016
  • Гермерот, Лотар
  • Штембергер, Кристиан
  • Греф, Патриция
  • Башур, Кинан
RU2761557C2
Химерные белки на основе утрофина и дистрофина человека и их применение для лечения миодистрофии Дюшенна 2021
  • Галкин Иван Ильич
  • Егорова Татьяна Владимировна
  • Старикова Анна Вячеславовна
  • Поликарпова Анна Вадимовна
  • Скопенкова Виктория Валерьевна
RU2767335C1
НЕОАНТИГЕНЫ И ИХ ПРИМЕНЕНИЕ 2019
  • Джунеджа, Викрам
  • Донг, Чжэнсинь
  • Изерт, Робин Джессика
RU2813924C2

Иллюстрации к изобретению RU 2 629 198 C1

Реферат патента 2017 года Пептид, обладающий способностью ингибировать миграцию клеток, стимулированную белком TARC

Изобретение относится к биологически активным пептидам. Предложен пептид формулы H-Gly-Ala-Ile-Pro-Leu-Arg-Lys-Leu-Lys-Thr-Trp-Tyr-OH, обладающий способностью ингибировать миграцию клеток, стимулированную хемокином TARC, и способ его получения. 2 н.п. ф-лы, 1 ил., 2 пр.

Формула изобретения RU 2 629 198 C1

1. Пептид формулы H-Gly-Ala-Ile-Pro-Leu-Arg-Lys-Leu-Lys-Thr-Trp-Tyr-ОН, обладающий способностью ингибировать миграцию клеток, стимулированную хемокином TARC.

2. Способ получения пептида по п. 1 твердофазным методом с использованием Fmoc-аминокислот.

Документы, цитированные в отчете о поиске Патент 2017 года RU2629198C1

US 6881406 B2, 19.04.2005
Basu, Shrabani et al "Molecular cloning and sequencing of 25 different rhesus macaque chemokine cDNAS reveals evolutionary conservation among C, CC, CXC, and CX3C families of chemokines
Cytokine+, 18(3), 140-148, 2002
Печь-кухня, могущая работать, как самостоятельно, так и в комбинации с разного рода нагревательными приборами 1921
  • Богач В.И.
SU10A1
Арефьева Т.И
"Миграция лейкоцитов и способы ее регуляции при атеросклерозе", АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени доктора биологических наук, МОСКВА, 2013.

RU 2 629 198 C1

Авторы

Азьмуко Андрей Андреевич

Арефьева Татьяна Игоревна

Красникова Татьяна Леонидовна

Молокоедов Александр Сергеевич

Овчинников Михаил Владимирович

Палькеева Марина Евгеньевна

Пылаева Екатерина Алексеевна

Радюхина Наталья Владимировна

Сидорова Мария Владимировна

Даты

2017-08-25Публикация

2016-06-21Подача