Область изобретения
Настоящее изобретение относится к штаммам вируса, генетически модифицированным из нового штамма метапневмовируса человека.
Настоящее изобретение относится к данным модифицированным штаммам, вирулентность которых ослаблена, для их применения в профилактическом или терапевтическом лечении вирусных инфекций, вызываемых вирусами семейства Pneumoviridae,a также вакцинным композициям, содержащим указанные модифицированные штаммы вируса.
Введение
Острые инфекции нижних дыхательных путей представляют собой одну из главных причин заболеваемости и смертности в мировом масштабе. У детей в возрасте менее 5 лет, в частности, они представляют вплоть до более чем 15% смертности, в зависимости от оцениваемых стран, и таким образом являются второй причиной смертности согласно Всемирной Организацией Здравоохранения.
Большинство острых инфекций нижних дыхательных путей, ассоциированных с различными патологиями, находящимися в диапазоне от простой простуды до серьезной пневмонии, значительным образом вызвано вирусами, такими как вирусы, принадлежащие к следующим семействам:
(i) вирус семейства Orthomyxoviridae (в частности, содержащего вирусы гриппа);
(ii) вирус семейства Paramyxoviridae;
(iii) вирус семейства Adenoviridae;
(iv) вирус семейства Picornaviridae;
(v) вирус семейства Coronaviridae и
(vi) вирус семейства Pneumoviridae, в частности, содержащего респираторно-синцитиальный вирус человека и метапневмовирус человека.
Респираторно-синцитиальный вирус человека (hRSV - от англ. human syncytial respiratory virus) и метапневмовирус человека (hMPV - от англ. human metapneumovirus) представляют собой вирусы, обуславливающие острые инфекции дыхательных путей, такие как бронхиолиты, бронхиты или пневмонии. Они главным образом подвергают опасности группы населения, которые представляют собой меленьких детей, в возрасте меньше чем 5 лет, пожилых людей и индивидов с подавленным иммунитетом.
hRSV является главным этиологическим агентом бронхиолитов и пневмоний у младенцев в возрасте меньше чем 1 год, с повышенной частотой встречаемости в возрасте меньше 6 месяцев. У взрослых инфицирование hRSV является редким и слабым, за исключением пожилых субъектов. Передача по существу происходит через дыхательные пути, в результате репликации вируса в дыхательных путях.
hRSV был выделен в 1957 году. Он представляет собой вирус с одноцепочечной РНК отрицательной полярности, «оболочечного типа», с капсидом спиралевидной симметрии. Он принадлежит к семейству Pneumoviridae и к роду Orthopneumovirus.
hMPV широко распространен при бронхиолитах и пневмониях у младенцев и в частности тяжело воздействует на детей в возрасте от 1 до 3 лет.
Основные симптомы инфицирования hMPV у детей включают ринорею, кашель, респираторный дистресс или в качестве альтернативы лихорадку. hMPV может также вызывать инфекции верхних дыхательных путей, будучи способным быть ассоциированным с ушными инфекциями, тогда как нереспираторные симптомы, такие как диарея, рвота и возникновение эритемы, являются редкими. hMPV предпочтительно нацелен на реснитчатые клетки респираторного дерева человека.
Инфицирование hMPV вызывает гистопатологические модификации в легких организма-хозяина и оказывает в частности следующее физиологическое действие:
- повреждение на уровне дыхательного эпителия;
- избыточная продукция слизи и
- острое воспаление, главным образом на уровне промежуточных легочных тканей, связанное с важной секрецией провоспалительных цитокинов и хемокинов.
При патологиях дыхательных путей у взрослых hMPV идентифицирован у 5 -10% взрослых или пожилых людей, имеющих острую инфекцию дыхательных путей, и у 3-5% взрослых, имеющих обострение хронической легочной патологии или пневмонии, приобретенной в обществе.
hMPV был выделен и описан впервые в 2001 году в Нидерландах (van den Hoogen et al., 2001). В следующим году несколько штаммов hMPV выделяли у пациентов, находящихся в Северной Америке (Peret et al., 2002). hMPV представляют собой вирусы с отрицательной одноцепочечной РНК, принадлежащие к семейству Pneumoviridae и к роду Metapneumovirus.
Средний возраст детей, госпитализированных вследствие осложнений инфекции, вызванной hMPV, составляет от 6 до 12 месяцев, а именно старше чем в случае инфекции, вызванной hRSV, которая главным образом встречается в возрасте от 0 до 3 месяцев. Однако, эпидемиология hMPV имеет целый ряд общих точек с эпидемиологией hRSV:
- он присутствует на всех континентах;
- его годовое распространение главным образом происходит зимой и весной, перекрываясь с распространением hRSV;
- его передача, возможно, также происходит посредством капель слюны.
На сегодняшний момент на рынке не существует профилактического или терапевтического воздействия, которое было бы эффективным и специфичным в отношении инфекции, вызываемой вирусами hRSV и hMPV, несмотря на то, что проводится активное исследование (Mazur et al., 2018).
Для лечения рибавирин, не освобожденный от нежелательных эффектов, или внутривенные иммуноглобулины, очень дорогие, могут использоваться иногда в серьезных случаях инфекций, вызванных hMPV или hRSV. В настоящее время разрабатываются другие типы лечений, такие как применение слитых пептидов-ингибиторов, сульфатированных гликозаминогликанов, интерферирующих РНК и некоторых иммуномодуляторов.
Обычный и широко предпочитаемый в настоящее время клинический подход заключается в лечении главным образом симптомов инфекции, одновременно помещая пациентов на искусственное дыхание (введение кислорода или механическая вентиляция) и посредством введения им бронхолитиков, кортикостероидов и/или антибиотиков для предупреждения или лечения бактериальных суперинфекций.
В отношении вакцинации групп населения, особенно подвергающихся воздействию hMPV, представляющих собой младенцев, маленьких детей и пожилых, крайне важно иметь незамедлительно безопасные и эффективные вакцины для уменьшения тяжести поражения дыхательных путей, которые оказывают сильное действие в данных возрастных диапазонах.
Разработка вакцины против hRSV и hMPV, таким образом, представляет не только сложную задачу, касающуюся здоровья, но также реальный социоэкономический вопрос с целью уменьшения высокой стоимости лечения и госпитализаций, ассоциированных с данными инфекциями, и сокращения применения антибиотиков в контексте бактериальных суперинфекций и, таким образом, ограничения возникновения устойчивости.
Предшествующий уровень техники
В Таблицах 1, 2 и 3 ниже перечислены разные подходы, находящиеся в разработке, для получения живых ослабленных вакцин из диких штаммов hMPV.
Штаммы вирусов считаются ослабленными in vitro, когда они демонстрируют пониженную способность к репликации, по сравнению с вирусом дикого типа (WT -от англ. wild type), и/или когда данные штаммы вируса приводят к более ограниченному образованию вспышек инфекции, в частности, синцития (соседние клетки, сливающиеся после инфицирования вирусом). In vivo, ослабленные штаммы вируса реплицируются при более низкой максимальной нагрузке и/или вызывают менее тяжелую патологию (с точки зрения потери массы или профиля воспаления, или гистопатологического повреждения), чем дикий штамм вируса.
Термин «Vero» обозначает линию клеток почки африканской зеленой мартышки, широко используемую в клеточной культуре для тестирования разных вирусов.
Термин «LLC-MK2» обозначает клеточную линию, происходящую из клеток почки макак-резусов, используемую для анализов инфекции, вызванной разными вирусами.
Символ указывает на то, что исследуемые клетки подвержены инфицированию вирусом.
Следующие сокращения используют для моделей исследования in vivo: М в случае мыши; Н в случае хомяка; CR в случае хлопковой крысы; СМ в случае яванского макака; AGM в случае африканской зеленой мартышки; Ch в случае шимпанзе; Rh в случае макака-резуса; и SCID в случае тяжелого комбинированного иммунодефицита (от англ. Severe Combined Immuno Deficiency).
Все анализируемые ослабленные штаммы вируса происходят из дикого штамма CAN97-83 подгруппы А2.
Международная заявка WO 2005/014626 относится к нескольким штаммам hMPV, обозначаемым следующими обозначениями: CAN 97-83, CAN 98-75 и HMPV 00-1. В данной заявке описан штамм рекомбинантного hMPV, обозначаемый CAN 97-83, генетически модифицированный для ослабления его вирулентности. Предложенные модификации в особенности относятся к полному удалению генов, кодирующих белки G и/или SH. Модифицированные штаммы вирусов могут быть использованы в терапии человека, для предупреждения или лечения инфекций, вызванных пневмовирусами. Введение дикого штамма или данных ослабленных штаммов хомякам делает возможным защитить их впоследствии от инфекции CAN97-83 hMPV. Однако, в WO 2005/014626 не упоминается обо всех защитных свойствах, в частности, не проведен контроль над массой обработанных животных. Такие же результаты эксперимента описаны в научных статьях, приведенных в таблице 2.
С теми же ослабленными штаммами, далее были получены результаты in vivo на животной модели обезьяны; штаммы рекомбинантного вируса с удаленными генами SH, G и М2-2 продолжают реплицироваться в дыхательных путях обезьян; и, кроме того, вызывают продукцию нейтрализующих антител, ровно как дикий штамм вируса CAN97-83.
Другие выделенные штаммы hMPV описаны в патенте США 8841433, также предложено их применение для получения вакцин.
Вакцины на основе применения ослабленных штаммов живых вирусов имеют целый ряд преимуществ.
С одной стороны, вакцины, полученные из ослабленных живых вирусов, имеют преимущество, заключающееся в том, что они вызывают сильный иммунный ответ на вирус, чья способность размножаться значимо снижена, таким образом, делая возможным избежать возникновения патологии, одновременно имитируя природную инфекцию. Во время разработки данных ослабленных штаммов важно найти идеальное равновесие между ослаблением и иммуногенностью.
С другой стороны, данные вакцины могут быть введены интраназальным путем, и таким образом имитируют природный способ поступления диких вирусов, таким образом, вызывая иммунный ответ, довольно похожий на физиологический ответ на инфекцию.
Кроме того, данная стратегия вакцинации не вызывает усиленной воспалительной реакции, как может происходить с инактивированными вакцинами. Наконец, добавление адъюванта обычно не является необходимым.
Таким образом, это является оптимальной стратегией вакцинирования для профилактики у групп населения, находящихся в группе риска, таких как маленькие дети и младенцы.
Описание изобретения
Предметом изобретения является ослабленный штамм вируса, происходящий из конкретного клинического штамма rC-85473 человеческого мета пне в мо в и руса, содержащий последовательность генома, представленную последовательностью SEQ ID NO. 1, причем указанный ослабленный штамм содержит одну или более генетических модификаций указанной последовательности SEQ ID NO. 1, ослабляющих вирулентность указанного штамма.
Ослабленные штаммы вируса согласно изобретению, в частности, представляют собой рекомбинантные штаммы, модифицированные посредством инактивации или удаления по меньшей мере одного гена, кодирующего один из акцессорных белков G и SH, с получением рекомбинантных вирусов, обозначаемых ΔG rC-85473 и ΔSH rC-85473, соответственно.
Более конкретно, предмет настоящего изобретения представляет собой ослабленный штамм вируса, происходящий из клинического штамма мета пне в мо в и руса человека, содержащего последовательность генома, представленную последовательностью SEQ ID NO. 1, причем указанный ослабленный штамм содержит по меньшей мере одну генетическую мутацию, выбранную из: инактивации гена, кодирующего акцессорный белок G, и инактивации гена, кодирующего акцессорный белок SH.
Данные штаммы отличались в отношении их инфекционности и их вирусной репликации в in vitro (линия клеток LLC-MK2) и ex vivo (восстановленный дыхательный эпителий человека, культивируемый на границе раздела воздух-жидкость) клеточных моделях, а также в отношении патогенеза вируса и их свойства вакцинной защиты в мышиной модели инфицирования hMPV.
Результаты, представленные в экспериментальном разделе, подчеркивают специфичные свойства данных штаммов вируса ΔG rC-85473 и ΔSH rC-85473, в сравнении со свойствами штаммов вирусов, модифицированных похожим путем, также с удаленными генами G или SH, но происходящих из другого клинического штамма hMPV (CAN98-75).
Вирусы ΔG или ΔSH rC-85473 имеют, в частности, следующее:
(i) характерный признак ослабленного вируса в мышиной модели, в отличие от рекомбинантного вируса ΔSH CAN98-75, который, в свою очередь, является очень вирулентным;
(ii) при сохранении их способности к репликации в системах связывания клеток (референсная линия LLC-MK2) и в суспензии, в отличие от рекомбинантных вирусов CAN98-75, которые гораздо менее продуктивны;
(iii) вирусы ΔG или ΔSH C-85473 преимущественно обладают следующими значимыми защитными свойствами: 100% выживаемость инфицированных мышей, маленькая потеря массы, индукция ответа, опосредованного нейтрализующими антителами, на гомологичный штамм вируса С-85473, серотип А) и по меньшей мере на один гетерологичный штамм (CAN98-75, серотип В), а также уменьшенный легочный патогенез у инфицированных животных, по сравнению с инфекционной стимуляцией, вызываемой диким hMPV (штамм rC-85473), который вызывает 50%-ную летальность в неиммунизированных контрольных группах.
Данный ослабленный штамм вируса может использоваться in vivo, ex vivo и in vitro как экспрессионный вектор по меньшей мере одного экзогенного гена, в частности, гена, кодирующего вирусный антиген и, кроме того, вирусные антигены, происходящие из респираторно-синцитиального вируса человека (hRSV) и, в частности, его слитый белок F.
Изобретение также относится к данному ослабленному штамму вируса для его применения в качестве лекарственного средства, и более конкретно для предупреждения и/или лечения инфекций, вызываемых вирусами семейства Pneumoviridae.
Наконец, изобретение также относится к вакцинной композиции, содержащей, в фармацевтически приемлемом носителе, по меньшей мере один ослабленный штамм вируса, такой как определено выше, и возможно адъювант.
Описание графических материалов
Фиг. 1. Рекомбинантные hMPV, полученные из клинических штаммов С-85473 и CAN98-75
[Фиг. 1А] Схематичное представление генома рекомбинантных вирусов, полученных посредством обратной генетики из клинического штамма С-85473, и в который клонирована кодирующая последовательность GFP (от англ. Green Fluorescent Protein - зеленый флуоресцентный белок) на своем 3' конце. Вирус rC-85473 содержит геном дикого штамма С-85473, экспрессирующий, кроме того, ген GFP. Геномы рекомбинантных вирусов, происходящих из штамма С-85473 и с удаленными генами SH (ΔSH-rC-85473) или G (ΔG-rC-85473), представлены ниже. Генетически модифицированные вирусы являются функциональными и репликативными, как например, показано на изображениях клеток LLC-MK2, инфицированных данными вирусами с множественностью инфекции (MOI - от англ. Multiplicity of Infection) 0,01, и за ними наблюдали посредством флуоресцентной микроскопии через трое суток после инфицирования.
[Фиг. 1В] Схематичное представление генома рекомбинантных вирусов, полученных посредством обратной генетики из клинического штамма CAN98-75, и в который клонирована кодирующая последовательность GFP (зеленый флуоресцентный белок). Вирус rCAN98-75 содержит геном дикого штамма CAN98-75, экспрессирующий, кроме того, ген GFP на своем 3' конце. Геномы рекомбинантных вирусов, происходящих из штамма CAN98-75 и с удаленными генами SH (ΔSH-rCAN98-75) или G (ΔG-rCAN98-75), представлены ниже. Генетически модифицированные вирусы являются функциональными и репликативными, как например, показано на изображениях клеток LLC-MK2, инфицированных данными вирусами с MOI 0,01, и за ними наблюдали посредством флуоресцентной микроскопии через трое суток после инфицирования.
Фиг 2. In vitro способности к репликации штаммов вируса rC-85473 и rCAN98-75 и штаммов, происходящих из них.
[Фиг. 2А] Вирусная нагрузка, оцениваемая по TCID50 (от англ. Tissue Culture Infections Dose - доза заражения 50% культуры ткани)/мл в супернатантах клеток, собираемых каждые сутки на протяжении 7 суток после инфицирования клеток LLC-MK2 рекомбинантными вирусами rCAN98-75 (черные кружки), ΔSH-rCAN 98-75 (черные квадраты) и ΔG-rCAN98-75 (черные треугольники) с множественностью инфекции (MOI) 0,01.
[Фиг. 2В] Вирусная нагрузка, оцениваемая посредством TCID50/мл в супернатантах клеток, собираемых каждые сутки на протяжении 7 суток после инфицирования клеток LLC-MK2 рекомбинантными вирусами rC-85473 (черные кружки), ΔSН-rC-85473 (черные квадраты) и ΔG-rC-85473 (черные треугольники) с множественностью инфекции (MOI) 0,01.
** р меньше 0,01 и *** р меньше 0,001 (двухфакторные дисперсионные анализы).
Фиг 3: In vivo характеристика рекомбинантных hMPV rCAN98-75 и rC-85473 посредством инфицирования мышей BALB/c: кривые массы и вирусные нагрузки легкого через 5 суток после инфицирования.
[Фиг. 3А] Мышей BALB/c инфицировали посредством интраназальной инстилляции культуральной среды OptiMem («имитационный» отрицательный контроль, черные треугольники) или 2,5×105 БОЕ (бляшкообразующая единица) рекомбинантных вирусов rCAN98-75 (черные кружки), ΔSH-rCAN98-75 (серые квадраты) и ΔG-rCAN98-75 (серые треугольники). Массу и выживаемость мышей контролировали ежесуточно на протяжении 14 суток.
[Фиг. 3В] Через 5 суток после инфицирования 5 мышей на группу (за исключением группы отрицательного контроля) подвергались умерщвлению для измерения вирусных нагрузок при легочной инфекции TCID50/грамм легкого.
[Фиг. 3С] Мышей BALB/c инфицировали посредством интраназальной инстилляции культуральной среды OptiMem («имитационный» отрицательный контроль, черные ромбы) или 5×105 TCID50 рекомбинантных вирусов rC-85473 (черные кружки), ΔSH-rC-85473 (серые квадраты) и ΔG-rC-85473 (серые треугольники). Массу и выживаемость мышей контролировали ежесуточно на протяжении 14 суток.
[Фиг. 3D] Через 5 суток после инфицирования 5 мышей на группу (за исключением группы отрицательного контроля) подвергались умерщвлению для измерения вирусных нагрузок при легочной инфекции ТСЮ50/грамм легкого.
Статистические критерии: двухфакторные дисперсионные анализы для сравнения каждого вируса с условием «имитации». * р меньше 0,05, ** р меньше 0,01 и *** р меньше 0,001.
Фиг. 4: In vivo защитные свойства рекомбинантных hMPV ΔG-rC-85473 и ΔSH-rC-85473 в модели инфекционной стимуляции мышей BALB/c.
[Фиг. 4А] Диаграмма протокола иммунизации (наверху) с последующим протоколом инфекционной стимуляции (внизу). Летальная доза соответствует 1×106 TCID50.
[Фиг. 4В] Инфекционная стимуляция мышей, иммунизированных штаммами вируса rC-85473 (черные кружки), ΔSH-rC-85473 (серые квадраты) или ΔG-rC-85473 (серые треугольники) или неиммунизированных («имитация», черные треугольники)
Через 21 сутки после иммунизации мышей инфицировали посредством интраназальной инстилляции летальной дозы (1×106 TCID50) дикого вируса rC-85473. Их массу отслеживали ежесуточно на протяжении 14 суток.
[Фиг. 4С] Кривые выживаемости мышей разных групп иммунизированных мышей после стимуляции.
«Имитационные» неиммунизированные мыши имеют только 50%-ную выживаемость; мыши, иммунизированные рекомбинантными вирусами rC-85473, ΔSH-rC-85473 или ΔG-rC-85473, имеют 100%-ную выживаемость.
[Фиг. 4D] Через 5 суток после инфекционной стимуляции (а именно, в сутки 26 после иммунизации) 4 мыши каждой группы подвергались умерщвлению для измерения их вирусных нагрузок при инфицировании легкого TCID50/г легкого, «н.в.» означает не выявляемый.
[Фиг. 4Е] Через 5 суток после инфекционной стимуляции (а именно, в сутки 26 после иммунизации) 4 мыши каждой группы подвергались умерщвлению для измерения их вирусных нагрузок при инфицировании легкого посредством ОТ-кПЦР (количественная полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией) (ген N).
Статистические критерии: двухфакторные дисперсионные анализы для сравнения каждого вируса с условием имитации. * р меньше 0,05, ** р меньше 0,01 и *** р меньше 0,001.
Фиг. 5: In vitro способности рекомбинантных вирусов rC-85473 и rCAN98-75 и их версий с делецией к связыванию с клеткой
[Фиг. 5А] Процентное содержание клеток LLC-MK2, в зависимости от времени связывания, инфицированных вирусом rCAN98-75 (кружки) и его ослабленными формами ΔSH-rCAN98-75 (квадраты) и ΔG-rCAN98-75 (треугольники).
[Фиг. 5В] Процентное содержание клеток LLC-MK2, в зависимости от времени связывания, инфицированных вирусом rC-85473 (кружки) и его ослабленными формами ΔSH-rC-85473 (квадраты) и ΔG-rC-85473 (треугольники).
Фиг. 6: Ex vivo способности к репликации рекомбинантных вирусов rC-85473 и rCAN98-75 на 3D модели восстановленного дыхательного эпителия человека и при культивировании на границе раздела воздух-жидкость.
[Фиг. 6А] Модели дыхательного эпителия человека в культуре инфицировали рекомбинантными вирусами rCAN98-75, ΔSH-rCAN98-75 и ΔG-rCAN98-75 (фотографии верхнего ряда) или рекомбинантными вирусами rC-85473 (белый), ΔSH-rC-85473 (темно-серый) и ΔG-rC-85473 (не поддающийся определению) (фотографии нижнего ряда).
[Фиг. 6В] Количественная оценка измеряемого потомства вируса (посредством количественной оценки вирусного генома) на апикальной поверхности эпителия, инфицированного рекомбинантными вирусами rCAN98-75 (WT, белый), ΔSH-rCAN98-75 (темно-серый) и ΔG-rCAN98-75 (светло-серый) (слева от пунктирной линии), или рекомбинантными вирусами rC-85473 (WT), ΔSH-rC-85473 и ΔG-rC-85473 (справа от пунктирной линии).
[Фиг. 6С] Количественная оценка генома вируса, находящегося в эпителии, инфицированном рекомбинантными вирусами rCAN98-75 (WT, белый), ΔSH-rCAN98-75 и ΔG-rCAN98-75 (слева от пунктирной линии), или рекомбинантными вирусами rC-85473 (WT, белый), ΔSH-rC-85473 и ΔG-rC-85473 (справа от пунктирной линии).
Фиг. 7. Секреция цитокинов и хемокинов, индуцированная инфицированием рекомбинантными вирусами rC-85473, на 3D модели восстановленного дыхательного эпителия человека и при культивировании на границе раздела воздух-жидкость.
Восстановленный дыхательный эпителий человека (MucilAir® НАЕ, Epithelix) инфицировали рекомбинантными вирусами rC-85473, ΔSH-rC-85473 и ΔG-rC-85473 при MOI 0,1. Спустя 5 суток после инфицирования, количество нескольких цитокинов и хемокинов измеряют посредством методики Luminex (Bio Plex Pro kit assay, BioRad) из основной среды инфицированного эпителия:
[Фиг. 7А] Хемокины МСР-1, IP-10, RANTES, IL-8, Т-лимфоцит привлекающий G-CSF (от англ. Granulocyte colony-stimulating factor - Гранулоцитарный колониестимулирующий фактор), моноциты/макрофаги, эозинофилы и/или нейтрофилы.
[Фиг. 7В] Количественная оценка провоспалительных цитокинов IFN-γ (от англ. interferon gamma - интерферон гамма) и TNF-α (от англ. tumour necrosis factor alpha - фактор некроза опухоли-альфа).
[Фиг. 7С] Количественная оценка цитокина IL-7, стимулирующего дифференцировку Т- и В-лимфоцитов.
[Фиг. 7D] Фактор роста FGF (от англ. fibroblast growth factor - фактор роста фибробластов), участвующий в восстановлении тканей.
Статистические критерии: однофакторный дисперсионный анализ для сравнения вирусов ΔSH-rC-85473 и ΔG-rC-85473 с вирусом rC-85473. *, р меньше 0,05, ** р меньше 0,01 и *** р меньше 0,001.
Фиг. 8. In vitro индуцированная вирусом секреция провоспалительных цитокинов 11-1β и TNF-α в модели иммортализованных мышиных макрофагов, инфицированных рекомбинантными hMPV rC-85473.
[Фиг. 8А] Оцениваемая вирусная нагрузка в БОЕ/мл в супернатантах клеток, собираемых каждые сутки на протяжении 2 суток после инфицирования клеточной линии иммортализованных мышиных макрофагов (линия BMDM, происходящая из костного мозга диких мышей), рекомбинантными вирусами rC-85473 (черный), ΔSH-rC-85473 (темно-серый) или ΔG-rC-85473 (светло-серый) при MOI 0,1.
[Фиг. 8В] Количество провоспалительного цитокина TNF-α, оцениваемого посредством анализа ELISA (от англ. enzyme-linked immunosorbent assay -твердофазный иммуноферментный анализ), из клеточных супернатантов, собираемых каждые сутки на протяжении 2 суток после инфицирования иммортализованных мышиных макрофагов рекомбинантными вирусами rC-85473 (черный), ΔSН-rC-85473 (темно-серый) или ΔG-rC-85473 (светло-серый) при MOI 0,1, в сравнении с неинфицированными «имитационными» иммортализованными мышиными макрофагами (белый).
[Фиг. 8С] Количество провоспалительного цитокина IL-1β, оцениваемого посредством анализа ELISA, из клеточных супернатантов, собираемых каждые сутки на протяжении 2 суток после инфицирования иммортализованных мышиных макрофагов рекомбинантными вирусами rC-85473 (черный), ΔSH-rC-85473 (темно-серый) или ΔG-rC-85473 (светло-серый) при MOI 0,1, в сравнении с неинфицированными «имитационными» иммортализованными мышиными макрофагами (белый).
Статистические критерии: двухфакторный дисперсионный анализ для сравнения вирусов ΔSН-rC-85473 и ΔG-rC-85473 с вирусом rC-85473. * р меньше 0,05 и ** р мкньше 0,01.
Фиг. 9. Воспаление легких и рекрутинг клеток иммунной системы в месте инфицирования in vivo, через 5 суток после инфицирования мышей BALB/c рекомбинантными hMPV rC-85473, ΔSH-rC-85473 и ΔG-rC-85473 (воспаление легких исключительно в случае ΔG-rC-85473).
[Фиг. 9А] Совокупный балльный показатель гистопатологии легкого, рассчитываемый в соответствии с оценкой интенсивности воспаления бронхиальных/эндобронхиальных, перибронхиальных, периваскулярных, интерстициальных, плевральных и внутриальвеолярных тканей легких мышей BALB/c, инфицированных вирусами rC-85473 (черный), ΔSH-rC-85473 (темно-серый), ΔG-rC-85473 (светло-серый) или «имитационных» неинфицированных, причем указанные ткани собирают и фиксируют посредством формальдегида через 5 суток после инфицирования вирусом.
[Фиг. 9В] Фенотипирование иммунных клеток, определяемое с помощью иммуномечения (антитела против CD45, против CD11b, против CD170, против Ly6C, против Ly6G, против CD11c, против CD115, против В220, против CD3ε, против CD4, против CD8a) посредством проточной цитометрии, из лизатов легких мышей BALB/c, инфицированных вирусами rC-85473 и ΔSH-rC-85473, спустя 5 суток после инфицирования. Рекрутированные клетки иммунной системы подразделяют на четыре категории: CD8+ Т-лимфоциты (CD8+ Т-клетки), CD4+ Т-лимфоциты (CD4+ Т-клетки), моноциты/макрофаги и нейтрофилы.
Статистические критерии: однофакторный дисперсионный анализ для сравнения вирусов ΔSH-rC-85473 и ΔG-rC-85473 с вирусом rC-85473. ** р меньше 0,01 и *** р меньше 0,001.
Фиг. 10. Характеристика in vivo вторичного иммунного ответа в мышиной модели BALB/c, иммунизированной рекомбинантными hMPV ΔG-C-85473 и ΔSH-C-85473, после инфекционной стимуляции.
Через 1 и/или 5 суток после инфекционной стимуляции вирусом WT rC-85473, как например, описано на Фиг. 4А, количество нескольких цитокинов и хемокинов измеряют методикой Luminex (BioPlex Pro kit assay, BioRad) из лизатов легкого [Фиг. 10А-С]; фенотипирование клеток иммунной системы, инфильтрированных в ткань легкого, определяют с помощью иммуномечения (антитела против CD45, против Ly6G, против CD11b, против CD170/Siglec-F, против Ly6C, против CD11c, против F4/80, против В220, против CD3ε, против CD4 и против CD8a) посредством проточной цитометрии, из лизатов легкого [Фиг. 10D-F]; и совокупный балльный показатель гистопатологии легкого рассчитывают в соответствии с оценкой интенсивности воспаления бронхиальных/эндобронхиальных, перибронхиальных, периваскулярных, интерстициальных, плевральных и внутриальвеолярных тканей легких мышей, фиксированных с помощью формальдегида [Фиг. 10G].
На Фиг. 10А-10G представлены:
- черным, группа мышей BALB/c, иммунизированных вирусом rC-85473;
- темно-серым, группа, иммунизированная вирусом ΔSH-C-85473;
- светло-серым, группа, иммунизированная вирусом ΔG-C-85473;
- и, если представлено, белым так называемая «имитационная» неиммунизированная группа.
N равен 2 или 3 мыши/группа, соответственно, в случае гистопатологических анализов или анализов секреции цитокинов/рекрутинга клеток.
Статистические критерии: двухфакторный дисперсионный анализ для сравнения каждой группы друг с другом * р меньше 0,05, ** р меньше 0,01 и *** р меньше 0,001.
[Фиг. 10А] Количественная оценка провоспалительных цитокинов IL-6 и IFN-y, после 1 и 5 суток инфекционной стимуляции.
[Фиг. 10В] Количественная оценка противовоспалительного цитокина IL-10, после 1 и 5 суток инфекционной стимуляции.
[Фиг. 10С] Количественная оценка привлечения хемокинов G-CSF, МСР-1, М1Р-1α и MIP-1β и стимуляции активации и дифференцировки иммунных клеток после 1 и 5 суток инфекционного стимулирования.
[Фиг. 10D] Количественная оценка CD8+ и CD4+ Т-лимфоцитов, инфильтрированных в ткань легкого мышей BALB/c, после 1 и 5 суток инфекционного стимулирования.
[Фиг. 10Е] Количественная оценка В-лимфоцитов, инфильтрированных в ткань легкого мышей BALB/c, после 1 и 5 суток инфекционного стимулирования.
[Фиг. 10F] Количественная оценка макрофагов и нейтрофилов, инфильтрированных в ткань легкого мышей BALB/c, после 1 и 5 суток инфекционного стимулирования.
[Фиг. 10G] Совокупный балльный показатель, после 5 суток инфекционного стимулирования.
Подробное описание изобретения
Вирусные штаммы метапневмовируса человека (hMPV)
hMPV идентифицировали в 2001 году, как являющиеся частью семейства Pneumoviridae.
Организация генома hMPV аналогична hRSV. Он подразделен на несколько ORF (от англ. Open Reading Frames - открытые рамки считывания), кодирующих белки N, Р, М, F, М2 (М2-1 и М2-2), SH, G и L. Общая структура генома представлена для вирусов rC-8543 и rCAN98-75 на фиг. 1А и 1В.
Вирусы - члены семейства Pneumoviridae экспрессируют на своей поверхности три гликопротеина, обозначаемых белками F, G и SH.
Слитый гликопротеин F, высококонсервативный среди разных подгрупп hMPV, участвует в проникновении вируса в клетки-мишени и образовании синцития, иными словами, больших многоядерных клеток, полученных в результате слияния отдельных клеток после их инфицирования вирусом. Также считается, что гликопротеин F является главным антигеном вирусов hRSV и hMPV, делая возможным индуцировать продукцию нейтрализующих антител.
Белок G представляет собой мембранный белок типа II, причем его С-концевой конец находится снаружи от клетки. Данный белок не является существенным для сборки вирусных компонентов и для репликации in vitro. В случае hRSV показано, что удаление гена, кодирующего данный белок, ослабляло вирулентность штамма во время инфицирования дыхательных путей мышей.
Белок SH также представляет собой мембранный белок типа II, функция которого в вирусном цикле все еще является неизвестной. В случае hRSV удаление гена, кодирующего белок SH, генерирует рекомбинантный вирус, способный к размножению in vitro, и вирулентность которого ослаблена в верхних дыхательных путях мышей, но не в нижней части указанных путей.
Генетический анализ клинических штаммов hMPV сделал возможным определить две главные группы (серотипы А и В) и четыре «небольшие» подгруппы (А1, А2, В1 и В2), главным образом в зависимости от вариабельности последовательности гликопротеинов поверхностного связывания (G) и слитых гликопротеинов (F). Затем было показано, что данные группы опять же могут быть подразделены на сублинии, такие как А2а и A2b (Huck et al., 2006).
Среди широко изученных штаммов вирусов можно привести штамм NL 00-1, принадлежащий к серотипу А1; штамм CAN 97-83, принадлежащий к серотипу А2; и штамм CAN 98-75, принадлежащий к серотипу В2.
В основе настоящего изобретения лежит вирусный штамм метапневмовируса человека, обозначаемый rC-85473, выделенный из образца пациента в Канаде, на который, в частности, ссылаются в статье (Hamelin et al., 2010).
Применение белка F данного штамма, в комбинации с белком М, было предложено в качестве стратегии вакцинации (Aerts et al., 2015а).
Применение данного штамма вируса rC-85473, инактивированного обработкой формалином, в качестве инактивированного живого вакцинного штамма, описано в статье (Palwithino et al., 2015). Подвергнутую тепловой инактивации версию штамма rC-85473 также тестировали (Hamelin et al., 2007).
Совсем недавно, сильные способности данного штамма к слиянию исследованы подробно, исходя из белковой последовательности его белка F (Dubois et al., 2017).
На последовательность гена F и гена М штамма rC-85473 дана ссылка в GenBank, соответственно, с номерами доступа KМ408076.1 и KМ408077.1.
Полная последовательность генома данного штамма вируса rC-85473, содержащая 13394 нуклеотида, раскрыта в данном документе впервые: она представлена в прилагаемом перечне последовательностей под референсной SEQ ID NO. 1.
Ниже в Таблице 4 показана выраженная в процентах идентичность данного штамма rC-85473 с тремя другими вирусными штаммами метапневмовируса человека: CAN 97-83, CAN 98-75 и NL 00-1.
Относительно высокой гомологии последовательностей, наблюдаемой в случае штамма NL 00-1, можно сделать вывод о том, что данный штамм rC-85473 является членом подгруппы А1.
Штамм rC-85473 характеризуется значительными фузогенными способностями, делающими возможным его проникновение в клетки-мишени с высокой частотой/высокой степенью инфицирования. Данная значительная фузогенная способность данного штамма позволяет получать особенно удлиненные синцитии. Синцитии представляют собой гигантские многоядерные клетки. Вирус rC-85473 обладает высокой способностью к индукции слияния клеток in vitro, приводя к образованию данных сильно удлиненных синтициев, состоящих из очень большего числа клеточных ядер.
Показано, что 5 аминокислот функционального домена HRA белка F, аминокислот, уникальных среди других известных штаммов hMPV, частично ответственны за данный гиперфузогенный фенотип (Aerts et al., 2015b; Dubois et al., 2017).
Согласно предпочтительному воплощению настоящего изобретения пептидная последовательность белка F ослабленного штамма вируса, происходящего из штамма rC-85473, содержит данные 5 аминокислот функционального домена HRA, как например, описано в (Dubois et al., 2017).
Согласно предпочтительному воплощению настоящего изобретения пептидная последовательность белка F ослабленного штамма вируса, полученного из штамма rC-85473, не является модифицированной и, таким образом, является идентичной пептидной последовательности белка F штамма rC-85473, как например, описано в (Dubois et al., 2017).
Технология обратной генетики
Технология обратной генетики делает возможным создание, из последовательности нуклеиновой кислоты, ДНК или РНК, и из соответствующих клеток-хозяев, функционального вируса, заключенного в капсид.
Рекомбинантный штамм rC-85473 человеческого метапневмовируса, таким образом, получали из клинического штамма, обозначаемого С-85473, выделенного у пациента.
Первая система обратной генетики, применяемая в отношении hMPV, была описана в 2004 году (Biachesi et al., 2004). Данная технология также описана в статье (Aerts et al., 2015b).
Принцип данной технологии, которая обеспечивает продукцию рекомбинантных hMPV, основан на применении линии клеток почки хомяка (ВНK-21), модифицированной для экспрессии конститутивно РНК-полимеразы бактериофага Т7 (клетки ВНK-Т7 или BSR-T7/5).
Элементы генома распространены в следующих пяти плазмидных элементах: плазмида, кодирующая антигеном hMPV, и 4 «сателлитные» плазмиды, кодирующие вирусные белки аппарата транскрипции (L, Р, N и М2-1).
После совместной трансфекции данных клеток антигеномной плазмидой hMPV и четырьмя «сателлитными» плазмидами, РНК-цепь, соответствующая цепи вирусного генома (отрицательная цепь РНК), транскрибируется посредством полимеразы Т7 со своего промотора.
Четыре белка, участвующих в транскрипции вируса hMPV, также экспрессируются трансфицированными клетками-хозяевами с образованием активного РНК-зависимого РНК-полимеразного (RdRP) комплекса. Данная функциональная вирусная полимераза, таким образом, транскрибирует геномную РНК в вирусную мРНК, затем реплицирует ее в новые молекулы вирусной геномной РНК, посредством транскрипции матричных цепей.
Трансляция и сборка вирусных белков с геномной РНК, таким образом, обеспечивают почкование инфекционных частиц hMPV из цитоплазматической мембраны трансфицированных клеток ВНК-Т7. Затем, амплификация рекомбинантных вирусов обеспечивается, благодаря добавлению в сокультуру клеток LLC-MK2 (ATCCCCL-7), пермиссивных в отношении инфекции.
Таким образом, исходя из геномной последовательности конкретного штамма вируса, возможно, получать рекомбинантные вирусы, благодаря данным модифицированным клеткам, которые имеются в продаже.
Ослабленный штамм вируса, происходящий из штамма rC-85473 Настоящее изобретение относится к ослабленному штамму вируса, полученному из штамма метапневмовируса человека, содержащего геномную последовательность, представленную последовательностью SEQ ID NO. 1, причем указанный ослабленный штамм содержит одну или более генетических модификаций указанной последовательности SEQ ID NO. 1, ослабляющих вирулентность указанного штамма.
В настоящей заявке термины «вирус» и «штамм вируса» используются в равной мере для обозначения конкретного штамма вируса, как например, идентифицировано ранее.
В смысле изобретения считается, что термин «полученный штамм» означает рекомбинантный штамм вируса, полученный посредством введения генетических модификаций в геном штамма вируса, так называемого «исходного штамма». Исходный штамм преимущественно представляет собой дикий штамм, например, клинический изолят.
Все генетические модификации, вводимые в исходный штамм, нацелены на ослабление вирулентности указанного исходного штамма, а не на модификацию идентичности его генома.
В частности, данные генетические модификации касаются только генов, кодирующих белки, не являющиеся крайне важными для репликации вируса, иными словами «акцессорные белки», такие как белки SH и G. В данном генетически модифицированном ослабленном штамме пептидная последовательность белка F исходного штамма rC-85473 не модифицирована, и, таким образом, имеет такую же пептидную последовательность, как и исходный штамм.
Вирулентность штамма вируса соответствует степени быстроты размножения вируса в данном организме, таким образом, его скорости заражения. Считается, что фраза «ослабление вирулентности», таким образом, означает уменьшение скорости заражения вирусом в организме.
Данное ослабление может принимать вид уменьшения в способностях к репликации штамма вируса, и/или уменьшения в его способности инфицировать клетки-мишени, и/или вместо этого уменьшения в патологии, вызываемой вирусной инфекцией организма.
Таким образом, считается, что фраза «ослабленный штамм вируса» означает, в смысле изобретения, рекомбинантный вирус, вирулентность которого уменьшена, по сравнению с вирулентностью исходного штамма вируса, иными словами, меньше, чем вирулентность исходного штамма вируса.
Для измерения вирулентности вирусного штамма, можно проводить in vitro, ex vivo или in vivo анализы, такие как, например, анализы способности к репликации in vitro (измеряется посредством титрования ТСID50/мл или количественной ПЦР), осуществляя контроль посредством наблюдения под микроскопом развития in vitro и ex vivo цитопатических эффектов, или осуществляя контроль над клиническими признаками патологии, наблюдение за легочной гистопатологией и измерение вирусных нагрузок легкого в модели инфицирования in vivo.
Для сравнения физиологических эффектов дикого штамма и ослабленного штамма, также возможно измерить/определить разные физиологические параметры, модифицированные на уровне легкого и/или других иммунных систем организма-хозяина вируса.
Как описано в примерах 7, 8 и 9 настоящей заявки, следующие эффекты, вызываемые вирусом, могут быть оценены для сравнения физиологических эффектов ослабленных штаммов вируса, или в сравнении друг с другом или с диким штаммом вируса:
- секреция провоспалительных цитокинов (клетками эпителия и/или макрофагами);
- секреция хемокинов;
- секреция факторов роста;
- уровень воспаления легких (балльная оценка, вычисляемая по оцениванию интенсивности воспаления тканей); и
- фенотипирование иммунных клеток, рекрутированных в месте инфицирования in vivo.
Данные разные измерения позволяют узнать более точно физиологический эффект каждого штамма вируса и выбрать в зависимости от данных характеристик те, которые будут наиболее подходящими для разработки ослабленной живой противовирусной вакцины.
Генетические модификации, вводимые в штамм вируса, для получения его ослабления
Настоящее изобретение относится к ослабленному штамму вируса, происходящему из штамма метапневмовируса человека, содержащего геномную последовательность, представленную последовательностью SEQ ID NO. 1, причем указанный ослабленный штамм содержит одну или более генетических модификаций указанной последовательности SEQ ID NO. 1, ослабляющих вирулентность указанного штамма.
Считается, что под фразой «генетические модификации, ослабляющие вирулентность указанного штамма» подразумеваются генетические модификации относительно генов, кодирующих белки, не являющиеся крайне важными для репликации вируса, хорошо известные специалисту в данной области. Среди данных белков, в частности, известны белки G и SH, описанные выше.
Иными словами настоящая заявка относится к ослабленному штамму вируса, полученному из штамма метапневмовируса человека, содержащего геномную последовательность, представленную последовательностью SEQ ID NO. 1, причем указанный ослабленный штамм генетически модифицирован для ослабления его вирулентности, что означает, что вводимые генетические мутации вводили исключительно в гены, кодирующие белки, не являющиеся крайне важными для репликации данного вируса.
Разные генетические модификации, делающие возможным ослабление вирулентности штамма вируса, известны специалисту в данной области. Данные модификации могут быть введены в геном исходного штамма rC-85473.
Генетические модификации обозначают, в смысле изобретения, все модификации исходной нуклеотидной последовательности, такие как делеция одного или более нуклеотидов, добавление одного или более нуклеотидов, и замена одного или более нуклеотидов. Данные модификации в частности содержат все модификации, позволяющие сдвинуть генетическую рамку считывания или ввести стоп-кодон в середину кодирующей последовательности, или удалить всю или часть одной или более кодирующих последовательностей.
Среди генетических модификаций, предназначенных для ослабления вирулентности штамма вируса, в частности, известны генетические модификации, позволяющие инактивировать или даже удалить один или более генов, кодирующих белки, не являющиеся крайне важными для репликации вируса в культуре.
Например, ослабленные вирусные штаммы метапневмовируса человека получены посредством инактивации, в частности, посредством удаления генов, кодирующих акцессорные белки SH, G и М2-2.
Однако, в зависимости от характеристик исходного штамма вируса, из которого получают ослабленные штаммы, функциональные характеристики ослабленных штаммов вируса могли бы очень отличаться, причем вирулентность штаммов зависит как от исходного генома, так и от сделанных генетических модификаций.
Согласно первому аспекту изобретения ослабленный штамм вируса согласно изобретению характеризуется тем, что модификации последовательности SEQ ID NO.1 включают инактивацию гена, кодирующего белок SH.
Более конкретно, ослабленный штамм вируса согласно изобретению характеризуется тем, что генетическая модификация последовательности SEQ ID NO. 1, ослабляющая вирулентность указанного штамма, заключается в инактивации гена, кодирующего белок SH.
В смысле изобретения, инактивация гена означает тот факт, что данный ген модифицирован таким путем, что продукт данного гена больше не экспрессируется или экспрессируется в неактивной форме, экспрессируется в таком маленьком количестве, что активность данного белка является несуществующей. Данная инактивация гена может осуществляться всеми методиками, хорошо известными специалисту в данной области.
В частности, инактивация гена может быть получена в результате введения точечной мутации в ген, в результате частичного или полного удаления кодирующих последовательностей гена или, вместо этого, в результате модификации промотора гена. Данные разные генетические модификации будут проводиться в соответствии с любой из методик молекулярной биологии, хорошо известных специалисту в данной области.
В смысле изобретения считается, что фраза «удаление гена» означает удаление из генома штамма вируса значимой части кодирующей последовательности данного гена, в частности:
- когда оно включает частичное удаление, по меньшей мере 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или 95% указанной кодирующей последовательности;
- когда оно включает полное удаление, 100% указанной кодирующей последовательности.
Согласно предпочтительному воплощению в ослабленном штамме вируса согласно изобретению ген, кодирующий белок SH, полностью удален, что означает, что вся (100%) кодирующая последовательность для белка SH была удалена из исходной последовательности SEQ ID NO. 1.
В частности, указанный штамм вируса содержит нуклеотидную последовательность, такую как представлено в SEQ ID NO. 2. Более конкретно, последовательность указанного штамма вируса состоит из нуклеотидной последовательности, такой как представлено в SEQ ID NO. 2.
Как проиллюстрировано в примерах данный ослабленный штамм, обозначаемый (ΔSH-rC-85473, обладает следующими характеристиками:
- In vitro, инфицирование и репликация на клетках в культуре является нормальным (отсутствует отличие от характеристик исходного штамма);
- In vivo, инфицирование мышей данным рекомбинантным вирусом (ΔSH-rC-85473 вызывает только очень маленькую потерю массы, в отличие от инфицирования исходным штаммом; выживаемость инфицированных мышей составляет 100%, тогда как данный ослабленный вирус реплицируется в тканях легкого;
- In vivo, перед иммунизацией мышей данным ослабленным штаммом защищает 100% мышей, стимулируемых летальной дозой дикого вируса rC-85473. Данная защита также проиллюстрирована отсутствием выявления инфекционного вируса rC-85473 в легких, спустя 5 суток после стимуляции; и большой нагрузкой микронейтрализации в сравнении с гомологичным штаммом вируса (С-85473, серотипа А) и в сравнении с по меньшей мере одним гетерологичным штаммом (CAN98-75, серотипа В) сывороток в D+21 после инфекционной стимуляции;
In vitro, способность к связыванию с клетками LLC-MK2 в культуре и инфицированию клеток гораздо лучше в случае ослабленного вируса ΔSH-rC-85473 (примерно 60% инфицированных клеток), в сравнении со способностью к связыванию с клетками и инфицированию клеток вируса ΔSH-rCAN98-75 (примерно 40% инфицированных клеток);
- Ex vivo, инфицирование модели дыхательного эпителия данным ослабленным штаммом вызывает секрецию цитокинов и хемокинов в количестве, эквивалентном или меньше, чем количество, вызываемое диким штаммом; воспалительный ответ, однако, уменьшается по сравнению с воспалительным ответом, вызываемым диким штаммом (фиг. 7А, 7В);
- In vitro, инфицирование макрофагов данным ослабленным штаммом индуцирует секрецию провоспалительных цитокинов, но с кинетикой, отличной от кинетики, вызываемой диким штаммом вируса (Фиг. 8В, 8С);
- In vivo, индуцируемое вирусом воспаление тканей легкого значимо меньше после инфицирования данным ослабленным штаммом, чем в случае дикого штамма (Фиг. 9А); однако, рекрутирование иммунных клеток все еще обеспечивается (фиг. 9В).
Согласно второму аспекту изобретения ослабленный штамм вируса согласно изобретению характеризуется тем, что модификации последовательности SEQ ID NO. 1 включают инактивацию гена, кодирующего белок G.
Более конкретно, ослабленный вирусный штамм согласно изобретению характеризуется тем, генетическая модификация последовательности SEQ ID NO.1, ослабляющая вирулентность указанного штамма, заключается в инактивации гена, кодирующего белок G.
Согласно предпочтительному воплощению в ослабленном штамме вируса согласно изобретению ген, кодирующий белок G, полностью удален, что означает, что вся (100%) кодирующая последовательность для белка G удалена из исходной последовательности SEQ ID NO. 1.
В частности, указанный штамм вируса содержит нуклеотидную последовательность, такую как представлено в SEQ ID NO. 3. Более конкретно, последовательность указанного штамма вируса состоит из нуклеотидной последовательности, такой как представлено в SEQ ID NO. 3.
Как проиллюстрировано в примерах данный ослабленный штамм, обозначенный ΔG-rC-85473, имеет следующие характеристики:
- In vitro, в модели клеток LLC-MK2, инфицирование и репликация на клетках в культуре являются нормальными (отсутствует отличие от характеристик исходного штамма);
- In vivo, инфицирование мышей, инфицируемых данным рекомбинантным вирусом ΔG-rC-85473, индуцирует только очень маленькую потерю массы; выживаемость инфицированных мышей составляет 100%; тогда как данный вирус реплицируется в тканях легкого;
- In vivo, предварительная иммунизация мышей данным ослабленным штаммом защищает 100% мышей, стимулированных летальной дозой дикого вируса rC-85473. Данная защита также проиллюстрирована отсутствием выявления инфекционного вируса и дикого генома rC-85473 в легких в D+5 после стимуляции; и высокой нагрузкой микронейтрализации в сравнении с гомологичным штаммом вируса (С-85473, серотипа А) и в сравнении с по меньшей мере одним гетерологичным штаммом (CAN98-75, серотипа В) сывороток в D+21 после инфекционной стимуляции;
- In vitro, способность связываться с клетками LLC-MK2 в культуре и инфицировать клетки гораздо лучше в случае ослабленного вируса ΔG-rC-85473 (примерно 60% инфицированных клеток), в сравнении со способностью связываться с клетками LLC-MK2 в культуре и инфицировать клетки вируса ΔG-rCAN98-75 (меньше чем 20% инфицированных клеток).
- Ex vivo, инфицирование модели дыхательного эпителия данным ослабленным штаммом индуцирует секрецию цитокинов и хемокинов в количестве, значительно меньшем, чем количество, индуцируемое диким штаммом (фиг. 7);
- In vitro, инфицирование макрофагов данным ослабленным штаммом индуцирует секрецию TNF-α, эквивалентно секреции, индуцируемой диким штаммом вируса; но только индуцирует очень незначительную секрецию IL-1β (Фиг. 8В, 8С);
- In vivo, индуцируемое вирусом воспаление тканей легкого значительно меньше после инфицирования данным ослабленным штаммом, чем в случае дикого штамма или чем в случае ослабленного штамма (ΔSH-rC-85473 (фиг. 9А).
Согласно третьему аспекту изобретения ослабленный штамм вируса согласно изобретению характеризуется тем, что модификации последовательности SEQ ID NO. 1 включают инактивацию двух генов, кодирующих белок G и белок SH.
Более конкретно, ослабленный штамм вируса согласно изобретению характеризуется тем, что генетические модификации последовательности SEQ ID NO. 1, ослабляющие вирулентность указанного штамма, заключаются в инактивации двух генов, из которых один кодирует белок SH и другой - белок G.
Согласно конкретному воплощению инактивация двух генов соответствует полному удалению одного или другого или данных двух генов, кодирующих белки G и SH.
Кроме того, понятно, что любая другая генетическая модификация, позволяющая ослаблять вирулентность штамма rC-85437, могла быть введена в геном указанного штамма, представленный последовательностью SEQ ID NO. 1.
Введение экзогенных генов в геном штамма вируса rC-85473 Согласно одному аспекту изобретения нуклеотидная последовательность ослабленного штамма вируса согласно изобретению могла быть генетически модифицирована введением по меньшей мере одного экзогенного гена.
Таким образом, ослабленный штамм вируса согласно изобретению имеет последовательность генома, которая содержит по меньшей мере один экзогенный ген. Данный экзогенный ген мог в частности представлять собой ген, кодирующий вирусный антиген.
В смысле данного изобретения считается, что термин «вирусный антиген» означает белковый элемент или элемент другой природы, экспрессируемый вирусом, который иммунологическая система индивида распознает как чужеродный и который вызывает ответ в указанном индивиде в результате продукции специфичных антител и/или стимуляции клеточного иммунного ответа.
Вирусные антигены в частности могли быть выбраны из антигенов, экспрессируемых по меньшей мере одним вирусом гриппа или по меньшей мере одним вирусом семейства Pneumoviridae, таким как hRSV, или по меньшей мере одним вирусом семейства Paramyxoviridae, таким как вирус парагриппа.
Более конкретно, указанный вирусный антиген мог быть выбран из всего или части белка F hRSV, и всего или части гемагглютинина вируса гриппа или парагриппа.
Данный ослабленный штамм вируса позволит во время его введения пациенту образовывать множественный иммунный ответ, и на экспрессируемый вирусный антиген и на hMPV.
Такой штамм, позволяющий получить объединенный иммунный ответ на несколько вирусов после единичного введения, является очень преимущественным.
Кроме того, такой ослабленный штамм вируса, содержащий по меньшей мере один экзогенный ген, мог быть использован in vivo, ex vivo или in vitro, в качестве экспрессионного вектора по меньшей мере одного экзогенного гена в клетках-мишенях метапневмовируса человека.
Фраза «клетки-мишени метапневмовируса человека» обозначает эпителиальные клетки дыхательных путей индивидов, подверженных инфицированию данным вирусом. Данная экспрессия также обозначает все клеточные линии, делающие возможной in vitro репликацию указанного вируса.
Ослабленный штамм вируса для его применения в качестве лекарственного средства
Настоящее изобретение также относится к ослабленному штамму вируса, такому как определено выше, для его применения в качестве лекарственного средства.
Действительно, данный штамм может быть использован, в частности, для лечения или предупреждения вирусных инфекций.
Термин «лечить» означает факт противодействия инфекции, вызываемой вирусом у человека или животного организма. Благодаря введению по меньшей мере одной композиции согласно изобретению, уровень вирусной инфекции (инфекционной нагрузки) в организме собирается снижаться, и предпочтительно вирус собирается полностью исчезнуть из данного организма. Термин «лечить» также означает факт ослабления симптомов, ассоциированных с вирусной инфекцией (респираторный синдром, почечная недостаточность, лихорадка и т.д.).
В смысле изобретения термин «предупреждать» означает факт избегания или по меньшей мере снижения риска возникновения инфекции у человека или животного организма. Благодаря введению по меньшей мере одного ослабленного штамма вируса согласно изобретению человеческие или животные клетки указанного организма становятся менее пермиссивными по отношению к инфекции и, таким образом, являются самыми подходящими для того, чтобы не быть инфицированными указанным вирусом.
Более конкретно, изобретение относится к ослабленному вирусному штамму, такому как определено выше, для его применения для предупреждения и/или лечения инфекций, вызываемых вирусами семейства Pneumoviridae.
Понятно, что данный ослабленный штамм вируса будет предпочтительно интегрирован в вакцинную композицию, содержащую фармацевтически приемлемый носитель, подходящий для суспендирования указанного штамма и для его введения.
Указанная вакцинная композиция содержит по меньшей мере один ослабленный штамм вируса согласно изобретению, делая возможной стимуляцию специфичным образом иммунной системы человека или животного организма.
Таким образом, вакцинная композиция содержит по меньшей мере один ослабленный живой штамм вируса, который играет роль антигена, а именно соединения, индуцирующего специфичный иммунный ответ в организме, который будет сохранять память о нем.
Такая вакцинная композиция могла бы использоваться в качестве профилактической вакцины, а именно, предназначенной для стимуляции специфичного иммунного ответа до инфицирования организма патогенным вирусом.
Такая вакцинная композиция могла бы также использоваться в качестве терапевтической вакцины, а именно, предназначенной для стимуляции специфичного иммунного ответа, наряду с инфицированием организма указанным патогенным вирусом.
Настоящее изобретение также относится к способу предупреждения и/или лечения инфекций, вызываемых Pneumoviridae, у человека, включающему введение индивидам, подверженным инфицированию такими вирусами, по меньшей мере одного ослабленного штамма вируса, такого как описано ранее.
Настоящее изобретению также относится к способу предупреждения и/или лечения инфекций, вызываемых Pneumoviridae у человека, включающему введение индивидам, подверженным инфицированию такими вирусами, по меньшей мере одной вакцинной композиции, содержащей по меньшей мере один ослабленный штамм вируса, такой как описано ранее.
Согласно конкретному воплощению изобретения инфекции представляют собой инфекции, вызываемые метапневмовирусами человека.
Согласно другому конкретному воплощению изобретения инфекции представляют собой инфекции, вызываемые ортопневмовирусами, такими как респираторно-синцитиальный вирус человека (hRSV).
Изобретение также относится к ослабленному штамму вируса, последовательность которого содержит по меньшей мере один экзогенный ген, кодирующий вирусный антиген, для его применения для предупреждения и/или лечения инфекций, вызываемых вирусами, где по меньшей мере один вирусный антиген экспрессируется указанным ослабленным штаммом вируса.
Согласно конкретному воплощению ослабленный штамм вируса согласно изобретению, содержащий в качестве экзогенного вирусного антигена белок F hRSV, мог быть использован для предупреждения и/или лечения инфекций, вызываемых hRSV.
Согласно другому конкретному воплощению ослабленный штамм вируса согласно изобретению, содержащий в качестве экзогенного вирусного антигена гемагглютинин вируса гриппа, мог быть использован для предупреждения и/или лечения инфекций, вызываемых вирусом гриппа.
Фармацевтическая композиция, содержащая по меньшей мере один ослабленный штамм вируса
Настоящее изобретение также относится к вакцинной композиции, содержащей в фармацевтически приемлемом носителе по меньшей мере один ослабленный штамм вируса согласно изобретению и возможно адъювант.
Согласно изобретению термин «фармацевтически приемлемый носитель» обозначает носители или вспомогательные вещества, а именно соединения, не оказывающие специфичного действия на инфекцию, рассматриваемую в данном документе. Данные носители или вспомогательные вещества являются фармацевтически приемлемыми, что говорит о том, что их можно вводить индивиду или животному без риска значимых вредных эффектов или недопустимых нежелательных действий.
Понятно, что вакцинная композиция согласно изобретению содержит по меньшей мере одно эффективное количество ослабленного штамма вируса. Считается, что термин «эффективное количество» означает, в смысле данного изобретения, количество ослабленного штамма вируса, достаточное для того, чтобы спровоцировать иммунный ответ в организме, которому его вводят.
Вакцинные композиции, используемые согласно настоящему изобретению, подходят для перорального, сублингвального, ингаляционного, подкожного, внутримышечного или внутривенного введения.
Согласно конкретному воплощению изобретения вакцинная композиция согласно изобретению характеризуется тем, что она находится в фармацевтической форме, предназначенной для введения посредством ингаляции.
Ингаляция обозначает поглощение дыхательными путями. В частности, это является способом поглощения соединений в терапевтических целях некоторых веществ в виде газа, микрокапель или порошков в суспензии.
Введение фармацевтических или ветеринарных композиций посредством ингаляции, иными словами посредством носовых и/или буккальных проходов, хорошо известно специалисту в данной области.
Различают два типа введения посредством ингаляции:
- введение посредством инсуффляции, когда композиции находятся в виде порошков, и
- введение посредством распыления, когда композиции находятся в виде аэрозолей (суспензий) или в виде растворов, например, находящихся под давлением водных растворов. В таком случае для введения фармацевтической или ветеринарной композиции будет рекомендовано применение небулайзера или спрея.
Фармацевтическая форма, рассматриваемая в данном документе, таким образом, преимущественно выбрана из: порошка, водной суспензии капель или раствора, находящегося под давлением.
Популяция индивидов для вакцинации главным образом представляет собой детскую популяцию, иными словами состоящую из индивидов в возрасте менее чем 18 лет и более конкретно маленьких детей в возрасте меньше чем 5 лет и младенцев. Действительно, вирусы семейства Pneumoviridae главным образом инфицируют данных индивидов, которые имеют склонность к менее сильному иммунитету, чем индивиды более старшего возраста.
Изобретение также относится к вакцинной композиции, как например, описано выше, для ее применения для предупреждения и/или лечения инфекций, вызываемых вирусами семейства Pneumoviridae.
Примеры
Пример 1: Рекомбинантные hMPV, полученные из клинических штаммов С-85473 и CAN98-75. 1А
Генетические конструкции, представленные на фиг. 1А и 1В, получали для того, чтобы вирусы были выявляемы за счет экспрессии GFP (зеленый флуоресцентный белок), и для введения в рекомбинантные референсные штаммы rC-85473 и rCAN98-75 генетических модификаций, предназначенных для ослабления их вирулентности:
- удаление гена, кодирующего белок SH (ΔSH);
- удаление гена, кодирующего белок G (ΔG).
Полные последовательности данных генетических конструкций представлены в SEQ ID NO. 4 (GFP rC-85473), SEQ ID NO.5 (GFP ΔSH-rC-85473), SEQ ID NO.6 (GFP ΔG-rC-85473) и SEQ ID NO. 8 (GFP rCAN98-75). Последовательности штаммов вируса, происходящие из rCAN98-75 и связанные с GFP, не представлены, но доступны для специалиста в данной области в зависимости от других представленных генетических конструкций.
Как показано на фотографиях клеток LLC-MK2, инфицированных, с множественностью инфекции (MOI) 0,01, вирусами, являющимися видимыми, благодаря GFP, следующие полученные рекомбинантные вирусы: ΔSH-rCAN98-75, ΔG-rCAN98-75, ΔSH-rC-85473 и ΔG-rC-85473 являются функциональными и репликативными. Клетки наблюдают посредством флуоресцентной микроскопии через трое суток после инфицирования.
Фотографии указывают на то, что рекомбинантные вирусы rCAN98-75 кажутся менее инфекционными и менее репликативными, чем рекомбинантные вирусы rC-85473: интенсивность флуоресценции ниже, и синцитии имеют более уменьшенные размеры.
Пример 2: In vitro способности рекомбинантных вирусов rC-85473 и rCAN98-75 к репликации
Клетки LLC-MK2 инфицировали отдельно, с множественностью инфекции 0,01, следующими рекомбинантными вирусами:
- rCAN98-75, ΔSH-rCAN98-75 и ΔG-rCAN98-75 (фиг. 2А)
- rC-85473, ΔSH- rC-85473 и ΔG-rC-85473 (фиг. 2В)
Клеточные супернатанты собирали каждые сутки на протяжении 7 суток, в трехкратной повторности, затем их вирусные нагрузки оценивали в ТСID50/мл. Двухфакторные дисперсионные статистические анализы проводили для сравнения каждого рекомбинантного вируса с делецией (ΔSH и ΔG) с диким рекомбинантным вирусом.
На Фиг. 2А и 2В показаны полученные результаты: способности к репликации и продукции отличаются в зависимости от природы исходного штамма, CAN98-75 или С-85473, в случае ослабленных рекомбинантных вирусов.
Рекомбинантные вирусы rC-85473, ΔSH-rC-85473 и ΔG-rC-85473 обладают способностями к репликации и продукции, гораздо лучшими, чем способности к репликации и продукции вирусов rCAN98-75, ΔSH-rCAN98-75 и ΔG-rCAN98-75. Вирусы ΔSH-rCAN98-75 и ΔG-rCAN98-75 являются наименее эффективными, тогда как вирусы ΔSH-rC-85473 и ΔG-rC-85473 обладают наилучшими способностями к продукции в культуре на клетках LLC-MK2.
Ниже в таблицах представлены средние нагрузки вирусных стоков, полученных и концентрированных для каждого рекомбинантного вируса rCAN98-75, ΔSH-rCAN98-75 и ΔG-rCAN98-75 (таблица 5) и rC-85473, ΔSH-rC-85473 и ΔG-rC-85473 (таблица 6).
Вирусные нагрузки рассчитывали в единицах «ТСID50», что представляет конечное разведение вируса, при котором 50% клеточной ткани разрушено инфекцией, или демонстрирует видимые цитопатические эффекты (доза заражения 50% культуры ткани).
Данные вирусные нагрузки подтверждают предшествующие результаты, а именно, что ослабленные штаммы вирусов, происходящие из С-85437, обладают удовлетворительными способностями к репликации, не уменьшенными в сравнении со способностями к репликации исходного штамма.
Пример 3: In vivo характеристика рекомбинантных hMPV rCAN98-75 и rC-85473 на модели инфицирования вирусом мышей BALB/c
Мышей BALB/c инфицировали посредством интраназальной инстилляции:
- культуральной среды OptiMem (имитация) или
- 2,5×105 единиц флуоресцирующих фокусов (FFU - от англ. Fluorescent Focal Unit) рекомбинантных вирусов, экспрессирующих GFP: rCAN98-75, (ΔSH-rCAN98-75 и ΔG-rCAN98-75, или
- 5×105 TCID50 вирусов, не экспрессирующих GFP: rC-85473, ΔSH-rC-85473 и ΔG-rC-85473.
Данные две используемые дозы вирусов эквивалентны (дикие вирусы создают эквивалентные эффекты у мышей после инфицирования).
Массу и выживаемость мышей отслеживали ежесуточно на протяжении 14 суток (масса, средняя по 10 мышам, ±SEM (от англ. standard error of mean -стандартная ошибка среднего).
Кроме того, через 5 суток после инфицирования, 5 мышей на группу подвергались умерщвлению для измерения вирусных нагрузок при инфицировании легкого в TCID50.
Статистические анализы проводили (двухфакторный дисперсионный анализ) для сравнения каждого вируса с условием имитации. * р меньше 0,05, ** р меньше 0,01 и *** р меньше 0,001.
На Фиг. 3А и 3В показаны результаты, полученные с вирусами rCAN98-75, ΔSH-rCAN98-75 и ΔG-rCAN98-75; на фиг. 3С и 3D показаны результаты, полученные с вирусами rC-85473, ΔSH-rC-85473 и ΔG-rC-85473.
Данные результаты указывают на то, что рекомбинантные вирусы ΔSH-rC-85473 или ΔG-rC-85473 вызывают только очень небольшую потерю массы; фактически, данные группы мышей ведут подобно неинфицированной группе мышей.
Кроме того, вирусные нагрузки легкого (Фиг. 3D) похожи на вирусные нагрузки легкого, наблюдаемые в группе, инфицированной вирусом rC-85473, указывая на репликацию в легком ослабленных вирусов с делецией.
Результаты различаются у рекомбинантных вирусов ΔSH-rCAN98-75 и ΔG-rCAN98-75: вирус ΔSH-rCAN98-75 вызывает очень большую потерю массы (Фиг. 3А); тогда как вирус ΔG-rCAN98-75 вызывает только очень незначительное уменьшение массы (Фиг. 3А), из-за его низкой способности к репликации в легких (Фиг. 3В).
Пример 4: In vivo защитные свойства рекомбинантных hMPV ΔG-rC-85473 и ΔSH-rC-85473 в мышиной модели BALB/c после инфекционной стимуляции диким вирусом rC-85473
Протокол иммунизации и инфекционной стимуляции показан на фиг. 4А.
Мышей BALB/c иммунизировали посредством интраназальной инстилляции культуральной среды OptiMem («имитационный» отрицательный контроль) или 5×105 TCID50 рекомбинантных вирусов rC-85473, ΔSH-rC-85473 или ΔG-rC-85473.
Через 21 сутки после иммунизации мышей инфицировали (инфекционная стимуляция) посредством интраназальной инстилляции летальной дозы (1×106 TCID50) дикого вируса rC-85473.
Массу и выживаемость мышей отслеживали ежесуточно на протяжении 14 суток (масса, средняя по 10 мышам, ±SEM, Фиг. 4В).
Выживаемость мышей контролировали ежесуточно на протяжении 14 суток после стимуляции для мышей разных групп (имитация с 50%-ной выживаемостью и иммунизировали рекомбинантными вирусами rC-85473, ΔSH-rC-85473 или ΔG-rC-85473, демонстрируя 100%-ную выживаемость). Результаты показаны на Фиг. 4С.
Через 5 суток после инфекционной стимуляции (а именно, в сутки 26 после иммунизации), 4 мыши каждой группы подвергались умерщвлению для измерения их вирусных нагрузок при легочной инфекции в TCID50 (Фиг. 4D) и ОТ-кПЦР (ген N, Фиг. 4Е).
Статистические критерии: двухфакторный дисперсионный анализ для сравнения каждого вируса с условием имитации. *р меньше 0,05, ** р меньше 0,01 и *** р меньше 0,001.
Данные результаты подтверждают, что рекомбинантные вирусы (ΔSH-rC-85473 или ΔG-rC-85473 вызывают только очень маленькую потерю массы (группы мышей ведут подобно группе неинфицированных мышей) и что, в данных экспериментальных условиях, защищают 100% мышей, стимулируемых летальной дозой дикого вируса rC-85473. Данная защита также проиллюстрирована отсутствием выявления инфекционного вируса и дикого генома rC-85473 (nd) в легких в D+5 после стимуляции и высокой нагрузкой микронейтрализации сывороток в D+21 после стимуляции (больше 160) мышей, иммунизированных заранее рекомбинантными вирусами (ΔSH-rC-85473 и ΔG-rC-85473.
Ниже в Таблице 7 показаны результаты анализов микронейтрализации, проводимых на сыворотках от мышей разных групп в D+20 (за 1 сутки до инфекционной стимуляции) и в D+42 (через 21 сутки после инфекционной стимуляции).
После инактивации на протяжении 30 минут при 56°С и разведения сывороток их инкубировали с 100 TCID50 (а именно, 100 инфекционных единиц, как например, определено в соответствии с TCDI50/мл) вируса rC-85473 или вируса rCAN98-75 в течение 2 часов при 37°С. Далее данную смесь применяли в отношении клеток LLC-MK2 для определения нагрузки нейтрализации.
Нагрузку в отношении нейтрализующих антител определяют по наибольшему разведению сыворотки, при которой клетки LLC-MK2, инкубируемые со смесью сыворотка плюс вирус, не демонстрируют цитопатических эффектов, иными словами, считаются негативными в отношении инфицирования (на основе тестов, проводимых в двухкратной повторности).
На фигурах представлено разведение анализируемых сывороток, при котором нагрузки в отношении специфичных антител эффективно нейтрализуют вирусную инфекцию (нагрузка микронейтрализации).
Результат 5 или 10 является характерным для первичного иммунного ответа (первая встреча с вирусом). Результат больше чем или равный 160 является характерным для максимального иммунного ответа и свидетельствует о том, что организм уже встречался с вирусом ранее и, таким образом, иммунизирован.
Штаммы вируса, происходящие из исходного штамма rC-85473, позволяют получать удовлетворительный нейтрализующий гуморальный ответ на hMPV С-85473 (серотип А) и, по меньшей мере, на вирус CAN98-75 (серотип В) после предварительной иммунизации ослабленными штаммами.
Пример 5: In vitro способности рекомбинантных вирусов rC-85473 и rCAN98-75 к связыванию с клетками
Клетки LLC-MK2 инфицировали (t равно 0):
- вирусом rCAN98-75 и его ослабленными формами ΔSH-rCAN98-75 и ΔG-rCAN98-75 (фиг. 5А);
- вирусом rC-85473 и его ослабленными формами ΔSH-rC-85473 и ΔG-rC-85473 (фиг. 5В);
Клетки инфицировали на льду в течение 0,5, 1, 2 или 3 ч для того, чтобы менять время связывания вирусов с клетками перед промывкой, затем инкубировали при 37°С в течение 24 ч.
Процентное содержание инфицированных клеток, измеренное через 24 ч после инфицирования, характеризует количество вируса, способного связываться с клетками за отведенное время (0,5, 1, 2 или 3 ч).
Результаты указывают на разные способности связывания с клетками LLC-MK2 в культуре (и, таким образом, способности инфицирования) для рекомбинантных вирусов в зависимости от источника их генома CAN98-75 или С-85473.
Результаты показывают гораздо лучшую способность связывания с клеткой и инфицирования клетки в случае ослабленных вирусов ΔSH-rC-85473 и ΔG-rC-85473 (примерно 60% инфицированных клеток), по сравнению с результатами для вирусов ΔSH-rCAN98-75 (40%) и ΔG-rCAN98-75 (меньше чем 20% инфицированных клеток).
Пример 6: Ex vivo способности рекомбинантных вирусов rC-85473 и rCAN98-75 к репликации в 3D модели восстановленного дыхательного эпителия человека и культивируемого на границе раздела воздух-жидкость
Восстановленный дыхательный эпителий человека (MucilAir® НАЕ, Epithelix) и поддерживаемый в культуре на границе раздела воздух-жидкость в соответствии с инструкциями поставщика Epithelix использовали для проведения данных экспериментов ex vivo.
Фотографии, показанные на фиг. 6А, показывают, что рекомбинантные вирусы rCAN98-75 оказываются менее инфекционными и менее репликативными, чем рекомбинантные вирусы rC-85473 (более низкая интенсивность флуоресценции и более уменьшенные размеры участков инфицирования).
Результаты количественной оценки вирусного генома в эпителии (фиг. 6С) подтверждают способности к репликации рекомбинантных вирусов rC-85473, ΔSH-rC-85473 и ΔG-rC-85473, а также рекомбинантных вирусов rCAN98-75 и (ΔSH-rCAN98-75, в отличие от вируса ΔG-rCAN98-75, который очень слабо реплицируется.
Результаты количественной оценки вирусного генома на поверхности апикального полюса эпителия (фиг. 6В) указывают на продукцию рекомбинантных вирусов rCAN98-75, ΔSH-rCAN98-75, ΔG-rCAN98-75, rC-85473 и ΔSH- rC-85473.
С другой стороны, геном вируса ΔG-rC-85473 не выявляют, что указывает на отсутствие продукции вирусного потомства. Гипотеза заключается в том, что вирус ΔG-rC-85473 мог потерять способность к почкованию на поверхности инфицированных клеток в данном комплексе и стратифицированной системе ех vivo.
Данные различия могли бы выступать в пользу изобретательского характера настоящего изобретения, фокусируясь на разных свойствах у рекомбинантных вирусов разных источников относительно штамма вируса hMPV, для защиты кандидатов ослабленных живых вакцин по настоящему изобретению ΔSH-rC-85473 и ΔG- rC-85473.
Пример 7: Секреция цитокинов и хемокинов, индуцируемая инфицированием рекомбинантными вирусами rC-85473, на 3D модели восстановленного дыхательного эпителия человека и культивируемого на границе раздела воздух-жидкость
Восстановленный дыхательный эпителий человека (MucilAir® НАЕ, Epithelix), поддерживаемый в культуре на границе раздела воздух-жидкость в соответствии с инструкциями поставщика Epithelix, использовали для проведения данных экспериментов ex vivo.
Количественная оценка селекции цитокинов и хемокинов, секретируемых в основную среду инфицированного эпителия, отражает индукцию клеточного ответа, который отличается в зависимости от оцениваемых рекомбинантных вирусов rC-85473 (фиг. 7).
а) вирус ΔG-rC-85473 индуцирует секрецию значимо меньшего количества разных анализируемых цитокинов и хемокинов, по сравнению с диким штаммом rC-85473, за исключением провоспалительного цитокина TNF-α. Данные согласуются с результатами, показанными на фиг.6, которые демонстрируют, что инфекционность данного вируса в восстановленном дыхательном эпителии человека значимо снижена, по сравнению с инфекционностью дикого штамма.
b) вирус ΔSH-rC-85473, даже при том, что его способность к инфицированию и репликации в модели восстановленного дыхательного эпителия человека повышена, по сравнению со способностью к инфицированию и репликации дикого рекомбинантного вируса rC-85473 (фиг. 6), индуцирует секрецию эквивалентного или меньшего количества панели цитокинов и хемокинов, оцениваемую по сравнению с секрецией, индуцируемой диким вирусом.
Уровни секретируемых хемокинов МСР-1, IP-10, RANTES, IL-8, G-CSF и провоспалительных цитокинов IFN-γ и TNF-α, по-видимому, указывают на то, что эпителиальные клетки, инфицируемые данным вирусом ΔSH-rC-85473, способны рекрутировать следующие клетки иммунной системы: Т-лимфоциты, моноциты/макрофаги, эозинофилы и/или нейтрофилы, необходимые для формирования иммунного ответа и адаптивного ответа хозяина.
Кроме того, вирус ΔSH-rC-85473 приводит к секреции IL-7, цитокина, индуцирующего дифференцировку неактивных лимфоцитов в активные Т- и В-лимфоциты, и FGF, фактора роста, участвующего в восстановлении органических тканей, в количествах, похожих на дикий вирус rC-85473.
Таким образом, инфицирование вирусом ΔSH-rC-85473 делает возможным формирование эпителиальными клетками первичного защитного ответа на инфекцию, при ассоциации с более ослабленным воспалительным ответом хозяина, в сравнении с воспалительным ответом, вызываемым диким вирусом.
Данные различия, таким образом, будут выступать за применение рекомбинантных вирусов, происходящих из штамма rC-85473, в качестве ослабленной живой вакцины и предпочтительно из ослабленного штамма ΔSH-rC-85473.
Пример 8: Репликация вируса и секреция провоспалительных цитокинов IL-1β и TNF-α in vitro рекомбинантных hMPV rC-85473 на модели иммортализованных макрофагов мыши
Иммортализованную линию мышиных макрофагов использовали для оценки репликации и способности к индукции провоспалительных цитокинов под действием рекомбинантных вирусов rC-85473, ΔSH-rC-85473 и ΔG-rC-85473.
Макрофаги образуют часть первичных клеток иммунной системы, рекрутированных в месте инфицирования (в настоящем случае, дыхательный эпителий). Макрофаги содействуют воспалительному ответу, врожденному ответу и стимуляции адаптивного ответа хозяина.
Макрофагов инфицировали рекомбинантными вирусами rC-85473, ΔSH-rC-85473 или ΔG-rC-85473, и их клеточные супернатанты собирали каждые сутки на протяжении 2 суток. Результаты показаны на фиг. 8.
a) вирусные нагрузки, измеряемые в БОЕ/мл, демонстрируют, что вирус ΔSH-rC-85473 обладает уменьшенной способностью к репликации на макрофагах, по сравнению с диким рекомбинантный вирусом, тогда как вирус ΔG-rC-85473 демонстрирует репликацию вируса, похожую на дикий вирус (фиг. 8А). Двухфакторные дисперсионные анализы проводили для сравнения кинетики репликации вируса с делецией ΔSH-rC-85473 с кинетикой репликации дикого рекомбинантного вируса.
b) далее, секрецию провоспалительных цитокинов TNF-α (фиг. 8В) и IL-1β (фиг. 8С) измеряли в супернатанте инфицированных макрофагов.
Вирус ΔSH-rC-85473 приводит к получению профиля цитокинов, значимо отличающегося от профиля цитокинов дикого вируса rC-85473 с более ранним пиком секреции, спустя 1 сутки после инфицирования, в сравнении с диким вирусом, который ассоциирован с пиком секреции через 2 суток после инфицирования, относительно данных двух цитокинов.
Вирус ΔG-rC-85473 индуцирует секрецию цитокина TNF-α на уровнях, сопоставимых с диким вирусом, но не индуцирует секрецию цитокина IL-1β во время первых 2 суток инфицирования.
Данные результаты демонстрируют, что вирус ΔSH-rC-85473 сохраняет способность инфицировать мышиные макрофаги и главным образом приводить к секреции провоспалительных цитокинов, несмотря на модифицированную кинетику.
Вирус ΔG-rC-85473 эффективно инфицирует мышиные макрофаги, но индуцирует более слабую секрецию провоспалительных цитокинов, как наблюдалось на модели восстановленного дыхательного эпителия человека.
Пример 9: Воспаление легких и рекрутинг клеток иммунной системы в месте инфицирования in vivo, индуцируемый после 5 суток инфицирования мышей BALB/c, под действием рекомбинантных hMPV rC-85473, ΔG-rC-85473 и ΔSH-rC-85473
Мышей BALB/c инфицировали посредством интраназальной инстилляции:
- культуральной среды OptiMem (имитация)
- 5×105 TCID50 рекомбинантных вирусов rC-85473, ΔSH-rC-85473 или ΔG-rC-85473.
После 5 суток инфицирования 5 мышей на группу подвергались умерщвлению, и их легкие брали для гистопатологического анализа, и проводили измерение балльных показателей воспаления, возникающего в результате инфицирования (фиг. 9А).
Статистические анализы проводили (двухфакторный дисперсионный анализ) для сравнения каждого условия друг с другом: *р меньше 0,05, ** р меньше 0,01 и *** р меньше 0,001.
На Фиг. 9А показано, как дикий вирус rC-85473 индуцирует сильное воспаление легких у инфицированных мышей, тогда как вирусы ДЭН-rC-85473 и ΔG-rC-85473 приводят к воспалению, уровень которого значимо ниже, чем в случае дикого вируса, в соответствии с уменьшенной тяжестью патологии с ослабленными штаммами, продемонстрированной ранее на фиг. 3.
Кроме того, через 5 суток после инфицирования 5 мышей на группу подвергались умерщвлению, и их легкие брали для абсолютной количественной оценки клеток иммунной системы - CD4+, CD8+ лимфоцитов, нейтрофилов и макрофагов, инфильтрированных в ткань легкого после инфицирования (фиг. 9В).
Статистические анализы проводили (однофакторный дисперсионный анализ) для сравнения условия ΔSH-rC-85473 с условием rC-85473: ** р меньше 0,01.
На Фиг. 9В продемонстрировано, что разные популяции клеток иммунной системы (CD4+ Т, CD8+ Т, нейтрофилов и макрофагов) подвергались рекрутингу в месте инфицирования после 5 суток инокуляции вирусов rC-85473 и ДВН-rC-85473, но в более низком количестве в случае ослабленного штамма, в частности, в отношении CD4+ лимфоцитов.
Таким образом, очевидно, что вирус ΔSH-rC-85473 приводит к пониженному уровню воспаления легких, в соответствии с ослаблением патологии, индуцируемой вирусом в мышиной модели (фиг. 3), и уменьшению секреции цитокинов инфицированными эпителиальными клетками (фиг. 7), одновременно обеспечивая эффективный рекрутинг разных клеток иммунной системы в месте инфицирования.
Данные разные результаты (фиг. 7-9) демонстрируют разные свойства у дикого рекомбинантного rC-85473 и вирусов с делецией в отношении их постинфекционных физиологических эффектов.
Ослабленный штамм ΔSH-rC-85473 кажется особенно перспективными в отношении разработки ослабленной живой вакцины относительно его свойств с точки зрения: (i) секреции воспалительных цитокинов и хемокинов эпителиальными клетками и клетками-макрофагами, (ii) индукции воспаления легких in vivo и (iii) инфильтрации in vivo клеток иммунной системы в инфицируемый орган. В действительности, инфицирование хозяина данным ослабленным штаммом ассоциировано как с эффективным первичным иммунным ответом (эквивалентным первичному иммунному ответу, наблюдаемому в случае дикого вируса), так и с ослабленным воспалительным ответом.
Пример 10: Секреция цитокинов/хемокинов, рекрутинг клеток иммунной системы в месте инфицирования in vivo и воспаление легких в модели мышей BALB/c, иммунизированных рекомбинантными hMPV rΔG-C-85473 и ΔSH-C-85473, поле инфекционной стимуляции
После инфицирования вирусом комплексный воспалительный и иммунный ответ формируется в месте инфицирования, благодаря секреции цитокинов и хемокинов инфицированными эпителиальными клетками (см. фиг. 7) и резидентными клетками иммунной системы (фиг. 8). Сначала, эффекторные клетки врожденного ответа (неспецифичного) подвергаются рекрутингу и затем, во-вторых, активируются эффекторные клетки адаптивного ответа (специфичного). Когда инфицированный индивид предварительно иммунизирован или вакцинирован, чем быстрее, важнее и специфичнее адаптивный ответ, тем эффективнее вторичный иммунный ответ. Это является характеристикой данного иммунного ответа, называемого вторичным, который описан в данном примере.
Мышей BALB/c иммунизировали посредством интраназальной инстилляции культуральной среды OptiMem («имитационный» отрицательный контроль) или 5×105 TCID50 рекомбинантных вирусов rC-85473, ΔSH-C-85473 или ΔG-C-85473.
Спустя 21 сутки после иммунизации, мышей инфицировали (инфекционная стимуляция) посредством интраназальной инстилляции летальной дозы (1×106 TCID50) дикого вируса rC-85473. Протокол иммунизации и инфекционной стимуляции показан на фиг.4 А.
Спустя 1 или 5 суток после инфекционной стимуляции (а именно, в сутки 22 или 26 после иммунизации, соответственно), 3 мыши каждой группы подвергались умерщвлению для количественной оценки селекции цитокинов и хемокинов, секретируемых в ткани легкого: результаты показаны на фиг. 10А, 10В и 10С. Данные результаты демонстрируют индукцию местного иммунного ответа, которая отличается в зависимости от рекомбинантных вирусов rC-85473, используемых для иммунизации мышей BALB/c:
- группы, иммунизированные вирусами ΔG-C-85473 и ΔSH-C-85473, демонстрируют более сильную секрецию провоспалительного цитокина IL-6 и хемокина МСР-1, чем группа, иммунизированная вирусом WT rC-85473, незамедлительно спустя 1 сутки после инфекционной стимуляции.
- кроме того, группа, иммунизированная вирусом ΔSH-С-85473, также демонстрирует значимое увеличение секреции противовоспалительного цитокина IL-10 и хемокинов G-CSF и MIP-1β, в сравнении с группой, иммунизированной вирусом WT и/или вирусом ΔG-С-85473.
Спустя 5 суток, уровни всех анализируемых цитокинов/хемокинов были резко снижены, по сравнению с уровнями, измеряемыми в сутки 1 после стимуляции, что демонстрирует ресорбцию цитокинов и воспалительный ответ, индуцируемый стимуляцией.
Данные результаты указывают на то, что иммунизация ослабленными вирусами ΔG-C-85473, и более конкретно ΔSH-C-85473, приводит к местному формированию цитокинового ответа, отличного от цитокинового ответа, индуцируемого иммунизацией соответствующим неослабленным вирусом WT.
Для оценки рекрутинга клеток иммунной системы в месте инфицирования измеряли количество основных популяций клеток иммунной системы, которые инфильтрируют в ткань легкого для того, чтобы бороться с инфекцией; результаты показаны на фиг. 10D, 10Е и 10F.
Таким образом, рекрутинг Т-лимфоцитов (CD8+ цитотоксические и CD4+ хелперы) и В-лимфоцитов значимо увеличен после иммунизации вирусом ΔSH-C-85473, по сравнению с группой, иммунизированной вирусом WT rC-85473, и по сравнению с группой, иммунизированной вирусом ΔG-C-85473 (значимое различие исключительно для В-лимфоцитов, фиг. 10Е), спустя 5 суток после инфекционной стимуляции.
Популяции рекрутированных макрофагов и нейтрофилов не показывают значимых различий между разными анализируемыми вирусами (фиг. 10F).
Группа мышей, иммунизированных вирусом ΔG-C-85473, демонстрирует профиль рекрутинга клеток, похожий на профиль группы, иммунизированной вирусом WT, что указывает на то, что вирус ΔG-C-85473 является таким же эффективным в отношении индукции иммунного ответа, как и дикий вирус (WT). Напротив, когда мышей иммунизировали заранее вирусом ΔSH-C-85473, адаптивный иммунный ответ в ответ на инфекционное стимулирование является более значимым, одновременно оставаясь уравновешенным, тогда как врожденный ответ, по-видимому, не подвергается воздействию, что дает основание полагать, что вирус ΔSH-C-85473 не будет вызывать более эффективный вторичный иммунный ответ.
Наконец, через 5 суток после стимулирования 2 мыши на группу подвергались умерщвлению для измерения бальных показателей воспаления легких, являющегося результатом стимулирования каждой иммунизированной или «имитационной» неиммунизированной группы; результаты показаны на фиг. 10G.
Как и ожидалось от применения летального инокулюма вируса WT rC-85473, который соответствует 50% смертности популяции [см. фиг. 4С], суммарный балльный показатель воспаления имитационно-иммунизированной группы является очень высоким. Как указано ранее, балльные показатели воспаления групп, иммунизированных вирусом WT rC-85473 или ΔG-C-85473, являются весьма сопоставимыми друг с другом и слегка уменьшенными, по сравнению с имитационно-иммунизированной группой, даже несмотря на то, что мыши данных групп не демонстрируют никакой смертности [Фиг. 4С].
Результаты фиг. 10 показывают, что мыши, иммунизированные вирусом ΔSH-С-85473, формируют очень ослабленный воспалительный ответ после инфекционной стимуляции, что дает основание полагать, что поражения легкого были уменьшены в данной группе. Аналогично, функциональные характеристики легкого были сохранены во время инфицирования.
Таким образом, ослабленный вирус ΔSH-C-85473 мог обеспечивать лучший рекрутинг клеток иммунной системы в легком, в количестве и в качестве, в ответ на вторичное инфицирование, и, таким образом, содействовать ограничению патофизиологии и воспаления легкого инфицированного хозяина. Данный более эффективный ответ хозяина также мог отражать лучший вторичный иммунный ответ на вирус hMPV.
В заключение, данный ослабленный вирус ΔSH-C-85473 обладает следующими характеристиками:
(i) он индуцирует большие количества провоспалительных, противовоспалительных цитокинов и хемокинов, чем другие анализируемые вирусы.
(ii) это обеспечивает более значимый, но уравновешенный, рекрутинг клеток иммунной системы (CD8+/CD4+ Т-лимфоциты и В-лимфоциты) в месте инфицирования,
(iii) одновременно генерируя ограниченное воспаление легких
Ссылки
Патенты WO 2005/014626 США 8841433
Библиографические ссылки по порядку цитирования в тексте
van den Hoogen BG, of Jong JC, Groen J, Kuiken T, of Groot R, Fouchier RA, et al. A newly discovered human pneumovirus isolated from young children with respiratory tract disease. Nat Med. 2001; 7(6):719-24
Peret TC, Boivin G, Li Y, Couillard M, Humphrey C, Osterhaus AD, Erdman DD, Anderson LJ. Characterization of human metapneum о viruses isolated from patients in North America. J Infect Dis. 2002 Jun 1; 185(11):1660-3.
Mazur NI, Higgins D, Nunes MC, Melero JA, Langedijk AC, Horsley N, Buchholz UJ, Openshaw PJ, McLellan JS, Englund JA, Mejias A, Karron RA, Simoes EA, Knezevic I, Ramilo O, Piedra PA, Chu HY, Falsey AR, Nair H, Kragten-Tabatabaie L, Greenough A, Baraldi E, Papadopoulos NG, Vekemans J, Polack FP, Powell M, Satav A, Walsh EE, Stein RT, Graham BS, Bont LJ; Respiratory Syncytial Virus Network (ReSViNET) Foundation. The respiratory syncytial virus vaccine landscape: lessons from the graveyard and promising candidates. Lancet Infect Dis. 2018 Jun 15. pii: S1473-3099(18)30292-5.
Herfst S, of Graaf M, Schrauwen EJ, Sprong L, Hussain K, van den Hoogen BG, Osterhaus AD, Fouchier RA. Generation of temperature-sensitive human metapneumovirus strains that provide protective immunity in hamsters. J Gen Virol. 2008 Jul; 89(Pt 7):1553-62.
Wei Y, Zhang Y, Cai H, Mirza AM, Iorio RM, Peeples ME, Niewiesk S, Li J. Roles of the putative integrin-binding motif of the human metapneumovirus fusion (f) protein in cell-cell fusion, viral infectivity, and pathogenesis. J Virol. 2014 Apr; 88(8):4338-52.
Yu CM, Li RP, Chen X, Liu P, Zhao XD. Replication and pathogenicity of attenuated human metapneumovirus F mutants in severe combined immunodeficiency mice. Vaccine. 2012 Jan 5; 30(2):231-6.
Liu P, Shu Z, Qin X, Dou Y, Zhao Y, Zhao X. A live attenuated human metapneumovirus vaccine strain provides complete protection against homologous viral infection and cross-protection against heterologous viral infection in BALB/c mice. Clin Vaccine Immunol. 2013 Aug; 20(8): 1246-54.
Zhang Y, Wei Y, Zhang X, Cai H, Niewiesk S, Li J. Rational design of human metapneumovirus live attenuated vaccine candidates by inhibiting viral mRNA cap methyltransferase. J Virol. 2014 Oct; 88(19):11411 -29
Biacchesi S, Skiadopoulos MH, Tran KC, Murphy BR, Collins PL, Buchholz UJ. Recovery of human metapneumovirus from cDNA: optimization of growth in vitro and expression of additional genes. Virology. 2004; 321(2):247-59
Biacchesi S, Skiadopoulos MH, Yang L, Lamirande EW, Tran KC, Murphy BR, Collins PL, Buchholz UJ. Recombinant human Metapneumovirus lacking the small hydrophobic SH and/or binding G glycoprotein: deletion of G yields a promising vaccine candidate. Journal of Virology. 2004 Dec; 78(23): 12877-87.
Biacchesi S, Pham QN, Skiadopoulos MH, Murphy BR, Collins PL, Buchholz UJ. infection of nonhuman primates with recombinant human metapneumovirus lacking the SH, G, or M2-2 protein categorizes each as a nonessential accessory protein and identifies vaccine candidates. Journal of virology. 2005; 79(19):12608-13.
Buchholz UJ, Biacchesi S, Pham QN, Tran KC, Yang L, Luongo CL, Skiadopoulos MH, Murphy BR, Collins PL. Deletion of M2 gene open reading frames 1 and 2 of human metapneumovirus: effects on RNA synthesis, attenuation, and immunogenicity. J Virol. 2005 Jun; 79(11):6588-97.
Schickli JH, Kaur J, Macphail M, Guzzetta JM, Spaete RR, Tang RS. Deletion of human metapneumovirus M2-2 increases mutation frequency and attenuates growth in hamsters. Virol J. 2008 Jun 3;5:69.
Pham QN, Biacchesi S, Skiadopoulos MH, Murphy BR, Collins PL, Buchholz UJ. Chimeric recombinant human metapneumoviruses with the nucleoprotein or phosphoprotein open reading frame replaced by that of avian metapneumovirus exhibit improved growth in vitro and attenuation in vivo. J Virol. 2005 Dec; 79(24):15114-22.
Tang RS, Schickli JH, MacPhail M, Fernandes F, Bicha L, Spaete J, Fouchier RA, Osterhaus AD, Spaete R, Haller AA. Effects of human metapneumovirus and respiratory syncytial virus antigen insertion in two 3' proximal genome positions of bovine/human parainfluenza virus type 3 on virus replication and immunogenicity. J Virol. 2003 Oct; 77(20): 10819-28.
Tang RS, Mahmood K, Macphail M, Guzzetta JM, Haller AA, Liu H, Kaur J, Lawlor HA, Stillman EA, Schickli JH, Fouchier RA, Osterhaus AD, Spaete RR. A host-range restricted parainfluenza virus type 3 (PIV3) expressing the human metapneumovirusfhMPV) fusion protein elicits protective immunity in African green monkeys. Vaccine. 2005 Feb 25; 23(14): 1657-67.
Russell CJ, Jones BG, Sealy RE, Surman SL, Mason JN, Hayden RT, Tripp RA, Takimoto T, Hurwitz JL. A Sendai recombinant virus vaccine expressing a gene for truncated human metapneumovirus (hMPV) fusion protein protects cotton rats from hMPV challenge. Virology. 2017 Sep; 509:60-66.
Huck B, Scharf G, Neumann-Haefelin D, Puppe W, Weigl J, Falcone V. Novel human metapneumovirus sublineage, Emerg Infect Dis. 2006 Jan; 12(1): 147-50.
Aerts L, Rhéaume C, Carbonneau J, Lavigne S, Couture C, Hamelin ME, Boivin G. Adjuvant effect of the human metapneumovirus (HMPV) matrix protein in HMPV subunit vaccines. J Gen Virol. 2015 Apr; 96(Pt 4):767-74.
Dubois J, Cavanagh MH, Terrier O, Hamelin ME, Lina B, Shi R, et al. Mutations in the fusion protein heptad repeat domains of human metapneumovirus impact on the formation of syncytia. The Journal of general virology. 2017; 98(6):1174-80.
Aerts L, Cavanagh MH, Dubois J, Carbonneau J, Rheaume C, Lavigne S, et al. Effect of in vitro syncytium formation on the severity of human metapneumovirus disease in a murine model. PloS one. 2015; 10(3):e0120283.
Hamelin ME, Gagnon C, Prince GA, Kiener P, Suzich J, Ulbrandt N, Boivin G. Prophylactic and therapeutic benefits of a monoclonal antibody against the fusion protein of human metapneumovirus in a mouse model. Antiviral Res. 2010 Oct; 88(1):31-7.
Palwithino CE, Cespedes PF, Lay MK, Riedel CA, Kalergis AM, Bueno SM. Understanding Lung Immunopathology Caused by the Human Metapneumovirus: Implications for Rational Vaccine Design. Crit Rev Immunol. 2015;35(3): 185-202. Review.
Hamelin ME, Couture C, Sackett MK, Boivin G. Enhanced lung disease and Th2 response following human metapneumovirus infection in mice immunised with the inactivated virus. J Gen Virol. 2007 Dec; 88(Pt 12):3391-400. PubMed PMID: 18024909.
--->
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
<110> UNIVERSITE CLAUDE BERNARD LYON 1
CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE (CNRS)
ECOLE NORMALE SUPERIEURE DE LYON
INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE
(INSERM)
UNIVERSITE LAVAL
<120> НОВЫЙ ОСЛАБЛЕННЫЙ ШТАММ ВИРУСА И ЕГО ПРИМЕНЕНИЕ В КАЧЕСТВЕ
ВАКЦИНЫ
<130> B376379PCT
<150> FR1856801
<151> 2018-07-23
<150> FR1902934
<151> 2019-03-21
<160> 8
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 13394
<212> ДНК
<213> метапевмовирус
<400> 1
gcgaaaaaaa cgcgtataaa ttagattaca aaaaaatatg ggacaagtga aaatgtctct
60
tcaagggatt cacctgagtg atctatcata caagcatgct atattaaaag agtctcagta
120
cacaataaaa agagatgtgg gtacaacaac tgcagtgaca ccctcatcat tgcaacaaga
180
aataacgctg ttgtgtggag aaattctgta tgctaaacat gctgattaca aatatgctgc
240
agaaatagga atacaatata ttagcacagc tttaggatca gagagagtgc agcagattct
300
gaggaactca ggcagtgaag tccaagtggt cttaaccaga acgtactctc tggggaaagt
360
taaaaacaat aaaggagaag atttacagat gttagacata cacggggtag agaagagctg
420
ggtagaagag atagacaaag aagcaaggaa aacaatggca accttgctta aggaatcatc
480
aggtaatatc ccacaaaatc agaggccctc agcaccagac acacccataa tcttattatg
540
tgtaggtgca ttaatattta ctaagctagc atcaaccata gaagtgggac tagagaccac
600
agtcagaagg gctaaccgtg tactaagtga tgcactcaag agatacccta gaatggacat
660
cccaaaaatt gccagatcct tctatgactt atttgaacaa aaagtgtatc acagaagttt
720
gttcattgag tatggcaaag cattaggctc atcatctaca ggcagcaaag cagaaagtct
780
atttgttaat atattcatgc aagcttatgg agccggtcaa acaatgctaa ggtggggggt
840
cattgccagg tcatccaaca atataatgtt aggacatgta tctgtccaag ctgagttaaa
900
acaggtcaca gaagtctatg acttggtgcg agaaatgggc cctgaatctg gacttctaca
960
tttaaggcaa agcccaaaag ctggactgtt atcactagcc aactgtccca actttgcaag
1020
tgttgttctc ggaaatgcct caggcttagg cataatcggt atgtatcgtg ggagagtacc
1080
aaacacagaa ttattttcag cagcagaaag ttatgccaaa agtttgaaag agagcaataa
1140
aatcaatttc tcttcattag gacttacaga tgaagagaaa gaggctgcag aacatttctt
1200
aaatgtgagt gacgacagtc aaaatgatta tgagtaatta aaaaagtggg acaagtcaaa
1260
atgtctttcc ctgaaggaaa agatattctt ttcatgggta atgaagcagc aaaattagca
1320
gaagctttcc agaaatcatt aaggaaacca agtcataaaa gatctcaatc tattatagga
1380
gaaaaagtga acactgtatc agaaacattg gaattaccta ctatcagtag acctgcaaaa
1440
ccaaccatac tgtcagaacc aaagttagca tggactgata aaggtggggc aatcaaaact
1500
gaaataaagc aagcaatcaa agtcatggat cctattgagg aagaagagtc tactgagaag
1560
aaggtgctgc cctccagtga tgggaaaacc cctgcagaaa agaaactgaa accatcaact
1620
aacaccaaaa agaaagtttc gtttacacca aatgaaccag gaaaatatac aaagttggaa
1680
aaagatgctc tagatttgct ctcagataat gaagaagaag atgcagaatc ttcaatctta
1740
acctttgaag aaagagatac ttcatcgtta agcattgagg ccagattgga atcaatagag
1800
gagaaattaa gcatgatatt agggctatta agaacactca acattgctac agcaggaccc
1860
acagcagcaa gagatgggat cagagatgca atgattggcg taagagagga attaatagca
1920
gacataataa aggaagccaa agggaaagca gcagaaatga tggaagagga aatgagtcaa
1980
cgatcaaaaa taggaaacgg tagtgtaaaa ctaacagaga aagcaaaaga gcttaacaaa
2040
attgttgaag atgaaagcac aagtggagaa tctgaagaag aagaagaacc aaaagacata
2100
caagacaata gtcaagaaga tgacatttac cagttaatta tgtagtttaa taaaaataaa
2160
caatgggaca agtaaaaatg gagtcctacc tagtagacac ttatcaaggc attccttaca
2220
cagcagctgt tcaagttgat ctaatagaaa aggacctgtt acctgcaagc ctaacaatat
2280
ggttcccttt gtttcaggcc aacacaccac cagcagtgct gctcgatcag ttgaaaaccc
2340
taacaataac cactctgtat gctgcatcac aaaatggtcc aatactcaaa gtgaatgcat
2400
cagcccaagg tgcagcaatg tctgtacttc ccaaaaaatt tgaagtcaat gcgactgtag
2460
cactcgatga atatagcaaa ttggaatttg acaaactcac agtctgtgaa gtaaaaacag
2520
tttacttaac aaccatgaaa ccatacggga tggtatcaaa atttgtgagc tcagccaaat
2580
cagttggcaa aaaaacacat gatctaatcg cactgtgtga ttttatggat ctagaaaaga
2640
acacacctgt tacaatacca gcattcatca aatcagtttc aatcaaagag agtgagtcag
2700
ctactgttga agctgctata agcagtgaag cagaccaagc tctaacacag gccaaaattg
2760
caccttatgc gggattgatt atgatcatga ctatgaacaa tcccaaaggc atattcaaaa
2820
agcttggagc tgggactcaa gttatagtag aactaggagc atatgtccag gctgaaagca
2880
taagtaaaat atgcaagact tggagccatc aagggacaag atatgtgttg aagtccagat
2940
aacagccaag caccttggcc aagagctact aactctatct catagattat aaagtcacca
3000
ttctagttat ataaaaatca agttagaaca agaattaaat caatcaagaa tgggacaaat
3060
aaaaatgtct tggaaagtgg tgatcatttt ttcattgtta ataacacctc aacacggtct
3120
taaagagagc tatttagaag agtcatgtag cactataact gaaggatatc tcagtgttct
3180
gaggacaggt tggtatacca acgtttttac actggaggta ggtgatgtag agaaccttac
3240
atgtgctgat ggacctagct taataaaaac agaattagac ctgaccaaaa gtgcactaag
3300
agaactcaga acagtttctg ctgatcaact ggcaagagag gagcaaattg agaatcccag
3360
acaatctaga tttgttctag gagcaatagc actcggtgtt gcaacagcag ctgcagttac
3420
agcaggtgtt gcaattgcca aaaccatccg gcttgaaagt gaagtaacag caattaagaa
3480
tgccctcaaa aagaccaatg aagcagtatc tacattgggg aatggagttc gagtgttggc
3540
aactgcagtg agggagctgg aagattttgt gagcaagaat ctaacacgtg caatcaacaa
3600
aaacaagtgc gacattgctg acctgaaaat ggccgttagc ttcagtcaat tcaacagaag
3660
gtttctaaat gttgtgcggc aattttcaga caatgctgga ataacaccag caatatcctt
3720
ggacttaatg acagatgctg aactagccag agctgtttcc aacatgccaa catctgcagg
3780
acaaataaaa ctgatgttgg agaaccgtgc aatggtaaga agaaaggggt tcggaatcct
3840
gataggagtt tacggaagct ccgtaattta catggtgcaa ctgccaatct ttggagttat
3900
agacacgcct tgctggatag taaaagcggc cccttcttgc tcagaaaaaa agggaaacta
3960
tgcttgcctt ttaagagaag atcaaggatg gtattgtcag aatgcagggt caactgttta
4020
ctacccaaat gaaaaagact gcgaaacaag aggagaccat gtcttttgcg acacagcagc
4080
aggaatcaat gttgctgagc agtcaaagga gtgcaacatc aacatatcca ctactaatta
4140
cccatgcaaa gttagcacag gaagacaccc tatcagtatg gttgcactgt ctcctcttgg
4200
ggctttggtt gcttgctaca agggagtgag ctgttccatt ggcagcaaca gagtagggat
4260
catcaagcaa ctgaacaaag gctgctctta tataaccaac caagacgcag acacagtgac
4320
aatagacaac actgtatacc agctaagcaa agttgagggc gaacagcatg ttataaaagg
4380
aaggccagtg tcaagcagct ttgatccagt caaatttcct gaagatcaat tcaatgttgc
4440
acttgaccaa gttttcgaaa gcattgagaa cagtcaggcc ttggtggatc aatcaaacag
4500
aatcctaagc agtgcagaga aaggaaacac tggcttcatc attgtaataa ttctaattgc
4560
tgtccttggc tctaccatga tcctagtgag tgtttttatc ataataaaga aaacaaagaa
4620
acccacagga gcacctccag agctgagtgg tgtcacaaac aatggcttca taccacataa
4680
ttagttaatt aaaaataaag taaattaaat taaaataaaa taaaattaaa attaaaataa
4740
aataaaaata aaaatttggg acaaatcata atgtctcgca aggctccatg caaatatgaa
4800
gtgcggggca aatgcaatag aggaagtgag tgcaagttta accacaatta ctggagttgg
4860
ccagatagat acttactaat aagatcaaat tatttattaa atcaactttt aaggaacact
4920
gatagagctg atggcttatc aataatatca ggagcaggca gagaagatag gacacaagat
4980
tttgtcctag gttccaccaa tgtggttcaa ggttatattg atgataacca aagcataaca
5040
aaagctgcag cctgttacag tctacataat ataatcaaac aactacaaga agttgaagtt
5100
aggcaggcta gagataacaa accatctgac agcaaacatg tggcacttca caacttagtc
5160
ctatcttata tggagatgag caaaattcct gcatctttaa tcaacaatct caaaagactg
5220
ccgagagaga aactgaaaaa attagcaaag cttataattg acttatcagc aggtgctgaa
5280
aatgactctt catatgcctt gcaagacagt gaaagcacta atcaagtgca gtgagcatgg
5340
tcctgttttc attactatag aggttgatta catgatatgg actcataagg acttaaaaga
5400
agctttatct aatgggatag tgaagtctca tactaacatt tacaattgtt atttagaaaa
5460
catagaaatt atatatgtca aggcttactt aagttagtaa aaacacatca gagtgggata
5520
aatgacaatg ataacattag atgtcattaa aagtgatggg tcttcaaaaa catgtactca
5580
cctcaaaaaa ttaattaaag accactctgg taaagtgctt attgtactta agttaatatt
5640
agctttacta acatttctca cagtgacaat caccatcaat tatataaaag tagaaaacaa
5700
tctgcaaata tgtcagtcaa aaactgaatc agacaaaaag gactcatcat caaataccac
5760
atcagtcaca accaagacta ctctaaatca tgatataaca cagtatttta aaagtttgat
5820
tcaaaggtat acaaactctg caataaacag agacacatgc tggaaaataa gcagaaatca
5880
atgcacaaac ataacaacat acaaattttt atgttttaaa tctgaagaaa caaaaaccaa
5940
caattgtgat aaactgacag atttatgcag aaacaaacca aaaccagctg ttgaagtgta
6000
tcacatagta gaatgccatt gtatatacac agttaaatgg aagtgctatc attacccaat
6060
agatgaaacc caatcctaaa taacactaga ttaggatcca tccaagtctg ttagttcaac
6120
aatttagtta tttaaaaata ttttgaaaac aagtaagttt ctatgatact tcataataat
6180
aagtaataat taattgctta atcatcatca caacattatt cgaaaccata actattcaat
6240
ttaagaagta aaaacaataa tatgggacaa gtagttatgg aggtgaaagt ggagaacatt
6300
cgaacaatag atatgctcaa agcaagagtg aaaaatcgtg tggcacgcag caaatgcttt
6360
aaaaatgcct ctttgatcct aataggaata actacattga gtatagccct caatatctat
6420
ctaatcataa actatacaat gcaagaaaac acatccgaat cagaacatca caccagctca
6480
tcacccatgg aatccagcag ggaaactcca acagtcccta tggacaactc agacaccaat
6540
ccaggctcac agtatccaac tcaacagtcc acagaaggct ccacactcta ctttgcagcc
6600
tcagcaagct caccagagac agaaccaaca tcaacaccag acacaacaag ccgcccgccc
6660
ttcgtcgaca cacacacaac actaccaagt gcaagcagaa caaggacaag tccggcagtc
6720
cacacaaaaa acaatccaag gacaagcccc agaacacatt ccccaccatg ggcaatgaca
6780
aggacggtcc gtggaaccac cactctccgc acaagcagca caagaaaaag accgtccaca
6840
gcatcagtcc aacctgacag cagcgcaaca acccacaaac acgaagaagc aagcccagtg
6900
agcccgcaaa catctgcgag cacagcaaga ccacaaagga agggcatgga ggccagcaca
6960
tcaacaacat acaaccaaac tagttaacaa aaaatacaaa ataactctaa gataaaccat
7020
atagacacca acaattgaga agccaaaagg caattcacaa tctctccaaa aaggcaacaa
7080
caccatatta gctccgctta aatctccctg gaaaaaacac tcgcccatat accaactata
7140
ccacaaccat cccaagaaaa aaagctgggt aaaacaacac ccaagagaca aataacaatg
7200
gatcctctta atgaatccac tgttaatgtc tatcttcccg actcatatct taaaggagtg
7260
atttctttta gtgagactaa tgcaattggt tcatgtctct taaaaagacc ttacctaaaa
7320
aatgacaaca ctgcaaaagt tgccatagag aatcctgtta tcgagcatgt tagactcaaa
7380
aatgcaatca attctaagat gaaaatatca gattacagga tagtagagcc agtaaacatg
7440
caacatgaaa ttatgaagaa tgtacacagt tgtgagctca cattattaaa acagttttta
7500
acaaggagta aaaatattag cactcttaaa ttaaatatga tatgtgattg gctgcagtta
7560
aagtctacat cagatgatac ctcaatctta agttttatag atgtagaatt tatacctagc
7620
tgggtaagca attggtttag taattggtac aatctcaaca agttgattct ggaattcagg
7680
aaagaagaag taataagaac tggttcaatc ttgtgtaggt cattgggtaa attagttttt
7740
gttgtatcat catacggatg tatagtcaag agcaacaaaa gcaaaagagt gagcttcttc
7800
acatacaatc aactgttaac atggaaagat gtgatgttaa gtagattcaa tgcaaatttc
7860
tgtatatggg taagcaacag tctgaatgaa aatcaagaag ggttagggtt gagaagtaat
7920
ctgcaaggca tattaactaa taagctatat gaaactgtag attatatgct tagtttgtgt
7980
tgcaatgaag gtttctcact tgtgaaagag tttgagggtt ttattatgag tgaaatcctt
8040
aggattactg aacatgctca attcagtact agatttagaa atactttatt aaatggatta
8100
actgatcaat tgacaaaatt aaaaaataaa aacagactca gagttcatgg taccgtgtta
8160
gaaaataatg attatccaat gtatgaagtt gtacttaaat tattaggaga tactttgaga
8220
tgtattaaat tattaatcaa taaaaactta gagaatgctg ctgaattata ctatatattt
8280
agaatattcg gtcacccaat ggtagatgaa agagatgcaa tggatgctgt caaattaaac
8340
aatgaaatca caaaaatcct caggttggag agcttgacag aactaagagg ggcattcata
8400
ttaaggatta tcaaaggatt tgtagacaac aacaaaagat ggccgaaaat taaaaactta
8460
aaagtgctta gtaaaagatg gactatgtac ttcaaagcaa aaagttaccc tagtcaactt
8520
gaattaagtg aacaagattt tttagagctt gctgcaatac agtttgaaca agagttttct
8580
gttcctgaaa aaaccaacct tgagatggta ttaaatgata aagctatatc acctcctaaa
8640
agattaattt ggtctgtgta cccaaaaaat tacttacctg agacaataaa aaatcgatat
8700
ctagaagaga ctttcaatgc aagtgatagt ctcaaaacaa gaagagtact agagtactat
8760
ttgaaagata ataaattcga ccaaaaagaa cttaaaagtt atgtggttaa acaagaatat
8820
ttaaatgata aggatcatat tgtctcgcta actggaaaag aaagagaatt aagtgtaggt
8880
agaatgtttg ctatgcaacc aggaaaacag cgacaaatac aaatattggc tgaaaaattg
8940
ttagctgata atattgtacc ctttttccca gaaactttaa caaagtatgg tgatctagat
9000
cttcagagaa taatggaaat caaatcagaa ctttcttcta ttaaaaccag aagaaatgat
9060
agttataata attacattgc aagagcatcc atagtaacag atttaagtaa gttcaaccaa
9120
gcctttaggt atgaaactac agcgatctgt gcggatgtag cagatgaact acatggaaca
9180
caaagcctat tctgttggtt acatcttatc gttcctatga ctacaatgat atgtgcctat
9240
agacatgcac caccagaaac aaaaggtgaa tatgatatag ataagataga agagcaaagt
9300
ggtttatata gatatcatat gggtggtatt gaaggatggt gtcaaaaact ctggacaatg
9360
gaagctatat ctttattaga tgttgtatct gtaaagacac gatgtcaaat gacatcttta
9420
ttaaacggtg acaaccaatc aatagatgta agtaaaccag ttaagttatc tgagggttta
9480
gatgaagtga aagcagatta tagcttggct gtaaaaatgc taaaagaaat aagagatgca
9540
tacagaaata taggccataa acttaaagaa ggggaaacat atatatcaag agatcttcag
9600
tttataagta aggtgattca atctgaagga gtaatgcatc ctacccctat aaaaaagatc
9660
ttaagagtgg gaccatggat aaacacaata ttagatgaca ttaaaaccag tgcagagtca
9720
atagggagtc tatgtcagga attagaattt aggggggaaa gcataatagt tagtctgata
9780
ttaaggaatt tttggctgta taatttatac atgcatgaat caaagcaaca ccccctagca
9840
gggaagcagt tattcaaaca actaaataaa acattaacat cagtgcagag attttttgaa
9900
attaaaaagg aaaatgaagt agtagatcta tggatgaaca taccaatgca gtttggagga
9960
ggagatccag tagtcttcta tagatctttc tatagaagga cccctgattt tttaactgaa
10020
gcaatcagtc atgtagatat tctgttaaaa atatcagcca acataagaaa tgaagcgaaa
10080
ataagtttct tcaaagcctt actgtcaata gaaaaaaatg aacgtgctac actgacaaca
10140
ctaatgagag accctcaagc tgtgggctca gagcgacaag caaaagtaac aagtgatatc
10200
aatagaacag cagttaccag catcttaagt ctttctccaa atcaactttt cagcgatagt
10260
gctatacact acagtagaaa tgaagaagag gtcggaatca ttgctgacaa cataacacct
10320
gtttatcctc atggactgag agttttgtat gaatcattac cttttcataa agctgaaaaa
10380
gttgtaaata tgatatcagg aacaaaatcc ataaccaact tattacagag aacatctgct
10440
attaatggtg aagatattga cagagctgta tccatgatgc tggagaacct aggattatta
10500
tctagaatat tgtcagtagt tgttgatagt atagaaattc caaccaaatc taatggtagg
10560
ctgatatgtt gtcagatatc tagaacccta agggagacat catggaataa tatggaaata
10620
gttggagtaa catcccctag catcactaca tgcatggatg tcatatatgc aactagctct
10680
catttgaaag ggataatcat tgaaaagttc agcactgaca gaactacaag aggtcaaaga
10740
ggtccaaaga gcccttgggt aggatcgagc acgcaagaga aaaaattagt tcctgtttat
10800
aacagacaaa ttctttcaaa acaacaaaga gaacagctag aagcaattgg aaaaatgaga
10860
tgggtatata aagggacacc aggtttaaga cgattactca ataagatttg tcttggaagt
10920
ttaggcatta gttacaaatg tgtaaaacct ttattaccta ggtttatgag tgtaaatttc
10980
ctacacaggt tatctgtcag tagtagacct atggaattcc cagcatcagt tccagcttat
11040
agaacaacaa attaccattt tgacactagt cctattaatc aagcactaag tgaaagattt
11100
gggaatgaag atattaattt ggtcttccaa aatgcaatca gctgtggaat tagcataatg
11160
agtgtagtag aacaattaac tggtaggagt ccaaaacagt tagttttaat accccaatta
11220
gaagaaatag acattatgcc accaccagtg tttcaaggga aattcaatta taagctagta
11280
gataagataa cttctgacca acatatcttc agtccagaca aaatagatat gttaacactg
11340
gggaaaatgc tcatgccaac tataaaaggt cagaaaacag atcagttctt gaacaagaga
11400
gagaattatt tccatgggaa caatcttatt gagtctttgt cagcagcgtt agcatgtcat
11460
tggtgtggga tattaacaga gcaatgtata gaaaataata ttttcaagaa agactggggt
11520
gacgggttca tatcggatca tgcttttatg gacttcaaaa tattcctatg tgtctttaaa
11580
actaaacttt tatgtagttg gggatcccaa gggaaaaaca ttaaagatga agatatagta
11640
gatgaatcga tagataaact gttaaggatt gataatactt tttggagaat gttcagcaag
11700
gttatgtttg aatcaaaggt taagaaaagg ataatgttat atgatgtaaa atttctatca
11760
ttagtaggtt atatagggtt taagaattgg tttatagaac agttgagatc agctgagttg
11820
catgaggtac cttggattgt caatgccgaa ggtgatctgg ttgagatcaa gtcaattaaa
11880
atctatttgc aactgataga gcagagttta tttttaagaa taactgtttt gaactataca
11940
gatatggcac atgctctcac aagattaatc agaaagaagt tgatgtgtga taatgcacta
12000
ttaacttcaa ttccatcccc aatggttaac ttaactcaag ttattgatcc tacagaacaa
12060
ttagcttatt tccctaagat aacatttgaa aggctaaaaa attatgacac tagttcaaat
12120
tatgctaaag gaaagctaac aaggaattac atgatactgt tgccatggca acatgttaat
12180
agatataact ttgtctttag ttctactgga tgtaaagtta gtctaaaaac atgcattgga
12240
aaacttatga aagatctaaa ccctaaagtt ctgtacttta ttggagaagg ggcaggaaat
12300
tggatggcca gaacagcatg tgaatatcct gacatcaaat ttgtatacag aagtttaaaa
12360
gatgaccttg atcatcatta tcctttggaa taccagagag tgataggaga attaagcagg
12420
ataatagata gtggtgaagg gctttcaatg gaaacaacag atgcaactca aaaaactcat
12480
tgggatttga tacacagagt aagcaaagat gctttattaa taactttatg tgatgcagaa
12540
tttaaggaca gagatgattt ttttaagatg gtaattctat ggaggaaaca tgtattatca
12600
tgcagaattt gcactaccta tgggacagac ctctatttat tcgcaaagta tcatgctaaa
12660
gactgcaata taaaattacc tttttttgtg agatcagttg ccacctttat tatgcaaggt
12720
agtaaactgt caggctcgga atgctacata ctcttaacac taggccacca caacaattta
12780
ccttgtcatg gagaaataca aaattctaag atgaaaatag cagcgtgtaa tgatttttat
12840
gctgcaaaaa aacttgacaa taaatcaatt gaagccaact gtaaatcact tttatcaggg
12900
ctaagaatac cgataaataa gaaggaatta aatagacaga gaaggttatt aacactacaa
12960
agcaaccatt cttctgtagc aacagttgga ggtagcaagg tcatagagtc taaatggtta
13020
acaaacaagg caaacacaat aattgattgg ttagaacata ttttaaattc tccaaaaggt
13080
gaattaaatt atgatttttt tgaagcatta gaaaatactt accctaatat gattaaacta
13140
atagataatc tagggaatgc agagattaaa aaactgatca aagtaactgg atatatgctt
13200
gtaagtaaaa aatgaaaaat gataaaaatg ataaaatagg tgacaacttc atactattcc
13260
aaagtaatca tttgattatg caattatgta atagttaatt aaaaactaaa aatcaaaagt
13320
taaaaactaa taactgtcat taagtttatt aaaaataaga aattataatt ggatgtatac
13380
ggtttttttg ccgt
13394
<210> 2
<211> 12645
<212> ДНК
<213> метапевмовирус
<400> 2
gcgaaaaaaa cgcgtataaa ttagattaca aaaaaatatg ggacaagtga aaatgtctct
60
tcaagggatt cacctgagtg atctatcata caagcatgct atattaaaag agtctcagta
120
cacaataaaa agagatgtgg gtacaacaac tgcagtgaca ccctcatcat tgcaacaaga
180
aataacgctg ttgtgtggag aaattctgta tgctaaacat gctgattaca aatatgctgc
240
agaaatagga atacaatata ttagcacagc tttaggatca gagagagtgc agcagattct
300
gaggaactca ggcagtgaag tccaagtggt cttaaccaga acgtactctc tggggaaagt
360
taaaaacaat aaaggagaag atttacagat gttagacata cacggggtag agaagagctg
420
ggtagaagag atagacaaag aagcaaggaa aacaatggca accttgctta aggaatcatc
480
aggtaatatc ccacaaaatc agaggccctc agcaccagac acacccataa tcttattatg
540
tgtaggtgca ttaatattta ctaagctagc atcaaccata gaagtgggac tagagaccac
600
agtcagaagg gctaaccgtg tactaagtga tgcactcaag agatacccta gaatggacat
660
cccaaaaatt gccagatcct tctatgactt atttgaacaa aaagtgtatc acagaagttt
720
gttcattgag tatggcaaag cattaggctc atcatctaca ggcagcaaag cagaaagtct
780
atttgttaat atattcatgc aagcttatgg agccggtcaa acaatgctaa ggtggggggt
840
cattgccagg tcatccaaca atataatgtt aggacatgta tctgtccaag ctgagttaaa
900
acaggtcaca gaagtctatg acttggtgcg agaaatgggc cctgaatctg gacttctaca
960
tttaaggcaa agcccaaaag ctggactgtt atcactagcc aactgtccca actttgcaag
1020
tgttgttctc ggaaatgcct caggcttagg cataatcggt atgtatcgtg ggagagtacc
1080
aaacacagaa ttattttcag cagcagaaag ttatgccaaa agtttgaaag agagcaataa
1140
aatcaatttc tcttcattag gacttacaga tgaagagaaa gaggctgcag aacatttctt
1200
aaatgtgagt gacgacagtc aaaatgatta tgagtaatta aaaaagtggg acaagtcaaa
1260
atgtctttcc ctgaaggaaa agatattctt ttcatgggta atgaagcagc aaaattagca
1320
gaagctttcc agaaatcatt aaggaaacca agtcataaaa gatctcaatc tattatagga
1380
gaaaaagtga acactgtatc agaaacattg gaattaccta ctatcagtag acctgcaaaa
1440
ccaaccatac tgtcagaacc aaagttagca tggactgata aaggtggggc aatcaaaact
1500
gaaataaagc aagcaatcaa agtcatggat cctattgagg aagaagagtc tactgagaag
1560
aaggtgctgc cctccagtga tgggaaaacc cctgcagaaa agaaactgaa accatcaact
1620
aacaccaaaa agaaagtttc gtttacacca aatgaaccag gaaaatatac aaagttggaa
1680
aaagatgctc tagatttgct ctcagataat gaagaagaag atgcagaatc ttcaatctta
1740
acctttgaag aaagagatac ttcatcgtta agcattgagg ccagattgga atcaatagag
1800
gagaaattaa gcatgatatt agggctatta agaacactca acattgctac agcaggaccc
1860
acagcagcaa gagatgggat cagagatgca atgattggcg taagagagga attaatagca
1920
gacataataa aggaagccaa agggaaagca gcagaaatga tggaagagga aatgagtcaa
1980
cgatcaaaaa taggaaacgg tagtgtaaaa ctaacagaga aagcaaaaga gcttaacaaa
2040
attgttgaag atgaaagcac aagtggagaa tctgaagaag aagaagaacc aaaagacata
2100
caagacaata gtcaagaaga tgacatttac cagttaatta tgtagtttaa taaaaataaa
2160
caatgggaca agtaaaaatg gagtcctacc tagtagacac ttatcaaggc attccttaca
2220
cagcagctgt tcaagttgat ctaatagaaa aggacctgtt acctgcaagc ctaacaatat
2280
ggttcccttt gtttcaggcc aacacaccac cagcagtgct gctcgatcag ttgaaaaccc
2340
taacaataac cactctgtat gctgcatcac aaaatggtcc aatactcaaa gtgaatgcat
2400
cagcccaagg tgcagcaatg tctgtacttc ccaaaaaatt tgaagtcaat gcgactgtag
2460
cactcgatga atatagcaaa ttggaatttg acaaactcac agtctgtgaa gtaaaaacag
2520
tttacttaac aaccatgaaa ccatacggga tggtatcaaa atttgtgagc tcagccaaat
2580
cagttggcaa aaaaacacat gatctaatcg cactgtgtga ttttatggat ctagaaaaga
2640
acacacctgt tacaatacca gcattcatca aatcagtttc aatcaaagag agtgagtcag
2700
ctactgttga agctgctata agcagtgaag cagaccaagc tctaacacag gccaaaattg
2760
caccttatgc gggattgatt atgatcatga ctatgaacaa tcccaaaggc atattcaaaa
2820
agcttggagc tgggactcaa gttatagtag aactaggagc atatgtccag gctgaaagca
2880
taagtaaaat atgcaagact tggagccatc aagggacaag atatgtgttg aagtccagat
2940
aacagccaag caccttggcc aagagctact aactctatct catagattat aaagtcacca
3000
ttctagttat ataaaaatca agttagaaca agaattaaat caatcaagaa tgggacaaat
3060
aaaaatgtct tggaaagtgg tgatcatttt ttcattgtta ataacacctc aacacggtct
3120
taaagagagc tatttagaag agtcatgtag cactataact gaaggatatc tcagtgttct
3180
gaggacaggt tggtatacca acgtttttac actggaggta ggtgatgtag agaaccttac
3240
atgtgctgat ggacctagct taataaaaac agaattagac ctgaccaaaa gtgcactaag
3300
agaactcaga acagtttctg ctgatcaact ggcaagagag gagcaaattg agaatcccag
3360
acaatctaga tttgttctag gagcaatagc actcggtgtt gcaacagcag ctgcagttac
3420
agcaggtgtt gcaattgcca aaaccatccg gcttgaaagt gaagtaacag caattaagaa
3480
tgccctcaaa aagaccaatg aagcagtatc tacattgggg aatggagttc gagtgttggc
3540
aactgcagtg agggagctgg aagattttgt gagcaagaat ctaacacgtg caatcaacaa
3600
aaacaagtgc gacattgctg acctgaaaat ggccgttagc ttcagtcaat tcaacagaag
3660
gtttctaaat gttgtgcggc aattttcaga caatgctgga ataacaccag caatatcctt
3720
ggacttaatg acagatgctg aactagccag agctgtttcc aacatgccaa catctgcagg
3780
acaaataaaa ctgatgttgg agaaccgtgc aatggtaaga agaaaggggt tcggaatcct
3840
gataggagtt tacggaagct ccgtaattta catggtgcaa ctgccaatct ttggagttat
3900
agacacgcct tgctggatag taaaagcggc cccttcttgc tcagaaaaaa agggaaacta
3960
tgcttgcctt ttaagagaag atcaaggatg gtattgtcag aatgcagggt caactgttta
4020
ctacccaaat gaaaaagact gcgaaacaag aggagaccat gtcttttgcg acacagcagc
4080
aggaatcaat gttgctgagc agtcaaagga gtgcaacatc aacatatcca ctactaatta
4140
cccatgcaaa gttagcacag gaagacaccc tatcagtatg gttgcactgt ctcctcttgg
4200
ggctttggtt gcttgctaca agggagtgag ctgttccatt ggcagcaaca gagtagggat
4260
catcaagcaa ctgaacaaag gctgctctta tataaccaac caagacgcag acacagtgac
4320
aatagacaac actgtatacc agctaagcaa agttgagggc gaacagcatg ttataaaagg
4380
aaggccagtg tcaagcagct ttgatccagt caaatttcct gaagatcaat tcaatgttgc
4440
acttgaccaa gttttcgaaa gcattgagaa cagtcaggcc ttggtggatc aatcaaacag
4500
aatcctaagc agtgcagaga aaggaaacac tggcttcatc attgtaataa ttctaattgc
4560
tgtccttggc tctaccatga tcctagtgag tgtttttatc ataataaaga aaacaaagaa
4620
acccacagga gcacctccag agctgagtgg tgtcacaaac aatggcttca taccacataa
4680
ttagttaatt aaaaataaag taaattaaat taaaataaaa taaaattaaa attaaaataa
4740
aataaaaata aaaatttggg acaaatcata atgtctcgca aggctccatg caaatatgaa
4800
gtgcggggca aatgcaatag aggaagtgag tgcaagttta accacaatta ctggagttgg
4860
ccagatagat acttactaat aagatcaaat tatttattaa atcaactttt aaggaacact
4920
gatagagctg atggcttatc aataatatca ggagcaggca gagaagatag gacacaagat
4980
tttgtcctag gttccaccaa tgtggttcaa ggttatattg atgataacca aagcataaca
5040
aaagctgcag cctgttacag tctacataat ataatcaaac aactacaaga agttgaagtt
5100
aggcaggcta gagataacaa accatctgac agcaaacatg tggcacttca caacttagtc
5160
ctatcttata tggagatgag caaaattcct gcatctttaa tcaacaatct caaaagactg
5220
ccgagagaga aactgaaaaa attagcaaag cttataattg acttatcagc aggtgctgaa
5280
aatgactctt catatgcctt gcaagacagt gaaagcacta atcaagtgca gtgagcatgg
5340
tcctgttttc attactatag aggttgatta catgatatgg actcataagg acttaaaaga
5400
agctttatct aatgggatag tgaagtctca tactaacatt tacaattgtt atttagaaaa
5460
catagaaatt atatatgtca aggcttactt aagttagtaa aaacacatca gagtgggaca
5520
agtagttatg gaggtgaaag tggagaacat tcgaacaata gatatgctca aagcaagagt
5580
gaaaaatcgt gtggcacgca gcaaatgctt taaaaatgcc tctttgatcc taataggaat
5640
aactacattg agtatagccc tcaatatcta tctaatcata aactatacaa tgcaagaaaa
5700
cacatccgaa tcagaacatc acaccagctc atcacccatg gaatccagca gggaaactcc
5760
aacagtccct atggacaact cagacaccaa tccaggctca cagtatccaa ctcaacagtc
5820
cacagaaggc tccacactct actttgcagc ctcagcaagc tcaccagaga cagaaccaac
5880
atcaacacca gacacaacaa gccgcccgcc cttcgtcgac acacacacaa cactaccaag
5940
tgcaagcaga acaaggacaa gtccggcagt ccacacaaaa aacaatccaa ggacaagccc
6000
cagaacacat tccccaccat gggcaatgac aaggacggtc cgtggaacca ccactctccg
6060
cacaagcagc acaagaaaaa gaccgtccac agcatcagtc caacctgaca gcagcgcaac
6120
aacccacaaa cacgaagaag caagcccagt gagcccgcaa acatctgcga gcacagcaag
6180
accacaaagg aagggcatgg aggccagcac atcaacaaca tacaaccaaa ctagttaaca
6240
aaaaatacaa aataactcta agataaacca tatagacacc aacaattgag aagccaaaag
6300
gcaattcaca atctctccaa aaaggcaaca acaccatatt agctccgctt aaatctccct
6360
ggaaaaaaca ctcgcccata taccaactat accacaacca tcccaagaaa aaaagctggg
6420
taaaacaaca cccaagagac aaataacaat ggatcctctt aatgaatcca ctgttaatgt
6480
ctatcttccc gactcatatc ttaaaggagt gatttctttt agtgagacta atgcaattgg
6540
ttcatgtctc ttaaaaagac cttacctaaa aaatgacaac actgcaaaag ttgccataga
6600
gaatcctgtt atcgagcatg ttagactcaa aaatgcaatc aattctaaga tgaaaatatc
6660
agattacagg atagtagagc cagtaaacat gcaacatgaa attatgaaga atgtacacag
6720
ttgtgagctc acattattaa aacagttttt aacaaggagt aaaaatatta gcactcttaa
6780
attaaatatg atatgtgatt ggctgcagtt aaagtctaca tcagatgata cctcaatctt
6840
aagttttata gatgtagaat ttatacctag ctgggtaagc aattggttta gtaattggta
6900
caatctcaac aagttgattc tggaattcag gaaagaagaa gtaataagaa ctggttcaat
6960
cttgtgtagg tcattgggta aattagtttt tgttgtatca tcatacggat gtatagtcaa
7020
gagcaacaaa agcaaaagag tgagcttctt cacatacaat caactgttaa catggaaaga
7080
tgtgatgtta agtagattca atgcaaattt ctgtatatgg gtaagcaaca gtctgaatga
7140
aaatcaagaa gggttagggt tgagaagtaa tctgcaaggc atattaacta ataagctata
7200
tgaaactgta gattatatgc ttagtttgtg ttgcaatgaa ggtttctcac ttgtgaaaga
7260
gtttgagggt tttattatga gtgaaatcct taggattact gaacatgctc aattcagtac
7320
tagatttaga aatactttat taaatggatt aactgatcaa ttgacaaaat taaaaaataa
7380
aaacagactc agagttcatg gtaccgtgtt agaaaataat gattatccaa tgtatgaagt
7440
tgtacttaaa ttattaggag atactttgag atgtattaaa ttattaatca ataaaaactt
7500
agagaatgct gctgaattat actatatatt tagaatattc ggtcacccaa tggtagatga
7560
aagagatgca atggatgctg tcaaattaaa caatgaaatc acaaaaatcc tcaggttgga
7620
gagcttgaca gaactaagag gggcattcat attaaggatt atcaaaggat ttgtagacaa
7680
caacaaaaga tggccgaaaa ttaaaaactt aaaagtgctt agtaaaagat ggactatgta
7740
cttcaaagca aaaagttacc ctagtcaact tgaattaagt gaacaagatt ttttagagct
7800
tgctgcaata cagtttgaac aagagttttc tgttcctgaa aaaaccaacc ttgagatggt
7860
attaaatgat aaagctatat cacctcctaa aagattaatt tggtctgtgt acccaaaaaa
7920
ttacttacct gagacaataa aaaatcgata tctagaagag actttcaatg caagtgatag
7980
tctcaaaaca agaagagtac tagagtacta tttgaaagat aataaattcg accaaaaaga
8040
acttaaaagt tatgtggtta aacaagaata tttaaatgat aaggatcata ttgtctcgct
8100
aactggaaaa gaaagagaat taagtgtagg tagaatgttt gctatgcaac caggaaaaca
8160
gcgacaaata caaatattgg ctgaaaaatt gttagctgat aatattgtac cctttttccc
8220
agaaacttta acaaagtatg gtgatctaga tcttcagaga ataatggaaa tcaaatcaga
8280
actttcttct attaaaacca gaagaaatga tagttataat aattacattg caagagcatc
8340
catagtaaca gatttaagta agttcaacca agcctttagg tatgaaacta cagcgatctg
8400
tgcggatgta gcagatgaac tacatggaac acaaagccta ttctgttggt tacatcttat
8460
cgttcctatg actacaatga tatgtgccta tagacatgca ccaccagaaa caaaaggtga
8520
atatgatata gataagatag aagagcaaag tggtttatat agatatcata tgggtggtat
8580
tgaaggatgg tgtcaaaaac tctggacaat ggaagctata tctttattag atgttgtatc
8640
tgtaaagaca cgatgtcaaa tgacatcttt attaaacggt gacaaccaat caatagatgt
8700
aagtaaacca gttaagttat ctgagggttt agatgaagtg aaagcagatt atagcttggc
8760
tgtaaaaatg ctaaaagaaa taagagatgc atacagaaat ataggccata aacttaaaga
8820
aggggaaaca tatatatcaa gagatcttca gtttataagt aaggtgattc aatctgaagg
8880
agtaatgcat cctaccccta taaaaaagat cttaagagtg ggaccatgga taaacacaat
8940
attagatgac attaaaacca gtgcagagtc aatagggagt ctatgtcagg aattagaatt
9000
taggggggaa agcataatag ttagtctgat attaaggaat ttttggctgt ataatttata
9060
catgcatgaa tcaaagcaac accccctagc agggaagcag ttattcaaac aactaaataa
9120
aacattaaca tcagtgcaga gattttttga aattaaaaag gaaaatgaag tagtagatct
9180
atggatgaac ataccaatgc agtttggagg aggagatcca gtagtcttct atagatcttt
9240
ctatagaagg acccctgatt ttttaactga agcaatcagt catgtagata ttctgttaaa
9300
aatatcagcc aacataagaa atgaagcgaa aataagtttc ttcaaagcct tactgtcaat
9360
agaaaaaaat gaacgtgcta cactgacaac actaatgaga gaccctcaag ctgtgggctc
9420
agagcgacaa gcaaaagtaa caagtgatat caatagaaca gcagttacca gcatcttaag
9480
tctttctcca aatcaacttt tcagcgatag tgctatacac tacagtagaa atgaagaaga
9540
ggtcggaatc attgctgaca acataacacc tgtttatcct catggactga gagttttgta
9600
tgaatcatta ccttttcata aagctgaaaa agttgtaaat atgatatcag gaacaaaatc
9660
cataaccaac ttattacaga gaacatctgc tattaatggt gaagatattg acagagctgt
9720
atccatgatg ctggagaacc taggattatt atctagaata ttgtcagtag ttgttgatag
9780
tatagaaatt ccaaccaaat ctaatggtag gctgatatgt tgtcagatat ctagaaccct
9840
aagggagaca tcatggaata atatggaaat agttggagta acatccccta gcatcactac
9900
atgcatggat gtcatatatg caactagctc tcatttgaaa gggataatca ttgaaaagtt
9960
cagcactgac agaactacaa gaggtcaaag aggtccaaag agcccttggg taggatcgag
10020
cacgcaagag aaaaaattag ttcctgttta taacagacaa attctttcaa aacaacaaag
10080
agaacagcta gaagcaattg gaaaaatgag atgggtatat aaagggacac caggtttaag
10140
acgattactc aataagattt gtcttggaag tttaggcatt agttacaaat gtgtaaaacc
10200
tttattacct aggtttatga gtgtaaattt cctacacagg ttatctgtca gtagtagacc
10260
tatggaattc ccagcatcag ttccagctta tagaacaaca aattaccatt ttgacactag
10320
tcctattaat caagcactaa gtgaaagatt tgggaatgaa gatattaatt tggtcttcca
10380
aaatgcaatc agctgtggaa ttagcataat gagtgtagta gaacaattaa ctggtaggag
10440
tccaaaacag ttagttttaa taccccaatt agaagaaata gacattatgc caccaccagt
10500
gtttcaaggg aaattcaatt ataagctagt agataagata acttctgacc aacatatctt
10560
cagtccagac aaaatagata tgttaacact ggggaaaatg ctcatgccaa ctataaaagg
10620
tcagaaaaca gatcagttct tgaacaagag agagaattat ttccatggga acaatcttat
10680
tgagtctttg tcagcagcgt tagcatgtca ttggtgtggg atattaacag agcaatgtat
10740
agaaaataat attttcaaga aagactgggg tgacgggttc atatcggatc atgcttttat
10800
ggacttcaaa atattcctat gtgtctttaa aactaaactt ttatgtagtt ggggatccca
10860
agggaaaaac attaaagatg aagatatagt agatgaatcg atagataaac tgttaaggat
10920
tgataatact ttttggagaa tgttcagcaa ggttatgttt gaatcaaagg ttaagaaaag
10980
gataatgtta tatgatgtaa aatttctatc attagtaggt tatatagggt ttaagaattg
11040
gtttatagaa cagttgagat cagctgagtt gcatgaggta ccttggattg tcaatgccga
11100
aggtgatctg gttgagatca agtcaattaa aatctatttg caactgatag agcagagttt
11160
atttttaaga ataactgttt tgaactatac agatatggca catgctctca caagattaat
11220
cagaaagaag ttgatgtgtg ataatgcact attaacttca attccatccc caatggttaa
11280
cttaactcaa gttattgatc ctacagaaca attagcttat ttccctaaga taacatttga
11340
aaggctaaaa aattatgaca ctagttcaaa ttatgctaaa ggaaagctaa caaggaatta
11400
catgatactg ttgccatggc aacatgttaa tagatataac tttgtcttta gttctactgg
11460
atgtaaagtt agtctaaaaa catgcattgg aaaacttatg aaagatctaa accctaaagt
11520
tctgtacttt attggagaag gggcaggaaa ttggatggcc agaacagcat gtgaatatcc
11580
tgacatcaaa tttgtataca gaagtttaaa agatgacctt gatcatcatt atcctttgga
11640
ataccagaga gtgataggag aattaagcag gataatagat agtggtgaag ggctttcaat
11700
ggaaacaaca gatgcaactc aaaaaactca ttgggatttg atacacagag taagcaaaga
11760
tgctttatta ataactttat gtgatgcaga atttaaggac agagatgatt tttttaagat
11820
ggtaattcta tggaggaaac atgtattatc atgcagaatt tgcactacct atgggacaga
11880
cctctattta ttcgcaaagt atcatgctaa agactgcaat ataaaattac ctttttttgt
11940
gagatcagtt gccaccttta ttatgcaagg tagtaaactg tcaggctcgg aatgctacat
12000
actcttaaca ctaggccacc acaacaattt accttgtcat ggagaaatac aaaattctaa
12060
gatgaaaata gcagcgtgta atgattttta tgctgcaaaa aaacttgaca ataaatcaat
12120
tgaagccaac tgtaaatcac ttttatcagg gctaagaata ccgataaata agaaggaatt
12180
aaatagacag agaaggttat taacactaca aagcaaccat tcttctgtag caacagttgg
12240
aggtagcaag gtcatagagt ctaaatggtt aacaaacaag gcaaacacaa taattgattg
12300
gttagaacat attttaaatt ctccaaaagg tgaattaaat tatgattttt ttgaagcatt
12360
agaaaatact taccctaata tgattaaact aatagataat ctagggaatg cagagattaa
12420
aaaactgatc aaagtaactg gatatatgct tgtaagtaaa aaatgaaaaa tgataaaaat
12480
gataaaatag gtgacaactt catactattc caaagtaatc atttgattat gcaattatgt
12540
aatagttaat taaaaactaa aaatcaaaag ttaaaaacta ataactgtca ttaagtttat
12600
taaaaataag aaattataat tggatgtata cggttttttt gccgt
12645
<210> 3
<211> 12473
<212> ДНК
<213> метапевмовирус
<400> 3
gcgaaaaaaa cgcgtataaa ttagattaca aaaaaatatg ggacaagtga aaatgtctct
60
tcaagggatt cacctgagtg atctatcata caagcatgct atattaaaag agtctcagta
120
cacaataaaa agagatgtgg gtacaacaac tgcagtgaca ccctcatcat tgcaacaaga
180
aataacgctg ttgtgtggag aaattctgta tgctaaacat gctgattaca aatatgctgc
240
agaaatagga atacaatata ttagcacagc tttaggatca gagagagtgc agcagattct
300
gaggaactca ggcagtgaag tccaagtggt cttaaccaga acgtactctc tggggaaagt
360
taaaaacaat aaaggagaag atttacagat gttagacata cacggggtag agaagagctg
420
ggtagaagag atagacaaag aagcaaggaa aacaatggca accttgctta aggaatcatc
480
aggtaatatc ccacaaaatc agaggccctc agcaccagac acacccataa tcttattatg
540
tgtaggtgca ttaatattta ctaagctagc atcaaccata gaagtgggac tagagaccac
600
agtcagaagg gctaaccgtg tactaagtga tgcactcaag agatacccta gaatggacat
660
cccaaaaatt gccagatcct tctatgactt atttgaacaa aaagtgtatc acagaagttt
720
gttcattgag tatggcaaag cattaggctc atcatctaca ggcagcaaag cagaaagtct
780
atttgttaat atattcatgc aagcttatgg agccggtcaa acaatgctaa ggtggggggt
840
cattgccagg tcatccaaca atataatgtt aggacatgta tctgtccaag ctgagttaaa
900
acaggtcaca gaagtctatg acttggtgcg agaaatgggc cctgaatctg gacttctaca
960
tttaaggcaa agcccaaaag ctggactgtt atcactagcc aactgtccca actttgcaag
1020
tgttgttctc ggaaatgcct caggcttagg cataatcggt atgtatcgtg ggagagtacc
1080
aaacacagaa ttattttcag cagcagaaag ttatgccaaa agtttgaaag agagcaataa
1140
aatcaatttc tcttcattag gacttacaga tgaagagaaa gaggctgcag aacatttctt
1200
aaatgtgagt gacgacagtc aaaatgatta tgagtaatta aaaaagtggg acaagtcaaa
1260
atgtctttcc ctgaaggaaa agatattctt ttcatgggta atgaagcagc aaaattagca
1320
gaagctttcc agaaatcatt aaggaaacca agtcataaaa gatctcaatc tattatagga
1380
gaaaaagtga acactgtatc agaaacattg gaattaccta ctatcagtag acctgcaaaa
1440
ccaaccatac tgtcagaacc aaagttagca tggactgata aaggtggggc aatcaaaact
1500
gaaataaagc aagcaatcaa agtcatggat cctattgagg aagaagagtc tactgagaag
1560
aaggtgctgc cctccagtga tgggaaaacc cctgcagaaa agaaactgaa accatcaact
1620
aacaccaaaa agaaagtttc gtttacacca aatgaaccag gaaaatatac aaagttggaa
1680
aaagatgctc tagatttgct ctcagataat gaagaagaag atgcagaatc ttcaatctta
1740
acctttgaag aaagagatac ttcatcgtta agcattgagg ccagattgga atcaatagag
1800
gagaaattaa gcatgatatt agggctatta agaacactca acattgctac agcaggaccc
1860
acagcagcaa gagatgggat cagagatgca atgattggcg taagagagga attaatagca
1920
gacataataa aggaagccaa agggaaagca gcagaaatga tggaagagga aatgagtcaa
1980
cgatcaaaaa taggaaacgg tagtgtaaaa ctaacagaga aagcaaaaga gcttaacaaa
2040
attgttgaag atgaaagcac aagtggagaa tctgaagaag aagaagaacc aaaagacata
2100
caagacaata gtcaagaaga tgacatttac cagttaatta tgtagtttaa taaaaataaa
2160
caatgggaca agtaaaaatg gagtcctacc tagtagacac ttatcaaggc attccttaca
2220
cagcagctgt tcaagttgat ctaatagaaa aggacctgtt acctgcaagc ctaacaatat
2280
ggttcccttt gtttcaggcc aacacaccac cagcagtgct gctcgatcag ttgaaaaccc
2340
taacaataac cactctgtat gctgcatcac aaaatggtcc aatactcaaa gtgaatgcat
2400
cagcccaagg tgcagcaatg tctgtacttc ccaaaaaatt tgaagtcaat gcgactgtag
2460
cactcgatga atatagcaaa ttggaatttg acaaactcac agtctgtgaa gtaaaaacag
2520
tttacttaac aaccatgaaa ccatacggga tggtatcaaa atttgtgagc tcagccaaat
2580
cagttggcaa aaaaacacat gatctaatcg cactgtgtga ttttatggat ctagaaaaga
2640
acacacctgt tacaatacca gcattcatca aatcagtttc aatcaaagag agtgagtcag
2700
ctactgttga agctgctata agcagtgaag cagaccaagc tctaacacag gccaaaattg
2760
caccttatgc gggattgatt atgatcatga ctatgaacaa tcccaaaggc atattcaaaa
2820
agcttggagc tgggactcaa gttatagtag aactaggagc atatgtccag gctgaaagca
2880
taagtaaaat atgcaagact tggagccatc aagggacaag atatgtgttg aagtccagat
2940
aacagccaag caccttggcc aagagctact aactctatct catagattat aaagtcacca
3000
ttctagttat ataaaaatca agttagaaca agaattaaat caatcaagaa tgggacaaat
3060
aaaaatgtct tggaaagtgg tgatcatttt ttcattgtta ataacacctc aacacggtct
3120
taaagagagc tatttagaag agtcatgtag cactataact gaaggatatc tcagtgttct
3180
gaggacaggt tggtatacca acgtttttac actggaggta ggtgatgtag agaaccttac
3240
atgtgctgat ggacctagct taataaaaac agaattagac ctgaccaaaa gtgcactaag
3300
agaactcaga acagtttctg ctgatcaact ggcaagagag gagcaaattg agaatcccag
3360
acaatctaga tttgttctag gagcaatagc actcggtgtt gcaacagcag ctgcagttac
3420
agcaggtgtt gcaattgcca aaaccatccg gcttgaaagt gaagtaacag caattaagaa
3480
tgccctcaaa aagaccaatg aagcagtatc tacattgggg aatggagttc gagtgttggc
3540
aactgcagtg agggagctgg aagattttgt gagcaagaat ctaacacgtg caatcaacaa
3600
aaacaagtgc gacattgctg acctgaaaat ggccgttagc ttcagtcaat tcaacagaag
3660
gtttctaaat gttgtgcggc aattttcaga caatgctgga ataacaccag caatatcctt
3720
ggacttaatg acagatgctg aactagccag agctgtttcc aacatgccaa catctgcagg
3780
acaaataaaa ctgatgttgg agaaccgtgc aatggtaaga agaaaggggt tcggaatcct
3840
gataggagtt tacggaagct ccgtaattta catggtgcaa ctgccaatct ttggagttat
3900
agacacgcct tgctggatag taaaagcggc cccttcttgc tcagaaaaaa agggaaacta
3960
tgcttgcctt ttaagagaag atcaaggatg gtattgtcag aatgcagggt caactgttta
4020
ctacccaaat gaaaaagact gcgaaacaag aggagaccat gtcttttgcg acacagcagc
4080
aggaatcaat gttgctgagc agtcaaagga gtgcaacatc aacatatcca ctactaatta
4140
cccatgcaaa gttagcacag gaagacaccc tatcagtatg gttgcactgt ctcctcttgg
4200
ggctttggtt gcttgctaca agggagtgag ctgttccatt ggcagcaaca gagtagggat
4260
catcaagcaa ctgaacaaag gctgctctta tataaccaac caagacgcag acacagtgac
4320
aatagacaac actgtatacc agctaagcaa agttgagggc gaacagcatg ttataaaagg
4380
aaggccagtg tcaagcagct ttgatccagt caaatttcct gaagatcaat tcaatgttgc
4440
acttgaccaa gttttcgaaa gcattgagaa cagtcaggcc ttggtggatc aatcaaacag
4500
aatcctaagc agtgcagaga aaggaaacac tggcttcatc attgtaataa ttctaattgc
4560
tgtccttggc tctaccatga tcctagtgag tgtttttatc ataataaaga aaacaaagaa
4620
acccacagga gcacctccag agctgagtgg tgtcacaaac aatggcttca taccacataa
4680
ttagttaatt aaaaataaag taaattaaat taaaataaaa taaaattaaa attaaaataa
4740
aataaaaata aaaatttggg acaaatcata atgtctcgca aggctccatg caaatatgaa
4800
gtgcggggca aatgcaatag aggaagtgag tgcaagttta accacaatta ctggagttgg
4860
ccagatagat acttactaat aagatcaaat tatttattaa atcaactttt aaggaacact
4920
gatagagctg atggcttatc aataatatca ggagcaggca gagaagatag gacacaagat
4980
tttgtcctag gttccaccaa tgtggttcaa ggttatattg atgataacca aagcataaca
5040
aaagctgcag cctgttacag tctacataat ataatcaaac aactacaaga agttgaagtt
5100
aggcaggcta gagataacaa accatctgac agcaaacatg tggcacttca caacttagtc
5160
ctatcttata tggagatgag caaaattcct gcatctttaa tcaacaatct caaaagactg
5220
ccgagagaga aactgaaaaa attagcaaag cttataattg acttatcagc aggtgctgaa
5280
aatgactctt catatgcctt gcaagacagt gaaagcacta atcaagtgca gtgagcatgg
5340
tcctgttttc attactatag aggttgatta catgatatgg actcataagg acttaaaaga
5400
agctttatct aatgggatag tgaagtctca tactaacatt tacaattgtt atttagaaaa
5460
catagaaatt atatatgtca aggcttactt aagttagtaa aaacacatca gagtgggata
5520
aatgacaatg ataacattag atgtcattaa aagtgatggg tcttcaaaaa catgtactca
5580
cctcaaaaaa ttaattaaag accactctgg taaagtgctt attgtactta agttaatatt
5640
agctttacta acatttctca cagtgacaat caccatcaat tatataaaag tagaaaacaa
5700
tctgcaaata tgtcagtcaa aaactgaatc agacaaaaag gactcatcat caaataccac
5760
atcagtcaca accaagacta ctctaaatca tgatataaca cagtatttta aaagtttgat
5820
tcaaaggtat acaaactctg caataaacag agacacatgc tggaaaataa gcagaaatca
5880
atgcacaaac ataacaacat acaaattttt atgttttaaa tctgaagaaa caaaaaccaa
5940
caattgtgat aaactgacag atttatgcag aaacaaacca aaaccagctg ttgaagtgta
6000
tcacatagta gaatgccatt gtatatacac agttaaatgg aagtgctatc attacccaat
6060
agatgaaacc caatcctaaa taacactaga ttaggatcca tccaagtctg ttagttcaac
6120
aatttagtta tttaaaaata ttttgaaaac aagtaagttt ctatgatact tcataataat
6180
aagtaataat taattgctta atcatcatca caacattatt cgaaaccata actattcaat
6240
ttaagaagta aaaacaataa tatgagacaa ataacaatgg atcctcttaa tgaatccact
6300
gttaatgtct atcttcccga ctcatatctt aaaggagtga tttcttttag tgagactaat
6360
gcaattggtt catgtctctt aaaaagacct tacctaaaaa atgacaacac tgcaaaagtt
6420
gccatagaga atcctgttat cgagcatgtt agactcaaaa atgcaatcaa ttctaagatg
6480
aaaatatcag attacaggat agtagagcca gtaaacatgc aacatgaaat tatgaagaat
6540
gtacacagtt gtgagctcac attattaaaa cagtttttaa caaggagtaa aaatattagc
6600
actcttaaat taaatatgat atgtgattgg ctgcagttaa agtctacatc agatgatacc
6660
tcaatcttaa gttttataga tgtagaattt atacctagct gggtaagcaa ttggtttagt
6720
aattggtaca atctcaacaa gttgattctg gaattcagga aagaagaagt aataagaact
6780
ggttcaatct tgtgtaggtc attgggtaaa ttagtttttg ttgtatcatc atacggatgt
6840
atagtcaaga gcaacaaaag caaaagagtg agcttcttca catacaatca actgttaaca
6900
tggaaagatg tgatgttaag tagattcaat gcaaatttct gtatatgggt aagcaacagt
6960
ctgaatgaaa atcaagaagg gttagggttg agaagtaatc tgcaaggcat attaactaat
7020
aagctatatg aaactgtaga ttatatgctt agtttgtgtt gcaatgaagg tttctcactt
7080
gtgaaagagt ttgagggttt tattatgagt gaaatcctta ggattactga acatgctcaa
7140
ttcagtacta gatttagaaa tactttatta aatggattaa ctgatcaatt gacaaaatta
7200
aaaaataaaa acagactcag agttcatggt accgtgttag aaaataatga ttatccaatg
7260
tatgaagttg tacttaaatt attaggagat actttgagat gtattaaatt attaatcaat
7320
aaaaacttag agaatgctgc tgaattatac tatatattta gaatattcgg tcacccaatg
7380
gtagatgaaa gagatgcaat ggatgctgtc aaattaaaca atgaaatcac aaaaatcctc
7440
aggttggaga gcttgacaga actaagaggg gcattcatat taaggattat caaaggattt
7500
gtagacaaca acaaaagatg gccgaaaatt aaaaacttaa aagtgcttag taaaagatgg
7560
actatgtact tcaaagcaaa aagttaccct agtcaacttg aattaagtga acaagatttt
7620
ttagagcttg ctgcaataca gtttgaacaa gagttttctg ttcctgaaaa aaccaacctt
7680
gagatggtat taaatgataa agctatatca cctcctaaaa gattaatttg gtctgtgtac
7740
ccaaaaaatt acttacctga gacaataaaa aatcgatatc tagaagagac tttcaatgca
7800
agtgatagtc tcaaaacaag aagagtacta gagtactatt tgaaagataa taaattcgac
7860
caaaaagaac ttaaaagtta tgtggttaaa caagaatatt taaatgataa ggatcatatt
7920
gtctcgctaa ctggaaaaga aagagaatta agtgtaggta gaatgtttgc tatgcaacca
7980
ggaaaacagc gacaaataca aatattggct gaaaaattgt tagctgataa tattgtaccc
8040
tttttcccag aaactttaac aaagtatggt gatctagatc ttcagagaat aatggaaatc
8100
aaatcagaac tttcttctat taaaaccaga agaaatgata gttataataa ttacattgca
8160
agagcatcca tagtaacaga tttaagtaag ttcaaccaag cctttaggta tgaaactaca
8220
gcgatctgtg cggatgtagc agatgaacta catggaacac aaagcctatt ctgttggtta
8280
catcttatcg ttcctatgac tacaatgata tgtgcctata gacatgcacc accagaaaca
8340
aaaggtgaat atgatataga taagatagaa gagcaaagtg gtttatatag atatcatatg
8400
ggtggtattg aaggatggtg tcaaaaactc tggacaatgg aagctatatc tttattagat
8460
gttgtatctg taaagacacg atgtcaaatg acatctttat taaacggtga caaccaatca
8520
atagatgtaa gtaaaccagt taagttatct gagggtttag atgaagtgaa agcagattat
8580
agcttggctg taaaaatgct aaaagaaata agagatgcat acagaaatat aggccataaa
8640
cttaaagaag gggaaacata tatatcaaga gatcttcagt ttataagtaa ggtgattcaa
8700
tctgaaggag taatgcatcc tacccctata aaaaagatct taagagtggg accatggata
8760
aacacaatat tagatgacat taaaaccagt gcagagtcaa tagggagtct atgtcaggaa
8820
ttagaattta ggggggaaag cataatagtt agtctgatat taaggaattt ttggctgtat
8880
aatttataca tgcatgaatc aaagcaacac cccctagcag ggaagcagtt attcaaacaa
8940
ctaaataaaa cattaacatc agtgcagaga ttttttgaaa ttaaaaagga aaatgaagta
9000
gtagatctat ggatgaacat accaatgcag tttggaggag gagatccagt agtcttctat
9060
agatctttct atagaaggac ccctgatttt ttaactgaag caatcagtca tgtagatatt
9120
ctgttaaaaa tatcagccaa cataagaaat gaagcgaaaa taagtttctt caaagcctta
9180
ctgtcaatag aaaaaaatga acgtgctaca ctgacaacac taatgagaga ccctcaagct
9240
gtgggctcag agcgacaagc aaaagtaaca agtgatatca atagaacagc agttaccagc
9300
atcttaagtc tttctccaaa tcaacttttc agcgatagtg ctatacacta cagtagaaat
9360
gaagaagagg tcggaatcat tgctgacaac ataacacctg tttatcctca tggactgaga
9420
gttttgtatg aatcattacc ttttcataaa gctgaaaaag ttgtaaatat gatatcagga
9480
acaaaatcca taaccaactt attacagaga acatctgcta ttaatggtga agatattgac
9540
agagctgtat ccatgatgct ggagaaccta ggattattat ctagaatatt gtcagtagtt
9600
gttgatagta tagaaattcc aaccaaatct aatggtaggc tgatatgttg tcagatatct
9660
agaaccctaa gggagacatc atggaataat atggaaatag ttggagtaac atcccctagc
9720
atcactacat gcatggatgt catatatgca actagctctc atttgaaagg gataatcatt
9780
gaaaagttca gcactgacag aactacaaga ggtcaaagag gtccaaagag cccttgggta
9840
ggatcgagca cgcaagagaa aaaattagtt cctgtttata acagacaaat tctttcaaaa
9900
caacaaagag aacagctaga agcaattgga aaaatgagat gggtatataa agggacacca
9960
ggtttaagac gattactcaa taagatttgt cttggaagtt taggcattag ttacaaatgt
10020
gtaaaacctt tattacctag gtttatgagt gtaaatttcc tacacaggtt atctgtcagt
10080
agtagaccta tggaattccc agcatcagtt ccagcttata gaacaacaaa ttaccatttt
10140
gacactagtc ctattaatca agcactaagt gaaagatttg ggaatgaaga tattaatttg
10200
gtcttccaaa atgcaatcag ctgtggaatt agcataatga gtgtagtaga acaattaact
10260
ggtaggagtc caaaacagtt agttttaata ccccaattag aagaaataga cattatgcca
10320
ccaccagtgt ttcaagggaa attcaattat aagctagtag ataagataac ttctgaccaa
10380
catatcttca gtccagacaa aatagatatg ttaacactgg ggaaaatgct catgccaact
10440
ataaaaggtc agaaaacaga tcagttcttg aacaagagag agaattattt ccatgggaac
10500
aatcttattg agtctttgtc agcagcgtta gcatgtcatt ggtgtgggat attaacagag
10560
caatgtatag aaaataatat tttcaagaaa gactggggtg acgggttcat atcggatcat
10620
gcttttatgg acttcaaaat attcctatgt gtctttaaaa ctaaactttt atgtagttgg
10680
ggatcccaag ggaaaaacat taaagatgaa gatatagtag atgaatcgat agataaactg
10740
ttaaggattg ataatacttt ttggagaatg ttcagcaagg ttatgtttga atcaaaggtt
10800
aagaaaagga taatgttata tgatgtaaaa tttctatcat tagtaggtta tatagggttt
10860
aagaattggt ttatagaaca gttgagatca gctgagttgc atgaggtacc ttggattgtc
10920
aatgccgaag gtgatctggt tgagatcaag tcaattaaaa tctatttgca actgatagag
10980
cagagtttat ttttaagaat aactgttttg aactatacag atatggcaca tgctctcaca
11040
agattaatca gaaagaagtt gatgtgtgat aatgcactat taacttcaat tccatcccca
11100
atggttaact taactcaagt tattgatcct acagaacaat tagcttattt ccctaagata
11160
acatttgaaa ggctaaaaaa ttatgacact agttcaaatt atgctaaagg aaagctaaca
11220
aggaattaca tgatactgtt gccatggcaa catgttaata gatataactt tgtctttagt
11280
tctactggat gtaaagttag tctaaaaaca tgcattggaa aacttatgaa agatctaaac
11340
cctaaagttc tgtactttat tggagaaggg gcaggaaatt ggatggccag aacagcatgt
11400
gaatatcctg acatcaaatt tgtatacaga agtttaaaag atgaccttga tcatcattat
11460
cctttggaat accagagagt gataggagaa ttaagcagga taatagatag tggtgaaggg
11520
ctttcaatgg aaacaacaga tgcaactcaa aaaactcatt gggatttgat acacagagta
11580
agcaaagatg ctttattaat aactttatgt gatgcagaat ttaaggacag agatgatttt
11640
tttaagatgg taattctatg gaggaaacat gtattatcat gcagaatttg cactacctat
11700
gggacagacc tctatttatt cgcaaagtat catgctaaag actgcaatat aaaattacct
11760
ttttttgtga gatcagttgc cacctttatt atgcaaggta gtaaactgtc aggctcggaa
11820
tgctacatac tcttaacact aggccaccac aacaatttac cttgtcatgg agaaatacaa
11880
aattctaaga tgaaaatagc agcgtgtaat gatttttatg ctgcaaaaaa acttgacaat
11940
aaatcaattg aagccaactg taaatcactt ttatcagggc taagaatacc gataaataag
12000
aaggaattaa atagacagag aaggttatta acactacaaa gcaaccattc ttctgtagca
12060
acagttggag gtagcaaggt catagagtct aaatggttaa caaacaaggc aaacacaata
12120
attgattggt tagaacatat tttaaattct ccaaaaggtg aattaaatta tgattttttt
12180
gaagcattag aaaatactta ccctaatatg attaaactaa tagataatct agggaatgca
12240
gagattaaaa aactgatcaa agtaactgga tatatgcttg taagtaaaaa atgaaaaatg
12300
ataaaaatga taaaataggt gacaacttca tactattcca aagtaatcat ttgattatgc
12360
aattatgtaa tagttaatta aaaactaaaa atcaaaagtt aaaaactaat aactgtcatt
12420
aagtttatta aaaataagaa attataattg gatgtatacg gtttttttgc cgt
12473
<210> 4
<211> 14141
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Ген GFP вставлен между положениями 40 и 784
<400> 4
gcgaaaaaaa cgcgtataaa ttagattaca aaaaaatatg ggacaagtga aaatggtgag
60
caagggcgag gagctgttca ccggggtggt gcccatcctg gtcgagctgg acggcgacgt
120
aaacggccac aagttcagcg tgtccggcga gggcgagggc gatgccacct acggcaagct
180
gaccctgaag ttcatctgca ccaccggcaa gctgcccgtg ccctggccca ccctcgtgac
240
caccctgacc tacggcgtgc agtgcttcag ccgctacccc gaccacatga agcagcacga
300
cttcttcaag tccgccatgc ccgaaggcta cgtccaggag cgcaccatct tcttcaagga
360
cgacggcaac tacaagaccc gcgccgaggt gaagttcgag ggcgacaccc tggtgaaccg
420
catcgagctg aagggcatcg acttcaagga ggacggcaac atcctggggc acaagctgga
480
gtacaactac aacagccaca acgtctatat catggccgac aagcagaaga acggcatcaa
540
ggtgaacttc aagatccgcc acaacatcga ggacggcagc gtgcagctcg ccgaccacta
600
ccagcagaac acccccatcg gcgacggccc cgtgctgctg cccgacaacc actacctgag
660
cacccagtcc gccctgagca aagaccccaa cgagaagcgc gatcacatgg tcctgctgga
720
gttcgtgacc gccgccggga tcactctcgg catggacgag ctgtacaagt aagttaatta
780
aaaagtggga caagtgaaaa tgtctcttca agggattcac ctgagtgatc tatcatacaa
840
gcatgctata ttaaaagagt ctcagtacac aataaaaaga gatgtgggta caacaactgc
900
agtgacaccc tcatcattgc aacaagaaat aacgctgttg tgtggagaaa ttctgtatgc
960
taaacatgct gattacaaat atgctgcaga aataggaata caatatatta gcacagcttt
1020
aggatcagag agagtgcagc agattctgag gaactcaggc agtgaagtcc aagtggtctt
1080
aaccagaacg tactctctgg ggaaagttaa aaacaataaa ggagaagatt tacagatgtt
1140
agacatacac ggggtagaga agagctgggt agaagagata gacaaagaag caaggaaaac
1200
aatggcaacc ttgcttaagg aatcatcagg taatatccca caaaatcaga ggccctcagc
1260
accagacaca cccataatct tattatgtgt aggtgcatta atatttacta agctagcatc
1320
aaccatagaa gtgggactag agaccacagt cagaagggct aaccgtgtac taagtgatgc
1380
actcaagaga taccctagaa tggacatccc aaaaattgcc agatccttct atgacttatt
1440
tgaacaaaaa gtgtatcaca gaagtttgtt cattgagtat ggcaaagcat taggctcatc
1500
atctacaggc agcaaagcag aaagtctatt tgttaatata ttcatgcaag cttatggagc
1560
cggtcaaaca atgctaaggt ggggggtcat tgccaggtca tccaacaata taatgttagg
1620
acatgtatct gtccaagctg agttaaaaca ggtcacagaa gtctatgact tggtgcgaga
1680
aatgggccct gaatctggac ttctacattt aaggcaaagc ccaaaagctg gactgttatc
1740
actagccaac tgtcccaact ttgcaagtgt tgttctcgga aatgcctcag gcttaggcat
1800
aatcggtatg tatcgtggga gagtaccaaa cacagaatta ttttcagcag cagaaagtta
1860
tgccaaaagt ttgaaagaga gcaataaaat caatttctct tcattaggac ttacagatga
1920
agagaaagag gctgcagaac atttcttaaa tgtgagtgac gacagtcaaa atgattatga
1980
gtaattaaaa aagtgggaca agtcaaaatg tctttccctg aaggaaaaga tattcttttc
2040
atgggtaatg aagcagcaaa attagcagaa gctttccaga aatcattaag gaaaccaagt
2100
cataaaagat ctcaatctat tataggagaa aaagtgaaca ctgtatcaga aacattggaa
2160
ttacctacta tcagtagacc tgcaaaacca accatactgt cagaaccaaa gttagcatgg
2220
actgataaag gtggggcaat caaaactgaa ataaagcaag caatcaaagt catggatcct
2280
attgaggaag aagagtctac tgagaagaag gtgctgccct ccagtgatgg gaaaacccct
2340
gcagaaaaga aactgaaacc atcaactaac accaaaaaga aagtttcgtt tacaccaaat
2400
gaaccaggaa aatatacaaa gttggaaaaa gatgctctag atttgctctc agataatgaa
2460
gaagaagatg cagaatcttc aatcttaacc tttgaagaaa gagatacttc atcgttaagc
2520
attgaggcca gattggaatc aatagaggag aaattaagca tgatattagg gctattaaga
2580
acactcaaca ttgctacagc aggacccaca gcagcaagag atgggatcag agatgcaatg
2640
attggcgtaa gagaggaatt aatagcagac ataataaagg aagccaaagg gaaagcagca
2700
gaaatgatgg aagaggaaat gagtcaacga tcaaaaatag gaaacggtag tgtaaaacta
2760
acagagaaag caaaagagct taacaaaatt gttgaagatg aaagcacaag tggagaatct
2820
gaagaagaag aagaaccaaa agacatacaa gacaatagtc aagaagatga catttaccag
2880
ttaattatgt agtttaataa aaataaacaa tgggacaagt aaaaatggag tcctacctag
2940
tagacactta tcaaggcatt ccttacacag cagctgttca agttgatcta atagaaaagg
3000
acctgttacc tgcaagccta acaatatggt tccctttgtt tcaggccaac acaccaccag
3060
cagtgctgct cgatcagttg aaaaccctaa caataaccac tctgtatgct gcatcacaaa
3120
atggtccaat actcaaagtg aatgcatcag cccaaggtgc agcaatgtct gtacttccca
3180
aaaaatttga agtcaatgcg actgtagcac tcgatgaata tagcaaattg gaatttgaca
3240
aactcacagt ctgtgaagta aaaacagttt acttaacaac catgaaacca tacgggatgg
3300
tatcaaaatt tgtgagctca gccaaatcag ttggcaaaaa aacacatgat ctaatcgcac
3360
tgtgtgattt tatggatcta gaaaagaaca cacctgttac aataccagca ttcatcaaat
3420
cagtttcaat caaagagagt gagtcagcta ctgttgaagc tgctataagc agtgaagcag
3480
accaagctct aacacaggcc aaaattgcac cttatgcggg attgattatg atcatgacta
3540
tgaacaatcc caaaggcata ttcaaaaagc ttggagctgg gactcaagtt atagtagaac
3600
taggagcata tgtccaggct gaaagcataa gtaaaatatg caagacttgg agccatcaag
3660
ggacaagata tgtgttgaag tccagataac agccaagcac cttggccaag agctactaac
3720
tctatctcat agattataaa gtcaccattc tagttatata aaaatcaagt tagaacaaga
3780
attaaatcaa tcaagaatgg gacaaataaa aatgtcttgg aaagtggtga tcattttttc
3840
attgttaata acacctcaac acggtcttaa agagagctat ttagaagagt catgtagcac
3900
tataactgaa ggatatctca gtgttctgag gacaggttgg tataccaacg tttttacact
3960
ggaggtaggt gatgtagaga accttacatg tgctgatgga cctagcttaa taaaaacaga
4020
attagacctg accaaaagtg cactaagaga actcagaaca gtttctgctg atcaactggc
4080
aagagaggag caaattgaga atcccagaca atctagattt gttctaggag caatagcact
4140
cggtgttgca acagcagctg cagttacagc aggtgttgca attgccaaaa ccatccggct
4200
tgaaagtgaa gtaacagcaa ttaagaatgc cctcaaaaag accaatgaag cagtatctac
4260
attggggaat ggagttcgag tgttggcaac tgcagtgagg gagctggaag attttgtgag
4320
caagaatcta acacgtgcaa tcaacaaaaa caagtgcgac attgctgacc tgaaaatggc
4380
cgttagcttc agtcaattca acagaaggtt tctaaatgtt gtgcggcaat tttcagacaa
4440
tgctggaata acaccagcaa tatccttgga cttaatgaca gatgctgaac tagccagagc
4500
tgtttccaac atgccaacat ctgcaggaca aataaaactg atgttggaga accgtgcaat
4560
ggtaagaaga aaggggttcg gaatcctgat aggagtttac ggaagctccg taatttacat
4620
ggtgcaactg ccaatctttg gagttataga cacgccttgc tggatagtaa aagcggcccc
4680
ttcttgctca gaaaaaaagg gaaactatgc ttgcctttta agagaagatc aaggatggta
4740
ttgtcagaat gcagggtcaa ctgtttacta cccaaatgaa aaagactgcg aaacaagagg
4800
agaccatgtc ttttgcgaca cagcagcagg aatcaatgtt gctgagcagt caaaggagtg
4860
caacatcaac atatccacta ctaattaccc atgcaaagtt agcacaggaa gacaccctat
4920
cagtatggtt gcactgtctc ctcttggggc tttggttgct tgctacaagg gagtgagctg
4980
ttccattggc agcaacagag tagggatcat caagcaactg aacaaaggct gctcttatat
5040
aaccaaccaa gacgcagaca cagtgacaat agacaacact gtataccagc taagcaaagt
5100
tgagggcgaa cagcatgtta taaaaggaag gccagtgtca agcagctttg atccagtcaa
5160
atttcctgaa gatcaattca atgttgcact tgaccaagtt ttcgaaagca ttgagaacag
5220
tcaggccttg gtggatcaat caaacagaat cctaagcagt gcagagaaag gaaacactgg
5280
cttcatcatt gtaataattc taattgctgt ccttggctct accatgatcc tagtgagtgt
5340
ttttatcata ataaagaaaa caaagaaacc cacaggagca cctccagagc tgagtggtgt
5400
cacaaacaat ggcttcatac cacataatta gttaattaaa aataaagtaa attaaattaa
5460
aataaaataa aattaaaatt aaaataaaat aaaaataaaa atttgggaca aatcataatg
5520
tctcgcaagg ctccatgcaa atatgaagtg cggggcaaat gcaatagagg aagtgagtgc
5580
aagtttaacc acaattactg gagttggcca gatagatact tactaataag atcaaattat
5640
ttattaaatc aacttttaag gaacactgat agagctgatg gcttatcaat aatatcagga
5700
gcaggcagag aagataggac acaagatttt gtcctaggtt ccaccaatgt ggttcaaggt
5760
tatattgatg ataaccaaag cataacaaaa gctgcagcct gttacagtct acataatata
5820
atcaaacaac tacaagaagt tgaagttagg caggctagag ataacaaacc atctgacagc
5880
aaacatgtgg cacttcacaa cttagtccta tcttatatgg agatgagcaa aattcctgca
5940
tctttaatca acaatctcaa aagactgccg agagagaaac tgaaaaaatt agcaaagctt
6000
ataattgact tatcagcagg tgctgaaaat gactcttcat atgccttgca agacagtgaa
6060
agcactaatc aagtgcagtg agcatggtcc tgttttcatt actatagagg ttgattacat
6120
gatatggact cataaggact taaaagaagc tttatctaat gggatagtga agtctcatac
6180
taacatttac aattgttatt tagaaaacat agaaattata tatgtcaagg cttacttaag
6240
ttagtaaaaa cacatcagag tgggataaat gacaatgata acattagatg tcattaaaag
6300
tgatgggtct tcaaaaacat gtactcacct caaaaaatta attaaagacc actctggtaa
6360
agtgcttatt gtacttaagt taatattagc tttactaaca tttctcacag tgacaatcac
6420
catcaattat ataaaagtag aaaacaatct gcaaatatgt cagtcaaaaa ctgaatcaga
6480
caaaaaggac tcatcatcaa ataccacatc agtcacaacc aagactactc taaatcatga
6540
tataacacag tattttaaaa gtttgattca aaggtataca aactctgcaa taaacagaga
6600
cacatgctgg aaaataagca gaaatcaatg cacaaacata acaacataca aatttttatg
6660
ttttaaatct gaagaaacaa aaaccaacaa ttgtgataaa ctgacagatt tatgcagaaa
6720
caaaccaaaa ccagctgttg aagtgtatca catagtagaa tgccattgta tatacacagt
6780
taaatggaag tgctatcatt acccaataga tgaaacccaa tcctaaataa cactagatta
6840
ggatccatcc aagtctgtta gttcaacaat ttagttattt aaaaatattt tgaaaacaag
6900
taagtttcta tgatacttca taataataag taataattaa ttgcttaatc atcatcacaa
6960
cattattcga aaccataact attcaattta agaagtaaaa acaataatat gggacaagta
7020
gttatggagg tgaaagtgga gaacattcga acaatagata tgctcaaagc aagagtgaaa
7080
aatcgtgtgg cacgcagcaa atgctttaaa aatgcctctt tgatcctaat aggaataact
7140
acattgagta tagccctcaa tatctatcta atcataaact atacaatgca agaaaacaca
7200
tccgaatcag aacatcacac cagctcatca cccatggaat ccagcaggga aactccaaca
7260
gtccctatgg acaactcaga caccaatcca ggctcacagt atccaactca acagtccaca
7320
gaaggctcca cactctactt tgcagcctca gcaagctcac cagagacaga accaacatca
7380
acaccagaca caacaagccg cccgcccttc gtcgacacac acacaacact accaagtgca
7440
agcagaacaa ggacaagtcc ggcagtccac acaaaaaaca atccaaggac aagccccaga
7500
acacattccc caccatgggc aatgacaagg acggtccgtg gaaccaccac tctccgcaca
7560
agcagcacaa gaaaaagacc gtccacagca tcagtccaac ctgacagcag cgcaacaacc
7620
cacaaacacg aagaagcaag cccagtgagc ccgcaaacat ctgcgagcac agcaagacca
7680
caaaggaagg gcatggaggc cagcacatca acaacataca accaaactag ttaacaaaaa
7740
atacaaaata actctaagat aaaccatata gacaccaaca attgagaagc caaaaggcaa
7800
ttcacaatct ctccaaaaag gcaacaacac catattagct ccgcttaaat ctccctggaa
7860
aaaacactcg cccatatacc aactatacca caaccatccc aagaaaaaaa gctgggtaaa
7920
acaacaccca agagacaaat aacaatggat cctcttaatg aatccactgt taatgtctat
7980
cttcccgact catatcttaa aggagtgatt tcttttagtg agactaatgc aattggttca
8040
tgtctcttaa aaagacctta cctaaaaaat gacaacactg caaaagttgc catagagaat
8100
cctgttatcg agcatgttag actcaaaaat gcaatcaatt ctaagatgaa aatatcagat
8160
tacaggatag tagagccagt aaacatgcaa catgaaatta tgaagaatgt acacagttgt
8220
gagctcacat tattaaaaca gtttttaaca aggagtaaaa atattagcac tcttaaatta
8280
aatatgatat gtgattggct gcagttaaag tctacatcag atgatacctc aatcttaagt
8340
tttatagatg tagaatttat acctagctgg gtaagcaatt ggtttagtaa ttggtacaat
8400
ctcaacaagt tgattctgga attcaggaaa gaagaagtaa taagaactgg ttcaatcttg
8460
tgtaggtcat tgggtaaatt agtttttgtt gtatcatcat acggatgtat agtcaagagc
8520
aacaaaagca aaagagtgag cttcttcaca tacaatcaac tgttaacatg gaaagatgtg
8580
atgttaagta gattcaatgc aaatttctgt atatgggtaa gcaacagtct gaatgaaaat
8640
caagaagggt tagggttgag aagtaatctg caaggcatat taactaataa gctatatgaa
8700
actgtagatt atatgcttag tttgtgttgc aatgaaggtt tctcacttgt gaaagagttt
8760
gagggtttta ttatgagtga aatccttagg attactgaac atgctcaatt cagtactaga
8820
tttagaaata ctttattaaa tggattaact gatcaattga caaaattaaa aaataaaaac
8880
agactcagag ttcatggtac cgtgttagaa aataatgatt atccaatgta tgaagttgta
8940
cttaaattat taggagatac tttgagatgt attaaattat taatcaataa aaacttagag
9000
aatgctgctg aattatacta tatatttaga atattcggtc acccaatggt agatgaaaga
9060
gatgcaatgg atgctgtcaa attaaacaat gaaatcacaa aaatcctcag gttggagagc
9120
ttgacagaac taagaggggc attcatatta aggattatca aaggatttgt agacaacaac
9180
aaaagatggc cgaaaattaa aaacttaaaa gtgcttagta aaagatggac tatgtacttc
9240
aaagcaaaaa gttaccctag tcaacttgaa ttaagtgaac aagatttttt agagcttgct
9300
gcaatacagt ttgaacaaga gttttctgtt cctgaaaaaa ccaaccttga gatggtatta
9360
aatgataaag ctatatcacc tcctaaaaga ttaatttggt ctgtgtaccc aaaaaattac
9420
ttacctgaga caataaaaaa tcgatatcta gaagagactt tcaatgcaag tgatagtctc
9480
aaaacaagaa gagtactaga gtactatttg aaagataata aattcgacca aaaagaactt
9540
aaaagttatg tggttaaaca agaatattta aatgataagg atcatattgt ctcgctaact
9600
ggaaaagaaa gagaattaag tgtaggtaga atgtttgcta tgcaaccagg aaaacagcga
9660
caaatacaaa tattggctga aaaattgtta gctgataata ttgtaccctt tttcccagaa
9720
actttaacaa agtatggtga tctagatctt cagagaataa tggaaatcaa atcagaactt
9780
tcttctatta aaaccagaag aaatgatagt tataataatt acattgcaag agcatccata
9840
gtaacagatt taagtaagtt caaccaagcc tttaggtatg aaactacagc gatctgtgcg
9900
gatgtagcag atgaactaca tggaacacaa agcctattct gttggttaca tcttatcgtt
9960
cctatgacta caatgatatg tgcctataga catgcaccac cagaaacaaa aggtgaatat
10020
gatatagata agatagaaga gcaaagtggt ttatatagat atcatatggg tggtattgaa
10080
ggatggtgtc aaaaactctg gacaatggaa gctatatctt tattagatgt tgtatctgta
10140
aagacacgat gtcaaatgac atctttatta aacggtgaca accaatcaat agatgtaagt
10200
aaaccagtta agttatctga gggtttagat gaagtgaaag cagattatag cttggctgta
10260
aaaatgctaa aagaaataag agatgcatac agaaatatag gccataaact taaagaaggg
10320
gaaacatata tatcaagaga tcttcagttt ataagtaagg tgattcaatc tgaaggagta
10380
atgcatccta cccctataaa aaagatctta agagtgggac catggataaa cacaatatta
10440
gatgacatta aaaccagtgc agagtcaata gggagtctat gtcaggaatt agaatttagg
10500
ggggaaagca taatagttag tctgatatta aggaattttt ggctgtataa tttatacatg
10560
catgaatcaa agcaacaccc cctagcaggg aagcagttat tcaaacaact aaataaaaca
10620
ttaacatcag tgcagagatt ttttgaaatt aaaaaggaaa atgaagtagt agatctatgg
10680
atgaacatac caatgcagtt tggaggagga gatccagtag tcttctatag atctttctat
10740
agaaggaccc ctgatttttt aactgaagca atcagtcatg tagatattct gttaaaaata
10800
tcagccaaca taagaaatga agcgaaaata agtttcttca aagccttact gtcaatagaa
10860
aaaaatgaac gtgctacact gacaacacta atgagagacc ctcaagctgt gggctcagag
10920
cgacaagcaa aagtaacaag tgatatcaat agaacagcag ttaccagcat cttaagtctt
10980
tctccaaatc aacttttcag cgatagtgct atacactaca gtagaaatga agaagaggtc
11040
ggaatcattg ctgacaacat aacacctgtt tatcctcatg gactgagagt tttgtatgaa
11100
tcattacctt ttcataaagc tgaaaaagtt gtaaatatga tatcaggaac aaaatccata
11160
accaacttat tacagagaac atctgctatt aatggtgaag atattgacag agctgtatcc
11220
atgatgctgg agaacctagg attattatct agaatattgt cagtagttgt tgatagtata
11280
gaaattccaa ccaaatctaa tggtaggctg atatgttgtc agatatctag aaccctaagg
11340
gagacatcat ggaataatat ggaaatagtt ggagtaacat cccctagcat cactacatgc
11400
atggatgtca tatatgcaac tagctctcat ttgaaaggga taatcattga aaagttcagc
11460
actgacagaa ctacaagagg tcaaagaggt ccaaagagcc cttgggtagg atcgagcacg
11520
caagagaaaa aattagttcc tgtttataac agacaaattc tttcaaaaca acaaagagaa
11580
cagctagaag caattggaaa aatgagatgg gtatataaag ggacaccagg tttaagacga
11640
ttactcaata agatttgtct tggaagttta ggcattagtt acaaatgtgt aaaaccttta
11700
ttacctaggt ttatgagtgt aaatttccta cacaggttat ctgtcagtag tagacctatg
11760
gaattcccag catcagttcc agcttataga acaacaaatt accattttga cactagtcct
11820
attaatcaag cactaagtga aagatttggg aatgaagata ttaatttggt cttccaaaat
11880
gcaatcagct gtggaattag cataatgagt gtagtagaac aattaactgg taggagtcca
11940
aaacagttag ttttaatacc ccaattagaa gaaatagaca ttatgccacc accagtgttt
12000
caagggaaat tcaattataa gctagtagat aagataactt ctgaccaaca tatcttcagt
12060
ccagacaaaa tagatatgtt aacactgggg aaaatgctca tgccaactat aaaaggtcag
12120
aaaacagatc agttcttgaa caagagagag aattatttcc atgggaacaa tcttattgag
12180
tctttgtcag cagcgttagc atgtcattgg tgtgggatat taacagagca atgtatagaa
12240
aataatattt tcaagaaaga ctggggtgac gggttcatat cggatcatgc ttttatggac
12300
ttcaaaatat tcctatgtgt ctttaaaact aaacttttat gtagttgggg atcccaaggg
12360
aaaaacatta aagatgaaga tatagtagat gaatcgatag ataaactgtt aaggattgat
12420
aatacttttt ggagaatgtt cagcaaggtt atgtttgaat caaaggttaa gaaaaggata
12480
atgttatatg atgtaaaatt tctatcatta gtaggttata tagggtttaa gaattggttt
12540
atagaacagt tgagatcagc tgagttgcat gaggtacctt ggattgtcaa tgccgaaggt
12600
gatctggttg agatcaagtc aattaaaatc tatttgcaac tgatagagca gagtttattt
12660
ttaagaataa ctgttttgaa ctatacagat atggcacatg ctctcacaag attaatcaga
12720
aagaagttga tgtgtgataa tgcactatta acttcaattc catccccaat ggttaactta
12780
actcaagtta ttgatcctac agaacaatta gcttatttcc ctaagataac atttgaaagg
12840
ctaaaaaatt atgacactag ttcaaattat gctaaaggaa agctaacaag gaattacatg
12900
atactgttgc catggcaaca tgttaataga tataactttg tctttagttc tactggatgt
12960
aaagttagtc taaaaacatg cattggaaaa cttatgaaag atctaaaccc taaagttctg
13020
tactttattg gagaaggggc aggaaattgg atggccagaa cagcatgtga atatcctgac
13080
atcaaatttg tatacagaag tttaaaagat gaccttgatc atcattatcc tttggaatac
13140
cagagagtga taggagaatt aagcaggata atagatagtg gtgaagggct ttcaatggaa
13200
acaacagatg caactcaaaa aactcattgg gatttgatac acagagtaag caaagatgct
13260
ttattaataa ctttatgtga tgcagaattt aaggacagag atgatttttt taagatggta
13320
attctatgga ggaaacatgt attatcatgc agaatttgca ctacctatgg gacagacctc
13380
tatttattcg caaagtatca tgctaaagac tgcaatataa aattaccttt ttttgtgaga
13440
tcagttgcca cctttattat gcaaggtagt aaactgtcag gctcggaatg ctacatactc
13500
ttaacactag gccaccacaa caatttacct tgtcatggag aaatacaaaa ttctaagatg
13560
aaaatagcag cgtgtaatga tttttatgct gcaaaaaaac ttgacaataa atcaattgaa
13620
gccaactgta aatcactttt atcagggcta agaataccga taaataagaa ggaattaaat
13680
agacagagaa ggttattaac actacaaagc aaccattctt ctgtagcaac agttggaggt
13740
agcaaggtca tagagtctaa atggttaaca aacaaggcaa acacaataat tgattggtta
13800
gaacatattt taaattctcc aaaaggtgaa ttaaattatg atttttttga agcattagaa
13860
aatacttacc ctaatatgat taaactaata gataatctag ggaatgcaga gattaaaaaa
13920
ctgatcaaag taactggata tatgcttgta agtaaaaaat gaaaaatgat aaaaatgata
13980
aaataggtga caacttcata ctattccaaa gtaatcattt gattatgcaa ttatgtaata
14040
gttaattaaa aactaaaaat caaaagttaa aaactaataa ctgtcattaa gtttattaaa
14100
aataagaaat tataattgga tgtatacggt ttttttgccg t
14141
<210> 5
<211> 13392
<212> ДНК
<213> искусственная последовательность
<220>
<223> Ген GFP вставлен между положениями 40 и 784
<400> 5
gcgaaaaaaa cgcgtataaa ttagattaca aaaaaatatg ggacaagtga aaatggtgag
60
caagggcgag gagctgttca ccggggtggt gcccatcctg gtcgagctgg acggcgacgt
120
aaacggccac aagttcagcg tgtccggcga gggcgagggc gatgccacct acggcaagct
180
gaccctgaag ttcatctgca ccaccggcaa gctgcccgtg ccctggccca ccctcgtgac
240
caccctgacc tacggcgtgc agtgcttcag ccgctacccc gaccacatga agcagcacga
300
cttcttcaag tccgccatgc ccgaaggcta cgtccaggag cgcaccatct tcttcaagga
360
cgacggcaac tacaagaccc gcgccgaggt gaagttcgag ggcgacaccc tggtgaaccg
420
catcgagctg aagggcatcg acttcaagga ggacggcaac atcctggggc acaagctgga
480
gtacaactac aacagccaca acgtctatat catggccgac aagcagaaga acggcatcaa
540
ggtgaacttc aagatccgcc acaacatcga ggacggcagc gtgcagctcg ccgaccacta
600
ccagcagaac acccccatcg gcgacggccc cgtgctgctg cccgacaacc actacctgag
660
cacccagtcc gccctgagca aagaccccaa cgagaagcgc gatcacatgg tcctgctgga
720
gttcgtgacc gccgccggga tcactctcgg catggacgag ctgtacaagt aagttaatta
780
aaaagtggga caagtgaaaa tgtctcttca agggattcac ctgagtgatc tatcatacaa
840
gcatgctata ttaaaagagt ctcagtacac aataaaaaga gatgtgggta caacaactgc
900
agtgacaccc tcatcattgc aacaagaaat aacgctgttg tgtggagaaa ttctgtatgc
960
taaacatgct gattacaaat atgctgcaga aataggaata caatatatta gcacagcttt
1020
aggatcagag agagtgcagc agattctgag gaactcaggc agtgaagtcc aagtggtctt
1080
aaccagaacg tactctctgg ggaaagttaa aaacaataaa ggagaagatt tacagatgtt
1140
agacatacac ggggtagaga agagctgggt agaagagata gacaaagaag caaggaaaac
1200
aatggcaacc ttgcttaagg aatcatcagg taatatccca caaaatcaga ggccctcagc
1260
accagacaca cccataatct tattatgtgt aggtgcatta atatttacta agctagcatc
1320
aaccatagaa gtgggactag agaccacagt cagaagggct aaccgtgtac taagtgatgc
1380
actcaagaga taccctagaa tggacatccc aaaaattgcc agatccttct atgacttatt
1440
tgaacaaaaa gtgtatcaca gaagtttgtt cattgagtat ggcaaagcat taggctcatc
1500
atctacaggc agcaaagcag aaagtctatt tgttaatata ttcatgcaag cttatggagc
1560
cggtcaaaca atgctaaggt ggggggtcat tgccaggtca tccaacaata taatgttagg
1620
acatgtatct gtccaagctg agttaaaaca ggtcacagaa gtctatgact tggtgcgaga
1680
aatgggccct gaatctggac ttctacattt aaggcaaagc ccaaaagctg gactgttatc
1740
actagccaac tgtcccaact ttgcaagtgt tgttctcgga aatgcctcag gcttaggcat
1800
aatcggtatg tatcgtggga gagtaccaaa cacagaatta ttttcagcag cagaaagtta
1860
tgccaaaagt ttgaaagaga gcaataaaat caatttctct tcattaggac ttacagatga
1920
agagaaagag gctgcagaac atttcttaaa tgtgagtgac gacagtcaaa atgattatga
1980
gtaattaaaa aagtgggaca agtcaaaatg tctttccctg aaggaaaaga tattcttttc
2040
atgggtaatg aagcagcaaa attagcagaa gctttccaga aatcattaag gaaaccaagt
2100
cataaaagat ctcaatctat tataggagaa aaagtgaaca ctgtatcaga aacattggaa
2160
ttacctacta tcagtagacc tgcaaaacca accatactgt cagaaccaaa gttagcatgg
2220
actgataaag gtggggcaat caaaactgaa ataaagcaag caatcaaagt catggatcct
2280
attgaggaag aagagtctac tgagaagaag gtgctgccct ccagtgatgg gaaaacccct
2340
gcagaaaaga aactgaaacc atcaactaac accaaaaaga aagtttcgtt tacaccaaat
2400
gaaccaggaa aatatacaaa gttggaaaaa gatgctctag atttgctctc agataatgaa
2460
gaagaagatg cagaatcttc aatcttaacc tttgaagaaa gagatacttc atcgttaagc
2520
attgaggcca gattggaatc aatagaggag aaattaagca tgatattagg gctattaaga
2580
acactcaaca ttgctacagc aggacccaca gcagcaagag atgggatcag agatgcaatg
2640
attggcgtaa gagaggaatt aatagcagac ataataaagg aagccaaagg gaaagcagca
2700
gaaatgatgg aagaggaaat gagtcaacga tcaaaaatag gaaacggtag tgtaaaacta
2760
acagagaaag caaaagagct taacaaaatt gttgaagatg aaagcacaag tggagaatct
2820
gaagaagaag aagaaccaaa agacatacaa gacaatagtc aagaagatga catttaccag
2880
ttaattatgt agtttaataa aaataaacaa tgggacaagt aaaaatggag tcctacctag
2940
tagacactta tcaaggcatt ccttacacag cagctgttca agttgatcta atagaaaagg
3000
acctgttacc tgcaagccta acaatatggt tccctttgtt tcaggccaac acaccaccag
3060
cagtgctgct cgatcagttg aaaaccctaa caataaccac tctgtatgct gcatcacaaa
3120
atggtccaat actcaaagtg aatgcatcag cccaaggtgc agcaatgtct gtacttccca
3180
aaaaatttga agtcaatgcg actgtagcac tcgatgaata tagcaaattg gaatttgaca
3240
aactcacagt ctgtgaagta aaaacagttt acttaacaac catgaaacca tacgggatgg
3300
tatcaaaatt tgtgagctca gccaaatcag ttggcaaaaa aacacatgat ctaatcgcac
3360
tgtgtgattt tatggatcta gaaaagaaca cacctgttac aataccagca ttcatcaaat
3420
cagtttcaat caaagagagt gagtcagcta ctgttgaagc tgctataagc agtgaagcag
3480
accaagctct aacacaggcc aaaattgcac cttatgcggg attgattatg atcatgacta
3540
tgaacaatcc caaaggcata ttcaaaaagc ttggagctgg gactcaagtt atagtagaac
3600
taggagcata tgtccaggct gaaagcataa gtaaaatatg caagacttgg agccatcaag
3660
ggacaagata tgtgttgaag tccagataac agccaagcac cttggccaag agctactaac
3720
tctatctcat agattataaa gtcaccattc tagttatata aaaatcaagt tagaacaaga
3780
attaaatcaa tcaagaatgg gacaaataaa aatgtcttgg aaagtggtga tcattttttc
3840
attgttaata acacctcaac acggtcttaa agagagctat ttagaagagt catgtagcac
3900
tataactgaa ggatatctca gtgttctgag gacaggttgg tataccaacg tttttacact
3960
ggaggtaggt gatgtagaga accttacatg tgctgatgga cctagcttaa taaaaacaga
4020
attagacctg accaaaagtg cactaagaga actcagaaca gtttctgctg atcaactggc
4080
aagagaggag caaattgaga atcccagaca atctagattt gttctaggag caatagcact
4140
cggtgttgca acagcagctg cagttacagc aggtgttgca attgccaaaa ccatccggct
4200
tgaaagtgaa gtaacagcaa ttaagaatgc cctcaaaaag accaatgaag cagtatctac
4260
attggggaat ggagttcgag tgttggcaac tgcagtgagg gagctggaag attttgtgag
4320
caagaatcta acacgtgcaa tcaacaaaaa caagtgcgac attgctgacc tgaaaatggc
4380
cgttagcttc agtcaattca acagaaggtt tctaaatgtt gtgcggcaat tttcagacaa
4440
tgctggaata acaccagcaa tatccttgga cttaatgaca gatgctgaac tagccagagc
4500
tgtttccaac atgccaacat ctgcaggaca aataaaactg atgttggaga accgtgcaat
4560
ggtaagaaga aaggggttcg gaatcctgat aggagtttac ggaagctccg taatttacat
4620
ggtgcaactg ccaatctttg gagttataga cacgccttgc tggatagtaa aagcggcccc
4680
ttcttgctca gaaaaaaagg gaaactatgc ttgcctttta agagaagatc aaggatggta
4740
ttgtcagaat gcagggtcaa ctgtttacta cccaaatgaa aaagactgcg aaacaagagg
4800
agaccatgtc ttttgcgaca cagcagcagg aatcaatgtt gctgagcagt caaaggagtg
4860
caacatcaac atatccacta ctaattaccc atgcaaagtt agcacaggaa gacaccctat
4920
cagtatggtt gcactgtctc ctcttggggc tttggttgct tgctacaagg gagtgagctg
4980
ttccattggc agcaacagag tagggatcat caagcaactg aacaaaggct gctcttatat
5040
aaccaaccaa gacgcagaca cagtgacaat agacaacact gtataccagc taagcaaagt
5100
tgagggcgaa cagcatgtta taaaaggaag gccagtgtca agcagctttg atccagtcaa
5160
atttcctgaa gatcaattca atgttgcact tgaccaagtt ttcgaaagca ttgagaacag
5220
tcaggccttg gtggatcaat caaacagaat cctaagcagt gcagagaaag gaaacactgg
5280
cttcatcatt gtaataattc taattgctgt ccttggctct accatgatcc tagtgagtgt
5340
ttttatcata ataaagaaaa caaagaaacc cacaggagca cctccagagc tgagtggtgt
5400
cacaaacaat ggcttcatac cacataatta gttaattaaa aataaagtaa attaaattaa
5460
aataaaataa aattaaaatt aaaataaaat aaaaataaaa atttgggaca aatcataatg
5520
tctcgcaagg ctccatgcaa atatgaagtg cggggcaaat gcaatagagg aagtgagtgc
5580
aagtttaacc acaattactg gagttggcca gatagatact tactaataag atcaaattat
5640
ttattaaatc aacttttaag gaacactgat agagctgatg gcttatcaat aatatcagga
5700
gcaggcagag aagataggac acaagatttt gtcctaggtt ccaccaatgt ggttcaaggt
5760
tatattgatg ataaccaaag cataacaaaa gctgcagcct gttacagtct acataatata
5820
atcaaacaac tacaagaagt tgaagttagg caggctagag ataacaaacc atctgacagc
5880
aaacatgtgg cacttcacaa cttagtccta tcttatatgg agatgagcaa aattcctgca
5940
tctttaatca acaatctcaa aagactgccg agagagaaac tgaaaaaatt agcaaagctt
6000
ataattgact tatcagcagg tgctgaaaat gactcttcat atgccttgca agacagtgaa
6060
agcactaatc aagtgcagtg agcatggtcc tgttttcatt actatagagg ttgattacat
6120
gatatggact cataaggact taaaagaagc tttatctaat gggatagtga agtctcatac
6180
taacatttac aattgttatt tagaaaacat agaaattata tatgtcaagg cttacttaag
6240
ttagtaaaaa cacatcagag tgggacaagt agttatggag gtgaaagtgg agaacattcg
6300
aacaatagat atgctcaaag caagagtgaa aaatcgtgtg gcacgcagca aatgctttaa
6360
aaatgcctct ttgatcctaa taggaataac tacattgagt atagccctca atatctatct
6420
aatcataaac tatacaatgc aagaaaacac atccgaatca gaacatcaca ccagctcatc
6480
acccatggaa tccagcaggg aaactccaac agtccctatg gacaactcag acaccaatcc
6540
aggctcacag tatccaactc aacagtccac agaaggctcc acactctact ttgcagcctc
6600
agcaagctca ccagagacag aaccaacatc aacaccagac acaacaagcc gcccgccctt
6660
cgtcgacaca cacacaacac taccaagtgc aagcagaaca aggacaagtc cggcagtcca
6720
cacaaaaaac aatccaagga caagccccag aacacattcc ccaccatggg caatgacaag
6780
gacggtccgt ggaaccacca ctctccgcac aagcagcaca agaaaaagac cgtccacagc
6840
atcagtccaa cctgacagca gcgcaacaac ccacaaacac gaagaagcaa gcccagtgag
6900
cccgcaaaca tctgcgagca cagcaagacc acaaaggaag ggcatggagg ccagcacatc
6960
aacaacatac aaccaaacta gttaacaaaa aatacaaaat aactctaaga taaaccatat
7020
agacaccaac aattgagaag ccaaaaggca attcacaatc tctccaaaaa ggcaacaaca
7080
ccatattagc tccgcttaaa tctccctgga aaaaacactc gcccatatac caactatacc
7140
acaaccatcc caagaaaaaa agctgggtaa aacaacaccc aagagacaaa taacaatgga
7200
tcctcttaat gaatccactg ttaatgtcta tcttcccgac tcatatctta aaggagtgat
7260
ttcttttagt gagactaatg caattggttc atgtctctta aaaagacctt acctaaaaaa
7320
tgacaacact gcaaaagttg ccatagagaa tcctgttatc gagcatgtta gactcaaaaa
7380
tgcaatcaat tctaagatga aaatatcaga ttacaggata gtagagccag taaacatgca
7440
acatgaaatt atgaagaatg tacacagttg tgagctcaca ttattaaaac agtttttaac
7500
aaggagtaaa aatattagca ctcttaaatt aaatatgata tgtgattggc tgcagttaaa
7560
gtctacatca gatgatacct caatcttaag ttttatagat gtagaattta tacctagctg
7620
ggtaagcaat tggtttagta attggtacaa tctcaacaag ttgattctgg aattcaggaa
7680
agaagaagta ataagaactg gttcaatctt gtgtaggtca ttgggtaaat tagtttttgt
7740
tgtatcatca tacggatgta tagtcaagag caacaaaagc aaaagagtga gcttcttcac
7800
atacaatcaa ctgttaacat ggaaagatgt gatgttaagt agattcaatg caaatttctg
7860
tatatgggta agcaacagtc tgaatgaaaa tcaagaaggg ttagggttga gaagtaatct
7920
gcaaggcata ttaactaata agctatatga aactgtagat tatatgctta gtttgtgttg
7980
caatgaaggt ttctcacttg tgaaagagtt tgagggtttt attatgagtg aaatccttag
8040
gattactgaa catgctcaat tcagtactag atttagaaat actttattaa atggattaac
8100
tgatcaattg acaaaattaa aaaataaaaa cagactcaga gttcatggta ccgtgttaga
8160
aaataatgat tatccaatgt atgaagttgt acttaaatta ttaggagata ctttgagatg
8220
tattaaatta ttaatcaata aaaacttaga gaatgctgct gaattatact atatatttag
8280
aatattcggt cacccaatgg tagatgaaag agatgcaatg gatgctgtca aattaaacaa
8340
tgaaatcaca aaaatcctca ggttggagag cttgacagaa ctaagagggg cattcatatt
8400
aaggattatc aaaggatttg tagacaacaa caaaagatgg ccgaaaatta aaaacttaaa
8460
agtgcttagt aaaagatgga ctatgtactt caaagcaaaa agttacccta gtcaacttga
8520
attaagtgaa caagattttt tagagcttgc tgcaatacag tttgaacaag agttttctgt
8580
tcctgaaaaa accaaccttg agatggtatt aaatgataaa gctatatcac ctcctaaaag
8640
attaatttgg tctgtgtacc caaaaaatta cttacctgag acaataaaaa atcgatatct
8700
agaagagact ttcaatgcaa gtgatagtct caaaacaaga agagtactag agtactattt
8760
gaaagataat aaattcgacc aaaaagaact taaaagttat gtggttaaac aagaatattt
8820
aaatgataag gatcatattg tctcgctaac tggaaaagaa agagaattaa gtgtaggtag
8880
aatgtttgct atgcaaccag gaaaacagcg acaaatacaa atattggctg aaaaattgtt
8940
agctgataat attgtaccct ttttcccaga aactttaaca aagtatggtg atctagatct
9000
tcagagaata atggaaatca aatcagaact ttcttctatt aaaaccagaa gaaatgatag
9060
ttataataat tacattgcaa gagcatccat agtaacagat ttaagtaagt tcaaccaagc
9120
ctttaggtat gaaactacag cgatctgtgc ggatgtagca gatgaactac atggaacaca
9180
aagcctattc tgttggttac atcttatcgt tcctatgact acaatgatat gtgcctatag
9240
acatgcacca ccagaaacaa aaggtgaata tgatatagat aagatagaag agcaaagtgg
9300
tttatataga tatcatatgg gtggtattga aggatggtgt caaaaactct ggacaatgga
9360
agctatatct ttattagatg ttgtatctgt aaagacacga tgtcaaatga catctttatt
9420
aaacggtgac aaccaatcaa tagatgtaag taaaccagtt aagttatctg agggtttaga
9480
tgaagtgaaa gcagattata gcttggctgt aaaaatgcta aaagaaataa gagatgcata
9540
cagaaatata ggccataaac ttaaagaagg ggaaacatat atatcaagag atcttcagtt
9600
tataagtaag gtgattcaat ctgaaggagt aatgcatcct acccctataa aaaagatctt
9660
aagagtggga ccatggataa acacaatatt agatgacatt aaaaccagtg cagagtcaat
9720
agggagtcta tgtcaggaat tagaatttag gggggaaagc ataatagtta gtctgatatt
9780
aaggaatttt tggctgtata atttatacat gcatgaatca aagcaacacc ccctagcagg
9840
gaagcagtta ttcaaacaac taaataaaac attaacatca gtgcagagat tttttgaaat
9900
taaaaaggaa aatgaagtag tagatctatg gatgaacata ccaatgcagt ttggaggagg
9960
agatccagta gtcttctata gatctttcta tagaaggacc cctgattttt taactgaagc
10020
aatcagtcat gtagatattc tgttaaaaat atcagccaac ataagaaatg aagcgaaaat
10080
aagtttcttc aaagccttac tgtcaataga aaaaaatgaa cgtgctacac tgacaacact
10140
aatgagagac cctcaagctg tgggctcaga gcgacaagca aaagtaacaa gtgatatcaa
10200
tagaacagca gttaccagca tcttaagtct ttctccaaat caacttttca gcgatagtgc
10260
tatacactac agtagaaatg aagaagaggt cggaatcatt gctgacaaca taacacctgt
10320
ttatcctcat ggactgagag ttttgtatga atcattacct tttcataaag ctgaaaaagt
10380
tgtaaatatg atatcaggaa caaaatccat aaccaactta ttacagagaa catctgctat
10440
taatggtgaa gatattgaca gagctgtatc catgatgctg gagaacctag gattattatc
10500
tagaatattg tcagtagttg ttgatagtat agaaattcca accaaatcta atggtaggct
10560
gatatgttgt cagatatcta gaaccctaag ggagacatca tggaataata tggaaatagt
10620
tggagtaaca tcccctagca tcactacatg catggatgtc atatatgcaa ctagctctca
10680
tttgaaaggg ataatcattg aaaagttcag cactgacaga actacaagag gtcaaagagg
10740
tccaaagagc ccttgggtag gatcgagcac gcaagagaaa aaattagttc ctgtttataa
10800
cagacaaatt ctttcaaaac aacaaagaga acagctagaa gcaattggaa aaatgagatg
10860
ggtatataaa gggacaccag gtttaagacg attactcaat aagatttgtc ttggaagttt
10920
aggcattagt tacaaatgtg taaaaccttt attacctagg tttatgagtg taaatttcct
10980
acacaggtta tctgtcagta gtagacctat ggaattccca gcatcagttc cagcttatag
11040
aacaacaaat taccattttg acactagtcc tattaatcaa gcactaagtg aaagatttgg
11100
gaatgaagat attaatttgg tcttccaaaa tgcaatcagc tgtggaatta gcataatgag
11160
tgtagtagaa caattaactg gtaggagtcc aaaacagtta gttttaatac cccaattaga
11220
agaaatagac attatgccac caccagtgtt tcaagggaaa ttcaattata agctagtaga
11280
taagataact tctgaccaac atatcttcag tccagacaaa atagatatgt taacactggg
11340
gaaaatgctc atgccaacta taaaaggtca gaaaacagat cagttcttga acaagagaga
11400
gaattatttc catgggaaca atcttattga gtctttgtca gcagcgttag catgtcattg
11460
gtgtgggata ttaacagagc aatgtataga aaataatatt ttcaagaaag actggggtga
11520
cgggttcata tcggatcatg cttttatgga cttcaaaata ttcctatgtg tctttaaaac
11580
taaactttta tgtagttggg gatcccaagg gaaaaacatt aaagatgaag atatagtaga
11640
tgaatcgata gataaactgt taaggattga taatactttt tggagaatgt tcagcaaggt
11700
tatgtttgaa tcaaaggtta agaaaaggat aatgttatat gatgtaaaat ttctatcatt
11760
agtaggttat atagggttta agaattggtt tatagaacag ttgagatcag ctgagttgca
11820
tgaggtacct tggattgtca atgccgaagg tgatctggtt gagatcaagt caattaaaat
11880
ctatttgcaa ctgatagagc agagtttatt tttaagaata actgttttga actatacaga
11940
tatggcacat gctctcacaa gattaatcag aaagaagttg atgtgtgata atgcactatt
12000
aacttcaatt ccatccccaa tggttaactt aactcaagtt attgatccta cagaacaatt
12060
agcttatttc cctaagataa catttgaaag gctaaaaaat tatgacacta gttcaaatta
12120
tgctaaagga aagctaacaa ggaattacat gatactgttg ccatggcaac atgttaatag
12180
atataacttt gtctttagtt ctactggatg taaagttagt ctaaaaacat gcattggaaa
12240
acttatgaaa gatctaaacc ctaaagttct gtactttatt ggagaagggg caggaaattg
12300
gatggccaga acagcatgtg aatatcctga catcaaattt gtatacagaa gtttaaaaga
12360
tgaccttgat catcattatc ctttggaata ccagagagtg ataggagaat taagcaggat
12420
aatagatagt ggtgaagggc tttcaatgga aacaacagat gcaactcaaa aaactcattg
12480
ggatttgata cacagagtaa gcaaagatgc tttattaata actttatgtg atgcagaatt
12540
taaggacaga gatgattttt ttaagatggt aattctatgg aggaaacatg tattatcatg
12600
cagaatttgc actacctatg ggacagacct ctatttattc gcaaagtatc atgctaaaga
12660
ctgcaatata aaattacctt tttttgtgag atcagttgcc acctttatta tgcaaggtag
12720
taaactgtca ggctcggaat gctacatact cttaacacta ggccaccaca acaatttacc
12780
ttgtcatgga gaaatacaaa attctaagat gaaaatagca gcgtgtaatg atttttatgc
12840
tgcaaaaaaa cttgacaata aatcaattga agccaactgt aaatcacttt tatcagggct
12900
aagaataccg ataaataaga aggaattaaa tagacagaga aggttattaa cactacaaag
12960
caaccattct tctgtagcaa cagttggagg tagcaaggtc atagagtcta aatggttaac
13020
aaacaaggca aacacaataa ttgattggtt agaacatatt ttaaattctc caaaaggtga
13080
attaaattat gatttttttg aagcattaga aaatacttac cctaatatga ttaaactaat
13140
agataatcta gggaatgcag agattaaaaa actgatcaaa gtaactggat atatgcttgt
13200
aagtaaaaaa tgaaaaatga taaaaatgat aaaataggtg acaacttcat actattccaa
13260
agtaatcatt tgattatgca attatgtaat agttaattaa aaactaaaaa tcaaaagtta
13320
aaaactaata actgtcatta agtttattaa aaataagaaa ttataattgg atgtatacgg
13380
tttttttgcc gt
13392
<210> 6
<211> 13220
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Ген GFP вставлен между положениями 40 и 784
<400> 6
gcgaaaaaaa cgcgtataaa ttagattaca aaaaaatatg ggacaagtga aaatggtgag
60
caagggcgag gagctgttca ccggggtggt gcccatcctg gtcgagctgg acggcgacgt
120
aaacggccac aagttcagcg tgtccggcga gggcgagggc gatgccacct acggcaagct
180
gaccctgaag ttcatctgca ccaccggcaa gctgcccgtg ccctggccca ccctcgtgac
240
caccctgacc tacggcgtgc agtgcttcag ccgctacccc gaccacatga agcagcacga
300
cttcttcaag tccgccatgc ccgaaggcta cgtccaggag cgcaccatct tcttcaagga
360
cgacggcaac tacaagaccc gcgccgaggt gaagttcgag ggcgacaccc tggtgaaccg
420
catcgagctg aagggcatcg acttcaagga ggacggcaac atcctggggc acaagctgga
480
gtacaactac aacagccaca acgtctatat catggccgac aagcagaaga acggcatcaa
540
ggtgaacttc aagatccgcc acaacatcga ggacggcagc gtgcagctcg ccgaccacta
600
ccagcagaac acccccatcg gcgacggccc cgtgctgctg cccgacaacc actacctgag
660
cacccagtcc gccctgagca aagaccccaa cgagaagcgc gatcacatgg tcctgctgga
720
gttcgtgacc gccgccggga tcactctcgg catggacgag ctgtacaagt aagttaatta
780
aaaagtggga caagtgaaaa tgtctcttca agggattcac ctgagtgatc tatcatacaa
840
gcatgctata ttaaaagagt ctcagtacac aataaaaaga gatgtgggta caacaactgc
900
agtgacaccc tcatcattgc aacaagaaat aacgctgttg tgtggagaaa ttctgtatgc
960
taaacatgct gattacaaat atgctgcaga aataggaata caatatatta gcacagcttt
1020
aggatcagag agagtgcagc agattctgag gaactcaggc agtgaagtcc aagtggtctt
1080
aaccagaacg tactctctgg ggaaagttaa aaacaataaa ggagaagatt tacagatgtt
1140
agacatacac ggggtagaga agagctgggt agaagagata gacaaagaag caaggaaaac
1200
aatggcaacc ttgcttaagg aatcatcagg taatatccca caaaatcaga ggccctcagc
1260
accagacaca cccataatct tattatgtgt aggtgcatta atatttacta agctagcatc
1320
aaccatagaa gtgggactag agaccacagt cagaagggct aaccgtgtac taagtgatgc
1380
actcaagaga taccctagaa tggacatccc aaaaattgcc agatccttct atgacttatt
1440
tgaacaaaaa gtgtatcaca gaagtttgtt cattgagtat ggcaaagcat taggctcatc
1500
atctacaggc agcaaagcag aaagtctatt tgttaatata ttcatgcaag cttatggagc
1560
cggtcaaaca atgctaaggt ggggggtcat tgccaggtca tccaacaata taatgttagg
1620
acatgtatct gtccaagctg agttaaaaca ggtcacagaa gtctatgact tggtgcgaga
1680
aatgggccct gaatctggac ttctacattt aaggcaaagc ccaaaagctg gactgttatc
1740
actagccaac tgtcccaact ttgcaagtgt tgttctcgga aatgcctcag gcttaggcat
1800
aatcggtatg tatcgtggga gagtaccaaa cacagaatta ttttcagcag cagaaagtta
1860
tgccaaaagt ttgaaagaga gcaataaaat caatttctct tcattaggac ttacagatga
1920
agagaaagag gctgcagaac atttcttaaa tgtgagtgac gacagtcaaa atgattatga
1980
gtaattaaaa aagtgggaca agtcaaaatg tctttccctg aaggaaaaga tattcttttc
2040
atgggtaatg aagcagcaaa attagcagaa gctttccaga aatcattaag gaaaccaagt
2100
cataaaagat ctcaatctat tataggagaa aaagtgaaca ctgtatcaga aacattggaa
2160
ttacctacta tcagtagacc tgcaaaacca accatactgt cagaaccaaa gttagcatgg
2220
actgataaag gtggggcaat caaaactgaa ataaagcaag caatcaaagt catggatcct
2280
attgaggaag aagagtctac tgagaagaag gtgctgccct ccagtgatgg gaaaacccct
2340
gcagaaaaga aactgaaacc atcaactaac accaaaaaga aagtttcgtt tacaccaaat
2400
gaaccaggaa aatatacaaa gttggaaaaa gatgctctag atttgctctc agataatgaa
2460
gaagaagatg cagaatcttc aatcttaacc tttgaagaaa gagatacttc atcgttaagc
2520
attgaggcca gattggaatc aatagaggag aaattaagca tgatattagg gctattaaga
2580
acactcaaca ttgctacagc aggacccaca gcagcaagag atgggatcag agatgcaatg
2640
attggcgtaa gagaggaatt aatagcagac ataataaagg aagccaaagg gaaagcagca
2700
gaaatgatgg aagaggaaat gagtcaacga tcaaaaatag gaaacggtag tgtaaaacta
2760
acagagaaag caaaagagct taacaaaatt gttgaagatg aaagcacaag tggagaatct
2820
gaagaagaag aagaaccaaa agacatacaa gacaatagtc aagaagatga catttaccag
2880
ttaattatgt agtttaataa aaataaacaa tgggacaagt aaaaatggag tcctacctag
2940
tagacactta tcaaggcatt ccttacacag cagctgttca agttgatcta atagaaaagg
3000
acctgttacc tgcaagccta acaatatggt tccctttgtt tcaggccaac acaccaccag
3060
cagtgctgct cgatcagttg aaaaccctaa caataaccac tctgtatgct gcatcacaaa
3120
atggtccaat actcaaagtg aatgcatcag cccaaggtgc agcaatgtct gtacttccca
3180
aaaaatttga agtcaatgcg actgtagcac tcgatgaata tagcaaattg gaatttgaca
3240
aactcacagt ctgtgaagta aaaacagttt acttaacaac catgaaacca tacgggatgg
3300
tatcaaaatt tgtgagctca gccaaatcag ttggcaaaaa aacacatgat ctaatcgcac
3360
tgtgtgattt tatggatcta gaaaagaaca cacctgttac aataccagca ttcatcaaat
3420
cagtttcaat caaagagagt gagtcagcta ctgttgaagc tgctataagc agtgaagcag
3480
accaagctct aacacaggcc aaaattgcac cttatgcggg attgattatg atcatgacta
3540
tgaacaatcc caaaggcata ttcaaaaagc ttggagctgg gactcaagtt atagtagaac
3600
taggagcata tgtccaggct gaaagcataa gtaaaatatg caagacttgg agccatcaag
3660
ggacaagata tgtgttgaag tccagataac agccaagcac cttggccaag agctactaac
3720
tctatctcat agattataaa gtcaccattc tagttatata aaaatcaagt tagaacaaga
3780
attaaatcaa tcaagaatgg gacaaataaa aatgtcttgg aaagtggtga tcattttttc
3840
attgttaata acacctcaac acggtcttaa agagagctat ttagaagagt catgtagcac
3900
tataactgaa ggatatctca gtgttctgag gacaggttgg tataccaacg tttttacact
3960
ggaggtaggt gatgtagaga accttacatg tgctgatgga cctagcttaa taaaaacaga
4020
attagacctg accaaaagtg cactaagaga actcagaaca gtttctgctg atcaactggc
4080
aagagaggag caaattgaga atcccagaca atctagattt gttctaggag caatagcact
4140
cggtgttgca acagcagctg cagttacagc aggtgttgca attgccaaaa ccatccggct
4200
tgaaagtgaa gtaacagcaa ttaagaatgc cctcaaaaag accaatgaag cagtatctac
4260
attggggaat ggagttcgag tgttggcaac tgcagtgagg gagctggaag attttgtgag
4320
caagaatcta acacgtgcaa tcaacaaaaa caagtgcgac attgctgacc tgaaaatggc
4380
cgttagcttc agtcaattca acagaaggtt tctaaatgtt gtgcggcaat tttcagacaa
4440
tgctggaata acaccagcaa tatccttgga cttaatgaca gatgctgaac tagccagagc
4500
tgtttccaac atgccaacat ctgcaggaca aataaaactg atgttggaga accgtgcaat
4560
ggtaagaaga aaggggttcg gaatcctgat aggagtttac ggaagctccg taatttacat
4620
ggtgcaactg ccaatctttg gagttataga cacgccttgc tggatagtaa aagcggcccc
4680
ttcttgctca gaaaaaaagg gaaactatgc ttgcctttta agagaagatc aaggatggta
4740
ttgtcagaat gcagggtcaa ctgtttacta cccaaatgaa aaagactgcg aaacaagagg
4800
agaccatgtc ttttgcgaca cagcagcagg aatcaatgtt gctgagcagt caaaggagtg
4860
caacatcaac atatccacta ctaattaccc atgcaaagtt agcacaggaa gacaccctat
4920
cagtatggtt gcactgtctc ctcttggggc tttggttgct tgctacaagg gagtgagctg
4980
ttccattggc agcaacagag tagggatcat caagcaactg aacaaaggct gctcttatat
5040
aaccaaccaa gacgcagaca cagtgacaat agacaacact gtataccagc taagcaaagt
5100
tgagggcgaa cagcatgtta taaaaggaag gccagtgtca agcagctttg atccagtcaa
5160
atttcctgaa gatcaattca atgttgcact tgaccaagtt ttcgaaagca ttgagaacag
5220
tcaggccttg gtggatcaat caaacagaat cctaagcagt gcagagaaag gaaacactgg
5280
cttcatcatt gtaataattc taattgctgt ccttggctct accatgatcc tagtgagtgt
5340
ttttatcata ataaagaaaa caaagaaacc cacaggagca cctccagagc tgagtggtgt
5400
cacaaacaat ggcttcatac cacataatta gttaattaaa aataaagtaa attaaattaa
5460
aataaaataa aattaaaatt aaaataaaat aaaaataaaa atttgggaca aatcataatg
5520
tctcgcaagg ctccatgcaa atatgaagtg cggggcaaat gcaatagagg aagtgagtgc
5580
aagtttaacc acaattactg gagttggcca gatagatact tactaataag atcaaattat
5640
ttattaaatc aacttttaag gaacactgat agagctgatg gcttatcaat aatatcagga
5700
gcaggcagag aagataggac acaagatttt gtcctaggtt ccaccaatgt ggttcaaggt
5760
tatattgatg ataaccaaag cataacaaaa gctgcagcct gttacagtct acataatata
5820
atcaaacaac tacaagaagt tgaagttagg caggctagag ataacaaacc atctgacagc
5880
aaacatgtgg cacttcacaa cttagtccta tcttatatgg agatgagcaa aattcctgca
5940
tctttaatca acaatctcaa aagactgccg agagagaaac tgaaaaaatt agcaaagctt
6000
ataattgact tatcagcagg tgctgaaaat gactcttcat atgccttgca agacagtgaa
6060
agcactaatc aagtgcagtg agcatggtcc tgttttcatt actatagagg ttgattacat
6120
gatatggact cataaggact taaaagaagc tttatctaat gggatagtga agtctcatac
6180
taacatttac aattgttatt tagaaaacat agaaattata tatgtcaagg cttacttaag
6240
ttagtaaaaa cacatcagag tgggataaat gacaatgata acattagatg tcattaaaag
6300
tgatgggtct tcaaaaacat gtactcacct caaaaaatta attaaagacc actctggtaa
6360
agtgcttatt gtacttaagt taatattagc tttactaaca tttctcacag tgacaatcac
6420
catcaattat ataaaagtag aaaacaatct gcaaatatgt cagtcaaaaa ctgaatcaga
6480
caaaaaggac tcatcatcaa ataccacatc agtcacaacc aagactactc taaatcatga
6540
tataacacag tattttaaaa gtttgattca aaggtataca aactctgcaa taaacagaga
6600
cacatgctgg aaaataagca gaaatcaatg cacaaacata acaacataca aatttttatg
6660
ttttaaatct gaagaaacaa aaaccaacaa ttgtgataaa ctgacagatt tatgcagaaa
6720
caaaccaaaa ccagctgttg aagtgtatca catagtagaa tgccattgta tatacacagt
6780
taaatggaag tgctatcatt acccaataga tgaaacccaa tcctaaataa cactagatta
6840
ggatccatcc aagtctgtta gttcaacaat ttagttattt aaaaatattt tgaaaacaag
6900
taagtttcta tgatacttca taataataag taataattaa ttgcttaatc atcatcacaa
6960
cattattcga aaccataact attcaattta agaagtaaaa acaataatat gagacaaata
7020
acaatggatc ctcttaatga atccactgtt aatgtctatc ttcccgactc atatcttaaa
7080
ggagtgattt cttttagtga gactaatgca attggttcat gtctcttaaa aagaccttac
7140
ctaaaaaatg acaacactgc aaaagttgcc atagagaatc ctgttatcga gcatgttaga
7200
ctcaaaaatg caatcaattc taagatgaaa atatcagatt acaggatagt agagccagta
7260
aacatgcaac atgaaattat gaagaatgta cacagttgtg agctcacatt attaaaacag
7320
tttttaacaa ggagtaaaaa tattagcact cttaaattaa atatgatatg tgattggctg
7380
cagttaaagt ctacatcaga tgatacctca atcttaagtt ttatagatgt agaatttata
7440
cctagctggg taagcaattg gtttagtaat tggtacaatc tcaacaagtt gattctggaa
7500
ttcaggaaag aagaagtaat aagaactggt tcaatcttgt gtaggtcatt gggtaaatta
7560
gtttttgttg tatcatcata cggatgtata gtcaagagca acaaaagcaa aagagtgagc
7620
ttcttcacat acaatcaact gttaacatgg aaagatgtga tgttaagtag attcaatgca
7680
aatttctgta tatgggtaag caacagtctg aatgaaaatc aagaagggtt agggttgaga
7740
agtaatctgc aaggcatatt aactaataag ctatatgaaa ctgtagatta tatgcttagt
7800
ttgtgttgca atgaaggttt ctcacttgtg aaagagtttg agggttttat tatgagtgaa
7860
atccttagga ttactgaaca tgctcaattc agtactagat ttagaaatac tttattaaat
7920
ggattaactg atcaattgac aaaattaaaa aataaaaaca gactcagagt tcatggtacc
7980
gtgttagaaa ataatgatta tccaatgtat gaagttgtac ttaaattatt aggagatact
8040
ttgagatgta ttaaattatt aatcaataaa aacttagaga atgctgctga attatactat
8100
atatttagaa tattcggtca cccaatggta gatgaaagag atgcaatgga tgctgtcaaa
8160
ttaaacaatg aaatcacaaa aatcctcagg ttggagagct tgacagaact aagaggggca
8220
ttcatattaa ggattatcaa aggatttgta gacaacaaca aaagatggcc gaaaattaaa
8280
aacttaaaag tgcttagtaa aagatggact atgtacttca aagcaaaaag ttaccctagt
8340
caacttgaat taagtgaaca agatttttta gagcttgctg caatacagtt tgaacaagag
8400
ttttctgttc ctgaaaaaac caaccttgag atggtattaa atgataaagc tatatcacct
8460
cctaaaagat taatttggtc tgtgtaccca aaaaattact tacctgagac aataaaaaat
8520
cgatatctag aagagacttt caatgcaagt gatagtctca aaacaagaag agtactagag
8580
tactatttga aagataataa attcgaccaa aaagaactta aaagttatgt ggttaaacaa
8640
gaatatttaa atgataagga tcatattgtc tcgctaactg gaaaagaaag agaattaagt
8700
gtaggtagaa tgtttgctat gcaaccagga aaacagcgac aaatacaaat attggctgaa
8760
aaattgttag ctgataatat tgtacccttt ttcccagaaa ctttaacaaa gtatggtgat
8820
ctagatcttc agagaataat ggaaatcaaa tcagaacttt cttctattaa aaccagaaga
8880
aatgatagtt ataataatta cattgcaaga gcatccatag taacagattt aagtaagttc
8940
aaccaagcct ttaggtatga aactacagcg atctgtgcgg atgtagcaga tgaactacat
9000
ggaacacaaa gcctattctg ttggttacat cttatcgttc ctatgactac aatgatatgt
9060
gcctatagac atgcaccacc agaaacaaaa ggtgaatatg atatagataa gatagaagag
9120
caaagtggtt tatatagata tcatatgggt ggtattgaag gatggtgtca aaaactctgg
9180
acaatggaag ctatatcttt attagatgtt gtatctgtaa agacacgatg tcaaatgaca
9240
tctttattaa acggtgacaa ccaatcaata gatgtaagta aaccagttaa gttatctgag
9300
ggtttagatg aagtgaaagc agattatagc ttggctgtaa aaatgctaaa agaaataaga
9360
gatgcataca gaaatatagg ccataaactt aaagaagggg aaacatatat atcaagagat
9420
cttcagttta taagtaaggt gattcaatct gaaggagtaa tgcatcctac ccctataaaa
9480
aagatcttaa gagtgggacc atggataaac acaatattag atgacattaa aaccagtgca
9540
gagtcaatag ggagtctatg tcaggaatta gaatttaggg gggaaagcat aatagttagt
9600
ctgatattaa ggaatttttg gctgtataat ttatacatgc atgaatcaaa gcaacacccc
9660
ctagcaggga agcagttatt caaacaacta aataaaacat taacatcagt gcagagattt
9720
tttgaaatta aaaaggaaaa tgaagtagta gatctatgga tgaacatacc aatgcagttt
9780
ggaggaggag atccagtagt cttctataga tctttctata gaaggacccc tgatttttta
9840
actgaagcaa tcagtcatgt agatattctg ttaaaaatat cagccaacat aagaaatgaa
9900
gcgaaaataa gtttcttcaa agccttactg tcaatagaaa aaaatgaacg tgctacactg
9960
acaacactaa tgagagaccc tcaagctgtg ggctcagagc gacaagcaaa agtaacaagt
10020
gatatcaata gaacagcagt taccagcatc ttaagtcttt ctccaaatca acttttcagc
10080
gatagtgcta tacactacag tagaaatgaa gaagaggtcg gaatcattgc tgacaacata
10140
acacctgttt atcctcatgg actgagagtt ttgtatgaat cattaccttt tcataaagct
10200
gaaaaagttg taaatatgat atcaggaaca aaatccataa ccaacttatt acagagaaca
10260
tctgctatta atggtgaaga tattgacaga gctgtatcca tgatgctgga gaacctagga
10320
ttattatcta gaatattgtc agtagttgtt gatagtatag aaattccaac caaatctaat
10380
ggtaggctga tatgttgtca gatatctaga accctaaggg agacatcatg gaataatatg
10440
gaaatagttg gagtaacatc ccctagcatc actacatgca tggatgtcat atatgcaact
10500
agctctcatt tgaaagggat aatcattgaa aagttcagca ctgacagaac tacaagaggt
10560
caaagaggtc caaagagccc ttgggtagga tcgagcacgc aagagaaaaa attagttcct
10620
gtttataaca gacaaattct ttcaaaacaa caaagagaac agctagaagc aattggaaaa
10680
atgagatggg tatataaagg gacaccaggt ttaagacgat tactcaataa gatttgtctt
10740
ggaagtttag gcattagtta caaatgtgta aaacctttat tacctaggtt tatgagtgta
10800
aatttcctac acaggttatc tgtcagtagt agacctatgg aattcccagc atcagttcca
10860
gcttatagaa caacaaatta ccattttgac actagtccta ttaatcaagc actaagtgaa
10920
agatttggga atgaagatat taatttggtc ttccaaaatg caatcagctg tggaattagc
10980
ataatgagtg tagtagaaca attaactggt aggagtccaa aacagttagt tttaataccc
11040
caattagaag aaatagacat tatgccacca ccagtgtttc aagggaaatt caattataag
11100
ctagtagata agataacttc tgaccaacat atcttcagtc cagacaaaat agatatgtta
11160
acactgggga aaatgctcat gccaactata aaaggtcaga aaacagatca gttcttgaac
11220
aagagagaga attatttcca tgggaacaat cttattgagt ctttgtcagc agcgttagca
11280
tgtcattggt gtgggatatt aacagagcaa tgtatagaaa ataatatttt caagaaagac
11340
tggggtgacg ggttcatatc ggatcatgct tttatggact tcaaaatatt cctatgtgtc
11400
tttaaaacta aacttttatg tagttgggga tcccaaggga aaaacattaa agatgaagat
11460
atagtagatg aatcgataga taaactgtta aggattgata atactttttg gagaatgttc
11520
agcaaggtta tgtttgaatc aaaggttaag aaaaggataa tgttatatga tgtaaaattt
11580
ctatcattag taggttatat agggtttaag aattggttta tagaacagtt gagatcagct
11640
gagttgcatg aggtaccttg gattgtcaat gccgaaggtg atctggttga gatcaagtca
11700
attaaaatct atttgcaact gatagagcag agtttatttt taagaataac tgttttgaac
11760
tatacagata tggcacatgc tctcacaaga ttaatcagaa agaagttgat gtgtgataat
11820
gcactattaa cttcaattcc atccccaatg gttaacttaa ctcaagttat tgatcctaca
11880
gaacaattag cttatttccc taagataaca tttgaaaggc taaaaaatta tgacactagt
11940
tcaaattatg ctaaaggaaa gctaacaagg aattacatga tactgttgcc atggcaacat
12000
gttaatagat ataactttgt ctttagttct actggatgta aagttagtct aaaaacatgc
12060
attggaaaac ttatgaaaga tctaaaccct aaagttctgt actttattgg agaaggggca
12120
ggaaattgga tggccagaac agcatgtgaa tatcctgaca tcaaatttgt atacagaagt
12180
ttaaaagatg accttgatca tcattatcct ttggaatacc agagagtgat aggagaatta
12240
agcaggataa tagatagtgg tgaagggctt tcaatggaaa caacagatgc aactcaaaaa
12300
actcattggg atttgataca cagagtaagc aaagatgctt tattaataac tttatgtgat
12360
gcagaattta aggacagaga tgattttttt aagatggtaa ttctatggag gaaacatgta
12420
ttatcatgca gaatttgcac tacctatggg acagacctct atttattcgc aaagtatcat
12480
gctaaagact gcaatataaa attacctttt tttgtgagat cagttgccac ctttattatg
12540
caaggtagta aactgtcagg ctcggaatgc tacatactct taacactagg ccaccacaac
12600
aatttacctt gtcatggaga aatacaaaat tctaagatga aaatagcagc gtgtaatgat
12660
ttttatgctg caaaaaaact tgacaataaa tcaattgaag ccaactgtaa atcactttta
12720
tcagggctaa gaataccgat aaataagaag gaattaaata gacagagaag gttattaaca
12780
ctacaaagca accattcttc tgtagcaaca gttggaggta gcaaggtcat agagtctaaa
12840
tggttaacaa acaaggcaaa cacaataatt gattggttag aacatatttt aaattctcca
12900
aaaggtgaat taaattatga tttttttgaa gcattagaaa atacttaccc taatatgatt
12960
aaactaatag ataatctagg gaatgcagag attaaaaaac tgatcaaagt aactggatat
13020
atgcttgtaa gtaaaaaatg aaaaatgata aaaatgataa aataggtgac aacttcatac
13080
tattccaaag taatcatttg attatgcaat tatgtaatag ttaattaaaa actaaaaatc
13140
aaaagttaaa aactaataac tgtcattaag tttattaaaa ataagaaatt ataattggat
13200
gtatacggtt tttttgccgt
13220
<210> 7
<211> 13280
<212> ДНЕ
<213> метапневмовирус
<400> 7
acgcgaaaaa aacgcgtata aattaaattc caaacaaaac gggacaaata aaaatgtctc
60
ttcaagggat tcacctaagt gatctgtcat ataaacatgc tatattaaaa gagtctcaat
120
acacaataaa aagagatgta ggcaccacaa ctgcagtgac accttcatca ttgcagcaag
180
agataacact tttgtgtgga gagattcttt acactaaaca tactgattac aaatatgctg
240
cagagatagg gatacaatat atttgcacgg ctctaggatc agaaagagta caacagattt
300
taagaaattc aggcagtgaa gttcaggtgg ttctaaccaa gacatactct ttagggaaag
360
gtaaaaatag taaaggggaa gagttgcaaa tgttagatat acatggagtg gaaaagagtt
420
gggtagaaga aatagacaaa gaggcaagaa aaacaatggt gactttgcta aaggaatcat
480
caggtaacat cccacaaaac cagaggcctt cagcaccaga cacaccaata attttattat
540
gtgtaggtgc tttaatattc actaaactag catcaacaat agaagttgga ctagagacta
600
cagttagaag agctaacaga gtgctaagtg atgcgctcaa aagataccct agggtagata
660
taccgaagat tgctagatct ttctatgaac tatttgagca gaaagtgtat tacaggagtc
720
tattcattga gtatgggaaa gctttaggct catcttcaac aggaagcaaa gcagaaagtt
780
tgtttgtaaa tatatttatg caagcttatg gagccggtca aacaatgcta aggtggggtg
840
tcattgccag atcatctaac aacataatgc taggacatgt gtctgtgcaa gctgaattga
900
agcaagttac agaggtttat gatttggtga gagaaatggg tcctgaatct gggcttttac
960
atctaagaca aagtccaaag gcaggactgt tatcgttggc caattgcccc gattttgcta
1020
gtgttgttct tggtaatgct tcaggtctag gtataatcgg aatgtacaga ggaagagtgc
1080
caaacacaga gctattttct gcagcagaaa gttatgccag aagcttaaaa gaaagcaaca
1140
aaatcaactt ctcctcatta gggctcacag acgaagaaaa agaagctgca gaacacttct
1200
taaacatgag tgatgacaat caagatgatt atgagtaatt aaaaaactgg gacaagtcaa
1260
aatgtcattc cctgaaggaa aagatatcct gttcatgggt aatgaagcag caaaaatagc
1320
agaagctttc cagaaatcac taaaaagatc aggtcacaaa agaacccagt ctattgtagg
1380
ggaaaaagta aacactatat cagaaactct agagctacct accatcagca aacctgcacg
1440
atcatctaca ctgctagagc caaaattggc atgggcagac agcagcagag ccaccaaaac
1500
cacagaaaaa caaacaacca aaacaacaga tcctgttgaa gaagaggaac tcaatgaaaa
1560
gaagatatca ccttccagtg atgggaagac tcccgcagag aaaaaatcaa aatctccaac
1620
caatgtaaaa aagaaagttt ccttcacatc aaatgaacca gggaaatata ccaaactaga
1680
aaaagatgcc ctagatttgc tctcagacaa tgaggaagaa gacgcagagt cctcaatctt
1740
aacctttgaa gagagagaca catcatcact aagcattgag gctagactag aatcaataga
1800
agagaagcta agcatgatat taggactgct tcgtacactt aacattgcaa cagcaggacc
1860
aacggctgca agagatggaa tcagagatgc aatgattggt ataagagaag aactaatagc
1920
agaaataata aaagaagcaa agggaaaagc agctgaaatg atggaagagg aaatgaatca
1980
aaggtcaaaa ataggtaatg gcagtgtaaa actaaccgag aaggcaaaag aacttaataa
2040
aattgttgaa gacgagagca caagcggtga atcagaagaa gaagaagaac caaaagaaac
2100
tcaggataac aatcaaggag aagatattta ccagttaatc atgtagttta ataaaaataa
2160
acaatgggac aagtcaagat ggagtcctat ctagtggaca cttatcaagg cattccctac
2220
acagctgctg ttcaagttga tctggtagaa aaagacttac taccagcaag tttgacaata
2280
tggtttcctc tattccaagc caacacacca ccagcggttt tgctcgatca gctaaagacc
2340
ttgacaataa caactctgta tgctgcatca cagaatggtc caatactcaa ggtaaatgca
2400
tcagctcagg gtgctgctat gtctgtactt cccaaaaaat tcgaagtaaa tgcaactgtg
2460
gcacttgatg aatacagcaa acttgacttt gacaagttaa cggtttgcga tgttaaaaca
2520
gtttatttga caaccatgaa accatatggg atggtgtcaa aatttgtgag ttcagccaaa
2580
tcagttggca acaagacaca tgatctaatt gcactgtgtg acttcatgga cctagagaaa
2640
aatatacctg tgacaatacc agcattcata aagtcagttt caatcaaaga gagtgagtca
2700
gccactgttg aagctgcaat aagcagtgag gccgaccaag cattaacaca agccaaaatt
2760
gcaccctatg caggactaat catgatcatg accatgaaca atccaaaagg tatattcaag
2820
aaactaggag ctggaacaca agtgatagta gagctagggg catatgttca agccgagagc
2880
atcagcagga tctgcaagag ctggagtcac caaggaacaa gatatgtact aaaatccaga
2940
taaaaataac tgtcctaatc aataattgct tatataatct taaagatcaa tgagcttatt
3000
attatagtta tataaaaaaa tttagaacta ggaaggtatt aatagaaagc gggacaagta
3060
aaaatgtctt ggaaagtgat gattatcatt tcgttactca taacacctca gcacggacta
3120
aaggaaagtt atttagaaga atcatgtagt actataactg aaggatatct cagtgtttta
3180
agaacaggtt ggtacaccaa tgtctttaca ttagaagttg gtgatgttga aaatcttaca
3240
tgtactgatg gacctagctt aatcaaaaca gaacttgacc taaccaaaag tgctctaaga
3300
gaactcaaaa cagtttctgc tgatcagtta gcgagagaag aacaaattga aaatcccaga
3360
caatcaaggt ttgtcctagg tgcaatagct cttggtgttg ccacagcagc agcagtcaca
3420
gcaggcattg cgatagccaa aaccataagg cttgagagtg aagtgaatgc aatcaaaggt
3480
gctctcaaaa caaccaatga ggcagtatcc acactaggaa atggagtgcg agtcctagcc
3540
accgcagtaa gagagctgaa agaatttgtg agcaaaaacc tgactagtgc aattaacaag
3600
aacaaatgtg acattgctga tctgaagatg gctgtcagct tcagtcaatt caacagaaga
3660
ttcctaaatg ttgtgcggca gttttcagac aatgcaggga taacaccagc aatatcattg
3720
gacctaatga ctgatgctga gctggccaga gctgtatcat acatgccaac atctgcagga
3780
cagataaaac taatgttaga gaaccgtgca atggtgagga gaaaaggatt tggaatcttg
3840
ataggggtct acggaagctc cgtgatttac atggtccagc tgccgatctt tggtgtcata
3900
gatacacctt gttggataat caaggcagct ccctcttgtt cagaaaaaga tggaaactat
3960
gcttgcctcc taagagagga tcaagggtgg tattgtaaaa atgcaggatc cactgtttac
4020
tacccaaata aaaaagactg cgaaacaaga ggtgatcatg ttttttgtga cacagctgca
4080
gggatcaatg ttgctgagca atcaagagaa tgcaacatca acatatctac aaccaactac
4140
ccatgcaaag tcagcacagg aagacaccct atcagcatgg ttgcactatc acctctcggt
4200
gctttggtgg cttgctacaa aggggttagc tgttcaattg gcagtaatcg ggttggaata
4260
atcaaacaac tacctaaagg ctgctcatac ataactaacc aggacgcaga cactgtaaca
4320
attgacaaca ctgtgtatca actaagcaaa gttgagggtg aacagcatgt aataaaaggg
4380
agaccagttt caagcagttt cgatccaatc aagtttcctg aggatcagtt caatgttgcg
4440
cttgatcaag tctttgaaag cattgaaaac agtcaagcac tagtggacca gtcaaacaaa
4500
attctgaaca gtgcagaaaa aggaaacact ggcttcatta ttgtaataat tttgattgct
4560
gttcttgggt taaccatgat ttcagtgagc atcatcatca taatcaaaaa aacaaggaaa
4620
cccacagggg cacctccaga gctgaatggt gttaccaacg gcggttttat accgcatagt
4680
tagttaatta aaaaatggga caaatcatca tgtctcgtaa agctccatgc aaatatgaag
4740
tacggggcaa gtgcaacagg ggaagtgagt gcaaattcaa ccacaattac tggagttggc
4800
ctgataggta tttattgtta agatcaaatt atctcttgaa tcagctttta agaaacactg
4860
ataaggctga tggtttgtca ataatatcag gagcaggtag agaagacagg actcaagact
4920
ttgttcttgg ttctactaat gtggttcaag ggtacattga tgacaatcaa ggaataacaa
4980
aggctgcagc ttgctatagt ctacataaca taataaaaca gctacaagaa atagaagtaa
5040
gacaggccag agataataag ctttctgaca gcaaacatgt ggcacttcac aacttgatat
5100
tatcctatat ggagatgagc aaaactcctg catccctgat taataaccta aagaaactac
5160
caagagaaaa actgaaaaaa ttagcgaaat taataattga tttatcagca ggaactgata
5220
atgactcttc atatgccttg caagacagtg aaagcactaa tcaagtgcag taagcatggt
5280
cccaaattca tcaccataga ggcagatgat atgatatgga cacacaaaga attaaaagag
5340
acactgtctg atgggatagc aaaatcacac accaatattt acagttgtta tttagaaaat
5400
atagaaataa tatatgttaa agcttactta agttagtaaa aaataaatag aatgggataa
5460
atgacaatga aaacattaga tgtcataaaa agtgacggat cctcagaaac atgtaatcaa
5520
ctcaaaaaaa taataaaaaa acactcaggt aaattgctta ttgcatcaaa accgacattg
5580
gccttattga cgtccttcac agtaacaatt actgtcaact atacaaaagt agaaaataat
5640
ttgcaggcat gtcaattaaa aaatgaatca gacaaaaagg acacaaagct aaataccaca
5700
tcaacaacaa tcagacccat tcctgatcta aatgcagtac agtacctgaa aaggctgatt
5760
cagaaacaca ccaactctgt cacaaaagac agagatacct gttggagaat acacacgaat
5820
caatgcacaa atataaaaat atataagttc ttatgttttg ggtctatgaa ttcaacaaat
5880
acagactgtg aagaaccaac agttctatgc gacaaaaagt caaaaaccat gacagaaaaa
5940
cataggaaag cagagtgtca ccgtccacat acaaccgagt ggtggtgcca ttatctttaa
6000
gagaaaactc agttttcaac attaaaatca gaacaaatca tatctagatc tattaatata
6060
atagtctagt tatttaaaaa ctctaaatat tgtctagact tcacaacacc ctgcggtcat
6120
atgcaataat caatggtcaa accactgttg caaacccacc tataatacaa tcactgagta
6180
atacaaaaca agaaaatggg acaagtggcc atggaagcaa gagtggagaa cattcgggca
6240
atagacatgt tcaaagcaaa gatgaaaaac cgtataagaa gtagcaagtg ccatagaaat
6300
gctacactga tccttattgg atcaacagca ccaagtatgg cactcaacac ccttttaatc
6360
attgatcatg caacatcaaa aaacatgacc aaagtggaac actgtgtcaa catgccgccg
6420
gtagaaccaa gcaagaagac cccaatgacc tctgcagcag acccaaacac caaacccaat
6480
ccacagcagg caacacagct gaccacagag gattcaacat ctctagcagc aaccctagag
6540
gaccatctac acacagggac aactccaaca ccagatgcaa cagtctccca gcaaaccaca
6600
gacgagcaca caacactgct gagatcaacc aacagacaga ccacccaaac aaccgcagag
6660
aaaaagccaa ccagagcaac aaccaaaaaa gaaaccacaa ctcgaaccac aagcacagct
6720
gcaacccaaa cactcaacac caccaaccaa actagcaatg gaagagaggc aaccacaaca
6780
tctgccagat ccagaaacaa tgccacaact caaagcagcg atcaaacaac ccaggcagca
6840
gacccaagct cccaatcaca acatacacag aaaagcacaa caacaacaca caacacagac
6900
acatcttctc caagtagtta acaaaaaaac tataaaataa ccatgaaaac caaaaaacta
6960
gaaaagttaa tttgaactca gaaaagaaca caaacactat atgaattgtt tgagcgtata
7020
tactaatgaa atagcatctg tttgtgcatc aataatacca tcattattta agaaataaga
7080
agaagctaaa attcaaggga caaataacaa tggatccgtt ttgtgaatcc actgtcaatg
7140
tctatcttcc tgattcatat ctcaaaggag taatatcttt cagtgaaacc aatgcaattg
7200
gctcatgcct tttgaaaaga ccctatctta aaaaagataa cactgctaaa gttgctgtag
7260
aaaaccctgt tgttgaacat gtcagactta gaaatgcagt catgaccaaa atgaagatat
7320
cagattataa agtggttgaa ccaattaata tgcagcatga aataatgaaa aatatacaca
7380
gttgtgagct cacattatta aaacaattct taacaagaag taaaaacatt agctccctaa
7440
aattaagtat gatatgtgat tggttacagt taaaatccac ctcagataac acatcaattc
7500
ttaattttat agatgtggag tttatacccg tttgggtgag caattggttt agtaactggt
7560
ataatctcaa taaattaatc ttagagttta gaagagagga agtaataaga actggttcaa
7620
ttttatgcag atcactaggc aagttagttt tcattgtatc atcttatggg tgtgtagtaa
7680
aaagcaacaa aagtaaaaga gtaagttttt tcacatataa ccaactgtta acatggaaag
7740
atgtgatgtt aagtaggttc aatgcaaact tttgtatatg ggtaagtaac aacctgaaca
7800
aaaatcaaga aggactagga tttagaagta atctacaagg tatgttaact aataaattat
7860
atgaaactgt tgattatatg ttaagtctat gtagcaatga agggttctca ctagtgaaag
7920
agttcgaagg ctttattatg agtgaaattc ttaaaattac tgagcatgct caattcagta
7980
ctaggtttag gaatacttta ttaaatgggt tgactgaaca attatcaatg ttgaaagcta
8040
aaaacagatc tagagttctt ggcactatat tagaaaacaa tgattacccc atgtatgaag
8100
tagtacttaa attattaggg gacactttga aaagtataaa attattaatt aacaagaatt
8160
tagaaaatgc tgcagaatta tattatatat tcagaatttt tggacaccct atggtagatg
8220
agagggaagc aatggatgct gttaaattaa ataatgagat tacaaaaatt cttaaactgg
8280
agagcttaac agaactaaga ggagcattta tactaagaat tataaaaggg tttgtagata
8340
ataataaaag atggcctaaa attaagaatt taaaagtgct cagtaaaaga tgggttatgt
8400
atttcaaagc taaaagttac cctagccaac ttgagctaag tgtacaagat tttttagaac
8460
ttgctgcagt acaattcgaa caggaatttt ctgtccctga aaaaaccaat cttgagatgg
8520
tattaaatga taaagcaata tctccaccaa aaaagttaat atggtcggta tatccaaaaa
8580
attatctacc tgaaattata aaaaatcaat atttagaaga ggtcttcaat gcaagtgaca
8640
gtcaaagaac gaggagagtc ttagaatttt acttaaaaga ttgcaaattt gatcaaaaag
8700
acctcaaacg ttatgtaact aaacaagagt atctaaatga caaagaccac attgtctcat
8760
taactgggaa agaaagagaa ttaagtgtag gcaggatgtt tgcaatgcaa cctggcaaac
8820
aaagacaaat acagatacta gccgagaaac ttttagctga taatattgta ccctttttcc
8880
cagaaacttt aacaaagtat ggtgacttgg atctccaaag aattatggaa atgaaatcag
8940
aactttcttc cattaaaact aggaagaatg atagttacaa caattatatt gcaagagcct
9000
ccatagtaac agacctaagt aaattcaatc aagcctttag atatgaaacc acagctatct
9060
gcgcagacgt agcagatgag ttacatggca cgcaaagctt attttgttgg ttacatctta
9120
ttgttcccat gaccacaatg atatgtgcat acagacatgc accaccagaa acaaaggggg
9180
agtatgatat agacaaaata gaagagcaaa gtgggctata cagataccat atgggaggga
9240
ttgaagggtg gtgtcagaag ttatggacaa tggaggcgat atccttgtta gatgtagtat
9300
ctgttaagac tcgttgtcag atgacctctc tattaaacgg agacaatcaa tcaatagatg
9360
tcagtaaacc agtaaaattg tctgaaggta tagatgaagt aaaagcagat tatagcttag
9420
caattaaaat gcttaaagag ataagagatg cctataaaaa cattggccat aaactcaaag
9480
aaggtgaaac atatatatca agagatcttc aatttataag taaggtgatt caatctgagg
9540
gggtcatgca tcctaccccc ataaaaaaga tattaagggt aggtccctgg ataaatacaa
9600
tactagatga cattaaaact agtgcagaat caatagggag tctgtgtcaa gaactagagt
9660
tcagaggaga aagtatacta gttagcttga tattaaggaa tttctggctg tataacttat
9720
acatgcatga gtcaaaacag catccgttag ctggaaaaca actgtttaaa caattgaaca
9780
aaacactaac atctgtgcaa agattttttg agctgaagaa agaaaatgat gtggttgacc
9840
tatggatgaa tataccaatg cagtttggag ggggagaccc agtagttttt tacagatctt
9900
tttacagaag gactcctgat ttcttgactg aagcaatcag ccatgtggat ttactgttaa
9960
aagtttcaaa caatattaaa aatgagacta agatacgatt ctttaaagcc ttattatcta
10020
tagaaaagaa tgaacgtgct acattaacaa cactaatgag agacccccag gcggtaggat
10080
cggaaagaca agctaaggta acaagtgata taaatagaac agcagttact agcatactga
10140
gtctatctcc gaatcagcta ttttgtgata gtgctataca ctatagcaga aatgaagaag
10200
aagtagggat cattgcagac aacataacac ctgtttatcc tcacggattg agagtgctct
10260
atgaatcact accttttcat aaggctgaaa aggttgtcaa tatgatatca ggtacaaagt
10320
ctataactaa cctattgcag agaacatctg ctatcaatgg tgaagatatt gatagagcag
10380
tgtctatgat gttagagaac ttagggttgt tatctaggat attgtcagta ataattaata
10440
gtatagaaat accaattaag tccaatggca gattgatatg ctgtcaaatt tctaagactt
10500
tgagagaaaa atcatggaac aatatggaaa tagtaggagt gacatctcca agtattgtaa
10560
catgtatgga tgttgtgtat gcgactagtt ctcatttaaa aggaataatt attgaaaaat
10620
tcagtactga caagaccaca agaggtcaga ggggaccaaa aagcccttgg gtaggatcaa
10680
gcactcaaga gaaaaaatta gttcctgttt ataacagaca aattctttca aaacaacaaa
10740
aagagcaact ggaagcaata ggaaaaatga ggtgggtgta taaaggaact ccagggctaa
10800
gaagattgct caataagatt tgcataggaa gtttaggtat tagctataaa tgtgtaaaac
10860
ctctattacc aagatttatg agtgtaaact tcttacatag gttatctgtt agtagcagac
10920
ccatggaatt cccagcttct gttccagctt ataggacaac aaattaccac tttgacacta
10980
gtccaatcaa ccaagcatta agtgagaggt tcgggaacga agacattaat ctagtgttcc
11040
aaaatgcaat cagctgcgga attagtataa tgagtgttgt agaacagtta actggtagaa
11100
gcccaaaaca attagtctta atcccccaat tagaagagat agatattatg ccccctcctg
11160
tatttcaagg aaaattcaat tataaactag ttgataaaat aacctccgat caacacatct
11220
tcagtcctga caaaatagac atattaacac tagggaagat gcttatgcct actataaaag
11280
gtcaaaaaac tgatcagttc ttaaataaga gagaaaacta tttccatgga aataatttaa
11340
ttgaatcttt atctgcagca cttgcatgcc attggtgtgg aatattaaca gaacagtgtg
11400
tagaaaacaa tatctttagg aaagactggg gtgatgggtt catatcagat catgccttca
11460
tggatttcaa gatatttcta tgtgtattta aaaccaaact tttatgtagt tggggatccc
11520
aagggaaaaa tgtaaaagat gaagatataa tagatgaatc cattgacaaa ttattaagaa
11580
ttgacaacac tttttggaga atgttcagca aagtcatgtt tgaatcaaag gtcaaaaaaa
11640
gaataatgtt atatgatgta aaattcctat cattagtagg ttatatagga tttaaaaact
11700
ggtttataga gcagttaaga gtagtagaat tgcatgaagt accctggatt gtcaatgctg
11760
aaggggagct agttgaaatt aaaccaatca aaatttattt gcagttaata gaacaaagtc
11820
tatctttaag aataactgtt ttgaattata cagacatggc acatgctctt acacgattaa
11880
ttaggaagaa attgatgtgt gataatgcac tctttaatcc aagttcatca ccaatgttta
11940
gtctaactca agttattgat cctacaacac agctagacta ttttcctaag gtaatatttg
12000
aaaggttaaa aagttatgac accagttcag actacaacaa agggaagtta acaagaaatt
12060
acatgacatt attaccatgg cagcacgtaa acaggtataa ttttgtcttt agttcaacag
12120
gatgtaaaat cagcttgaag acatgcatcg ggaaattgat aaaggactta aaccctaagg
12180
ttctttactt tattggagaa ggagcaggta actggatggc aagaacagca tgtgagtatc
12240
ctgacataaa atttgtatat aggagtttaa aggatgatct tgatcaccat tacccattag
12300
aatatcaaag ggtaataggt gatttaaata gagtaataga tggtggtgaa ggattatcaa
12360
tggagaccac agatgcaact caaaagactc attgggactt gatacacaga ataagtaaag
12420
atgctttatt gataacattg tgtgatgcag aattcaaaaa cagagatgat ttctttaaaa
12480
tggtaattct ttggagaaaa catgtattat catgtagaat ctgtacagct tatggaacag
12540
atctttactt atttgcaaag tatcatgcga cggactgcaa tataaagtta ccattttttg
12600
taaggtctgt agctactttt attatgcaag gaagcaaatt gtcaggatca gaatgttaca
12660
tacttttaac attaggtcat cacaataatc tgccatgtca cggagaaata caaaattcca
12720
aaatgagaat agcagtgtgt aatgatttcc atgcctcaaa aaaactagac aacaaatcaa
12780
ttgaagcaaa ctgcaaatct cttctatcag gattaagaat accaataaac aaaaaagagt
12840
taaatagaca aaagaaactg ttaacactac aaagcaatca ttcttccata gcaacagttg
12900
gcggaagtaa gattatagaa tccaaatggt taaagaataa agcaagtaca ataattgatt
12960
ggttagagca tatcttgaat tctccaagag gtgaattaaa ctatgatttc tttgaagcat
13020
tagagaacac atatcccaat atgatcaagc ttatagataa cctgggaaat gcagagataa
13080
aaaaactaat caaagttacc gggtatatgc ttgtgagtga gaagtaataa taataataat
13140
aatcaaccat aatctcacac aactgagaaa atgatcatct aacagtttaa ttgaccatta
13200
gttaattaaa aattataaat tagtaactaa ttgataaaaa ataagaaatt gaaattgaat
13260
gtatacggtt tttttgccgt
13280
<210> 8
<211> 14028
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Ген GFP вставлен между положениями 41 и 785
<400> 8
acgcgaaaaa aacgcgtata aattaaattc caaacaaaac gggacaaata aaaatggtga
60
gcaagggcga ggagctgttc accggggtgg tgcccatcct ggtcgagctg gacggcgacg
120
taaacggcca caagttcagc gtgtccggcg agggcgaggg cgatgccacc tacggcaagc
180
tgaccctgaa gttcatctgc accaccggca agctgcccgt gccctggccc accctcgtga
240
ccaccctgac ctacggcgtg cagtgcttca gccgctaccc cgaccacatg aagcagcacg
300
acttcttcaa gtccgccatg cccgaaggct acgtccagga gcgcaccatc ttcttcaagg
360
acgacggcaa ctacaagacc cgcgccgagg tgaagttcga gggcgacacc ctggtgaacc
420
gcatcgagct gaagggcatc gacttcaagg aggacggcaa catcctgggg cacaagctgg
480
agtacaacta caacagccac aacgtctata tcatggccga caagcagaag aacggcatca
540
aggtgaactt caagatccgc cacaacatcg aggacggcag cgtgcagctc gccgaccact
600
accagcagaa cacccccatc ggcgacggcc ccgtgctgct gcccgacaac cactacctga
660
gcacccagtc cgccctgagc aaagacccca acgagaagcg cgatcacatg gtcctgctgg
720
agttcgtgac cgccgccggg atcactctcg gcatggacga gctgtacaag taagttaatt
780
aaaaaactgg gacaaataaa aatgtctctt caagggattc acctaagtga tctgtcatat
840
aaacatgcta tattaaaaga gtctcaatac acaataaaaa gagatgtagg caccacaact
900
gcagtgacac cttcatcatt gcagcaagag ataacacttt tgtgtggaga gattctttac
960
actaaacata ctgattacaa atatgctgca gagataggga tacaatatat ttgcacggct
1020
ctaggatcag aaagagtaca acagatttta agaaattcag gcagtgaagt tcaggtggtt
1080
ctaaccaaga catactcttt agggaaaggt aaaaatagta aaggggaaga gttgcaaatg
1140
ttagatatac atggagtgga aaagagttgg gtagaagaaa tagacaaaga ggcaagaaaa
1200
acaatggtga ctttgctaaa ggaatcatca ggtaacatcc cacaaaacca gaggccttca
1260
gcaccagaca caccaataat tttattatgt gtaggtgctt taatattcac taaactagca
1320
tcaacaatag aagttggact agagactaca gttagaagag ctaacagagt gctaagtgat
1380
gcgctcaaaa gataccctag ggtagatata ccgaagattg ctagatcttt ctatgaacta
1440
tttgagcaga aagtgtatta caggagtcta ttcattgagt atgggaaagc tttaggctca
1500
tcttcaacag gaagcaaagc agaaagtttg tttgtaaata tatttatgca agcttatgga
1560
gccggtcaaa caatgctaag gtggggtgtc attgccagat catctaacaa cataatgcta
1620
ggacatgtgt ctgtgcaagc tgaattgaag caagttacag aggtttatga tttggtgaga
1680
gaaatgggtc ctgaatctgg gcttttacat ctaagacaaa gtccaaaggc aggactgtta
1740
tcgttggcca attgccccaa ttttgctagt gttgttcttg gtaatgcttc aggtctaggt
1800
ataatcggaa tgtacagagg aagagtgcca aacacagagc tattttctgc agcagaaagt
1860
tatgccagaa gcttaaaaga aagcaacaaa atcaacttct cctcattagg gctcacagac
1920
gaagaaaaag aagctgcaga acacttctta aacatgagtg atgacaatca agatgattat
1980
gagtaattaa aaaactggga caagtcaaaa tgtcattccc tgaaggaaaa gatatcctgt
2040
tcatgggtaa tgaagcagca aaaatagcag aagctttcca gaaatcacta aaaagatcag
2100
gtcacaaaag aacccagtct attgtagggg aaaaagtaaa cactatatca gaaactctag
2160
agctacctac catcagcaaa cctgcacgat catctacact gctagagcca aaattggcat
2220
gggcagacag cagcagagcc accaaaacca cagaaaaaca aacaaccaaa acaacagatc
2280
ctgttgaaga agaggaactc aatgaaaaga agatatcacc ttccagtgat gggaagactc
2340
ccgcagagaa aaaatcaaaa tctccaacca atgtaaaaaa gaaagtttcc ttcacatcaa
2400
atgaaccagg gaaatatacc aaactagaaa aagatgccct agatttgctc tcagacaatg
2460
aggaagaaga cgcagagtcc tcaatcttaa cctttgaaga gagagacaca tcatcactaa
2520
gcattgaggc tagactagaa tcaatagaag agaagctaag catgatatta ggactgcttc
2580
gtacacttaa cattgcaaca gcaggaccaa cggctgcaag agatggaatc agagatgcaa
2640
tgattggtat aagagaagaa ctaatagcag aaataataaa agaagcaaag ggaaaagcag
2700
ctgaaatgat ggaagaggaa atgaatcaaa ggtcaaaaat aggtaatggc agtgtaaaac
2760
taaccgagaa ggcaaaagaa cttaataaaa ttgttgaaga cgagagcaca agcggtgaat
2820
cagaagaaga agaagaacca aaagaaactc aggataacaa tcaaggagaa gatatttacc
2880
agttaatcat gtagtttaat aaaaataaac aatgggacaa gtcaagatgg agtcctatct
2940
agtggacact tatcaaggca ttccctacac agctgctgtt caagttgatc tggtagaaaa
3000
agacttacta ccagcaagtt tgacaatatg gtttcctcta ttccaagcca acacaccacc
3060
agcggttttg ctcgatcagc taaagacctt gacaataaca actctgtatg ctgcatcaca
3120
gaatggtcca atactcaagg taaatgcatc agctcagggt gctgctatgt ctgtacttcc
3180
caaaaaattc gaagtaaatg caactgtggc acttgatgaa tacagcaaac ttgactttga
3240
caagttaacg gtttgcgatg ttaaaacagt ttatttgaca accatgaaac catatgggat
3300
ggtgtcaaaa tttgtgagtt cagccaaatc agttggcaac aagacacatg atctaattgc
3360
actgtgtgac ttcatggacc tagagaaaaa tatacctgtg acaataccag cattcataaa
3420
gtcagtttca atcaaagaga gtgagtcagc cactgttgaa gctgcaataa gcagtgaggc
3480
cgaccaagca ttaacacaag ccaaaattgc accctatgca ggactaatca tgatcatgac
3540
catgaacaat ccaaaaggta tattcaagaa actaggagct ggaacacaag tgatagtaga
3600
gctaggggca tatgttcaag ccgagagcat cagcaggatc tgcaagagct ggagtcacca
3660
aggaacaaga tatgtactaa aatccagata aaaataactg tcctaatcaa taattgctta
3720
tataatctta aagatcaatg agcttattat tatagttata taaaaaaatt tagaactagg
3780
aaggtattaa tagaaagcgg gacaagtaaa aatgtcttgg aaagtgatga ttatcatttc
3840
gttactcata acacctcagc acggactaaa ggaaagttat ttagaagaat catgtagtac
3900
tataactgaa ggatatctca gtgttttaag aacaggttgg tacaccaatg tctttacatt
3960
agaagttggt gatgttgaaa atcttacatg tactgatgga cctagcttaa tcaaaacaga
4020
acttgaccta accaaaagtg ctctaagaga actcaaaaca gtttctgctg atcagttagc
4080
gagagaagaa caaattgaaa atcccagaca atcaaggttt gtcctaggtg caatagctct
4140
tggtgttgcc acagcagcag cagtcacagc aggcattgcg atagccaaaa ccataaggct
4200
tgagagtgaa gtgaatgcaa tcaaaggtgc tctcaaaaca accaatgagg cagtatccac
4260
actaggaaat ggagtgcgag tcctagccac cgcagtaaga gagctgaaag aatttgtgag
4320
caaaaacctg actagtgcaa ttaacaagaa caaatgtgac attgctgatc tgaagatggc
4380
tgtcagcttc agtcaattca acagaagatt cctaaatgtt gtgcggcagt tttcagacaa
4440
tgcagggata acaccagcaa tatcattgga cctaatgact gatgctgagc tggccagagc
4500
tgtatcatac atgccaacat ctgcaggaca gataaaacta atgttagaga accgtgcaat
4560
ggtgaggaga aaaggatttg gaatcttgat aggggtctac ggaagctccg tgatttacat
4620
ggtccagctg ccgatctttg gtgtcataga tacaccttgt tggataatca aggcagctcc
4680
ctcttgttca gaaaaagatg gaaactatgc ttgcctccta agagaggatc aagggtggta
4740
ttgtaaaaat gcaggatcca ctgtttacta cccaaatgaa aaagactgcg aaacaagagg
4800
tgatcatgtt ttttgtgaca cagctgcagg gatcaatgtt gctgagcaat caagagaatg
4860
caacatcaac atatctacaa ccaactaccc atgcaaagtc agcacaggaa gacaccctat
4920
cagcatggtt gcactatcac ctctcggtgc tttggtggct tgctacaaag gggttagctg
4980
ttcaattggc agtaatcggg ttggaataat caaacaacta cctaaaggct gctcatacat
5040
aactaaccag gacgcagaca ctgtaacaat tgacaacact gtgtatcaac taagcaaagt
5100
tgagggtgaa cagcatgtaa taaaagggag accagtttca agcagtttcg atccaatcaa
5160
gtttcctgag gatcagttca atgttgcgct tgatcaagtc tttgaaagca ttgaaaacag
5220
tcaagcacta gtggaccagt caaacaaaat tctgaacagt gcagaaaaag gaaacactgg
5280
cttcattatt gtaataattt tgattgctgt tcttgggtta accatgattt cagtgagcat
5340
catcatcata atcaaaaaaa caaggaaacc cacaggggca cctccagagc tgaatggtgt
5400
taccaacggc ggttttatac cgcatagtta gttaattaaa aaatgggaca aatcatcatg
5460
tctcgtaaag ctccatgcaa atatgaagta cggggcaagt gcaacagggg aagtgagtgc
5520
agattcaacc acaattactg gagttggcct gataggtatt tattgttaag atcaaattat
5580
ctcttgaatc agcttttaag aaacactgat aaggctgatg gtttgtcaat aatatcagga
5640
gcaggtagag aagacaggac tcaagacttt gttcttggtt ctactaatgt ggttcaaggg
5700
tacattgatg acaatcaagg aataacaaag gctgcagctt gctatagtct acataacata
5760
ataaaacagc tacaagaaat agaagtaaga caggccagag ataataagct ttctgacagc
5820
aaacatgtgg cacttcacaa cttgatatta tcctatatgg agatgagcaa aactcctgca
5880
tccctgatta ataacctaaa gaaactacca agagaaaaac tgaaaaaatt agcgaaatta
5940
ataattgatt tatcagcagg aactgataat gactcttcat atgccttgca agacagtgaa
6000
agcactaatc aagtgcagta agcatggtcc caaattcatt accatagagg cagatgatat
6060
gatatggaca cacaaagaat taaaagagac actgtctgat gggatagtaa aatcacacac
6120
caatatttac agttgttatt tagaaaatat agaaataata tatgttaaag cttacttaag
6180
ttagtaaaaa ataaatagaa tgggataaat gacaatgaaa acattagatg tcataaaaag
6240
tgacggatcc tcagaaacat gtaatcaact caaaaaaata ataaaaaaac actcaggtaa
6300
attgcttatt gcattaaaac tgatattggc cttattgacg tttttcacag taacaattac
6360
tgttaactat ataaaagtag aaaataattt gcaggcatgt caattaaaaa atgaatcaga
6420
caaaaaggac acaaagctaa ataccacatc aacaacaatc agacccattc ctgatctaaa
6480
tgcagtacag tacttgaaaa ggctgattca gaaacacacc aactttgtca taaaagacag
6540
agatacctgt tggagaatac acacgaatca atgcacaaat ataaaaatat ataagttctt
6600
atgttttggg tctatgaatt caacaaatac agactgtgaa gaactaacag ttttatgcga
6660
caaaaagtca aaaaccatga cagaaaaaca taggaaagca gagtgtcact gtctacatac
6720
aaccgagtgg tggtgttatt atctttaaga gaaaactcag ttttcaacat taaaatcaga
6780
acaaatcata tctagatcta ttaatataat agtttagtta tttaaaaact ctaaatattg
6840
tctagacttc acaacacttt gcggtcatat gcaataatca atggtcaaac cactgttgca
6900
aactcaccta taatataatc actgagtaat acaaaacaag aaaatgggac aagtggccat
6960
ggaagtaaga gtggagaaca ttcgggcaat agacatgttc aaagcaaaga tgaaaaaccg
7020
tataagaagt agcaagtgct atagaaatgc tacactgatc cttattggat caacagcact
7080
aagtatggca ctcaatattt ttttaatcat tgattatgca acatcaaaaa acatgaccaa
7140
agtggaacac tgtgtcaata tgccgccggt agaaccaagc aagaagaccc caatgacctc
7200
tgcagtagac ccaaacacca aacccaatcc acagcaggca acacagctga ccacagagga
7260
ttcaacatct ctagcagcaa ccctagagga ccatctacac acagggacaa ctccaacacc
7320
agatgcaaca gtctctcagc aaaccacaga cgagcacaca acactgctga gatcaaccaa
7380
cagacagacc acccaaacaa ccgcagagaa aaagccaacc agagcaacaa ccaaaaaaga
7440
aaccacaact cgaaccacaa gcacagctgc aacccaaaca ctcaacacca ccaaccaaac
7500
tagcaatgga agagaggcaa ccacaacatc tgccagatcc agaaacaatg ccacaactca
7560
aagcagcgat caaacaaccc aggcagcaga cccaagctcc caatcacaac atacacagaa
7620
aagcacaaca acaacacaca acacagacac atcttctcca agtagttaac aaaaaaacta
7680
taaaataacc atgaaaacca aaaaactaga aaagttaatt tgaactcaga aaagaacaca
7740
aacactatat gaattgtttg agcgtatata ctaatgaaat agcatctgtt tgtgcatcaa
7800
taataccatc attatttaag aaataagaag aagctaaaat tcaagggaca aataacaatg
7860
gatccgtttt gtgaatccac tgtcaatgtc tatcttcctg attcatatct caaaggagta
7920
atatctttca gtgaaaccaa tgcaattggc tcatgccttt tgaaaagacc ctatcttaaa
7980
aaagataaca ctgctaaagt tgctgtagaa aaccctgttg ttgaacatgt cagacttaga
8040
aatgcagtca tgaccaaaat gaagatatca gattataaag tggttgaacc aattaatatg
8100
cagcatgaaa taatgaaaaa tatacacagt tgtgagctca cattattaaa acaattctta
8160
acaagaagta aaaacattag ctccctaaaa ttaagtatga tatgtgattg gttacagtta
8220
aaatccacct cagataacac atcaattctt aattttatag atgtggagtt tatacccgtt
8280
tgggtgagca attggtttag taactggtat aatctcaata aattaatctt agagtttaga
8340
agagaggaag taataagaac tggttcaatt ttatgcagat cactaggcaa gttagttttc
8400
attgtatcat cttatgggtg tgtagtaaaa agcaacaaaa gtaaaagagt aagttttttc
8460
acatataacc aactgttaac atggaaagat gtgatgttaa gtaggttcaa tgcaaacttt
8520
tgtatatggg taagtaacaa cctgaacaaa aatcaagaag gactaggatt tagaagtaat
8580
ctacaaggta tgttaactaa taaattatat gaaactgttg attatatgtt aagtctatgt
8640
agcaatgaag ggttctcact agtgaaagag ttcgaaggct ttattatgag tgaaattctt
8700
aaaattactg agcatgctca attcagtact aggtttagga atactttatt aaatgggttg
8760
actgaacaat tatcaatgtt gaaagctaaa aacagatcta gagttcttgg cactatatta
8820
gaaaacaatg attaccccat gtatgaagta gtacttaaat tattagggga cactttgaaa
8880
agtataaaat tattaattaa caagaattta gaaaatgctg cagaattata ttatatattc
8940
agaatttttg gacaccctat ggtagatgag agggaagcaa tggatgctgt taaattaaat
9000
aatgagatta caaaaattct taaactggag agcttaacag aactaagagg agcatttata
9060
ctaagaatta taaaagggtt tgtagataat aataaaagat ggcctaaaat taagaattta
9120
aaagtgctca gtaaaagatg ggttatgtat ttcaaagcta aaagttaccc tagccaactt
9180
gagctaagtg tacaagattt tttagaactt gctgcagtac aattcgaaca ggaattttct
9240
gtccctgaaa aaaccaatct tgagatggta ttaaatgata aagcaatatc tccaccaaaa
9300
aagttaatat ggtcggtata tccaaaaaat tatctacctg aaattataaa aaatcaatat
9360
ttagaagagg tcttcaatgc aagtgacagt caaagaacga ggagagtctt agaattttac
9420
ttaaaagatt gcaaatttga tcaaaaagac ctcaaacgtt atgtaactaa acaagagtat
9480
ctaaatgaca aagaccacat tgtctcatta actgggaaag aaagagaatt aagtgtaggc
9540
aggatgtttg caatgcaacc tggcaaacaa agacaaatac agatactagc cgagaaactt
9600
ttagctgata atattgtacc ctttttccca gaaactttaa caaagtatgg tgacttggat
9660
ctccaaagaa ttatggaaat gaaatcagaa ctttcttcca ttaaaactag gaagaatgat
9720
agttacaaca attatattgc aagagcctcc atagtaacag acctaagtaa attcaatcaa
9780
gcctttagat atgaaaccac agctatctgc gcagacgtag cagatgagtt acatggcacg
9840
caaagcttat tttgttggtt acatcttatt gttcccatga ccacaatgat atgtgcatac
9900
agacatgcac caccagaaac aaagggggag tatgatatag acaaaataga agagcaaagt
9960
gggctataca gataccatat gggagggatt gaagggtggt gtcagaagtt atggacaatg
10020
gaggcgatat ccttgttaga tgtagtatct gttaagactc gttgtcagat gacctctcta
10080
ttaaacggag acaatcaatc aatagatgtc agtaaaccag taaaattgtc tgaaggtata
10140
gatgaagtaa aagcagatta tagcttagca attaaaatgc ttaaagagat aagagatgcc
10200
tataaaaaca ttggccataa actcaaagaa ggtgaaacat atatatcaag agatcttcaa
10260
tttataagta aggtgattca atctgagggg gtcatgcatc ctacccccat aaaaaagata
10320
ttaagggtag gtccctggat aaatacaata ctagatgaca ttaaaactag tgcagaatca
10380
atagggagtc tgtgtcaaga actagagttc agaggagaaa gtatactagt tagcttgata
10440
ttaaggaatt tctggctgta taacttatac atgcatgagt caaaacagca tccgttagct
10500
ggaaaacaac tgtttaaaca attgaacaaa acactaacat ctgtgcaaag attttttgag
10560
ctgaagaaag aaaatgatgt ggttgaccta tggatgaata taccaatgca gtttggaggg
10620
ggagacccag tagtttttta cagatctttt tacagaagga ctcctgattt cttgactgaa
10680
gcaatcagcc atgtggattt actgttaaaa gtttcaaaca atattaaaaa tgagactaag
10740
atacgattct ttaaagcctt attatctata gaaaagaatg aacgtgctac attaacaaca
10800
ctaatgagag acccccaggc ggtaggatcg gaaagacaag ctaaggtaac aagtgatata
10860
aatagaacag cagttactag catactgagt ctatctccga atcagctatt ttgtgatagt
10920
gctatacact atagcagaaa tgaagaagaa gtagggatca ttgcagacaa cataacacct
10980
gtttatcctc acggattgag agtgctctat gaatcactac cttttcataa ggctgaaaag
11040
gttgtcaata tgatatcagg tacaaagtct ataactaacc tattgcagag aacatctgct
11100
atcaatggtg aagatattga tagagcagtg tctatgatgt tagagaactt agggttgtta
11160
tctaggatat tgtcagtaat aattaatagt atagaaatac caattaagtc caatggcaga
11220
ttgatatgct gtcaaatttc taagactttg agagaaaaat catggaacaa tatggaaata
11280
gtaggagtga catctccaag tattgtaaca tgtatggatg ttgtgtatgc gactagttct
11340
catttaaaag gaataattat tgaaaaattc agtactgaca agaccacaag aggtcagagg
11400
ggaccaaaaa gcccttgggt aggatcaagc actcaagaga aaaaattagt tcctgtttat
11460
aacagacaaa ttctttcaaa acaacaaaaa gagcaactgg aagcaatagg aaaaatgagg
11520
tgggtgtata aaggaactcc agggctaaga agattgctca ataagatttg cataggaagt
11580
ttaggtatta gctataaatg tgtaaaacct ctattaccaa gatttatgag tgtaaacttc
11640
ttacataggt tatctgttag tagcagaccc atggaattcc cagcttctgt tccagcttat
11700
aggacaacaa attaccactt tgacactagt ccaatcaacc aagcattaag tgagaggttc
11760
gggaacgaag acattaatct agtgttccaa aatgcaatca gctgcggaat tagtataatg
11820
agtgttgtag aacagttaac tggtagaagc ccaaaacaat tagtcttaat cccccaatta
11880
gaagagatag atattatgcc ccctcctgta tttcaaggaa aattcaatta taaactagtt
11940
gataaaataa cctccgatca acacatcttc agtcctgaca aaatagacat attaacacta
12000
gggaagatgc ttatgcctac tataaaaggt caaaaaactg atcagttctt aaataagaga
12060
gaaaactatt tccatggaaa taatttaatt gaatctttat ctgcagcact tgcatgccat
12120
tggtgtggaa tattaacaga acagtgtgta gaaaacaata tctttaggaa agactggggt
12180
gatgggttca tatcagatca tgccttcatg gatttcaaga tatttctatg tgtatttaaa
12240
accaaacttt tatgtagttg gggatcccaa gggaaaaatg taaaagatga agatataata
12300
gatgaatcca ttgacaaatt attaagaatt gacaacactt tttggagaat gttcagcaaa
12360
gtcatgtttg aatcaaaggt caaaaaaaga ataatgttat atgatgtaaa attcctatca
12420
ttagtaggtt atataggatt taaaaactgg tttatagagc agttaagagt agtagaattg
12480
catgaagtac cctggattgt caatgctgaa ggggagctag ttgaaattaa accaatcaaa
12540
atttatttgc agttaataga acaaagtcta tctttaagaa taactgtttt gaattataca
12600
gacatggcac atgctcttac acgattaatt aggaagaaat tgatgtgtga taatgcactc
12660
tttaatccaa gttcatcacc aatgtttagt ctaactcaag ttattgatcc tacaacacag
12720
ctagactatt ttcctaaggt aatatttgaa aggttaaaaa gttatgacac cagttcagac
12780
tacaacaaag ggaagttaac aagaaattac atgacattat taccatggca gcacgtaaac
12840
aggtataatt ttgtctttag ttcaacagga tgtaaaatca gcttgaagac atgcatcggg
12900
aaattgataa aggacttaaa ccctaaggtt ctttacttta ttggagaagg agcaggtaac
12960
tggatggcaa gaacagcatg tgagtatcct gacataaaat ttgtatatag gagtttaaag
13020
gatgatcttg atcaccatta cccattagaa tatcaaaggg taataggtga tttaaataga
13080
gtaatagatg gtggtgaagg attatcaatg gagaccacag atgcaactca aaagactcat
13140
tgggacttga tacacagaat aagtaaagat gctttattga taacattgtg tgatgcagaa
13200
ttcaaaaaca gagatgattt ctttaaaatg gtaattcttt ggagaaaaca tgtattatca
13260
tgtagaatct gtacagctta tggaacagat ctttacttat ttgcaaagta tcatgcgacg
13320
gactgcaata taaagttacc attttttgta aggtctgtag ctacttttat tatgcaagga
13380
agcaaattgt caggatcaga atgttacata cttttaacat taggtcatca caataatctg
13440
ccatgtcacg gagaaataca aaattccaaa atgagaatag cagtgtgtaa tgatttccat
13500
gcctcaaaaa aactagacaa caaatcaatt gaagcaaact gcaaatctct tctatcagga
13560
ttaagaatac caataaacaa aaaagagtta aatagacaaa agaaactgtt aacactacaa
13620
agcaatcatt cttccatagc aacagttggc ggaagtaaga ttatagaatc caaatggtta
13680
aagaataaag caagtacaat aattgattgg ttagagcata tcttgaattc tccaaaaggt
13740
gaattaaact atgatttctt tgaagcatta gagaacacat atcccaatat gatcaagctt
13800
atagataacc tgggaaatgc agagataaaa aaactaatca aagttaccgg gtatatgctt
13860
gtgagtgaga agtaataata ataataataa tcaaccataa tctcacacaa ctgagaaaat
13920
gatcatctaa cagtttaatt gaccattagt taattaaaaa ttataaatta gtaactaatt
13980
gataaaaaat aagaaattga aattgaatgt atacggtttt tttgccgt
14028
<---
Настоящее изобретение относится к биотехнологии и медицине. Предложен ослабленный штамм метапневмовируса человека, происходящий из штамма rC-85473, содержащий генетические модификации последовательности SEQ ID NO. 1, ослабляющие вирулентность указанного штамма. Модификации заключаются в инактивации гена, кодирующего белок SH, инактивации гена, кодирующего белок G, или инактивации этих двух генов - кодирующих белок G и белок SH. Предложено применение in vitro указанного ослабленного штамма метапневмовируса человека в качестве экспрессионного вектора по меньшей мере одного экзогенного гена в клетках-мишенях метапневмовируса человека. Предложена вакцинная композиция для профилактики или лечения инфекций, вызываемых вирусами семейства Pneumoviridae, содержащая в фармацевтически приемлемом носителе по меньшей мере один указанный ослабленный штамм метапневмовируса человека. Вакцина безопасна и эффективна для уменьшения тяжести поражения дыхательных путей в отношении вакцинации групп населения, особенно подвергающихся воздействию hMPV, представляющих собой младенцев, маленьких детей и пожилых. 3 н. и 10 з.п. ф-лы, 8 табл., 33 ил., 10 пр.
1. Ослабленный штамм метапневмовируса человека, происходящий из штамма rC-85473, содержащий генетические модификации последовательности SEQ ID NO. 1, ослабляющие вирулентность указанного штамма, для профилактики или лечения инфекций, вызываемых вирусами семейства Pneumoviridae, отличающийся тем, что генетические модификации последовательности SEQ ID NO. 1 заключаются в инактивации гена, кодирующего белок SH, инактивации гена, кодирующего белок G, или инактивации этих двух генов, кодирующих белок G и белок SH.
2. Ослабленный штамм метапневмовируса человека, происходящий из штамма rC-85473, по п. 1, отличающийся тем, что указанный штамм содержит последовательность SEQ ID NO. 2.
3. Ослабленный штамм метапневмовируса человека, происходящий из штамма rC-85473, по п. 1, отличающийся тем, что указанный штамм содержит последовательность SEQ ID NO. 3.
4. Ослабленный штамм метапневмовируса человека, происходящий из штамма rC-85473, по одному из пп. 1-3, последовательность которого содержит по меньшей мере один экзогенный ген.
5. Ослабленный штамм метапневмовируса человека, происходящий из штамма rC-85473, по п. 4, где экзогенный ген кодирует вирусный антиген.
6. Применение in vitro ослабленного штамма метапневмовируса человека, происходящего из штамма rC-85473, по п. 4 или 5 в качестве экспрессионного вектора по меньшей мере одного экзогенного гена в клетках-мишенях метапневмовируса человека.
7. Ослабленный штамм метапневмовируса человека, происходящий из штамма rC-85473, по одному из пп. 1-5 для применения в качестве лекарственного средства в предупреждении и/или лечении инфекций, вызываемых вирусами семейства Pneumoviridae.
8. Ослабленный штамм метапневмовируса человека, происходящий из штамма rC-85473, для применения по п. 7, для предупреждения и/или лечения инфекций, вызываемых метапневмовирусами человека.
9. Ослабленный штамм метапневмовируса человека, происходящий из штамма rC-85473, для применения по п. 7, для предупреждения и/или лечения инфекций, вызываемых ортопневмовирусами, такими как респираторно-синцитиальный вирус человека.
10. Ослабленный штамм метапневмовируса человека, происходящий из штамма rC-85473, по п. 4 или 5 для применения в предупреждении и/или лечении инфекций, вызываемых вирусами, чей по меньшей мере один вирусный антиген экспрессируется указанным ослабленным штаммом вируса.
11. Вакцинная композиция для профилактики или лечения инфекций, вызываемых вирусами семейства Pneumoviridae, содержащая, в фармацевтически приемлемом носителе, по меньшей мере один ослабленный штамм метапневмовируса человека, происходящий из штамма rC-85473, по одному из пп. 1-5 в эффективном количестве.
12. Вакцинная композиция по п. 11, дополнительно содержащая адъювант.
13. Вакцинная композиция по п. 11 или 12, отличающаяся тем, что указанная композиция находится в фармацевтической форме, выбранной из порошка, водной суспензии капель или раствора, находящегося под давлением.
Способ приготовления мыла | 1923 |
|
SU2004A1 |
BIACCHESI S et al., Recombinant human Metapneumoviras lacking the small hydrophobic SH and/or attachment G glycoprotein: deletion of G yields a promising vaccine candidate," JOURNAL OF VIROLOGY, THE AMERICAN SOCIETY FOR MICROBIOLOGY, US, vol | |||
Парный автоматический сцепной прибор для железнодорожных вагонов | 0 |
|
SU78A1 |
Прибор для равномерного смешения зерна и одновременного отбирания нескольких одинаковых по объему проб | 1921 |
|
SU23A1 |
Авторы
Даты
2023-09-06—Публикация
2019-07-12—Подача