ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИ, К КОТОРОЙ ОТНОСИТСЯ ИЗОБРЕТЕНИЕ
[0001] Настоящее изобретение относится к биспецифическим антиген связывающим молекулам, которые связывают простатспецифический мембранный антиген (PSMA) и CD3, в комбинации с костимуляцией 4-1ВВ, а также к способам их применения.
ССЫЛКА НА ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
[0002] Официальная копия перечня последовательностей подается одновременно с описанием в электронном виде через EFS-Web в виде перечня последовательностей в формате ASCII с именем файла 10595WO01_SEQ_LIST_ST25, дата создания 19 июня 2020 г., и размером приблизительно 4096 байт. Перечень последовательностей, содержащийся в этом документе формата ASCII, является частью описания и включен в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.
ПРЕДПОСЫЛКИ ИЗОБРЕТЕНИЯ
[0003] Простатспецифический мембранный антиген (PSMA), также известный как фолатгидролаза 1 (FOLH1), представляет собой интегральный, неслущивающийся мембранный гликопротеин, который на высоком уровне экспрессируется в эпителиальных клетках предстательной железы и является маркером клеточной поверхности при раке предстательной железы. Его экспрессия поддерживается при кастрационно-резистентном раке предстательной железы, состоянии с неблагоприятным исходом и ограниченными возможностями лечения. Были исследованы способы лечения рака предстательной железы путем нацеливания на PSMA. Например, иттрий-90-капромаб представляет собой радиотерапевтический препарат, содержащий моноклональное антитело к внутриклеточному эпитопу PSMA; J591, моноклональное антитело к внеклеточному эпитопу PSMA, является частью радиотерапевтического препарата лютеций-177-J591; и MLN2704, в котором с J591 конъюгирован майтанзиноид-1 (DM1, ингибитор образования микротрубочек). Данные виды терапии были ассоциированы с токсичностью. PSMA также экспрессируется внутри новообразованных сосудов других опухолей, например, при типах карциномы мочевого пузыря, почки, желудка и толстой и прямой кишки.
[0004] CD3 представляет собой гомодимерный или гетеродимерный антиген, экспрессируемый на Т-клетках в ассоциации с Т-клеточным рецепторным комплексом (TCR), и он необходим для активации Т-клеток. Функциональный CD3 образуется за счет димерной ассоциации двух из четырех различных цепей: эпсилон, дзета, дельта и гамма. Димерные структуры CD3 включают гамма/эпсилон, дельта/эпсилон и дзета/дзета. Было показано, что антитела к CD3 содействуют образованию кластеров CD3 на Т-клетках, тем самым вызывая активацию Т-клеток аналогично вовлечению TCR за счет нагруженных пептидом молекул МНС. Таким образом, антитела к CD3 были предложены для терапевтических целей с вовлечением активации Т-клеток. Кроме того, биспецифические антитела, способные связывать CD3 и целевой антиген, были предложены для терапевтических путей применения, включая нацеливание иммунных ответов с участием Т-клеток на ткани и клетки, экспрессирующие целевой антиген.
[0005] При активации Т-клеток костимуляция через суперсемейство рецепторов TNF является ключевым фактором выживания, приобретения эффекторных функций и дифференцировки клеток памяти. 4-1ВВ (Tnfrsf9), также известный как CD137, является представителем суперсемейства рецепторов TNF. Экспрессия рецептора индуцируется при активации лимфоцитов после TCR-опосредованного примирования, но ее уровни могут быть увеличены за счет костимуляции CD28. Воздействие лигандов или агонистических моноклональных антител (mAb) на CD8+ Т-клетки костимулирует 4-1ВВ, способствуя клональной экспансии, выживанию и развитию Т-клеток, индуцированной пролиферации периферических моноцитов, активации NF-каппа В, усилению апоптоза Т-клеток, индуцированному запущенной TCR/CD3 активацией, образованию клеток памяти и регуляции костимуляции посредством CD28 для содействия ответам с участием Th1-клеток.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ
[0006] В данном документе представлены способы лечения рака у субъекта. В некоторых аспектах способы предусматривают введение субъекту фармацевтической композиции, содержащей биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к PSMA/CD3 или антитело к PSMA и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель, и дальнейшее введение субъекту агониста 4-1ВВ. В некоторых аспектах способы предусматривают введение субъекту фармацевтической композиции, содержащей биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к PSMA/CD3 или антитело к PSMA, агонист 4-1ВВ и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель. В некоторых вариантах осуществления рак выбран из группы, состоящей из рака предстательной железы, рака почки, рака мочевого пузыря, колоректального рака и рака желудка. В некоторых случаях рак представляет собой рак предстательной железы. В некоторых случаях рак предстательной железы представляет собой кастрационно-резистентный рак предстательной железы.
[0007] Кроме того, в данном документе представлены способы лечения рака или подавления роста опухоли. В некоторых аспектах способы предусматривают введение субъекту, нуждающемуся в этом, терапевтически эффективного количества каждого из: (а) антитела к PSMA или его антигенсвязывающего фрагмента или биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA и (b) агониста 4-1ВВ.
[0008] В данном документе также представлены терапевтические способы нацеливания/уничтожения опухолевых клеток, экспрессирующих PSMA. В некоторых аспектах терапевтические способы предусматривают введение терапевтически эффективного количества биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA или антитела к PSMA и терапевтически эффективного количества агониста 4-1ВВ субъекту, нуждающемуся в этом. В некоторых аспектах биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к CD3/PSMA или антитело к PSMA и агонист 4-1ВВ составляют отдельно. В некоторых аспектах биспецифическая антиген связывающая молекула к CD3/PSMA или антитело к PSMA и агонист 4-1ВВ составлены в одной фармацевтической композиции.
[0009] В данном документе также представлено применение биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA или антитела к PSMA с агонистом 4-1ВВ в изготовлении лекарственного препарата для лечения заболевания или нарушения, связанного с клетками, экспрессирующими PSMA, или вызванного ими.
[0010] Введение антитела к PSMA или его антигенсвязывающего фрагмента или биспецифического антитела к PSMA/CD3 субъекту, нуждающемуся в этом, в комбинации с агонистом 4-1ВВ может уменьшить объем опухоли по сравнению с таковым при лечении в отсутствие агониста 4-1ВВ.
[0011] Введение антитела к PSMA или его антигенсвязывающего фрагмента или биспецифического антитела к PSMA/CD3 субъекту, нуждающемуся в этом, в комбинации с агонистом 4-1ВВ может увеличить безопухолевую выживаемость по сравнению с таковой при лечении в отсутствие агониста 4-1ВВ.
[0012] Введение антитела к PSMA или его антигенсвязывающего фрагмента или биспецифического антитела к PSMA/CD3 субъекту, нуждающемуся в этом, в комбинации с агонистом 4-1ВВ может увеличивать экспрессию TRAF1 в опухоли в по меньшей мере приблизительно 4 раза по сравнению с экспрессией TRAF1 в опухоли субъекта, которому вводили биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к CD3/PSMA в отсутствие агониста 4-1ВВ.
[0013] Введение антитела к PSMA или его антигенсвязывающего фрагмента или биспецифического антитела к PSMA/CD3 субъекту, нуждающемуся в этом, в комбинации с агонистом 4-1ВВ может увеличить экспрессию Bcl2 в опухоли в по меньшей мере приблизительно 2 раза по сравнению с экспрессией Bcl2 в опухоли субъекта, которому вводили биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к CD3/PSMA в отсутствие агониста 4-1ВВ.
[0014] Введение антитела к PSMA или его антигенсвязывающего фрагмента или биспецифического антитела к PSMA/CD3 субъекту, нуждающемуся в этом, в комбинации с агонистом 4-1ВВ может увеличить экспрессию BFL-1 в опухоли в по меньшей мере приблизительно 3 раза по сравнению с экспрессией BFL-1 в опухоли субъекта, которому вводили биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к CD3/PSMA в отсутствие агониста 4-1ВВ.
[0015] Введение антитела к PSMA или его антигенсвязывающего фрагмента или биспецифического антитела к PSMA/CD3 субъекту, нуждающемуся в этом, в комбинации с агонистом 4-1ВВ может увеличить экспансию CD8+ Т-клеток в опухоли и/или увеличить выживаемость CD8+Т-клеток по сравнению с CD8+ Т-клетками в опухоли субъекта, которому вводили биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к CD3/PSMA в отсутствие агониста 4-1ВВ.
[0016] Агонист 4-1ВВ может представлять собой низкомолекулярный или биологический агонист 4-1ВВ, и в некоторых аспектах представляет собой антитело. Иллюстративные агонисты 4-1ВВ включают коммерчески доступные антитела, например антитела к 4-1ВВ мыши, и терапевтические антитела, такие как урелумаб и утомилумаб.
[0017] В соответствии со способами, представленными в данном документе, применимыми являются антитела к PSMA или их антигенсвязывающие фрагменты, а также биспецифические антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, которые связывают PSMA человека и CD3 человека. Биспецифические антитела применимы, среди прочего для нацеливания на Т-клетки, экспрессирующие CD3, и для стимуляции активации Т-клеток, например, в условиях, когда полезным или необходимым является опосредованное Т-клетками уничтожение клеток, экспрессирующих PSMA. Например, биспецифические антитела могут направлять СО3-опосредованную активацию Т-клеток на специфические клетки, экспрессирующие PSMA, такие как опухолевые клетки предстательной железы.
[0018] Антитела к PSMA или их антигенсвязывающие фрагменты, которые связывают PSMA, применимы в комбинации с агонистом 4-1ВВ для лечения заболеваний и нарушений, связанных с опухолями, экспрессирующими PSMA, или вызванных ими, и, в частности, опухолями, которые являются очень крупными и/или сложнее поддаются лечению. Иллюстративные антитела к PSMA и их антигенсвязывающие фрагменты подробно описаны в патенте США №10179819. В некоторых аспектах антитело к PSMA содержит HCVR под SEQ ID NO: 66 и общую легкую цепь под SEQ ID N0:1386, упоминаемые в патенте США №10179819. В некоторых аспектах антитело к PSMA представляет собой антитело Н1Н11810Р, упоминаемое в патенте США №10179819.
[0019] Биспецифические антигенсвязывающие молекулы (например, антитела), которые связывают PSMA и CD3, также упоминаются в данном документе как «биспецифические молекулы к PSMA/CD3», «биспецифические молекулы к CD3/PSMA», «bsAb к PSMAxCD3» или просто «PSMAxCD3». Связывающая PSMA часть биспецифической молекулы к PSMA/CD3 применима для нацеливания на клетки (например, опухолевые клетки), которые экспрессируют PSMA (например, опухоли предстательной железы), а связывающая CD3 часть биспецифической молекулы применима для активации Т-клеток. Одновременное связывание PSMA на опухолевой клетке и CD3 на Т-клетке облегчает направленное уничтожение (клеточный лизис) подвергаемой нацеливанию опухолевой клетки под действием активированной Т-клетки. Следовательно, биспецифические молекулы к PSMA/CD3, применимые в данном документе, применимы, среди прочего, для лечения заболеваний и нарушений, связанных с опухолями, экспрессирующими PSMA, или вызванных ими (например, рака предстательной железы). Биспецифические молекулы к PSMA/CD3 также применимы в комбинации с агонистом 4-1ВВ для лечения заболеваний и нарушений, связанных с опухолями, экспрессирующими PSMA, или вызванных ими, и, в частности, опухолями, которые являются очень крупными и/или сложнее поддаются лечению.
[0020] Биспецифические антигенсвязывающие молекулы содержат первый антиген связывающий домен, который специфически связывает CD3 человека, и второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает PSMA.
[0021] Иллюстративные биспецифические антитела, применимые в соответствии со способами, представленными в данном документе, представляют собой биспецифические молекулы к CD3/PSMA, где первый антигенсвязывающий домен, который специфически связывает CD3, содержит любую из аминокислотных последовательностей HCVR, любую из аминокислотных последовательностей LCVR, любую из пар аминокислотных последовательностей HCVR/LCVR, любую из аминокислотных последовательностей CDR1-CDR2-CDR3 тяжелой цепи или любую из аминокислотных последовательностей CDR1-CDR2-CDR3 легкой цепи, изложенных в публикации заявки на патент США 2014/0088295.
[0022] В соответствии со способами, представленными в данном документе, применимыми являются биспецифические антигенсвязывающие молекулы к CD3/PSMA, где первый антигенсвязывающий домен, который специфически связывает CD3, содержит любую из аминокислотных последовательностей HCVR и/или любую из аминокислотных последовательностей LCVR или по сути сходную с ними последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичностью последовательности, как изложено в таблицах 12, 14, 15, 18 и 20 патента США №10179819. В некоторых аспектах первый антигенсвязывающий домен, который специфически связывает CD3, содержит аминокислотную последовательность вариабельной области тяжелой цепи (HCVR-1) под SEQ ID NO: 2.
[0023] В соответствии со способами, представленными в данном документе, применимыми являются биспецифические молекулы к CD3/PSMA, где второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает PSMA, содержит любую из аминокислотных последовательностей HCVR и/или любую из аминокислотных последовательностей LCVR или по сути сходную с ними последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичностью последовательности, как изложено в таблице 1 патента США №10179819. В некоторых аспектах второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает PSMA, содержит аминокислотную последовательность вариабельной области тяжелой цепи (HCVR-2) под SEQ ID NO: 1.
[0024] В соответствии со способами, представленными в данном документе, применимыми являются биспецифические молекулы к CD3/PSMA, где первый антигенсвязывающий домен, который специфически связывает CD3, содержит аминокислотную последовательность HCVR-1 под SEQ ID NO: 2, и где второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает PSMA, содержит аминокислотную последовательность HCVR-2 под SEQ ID NO: 1. В некоторых аспектах биспецифическая молекула к CD3/PSMA содержит аминокислотную последовательность вариабельной области общей легкой цепи (LCVR) под SEQ ID NO: 3.
[0025] В одном аспекте в данном документе представлена фармацевтическая композиция, содержащая антигенсвязывающую молекулу к PSMA или биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к PSMA/CD3 и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель. В некоторых аспектах фармацевтическая композиция дополнительно содержит агонист 4-1ВВ.
[0026] В соответствии со способами по настоящему изобретению применимыми являются антитела к PSMA и их антигенсвязывающие фрагменты, а также биспецифические антигенсвязывающие молекулы к CD3/PSMA, характеризующиеся модифицированным паттерном гликозилирования. В некоторых вариантах применения может быть применима модификация с удалением нежелательных сайтов гликозилирования или антитело без фукозного фрагмента, присутствующего в олигосахаридной цепи, например, для увеличения функционального свойства антителозависимой клеточной цитотоксичности (ADCC) (см. Shield et al. (2002) JBC 277:26733). В других вариантах применения модификацию, представляющую собой галактозилирование, можно осуществлять для модифицирования комплементзависимой цитотоксичности (CDC).
[0027] В одном аспекте настоящего изобретения представлена фармацевтическая композиция, содержащая антитело к PSMA или его антигенсвязывающий фрагмент или биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к CD3/PSMA, раскрытую в данном документе, агонист 4-1ВВ и фармацевтически приемлемый носитель. В связанном аспекте настоящего изобретения описана композиция, которая представляет собой комбинацию биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA, агониста 4-1ВВ и третьего терапевтического средства. В одном варианте осуществления третье терапевтическое средство представляет собой любое средство, при объединении которого с биспецифической антигенсвязывающей молекулой к CD3/PSMA обеспечивается преимущество. Иллюстративные средства, которые можно комбинировать с биспецифической антигенсвязывающей молекулой к CD3/PSMA с обеспечением преимущества, подробно обсуждаются в другом разделе данного документа.
[0028] В другом аспекте в данном документе представлены меченные радиоактивной меткой конъюгаты на основе антитела к PSMA и конъюгаты на основе биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA для применения в иммунной РЕТ-визуализации. Конъюгат содержит антитело к PSMA или биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к CD3/PSMA, хелатообразующий фрагмент и позитронный излучатель.
[0029] В данном документе представлены способы синтеза указанных конъюгатов и синтетических промежуточных соединений, применимых для этого.
[0030] В данном документе представлены способы визуализации ткани, которая экспрессирует PSMA, при этом способы предусматривают введение в ткань меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела к PSMA или конъюгата на основе биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA, описанной в данном документе; и визуальное наблюдение экспрессии PSMA посредством визуализации с помощью позитронно-эмиссионной томографии (PET).
[0031] В данном документе представлены способы визуализации ткани, содержащей клетки, экспрессирующие PSMA, при этом способы предусматривают введение в ткань меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела к PSMA или конъюгата на основе биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA, описанной в данном документе, и визуальное наблюдение экспрессии PSMA посредством РЕТ-визуализации.
[0032] В данном документе представлены способы обнаружения PSMA в ткани, при этом способы предусматривают введение в ткань меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела к PSMA или конъюгата на основе биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA, описанной в данном документе; и визуальное наблюдение экспрессии PSMA посредством РЕТ-визуализации. В одном варианте осуществления ткань присутствует в субъекте-человеке. В определенных вариантах осуществления субъект представляет собой отличное от человека млекопитающее. В определенных вариантах осуществления у субъекта имеется заболевание или нарушение, такое как рак, воспалительное заболевание или инфекция.
[0033] В данном документе представлены способы обнаружения PSMA в ткани, при этом способы предусматривают приведение ткани в контакт с антителом к PSMA или биспецифической антигенсвязывающей молекулой к CD3/PSMA, конъюгированными с флуоресцентной молекулой, описанной в данном документе; и визуальное наблюдение экспрессии PSMA посредством флуоресцентной визуализации.
[0034] В данном документе представлены способы идентификации субъекта, подходящего для противоопухолевой терапии, при этом способы предусматривают отбор субъекта с солидной опухолью, введение меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела к PSMA или конъюгата на основе биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA, описанного в данном документе, и визуальное наблюдение введенного меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела в опухоли посредством РЕТ-визуализации, при этом присутствие меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела в опухоли позволяет идентифицировать субъекта как подходящего для противоопухолевой терапии.
[0035] В данном документе представлены способы лечения опухоли, при этом способы предусматривают отбор субъекта с солидной опухолью, определение того, является ли солидная опухоль PSMA-положительной, и введение средства противоопухолевой терапии субъекту, нуждающемуся в этом. В определенных вариантах осуществления средство противоопухолевой терапии предусматривает ингибитор сигнальной оси PD-1/PD-L1 (например, антитело к PD-1 или антитело к PD-L1), пример средства терапии на основе ингибитора контрольных точек иммунного ответа. В определенных вариантах осуществления субъекту вводят меченный радиоактивной меткой конъюгат на основе антитела к PSMA или конъюгат на основе биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA, описанной в данном документе, и локализацию меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела визуализируют за счет визуализации с помощью позитронно-эмиссионной томографии (PET) для определения того, является ли опухоль PSMA-положительной. В определенных вариантах осуществления субъекту дополнительно вводят меченный радиоактивной меткой конъюгат на основе антитела к PD-1 и локализации меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела визуализируют за счет визуализации с помощью позитронно-эмиссионной томографии (PET) для определения того, является ли опухоль PD-1-положительной.
[0036] В данном документе представлены способы отслеживания эффективности средства противоопухолевой терапии у субъекта, при этом способы предусматривают отбор субъекта с солидной опухолью, где субъект подвергается лечению с помощью средства противоопухолевой терапии, введение субъекту меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела к PSMA или конъюгата на основе биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA, описанного в данном документе, осуществление визуализации локализации введенного меченного радиоактивной меткой конъюгата в опухоли посредством РЕТ-визуализации и определение опухолевого роста, где уменьшение поглощения конъюгата или сигнала радиоактивной метки относительно исходного уровня указывает на эффективность средства противоопухолевой терапии.
[0037] В определенных вариантах осуществления средство противоопухолевой терапии предусматривает ингибитор PD-1 (например, REGN2810, BGB-A317, ниволумаб, пидилизумаб и пембролизумаб), ингибитор PD-L1 (например, атезолизумаб, авелумаб, дурвалумаб, MDX-1105 и REGN3504, а также раскрытые в публикации заявки на патент № US 2015-0203580), ингибитор CTLA-4 (например, ипилимумаб), ингибитор TIM3, ингибитор BTLA, ингибитор TIGIT, ингибитор CD47, ингибитор GITR, антагонист другого Т-клеточного коингибитора или лиганда (например, антитело к LAG3, CD-28, 2 В4, LY108, LAIR1, ICOS, CD160 или VISTA), ингибитор индоламин-2,3-диоксигеназы (IDO), антагонист фактора роста эндотелия сосудов (VEGF) [например, «VEGF-ловушка», такая как афлиберцепт или другой ингибирующий VEGF слитый белок, изложенный в US 7087411, или антитело к VEGF или его антигенсвязывающий фрагмент (например, бевацизумаб или ранибизумаб) или низкомолекулярный ингибитор киназы рецептора VEGF (например, сунитиниб, сорафениб или пазопаниб)], ингибитор Ang2 (например, несвакумаб), ингибитор трансформирующего фактора роста бета (TGFβ), ингибитор рецептора эпидермального фактора роста (EGFR) (например, эрлотиниб, цетуксимаб), ингибитор CD20 (например, антитело к CD20, такое как ритуксимаб), антитело к опухоль-специфическому антигену [например, СА9, СА125, ассоциированному с меланомой антигену-3 (MAGE3), карциноэмбриональному антигену (СЕА), виментину, опухолевому М2-РК, специфическому для предстательной железы антигену (PSA), муцину-1, MART-1 и СА19-9], вакцину (например, бациллу Кальмета-Герена, противораковую вакцину), адъювант для повышения презентирования антигена (например, гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор), биспецифическое антитело (например, биспецифическое антитело к CD3xCD20 или биспецифическое антитело к PSMAxCD3), цитотоксин, химиотерапевтическое средство (например, дакарбазин, темозоломид, циклофосфамид, доцетаксел, доксорубицин, даунорубицин, цисплатин, карбоплатин, гемцитабин, метотрексат, митоксантрон, оксалиплатин, паклитаксел и винкристин), циклофосфамид, средство лучевой терапии, ингибитор IL-6R (например, сарилумаб), ингибитор IL-4R (например, дупилумаб), ингибитор IL-10, цитокин, такой как IL-2, IL-7, IL-21 и IL-15, конъюгат антитела и лекарственного средства (ADC) (например, ADC на основе антитела к CD 19 и DM4 и ADC на основе антитела к DS6 и DM4).
[0038] В данном документе представлены способы увеличения экспансии CD8+Т-клеток в опухолевой ткани. В некоторых аспектах способы предусматривают введение субъекту, нуждающемуся в этом, терапевтически эффективного количества каждого из: (а) биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA и (b) агониста 4-1ВВ.
[0039] В данном документе представлены способы инициирования и/или усиления Т-клеточного ответа в отношении опухолей. В некоторых аспектах способы предусматривают введение субъекту, нуждающемуся в этом, терапевтически эффективного количества каждого из: (а) биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA и (b) агониста 4-1ВВ.
[0040] В некоторых аспектах отношение CD8+ Т-клеток к Treg увеличивается в опухолевой ткани по сравнению с отношением CD8+ Т-клеток к Treg в опухолевой ткани у субъекта, которому вводят биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к CD3/PSMA в отсутствие агониста 4-1ВВ. В некоторых аспектах последующее воздействие опухолевых клеток инициирует ответ с участием клеток памяти у субъекта, подвергавшегося лечению биспецифической антигенсвязывающей молекулой к CD3/PSMA в присутствии агониста 4-1ВВ.
[0041] Другие варианты осуществления будут очевидны из обзора следующего подробного описания.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ГРАФИЧЕСКИХ МАТЕРИАЛОВ
[0042] На фигурах 1A-1G показано, что биспецифическое антитело к PSMAxCD3 может связываться с линиями клеток, экспрессирующим антиген как на высоком, так и на низком уровне, и продемонстрировано, что биспецифическое антитело к PSMAxCD3 способно индуцировать мишень-зависимую CD3-опосредованную активацию Т-клеток, приводящую к уничтожению опухолевых клеток, экспрессирующих PSMA. Показаны данные для двух объединенных лунок, и они представляют три независимых эксперимента.
[0043] На фигурах 2А-2В продемонстрировано подавление роста клеток рака предстательной железы человека на модели ксеногенной опухоли в результате лечения биспецифическим антителом к PSMAxCD3. На фигуре 2А мышам NSG совместно имплантировали подкожно клетки 22Rv1 и человеческие РВМС. В дни 0, 3 и 7 мышам вводили дозу, составляющую 0,1, 1 мг/кг PSMAxCD3 или 1 мг/кг контроля связывания CD3. На фигуре 2 В мышам NSG совместно имплантировали подкожно клетки С4-2 и человеческие РВМС. В дни 0, 3 и 7 мышам вводили дозу, составляющую 0,01, 0,1 мг/кг PSMAxCD3 или 0,1 мг/кг контроля связывания CD3. Средние объемы опухолей представлены в виде SEM (n=5, 3 повтора). ****р<0,0001. Статистическую значимость измеряют с посредством двухфакторного ANOVA при сравнении с контролем связывания CD3.
[0044] На фигурах 3A-3D показана экспрессия PSMA и накопление биспецифического антитела к PSMAxCD3 в экспрессирующих PSMA тканях мыши HuT, а также клиренс лекарственного средства. На фигуре ЗА показана относительная экспрессия PSMA в тканях мышей HuT, как определено с помощью RT-PCR. На фигурах 3В и 3С показано биораспределение в тканях ex vivo, измеренное в день 6 и представленное в виде процента от введенной дозы на грамм ткани (% ID/г) и в виде соотношения содержания в ткани и крови. Данные показаны в виде среднего значения ±SD. На фигуре 3D показан клиренс лекарственного средства PSMAxCD3 с течением времени, измеренный у мышей, обработанных PSMAxCD3 в дозе 1 мг/кг.
[0045] На фигурах 4А-4С продемонстрировано, что лечение биспецифическим антителом к PSMAxCD3 привело к предотвращению или задержке опухолевого роста у мышей HuT, которым имплантировали линию клеток аденокарциномы предстательной железы мыши, экспрессирующей PSMA человека, в случае опухолей, размер которых не превышал 200 мм3. В случае более крупных опухолях наблюдали стремительный, но временный противоопухолевый ответ.На фигуре 4А показано, что мышей обрабатывали контролем связывания CD3 (кружок) или PSMAxCD3 (квадрат) в дозе 5 мг/кг в дни 0, 4, 7 и 11. 5/5 мышей не имели опухолей. Средние объемы опухолей представлены в виде SEM (n=7, 3 повтора). ****Р<0,0001. На фигуре 4 В показано, что опухоли объемом 50 мм3 обрабатывали с помощью контроля связывания CD3 (кружок) или PSMAxCD3 (квадрат) в дозе 5 мг/кг в дни 8, 12, 15 и 19. 2/5 мышей не имели опухолей. Средние объемы опухолей представлены в виде SEM (n=5, 3 повтора). ****р<0,0001. На фигуре 4С показано, что опухоли объемом 200 мм3 обрабатывали с помощью контроля связывания CD3 (кружок) или PSMAxCD3 (квадрат) в дозе 5 мг/кг в дни 9, 12, 16 и 19. 0/5 мышей не имели опухолей. Средние объемы опухолей представлены в виде SEM (n=5, 3 повтора). **Р=0,0014.
[0046] На фигурах 5A-5D продемонстрированы результаты обработки биспецифическими антителами к PSMAxCD3 мышей HuT, имеющих две опухоли разного размера на противоположных боках. Данные показывают, что биспецифическое антитело нацеливается на опухоли независимо от размера, но его эффективность ограничена опухолями меньшего размера. На фигуре 5А показан средний объем небольшой опухоли, представленный в виде SEM (n=5, три повтора). ***Р<0,001. На фигуре 5 В показан средний объем крупной опухоли, представленный в виде SEM (n=5, 3 повтора). *Р=0,01. Все критерии статистической значимости измерены посредством двухфакторного ANOVA при сравнении с контролем связывания CD3. На фигурах 5С и 5D показано биораспределение в тканях ex vivo, измеренное в день 6 и представленное в виде процента от введенной дозы на грамм ткани (% ID/г) и в виде соотношения содержания в ткани и крови после введения 89Zr-PSMAxCD3 или контроля связывания 89Zr-CD3 в дозе 1 мг/кг мышам, несущим небольшие и крупные опухоли. Данные показаны в виде среднего значения ±SD.
[0047] На фигурах 6A-6D продемонстрирована противоопухолевая эффективность биспецифического антитела к PSMAxCD3 с костимуляцией посредством антитела к 4-1ВВ в крупных опухолях TRAMP-C2hPMSA (200 мм3). На фигуре 6А показаны репрезентативные диаграммы проточной цитометрии и MFI экспрессии 4-1ВВ в CD4 и CD8 Т-клетках опухоли и селезенки через 48 часов после введения контроля связывания CD3 или PSMAxCD3 в дозе 5 мг/кг (n=5). На фигуре 6В показано, что сформированные опухоли TRAMP-C2-hPMSA объемом 200 мм3 обрабатывали один раз в день 9 с помощью контроля связывания CD3 в дозе 5 мг/кг (белые кружки), антитела к4-1ВВ в дозе 2,5 мг/кг (закрашенные кружки), PSMAxCD3 в дозе 1 мг/кг (белые треугольники), PSMAxCD3 в дозе 5 мг/кг (закрашенные треугольники), PSMA в дозе 1 мг/кг + антитело к 4-1ВВ в дозе 2,5 мг/кг (белые квадраты) или PSMAxCD3 в дозе 5 мг/кг + антитело к -4-1ВВ в дозе 2,5 мг/кг (закрашенные квадраты). Средний объем опухоли представлен в виде SEM (n=10, 3 повтора). ****Р<0,0001. Статистическую значимость измеряли посредством двухфакторного ANOVA при сравнении с контролем связывания CD3. На фигуре 6С представлены кривые безопухолевой выживаемости, на которых изображено умерщвление мышей с опухолями >2000 мм3. Значимость измеряли посредством критерия Гехана-Бреслоу-Уилкоксона при сравнении с контролем связывания CD3. ****Р<0,0001. Число мышей без опухолей (TF) было следующим: 0/10 для контроля связывания CD3; 0/10 для PSMAxCD3 в дозе 5 мг/кг; 1/10 для PSMAxCD3 в дозе 1 мг/кг; 2/10 для контроля антитела 4-1ВВ; 6/10 для PSMA в дозе 1 мг/кг + антитело 4-1ВВ в дозе 2,5 мг/кг и 5/10 для PSMAxCD3 в дозе 5 мг/кг + антитело к 4-1ВВ в дозе 2,5 мг/кг. На фигуре 6D представлена относительная экспрессия генов пути 4-1ВВ в опухолях через 72 часа после введения средства обработки. (п=6) ****Р<0,0001, ***Р<0,009, *Р<0,05. Статистическую значимость измеряли с помощью од но факторного ANOVA.
[0048] На фигурах 7А-7В показано увеличение количества CD8 Т-клеток в опухоли после комбинированной терапии с помощью PSMAxCD3 и антитела к 4-1ВВ, а также формирование иммунологической памяти. На фигуре 7 В мышам, у которых опухоль объемом 50 мм3 исчезла, повторно вводили опухолевые клетки TRAMP-C2-hPSMA, и они были защищены от вторичной опухоли, что свидетельствует о том, что опухолеспецифическая иммунологическая память может быть индуцирована с помощью биспецифических антител к CD3.
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ
[0049] Перед приведением описания настоящего изобретения следует понимать, что настоящее изобретение не ограничивается конкретными описанными способами и условиями экспериментов, поскольку такие способы и условия могут варьировать. Также следует понимать, что терминология, используемая в данном документе, предназначена только для целей описания конкретных вариантов осуществления и не предназначена для ограничения, поскольку объем настоящего изобретения будет ограничиваться только прилагаемой формулой изобретения.
[0050] Если не определено иное, то все технические и научные термины, используемые в данном документе, имеют такое же значение, как это обычно понимает специалист средней квалификации в области техники, к которой принадлежит настоящее изобретение. Используемый в данном документе термин «приблизительно» при использовании в отношении конкретного упомянутого числового значения означает, что значение может отличаться от упомянутого значения на не более чем 1%. Например, используемое в данном документе выражение «приблизительно 100» включает 99 и 101 и все значения между ними (например, 99,1, 99,2, 99,3, 99,4 и т.д.).
[0051] Хотя при практическом осуществлении или тестировании настоящего изобретения можно применять любые способы и материалы, сходные с описанными в данном документе или эквивалентные им, в данном документе описаны только предпочтительные способы и материалы. Все патенты, заявки на патент и непатентные публикации, упомянутые в данном описании, включены в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.
[0052] Как показано в примерах, противоопухолевую эффективность PSMAxCD3 наблюдали в отношении небольших опухолей, однако противоопухолевая эффективность была значительно снижена в отношении более крупных опухолей, что более реалистично отражало трудности с лечением солидных опухолей в клинической практике.
[0053] Как показано ниже, биспецифические антитела к PSMAxCD3 приводили к инфильтрации, активации и пролиферации CD8 Т-клеток, что было эффективным в случае небольших опухолях, но не в случае более крупных опухолей. Авторы настоящего изобретения стремились усилить и продлить индуцированную PSMAxCD3 активность Т-клеток путем обеспечения костимулирующего сигнала с применением агониста 4-1ВВ. Путь передачи сигналов с участием 4-1ВВ может увеличивать интенсивность и продолжительность Т-клеточных ответов, содействуя выживанию Т-клеток, устраняя анергию Т-клеток и впоследствии образуя Т-клетки памяти для содействия выраженной противоопухолевой активности.
[0054] Как показано в данном документе, объединение биспецифического антитела к PSMAxCD3 с костимуляцией 4-1ВВ привело к усилению инфильтрации, активации и пролиферации CD8 Т-клеток, что привело к поразительной противоопухолевой эффективности в более крупных опухолях при однократной дозе. Данная комбинация также может индуцировать образование опухолеспецифических Т-клеток памяти.
[0055] В данном документе продемонстрирована способность антител к PSMA и биспецифических антител к PSMAxCD3 активировать внутриопухолевые Т-клетки и способность костимуляции 4-1ВВ увеличивать интенсивность и продолжительность Т-клеточного ответа, что приводит к значительной противоопухолевой эффективности. Объединение антител к PSMA и биспецифических антител к PSMAxCD3 с костимуляцией 4-1ВВ применимо в способах лечения сформировавшихся солидных опухолей для достижения лучшей общей выживаемости.
Пути терапевтического применения антигенсвязывающих молекул
[0056] В настоящее изобретение включены способы, предусматривающие введение субъекту, нуждающемуся в этом, антитела к PSMA или его антигенсвязывающего фрагмента или биспецифической антигенсвязывающей молекулы, которая специфически связывает CD3 и PSMA, с агонистом 4-1ВВ. Терапевтическая композиция, применимая в соответствии со способами, описанными в данном документе, может содержать антитело к PSMA или биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к PSMAxCD3 и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель. Используемое в данном документе выражение «субъект, нуждающийся в этом» означает человека или отличное от человека животное, которые демонстрируют один или более симптомов или признаков рака (например, субъекта, у которого имеется опухоль или который страдает от любого из типов рака, упомянутых в данном документе ниже) или которые иным образом получат пользу от подавления или снижения активности PSMA или истощения PSMA + клеток (например, клеток рака предстательной железы).
[0057] Антитела и биспецифические антигенсвязывающие молекулы, раскрытые в данном документе (и терапевтические композиции, содержащие их), применимы, среди прочего, в комбинации с агонистом 4-1ВВ для лечения любого заболевания или нарушения, при которых были бы полезны стимуляция, активация и/или нацеливание иммунного ответа. В частности, антитела к PSMA и биспецифические антигенсвязывающие молекулы к CD3/PSMA в комбинации с агонистом 4-1ВВ можно использовать для лечения, предупреждения и/или облегчения любого заболевания или нарушения, ассоциированного с экспрессией PSMA или активностью или пролиферацией PSMA + клеток или опосредованного ими. Механизм действия, с помощью которого достигаются терапевтические способы, раскрытые в данном документе, включает уничтожение клеток, экспрессирующих PSMA, в присутствии эффекторных клеток, например, посредством CDC, апоптоза, ADCC, фагоцитоза или посредством комбинации двух или более из этих механизмов. Клетки, экспрессирующие PSMA, которые можно подавлять или уничтожать с помощью антител или биспецифических антигенсвязывающих молекул, включают, например, клетки опухоли предстательной железы. Дополнительный терапевтический эффект достигается за счет костимуляции 4-1ВВ, в том числе вклад в клональную экспансию, выживание и развитие Т-клеток, индуцированную пролиферацию периферических моноцитов, активацию NF-каппа В, усиление апоптоза Т-клеток, индуцированного запущенной TCR/CD3 активацией, образование клеток памяти.
[0058] Антигенсвязывающие молекулы, в том числе антитела к PSMA и биспецифические антитела к PSMA/CD3, в комбинации с агонистом 4-1ВВ можно применять для лечения, например, первичных и/или метастатических опухолей, возникающих в желудочно-кишечном тракте, предстательной железе, почке и/или мочевом пузыре. В определенных вариантах осуществления антитела или биспецифические антигенсвязывающие молекулы применяются для лечения одного или более из следующих типов рака: светлоклеточной почечно-клеточной карциномы, хромофобной почечно-клеточной карциномы, (почечной) онкоцитомы, (почечной) переходно-клеточная карциномы, рака предстательной железы, колоректального рака, рака желудка, уротелиальной карциномы, аденокарциномы (мочевого пузыря) или мелкоклеточной карциномы (мочевого пузыря). В соответствии с определенными вариантами осуществления настоящего изобретения антитела к PSMA и биспецифические антитела к PSMA/CD3 в комбинации с агонистом 4-1ВВ применимы для лечения пациента, пораженного кастрационно-резистентным раком предстательной железы. В соответствии с другими связанными вариантами осуществления, раскрытыми в данном документе, предложены способы, предусматривающие введение биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA в комбинации с агонистом 4-1ВВ пациенту, пораженному кастрационно-резистентным раком предстательной железы.
[0059] В настоящее изобретение также включены способы лечения сформировавшихся опухолей у субъекта, при этом сформировавшаяся определяется как поддающаяся измерению опухоль, т.е. поддающаяся измерению способом, подходящим для данного типа рака.
[0060] В настоящее изобретение также включены способы лечения остаточного рака у субъекта. Используемый в данном документе термин «остаточный рак» означает наличие или сохранение одной или более раковых клеток у субъекта после лечения с помощью противораковой терапии.
[0061] В соответствии с определенными аспектами в настоящем изобретении представлены способы лечения заболевания или нарушения, ассоциированных с экспрессией PSMA (например, рака предстательной железы), предусматривающие введение одной или более биспецифических антигенсвязывающих молекул, описанных в другом разделе, в комбинации с агонистом 4-1ВВ субъекту после того, как было установлено, что у субъекта имеется рак предстательной железы (например, кастрационно-резистентный рак предстательной железы). Например, в настоящее изобретение включены способы лечения рака предстательной железы, предусматривающие введение биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA пациенту через 1 день, 2 дня, 3 дня, 4 дня, 5 дней, 6 дней, 1 неделю, 2 недели, 3 недели или 4 недели, 2 месяца, 4 месяца, 6 месяцев, 8 месяцев, 1 год или более после того, как субъект получил гормональную терапию (например, антиандрогенную терапию).
Определения
[0062] Используемое в данном документе выражение «CD3» относится к антигену, который экспрессируется на Т-клетках как часть мультимолекулярного Т-клеточного рецептора (TCR) и который состоит из гомодимера или гетеродимера, образованного при ассоциации двух из четырех рецепторных цепей: CD3-эпсилон, CD3-дельта, CD3-дзета и CD3-гамма. Все ссылки на белки, полипептиды и фрагменты белка в данном документе относятся к человеческой версии соответствующего белка, полипептида или фрагмента белка, если явно не указано, что они получены от отличных от человека видов. Таким образом, выражение «CD3» означает CD3 человека, если не указано, что он происходит из отличных от человека видов, например, «CD3 мыши», «CD3 обезьяны» и т.д.
[0063] Используемое в данном документе «антитело, которое связывает CD3» или «антитело к CD3» включает антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, которые специфически распознают отдельную субъединицу CD3 (например, эпсилон, дельта, гамма или дзета), а также антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, которые специфически распознают димерный комплекс из двух субъединиц CD3 (например, димеры CD3 гамма/эпсилон, дельта/эпсилон и дзета/дзета). Применимые в данном документе антитела и антигенсвязывающие фрагменты могут связывать растворимый CD3 и/или CD3, экспрессируемый на поверхности клетки. Растворимый CD3 включает природные белки CD3, а также рекомбинантные варианты белков CD3, такие как, например, мономерные и димерные конструкции CD3, в которых отсутствует трансмембранный домен или которые иным образом не ассоциированы с клеточной мембраной.
[0064] Используемое в данном документе выражение «CD3, экспрессируемый на клеточной поверхности», означает один или более белков CD3, которые экспрессируются на поверхности клетки in vitro или in vivo, вследствие чего по меньшей мере часть белка CD3 располагается на внеклеточной стороне клеточной мембраны и доступна для антигенсвязывающей части антитела. «CD3, экспрессируемый на клеточной поверхности» включает белки CD3, содержащиеся в рамках функционального Т-клеточного рецептора в мембране клетки. Выражение «CD3, экспрессируемый на клеточной поверхности» включает белок CD3, экспрессируемый как часть гомодимера или гетеродимера на поверхности клетки (например, димеры CD3 гамма/эпсилон, дельта/эпсилон и дзета/дзета). Выражение «CD3, экспрессируемый на клеточной поверхности» также включает цепь CD3 (например, CD3-эпсилон, СО3-дельта или CD3-raMMa), которая экспрессируется сама по себе, без других типов цепей CD3, на поверхности клетки. «CD3, экспрессируемый на клеточной поверхности» может содержать белок CD3, экспрессируемый на поверхности клетки, которая в норме экспрессирует белок CD3, или состоять из него. В качестве альтернативы «CD3, экспрессируемый на клеточной поверхности» может содержать белок CD3, экспрессируемый на поверхности клетки, которая в норме не экспрессирует CD3 человека на своей поверхности, но была искусственно сконструирована для экспрессии CD3 на своей поверхности, или состоять из него.
[0065] Используемое в данном документе выражение «PSMA» относится к простатспецифическому мембранному антигену, также известному как фолатгидролаза 1 (FOLH1). PSMA представляет собой интегральный, неслущивающийся мембранный гликопротеин, который на высоком уровне экспрессируется в эпителиальных клетках предстательной железы и является маркером клеточной поверхности при раке предстательной железы. PSMA представляет собой привлекательную мишень клеточной поверхности для злокачественных новообразований на поздних стадиях. Он также экспрессируется на новообразованных сосудах при типах светлоклеточной карциномы почки, типах рака мочевого пузыря, толстой кишки и молочной железы.
[0066] Используемое в данном документе выражение «4-1ВВ», также известное как CD 137, относится к индуцированной активацией костимулирующей молекуле. 4-1ВВ представляет собой важный регулятор иммунных ответов и является представителем суперсемейства рецепторов TNF. Выражение «агонист 4-1ВВ» означает любой лиганд, который связывает 4-1ВВ и активирует рецептор. Иллюстративные агонисты 4-1ВВ включают урелумаб (BMS-663513) и утомилумаб (PF-05082566), а также коммерчески доступные антитела к 4-1ВВ мыши. Кроме того, термин «агонист 4-1ВВ» относится к любой молекуле, которая частично или полностью стимулирует, индуцирует, увеличивает и/или активирует биологическую активность 4-1ВВ. Подходящие агонистические молекулы, в частности, включают агонистические антитела или фрагменты антител, в том числе биспецифические антитела, например, биспецифическое антитело, содержащее одно плечо, которое связывает 4-1ВВ на иммунной клетке, и другое плечо, которое связывается, например, с антигеном на опухолевой мишени. Термин также включает фрагменты или варианты аминокислотной последовательности нативных полипептидов, пептидов, антисмысловых олигонуклеотидов, малых органических молекул и т.д. В некоторых вариантах осуществления активация в присутствии агониста происходит дозозависимым образом. В некоторых вариантах осуществления измеренный сигнал (например, биологическая активность) на по меньшей мере приблизительно 5%, по меньшей мере приблизительно 10%, по меньшей мере приблизительно 15%, по меньшей мере приблизительно 20%, по меньшей мере приблизительно 25%, по меньшей мере приблизительно 30%, по меньшей мере приблизительно 35%, по меньшей мере приблизительно 40%, по меньшей мере приблизительно 45%, по меньшей мере приблизительно 50%, по меньшей мере приблизительно 55%, по меньшей мере приблизительно 60%, по меньшей мере приблизительно 65%, по меньшей мере приблизительно 70%, по меньшей мере приблизительно 75%, по меньшей мере приблизительно 80%, по меньшей мере приблизительно 85%, по меньшей мере приблизительно 90%, по меньшей мере приблизительно 95% или по меньшей мере приблизительно 100% превышает сигнал, измеренный при использовании отрицательного контроля в сопоставимых условиях. Эффективность агониста также можно определить с применением функциональных анализов, таких как способность агониста активировать или стимулировать функцию полипептида. Например, функциональный анализ может предусматривать приведение полипептида в контакт с агонистической молекулой-кандидатом и измерение обнаруживаемого изменения одной или более биологических активностей, в норме ассоциированных с полипептидом. Эффективность агониста обычно определяется его значением ЕС50 (концентрация, требуемая для активации 50% ответа с участием агониста). Чем ниже значение ЕС50, тем выше эффективность агониста и тем ниже концентрация, требуемая для активации максимального биологического ответа. Агонист 4-1ВВ может также включать молекулу, содержащую лиганд 4-1ВВ или фрагмент лиганда 4-1ВВ, например, биспецифическую молекулу, содержащую одно плечо, которое содержит 4-1BBL или его фрагмент, и другое плечо, которое связывается, например, с антигеном на опухоли. Эти фрагменты могут включать Fc-область.
[0067] Термин «антигенсвязывающая молекула» включает антитела и антигенсвязывающие фрагменты антител, в том числе, например, биспецифические антитела.
[0068] Используемый в данном документе термин «антитело» означает любую антигенсвязывающую молекулу или молекулярный комплекс, содержащие по меньшей мере одну определяющую комплементарность область (CDR), которая специфически связывается или взаимодействует с определенным антигеном (например, PSMA или CD3). Термин «антитело» включает молекулы иммуноглобулинов, содержащие четыре полипептидные цепи, две тяжелые (Н) цепи и две легкие (L) цепи, соединенные между собой дисульфидными связями, а также их мультимеры (например, IgM). Каждая тяжелая цепь содержит вариабельную область тяжелой цепи (сокращенно обозначаемую в данном документе как HCVR или VH) и константную область тяжелой цепи. Константный участок тяжелой цепи содержит три домена СН1, CH2 и СН3. Каждая легкая цепь содержит вариабельную область легкой цепи (сокращенно обозначаемую в данном документе как LCVR или VL) и константную область легкой цепи. Константная область легкой цепи содержит один домен (CL1). Области VH и VL могут быть дополнительно подразделены на области гипервариабельности, называемые определяющими комплементарность областями (CDR), чередующиеся с более консервативными областями, называемыми каркасными областями (FR). Каждая VH и VL состоит из трех CDR и четырех FR, расположенных от амино-конца к карбокси-концу в следующем порядке: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4. В различных вариантах осуществления, раскрытых в данном документе, FR антитела к PSMA или антитела к CD3 (или их антигенсвязывающей части), могут быть идентичны последовательностям зародышевой линии человека или могут быть модифицированы естественным или искусственным путем. Консенсусную аминокислотную последовательность можно определить на основании анализа на основе параллельного сравнения двух или более CDR.
[0069] Используемый в данном документе термин «антитело» также включает антигенсвязывающие фрагменты молекул полного антитела. Используемые в данном документе термины «антигенсвязывающая часть» антитела, «антигенсвязывающий фрагмент» антитела и т.п.включают любой встречающийся в природе, полученный ферментативным путем, синтетический или сконструированный с помощью методов генной инженерии полипептид или гликопротеин, которые специфически связывают антиген с образованием комплекса. Антигенсвязывающие фрагменты антитела могут быть получены, например, из молекул полного антитела с помощью любых подходящих стандартных методик, таких как протеолитическое расщепление или рекомбинантные технологии генной инженерии, включающие манипуляцию с ДНК, кодирующей вариабельные и необязательно константные домены антител, и ее экспрессию. Такая ДНК известна и/или легкодоступна, например, из коммерческих источников, библиотек ДНК (включая, например, фаговые библиотеки антител) или может быть синтезирована. ДНК можно секвенировать и с ней можно проводить химические манипуляции или манипуляции с применением методик молекулярной биологии, например, для расположения одного или более вариабельных и/или константных доменов в подходящей конфигурации или для введения кодонов, включения остатков цистеина, модификации, добавления или удаления аминокислот и т.д.
[0070] Неограничивающие примеры антигенсвязывающих фрагментов включают: (i) Fab-фрагменты; (ii) F(ab')2-фрагменты; (iii) Fd-фрагменты; (iv) Fv-фрагменты; (v) одноцепочечные молекулы Fv (scFv); (vi) dAb-фрагменты и (vii) минимальные распознающие единицы, состоящие из аминокислотных остатков, которые имитируют гипервариабельную область антитела (например, выделенная определяющая комплементарность область (CDR), такая как пептид CDR3), или пептид FR3-CDR3-FR4 с ограниченной конформационной свободой. Другие сконструированные молекулы, такие как домен-специфические антитела, однодоменные антитела, антитела с удаленным доменом, химерные антитела, антитела с привитой CDR, диатела, триатела, тетратела, минитела, нанотела (например, моновалентные нанотела, бивалентные нанотела и т.д.), иммунофармацевтические препараты на основе модульного белка небольшого размера (SMIP) и вариабельные домены IgNAR акулы, также охватываются выражением «антигенсвязывающий фрагмент», используемым в данном документе.
[0071] Антигенсвязывающий фрагмент антитела, как правило, будет содержать по меньшей мере один вариабельный домен. Вариабельный домен может быть любого размера или аминокислотного состава и обычно будет содержать по меньшей мере одну CDR, которая находится в смежном положении или в одной рамке считывания с одной или более каркасными последовательностями. В антигенсвязывающих фрагментах, содержащих домен VH, ассоциированный с доменом VL, домены VH и VL могут располагаться в любом подходящем порядке друг относительно друга. Например, вариабельная область может быть димерной и содержать димеры VH-VH, VH-VL или VL-VL. В качестве альтернативы антигенсвязывающий фрагмент антитела может содержать мономерный домен VH или VL.
[0072] В определенных вариантах осуществления антигенсвязывающий фрагмент антитела может содержать по меньшей мере один вариабельный домен, ковалентно связанный с по меньшей мере одним константным доменом. Неограничивающие иллюстративные конфигурации вариабельных и константных доменов, которые могут находиться в пределах антигенсвязывающего фрагмента антитела, применимого в данном документе, включают (i) VH-CH1; (ii) VH-CH2; (iii) VH-СН3; (iv) VH-CH1-CH2; (v) VH-CH1-CH2-CH3; (vi) VH-CH2-CH3; (vii) VH-CL; (viii) VL-CH1; (ix) VL-CH2; (x) VL-CH3; (xi) VL-CH1-CH2; (xii) VL-CH1-CH2-CH3; (xiii) VL-CH2-CH3 и (xiv) VL-CL. В любой конфигурации вариабельных и константных доменов, в том числе любой из иллюстративных конфигураций, перечисленных выше, вариабельные и константные домены могут быть либо непосредственно соединены друг с другом, либо могут быть соединены посредством целой шарнирной или линкерной области или ее части. Шарнирная область может состоять из по меньшей мере 2 (например, 5, 10, 15, 20, 40, 60 или больше) аминокислот, которые обеспечивают образование гибкой или полугибкой связи между смежными вариабельным и/или константным доменами в одной полипептидной молекуле. Более того, антигенсвязывающий фрагмент антитела, применимого в данном документе, может содержать гомодимер или гетеродимер (или другой мультимер) в любой из конфигураций вариабельного и константного доменов, изложенных выше, находящихся в нековалентной ассоциации друг с другом и/или с одним или более мономерными доменом VH или VL (например, с помощью дисульфидной связи(-ей)).
[0073] Как и в случае с молекулами полного антитела антигенсвязывающие фрагменты могут быть моноспецифическими или полиспецифическими (например, биспецифическими). Полиспецифический антигенсвязывающий фрагмент антитела, как правило, будет содержать по меньшей мере два различных вариабельных домена, где каждый вариабельный домен способен специфически связываться с отдельным антигеном или с другим эпитопом того же антигена. Любой формат полиспецифических антител, в том числе иллюстративные форматы биспецифических антител, раскрытые в данном документе, могут быть адаптированы для применения в рамках антигенсвязывающего фрагмента антитела, применимого в данном документе, с помощью традиционных методик, доступных в данной области техники.
[0074] Антитела, применимые в данном документе, могут функционировать посредством комплементзависимой цитотоксичности (CDC) или зависимой от антителозависимой опосредованной клетками цитотоксичности (ADCC). «Комплементзависимая цитотоксичность» (CDC) относится к лизису экспрессирующих антиген клеток с участием антитела, раскрытого в данном документе, в присутствии комплемента. «Антителозависимая опосредованная клетками цитотоксичность» (ADCC) относится к опосредованной клетками реакции, при которой неспецифические цитотоксические клетки, которые экспрессируют Fc-рецепторы (FcR) (например, натуральные клетки-киллеры (NK), нейтрофилы и макрофаги), распознают связанное антитело на клетке-мишени и за счет этого осуществляют лизис клетки-мишени. CDC и ADCC могут быть измерены с использованием анализов, которые хорошо известны и доступны в данной области техники (см., например, патенты США №№5500362 и 5821337, а также Clynes et al. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 95:652-656). Константная область антитела важна для способности антитела фиксировать комплемент и опосредовать клеточно-зависимую цитотоксичность. Таким образом, изотип антитела может быть выбран на основании того, необходимо ли, чтобы антитело опосредовало цитотоксичность.
[0075] В определенных вариантах осуществления биспецифические антитела к PSMA/CD3, применимые в данном документе, представляют собой человеческие антитела. Предусматривается, что используемый в данном документе термин «человеческое антитело» включает антитела, содержащие вариабельные и константные области, полученные из последовательностей иммуноглобулина зародышевой линии человека. Антитела человека могут содержать аминокислотные остатки, не кодируемые последовательностями иммуноглобулина зародышевой линии человека (например, мутации, введенные посредством случайного или сайт-специфического мутагенеза in vitro или посредством соматической мутации in vivo), например, в CDR и, в частности, CDR3. Однако подразумевается, что используемый в данном документе термин «человеческое антитело» не включает антитела, в которых последовательности CDR, полученные из зародышевой линии другого вида млекопитающих, например мыши, были привиты на человеческие каркасные последовательности.
[0076] В некоторых вариантах осуществления антитела, применимые в соответствии со способами, раскрытыми в данном документе, могут быть рекомбинантными человеческими антителами. Подразумевается, что используемый в данном документе термин «рекомбинантное человеческое антитело» включает все антитела человека, которые получают, экспрессируют, создают или выделяют посредством рекомбинантных способов, такие как антитела, экспрессируемые с применением рекомбинантного вектора экспрессии, трансфицированного в клетку-хозяина (дополнительно описанные ниже), антитела, выделяемые из рекомбинантной комбинаторной библиотеки человеческих антител (дополнительно описанные ниже), антитела, выделяемые из животного (например, мыши), которое является трансгенным по генам иммуноглобулинов человека (см., например, Taylor et al. (1992) Nucl. Acids Res. 20:6287-6295), или антитела, получаемые, экспрессируемые, создаваемые или выделяемые посредством любых других способов, которые включают сплайсинг последовательностей генов иммуноглобулинов человека с другими последовательностями ДНК. Такие рекомбинантные человеческие антитела содержат вариабельные и константные области, полученные из последовательностей иммуноглобулина зародышевой линии человека. Однако в определенных вариантах осуществления такие рекомбинантные человеческие антитела подвергают мутагенезу in vitro (или, если используют животное, трансгенное по последовательностям Ig человека, соматическому мутагенезу in vivo) и, таким образом, аминокислотные последовательности областей VH и VL рекомбинантных антител представляют собой последовательности, которые, хотя и получены из последовательностей VH и VL зародышевой линии человека и родственны им, могут не существовать в природе в репертуаре антител зародышевой линии человека in vivo.
[0077] Человеческие антитела могут существовать в двух формах, которые ассоциированы с гетерогенностью шарнира. В одной форме молекула иммуноглобулина содержит стабильную конструкцию из четырех цепей размером приблизительно 150-160 кДа, в которой димеры удерживаются вместе межцепочечной дисульфидной связью при тяжелых цепях. Во второй форме димеры не связаны межцепочечными дисульфидными связями, и образуется молекула размером приблизительно 75-80 кДа, состоящая из соединенных ковалентной связью легкой и тяжелой цепей (полуантитело). Эти формы было чрезвычайно трудно разделить даже после аффинной очистки.
[0078] Частота появления второй формы в различных изотипах интактного IgG обусловлена без ограничения структурными различиями, ассоциированными с изотипом шарнирного участка антитела. Одна аминокислотная замена в шарнирном участке шарнира IgG4 человека может значительно снизить частоту появления второй формы (Angal et al. (1993) Molecular Immunology 30:105) до уровней, как правило, наблюдаемых при использовании шарнира IgG1 человека. Настоящее изобретение охватывает антитела, содержащие одну или более мутаций в шарнире, области СН2 или CH3, которые могут быть необходимы, например, при получении, для обеспечения улучшения выхода необходимой формы антитела.
[0079] Антитела, применимые в данном документе, могут представлять собой выделенные антитела. Используемый в данном документе термин «выделенное антитело» означает антитело, которое было идентифицировано и отделено от по меньшей мере одного компонента его природного окружения и/или извлечено из такового. Например, антитело, которое было отделено или удалено от по меньшей мере одного компонента из организма, или из ткани или клетки, в которых антитело существует или продуцируется естественным путем, является «выделенным антителом» для целей настоящего изобретения. Выделенное антитело также включает антитело in situ в пределах рекомбинантной клетки. Выделенные антитела представляют собой антитела, которые были подвергнуты по меньшей мере одной стадии очистки или выделения. В соответствии с определенными вариантами осуществления выделенное антитело может по сути не содержать другой клеточный материал и/или химические вещества.
[0080] Антитела к PSMA и биспецифические антитела к PSMA/CD3, применимые в соответствии со способами, раскрытыми в данном документе, могут содержать одну или более аминокислотных замен, вставок и/или делеций в каркасных областях и/или областях CDR вариабельных доменов тяжелой и легкой цепей по сравнению с соответствующими последовательностями зародышевой линии, из которых были получены антитела. Такие мутации можно легко определить путем сравнения аминокислотных последовательностей, раскрытых в данном документе, с последовательностями зародышевой линии, доступными, например, из общедоступных баз данных последовательностей антител. Настоящее изобретение включает антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, которые получены из любых аминокислотных последовательностей, раскрытых в данном документе, где одна или более аминокислот в пределах одной или более каркасных областей и/или областей CDR мутированы с получением соответствующего(-их) остатка(-ов) из последовательности зародышевой линии, из которой получено антитело, или с получением соответствующего(-их) остатка(-ов) из другой последовательности зародышевой линии человека, или с получением консервативной аминокислотной замены из соответствующего(-их) остатка(-ов) зародышевой линии (такие изменения последовательности в данном документе в совокупности обозначаются как «мутации зародышевой линии»). Специалист средней квалификации в данной области техники, беря за основу раскрытые в данном документе последовательности вариабельных областей тяжелой и легкой цепей, легко может получить многочисленные антитела и антигенсвязывающие фрагменты, которые содержат одну или более отдельных мутаций зародышевой линии или их комбинации. В определенных вариантах осуществления все остатки из каркасного области и/или CDR в доменах VH и/или VL подвергнуты обратной мутации с получением остатков, встречающихся в исходной последовательности зародышевой линии, из которой было получено антитело. В других вариантах осуществления только определенные остатки подвергнуты обратной мутации с получением исходной последовательности зародышевой линии, например, мутации подвергнуты только остатки, находящиеся в пределах первых 8 аминокислот FR1 или в пределах последних 8 аминокислот FR4, или мутации подвергнуты только остатки, находящиеся в пределах CDR1, CDR2 или CDR3. В других вариантах осуществления один или более остатков из каркасной области и/или CDR подвергнуты мутации с получением соответствующего(-их) остатка(-ов) из другой последовательности зародышевой линии (т.е. последовательности зародышевой линии, которая отличается от последовательности зародышевой линии, из которой исходно было получено антитело). Кроме того, антитела, применимые в данном документе, могут содержать любую комбинацию из двух или более мутаций зародышевой линии в пределах каркасных областей и/или областей CDR, например, где определенные отдельные остатки подвергнуты мутации с получением соответствующего остатка из конкретной последовательности зародышевой линии, при этом определенные другие остатки, которые отличаются от исходной последовательности зародышевой линии, сохраняют или подвергают мутации с получением соответствующего остатка из другой последовательности зародышевой линии. После получения антитела и антигенсвязывающие фрагменты, которые содержат одну или более мутаций зародышевой линии, можно легко протестировать в отношении одного или более необходимых свойств, таких как улучшенная специфичность связывания, повышенная аффинность связывания, улучшенные или усиленные антагонистические или агонистические биологические свойства (в случае необходимости), сниженная иммуногенность и т.п. Настоящее изобретение охватывает антитела и антигенсвязывающие фрагменты, полученные с помощью этого общего способа.
[0081] В соответствии со способами, представленными в данном документе, применимы антитела к PSMA/CD3, содержащие варианты любой из раскрытых в данном документе аминокислотных последовательностей HCVR, LCVR и/или CDR, имеющие одну или более консервативных замен. Например, настоящее изобретение включает антитела к PSMA/CD3, содержащие аминокислотные последовательности HCVR, LCVR и/или CDR, например, с 10 или меньше, 8 или меньше, 6 или меньше, 4 или меньше и т.д. консервативными аминокислотными заменами по сравнению с любой из аминокислотных последовательностей HCVR или LCVR, изложенных в таблице 1 в данном документе.
[0082] Термин «эпитоп» относится к антигенной детерминанте, которая взаимодействует со специфическим антигенсвязывающим сайтом в вариабельной области молекулы антитела, известным как паратоп. Один антиген может содержать более чем один эпитоп. Таким образом, различные антитела могут связываться с различными зонами на антигене и могут оказывать различные биологические эффекты. Эпитопы могут быть конформационными или линейными. Конформационный эпитоп образуют аминокислоты из разных сегментов линейной полипептидной цепи, располагающиеся рядом в пространстве. Линейный эпитоп представляет собой эпитоп, образуемый смежными аминокислотными остатками в полипептидной цепи. В определенных обстоятельствах эпитоп может содержать фрагменты сахаридов, фосфорильные группы или сульфонильные группы на антигене.
[0083] Термин «идентичность по сути» или «по сути идентичный» по отношению к нуклеиновой кислоте или ее фрагменту указывает на то, что при оптимальном выравнивании с учетом соответствующих нуклеотидных вставок или делеций с другой последовательностью нуклеиновой кислоты (или ее комплементарной нитью) идентичность нуклеотидной последовательности составляет по меньшей мере приблизительно 95% и более предпочтительно по меньшей мере приблизительно 96%, 97%, 98% или 99% нуклеотидных оснований, как измерено с помощью хорошо известного алгоритма определения идентичности последовательностей, такого как FASTA, BLAST или Gap, как обсуждается ниже. Молекула нуклеиновой кислоты, которая по сути идентична молекуле эталонной нуклеиновой кислоты, в определенных случаях может кодировать полипептид, имеющий такую же или по сути сходную аминокислотную последовательность, что и полипептид, кодируемый молекулой эталонной нуклеиновой кислоты.
[0084] Применительно к полипептидам термин «сходство по сути» или «по сути сходный» означает, что две пептидные последовательности при оптимальном выравнивании, как, например, с помощью программ GAP или BESTFIT, с применением значений штрафа за открытие гэпа по умолчанию, характеризуются по меньшей мере 95% идентичностью последовательности, еще более предпочтительно по меньшей мере 98% или 99% идентичностью последовательности. Предпочтительно, положения остатков, не являющихся идентичными, отличаются консервативными аминокислотными заменами. «Консервативная аминокислотная замена» представляет собой замену, при которой аминокислотный остаток заменен другим аминокислотным остатком, содержащим боковую цепь (R-группу) со сходными химическими свойствами (например, зарядом или гидрофобностью). В целом, консервативная аминокислотная замена по сути не будет изменять функциональные свойства белка. В случаях, если две или более аминокислотные последовательности отличаются друг от друга консервативными заменами, процентную идентичность последовательности или степень сходства можно регулировать в сторону повышения для коррекции консервативного характера замены. Средства для осуществления такой коррекции хорошо известны специалистам в данной области техники. См., например, Pearson (1994) Methods Mol. Biol. 24: 307-331, которая включена в данный документ посредством ссылки. Примеры групп аминокислот, которые содержат боковые цепи со сходными химическими свойствами, включают: (1) алифатические боковые цепи: глицин, аланин, валин, лейцин и изолейцин; (2) алифатические боковые цепи с гидроксильными группами: серии и треонин; (3) амид-содержащие боковые цепи: аспарагин и глутамин; (4) ароматические боковые цепи: фенилаланин, тирозин и триптофан; (5) основные боковые цепи: лизин, аргинин и гистидин; (6) кислые боковые цепи: аспартат и глутамат и (7) серосодержащие боковые цепи: цистеин и метионин. Предпочтительными группами консервативных аминокислотных замен являются валин-лейцин-изолейцин, фенилаланин-тирозин, лизин-аргинин, аланин-валин, глутамат-аспартат и аспарагин-глутамин. В качестве альтернативы консервативным замещением является любое изменение, имеющее положительное значение в матрице логарифмической функции правдоподобия РАМ250, раскрытой в Gonnet et al. (1992) Science 256: 1443 1445, которая включена в данный документ посредством ссылки. «Умеренно консервативным» замещением является любое изменение, имеющее неотрицательное значение в матрице логарифмической функции правдоподобия РАМ250.
[0085] Для полипептидов сходство последовательностей, которое также называют идентичностью последовательностей, как правило, измеряют с помощью программного обеспечения для анализа последовательностей. Программное обеспечение для анализа белков сопоставляет сходные последовательности с применением показателей сходства, присваиваемых различным заменам, делециям и другим модификациям, в том числе консервативным аминокислотным заменам. Например, программный пакет GCG включает программы, такие как Gap и Bestfit, которые можно применять с параметрами по умолчанию для определения степени гомологии последовательностей или идентичности последовательностей между близкородственными полипептидами, такими как гомологичные полипептиды от различных видов организмов, или между белком дикого типа и его мутеином. См., например, GCG версии 6.1. Полипептидные последовательности также можно сравнивать с помощью FASTA с применением параметров по умолчанию или рекомендованных параметров; программа в GCG версии 6.1. FASTA (например, FASTA2 и FASTA3) обеспечивает выравнивания и расчет процента идентичности последовательности в областях наибольшего перекрывания между последовательностями запроса и поиска (Pearson (2000), выше). Другим предпочтительным алгоритмом при сравнении последовательности, раскрытой в данном документе, с базой данных, содержащей большое количество последовательностей от разных организмов, является компьютерная программа BLAST, в частности BLASTP или TBLASTN, с использованием параметров по умолчанию. См., например, Altschul et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:403-110 и Altschul et al. (1997) Nucleic Acids Res. 25:3389-402, каждая из которых включена в данный документ посредством ссылки.
Варианты последовательности
[0086] Биспецифические антитела, применимые в данном документе, содержат одну или более аминокислотных замен, вставок и/или делеций в каркасных областях и/или областях CDR вариабельных доменов тяжелой цепи по сравнению с соответствующими последовательностями зародышевой линии, из которых были получены антитела.
[0087] Также в данном документе применимы антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, которые получены из любых аминокислотных последовательностей, раскрытых в данном документе, где одна или более аминокислот в пределах одной или более каркасных областей и/или областей CDR подвергнуты мутации с получением соответствующего(-их) остатка(-ов) из последовательности зародышевой линии, из которой получено антитело, или с получением соответствующего(-их) остатка(-ов) из другой последовательности зародышевой линии человека, или с получением консервативной аминокислотной замены из соответствующего(-их) остатка(-ов) зародышевой линии (такие изменения последовательностей обозначаются в данном документе в совокупности как «мутации зародышевой линии»).
[0088] Кроме того, антитела, применимые в данном документе, могут содержать любую комбинацию из двух или более мутаций зародышевой линии в пределах каркасных областей и/или областей CDR, например, где определенные отдельные остатки подвергнуты мутации с получением соответствующего остатка из конкретной последовательности зародышевой линии, при этом определенные другие остатки, которые отличаются от исходной последовательности зародышевой линии, сохраняют или подвергают мутации с получением соответствующего остатка из другой последовательности зародышевой линии. После получения антитела и антигенсвязывающие фрагменты, которые содержат одну или более мутаций зародышевой линии, можно протестировать в отношении одного или более необходимых свойств, таких как улучшенная специфичность связывания, слабая или сниженная аффинность связывания, улучшенные или усиленные фармакокинетические свойства, сниженная иммуногенность и т.д. Антитела и антигенсвязывающие фрагменты, полученные с помощью этого общего способа с учетом инструкций из настоящего изобретения, охватываются настоящим изобретением.
[0089] В соответствии с настоящим изобретением применимы биспецифические антитела, содержащие варианты любой из раскрытых в данном документе аминокислотных последовательностей HCVR или LCVR, имеющие одну или более консервативных замен. Антитела и биспецифические антигенсвязывающие молекулы, применимые в данном документе, содержат одну или более аминокислотных замен, вставок и/или делеций в каркасных областях и/или областях CDR HCVR и LCVR по сравнению с соответствующими последовательностями зародышевой линии, из которых были получены отдельные антигенсвязывающие домены, при одновременном сохранении или улучшении необходимых антигенсвязывающих характеристик. «Консервативная аминокислотная замена» представляет собой замену, при которой аминокислотный остаток заменен другим аминокислотным остатком, содержащим боковую цепь (R-группу) со сходными химическими свойствами (например, зарядом или гидрофобностью). В целом, консервативная аминокислотная замена по сути не будет изменять функциональные свойства белка. Примеры групп аминокислот, которые содержат боковые цепи со сходными химическими свойствами, включают: (1) алифатические боковые цепи: глицин, аланин, валин, лейцин и изолейцин; (2) алифатические боковые цепи с гидроксильными группами: серии и треонин; (3) амид-содержащие боковые цепи: аспарагин и глутамин; (4) ароматические боковые цепи: фенилаланин, тирозин и триптофан; (5) основные боковые цепи: лизин, аргинин и гистидин; (6) кислые боковые цепи: аспартат и глутамат и (7) серосодержащие боковые цепи: цистеин и метионин. Предпочтительными группами консервативных аминокислотных замен являются валин-лейцин-изолейцин, фенилаланин-тирозин, лизин-аргинин, аланин-валин, глутамат-аспартат и аспарагин-глутамин. В качестве альтернативы консервативным замещением является любое изменение, имеющее положительное значение в матрице логарифмической функции правдоподобия РАМ250, раскрытой в Gonnet et al. (1992) Science 256: 1443-1445. «Умеренно консервативным» замещением является любое изменение, имеющее неотрицательное значение в матрице логарифмической функции правдоподобия РАМ250.
[0090] Настоящее изобретение также включает антигенсвязывающие молекулы, содержащие антигенсвязывающий домен с аминокислотной последовательностью HCVR и/или CDR, которая по сути идентична любой из аминокислотных последовательностей HCVR и/или CDR, раскрытых в данном документе, при одновременном сохранении или улучшении необходимой аффинности к антигену. Термин «идентичность по сути» или «по сути идентичный» по отношению к аминокислотной последовательности означает, что две аминокислотные последовательности при оптимальном выравнивании, как, например, с помощью программ GAP или BESTFIT с применением значений штрафа за открытие гэпа по умолчанию, характеризуются по меньшей мере 95% идентичностью последовательности, еще более предпочтительно по меньшей мере 98% или 99% идентичностью последовательности. Предпочтительно, положения остатков, не являющихся идентичными, отличаются консервативными аминокислотными заменами. В случаях, если две или более аминокислотные последовательности отличаются друг от друга консервативными заменами, процентную идентичность последовательности или степень сходства можно регулировать в сторону повышения для коррекции консервативного характера замены. Средства для осуществления такой коррекции хорошо известны специалистам в данной области техники. См., например, Pearson (1994) Methods Mol. Biol. 24. 307-331.
[0091] Для полипептидов сходство последовательностей, которое также называют идентичностью последовательностей, как правило, измеряют с помощью программного обеспечения для анализа последовательностей. Программное обеспечение для анализа белков сопоставляет сходные последовательности с применением показателей сходства, присваиваемых различным заменам, делециям и другим модификациям, в том числе консервативным аминокислотным заменам. Например, программный пакет GCG включает программы, такие как Gap и Bestfit, которые можно применять с параметрами по умолчанию для определения степени гомологии последовательностей или идентичности последовательностей между близкородственными полипептидами, такими как гомологичные полипептиды от различных видов организмов, или между белком дикого типа и его мутеином. См., например, GCG версии 6.1. Полипептидные последовательности также можно сравнивать с помощью FASTA с применением параметров по умолчанию или рекомендованных параметров; программа в GCG версии 6.1. FASTA (например, FASTA2 и FASTA3) обеспечивает выравнивания и расчет процента идентичности последовательности в областях наибольшего перекрывания между последовательностями запроса и поиска (Pearson (2000), выше). Другим предпочтительным алгоритмом при сравнении последовательности, раскрытой в данном документе, с базой данных, содержащей большое количество последовательностей от разных организмов, является компьютерная программа BLAST, в частности BLASTP или TBLASTN, с использованием параметров по умолчанию. См., например, Altschul et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:403^110 и Altschul et al. (1997) Nucleic Acids Res. 25:3389^102.
[0092] После получения антигенсвязывающие домены, которые содержат одну или более мутаций зародышевой линии, тестировали в отношении уменьшенной аффинности связывания с использованием одного или более анализов in vitro. Хотя антитела, которые распознают конкретный антиген, как правило, проходят скрининг с точки зрения тестирования в отношении высокой (т.е. сильной) аффинности связывания с антигеном, антитела, применимые в данном документе, демонстрируют слабое связывание или отсутствие обнаруживаемого связывания. Биспецифические антигенсвязывающие молекулы, содержащие один или несколько антигенсвязывающих доменов, полученных таким общим способом, также охватываются настоящим изобретением и, как было обнаружено, приносят пользу в качестве средств терапии опухолей на основе авидности.
[0093] С помощью описанных в данном документе способов могут быть реализованы неожиданные преимущества, например улучшенные фармакокинетические свойства и низкая токсичность для пациента.
Связывающие свойства антител
[0094] Используемый в данном документе термин «связывание» в контексте связывания антитела, иммуноглобулина, связывающего фрагмента антитела или Fc-содержащего белка с любым, например, заранее определенным антигеном, таким как белок клеточной поверхности или его фрагмент, как правило, относится к взаимодействию или ассоциации между минимум двумя объектами или молекулярными структурами, таким как взаимодействие антитело-антиген.
[0095] Например, аффинность связывания, как правило, соответствует значению KD, составляющему приблизительно 10-7М или меньше, как, например, приблизительно 10-8М или меньше, как, например, приблизительно 10-9 М или меньше, при определении, например, с помощью технологии поверхностного плазмонного резонанса (SPR) в приборе BIAcore 3000 с использованием антигена в качестве лиганда и антитела, Ig, связывающего фрагмента антитела или Fc-содержащего белка в качестве аналита (или антилиганда). Традиционно также используются стратегии связывания на основе клеток, такие как анализы связывания с сортировкой флуоресцентно-активируемых клеток (FACS), и данные, полученные в FACS, хорошо коррелируют с другими методами, такими как конкурентное связывание лигандов с радиоактивной меткой и SPR (Benedict, СА, J Immunol Methods. 1997, 201(2):223-31; Geuijen, СА, et al. J Immunol Methods. 2005, 302(l-2):68-77).
[0096] Соответственно, антитело или антигенсвязывающий белок, раскрытые в данном документе, связываются с заранее определенным антигеном или молекулой (рецептором) клеточной поверхности, с аффинностью, соответствующей значению KD, которое в по меньшей мере десять раз ниже, чем его аффинность связывания с неспецифическим антигеном (например, BSA, казеином). В соответствии с настоящим изобретением аффинность антитела, соответствующая значению KD, которое равно или в менее чем десять раз ниже, чем значение для неспецифического антигена, может считаться необнаруживаемым связыванием, однако такое антитело можно спаривать со вторым антиген связывающим плечом для получения биспецифического антитела, раскрытого в данном документе.
[0097] Термин «KD» (М) относится к равновесной константе диссоциации конкретного взаимодействия антитело-антиген или равновесной константе диссоциации связывания антитела или связывающего фрагмента антитела с антигеном. Между KD и аффинностью связывания существует обратная зависимость, следовательно, чем меньше значение KD, тем выше, т.е. сильнее, аффинность. Таким образом, термины «более высокая аффинность» или «более сильная аффинность» относятся к более высокой способности вступать во взаимодействие и, следовательно, к меньшему значению KD, и, наоборот, термины «более низкая аффинность» или «более слабая аффинность» относятся к более низкой способности вступать во взаимодействие и, следовательно, большему значении KD. В некоторых случаях более высокая аффинность связывания (или KD) конкретной молекулы (например, антитела) с ее молекулой-партнером по взаимодействию (например, антигеном X) по сравнению с аффинностью связывания молекулы (например, антитела) с другой молекулой-партнером по взаимодействию (например, антигеном Y) может быть выражена как отношение связывания, определяемое путем деления большего значения KD (более низкая или более слабая аффинность) на меньшее KD (более высокая или более сильная аффинность), например, выраженное как аффинность связывания в 5 раз или 10 раз больше, в зависимости от обстоятельств.
[0098] Термин «kd» (сек -1 или 1/с) относится к константе скорости диссоциации конкретного взаимодействия антитело-антиген или константе скорости диссоциации связывания антитела или связывающего фрагмента антитела. Указанное значение также обозначается как значение koff.
[0099] Термин «ka» (М-1 х сек-1 или 1/М) относится к константе скорости ассоциации конкретного взаимодействия антитело-антиген или константе скорости ассоциации связывания антитела или связывающего фрагмента антитела.
[00100] Термин «КА» (М-1 или 1/М) относится к равновесной константе ассоциации конкретного взаимодействия антитело-антиген или равновесной константе скорости ассоциации связывания антитела или связывающего фрагмента антитела. Равновесную константу ассоциации получают путем деления ka на kd.
[00101] Термин «ЕС50» или «ЕС50» относится к полумаксимальной эффективной концентрации, которая включает концентрацию антитела, которая вызывает половинный ответ между исходным уровнем и максимумом после указанного времени воздействия. ЕС50 фактически представляет концентрацию антитела, при которой наблюдается 50% от его максимального эффекта. В некоторых вариантах осуществления значение ЕС50 равно концентрации антитела, раскрытого в данном документе, которая дает полумаксимальное связывание с клетками, экспрессирующими CD3 или опухолеассоциированный антиген, как определено, например, с помощью анализа связывания FACS. Таким образом, сниженное или более слабое связывание наблюдается при повышенном значении ЕС50 или полумаксимальной эффективной концентрации.
[00102] В одном варианте осуществления уменьшенное связывание можно определить как повышение концентрации антитела ЕС50, которая обеспечивает связывание с полумаксимальным количеством целевых клеток.
[00103] В другом варианте осуществления значение ЕС50 представляет концентрацию антитела, которая вызывает полумаксимальное истощение целевых клеток за счет цитотоксической активности Т-клеток. Таким образом, повышенная цитотоксическая активность (например, опосредованное Т-клетками уничтожение опухолевых клеток) наблюдается при уменьшенном значении ЕС50 или полумаксимальной эффективной концентрации.
Биспецифические антигенсвязывающие молекулы
[00104] Используемые в данном документе антитела могут быть моноспецифическими, биспецифическими или полиспецифическими. Полиспецифические антитела могут быть специфичными к разным эпитопам одного целевого полипептида или могут содержать антигенсвязывающие домены, специфические в отношении более чем одного целевого полипептида. См., например, Tutt et al., 1991, J. Immunol. 147:60-69; Kufer et al, 2004, Trends Biotechnol. 22:238-244. Биспецифические антитела к PSMA/CD3, применимые в данном документе, могут быть связаны или экспрессированы совместно с другой функциональной молекулой, например, с другим пептидом или белком. Например, антитело или его фрагмент могут быть функционально соединены (например, посредством образования химической связи, генетического слияния, нековалентной ассоциации или иным образом) с одним или более другими молекулярными объектами, такими как другое антитело или фрагмент антитела, с получением биспецифического или полиспецифического антитела со второй или дополнительной специфичностью связывания.
[00105] Подразумевается, что использование выражения «антитело к CD3» или «антитело к PSMA» включает как моноспецифические антитела к CD3 или антитела к PSMA, так и биспецифические антитела, содержащие CD3-связывающее плечо и PSMA-связывающее плечо. Таким образом, настоящее описание включает моноспецифические антитела, которые связывают PSMA, например, антитела к PSMA, описанные в патенте США №10179819. Иллюстративные антитела к PSMA включают антитело H1H11810P и антитела, содержащие CDR в пределах антитела Н1Н11810, раскрытом в патенте США №10179819. Кроме того, настоящее изобретение включает биспецифические антитела, в которых одно плечо иммуноглобулина связывает CD3 человека, а другое плечо иммуноглобулина является специфическим в отношении PSMA человека. Иллюстративные последовательности биспецифического антитела, применимого в соответствии со способами, представленными в данном документе, показаны в таблице 1.
[00106] В определенных вариантах осуществления CD3-связывающее плечо связывается с CD3 человека и индуцирует активацию человеческих Т-клеток. В определенных вариантах осуществления CD3-связывающее плечо слабо связывается с CD3 человека и индуцирует активацию человеческих Т-клеток. В других вариантах осуществления CD3-связывающее плечо слабо связывается с CD3 человека и индуцирует уничтожение клеток, экспрессирующих опухолеассоциированных антиген, в рамках биспецифического или полиспецифического антитела. В других вариантах осуществления CD3-связывающее плечо связывается или слабо ассоциирует с CD3 человека и яванского макака (обезьяны), при этом связывающее взаимодействие не обнаруживается с помощью анализов in vitro, известных в данной области техники.
[00107] В соответствии с определенными иллюстративными вариантами осуществления настоящее изобретение включает биспецифические антигенсвязывающие молекулы, которые специфически связывают CD3 и PSMA. Такие молекулы могут обозначаться в данном документе, например, как «биспецифические молекулы к CD3/PSMA», или «биспецифические молекулы к CD3xPSMA» или «CD3xPSMA» или с помощью других аналогичных терминов (например, биспецифические молекулы к PSMA/CD3).
[00108] Используемый в данном документе термин «PSMA» относится к белку PSMA человека, если не указано, что он принадлежит к отличному от человека виду (например, «PSMA мыши», «PSMA обезьяны» и т.д.).
[00109] Вышеупомянутые биспецифические антигенсвязывающие молекулы, которые специфически связывают CD3 и PSMA, могут содержать антигенсвязывающую молекулу к CD3, которая связывается с CD3 со слабой аффинностью связывания, как, например, проявляет KD, составляющую более приблизительно 40 нМ, как измерено посредством анализа аффинного связывания in vitro.
[00110] Используемое в данном документе выражение «антигенсвязывающая молекула» означает белок, полипептид или молекулярный комплекс, содержащий или состоящий из по меньшей мере одной определяющей комплементарность области (CDR), которая отдельно или в комбинации с одной или более дополнительными CDR и/или каркасными областями (FR), специфически связывается с конкретным антигеном. В определенных вариантах осуществления антигенсвязывающая молекула представляет собой антитело или фрагмент антитела в том качестве, как эти термины определены в другом разделе в данном документе.
[00111] Используемое в данном документе выражение «биспецифическая антигенсвязывающая молекула» означает белок, полипептид или молекулярный комплекс, содержащий по меньшей мере первый антигенсвязывающий домен и второй антигенсвязывающий домен. Каждый антигенсвязывающий домен в пределах биспецифической антигенсвязывающей молекулы содержит по меньшей мере одну CDR, которая отдельно или в комбинации с одной или более дополнительными CDR и/или FR специфически связывается с конкретным антигеном. В контексте настоящего изобретения первый антигенсвязывающий домен специфически связывает первый антиген (например, CD3), а второй антигенсвязывающий домен специфически связывает второй, отдельный антиген (например, PSMA).
[00112] В определенных иллюстративных вариантах осуществления биспецифическая антигенсвязывающая молекула представляет собой биспецифическое антитело. Каждый антигенсвязывающий домен биспецифического антитела содержит вариабельный домен тяжелой цепи (HCVR) и вариабельный домен легкой цепи (LCVR). В рамках биспецифической антигенсвязывающей молекулы, содержащей первый и второй антигенсвязывающий домен (например, биспецифического антитела), CDR первого антигенсвязывающего домена могут обозначаться с помощью префикса «А1», a CDR второго антигенсвязывающего домена могут обозначаться с помощью префикса «А2». Таким образом, CDR первого антигенсвязывающего домена могут обозначаться в данном документе как А1-HCDR1, A1-HCDR2 и A1-HCDR3; a CDR второго антигенсвязывающего домена могут обозначаться в данном документе как A2-HCDR1, A2-HCDR2 и A2-HCDR3.
[00113] Первый антигенсвязывающий домен и второй антигенсвязывающий домен могут быть прямо или опосредованно соединены друг с другом с образованием биспецифической антигенсвязывающей молекулы, применимой в данном документе. В качестве альтернативы каждый из первого антигенсвязывающего домена и второго антигенсвязывающего домена могут быть соединены с отдельным доменом мультимеризации. Ассоциация одного домена мультимеризации с другим доменом мультимеризации облегчает ассоциацию между двумя антигенсвязывающими доменами, за счет чего образуется биспецифическая антигенсвязывающая молекула. Используемый в данном документе «домен мультимеризации» подразумевает любую макромолекулу, белок, полипептид, пептид или аминокислоту, которые характеризуются способностью ассоциировать с вторым доменом мультимеризации с такой же или подобной структурой или составом. Например, домен мультимеризации может представлять собой полипептид, содержащий домен СН3 иммуноглобулина. Неограничивающим примером компонента мультимеризации является Fc-часть иммуноглобулина (содержащая домен CH2-СН3), например, Fc-домен IgG, выбранного из изотипов IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4, а также любого аллотипа в пределах каждой изотипической группы.
[00114] Биспецифические антигенсвязывающие молекулы, применимые в данном документе, как правило, содержат два домена мультимеризации, например, два Fc-домена, каждый из которых по отдельности является частью отдельной тяжелой цепи антитела. Первый и второй домены мультимеризации могут относиться к одному и тому же изотипу IgG, такому как, например, IgG1/IgG1, IgG2/IgG2, IgG4/IgG4. В качестве альтернативы первый и второй домены мультимеризации могут относиться к разным изотипам IgG, таким как, например, IgG1/IgG2, IgG1/IgG4, IgG2/IgG4 и т.д.
[00115] В определенных вариантах осуществления домен мультимеризации представляет собой Fc-фрагмент или аминокислотную последовательность длиной от 1 до приблизительно 200 аминокислот, содержащую по меньшей мере один остаток цистеина. В других вариантах осуществления домен мультимеризации представляет собой остаток цистеина или короткий цистеинсодержащий пептид. Другие домены мультимеризации включают пептиды или полипептиды, содержащие лейциновую застежку, мотив спираль-петля или мотив суперспираль, или состоящие из них.
[00116] Любой формат биспецифического антитела или технологию можно использовать для получения биспецифических антигенсвязывающих молекул, применимых в данном документе. Например, антитело или его фрагмент, характеризующиеся первой антигенсвязывающей специфичностью, можно функционально связать (например, путем образования химического связи, генетического слияния, нековалентной ассоциации или иным образом) с одним или более другими молекулярными объектами, такими как другое антитело или фрагмент антитела, характеризующиеся второй антигенсвязывающей специфичностью, с получением биспецифической антигенсвязывающей молекулы. Конкретные иллюстративные биспецифические форматы, которые можно использовать в контексте настоящего изобретения, включают без ограничения, например, биспецифические форматы на основе scFv или диател, слияния IgG-scFv, двойной вариабельный домен (DVD)-Ig, квадрому, «выступы-в углубления», общую легкую цепь (например, общую легкую цепь со структурой «выступы-в-углубления» и т.п.), CrossMab, CrossFab, (SEED)-антитело, «лейциновую застежку», дуотело, IgG1/IgG2, Fab (DAF)-IgG двойного действия и биспецифические форматы Mab2 (обзор вышеизложенных форматов см., например, в Klein et al. 2012, mAbs 4:6, 1 11, и цитируемых в нем ссылках).
[00117] В контексте биспецифических антигенсвязывающих молекул, применимых в данном документе, домены мультимеризации, например, Fc-домены, могут содержать одно или более аминокислотных изменений (например, вставки, делеции или замены) по сравнению со встречающейся в природе версией Fc-домена дикого типа. Например, настоящее изобретение включает биспецифические антигенсвязывающие молекулы, содержащие одну или более модификаций в Fc-домене, которые приводят к получению модифицированного Fc-домена, характеризующегося модифицированным взаимодействием связывания (например, усиленным или ослабленным) между Fc и FcRn. В одном варианте осуществления биспецифическая антигенсвязывающая молекула содержит модификацию в области CH2 или СН3, где модификация увеличивает аффинность Fc-домена в отношении FcRn в кислой среде (например, в эндосоме, где рН находится в диапазоне от приблизительно 5,5 до приблизительно 6.0). Неограничивающие примеры таких модификаций Fc включают, например, модификацию в положении 250 (например, Е или Q); 250 и 428 (например, L или F); 252 (например, L/Y/F/W или Т), 254 (например, S или Т) и 256 (например, S/R/Q/E/D или Т), или модификацию в положении 428 и/или 433 (например, L/R/S/P/Q или K) и/или 434 (например, H/F или Y); или модификацию в положении 250 и/или 428, или модификацию в положении 307 или 308 (например, 308F, V308F) и 434. В одном варианте осуществления модификация включает модификацию 428L (например, M428L) и 434S (например, N434S); модификацию 428L, 2591 (например, V259I) и 308F (например, V308F); модификацию 433К (например, H433K) и 434 (например, 434Y); модификацию 252, 254 и 256 (например, 252Y, 254Т и 256Е); модификацию 250Q и 428L (например, T250Q и M428L) и модификацию 307 и/или 308 (например, 308F или 308Р).
[00118] В настоящее изобретение также включены биспецифические антигенсвязывающие молекулы, содержащие домен CH3 первого Ig и домен CH3 второго Ig, где домены CH3 первого и второй Ig отличаются друг от друга по меньшей мере одной аминокислотой, и где отличие в по меньшей мере одной аминокислоте снижает связывание биспецифического антитела с белком А по сравнению с биспецифическим антителом, в котором отсутствует аминокислотное отличие. В одном варианте осуществления домен CH3 первого Ig связывает белок А, а домен CH3 второго Ig содержит мутацию, которая ослабляет или устраняет связывание белка А, такую как модификация H95R (согласно нумерации экзонов IMGT; H435R согласно нумерации EU). Второй CH3 может дополнительно содержать модификацию Y96F (согласно IMGT; Y436F согласно EU). См., например, патент США №8586713.
Дополнительные модификации, которые могут встречаться в пределах второго CH3, включают: D16E, L18M, N44S, K52N, V57M и V82I (согласно IMGT; D356E, L358M, N384S, K392N, V397M и V422I согласно EU) в случае антител IgG1; N44S, K52N и V82I (IMGT; N384S, K392N и V422I согласно EU) в случае антител IgG2, а также Q15R, N44S, K52N, V57M, R69K, E79Q и V82I (согласно IMGT; Q355R, N384S, K392N, V397M, R409K, E419Q и V422I согласно EU) в случае антител IgG4.
[00119] В определенных вариантах осуществления Fc-домен может быть химерным, объединяющим последовательности Fc, полученные из более чем одного изотипа иммуноглобулина. Например, химерный Fc-домен может содержать часть или всю последовательность CH2, полученную из области CH2 IgG1 человека, IgG2 человека или IgG4 человека, и часть или всю последовательность CH3, полученную из IgG1 человека, IgG2 человека или IgG4 человека. Химерный Fc-домен также может содержать химерную шарнирную область. Например, химерный шарнир может содержать «верхнюю шарнирную» последовательность, полученную из шарнирной области IgG1 человека, IgG2 человека или IgG4 человека, в комбинации с «нижней шарнирной» последовательностью, полученной из шарнирной области IgG1 человека, IgG2 человека или IgG4 человека. Конкретный пример химерного Fc-домена, который может быть включен в любую из антигенсвязывающих молекул, изложенных в данном документе, содержит от N- к С-концу: [Сн1 IgG4] - [верхний шарнир IgG4] - [нижний шарнир IgG2] - [СН2 IgG4] - [СН3 IgG4]. Другой пример химерного Fc-домена, который может быть включен в любую из антигенсвязывающих молекул, изложенных в данном документе, содержит от N- к С-концу: [Сн1 IgG1] - [верхний шарнир IgG1] - [нижний шарнир IgG2] - [СН2 IgG4] - [СН3 IgG1]. Эти и другие примеры химерных Fc-доменов, которые могут быть включены в любую из антигенсвязывающих молекул, применимых в данном документе, описаны в публикации заявки на патент США 2014/0243504, опубликованной 28 августа 2014 г., которая включена в данный документ во всей своей полноте. Химерные Fc-домены, содержащие эти общие структурные схемы и их варианты, могут характеризоваться измененным связыванием с Fc-рецептором, что, в свою очередь, влияет на эффекторную функцию Fc.
рН-зависимое связывание
[00120] В настоящее изобретение включены антитела к PSMA и биспецифические антигенсвязывающие молекулы к CD3/PSMA с рН-зависимыми характеристиками связывания. Например, плечо к PSMA биспецифической антигенсвязывающей молекулы, применимой в данном документе, может демонстрировать сниженное связывание с PSMA при кислом рН по сравнению со связыванием при нейтральном рН. В качестве альтернативы биспецифические антигенсвязывающие молекулы к CD3/PSMA, применимые в данном документе, могут проявлять усиленное связывание с PSMA при кислом рН по сравнению со связыванием при нейтральном рН. Выражение «кислый рН» включает значения рН, составляющие менее приблизительно 6,2, например, приблизительно 6,0, 5,95, 5,9, 5,85, 5,8, 5,75, 5,7, 5,65, 5,6, 5,55, 5,5, 5,45, 5,4, 5,35, 5,3, 5,25, 5,2, 5,15, 5,1, 5,05, 5,0 или меньше. Используемое в данном документе выражение «нейтральный рН» означает рН, составляющий от приблизительно 7,0 до приблизительно 7,4. Выражение «нейтральный рН» включает значения рН, составляющие приблизительно 7,0, 7,05, 7,1, 7,15, 7,2, 7,25, 7,3, 7,35 и 7,4.
[00121] В некоторых случаях «сниженное связывание … при кислом рН по сравнению со связыванием при нейтральном рН» выражают в виде отношения значения KD связывания антитела с его антигеном при кислом рН к значению KD связывания антитела с его антигеном при нейтральном рН (или наоборот). Например, для целей настоящего изобретения антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно рассматривать как проявляющие «сниженное связывание с PSMA при кислом рН по сравнению со связыванием при нейтральном рН», если антитело или его антигенсвязывающий фрагмент проявляют отношение KD при кислых/нейтральных условиях, составляющее приблизительно 3,0 или больше. В определенных иллюстративных вариантах осуществления отношение KD при кислых/нейтральных условиях для антитела или антигенсвязывающего фрагмента может составлять приблизительно 3,0, 3,5, 4,0, 4,5, 5,0, 5,5, 6,0, 6,5, 7,0, 7,5, 8,0, 8,5, 9,0, 9,5, 10,0, 10,5, 11,0, 11,5, 12,0, 12,5, 13,0, 13,5, 14,0, 14,5, 15,0, 20,0, 25,0, 30,0, 40,0, 50,0, 60,0, 70,0, 100,0 или больше.
[00122] Антитела с рН-зависимыми характеристиками связывания можно получить, например, путем скрининга группы антител в отношении сниженного (или усиленного) связывания с конкретным антигеном при кислом рН по сравнению с нейтральным рН. Кроме того, модификации антигенсвязывающего домена на уровне аминокислот могут давать антитела с рН-зависимыми характеристиками. Например, путем замены одной или более аминокислот антигенсвязывающего домена (например, в пределах CDR) на остаток гистидина можно получить антитело со сниженной антигенсвязывающей способностью при кислом рН по сравнению с нейтральным рН.
Антитела, содержащие варианты Fc
[00123] В соответствии с определенными вариантами осуществления, применимыми в данном документе, представлены антитела к PSMA и биспецифические антигенсвязывающие молекулы к CD3/PSMA, содержащие Fc-домен, содержащий одну или более мутаций, которые усиливают или ослабляют связывание антитела с рецептором FcRn, например, при кислом рН по сравнению с нейтральным рН. Например, в настоящее изобретение включены антитела, содержащие мутацию в области CH2- или CH3 Fc-домена, где мутация(-и) обеспечивает(-ют) повышение аффинности Fc-домена в отношении FcRn в кислой среде (например, в эндосоме, где значение рН находится в диапазоне от приблизительно 5,5 до приблизительно 6,0). Результатом таких мутаций может быть увеличение периода полужизни антитела в сыворотке крови при введении животному. Неограничивающие примеры таких модификаций Fc включают, например, модификацию в положении 250 (например, Е или Q); 250 и 428 (например, L или F); 252 (например, L/Y/F/W или Т), 254 (например, S или Т) и 256 (например, S/R/Q/E/D или Т), или модификацию в положении 428 и/или 433 (например, H/L/R/S/P/Q или K) и/или 434 (например, H/F или Y); или модификацию в положении 250 и/или 428, или модификацию в положении 307 или 308 (например, 308F, V308F) и 434. В одном варианте осуществления модификация включает модификацию 428L (например, M428L) и 434S (например, N434S); модификацию 428L, 2591 (например, V259I) и 308F (например, V308F); модификацию 433К (например, H433K) и 434 (например, 434Y); модификацию 252, 254 и 256 (например, 252Y, 254Т и 256Е); модификацию 250Q и 428L (например, T250Q и M428L) и модификацию 307 и/или 308 (например, 308F или 308Р).
[00124] Например, в настоящее изобретение включены антитела к PSMA и биспецифические антигенсвязывающие молекулы к CD3/PSMA, содержащие Fc-домен, содержащий одну или более пар или групп мутаций, выбранных из группы, состоящей из: 250Q и 248L (например, T250Q и M248L); 252Y, 254Т и 256Е (например, M252Y, S254T и Т256Е); 428L и 434S (например, M428L и N434S); а также 433K и 434F (например, H433K и N434F). Объемом настоящего изобретения предусмотрены все возможные комбинации вышеупомянутых мутаций в Fc-домене и другие мутации в пределах вариабельных доменов антитела, раскрытых в данном документе.
Биологические характеристики антител и биспецифических антигенсвязывающих молекул
[00125] В соответствии с настоящим описанием применимы моноспецифические и биспецифические антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, которые связывают экспрессирующие CD3 человеческие Т-клетки и/или PSMA человека с высокой аффинностью (например, при значениях KD на субнаномолярнои уровне). Такие антитела и их свойства раскрыты в патенте США №10179819, включенном в данный документ посредством ссылки. Такие биспецифические антитела особенно применимы в комбинации с агонистом 4-1ВВ при лечении опухолей.
[00126] В данном документе применимы антитела к PSMA и биспецифические антигенсвязывающие молекулы к CD3/PSMA, которые проявляют одну или более характеристик, выбранных из группы, состоящей из: (а) ингибирования опухолевого роста у мышей с ослабленным иммунитетом, несущих ксенотрансплантаты рака предстательной железы человека; (b) ингибирования опухолевого роста у иммунокомпетентных мышей, несущих ксенотрансплантаты рака предстательной железы человека; (с) подавления опухолевого роста у мышей с ослабленным иммунитетом, несущих ксенотрансплантаты рака предстательной железы человека; и (d) снижения опухолевого роста у сформировавшихся опухолей в иммунокомпетентных мышах, несущих ксенотрансплантаты рака предстательной железы человека (см., например, патент США №10179819, пример 8).
[00127] В данном документе применимы антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, которые связывают CD3 человека со средней или низкой аффинностью, в зависимости от терапевтического контекста и конкретных свойств нацеливания, которые необходимы. Например, в рамках биспецифической антигенсвязывающей молекулы, где одно плечо связывает CD3, а другое плечо связывает целевой антиген (например, PSMA), может быть необходимо, чтобы плечо, связывающее целевой антиген, связывало целевой антиген с высокой аффинностью, в то время как плечо к CD3 связывало CD3 со всего лишь умеренной или низкой аффинностью. Таким образом, может достигаться предпочтительное нацеливание антигенсвязывающей молекулы на клетки, экспрессирующие целевой антиген, при одновременном предотвращении общего/нецелевого связывания CD3 и последующих нежелательных побочных эффектов, ассоциированных с этим.
[00128] Биспецифические антигенсвязывающие молекулы (например, биспецифические антитела), применимые в данном документе, способны одновременно связываться с CD3 человека и PSMA человека. Связывающее плечо, которое взаимодействует с клетками, экспрессирующими CD3, может характеризоваться слабым или не обнаруживаемым связыванием, как измерено в подходящем анализе связывания in vitro. Степень, в которой биспецифическая антигенсвязывающая молекула связывает клетки, экспрессирующие CD3 и/или PSMA, можно оценить с помощью сортировки флуоресцентно-активируемых клеток (FACS), как проиллюстрировано в патенте США №10179819, пример 5.
[00129] Например, в данном документе применимы биспецифические антитела, которые специфически связывают линии человеческих Т-клеток, которые экспрессируют CD3, но не экспрессируют PSMA (например, Jurkat), Т-клетки приматов (например, мононуклеарные клетки периферической крови яванского макака [РВМС]) и/или клетки, экспрессирующие PSMA. В данном документе применимы биспецифические антигенсвязывающие молекулы, которые связывают любые из вышеупомянутых Т-клеток и линий Т-клеток со значением ЕС50, составляющим от приблизительно 1,8×10-8 (18 нМ) до приблизительно 2,1×10-7(210 нМ) или больше (т.е. с более слабой аффинностью), или ЕС50 является не обнаруживаемой, как определено с использованием анализа связывания FACS, изложенного в патенте США №10179819, пример 5, или по сути аналогичного анализа. Также применимы биспецифические антитела, которые связываются с клетками и линиями клеток, экспрессирующими PSMA, со значением ЕС50, составляющим 5,6 нМ (5,6 × 10-9) или меньше, как определено с использованием анализа связывания FACS, изложенного в патенте США №10179819, пример 5, или по сути аналогичного анализа.
[00130] В некоторых аспектах биспецифические антитела связывают CD3 человека со слабой (т.е. низкой) аффинностью или даже без обнаруживаемой аффинности. В соответствии с определенными вариантами осуществления в настоящее изобретение включены антитела и антигенсвязывающие фрагменты антител, которые связывают CD3 человека (например, при 37°С) с KD, составляющей более чем приблизительно 11 нМ, как измерено с помощью поверхностного плазмонного резонанса.
[00131] В некоторых аспектах биспецифические антитела связывают CD3 обезьяны (например, яванского макака) со слабой (т.е. низкой) аффинностью или даже без обнаруживаемой аффинности.
[00132] В некоторых аспектах биспецифические антитела связывают CD3 человека и индуцируют активацию Т-клеток. Например, определенные антитела к CD3 индуцируют активацию человеческих Т-клеток при значении ЕС50, составляющем менее приблизительно 113 пМ, как измерено с помощью анализа активации Т-клеток in vitro.
[00133] Биспецифические антитела, применимые в данном документе, могут связывать CD3 человека и индуцировать опосредованное Т-клетками уничтожение опухолевых клеток, экспрессирующих антиген. Например, в настоящее изобретение включены биспецифические антитела, которые индуцируют опосредованное Т-клетками уничтожение опухолевых клеток при ЕС50, составляющей менее приблизительно 1,3 нМ, как измерено в анализе опосредованного Т-клетками уничтожения опухолевых клеток in vitro.
[00134] Биспецифические антитела, применимые в данном документе, могут связывать CD3 с диссоциативным периодом полужизни (t½), составляющим менее приблизительно 10 минут, как измерено с помощью поверхностного плазмонного резонанса при 25°С или 37°С.
[00135] Биспецифические антигенсвязывающие молекулы к CD3/PSMA, применимые в данном документе, могут дополнительно проявлять одну или несколько характеристик, выбранных из группы, состоящей из: (а) индукции пролиферации РВМС in vitro; (b) активации Т-клеток посредством индукции высвобождения IFN-гамма и усиления экспрессии CD25 в цельной крови человека; и (с) индукции опосредованной Т-клетками цитотоксичности в отношении линий клеток, устойчивых к антителам к PSMA.
[00136] В настоящее изобретение представлены биспецифические антигенсвязывающие молекулы к CD3/PSMA, которые способны истощать клетки, экспрессирующие опухолевый антиген, у субъекта (см., например, патент СГДА №10179819, пример 8). Например, в соответствии с определенными вариантами осуществления представлены биспецифические антигенсвязывающие молекулы к CD3/PSMA, где однократное введение субъекту биспецифической антигенсвязывающей молекулы из расчета 1 мкг, или 10 мкг, или 100 мкг, или 1 мг, 3 мг, 5 мг, 10 мкг, 30 мг, 50 мг, 100 мг, 300 мг или 500 мг на пациента (например, в дозе, составляющей приблизительно 5 мг/кг, приблизительно 2,5 мг/кг, приблизительно 1 мг/кг, приблизительно 0,1 мг/кг, приблизительно 0,08 мг/кг, приблизительно 0,06 мг/кг, приблизительно 0,04 мг/кг, приблизительно 0,02 мг/кг, приблизительно 0,01 мг/кг или меньше) вызывает снижение количества клеток, экспрессирующих PSMA, у субъекта (например, опухолевый рост у субъекта подавляется или ингибируется) ниже обнаруживаемых уровней. В определенных вариантах осуществления однократное введение биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA в дозе, составляющей приблизительно 0,4 мг/кг, вызывает снижение опухолевого роста у субъекта ниже обнаруживаемых уровней в приблизительно день 7, приблизительно день 6, приблизительно день 5, приблизительно день 4, приблизительно день 3, приблизительно день 2 или приблизительно день 1 после введения субъекту биспецифической антигенсвязывающей молекулы. В соответствии с определенными вариантами осуществления однократное введение биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA, раскрытой в данном документе, в дозе, составляющей по меньшей мере приблизительно 0,01 мг/кг, приводит к тому, что количество опухолевых клеток, экспрессирующих PSMA, остается ниже обнаруживаемых уровней вплоть до по меньшей мере приблизительно 7 дней, 8 дней, 9 дней, 10 дней, 11 дней, 12 дней, 13 дней, 14 дней, 15 дней, 16 дней, 17 дней после введения или больше. Используемое в данном документе выражение «ниже обнаруживаемых уровней» означает, что опухолевые клетки не могут быть прямо или опосредованно обнаружены как растущие подкожно у субъекта с использованием стандартных методов измерения штангенциркулем, например, как изложено в патенте США №10179819, пример 8, упомянутом в данном документе.
[00137] Также в соответствии со способами, представленными в данном документе, применимы биспецифические антигенсвязывающие молекулы к CD3/PSMA, которые проявляют одну или более характеристик, выбранных из группы, состоящей из: (а) ингибирования опухолевого роста у мышей с ослабленным иммунитетом, несущих ксенотрансплантаты рака предстательной железы человека; (b) ингибирования опухолевого роста у иммунокомпетентных мышей, несущих ксенотрансплантаты рака предстательной железы человека; (с) подавления опухолевого роста у мышей с ослабленным иммунитетом, несущих ксенотрансплантаты рака предстательной железы человека; и (d) снижения опухолевого роста у сформировавшихся опухолей в иммунокомпетентных мышах, несущих ксенотрансплантаты рака предстательной железы человека (см., например, патент США №10179819, пример 8). Иллюстративные биспецифические антигенсвязывающие молекулы к CD3/PSMA могут дополнительно проявлять одну или более характеристик, выбранных из группы, состоящей из: (а) индуцирует временное дозозависимое повышение циркулирующих цитокинов и (b) индуцирует временное снижение циркулирующих Т клеток.
Эпитопное картирование и родственные технологии
[00138] Эпитоп на CD3 и/или PSMA, с которым связываются антигенсвязывающие молекулы, применимые в данном документе, может состоять из одной непрерывной последовательности из 3 или более (например, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более) аминокислот белка CD3 или PSMA. В качестве альтернативы эпитоп может состоять из нескольких несмежных аминокислот (или аминокислотных последовательностей) CD3 или PSMA. Антитела, применимые в соответствии со способами, раскрытыми в данном документе, могут взаимодействовать с аминокислотами, содержащимися в пределах одной цепи CD3 (например, СО3-эпсилон, СО3-дельта или СО3-гамма), или могут взаимодействовать с аминокислотами в двух или более различных цепях CD3. Используемый в данном документе термин «эпитоп» относится к антигенной детерминанте, которая взаимодействует со специфическим антигенсвязывающим сайтом в вариабельной области молекулы антитела, известным как паратоп. Один антиген может содержать более чем один эпитоп. Таким образом, различные антитела могут связываться с различными зонами на антигене и могут оказывать различные биологические эффекты. Эпитопы могут быть конформационными или линейными. Конформационный эпитоп образуют аминокислоты из разных сегментов линейной полипептидной цепи, располагающиеся рядом в пространстве. Линейный эпитоп представляет собой эпитоп, образуемый смежными аминокислотными остатками в полипептидной цепи. В определенных обстоятельствах эпитоп может содержать фрагменты сахаридов, фосфорильные группы или сульфонильные группы в антигене.
[00139] Разные методики, известные специалистам средней квалификации в данной области техники, можно использовать для определения «взаимодействует ли антигенсвязывающий домен антитела с одной или более аминокислотами» в пределах полипептида или белка. Иллюстративные методики включают, например, традиционный анализ перекрестного блокирования, такой как описано в Antibodies, Harlow and Lane (Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harb., NY), аланин-сканирующий мутационный анализ, анализ на основе пептидного блоттинга (Reineke, 2004, Methods Mol Biol 248: 443-163) и анализ пептидного расщепления. Кроме того, можно использовать такие способы, как вырезание эпитопа, выделение эпитопа и химическая модификация антигенов (Tomer, 2000, Protein Science 9:487-196). Другим способом, который можно использовать для идентификации в пределах полипептида аминокислот, с которыми взаимодействует антигенсвязывающий домен антитела, является водородно-дейтериевый обмен, обнаруживаемый посредством масс-спектрометрии. В общих чертах метод водородно-дейтериевого обмена включает мечение дейтерием белка, представляющего интерес, с последующим связыванием антитела с меченным дейтерием белком. Затем комплекс белок/антитело переносят в воду, чтобы обеспечить осуществление водородно-дейтериевого обмена по всем остаткам, за исключением защищенных антителом остатков (которые остаются меченными дейтерием). После диссоциации антитела целевой белок подвергают расщеплению протеазами и анализу посредством масс-спектрометрии, за счет чего выявляют меченные дейтерием остатки, которые соответствуют специфическим аминокислотам, с которыми взаимодействует антитело. См., например, Ehring (1999) Analytical Biochemistry 267(2):252-259; Engen and Smith (2001) Anal. Chem. 73:256A-265A. Для картирования эпитопа также можно использовать рентгеновскую кристаллографию комплекса антиген/антитело.
[00140] Иллюстративные биспецифические антигенсвязывающие молекулы, применимые в данном документе, могут содержать первый антигенсвязывающий домен, который специфически связывает CD3 человека и/или CD3 яванского макака с низкой или определяемой аффинностью связывания, и второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает PSMA человека, где первый антигенсвязывающий домен связывается с тем же эпитопом на CD3, что и любой из конкретных иллюстративных CD3-специфических антигенсвязывающих доменов, описанных в данном документе, и/или где второй антигенсвязывающий домен связывается с тем же эпитопом на PSMA, что и любой из конкретных иллюстративных PSMA-специфических антигенсвязывающих доменов, описанных в данном документе.
[00141] Аналогичным образом биспецифические антигенсвязывающие молекулы, применимые в данном документе, могут содержать первый антигенсвязывающий домен, который специфически связывает CD3 человека, и второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает PSMA человека, где первый антигенсвязывающий домен конкурирует за связывание с CD3 с любым из конкретных иллюстративных CD3-специфических антигенсвязывающих доменов, описанных в данном документе в таблице 1, и/или где второй антигенсвязывающий домен конкурирует за связывание с PSMA с любым из конкретных иллюстративных PSMA-специфических антигенсвязывающих доменов, описанных в данном документе в таблице 1.
[00142] С использованием традиционных способов, известных в данной области техники, можно легко определить, связывается ли конкретная антигенсвязывающая молекула (например, антитело) или ее антигенсвязывающий домен с тем же эпитопом, что и эталонная антигенсвязывающая молекула по настоящему изобретению, или конкурирует с ней. Например, чтобы определить, связывается ли тестируемое антитело с тем же эпитопом на PSMA (или CD3), что и эталонная биспецифическая антигенсвязывающая молекула по настоящему изобретению, сначала обеспечивают возможность связывания эталонной биспецифической молекулы с белком PSMA (или белком CD3). Затем оценивают способность тестируемого антитела связываться с молекулой PSMA (или CD3). Если тестируемое антитело способно связываться с PSMA (или CD3) после насыщающего связывания с эталонной биспецифической антигенсвязывающей молекулой, можно сделать вывод, что исследуемое антитело связывается с эпитопом PSMA (или CD3), отличным от эпитопа, с которым связывается эталонная биспецифическая антигенсвязывающая молекула. С другой стороны, если тестируемое антитело не способно связываться с молекулой PSMA (или CD3) после насыщающего связывания с эталонной биспецифической антигенсвязывающей молекулой, то тестируемое антитело может связываться с тем же эпитопом PSMA (или CD3), что и эпитоп, связанный эталонной биспецифической антигенсвязывающей молекулой. Затем можно провести дополнительные традиционные эксперименты (например, анализы с мутацией пептидов и анализы связывания) для того, чтобы подтвердить, действительно ли наблюдаемое отсутствие связывания тестируемого антитела обусловлено связыванием с тем же эпитопом, с которым связывается эталонная биспецифическая антигенсвязывающая молекула, или что причиной отсутствия наблюдаемого связывания является стерическое блокирование (или другое явление). Эксперименты такого типа можно проводить с применением ELISA, RIA, Biacore, проточной цитометрии или любого другого количественного или качественного анализа связывания антитела, доступного в данной области техники. В соответствии с определенными вариантами осуществления настоящего изобретения два антигенсвязывающих белка связываются с одним и тем же (или перекрывающимся) эпитопом, если, например, 1-, 5-, 10-, 20- или 100-кратный избыток одного антигенсвязывающего белка подавляет связывание другого на по меньшей мере 50%, но предпочтительно 75%, 90% или даже 99%, как измерено в анализе конкурентного связывания (см., например, Junghans et al., Cancer Res. 1990:50:1495-1502). В качестве альтернативы, считается, что два антигенсвязывающих белка связываются с одним и тем же эпитопом, если практически все аминокислотные мутации в антигене, которые ослабляют или устраняют связывание одного антигенсвязывающего белка, ослабляют или устраняют связывание другого. Считается, что два антигенсвязывающих белка имеют «перекрывающиеся эпитопы», если только часть аминокислотных мутаций, которые ослабляют или устраняют связывание одного антигенсвязывающего белка, ослабляют или устраняют связывание другого.
[00143] Для определения того, конкурирует ли антитело или антигенсвязывающий домен за связывание с эталонной антигенсвязывающей молекулой, описанную выше методику связывания выполняют в двух направлениях. В первом направлении обеспечивается возможность связывания эталонной антигенсвязывающей молекулы с белком PSMA (или белком CD3) в условиях насыщения с последующей оценкой связывания тестируемого антитела с молекулой PSMA (или CD3). Во втором направлении обеспечивается возможность связывания тестируемого антитела с молекулой PSMA (или CD3) в условиях насыщения с последующей оценкой связывания эталонной антигенсвязывающей молекулы с молекулой PSMA (или CD3). Если в обоих направлениях только первая (насыщающая) антигенсвязывающая молекула способна к связыванию с молекулой PSMA (или CD3), то делается заключение, что тестируемое антитело и эталонная антигенсвязывающая молекула конкурируют за связывание с PSMA (или CD3). Специалисту средней квалификации в данной области техники будет понятно, что антитело, которое конкурирует за связывание с эталонной антигенсвязывающей молекулой, необязательно должно связываться с тем же эпитопом, что и эталонное антитело, но может стерически блокировать связывание эталонного антитела за счет связывания перекрывающегося или смежного эпитопа.
Получение антигенсвязывающих доменов и конструирование биспецифических молекул
[00144] Антигенсвязывающие домены, специфические в отношении конкретных антигенов, можно получать с помощью любой технологии получения антител, известной в данной области техники. После получения два разных антигенсвязывающих домена, специфических в отношении двух разных антигенов (например, CD3 и PSMA), можно соответствующим образом расположить относительно друг друга с получением биспецифической антигенсвязывающей молекулы с использованием традиционных способов. (Обсуждение иллюстративных форматов биспецифических антител, которые можно использовать для конструирования биспецифических антигенсвязывающих молекул по настоящему изобретению, приведено в другом разделе в данном документе). В определенных вариантах осуществления один или более отдельных компонентов (например, тяжелая и легкая цепи) полиспецифических антигенсвязывающих молекул получены из химерных, гуманизированных или полностью человеческих антител. Способы получения таких антител хорошо известны в данной области техники. Например, одну или более тяжелых и/или легких цепей биспецифических антигенсвязывающих молекул, применимых в данном документе, можно получить с использованием технологии VELOCIMMUNE™. С помощью технологии VELOCIMMUNE™ (см., например, патенты US 6596541, Regeneron Pharmaceuticals, VELOCIMMUNE® или любую другую технологию получения человеческих антител) первоначально выделяют химерные высокоаффинные антитела к конкретному антигену (например, CD3 или PSMA), содержащие человеческую вариабельную область и мышиную константную область. Антитела подвергают анализу и отбирают по необходимым характеристикам, в том числе аффинности, селективности, эпитопу и т.д. Мышиные константные области заменяют необходимой человеческой константной областью для получения полностью человеческих тяжелых и/или легких цепей, которые могут быть включены в биспецифические антигенсвязывающие молекулы, применимые в данном документе.
[00145] Сконструированных с помощью генной инженерии животных можно использовать для получения человеческих биспецифических антигенсвязывающих молекул. Например, можно использовать генетически модифицированную мышь, у которой отсутствует способность осуществлять реаранжировку и экспрессию эндогенной последовательности вариабельной области легкой цепи иммуноглобулина мыши, при этом мышь экспрессирует только один или два вариабельных домена человеческой легкой цепи, кодируемые последовательностями иммуноглобулина человека, функционально связанные с геном мышиной константной области каппа-цепи в эндогенном локусе мышиной каппа-цепи. Таких генетически модифицированных мышей можно использовать для получения полностью человеческих биспецифических антигенсвязывающих молекул, содержащих две разные тяжелые цепи, которые ассоциируют с идентичной легкой цепью, которая содержит вариабельный домен, полученный из одного из двух различных генных сегментов вариабельной области человеческой легкой цепи. (Подробное обсуждение таких полученным методами генной инженерии мышей и их применение для получения биспецифических антигенсвязывающих молекул см., например, в патенте США №10143186).
Биоэквиваленты
[00146] Раскрытые в настоящем изобретении способы предполагают применение антигенсвязывающих молекул, имеющих аминокислотные последовательности, которые отличаются от последовательностей иллюстративных молекул, раскрытых в данном документе, но которые сохраняют способность связывать CD3 и/или PSMA. Такие молекулы-варианты могут содержать одно или более добавлений, делеций или замен аминокислот при сравнении с исходной последовательностью, однако проявляют биологическую активность, которая практически эквивалентна активности описанных биспецифических антигенсвязывающих молекул.
[00147] В данном документе применимы антигенсвязывающие молекулы, которые являются биоэквивалентами любой из иллюстративных антигенсвязывающих молекул, изложенных в таблице 1. Два антигенсвязывающих белка или антитела считаются биоэквивалентами, если, например, они являются фармацевтическими эквивалентами или фармацевтическими альтернативами, у которых скорость и/или степень поглощения не демонстрирует значительного отличия при введении с одинаковой молярной дозой в сходных экспериментальных условиях, как в случае однократной дозы, так и в случае нескольких доз. Некоторые антигенсвязывающие белки будут считаться эквивалентами или фармацевтическими альтернативами, если они являются эквивалентными по степени их поглощения, но не по скорости их поглощения, и все же могут считаться биоэквивалентами, поскольку такие отличия в скорости поглощения являются предусмотренными и отражены в листке-вкладыше, не являются необходимыми для достижения эффективных концентраций лекарственного средства в организме, например, при длительном применении, и считаются незначимыми с медицинской точки зрения в случае конкретного исследуемого лекарственного продукта.
[00148] В одном варианте осуществления два антигенсвязывающих белка являются биоэквивалентами, если отсутствуют клинически значимые отличия с точки зрения их безопасности, чистоты и эффективности.
[00149] В одном варианте осуществления два антигенсвязывающих белка являются биоэквивалентами, если пациента можно перевести один или более раз с эталонного продукта на биологический продукт без ожидаемого увеличения риска возникновения нежелательных эффектов, в том числе значимого с клинической точки зрения изменения иммуногенности, или уменьшения эффективности по сравнению с таковой при продолжении терапии без такого перевода.
[00150] В одном варианте осуществления два антигенсвязывающих белка являются биоэквивалентами, если они оба действуют согласно общему механизму или механизмам действия при условии или условиях применения, в том объеме, в котором такие механизмы известны.
[00151] Биоэквивалентность можно продемонстрировать с помощью способов in vivo и in vitro. Измерения степени биоэквивалентности включают, например, (а) тест на человеке или других млекопитающих in vivo, в котором концентрацию антитела или его метаболитов измеряют в крови, плазме крови, сыворотке крови или других биологических жидкостях в зависимости от времени; (b) тест in vitro, который коррелировал с данными биодоступности у человека in vivo и с достаточной точностью предсказывал их; (с) тест на человеке и других млекопитающих in vivo, в котором соответствующий ранний фармакологический эффект антитела (или его мишени) измеряют в зависимости от времени; и (d) строго контролируемое клиническое испытание, в котором устанавливают безопасность, эффективность или биодоступность или биоэквивалентность антигенсвязывающего белка.
[00152] Варианты-биоэквиваленты иллюстративных биспецифических антигенсвязывающих молекул, изложенных в данном документе, можно сконструировать с помощью, например, осуществления различных замен остатков или последовательностей, или делеций концевых или внутренних остатков или последовательностей, которые не являются необходимыми для биологической активности. Например, остатки цистеина, не являющиеся необходимыми для биологической активности, можно подвергнуть делеций или заменить другими аминокислотами для предупреждения образования при ренатурации внутримолекулярных дисульфидных мостиков, которые не являются необходимыми или являются неправильными. В других ситуациях антигенсвязывающие белки-биоэквиваленты могут включать варианты иллюстративных биспецифических антигенсвязывающих молекул, изложенных в данном документе, которые содержат аминокислотные изменения, которые модифицируют характеристики гликозилирования молекул, например мутации, которые устраняют или удаляют гликозилирование.
Видовая селективность и межвидовая перекрестная реактивность
[00153] В соответствии с определенными вариантами осуществления биспецифические антигенсвязывающие молекулы, применимые в данном документе, связываются с CD3 человека, но не с CD3 других видов. В данном документе также применимы антигенсвязывающие молекулы, которые связываются с PSMA человека, но не с PSMA других видов. Раскрытые в настоящее время способы также предполагают применение биспецифических антигенсвязывающих молекул, которые связываются с CD3 человека и с CD3 одного или нескольких видов, не относящихся к человеку; и/или биспецифических антигенсвязывающих молекул, которые связываются с PSMA человека и с PSMA одного или более отличных от человека видов.
[00154] В соответствии с определенными иллюстративными вариантами осуществления антигенсвязывающие молекулы, применимые в данном документе, связываются с CD3 человека и/или PSMA человека и могут связываться или не связываться, в зависимости от конкретного случая, с одним или более из CD3 и/или PSMA мыши, крысы, морской свинки, хомяка, песчанки, свиньи, кошки, собаки, кролика, козы, овцы, коровы, лошади, верблюда, яванского макака, мартышки, макака-резуса или шимпанзе. Например, в конкретном иллюстративном варианте осуществления настоящего изобретения представлены биспецифические антигенсвязывающие молекулы, содержащие первый антигенсвязывающий домен, который связывает CD3 человека и CD3 яванского макака, и второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает PSMA человека.
Меченные радиоактивной меткой иммуноконъюгаты на основе антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3 для иммунной РЕТ-визуализации
[00155] В данном документе представлены меченные радиоактивной меткой антигенсвязывающие белки, которые связывают антитело к PSMA или антигенсвязывающую молекулу к PSMA/CD3. В некоторых вариантах осуществления меченные радиоактивной меткой антигенсвязывающие белки предусматривают антигенсвязывающий белок, ковалентно связанный с позитронным излучателем. В некоторых вариантах осуществления меченные радиоактивной меткой антигенсвязывающие белки предусматривают антигенсвязывающий белок, ковалентно связанный с одним или более хелатообразующими фрагментами, которые представляют собой химические фрагменты, способные образовывать хелатный комплекс с позитронным излучателем.
[00156] Подходящие меченные радиоактивной меткой антигенсвязывающие белки, например меченные радиоактивной меткой антитела, включают те, которые не нарушают или по сути не нарушают функцию Т-клеток при воздействии меченного радиоактивной меткой антигенсвязывающего белка. В некоторых вариантах осуществления меченный радиоактивной меткой антигенсвязывающий белок, который связывает антигенсвязывающую молекулу к PSMA/CD3, является слабым блокатором функции CD3 Т-клеток, т.е. функция Т-клеток не нарушается или по сути не нарушается при воздействии меченного радиоактивной меткой антитела. Применение меченного радиоактивной меткой CD3-связывающего белка, оказывающего минимальное влияние на опосредованную CD3 функцию Т-клеток в соответствии со способами, представленными в данном документе, гарантирует то, что субъект, подвергнутый лечению с помощью такой молекулы, не будет получать негативных эффектов вследствие неспособности его Т-клеток устранять инфекцию.
[00157] В некоторых вариантах осуществления представлены антитело к PSMA или антигенсвязывающая молекула к PSMA/CD3, например, биспецифические антитела, где указанные антигенсвязывающие белки ковалентно связаны с одним или более фрагментами, имеющими следующую структуру:
где L представляет собой хелатообразующий фрагмент, М представляет собой позитронный излучатель, и z независимо в каждом случае составляет 0 или 1, и где по меньшей мере один из z составляет 1.
[00158] В некоторых вариантах осуществления меченный радиоактивной меткой антигенсвязывающий белок представляет собой соединение формулы (I):
А представляет собой антитело к PSMA или антигенсвязывающую молекулу к PSMA/CD3, L представляет собой хелатообразующий фрагмент, М представляет собой позитронный излучатель, z составляет 0 или 1, и k составляет целое число от 0 до 30. В некоторых вариантах осуществления k составляет 1. В некоторых вариантах осуществления к составляет 2.
[00159] В определенных вариантах осуществления меченный радиоактивной меткой антигенсвязывающий белок представляет собой соединение формулы (II):
где А представляет собой антитело к PSMA или антигенсвязывающую молекулу к PSMA/CD3, L представляет собой хелатообразующий фрагмент, М представляет собой позитронный излучатель, и k представляет собой целое число от 1 до 30.
[00160] В некоторых вариантах осуществления в данном документе представлены композиции, содержащие конъюгат, имеющий следующую структуру:
где А представляет собой антитело к PSMA или антигенсвязывающую молекулу к PSMA/CD3, L представляет собой хелатообразующий фрагмент, и k составляет целое число от 1 до 30; где конъюгат образует хелатное соединение с позитронным излучателем в количестве, достаточном для обеспечения удельной активности, подходящей для клинической РЕТ-визуализации.
[00161] Ниже представлены хелатообразующие фрагменты и позитронные излучатели.
Позитронные излучатели и хелатообразующие фрагменты
[00162] Подходящие позитронные излучатели включают без ограничения те, которые образуют стабильные комплексы с хелатообразующим фрагментом и характеризуются периодами физической полужизни, подходящими для целей иммунной РЕТ-визуализации. Иллюстративные позитронные излучатели включают без ограничения 89Zr, 68Ga, 64Cu, 44Sc и 86Y. Подходящие позитронные излучатели также включают те, которые непосредственно связываются с биспецифической антигенсвязывающей молекулой к PSMA/CD3, в том числе без ограничения 76Br и 124I, и те, которые введены посредством простетической группы, например, 18F.
[00163] Описанные в данном документе хелатообразующие фрагменты представляют собой химические фрагменты, которые ковалентно связаны с антигенсвязывающей молекулой к PSMA/CD3 и содержат часть, способную образовывать хелатное соединение с позитронным излучателем, т.е. способную вступать в реакцию с позитронным излучателем с образованием координированного хелатного комплекса. Подходящие фрагменты включают те, которые обеспечивают эффективную загрузку конкретного металла и образуют комплексы металл-хелатор, которые являются в достаточной степени стабильными in vivo для диагностических путей применения, например, для иммунной РЕТ-визуализации. Иллюстративные хелатообразующие фрагменты включают те, которые обеспечивают сведение к минимуму диссоциации позитронного излучателя и его накопление в минеральном костном веществе, белках плазмы крови и/или его отложение в костном мозге до степени, подходящей для диагностических путей применения.
[00164] Примеры хелатообразующих фрагментов включают без ограничения те, которые образуют стабильные комплексы с позитронными излучателями 89Zr, 68Ga, 64Cu, 44Sc и/или 86Y. Иллюстративные хелатообразующие фрагменты включают без ограничения фрагменты, описанные в Nature Protocols, 5(4): 739, 2010; Bioconjugate Chem., 26(12): 2579 (2015); Chem Commun (Camb), 51(12): 2301 (2015); Mol. Pharmaceutics, 12: 2142 (2015); Mol. Imaging Biol, 18: 344 (2015); Eur. J. Nucl. Med. Mol. Imaging, 37:250 (2010); Eur. J. Nucl. Med. Mol. Imaging (2016). doi:10.1007/s00259-016-3499-x; Bioconjugate Chem., 26(12): 2579 (2015); WO 2015/140212 A1 и US 5639879, которые включены посредством ссылки во всей своей полноте.
[00165] Иллюстративные хелатообразующие фрагменты также включают без ограничения те, которые содержат десферроксамин (DFO), 1,4,7,10-тетрауксусную кислоту (DOTA), диэтилентриаминпентауксусную кислоту (DTPA), этилендиаминтетрауксусную кислоту (EDTA), 1,4,7,10-тетраазациклододекан-1,4,7,10-тетра(метиленфосфоновую) кислоту (DOTP), (1R, 4R, 7R, 10R)-α'α''α'''-тетраметил-1,4,7,10-тетраазациклододекан-1,4,7,10-тетрауксусную кислоту (DOTMA), 1,4,8,11-тетраазациклотетрадекан-1,4,8,11-тетрауксусную кислоту (ТЕТА), Н4октапа, Н6фоспа, Н2дедпа, Н5декапа, Н2азапа, НОРО, DO2A, 1,4,7,10-тетракис(карбамоилметил)-1,4,7,10-тетраазациклододекан (DOTAM), 1,4,7-триазациклононан-N,N',N''-триуксусную кислоту (NOTA), 1,4,7,10-тетракис(карбамоилметил)-1,4,7,10-тетраазациклододекан (DOTAM), 1,4,8,11-тетраазабицикло[6.6.2]гексадекан-4,11-дикетиновую кислоту (СВ-ТЕ2А), 1,4,7,10-тетраазациклододекан (циклен), 1,4,8,11-тетраазациклотетрадекан (циклам), октадентатные хелаторы, октадентатные бифункциональные хелатирующие средства, например, DFO*, гексадентатные хелаторы, фосфонатные хелаторы, макроциклические хелаторы, хелаторы, содержащие макроциклические терефталамидные лиганды, бифункциональные хелаторы, фузаринин С и хелаторы, которые представляют собой производные фузаринина С, триацетилфузарин С (TAFC), ферроксамин Е (FOXE), ферроксамин В (FOXB), феррихром A (FCHA) и т.п.
[00166] В некоторых вариантах осуществления хелатообразующие фрагменты ковалентно связаны с биспецифической антигенсвязывающей молекулой к PSMA/CD3 за счет линкерного фрагмента, который ковалентно присоединяет хелатообразующую часть хелатообразующего фрагмента к связывающему белку. В некоторых вариантах осуществления эти линкерные фрагменты образованы в результате реакции между реакционноспособным фрагментом биспецифической антигенсвязывающей молекулы, например, цистеином или лизином антитела, и реакционноспособным фрагментом, который присоединен к хелатору, в том числе, например, п-изотиоцианатобенильной группой и реакционноспособными фрагментами, представленными в способах конъюгации ниже. Кроме того, такие линкерные фрагменты необязательно содержат химические группы, используемые в целях регулировки полярности, растворимости, стерических взаимодействий, жесткости и/или длины между хелатообразующей частью и биспецифической антигенсвязывающей молекулой к PSMA/CD3.
Получение меченных радиоактивной меткой конъюгатов на основе биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3
[00167] Меченные радиоактивной меткой конъюгаты на основе антитела к PSMA и конъюгаты на основе биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3 можно получить с помощью: (1) осуществления реакции антигенсвязывающей молекулы с молекулой, содержащей хелатор для позитронного излучателя и фрагмент, вступающий в реакцию с необходимым сайтом конъюгации биспецифического связывающего белка, и (2) загрузки требуемого позитронного излучателя.
[00168] Подходящие сайты конъюгации включают без ограничения лизин и цистеин, оба из которых, например, могут быть нативными или сконструированными, и могут, например, присутствовать в тяжелой или легкой цепи антитела. Цистеиновые сайты конъюгации включают без ограничения полученные путем мутации, вставки или восстановления дисульфидных связей антитела. Способы получения антител со сконструированным остатком цистеина включают без ограничения способы, раскрытые в WO 2011/056983. Сайт специфические способы конъюгации также можно применять для направления реакции конъюгации в специфические сайты антитела, достижения требуемой стехиометрии и/или достижения требуемого соотношения хелатора и антитела. Такие способы конъюгации известны специалистам средней квалификации в данной области техники и включают без ограничения конструирование остатка цистеина и ферментативные и химико-ферментативные способы, в том числе без ограничения конъюгацию по остатку глутамина, конъюгацию по Q295 и конъюгацию, опосредованную трансглутаминазой, а также способы, которые описаны в J. Clin. Immunol., 36: 100 (2016), включенном в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте. Подходящие фрагменты, вступающие в реакцию с необходимым сайтом конъюгации, обычно обеспечивают эффективное и легкое связывание биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3, например биспецифического антитела, и хелатора для позитронного излучателя. Фрагменты, вступающие в реакцию с лизиновыми и цистеиновыми сайтами, включают электрофильные группы, которые известны специалистам средней квалификации в данной области техники. В определенных аспектах, если необходимым сайтом конъюгации является остаток лизина, реакционноспособный фрагмент представляет собой изотиоцианат, например, п-изотиоцианатобенильную группу или реакционноспособный сложный эфир. В определенных аспектах, если необходимым сайтом конъюгации является остаток цистеина, реакционноспособный фрагмент представляет собой малеимид.
[00169] Если хелатор представляет собой десферроксамин (DFO), подходящие реакционноспособные фрагменты включают без ограничения
изотиоциантатобензильную группу, сложный н-гидроксисукцинимидный эфир, сложный 2,3,5,6-тетрафторфенольный эфир, н-сукцинимидил-S-ацетилтиоацетат и фргаменты, описанные в BioMed Research International, Vol 2014, ID статьи 203601, включенной в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте. В определенных вариантах осуществления молекула, содержащая хелатор для позитронного излучателя и фрагмент, вступающий в реакцию с сайтом конъюгации, представляет собой п-изотиоциантатобензилдесферроксамин (p-SCN-Bn-DFO):
[00170] Загрузку позитронного излучателя осуществляют путем инкубации конъюгата хелатора и биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3 с позитронным излучателем в течение времени, достаточного для обеспечения образования координационной связи указанного позитронного излучателя с хелатором, например, путем осуществления способов, описанных в примерах, приведенных в данном документе, или по сути аналогичного способа.
Иллюстративные варианты осуществления конъюгатов
[00171] В настоящее изобретение включены меченные радиоактивной меткой конъюгаты на основе антитела, содержащие антитело к PSMA или биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к PSMA/CD3 и позитронный излучатель. В настоящее изобретение также включены меченные радиоактивной меткой конъюгаты на основе антитела, содержащие антитело к PSMA или биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к PSMA/CD3, хелатообразующий фрагмент и позитронный излучатель.
[00172] В некоторых вариантах осуществления хелатообразующий фрагмент предусматривает хелатор, способный образовывать комплекс с 89Zr. В определенных вариантах осуществления хелатообразующий фрагмент предусматривает десферроксамин. В определенных вариантах осуществления хелатообразующий фрагмент представляет собой п-изотиоцианатобензилдесферроксамин.
[00173] В некоторых вариантах осуществления позитронный излучатель представляет собой 89Zr. В некоторых вариантах осуществления менее 1,0% антитела к PSMA или биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3 конъюгировано с позитронным излучателем, менее 0,9% антитела к PSMA или биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3 конъюгировано с позитронным излучателем, менее 0,8% антитела к PSMA или биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3 конъюгировано с позитронным излучателем, менее 0,7% антитела к PSMA или биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3 конъюгировано с позитронным излучателем, менее 0,6% антитела к PSMA или биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3 конъюгировано с позитронным излучателем, менее 0,5% антитела к PSMA или биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3 конъюгировано с позитронным излучателем, менее 0,4% антитела к PSMA или биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3 конъюгировано с позитронным излучателем, менее 0,3% антитела к PSMA или биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3 конъюгировано с позитронным излучателем, менее 0,2% антитела к PSMA или биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3 конъюгировано с позитронным излучателем или менее 0,1% антитела к PSMA или биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3 конъюгировано с позитронным излучателем.
[00174] В некоторых вариантах осуществления отношение хелатообразующего фрагмента к антителу в конъюгате составляет от 1,0 до 2,0. Используемый в данном документе термин «отношение хелатообразующего фрагмента к антителу» представляет собой среднее отношение хелатообразующего фрагмента к антителу и является показателем загрузки хелатора на антитело. Данное соотношение аналогично «DAR», т.е. отношению лекарственного средства к антителу, которое применяют специалисты в данной области для измерения загрузки лекарственного средства на антитело в случае конъюгатов антитела и лекарственного средства (ADC); при этом в контексте конъюгатов для iPET-визуализации, описанных в данном документе, отношение хелатообразующего фрагмента к антителу можно установить с помощью способов, описанных в данном документе, и других способов определения DAR, известных в данной области техники, например, описанных в Wang et al., Antibody-Drug Conjugates, The 21st Century Magic Bullets for Cancer (2015). В некоторых вариантах осуществления отношение хелатообразующего фрагмента к антителу составляет приблизительно 1,7. В некоторых вариантах осуществления отношение хелатообразующего фрагмента к антителу составляет от 1,0 до 2,0. В некоторых вариантах осуществления отношение хелатообразующего фрагмента к антителу составляет приблизительно 1,7.
[00175] В конкретном варианте осуществления хелатообразующий фрагмент представляет собой п-изотиоцианатобензилдесферроксамин, и позитронный излучатель представляет собой 89Zr. В другом конкретном варианте осуществления хелатообразующий фрагмент представляет собой п-изотиоцианатобензилдесферроксамин, и позитронный излучатель представляет собой 89Zr, и отношение хелатообразующего фрагмента к антителу в конъюгате составляет от 1 до 2.
[00176] В некоторых вариантах осуществления в данном документе представлены антитела к PSMA или биспецифические антигенсвязывающие молекулы к PSMA/CD3, где указанные антигенсвязывающие молекулы ковалентно связаны с одним или более фрагментами, имеющими следующую структуру:
где L представляет собой хелатообразующий фрагмент, М представляет собой позитронный излучатель, и z независимо в каждом случае составляет 0 или 1, и где по меньшей мере один из z составляет 1. В определенных вариантах осуществления меченный радиоактивной меткой антигенсвязывающий белок представляет собой соединение формулы (I):
причем А представляет собой антитело к PSMA или биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к PSMA/CD3, L представляет собой хелатообразующий фрагмент, М представляет собой позитронный излучатель, z составляет 0 или 1, и к составляет целое число от 0 до 30. В некоторых вариантах осуществления к составляет 1. В некоторых вариантах осуществления к составляет 2.
[00177] В некоторых вариантах осуществления L представляет собой:
[00178] В некоторых вариантах осуществления М представляет собой 89Zr.
[00179] В некоторых вариантах осуществления к составляет целое число от 1 до 2. В некоторых вариантах осуществления к составляет 1. В некоторых вариантах осуществления k составляет 2.
[00180] В некоторых вариантах осуществления -L-M представляет собой:
[00181] В настоящее изобретение также включены способы синтеза меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела, предусматривающие приведение в контакт соединения формулы (III):
с 89Zr, где А представляет собой антитело к PSMA или биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к PSMA/CD3. В определенных вариантах осуществления соединение формулы (III) синтезируют путем приведения антитела к PSMA или биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3 в контакт cp-SCN-Bn-DFO.
[00182] В данном документе также представлен продукт реакции соединения формулы (III) с 89Zr.
[00183] В данном документе представлены соединения формулы (Ш):
где А представляет собой биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к PSMA/CD3, и k составляет целое число от 1 до 30. В некоторых вариантах осуществления k составляет 1 или 2.
[00184] В данном документе представлены конъюгаты на основе антитела, содержащие: (i) антитело к PSMA или биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к PSMA/CD3 и (ii) один или более хелатообракующих фрагментов.
[00185] В некоторых вариантах осуществления хелатообразующий фрагмент предусматривает:
представляет собой ковалентную связь с антителом или его антиген связывающим фрагментом
[00186] В некоторых аспектах конъюгат на основе антитела характеризуется отношением хелатообразующего фрагмента к антителу, составляющим от приблизительно 1,0 до приблизительно 2,0. В некоторых аспектах конъюгат на основе антитела характеризуется отношением хелатообразующего фрагмента к антителу, составляющим приблизительно 1,7.
[00187] В некоторых вариантах осуществления в данном документе представлены композиции, содержащие конъюгат, имеющий следующую структуру:
где А представляет собой антитело к PSMA или биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к PSMA/CD3, L представляет собой хелатообразующий фрагмент, и к составляет целое число от 1 до 30, при этом конъюгат образует хелатное соединение с позитронным излучателем в количестве, достаточном для обеспечения удельной активности, подходящей для клинической РЕТ-визуализации. В некоторых вариантах осуществления количество хелатированного позитронного излучателя представляет собой количество, достаточное для обеспечения удельной активности, составляющей от приблизительно 1 до приблизительно 50 мКи на 1-50 мг биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3.
[00188] В некоторых вариантах осуществления количество хелатированного позитронного излучателя представляет собой количество, достаточное для обеспечения удельной активности до 50 мКи, до 45 мКи, до 40 мКи, до 35 мКи, до 30 мКи, до 25 мКи или до 10 мКи на 1-50 мг биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3, например, в диапазоне от приблизительно 5 до приблизительно 50 мКи, от приблизительно 10 до приблизительно 40 мКи, от приблизительно 15 до приблизительно 30 мКи, от приблизительно 7 до приблизительно 25 мКи, от приблизительно 20 до приблизительно 50 мКи или от приблизительно 5 до приблизительно 10 мКи.
Способы применения меченных радиоактивной меткой имму ноконъюг атов
[00189] В определенных аспектах настоящего изобретения представлены диагностические и терапевтические способы применения меченных радиоактивной меткой конъюгатов на основе антител по настоящему изобретению.
[00190] В соответствии с одним аспектом настоящего изобретения представлены способы обнаружения PSMA в ткани, при этом способы предусматривают введение в ткань меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела к PSMA или конъюгата на основе биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3, представленных в данном документе, и визуальное наблюдение экспрессии PSMA посредством визуализации с помощью позитронно-эмиссионной томографии (PET). В определенных вариантах осуществления ткань содержит клетки или линии клеток. В определенных вариантах осуществления ткань присутствует в субъекте, где субъект представляет собой млекопитающее. В определенных вариантах осуществления субъект представляет собой субъекта-человека. В определенных вариантах осуществления у субъекта имеется заболевание или нарушение, выбранное из группы, состоящей из рака, который экспрессирует антиген PSMA, такого как рак предстательной железы, рак почки, рак мочевого пузыря, колоректальный рак и рак желудка. В одном варианте осуществления у субъекта имеется рак предстательной железы.
[00191] В соответствии с одним аспектом настоящего изобретения представлены способы визуализации ткани, которая экспрессирует PSMA, предусматривающие введение в ткань меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела к PSMA или конъюгата на основе биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3, предусмотренных настоящим раскрытием, и визуальное наблюдение экспрессии PSMA посредством визуализации с помощью позитронно-эмиссионной томографии (PET). В одном варианте осуществления ткань содержится в опухоли. В одном варианте осуществления ткань содержится в культуре опухолевых клеток или линии опухолевых клеток. В одном варианте осуществления ткань содержится в очаге опухоли у субъекта. В одном варианте осуществления ткань представляет собой внутриопухолевые лимфоциты в ткани. В одном варианте осуществления ткань содержит клетки, экспрессирующие PSMA.
[00192] В соответствии с одним аспектом настоящего изобретения представлены способы определения, подходит ли субъект, у которого имеется опухоль, для противоопухолевой терапии, при этом способы предусматривают введение меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела по настоящему изобретению и локализацию введенного меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела в опухоли посредством РЕТ-визуализации, при этом присутствие меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела в опухоли позволяет идентифицировать субъекта как подходящего для противоопухолевой терапии.
[00193] В соответствии с одним аспектом настоящего изобретения представлены способы прогнозирования ответа субъекта, у которого имеется солидная опухоль, на противоопухолевую терапию, при этом способы предусматривают определение того, является ли опухоль PSMA-положительной, при этом положительный ответ субъекта прогнозируют в том случае, если опухоль является PSMA-положительной. В определенных вариантах осуществления опухоль определяют как положительную путем введения меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела по настоящему изобретению и локализации меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела в опухоли посредством РЕТ-визуализации, где присутствие меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела в опухоли указывает на то, что опухоль является PSMA-положительной.
[00194] В соответствии с одним аспектом настоящего изобретения представлены способы обнаружения PSMA-положительной опухоли у субъекта. Способы, в соответствии с данным аспектом, предусматривают введение субъекту меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела по настоящему изобретению и определение локализации меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела посредством РЕТ-визуализации, где присутствие меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела в опухоли указывает на то, что опухоль является PSMA-положительной.
[00195] В данном документе представлены способы прогнозирования положительного ответа на противоопухолевую терапию, предусматривающие введение субъекту меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела к PSMA или конъюгата на основе биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3 для определения присутствия PSMA-положительных клеток в солидной опухоли. Присутствие PSMA-положительных клеток прогнозирует положительный ответ на противоопухолевую терапию.
[00196] Используемое в данном документе выражение «субъект, нуждающийся в этом» означает человека или отличное от человека млекопитающее, у которого проявляется один или более симптомов или признаков рака, и/или у которого был диагностирован рак, в том числе солидная опухоль, и который нуждается в его лечении. Во многих вариантах осуществления термин «субъект» может использоваться взаимозаменяемо с термином «пациент». Например, у субъекта-человека может быть диагностирована первичная или метастатическая опухоль и/или один или более симптомов или признаков, в том числе без ограничения необъяснимая потеря веса, общая слабость, постоянная усталость, потеря аппетита, лихорадка, ночная потливость, боль в костях, одышка, вздутие живота, боль/давление в груди, увеличение селезенки и повышение уровня связанного с раком биомаркера (например, СА125). Данное выражение включает субъектов с первичными или сформировавшимися опухолями. В конкретных вариантах осуществления выражение включает субъектов-людей, у которых имеется солидная опухоль, например, рак толстой кишки, рак молочной железы, рак легкого, рак предстательной железы, рак кожи, рак печени, рак кости, рак яичника, рак шейки матки, рак поджелудочной железы, рак головы и шеи и рак головного мозга, и/или которые нуждаются в ее лечении. Термин включает субъектов с первичными или метастатическими опухолями (злокачественными новообразованиями на поздней стадии). В определенных вариантах осуществления выражение «субъект, нуждающийся в этом» включает субъектов с солидной опухолью, которая является устойчивой или рефрактерной к предшествующей терапии (например, лечению с помощью противоракового средства) или недостаточно контролируется ею. Например, выражение включает субъектов, которых подвергали лечению с помощью одной или более линий предшествующей терапии, таких как химиотерапия (например, карбоплатин или доцетаксел). В определенных вариантах осуществления выражение «субъект, нуждающийся в этом» включает субъектов с солидной опухолью, которые подвергали лечению с помощью одной или более линий предшествующей терапии, но у которые впоследствии произошел рецидив или метастазирование. В определенных вариантах осуществления способы по настоящему изобретению применяют у субъекта с солидной опухолью. Термины «опухоль», «рак» и «злокачественное новообразование» используются в данном документе взаимозаменяемо. Используемый в данном документе термин «солидная опухоль» относится к аномальной массе ткани, которая обычно не содержит кист или зон с жидкостью. Солидные опухоли могут быть доброкачественными (не являются раковыми) или злокачественными (раковыми). Для целей настоящего изобретения термин «солидная опухоль» означает злокачественные солидные опухоли. Термин включает различные типы солидных опухолей, названные по типам клеток, которые их образуют, а именно саркомы, карциномы и лимфомы.
[00197] В определенных вариантах осуществления рак или опухоль выбраны из группы, состоящей из астроцитомы, рака анального канала, рака мочевого пузыря, рака крови, рака кости, рака головного мозга, рака молочной железы, рака шейки матки, светлоклеточной почечно-клеточной карциномы, колоректального рака, микросателлитно-промежуточного колоректального рака, плоскоклеточной карциномы кожи, диффузной крупноклеточной лимфомы из В-клеток, рака эндометрия, рака пищевода, фибросаркомы, рака желудка, глиобластомы, мультиформной глиобластомы, плоскоклеточной карциномы головы и шеи, гепатоцеллюлярной карциномы, типов лейкоза, рака печени, лейомиосаркомы, рака легкого, лимфомы, меланомы, мезотелиомы, миеломы, рака носоглотки, немелкоклеточного рака легкого, остеосаркомы, рака яичника, рака поджелудочной железы, первичного и/или рецидивирующего рака, рака предстательной железы, почечно-клеточной карциномы, рабдомиосаркомы, рака слюнной железы, рака кожи, мелкоклеточного рака легкого, плоскоклеточного рака, рака желудка, синовиальной саркомы, рака яичка, рака щитовидной железы, трижды негативного рака молочной железы, рака матки и опухоли Вильмса. В некоторых аспектах рак представляет собой первичный рак. В некоторых аспектах рак представляет собой метастатический и/или рецидивирующий рак.
[00198] В определенных вариантах осуществления рак или опухоль выбраны из PSMA-положительной опухоли, такой как опухоль, происходящая из эпителия предстательной железы, слизистой оболочки двенадцатиперстной кишки, проксимальных почечных канальцев или нейроэндокринных клеток крипт толстой кишки. В некоторых аспектах рак представляет собой рак мочевого пузыря, рак почки, рак желудка или колоректальную карциному. В некоторых аспектах рак представляет собой рак предстательной железы. В некоторых аспектах рак представляет собой метастатический рак, происходящий из первичной опухоли предстательной железы.
[00199] Используемые в данном документе термины «лечить», «осуществлять лечение» или т.п.означают облегчение симптомов, устранение причин симптомов либо на временной, либо на постоянной основе, задержку или подавление опухолевого роста, уменьшение нагрузки опухолевых клеток или опухолевой массы, содействие регрессу опухоли, обеспечение уменьшения, некроза и/или исчезновения опухоли, предупреждение рецидива опухоли, предупреждение или подавление метастазирования, ингибирование метастатического опухолевого роста и/или увеличение продолжительность выживания субъекта.
[00200] В определенных вариантах осуществления меченный радиоактивной меткой конъюгат на основе антитела к PSMA или конъюгат на основе биспецифической молекулы к PSMA/CD3 вводят субъекту внутривенно или подкожно. В определенных вариантах осуществления меченный радиоактивной меткой конъюгат на основе антитела вводят внутрь опухоли. После введения меченный радиоактивной меткой конъюгат на основе антитела локализуют в опухоли. Локализованный меченный радиоактивной меткой конъюгат на основе антитела визуализируют посредством РЕТ-визуализации, а поглощение опухолью меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела измеряют посредством способов, известных в данной области техники. В определенных вариантах осуществления визуализацию проводят через 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7 дней после введения меченного радиоактивной меткой конъюгата. В определенных вариантах осуществления визуализацию проводят в тот же день после введения меченного радиоактивной меткой конъюгата на основе антитела.
[00201] В определенных вариантах осуществления меченный радиоактивной меткой конъюгат на основе антитела к PSMA или конъюгат на основе биспецифической антигенсвязывающей молекулы к PSMA/CD3 можно вводить в дозе, составляющей от приблизительно 0,1 мг/кг массы тела до приблизительно 100 мг/кг массы тела субъекта, например, от приблизительно 0,1 мг/кг до приблизительно 50 мг/кг, или от приблизительно 0,5 мг/кг до приблизительно 25 мг/кг, или от приблизительно 0,1 мг/кг до приблизительно 1,0 мг/кг массы тела.
Составление и введение терапевтического препарата
[00202] В соответствии с настоящим изобретением применимы фармацевтические композиции, содержащие антигенсвязывающие молекулы, применимые в данном документе. В некоторых аспектах фармацевтическая композиция дополнительно содержит агонист 4-1ВВ. Фармацевтические композиции составляют с подходящими носителями, вспомогательными веществами и другими средствами, которые обеспечивают улучшение переноса, доставки, переносимости и т.п. Множество подходящих составов можно найти в справочнике, хорошо известном всем химикам-фармацевтам: Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Company, Истон, Пенсильвания, США. Эти составы включают, например, порошки, пасты, мази, желе, воска, масла, липиды, везикулы, содержащие липиды (катионные или анионные) (такие как LIPOFECTIN™, Life Technologies, Карлсбад, Калифорния, США), конъюгаты на основе ДНК, безводные абсорбционные пасты, эмульсии типа «масло воде» и «вода в масле», эмульсии на основе карбовакса (полиэтиленгликоли с различной молекулярной массой), полужидкие гели и полужидкие смеси, содержащие карбовакс. См. также Powell et al. «Compendium of excipients for parenteral formulations)) PDA (1998) J Pharm Sci Technol 52:238-311.
[00203] Доза антигенсвязывающей молекулы, вводимой пациенту, может варьироваться в зависимости от возраста и размера тела пациента, целевого заболевания, состояний, пути введения и т.п. Предпочтительную дозу, как правило, рассчитывают в соответствии с массой тела или площадью поверхности тела. Если биспецифическая антигенсвязывающая молекула применяется для терапевтических целей у взрослого пациента, преимущественным является внутривенное введение биспецифической антигенсвязывающей молекулы в норме в однократной дозе, составляющей от приблизительно 0,01 до приблизительно 20 мг/кг массы тела, более предпочтительно от приблизительно 0,02 до приблизительно 7, от приблизительно 0,03 до приблизительно 5 или от приблизительно 0,05 до приблизительно 3 мг/кг массы тела. В некоторых аспектах может быть преимущественным внутривенное введение биспецифической антигенсвязывающей молекулы в норме в однократной дозе, составляющей приблизительно 50 мг, или приблизительно 75 мг, или приблизительно 100 мг, или приблизительно 150 мг, или приблизительно 200 мг, или приблизительно 250 мг, или приблизительно 300 мг, или приблизительно 350 мг, или приблизительно 400 мг. В зависимости от тяжести состояния можно корректировать частоту введения и длительность лечения. Эффективные дозировки и схемы введения биспецифической антигенсвязывающей молекулы могут быть определены эмпирически; например, путем периодического оценивания можно контролировать прогресс пациента, и соответствующим образом корректировать дозу. Более того, можно выполнять межвидовое масштабирование дозировок с применением способов, хорошо известных в данной области техники (например, Mordenti et al, 1991, Pharmaceut. Res. 5:1351).
[00204] Доза агониста 4-IBB, вводимого пациенту, может варьироваться в зависимости от возраста и размера тела пациента, целевого заболевания, состояний, пути введения и т.п.Предпочтительную дозу, как правило, рассчитывают в соответствии с массой тела или площадью поверхности тела. Если агонист 4-1ВВ применяется для терапевтических целей у взрослого пациента, преимущественным является внутривенное введение агониста в норме в однократной дозе, составляющей от приблизительно 0,01 до приблизительно 20 мг/кг массы тела, более предпочтительно от приблизительно 0,02 до приблизительно 7, от приблизительно 0,03 до приблизительно 5 или от приблизительно 0,05 до приблизительно 3 или приблизительно 2,5 мг/кг массы тела.
[00205] Известны различные системы доставки, и их можно применять для введения фармацевтических композиций, применимый в данном документе, например, инкапсулирование в липосомы, микрочастицы, микрокапсулы, рекомбинантные клетки, способные экспрессировать мутантные вирусы, опосредованный рецепторами эндоцитоз (см., например, Wu et al., 1987, J. Biol. Chem. 262:4429-4432). Способы введения включают без ограничения внутрикожный, внутримышечный, внутрибрюшинный, внутривенный, подкожный, интраназальный, эпидуральный и пероральный пути. Композицию можно вводить любым удобным путем, например посредством инфузии или болюсной инъекции, посредством абсорбции через эпителиальные или кожно-слизистые покровы (например, слизистую оболочку ротовой полости, слизистую оболочку прямой кишки и кишечника и т.д.), и ее можно вводить вместе с другими биологически активными средствами. Введение может быть системным или местным.
[00206] Фармацевтическую композицию, применимую в данном документе, можно доставлять подкожно или внутривенно с помощью стандартной иглы и шприца. Кроме того, что касается подкожной доставки, то при доставке фармацевтической композиции, применимой в данном документе, свободно можно применять устройство для доставки по типу шприца-ручки. Такое устройство для доставки по типу шприца-ручки может быть многоразовым или одноразовым. В многоразовом устройстве для доставки по типу шприца-ручки обычно используется сменный картридж, который содержит фармацевтическую композицию. После того, как вся фармацевтическая композиция из картриджа была введена, и картридж опустошился, пустой картридж можно сразу удалить в отходы и заменить новым картриджем, который содержит фармацевтическую композицию. Устройство для доставки по типу шприца-ручки затем можно применять повторно. В случае одноразового устройства для доставки по типу шприца-ручки сменный картридж отсутствует. Вместо этого одноразовое устройство для доставки по типу шприца-ручки предоставляется предварительно заполненным фармацевтической композицией, содержащейся в резервуаре внутри устройства. После опустошения резервуара от фармацевтической композиции устройство помещается в отходы целиком.
[00207] При подкожной доставке фармацевтической композиции, применимой в данном документе, применяют разнообразные многоразовые устройства для доставки по типу шприца-ручки и автоинъектора. Примеры включают без ограничения AUTOPEN™ (Owen Mumford, Inc., Вудсток, Великобритания), шприц-ручку DISETRONIC™ (Disetronic Medical Systems, Бургдорф, Швейцария), шприц-ручку HUMALOG MIX 75/25™, шприц-ручку HUMALOG™, шприц-ручку HUMALIN 70/30™ (Eli Lilly and Co., Индианаполис, Индиана, США), NOVOPEN™ I, II и III (Novo Nordisk, Копенгаген, Дания), NOVOPEN JUNIOR™ (Novo Nordisk, Копенгаген, Дания), шприц-ручку BD™ (Becton Dickinson, Франклин-Лэйкс, Нью-Джерси, США), OPTIPEN™, OPTIPEN PRO™, OPTIPEN STARLET™ и OPTICLIK™ (Sanofi-Aventis, Франкфурт, Еермания), при этом упомянуты лишь некоторые из них. Примеры одноразовых устройств для доставки в виде шприца-ручки, применяемых для подкожного введения фармацевтической композиции, применимой в данном документе, включают без ограничения шприц-ручку SOLOSTAR™ (sanofi-aventis), FLEXPEN™ (Novo Nordisk) и KWIKPEN™ (Eli Lilly), автоинъектор SURECLICK™ (Amgen, Таузанд-Окс, Калифорния, США), PENLET™ (Haselmeier, Штутгарт, Еермания), EPIPEN (Dey, L.P.) и шприц-ручку HUMIRA™ (Abbott Labs, Эббот-Парк, Иллинойс, США), при этом упомянуты лишь несколько из них.
[00208] В определенных ситуациях фармацевтическую композицию можно доставлять в виде системы с контролируемым высвобождением. В одном варианте осуществления можно применять помпу (см. Langer, выше; Sefton, 1987, CRC Crit. Ref. Biomed. Eng. 14:201). В другом варианте осуществления можно применять полимерные материалы; см. Medical Applications of Controlled Release, Langer and Wise (eds.), 1974, CRC Pres., Бока-Ратон, Флорида, США. В еще одном варианте осуществления систему с контролируемым высвобождением можно поместить вблизи мишени композиции, при этом требуется лишь часть системной дозы (см., например, Goodson, 1984, в Medical Applications of Controlled Release, выше, т.2, стр. 115 138). Другие системы с контролируемым высвобождением обсуждаются в обзоре Langer, 1990, Science 249:1527-1533.
[00209] Инъекционные препараты могут включать лекарственные формы для внутривенных, подкожных, внутрикожных и внутримышечных инъекций, для капельных инфузий и т.п. Эти инъекционные препараты можно получить с помощью общеизвестных способов. Например, инъекционные препараты можно получить, например, путем растворения, суспендирования или эмульгирования антитела или его соли, описанных выше, в стерильной водной среде или масляной среде, традиционно применяемых для инъекций. В качестве водной среды для инъекций применяют, например, физиологический солевой раствор, изотонический раствор, содержащий глюкозу и другие вспомогательные средства и т.п., которые можно применять в комбинации с подходящим солюбилизирующим средством, таким как спирт (например, этанол), многоатомный спирт (например, пропиленгликоль, полиэтиленгликоль), неионогенное поверхностно-активное вещество [например, полисорбат 80, НСО-50 (полиоксиэтиленовый (50 моль) аддукт гидрогенизированного касторового масла)] и т.п. В качестве масляной среды используют, например, кунжутное масло, соевое масло и т.п., которые можно применять в комбинации с солюбилизирующим средством, таким как бензилбензоат, бензиловый спирт и т.п. Полученным таким способом инъекционным составом предпочтительно наполняют подходящую ампулу.
[00210] Преимущественно описанные выше фармацевтические композиции для перорального или парентерального применения получают в виде лекарственных форм со стандартной дозой, подобранной таким образом, чтобы она соответствовала дозе активных ингредиентов. Такие лекарственные формы со стандартной дозой включают, например, таблетки, пилюли, капсулы, инъекционные составы (ампулы), суппозитории и т.д. Количество содержащегося вышеупомянутого антитела обычно составляет от приблизительно 0,5 до приблизительно 500 мг на лекарственную форму со стандартной дозой; в частности в форме инъекционного состава; в случае других лекарственных форм предпочтительно, чтобы содержание вышеупомянутого антитела составляло от приблизительно 5 до приблизительно 100 мг и от приблизительно 10 до приблизительно 250 мг.
Средства и составы для комбинированной терапии
[00211] В настоящем изобретении представлены способы, которые предусматривают введение фармацевтической композиции, содержащей любые из иллюстративных моноспецифических или биспецифических антигенсвязывающих молекул, описанных в данном документе, в комбинации с агонистом 4-1ВВ и одним или несколькими дополнительными терапевтическими средствами. Иллюстративные дополнительные терапевтические средства, которые можно комбинировать или вводить в комбинации с агонистом 4-1ВВ и биспецифической антигенсвязывающей молекулой, применимыми в данном документе, включают, например, антагонист EGFR (например, антитело к EGFR [например, цетуксимаб или панитумумаб] или низкомолекулярный ингибитор EGFR [например, гефитиниб или эрлотиниб]), антагонист другого представителя семейства EGFR, такого как Her2/ErbB2, ErbB3 или ErbB4 (например, антитело к ErbB2, антитело к ErbB3 или антитело к ErbB4 или низкомолекулярный ингибитор активности ErbB2, ErbB3 или ErbB4), антагонист EGFRvIII (например, антитело, которое специфически связывает EGFRvIII), антагонист сМЕТ (например, антитело к сМЕТ), антагонист IGF1R (например, антитело к IGF1R), ингибитор B-raf (например, вемурафениб, сорафениб, GDC-0879, PLX-4720), ингибитор PDGFR-α (например, антитело к PDGFR-α), ингибитор PDGFR-β (например, антитело к PDGFR-β), антагонист VEGF (например, VEGF-»ловушка», см., например, патент США №7087411 (также называемый в данном документе «слитый белок, ингибирующий VEGF»), антитело к VEGF (например, бевацизумаб), низкомолекулярный ингибитор киназы рецептора VEGF (например, сунитиниб, сорафениб или пазопаниб)), антагонист DLL4 (например, антитело к DLL4, раскрытое в заявке на патенте США №2009/0142354, такое как REGN421), антагонист Ang2 (например, антитело к Ang2, раскрытое в заявке на патент США №2011/0027286, такое как Н1Н685Р), антагонист FOLH1 (PSMA), антагонист PRLR (например, антитело к PRLR), антагонист STEAP1 или STEAP2 (например, антитело к STEAP1 или антитело к STEAP2), антагонист TMPRSS2 (например, антитело к TMPRSS2), антагонист MSLN (например, антитело к MSLN), антагонист СА9 (например, антитело к СА9), антагонист уроплакина (например, антитело к уроплакину) и т.д. Другие средства, которые предпочтительно можно вводить в комбинации с композициями, представленными в данном документе, включают ингибиторы цитокинов, в том числе низкомолекулярные ингибиторы цитокинов и антитела, которые связываются с цитокинами, такими как IL-1, IL-2, IL- 3, IL-4, IL-5, IL-6, IL-8, IL-9, IL-11, IL-12, IL-13, IL-17, IL-18, или с их соответствующими рецепторами. Фармацевтические композиции, применимые в данном документе (например, фармацевтические композиции, содержащие биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к CD3/PSMA, раскрытую в данном документе), также можно вводить как часть схемы терапии, включающей агонист 4-1ВВ и одну или несколько комбинаций терапевтических препаратов, выбранных из «ICE»: ифосфамид (например, Ifex®), карбоплатин (например, Paraplatin®), этопозид (например, Etopophos®, Toposar®, VePesid®, VP-16); «DHAP»: дексаметазон (например, Decadron®), цитарабин (например, Cytosar-U®, цитозина арабинозид, ara-С), цисплатин (например, Platinol®-AQ); и «ESHAP»: этопозид (например, Etopophos®, Toposar®, VePesid®, VP-16), метилпреднизолон (например, Medrol®), цитарабин в высоких дозах, цисплатин (например, Platinol®-AQ).
[00212] В настоящее изобретение также включены комбинации терапевтических препаратов, содержащие любую из антигенсвязывающих молекул, упомянутых в данном документе, и ингибитор одного или более из VEGF, Ang2, DLL4, EGFR, ErbB2, ErbB3, ErbB4, EGFRvIII, cMet, IGF1R, B-raf, PDGFR-α, PDGFR-β, PRLR, STEAP1, STEAP2, TMPRSS2, MSLN, CA9, уроплакина или любого из вышеупомянутых цитокинов, где ингибитор представляет собой аптамер, антисмысловую молекулу, рибозим, siRNA, пептитело, нанотело или фрагмент антитела (например, Fab-фрагмент; Р(ab')2-фрагмент; Fd-фрагмент; Fv-фрагмент; scFv; dAb-фрагмент; или другие сконструированные молекулы, такие как диатела, триатела, тетратела, мини-тела и минимальные распознающие единицы). Антигенсвязывающие молекулы, раскрытые в данном документе, также можно вводить и/или совместно составлять в комбинации с противовирусными препаратами, антибиотиками, анальгетиками, кортикостероидами и/или NSAID. Антигенсвязывающие молекулы, раскрытые в данном документе, также можно вводить как часть схемы лечения, которая также включает лучевую терапию и/или стандартную химиотерапию.
[00213] Дополнительный терапевтически активный(-ые) компонент(-ы) можно вводить непосредственно перед введением антигенсвязывающей молекулы, применимой в данном документе, одновременно с ней или вскоре после ее введения (для целей настоящего изобретения такие схемы введения рассматриваются как введение антигенсвязывающей молекулы «в комбинации с» дополнительным терапевтически активным компонентом).
[00214] В настоящее изобретение включены фармацевтические композиции, в которых антигенсвязывающая молекула, применимая в данном документе, составлена совместно с одним или более из дополнительных терапевтически активных компонентов, описанных в другом разделе в данном документе.
Схемы введения
[00215] В соответствии с определенными вариантами осуществления настоящего изобретения субъекту можно вводить несколько доз антигенсвязывающей молекулы (например, антитела к PSMA или биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA) в течение определенного периода времени. Кроме того, субъекту можно вводить несколько доз агониста 4-1ВВ в течение определенного периода времени. Способы согласно этому аспекту включают последовательное введение субъекту одной или более доз каждого терапевтического препарата, т.е. одной или более доз антигенсвязывающей молекулы и одной или более доз агониста 4-1ВВ. Используемое в данном документе «последовательное введение» означает, что каждую дозу терапевтического препарата, например, антигенсвязывающей молекулы, вводят субъекту в отдельный момент времени, например, в разные дни, разделенные заранее определенным интервалом (например, часами, днями, неделями или месяцами). В настоящее изобретение включены способы, которые предусматривают последовательное введение пациенту однократной начальной дозы антигенсвязывающей молекулы, называемой нагрузочной дозой, а затем одной или более вторичных доз антигенсвязывающей молекулы, и необязательно затем одной или более третичных доз антигенсвязывающей молекулы. В настоящее изобретение включены способы, которые предусматривают последовательное введение пациенту однократной начальной дозы агониста 4-1ВВ, называемой нагрузочной дозой, а затем одной или более вторичных доз агониста 4-1ВВ, и необязательно затем одной или более третичных доз агониста 4-1ВВ.
[00216] Термины «начальная доза», «вторичные дозы» и «третичные дозы» относятся к временной последовательности введения антигенсвязывающей молекулы и/или агониста 4-1ВВ, применимых в данном документе. Таким образом, «начальная доза» представляет собой дозу, которую вводят в начале схемы лечения (также называется «исходной дозой»); «вторичные дозы» представляют собой дозы, которые вводят после начальной дозы; и «третичные дозы» представляют собой дозы, которые вводят после вторичных доз. Все из начальной, вторичной и третичной доз могут содержать одинаковое количество антигенсвязывающей молекулы (или агониста 4-1ВВ), но обычно могут отличаться друг от друга по частоте введения. Однако в определенных вариантах осуществления количество антигенсвязывающей молекулы (или агониста 4-1ВВ), содержащегося в начальной, вторичной и/или третичной дозах, отличается друг от друга (например, при необходимости корректируется в сторону повышения или понижения) на протяжении курса лечения. В определенных вариантах осуществления две или более (например, 2, 3, 4 или 5) доз вводятся в начале режима лечения как «нагрузочные дозы», а затем последующие дозы вводятся с меньшей частотой (например, «поддерживающие дозы»).
[00217] В одном иллюстративном варианте осуществления настоящего изобретения каждую вторичную и/или третичную дозу вводят через 1-26 (например, 1, 1½, 2, 2½, 3, 3½, 4, 4½, 5, 5½, 6, 6½, 7, 7½, 8, 8½, 9, 9½, 10, 10½, 11, 11½, 12, 12½, 13, 13½, 14, 14½, 15, 15½, 16, 16½, 17, 17½, 18, 18½, 19, 19½, 20, 20½, 21, 21½, 22, 22½, 23, 23½, 24, 24½, 25, 25½, 26, 26½ или более) недель после непосредственно предшествующей дозы. Используемая в данном документе фраза «непосредственно предшествующая доза» означает дозу антигенсвязывающей молекулы (или агониста 4-1ВВ) в последовательности из нескольких введений, которую вводят пациенту перед введением ближайшей следующей дозы в последовательности без введения промежуточных доз.
[00218] Способы согласно данному аспекту настоящего изобретения могут предусматривать введение пациенту любого количества вторичных и/или третичных доз агониста 4-1ВВ, антитела к PSMA или биспецифической антигенсвязывающей молекулы, которая специфически связывает PSMA и CD3. Например, в определенных вариантах осуществления пациенту вводят только одну вторичную дозу. В других вариантах осуществления пациенту вводят две или более (например, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 или более) вторичных доз. Аналогичным образом в определенных вариантах осуществления пациенту вводят только одну третичную дозу. В других вариантах осуществления пациенту вводят две или более (например, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 или более) третичных доз.
[00219] В вариантах осуществления, включающих несколько вторичных доз, каждую вторичную дозу можно вводить с той же частотой, что и другие вторичные дозы. Например, каждую вторичную дозу можно вводить пациенту через 1-2 недели после введения непосредственно предшествующей дозы. Аналогичным образом в вариантах осуществления, включающих несколько третичных доз, каждую третичную дозу можно вводить с той же частотой, что и другие третичные дозы. Например, каждую третичную дозу можно вводить пациенту через 2-4 недели после введения непосредственно предшествующей дозы. В качестве альтернативы частота, с которой пациенту вводят вторичные и/или третичные дозы, может варьироваться на протяжении схемы лечения. Врач может корректировать частоту введения в ходе курса лечения в зависимости от потребностей отдельного пациента после клинического обследования.
Пути применения антител в диагностике
[00220] Биспецифические антитела по настоящему изобретению также можно применять для обнаружения и/или измерения содержания PSMA или клеток, экспрессирующих PSMA, в образце, например, для диагностических целей. Например, антитело к PSMA или его фрагмент можно применять для диагностики состояния или заболевания, характеризующихся отклоняющейся от нормы экспрессией PSMA (например, сверхэкспрессией, недостаточной экспрессией, отсутствием экспрессии и т.д.). Иллюстративные диагностические анализы для определения PSMA могут предусматривать, например, приведение образца, полученного от пациента, в контакт с биспецифическим антителом к PSMAxCD3, где биспецифическое антитело помечено с помощью обнаруживаемой метки или репортерной молекулы. В качестве альтернативы в диагностических вариантах применения можно использовать немеченое биспецифическое антитело к PSMAxCD3 в комбинации со вторичным антителом, которое само по себе является меченным для обеспечения обнаружения. Обнаруживаемая метка или репортерная молекула могут представлять собой радиоактивный изотоп, такой как 3Н, 14С, 32Р, 35S или 125I; флуоресцентный или хемилюминесцентный фрагмент, такой как флуоресцеинизотиоцианат или родамин; или фермент, такой как щелочная фосфатаза, бета-галактозидаза, пероксидаза хрена или люцифераза. Другое иллюстративное диагностическое применение биспецифических антител к PSMAxCD3, применимых в данном документе, включает антитела, меченные 89Zr, например, меченные 89-десфероксамином, для целей неинвазивной идентификации и отслеживания опухолевых клеток в субъекте (например, посредством визуализации с помощью позитронно-эмиссионной томографии (PET)). (См., например, Tavare, R. et al. Cancer Res. 2016 Jan l;76(1):73-82; and Azad, BB. et al. Oncotarget. 2016 Mar 15;7(11): 12344-58.) Конкретные иллюстративные анализы, которые можно использовать для обнаружения или измерения содержания PSMA в образце, включают твердофазный иммуноферментный анализ (ELISA), радиоиммунологический анализ (RIA) и сортировку флуоресцентно-активируемых клеток (FACS).
[00221] Образцы, которые можно использовать в диагностических анализах на PSMA в соответствии с настоящим изобретением, включают образец любой ткани или жидкости, который можно получить от пациента и который содержит поддающиеся обнаружению количества белка PSMA или его фрагментов в нормальном или патологическом состояниях. Обычно для первоначального определения исходного или стандартного уровня PSMA будут измерять уровни PSMA в конкретном образце, полученном от здорового пациента (например, пациента, не пораженного заболеванием или состоянием, ассоциированными с аномальными уровнями или активностью PSMA). Данный исходный уровень PSMA затем можно сравнивать с уровнями PSMA, измеренными в образцах, полученных от индивидуумов с подозрением на наличие заболевания или состояния, связанных с PSMA (например, опухоли, содержащей клетки, экспрессирующие PSMA).
ПРИМЕРЫ
[00222] Следующие примеры представлены с тем, чтобы обеспечить специалистов средней квалификации в данной области техники полным раскрытием и описанием того, как осуществлять и применять способы и композиции, применимые в данном документе, и они не предполагают ограничение объема того, что авторы настоящего изобретения рассматривают в качестве своего изобретения. Были приложены усилия для обеспечения точности в используемых числах (например, количествах, температуре и т.п.), однако необходимо учитывать некоторые экспериментальные погрешности и отклонения. Если не указано иное, то части являются частями по весу, молекулярная масса представляет собой среднюю молекулярную массу, температура представлена в градусах Цельсия, а давление является атмосферным или близким к атмосферному.
Пример 1. Получение биспецифических антител, которые связывают простатспецифический мембранный антиген (PSMA) и CD3
[00223] В настоящем изобретении представлены антитела к PSMA, применимые в соответствии со способами, раскрытыми в данном документе. Антитела получали в соответствии с раскрытием, представленным в патенте США №10179819. Иллюстративные антитела, применимые в данном документе, включают антитело Н1Н11810Р, а также последовательности CDR, HCVR и LCVR, охватываемые этим антителом. Фактически, иллюстративное антитело к PSMA или его антигенсвязывающий фрагмент содержат HCVR под SEQ ID NO: 66 и LCVR под SEQ ID NO: 1386, описанные в патенте США №10179819.
[00224] В настоящем изобретении также представлены биспецифические антигенсвязывающие молекулы, которые связывают CD3 и простатспецифический мембранный антиген (PSMA); такие биспецифические антигенсвязывающие молекулы также обозначаются в данном документе как «биспецифические молекулы к PSMA/CD3». Связывающая PSMA часть биспецифической молекулы к PSMA/CD3 применима для нацеливания на опухолевые клетки, которые экспрессируют PSMA, а связывающая CD3 часть биспецифической молекулы применима для активации Т-клеток. Одновременное связывание PSMA на опухолевой клетке и CD3 на Т-клетке облегчает направленное уничтожение (клеточный лизис) подвергаемой нацеливанию опухолевой клетки под действием активированной Т-клетки.
[00225] Биспецифические антитела, содержащие PSMA-специфический связывающий домен и CD3-специфический связывающий домен, конструировали с применением стандартных методов, где каждый из антигенсвязывающего домена к PSMA и антигенсвязывающего домена к CD3 содержат разные, отличающиеся HCVR, спаренные с общей LCVR. В некоторых случаях биспецифические антитела конструировали с использованием тяжелой цепи из антитела к CD3, тяжелой цепи из антитела к PSMA и общей легкой цепи. В других случаях биспецифические антитела конструировали с использованием тяжелой цепи из антитела к CD3, тяжелой цепи из антитела к PSMA и легкой цепи от антитела к CD3. В некоторых случаях биспецифические антитела конструировали с использованием HCVR из антитела к CD3, HCVR из антитела к PSMA и общей LCVR. В других случаях биспецифические антитела конструировали с использованием HCVR из антитела к CD3, HCVR из антитела к PSMA и LCVR из антитела к CD3.
[00226] Обобщение составных частей иллюстративной конструкции биспецифического антитела к PSMAxCD3 изложено в таблице 1.
Пример 2. Нацеливание на PSMA с помощью биспецифических молекул к CD3 индуцирует противоопухолевые ответы, которые усиливаются посредством костимуляции 4-1ВВ
[00227] Биспецифическое антитело к PSMAxCD3, нацеливающееся на опухолевый антиген рака предстательной железы, PSMA, оценивали на нескольких доклинических моделях солидных опухолей. Для изучения противоопухолевой эффективности в присутствии интактной иммунной системы и экспрессии PSMA в нормальных тканях разрабатывали мышей, гуманизированных по CD3 и PSMA. Иммунная РЕТ-визуализация продемонстрировала, что PSMAxCD3 накапливается в тканях и опухолях, экспрессирующих PSMA, что ассоциировано со значительной противоопухолевой эффективностью. Однако PSMAxCD3 теряло свою эффективность по мере увеличения опухолевой нагрузки. В рамках стимуляции эффективности у мышей с более высокой опухолевой нагрузкой, PSMAxCD3 в комбинации с костимуляцией антителом к 4-1ВВ (антитело к 4-1bb мыши от InVivoPlus, изотип IgG1 крысы, номер по каталогу ВР0169) достигало выраженной активации Т-клеток, продуцирования цитокинов, пролиферации и образование клеток памяти, что привело к повышенной эффективности и устойчивым противоопухолевым ответам, данный пример демонстрирует, что биспецифические антитела к CD3 в комбинации с костимуляцией антителом к 4-1ВВ являются перспективной терапевтической комбинацией против солидных опухолей.
[00228] Во всех исследованиях в данном примере в качестве контроля использовали биспецифическое антитело к CD3 с нерелевантным нацеливающим плечом (контроль связывания CD3). Эффективность In vivo оценивали как на ксеногенных, так и на сингенных мышиных моделях. В ксеногенных моделях мышам NSG прививали человеческие РВМС и клетки С4-2 или 22Rv1 (размер выборки 5 мышей на группу). Для сингенных моделей (размер выборки 5-10 мышей на группу) мышам HuT имплантировали клетки TRAMP-C2-hPSMA. Все исследования на животных проводились в соответствии с Руководством по содержанию и использованию лабораторных животных NIH.
PSMAxCD3 индуцирует мишень-зависимую активацию Т-клеток и цитотоксичность в отношении опухолевых клеток.
[00229] Биспецифическую антигенсвязывающую молекулу PSMAxCD3 получали путем иммунизации мышей Veloclmmune® с помощью PSMA и CD3 человека. Полученное биспецифическое антитело к PSMAxCD3 имеет стабилизированный шарнир, минимизированную эффекторную функцию, изотип IgG4.
[00230] Для определения связывания PSMAxCD3 с JURKAT и предварительно активированными человеческими Т-клетками использовали анализ на основе проточной цитометрии с обнаружением с помощью РЕ-антитела к IgG человека. Человеческие Т-клетки предварительно активировали с помощью антитела к CD3/CD28 в течение 6 дней. После активации 2×105 активированных человеческих Т-клеток или клеток JURKAT/лунка инкубировали в течение 30 минут при 4°С с PSMAxCD3 из расчета 10 мкг/мл. После инкубации клетки дважды промывали холодным PBS (1% FBS). После промывки к клеткам добавляли вторичное РЕ-антитело к антителам человека и инкубировали в течение дополнительных 30 минут. В качестве контроля использовали лунки, не содержащие антител или содержащие только вторичные антитела. После инкубации клетки анализировали с помощью проточной цитометрии на BD FACS Canto II.
[00231] Для определения связывания PSMAxCD3 с линиями клеток, экспрессирующими PSMA, также использовали анализ на основе проточной цитометрии. Клетки С4-2, 22Rv1 или TRAMP-C2-hPSMA (2×106 клеток/лунка) инкубировали с PSMAxCD3 (10 мкг/мл) в течение 15 минут при 4°С. После инкубации клетки дважды промывали холодным PBS (2% FBS) и добавляли вторичное АРС-антитело к антителам человека в течение дополнительных 20 минут на льду. В качестве контроля включали отсутствие окрашивания или окрашивание только вторичным антителом. Образцы анализировали на анализаторе клеток BD LSRFortessa.
[00232] Вкратце, линии клеток, экспрессирующих PSMA (клетки 22Rv1 и С4-2), метили с помощью 1 мкМ Violet Cell Tracker и высевали на ночь при 37°С. Отдельно человеческие РВМС высевали в среду с добавлением RPMI из расчета 1×106 клеток/мл и инкубировали на протяжении ночи при 37°С для обогащения лимфоцитами за счет истощения прикрепляющихся макрофагов, дендритных клеток и некоторых моноцитов. На следующий день целевые клетки инкубировали совместно с подвергнутыми истощению по прикрепляющимся клеткам наивными РВМС (соотношение эффектор/целевая клетка 4:1) и серийными разведениями либо PSMAxCD3, либо контроля связывания CD3 в течение 48 часов при 37°С. Клетки удаляли из культуральных планшетов с использованием буфера для диссоциации, не содержащего ферментов, и анализировали с помощью проточной цитометрии. Для FACS-анализа клетки окрашивали с помощью Far Red Cell Tracker для определения мертвых/живых клеток (Invitrogen). Для оценки специфичности уничтожения клетки гейтировали по популяциям, меченным Violet cell tracker. Процент живых целевых клеток регистрировали для расчета скорректированной выживаемости следующим образом: Скорректированная выживаемость = (R1/R2)*100, где R1 = % живых целевых клеток в присутствии антитела, a R2 = % живых целевых клеток в отсутствие тестируемого антитела. Активацию Т-клеток оценивали путем инкубации клеток с непосредственно конъюгированными антителами к CD2, CD69 и CD25 и путем регистрации процента активированных (CD69+) Т-клеток или (CD25+) Т-клеток от общего числа Т-клеток (CD2+).
[00233] Анализ на основе проточной цитометрии продемонстрировал, что PSMAxCD3 специфически связывается с CD3 на Т-клетках Jurkat и человеческими РВМС (фигура 1А). Кроме того, PSMAxCD3 специфически связывается с линиями клеток опухолей человека 22Rvl и С4-2, экспрессирующих PSMA на различных уровнях, демонстрируя, что PSMAxCD3 может связываться с линиями клеток, экспрессирующими антиген как на низком уровне, так и на высоком уровне (фигура 1 В). Чтобы оценить цитотоксический потенциал PSMAxCD3, проводили анализ уничтожения клеток in vitro на основе проточной цитометрии. PSMAxCD3 индуцировало уничтожение клеток 22Rv1 (ЕС50 1,79×10-11) и С4-2 (ЕС50 2,23×10-11), в то время как контроль связывания CD3 не индуцировал (фигура 1С). В ответ на PSMAxCD3 на Т-клетках повышались уровни раннего маркера активации CD69 (фигура 1D) и позднего маркера активации CD25 (фигура 1E). PSMAxCD3 также индуцировал высвобождение цитокинов (IFNγ и TNFα), когда Т-клетки инкубировали с опухолевыми клетками С4-2 или 22Rv1 (фигура 1F, G).
[00234] Вместе эти результаты продемонстрировали, что PSMAxCD3 способно индуцировать мишень-зависимую CD3-опосредованную активацию Т-клеток, приводящую к уничтожению опухолевых клеток, экспрессирующих PSMA.
PSMAxCDS подавляет рост клеток рака предстательной железы человека в ксеногенной модели опухоли
[00235] Две мышиные модели с подкожным ксенотрансплантатом опухоли создавали применением линий клеток опухолей человека 22Rv1 и С4-2. Человеческие РВМС доставляли в качестве источника Т-клеток с CD3 человека в мышей NSG во время имплантации опухоли, и мышей немедленно обрабатывали контролем связывания CD3 или PSMAxCD3. У мышей, которым имплантировали опухолевые клетки 22Rv1, показано подавление опухолевого роста при введении PSMAxCD3 в дозе 0,1 мг/кг и 1 мг/кг (фигура 2А), в то время как у мышей, которым имплантировали опухолевые клетки С4-2, показано значительное ингибирование опухолевого роста с помощью PSMAxCD3 в дозе всего 0,01 мг/кг (фигура 2В).
Исследования сингенных опухолей
[00236] Сингенные исследования проводили на мышах, генетически модифицированных для экспрессии CD3 человека и части PSMA человека с использованием технологии VelociGene®. Мышам (5-7/группа, возраст 8-16 недель) вводили подкожной (SC) инъекцией 5×106 клеток TRAMP-C2-hPSMA. Мышам вводили PSMAxCD3 и контроль связывания CD3 в дозе 5 мг/кг два раза в неделю, осуществляя в общей сложности 4 обработки. Рост опухоли измеряли штангенциркулем. Объем опухоли на основании измерений штангенциркулем рассчитывали по формуле: объем = (длина х ширина2)/2. Для исследований с применением PSMAxCD3 + антитело к 4-1ВВ (LOB12.3, BioXcell) группы контроля связывания CD3 обрабатывали изотипическим контролем IgG крысы, а группы антитела к 4-1ВВ обрабатывали контролем связывания CD3. Для исследований воздействия клеток памяти на опухоли мышам, у которых опухоль исчезла в ответ на лечение, повторно вводили 1×10 клеток TRAMP-C2-hPSMA через 35 дней после инъекции опухоли в противоположный бок.
Получение иммуноконъюгата и PET мелких животных
[00237] Предварительно откалиброванный прибор для РЕТ/СТ Sofie Biosciences G8 (Sofie Biosciences (Калвер-Сити, Калифорния, США) и Perkin Elmer) использовали для получения изображений PET и СТ. Энергетическое окно варьировали от 150 до 650 кэВ при преобразованном разрешении, составляющем 1,4 мм в центре поля зрения. В день 6 после введения дозы мышей подвергали индукционной анестезии с использованием изофлурана и поддерживали под непрерывным потоком изофлурана в течение 10-минутного сбора данных посредством PET в статическом режиме с последующим сбором данных посредством СТ. Данные PET с поправкой на распад и данные СТ обрабатывали с использованием программного обеспечения VivoQuant (inviCRO Imaging Services) в ложно окрашенные проекции максимальной интенсивности совместно регистрируемых РЕТ-СТ на цветовой шкале, откалиброванной для указания диапазона сигнала от 0 до 15% от введенной дозы на объем, выраженные как % ID/г. Для анализа биораспределения ex vivo мышей умерщвляли после сбора данных посредством РЕТ/СТ. Затем собирали кровь, нормальные ткани и опухоль и помещали в пробирки для подсчета. Затем радиоактивность у-излучения для всех образцов подсчитывали на автоматическом счетчике гамма-излучения (AMG, Hidex), и результаты регистрировали в виде нормализованного числа импульсов в минуту (cpm). % ID для каждого образца определяли с использованием импульсов в образце относительно импульсов в стандартах доз, приготовленных из исходного введенного материала. Впоследствии индивидуальные значения % ID/г получали путем деления значения % ID на соответственную массу соответствующего образца крови, тканей или опухоли.
Иммунная РЕТ-визуализация демонстрирует биораспределение PSMAxCDS in vivo у мышей HuT
[00238] В ксеногенных моделях используют мышей с иммунодефицитом, у которых отсутствуют зрелые В-, Т- и NK-клетки. Чтобы изучить эффективность PSMAxCD3 на модели иммунокомпетентных мышей, авторы настоящего изобретения получили методами генной инженерии мышей Human Target (HuT) для экспрессии PSMA и CD3 человека путем удаления мышиной последовательности и замены ее ортологическими областями CD3 и PSMA человека. Экспрессию транскрипта PSMA человека обнаружили в спинном мозге, головном мозге, печени, почке, семенниках и слюнных железах, при этом в предстательной железе обнаружили очень незначительную экспрессию (фигура ЗА). Кроме того, экспрессию белка PSMA также подтверждали с помощью иммуногистохимического анализа, и она показала аналогичный паттерн экспрессии (данные не показаны; и Skokos et al., представлено к публикации). Для определения биодоступности антигена PSMA in vivo и распределения PSMAxCD3 в мышах HuT использовали иммунную PET (iPET) визуализацию для отслеживания локализации антитела. Мышам HuT вводили инъекцией 89Zr-антитело к PSMA (двухвалентное антитело, используемое для получения PSMAxCD3), 89Zr-PSMAxCD3 или 89Zr-контроль связывания CD3 для оценки распределения в тканях. У мышей, которым вводили инъекцией 89Zr-контроль связывания CD3, специфическое нацеливание отсутствовало. У мышей, которым вводили инъекцией 89Zr-антитело к PSMA, продемонстрировано специфическое поглощение в печени, почках, придатках яичка, слезных железах, слюнных железах и дренирующих лимфатических узлах. Следует отметить, что головной мозг и семенники идентифицировали как ткани, экспрессирующие PSMA, однако iPET не обнаруживала нацеливания, возможно из-за гематоэнцефалического барьера и недосягаемости антигена. У мышей, которым вводили 89Zr-PSMAxCD3, показан профиль распределения, аналогичный профилю распределения бивалентного 89Zr-антитело к PSMA, за исключением снижения поглощения в почке и повышения поглощения в селезенке, что указывает на то, что распределение PSMAxCD3 в основном обусловлено PSMA-связывающим плечом (фигура 3В и 3С). Чтобы подтвердить это, исследовали выведение лекарственного средства из сыворотки крови у мышей, гуманизированных только по CD3 или в дополнение к PSMA. В то время как концентрации лекарственного средства в сыворотке крови мышей HuT (CD3) были аналогичны мышам WT, у мышей HuT (PSMA и CD3) показано более быстрое выведение лекарственного средства из сыворотки крови (фигура 3D).
[00239] Наконец, гуманизация данных мышей не изменила поликлональное развитие CD8 и CD4 Т-клеток в селезенке, как определяли с использованием Т-клеточного рецептора (TCR) Vβ. Мыши HuT также имеют сходное общее количество Т-клеток и относительные доли CD4, CD8 и регуляторных Т-клеток (Treg) относительно мышей WT (данные не показаны и Crawford et al., Sci. Transl. Med. 11, eaau7534 (2019))
[00240] Вместе эти данные продемонстрировали, что распределение PSMAxCD3 определяется PSMA-связывающим плечом, и у данных мышей HuT оно локализуется с отбором тканей, экспрессирующих антиген.
PSMAxCDS является эффективным в отношении небольших сформированных опухолей у мышей HuT
[00241] Мышам HuT подкожно имплантировали линию клеток аденокарциномы предстательной железы мыши, экспрессирующих PSMA человека (TRAMP-C2-hPSMA). Обработка с помощью PSMAxCD3, начатая в день имплантации опухоли, полностью предотвращала рост опухоли по сравнению с мышами, которые получали контроль связывания CD3 (фигура 4А). Обработка с помощью PSMAxCD3, начатая при размере опухоли, составляющем приблизительно 50 мм3 (фигура 4В), также продемонстрировала значительную противоопухолевую эффективность. Однако, несмотря на значительную эффективность, индуцированную данными схемами лечения, если обработку откладывали до тех пор, пока опухоли не достигали примерно 200 мм3, противоопухолевая эффективность снижалась, демонстрируя быстрый, но временный противоопухолевый ответ (фигура 4С). Проточная цитометрия подтвердила, что экспрессия PSMA-мишени все еще сохранялась в опухолях TRAMP-C2-hPSMA, указывая, что отсутствие эффективности не было обусловлено отсутствием мишени. Кроме того, более высокая доза PSMAxCD3 на уровне 20 мг/кг все еще была недостаточной для контроля опухолей объемом 200 мм3, даже если сохранялась экспрессия PSMA-мишени (данные не показаны).
PSMAxCDS нацеливается на опухоли независимо от размера, но эффективность ограничивается опухолями меньшего размера.
[00242] Чтобы определить, определяется ли противоопухолевая эффективность местным окружением опухоли или общей опухолевой нагрузкой у мышей, создавали двустороннюю модель опухоли так, чтобы у каждой мыши на противоположных боках была небольшая и крупная опухоль. Мышам HuT вводили подкожной (SC) инъекций 1×107 (левый бок) и 1,25 × 10б (правый бок) клеток TRAMP-C2-hPSMA. В день 12, когда размер опухолей составлял приблизительно 150 мм3 (левый бок) и 50 мм3 (правый бок), мышам вводили PSMAxCD3 или контроль связывания CD3 в дозе 5 мг/кг дважды в неделю, осуществляя в общей сложности 4 обработки.
[00243] Хотя PSMAxCD3 было способно задерживать прогрессирование опухолей меньшего размера (фигура 5А), оно не оказывало влияния на более крупную опухоль на противоположном боку того же животного (фигура 5В). Эти данные свидетельствуют о том, что эффективность PSMAxCD3 определяется факторами, присущими опухоли, а не общей опухолевой нагрузкой или системной дисфункцией Т-клеток. Впоследствии, чтобы определить, может ли PSMAxCD3 проникать в крупные опухоли, мышам HuT, несущим двусторонние опухоли, вводили инъекцией 89Zr-PSMAxCD3 или 89Zr-контроль связывания CD3. У мышей, подвергнутых инъекции, показано специфическое поглощение 89Zr-PSMAxCD3 в периферических тканях и опухолях. Напротив, у мышей не показано специфическое поглощение 89Zr-контроля связывания CD3 в опухолях или тканях. Кроме того, анализ биораспределения ex vivo подтвердил, что существует аналогичное поглощение PSMAxCD3 наблюдается у небольших и крупных опухолей, следовательно отсутствие ответа не обусловлено отсутствием нацеливания PSMAxCD3 (фигура 5С и 5D).
Проточная цитометрия ex vivo
[00244] Проточную цитометрию использовали для обнаружения Т-клеток в кровотоке и для изучения статуса активации внутриопухолевых Т-клеток через 48 часов или 96 часов после обработки или для изучения сохранения PSMA-мишени на опухолевых клетках. Опухоли механически разрушали и расщепляли ферментами в течение 9 минут при 42°С в присутствии коллагеназы II (175 единиц/мл; Worthington), коллагеназы IV (200 единиц/мл; Gibco) и ДНКазы 1 (400 единиц/мл; Sigma). Затем подвергнутый расщеплению материал пропускали через фильтр для клеток. Для обнаружения Т-клеток использовали комбинацию CD45 (30-F11, Biolegend), CD90.2 (30-Н12, Biolegend), CD8 (53-6,7 BD Pharmingen), CD4 (GK1.5, BD Pharmingen) и FOXP3 (FJK-165, EBiosciences). Активацию Т-клеток исследовали с использованием антител к гранзиму В (GB11, BD Pharmingen), Ki67 (16А8, Biolegend) и 4-1ВВ (IAH2, BD Pharmingen). Окрашивание проводили с использованием набора буферов для окрашивания Ebioscience FoxP3. Т-клетки идентифицировали как CD45+, CD90.2+, CD8+, CD4+ или CD4+ FOXP3+.
PSMAxCDS индуцирует инфильтрацию и активацию Т-клеток в небольших и крупных опухолях
[00245] Чтобы оценить частоту и пространственное распределение внутриопухолевых Т-клеток, опухоли анализировали с помощью иммуногистохимического анализа. Парафиновые срезы тканей или опухолей толщиной 5 мкм окрашивали с помощью антитела к PSMA (ERP6253, АВСАМ), антитела к CD3 (А045229, DAKO), антитела к CD4 (АЬ183685, АВСАМ), антитела к CD8 (4SM15, eBiosciences) и антитела к FOXP3 (12653, Cell Signaling Technologies) с помощью IHC с применением Ventana Discovery XT (Ventana; Тусок, Аризона, США). Иммуногистохимическое окрашивание проводили на автоматизированной системе IHC-окрашивания Discovery XT с использованием набора для обнаружения Ventana DAB Map.Предметные стекла вручную перекрашивали гематоксилином (2 минуты), обезвоживали и накрывали покровным стеклом. Изображения получали на сканере предметных стекол Aperio AT 2 (Leica Biosystems; Буффало-Еров, Иллинойс, США) и анализировали с применением программного обеспечения Indica HALO (Indica Labs; Корралес, Нью-Мексико, США). Окрашивание гематоксилином-эозином выполняли в Histoserv, Inc (Джермантаун, Мэриленд, США).
[00246] На исходном уровне в отсутствие обработки CD4+ и CD8+ Т-клетки инфильтруют как небольшие, так и крупные опухоли. Затем опухоли исследовали после обработки PSMAxCD3 или контролем связывания CD3. Обработка с помощью PSMAxCD3 содействовали увеличению частоты встречаемости CD8+ Т-клеток как в опухолях объемом 50 мм3, так и объемом 200 мм3. Напротив, значительного влияния на частоту встречаемости CD4+ Т-клеток не наблюдали. Кроме того, частота встречаемости иммуносупрессорных FOXP3+ Treg-клеток была аналогичной у всех групп (данные не показаны). Поскольку Т-клетки присутствовали как в небольших, так и в крупных опухолях, определяли активность данных Т-клеток после введения PSMAxCD3 или контроля связывания CD3.
[00247] С помощью анализа на основе проточной цитометрии определили, что CD8+ и CD4+ Т-клетки как в небольших, так и в крупных опухолях активировали маркер цитолиза гранзим В и маркер пролиферации Ki67 после обработки с помощью PSMAxCD3 (данные не показаны). Дополнительно исследовали концентрации цитокинов IFN-β, IL-2 и TNF-α в сыворотке крови после введения PSMAxCD3, чтобы показать активацию Т-клеток. У обработанных PSMAxCD3 мышей HuT, несущих опухоли, системная продукция цитокинов индуцировалась через 4 часа, однако высвобождение цитокинов возвращалось к концентрациям исходного уровня через 72 часа, что указывает на сильный, но временный Т-клеточный ответ (данные не показаны). Напротив, обработка с помощью PSMAxCD3 в комбинации с антителом к 4-1ВВ приводила к усилению высвобождения цитокинов через 96 часов после обработки, что свидетельствует о стойком Т-клеточном ответе. Данные результаты позволяют предположить, что, хотя первоначального ответа может быть достаточно для устранения более мелких опухолей, размер которых уже уменьшился за 48 часов, Т-клетки не могут победить быстрорастущую крупную опухоль. Следовательно, для обеспечения противоопухолевого ответа в более крупных опухолях может потребоваться дополнительная костимуляция, служащая для стимуляции пролиферации и экспансии опухолеспецифических Т-клеток.
PSMAxCDS с костимуляцией 4-1ВВ является очень эффективным против более крупных опухолей.
[00248] Т-клетки из более крупной опухоли исследовали в отношении экспрессии 4-1ВВ. Анализ на основе проточной цитометрии продемонстрировал, что PSMAxCD3 индуцирует зависимую от активации поверхностную экспрессию 4-1ВВ, которая ограничена внутриопухолевыми Т-клетками, поскольку экспрессию не наблюдали на Т-клетках селезенки (фигура 6А). Затем определили, может ли костимуляция пути 4-1ВВ повысить противоопухолевую эффективность у мышей с более высокой опухолевой нагрузкой. В то время как PSMAxCD3 или антитело к 4-1ВВ по отдельности демонстрировали некоторую задержку роста опухоли, у мышей, обработанных однократной дозой PSMAxCD3 в комбинации с антителом к 4-1ВВ, наблюдали поразительную противоопухолевую эффективность (фигура 6В) и полный клиренс 50-60% опухолей в день 60 (фигура 6С). Следует отметить, что мыши, которые получали PSMAxCD3 в комбинации с антителом к 4-1ВВ, действительно испытывали временную потерю веса при введении более высокой дозы PSMAxCD3 в комбинации с антителом к -4-1ВВ. Данную временную потерю веса можно смягчить, уменьшив дозу PSMAxCD3 с 5 мг/кг до 1 мг/кг в комбинации с антителом к 4-1ВВ, что не влияет на общую противоопухолевую эффективность (данные не показаны). Кроме того, у мышей, обработанных с помощью PSMAxCD3 в комбинации с антителом 4-1ВВ, показана повышенная экспрессия транскрипта адаптерного белка TRAF1, который является необходимым для путей активации, индуцированных 4-1ВВ, а также для активации генов выживания Bcl2, Bcl-XL (Bcl211) и BFL-1 (Bcl2a1a) (фигура 6D).
PSMAxCDS при костимуляции 4-1ВВ обеспечивает увеличение экспансии и продлевает выживаемость CD8 Т-клеток
[00249] Высвобождение цитокинов в сыворотку крови оценивали как показатель активации Т-клеток, и у мышей, обработанных с помощью PSMAxCD3 в комбинации с антителом к 4-1ВВ, показана усиленная и устойчивая индукция цитокинов даже через 96 часов после обработки, в то время как концентрации цитокинов вернулись к исходным уровням у мышей, обработанных с помощью PSMAxCD3 отдельно (данные не показаны). Поскольку гены выживания активируются посредством путей 4-1ВВ, исследовали инфильтрирующие опухоль CD8 и CD4 Т-клетки через 96 часов после обработки. Действительно, у мышей, обработанных с помощью комбинированного лечения, наблюдали заметную экспансию компартмента CD8 Т-клеток по сравнению с мышами, обработанными контролем связывания CD3, антителом к 4-1ВВ или PSMAxCD3 отдельно (фигура 7А). Кроме того, PSMAxCD3 в комбинации с антителом к4-1ВВ увеличивали долю и общее число гранзим В+ (данные не показаны) и Ki67+ (данные не показаны) CD8 Т-клеток, что позволяет предположить, что комбинированное лечение индуцирует экспансию инфильтрирующих опухоль Т-клеток, способных оказывать цитотоксическое действие и характеризующихся длительной пролиферацией. Хотя общее количество Treg-клеток было аналогичным во всех группах обработки, отношение CD8 к Treg было значительно увеличено вследствие экспансии CD8+ Т-клеток у мышей, получивших комбинированное лечение (данные не показаны). Мышей, у которых исчезли крупные опухоли, подвергали повторному введению клеток TRAMP-C2-hPSMA в противоположный бок. По сравнению с не подвергавшимися воздействию мышами, мыши, которые получали комбинированное лечение, были способны контролировать вторичное введение опухоли, что указывает на образование опухолеспецифических клеток иммунологической памяти (фигура 7 В и таблица 2).
[00250] В целом данные продемонстрировали, что, хотя PSMAxCD3 способно индуцировать активацию, продуцирование цитокинов и пролиферацию Т-клеток в краткосрочном периоде, комбинация с антителом к 4-1ВВ может продлевать и усиливать данные эффекты для достижения противоопухолевой эффективности даже в сформировавшихся опухолях. Кроме того, мыши, обработанные с помощью PSMAxCD3 или PSMAxCD3 + антитело к 4-1ВВ, были защищены от вторичного введения опухоли.
Выводы
[00251] Биспецифическое антитело к CD3, нацеливающееся на опухолевый антиген PSMA (PSMAxCD3), демонстрирует доклиническую эффективность на нескольких мышиных моделях. PSMAxCD3 в комбинации с антителом к 4-1ВВ обеспечивает устойчивую противоопухолевую активность, что приводит к долгосрочному выживанию мышей, демонстрируя, что костимуляция может повысить эффективность биспецифических антител к CD3 в отношении солидных опухолей на поздних стадиях.
[00252] Объем настоящего изобретения не ограничен конкретными вариантами осуществления, описанными в данном документе. В действительности различные модификации настоящего изобретения в дополнение к описанным в данном документе будут очевидны специалистам в данной области техники на основании вышеизложенного описания. Предполагается, что такие модификации входят в объем прилагаемой формулы изобретения.
--->
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
<110> Ридженерон Фармасьютикалс, Инк.
Кершнер, Джессика Р.
Кроуфорд, Элисон
Чиу, Даника
<120> ПРИМЕНЕНИЕ БИСПЕЦИФИЧЕСКИХ АНТИГЕНСВЯЗЫВАЮЩИХ МОЛЕКУЛ, КОТОРЫЕ
СВЯЗЫВАЮТ PSMA И CD3, В КОМБИНАЦИИ С КОСТИМУЛЯЦИЕЙ 4-1BB
<130> 10595WO01
<140>TBD
<141> 2020-06-19
<150> 62/864999
<151> 2019-06-21
<160> 3
<170>PatentIn версия 3.5
<210> 1
<211> 124
<212> БЕЛОК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Синтетическая
<400> 1
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Ser Tyr Ala Gly Asn Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Val Ser Arg Asp Asn Ser Lys Lys Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Asp Ser Tyr Tyr Asp Phe Leu Thr Asp Pro Asp Val Leu Asp
100 105 110
Ile Trp Gly Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 2
<211> 124
<212> БЕЛОК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Синтетическая
<400> 2
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Asp Tyr
20 25 30
Ser Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gly Ile Ser Trp Asn Ser Gly Ser Ile Gly Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Tyr Gly Ser Gly Tyr Gly Lys Phe Tyr Tyr Tyr Gly Met Asp
100 105 110
Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 3
<211> 108
<212> БЕЛОК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Синтетическая
<400> 3
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Pro
85 90 95
Ile Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile Lys
100 105
<---
название | год | авторы | номер документа |
---|---|---|---|
ПРИМЕНЕНИЕ БИСПЕЦИФИЧЕСКИХ АНТИГЕНСВЯЗЫВАЮЩИХ МОЛЕКУЛ, КОТОРЫЕ СВЯЗЫВАЮТ MUC16 И CD3, В КОМБИНАЦИИ С КОСТИМУЛЯЦИЕЙ 4-1BB | 2020 |
|
RU2822091C2 |
НОВОЕ PSMA-СВЯЗЫВАЮЩЕЕ АНТИТЕЛО И ЕГО ПРИМЕНЕНИЯ | 2017 |
|
RU2762704C2 |
АНТИТЕЛА, СВЯЗЫВАЮЩИЕ CD3 | 2017 |
|
RU2790288C2 |
АНТИТЕЛА, СВЯЗЫВАЮЩИЕ CD3 | 2017 |
|
RU2807216C2 |
Молекулы, связывающиеся с 4-1ВВ | 2011 |
|
RU2710717C2 |
HER-2-НАПРАВЛЕННЫЕ АНТИГЕНСВЯЗЫВАЮЩИЕ МОЛЕКУЛЫ, СОДЕРЖАЩИЕ 4-1BBL | 2019 |
|
RU2815451C2 |
БИСПЕЦИФИЧЕСКИЕ АНТИГЕНСВЯЗЫВАЮЩИЕ МОЛЕКУЛЫ | 2012 |
|
RU2650775C2 |
СПОСОБЫ ЛЕЧЕНИЯ РАКА, ВКЛЮЧАЮЩИЕ СВЯЗЫВАЮЩИЕ TIGIT АГЕНТЫ | 2017 |
|
RU2765410C2 |
БИСПЕЦИФИЧЕСКИЕ АНТИТЕЛА К CD25 И Fc ГАММА-РЕЦЕПТОРУ ДЛЯ ЭЛИМИНАЦИИ ОПУХОЛЕСПЕЦИФИЧЕСКИХ КЛЕТОК | 2017 |
|
RU2759970C2 |
PSMA×CD3 БИСПЕЦИФИЧЕСКОЕ ОДНОЦЕПОЧЕЧНОЕ АНТИТЕЛО С МЕЖВИДОВОЙ СПЕЦИФИЧНОСТЬЮ | 2009 |
|
RU2559531C2 |
Изобретение относится к области биотехнологии. Описана группа изобретений, включающая применение биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA и агониста 4-1ВВ для лечения PSMA-положительного рака или подавления роста PSMA-положительной опухоли, применение биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA и агониста 4-1ВВ для увеличения размножения CD8+ Т-клеток в PSMA-положительной опухолевой ткани, применение биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA и агониста 4-1ВВ для инициирования и/или усиления Т-клеточного ответа в отношении PSMA-положительной опухоли и фармацевтическую комбинацию для лечения PSMA-положительного рака или подавления роста PSMA-положительной опухоли, увеличения размножения CD8+ Т-клеток в PSMA-положительной опухолевой ткани и/или инициирования и/или усиления Т-клеточного ответа в отношении PSMA-положительной опухоли. Изобретение расширяет арсенал средств для лечения PSMA-положительного рака или подавления роста PSMA-положительной опухоли, увеличения размножения CD8+ Т-клеток в PSMA-положительной опухолевой ткани и/или инициирования и/или усиления Т-клеточного ответа в отношении PSMA-положительной опухоли. 4 н. и 30 з.п. ф-лы, 7 ил., 2 табл., 2 пр.
1. Применение биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA и агониста 4-1ВВ для лечения PSMA-положительного рака или подавления роста PSMA-положительной опухоли, где биспецифическая антигенсвязывающая молекула к CD3/PSMA содержит:
первый антигенсвязывающий домен, который специфически связывает CD3 человека; и
второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает PSMA человека и содержит три аминокислотные последовательности определяющей комплементарность области тяжелой цепи (HCDR1-2, HCDR2-2 и HCDR3-2) в пределах аминокислотной последовательности вариабельной области тяжелой цепи (HCVR-2) под SEQ ID NO: 1 и три аминокислотные последовательности определяющей комплементарность области легкой цепи (LCDR1, LCDR2 и LCDR3) в пределах аминокислотной последовательности вариабельной области легкой цепи (LCVR), содержащей SEQ ID NO: 3; и
где агонист 4-1ВВ представляет собой антитело к 4-1ВВ.
2. Применение по п. 1, где рак выбран из группы, состоящей из рака предстательной железы, рака почки, рака мочевого пузыря, колоректального рака и рака желудка.
3. Применение по п. 2, где рак представляет собой рак предстательной железы.
4. Применение по п. 3, где рак предстательной железы представляет собой кастрационно-резистентный рак предстательной железы.
5. Применение по п. 1, где биспецифическое антитело к CD3/PSMA и агонист 4-1ВВ вводят отдельно.
6. Применение по п. 1, где биспецифическое антитело к CD3/PSMA и агонист 4-1ВВ вводят совместно.
7. Применение по п. 1, где биспецифическое антитело к CD3/PSMA вводят до, одновременно или после агониста 4-1ВВ.
8. Применение по п. 7, где биспецифическое антитело к CD3/PSMA вводят до агониста 4-1ВВ.
9. Применение по п. 7, где биспецифическое антитело к CD3/PSMA вводят в тот же день, что и агонист 4-1ВВ.
10. Применение по любому из пп. 1-9, где биспецифическое антитело к CD3/PSMA вводят в комбинации с агонистом 4-1ВВ.
11. Применение по п. 1, где антитело к 4-1ВВ представляет собой антитело, выбранное из группы, состоящей из урелумаба и утомилумаба.
12. Применение по любому из пп. 1-11, где первый антигенсвязывающий домен, который специфически связывает CD3 человека, содержит аминокислотную последовательность вариабельной области тяжелой цепи (HCVR-1) под SEQ ID NO: 2.
13. Применение по любому из пп. 1-12, где второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает PSMA человека, содержит аминокислотную последовательность вариабельной области тяжелой цепи (HCVR-2) под SEQ ID NO: 1.
14. Применение по любому из пп. 1-13, где первый антигенсвязывающий домен, который специфически связывает CD3, содержит аминокислотную последовательность HCVR-1 под SEQ ID NO: 2 и второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает PSMA, содержит аминокислотную последовательность HCVR-2 под SEQ ID NO: 1.
15. Применение по любому из пп. 1-14, где биспецифическая антигенсвязывающая молекула содержит общую LCVR под SEQ ID NO: 3.
16. Применение по п. 1, где объем опухоли уменьшается по сравнению с таковым при лечении в отсутствие агониста 4-1ВВ.
17. Применение по п. 1, где безопухолевая выживаемость увеличивается по сравнению с таковой при лечении в отсутствие агониста 4-1ВВ.
18. Применение по п. 1, где экспрессия TRAF1 в опухоли субъекта увеличивается в по меньшей мере приблизительно 4 раза по сравнению с экспрессией TRAF1 в опухоли субъекта, которому вводили биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к CD3/PSMA в отсутствие агониста 4-1ВВ.
19. Применение по п. 1, где экспрессия Вс12 в опухоли субъекта увеличивается в по меньшей мере приблизительно 2 раза по сравнению с экспрессией Вс12 в опухоли субъекта, которому вводили биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к CD3/PSMA в отсутствие агониста 4-1ВВ.
20. Применение по п. 1, где экспрессия BFL-1 в опухоли субъекта увеличивается в по меньшей мере приблизительно 3 раза по сравнению с экспрессией BFL-1 в опухоли субъекта, которому вводили биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к CD3/PSMA в отсутствие агониста 4-1ВВ.
21. Применение по п. 1, где размножение CD8+ Т-клеток в опухоли субъекта увеличивается и/или выживаемость CD8+ Т-клеток увеличивается по сравнению с таковыми у CD8+ Т-клеток в опухоли субъекта, которому вводили биспецифическую антигенсвязывающую молекулу к CD3/PSMA в отсутствие агониста 4-1ВВ.
22. Применение биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA и агониста 4-1ВВ для увеличения размножения CD8+ Т-клеток в PSMA-положительной опухолевой ткани, где биспецифическая антигенсвязывающая молекула к CD3/PSMA содержит:
первый антигенсвязывающий домен, который специфически связывает CD3 человека; и
второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает PSMA человека и содержит три аминокислотные последовательности определяющей комплементарность области тяжелой цепи (HCDR1-2, HCDR2-2 и HCDR3-2) в пределах аминокислотной последовательности вариабельной области тяжелой цепи (HCVR-2) под SEQ ID NO: 1 и три аминокислотные последовательности определяющей комплементарность области легкой цепи (LCDR1, LCDR2 и LCDR3) в пределах аминокислотной последовательности вариабельной области легкой цепи (LCVR), содержащей SEQ ID NO: 3;
и где агонист 4-1ВВ представляет собой антитело к 4-1ВВ.
23. Применение по п. 22, где отношение CD8+ Т-клеток к Treg увеличивается в опухолевой ткани субъекта, подвергавшегося лечению биспецифической антигенсвязывающей молекулой к CD3/PSMA вместе с агонистом 4-1ВВ, по сравнению с отношением CD8+ Т-клеток к Treg в опухолевой ткани субъекта, подвергавшегося лечению биспецифической антигенсвязывающей молекулой к CD3/PSMA в отсутствие агониста 4-1ВВ.
24. Применение по п. 1, где последующее воздействие опухолевых клеток инициирует ответ с участием клеток памяти у субъекта, подвергавшегося лечению биспецифической антигенсвязывающей молекулой к CD3/PSMA в присутствии агониста 4-1ВВ.
25. Применение биспецифической антигенсвязывающей молекулы к CD3/PSMA и агониста 4-1ВВ для инициирования и/или усиления Т-клеточного ответа в отношении PSMA-положительной опухоли, предусматривающее введение композиции субъекту, нуждающемуся в этом, где биспецифическая антигенсвязывающая молекула к CD3/ PSMA содержит:
первый антигенсвязывающий домен, который специфически связывает CD3 человека; и
второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает PSMA человека и содержит три аминокислотные последовательности определяющей комплементарность области тяжелой цепи (HCDR1-2, HCDR2-2 и HCDR3-2) в пределах аминокислотной последовательности вариабельной области тяжелой цепи (HCVR-2) под SEQ ID NO: 1 и три аминокислотные последовательности определяющей комплементарность области легкой цепи (LCDR1, LCDR2 и LCDR3) в пределах аминокислотной последовательности вариабельной области легкой цепи (LCVR), содержащей SEQ ID NO: 3;
где агонист 4-1ВВ представляет собой антитело к 4-1ВВ.
26. Фармацевтическая комбинация для лечения PSMA-положительного рака или подавления роста PSMA-положительной опухоли, увеличения размножения CD8+ Т-клеток в PSMA-положительной опухолевой ткани и/или инициирования и/или усиления Т-клеточного ответа в отношении PSMA-положительной опухоли, содержащая:
(a) биспецифическую антигенсвязывающую молекулу, содержащую: (i) первый антигенсвязывающий домен, который специфически связывает CD3 человека, (ii) второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает PSMA человека и содержит три аминокислотные последовательности определяющей комплементарность области тяжелой цепи (HCDR1-2, HCDR2-2 и HCDR3-2) в пределах аминокислотной последовательности вариабельной области тяжелой цепи (HCVR-2) под SEQ ID NO: 1 и три аминокислотные последовательности определяющей комплементарность области легкой цепи (LCDR1, LCDR2 и LCDR3) в пределах аминокислотной последовательности вариабельной области легкой цепи (LCVR), содержащей SEQ ID NO: 3;
(b) агонист 4-1ВВ, где агонист 4-1ВВ представляет собой антитело к 4-1ВВ; и
(c) фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
27. Фармацевтическая комбинация по п. 26, где биспецифическая антигенсвязывающая молекула из части (а) содержит аминокислотную последовательность общей LCVR под SEQ ID NO: 3.
28. Фармацевтическая комбинация по п. 26, где первый антигенсвязывающий домен, который специфически связывает CD3 человека содержит аминокислотную последовательность вариабельной области тяжелой цепи (HCVR-1) под SEQ ID NO: 2.
29. Фармацевтическая комбинация по п. 26, где второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает PSMA человека содержит аминокислотную последовательность вариабельной области тяжелой цепи (HCVR-2) под SEQ ID NO: 1.
30. Фармацевтическая комбинация по п. 26, где первый антигенсвязывающий домен, который специфически связывает CD3, содержит аминокислотную последовательность HCVR-1 под SEQ ID NO: 2 и второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает PSMA, содержит аминокислотную последовательность HCVR-2 под SEQ ID NO: 1.
31. Применение по п. 22 или 25, где первый антигенсвязывающий домен, который специфически связывает CD3 человека, содержит аминокислотную последовательность вариабельной области тяжелой цепи (HCVR-1) под SEQ ID NO: 2.
32. Применение по п. 22 или 25, где второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает PSMA человека, содержит аминокислотную последовательность вариабельной области тяжелой цепи (HCVR-2) под SEQ ID NO: 1.
33. Применение по п. 31 или 32, где первый антигенсвязывающий домен, который специфически связывает CD3, содержит аминокислотную последовательность HCVR-1 под SEQ ID NO: 2 и второй антигенсвязывающий домен, который специфически связывает PSMA, содержит аминокислотную последовательность HCVR-2 под SEQ ID NO: 1.
34. Применение по п. 22 или 25, где биспецифическая антигенсвязывающая молекула содержит общую LCVR под SEQ ID NO: 3.
WO 2018114754 A1, 28.06.2018 | |||
WO 2017023761 A1, 09.02.2017 | |||
JP 2015535828 A, 17.12.2015 | |||
JP 2018537516 A, 20.12.2018 | |||
WO 2012145183 A2, 26.10.2012 | |||
PSMA×CD3 БИСПЕЦИФИЧЕСКОЕ ОДНОЦЕПОЧЕЧНОЕ АНТИТЕЛО С МЕЖВИДОВОЙ СПЕЦИФИЧНОСТЬЮ | 2009 |
|
RU2559531C2 |
Авторы
Даты
2024-07-01—Публикация
2020-06-19—Подача