КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ Российский патент 2024 года по МПК C12N1/20 A61K35/74 A61K35/742 A61P1/00 

[001] Настоящая заявка испрашивает приоритет по предварительной заявке на патент США № 61/760584, поданной 4 февраля 2013 г., предварительной заявке на патент США № 61/760585, поданной 4 февраля 2013 г., предварительной заявке на патент США № 61/760574, поданной 4 февраля 2013 г., предварительной заявке на патент США № 61/760606, поданной 4 февраля 2013 г., и предварительной заявке на патент США № 61/926918, поданной 13 января 2014 г. Все указанные заявки включены посредством ссылки полностью для любых целей.

ССЫЛКА НА ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

[002] Настоящая заявка включает Перечень последовательностей, поданный в электронном формате в виде текстового файла, озаглавленного «25970PCT_sequencelisting.txt», созданного 2 февраля 2014 г. и имеющего размер 4 100 000 байтов. Указанный перечень последовательностей включен посредством ссылки.

Область техники

[003] Микроорганизмы колонизируют желудочно-кишечный тракт (ЖКТ), кожу и другие эпителиальные и тканевые ниши в организме млекопитающих, например, ротовую полость, поверхность глаз и влагалище. В желудочно-кишечном тракте локализовано многочисленное и разнообразное сообщество микроорганизмов. Среду или нишу для сообщества множества различных видов или организмов, в том числе разнообразных штаммов бактерий обеспечивает сложная система. Сотни разных видов могут образовывать сообщество комменсалов в ЖКТ здорового индивидуума; указанный набор организмов развивается с момента рождения с формированием функционально зрелой популяции микроорганизмов приблизительно к возрасту 3-х лет. Взаимодействия между штаммами микроорганизмов в указанных популяциях, а также между микроорганизмами и хозяином, например, с иммунной системой хозяина, формируют структуру указанного сообщества, при этом на распределение микроорганизмов влияет доступность ресурсов и конкуренция за ресурсы. Такими ресурсами могут быть пища, местоположение и доступность пространства для роста, или физическая структура, к которой может прикрепляться микроорганизм. Например, рацион питания хозяина вносит вклад в формирование флоры ЖКТ.

[004] Нормальная микробиота обеспечивает ряд преимуществ для хозяина, в том числе устойчивость к колонизации широким спектром патогенов, биосинтез и поглощение важнейших питательных веществ, а также стимуляцию иммунной системы для поддержания здоровья кишечного эпителия и адекватной регуляции системного иммунитета. В условиях «дисбиоза» или нарушенного симбиоза функции микробиоты могут утрачиваться или нарушаться, что приводит к повышенной восприимчивости к патогенам, измененным метаболическим профилям или индукции провоспалительных сигналов, что может приводить к местному или системному воспалению или аутоиммунным реакциям. Таким образом, микробиота ЖКТ играет важную роль в патогенезе многих заболеваний и расстройств, в том числе разнообразных патогенных инфекций пищеварительного тракта. Например, восприимчивость субъектов к патогенным инфекциям повышается, если нормальная микробиота ЖКТ была повреждена в результате применения антибиотиков широкого спектра действия. Многие из указанных заболеваний и расстройств представляют собой хронические состояния, значительно снижающие качество жизни субъекта и способные в конечном итоге приводить к смертельному исходу.

[005] Производители пробиотиков утверждали, что предлагаемые ими составы с бактериями способствуют поддержанию здоровья млекопитающих за счет сохранения естественной микрофлоры ЖКТ и усиления нормального контроля над аберрантными иммунными реакциями. См., например, патент США № 8034601. Пробиотики тем не менее были ограничены очень узкой группой родов и, соответственно, ограниченным числом видов; таким образом, во многих ситуациях они не заменяют адекватным образом отсутствующую естественную микрофлору ЖКТ.

[006] Таким образом, у практикующих специалистов имеется потребность в способе заселения желудочно-кишечного тракта субъекта разнообразными полезными наборами микробиоты для коррекции дисбиоза.

[007] Соответственно, отвечая на потребность в устойчивых, действенных и эффективных композициях и способах лечения заболеваний ЖКТ путем восстановления или усиления функций микробиоты, авторы настоящего изобретения решают указанные и другие проблемы предшествующего уровня техники, предлагая композиции и способы лечения субъектов.

СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ

[008] Раскрытые в настоящем изобретении терапевтические композиции, содержащие непатогенные способные к прорастанию бактериальные споры для предотвращения, контроля и лечения заболеваний, расстройств и состояний ЖКТ и поддержания общего здоровья в области пищеварения. Указанные композиции обладают полезными свойствами, поскольку подходят для безопасного введения человеку и другим субъектам-млекопитающим, а также эффективны при многочисленных желудочно-кишечных заболеваниях, расстройствах и состояниях и для поддержания общего здоровья в области питания.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ЧЕРТЕЖЕЙ

[009] На фиг. 1A приведено схематическое изображение гена 16S рРНК и указаны координаты гипервариабельных областей 1-9 (V1-V9). Координаты V1-V9: 69-99, 137-242, 433-497, 576-682, 822-879, 986-1043, 1117-1173, 1243-1294 и 1435-1465, соответственно, на основе нумерации с применением системы номенклатуры для E. coli по Brosius et al., Complete nucleotide sequence of a 16S ribosomal RNA gene from Escherichia coli, PNAS 75(10):4801-4805 (1978). На фиг. 1B выделены жирным шрифтом нуклеотидные последовательности для каждой гипервариабельной области в типовой референсной последовательности 16S E. coli, описанной Brosius et al.

[010] На фиг. 2 приведена фотография градиента CsCl, демонстрирующая отделение спор от другого остаточного материала среды обитания.

[011] На фиг. 3 приведено три фазово-контрастных изображения, демонстрирующих нарастающее обогащение спорами из суспензии фекалий; обработанного этанолом и очищенного CsCl состава со спорами; и обработанного этанолом и очищенного CsCl и сахарозой состава со спорами.

[012] На фиг. 4 приведена совокупность кривых выживаемости, демонстрирующих эффективность популяции спор в модели профилактики C. difficile на мышах.

[013] На фиг. 5 приведена совокупность кривых выживаемости, демонстрирующих эффективность популяции спор в модели предотвращения рецидива C. difficile на хомяках.

[014] На фиг. 6 продемонстрирована жизнеспособность клеток при разнообразных вариантах обработки этанолом и термообработки в течение различных периодов времени.

[015] На фиг. 7 продемонстрирована способность к выживанию клеток из четырех донорских образцов фекалий после термообработки при 60°C в течение 5 минут.

[016] На фиг. 8 продемонстрировано, что этанол уменьшает численность и анаэробных, и аэробных бактериальных видов на несколько порядков величины за секунды.

[017] На фиг. 9 продемонстрирована зависимость концентрации спор от времени в полученных образцах фекалий от нескольких доноров.

[018] На фиг. 10 показана выраженная корреляция и линейная зависимость между измерением концентрации ДПК с применением анализа сопряженных спектров флуоресценции и количеством жизнеспособных споровых колониеобразующих единиц.

[019] На фиг. 11 показан эффект различных обработок способствующим прорастанию веществом на способность бактерий к вегетативному росту в популяции спор.

[020] На фиг. 12 показано увеличение бактериального разнообразия при применении обработки способствующим прорастанию веществом для получения вегетативных форм бактерий из популяций спор.

[021] На фиг. 13 показана роль термоактивации при различных температурах на спорах из трех разных образцов донорских фекалий.

[022] На фиг. 14 показано, что обработка лизоцимом совместно с термоактивацией улучшает прорастание при большинстве температур.

[023] На фиг. 15 приведены концентрации спор, присутствующих в образце фекалий, при культивировании на разных средах.

[024] На фиг. 16 показано аналогичное спорообразование при инкубировании планшетов в течение 2 и 7 дней после прорастания популяции спор на планшетах с различными средами.

[025] На фиг. 17 показана защитная эффективность популяции спор у мышей, стимулированных C. difficile, по оценке на основании изменения массы тела мышей на протяжении эксперимента. Каждый график отражает изменение массы тела индивидуальной мыши относительно дня -1 на протяжении эксперимента. Число смертей на протяжении эксперимента указано сверху над графиком и отражено окончанием линии перед днем 6. На верхних панелях (слева направо) представлены группа с контролем-носителем, группа с суспензией фекалий и группа с необработанным нестимулированным контролем; на нижних панелях представлены обработанный этанолом и очищенный в градиенте состав со спорами; обработанный этанолом очищенный в градиенте «способный к прорастанию» состав со спорами, и обработанные этанолом очищенный в градиенте «способный к споруляции» состав.

[026] На фиг. 18 представлено разнообразие микроорганизмов, измеренное в обработанных этанолом споровых образцах и образцах пациента до лечения и после лечения. Общее разнообразие микроорганизмов определяют с применением индекса альфа-разнообразия Chao1 и измеряют с той же глубиной анализа генома для подтверждения адекватного перекрытия последовательностей для анализа микробиома в целевых образцах. Пациент до лечения (фиолетовый) был носителем микробиома со значительно уменьшенным общим разнообразием по сравнению с обработанными этанолом спорами (красный) и с пациентом после лечения на 5 день (синий), 14 (оранжевый) день и 25 (зеленый) день.

[027] На фиг. 19 показано, как происходит сдвиг экогруппы микроорганизмов у пациента при лечении обработанными этанолом спорами от дисбиотического состояния в сторону здорового состояния. Анализ главных координат на основании общего разнообразия и структуры микробиома (бета-разнообразие Брея-Кертиса) пациента до и после лечения показывает, что сочетание приживления OTU при лечении спорами и стимуляции экогруппы микроорганизмов пациента приводит к получению экогруппы микроорганизмов, отличной как от микробиома до лечения, так и от экогруппы при лечении обработанными этанолом спорами.

[028] На фиг. 20 показана стимуляция видов Bacteroides у пациентов, получавших лечение популяции спор. Сравнение количества колоний Bacteroides из суспензии фекалий до лечения и на 4 неделе после лечения демонстрирует увеличение в 4 log или более. Колонии нумеровали по серийным разведениям и высевали на агар с желчными кислотами и эскулином для Bacteroides, высокоселективный в отношении группы B. fragilis. Виды определяли путем идентификации полноразмерных последовательностей 16S.

[029] На фиг. 21 показано увеличение числа приживающихся видов и стимулируемых видов в микробиомах пациента после лечения обработанной этанолом популяции спор. Относительную распространенность видов, которые приживались или были стимулированы согласно описанию, определяли на основании числа прочтений последовательностей 16S. Все графики соответствуют разным пациентам, получавшим лечение рецидивирующего C. difficile обработанной этанолом популяции спор.

[030] На фигурах представлены различные варианты реализации настоящего изобретения исключительно в иллюстративных целях. Специалист в данной области техники легко поймет из приведенного ниже описания, что альтернативные варианты реализации проиллюстрированных в настоящем документе структур и способов могут быть реализованы без отступления от принципов настоящего изобретения, описанных в настоящем документе.

Описание таблиц

[031] Таблица 1. Перечень функциональных таксономических единиц (OTU) с таксономической принадлежностью к роду, виду и филогенетической кладе. Принадлежность клад бактериальных OTU основана на данных о последовательностях 16S. Клады определяют на основании топологии филогенетического дерева, сконструированного на основании полноразмерных последовательностей 16S с применением методов максимального правдоподобия, известных специалистам в области филогенетики. Конструируют клады для подтверждения того, что все OTU в определенной кладе: (i) расположены в пределах определенного числа узлов с бутстреп-поддержкой друг от друга, и (ii) отличаются не более чем на 5% в отношении генетического сходства. OTU, принадлежащие одной кладе, можно определить как генетически и филогенетически отличные от OTU другой клады на основании данных секвенирования 16S-V4, при этом OTU, попадающие в одну кладу, являются близкородственными. OTU, попадающие в одну кладу, являются эволюционно близкородственными, и могут быть отличимы или неотличимы друг от друга при применении данных секвенирования 16S-V4. Представители одной клады, благодаря эволюционному родству, играют аналогичные функциональные роли в экогруппе микроорганизмов, например, обнаруживаемых в кишечнике человека. Композиции, где одни виды замещены другими из той же клады, предположительно сохраняют консервативную экологическую функцию и, соответственно, подходят для применения в настоящем изобретении. Для всех OTU обозначено наличие предполагаемой способности образовывать споры и то, являются ли они патогенными или патобионтными (см. определения для описания «патобионта»). Приоритетные патогены по классификации NIAID обозначены как «категория A», «категория B» или «категория C», а оппортунистические патогены обозначены как «ОП». OTU, которые не являются патогенными, или способность которых существовать в виде патогенов неизвестна, обозначены отметкой «НЕТ». «SEQ ID №» соответствует идентификатору OTU в Перечне последовательностей; «№ доступа в общедоступной базе данных» соответствует идентификационному номеру OTU в общедоступной базе последовательностей.

[032]

[033] В таблице 2 приведены бактериальные OTU, идентифицированные с помощью анализа 16s обработанной этанолом популяции спор до и после очищения в градиенте CsCl.

[034] В таблице 3 приведены смертность и изменение массы тела мышей, получавших лечение суспензией донорских фекалий и обработанным этанолом и/или термообработанным составом со спорами в различных разведениях,

[035] В таблице 4 приведены OTU, идентифицированные среди спорообразующих видов, полученных путем выделения колоний из состава со спорами, включая различные варианты термообработки

[036] Таблица 5 содержит OTU, не идентифицированные в необработанных фекальных суспензиях, однако идентифицированные в обработанных этанолом или термообработанных популяциях спор.

[037] Таблица 6 содержит OTU, идентифицированные в обработанной этанолом популяции спор, выделенной из образца микробиома от донора A.

[038] Таблица 7 содержит OTU, идентифицированные в обработанной этанолом популяции спор, выделенной из образца микробиома от донора B.

[039] Таблица 8 содержит OTU, идентифицированные в обработанной этанолом популяции спор, выделенной из образца микробиома от донора C.

[040] Таблица 9 содержит OTU, идентифицированные в обработанной этанолом популяции спор, выделенной из образца микробиома от донора D.

[041] Таблица 10 содержит OTU, идентифицированные в обработанной этанолом популяции спор, выделенной из образца микробиома от донора E.

[042] Таблица 11 содержит OTU, идентифицированные в обработанной этанолом популяции спор, выделенной из образца микробиома от донора F.

[043] Таблица 12 содержит OTU, идентифицированные в культивируемых обработанных этанолом популяциях спор на разных средах типов.

[044] Таблица 13. Виды, идентифицированные как «способные к прорастанию» и «способные к споруляции» методом точечного выделения колоний

[045] Таблица YYY. Виды, идентифицированные как «способные к прорастанию» с применением метода 16S-V4 NGS.

[046] Таблица ZZZ. Виды, идентифицированные как «способные к споруляции» с применением метода 16s-V4 NGS.

[047] На таблице AC приведены данные относительно содержания спор для 3 разных обработанных этанолом составов со спорами, примененных для успешного лечения 3 пациентов, страдающих рецидивирующей инфекцией C. difficile.

[048] Таблица AD. Дозы ДПК в таблице AC при нормировании к 4×10⁵ СКОЕ на дозу

[049] Таблица GB. OTU, детектированные минимум по десяти прочтения последовательностей 16S-V4 по меньшей мере в одном обработанном этанолом составе со спорами (панмикробиом). Отмечены OTU, приживающиеся у получавших лечение пациентов, и процент пациентов, у которых они приживаются, а также клады, статус спорообразования и статус ключевых OTU. Отмеченные звездочкой OTU встречаются в ≥80% обработанных этанолом составов и приживаются у ≥50% получавших лечение пациентов.

[050] В таблице GC ранжированы первые 20 OTU по CES, при этом имеется дополнительное требование: должно быть показано, что OTU приживается, чтобы она считалась коровым экологическим элементом.

[051] Таблица GD: Коровые экологические подгруппы, протестированные в модели на мышах с C. difficile

[052] Таблица GE: Результаты для бактериальных композиций, протестированных в модели на мышах с C. difficile.

[053] Таблица GF. OTU и принадлежность их клад, протестированные в тройных комбинациях, с результатами анализа ингибирования in vitro

[054] Таблица ZA. Композиции с микроорганизмами, которые вводят через оральный зонд в день -1

[055] Таблица TAB. Популяция OTU в 2, 3 и 4 день после дозирования композициями с микроорганизмами

[056] Таблица TAC. Популяция клад в 2, 3 и 4 дни после дозирования композициями с микроорганизмами

[057] Таблица TAD. Смертность в экспериментальной группе мышей, стимулированных 10^4,5 спор C. difficile в 0 день

ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ

ОБЩИЙ ОБЗОР

[058] В настоящем изобретении раскрыты терапевтические композиции, содержащие непатогенные, способные к прорастанию бактериальные споры, для предотвращения, контроля и лечения заболеваний, расстройств и состояний ЖКТ и поддержания общего здоровья в области пищеварения. Указанные композиции обладают полезными свойствами, поскольку подходят для безопасного введения человеку и другим субъектам-млекопитающим, а также эффективны при многочисленных желудочно-кишечных заболеваниях, расстройствах и состояниях и для поддержания общего здоровья в области пищеварения. Хотя композиции на основе спор известны, их обычно получают с применением других техник, таких как лиофилизация или высушивание распылением жидких бактериальных культур, что приводит к неудовлетворительной эффективности, нестабильности, существенной вариабельности и отсутствию адекватной безопасности и эффективности.

[059] Было обнаружено, что популяции бактериальных спор могут быть получены из биологических материалов, полученных от субъектов-млекопитающих, в том числе человека. Указанные популяции вводят в состав композиций согласно настоящему изобретению и вводят субъектам-млекопитающим с применением способов согласно описанию в настоящем документе.

ОПРЕДЕЛЕНИЯ

[060] «Микробиота» относится к сообществу микроорганизмов, которые встречаются (продолжительное время или временно) в организме и на организме субъекта-животного, как правило, млекопитающего, такого как человек, в том числе эукариот, архей, бактерий и вирусов (включая бактериальные вирусы, т.е. фаги).

[061] «Микробиом» относится к генетическому содержанию сообществ микроорганизмов, живущих в организме и на организме человека, продолжительное время или временно, в том числе эукариот, архей, бактерий и вирусов (включая бактериальные вирусы (т.е. фаги)), при этом «генетическое содержание» включает геномную ДНК, РНК, такую как рибосомальная РНК, эпигеном, плазмиды и все другие типы генетической информации.

[062] «Носительство микроорганизмов» или просто «носительство» относится к популяции микроорганизмов, населяющей нишу в организме или на поверхности организма человека. Носительство часто определяют как относительную распространенность. Например, OTU1 содержит 60% от общего носительства микроорганизмов, что означает, что относительная распространенность OTU1 составляет 60% относительно других OTU в образце, для которого проводилось измерение. Носительство чаще всего определяют на основании данных геномного секвенирования, в этом случае относительная распространенность или носительство одной OTU или группы OTU определяется по отношению числа прочтений секвенирования, которые относятся к указанной(ым) OTU, и общего числа прочтений секвенирования для указанного образца.

[063] «Стимуляция микроорганизмов» или просто «стимуляция» относится к формированию или значимому увеличению популяции микроорганизмов, которые (i) отсутствуют или не детектируются (по оценке с применением стандартных геномных и микробиологических техник) во вводимой терапевтической композиции с микроорганизмами, (ii) отсутствуют, не детектируются или редко встречаются в нише организма хозяина (например, желудочно-кишечном тракте, коже, в ноздрях или влагалище) до доставки композиции с микроорганизмами, и (iii) обнаруживаются после введения композиции с микроорганизмами, или их численность значительно увеличивается, например 2-кратно, 5-кратно, 1×10², 1×10³, 1×10⁴, 1×10⁵, 1×10⁶, 1×10⁷, или более чем на 1×10⁸, в тех случаях, когда они ранее редко встречались. Микроорганизмы стимулированных групп могут быть получены из экзогенных источников, таких как пища и окружающая среда, или вырастать в микронишах в организме хозяина, где они встречаются с низкой частотой.

[064] Введение указанной терапевтической композиции с микроорганизмами индуцирует экологический сдвиг в целевой нише, способствующий созданию благоприятных условий для роста указанных комменсальных микроорганизмов. В отсутствие лечения терапевтической композицией с микроорганизмами хозяин может постоянно подвергаться воздействию указанных микроорганизмов; тем не менее, устойчивый рост и положительное влияние на здоровье, связанные со стабильной популяцией микроорганизмов с повышенной численностью, составляющих стимулированную экогруппу, не наблюдаются.

[065] «Приживление микроорганизмов» или просто «приживление» относится к приживлению OTU, содержащих терапевтическую композицию с микроорганизмами в целевой нише которые отсутствуют у получающего лечение хозяина до лечения. Микроорганизмы, которые составляют прижившуюся экогруппу, присутствуют в терапевтической композиции с микроорганизмами и становятся компонентами экогруппы микроорганизмов хозяина при лечении. Прижившиеся OTU могут сохраняться временно, или демонстрируют долгосрочную стабильность в экогруппе микроорганизмов, которые заселяют организм хозяина после лечения терапевтической композицией с микроорганизмами. Прижившаяся экогруппа может индуцировать в целевой нише экологический сдвиг, который способствует созданию благоприятных условий для роста комменсальных микроорганизмов, способных катализировать сдвиг дисбиотической экогруппы к экогруппе, соответствующей здоровому состоянию.

[066] «Экологическая ниша» или просто «ниша» относится к экологическому пространству, которое занимает организм или группа организмов. Ниша характеризует то, как организм или популяция организмов отвечает на распределение ресурсов, физические показатели (например, пространство в тканях хозяина) и конкуренцию (например, ростом, если ресурсов достаточно, а хищники, паразиты и патогены немногочисленны), и как он, в свою очередь, изменяет эти же показатели (например, ограничивая доступ к ресурсам для других организмов, функционируя в качестве источника пищи для хищников и потребителя добычи).

[067] «Дисбиоз» относится к состоянию микробиоты пищеварительного тракта или другой области организма субъекта, в том числе поверхностей слизистых оболочек и кожи, где нарушено(а) нормальное разнообразие и/или функция экосистемы. Указанное болезненное состояние может быть обусловлено уменьшением разнообразия, избыточным ростом одного или большего количества патогенов или патобионтов, симбиотических организмов, способных вызывать заболевание только тогда, когда у субъекта имеются определенные генетические условия и/или условия окружающей среды, или сдвиг в сторону экосистемы микроорганизмов, которая уже не обеспечивает необходимую функцию у субъекта-хозяина, и, соответственно уже не способствует поддержанию здоровья.

[068] «Патобионты» или «оппортунистические патогены» относится к симбиотическим организмам, способным вызывать заболевание исключительно тогда, когда у субъекта имеются определенные генетические условия и/или условия окружающей среды.

[069] «Филогенетическое дерево» относится к графическому представлению эволюционных взаимосвязей между генетическими последовательностями, полученных с применением определенного набора алгоритмов филогенетической реконструкции (например, принцип экономии, максимального правдоподобия, или байесовский метод). Узлы дерева соответствуют отдельным предковым последовательностям; достоверности любого узла обеспечиваются бутстепом или критерием байесовской апостериорной вероятности, измеряющей неопределенность ветвей.

[070] «Функциональные таксономические единицы», «OTU», относятся к конечному листу филогенетического дерева и определяются последовательностью нуклеиновых кислот, например, всего генома или конкретной генетической последовательностью, и всеми последовательностями, обладающими идентичностью последовательностей с указанной последовательностью нуклеиновых кислот на уровне вида. Согласно некоторым вариантам реализации специфическая генетическая последовательность может представлять собой последовательность 16S или часть последовательности 16S. Согласно другим вариантам реализации секвенируют и сравнивают полные геномы двух элементов. Согласно другому варианту реализации выбранные области, такие как мультилокусные метки последовательностей (MLST), специфические гены или группы генов могут генетически сравниваться. В вариантах реализации с 16S OTU, обладающие ≥97% средней идентичности нуклеотидов по всем 16S, или некоторым вариабельным областям 16S, считаются одной OTU (см., например, Claesson MJ, Wang Q, O’Sullivan O, Greene-Diniz R, Cole JR, Ros RP, and O’Toole PW. 2010. Comparison of two next-generation sequencing technologies for resolving highly complex microbiota composition using tandem variable 16S rRNA gene regions. Nucleic Acids Res 38: e200. Konstantinidis KT, Ramette A, and Tiedje JM. 2006. The bacterial species definition in the genomic era. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 361: 1929-1940.). Согласно вариантам реализации, задействующим весь геном, метки MLST, специфические гены или группы генов OTU, обладающие ≥95% средней идентичности нуклеотидов, считают одной OTU (см., например, Achtman M, and Wagner M. 2008. Microbial diversity and the genetic nature of microbial species. Nat. Rev. Microbiol. 6: 431-440. Konstantinidis KT, Ramette A, and Tiedje JM. 2006. The bacterial species definition in the genomic era. . Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 361: 1929-1940.). OTU часто определяют через сравнение последовательностей у разных организмов. Обычно последовательности менее чем с 95% идентичностью последовательностей не считают принадлежащими одной OTU. OTU могут также описываться любой комбинацией нуклеотидных маркеров или генов, в частности, высококонсервативных генов (например, генов «домашнего хозяйства»), или их комбинацией. Такое описание задействует, например, данные секвенирования WGS или последовательности всего генома.

[071] «Остаточные продукты среды обитания» относится к материалу, происходящему из местообитания микробиоты в организме или на организме человека или животного. Например, микробиота обитает в экскрементах, в желудочно-кишечном тракте, на собственно коже, в слюне, слизи дыхательных путей или выделениях мочеполового тракта (т.е. это биологические материалы, связанные с сообществом микроорганизмов). «По существу не содержащий остаточных продуктов среды обитания» означает, что бактериальная композиция уже не содержит биологического материала, связанного со средой обитания микроорганизмов на организме или в организме субъекта, человека или животного, и является на 100%, 99%, 98%, 97%, 96% или 95% свободной от любого загрязняющего биологического материала, связанного с сообществом микроорганизмов. Остаточные продукты среды обитания могут включать абиотические материалы (в том числе непереваренную пищу) или могут включать нежелательные микроорганизмы. «По существу не содержащий остаточных продуктов среды обитания» может также означать, что бактериальная композиция не содержит детектируемых клеток человека или животного, и что детектируются только клетки микроорганизмов. Согласно одному варианту реализации «по существу не содержащий остаточных продуктов среды обитания» может также означать, что бактериальная композиция не содержит детектируемых вирусных загрязняющих примесей (в том числе бактериальных вирусов (т.е. фагов)), грибных и микоплазменных загрязняющих примесей. Согласно другому варианту реализации это означает, что менее чем 1×10^-2%, 1×10^-3%, 1×10^-4%, 1×10^-5%, 1×10^-6%, 1×10^-7%, 1×10^-8% жизнеспособных клеток в бактериальной композиции принадлежать человеку или животному, а не клеткам микроорганизмов. Существует несколько способов обеспечения указанной степени чистоты, ни один из которых не являются ограничивающим. Так, загрязнение может быть уменьшено путем выделения требуемых компонентов путем проведения нескольких этапов пересева одиночных колоний методом штриха на твердых средах, до того момента, когда дублирующие штрихи (например, не ограничиваясь указанным, два штриха) из последовательных одиночных колоний не будут обеспечивать морфологию исключительно одиночных колоний. Как вариант, уменьшение загрязнения может достигаться путем проведения нескольких циклов серийных разведений до получения одиночных нужных клеток (например, разведение 10^-8 или 10^-9), например, путем проведения несколько 10-кратных серийных разведений. Затем можно подтвердить получение одиночных клеток, показав, что в нескольких изолированных колониях наблюдается аналогичная форма клеток и окрашивание по Граму. Другие способы подтверждение надлежащей чистоты включают генетический анализ (например, ПЦР, секвенирование ДНК), серологический и антигенный анализ, ферментный и метаболический анализ, и способы с применением таких инструментов, как проточная цитометрия с реагентами для различения нужных компонентов и загрязняющих примесей.

[072] «Клада» относится к OTU или представителям филогенетического дерева, расположенным ниже статистически достоверного узла филогенетического дерева. Клада содержит набор конечных листьев филогенетического дерева, представляющих собой отдельные монофилетические эволюционные единицы, обладающие определенной степенью сходства последовательностей.

[073] В области микробиологии, «16S-секвенирование», или «16S-рРНК», или «16S» относится к последовательности, полученной в результате определения нуклеотидов, которые содержат ген(ы) рибосомальной РНК 16S. Длина бактериальных 16S рРНК составляет приблизительно 1500 нуклеотидов и используют для реконструкции эволюционных взаимосвязей и сходства последовательностей между бактериальными изолятами с применением филогенетических методов. Последовательности 16S используют для филогенетической реконструкции, поскольку они обычно высококонсервативны, однако содержат специфические гипервариабельные области, содержащие достаточно разнообразные нуклеотиды для различения родов и видов большинства бактерий.

[074] Термин «области V1-V9» 16S рРНК относится к первым девяти гипервариабельным областям гена 16S рРНК, которые используют для генотипирования бактериальных образцов. Указанные области у бактерий определяют нуклеотиды 69-99, 137-242, 433-497, 576-682, 822-879, 986-1043, 1117-1173, 1243-1294 и 1435-1465, соответственно, с применением нумерации на основе системы номенклатуры E. coli. Brosius et al., Complete nucleotide sequence of a 16S ribosomal RNA gene from Escherichia coli, PNAS 75(10):4801-4805 (1978). Согласно некоторым вариантам реализации по меньшей мере что-либо одно из областей V1, V2, V3, V4, V5, V6, V7, V8, и V9 используют для определения OTU. Согласно одному варианту реализации области V1, V2, и V3 используют для определения OTU. Согласно другому варианту реализации области V3, V4 и V5 используют для определения OTU. Согласно другому варианту реализации используют область V4 для определения OTU. Специалист в данной области техники может идентифицировать специфические гипервариабельные области кандидатной 16S рРНК путем сравнения указанной представляющей интерес кандидатной последовательности с референсной последовательностью и идентифицировать гипервариабельные области на основании сходства с референсными гипервариабельными областами; или, как вариант, можно использовать характеризацию микроорганизмов или сообщества микроорганизмов с применением полногеномного секвенирования методом «дробовика» (WGS).

[075] Термин «субъект» относится к любому субъекту-животному, в том числе человеку, лабораторным животным (например, приматам, крысам, мышам), сельскохозяйственным животным (например, коровам, овцам, козам, свиньям, индейкам и курам) и домашним животным (например, собакам, кошкам и грызунам). Субъект может страдать дисбиозом в том числе, но не ограничиваясь перечисленными, инфекцией, обусловленной патогеном ЖКТ, или у него возможно имеется риск развития или передачи окружающим инфекции, обусловленной патогеном ЖКТ.

[076] Термин «фенотип» относится к набору поддающихся наблюдению характеристик индивидуального объекта. Например, индивидуальный субъект может иметь фенотип, соответствующий «здоровому состоянию» или «заболеванию». Фенотипы описывают состояние объекта, и все объекты, имеющие определенный фенотип, обладают одинаковым набором характеристик, описывающий указанный фенотип. Фенотип индивидуума обусловлен отчасти или полностью взаимодействием генома и/или микробиома объекта с окружающей средой.

[077] Термин «экосистема» относится к объединению OTU, которые совместно встречаются у ряда субъектов. В настоящем документе «систему» определяют математически с применением графа, отражающего то, как специфические узлы (т.е. OTU) и ребра (соединения между специфическими OTU) соотносятся друг с другом, для определения экологической структуры объединения OTU. Любая заданная экосистема обладает собственным филогенетическим разнообразием и функциональными свойствами. Экосистема может также быть определена через функцию, где, например, узлы будут включать такие элементы, как, не ограничиваясь перечисленными, ферменты, кластеры ортологичных групп (COGS; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21090/) или пути KEGG (www.genome.jp/kegg/).

[078] Термины «класс системы», «коровая система» и «коровая экосистема» относятся к группе экосистем, как правило, как определено численными методами, содержат экогруппы с аналогичными филогенетическими и/или функциональными характеристиками. Коровая система, соответственно, содержит важные биологические признаки группы (т.е. кластера), определенные либо филогенетически, либо функционально, родственных экосистем. Одним из вариантов реализации коровой экосистемы является сконструированное объединение микроорганизмов, как правило, непатогенных бактерий, отражающее коровые характеристики набора филогенетически или функционально связанных экосистем, наблюдаемых у большого числа разных субъектов. Во многих случаях коровая система, сконструированная согласно описанию в настоящем документе, существует в виде экосистемы, наблюдаемой у одного или большего количества субъектов. Экогруппы коровой системы подходят для устранения или уменьшения дисбиоза у субъектов в тех случаях, когда была повреждена базовая родственная экосистема.

[079] Термин «ключевые OTU» относится к одной или большему количеству OTU, обычных для многих экосистем и являющихся представителями экосистем, которые встречаются у многих субъектов (т.е. являются распространенными) (фиг. 1). Ввиду универсальной природы ключевых OTU они играют важнейшую роль в функционировании экосистем у здоровых субъектов и часто отсутствуют, либо их уровни снижены, у субъектов с заболеванием. Ключевые OTU могут присутствовать у субъектов с низкой, умеренной или высокой распространенностью.

[080] Термин «неключевые OTU» относится к OTU, наблюдаемым в экосистеме и не являющимся ключевыми OTU.

[081] Термин «филогенетическое разнообразие» относится к биоразнообразию, свойственному определенной экосистеме или коровой экосистеме, по оценке на основании OTU, которые содержатся в указанной системе. Филогенетическое разнообразие представляет собой относительный термин, то есть экосистема или коровая система, сравнительно более филогенетически разнообразная относительно другой системы, содержит большее число уникальных видов, родов и таксономических семейств. Уникальность видов, родов или таксономического семейства обычно определяют с применением филогенетического дерева, которое отражает генетическое разнообразие все видов, родов и таксономических семейств относительно друг друга. Согласно другому варианту реализации филогенетическое разнообразие может быть измерено с применением общей длины ветвей или средней длины ветвей филогенетического дерева.

[082] «Спора», или «эндоспора» относится к элементу, в частности, бактериальному элементу, находящемуся в покоящемся, не вегетативном и не репродуктивном состоянии. Споры обычно устойчивы к стресс-факторам окружающей среды, таким как излучение, высыхание, обработка ферментами, изменение температуры, недостаток питательных веществ и химические дезинфицирующие средства.

[083] «Популяция спор» относится к совокупности спор, присутствующих в композиции. Синонимы, используемые в настоящем документе, включают споровую композицию, состав со спорами, обработанную этанолом споровую фракцию и споровую экогруппу. Популяция спор может быть очищена из донорского фекального материала, например, с применением этанола или термообработки, или разделения в градиенте плотности, или любой комбинации способов, описанных в настоящем документе, для увеличения чистоты, активности и/или концентрации спор в образце. Как вариант, популяция спор может быть получена с применением методов культивирования, начиная с выделенных спорообразующих видов или спорообразующих OTU, или смеси таких видов, в вегетативной форме либо в виде спор.

[084] Согласно одному варианту реализации состав со спорами содержит спорообразующие виды, при этом остаточные неспорообразующие виды инактивированы с применением химической или физической обработки, в том числе этанолом, детергентом, нагреванием, ультразвуком и т.п.; или указанные неспорообразующие виды удалены из состава со спорами путем проведения различных этапов разделения, в том числе разделения в градиенте плотности, центрифугирования, фильтрации и/или хроматографии; либо способы инактивации и разделения комбинируют для получения указанного состава со спорами. Согласно еще одному варианту реализации состав со спорами содержит спорообразующие виды, обогащенные спорами относительно жизнеспособных не образующих спор или вегетативных форм спорообразующих бактерии. Согласно указанному варианту реализации наблюдается 2-кратное, 5-кратное, 10-кратное, 50-кратное, 100-кратное, 1000-кратное, 10 000-кратное или более чем 10 000-кратное обогащение по спорам по сравнению со всеми вегетативными формами бактерий. Согласно еще одному варианту реализации споры в споровом составе частично прорастают при обработке и получении препаратов, так что конечная композиция содержит споры и вегетативные бактерии, происходящие из спорообразующих видов.

[085] «Способствующее прорастанию вещество» представляет собой материал, или композицию, или физико-химический процесс, способный индуцировать вегетативный рост у бактерий, которые находятся в покоящейся споровой форме, или группы бактерий в споровой форме, напрямую или опосредованно, в организме-хозяине и/или in vitro.

[086] «Индуцирующий споруляцию агент» представляет собой материал или физико-химический процесс, способный индуцировать споруляцию у бактерии, прямо или непрямо, в организме-хозяине и/или in vitro.

[087] Термин «увеличивать получение бактериальных спор» включает индуцирующую(ий) споруляцию активность или агент. «Получение» включает преобразование вегетативных бактериальных клеток в споры и увеличение скорости такого преобразования, а также уменьшение прорастания бактерий в форме спор, уменьшение скорости разложения спор in vivo или ex vivo, или увеличение общего выхода спор (например, за счет увеличения объемного выхода фекального материала).

[088] «Колонизация» организма-хозяина включает не носящее временного характера пребывание бактерии или другого микроскопического организма. В настоящем документе «уменьшение колонизации» желудочно-кишечного тракта субъекта-хозяина (или любой другой микробиотической ниши) патогенной бактерией включает уменьшение времени пребывания указанного патогена в желудочно-кишечном тракте, а также снижение количества (или концентрации) указанного патогена в желудочно-кишечном тракте или прикрепленного к люминальной поверхности желудочно-кишечного тракта. Измерение снижения количества адгезивных патогенов может быть продемонстрировано, например, в биопсийном образце, или снижение может быть измерено непрямо, например, путем измерения патогенной нагрузки в экскрементах хозяина-млекопитающего.

[089] «Комбинация» двух или большего числа бактерий включает физическое сосуществование двух бактерий, в одном и том же материале или продукте либо в физически связанных продуктах, а также совместное по времени введение или колокализацию двух бактерий.

[090] «Цитотоксическая» активность или бактерия включает способность вызывать гибель бактериальной клетки, например, патогенной бактериальной клетки. «Цитостатическая» активность или бактерия включает способность ингибировать, частично или полностью, рост, метаболизм и/или пролиферацию бактериальной клетки, например, патогенной бактериальной клетки.

[091] Не содержащий «непищевых продуктов» означает, что бактериальная композиция или другой описанный в настоящем документе материал не содержит существенного количества несъедобного продукта, например, продукта или материала, непригодного для употребления в пищу, вредного или по иным причинам нежелательного для продукта, подходящего для введения, например, перорального введения, субъекту-человеку. Непищевые продукты часто присутствуют в составах с бактериями, известных из предшествующего уровня техники.

[092] В настоящем документе термин «витамин» включает любые из ряда жирорастворимых или водорастворимых органических веществ (неограничивающие примеры включают витамин A, витамин B1 (тиамин), витамин B2 (рибофлавин), витамин B3 (ниацин или ниацинамид), витамин B5 (пантотеновую кислоту), витаминB6 (пиридоксин, пиридоксаль или пиридоксамин, или гидрохлорид пиридоксина), витамин B7 (биотин), витамин B9 (фолиевую кислоту) и витамин B12 (различные кобаламины; в витаминных добавках, как правило, цианокобаламин), витамин C, витамин D, витамин E, витамин K, K1 и K2 (т.е. MK-4, MK-7), фолиевую кислоту и биотин), необходимые в незначительных количествах для нормального роста и активности организма, и получаемые в естественных условиях из растительной и животной пищи или синтетически, провитамины, производные, аналоги.

[093] В настоящем документе термин «минеральные вещества» включают бор, кальций, хром, медь, йод, железо, магний, марганец, молибден, никель, фосфор, калий, селен, кремний, олово, ванадий, цинк или их комбинации.

[094] В настоящем документе термин «антиоксидант» включает любой один или большее количество различных веществ, таких как бета-каротин (предшественник витамина A), витамин C, витамин E и селен), которые ингибируют окисление или реакции, стимулируемые реактивными кислородными веществами («ROS») и другими радикалами и не являющимися радикалами веществами. Кроме того, антиоксиданты являются молекулами, которые способны замедлять или предотвращать окисление других молекул. Неограничивающие примеры антиоксидантов включают астаксантин, каротиноиды, кофермент Q10 («CoQ10»), флавоноиды, глутатион, ягоды годжи (дереза), гесперидин, состав на основе молока и ягод годжи (Lacto-Wolfberry), лигнан, лютеин, ликопен, полифенолы, селен, витамин A, витамин C, витамин E, зеаксантин или их комбинации.

КОМПОЗИЦИИ

[095] Раскрытые в настоящем изобретении терапевтические композиции, содержащие непатогенные, способные к прорастанию бактериальные споры, для предотвращения, контроля и лечения заболеваний, расстройств и состояний ЖКТ и поддержания общего здоровья в области пищеварения. Указанные композиции обладают полезными свойствами, поскольку подходят для безопасного введения человеку и другим субъектам-млекопитающим, а также эффективны при многочисленных желудочно-кишечных заболеваниях, расстройствах и состояниях, и для поддержания общего здоровья в области пищеварения. Хотя композиции на основе спор известны, их обычно получают с применением других техник, таких как лиофилизация или высушивание распылением жидких бактериальных культур, что приводит к неудовлетворительной эффективности, нестабильности, существенной вариабельности и отсутствию адекватной безопасности и эффективности.

[096] Было обнаружено, что популяции бактериальных спор могут быть получены из биологических материалов, полученных от субъектов-млекопитающих, в том числе человека. Указанные популяции вводят в состав композиций согласно настоящему изобретению, и вводят субъектам-млекопитающим с применением способов согласно описанию в настоящем документе.

[097] Предложены терапевтические композиции, содержащие очищенную популяцию бактериальных спор. В настоящем документе термины «очищать», «очищенный» и «очищение» относятся к состоянию популяции (например, к совокупности известной или неизвестной численности и/или концентрации) требуемых бактериальных спор, подвергнутых одному или нескольким процессам очищения, например, отбору по требуемым бактериальным спорам или обогащению требуемыми бактериальными спорами, или как вариант, к удалению или уменьшению количества остаточных продуктов среды обитания согласно описанию в настоящем документе. Согласно некоторым вариантам реализации в очищенной популяции отсутствует детектируемая нежелательная активность или, как вариант, уровень или количество нежелательной активности являются приемлемыми или ниже приемлемых уровня или количества. Согласно другим вариантам реализации очищенная популяция содержит приемлемое(ую) количество и/или концентрацию требуемых бактериальных спор или бόльшее(ую) количество и/или концентрацию. Согласно другим вариантам реализации указанное отношение требуемой и нежелательной активностей (например, спор и вегетативных бактерий), изменялось в 2, 5, 10, 30, 100, 300, 1×10⁴, 1×10⁵, 1×10⁶, 1×10⁷, 1×10⁸ или более чем 1×10⁸ раз. Согласно другим вариантам реализации очищенная популяция бактериальных спор обогащена относительно исходного материала (например, фекального материала), из которого получают указанную популяцию. Указанное обогащение может составлять 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,9%, 99,99%, 99,999%, 99,9999%, 99,9999% или более чем 99,999999% по сравнению с исходным материалом.

[098] Согласно определенным вариантам реализации в указанных очищенных популяциях бактериальных спор наблюдаются пониженные или недетектируемые уровни одной или большего числа патогенных активностей, таких как токсичность, способность вызывать инфекцию у реципиента - субъекта-млекопитающего, нежелательная иммуномодулирующая активность, аутоиммунный ответ, метаболический ответ, или воспалительный ответ, или неврологическая реакция. Такое уменьшение патогенной активности может составлять 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,9%, 99,99%, 99,999%, 99,9999%, или более чем 99,9999% по сравнению с исходным материалом. Согласно другим вариантам реализации в очищенных популяциях бактериальных спор содержится меньше органолептических компонентов по сравнению с фекальным материалом, например, менее выраженный запах, вкус, внешний вид и умами.

[099] Предложены очищенные популяции бактериальных спор, по существу не содержащие остаточных продуктов среды обитания. Согласно определенным вариантам реализации это означает, что композиция с бактериальными спорами уже не содержит существенного количества биологического вещества, связанного с сообществом микроорганизмов, обитающих на организме или в организме субъекта-человека или животного, и очищенная популяция спор может быть на 100%, 99%, 98%, 97%, 96% или 95% очищена от каких-либо загрязнений биологическим веществом, связанным с указанным сообществом микроорганизмов. «По существу не содержащие остаточных продуктов среды обитания» может также означать, что композиция с бактериальными спорами не содержит детектируемых клеток человека или животного, и что детектируются только клетки микроорганизмов, в частности, детектируются только требуемые клетки микроорганизмов. Согласно другому варианту реализации это означает, что менее чем 1×10^-2%, 1×10^-3%, 1×10^-4%, 1×10^-5%, 1×10^-6%, 1×10^-7%, 1×10^-8% клеток в бактериальной композиции принадлежат человеку или животному, а не микроорганизмам. Согласно другому варианту реализации количество остаточного продукта среды обитания, присутствующего в очищенной популяции, уменьшается по меньшей мере до определенного уровня относительно фекального материала, полученного от донора - субъекта-млекопитающего, например, по меньшей мере приблизительно на 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,9%, 99,99%, 99,999%, 99,9999% или более чем на 99,9999%.

[0100] Согласно одному варианту реализации «по существу не содержащие остаточных продуктов среды обитания» или «по существу не содержащие патогенного материала на детектируемом уровне» означает, что бактериальная композиция не содержит детектируемых вирусных загрязнений (в том числе бактериальных вирусов (т.е. фагов)), грибных, микоплазменных или токсоплазменных загрязнений, или эукариотических паразитов, например, гельминтов. Как вариант, очищенные популяции спор по существу не содержат бесклеточного материала, например, ДНК, материала вирусной оболочки или нежизнеспособного бактериального материала. Как вариант, очищенная популяция спор может быть обработана способом, который обеспечивает гибель, инактивацию или устранение одного или большего количества специфических нежелательных вирусов, таких как кишечный вирус, в том числе норовирус, полиовирус или вирус гепатита А.

[0101] Согласно описанию в настоящем документе, очищение популяций спор может быть продемонстрировано с помощью генетического анализа (например, ПЦР, секвенирования ДНК), серологического и антигенного анализа, микроскопического анализа, анализа микроорганизмов, в том числе прорастания и культивирования, и способов с применением таких инструментов, как проточная цитометрия с реагентами для различения требуемых бактериальных спор и нежелательных загрязняющих материалов.

[0102] Примеры биологических материалов включают фекальные материалы, такие как экскременты, или материалы, выделенные из различных сегментов тонкого и толстого кишечника. Фекальные материалы получают от донора - субъекта-млекопитающего, или они могут быть получены от более чем одного субъекта-донора, например, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 75, 100, 200, 300, 400, 500, 750, 1000 или от более чем 1000 доноров, при этом такие материалы затем объединяют до очищения требуемых бактериальных спор. Согласно другому варианту реализации фекальные материалы могут быть получены многократно от единственного субъекта-донора и может быть объединена совокупность образцов, например, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 32, 35, 40, 45, 48, 50, 100 образцов от единственного донора.

[0103] Согласно альтернативным вариантам реализации указанные требуемые бактериальные споры очищают из одного образца фекального материала, полученного от единственного донора, и после такого очищения комбинируют с очищенными популяциями спор, также полученными при очищении, либо от одного и того же донора в разные моменты времени, или от одного или нескольких разных доноров, или используют оба варианта.

[0104] Доноры - субъекты-млекопитающие обычно отличаются нормальным состоянием здоровья и обладают микробиотой, соответствующей указанному нормальному состоянию здоровья. Часто субъектам-донорам не вводили соединений с антибиотической активностью в течение определенного периода времени перед получением фекального материала. Согласно определенным вариантам реализации указанные субъекты-доноры не страдают ожирением или избыточной массой тела, и могут иметь показатели индекса массы тела (ИМТ) ниже 25, например, от 18,5 до 24,9. Согласно другим вариантам реализации субъекты-доноры не имеют психических заболеваний или не имеют в личном или семейном анамнезе психических заболеваний, таких как тревожное расстройство, депрессия, биполярное расстройство, расстройства аутистического спектра, шизофрения, панические расстройства, расстройства, связанные с дефицитом внимания (гиперактивностью), расстройства пищевого поведения или расстройства настроения. Согласно другим вариантам реализации у субъектов-доноров отсутствует заболевание, связанное с раздражением кишечника (например, болезнь Крона, язвенный колит), синдром раздраженного кишечника, целиакия, рак ободочной и прямой кишки или указанные заболевания отсутствуют в семейном анамнезе. Согласно другим вариантам реализации проводят скрининг доноров на переносимые с кровью патогены и передающиеся через фекалии патогены с применением стандартных техник, известных специалистам в данной области техники (например, тестирования на нуклеиновые кислоты, серологического тестирования, тестирования на антигены, техник культивирования, ферментативного анализа, анализов бесклеточных фекальных фильтратов на токсины на чувствительных субстратах - клеточных культурах).

[0105] Согласно некоторым вариантам реализации доноров также отбирают на основании присутствия определенных родов и/или видов, обеспечивающих повышенную эффективность терапевтических композиций, содержащих указанные роды или виды. Согласно другим вариантам реализации в фекальном материале предпочтительных доноров образуются относительно более высокие концентрации спор, чем у других доноров. Согласно дополнительным вариантам реализации предпочтительные доноры обеспечивают фекальный материал, из которого очищают споры, отличающиеся повышенной эффективностью; указанную повышенную эффективность измеряют в исследованиях in vitro или на животных согласно приведенному ниже описанию. Согласно некоторым вариантам реализации указанный донор может подвергаться одной или нескольким обработкам до взятия донорского материала для уменьшения количества нежелательного материала в фекальном материале и/или увеличения количества требуемых популяций спор.

[0106] Целесообразно проводить скрининг состояния здоровья субъекта-донора перед и, необязательно, один или несколько раз после сбора фекального материала. Такой скрининг позволяет идентифицировать доноров-носителей патогенных материалов, такие как вирусы (ВИЧ, гепатит, полиовирус) и патогенные бактерии. После сбора материала проводят скрининг доноров в течение приблизительно одной недели, двух недель, трех недель, одного месяца, двух месяцев, трех месяцев, шести месяцев, одного года или более чем одного года, и такой скрининг может проводиться ежедневно, еженедельно, раз в две недели, ежемесячно, раз в два месяца, раз в полгода или ежегодно. Доноров, которые прошли скрининг, результаты тестов для которых не были положительными до или после, либо ни до, ни после отбора донорского материала, считают «валидированными» донорами.

[0107] Обработка растворителем. Для очищения бактериальных спор фекальный материал один или несколько раз обрабатывают растворителем. Обработка растворителем представляет собой обработку смешивающимся растворителем (частично смешивающимся или полностью смешивающимся) или обработку несмешивающимся растворителем. Смешиваемость представляет собой способность двух жидкостей смешиваться друг с другом с образованием гомогенного раствора. Вода и этанол, например, полностью смешиваются, так что смесь, содержащая воду и этанол в любом соотношении, будет однофазной. Смешиваемость выражают через массовые % или через массу одного из растворителей на 100 г конечного раствора. Если два растворителя полностью смешиваются в любых пропорциях, их смешиваемость составляет 100%. Полностью смешивающиеся с водой растворы образуют спирты, например, метанол, этанол, изопропанол, бутанол, пропандиол, бутандиол и т.д. Спирты могут быть заранее соединены с водой; например, могут быть представлены в виде 10%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 89%, 85%, 90%, 95% или более чем 95% раствором. Другие растворители являются только частично смешивающимися, что означает, что только определенная часть растворяется в воде. Простой диэтилэфир, например, частично способен смешиваться с водой. До 7 г простого диэтилэфира растворяются в 93 г воды с получением 7% (масс.%) раствора. Если добавить большее количество диэтилэфира, образуется двухфазный раствор с отдельным слоем диэтилэфира над водой. Другие частично смешиваемые материалы включают простые эфиры, пропаноат, бутаноат, хлороформ, диметоксиэтан или тетрагидрофуран. С другой стороны, масло, например, алкан и вода являются несмешиваемыми и образуют две фазы. Также обработку несмешивающимся растворителем необязательно комбинируют с детергентом, либо ионогенным, либо неионогенным. Примеры детергентов включают Triton X-100, Tween 20, Tween 80, Nonidet P40, плюроник или полиол. Этапы обработки растворителем снижает жизнеспособность неспорообразующих бактериальных видов на 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 99%, 99,9%, 99,99%, 99,999%, или на 99,9999%, и он может необязательно снижать жизнеспособность контаминирующих протистов, паразитов и/или вирусов.

[0108] Хроматографическая обработка. Для очищения популяций спор фекальные материалы подвергают одной или нескольким хроматографическим обработкам, последовательно или параллельно. При хроматографической обработке раствор, содержащий фекальный материал, приводят в контакт с твердой средой, содержащей a среду для хроматографии с гидрофобным взаимодействием (HIC) или среду для аффинной хроматографии. Согласно альтернативному варианту реализации твердую среду, способную абсорбировать остаточный продукт среды обитания, присутствующий в фекальном материале, приводят в контакт с твердой средой, которая адсорбирует остаточный продукт среды обитания. Согласно определенным вариантам реализации указанная среда для HIC содержит сефарозу или дериватизированную сефарозу, например, бутилсефарозу, октилсефарозу, фенилсефарозу или бутил-s-сефарозу. Согласно другим вариантам реализации указанная среда для аффинной хроматографии содержит материал, дериватизированный муцином типа I, II, III, IV, V или VI, или олигосахаридами, происходящими из муцинов или аналогичными происходящим из муцинов типа I, II, III, IV, V или VI. Как вариант, среда для аффинной хроматографии содержит материал, дериватизированный антителами, распознающими споробразующие бактерии.

[0109] Механическая обработка. Предложено физическое разрушение фекального материала, в частности, путем одной или нескольких механических обработок, таких как смешивание, перемешивание, встряхивание, обработка на вортексе, ударная пульверизация и обработка ультразвуком. Согласно настоящему изобретению указанная обработка с механическим разрушением по существу разрушает неспоровый материал, присутствующий в фекальном материале, и по существу не разрушает споры, присутствующие в фекальном материале, или может разрушать споровый материал в меньшей степени, чем неспоровый материал, например, в 2 раза, в 5, 10, 30, 100, 300, 1000 или более чем в 1000 раз. Кроме того, механическая обработка гомогенизирует материал для последующего взятия образцов, тестирования и обработки. Механическая обработка необязательно включает обработку фильтрацией, при которой нужные популяции спор остаются на фильтре, а нежелательные (неспоровые) фекальные компоненты проходят через фильтр, и затем споровую фракцию извлекают из фильтрующей среды. Как вариант, нежелательные частицы и эукариотические клетки могут оставаться на фильтре, а бактериальные клетки, в том числе споры, могут проходить через фильтр. Согласно некоторым вариантам реализации споровую фракцию, остающуюся на фильтре, подвергают диафильтрации, при этом указанные оставшиеся споры приводят в контакт с жидкостью для промывания, как правило, стерильным содержащим соли раствором или другим разбавителей, таким как совместимый с водой полимер, например, раствором полиэтиленгликоля (ПЭГ) с низкой молекулярной массой, для дополнительного уменьшения количества или удаления нежелательных фекальных компонентов.

[0110] Термообработка. Предложено термическое разрушение фекального материала. Обычно фекальный материал смешивают с содержащим соли раствором, таким как забуференный фосфатом солевой раствор (ФСБ), и помещают в среду с повышенной температурой, например, в теплую комнату, инкубатор, на водяную баню, или т.п., таким образом, чтобы между нагретой средой и фекальным материалом происходил эффективный теплообмен. Предпочтительно раствор фекального материала перемешивают во время инкубирования для увеличения теплопроводности и разрушения агрегатов частиц. Термообработка может модулироваться за счет температуры окружающей среды и/или продолжительности термообработки. Например, фекальный материал или жидкость, содержащую фекальный материал, подвергают воздействию среды с повышенной температурой, например, горячей водяной бани, температура которой составляет по меньшей мере приблизительно 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100 или более чем 100°С, в течение по меньшей мере приблизительно 1, 5, 10, 15, 20, 30, 45 секунд, или 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 40 или 50 минут, или 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более 10 часов. Согласно определенным вариантам реализации термообработка происходит при двух различных температурах, например, в течение 30 секунд в среде с температурой 100 градусов Цельсия, а затем в течение 10 минут в среде с температурой 50 градусов Цельсия. Согласно предпочтительным вариантам реализации температура и продолжительность термообработки являются достаточными для гибели или удаления патогенных материалов, и при этом по существу не повреждают или не уменьшают количество способных к прорастанию спор. Согласно другим предпочтительным вариантам реализации температура и продолжительность термообработки являются достаточно небольшими для уменьшения прорастания популяции спор.

[0111] Обработка облучением. Предложены способы обработки фекального материала или разделенных компонентов фекального материала ионизирующим излучением, как правило, гамма-излучением, ультрафиолетовым излучением или облучением электронным пучком с обеспечением уровня энергии, достаточного для гибели патогенных материалов, но по существу не повреждающего нужные популяции спор. Например, ультрафиолетовое излучение с длиной волны 254 нм с обеспечением уровня энергии, составляющим менее чем приблизительно 22 000 мкВт на см² в секунду, обычно не разрушает требуемые споры.

[0112] Обработка центрифугированием и разделение по плотности. Предложены способы отделения требуемых популяций спор от других компонентов фекального материала путем центрифугирования. Раствор, содержащий фекальный материал, один или несколько раз обрабатывают центрифугированием, например, приблизительно при 200×g, 1000×g, 2000×g, 3000×g, 4000×g, 5000×g, 6000×g, 7000×g, 8000×g или более чем 8000×g. Дифференциальное центрифугирование позволяет отделить требуемые споры от нежелательного неспорового материала; при малых мощностях споры остаются в растворе, а при более высоких мощностях споры осаждаются, тогда как примеси меньшего размера (например, вирусные частицы, фаги, микроскопические волокна, биологические макромолекулы, такие как свободный белок, нуклеиновые кислоты и липиды) остаются в растворе. Например, при первом центрифугировании с малой мощностью осаждаются волокнистые материалы; при втором центрифугировании с большей мощностью осаждаются нежелательные эукариотические клетки, а при третьем центрифугировании с еще большей мощностью осаждаются требуемые споры, однако загрязняющие примеси более малого размера остаются в суспензии. Согласно некоторым вариантам реализации градиенты или «подушки» плотности или подвижности (например, «ступенчатые подушки»»), такие как градиенты CsCl, перколла, фиколла, никоденза, гистоденза или градиенты сахарозы, используют для разделения требуемых популяций спор и других материалов в фекальном материале.

[0113] Также в настоящем документе предложены способы получения популяций спор, сочетающие два или большее число вариантов обработки, описанных в настоящем документе, для синергетического очищения требуемых спор наряду с уничтожением или удалением нежелательных материалов и/или активностей из популяции спор. Как правило, желательно сохранение популяций спор в не способствующих прорастанию и росту условиях и средах, для минимизации роста патогенных бактерий, присутствующих в популяциях спор, и для минимизации прорастания спор с образованием вегетативных бактериальных клеток.

[0114] Очищенные популяции спор. Согласно описанию в настоящем документе очищенные популяции спор содержат комбинации комменсальных бактерии кишечной микробиоты человека, обладающие способностью значимо способствовать функции здоровой микробиоты при введении субъекту-млекопитающему. Считается, что, не ограничиваясь конкретным механизмом, такие композиции ингибируют рост патогена, такого как C. difficile, Salmonella spp., энтеропатогенные E. coli, Fusobacterium spp., Klebsiella spp. и устойчивые к ванкомицину Enterococcus spp., таким образом, что может поддерживаться здоровая, разнообразная защитная микробиота или, в случае инфекций патогенными бактериями, например, инфекции C. difficile, заново заселять просвет кишечника для восстановления экологического контроля над потенциальными патогенами. Согласно одному варианту реализации очищенные популяции спор могут приживаться у хозяина и присутствовать в течение 1 дня, 2 дней, 3 дней, 4 дней, 5 дней, 6 дней, 7 дней, 10 дней, 14 дней, 21 дней, 25 дней, 30 дней, 60 дней, 90 дней или дольше чем 90 дней. Кроме того, очищенные популяции спор могут индуцировать приживление у хозяина других здоровых комменсальных бактерий, обнаруживаемых в здоровом кишечнике, не присутствующих в указанных очищенных популяциях спор или присутствующих в меньшем количестве, и, соответственно, считается, что указанные виды «стимулируют» введенные популяции спор. Таким образом, стимуляция комменсальных видов в очищенной популяции спор в кишечнике реципиента приводит к формированию более разнообразной популяции кишечной микробиоты по сравнению с присутствующей изначально.

[0115] Предпочтительные бактериальные роды включают Acetanaerobacterium, Acetivibrio, Alicyclobacillus, Alkaliphilus, Anaerofustis, Anaerosporobacter, Anaerostipes, Anaerotruncus, Anoxybacillus, Bacillus, Bacteroides, Blautia, Brachyspira, Brevibacillus, Bryantella, Bulleidia, Butyricicoccus, Butyrivibrio, Catenibacterium, Chlamydiales, Clostridiaceae, Clostridiales, Clostridium, Collinsella, Coprobacillus, Coprococcus, Coxiella, Deferribacteres, Desulfitobacterium, Desulfotomaculum, Dorea, Eggerthella, Erysipelothrix, Erysipelotrichaceae, Ethanoligenens, Eubacterium, Faecalibacterium, Filifactor, Flavonifractor, Flexistipes, Fulvimonas, Fusobacterium, Gemmiger, Geobacillus, Gloeobacter, Holdemania, Hydrogenoanaerobacterium, Kocuria, Lachnobacterium, Lachnospira, Lachnospiraceae, Lactobacillus, Lactonifactor, Leptospira, Lutispora, Lysinibacillus, Mollicutes, Moorella, Nocardia, Oscillibacter, Oscillospira, Paenibacillus, Papillibacter, Pseudoflavonifractor, Robinsoniella, Roseburia, Ruminococcaceae, Ruminococcus, Saccharomonospora, Sarcina, Solobacterium, Sporobacter, Sporolactobacillus, Streptomyces, Subdoligranulum, Sutterella, Syntrophococcus, Thermoanaerobacter, Thermobifida, Turicibacter

[0116] Предпочтительные бактериальные виды представлены в таблице 1 и отмечены как спорообразующие. В тех случаях, когда приведены конкретные штаммы вида, специалисту в данной области техники будет понятно, что приведенный штамм может быть заменен на другие штаммы указанного вида.

[0117] Согласно некоторым вариантам реализации споробразующие бактерии идентифицируют по присутствию последовательностей нуклеиновых кислот, которые модулируют споруляцию. В частности, характерные для споруляции гены высококонсервативны у всех представителей дальнородственных родов, в том числе Clostridium и Bacillus. С применением традиционных подходов «прямой» генетики были идентифицированы многие, если не все, гены, критически важные для споруляции (spo). Программа развития споруляции частично управляется последовательным действием четырех компартмент-специфических сигма-факторов (наблюдаемых в следующем порядке: σF, σE, σG и σK), активность которых ограничена проспорой (σF и σG) или материнской клеткой (σE и σK). Согласно другим вариантам реализации споробразующие бактерии идентифицируют по биохимической активности продуцирующих ДПК ферментов или путем анализа содержания ДПК в культурах. В ходе бактериальной споруляции продуцируются большие количества ДПК, составляющие 5-15% от массы споры. Поскольку не все жизнеспособные споры прорастают и растут в известных условиях среды, сложно оценить общее число спор в популяции бактерий. Таким образом, измеренное содержание ДПК хорошо коррелирует с содержанием спор и представляет собой подходящий показатель для определения общего содержания спор в бактериальной популяции.

[0118] Предложены популяции спор, содержащие более чем один тип бактерий. В настоящем документе «тип» или более одного «типа» бактерий может различаться на уровне рода, вида, подвида, штамма, или с применением любого другого таксономического метода, согласно описанию в настоящем документе и иными известными в данной области техники способами.

[0119] Согласно некоторым вариантам реализации все или по существу все бактериальные споры, присутствующие в очищенной популяции, получены из фекального материала, обработанного согласно описанию в настоящем документе или иным известным способом в данной области техники. Согласно альтернативным вариантам реализации одну или большее количество бактериальных спор или типов бактериальных спор получают в культуре и комбинируют для получения очищенной популяции спор. Согласно другим альтернативным вариантам реализации одну или большее количество указанных полученных в культуре популяций спор комбинируют с полученной из фекального материала популяцией спор для получения гибридной популяции спор. Бактериальные композиции могут содержать по меньшей мере два типа указанных предпочтительных бактерий, в том числе штаммы одного вида. Например, бактериальная композиция может содержать по меньшей мере 2, по меньшей мере 3, по меньшей мере 4, по меньшей мере 5, по меньшей мере 6, по меньшей мере 7, по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей мере 18, по меньшей мере 19, или по меньшей мере 20 или более чем 20 типов бактерий, по оценке на основании видов или функциональной таксономической единицы (OTU), включающей такие виды.

[0120] Таким образом, предложены способы получения композиции, содержащей популяцию бактериальных спор, подходящую для терапевтического введения нуждающемуся в этом субъекту-млекопитающему. Указанную композицию получают, как правило, путем проведения этапов: (a) получения фекального материала, полученного от донора - субъекта-млекопитающего; и (b) проведения по меньшей мере одного варианта очищения или этапа очищения указанного фекального материала в таких условиях, чтобы получить из указанного фекального материала популяцию бактериальных спор. Состав с указанной композицией получают таким образом, что одна доза для перорального приема содержит по меньшей мере приблизительно 1×10⁴ колониеобразующих единиц указанных бактериальных спор, и одна доза для перорального приема, как правило, содержит приблизительно 1×10⁴, 1×10⁵, 1×10⁶, 1×10⁷, 1×10⁸, 1×10⁹, 1×10¹⁰, 1×10¹¹, 1×10¹², 1×10¹³, 1×10¹⁴, 1×10¹⁵ или более чем 1×10¹⁵ КОЕ указанных бактериальных спор. Присутствие и/или концентрация определенного типа бактериальных спор могут быть известны или неизвестны в определенной очищенной популяции спор. В случае, когда известна, например, концентрация спор определенного штамма, или совокупности всех штаммов составляет, например, 1×10⁴, 1×10⁵, 1×10⁶, 1×10⁷, 1×10⁸, 1×10⁹, 1×10¹⁰, 1×10¹¹, 1×10¹², 1×10¹³, 1×10¹⁴, 1×10¹⁵ или более чем 1×10¹⁵ жизнеспособных бактериальных спор на грамм композиции или на введенную дозу.

[0121] В некоторых составах указанная композиция содержит по меньшей мере приблизительно 0,5%,1%, 2%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или более чем 90% спор по массе. В некоторых составах введенная доза не превышает 200, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900 мг или 1; 1,1; 1,2; 1,3; 1,4; 1,5; 1,6; 1,7; 1,8; или 1,9 г по массе.

[0122] Бактериальные споровые композиции обычно вводят в составы для перорального введения или гастрального введения, как правило, субъекту-млекопитающему. Согласно конкретным вариантам реализации указанную композицию вводят в состав для перорального введения в твердой, полутвердой, гелевой или жидкой форме, например, в форме пилюль, таблеток, капсул или пастилок. Согласно некоторым вариантам реализации такие составы содержат кишечнорастворимое покрытие или покрыты кишечнорастворимым покрытием для защиты бактерий при прохождении через желудок и тонкий кишечник, хотя споры обычно устойчивы в желудке и тонком кишечнике. Согласно другим вариантам реализации указанные бактериальные споровые композиции могут быть введены в состав со способствующим прорастанию веществом для улучшения приживления или эффективности. Согласно другим вариантам реализации указанные бактериальные споровые композиции могут быть введены в состав с пребиотическими веществами или вводиться вместе с пребиотическими веществами для улучшения приживления или эффективности.

[0123] Может быть получен состав с бактериальными споровыми композициями, эффективный у определенного субъекта-млекопитающего при однократном введении или при многократном введении. Например, однократное введение по существу эффективно для уменьшения содержания Cl. difficile и/или токсина Cl. difficile у субъекта-млекопитающего, которому вводят указанную композицию. По существу эффективный означает, что содержание Cl. difficile и/или токсин Cl. difficile у субъекта уменьшается по меньшей мере на 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98%, 99% или более чем на 99% после введения указанной композиции. Как вариант, эффективность может быть измерена по отсутствию симптомов диареи или отсутствию носительства C. difficile или токсина C. difficile через 2 дня, 4 дня, 1 неделю, 2 недели, 4 недели, 8 недель или более 8 недель.

Бактериальные композиции

[0124] Предложены бактерии и комбинации бактерий кишечной микробиоты человека, обладающие способностью значимо способствовать функциям здоровой микробиоты при введении хозяевам-млекопитающим. Считается, не ограничиваясь конкретным механизмом, что такие композиции ингибируют рост, пролиферацию, и/или колонизацию одной или множества(ом) патогенных бактерий в дисбиотической микробиотической нише, таким образом нормальная разнообразная защитная микробиота колонизирует и заселяет просвет кишечника для формирования или восстановления экологического контроля над патогенами или потенциальными патогенами (например, некоторые бактерии являются патогенными только при присутствии в дисбиотической среде). Ингибирование патогенов включает такие патогены, такие как C. difficile, Salmonella spp., энтеропатогенные E coli, обладающие множественной лекарственной устойчивостью бактерии, такие как Klebsiella и E. coli, устойчивые к карбапенемам Enterobacteriaceae (CRE), устойчивые к бета-лактамам расширенного спектра Enterococci (ESBL) и устойчивые к ванкомицину Enterococci (VRE).

[0125] В настоящем документе «тип» или более одного «типа» бактерий может различаться на уровне рода, вида, подвида, штамма или с применением любого другого таксономического метода, согласно описанию в настоящем документе и иными известными в данной области техники способами.

[0126] Бактериальные композиции могут содержать два типа бактерий (называясь «бинарными комбинациями» или «бинарными парами») или более чем два типа бактерий. Например, бактериальная композиция может содержать по меньшей мере 2, по меньшей мере 3, по меньшей мере 4, по меньшей мере 5, по меньшей мере 6, по меньшей мере 7, по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей мере 18, по меньшей мере 19, по меньшей мере 20, или по меньшей мере 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, или по меньшей мере 40, по меньшей мере 50 или более чем 50 типов бактерий, по оценке на основе видов или функциональных таксономических единиц (OTU), или иным образом согласно описанию в настоящем документе.

[0127] Согласно другому варианту реализации число типов бактерий, присутствующих в бактериальной композиции, равно известному значению или ниже известного значения. Например, в таких вариантах реализации бактериальная композиция содержит 50 или менее типов бактерий, например, 49, 48, 47, 46, 45, 44, 43, 42, 41, 40, 39, 38, 37, 36, 35, 34, 33, 32, 31, 30, 29, 28, 27, 26, 25, 24, 23, 22, 21, 20, 19, 18, 17, 16, 15, 14, 13, 12, 11, или 10 или менее, или 9 или менее типов бактерий, 8 или менее типов бактерий, 7 или менее типов бактерий, 6 или менее типов бактерий, 5 или менее типов бактерий, 4 или менее типов бактерий, или 3 или менее типов бактерий. Согласно другому варианту реализации бактериальная композиция содержит от 2 до не более чем 40, от 2 до не более чем 30, от 2 до не более чем 20, от 2 до не более чем 15, от 2 до не более чем 10, или от 2 до не более чем 5 типов бактерий.

Бактериальные композиции, описанные через виды

[0128] Могут быть получены бактериальные композиции, содержащие по меньшей мере два типа выделенных бактерий, выбранных из видов в таблице 1.

[0129] Согласно одному варианту реализации указанная бактериальная композиция содержит по меньшей мере какую-либо одну и, предпочтительно, более чем одну из следующих бактерий: Enterococcus faecalis (ранее была известна как Streptococcus faecalis), Clostridium innocuum, Clostridium ramosum, Bacteroides ovatus, Bacteroides vulgatus, Bacteroides thetaoiotaomicron, Escherichia coli (1109 и 1108-1), Clostridum bifermentans и Blautia producta (ранее была известна как Peptostreptococcus productus). Согласно альтернативному варианту реализации по меньшей мере какой-либо один из вышеперечисленных видов по существу не присутствует в указанной бактериальной композиции.

[0130] Согласно одному варианту реализации указанная бактериальная композиция содержит по меньшей мере какую-либо одну и, предпочтительно, более чем одну из следующих бактерий: Enterococcus faecalis (ранее была известна как Streptococcus faecalis), Clostridium innocuum, Clostridium ramosum, Bacteroides ovatus, Bacteroides vulgatus, Bacteroides thetaoiotaomicron, Escherichia coli (1109 и 1108-1), Clostridum bifermentans и Blautia producta (ранее была известна как Peptostreptococcus productus). Согласно альтернативному варианту реализации по меньшей мере какой-либо один из вышеперечисленных видов по существу не присутствует в указанной бактериальной композиции.

[0131] Согласно другому варианту реализации указанная бактериальная композиция содержит по меньшей мере какую-либо одну и, предпочтительно, более чем одну из следующих бактерий: Acidaminococcus intestinalis, Bacteroides ovatus, два штамма Bifidobacterium adolescentis, два штамма Bifidobacterium longum, Blautia producta, Clostridium cocleatum, Collinsella aerofaciens, два штамма Dorea longicatena, Escherichia coli, Eubacterium desmolans, Eubacterium eligens, Eubacterium limosum, четыре штамма Eubacterium rectale, Eubacterium ventriosumi, Faecalibacterium prausnitzii, Lachnospira pectinoshiza, Lactobacillus casei, Lactobacillus casei/paracasei, Paracateroides distasonis, Raoultella sp., один штамм Roseburia (выбранный из Roseburia faecalis или Roseburia faecis), Roseburia intestinalis, два штамма Ruminococcus torques, два штамма Ruminococcus obeum и Streptococcus mitis. Согласно альтернативному варианту реализации по меньшей мере какой-либо один из вышеперечисленных видов по существу не присутствует в указанной бактериальной композиции.

[0132] Согласно еще одному варианту реализации указанная бактериальная композиция содержит по меньшей мере какую-либо одну и, предпочтительно, более чем одну из следующих бактерий: Barnesiella intestinihominis; Lactobacillus reuteri; вид, описанный как один из Enterococcus hirae, Enterococus faecium или Enterococcus durans; вид, описанный как один из Anaerostipes caccae или Clostridium indolis; вид, описанный как один из Staphylococcus warneri или Staphylococcus pasteuri; и Adlercreutzia equolifaciens. Согласно альтернативному варианту реализации по меньшей мере какой-либо один из вышеперечисленных видов по существу не присутствует в указанной бактериальной композиции.

[0133] Согласно другим вариантам реализации указанная бактериальная композиция содержит по меньшей мере какую-либо одну и, предпочтительно, более чем одну из следующих бактерий: Clostridium absonum, Clostridium argentinense, Clostridium baratii, Clostridium bartlettii, Clostridium bifermentans, Clostridium botulinum, Clostridium butyricum, Clostridium cadaveris, Clostridium camis, Clostridium celatum, Clostridium chauvoei, Clostridium clostridioforme, Clostridium cochlearium, Clostridium difficile, Clostridium fallax, Clostridium felsineum, Clostridium ghonii, Clostridium glycolicum, Clostridium haemolyticum, Clostridium hastiforme, Clostridium histolyticum, Clostridium indolis, Clostridium innocuum, Clostridium irregulare, Clostridium limosum, Clostridium malenominatum, Clostridium novyi, Clostridium oroticum, Clostridium paraputrificum, Clostridium perfringens, Clostridium piliforme, Clostridium putrefaciens, Clostridium putrificum, Clostridium ramosum, Clostridium sardiniense, Clostridium sartagoforme, Clostridium scindens, Clostridium septicum, Clostridium sordellii, Clostridium sphenoides, Clostridium spiroforme, Clostridium sporogenes, Clostridium subterminale, Clostridium symbiosum, Clostridium tertium, Clostridium tetani, Clostridium welchii и Clostridium villosum. Согласно альтернативному варианту реализации по меньшей мере какой-либо один из вышеперечисленных видов по существу не присутствует в указанной бактериальной композиции.

[0134] Согласно одному варианту реализации указанная бактериальная композиция содержит по меньшей мере какую-либо одну и, предпочтительно, более чем одну из следующих бактерий: Clostridium innocuum, Clostridum bifermentans, Clostridium butyricum, Bacteroides fragilis, Bacteroides thetaiotaomicron, Bacteroides uniformis, три штамма Escherichia coli и Lactobacillus sp. Согласно альтернативному варианту реализации по меньшей мере какой-либо один из вышеперечисленных видов по существу не присутствует в указанной бактериальной композиции.

[0135] Согласно одному варианту реализации указанная бактериальная композиция содержит по меньшей мере какую-либо одну и, предпочтительно, более чем одну из следующих бактерий: Clostridium bifermentans, Clostridium innocuum, Clostridium butyricum, три штамма Escherichia coli, три штамма Bacteroides и Blautia producta. Согласно альтернативному варианту реализации по меньшей мере какой-либо один из вышеперечисленных видов по существу не присутствует в указанной бактериальной композиции.

[0136] Согласно одному варианту реализации указанная бактериальная композиция содержит по меньшей мере какую-либо одну и, предпочтительно, более чем одну из следующих бактерий: Bacteroides sp., Escherichia coli и непатогенная Clostridia, в том числе Clostridium innocuum, Clostridium bifermentans и Clostridium ramosum. Согласно альтернативному варианту реализации по меньшей мере какой-либо один из вышеперечисленных видов по существу не присутствует в указанной бактериальной композиции.

[0137] Согласно одному варианту реализации указанная бактериальная композиция содержит по меньшей мере какую-либо одну и, предпочтительно, более чем одну из следующих бактерий: виды Bacteroides, Escherichia coli и непатогенная Clostridia, например, Clostridium butyricum, Clostridium bifermentans и Clostridium innocuum. Согласно альтернативному варианту реализации по меньшей мере какой-либо один из вышеперечисленных видов по существу не присутствует в указанной бактериальной композиции.

[0138] Согласно одному варианту реализации указанная бактериальная композиция содержит по меньшей мере какую-либо одну и, предпочтительно, более чем одну из следующих бактерий: Bacteroides caccae, Bacteroides capillosus, Bacteroides coagulans, Bacteroides distasonis, Bacteroides eggerthii, Bacteroides forsythus, Bacteroides fragilis, Bacteroides fragilis-ryhm, Bacteroides gracilis, Bacteroides levii, Bacteroides macacae, Bacteroides merdae, Bacteroides ovatus, Bacteroides pneumosintes, Bacteroides putredinis, Bacteroides pyogenes, Bacteroides splanchnicus, Bacteroides stercoris, Bacteroides tectum, Bacteroides thetaiotaomicron, Bacteroides uniformis, Bacteroides ureolyticus и Bacteroides vulgatus. Согласно альтернативному варианту реализации по меньшей мере какой-либо один из вышеперечисленных видов по существу не присутствует в указанной бактериальной композиции.

[0139] Согласно одному варианту реализации указанная бактериальная композиция содержит по меньшей мере какую-либо одну и, предпочтительно, более чем одну из следующих бактерий: Bacteroides, Eubacteria, Fusobacteria, Propionibacteria, Lactobacilli, анаэробные кокки, Ruminococcus, Escherichia coli, Gemmiger, Desulfomonas и Peptostreptococcus. Согласно альтернативному варианту реализации по меньшей мере какой-либо один из вышеперечисленных видов по существу не присутствует в указанной бактериальной композиции.

[0140] Согласно одному варианту реализации указанная бактериальная композиция содержит по меньшей мере какую-либо одну и, предпочтительно, более чем одну из следующих бактерий: Bacteroides fragilis ss. Vulgatus, Eubacterium aerofaciens, Bacteroides fragilis ss. Thetaiotaomicron, Blautia producta (ранее была известна как Peptostreptococcus productus II), Bacteroides fragilis ss. Distasonis, Fusobacterium prausnitzii, Coprococcus eutactus, Eubacterium aerofaciens III, Blautia producta (ранее была известна как Peptostreptococcus productus I), Ruminococcus bronii, Bifidobacterium adolescentis, Gemmiger formicilis, Bifidobacterium longum, Eubacterium siraeum, Ruminococcus torques, Eubacterium rectale III-H, Eubacterium rectale IV, Eubacterium eligens, Bacteroides eggerthii, Clostridium leptum, Bacteroides fragilis ss. A, Eubacterium biforme, Bifidobacterium infantis, Eubacterium rectale III-F, Coprococcus comes, Bacteroides capillosus, Ruminococcus albus, Eubacterium formicigenerans, Eubacterium hallii, Eubacterium ventriosum I, Fusobacterium russii, Ruminococcus obeum, Eubacterium rectale II, Clostridium ramosum I, Lactobacillus leichmanii, Ruminococcus cailidus, Butyrivibrio crossotus, Acidaminococcus fermentans, Eubacterium ventriosum, Bacteroides fragilis ss. fragilis, Bacteroides AR, Coprococcus catus, Eubacterium hadrum, Eubacterium cylindroides, Eubacterium ruminantium, Eubacterium CH-1, Staphylococcus epidermidis, Peptostreptococcus BL, Eubacterium limosum, Bacteroides praeacutus, Bacteroides L, Fusobacterium mortiferum I, Fusobacterium naviforme, Clostridium innocuum, Clostridium ramosum, Propionibacterium acnes, Ruminococcus flavefaciens, Ruminococcus AT, Peptococcus AU-1, Eubacterium AG, -AK, -AL, -AL-1, -AN; Bacteroides fragilis ss. ovatus, -ss. d, -ss. f; Bacteroides L-1, L-5; Fusobacterium nucleatum, Fusobacterium mortiferum, Escherichia coli, Streptococcus morbiliorum, Peptococcus magnus, Peptococcus G, AU-2; Streptococcus intermedius, Ruminococcus lactaris, Ruminococcus CO Gemmiger X, Coprococcus BH, -CC; Eubacterium tenue, Eubacterium ramulus, Eubacterium AE, -AG-H, -AG-M, -AJ, -BN-1; Bacteroides clostridiiformis ss. clostridliformis, Bacteroides coagulans, Bacteroides orails, Bacteroides ruminicola ss. brevis, -ss. ruminicola, Bacteroides splanchnicus, Desuifomonas pigra, Bacteroides L-4, -N-i; Fusobacterium H, Lactobacillus G и Succinivibrio A. Согласно альтернативному варианту реализации по меньшей мере какой-либо один из вышеперечисленных видов по существу не присутствует в указанной бактериальной композиции.

Бактериальные композиции, определенные через функциональные таксономические единицы (OTU)

[0141] Могут быть получены бактериальные композиции, содержащие по меньшей мере два типа выделенных бактерий, выбранные из видов в таблице 1.

[0142] Согласно одному варианту реализации OTU могут характеризоваться одной или большим количеством вариабельных областей последовательности 16S (V1-V9). Указанные области у бактерий определяют нуклеотиды 69-99, 137-242, 433-497, 576-682, 822-879, 986-1043, 1117-1173, 1243-1294 и 1435-1465, соответственно, с применением нумерации на основе системы номенклатуры E. coli. (См., например, Brosius et al., Complete nucleotide sequence of a 16S ribosomal RNA gene from Escherichia coli, PNAS 75(10):4801-4805 (1978)). Согласно некоторым вариантам реализации для определения OTU используют по меньшей мере какую-либо одну из областей V1, V2, V3, V4, V5, V6, V7, V8 и V9. Согласно одному варианту реализации области V1, V2, и V3 используют для определения OTU. Согласно другому варианту реализации области V3, V4, и V5 используют для определения OTU. Согласно другому варианту реализации область V4 используют для определения OTU.

Бактериальные композиции, не содержащие определенных бактериальных видов или штаммов

[0143] Согласно одному варианту реализации указанная бактериальная композиция не содержит по меньшей мере какую-либо одну бактерию из Enterococcus faecalis (ранее была известна как Streptococcus faecalis), Clostridium innocuum, Clostridium ramosum, Bacteroides ovatus, Bacteroides vulgatus, Bacteroides thetaoiotaomicron, Escherichia coli (1109 и 1108-1), Clostridum bifermentans и Blautia producta (ранее была известна как Peptostreptococcus productus).

[0144] Согласно другому варианту реализации указанная бактериальная композиция не содержит по меньшей мере какую-либо одну бактерию из Acidaminococcus intestinalis, Bacteroides ovatus, два вида Bifidobacterium adolescentis, два вида Bifidobacterium longum, Collinsella aerofaciens, два вида Dorea longicatena, Escherichia coli, Eubacterium eligens, Eubacterium limosum, четыре вида Eubacterium rectale, Eubacterium ventriosumi, Faecalibacterium prausnitzii, Lactobacillus casei, Lactobacillus paracasei, Paracateroides distasonis, Raoultella sp., один вид Roseburia (выбранный из Roseburia faecalis или Roseburia faecis), Roseburia intestinalis, два вида Ruminococcus torques и Streptococcus mitis.

[0145] Согласно еще одному варианту реализации указанная бактериальная композиция не содержит по меньшей мере какую-либо одну бактерию из Barnesiella intestinihominis; Lactobacillus reuteri; вид, описанный как один из Enterococcus hirae, Enterococus faecium, или Enterococcus durans; вид, описанный как один из Anaerostipes caccae или Clostridium indolis; вид, описанный как один из Staphylococcus warneri или Staphylococcus pasteuri; и Adlercreutzia equolifaciens.

[0146] Согласно другим вариантам реализации указанная бактериальная композиция не содержит по меньшей мере что-либо одно из Clostridium absonum, Clostridium argentinense, Clostridium baratii, Clostridium bifermentans, Clostridium botulinum, Clostridium butyricum, Clostridium cadaveris, Clostridium camis, Clostridium celatum, Clostridium chauvoei, Clostridium clostridioforme, Clostridium cochlearium, Clostridium difficile, Clostridium fallax, Clostridium felsineum, Clostridium ghonii, Clostridium glycolicum, Clostridium haemolyticum, Clostridium hastiforme, Clostridium histolyticum, Clostridium indolis, Clostridium innocuum, Clostridium irregulare, Clostridium limosum, Clostridium malenominatum, Clostridium novyi, Clostridium oroticum, Clostridium paraputrificum, Clostridium perfringens, Clostridium piliforme, Clostridium putrefaciens, Clostridium putrificum, Clostridium ramosum, Clostridium sardiniense, Clostridium sartagoforme, Clostridium scindens, Clostridium septicum, Clostridium sordellii, Clostridium sphenoides, Clostridium spiroforme, Clostridium sporogenes, Clostridium subterminale, Clostridium symbiosum, Clostridium tertium, Clostridium tetani, Clostridium welchii и Clostridium villosum.

[0147] Согласно другому варианту реализации указанная бактериальная композиция не содержит по меньшей мере какую-либо одну бактерию из Clostridium innocuum, Clostridum bifermentans, Clostridium butyricum, Bacteroides fragilis, Bacteroides thetaiotaomicron, Bacteroides uniformis, три штамма Escherichia coli и Lactobacillus sp.

[0148] Согласно другому варианту реализации указанная бактериальная композиция не содержит по меньшей мере какую-либо одну бактерию из Clostridium bifermentans, Clostridium innocuum, Clostridium butyricum, три штамма Escherichia coli, три штамма Bacteroides и Blautia producta (ранее была известна как Peptostreptococcus productus).

[0149] Согласно другому варианту реализации указанная бактериальная композиция не содержит по меньшей мере какую-либо одну бактерию из Bacteroides sp., Escherichia coli, и непатогенной Clostridia, в том числе Clostridium innocuum, Clostridium bifermentans и Clostridium ramosum.

[0150] Согласно другому варианту реализации указанная бактериальная композиция не содержит по меньшей мере какую-либо одну бактерию из более чем одного вида Bacteroides, Escherichia coli и непатогенной Clostridia, например, Clostridium butyricum, Clostridium bifermentans и Clostridium innocuum.

[0151] Согласно другому варианту реализации указанная бактериальная композиция не содержит по меньшей мере какую-либо одну бактерию из Bacteroides caccae, Bacteroides capillosus, Bacteroides coagulans, Bacteroides distasonis, Bacteroides eggerthii, Bacteroides forsythus, Bacteroides fragilis, Bacteroides fragilis-ryhm, Bacteroides gracilis, Bacteroides levii, Bacteroides macacae, Bacteroides merdae, Bacteroides ovatus, Bacteroides pneumosintes, Bacteroides putredinis, Bacteroides pyogenes, Bacteroides splanchnicus, Bacteroides stercoris, Bacteroides tectum, Bacteroides thetaiotaomicron, Bacteroides uniformis, Bacteroides ureolyticus и Bacteroides vulgatus.

[0152] Согласно другому варианту реализации указанная бактериальная композиция не содержит по меньшей мере какую-либо одну бактерию из Bacteroides, Eubacteria, Fusobacteria, Propionibacteria, Lactobacilli, анаэробных кокков, Ruminococcus, Escherichia coli, Gemmiger, Desulfomonas и Peptostreptococcus.

[0153] Согласно другому варианту реализации указанная бактериальная композиция не содержит по меньшей мере какую-либо одну бактерию из Bacteroides fragilis ss. Vulgatus, Eubacterium aerofaciens, Bacteroides fragilis ss. Thetaiotaomicron, Blautia producta (ранее была известна как Peptostreptococcus productus II), Bacteroides fragilis ss. Distasonis, Fusobacterium prausnitzii, Coprococcus eutactus, Eubacterium aerofaciens III, Blautia producta (ранее была известна как Peptostreptococcus productus I), Ruminococcus bromii, Bifidobacterium adolescentis, Gemmiger formicilis, Bifidobacterium longum, Eubacterium siraeum, Ruminococcus torques, Eubacterium rectale III-H, Eubacterium rectale IV, Eubacterium eligens, Bacteroides eggerthii, Clostridium leptum, Bacteroides fragilis ss. A, Eubacterium biforme, Bifidobacterium infantis, Eubacterium rectale III-F, Coprococcus comes, Bacteroides capillosus, Ruminococcus albus, Eubacterium formicigenerans, Eubacterium hallii, Eubacterium ventriosum I, Fusobacterium russii, Ruminococcus obeum, Eubacterium rectale II, Clostridium ramosum I, Lactobacillus leichmanii, Ruminococcus cailidus, Butyrivibrio crossotus, Acidaminococcus fermentans, Eubacterium ventriosum, Bacteroides fragilis ss. fragilis, Bacteroides AR, Coprococcus catus, Eubacterium hadrum, Eubacterium cylindroides, Eubacterium ruminantium, Eubacterium CH-1, Staphylococcus epidermidis, Peptostreptococcus BL, Eubacterium limosum, Bacteroides praeacutus, Bacteroides L, Fusobacterium mortiferum I, Fusobacterium naviforme, Clostridium innocuum, Clostridium ramosum, Propionibacterium acnes, Ruminococcus flavefaciens, Ruminococcus AT, Peptococcus AU-1, Eubacterium AG, -AK, -AL, -AL-1, -AN; Bacteroides fragilis ss. ovatus, -ss. d, -ss. f; Bacteroides L-1, L-5; Fusobacterium nucleatum, Fusobacterium mortiferum, Escherichia coli, Streptococcus morbiliorum, Peptococcus magnus, Peptococcus G, AU-2; Streptococcus intermedius, Ruminococcus lactaris, Ruminococcus CO Gemmiger X, Coprococcus BH, -CC; Eubacterium tenue, Eubacterium ramulus, Eubacterium AE, -AG-H, -AG-M, -AJ, -BN-1; Bacteroides clostridiiformis ss. clostridliformis, Bacteroides coagulans, Bacteroides orails, Bacteroides ruminicola ss. brevis, -ss. ruminicola, Bacteroides splanchnicus, Desuifomonas pigra, Bacteroides L-4, -N-i; Fusobacterium H, Lactobacillus G и Succinivibrio A.

Ингибирование бактериальных патогенов

[0154] Согласно некоторым вариантам реализации указанная бактериальная композиция обеспечивает защитный или терапевтический эффект от инфекции одним или большим количеством представляющих интерес патогенов ЖКТ.

[0155] Перечень типовых бактериальных патогенов приведен в таблице 1, на что указывает патогенный статус.

[0165] Согласно некоторым вариантам реализации указанная патогенная бактерия выбрана из группы, состоящей из Yersinia, Vibrio, Treponema, Streptococcus, Staphylococcus, Shigella, Salmonella, Rickettsia, Orientia, Pseudomonas, Neisseria, Mycoplasma, Mycobacterium, Listeria, Leptospira, Legionella, Klebsiella, Helicobacter, Haemophilus, Francisella, Escherichia, Ehrlichia, Enterococcus, Coxiella, Corynebacterium, Clostridium, Chlamydia, Chlamydophila, Campylobacter, Burkholderia, Brucella, Borrelia, Bordetella, Bifidobacterium, Bacillus, обладающих множественной лекарственной устойчивостью бактерий, устойчивых к бета-лактамам расширенного спектра энтерококков (ESBL), устойчивых к карбапенемам Enterobacteriaceae (CRE) и устойчивых к ванкомицину энтерококков (VRE).

[0157] Согласно некоторым вариантам реализации указанные патогены включают, не ограничиваясь перечисленными, Aeromonas hydrophila, Campylobacter fetus, Plesiomonas shigelloides, Bacillus cereus, Campylobacter jejuni, Clostridium botulinum, Clostridium difficile, Clostridium perfringens, энтероагрегативную Escherichia coli, энтерогеморрагическую Escherichia coli, энтероинвазивную Escherichia coli, энтеротоксигенную Escherichia coli (например, но не ограничиваясь перечисленными, LT и/или ST), Escherichia coli 0157:H7, Helicobacter pylori, Klebsiellia pneumonia, Lysteria monocytogenes, Plesiomonas shigelloides, Salmonella spp., Salmonella typhi, Salmonella paratyphi, Shigella spp., Staphylococcus spp., Staphylococcus aureus, устойчивые к ванкомицину Enterococcus spp., Vibrio spp., Vibrio cholerae, Vibrio parahaemolyticus, Vibrio vulnificus и Yersinia enterocolitica.

[0158] Согласно одному варианту реализации представляющий интерес патоген представляет собой по меньшей мере один патоген, выбранный из Clostridium difficile, Salmonella spp., патогенной Escherichia coli, устойчивых к ванкомицину Enterococcus spp. и устойчивых к бета-лактамам расширенного спектра Enterococci (ESBL).

Очищенные популяции спор

[0159] Согласно некоторым вариантам реализации бактериальные композиции содержат очищенные популяции спор. Очищенные популяции спор содержат комбинации комменсальных бактерии кишечной микробиоты человека, обладающие способностью значимо способствовать функциям нормальной микробиоты при введении субъекту-млекопитающему. Считается, что, не ограничиваясь конкретным механизмом, такие композиции ингибируют рост патогена, такого как C. difficile, Salmonella spp., энтеропатогенных E. coli и устойчивых к ванкомицину Enterococcus spp., поддерживая таким образом здоровую разнообразную защитную микробиоту, или, в случае инфекций патогенными бактериями, например, инфекции C. difficile, позволяя ей заново заселять просвет кишечника для восстановления экологического контроля над потенциальными патогенами. Согласно некоторым вариантам реализации споры дрожжей и другие грибные споры также очищают и отбирают для терапевтического применения.

[0160] Раскрытые в настоящем изобретении терапевтические композиции, содержащие непатогенные способные к прорастанию бактериальные споры, для предотвращения, контроля и лечения заболеваний, расстройств и состояний ЖКТ и поддержания общего здоровья в области пищеварения. Указанные композиции обладают полезными свойствами, поскольку подходят для безопасного введения человеку и другим субъектам-млекопитающим, а также эффективны при многочисленных желудочно-кишечных заболеваниях, расстройствах и состояниях и для поддержания общего здоровья в области пищеварения. Хотя композиции на основе спор известны, их обычно получают с применением других техник, таких как лиофилизация или высушивание распылением жидких бактериальных культур, что приводит к неудовлетворительной эффективности, нестабильности, существенной вариабельности и отсутствию адекватной безопасности.

[0161] Было обнаружено, что популяции бактериальных спор могут быть получены из биологических материалов, полученных от субъектов-млекопитающих, в том числе человека. Указанные популяции вводят в состав композиций согласно настоящему изобретению и вводят субъектам-млекопитающим с применением способов согласно описанию в настоящем документе.

[0162] Предложены терапевтические композиции, содержащие очищенную популяцию бактериальных спор. В настоящем документе термины «очищать», «очищенный» и «очищать» относятся к состоянию популяции (например, совокупности известной или неизвестной численности и/или концентрации) требуемых бактериальных спор, подвергнутых одному или нескольким процессам очищения, например, отбору или обогащению по требуемым бактериальным спорам, или, как вариант, к удалению или уменьшению количества остаточных продуктов среды обитания согласно описанию в настоящем документе. Согласно некоторым вариантам реализации в очищенной популяции отсутствует детектируемая нежелательная активность или, как вариант, уровень или количество нежелательной активности являются приемлемыми или ниже приемлемых уровня или количества. Согласно другим вариантам реализации очищенная популяция содержит приемлемое(ую) количество и/или концентрацию требуемых бактериальных спор или бόльшее(ую) количество и/или концентрацию. Согласно другим вариантам реализации указанный очищенная популяция бактериальных спор обогащена относительно исходного материала (например, фекального материала), из которого получают указанную популяцию. Указанное обогащение может составлять 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,9%, 99,99%, 99,999%, 99,9999%, или более чем 99,9999% по сравнению с исходным материалом.

[0163] Согласно определенным вариантам реализации в указанных очищенных популяциях бактериальных спор наблюдаются пониженные или недетектируемые уровни одной или большего числа патогенных активностей, таких как токсичность, способность вызывать инфекцию у реципиента - субъекта-млекопитающего, нежелательная иммуномодулирующая активность, аутоиммунный ответ, метаболический ответ, или воспалительный ответ, или неврологическая реакция. Такое уменьшение патогенной активности может составлять 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,9%, 99,99%, 99,999%, 99,9999%, или более чем на 99,9999% по сравнению с исходным материалом. Согласно другим вариантам реализации в очищенных популяциях бактериальных спор содержится меньше органолептических компонентов по сравнению с фекальным материалом, например, менее выраженный запах, вкус, внешний вид и умами.

[0164] Предложены очищенные популяции бактериальных спор, которые по существу не содержат остаточных продуктов среды обитания. Согласно определенным вариантам реализации это означает, что композиция с бактериальными спорами уже не содержит существенного количества биологического вещества, связанного с сообществом микроорганизмов, обитающих на организме или в организме субъекта-человека или животного, и очищенная популяция спор может быть на 100%, 99%, 98%, 97%, 96% или 95% очищена от каких-либо загрязнений биологическим веществом, связанным с указанным сообществом микроорганизмов. «По существу не содержащие остаточные продукты среды обитания» может также означать, что композиция с бактериальными спорами не содержит детектируемых клеток человека или животного, и что детектируются исключительно клетки микроорганизмов, в частности, детектируются только требуемые клетки микроорганизмов. Согласно другому варианту реализации это означает, что менее чем 1×10^-2%, 1×10^-3%, 1×10^-4%, 1×10^-5%, 1×10^-6%, 1×10^-7%, 1×10^-8% клеток в бактериальной композиции принадлежат человеку или животному, а не микроорганизмам. Согласно другому варианту реализации количество остаточного продукта среды обитания, присутствующего в очищенной популяции, уменьшается по меньшей мере до определенного уровня относительно фекального материала, полученного от донора - субъекта-млекопитающего, например, уменьшается по меньшей мере приблизительно на 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,9%, 99,99%, 99,999%, 99,9999%, или более чем на 99,9999%.

[0165] Согласно одному варианту реализации «по существу не содержащие остаточных продуктов среды обитания» или «по существу не содержащие на детектируемом уровне патогенного материала» означает, что бактериальная композиция не содержит детектируемых вирусных загрязнений (в том числе бактериальных вирусов (т.е. фагов)), грибных, микоплазменных или токсоплазменных загрязнений, или эукариотических паразитов, таких как гельминты. Как вариант, очищенные популяции спор по существу не содержат бесклеточного материала, например, ДНК, материала вирусной оболочки, или нежизнеспособного бактериального материала.

[0166] Согласно описанию в настоящем документе очищение популяций спор может быть продемонстрировано с помощью генетического анализа (например, ПЦР, секвенирования ДНК), серологического и антигенного анализа, и способов с применением таких инструментов, как проточная цитометрия с реагентами для различения требуемых бактериальных спор и нежелательных загрязняющих материалов.

[0167] Примеры биологических материалов включают фекальные материалы, такие как кал, или материалы, выделенные из различных сегментов тонкого и толстого кишечника. Фекальные материалы получают от донора - субъекта-млекопитающего, или они могут быть получены от более чем одного субъекта-донора, например, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 75, 100, 200, 300, 400, 500, 750, 1000 или от более чем 1000 доноров, при этом такие материалы затем объединяют до очищения требуемых бактериальных спор.

[0168] Согласно альтернативным вариантам реализации указанный требуемые бактериальные споры очищают из одного образца фекального материала, полученного от единственного донора, и после такого очищения комбинируют с очищенными популяциями спор, также полученными при очищении, либо от одного и того же донора в разные моменты времени, или от одного или нескольких разных доноров, или используют оба варианта.

[0169] Предпочтительные бактериальные роды включают Acetonema, Alkaliphilus, Alicyclobacillus, Amphibacillus, Ammonifex, Anaerobacter, Anaerofustis, Anaerostipes, Anaerotruncus, Anoxybacillus, Bacillus, Blautia, Brevibacillus, Bryantella, Caldicellulosiruptor, Caloramator, Candidatus, Carboxydibrachium, Carboxydothermus, Clostridium, Cohnella, Coprococcus, Dendrosporobacter Desulfitobacterium, Desulfosporosinus, Desulfotomaculum, Dorea, Eubacterium, Faecalibacterium, Filifactor, Geobacillus, Halobacteroides, Heliobacillus, Heliobacterium, Heliophilum, Heliorestis, Lachnoanaerobaculum, Lysinibacillus, Moorella, Oceanobacillus, Orenia (S.), Oxalophagus, Oxobacter, Paenibacillus, Pelospora, Pelotomaculum, Propionispora, Roseburia, Ruminococcus, Sarcina, Sporobacterium, Sporohalobacter, Sporolactobacillus, Sporomusa, Sporosarcina, Sporotomaculum, Subdoligranulum, Symbiobacterium, Syntrophobotulus, Syntrophospora, Terribacillus, Thermoanaerobacter и Thermosinus.

[0170] Предпочтительные бактериальные виды представлены в таблице X4. В тех случаях, когда приведены конкретные штаммы вида, специалисту в данной области техники будет понятно, что приведенный штамм может быть заменен на другие штаммы указанного вида.

[0171] Согласно некоторым вариантам реализации споробразующие бактерии идентифицируют по присутствию последовательностей нуклеиновых кислот, которые модулируют споруляцию. В частности, характерные для споруляции гены высококонсервативны у всех представителей дальнородственных родов, в том числе Clostridium и Bacillus. С применением традиционных подходов «прямой» генетики были идентифицированы многие, если не все, гены, критически важные для споруляции (spo). Программа развития споруляции частично управляется последовательным действием четырех компартмент-специфических сигма-факторов (наблюдаемых в следующем порядке: σF, σE, σG и σK), активность которых ограничена проспорой (σF и σG) или материнской клеткой (σE и σK).

[0172] Предложены популяции спор, содержащие более одного типа бактерий. В настоящем документе «тип» или более одного «типа» бактерий может различаться на уровне рода, вида, подвида, штамма или с применением любого другого таксономического метода, согласно описанию в настоящем документе и иными известными в данной области техники способами.

[0173] Согласно некоторым вариантам реализации все или по существу все бактериальные споры, присутствующие в очищенной популяции, получены из фекального материала, обработанного согласно описанию в настоящем документе или иным известным способом в данной области техники. Согласно альтернативным вариантам реализации одну или большее количество бактериальных спор или типов бактериальных спор получают в культуре и комбинируют для получения очищенной популяции спор. Согласно другим альтернативным вариантам реализации одну или большее количество указанных полученных в культуре популяций спор комбинируют с полученной из фекального материала популяцией спор для получения гибридной популяции спор. Бактериальные композиции могут содержать по меньшей мере два типа указанных предпочтительных бактерий, в том числе штаммы одного вида. Например, бактериальная композиция может содержать по меньшей мере 2, по меньшей мере 3, по меньшей мере 4, по меньшей мере 5, по меньшей мере 6, по меньшей мере 7, по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей мере 18, по меньшей мере 19, или по меньшей мере 20 или более чем 20 типов бактерий, по оценке на основании видов или функциональных таксономических единиц (OTU), включающих такие виды.

[0174] Таким образом, предложены способы получения композиций, содержащих популяцию бактериальных спор, подходящую для терапевтического введения нуждающемуся в этом субъекту-млекопитающему. Указанную композицию получают, как правило, путем проведения этапов: (a) получения фекального материала от донора - субъекта-млекопитающего; и (b) проведения по меньшей мере одного варианта очищения или этапа очищения указанного фекального материала в таких условиях, чтобы получить из указанного фекального материала популяцию бактериальных спор. Состав с указанной композицией получают таким образом, что одна доза для перорального приема содержит по меньшей мере приблизительно 1×10⁴ колониеобразующих единиц указанных бактериальных спор, и одна доза для перорального приема, как правило, содержит приблизительно 1×10⁴, 1×10⁵, 1×10⁶, 1×10⁷, 1×10⁸, 1×10⁹, 1×10¹⁰, 1×10¹¹, 1×10¹², 1×10¹³, 1×10¹⁴, 1×10¹⁵, или более чем на 1×10¹⁵ КОЕ указанных бактериальных спор. Присутствие и/или концентрация определенного типа бактериальных спор может быть известно или неизвестно для определенной очищенной популяции спор. Если известна, например, концентрация спор определенного штамма или совокупности всех штаммов, она составляет, например, 1×10⁴, 1×10⁵, 1×10⁶, 1×10⁷, 1×10⁸, 1×10⁹, 1×10¹⁰, 1×10¹¹, 1×10¹², 1×10¹³, 1×10¹⁴, 1×10¹⁵ или более чем 1×10¹⁵ жизнеспособных бактериальных спор на грамм композиции или на введенную дозу.

[0175] В некоторых составах композиция содержит по меньшей мере приблизительно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или более чем 90% спор по массе. В некоторых составах введенная доза не превышает 200, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900 мг или 1; 1,1; 1,2; 1,3; 1,4; 1,5; 1,6; 1,7; 1,8; или 1,9 г по массе.

[0176] Бактериальные споровые композиции обычно вводят в составы для перорального или гастрального введения, как правило, субъекту-млекопитающему. Согласно конкретным вариантам реализации указанную композиция вводят в состав для перорального введения в виде твердой, полутвердой, гелевой или жидкой формы, например, в форме пилюли, таблетки, капсулы или пастилки. Согласно некоторым вариантам реализации такие составы содержат кишечнорастворимое покрытие или покрыты кишечнорастворимым покрытием для защиты бактерии при прохождении через желудок и тонкий кишечник, хотя споры обычно устойчивы в желудке и тонком кишечнике.

[0177] Бактериальные споровые композиции могут быть введены в состав, эффективный у определенного субъекта-млекопитающего при однократном введении или при многократном введении. Например, однократное введение по существу эффективно для уменьшения содержания токсина Cl. difficile и/или Cl. difficile у субъекта-млекопитающего, которому вводят указанную композицию. «По существу эффективный» означает, что содержание токсина Cl. difficile и/или Cl. difficile у субъекта уменьшается по меньшей мере на 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98%, 99% или более чем на 99% после введения указанной композиции.

СПОСОБЫ

Способы определения последовательностей 16S

[0178] OTU могут быть определены либо посредством полного 16S-секвенирования гена рРНК, секвенированием конкретной гипервариабельной области указанного гена (т.е. V1, V2, V3, V4, V5, V6, V7, V8 или V9), или посредством секвенирования любой комбинации гипервариабельных областей указанного гена (например, V1-3 или V3-5). Длина бактериальных 16S рРНК составляет приблизительно 1500 нуклеотидов, и их используют для реконструкции эволюционных взаимосвязей и сходства последовательностей между бактериальными изолятами с применением филогенетических методов. Последовательности 16S используют для филогенетической реконструкции, поскольку они обычно высококонсервативны, однако содержат специфические гипервариабельные области, содержащие достаточно разнообразные нуклеотиды для различения родов и видов большинства микроорганизмов.

[0179] Используя хорошо известные техники, для определения полной последовательности 16S или последовательности любой гипервариабельной области последовательности 16S, геномную ДНК экстрагируют из бактериального образца, 16S рРНК (полностью или специфические гипервариабельные области) амплифицировали с применением полимеразной цепной реакции (ПЦР), очищали продукты ПЦР и определяли нуклеотидные последовательности для определения генетического состава гена 16S или субдомена указанного гена. В том случае, если проводится полное 16S-секвенирование, используемый метод секвенирования может быть представлен, не ограничиваясь указанным, секвенированием по Сэнгеру. В том случае, если используется одна или большее количество гипервариабельных областей, таких как область V4, секвенирование может быть проведено, не ограничиваясь перечисленным, с применением метода Сэнгера или метода секвенирования нового поколения, например, метода от Illumina (секвенирование синтезом) с применением штрихкодированных праймеров, позволяющих проводить несколько реакций.

[0180] OTU могут быть определены по комбинации нуклеотидных маркеров или генов, в частности, высококонсервативных генов (например, генов «домашнего хозяйства») или их комбинации, полной последовательности генома или части последовательности генома, полученной с применением амплифицированных генетических продуктов, или последовательности всего генома (WGS). С применением хорошо известных способов специфические геномные области ДНК, экстрагированной из бактериального образца, амплифицируют с применением ПЦР и секвенируют для определения нуклеотидной последовательности амплифицированных продуктов. При секвенировании полного генома методом дробовика (WGS) экстрагированную ДНК прямо секвенируют без амплификации. Информация о последовательностях может быть получена с применением любой технологии секвенирования, включая, но не ограничиваясь перечисленными, метод Сэнгера, метод от Illumina, 454 Life Sciences, Ion Torrent, ABI, Pacific Biosciences и/или Oxford Nanopore.

Способы получения бактериальной композиции для введения субъекту

[0181] Способы получения бактериальных композиций могут включать три основных этапа обработки в сочетании с одним или несколькими этапами смешивания. Указанные этапы включают создания банков организмов, получения организмов и их сохранение.

[0182] Для получения банков штаммы, входящие в бактериальную композицию, могут (1) быть выделены прямо из образца или взяты из банкированного основного раствора, (2) необязательно культивироваться на питательном агаре или бульоне, который обеспечивает рост, для получения жизнеспособной биомассы, и (3) указанную биомассу необязательно сохраняют в виде нескольких аликвот для долгосрочного хранения.

[0183] Согласно вариантам реализации, в которых используется этап культивирования, агар или бульон могут содержать питательные вещества, обеспечивающие существенные элементы и специфические факторы, которые обеспечивают рост. Примером является среда, состоящая из 20 г/л глюкозы, 10 г/л дрожжевого экстракта, 10 г/л соевого пептона, 2 г/л лимонной кислоты, 1.5 г/л одноосновного фосфата натрия, 100 мг/л цитрата аммония железа, 80 мг/л сульфата магния, 10 мг/л геминхлорида, 2 мг/л хлорида кальция, 1 мг/л менадиона. Разнообразные микробиологические среды и варианты хорошо известны в данной области техники (например, R.M. Atlas, Handbook of Microbiological Media (2010) CRC Press). Среда может быть добавлена в культуру в начале, может быть во время культивирования или может протекать через культуру периодически/постоянно. Штаммы в бактериальной композиции могут культивироваться по отдельности, в виде подгруппы бактериальной композиции или как целая коллекция, содержащая указанную бактериальную композицию. Например, первый штамм может культивироваться вместо с вторым штаммом в смешанной непрерывной культуре, при скорости разведения ниже максимальной скорости роста любой клетки для предотвращения вымывания культуры из культуральной среды.

[0184] Инокулированную культуру инкубируют в благоприятных условиях на протяжении времени, достаточного для наращивания биомассы. В случае бактериальных композиций для применения у человека это часто соответствует температуре 37°C, pH, и другим показателям со значениями, сходными с нормальной нишей в организме человека. Среда может активность контролироваться, пассивно контролироваться (например, с помощью буферов), либо ей позволяют произвольно изменяться. Например, для анаэробных бактериальных композиций (например, микробиоты кишечника) может использоваться бескислородная/восстановительная среда. Это может достигаться путем добавления восстановительных агентов, таких как цистеин, в бульон, и/или удаление из него кислорода. Например, культура бактериальной композиции может культивироваться при 37°C, pH 7, в описанной выше среде, предварительно восстановленной 1 г/л цистеина HCl.

[0185] При достижении культурой достаточной биомассы, указанная культура может быть подвергнута предохраняющей обработке для банкирования. Указанные организмы могут быть помещены в химическую среду, защищающую их от замерзания (добавление ‘криопротекторов’), высыхания (‘лиопротекторы’) и/или осмотического шока (‘осмопротекторы’), распределены по нескольким (необязательно идентичным) контейнерам для получения однородного банка, и затем культура может быть обработана для предохранения. Контейнеры обычно непроницаемы и снабжены механизмом закрытия, обеспечивающим изоляцию от окружающей среды. Криоконсервацию проводят путем замораживания жидкости при сверхнизких температурах (например, при -80°C или ниже). При консервации высушиванием воду из культуры удаляют путем испарения (в случае высушивания распылением или «холодной сушки») или сублимацией (например, при лиофилизации, лиофильной распылительной сушке). Удаление воды улучшает стабильность бактериальной композиции при долгосрочном хранении при температурах выше криогенных. Если бактериальная композиция содержит спорообразующие виды и обеспечивает образование спор, конечная композиция может быть очищена дополнительными способами, например, законсервирована центрифугированием в градиенте плотности с применением описанных выше техник. Банкирование бактериальной композиции может быть выполнено путем культивирования и консервации штаммов по отдельности, или путем смешивания штаммов друг с другом с получением комбинированного банка. В примере криоконсервации культура бактериальной композиции может быть собрана путем центрифугирования для осаждения клеток из культуральной среды, супернатант декантирован и заменен свежим культуральным бульоном, содержащим 15% глицерина. Затем аликвоты культуры могут быть помещены в криопробирки объемом 1 мл, запечатаны и помещены в среду с температурой -80°C для длительного сохранения жизнеспособности. Указанная процедура обеспечивает приемлемую жизнеспособность при восстановлении из замороженного состояния.

[0186] Получение организмов может проводиться с применением аналогичных банкированию этапов культивирования, в том числе в аналогичного состава среды и условий культивирования. Оно может проводиться в большем масштабе, в частности для клинических разработок или коммерческого производства. При масштабах может проводиться несколько субкультиваций бактериальной композиции перед итоговой культивацией. В конце культивации культуру собирают для дальнейшего включения в лекарственную форму для введения. Последнее может включать концентрацию, удаление нежелательных компонентов среды и/или введение в химическую среду, сохраняющую бактериальную композицию и придающую ей надлежащие качества для введения выбранным способом. Например, бактериальная композиция может культивироваться до концентрации 10¹⁰ КОЕ/мл, затем быть сконцентрирована 20-кратно с применением тангенциальной проточной микрофильтрации; отработанная среда может быть заменена диафильтрацией на консервирующую среду, состоящую из 2% желатина, 100 мМ трегалозы, и 10 мМ натрий-фосфатного буфера. Затем суспензия может быть лиофилизирована с получением порошка и титрована.

[0187] После высушивания порошок может быть перемолот до подходящей степени, смешан с другими культурами и/или наполнителем, таким как микрокристаллическая целлюлоза, для обеспечения структуры и удобства использования, и получен состав с бактериальной композицией согласно описанию в настоящем документе.

Введение бактериальных композиций

[0188] Бактериальные композиции, предложенные в настоящем изобретении, подходят для введения нуждающимся в этом млекопитающим и не являющимся млекопитающими животным. Согласно определенным вариантам реализации указанный субъект-млекопитающее представляет собой субъекта-человека, у которого имеются один или большее количество симптомов дисбиоза, в том числе, но не ограничиваясь перечисленными, избыточный рост нежелательного патобионта или патогена, уменьшение представленности ключевых бактериальных таксонов, таких как Bacteroidetes или Firmicutes, или соответствующих им родов или видов, или уменьшение разнообразия видов микроорганизмов по сравнению со здоровым индивидуумом, или уменьшение общей распространенности анаэробных бактерий.

[0189] В том случае, если субъект-млекопитающее страдает заболеванием, расстройством или состоянием, характеризующимся аберрантной микробиотой, бактериальные композиции, описанные в настоящем документе, подходят для лечения указанного заболевания, расстройства или состояния. Согласно некоторым вариантам реализации указанный субъект-млекопитающее не получал антибиотики до лечения указанными бактериальными композициями. Например, указанному субъекту-млекопитающему не вводили по меньшей мере две дозы ванкомицина, метронидазола и/или аналогичного соединения с антибиотической активностью в течение одной недели перед введением указанной терапевтической композиции. Согласно другим вариантам реализации указанный субъект-млекопитающее ранее не получал соединение с антибиотической активностью в течение месяца перед введением указанной терапевтической композиции. Согласно другим вариантам реализации указанный субъект-млекопитающее получал один или большее количество вариантов лечения одним или несколькими разными соединениями с антибиотической активностью, и такое лечение не приводило к улучшению или приводило к ухудшению симптомов. Согласно некоторым вариантам реализации указанную композицию со спорами вводят после успешного курса антибиотиков для предотвращения дисбиоза и улучшения восстановления разнообразной нормальной микробиоты.

[0190] Согласно некоторым вариантам реализации указанное заболевание, расстройство или состояние ЖКТ представляет собой диарею, вызываемую C. difficile, в том числе рецидивирующую инфекцию C. difficile, язвенный колит, колит, болезнь Крона или синдром раздраженного кишечника. Благоприятным образом, указанную терапевтическую композицию вводят всего один раз до улучшения состояния при заболевании, расстройстве или состоянии. Согласно некоторым вариантам реализации терапевтическую композицию вводят с интервалами более чем два дня, например, один раз каждые три, четыре, пять или шесть дней, или еженедельно, или реже, чем еженедельно. Состав также может вводиться периодически в соответствии с установленной схемой, например, один раз в сутки, еженедельно или один раз в месяц, или тогда, когда у субъекта происходит рецидив первичной болезни. Согласно другому варианту реализации указанный состав может вводиться на долговременной основе индивидуумам, у которых имеется риск инфекции указанными патогенами, или индивидуумам, которые могут быть носителями указанных патогенов, в том числе индивидуумам, у которых будет проведена инвазивная медицинская процедура (такая как хирургическое вмешательство), подлежащим госпитализации, живущим в учреждении для долгосрочной медицинской помощи или реабилитации, контактирующим с патогенами по роду профессиональной деятельности (индивидуумы, работа которых связана с сельскохозяйственными животными и переработкой животных продуктов) или потенциальным носителям патогенов (в том числе работникам больниц, таким как врачи, медицинские сестры и другие медицинские специалисты).

[0191] Также предложены способы лечения или профилактики у субъекта-млекопитающего, страдающего заболеванием, расстройством или состоянием обмена веществ, или имеющего риск развития заболевания, расстройства или состояния обмена веществ, выбранного из группы, состоящей из диабета, метаболического синдрома, ожирения, заболевания сердца, аутоиммунного заболевания, заболевания печени и аутизма с применением терапевтических композиций, описанных в настоящем документе.

[0192] Согласно вариантам реализации композицию с бактериальными спорами вводят энтерально. Это преимущественно включает пероральное введение или введение через оральный или назальный зонд (в том числе назогастральный, назоеюнальный, орогастральный или ороеюнальный). Согласно другим вариантам реализации введение включает ректальное введение (в том числе с применением клизмы, суппозитория или колоноскопии). Бактериальная композиция может вводиться по меньшей мере в одну область желудочно-кишечного тракта, в том числе рот, пищевод, желудок, тонкий кишечник, толстый кишечник и прямую кишку. Согласно некоторым вариантам реализации ее вводят во все области желудочно-кишечного тракта. Бактериальные композиции могут вводиться перорально в форме медикаментов, таких как порошки, капсулы, таблетки, гели или жидкости. Бактериальные композиции могут также вводиться в гелевой или жидкой форме перорально или через назогастральный зонд, или ректально в гелевой или жидкой форме, через клизму или путем инстилляции через колоноскоп, или в виде суппозитория.

[0193] Если композицию вводят колоноскопически и, необязательно, если бактериальную композицию вводят ректально иным способом (например, с применением клизмы или суппозитория) или субъект может получать состав для очищения толстой кишки, даже если у указанного субъекта используется пероральное введение. Состав для очищения толстой кишки может облегчать надлежащее использование колоноскопа или другого устройства для введения, однако даже если он не выполняет механическую функцию, он может максимизировать долю бактериальной композиции относительно других организмов, ранее присутствовавших в желудочно-кишечном тракте указанного субъекта. Может быть использован любой легкодоступный состав для очищения толстой кишки, например, состав, обычно используемый при проведении у субъекта колоноскопии.

[0194] Для оценки субъекта симптомы дисбиоза оценивают после лечения в диапазоне времени от 1 дня до 6 месяцев после введения очищенной популяции спор. В течение указанного периода собирают фекальный материал, и микроорганизмы, присутствующие в желудочно-кишечном тракте, могут быть проанализированы с помощью анализа секвенирования 16S рРНК или метагеномного секвенирования или других анализов, общеупотребительных среди специалистов. В указанный период времени наблюдается восстановление популяции видов, происходящих из популяции спор, а также стимуляция комменсальных микроорганизмов, не присутствующих в популяции спор, поскольку популяция спор катализирует восстановление состояния экогруппы пищеварительного тракта, соответствующее здоровому биозу. Наилучшим образом понять приведенное описание можно в свете информации из цитируемых в описании источников. Представленные в описании варианты реализации иллюстрируют варианты реализации и не предназначены для ограничения объема. Для специалиста будет ясно, что включены многие другие варианты реализации. Все публикации и патент, цитируемые в настоящем описании, полностью включены посредством ссылки. В тех случаях, когда включенный посредством ссылки материал противоречит или не согласуется с настоящим описанием, настоящее описание имеет преимущественную силу относительно любого такого материала. Цитирование каких-либо источников не означает, что такие источники представляют предшествующий уровень техники.

Способы лечения субъекта

[0195] Согласно некоторым вариантам реализации раскрытые в настоящем изобретении композиции вводят пациенту или потребителю (иногда называемому общим термином «субъект»). В настоящем документе «вводить» и «введение» охватывает варианты реализации, в которых один индивидуум направляет другого с целью потребления последним бактериальной композиции определенным образом и/или для определенной цели, а также ситуации, в которых потребитель использует бактериальную композицию определенным образом и/или для определенной цели независимо или противоречащим каким-либо полученным от второго индивидуума инструкциям образом. Неограничивающие примеры вариантов реализации, согласно которым один индивидуум направляет другого с целью потребления последним бактериальной композиции определенным образом и/или для определенной цели, включают варианты, когда лечащий врач прописывает курс действий и/или лечения пациенту, когда родитель руководит потреблением бактериальной композиции несовершеннолетним потребителем (например, ребенком), когда тренер рекомендует потребителю (например, спортсмену) конкретный курс действий и/или лечения, и когда производитель, распространитель или поставщик рекомендует условия применения конечному потребителю, например, с использованием рекламы или этикетки на упаковке или на других материалах, предлагаемых вместе с продаваемым или поставляемым на рынок продуктом.

[0196] Указанные бактериальные композиции обеспечивают защитный и/или терапевтический эффект от инфекции одним или большим количеством представляющих интерес патогенов ЖКТ и могут вводиться после окончания эпизода острой инфекции для предотвращения рецидива, во время эпизода острой инфекции в качестве дополнения к терапии антибиотиками, если бактериальная композиция не чувствительная к тем же антибиотикам, что и патоген ЖКТ, или для предотвращения инфекции или уменьшения передачи от носителей заболевания.

[0197] Предлагаемые бактериальные композиции могут подходить для применения в разнообразных клинических ситуациях. Например, указанные бактериальные композиции могут вводиться в качестве дополнительного лечения вместе с антибиотиками, если пациент страдает острой инфекцией, для снижения риска рецидива после ослабления острой инфекции или в том случае, когда пациент находится в непосредственной близости от других индивидуумов, у которых имеются серьезные желудочно-кишечные инфекции или риск их развития (врачи, медицинские сестры, работники больниц, члены семей больных или госпитализированных субъектов).

[0198] Предлагаемые бактериальные композиции могут вводиться животным, в том числе человеку, лабораторным животным (например, приматам, крысам, мышам), сельскохозяйственным животным (например, коровам, овцам, козам, свиньям, индейкам, курам) и домашним животным (например, собакам, кошкам, грызунам).

[0199] Согласно предложенному способу бактериальная композиция может вводиться энтерально, другими словами, с доступом в желудочно-кишечный тракт. Это включает пероральное введение, ректальное введение (в том числе через клизму, в виде суппозитория или с применением колоноскопии), введение через оральный или назальный зонд (назогастральный, назоеюнальный, орогастральный, или ороеюнальный), как более подробно изложено в настоящем документе.

Протоколы предварительной обработки

[0200] Перед введением бактериальной композиции необязательно проводят предварительную обработку пациента согласно протоколу для подготовки желудочно-кишечного тракта к получению бактериальной композиции. Указанный протокол предварительной обработки целесообразен при определенных вариантах реализации, например, если у пациента имеется острая инфекция высокоустойчивым патогеном. Согласно другим вариантам реализации указанный протокол предварительной обработки является полностью необязательным, например, если патоген, вызывающий инфекцию, не является устойчивым, или в тех случаях, когда у указанного пациента имелась острая инфекция, которая была успешно излечена, однако лечащий врач опасается, что инфекция может рецидивировать. В таких случаях протокол предварительной обработки может повысить способность бактериальной композиции оказывать воздействие на микробиом пациента.

[0201] Одним из способов подготовки пациента к введению экосистемы микроорганизмов может быть введение по меньшей мере одного антибиотика для изменения состава бактерий у пациента. Другим способом подготовки пациента к введению экосистемы микроорганизмов может быть введение указанному пациенту состава для очищения толстой кишки для опустошения толстой кишки по существу, например, состава, используемого при подготовке пациентов к колоноскопии. Под «опустошением толстой кишки по существу» в настоящей заявке подразумевается удаление по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95% или приблизительно 100% содержимого обычного объема толстой кишки. Лечение антибиотиками может предшествовать осуществлению протокола очищения толстой кишки.

[0202] В том случае, если пациент получал антибиотик для лечения инфекции, или если пациент получал антибиотик в ходе осуществления конкретного протокола предварительной обработки, согласно одному варианту реализации введение указанного антибиотика может быть заблаговременно прекращено, чтобы обеспечить снижение в кишечнике концентрации антибиотика по существу до введения бактериальной композиции. Согласно одному варианту реализации введение антибиотика может быть прекращено за 1, 2 или 3 дня до введения бактериальной композиции. Согласно другому варианту реализации введение антибиотика может быть прекращено за 3, 4, 5, 6 или 7 периодов полужизни указанного антибиотика до введения бактериальной композиции. Согласно другому варианту реализации антибиотик может быть выбран таким образом, что компоненты бактериальной композиции имеют MIC50, превышающую концентрацию указанного антибиотика в кишечнике.

[0203] MIC50 бактериальной композиции или элементов указанной композиции может быть определена с применением способов, хорошо известных в данной области техники. Reller et al., Antimicrobial Susceptibility Testing: A Review of General Principles and Contemporary Practices, Clinical Infectious Diseases 49(11):1749-1755 (2009). Согласно такому варианту реализации дополнительный период времени между введением антибиотика и введением бактериальной композиции не является необходимым. Если в лечение острой инфекции включен протокол предварительной обработки, антибиотик может быть подобран так, что указанная инфекция будет чувствительна к указанному антибиотику, а компоненты бактериальной композиции будут нечувствительны к указанному антибиотику.

Способы введения

[0204] Бактериальные композиции, предложенные в настоящем изобретении, подходят для введения нуждающемуся в этом млекопитающим и не являющимся млекопитающими животным. Согласно определенным вариантам реализации указанный субъект-млекопитающее представляет собой субъекта-человека, у которого присутствуют один или большее количество симптомов дисбиоза.

[0205] Если субъект-млекопитающее страдает заболеванием, расстройством или состоянием, характеризующимся аберрантной микробиотой, для его лечения подходят бактериальные композиции, описанные в настоящем документе. Согласно некоторым вариантам реализации указанный субъект-млекопитающее не получал антибиотики до лечения бактериальными композициями. Например, указанному субъекту-млекопитающему не вводили по меньшей мере две дозы ванкомицина, метронидазола и/или аналогичного соединения с антибиотической активностью в течение одной недели перед введением указанной терапевтической композиции. Согласно другим вариантам реализации указанный субъект-млекопитающее ранее не получал соединения с антибиотической активностью в течение месяца перед введением указанной терапевтической композиции. Согласно другим вариантам реализации проводили лечение указанного субъекта-млекопитающего один или большее количество раз одним или несколькими разными соединениями с антибиотической активностью, и такое лечение не привело к улучшению или привело к ухудшению симптомов.

[0206] Согласно некоторым вариантам реализации указанное заболевание, расстройство или состояние ЖКТ представляет собой диарею, вызванную C. difficile, в том числе рецидивирующей инфекцией C. difficile, язвенный колит, колит, болезнь Крона или синдром раздраженного кишечника. Благоприятным образом, терапевтическую композицию вводят только один раз до улучшения состояния при указанном заболевании, расстройстве или состоянии. Согласно некоторым вариантам реализации терапевтическую композицию вводят с интервалами более чем два дня, например, один раз в три, четыре, пять или шесть дней, каждую неделю или реже, чем еженедельно. Согласно другим вариантам реализации указанный состав может вводиться периодически в соответствии с заданной схемой, например, один раз в сутки, один раз в неделю или один раз в месяц, или тогда, когда у субъекта происходит рецидив первичного заболевания. Согласно другому варианту реализации указанный состав может вводиться на долгосрочной основе субъектам, у которых имеется риск инфекции указанными патогенами или субъектам, которые могут являться носителями указанных патогенов, в том числе субъектам, у которых будет проведена инвазивная медицинская процедура (такая как хирургическое вмешательство), подлежащим госпитализации, живущим в учреждении для долгосрочной медицинской помощи или реабилитации, контактирующим с патогенами по роду профессиональной деятельности (субъекты, работа которых связана с сельскохозяйственными животными и переработкой животных продуктов), или потенциальным носителям патогенов (в том числе работникам больниц, таким как врачи, медицинские сестры и другие медицинские специалисты).

[0208] Согласно определенным вариантам реализации указанную бактериальную композицию вводят энтерально. Это преимущественно включает пероральное введение, или введение через оральный или назальный зонд (в том числе назогастральный, назоеюнальный, орогастральный или ороеюнальный). Согласно другим вариантам реализации введение включает ректальное введение (в том числе клизму, суппозитории или колоноскопию). Бактериальная композиция может вводиться по меньшей мере в одну область желудочно-кишечного тракта, в том числе в рот, пищевод, желудок, тонкий кишечник, толстый кишечник и прямую кишку. Согласно некоторым вариантам реализации ее вводят во все области желудочно-кишечного тракта. Бактериальные композиции могут вводиться перорально в форме таких медикаментов, как порошки, капсулы, таблетки, гели или жидкости. Бактериальные композиции могут также вводиться в гелевой или жидкой форме перорально или через назогастральный зонд, или ректально в гелевой или жидкой форме, с помощью клизмы, или путем инстилляции через колоноскоп, или в форме суппозитория.

[0208] Если композицию вводят колоноскопически и, необязательно, если бактериальную композицию вводят ректально иным способом (например, с применением клизмы или суппозитория) или даже если у субъекта используется пероральное введение, указанный субъект может получать состав для очищения толстой кишки. Состав для очищения толстой кишки может облегчать надлежащее использование колоноскопа или других устройств для введения, но даже если он не выполняет механическую функцию, он может максимизировать долю бактериальной композиции относительно других организмов, ранее присутствовавших в желудочно-кишечном тракте указанного субъекта. Может быть использован любой легкодоступный состав для очищения толстой кишки, например, составы, обычно используемые у субъекта при колоноскопии.

Дозировки и схема введения

[0209] Согласно некоторым вариантам реализации предложены бактерии и бактериальные композиции в дозированной лекарственной форме. Согласно определенным вариантам реализации указанная лекарственная форма предназначена для введения по меньшей мере одной OTU или их комбинации, раскрытых в настоящем изобретении, при этом указанное общее количество введенной бактериальной композиции выбирают из 0,1 нг - 10 г, 10 нг - 1 г, 100 нг - 0,1 г, 0,1- 500 мг, 1-100 мг или 10-15 мг. Согласно другим вариантам реализации указанная бактериальная композиция потребляется со скоростью от 0,1 нг до 10 г в день, от 10 нг до 1 г в день, 100 нг до 0,1 г в день, 0,1 мг -500 мг в день, 1-100 мг в день, или 10-15 мг в день, или более.

[0210] Согласно определенным вариантам реализации период лечения составляет по меньшей мере 1 день, по меньшей мере 2 дней, по меньшей мере 3 дня, по меньшей мере 4 дня, по меньшей мере 5 дней, по меньшей мере 6 дней, по меньшей мере 1 неделю, по меньшей мере 2 недели, по меньшей мере 3 недели, по меньшей мере 4 недели, по меньшей мере 1 месяц, по меньшей мере 2 месяца, по меньшей мере 3 месяца, по меньшей мере 4 месяца, по меньшей мере 5 месяцев, по меньшей мере 6 месяцев или по меньшей мере 1 год. Согласно некоторым вариантам реализации период лечения составляет от 1 дня до 1 недели, от 1 недели до 4 недель, от 1 месяца до 3 месяцев, от 3 месяцев до 6 месяцев, от 6 месяцев до 1 года, или более года.

[0211] Согласно одному варианту реализации пациенту в виде определенной лекарственной формы может вводиться общее количество микроорганизмов 10⁵ и 10¹². Согласно другому варианту реализации эффективное количество может обеспечиваться в виде 1-500 мл или 1-500 г бактериальной композиции, содержащей от 10⁷ до 10¹¹ бактерий на мл или на грамм, или в виде капсулы, таблетки или суппозитория, содержащей(его) от 1 мг до 1000 мг лиофилизированного порошка, содержащего от 10⁷ до 10¹¹ бактерий. Получающим острое лечение пациентам могут вводиться более высокие дозы по сравнению с получающими хроническое лечение (например, работниками больниц или пациентами учреждений долгосрочной медицинской помощи).

[0212] Любые составы, описанные в настоящем документе, могут вводиться в виде одной дозы однократно или многократно, например, один раз в сутки на протяжении нескольких дней, или более чем один раз в сутки в день введения (в том числе дважды в сутки, трижды в сутки, или до пяти раз в сутки). Согласно другому варианту реализации указанный состав может вводиться периодически в соответствии с принятой схемой, например, один раз еженедельно, один раз в месяц, или тогда, когда у субъекта происходит рецидив первичного заболевания. Согласно одному варианту реализации указанный состав может вводиться на долгосрочной основе индивидуумам, у которых имеется риск инфекции указанными патогенами или индивидуумам, которые могут являться носителями указанных патогенов, в том числе индивидуумам, у которых будет проведена инвазивная медицинская процедура (такая как хирургическое вмешательство), подлежащим госпитализации, живущим в учреждении для долгосрочной медицинской помощи или реабилитации, индивидуумам, контактирующим с патогенами по роду профессиональной деятельности (индивидуумам, работа которых связана с сельскохозяйственными животными и переработкой животных продуктов), или потенциальным носителям патогенов (в том числе работникам больниц, таким как врачи, медицинские сестры и другие медицинские специалисты).

Выбор пациентов

[0213] Конкретные бактериальные композиции могут быть выбраны для индивидуальных пациентов или для пациентов с конкретными профилями. Например, у определенного пациента может быть проведено 16S-секвенирование для идентификации бактерий, присутствующих в его/ее микробиоте. Указанное секвенирование может либо обеспечивать профилирование полного микробиома пациента с применением 16S-секвенирования (до уровня семейства, рода или вида), части микробиома пациента с применением 16S-секвенирования, или может использоваться для детекции присутствия или отсутствия специфических кандидатных бактерий, которые являются биомаркерами здоровья или конкретного болезненного состояния, например, маркерами обладающих множественной лекарственной устойчивостью организмов или конкретных представляющих интерес родов, таких как Escherichia. На основании информации о биомаркерах может быть выбрана конкретные композиция для введения пациенту для расширения или дополнения микробиоты пациента, для восстановления здоровья, или лечения или предотвращения заболевания. Согласно другому варианту реализации может проводиться скрининг пациентов для определения состава их микробиоты для определения вероятности успешного лечения.

Комбинированная терапия

[0214] Бактериальные композиции могут вводиться с другими агентами в режиме комбинированной терапии, в том числе с противомикробными агентами и пребиотиками. Введение может быть последовательным, на протяжении периода нескольких часов или дней, или одновременным.

[0215] Согласно одному варианту реализации бактериальные композиции включают в комбинированную терапию одним или несколькими противомикробными агентами, которые включают антибактериальные агенты, фунгицидные агенты, противовирусные агенты и противопаразитарные агенты.

[0216] Антибактериальные агенты могут включать цефалоспориновые антибиотики (цефалексин, цефуроксим, цефадроксил, цефазолин, цефалотин, цефаклор, цефамандол, цефокситин, цефпрозил и цефтобипрол); фторхинолоновые антибиотики (ципро, левакин, флоксин, текин, авелокс и норфлокс); тетрациклиновые антибиотики (тетрациклин, миноциклин, окситетрациклин и доксициклин); пенициллиновые антибиотики (амоксициллин, ампициллин, пенициллин V, диклоксациллин, карбенициллин, ванкомицин и метициллин); и карбапенемовые антибиотики (эртапенем, дорипенем, имипенем/циластатин и меропенем).

[0217] Противовирусные агенты могут включать абакавир, ацикловир, адефовир, ампренавир, атазанавир, цидофовир, дарунавир, делавирдин, диданозин, докозанол, эфавиренц, элвитегравир, эмтрицитабин, энфувиртид, этравирин, фамцикловир, фоскарнет, фомивирсен, ганцикловир, индинавир, идоксуридин, ламивудин, лопинавир, маравирок, MK-2048, нелфинавир, невирапин, пенцикловир, ралтегравир, рилпивирин, ритонавир, саквинавир, ставудин, тенофовир, трифлуридин, валацикловир, валганцикловир, видарабин, ибацитабин, амантадин, озелтамивир, римантадин, типранавир, зальцитабин, занамивир и зидовудин.

[0218] Примеры фунгицидных соединений включают, не ограничиваясь перечисленными, полиеновые фунгицидные средства, такие как натамицин, римоцидин, филипин, нистатин, амфотерицин, кандицин и хамицин; имидазольные фунгицидные средства, такие как миконазол, кетоконазол, клотримазол, эконазол, омоконазол, бифоназол, бутоконазол, фентиконазол, изоконазол, оксиконазол, сертаконазол, сульконазол и тиоконазол; триазольные фунгицидные средства, такие как флуконазол, итраконазол, изавуконазол, равуконазол, позаконазол, вориконазол, терконазол и альбаконазол; тиазольные фунгицидные средства, такие как абафунгин; аллиламиновые фунгицидные средства, такие как тербинафин, нафтифин и бутенафин; и эхинокандиновые фунгицидные средства, такие как анидулафунгин, каспофунгин и микафунгин. Другие соединения, обладающие фунгицидными свойствами, включают, не ограничиваясь перечисленными, полигодиал, бензойную кислоту, циклопирокс, толнафтат, ундециленовую кислоту, флуцитозин или 5-фторцитозин, гризеофульвин и галопрогин.

[0219] Согласно одному варианту реализации бактериальные композиции включены в комбинированную терапию с одним или несколькими кортикостероидами, месалазином, месаламином, сульфасалазином, производными сульфасалазина, иммуносупрессивными лекарственными средствами, циклоспорином A, меркаптопурином, преднизолоном, азатиопурином, метотрексатом, антигистаминными средствами, глюкокортикоидами, адреналином, теофиллином, кромолином натрия, антилейкотриенами, антихолинергическими лекарственными средствами для лечения ринитов, антихолинергическими противоотечными средствами, стабилизаторами тучных клеток, вакцинами с моноклональными антителами против IgE и их комбинациями.

[0220] Пребиотик представляет собой избирательно ферментируемый ингредиент, обеспечивающий специфические изменения и состава, и/или активности микробиоты ЖКТ, благоприятные для самочувствия и состояния здоровья хозяина. Пребиотики могут включать сложные углеводы, аминокислоты, пептиды или другие необходимые питательные компоненты для выживания бактериальной композиции. Пребиотики включают, не ограничиваясь перечисленными, аминокислоты, биотин, фруктоолигосахариды, галактоолигосахариды, инулин, лактулозу, маннановые олигосахариды, обогащенный олигофруктозой инулин, олигофруктозу, олигодекстрозу, тагатозу, транс-галактоолигосахарид и ксилоолигосахариды.

Способы тестирования способности бактериальных композиций к заселению

Анализ in vivo для оценки заселения желудочно-кишечного тракта субъекта бактериальной композицией

[0221] Для определения того, заселяет ли бактериальная композиция желудочно-кишечного тракт субъекта, может использоваться модель на животных, например, модель на мышах. Реализация модели может начинаться с оценки микробиоты мышей. Качественную оценку можно получить с применением 16S-профилирования сообщества микроорганизмов в экскрементах здоровых мышей. С этой целью может также использоваться полногеномное секвенирование, полногеномное секвенирование методом «дробовика» (WGS) или традиционные микробиологические техники. Количественную оценку можно получить с применением количественной ПЦР (кПЦР), описанной ниже, или с применением традиционных микробиологических техник и подсчета образующихся колоний.

[0222] Мыши необязательно могут получать лечение антибиотиками для имитации состояния дисбиоза. Лечение антибиотиками может снижать таксономическое изобилие, разнообразие и равномерность распределения сообщества, в том числе снижение распространенности значительного числа бактериальных таксонов. Dethlefsen et al., The pervasive effects of an antibiotic on the human gut microbiota, as revealed by deep 16S rRNA sequencing, PLoS Biology 6(11):3280 (2008). По меньшей мере один антибиотик может использоваться, и антибиотики хорошо известны. Антибиотики могут включать аминогликозидный антибиотик (амикацин, арбекацин, гентамицин, канамицин, неомицин, нетилмицин, паромомицин, родострептомицин, стрептомицин, тобрамицин и апрамицин), амоксициллин, ампициллин, аугментин (комбинация амоксициллина/клавуланата калия), цефалоспорин (цефаклор, цефадроксил, цефазолин, цефиксим, цефокситин, цефпрозил, цефтазидим, цефуроксим, цефалексин), клавуланат калия, клиндамицин, колистин, гентамицин, канамицин, метронидазол или ванкомицин. В качестве индивидуального неограничивающего конкретного примера, мышам может предоставляться питьевая вода, содержащая смесь антибиотиков канамицина, колистина, гентамицина, метронидазола и ванкомицина в концентрации 40 мг/кг, 4,2 мг/кг, 3,5 мг/кг, 21,5 мг/кг и 4,5 мг/кг (мг на среднюю массу тела мыши), соответственно, в течение 7 дней. Как вариант, мышам может вводиться ципрофлоксацин в дозе 15-20 мг/кг (мг на среднюю массу тела мыши) в течение 7 дней.

В том случае, если мыши получают антибиотик, может выдерживаться «отмывочный период» продолжительностью от одного дня до трех дней, без лечения антибиотиками и без лечения бактериальной композицией.

[0223] Затем тестируемую бактериальную композицию вводят мышам через оральный зонд. Тестируемая бактериальная композиция может вводиться в объеме 0,2 мл, содержащем 10⁴ КОЕ бактерий каждого типа, входящего в бактериальную композицию. Зависимость доза-ответ может оцениваться с использованием диапазона доз, в том числе, но не ограничиваясь перечисленными, 10², 10³, 10⁴, 10⁵, 10⁶, 10⁷, 10⁸, 10⁹ и/или 10¹⁰.

[0224] Может проводиться исследование мышей с применением 16S-секвенирования, полногеномного секвенирования, полногеномного секвенирования методом «дробовика» (WGS) или традиционных микробиологических техник для определения того, заселяет ли тестируемая бактериальная композиция желудочно-кишечный тракт мышей. Например, через день, через три дня, через неделю, через две недели и через один месяц после введения бактериальной композиции мышам, проводят 16S-профилирование для определения того, заселила ли тестируемая бактериальная композиция желудочно-кишечный тракт мышей. Дополнительно или в альтернативных вариантах в те же периоды времени может проводиться количественный анализ, в том числе с применением кПЦР и традиционных микробиологических техник, таких как подсчет колоний.

[0225] Кроме того, может оцениваться зависимость числа секвенированных последовательностей, точно соответствующих последовательностям бактериальной композиции, от времени, для определения того, какие конкретно компоненты бактериальной композиции остаются в желудочно-кишечном тракте через конкретный период времени. Согласно одному варианту реализации штаммы бактериальной композиции сохраняются на протяжении требуемого периода времени. Согласно другому варианту реализации указанный компоненты бактериальной композиции сохраняются на протяжении требуемого периода времени, в то же время повышая способность других микроорганизмов (например, присутствующих в окружающей среде, пище и т.п.) заселять желудочно-кишечный тракт, что дополнительно увеличивает общее разнообразие, согласно описанию ниже.

Способность бактериальных композиций заселять различные области желудочно-кишечного тракта

[0226] Также может оцениваться способность предложенных бактериальных композиций заселять различные области желудочно-кишечного тракта. Согласно одному варианту реализации бактериальная композиция может быть выбрана исходя из способности заселять одну или более чем одну область желудочно-кишечного тракта, в том числе, но не ограничиваясь перечисленными, желудок, тонкий кишечник (двенадцатиперстная кишка, тощая кишка и подвздошная кишка), толстый кишечник (слепая кишка, ободочная кишка (восходящая кишка, поперечноободочная кишка, нисходящая кишка и сигмовидная кишка) и прямая кишка).

[0227] Может проводиться исследование in vivo для определения того, какие области желудочно-кишечного тракта заселяет определенная бактериальная композиция. Может использоваться модель на мышах, аналогичная вышеописанной, за исключением того, что вместо анализа экскрементов, продуцируемых мышами, могут быть извлечены и исследованы по отдельности конкретные области желудочно-кишечного тракта. Например, может быть извлечена по меньшей мере одна конкретная область желудочно-кишечного тракта, и может быть проведено качественное или количественное определение содержимого указанной области желудочно-кишечного тракта. Согласно другому варианту реализации необязательно может быть извлечено указанное содержимое, и может проводиться качественное или количественное определение извлеченных тканей мыши.

кПЦР

[0228] Одним из количественных методов для определения того, заселяет ли бактериальная композиция желудочно-кишечный тракт, может быть количественная ПЦР (кПЦР). Могут использоваться стандартные техники получения стандартной кривой для представляющей интерес бактериальной композиции, для всех компонентов бактериальной композиции совместно, либо индивидуально, либо для подгрупп (если это применимо). Геномная ДНК может быть экстрагирована из образцов с применением коммерчески доступных наборов, таких как набор для выделения ДНК Mo Bio Powersoil®-htp 96 Well Soil DNA Isolation Kit (Mo Bio Laboratories, Карлсбад, Калифорния), набор для выделения ДНК Mo Bio Powersoil® DNA Isolation Kit (Mo Bio Laboratories, Карлсбад, Калифорния) или мининабор для выделения ДНК из кала QIAamp DNA Stool Mini Kit (QIAGEN, Валенсия, Калифорния) в соответствии с инструкциями производителя.

[0229] Согласно некоторым вариантам реализации кПЦР может проводиться с применением HotMasterMix (5PRIME, Гейтерсберг, Мэриленд) и праймеров, специфических в отношении представляющей интерес бактериальной композиции, и может проводиться на 96-луночном штрихкодированном реакционном планшете MicroAmp^® (MicroAmp^®Fast Optical 96-well Reaction Plate with Barcode) (0,1мл) (Life Technologies, Гранд-Айленд, Нью-Йорк) и выполняться на термоциклере BioRad C1000™, оснащенном системой реального времени CFX96™ (BioRad, Геркулес, Калифорния), с регистрацией флуоресценции в каналах FAM и ROX. Значение Cq для каждой лунки в канале FAM определяют с помощью программного обеспечения CFX Manager™, версия 2.1. log₁₀(КОЕ/мл) для каждого экспериментального образца рассчитывают подстановкой значений Cq для определенного образца в установленную по стандартной кривой линейную регрессионную модель, сравнивающую значения Cq для лунок, использованных для построения стандартной кривой, с известной log₁₀(КОЕ/мл) для указанных образцов. Специалист может использовать и другие альтернативные режимы кПЦР.

Способы характеризации бактериальных композиций

[0230] Согласно определенным вариантам реализации предложены способы тестирования определенных характеристик бактериальных композиций. Например, определяют чувствительность бактериальных композиций к определенным параметрам окружающей среды, например, для отбора конкретных желательных характеристик для определенной композиции, состава и/или использования. Например, компоненты бактериальной композиции могут тестироваться на pH-устойчивость, устойчивость к желчным кислотам и/или чувствительность к антибиотикам, либо индивидуально, то есть поочередно тестируется чувствительность каждого компонента, либо совместно, поскольку бактериальная композиция содержит несколько бактериальных компонентов (совместно называемых в данном разделе бактериальной композицией).

Тестирование на pH-чувствительность

[0231] Если предполагается введение бактериальной композиции не через толстую или прямую кишку (т.е., например, перорально), необязательное тестирование на pH-устойчивость улучшает качество отбора бактериальных композиций с максимальной выживаемостью в условиях варьирующих значений pH различных областей ЖКТ. Понимание того, как бактериальные композиции реагируют на значения pH в ЖКТ, также помогает при приготовлении составов, то есть количество бактерий в лекарственной форме может быть увеличено, если это целесообразно, и/или композиция может вводиться в покрытой кишечнорастворимым покрытием капсуле или таблетке, либо с буферной или защитной композицией. Поскольку значения pH в желудке могут на непродолжительное время опускаться до pH 1-2 после приема богатой белком пищи и до того, как физиологические механизмы обеспечат коррекцию до pH 3-4, а в состоянии покоя значения pH часто составляют pH 4-5, а значения pH в тонком кишечнике могут варьировать от pH 6 до 7,4, могут быть получены бактериальные композиции, выживающие в указанных варьирующих диапазонах значений pH (в частности, отличающиеся тем, что по меньшей мере 1%, 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или до 100% бактерий способны выживать в течение времени прохождения по ЖКТ в различных диапазонах значений pH). Эта способность может быть протестирована путем воздействия на бактериальную композицию значений рН в варьирующих диапазонах, на протяжении ожидаемого времени прохождения через ЖКТ при значениях рН в указанных диапазонах. Соответственно, согласно неограничивающему примеру, культуры бактериальных композиций возрастом 18 часов могут культивироваться на стандартной среде, например, среде для кишечной микробиоты («GMM», см. Goodman et al., Extensive personal human gut microbiota culture collections characterized and manipulated in gnotobiotic mice, PNAS 108(15):6252-6257 (2011)) или другой не содержащей продуктов животного происхождения среде, с добавлением корректирующих pH агентов для обеспечения значений pH 1-2 на протяжении 30 минут, pH 3-4 на протяжении 1 часа, pH 4-5 на протяжении 1-2 часов и pH 6-7,4 на протяжении 2,5 - 3 часов. Альтернативный способ тестирования устойчивости к кислотам описан в патенте США № 4839281. Выживаемость бактерий может быть определена путем культивирования указанных бактерий и подсчета колоний на подходящих селективных или неселективных средах.

Тестирование на чувствительность к желчным кислотам

[0232] Дополнительно, согласно некоторым вариантам реализации тестирование на чувствительность к желчным кислотам улучшает качество отбора бактериальных композиций, выживающих при воздействии желчной кислоты при прохождении через ЖКТ. Желчные кислоты секретируются в тонкий кишечник и могут, как и значения pH, влиять на выживаемость бактериальных композиций. Указанная способность может быть протестирована путем воздействия на бактериальные композиции желчными кислотами на протяжении ожидаемого времени воздействия желчных кислот в ЖКТ. Например, могут быть получены растворы желчных кислот в нужных концентрациях с применением 0,05 мМ Tris при pH 9 в качестве растворителя. После растворения желчной кислоты pH раствора может быть доведен до значения 7,2 добавлением 10% HCl. Бактериальные композиции могут культивироваться в 2,2 мл состава с желчными кислотами, имитирующего концентрацию и тип желчных кислот у пациента, 1,0 мл среды с 10% стерилизованных фильтрацией экскрементов и 0,1 мл 18-часовой культуры определенного штамма бактерий. Инкубирование может проводиться в течение 2,5-3 часов или дольше. Альтернативный способ тестирования стабильности при воздействии желчной кислотой описан в патенте США № 4839281. Выживаемость бактерий может быть определена путем культивирования указанных бактерии и подсчета колоний на подходящих селективных или неселективных средах.

Тестирование на чувствительность к антибиотикам

[0233] Дополнительным необязательным тестом на чувствительность может быть тестирование бактериальных композиций на чувствительность к антибиотикам. Согласно одному варианту реализации бактериальные композиции могут быть выбраны таким образом, что бактериальные компоненты чувствительны к антибиотикам, соответственно, при необходимости они могут быть элиминированы или их количество в желудочно-кишечном тракте пациента по существу уменьшено при применении по меньшей мере одного антибиотика, направленно воздействующего на указанную бактериальную композицию.

Адгезивность в отношении клеток ЖКТ

[0234] Необязательно может проводиться тестирование бактериальных композиций на способность прикрепляться к клеткам ЖКТ. Способ тестирования адгезии к клеткам ЖКТ описан в патенте США № 4839281.

Способы очищения спор

Обработка растворителем

[0235] Для очищения бактериальных спор фекальный материал один или несколько раз обрабатывают растворителем. Обработка растворителем представляет собой обработку смешивающимся растворителем (частично смешивающимся или полностью смешивающимся) или обработка несмешивающимся растворителем. Смешиваемость представляет собой способность двух жидкостей смешиваться друг с другом с образованием гомогенного раствора. Вода и этанол, например, полностью смешиваются, так что смесь, содержащая воду и этанол в любом соотношении, будет однофазной. Смешиваемость выражают через массовые % или через массу одного из растворителей на 100 г конечного раствора. Если два растворителя полностью смешиваются в любых пропорциях, их смешиваемость составляет 100%. Полностью смешивающиеся с водой растворы образуют спирты, например, метанол, этанол, изопропанол, бутанол и т.п. Спирты могут быть заранее соединены с водой; например, например, могут быть представлены 10%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 89%, 85%, 90%, 95% или более чем 95% раствором. Другие растворители являются только частично смешивающимися, что означает, что только определенная часть растворяется в воде. Простой диэтилэфир, например, частично способен смешиваться с водой. До 7 г простого диэтилэфира растворяются в 93 г воды с получением 7% (масс.%) раствора. Если добавить большее количество диэтилэфира, образуется двухфазный раствор с отдельным слоем диэтилэфира над водой. Другие смешиваемые материалы включают простые эфиры, диметоксиэтан или тетрагидрофуран. Напротив, масло, такое как алкан, и вода являются несмешиваемыми и образуют две фазы. Также обработку несмешивающимся растворителем необязательно комбинируют с детергентом, либо ионогенным, либо неионогенным. Примеры детергентов включают Triton X-100, Tween 20, Tween 80, Nonidet P40, плюроник или полиол.

Хроматографическая обработка

[0236] Для очищения популяций спор фекальный материал подвергают одной или нескольким хроматографическим обработкам последовательно или параллельно. При хроматографической обработке раствор, содержащий фекальный материал, приводят в контакт с твердой средой, содержащей среду для хроматографии с гидрофобным взаимодействием (HIC) или среду для аффинной хроматографии. Согласно альтернативному варианту реализации твердую среду, способную абсорбировать остаточный продукт среды обитания, присутствующий в фекальном материале, приводят в контакт с твердой средой, которая адсорбирует остаточный продукт среды обитания. Согласно определенным вариантам реализации указанная среда для HIC содержит сефарозу или дериватизированную сефарозу, например, бутилсефарозу, октилсефарозу, фенилсефарозу или бутил-s-сефарозу. Согласно другим вариантам реализации указанная среда для аффинной хроматографии содержит материал, дериватизированный муцином типа I, II, III, IV, V или VI, или олигосахаридами, происходящими из муцинов или аналогичные происходящим из муцинов типа I, II, III, IV, V или VI. Как вариант, среда для аффинной хроматографии содержит материал, дериватизированный антителами, распознающими споробразующие бактерии.

Механическая обработка

[0237] Предложено физическое разрушение фекального материала, в частности, путем одной или нескольких механических обработок, таких как смешивание, перемешивание, встряхивание, обработка на вортексе, ударная пульверизация и обработка ультразвуком. Согласно настоящему изобретению указанная обработка с механическим разрушением по существу разрушает неспоровый материал, присутствующий в фекальном материале, и по существу не разрушает споры, присутствующие в фекальном материале. Механическая обработка необязательно включает обработку фильтрацией, при которой нужные популяции спор остаются на фильтре, а нежелательные (неспоровые) фекальные компоненты проходят через фильтр, и споровую фракцию извлекают из фильтрующей среды. Как вариант, нежелательные частицы и эукариотические клетки могут оставаться на фильтре, а бактериальные клетки, в том числе споры, могут проходить через фильтр. Согласно некоторым вариантам реализации споровую фракцию, оставшуюся на фильтрующей среде, подвергают диафильтрации, при этом указанные оставшиеся споры приводят в контакт с жидкостью для промывания, как правило, стерильным содержащим соли раствором или другим разбавителем, для дополнительного уменьшения количества или устранения нежелательных фекальных компонентов.

Термообработка

[0238] Предложено термическое разрушение фекального материала. Обычно фекальный материал смешивают с содержащим соли раствором, таким как забуференный фосфатом солевой раствор (ФСБ), и помещают в среду с повышенной температурой, например, в теплую комнату, инкубатор, на водяную баню, или т.п., таким образом, чтобы между нагретой средой и фекальным материалом происходил эффективный теплообмен. Предпочтительно раствор фекального материала перемешивают во время инкубирования для увеличения теплопроводности и разрушения агрегатов частиц. Термообработка может модулироваться за счет температуры окружающей среды и/или продолжительности термообработки. Например, фекальный материал или жидкость, содержащую фекальный материал, подвергают воздействию среды с повышенной температурой, например, горячей водяной бани. температура которой составляет по меньшей мере приблизительно 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100 или более чем 100°С, в течение по меньшей мере приблизительно 1, 5, 10, 15, 20, 30, 45 секунд, или 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 40 или 50 минут, или 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более 10 часов. Согласно определенным вариантам реализации термообработка происходит при двух различных температурах, например, в течение 30 секунд в среде с температурой 100 градусов Цельсия, а затем в течение 10 минут в среде с температурой 50 градусов Цельсия. Согласно предпочтительным вариантам реализации температура и продолжительность термообработки являются достаточными для гибели или удаления патогенных материалов, и при этом по существу не повреждают или не уменьшают количество способных к прорастанию спор.

Обработка облучением

[0239] Предложены способы обработки фекального материала или разделенных компонентов фекального материала ионизирующим излучением, как правило, гамма-излучением, ультрафиолетовым излучением или облучением электронным пучком с обеспечением уровня энергии, достаточного для гибели патогенных материалов, но по существу не повреждающего нужные популяции спор. Например, ультрафиолетовое излучение с длиной волны 254 нм с обеспечением уровня энергии, составляющим менее чем приблизительно 22000 мкВт на см² в секунду, обычно не разрушает требуемые споры.

Обработка центрифугированием и разделение по плотности

[0240] Предложены способы отделения требуемых популяций спор от других компонентов фекального материала путем центрифугирования. Раствор, содержащий фекальный материал, один или несколько раз обрабатывают центрифугированием, например, приблизительно при 1000×g, 2000×g, 3000×g, 4000×g, 5000×g, 6000×g, 7000×g, 8000×g или более чем 8000×g. Дифференциальное центрифугирование обеспечивает отделение требуемых спор от ненужного неспорового материала; при малых мощностях споры остаются в растворе, а при более высоких мощностях споры осаждаются, тогда как примеси меньшего размера (например, вирусные частицы, фаги) остаются в растворе. Например, при первом центрифугировании с малой мощностью осаждаются волокнистые материалы; при втором центрифугировании с большей мощностью осаждаются нежелательные эукариотические клетки, а при третьем центрифугировании с еще большей мощностью осаждаются требуемые споры, хотя загрязняющие примеси небольших размеров остаются в суспензии. Согласно некоторым вариантам реализации используются градиенты или «подушки» для разделения в градиенте плотности или подвижности (например, «ступенчатые подушки»), например, градиенты перколла, фиколла, никоденза, гистоденза или сахарозы, для разделения требуемых популяций спор и других материалов в фекальном материале.

[0241] Также в настоящем документе предложены способы получения популяций спор, сочетающие два или большее число вариантов обработки, описанных в настоящем документе, для синергетического очищения требуемых спор наряду с уничтожением или удалением нежелательных материалов и/или активностей из популяции спор. Как правило, желательно сохранение популяций спор в не способствующих прорастанию и росту условиях и средах для минимизации роста патогенных бактерий, присутствующих в указанных популяциях спор, и для минимизации прорастания спор с образованием вегетативных бактериальных клеток.

ФАРМАЦЕВТИЧЕСКИЕ КОМПОЗИЦИИ И СОСТАВЫ

Составы

[0242] Предложены составы для введения человеку и другим нуждающимся в этом субъектам. Обычно бактериальные композиции комбинируют с дополнительными активными и/или неактивными материалами для получения конечного продукта, которые могут быть представлены единичной дозированной формой или многодозовым форматом.

[0243] Согласно некоторым вариантам реализации указанная композиция содержит по меньшей мере один углевод. «Углевод» относится к сахару или полимеру сахаров. Термины «сахарид», «полисахарид», «углевод» и «олигосахарид» могут быть использованы взаимозаменяемо. Большинство углеводов представляют собой альдегиды или кетоны с многочисленными гидроксильными группами, как правило, по одной на каждом атоме углерода в молекуле. Углеводы обычно имеют молекулярную формулу C_nH_2nO_n. Углевод может представлять собой моносахарид, дисахарид, трисахарид, олигосахарид или полисахарид. Большинство основных углеводов представляют собой моносахариды, например, глюкоза, сахароза, галактоза, манноза, рибоза, арабиноза, ксилоза и фруктоза. Дисахариды представляют собой два соединенных моносахарида. Примеры дисахаридов включают сахарозу, мальтозу, целлобиозу и лактозу. Как правило, олигосахарид включает от трех до шести моносахаридных единиц (например, раффиноза, стахиоза), а полисахариды включают шесть или более моносахаридных единиц. Примеры полисахаридов включают крахмал, гликоген и целлюлозу. Углеводы могут содержать модифицированные сахаридные единицы, например, 2’-дезоксирибозу, где удалена гидроксильная группа, 2’-фторрибозу, где гидроксильная группа заменена на фтор, или N-ацетилглюкозамин, азотсодержащую форму глюкозы (например, 2’-фторрибоза, дезоксирибоза и гексоза). Углеводы могут существовать в виде множества различных форм, например, конформеров, циклических форм, ациклических форм, стереоизомеров, таутомеров, аномеров и изомеров.

[0244] Согласно некоторым вариантам реализации указанная композиция содержит по меньшей мере один липид. В настоящем документе «липид» включает жиры, масла, триглицериды, холестерин, фосфолипиды, жирные кислоты в любой форме, включая свободные жирные кислоты. Жиры, масла и жирные кислоты могут быть насыщенными, ненасыщенными (цис или транс) или частично ненасыщенными (цис или транс). Согласно некоторым вариантам реализации указанный липид содержит по меньшей мере одну жирную кислоту, выбранную из лауриновой кислоты (12:0), миристиновой кислоты (14:0), пальмитиновой кислоты (16:0), пальмитолеиновой кислоты (16:1), маргариновой кислоты (17:0), гептадеценовой кислоты (17:1), стеариновой кислоты (18:0), олеиновой кислоты (18:1), линолевой кислоты (18:2), линоленовой кислоты (18:3), октадекатетраеновой кислоты (18:4), арахидоновой кислоты (20:0), эйкозеновой кислоты (20:1), эйкозадиеновой кислоты (20:2), эйкозатетраеновой кислоты (20:4), эйкозапентаеновой кислоты (20:5) (ЭПК), докозановой кислоты (22:0), докозеновой кислоты (22:1), докозапентаеновой кислоты (22:5), докозагексановой кислоты (22:6) (ДГК), и тетракозановой кислоты (24:0). Согласно другим вариантам реализации указанная композиция содержит по меньшей мере один модифицированный липид, например, липид, который был модифицирован посредством кулинарной обработки.

[0245] Согласно некоторым вариантам реализации указанная композиция содержит по меньшей мере один дополнительный минеральное вещество или источник минерального вещества. Примеры минеральных веществ включают, без ограничения: хлорид, натрий, кальций, железо, хром, медь, йод, цинк, магний, марганец, молибден, фосфор, калий и селен. Подходящий формы любых из перечисленных минеральных веществ включают растворимые минеральные соли, малорастворимые минеральные соли, нерастворимые минеральные соли, хелатированные минеральные вещества, минеральные комплексы, нереакционноспособные минеральные вещества, такие как карбонильные минеральные вещества, и восстановленные минеральные вещества и их комбинации.

[0246] Согласно определенным вариантам реализации указанная композиция содержит по меньшей мере один дополнительный витамин. Указанный по меньшей мере один витамин может относиться к жирорастворимым или водорастворимым витаминам. Подходящие витамины включают, не ограничиваясь перечисленными, витамин C, витамин A, витамин E, витамин B12, витамин K, рибофлавин, ниацин, витамин D, витамин B6, фолиевую кислоту, пиридоксин, тиамин, пантотеновую кислоту и биотин. Подходящие формы любых из перечисленных витаминов представлены солями витамина, производными витамина, компонентами, обладающими идентичной или аналогичной витамину активностью, и метаболитами витамина.

[0247] Согласно другим вариантам реализации указанная композиция содержит вспомогательное вещество. Неограничивающие примеры подходящих вспомогательных веществ включают буферизующий агент, консервант, стабилизатор, связывающее вещество, уплотняющий агент, смазывающее вещество, усилитель диспергирования, улучшающий распадаемость агент, вкусоароматический агент, подсластитель и красящий агент.

[0248] Согласно другому варианту реализации указанное вспомогательное вещество представляет собой буферизующий агент. Неограничивающие примеры подходящих буферизующих агентов включают цитрат натрия, карбонат магния, бикарбонат магния, карбонат кальция и бикарбонат кальция.

[0249] Согласно некоторым вариантам реализации указанное вспомогательное вещество содержит консервант. Неограничивающие примеры подходящих консервантов включают антиоксиданты, такие как альфа-токоферол и аскорбат, и противомикробные средства, такие как парабены, хлорбутанол и фенол.

[0250] Согласно другим вариантам реализации указанная композиция содержит связывающее вещество в качестве вспомогательного вещества. Неограничивающие примеры подходящих связывающих веществ включают крахмал, прежелатинизированный крахмал, желатин, поливинилпирролидон, целлюлозу, метилцеллюлозу, карбоксиметилцеллюлозу натрия, этилцеллюлозу, полиакриламиды, поливинилоксоазолидон, поливиниловые спирты, спирт жирной кислоты C₁₂-C₁₈, полиэтиленгликоль, полиолы, сахариды, олигосахариды и их комбинации.

[0251] Согласно другому варианту реализации указанная композиция содержит смазывающее вещество в качестве вспомогательное вещество. Неограничивающие примеры подходящих смазывающих веществ включают стеарат магния, стеарат кальция, стеарат цинка, гидрогенизированные растительные масла, стеротекс, полиоксиэтилена моностеарат, тальк, полиэтиленгликоль, бензоат натрия, лаурилсульфат натрия, лаурилсульфат магния и легкое минеральное масло.

[0252] Согласно другим вариантам реализации указанная композиция содержит усилитель диспергирования в качестве вспомогательного вещества. Неограничивающие примеры подходящих диспергирующих агентов включают крахмал, альгиновую кислоту, поливинилпирролидоны, гуаровую камедь, каолин, бентонит, очищенную древесную целлюлозу, натрия крахмала гликолят, изоаморфный силикат и микрокристаллическую целлюлозу как эмульгирующие поверхностно-активные вещества с высоким ГЛБ.

[0253] Согласно некоторым вариантам реализации указанная композиция содержит разрыхлитель в качестве вспомогательного вещества. Согласно другим вариантам реализации указанный разрыхлитель представляет собой нешипучий разрыхлитель. Неограничивающие примеры подходящих нешипучих разрыхлителей включают крахмал, например, кукурузный крахмал, картофельный крахмал, их прежелатинизированный и модифицированный крахмал, подсластители, глины, такие как бентонит, микрокристаллическую целлюлозу, альгинаты, натрия крахмала гликолят, камеди, такие как агар-агар, гуаровая камедь, камедь плодов рожкового дерева, камедь карайя, пектин и трагакант. Согласно другому варианту реализации указанный разрыхлитель представляет собой шипучий разрыхлитель. Неограничивающие примеры подходящих шипучих разрыхлителей включают бикарбонат натрия в комбинации с лимонной кислотой, и бикарбонат натрия в комбинации с винной кислотой.

[0254] Согласно другому варианту реализации указанное вспомогательное вещество содержит вкусоароматический агент. Вкусоароматические агенты могут быть выбраны из синтетических ароматических масел и вкусоароматических веществ; природных масел; экстрактов растений, листьев, цветов и плодов; и их комбинаций. Согласно некоторым вариантам реализации вкусоароматический агент выбирают из коричных масел; масла гаультерии; перечно-мятных масел; масла клевера; масла плевела пастбищного; масла аниса; эвкалипта; ванили; цитрусового масла, например, масла лимона, масла апельсина, винограда, грейпфрута; и фруктовых эссенций, в том числе яблока, персика, груши, клубники, малины, вишни, сливы, ананаса и абрикоса.

[0255] Согласно другим вариантам реализации указанное вспомогательное вещество включает подсластитель. Неограничивающие примеры подходящих подсластителей включают глюкозу (кукурузный сироп), декстрозу, инвертный сахар, фруктозу и их смеси (когда они не используются в качестве носителя); сахарин и различные соли сахарина, такие как натриевая соль; дипептидные подсластители, такие как аспартам; дигидрохалконовые компоненты, глицирризин; Stevia Rebaudiana (стевиозид); хлорные производные сахарозы, такие как сукралоза; и сахарные спирты, такие как сорбит, маннит, силит, и т.п. Также включены гидрогенизированные гидролизаты крахмала и синтетический подсластитель 3,6-дигидро-6-метил-1,2,3-оксатиазин-4-он-2,2-диоксид, в частности, его калиевая соль (ацесульфам-K), а также натриевые и кальциевые соли.

[0256] Согласно другим вариантам реализации указанная композиция содержит красящий агент. Неограничивающие примеры подходящих красящих агентов включают пищевые, лекарственные и косметические красители (FD&C), лекарственные и косметические красители (D&C), и лекарственные и косметические красители для наружного применения (Ext. D&C). Красящие агенты могут использоваться в форме красителей или соответствующих им пигментов.

[0257] Массовая доля вспомогательного вещества или комбинации вспомогательных веществ в составе составляет обычно приблизительно 99% или менее, например, приблизительно 95% или менее, приблизительно 90% или менее, приблизительно 85% или менее, приблизительно 80% или менее, приблизительно 75% или менее, приблизительно 70% или менее, приблизительно 65% или менее, приблизительно 60% или менее, приблизительно 55% или менее, 50% или менее, приблизительно 45% или менее, приблизительно 40% или менее, приблизительно 35% или менее, приблизительно 30% или менее, приблизительно 25% или менее, приблизительно 20% или менее, приблизительно 15% или менее, приблизительно 10% или менее, приблизительно 5% или менее, приблизительно 2% или менее, или приблизительно 1% или менее от общей массы указанной композиции.

[0258] Бактериальные композиции, раскрытые в настоящем изобретении, могут быть введены в разнообразные составы и могут вводиться с применением ряда различных способов. Указанные композиции могут вводиться перорально, ректально или парентерально, в виде составов, при необходимости содержащих стандартные приемлемые носители, адъюванты и основы. Термин «парентеральный» в настоящем документе включает техники подкожного, внутривенного, внутримышечного или внутригрудинного инъецирования и инфузии. Согласно примеру варианта реализации бактериальную композицию вводят перорально.

[0259] Твердые дозированные формы для перорального введения включают капсулы, таблетки, каплеты, пилюли, драже, пастилки, порошки и гранулы. Капсула, как правило, содержит материал сердцевины, содержащий бактериальную композицию, и оболочку, которая инкапсулирует материал сердцевины. Согласно некоторым вариантам реализации указанный материал сердцевины содержит по меньшей мере что-либо одно из твердого вещества, жидкости и эмульсии. Согласно другим вариантам реализации указанный материал оболочки содержит по меньшей мере что-либо одно из мягкого желатина, твердого желатина и полимера. Подходящие полимеры включают, не ограничиваясь перечисленными: полимеры целлюлозы, такие как гидроксипропилцеллюлоза, гидроксиэтилцеллюлоза, гидроксипропилметилцеллюлоза (HPMC), метилцеллюлоза, этилцеллюлоза, ацетат целлюлозы, фталат ацетата целлюлозы, тримеллитат ацетата целлюлозы, фталат гидроксипропилметилцеллюлозы, сукцинат гидроксипропилметилцеллюлозы и карбоксиметилцеллюлоза натрия; полимеры и coполимеры акриловой кислоты, такие как образованные из акриловой кислоты, метакриловой кислоты, метилакрилата, метилакрилата аммония, этилакрилата, метилметакрилата и/или этилметакрилата (например, coполимеры, продаваемые под торговым наименованием «Эудрагит» (Eudragit)); виниловые полимеры и coполимеры, такие как полвинилпирролидон, поливинилацетат, поливинилацетатфталат, сополимер винилацетата и кротоновой кислоты и сополимеры этилена и винилацетата; и шеллак (очищенный сырой шеллак). Согласно другим вариантам реализации по меньшей мере один полимер функционирует в качестве маскирующег вкус агента.

[0260] Таблетки, пилюли и т.п. могут быть прессованными, многократно прессованными, многослойными и/или покрытыми оболочкой. Покрытие может быть однослойным или многослойным. Согласно одному варианту реализации материал для покрытия содержит по меньшей мере что-либо одно из сахарида, полисахарида и гликопротеинов, экстрагированных по меньшей мере из чего-либо одного из растения, гриба и микроорганизма. Неограничивающие примеры включают кукурузный крахмал, пшеничный крахмал, картофельный крахмал, тапиоковый крахмал, целлюлоза, гемицеллюлоза, декстраны, мальтодекстрин, циклодекстрины, инулины, пектин, маннаны, гуммиарабик, камедь плодов рожкового дерева, камедь мескитового дерева, гуаровую камедь, камедь карайя, камедь гхатти, трагакантовую камедь, фунори, каррагинаны, агар-агар, альгинаты, хитозаны или геллановую камедь. Согласно некоторым вариантам реализации материал для покрытия содержит белок. Согласно другому варианту реализации указанный материал для покрытия содержит по меньшей мере что-либо одно из жира и масла. Согласно другим вариантам реализации указанное по меньшей мере что-либо одно из жира и масла имеет высокую температуру плавления. Согласно еще одному варианту реализации указанное по меньшей мере что-либо одно из жира и масла гидрогенизировано или частично гидрогенизировано. Согласно одному варианту реализации по меньшей мере что-либо одно из жира и масла получено из растения. Согласно другим вариантам реализации указанный по меньшей мере что-либо одно из жира и масла содержит по меньшей мере что-либо одно из глицеридов, свободных жирных кислот и сложных эфиров жирных кислот. Согласно некоторым вариантам реализации указанный материал для покрытия содержит по меньшей мере один пищевой воск. Указанный пищевой воск может быть получен из животных, насекомых или растений. Неограничивающие примеры включают пчелиный воск, ланолин, воск мирики, карнаубский воск и воск рисовых отрубей. Кроме того, могут быть получены таблетки и пилюли с кишечнорастворимыми покрытиями.

[0261] Как вариант, порошки или гранулы, в форме которых реализованы бактериальные композиции, раскрытые в настоящем изобретении, могут быть включены в пищевой продукт. Согласно некоторым вариантам реализации указанный пищевой продукт представляет собой напиток для перорального приема. Неограничивающие примеры подходящих напитков включают фруктовый сок, фруктовый напиток, искусственно ароматизированный напиток, искусственно подслащенный напиток, газированный напиток, спортивный напиток, жидкий молочный продукт, коктейль, алкогольный напиток, напиток с кофеином, детское питание и т.д. Другие подходящие способы перорального введения включают водные и неводные растворы, эмульсии, суспензии, а также растворы и/или суспензии, восстанавливаемые из нешипучих гранул, содержащих по меньшей мере что-либо одно из подходящих растворителей, консервантов, эмульгирующих агентов, суспендирующих агентов, разбавителей, подсластителей, красящих агентов и вкусоароматических агентов.

[0262] Согласно некоторым вариантам реализации указанный пищевой продукт может представлять собой твердый пищевой продукт. Подходящие примеры твердого пищевого продукта включают без ограничения питательный батончик, закусочный батончик, печенье, брауни, маффин, крекер, брикет мороженого, замороженный йогуртовый брикет и т.п.

[0263] Согласно другим вариантам реализации раскрытые в настоящем изобретении композиции включены в продукты лечебного питания. Согласно некоторым вариантам реализации указанные продукты лечебного питания представляют собой готовый к применению пищевой продукт, который необязательно содержит некоторые или все необходимые макроэлементы и микроэлементы. Согласно другому варианту реализации раскрытые в настоящем изобретении композиции включены в пищевую добавку, предназначенную для смешивания с обычной пищей. Согласно одному варианту реализации указанная пищевая добавка содержит некоторые или все необходимые макроэлементы и микроэлементы. Согласно другому варианту реализации раскрытые в настоящем изобретении бактериальные композиции смешивают или добавляют в обычную пищу для повышения белковой ценности пищи. Примеры включают основные виды продовольствия (зерновые продукты, соль, сахар, масло для приготовления пищи, маргарин), напитки (кофе, чай, газированные напитки, пиво, спиртные напитки, спортивные напитки), снэки, сладости и другие пищевые продукты.

[0264] Согласно одному варианту реализации указанными составами наполняют желатиновые капсулы для перорального введения. Примером подходящей капсулы является желатиновая капсула массой 250 мг, содержащая от 10 (до 100 мг) лиофилизированного порошка (от 10⁸ до 10¹¹ бактерий), 160 мг микрокристаллической целлюлозы, 77,5 мг желатина и 2,5 мг стеарата магния. Согласно альтернативному варианту реализации может быть использовано от 10⁵ до 10¹², от 10⁵ до 10⁷, от 10⁶ до 10⁷, или от 10⁸ до 10¹⁰ бактерий, с соответствующими корректировками вспомогательных веществ при необходимости. Согласно альтернативному варианту реализации может использоваться капсула или таблетка с кишечнорастворимым покрытием или с буферной или защитной композицией.

Примеры

[0265] Ниже приведены примеры конкретных вариантов реализации настоящего изобретения. Указанные примеры предложены исключительно в иллюстративных целях, и не предназначены для какого-либо ограничения объема настоящего изобретения. Были предприняты усилия, чтобы обеспечить точность приводимых численных значений (например, количеств, температур и т.п.), однако следует, разумеется, учитывать возможность определенных экспериментальных ошибок и погрешностей.

[0266] При реализации настоящего изобретения используются, если не указано иное, стандартные способы химии белков, биохимии, техник рекомбинантной ДНК и фармакологии на существующем уровне техники. Такие техники подробно описаны в литературе. См., например, T.E. Creighton, Proteins: Structures and Molecular Properties (W.H. Freeman and Company, 1993); A.L. Lehninger, Biochemistry (Worth Publishers, Inc., текущее издание); Sambrook, et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual (2^nd Edition, 1989); Methods In Enzymology (S. Colowick and N. Kaplan eds., Academic Press, Inc.); Remington's Pharmaceutical Sciences, 18^th Edition (Easton, Pennsylvania: Mack Publishing Company, 1990); Carey and Sundberg Advanced Organic Chemistry 3^rd Ed. (Plenum Press) Vols A and B(1992).

Пример 1. Получение фекального материала.

[0267] Свежие образцы фекалий получали от здоровых доноров-людей, прошедших скрининг на общее хорошее состояние здоровья и отсутствие инфекционных заболеваний, отвечающих критериям включения и исключения, при этом критерии включения включают хорошее состояние здоровья, отсутствие серьезных заболеваний в анамнезе, по результатам физического осмотра или аномальных клинических показателей, регулярное опорожнение кишечника со стулом, внешний вид которого соответствует, как правило, 2, 3, 4, 5 или 6 типу согласно Бристольской шкале стула, и имеющих ИМТ ≥18 кг/м² и ≤25 кг/м². Критерии исключения, как правило, предусматривали значимые хронические или острые медицинские состояния, в том числе заболевания почек, печени, легких, ЖКТ, сердечно-сосудистой системы, мочеполовой системы, эндокринной системы, иммунной системы, обмена веществ, неврологическое или гематологическое заболевание, наличие в семейном анамнезе воспалительного заболевания кишечника, в том числе болезни Крона и язвенного колита, синдрома раздраженного кишечника, злокачественные новообразования толстой кишки, желудка или другой области ЖКТ, или синдромы полипоза желудочно-кишечного тракта, или недавнее употребление йогурта или коммерческих пробиотических материалов, где первичным(и) компонентом(ами) являет(ют)ся организм(ы). Образцы собирали непосредственно с применением системы сбора образцов на основе кресла-туалета, включающей пластиковый держатель, устанавливаемый на туалетное сиденье, и контейнер для сбора образцов, установленный на держателе. Экскременты попадали в контейнер, после чего на контейнер помещали крышку и плотно закрывали. Затем помещенный на лед образец не позднее чем через 1-4 часов доставляли для обработки. Образцы перемешивали стерильным одноразовым инструментом, и аликвоты массой 2-4 г взвешивали, помещали в пробирки и мгновенно замораживали на ледяной бане с сухим льдом/этанолом. Аликвоты хранили в замороженном состоянии при -80°С до использования.

[0268] Необязательно фекальный материал суспендировали в растворе, и/или удаляли волокна и/или частицы. Извлекали замороженную хранящуюся при -80°С аликвоту, содержащую известную массу экскрементов, и размораживали при комнатной температуре. Добавляли стерильный 1× ФСБ для получения 10% суспензии (масса/объем), и интенсивно перемешивали на вортексе для суспендирования фекального материала до достижения гомогенного внешнего вида материала. Затем материалу позволяли отстояться в течение 10 минут при комнатной температуре для осаждения волокон и частиц. После этого суспензию над осадком аккуратно забирали в новую пробирку, и она содержала очищенную популяцию спор. Необязательно, затем суспензию центрифугировали на низкой скорости, например, 1000×g, в течение 5 минут для осаждения частиц, в том числе волокон. Осадок утилизировали, а супернатант, содержащий вегетативные организмы и споры, помещали в новую пробирку. Затем супернатант центрифугировали при 6000×g в течение 10 минут для осаждения вегетативных организмов и спор. Затем осадок ресуспендировали в 1× ФСБ при интенсивном перемешивании на вортексе до достижения гомогенного внешнего вида материала.

Пример 2. Очищение спор из обработанного спиртом фекального материала.

[0269] 10% суспензию (масса/объем) фекального материала человека в ФСБ смешивали с абсолютным этанолом в соотношении 1:1 и перемешивали на вортексе в течение 1 минуты. Суспензию инкубировали при 37°С в течение 1 часа. После инкубирования суспензию центрифугировали на 13000 об/мин в течение 5 минут для осаждения спор. Супернатант утилизировали, а осадок ресуспендировали в равном объеме ФСБ. Добавляли глицерин до конечной концентрации 15% и помещали очищенную споровую фракцию на хранение при -80°С.

Пример 2A. Получение состава со спорами из обработанного спиртом фекального материала.

[0270] 10% суспензию (масса/объем) фекального материала человека в ФСБ смешивали с абсолютным этанолом в соотношении 1:1 и перемешивали на вортексе в течение 1 минуты. Суспензию инкубировали при 37°С в течение 1 часа. После инкубирования суспензию центрифугировали при 13000 об/мин в течение 5 минут для концентрации спор в осадке, содержащем очищенный споровый состав. Супернатант утилизировали, а осадок ресуспендировали в равном объеме ФСБ. Добавляли глицерин до конечной концентрации 15% и помещали очищенный состав со спорами на хранение при -80°С.

Пример 3. Очищение спор из термообработанного фекального материала.

[0271] 10% суспензию (масса/объем) фекального материала человека в ФСБ инкубировали на водяной бане при 80°С в течение 30 минут. Добавляли глицерин до конечной концентрации 15% и помещали обогащенный споросодержащий материал на хранение при -80°С.

Пример 4. Очищение спор из обработанного спиртом и термообработанного фекального материала.

[0272] 10% суспензию (масса/объем) экскрементов человека в ФСБ смешивали с абсолютным этанолом в соотношении 1:1 и перемешивали на вортексе в течение 1 минуты. Суспензию инкубировали на водяной бане в аэробных условиях при 37°С в течение 1 часа. После инкубирования суспензию центрифугировали на 13000 об/мин в течение 5 минут для осаждения спор. Супернатант утилизировали, а осадок ресуспендировали в равном объеме ФСБ. Затем обработанную этанолом популяцию спор инкубировали на водяной бане при 80°С в течение 30 минут. Добавляли глицерин до конечной концентрации 15% и помещали очищенную споровую фракцию на хранение при -80 C.

Пример 5. Очищение спор из обработанного детергентом фекального материала.

[0273] Получают 10% суспензию (масса/объем) экскрементов человека в ФСБ, содержащую конечную концентрацию Triton X-100 от 0,5 до 2%. После инкубирования при встряхивании в течение 30 минут при 25-37°С образец центрифугировали на 1000 g в течение 5-10 минут для осаждения частиц и больших клеток. Бактериальные споры извлекают из фракции супернатанта, при этом очищенная популяция спор может необязательно подвергаться дополнительной обработке, например, согласно примеру 4. Без привязки к конкретной теории, добавление детергента к фекальной смеси обеспечивает получение более качественных популяций спор, по меньшей мере отчасти за счет улучшения отделения спор от частиц, что приводит к большему выходу спор.

Пример 6. Очищение спор путем хроматографического разделения фекального материала.

[0274] Обогащенную спорами популяцию, например, полученную согласно примерам 1-5 выше, смешивают с NaCl до конечной общей концентрации соли 4M и приводят в контакт с октилсефарозой 4 Fast Flow для связывания гидрофобной споровой фракции. Смолу промывают 4M NaCl для удаления менее гидрофобных компонентов, споры элюируют дистиллированной водой, и собирают нужную обогащенную споровую фракцию на основании УФ-поглощения.

Пример 7. Очищение спор путем фильтрации фекального материала.

[0275] Обогащенную спорами популяцию, например, полученную согласно примерам 1-6 выше, разбавляют ФСБ до 1:10 и помещают в резервуар системы для тангенциальной проточной микрофильтрации. Гидрофильный тангенциальный фильтр из смешанного эфира целлюлозы с размером пор 0,2 мкм соединяют с резервуаром, например, посредством трубки, замкнутой в петлю. Разбавленный состав со спорами многократно прокачивают по петле насосом, и под действием градиента давления на стенках микрофильтра жидкость супернатанта проходит через поры фильтра. При правильном выборе размера пор фильтра требуемые бактериальные споры удерживаются, а загрязняющие примеси меньшего размера, такие как клеточный дебрис, и другие загрязняющие примеси в экскрементах, такие как бактериофаги, проходят через фильтр. Периодически в резервуар добавляют свежий ФСБ-буфер для улучшения вымывания загрязняющих примесей. В конце диафильтрации споры концентрируют приблизительно десятикратно до исходной концентрации. Очищенные споры собирали из резервуара и хранили согласно описанию в настоящем документе.

Пример 8. Характеризация очищенных популяций спор.

[0276] Количество жизнеспособных спор подсчитывают, выполняя 10-кратные серийные разведения в ФСБ и высевая в чашки Петри на кровяной агар для Brucella или подходящую твердую среду. Планшеты инкубируют при 37°С в течение 2 дней. Подсчитывают колонии на чашке для разведения с 50-400 колоний и используют для обратного подсчета числа жизнеспособных спор в популяции. Также продемонстрирована способность к росту с образованием вегетативных бактерий. Визуально количество подсчитывают с применением фазово-контрастной микроскопии. Состав со спорами либо разводят в ФСБ, либо концентрируют путем центрифугирования, и аликвоту объемом 5 мкл помещают в счетную камеру Петрова-Хауссера для визуализации при увеличении 400×. Подсчитывают споры в полях сетки размером 0,05 мм × 0,05 мм, определяют среднее подсчитанное число спор на поле и используют для расчета количества спор на мл состава. Уменьшение количества липополисахарида (ЛПС) в очищенных популяциях спор измеряют с применением анализа с лизатом амебоцитов мечехвоста (LAL), например, коммерчески доступного набора ToxinSensor™ Chromogenic LAL Endotoxin Assay Kit (GenScript, Пискатауэй, Нью-Джерси) или других стандартных способов, известных специалистам в данной области техники.

Пример 9. Определение бактериальных патогенов в очищенных популяциях спор.

[0277] Бактериальные патогены, присутствующие в очищенной популяции спор, определяют с помощью кПЦР с применением специфических олигонуклеотидных праймеров следующим образом.

[0278] Получение стандартных кривых. Стандартную кривую строят на основании лунок, содержащих представляющий интерес патоген в известной концентрации, или одновременно количественно определяют с применением селективного посева бляшкой. Серийные разведения культур в двух повторностях выполняют в стерильном забуференном фосфатом солевом растворе. Затем из образцов для стандартной кривой наряду с другими образцами экстрагируют геномную ДНК.

Экстракция геномной ДНК.

[0279] Геномная ДНК может быть экстрагирована из 100 мкл образцов фекалий, происходящих из фекалий образцов или очищенных составов со спорами с применением набора для выделения ДНК Mo Bio Powersoil®-htp 96 Well Soil DNA Isolation Kit (Mo Bio Laboratories, Карлсбад, Калифорния) в соответствии с инструкциями производителя, с двумя исключениями: измельчение гранулами выполняют в течение 2 × 4:40 минут с применением гомогенизатора BioSpec Mini-Beadbeater-96 (BioSpec Products, Бартлезвилль, Оклахома) и ДНК элюируют в 50 мкл раствора C6. Как вариант, геномная ДНК может быть выделена с применением набора для выделения ДНК Mo Bio Powersoil® DNA Isolation Kit (Mo Bio Laboratories, Карлсбад, Калифорния), набора для ПЦР Sigma-Aldrich Extract-N-Amp™Plant PCR Kit, мининабора QIAamp DNA Stool Mini Kit (QIAGEN, Валенсия, Калифорния) в соответствии с инструкциями производителей.

Состав и условия для кПЦР.

[0280] Реакция кПЦР для детекции C. difficile включает 1× HotMasterMix (5PRIME, Гейтерсберг, Мэриленд), 900 нМ Wr-tcdB-F (AGCAGTTGAATATAGTGGTTTAGTTAGAGTTG, IDT, Коралвилль, Айова), 900 нМ Wr-tcdB-R (CATGCTTTTTTAGTTTCTGGATTGAA, IDT, Коралвилль, Айова), 250 нМ We-tcdB-P (6FAM-CATCCAGTCTCAATTGTATATGTTTCTCCA-MGB, Life Technologies, Гранд-Айленд, Нью-Йорк) и воду для ПЦР (Mo Bio Laboratories, Карлсбад, Калифорния) до 18 мкл (модифицированные праймеры на основе: Wroblewski, D. et al. Rapid Molecular Characterization of Clostridium difficile and Assessment of Populations of C. difficile in Stool Specimens. Journal of Clinical Microbiology 47:2142-2148 (2009)). Аликвоты указанной реакционной смеси распределяют в лунки 96-луночного штрихкодированного реакционного планшета MicroAmp® Fast Optical 96-well Reaction Plate with Barcode (0,1мл) (Life Technologies, Гранд-Айленд, Нью-Йорк). К указанной реакционной смеси добавляют 2 мкл экстрагированной геномной ДНК. Проводят кПЦР на термоциклере BioRad C1000™, оборудованном системой реального времени CFX96™ Real-Time System (BioRad, Геркулес, Калифорния). Используют следующие условия термоциклирования: 95°C в течение 2 минут с последующими 45 циклами при 95°C по 3 секунды, 60°C по 30 секунд, и регистрируют флуоресценцию в каналах FAM и ROX. Другие бактериальные патогены могут быть детектированы с применением праймеров и зонда, специфических в отношении представляющего интерес патогена.

Анализ данных.

[0281] Значение Cq для каждой лунки канала FAM определяют с применением программного обеспечения CFX Manager™, версия 2.1. Значение log10(КОЕ/мл) для каждого экспериментального образца рассчитывают путем подстановки значения Cq определенного образца в линейную регрессионную модель, установленную по стандартной кривой, сравнивающую значения Cq лунок, использованных для стандартной кривой, с известными log10(КОЕ/мл) для указанных образцов.

[0282] Вирусные патогены, присутствующие в очищенной популяции спор, определяют с помощью кПЦР согласно описанию в настоящем документе, а также иными известными в данной области техники способами.

Пример 10: Идентификация видов

[0283] Идентичность спорообразующих видов, выросших из комплексной фракции, может быть определена несколькими способами. Во-первых, индивидуальные колонии могут высеваться уколом в жидкую среду в формате 96-луночных планшетов, культивироваться и храниться в виде основных растворов в 15% глицерине при -80°C. Аликвоты указанных культур могут быть помещены в лизирующий клеточный буфер, и могут использоваться методы ПЦР колоний для амплификации и секвенирования гена 16S рРНК (Пример 2). Как вариант, колонии могут быть полностью очищены несколькими пересевами методом штриха на твердой среде. Хорошо выраженные колонии высевают методом штриха на новые чашки того же типа и инкубируют в течение 48-72 часов при 37°С. Процесс повторяют несколько раз для подтверждения полной чистоты. Чистые культуры могут анализироваться с применением фенотипических методов или секвенирования, в том числе амплификации и секвенирования 16S рРНК согласно описанию в примерах 11 и 12. Определение последовательностей в чистых изолятах или смешанных сообществах, например, соскобах с чашек и споровых фракциях, может также включать полногеномное секвенирование методом «дробовика». Последний метод подходит для определения присутствия генов, связанных со споруляцией, устойчивостью к антибиотикам, патогенности и вирулентности. Колонии могут также собираться соскобом с чашек en masse и секвенироваться с применением метода массивного параллельного секвенирования согласно описанию в примерах 11 и 12, что обеспечивает идентификацию индивидуальных 16S-«сигнатур» в комплексной смеси. Необязательно образец может быть секвенирован до прорастания (при использовании подходящих процедур выделения ДНК для лизиса и высвобождения ДНК из спор) для сравнения разнообразия способных к прорастанию видов с общим числом видов в споровом образце. В качестве альтернативного варианта или как дополнение к анализу 16S может также использоваться времяпролетная масс-спектрометрия с ионизацией лазерной десорбцией при содействии матрицы (МАЛДИ) для идентификации видов (см. обзор в Anaerobe 22:123).

Пример 11: 16S-секвенирование для определения функциональных таксономических единиц (OTU)

Способ определения последовательности 16S

[0284] OTU могут быть определены посредством полного 16S-секвенирования гена рРНК, посредством секвенирования конкретной гипервариабельной области указанного гена (т.е. V1, V2, V3, V4, V5, V6, V7, V8 или V9) или посредством секвенирования любой комбинации гипервариабельных областей указанного гена (например, V1-3 или V3-5). Длина бактериальных 16S рРНК составляет приблизительно 1500 нуклеотидов и их используют для реконструкции эволюционных взаимосвязей и сходства последовательностей между бактериальными изолятами с применением филогенетических методов. Последовательности 16S используют для филогенетической реконструкции, поскольку они обычно высококонсервативны, однако содержат специфические гипервариабельные области, содержащие достаточно разнообразные нуклеотиды для различения родов и видов большинства микроорганизмов.

[0285] С применением хорошо известных техник, для определения полной последовательности 16S или последовательности любой гипервариабельной области последовательности 16S, геномную ДНК экстрагируют из бактериального образца, 16S рРНК (полную область или конкретные гипервариабельные области) амплифицировали с применением полимеразной цепной реакции (ПЦР), очищали продукты ПЦР и устанавливали нуклеотидные последовательности для определения генетического состава гена 16S или субдомена указанного гена. При проведении 16S-секвенирования используемый способ секвенирования может представлять собой, не ограничиваясь указанным, секвенирование по Сэнгеру. Если используются одна или большее количество гипервариабельных областей, таких как область V4, секвенирование может проводиться с применением, не ограничиваясь перечисленными, метода Сэнгера или метода секвенирования нового поколения, такого как секвенирование Illumina (секвенирование путем синтеза) с применением штрихкодированных праймеров, позволяющих проводить несколько реакций.

[0286] Помимо гена рРНК 16S, OTU можно определять путем секвенирования выбранной группы генов, которые известны как маркерные гены определенного вида или таксономической группы OTU. Указанные гены могут, как вариант, анализироваться с применением стратегии скрининга на основе ПЦР. Например, различные штаммы патогенной Escherichia coli можно отличить, используя ДНК генов, кодирующих термолабильные (LTI, LTIIa и LTIIb) и термостабильные (STI и STII) токсины, веротоксин типов 1, 2 и 2e (VT1, VT2 и VT2e, соответственно), цитотоксические некротизирующие факторы (CNF1 и CNF2), механизмы прикрепления и сглаживания (eaeA), энтероагрегативные механизмы (Eagg) и энтероинвазивные механизмы (Einv). Специалистам в области таксономической идентификации на основе секвенирования известны оптимальные гены для использования в качестве маркерных генов при определении таксономической принадлежности OTU.

Экстракция геномной ДНК

[0287] Геномную ДНК экстрагируют из чистых культур микроорганизмов с применением метода горячего щелочного лизиса. 1 мкл культуры микроорганизмов добавляют к 9 мкл лизирующего буфера (25мМ NaOH, 0,2 мМ EDTA), и смесь инкубируют при 95°C в течение 30 минут. Затем образцы охлаждают до 4°C и нейтрализуют добавлением 10 мкл нейтрализующего буфера (40 мМ Tris-HCl), и 10-кратно разводят элюирующим буфером (10 мМ Tris-HCl). Как вариант, геномную ДНК экстрагируют из чистых культур микроорганизмов с применением коммерчески доступных наборов, таких как набор для выделения ДНК Mo Bio Ultraclean® Microbial DNA Isolation Kit (Mo Bio Laboratories, Карлсбад, Калифорния), или с помощью стандартных способов, известных специалистам в данной области техники.

Амплификация последовательностей 16S для прямого секвенирования по Сэнгеру

[0288] Для амплификации бактериальных 16S рРНК (фиг. 1A) 2 мкл экстрагированной гДНК добавляют в 20 мкл конечного объема ПЦР-реакции. В случае полноразмерного 16S-секвенирования реакция ПЦР также включает 1× HotMasterMix (5PRIME, Гейтерсберг, Мэриленд), 250 нМ 27f (AGRGTTTGATCMTGGCTCAG, IDT, Коралвилль, Айова) и 250 нМ 1492r (TACGGYTACCTTGTTAYGACTT, IDT, Коралвилль, Айова) с водой для ПЦР (Mo Bio Laboratories, Карлсбад, Калифорния) для уравновешивания объема. Как вариант, используют другие универсальные бактериальные праймеры или термостабильные полимеразы, известные специалистам в данной области техники. Например, специалистам в данной области техники доступны праймеры для секвенирования «V1-V9-областей» 16S рРНК (фиг. 1A). Указанные области относятся к первым девяти гипервариабельным областям гена 16S рРНК, которые используют для генотипирования бактериальных образцов. Указанные области у бактерий определяют нуклеотиды 69-99, 137-242, 433-497, 576-682, 822-879, 986-1043, 1117-1173, 1243-1294 и 1435-1465, соответственно, с применением нумерации на основе системы номенклатуры E. coli. Brosius et al., Complete nucleotide sequence of a 16S ribosomal RNA gene from Escherichia coli, PNAS 75(10):4801-4805 (1978). Согласно некоторым вариантам реализации по меньшей мере какую-либо одну из областей V1, V2, V3, V4, V5, V6, V7, V8 и V9 используют для определения OTU. Согласно одному варианту реализации области V1, V2, и V3 используют для определения OTU. Согласно другому варианту реализации области V3, V4, и V5 используют для определения OTU. Согласно другому варианту реализации область V4 используют для определения OTU. Специалист в данной области техники может идентифицировать специфические гипервариабельные области кандидатной 16S рРНК (на фиг. 1A) путем сравнения представляющей интерес кандидатной последовательности с референсной последовательностью (фиг. 1B) и идентификации гипервариабельных областей на основании сходства с референсными гипервариабельными областями.

[0289] ПЦР выполняют на коммерчески доступных термоциклерах, например, BioRad MyCycler™ (BioRad, Геркулес, Калифорния). Реакции проводят при 94°C в течение 2 минут с последующими 30 циклами при 94°C в течение 30 секунд, 51°C в течение 30 секунд, и 68°C в течение 1 минуты и 30 секунд, с последующим 7-минутным удлинением при 72°C и периодом неопределенной продолжительности при 4°C. После ПЦР проводят гель-электрофорез части реакционных продуктов для подтверждения успешной амплификации продукта размером ~1,5 кБ.

[0290] Для удаления нуклеотидов и олигонуклеотидов из продуктов ПЦР 2 мкл HT ExoSap-IT (Affymetrix, Санта-Клара, Калифорния) добавляют к 5 мкл продукта ПЦР с последующим 15-минутным инкубированием при 37°C, и затем 15-минутной инактивацией при 80°C.

Амплификация последовательностей 16S для прямого определения с применением технологий массивного параллельного секвенирования

[0291] Для проведения амплификации для прямого секвенирования с использованием технологий на основе коротких прочтений, такой как Illumina, требуется применение праймеров, известных специалистам в данной области техники, дополнительно включающих основанную на последовательностях штрихкодированную метку. Например, для амплификации гипервариабельной области V4 16s бактериальной 16S рРНК, 2 мкл экстрагированной гДНК добавляют к 20 мкл конечного объема реакции ПЦР. Реакция ПЦР также включает 1× HotMasterMix (5PRIME, Гейтерсберг, Мэриленд), 200 нМ V4_515f_adapt (AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA, IDT, Коралвилль, Айова), 200 нМ штрихкодированный 806rbc (CAAGCAGAAGACGGCATACGAGAT_12bpGolayBarcode_AGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT, IDT, Коралвилль, Айова) с водой для ПЦР (Mo Bio Laboratories, Карлсбад, Калифорния) для уравновешивания объема. Указанные праймеры включают штрихкодированные адаптеры для секвенирования синтезом от Illumina. Необязательно может проводиться две, три или четыре идентичных параллельных реакции. Как вариант, используют другие универсальные бактериальные праймеры или термостабильные полимеразы, известные специалистам в данной области техники, для получения других уровней погрешности при амплификации и секвенировании, а также результатов для альтернативных технологий секвенирования.

[0292] ПЦР-амплификацию выполняют на коммерчески доступных термоциклерах, таких как BioRad MyCycler™ (BioRad, Геркулес, Калифорния). Реакции проводят при 94°C в течение 3 минут с последующими 25 циклами при 94°C в течение 45 секунд, 50°C в течение 1 минуты, и 72°C в течение 1 минуты и 30 секунд, с последующим 10-минутным удлинением при 72°C и периодом неопределенной продолжительности при 4°C. После ПЦР проводят гель-электрофорез части реакционных продуктов для подтверждения успешной амплификации продукта размером ~1,5 кБ. Очищение продуктов ПЦР выполняют согласно описанию в предыдущем примере.

Секвенирование по Сэнгеру целевых ампликонов из чистых гомогенных образцов

[0293] Для детекции нуклеиновых кислот для каждого образца проводят две реакции секвенирования для получения прямого и обратного прочтения последовательности. Для полноразмерного 16S-секвенирования используют праймеры 27f и 1492r. 40 нг очищенных ExoSap-IT продуктов ПЦР смешивают с 25 пмоль праймера для секвенирования и водой для молекулярной биологии от Mo Bio (Mo Bio Laboratories, Карлсбад, Калифорния) с получением общего объема 15 мкл. Указанную реакционную смесь отправляют для проведения секвенирования по Сэнгеру в коммерческую организацию, такую как Genewiz (Саут-Плейнфилд, Нью-Джерси).

Массивное параллельное секвенирование целевых ампликонов из гетерогенных образцов

[0294] Количественное определение ДНК и конструирование библиотеки. Очищенные продукты ПЦР-амплификации количественно определяют с применением аналитического набора Quant-iT™ PicoGreen® dsDNA Assay Kit (Life Technologies, Гранд-Айленд, Нью-Йорк) в соответствии с инструкциями производителя. После количественного определения очищенные штрихкодированные продукты ПЦР комбинируют таким образом, что все отдельные продукты ПЦР присутствуют в эквимолярных отношениях, для получения готовой библиотеки Illumina.

[0295] Детекция нуклеиновых кислот. Полученную библиотеку секвенируют на секвенаторах Illumina HiSeq или MiSeq (Illumina, Сан-Диего, Калифорния), с определением кластеров, гибридизацией на матрице, изотермальной амплификацией, линеаризацией, блокированием, денатурацией и гибридизацией праймеров секвенирования в соответствии с инструкциями производителя. Для секвенирования используют 16SV4SeqFw (TATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA), 16SV4SeqRev (AGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT) и 16SV4Index (ATTAGAWACCCBDGTAGTCCGGCTGACTGACT) (IDT, Коралвилль, Айова). Могут использоваться другие технологии секвенирования, например, но не ограничиваясь перечисленными, 454, Pacific Biosciences, Helicos, Ion Torrent и Nanopore, с применением протоколов, стандартных для специалиста в области геномного секвенирования.

Пример 12: Определение принадлежности прочтений секвенирования

[0296] Определение принадлежности первичных прочтений

[0297] Последовательности нуклеиновых кислот анализируют и определяют таксономическую принадлежность с использованием сходства последовательностей и методов филогенетической классификации, или комбинации указанных двух стратегий. Аналогичный подход может использоваться для присвоения наименований белкам, транскрипционным факторам и любых других схем классификации последовательностей нуклеиновых кислот. Способы на основе сходства последовательностей включают способы, известные специалистам в данной области техники, включая, но не ограничиваясь перечисленными, BLAST, BLASTx, tBLASTn, tBLASTx, RDP-классификатор, DNAclust и различные варианты реализации указанных алгоритмов, такие как Qiime или Mothur. Указанные способы основаны на картировании прочтений секвенирования на референсную базу данных и отборе совпадений с лучшим показателем и собственным значением. Стандартные базы данных включают, не ограничиваясь перечисленными, Human Microbiome Project, неизбыточную базу данных NCBI, Greengenes, RDP и Silva. Филогенетические способы могут использоваться в комбинации с методами на основе сходства последовательностей для улучшения точности прогнозирования принадлежности или таксономического определения. В настоящей работе древовидная топология и узловая структура используются для увеличения разрешающей способности анализа. При указанном подходе авторы анализируют последовательности нуклеиновых кислот с применением одного из многочисленных методов на основе сходства последовательностей и действенных филогенетических способов, которые хорошо известны специалистам в данной области техники, в том числе, но не ограничиваясь перечисленными, филогенетической реконструкции методом максимального правдоподобия (см., например, Liu K, Linder CR, and Warnow T. 2011. RAxML and FastTree: Comparing Two Methods for Large-Scale Maximum Likelihood Phylogeny Estimation. PLoS ONE 6: e27731. McGuire G, Denham MC, and Balding DJ. 2001. Models of sequence evolution for DNA sequences containing gaps. Mol. Biol. Evol 18: 481-490. Wróbel B. 2008. Statistical measures of uncertainty for branches in phylogenetic trees inferred from molecular sequences by using model-based methods. J. Appl. Genet. 49: 49-67). Прочтения последовательностей располагают в референсной филогенетической системе, содержащей подходящие референсные последовательности. Определение приналежности осуществляют на основании расположения прочтения на филогенетическом дереве. Определенность или значимость установленной принадлежности OTU определяют на основе сходства последовательностей OTU с референсной последовательностью нуклеиновых кислот, и близости последовательности OTU к одной или нескольким референсным последовательностям в филогенетической системе. Например, специфичность определения таксономической принадлежности определяют со степенью достоверности на уровне семейства, рода, вида или штамма, при этом степень достоверности основана на положении ветвей с бутстреп-поддержкой на референсном филогенетическом дереве относительно расположения последовательности исследуемой OTU.

[0298] Распределение клад

[0299] Возможность идентификации по 16S-V4 принадлежности OTU к конкретному виду зависит отчасти от разрешающей способности области 16S-V4 гена 16S для конкретного вида или группы видов. Как плотность доступных референсных последовательностей 16S для разных областей указанного дерева, так и природная вариабельность гена 16S у разных видов определяет точность таксономической классификации. С учетом топологической природы филогенетического дерева и того факта, что указанное дерево отражает иерархические взаимоотношения OTU, основанные на сходстве их последовательностей и базовой эволюционной модели, таксономическая классификация прочтения может быть распространена на более высокий уровень с применением основанной на кладах процедуры определения принадлежности (таблица 1). При применении указанного подхода клады определяют на основании топологии филогенетического дерева, сконструированного на основании полноразмерных последовательностей 16S с применением максимального правдоподобия или других филогенетических моделей, известных специалистам в области филогенетики. Клады конструируют для подтверждения того, что все OTU в определенной кладе: (i) в пределах определенного числа узлов с бутстреп-поддержкой друг от друга (обычно, 1-5 значений бутстрепа), и (ii) отличаются не более чем на 5% в отношении генетического сходства. OTU, принадлежащие одной кладе, можно определить как генетически и филогенетически отличные от OTU другой клады на основании данных секвенирования 16S-V4. OTU, попадающие в одну кладу, являются эволюционно близкородственными и могут быть отличимы или неотличимы друг от друга при применении данных секвенирования 16S-V4. Мощность основанного на кладах анализа заключается в том, что представители одной клады, благодаря эволюционному родству, предположительно играют аналогичные функциональные роли в экогруппе микроорганизмов, например, обнаруживаемых в кишечнике человека. Композиции, где одни виды замещены другими из той же клады, предположительно сохраняют консервативную экологическую функцию и, соответственно, подходят для применения в настоящем изобретении.

[0300] Примечательно, что последовательности 16S из изолятов определенных OTU филогенетически располагаются в соответствующих кладах, что иногда противоречит определению до вида и рода на основе микробиологических методов, которое может предшествовать определению на основе 16S. Расхождения между таксономическим определением на основании микробиологических характеристик относительно определения на основе генетического секвенирования известны из литературы.

Пример 13: Проращивание спор

[0301] Проращивание споровой фракции увеличивает число жизнеспособных спор, которые растут на разных типах сред. Для проращивания популяции спор образец перемещают в анаэробную камеру, ресуспендируют в предварительно восстановленном ФСБ, перемешивают и инкубируют в течение 1 часа при 37°С для обеспечения прорастания. Способствующие прорастанию вещества могут включать аминокислоты (например, аланин, глицин), сахара (например, фруктоза), нуклеозиды (например, инозин), соли желчных кислот (например, холат и таурохолат), катионы металлов (например, Mg2+, Ca2+), жирные кислоты и длинноцепочечные алкиламины (например, додециламин, «Germination of bacterial spores with alkyl primary amines» J. Bacteriology, 1961). Указанные смеси или более сложные природные смеси, такие как сок рубца или бычья желчь, могут использоваться для индуцирования прорастания. Бычья желчь представляет собой дегидратированную бычью желчь, состоящую из жирных кислот, желчные кислоты, неорганические соли, сульфаты, желчные пигменты, холестерин, муцин, лецитин, глюкуроновые кислоты, порфирины и мочевину. Прорастание может также осуществляться в ростовой среде, такой как предварительно восстановленная среда BHIS с бычьей желчью для прорастания, в которой за счет BHIS (порошок сердечно-мозгового бульона (37 г/л), дрожжевого экстракта (5 г/л), L-цистеина HCl (1 г/л)) обеспечиваются пептиды, аминокислоты, неорганические ионы и сахара в комплексных смесях BHI и дрожжевых экстрактах, а бычья желчь обеспечивает дополнительные способствующие прорастанию желчные кислоты.

[0302] Кроме того, для проращивания спор может применяться давление. Выбор способствующих прорастанию веществ могут варьировать в зависимости от требуемого микроорганизма. Для разных видов требуются разные способствующие прорастанию вещества; и разные способствующие прорастанию вещества могут требоваться для оптимального прорастания разных изолятов одного и того же вида. Наконец, важно разводить смесь до посева, поскольку некоторые способствующие прорастанию вещества ингибируют рост микроорганизмов в вегетативном состоянии. Например, было показано, что алкиламины должны быть нейтрализованы анионными липофилами для стимуляции оптимального роста. Желчные кислоты могут также ингибировать рост некоторых организмов, несмотря на то, что они способствуют их прорастанию, и их необходимо разводить перед посевом для получения жизнеспособных клеток.

[0303] Например, раствор BHIS/бычьей желчи используют в качестве способствующего прорастанию вещества; он содержит 0,5X среды BHIS с 0,25% бычьей желчи (дегидратированной бычьей желчи), где 1× среда BHIS содержит на литр раствора следующее: 6 г сердечно-мозгового бульона из сухого вещества, 7 г пептического гидролизата животной ткани, 14,5 г панкреатического гидролизата казеина, 5 г дрожжевого экстракта, 5 г хлорида натрия, 2 г глюкозы, 2,5 г динатрия фосфата и 1 г цистеина. Кроме того, Ca-ДПК представляет собой способствующее прорастанию вещество и содержит 40 мМ CaCl₂ и 40мМ дипиколиновой кислоты (ДПК). Сок рубца (Bar Diamond, Inc.) также представляет собой способствующее прорастанию вещество. Искусственный желудочный сок (Ricca Chemical) представляет собой способствующее прорастанию вещество и состоит из 0,2% (масса/объем) хлорида натрия в 0,7% (об./об.) соляной кислоты. Муциновая среда представляет собой способствующее прорастанию вещество, и ее получают путем добавления следующих компонентов к 1 л дистиллированной стерильной воды: 0,4 г KH₂PO₄, 0,53 г Na₂HPO₄, 0,3 г NH₄Cl, 0,3 г NaCl, 0,1 г MgCl₂ × 6H₂O, 0,11 г CaCl₂, 1 мл раствора щелочных микроэлементов, 1 мл раствора кислых микроэлементов, 1 мл витаминного раствора, 0,5 мг резазурина, 4 г NaHCO₃, 0,25 г Na₂S × 9 H₂O. Растворы микроэлементов и витаминов получали согласно существующему описанию (Stams et al., 1993). Все компоненты автоклавировали, за исключением витаминов, которые стерилизовали фильтрацией. К базовой среде добавляли 0,7% (об./об.) осветленного стерильного сока рубца и 0,25% (об./об.) коммерческого свиного желудочного муцина (тип III; Sigma), очищенного осаждением в этаноле согласно существующему описанию (Miller & Hoskins, 1981). Указанная среда в настоящем документе называется муциновой средой.

[0304] Фетальная бычья сыворотка (Gibco) может использоваться в качестве способствующего прорастанию вещества, и содержит 5% термоинактивированной ФБС, в забуференном фосфатом солевом растворе (ФСБ, Fisher Scientific), содержащем 0,137M хлорида натрия, 0,0027M хлорида натрия, 0,0119M фосфатного буфера. Тиогликолят представляет собой способствующее прорастанию вещество согласно существующему описанию (Kamiya et al Journal of Medical Microbiology 1989) и содержит 0,25M (pH10) тиогликолята натрия. Раствор додециламина, содержащий 1мМ додециламин в ФСБ, представляет собой способствующее прорастанию вещество. Раствор сахара может использоваться в качестве способствующего прорастанию вещества и содержит 0,2% фруктозы, 0,2% глюкозы и 0,2% маннита. Раствор аминокислот может также применяться в качестве способствующего прорастанию вещества; он содержит 5 мМ аланин, 1 мМ аргинин, 1 мМ гистидин, 1 мМ лизин, 1 мМ пролин, 1 мМ аспарагин, 1 мМ аспарагиновой кислоты, 1 мМ фенилаланин. Способствующая прорастанию смесь, называемая здесь Germix 3, может представлять собой способствующее прорастанию вещество; она содержит 5мМ аланин, 1мМ аргинин, 1мМ гистидин, 1мМ лизин, 1мМ пролин, 1мМ аспарагин, 1 мМ аспарагиновой кислоты, 1мМ фенилаланин, 0,2% таурохолата, 0,2% фруктозы, 0,2% маннита, 0,2% глюкозы, 1мМ инозин, 2,5 мМ Ca-ДПК и 5мМ KCl. Среда BHIS + ДПК представляет собой способствующую прорастанию смесь и содержит среду BHIS и 2мМ Ca-ДПК. Супернатант отработанной среды от Escherichia coli, называемый здесь EcSN, представляет собой способствующее прорастанию вещество; его получают путем культивирования E. coli MG1655 на среде SweetB/Fos с инулином в анаэробных условиях в течение 48 часов, осаждения клеток центрифугированием при 20000 ОСЦ в течение 20 минут, сбора супернатанта и нагревания до 60°C на протяжении 40 минут. Наконец, указанный раствор стерилизуют фильтрацией и используют в качестве способствующего прорастанию раствора.

Пример 14: Выбор сред для роста

[0305] Важно подобрать подходящие среды для поддержания роста, в том числе предпочтительные источники углерода. Например, некоторые организмы предпочитают сложные сахара, такие как целлобиоза, простым сахарам. Примеры сред, используемых для выделения спорулирующих организмов, включают EYA, BHI, BHIS и GAM (см. ниже полные названия и ссылки). Ряд разведений высевают для подтверждения того, что на некоторых планшетах образуются хорошо изолированные колонии для анализа, или как вариант, с планшетов с плотными колониями может быть взять соскоб и суспендирован в ФСБ для получения смешанного разнообразного сообщества.

[0306] Планшеты инкубируют в анаэробных условиях или в аэробных условиях при 37°C в течение 48-72 или более часов, при ориентации на анаэробные или аэробные спорообразующие бактерии, соответственно.

[0307] Твердые среды для планшетов включают:

- Анаэробную среду Гифу (GAM, Nissui) без декстрозы с добавлением фруктоолигосахариды/инулина (0,4%), маннита (0,4%), инулина (0,4%), или фруктозы (0,4%), или их комбинации.

- Модифицированную Sweet GAM [Анаэробная среда Гифу (GAM, Nissui)], с добавлением глюкозы, целлобиозы, мальтозы, L-арабинозы, фруктозы, фруктоолигосахаридов/инулина, маннита и лактата натрия)

- Кровяной агар для Brucella (BBA, Atlas, Handbook of Microbiological Media, 4th ed, ASM Press, 2010)

- ФЭА-среду с овечьей кровью (Anaerobe Systems; 5% агар с овечьей кровью с фенилэтиловым спиртом)

- Яично-желточный агар (EYA) (Atlas, Handbook of Microbiological Media, 4th ed, ASM Press, 2010)

- Сульфитный молочный агар с полимиксином (Mevissen-Verhage et al., J. Clin. Microbiol. 25:285-289 (1987))

- Муциновый агар (Derrien et al., IJSEM 54: 1469-1476 (2004))

- Полигалактуронатный агар (Jensen & Canale-Parola, Appl. Environ. Microbiol. 52:880-997 (1986))

- M2GSC (Atlas, Handbook of Microbiological Media, 4^th ed, ASM Press, 2010)

- Агар M2 (Atlas, Handbook of Microbiological Media, 4^th ed, ASM Press, 2010) с добавлением крахмала (1%), маннита (0,4%), лактата (1,5 г/л) или лактозы (0,4%)

- Sweet B - Сердечно-мозговой агар (Atlas, Handbook of Microbiological Media, 4^th ed, ASM Press, 2010) с добавлением дрожжевого экстракта (0,5%), гемина, цистеина (0,1%), мальтозы (0,1%), целлобиозы (0,1%), растворимого крахмала (Sigma, 1%), морфолинпропансульфоновая кислота (MOPS) (50мМ, pH 7).

- ПДА с салицином (пептонно-дрожжевой агар с добавлением салицина) (Atlas, Handbook of Microbiological Media, 4^th ed, ASM Press, 2010).

- Модифицированный сердечно-мозговой бульон (M-BHI) [[сладкий и кислый]] содержит на литр: 37,5 г порошка сердечно-мозгового бульона (Remel), 5 г дрожжевого экстракта, 2,2 г мясного экстракта, 1,2 г экстракта печени, 1 г цистеина HCl, 0,3 г тиогликолята натрия, 10 мг гемина, 2 г растворимого крахмала, 2 г ФОС/инулина, 1 г целлобиозы, 1 г L-арабинозы, 1 г маннита, 1 Na-лактата, 1 мл Tween 80, 0,6 г MgSO4×7H2O, 0,6 г CaCl2, 6 г(NH4)2SO4, 3 г KH2PO4, 0,5 г K2HPO4, 33 мМ уксусную кислоту, 9мМ пропионовую кислоту, 1 мМ изомасляную кислоту, 1 мМ изовалериановую кислоту, 15 г агара, и после автоклавирования добавляют 50 мл 8% раствора NaHCO₃ и 50 мл 1M MOPS-KOH (pH 7).

- Агар для Eubacterium по Noack-Blaut (см. Noack et al. J. Nutr. (1998) 128:1385-1391)

- Агар BHIS az1/ge2 - BHIS az/ge (Reeves et. al. Infect. Immun. 80:3786-3794 (2012)) [Сердечно-мозговой агар (Atlas, Handbook of Microbiological Media, 4^th ed, ASM Press, 2010) с добавлением дрожжевого экстракта 0,5%, цистеина 0,1%, 0,1% целлобиозы, 0,1% инулина, 0,1% мальтозы, азтреонама 1 мг/л, гентамицина 2 мг/л]

- BHIS CInM az1/ge2- BHIS CInM [Сердечно-мозговой агар (Atlas, Handbook of Microbiological Media, 4^th ed, ASM Press, 2010) с добавлением дрожжевого экстракта 0,5%, цистеина 0,1%, 0,1% целлобиозы, 0,1% инулина, 0,1% мальтозы, азтреонама 1 мг/л, гентамицина 2 мг/л]

Пример 15: Очищение и выделение спорообразующей фракции из экскрементов

[0308] Для очищения и избирательного выделения эффективных спор из фекального материала донорский материал сначала смешивают с солевым раствором с применением устройства гомогенизации (например, лабораторного блендера) для получения 20% суспензии (масса/объем). Добавляют 100% этанол в качестве инактивирующей обработки, продолжающейся от 10 секунд до 1 часа. Конечная концентрация спирта может варьировать от 30-90%, предпочтительно 50-70%. Выполняют высокоскоростное центрифугирование (3200 ОСЦ в течение 10 мин) для удаления растворителя; осадок сохраняют и промывают. Затем, после того как промытый осадок ресуспендирован, проводят этап центрифугирования на низкой скорости (200 ОСЦ в течение 4 мин) для удаления растительных частиц большого размера, и сохраняют супернатант, содержащий споры. Выполняют высокоскоростное центрифугирование (3200 ОСЦ в течение 10 мин) супернатанта для концентрирования спорового материала. Затем промывают и ресуспендируют осадок для получения 20% суспензии. Указанная суспензия представляет собой обработанный этанолом состав со спорами. Концентрированную суспензию отделяют в градиенте плотности, например, в градиенте CsCl, сахаразы или с использованием их комбинации, с получением обработанного этанолом очищенного в градиенте состава со спорами. Например, очищение в градиенте CsCl проводят, загружая 20% объема суспензии спор сверху на 80% объема последовательного градиента CsCl (масса/объем), содержащего уровни 64%, 50%, 40% CsCl (масса/объем), и центрифугируя в течение 20 минут на 3200 ОСЦ. Затем споровую фракцию пропускают через градиент сахарозы с уровнями 67%, 50%, 40% и 30% (масса/объем). При центрифугировании в качающемся бакет-роторе в течение 10 мин при 3200 ОСЦ. Споры остаются в основном в 30% и 40% фракциях сахарозы. Нижнюю споровую фракцию (фиг. 2) извлекали и промывали с получением концентрированного обработанного этанолом очищенного в градиенте состава со спорами. Используя светоотражающие свойства спор, наблюдаемые при применении фазово-контрастной микроскопия (споры яркие и отражают свет, в то же время проросшие споры и вегетативные клетки выглядят темными), можно наблюдать обогащение споровой фракцией бактериальных клеток из суспензии фекалий (фиг. 3, слева) по сравнению с обработанным этанолом очищенном в градиенте CsCl составом со спорами (фиг. 3, в центре) и обработанным этанолом очищенном в градиенте CsCl и в градиенте сахарозы составом со спорами (фиг. 3, справа).

[0309] Кроме того, рост спор после обработки способствующим прорастанию веществом может также использоваться для количественного определения жизнеспособной популяции спор. Вкратце, образцы инкубировали со способствующим прорастанию веществом (бычья желчь, 0,5% , до 1 часа), разводили и высевали в анаэробных условиях на BBA (кровяной агар для Brucella) или аналогичную среду (см., например, примеры 4 и 5). Точечно отбирали индивидуальные колонии и выделяли ДНК для полноразмерного 16S-секвенирования для идентификации видового состава (см., например, примеры 2 и 3). Анализ показал, что всего присутствовало 22 вида (таблица 2), большинство из которых присутствует и в материале, очищенном с применением градиента, так и в материале, очищенном без применения градиента, что указывает на отсутствие сдвига или на присутствие несущественного сдвига экогруппы в результате очищения в градиенте. Подсчет выхода спор демонстрирует эффективное выделение 38% спор исходного фекального материала, как показывает прорастание и посев спор на BBA или измерение уровня ДПК в образце.

Пример 16: Бактериальные композиции предотвращают инфекцию C. difficile в модели на мышах

[0310] Для тестирования терапевтического потенциала бактериальных композиций использовали модель на мышах профилактики инфекции C. difficile (модель на основе Chen, et al., A mouse model of Clostridium difficile associated disease, Gastroenterology 135(6):1984-1992). Две клетки, каждая с пятью мышами, использовали для тестирования для каждой группы эксперимента. Все мыши получали коктейль антибиотиков, состоящий из 10% глюкозы, канамицина (0,5 мг/мл), гентамицина (0,044 мг/мл), колистина (1062,5 ед/мл), метронидазола (0,269 мг/мл), ципрофлоксацина (0,156 мг/мл), ампициллина (0,1 мг/мл) и ванкомицина (0,056 мг/мл) в питьевой воде с -14 по -5 день включительно, и дозу 10мг/кг клиндамицина через оральный зонд на -3 день. На -1 день они получали либо тестируемый состав, либо контроль-носитель через оральный зонд. На 0 день их стимулировали введением приблизительно 4,5 log10 КОЕ C. difficile (ATCC 43255) через оральный зонд. Необязательно группа положительного контроля получала ванкомицин с -1 по 3 день помимо антибиотика и описанной выше стимуляции C. difficile. Экскременты собирали из клеток для анализа носительства бактерий, смертность оценивали каждый день с 0 по 6 день, и оценивали массу тела и последующее изменение массы тела у животного, при этом снижение массы тела считали связанным с инфекцией C. difficile. Смертность и уменьшение снижения массы тела при применении тестируемого состава по сравнению с основой использовали для оценки успешности применения тестируемого состава. Кроме того, проводили оценку симптомов C. difficile ежедневно, с -1 по 6 день включительно. Клинический показатель присваивали по шкале от 0 до 4, комбинируя показатели внешнего вида (0-2 пункта на основании нормального внешнего вида, сгорбленности, пилоэрекции или летаргического состояния) и клинические признаки (0-2 пункта на основании нормального внешнего вида, мокрого хвоста, пониженной на ощупь температуры или изоляции от других животных).

[0311] В нестимулированной контрольной группе животных стимулировали C. difficile. В группе положительного контроля с ванкомицином животные получали дозу C. difficile и лечение ванкомицином с -1 по 3 день включительно. Отрицательный контроль получал через зонд только ФСБ без бактерий. В экспериментальных группах тестировали разведения 1×, 0,1×, 0,01× происходящие из состава с обработанными этанолом спорами от одного донора (см., например, пример 6) или термообработанные экскременты, полученные путем нагревания 20% суспензии в течение 30 минут при 80°C. Дозы для подсчитанных КОЕ определяли по конечным обработанным этанолом спорам; вводили разведения от общего числа спор, дозы 1×, 0,1×, 0,01× споровой смеси для обработанной этанолом фракции, и дозу 1× для термообработанной фракции.

[0312] Снижение массы тела и смертность оценивали на 3 день. У отрицательного контроля, получавшего только C. difficile, наблюдалась 20% смертность и снижение массы тела на 3 день, тогда как у положительного контроля, получавшего 10% суспензию фекалий человека, не наблюдалось смертей или снижения массы тела на 3 день (Таблица 3). Обработанные EtOH экскременты предотвращают смертность и снижение массы тела в трех разведениях, а термообработанная фракция оказывала защитный эффект в единственной протестированной дозировке. Эти данные указывают на то, что споровая фракция эффективна для предотвращения инфекции C. difficile у мышей.

Пример 17: Модель профилактики и предотвращения рецидивов на хомяках

[0313] Предыдущие исследования на хомяках с применением токсигенных и нетоксигенных штаммов C. difficile показали, что модель на хомяках подходит для изучения рецидивов после лечения антибиотиками и эффектов профилактического лечения флорой слепой кишки при инфекции C. difficile (Wilson et al. 1981, Wilson et al. 1983, Borriello et al. 1985) и, в более широком смысле, инфекционной болезни желудочно-кишечного тракта. Для демонстрации профилактического применения тестируемого состава для облегчения инфекции C. difficile используют следующую модель на хомяках. В профилактической модели клиндамицин (10мг/кг п/к) вводят на -5 день, тестируемый состав или контроль вводят на -3 день, а стимуляция C. difficile происходит на 0 день. В группе положительного контроля затем вводили ванкомицин на 1-5 день (а контроль-носитель вводили на -3 день). Экскременты собирают на -5, -4, -1, 1, 3, 5, 7, 9 день и оценивают носительство и снижение уровня патогена в образцах фекалий с помощью микробиологических методов, 16S-секвенирования или других способов, используемых специалистами в данной области техники. Смертность оценивают на протяжении эксперимента в течение 21 дня после стимуляции C. difficile. Кривые процента выживаемости показывают, что обработанные этанолом споры и обработанные этанолом очищенные в градиенте споры оказывают лучший защитный эффект на хомяков по сравнению с ванкомициновым контролем и контролем-носителем.

[0314] См. фиг. 4: Профилактическая модель с обработанным этанолом составом со спорами и обработанным этанолом очищенным в градиенте составом со спорами.

[0315] В модели предотвращения рецидива хомяков стимулируют токсигенными штаммами C. difficile на 0 день, вводят клиндамицин через оральный зонд на 1 день и дозируют ванкомицином на 2-6 день. Затем вводят экспериментальное или контрольное лечение на 7, 8 и 9 день. Состав хомяков для каждой группы включал 8 хомяков на группу. Фекальный материал собирают на -1, 1, 3, 5, 7, 10 и 13 день и оценивают смертность у хомяков на протяжении всего эксперимента. Кривые выживаемости используют для оценки успешности применения тестируемого состава, например, обработанных этанолом спор, или обработанных этанолом очищенных в градиенте спор относительно контрольного лечения для предотвращения смертности у хомяков. Кривые выживаемости демонстрируют максимальную эффективность обработанных этанолом очищенных в градиенте спор, затем идут обработанные этанолом споры. Оба варианта лечения увеличивали процент выживаемости по сравнению с лечением только ванкомицином.

[0316] См. фиг. 5: Модель предотвращения рецидива с обработанными этанолом спорами и обработанными этанолом очищенными в градиенте спорами

Пример 18: Клиническое лечение рецидивирующей C. difficile у пациентов

[0317] Для оценки эффективности тестируемого состава (например, обработанных этанолом составов со спорами, см. пример 15) для лечения рецидивирующей C. difficile у пациентов-людей выполняли следующую процедуру: брали экскременты от здорового донора, инактивировали с применением описанного ниже протокола обработки этанолом состава со спорами, и лечили рецидивирующую C. difficile у пациентов, имеющих такие показания. Проводили скрининг общего анамнеза не являющихся родственниками доноров на отсутствие хронических медицинских состояний (в том числе воспалительного заболевания кишечника; синдрома раздраженного кишечника; целиакии; или любых злокачественных новообразований ЖКТ или полипоза в анамнезе), отсутствие факторов риска в отношении передаваемых инфекций, отсутствие использования антибиотиков в течение предшествуюших 6 месяцев, и отрицательные результаты лабораторных анализов на передаваемые с кровью патогены (ВИЧ, ТЛВЧ, ВГС, ВГВ, ЦМВ, ВГА и Treponema pallidum) и фекальные бактериальные патогены (Salmonella, Shigella, Yersinia, Campylobacter, E. coli 0157), яйца паразитов и паразиты, и другие инфекционные агенты (Giardia, Cryptosporidium Cyclospora, Isospora) до сдачи стула.

[0318] Экскременты донора быстро замораживали после получения и готовили образцы для тестирования. Для использования приблизительно 75 г экскрементов донора размораживали и ресуспендировали в 500 мл небактериостатического нормального солевого раствора и перемешивали в одноразовом стеклянном или пластиковом блендере. Полученную суспензию последовательно проводили через стерильные одноразовые сита, устраняющие частицы размером 600, 300 и 200 микрон. Затем суспензию непродолжительно центрифугировали (200 ОСЦ в течение 4 мин) для разделения волокнистого материала и частиц, и супернатант (содержащий бактериальные клетки и споры) переносили в новый контейнер. Этанол добавляли до конечной концентрации 50% и полученную ~1500 мл суспензию инкубировали при комнатной температуре на протяжении 1 часа при непрерывном перемешивании для инактивации вегетативных бактериальных клеток. В середине инактивации суспензию переносили в новый сосуд для подтверждения полного контакта с этанолом. Твердое вещество осаждали центрифугированием и троекратно промывали нормальным солевым раствором для удаления остаточного этанола. Полученный осадок ресуспендировали в минимальном объеме 100% стерильного глицерина чистоты USP и наполняли приблизительно 30 капсул для отсроченного высвобождения размера 0 (гипромеллозные капсулы DRcaps, Capsugel, Inc.), по 0,65 мл суспензии в каждую капсулу. Капсулы немедленно закрывали и помещали на замораживающий алюминиевый блок с сухим льдом при температуре -80°C для замораживания. Замороженные капсулы, в свою очередь, заключали в капсулы DRcaps размера 00 для повышения стабильности капсул, наносили метки и немедленно помещали на хранение при температуре < -65°C. Конечный продукт хранили при < -65°C до дня и момента использования. Инкапсулированный продукт может храниться неопределенно долго при < -65°C. В день дозирования капсулы нагревали на водном льду в течение 1-2 часов для улучшения переносимости, и затем вводили с водой ad libitium.

[0319] Пациент 1 представляет собой женщину возрастом 45 лет с инфекцией C. difficile и диареей в анамнезе по меньшей мере за 1 год до лечения. Ранее она получала лечение несколькими курсами антибиотиков, после которых каждый раз возникал рецидив связанной с C. difficile диареи.

[0320] Пациент 2 представляет собой женщину в возрасте 81 года, страдавшую рецидивирующей инфекцией C. difficile на протяжении 6 месяцев до лечения, несмотря на адекватную терапию антибиотиками после каждого рецидива.

[0321] За 24 часа до начала перорального лечения терапию антибиотиками против CDAD прекращали. У каждого пациента проводили подготовку толстой кишки с целью уменьшить конкурентную микробную нагрузку в желудочно-кишечном тракте и облегчить восстановление популяции спорообразующими организмами в исследуемом продукте.

[0322] Утром первого дня лечения пациенты получали дозу в виде капсул с отсроченным высвобождением, содержащих исследуемый продукт, с водой ad libitum. Пациентов просили воздержаться от приема пищи в течение 1 часа после приема. На следующий день пациент возвращался в клинику для получения дополнительной дозы. Пациентов просили воздержаться от приема пищи в течение 4 часов до получения второй дозы и в течение 1 часа после дозирования.

[0323] Проводилось тщательное наблюдение за обеими пациентками для обнаружения признаков рецидива или нежелательных симптомов после лечения. Пациенткам звонили по телефону на 2 день, 4 день и через 1, 2 и 4 недели, и каждую пациентку опрашивали относительно общего состояния и состояния CDAD и связанных симптомов. Образцы стула собирали в исходный момент и через 1, 2, 4 и 8 недель после лечения для оценки изменений в микробиоте кишечника путем 16S-секвенирования и подсчета спор с помощью описанных ранее способов (см., например, примеры 11 и 12). На протяжении 4 недель после лечения у каждой пациентки наблюдалось постепенное улучшение без признаков рецидива C. difficile.

[0324] Шестеро других пациентов с рецидивирующей связанной с C. difficile диарей получали аналогичное лечение, рецидивы CDI отсутствовали, и не требовалось возобновление применения антибиотиков (всего 8 пациентов). Кроме того, отсутствовали связанные с лечением серьезные нежелательные явления.

Пример 19: обработка суспензии фекалий этанолом или термообработка значительно уменьшает число вегетативных клеток и приводит к обогащению спорообразующими видами

[0325] Обработка образца, предпочтительно образца фекалий человека, для инактивации или гибели по существу всех вегетативных форм бактерий, присутствующих в указанном образце, приводит к отбору и обогащению по споровой фракции. Способы инактивации могут включать нагревание, сонификацию (обработку ультразвуком), лизирование детергентами, ферментативное расщепление (например, лизоцимом и/или протеиназой K), обработку этанолом или кислотой, воздействие растворителями (тетрагидрофураном, 1-бутанолом, 2-бутанолом, 1,2 пропандиолом, 1,3 пропандиолом, бутаноатом, пропаноатом, хлороформом, простым диметилэфиром и детергентом наподобие Тритона X-100, простым диэтилэфиром), или комбинацию указанных способов. Чтобы показать эффективность индуцированной этанолом инактивации вегетативных клеток, 10% суспензию фекалий смешивали с абсолютным этанолом в соотношении 1:1 и перемешивали на вортексе в течение 1 минуты. Суспензию инкубировали при комнатной температуре в течение 30 минут, 1 ч, 4 ч или 24 ч. После инкубирования суспензию центрифугировали при 13000 об/мин в течение 5 минут для осаждения спор. Супернатант утилизируют, а осадок ресуспендируют в равном объеме ФСБ. Жизнеспособные клетки подсчитывали согласно приведенному ниже описанию.

[0326] Чтобы показать эффективность термообработки для инактивации вегетативных клеток, 10-20% суспензию фекалий инкубировали при 70°C, 80°C, 90°C или 100°C в течение 10 мин или 1 часа.

[0327] После обработки этанолом или термообработки оставшиеся жизнеспособные клетки подсчитывали после 24 часов инкубирования на планшетах путем определения зависимости титра бактерий на кровяном агаре для Brucella (BBA) от обработки и времени (см. фиг. 6). Обработка этанолом в течение 1 часа и 25 часов оказывала аналогичный эффект, уменьшая число жизнеспособных клеток приблизительно на 4 log, тогда как повышение температуры и времени воздействия высокими температурами приводит к большему уменьшению числа жизнеспособных клеток, при отсутствии детектируемых колоний при воздействии 100°C на протяжении либо 10 минут, либо 1 часа. В данном эксперименте не использовались способствующие прорастанию вещества. Через несколько дней дополнительного культивирования на планшетах несколько колоний отбирали точечным методом из обработанных образцов и идентифицировали посредством анализа 16S рРНК (см., например, примеры 11 и 12). Они включали известные спорообразующие Clostridium spp. а также виды, ранее не описанные как спорообразующие бактерии, в том числе Ruminococcus bromii и Anaerotruncus colihominis (Lawson, et al., 2004), и Eubacterium sp. (таблица 4). См. фиг. 6: Термообработка и обработка этанолом уменьшают жизнеспособность клеток

[0328] Чтобы показать, что число вегетативных клеток значительно уменьшается при обработке этанолом, известные неспорообразующие бактерии обрабатывает этанолом согласно приведенному описанию (см., например, пример 15) и определяли жизнеспособность путем посева на BBA в анаэробных условиях (см., например, пример 14). Фекальный материал от четырех независимых доноров подвергали действию температуры 60°C в течение 5 минут, а затем высевали на три типа селективных сред либо в аэробных (+ O₂), либо в анаэробных условиях (- O₂) (BBA + аэробная среда, Мак-Конки с лактозой + аэробная среда, среда для Bacteroides с желчными кислотами и эскулином + анаэробная среда) для идентификации известных неспорообразующих Enterobacteria (выживающих на агаре Мак-Конки) и бактерий группы Bacteroides fragilis (выживающих на чашках с агаром для Bacteroides с желчными кислотами и эскулином). Предел детекции данных анализов составляет приблизительно 20 КОЕ/мл. Способствующие прорастанию вещества не использовались в данном эксперименте (фиг. 7). И обработка этанолом, и термоактивации значительно снижают жизнеспособность клеток из фекального материала до порога детекции при применении лактозного агара Мак-Конки и агара BBE. Оставшиеся клетки, идентифицированные на среде BBA при культивировании в анаэробных условиях, содержат независимые от способствующих прорастанию веществ спорообразующие виды. См. фиг. 7: Уменьшение количества неспорообразующих вегетативных клеток при обработке температурой 60°C в течение 5 минут

[0329] Кроме того, при обработке этанолом, как было показано, быстро гибнут как аэробные, так и неспорообразующие анаэробные колониеобразующие единицы в 10% суспензии фекалий, как было определено путем посева на богатую среду (BBA). Уменьшение количества высеваемых КОЕ составляет 4 порядка величины за секунды, как показано на фиг. 8.

[0330] См. фиг. 8: Видно, что с течением времени обработка этанолом уменьшает число КОЕ как анаэробных, так и аэробных бактерий

Пример 20: Виды, идентифицированные и выделенные как спорообразующие бактерии при обработке этанолом

[0331] Чтобы показать, что при применении способов термообработки или обработки этанолом происходит обогащение спорообразующими видами, проводили сравнение >7000 изолятов колоний с повторностями для идентификации видов (например, идентифицировали независимым образом в нескольких составах, см. примеры 1, 2 и 3), выделенных только из суспензии фекалий, обработанной 50% этанолом или термообработанной, и не выделенных из необработанной суспензии фекалий (таблица 5). Эти данные указывают на возможность отбора спорообразующих видов из фекального материала, и идентифицируют как спорообразующие бактерии организмы, ранее не описанные как спорообразующие в литературе. В каждом случае организмы отбирали точечным методом в виде изолированных колоний, культивировали в анаэробных условиях, а затем проводили полноразмерное 16S-секвенирование для идентификации видов.

[0332] Для дальнейшей идентификации спорообразующих бактерий обработанные этанолом образцы фекалий от доноров A, B, C, D, E и F высевали на разнообразные типы твердых сред, одиночные колонии собирали точечным методом и культивировали в бульоне в формате 96-луночных планшетов (таблицы 6-11). Затем амплифицировали посредством ПЦР ген 16S рРНК и выполняли прямое циклическое секвенирование (см. примеры 11 и 12). Идентификация основана на прямых прочтениях, полученных при прямом циклическом секвенировании гена 16S рРНК.

[0333] У разных индивидуумов наблюдается неожиданная гетерогенность микробиомов (Clemente et al., 2012), что оказывает влияние на определение потенциальной эффективности различных доноров для получения подходящий споровых композиций. Описанный ниже способ подходит для скрининга доноров, в тех случаях, когда, например, целесообразно или необходимо получение конкретного количества или разнообразия спорообразующих организмов для репопуляции микробиома после лечения антибиотиками или лечения конкретного заболевания или состояния. Кроме того, такой скрининг целесообразен в случаях, когда существует потребность в проведении скрининга доноров с целью выделения микроорганизмов, способных к спорообразованию, или в случаях, когда требуется получить очищенный состав спорообразующих организмов от конкретного донора.

[0334] Общее число спор также представляет собой меру активности конкретного донорского материала или очищенного состава со спорами, и критически важен для определения качества материала, необходимого для обеспечения требуемого уровня дозы. Для исследования вариабельности общего числа спор донорские образцы получали и обрабатывали согласно описанию в предыдущих примерах. Затем определяли число спор в материалах донора в КОЕ/г путем культивирования на чашках со средой в различных титрах для определения содержания спор в донорском материале. Кроме того, для оценки содержания спор использовали анализ ДПК (обозначено как «споровый эквивалент») согласно описанию в примере 21. Как видно на фиг. 9, у индивидуальных доноров в течением времени наблюдается различие, составляющее 2log, а между разными донорами возможны отличия, составляющие до 3log. Одной из возможных причин различий в содержании спор является то, что нежизнеспособные споры и неспособные к прорастанию споры не выявляются при посеве, однако содержат достаточно ДПК для измерения. Другая возможность заключается в том, что из-за межвидовой вариабельности содержания ДПК в спорах некоторые сложные смеси содержат богатые ДПК споры, тогда как другие смеси содержат бедные ДПК споры. Отбор доноров, обеспечивающих высокое число спор, важен для определения продуктивности выделения спор из образцов донорских фекалий путем идентификации предпочтительных доноров.

[0335] См. фиг. 9: Концентрация спор в донорском материале от клинических доноров

[0336] Свежий образец фекалий от донора F обрабатывали согласно описанию в примере 15 для получения обработанной этанолом споровой фракции, проращивали обработкой BHIS с бычьей желчью в течение 1 ч согласно описанию (см., например, Пример 13), а затем высевали на разнообразные среды (см., например, пример 14). Колонии высевали точечным методом, следя за тем, чтобы несколько колоний каждого морфологически отличного типа попало в каждую чашку для захвата максимально возможного разнообразия. Колонии подсчитывают на чашках с каждым типом среды с хорошо изолированными колониями для подсчета числа колониеобразующих единиц на мл (таблица 12). Колонии высевали точечным методом на одну из нескольких жидких сред, определяли 16S рРНК последовательности (см., например, примеры 11 и 12) и анализировали согласно описанию выше. Число уникальных OTU для каждого типа среды приведено внизу, первыми указаны среды с наибольшим числом уникальных OTU (таблица 12). Комбинации 3-5 первых 5 типов сред обеспечивают разнообразие, а некоторые другие могут быть выбраны для нацеливания на конкретные представляющие интерес виды. Колониеобразующие единицы могут быть подсчитаны для определенного вида с использованием данных 16S, и указанные значения могут использоваться для определения того, представлен ли на достаточной уровне определенный организм. Совокупность спор от донора F согласно определению в данном эксперименте включает указанные 52 вида согласно данным 16S-секвенирования (таблица 12).

[0337] Для скрининга доноров-людей на присутствие разнообразия спорообразующих бактерий и/или на специфические споробразующие бактерии, образцы фекалий подготавливали с применением способствующих прорастанию веществ и селективных методов культивирования, собирали колонии точечным методом (см., например, примеры 13 и 14) и анализировали разнообразие 16S согласно приведенному описанию (см. примеры 11 и 12). Оценка разнообразия у донора может включать подсчет КОЕ/мл устойчивых к этанолу клеток на среде определенного типа, или КОЕ/мл определенного вида, с применением анализа 16S полученных на указанной среде точечным методом колоний для определения уровня спор определенного представляющего интерес вида. Указанный тип основанного на культивировании анализа может быть дополнен независимыми от культивирования способами, такими как кПЦР с зондами, специфическими в отношении видов или родов, представляющих интерес, или метагеномное секвенирование составов со спорами, или 16S-профилирование составов со спорами с применением методов секвенирования вариабельных областей от Illumina 16S (см., например, примеры 11 и 12).

Пример 21: Количественное определение концентрации спор с применением анализа на ДПК

[0338] Способы оценки концентрация спор в сложных смесях, как правило, требуют разделения и отбора спор с последующим культивированием индивидуальных видов для определения числа колониеобразующих единиц. На существующем уровне техники отсутствуют способы количественного проращивания всех спор сложной смеси, поскольку для многих видов не были идентифицированы подходящие способствующие прорастанию вещества. Кроме того, споруляция предположительно является стохастическим процессом в результате эволюционного отбора, что означает, что не все споры одного вида прорастают с одинаковым откликом на воздействие способствующим прорастанию веществом в некоторой концентрации и с некоторой продолжительностью и другие условия окружающей среды. Как вариант, был разработан способ количественного определения споровых частиц в образце на основе ключевого метаболита бактериальных спор, дипиколиновой кислоты (ДПК), позволяющий избежать влияния на результаты фекальных загрязняющих примесей. В указанном анализе использован тот факт, что ДПК хелатирует Тербий 3+ с образованием люминесцентного комплекса (Fichtel et al., FEMS Microbiology Ecology, 2007; Kort et al., Applied and Environmental Microbiology, 2005; Shafaat and Ponce, Applied and Environmental Microbiology, 2006; Yang and Ponce, International Journal of Food Microbiology, 2009; Hindle and Hall, Analyst 1999). При флуоресцентном анализе с временным разрешением детектируется люминесценция тербия в присутствии ДПК, что обеспечивает количественную оценку концентрации ДПК в растворе.

[0339] Для проведения анализа 1 мл оцениваемого спорового стандарта переносили в микроцентрифужную пробирку объемом 2 мл. Образцы центрифугировали на 13000 ОСЦ в течение 10 мин, и образец промывали в 1 мл стерильной деионизированной H₂O. Еще раз промывали, повторяя центрифугирование. Переносили 1 мл раствора в пробирки Хангейта и автоклавировали образцы в режиме пара в течение 30 минут при 250°C. Добавляли 100 мкл 30 мкМ раствора TbCl₃ (400мМ ацетата натрия, pH 5, 0, 30 мкМ TbCl₃) к образцу. Получали серийные разведения автоклавированного материала и измеряли флуоресценцию каждого образца с возбуждением светом на 275 нм и измерением излучения на длине волны 543 нм со временем интегрирования 1,25 мс и задержкой 0,1 мс.

[0340] Очищенные споры получали согласно существующему описанию (например, см. http://www.epa.gov/pesticides/способы/MB-28-00.pdf). Готовили серийные разведения очищенных спор из культур C. bifermentans, C. sporogenes и C. butyricum и оценивали путем посева на среду BBA и инкубирования в течение ночи при 37°С для определения значения КОЕ/мл. На фиг. 10 представлена линейная зависимость у разных спорообразующих бактерий, с изменениями, составляющими несколько логарифмических единиц, подтверждающая, что анализ ДПК подходит в качестве способа оценки содержания спор.

[0341] См. фиг. 10: Линейный диапазон анализа ДПК по сравнению с подсчетом числа КОЕ/мл

[0342] Расхождение между оценкой содержания спор по числу КОЕ способных к прорастанию спор и оценкой при анализе ДПК для сложных популяций спор имеет большое значение для определения активности обработанного этанолом состава со спорами при клиническом применении. В таблице AC приведены данные по содержанию спор для 3 разных обработанных этанолом составов со спорами, использованных для успешного лечения 3 пациентов страдающих рецидивирующей инфекцией C. difficile. Содержание спор для каждого состава со спорами определяют с применением двух описанных способов.

Таблица AC. Количественное определение спор для обработанных этанолом составов со спорами с использованием анализа споровых КОЕ (СКОЕ) и анализа ДПК

Состав Капсулы СКОЕ / 30 Капсулы ДПК SEq / 30 Отношение СКОЕ / ДПК Состав 1 4,0 × 10⁵ 6,8 × 10⁷ 5,9 × 10^-3 Состав 2 2,1 × 10⁷ 9,2 × 10⁸ 0,023 Состав 3 6,9 × 10⁹ 9,6 × 10⁹ 0,72

[0343] Очевиден тот факт, что содержание спор в 30 капсулах значительно варьирует. При оценке по способным к прорастанию СКОЕ содержание спор варьирует более чем в 10 000 раз. По оценке с применением анализа ДПК содержание спор варьирует более чем в 100 раз. В отсутствие анализа ДПК сложно установить минимальную дозу для введения пациенту. Например, в отсутствие данных анализа ДПК можно заключить, что минимальная эффективная доза спор составляет 4 × 10⁵ или менее с применением анализа СКОЕ (например, состав 1, таблица AC). Однако при использовании указанной дозы СКОЕ для нормирования доз в клинических условиях фактическая доза спор, получаемая пациентами, будет значительно ниже для других обработанных этанолом составов со спорами по оценке с применением анализа ДПК (таблица AD).

Таблица AD. Дозы ДПК в таблице AC при нормировании к 4 × 10⁵ СКОЕ на дозу

Состав СКОЕ / 30 капсул ДПК SEq / 30 капсул Доля от дозы состава 1 Состав 1 4,0 × 105 6,8 × 107 1,0 Состав 2 4,0 × 105 1,8 × 107 0,26 Состав 3 4,0 × 105 5,6 × 105 0,0082

[0344] Становится ясно, что из-за вариабельности показателей СКОЕ и ДПК в разных донорских материалах использование СКОЕ в качестве меры активности в определенных случаях будет приводить к существенному занижению дозы. Например, выбор дозы 4×10⁵ СКОЕ (измеренная эффективная доза для донорского состава 1) для продукта с составом 3 приведет к потенциальному более чем 100-кратному занижению дозы. Эта ситуация может быть исправлена только определением активности на основании анализа ДПК, лучше отражающим общее число спор в обработанном этанолом составе со спорами. Неожиданное открытие, сделанное авторами настоящего исследования, заключается в том, что анализ ДПК уникальным образом подходит для определения активности и дозировок обработанного этанолом состава со спорами.

Пример 22: Демонстрация улучшения роста при воздействии способствующим прорастанию веществом

[0345] Для повышения способности к прорастанию обработанных этанолом спор и демонстрации жизнеспособности спор споры от трех разных доноров проращивали с применением различной обработки и высевали на разные среды. Стимуляцию прорастания с применением BHIS/бычьей желчи (BHIS ox), Ca-ДПК, сока рубца (RF), искусственного желудочного сока (ИЖС), муциновой среды (Muc), фетальной бычьей сыворотки (ФБС) или тиогликолята (Thi) в течение 1 часа при 37°С в анаэробных условиях проводили согласно имеющемуся описанию (см., например, примеры 13 и 14) на образцах от двух независимых доноров (фиг. 11). Обработанную способствующим прорастанию спор веществом смесь серийно разводили и высевали на чашки с различными средами, в том числе BBA, Sweet B, Sweet B + лизоцим (2 мкг/мл), M2GSC и M2GSC + лизоцим (2 мкг/мл) согласно вышеприведенному описанию (см., например, примеры 13 и 14) для оценки прорастания спор. Подсчитывали колониеобразующие единицы и определяли титры с применением стандартных техник, известных специалистам в данной области техники. Ка видно на фиг. 11, максимальное число колониеобразующих единиц получено при обработке BHI с бычьей желчью. Указанная стимулирующая прорастание обработка также значительно увеличивает разнообразие, судя по оценке числа OTU, идентифицированных при 16S-секвенировании образцов (см., например, примеры 11 и 12) по сравнению с посевами без этапа стимуляции прорастания (фиг. 12). Как видно на фиг. 11, обработка разными способствующими прорастанию веществами оказывает варьирующие эффекты на число КОЕ от донора A (сверху слева) и донора B (снизу справа). По оси Y отложено число КОЕ спор на мл. Как видно на фиг. 12, проращивание значительно повышает разнообразие культивированных спорообразующих OTU.

[0346] Для тестирования эффекта термоактивации на стимуляцию прорастания обработанные этанолом образцы фекалий от трех разных доноров обрабатывали в течение 15 мин, воздействуя комнатной температурой, температурой 55°C, 65°C, 75°C или 85°C, а затем проращивали с применением BHIS+ Бычья желчь в течение 1 ч при 37°С и высевали на среду BBA (фиг. 13) согласно вышеприведенному описанию (см., например, примеры 13 и 14). Предварительное воздействие комнатной температурой обеспечивало получение равного или даже большего количества спор, чем воздействие более высокими температурами, для образцов от всех трех доноров. Также исследовали влияние температуры при проращивании, инкубируя образцы при комнатной температуре или при 37°C на протяжении 1 часа в анаэробных условиях до посева на BBA. Различий в количествах КОЕ для указанных двух вариантов условий не наблюдалось. Также тестировали влияние добавления лизоцима в чашки (2 мкг/мл) на образце от одного донора, используя различные температуры активации с последующим инкубированием в присутствии или в отсутствие лизоцима. Добавление лизоцима оказывало незначительный эффект при посеве на среду Sweet B или M2GSC, но меньший, чем при обработке BHIS с бычьей желчью без лизоцима в течение 1 часа (фиг. 14).

[0347] Как видно на фиг. 13, термоактивация в качестве стимулирующей прорастание обработки с применением BHIS + бычья желчь. Как видно на фиг. 14, лизоцим оказывает незначительный эффект, способствующий прорастанию.

[0348] Также исследовали время прорастания, обрабатывая 10% суспензию обработанных этанолом экскрементов от одного донора (см., например, пример 15), чем-либо из BHIS, таурохолата, бычьей желчи или Germix в течение 0, 15, 30 или 60 минут с последующим посевом на среду BHIS, EYA или BBA (см., например, примеры 13 и 14). Через 60 минут большинство КОЕ во всех использованных комбинациях прорастали и тестирование сред завершалось.

Пример 23: Демонстрация эффективности способных к прорастанию и способных к споруляции фракций обработанных этанолом спор

[0349] Для оценки способов идентификации и очищения, и для усиления (например, путем модуляции разнообразия в композициях) активной спорообразующей экогруппы, происходящей из образцов донорских фекалий, обработанную этанолом популяцию спор (согласно описанию в примере 15) дополнительно разделяли на фракции. «Способную к прорастанию фракцию» получали обработкой обработанного этанолом состава со спорами бычьей желчью, посевом на различные твердые среды с последующим, через 2 дня или 7 дней культивирования, соскобом всех выросших бактерий с чашек в 5 мл ФСБ на чашку для получения бактериальной суспензии. «Способную к споруляции фракцию» получали согласно описанию выше, за исключением того, что клеткам позволили расти на твердой среде в течение 2 дней или 7 дней (продолжительность увеличивали для обеспечения споруляции, что является обычным для протоколов споруляции), и полученную бактериальную суспензию обрабатывали 50% этанолом для получения популяции «способных к споруляции» спор, или видов, способных образовывать споры. При подготовке указанных фракций фекальный материал от донора A использовали для получения обработанного этанолом состава со спорами согласно вышеприведенному описанию в примере 15; затем содержание спор определяли анализом ДПК и КОЕ/мл при культивировании на разных средах (фиг. 15) согласно вышеприведенному описанию (см. пример 21). См. фиг. 15: Споры, изначально присутствующие в обработанном этанолом составе со спорами по оценке с применением ДПК и КОЕ/мл при культивировании на определенных средах.

[0350] Для определения фракции, которая способна к споруляции, оценивали содержание КОЕ и ДПК в 2-дневных и 7-дневных «способных к прорастанию» фракциях до и после обработки этанолом для получения споровой фракции. Бактериальные суспензии обрабатывали этанолом, проращивали с применением бычьей желчи, и высевали на те же типы сред, на которых культивировали «способную к прорастанию» фракцию. Данные по ДПК показали, что при культивировании на чашках в течение 2 и 7 дней образовывалось такое же общее количество спор. Колонии с нескольких типов сред собирали точечным методом для анализа последовательностей 16S для идентификации присутствующих спорообразующих бактерий (таблица 13).

[0351] 2-дневную «способную к прорастанию» фракцию и 7-дневную «способную к споруляции» фракцию использовали для лечения в аналитической модели профилактики на мышах согласно приведенному описанию (см., например, пример 16). В качестве контроля подготовленную 10% суспензию фекалий от донора (Донор B) также вводили мышам для моделирования трансплантации фекальной микробиоты (FMT). Снижение массы тела и смертность в различных экспериментальных и контрольных группах исследования представлены на графиках на фиг. 17 и обобщены в таблице 15, которая также содержит информацию о дозировках. Указанные данные ясно показывают, что и «способная к прорастанию» и «способная к споруляции» фракции эффективны для защиты мышей от C. difficile при стимуляции C. difficile в модели профилактики на мышах (см., например, пример 16). Эффективность указанных фракций показывает также, что присутствующие в них виды ответственны за эффективность споровой фракции, поскольку выделение фракций дополнительно уменьшает присутствие каких бы то ни было потенциальных загрязняющих примесей из исходного состава со спорами.

[0352] См. фиг. 16: Титр «способной к прорастанию» фракции через 2 дня (слева) и способной к споруляции фракции (справа), по ДПК и КОЕ/мл. «Способную к споруляции» фракцию, полученную через 7 дней роста, измеряли согласно вышеприведенному описанию с применением анализов прорастания и роста или содержания ДПК согласно вышеприведенному описанию (см. пример 21).

[0353] Виды, присутствующие в «способных к прорастанию» и «способных к споруляции» фракциях определяли посредством секвенирования полноразмерных 16S полученных точечным методом колоний и посредством 16S-секвенирования нового поколения (16S-NGS) собственно фракций. Данные для выделенных точечным методом колоний указывают на то, что виды Clostridium очень многочисленны в обеих фракциях, а данные NGS-секвенирования показывают наличие других спорообразующих организмов, которые, как правило, обнаруживаются в обработанных этанолом составы со спорами.

[0354] Результаты представлены следующим образом: см. таблицу 13. Виды, идентифицированные как «способные к прорастанию» и «способные к споруляции» с применением точечного метода выделения колоний. См. таблицу YYY. Виды, идентифицированные как «способные к прорастанию» с применением 16S-V4 NGS-секвенирования. См. таблицу ZZZ. Виды, идентифицированные как «способные к споруляции» с применением подхода 16s-V4 NGS. См. фиг. 17: В модели профилактики на мышах продемонстрировано, что «способные к прорастанию» и «способные к споруляции» составы обеспечивают защиту при стимуляции C. difficile. Каждый график отражает изменение индивидуальной массы тела мышей относительно дня -1 на протяжении эксперимента. Число смертей на протяжении эксперимента указано сверху над графиком и отражено линейным окончанием перед днем 6. На верхних панелях (слева направо) представлены группа с контролем-носителем, группа с суспензией фекалий и группа необработанного нестимулированного контроля, тогда как нижние панели соответствуют обработанному этанолом очищенному в градиенте составу со спорами; обработанному этанолом очищенному в градиенте «способному к прорастанию» составу и обработанному этанолом очищенному в градиенте «способному к споруляции» составу. См. таблицу 15: Результаты профилактической модели на мышах и информация о дозировании.

Пример 24: Эффективность объединенных донорских образцов для профилактики у мышей

[0355] Для тестирования эффективности и дозировок объединенных донорских образцов используется модель профилактики на мышах с C. difficile (например, см. пример 16) со смешанными двумя и более донорскими образцами согласно вышеприведенному описанию. Снижение массы тела и смертность при применении смешанного спорового продукта относительно спорового продукта, происходящего от одного донора при разных дозировках, определяют, эквивалентны ли две указанные схемы лечения или одна значительно эффективнее другой.

[0356] Дозировка спорового продукта, происходящего от одного или нескольких доноров, составляет от 1E4 до 1E10 КОЕ/мл. Споровый продукт получают смешиванием продуктов, происходящих от любого числа доноров в диапазоне от 1 до 10 либо в равных концентрациях, либо в других известных концентрациях.

[0357] Кроме того, указанный способ может использоваться для размножения споровой фракции для целей производства. Для целей производства обогащенную споровую фракцию (например, очищенную и обработанную EtOH фракцию образца фекалий) сохраняют в виде совокупности аликвот, формирующих банк жизнеспособных спорообразующих организмов. Аликвоту из указанного банка восстанавливают обработкой способствующим прорастанию веществом с последующим культивированием на среде и в условиях, в целом благоприятных для спорообразующих организмов и стимулирующих споруляцию. Через достаточное для размножения время размножившиеся бактерии, в том числе споры, собирают, и указанный состав растворяют или проводят термообработку для выделения споровой фракции. Указанная фракция может быть дополнительно очищена от неспоровых форм и компонентов культуральной среды. Процесс размножения, выделения спор и, необязательно, очищения может быть повторен в возрастающих объемах для получения больших количеств для дальнейшего использования. Когда собрано достаточно размноженного способного к прорастанию/способного к споруляции материала, он может быть дополнительно очищен, сконцентрирован или разведен, и/или законсервирован в виде, подходящем для дальнейшего использования, например, для клинического дозирования.

[0358] В описанный выше процесс могут быть включены характеристики, обеспечивающие возможность его дальнейшего использования, в частности, применения продукта, например, клинического применения. Получение исходной споровой фракции может проводиться в контролируемых условиях (условиях cGMP), и может быть валидировано удаление неспоровых организмов с высокой степенью надежности. Прорастание может проводиться с применением реагентов, более стандартизированных, чем природные продукты, такие как бычья желчь, например, синтетические смеси солей желчных кислот. Размножение может осуществляться с использованием сред, компоненты которых являются предпочтительными в отношении клинической безопасности, например, получены от сертифицированных животных или получены не из животных. Условия могут быть подобраны так, чтобы обеспечивать стабильные композиции спорулирующих организмов, менее подверженные загрязнению и лучше подходящих для масштабирования, например, закрытые ферментеры с мешалкой, оборудованные системой обратной связи. Спорулирующие организмы могут быть выделены из процесса с применением процедур, по отдельности или в сочетании жестко элиминирующих неспоровые элементы и другие остаточные продукты процесса, например, обработки растворителем, экстракция в двухфазной водной системе и/или продолжительная термообработка при 60°C. Консервация может включать добавление вспомогательных веществ и/или коррекцию условий таким образом, чтобы обеспечить преобразование в предпочтительную лекарственную форму, пригодную для длительного хранения, например, добавление трегалозы с последующей лиофилизацией или распылительной сушкой, дополнительного смешивания порошка с микрокристаллической целлюлозой и заключение в желатиновую капсулу с образованием подходящего для перорального дозирования продукта.

Пример 25: Приживление, стимуляция и снижение носительства патогена у пациентов, получавших лечение споровыми композициями

[0359] Для характеризации состава микробиоты пациента за 1, 2, 3, 4, и 5, 6, 7, 8, 9 и 10 недель до лечения (перед лечением) и до 4 недель после лечения использовали дополнительные геномные и микробиологические способы.

[0360] Для определения OTU, приживающихся при лечении обработанным этанолом составом со спорами у пациентов, и ответного изменения их микробиома, указанный микробиом определяли посредством секвенирования 16S-V4 до лечения (перед лечением) обработанным этанолом составом со спорами и до 25 дней после получения лечения. Например, лечение пациента 1 обработанным этанолом составом со спорами приводило к приживление OTU при лечении спорами и к стимуляции микробиома пациента (фиг. 18 и фиг. 19). К 25 дню после лечения в общем пуле микроорганизмов доминировали виды следующих таксономических групп: Bacteroides, Sutterella, Ruminococcus, Blautia, Eubacterium, Gemmiger/Faecalibacterium и не образующие спор Lactobacillus (см. конкретные OTU в таблице 16 и таблице 2). Первые два рода представляют OTU, не образующие спор, а последние таксономические группы представляют OTU, которые, предположительно, образуют споры.

[0361] Лечение пациентов обработанным этанолом составом со спорами приводит к формированию экогруппы микроорганизмов, обладающей большим разнообразием, чем до лечения (фиг. 18). Характеризация микробиома на основе генома подтверждала приживление диапазона OTU, которые отсутствовали у пациента до лечения (таблица 16). Указанные OTU содержали как бактериальные виды, способные или не способные образовывать споры, так и OTU, представляющие несколько филогенетических клад. Организмы, которые отсутствуют у пациента 1 до лечения, либо приживаются, непосредственно попадая из обработанной этанолом споровой фракции, либо происходит их стимуляция благодаря созданию в кишечнике среды, благоприятной для разнообразной здоровой микробиоты. Кроме того, численность бактерий группы Bacteroides fragilis увеличивалась на 4log и 6log у пациентов 1 и 2 (фиг. 20).

[0362] OTU, составляющие стимулированную экогруппу, не присутствуют у пациента до лечения и/или встречаются исключительно редко, так что не составляют значимую фракцию от общего носительства микроорганизмов и не детектируются с помощью методов геномного и/или микробиологического анализа. OTU, которые являются представителями приживающихся и стимулированных экогрупп, идентифицировали путем определения OTU, относительная распространенность которых увеличивается после лечения, и которые, соответственно: (i) присутствуют в обработанном этанолом составе со спорами и отсутствуют у пациента до лечения, или (ii) отсутствуют в обработанном этанолом составе со спорами, но их относительная распространенность увеличивается со временем после лечения составом благодаря формированию в результате лечения благоприятных для роста условий. Примечательно, что последние OTU способны вырастать из резервуаров, где они встречаются у пациента с низкой частотой, или появляться из экзогенных источников, например, из пищи. OTU, которые составляют «коровую» стимулируемую или приживающуюся экогруппу, могут быть определены по общему проценту пациентов, у которых наблюдается их приживление и/или стимуляция; чем выше указанный процент, тем более вероятно, что они входят в коровую экогруппу, отвечающую за катализирование сдвига в направлении от дисбиотической экогруппы. Доминирующие OTU в экогруппе могут быть идентифицированы с применением нескольких способов, в том числе, но не ограничиваясь перечисленными, определение OTU, имеющих максимальную относительную распространенность либо в стимулированных, либо в приживающихся экогруппах, и определение порога общей относительной распространенности. Например, доминирующие OTU в стимулируемой экогруппе пациента 1 идентифицировали путем определения OTU с максимальной относительной распространенности, которые совместно составляют 60% носительства микроорганизмов, входящих в указанную стимулируемую экогруппу у пациента.

[0363] См. фиг. 18: Разнообразие микроорганизмов, измеренное в образцах после обработки обработанными этанолом спорами и образцах от пациента до и после лечения. Общее разнообразие микроорганизмов определяют с применением индекса альфа-разнообразия Chao1 и измеряют при разной глубине анализа генома для подтверждения адекватного покрытия последовательностей для анализа микробиома в целевых образцах. Пациент до лечения (фиолетовый) был носителем микробиома со значительно уменьшенным общим разнообразием по сравнению пациентом, получавшим лечение обработанными этанолом спорами (красный) и пациентом после лечения на 5 день (синий), 14 день (оранжевый) и 25 день (зеленый).

[0364] См. фиг. 19: В экогруппе микроорганизмов пациента при лечении обработанными этанолом спорами происходит сдвиг от дисбиотического состояния к здоровому состоянию. Анализ главных координат на основании общего разнообразия и структуры микробиома (бета-разнообразие Брея-Кертиса) пациента до и после лечения показывает, что приживление OTU при лечении спорами и стимуляция экогруппы микроорганизмов у пациента приводит к формированию экогруппы микроорганизмов, отличной как от микробиома до лечения, так и от экогруппы при лечении обработанными этанолом спорами (таблица 16).

[0365] См. фиг. 20: Стимуляция видов Bacteroides у пациентов. Сравнение числа групп вида Bacteroides fragilis на КОЕ/г экскрементов до лечения и на 4 неделе после лечения обнаруживает увеличение 4log или более. Возможность с помощью 16S-V4-идентификации OTU определять принадлежность OTU к конкретному виду зависит отчасти от разрешения области 16S-V4 гена 16S для конкретного вида или группы видов. Как плотность доступных референсных последовательностей 16S для разных областей указанного дерева, так и свойственная гену 16S вариабельность у разных видов определяют точность таксономической классификации определенного прочтения последовательности. С учетом топологической природы филогенетического дерева и того, что дерево отражает иерархические взаимоотношения OTU на основании сходства их последовательностей и базовой эволюционной модели, таксономическая классификация прочтения может быть распространена на более высокий уровень с применением основанной на кладах процедуры определения принадлежности (таблица 1). При использовании указанного подхода клады определяют на основании топологии филогенетического дерева, сконструированного на основании полноразмерных последовательностей 16S с применением максимального правдоподобия или других филогенетических моделей, известных специалистам в области филогенетики. Клады конструируют для подтверждения того, что все OTU в определенной кладе: (i) расположены в пределах определенного числа узлов с бутстреп-поддержкой друг от друга (обычно, 1-5 значений бутстрепа), и (ii) отличаются не более чем на 5% в отношении генетического сходства. OTU, принадлежащие одной кладе, можно определить как генетически и филогенетически отличные от OTU другой клады на основании данных секвенирования 16S-V4. OTU, попадающие в одну кладу, являются эволюционно близкородственными, и могут быть отличимы или неотличимы друг от друга на основании данных секвенирования 16S-V4. Мощность основанного на кладах анализа обусловлена тем, что представители одной клады, благодаря эволюционному родству, играют аналогичные функциональные роли в экогруппе микроорганизмов, например, обнаруживаемых в кишечнике человека. Композиции, где одни виды замещены другими из той же клады, предположительно сохраняют консервативную экологическую функцию и, соответственно, подходят для применения в настоящем изобретении.

[0366] Образцы стула разделяли на аликвоты и ресуспендировали 10× (объем/масса) либо в 100% этаноле (для определения генома) или в ФСБ, содержащем 15% глицерина (для выделения микроорганизмов), а затем хранили при -80°C до использования. Для анализа геномных 16S-последовательностей определяли полные 16S-последовательности для полученных точечным методом из изолятов на чашках колоний согласно описанию в примерах 11 и 12, и первичные образцы стула подготавливали для направленной работы с 16S-V4 с применением способа для гетерогенных образцов в примере 10.

[0367] Примечательно, что последовательности 16S изолятов определенной OTU филогенетически располагаются в составе соответствующих им клад, несмотря на то, что фактическое таксономическое определение вида и рода может указывать на их таксономическое отличие от других представителей клад, в которые они распределены. Расхождения между таксономическим наименованием OTU на основе микробиологических характеристик и на основе генетического секвенирования известны из литературы. Для перечисленных в сноске OTU из указанной таблицы известны расхождения при разных способах присвоения таксономического наименования.

[0368] Приживление OTU у пациента при лечении обработанным этанолом составом со спорами, а также итоговая стимуляция резидентного микробиома приводили к значительному снижению уровней и элиминированию у пациента носительства других патогенных видов помимо C. difficile. 16S-V4-секвенирование первичных образцов стула показало, что до лечения 20% прочтений соответствовали роду Klebsiella и еще 19% принадлежали роду Fusobacterium. Эти поразительные данные свидетельствуют о присутствии глубоко дисбиотической микробиоты, связанной с рецидивирующей C. difficile инфекцией и хроническим применением антибиотиков. У здоровых индивидуумов Klebsiella является резидентом микробиома человека всего у приблизительно 2% субъектов на основании анализа базы данных HMP (www.hmpdacc.org), и средняя относительная распространенность Klebsiella составляет всего приблизительно 0,09% в экскрементах указанных людей. Неожиданное обнаружение 20% относительной распространенности у пациента 1 до лечения указывает на провоспалительное состояние ЖКТ, позволяющее «патобионту» разрастаться и побеждать в конкурентной борьбе комменсальные организмы, в норме обнаруживаемые в кишечнике. Аналогичным образом, резко выраженный избыточный рост Fusobacterium указывает на глубокий дисбиоз микробиоты ЖКТ. Один вид Fusobacterium, F. nucleatum (OTU филогенетически неотличима от Fusobacterium sp. 3_1_33 на основании 16S-V4), был назван «новым патогеном ЖКТ» на основании связи с ВЗК, болезнью Крона и раком ободочной и прямой кишки у людей, а также подтвержденной способности вызывать развитие рака ободочной и прямой кишки в моделях на животных [Allen-Vercoe, Gut Microbes (2011) 2:294-8]. Важно, что ни Klebsiella, ни Fusobacterium не были детектированы среди прочтений 16S-V4 на 25 день (Таблица 18).

[0369] Для дальнейшего определения колонизации пищеварительного тракта Klebsiella и другими Enterobacteriaceae и для идентификации видов указанных организмов образцы фекалий, собранные до лечения и на 25 день, хранящиеся при -80°C в виде суспензий с ФСБ и глицерином, высевали на разнообразные селективные среды, в том числе на лактозную среду Мак-Конки (селективную среду для грамотрицательных энтеробактерий) и цитратную среду Симмонса с инозитолом (селективную среду для Klebsiella spp) [Van Cregten et al., J. Clin. Microbiol. (1984) 20: 936-41]. Идентифицированные в образцах от пациента энтеробактерии включали K. pneumoniae, Klebsiella sp. Co_9935 и E. coli. Удивительным образом, численность всех видов Klebsiella уменьшалась на 2-4 логарифмических единицы, тогда как E. coli, нормального комменсального организма, присутствующего в нормальной микробиоте, уменьшалось менее чем на 1log (таблица 19). Указанное уменьшение носительства Klebsiella spp. наблюдается у нескольких пациентов (таблица 19). У четырех индивидуальных пациентов исследовали присутствие Klebsiella spp. до лечения и через 4 недель после лечения. Klebsiella spp. детектировали по росту на селективной цитратной среде Симмонса с инозитолом согласно вышеприведенному описанию. Проведение серийных разведений и посева с последующим определением титров КОЕ/мл для морфологически отличных видов и идентификация представителей указанных морфологически отличных классов с применением секвенирования полноразмерных последовательностей 16S, позволили рассчитать титры для конкретных видов.

[0370] Род Bacteroides представляет собой важного члена микробиоты ЖКТ; 100% образцов стула согласно проекту «Микробиом человека» («Human Microbiome Project») содержат по меньшей мере один вид Bacteroides с общей относительной распространенностью в указанных образцах, составляющей от 0,96% до 93,92% с медианной относительной распространенностью 52,67% (справочные данные HMSMCP, www.hmpdacc.org). Была показана связь Bacteroides в кишечнике с ферментацией аминокислот и разложением сложных полисахаридов. Его присутствие в кишечнике стимулируется богатыми продуктами животного происхождения диетами, свойственными типичному западному рациону питания [David, L. A. et al., Nature (2013) doi:10.1038/nature12820]. Удивительным образом, до лечения менее чем 0,008% прочтений 16S-V4 от пациента 1 картировались на род Bacteroides, с высокой вероятностью указывая на отсутствие видов Bacteroides на уменьшение численности жизнеспособных Bacteroides до экстремально малых уровней в микробиоме кишечника пациента. После лечения через 5 дней ≥42% прочтений 16S-V4 может быть отнесено к роду Bacteroides, а к 25 дню после лечения 59,48% микробиома кишечника пациентов составлял Bacteroides. Указанные результаты подтверждали микробиологически по отсутствию детектируемых Bacteroides в образце, взятом до лечения, путем посева на две разные селективные среды дл Bacteroides: агар для Bacteroides с желчными кислотами и эскулином (BBE), селективный в отношении группы Bacteroides fragilis [Livingston, S.J.et al J. Clin. Microbiol (1978). 7: 448-453] и арабинозный агар без полиаминов (PFA) [Noack et al. J. Nutr. (1998) 128: 1385-1391; модифицирован замещением глюкозы арабинозой]. Предел детекции для взятого до лечения образца в высокоселективном агаре BBE составлял <2×10³ КОЕ/г, а предел детекции Bacteroides на агаре PFA составлял приблизительно 2×10⁷ КОЕ/г из-за роста на указанной среде многих не относящихся к Bacteroides видов. Число колоний видов Bacteroides на 25 день достигало 2×10¹⁰ КОЕ/г, что согласуется с данными 16S-V4-секвенирования и указывает глубокую реорганизацию микробиоты пищеварительного тракта у пациента 1 (Таблица 20).

[0371] Примечательна значительная распространенность Bacteroides у пациента 1 на 25 (а также уже на 5 день по данным 16S-V4-секвенирования). Жизнеспособные бактерии группы Bacteroides fragilis отсутствовали в обработанный этанолом споровой популяция на основании микробиологических посевов (при пороге детекции 10 КОЕ/мл). Таким образом, введение обработанной этанолом популяции спор пациенту 1 приводило не только к приживлению спорообразующих видов, но также и к восстановлению высоких уровней неспорообразующих видов, обычно обнаруживаемых у здоровых индивидуумов, путем создания ниши, позволяющей обеспечить восстановление популяции видов Bacteroides. Указанные организмы с наибольшей вероятностью либо присутствуют с крайне низкой распространенностью в ЖКТ пациента 1, или присутствуют в резервуаре в ЖКТ, из которого способны восстанавливаться до высокого титра. Указанные виды могут также быть реинокулированы перорально из пищи после лечения. Авторы настоящего изобретения называют указанное восстановление здоровой популяции пищеварительного тракта с OTU, не присутствующих в обработанной этанолом популяции спор «стимуляцией». Стимуляция представляет собой важное явление, демонстрирующее возможность использования обработанной этанолом споровой экогруппу для восстановления нормальной микробиоты за счет заселения другой совокупностью организмов или комменсальных организмов, фактически не являющихся компонентами собственно обработанной этанолом популяции спор; в частности лечение спорами и приживление OTU из споровой композиции создает нишу, благоприятную для разрастания OTU, необходимых для сдвига дисбиотического состава микробиома в сторону связанных со здоровым состоянием экогруппы микроорганизмов. Разнообразие видов Bacteroides и их приблизительная относительная распространенность в кишечнике пациента 1 представлены в таблице 21, включающей по меньшей мере 8 разных видов.

[0372] См. фиг. 21: Приживающиеся виды и стимулируемые виды в микробиомах пациентов после лечения обработанной этанолом популяцией спор. Относительная распространенность прижившихся или стимулированных видов определяли согласно описанию на основании числа прочтений 16S-последовательностей. Каждый график соответствует одному пациенту, получавшему лечение от рецидивирующей C. difficile обработанной этанолом популяцией спор.

[0373] Влияние лечения обработанной этанолом популяцией спор на носительство устойчивых к имипенему Enterobacteriaceae оценивали путем посева из клинических образцов от пациентов 2, 4 и 5, взятых до лечения и на 28 день, на лактозную среду Мак-Конки с 1 мкг/мл имипенема. Количество резистентных организмов определяли морфологически, регистрировали и получали ДНК для секвенирования полноразмерных 16S рРНК согласно описанию выше. Изоляты идентифицировали как Morganella morganii, Providencia rettgeri и Proteus pennerii. Все указанные организмы представляют собой комменсальные организмы кишечника; избыточный рост может приводить к бактеремии и/или инфекциям мочевыводящих путей, при которых требуется агрессивное лечение антибиотиками и, в некоторых случаях, госпитализация [Kim, B-N, et al Scan J. Inf Dis (2003) 35: 98-103; Lee, I-K и Liu, J-W J. Microbiol Immunol Infect (2006) 39: 328-334; O’Hara et al, Clin Microbiol Rev (2000) 13: 534]. Титры организмов до лечения и на 28 день для каждого пациента представлен в таблице 22. Важно, что введение обработанного этанолом состава со спорами приводило более чем к 100-кратному снижению в 4 из 5 случаев носительства Enterobacteriaceae с рядом устойчивых к имипенему организмов (Таблица 22).

[0374] Помимо определения вида и регистрации, несколько изолятов каждого организма от пациента 4 культивировали в течение ночи в 96-луночных планшетах, содержащие серии 2-кратных разведений имипенема для количественного определения минимальной ингибирующей концентрации (MIC) антибиотика. Рост организмов детектировали по рассеянию света на 600 нм с помощью планшет-ридера SpectraMax M5e. В клинических условиях указанные виды считают устойчивыми к имипенему, если MIC для них составляет 1 мкг/мл или выше. MIC для изолятов M. morganii из образцов от пациента D до лечения составляли 2-4 мкг/мл, а MIC для P. pennerii изолятов составляли 4-8 мкг/мл. Таким образом, введение обработанной этанолом популяции спор пациенту 4 приводило к выведению двух устойчивых к имипенему организмов (таблица 16).

Пример 26. Обогащение и очищение бактерий.

[0375] Для очищения индивидуальных бактериальных штаммов выбирали чашки с разведениями, плотность на которых позволяла произвести разделение одиночных колоний. Колонии собирали точечным методом с помощью стерильного инструмента (стерильной петли или иглы) и повторно высевали методом штриха на BBA или другую твердую среду. Планшеты инкубировали при 37°C в течение 3-7 дней. Одну или большее количество хорошо изолированных одиночных колоний основного морфологического типа пересевали методом штриха. Указанный процесс повторяли по меньшей мере трижды до появления стабильной единственной морфологии колоний. Выделенный микроорганизм затем культивировали в анаэробных условиях в жидкой среде в течение 24 часов или более для получения чистой культуры с 10⁶-10¹⁰ КОЕ/мл. Жидкая ростовая среда может включать среду на основе сердечно-мозгового бульона (Atlas, Handbook of Microbiological Media, 4^th ed., ASM Press, 2010) с добавлением дрожжевого экстракта, гемина, цистеина и углеводов (например, мальтозы, целлобиозы, растворимого крахмала) или другой ранее описанной среды (см., например, пример 14). Культуру центрифугировали при 10000×g в течение 5 минут для осаждения бактерий, отработанную культуральную среду удаляли, и бактерии ресуспендировали в стерильном ФСБ. Добавляли стерильный 75% глицерин до конечной концентрации 20%. Аликвоту глицеринового основного раствора титровали методом серийных разведений и посева. Оставшуюся часть основного раствора замораживали на сухом льду в течение 10-15 минут и затем помещали в условия с температурой -80°C для длительного хранения.

Пример 27. Состав клеточных банков.

[0376] Клеточные банки (RCB) бактериальных штаммов получали следующим образом. Бактериальные штаммы высевали из хранящихся при -80°C замороженных базовых составов с глицерином на кровяной агар для Brucella с гемином или витамином K (Atlas, Handbook of Microbiological Media, 4^th ed, ASM Press, 2010), M2GSC (Atlas, Handbook of Microbiological Media, 4^th ed, ASM Press, 2010) или другую твердую ростовую среду, и инкубировали от 24 до 48 ч при 37°C в анаэробной камере с газовой смесью H₂:CO₂:N₂ 10:10:80. Одиночные колонии собирали точечным методом и использовали для инокуляции от 250 мл до 1 л бульона Вилкинса-Шалгрена, бульона с сердечно-мозговым экстрактом, бульона M2GSC или другой ростовой среды, и культивировали до достижения середины экспоненциальной фазы - поздней экспоненциальной фазы, либо до достижения стационарной фазы роста. Как вариант, одиночные колонии могут быть использованы для инокуляции пилотной культуры объемом 10 мл, затем используемой для инокуляции культуры большего объема. Ростовую среду и фазу роста для сбора выбирали таким образом, чтобы максимизировать титр клеток, споруляцию (при необходимости) и фенотипы, которые могут быть связаны с нужными клетками in vitro или in vivo. Культуры необязательно культивировали в статическом режиме или при перемешивании, в зависимости от того, что именно обеспечивало максимальный титр клеток. Затем культуры концентрировали 10-кратно или более путем центрифугирования при 5000 об/мин в течение 20 минут, и ресуспендировали в стерильном забуференном фосфатом солевом растворе (ФСБ) с добавлением 15% глицерина. Аликвоты объемом 1 мл переносили в криопробирки объемом 1,8 мл, которые замораживали на сухом льду и хранили при -80°C. Идентичность определенного клеточного банка подтверждали путем ПЦР-амплификации гена 16S рРНК с последующим прямым циклическим секвенированием по Сэнгеру, и сравнения с курируемой базой данных рРНК для определения таксономического идентификатора. Затем подтверждали, что каждый банк обеспечивает получение колоний с единственной морфологией при высевании методом штриха на кровяной агар для Brucella или агар M2GSC. Если наблюдалось более одного варианта морфологии, принадлежность колоний к предполагаемому виду подтверждали путем ПЦР-анализа и секвенирования гена 16S рРНК. Варианты морфологии колоний могут наблюдаться и в чистых культурах; для многих бактерий подробно описаны механизмы образования колоний с варьирующей морфологией (van der Woude, Clinical Microbiology Reviews, 17:518, 2004), в том числе для видов Clostridium (Wadsworth-KTL Anaerobic Bacteriology Manual, 6^th Ed, Jousimie-Somer, et al., 2002). Для RCB облигатных анаэробов подтверждали отсутствие аэробных колониеобразующих единиц с порогом детекции 10 КОЕ/мл.

Пример 28. Определение титра.

[0377] Число жизнеспособных клеток на мл определяли на свежесобранной промытой и концентрированной культуре путем посева серийных разведений RCB на кровяной агар для Brucella или другую твердую среду, и оно варьировало от 10⁶ до 10¹⁰ КОЕ/мл. Влияние замораживания на жизнеспособность определяли путем титрования банков после одного или двух циклов замораживания-размораживания на сухом льду или при -80°C, с последующим размораживанием в анаэробной камере при комнатной температуре. Для некоторых штаммов наблюдалось падение числа жизнеспособных КОЕ/мл на 1-3log после первого или второго цикла замораживания-размораживания, тогда как на жизнеспособность других это не влияло.

Пример 29. Состав бактериальных композиций.

[0378] Индивидуальные штаммы, как правило, размораживали на льду и комбинировали в анаэробной камере для получения смесей, с последующим вторым замораживанием при -80°C для сохранения смешанных образцов. При получении комбинаций штаммов для анализов in vitro или in vivo число КОЕ в конечной смеси оценивали на основании титра при втором замораживании-размораживании индивидуальных штаммов. При экспериментах на грызунах штаммы могут быть скомбинированы в равных количествах для доставки от 1e4 до 1e10 на штамм. Кроме того, некоторые бактерии могут не вырастать до титра, достаточного для создания клеточных банков, обеспечивающих получение композиций, в которых все бактерии присутствовали бы в количестве 1e10.

Пример 30. Идентификация ключевых OTU и функций

[0379] Организм человека представляет собой экосистему, в которой микробиота, и микробиом играют важную роль в основных нормальных функциях систем человека (например, метаболической, иммунологической и неврологической). Микробиота и конечный микробиом содержат экогруппу микроорганизмов, которые сосуществуют у индивидуальных субъектов, взаимодействуя друг с другом и с хозяином (т.е. субъектом-млекопитающим) с формированием динамического сообщества с присущим ему биоразнообразием и функциональными характеристиками. В указанных системах взаимодействия микроорганизмов (т.е. экогруппах) конкретные представители могут вносить более существенный вклад, чем другие; соответственно, указанные представители также обнаруживаются во многих экогруппах, и удаление указанных микроорганизмов из экогруппы может оказывать существенное влияние на функциональные возможности конкретной экогруппы. В 1969 году Робертом Пейном (Robert Paine) была предложена концепция «ключевых видов» (см. Paine RT. 1969. A note on trophic complexity and community stability. The American Naturalist 103: 91-93.) для описания существования таких ключевых видов, составляющих неотъемлемую часть определенной экосистемы независимо от их распространенности в экологическом сообществе. Изначально Пейн описал роль морской звезды Pisaster ochraceus в морских экосистемах; с тех пор концепция была экспериментально подтверждена для многочисленных экосистем.

[0380] Ключевые OTU и/или функции определяют вычислительными методами путем анализа экосистем, обнаруженных в определенном наборе образцов, имеющих специфический фенотип. Ключевые OTU и/или функции определены как все узлы заданной группы систем, отвечающие двум или большему числу следующих критериев. Согласно Критерию 1 узел часто встречается в системах, и системы, где встречается указанный узел, обнаруживаются у значительного количества индивидуумов; частота встречаемости указанных узлов в системах и распространенность указанных систем у индивидуумов показывает, что указанные узлы выполняют важную биологическую функцию у многих индивидуумов. Согласно Критерию 2, узел часто наблюдается в системах, и каждая из систем, где наблюдается указанный узел, содержит значительное число узлов - эти узлы, таким образом, являются «суперконнекторами», то есть образуют ядро большинства система и, соответственно, обладают большой биологической значимостью в смысле функционального вклада в определенную экогруппу. Согласно Критерию 3, узел обнаруживается в системах, содержащих значительное число узлов (т.е. больших системах), и известно, что указанные системы, где обнаруживается указанный узел, встречаются у большого числа субъектов; указанные системы потенциально представляют большой интерес, поскольку маловероятно, что большие системы, встречающиеся у многих индивидуумов, образуются исключительно случайным образом; с высокой вероятностью это указывает на биологическую значимость. Необязательно, нужные пороги для частоты, с которой узел встречается в экогруппах системы, частоты, с которой определенная система встречается в образцах от субъектов и для размера определенной системы, необходимого для ее классификации как ключевого узла, определяют как 50-й, 70-й, 80-й или 90-й процентили распределения указанных переменных. Необязательно, нужные пороги определяют по значению определенной переменной, существенно отличающемуся от среднего ли медианного значения определенной переменной, с применением стандартных параметрических или непараметрических критериев статистической значимости. Согласно другому варианту реализации ключевой узел определяют узел, встречающийся в образце с представляющим интерес фенотипом, например, но не ограничиваясь указанным, «здоровый» фенотип, и в то же время не встречающийся в образце с не представляющим интереса фенотипом, например, но не ограничиваясь указанным, «болезненным» фенотипом. Необязательно, ключевой узел определяют как узел, который, как показано, значимо отличается от обнаруживаемых с применением данных пермутационных тестов для оценки значимости.

Пример 31. Идентификация коровой экогруппы в обработанном этанолом составе со спорами

[0381] Десять разных обработанных этанолом составов со спорами получали от 6 разных доноров (согласно описанию в примере 15). Указанные составы со спорами использовали для лечения 10 пациентов, каждый из которых страдал рецидивирующей инфекцией C. difficile. Пациентов идентифицировали с применением критериев включения/исключения, описанных в примере 18, а доноров идентифицировали с использованием критериев, описанных в примере 1. Ни у одного из пациентов не наблюдалось рецидива C. difficile за 4 недели наблюдения после лечения, хотя исходя из литературных источников, можно было ожидать возникновения рецидива у 70-80% субъектов после отмены антибиотика [Van Nood, et al., NEJM (2013)]. Таким образом, обработанные этанолом составы со спорами от нескольких разных доноров и нескольких взятий донорских материалов продемонстрировали примечательную клиническую эффективность.

[0382] Для определения коровой экогруппы, определяющей примечательную клиническую эффективность обработанного этанолом состава со спорами, проводили следующий анализ. Состав OTU состава со спорами определяли путем секвенирования 16S-V4 рРНК, и численными методами определяли принадлежность OTU согласно примеру 12. В качестве надежного порога для определения только OTU, с крайне малой вероятностью появившихся в результате ошибок во время амплификации или секвенирования, устанавливали требование детекции по меньшей мере 10 прочтений последовательностей OTU в обработанном этанолом составе со спорами. В рутинных способах, используемых специалистами в области определения микробиома геномными методами, для относительной распространенности прочтения в качестве значения отсечения применяется порог, существенно меньший чем значение ≥10 прочтений, используемое для указанного анализа, и составляющий 0,005% (см., например, Bokulich, A. et al., 2013. Quality-filtering vastly improves diversity estimates from Illumina amplicon sequencing. Nature Methods 10: 57-59), что эквивалентно ≥2 прочтениям при глубине секвенирования, достигаемой для образцов при анализе в данном примере, Все таксономические определения и распределение клад выполнялись для каждой OTU согласно описанию в примерах 12. Итоговый перечень OTU, распределение клад и частота детекции в составах со спорами приведены в таблице GB. Указаны OTU, которые приживаются у получавших лечение пациентов, и процент пациентов, у которых они приживаются, а также клады, статус спорообразования и статус ключевых OTU. Отмеченные звездочкой OTU встречаются в ≥80% обработанных этанолом составов и приживаются у ≥50% получавших лечение пациентов.

Таблица GB. OTU, детектируемые по меньшей мере по 10 прочтениям последовательностей 16S-V4 по меньшей мере в одном обработанном этанолом составе со спорами (панмикробиом).

OTU Клада % составов со спорами с OTU % Пациентов с приживленными OTU Спорообразующие Ключевые OTU Prevotella_maculosa клада_104 10% 0% НЕТ НЕТ Prevotella_copri клада_168 20% 0% НЕТ НЕТ Bacteroides_caccae клада_170 30% 0% НЕТ ДА Bifidobacterium_sp_TM_7* клада_172 90% 60% НЕТ НЕТ Bifidobacterium_gallicum клада_172 70% 20% НЕТ НЕТ Bifidobacterium_dentium клада_172 50% 0% НЕТ НЕТ Lactobacillus_casei клада_198 20% 10% НЕТ НЕТ Actinomyces_odontolyticus клада_212 20% 30% НЕТ НЕТ Clostridium_colicanis клада_223 10% 10% ДА НЕТ Clostridiales_sp_SS3_4* клада_246 100% 70% ДА НЕТ Clostridium_sporogenes клада_252 40% 40% ДА НЕТ Clostridium_butyricum клада_252 20% 20% ДА НЕТ Clostridium_disporicum клада_253 40% 30% ДА НЕТ Clostridium_hylemonae* клада_260 100% 50% ДА НЕТ Clostridium_scindens клада_260 10% 60% ДА НЕТ Coprococcus_comes* клада_262 90% 80% ДА ДА Бактерия Lachnospiraceae_1_4_56FAA* клада_262 90% 80% ДА ДА Ruminococcus_torques клада_262 30% 70% ДА ДА Parabacteroides_merdae клада_286 30% 20% НЕТ ДА Bifidobacterium_bifidum клада_293 10% 0% НЕТ НЕТ Johnsonella_ignava клада_298 10% 10% НЕТ НЕТ Blautia_glucerasea* клада_309 100% 80% ДА НЕТ Blautia_sp_M25* клада_309 100% 70% ДА ДА Бактерия Lachnospiraceae_6_1_63FAA* клада_309 100% 60% ДА НЕТ Eubacterium_cellulosolvens клада_309 10% 30% ДА ДА Lactobacillus_fermentum клада_313 10% 0% НЕТ НЕТ Sarcina_ventriculi клада_353 10% 10% ДА НЕТ Clostridium_bartlettii* клада_354 90% 70% ДА НЕТ Clostridium_bifermentans клада_354 70% 70% ДА НЕТ Clostridium_mayombei клада_354 50% 50% ДА НЕТ Dorea_longicatena* клада_360 100% 60% ДА ДА Бактерия Lachnospiraceae_9_1_43BFAA клада_360 100% 30% ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae_2_1_58FAA* клада_360 80% 80% ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae_2_1_46FAA клада_360 50% 50% ДА НЕТ Lactobacillus_perolens клада_373 10% 0% НЕТ НЕТ Bacteroides_dorei клада_378 60% 50% НЕТ ДА Eubacterium_biforme клада_385 10% 0% ДА НЕТ Peptoniphilus_sp_gpac077 клада_389 10% 20% НЕТ НЕТ Coprococcus_catus* клада_393 100% 70% ДА ДА Eubacterium_hallii* клада_396 90% 60% ДА ДА Anaerosporobacter_mobilis клада_396 40% 60% ДА НЕТ Bacteroides_pectinophilus клада_396 10% 60% ДА НЕТ Lactobacillus_hominis клада_398 10% 0% НЕТ НЕТ Lactococcus_lactis клада_401 40% 40% НЕТ НЕТ Ruminococcus_champanellensis* клада_406 80% 50% ДА НЕТ Ruminococcus_callidus клада_406 10% 10% ДА НЕТ Clostridium_clostridioforme* клада_408 100% 60% ДА ДА Eubacterium_hadrum* клада_408 100% 90% ДА ДА Clostridium_symbiosum клада_408 30% 50% ДА ДА Anaerostipes_caccae клада_408 10% 50% ДА НЕТ Parasutterella_excrementihominis клада_432 10% 0% НЕТ НЕТ Sutterella_stercoricanis клада_432 10% 0% НЕТ НЕТ Eubacterium_rectale* клада_444 100% 80% ДА ДА Lachnobacterium_bovis* клада_444 100% 80% ДА НЕТ Desulfovibrio_desulfuricans клада_445 10% 0% НЕТ ДА Eubacterium_sp_оральный клон_JS001* клада_476 80% 70% ДА НЕТ Faecalibacterium_prausnitzii* клада_478 100% 60% ДА ДА Subdoligranulum_variabile* клада_478 100% 80% ДА ДА Coprobacillus_sp_D7* клада_481 90% 60% ДА НЕТ Clostridium_cocleatum клада_481 60% 20% ДА НЕТ Clostridium_spiroforme клада_481 40% 50% ДА НЕТ Eubacterium_ramulus* клада_482 80% 60% ДА НЕТ Flavonifractor_plautii клада_494 70% 60% ДА ДА Pseudoflavonifractor_capillosus клада_494 60% 60% ДА ДА Ruminococcaceae_бактерия_D16 клада_494 30% 50% ДА ДА Acetivibrio_cellulolyticus* клада_495 70% 80% ДА НЕТ Clostridium_stercorarium клада_495 40% 50% ДА НЕТ Enterococcus_durans клада_497 10% 10% НЕТ НЕТ Enterococcus_faecium клада_497 10% 10% НЕТ НЕТ Dialister_invisus клада_506 50% 10% НЕТ НЕТ Eubacterium_limosum клада_512 20% 0% ДА НЕТ Ruminococcus_flavefaciens клада_516 60% 60% ДА НЕТ Eubacterium_ventriosum клада_519 30% 60% ДА ДА Bilophila_wadsworthia клада_521 90% 0% НЕТ ДА Lachnospira_pectinoschiza клада_522 40% 60% ДА НЕТ Eubacterium_eligens клада_522 30% 50% ДА ДА Catonella_morbi клада_534 20% 0% НЕТ НЕТ Clostridium_sporosphaeroides* клада_537 100% 80% ДА НЕТ Ruminococcus_bromii клада_537 60% 30% ДА ДА Clostridium_leptum клада_537 40% 70% ДА ДА Clostridium_sp_YIT_12069 клада_537 40% 60% ДА НЕТ Clostridium_viride клада_540 10% 10% ДА НЕТ Megamonas_funiformis клада_542 50% 0% НЕТ НЕТ Eubacterium_ruminantium* клада_543 80% 90% ДА НЕТ Coprococcus_eutactus клада_543 20% 20% ДА НЕТ Collinsella_aerofaciens клада_553 50% 10% ДА ДА Alkaliphilus_metalliredigenes клада_554 40% 10% ДА НЕТ Turicibacter_sanguinis клада_555 80% 40% ДА НЕТ Phascolarctobacterium_faecium клада_556 20% 0% НЕТ НЕТ Clostridiales_бактерия_оральный клон_P4PA* клада_558 80% 50% НЕТ НЕТ Lutispora_thermophila клада_564 100% 0% ДА НЕТ Coriobacteriaceae_бактерия_JC110 клада_566 70% 0% НЕТ НЕТ Eggerthella_sp_1_3_56FAA клада_566 70% 30% НЕТ НЕТ Adlercreutzia_equolifaciens клада_566 40% 0% НЕТ НЕТ Gordonibacter_pamelaeae клада_566 30% 0% НЕТ ДА Slackia_isoflavoniconvertens клада_566 10% 0% НЕТ НЕТ Eubacterium_desmolans* клада_572 90% 70% ДА НЕТ Papillibacter_cinnamivorans* клада_572 90% 80% ДА НЕТ Clostridium_colinum клада_576 30% 30% ДА НЕТ Akkermansia_muciniphila клада_583 60% 10% НЕТ ДА Clostridiales_бактерия_оральный _таксон_F32 клада_584 60% 30% НЕТ НЕТ Prochlorococcus_marinus клада_592 30% 0% НЕТ НЕТ Methanobrevibacter_wolinii клада_595 30% 0% НЕТ НЕТ Bacteroides_fragilis клада_65 20% 30% НЕТ ДА Lactobacillus_delbrueckii клада_72 10% 0% НЕТ НЕТ Escherichia_coli клада_92 50% 0% НЕТ ДА Clostridium_sp_D5 клада_96 80% 60% ДА НЕТ Streptococcus_thermophilus клада_98 90% 20% НЕТ ДА Streptococcus_sp_CM6 клада_98 20% 10% НЕТ НЕТ Streptococcus_sp_оральный клон_ASCE05 клада_98 10% 0% НЕТ НЕТ

[0383] Далее, был сделан вывод, что для признания OTU представителем коровой экогруппы состава со спорами необходимо подтверждение того, что указанная OTU приживается у пациента. Приживление имеет важное значение по двум причинам. Во-первых, приживление представляет собой обязательный элемент механизма восстановления микробиома и элиминации колонизации C. difficile. Приживающиеся с большей частотой OTU с высокой вероятностью являются компонентами коровой экогруппы состава со спорами. Во-вторых, OTU, детектированные посредством секвенирования состава со спорами (согласно таблице GB) могут включать нежизнеспособные споры или другие загрязняющие молекулы ДНК, не связанные со спорами. Требование подтвержденного приживления OTU у пациента позволяет устранить OTU, соответствующие нежизнеспособным спорам или загрязняющим последовательностям. В таблице GB также приведены все OTU, детектированные в составе со спорами, которые, как было показано, приживаются по меньшей мере у одного пациента после лечения. OTU, составляющие значительный процент в проанализированных обработанных этанолом составах со спорами, которые приживаются у большого числа пациентов, представляют собой подгруппу коровой экогруппы, с высокой вероятностью катализирующую сдвиг от дисбиотической экогсистемы, характериной для болезненного состояния, к здоровому микробиому.

[0384] Третий подход применяли для дополнительного исследования коровой экогруппы состава со спорами. Анализ систем на основе численных методов позволили описать экогруппы микроорганизмов, присутствующих в микробиоте значительной популяции здоровых индивидуумов. Указанные экогруппы составлены множеством OTU, некоторые которых определены как ключевые OTU. Ключевые OTU определяют численными методами согласно описанию в примере 30. Ключевые OTU образуют основу экогрупп микроорганизмов, в которых встречаются, и, соответственно, являются критически важными для функционирования системных экогрупп у здоровых субъектов. Ключевые OTU, связанные с экогруппами микроорганизмов, ассоциированных со здоровыми субъектами, часто отсутствуют или их численность понижена у субъектов с заболеванием. Ключевые OTU могут встречаться у субъектов с низкой, умеренной или высокой распространенностью. В таблице GB дополнительно отмечено, какие из OTU в составе со спорами являются ключевыми OTU, связанными исключительно со здоровыми индивидуумами, которые не являются носителями заболевания.

[0385] На основании указанных данных было сделано несколько важных выводов. Относительно незначительное число видов, всего 16, детектируются во всех составах со спорами от 6 доноров при 10 отборах донорских материалов. Эти результаты являются неожиданными, поскольку в базе данных HMP (www.hmpdacc.org) описана огромная вариабельность комменсальных видов у здоровых индивидуумов. Присутствие незначительного числа стабильных OTU поддерживает концепцию коровой экосистемы. Данные о приживлении также подтверждают указанное заключение. Регрессионный анализ показывает значимую корреляцию между частотой детекции в составе со спорами и частотой приживления у донора: R = 0,43 (p < 0,001). Априорного условия, определяющего, что OTU, часто детектируемые в составе со спорами, необязательно должны или будут приживаться, не существует. Например, Lutispora thermophila, спорообразующий вид, обнаруживаемый во всех 10 составах со спорами, не приживается ни у одного пациента. Bilophila wadsworthia, грамотрицательный анаэроб, присутствует в 9 из 10 донорских материалов, и тем не менее не приживаются ни у одного пациента, что, предположительно, указывает нa его присутствие в обработанном этанолом составе со спорами в качестве нежизнеспособной примеси. Наконец, следует отметить выраженное преобладание ранее определенных ключевых OTU среди наиболее часто встречающихся OTU в составах со спорами.

[0386] Указанные три фактора - преобладание в составе со спорами, частота приживления и определение как ключевой OTU - позволили разработать «показатель коровой экогруппы» (CES) для ранжирования индивидуальных OTU. CES определяли следующим образом:

- 40% множитель для присутствия OTU в составе со спорами

- коэффициент 1 для присутствия в 1-3 составах со спорами

- коэффициент 2,5 для присутствия в 4-8 составах со спорами

- коэффициент 5 для присутствия в ≥ 9 составах со спорами

- 40% множитель для приживления у пациента

- коэффициент 1 для приживления у 1-4 пациентов

- коэффициент 2,5 для приживления у 5-6 пациентов

- коэффициент 5 для приживления у ≥ 7 пациентов

- 20% множитель для ключевых OTU

- коэффициент 1 для ключевых OTU

- коэффициент 0 для неключевой OTU.

[0387] При применении указанного руководства показатель CES имеет максимально возможное значение, равное 5, и минимальное возможное значение, равное 0,8. Например, OTU, обнаруживаемой в 8 из 10 составов со спорами, приживавшихся у 3 пациентов, и представляющей собой ключевую OTU, было бы присвоено следующее значение CES:

CES = (0,4 × 2,5) + (0,4 × 1) + (0,2 × 1) = 1,6

[0388] В таблице GC ранжированы по CES первые 20 OTU, при дополнительном условии продемонстрированного приживления OTU для того, чтобы OTU считалась коровым экологическим элементом.

Таблица GC. Первые 20 OTU, ранжированные по CES

OTU Клада CES Спорообразователи Ключевые OTU Eubacterium_hadrum клада_408 4,2 ДА ДА Eubacterium_rectale клада_444 4,2 ДА ДА Subdoligranulum_variabile клада_478 4,2 ДА ДА Blautia_sp_M25 клада_309 4,2 ДА ДА Coprococcus_catus клада_393 4,2 ДА ДА Бактерия Lachnospiraceae_1_4_56FAA клада_262 4,2 ДА ДА Coprococcus_comes клада_262 4,2 ДА ДА Blautia_glucerasea клада_309 4,0 ДА НЕТ Lachnobacterium_bovis клада_444 4,0 ДА НЕТ Clostridium_sporosphaeroides клада_537 4,0 ДА НЕТ Clostridiales_sp_SS3_4 клада_246 4,0 ДА НЕТ Papillibacter_cinnamivorans клада_572 4,0 ДА НЕТ Clostridium_bartlettii клада_354 4,0 ДА НЕТ Eubacterium_desmolans клада_572 4,0 ДА НЕТ Clostridium_clostridioforme клада_408 3,2 ДА ДА Dorea_longicatena клада_360 3,2 ДА ДА Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 3,2 ДА ДА Eubacterium_hallii клада_396 3,2 ДА ДА Clostridium_leptum клада_537 3,2 ДА ДА Бактерия Lachnospiraceae_6_1_63FAA клада_309 3,0 ДА НЕТ

Пример 32. Определение эффективных коровых экологических подгрупп

[0389] Количество организмов желудочно-кишечном тракте человека, а также различия разнообразия между здоровыми индивидуумами, указывают на функциональную избыточность экогруппы микробиома здорового кишечника (см. The Human Microbiome Consortia. 2012. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome. Nature 486: 207-214). Указанная избыточность с высокой вероятностью означает, что коровые экологические подгруппы описывают терапевтически благоприятные компоненты обработанного этанолом состава со спорами, и что такие подгруппы могут сами по себе представлять полезные композиции для лечения инфекции C. difficile при условии наличия функциональных характеристик экогруппы. Используя CES, можно установить приоритет индивидуальных OTU при оценке эффективности в качестве коровой экологической подгруппы.

[0390] Другой аспект функциональной избыточности заключается в том, что эволюционно родственные организмы (т.е. близко расположенные на филогенетическом дереве, например, сгруппированные в одну кладу) также будут представлять собой эффективные заместители в коровой экогруппе или ее подгруппе при лечении C. difficile.

[0391] Для специалиста в данной области техники выбор подходящих подгрупп OTU для тестирования in vitro (см., например, пример 33 ниже) или in vivo (см., например, примеры 16 или 17) является простым. Подгруппы могут быть отобраны путем выделения любых 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более чем 10 OTU из таблицы GB, в частности, с фокусом на OTU, имеющих более высокие CES, например, OTU, приведенных в таблице GC. Кроме того, используя информацию о взаимосвязях между кладами согласно примеру 12 и таблице 1 выше, можно подобрать родственные OTU для замещения OTU с приемлемыми значениями CES. Указанные организмы могут культивироваться в анаэробных условиях in vitro с применением подходящих сред (выбранных из описанных в примере 14 выше), а затем скомбинированы в требуемой пропорции. В типовом эксперименте в модели с C. difficile на мышах используется по меньшей мере 10⁴ и предпочтительно по меньшей мере 10⁵, 10⁶, 10⁷, 10⁸, 10⁹ или более чем 10⁹ колониеобразующих единиц каждого микроорганизма из композиции. Вариации продуктивности культуры иногда могут означать, что организмы сочетаются в неравных пропорциях, например, 1:10, 1:100, 1:1000, 1:10 000, 1:100 000, или более 1:100 000. При этом важно, чтобы в указанных композициях каждый штамм присутствовал в минимально достаточном количестве для того, чтобы можно было измерить вклад указанного штамма в эффективность коровой экологической подгруппы. Используя принципы и инструкции, приведенные в настоящем документе, специалист в данной области техники сможет легко определить на основании клад заместителей для тестирования эффективности подгрупп коровой экосистемы. В таблице GB представлены клады для всех OTU, детектированных в составе со спорами, а в таблице 1 представлены OTU, которые могут быть использованы в качестве заместителей на основании взаимосвязей клад.

Пример 33. Тестирование коровых экологических подгрупп в модели на мышах

[0392] Ряд коровых экологических подгрупп был протестирован в модели на мышах с C. difficile. Отрицательный контроль представлял собой забуференный фосфатом солевой раствор, а положительный контроль представлял собой 10% суспензию фекалий человека. Указанные подгруппы описаны в таблице GD.

Таблица GD: Коровые экологические подгруппы, протестированные в модели с C. difficile на мышах

Подгруппа OTU Замена OTU в таблице 1 (Клада) Подгруппа 1 Collinsella aerofaciens нет (Клада_553) Clostridium tertium C. sporogenes (Клада_252) Clostridium disporicum нет (Клада_253) Clostridium innocuum Clostridium_sp_HGF2 (Клада_351) Clostridium mayombei нет (Клада_354) Clostridium butyricum нет (Клада_252) Coprococcus comes нет (Клада_262) Clostridium hylemonae нет (Клада_260) Clostridium bolteae E. hadrum (Клада_408) Clostridium symbiosum C. clostridioforme (Клада_408) Clostridium orbiscindens R._бактерия_D16 (Клада_494) Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA C. scindens (Клада_260) Blautia producta Blautia_sp_M25 (Клада_309) Ruminococcus gnavus D. longicatena(Клада_360) Ruminococcus bromii нет (Клада_537) Подгруппа 2 Collinsella aerofaciens нет (Клада_553) Clostridium butyricum нет (Клада_252) Clostridium hylemonae нет (Клада_260) Blautia producta Blautia_sp_M25 (Клада_309) Подгруппа 3 Collinsella aerofaciens нет (Клада_553) Clostridium innocuum Clostridium_sp_HGF2 (Клада_351) Coprococcus comes нет (Клада_262) Ruminococcus bromii нет (Клада_537) Подгруппа 4 Clostridium butyricum нет (Клада_252) Clostridium hylemonae нет (Клада_260) Blautia producta Blautia_sp_M25 (Клада_309) Подгруппа 5 Clostridium butyricum нет (Клада_252) Clostridium hylemonae нет (Клада_260) Подгруппа 6 Blautia producta Blautia_sp_M25 (Клада_309) Clostridium butyricum нет (Клада_252) Подгруппа 7 Clostridium orbiscindens R._бактерия_D16 (Клада_494) Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA C. scindens (Клада_260) Eubacterium rectale нет (Клада_444)

[0393] Две клетки по 5 мышей в каждой использовали для тестирования для каждой группы эксперимента. Все мыши получали коктейль антибиотиков, состоящий из 10% глюкозы, канамицина (0,5 мг/мл), гентамицина (0,044 мг/мл), колистина (1062,5 ед/мл), метронидазола (0,269 мг/мл), ципрофлоксацина (0,156 мг/мл), ампициллина (0,1 мг/мл) и ванкомицина (0,056 мг/мл) в питьевой воде с -14 по -5 день включительно, и дозу 10мг/кг клиндамицина через оральный зонд на -3 день. На день -1 они получали либо тестируемые составы, либо контрольные продукты через оральный зонд. На 0 день их стимулировали введением приблизительно 4,5 log10 КОЕ C. difficile (ATCC 43255) через оральный зонд. Смертность оценивали каждый день с 0 по 6 день; оценивали массу тела и последующее изменение массы тела у животного, при этом снижение массы тела считали связанным с инфекцией C. difficile. Смертность и уменьшение снижения массы тела при применении тестируемого состава по сравнению с пустой основой использовали для оценки успешности применения тестируемого состава. Кроме того, ежедневно проводили оценку симптомов C. difficile от -1 дня до 6 дня включительно. Оценку симптомов проводили на основании внешнего вида (0-2 пункта на основании нормального вида, сгорбленности, пилоэрекции или летаргического состояния), дыхания (0-2 пункта на основании нормального, быстрого или поверхностного дыхания, с диафрагмальным дыханием), клинических признаков (0-2 пункта на основании нормального внешнего вида, мокрого хвоста, пониженной на ощупь температуры или изоляции от других животных).

[0394] Помимо определения кумулятивной смертности для каждой группы рассчитывают среднюю минимальную относительную массу тела как среднее значение минимальной массы тела каждой мыши относительно дня -1, и средний максимальный клинический показатель как среднее значение максимального комбинированного клинического показателя каждой мыши с присвоением значения 4 в случае смерти. Результаты представлены в таблице GE.

Таблица GE: Результаты для бактериальных композиций, протестированный в a C. difficile модель на мышах.

Группа Доза Кумулятивная смертность (%) Средняя минимальная относительная масса тела Средний максимальный клинический показатель (Смерть = 4) Контроль-носитель - 40 0,87 2,8 Контрольные экскременты 5,8e8 КОЕ всего 0 0,99 0 Подгруппа 1 1e8 КОЕ/OTU 0 0,98 0 Подгруппа 2 1e8 КОЕ/OTU 10 0,84 2,1 Подгруппа 3 1e8 КОЕ/OTU 10 0,84 2,2 Подгруппа 4 1e8 КОЕ/OTU 0 0,87 2 Подгруппа 5 1e8 КОЕ/OTU 20 0,91 1,7 Подгруппа 6 1e8 КОЕ/OTU 40 0,82 2,8 Подгруппа 7 1e8 КОЕ/OTU 0 0,90 1

Пример 34. Определение коровых экологических подгрупп в анализе ингибирования C. difficile in vitro

[0395] Флаконы с банкированным глицериновым основным раствором, хранящиеся при температуре -80°C, размораживали и разводили до 1e8 КОЕ/мл. Выбранные штаммы и принадлежность их клад приведены в таблице GF. Каждый штамм затем разводили 10× (до конечной концентрации 1e7 КОЕ/мл каждого штамма) в 200 мкл ФСБ + 15% глицерина в лунках 96-луночного планшета. Затем планшеты замораживали при -80 °C. Перед проведением анализа планшеты извлекали из среды с температурой -80 °C и размораживали при комнатной температуре в анаэробных условиях для тестирования в анализе ингибирования C. difficile in vitro (CivSim).

[0396] Ночную культуру Clostridium difficile культивируют в анаэробных условиях на SweetB-FosIn или другой подходящей среде для роста C. difficile. SweetB-FosIn представляет собой комплексную среду, состоящую из сердечно-мозгового бульона, дрожжевого экстракта, цистеина, целлобиозы, мальтозы, растворимого крахмала, фруктоолигосахаридов/инулина и гемина, и его забуферивают MOPS. Через 24 ч роста культуру разбавляют 100 000-кратно комплексной средой, такой как SweetB-FosIn, которая подходит для роста широкого спектра анаэробных бактериальных видов. Аликвоты разведенной смеси C. difficile переносят в лунки 96-луночного планшета (180 мкл в каждую лунку). Затем добавляют 20 мкл подгруппы коровой экосистемы в каждую лунку в конечной концентрации 1e6 КОЕ/мл каждого вида. Как вариант, каждый вид может тестироваться в анализе при разных начальных концентрациях (1e9 КОЕ/мл, 1e8 КОЕ/мл, 1e7 КОЕ/мл, 1e5 КОЕ/мл, 1e4 КОЕ/мл, 1e3 КОЕ/мл, 1e2 КОЕ/мл). Контрольные лунки, инокулированные только C. difficile, включены для сравнения с ростом C. difficile без ингибирования. Дополнительные лунки используют для контролей, которые либо ингибируют, либо не ингибируют рост C. difficile. Одним из примеров положительного контроля, который ингибирует рост, является комбинация Blautia producta, Clostridium bifermentans и Escherichia coli. Одним из примеров контроля, демонстрирующего пониженное ингибирование роста C. difficile, является комбинация Bacteroides thetaiotaomicron, Bacteroides ovatus и Bacteroides vulgatus. Планшеты заворачивают в парафильм и инкубируют в течение 24 ч при 37°C в анаэробных условиях. Через 24 ч проводят серийные разведения содержимого лунок, содержащих только C. difficile, и высевают для определения титра. 96-луночный планшет замораживают при -80C до количественного определения C. difficile с применением анализа кПЦР.

[0397] Строят стандартную кривую на основе лунки из каждого аналитического планшета, содержащей только патогенный C. difficile, культивированный на среде SweetB + FosIn, и количественно определенный с применением селективного посева бляшкой. Серийные разведения культуры выполняют в стерильном забуференном фосфатом солевом растворе. Геномную ДНК экстрагируют из образцов, использованных для стандартной кривой, наряду с другими лунками.

[0398] Геномную ДНК экстрагируют из 5 мкл каждого образца с использованием протокола разведения, замораживания/оттаивания и термического лизиса. 5 мкл размороженных образцов добавляют в 45 мкл ультрачистой воды (UltraPure, Life Technologies, Карлсбад, Калифорния) и перемешивают пипетированием. Планшеты с разведенными образцами замораживают при -20 °C до использования для кПЦР, которая включает этап термического лизиса перед амплификацией. Как вариант, геномную ДНК выделяют с применением набора для выделения ДНК Mo Bio Powersoil^®-htp 96 Well Soil DNA Isolation Kit (Mo Bio Laboratories, Карлсбад, Калифорния), набора для выделения ДНК Mo Bio Powersoil^® DNA Isolation Kit (Mo Bio Laboratories, Карлсбад, Калифорния) или мининабора для выделения ДНК из стула QIAamp DNA Stool Mini Kit (QIAGEN, Валенсия, Калифорния) в соответствии с инструкциями производителя.

[0399] Реакционная смесь для кПЦР содержит 1× универсальных зондов SsoAdvanced Universal Probes Supermix, 900 нМ праймер Wr-tcdB-F (AGCAGTTGAATATAGTGGTTTAGTTAGAGTTG, IDT, Коралвилль, Айова), 900 нМ праймер Wr-tcdB-R (CATGCTTTTTTAGTTTCTGGATTGAA, IDT, Коралвилль, Айова), 250 нМ зонд Wr-tcdB-P (6FAM-CATCCAGTCTCAATTGTATATGTTTCTCCA-MGB, Life Technologies, Гранд-Айленд, Нью-Йорк) и воду для молекулярно-биологических целей (Mo Bio Laboratories, Карлсбад, Калифорния), до 18 мкл (модифицированные праймеры по: Wroblewski, D. et al., Rapid Molecular Characterization of Clostridium difficile and Assessment of Populations of C. difficile in Stool Specimens, Journal of Clinical Microbiology 47:2142-2148 (2009)). Аликвоты указанной реакционной смеси распределяют в лунки 96-луночного твердого тонкостенного низкопрофильного планшета для ПЦР с «юбкой» (BioRad, Геркулес, Калифорния). К указанной реакционной смеси добавляют 2 мкл разведенных, замороженных и размороженных образцов и планшет запечатывают герметизирующим материалом Microseal ‘B’ (BioRad, Геркулес, Калифорния). кПЦР выполняют на термоциклере BioRad C1000™, оборудованном системой реального времени CFX96™ Real-Time System (BioRad, Геркулес, Калифорния). Используют следующие условия термоциклирования: 95°C в течение 15 минут с последующим 45 циклами при 95°C по 5 секунд, 60°C по 30 секунд; флуоресценцию регистрируют в канале FAM. Как вариант, кПЦР выполняют другими стандартными способами, известными специалистам в данной области техники.

[0400] Значение Cq для каждой лунки в канале FAM определяют с помощью ПО CFX Manager™ 3.0. log₁₀(КОЕ/мл) C. difficile для каждого экспериментального образца рассчитывают подстановкой значения Cq для определенного образца в линейную регрессионную модель, установленную по стандартной кривой, сравнивающей значения Cq для лунок стандартной кривой с известными log₁₀(КОЕ/мл) для указанных образцов. Логарифмизированное ингибирование рассчитывают для каждого образца путем вычитания log₁₀(КОЕ/мл) C. difficile в образце из log₁₀(КОЕ/мл) C. difficile в образце на каждом аналитическом планшете, использованном для получения стандартной кривой, куда не добавлялись дополнительные бактерии. Среднее логарифмизированное ингибирование рассчитывают для всех повторностей для каждой композиции.

[0401] Строят гистограммы размаха и стандартного отклонения для каждой композиции. Значения размаха или стандартные отклонения логарифмизированного ингибирования, которые отклоняются от общего распределения, исследуют как вероятные выбросы. Если удаление одной точки данных логарифмизированного ингибирования из одной из бинарных пар, идентифицированных на гистограммах, приводит к согласованности размаха или стандартного отклонения со значениями для большинства образцов, указанную точку данных удаляют как выброс и производят перерасчет среднего логарифмизированного значения ингибирования.

[0402] Объединенную дисперсию для всех образцов, оцениваемых в анализе, определяют как среднее взвешенное значение дисперсий образцов с учетом числа степеней свободы образцов. Затем рассчитывают объединенную стандартную ошибку как квадратный корень объединенной дисперсии, разделенный на квадратный корень числа образцов. Доверительные интервалы для нулевой гипотезы определяют, умножая объединенную стандартную ошибку на z-показатель, соответствующий определенному процентному порогу. Средние логарифмизированные значения ингибирования за пределами доверительного интервала считают ингибирующими при положительных значениях, или стимулирующими при отрицательных значениях, при проценте достоверности, соответствующем используемому интервалу. Тройные комбинации со средним логарифмизированным значением ингибирования более чем 0,312 регистрируют как ++++ (≥ 99% доверительный интервал (ДИ) для нулевой гипотезы), со средним логарифмизированным значением ингибирования от 0,221 до 0,312 как +++ (95% < ДИ <99%), со средним логарифмизированным значением ингибирования от 0,171 до 0,221 как ++ (90% < ДИ <95%), со средним логарифмизированным значением ингибирования от 0,113 до 0,171 как + (80% < ДИ <90%), со средним логарифмизированным значением ингибирования от -0,113 и -0. 171 как - (80% < ДИ <90%), со средним логарифмизированным значением ингибирования от -0,171 до -0,221 как -- (90% < ДИ <95%), со средним логарифмизированным значением ингибирования от -0,221 до -0,312 как --- (95% < ДИ <99%) и со средним логарифмизированным значением ингибирования менее -0,312 как ---- (99% < ДИ).

Таблица GF. OTU и принадлежность их клад, протестированные в тройных комбинациях, с результатами анализа ингибирования in vitro

OTU1 Клада1 OTU2 Клада2 OTU3 Клада3 Результаты Clostridium_bolteae клада_408 Blautia_producta клада_309 Eubacterium_rectale клада_444 ++++ Clostridium_bolteae клада_408 Clostridium_symbiosum клада_408 Blautia_producta клада_309 ++++ Clostridium_bolteae клада_408 Clostridium_symbiosum клада_408 Eubacterium_rectale клада_444 - Clostridium_bolteae клада_408 Clostridium_symbiosum клада_408 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 - Clostridium_bolteae клада_408 Clostridium_symbiosum клада_408 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 Clostridium_bolteae клада_408 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 Blautia_producta клада_309 ++++ Clostridium_bolteae клада_408 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 Eubacterium_rectale клада_444 Clostridium_bolteae клада_408 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 ++++ Clostridium_bolteae клада_408 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 Blautia_producta клада_309 ++++ Clostridium_bolteae клада_408 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 Eubacterium_rectale клада_444 + Clostridium_symbiosum клада_408 Blautia_producta клада_309 Eubacterium_rectale клада_444 ++++ Clostridium_symbiosum клада_408 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 Blautia_producta клада_309 ++++ Clostridium_symbiosum клада_408 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 Eubacterium_rectale клада_444 Clostridium_symbiosum клада_408 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 + Clostridium_symbiosum клада_408 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 Blautia_producta клада_309 ++++ Clostridium_symbiosum клада_408 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 Eubacterium_rectale клада_444 Collinsella_aerofaciens клада_553 Blautia_producta клада_309 Eubacterium_rectale клада_444 ++++ Collinsella_aerofaciens клада_553 Clostridium_bolteae клада_408 Blautia_producta клада_309 ++++ Collinsella_aerofaciens клада_553 Clostridium_bolteae клада_408 Clostridium_symbiosum клада_408 ++++ Collinsella_aerofaciens клада_553 Clostridium_bolteae клада_408 Eubacterium_rectale клада_444 ++++ Collinsella_aerofaciens клада_553 Clostridium_bolteae клада_408 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 ++++ Collinsella_aerofaciens клада_553 Clostridium_bolteae клада_408 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 ++++ Collinsella_aerofaciens клада_553 Clostridium_symbiosum клада_408 Blautia_producta клада_309 ++++ Collinsella_aerofaciens клада_553 Clostridium_symbiosum клада_408 Eubacterium_rectale клада_444 Collinsella_aerofaciens клада_553 Clostridium_symbiosum клада_408 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 Collinsella_aerofaciens клада_553 Clostridium_symbiosum клада_408 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 + Collinsella_aerofaciens клада_553 Coprococcus_comes клада_262 Blautia_producta клада_309 ++++ Collinsella_aerofaciens клада_553 Coprococcus_comes клада_262 Clostridium_bolteae клада_408 ++++ Collinsella_aerofaciens клада_553 Coprococcus_comes клада_262 Clostridium_symbiosum клада_408 +++ Collinsella_aerofaciens клада_553 Coprococcus_comes клада_262 Eubacterium_rectale клада_444 +++ Collinsella_aerofaciens клада_553 Coprococcus_comes клада_262 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 ++++ Collinsella_aerofaciens клада_553 Coprococcus_comes клада_262 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 +++ Collinsella_aerofaciens клада_553 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 Blautia_producta клада_309 ++++ Collinsella_aerofaciens клада_553 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 Eubacterium_rectale клада_444 +++ Collinsella_aerofaciens клада_553 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 +++ Collinsella_aerofaciens клада_553 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 Blautia_producta клада_309 ++++ Collinsella_aerofaciens клада_553 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 Eubacterium_rectale клада_444 ++++ Coprococcus_comes клада_262 Blautia_producta клада_309 Eubacterium_rectale клада_444 ++++ Coprococcus_comes клада_262 Clostridium_bolteae клада_408 Blautia_producta клада_309 ++++ Coprococcus_comes клада_262 Clostridium_bolteae клада_408 Clostridium_symbiosum клада_408 Coprococcus_comes клада_262 Clostridium_bolteae клада_408 Eubacterium_rectale клада_444 - Coprococcus_comes клада_262 Clostridium_bolteae клада_408 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 +++ Coprococcus_comes клада_262 Clostridium_bolteae клада_408 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 +++ Coprococcus_comes клада_262 Clostridium_symbiosum клада_408 Blautia_producta клада_309 ++++ Coprococcus_comes клада_262 Clostridium_symbiosum клада_408 Eubacterium_rectale клада_444 - - Coprococcus_comes клада_262 Clostridium_symbiosum клада_408 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 Coprococcus_comes клада_262 Clostridium_symbiosum клада_408 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 Coprococcus_comes клада_262 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 Blautia_producta клада_309 ++++ Coprococcus_comes клада_262 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 Eubacterium_rectale клада_444 - Coprococcus_comes клада_262 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 Coprococcus_comes клада_262 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 Blautia_producta клада_309 ++++ Coprococcus_comes клада_262 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 Eubacterium_rectale клада_444 Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 Blautia_producta клада_309 Eubacterium_rectale клада_444 ++++ Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 Blautia_producta клада_309 ++++ Faecalibacterium_prausnitzii клада_478 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 Eubacterium_rectale клада_444 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 Blautia_producta клада_309 Eubacterium_rectale клада_444 ++++

[0403] Анализ CivSim показывает, что многие тройные комбинации ингибируют C. difficile. 39 из 56 комбинаций демонстрировали ингибирование с доверительным интервалом >80%; 36 из 56 с ДИ > 90%; 36 из 56 с ДИ > 95%; 29 из 56 с ДИ >99%. Неограничивающие примеры тройных комбинаций включают комбинации со средним логарифмизированным снижением более чем на 0,171, например, любую комбинацию из приведенных в таблице 6 с показателем ++++, например, Colinsella aerofaciens, Coprococcus comes и Blautia producta. Что не менее важно, анализ CivSim описывает тройные комбинации, эффективно не ингибирующие C. difficile. 5 из 56 комбинаций способствуют росту с достоверностью >80%; 2 из 56 способствуют росту с достоверностью>90%; 1 из 56, Coprococcus comes, Clostridium symbiosum и Eubacterium rectale, способствуют росту с достоверностью >95%. 12 из 56 комбинаций нейтральны по оценке в указанном анализе, что означает, что они не способствуют росту и не ингибируют рост C. difficile в измеряемых пределах.

[0404] Для специалиста в данной области техники очевидна возможность использования метода CivSim для определения эффективных подгрупп коровой экосистемы, полученных из обработанной этанолом споровой фракции и продемонстрировавших эффективность для лечения от C. difficile у человека.

Пример AAZA: Бактериальные композиции, заселяющие ЖКТ в модели на мышах.

[0405] В модели на мышах оценивали способность двух бактериальных композиций заселять желудочно-кишечный тракт. Бактерии культивировали согласно описанию в ***примере 14. Композиции предварительно получали в анаэробных условиях и суспендировали в ФСБ + 15% глицерина и хранили при ≥-70°C до использования.

[0406] Группы мышей (10 самок/группу; 5 на клетку) получали предварительное лечение на -14 - -5 дни коктейлем антибиотиков, состоящим из 10% глюкозы, канамицина (0,5 мг/мл), гентимицина (0,044 мг/мл), колистина (1062,5 ед/мл), метронидазола (0,269 мг/мл), ципрофлоксацина (0,156 мг/мл), ампициллина (0,1 мг/мл) и ванкомицина (0,056 мг/мл) в питьевой воде. На -3 день они получали 10 мг/кг клиндамицина через оральный зонд. На день -1 их дозировали композициями с микроорганизмами через оральный зонд в объеме 0,2 мл (таблица ZA). Композиции с микроорганизмами содержали приблизительно равные количества каждой OTU и вводились в дозах приблизительно 1×10⁹, 1×10⁸ и 1×10⁷ на OTU для каждой композиции (например, композицию с микроорганизмами 1, содержащую 15 штаммов, вводили в дозах приблизительно 1,5×10¹⁰, 1,5×10⁹ и 1,5×10⁸ общих КОЕ). Образцы фекалий собирали из каждой клетки на -1 день (приблизительно за 1 час до дозирования) и на 2, 3 и 4 дни после дозирования. Экскременты хранили в замороженном виде до обработки и секвенирования. Изменения массы тела мышей, получавших лечение любыми композициями с микроорганизмами, были аналогичны наблюдаемым у нестимулированных контрольных мышей.

[0407] Параллельно группы животных, получавших лечение теми же композициями с микроорганизмами на день -1, стимулировали на 0 день приблизительно 10^4,5 споры Clostridium difficile (ATCC 43255) через оральный зонд. Смертность стимулированных C. difficile животных оценивали каждый день с дня 0 до дня 6; оценивали массу тела и последующее изменение массы тела у животного, считая снижение массы тела связанным с инфекцией C. difficile. Понижение смертности и снижения массы тела при применении тестируемого состава по сравнению с пустой основой использовали для оценки успешности применения тестируемого состава.

Таблица ZA. Композиции с микроорганизмами, введенная через оральный зонд на день -1

OTU Клада Композиция с микроорганизмами 1 Clostridium_butyricum клада_252 Clostridium_disporicum клада_253 Clostridium_hylemonae клада_260 Clostridium_orbiscindens клада_494 Clostridium_symbiosum клада_408 Collinsella_aerofaciens клада_553 Coprococcus_comes клада_262 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 Ruminococcus_bromii клада_537 Blautia_producta клада_309 Clostridium_bolteae клада_408 Clostridium_innocuum клада_351 Clostridium_mayombei клада_354 Clostridium_tertium клада_252 Ruminococcus_gnavus клада_360 Композиция с микроорганизмами 2 Clostridium_disporicum клада_253 Clostridium_orbiscindens клада_494 Clostridium_symbiosum клада_408 Collinsella_aerofaciens клада_553 Eubacterium_rectale клада_444 Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA клада_260 Blautia_producta клада_309 Clostridium_innocuum клада_351 Clostridium_mayombei клада_354

[0408] Образцы фекалий обрабатывали путем выделения и секвенирования ДНК в соответствии с ***примерами 11 и 12. Определение принадлежности OTU из образцов фекалий дней -1, 2, 3 и 4 проводили путем анализа прочтений последовательностей 16S-V4 и распределения OTU согласно описанию в ***примере 11. Клады распределяли согласно описанию в ***примере 11. Общее число прочтений определяли для каждой OTU или каждой клады путем суммирования результатов для клеток одной экспериментальной группы. Образцы с 10 или менее прочтениями последовательностей для определенной OTU или клады считали соответствующими уровню ниже фонового и не включали в процесс суммирования. Результаты представлены по OTU (Таблица TAB) и по кладам (Таблица TAC).

Таблица TAB. Популяция OTU на дни 2, 3 и 4 после дозирования композициями с микроорганизмами

Таблица TAC. Популяция клад на дни 2, 3 и 4 после дозирования композициями с микроорганизмами

1×10⁹ на OTU 1×10⁸ на OTU 1×10⁷ на OTU Композиция с микроорганизмами 1 -1 2 3 4
-1 2 3 4
-1 2 3 4 клада_252 0 444 252 87
0 198 122 125
209 394 231 88 клада_253 10 1746 1190 887
0 1746 769 1011
201 11175 1531 1152 клада_260 0 599 594 438
0 554 346 433
0 521 454 390 клада_262 0 14 151 51
0 0 0 0
0 12 21 57 клада_309 0 11093 9750 4023
0 9991 5208 5145
19 9311 6369 4951 клада_351 0 9064 10647 7751
0 6528 7259 8213
0 8903 10049 8701 клада_354 0 0 0 0
0 0 0 31
173 0 0 0 клада_360 0 14300 10220 11036
0 12553 12989 6889
0 9308 13483 9292 клада_408 13 8892 12985 12101
23 3952 7260 10652
43 4079 8581 14929 клада_494 0 226 227 565
0 188 184 411
0 221 200 351 клада_537 0 0 68 225
0 0 0 0
0 0 0 55 клада_553 0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0














Композиция с микроорганизмами 2 -1 2 3 4
-1 2 3 4
-1 2 3 4 клада_253 29 11810 10948 14672
0 11349 13978 3942
0 11995 7005 6268 клада_260 0 1125 1312 854
0 1049 1295 1250
0 792 2121 1637 клада_309 54 12513 13731 7849
0 11610 12004 12672
0 7407 14111 10858 клада_351 0 7651 9939 5936
0 8495 9724 9207
0 6005 9833 7655 клада_354 149 0 127 429
0 0 0 39
12 0 0 0 клада_408 18 2242 4989 10480
12 1688 5580 3789
0 1068 1561 6281 клада_444 41 0 49 202
0 18 0 12
0 14 82 1578 клада_494 0 510 465 1054
0 332 565 596
0 310 319 476 клада_553 0 0 0 0
0 0 1172 0
0 0 247 0

[0409] При изучении данных по OTU в таблице TAB обнаруживается несколько паттернов. Во-первых, наблюдается группа OTU без прочтений последовательностей на -1 день, демонстрирующая впоследствии значительное число прочтений последовательностей на 2, 3 или 4 день; указанная группа включает Cl. butyricum, Cl. hylemonae, Cl. orbiscindens, Cl. symbiosum, и бактерию L._5_1_57FAA. Данные для Cl. disporicum сопоставимы с указанной группой, поскольку для нее число прочтений последовательностей на -1 день очень близко к фоновому (10 и 29 в композициях 1 и 2, соответственно), но затем оно возрастает до 1000-кратного на 2, 3 или 4 день. Во-вторых, наблюдаются OTU, например, Co. aerofaciens, C. comes, R. bromii, B. producta, Cl. bolteae, Cl. mayombei, Cl. innocuum, Cl. tertium и R. gnavus, которые не детектируются на уровне OTU ни в образце -1 дня, ни в последующих образцах. В композиции 2 Co. aerofaciens детектируют временно на 2 день в группах, получавших дозы 1×10⁸ и 1×10⁷; E. rectale в той же экспериментальной группе детектируют на 3 день, что указывает на возможное наличие взаимосвязи между временным заселением Co. aerofaciens и последующим заселением E. rectale в указанных группах мышей. Неожиданное наблюдение заключается в том, что наблюдаемое число прочтений последовательностей OTU не является в большой степени дозозависимым. В целом, указанные данные согласуются с моделью, согласно которой происходит быстрое заселение OTU после перорального введения.

[0410] Основанный на кладах анализ в таблице TAC выполняли для более тщательной оценки популяции в ЖКТ. Основанный на кладах анализ не выявляет некоторые детали, которые позволяет обнаружить анализ OTU. Например, Cl. tertium и Cl. butyricum являются представителями одной и той же клады, и, соответственно, основанный на кладах анализ не позволяет различить динамику указанных индивидуальных OTU. Тем не менее, основанный на кладах анализ обеспечивает компенсирующее преимущество, поскольку он чувствителен в отношении измерения изменений популяции, которые может не учитывать анализ на основе OTU. Возможность с помощью 16S-V4-идентификации OTU определить принадлежность OTU к конкретному виду зависит отчасти от разрешающей способности области 16S-V4 область для конкретного вида или группы видов. Как плотность доступных референсных последовательностей 16S для разных областей указанного дерева, так и свойственная гену 16S вариабельность у разных видов определяют точность таксономической классификации. Таким образом, в некоторых случаях популяция видов может отслеживаться с применением основанного на кладах определения принадлежности, если детекция на основе OTU в сложной популяции недостаточно чувствительна. Например, основанный на кладах анализ в таблице 2B подтверждает, что R. bromii, B. producta, Cl. innocuum и R. gnavus были способны к заселению, поскольку каждая OTU представляет одного представителя клады в композиции с микроорганизмами, а число прочтений последовательностей от недетектируемого на -1 день увеличивалось до значительного отличия от фона на 2, 3 или 4 день. Секвенирование V4 16S и основанный на кладах анализ не позволили определить, происходило заселение Cl. tertium или Cl. bolteae, поскольку присутствовали другие представители их клад (Cl. butyricum и Cl. symbiosum, соответственно) и, как было показано на уровне OTU, они заселяли организм мышей.

[0411] Мыши, параллельно стимулированные C. difficile, были в значительно степени защищены, как видно из таблицы TAD. Среди мышей, которым вводили через зонд носитель (забуференный фосфатом солевой раствор), наблюдалась 100% смертность, тогда как композиции с микроорганизмами 1 и 2 оказывали защитное действие при всех уровнях доз, при смертности от 0 до 10% к 6 дню, последнему дню эксперимента. Кроме того, снижение массы тела у животных, получавших лечение композициями с микроорганизмами 1 и 2, было минимальным по сравнению с животными, получавшими через зонд основу. Указанные данные подтверждают, что заселение желудочно-кишечного тракта композициями с микроорганизмами оказывает благоприятный клинический эффект, устраняя состояние дисбиоза, так что животные способны противостоять инфекции патогеном.

Таблица TAD. Смертность в экспериментальной группе мышей, стимулированных спорами 10^4,5 C. difficile на 0 день

Группа Доза (КОЕ на OTU) Смерти (% смертности) Контроль-носитель Н/О 10 (100%) Композиция с микроорганизмами 1 109 1 (10%)
108 1 (10%)
107 0 (0%) Композиция с микроорганизмами 2 109 0 (0%)
108 1 (10%)
107 1 (10%)

Пример 36: Профилактическое использование и лечение колонизации устойчивым к ванкомицину энтерококком (VRE) в модели на мышах

[0412] Появление и распространение высокоустойчивых к антибиотикам бактерий представляет важную клиническую проблему (Snitkin et al Science Translational Medicine, 2012). В последние годы число инфекций, вызываемых такими организмами, как устойчивый к метициллину Staphylococcus aureus, устойчивые к карбапенему Enterobacteriaceae, устойчивые к ванкомицину Enterococcus (VRE) и Clostridium difficile, значительно выросло, и многие из указанных штаммов приобретают устойчивость к немногочисленным сохраняющим эффективность антибиотикам. Большинство инфекций, вызванных высокоустойчивыми к антибиотикам бактериями, приобретаются при госпитализации, и предотвращение передачи от пациента к пациенту указанных патогенов представляет собой одну из главных проблем, с которыми сталкиваются больницы и клиники. Большинство высокоустойчивых к антибиотикам бактериальных штаммов принадлежат родам, колонизирующим поверхности слизистых оболочек, обычно с низкой плотностью. Микробиота с весьма сложным составом, в норме колонизирующая поверхности слизистых оболочек, ингибирует размножение и доминирование таких бактерий, как Enterobacteriaceae и Enterococcaceae. Разрушение нормальной флоры в результате введения антибиотиков, тем не менее, приводит к прекращению ингибирования устойчивых к антибиотикам представителей указанных бактериальных семейств, приводя к их размножению до очень высокой численности (Ubeda et al Journal of Clinical Investigation 2010). Колонизация указанными организмами в высокой концентрации может быть губительной для восприимчивого пациента, приводя к бактериемии и сепсису (Taur et al, Clinical Infectious Disease, 2012).

[0413] Для тестирования применения тестируемого состава с бактериальной композицией, например, популяции спор, для профилактики и лечения инфекции VRE используют модель на мышах согласно вышеприведенному описанию (Ubeda et al, Infectious Immunity 2013, Ubeda et al, Journal of clinical investigation, 2010). Вкратце, эксперименты проводят на самках мышей C57BL/6J возрастом 7 недель, приобретаемых у Jackson Laboratory, размещали с доступом к обработанной облучением пище и представляли подкисленную воду. Мышей размещают в индивидуальных помещениях, чтобы избежать взаимного заражения в результате копрофагии. В случае экспериментальных инфекций VRE мыши получали лечение ампициллином (0,5 г/л) в питьевой воде, которую меняли каждые 3 дня.

[0414] В модели лечения на 1 день мышей инфицируют с использованием орального зонда 10⁸ КОЕ устойчивого к ванкомицину штамма Enterococcus faecium, приобретенного у ATCC (ATCC 700221). Через день после инфицирования (день 1) лечение антибиотиками прекращают и определяют уровни VRE в разные моменты времени путем посева серийных разведений осажденных фекалий на планшеты с агаром Enterococcosel (Difco) с ванкомицином (8 мкг/мл; Sigma). Колонии VRE идентифицируют по внешнему виду и подтверждают путем окрашивания по Граму или других ранее описанных способов (см., например, пример 1, 2 и 3). Кроме того, согласно вышеприведенному описанию (Ubeda et al Journal of Clinical Investigation 2010), ПЦР гена vanA, который придает устойчивость к ванкомицину, подтверждает присутствие VRE у инфицированных мышей. Тестируемый состав, например, бактериальную композицию или обработанный этанолом очищенный в градиенте состав со спорами (согласно описанию в настоящем документе), суспензию фекалий или антибиотики для лечения вводят в ФСБ на 1-3 день, при этом отрицательный контроль содержит только ФСБ и также вводится на 1-3 день через оральный зонд. Свежие осажденные фекалии получают ежедневно на протяжении эксперимента от -7 дня до 10 дня. Образцы немедленно замораживают и хранят при -80°C. ДНК экстрагировали с применением стандартных техник и анализировали с помощью 16S или сопоставимых способов (см., например, пример 2 и 3).

[0415] В модели колонизации ампициллин вводят согласно описанию выше для дня -7 - дня 1, лечение тестируемым составом или контролем-носителем проводят на день 0-2, и устойчивые бактерии VRE в концентрации 10⁸ КОЕ вводят на 14 день. Образцы фекалий отбирают на протяжении всего эксперимента ежедневно от -7 дня до 21 дня и используют для 16S-секвенирования согласно вышеприведенному описанию (см., например, примеры 2 и 3).

[0416] В обеих моделях титры VRE в экскрементах используют для оценки успешности тестируемого состава относительно отрицательного контроля. Кроме того, оценивают состав микробиоты в отношении способности тестируемого состава индуцировать формирование здорового микробиома.

Пример 37: Профилактическое использование и лечение колонизации устойчивой к карбапенемам клебсиеллой (CRKB) в модели на мышах

[0417] Появление штаммов Klebsiella pneumoniae с пониженной восприимчивостью к карбапенемам представляет собой серьезную угрозу для госпитализированных пациентов. Устойчивость к карбапенемам у указанных организмов чаще всего опосредует карбапенемаза K. pneumoniae (KPC), класс A бета-лактамаз, который также придает устойчивость к цефалоспоринам широкого спектра и коммерчески доступным комбинациям ингибиторов бета-лактамов/бета-лактамаз (Queenan et al, Clinical Microbiology Review, 2007). Продуцирующие KPC штаммы K. pneumoniae (KPC-Kp) часто несут детерминанты, придающие устойчивость против нескольких других классов противомикробных средств, в том числе аминогликозидов и фторхинолонов, что приводит к появлению обладающих действительно множественной лекарственной устойчивостью (MDR) организмов (Hirsch et al, Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 2009). Учитывая ограниченные возможности противомикробной терапии, инфекции, вызываемые KPC-Kp, представляют огромную терапевтическую проблему и связаны с неблагоприятными клиническими исходами.

[0418] Протокол лечения в модели на мышах согласно вышеприведенному описанию (например, Perez et al, Antimicrobial Agents Chemotherapy, 2011) используют для оценки тестируемого состава, например, бактериальной композиции, лечить устойчивые к карбапенемам Klebsiella и уменьшать носительство в ЖКТ. Используют самок мышей CF1 (Harlan Sprague-Dawley, Индианаполис, Индиана), которых содержат в отдельных помещениях, весом от 25 до 30 г.

[0419] Подробно описанный штамм K. pneumoniae, VA-367 (8, 9, 25), используют для указанного исследования. Указанный клинический изолят является генетически родственным штамму KPC-Kp, циркулирующему на востоке США. Определение механизмов устойчивости у K. pneumoniae VA-367 посредством анализа ПЦР и последовательностей ДНК показало присутствие bla_KPC-3, bla_TEM-1, bla_SHV-11, и bla_SHV-12, а также qnrB19 и aac(6’)-lb. Кроме того, ПЦР и секвенирование ДНК показали наличие повреждений в кодирующих последовательностях следующих генов белков внешней мембраны: ompK35, ompK36 и ompK37. Тестирование на восприимчивость к антибиотикам (AST) выполняли методом разведений на агаре и интерпретировали в соответствии с текущими рекомендациями Института клинических и лабораторных стандартов (CLSI). Проводили модифицированный тест Ходжа в соответствии с описанным ранее способом (см., например, Anderson et al, Journal of Clinical Microbiology, 2007) с эртапенемом, меропенемом и имипенемом. Тигециклин и полимиксин E оценивали с помощью анализов на восприимчивость E-test (AB bioMerieux, Сольна, Швеция). Результаты для тигециклина интерпретировали в соответствии с рекомендациями Управления по контролю за пищевыми продуктами и лекарственными средствами США (FDA) и в соответствии с рекомендациями CLSI (критерии для Pseudomonas) для полимиксина E.

[0420] Мышей (по 10 на группу) распределяют в группы для получения тестируемого состава, например, бактериальной композиции, обработанного этанолом состава со спорами (см., например, пример 6), антибиотика клиндамицина, пиперациллин-тазобактам, тигециклин, эртапенем, цефепим, ципрофлоксацина или их комбинации, или в контрольную группу, получающую только основу. Им вводят тестируемый состав ежедневно от -10 дня до 0 дня. На 0 день 10³ КОЕ KPC-Kp VA-367, разведенного в 0,5 мл забуференного фосфатом солевого раствора (ФСБ) вводили через оральный зонд с применением питательной трубки из нержавеющей стали (Perfektum; Popper & Sons, Нью Гайд-парк, Нью-Йорк). Образцы стула собирали на 1, 4, 6, и 11 день после введения KPC-Kp для измерения концентрации устойчивой к карбапенему K. pneumoniae. Образцы стула (100 мг, разведенные в 800 мл ФСБ) высевают на агар Мак-Конки с 0,5 мкг/мл имипенема и без имипенема, и определяли число КОЕ на грамм стула. Как вариант, могут быть использованы другие способы измерения уровней устойчивой к карбапенему K. pneumonia, например, ПЦР, тестирование на антигены, которые может использовать специалист в данной области техники.

[0421] Образцы стула собирали через 5 дней лечения для оценки эффектов антибиотиков микрофлору стула и для измерения уровней антибиотика в стуле. Для оценки эффектов на микрофлору использовали свежие образцы стула согласно вышеприведенному описанию (см., например, примеры 2 и 3). Проводят дополнительные эксперименты для исследования того, приводило ли введение тестируемого состава, например, бактериальной композиции, к элиминированию или сохранению колонизации KPC-Kp VA-367.

[0422] Мыши получали лечение клиндамицином подкожно для уменьшения численности нормальной кишечной флоры за 1 день до получения 10⁴ КОЕ KPC-Kp VA-367 через оральный зонд, и указанные мыши продолжали получать клиндамицин подкожно через день в течение 7 дней. Параллельно, в течение 7 дней после дозирования KPC-Kp через оральный зонд мыши получали через оральный зонд обычный солевой раствор (контрольная группа) или бактериальную композицию согласно описанию. Дополнительную дозу клиндамицина вводили подкожно через 20 дней после введения KPC-Kp VA-367 для оценки того, могли ли присутствовать низкие уровни устойчивого к карбапенему K. pneumoniae, который может стимулироваться при элиминировании анаэробной микрофлоры. Образцы стула собирали в исходный момент и на 3, 6, 8, 11, 16, и 21 день после введения KPC-Kp VA-367 через зонд. Бактериальную композицию оценивают по снижению уровня CRKB в экскрементах.

[0423] Если не указано иное, все численные значения, выражающие количества ингредиентов, реакционные условия и т.п., используемые в описании, в том числе формуле изобретения, следует во всех случаях понимать как модифицированные термином «приблизительно». Соответственно, если не указано иное, численные показатели являются приблизительными и могут варьировать в зависимости от требуемых свойств, которые необходимо получить. Как минимум, не в качестве попытки ограничения применения доктрины эквивалентов к объему формулы изобретения, каждый численный показатель должен рассматриваться в свете значащих цифр и обычных способов округления.

[0424] Если не указано иное, термин «по меньшей мере» перед группой элементов следует понимать как относящийся к каждому элементу в указанной группе.

[0425] Несмотря на то, что настоящее изобретение было конкретным образом продемонстрировано и описано с использованием ссылок на предпочтительные варианты реализации и различные альтернативные варианты реализации, специалисты в соответствующей области техники должны понимать, что различные изменения формы и деталей могут быть произведены без отступления от сущности и объем изобретения.

[0426] Все источники, выданные патенты и патентные заявки, цитируемые в тексте настоящего описания включены в настоящий документ посредством ссылки полностью и для любых целей.

дополнительные таблицы

Таблица 1: Перечень функциональных таксономических единиц (OTU) с таксономической классификацией до рода, вида и филогенетической клады

[0427] Принадлежность клад бактериальных OTU основана на данных о последовательностях 16S. Клады определяют на основании топологии филогенетического дерева, сконструированного на основании полноразмерных последовательностей 16S с применением методов максимального правдоподобия, известных специалистам в области филогенетики. Клады конструируют для подтверждения того, что все OTU в определенной кладе: (i) расположены в пределах определенного числа узлов с бутстреп-поддержкой друг от друга, и (ii) отличаются не более чем на 5% в отношении генетического сходства. OTU, принадлежащие одной кладе, можно определить как генетически и филогенетически отличные от OTU другой клады на основании данных секвенирования 16S-V4, тогда как OTU, попадающие в одну кладу, являются близкородственными. OTU, попадающие в одну кладу, являются эволюционно близкородственными и могут быть отличимы или неотличимы друг от друга на основании данных секвенирования 16S-V4. Представители одной клады, благодаря эволюционному родству, играют аналогичные функциональные роли в экогруппе микроорганизмов, например, обнаруживаемых в кишечнике человека. Композиции, где одни виды замещены другими из той же клады, предположительно сохраняют консервативную экологическую функцию и, соответственно, подходят для применения в настоящем изобретении. Для всех OTU обозначено наличие предполагаемой способности образовывать споры и то, являются ли они патогенными или патобионтными (см. определения для описания «патобионта»). Приоритетные патогены по классификации NIAID обозначены как «категория A», «категория B» или «категория C», а оппортунистические патогены обозначены как «ОП». OTU, которые не являются патогенными, или способность которых существовать в виде патогенов неизвестна, обозначены отметкой «НЕТ». «SEQ ID №» соответствует идентификатору OTU в Перечне последовательностей, а «№ доступа в общедоступной базе данных» соответствует идентификатору OTU в общедоступной базе последовательностей.

OUT SEQ ID № № доступа в общедоступной базе данных Клада Спорообразователи Патогенный статус Eubacterium saburreum 858 AB525414 клада_178 ДА НЕТ Eubacterium sp., оральный клон IR009 866 AY349376 клада_178 ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae ICM62 1061 HQ616401 клада_178 ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae MSX33 1062 HQ616384 клада_178 ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae, оральный таксон 107 1063 ADDS01000069 клада_178 ДА НЕТ Alicyclobacillus acidocaldarius 122 NR_074721 клада_179 ДА НЕТ Clostridium baratii 555 NR_029229 клада_223 ДА НЕТ Clostridium colicanis 576 FJ957863 клада_223 ДА НЕТ Clostridium paraputrificum 611 AB536771 клада_223 ДА НЕТ Clostridium sardiniense 621 NR_041006 клада_223 ДА НЕТ Eubacterium budayi 837 NR_024682 клада_223 ДА НЕТ Eubacterium moniliforme 851 HF558373 клада_223 ДА НЕТ Eubacterium multiforme 852 NR_024683 клада_223 ДА НЕТ Eubacterium nitritogenes 853 NR_024684 клада_223 ДА НЕТ Anoxybacillus flavithermus 173 NR_074667 клада_238 ДА НЕТ Bacillus aerophilus 196 NR_042339 клада_238 ДА НЕТ Bacillus aestuarii 197 GQ980243 клада_238 ДА НЕТ Bacillus amyloliquefaciens 199 NR_075005 клада_238 ДА НЕТ Bacillus anthracis 200 AAEN01000020 клада_238 ДА Категория A Bacillus atrophaeus 201 NR_075016 клада_238 ДА ОП Bacillus badius 202 NR_036893 клада_238 ДА ОП Bacillus cereus 203 ABDJ01000015 клада_238 ДА ОП Bacillus circulans 204 AB271747 клада_238 ДА ОП Bacillus firmus 207 NR_025842 клада_238 ДА ОП Bacillus flexus 208 NR_024691 клада_238 ДА ОП Bacillus fordii 209 NR_025786 клада_238 ДА ОП Bacillus halmapalus 211 NR_026144 клада_238 ДА ОП Bacillus herbersteinensis 213 NR_042286 клада_238 ДА ОП Bacillus idriensis 215 NR_043268 клада_238 ДА ОП Bacillus lentus 216 NR_040792 клада_238 ДА ОП Bacillus licheniformis 217 NC_006270 клада_238 ДА ОП Bacillus megaterium 218 GU252124 клада_238 ДА ОП Bacillus nealsonii 219 NR_044546 клада_238 ДА ОП Bacillus niabensis 220 NR_043334 клада_238 ДА ОП Bacillus niacini 221 NR_024695 клада_238 ДА ОП Bacillus pocheonensis 222 NR_041377 клада_238 ДА ОП Bacillus pumilus 223 NR_074977 клада_238 ДА ОП Bacillus safensis 224 JQ624766 клада_238 ДА ОП Bacillus simplex 225 NR_042136 клада_238 ДА ОП Bacillus sonorensis 226 NR_025130 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. 10403023 MM10403188 227 CAET01000089 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. 2_A_57_CT2 230 ACWD01000095 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. 2008724126 228 GU252108 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. 2008724139 229 GU252111 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. 7_16AIA 231 FN397518 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. AP8 233 JX101689 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. B27(2008) 234 EU362173 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. BT1B_CT2 235 ACWC01000034 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. GB1.1 236 FJ897765 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. GB9 237 FJ897766 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. HU19.1 238 FJ897769 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. HU29 239 FJ897771 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. HU33.1 240 FJ897772 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. JC6 241 JF824800 клада_238 ДА ОП Bacillus sp., оральный таксон F79 248 HM099654 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. SRC_DSF1 243 GU797283 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. SRC_DSF10 242 GU797292 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. SRC_DSF2 244 GU797284 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. SRC_DSF6 245 GU797288 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. tc09 249 HQ844242 клада_238 ДА ОП Bacillus sp. zh168 250 FJ851424 клада_238 ДА ОП Bacillus sphaericus 251 DQ286318 клада_238 ДА ОП Bacillus sporothermodurans 252 NR_026010 клада_238 ДА ОП Bacillus subtilis 253 EU627588 клада_238 ДА ОП Bacillus thermoamylovorans 254 NR_029151 клада_238 ДА ОП Bacillus thuringiensis 255 NC_008600 клада_238 ДА ОП Bacillus weihenstephanensis 256 NR_074926 клада_238 ДА ОП Geobacillus kaustophilus 933 NR_074989 клада_238 ДА НЕТ Geobacillus stearothermophilus 936 NR_040794 клада_238 ДА НЕТ Geobacillus thermodenitrificans 938 NR_074976 клада_238 ДА НЕТ Geobacillus thermoglucosidasius 939 NR_043022 клада_238 ДА НЕТ Lysinibacillus sphaericus 1193 NR_074883 клада_238 ДА НЕТ Clostridiales sp. SS3_4 543 AY305316 клада_246 ДА НЕТ Clostridium beijerinckii 557 NR_074434 клада_252 ДА НЕТ Clostridium botulinum 560 NC_010723 клада_252 ДА Категория A Clostridium butyricum 561 ABDT01000017 клада_252 ДА НЕТ Clostridium chauvoei 568 EU106372 клада_252 ДА НЕТ Clostridium favososporum 582 X76749 клада_252 ДА НЕТ Clostridium histolyticum 592 HF558362 клада_252 ДА НЕТ Clostridium isatidis 597 NR_026347 клада_252 ДА НЕТ Clostridium limosum 602 FR870444 клада_252 ДА НЕТ Clostridium sartagoforme 622 NR_026490 клада_252 ДА НЕТ Clostridium septicum 624 NR_026020 клада_252 ДА НЕТ Clostridium sp. 7_2_43FAA 626 ACDK01000101 клада_252 ДА НЕТ Clostridium sporogenes 645 ABKW02000003 клада_252 ДА НЕТ Clostridium tertium 653 Y18174 клада_252 ДА НЕТ Clostridium carnis 564 NR_044716 клада_253 ДА НЕТ Clostridium celatum 565 X77844 клада_253 ДА НЕТ Clostridium disporicum 579 NR_026491 клада_253 ДА НЕТ Clostridium gasigenes 585 NR_024945 клада_253 ДА НЕТ Clostridium quinii 616 NR_026149 клада_253 ДА НЕТ Clostridium hylemonae 593 AB023973 клада_260 ДА НЕТ Clostridium scindens 623 AF262238 клада_260 ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae 5_1_57FAA 1054 ACTR01000020 клада_260 ДА НЕТ Clostridium glycyrrhizinilyticum 588 AB233029 клада_262 ДА НЕТ Clostridium nexile 607 X73443 клада_262 ДА НЕТ Coprococcus comes 674 ABVR01000038 клада_262 ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae 1_1_57FAA 1048 ACTM01000065 клада_262 ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae 1_4_56FAA 1049 ACTN01000028 клада_262 ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae 8_1_57FAA 1057 ACWQ01000079 клада_262 ДА НЕТ Ruminococcus lactaris 1663 ABOU02000049 клада_262 ДА НЕТ Ruminococcus torques 1670 AAVP02000002 клада_262 ДА НЕТ Paenibacillus lautus 1397 NR_040882 клада_270 ДА НЕТ Paenibacillus polymyxa 1399 NR_037006 клада_270 ДА НЕТ Paenibacillus sp. HGF5 1402 AEXS01000095 клада_270 ДА НЕТ Paenibacillus sp. HGF7 1403 AFDH01000147 клада_270 ДА НЕТ Eubacterium sp., оральный клон JI012 868 AY349379 клада_298 ДА НЕТ Alicyclobacillus contaminans 124 NR_041475 клада_301 ДА НЕТ Alicyclobacillus herbarius 126 NR_024753 клада_301 ДА НЕТ Alicyclobacillus pomorum 127 NR_024801 клада_301 ДА НЕТ Blautia coccoides 373 AB571656 клада_309 ДА НЕТ Blautia glucerasea 374 AB588023 клада_309 ДА НЕТ Blautia glucerasei 375 AB439724 клада_309 ДА НЕТ Blautia hansenii 376 ABYU02000037 клада_309 ДА НЕТ Blautia luti 378 AB691576 клада_309 ДА НЕТ Blautia product 379 AB600998 клада_309 ДА НЕТ Blautia schinkii 380 NR_026312 клада_309 ДА НЕТ Blautia sp. M25 381 HM626178 клада_309 ДА НЕТ Blautia stercoris 382 HM626177 клада_309 ДА НЕТ Blautia wexlerae 383 EF036467 клада_309 ДА НЕТ Bryantella formatexigens 439 ACCL02000018 клада_309 ДА НЕТ Clostridium coccoides 573 EF025906 клада_309 ДА НЕТ Eubacterium cellulosolvens 839 AY178842 клада_309 ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae 6_1_63FAA 1056 ACTV01000014 клада_309 ДА НЕТ Ruminococcus hansenii 1662 M59114 клада_309 ДА НЕТ Ruminococcus obeum 1664 AY169419 клада_309 ДА НЕТ Ruminococcus sp. 5_1_39BFAA 1666 ACII01000172 клада_309 ДА НЕТ Ruminococcus sp. K_1 1669 AB222208 клада_309 ДА НЕТ Syntrophococcus sucromutans 1911 NR_036869 клада_309 ДА НЕТ Bacillus alcalophilus 198 X76436 клада_327 ДА НЕТ Bacillus clausii 205 FN397477 клада_327 ДА ОП Bacillus gelatini 210 NR_025595 клада_327 ДА ОП Bacillus halodurans 212 AY144582 клада_327 ДА ОП Bacillus sp., оральный таксон F26 246 HM099642 клада_327 ДА ОП Clostridium innocuum 595 M23732 клада_351 ДА НЕТ Clostridium sp. HGF2 628 AENW01000022 клада_351 ДА НЕТ Clostridium perfringens 612 ABDW01000023 клада_353 ДА Категория B Sarcina ventriculi 1687 NR_026146 клада_353 ДА НЕТ Clostridium bartlettii 556 ABEZ02000012 клада_354 ДА НЕТ Clostridium bifermentans 558 X73437 клада_354 ДА НЕТ Clostridium ghonii 586 AB542933 клада_354 ДА НЕТ Clostridium glycolicum 587 FJ384385 клада_354 ДА НЕТ Clostridium mayombei 605 FR733682 клада_354 ДА НЕТ Clostridium sordellii 625 AB448946 клада_354 ДА НЕТ Clostridium sp. MT4 E 635 FJ159523 клада_354 ДА НЕТ Eubacterium tenue 872 M59118 клада_354 ДА НЕТ Clostridium argentinense 553 NR_029232 клада_355 ДА НЕТ Clostridium sp. JC122 630 CAEV01000127 клада_355 ДА НЕТ Clostridium sp. NMBHI_1 636 JN093130 клада_355 ДА НЕТ Clostridium subterminale 650 NR_041795 клада_355 ДА НЕТ Clostridium sulfidigenes 651 NR_044161 клада_355 ДА НЕТ Dorea formicigenerans 773 AAXA02000006 клада_360 ДА НЕТ Dorea longicatena 774 AJ132842 клада_360 ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae 2_1_46FAA 1050 ADLB01000035 клада_360 ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae 2_1_58FAA 1051 ACTO01000052 клада_360 ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae 4_1_37FAA 1053 ADCR01000030 клада_360 ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae 9_1_43BFAA 1058 ACTX01000023 клада_360 ДА НЕТ Ruminococcus gnavus 1661 X94967 клада_360 ДА НЕТ Ruminococcus sp. ID8 1668 AY960564 клада_360 ДА НЕТ Blautia hydrogenotrophica 377 ACBZ01000217 клада_368 ДА НЕТ Lactonifactor longoviformis 1147 DQ100449 клада_368 ДА НЕТ Robinsoniella peoriensis 1633 AF445258 клада_368 ДА НЕТ Eubacterium infirmum 849 U13039 клада_384 ДА НЕТ Eubacterium sp. WAL 14571 864 FJ687606 клада_384 ДА НЕТ Бактерия Erysipelotrichaceae5_2_54FAA 823 ACZW01000054 клада_385 ДА НЕТ Eubacterium biforme 835 ABYT01000002 клада_385 ДА НЕТ Eubacterium cylindroides 842 FP929041 клада_385 ДА НЕТ Eubacterium dolichum 844 L34682 клада_385 ДА НЕТ Eubacterium sp. 3_1_31 861 ACTL01000045 клада_385 ДА НЕТ Eubacterium tortuosum 873 NR_044648 клада_385 ДА НЕТ Bulleidia extructa 441 ADFR01000011 клада_388 ДА НЕТ Solobacterium moorei 1739 AECQ01000039 клада_388 ДА НЕТ Coprococcus catus 673 EU266552 клада_393 ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae, оральный таксон F15 1064 HM099641 клада_393 ДА НЕТ Clostridium cochlearium 574 NR_044717 клада_395 ДА НЕТ Clostridium malenominatum 604 FR749893 клада_395 ДА НЕТ Clostridium tetani 654 NC_004557 клада_395 ДА НЕТ Acetivibrio ethanolgignens 6 FR749897 клада_396 ДА НЕТ Anaerosporobacter mobilis 161 NR_042953 клада_396 ДА НЕТ Bacteroides pectinophilus 288 ABVQ01000036 клада_396 ДА НЕТ Clostridium aminovalericum 551 NR_029245 клада_396 ДА НЕТ Clostridium phytofermentans 613 NR_074652 клада_396 ДА НЕТ Eubacterium hallii 848 L34621 клада_396 ДА НЕТ Eubacterium xylanophilum 875 L34628 клада_396 ДА НЕТ Ruminococcus callidus 1658 NR_029160 клада_406 ДА НЕТ Ruminococcus champanellensis 1659 FP929052 клада_406 ДА НЕТ Ruminococcus sp. 18P13 1665 AJ515913 клада_406 ДА НЕТ Ruminococcus sp. 9SE51 1667 FM954974 клада_406 ДА НЕТ Anaerostipes caccae 162 ABAX03000023 клада_408 ДА НЕТ Anaerostipes sp. 3_2_56FAA 163 ACWB01000002 клада_408 ДА НЕТ Бактерия Clostridiales 1_7_47FAA 541 ABQR01000074 клада_408 ДА НЕТ Clostridiales sp. SM4_1 542 FP929060 клада_408 ДА НЕТ Clostridiales sp. SSC_2 544 FP929061 клада_408 ДА НЕТ Clostridium aerotolerans 546 X76163 клада_408 ДА НЕТ Clostridium aldenense 547 NR_043680 клада_408 ДА НЕТ Clostridium algidixylanolyticum 550 NR_028726 клада_408 ДА НЕТ Clostridium amygdalinum 552 AY353957 клада_408 ДА НЕТ Clostridium asparagiforme 554 ACCJ01000522 клада_408 ДА НЕТ Clostridium bolteae 559 ABCC02000039 клада_408 ДА НЕТ Clostridium celerecrescens 566 JQ246092 клада_408 ДА НЕТ Clostridium citroniae 569 ADLJ01000059 клада_408 ДА НЕТ Clostridium clostridiiformes 571 M59089 клада_408 ДА НЕТ Clostridium clostridioforme 572 NR_044715 клада_408 ДА НЕТ Clostridium hathewayi 590 AY552788 клада_408 ДА НЕТ Clostridium indolis 594 AF028351 клада_408 ДА НЕТ Clostridium lavalense 600 EF564277 клада_408 ДА НЕТ Clostridium saccharolyticum 620 CP002109 клада_408 ДА НЕТ Clostridium sp. M62_1 633 ACFX02000046 клада_408 ДА НЕТ Clostridium sp. SS2_1 638 ABGC03000041 клада_408 ДА НЕТ Clostridium sphenoides 643 X73449 клада_408 ДА НЕТ Clostridium symbiosum 652 ADLQ01000114 клада_408 ДА НЕТ Clostridium xylanolyticum 658 NR_037068 клада_408 ДА НЕТ Eubacterium hadrum 847 FR749933 клада_408 ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae 3_1_57FAA_CT1 1052 ACTP01000124 клада_408 ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae 5_1_63FAA 1055 ACTS01000081 клада_408 ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae A4 1059 DQ789118 клада_408 ДА НЕТ Бактерия Lachnospiraceae DJF VP30 1060 EU728771 клада_408 ДА НЕТ Lachnospiraceae, геномовид C1 1065 AY278618 клада_408 ДА НЕТ Clostridium difficile 578 NC_013315 клада_409 ДА ОП Eubacterium sp. AS15b 862 HQ616364 клада_428 ДА НЕТ Eubacterium sp. OBRC9 863 HQ616354 клада_428 ДА НЕТ Eubacterium sp., оральный клон OH3A 871 AY947497 клада_428 ДА НЕТ Eubacterium yurii 876 AEES01000073 клада_428 ДА НЕТ Clostridium acetobutylicum 545 NR_074511 клада_430 ДА НЕТ Clostridium algidicarnis 549 NR_041746 клада_430 ДА НЕТ Clostridium cadaveris 562 AB542932 клада_430 ДА НЕТ Clostridium carboxidivorans 563 FR733710 клада_430 ДА НЕТ Clostridium estertheticum 580 NR_042153 клада_430 ДА НЕТ Clostridium fallax 581 NR_044714 клада_430 ДА НЕТ Clostridium felsineum 583 AF270502 клада_430 ДА НЕТ Clostridium frigidicarnis 584 NR_024919 клада_430 ДА НЕТ Clostridium kluyveri 598 NR_074165 клада_430 ДА НЕТ Clostridium magnum 603 X77835 клада_430 ДА НЕТ Clostridium putrefaciens 615 NR_024995 клада_430 ДА НЕТ Clostridium sp. HPB_46 629 AY862516 клада_430 ДА НЕТ Clostridium tyrobutyricum 656 NR_044718 клада_430 ДА НЕТ Sutterella parvirubra 1899 AB300989 клада_432 ДА НЕТ Acetanaerobacterium elongatum 4 NR_042930 клада_439 ДА НЕТ Clostridium cellulosi 567 NR_044624 клада_439 ДА НЕТ Ethanoligenens harbinense 832 AY675965 клада_439 ДА НЕТ Eubacterium rectale 856 FP929042 клада_444 ДА НЕТ Eubacterium sp., оральный клон GI038 865 AY349374 клада_444 ДА НЕТ Lachnobacterium bovis 1045 GU324407 клада_444 ДА НЕТ Roseburia cecicola 1634 GU233441 клада_444 ДА НЕТ Roseburia faecalis 1635 AY804149 клада_444 ДА НЕТ Roseburia faecis 1636 AY305310 клада_444 ДА НЕТ Roseburia hominis 1637 AJ270482 клада_444 ДА НЕТ Roseburia intestinalis 1638 FP929050 клада_444 ДА НЕТ Roseburia inulinivorans 1639 AJ270473 клада_444 ДА НЕТ Brevibacillus brevis 410 NR_041524 клада_448 ДА НЕТ Brevibacillus laterosporus 414 NR_037005 клада_448 ДА НЕТ Bacillus coagulans 206 DQ297928 клада_451 ДА ОП Sporolactobacillus инулинus 1752 NR_040962 клада_451 ДА НЕТ Kocuria palustris 1041 EU333884 клада_453 ДА НЕТ Nocardia farcinica 1353 NC_006361 клада_455 ДА НЕТ Bacillus sp., оральный таксон F28 247 HM099650 клада_456 ДА ОП Catenibacterium mitsuokai 495 AB030224 клада_469 ДА НЕТ Clostridium sp. TM_40 640 AB249652 клада_469 ДА НЕТ Coprobacillus cateniformis 670 AB030218 клада_469 ДА НЕТ Coprobacillus sp. 29_1 671 ADKX01000057 клада_469 ДА НЕТ Clostridium rectum 618 NR_029271 клада_470 ДА НЕТ Eubacterium nodatum 854 U13041 клада_476 ДА НЕТ Eubacterium saphenum 859 NR_026031 клада_476 ДА НЕТ Eubacterium sp., оральный клон JH012 867 AY349373 клада_476 ДА НЕТ Eubacterium sp., оральный клон JS001 870 AY349378 клада_476 ДА НЕТ Faecalibacterium prausnitzii 880 ACOP02000011 клада_478 ДА НЕТ Gemmiger formicilis 932 GU562446 клада_478 ДА НЕТ Subdoligranulum variabile 1896 AJ518869 клада_478 ДА НЕТ Бактерия Clostridiaceae JC13 532 JF824807 клада_479 ДА НЕТ Clostridium sp. MLG055 634 AF304435 клада_479 ДА НЕТ Бактерия Erysipelotrichaceae3_1_53 822 ACTJ01000113 клада_479 ДА НЕТ Clostridium cocleatum 575 NR_026495 клада_481 ДА НЕТ Clostridium ramosum 617 M23731 клада_481 ДА НЕТ Clostridium saccharogumia 619 DQ100445 клада_481 ДА НЕТ Clostridium spiroforme 644 X73441 клада_481 ДА НЕТ Coprobacillus sp. D7 672 ACDT01000199 клада_481 ДА НЕТ Бактерия Clostridiales SY8519 535 AB477431 клада_482 ДА НЕТ Clostridium sp. SY8519 639 AP012212 клада_482 ДА НЕТ Eubacterium ramulus 855 AJ011522 клада_482 ДА НЕТ Erysipelothrix inopinata 819 NR_025594 клада_485 ДА НЕТ Erysipelothrix rhusiopathiae 820 ACLK01000021 клада_485 ДА НЕТ Erysipelothrix tonsillarum 821 NR_040871 клада_485 ДА НЕТ Holdemania filiformis 1004 Y11466 клада_485 ДА НЕТ Бактерия Mollicutes pACH93 1258 AY297808 клада_485 ДА НЕТ Coxiella burnetii 736 CP000890 клада_486 ДА Категория B Clostridium hiranonis 591 AB023970 клада_487 ДА НЕТ Clostridium irregulare 596 NR_029249 клада_487 ДА НЕТ Clostridium orbiscindens 609 Y18187 клада_494 ДА НЕТ Clostridium sp. NML 04A032 637 EU815224 клада_494 ДА НЕТ Flavonifractor plautii 886 AY724678 клада_494 ДА НЕТ Pseudoflavonifractor capillosus 1591 AY136666 клада_494 ДА НЕТ Бактерия Ruminococcaceae D16 1655 ADDX01000083 клада_494 ДА НЕТ Acetivibrio cellulolyticus 5 NR_025917 клада_495 ДА НЕТ Clostridium aldrichii 548 NR_026099 клада_495 ДА НЕТ Clostridium clariflavum 570 NR_041235 клада_495 ДА НЕТ Clostridium stercorarium 647 NR_025100 клада_495 ДА НЕТ Clostridium straminisolvens 649 NR_024829 клада_495 ДА НЕТ Clostridium thermocellum 655 NR_074629 клада_495 ДА НЕТ Fusobacterium nucleatum 901 ADVK01000034 клада_497 ДА НЕТ Eubacterium barkeri 834 NR_044661 клада_512 ДА НЕТ Eubacterium callanderi 838 NR_026330 клада_512 ДА НЕТ Eubacterium limosum 850 CP002273 клада_512 ДА НЕТ Anaerotruncus colihominis 164 ABGD02000021 клада_516 ДА НЕТ Clostridium methylpentosum 606 ACEC01000059 клада_516 ДА НЕТ Clostridium sp. YIT 12070 642 AB491208 клада_516 ДА НЕТ Hydrogenoanaerobacterium saccharovorans 1005 NR_044425 клада_516 ДА НЕТ Ruminococcus albus 1656 AY445600 клада_516 ДА НЕТ Ruminococcus flavefaciens 1660 NR_025931 клада_516 ДА НЕТ Clostridium haemolyticum 589 NR_024749 клада_517 ДА НЕТ Clostridium novyi 608 NR_074343 клада_517 ДА НЕТ Clostridium sp. LMG 16094 632 X95274 клада_517 ДА НЕТ Eubacterium ventriosum 874 L34421 клада_519 ДА НЕТ Bacteroides galacturonicus 280 DQ497994 клада_522 ДА НЕТ Eubacterium eligens 845 CP001104 клада_522 ДА НЕТ Lachnospira multipara 1046 FR733699 клада_522 ДА НЕТ Lachnospira pectinoschiza 1047 L14675 клада_522 ДА НЕТ Lactobacillus rogosae 1114 GU269544 клада_522 ДА НЕТ Bacillus horti 214 NR_036860 клада_527 ДА ОП Bacillus sp. 9_3AIA 232 FN397519 клада_527 ДА ОП Eubacterium brachy 836 U13038 клада_533 ДА НЕТ Filifactor alocis 881 CP002390 клада_533 ДА НЕТ Filifactor villosus 882 NR_041928 клада_533 ДА НЕТ Clostridium leptum 601 AJ305238 клада_537 ДА НЕТ Clostridium sp. YIT 12069 641 AB491207 клада_537 ДА НЕТ Clostridium sporosphaeroides 646 NR_044835 клада_537 ДА НЕТ Eubacterium coprostanoligenes 841 HM037995 клада_537 ДА НЕТ Ruminococcus bromii 1657 EU266549 клада_537 ДА НЕТ Eubacterium siraeum 860 ABCA03000054 клада_538 ДА НЕТ Clostridium viride 657 NR_026204 клада_540 ДА НЕТ Oscillibacter sp. G2 1386 HM626173 клада_540 ДА НЕТ Oscillibacter valericigenes 1387 NR_074793 клада_540 ДА НЕТ Oscillospira guilliermondii 1388 AB040495 клада_540 ДА НЕТ Butyrivibrio crossotus 455 ABWN01000012 клада_543 ДА НЕТ Clostridium sp. L2_50 631 AAYW02000018 клада_543 ДА НЕТ Coprococcus eutactus 675 EF031543 клада_543 ДА НЕТ Coprococcus sp. ART55_1 676 AY350746 клада_543 ДА НЕТ Eubacterium ruminantium 857 NR_024661 клада_543 ДА НЕТ Collinsella aerofaciens 659 AAVN02000007 клада_553 ДА НЕТ Alkaliphilus metalliredigenes 137 AY137848 клада_554 ДА НЕТ Alkaliphilus oremlandii 138 NR_043674 клада_554 ДА НЕТ Clostridium sticklandii 648 L04167 клада_554 ДА НЕТ Turicibacter sanguinis 1965 AF349724 клада_555 ДА НЕТ Fulvimonas sp. NML 060897 892 EF589680 клада_557 ДА НЕТ Desulfitobacterium frappieri 753 AJ276701 клада_560 ДА НЕТ Desulfitobacterium hafniense 754 NR_074996 клада_560 ДА НЕТ Desulfotomaculum nigrificans 756 NR_044832 клада_560 ДА НЕТ Lutispora thermophila 1191 NR_041236 клада_564 ДА НЕТ Brachyspira pilosicoli 405 NR_075069 клада_565 ДА НЕТ Eggerthella lenta 778 AF292375 клада_566 ДА НЕТ Streptomyces albus 1888 AJ697941 клада_566 ДА НЕТ Бактерия Chlamydiales NS11 505 JN606074 клада_567 ДА НЕТ Anaerofustis stercorihominis 159 ABIL02000005 клада_570 ДА НЕТ Butyricicoccus pullicaecorum 453 HH793440 клада_572 ДА НЕТ Eubacterium desmolans 843 NR_044644 клада_572 ДА НЕТ Papillibacter cinnamivorans 1415 NR_025025 клада_572 ДА НЕТ Sporobacter termitidis 1751 NR_044972 клада_572 ДА НЕТ Deferribacteres sp., оральный клон JV006 744 AY349371 клада_575 ДА НЕТ Clostridium colinum 577 NR_026151 клада_576 ДА НЕТ Clostridium lactatifermentans 599 NR_025651 клада_576 ДА НЕТ Clostridium piliforme 614 D14639 клада_576 ДА НЕТ Saccharomonospora viridis 1671 X54286 клада_579 ДА НЕТ Thermobifida fusca 1921 NC_007333 клада_579 ДА НЕТ Leptospira licerasiae 1164 EF612284 клада_585 ДА ОП Moorella thermoacetica 1259 NR_075001 клада_590 ДА НЕТ Thermoanaerobacter pseudethanolicus 1920 CP000924 клада_590 ДА НЕТ Flexistipes sinusarabici 888 NR_074881 клада_591 ДА НЕТ Gloeobacter violaceus 942 NR_074282 клада_596 ДА НЕТ Eubacterium sp., оральный клон JN088 869 AY349377 клада_90 ДА НЕТ Clostridium oroticum 610 FR749922 клада_96 ДА НЕТ Clostridium sp. D5 627 ADBG01000142 клада_96 ДА НЕТ Eubacterium contortum 840 FR749946 клада_96 ДА НЕТ Eubacterium fissicatena 846 FR749935 клада_96 ДА НЕТ Corynebacterium coyleae 692 X96497 клада_100 НЕТ НЕТ Corynebacterium mucifaciens 711 NR_026396 клада_100 НЕТ НЕТ Corynebacterium ureicelerivorans 733 AM397636 клада_100 НЕТ НЕТ Corynebacterium appendicis 684 NR_028951 клада_102 НЕТ НЕТ Corynebacterium genitalium 698 ACLJ01000031 клада_102 НЕТ НЕТ Corynebacterium glaucum 699 NR_028971 клада_102 НЕТ НЕТ Corynebacterium imitans 703 AF537597 клада_102 НЕТ НЕТ Corynebacterium riegelii 719 EU848548 клада_102 НЕТ НЕТ Corynebacterium sp. L_2012475 723 HE575405 клада_102 НЕТ НЕТ Corynebacterium sp. NML 93_0481 724 GU238409 клада_102 НЕТ НЕТ Corynebacterium sundsvallense 728 Y09655 клада_102 НЕТ НЕТ Corynebacterium tuscaniae 730 AY677186 клада_102 НЕТ НЕТ Prevotella maculosa 1504 AGEK01000035 клада_104 НЕТ НЕТ Prevotella oris 1513 ADDV01000091 клада_104 НЕТ НЕТ Prevotella salivae 1517 AB108826 клада_104 НЕТ НЕТ Prevotella sp. ICM55 1521 HQ616399 клада_104 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон AA020 1528 AY005057 клада_104 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон GI032 1538 AY349396 клада_104 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный таксон G70 1558 GU432179 клада_104 НЕТ НЕТ Prevotella corporis 1491 L16465 клада_105 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 4_1_36 312 ACTC01000133 клада_110 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. AR20 315 AF139524 клада_110 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. D20 319 ACPT01000052 клада_110 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. F_4 322 AB470322 клада_110 НЕТ НЕТ Bacteroides uniformis 329 AB050110 клада_110 НЕТ НЕТ Prevotella nanceiensis 1510 JN867228 клада_127 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный таксон 299 1548 ACWZ01000026 клада_127 НЕТ НЕТ Prevotella bergensis 1485 ACKS01000100 клада_128 НЕТ НЕТ Prevotella buccalis 1489 JN867261 клада_129 НЕТ НЕТ Prevotella timonensis 1564 ADEF01000012 клада_129 НЕТ НЕТ Prevotella oralis 1512 AEPE01000021 клада_130 НЕТ НЕТ Prevotella sp. SEQ072 1525 JN867238 клада_130 НЕТ НЕТ Leuconostoc carnosum 1177 NR_040811 клада_135 НЕТ НЕТ Leuconostoc gasicomitatum 1179 FN822744 клада_135 НЕТ НЕТ Leuconostoc inhae 1180 NR_025204 клада_135 НЕТ НЕТ Leuconostoc kimchii 1181 NR_075014 клада_135 НЕТ НЕТ Edwardsiella tarda 777 CP002154 клада_139 НЕТ НЕТ Photorhabdus asymbiotica 1466 Z76752 клада_139 НЕТ НЕТ Psychrobacter arcticus 1607 CP000082 клада_141 НЕТ НЕТ Psychrobacter cibarius 1608 HQ698586 клада_141 НЕТ НЕТ Psychrobacter cryohalolentis 1609 CP000323 клада_141 НЕТ НЕТ Psychrobacter faecalis 1610 HQ698566 клада_141 НЕТ НЕТ Psychrobacter nivimaris 1611 HQ698587 клада_141 НЕТ НЕТ Psychrobacter pulmonis 1612 HQ698582 клада_141 НЕТ НЕТ Pseudomonas aeruginosa 1592 AABQ07000001 клада_154 НЕТ НЕТ Pseudomonas sp. 2_1_26 1600 ACWU01000257 клада_154 НЕТ НЕТ Corynebacterium confusum 691 Y15886 клада_158 НЕТ НЕТ Corynebacterium propinquum 712 NR_037038 клада_158 НЕТ НЕТ Corynebacterium pseudodiphtheriticum 713 X84258 клада_158 НЕТ НЕТ Bartonella bacilliformis 338 NC_008783 клада_159 НЕТ НЕТ Bartonella grahamii 339 CP001562 клада_159 НЕТ НЕТ Bartonella henselae 340 NC_005956 клада_159 НЕТ НЕТ Bartonella quintana 341 BX897700 клада_159 НЕТ НЕТ Bartonella tamiae 342 EF672728 клада_159 НЕТ НЕТ Bartonella washoensis 343 FJ719017 клада_159 НЕТ НЕТ Brucella abortus 430 ACBJ01000075 клада_159 НЕТ Категория B Brucella canis 431 NR_044652 клада_159 НЕТ Категория B Brucella ceti 432 ACJD01000006 клада_159 НЕТ Категория B Brucella melitensis 433 AE009462 клада_159 НЕТ Категория B Brucella microti 434 NR_042549 клада_159 НЕТ Категория B Brucella ovis 435 NC_009504 клада_159 НЕТ Категория B Brucella sp. 83_13 436 ACBQ01000040 клада_159 НЕТ Категория B Brucella sp. BO1 437 EU053207 клада_159 НЕТ Категория B Brucella suis 438 ACBK01000034 клада_159 НЕТ Категория B Ochrobactrum anthropi 1360 NC_009667 клада_159 НЕТ НЕТ Ochrobactrum intermedium 1361 ACQA01000001 клада_159 НЕТ НЕТ Ochrobactrum pseudintermedium 1362 DQ365921 клада_159 НЕТ НЕТ Prevotella, геномовид C2 1496 AY278625 клада_164 НЕТ НЕТ Prevotella multisaccharivorax 1509 AFJE01000016 клада_164 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон IDR_CEC_0055 1543 AY550997 клада_164 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный таксон 292 1547 GQ422735 клада_164 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный таксон 300 1549 GU409549 клада_164 НЕТ НЕТ Prevotella marshii 1505 AEEI01000070 клада_166 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон IK053 1544 AY349401 клада_166 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный таксон 781 1554 GQ422744 клада_166 НЕТ НЕТ Prevotella stercorea 1562 AB244774 клада_166 НЕТ НЕТ Prevotella brevis 1487 NR_041954 клада_167 НЕТ НЕТ Prevotella ruminicola 1516 CP002006 клада_167 НЕТ НЕТ Prevotella sp. sp24 1560 AB003384 клада_167 НЕТ НЕТ Prevotella sp. sp34 1561 AB003385 клада_167 НЕТ НЕТ Prevotella albensis 1483 NR_025300 клада_168 НЕТ НЕТ Prevotella copri 1490 ACBX02000014 клада_168 НЕТ НЕТ Prevotella oulorum 1514 L16472 клада_168 НЕТ НЕТ Prevotella sp. BI_42 1518 AJ581354 клада_168 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон P4PB_83 P2 1546 AY207050 клада_168 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный таксон G60 1557 GU432133 клада_168 НЕТ НЕТ Prevotella amnii 1484 AB547670 клада_169 НЕТ НЕТ Bacteroides caccae 268 EU136686 клада_170 НЕТ НЕТ Bacteroides finegoldii 277 AB222699 клада_170 НЕТ НЕТ Bacteroides intestinalis 283 ABJL02000006 клада_171 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. XB44A 326 AM230649 клада_171 НЕТ НЕТ Bifidobacteriaceae, геномовид C1 345 AY278612 клада_172 НЕТ НЕТ Bifidobacterium adolescentis 346 AAXD02000018 клада_172 НЕТ НЕТ Bifidobacterium angulatum 347 ABYS02000004 клада_172 НЕТ НЕТ Bifidobacterium animalis 348 CP001606 клада_172 НЕТ НЕТ Bifidobacterium breve 350 CP002743 клада_172 НЕТ НЕТ Bifidobacterium catenulatum 351 ABXY01000019 клада_172 НЕТ НЕТ Bifidobacterium dentium 352 CP001750 клада_172 НЕТ ОП Bifidobacterium gallicum 353 ABXB03000004 клада_172 НЕТ НЕТ Bifidobacterium infantis 354 AY151398 клада_172 НЕТ НЕТ Bifidobacterium kashiwanohense 355 AB491757 клада_172 НЕТ НЕТ Bifidobacterium longum 356 ABQQ01000041 клада_172 НЕТ НЕТ Bifidobacterium pseudocatenulatum 357 ABXX02000002 клада_172 НЕТ НЕТ Bifidobacterium pseudolongum 358 NR_043442 клада_172 НЕТ НЕТ Bifidobacterium scardovii 359 AJ307005 клада_172 НЕТ НЕТ Bifidobacterium sp. HM2 360 AB425276 клада_172 НЕТ НЕТ Bifidobacterium sp. HMLN12 361 JF519685 клада_172 НЕТ НЕТ Bifidobacterium sp. M45 362 HM626176 клада_172 НЕТ НЕТ Bifidobacterium sp. MSX5B 363 HQ616382 клада_172 НЕТ НЕТ Bifidobacterium sp. TM_7 364 AB218972 клада_172 НЕТ НЕТ Bifidobacterium thermophilum 365 DQ340557 клада_172 НЕТ НЕТ Leuconostoc citreum 1178 AM157444 клада_175 НЕТ НЕТ Leuconostoc lactis 1182 NR_040823 клада_175 НЕТ НЕТ Alicyclobacillus acidoterrestris 123 NR_040844 клада_179 НЕТ НЕТ Alicyclobacillus cycloheptanicus 125 NR_024754 клада_179 НЕТ НЕТ Acinetobacter baumannii 27 ACYQ01000014 клада_181 НЕТ НЕТ Acinetobacter calcoaceticus 28 AM157426 клада_181 НЕТ НЕТ Acinetobacter, геномовид C1 29 AY278636 клада_181 НЕТ НЕТ Acinetobacter haemolyticus 30 ADMT01000017 клада_181 НЕТ НЕТ Acinetobacter johnsonii 31 ACPL01000162 клада_181 НЕТ НЕТ Acinetobacter junii 32 ACPM01000135 клада_181 НЕТ НЕТ Acinetobacter lwoffii 33 ACPN01000204 клада_181 НЕТ НЕТ Acinetobacter parvus 34 AIEB01000124 клада_181 НЕТ НЕТ Acinetobacter schindleri 36 NR_025412 клада_181 НЕТ НЕТ Acinetobacter sp. 56A1 37 GQ178049 клада_181 НЕТ НЕТ Acinetobacter sp. CIP 101934 38 JQ638573 клада_181 НЕТ НЕТ Acinetobacter sp. CIP 102143 39 JQ638578 клада_181 НЕТ НЕТ Acinetobacter sp. M16_22 41 HM366447 клада_181 НЕТ НЕТ Acinetobacter sp. RUH2624 42 ACQF01000094 клада_181 НЕТ НЕТ Acinetobacter sp. SH024 43 ADCH01000068 клада_181 НЕТ НЕТ Lactobacillus jensenii 1092 ACQD01000066 клада_182 НЕТ НЕТ Alcaligenes faecalis 119 AB680368 клада_183 НЕТ НЕТ Alcaligenes sp. CO14 120 DQ643040 клада_183 НЕТ НЕТ Alcaligenes sp. S3 121 HQ262549 клада_183 НЕТ НЕТ Oligella ureolytica 1366 NR_041998 клада_183 НЕТ НЕТ Oligella urethralis 1367 NR_041753 клада_183 НЕТ НЕТ Eikenella corrodens 784 ACEA01000028 клада_185 НЕТ НЕТ Kingella denitrificans 1019 AEWV01000047 клада_185 НЕТ НЕТ Kingella, геномовид P1, оральный клон MB2_C20 1020 DQ003616 клада_185 НЕТ НЕТ Kingella kingae 1021 AFHS01000073 клада_185 НЕТ НЕТ Kingella oralis 1022 ACJW02000005 клада_185 НЕТ НЕТ Kingella sp., оральный клон ID059 1023 AY349381 клада_185 НЕТ НЕТ Neisseria elongata 1330 ADBF01000003 клада_185 НЕТ НЕТ Neisseria, геномовид P2 оральный клон MB5_P15 1332 DQ003630 клада_185 НЕТ НЕТ Neisseria sp., оральный клон JC012 1345 AY349388 клада_185 НЕТ НЕТ Neisseria sp. SMC_A9199 1342 FJ763637 клада_185 НЕТ НЕТ Simonsiella muelleri 1731 ADCY01000105 клада_185 НЕТ НЕТ Corynebacterium glucuronolyticum 700 ABYP01000081 клада_193 НЕТ НЕТ Corynebacterium pyruviciproducens 716 FJ185225 клада_193 НЕТ НЕТ Rothia aeria 1649 DQ673320 клада_194 НЕТ НЕТ Rothia dentocariosa 1650 ADDW01000024 клада_194 НЕТ НЕТ Rothia sp., оральный таксон 188 1653 GU470892 клада_194 НЕТ НЕТ Corynebacterium accolens 681 ACGD01000048 клада_195 НЕТ НЕТ Corynebacterium macginleyi 707 AB359393 клада_195 НЕТ НЕТ Corynebacterium pseudogenitalium 714 ABYQ01000237 клада_195 НЕТ НЕТ Corynebacterium tuberculostearicum 729 ACVP01000009 клада_195 НЕТ НЕТ Lactobacillus casei 1074 CP000423 клада_198 НЕТ НЕТ Lactobacillus paracasei 1106 ABQV01000067 клада_198 НЕТ НЕТ Lactobacillus zeae 1143 NR_037122 клада_198 НЕТ НЕТ Prevotella dentalis 1492 AB547678 клада_205 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон ASCG10 1529 AY923148 клада_206 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон HF050 1541 AY349399 клада_206 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон ID019 1542 AY349400 клада_206 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон IK062 1545 AY349402 клада_206 НЕТ НЕТ Prevotella, геномовид P9 оральный клон MB7_G16 1499 DQ003633 клада_207 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон AU069 1531 AY005062 клада_207 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон CY006 1532 AY005063 клада_207 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон FL019 1534 AY349392 клада_207 НЕТ НЕТ Actinomyces, геномовид C1 56 AY278610 клада_212 НЕТ НЕТ Actinomyces, геномовид C2 57 AY278611 клада_212 НЕТ НЕТ Actinomyces, геномовид P1 оральный клон MB6_C03 58 DQ003632 клада_212 НЕТ НЕТ Actinomyces georgiae 59 GU561319 клада_212 НЕТ НЕТ Actinomyces israelii 60 AF479270 клада_212 НЕТ НЕТ Actinomyces massiliensis 61 AB545934 клада_212 НЕТ НЕТ Actinomyces meyeri 62 GU561321 клада_212 НЕТ НЕТ Actinomyces odontolyticus 66 ACYT01000123 клада_212 НЕТ НЕТ Actinomyces orihominis 68 AJ575186 клада_212 НЕТ НЕТ Actinomyces sp. CCUG 37290 71 AJ234058 клада_212 НЕТ НЕТ Actinomyces sp. ICM34 75 HQ616391 клада_212 НЕТ НЕТ Actinomyces sp. ICM41 76 HQ616392 клада_212 НЕТ НЕТ Actinomyces sp. ICM47 77 HQ616395 клада_212 НЕТ НЕТ Actinomyces sp. ICM54 78 HQ616398 клада_212 НЕТ НЕТ Actinomyces sp., оральный клон IP081 87 AY349366 клада_212 НЕТ НЕТ Actinomyces sp., оральный таксон 178 91 AEUH01000060 клада_212 НЕТ НЕТ Actinomyces sp., оральный таксон 180 92 AEPP01000041 клада_212 НЕТ НЕТ Actinomyces sp. TeJ5 80 GU561315 клада_212 НЕТ НЕТ Haematobacter sp. BC14248 968 GU396991 клада_213 НЕТ НЕТ Paracoccus denitrificans 1424 CP000490 клада_213 НЕТ НЕТ Paracoccus marcusii 1425 NR_044922 клада_213 НЕТ НЕТ Grimontia hollisae 967 ADAQ01000013 клада_216 НЕТ НЕТ Shewanella putrefaciens 1723 CP002457 клада_216 НЕТ НЕТ Afipia, геномовид 4 111 EU117385 клада_217 НЕТ НЕТ Rhodopseudomonas palustris 1626 CP000301 клада_217 НЕТ НЕТ Methylobacterium extorquens 1223 NC_010172 клада_218 НЕТ НЕТ Methylobacterium podarium 1224 AY468363 клада_218 НЕТ НЕТ Methylobacterium radiotolerans 1225 GU294320 клада_218 НЕТ НЕТ Methylobacterium sp. 1sub 1226 AY468371 клада_218 НЕТ НЕТ Methylobacterium sp. MM4 1227 AY468370 клада_218 НЕТ НЕТ Achromobacter denitrificans 18 NR_042021 клада_224 НЕТ НЕТ Achromobacter piechaudii 19 ADMS01000149 клада_224 НЕТ НЕТ Achromobacter xylosoxidans 20 ACRC01000072 клада_224 НЕТ НЕТ Bordetella bronchiseptica 384 NR_025949 клада_224 НЕТ ОП Bordetella holmesii 385 AB683187 клада_224 НЕТ ОП Bordetella parapertussis 386 NR_025950 клада_224 НЕТ ОП Bordetella pertussis 387 BX640418 клада_224 НЕТ ОП Microbacterium chocolatum 1230 NR_037045 клада_225 НЕТ НЕТ Microbacterium flavescens 1231 EU714363 клада_225 НЕТ НЕТ Microbacterium lacticum 1233 EU714351 клада_225 НЕТ НЕТ Microbacterium oleivorans 1234 EU714381 клада_225 НЕТ НЕТ Microbacterium oxydans 1235 EU714348 клада_225 НЕТ НЕТ Microbacterium paraoxydans 1236 AJ491806 клада_225 НЕТ НЕТ Microbacterium phyllosphaerae 1237 EU714359 клада_225 НЕТ НЕТ Microbacterium schleiferi 1238 NR_044936 клада_225 НЕТ НЕТ Microbacterium sp. 768 1239 EU714378 клада_225 НЕТ НЕТ Microbacterium sp., оральный штамм C24KA 1240 AF287752 клада_225 НЕТ НЕТ Microbacterium testaceum 1241 EU714365 клада_225 НЕТ НЕТ Corynebacterium atypicum 686 NR_025540 клада_229 НЕТ НЕТ Corynebacterium mastitidis 708 AB359395 клада_229 НЕТ НЕТ Corynebacterium sp. NML 97_0186 725 GU238411 клада_229 НЕТ НЕТ Mycobacterium elephantis 1275 AF385898 клада_237 НЕТ ОП Mycobacterium paraterrae 1288 EU919229 клада_237 НЕТ ОП Mycobacterium phlei 1289 GU142920 клада_237 НЕТ ОП Mycobacterium sp. 1776 1293 EU703152 клада_237 НЕТ НЕТ Mycobacterium sp. 1781 1294 EU703147 клада_237 НЕТ НЕТ Mycobacterium sp. AQ1GA4 1297 HM210417 клада_237 НЕТ НЕТ Mycobacterium sp. GN_10546 1299 FJ497243 клада_237 НЕТ НЕТ Mycobacterium sp. GN_10827 1300 FJ497247 клада_237 НЕТ НЕТ Mycobacterium sp. GN_11124 1301 FJ652846 клада_237 НЕТ НЕТ Mycobacterium sp. GN_9188 1302 FJ497240 клада_237 НЕТ НЕТ Mycobacterium sp. GR_2007_210 1303 FJ555538 клада_237 НЕТ НЕТ Anoxybacillus contaminans 172 NR_029006 клада_238 НЕТ НЕТ Bacillus aeolius 195 NR_025557 клада_238 НЕТ НЕТ Brevibacterium frigoritolerans 422 NR_042639 клада_238 НЕТ НЕТ Geobacillus sp. E263 934 DQ647387 клада_238 НЕТ НЕТ Geobacillus sp. WCH70 935 CP001638 клада_238 НЕТ НЕТ Geobacillus thermocatenulatus 937 NR_043020 клада_238 НЕТ НЕТ Geobacillus thermoleovorans 940 NR_074931 клада_238 НЕТ НЕТ Lysinibacillus fusiformis 1192 FN397522 клада_238 НЕТ НЕТ Planomicrobium koreense 1468 NR_025011 клада_238 НЕТ НЕТ Sporosarcina newyorkensis 1754 AFPZ01000142 клада_238 НЕТ НЕТ Sporosarcina sp. 2681 1755 GU994081 клада_238 НЕТ НЕТ Ureibacillus composti 1968 NR_043746 клада_238 НЕТ НЕТ Ureibacillus suwonensis 1969 NR_043232 клада_238 НЕТ НЕТ Ureibacillus terrenus 1970 NR_025394 клада_238 НЕТ НЕТ Ureibacillus thermophilus 1971 NR_043747 клада_238 НЕТ НЕТ Ureibacillus thermosphaericus 1972 NR_040961 клада_238 НЕТ НЕТ Prevotella micans 1507 AGWK01000061 клада_239 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон DA058 1533 AY005065 клада_239 НЕТ НЕТ Prevotella sp. SEQ053 1523 JN867222 клада_239 НЕТ НЕТ Treponema socranskii 1937 NR_024868 клада_240 НЕТ ОП Treponema sp. 6:H:D15A_4 1938 AY005083 клада_240 НЕТ НЕТ Treponema sp., оральный таксон 265 1953 GU408850 клада_240 НЕТ НЕТ Treponema sp., оральный таксон G85 1958 GU432215 клада_240 НЕТ НЕТ Porphyromonas endodontalis 1472 ACNN01000021 клада_241 НЕТ НЕТ Porphyromonas sp., оральный клон BB134 1478 AY005068 клада_241 НЕТ НЕТ Porphyromonas sp., оральный клон F016 1479 AY005069 клада_241 НЕТ НЕТ Porphyromonas sp., оральный клон P2PB_52 P1 1480 AY207054 клада_241 НЕТ НЕТ Porphyromonas sp., оральный клон P4GB_100 P2 1481 AY207057 клада_241 НЕТ НЕТ Acidovorax sp. 98_63833 26 AY258065 клада_245 НЕТ НЕТ Бактерия Comamonadaceae NML000135 663 JN585335 клада_245 НЕТ НЕТ Бактерия Comamonadaceae NML790751 664 JN585331 клада_245 НЕТ НЕТ Бактерия Comamonadaceae NML910035 665 JN585332 клада_245 НЕТ НЕТ Бактерия Comamonadaceae NML910036 666 JN585333 клада_245 НЕТ НЕТ Comamonas sp. NSP5 668 AB076850 клада_245 НЕТ НЕТ Delftia acidovorans 748 CP000884 клада_245 НЕТ НЕТ Xenophilus aerolatus 2018 JN585329 клада_245 НЕТ НЕТ Oribacterium sp., оральный таксон 078 1380 ACIQ02000009 клада_246 НЕТ НЕТ Oribacterium sp., оральный таксон 102 1381 GQ422713 клада_246 НЕТ НЕТ Weissella cibaria 2007 NR_036924 клада_247 НЕТ НЕТ Weissella confusa 2008 NR_040816 клада_247 НЕТ НЕТ Weissella hellenica 2009 AB680902 клада_247 НЕТ НЕТ Weissella kandleri 2010 NR_044659 клада_247 НЕТ НЕТ Weissella koreensis 2011 NR_075058 клада_247 НЕТ НЕТ Weissella paramesenteroides 2012 ACKU01000017 клада_247 НЕТ НЕТ Weissella sp. KLDS 7.0701 2013 EU600924 клада_247 НЕТ НЕТ Mobiluncus curtisii 1251 AEPZ01000013 клада_249 НЕТ НЕТ Enhydrobacter aerosaccus 785 ACYI01000081 клада_256 НЕТ НЕТ Moraxella osloensis 1262 JN175341 клада_256 НЕТ НЕТ Moraxella sp. GM2 1264 JF837191 клада_256 НЕТ НЕТ Brevibacterium casei 420 JF951998 клада_257 НЕТ НЕТ Brevibacterium epidermidis 421 NR_029262 клада_257 НЕТ НЕТ Brevibacterium sanguinis 426 NR_028016 клада_257 НЕТ НЕТ Brevibacterium sp. H15 427 AB177640 клада_257 НЕТ НЕТ Acinetobacter radioresistens 35 ACVR01000010 клада_261 НЕТ НЕТ Lactobacillus alimentarius 1068 NR_044701 клада_263 НЕТ НЕТ Lactobacillus farciminis 1082 NR_044707 клада_263 НЕТ НЕТ Lactobacillus kimchii 1097 NR_025045 клада_263 НЕТ НЕТ Lactobacillus nodensis 1101 NR_041629 клада_263 НЕТ НЕТ Lactobacillus tucceti 1138 NR_042194 клада_263 НЕТ НЕТ Pseudomonas mendocina 1595 AAUL01000021 клада_265 НЕТ НЕТ Pseudomonas pseudoalcaligenes 1598 NR_037000 клада_265 НЕТ НЕТ Pseudomonas sp. NP522b 1602 EU723211 клада_265 НЕТ НЕТ Pseudomonas stutzeri 1603 AM905854 клада_265 НЕТ НЕТ Paenibacillus barciнетnsis 1390 NR_042272 клада_270 НЕТ НЕТ Paenibacillus barengoltzii 1391 NR_042756 клада_270 НЕТ НЕТ Paenibacillus chibensis 1392 NR_040885 клада_270 НЕТ НЕТ Paenibacillus cookii 1393 NR_025372 клада_270 НЕТ НЕТ Paenibacillus durus 1394 NR_037017 клада_270 НЕТ НЕТ Paenibacillus glucanolyticus 1395 D78470 клада_270 НЕТ НЕТ Paenibacillus lactis 1396 NR_025739 клада_270 НЕТ НЕТ Paenibacillus pabuli 1398 NR_040853 клада_270 НЕТ НЕТ Paenibacillus popilliae 1400 NR_040888 клада_270 НЕТ НЕТ Paenibacillus sp. CIP 101062 1401 HM212646 клада_270 НЕТ НЕТ Paenibacillus sp. JC66 1404 JF824808 клада_270 НЕТ НЕТ Paenibacillus sp. R_27413 1405 HE586333 клада_270 НЕТ НЕТ Paenibacillus sp. R_27422 1406 HE586338 клада_270 НЕТ НЕТ Paenibacillus timonensis 1408 NR_042844 клада_270 НЕТ НЕТ Rothia mucilaginosa 1651 ACVO01000020 клада_271 НЕТ НЕТ Rothia nasimurium 1652 NR_025310 клада_271 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный таксон 302 1550 ACZK01000043 клада_280 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный таксон F68 1556 HM099652 клада_280 НЕТ НЕТ Prevotella tannerae 1563 ACIJ02000018 клада_280 НЕТ НЕТ Бактерия Prevotellaceae P4P_62 P1 1566 AY207061 клада_280 НЕТ НЕТ Porphyromonas asaccharolytica 1471 AENO01000048 клада_281 НЕТ НЕТ Porphyromonas gingivalis 1473 AE015924 клада_281 НЕТ НЕТ Porphyromonas macacae 1475 NR_025908 клада_281 НЕТ НЕТ Porphyromonas sp. UQD 301 1477 EU012301 клада_281 НЕТ НЕТ Porphyromonas uenonis 1482 ACLR01000152 клада_281 НЕТ НЕТ Leptotrichia buccalis 1165 CP001685 клада_282 НЕТ НЕТ Leptotrichia hofstadii 1168 ACVB02000032 клада_282 НЕТ НЕТ Leptotrichia sp., оральный клон HE012 1173 AY349386 клада_282 НЕТ НЕТ Leptotrichia sp., оральный таксон 223 1176 GU408547 клада_282 НЕТ НЕТ Bacteroides fluxus 278 AFBN01000029 клада_285 НЕТ НЕТ Bacteroides helcogenes 281 CP002352 клада_285 НЕТ НЕТ Parabacteroides johnsonii 1419 ABYH01000014 клада_286 НЕТ НЕТ Parabacteroides merdae 1420 EU136685 клада_286 НЕТ НЕТ Treponema denticola 1926 ADEC01000002 клада_288 НЕТ ОП Treponema, геномовид P5 оральный клон MB3_P23 1929 DQ003624 клада_288 НЕТ НЕТ Treponema putidum 1935 AJ543428 клада_288 НЕТ ОП Treponema sp., оральный клон P2PB_53 P3 1942 AY207055 клада_288 НЕТ НЕТ Treponema sp., оральный таксон 247 1949 GU408748 клада_288 НЕТ НЕТ Treponema sp., оральный таксон 250 1950 GU408776 клада_288 НЕТ НЕТ Treponema sp., оральный таксон 251 1951 GU408781 клада_288 НЕТ НЕТ Anaerococcus hydrogenalis 144 ABXA01000039 клада_289 НЕТ НЕТ Anaerococcus sp. 8404299 148 HM587318 клада_289 НЕТ НЕТ Anaerococcus sp. gpac215 156 AM176540 клада_289 НЕТ НЕТ Anaerococcus vaginalis 158 ACXU01000016 клада_289 НЕТ НЕТ Propionibacterium acidipropionici 1569 NC_019395 клада_290 НЕТ НЕТ Propionibacterium avidum 1571 AJ003055 клада_290 НЕТ НЕТ Propionibacterium granulosum 1573 FJ785716 клада_290 НЕТ НЕТ Propionibacterium jensenii 1574 NR_042269 клада_290 НЕТ НЕТ Propionibacterium propionicum 1575 NR_025277 клада_290 НЕТ НЕТ Propionibacterium sp. H456 1577 AB177643 клада_290 НЕТ НЕТ Propionibacterium thoenii 1581 NR_042270 клада_290 НЕТ НЕТ Bifidobacterium bifidum 349 ABQP01000027 клада_293 НЕТ НЕТ Leuconostoc mesenteroides 1183 ACKV01000113 клада_295 НЕТ НЕТ Leuconostoc pseudomesenteroides 1184 NR_040814 клада_295 НЕТ НЕТ Johnsonella ignava 1016 X87152 клада_298 НЕТ НЕТ Propionibacterium acnes 1570 ADJM01000010 клада_299 НЕТ НЕТ Propionibacterium sp. 434_HC2 1576 AFIL01000035 клада_299 НЕТ НЕТ Propionibacterium sp. LG 1578 AY354921 клада_299 НЕТ НЕТ Propionibacterium sp. S555a 1579 AB264622 клада_299 НЕТ НЕТ Alicyclobacillus sp. CCUG 53762 128 HE613268 клада_301 НЕТ НЕТ Actinomyces cardiffensis 53 GU470888 клада_303 НЕТ НЕТ Actinomyces funkei 55 HQ906497 клада_303 НЕТ НЕТ Actinomyces sp. HKU31 74 HQ335393 клада_303 НЕТ НЕТ Actinomyces sp., оральный таксон C55 94 HM099646 клада_303 НЕТ НЕТ Kerstersia gyiorum 1018 NR_025669 клада_307 НЕТ НЕТ Pigmentiphaga daeguensis 1467 JN585327 клада_307 НЕТ НЕТ Aeromonas allosaccharophila 104 S39232 клада_308 НЕТ НЕТ Aeromonas enteropelogenes 105 X71121 клада_308 НЕТ НЕТ Aeromonas hydrophila 106 NC_008570 клада_308 НЕТ НЕТ Aeromonas jandaei 107 X60413 клада_308 НЕТ НЕТ Aeromonas salmonicida 108 NC_009348 клада_308 НЕТ НЕТ Aeromonas trota 109 X60415 клада_308 НЕТ НЕТ Aeromonas veronii 110 NR_044845 клада_308 НЕТ НЕТ Marvinbryantia formatexigens 1196 AJ505973 клада_309 НЕТ НЕТ Rhodobacter sp., оральный таксон C30 1620 HM099648 клада_310 НЕТ НЕТ Rhodobacter sphaeroides 1621 CP000144 клада_310 НЕТ НЕТ Lactobacillus antri 1071 ACLL01000037 клада_313 НЕТ НЕТ Lactobacillus coleohominis 1076 ACOH01000030 клада_313 НЕТ НЕТ Lactobacillus fermentum 1083 CP002033 клада_313 НЕТ НЕТ Lactobacillus gastricus 1085 AICN01000060 клада_313 НЕТ НЕТ Lactobacillus mucosae 1099 FR693800 клада_313 НЕТ НЕТ Lactobacillus oris 1103 AEKL01000077 клада_313 НЕТ НЕТ Lactobacillus pontis 1111 HM218420 клада_313 НЕТ НЕТ Lactobacillus reuteri 1112 ACGW02000012 клада_313 НЕТ НЕТ Lactobacillus sp. KLDS 1.0707 1127 EU600911 клада_313 НЕТ НЕТ Lactobacillus sp. KLDS 1.0709 1128 EU600913 клада_313 НЕТ НЕТ Lactobacillus sp. KLDS 1.0711 1129 EU600915 клада_313 НЕТ НЕТ Lactobacillus sp. KLDS 1.0713 1131 EU600917 клада_313 НЕТ НЕТ Lactobacillus sp. KLDS 1.0716 1132 EU600921 клада_313 НЕТ НЕТ Lactobacillus sp. KLDS 1.0718 1133 EU600922 клада_313 НЕТ НЕТ Lactobacillus sp., оральный таксон 052 1137 GQ422710 клада_313 НЕТ НЕТ Lactobacillus vaginalis 1140 ACGV01000168 клада_313 НЕТ НЕТ Brevibacterium aurantiacum 419 NR_044854 клада_314 НЕТ НЕТ Brevibacterium linens 423 AJ315491 клада_314 НЕТ НЕТ Lactobacillus pentosus 1108 JN813103 клада_315 НЕТ НЕТ Lactobacillus plantarum 1110 ACGZ02000033 клада_315 НЕТ НЕТ Lactobacillus sp. KLDS 1.0702 1123 EU600906 клада_315 НЕТ НЕТ Lactobacillus sp. KLDS 1.0703 1124 EU600907 клада_315 НЕТ НЕТ Lactobacillus sp. KLDS 1.0704 1125 EU600908 клада_315 НЕТ НЕТ Lactobacillus sp. KLDS 1.0705 1126 EU600909 клада_315 НЕТ НЕТ Agrobacterium radiobacter 115 CP000628 клада_316 НЕТ НЕТ Agrobacterium tumefaciens 116 AJ389893 клада_316 НЕТ НЕТ Corynebacterium argentoratense 685 EF463055 клада_317 НЕТ НЕТ Corynebacterium diphtheriae 693 NC_002935 клада_317 НЕТ ОП Corynebacterium pseudotuberculosis 715 NR_037070 клада_317 НЕТ НЕТ Corynebacterium renale 717 NR_037069 клада_317 НЕТ НЕТ Corynebacterium ulcerans 731 NR_074467 клада_317 НЕТ НЕТ Aurantimonas coralicida 191 AY065627 клада_318 НЕТ НЕТ Aureimonas altamirensis 192 FN658986 клада_318 НЕТ НЕТ Lactobacillus acidipiscis 1066 NR_024718 клада_320 НЕТ НЕТ Lactobacillus salivarius 1117 AEBA01000145 клада_320 НЕТ НЕТ Lactobacillus sp. KLDS 1.0719 1134 EU600923 клада_320 НЕТ НЕТ Lactobacillus buchneri 1073 ACGH01000101 клада_321 НЕТ НЕТ Lactobacillus, геномовид C1 1086 AY278619 клада_321 НЕТ НЕТ Lactobacillus, геномовид C2 1087 AY278620 клада_321 НЕТ НЕТ Lactobacillus hilgardii 1089 ACGP01000200 клада_321 НЕТ НЕТ Lactobacillus kefiri 1096 NR_042230 клада_321 НЕТ НЕТ Lactobacillus parabuchneri 1105 NR_041294 клада_321 НЕТ НЕТ Lactobacillus parakefiri 1107 NR_029039 клада_321 НЕТ НЕТ Lactobacillus curvatus 1079 NR_042437 клада_322 НЕТ НЕТ Lactobacillus sakei 1116 DQ989236 клада_322 НЕТ НЕТ Aneurinibacillus aneurinilyticus 167 AB101592 клада_323 НЕТ НЕТ Aneurinibacillus danicus 168 NR_028657 клада_323 НЕТ НЕТ Aneurinibacillus migulanus 169 NR_036799 клада_323 НЕТ НЕТ Aneurinibacillus terranovensis 170 NR_042271 клада_323 НЕТ НЕТ Staphylococcus aureus 1757 CP002643 клада_325 НЕТ Категория B Staphylococcus auricularis 1758 JQ624774 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus capitis 1759 ACFR01000029 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus caprae 1760 ACRH01000033 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus carnosus 1761 NR_075003 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus cohnii 1762 JN175375 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus condimenti 1763 NR_029345 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus epidermidis 1764 ACHE01000056 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus equorum 1765 NR_027520 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus haemolyticus 1767 NC_007168 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus hominis 1768 AM157418 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus lugdunensis 1769 AEQA01000024 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus pasteuri 1770 FJ189773 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus pseudintermedius 1771 CP002439 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus saccharolyticus 1772 NR_029158 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus saprophyticus 1773 NC_007350 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus sp. клон bottae7 1777 AF467424 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus sp. H292 1775 AB177642 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus sp. H780 1776 AB177644 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus succinus 1778 NR_028667 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus warneri 1780 ACPZ01000009 клада_325 НЕТ НЕТ Staphylococcus xylosus 1781 AY395016 клада_325 НЕТ НЕТ Cardiobacterium hominis 490 ACKY01000036 клада_326 НЕТ НЕТ Cardiobacterium valvarum 491 NR_028847 клада_326 НЕТ НЕТ Pseudomonas fluorescens 1593 AY622220 клада_326 НЕТ НЕТ Pseudomonas gessardii 1594 FJ943496 клада_326 НЕТ НЕТ Pseudomonas monteilii 1596 NR_024910 клада_326 НЕТ НЕТ Pseudomonas poae 1597 GU188951 клада_326 НЕТ НЕТ Pseudomonas putida 1599 AF094741 клада_326 НЕТ НЕТ Pseudomonas sp. G1229 1601 DQ910482 клада_326 НЕТ НЕТ Pseudomonas tolaasii 1604 AF320988 клада_326 НЕТ НЕТ Pseudomonas viridiflava 1605 NR_042764 клада_326 НЕТ НЕТ Listeria grayi 1185 ACCR02000003 клада_328 НЕТ ОП Listeria innocua 1186 JF967625 клада_328 НЕТ НЕТ Listeria ivanovii 1187 X56151 клада_328 НЕТ НЕТ Listeria monocytogenes 1188 CP002003 клада_328 НЕТ Категория B Listeria welshimeri 1189 AM263198 клада_328 НЕТ ОП Capnocytophaga sp., оральный клон ASCH05 484 AY923149 клада_333 НЕТ НЕТ Capnocytophaga sputigena 489 ABZV01000054 клада_333 НЕТ НЕТ Leptotrichia, геномовид C1 1166 AY278621 клада_334 НЕТ НЕТ Leptotrichia shahii 1169 AY029806 клада_334 НЕТ НЕТ Leptotrichia sp. neutropenicПациент 1170 AF189244 клада_334 НЕТ НЕТ Leptotrichia sp., оральный клон GT018 1171 AY349384 клада_334 НЕТ НЕТ Leptotrichia sp., оральный клон GT020 1172 AY349385 клада_334 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 20_3 296 ACRQ01000064 клада_335 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 3_1_19 307 ADCJ01000062 клада_335 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 3_2_5 311 ACIB01000079 клада_335 НЕТ НЕТ Parabacteroides distasonis 1416 CP000140 клада_335 НЕТ НЕТ Parabacteroides goldsteinii 1417 AY974070 клада_335 НЕТ НЕТ Parabacteroides gordonii 1418 AB470344 клада_335 НЕТ НЕТ Parabacteroides sp. D13 1421 ACPW01000017 клада_335 НЕТ НЕТ Capnocytophaga, геномовид C1 477 AY278613 клада_336 НЕТ НЕТ Capnocytophaga ochracea 480 AEOH01000054 клада_336 НЕТ НЕТ Capnocytophaga sp. GEJ8 481 GU561335 клада_336 НЕТ НЕТ Capnocytophaga sp. оральный штамм A47ROY 486 AY005077 клада_336 НЕТ НЕТ Capnocytophaga sp. S1b 482 U42009 клада_336 НЕТ НЕТ Paraprevotella clara 1426 AFFY01000068 клада_336 НЕТ НЕТ Bacteroides heparinolyticus 282 JN867284 клада_338 НЕТ НЕТ Prevotella heparinolytica 1500 GQ422742 клада_338 НЕТ НЕТ Treponema, геномовид P4 оральный клон MB2_G19 1928 DQ003618 клада_339 НЕТ НЕТ Treponema, геномовид P6 оральный клон MB4_G11 1930 DQ003625 клада_339 НЕТ НЕТ Treponema sp., оральный таксон 254 1952 GU408803 клада_339 НЕТ НЕТ Treponema sp., оральный таксон 508 1956 GU413616 клада_339 НЕТ НЕТ Treponema sp., оральный таксон 518 1957 GU413640 клада_339 НЕТ НЕТ Chlamydia muridarum 502 AE002160 клада_341 НЕТ ОП Chlamydia trachomatis 504 U68443 клада_341 НЕТ ОП Chlamydia psittaci 503 NR_036864 клада_342 НЕТ Категория B Chlamydophila pneumoniae 509 NC_002179 клада_342 НЕТ ОП Chlamydophila psittaci 510 D85712 клада_342 НЕТ ОП Anaerococcus octavius 146 NR_026360 клада_343 НЕТ НЕТ Anaerococcus sp. 8405254 149 HM587319 клада_343 НЕТ НЕТ Anaerococcus sp. 9401487 150 HM587322 клада_343 НЕТ НЕТ Anaerococcus sp. 9403502 151 HM587325 клада_343 НЕТ НЕТ Gardnerella vaginalis 923 CP001849 клада_344 НЕТ НЕТ Campylobacter lari 466 CP000932 клада_346 НЕТ ОП Anaerobiospirillum succiniciproducens 142 NR_026075 клада_347 НЕТ НЕТ Anaerobiospirillum thomasii 143 AJ420985 клада_347 НЕТ НЕТ Ruminobacter amylophilus 1654 NR_026450 клада_347 НЕТ НЕТ Succinatimonas hippie 1897 AEVO01000027 клада_347 НЕТ НЕТ Actinomyces europaeus 54 NR_026363 клада_348 НЕТ НЕТ Actinomyces sp., оральный клон GU009 82 AY349361 клада_348 НЕТ НЕТ Moraxella catarrhalis 1260 CP002005 клада_349 НЕТ НЕТ Moraxella lincolnii 1261 FR822735 клада_349 НЕТ НЕТ Moraxella sp. 16285 1263 JF682466 клада_349 НЕТ НЕТ Psychrobacter sp. 13983 1613 HM212668 клада_349 НЕТ НЕТ Actinobaculum massiliae 49 AF487679 клада_350 НЕТ НЕТ Actinobaculum schaalii 50 AY957507 клада_350 НЕТ НЕТ Actinobaculum sp. BM#101342 51 AY282578 клада_350 НЕТ НЕТ Actinobaculum sp. P2P_19 P1 52 AY207066 клада_350 НЕТ НЕТ Actinomyces sp., оральный клон IO076 84 AY349363 клада_350 НЕТ НЕТ Actinomyces sp., оральный таксон 848 93 ACUY01000072 клада_350 НЕТ НЕТ Actinomyces neuii 65 X71862 клада_352 НЕТ НЕТ Mobiluncus mulieris 1252 ACKW01000035 клада_352 НЕТ НЕТ Blastomonas natatoria 372 NR_040824 клада_356 НЕТ НЕТ Novosphingobium aromaticivorans 1357 AAAV03000008 клада_356 НЕТ НЕТ Sphingomonas sp., оральный клон FI012 1745 AY349411 клада_356 НЕТ НЕТ Sphingopyxis alaskensis 1749 CP000356 клада_356 НЕТ НЕТ Oxalobacter formigenes 1389 ACDQ01000020 клада_357 НЕТ НЕТ Veillonella atypical 1974 AEDS01000059 клада_358 НЕТ НЕТ Veillonella dispar 1975 ACIK02000021 клада_358 НЕТ НЕТ Veillonella, геномовид P1 оральный клон MB5_P17 1976 DQ003631 клада_358 НЕТ НЕТ Veillonella parvula 1978 ADFU01000009 клада_358 НЕТ НЕТ Veillonella sp. 3_1_44 1979 ADCV01000019 клада_358 НЕТ НЕТ Veillonella sp. 6_1_27 1980 ADCW01000016 клада_358 НЕТ НЕТ Veillonella sp. ACP1 1981 HQ616359 клада_358 НЕТ НЕТ Veillonella sp. AS16 1982 HQ616365 клада_358 НЕТ НЕТ Veillonella sp. BS32b 1983 HQ616368 клада_358 НЕТ НЕТ Veillonella sp. ICM51a 1984 HQ616396 клада_358 НЕТ НЕТ Veillonella sp. MSA12 1985 HQ616381 клада_358 НЕТ НЕТ Veillonella sp. NVG 100cf 1986 EF108443 клада_358 НЕТ НЕТ Veillonella sp. OK11 1987 JN695650 клада_358 НЕТ НЕТ Veillonella sp., оральный клон ASCG01 1990 AY923144 клада_358 НЕТ НЕТ Veillonella sp., оральный клон ASCG02 1991 AY953257 клада_358 НЕТ НЕТ Veillonella sp., оральный клон OH1A 1992 AY947495 клада_358 НЕТ НЕТ Veillonella sp., оральный таксон 158 1993 AENU01000007 клада_358 НЕТ НЕТ Kocuria marina 1040 GQ260086 клада_365 НЕТ НЕТ Kocuria rhizophila 1042 AY030315 клада_365 НЕТ НЕТ Kocuria rosea 1043 X87756 клада_365 НЕТ НЕТ Kocuria varians 1044 AF542074 клада_365 НЕТ НЕТ Бактерия Clostridiaceae END_2 531 EF451053 клада_368 НЕТ НЕТ Micrococcus antarcticus 1242 NR_025285 клада_371 НЕТ НЕТ Micrococcus luteus 1243 NR_075062 клада_371 НЕТ НЕТ Micrococcus lylae 1244 NR_026200 клада_371 НЕТ НЕТ Micrococcus sp. 185 1245 EU714334 клада_371 НЕТ НЕТ Lactobacillus brevis 1072 EU194349 клада_372 НЕТ НЕТ Lactobacillus parabrevis 1104 NR_042456 клада_372 НЕТ НЕТ Pediococcus acidilactici 1436 ACXB01000026 клада_372 НЕТ НЕТ Pediococcus pentosaceus 1437 NR_075052 клада_372 НЕТ НЕТ Lactobacillus dextrinicus 1081 NR_036861 клада_373 НЕТ НЕТ Lactobacillus perolens 1109 NR_029360 клада_373 НЕТ НЕТ Lactobacillus rhamnosus 1113 ABWJ01000068 клада_373 НЕТ НЕТ Lactobacillus saniviri 1118 AB602569 клада_373 НЕТ НЕТ Lactobacillus sp. BT6 1121 HQ616370 клада_373 НЕТ НЕТ Mycobacterium mageritense 1282 FR798914 клада_374 НЕТ ОП Mycobacterium neoaurum 1286 AF268445 клада_374 НЕТ ОП Mycobacterium smegmatis 1291 CP000480 клада_374 НЕТ ОП Mycobacterium sp. HE5 1304 AJ012738 клада_374 НЕТ НЕТ Dysgonomonas gadei 775 ADLV01000001 клада_377 НЕТ НЕТ Dysgonomonas mossii 776 ADLW01000023 клада_377 НЕТ НЕТ Porphyromonas levii 1474 NR_025907 клада_377 НЕТ НЕТ Porphyromonas somerae 1476 AB547667 клада_377 НЕТ НЕТ Bacteroides barnesiae 267 NR_041446 клада_378 НЕТ НЕТ Bacteroides coprocola 272 ABIY02000050 клада_378 НЕТ НЕТ Bacteroides coprophilus 273 ACBW01000012 клада_378 НЕТ НЕТ Bacteroides dorei 274 ABWZ01000093 клада_378 НЕТ НЕТ Bacteroides massiliensis 284 AB200226 клада_378 НЕТ НЕТ Bacteroides plebeius 289 AB200218 клада_378 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 3_1_33FAA 309 ACPS01000085 клада_378 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 3_1_40A 310 ACRT01000136 клада_378 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 4_3_47FAA 313 ACDR02000029 клада_378 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 9_1_42FAA 314 ACAA01000096 клада_378 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. NB_8 323 AB117565 клада_378 НЕТ НЕТ Bacteroides vulgatus 331 CP000139 клада_378 НЕТ НЕТ Bacteroides ovatus 287 ACWH01000036 клада_38 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 1_1_30 294 ADCL01000128 клада_38 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 2_1_22 297 ACPQ01000117 клада_38 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 2_2_4 299 ABZZ01000168 клада_38 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 3_1_23 308 ACRS01000081 клада_38 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. D1 318 ACAB02000030 клада_38 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. D2 321 ACGA01000077 клада_38 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. D22 320 ADCK01000151 клада_38 НЕТ НЕТ Bacteroides xylanisolvens 332 ADKP01000087 клада_38 НЕТ НЕТ Treponema лецитинolyticum 1931 NR_026247 клада_380 НЕТ ОП Treponema parvum 1933 AF302937 клада_380 НЕТ ОП Treponema sp., оральный клон JU025 1940 AY349417 клада_380 НЕТ НЕТ Treponema sp., оральный таксон 270 1954 GQ422733 клада_380 НЕТ НЕТ Parascardovia denticolens 1428 ADEB01000020 клада_381 НЕТ НЕТ Scardovia inopinata 1688 AB029087 клада_381 НЕТ НЕТ Scardovia wiggsiae 1689 AY278626 клада_381 НЕТ НЕТ Бактерия Clostridiales 9400853 533 HM587320 клада_384 НЕТ НЕТ Mogibacterium diversum 1254 NR_027191 клада_384 НЕТ НЕТ Mogibacterium neglectum 1255 NR_027203 клада_384 НЕТ НЕТ Mogibacterium pumilum 1256 NR_028608 клада_384 НЕТ НЕТ Mogibacterium timidum 1257 Z36296 клада_384 НЕТ НЕТ Borrelia burgdorferi 389 ABGI01000001 клада_386 НЕТ ОП Borrelia garinii 392 ABJV01000001 клада_386 НЕТ ОП Borrelia sp. NE49 397 AJ224142 клада_386 НЕТ ОП Caldimonas manganoxidans 457 NR_040787 клада_387 НЕТ НЕТ Бактерия Comamonadaceae, оральный таксон F47 667 HM099651 клада_387 НЕТ НЕТ Lautropia mirabilis 1149 AEQP01000026 клада_387 НЕТ НЕТ Lautropia sp., оральный клон AP009 1150 AY005030 клада_387 НЕТ НЕТ Peptoniphilus asaccharolyticus 1441 D14145 клада_389 НЕТ НЕТ Peptoniphilus duerdenii 1442 EU526290 клада_389 НЕТ НЕТ Peptoniphilus harei 1443 NR_026358 клада_389 НЕТ НЕТ Peptoniphilus indolicus 1444 AY153431 клада_389 НЕТ НЕТ Peptoniphilus lacrimalis 1446 ADDO01000050 клада_389 НЕТ НЕТ Peptoniphilus sp. gpac077 1450 AM176527 клада_389 НЕТ НЕТ Peptoniphilus sp. JC140 1447 JF824803 клада_389 НЕТ НЕТ Peptoniphilus sp., оральный таксон 386 1452 ADCS01000031 клада_389 НЕТ НЕТ Peptoniphilus sp., оральный таксон 836 1453 AEAA01000090 клада_389 НЕТ НЕТ Peptostreptococcaceae бактерия ph1 1454 JN837495 клада_389 НЕТ НЕТ Dialister pneumosintes 765 HM596297 клада_390 НЕТ НЕТ Dialister sp., оральный таксон 502 767 GQ422739 клада_390 НЕТ НЕТ Cupriavidus metallidurans 741 GU230889 клада_391 НЕТ НЕТ Herbaspirillum seropedicae 1001 CP002039 клада_391 НЕТ НЕТ Herbaspirillum sp. JC206 1002 JN657219 клада_391 НЕТ НЕТ Janthinobacterium sp. SY12 1015 EF455530 клада_391 НЕТ НЕТ Massilia sp. CCUG 43427A 1197 FR773700 клада_391 НЕТ НЕТ Ralstonia pickettii 1615 NC_010682 клада_391 НЕТ НЕТ Ralstonia sp. 5_7_47FAA 1616 ACUF01000076 клада_391 НЕТ НЕТ Francisella novicida 889 ABSS01000002 клада_392 НЕТ НЕТ Francisella philomiragia 890 AY928394 клада_392 НЕТ НЕТ Francisella tularensis 891 ABAZ01000082 клада_392 НЕТ Категория A Ignatzschineria indica 1009 HQ823562 клада_392 НЕТ НЕТ Ignatzschineria sp. NML 95_0260 1010 HQ823559 клада_392 НЕТ НЕТ Streptococcus mutans 1814 AP010655 клада_394 НЕТ НЕТ Lactobacillus gasseri 1084 ACOZ01000018 клада_398 НЕТ НЕТ Lactobacillus hominis 1090 FR681902 клада_398 НЕТ НЕТ Lactobacillus iners 1091 AEKJ01000002 клада_398 НЕТ НЕТ Lactobacillus johnsonii 1093 AE017198 клада_398 НЕТ НЕТ Lactobacillus senioris 1119 AB602570 клада_398 НЕТ НЕТ Lactobacillus sp., оральный клон HT002 1135 AY349382 клада_398 НЕТ НЕТ Weissella beninensis 2006 EU439435 клада_398 НЕТ НЕТ Sphingomonas echinoides 1744 NR_024700 клада_399 НЕТ НЕТ Sphingomonas sp., оральный таксон A09 1747 HM099639 клада_399 НЕТ НЕТ Sphingomonas sp., оральный таксон F71 1748 HM099645 клада_399 НЕТ НЕТ Zymomonas mobilis 2032 NR_074274 клада_399 НЕТ НЕТ Arcanobacterium haemolyticum 174 NR_025347 клада_400 НЕТ НЕТ Arcanobacterium pyogenes 175 GU585578 клада_400 НЕТ НЕТ Trueperella pyogenes 1962 NR_044858 клада_400 НЕТ НЕТ Lactococcus garvieae 1144 AF061005 клада_401 НЕТ НЕТ Lactococcus lactis 1145 CP002365 клада_401 НЕТ НЕТ Brevibacterium mcbrellneri 424 ADNU01000076 клада_402 НЕТ НЕТ Brevibacterium paucivorans 425 EU086796 клада_402 НЕТ НЕТ Brevibacterium sp. JC43 428 JF824806 клада_402 НЕТ НЕТ Selenomonas artemidis 1692 HM596274 клада_403 НЕТ НЕТ Selenomonas sp. FOBRC9 1704 HQ616378 клада_403 НЕТ НЕТ Selenomonas sp., оральный таксон 137 1715 AENV01000007 клада_403 НЕТ НЕТ Desmospora activa 751 AM940019 клада_404 НЕТ НЕТ Desmospora sp. 8437 752 AFHT01000143 клада_404 НЕТ НЕТ Paenibacillus sp., оральный таксон F45 1407 HM099647 клада_404 НЕТ НЕТ Corynebacterium ammoniagenes 682 ADNS01000011 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium aurimucosum 687 ACLH01000041 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium bovis 688 AF537590 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium canis 689 GQ871934 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium casei 690 NR_025101 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium durum 694 Z97069 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium efficiens 695 ACLI01000121 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium falsenii 696 Y13024 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium flavescens 697 NR_037040 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium glutamicum 701 BA000036 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium jeikeium 704 ACYW01000001 клада_405 НЕТ ОП Corynebacterium kroppenstedtii 705 NR_026380 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium lipophiloflavum 706 ACHJ01000075 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium matruchotii 709 ACSH02000003 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium minutissimum 710 X82064 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium resistens 718 ADGN01000058 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium simulans 720 AF537604 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium singulare 721 NR_026394 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium sp. 1 ex sheep 722 Y13427 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium sp. NML 99_0018 726 GU238413 клада_405 НЕТ НЕТ Corynebacterium striatum 727 ACGE01000001 клада_405 НЕТ ОП Corynebacterium urealyticum 732 X81913 клада_405 НЕТ ОП Corynebacterium variabile 734 NR_025314 клада_405 НЕТ НЕТ Aerococcus sanguinicola 98 AY837833 клада_407 НЕТ НЕТ Aerococcus urinae 99 CP002512 клада_407 НЕТ НЕТ Aerococcus urinaeequi 100 NR_043443 клада_407 НЕТ НЕТ Aerococcus viridans 101 ADNT01000041 клада_407 НЕТ НЕТ Fusobacterium naviforme 898 HQ223106 клада_408 НЕТ НЕТ Moryella indoligenes 1268 AF527773 клада_408 НЕТ НЕТ Selenomonas, геномовид P5 1697 AY341820 клада_410 НЕТ НЕТ Selenomonas sp., оральный клон IQ048 1710 AY349408 клада_410 НЕТ НЕТ Selenomonas sputigena 1717 ACKP02000033 клада_410 НЕТ НЕТ Hyphomicrobium sulfonivorans 1007 AY468372 клада_411 НЕТ НЕТ Methylocella silvestris 1228 NR_074237 клада_411 НЕТ НЕТ Legionella pneumophila 1153 NC_002942 клада_412 НЕТ ОП Lactobacillus coryniformis 1077 NR_044705 клада_413 НЕТ НЕТ Arthrobacter agilis 178 NR_026198 клада_414 НЕТ НЕТ Arthrobacter arilaitensis 179 NR_074608 клада_414 НЕТ НЕТ Arthrobacter bergerei 180 NR_025612 клада_414 НЕТ НЕТ Arthrobacter globiformis 181 NR_026187 клада_414 НЕТ НЕТ Arthrobacter nicotianae 182 NR_026190 клада_414 НЕТ НЕТ Mycobacterium abscessus 1269 AGQU01000002 клада_418 НЕТ ОП Mycobacterium chelonae 1273 AB548610 клада_418 НЕТ ОП Bacteroides salanitronis 291 CP002530 клада_419 НЕТ НЕТ Paraprevotella xylaniphila 1427 AFBR01000011 клада_419 НЕТ НЕТ Barnesiella intestinihominis 336 AB370251 клада_420 НЕТ НЕТ Barnesiella viscericola 337 NR_041508 клада_420 НЕТ НЕТ Parabacteroides sp. NS31_3 1422 JN029805 клада_420 НЕТ НЕТ Бактерия Porphyromonadaceae NML 060648 1470 EF184292 клада_420 НЕТ НЕТ Tannerella forsythia 1913 CP003191 клада_420 НЕТ НЕТ Tannerella sp. 6_1_58FAA_CT1 1914 ACWX01000068 клада_420 НЕТ НЕТ Mycoplasma amphoriforme 1311 AY531656 клада_421 НЕТ НЕТ Mycoplasma genitalium 1317 L43967 клада_421 НЕТ НЕТ Mycoplasma pneumoniae 1322 NC_000912 клада_421 НЕТ НЕТ Mycoplasma penetrans 1321 NC_004432 клада_422 НЕТ НЕТ Ureaplasma parvum 1966 AE002127 клада_422 НЕТ НЕТ Ureaplasma urealyticum 1967 AAYN01000002 клада_422 НЕТ НЕТ Treponema, геномовид P1 1927 AY341822 клада_425 НЕТ НЕТ Treponema sp., оральный таксон 228 1943 GU408580 клада_425 НЕТ НЕТ Treponema sp., оральный таксон 230 1944 GU408603 клада_425 НЕТ НЕТ Treponema sp., оральный таксон 231 1945 GU408631 клада_425 НЕТ НЕТ Treponema sp., оральный таксон 232 1946 GU408646 клада_425 НЕТ НЕТ Treponema sp., оральный таксон 235 1947 GU408673 клада_425 НЕТ НЕТ Treponema sp. ovine footrot 1959 AJ010951 клада_425 НЕТ НЕТ Treponema vincentii 1960 ACYH01000036 клада_425 НЕТ ОП Burkholderiales бактерия 1_1_47 452 ADCQ01000066 клада_432 НЕТ ОП Parasutterella excrementihominis 1429 AFBP01000029 клада_432 НЕТ НЕТ Parasutterella secunda 1430 AB491209 клада_432 НЕТ НЕТ Sutterella morbirenis 1898 AJ832129 клада_432 НЕТ НЕТ Sutterella sanguinus 1900 AJ748647 клада_432 НЕТ НЕТ Sutterella sp. YIT 12072 1901 AB491210 клада_432 НЕТ НЕТ Sutterella stercoricanis 1902 NR_025600 клада_432 НЕТ НЕТ Sutterella wadsworthensis 1903 ADMF01000048 клада_432 НЕТ НЕТ Propionibacterium freudenreichii 1572 NR_036972 клада_433 НЕТ НЕТ Propionibacterium sp., оральный таксон 192 1580 GQ422728 клада_433 НЕТ НЕТ Tessaracoccus sp., оральный таксон F04 1917 HM099640 клада_433 НЕТ НЕТ Peptoniphilus ivorii 1445 Y07840 клада_434 НЕТ НЕТ Peptoniphilus sp. gpac007 1448 AM176517 клада_434 НЕТ НЕТ Peptoniphilus sp. gpac018A 1449 AM176519 клада_434 НЕТ НЕТ Peptoniphilus sp. gpac148 1451 AM176535 клада_434 НЕТ НЕТ Flexispira rappini 887 AY126479 клада_436 НЕТ НЕТ Helicobacter bilis 993 ACDN01000023 клада_436 НЕТ НЕТ Helicobacter cinaedi 995 ABQT01000054 клада_436 НЕТ НЕТ Helicobacter sp. Нет 998 U44756 клада_436 НЕТ НЕТ Brevundimonas subvibrioides 429 CP002102 клада_438 НЕТ НЕТ Hyphomonas neptunium 1008 NR_074092 клада_438 НЕТ НЕТ Phenylobacterium zucineum 1465 AY628697 клада_438 НЕТ НЕТ Streptococcus downei 1793 AEKN01000002 клада_441 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. SHV515 1848 Y07601 клада_441 НЕТ НЕТ Acinetobacter sp. CIP 53.82 40 JQ638584 клада_443 НЕТ НЕТ Halomonas elongata 990 NR_074782 клада_443 НЕТ НЕТ Halomonas johnsoniae 991 FR775979 клада_443 НЕТ НЕТ Butyrivibrio fibrisolvens 456 U41172 клада_444 НЕТ НЕТ Roseburia sp. 11SE37 1640 FM954975 клада_444 НЕТ НЕТ Roseburia sp. 11SE38 1641 FM954976 клада_444 НЕТ НЕТ Shuttleworthia satelles 1728 ACIP02000004 клада_444 НЕТ НЕТ Shuttleworthia sp. MSX8B 1729 HQ616383 клада_444 НЕТ НЕТ Shuttleworthia sp., оральный таксон G69 1730 GU432167 клада_444 НЕТ НЕТ Bdellovibrio sp. MPA 344 AY294215 клада_445 НЕТ НЕТ Desulfobulbus sp., оральный клон CH031 755 AY005036 клада_445 НЕТ НЕТ Desulfovibrio desulfuricans 757 DQ092636 клада_445 НЕТ НЕТ Desulfovibrio fairfieldensis 758 U42221 клада_445 НЕТ НЕТ Desulfovibrio piger 759 AF192152 клада_445 НЕТ НЕТ Desulfovibrio sp. 3_1_syn3 760 ADDR01000239 клада_445 НЕТ НЕТ Geobacter bemidjiensis 941 CP001124 клада_445 НЕТ НЕТ Brachybacterium alimentarium 401 NR_026269 клада_446 НЕТ НЕТ Brachybacterium conglomeratum 402 AB537169 клада_446 НЕТ НЕТ Brachybacterium tyrofermentans 403 NR_026272 клада_446 НЕТ НЕТ Dermabacter hominis 749 FJ263375 клада_446 НЕТ НЕТ Aneurinibacillus thermoaerophilus 171 NR_029303 клада_448 НЕТ НЕТ Brevibacillus agri 409 NR_040983 клада_448 НЕТ НЕТ Brevibacillus centrosporus 411 NR_043414 клада_448 НЕТ НЕТ Brevibacillus choshinensis 412 NR_040980 клада_448 НЕТ НЕТ Brevibacillus invocatus 413 NR_041836 клада_448 НЕТ НЕТ Brevibacillus parabrevis 415 NR_040981 клада_448 НЕТ НЕТ Brevibacillus reuszeri 416 NR_040982 клада_448 НЕТ НЕТ Brevibacillus sp. phR 417 JN837488 клада_448 НЕТ НЕТ Brevibacillus thermoruber 418 NR_026514 клада_448 НЕТ НЕТ Lactobacillus murinus 1100 NR_042231 клада_449 НЕТ НЕТ Lactobacillus oeni 1102 NR_043095 клада_449 НЕТ НЕТ Lactobacillus ruminis 1115 ACGS02000043 клада_449 НЕТ НЕТ Lactobacillus vini 1141 NR_042196 клада_449 НЕТ НЕТ Gemella haemolysans 924 ACDZ02000012 клада_450 НЕТ НЕТ Gemella morbillorum 925 NR_025904 клада_450 НЕТ НЕТ Gemella morbillorum 926 ACRX01000010 клада_450 НЕТ НЕТ Gemella sanguinis 927 ACRY01000057 клада_450 НЕТ НЕТ Gemella sp., оральный клон ASCE02 929 AY923133 клада_450 НЕТ НЕТ Gemella sp., оральный клон ASCF04 930 AY923139 клада_450 НЕТ НЕТ Gemella sp., оральный клон ASCF12 931 AY923143 клада_450 НЕТ НЕТ Gemella sp. WAL 1945J 928 EU427463 клада_450 НЕТ НЕТ Sporolactobacillus nakayamae 1753 NR_042247 клада_451 НЕТ НЕТ Gluconacetobacter entanii 945 NR_028909 клада_452 НЕТ НЕТ Gluconacetobacter europaeus 946 NR_026513 клада_452 НЕТ НЕТ Gluconacetobacter hansenii 947 NR_026133 клада_452 НЕТ НЕТ Gluconacetobacter oboediens 949 NR_041295 клада_452 НЕТ НЕТ Gluconacetobacter xylinus 950 NR_074338 клада_452 НЕТ НЕТ Auritibacter ignavus 193 FN554542 клада_453 НЕТ НЕТ Dermacoccus sp. Ellin185 750 AEIQ01000090 клада_453 НЕТ НЕТ Janibacter limosus 1013 NR_026362 клада_453 НЕТ НЕТ Janibacter melonis 1014 EF063716 клада_453 НЕТ НЕТ Acetobacter aceti 7 NR_026121 клада_454 НЕТ НЕТ Acetobacter fabarum 8 NR_042678 клада_454 НЕТ НЕТ Acetobacter lovaniensis 9 NR_040832 клада_454 НЕТ НЕТ Acetobacter malorum 10 NR_025513 клада_454 НЕТ НЕТ Acetobacter orientalis 11 NR_028625 клада_454 НЕТ НЕТ Acetobacter pasteurianus 12 NR_026107 клада_454 НЕТ НЕТ Acetobacter pomorum 13 NR_042112 клада_454 НЕТ НЕТ Acetobacter syzygii 14 NR_040868 клада_454 НЕТ НЕТ Acetobacter tropicalis 15 NR_036881 клада_454 НЕТ НЕТ Gluconacetobacter azotocaptans 943 NR_028767 клада_454 НЕТ НЕТ Gluconacetobacter diazotrophicus 944 NR_074292 клада_454 НЕТ НЕТ Gluconacetobacter johannae 948 NR_024959 клада_454 НЕТ НЕТ Nocardia brasiliensis 1351 AIHV01000038 клада_455 НЕТ НЕТ Nocardia cyriacigeorgica 1352 HQ009486 клада_455 НЕТ НЕТ Nocardia puris 1354 NR_028994 клада_455 НЕТ НЕТ Nocardia sp. 01_Je_025 1355 GU574059 клада_455 НЕТ НЕТ Rhodococcus equi 1623 ADNW01000058 клада_455 НЕТ НЕТ Oceanobacillus caeni 1358 NR_041533 клада_456 НЕТ НЕТ Oceanobacillus sp. Ndiop 1359 CAER01000083 клада_456 НЕТ НЕТ Ornithinibacillus bavariensis 1384 NR_044923 клада_456 НЕТ НЕТ Ornithinibacillus sp. 7_10AIA 1385 FN397526 клада_456 НЕТ НЕТ Virgibacillus proomii 2005 NR_025308 клада_456 НЕТ НЕТ Corynebacterium amycolatum 683 ABZU01000033 клада_457 НЕТ ОП Corynebacterium hansenii 702 AM946639 клада_457 НЕТ НЕТ Corynebacterium xerosis 735 FN179330 клада_457 НЕТ ОП Бактерия Staphylococcaceae NML 92_0017 1756 AY841362 клада_458 НЕТ НЕТ Staphylococcus fleurettii 1766 NR_041326 клада_458 НЕТ НЕТ Staphylococcus sciuri 1774 NR_025520 клада_458 НЕТ НЕТ Staphylococcus vitulinus 1779 NR_024670 клада_458 НЕТ НЕТ Stenotrophomonas maltophilia 1782 AAVZ01000005 клада_459 НЕТ НЕТ Stenotrophomonas sp. FG_6 1783 EF017810 клада_459 НЕТ НЕТ Mycobacterium africanum 1270 AF480605 клада_46 НЕТ ОП Mycobacterium alsiensis 1271 AJ938169 клада_46 НЕТ ОП Mycobacterium avium 1272 CP000479 клада_46 НЕТ ОП Mycobacterium colombiense 1274 AM062764 клада_46 НЕТ ОП Mycobacterium gordonae 1276 GU142930 клада_46 НЕТ ОП Mycobacterium intracellulare 1277 GQ153276 клада_46 НЕТ ОП Mycobacterium kansasii 1278 AF480601 клада_46 НЕТ ОП Mycobacterium lacus 1279 NR_025175 клада_46 НЕТ ОП Mycobacterium leprae 1280 FM211192 клада_46 НЕТ ОП Mycobacterium lepromatosis 1281 EU203590 клада_46 НЕТ ОП Mycobacterium mantenii 1283 FJ042897 клада_46 НЕТ ОП Mycobacterium marinum 1284 NC_010612 клада_46 НЕТ ОП Mycobacterium microti 1285 NR_025234 клада_46 НЕТ ОП Mycobacterium parascrofulaceum 1287 ADNV01000350 клада_46 НЕТ ОП Mycobacterium seoulense 1290 DQ536403 клада_46 НЕТ ОП Mycobacterium sp. 1761 1292 EU703150 клада_46 НЕТ НЕТ Mycobacterium sp. 1791 1295 EU703148 клада_46 НЕТ НЕТ Mycobacterium sp. 1797 1296 EU703149 клада_46 НЕТ НЕТ Mycobacterium sp. B10_07.09.0206 1298 HQ174245 клада_46 НЕТ НЕТ Mycobacterium sp. NLA001000736 1305 HM627011 клада_46 НЕТ НЕТ Mycobacterium sp. W 1306 DQ437715 клада_46 НЕТ НЕТ Mycobacterium tuberculosis 1307 CP001658 клада_46 НЕТ Категория C Mycobacterium ulcerans 1308 AB548725 клада_46 НЕТ ОП Mycobacterium vulneris 1309 EU834055 клада_46 НЕТ ОП Xanthomonas campestris 2016 EF101975 клада_461 НЕТ НЕТ Xanthomonas sp. kmd_489 2017 EU723184 клада_461 НЕТ НЕТ Dietzia natronolimnaea 769 GQ870426 клада_462 НЕТ НЕТ Dietzia sp. BBDP51 770 DQ337512 клада_462 НЕТ НЕТ Dietzia sp. CA149 771 GQ870422 клада_462 НЕТ НЕТ Dietzia timorensis 772 GQ870424 клада_462 НЕТ НЕТ Gordonia bronchialis 951 NR_027594 клада_463 НЕТ НЕТ Gordonia polyisoprenivorans 952 DQ385609 клада_463 НЕТ НЕТ Gordonia sp. KTR9 953 DQ068383 клада_463 НЕТ НЕТ Gordonia sputi 954 FJ536304 клада_463 НЕТ НЕТ Gordonia terrae 955 GQ848239 клада_463 НЕТ НЕТ Leptotrichia goodfellowii 1167 ADAD01000110 клада_465 НЕТ НЕТ Leptotrichia sp., оральный клон IK040 1174 AY349387 клада_465 НЕТ НЕТ Leptotrichia sp., оральный клон P2PB_51 P1 1175 AY207053 клада_465 НЕТ НЕТ Bacteroidales, геномовид P7 оральный клон MB3_P19 264 DQ003623 клада_466 НЕТ НЕТ Butyricimonas virosa 454 AB443949 клада_466 НЕТ НЕТ Odoribacter laneus 1363 AB490805 клада_466 НЕТ НЕТ Odoribacter splanchnicus 1364 CP002544 клада_466 НЕТ НЕТ Capnocytophaga gingivalis 478 ACLQ01000011 клада_467 НЕТ НЕТ Capnocytophaga granulosa 479 X97248 клада_467 НЕТ НЕТ Capnocytophaga sp., оральный клон AH015 483 AY005074 клада_467 НЕТ НЕТ Capnocytophaga sp. оральный штамм S3 487 AY005073 клада_467 НЕТ НЕТ Capnocytophaga sp., оральный таксон 338 488 AEXX01000050 клада_467 НЕТ НЕТ Capnocytophaga canimorsus 476 CP002113 клада_468 НЕТ НЕТ Capnocytophaga sp., оральный клон ID062 485 AY349368 клада_468 НЕТ НЕТ Lactobacillus catenaformis 1075 M23729 клада_469 НЕТ НЕТ Lactobacillus vitulinus 1142 NR_041305 клада_469 НЕТ НЕТ Cetobacterium somerae 501 AJ438155 клада_470 НЕТ НЕТ Fusobacterium gonidiaformans 896 ACET01000043 клада_470 НЕТ НЕТ Fusobacterium mortiferum 897 ACDB02000034 клада_470 НЕТ НЕТ Fusobacterium necrogenes 899 X55408 клада_470 НЕТ НЕТ Fusobacterium necrophorum 900 AM905356 клада_470 НЕТ НЕТ Fusobacterium sp. 12_1B 905 AGWJ01000070 клада_470 НЕТ НЕТ Fusobacterium sp. 3_1_5R 911 ACDD01000078 клада_470 НЕТ НЕТ Fusobacterium sp. D12 918 ACDG02000036 клада_470 НЕТ НЕТ Fusobacterium ulcerans 921 ACDH01000090 клада_470 НЕТ НЕТ Fusobacterium varium 922 ACIE01000009 клада_470 НЕТ НЕТ Mycoplasma arthritidis 1312 NC_011025 клада_473 НЕТ НЕТ Mycoplasma faucium 1314 NR_024983 клада_473 НЕТ НЕТ Mycoplasma hominis 1318 AF443616 клада_473 НЕТ НЕТ Mycoplasma orale 1319 AY796060 клада_473 НЕТ НЕТ Mycoplasma salivarium 1324 M24661 клада_473 НЕТ НЕТ Mitsuokella jalaludinii 1247 NR_028840 клада_474 НЕТ НЕТ Mitsuokella multacida 1248 ABWK02000005 клада_474 НЕТ НЕТ Mitsuokella sp., оральный таксон 521 1249 GU413658 клада_474 НЕТ НЕТ Mitsuokella sp., оральный таксон G68 1250 GU432166 клада_474 НЕТ НЕТ Selenomonas, геномовид C1 1695 AY278627 клада_474 НЕТ НЕТ Selenomonas, геномовид P8 оральный клон MB5_P06 1700 DQ003628 клада_474 НЕТ НЕТ Selenomonas ruminantium 1703 NR_075026 клада_474 НЕТ НЕТ Veillonellaceae бактерия, оральный таксон 131 1994 GU402916 клада_474 НЕТ НЕТ Alloscardovia omnicolens 139 NR_042583 клада_475 НЕТ НЕТ Alloscardovia sp. OB7196 140 AB425070 клада_475 НЕТ НЕТ Bifidobacterium urinalis 366 AJ278695 клада_475 НЕТ НЕТ Prevotella loescheii 1503 JN867231 клада_48 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон ASCG12 1530 DQ272511 клада_48 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон GU027 1540 AY349398 клада_48 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный таксон 472 1553 ACZS01000106 клада_48 НЕТ НЕТ Selenomonas dianae 1693 GQ422719 клада_480 НЕТ НЕТ Selenomonas flueggei 1694 AF287803 клада_480 НЕТ НЕТ Selenomonas, геномовид C2 1696 AY278628 клада_480 НЕТ НЕТ Selenomonas, геномовид P6 оральный клон MB3_C41 1698 DQ003636 клада_480 НЕТ НЕТ Selenomonas, геномовид P7 оральный клон MB5_C08 1699 DQ003627 клада_480 НЕТ НЕТ Selenomonas infelix 1701 AF287802 клада_480 НЕТ НЕТ Selenomonas noxia 1702 GU470909 клада_480 НЕТ НЕТ Selenomonas sp., оральный клон FT050 1705 AY349403 клада_480 НЕТ НЕТ Selenomonas sp., оральный клон GI064 1706 AY349404 клада_480 НЕТ НЕТ Selenomonas sp., оральный клон GT010 1707 AY349405 клада_480 НЕТ НЕТ Selenomonas sp., оральный клон HU051 1708 AY349406 клада_480 НЕТ НЕТ Selenomonas sp., оральный клон IK004 1709 AY349407 клада_480 НЕТ НЕТ Selenomonas sp., оральный клон JI021 1711 AY349409 клада_480 НЕТ НЕТ Selenomonas sp., оральный клон JS031 1712 AY349410 клада_480 НЕТ НЕТ Selenomonas sp., оральный клон OH4A 1713 AY947498 клада_480 НЕТ НЕТ Selenomonas sp., оральный клон P2PA_80 P4 1714 AY207052 клада_480 НЕТ НЕТ Selenomonas sp., оральный таксон 149 1716 AEEJ01000007 клада_480 НЕТ НЕТ Бактерия Veillonellaceae, оральный таксон 155 1995 GU470897 клада_480 НЕТ НЕТ Agrococcus jenensis 117 NR_026275 клада_484 НЕТ НЕТ Microbacterium gubbeenense 1232 NR_025098 клада_484 НЕТ НЕТ Pseudoclavibacter sp. Timone 1590 FJ375951 клада_484 НЕТ НЕТ Tropheryma whipplei 1961 BX251412 клада_484 НЕТ НЕТ Zimmermannella bifida 2031 AB012592 клада_484 НЕТ НЕТ Legionella hackeliae 1151 M36028 клада_486 НЕТ ОП Legionella longbeachae 1152 M36029 клада_486 НЕТ ОП Legionella sp. D3923 1154 JN380999 клада_486 НЕТ ОП Legionella sp. D4088 1155 JN381012 клада_486 НЕТ ОП Legionella sp. H63 1156 JF831047 клада_486 НЕТ ОП Legionella sp. NML 93L054 1157 GU062706 клада_486 НЕТ ОП Legionella steelei 1158 HQ398202 клада_486 НЕТ ОП Tatlockia micdadei 1915 M36032 клада_486 НЕТ НЕТ Helicobacter pullorum 996 ABQU01000097 клада_489 НЕТ НЕТ Acetobacteraceae бактерия AT_5844 16 AGEZ01000040 клада_490 НЕТ НЕТ Roseomonas cervicalis 1643 ADVL01000363 клада_490 НЕТ НЕТ Roseomonas mucosa 1644 NR_028857 клада_490 НЕТ НЕТ Roseomonas sp. NML94_0193 1645 AF533357 клада_490 НЕТ НЕТ Roseomonas sp. NML97_0121 1646 AF533359 клада_490 НЕТ НЕТ Roseomonas sp. NML98_0009 1647 AF533358 клада_490 НЕТ НЕТ Roseomonas sp. NML98_0157 1648 AF533360 клада_490 НЕТ НЕТ Rickettsia akari 1627 CP000847 клада_492 НЕТ ОП Rickettsia conorii 1628 AE008647 клада_492 НЕТ ОП Rickettsia prowazekii 1629 M21789 клада_492 НЕТ Категория B Rickettsia rickettsii 1630 NC_010263 клада_492 НЕТ ОП Rickettsia slovaca 1631 L36224 клада_492 НЕТ ОП Rickettsia typhi 1632 AE017197 клада_492 НЕТ ОП Anaeroglobus geminatus 160 AGCJ01000054 клада_493 НЕТ НЕТ Megasphaera, геномовид C1 1201 AY278622 клада_493 НЕТ НЕТ Megasphaera micronuciformis 1203 AECS01000020 клада_493 НЕТ НЕТ Clostridiales, геномовид BVAB3 540 CP001850 клада_495 НЕТ НЕТ Tsukamurella paurometabola 1963 X80628 клада_496 НЕТ НЕТ Tsukamurella tyrosinosolvens 1964 AB478958 клада_496 НЕТ НЕТ Abiotrophia para_adiacens 2 AB022027 клада_497 НЕТ НЕТ Carnobacterium divergens 492 NR_044706 клада_497 НЕТ НЕТ Carnobacterium maltaromaticum 493 NC_019425 клада_497 НЕТ НЕТ Enterococcus avium 800 AF133535 клада_497 НЕТ НЕТ Enterococcus caccae 801 AY943820 клада_497 НЕТ НЕТ Enterococcus casseliflavus 802 AEWT01000047 клада_497 НЕТ НЕТ Enterococcus durans 803 AJ276354 клада_497 НЕТ НЕТ Enterococcus faecalis 804 AE016830 клада_497 НЕТ НЕТ Enterococcus faecium 805 AM157434 клада_497 НЕТ НЕТ Enterococcus gallinarum 806 AB269767 клада_497 НЕТ НЕТ Enterococcus gilvus 807 AY033814 клада_497 НЕТ НЕТ Enterococcus hawaiiensis 808 AY321377 клада_497 НЕТ НЕТ Enterococcus hirae 809 AF061011 клада_497 НЕТ НЕТ Enterococcus italicus 810 AEPV01000109 клада_497 НЕТ НЕТ Enterococcus mundtii 811 NR_024906 клада_497 НЕТ НЕТ Enterococcus raffinosus 812 FN600541 клада_497 НЕТ НЕТ Enterococcus sp. BV2CASA2 813 JN809766 клада_497 НЕТ НЕТ Enterococcus sp. CCRI_16620 814 GU457263 клада_497 НЕТ НЕТ Enterococcus sp. F95 815 FJ463817 клада_497 НЕТ НЕТ Enterococcus sp. RfL6 816 AJ133478 клада_497 НЕТ НЕТ Enterococcus thailandicus 817 AY321376 клада_497 НЕТ НЕТ Fusobacterium canifelinum 893 AY162222 клада_497 НЕТ НЕТ Fusobacterium, геномовид C1 894 AY278616 клада_497 НЕТ НЕТ Fusobacterium, геномовид C2 895 AY278617 клада_497 НЕТ НЕТ Fusobacterium periodonticum 902 ACJY01000002 клада_497 НЕТ НЕТ Fusobacterium sp. 1_1_41FAA 906 ADGG01000053 клада_497 НЕТ НЕТ Fusobacterium sp. 11_3_2 904 ACUO01000052 клада_497 НЕТ НЕТ Fusobacterium sp. 2_1_31 907 ACDC02000018 клада_497 НЕТ НЕТ Fusobacterium sp. 3_1_27 908 ADGF01000045 клада_497 НЕТ НЕТ Fusobacterium sp. 3_1_33 909 ACQE01000178 клада_497 НЕТ НЕТ Fusobacterium sp. 3_1_36A2 910 ACPU01000044 клада_497 НЕТ НЕТ Fusobacterium sp. AC18 912 HQ616357 клада_497 НЕТ НЕТ Fusobacterium sp. ACB2 913 HQ616358 клада_497 НЕТ НЕТ Fusobacterium sp. AS2 914 HQ616361 клада_497 НЕТ НЕТ Fusobacterium sp. CM1 915 HQ616371 клада_497 НЕТ НЕТ Fusobacterium sp. CM21 916 HQ616375 клада_497 НЕТ НЕТ Fusobacterium sp. CM22 917 HQ616376 клада_497 НЕТ НЕТ Fusobacterium sp., оральный клон ASCF06 919 AY923141 клада_497 НЕТ НЕТ Fusobacterium sp., оральный клон ASCF11 920 AY953256 клада_497 НЕТ НЕТ Granulicatella adiacens 959 ACKZ01000002 клада_497 НЕТ НЕТ Granulicatella elegans 960 AB252689 клада_497 НЕТ НЕТ Granulicatella paradiacens 961 AY879298 клада_497 НЕТ НЕТ Granulicatella sp., оральный клон ASC02 963 AY923126 клада_497 НЕТ НЕТ Granulicatella sp., оральный клон ASCA05 964 DQ341469 клада_497 НЕТ НЕТ Granulicatella sp., оральный клон ASCB09 965 AY953251 клада_497 НЕТ НЕТ Granulicatella sp., оральный клон ASCG05 966 AY923146 клада_497 НЕТ НЕТ Tetragenococcus halophilus 1918 NR_075020 клада_497 НЕТ НЕТ Tetragenococcus koreensis 1919 NR_043113 клада_497 НЕТ НЕТ Vagococcus fluvialis 1973 NR_026489 клада_497 НЕТ НЕТ Chryseobacterium anthropi 514 AM982793 клада_498 НЕТ НЕТ Chryseobacterium gleum 515 ACKQ02000003 клада_498 НЕТ НЕТ Chryseobacterium hominis 516 NR_042517 клада_498 НЕТ НЕТ Treponema refringens 1936 AF426101 клада_499 НЕТ ОП Treponema sp., оральный клон JU031 1941 AY349416 клада_499 НЕТ НЕТ Treponema sp., оральный таксон 239 1948 GU408738 клада_499 НЕТ НЕТ Treponema sp., оральный таксон 271 1955 GU408871 клада_499 НЕТ НЕТ Alistipes finegoldii 129 NR_043064 клада_500 НЕТ НЕТ Alistipes onderdonkii 131 NR_043318 клада_500 НЕТ НЕТ Alistipes putredinis 132 ABFK02000017 клада_500 НЕТ НЕТ Alistipes shahii 133 FP929032 клада_500 НЕТ НЕТ Alistipes sp. HGB5 134 AENZ01000082 клада_500 НЕТ НЕТ Alistipes sp. JC50 135 JF824804 клада_500 НЕТ НЕТ Alistipes sp. RMA 9912 136 GQ140629 клада_500 НЕТ НЕТ Mycoplasma agalactiae 1310 AF010477 клада_501 НЕТ НЕТ Mycoplasma bovoculi 1313 NR_025987 клада_501 НЕТ НЕТ Mycoplasma fermentans 1315 CP002458 клада_501 НЕТ НЕТ Mycoplasma flocculare 1316 X62699 клада_501 НЕТ НЕТ Mycoplasma ovipneumoniae 1320 NR_025989 клада_501 НЕТ НЕТ Arcobacter butzleri 176 AEPT01000071 клада_502 НЕТ НЕТ Arcobacter cryaerophilus 177 NR_025905 клада_502 НЕТ НЕТ Campylobacter curvus 461 NC_009715 клада_502 НЕТ ОП Campylobacter rectus 467 ACFU01000050 клада_502 НЕТ ОП Campylobacter showae 468 ACVQ01000030 клада_502 НЕТ ОП Campylobacter sp. FOBRC14 469 HQ616379 клада_502 НЕТ ОП Campylobacter sp. FOBRC15 470 HQ616380 клада_502 НЕТ ОП Campylobacter sp., оральный клон BB120 471 AY005038 клада_502 НЕТ ОП Campylobacter sputorum 472 NR_044839 клада_502 НЕТ ОП Bacteroides ureolyticus 330 GQ167666 клада_504 НЕТ НЕТ Campylobacter gracilis 463 ACYG01000026 клада_504 НЕТ ОП Campylobacter hominis 464 NC_009714 клада_504 НЕТ ОП Dialister invisus 762 ACIM02000001 клада_506 НЕТ НЕТ Dialister micraerophilus 763 AFBB01000028 клада_506 НЕТ НЕТ Dialister microaerophilus 764 AENT01000008 клада_506 НЕТ НЕТ Dialister propionicifaciens 766 NR_043231 клада_506 НЕТ НЕТ Dialister succinatiphilus 768 AB370249 клада_506 НЕТ НЕТ Megasphaera elsdenii 1200 AY038996 клада_506 НЕТ НЕТ Megasphaera, геномовид type_1 1202 ADGP01000010 клада_506 НЕТ НЕТ Megasphaera sp. BLPYG_07 1204 HM990964 клада_506 НЕТ НЕТ Megasphaera sp. UPII 199_6 1205 AFIJ01000040 клада_506 НЕТ НЕТ Chromobacterium violaceum 513 NC_005085 клада_507 НЕТ НЕТ Laribacter hongkongensis 1148 CP001154 клада_507 НЕТ НЕТ Methylophilus sp. ECd5 1229 AY436794 клада_507 НЕТ НЕТ Finegoldia magna 883 ACHM02000001 клада_509 НЕТ НЕТ Parvimonas micra 1431 AB729072 клада_509 НЕТ НЕТ Parvimonas sp., оральный таксон 110 1432 AFII01000002 клада_509 НЕТ НЕТ Peptostreptococcus micros 1456 AM176538 клада_509 НЕТ НЕТ Peptostreptococcus sp., оральный клон FJ023 1460 AY349390 клада_509 НЕТ НЕТ Peptostreptococcus sp. P4P_31 P3 1458 AY207059 клада_509 НЕТ НЕТ Helicobacter pylori 997 CP000012 клада_510 НЕТ ОП Anaplasma marginale 165 ABOR01000019 клада_511 НЕТ НЕТ Anaplasma phagocytophilum 166 NC_007797 клада_511 НЕТ НЕТ Ehrlichia chaffeensis 783 AAIF01000035 клада_511 НЕТ ОП Neorickettsia risticii 1349 CP001431 клада_511 НЕТ НЕТ Neorickettsia sennetsu 1350 NC_007798 клада_511 НЕТ НЕТ Pseudoramibacter alactolyticus 1606 AB036759 клада_512 НЕТ НЕТ Veillonella montpellierensis 1977 AF473836 клада_513 НЕТ НЕТ Veillonella sp., оральный клон ASCA08 1988 AY923118 клада_513 НЕТ НЕТ Veillonella sp., оральный клон ASCB03 1989 AY923122 клада_513 НЕТ НЕТ Inquilinus limosus 1012 NR_029046 клада_514 НЕТ НЕТ Sphingomonas sp., оральный клон FZ016 1746 AY349412 клада_514 НЕТ НЕТ Anaerococcus lactolyticus 145 ABYO01000217 клада_515 НЕТ НЕТ Anaerococcus prevotii 147 CP001708 клада_515 НЕТ НЕТ Anaerococcus sp. gpac104 152 AM176528 клада_515 НЕТ НЕТ Anaerococcus sp. gpac126 153 AM176530 клада_515 НЕТ НЕТ Anaerococcus sp. gpac155 154 AM176536 клада_515 НЕТ НЕТ Anaerococcus sp. gpac199 155 AM176539 клада_515 НЕТ НЕТ Anaerococcus tetradius 157 ACGC01000107 клада_515 НЕТ НЕТ Bacteroides coagulans 271 AB547639 клада_515 НЕТ НЕТ Бактерия Clostridiales 9403326 534 HM587324 клада_515 НЕТ НЕТ Бактерия Clostridiales ph2 539 JN837487 клада_515 НЕТ НЕТ Peptostreptococcus sp. 9succ1 1457 X90471 клада_515 НЕТ НЕТ Peptostreptococcus sp., оральный клон AP24 1459 AB175072 клада_515 НЕТ НЕТ Tissierella praeacuta 1924 NR_044860 клада_515 НЕТ НЕТ Helicobacter canadensis 994 ABQS01000108 клада_518 НЕТ НЕТ Peptostreptococcus anaerobius 1455 AY326462 клада_520 НЕТ НЕТ Peptostreptococcus stomatis 1461 ADGQ01000048 клада_520 НЕТ НЕТ Bilophila wadsworthia 367 ADCP01000166 клада_521 НЕТ НЕТ Desulfovibrio vulgaris 761 NR_074897 клада_521 НЕТ НЕТ Actinomyces nasicola 64 AJ508455 клада_523 НЕТ НЕТ Cellulosimicrobium funkei 500 AY501364 клада_523 НЕТ НЕТ Lactococcus raffinolactis 1146 NR_044359 клада_524 НЕТ НЕТ Bacteroidales, геномовид P1 258 AY341819 клада_529 НЕТ НЕТ Bacteroidales, геномовид P2 оральный клон MB1_G13 259 DQ003613 клада_529 НЕТ НЕТ Bacteroidales, геномовид P3 оральный клон MB1_G34 260 DQ003615 клада_529 НЕТ НЕТ Bacteroidales, геномовид P4 оральный клон MB2_G17 261 DQ003617 клада_529 НЕТ НЕТ Bacteroidales, геномовид P5 оральный клон MB2_P04 262 DQ003619 клада_529 НЕТ НЕТ Bacteroidales, геномовид P6 оральный клон MB3_C19 263 DQ003634 клада_529 НЕТ НЕТ Bacteroidales, геномовид P8 оральный клон MB4_G15 265 DQ003626 клада_529 НЕТ НЕТ Бактерия Bacteroidetes, оральный таксон D27 333 HM099638 клада_530 НЕТ НЕТ Бактерия Bacteroidetes, оральный таксон F31 334 HM099643 клада_530 НЕТ НЕТ Бактерия Bacteroidetes, оральный таксон F44 335 HM099649 клада_530 НЕТ НЕТ Flavobacterium sp. NF2_1 885 FJ195988 клада_530 НЕТ НЕТ Myroides odoratimimus 1326 NR_042354 клада_530 НЕТ НЕТ Myroides sp. MY15 1327 GU253339 клада_530 НЕТ НЕТ Бактерия Chlamydiales NS16 507 JN606076 клада_531 НЕТ НЕТ Chlamydophila pecorum 508 D88317 клада_531 НЕТ ОП Parachlamydia sp. UWE25 1423 BX908798 клада_531 НЕТ НЕТ Fusobacterium russii 903 NR_044687 клада_532 НЕТ НЕТ Streptobacillus moniliformis 1784 NR_027615 клада_532 НЕТ НЕТ Бактерия Eubacteriaceae P4P_50 P4 833 AY207060 клада_533 НЕТ НЕТ Abiotrophia defectiva 1 ACIN02000016 клада_534 НЕТ НЕТ Abiotrophia sp., оральный клон P4PA_155 P1 3 AY207063 клада_534 НЕТ НЕТ Catonella, геномовид P1 оральный клон MB5_P12 496 DQ003629 клада_534 НЕТ НЕТ Catonella morbi 497 ACIL02000016 клада_534 НЕТ НЕТ Catonella sp., оральный клон FL037 498 AY349369 клада_534 НЕТ НЕТ Eremococcus coleocola 818 AENN01000008 клада_534 НЕТ НЕТ Facklamia hominis 879 Y10772 клада_534 НЕТ НЕТ Granulicatella sp. M658_99_3 962 AJ271861 клада_534 НЕТ НЕТ Campylobacter coli 459 AAFL01000004 клада_535 НЕТ ОП Campylobacter concisus 460 CP000792 клада_535 НЕТ ОП Campylobacter fetus 462 ACLG01001177 клада_535 НЕТ ОП Campylobacter jejuni 465 AL139074 клада_535 НЕТ Категория B Campylobacter upsaliensis 473 AEPU01000040 клада_535 НЕТ ОП Atopobium minutum 183 HM007583 клада_539 НЕТ НЕТ Atopobium parvulum 184 CP001721 клада_539 НЕТ НЕТ Atopobium rimae 185 ACFE01000007 клада_539 НЕТ НЕТ Atopobium sp. BS2 186 HQ616367 клада_539 НЕТ НЕТ Atopobium sp. F0209 187 EU592966 клада_539 НЕТ НЕТ Atopobium sp. ICM42b10 188 HQ616393 клада_539 НЕТ НЕТ Atopobium sp. ICM57 189 HQ616400 клада_539 НЕТ НЕТ Atopobium vaginae 190 AEDQ01000024 клада_539 НЕТ НЕТ Бактерия Coriobacteriaceae BV3Ac1 677 JN809768 клада_539 НЕТ НЕТ Actinomyces naeslundii 63 X81062 клада_54 НЕТ НЕТ Actinomyces oricola 67 NR_025559 клада_54 НЕТ НЕТ Actinomyces oris 69 BABV01000070 клада_54 НЕТ НЕТ Actinomyces sp. 7400942 70 EU484334 клада_54 НЕТ НЕТ Actinomyces sp. ChDC B197 72 AF543275 клада_54 НЕТ НЕТ Actinomyces sp. GEJ15 73 GU561313 клада_54 НЕТ НЕТ Actinomyces sp. M2231_94_1 79 AJ234063 клада_54 НЕТ НЕТ Actinomyces sp., оральный клон GU067 83 AY349362 клада_54 НЕТ НЕТ Actinomyces sp., оральный клон IO077 85 AY349364 клада_54 НЕТ НЕТ Actinomyces sp., оральный клон IP073 86 AY349365 клада_54 НЕТ НЕТ Actinomyces sp., оральный клон JA063 88 AY349367 клада_54 НЕТ НЕТ Actinomyces sp., оральный таксон 170 89 AFBL01000010 клада_54 НЕТ НЕТ Actinomyces sp., оральный таксон 171 90 AECW01000034 клада_54 НЕТ НЕТ Actinomyces urogenitalis 95 ACFH01000038 клада_54 НЕТ НЕТ Actinomyces viscosus 96 ACRE01000096 клада_54 НЕТ НЕТ Orientia tsutsugamushi 1383 AP008981 клада_541 НЕТ ОП Megamonas funiformis 1198 AB300988 клада_542 НЕТ НЕТ Megamonas hypermegale 1199 AJ420107 клада_542 НЕТ НЕТ Aeromicrobium marinum 102 NR_025681 клада_544 НЕТ НЕТ Aeromicrobium sp. JC14 103 JF824798 клада_544 НЕТ НЕТ Luteococcus sanguinis 1190 NR_025507 клада_544 НЕТ НЕТ Propionibacteriaceae бактерия NML 02_0265 1568 EF599122 клада_544 НЕТ НЕТ Rhodococcus corynebacterioides 1622 X80615 клада_546 НЕТ НЕТ Rhodococcus erythropolis 1624 ACNO01000030 клада_546 НЕТ НЕТ Rhodococcus fascians 1625 NR_037021 клада_546 НЕТ НЕТ Segniliparus rotundus 1690 CP001958 клада_546 НЕТ НЕТ Segniliparus rugosus 1691 ACZI01000025 клада_546 НЕТ НЕТ Exiguobacterium acetylicum 878 FJ970034 клада_547 НЕТ НЕТ Macrococcus caseolyticus 1194 NR_074941 клада_547 НЕТ НЕТ Streptomyces sp. 1 AIP_2009 1890 FJ176782 клада_548 НЕТ НЕТ Streptomyces sp. SD 524 1892 EU544234 клада_548 НЕТ НЕТ Streptomyces sp. SD 528 1893 EU544233 клада_548 НЕТ НЕТ Streptomyces thermoviolaceus 1895 NR_027616 клада_548 НЕТ НЕТ Borrelia afzelii 388 ABCU01000001 клада_549 НЕТ ОП Borrelia crocidurae 390 DQ057990 клада_549 НЕТ ОП Borrelia duttonii 391 NC_011229 клада_549 НЕТ ОП Borrelia hermsii 393 AY597657 клада_549 НЕТ ОП Borrelia hispanica 394 DQ057988 клада_549 НЕТ ОП Borrelia persica 395 HM161645 клада_549 НЕТ ОП Borrelia рецидивирующейis 396 AF107367 клада_549 НЕТ ОП Borrelia spielmanii 398 ABKB01000002 клада_549 НЕТ ОП Borrelia turicatae 399 NC_008710 клада_549 НЕТ ОП Borrelia valaisiana 400 ABCY01000002 клада_549 НЕТ ОП Providencia alcalifaciens 1586 ABXW01000071 клада_55 НЕТ НЕТ Providencia rettgeri 1587 AM040492 клада_55 НЕТ НЕТ Providencia rustigianii 1588 AM040489 клада_55 НЕТ НЕТ Providencia stuartii 1589 AF008581 клада_55 НЕТ НЕТ Treponema pallidum 1932 CP001752 клада_550 НЕТ ОП Treponema phagedenis 1934 AEFH01000172 клада_550 НЕТ НЕТ Treponema sp. клон DDKL_4 1939 Y08894 клада_550 НЕТ НЕТ Acholeplasma laidlawii 17 NR_074448 клада_551 НЕТ НЕТ Mycoplasma putrefaciens 1323 U26055 клада_551 НЕТ НЕТ Mycoplasmataceae, геномовид P1 оральный клон MB1_G23 1325 DQ003614 клада_551 НЕТ НЕТ Spiroplasma insolitum 1750 NR_025705 клада_551 НЕТ НЕТ Collinsella intestinalis 660 ABXH02000037 клада_553 НЕТ НЕТ Collinsella stercoris 661 ABXJ01000150 клада_553 НЕТ НЕТ Collinsella tanakaei 662 AB490807 клада_553 НЕТ НЕТ Caminicella sporogenes 458 NR_025485 клада_554 НЕТ НЕТ Acidaminococcus fermentans 21 CP001859 клада_556 НЕТ НЕТ Acidaminococcus intestini 22 CP003058 клада_556 НЕТ НЕТ Acidaminococcus sp. D21 23 ACGB01000071 клада_556 НЕТ НЕТ Phascolarctobacterium faecium 1462 NR_026111 клада_556 НЕТ НЕТ Phascolarctobacterium sp. YIT 12068 1463 AB490812 клада_556 НЕТ НЕТ Phascolarctobacterium succinatutens 1464 AB490811 клада_556 НЕТ НЕТ Acidithiobacillus ferrivorans 25 NR_074660 клада_557 НЕТ НЕТ Бактерия Xanthomonadaceae NML 03_0222 2015 EU313791 клада_557 НЕТ НЕТ Catabacter hongkongensis 494 AB671763 клада_558 НЕТ НЕТ Christensenella minuta 512 AB490809 клада_558 НЕТ НЕТ Бактерия Clostridiales оральный клон P4PA_66 P1 536 AY207065 клада_558 НЕТ НЕТ Бактерия Clostridiales, оральный таксон 093 537 GQ422712 клада_558 НЕТ НЕТ Heliobacterium modesticaldum 1000 NR_074517 клада_560 НЕТ НЕТ Alistipes indistinctus 130 AB490804 клада_561 НЕТ НЕТ Bacteroidales бактерия ph8 257 JN837494 клада_561 НЕТ НЕТ Candidatus Sulcia muelleri 475 CP002163 клада_561 НЕТ НЕТ Cytophaga xylanolytica 742 FR733683 клада_561 НЕТ НЕТ Flavobacteriaceae, геномовид C1 884 AY278614 клада_561 НЕТ НЕТ Gramella forsetii 958 NR_074707 клада_561 НЕТ НЕТ Sphingobacterium faecium 1740 NR_025537 клада_562 НЕТ НЕТ Sphingobacterium mizutaii 1741 JF708889 клада_562 НЕТ НЕТ Sphingobacterium multivorum 1742 NR_040953 клада_562 НЕТ НЕТ Sphingobacterium spiritivorum 1743 ACHA02000013 клада_562 НЕТ НЕТ Jonquetella anthropi 1017 ACOO02000004 клада_563 НЕТ НЕТ Pyramidobacter piscolens 1614 AY207056 клада_563 НЕТ НЕТ Synergistes, геномовид C1 1904 AY278615 клада_563 НЕТ НЕТ Synergistes sp. RMA 14551 1905 DQ412722 клада_563 НЕТ НЕТ Бактерия Synergistetes ADV897 1906 GQ258968 клада_563 НЕТ НЕТ Candidatus Arthromitus sp. SFB_mouse_Yit 474 NR_074460 клада_564 НЕТ НЕТ Gracilibacter thermotolerans 957 NR_043559 клада_564 НЕТ НЕТ Brachyspira aalborgi 404 FM178386 клада_565 НЕТ НЕТ Brachyspira sp. HIS3 406 FM178387 клада_565 НЕТ НЕТ Brachyspira sp. HIS4 407 FM178388 клада_565 НЕТ НЕТ Brachyspira sp. HIS5 408 FM178389 клада_565 НЕТ НЕТ Adlercreutzia equolifaciens 97 AB306661 клада_566 НЕТ НЕТ Бактерия Coriobacteriaceae JC110 678 CAEM01000062 клада_566 НЕТ НЕТ Бактерия Coriobacteriaceae phI 679 JN837493 клада_566 НЕТ НЕТ Cryptobacterium curtum 740 GQ422741 клада_566 НЕТ НЕТ Eggerthella sinensis 779 AY321958 клада_566 НЕТ НЕТ Eggerthella sp. 1_3_56FAA 780 ACWN01000099 клада_566 НЕТ НЕТ Eggerthella sp. HGA1 781 AEXR01000021 клада_566 НЕТ НЕТ Eggerthella sp. YY7918 782 AP012211 клада_566 НЕТ НЕТ Gordonibacter pamelaeae 680 AM886059 клада_566 НЕТ НЕТ Gordonibacter pamelaeae 956 FP929047 клада_566 НЕТ НЕТ Slackia equolifaciens 1732 EU377663 клада_566 НЕТ НЕТ Slackia exigua 1733 ACUX01000029 клада_566 НЕТ НЕТ Slackia faecicanis 1734 NR_042220 клада_566 НЕТ НЕТ Slackia heliotrinireducens 1735 NR_074439 клада_566 НЕТ НЕТ Slackia isoflavoniconvertens 1736 AB566418 клада_566 НЕТ НЕТ Slackia piriformis 1737 AB490806 клада_566 НЕТ НЕТ Slackia sp. NATTS 1738 AB505075 клада_566 НЕТ НЕТ Бактерия Chlamydiales NS13 506 JN606075 клада_567 НЕТ НЕТ Бактерия Victivallaceae NML 080035 2003 FJ394915 клада_567 НЕТ НЕТ Victivallis vadensis 2004 ABDE02000010 клада_567 НЕТ НЕТ Streptomyces griseus 1889 NR_074787 клада_573 НЕТ НЕТ Streptomyces sp. SD 511 1891 EU544231 клада_573 НЕТ НЕТ Streptomyces sp. SD 534 1894 EU544232 клада_573 НЕТ НЕТ Cloacibacillus evryensis 530 GQ258966 клада_575 НЕТ НЕТ Deferribacteres sp., оральный клон JV001 743 AY349370 клада_575 НЕТ НЕТ Deferribacteres sp., оральный клон JV023 745 AY349372 клада_575 НЕТ НЕТ Бактерия Synergistetes LBVCM1157 1907 GQ258969 клада_575 НЕТ НЕТ Бактерия Synergistetes, оральный таксон 362 1909 GU410752 клада_575 НЕТ НЕТ Бактерия Synergistetes, оральный таксон D48 1910 GU430992 клада_575 НЕТ НЕТ Peptococcus sp., оральный клон JM048 1439 AY349389 клада_576 НЕТ НЕТ Helicobacter winghamensis 999 ACDO01000013 клада_577 НЕТ НЕТ Wolinella succinogenes 2014 BX571657 клада_577 НЕТ НЕТ Olsenella, геномовид C1 1368 AY278623 клада_578 НЕТ НЕТ Olsenella profusa 1369 FN178466 клада_578 НЕТ НЕТ Olsenella sp. F0004 1370 EU592964 клада_578 НЕТ НЕТ Olsenella sp., оральный таксон 809 1371 ACVE01000002 клада_578 НЕТ НЕТ Olsenella uli 1372 CP002106 клада_578 НЕТ НЕТ Nocardiopsis dassonvillei 1356 CP002041 клада_579 НЕТ НЕТ Peptococcus niger 1438 NR_029221 клада_580 НЕТ НЕТ Peptococcus sp., оральный таксон 167 1440 GQ422727 клада_580 НЕТ НЕТ Akkermansia muciniphila 118 CP001071 клада_583 НЕТ НЕТ Opitutus terrae 1373 NR_074978 клада_583 НЕТ НЕТ Бактерия Clostridiales, оральный таксон F32 538 HM099644 клада_584 НЕТ НЕТ Leptospira borgpetersenii 1161 NC_008508 клада_585 НЕТ ОП Leptospira broomii 1162 NR_043200 клада_585 НЕТ ОП Leptospira interrogans 1163 NC_005823 клада_585 НЕТ ОП Methanobrevibacter gottschalkii 1213 NR_044789 клада_587 НЕТ НЕТ Methanobrevibacter millerae 1214 NR_042785 клада_587 НЕТ НЕТ Methanobrevibacter oralis 1216 HE654003 клада_587 НЕТ НЕТ Methanobrevibacter thaueri 1219 NR_044787 клада_587 НЕТ НЕТ Methanobrevibacter smithii 1218 ABYV02000002 клада_588 НЕТ НЕТ Deinococcus radiodurans 746 AE000513 клада_589 НЕТ НЕТ Deinococcus sp. R_43890 747 FR682752 клада_589 НЕТ НЕТ Thermus aquaticus 1923 NR_025900 клада_589 НЕТ НЕТ Actinomyces sp. c109 81 AB167239 клада_590 НЕТ НЕТ Syntrophomonadaceae, геномовид P1 1912 AY341821 клада_590 НЕТ НЕТ Anaerobaculum hydrogeniformans 141 ACJX02000009 клада_591 НЕТ НЕТ Microcystis aeruginosa 1246 NC_010296 клада_592 НЕТ НЕТ Prochlorococcus marinus 1567 CP000551 клада_592 НЕТ НЕТ Methanobrevibacter acididurans 1208 NR_028779 клада_593 НЕТ НЕТ Methanobrevibacter arboriphilus 1209 NR_042783 клада_593 НЕТ НЕТ Methanobrevibacter curvatus 1210 NR_044796 клада_593 НЕТ НЕТ Methanobrevibacter cuticularis 1211 NR_044776 клада_593 НЕТ НЕТ Methanobrevibacter filiformis 1212 NR_044801 клада_593 НЕТ НЕТ Methanobrevibacter woesei 1220 NR_044788 клада_593 НЕТ НЕТ Roseiflexus castenholzii 1642 CP000804 клада_594 НЕТ НЕТ Methanobrevibacter olleyae 1215 NR_043024 клада_595 НЕТ НЕТ Methanobrevibacter ruminantium 1217 NR_042784 клада_595 НЕТ НЕТ Methanobrevibacter wolinii 1221 NR_044790 клада_595 НЕТ НЕТ Methanosphaera stadtmanae 1222 AY196684 клада_595 НЕТ НЕТ Chloroflexi, геномовид P1 511 AY331414 клада_596 НЕТ НЕТ Halorubrum lipolyticum 992 AB477978 клада_597 НЕТ НЕТ Methanobacterium formicicum 1207 NR_025028 клада_597 НЕТ НЕТ Acidilobus saccharovorans 24 AY350586 клада_598 НЕТ НЕТ Hyperthermus butylicus 1006 CP000493 клада_598 НЕТ НЕТ Ignicoccus islandicus 1011 X99562 клада_598 НЕТ НЕТ Metallosphaera sedula 1206 D26491 клада_598 НЕТ НЕТ Thermofilum pendens 1922 X14835 клада_598 НЕТ НЕТ Prevotella melaninogenica 1506 CP002122 клада_6 НЕТ НЕТ Prevotella sp. ICM1 1520 HQ616385 клада_6 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон FU048 1535 AY349393 клада_6 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон GI030 1537 AY349395 клада_6 НЕТ НЕТ Prevotella sp. SEQ116 1526 JN867246 клада_6 НЕТ НЕТ Streptococcus anginosus 1787 AECT01000011 клада_60 НЕТ НЕТ Streptococcus milleri 1812 X81023 клада_60 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. 16362 1829 JN590019 клада_60 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. 69130 1832 X78825 клада_60 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. AC15 1833 HQ616356 клада_60 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. CM7 1839 HQ616373 клада_60 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. OBRC6 1847 HQ616352 клада_60 НЕТ НЕТ Burkholderia ambifaria 442 AAUZ01000009 клада_61 НЕТ ОП Burkholderia cenocepacia 443 AAHI01000060 клада_61 НЕТ ОП Burkholderia cepacia 444 NR_041719 клада_61 НЕТ ОП Burkholderia mallei 445 CP000547 клада_61 НЕТ Категория B Burkholderia multivorans 446 NC_010086 клада_61 НЕТ ОП Burkholderia oklahomensis 447 DQ108388 клада_61 НЕТ ОП Burkholderia pseudomallei 448 CP001408 клада_61 НЕТ Категория B Burkholderia rhizoxinica 449 HQ005410 клада_61 НЕТ ОП Burkholderia sp. 383 450 CP000151 клада_61 НЕТ ОП Burkholderia xenovorans 451 U86373 клада_61 НЕТ ОП Prevotella buccae 1488 ACRB01000001 клада_62 НЕТ НЕТ Prevotella, геномовид P8 оральный клон MB3_P13 1498 DQ003622 клада_62 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон FW035 1536 AY349394 клада_62 НЕТ НЕТ Prevotella bivia 1486 ADFO01000096 клада_63 НЕТ НЕТ Prevotella disiens 1494 AEDO01000026 клада_64 НЕТ НЕТ Bacteroides faecis 276 GQ496624 клада_65 НЕТ НЕТ Bacteroides fragilis 279 AP006841 клада_65 НЕТ НЕТ Bacteroides nordii 285 NR_043017 клада_65 НЕТ НЕТ Bacteroides salyersiae 292 EU136690 клада_65 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 1_1_14 293 ACRP01000155 клада_65 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 1_1_6 295 ACIC01000215 клада_65 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 2_1_56FAA 298 ACWI01000065 клада_65 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. AR29 316 AF139525 клада_65 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. B2 317 EU722733 клада_65 НЕТ НЕТ Bacteroides thetaiotaomicron 328 NR_074277 клада_65 НЕТ НЕТ Actinobacillus minor 45 ACFT01000025 клада_69 НЕТ НЕТ Haemophilus parasuis 978 GU226366 клада_69 НЕТ НЕТ Vibrio cholerae 1996 AAUR01000095 клада_71 НЕТ Категория B Vibrio fluvialis 1997 X76335 клада_71 НЕТ Категория B Vibrio furnissii 1998 CP002377 клада_71 НЕТ Категория B Vibrio mimicus 1999 ADAF01000001 клада_71 НЕТ Категория B Vibrio parahaemolyticus 2000 AAWQ01000116 клада_71 НЕТ Категория B Vibrio sp. RC341 2001 ACZT01000024 клада_71 НЕТ Категория B Vibrio vulnificus 2002 AE016796 клада_71 НЕТ Категория B Lactobacillus acidophilus 1067 CP000033 клада_72 НЕТ НЕТ Lactobacillus amylolyticus 1069 ADNY01000006 клада_72 НЕТ НЕТ Lactobacillus amylovorus 1070 CP002338 клада_72 НЕТ НЕТ Lactobacillus crispatus 1078 ACOG01000151 клада_72 НЕТ НЕТ Lactobacillus delbrueckii 1080 CP002341 клада_72 НЕТ НЕТ Lactobacillus helveticus 1088 ACLM01000202 клада_72 НЕТ НЕТ Lactobacillus kalixensis 1094 NR_029083 клада_72 НЕТ НЕТ Lactobacillus kefiranofaciens 1095 NR_042440 клада_72 НЕТ НЕТ Lactobacillus leichmannii 1098 JX986966 клада_72 НЕТ НЕТ Lactobacillus sp. 66c 1120 FR681900 клада_72 НЕТ НЕТ Lactobacillus sp. KLDS 1.0701 1122 EU600905 клада_72 НЕТ НЕТ Lactobacillus sp. KLDS 1.0712 1130 EU600916 клада_72 НЕТ НЕТ Lactobacillus sp., оральный клон HT070 1136 AY349383 клада_72 НЕТ НЕТ Lactobacillus ultunensis 1139 ACGU01000081 клада_72 НЕТ НЕТ Prevotella intermedia 1502 AF414829 клада_81 НЕТ НЕТ Prevotella nigrescens 1511 AFPX01000069 клада_81 НЕТ НЕТ Prevotella pallens 1515 AFPY01000135 клада_81 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный таксон 310 1551 GQ422737 клада_81 НЕТ НЕТ Prevotella, геномовид C1 1495 AY278624 клада_82 НЕТ НЕТ Prevotella sp. CM38 1519 HQ610181 клада_82 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный таксон 317 1552 ACQH01000158 клада_82 НЕТ НЕТ Prevotella sp. SG12 1527 GU561343 клада_82 НЕТ НЕТ Prevotella denticola 1493 CP002589 клада_83 НЕТ НЕТ Prevotella, геномовид P7 оральный клон MB2_P31 1497 DQ003620 клада_83 НЕТ НЕТ Prevotella histicola 1501 JN867315 клада_83 НЕТ НЕТ Prevotella multiformis 1508 AEWX01000054 клада_83 НЕТ НЕТ Prevotella sp. JCM 6330 1522 AB547699 клада_83 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный клон GI059 1539 AY349397 клада_83 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный таксон 782 1555 GQ422745 клада_83 НЕТ НЕТ Prevotella sp., оральный таксон G71 1559 GU432180 клада_83 НЕТ НЕТ Prevotella sp. SEQ065 1524 JN867234 клада_83 НЕТ НЕТ Prevotella veroralis 1565 ACVA01000027 клада_83 НЕТ НЕТ Bacteroides acidifaciens 266 NR_028607 клада_85 НЕТ НЕТ Bacteroides cellulosilyticus 269 ACCH01000108 клада_85 НЕТ НЕТ Bacteroides clarus 270 AFBM01000011 клада_85 НЕТ НЕТ Bacteroides eggerthii 275 ACWG01000065 клада_85 НЕТ НЕТ Bacteroides oleiciplenus 286 AB547644 клада_85 НЕТ НЕТ Bacteroides pyogenes 290 NR_041280 клада_85 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 315_5 300 FJ848547 клада_85 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 31SF15 301 AJ583248 клада_85 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 31SF18 302 AJ583249 клада_85 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 35AE31 303 AJ583244 клада_85 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 35AE37 304 AJ583245 клада_85 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 35BE34 305 AJ583246 клада_85 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. 35BE35 306 AJ583247 клада_85 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. WH2 324 AY895180 клада_85 НЕТ НЕТ Bacteroides sp. XB12B 325 AM230648 клада_85 НЕТ НЕТ Bacteroides stercoris 327 ABFZ02000022 клада_85 НЕТ НЕТ Actinobacillus pleuropneumoniae 46 NR_074857 клада_88 НЕТ НЕТ Actinobacillus ureae 48 AEVG01000167 клада_88 НЕТ НЕТ Haemophilus aegyptius 969 AFBC01000053 клада_88 НЕТ НЕТ Haemophilus ducreyi 970 AE017143 клада_88 НЕТ ОП Haemophilus haemolyticus 973 JN175335 клада_88 НЕТ НЕТ Haemophilus influenzae 974 AADP01000001 клада_88 НЕТ ОП Haemophilus parahaemolyticus 975 GU561425 клада_88 НЕТ НЕТ Haemophilus parainfluenzae 976 AEWU01000024 клада_88 НЕТ НЕТ Haemophilus paraphrophaemolyticus 977 M75076 клада_88 НЕТ НЕТ Haemophilus somnus 979 NC_008309 клада_88 НЕТ НЕТ Haemophilus sp. 70334 980 HQ680854 клада_88 НЕТ НЕТ Haemophilus sp. HK445 981 FJ685624 клада_88 НЕТ НЕТ Haemophilus sp., оральный клон ASCA07 982 AY923117 клада_88 НЕТ НЕТ Haemophilus sp., оральный клон ASCG06 983 AY923147 клада_88 НЕТ НЕТ Haemophilus sp., оральный клон BJ021 984 AY005034 клада_88 НЕТ НЕТ Haemophilus sp., оральный клон BJ095 985 AY005033 клада_88 НЕТ НЕТ Haemophilus sp., оральный таксон 851 987 AGRK01000004 клада_88 НЕТ НЕТ Haemophilus sputorum 988 AFNK01000005 клада_88 НЕТ НЕТ Histophilus somni 1003 AF549387 клада_88 НЕТ НЕТ Mannheimia haemolytica 1195 ACZX01000102 клада_88 НЕТ НЕТ Pasteurella bettyae 1433 L06088 клада_88 НЕТ НЕТ Moellerella wisconsensis 1253 JN175344 клада_89 НЕТ НЕТ Morganella morganii 1265 AJ301681 клада_89 НЕТ НЕТ Morganella sp. JB_T16 1266 AJ781005 клада_89 НЕТ НЕТ Proteus mirabilis 1582 ACLE01000013 клада_89 НЕТ НЕТ Proteus penneri 1583 ABVP01000020 клада_89 НЕТ НЕТ Proteus sp. HS7514 1584 DQ512963 клада_89 НЕТ НЕТ Proteus vulgaris 1585 AJ233425 клада_89 НЕТ НЕТ Oribacterium sinus 1374 ACKX01000142 клада_90 НЕТ НЕТ Oribacterium sp. ACB1 1375 HM120210 клада_90 НЕТ НЕТ Oribacterium sp. ACB7 1376 HM120211 клада_90 НЕТ НЕТ Oribacterium sp. CM12 1377 HQ616374 клада_90 НЕТ НЕТ Oribacterium sp. ICM51 1378 HQ616397 клада_90 НЕТ НЕТ Oribacterium sp. OBRC12 1379 HQ616355 клада_90 НЕТ НЕТ Oribacterium sp., оральный таксон 108 1382 AFIH01000001 клада_90 НЕТ НЕТ Actinobacillus actinomycetemcomitans 44 AY362885 клада_92 НЕТ НЕТ Actinobacillus succinogenes 47 CP000746 клада_92 НЕТ НЕТ Aggregatibacter actinomycetemcomitans 112 CP001733 клада_92 НЕТ НЕТ Aggregatibacter aphrophilus 113 CP001607 клада_92 НЕТ НЕТ Aggregatibacter segnis 114 AEPS01000017 клада_92 НЕТ НЕТ Averyella dalhousiensis 194 DQ481464 клада_92 НЕТ НЕТ Bisgaard Taxon 368 AY683487 клада_92 НЕТ НЕТ Bisgaard Taxon 369 AY683489 клада_92 НЕТ НЕТ Bisgaard Taxon 370 AY683491 клада_92 НЕТ НЕТ Bisgaard Taxon 371 AY683492 клада_92 НЕТ НЕТ Buchnera aphidicola 440 NR_074609 клада_92 НЕТ НЕТ Cedecea davisae 499 AF493976 клада_92 НЕТ НЕТ Citrobacter amalonaticus 517 FR870441 клада_92 НЕТ НЕТ Citrobacter braakii 518 NR_028687 клада_92 НЕТ НЕТ Citrobacter farmeri 519 AF025371 клада_92 НЕТ НЕТ Citrobacter freundii 520 NR_028894 клада_92 НЕТ НЕТ Citrobacter gillenii 521 AF025367 клада_92 НЕТ НЕТ Citrobacter koseri 522 NC_009792 клада_92 НЕТ НЕТ Citrobacter murliniae 523 AF025369 клада_92 НЕТ НЕТ Citrobacter rodentium 524 NR_074903 клада_92 НЕТ НЕТ Citrobacter sedlakii 525 AF025364 клада_92 НЕТ НЕТ Citrobacter sp. 30_2 526 ACDJ01000053 клада_92 НЕТ НЕТ Citrobacter sp. KMSI_3 527 GQ468398 клада_92 НЕТ НЕТ Citrobacter werkmanii 528 AF025373 клада_92 НЕТ НЕТ Citrobacter youngae 529 ABWL02000011 клада_92 НЕТ НЕТ Cronobacter malonaticus 737 GU122174 клада_92 НЕТ НЕТ Cronobacter sakazakii 738 NC_009778 клада_92 НЕТ НЕТ Cronobacter turicensis 739 FN543093 клада_92 НЕТ НЕТ Enterobacter aerogenes 786 AJ251468 клада_92 НЕТ НЕТ Enterobacter asburiae 787 NR_024640 клада_92 НЕТ НЕТ Enterobacter cancerogenus 788 Z96078 клада_92 НЕТ НЕТ Enterobacter cloacae 789 FP929040 клада_92 НЕТ НЕТ Enterobacter cowanii 790 NR_025566 клада_92 НЕТ НЕТ Enterobacter hormaechei 791 AFHR01000079 клада_92 НЕТ НЕТ Enterobacter sp. 247BMC 792 HQ122932 клада_92 НЕТ НЕТ Enterobacter sp. 638 793 NR_074777 клада_92 НЕТ НЕТ Enterobacter sp. JC163 794 JN657217 клада_92 НЕТ НЕТ Enterobacter sp. SCSS 795 HM007811 клада_92 НЕТ НЕТ Enterobacter sp. TSE38 796 HM156134 клада_92 НЕТ НЕТ Бактерия Enterobacteriaceae 9_2_54FAA 797 ADCU01000033 клада_92 НЕТ НЕТ Бактерия Enterobacteriaceae CF01Ent_1 798 AJ489826 клада_92 НЕТ НЕТ Бактерия Enterobacteriaceae Smarlab 3302238 799 AY538694 клада_92 НЕТ НЕТ Escherichia albertii 824 ABKX01000012 клада_92 НЕТ НЕТ Escherichia coli 825 NC_008563 клада_92 НЕТ Категория B Escherichia fergusonii 826 CU928158 клада_92 НЕТ НЕТ Escherichia hermannii 827 HQ407266 клада_92 НЕТ НЕТ Escherichia sp. 1_1_43 828 ACID01000033 клада_92 НЕТ НЕТ Escherichia sp. 4_1_40B 829 ACDM02000056 клада_92 НЕТ НЕТ Escherichia sp. B4 830 EU722735 клада_92 НЕТ НЕТ Escherichia vulneris 831 NR_041927 клада_92 НЕТ НЕТ Ewingella americana 877 JN175329 клада_92 НЕТ НЕТ Haemophilus, геномовид P2 оральный клон MB3_C24 971 DQ003621 клада_92 НЕТ НЕТ Haemophilus, геномовид P3 оральный клон MB3_C38 972 DQ003635 клада_92 НЕТ НЕТ Haemophilus sp., оральный клон JM053 986 AY349380 клада_92 НЕТ НЕТ Hafnia alvei 989 DQ412565 клада_92 НЕТ НЕТ Klebsiella oxytoca 1024 AY292871 клада_92 НЕТ ОП Klebsiella pneumoniae 1025 CP000647 клада_92 НЕТ ОП Klebsiella sp. AS10 1026 HQ616362 клада_92 НЕТ НЕТ Klebsiella sp. Co9935 1027 DQ068764 клада_92 НЕТ НЕТ Klebsiella sp. обогащение culture clone SRC_DSD25 1036 HM195210 клада_92 НЕТ НЕТ Klebsiella sp. OBRC7 1028 HQ616353 клада_92 НЕТ НЕТ Klebsiella sp. SP_BA 1029 FJ999767 клада_92 НЕТ НЕТ Klebsiella sp. SRC_DSD1 1033 GU797254 клада_92 НЕТ НЕТ Klebsiella sp. SRC_DSD11 1030 GU797263 клада_92 НЕТ НЕТ Klebsiella sp. SRC_DSD12 1031 GU797264 клада_92 НЕТ НЕТ Klebsiella sp. SRC_DSD15 1032 GU797267 клада_92 НЕТ НЕТ Klebsiella sp. SRC_DSD2 1034 GU797253 клада_92 НЕТ НЕТ Klebsiella sp. SRC_DSD6 1035 GU797258 клада_92 НЕТ НЕТ Klebsiella variicola 1037 CP001891 клада_92 НЕТ НЕТ Kluyvera ascorbata 1038 NR_028677 клада_92 НЕТ НЕТ Kluyvera cryocrescens 1039 NR_028803 клада_92 НЕТ НЕТ Leminorella grimontii 1159 AJ233421 клада_92 НЕТ НЕТ Leminorella richardii 1160 HF558368 клада_92 НЕТ НЕТ Pantoea agglomerans 1409 AY335552 клада_92 НЕТ НЕТ Pantoea ananatis 1410 CP001875 клада_92 НЕТ НЕТ Pantoea brenneri 1411 EU216735 клада_92 НЕТ НЕТ Pantoea citrea 1412 EF688008 клада_92 НЕТ НЕТ Pantoea conspicua 1413 EU216737 клада_92 НЕТ НЕТ Pantoea septica 1414 EU216734 клада_92 НЕТ НЕТ Pasteurella dagmatis 1434 ACZR01000003 клада_92 НЕТ НЕТ Pasteurella multocida 1435 NC_002663 клада_92 НЕТ НЕТ Plesiomonas shigelloides 1469 X60418 клада_92 НЕТ НЕТ Raoultella ornithinolytica 1617 AB364958 клада_92 НЕТ НЕТ Raoultella planticola 1618 AF129443 клада_92 НЕТ НЕТ Raoultella terrigena 1619 NR_037085 клада_92 НЕТ НЕТ Salmonella bongori 1683 NR_041699 клада_92 НЕТ Категория B Salmonella enterica 1672 NC_011149 клада_92 НЕТ Категория B Salmonella enterica 1673 NC_011205 клада_92 НЕТ Категория B Salmonella enterica 1674 DQ344532 клада_92 НЕТ Категория B Salmonella enterica 1675 ABEH02000004 клада_92 НЕТ Категория B Salmonella enterica 1676 ABAK02000001 клада_92 НЕТ Категория B Salmonella enterica 1677 NC_011080 клада_92 НЕТ Категория B Salmonella enterica 1678 EU118094 клада_92 НЕТ Категория B Salmonella enterica 1679 NC_011094 клада_92 НЕТ Категория B Salmonella enterica 1680 AE014613 клада_92 НЕТ Категория B Salmonella enterica 1682 ABFH02000001 клада_92 НЕТ Категория B Salmonella enterica 1684 ABEM01000001 клада_92 НЕТ Категория B Salmonella enterica 1685 ABAM02000001 клада_92 НЕТ Категория B Salmonella typhimurium 1681 DQ344533 клада_92 НЕТ Категория B Salmonella typhimurium 1686 AF170176 клада_92 НЕТ Категория B Serratia fonticola 1718 NR_025339 клада_92 НЕТ НЕТ Serratia liquefaciens 1719 NR_042062 клада_92 НЕТ НЕТ Serratia marcescens 1720 GU826157 клада_92 НЕТ НЕТ Serratia odorifera 1721 ADBY01000001 клада_92 НЕТ НЕТ Serratia proteamaculans 1722 AAUN01000015 клада_92 НЕТ НЕТ Shigella boydii 1724 AAKA01000007 клада_92 НЕТ Категория B Shigella dysenteriae 1725 NC_007606 клада_92 НЕТ Категория B Shigella flexneri 1726 AE005674 клада_92 НЕТ Категория B Shigella sonnei 1727 NC_007384 клада_92 НЕТ Категория B Tatumella ptyseos 1916 NR_025342 клада_92 НЕТ НЕТ Trabulsiella guamensis 1925 AY373830 клада_92 НЕТ НЕТ Yersinia aldovae 2019 AJ871363 клада_92 НЕТ ОП Yersinia aleksiciae 2020 AJ627597 клада_92 НЕТ ОП Yersinia bercovieri 2021 AF366377 клада_92 НЕТ ОП Yersinia enterocolitica 2022 FR729477 клада_92 НЕТ Категория B Yersinia frederiksenii 2023 AF366379 клада_92 НЕТ ОП Yersinia intermedia 2024 AF366380 клада_92 НЕТ ОП Yersinia kristensenii 2025 ACCA01000078 клада_92 НЕТ ОП Yersinia mollaretii 2026 NR_027546 клада_92 НЕТ ОП Yersinia pestis 2027 AE013632 клада_92 НЕТ Категория A Yersinia pseudotuberculosis 2028 NC_009708 клада_92 НЕТ ОП Yersinia rohdei 2029 ACCD01000071 клада_92 НЕТ ОП Yokenella regensburgei 2030 AB273739 клада_92 НЕТ НЕТ Conchiformibius kuhniae 669 NR_041821 клада_94 НЕТ НЕТ Morococcus cerebrosus 1267 JN175352 клада_94 НЕТ НЕТ Neisseria bacilliformis 1328 AFAY01000058 клада_94 НЕТ НЕТ Neisseria cinerea 1329 ACDY01000037 клада_94 НЕТ НЕТ Neisseria flavescens 1331 ACQV01000025 клада_94 НЕТ НЕТ Neisseria gonorrhoeae 1333 CP002440 клада_94 НЕТ ОП Neisseria lactamica 1334 ACEQ01000095 клада_94 НЕТ НЕТ Neisseria macacae 1335 AFQE01000146 клада_94 НЕТ НЕТ Neisseria meningitidis 1336 NC_003112 клада_94 НЕТ ОП Neisseria mucosa 1337 ACDX01000110 клада_94 НЕТ НЕТ Neisseria pharyngis 1338 AJ239281 клада_94 НЕТ НЕТ Neisseria polysaccharea 1339 ADBE01000137 клада_94 НЕТ НЕТ Neisseria sicca 1340 ACKO02000016 клада_94 НЕТ НЕТ Neisseria sp. KEM232 1341 GQ203291 клада_94 НЕТ НЕТ Neisseria sp., оральный клон AP132 1344 AY005027 клада_94 НЕТ НЕТ Neisseria sp. оральный штамм B33KA 1346 AY005028 клада_94 НЕТ НЕТ Neisseria sp., оральный таксон 014 1347 ADEA01000039 клада_94 НЕТ НЕТ Neisseria sp. TM10_1 1343 DQ279352 клада_94 НЕТ НЕТ Neisseria subflava 1348 ACEO01000067 клада_94 НЕТ НЕТ Okadaella gastrococcus 1365 HQ699465 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus agalactiae 1785 AAJO01000130 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus alactolyticus 1786 NR_041781 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus australis 1788 AEQR01000024 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus bovis 1789 AEEL01000030 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus canis 1790 AJ413203 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus constellatus 1791 AY277942 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus cristatus 1792 AEVC01000028 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus dysgalactiae 1794 AP010935 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus equi 1795 CP001129 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus equinus 1796 AEVB01000043 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus gallolyticus 1797 FR824043 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus, геномовид C1 1798 AY278629 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus, геномовид C2 1799 AY278630 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus, геномовид C3 1800 AY278631 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus, геномовид C4 1801 AY278632 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus, геномовид C5 1802 AY278633 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus, геномовид C6 1803 AY278634 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus, геномовид C7 1804 AY278635 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus, геномовид C8 1805 AY278609 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus gordonii 1806 NC_009785 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus infantarius 1807 ABJK02000017 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus infantis 1808 AFNN01000024 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus intermedius 1809 NR_028736 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus lutetiensis 1810 NR_037096 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus massiliensis 1811 AY769997 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus mitis 1813 AM157420 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus oligofermentans 1815 AY099095 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus oralis 1816 ADMV01000001 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus parasanguinis 1817 AEKM01000012 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus pasteurianus 1818 AP012054 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus peroris 1819 AEVF01000016 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus pneumoniae 1820 AE008537 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus porcinus 1821 EF121439 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus pseudopneumoniae 1822 FJ827123 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus pseudoporcinus 1823 AENS01000003 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus pyogenes 1824 AE006496 клада_98 НЕТ ОП Streptococcus ratti 1825 X58304 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sanguinis 1827 NR_074974 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sinensis 1828 AF432857 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. 2_1_36FAA 1831 ACOI01000028 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. 2285_97 1830 AJ131965 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. ACS2 1834 HQ616360 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. AS20 1835 HQ616366 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. BS35a 1836 HQ616369 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. C150 1837 ACRI01000045 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. CM6 1838 HQ616372 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. ICM10 1840 HQ616389 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. ICM12 1841 HQ616390 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. ICM2 1842 HQ616386 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. ICM4 1844 HQ616387 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. ICM45 1843 HQ616394 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. M143 1845 ACRK01000025 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp. M334 1846 ACRL01000052 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASB02 1849 AY923121 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCA03 1850 DQ272504 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCA04 1851 AY923116 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCA09 1852 AY923119 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCB04 1853 AY923123 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCB06 1854 AY923124 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCC04 1855 AY923127 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCC05 1856 AY923128 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCC12 1857 DQ272507 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCD01 1858 AY923129 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCD09 1859 AY923130 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCD10 1860 DQ272509 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCE03 1861 AY923134 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCE04 1862 AY953253 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCE05 1863 DQ272510 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCE06 1864 AY923135 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клонASCE09 1865 AY923136 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCE10 1866 AY923137 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCE12 1867 AY923138 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCF05 1868 AY923140 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCF07 1869 AY953255 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCF09 1870 AY923142 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон ASCG04 1871 AY923145 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон BW009 1872 AY005042 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон CH016 1873 AY005044 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон GK051 1874 AY349413 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон GM006 1875 AY349414 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон P2PA_41 P2 1876 AY207051 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный клон P4PA_30 P4 1877 AY207064 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный таксон 071 1878 AEEP01000019 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный таксон G59 1879 GU432132 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный таксон G62 1880 GU432146 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus sp., оральный таксон G63 1881 GU432150 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus suis 1882 FM252032 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus thermophilus 1883 CP000419 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus salivarius 1826 AGBV01000001 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus uberis 1884 HQ391900 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus urinalis 1885 DQ303194 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus vestibularis 1886 AEKO01000008 клада_98 НЕТ НЕТ Streptococcus viridans 1887 AF076036 клада_98 НЕТ НЕТ Бактерия Synergistetes, оральный клон 03 5 D05 1908 GU227192 клада_98 НЕТ НЕТ

Таблица X4. Спорообразующие бактериальные виды

Alkaliphilus metalliredigens Ammonifex degensii Anaerofustis stercorihominis Anaerostipes caccae Anaerotruncus colihominis Bacillus amyloliquefaciens Bacillus anthracis Bacillus cellulosilyticus Bacillus cereus Bacillus clausii Bacillus coagulans Bacillus cytotoxicus Bacillus halodurans Bacillus licheniformis Bacillus pumilus Bacillus subtilis Bacillus thuringiensis Bacillus weihenstephanensis Blautia hansenii Brevibacillus brevis Bryantella formatexigens Caldicellulosiruptor saccharolyticus Candidatus Desulforudis audaxviato Carboxydibrachium pacificum Carboxydothermus hydrogenoformans Clostridium acetobutylicum Clostridium asparagiforme Clostridium bartlettii Clostridium beijerinckii Clostridium bolteae Clostridium botulinum A str. ATCC 19397 Clostridium botulinum B str. Eklund 17B Clostridium butyricum, патогенный E4 штамм BoNT BL5262 Clostridium Carboxidivorans Clostridium cellulolyticum Clostridium cellulovorans Clostridium difficile Clostridium hathewayi Clostridium hylemonae Clostridium kluyveri Clostridium leptum Clostridium methylpentosum Clostridium nexile Clostridium novyi NT Clostridium papyrosolvens Clostridium perfringens Clostridium phytofermentans ISDg Clostridium scindens Clostridium sp. 7_2_43FAA Clostridium sporogenes Clostridium tetani Clostridium thermocellum Coprococcus comes Desulfotomaculum reducens Dorea longicatena Eubacterium eligens Eubacterium hallii Eubacterium rectale Eubacterium ventriosum Faecalibacterium prausnitzii Geobacillus kaustophilus Geobacillus sp. G11MC16 Geobacillus thermodenitrificans Heliobacterium modesticaldum Lysinibacillus sphaericus Oceanobacillus iheyensis Paenibacillus sp. JDR-2 Pelotomaculum thermopropionicum Roseburia intestinalis Ruminococcus bromii Ruminococcus gnavus Ruminococcus obeum Ruminococcus torques Subdoligranulum variabile Symbiobacterium thermophilum Thermoanaerobacter italicus Thermoanaerobacter tengcongensis Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum Thermosinus carboxydivorans

Таблица 2. Виды, выделенные из обработанного этанолом состава со спорами до (слева) и после (справа) этапа градиента CsCl

Изоляты Обработанный этанолом состав со спорами Обработанный этанолом очищенный в градиенте состав со спорами Bacillus coagulans 7 2 Blautia luti 1 1 Blautia sp 14 13 Blautia wexlerae 3 1 Ruminococcus obeum 4 2 Clostridiales sp 1 2 Clostridium aerotolerans 1 2 Clostridium disporicum 0 1 Clostridium sp 1 1 Clostridium symbiosum 0 1 Dorea longicatena 8 6 Eubacterium cellulosolvens 1 0 Eubacterium ventriosum 2 2 Gemmiger formicilis 0 1 Robinsoniella peoriensis 0 1 Roseburia hominis 3 6 Roseburia intestinalis 9 7 Ruminococcus sp 5 2 Syntrophococcus sucromutans 1 1 Turicibacter sanguinis 3 4 Clostridiales sp 7 9 Clostridium bartlettii 8 11 Clostridium irregulare 0 1 Clostridium sordellii 4 6 Lachnospiraceae sp 1 0

Таблица 3. Смертность и изменение массы тела у мышей, стимулированных C. difficile, с обработкой или без обработки обработанным этанолом споровым продуктом.

Тестируемый состав Смертность (n=10) % изменения массы тела на 3 день Носитель (отрицательный контроль) 20% -10,5% Донорские экскременты (положительный контроль) 0 -0,1% Обработанные EtOH экскременты 1× 0 2,3% Обработанные EtOH экскременты 0,1× 0 2,4% Обработанные EtOHэкскременты 0.01× 0 -3% Термообработанные экскременты 0 0,1%

Таблица 4. Идентифицированные на основании 16S рРНК спорообразующие виды из чашек с выделенными точечным методом колониями.

Обработка Виды Количество изолятов 70°С 1 ч Clostridium_celatum 4 70°С 1 ч Clostridium_clostridioform 1 70°С 1 ч Clostridium_hylemonae 1 70°С 1 ч Clostridium_paraputrificum 3 70°С 1 ч Clostridium_sp_D5 1 70°С 1 ч Clostridium_symbiosum 1 80°С 1 ч Clostridium_bartlettii 6 80°С 1 ч Clostridium_butyricum 1 80°С 1 ч Clostridium_paraputrificum 5 80°С 1 ч Coprobacillus_sp_D7 1 80°С 1 ч Eubacterium_sp_WAL_14571 1 80°С 1 ч Ruminococcus_bromii 1 90°С 1 ч Clostridium_butyricum 1 90°С 10 мин Ruminococcus_bromii 1 90°С 10 мин Anaerotruncus_colihominis 2 90°С 10 мин Clostridium_bartlettii 1 100°С 10 мин Ruminococcus_bromii 1

Таблица 5. Спорообразующие виды, идентифицированные в обработанных этанолом или термообработанных образцах и не идентифицированные в необработанных образцах

Виды Выделенные из необработанных образцов Выделенные из обработанных EtOH образцов Выделенные из термообработанных образцов Acetivibrio ethanolgignens x Anaerofustis stercorihominis x Bacillus anthracis x Bacillus horti x Bacillus licheniformis x Bacillus nealsonii x Bacillus pumilus x Bacillus sp. BT1B_CT2 x Bacillus thuringiensis x Bacteroides galacturonicus (филогенетически относится к Clostridiales) x Bacteroides pectinophilus (филогенетически относится к Clostridiales) x Blautia wexlerae x x Brachyspira pilosicoli x Brevibacillus parabrevis x Clostridium aldenense x Clostridium beijerinckii x Clostridium carnis x Clostridium celatum x Clostridium favososporum x Clostridium hylemonae x Clostridium irregular x Clostridium methylpentosum x Clostridium sp. D5 x x Clostridium sp. L2-50 x Clostridium sp. MT4 E x Clostridium sp. NML 04A032 x Clostridium sp. SS2/1 x Clostridium sp. YIT 12069 x Clostridium stercorarium x Clostridium xylanolyticum x Coprococcus sp. ART55/1 x Deferribacteres sp., оральный клон JV006 x Desulfitobacterium frappieri x Eubacterium callanderi x Eubacterium siraeum x Exiguobacterium acetylicum x Gemmiger formicilis x Lachnospira multipara x Lachnospira pectinoschiza x Roseburia faecalis x Ruminococcus albus x

Таблица 6. Донор A, 45 видов в 374 секвенированных устойчивых к EtOH колониях

OUT Anaerostipes_sp_3_2_56FAA Bacillus_anthracis Bacillus_cereus Bacillus_thuringiensis Blautia_producta Blautia_sp_M25 Clostridiales_sp_SSC_2 Clostridium_aldenense Clostridium_bartlettii Clostridium_bolteae Clostridium_celatum Clostridium_disporicum Clostridium_ghonii Clostridium_hathewayi Clostridium_lactatifermentans Clostridium_mayombei Clostridium_orbiscindens Clostridium_paraputrificum Clostridium_perfringens Clostridium_sordellii Clostridium_stercorarium Clostridium_straminisolvens Clostridium_tertium Coprobacillus_sp_D7 Coprococcus_catus Deferribacteres_sp, оральный клон_JV006 Dorea_formicigenerans Eubacterium_rectale Eubacterium_siraeum Eubacterium_sp_WAL_14571 Eubacterium_ventriosum Flexistipes_sinusarabici Fulvimonas_sp_NML_060897 Бактерия Lachnospiraceae_2_1_58FAA Бактерия Lachnospiraceae_3_1_57FAA Бактерия Lachnospiraceae_A4 Бактерия Lachnospiraceae_оральный _таксон_F15 Moorella_thermoacetica Roseburia_faecalis Roseburia_hominis Ruminococcus_albus Ruminococcus_bromii Ruminococcus_gnavus Ruminococcus_sp_5_1_39BFAA Ruminococcus_torques

Таблица 7. Донор B, 26 видов в 195 секвенированных устойчивых к EtOH колониях

OUT Bacillus_horti Blautia_wexlerae Chlamydiales_бактерия_NS11 Clostridiales_sp_SSC_2 Clostridium_bartlettii Clostridium_celatum Clostridium_disporicum Clostridium_ghonii Clostridium_oroticum Clostridium_paraputrificum Clostridium_perfringens Clostridium_sordellii Clostridium_sp_L2_50 Clostridium_sp_MT4_E Clostridium_straminisolvens Coprococcus_sp_ART55_1 Eubacterium_callanderi Eubacterium_rectale Eubacterium_ruminantium Gemmiger_formicilis Lachnospira_pectinoschiza Ruminococcus_albus Ruminococcus_gnavus Ruminococcus_obeum Ruminococcus_sp_5_1_39BFAA Ruminococcus_sp_K_1

Таблица 8. Донор C, 39 видов в 416 секвенированных устойчивых к EtOH колониях

OTU Bacteroides_galacturonicus Bacteroides_pectinophilus Blautia_producta Blautia_sp_M25 Blautia_wexlerae Clostridiales_sp_SS3_4 Clostridiales_sp_SSC_2 Clostridium_bartlettii Clostridium_citroniae Clostridium_disporicum Clostridium_indolis Clostridium_orbiscindens Clostridium_paraputrificum Clostridium_sordellii Clostridium_sp_NML_04A032 Clostridium_sp_SS2_1 Clostridium_straminisolvens Clostridium_viride Clostridium_xylanolyticum Coprobacillus_sp_D7 Dorea_longicatena Eubacterium_rectale Eubacterium_ventriosum Hydrogenoanaerobacterium_saccharovorans Lachnospira_multipara Lachnospira_pectinoschiza Бактерия Lachnospiraceae_A4 Oscillibacter_sp_G2 Pseudoflavonifractor_capillosus Roseburia_hominis Roseburia_intestinalis Ruminococcus_albus Ruminococcus_lactaris Ruminococcus_obeum Ruminococcus_sp_5_1_39BFAA Ruminococcus_sp_K1 Ruminococcus_torques Syntrophococcus_sucromutans

Таблица 9. Донор D, 12 видов в 118 секвенированных устойчивых к EtOH колониях

OTU Blautia_luti Blautia_wexlerae Brachyspira_pilosicoli Clostridium_paraputrificum Collinsella_aerofaciens Coprobacillus_sp_D7 Desulfitobacterium_frappieri Eubacterium_rectale Moorella_thermoacetica Ruminococcus_gnavus Ruminococcus_obeum Ruminococcus_sp_K1

Таблица 10. Донор E, 11 видов в 118 секвенированных устойчивых к EtOH колониях

OTU Blautia_luti Blautia_wexlerae Brachyspira_pilosicoli Clostridium_paraputrificum Coprobacillus_sp_D7 Desulfitobacterium_frappieri Eubacterium_rectale Moorella_thermoacetica Ruminococcus_gnavus Ruminococcus_obeum Ruminococcus_sp_K_1

Таблица 11. Донор F, 54 OTU в 768 секвенированных устойчивых к EtOH колониях

OTU Anaerofustis_stercorihominis Anaerostipes_sp_3_2_56FAA Bacillus_nealsonii Bacillus_sp_BT1B_CT2 Blautia_producta Butyrivibrio_crossotus Clostridiales_бактерия_SY8519 Clostridiales_sp_1_7_47 Clostridium_aldenense Clostridium_bartlettii Clostridium_bolteae Clostridium_butyricum Clostridium_citroniae Clostridium_clostridioforme Clostridium_disporicum Clostridium_favososporum Clostridium_glycolicum Clostridium_hathewayi Clostridium_indolis Clostridium_leptum Clostridium_mayombei Clostridium_nexile Clostridium_orbiscindens Clostridium_sordellii Clostridium_sp_7_2_43FAA Clostridium_sp_D5 Clostridium_sp_M62_1 Clostridium_sp_NML_04A032 Clostridium_spiroforme Clostridium_symbiosum Clostridium_tertium Coprobacillus_sp_29_1 Coprobacillus_sp_D7 Eubacterium_contortum Eubacterium_desmolans Eubacterium_ramulus Exiguobacterium_acetylicum Faecalibacterium_prausnitzii Бактерия Lachnospiraceae_2_1_58FAA Бактерия Lachnospiraceae_3_1_57FAA Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA Бактерия Lachnospiraceae_6_1_63FAA Бактерия Lachnospiraceae,_оральный _таксон_F15 Marvinbryantia_formatexigens Mycoplasma_amphoriforme Oscillibacter_sp_G2 Pseudoflavonifractor_capillosus Ruminococcus_gnavus Ruminococcus_hansenii Ruminococcus_obeum Ruminococcus_sp_5_1_39BFAA Ruminococcus_sp_ID8 Turicibacter_sanguinis

Таблица 12. Организмы, вырастающие из обработанной этанолом популяции спор, на разных средах (см. в примере 5 полные наименования сред и ссылки)

Среда Общее число прочтений Уникальные OTU % уникальных OTU M2GSC 93 33 0,35 M-BHI 66 26 0,39 Sweet B 74 23 0,31 GAM фруктоза 44 18 0,41 M2 маннит 39 17 0,44 M2 растворимый крахмал 62 16 0,26 M2 лактат 43 14 0,33 GAM FOS/Инулин 52 14 0,27 EYA 29 13 0,45 Муцин 19 12 0,63 M2 с лактозой 32 12 0,38 BHIS az1/ge2 35 12 0,34 BHIS CInM az1/ge2 24 11 0,46 GAM с маннитом 41 11 0,27 BBA 29 10 0,34 Полимиксин-сульфитный молочный 48 9 0,19 Агар для Eubacterium по Noack-Blaut 12 4 0,33 всего проанализировано 742

Таблица 13. Виды, идентифицированные как способные к прорастанию и способные к споруляции путем точечного выделения культуры из колоний

OTU BBA GAM + ФОС/инулин M2GSC Sweet B + ФОС/Инулин Sweet GAM Всего Blautia producta 1 1 Clostridium bartlettii 4 1 5 Clostridium bolteae 2 5 1 8 Clostridium botulinum 5 5 Clostridium butyricum 37 43 8 1 33 122 Clostridium celatum 4 1 5 Clostridium clostridioforme 1 1 2 Clostridium disporicum 26 26 22 33 50 157 Clostridium glycolicum 4 9 14 27 Clostridium mayombei 2 2 4 Clostridium paraputrificum 8 8 33 16 6 71 Clostridium sordellii 14 14 Clostridium sp. 7_2_43FAA 1 1 Clostridium symbiosum 3 3 Clostridium tertium 1 1 2 (пусто) 2 31 33 Всего 92 92 92 92 92 460

Таблица 15. Результаты профилактической модели на мышах и информация о дозировании для способных к прорастанию и способных к споруляции фракций.

[0428] Клинический показатель основано на комбинированной фенотипической оценке состояния здоровья мыши по шкале от 0 до 4 по нескольким параметрам, в том числе внешнему виду (0-2 пункта на основании нормального внешнего вида, сгорбленность, пилоэрекция или летаргическое состояние), и клинические признаки (0-2 пункта на основании нормального внешнего вида, мокрого хвоста, пониженной на ощупь температуры или изоляции от других животных).

Тестируемый состав Доза Число смертей к дню 6 Средняя масса тела на 3 день относительно дня -1 Средний клинический показатель на 3 день Основа Н/О 10 0,72 NA Нестимулированные Н/О 0 1,03 0 Донор B, суспензия фекалий 0,2 мл 10% суспензии 1 0,91 0,11 Донор A, споровый состав, способный к прорастанию 8,99*10⁷ Споровых эквивалента на дозу 0 1,02 0 Донор A, споровый состав, способный к споруляции 7,46*10⁷ Споровых эквивалента на дозу 0 0,99 0

Таблица 16. Бактериальные OTU, связанные с приживлением и экологической стимуляцией, и приживление более разнообразной экогруппы микроорганизмов у пациентов, получавших лечение обработанным этанолом составом со спорами.

OTU Филогенетическая клада Спорообразующие OTU Доминирующие OTU в стимулированной экогруппе Bacteroides sp. 2_1_22 клада38 НЕТ ДА Streptococcus anginosus клада60 НЕТ Prevotella intermedia клада81 НЕТ Prevotella nigrescens клада81 НЕТ Oribacterium sp. ACB7 клада90 НЕТ Prevotella salivae клада104 НЕТ Bacteroides intestinalis клада171 НЕТ ДА Bifidobacterium dentium клада172 НЕТ Alcaligenes faecalis клада183 НЕТ Rothia dentocariosa клада194 НЕТ Peptoniphilus lacrimalis клада291 НЕТ Anaerococcus sp. gpac155 клада294 НЕТ Sutterella stercoricanis клада302 НЕТ ДА Bacteroides sp. 3_1_19 клада335 НЕТ ДА Parabacteroides goldsteinii клада335 НЕТ Bacteroides dorei клада378 НЕТ ДА Bacteroides massiliensis клада378 НЕТ Lactobacillus iners клада398 НЕТ Granulicatella adiacens клада460 НЕТ Eggerthella sp. 1_3_56FAA клада477 НЕТ Gordonibacter pamelaeae клада477 НЕТ Finegoldia magna клада509 НЕТ Actinomyces nasicola клада523 НЕТ Streptobacillus moniliformis клада532 НЕТ Oscillospira guilliermondii клада540 НЕТ Orientia tsutsugamushi клада541 НЕТ Christensenella minuta клада558 НЕТ Clostridium oroticum клада96 ДА Clostridium sp. D5 клада96 ДА Clostridium glycyrrhizinilyticum клада147 ДА Coprococcus comes клада147 ДА Ruminococcus lactaris клада147 ДА Ruminococcus torques клада147 ДА ДА Clostridiales sp. SS3/4 клада246 ДА Clostridium hylemonae клада260 ДА Clostridium aerotolerans клада269 ДА Clostridium asparagiforme клада300 ДА ДА Clostridium sp. M62/1 клада300 ДА Clostridium symbiosum клада300 ДА Lachnospiraceae, геномовид C1 клада300 ДА Blautia sp. M25 клада304 ДА ДА Blautia stercoris клада304 ДА Ruminococcus hansenii клада304 ДА Ruminococcus obeum клада304 ДА Ruminococcus sp. 5_1_39BFAA клада304 ДА Bryantella formatexigens клада309 ДА Eubacterium cellulosolvens клада309 ДА Clostridium sp. HGF2 клада351 ДА Clostridium bartlettii клада354 ДА Clostridium bifermentans клада354 ДА Clostridium glycolicum клада354 ДА Eubacterium tenue клада354 ДА Dorea formicigenerans клада360 ДА Dorea longicatena клада360 ДА Бактерия Lachnospiraceae 2_1_46FAA клада360 ДА Бактерия Lachnospiraceae 9_1_43BFAA клада360 ДА ДА Ruminococcus gnavus клада360 ДА Clostridium hathewayi клада362 ДА Blautia hydrogenotrophica клада368 ДА Бактерия Clostridiaceae END-2 клада368 ДА Roseburia faecis клада369 ДА Roseburia hominis клада370 ДА Roseburia intestinalis клада370 ДА Eubacterium sp. WAL 14571 клада384 ДА Бактерия Erysipelotrichaceae5_2_54FAA клада385 ДА Eubacterium biforme клада385 ДА Eubacterium dolichum клада385 ДА Coprococcus catus клада393 ДА Acetivibrio ethanolgignens клада396 ДА Anaerosporobacter mobilis клада396 ДА Bacteroides pectinophilus клада396 ДА Eubacterium hallii клада396 ДА Eubacterium xylanophilum клада396 ДА Anaerostipes caccae клада408 ДА Бактерия Clostridiales 1_7_47FAA клада408 ДА Clostridium aldenense клада408 ДА Clostridium citroniae клада408 ДА Eubacterium hadrum клада408 ДА ДА Acetanaerobacterium elongatum клада439 ДА Faecalibacterium prausnitzii клада478 ДА Gemmiger formicilis клада478 ДА ДА Eubacterium ramulus клада482 ДА Бактерия Lachnospiraceae 3_1_57FAA_CT1 клада483 ДА Бактерия Lachnospiraceae A4 клада483 ДА ДА Бактерия Lachnospiraceae DJF VP30 клада483 ДА Holdemania filiformis клада485 ДА Clostridium orbiscindens клада494 ДА Pseudoflavonifractor capillosus клада494 ДА Бактерия Ruminococcaceae D16 клада494 ДА Acetivibrio cellulolyticus клада495 ДА Eubacterium limosum клада512 ДА Anaerotruncus colihominis клада516 ДА Clostridium methylpentosum клада516 ДА Clostridium sp. YIT 12070 клада516 ДА Hydrogenoanaerobacterium saccharovorans клада516 ДА Eubacterium ventriosum клада519 ДА Eubacterium eligens клада522 ДА Lachnospira pectinoschiza клада522 ДА Lactobacillus rogosae клада522 ДА ДА Clostridium leptum клада537 ДА Eubacterium coprostanoligenes клада537 ДА Ruminococcus bromii клада537 ДА Clostridium viride клада540 ДА Butyrivibrio crossotus клада543 ДА Coprococcus eutactus клада543 ДА Eubacterium ruminantium клада543 ДА Eubacterium rectale клада568 ДА ДА Roseburia inulinivorans клада568 ДА Butyricicoccus pullicaecorum клада572 ДА Eubacterium desmolans клада572 ДА Papillibacter cinnamivorans клада572 ДА Sporobacter termitidis клада572 ДА Clostridium lactatifermentans клада576 ДА

Таблица 18. Снижение нагрузки оппортунистическими патогенами или патобионтами при применении обработанных этанолом спор.

До лечения День 5 День 14 День 25 Klebsiella (% от общих прочтений) 20,27% 1,32% 7,62% 0,00% Fusobacterium (%от общих прочтений) 19,14% 3,01% 0,01% 0,00%

Таблица 19. Изменения Enterobacteria в зависимости от лечения, измеренные на цитратном агаре Симмонса

Пациент Организм Титр до лечения (КОЕ/г) Титр на 25 день (КОЕ/г) 1 Klebsiella pneumoniae 9×10⁶ 1×10³ 1 Klebsiella sp. Co9935 4×10⁶ 1×10³ 1 Escherichia coli 7×10⁶ 1×10⁶ 2 Klebsiella sp. Co9935 4×10⁶ 1×10³ 4 Klebsiella pneumoniae 3×10⁸ <1×10⁴ 4 Klebsiella sp. Co9935 6×10⁷ <1×10⁴ 5 Klebsiella pneumoniae 1×10⁶ <1×10⁴

Таблица 20. Стимуляция Bacteroides в зависимости от лечения бактериальной композицией пациента 1

Среда Виды Bacteroides Титр до лечения (КОЕ/г) Титр на 25 день (КОЕ/г) BBE Группа B. fragilis <2×10⁴ 3×10⁸ PFA Все Bacteroides <2×10⁷ 2×10¹⁰

Таблица 21. Bacteroides spp. после лечения обработанным этанолом составом со спорами на основании полных последовательностей 16S рРНК выделенных штаммов

Виды % общищ КОЕ Bacteroides (1.58E10 КОЕ/г) Bacteroides sp. 4_1_36 63% Bacteroides cellulosilyticus 14% Bacteroides sp. 1_1_30 14% Bacteroides uniformis 4,8% Bacteroides ovatus 1,7% Bacteroides dorei 0,91% Bacteroides xylanisolvens 0,83% Bacteroides sp. 3_1_19 0,23%

Таблица 22. Титры (в КОЕ/г) устойчивых к имипенему M. morganii, P. rettgeri и P. pennerii от пациентов B, D и E

Пациент Организм Титр до лечения Титр на 28 день * Пациент 2 M. morganii 1×10⁴ 6×10² Пациент 2 P. rettgeri 9×10³ <5×10¹ Пациент 4 M. morganii 2×10⁴ <5×10¹ Пациент 4 P. pennerii 2×10⁴ <5×10¹ Пациент 5 M. morganii 5×10³ <5×10¹

* Порог детекции на основании посева 200 мкл 10% (масса/объем) суспензии составляет 5×10¹.

Таблица YYY. Виды, идентифицированные как способные к прорастанию согласно 16S с применением точечного метода выделения колоний

Clostridium_paraputrificum Clostridium_disporicum Clostridium_glycolicum Clostridium_bartlettii Clostridium_butyricum Ruminococcus_bromii Бактерия Lachnospiraceae_2_1_58FAA Eubacterium_hadrum Turicibacter_sanguinis Бактерия Lachnospiraceae_оральный _таксон_F15 Clostridium_perfringens Clostridium_bifermentans Roseburia_sp_11SE37 Clostridium_quinii Ruminococcus_lactaris Clostridium_botulinum Clostridium_tyrobutyricum Blautia_hansenii Clostridium_kluyveri Clostridium_sp_JC122 Clostridium_hylemonae Clostridium_celatum Clostridium_straminisolvens Clostridium_orbiscindens Roseburia_cecicola Eubacterium_tenue Clostridium_sp_7_2_43FAA Бактерия Lachnospiraceae_4_1_37FAA Eubacterium_rectale Clostridium_viride Ruminococcus_sp_K_1 Clostridium_symbiosum Ruminococcus_torques Clostridium_algidicarnis

Таблица ZZZ. Виды, идентифицированные как способные к споруляции с помощью методов 16S-NGS

Clostridium_paraputrificum Clostridium_bartlettii Бактерия Lachnospiraceae_2_1_58FAA Clostridium_disporicum Ruminococcus_bromii Eubacterium_hadrum Clostridium_butyricum Roseburia_sp_11SE37 Clostridium_perfringens Clostridium_glycolicum Clostridium_hylemonae Clostridium_orbiscindens Ruminococcus_lactaris Clostridium_symbiosum Бактерия Lachnospiraceae_оральный _таксон_F15 Blautia_hansenii Turicibacter_sanguinis Clostridium_straminisolvens Clostridium_botulinum Бактерия Lachnospiraceae_4_1_37FAA Roseburia_cecicola Ruminococcus_sp_K_1 Clostridium_bifermentans Eubacterium_rectale Clostridium_quinii Clostridium_viride Clostridium_kluyveri Clostridium_tyrobutyricum Oscillibacter_sp_G2 Clostridium_sp_JC122 Бактерия Lachnospiraceae_3_1_57FAA Clostridium_aldenense Ruminococcus_torques Clostridium_sp_7_2_43FAA Clostridium_celatum Eubacterium_sp_WAL_14571 Eubacterium_tenue Бактерия Lachnospiraceae_5_1_57FAA Clostridium_clostridioforme Clostridium_sp_YIT_12070 Blautia_sp_M25 Anaerostipes_caccae Roseburia_inulinivorans Clostridium_sp_D5 Clostridium_asparagiforme Coprobacillus_sp_D7 Clostridium_sp_HGF2 Clostridium_citroniae Clostridium_difficile Oscillibacter_valericigenes Clostridium_algidicarnis

--->

ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

<110> СЕРЕС ХЕЛС, ИНК.

<120> КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ

<130> 28413-25970

<140>

<141>

<150> 61/926,918

<151> 2014-01-13

<150> 61/760,584

<151> 2013-02-04

<150> 61/760,585

<151> 2013-02-04

<150> 61/760,574

<151> 2013-02-04

<150> 61/760,606

<151> 2013-02-04

<160> 2032

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 1532

<212> DNA

<213> Abiotrophia defectiva

<400> 1

atgagagttt gatcctggct caggatgaac gctggcggcg tgcctaacac atgcaagtcg

60

aacggagatt acggacggaa gttttcggat ggaagcctgt aattcttagt ggcggacggg

120

tgagtaacgc gtgggcaacc tgccctatac agggggatag cagctggaaa cggctggtaa

180

gaccgcataa gtcggttaaa tcgcatgatt tgatcgggaa atgagcaatc aggtatagga

240

tgggcccgcg tccgattagc cagttggcag ggtaaaagcc taccaaagcg acgatcggta

300

gccggactga gaggtcggac ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg

360

aggcagcagt gggggatatt gcacaatgga ggaaactctg atgcagcgac gccgcgtgag

420

tgaagaagta tttcggtatg taaagctcta tcagcaggga agatgatgac ggtacctgac

480

taagaagccc cggctaacta cgcgccagca gccgcggtaa tacgtagggg gcaagcgtta

540

tccggattta ctgggtgtaa agggagcgca ggcggttttg caagttgaga gtggaagcag

600

ggggctcaac cccctgactg ctcccaaaac tgtaaaactt gagtatggga gaggcaggcg

660

gaattcctag tgtagcggtg aaatgcttag atattaggaa gaacaccggt ggcgaaggcg

720

gcctgctgga ccaaaactga cgctgaggct cgaaagcgtg ggtagcaaac aggattagat

780

accctggtag tccacgctgt aaacgatgaa tactaggtgc tgggatgcat aagcatttcg

840

gtgccgtcgc aaacgcatta agtattccac ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc

900

aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gacgcaacgc

960

gaagaacctt acccggtctt gagatcctcc tgaatactga gtaatgtcag tagtccttcg

1020

ggacaggaga gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1080

agtcccgcaa cgagcgcaac ccctattttt agtagccagc ggttcggccg ggcactctaa

1140

agagactgcc gaggataact cggaggaagg cggggatgac gtcaaatcat catgcccctt

1200

atgaccgggg ctacacacgt gctacaatgg cagttacaga gggaagcgaa ggcgtgagcc

1260

ggagcaaatc tcagaaaggc tgcctcagtt cggattgtag tctgcaactc gactacatga

1320

agctggaatc gctagtaatc gcgaatcaga atgtcgcggt gaatacgttc ccgggtcttg

1380

tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtcg gaaatgcccg aagtcagtgg cctaaccgta

1440

agggaggagc tgccgaaggc aggtctggtg actggggtga agtcgtaaca aggtagccgt

1500

atcggaaggt gcggctggat cacctccttt ct

1532

<210> 2

<211> 1407

<212> DNA

<213> Abiotrophia para-adiacens

<400> 2

agagtttgat catggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac

60

gagagcgacc ggtgcttgca ctggtcaatc tagtggcgaa cgggtgagta acacgtgggt

120

aacctgccca tcagaggggg ataacattcg gaaacggatg ctaaaaccgc ataggtcttc

180

gaaccgcatg gtttgaagag gaaaagaggc gcaagcttct gctgatggat ggacccgcgg

240

tgcattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggccg tgatgcatag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacattgg gactgagaca cggcccaaac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc cgcaatggac gcaagtctga cggagcaacg ccgcgtgagt gaagaaggtt

420

ttcggatcgt aaaactctgt tgttagagaa gaacaagtgc tagagtaact gttagcgcct

480

tgacggtatc taaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

ggtggcaagc gttgtccgga tttattgggc gtaaagcgag cgcaggcggt tccttaagtc

600

tgatgtgaaa gcccccggct caaccgggga gggtcattgg aaactgggga acttgagtgc

660

agaagaggag agtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat ggaggaacac

720

cagtggcgaa ggcgactctc tggtctgtaa ctgacgctga ggctcgaaag cgtgggtagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa gtgttggagg

840

gtttccgccc ttcagtgctg cagttaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg

900

caaggttgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccaag tcttgacatc ctttgaccac tctagagata

1020

gagctttccc ttcggggaca aagtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat tactagttgc cagcattgag

1140

ttgggcactc tagtgagact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1200

catcatgccc cttatgactt gggctacaca cgtgctacaa tggatggtac aacgagcagc

1260

gaactcgcga gggtaagcga atctcttaaa gccattctca gttcggattg taggctgcaa

1320

ctcgcctaca tgaagccgga atcgctagta atcgcggatc agcacgccgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgt

1407

<210> 3

<211> 1328

<212> DNA

<213> Abiotrophia sp. oral clone P4PA_155 P1

<400> 3

gacgaacgct ggcggtgtgc ctaatacatg caagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta

60

acacgtgggt aacctacctc atagtggggg ataacagtcg gaaacgactg ctaataccgc

120

atagggaaag tcgctaagag atggacccgc ggtgcattag ctggttggta gggtaaaggc

180

ctaccaaggc gatgatgcat agccgacctg agagggtgat cggccacatt gggactgaga

240

ctcggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tccgcaatgg acgcaagtct

300

gacggagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg tcttcggatc gtaaagctct gttgttggag

360

aagatgacgg tatctaaccg gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtggc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag ggagtgtagg cggtctttta

480

agtctgatgt gaaagcccac ggctcaaccg tggagggtca ttggaaactg ggagacttga

540

gtgcagaaga ggagagcgga attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat atatggagga

600

acaccagtgg cgaaggcggc tctctggtct gactgacgct gaggctcgaa agcgtgggga

660

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aagtgttgga

720

gcttcagtgc tggagttaac gcaataagca ctccgcctgg ggagtacggc cgcaaggctg

780

aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag

840

caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca tcgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctataa ctagttgcca

960

gcatggggac tctagttaga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1020

atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca cacgtgctac aatggatggc aacgagcagc

1080

gaactcgcga gggtaagcga atctctacca ttctcagttc ggatgtagtc tgcaacccga

1140

ctacagaagc cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcacg ccgcggtgaa tacgttcccg

1200

ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta acacccgaag ccggtgccta

1260

gggagccgtc gaaggtggga tagatgattg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtatcg

1320

gaaggtgc

1328

<210> 4

<211> 1533

<212> DNA

<213> Acetanaerobacterium elongatum

<400> 4

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgcgcc taacacatgc aagtcgagcg

60

gagtaatgtc taacacagag cggtgaagga tgattcactg ttgtgtgtta gatgttactt

120

agcggcggac gggtgagtaa cacgtgagca atctgccttt cagaggggga taacgtttgg

180

aaacgaacgc taataccgca tgatatacct aggtcgcatg accttggtat caaaggagca

240

atccgctgaa agatgagctc gcgtccgatt aggtagttgg tgaggtaacg gcccaccaag

300

cctgcgatcg gtagccggac tgagaggtcg atcggccaca ttgggactga gacacggccc

360

agactcctac gggaggcagc agtgggggat attgcacaat ggaggaaact ctgatgcagc

420

gacgccgcgt gagggaagaa ggtcttcgga ttgtaaacct ctgtcttcgg ggacgataat

480

gacggtaccc gaggaggaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

540

gtggcaagcg ttgtccggaa ttactgggtg taaagggagc gtaggcgggc tcgcaagttg

600

aatgttaaat ctaccggctc aaccggtaac cgcgttcaaa actgcgagtc ttgagtgtag

660

tagaggcagg cggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattagg aggaacacca

720

gtggcgaagg cggcctgctg ggcttttact gacgctgatg ctcgaaagca tggggagcaa

780

acaggattag ataccctggt agtccatgcc gtaaacgatg attactaggt gtggggggac

840

tgaccccttc cgtgccgcag ttaacacaat aagtaatcca cctggggagt acggccgcaa

900

ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagca gtggagtatg tggtttaatt

960

cgaagcaacg cgaagaacct taccaggtct tgacatcgca cgcattacct agagataggg

1020

aagcccttcg gggcgtgtag acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttacagtta gttgctacgc aagagcactc

1140

taacaggact gccgttgaca aaacggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc

1200

cttatgacct gggccacaca cgtactacaa tggccatcaa cagaggggtg caaagccgcg

1260

aggcagagca aatctcaaaa aatggtctca gttcggattg caggctgcaa ctcgcctgca

1320

tgaagccgga attgctagta atcgcgaatc agcatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac accatgagag ccggtaacac ccgaagcttg tagtctaacc

1440

gcaaggagga cgcaattgaa ggtggggctg gtaattgggg tgaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc tta

1533

<210> 5

<211> 1464

<212> DNA

<213> Acetivibrio cellulolyticus

<400> 5

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgagc ggagaatata gcaatatatt

60

cttagcggcg gacgggtgag taacgcgtgg gcaatctgcc tcatacaggg ggataacact

120

gggaaactag tgctaatacc gcataaaata gtgaagtggc atcactttac tatcaaagga

180

gcaatccggt gtgagatgag cccgcgtccg attagctagt tggtggggta acggcccacc

240

aaggcgacga tcggtagccg aactgagagg ttgatcggcc acattgggac tgagacacgg

300

cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcgc aatgggggaa accctgacgc

360

agcaacgccg cgtgaaggat gaaggttttc ggattgtaaa cttctttgat tggggacgat

420

aatgacggta cccaaaaaac aagccacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

taggtggcaa gcgttgtccg gatttactgg gtgtaaaggg cgtgtaggcg gggatgcaag

540

tcagatgtga aattcggggc tcaaccccgg cgctgcatct gaaactgtat ctcttgagtg

600

ctggagagga aagcggaatt cctagtgtag cggtgaaatg cgtagatatt aggaggaaca

660

ccagtggcga aggcggcttt ctggacagta actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag

720

cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atggatacta ggtgtaggag

780

gtatcgaccc cttctgtgcc ggagttaaca caataagtat cccacctggg gagtacggcc

840

gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcagtggag tatgtggttt

900

aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag ggcttgacat accattgacg tayctagaga

960

taggtatttc ttcgggacaa tggatacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1020

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctgt tgttagttgc catcattaag

1080

ttgggcactc tagcgagact gccggtgaca aatcggagga aggtggggac gacgtcaaat

1140

catcatgccc cttatgtcct gggctacaca cgtactacaa tggctattac agagggaagc

1200

gaagccgtga ggtggagcaa atctccaaaa atagtcccag ttcagattgt aggctgaaac

1260

tcgcctacat gaagtcggaa ttgctagtaa tggcaggtca gcatactgcc gtgaatacgt

1320

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgagagt ctgcaacacc cgaagtcagt

1380

agtctaactg taaagaggac gctgccgaag gtggggccga tgattggggt gaagtcgtaa

1440

caaggtagcc gtatcggaag gtgc

1464

<210> 6

<211> 1529

<212> DNA

<213> Acetivibrio ethanolgignens

<400> 6

tgatcctggc tcaggatgaa cgctggcggc gtgcttaaca catgcaagtc gaacgaagca

60

cttaaaacag attggaatag cttgctagga agagaagttt tatttgactg agtggcggac

120

gggtgagtaa cgcgtgggta acctgcctca cacaggggga taacagttag aaatgactgc

180

taataccgca taatatgcag cctcgcatga gactgctttg aaaactccgg tggtgtgaga

240

tgggcccgcg tctgattagc cagttggcag ggtaacggcc taccaaagcg acgatcagta

300

gccggcttga gagagtgaac ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg

360

aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcgac gccgcgtgag

420

tgaagaagta tttcggtatg taaagctcta tcagcaggga agataatgac ggtacctgac

480

taagaagccc cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggg gcaagcgtta

540

tccggattta ctgggtgtaa agggagcgta ggtggttcgg caagtctgat gtgaaagccc

600

ggggctcaac cccgggactg cattggaaac tgtcggactt gagtgctgga gaggtaagtg

660

gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag atattaggag gaacaccagt ggcgaaggcg

720

gcttactgga cagtaactga cactgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

780

accctggtag tccacgccgt aaacgatgaa tactaggtgt cggggcccat aagggcttcg

840

gtgccgcagc taacgcaata agtattccac ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc

900

aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc

960

gaagaacctt accaggtctt gacatcccga cgaccggccc gtaacggggt cctttcttcg

1020

gaacgtcggt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1080

agtcccgcaa cgagcgcaac ccctgttctt agtagccagc agttcggctg ggcactctag

1140

ggagactgcc agggataacc tggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt

1200

atgatctggg ctacacacgt gctacaatgg cgtaaacaaa gggaagcgac cctgtgaagg

1260

taagcaaatc tcaaaaataa cgtctcagtt cggattgtag tctgcaactc gactacatga

1320

agctggaatc gctagtaatc gcaaatcaga atgttgcggt gaatacgttc ccgggtcttg

1380

tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtcg gatatgcccg aagtcagtga cctaaccgca

1440

aggagggagc tgccgaaggt ggagccgatg actggggtga agtcgtaaca aggtagccgt

1500

atcggaaggt gcggctggat cacctcctt

1529

<210> 7

<211> 1480

<212> DNA

<213> Acetobacter aceti

<400> 7

gagtttgatt ctggctcaga gcgaacgctg gcggcatgct taacacatgc aagtcgcacg

60

aaggcttcgg ccttagtggc ggacgggtga gtaacgcgta ggaatctatc catgggtggg

120

ggataactcc gggaaactgg agctaatacc gcatgatacc tgagggtcaa aggcgcaagt

180

cgcctgtgga ggagtctgcg tttgattagc ttgttggtgg ggtaaaggcc taccaaggcg

240

atgatcaata gctggtctga gaggatgatc agccacactg ggactgagac acggcccaga

300

ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg ggcaaccctg atccagcaat

360

gccgcgtgtg tgaagaaggt tttcggattg taaagcactt tcggcgggga cgatgatgac

420

ggtacccgca gaagaagccc cggctaactt cgtgccagca gccgcggtaa tacgaagggg

480

gctagcgttg ctcggaatga ctgggcgtaa agggcgtgta ggcggtttgt acagtcagat

540

gtgaaatccc cgggcttaac ctgggagctg catttgatac gtgcagacta gagtatgaga

600

gagggttgtg gaattctcag tgtagaggtg aaattcgtag atattgggaa gaacaccggt

660

ggcgaaggcg gcaacctggc tcattactga cgctgaggcg cgaaagcgtg gggagcaaac

720

aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacgatgtg tgctggatgt tgggtaactt

780

agttactcag tgtcgtagct aacgcgataa gcacaccgcc tggggagtac ggccgcaagg

840

ttgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

900

aagcaacgcg cagaacctta ccagggcttg tatggagagg ctgtattcag agatggatat

960

ttcccgcaag ggacctcttg cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1020

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcttt agttgccagc atgtttgggt

1080

gggcactcta aagagactgc cggtgacaag ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtcc

1140

tcatggccct tatgtcctgg gctacacacg tgctacaatg gcggtgacag tgggaagcta

1200

gatggcgaca tcgtgccgat ctctaaaaac cgtctcagtt cggattgcac tctgcaactc

1260

gagtgcatga aggtggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc

1320

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg gtttgacctt aagccggtga

1380

gcgaaccgca aggacgcagc cgaccacggt cgggtcagcg actggggtga agtcgtaaca

1440

aggtagccgt aggggaacct gcggctggat cacctccttt

1480

<210> 8

<211> 1442

<212> DNA

<213> Acetobacter fabarum

<400> 8

agcgaacgct ggcggcatgc ttaacacatg caagtcgcac gaacctttcg gggttagtgg

60

cggacgggtg agtaacgcgt aggaatctgt ccacgggtgg gggataactc tgggaaactg

120

gagctaatac cgcatgatac ctgagggtca aaggcgcaag tcgcctgtgg aggagcctgc

180

gttcgattag ctagttggtg gggtaaaggc ctaccaaggc gatgatcgat agctggtttg

240

agaggatgat cagccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

300

tggggaatat tggacaatgg gggcaaccct gatccagcaa tgccgcgtgt gtgaagaagg

360

tcttcggatt gtaaagcact ttcgacgggg acgatgatga cggtacccgt agaagaagcc

420

ccggctaact tcgtgccagc agccgcggta atacgaaggg ggctagcgtt gctcggaatg

480

actgggcgta aagggcgtgt aggcggttta cacagtcaga tgtgaaatcc ccgggcttaa

540

cctgggagct gcatttgata cgtgtagact agagtgtgag agagggttgt ggaattccca

600

gtgtagaggt gaaattcgta gatattggga agaacaccgg tggcgaaggc ggcaacctgg

660

ctcattactg acgctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta

720

gtccacgctg taaacgatgt gtgctagatg ttgggtaact ttgttattca gtgtcgcagt

780

taacgcgtta agcacaccgc ctggggagta cggccgcaag gttgaaactc aaaggaattg

840

acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gcagaacctt

900

accagggctt gaatgtagag gctgtattca gagatggata tttcccgcaa gggacctcta

960

acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1020

acgagcgcaa cccctatctt tagttgccag catgtttggg tgggcactct agagagactg

1080

ccggtgacaa gccggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc ctcatggccc ttatgtcctg

1140

ggctacacac gtgctacaat ggcggtgaca gtgggaagct agatggtgac atcgtgctga

1200

tctctaaaag ccgtctcagt tcggattgca ctctgcaact cgagtgcatg aaggtggaat

1260

cgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1320

cccgtcacac catgggagtt ggtttgacct taagccggtg agcgaacccg caaggggcgc

1380

agccgaccac ggtcgggtca gcgactgggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtaggggaa

1440

cc

1442

<210> 9

<211> 1443

<212> DNA

<213> Acetobacter lovaniensis

<400> 9

tgagttttga tcctggctca gagcgaacgc tggcggcatg cttaacacat gcaagtcgca

60

cgaacctttc ggggttagtg gcggacgggt gagtaacgcg taggaatctg tccacgggtg

120

ggggataact ctgggaaact ggagctaata ccgcatgata cctgagggtc aaaggcgcaa

180

gtcgcctgtg gaggagcctg cgttcgatta gctagttggt ggggtaaagg cctaccaagg

240

cgatgatcga tagctggttt gagaggatga tcagccacac tgggactgag acacggccca

300

gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttggacaatg ggggcaaccc tgatccagca

360

atgccgcgtg tgtgaagaag gtcttcggat tgtaaagcac tttcgacggg gacgatgatg

420

acggtacccg tagaagaagc cccggctaac ttcgtgccag cagccgcggt aatacgaagg

480

gggctagcgt tgctcggaat gactgggcgt aaagggcgtg taggcggttt acacagtcag

540

atgtgaaatc cccgggctta acctgggagc tgcatttgat acgtgtagac tagagtgtga

600

gagagggttg tggaattccc agtgtagagg tgaaattcgt agatattggg aagaacaccg

660

gtggcgaagg cggcaacctg gctcatgact gacgctgagg cgcgaaagcg tggggagcaa

720

acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacgatg tgtgctagat gttgggtaac

780

tttgttattc agtgtcgcag ttaacgcgtt aagcacaccg cctggggagt acggccgcaa

840

ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

900

cgaagcaacg cgcagaacct taccagggct tgaatgtaga ggctgtattc agagatggat

960

atttcccgca agggacctct aacacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga

1020

gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctatct ttagttgcca gcatgtttgg

1080

gtgggcactc tagagagact gccggtgaca agccggagga aggtggggat gacgtcaagt

1140

cctcatggcc cttatgtcct gggctacaca cgtgctacaa tggcggtgac agtgggaagc

1200

tagatggtga catcatgctg atctctaaaa gccgtctcag ttcggattgc actctgcaac

1260

tcgagtgcat gaaggtggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt

1320

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt tggtttgacc ttaagccggt

1380

gagcgaaccc gcaaggggcg cagccgacca cggtcgggtc cagcgactgg ggtgaagtcg

1440

tac

1443

<210> 10

<211> 1442

<212> DNA

<213> Acetobacter malorum

<400> 10

agcgaacgct ggcggcatgc ttaacacatg caagtcgcac gaaggcttcg gccttagtgg

60

cggacgggtg agtaacgcgt aggaatctat ccacgggtgg gggataactc cgggaaactg

120

gagctaatac cgcatgatac ctgagggtca aaggcgcaag tcgcctgtgg aggagcctgc

180

gtttgattag cttgttggtg gggtaatggc ctaccaaggc gatgatcaat agctggtctg

240

agaggatgat cagccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

300

tggggaatat tggacaatgg gggcaaccct gatccagcaa tgccgcgtgt gtgaagaagg

360

ttttcggatt gtaaagcact ttcggcgggg acgatgatga cggtacccgc agaagaagcc

420

ccggctaact tcgtgccagc agccgcggta atacgaaggg ggctagcgtt gctcggaatg

480

actgggcgta aagggcgtgt aggcggtttg tacagttaga tgtgaaatcc ccgggcttaa

540

cctgggagct gcatttaata cgtgcagact agagtgtgag agagggttgt ggaattccca

600

gtgtagaggt gaaattcgta gatattggga agaacaccgg tggcgaaggc ggcaacctgg

660

ctcattactg acgctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta

720

gtccacgctg taaacgatgt gtgctggatg ttgggtaact tagttactca gtgtcgtagc

780

taacgcgata agcacaccgc ctggggagta cggccgcaag gttgaaactc aaaggaattg

840

acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gcagaacctt

900

accagggctt gtatgggtag gctgtgtcca gagatgggca tttcccgcaa gggacctacc

960

gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1020

acgagcgcaa cccctatctt tagttgccag catgtttggg tgggcactct agagagactg

1080

ccggtgacaa gccggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc ctcatggccc ttatgtcctg

1140

ggctacacac gtgctacaat ggcgatgaca atgggaagct agatggcgac atcgtgctga

1200

tctcaaaaag tcgtctcagt tcggattgca ctctgcaact cgagtgcatg aaggtggaat

1260

cgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1320

cccgtcacac catgggagtt ggtttgacct taagccggtg agcgaacccg caaggggcgc

1380

agccgaccac ggtcgggtca gcgactgggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtaggggaa

1440

cc

1442

<210> 11

<211> 1401

<212> DNA

<213> Acetobacter orientalis

<400> 11

tgagtttgat cctggctcag agcgaacgct ggcggcatgc ttaacacatg caagtcgcac

60

gaaggtttcg gccttagtgg cggacgggtg agtaacgcgt aggaatctat ccatgggtgg

120

gggataactc tgggaaactg gagctaatac cgcatgatac ctgagggtca aaggcgcgag

180

tcgcctgtgg aggagcctgc gtttgattag cttgttggtg gggtaatggc ctaccaaggc

240

gatgatcaat agctggtctg agaggatgat cagccacact gggactgaga cacggcccag

300

actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tggacaatgg gggcaaccct gatccagcaa

360

tgccgcgtgt gtgaagaagg ttttcggatt gtaaagcact ttcgacgggg acgatgatga

420

cggtacccgt agaagaagcc ccggctaact tcgtgccagc agccgcggta atacgaaggg

480

ggctagcgtt gctcggaatg actgggcgta aagggcgtgt aggcggtttg tacagtcaga

540

tgtgaaatcc ccgggcttaa cctgggagct gcatttgata cgtgcagact agagtgtgag

600

agagggttgt ggaattccca gtgtagaggt gaaattcgta gatattggga agaacaccgg

660

tggcgaaggc ggcaacctgg ctcataactg acgctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa

720

caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt gtgctagatg ttgggtaact

780

tagttattca gtgtcgcagt taacgcgtta agcacaccgc ctggggagta cggccgcaag

840

gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc

900

gaagcaacgc gcagaacctt accagggctt gtatgggtag gctgtgtcca gagatgggca

960

tttcccgcaa gggacctacc gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1020

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatctt tagttgccag catgtttggg

1080

tgggcactct agagagactg ccggtgacaa gccggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1140

ctcatggccc ttatgtcctg ggctacacac gtgctacaat ggcggtgaca gtgggaagct

1200

agatggcgac atcgtgctga tctctaaaaa ccgtctcagt tcggattgta ctctgcaact

1260

cgagtacatg aaggtggaat cgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg tgaatacgtt

1320

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtt ggtttgacct taagccggtg

1380

agcgaacccg caaggggcgc a

1401

<210> 12

<211> 1479

<212> DNA

<213> Acetobacter pasteurianus

<400> 12

gagtttgatt ctggctcaga gcgaacgctg gcggcatgct taacacatgc aagtcgcacg

60

aaggtttcgg ccttagtggc ggacgggtga gtaacgcgta ggtatctatc catgggtggg

120

ggataacact gggaaactgg tgctaatacc gcatgacacc tgagggtcaa aggcgcaagt

180

cgcctgtgga ggagcctgcg tttgattagc tagttggtgg ggtaaaggcc taccaaggcg

240

atgatcaata gctggtttga gaggatgatc agccacactg ggactgagac acggcccaga

300

ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg ggcaaccctg atccagcaat

360

gccgcgtgtg tgaagaaggt cttcggattg taaagcactt tcgacgggga cgatgatgac

420

ggtacccgta gaagaagccc cggctaactt cgtgccagca gccgcggtaa tacgaagggg

480

gctagcgttg ctcggaatga ctgggcgtaa agggcgtgta ggcggtttgt acagtcagat

540

gtgaaatccc cgggcttaac ctgggagctg catttgatac gtgcagacta gagtgtgaga

600

gagggttgtg gaattcccag tgtagaggtg aaattcgtag atattgggaa gaacaccggt

660

ggcgaaggcg gcaacctggc tcattactga cgctgaggcg cgaaagcgtg gggagcaaac

720

aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacgatgtg tgctagatgt tgggtgactt

780

agtcattcag tgtcgcactt aacgcgttaa gcacaccgcc tggggagtac ggccgcaagg

840

ttgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaaggcgt ggagcatgtg gtttaattcg

900

aagcaacgcg cagaacctta ccagggcttg aatgtagagg ctgcaagcag agatgtttgt

960

ttcccgcaag ggacctctaa cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1020

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctatcttt agttgccatc aggttgggct

1080

gggcactcta gagagactgc cggtgacaag ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtcc

1140

tcatggccct tatgtcctgg gctacacacg tgctacaatg gcggtgagag tgggaagcta

1200

ggtggtgaca ccatggtgat ctctaaaagc cgtctcagtt cggattgcac tctgcaactc

1260

gagtgcatga aggtggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc

1320

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg gtttgacctt aagccggtga

1380

gcgaaccgca aggacgcagc gaccacggtc gggtcagcga ctggggtgaa gtcgtaacaa

1440

ggtagccgta ggggaacctg cggctggatc acctccttt

1479

<210> 13

<211> 1440

<212> DNA

<213> Acetobacter pomorum

<400> 13

agcgaacgct ggcggcatgc ttaacacatg caagtcgcac gaaggtttcg gccttagtgg

60

cggacgggtg agtaacgcgt aggtatctat ccatgggtgg gggataacac tgggaaactg

120

gtgctaatac cgcatgacac ctgagggtca aaggcgcaag tcgcctgtgg aggagcctgc

180

gtttgattag ctagttggtg gggtaaaggc ctaccaaggc gatgatcaat agctggtttg

240

agaggatgat cagccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

300

tggggaatat tggacaatgg gggcaaccct gatccagcaa tgccgcgtgt gtgaagaagg

360

tcttcggatt gtaaagcact ttcgacgggg acgatgatga cggtacccgt agaagaagcc

420

ccggctaact tcgtgccagc agccgcggta atacgaaggg ggctagcgtt gctcggaatg

480

actgggcgta aagggcgtgt aggcggtttg tacagtcaga tgtgaaatcc ccgggcttaa

540

cctgggagct gcatttgata cgtgcagact agagtatgag agagggttgt ggaattccca

600

gtgtagaggt gaaattcgta gatattggga agaacaccgg tggcgaaggc ggcaacctgg

660

ctcattactg acgctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta

720

gtccacgctg taaacgatgt gtgctagatg ttgggtaact tagttattca gtgtcgcagt

780

taacgcgtta agcacaccgc ctggggagta cggccgcaag gttgaaactc aaaggaattg

840

acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gcagaacctt

900

accagggctt gaatgtagag gctgcaagca gagatgtttg tttcccgcaa gggacctcta

960

acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1020

acgagcgcaa cccctatctt tagttgccat caggttgggc tgggcactct agagagactg

1080

ccggtgacaa gccggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc ctcatggccc ttatgtcctg

1140

ggctacacac gtgctacaat ggcggtgaca gtgggaagct aggtggtgac accatgctga

1200

tctctaaaag ccgtctcagt tcggattgca ctctgcaact cgagtgcatg aaggtggaat

1260

cgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1320

cccgtcacac catgggagtt ggtttgacct taagccggtg agcgaaccgc aaggacgcag

1380

ccgaccacgg tcgggtcagc gactggggtg aagtcgtaac aaggtagccg taggggaacc

1440

<210> 14

<211> 1412

<212> DNA

<213> Acetobacter syzygii

<400> 14

agcgaacgct ggcggcatgc ttaacacatg caagtcgcac gaacctttcg gggttagtgg

60

cggacgggtg agtaacgcgt aggaatctgt ccatgggtgg gggataactc tgggaaactg

120

gagctaatac cgcatgatac ctgagggtca aaggcgcaag tcgcctgtgg aggagcctgc

180

gttcgattag ctagttggtg gggtaaaggc ctaccaaggc gatgatcgat agctggtttg

240

agaggatgat cagccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

300

tggggaatat tggacaatgg gggcaaccct gatccagcaa tgccgcgtgt gtgaagaagg

360

tcttcggatt gtaaagcact ttcgacgggg acgatgatga cggtacccgt agaagaagcc

420

ccggctaact tcgtgccagc agccgcggta atacgaaggg ggctagcgtt gctcggaatg

480

actgggcgta aagggcgtgt aggcggtttg tacagtcaga tgtgaaatcc ccgggcttaa

540

cctgggagct gcatttgata cgtacagact agagtgtgag agagggttgt ggaattccca

600

gtgtagaggt gaaattcgta gatattggga agaacaccgg tggcgaaggc ggcaacctgg

660

ctcattactg acgctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta

720

gtccacgctg taaacgatgt gtgctagatg ttgggtgact ttgtcattca gtgtcgcagt

780

taacgcgtta agcacaccgc ctggggagta cggccgcaag gttgaaactc aaaggaattg

840

acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gcagaacctt

900

accagggctt gaatgtagag gctgtattca gagatggata tttcccgcaa gggacctcta

960

acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1020

acgagcgcaa cccctatctt tagttgccag catgtttggg tgggcactct agagagactg

1080

ccggtgacaa gccggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc ctcatggccc ttatgtcctg

1140

ggctacacac gtgctacaat ggcggtgaca gtgggaagct agatggtgac atcgtgctga

1200

tctctaaaag ccgtctcagt tcggattgca ctctgcaact cgagtgcatg aaggtggaat

1260

cgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1320

cccgtcacac catgggagtt ggtttgacct taagccggtg agcgaacccg caaggggcgc

1380

agccgaccac ggtcgggtca gcgactgggg tg

1412

<210> 15

<211> 1443

<212> DNA

<213> Acetobacter tropicalis

<220>

<221> modified_base

<222> (9)..(9)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 15

tgagttganc tggctcagag cgaacgctgg cggcatgctt aacacatgca agtcgcacga

60

aggtttcggc cttagtggcg gacgggtgag taacgcgtag gaatctatcc atgggtgggg

120

gataactctg ggaaactgga gctaataccg catgatacct gagggtcaaa ggcgcaagtc

180

gcctgtggag gagcctgcgt tcgattagct tgttggtggg gtaatggcct accaaggcga

240

tgatcgatag ctggtctgag aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac

300

tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggg gcaaccctga tccagcaatg

360

ccgcgtgtgt gaagaaggtt ttcggattgt aaagcacttt cggcggggac gatgatgacg

420

gtacccgcag aagaagcccc ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgaaggggg

480

ctagcgttgc tcggaatgac tgggcgtaaa gggcgtgtag gcggtttgta cagtcagatg

540

tgaaatcccc gggcttaacc tgggagctgc atttgatacg tgcagactag agtgtgagag

600

agggttgtgg aattcccagt gtagaggtga aattcgtaga tattgggaag aacaccggtg

660

gcgaaggcgg caacctggct catgactgac gctgaggcgc gaaagcgtgg ggagcaaaca

720

ggattagata ccctggtagt ccacgctgta aacgatgtgt gctggatgtt gggcaactta

780

gttgttcagt gtcgtagcta acgcgataag cacaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt

840

tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga

900

agcaacgcgc agaaccttac cagggcttgt atgtgtaggc tgtgtccaga gatgggcatt

960

tcccgcaagg gacctacagc acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1020

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctatcttta gttgccagca tgtttgggtg

1080

ggcactctag agagactgcc ggtgacaagc cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcct

1140

catggccctt atgtcctggg ctacacacgt gctacaatgg cggtgacagt gggaagctag

1200

atggcgacat cgtgctgatc tctaaaagcc gtctcagttc ggattgcact ctgcaactcg

1260

agtgcatgaa ggtggaatcg ctagtaatcg cggatcaagc atgccgcggt gaatacgttc

1320

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg gtttgacctt aagccggtga

1380

gcgaacccag ctaatggggc gcagccgacc acggtcgggt cagcgactgg ggtgaagtcg

1440

tac

1443

<210> 16

<211> 1475

<212> DNA

<213> Acetobacteraceae bacterium AT-5844

<400> 16

agagtttgat cctggctcag agtgaacgct ggcggcatgc ttaacacatg caagtcgtgc

60

gccccgcaag gggagcggcg gacgggtgag taacacgtag gaatgtgtcc ggaggtgggg

120

gataaccctg ggaaactagg gctaataccg catatgggct gaggcccaaa gccgtgaggc

180

gccatcggag tagcctgcgc ctgattagct agttggtggg gtaaaggcct accaaggcga

240

cgatcagtag ctggtctgag aggacgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac

300

tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggc gcaagcctga tccagcaatg

360

ccgcgtgtgt gaagaaggtc ttcggatcgt aaagcacttt cggcggggac gatgatgacg

420

gtacccgcag aagaagcccc ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgaaggggg

480

ctagcgttac tcggaattac tgggcgtaaa gggcgcgtag gcggcgttcc aagttaggcg

540

tgaaagtcct gggctcaacc tgggaactgc gcttaagact ggagtgcttg aggatggaag

600

agggttgtgg aattcccagt gtagaggtga aattcgtaga tattgggaag aacaccggtg

660

gcgaaggcgg caacctggtc cattactgac gctgaggcgc gatagcgtgg ggagcaaaca

720

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgtgc gctggatgtt gggggtccta

780

gaccttcagt gtcgtagcta acgcgataag cgcaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt

840

tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga

900

agcaacgcgc agaaccttac cagctcttga catgggtagg accggtgcag agatgcactt

960

ttcccgcaag ggacctaccg cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1020

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac cctcgccttt agttgccagc atgtttgggt

1080

gggcactcta aaggaactgc cggtgacaag ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtcc

1140

tcatggccct tatgggctgg gctacacacg tgctacaatg gcggtgacaa cgggatgcca

1200

ggcagcgatg ccgagccgat cccaaaaagc cgtctcagtt cagattgcag cctgcaactc

1260

ggctgcatga aggtggaatc gctagtaatc gcggatcagc acgccgcggt gaatacgttc

1320

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg gttttacctt aagtcggtgc

1380

ggtaaccgca aggagctagc cgaccacggt aggatcagtg actggggtga agtcgtaaca

1440

aggtagccgt aggggaacct gcggctggat cacct

1475

<210> 17

<211> 1506

<212> DNA

<213> Acholeplasma laidlawii

<400> 17

tatatggaga gtttgatcct ggctcaggat gaacgctggc ggcgtgccta atacatgcaa

60

gtcgaacgaa gcatcttcgg atgcttagtg gcgaacgggt gagtaacacg tagataacct

120

acctttaact cgaggataac tccgggaaac tggagctaat actggatagg atgtgtgcat

180

gaaaaaaaca catttaaaga tttatcggtt taagaggggt ctgcggcgca ttagttagtt

240

ggtggggtaa aagcctacca agacgatgat gcgtagccgg actgagaggt ctaccggcca

300

cattgggact gagaacggcc caaactccta cgggaggcag cagtagggaa ttttcggcaa

360

tgggggaaac cctgaccgag caacgccgcg tgaacgacga agtacttcgg tatgtaaagt

420

tcttttatat gggaagaaaa attaaaaatt gacggtacca tatgaataag ccccggctaa

480

ctatgtgcca gcagccgcgg taatacatag ggggcgagcg ttatccggat ttactgggcg

540

taaagggtgc gtaggtggtt ataaaagttt gtggtgtaag tgcagtgctt aacgctgtga

600

ggctatgaaa actatataac tagagtgaga cagaggcaag tggaattcca tgtgtagcgg

660

taaaatgcgt aaatatatgg aggaacacca gtggcgaagg cggcttgctg ggtctatact

720

gacactgatg cacgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc

780

gtaaacgatg agaactaagt gttggccaaa aggtcagtgc tgcagttaac gcattaagtt

840

ctccgcctga gtagtacgta cgcaagtatg aaactcaaag gaattgacgg gaccccgcac

900

aagcggtgga tcatgttgtt taattcgaag atacacgaaa aaccttacca ggtcttgaca

960

tactctgcaa aggcttagaa ataagttcgg aggctaacag atgtacaggt ggtgcacggt

1020

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatt

1080

gctagttacc atcattaagt tggggactct agcgagactg ccagtgataa attggaggaa

1140

ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacaaac gtgatacaat

1200

ggctggaaca aagagaagcg atagggtgac ctggagcgaa actcacaaaa acagtctcag

1260

ttcggattgg agtctgcaac tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcaaatca

1320

gcatgttgcg gtgaatacgt tctcggggtt tgtacacacc gcccgtcaaa ccacgaaagt

1380

gggcaatacc caacgccggt ggcctaaccc gaaagggagg gagccgtcta aggtagggtc

1440

catgattggg gttaagtcgt aacaaggtat ccctacggga acgtggggat ggatcacctc

1500

ctttct

1506

<210> 18

<211> 1523

<212> DNA

<213> Achromobacter denitrificans

<220>

<221> modified_base

<222> (847)..(847)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1509)..(1509)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 18

agagtttgat catggctcag attgaacgct agcgggatgc cttacacatg caagtcgaac

60

ggcagcacgg acttcggtct ggtggcgagt ggcgaacggg tgagtaatgt atcggaacgt

120

gcccagtagc gggggataac tacgcgaagg cgtagctaat accgcatacg ccctacgggg

180

gaaagcaggg gatcgcaaga ccttgcacta ttggagcggc cgatatcgga ttagctagtt

240

ggtggggtaa cggctcacca aggcgacgat ccgtagctgg tttgagagga cgaccagcca

300

cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga attttggaca

360

atgggggaaa ccctgatcca gccatcccgc gtgtgcgatg aaggccttcg ggttgtaaag

420

cacttttggc aggaaagaaa cgtcgcgggt taataccccg gggaactgac ggtacctgca

480

gaataagcac cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggt gcaagcgtta

540

atcggaatta ctgggcgtaa agcgtgcgca ggcggttcgg aaagaaagat gtgaaatccc

600

agagcttaac tttggaactg catttttaac taccgggcta gagtgtgtca gagggaggtg

660

gaattccgcg tgtagcagtg aaatgcgtag atatgcggag gaacaccgat ggcgaaggca

720

gcctcctggg ataacactga cgctcatgca cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

780

accctggtag tccacgccct aaacgatgtc aactagctgt tggggccttc gggccttggt

840

agcgcancta acgcgtgaag ttgaccgcct ggggagtacg gtcgcaagat taaaactcaa

900

aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gatgatgtgg attaattcga tgcaacgcga

960

aaaaccttac ctacccttga catgtctgga atcctgaaga gatttaggag tgctcgcaag

1020

agaaccggaa cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1080

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcatt agttgctacg aaagggcact ctaatgagac

1140

tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaag tcctcatggc ccttatgggt

1200

agggcttcac acgtcataca atggtcggga cagagggtcg ccaacccgcg agggggagcc

1260

aatcccagaa acccgatcgt agtccggatc gcagtctgca actcgactgc gtgaagtcgg

1320

aatcgctagt aatcgcggat cagcatgtcg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccatggga gtgggtttta ccagaagtag ttagcctaac cgcaaggagg

1440

gcgattacca cggtaggatt catgactggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtatcgga

1500

aggtgcggnt ggatcacctc ctt

1523

<210> 19

<211> 1534

<212> DNA

<213> Achromobacter piechaudii

<400> 19

ttaaactgaa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgcta gcgggatgcc ttacacatgc

60

aagtcgaacg gcagcacgga cttcggtctg gtggcgagtg gcgaacgggt gagtaatgta

120

tcggaacgtg cctagtagcg ggggataact acgcgaaagc gtagctaata ccgcatacgc

180

cctacggggg aaagcagggg atcgtaagac cttgcactat tagagcggcc gatatcggat

240

tagctagttg gtggggtaat ggctcaccaa ggcgacgatc cgtagctggt ttgagaggac

300

gaccagccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

ttttggacaa tgggggaaac cctgatccag ccatcccgcg tgtgcgatga aggccttcgg

420

gttgtaaagc acttttggca ggaaagaaac gtcatgggct aataccccgt gaaactgacg

480

gtacctgcag aataagcacc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggtg

540

caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgtgcgcag gcggttcgga aagaaagatg

600

tgaaatccca gagcttaact ttggaactgc atttttaact accgagctag agtgtgtcag

660

agggaggtgg aattccgcgt gtagcagtga aatgcgtaga tatgcggagg aacaccgatg

720

gcgaaggcag cctcctggga taacactgac gctcatgcac gaaagcgtgg ggagcaaaca

780

ggattagata ccctggtagt ccacgcccta aacgatgtca actagctgtt ggggccttcg

840

ggccttggta gcgcagctaa cgcgtgaagt tgaccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt

900

aaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg atgatgtgga ttaattcgat

960

gcaacgcgaa aaaccttacc tacccttgac atgtctggaa ttccgaagag atttggaagt

1020

gctcgcaaga gaactggaac acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtcatta gttgctacga aagggcactc

1140

taatgagact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaagt cctcatggcc

1200

cttatgggta gggcttcaca cgtcatacaa tggtcgggac agagggtcgc caacccgcga

1260

gggggagcca atcccagaaa cccgatcgta gtccggatcg cagtctgcaa ctcgactgcg

1320

tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agcatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggtc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggttttac cagaagtagt tagcctaacc

1440

gcaagggggg cgattaccac ggtaggattc atgactgggg tgaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttc

1534

<210> 20

<211> 1534

<212> DNA

<213> Achromobacter xylosoxidans

<400> 20

ttaaactgaa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgcta gcgggatgcc ttacacatgc

60

aagtcgaacg gcagcacgga cttcggtctg gtggcgagtg gcgaacgggt gagtaatgta

120

tcggaacgtg cccagtagcg ggggataact acgcgaaagc gtagctaata ccgcatacgc

180

cctacggggg aaagcagggg atcgcaagac cttgcactat tggagcggcc gatatcggat

240

tagctagttg gtggggtaac ggctcaccaa ggcgacgatc cgtagctggt ttgagaggac

300

gaccagccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

ttttggacaa tgggggaaac cctgatccag ccatcccgcg tgtgcgatga aggccttcgg

420

gttgtaaagc acttttggca ggaaagaaac gtcgcgggtt aatacctcgc gaaactgacg

480

gtacctgcag aataagcacc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggtg

540

caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgtgcgcag gcggttcgga aagaaagatg

600

tgaaatccca gagcttaact ttggaactgc atttttaact accgggctag agtgtgtcag

660

agggaggtgg aattccgcgt gtagcagtga aatgcgtaga tatgcggagg aacaccgatg

720

gcgaaggcag cctcctggga taacactgac gctcatgcac gaaagcgtgg ggagcaaaca

780

ggattagata ccctggtagt ccacgcccta aacgatgtca actagctgtt ggggccttcg

840

ggccttggta gcgcagctaa cgcgtgaagt tgaccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt

900

aaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg atgatgtgga ttaattcgat

960

gcaacgcgaa aaaccttacc tacccttgac atgtctggaa tgccgaagag atttggcagt

1020

gctcgcaaga gagccggaac acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtcatta gttgctacga aagggcactc

1140

taatgagact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaagt cctcatggcc

1200

cttatgggta gggcttcaca cgtcatacaa tggtcgggac agagggtcgc caacccgcga

1260

gggggagcca atcccagaaa cccgatcgta gtccggatcg cagtctgcaa ctcgactgcg

1320

tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agcatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggtc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggttttac cagaagtagt tagcctaacc

1440

gcaagggggg cgattaccac ggtaggattc atgactgggg tgaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttc

1534

<210> 21

<211> 1545

<212> DNA

<213> Acidaminococcus fermentans

<400> 21

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggagaacttt cttcggaatg ttcttagtgg cgaacgggtg agtaacgcgt aggcaacctg

120

ccctctggtt ggggacaaca ttccgaaagg gatgctaata ccgaatgaga tcctctttcc

180

gcatggagag aggatgaaag atggcctcta cttgtaagct atcgccagaa gatgggcctg

240

cgtctgatta gcttgtaggt gaggtaacgg ctcacctagg cgatgatcag tagccggtct

300

gagaggatga acggccacat tgggactgag acacggccca aactcctacg ggaggcagca

360

gtggggaatc ttccgcaatg gacgaaagtc tgacggagca acgccgcgtg agtgatgaag

420

gccttcgggt tgtaaaactc tgttgtcagg gacgaaagca ccgatctata atacattttg

480

gtgttgacgg tacctgacga ggaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

540

cgtaggtggc aagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag agcatgtagg cgggctttta

600

agtccgacgt gaaaatgcgg ggcttaaccc cgtatggcgt tggatactgg aagtcttgag

660

tgcaggagag gaaaggggaa ttcccagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttgggaggaa

720

caccagtggc gaaggcgcct ttctggactg tgtctgacgc tgagatgcga aagccagggt

780

agcaaacggg attagatacc ccggtagtcc tggccgtaaa cgatgggtac taggtgtagg

840

aggtatcgac cccttctgtg ccggagttaa cgcaataagt accccgcctg gggactacga

900

tcgcaagatt gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agtatgtggt

960

ttaattcgac gcaacgcgaa gaaccttacc aaggcttgac attgagtgaa agacccagag

1020

atgggtcccc ttcttcggaa gcacgaaaac aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt

1080

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcctatgt taccagcacg

1140

taatggtggg gactcatagg agactgccag ggataacctg gaggaaggcg gggatgacgt

1200

caagtcatca tgccccttat gtcttgggct acacacgtac tacaatggtc ggcaacaaag

1260

ggcagcgaag ccgcgaggcg gagccaatcc cagaaacccg accccagttc ggatcgcagg

1320

ctgcaacccg cctgcgtgaa gttggaatcg ctagtaatcg caggtcagca tactgcggtg

1380

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cgaaagttgg taacacccga

1440

agccggtgag ataacctttt aggagtcagc tgtctaaggt ggggccgatg attggggtga

1500

agtcgtaaca aggtagccgt tcgagaacga gcggctggat cacct

1545

<210> 22

<211> 1489

<212> DNA

<213> Acidaminococcus intestini

<400> 22

ctggcggcgt gcttaacaca tgcaagtcga acggagaact tatttcggta agttcttagt

60

ggcgaacggg tgagtaacgc gtgggcaacc tgccctccag ttggggacaa cattccgaaa

120

gggatgctaa taccgaatgt cctccctcct ccgcatggag gagggaggaa agatggcctc

180

tgcttgcaag ctatcgctgg aagatgggcc cgcgtctgat tagctagttg gtggggtaac

240

ggctcaccaa ggcgatgatc agtagccggt ctgagaggat gaacggccac attgggactg

300

agacacggcc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa tcttccgcaa tggacgaaag

360

tctgacggag caacgccgcg tgagtgatga aggtcttcgg attgtaaaac tctgttgtta

420

gggacgaaag caccgtgttc gaacaggtca tggtgttgac ggtacctaac gaggaagcca

480

cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgttg tccggaatta

540

ttgggcgtaa agagcatgta ggcgggcttt taagtctgac gtgaaaatgc ggggcttaac

600

cccgtatggc gttggatact ggaagtcttg agtgcaggag aggaaagggg aattcccagt

660

gtagcggtga aatgcgtaga tattgggagg aacaccagtg gcgaaggcgc ctttctggac

720

tgtgtctgac gctgagatgc gaaagccagg gtagcaaacg ggattagata ccccggtagt

780

cctggccgta aacgatggat actaggtgta ggaggtatcg accccttctg tgccggagtt

840

aacgcaataa gtatcccgcc tggggactac gatcgcaaga ttgaaactca aaggaattga

900

cgggggcccg cacaagcggt ggagtatgtg gtttaattcg acgcaacgcg aagaacctta

960

ccaaggcttg acattgagtg aaagacctag agataggtcc ctcccttcgg ggacacgaaa

1020

acaggtggtg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

1080

gagcgcaacc cctatcctat gttaccagcg cgtaaaggcg gggactcata ggagactgcc

1140

agggataact tggaggaagg cggggatgac gtcaagtcat catgcccctt atgtcttggg

1200

ctacacacgt actacaatgg tcggcaacaa agggcagcga aaccgcgagg tggagcaaat

1260

cccagaaacc cgaccccagt tcggatcgta ggctgcaacc cgcctacgtg aagttggaat

1320

cgctagtaat cgcaggtcag catactgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1380

cccgtcacac cacgaaagtt ggtaacaccc gaagccggtg agataacctt ttaggagtca

1440

gctgtctaag gtggggccga tgattggggt gaagtcgtaa caaggtagc

1489

<210> 23

<211> 1556

<212> DNA

<213> Acidaminococcus sp. D21

<400> 23

ttggagagtt tgatcctggc tcaggacgaa cgctggcggc gtgcttaaca catgcaagtc

60

gaacggagaa cttatttcgg taagttctta gtggcgaacg ggtgagtaac gcgtgggcaa

120

cctgccctcc agttggggac aacattccga aagggatgct aataccgaat gtcctccctc

180

ctccgcatgg aggagggagg aaagatggcc tctgcttgca agctatcgct ggaagatggg

240

cccgcgtctg attagctagt tggtggggta acggctcacc aaggcgatga tcagtagccg

300

gtctgagagg atgaacggcc acattgggac tgagacacgg cccaaactcc tacgggaggc

360

agcagtgggg aatcttccgc aatggacgaa agtctgacgg agcaacgccg cgtgagtgat

420

gaaggtcttc ggattgtaaa actctgttgt tagggacgaa agcaccgtgt tcgaacaggt

480

catggtgttg acggtaccta acgaggaagc cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt

540

aatacgtagg tggcaagcgt tgtccggaat tattgggcgt aaagagcatg taggcgggct

600

tttaagtctg acgtgaaaat gcggggctta accccgtatg gcgttggata ctggaagtct

660

tgagtgcagg agaggaaagg ggaattccca gtgtagcggt gaaatgcgta gatattggga

720

ggaacaccag tggcgaaggc gcctttctgg actgtgtctg acgctgagat gcgaaagcca

780

gggtagcaaa cgggattaga taccccggta gtcctggccg taaacgatgg atactaggtg

840

taggaggtat cgaccccttc tgtgccggag ttaacgcaat aagtatcccg cctggggact

900

acgatcgcaa gattgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagtatg

960

tggtttaatt cgacgcaacg cgaagaacct taccaaggct tgacattgag tgaaagacct

1020

agagataggt ccctcccttc ggggacacga aaacaggtgg tgcatggctg tcgtcagctc

1080

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatcct atgttaccag

1140

cgcgtaaagg cggggactca taggagactg ccagggataa cttggaggaa ggcggggatg

1200

acgtcaagtc atcatgcccc ttatgtcttg ggctacacac gtactacaat ggtcggcaac

1260

aaagggcagc gaaaccgcga ggtggagcaa atcccagaaa cccgacccca gttcggatcg

1320

taggctgcaa cccgcctacg tgaagttgga atcgctagta atcgcaggtc agcatactgc

1380

ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgaaag ttggtaacac

1440

ccgaagccgg tgagataacc ttttaggagt cagctgtcta aggtggggcc gatgattggg

1500

gtgaagtcgt aacaaggtag ccgttcgaga acgagcggct ggatcacctc ctttct

1556

<210> 24

<211> 1451

<212> DNA

<213> Acidilobus saccharovorans

<400> 24

tccggttgat cctgccggac ccgactgcta tcggggtgag gctaagccat gggagtcgcg

60

cgcccagccg ccgctgggcg ggcgcacggc tgagtaacac gtagctaacc taccctcggg

120

acggggataa ccccgggaaa ctggggctaa tccccgatag gcgagggggc ctggaatggt

180

ccctcgccga aagggaccct ggggggttat cgcctggggt ccgcccgagg atggggctgc

240

ggcccatcat ggtagttggc ggggtaatgg cccgccaagc cgacgacggg taggggccgt

300

gggagcggga gcccccagat gggccctgag acaagggccc aggccctacg gggcgcacca

360

ggcgcgaaac ctccgcaatg cgggaaaccg tgacggggtc accccgagtg ctcccgtaag

420

ggagcttttc cccgctgcaa ggaggcgggg gaataagcgg ggggcaagtc tggtgtcagc

480

cgccgcggta ataccagccc cgcgagtggt cgggacgtct actgggccta aagcgcccgt

540

agccggcccc gtaagtccct cctgaaagcc ctgggctcaa cccagggagt gggggggata

600

ctgcggggct agggggcggg agaggccggg ggtaccccag gggtaggggc gaaatccgat

660

aatccctggg ggaccaccag tggcgaaagc gcccggctgg aacgcgcccg acggtgaggg

720

gcgaaagccg ggggagcgaa ccggattaga tacccgggta gtcccggctg taaacgatgc

780

gggctaggtg tcgggcgggc gttagagccc gcccggtgcc gcagggaagc cgttaagccc

840

gccgcctggg gagtacggcc gcaaggctga aactttaagg aattggcggg ggggcacaca

900

aggggtggag cctgcggctc aattggagtc aacgccggga acctcaccgg gggcgacagc

960

aggatgacgg ccaggctaac gaccttgccc gacgcgctga ggggaggtgc atggccgtcg

1020

ccagctcgtg ctgtgaagtg tcctgttaag tcaggcaacg agcgagaccc ccgcccctag

1080

ttgcgacccg gcgggagacc gttggggcac actaggggga ctgccgccgc taaggcggag

1140

gaaggagggg gccacggcag gtcagcatgc ccctaaaccc cgggttgcac gcgggctaca

1200

atggcgggra cagcgggatc cgaccccgaa agggggaggc aatccctcaa accccgccgt

1260

agtcgggatt gggggctgta actcgccccc atgaacctgg aatccctagt aaccgcgcgt

1320

caacatcgcg cggtgaatac gtccctgccc cttgtacaca ctgcccgtcg ctccacctga

1380

gagaaggagg ggtgaggctt cctccttcgg gagggagtcg aacccctcct tctcgagggg

1440

ggagaagtcg t

1451

<210> 25

<211> 1524

<212> DNA

<213> Acidithiobacillus ferrivorans

<400> 25

agagtttgat cctggctcag attgaacgct ggcggcatgc ctaacacatg caagtcgaac

60

ggtagcaggc cttcgggtgc tgacgagtgg cggacgggtg agtaatgcgt aggaatctgt

120

cttttagtgg gggacaaccc agggaaactt gggctaatac cgcatgagcc ctgaggggga

180

aagcggggga tcttcggacc tcgcgctaag agaagagcct acgtctgatt agctagttgg

240

tagggtaaag gcctaccaag gcgacgatca gtagctggtc tgagaggacg accagccaca

300

ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat ttttcgcaat

360

gggggcaacc ctgacgaagc aatgccgcgt ggatgaagaa ggccttcggg ttgtaaagtc

420

ctttcgtggg ggacgaaaag gtggttccta atacgagctg ctgttgacgt gaacccaaga

480

agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggggggtgc aagcgttaat

540

cggaatcact gggcgtaaag ggtgcgtagg cggtacgtta ggtctgtcgt gaaatccccg

600

ggctcaacct gggaatggcg gtagaaaccg gcgaactaga gtatgggaga gggtggtgga

660

attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga acatcagtgg cgaaggcggc

720

cacctggccc aatactgacg ctgaggcacg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac

780

cctggtagtc cacgccctaa acgatgaata ctagatgttt ggtacctagc gtactgagtg

840

tcgtagctaa cgcgataagt attccgcctg ggaagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa

900

ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gcaacgcgaa

960

gaaccttacc tgggcttgac atgtccggaa tcctgcagag atgcgggagt gcccttcggg

1020

gaatcggaac acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1080

gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtcctta gttgccagcg gttcggccgg gcactctagg

1140

gagactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcctc atggccttta

1200

tgtccagggc tacacacgtg ctacaatggc gcgtacagag ggacgccaaa ccgcgaggtg

1260

gagcagaccc cagaaagcgc gtcgtagttc ggattgcagt ctgcaactcg actgcatgaa

1320

gtcggaatcg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacca tgggagtaga ttgtaccaga agcggctagc ctaaccttcg

1440

ggagggcggt taccacggta tggtttatga ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1500

ggggaacctg cggctggatc acct

1524

<210> 26

<211> 1332

<212> DNA

<213> Acidovorax sp. 98-63833

<400> 26

tgagtttgat cctggctcag attgaacgct ggcggcatgc cttacacatg caagtcgaac

60

gagtggcgaa cgggtgagta atacatcgga acgtgcctag tagtggggga taactactcg

120

aaagagtggc taataccgca tgaggaaagg tgctactaga gcggccgatg gcagattagg

180

tagttggtgg gataaaagct taccaagcca acgatctgta gctggtctga gaggacgatc

240

agccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatttt

300

ggacaatggg cgaaagcctg atccagcaat gccgcgtgca ggatgaaggc cttcgggttg

360

taaactgctt ttgtacggaa cgatgacggt accgtaagaa taagcaccgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgca agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc

480

gtgcgcaggc ggttttgtaa gacagaggtg aaatccccgg gctcaacctg ggaactgcct

540

ttgtgactgc aaggctagag tacggcagag ggggatggaa ttccgcgtgt agcagtgaaa

600

tgcgtagata tgcggaggaa caccgatggc gaaggcaatc ccctgggcct actgacgctc

660

atgcacgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccctaaacg

720

atgtcaactg gttgttgggt actcagtaac gaagctaacg cgtgaagttg accgcctggg

780

gagtacggcc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggat

840

gatgtggttt aattcgatgc aacgcgaaaa accttaccca cctttgacat gcacaggtgc

900

tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccttgccat tagttgctac ggcactctaa tgggactgcc ggtgacaaac cggaggaagg

1020

tggggatgac gtcaagtcct catggccctt ataggtgggg ctacacacgt catacaatgg

1080

ctggcaaagg gttgccaacc cgcgaggggg agctaatccc atccagtcgt agtccggacg

1140

cagtctgcaa ctcgactgcg gaagtcggaa tcgctagtaa tcgtggatca gcatgtcacg

1200

gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagc gggtctcgcc

1260

agaagtaggt gcctagggcg cttaccacgg cggggttcgt gactggggtg aagtcgtaac

1320

aaggtagccg ta

1332

<210> 27

<211> 1539

<212> DNA

<213> Acinetobacter baumannii

<400> 27

tttaactgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgagcg ggggaaggta gcttgctacc ggacctagcg gcggacgggt gagtaatgct

120

taggaatctg cctattagtg ggggacaaca tctcgaaagg gatgctaata ccgcatacgt

180

cctacgggag aaagcagggg atcttcggac cttgcgctaa tagatgagcc taagtcggat

240

tagctagttg gtggggtaaa ggcctaccaa ggcgacgatc tgtagcgggt ctgagaggat

300

gatccgccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

tattggacaa tggggggaac cctgatccag ccatgccgcg tgtgtgaaga aggccttatg

420

gttgtaaagc actttaagcg aggaggaggc tactttagtt aatacctaga gatagtggac

480

gttactcgca gaataagcac cggctaactc tgtgccagca gccgcggtaa tacagagggt

540

gcgagcgtta atcggattta ctgggcgtaa agcgtgcgta ggcggcttat taagtcggat

600

gtgaaatccc cgagcttaac ttgggaattg cattcgatac tggtgagcta gagtatggga

660

gaggatggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccgat

720

ggcgaaggca gccatctggc ctaatactga cgctgaggta cgaaagcatg gggagcaaac

780

aggattagat accctggtag tccatgccgt aaacgatgtc tactagccgt tggggccttt

840

gaggctttag tggcgcagct aacgcgataa gtagaccgcc tggggagtac ggtcgcaaga

900

ctaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

960

atgcaacgcg aagaacctta cctggccttg acatactaga aactttccag agatggattg

1020

gtgccttcgg gaatctagat acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttttcctta cttgccagca tttcggatgg

1140

gaactttaag gatactgcca gtgacaaact ggaggaaggc ggggacgacg tcaagtcatc

1200

atggccctta cggccagggc tacacacgtg ctacaatggt cggtacaaag ggttgctaca

1260

cagcgatgtg atgctaatct caaaaagccg atcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg

1320

actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg cggatcagaa tgccgcggtg aatacgttcc

1380

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtttg ttgcaccaga agtagctagc

1440

ctaactgcaa agagggcggt taccacggtg tggccgatga ctggggtgaa gtcgtaacaa

1500

ggtagccgta ggggaacctg cggctggatc acctcctta

1539

<210> 28

<211> 1607

<212> DNA

<213> Acinetobacter calcoaceticus

<400> 28

cactactcac gcgttgggag ctctcccata tggtcgacct gcaggcggcc gcgaattcac

60

tagtgattag agtttgatta tggctcagat tgaacgctgg cggcaggctt aacacatgca

120

agtcgagcgg agtgatggtg cttgcactat cacttagcgg cggacgggtg agtaatgctt

180

aggaatctgc ctattagtgg gggacaacat ttcgaaagga atgctaatac cgcatacgtc

240

ctacgggaga aagcagggga tcttcggacc ttgcgctaat agatgagcct aagtcggatt

300

agctagttgg tggggtaaag gcctaccaag gcgacgatct gtagcgggtc tgagaggatg

360

atccgccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

420

attggacaat gggcgcaagc ctgatccagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttatgg

480

ttgtaaagca ctttaagcga ggaggaggct actgaagtta ataccttcag atagtggacg

540

ttactcgcag aataagcacc ggctaactct gtgccagcag ccgcggtaat acagagggtg

600

caagcgttaa tcggatttac tgggcgtaaa gcgcgcgtag gcggctaatt aagtcaaatg

660

tgaaatcccc gagcttaact tgggaattgc attcgatact ggttagctag agtgtgggag

720

aggatggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccgatg

780

gcgaaggcag ccatctggcc taacactgac gctgaggtgc gaaagcatgg ggagcaaaca

840

ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacgatgtct actagccgtt ggggcctttg

900

aggctttagt ggcgcagcta acgcgataag tagaccgcct ggggagtacg gtcgcaagac

960

taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga

1020

tgcaacgcga agaaccttac ctggccttga catagtaaga actttccaga gatggattgg

1080

tgccttcggg aacttacata caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

1140

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttttccttat ttgccagcga gtaatgtcgg

1200

gaactttaag gatactgcca gtgacaaact ggaggaaggc ggggacgacg tcaagtcatc

1260

atggccctta cggccagggc tacacacgtg ctacaatggt cggtacaaag ggttgctacc

1320

tagcgatagg atgctaatct caaaaagccg atcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg

1380

actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg cggatcagaa tgccgcggtg aatacgttca

1440

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtttg ttgcaccaga agtaggtagt

1500

ctaaccgcaa gggggacgct taccacggtg tggccgatga ctggggtgaa gtcgtaacaa

1560

ggtaaccgta aatcgaattc ccgcggccgc catggcggcc ggagctg

1607

<210> 29

<211> 1296

<212> DNA

<213> Acinetobacter genomosp. C1

<400> 29

attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgagc gagcggcgga cgggtgagta

60

atgcttagga atctgcctat tagtggggga caacattccg aaaggaatgc taataccgca

120

tacggaaagg cgctaataga tgagcctaag tcggattagc tagttggtgg ggtaaaggcc

180

taccaaggcg acgatctgta gcgggtctga gaggatgatc cgccacactg ggactgagac

240

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg cggaagcctg

300

atccagtcat gccgcgtgtg tgaggaaggc cttttggttg taaagcactt taagcgagga

360

ggaggacgtt actcgcagaa taagcaccgg ctaactctgt gccagcagcc gcggtaatac

420

agagggtgcg agcgttaatc ggatttactg ggcgtaaagc gtgcgtaggc ggctgattaa

480

gtcggatgtg aaatccctga gcttaactta ggaattgcat tcgatactgg tcagctagag

540

tatgggagag gatggtagaa ttccaggtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tctggaggaa

600

taccgatggc gaaggcagcc atctggccta actgacgctg aggtacgaaa gcatggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg atgtctacta gccgttgggg

720

ctttagtggc gcggctaacg cgataagtag accgcctggg gagtacggtc gcaagactaa

780

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

840

aacgcgaaga accttacctg gccttgacat atacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgccgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttttcct tacttgccag

960

catatgggaa ctttaaggat actgccagtg acaaactgga ggaaggcggg gacgacgtca

1020

agtcatcatg gcccttacgg ccagggctac acacgtgcta caatggtcgg caaagggttg

1080

ctacctagcg ataggatgct aatctcaacc gatcgtagtc cggatggagt ctgcaactcg

1140

actccagaag tcggaatcgc tagtaatcgc ggatcagaat gccgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtttgt tgcaccagaa gtaggtgtct

1260

aggacgctta ccacggtgtg gccgatgact ggggtg

1296

<210> 30

<211> 1540

<212> DNA

<213> Acinetobacter haemolyticus

<400> 30

ttaaactgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgagcg gggaagtgta gcttgctaca ttacctagcg gcggacgggt gagtaatgct

120

taggaatctg cctattagtg ggggacaaca ttccgaaagg aatgctaata ccgcatacgt

180

cctacgggag aaagcagggg atcttcggac cttgcgctaa tagatgagcc taagtcggat

240

tagctagttg gtggggtaaa ggcctaccaa ggcgacgatc tgtagcgggt ctgagaggat

300

gatccgccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

tattggacaa tgggcggaag cctgatccag ccatgccgcg tgtgtgaaga aggccttttg

420

gttgtaaagc actttaagcg aggaggaggc tactctagtt aatacctaga gatagtggac

480

gttactcgca gaataagcac cggctaactc tgtgccagca gccgcggtaa tacagagggt

540

gcgagcgtta atcggattta ctgggcgtaa agcgtgcgta ggcggctgat taagtcggat

600

gtgaaatccc tgagcttaac ttaggaattg cattcgatac tggtcagcta gagtatggga

660

gaggatggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccgat

720

ggcgaaggca gccatctggc ctaatactga cgctgaggta cgaaagcatg gggagcaaac

780

aggattagat accctggtag tccatgccgt aaacgatgtc tactagccgt tggggccttt

840

gaggctttag tggcgcagct aacgcgataa gtagaccgcc tggggagtac ggtcgcaaga

900

ctaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

960

atgcaacgcg aagaacctta cctggtcttg acatagtaag aactttccag agatggattg

1020

gtgccttcgg gaacttacat acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttttcctta tttgccagcg ggttaagccg

1140

ggaactttaa ggatactgcc agtgacaaac tggaggaagg cggggacgac gtcaagtcat

1200

catggccctt acgaccaggg ctacacacgt gctacaatgg tcggtacaaa gggttgctac

1260

ctagcgatag gatgctaatc tcaaaaagcc gatcgtagtc cggattggag tctgcaactc

1320

gactccatga agtcggaatc gctagtaatc gcggatcaga atgccgcggt gaatacgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttt gttgcaccag aagtaggtag

1440

tctaaccgta aggaggacgc ttaccacggt gtggccgatg actggggtga agtcgtaaca

1500

aggtagccgt aggggaacct gcggctggat cacctcctta

1540

<210> 31

<211> 1447

<212> DNA

<213> Acinetobacter johnsonii

<400> 31

cctagcggcg gacgggtgag taatgcttag gaatctgcct attagtgggg gacaacattc

60

cgaaaggaat gctaataccg catacgccct acgggggaaa gcaggggatc ttcggacctt

120

gcgctaatag atgagcctaa gtcagattag ctagttggtg gggtaaaggc ctaccaaggc

180

gacgatctgt agcgggtctg agaggatgat ccgccacact gggactgaga cacggcccag

240

actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tggacaatgg gcgaaagcct gatccagcca

300

tgccgcgtgt gtgaagaagg ccttttggtt gtaaagcact ttaagcgagg aggaggctac

360

ttagattaat actctaggat agtggacgtt actcgcagaa taagcaccgg ctaactctgt

420

gccagcagcc gcggtaatac agagggtgcg agcgttaatc ggatttactg ggcgtaaagc

480

gtgcgtaggc ggcttcttaa gtcggatgtg aaatccctga gcttaactta ggaattgcat

540

tcgatactgg gaagctagag tatgggagag gatggtagaa ttccaggtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagaga tctggaggaa taccgatggc gaaggcagcc atctggccta atactgacgc

660

tgaggtacga aagcatgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc atgccgtaaa

720

cgatgtctac tagccgttgg ggcctttgag gctttagtgg cgcagctaac gcgataagta

780

gaccgcctgg ggagtacggt cgcaagacta aaactcaaat gaattgacgg gggcccgcac

840

aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg caacgcgaag aaccttacct ggtcttgaca

900

tagtaagaac tttccagaga tggattggtg ccttcgggaa cttacataca ggtgctgcat

960

ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt

1020

ttccttattt gccagcgggt taagccggga actttaagga tactgccagt gacaaactgg

1080

aggaaggcgg ggacgacgtc aagtcatcat ggcccttacg accagggcta cacacgtgct

1140

acaatggtcg gtacaaaggg ttgctaccta gcgataggat gctaatctca aaaagccgat

1200

cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgcg

1260

gatcagaatg ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg

1320

ggaatttgtt gcaccagaag taggtagtct aaccgcaagg aggacgctta ccacggtgtg

1380

gccgatgact ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtagg ggaacctgcg gctggatcac

1440

ctcctta

1447

<210> 32

<211> 1537

<212> DNA

<213> Acinetobacter junii

<400> 32

aactgaagag tttgatcatg gctcagattg aacgctggcg gcaggcttaa cacatgcaag

60

tcgagcggag atgaggtgct tgcaccttat cttagcggcg gacgggtgag taatgcttag

120

gaatctgcct attagtgggg gacaacattc cgaaaggaat gctaataccg catacgtcct

180

acgggagaaa gcaggggatc ttcggacctt gcgctaatag atgagcctaa gtcggattag

240

ctagttggtg gggtaaaggc ctaccaaggc gacgatctgt agcgggtctg agaggatgat

300

ccgccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tggacaatgg ggggaaaccc tgatccagcc atgccgcgtg tgtgaagaag gccttatggt

420

tgtaaagcac tttaagcgag gaggaggcta ctgagactaa tactcttgga tagtggacgt

480

tactcgcaga ataagcaccg gctaactctg tgccagcagc cgcggtaata cagagggtgc

540

gagcgttaat cggatttact gggcgtaaag cgtgcgtagg cggcttttta agtcggatgt

600

gaaatccccg agcttaactt gggaattgca ttcgatactg ggaagctaga gtatgggaga

660

ggatggtaga attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga ataccgatgg

720

cgaaggcagc catctggcct aatactgacg ctgaggtacg aaagcatggg gagcaaacag

780

gattagatac cctggtagtc catgccgtaa acgatgtcta ctagccgttg gggcctttga

840

ggctttagtg gcgcagctaa cgcgataagt agaccgcctg gggagtacgg tcgcaagact

900

aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat

960

gcaacgcgaa gaaccttacc tggccttgac atactagaaa ctttccagag atggattggt

1020

gccttcggga atctagatac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

1080

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tttccttact tgccagcatt tcggatggga

1140

actttaagga tactgccagt gacaaactgg aggaaggcgg ggacgacgtc aagtcatcat

1200

ggcccttacg gccagggcta cacacgtgct acaatggtcg gtacaaaggg ttgctacaca

1260

gcgatgtgat gctaatctca aaaagccgat cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac

1320

tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgcg gatcagaatg ccgcggtgaa tacgttcccg

1380

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtttgtt gcaccagaag taggtagtct

1440

aaccgcaagg aggacgctta ccacggtgtg gccgatgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1500

tagccgtagg ggaacctgcg gctggatcac ctcctta

1537

<210> 33

<211> 1449

<212> DNA

<213> Acinetobacter lwoffii

<400> 33

gacctagcgg cggacgggtg agtaatgctt aggaatctgc ctattagtgg gggacaacat

60

ctcgaaaggg atgctaatac cgcatacgtc ctacgggaga aagcagggga ccttcgggcc

120

ttgcgctaat agatgagcct aagtcggatt agctagttgg tggggtaaag gcctaccaag

180

gcgacgatct gtagcgggtc tgagaggatg atccgccaca ctgggactga gacacggccc

240

agactcctac gggaggcagc agtggggaat attggacaat ggggggaacc ctgatccagc

300

catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttttgg ttgtaaagca ctttaagcga ggaggaggct

360

accgagatta atactcttgg atagtggacg ttactcgcag aataagcacc ggctaactct

420

gtgccagcag ccgcggtaat acagagggtg caagcgttaa tcggatttac tgggcgtaaa

480

gcgcgcgtag gtggccaatt aagtcaaatg tgaaatcccc gagcttaact tgggaattgc

540

attcgatact ggttggctag agtatgggag aggatggtag aattccaggt gtagcggtga

600

aatgcgtaga gatctggagg aataccgatg gcgaaggcag ccatctggcc taatactgac

660

actgaggtgc gaaagcatgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccatgccgta

720

aacgatgtct actagccgtt ggggcctttg aggctttagt ggcgcagcta acgcgataag

780

tagaccgcct ggggagtacg gtcgcaagac taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc

840

acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga tgcaacgcga agaaccttac ctggtcttga

900

catagtaaga actttccaga gatggattgg tgccttcggg aacttacata caggtgctgc

960

atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1020

ttttccttat ttgccagcgg gttaagccgg gaactttaag gatactgcca gtgacaaact

1080

ggaggaaggc ggggacgacg tcaagtcatc atggccctta cgaccagggc tacacacgtg

1140

ctacaatggt cggtacaaag ggttgctacc tcgcgagagg atgctaatct caaaaagccg

1200

atcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg

1260

cggatcagaa tgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca

1320

tgggagtttg ttgcaccaga agtaggtagt ctaaccttag gggggacgct taccacggtg

1380

tggcagatga ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta ggggaacctg cggctggatc

1440

acctcctta

1449

<210> 34

<211> 1517

<212> DNA

<213> Acinetobacter parvus

<400> 34

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgagc

60

ggggattggg tgcttgcacc taatcttagc ggcggacggg tgagtaatgc ttaggaatct

120

gccatttagt gggggacaac attccgaaag ggatgctaat accgcatacg ccctacgggg

180

gaaagcaggg gatcttcgga ccttgcgcta aatgatgagc ctaagtcgga ttagctagtt

240

ggtggggtaa aggcctacca aggcgacgat ctgtagcggg tctgagagga tgatccgcca

300

cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattggaca

360

atgggcggaa gcctgatcca gccatgccgc gtgtgtgaag aaggcctttt ggttgtaaag

420

cactttaagc gaggaggagg ctacctggat taatactcta ggatagtgga cgttactcgc

480

agaataagca ccggctaact ctgtgccagc agccgcggta atacagaggg tgcgagcgtt

540

aatcggattt actgggcgta aagcgtgcgt aggcggctga ttaagtcgga tgtgaaatcc

600

ctgagcttaa cttaggaatt gcattcgata ctggtcagct agagtatggg agaggatggt

660

agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccga tggcgaaggc

720

agccatctgg cctaatactg acgctgaggt acgaaagcat ggggagcaaa caggattaga

780

taccctggta gtccatgccg taaacgatgt ctactagccg ttggggcctt tgaggcttta

840

gtggcgcagc taacgcgata agtagaccgc ctggggagta cggtcgcaag actaaaactc

900

aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gatgcaacgc

960

gaagaacctt acctggcctt gacatagtag aaactttcca gagatggatt ggtgccttcg

1020

ggaatctaca tacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1080

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttttcctt acttgccagc atttcggatg ggaactttaa

1140

ggatactgcc agtgacaaac tggaggaagg cggggacgac gtcaagtcat catggccctt

1200

acggccaggg ctacacacgt gctacaatgg tcggtacaaa gggttgctac ctagcgatag

1260

gatgctaatc tcaaaaagcc gatcgtagtc cggattggag tctgcaactc gactccatga

1320

agtcggaatc gctagtaatc gcggatcaga atgccgcggt gaatacgttc ccgggccttg

1380

tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttt gttgcaccag aagtaggtag tctaacctta

1440

ggggggacgc ttaccacggt gtggccgatg actggggtga agtcgtaaca aggtagccgt

1500

aggggaacct gcggctg

1517

<210> 35

<211> 1539

<212> DNA

<213> Acinetobacter radioresistens

<400> 35

tttaactgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgagcg gatgaaggta gcttgctacc ggattcagcg gcggacgggt gagtaatgct

120

taggaatctg cctattagtg ggggacaacg ttccgaaagg agcgctaata ccgcatacgt

180

cctacgggag aaagcagggg acctttgggc cttgcgctaa tagatgagcc taagtcggat

240

tagctagttg gtagggtaaa ggcctaccaa ggcgacgatc tgtagcgggt ctgagaggat

300

gatccgccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

tattggacaa tggggggaac cctgatccag ccatgccgcg tgtgtgaaga aggccttttg

420

gttgtaaagc actttaagcg aggaggaggc tacctagatt aatactttag gatagtggac

480

gttactcgca gaataagcac cggctaactc tgtgccagca gccgcggtaa tacagagggt

540

gcgagcgtta atcggattta ctgggcgtaa agcgtgcgta ggcggccaat taagtcaaat

600

gtgaaatccc cgagcttaac ttgggaattg cattcgatac tggttggcta gagtatggga

660

gaggatggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccgat

720

ggcgaaggca gccatctggc ctaatactga cgctgaggta cgaaagcatg gggagcaaac

780

aggattagat accctggtag tccatgccgt aaacgatgtc tactagccgt tggggccctt

840

gaggctttag tggcgcagct aacgcgataa gtagaccgcc tggggagtac ggtcgcaaga

900

ctaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

960

atgcaacgcg aagaacctta cctggccttg acatacagag aactttccag agatggattg

1020

gtgccttcgg gaactctgat acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttttcctta tttgccagca cttcgggtgg

1140

gaactttaag gatactgcca gtgacaaact ggaggaaggc ggggacgacg tcaagtcatc

1200

atggccctta cggccagggc tacacacgtg ctacaatggt cggtacaaag ggttgctaca

1260

cagcgatgtg atgctaatct caaaaagccg atcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg

1320

actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg cggatcagaa tgccgcggtg aatacgttcc

1380

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtttg ttgcaccaga agtaggtagt

1440

ctaaccgcaa ggaggacgct taccacggtg tggccgatga ctggggtgaa gtcgtaacaa

1500

ggtagccgta ggggaacctg cggctggatc acctcctta

1539

<210> 36

<211> 1466

<212> DNA

<213> Acinetobacter schindleri

<400> 36

ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgagc ggggaaaggt accttgctac ctgacctagc

60

ggcggacggg tgagtaatgc ttaggaatct gcctattagt gggggacaac gttccgaaag

120

gaacgctaat accgcatacg ccctacgggg gaaagcaggg gatcttcgga ccttgcgcta

180

atagatgagc ctaagtcgga ttagctagtt ggtggggtaa aggcctacca aggcgacgat

240

ctgtagcggg tctgagagga tgatccgcca cactgggact gagacacggc ccagactcct

300

acgggaggca gcagtgggga atattggaca atgggcggaa gcctgatcca gccatgccgc

360

gtgtgtgaag aaggcctttt ggttgtaaag cactttaagc gaggaggagg ctcctttagt

420

taatacctaa agagagtgga cgttactcgc agaataagca ccggctaact ctgtgccagc

480

agccgcggta atacagaggg tgcgagcgtt aatcggattt actgggcgta aagcgtgcgt

540

aggcggcttt ttaagtcgga tgtgaaatcc ctgagcttaa cttaggaatt gcattcgata

600

ctggaaagct agagtatggg agaggatggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta

660

gagatctgga ggaataccga tggcgaaggc agccatctgg cctaatactg acgctgaggt

720

acgaaagcat ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccatgccg taaacgatgt

780

ctactagccg ttggggcctt tgaggcttta gtggcgcagc taacgcgata agtagaccgc

840

ctggggagta cggtcgcaag actaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg

900

tggagcatgt ggtttaattc gatgcaacgc gaagaacctt acctggcctt gacatactaa

960

gaactttcca gagatggatt ggtgccttcg ggaacttaga tacaggtgct gcatggctgt

1020

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttttcctt

1080

atttgccatc gggtaatgcc gggaacttta aggatactgc cagtgacaaa ctggaggaag

1140

gcggggacga cgtcaagtca tcatggccct tacggccagg gctacacacg tgctacaatg

1200

gtcggtacaa agggttgcta cctcgcgaga ggatgctaat ctcaaaaagc cgatcgtagt

1260

ccggatcgca gtctgcaact cgactgcgtg aagtcggaat cgctagtaat cgcggatcag

1320

aatgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtt

1380

tgttgcacca gaagtaggta gtctaaccgc aaggaggacg cttaccacgg tgtggccgat

1440

gactgggacg aagtcgtaac aaggta

1466

<210> 37

<211> 1291

<212> DNA

<213> Acinetobacter sp. 56A1

<400> 37

gcttgctact ggacctagcg gcggacgggt gagtaatgct taggaatctg cctattagtg

60

ggggacaaca tctcgaaagg gatgctaata ccgcatacgt cctacgggag aaagcagggg

120

atcttcggac cttgcgctaa tagatgagcc taagtcggat tagctagttg gtggggtaaa

180

ggcctaccaa ggcgacgatc tgtagcgggt ctgagaggat gatccgccac actgggactg

240

agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa tggggggaac

300

cctgatccag ccatgccgcg tgtgtggaag aaggccttat ggttgtaaag cactttaagc

360

gaggaggagg ctactttagt taatacctag agatagtgga cgttactcgc agaataagca

420

ccggctaact ctgtgccagc agccgcggta atacagaggg tgcgagcgtt aatcggattt

480

actgggcgta aagcgtgcgt aggcggctta ttaagtcgga tgtgaaatcc ccgagcttaa

540

cttgggaatt gcattcgata ctggtgagct agagtatggg agaggatggt agaattccag

600

gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccga tggcgaaggc agccatctgg

660

cctaatactg acgctgaggt acgaaagcat ggggagcaaa caggattaga taccctggta

720

gtccatgccg taaacgatgt ctactagccg ttggggcctt tgaggcttta gtggcgcagc

780

taacgcgata agtagaccgc ctggggagta cggtcgcaag actaaaactc aaatgaattg

840

acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gatgcaacgc gaagaacctt

900

acctggcctt gacatactag aaactttcca gagatggatt ggtgccttcg ggaatctaga

960

tacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1020

cgagcgcaac ccttttcctt acttgccagc atttcggatg ggaactttaa ggatactgcc

1080

agtgacaaac tggaggaagg cggggacgac gtcaagtcat catggccctt acggccaggg

1140

ctacacacgt gctacaatgg tcggtacaaa gggttgctac acagcgatgt gatgctaatc

1200

tcaaaaagcc gatcgtagtc cggattggag tctgcaactc gactccatga agtcggaatc

1260

gctagtaatc gcggatcaga atgccgcggt g

1291

<210> 38

<211> 1513

<212> DNA

<213> Acinetobacter sp. CIP 101934

<400> 38

ctcagattga acgctggcgg caggcttaac acatgcaagt cgagcgggga aggttgcttc

60

ggtaactgac ctagcggcgg acgggtgagt aatgcttagg aatctgccta ttagtggggg

120

acaacgttcc gaaaggaacg ctaataccgc atacgcccta cgggggaaag caggggatct

180

tcggaccttg cgctaataga tgagcctaag tcggattagc tagttggtgg ggtaaaggcc

240

taccaaggcg acgatctgta gcgggtctga gaggatgatc cgccacactg ggactgagac

300

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg cgcaagcctg

360

atccagccat gccgcgtgtg tgaagaaggc cttttggttg taaagcactt taagcgagga

420

ggaggctcct ttagttaata cctaaagtga gtggacgtta ctcgcagaat aagcaccggc

480

taactctgtg ccagcagccg cggtaataca gagggtgcga gcgttaatcg gatttactgg

540

gcgtaaagcg tgcgtaggcg gctttttaag tcggatgtga aatccctgag cttaacttag

600

gaattgcatt cgatactgga aagctagagt atgggagagg atggtagaat tccaggtgta

660

gcggtgaaat gcgtagagat ctggaggaat accgatggcg aaggcagcca tctggcctaa

720

tactgacgct gaggtacgaa agcatgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

780

tgccgtaaac gatgtctact agccgttggg gcctttgagg ctttagtggc gcagctaacg

840

cgataagtag accgcctggg gagtacggtc gcaagactaa aactcaaatg aattgacggg

900

ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg

960

gccttgacat actaagaact ttccagagat ggattggtgc cttcgggaac ttagatacag

1020

gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1080

gcaacccttt tccttatttg ccagcgggta atgccgggaa ctttaaggat actgccagtg

1140

acaaactgga ggaaggcggg gacgacgtca agtcatcatg gcccttacgg ccagggctac

1200

acacgtgcta caatggtcgg tacaaagggt tgctacctcg cgagaggatg ctaatctcaa

1260

aaagccgatc gtagtccgga tcgcagtctg caactcgact gcgtgaagtc ggaatcgcta

1320

gtaatcgcgg atcagaatgc cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

cacaccatgg gagtttgttg caccagaagt aggtagtcta accgcaagga ggacgcttac

1440

cacggtgtgg ccgatgactg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtaggg gaacctgcgg

1500

ttggatcacc tcc

1513

<210> 39

<211> 1494

<212> DNA

<213> Acinetobacter sp. CIP 102143

<400> 39

tggctcagat tgaacgctgg cggcaggctt aacacatgca agtcgagcgg ggattgggtg

60

cttgcaccta atcttagcgg cggacgggtg agtaatgctt aggaatctgc catttagtgg

120

gggacaacat tccgaaaggg atgctaatac cgcatacgcc ctacggggga aagcagggga

180

tcttcggacc ttgcgctaaa tgatgagcct aagtcggatt agctagttgg tggggtaaag

240

gcctaccaag gcgacgatct gtagcgggtc tgagaggatg atccgccaca ctgggactga

300

gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attggacaat ggggggaagc

360

ctgatccagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttttgg ttgtaaagca ctttaagcga

420

ggaggaggct acctggatta atactctagg atagtggacg ttactcgcag aataagcacc

480

ggctaactct gtgccagcag ccgcggtaat acagagggtg cgagcgttaa tcggatttac

540

tgggcgtaaa gcgtgcgtag gcggctgatt aagtcggatg tgaaatccct gagcttaact

600

taggaattgc attcgatact ggtcagctag agtatgggag aggatggtag aattccaggt

660

gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccgatg gcgaaggcag ccatctggcc

720

taatactgac gctgaggtac gaaagcatgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt

780

ccatgccgta aacgatgtct actagccgtt ggggcctttg aggctttagt ggcgcagcta

840

acgcgataag tagaccgcct ggggagtacg gtcgcaagac taaaactcaa atgaattgac

900

gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga tgcaacgcga agaaccttac

960

ctggccttga catagtagaa actttccaga gatggattgg tgccttcggg aatctacata

1020

caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc ttttccttac ttgccagcat ttcggatggg aactttaagg atactgccag

1140

tgacaaactg gaggaaggcg gggacgacgt caagtcatca tggcccttac ggccagggct

1200

acacacgtgc tacaatggtc ggtacaaagg gttgctacct agcgatagga tgctaatctc

1260

aaaaagccga tcgtagtccg gattggagtc tgcaactcga ctccatgaag tcggaatcgc

1320

tagtaatcgc ggatcagaat gccgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc

1380

gtcacaccat gggagtttgt tgcaccagaa gtaggtagtc taaccttagg ggggacgctt

1440

accacggtgt ggccgatgac tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtag ggga

1494

<210> 40

<211> 1465

<212> DNA

<213> Acinetobacter sp. CIP 53.82

<400> 40

acatgcaagt cgagcgggga tagggtgctt gcacctgatt cctagcggcg gacgggtgag

60

taaagcttag gaatctgcct attagtgggg gacaacattc cgaaagggat gctaataccg

120

catacgccct acgggggaaa gcaggggatc ttcggacctt gcgctaatag atgagcctaa

180

gtcggattag ctagttggtg gggtaaaggc ctaccaaggc gacgatctgt agcgggtctg

240

agaggatgat ccgccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

300

tggggaatat tggacaatgg ggggaaccct gatccagcca tgccgcgtgt gtgaagaagg

360

ccttttggtt gtaaagcact ttaagcgagg aggaggcgct ctaggataat accctagatg

420

cgtggacgtt actcgcagaa taagcaccgg ctaactctgt gccagcagcc gcggtaatac

480

agagggtgcg agcgttaatc ggatttactg ggcgtaaagc gcgcgtaggt ggctaattaa

540

gtcaaatgtg aaatccccga gcttaacttg ggaattgcat tcgatactgg ttagctagag

600

tatgggagag gatggtagaa ttccaggtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tctggaggaa

660

taccgatggc gaaggcagcc atctggccta atactgacac tgaggtgcga aagcatgggg

720

agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc atgccgtaaa cgatgtctac tagccgttgg

780

ggcctttgag gctttagtgg cgcagctaac gcgataagta gaccgcctgg ggagtacggt

840

cgcaagacta aaactcaaat gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

900

taattcgatg caacgcgaag aaccttacct ggccttgaca tacagagaac tttccagaga

960

tggattggtg ccttcgggaa ctctgataca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc

1020

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt ttccttactt gccagcattt

1080

cggatgggaa ctttaaggat actgccagtg acaaactgga ggaaggcggg gacgacgtca

1140

agtcatcatg gcccttacgg ccagggctac acacgtgcta caatggtcgg tacaaagggt

1200

tgctacacag cgatgtgatg ctaatctcaa aaagccgatc gtagtccgga ttggagtctg

1260

caactcgact ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagaatgc cgcggtgaat

1320

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtttgttg caccagaagt

1380

aggtagtcta accttaggga ggacgcttac cacggtgtgg ccgatgactg gggtgaagtc

1440

gtaacaaggt agccgtaggg gaacc

1465

<210> 41

<211> 1280

<212> DNA

<213> Acinetobacter sp. M16-22

<220>

<221> modified_base

<222> (489)..(489)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 41

cgagcggacg ggtgagtgat gcttgggagt ctgcctgtta gtgggggaca acttcttaca

60

ggggatgcta ataccgccca catcctaccg gagaaagcag gggatcttcc ttccttgctc

120

tagtagatga acctgcctcg gattaactag ttggtggggt aaaggcctac ccaggcgacc

180

atctatcccg ggtctgagag gatgatccac cacactggga ctgagacaca gcccagactc

240

ctaccggagg caggagtggg gaatatagga caatgggggg aaccctgatc catgcatgcc

300

gcgtgtgtga agaaggcctt atggttgtaa agcactttaa tcgaggagga ggctacttta

360

gttagtacct agagatagtg gacgttactc gcagaataag caccggctaa ctctgtgcca

420

ccagccgcgg taatacagag ggtgcgagcg ttaatcggat ttactgggcg taaagcgcgc

480

gcaggcggnt atcaagtcgg atgtgaaatc cccgagctca acttgggaat tgcattcgat

540

actggcgagc tagagtatgg gagaggaggg tagaattcca ggtgtagcgg tgaaatgcgt

600

agagatctgg aggaataccg atggcgaagg cagccatctg gcctaatact gacgctgagg

660

tacgaaagca tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccatgcc gtaaacgatg

720

tctactagcc ggtggtgcct ttgaggcgtt agttgcgcag ctaacgcgat aagtagaccg

780

cctggggagt acggtcgcaa gattaaaact caaatgaatt gacgggggcc cgcacaagcg

840

gtggagcatg tggtttaatt cgatgcaacg cgaagaacct tacctggcct tgacatacta

900

gaaactttcc agagatggat tggtgccttc gggaatttag atacaggtgc tgcatggctg

960

tcgtcagctc gtgttgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttttcct

1020

tacttgccag catttcggat gggaacttta aggatactgc cagtgacaaa ctggaggaag

1080

gcggggacga cgtcaagtca tcatggccct tacggccagg gctacacacg tgctacaatg

1140

gtcggtacaa agggatgcta cacagcgagg tcatgctaat ctcaaaaagc cgatcgtagt

1200

ccggattgga gtctgcaact cgactccatg aagtcggaat cgctagtaat cgcggatcag

1260

aatgccgcgg tgaatacgtt

1280

<210> 42

<211> 1540

<212> DNA

<213> Acinetobacter sp. RUH2624

<400> 42

tttaactgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgagcg ggggaaggta gcttgctacc ggacctagcg gcggacgggt gagtaatgct

120

taggaatctg cctattagtg ggggacaaca tctcgaaagg gatgctaata ccgcatacgt

180

cctacgggag aaagcagggg atcttcggac cttgcgctaa tagatgagcc taagtcggat

240

tagctagttg gtggggtaaa ggcctaccaa ggcgacgatc tgtagcgggt ctgagaggat

300

gatccgccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

tattggacaa tgggcgcaag cctgatccag ccatgccgcg tgtgtgaaga aggccttatg

420

gttgtaaagc actttaagcg aggaggaggc tactttagat aatacctaga gatagtggac

480

gttactcgca gaataagcac cggctaactc tgtgccagca gccgcggtaa tacagagggt

540

gcaagcgtta atcggattta ctgggcgtaa agcgcgcgta ggcggctaat taagtcaaat

600

gtgaaatccc cgagcttaac ttgggaattg cattcgatac tggttagcta gagtgtggga

660

gaggatggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccgat

720

ggcgaaggca gccatctggc ctaacactga cgctgaggtg cgaaagcatg gggagcaaac

780

aggattagat accctggtag tccatgccgt aaacgatgtc tactagccgt tggggccttt

840

gaggctttag tggcgcagct aacgcgataa gtagaccgcc tggggagtac ggtcgcaaga

900

ctaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

960

atgcaacgcg aagaacctta cctggccttg acatagtaag aactttccag agatggattg

1020

gtgccttcgg gaacttacat acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttttcctta tttgccagcg agtaatgtcg

1140

ggaactttaa ggatactgcc agtgacaaac tggaggaagg cggggacgac gtcaagtcat

1200

catggccctt acggccaggg ctacacacgt gctacaatgg tcggtacaaa gggttgctac

1260

acagcgatgt gatgctaatc tcaaaaagcc gatcgtagtc cggattggag tctgcaactc

1320

gactccatga agtcggaatc gctagtaatc gcggatcaga atgccgcggt gaatacgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttt gttgcaccag aagtagctag

1440

cctaactgca aagagggcgg ttaccacggt gtggccgatg actggggtga agtcgtaaca

1500

aggtagccgt aggggaacct gcggctggat cacctcctta

1540

<210> 43

<211> 1540

<212> DNA

<213> Acinetobacter sp. SH024

<400> 43

tttaactgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgagcg gagagaggta gcttgctact gatcttagcg gcggacgggt gagtaatgct

120

taggaatctg cctattagtg ggggacaaca tttcgaaagg aatgctaata ccgcatacgt

180

cctacgggag aaagcagggg atcttcggac cttgcgctaa tagatgagcc taagtcggat

240

tagctagttg gtggggtaaa ggcctaccaa ggcgacgatc tgtagcgggt ctgagaggat

300

gatccgccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

tattggacaa tgggcgcaag cctgatccag ccatgccgcg tgtgtgaaga aggccttatg

420

gttgtaaagc actttaagcg aggaggaggc tactttagat aatacctaga gatagtggac

480

gttactcgca gaataagcac cggctaactc tgtgccagca gccgcggtaa tacagagggt

540

gcaagcgtta atcggattta ctgggcgtaa agcgcgcgta ggcggctaat taagtcaaat

600

gtgaaatccc cgagcttaac ttgggaattg cattcgatac tggttagcta gagtgtggga

660

gaggatggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccgat

720

ggcgaaggca gccatctggc ctaacactga cgctgaggtg cgaaagcatg gggagcaaac

780

aggattagat accctggtag tccatgccgt aaacgatgtc tactagccgt tggggccttt

840

gaggctttag tggcgcagct aacgcgataa gtagaccgcc tggggagtac ggtcgcaaga

900

ctaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

960

atgcaacgcg aagaacctta cctggccttg acatagtaag aactttccag agatggattg

1020

gtgccttcgg gaacttacat acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttttcctta tttgccagcg agtaatgtcg

1140

ggaactttaa ggatactgcc agtgacaaac tggaggaagg cggggacgac gtcaagtcat

1200

catggccctt acggccaggg ctacacacgt gctacaatgg tcggtacaaa gggttgctac

1260

ctagcgatag gatgctaatc tcaaaaagcc gatcgtagtc cggattggag tctgcaactc

1320

gactccatga agtcggaatc gctagtaatc gcggatcaga atgccgcggt gaatacgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttt gttgcaccag aagtagctag

1440

cctaactgca aagagggcgg ttaccacggt gtggccgatg actggggtga agtcgtaaca

1500

aggtagccgt aggggaacct gcggctggat cacctcctta

1540

<210> 44

<211> 1362

<212> DNA

<213> Actinobacillus actinomycetemcomitans

<400> 44

attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcggac ggtagcagga gaaagcttgc

60

tttcttgctg acgagtggcg gacgggtgag taatgcttgg ggatctgtct tatggagggg

120

gataacgacg ggaaactgtc gctaataccg cgtagagtcg ggagacgaaa gtgcgggacc

180

ttagggccgc atgccatgag atgagcccaa gtgtgattag gtagttggtg gggtaaaggc

240

ctaccaagcc gacgatcgct agctggtctg agaggatggc cagccacacc gggactgaga

300

cacggcccgg actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcgcaatgg gggcaaccct

360

gacgcagcca tgccgcgtga atgaagaagg ccttcgggtt gtaaagttct ttcggtgatg

420

aggaaggttg gtgtgttaat agcatgccaa cttgacgtta aatacagaag aagcaccggc

480

taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gggggtgcta gcgttaatcg gaataactgg

540

gcgtaaaggg cacgtaggcg gacctttaag tgaggtgtga aatccccggg cttaacctgg

600

gaattgcatt tcatactggg ggtctggagt actttaggga ggggtagaat tccacgtgta

660

gcggtgaaat gcgtagagat gtggaggaat accgaaggcg aaggcagccc cttggggatg

720

tactgacgct gatgtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

780

cgctgtaaac ggtgtcgatt tggggattgg ggtttagccc tggtgcccga agctaacgtg

840

ataaatcgac cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg

900

cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctact

960

cttgacatcc gaagaagaac tcagagatgg gtttgtgcct tagggagctt tgagacaggt

1020

gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgttgtg aaatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc

1080

aacccttatc ctttgttgcc agcgattagg tcgggaactc aaaggagact gccggtgata

1140

aaccggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc cttacgagta gggctacaca

1200

cgtgctacaa tggcgtatac agagggtaac caaccagcga tggggagtga atctcagaaa

1260

gtgcgtctaa gttcggattg gagtctgcaa ctcgactcca tgaagtcgga atcgctagta

1320

atcgcgaatc agaatgttgc ggtgaatacg ttcccgggcc tt

1362

<210> 45

<211> 1542

<212> DNA

<213> Actinobacillus minor

<400> 45

gaattgaaga gtttgatcat ggctcagatt gaacgctggc ggcaggctta acacatgcaa

60

gtcgaacggt aacagggaga aagcttgctt tctttgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgcttggg aatctggctt atggaggggg ataactacgg gaaactgtag ctaataccgc

180

gtaatatctt cggattaaag ggtgggaccg taaggccacc tgccataaga tgagcccaag

240

tgggattagg tagttggtgg ggtaaaggcc taccaagccg acgatctcta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg gggaaccctg atgcagccat gccgcgtgaa tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagttctt tcggtgatga ggaaggcagg taagttaata gcttacttga

480

ttgacgttag tcacagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcgag cgttaatcgg aatgactggg cgtaaagggc acgcaggcgg tgacttaagt

600

gagatgtgaa agccccgggc ttaacctggg aattgcattt catactgggt cgctagagta

660

ttttagggag gggtagaatt ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaata

720

ccgaaggcga aggcagcccc ttgggaatat actgacgctc atgtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg ctgtcgattt ggggattggg

840

ctttgagctt ggtgcccgta gctaacgtga taaatcgacc gcctggggag tacggccgca

900

aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctactc ttgacatcca aagaagaact cagagatgag

1020

tttgtgcctt cgggaacttt gagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgttgtga

1080

aatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttatcc tttgttgcca gcggttaggc

1140

cgggaactca aaggagactg ccagtgataa actggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

atcatggccc ttacgagtag ggctacacac gtgctacaat ggcgtataca gagggaagca

1260

atatggcgac atggagcaaa tctcacaaag tacgtctaag tccggattgg agtctgcaac

1320

tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcaaatca gaatgttgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgtacc agaagtagat

1440

agcttaacgg aaacgggggc gtttaccacg gtatgattca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtaacc gtaggggaac ctgcggttgg atcacctcct ta

1542

<210> 46

<211> 1538

<212> DNA

<213> Actinobacillus pleuropneumoniae

<400> 46

gaattgaaga gtttgatcat ggctcagatt gaacgctggc ggcaggctta acacatgcaa

60

gtcgaacggt aacgggaagg gagcttgctt tctttgccga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgcttggg aatctggctt atggaggggg ataactacgg gaaactgtag ctaataccgc

180

gtaatatcta tggattaaag ggtgggactt tcgggccacc tgccataaga tgagcccaag

240

tgggattagg tagttggtta ggtaaaggct gaccaagccg acgatctcta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg ggggaacctg atgcagccat gccgcgtgaa tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagttctt tcggtagcga ggaaggtatc aaatttaata gatttggtaa

480

ttgacgttaa ctacagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcgag cgttaatcgg aataactggg cgtaaagggc acgcaggcgg tgtgattaag

600

tgagatgtga aagccccggg cttaacctgg gattgcatta catactggtc aactagagta

660

ctttagggag ggggagaatt ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaata

720

ccgaaggcga aggcagcccc ttgggaatgt actgacgctc atgtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg ctgtcgattt ggggattgga

840

ctgtgagtct ggtgcccgaa gctaacgtga taaatcgacc gcctggggag tacggccgca

900

aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctactc ttgacatcca tggaatcttg tagagatacg

1020

agagtgcctt cgggaaccat gagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgttgtga

1080

aatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttatcc tttgttgcca gcgattaggt

1140

cgggaactca aaggagactg ccggtgataa accggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

atcatggccc ttacgagtag ggctacacac gtgctacaat ggcgtataca gagggaagca

1260

agatggcgac atggagcaaa tctcacaaag tacgtctaag tccggattgg agtctgcaac

1320

tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcaaatca gaatgttgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgtacc agaagtagat

1440

agcttaaccg aaaggggggc gtttaccacg gtatgattca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtaacc gtaggggaac ctgcggttgg atcacctc

1538

<210> 47

<211> 1536

<212> DNA

<213> Actinobacillus succinogenes

<400> 47

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggtaacgggt ggaaagcttg ctttccatgc tgacgagtgg cggacgggtg agtaatgctt

120

ggggatctgg cttatggagg gggataacga cgggaaactg tcgctaatac cgcgtaatgt

180

ctaaggacta aagggtggga ttttcggacc gcccgccata agatgagccc aagtgggatt

240

aggtagttgg tggggtaaag gcctaccaag ccgacgatct ctagctggtc tgagaggatg

300

accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

360

attgcgcaat gggggcaacc ctgacgcagc catgccgcgt gaatgaagaa ggccttcggg

420

ttgtaaagtt ctttcggtgg tgaggaaggc gaataagtta acagcttatt cgattgacgt

480

tagccacaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc

540

gagcgttaat cggaataact gggcgtaaag ggcacgcagg cggctattta agtgagatgt

600

gaaatccccg ggcttaacct gggaactgca tttcagactg ggtagctaga gtactttagg

660

gaggggtaga attccacgtg tagcggtgaa atgcgtagag atgtggagga ataccgaagg

720

cgaaggcagc cccttgggaa cgtactgacg ctcatgtgcg aaagcgtggg gagcaaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgctgtaa acgctgtcga tttggggatt gggcgataag

840

cctggtgccc gaagctaacg tgataaatcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

900

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

960

aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat cctcagaatc cggtagagat atcggagtgc

1020

cttcgggaac tgagagacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta tcctttgttg ccagcatgta gagatgggaa

1140

ctcaaaggag actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg

1200

gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggcgta tacagaggga aacgagcctg

1260

cgagggggag tgaatctcag aaagtgcgtc gtagtccgga ttggagtctg caactcgact

1320

ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcga atcagcatgt cgcggtgaat acgttcccgg

1380

gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttg taccagaagt agatagctta

1440

accgaaaggg ggggcgttta ccacggtatg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1500

taaccgtagg ggaacctgcg gttggatcac ctcctt

1536

<210> 48

<211> 1543

<212> DNA

<213> Actinobacillus ureae

<400> 48

ttgaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacaggga ttagcttgct aatttgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgcttggg aatttggctc atggaggggg ataactacgg gaaactgtag ctaataccgc

180

gtaatatctt aggattaaag tgtgggaccg caaggccaca tgccatgaga tgagcccaag

240

tgggattagg tagttggtgg ggtaaaggcc taccaagccg acgatctcta gctggtctga

300

gaggatgatc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg ggggaccctg atgcagccat gccgcgtgaa tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagttctt tcggtagcga ggaaggtatc aaatttaata gatttggtaa

480

ttgacgttaa ctacagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcgag cgttaatcgg aataactggg cgtaaagggc acgcaggcgg ttgattaagt

600

gagatgtgaa agccctgggc ttaacctggg aattgcattt catactggtc aactagagta

660

ctttagggag gggtagaatt ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaata

720

ccgaaggcga aggcagcccc ttgggaatgt actgacgctc atgtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg ctgtcgattt ggggattggg

840

ctttgagctt ggtgcccgta gctaacgtga taaatcgacc gcctggggag tacggccgca

900

aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctactc ttgacatcca tggaatcttg tagagatacg

1020

agagtgcctt cgggaaccat gagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgttgtga

1080

aatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttatcc tttgttgcca gcgatttggt

1140

cgggaactca aaggagactg ccagtgataa actggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

atcatggccc ttacgagtag ggctacacac gtgctacaat ggcgtataca gagggaagca

1260

atatggcgac atggagcaaa tctcacaaag tacgtctaag tccggattgg agtctgcaac

1320

tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcaaatca gaatgttgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgtacc agaagtagat

1440

agcttaaccg caaggggggc gtttaccacg gtatgattca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtaacc gtaggggaac ctgcggttgg atcacctcct tac

1543

<210> 49

<211> 1500

<212> DNA

<213> Actinobaculum massiliae

<400> 49

agtttgatcc tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca agtcgaacgg

60

aaaggccctt ccttttttgg ttgggtgctc gagtggcgaa cgggtgagta ttacgtgagt

120

aacctgccct caactgtggg ataagcctgg gaaactgggt ctaatactgc atattcttct

180

ttcaccgcat ggtgggggtt ggaaagtttt ttcggttggg gatgggctcg cggcctatca

240

gcttgttggt ggggtgatgg cctaccaagg cggtgacggg tagccggcct gagagggtgg

300

tcggccacat tgggactgag atacggccca gactcctacg ggaggcagca gtgggggata

360

ttgcacaatg ggcgcaagcc tgatgcagcg acgccgcgtg agggatgaag gctttcgggt

420

tgtaaacctc tttcggtaca gaacaaggca cgttttttgc gtgtggaggg tatgtgcaga

480

agaagcgccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggcgc gagcgttgtc

540

cggaattatt gggcgtaaag ggctcgtagg cggcttgttg cgcctgctgt gaaaacgcgg

600

ggcttaactc cgcgcgtgca gtgggtacgg gcaggcttga gtgtggtagg ggtgactgga

660

attccrggtg tagcggtgga atgcgcagat atctggagga acaccgatgg cgaaggcagg

720

tcactgggcc attactgacg ctgaggagcg aaagcgtggg tagcgaacag gattagatac

780

cctggtagtc cacgctgtaa acgttgggaa ctaggtgtgg ggcccttttc cggggttctg

840

cgccgtagct aacgcattaa gttccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca

900

aaggaattga cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgcg gattaattcg atgcaacgcg

960

aagaacctta ccaaggcttg acatacaccg ggagcatgca gagatgtgtg tgcctttttg

1020

gctggtgtac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaaccct tgtctcgtgt tgccagcgcg ttatggtggg gactcacgag

1140

agactgccgg ggttaactcg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat

1200

gtcttgggct tcacgcatgc tacaatggcc ggtacagtgg gttgcgatac tgtgaggtgg

1260

agcgaatctc tgaaagccgg tctcagttcg gatcggggtc tgcaactcga cctcgtgaag

1320

tcggagtcgc tagtaatcgc ggatcagcat tgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcacgtca cgaaagttgg caacacccga agcccgtggc ctaacctttt

1440

ggggggagcg gtcgaaggtg gggttggcga ttgggacgaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1500

<210> 50

<211> 1487

<212> DNA

<213> Actinobaculum schaalii

<400> 50

ggttcaggac gaacgctggc ggcgtgctta acacatgcaa gtcgaacgat gaaacctagc

60

aatctttggt tgttgggtgg attagtggcg aacgggtgag taatacgtgg gtaacctgcc

120

ctcctttttg ggataagcct tggaaacggg gtctaatacc gaatattctg gatgattcgc

180

atggattgtt tgggaaagct tttgtgaagg gggatgggct cgcggcctat cagcttgttg

240

gtggggtgat ggcctaccaa ggcggtgacg ggtagccggc ctgagagggt gaccggccac

300

attgggactg agatacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggga tattgcacaa

360

tgggcgaaag cctgatgcag cgacgccgcg tgggggatga aggctttcgg gttgtaaacc

420

tctttcgcta tcgaacaagg ctcactatag ggtgggttga gggtaggtgg agaagaagcg

480

ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg cgcgagcgtt gtccggaatt

540

attgggcgta aagggcttgt aggcggcttg ttgcgcctgc tgtgaaaacg cggggcttaa

600

cttcgcgcgt gcagtgggta cgggcaggct tgagtgtggt aggggtgact ggaattccag

660

gtgtagcggt ggaatgcgca gatatctgga ggaacaccga tggcgaaggc aggtcactgg

720

gccattactg acgctgagga gcgaaagcat gggtagcgaa caggattaga taccctggta

780

gtccatgctg taaacgttgg gaactaggtg tggggggcct ttccaggttt tctgcgccgt

840

agctaacgca ttaagttccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cggcggagca tgcggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac

960

cttaccaagg cttgacatac accgcggggc tgcagagatg tggttgcatt tggttggtgg

1020

tgtacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1080

aacgagcgca acccttgtct cgtgttgcca gcatgttgtg gtggggactc acgagagact

1140

gccggggtta actcggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgtctt

1200

gggcttcacg catgctacaa tggccggtac agagggttgc gatatcgtaa ggtggagcka

1260

atcccttaaa gctggtctca gttcggatcg gggtctgcaa ctcgacctcg tgaagtcgga

1320

gtcgctagta atcgcggatc agcattgccg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1380

ccgcccgtca cgtcacgaaa gttggtaaca cccgtagctc gtggcctaac cattttatgt

1440

ggggggagcg gtcgaaggtg gggctggcga ttgggacgaa gtcgtaa

1487

<210> 51

<211> 1283

<212> DNA

<213> Actinobaculum sp. BM#101342

<400> 51

atggaaacgg ggtctaatac tggatattcc tgtctggtcg catggctggg tggggaaagt

60

tttttcggtg ggggatgggc tcgcggccta tcagcttgtt ggtggggtga tggcctacca

120

aggcgtcgac gggtagccgg cctgagaggg tgaccggcca cactgggact gagatacggc

180

ccagactcct acgggaggca gcagtggggg atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca

240

gcgacgccgc gtgggggatg acggctttcg ggttgtaaac ctctttcgtc gggggacaag

300

gctctgcttg gtggtggggt tgagggtacc cggtgaagaa gcgccggcta actacgtgcc

360

agcagccgcg gtaatacgta gggcgcgagc gttgtccgga attattgggc gtaaagggct

420

cgtaggcggc ttgtcgcgtc tgctgtgaaa atgcggggct taactccgta cgtgcagtgg

480

gtacgggcag gctagagtgc ggtaggggtg actggaattc ctggtgtagc ggtggaatgc

540

gcagatatca ggaggaacac cgatggcgaa ggcaggtcac tgggctgtta ctgacgctga

600

ggagcgaaag cgtggggagc gaacaggatt agataccctg gtagtccatg ctgtaaacgt

660

tgggaactag gtgtggggtt ctttccacgg attctgcgcc ggagctaacg cattaagttc

720

cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

780

agcggcggag catgcggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccaa ggcttgacat

840

acgctgggac ggtgcagaga tgtgctggct tttgctggtg tacaggtggt gcatggttgt

900

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtctcg

960

tgttgccagc aggttgggct ggggactcac gggagactgc cggggttaac tcggaggaag

1020

gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgtcttgg gcttcacgca tgctacaatg

1080

gccggtacag agggttgcga tatcgtgagg tggagcgaat cccttaaagt cggtctcagt

1140

tcggatcggg gtctgcaact cgaccccgtg aagtcggagt cgctagtaat cgcggatcag

1200

caacgccgcg gtgaatacgt tctcgggcct tgtacacacc gcccgtcacg tcacgaaagt

1260

tggcaacacc cgaagctcgt ggc

1283

<210> 52

<211> 1313

<212> DNA

<213> Actinobaculum sp. P2P_19 P1

<400> 52

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta

60

atacgtgagt aacctgccct cttctttggg ataagccttg gaaacggggt ctaatactgg

120

atattgaaag cggtggggga tgggctcgcg gcctatcagc ttgttggtgg ggtgatggcc

180

taccaaggcg tcgacgggta gccggcctga gagggtgacc ggccacactg ggactgagat

240

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt gggggatatt gcacaatggg cgcaagcctg

300

atgcagcgac gccgcgtggg ggatgacggc tttcgggttg taaacctctt tcgtcggggg

360

acatgagggt acccggtgaa gaagcgccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

420

gtagggcgcg agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaagg gctcgtaggc ggcttgtcgc

480

gtctgctgtg aaaatgcggg gcttaactcc gtacgtgcag tgggtacggg caggctagag

540

tgcggtaggg gtgactggaa ttcctggtgt agcggtggaa tgcgcagata tcaggaggaa

600

caccgatggc gaaggcaggt cactgggctg actgacgctg aggagcgaaa gcgtggggag

660

cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gctgtaaacg ttgggaacta ggtgtggggt

720

attctgcgcc ggagctaacg cattaagttc cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa

780

aactcaaagg gattgacggg ggcccgcaca agcggcggag catgcggatt aattcgatgc

840

aacgcgaaga accttaccaa ggcttgacat atacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtctc gtgttgccag

960

cagctgggga ctcacgggag actgccgggg ttaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

aatcatcatg ccccttatgt cttgggcttc acgcatgcta caatggccgg cagagggttg

1080

cgatatcgtg aggtggagcg aatccctttc ggtctcagtt cggacggggt ctgcaactcg

1140

accccggaag tcggagtcgc tagtaatcgc ggatcagcaa cgccgcggtg aatacgttct

1200

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca cgaaagttgg caacacccga agctcgtgcc

1260

tagggagcgg tcgaaggtgg ggttggcgat tgggacgaag tcgtaacaag gta

1313

<210> 53

<211> 1526

<212> DNA

<213> Actinomyces cardiffensis

<400> 53

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

atgatgcggt gcgtgcaccg ttgattagtg gcgaacgggt gagtaacacg tgagtaacct

120

gccctcttct ttgggataac ggtctgaaag ggctgctaat actgaatatt cacatgtctt

180

cgcatggggg tgtgtggaaa gagatgcttt tgggtgtttt tggtggggga tgggctcgcg

240

gcctatcagc ttgttggtgg ggtagtggcc taccaaggct ttgacgggta accggcctga

300

gagggtgacc ggtcacattg ggactgagat acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatttt gcacaatgga cgcaagtctg atgcagcgac gccgcgtgag ggatgtaggc

420

cttcgggttg tgaacctctt tcgctcatgg tcaagccgca gctttgggtt gtggtgaggg

480

tagtgggtaa agaagcgccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggcgc

540

gagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag ggcttgtagg cggttggtcg cgtctgccgt

600

gaaatcctct ggcttaactg ggggcgtgcg gtgggtacgg gctggcttga gtgcggtagg

660

ggagactgga attcctggtg tagcggtgga atgcgcagat atcaggagga acaccggtgg

720

cgaaggcggg tctctgggcc gttactgacg ctgaggagcg aaagcgtggg gagcgaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgctgtaa acgttgggca ctaggtgtgg gggccacccg

840

tggtttctgc gccgtagcta acgctttaag tgccccgcct ggggagtacg gccgcaaggc

900

taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggcg gagcatgcgg attaattcga

960

tgcaacgcga agaaccttac caaggcttga catgcgccct gacgctgcag agatgtggtg

1020

gcatttggtt gggggtgtac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

1080

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgccctatgt tgccagcacg ttgtggtggg

1140

gactcgtggg ggactgccgg ggttaactcg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca

1200

tgccccttat gtcttgggct tcacgcatgc tacaatggct ggtacagagg gttgcgatgt

1260

cgtaaggcgg agcgaatccc ttaaagctgg tctcagttcg gattggggtc tgcaactcga

1320

ccccatgaag gtggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttct

1380

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca cgaaagttgg taacacccga agctcatggc

1440

ctaaccggtt tgtctggggg gagtggtcga aggtgggatt ggcgattggg acgaagtcgt

1500

aacaaggtag ccgtaccgga aggtgc

1526

<210> 54

<211> 1410

<212> DNA

<213> Actinomyces europaeus

<220>

<221> modified_base

<222> (318)..(318)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (325)..(325)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 54

cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gggatccaaa

60

ggctttttgt ttttggtgag agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgagta acctgccccc

120

ttcttttgga taaccgcatg aaagtgtggc taatacagga tattccaggc tggtcgcatg

180

attggtttgg gaaatggttt ggtctggtgg gggatgggct cgcggcctat cagcttgttg

240

gtggggtgat ggcctaccaa ggcggtgacg ggtagccggc ctgagagggt gggcggtcac

300

actgggactg agatacgncc cagantccta cgggaggcag cagtggggga ttttgcacaa

360

tgggcgcaag cctgatgcag cgacgccgcg tgagggatga aggccttcgg gttgtaaacc

420

tctttcgctg ggttgaaagg ccatgctttg ggtgtggttg atttgaactg gtaaagaagt

480

accggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gtactagcgt tgtccggatt

540

tattgggcgt aaagggcttg taggtggttt gtcgcgtctg tcgtgaaatc ctgtggctta

600

accatgggct tgcggtgggt acgggcaggc ttgagtgcgg taggggagac tggaattcct

660

ggtgtagcgg tggaatgcgc agatatcagg aggaacaccg gtggcgaagg cgggtctctg

720

ggccgttact gacactgagg agcgaaagcg tggggagcga acaggattag ataccctggt

780

agtccatgct gtaaacgttg ggcactaggt gtgggggccg tgtggtttct gcgccgtagc

840

taacgcatta agtgtcccgc ctggggagta cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg

900

acggggaccc gcacaagcgg cggagcatgc ggattaattc gatgcaacgc gaagaacctt

960

accaaggctt gacatgcacc ggtacagtgt agagatatgc tggccttttt ggctggtgtg

1020

caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc ttgtctcgtg ttgccagcat ttggttgggg actctcgaga gactgccggg

1140

gttaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg tcttgggctt

1200

cacgcatgct acaatggatg gtacagaggg ttgcgatact gtgaggtgga gctaatccct

1260

taaagctgtt ctcagttcgg atcgtagtct gcaactcgac tacgtgaagg tggagtcgct

1320

agtaatcgca gatcagcaac gctgcggtga atacgttctc gggtcttgta cacaccgccc

1380

gtcacgtcac gaaagttggt aacacccgaa

1410

<210> 55

<211> 1503

<212> DNA

<213> Actinomyces funkei

<400> 55

atcatggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcttaacaca tgcaagtcga acggactggc

60

cttgagcttg cttggggttg gtgagtggcg aacgggtgag taacacgtga gtaacctgcc

120

ctcttctttg ggataacggt cggaaacggc tgctaatact ggatattcac tcattggcgc

180

atgttggtgg gtggaaagat gcacttttgg tgtttttggt gggggatggg ctcgcggcct

240

atcagcttgt tggtggggtg atggcctacc aaggctttga cgggtaaccg gcctgagagg

300

gtgaccggtc acattgggac tgagatacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

360

aattttgcac aatgggcgca agcctgatgc agcgacgccg cgtgagggat ggaggccttc

420

gggttgtgaa cctctttcgc tcatggtcaa gccgcgactt tgggttgtgg tgagggtagt

480

gggtaaagaa gcgccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggcgcgagc

540

gttgtccgga attattgggc gtaaagggct tgtaggcggt tggtcgcgtc tgccgtgaaa

600

tcctctggct taactggggg cgtgcggtgg gtacgggtcg acttgagtgc ggtaggggag

660

actggaattc ctggtgtagc ggtggaatgc gcagatatca ggaggaacac cggtggcgaa

720

ggcgggtctc tgggccgtta ctgacgctga ggagcgaaag cgtggggagc gaacaggatt

780

agataccctg gtagtccacg ctgtaaacgt tgggcactag gtgtgggggc cacccgtggt

840

ttctgcgccg tagctaacgc tttaagtgcc ccgcctgggg agtacggccg caaggctaaa

900

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggcggagc atgcggatta attcgatgca

960

acgcgaagaa ccttaccaag gcttgacatg catcctgagc cttcagagat ggaggtgcat

1020

ttggttgggg gtgtgcaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg

1080

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgcc ctatgttgcc agcacgttgt ggtggggact

1140

cgtgggggac tgccggggtt aactcggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc

1200

ccttatgtct tgggcttcac gcatgctaca atggctggta cagagggttg cgatgctgtg

1260

aggcggagcg aatcccttaa agccggtctc agttcggatt ggggtctgca actcgacccc

1320

atgaaggtgg agtcgctagt aatcgcagat cagcaacgct gcggtgaata cgttctcggg

1380

ccttgtacac accgcccgtc acgtcacgaa agttggtaac acccgaagct catggcctaa

1440

ccgccttttt ggtgggggga gtggtcgaag gtgggattgg cgattgggac gaagtcgtaa

1500

caa

1503

<210> 56

<211> 1326

<212> DNA

<213> Actinomyces genomosp. C1

<400> 56

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta

60

tcacgtgagt aacctgccct tcggtcctgg ataaccgctt gaaagggcgg ctaatacggg

120

gtggtgatag tcggcggggg atgggctcgc ggcctatcag cttgttggtg gggtgatggc

180

ctaccaaggc ggtgacgggt agccggcctg agagggtggg cggccacact gggactgaga

240

tacggcccag actcctgcgg gaggcagcag tggggggtat tgcacaatgg gcggaagcct

300

gatgcagcga cgtcgcgtga gggatggagg ccttcgggtt gtgaacctct gtttccggtg

360

gtgatgacgg tagccgggga tgaagcgccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtagggcgc gagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag ggcttgtagg cggctggtcg

480

cgtctgccgt gaaattctcc ggctcaaccg ggggcttgcg gtgggtacgg gccagctgga

540

gtgcggtagg ggaggctgga actcctggtg tagcggtgga atgcgcagat atcaggagga

600

acaccggtgg cgaaggcggg tctctgggcc gactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga

660

gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gttgggcact aggtgtgggc

720

cggtccgcgc cgcagctaac gcattaagtg ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcgacgga gcatgcggat taattcgatg

840

caacgcgaag aaccttacca gggcttgaca tgtgcaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctgtcc cgtgttgcca

960

gcgcgcgggg actctcggga gactgccggg gtcaactcgg aggagggtgg ggacgacgtc

1020

aaatcatcat gcccctgacg tcctgggctt cacgcatgct acaatggccg gcagagggtt

1080

gcgatgccgt gaggcggggc gaatcccttc cggtctcagt tcggacggtg tctgcaactc

1140

gacaccggaa gtcggagtcg ctagtaatcg cagatcagca ttgctgcggt gaatacgttc

1200

tcgggccttg tacacaccgc ccgtcacgtc atgaaagtcg gtgacgcccg aagcccgtgc

1260

gagcggtcga aggcggggcc ggtgattggg acgaagtcgt aacaaggtag ccgtaccgga

1320

aggtgc

1326

<210> 57

<211> 1331

<212> DNA

<213> Actinomyces genomosp. C2

<400> 57

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg yaagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta

60

acacgtgagt aacctgcccc cttctttggg ataacgcccg gaaacgggtg ctaatactgg

120

atattgaaag ctggtggggg atgggctcgc ggcctatcag cttgttggtg gggtgatggc

180

ctaccaaggc tttgacgggt agccggcctg agagggtgac cggtcacatt gggactgaga

240

tacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct

300

gatgcagcga cgccgcgtga gggatggagg ccttcgggtt gtgaacctct ttcgctcatg

360

gtcatgaggg tagtgggtaa agaagcgccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtagggcgc gagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag ggcttgtagg cggttggtcg

480

cgtctgccgt gaaatcctct ggcttaactg ggggcgtgcg gtgggtacgg gctgacttga

540

gtgcggtagg ggagactgga actcctggtg tagcggtgga atgcgcagat atcaggaaga

600

acaccggtgg cgaaggcggg tctctgggcc gactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga

660

gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgctgtaaac gttgggcact aggtgtgggg

720

gtttctgcgc cgtagctaac gctttaagtg ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga gcatgcggat taattcgatg

840

caacgcgaag aaccttacca aggcttgaca tgtgcaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgccc tatgttgcca

960

gcacgtgggg actcgtgggg gactgccggg gttaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1020

aaatcatcat gccccttatg tcttgggctt cacgcatgct acaatggttg gcagagggtt

1080

gcgatactgt gaggtggagc gaatcccttc cagtctcagt tcggatgggg tctgcaactc

1140

gaccccagaa ggtggagtcg ctagtaatcg cagatcagca acgctgcggt gaatacgttc

1200

tcgggccttg tacacaccgc ccgtcacgtc acgaaagttg gtaacacccg aagcccatgc

1260

ctagggagtg gtcgaaggtg ggattggcga ttgggacgaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1320

ccggaaggtg c

1331

<210> 58

<211> 1290

<212> DNA

<213> Actinomyces genomosp. P1 oral clone MB6_C03

<400> 58

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta

60

tcacgtgagt aacctgccct cctctcctgg ataaccgctt gagagggcgg ctaatacggg

120

gtggtgatag tcggtggggg atgggctcgc ggcctatcag cttgttggtg gggtgatggc

180

ccaccaaggc ggtgacgggt agccggcctg agagggtggg cggccacact gggactgaga

240

cacggcccag actcctgcgg gaggcagcag tggggggtat tgcacaatgg gcggaagcct

300

gatgcagcga cgtcgcgtga gggatggagg ccttcgggtt gtgaacctct gttcccggtg

360

gtgatgacgg tagccgggta tgaagcgccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtagggccc aagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag ggcttgtagg cggccggccg

480

cgtccgtcgt gaaatcctcc ggctcaaccg ggggcttgcg gtgggtacgg gtcggctgga

540

gtgcggcagg ggaggctgga actcctggtg tagcggtgga atgcgcagat atcaggagga

600

acaccggtgg cgaaggcggg tctctgggcc gactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga

660

gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gttgggcact aggtgtgggg

720

cgctccgcgc cgtagctaac gcattaagtg ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga gcatgcggat taattcgatg

840

caacgcgaag aaccttacca gggcttgaca tgcgcaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctgtcc cgtgttgcca

960

gcgcgcgggg actctcggga gactgccggg gtcaactcgg aggagggtgg ggacgacgtc

1020

aaatcatcat gcccctgacg tcctgggctt cacgcatgct acaatggccg gcagagggtt

1080

gcgatgccgc gaggcggggc gaatcccttc cggtctcagt tcggacggtg tctgcaactc

1140

gacaccggaa gtcggagtcg ccagtaatcg cagatcagca ctgctgcggt gaatacgttc

1200

tcgggccttg tacacaccgc ccgtcacgtc atgaaagtcg gcgacgcccg aagcccgtgc

1260

gagcggtcga aggcggggcc ggtgattggg

1290

<210> 59

<211> 1427

<212> DNA

<213> Actinomyces georgiae

<400> 59

acacatgcag tcgaacgctg aagcctggct ttgtgttggg tggatgagtg gcgaacgggt

60

gagtaacacg tgagtaacct gccctcttct tcgggataac ggtctgaaag ggctgctaat

120

accgggtatt cactggtcct cgcatggggg ttggtggaaa ggttttttct ggtgggggat

180

gggctcgcgg cctatcagct tgttggtggg gtgatggcct accaaggctt tgacgggtag

240

ccggcctgag agggtgaccg gtcacattgg gactgagata cggcccagac tcctacggga

300

ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc ggaagcctga tgcagcgacg ccgcgtgagg

360

gatggaggcc ttcgggttgt gaacctcttt cgcccgtggt caagccgcaa ctgtgggttg

420

tggtgagggt agtgggtaaa gaagcgccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

480

gtagggcgcg agcgttgtcc gggaattatt gggcgtaaag ggcttgtagg cggctggtcg

540

cgtctgccgt gaaatcctct ggctcaactg ggggcgtgcg gtgggtacgg gctggcttga

600

gtgcggtagg ggaggctgga actcctggtg tagcggtgga atgcgcagat atcaggaaga

660

acaccggtgg cgaaggcggg tctctgggcc gttactgacg ctgaggagcg aaagcgtggg

720

gagcgaacag gattagatac cctggtagtc cacgctgtaa acgttgggca ctaggtgtgg

780

gggccacccg tggtttccgc gccgtagcta acgctttaag tgccccgcct ggggagtacg

840

gccgcaaggc taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggcg gagcatgcgg

900

attaattcga tgcaacgcga agaaccttac caaggcttga catgcgcccc gggcgcgcgg

960

agacgcgcgc gcatttggtt gggggtgtgc aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt

1020

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgccctatgt tgccagcgcg

1080

ttatggcggg gactcgtggg ggactgccgg ggttaactcg gaggaaggtg gggatgacgt

1140

caaatcatca tgccccttat gtcttgggct tcacgcatgc tacaatggct ggtacagagg

1200

gttgcgatgc cgtgaggcgg ggcgaatccc ttaaagccgg tctcagttcg gattggggtc

1260

tgcaactcga ccccatgaag gtggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg

1320

aatacgttct cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca cgaaagttgg taacgcccga

1380

agcccatggc ccaaccggct cttgctgggg ggagtggtcg aaggtgg

1427

<210> 60

<211> 1446

<212> DNA

<213> Actinomyces israelii

<400> 60

cgtgcttaac acatgcaagt cgaacgggtc tgccttgttt tttgcggggt gggtcagtgg

60

cgaacgggtg agtaacacgt gagtaacctg cccctcactt ctggataacc gcttgaaagg

120

gtggctaata cggggtgttc tggctgtgcc gcatggtgtg gctgggaaag attcactttt

180

gtggtgtttt ggtgggggat gggctcgcgg cctatcagct tgttggtggg gtgatggcct

240

gccaaggctt tgacgggtag ccggcctgag agggtgggcg gtcacactgg gactgagata

300

cggcccagac tcctgcggga ggcagcagtg gggggtattg cacaatgggc ggaagcctga

360

tgcagcgacg tcgcgtgagg gatggaggcc ttcgggttgt gaacctcttt cgccggtgaa

420

gaaggtcctg ttctttgtgg tggggctgac ggtagccggg ttatgaagcg ccggctaact

480

acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg cgcgagcgtt gtccggaatt attgggcgta

540

aagggcttgt aggcggctgg tcgcgtctgc cgtgaaatcc tctggctcag ctgggggcgt

600

gcggtgggta cgggctggct tgagtgcggt aggggaggct ggaactcctg gtgtagcggt

660

ggaatgcgca gatatcagga ggaacaccgg tggcgaaggc gggtctctgg gccgttactg

720

acgctgagga gcgaaagcgt ggggagcgaa caggattaga taccctggta gtccatgctg

780

taaacgttgg gcactaggtg tggggggtct ttccgggtcc tccgcgccgt agctaacgct

840

ttaagtgccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg

900

cccgcacaag cggcggagca tgcggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttaccaggg

960

cttgacatgg gccggctgct cctggagacg ggggcctccc ttttttgggc cggttcacag

1020

gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1080

gcaacccctg tcccgtgttg ccagcgtgtt gtggcgggga ctcgcgggag actgccgggg

1140

ttaactcgga ggagggtggg gacgacgtca aatcatcatg ccccttatgt cctgggcttc

1200

acgcatgcta caatggccgg tacagtgggt tgcgatgtcg tgaggcggag cgaatccctt

1260

aaagccggtc tcagttcgga tcggtgtctg caactcgaca ccgtgaagct ggagtcgcta

1320

gtaatcgcag atcagcagtg ctgcggtgaa tacgttctcg ggccttgtac acaccgcccg

1380

tcacgtcatg aaagccggcg acacccgaag cccgtggccc tgtggggagc ggtcgaaggt

1440

ggggct

1446

<210> 61

<211> 1520

<212> DNA

<213> Actinomyces massiliensis

<400> 61

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gggccttgtc cccttttttt tgggggtggg gttagtggcg aacgggtgag taacacgtga

120

gtaacctgcc cctcacttct ggataaccgc ttgaaagggt ggctaatacg gggtgttctg

180

gcctgctcgc atgggtgggt ttggaaagat tcgaccggtt ttggttgttt tggtggggga

240

tgggctcgcg gcctatcagc ttgttggtgg ggtgatggcc tgccaaggct ttgacgggta

300

gccggcctga gagggtgggc ggtcacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg

360

aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagcgac gccgcgtgag

420

ggatggaggc cttcgggttg tgaacctctt tcgccagtga agaaggtcct gctctttgtg

480

gtggggttga cggtagctgg gttaatgaag cgccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

540

taatacgtag ggcgcgagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagggctt gtaggcggct

600

ggtcgcgtct gccgtgaaat cctctggctc agctgggggc gtgcggtggg tacgggctgg

660

cttgagtgcg gtaggggaga ctggaactcc tggtgtagcg gtggaatgcg cagatatcag

720

gaggaacacc ggtggcgaag gcgggtctct gggccgttac tgacgctgag gagcgaaagc

780

gtggggagcg aacaggatta gataccctgg tagtccacgc tgtaaacgtt gggcactagg

840

tgtggggggc cttttccggg ttttccgcgc cgtagctaac gcattaagtg ccccgcctgg

900

ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga

960

gcatgcggat taattcgatg caacgcgaag aaccttacca aggcttgaca tgggctggat

1020

tgcttcggag acggggtttc ccttttttgg gctggttcac aggtggtgca tggttgtcgt

1080

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtctcgtgt

1140

tgccagcacg ttgtggtggg gactcgcggg agactgccgg ggttaactcg gaggaaggtg

1200

gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gtcttgggct tcacgcatgc tacaatggcc

1260

ggtacagtgg gttgcgatgc tgtgaggcgg agcgaatccc tgaaagccgg tctcagttcg

1320

gatcggtgtc tgcaactcga caccgtgaag ttggagtcgc tagtaatcgc agatcagcag

1380

cgctgcggtg aatacgttct cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca tgaaagctgg

1440

caacacccga agcccgtggc cttatgggga gcggtcgaag gtggggctgg tgattgggac

1500

gaagtcgtaa caaggtaacc

1520

<210> 62

<211> 1411

<212> DNA

<213> Actinomyces meyeri

<400> 62

attgccaagt tcgaaacgct gaagcctagc ttgctgggtg gatgagtggc gaacgggtga

60

gtaacacgtg agtaacctgc cctcttcttt gggataacgc ccggaaatgg gtgctaatac

120

tggatattca ctggtcttcg catgggggtt ggtggaaagg gtttttctgg tgggggatgg

180

gctcgcggcc tatcagcttg ttggtggggt gatggcctac caaggctttg acgggtagcc

240

ggcctgagag ggtgaccggt cacattggga ctgagatacg gcccagactc ctacgggagg

300

cagcagtggg gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagcgacgcc gcgtgaggga

360

tggaggcctt cgggttgtga acctctttcg ctcatggtca agccgcaact gtgggttgtg

420

gtgagggtag tgggtaaaga agcgccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtatacgta

480

ggcgcgagcg ttgtccgaat tattgggcgt aaagggcttg taggcggttg gtcgcgtctg

540

tcgtgaaatc ctctggctta actgggggcg tgcggtgggt acgggctggc ttgagtgcgg

600

taggagagac tggaactcct ggtgtagcgg tggaatgcgc agatatcagg aagaacaccg

660

gtggcgaagg cgggtctctg ggccgttact gacgctgagg agcgaaagcg tggggagcga

720

acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacgttg ggcactaggt gtgggggcca

780

cccgtggttt ctgcgccgta gctaacgctt taagtgcccc gcctggggag tacggccgca

840

aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat gcggattaat

900

tcgatgcaac gcgaagaacc ttaccaaggc ttgacatgcg ccctgggcgt gcggagacgt

960

gcgtgcattt ggttgggggt gtgcaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1020

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgccct atgttgccag cacgttgtgg

1080

tggggactcg tgggggactg ccggggttaa ctcggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc

1140

atcatgcccc ttatgtcttg ggcttcacgc atgctacaat ggttggtaca gagggttgcg

1200

atatcgtgag gtggagcgaa tcccttaaag ccagtctcag ttcggattgg ggtctgcaac

1260

tcgaccccat gaaggtggag tcgctagtaa tcgcagatca gcaacgctgc ggtgaatacg

1320

ttctcgggcc ttgtacacac cgcccgtcac gtcacgaaag ttggtaacac ccgaagccca

1380

tggcctaacc ggtttttgct ggggggggaa g

1411

<210> 63

<211> 1450

<212> DNA

<213> Actinomyces naeslundii

<400> 63

tcctgactca ggacgaacgc tgccggcgta cataacacat gcaagtcgaa cggtgaaggg

60

gcctgctttt gtgggtcctg gatgagtggc gaacgggtga gtaacacgtg agtaacctgc

120

ccccttcttc tggataaccg catgaaagtg tggctaatac gggatattct gggtctgtcg

180

catggtgggc ctgggaaaga ttgcgccttt tttggtgttt ttggtggggg atgggctcgc

240

ggcctatcag cttgttggtg gggtgatggc ctgccaaggc ggtgacgggt agccggcctg

300

agagggtgga cggtcacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

360

tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcga cgccgcgtga gggatggagg

420

ccttcgggtt gtgaacctct ttcgccagtg aagcaggcct gcctcgtttg tgggtgggtt

480

gacggtagct ggataagaag cgccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

540

ggcgcgagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagagctc gtaggcggct ggtcgcgtct

600

gtcgtgaaat cctctggctt aactgggggc ttgcggtggg tacgggccgg cttgagtgcg

660

gtaggggaga ctggaactcc tggtgtagcg gtggaatgcg cagatatcag gaagaacacc

720

ggtggcgaag gcgggtctct gggccgttac tgacgctgag gagcgaaagc gtggggagcg

780

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgtt gggcactagg tgtggggggc

840

cttttccggg tcttccgcgc cgtagctaac gcattaagtg ccccgcctgg ggagtacggc

900

cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga gcatgcggat

960

taattcgatg caacgcgaag aaccttacca aggcttgaca tgtgccggtc tgctccggag

1020

acggggtttc ctcctttgtg ggggctggtt cacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

1080

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtctcg tgttgccagc

1140

acgttgtggt ggggactcgc gggagactgc cggggtcaac tcggaggaag gtggggatga

1200

cgtcaaatca tcatgcccct tatgtcttgg gcttcacgca tgctacaatg gccggtacag

1260

agggctgcga taccgtgagg tggagcgaat cccttaaagc cggtctcagt tcggatcggt

1320

gtctgcaact cgacaccgtg aagttggagt cgctagtaat cgcagatcag caacgctgcg

1380

gtgaatacgt tctcgggcct tgtacacacc gcccgtcacg tcatgaaagt cggcaacacc

1440

cgaagcccgt

1450

<210> 64

<211> 1328

<212> DNA

<213> Actinomyces nasicola

<400> 64

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta

60

acacgtgagt aacctgcccc cttctttggg ataactgccg gaaacggtgg ctaatactgg

120

atattgaaag ctggtggggg atgggctcgc ggcctatcag cttgttggtg gggtgatggc

180

ctaccaaggc tttgacgggt agccggcctg agagggtgac cggccacact gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct

300

gatgcagcga cgccgcgtga gggatgacgg ccttcgggtt gtaaacctct ttcagtaggg

360

aagaagacgg tacctgcaga agaagcgccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtagggcgc aagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag agctcgtagg cggcttgtcg

480

cgtctgtcgt gaaaacctgc agcttaactg tgggcttgcg gtgggtacgg gctggcttga

540

gtgcagtagg ggagactgga attcctggtg tagcggtgga atgcgcagat atcaggagga

600

acaccggtgg cgaaggcggg tctctgggct gactgacgct gaggagcgaa agcatgggga

660

gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca tgccgtaaac gttgggcact aggtgtgggg

720

atttctgtgc cgtagctaac gcattaagtg ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga gcatgcggat taattcgatg

840

caacgcgaag aaccttacca aggcttgaca tatacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgtct catgttgcca

960

gcacgtgggg actcatgaga gactgccggg gttaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1020

aaatcatcat gccccttatg tcttgggctt cacgcatgct acaatggccg gcagtgggtt

1080

gcgatctcgt gagggggagc taatccttgc cggtctcagt tcggatgggg tctgcaactc

1140

gaccccagaa gtcggagtcg ctagtaatcg cagatcagca acgctgcggt gaatacgttc

1200

tcgggccttg tacacaccgc ccgtcacgtc acgaaagttg gtaacacccg aagctcatgc

1260

ctagggagtg gtcgaaggtg ggactggcga ttgggacgaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1320

ccggaagg

1328

<210> 65

<211> 1489

<212> DNA

<213> Actinomyces neuii

<220>

<221> modified_base

<222> (159)..(159)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 65

cgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca agtcgaacgg gatccattag cgcttttgtg

60

tttttggtga gagtggcgaa cgggtgagta acacgtgagt aacctgccct tttctttggg

120

ataagcctgg gaaactgggt ctaatactgg atgttccgnc ttcctcgcat ggggttgttg

180

ggaaaggttt tttctggatt gggatgggct cgcggcttat cagcttgttg gtggggtgat

240

ggcttaccaa ggctttgacg ggtagccggc ctgagagggt ggtcggtcac actgggactg

300

agatacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggga tattgcacaa tggacggaag

360

tctgatgcac cgacgtcgtg tgggggatga aggccttcgg gttgtaaact cctttcgccc

420

gcggaaaagg cagggttttg gccttgttga tggtagtggg taaagaagcg ccggctcact

480

acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg cgcgagcgtt gtccggaatt attgggcgta

540

aagggctcgt aggcggtttg tcgcgtctag cgtttaaggc tcgggcttaa cccgggtttg

600

cgttgggtac gggcaggctt gagtgcggta ggggtaactg gaattcctgg tgtagcggtg

660

gaatgcgcag atatcaggag gaacaccggt ggcgaaggcg ggttactggg ccgttactga

720

cgctgaggag cgagagcgtg gggagcgaac aggattagat accctggtag tccatgctgt

780

aaacgttggg cactaggtgt gggggctggt ttcatggttc cgcgccgtag ctaacgcatt

840

aagtgccccg cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact caaaggaatt gacgggggcc

900

cgcacaagcg gcggagcatg cggattaatt cgatgcaacg cgaagaacct taccaaggct

960

tgacatgcac cgcgagactg cagagatgtg gttgccttcg gggtggtgtg caggtggtgc

1020

atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct

1080

tgtctcatgt tgccagcacg ttatggtggg gactcgtgag agactgccgg ggttaactcg

1140

gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatga tgccccatat gtcttgggct tcacgcatgc

1200

tacagtggtg tctacagagg gttgctattc cgtgaggttg agcgaatctc ttaaagggca

1260

tcttggttcg gatcgcagtc tgcaactcga ctgcgtgaag gtggagtcgc tagtaatcgc

1320

agatgagcat tgctgcggtg aatacgttct cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca

1380

cgaaagttgg taacacccga agcctgtggc ctaacctttt tggggggagt ggtcgaaggt

1440

ggggctagcg attgggacga agtcgtaaca aggtagccgt accggaagg

1489

<210> 66

<211> 1548

<212> DNA

<213> Actinomyces odontolyticus

<400> 66

tttgttcgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg ctgaagccta gcttgctggg tggatgagtg gcgaacgggt gagtaacacg

120

tgagtaacct gcccccttct ttgggataac gcccggaaac gggtgctaat actggatatt

180

cactggtctt cgcatggggg ttggtggaaa ggtttgttct ggtgggggat gggctcgcgg

240

cctatcagct tgttggtggg gtgatggcct accaaggctt tgacgggtag ccggcctgag

300

agggtgaccg gtcacattgg gactgagata cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

360

gggaatattg cacaatgggc gaaagcctga tgcagcgacg ccgcgtgagg gatggaggcc

420

ttcgggttgt aaacctcttt cgctcatggt caagccgcaa cattggttgt ggtgagggta

480

gtgggtaaag aagcgccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggcgcga

540

gcgttgtccg gaattattgg gcgtaaaggg cttgtaggcg gttggtcgcg tctgccgtga

600

aatcctctgg cttaactggg ggcgtgcggt gggtacgggc tgacttgagt gcggtagggg

660

agactggaac tcctggtgta gcggtggaat gcgcagatat caggaagaac accggtggcg

720

aaggcgggtc tctgggccgt tactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga gcgaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgctgtaaac gttgggcact aggtgtgggg gccacccgtg

840

gtttctgcgc cgtagctaac gctttaagtg ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta

900

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga gcatgcggat taattcgatg

960

caacgcgaag aaccttacca aggcttgaca tgcacggcgg cactgcagag atgtggtggc

1020

atttagttgg tcgtgtgcag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg ccctatgttg ccagcacgtg atggtgggga

1140

ctcgtggggg actgccgggg ttaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg

1200

ccccttatgt cttgggcttc acgcatgcta caatggttgg tacagagggt tgcgaaatcg

1260

tgaggtggag cgaatccctt aaagccagtc tcagttcgga ttggggtctg caactcgacc

1320

ccatgaaggt ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa tacgttctcg

1380

ggccttgtac acaccgcccg tcacgtcacg aaagttggta acacccgaag cccatggcct

1440

aaccgctttg tgtgggggga gtggtcgaag gtgggattgg cgattgggac gaagtcgtaa

1500

caaggtagcc gtaccggaag gtgcggctgg atcacctcct ttctaggg

1548

<210> 67

<211> 1508

<212> DNA

<213> Actinomyces oricola

<220>

<221> modified_base

<222> (32)..(32)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 67

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg cnagtcgaac gggccggccc cttgtttttt

60

ggggggttgg ttgagtggcg aacgggtgag taacacgtga gtaacctgcc ctcttcttct

120

ggataaccgc atgaaagtgt ggctaatacg ggatattctg gtctgcctgc atgggtgggt

180

tgggaaagat tcactttggt gttttggtgg gggatgggct cgcggcctat cagcttgttg

240

gtggggtgat ggcctaccaa ggcggtgacg ggtagccggc ctgagagggt gggcggtcac

300

actgggactg agatacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggga tattgcacaa

360

tgggcggaag cctgatgcag cgacgtcgcg tgagggatgg aggccttcgg gttgtgaacc

420

tctttcgcca gtgaagtagg tctgctcctg tgtgggtggg ttgacggtag ctgggttttt

480

aagaagcgcc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtgat acgtagggcg cgagcgttgt

540

ccggaattat tgggcgtaaa gggcttgtag gcggctggtc gcgtctgccg tgaaatcctc

600

tggcttaact gggggtgtgc ggtgggtacg ggtcggcttg agtgcggtag gggaggctgg

660

aactcctggt gtagcggtgg aatgcgcaga tatcaggaag aacaccggtg gcgaaggcgg

720

gtctctgggc cgttactgac gctgaggagc gaaagcgtgg ggagcgaaca ggattagata

780

ccctggtagt ccatgctgta aacgttgggc actaggtgtg gggggccttt ccgggttttc

840

cgcgccgtag ctaacgcttt aagtgccccg cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact

900

caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gcggagcatg cggattaatt cgatgcaacg

960

cgaagaacct taccaaggct tgacatgggc tggtttggtc tggagacagg ccgtcccttt

1020

ttttggggct ggttcacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg

1080

gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt ctcgtgttgc cagcatgttg tggtggggac

1140

tcgcgggaga ctgccggggt taactcggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc

1200

cccttatgtc ttgggcttca cgcatgctac aatggccggt acagtgggtt gcgatgtcgt

1260

gaggcggagc gaatccctta aagccggtct cagttcggat cggtgtctgc aactcgacac

1320

cgtgaagttg gagtcgctag taatcgcaga tcagcaacgc tgcggtgaat acgttctcgg

1380

gccttgtaca caccgcccgt cacgtcatga aagtcggcaa cacccgaagc ccgtggcctt

1440

atggggagcg gtcgaaggtg gggctggtga ttgggacgaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1500

ccggaagg

1508

<210> 68

<211> 1517

<212> DNA

<213> Actinomyces orihominis

<400> 68

tcaggacgaa cgctggcggc gtgcttaaca catgcaagtc gaacgggccc gcccctgttt

60

ttgggggtgg gttgagtggc gaacgggtga gtatcacgtg agtaacctgc cccctgctcc

120

tggataactg cttgaaaggg cggctaatac ggggtgtgcc ggctggtccg catgggcctg

180

gtcgggatag tttcatcttc gggtgtttcg gtgggggatg ggctcgcggc ctatcagctt

240

gttggtgggg tgatggccca ccaaggcggt gacgggtagc cggcctgaga gggtgggcgg

300

ccacactggg actgagacac ggcccagact cctgcgggag gcagcagtgg ggggtattgc

360

acaatgggcg gaagcctgat gcagcgacgt cgcgtgaggg atggaggcct tcgggttgtg

420

aacctctttc tccggtggtg aaggccctgt ccgttgcggc ggggttgacg gtagccgggt

480

atgaagcgcc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggcg cgagcgttgt

540

ccggaattat tgggcgtgaa gggcttgtag gcggccggtc gcgtccgccg tgaaattctc

600

cggctcaacc gggggcttgc ggtgggtacg ggccggctgg agtgcggtag gggaggctgg

660

aactcctggt gtagcggtgg aatgcgcaga tatcaggagg aacaccggtg gcgaaggcgg

720

gtctctgggc cgttactgac gctgaggagc gaaagcgtgg ggagcgaaca ggattagata

780

ccctggtagt ccacgccgta aacgttgggc actaggtgtg gggccccgct cggcgggggt

840

ccgcgccgca gctaacgcat taagtgcccc gcctggggag tacggccgca aggctaaaac

900

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat gcggattaat tcgatgcaac

960

gcgaagaacc ttaccagggc ttgacatggg ggcggcggcg ccggagacgg cgcctccctt

1020

tttcgggcgc ccccgcaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg

1080

ttaagtcccg caacgagcgc aacccctgtc ccgtgttgcc agcgcgtcgt ggcggggact

1140

ctcgggagac tgccggggtc aactcggagg agggtgggga cgacgtcaaa tcatcatgcc

1200

cctgacgtcc tgggcttcac gcatgctaca atggccggta cagagggttg cgatgccgtg

1260

aggcggggcg aatcccttaa agccggtctc agttcggatc ggtgtctgca actcgacacc

1320

gtgaagtcgg agtcgctagt aatcgcagat cagcattgct gcggtgaata cgttctcggg

1380

ccttgtacac accgcccgtc acgtcatgaa agtcggcgac gcccgaagcc cgtggcccca

1440

tggggagcgg tcgaaggcgg ggccggtgat tgggacgaag tcgtaacaag gtagccgtac

1500

cggaaggtgc ggctgga

1517

<210> 69

<211> 1535

<212> DNA

<213> Actinomyces oris

<400> 69

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggtgaaggga tcagcttgct ggttctggat gagtggcgaa cgggtgagta acacgtgagt

120

aacctgcccc cttcttctgg ataaccgcat gaaagtgtgg ctaatacggg atattctggg

180

tctgtcgcat gacgggtctg ggaaagatgc gcctttgggt gtttttggtg ggggatgggc

240

tcgcggccta tcagcttgtt ggtggggtga tggcctacca aggcggtgac gggtagccgg

300

cctgagaggg tggacggtca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

360

gcagtgggga atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gcgacgccgc gtgagggatg

420

gaggccttcg ggttgtgaac ctctttcgcc agtgaagcag gcccgcctct tttgtgggtg

480

ggttgacggt agctggataa gaagcgccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

540

gtagggcgcg agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaaga gctcgtaggc ggctggtcgc

600

gtctgtcgtg aaatcctctg gcttaactgg gggcttgcgg tgggtacggg ccggcttgag

660

tgcggtaggg gagactggaa ctcctggtgt agcggtggaa tgcgcagata tcaggaagaa

720

caccggtggc gaaggcgggt ctctgggccg ttactgacgc tgaggagcga aagcgtgggg

780

agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgttgggcac taggtgtggg

840

ggggcctttt ccgggtcttc cgcgccgtag ctaacgcatt aagtgccccg cctggggagt

900

acggccgcaa ggctaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gcggagcatg

960

cggattaatt cgatgcaacg cgaagaacct taccaaggct tgacatgtgc cggtcggctc

1020

cggagacggg gtttcctcct tgtggggccg gttcacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

1080

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc ccgtgttgcc

1140

agcacgttgt ggtggggact cgcgggagac tgccggggtc aactcggagg aaggtgggga

1200

tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtct tgggcttcac gcatgctaca atggccggta

1260

cagagggctg cgataccgtg aggtggagcg aatcccttaa agccggtctc agttcggatc

1320

ggtgtctgca actcgacacc gtgaagttgg agtcgctagt aatcgcagat cagcaacgct

1380

gcggtgaata cgttctcggg ccttgtacac accgcccgtc acgtcatgaa agtcggcaac

1440

acccgaagcc cgtggcccta cggggagcgg tcgaaggtgg ggctggtgat tgggacgaag

1500

tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc ggctg

1535

<210> 70

<211> 1464

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. 7400942

<400> 70

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggtgaagctc ctggcttttg

60

ttgggggtgg atgagtggcg aacgggtgag taacacgtga gtaacctgcc cctttcttct

120

ggataccgcc acgaaagtgg tgttaatacg ggatattctg gcyctgtcgc atggkggggt

180

tgggaaaggt cttttctggt gggggatggg ctcgcggcct atcagcttgt tggtggggtg

240

atggcctacc aaggcgttga cgggtagccg gcctgagagg gtggacggcc acactgggac

300

tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatgggcgga

360

agcctgatgc agcgacgccg cgtgagggat ggaggccttc gggttgtgaa cctctttcgc

420

cagtgaagca ggcccgctcc ttgtgggtgg gttgacggta gctggataag aagcgccggc

480

taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggcgcga gcgttgtccg gaattattgg

540

gcgtaaaggg cttgtaggcg gctggtcgcg tctgccgtga aatcccctgg cttaactggg

600

ggcgtgcggt gggtacgggc cggcttgagt gcggtagggg agactggaat tcctggtgta

660

gcggtggaat gcgcagatat caggaggaac accggtggcg aaggcgggtc tctgggccgt

720

tactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca

780

cgccgtaaac gttgggcact aggtgtgggg ggcctttccg ggtcctccgc gccgcagcta

840

acgcattaag tgccccgcct ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa aggaattgac

900

gggggcccgc acaagcggcg gagcatgcgg attaattcga tgcaacgcga agaaccttac

960

caaggcttga catgtcggcg attcccgcgg agacgcggtc tccccctcgt ggggcgccgt

1020

cacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1080

cgagcgcaac ccctgtcccg tgttgccagc acgtcgtggt ggggactcgc gggagactgc

1140

cggggtcaac tcggaggagg gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgtcttgg

1200

gcttcacgca tgctacaatg gccggtacag agggttgcga tgccgcgagg cggggcgaat

1260

cccttaaagc cggtctcagt tcggatcggt gtctgcaact cgacaccgtg aagttggagt

1320

cgctagtaat cgcggatcag caacgccgcg gtgaatacgt tctcgggcct tgtacacacc

1380

gcccgtcacg tcatgaaagt cggcaacacc cgaagcccgt ggccccatgg ggagcggtcg

1440

aaggtggggc cggtgattgg gacg

1464

<210> 71

<211> 1367

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. CCUG 37290

<220>

<221> modified_base

<222> (671)..(671)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1259)..(1259)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 71

acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg ctgaagacct ggcttttgtt

60

gggttggatg agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgagta acctgccctc ttctttggga

120

taacgcccgg aaacgggtgc taatactgga tattcactgg ccttcgcatg ggggttggtg

180

gaaaggtttg ttctggtggg ggatgggctc gcggcctatc agcttgttgg tggggtgatg

240

gcctaccaag gctttgacgg gtagccggcc tgagagggtg accggtcaca ttgggactga

300

gatacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgaaagc

360

ctgatgcagc gacgccgcgt gagggatgga ggccttcggg ttgtaaacct ctttcgctca

420

tggtcaagcc gcaactgtgg gttgtggtga gggtagtggg taaagaagcg ccggctaact

480

acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg cgcgagcgtt gtccggaatt attgggcgta

540

aagggcttgt aggcggttgg tcgcgtctgc cgtgaaattc tctggcttaa ctgggggcgt

600

gcggtgggta cgggctgact tgagtgcggt aggggagact ggaactcctg gtgtagcggt

660

ggaatgcgca natatcagga agaacaccgg tggcgaaggc gggtctctgg gccgttactg

720

acgctgagga gcgaaagcgt ggggagcgaa caggattaga taccctggta gtccacgctg

780

taaacgttgg gcactaggtg tgggggccac ccgtggtttc tgcgccgtag ctaacgcttt

840

aagtgccccg cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact caaaggaatt gacgggggcc

900

cgcacaagcg gcggagcatg cggattaatt cgatgcaacg cgaagaacct taccaaggct

960

tgacatgcac ggcggcactg cagagatgtg gtggcatttg gttggtcgtg tgcaggtggt

1020

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1080

ccttgcccta tgttgccagc acgtgatggt ggggactcgt gggggactgc cggggttaac

1140

tcggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgtcttgg gcttcacgca

1200

tgctacaatg gttggtacag agggttgcga tactgtgagg tggagcgaat cccttaaanc

1260

cagtctcagt tcggattggg gtctgcaact cgaccccatg aaggtggagt cgctagtaat

1320

cgcagatcag caacgctgcg gtgaatacgt tctcgggcct tgtacac

1367

<210> 72

<211> 1501

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. ChDC B197

<400> 72

agagtttgat cctggctcag acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

gtgaagggac cagcttgctg gttctggatg agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgagta

120

acctgccccc ttcttctgga taaccgcatg aaagtgtggc taatacggga tattctgggt

180

ctgtcgcatg acgggcccgg gaaagatatt gcttcggtgg gggatgggct cgcggcctat

240

cagcttgttg gtggggtgat ggcctaccaa ggcggtgacg ggtagccggc ctgagagggt

300

ggacggtcac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag cgacgccgcg tgagggatgg aggccttcgg

420

gttgtaaacc tctttcgcca gtgaagcagg cctgctcctt gtgggtgggt tgacggtagc

480

tggataagaa gcgccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggcgcgagc

540

gttgtccgga attattgggc gtaaagagct cgtaggcggc tggtcgcgtc tgtcgtgaaa

600

tcctctggct taactggggg cttgcggtgg gtacgggccg gcttgagtgc ggtaggggag

660

actggaactc ctggtgtagc ggtggaatgc gcagatatca ggaagaacac cggtggcgaa

720

ggcgggtctc tgggccgtta ctgacgctga ggagcgaaag cgtggggagc gaacaggatt

780

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacgt tgggcactag tgtggggggc cttttccggg

840

tcttccgcgc cgtagctaac gcattaagtg ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta

900

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga gcatgcggat taattcgatg

960

caacgcgaag aaccttacca aggcttgaca tgtgccggtc ggctccggag acggggcttc

1020

ctccttgtgg ggccggttca caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtcccgtg ttgccagcac gttgtggtgg

1140

ggactcgcgg gagactgccg gggtcaactc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc

1200

atgcccctta tgtcttgggc ttcacgcatg ctacaatggc cggtacagag ggctgcgata

1260

ccgtgaggtg gagcgaatcc cttaaagccg gtctcagttc ggatcggtgt ctgcaactcg

1320

acaccgtgaa gctggagtcg ctagtaatcg cagatcagca acgctgcggt gaatacgttc

1380

tcgggccttg tacacaccgc ccgtcacgtc atgaaagtcg gcaacacccg aagcccgtgg

1440

ccctacgggg agcggtcgaa ggtggggctg gtgattggga cgaagtcgta acaaggtaac

1500

c

1501

<210> 73

<211> 1274

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. GEJ15

<220>

<221> modified_base

<222> (398)..(400)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (450)..(450)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 73

taacctgccc tcttcttctg gataacctca tgaaagtggg gctaatacgg ggtattccgg

60

gtctgtcgca tggcgggttt gggaaagatt gcgcctttgg gtgttttcgg tgggggatgg

120

gctcgcggcc tatcagcttg ttggtggggt gatggcctac caaggcggtg acgggtagcc

180

ggcctgagag ggtggacggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctgcgggagg

240

cagcagtggg gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagcgacgcc gcgtgaggga

300

tggaggcctt cgggttgtga acctctttcg ccagtgaagc aggcctgctc gttgtcgtgg

360

tgacgtagct gatagagcgc gctactacgt gcagcagnnn gtatacgtag gcgcgagcgt

420

gtcagtaagt atgggcgtaa agagctcgtn gcgctggtcg cgtctgtcgt gaaatcatct

480

ggcttaactg ggggcttgcg gtgggtacgg gccggcttga gtgcggtagg ggaggctgga

540

actcctggtg tagcggtgga atgcgcagat atcaggaaga acaccggtgg cgaaggcggg

600

tctctgggcc gttactgacg ctgaggagcg aaagcgtggg gagcgaacag gattagatac

660

cctggtagtc cacgccgtaa acgttgggca ctaggtgtgg ggggcctttt ccgggttctt

720

ccgcgccgta gctaacgcat taagtgcccc gcctggggag tacggccgca aggctaaaac

780

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat gcggattaat tcgatgcaac

840

gcgaagaacc ttaccaaggc ttgacatgtg ccggtcggct ccggagacgg ggtttccctc

900

ctttgtgggg gccggttcac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

960

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc tgtcccgtgt tgccagcacg ttgtggtggg

1020

gactcgcggg agactgccgg ggtcaactcg gaggagggtg gggatgacgt caaatcatca

1080

tgccccttat gtcttgggct tcacgcatgc tacaatggcc ggtacagagg gctgcgatgc

1140

cgtgaggtgg agcgaatccc ttaaagccgg tctcagttcg gatcggtgtc tgcaactcga

1200

caccgtgaag ttggagtcgc tagtaatcgc agatcagcca acgctgcggt gaatacgttc

1260

ctcgggcctt gtac

1274

<210> 74

<211> 1320

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. HKU31

<400> 74

acggactgct cttcagcttg ctggggggtg gtgagtggcg aacgggtgag taacacgtga

60

gtaacctgcc ctcttctttg ggataactgc cggaaacggt tgctaatacc gggtattcac

120

tggtctccgc atgggggttg gtggaaaggg gcctcttttg gggtttctgg tgggggatgg

180

gctcgcggct tatcagcttg ttggtggggt gatggcctac caaggctttg acgggtagcc

240

ggcctgagag ggtgaccggt cacattggga ctgagatacg gcccagactc ctacgggagg

300

cagcagtggg gaattttgca caatgggcgc aagcctgatg cagcgacgcc gcgtgaggga

360

tggaggcctt cgggttgtaa acctctttcg ctcatggtca agccgcaact gtggttgtgg

420

tgagggtagt gggtaaagaa gcgccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

480

gggcgcgagc gttgtccgga attattgggc gtaaagggct tgtaggcggt ttgtcgcgtc

540

tgccgtgaaa ttccctggct taactggggg cgtgcggtgg gtacgggcag gcttgagtgc

600

ggtaggggag actggaattc ctggtgtagc ggtggaatgc gcagatatca ggaggaacac

660

cggtggcgaa ggcgggtctc tgggccgtta ctgacgctga ggagcgaaag catggggagc

720

gaacaggatt agataccctg gtagtccatg ctgtaaacgt tgggcactag gtgtggggac

780

cgtccttggt ttctgcgccg tagctaacgc tttaagtgcc ccgcctgggg agtacggccg

840

caaggctaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggcggagc atgcggatta

900

attcgatgca acgcgaagaa ccttaccaag gcttgacatg caccgcgaca ctgcagagat

960

gtggtggcct tcggggtggt gtgcaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1020

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgccct atgttgccag cacgttgtgg

1080

tggggactcg tgggggactg ccggggttaa ctcggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc

1140

atcatgcccc ttatgtcttg ggcttcacgc atgctacaat ggtcggtaca gagggttgcg

1200

ataccgyrag gtggagcgaa tcccttaaag ccggtctcag ttcggattgg ggtctgcaac

1260

tcgaccccat gaaggtggag tcgctagtaa tcgcagatca gcaacgctgc ggtgaatacg

1320

<210> 75

<211> 1265

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. ICM34

<400> 75

acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg agtggcgaac gggtgagtaa

60

cacgtgagta acctgccctc ttctttggga taacgcccgg aaacgggtgc taatactgga

120

tattgaaagc tggtggggga tgggctcgcg gcctatcagc ttgttggtgg ggtgatggcc

180

taccaaggct ttgacgggta gccggcctga gagggtgacc ggtcacattg ggactgagat

240

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg cgaaagcctg

300

atgcagcgac gccgcgtgag ggatggaggc cttcgggttg taaacctctt tcgctcatgg

360

tcatgagggt agtgggtaaa gaagcgccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

420

gtagggcgcg agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaagg gcttgtaggc ggttggtcgc

480

gtctgccgtg aaattctctg gcttaactgg gggcgtgcgg tgggtacggg ctgacttgag

540

tgcggtaggg gagactggaa ctcctggtgt agcggtggaa tgcgcagata tcaggaagaa

600

caccggtggc gaaggcgggt ctctgggccg actgacgctg aggagcgaaa gcgtggggag

660

cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg ttgggcacta ggtgtggggg

720

tttctgcgcc gtagctaacg ctttaagtgc cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag catgcggatt aattcgatgc

840

aacgcgaaga accttaccaa ggcttgacat gtgcaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgccct atgttgccag

960

cacgtgggga ctcgtggggg actgccgggg ttaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

aatcatcatg ccccttatgt cttgggcttc acgcatgcta caatggttgg cagagggttg

1080

cgatactgtg aggtggagcg aatcccttcc agtctcagtt cggatggggt ctgcaactcg

1140

accccagaag gtggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttct

1200

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca cgaaagttgg taacacccga agcccatgcc

1260

taggg

1265

<210> 76

<211> 1331

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. ICM41

<400> 76

tcttctttgg gataacgccc ggaaacgggt gctaatactg gatattcact gatcttcgca

60

tgggggttgg tggaaaggtt ttttctggtg ggggatgggc tcgcggccta tcagcttgtt

120

ggtggggtga tggcctacca aggctttgac gggtagccgg cctgagaggg tgaccggtca

180

cattgggact gagatacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca

240

atgggcgaaa gcctgatgca gcgacgccgc gtgagggatg gaggccttcg ggttgtaaac

300

ctctttcgct catggtcaag ccgcaactta gggttgtggt gagggtagtg ggtaaagaag

360

cgccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggcgcgagcg ttgtccggaa

420

ttattgggcg taaagggctt gtaggcggtt ggtcgcgtct gccgtgaaat cctctggctt

480

aactgggggc gtgcggtggg tacgggctga cttgagtgcg gtaggggaga ctggaactcc

540

tggtgtagcg gtggaatgcg cagatatcag gaagaacacc ggtggcgaag gcgggtctct

600

gggccgttac tgacgctgag gagcgaaagc gtggggagcg aacaggatta gataccctgg

660

tagtccacgc tgtaaacgtt gggcactagg tgtgggggcc acccgtggtt tctgcgccgt

720

agctaacgct ttaagtgccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa

780

ttgacggggg cccgcacaag cggcggagca tgcggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac

840

cttaccaagg cttgacatgc acggcggcac tgcagagatg tggtggcatt tagttggtcg

900

tgtgcaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

960

aacgagcgca acccttgccc tatgttgcca gcacgtgatg gtggggactc gtgggggact

1020

gccggggtta actcggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgtctt

1080

gggcttcacg catgctacaa tggttggtac agagggttgc gatatcgtga ggtggagcga

1140

atcccttaaa gccagtctca gttcggattg gggtctgcaa ctcgacccca tgaaggtgga

1200

gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg cggtgaatac gttctcgggc cttgtacaca

1260

ccgcccgtca cgtcacgaaa gttggtaaca cccgaagccc atggcctaac cgcgtttgcg

1320

gggggagtgg t

1331

<210> 77

<211> 1281

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. ICM47

<400> 77

gctcaggacg aacgctggcg gcgtgcttaa cacatgcaag tcgaacgagt ggcgaacggg

60

tgagtaacac gtgagtaacc tgccctcttc tttgggataa cgcccggaaa cgggtgctaa

120

tactggatat tgaaagctgg tgggggatgg gctcgcggcc tatcagcttg ttggtggggt

180

gatggcctac caaggctttg acgggtagcc ggcctgagag ggtgaccggt cacattggga

240

ctgagatacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggcga

300

aagcctgatg cagcgacgcc gcgtgaggga tggaggcctt cgggttgtaa acctctttcg

360

ctcatggtca tgagggtagt gggtaaagaa gcgccggcta actacgtgcc agcagccgcg

420

gtaatacgta gggcgcgagc gttgtccgga attattgggc gtaaagggct tgtaggcggt

480

tggtcgcgtc tgccgtgaaa ttctctggct taactggggg cgtgcggtgg gtacgggctg

540

acttgagtgc ggtaggggag actggaactc ctggtgtagc ggtggaatgc gcagatatca

600

ggaagaacac cggtggcgaa ggcgggtctc tgggccgact gacgctgagg agcgaaagcg

660

tggggagcga acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacgttg ggcactaggt

720

gtgggggttt ctgcgccgta gctaacgctt taagtgcccc gcctggggag tacggccgca

780

aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat gcggattaat

840

tcgatgcaac gcgaagaacc ttaccaaggc ttgacatgtg caggtggtgc atggttgtcg

900

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgccctatg

960

ttgccagcac gtggggactc gtgggggact gccggggtta actcggagga aggtggggat

1020

gacgtcaaat catcatgccc cttatgtctt gggcttcacg catgctacaa tggttggcag

1080

agggttgcga tactgtgagg tggagcgaat cccttccagt ctcagttcgg atggggtctg

1140

caactcgacc ccagaaggtg gagtcgctag taatcgcaga tcagcaacgc tgcggtgaat

1200

acgttctcgg gccttgtaca caccgcccgt cacgtcacga aagttggtaa cacccgaagc

1260

ccatgcctag ggagtggtcg a

1281

<210> 78

<211> 1260

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. ICM54

<400> 78

gaacgctggc ggcgtgctta acacatgcaa gtcgaacgag tggcgaacgg gtgagtaaca

60

cgtgagtaac ctgccccctt ctttgggata acgcccggaa acgggtgcta atactggata

120

ttgaaagctg gtgggggatg ggctcgcggc ctatcagctt gttggtgggg tgatggccta

180

ccaaggcttt gacgggtagc cggcctgaga gggtgaccgg tcacattggg actgagatac

240

ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg aaagcctgat

300

gcagcgacgc cgcgtgaggg atgacggcct tcgggttgta aacctctttc gctcatggtc

360

atgagggtag tgggtaaaga agcgccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

420

agggcgcgag cgttgtccgg aattattggg cgtaaagggc ttgtaggcgg ttggtcgcgt

480

ctgccgtgaa atcctctggc ttaactgggg gcgtgcggtg ggtacgggct gacttgagtg

540

cggtagggga gactggaact cctggtgtag cggtggaatg cgcagatatc aggaagaaca

600

ccggtggcga aggcgggtct ctgggccgac tgacgctgag gagcgaaagc gtggggagcg

660

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc tgtaaacgtt gggcactagg tgtgggggtt

720

tctgcgccgt agctaacgct ttaagtgccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa

780

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggcggagca tgcggattaa ttcgatgcaa

840

cgcgaagaac cttaccaagg cttgacatgt gcaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt

900

gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgccctat gttgccagca

960

cgtggggact cgtgggggac tgccggggtt aactcggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1020

tcatcatgcc ccttatgtct tgggcttcac gcatgctaca atggttggca gagggttgcg

1080

atactgtgag gtggagcgaa tcccttccag tctcagttcg gatggggtct gcaactcgac

1140

cccagaaggt ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa tacgttctcg

1200

ggccttgtac acaccgcccg tcacgtcacg aaagttggta acacccgaag cccatgccta

1260

<210> 79

<211> 1484

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. M2231/94/1

<220>

<221> modified_base

<222> (770)..(770)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (772)..(772)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (878)..(878)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (939)..(939)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 79

ttgatcctgg ctcaggacga acgctgacgg cgtgcttaac acatgcaagt cgaacggtga

60

agcccctttt tttggggtgg atgagtggcg aacgggtgag taacacgtga gtaacctgcc

120

cctgactcct ggataactgc ttgaaagggt ggctaatacg ggdgtgtcct ggcctgggcg

180

catgtctggg tttggaaaga ttccatgttt ttggttttgg ttggggatgg gctcgcggcc

240

tatcagcttg ttggtggggt gatggcctac caaggcgttg acgggtagcc ggcctgagag

300

ggtggacggt cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagcgacgcc gcgtgaggga tgacggcctt

420

cgggttgtaa acctctttcg ccagtgagga aggcctgctc ctttttgtgg gtgggttgac

480

ggtagctgga taagaagcgc cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggc

540

gcgagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa agagctcgta ggcggctggt cgcgtctgcc

600

gtgaaatccc ctggcttaac tgggggcgtg cggtgggtac gggccggctt gagtgcggta

660

ggggaggctg gaactcctgg tgtagcggtg gaatgcgcag atatcaggag gaacaccggt

720

ggcgaaggcg ggtctctggg ccgttactga cgctgaggag cgaaagcgtn gngagcgaac

780

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgttggg cactaggtgt ggggggtctt

840

tccgggtcct ccgcgccgta gctaacgcat taagtgcncc gcctggggag tacggccgca

900

aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaanc ggcggagcat gcggattaat

960

tcgatgcaac gcgaagaacc ttaccaaggc ttgacatgtc agcgctggct gcagagatgt

1020

ggtctcctca cttgtggggc gctgtcacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg

1080

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg tcccgtgttg ccagcacgtc

1140

gtggtgggga ctcgcgggag actgccgggg tcaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca

1200

aatcatcatg ccccttatgt cttgggcttc acgcatgcta caatggccgg tacagagggc

1260

tgcgatgccg tgaggcggag cgaatccctt aaagccggtc tcagttcgga tcggtgtctg

1320

caactcgaca ccgtgaagtt ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa

1380

tacgtcctcg ggccttgtac acaccgcccg tcacgtcatg aaagctggca acacccgaag

1440

cccgtggccc tacggggagc ggtcgaaggt ggggctggtg attg

1484

<210> 80

<211> 1419

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. TeJ5

<220>

<221> modified_base

<222> (500)..(500)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (503)..(503)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 80

gcttacacat gcagtcgaac gatgatgcgg cgcttgcgcc gttgattagt ggcgaacggg

60

tgagtaacac gtgagtaacc tgcccccttc ttcgggataa cggtctgaaa gggctgctaa

120

taccgggtat tcactggtct ccgcatgggg gctggtggaa agggtttttt ctggtggggg

180

atgggctcgc ggcctatcag cttgttggtg gggtgatggc ccaccaaggc tttgacgggt

240

agccggcctg agagggtgac cggtcacatt gggactgaga tacggcccag actcctacgg

300

gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcga cgccgcgtga

360

gggatggagg ccttcgggtt gtgaacctct ttcgcccgtg gtcaagccgc gacgtgggtc

420

gtggtgaggg tagtgggtaa agaagcgccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

480

cgtagggcgc gagcgtgtcn ganatgggcg taaagggctg taggcgctgg tcgcgtctgc

540

cgtgaaatcc tctggctcaa ctgggagcgt gcggtgggta cgggctggct tgagtgcggt

600

aggggaggct ggaactctgg tgtagcggtg gaatgcgcag atatcaggaa gaacaccggt

660

ggcgaaggcg ggtctctggg ccgttactga cgctgaggag cgaaagcgtg gggagcgaac

720

aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacgttggg cactaggtgt gggggccacc

780

cgtggttccc gcgccgtagc taacgcttta agtgccccgc ctggggagta cggccgcaag

840

gctaaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg cggagcatgc ggattaattc

900

gatgcaacgc gaagaacctt accaaggctt gacatgcgcc ccgggcgcgc ggagacgcgc

960

gcgcatttgg ttgggggtgt gcaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1020

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgccctat gttgccagcg cgttgtggcg

1080

gggactcgtg ggggactgcc ggggttaact cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat

1140

catgcccctt atgtcttggg cttcacgcat gctacaatgg ccggtacaga gggttgcgat

1200

gccgtgaggc ggggcgaatc ccttaaagcc ggtctcagtt cggattgggg tctgcaactc

1260

gaccccatga aggtggagtc gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg tgaatacgtt

1320

ctcgggcctt gtacacaccg cccgtcacgt cacgaaagtt ggtaacgccc gaagcccatg

1380

gcccaaccgg ctcttgctgg ggggagtggt cgaaggtgg

1419

<210> 81

<211> 1443

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. c109

<400> 81

gccccacaca tgcaagtgga gcgacgaacc ggggcttgcc ccggggcaga gccgcgaacg

60

ggtgagtaac acgtgggtta cctgccccga tgactgggac aacccgtcga aagacgggct

120

aataccggat gtgccccttg ggggaaagga agcttcggcc tccgcatcgg gatgggcccg

180

cggcgcatta gcttgttggt ggggtaatgg cttaccaagg cgacgatgcg tagctggtct

240

gagaggacga tcagccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca

300

gtggggaatc ttgcacaatg cgcgaaagcg tgatgcagca acgccgcgtg cgggaagaag

360

gccctagggt tgtaaaccgc tttcagttgg gacgaagctt cagtcgttaa tagcggtttg

420

gagtgacggt accttcagaa gaagcgccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

480

gtagggcgcg agcgttgtcc ggaatcattg ggcgtaaagc gcgtgtaggc ggctgagtaa

540

gtctgctgtg aaagtccagg gctcaaccct ggaatgtcgg cggatactgc tcagctggag

600

tacgggaggg gcgagtggaa ttcctggtgt agcggtggaa tgcgcagata tcaggaggaa

660

cacctatggc gaaggcagct cgctggaacg ttactgacgc tgagacgcga aagcgtgggg

720

agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgctgtaaa cgatggatac taggtgtggg

780

gggtgtcaac tccctccgtg ccgaagctaa cgcattaagt atcccgcctg gggagtacgg

840

ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcagcgg agcatgtggt

900

ttaattcgac gcaacgcgaa gaaccttacc tgggcttgac atgttcttga tcggcgtgga

960

aacacgtctt ccctcacggg caagatcaca ggtggtgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc

1020

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccccc gtcgtatgtt gccagcattt

1080

agttggggac tcatgcgaga ctgccggtgg caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1140

gtcatcatgc cccttatgtc cagggctaca cacgtgctac attggcgtat acaaagggta

1200

gcgataccgc gaggtggagc gaatctcaca aagtacgtct cggttcggat tgcaggctga

1260

aactcgcctg catgaaggtg gagttgctag taatcgtgga tcagcaatgc cgcggtgaat

1320

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacgg gagtgagcaa cacccgaagc

1380

cggtggccta acccgcaagg gagggagccg tcgaaggtgg ggctcgtgac tggggtgaag

1440

tcg

1443

<210> 82

<211> 1547

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. oral clone GU009

<400> 82

gagtttgatt ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

ggcccgcacc ttttttgggg gcgggttgag tggcgaacgg gtgagtatca cgtgagtaac

120

ctgccctcct ctcctggata accgcttgaa agggcggcta atacggggtg gtccggttgg

180

tccgcatggg ccggtcggga tagtttcatc ttcgggtgtt tcggtggggg atgggctcgc

240

ggcctatcag cttgttggtg gggtgatggc ccaccaaggc ggtgacgggt agccggcctg

300

agagggtggg cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctgcgg gaggcagcag

360

tggggggtat tgcacaatgg gcggaagcct gatgcagcga cgtcgcgtga gggatggagg

420

ccttcgggtt gtgaacctct gtttccggtg gtgaaggccc cgcccctggt ggtggggttg

480

acggtagccg ggtatgaagc gccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg

540

gcgcgagcgt tgtccggaat tattgggcgt aaagggcttg taggcggccg gccgcgtccg

600

tcgtgaaatc ctccggctca accgggggct tgcggtgggt acgggtcggc tggagtgcgg

660

caggggaggc tggaactcct ggtgtagcgg tggaatgcgc agatatcagg aagaacaccg

720

gtggcgaagg cgggtctctg ggccgttact gacgctgagg agcgaaagcg tggggagcga

780

acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacgttg ggcactaggt gtgggggcca

840

cccgtggttt ctgcgccgta gctaacgctt taagtgcccc gcctggggag tacggccgca

900

aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat gcggattaat

960

tcgatgcaac gcgaagaacc ttaccaaggc ttgacatgca cggcggcact gcagagatgt

1020

ggtggcattt agttggtcgt gtgcaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1080

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgccct atgttgccag cacgtgatgg

1140

tggggactcg tgggggactg ccggggttaa ctcggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc

1200

atcatgcccc ttatgtcttg ggcttcacgc atgctacaat ggttggtaca gagggttgcg

1260

atatcgtgag gtggagcgaa tcccttaaag ccagtctcag ttcggattgg ggtctgcaac

1320

tcgaccccat gaaggtggag tcgctagtaa tcgcagatca gcaacgctgc ggtgaatacg

1380

ttctcgggcc ttgtacacac cgcccgtcac gtcacgaaag ttggtaacac ccgaagccca

1440

tggcctaacc ggtttgccgg ggggagtggt cgaaggtggg attggcgatt gggacgaagt

1500

cgtaacaagg tagccgtacc ggaaggtgcg gctggaacac ctccttc

1547

<210> 83

<211> 1366

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. oral clone GU067

<400> 83

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgagta acctgccccc ttcttctgga taaccgcatg

120

aaagtgtggc taatacggga tattgaaagt cggtggggga tgggctcgcg gcctatcagc

180

ttgttggtgg ggtgatggcc taccaaggcg gtgacgggta gccggcctga gagggtggac

240

ggtcacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

300

gcacaatggg cgcaagcctg atgcagcgac gccgcgtgag ggatggaggc cttcgggttg

360

taaacctctt tcgccagtga agctgacggt agctggataa gaagcgccgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtagggcgcg agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaaga

480

gctcgtaggc ggctggtcgc gtctgtcgtg aaatcctctg gcttaactgg gggcttgcgg

540

tgggtacggg ccggcttgag tgcggtaggg gagactggaa ctcctggtgt agcggtggaa

600

tgcgcagata tcaggaagaa caccggtggc gaaggcgggt ctctgggccg actgacgctg

660

aggagcgaaa gcgtggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

ttgggcacta ggtgtggggg cttccgcgcc gtagctaacg cattaagtgc cccgcccggg

780

gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag

840

catgcggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccaa ggcttgacat gcacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccttgtctc gtgttgccag cacgtgggga ctcgcgggag actgccgggg ttaactcgga

1020

ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgt cttgggcttc acgcatgcta

1080

caatggccgg cagtgggttg cgatgctgtg aggcggagcg aatccctgcc ggtctcagtt

1140

cggacggtgt ctgcaactcg acaccggaag ttggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa

1200

cgctgcggtg aatacgttct cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca tgaaagctgg

1260

caacacccga agcccgtgcc tgggagcggt cgaaggtggg gctggtgatt gggacgaagt

1320

cgtaacaagg tagccgtacc ggaaggtgcg gctggaacac ctcctt

1366

<210> 84

<211> 1532

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. oral clone IO076

<400> 84

gagtttgatt ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

atgaagcgct gtctttttgg cggtgtggat tagtggcgaa cgggtgagta atacgcgggc

120

aacctgcccc tctgcttcgg gataagcttt ggaaacgggg tctaataccg gatgtgcctg

180

tctggtcgca tggctgggcg gggaaagatg tttttcggcg ggggatgggc tcgcggccta

240

tcagcttgtt ggtggggtga cggcctacca aggcgtcgac gggtagccgg cctgagaggg

300

tggtcggcca cactgggact gagatacggc ccagactcct acgggaggca gcagtggggg

360

atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gcgacgccgc gtgggggatg gaggctttcg

420

ggttgtaaac ccctttcggc gcgggacaag gctccgtttg gcggggttga gggtacgcgt

480

caaagaagcg ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg cgcgagcgtt

540

gtccggaatt attgggcgta aagggctcgt aggcggcttg tcgcgtctgc tgtgaaaacg

600

cggggctcaa ctccgcgcgt gcagtgggta cgggcaggct ggagtgcggc aggggtggct

660

ggaattcctg gtgtagcggt ggaatgcgca gatatcagga agaacaccga tggcgaaggc

720

aggccactgg gccgtcactg acgctgggga gcgaaagcgt ggggagcgaa caggattaga

780

taccctggta gtccacgccg taaacgttgg gcactaggtg tggggggcct tttccgggtc

840

ttccgcgccg tagctaacgc attaagtgcc ccgcctgggg agtacggtcg caaggctaaa

900

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggcggagc atgcggatta attcgatgca

960

acgcgaagaa ccttaccaag gcttgacatg tgccggtcgg ctccggagac gggagcgtcc

1020

cctttttgtg ggctggttca caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtctcgtg ttgccagcac gttgtggtgg

1140

ggactcgcgg gagactgccg gggtcaactc ggaggagggt ggggatgacg tcaaatcatc

1200

atgcccctta tgtcttgggc ttcacgcatg ctacaatggc cggtacagtg ggttgcgatg

1260

tcgtgaggcg gagcgaatcc ctgaaagccg gtctcagttc ggatcggtgt ctgcaactcg

1320

acaccgtgaa gttggagtcg ctagtaatcg cagatcagca acgctgcggt gaatacgttc

1380

tcgggccttg tacacaccgc ccgtcacgtc atgaaagtcg gcaacacccg aagcccgtgg

1440

ccttatgggg agcggtcgaa ggtggggctg gtgattggga cgaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtaccggaa ggtgcggctg gaacacctcc tt

1532

<210> 85

<211> 1544

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. oral clone IO077

<400> 85

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

gtgaagggat cagcttgctg gttctggatg agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgagta

120

acctgccccc ttcttctgga taaccgcatg aaagtgtggc taatacggga tattctgggt

180

ctgtcgcatg gcgggtctgg gaaagatgcg cctttgggtg tttttggtgg gggatgggct

240

cgcggcctat cagcttgttg gtggggtgat ggcctaccaa ggcggtgacg ggtagccggc

300

ctgagagggt ggacggtcac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag

360

cagtggggaa tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag cgacgccgcg tgagggatgg

420

aggccttcgg gttgtaaacc tctttcgcca gtgaagcagg cctgctcctt gtgggtgggt

480

tgacggtagc tggataagaa gcgccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

gggcgcgagc gttgtccgga attattgggc gtaaagagct cgtaggcggc tggtcgcgtc

600

tgtcgtgaaa tcctctggct taactggggg cgtgcggtgg gtacgggccg gcttgagtgc

660

ggtaggggag gctggaattc ctggtgtagc ggtggaatgc gcagatatca ggaggaacac

720

cggtggcgaa ggcgggtctc tgggccgtgt actgacgctg agagcgaaag cgtggggagc

780

gaacaggatt agataccctg gtagtccatg ctgtaaacgt tgggcactag gtgtgggggg

840

tctttccggg tcttccgcgc cgtagctaac gcattaagtg ccccgcctgg ggagtacggc

900

cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga gcatgcggat

960

taattcgatg caacgcgaag aaccttacca aggcttgaca tgggccggtg gttcccggag

1020

acgggagcgt cccctttttg tgggctggtt cacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

1080

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtctcg tgttgccagc

1140

acgttgtggt ggggactcgc gggagactgc cggggtcaac tcggaggagg gtggggatga

1200

cgtcaaatca tcatgcccct tatgtcttgg gcttcacgca tgctacaatg gccggtacag

1260

tgggttgcga tgtcgtgagg cggagcgaat ccctgaaagc cggtctcagt tcggatcggt

1320

gtctgcaact cgacaccgtg aagttggagt cgctagtaat cgcagatcag caacgctgcg

1380

gtgaatacgt tctcgggccc tgtacacacc gcccgtcacg tcatgaaagt cggcaacacc

1440

cgaagcccgt ggccttatgg ggagcggtcg aaggtggggc tggtgattgg gacgaagtcg

1500

taacaaggta gccgtaccgg aaggtgcggt tggatcacct cctt

1544

<210> 86

<211> 1362

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. oral clone IP073

<400> 86

gagtttgatt ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgagta acctgccctc ttctcttgga taactgcttg

120

aaagggcggc taatacggga tgttgaaagt tggtggggga tgggctcgcg gcttatcagc

180

ttgttggtgg ggtgatggcc taccaaggcg gtgacgggta gccggcctga gagggtggac

240

ggtcacactg ggactgagac acggcccaga ctcctgcggg aggcagcagt gggggatttt

300

gcacaatggg cgcaagcctg atgcagcgac gccgcgtgag ggatggaggc cttcgggttg

360

tgaacctctg tcgccggtga tgttgacggt agccgggtat gaagtgccgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtagggcgcg agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaaga

480

gctcgtaggc ggctggtcgc gtctgtcgtg aaatcctctg gcttaactgg gggcgtgcgg

540

tgggtacggg ccggcttgag tgcggtaggg gaggctggaa ttcctggtgt agcggtggaa

600

tgcgcagata tcaggaggaa caccggtggc gaaggcgggt ctctgggccg actgacgctg

660

aggagcgaaa gcgtggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gctgtaaacg

720

ttgggcacta ggtgtggggg cttccgcgcc gtagctaacg cattaagtgc cccgcctggg

780

gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag

840

catgcggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccaa ggcttgacat gcacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccttgtctc gtgttgccag cacgtgggga ctcgcgggag actgccgggg tcaactcgga

1020

ggagggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgt cttgggcttc acgcatgcta

1080

caatggccgg cagagggctg cgataccgtg aggtggagcg aatcccttcc ggtctcagtt

1140

cggacggtgt ctgcaactcg acaccggaag ttggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa

1200

cgctgcggtg aatacgttct cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca tgaaagtcgg

1260

caacacccga agcccgtgcg agcggtcgaa ggtggggctg gtgattggga cgaagtcgta

1320

acaaggtagc cgtaccggaa ggtgcggctg gatcacctcc tt

1362

<210> 87

<211> 1543

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. oral clone IP081

<400> 87

gagtttgatt ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

ggcccgctct cttttttggg ggtgggttga gtggcgaacg ggtgagtatc acgtgagtaa

120

cctgccccct gctcctggat aactgcttga aagggcggct aatacggggt gtgccggctg

180

gtccgcatgg gcctggtcgg gatagtttca tcttcgggtg tttcggtggg ggatgggctc

240

gcggcctatc agcttgttgg tggggtgatg gcccaccaag gcggtgacgg gtagccggcc

300

tgagagggtg ggcggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctgc gggaggcagc

360

agtggggggt attgcacaat gggcggaagc ctgatgcagc gacgtcgcgt gagggatgga

420

ggccttcggg ttgtgaacct ctttctccgg tggtgaaggc cctgtccgtt gcggcggggt

480

tgacggtagc cgggtatgaa gcgccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

gggcgcgagc gttgtccgga attattgggc gtgaagggct tgtaggcggc cggtcgcgtc

600

cgccgtgaaa ttctccggct caaccggggg cttgcggtgg gtacgggccg gctggagtgc

660

ggtaggggag gctggaactc ctggtgtagc ggtggaatgc gcagatatca ggaggaacac

720

cggtggcgaa ggcgggtctc tgggccgtta ctgacgctga ggagcgaaag cgtggggagc

780

gaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacgt tgggcactag gtgtgggggg

840

ccttttccgg gtcttccgcg ccgtagctaa cgcattaagt gccccgcctg gggagtacgg

900

tcgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggcgg agcatgcgga

960

ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc aaggcttgac atgtgccggt cggctccgga

1020

gacggggttt cctccttgtg gggccggttc acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt

1080

gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtctcgt gttgccagca

1140

cgttgtggtg gggactcgcg ggagactgcc ggggtcaact cggaggaggg tggggatgac

1200

gtcaaatcat catgcccctt atgtcttggg cttcacgcat gctacaatgg ccggtacagt

1260

gggttgcgat gtcgtgaggc ggagcgaatc cctgaaagcc ggtctcagtt cggatcggtg

1320

tctgcaactc gacaccgtga agttggagtc gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg

1380

tgaatacgtt ctcgggcctt gtacacaccg cccgtcacgt catgaaagtc ggcaacaccc

1440

gaagcccgtg gccttatggg gagcggtcga aggtggggct ggtgattggg acgaagtcgt

1500

aacaaggtag ccgtaccgga aggtgcggct ggatcacctc ctt

1543

<210> 88

<211> 1366

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. oral clone JA063

<400> 88

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgagta acctgccccc ttcttctgga taaccgcatg

120

aaagtgtggc taatacggga tattgaaagt tggtggggga tgggctcgcg gcctatcagc

180

ttgttggtgg ggtgatggcc taccaaggcg gtgacgggta gccggcctga gagggtggac

240

ggtcacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

300

gcacaatggg cgcaagcctg atgcagcgac gccgcgtgag ggatggaggc cttcgggttg

360

tgaacctctt tcgccagtga agctgacggt agctggataa gaagcgccgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gtggtaatac gtagggcgcg agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaaga

480

gctcgtaggc ggctggtcgc gtctgtcgtg aaatcctctg gcttaactgg gggcttgcgg

540

tgggtacggg ccggcttgag tgcggtaggg gaggctggaa ctcctggtgt agcggtggaa

600

tgcgcagata tcaggaagaa caccggtggc gaaggcgggt ctctgggccg actgacgctg

660

aggagcgaaa gcgtggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

ttgggcacta ggtgtggggg tttccgcgcc gtagctaacg cattaagtgc cccgcctggg

780

gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag

840

catgcggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccaa ggcttgacat gcacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccttgtctc gtgttgccag cacgtgggga ctcgcgggag actgccgggg tcaactcgga

1020

ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgt cttgggcttc acgcatgcta

1080

caatggccgg cagagggctg cgataccgtg aggtggagcg aatcccttcc ggtctcagtt

1140

cggacggtgt ctgcaactcg acaccggaag ttggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa

1200

cgctgcggtg aatacgttct cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca tgaaagtcgg

1260

caacacccga agcccgtgcc tgggagcggt cgaaggtggg gctggtgatt gggacgaagt

1320

cgtaacaagg tagccgtacc ggaaggtgcg gctggaacac ctcctt

1366

<210> 89

<211> 1563

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. oral taxon 170

<400> 89

tttgtttgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gtgaagcgcc ttcctttgtg gtgggtgtgg atgagtggcg aacgggtgag

120

taacacgtga gtaacctgcc cccttcttct ggataaccgc atgaaagtgt ggctaatacg

180

ggatattctg tgcctgctgc atggtgggtg tgggaaagat tgcgcctttg ggtgtttttg

240

gtgggggatg ggctcgcggc ctatcagctt gttggtgggg tgatggccta ccaaggcggt

300

gacgggtagc cggcctgaga gggtggacgg tcacactggg actgagacac ggcccagact

360

cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat gcagcgacgc

420

cgcgtgaggg atggaggcct tcgggttgtg aacctctttc gccagtgaag caggcctgtc

480

cctgtgtggg tgggttgacg gtagctggat aagaagcgcc ggctaactac gtgccagcag

540

ccgcggtaat acgtagggcg cgagcgttgt ccggaattat tgggcgtaaa gagctcgtag

600

gcggctggtc gcgtctgtcg tgaaatcctc tggcttaact gggggcttgc ggtgggtacg

660

ggccggcttg agtgcggtag gggaggctgg aactcctggt gtagcggtgg aatgcgcaga

720

tatcaggaag aacaccggtg gcgaaggcgg gtctctgggc cgttactgac gctgaggagc

780

gaaagcgtgg ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgttgggc

840

actaggtgtg gggggccttt tccgggtttt ccgcgccgta gctaacgcat taagtgcccc

900

gcctggggag tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc

960

ggcggagcat gcggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc ttaccaaggc ttgacatgtg

1020

ccggtttgct tcggagacgg ggtttcctcc tttgtggggg ctggttcaca ggtggtgcat

1080

ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt

1140

gtctcgtgtt gccagcacgt tgtggtgggg actcgcggga gactgccggg gtcaactcgg

1200

aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg tcttgggctt cacgcatgct

1260

acaatggccg gtacagaggg ctgcgatacc gtgaggtgga gcgaatccct taaagccggt

1320

ctcagttcgg atcggtgtct gcaactcgac accgtgaagt tggagtcgct agtaatcgca

1380

gatcagcaac gctgcggtga atacgttctc gggccttgta cacaccgccc gtcacgtcat

1440

gaaagtcggc aacacccgaa gcccgtggcc ctatggggag cggtcgaagg tggggctggt

1500

gattgggacg aagtcgtaac aaggtagccg taccggaagg tgcggctgga tcacctcctt

1560

tct

1563

<210> 90

<211> 1561

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. oral taxon 171

<400> 90

tttgtttgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gtgaaggggc ctgcttttgt gggtcctgga tgagtggcga acgggtgagt

120

aacacgtgag taacctgccc ccttcttctg gataaccgca tgaaagtgtg gctaatacgg

180

gatattctgt gcctgctgca tggtgggtgt gggaaagatt gtgcctttgg gtgttttcgg

240

tgggggatgg gctcgcggcc tatcagcttg ttggtggggt gatggcctac caaggcggtg

300

acgggtagcc ggcctgagag ggtggacggt cacactggga ctgagacacg gcccagactc

360

ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagcgacgcc

420

gcgtgaggga tggaggcctt cgggttgtga acctctttcg ccagtgaagc aggcctgtcc

480

cttttgtggg tgggttgacg gtagctggat aagaagcgcc ggctaactac gtgccagcag

540

ccgcggtaat acgtagggcg cgagcgttgt ccggaattat tgggcgtaaa gagctcgtag

600

gcggctggtc gcgtctgtcg tgaaatcctc tggcttaact gggggcttgc ggtgggtacg

660

ggccggcttg agtgcggtag gggagactgg aactcctggt gtagcggtgg aatgcgcaga

720

tatcaggaag aacaccggtg gcgaaggcgg gtctctgggc cgttactgac gctgaggagc

780

gaaagcgtgg ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgttgggc

840

actaggtgtg gggggccttt tccgggtctt ccgcgccgta gctaacgcat taagtgcccc

900

gcctggggag tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc

960

ggcggagcat gcggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc ttaccaaggc ttgacatgtg

1020

ccggtcggct ccggagacgg ggtttcctcc ttgtggggcc ggttcacagg tggtgcatgg

1080

ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt

1140

cccgtgttgc cagcacgttg tggtggggac tcgcgggaga ctgccggggt caactcggag

1200

gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgtc ttgggcttca cgcatgctac

1260

aatggccggt acagagggct gcgataccgt gaggtggagc gaatccctta aagccggtct

1320

cagttcggat cggtgtctgc aactcgacac cgtgaagttg gagtcgctag taatcgcaga

1380

tcagcaacgc tgcggtgaat acgttctcgg gccttgtaca caccgcccgt cacgtcatga

1440

aagtcggcaa cacccgaagc ccgtggccct acggggagcg gtcgaaggtg gggctggtga

1500

ttgggacgaa gtcgtaacaa ggtagccgta ccggaaggtg cggctggatc acctcctttc

1560

t

1561

<210> 91

<211> 1551

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. oral taxon 178

<400> 91

tttgttcgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg cgcctgtcct ctggttttcc ggggggtggg tgagtggcga acgggtgagt

120

aacacgtgag taacctgccc ccttcttcgg gataacggtc tgaaagggct gctaataccg

180

ggtattcact ggtctccgca tggggtctgg tggaaaggtt ttttctggtg ggggatgggc

240

tcgcggccta tcagcttgtt ggtggggtga tggcccacca aggctttgac gggtagccgg

300

cctgagaggg tgaccggtca cattgggact gagatacggc ccagactcct acgggaggca

360

gcagtgggga atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gcgacgccgc gtgagggatg

420

gaggccttcg ggttgtgaac ctctttcgcc cgtggtcaag ccgcgacgtg ggtcgtggtg

480

agggtagtgg gtaaagaagc gccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg

540

gcgcgagcgt tgtccggaat tattgggcgt aaagggcttg taggcggctg gtcgcgtctg

600

ccgtgaaatc ctctggctca actgggggcg tgcggtgggt acgggctggc ttgagtgcgg

660

taggggaggc tggaactcct ggtgtagcgg tggaatgcgc agatatcagg aagaacaccg

720

gtggcgaagg cgggtctctg ggccgttact gacgctgagg agcgaaagcg tggggagcga

780

acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacgttg ggcactaggt gtgggggcca

840

cccgtggttc ccgcgccgta gctaacgctt taagtgcccc gcctggggag tacggccgca

900

aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat gcggattaat

960

tcgatgcaac gcgaagaacc ttaccaaggc ttgacatgcg ccccgggcgc gcggagacgc

1020

gcgcgcattt ggttgggggt gtgcaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1080

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgccct atgttgccag cgcgttgtgg

1140

cggggactcg tgggggactg ccggggttaa ctcggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc

1200

atcatgcccc ttatgtcttg ggcttcacgc atgctacaat ggccggtaca gagggttgcg

1260

atgccgtgag gcggggcgaa tcccttaaag ccggtctcag ttcggattgg ggtctgcaac

1320

tcgaccccat gaaggtggag tcgctagtaa tcgcagatca gcaacgctgc ggtgaatacg

1380

ttctcgggcc ttgtacacac cgcccgtcac gtcacgaaag ttggtaacgc ccgaagccca

1440

tggcccaacc ggctcttgct ggggggagtg gtcgaaggtg ggatcggcga ttgggacgaa

1500

gtcgtaacaa ggtagccgta ccggaaggtg cggctggatc acctcctttc t

1551

<210> 92

<211> 1545

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. oral taxon 180

<400> 92

tttgttcgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg ctgaagctca gcttttgttg ggtggatgag tggcgaacgg gtgagtaaca

120

cgtgagtaac ctgccccctt ctttgggata acgcccggaa acgggtgcta atactggata

180

ttcactggtc ttcgcatggg ggttggtgga aagggttttt ctggtggggg atgggctcgc

240

ggcctatcag cttgttggtg gggtgatggc ctaccaaggc tttgacgggt agccggcctg

300

agagggtgac cggtcacatt gggactgaga tacggcccag actcctacgg gaggcagcag

360

tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcga cgccgcgtga gggatggagg

420

ccttcgggtt gtgaacctct ttcgctcatg gtcaagccgc aacaatggtt gtggtgaggg

480

tagtgggtaa agaagcgccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggcgc

540

gagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag ggcttgtagg cggttggtcg cgtctgccgt

600

gaaatcctct ggcttaactg ggggcgtgcg gtgggtacgg gctgacttga gtgcggtagg

660

ggagactgga actcctggtg tagcggtgga atgcgcagat atcaggaaga acaccggtgg

720

cgaaggcggg tctctgggcc gttactgacg ctgaggagcg aaagcgtggg gagcgaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgctgtaa acgttgggca ctaggtgtgg gggccacccg

840

tggtttctgc gccgtagcta acgctttaag tgccccgcct ggggagtacg gccgcaaggc

900

taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggcg gagcatgcgg attaattcga

960

tgcaacgcga agaaccttac caaggcttga catgcacggc ggcactgcag agatgtggtg

1020

gcatttagtt ggtcgtgtgc aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

1080

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgccctatgt tgccagcacg tgatggtggg

1140

gactcgtggg ggactgccgg ggttaactcg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca

1200

tgccccttat gtcttgggct tcacgcatgc tacaatggtt ggtacagagg gttgcgatac

1260

tgtgaggtgg agcgaatccc ttaaagccag tctcagttcg gattggggtc tgcaactcga

1320

ccccatgaag gtggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttct

1380

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca cgaaagttgg taacacccga agcccatggc

1440

ctaaccgctt ttgcgggggg agtggtcgaa ggtgggattg gcgattggga cgaagtcgta

1500

acaaggtagc cgtaccggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1545

<210> 93

<211> 1548

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. oral taxon 848

<400> 93

tttttgtgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg atgaagcgct gtctttttga tggtgtggat tagtggcgaa cgggtgagta

120

atacgcgggc aacctgcccc tctgcttcgg gataagcttt ggaaacgggg tctaataccg

180

gatgtgcctg tctggtcgca tggctgggcg gggaaagatg tttttcggcg ggggatgggc

240

tcgcggccta tcagcttgtt ggtggggtga cggcctacca aggcgtcgac gggtagccgg

300

cctgagaggg tggtcggcca cactgggact gagatacggc ccagactcct acgggaggca

360

gcagtggggg atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gcgacgccgc gtgggggatg

420

gaggctttcg ggttgtaaac ccctttcggc gcgggacaag gctccgtttg gcggggttga

480

gggtacgcgt caaagaagcg ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg

540

cgcgagcgtt gtccggaatt attgggcgta aagggctcgt aggcggcttg tcgcgtctgc

600

tgtgaaaacg cggggctcaa ctccgcgcgt gcagtgggta cgggcaggct ggagtgcggc

660

aggggtggct ggaattcctg gtgtagcggt ggaatgcgca gatatcagga agaacaccga

720

tggcgaaggc aggccactgg gccgtcactg acgctgagga gcgaaagcgt ggggagcgaa

780

caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgttgg gaactaggtg tggggtctgt

840

tccacggatt ctgcgccgga gctaacgcgt taagttcccc gcctggggag tacggccgca

900

aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat gcggattaat

960

tcgatgcaac gcgaagaacc ttaccaaggc ttgacatgtg ccgggagggc gcggagacgc

1020

gtctgccttc gggccggttc acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtcccgt gttgccagcg cgttgtggcg

1140

gggactcacg ggggactgcc ggggtcaact cggaggaagg tggggacgac gtcaaatcat

1200

catgcccctt atgccttggg cttcacgcat gctacaatgg ccggtacaga gggtggcgat

1260

gccgtgaggc ggagcgaatc ttgtaaagcc ggtctcagtt cggatcgggg tctgcaactc

1320

gggcccgtga agtcggagtc gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg tgaatacgtt

1380

ctcgggcctt gtacacaccg cccgtcacgt cacgaaagtc ggcgacgccc gaagcccgtg

1440

gctctgcttg tgcggggagc ggtcgaaggc ggggttggcg attgggacga agtcgtaaca

1500

aggtagccgt accggaaggt gcggctggat cacctccttt ctagggag

1548

<210> 94

<211> 1505

<212> DNA

<213> Actinomyces sp. oral taxon C55

<400> 94

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcggac

60

ggactgcttg ggggcttgct cctgggtggt gagtggcgaa cgggtgagta acacgtgagt

120

aacctgccct cttcttcggg ataacggttg gaaacggctg ctaataccgg gtattcactg

180

gtcctcgcat gggggttggt ggaaaggggt ttttctggtg ggggatgggc tcgcggctta

240

tcagcttgtt ggtggggtga tggcttacca aggctttgac gggtagccgg cctgagaggg

300

tgaccggtca cattgggact gagatacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga

360

attttgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gcgacgccgc gtgagggatg gaggccttcg

420

ggttgtgaac ctctttcgct catggtcaag ccgcagtttt gtctgtggtg agggtagtgg

480

gtaaagaagc gccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gcgcgagcgt

540

tgtccggaat tattgggcgt aaagggcttg taggcggctt gtcgcgtctg ccgtgaaatc

600

ctctggctta actgggggcg tgcggtgggt acgggctggc ttgagtgcgg taggggagac

660

tggaattcct ggtgtagcgg tggaatgcgc agatatcagg aggaacaccg gtggcgaagg

720

cgggtctctg ggccgttact gacgctgagg aacgaaagca tggggagcga acaggattag

780

ataccctggt agtccatgct gtaaacgttg ggcactaggt gtgggggccg tccttggttt

840

ctgcgccgta gctaacgctt taagtgcccc gcctggggag tacggccgca aggctaaaac

900

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat gcggattaat tcgatgcaac

960

gcgaagaacc ttaccaaggc ttgacatgca ccgcgacact gcagagatgt ggtggccttc

1020

ggggtggtgt gcaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1080

gtcccgcaac gagcgcaacc cttgccctat gttgccagca cgttgtggtg gggactcgtg

1140

ggggactgcc ggggttaact cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt

1200

atgtcttggg cttcacgcat gctacaatgg caggtacaga gggttgcgat gccgtgaggt

1260

ggagcgaatc ccttaaagct tgtctcagtt cggattgggg tctgcaactc gaccccatga

1320

aggtggagtc gctagtaatc gcagatcagc aacgctgggg tgaatacgtt ctcgggcctt

1380

gtacacaccg cccgtcacgt cacgaaagtt ggtaacaccc gaagcccatg gcccaaccat

1440

ttcggtgggg ggagtggtcg aaggtgggat tggcgattgg gacgaagtcg taacaaggta

1500

gccgt

1505

<210> 95

<211> 1543

<212> DNA

<213> Actinomyces urogenitalis

<400> 95

tttgtttgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gtgaagctcc agcttgctgg ggtggatgag tggcgaacgg gtgagtaaca

120

cgtgagtaac ctgccccctt cttctggata actgcttgaa agggtagcta atacgggata

180

ttctggcctg ctcgcatggg tgggtttgga aaggtttttt ctggtggggg atgggctcgc

240

ggcctatcag cttgttggtg gggtgatggc ctaccaaggc ggtgacgggt agccggcctg

300

agagggtgga cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

360

tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcga cgccgcgtga gggatggagg

420

ccttcgggtt gtaaacctct ttcgccagtg aagcaggcca tcttctttgt ggggtggttg

480

acggtagctg gataagaagc gccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg

540

gcgcgagcgt tgtccggaat tattgggcgt aaagagctcg taggcggctg gtcgcgtctg

600

tcgtgaaatc ccctggctta actgggggct tgcggtgggt acgggccggc ttgagtgcgg

660

taggggagac tggaattcct ggtgtagcgg tggaatgcgc agatatcagg aggaacaccg

720

gtggcgaagg cgggtctctg ggccgttact gacgctgagg agcgaaagcg tggggagcga

780

acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgttg ggcactaggt gtgggggctc

840

tttccggggt ttccgcgccg tagctaacgc attaagtgcc ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggctaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggcggagc atgcggatta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttaccaag gcttgacatg tgagcgtctg cctcagagat

1020

ggggtttcct ccttgtgggg cgctttcaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc

1080

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gtcccgtgtt gccagcacgt

1140

tgtggtgggg actcgcggga gactgccggg gtcaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1200

aaatcatcat gccccttatg tcttgggctt cacgcatgct acaatggccg gtacagaggg

1260

ttgcgatgtc gtgaggcgga gcgaatccct taaagccggt ctcagttcgg atcggtgtct

1320

gcaactcgac accgtgaagt tggagtcgct agtaatcgca gatcagcaac gctgcggtga

1380

atacgttctc gggccttgta cacaccgccc gtcacgtcat gaaagtcggc aacacccgaa

1440

gcccgtggcc ttacggggag cggtcgaagg tggggctggt gattgggacg aagtcgtaac

1500

aaggtagccg taccggaagg tgcggctgga tcacctcctt tct

1543

<210> 96

<211> 1556

<212> DNA

<213> Actinomyces viscosus

<400> 96

tttgtttgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gtgaagggat cagcttgctg gttctggatg agtggcgaac gggtgagtaa

120

cacgtgagta acctgccccc ttcttctgga taaccgcatg aaagtgtggc taatacggga

180

tattctgggt ctgtcgcatg gcgggcctgg gaaagatgcg cctttgggtg tttttggtgg

240

gggatgggct cgcggcctat cagcttgttg gtggggtgat ggcctaccaa ggcggtgacg

300

ggtagccggc ctgagagggt ggacggtcac actgggactg agacacggcc cagactccta

360

cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag cgacgccgcg

420

tgagggatgg aggccttcgg gttgtaaacc tctttcgcca gtgaagcagg cctgtccctt

480

gtgggtgggt tgacggtagc tggataagaa gcgccggcta actacgtgcc agcagccgcg

540

gtaatacgta gggcgcgagc gttgtccgga attattgggc gtaaagagct cgtaggcggc

600

tggtcgcgtc tgtcgtgaaa tcctctggct taactggggg cttgcggtgg gtacgggccg

660

gcttgagtgc ggtaggggag actggaactc ctggtgtagc ggtggaatgc gcagatatca

720

ggaagaacac cggtggcgaa ggcgggtctc tgggccgtta ctgacgctga ggagcgaaag

780

cgtggggagc gaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacgt tgggcactag

840

gtgtgggggg ccttttccgg gtcttccgcg ccgtagctaa cgcattaagt gccccgcctg

900

gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggcgg

960

agcatgcgga ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc aaggcttgac atgtgccggt

1020

cggctccgga gacggggttt cctccttgtg gggccggttc acaggtggtg catggttgtc

1080

gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtcccgt

1140

gttgccagca cgttgtggtg gggactcgcg ggagactgcc ggggtcaact cggaggaagg

1200

tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgtcttggg cttcacgcat gctacaatgg

1260

ccggtacaga gggctgcgat accgtgaggt ggagcgaatc ccttaaagcc ggtctcagtt

1320

cggatcggtg tctgcaactc gacaccgtga agttggagtc gctagtaatc gcagatcagc

1380

aacgctgcgg tgaatacgtt ctcgggcctt gtacacaccg cccgtcacgt catgaaagtc

1440

ggcaacaccc gaagcccgtg gccctacggg gagcggtcga aggtggggct ggtgattggg

1500

acgaagtcgt aacaaggtag ccgtaccgga aggtgcggct ggatcacctc ctttct

1556

<210> 97

<211> 1331

<212> DNA

<213> Adlercreutzia equolifaciens

<400> 97

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgacca acctgccccg cgctccggga caaccgctgg

120

aaacggcggc taataccgga tgctgaaagc ggcgcgggat ggggtcgcgg cccattaggt

180

agacggcggg gtaacggccc accgtgcccg cgatgggtag ccggactgag aggtcgaccg

240

gccacattgg gactgagata cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaattttg

300

cgcaatgggg gcaaccctga cgcagcaacg ccgcgtgcgg gacgaaggcc ttcgggttgt

360

aaaccgcttt cagcagggaa gaagacggta cctgcagaag aagctccggc taactacgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg tagggggcga gcgttatccg gattcattgg gcgtaaagcg

480

cgcgtaggcg gccgcctaag cggaacctct aatcccgggg ctcaacctcg ggccgggttc

540

cggactgggc ggctcgagtg cggtagaggc aggcggaatt cccggtgtag cggtggaatg

600

cgcagatatc gggaagaaca ccgatggcga aggcagcctg ctgggccgac tgacgctgag

660

gcgcgaaagc tgggggagcg aacaggatta gataccctgg tagtcccagc cgtaaacgat

720

ggacgctagg tgtgggggcc cccgtgccgc agccaacgca ttaagcgtcc cgcctgggga

780

gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cagcggagca

840

tgtggcttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggg cttgacatgc gcaggtggtg

900

catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

960

cccgtcccgt gttgccagca tggggactcg cgggagactg ccggcgtcaa gccggaggaa

1020

ggtggggacg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgccctg ggctgcacac gtgctacaat

1080

ggccggcaga gggttgccac cccgcgaggg ggagcggatc ccggccggtc ccagttcgga

1140

cgcaggctgc aacccgcctg cggaagtcgg agttgctagt aatcgcggat cagcatgccg

1200

cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccacccga gtcgtctgca

1260

cccgaagccg ccgccgacgg aggcgtcgaa ggtgtggagg gtaagggggg tgaagtcgta

1320

acaaggtaac c

1331

<210> 98

<211> 1488

<212> DNA

<213> Aerococcus sanguinicola

<400> 98

ctcaggacga acgctggcgg catgcctaat acatgcaagt cgagcgaacc gacgaagtgc

60

ttgcacttct gacgttagcg gcggacgggt gagtaacacg taaggaacct acctatgagc

120

gggggacaac atccggaaac gggtgctaat accgcatagt aatttgtcag gcatctgaca

180

aattggaaag acggcttttg ctgtcactca tagatggtct tgcggtgcat tagctagttg

240

gtgggataaa agcttaccaa ggccatgatg catagccgac ctgagagggt aatcggccac

300

actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtagggaa tcttccgcaa

360

tgggcgcaag cctgacggag caatgccgcg tgagtgaaga aggttttcgg atcgtaaaac

420

tctgttgtaa gagaagaaca aattgtagag taactgctac agtcttgacg gtatcttacc

480

agaaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg caagcgttgt

540

ccggatttat tgggcgtaaa gggagcgcag gtggtttctt aagtctgatg tgaaagccca

600

cggcttaacc gtggagggtc attggaaact gggaaacttg agtgcagaag aggaaagtgg

660

aactccatgt gtagcggtgg aatgcgtaga tatatggaag aacaccagtg gcgaaggcga

720

ctttctggtc tgtaactgac actgaggctc gaaagcgtgg gtagcaaaca ggattagata

780

ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt gctaggtgtt ggagggtttc cgcccttcag

840

tgccgcagtt aacgcattaa gcactccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctgaaactca

900

aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg

960

aagaacctta ccaagtcttg acatcctttg accactctag agatagagct ttcccttcgg

1020

ggacaaagtg acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1080

gtcccgcaac gagcgcaacc cttattgtta gttgccagca tttagttggg cactctagcg

1140

agactgccgg tgacaaaccg gaggaaggcg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat

1200

gacttgggct acacacgtgc tacaatggat ggtacaacgg gctgcgaact cgcgagagtc

1260

agcgaatccc ttaaagccat tctcagttcg gattgcaggc tgcaactcgc ctgcatgaag

1320

ccggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcac gccgcggtga atacgttccc gggtcttgta

1380

cacaccgccc gtcacaccac gagagtttgt aacacccgaa gtcggtgagg taaccttttg

1440

gagccagccg ccgaaggtgg gacagatgat tggggtgaag tcgtaaca

1488

<210> 99

<211> 1546

<212> DNA

<213> Aerococcus urinae

<400> 99

atgagagttt gatcctggct caggacgaac gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg

60

agcgaaccga agaagtgctt gcacttctga cgttagcggc ggacgggtga gtaacacgta

120

aggaacctac cgataagcgg gggacaacat ccggaaacgg gtgctaatac cgcataggaa

180

acaccacctc atggtggtgt ttggaaagac ggctttgctg tcacttatcg atggccttgc

240

ggtgcattag ctcgttggtg gggtaacggc ctaccaaggc aatgatgcat agccgacctg

300

agagggtaat cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg gaggcagcag

360

tagggaatct tccgcaatgg gcgcaagcct gacggagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg

420

ttttcggatc gtaaagctct gttgtaagag aagaacaaat tggagagtaa ctgctccagt

480

cttgacggta tcttaccaga aagccacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

taggtggcaa gcgttgtccg gatttattgg gcgtaaaggg ggcgcaggcg gtttcttaag

600

tctgatgtga aagcccacgg cttaaccgtg gaagtgcatt ggaaactggg gaacttgagt

660

acagaagagg aaagtggaac tccatgtgta gcggtggaat gcgtagatat atggaagaac

720

accagtggcg aaggcgactt tctggtctgt cactgacgct gaggcccgaa agcgtgggta

780

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aggtgttgga

840

gggtttccac ccttcagtgc cggagttaac gcattaagca ctccgcctgg ggagtacggc

900

cgcaaggctg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

960

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca agtcttgaca tcctttgacc actctagaga

1020

tagagctttc ccttcgggga caaagtgaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc

1080

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt attgttagtt gccagcattg

1140

agttgggcac tctagcgaga ctgccggtga caaaccggag gaaggcgggg atgacgtcaa

1200

atcatcatgc cccttatgac ttgggctaca cacgtgctac aatggatggt acaacgagca

1260

gcgaccttgt gaaagcaagc gaatctctta aagccattct cagttcggat tgtagtctgc

1320

aactcgacta catgaagccg gaatcgctag taatcgcgga tcagcacgcc gcggtgaata

1380

cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac acctgaagtc

1440

ggtgaggtaa cctttggagc cagccgccga aggtgggaca gatgattggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtag ccgtaggtga acctgcggct ggatcacctc ctttct

1546

<210> 100

<211> 1419

<212> DNA

<213> Aerococcus urinaeequi

<220>

<221> modified_base

<222> (1092)..(1092)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 100

acatgcaagt cgagcgaaca gatgaagtgc ttgcacttct gacgttagcg gcgaacgggt

60

gagtaacacg taaggaatct acctataagc gggggataac attcggaaac gggtgctaat

120

accgcataat atcttcttcc gcatggaagg agattgaaag acggctctgc tgtcacttat

180

agatgacctt gcggtgcatt agttagttgg tggggtaacg gcctaccaag acgatgatgc

240

atagccgacc tgagagggtg atcggccaca ttgggactga gacacggccc aaactcctac

300

gggaggcagc agtagggaat cttccgcaat gggcgaaagc ctgacggagc aatgccgcgt

360

gagtgaagaa ggccttcggg tcgtaaaact ctgttataag agaagaacaa attgtagagt

420

aactgctaca gtcttgacgg tatcttatca gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc

480

cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag ggagcgcagg

540

tggtttctta agtctgatgt gaaagcccac ggcttaaccg tggagggtca ttggaaactg

600

ggaaacttga gtacagaaga ggaatgtgga actccatgtg tagcggtgga atgcgtagat

660

atatggaaga acaccagtgg cgaaggcgac attctggtct gttactgaca ctgaggctcg

720

aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg

780

ctaggtgttg gagggtttcc gcccttcagt gccgcagtta acgcattaag cactccgcct

840

ggggagtacg accgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg

900

gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caagtcttga catcctttga

960

ccaccctaga gatagggctt tcccttcggg gacaaagtga caggtggtgc atggttgtcg

1020

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ctattattag

1080

ttgccagcat tnagttgggc actctaatga gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg

1140

ggatgacgtc aaatcagcat gccccttatg acttgggcta cacacgtgct acaatggatg

1200

gtacaacgag tcgcaaaccc gcgagggcaa gcaaatctct taaagccatt ctcagttcgg

1260

attgcaggct gcaactcgcc tgcatgaagc cggaatcgct agtaatcgtg gatcagcacg

1320

ccacggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta

1380

acacccgaag tcggtgaggt aacctttatg gagccagcc

1419

<210> 101

<211> 1548

<212> DNA

<213> Aerococcus viridans

<400> 101

atgagagttt gatcctggct caggacgaac gctggcggca tgcctaatac atgcaagtcg

60

agcgaacaga tgaagtgctt gcacttctga cgttagcggc gaacgggtga gtaacacgta

120

aggaatctac ctataagcgg gggataacat tcggaaacgg gtgctaatac cgcataatat

180

tttcttccgc atggaagaag attgaaagac ggctctgctg tcacttatag atgaccttgc

240

ggtgcattag ttagttggtg gggtaatggc ctaccaagac gatgatgcat agccgacctg

300

agagggtgat cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg gaggcagcag

360

tagggaatct tccgcaatgg gcgaaagcct gacggagcaa tgccgcgtga gtgaagaagg

420

ccttcgggtc gtaaaactct gttataagag aagaacaaat tgtagagtaa ctgctacagt

480

cttgacggta tcttatcaga aagccacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

taggtggcaa gcgttgtccg gatttattgg gcgtaaaggg agcgcaggtg gtttcttaag

600

tctgatgtga aagcccacgg cttaaccgtg gagggtcatt ggaaactggg aaacttgagt

660

acagaagagg aatgtggaac tccatgtgta gcggtggaat gcgtagatat atggaagaac

720

accagtggcg aaggcgacat tctggtctgt tactgacact gaggctcgaa agcgtgggga

780

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aggtgttgga

840

gggtttccgc ccttcagtgc cgcagttaac gcattaagca ctccgcctgg ggagtacgac

900

cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

960

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca agtcttgaca tcctttgacc accctagaga

1020

tagggctttc ccttcgggga caaagtgaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc

1080

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct attattagtt gccagcattt

1140

agttgggcac tctaatgaga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1200

atcagcatgc cccttatgac ttgggctaca cacgtgctac aatggatggt acaacgagtc

1260

gcaaacccgc gagggcaagc aaatctctta aagccattct cagttcggat tgcaggctgc

1320

aactcgcctg catgaagccg gaatcgctag taatcgtgga tcagcacgcc acggtgaata

1380

cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac acccgaagtc

1440

ggtgaggtaa cctttatgga gccagccgcc gaaggtggga cagatgattg gggtgaagtc

1500

gtaacaaggt agccgtatcg gaaggtgcgg ctggatcacc tcctttct

1548

<210> 102

<211> 1357

<212> DNA

<213> Aeromicrobium marinum

<400> 102

aagtygagcg gtaaggctcc ttcgggagta cacgagcggc gaacgggtga gtaacacgtg

60

agcaatctgc ccttctcttc ggaataacca ttggaaacga tggctaatgc cgaatacgac

120

ctcggatcac atgttctgag gtggaaagct ccggcggaga aggatgagct cgcggcctat

180

cagctagttg gtgaggtaac ggctcaccaa ggcattgacg ggtagccggc ctgagagggt

240

gaccggccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

300

tattggacaa tgggcgaaac cttgatccag caacgccgcg tgagggatga cggccttcgg

360

gttgtaaacc tctttcagcg gggacgaagc gaaagtgacg gtacccgcag aagaaggacc

420

kgccaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggtc cgagcgttgt ccggaattat

480

tgggcgtaaa gggctcgtag gcggtttgtc gcgtcgggag tgaaaactca gggctcaacc

540

ctgagcgtgc ttccgatacg ggcagactag aggtatgcag gggagaacgg aattcctggt

600

gtagcggtgg aatgcgcaga tatcaggagg aacaccggtg gcgaaggcgg ttctctgggc

660

attacctgac gctgaggagc gaaagcatgg ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt

720

ccatgccgta aacgttgggc gctaggtgtg gggaccttcc acggtctccg tgccgcagct

780

aacgcattaa gcgccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga

840

cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgct gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta

900

cctgggtttg acatataccg gaaagctgca gagatgtagc cccccttgtg gtcggtatac

960

aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1020

gcgcaaccct cgttctatgt tgccagcacg taatggtggg gactcatagg agactgccgg

1080

ggtcaactcg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcttca tgccccttat gtccagggct

1140

tcaagcatgc tacaatggcc ggtacaaagg gctgcgaaac cgcaaggtgg agcgaatccc

1200

aaaaagccgg tctcagttcg gattggggtc tgcaactcga ccccatgaag tcggagtcgc

1260

tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1320

cgtcacgtca tgaaagtcgc aacacccgaa gccagtg

1357

<210> 103

<211> 1468

<212> DNA

<213> Aeromicrobium sp. JC14

<400> 103

ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgagcg gtaaggccct

60

ttcgggggta cacgagcggc gaacgggtga gtaacacgtg agcaatctgc ccctgtctct

120

gggataacca ctggaaacgg tggctaatac cggatatgac ctccttctgc atggttggtg

180

gtggaaaagt ccgctggaca gggatgagct cgcggcctat cagcttgttg gtggggtaat

240

ggcctaccaa ggcgacgacg ggtagccggc ctgagagggt gaccggccac actgggactg

300

agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa tgggcgaaag

360

cctgatccag caacgccgcg tgagggatga cggccttcgg gttgtaaacc tctttcagca

420

gggacgaagc gaaagtgacg gtacctgcag aagaaggacc ggccaactac gtgccagcag

480

ccgcggtaat acgtagggtc cgagcgttgt ccggaattat tgggcgtaaa gggctcgtag

540

gcggtttgtc acgtcgggag tgaaaactca gggcttaacc ctgagcgtgc ttccgatacg

600

ggctgactag agggatgcag gggagaacgg aattcctggt gtagcggtgg aatgcgcaga

660

tatcaggagg aacaccggtg gcgaaggcgg ttctctgggc atttcctgac gctgaggagc

720

gaaagcatgg ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacgttgggc

780

gctaggtgtg gggaccttcc acggtttccg tgccgcagct aacgcattaa gcgccccgcc

840

tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggc

900

ggagcatgct gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctgggtttg acatatgccg

960

gaaagcgcca gagatggtgc ccctttttgt cggtatacag gtggtgcatg gctgtcgtca

1020

gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctcg tcctatgttg

1080

ccagcacgtt atggtgggga ctcataggag actgccgggg tcaactcgga ggaaggtggg

1140

gatgacgtca agtcatcatg ccccttatgt ccagggcttc aagcatgcta caatggccgg

1200

tacaatgggc tgcgataccg cgaggtggag cgaatcccaa aaagccggtc tcagttcgga

1260

ttggggtctg caactcgacc ccatgaagtc ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcaacg

1320

ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacgtcatg aaagtcggca

1380

acacccgaag ccggtggcct aacccttgtg gagggagccg tcgaaggtgg ggctggcgat

1440

tgggacgaag tcgtaacaag tagccgta

1468

<210> 104

<211> 1503

<212> DNA

<213> Aeromonas allosaccharophila

<400> 104

gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc aagtcgagcg

60

gcagcgggaa agtagcttgc tacttttgcc ggcgagcggc ggacgggtga gtaatgcctg

120

gggatctgcc cagtcgaggg ggataacagt tggaaacgac tgctaatacc gcatacgccc

180

tacgggggaa agcaggggac cttcgggcct tgcgcgattg gatgaaccca ggtgggatta

240

gctagttggt gaggtaatgg ctcaccaagg cgacgatccc tagctggtct gagaggatga

300

tcagccacac tggaactgag acacggtcca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata

360

ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagcc atgccgcgtg tgtgaagaag gccttcgggt

420

tgtaaagcac tttcagcgag gaggaaaggt tggtagcgaa taactgccag ctgtgacgtt

480

actcgcagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgca

540

agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gcacgcaggc ggttggataa gttagatgtg

600

aaagccccgg gctcaacctg ggaattgcat ttaaaactgt ccagctagag tcttgtagag

660

gggggtagaa ttccaggtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tctggaggaa taccggtggc

720

gaaggcggcc ccctggacaa agactgacgc tcaggtgcga aagcgtgggg agcaaacagg

780

attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgtcgat ttggaggctg tgtccttgag

840

acgtggcttc cggagctaac gcgttaaatc gaccgcctgg ggagtacggc cgcaaggtta

900

aaactcaaat gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg

960

caacgcgaag aaccttacct ggccttgaca tgtctggaat ccctaagaga ttggggagtg

1020

ccttcgggaa tcagaacaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

1080

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct gtcctttgtt gccagcacgt aatggtggga

1140

actcaaggga gactgccggt gataaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat

1200

ggcccttacg gccagggcta cacacgtgct acaatggcgc gtacagaggg ctgcaagcta

1260

gcgatagtga gcgaatccca aaaagcgcgt cgtagtccgg atcggagtct gcaactcgac

1320

tccgtgaagt cggaatcgct agtaatcgca aatcagaatg ttgcggtgaa tacgttcccg

1380

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaccagaag tagatagctt

1440

aaccttcggg agggcgttta ccacggtgtg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1500

taa

1503

<210> 105

<211> 1490

<212> DNA

<213> Aeromonas enteropelogenes

<220>

<221> modified_base

<222> (187)..(187)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (197)..(197)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (212)..(212)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (662)..(664)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (677)..(677)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1009)..(1009)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1107)..(1107)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1115)..(1115)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1329)..(1329)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 105

agtttgatca tggctcagat tgaacgctgg cggcaggcct aacacatgca agtcgagcgg

60

cagcgggaaa gtagcttgct acttttgccg gcgagcggcg gacgggtgag taatgcctgg

120

gaaattgccc agtcgagggg gataacagtt ggaaacgact gctaataccg catacgccta

180

cgggggnaag caggggncct tcgggccttg cncgattgga tatgcccagg tgggattagc

240

tagttggtga ggtaatggct caccaaggcg acgatcccta gctggtctga gaggatgatc

300

agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

360

gcacaatggg ggaaaccctg atgcagccat gccgcgtgtg tgaagaaggc cttcgggttg

420

taaagcactt tcagcgagga ggaaaggtca gtagctaata tctgctggct gtgacgttac

480

tcgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg agggtgcaag

540

cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg ttggataagt tagatgtgaa

600

agccccgggc tcaacctggg aattgcattt aaaactgtcc ggctagagtc ttgtagaggg

660

gnnnagaatt ccaggtntag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata ccggtggcga

720

aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag caaacaggat

780

tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtcgattt ggaggctgtg tccttgagac

840

gtggcttccg gagctaacgc gttaaatcga ccgcctgggg agtacggccg caaggttaaa

900

actcaaatga attgacgggg gccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa

960

cgcgaagaac cttacctggc cttgacatgt ctggaatcct gcagagatnc gggagtgcct

1020

tcgggaatca gaacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg

1080

ttaagtcccg caacgagcgc aaccccngtc ctttnttgcc agcacgtaat ggtgggaact

1140

caagggagac tgccggtgat aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatggc

1200

ccttacggcc agggctacac acgtgctaca atggcgcgta cagagggctg caagctagcg

1260

atagtgagcg aatcccaaaa agcgcgtcgt agtccggatt ggagtctgca actcgactcc

1320

atgaagtcng aatcgctagt aatcgcaaat cagaatgttg cggtgaatac gttcccgggc

1380

cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca ccagaagtag atagcttaac

1440

cttcgggagg gcgtttacca cggtgtgatt catgactggg gtgaagtcgt

1490

<210> 106

<211> 1547

<212> DNA

<213> Aeromonas hydrophila

<400> 106

taaattgaag agtttgatca tggctcagat tgaacgctgg cggcaggcct aacacatgca

60

agtcgagcgg cagcgggaaa gtagcttgct acttttgccg gcgagcggcg gacgggtgag

120

taatgcctgg gaaattgccc agtcgagggg gataacagtt ggaaacgact gctaataccg

180

catacgccct acgggggaaa gcaggggacc ttcgggcctt gcgcgattgg atatgcccag

240

gtgggattag ctagttggtg aggtaatggc tcaccaaggc gacgatccct agctggtctg

300

agaggatgat cagccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag

360

tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcca tgccgcgtgt gtgaagaagg

420

ccttcgggtt gtaaagcact ttcagcgagg aggaaaggtt gatgcctaat acgtatcaac

480

tgtgacgtta ctcgcagaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

gagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg cacgcaggcg gttggataag

600

ttagatgtga aagccccggg ctcaacctgg gaattgcatt taaaactgtc cagctagagt

660

cttgtagagg ggggtagaat tccaggtgta gcggtgaaat gcgtagagat ctggaggaat

720

accggtggcg aaggcggccc cctggacaaa gactgacgct caggtgcgaa agcgtgggga

780

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgtcgatt tggaggctgt

840

gtccttgaga cgtggcttcc ggagctaacg cgttaaatcg accgcctggg gagtacggcc

900

gcaaggttaa aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt

960

aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg gccttgacat gtctggaatc ctgcagagat

1020

gcgggagtgc cttcgggaat cagaacacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg

1080

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccctg tcctttgttg ccagcacgta

1140

atggtgggaa ctcaagggag actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca

1200

agtcatcatg gcccttacgg ccagggctac acacgtgcta caatggcgcg tacagagggc

1260

tgcaagctag cgatagtgag cgaatcccaa aaagcgcgtc gtagtccgga tcggagtctg

1320

caactcgact ccgtgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcaa atcagaatgt tgcggtgaat

1380

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttg caccagaagt

1440

agatagctta accttcggga gggcgtttac cacggtgtga ttcatgactg gggtgaagtc

1500

gtaacaaggt aaccctaggg gaacctgggg ttggatcacc tccttac

1547

<210> 107

<211> 1503

<212> DNA

<213> Aeromonas jandaei

<400> 107

gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc aagtcgagcg

60

gcagcgggaa agtagcttgc tacttttgcc ggcgagcggc ggacgggtga gtaatgcctg

120

gggatctgcc cagtcgaggg ggataactac tggaaacggt agctaatacc gcatacgccc

180

tacgggggaa agcaggggac cttcgggcct tgcgcgattg gatgaaccca ggtgggatta

240

gctagttggt gaggtaacgg ctcaccaagg cgacgatccc tagctggtct gagaggatga

300

tcagccacac tggaactgag acacggtcca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata

360

ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagcc atgccgcgtg tgtgaagaag gccttcgggt

420

tgtaaagcac tttcagcgag gaggaaaggt cagtagctaa tatctgctgg ctgtgacgtt

480

actcgcagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgca

540

agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gcacgcaggc ggttggataa gttagatgtg

600

aaagccccgg gctcaacctg ggaattgcat ttaaaactgt ccagctagag tcttgtagag

660

gggggtagaa ttccaggtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tctggaggaa taccggtggc

720

gaaggcggcc ccctggacaa agactgacgc tcaggtgcga aagcgtgggg agcaaacagg

780

attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgtcgat ttggaggctg tgtccttgag

840

acgtggcttc cggagctaac gcgttaaatc gaccgcctgg ggagtacggc cgcaaggtta

900

aaactcaaat gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg

960

caacgcgaag aaccttacct ggccttgaca tgtctggaat cctgcagaga tgcgggagtg

1020

ccttcgggaa tcagaacaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

1080

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct gtcctttgtt gccagcacgt aatggtggga

1140

actcaaggga gactgccggt gataaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat

1200

ggcccttacg gccagggcta cacacgtgct acaatggcgc gtacagaggg ctgcaagcta

1260

gcgatagtga gcgaatccca aaaagcgcgt cgtagtccgg atcggagtct gcaactcgac

1320

tccgtgaagt cggaatcgct agtaatcgca aatcagaatg ttgcggtgaa tacgttcccg

1380

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaccagaag tagatagctt

1440

aaccttcggg agggcgttta ccacggtgtg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1500

taa

1503

<210> 108

<211> 1546

<212> DNA

<213> Aeromonas salmonicida

<400> 108

aaattgaaga gtttgatcat ggctcagatt gaacgctggc ggcaggccta acacatgcaa

60

gtcgagcggc agcgggaaag tagcttgcta cttttgccgg cgagcggcgg acgggtgagt

120

aatgcctggg gatctgccca gtcgaggggg ataacagttg gaaacgactg ctaataccgc

180

atacgcccta cgggggaaag gaggggacct tcgggccttt cgcgattgga tgaacccagg

240

tgggattagc tagttggtgg ggtaatggct caccaaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgatc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg ggaaaccctg atgcagccat gccgcgtgtg tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagcactt tcagcgagga ggaaaggttg gcgcctaata cgtgtcaact

480

gtgacgttac tcgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg ttggataagt

600

tagatgtgaa agccccgggc tcaacctggg aattgcattt aaaactgtcc agctagagtc

660

ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtcgattt ggaggctgtg

840

tccttgagac gtggcttccg gagctaacgc gttaaatcga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg ccttgacatg tctggaatcc tgtagagata

1020

cgggagtgcc ttcgggaatc agaacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctgt cctttgttgc cagcacgtaa

1140

tggtgggaac tcaagggaga ctgccggtga taaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1200

gtcatcatgg cccttacggc cagggctaca cacgtgctac aatggcgcgt acagagggct

1260

gcaagctagc gatagtgagc gaatcccaaa aagcgcgtcg tagtccggat cggagtctgc

1320

aactcgactc cgtgaagtcg gaatcgctag taatcgcgaa tcagaatgtc gcggtgaata

1380

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggttgc accagaagta

1440

gatagcttaa ccttcgggag ggcgtttacc acggtgtgat tcatgactgg ggtgaagtcg

1500

taacaaggta accctagggg aacctggggt tggatcacct ccttac

1546

<210> 109

<211> 1503

<212> DNA

<213> Aeromonas trota

<400> 109

gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc aagtcgagcg

60

gcagcgggaa agtagcttgc tacttttgcc ggcgagcggc ggacgggtga gtaatgcctg

120

ggaaattgcc cagtcgaggg ggataacagt tggaaacgac tgctaatacc gcatacgccc

180

tacgggggaa agcaggggac cttcgggcct tgcgcgattg gatatgccca ggtgggatta

240

gctagttggt gaggtaatgg ctcaccaagg cgacgatccc tagctggtct gagaggatga

300

tcagccacac tggaactgag acacggtcca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata

360

ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagcc atgccgcgtg tgtgaagaag gccttcgggt

420

tgtaaagcac tttcagcgag gaggaaaggt cagtagctaa tatctgctgg ctgtgacgtt

480

actcgcagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgca

540

agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gcacgcaggc ggttggataa gttagatgtg

600

aaagccccgg gctcaacctg ggaattgcat ttaaaactgt ccggctagag tcttgtagag

660

gggggtagaa ttccaggtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tctggaggaa taccggtggc

720

gaaggcggcc ccctggacaa agactgacgc tcaggtgcga aagcgtgggg agcaaacagg

780

attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgtcgat ttggaggctg tgtccttgag

840

acgtggcttc cggagctaac gcgttaaatc gaccgcctgg ggagtacggc cgcaaggtta

900

aaactcaaat gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg

960

caacgcgaag aaccttacct ggccttgaca tgtctggaat cctgcagaga tgcgggagtg

1020

ccttcgggaa tcagaacaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

1080

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct gtcctttgtt gccagcacgt aatggtggga

1140

actcaaggga gactgccggt gataaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat

1200

ggcccttacg gccagggcta cacacgtgct acaatggcgc gtacagaggg ctgcaagcta

1260

gcgatagtga gcgaatccca aaaagcgcgt cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac

1320

tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgca aatcagaatg ttgcggtgaa tacgttcccg

1380

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaccagaag tagatagctt

1440

aaccttcggg agggcgttta ccacggtgtg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1500

taa

1503

<210> 110

<211> 1532

<212> DNA

<213> Aeromonas veronii

<220>

<221> modified_base

<222> (1495)..(1496)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1510)..(1510)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 110

gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc aagtcgagcg

60

gcagcgggaa agtagcttgc tacttttgcc ggcgagcggc ggacgggtga gtaatgcctg

120

gggatctgcc cagtcgaggg ggataactac tggaaacggt agctaatacc gcatacgcct

180

acgggggaaa gcaggggacc ttcgggcctt gcgcgattgg atgaacccag gtgggattag

240

ctagttggtg aggtaatggc tcaccaaggc gacgatccct agctggtctg agaggatgat

300

cagccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcca tgccgcgtgt gtgaagaagg ccttcgggtt

420

gtaaagcact ttcagcgagg aggaaaggtt ggtagctaat aactgccagc tgtgacgtta

480

ctcgcagaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa

540

gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg cacgcaggcg gttggataag ttagatgtga

600

aagccccggg ctcaacctgg gaattgcatt taaaactgtc cagctagagt cttgtagagg

660

ggggtagaat tccaggtgta gcggtgaaat gcgtagagat ctggaggaat accggtggcg

720

aaggcggccc cctggacaaa gactgacgct caggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgtcgatt tggaggctgt gtccttgaga

840

cgtggcttcc ggagctaacg cgttaaatcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

900

aactcaaatg aattgacggg ggccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgca

960

acgcgaagaa ccttacctgg ccttgacatg tctggaatcc tgtagagata cgggagtgcc

1020

ttcgggaatc agaacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg

1080

gttaagtccc gcaacgagcg caacccctgt cctttgttgc cagcacgtaa tggtgggaac

1140

tcaagggaga ctgccggtga taaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgg

1200

cccttacggc cagggctaca cacgtgctac aatggcgcgt acagagggct gcaagctagc

1260

gatagtgagc gaatcccaaa aagcgcgtcg tagtccggat cggagtctgc aactcgactc

1320

cgtgaagtcg gaatcgctag taatcgcaaa tcagaatgtt gcggtgaata cgttcccggg

1380

ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggttgc accagaagta gatagcttaa

1440

ccttcgggag ggcgtttacc acggtgtgat tcatgactgg ggtgaagtcg taacnnggta

1500

accctagggn aacctgcggc tggatcacct cc

1532

<210> 111

<211> 1420

<212> DNA

<213> Afipia genomosp. 4

<400> 111

tggctcagag cgaacgctgg cggcaggctt aacacatgca agtcgaacgg gcgtagcaat

60

acgtcagtgg cagacgggtg agtaacgcgt gggaacgtac cttttggttc ggaacaactg

120

agggaaactt cagctaatac cggataagcc cttacgggga aagatttatc gccgaaagat

180

cggcccgcgt ctgattagct agttggtgag gtaatggctc accaaggcga cgatcagtag

240

ctggtctgag aggatgatca gccacattgg gactgagaca cggcccaaac tcctacggga

300

ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggc gaaagcctga tccagccatg ccgcgtgagt

360

gatgaaggcc ctagggttgt aaagctcttt tgtgcgggaa gataatgacg gtaccgcaag

420

aataagcccc ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgaaggggg ctagcgttgc

480

tcggaatcac tgggcgtaaa gggtgcgtag gcgggtcttt aagtcagagg tgaaagcctg

540

gagctcaact ccagaactgc ctttgatact gaggatcttg agtatgggag aggtgagtgg

600

aactgcgagt gtagaggtga aattcgtaga tattcgcaag aacaccagtg gcgaaggcgg

660

ctcactggcc cataactgac gctgaggcac gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata

720

ccctggtagt ccacgccgta aacgatgaat gccagccgtt agtgggttta ctcactagtg

780

gcgcagctaa cgctttaagc attccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt aaaactcaaa

840

ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgac gcaacgcgca

900

gaaccttacc agcccttgac atgtccagga ccggtcgcag agatgtgacc ttctcttcgg

960

agcctggagc acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1020

gtcccgcaac gagcgcaacc cccgtcctta gttgctacca tttagttgag cactctaagg

1080

agactgccgg tgataagccg cgaggaaggt ggggatgacg tcaagtcctc atggccctta

1140

cgggctgggc tacacacgtg ctacaatggc ggtgacaatg ggatgctaag gggcgacccc

1200

tcgcaaatct caaaaagccg tctcagttcg gattgggctc tgcaactcga gcccatgaag

1260

ttggaatcgc tagtaatcgt ggatcagcat gccacggtga atacgttccc gggccttgta

1320

cacaccgccc gtcacaccat gggagttggt tttacctgaa gacggtgcgc taaccgcaag

1380

gaggcagccg gccacggtag ggtcagcgac tgggggaagt

1420

<210> 112

<211> 1540

<212> DNA

<213> Aggregatibacter actinomycetemcomitans

<400> 112

aattgaagag tttgatcatg gctcagattg aacgctggcg gcaggcttaa cacatgcaag

60

tcggacggta gcaggtaagt acttgtactt atgctgacga gtggcggacg ggtgagtaat

120

gcttgggaat ctgtcttatg gagggggata acgacgggaa actgtcgcta ataccgcgta

180

gaatcgggag atgaaagtgt gggaccttcg ggccacatgc cataggatga gcccaagtgt

240

gattaggtag ttggtggggt aaaggcctac caagccgacg atcgctagct ggtctgagag

300

gatggccagc cacaccggga ctgagacacg gcccggactc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaatattgcg caatgggggc aaccctgacg cagccatgcc gcgtgaatga agaaggcctt

420

cgggttgtaa agttctttcg gtgatgagga aggttggtgt gttaatagca tgccaaattg

480

acgttaaata cagaagaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggggg

540

gtgcgagcgt taatcggaat aactgggcgt aaagggcacg taggcggacc tttaagtgag

600

gtgtgaaatc cccgggctta acctgggaat tgcatttcat actgggggtc tggagtactt

660

tagggagggg tagaattcca cgtgtagcgg tgaaatgcgt agagatgtgg aggaataccg

720

aaggcgaagg cagccccttg gggatgtact gacgctgatg tgcgaaagcg tggggagcaa

780

acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacggtg tcgatttggg gattggggtt

840

tagccctggt gcccgaagct aacgtgataa atcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg

900

ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

960

atgcaacgcg aagaacctta cctactcttg acatccgaag aagaactcag agatgggttt

1020

gtgccttagg gagctttgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gttgtgaaat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg acttggtcgg

1140

gaactcaaag gagactgccg gtgataaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc

1200

atggccctta cgagtagggc tacacacgtg ctacaatggc gtatacagag ggtaaccaac

1260

cagcgatggg gagtgaatct cagaaagtac gtctaagtcc ggattggagt ctgcaactcg

1320

actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg cgaatcagaa tgttgcggtg aatacgttcc

1380

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgtaccaga agtagatagc

1440

ttaaccgaga ggggggcgtt taccacggta tgattcatga ctggggtgaa gtcgtaacaa

1500

ggtaaccgta ggggaacctg cggttggatc acctccttac

1540

<210> 113

<211> 1539

<212> DNA

<213> Aggregatibacter aphrophilus

<400> 113

aattgaagag tttgatcatg gctcagattg aacgctggcg gcaggcttaa cacatgcaag

60

tcgaacggta gcaggtaagt acttgtactt atgctgacga gtggcggacg ggtgagtaat

120

gcttggggat ctggcttatg gagggggata acgacgggaa actgtcgcta ataccgcgta

180

gaatcgggag atgaaagtgt gggaccttcg ggccacatgc cataggatga gcccaagtgg

240

gattaggtag ttggtggggt aatggcctac caagccgacg atctctagct ggtctgagag

300

gatgaccagc cacaccggga ctgagacacg gcccggactc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaatattgcg caatgggggc aaccctgacg cagccatgcc gcgtgaatga agaaggcctt

420

cgggttgtaa agttctttcg gtgacgagga aggttgttgt gttaatagcg caacaaattg

480

acgttaatca cagaagaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

540

gtgcgagcgt taatcggaat aactgggcgt aaagggcacg caggcggact tttaagtgag

600

gtgtgaaatc cccgggctta acctgggaat tgcatttcag actgggggtc tagagtactt

660

tagggagggg tagaattcca cgtgtagcgg tgaaatgcgt agagatgtgg aggaataccg

720

aaggcgaagg cagccccttg ggaatgtact gacgctcatg tgcgaaagcg tggggagcaa

780

acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacggtg tcgatttggg gattgtgctt

840

tgagcttggt gcccgtagct aacgtgataa atcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg

900

ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

960

atgcaacgcg aagaacctta cctactcttg acatccatgg aatcttgtag agatatgaga

1020

gtgccttcgg gaaccatgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gttgtgaaat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg atttggtcgg

1140

gaactcaaag gagactgccg gtgataaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc

1200

atggccctta cgagtagggc tacacacgtg ctacaatggc gtatacagag ggcgacgaag

1260

ccgcgaggtg gagtgaatct cagaaagtac gtctaagtcc ggattggagt ctgcaactcg

1320

actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg cgaatcagaa tgtcgcggtg aatacgttcc

1380

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgtaccaga agtagatagc

1440

ttaaccttcg gggggcgttt accacggtat gattcatgac tggggtgaag tcgtaacaag

1500

gtaaccgtag gggaacctgc ggttggatca cctccttac

1539

<210> 114

<211> 1543

<212> DNA

<213> Aggregatibacter segnis

<400> 114

ttgaactgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacaggag agagcttgct ttcttgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgcttggg aatctggctt atggaggggg ataacgacgg gaaactgtcg ctaataccgc

180

gtagagtcga gagacgaaag tgcgggaccg caaggccgca tgccatagga tgagcccaag

240

tgggattagg tagttggtgg ggtaatggcc taccaagccg acgatctcta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacaccg ggactgagac acggcccgga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcgcaatggg ggcaaccctg acgcagccat gccgcgtgaa tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagttctt tcggtgacga ggaaggcgtg atgtttaata ggcatcacga

480

ttgacgttaa tcacagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcgag cgttaatcgg aataactggg cgtaaagggc acgcaggcgg ctatttaagt

600

gaggtgtgaa atccccgggc ttaacctggg aattgcattt cagactgggt agctagagta

660

ctttagggag gggtagaatt ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaata

720

ccgaaggcga aggcagcccc ttgggaatgt actgacgctc atgtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg ctgtcgattt ggggattggg

840

ccttgagctt ggtgcccgaa gctaacgtga taaatcgacc gcctggggag tacggccgca

900

aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctactc ttgacatcca tggaatcttg tagagatatg

1020

agagtgcctt cgggaaccat gagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgttgtga

1080

aatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttatcc tttgttgcca gcgattcggt

1140

cgggaactca aaggagactg ccggtgataa accggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

atcatggccc ttacgagtag ggctacacac gtgctacaat ggcgtataca gagggcgacg

1260

aagccgcgag gtggagtgaa tctcacaaag tacgtctaag tccggattgg agtctgcaac

1320

tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcgaatca gaatgtcgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgtacc agaagtagat

1440

agcttaacct tcgggagggc gtttaccacg gtatgattca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtaacc gtaggggaac ctgcggttgg atcacctcct tac

1543

<210> 115

<211> 1492

<212> DNA

<213> Agrobacterium radiobacter

<400> 115

ctcaacatga gagtttgatc ctggctcaga acgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgagcg ccccgcaagg ggagcggcag acgggtgagt aacgcgtggg aatctaccct

120

tttctacgga ataacgcagg gaaacttgtg ctaataccgt atgtgtcctt cgggagaaag

180

atttatcggg aaaggatgag cccgcgttgg attagctagt tggtggggta aaggcctacc

240

aaggcgacga tccatagctg gtctgagagg atgatcagcc acattgggac tgagacacgg

300

cccaaactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattggac aatgggcgca agcctgatcc

360

agccatgccg cgtgagtgat gaaggcccta gggttgtaaa gctctttcac cggagaagat

420

aatgacggta tccggagaag aagccccggc taacttcgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

aagggggcta gcgttgttcg gaattactgg gcgtaaagcg cacgtaggcg gatcgatcag

540

tcaggggtga aatcccaggg ctcaaccctg gaactgcctt tgatactgtc gatctggagt

600

atggaagagg tgagtggaat tccgagtgta gaggtgaaat tcgtagatat tcggaggaac

660

accagtggcg aaggcggctc actggtccat tactgacgct gaggtgcgaa agcgtgggga

720

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatgtt agccgtcggg

780

cagtatactg ttcggtggcg cagctaacgc attaaacatt ccgcctgggg agtacggtcg

840

caagattaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

900

attcgaagca acgcgcagaa ccttaccagc ccttgacatc ctgtgttacc cgtagagata

960

tggggtccac ttcggtggcg cagagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt

1020

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caaccctcgc ccttagttgc cagcattcag

1080

ttgggcactc taaggggact gccggtgata agccgagagg aaggtgggga tgacgtcaag

1140

tcctcatggc ccttacgggc tgggctacac acgtgctaca atggtggtga cagtgggcag

1200

cgagcacgcg agtgtgagct aatctccaaa agccatctca gttcggattg cactctgcaa

1260

ctcgagtgca tgaagttgga atcgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg

1320

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag ttggttttac ccgaaggtag

1380

tgcgctaacc gcaaggaggc agctaaccac ggtagggtca gcgactgggg tgaagtcgta

1440

acaaggtagc cgtaggggaa cctgcggctg gatcacctcc tttctaagga ag

1492

<210> 116

<211> 1437

<212> DNA

<213> Agrobacterium tumefaciens

<400> 116

aacgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgaac gccccgcaag gggagtggca

60

gacgggtgag taacgcgtgg gaacataccc tttcctgcgg aatagctccg ggaaactgga

120

attaataccg catacgccct acgggggaaa gatttatcgg ggaaggattg gcccgcgttg

180

gattagctag ttggtggggt aaaggcctac caaggcgacg atccatagct ggtctgagag

240

gatgatcagc cacattggga ctgagacacg gcccaaactc ctacgggagg cagcagtggg

300

gaatattgga caatgggcgc aagcctgatc cagccatgcc gcgtgagtga tgaaggcctt

360

agggttgtaa agctctttca ccggagaaga taatgacggt atccggagaa gaagccccgg

420

ctaacttcgt gccagcagcc gcggtaatac gaagggggct agcgttgttc ggaattactg

480

ggcgtaaagc gcacgtaggc ggatatttaa gtcaggggtg aaatcccaga gctcaactct

540

ggaactgcct ttgatactgg gtatcttgag tatggaagag gtaagtggaa ttccgagtgt

600

agaggtgaaa ttcgtagata ttcggaggaa caccagtggc gaaggcggct tactggtcca

660

ttactgacgc tgaggtgcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

720

acgccgtaaa cgatgaatgt tagccgtcgg gcagtatact gttcggtggc gcagctaacg

780

cattaaacat tccgcctggg gagtacggtc gcaagattaa aactcaaagg aattgacggg

840

ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgcaga accttaccag

900

ctcttgacat tcggggtttg ggcagtggag acattgtcct tcagttaggc tggccccaga

960

acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

1020

gagcgcaacc ctcgccctta gttgccagca tttagttggg cactctaagg ggactgccgg

1080

tgataagccg agaggaaggt ggggatgacg tcaagtcctc atggccctta cgggctgggc

1140

tacacacgtg ctacaatggt ggtgacagtg ggcagcgaga cagcgatgtc gagctaatct

1200

ccaaaagcca tctcagttcg gattgcactc tgcaactcga gtgcatgaag ttggaatcgc

1260

tagtaatcgc agatcagcat gctgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc

1320

gtcacaccat gggagttggt tttacccgaa ggtagtgcgc taaccgcaag gaggcagcta

1380

accacggtag ggtcagcgac tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtag gggaacc

1437

<210> 117

<211> 1473

<212> DNA

<213> Agrococcus jenensis

<400> 117

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gatgaaggag gagcttgctc

60

ctccggatta gtggcgaacg ggtgagtaat acgtgagcaa tgtgcccttg actctgggat

120

aagcgctgga aacggcgtct aataccggat acgacgaccg gaggcatctc ctggtcgtgg

180

aaagaacttc ggtcaaggat cagctcacgg cctatcagct agttggtgag gtaacggctc

240

accaaggcga cgacgggtag ccggcctgag agggtgaccg gccacactgg gactgagaca

300

cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga

360

tgcagcaacg ccgcgtgagg gacgaaggcc ttcgggttgt aaacctcttt tagcagggaa

420

gaagcgaaag tgacggtacc tgcagaaaaa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg

480

gtaatacgta gggtgcaagc gttgtccgga attattgggc gtaaagagct cgtaggcggt

540

ttgtcacgtc tgctgtgaaa acccgaggct caacctcggg cttgcagtgg gtacgggcag

600

actagagtgc ggtaggggag attggaattc ctggtgtagc ggtggaatgc gcagatatca

660

ggaggaacac cgatggcgaa ggcagatctc tgggccgtaa ctgacgctga ggagcgaaag

720

catggggagc aaacaggctt agataccctg gtagtccatg ccgtaaacgt tgggaactag

780

atgtggggac cattccacgg tctccgtgtc gtagctaacg cattaagttc cccgcctggg

840

gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag

900

catgcggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccaa ggcttgacat atacgagaac

960

gcactggaga cagtgaactc tttggacact cgtatacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag

1020

ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caaccctcgt cctatgttgc

1080

cagcacgtaa tggtgggaac tcatgggata ctgccggggt caactcggag gaaggtgggg

1140

atgaggtcaa atcatcatgc cccttatgtc ttgggcttca cgcatgctac aatggccggt

1200

acaatgggct gcgataccgc aaggtggagc gaatcccaaa aagccggtct cagttcggat

1260

tgaggtctgc aactcgacct catgaagtcg gagtcgctag taatcgtaga tcagcaacgc

1320

tacggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt caagtcatga aagtcggtaa

1380

cacccgaagc cagtggccta accttttgga gggagctgtc gaaggtggga tcggtgatta

1440

ggactaagtc gtaacaaggt agccgtaccg gaa

1473

<210> 118

<211> 1368

<212> DNA

<213> Akkermansia muciniphila

<400> 118

tcgaacgaga gaattgctag cttgctaata attctctagt ggcgcacggg tgagtaacac

60

gtgagtaacc tgcccccgag agcgggatag ccctgggaaa ctgggattaa taccgcatag

120

tatcgaaaga ttaaagcagc aatgcgcttg gggatgggct cgcggcctat tagttagttg

180

gtgaggtaac ggctcaccaa ggcgatgacg ggtagccggt ctgagaggat gtccggccac

240

actggaactg agacacggtc cagacaccta cgggtggcag cagtcgagaa tcattcacaa

300

tgggggaaac cctgatggtg cgacgccgcg tgggggaatg aaggtcttcg gattgtaaac

360

ccctgtcatg tgggagcaaa ttaaaaagat agtacccaag aggaagagac ggctaactct

420

gtgccagcag ccgcggtaat acagaggtct caagcgttgt tcggaatcac tgggcgtaaa

480

gcgtgcgtag gctgtttcgt aagtcgtgtg tgaaaggcgc gggctcaacc cgcggacggc

540

acatgatact gcgagactag agtaatggag ggggaaccgg aattctcggt gtagcagtga

600

aatgcgtaga tatcgagagg aacactcgtg gcgaaggcgg gttcctggac attaactgac

660

gctgaggcac gaaggccagg ggagcgaaag ggattagata cccctgtagt cctggcagta

720

aacggtgcac gcttggtgtg cggggaatcg accccctgcg tgccggagct aacgcgttaa

780

gcgtgccgcc tggggagtac ggtcgcaaga ttaaaactca aagaaattga cggggacccg

840

cacaagcggt ggagtatgtg gcttaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctgggcttg

900

acatgtaatg aacaacatgt gaaagcatgc gactcttcgg aggcgttaca caggtgctgc

960

atggcggtcg tcagctcatg tcctgagatg tttggttaag tccagcaacg agcgcaaccc

1020

ctgttgccag ttaccagcac gtgaaggtgg ggactctggc gagactgccc agatcaactg

1080

ggaggaaggt ggggacgacg tcaggtcagt atggccctta tgcccagggc tgcacacgta

1140

ctacaatgcc cagtacagag ggggccgaag ccgcgaggcg gaggaaatcc tgaaaactgg

1200

gcccagttcg gactgtaggc tgcaacccgc ctacacgaag ccggaatcgc tagtaatggc

1260

gcatcagcta cggcgccgtg aatacgttcc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacatca

1320

tggaagccgg tcgcacccga agtatctgaa gccaaccgca aggaggca

1368

<210> 119

<211> 1462

<212> DNA

<213> Alcaligenes faecalis

<220>

<221> modified_base

<222> (432)..(432)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (446)..(446)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 119

attgaacgct agcgggatgc tttacacatg caagtcgaac ggcagcgcga gagagcttgc

60

tctcttggcg gcgagtggcg gacgggtgag taatatatcg gaacgtgccc agtagcgggg

120

gataactact cgaaagagtg gctaataccg catacgccct acgggggaaa gggggggatc

180

gcaagacctc tcactattgg agcggccgat atcggattag ctagttggtg gggtaaaggc

240

tcaccaaggc aacgatccgt agctggtttg agaggacgac cagccacact gggactgaga

300

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaattt tggacaatgg gggaaaccct

360

gatccagcca tcccgcgtgt atgatgaagg ccttcgggtt gtaaagtact tttggcagag

420

aagaaaaggt anctcctaat acgagntact gctgacggta tctgcagaat aagcaccggc

480

taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg

540

gcgtaaagcg tgtgtaggcg gttcggaaag aaagatgtga aatcccaggg ctcaaccttg

600

gaactgcatt tttaactgcc gagctagagt atgtcagagg ggggtagaat tccacgtgta

660

gcagtgaaat gcgtagatat gtggaggaat accgatggcg aaggcagccc cctgggataa

720

tactgacgct cagacacgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

780

cgccctaaac gatgtcaact agctgttggg gccgttaggc cttagtagcg cagctaacgc

840

gtgaagttga ccgcctgggg agtacggtcg caagattaaa actcaaagga attgacgggg

900

acccgcacaa gcggtggatg atgtggatta attcgatgca acgcgaaaaa ccttacctac

960

ccttgacatg tctggaaagc cgaagagatt tggccgtgct cgcaagagaa ccggaacaca

1020

ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1080

cgcaaccctt gtcattagtt gctacgcaag agcactctaa tgagactgcc ggtgacaaac

1140

cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcct catggccctt atgggtaggg cttcacacgt

1200

catacaatgg tcgggacaga gggtcgccaa cccgcgaggg ggagccaatc tcagaaaccc

1260

gatcgtagtc cggatcgcag tctgcaactc gactgcgtga agtcggaatc gctagtaatc

1320

gcggatcaga atgtcgcggt gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc

1380

atgggagtgg gtttcaccag aagtaggtag cctaaccgta aggagggcgc ttaccacggt

1440

gggattcatg actggggtga ag

1462

<210> 120

<211> 1499

<212> DNA

<213> Alcaligenes sp. CO14

<400> 120

gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgcta gcgggatgct ttacacatgc aagtcgaacg

60

gcagcgcgag agagcttgct ctcttggcgg cgagtggcgg acgggtgagt aatatatcgg

120

aacgtgccca gtagcggggg ataactactc gaaagagtgg ctaataccgc atacgcccta

180

cgggggaaag ggggggatcg caagacctct cactattgga gcggccgata tcggattagc

240

tagttggtgg ggtaaaggct caccaaggca acgatccgta gctggtttga gaggacgacc

300

agccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatttt

360

ggacaatggg ggaaaccctg atccagccat cccgcgtgta tgatgaaggc cttcgggttg

420

taaagtactt ttggcagaga agaaaaggta tctcctaata cgagatactg ctgacggtat

480

ctgcagaata agcaccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggtgcaag

540

cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgt gtgtaggcgg ttcggaaaga aagatgtgaa

600

atcccagggc tcaaccttgg aactgcattt ttaactgccg agctagagta tgtcagaagg

660

ggggtagaat tccacgtgta gcagtgaaat gcgtagatat gtggaggaat accgatggcg

720

aaggcagccc cctgggataa tactgacgct cagacacgaa gcgtggggag caaacaggat

780

tagataccct ggtagtccac gccctaaacg atgtcaacta gctgttgggg ccgttaggcc

840

ttagtagcgc agctaacgcg tgaagttgac cgcctgggga gtacggtcgc aagattaaaa

900

ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggatga tgtggattaa ttcgatgcaa

960

cgcgaaaaac cttacctacc cttgacatgt ctggaaagcc gaagagattt ggccgtgctc

1020

gcaagagaac cggaacacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg tcattagttg ctacgcaaga gcactctaat

1140

gagactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcctc atggccctta

1200

tgggtagggc ttcacacgtc atacaatggt cgggacagag ggtcgccaac ccgcgagggg

1260

gagccaatct cagaaacccg atcgtagtcc ggatcgcagt ctgcaactcg actgcgtgaa

1320

gtcggaatcg ctagtaatcg cggatcagaa tgtcgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg tttcaccaga agtaggtagc ctaaccgtaa

1440

ggagggcgct taccacggtg ggattcatga ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgt

1499

<210> 121

<211> 1404

<212> DNA

<213> Alcaligenes sp. S3

<400> 121

atgcaagtcg aacggcagcg cgagagagct tgctctcttg gcggcgagtg gcggacgggt

60

gagtaatata tcggaacgtg cccagtagcg ggggataact actcgaaaga gtggctaata

120

ccgcatacgc cctacggggg aaaggggggg atcgcaagac ctctcactat tggagcggcc

180

gatatcggat tagctagttg gtggggtaaa ggctcaccaa ggcaacgatc cgtagctggt

240

ttgagaggac gaccagccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag

300

cagtggggaa ttttggacaa tgggggaaac cctgatccag ccatcccgcg tgtatgatga

360

aggccttcgg gttgtaaagt acttttggca gagaagaaaa ggtacctcct aatacgaggt

420

actgctgacg gtatctgcag aataagcacc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtagggtg caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgtgtgtag gcggttcgga

540

aagaaagatg tgaaatccca gggctcaacc ttggaactgc atttttaact gccgagctag

600

agtatgtcag aggggggtag aattccacgt gtagcagtga aatgcgtaga tatgtggagg

660

aataccgatg gcgaaggcag ccccctggga taatactgac gctcagacac gaaagcgtgg

720

ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgcccta aacgatgtca actagctgtt

780

ggggccgtta ggccttagta gcgcagctaa cgcgtgaagt tgaccgcctg gggagtacgg

840

tcgcaagatt aaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg atgatgtgga

900

ttaattcgat gcaacgcgaa aaaccttacc tacccttgac atgtctggaa agccgaagag

960

atttggccgt gctcgcaaga gaaccggaac acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt

1020

gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtcatta gttgctacgc

1080

aagagcactc taatgagact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaagt

1140

cctcatggcc cttatgggta gggcttcaca cgtcatacaa tggtcgggac agagggtcgc

1200

caacccgcga gggggagcca atctcagaaa cccgatcgta gtccggatcg cagtctgcaa

1260

ctcgactgcg tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agaatgtcgc ggtgaatacg

1320

ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggtttcac cagaagtagg

1380

tagcctaacc gtaaggaggg cgct

1404

<210> 122

<211> 1528

<212> DNA

<213> Alicyclobacillus acidocaldarius

<400> 122

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

ggacctcttt tgaggtcagc ggcggacggg tgaggaacac gtgggtaatc tgcctttcag

120

accggaataa cgcccggaaa cgggcgctaa tatgccggat acgcccgcga ggaggcatct

180

tcttgcgggg aaaggcccga ttgggccgct gagagaggag cccgcggcgc attagctagt

240

tggcggggta acggcccacc aaggcgacga tgcgtagccg acctgagagg gtgaccggcc

300

acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtaggg aatcttccgc

360

aatgggcgca agcctgacgg agcaacgccg cgtgagcgaa gaaggccttc gggttgtaaa

420

gctctgttgc tcggggagag cggcatgggg agtggaaagc cccatgcgag acggtaccga

480

gtgaggaagc cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aaaacgtagg gggcgagcgt

540

tgtccggaat cactgggcgt aaagggtgcg taggcggtcg agcaagtctg gagtgaaagt

600

ccatggctca accatgggat ggctctggaa actgcttgac ttgagtgctg gagaggcaag

660

gggaattcca cgtgtagcgg tgaaatgcgt agagatgtgg aggaatacca gtggcgaagg

720

cgccttgctg gacagtgact gacgctgagg cacgaaagcg tggggagcaa acaggattag

780

ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaggt gttgggggga cacaccccag

840

tgccgaagga aacccaataa gcactccgcc tggggagtac ggtcgcaaga ctgaaactca

900

aaggaattga cgggggcccg cacaagcagt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg

960

aagaacctta ccagggcttg acatccctct gacgggtgca gagatgcacc ttcccttcgg

1020

ggcagaggag acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttca

1080

gtcccgcaac gagcgcaacc cttgacctgt gttaccagcg cgttgaggcg gggactcaca

1140

ggtgactgcc ggcgcaagtc ggaggaaggc ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctga

1200

tgtcctgggc tacacacgtg ctacaatggg cggtacaaag ggaggcgaag ccgcgaggcg

1260

gagcgaaacc caaaaagccg ctcgtagttc ggattgcagg ctgcaactcg cctgcatgaa

1320

gccggaattg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacca cgagagtcgg caacacccga agtcggtgag gtaaccccga

1440

aaggggagcc agccgccgaa ggtggggtcg atgattgggg tgaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtaccggaa ggtgcggctg gatcacct

1528

<210> 123

<211> 1514

<212> DNA

<213> Alicyclobacillus acidoterrestris

<400> 123

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

gagcccttcg gggctagcgg cggacgggtg agtaacacgt gggcaatctg cctttcagac

120

tggaataaca ctcggaaacg ggtgctaatg ccggataata cacgggtagg catctacttg

180

tgttgaaaga tgcaactgca tcgctgagag aggagcccgc ggcgcattag ctagttggtg

240

aggtaacggc tcaccaaggc gacgatgcgt agccgacctg agagggtgac cggccacact

300

gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tccgcaatgg

360

gcgcaagcct gacggagcaa cgccgcgtga gcgaagaagg ccttcgggtt gtaaagctct

420

gttgctcggg gagagcgaca aggagagtgg aaagctcctt gtgagacggt accgagtgag

480

gaagccccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggggca agcgttgtcc

540

ggaatcactg ggcgtaaagc gtgcgtaggc ggttgtgtaa gtctgaagtg aaagtccaag

600

gctcaacctt gggattgctt tggaaactgc atgacttgag tgctggagag gcaaggggaa

660

ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tgtggaggaa taccagtggc gaaggcgcct

720

tgctggacag tgactgacgc tgaggcacga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc

780

ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgagtgc taggtgttgg ggggacacac cccagtgccg

840

aaggaaaccc aataagcact ccgcctgggg agtacggtcg caagactgaa actcaaagga

900

attgacgggg gcccgcacaa gcagtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa

960

ccttaccagg gcttgacatc cctctgaccg gtgcagagat gtaccttccc ttcggggcag

1020

aggagacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1080

gcaacgagcg caacccttga tctgtgttac cagcacgtag aggtggggac tcacaggtga

1140

ctgccggcgt aagtcggagg aaggcgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ctttatgtcc

1200

tgggctacac acgtgctaca atgggcggta caacgggaag cgaagccgcg aggtggagca

1260

aaacctaaaa agccgttcgt agttcggatt gcaggctgca actcgcctgc atgaagccgg

1320

aattgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatcc gttcccgggc cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccacgaga gtcggcaaca cccgaagtcg gtgaggtaac cgttatggag

1440

ccagccgccg aaggtggggt tgatgattgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtatcgg

1500

aaggtgcggt tgga

1514

<210> 124

<211> 1520

<212> DNA

<213> Alicyclobacillus contaminans

<220>

<221> modified_base

<222> (182)..(182)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (192)..(192)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (476)..(476)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 124

tagagtttga tcatggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaatacat gcaagtcgag

60

cggacggaag ggagcttgct cctggaagtc agcggcggac gggtgagtaa cacgtgggta

120

atctgcctgt cagaccggaa taacgcctgg aaacgggtgc taatgccgga tagtcagtct

180

tngggcatct tnggactggg aaaggcgcta aggcgtcact gacagaggag cccgcggcgc

240

attagctagt tggtggggta aaggcctacc aaggcgacga tgcgtagccg acctgagagg

300

gtgaccggcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtaggg

360

aatcttcggc aatgggcgaa agcctgaccg agcaacgccg cgtgagcgaa gaaggccttc

420

gggttgtaaa gctcagtcac tcgggaagag cgaaccggag agggaatgct ctggtngaga

480

cggtaccgag agaggaagcc ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg

540

ggcgagcgtt gtccggaatc actgggcgta aagcgtgcgt aggcggtttg gtaagtccgg

600

agtgaaagac cagggctcaa ccctgggggt gctttggaaa ctgccagact tgagtgctgg

660

agaggcaagg ggaattccac gtgtagcggt gaaatgcgta gagatgtgga ggaataccag

720

tggcgaaggc gccttgctgg acagtgactg acgctgaggc acgaaagcgt ggggagcaaa

780

caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga gtgctaggtg ttggggggta

840

ccaccctcag tgccgaagga aacccaataa gcactccgcc tggggagtac ggtcgcaaga

900

ctgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcagt ggagcatgtg gtttaattcg

960

aagcaacgcg aagaacctta ccagggcttg acatccctct gacgggttca gagatgagcc

1020

gtcccttcgg ggcagaggag acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgacctgt gttaccagca cgtgaaggtg

1140

gggactcaca ggtgactgcc ggcgtaagtc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc

1200

atgcccttta tgtcctgggc tacacacgtg ctacaatggg cggtacaacg ggaagcgaga

1260

ccgcgaggtg gagcgaaacc ctgaaagccg ttcgtagttc ggattgcagg ctgcaactcg

1320

cctgcatgaa gccggaattg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg aatccgttcc

1380

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagttgg caacacccga agtcggtgag

1440

gtaacccttt agggagccag ccgccgaagg tggggtcgat gattggggtg aagtcgtaac

1500

aaggtagccg tatcggaagg

1520

<210> 125

<211> 1517

<212> DNA

<213> Alicyclobacillus cycloheptanicus

<400> 125

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

ggacccttcg gggtcagcgg cggacgggtg agtaacacgt gggtaatctg cccaactgac

120

cggaataacg cctggaaacg ggtgctaatg ccggataggc agcgagcagg catctgctcg

180

ctgggaaagg tgcaaatgca ccgcagatgg aggagcccgc ggcgcattag ctggttggtg

240

gggtaacggc tcaccaaggc gacgatgcgt agccgacctg agagggtgga cggccacact

300

gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tccgcaatgg

360

gcgcaagcct gacggagcaa cgccgcgtga gcgaagaagg ccttcgggtt gtaaagctca

420

gtcactcggg aagagcggca aggggagtgg aaagcccctt gagagacggt accgagagag

480

gaagccccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggggca agcgttgtcc

540

ggaatcactg ggcgtaaagc gtgcgtaggc ggttgcgtgt gtccggggtg aaagtccagg

600

gctcaaccct gggaatgcct tggaaactgc gtaacttgag tgctggagag gcaaggggaa

660

ttccgcgtgt agcggtggaa tgcgtagata tgcggaggaa taccagtggc gaaggcgcct

720

tgctggacag tgactgacgc tgaggcacga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc

780

ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgagtgc taggtgttgg ggggtaccac cctcagtgcc

840

gaaggaaacc caataagcac tccgcctggg gagtacggtc gcaagactga aactcaaagg

900

aattgacggg ggcccgcaca agcagtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga

960

accttaccag ggcttgacat ccccctgaca gccgcagaga tgcggtttcc cttcggggca

1020

ggggagacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1080

cgcaacgagc gcaacccttg aactgtgtta ccagcacgtg aaggtgggga ctcacagttg

1140

actgccggcg taagtcggag gaaggcgggg atgacgtcaa atcatcatgc cctttatgtc

1200

ctgggctaca cacgtgctac aatgggcggt acaacgggaa gcgagaccgc gaggtggagc

1260

aaacccctga aagccgttcg tagttcggat tgcaggctgc aactcgcctg catgaagccg

1320

gaattgctag taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaatc cgttcccggg ccttgtacac

1380

accgcccgtc acaccacgag agtcggcaac acccgaagtc ggtggggtaa cccgtcaggg

1440

ggccagccgc cgaaggtggg gttgatgatt ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtatc

1500

ggaaggtgcg gttggat

1517

<210> 126

<211> 1529

<212> DNA

<213> Alicyclobacillus herbarius

<220>

<221> modified_base

<222> (1025)..(1025)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1027)..(1027)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1135)..(1135)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1138)..(1138)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1331)..(1331)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 126

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

ggacggaagg gagcttgctc ccggacgtca gcggcggacg ggtgaggaac acgtgggcaa

120

tctgcccatc agtcgggaat aacactcgga aacgggtgct aatgccggat aggcatcttg

180

ggggcatccc tgggatggga aaggcgctta ggcgctgctg atggaggagc ccgcggcgca

240

ttagctggtt ggcggggtaa cggcccacca aggcgacgat gcgtagccga cctgagaggg

300

tgaccggcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtaggga

360

atcttccgca atgggcgcaa gcctgacgga gcaacgccgc gtgagcgaag aaggccttcg

420

ggttgtaaag ctcagtcaat cgggaagagc gacctaggga gggaatgccc taggggagac

480

ggtaccgatg gaggaagccc cggcaaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggg

540

gcgagcgttg tccggaatga ctgggcgtaa agcgtgcgta ggcggcctta cgcgtctgag

600

gtttaagacc acggctcaac cgtgggggtg ccttggaaac ggtgaggctt gagtgctgga

660

gaggcaaggg gaattccacg tgtagcggtg aaatgcgtag agatgtggag gaatacccgt

720

ggcgaaggcg ccttgctgga cagtgactga cgctgaggca cgaaagcgtg gggagcaaac

780

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag tgctaggtgt tgggggtgcg

840

agccctcagt gccgaaggaa acccaataag cactccgcct ggggagtacg gtcgcaagac

900

tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcagtg gagcatgtgg tttaattcga

960

agcaacgcga agaaccttac cagggcttga catccctctg acgcactcag agatgggtgt

1020

tcccntntgg gcagaggaga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgacctgtg ttaccagcgc gtganggngg

1140

ggactcacag gtgactgccg gcgcaagccg gaggaaggcg gggatgacgt caaatcatca

1200

tgcccttgat gtcctgggcg acacacgtgc tacaatgggc ggtacaacgg gcagcgagac

1260

cgcgaggtgg agcgaatccc tgaaagccgc tcgtagttcg gattgcaggc tgcaacccgc

1320

ctgcatgaag ncggaattgc tagtaatcgc ggatcagcat gccgcggtga atccgttccc

1380

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagtgagc aacacccgaa gtcggtgagg

1440

caaccggata ggagccagcc gccgaaggtg gggctcgcga ttggggtgaa gtcgtaacaa

1500

ggtagccgta tcggaaggtg cggttggat

1529

<210> 127

<211> 1528

<212> DNA

<213> Alicyclobacillus pomorum

<220>

<221> modified_base

<222> (1017)..(1017)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 127

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

ggacggaagg gagcttgctc ccggaagtca gcggcggacg ggtgagtaac acgtgggcaa

120

tctgcctgtc agaccggaat aacgcctgga aacgggtgct aatgccggat aggcaatctg

180

gaggcatctc tggattggga aaggcgcgga tgcgccactg acagaggagc ccgcggcgca

240

ttagctagtt ggtggggtaa cggctcacca aggcgacgat gcgtagccga cctgagaggg

300

tgaccggcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtaggga

360

atcttcggca atgggcgaaa gcctgaccga gcaacgccgc gtgagcgaag aaggccttcg

420

ggttgtaaag ctcagtcact cgggaagagc ggtaaggaga ggaaatgctc ctttcgagac

480

ggtaccgaga gaggaagccc cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggg

540

gcgagcgttg tccggaatca ctgggcgtaa agcgtgcgta ggcggtttgt taagtccgaa

600

gtgaaagtcc agggctcaac cttgggattg ctttggaaac tggcagactt gagtgctgga

660

gaggcaaggg gaattccacg tgtagcggtg aaatgcgtag atatgtggag gaataccagt

720

ggcgaaggcg ccttgctgga cagtgactga cgctgaggca cgaaagcgtg gggagcaaac

780

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag tgctaggtgt tggggggtac

840

caccctcagt gccgaaggaa acccaataag cactccgcct ggggagtacg gtcgcaagac

900

tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcagtg gagcatgtgg tttaattcga

960

agcaacgcga agaaccttac cagggcttga catccctctg accggtgcag agatgtncct

1020

tcccttcggg gcagaggaga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgacctgtg ttaccagcac gtgatggtgg

1140

ggactcacag gtgactgccg gcgtaagtcg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca

1200

tgccctttat gtcctgggct acacacgtgc tacaatgggc ggtacaacgg gaagcgagac

1260

cgcgaggtgg agcgaatccc tgaaagccgt tcgtagttcg gattgcaggc tgcaactcgc

1320

ctgcatgaag ccggaattgc tagtaatcgc ggatcagcat gccgcggtga atccgttccc

1380

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagttggc aacacccgaa gtcggtgagg

1440

taaccgcaag gagccagccg ccgaaggtgg ggtcgacgat tggggtgaag tcgtaacaag

1500

gtagccgtat cggaaggtgc ggttggat

1528

<210> 128

<211> 1464

<212> DNA

<213> Alicyclobacillus sp. CCUG 53762

<400> 128

aacgctggcg gcgtgcctaa tacatgcaag tcgcgcgaac ggaaggagag cttgctcttc

60

tgaagttagc ggcggacggg tgagtaacac gtgggcaacc tgcctgacag accgggataa

120

cgcttggaaa cgagtgctaa taccggatag gcaaacggga ggcatctcct gattgagaaa

180

ggcgctacgg cgtcactgtc agatgggccc gcggcgcatt agctagttgg tgaggtaacg

240

gctcaccaag gcgacgatgc gtagccgacc tgagagggtg accggccaca ctgggactga

300

gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtagggaat cttccacaat gggcgcaagc

360

ctgatggagc aacgccgcgt gagtgatgaa ggccttcggg ttgtaaaact ctgtcttctg

420

ggacgaacgg gcaggagagg gaatgctcct gccatgacgg taccagagga ggaagccacg

480

gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttgtc cggaattact

540

gggcgtaaag cgcgcgcagg cggccattta agtctggggt gaaagcccgg ggctcaaccc

600

cgggattgcc ttggatactg gatggcttga gcatcggaga ggcaagggga attccacgtg

660

tagcggtgaa atgcgtagag atgtggagga acaccagtgg cgaaggcgcc ttgctggccg

720

attgctgacg ctgaggcgcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc

780

cacgccgtaa acgatgagtg ctaggtgttg gcggtttcaa taccgtcagt gccgaagcta

840

acgcattaag cactccgcct ggggagtacg gtcgcaagac tgaaactcaa aggaattgac

900

gggggcccgc acaagcagtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac

960

caagacttga catcccgctg accggtctag agataggcct tcccttcggg gcagcggaga

1020

caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc ttgaactgtg ttgccagcat tgagttgggc actcacagtt gactgccggt

1140

gacaaaccgg aggaaggcgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg tcttgggcta

1200

cacacgtgct acaatgggcg gtacagaggg atgcgaaacc gcgaggtgga gcgaaaccct

1260

taaagccgtt cgtagttcgg attgcaggct gcaactcgcc tgcatgaagc cggaattgct

1320

agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg

1380

tcacaccacg agagttggta acacccgaag tcggtgaggt aaccttatgg agccagccgc

1440

cgaaggtggg atcgatgatt gggg

1464

<210> 129

<211> 1384

<212> DNA

<213> Alistipes finegoldii

<220>

<221> modified_base

<222> (24)..(25)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (27)..(27)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 129

gtcgaggggc agcggggagt agcnngnctc cgccggcgac cggcgcacgg gtgcgtaacg

60

cgtatgcaac ctacctttaa caggggcata acactgagaa attggtacta attccccata

120

acattcgaga aggcatcttc ttgggttaaa aactccggtg gttaaagatg ggcatgcgtt

180

gtattagcta gttggtgagg taacggctca ccaaggcaac gatacatagg gggactgaga

240

ggttaacccc ccacattggt actgagacac ggaccaaact cctacgggag gcagcagtga

300

ggaatattgg tcaatggacg caagtctgaa ccagccatgc cgcgtgcagg aagacggctc

360

tatgagttgt aaactgcttt tgtactaggg taaacgcttc tacgtgtagg agcctgaaag

420

tatagtacga ataaggatcg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggaggatcc

480

aagcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggtgcgtagg cggtttgata agttagaggt

540

gaaataccgg ggctcaactc cggaactgcc tctaatactg ttgaactaga gagtagttgc

600

ggtaggcgga atgtatggtg tagcggtgaa atgcttagag atcatacaga acaccgattg

660

cgaaggcagc ttaccaaact atatctgacg ttgaggcacg aaagcgtggg gagcaaacag

720

gattagatac cctggtagtc cacgcagtaa acgatgataa ctcgttgtcg gcgatacaca

780

gtcggtgact aagcgaaagc gataagttat ccacctgggg agtacgttcg caagaatgaa

840

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggaggaac atgtggttta attcgatgat

900

acgcgaggaa ccttacccgg gcttgaaagt tagtgacgat tctggaaaca ggatttccct

960

tcggggcacg aaactaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct cgtgccgtga ggtgtcgggt

1020

taagtcccat aacgagcgca acccctaccg ttagttgcca tcaggtcaag ctgggcactc

1080

tggcgggact gccggtgtaa gccgagagga aggtggggat gacgtcaaat cagcacggcc

1140

cttacgtccg gggctacaca cgtgttacaa tggtaggtac agagggccgc taccccgcga

1200

ggggatgcca atctcgaaag cctatctcag ttcggatcgg aggctgaaac ccgcctccgt

1260

gaagttggat tcgctagtaa tcgcgcatca gccatggcgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1320

ttgtacacac cgcccgtcaa gccatggaag ctgggggtgc ctgaagttcg tgaccgcaag

1380

gagc

1384

<210> 130

<211> 1317

<212> DNA

<213> Alistipes indistinctus

<400> 130

gataaacgct agcggcaggc ctaacacatg caagtcgagg gaccggcgca cgggtgcgta

60

acgcgtatgc aacctacctt taacaggggg ataatccgaa gaaatttggt ctaatacccc

120

ataatgaaaa atggttagag atgggcatgc gttgtattag ctagttggtg aggtaacggc

180

tcaccaaggc tacgatacat agggggactg agaggttttc cccccacact ggtactgaga

240

cacggaccag actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat tggtcaatgg acgcaagtct

300

gaaccagcca tgccgcgtgc aggatgaagg tgtatgcatt gtaaactgct tttgtacgag

360

ggtatgaaag tatcgtacga ataagggtcg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata

420

cggaggaccc gagcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggtgcgtagg cggattagta

480

agttagaggt gaaagctcga tgctcaacat cgaaattgcc tctgatactg ttagtctaga

540

gtatagttgc ggaaggcgga atgtgtggtg tagcggtgaa atgcttagat atcacacaga

600

acaccgattg cgaaggcagc tttccaagct aactgacgct gatgcacgaa agcgtgggga

660

gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgataact cgttgcaggc

720

gagtctgtga cttagcgaaa gcgttaagtt atccacctgg ggagtacgtt cgcaagaatg

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggagga acatgtggtt taattcgatg

840

atacgcgagg aaccttaccc gggcttgaaa gtactaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgccgtga ggtgtcgggt taagtcccat aacgagcgca acccctactg ttagttacca

960

gcacgtgggc actctagcag gactgccggt gtaagccgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

aatcagcacg gcccttacgt ccggggcgac acacgtgtta caatggtcgg cagagggtcg

1080

ctaccccgtg aggggatgcc aatctcgccg atctcagttc ggatggaggc tgaaactcgc

1140

ctccagaagt tggattcgct agtaatcgcg catcagccat ggcgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcaagccat gggagttggg ggtgcctgaa gtacgtgcgt

1260

cctagggcaa aaccgatgac tggggctaag tcgtaacaag gtagccgtac cggaagg

1317

<210> 131

<211> 932

<212> DNA

<213> Alistipes onderdonkii

<220>

<221> modified_base

<222> (16)..(16)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (18)..(18)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (99)..(99)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (137)..(137)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (151)..(151)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 131

atcgtacgaa taaggntngg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggaggattca

60

agcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg gtgcgtagnc ggtttgataa gttagaggtg

120

aaatcccggg gcttaantcc ggaactgcct ntaatactgt tagactagag agtagttgcg

180

gtaggcggaa tgtatggtgt agcggtgaaa tgcttagaga tcatacagaa caccgattgc

240

gaaggcagct taccaaacta tatctgacgt tgaggcacga aagcgtgggg agcaaacagg

300

attagatacc ctggtagtcc acgcagtaaa cgatgataac tcgttgtcgg cgatacacag

360

tcggtgacta agcgaaagcg ataagttatc cacctgggga gtacgttcgc aagaatgaaa

420

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggaggaaca tgtggtttaa ttggatgata

480

cgcgaggaac cttacccggg cttgaaagtt actgacgatt ctggaaacag gatttccctt

540

cggggcagga aactaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcgggtt

600

aagtcccata acgagcgcaa cccctaccgt tagttgccat caggtcaagc tgggcactct

660

ggcgggactg ccggtgtaag ccgagaggaa ggtggggatg acgtcaaatc agcacggccc

720

ttacgtccgg ggctacacac gtgttacaat ggtaggtaca gagggtcgct accccgtgag

780

gggatgccaa tctcgaaagc ctatctcagt tcggattgga ggctgaaacc cgcctccatg

840

aagttggatt cgctagtaat cgcgcatcag ccatggcgcg gtgaatacgt tcccgggcct

900

tgtacacacc gcccgtcaag ccatggaagc tg

932

<210> 132

<211> 1523

<212> DNA

<213> Alistipes putredinis

<400> 132

gagagtttga tcctggctca ggatgaacgc tagcggcagg cttaacacat gcaagtcgag

60

gggcagcata atggatagca atatctatgg tggcgaccgg cgcacgggtg cgtaacgcgt

120

atgcaaccta cctttaacag ggggataaca ctgagaaatt ggtactaata ccccataata

180

tcatagaagg catcttttat ggttgaaaat tccgatggtt agagatgggc atgcgttgta

240

ttagctagtt ggtggggtaa cggctcacca aggcgacgat acataggggg actgagaggt

300

taacccccca cactggtact gagacacgga ccagactcct acgggaggca gcagtgagga

360

atattggtca atggacgcaa gtctgaacca gccatgccgc gtgcaggatg acggctctat

420

gagttgtaaa ctgcttttgt acgagggtaa acgcagatac gtgtatctgt ctgaaagtat

480

cgtacgaata aggatcggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg aggattcaag

540

cgttatccgg atttattggg tttaaagggt gcgtaggcgg tttgataagt tagaggtgaa

600

atttcggggc tcaaccctga acgtgcctct aatactgttg agctagagag tagttgcggt

660

aggcggaatg tatggtgtag cggtgaaatg cttagagatc atacagaaca ccgattgcga

720

aggcagctta ccaaactata tctgacgttg aggcacgaaa gcgtggggag caaacaggat

780

tagataccct ggtagtccac gcagtaaacg atgataactc gttgtcggcg atacacagtc

840

ggtgactaag cgaaagcgat aagttatcca cctggggagt acgttcgcaa gaatgaaact

900

caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gaggaacatg tggtttaatt cgatgatacg

960

cgaggaacct tacccgggct tgaaagttag cgacgattct tgaaagagga tttcccttcg

1020

gggcgcgaaa ctaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt gtcgggttaa

1080

gtcccataac gagcgcaacc cctaccgtta gttgccatca ggtgaagctg ggcactctgg

1140

cgggactgcc ggtgtaagcc gagaggaagg tggggatgac gtcaaatcag cacggccctt

1200

acgtccgggg ctacacacgt gttacaatgg taggtacaga gggcagctac ccagcgatgg

1260

gatgcgaatc tcgaaagcct atctcagttc ggattggagg ctgaaacccg cctccatgaa

1320

gttggattcg ctagtaatcg cgcatcagcc atggcgcggt gaatacgttc ccgggccttg

1380

tacacaccgc ccgtcaagcc atgggagccg ggggtgcctg aagttcgtga ccgcaaggag

1440

cgacctaggg caaaactggt gactggggct aagtcgtaac aaggtagccg taccggaagg

1500

tgcggctgga acacctcctt tct

1523

<210> 133

<211> 1355

<212> DNA

<213> Alistipes shahii

<220>

<221> modified_base

<222> (753)..(753)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 133

gcaatacact ggtggcgacc ggcgcacggg tgcgtaacgc gtatgcaacc tacccataac

60

agggggataa cactgagaaa ttggtactaa taccccataa catcaggacc ggcatcggtt

120

ttggttgaaa actccggtgg ttatggatgg gcatgcgttg tattagctgg ttggtgaggt

180

aacggctcac caaggcaacg atacataggg ggactgagag gttaaccccc cacattggta

240

ctgagacacg gaccaaactc ctacgggagg cagcagtgag gaatattggt caatggacgc

300

aagtctgaac cagccatgcc gcgtgcagga agacggctct atgagttgta aactgctttt

360

gtacgagggt aaacgctctt acgtgtaaga gcctgaaagt atcgtacgaa taaggtcggc

420

taactcgtgc cagcagccgc ggtaatacgg aggcaagcgt tatccggatt tattgggttt

480

aaagggtgcg taggcggttt gataagttag aggtgaaata ccggtgctta acaccggaac

540

tgcctctaat actgttgact agagagtagt tgcggtaggc ggaatgtatg gtgtagcggt

600

gaaatgctta gagatcatac agaacaccga ttgcgaaggc agcttaccaa actatatctg

660

acgttgaggc acgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgcag

720

taaacgatga taactcgctg tcggcgatac acngtcggcg gctaagcgaa agcgataagt

780

tatccacctg gggagtacgt tcgcaagaat gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca

840

caagcggagg aacatgtggt ttaattcgat gatacgcgag gaaccttacc cgggcttgaa

900

agttactgac gattctggaa acaggatttc ccttcggggc aggaaactag gtgctgcatg

960

gttgtcgtca gctcgtgccg tgaggtgtcg ggttaagtcc cataacgagc gcaaccccta

1020

ccgttagttg ccatcaggtc aagctgggca ctctggcggg actgccggtg taagccgaga

1080

ggaaggtggg gatgacgtca aatcagcacg gcccttacgt ccggggctac acacgtgtta

1140

caatggtagg tacagagggc agctacccag tgatgggatg cgaatctcga aagcctatct

1200

cagttcggat cggaggctga aacccgcctc cgtgaagttg gattcgctag taatcgcgca

1260

tcagccatgg cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt caagccatgg

1320

aagctggggg tgcctgaagt tcgtgaccgc aagga

1355

<210> 134

<211> 1432

<212> DNA

<213> Alistipes sp. HGB5

<400> 134

ggcgaccggc gcacgggtgc gtaacgcgta tgcaacctac ctttaacagg ggcataacac

60

tgagaaattg gtactaattc cccataacat tcgagaaggc atcttcttgg gttaaaaact

120

ccggtggtta aagatgggca tgcgttgtat tagctagttg gtgaggtaac ggctcaccaa

180

ggcaacgata cataggggga ctgagaggtt aaccccccac attggtactg agacacggac

240

caaactccta cgggaggcag cagtgaggaa tattggtcaa tggacgcaag tctgaaccag

300

ccatgccgcg tgcaggaaga cagctctatg agttgtaaac tgcttttgta ctagggtaaa

360

cgctcctacg tgtaggagtc tgaaagtata gtacgaataa ggatcggcta actccgtgcc

420

agcagccgcg gtaatacgga ggatccaagc gttatccgga tttattgggt ttaaagggtg

480

cgtaggcggt ttgataagtt agaggtgaaa taccggggct caactccgga actgcctcta

540

atactgttga actagagagt agttgcggta ggcggaatgt atggtgtagc ggtgaaatgc

600

ttagagatca tacagaacac cgattgcgaa ggcagcttac caaactatat ctgacgttga

660

ggcacgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg cagtaaacga

720

tgataactcg ttgtcggcga tacacagtcg gtgactaagc gaaagcgata agttatccac

780

ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg

840

aggaacatgt ggtttaattc gatgatacgc gaggaacctt acccgggctt gaaagttagt

900

gacgattctg gaaacaggat ttcccttcgg ggcacgaaac taggtgctgc atggttgtcg

960

tcagctcgtg ccgtgaggtg tcgggttaag tcccataacg agcgcaaccc ctaccgttag

1020

ttgccatcag gtcaagctgg gcactctggc gggactgccg gtgtaagccg agaggaaggt

1080

ggggatgacg tcaaatcagc acggccctta cgtccggggc tacacacgtg ttacaatggt

1140

aggtacagag ggccgctacc ccgtgagggg atgccaatct cgaaagccta tctcagttcg

1200

gatcggaggc tgaaacccgc ctccgtgaag ttggattcgc tagtaatcgc gcatcagcca

1260

tggcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagcca tggaagctgg

1320

gggtgcctga agttcgtgac cgcaaggagc gacctagggc aaaaccggtg actggggcta

1380

agtcgtaaca aggtagccgt accggaaggt gcggctggaa cacctccttt ct

1432

<210> 135

<211> 1480

<212> DNA

<213> Alistipes sp. JC50

<400> 135

tgatcctggc tcaggatgaa cgctagcggc aggcctaaca catgcaagtc gaggggcagc

60

gggattgaag cttgcttcaa ttgccggcga ccggcgcacg ggtgcgtaac gcgtatgcaa

120

cctacccata acagggggat aacactgaga aatcggtact aatatcccat aacatcatga

180

ggggcatccc ttatggttga aaactccggt ggttatggat gggcatgcgt tgtattagct

240

ggttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgatacatag ggggactgag aggttaaccc

300

cccacattgg tactgagaca cggaccaaac tcctacggga ggcagcagtg aggaatattg

360

gtcaatggac gcaagtctga accagccatg ccgcgtgcag gatgacggct ctatgagttg

420

taaactgctt ttgtacgagg gtaaacccgg atacgtgtat ccggctgaaa gtatcgtacg

480

aataaggatc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggaggatt caagcgttat

540

ccggatttat tgggtttaaa gggtgcgtag gcggtttgat aagttagagg tgaaataccg

600

gtgcttaaca ccggaactgc ctctaatact gttgagctag agagtagttg cggtaggcgg

660

aatgtatggt gtagcggtga aatgcttaga gatcatacag aacaccgatt gcgaaggcag

720

cttaccaaac tatatctgac gttgaggcac gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata

780

ccctggtagt ccacgcagta aacgatgata actcgctgtc ggcgatacac agtcggtggc

840

taagcgaaag cgataagtta tccacctggg gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg

900

aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa catgtggttt aattcgatga tacgcgagga

960

accttacccg ggcttgaaag ttactgacga ttctggaaac aggatttccc ttcggggcag

1020

gaaactaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgtcggg ttaagtccca

1080

taacgagcgc aacccctacc gttagttgcc atcaggtcaa gctgggcact ctggcgggac

1140

tgccggtgta agccgagagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcagcacggc ccttacgtcc

1200

ggggctacac acgtgttaca atggtaggta cagagggcag ctacccagtg atgggatgcg

1260

aatctcgaaa gcctatctca gttcggattg gaggctgaaa cccgcctcca tgaagttgga

1320

ttcgctagta atcgcgcatc agccatggcg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1380

ccgcccgtca agccatggaa gctgggggtg cctgaagttc gtgaccgcaa ggagcgacct

1440

agggcaaaac cggtgactgg ggctaagtcg taacaaggta

1480

<210> 136

<211> 1304

<212> DNA

<213> Alistipes sp. RMA 9912

<400> 136

gctcaggatg aacgctagcg gcaggcctaa cacatgcaag tcgagggacc ggcgcacggg

60

tgcgtaacgc gtatgtaacc tacctataac aggggcataa cactgagaaa ttggtactaa

120

ttccccataa tgaaaagtgg ttatagatgg acatgcgttg tattagctag ttggtgaggt

180

aacggctcac caaggcaacg atacataggg ggactgagag gttaaccccc cacactggta

240

ctgagacacg gaccagactc ctacgggagg cagcagtgag gaatattggt caatggacgc

300

aagtctgaac cagccatgcc gcgtgcagga agacggctta tgagttgtaa actgcttttg

360

tacgagggta tgaaagtatc gtacgaataa ggatcggcta actccgtgcc agcagccgcg

420

gtaatacgga ggattcaagc gttatccgga tttattgggt ttaaagggtg cgtaggcggt

480

ttgataagtt agaggtgaaa tcccggggct taactccgga actgcctcta atactgttag

540

actagagagt agttgcggta ggcggaatgt atggtgtagc ggtgaaatgc ttagagatca

600

tacagaacac cgattgcgaa ggcagcttac caaactatct gacgttgagg cacgaaagcg

660

tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgca gtaaacgatg ataactcgtt

720

gtcggcgagt cggtgactaa gcgaaagcga taagttatcc acctggggag tacgttcgca

780

agaatgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat

840

tcgatgatac gcgaggaacc ttacccgggc ttgaaagtac taggtgctgc atggttgtcg

900

tcagctcgtg ccgtgaggtg tcgggttaag tcccataacg agcgcaaccc ctaccgttag

960

ttgccatcag ctgggcactc tggcgggact gccggtgtaa gccggaggaa ggtggggatg

1020

acgtcaaatc agcacggccc ttacgtccgg ggctacacac gtgttacaat ggtaggcaga

1080

gggtcgctac tccgtgagga gatgccaatc tcgcctatct cagttcggat ggaggctgaa

1140

acccgcctcc agaagttgga ttcgctagta atcgcgcatc agccatggcg cggtgaatac

1200

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca agccatggaa gctgggggtg cctgaagttc

1260

gtgcgaccta gggcaaaacc ggtaactggg gctaagtcgt aaca

1304

<210> 137

<211> 1404

<212> DNA

<213> Alkaliphilus metalliredigenes

<220>

<221> modified_base

<222> (133)..(133)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (151)..(151)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (674)..(675)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 137

cctccttaga gtttgatcct ggctcaggat gaacgctggc ggcgtgccta acacatgcaa

60

gtcgagcggg ttaatctgac ggaagccttc gggtggaaga aagtgaaact agcggcggac

120

gggtgagtaa cgncgtgggc aacctacctt ngtacagggg gacaacaacg ggaaaccgtt

180

gctaataccc cataaaaccc tagaggggca tcccttaagg gtcaaagaat ttcggtacaa

240

gatgggcccg cgtctgatta gctagttggt gaggtaatgg ctcaccaagg cgacgatcag

300

tagccgacct gagagggtga tcggccacac tggaactgag acacggtcca gactcctacg

360

ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggcgaaagcc tgatgcagca acgccgcgtg

420

agcgatgaag gccttcgggt cgtaaagctc tgtcctaggg gaagaatatt gacggtaccc

480

taggaggaag ccccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggggcaagcg

540

ttatccggaa tcactgggcg taaagggtgc gtaggcggtc ttgcaagtca gaggtgaaag

600

gctacggctc aaccgtagta agcctttgaa actgctaaga cttgagtatg ggagaggaaa

660

gtggaattcc tagnntagcg gtgaaatgcg tagatattag gaggaacacc agtggcgaag

720

gcgactttct ggacccatta ctgaccgctg aggcacgaaa agcgtggggg agcaaacagg

780

attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa caatgagtgc taggatgttg ggggtcgaac

840

ctcagtgccg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgctca caagcagtga

900

aactcaaagg aattgactgg ggacccgcac aagcagctgg agcatgtggt ttaattcgaa

960

gcaacgcgaa gaaccttacc tggacgttga catccctcgg accactcctt aaccggagtc

1020

ttcccttcgg ggactgaggt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1080

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcttt agttgccagc agttcggctg

1140

ggcactctag agagactgcc ggggataact cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat

1200

catgcccctt atgttcaggg ctacacacgt gctacaatgg ccgatacaac gggcagcgaa

1260

ggagtaatcc ggagcaaatc ctataaagtc ggtcccagtt cggattgtgg gctgaaactc

1320

gcccacatga agctggagtt gctagtaatc gcgaatcaga atgtctgcgg tgaatgcgtt

1380

cccgggtctt gtacactacc agcc

1404

<210> 138

<211> 1314

<212> DNA

<213> Alkaliphilus oremlandii

<400> 138

aataccccat gacgcctttt gggggcatcc ctaaaaggtc aaagaacttc ggtacaggat

60

gggcccgcgt ctgattagct agttggtgag gtaatggctc accaaggcga cgatcagtag

120

ccggcctgag agggtgaacg gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga

180

ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggg gaaaccctga tgcagcaacg ccgcgtgagc

240

gatgaaggcc ttcgggtcgt aaagctctgt cctaagggaa gataatgacg gtaccttagg

300

aggaagcccc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggggg caagcgttat

360

ccggaatcat tgggcgtaaa gggtgcgtag gctgccctat aggtcagagg tcaaaggcta

420

cggctcaacc gtagtaagcc tttgaaactg tagggcttga gtgcaggaga ggagagtgga

480

attcctagtg tagcggtgaa atgcgtagat attaggagga acaccagtgg cgaaggcgac

540

tctctggact gcaactgacg ctgaggcacg aaagcgtggg tagcgaacag gattagatac

600

cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaggtgttg ggggtcgaac ctcggtgccg

660

aagttaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgtacg caagtatgaa actcaaagga

720

attgacgggg acccgcacaa gcagcggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa

780

ccttacctgg acttgacatc cctctgaccg attcttaacc gaatccttcc cttcggggac

840

agaggagaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgggatgtt gggttaagtc

900

ccgcaacgag cgcaaccctt gtctttagtt gccatcatta agttgggcac tctagagaga

960

ctgccgggga taactcggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgtt

1020

cagggctaca cacgtgctac aatggccgat acaacgggca gcgaaagagt aatctggagc

1080

aaatcctaca aaatcggtcc cagttcggat tgtgggctga aactcgccca catgaagttg

1140

gagttgctag taatcgcgga tcagaatgtc gcggtgaatg cgttcccggg tcttgtacac

1200

accgcccgtc acaccatggg agttggaagc acccgaagcc agctatctaa ccgtaaggag

1260

gaagctgtcg aaggtgaagc taatgactgg ggtgaagtcg taacaaggta gccg

1314

<210> 139

<211> 1482

<212> DNA

<213> Alloscardovia omnicolens

<400> 139

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gggatccttt ctagcttgct

60

aggggggtga gagtggcgaa cgggtgagta acgcgtgatt aacctgccgt gtagtttgga

120

atagctcctg gaaacgggtg gtaatgccga atgttccaca tgctcgcatg ggtgtgtggg

180

aaaacgtttt agtgctatgc gatgggatcg cgtcctatca gcttgttggt ggggtagtgg

240

cctaccaagg cttcgacggg tagccggcct gagagggcga ccggccacat tgggactgag

300

atacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg gggggaaccc

360

tgatgcagcg acgccgcgtg cgggatgacg gccttcgggt tgtaaaccgc ttttattggg

420

gagcaagcgt gagtgagtgt accttttgaa taagcaccgg ctaactacgt gccagcagcc

480

gcggtaatac gtagggtgca agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaaga gctcgtaggc

540

ggtttgtcgc gtctggtgtg aaagtccatc gcttaacggt ggattggcgc tgggtacggg

600

caggctagag tgtagtaggg gagactggaa ttctcggtgt aacggtggaa tgtgtagata

660

tcgggaagaa caccaatggc gaaggcaggt ctctgggcta ttactgacgc tgaggagcga

720

aagcgtgggg agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cggtggatgc

780

tggatgtggg gccctttcca cgggttctgt gtcggagcta acgcgttaag catcccgcct

840

ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa agaaattgac gggggcccgc acaagcggcg

900

gagcatgcgg attaattcga tgcaacgcga agaaccttac caagacttga catgttaacg

960

atggcctcag agatggggtg tctcttcgga gcgttttcac aggtggtgca tggtcgtcgt

1020

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtcttgtgt

1080

tgccagcacg ttatggtggg aactcacaag agaccgccgg ggttaactcg gaggaaggtg

1140

gggatgacgt cagatcatca tgccccttac gtcttgggct tcacgcatgc tacaatggcc

1200

ggtacagcga ggtgcgatag ggtgacctgg agcggatctc tgaaaaccgg tctcagttcg

1260

gatcggagcc tgcaactcgg ctccgtgaag gtggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa

1320

cgctgcggtg aatgcgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagtca tgaaagtggg

1380

cagcacccga agccggtggc ctaacagttt ttgctggggg agccgtctaa ggtgaggttc

1440

gcgattggga ctaagtcgta acaaggtagc cgtaccggaa gg

1482

<210> 140

<211> 1230

<212> DNA

<213> Alloscardovia sp. OB7196

<400> 140

cgaacgagtg gcgaacgggt gagtaacgcg tgatcaacct gccgtgtagt ggggaatagc

60

tcctggaaac gggtggtaat gccctatgtt gaaaggtgct atgcgatggg atcgcgtcct

120

atcagcttgt tggtggggta atggcctacc aaggcttcga cgggtagccg gcctgagagg

180

gcgaccggcc acattgggac tgagatacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

240

aatattgcac aatgggggaa accctgatgc agcgacgccg cgtgcgggat gacggccttc

300

gggttgtaaa ccgcttttaa ttgggagcat gagtgtacct tttgaataag caccggctaa

360

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggtgcaagcg ttgtccggaa ttattgggcg

420

taaagagctc gtaggcggtt tgtcgcgtct ggtgtgaaag tccatcgctt aacggtggat

480

ttgcgctggg tacgggcagg ctagagtgta gtaggggaga ctggaattcc cggtgtaacg

540

gtggaatgtg tagatatcgg gaagaacacc aatggcgaag gcaggtctct gggctaactg

600

acgctgagga gcgaaagcgt ggggagcgaa caggattaga taccctggta gtccacgccg

660

taaacggtgg atgctggatg tggggcgttc tgtgtcggag ctaacgcgtt aagcatcccg

720

cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact caaagaaatt gacgggggcc cgcacaagcg

780

gcggagcatg cggattaatt cgatgcaacg cgaagaacct taccaagact tgacatgcac

840

aggtggtgca tggtcgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

900

gcgcaaccct tgtcttgtgt tgccagcacg tgggaactca caagagaccg ccggggttaa

960

ctcggaggaa ggtggggatg acgtcagatc atcatgcccc ttacgtcttg ggcttcacgc

1020

atgctacaat ggccggcagc gaggtgcgat agggtgacct ggagcggatc tctgccggtc

1080

tcagttcgga tggagcctgc aactcggctc cagaaggtgg agtcgctagt aatcgcagat

1140

cagcaacgct gcggtgaatg cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc aagtcatgaa

1200

agtgggcaac acccgaagcc ggtgcctagg

1230

<210> 141

<211> 1528

<212> DNA

<213> Anaerobaculum hydrogeniformans

<400> 141

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgcgc ttaacacatg caagtcgtgc

60

gatacctcga gcgagtctta cgacaagctc aaggtagagc ggcggacggg tgagtaacac

120

gtgagtagct gtcctaagga gggggataac gcctggaaac gggtgctaaa accccatatg

180

cctcgcaaga ggtgaaaatg tagcttgcta cagccttagg gtgtgctcgc ggcctatcag

240

ctagttggtg aggtaacggc tcaccaaggc taagacgggt agccggcctg agagggtgta

300

cggccacact ggaattgaga tacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatct

360

tgggcaatgg gcgaaagcct gacccagcga cgccgcgttg gggatgaagc ccttcggggt

420

gtaaacccat gttgtagggg acgaagaaag tgacggtacc ctacgaggaa gccccggcta

480

actacgtgcc agcagccgcg gtaagacgta gggggcaagc gttgtccgga attactgggc

540

gtaaagggca cgcaggcggt gcgccaagtc gagggtgtaa agttacggct caaccgtgac

600

attgcaatcg atactggcgc gctggagtgc gggagaggga agtggaattc ccggtgtagc

660

ggtgaaatgc gtagatatcg ggaggaacgc cagtggcgaa ggcggcttcc tggcccgcga

720

ctgacgctca tgtgcgaaag ccaggggagc gaaccggatt agatacccgg gtagtcctgg

780

ccgtaaacga tgggtgctag gtgtaggcgc gtcaagcgtc tgtgccgcag ttaacgcgat

840

aagcacctcg cctggggagt acggtcgcaa ggctgaaact caaaggaatt gacgggggcc

900

cgcacaagcg gtggagcacg tggtttaatt cgatgcaaac cgaagaacct tacctgggtt

960

tgacatgcag gtggtacgaa cctgaaaggg cgaggaccat atcttcggat gtggagcctg

1020

cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1080

cgagcgcaac ccctgcgcct agttgccatc agttaggctg ggcactctag gcggactgcc

1140

ggcgacaagt cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catggccttt aagcccaggg

1200

cgacacacgt gctacaatgg ccagcacaga gggcggcaag tccgcgaggg caagcgaatc

1260

ccttaaagct ggtcttagtt cggatcgcag tctgcaaccc gactgcgtga agccggaatc

1320

gctagtaatc gccggtcagc catacggcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1380

cccgtcacac cacccgagtt gggtgctccc gaagccgccg gcccaacccc tttttgggga

1440

gggaggcgtc gaaggagtgt ctgataaggg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtaccg

1500

gaaggtgcgg ctggatcacc tcctttct

1528

<210> 142

<211> 1468

<212> DNA

<213> Anaerobiospirillum succiniciproducens

<400> 142

gctggcggca ggcctaatac atgcaagtcg aacggtaaca gcagagagct tgctctttgg

60

ctgacgagtg gcggacgggt gagtaaggct tgggaatctg cctggtagtg ggggacaaca

120

gttggaaacg actgctaata ccgcatactc ccttcggggg aaagacttcg gttgctatca

180

gatgagccca agtgggatta gctagtaggt gaggtaaagg ctcacctagg cgacgatctc

240

tagctggtct gagaggatga tcagccacat tgggactgag acacggccca gactcctacg

300

ggaggcagca gtagggaata ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagcc atgccgcgtg

360

tgtgaagaag gccttcgggt tgtaaagcac tttcagtggg gaggaaacac tgacgttacc

420

cacagaagaa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga gggtgcaagc

480

gttaatcgga ataactgggc gtaaagggca tgtaggcgga aaggtaagta ggatgtgaaa

540

tacccgggct caacctgggt tggtcattct aaactgcctt tctagagtat tgcagaggga

600

gatggaattt caggtgtagc ggtggaatgc gtagatatct gaaagaacac cagaggcgaa

660

ggcggtctcc tgggcaaata ctgacgctga ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt

720

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgtcgattag gagcttgaac ttcggtttgg

780

gttccgcagc taacgcgata aatcgaccgc ctggggagta cggccgcaag gttaaaactc

840

aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc

900

gaagaacctt acctgacctt gacatcgtag gaatctttya gagatragag agtgccttcg

960

ggaacctaca gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1020

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcctt tgttgccaac aggtaaagct gggaactcaa

1080

aggagactgc cggtgacaaa ccggaggaag gtagggatga cgtcaagtca tcatggccct

1140

tacggtcagg gctacacacg tgctacaatg gggcgtacag agggaaacga taccgtgagg

1200

tggagtggaa cccacaaagc gtcccgcagt tcggattgga gtctgcaact cgactccatg

1260

aagtcggaat cgctagtaat cgcaaatcag aatgttgcgg tgaatacgtt cccgggcctt

1320

gtacacaccg cccgtcacac catgggagcg gattgcacca gaagtagtta gcttaaccga

1380

aaggagggcg attaccacgg tgtggtctgt gactggggtg aagtcgtaac aaggtaaccg

1440

taggggaacc tgcggttgga tcacctcc

1468

<210> 143

<211> 1494

<212> DNA

<213> Anaerobiospirillum thomasii

<400> 143

cctggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaatacatg caagtcgaac ggtaacagta

60

agatagcttg ctatcttagc tgacgagtgg cggacgggtg agtaaagtct gggaaactgc

120

ctgatagagg gggacaacag ctggaaacgg ctgctaatac cgcatacacc ctgaggggga

180

aaggagcaat ccgctatcag atgtgcccag atgggattag ctagtaggtg tggtaagggc

240

gcacctaggc gacgatctct agctggtctg agaggatgat cagccacatt gggactgaga

300

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatat tgcacaatgg ggggaaccct

360

gatgcagcca tgcccgctgt gtgaagaagg ccttcgggtt gtaaagcact ttcagtgggg

420

aggaaatcgc aagagtgacg ttacccacag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag

480

ccgcggtaat acggagggtg caagcgttaa tcggaataac tgggcgtaaa gggcatgtag

540

gcggatagtc aagtaaggtg tgaaagcccc gggctcaacc tgggaactgc actttaaact

600

aactatctag agtattgcag agggaaatgg aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga

660

tatctggaag aacaccagag gcgaaggcga tctcctgggc agatactgac gctgaggtgc

720

gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgtcg

780

attagaagct tgagcgatag tttgggtttc gtagctaacg cgctaaatcg accgcctggg

840

gagtacggcc gcaaggttaa aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

900

catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg accttgacat cgtaggaatg

960

aataagagat tattcagtgc cttcgggagc ctatagacag gtgctgcatg gctgtcgtca

1020

gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg tcctttgttg

1080

ccagcgggta aagccgggaa ctcaaaggag actgccagtg acaaactgga ggaaggcagg

1140

gatgacgtca agtcatcatg gcccttacgg tcagggctac acacgtgcta caatggggcg

1200

tacagaggga gacgaaaccg cgaggtggag tggagcccac aaagcgtccc gcagttcgga

1260

ttggagtctg caactcgact ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcaa atcagaatgt

1320

tgcggtgaat acgtccccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgaattg

1380

caccagaagt agttagccta accgcaagga gggcgattac cacggtgtgg tttatgactg

1440

gggtgaagtc gtaacaaggt aaccataggg gaacctgtgg ctggatcacc tcct

1494

<210> 144

<211> 1530

<212> DNA

<213> Anaerococcus hydrogenalis

<400> 144

tttaattgag agtttgatcc tggctcagga taaacgctgg cggcgtgcat aacacatgca

60

agtcgaacga tgaaacttag atgatttctt cggaatgaac ttaagtggat tagtggcgaa

120

cgggtgagta acacgtgagt aacctgcctt acacaagggg atagcctctg gaaacggaga

180

ataataccct ataaagtcta atcagcccat gctggaaaga ccaaagattt atcggtgtaa

240

gatggacttg cgtctgatta gctagttggt gagataaaag ctcaccaagg cgacgatcag

300

tagccggctt gagagagtgt acggccacat tgggactgag acacggccca aactcctacg

360

ggaggcagca gtggggaatt ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagcg acgccgcgtg

420

atttagaagg ccttcgggtt gtaaaaatct tttttacggg atgaaaatga cagtaccgta

480

agaataaggt ccggctaaat acgtgccagc agccgcggta atacgtatgg accgagcgtt

540

gtccggaatc attgggcgta aagggtacgt aggcggccta gtaagttaga agttaaagaa

600

tatagctcaa ctatataaag cttttaaaac tgctaggctt gagagatgga agggaaagtg

660

gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgcag atattaggaa gaataccggt ggcgaaggcg

720

actttctggt catcatctga cgctgaggta cgaaagcgtg ggtagcaaac aggattagat

780

accctggtag tccacgctgt aaacgatgag tgttaggttc ttggaataat ctgggagccg

840

cagctaacgc attaaacact ccgcctgggg agtacgcacg caagtgtgaa actcaaagga

900

attgacgggg acccgcacaa gcagcggagc atgtggttta attcgacgca acgcgaagaa

960

ccttaccaag tcttgacata tttcggaggg aattagagat aattccttac gacttcggtc

1020

gactgaaata caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag

1080

tcccataacg agcgcaaccc ctatcgttag ttaccatcat taagttgggg actctagcga

1140

tactgccggt gataaaccgg aggaaggtgg ggacgacgtc aaatcatcat gccctttatg

1200

acttgggcta cacacgtgct acaatggcag atacagaggg cagcgaaaga gtgatctgaa

1260

gcgaaactca caaaatctgt cccagttcgg attgtactct gcaactcgag tacatgaagt

1320

tggagttgct agtaatcgcg aatcagaatg tcgcggtgaa tgcgttcccg ggtcttgtac

1380

acaccgcccg tcacaccatg gaagttggca atacccgaag cctgtgagcg aaccttttag

1440

gacgcagcag tcgaaggtag ggtcagtaac tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtat

1500

cggaaggtgc ggctggatca cctcctttct

1530

<210> 145

<211> 1426

<212> DNA

<213> Anaerococcus lactolyticus

<400> 145

tggattagtg gcggacgggt gagtaacgcg tgagtaacct gccttagaga aggggatagc

60

ctttggaaac gaagaataat accctataac accaacacct cgcatgaaga gttggtcaaa

120

gatttatcgc tctaagatgg acttgcgtct gattagttag ttggtgaggt aacggcccac

180

caagacagcg atcagtagcc ggcttgagag agtgtacggc cacattggga ctgagacacg

240

gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaattttgca caatggggga aaccctgatg

300

cagcgacgcc gcgtgattta gaaggccttc gggttgtaaa aatcttttct atgggaagaa

360

aatgacagta ccataggaat aaggaccggc taattacgtg ccagcagccg cggtaatacg

420

taaggtccga gcgttgtccg gaatcattgg gcgtaaaggg tacgtaggcg ggtaagcaag

480

ttagaagtga aatcctgtag ctcaactaca gtaagctttt aaaactgctc atcttgagat

540

atggaaggga aagtggaatt cctagtgtag cggtgaaatg cgcagatatt aggaggaata

600

ccggtggcga aggcgacttt ctggccataa tctgacgctg aggtacgaaa gcgtgggtag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgtta ggtgtctgga

720

gtaaatctgg gtgccgcagc taacgcatta aacactccgc ctggggagta cgcgcgcaag

780

cgtgaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcag cggagcatgt ggtttaattc

840

gacgcaacgc gaagaacctt accaagtctt gacatattac ggcgggagct agagatagtt

900

ccttacttct tcggaagact gtaatacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

960

gagatgttgg gttaagtccc ataacgagcg caacccctat cgttagttac catcattaag

1020

ttggggactc taacaatact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1080

catcatgccc tttatgactt gggctacaca cgtgctacaa tggcaggtac acagagcagc

1140

taaacagcga tgtcacgcga atctcaaaaa gcctgtccca gttcggattg cactctgcaa

1200

ctcgagtgca tgaagttgga gttgctagta atcgtggatc agaatgccgc ggtgaatgcg

1260

ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac accatggaag ttggcaatac ccgaagcctg

1320

tgagcgaacc cttgtggacg cagcagtcga aggtagggtc agtaactggg gtgaagtcgt

1380

aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct ggatcacctc ctttct

1426

<210> 146

<211> 1407

<212> DNA

<213> Anaerococcus octavius

<400> 146

gattaacgct ggcggcgtgc ataacacatg caagtcgaac gatgaaactt aaatgatttc

60

ttcggaatga acttaagtgg attagtggcg gacgggtgag taacgcgtga gtaacctgcc

120

ttacacaagg ggatagccgt tggaaacgac gaataatacc ctatgaaact atcacttcgc

180

atgaagcgat agtcaaagtg ttagcggtgt aagatggact tgcgtctgat tagctagttg

240

gtgagaaaaa agcccaccaa ggcaacgatc agtagccggc ttgagagagt gtacggccac

300

attgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa ttttgcacaa

360

tgggggaaac cctgatgcag cgacgccgcg tgatttagaa ggccttcggg ttgtaaaaat

420

cttttgtata ggaagaaaat gacagtacta tacgaataag gtccggctaa ttacgtgcca

480

gcagccgcgg taatacgtaa ggaccgagcg ttgtccggaa tcattgggcg taaagggtac

540

gtaggcgggt cattaagtta gaagtcaaag gctatagctc aactatagta agcttctaaa

600

actggagacc ttgagtaatg gaagggaaag tggaattcct agtgtagcgg tggaatgcgc

660

agatattagg aggaataccg gtggcgaagg cgactttctg gccattaact gacgctgagg

720

tacgaaagcg tgggtagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg

780

agtgttaggt gtctggagta aatctgggtg ccgcagctaa cgcattaaac actccgcctg

840

gggagtacgc acgcaagtgt gaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcagcgg

900

agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc aagtcttgac atattttgga

960

agcacttaga gataagtgcc tatatcttcg gataactgaa atacaggtgg tgcatggttg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccata acgagcgcaa cccctatggc

1080

tagttaccat cattaagttg gggactctag caatactgcc ggtgacaaac cggaggaagg

1140

tggggatgac gtcaaatcat catgcccttt atgacttggg ctacacacgt gctacaatgg

1200

caggtacaga gggcagcaag acagcgatgt taagcaaaac tcaaaaagcc tgtcccagtt

1260

cggattgcac tctgcaactc gagtgcatga agttggagtt gctagtaatc gtggatcaga

1320

atgccacggt gaatgcgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc atggaagttg

1380

gcaatacccg aagcctgtga gcgaacc

1407

<210> 147

<211> 1521

<212> DNA

<213> Anaerococcus prevotii

<400> 147

agagtttgat cctggctcag gataaacgct ggcggcgtgc ataacacatg caagtcgaac

60

gatgaagctt aaatgatctc ttcggagtga ccttaagtgg attagtggcg gacgggtgag

120

taacgcgtga gtaacctgcc ttgcacaagg ggatagccgt tggaaacgac gaataatacc

180

ctatgatatg atagcctcgc atgaagctat catcaaagat ttatcggtgt aagatggact

240

cgcgtctgat tagctagttg gtggggtaac agctcaccaa ggcaacgatc agtagccggc

300

ttgagagagt gtacggccac attgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag

360

cagtggggaa ttttgcacaa tgggggcaac cctgatgcag cgacgccgcg tgatttagaa

420

ggccttcggg ttgtaaaaat cttttgtatg ggaagaaaat gacagtacca tacgaataag

480

gaccggctaa ttacgtgcca gcagccgcgg taatacgtaa ggtccgagcg ttgtccggaa

540

tcattgggcg taaagggtac gtaggcggat aagcaagtta gaagtgaaat cctatagctc

600

aactatagta agcttttaaa actgctcatc ttgaggtatg gaagggaaag tggaattcct

660

agtgtagcgg tgaaatgcgc agatattagg aggaatacca gtggcgaagg cgactttctg

720

gccataaact gacgctgagg tacgaaagcg tgggtagcaa acaggattag ataccctggt

780

agtccacgcc gtaaacgatg agtgttaggt gtctggaata atctgggtgc cgcagctaac

840

gcaataaaca ctccgcctgg ggagtacgca cgcaagtgtg aaactcaaag gaattgacgg

900

ggacccgcac aagcagcgga gcatgtggtt taattcgacg caacgcgaag aaccttacca

960

agtcttgaca tattacggcg gggtctagag atagactctt acttcttcgg aagactgtaa

1020

tacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccataa

1080

cgagcgcaac ccctattgtt agttaccatc attaagttgg ggactctagc aatactgccg

1140

gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccttta tgacttgggc

1200

tacacacgtg ctacaatggc aggtacagag ggaagcgaga ctgcgaagtt aagcaaaact

1260

caaaaagcct gtcccagttc ggattgcact ctgcaactcg agtgcatgaa gttggagttg

1320

ctagtaatcg cagatcagaa tgctgcggtg aatgcgttcc cgggtcttgt acacaccgcc

1380

cgtcacacca tggaagttgg caatacccga agcctgtgag ctaaccttta gggagcagca

1440

gtcgaaggta gggtcagtaa ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta tcggaaggtg

1500

cggctggatc acctcctttc t

1521

<210> 148

<211> 1492

<212> DNA

<213> Anaerococcus sp. 8404299

<400> 148

agagtttgat cctggctcag gataaacgct ggcggcgtgc ataacacatg caagtcgaac

60

gatgaacctt aattgatttc ttcggaatga aattaagctg gattagtggc gaacgggtga

120

gtaacacgtg agtaacctgc cttacacaag gggatagcct ttggaaacga agaataatac

180

cctataaagt caaacaatat cgcatgctar agtgaccaaa gatttatcgg tgtaagatgg

240

acttgcgtct gattagctag ttggtgagat aaaagcccac caaggcgacg atcagtagcc

300

ggcttgagag agtgtacggc cacattggga ctgagacacg gcccaaactc ctacgggagg

360

cagcagtggg gaattttgca caatggggga aaccctgatg cagcgacgcc gcgtgattta

420

gaaggccttc gggttgtaaa aatctttttt atgggatgaa aatgacagta ccataagaat

480

aaggtccggc taaatacgtg ccagcagccg cggtaatacg tatggaccga gcgttgtccg

540

gaatcattgg gcgtaaaggg tacgtaggcg gcctagtaag ttagaagtga aataatatag

600

ctcaactata taaagctttt aaaactgtta ggcttgagag atgaaaggga aagtggaatt

660

cctagtgtag cggtgaaatg cgcagatatt aggaagaata ccggtggcga aggcgacttt

720

ctggtcatca tctgacgctg aggtacgaaa gcgtgggtag caaacaggat tagataccct

780

ggtagtccac gctgtaaacg atgagtgtta ggttcttgga ataatctggg agccgcagct

840

aacgcattaa acactccgcc tggggagtac gcacgcaagt gtgaaactca aaggaattga

900

cggggacccg cacaagcagc ggagcatgtg gtttaattcg acgcaacgcg aagaacctta

960

ccaagtcttg acataatacg gagggaatta gagataattt cttatcactt cggtgaactg

1020

tattacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtccca

1080

taacgagcgc aacccctatc gttagttacc atcattaagt tggggactct agcgatactg

1140

ccggtgataa accggaggaa ggtggggacg acgtcaaatc atcatgccct ttatgacttg

1200

ggctacacac gtgctacaat ggcagataca gagggcagcg aaagagcgat ctgaagcgaa

1260

actcacaaag tctgtcccag ttcggattgt actctgcaac tcgagtacat gaagttggag

1320

ttgctagtaa tcgcgaatca gaatgtcgcg gtgaatgcgt tcccgggtct tgtacacacc

1380

gcccgtcaca ccatgggagt tggcaatacc cgaagcctgt gagcgaacca attggacgca

1440

gcagtcgaag gtagggtcag taactggggt gaagtcgtaa caaggtagcc gt

1492

<210> 149

<211> 1486

<212> DNA

<213> Anaerococcus sp. 8405254

<400> 149

tagagtttga tcctggctca ggattaacgc tggcggcgtg cataacacat gcaagtcgaa

60

cgatgaaact ttaatgaacc cttcggggag aattaaagcg gattagtggc gaacgggtga

120

gtaacgcgtg agtaacctgc cttacacaag gggatagcct ttggaaacga agaataatac

180

cctataaaac cataaaggca catgcaatta tggtcaaagt attagcggtg taagatggac

240

ttgcgtctga ttagctagtt ggtgagataa aagcccacca aggcaacgat cagtagccgg

300

cttgagagag tgtacggcca cattgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

360

gcagtgggga attttgcaca atgggggaaa ccctgatgca gcgacgccgc gtgatttaga

420

aggccttcgg gttgtaaaaa tcttttgtat aggaagaaaa tgacagtact atacgaataa

480

ggtccggcta attacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta aggaccgagc gttgtccgga

540

atcattgggc gtaaagggta cgtaggcggc tagaaaagtt agaagtcaaa ggctatagct

600

caactatagt aagcttctaa aactatttag cttgagagat ggaagggaaa gtggaattcc

660

tagtgtagcg gtggaatgcg cagatattag gaggaatacc ggtggcgaag gcgactttct

720

ggccattttc tgacgctgag gtacgaaagc gtgggtagca aacaggatta gataccctgg

780

tagtccacgc cgtaaacgat gagtgttagg tgtctggagt caaatctggg tgccgcagca

840

aacgcattaa acactccgcc tggggagtac gcacgcaagt gtgaaactca aaggaattga

900

cggggacccg cacaagcagc ggagcatgtg gtttaattcg acgcaacgcg aagaacctta

960

ccaagtcttg acatatttta gaagcaatta gagataattg cctatatctt cggataacta

1020

aaatacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtccca

1080

taacgagcgc aacccctatt gctagttacc atcattaagt tggggactct agtaatactg

1140

ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgccct ttatgacttg

1200

ggctacacac gtgctacaat ggcaggtaca cagggaagca agactgtgaa gttaagcaaa

1260

actcaaaaag cctgtcccag ttcggattgc actctgcaac tcgagtgcat gaagttggag

1320

ttgctagtaa tcgcagatca gaatgctgcg gtgaatgcgt tcccgggtct tgtacacacc

1380

gcccgtcaca ccatggaagt tggcaatacc cgaagcctgt gagcgaaccc tttggggcgc

1440

agcagtcgaa ggtagggtca gtaactgggg tgaagtcgta acaagg

1486

<210> 150

<211> 1435

<212> DNA

<213> Anaerococcus sp. 9401487

<400> 150

tagagtttga tcctggctca ggattaacgc tggcggcgtg cataacacat gcaagtcgaa

60

cgatgaaact taaaagattt cttcggaatg accttaagtg gattagtggc ggacgggtga

120

gtaacgcgtg agtaacctgc cttacacaag gggatagcct ctggaaacgg agaataatac

180

cctataacac catcaaatcg catgaagtga tggtcaaagt gttagcggtg taagatggac

240

ttgcgtctga ttagctagtt ggtgagaaaa aagcccacca aggcaacgat cagtagccgg

300

cttgagagag tgtacggcca cattgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

360

gcagtgggga attttgcaca atgggggaaa ccctgatgca gcgacgccgc gtgatttaga

420

aggccttcgg gttgtaaaaa tcttttgtat aggaagaaaa tgacagtact atacgaataa

480

ggtccggcta attacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta aggaccgagc gttgtccgga

540

atcattgggc gtaaagggta cgtaggcggg tttttaagtt agaagtcaaa ggctatagct

600

caactatagt aagcttctaa aactgggaac cttgagagat ggaagggaaa gtggaattcc

660

tagtgtagcg gtggaatgcg cagatattag gaggaatacc ggtggcgaag gcgactttct

720

ggccattttc tgacgctgag gtacgaaagc gtgggtagca aacaggatta gataccctgg

780

tagtccacgc cgtaaacgat gagtgttagg tgtctggagt aaatctgggt gccgcagcta

840

acgcattaaa cactccgcct ggggagtacg cacgcaagtg tgaaactcaa aggaattgac

900

ggggacccgc acaagcagcg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac

960

caagtcttga catattacgg cagggattag agataatccc ctacatcttc ggatgactgt

1020

aatacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccat

1080

aacgagcgca accccttttg ctagttacca tcattaagtt ggggactcta gcaatactgc

1140

cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgccctt tatgacttgg

1200

gctacacacg tgctacaatg gcaggtacac agggcagcaa gacagtgatg ttaagcgaaa

1260

ctcaaaaagc ctgtcccagt tcggattgca ctctgcaact cgagtgcatg aagttggagt

1320

tgctagtaat cgtggatcag aatgccgcgg tgaatgcgtt cccgggtctt gtacacaccg

1380

cccgtcacac catggaagtt ggcaataccc gaagcctgtg agctaaccct ttggg

1435

<210> 151

<211> 1289

<212> DNA

<213> Anaerococcus sp. 9403502

<400> 151

aagtaatcaa agtgttttag cggtgtaaga tggacttgcg tctgattagc tagttggtga

60

gataacagct caccaaggca acgatcagta gccggcttga gagagtgtac ggccacattg

120

ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatttt gcacaatggg

180

ggcaaccctg atgcagcgac gccgcgtgat ttatgaaggc cttcgggttg taaaaatctt

240

ttgtatagga agaagatgac agtactatac gaataaggtc cggctaatta cgtgccagca

300

gccgcggtaa tacgtaagga ccgagcgttg tccggaatca ttgggcgtaa agggtacgta

360

ggcggccamt taagttagaa gtcaaaggct atagctcaac tatagtaagc ttctaaaact

420

gggtggcttg agagatggaa gggaaagtgg aattcctagt gtagcggtga aatgcgcaga

480

tattaggagg aataccggtg gcgaaggcga ctttctggcc attatctgac gctgaggtac

540

gaaagcgtgg gtagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt

600

gttaggtgtc tggagtaaat ctgggtgccg cagctaacgc attaaacact ccgcctgggg

660

agtacgcacg caagtgtgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcagcggagc

720

atgtggttta attcgaagca acgcgaaaaa ccttaccaag tcttgacata ttacggcgtt

780

tcttagagat aagaagctat atcttcggat aactgtaata caggtggtgc atggttgtcg

840

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccataacg agcgcaaccc ttatggctag

900

ttaccatcat taagttgggg actctagcaa tactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg

960

ggatgacgtc aaatcatcat gccctttatg acttgggcta cacacgtgct acaatggcag

1020

gtacagaggg cagcgaaact gygaagttaa gcgaaactca aaaagcctgt cccagttcgg

1080

attgcactct gcaactcgag tgcatgaagt tggagttgct agtaatcgca gatcagaatg

1140

ctgcggtgaa tgcgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccatg gaagttggca

1200

atacccgaag cctgtgagcg aaccctttgg gacgcagcag tcgaaggtag ggtcagtaac

1260

tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgta

1289

<210> 152

<211> 1445

<212> DNA

<213> Anaerococcus sp. gpac104

<400> 152

gattaacgct ggcggcgtgc ataacacatg caagtggaac gatgaaactt gaatgatctc

60

ttcggagtga acttaagtgg attagtggcg gacgggtgag taacgcgtga gtaacctgcc

120

ttagagaagg ggatagcctt tggaaacgaa gaataatacc ctatgacatg atagcctcgc

180

atgagattat crtcaaagat ttatcgctct aagatggact tgcgtctgat tagttagttg

240

gtggggtaac ggcccaccaa gacagcgatc agtagccggc ttgagagagt gtacggccac

300

attgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa ttttgcacaa

360

tgggggaaac cctgatgcag cgacgccgcg tgatttagaa ggccttcggg ttgtaaaaat

420

cttttctatg ggaagaacat gacagtacca taggaataag gaccggctaa ttacgtgcca

480

gcagccgcgg taatacgtaa ggtccgagcg ttgtccggaa tcattgggcg taaagggtac

540

gtaggcgggt aagcaagtta gaagtgaaat cctatagctc aactatagta agcttttaaa

600

actgctcatc ttgaggtatg gaagggaaag tggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgc

660

agatattagg aggataccgg tggcgaaggc gactttctgg cataacctga cgctgaggta

720

cgaaagcgtg ggtagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag

780

tgttaggtgt ctggagtaaa tctgggtgcc gcagtaacgc attaaacact ccgcctgggg

840

agtacgcgcg caagcgtgaa actcaaagga attgacggga cccgcacaag cagcggagca

900

tgtggtttaa ttcgacgcaa cgcgaagaac cttaccaagt cttgacatat tacggcggga

960

gctagagata gttccttact tcttcggaag actgtaatac aggtggtgca tggttgtcgt

1020

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccataacga gcgcaacccc tattgttagt

1080

taccatcatt aagttgggga ctctaacgat actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg

1140

gacgacgtca aatcatcatg ccctttatga cttgggctac acacgtgcta caatggcagg

1200

tacacagagc agctaaacag tgatgtcttg cgaatctcaa aaagcctgtc ccagttcgga

1260

ttgtactctg caactcgagt acatgaagtt ggagttgcta gtaatcgtga atcagaatgt

1320

cgcggtgaat gcgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatgg aagttggcaa

1380

tgcccgaagc ctgtgagcga acccttgtgg gcgcagcagt cgaaggtagg gtcagtaact

1440

gggtg

1445

<210> 153

<211> 1450

<212> DNA

<213> Anaerococcus sp. gpac126

<220>

<221> modified_base

<222> (842)..(842)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 153

gattaacgct ggcggcgtgc ataacacatg caagtcgaac gatgaaagct aaatgatttc

60

ttcggaatga atttagccgg attagtggcg gacgggtgag taacgcgtga gtaacctgcc

120

ttagagaagg ggatagcctt tggaaacgaa gaataatacc ctatgacacc aacacctcgc

180

atgaagagtt ggtcaaagat ttatcgctct aagatggact tgcgtctgat tagttagttg

240

gtgaggtaac ggctcaccaa gacagcgatc agtagccggc ttgagagagt gtacggccac

300

attgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa ttttgcacaa

360

tgggggaaac cctgatgcag cgacgccgcg tgatttagaa ggccttcggg ttgtaaaaat

420

cttttctatg ggaagaaaat gacagtacca taggaataag gaccggctaa ttacgtgcca

480

gcagccgcgg taatacgtaa ggtccgagcg ttgtccggaa tcattgggcg taaagggtac

540

gtaggcgggt aagcaagtta gaagtgaaat cctatagctc aactatagta agcttttaaa

600

actgctcatc ttgaggtatg gaagggaaag tggattccta gtgtagcggt gaaatgcgca

660

gatattaggg gggataccgg tggcgaaggc gactttctgg cataacctga cgctgaggta

720

cgaaagcgtg ggtagcaaac agggttagat accyggkagt ccacgccgta aacgawgagt

780

gataggtgtc tggagaaaat ctgggtgccg cagtaacgca twaaacactc csccctgggg

840

antacgcgcg caagcgtgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcagcggagc

900

atgtggttta attcgacgca acgcgaagaa cctttaccaa gtctagacat attaccggcg

960

ggatctagag atagatccct acttcttcgg aagactgtaa tacaggtggt gcatgtttgt

1020

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccataa gcgagcgcaa cccctattgt

1080

tagttaccat cattaagttg gggactctaa cgatactgcc gttgacaaac cggagaaagt

1140

tggggacgac gtcaaatcat catgcccttt atgacttggg ctacacacgt gctacaatgg

1200

caggtacaca gagcagctag acagcgatgt catgcaaatc tcaaaaagcc tgtccccagt

1260

tcggattgta ctctgcaact cgagtacatg aagttggagt tgctagtaat cgtggatcag

1320

aatgccgcgg tgaatgcgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catggaagtt

1380

ggcaataccc gaagcctgtg agcgaaccct tgtggaagca gcagtcgaag gtagggtcag

1440

taactgggtg

1450

<210> 154

<211> 1440

<212> DNA

<213> Anaerococcus sp. gpac155

<220>

<221> modified_base

<222> (1373)..(1373)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1395)..(1397)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1401)..(1401)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 154

gattaacgct ggcggcgttc ataacacatg caagtcgaac gatgaaactt aaatgatctc

60

ttcggagtga atttaagtgg attagtggcg gacgggtgag taacgcgtga gtaacctgcc

120

ttagagaagg ggatagcctt tggaaacgaa gaataatacc ctatgaaacc ataacctcgc

180

atgaggcctt ggtcaaagat ttatcgctct aagatggact tgcgtctgat tagttagttg

240

gtggggtaac ggcccaccaa gacagcgatc agtagccggc ttgagagagt gtacggccac

300

attgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa ttttgcacaa

360

tgggggaaac cctgatgcag cgacgccgcg tgatttagaa ggccttcggg ttgtaaaaat

420

cttttctatg ggaagaaaat gacagtacca taggaataag gaccggctaa ttacgtgcca

480

gcagccgcgg taatacgtaa ggtccgagcg ttgtccggaa tcattgggcg taaagggtac

540

gtaggcgggt aagcaagtta gaagtgaaat cctatagctc aactatagta agcttttaaa

600

actgctcatc ttgaggtatg gaagggaaag tggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgc

660

agatattagg aggaataccg gtggcgaagg cgactttctg gccataccct gacgctgagg

720

tacgaaagcg tgggtagcaa accaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat

780

gagtgttagg tgtctggagt aaatctgggt gccgcagcta acgcattaaa cactccgccc

840

tggggagtac gcgcgcaagc gtgaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcagc

900

ggagcatgtg gtttaattcg acgcaacgcg aagaacctta ccaagtcttg acatattacg

960

gcggaactta gagataagtt cttatgactt cggtcaactg taatacaggt ggtgcatggt

1020

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtccca taacgagcgc aacccctatt

1080

gttagttacc atcattaagt tggggactct aacgatactg ccggtgacaa accggaggaa

1140

ggtggggacg acgtcaaatc atcatgccct ttatgacttg ggctacacac gtgctacaat

1200

ggcaggtaca cagagcagct aaacagtgat gtcttgcgaa tctcaaaaag cctgtcccag

1260

ttcggattgt actctgcaac tcgagtacat gaagttggag ttgctagtaa tcgtgaatca

1320

gaatgtcgcg gtgaatgcgt tcccggtctt gtacacacgc cgtcacacca tgnagttgca

1380

tacccgagcc tgtgnnnccc ngtgggcgcc gcagtcgaag gtaggtcagt aactggggtg

1440

<210> 155

<211> 1457

<212> DNA

<213> Anaerococcus sp. gpac199

<400> 155

gattaacgct ggcggcgtgc ataacacatg caagtggaac gatgaaactt ttttgatttc

60

ttcggaatga atataagtgg attagtggcg gacgggtgag taacgcgtga gtaacctgcc

120

ttagagaagg ggatagcctt tggaaacgaa gaataatacc ctatgaaacc ataacctcgc

180

atgaggcctt ggtcaaagat ttatcgctct aagatggact tgcgtctgat tagttagttg

240

gtggggtaac ggcctaccaa gacagcgatc agtagccggc ttgagagagt gtacggccac

300

attgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa ttttgcacaa

360

tgggggaaac cctgatgcag cgacgccgcg tgatttagaa ggccttcggg gttgtaaaaa

420

tcttttctat gggaagaaaa tgacagtacc atagggaata agggaccggg ctaattacgt

480

gccagcagcc gcgggtaata cgtaaggtcc gcagcgttgt ccggaatcat tgggcgtaaa

540

gggtacgtag gcgggtaagc aagttagaag tgaaatccta tagctcaact atagtaagct

600

tttaaaactg ctcatcttga ggtatggaag ggaaagtggg attcctagtg tagcggtgaa

660

atgcgcagat attaggagga taccgggtgg cgaaggcgac tttctgccaa taccctgacg

720

ctgaggtacg aaagcgtggt agcaaaccag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa

780

acgatgagtg ttaggtgtct ggagtaaatc tgggtgccgc agctaacgca ttaaacactc

840

cgcctgggga gtacgcgcgc aagcgtgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag

900

cagcggagca tgtgtttaat tcgacgcaac gcgaagaacc ttaccaagtc ttgacatatt

960

acggcggaac ttagagataa gttcttatga cttcggtcaa ctgtaataca ggtggtgcat

1020

ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccataacgag cgcaacccct

1080

attgttagtt accatcatta agttggggac tctaacgata ctgccggtga caaaccggag

1140

gaaggtgggg acgacgtcaa atcatcatgc cctttatgat cttgggctac acacgtgcta

1200

caatggcagg tacacagagc agctaaacag tgatgtcttg cgaatctcaa aaagcctgtc

1260

ccagttcgga ttgtactctg caactcgagt acatgaagtt ggagttgcta gtaatcgtga

1320

atcagaatgt cgcggtgaat gcgttccccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccatg

1380

gaagttggca atacccgaag ccctgtgagc gaacccaatt gggcgcagca gtcgaaggta

1440

ggtcagtaac tggggtg

1457

<210> 156

<211> 1458

<212> DNA

<213> Anaerococcus sp. gpac215

<220>

<221> modified_base

<222> (13)..(13)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (737)..(737)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (741)..(741)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (761)..(761)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 156

taacgctggc ggncgtgcat aacacatgca agtcgaacga tgaaacttaa atgatttctt

60

cggaatgaac ttaagcggat tagtggcgaa cgggtgagta acacgtgagt aacctgcctt

120

acacaagggg atagcctttg gaaacgaaga ataataccct ataacgtcaa attatcgcat

180

gatagaatga ccaaagattt atcggtgtaa gatggacttg cgtctgatta gctagttggt

240

gagataaagg cccaccaagg caacgatcag tagccggctt tgagagagtg tacggccaca

300

ttgggactga gacacggccc aaactcctac gggaggcagc agtggggaat tttgcacaat

360

gggggaaacc ctgatgcagc gacgccgcgt gatttagaag gccttcgggt tgtaaaaatc

420

ttttttatgg gatgaaaatg acagtaccat aagaataagg tccggctaaa tacgtgccag

480

cagccgcggt aatacgtatg gaccgagcgt tgtccggaat cattgggcgt aaagggtacg

540

taggcggccc agtaagttag aagtgaaata atatagctca actatataaa gcttttaaaa

600

ctgctaggct tgagagatgg aagggaaagt ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgca

660

gatattagga agaataccgg tgccgaagcg actttctggt catcatctgg acgttgaggt

720

acgaaagcgt tggttancaa nccaggatta gatacccctg ntagtccacg gcctgtaaac

780

gatgagtgtt agttcttgga ataatctggg agccgcagct aacgcattaa acactccgcc

840

tggggagtac gcacgcaagt gtgaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcagc

900

ggagcatgtg gtttaattcg acgcaacgcg aagaacctta ccaagtcttg acataatacg

960

gagggaatta gagatagttt cttaagactt cggtctactg tattacaggt ggtgcatggt

1020

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtccca taacgagcgc aacccctatc

1080

gttagttacc atcattaagt tggggactct agcgatactg ccggtgataa accggaggaa

1140

ggtggggacg acgtcaaatc atcaatgccc cttttaatgg aaccttgggc tacacacgtg

1200

ctacaatggc aggtacagag ggcagcgaaa gagcgatctg aagcgaaact caaaaaacct

1260

gtcccagttc ggattgtact ctgcaactcg agtacatgaa gttggagttg ctagtaatcg

1320

cgaatcagaa tgtcgcggtg aatgcgttcc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca

1380

tgggagttgg caatacccga agcctgtgag cgacctttta ggacgcagca gtcgaaggta

1440

ggatcagtaa gctgggtg

1458

<210> 157

<211> 1530

<212> DNA

<213> Anaerococcus tetradius

<400> 157

ttatatatga gagtttgatc ctggctcagg attaacgctg gcggcgtgca taacacatgc

60

aagtcgaacg atgaagatat ttagattcct tcgggatgaa aaatattgga ttagtggcgg

120

acgggtgagt aacgcgtgag taacctgcct tacacaaggg gatagccgtt ggaaacgacg

180

aataataccc tatgacataa actcttcgca tgaagagctt atcaaagatt tatcggtgta

240

agatggactc gcgtctgatt agctagttgg tgaggtaacg gcccaccaag gcaacgatca

300

gtagccggct tgagagagtg tacggccaca ttgggactga gacacggccc agactcctac

360

gggaggcagc agtggggaat tttgcacaat gggggaaacc ctgatgcagc gacgccgcgt

420

gatttagaag gccttcgggt tgtaaaaatc ttttgtatgg gaagaaaatg acagtaccat

480

acgaataagg accggctaat tacgtgccag cagccgcggt aatacgtaag gtccgagcgt

540

tgtccggaat cattgggcgt aaagggtacg taggcggata agcaagttag aagtgaaatc

600

ctatagctca actatagtaa gcttttaaaa ctgctcatct tgaggtatgg aagggaaagt

660

ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgca gatattagga ggaataccgg tggcgaaggc

720

gactttctgg ccataaactg acgctgaggt acgaaagcgt gggtagcaaa caggattaga

780

taccctggta gtccacgccg taaacgatga gtgttaggtg tctggaataa tctgggtgcc

840

gcagctaacg caataaacac tccgcctggg gagtacgcac gcaagtgtga aactcaaagg

900

aattgacggg gacccgcaca agcagcggag catgtggttt aattcgacgc aacgcgaaga

960

accttaccaa gtcttgacat attacggagg gaattagaga tagttcctta cttcttcgga

1020

agactgtaat acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1080

gtcccataac gagcgcaacc cctatattta gttaccatca ttaagttggg gactctagat

1140

atactgccgg tgataaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccctttat

1200

gacttgggct acacacgtgc tacaatggca ggtacacagg gaagcgagac tgcgaagtta

1260

agcaaaactc aaaaagcctg tcccagttcg gattgcactc tgcaactcga gtgcatgaag

1320

ttggagttgc tagtaatcgt ggatcagaat gccgcggtga atgcgttccc gggtcttgta

1380

cacaccgccc gtcacaccat ggaagttggc aatacccgaa gcctgtgagc taaccattag

1440

gaagcagcag tcgaaggtag ggtcagtaac tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtat

1500

cggaaggtgc ggctggatca cctcctttct

1530

<210> 158

<211> 1425

<212> DNA

<213> Anaerococcus vaginalis

<400> 158

tggattagtg gcgaacgggt gagtaacacg tgagtaacct gccttacaca aggggatagc

60

ctttggaaac gaagaataat accctataaa gtcaaaatat cgcatgataa aatgaccaaa

120

gatttatcgg tgtaagatgg acttgcgtct gattagctag ttggtgagat aaaagcccac

180

caaggcgacg atcagtagcc ggcttgagag agtgtacggc cacattggga ctgagacacg

240

gcccaaactc ctacgggagg cagcagtggg gaattttgca caatggggga aaccctgatg

300

cagcgacgcc gcgtgattta gaaggccttc gggttgtaaa aatctttttt atgggatgaa

360

aatgacagta ccataagaat aaggtccggc taaatacgtg ccagcagccg cggtaatacg

420

tatggaccga gcgttgtccg gaatcattgg gcgtaaaggg tacgtaggcg gcctagtaag

480

ttagaagtga aataatatag ctcaactata taaagctttt aaaactgtta ggcttgagag

540

atgaaaggga aagtggaatt cctagtgtag cggtgaaatg cgcagatatt aggaagaata

600

ccggtggcga aggcgacttt ctggtcatca tctgacgctg aggtacgaaa gcgtgggtag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg atgagtgtta ggttcttgga

720

ataatctggg agccgcagct aacgcattaa acactccgcc tggggagtac gcacgcaagt

780

gtgaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcagc ggagcatgtg gtttaattcg

840

acgcaacgcg aagaacctta ccaagtcttg acataatacg gagggaatta gagataattt

900

tctatgactt cggtctactg tattacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

960

agatgttggg ttaagtccca taacgagcgc aacccctatc gttagttacc atcattaagt

1020

tggggactct agcgatactg ccggtgataa accggaggaa ggtggggacg acgtcaaatc

1080

atcatgccct ttatgacttg ggctacacac gtgctacaat ggcagataca gagggcagcg

1140

aaagagcgat ctgaagcgaa actcacaaag tctgtcccag ttcggattgt actctgcaac

1200

tcgagtacat gaagttggag ttgctagtaa tcgcgaatca gaatgtcgcg gtgaatgcgt

1260

tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt tggcaatacc cgaagcctgt

1320

gagcgaacct tttaggacgc agcagtcgaa ggtagggtca gtaactgggg tgaagtcgta

1380

acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1425

<210> 159

<211> 1035

<212> DNA

<213> Anaerofustis stercorihominis

<220>

<221> modified_base

<222> (868)..(868)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (940)..(941)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (956)..(956)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1004)..(1004)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1020)..(1021)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 159

gtcgaacgag aagcttacaa ttgatccttc gggtgaagct gtaagtggac agtggcgaac

60

gggtgagtaa cgcgtaggta accaacctca tgcaggggga tagcccaggg aaacttggat

120

taaacccgca taagaccaca gcaccgcatg gtgcagaggt aaaaactccg gtggcatgag

180

acggacctgc gtcttattag gtagttggtg aggtaacggc tcaccaagcc aacgatgagt

240

agccgacctg agagggtgat cggccacatt gggactgaga cacggcccag actcctacgg

300

gaggcagcag tggggaatat tgcgcaatgg ggggaaccct gacgcagcaa cgccgcgtga

360

gcgatgaagg ttttcggatc gtaaagctct gtctttgggg aagataatga cggtacccaa

420

ggaggaagct ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg agcaagcgtt

480

gtccggattc actgggcgta aagagcacgt aggcggttaa ttaagtcagg tgtgaaagtt

540

ttcggctcaa ccggaaaagt gcacttgaaa ctgaataact tgagtatcgg agaggtaagc

600

ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta gagattagga agaacaccgg tggcgaaggc

660

ggcttactgg acgataactg acgctgaggt gcgaaagcgt ggggagcgaa caggattaga

720

taccctggta gtccacgccg taaacgatga atactaggtg ttggggtaac tcagtgccgc

780

agttaacaca ttaagtattc cgcctgggga gtacgctcgc aagagtgaaa ctcaaaggaa

840

ttgacggggg cccgcacaag cagcgganca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac

900

cttaccaggt cttgacatcc cttgaccgcc taagagattn nctttccttc gggacnagga

960

gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgtngggtta agtcccgcan

1020

nagcgcaacc cttat

1035

<210> 160

<211> 1316

<212> DNA

<213> Anaeroglobus geminatus

<400> 160

agagtttgat cctggctcag gacaacgctg gcggcgtgcg taacacatgc aagtcgaacg

60

agagagtgag agaagcttgc ttttcttaca atcgagtggc aaacgggtga gtaacgcgta

120

aacaacctgc cccgcagatg gggacaacag ctggaaacgg ctgctaatac cgaatacggt

180

cctcttagcg catggtaaga ggaagaaagg gtggcctctg gaacaagcta ccgctgtggg

240

aggggtttgc gtctgattag ctggttggag gggtaacggc ccaccaaggc gacgatcagt

300

agccggtctg agaggatgaa cggccacatt ggaactgaga cacggtccag actcctacgg

360

gaggcagcag tggggaatct tccgcaatgg gcgaaagcct gacggagcaa cgccgcgtga

420

gtgaagacgg ccttcgggtt gtaaagctct gttatagggg acgaacggcc gggtagcgaa

480

gagggagccg gcatgacggt accgtaagag aaagccacgg ctaactacgt gccagcagcc

540

gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggaatgattg ggcgtaaagg gcgcttggcg

600

gctgtgtaag tctgtctaga aagtgcgggg ctaaaccccg tgagaggatg gaaactggac

660

agctgagagt gtcggagagg aaagcggaat tcctagtgta gcggtgaaat gcgtagatat

720

taggaggaac accggtggcg aaagcggctt tctggacgac aactgacgct gaggcgcgaa

780

agccagggga gcaaacggga ttagataccc cggtagtcct ggccgtaaac gatgggtact

840

aggtgtagga ggtatcgacc cctcctgtgc cggagttaac gcaataagta ccccgcctgg

900

ggagtacggc cgcaaggctg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga

960

gtatgtggtt taattcgacg caacgcgaag aaccttacca agccttgaca ttgctcgcaa

1020

cgggtagaga tacctggttc ttcttcggaa gacgagacaa caggtggtgc acggctgtcg

1080

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ctatcttcag

1140

ttaccagcac gtagaggtgg ggactcagga gagactgccg cagacaatgc ggaggaaggc

1200

ggggacgacg tcaagtcatc atgcccctta tggcttgggc tacacacgta ctacaatggc

1260

tctaaataga gggaagcgaa ggagcgatcc ggagcaaacc ccgcaaacag agtccc

1316

<210> 161

<211> 1390

<212> DNA

<213> Anaerosporobacter mobilis

<400> 161

ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gaagcaacta tcttgcttgc aagagagttg

60

acttagtggc ggacgggtga gtaacgcgtg ggtaacctgc ctcatacagg gggataacag

120

ttggaaacga ctgctaagac cgcataaccc gctagtgtcg catgacacgg acggaaaata

180

tttataggta tgagatgggc ccgcgtctga ttagctagtt ggtaaggtaa cggcttacca

240

aggcgacgat cagtagccga cttgagagag tgatcggcca cattgggact gagacacggc

300

ccaaactcct acgggaggca gcagtgggga atattggaca atgggggaaa ccctgatcca

360

gcgacgccgc gtgagtgaag aagtatttcg gtatgtaaag ctctatcagc agggaagata

420

atgacagtac ctgactaaga agccccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

480

agggggcaag cgttatccgg atttactggg tgtaaaggga gcgtaggtgg catggcaagt

540

cagaagtgaa agcccagggc tcaaccctgg gactgctttt gaaactgtca agctagagtg

600

caggagaggt aagtggaatt cctagtgtag cggtgaaatg cgtagatatt aggaggaaca

660

ccagtggcga aggcggctta ctggactgta actgacactg aggctcgaaa gcgtggggag

720

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgaatacta ggtgtctggg

780

attcgattct caggtgccga cgctaacgca ttaagtattc cacctgggga gtacgttcgc

840

aagaatgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

900

ttcgaagcaa cgcgaagaac cttacctagt cttgacatcc cgatgaccgg actttaatcg

960

gtccttctct tcggagcatc ggagacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1020

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccctatc tttagtagcc agcatttaag

1080

gtgggcactc tagagagact gccagggata acctggagga aggtggggat gacgtcaaat

1140

catcatgccc cttatgacta gggctacaca cgtgctacaa tggtgataac aaagtgaagc

1200

agcctcgtga gagtgagcaa atcacaaaaa tgtcatctca gttcggattg tagtctgcaa

1260

ctcgactaca tgaagctgga atcgctagta atcgcgaatc agaatgtcgc ggtgaatacg

1320

ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag ttggtaatgc ccgaagtcag

1380

tgacccaacc

1390

<210> 162

<211> 1539

<212> DNA

<213> Anaerostipes caccae

<400> 162

ttgaacatga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg aagcatttag gattgaagtt ttcggatgga tttcctatat gactgagtgg

120

cggacgggtg agtaacgcgt ggggaacctg ccctatacag gggggataac agctggaaac

180

ggctgctaat accgcataag cgcacagaat cgcatgattc agtgtgaaaa gccctggcag

240

tataggatgg tcccgcgtct gattagctgg ttggtgaggt aacggctcac caaggcgacg

300

atcagtagcc ggcttgagag agtgaacggc cacattggga ctgagacacg gcccaaactc

360

ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatggggga aaccctgatg cagcgacgcc

420

gcgtgagtga agaagtattt cggtatgtaa agctctatca gcagggaaga aaacagacgg

480

tacctgacta agaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc

540

aagcgttatc cggaattact gggtgtaaag ggtgcgtagg tggcatggta agtcagaagt

600

gaaagcccgg ggcttaaccc cgggactgct tttgaaactg tcatgctgga gtgcaggaga

660

ggtaagcgga attcctagtg tagcggtgaa atgcgtagat attaggagga acaccagtgg

720

cgaaggcggc ttactggact gtcactgaca ctgatgcacg aaagcgtggg gagcaaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgaata ctaggtgtcg gggccgtaga

840

ggcttcggtg ccgcagcaaa cgcagtaagt attccacctg gggagtacgt tcgcaagaat

900

gaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa

960

gcaacgcgaa gaaccttacc tggtcttgac atcccaatga gcgaacctta accggttttt

1020

tctttcgaga cattggagac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

1080

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc tatctttagt agccagcatt taaggtgggc

1140

actctagaga gactgccagg gataacctgg aggaaggtgg ggacgacgtc aaatcatcat

1200

gccccttatg gccagggcta cacacgtgct acaatggcgt aaacaaaggg aagcgaagtc

1260

gtgaggcgaa gcaaatccca gaaataacgt ctcagttcgg attgtagtct gcaactcgac

1320

tacatgaagc tggaatcgct agtaatcgtg aatcagaatg tcacggtgaa tacgttcccg

1380

ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtcagta acgcccgaag tcagtgaccc

1440

aaccgcaagg agggagctgc cgaaggtggg accgataact ggggtgaagt cgtaacaagg

1500

tagccgtatc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctttct

1539

<210> 163

<211> 1344

<212> DNA

<213> Anaerostipes sp. 3_2_56FAA

<220>

<221> modified_base

<222> (25)..(25)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (44)..(44)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 163

cggatggatt tcctatatga ctgantggcg gacgggtgag taangcgtgg ggaacctgcc

60

ctatacaggg ggataacagc tggaaacggc tgctaatacc gcataagcgc acagaatcgc

120

atgattcagt gtgaaaagcc ctggcagtat aggatggtcc cgcgtctgat tagctggttg

180

gtgaggtaac ggctcaccaa ggcgacgatc agtagccggc ttgagagagt gaacggccac

240

attgggactg agacacggcc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa

300

tgggggaaac cctgatgcag cgacgccgcg tgagtgaaga agtatttcgg tatgtaaagc

360

tctatcagca gggaagaaaa cagacggtac ctgactaaga agccccggct aactacgtgc

420

agcccggtaa cgggggcaag cgttatcgga attactgggt gtaaagggtg cgtaggtggc

480

atggtaagtc agaagtgaaa gcccggggct taaccccggg actgcttttg aaactgtcat

540

gctggagtgc aggagaggta agcggaattc ctagtgtagc ggtgaaatgc gtagatatta

600

ggaggaacac cagtggcgaa ggcggcttac tggactgtca ctgacactga tgcacgaaag

660

cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgaatactag

720

gtgtcggggc cgtagaggct tcggtgccgc agcaaacgca gtaagtattc cacctgggga

780

gtacgttcgc aagaatgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggagca

840

tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttacctggt cttgacatcc caatgaccga

900

accttaaccg gttttttctt tcgagacatt ggagacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

960

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccctatc tttagtagcc

1020

agcattacgg atgggcactc tagagagact gccagggata acctggagga aggtggggac

1080

gacgtcaaat catcatgccc cttatggcca gggctacaca cgtgctacaa tggcgtaaac

1140

aaagggaagc gaagtcgtga ggcgaagcaa atcccagaaa taacgtctca gttcggattg

1200

tagtctgcaa ctcgactaca tgaagctgga atcgctagta atcgtgaatc agaatgtcac

1260

ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tcagtaacgc

1320

ccgaagtcag tgacccaacc gcaa

1344

<210> 164

<211> 1360

<212> DNA

<213> Anaerotruncus colihominis

<400> 164

cttacgtttt gaagttttcg gatggatgaa tgtaagctta gtggcggacg ggtgagtaac

60

acgtgagcaa cctgcctttc agagggggat aacagccgga aacggctgct aataccgcat

120

gatgttgcgg gggcacatgc ccctgcaacc aaaggagcaa tccgctgaaa gatgggctcg

180

cgtccgatta gccagttggc ggggtaacgg cccaccaaag cgacgatcgg tagccggact

240

gagaggttga acggccacat tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca

300

gtgggggata ttgcacaatg ggcgaaagcc tgatgcagcg acgccgcgtg agggaagacg

360

gtcttcggat tgtaaacctc tgtctttggg gaagaaaatg acggtaccca aagaggaagc

420

tccggctaac tacgtgccag cagcgcggta atacgtaggg agcaagcgtt gtccggaatt

480

actgggtgta aagggagcgt aggcgggatg gcaagtagaa tgttaaatcc atcggtcaac

540

cggtggctgc gttctaaact gccgttcttg agtgaagtag aggcaggcgg aattcctagt

600

gtagcggtga aatgcgtaga tattaggagg aacaccagtg gcgaaggcgg cctgctgggc

660

tttaactgac gctgaggctc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt

720

ccacgccgta aacgatgatt actaggtgtg gggggactga ccccttccgt gccgcagtta

780

acacaataag taatccacct ggggagtacg gccgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac

840

gggggcccgc acaagcagtg gagtatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac

900

caggtcttga catcggatgc atagcctaga gataggtgaa gcccttcggg gcatccagaa

960

aggtggtgca tgagtgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1020

gcgcaaccct tattattagt tgctacgcaa gagcactcta atgagactgc cgttgacaaa

1080

acggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg

1140

tactacaatg gcactaaaac agagggcggc gacaccgcga ggtgaagcga atcccgaaaa

1200

agtgtctcag ttcagattgc aggctgcaac ccgcctgcat gaagtcggaa ttgctagtaa

1260

tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca

1320

ccatgggagt cggtaacacc cgaagccagt agcctaaccg

1360

<210> 165

<211> 1505

<212> DNA

<213> Anaplasma marginale

<400> 165

tcaaacttga gagtttgatc ctggctcaga acgaacgctg gcggcaagct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaccgtatac gcagcttgct gcgtgtatgg ttagtggcag acgggtgagt

120

aatgcatagg aatctaccta gtagtatggg atagccacta gaaatggtgg gtaatactgt

180

ataatccctg cgggggaaag atttatcgct attagatgag cctatgtcag attagctagt

240

tggtggggta atggcctacc aaggcggtga tctgtagctg gtctgagagg atgatcagcc

300

acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattggac

360

aatgggcgca agcctgatcc agctatgccg cgtgagtgag gaaggcctta gggttgtaaa

420

actctttcag tagggaagat aatgacggta cctacagaag aagtcccggc aaactccgtg

480

ccagcagccg cggtaatacg gagggggcaa gcgttgttcg gaattattgg gcgtaaaggg

540

catgtaggcg gtttggtaag ttaaaggtga aataccaggg cttaaccctg gggctgcttt

600

taatactgca ggactagagt ccggaagagg atagcggaat tcctagtgta gaggtgaaat

660

tcgtagatat taggaggaac accagtggcg aaggcggctg tctggtccgg tactgacgct

720

gaggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgctgtaaac

780

gatgagtgct gaatgtgggg gcttttgcct ctgtgttgta gctaacgcgt taagcactcc

840

gcctggggac tacggtcgca agactaaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc

900

ggtggagcat gtggtttaat tcgatgcaac gcgaaaaacc ttaccacttc ttgacatgga

960

ggctagatcc ttcttaacag aagggcgcag ttcggctggg cctcgcacag gtgctgcatg

1020

gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctca

1080

tccttagtta ccagcgggta atgccgggca ctttaaggaa actgccagtg ataaactgga

1140

ggaaggtggg gatgatgtca agtcagcacg gcccttatgg ggtgggctac acacgtgcta

1200

caatggcgac tacaataggt tgcaacgtcg caaggctgag ctaatccgta aaagtcgtct

1260

cagttcggat tgtcctctgt aactcgaggg catgaagtcg gaatcgctag taatcgtgga

1320

tcagcatgcc acggtgaata cgttctcggg tcttgtacac actgcccgtc acgccatggg

1380

aattggctta actcgaagct ggtgcgccaa ccgtaaggag gcagccattt aaggttgggt

1440

cggtgactgg ggtgaagtcg taacaaggta gctgtaggtg aacctgcggc tggattacct

1500

ccttt

1505

<210> 166

<211> 1508

<212> DNA

<213> Anaplasma phagocytophilum

<400> 166

tcaaacttga gagtttgatc ctggctcaga acgaacgctg gcggcaagct taacacatgc

60

aagtcgaacg gattattctt tatagcttgc tataaagaat agttagtggc agacgggtga

120

gtaatgcata ggaatctacc tagtagtatg ggatagccac tagaaatggt gggtaatact

180

gtataatccc tgcgggggaa agatttatcg ctattagatg agcctatgtt agattagcta

240

gttggtaggg taaaggccta ccaaggcgat gatctatagc tggtctgaga ggatgatcag

300

ccacactgga actgagatac ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg

360

acaatgggcg caagcctgat ccagctatgc cgcgtgagtg aggaaggcct tagggttgta

420

aaactctttc agtagggaag ataatgacgg tacctacaga agaagtcccg gcaaactccg

480

tgccagcagc cgcggtaata cggagggggc aagcgttgtt cggaattatt gggcgtaaag

540

ggcatgtagg cggttcggta agttaaaggt gaaatgccag ggcttaaccc tggagctgct

600

tttaatactg ccagactaga gtccgggaga ggatagcgga attcctagtg tagaggtgaa

660

attcgtagat attaggagga acaccagtgg cgaaggcggc tatctggtcc ggtactgacg

720

ctgaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgctgtaa

780

acgatgagtg ctgaatgtgg ggatttttta tctctgtgtt gtagctaacg cgttaagcac

840

tccgcctggg gactacggtc gcaagactaa aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca

900

agcggtggag catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaaa accttaccac tccttgacat

960

ggagattaga tccttcttaa cggaagggcg cagttcggct ggatctcgca caggtgctgc

1020

atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgtaaccc

1080

tcatccttag ttgccagcgg gttaagccgg gcactttaag gaaactgcca gtggtaaact

1140

ggaggaaggt ggggatgatg tcaagtcagc acggccctta tggggtgggc tacacacgtg

1200

ctacaatggt gactacaata ggttgcaatg tcgcaaggct gagctaatcc gtaaaagtca

1260

tctcagttcg gattgtcctc tgcaactcga gggcatgaag tcggaatcgc tagtaatcgt

1320

ggatcagcat gccacggtga atacgttctc gggtcttgta cacactgccc gtcacgccat

1380

gggaattggc ttaactcgaa gctggtgcgc caaccgaaag gaggcagcca tttaaggttg

1440

ggtcagtgac tagggtgaag tcgtaacaag gtagctgtag gtgaacctgc ggctggatta

1500

cctccttt

1508

<210> 167

<211> 1393

<212> DNA

<213> Aneurinibacillus aneurinilyticus

<400> 167

gtcgagcgga ccaaagaaga gcttgctctt cggcggttag cggcggacgg gtgagtaaca

60

cgtaggcaac ctgcctgtac gactgggata actccgggaa accggagcta ataccggata

120

cgtttttcag accgcatggt ctgaaagaga aagacctttg gtcacgtaca gatgggcctg

180

cggcgcatta gctagttggt ggggtaacgg cctaccaagg cgacgatgcg tagccgacct

240

gagagggtga tcggccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca

300

gtagggaatc ttccgcaatg gacgaaagtc tgacggagca acgccgcgtg aacgatgaag

360

gttttcggat cgtaaagttc tgttgttagg gaagaaccgc cgggatgacc tcccggtctg

420

acggtaccta acgagaaagc cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg

480

gggcaagcgt tgtccggaat tattgggcgt aaagcgcgcg caggcggctt cttaagtcag

540

gtgtgaaagc ccacggtcaa ccgtggaggg ccacttgaaa ctgggaggct tgagtgcagg

600

agaggagagc ggaattccac gtgtagcggt gaaatgcgta gagatgtgga ggaacacccg

660

tggcgaaggc ggctctctgg cctgtaactg acgctgagcg cgaaagcgtg gggagcgaac

720

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgttgag tgctaggtgt tggggactcc

780

aatcctcagt gccgcagcta acgcaataag cactccgcct ggggagtacg gccgcaaggc

840

tgaaactcaa aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga

900

agcaacgcga agaaccttac cagggcttga catcccgctg accctcctag agataggagc

960

tctcttcgga gcagcggtga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

1020

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtccttag ttgccagcat tcagttgggc

1080

actctaggga gactgccgtc gacaagacgg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat

1140

gccccttatg tcctgggcta cacacgtgct acaatggatg gaacaacggg cagccaactc

1200

gcgagagtgc gccaatccct taaaaccatt ctcagttcgg attgcaggct gcaactcgcc

1260

tgcatgaagc cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg

1320

ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgca acacccgaag tcggtgaggt

1380

aaccgcaagg agc

1393

<210> 168

<211> 1417

<212> DNA

<213> Aneurinibacillus danicus

<220>

<221> modified_base

<222> (809)..(809)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1245)..(1245)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 168

cgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca agtcgagcgg accaacggag agcttgctct

60

cctgcggtca gcggcggacg ggtgagtaac acgtaggcaa cctgcctgta cgaccgggat

120

aactccggga aaccggagct aataccggat aggatttcag accgcatggt ttggaatgga

180

aagaccctgt gtcacgtaca gatgggcctg cggcgcatta gctagttggt ggggtaacgg

240

cctaccaagg cgacgatgcg tagccgacct gagagggtga acggccacac tgggactgag

300

acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttccgcaatg gacgaaagtc

360

tgacggagca acgccgcgtg aacgaagaag gttttcggat cgtaaagttc tgttgttagg

420

gaagaaccgc cgggataacc tcccggtctg acggtaccta acgagaaagc cccggctaac

480

tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gggcaagcgt tgtccggaat tattgggcgt

540

aaagcgcgcg caggcggctt cttaagtcag gtgtgaaagc ccacggctca accgtggagg

600

gccacttgaa actgggaggc ttgagtgcag gagaggagag cggaattcca cgtgtagcgg

660

tgaaatgcgt agagatgtgg aggaacacct gtggcgaagg cggctctctg gcctgtaact

720

gacgctgagg cgcgaaagcg tggggagcga acaggattag ataccctggt agtccacgcc

780

gtaaacgatg agtgctaggt gttggggtnt ccaaacctca gtgccgcagc taacgcaata

840

agcactccgc ctggggagta cggccgcaag gctgaaactc aaaggaattg acggggaccc

900

gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accagggctt

960

gacatcccgc tgacccctct agagatagag gcttccttcg ggacagcggt gacaggtggt

1020

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1080

ccttgtcctt agttgccagc attcagttgg gcactctagg gagactgccg tcgacaagac

1140

ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgtcctgggc tacacacgtg

1200

ctacaatgga tggaacaacg ggcagccaac tcgcgagagt gagcnaatcc cttaaaacca

1260

ttctcagttc ggattgcagg ctgcaactcg cctgcatgaa gccggaatcg ctagtaatcg

1320

cggatcagca tgccgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca

1380

cgagagtttg caacacccga agtcggtgag gtaacct

1417

<210> 169

<211> 1483

<212> DNA

<213> Aneurinibacillus migulanus

<400> 169

aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtcga gcggaccaat gaagagcttg

60

ctcttcggcg gttagcggcg gacgggtgag taacacgtag gcaacctgcc tgtacgactg

120

ggataactcc gggaaaccgg agctaatacc ggatacttct ttcagaccgc atggtctgaa

180

agagaaagac ctttggtcac gtacagatgg gcctgcggcg cattagctag ttggtggggt

240

aacggcctac caaggcgacg atgcgtagcc gacctgagag ggtgatcggc cacactggga

300

ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatcttccg caatggacga

360

aagtctgacg gagcaacgcc gcgtgaacga tgaaggtttt cggatcgtaa agttctgttg

420

ttagggaaga accgccggga tgacctcccg gtctgacggt acctaacgag aaagccccgg

480

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggggca agcgttgtcc ggaattattg

540

ggcgtaaagc gcgcgcaggc ggcttcttaa gtcaggtgtg aaagcccacg gctcaaccgt

600

ggagggccac ttgaaactgg gaagcttgag tgcaggagag gagagcggaa ttccacgtgt

660

agcggtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa cacccgtggc gaaggcggct ctctggcctg

720

taactgacgc tgaggcgcga aagcgtgggg agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

acgccgtaaa cgttgagtgc taggtgttgg ggactccaat cctcagtgcc gcagctaacg

840

caataagcac tccgcctggg gagtacggcc gcaaggctga aactcaaagg aattgacggg

900

gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag

960

ggcttgacat cccgctgacc ctcctagaga taggagctct cttcggagca gcggtgacag

1020

gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1080

gcaacccttg tccttagttg ccagcattta gttgggcact ctagggagac tgccgtcgac

1140

aagacggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtcc tgggctacac

1200

acgtgctaca atggatggaa caacgggcag ccaactcgcg agagtgcgcg aatcccttaa

1260

aaccattctc agttcggatt gcaggctgca actcgcctgc atgaagccgg aatcgctagt

1320

aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca

1380

caccacgaga gtttgcaaca cccgaagtcg gtgaggtaac cgcaaggagc cagccgccga

1440

aggtggggca gatgattggg gtgaagtcgt aacaaggtat ccg

1483

<210> 170

<211> 1415

<212> DNA

<213> Aneurinibacillus terranovensis

<400> 170

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc ggacytttaa aagcttgctt

60

ttaaaggtta gcggcggacg ggtgagtaac acgtgggcaa cctgcctgta agctcgggat

120

aactccggga aaccggagct aataccgaat acgattcgca accgcatggt tgcgaatgga

180

aagttttcga acacttacag atgggcccgc ggcgcattag ctggttggtg gggtaacggc

240

ctaccaaggc gacgatgcgt agccgacctg agagggtgat cggccacact gggactgaga

300

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tccgcaatgg acgaaagtct

360

gacggagcaa cgccgcgtga gcgatgaagg ttttcggatc gtaaagctct gttgtcaggg

420

aagaaccgcc gggacgacct cccggtctga cggtacctga cgagaaagcc ccggctaact

480

acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg ggcaagcgtt gtccggaatt attgggcgta

540

aagcgcgcgc aggcggcctt ttaagtcagg tgtgaaagcc cgcggctcaa ccgtggaggg

600

ccacctgaaa ctgggaggct tgagtgcagg agaggagagc ggaattccac gtgtagcggt

660

gaaatgcgta gagatgtgga ggaacacccg tggcgaaggc ggctctctgg cctgtaactg

720

acgctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg

780

taaacgatga gtgctaggtg ttggggactc caatcctcag tgccgcagct aacgcaataa

840

gcactccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctgaaactca aaggaattga cggggacccg

900

cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaggacttg

960

acatcccgct gacccctcta gagatagagg ctcccttcgg ggcagcggtg acaggtggtg

1020

catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

1080

cttgtccgta gttgccagca ttgagttggg cactctacgg agactgccgt cgacaagacg

1140

gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gtcctgggct acacacgtgc

1200

tacaatggat ggtacaacgg gccgccagct cgcgagagtg agcgaatccc taaaaaccat

1260

tctcagttcg gattgcaggc tgcaactcgc ctgcatgaag ccggaatcgc tagtaatcgc

1320

ggatcagcat gccgcggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccac

1380

gagagtttgc aacacccgaa gtcggtgagg taacc

1415

<210> 171

<211> 1219

<212> DNA

<213> Aneurinibacillus thermoaerophilus

<400> 171

ttcctgaggt tagcggcgga cgggtgagta acacgtaggc aacctgcctg tacgaccggg

60

ataactccgg gaaaccggag ctaataccgg ataggatgcc gaaccgcatg gttcggcatg

120

gaaaggcctt tgagccgcgt acagatgggc ctgcggcgca ttagctagtt ggtggggtaa

180

cggcctacca aggcgacgat gcgtagccga cctgagaggg tgaacggcca cactgggact

240

gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtaggga atcttccgca atggacgaaa

300

gtctgacgga gcaacgccgc gtgagtgagg aaggtcttcg gatcgtaaaa ctctgttgtc

360

agggaagaac cgccgggatg acctcccggt ctgacggtac ctgacgagaa agccccggct

420

aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggggcaag cgttgtccgg aattattggg

480

cgtaaagcgc gcgcaggcgg cttcttaagt caggtgtgaa agcccacggc tcaaccgtgg

540

agggccatct gaaactgggg agcttgagtg cagaaggaga gcggaattcc acgtgtacgg

600

tgaaatgcgt aagatgtgga ggaacaccag tggcgaaggc ggctctctgg cctgtaactg

660

acgtgaggcg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattaata ccctggtagt cacccgtaaa

720

cgatgagtgc taggtgttgg ggagtccacc tcctcagtgc gcataacgca ataacactcc

780

cctgggagta cgccgcaagg ctgaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcggt

840

ggagcatgtg gtttaattta agcaacgcga aaaccttacc agggcttgac atcccgctga

900

cccctccaga gatggaggtt tccttcggga cagcggtgac aggtggtgca tggttgtcgt

960

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtcctttgt

1020

tgccagcatt cagttgggca ctctaaggag actgccgtcg acaagacgga ggaaggtggg

1080

gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgt cctgggctac acacgtgcta caatggacgg

1140

tacaacgggc gtgccaaccc gcgagggtga gccaatccct aaaaaccgtt ctcagttcgg

1200

attgcaggct gcaactcgc

1219

<210> 172

<211> 1541

<212> DNA

<213> Anoxybacillus contaminans

<400> 172

ttagaggttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtcga

60

gcggaccgaa aagaagcttg cttcgattcg gttagcggcg gacgggtgag taacacgtgg

120

gcaacctgcc ctgtagacgg ggataacacc gagaaatcgg tgctaatacc ggataacacg

180

aaakgycgca tggyctttcg ttgaaaggcg gcgcaagctg tcgctacagg atgggcccgc

240

ggcgcattag ctagttggtg aggtaacggc tcaccaaggc gacgatgcgt agccgacctg

300

agagggtgat cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

360

tagggaatct tccgcaatgg acgaaagtct gacggagcaa cgccgcgtga gcgaagaagg

420

tcttcggatt gtaaagctct gttgttaggg aagaacaagt accgcagtaa ctggcggtac

480

cttgacggta cctaacgaga aagccacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

taggtggcaa gcgttgtccg gaattattgg gcgtaaagcg cgcgcaggcg gtcctttaag

600

tctgatgtga aagcccacgg ctcaaccgtg gagggtcatt ggaaactggg ggacttgagt

660

gcagaagagg agagcggaat tccacgtgta gcggtgaaat gcgtagagat gtggaggaac

720

accagtggcg aaggcggctc tctggtctgt aactgacgct gaggcgcgaa agcgtgggga

780

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aagtgttaga

840

ggggttacac cctttagtgc tgtagctaac gcattaagca ctccgcctgg ggagtacgct

900

cgcaagagtg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

960

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca tcccttgaca acccaagaga

1020

ttgggcgttc cccttcgggg gacaaggtga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1080

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgaccttag ttgccagcat

1140

tgagttgggc actctaaggt gactgccgat gacaaatcgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1200

aaatcatcat gccccttatg acctgggcta cacacgtgct acaatgggcg gtacaaaggg

1260

ttgcaaaccc gcgaggggga gccaatccca aaaagccgct ctcagttcgg attgcaggct

1320

gcaactcgcc tgcatgaagc cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa

1380

tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgca acacccgaag

1440

tcggtgaggt aacccttacg ggagccagcc gccgaaggtg gggcagatga ttggggtgaa

1500

gtcgtaacaa ggtagccgta tcggaaggtg cggctggatc a

1541

<210> 173

<211> 1405

<212> DNA

<213> Anoxybacillus flavithermus

<220>

<221> modified_base

<222> (12)..(12)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 173

gcggacgaat cnaaagcttg cttttgattc gttagcggcg gacgggtgag taacacgtgg

60

gcaacctgcc ctgtagacgg ggataacacc gagaaatcgg tgctaatacc ggataacacg

120

aaatgtcgca tgacgtttcg ttgaaagacg gcgcaagctg tcgctacagg atgggcccgc

180

ggcgcattag ctagttggtg aggtaacggc tcaccaaggc gacgatgcgt agccgacctg

240

agagggtgat cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

300

tagggaatct tccgcaatgg acgaaagtct gacggagcaa cgccgcgtga gcgaagaagg

360

ccttcgggtc gtaaagctct gttgttaggg aagaacaagt aacgcagtaa ctggcgttac

420

cgtgacggta cctaacgaga aagccacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

taggtggcaa gcgttgtccg gaattattgg gcgtaaagcg cgcgcaggcg gttccttaag

540

tctgatgtga aagccacggc tcaaccgtgg agggtcattg gaaactgggg gacttgagtg

600

cagaagagga gagcggaatt ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaaca

660

ccagtggcga aggcggctct ctggtctgta actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag

720

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgtaa gtgttagagg

780

gtatccgccc tttagtgctg tagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgctcg

840

caagagtgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

900

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccaag tcttgacatc ccctgacaac ccgagagatc

960

gggcgttccc ccttcggggg gacagggtga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1020

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc tcgaccttag ttgccagcat

1080

tcagttgggc actctaaggt gactgccggc taaaagtcgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1140

aaatcatcat gccccttatg acctgggcta cacacgtgct acaatgggcg gtacaaaggg

1200

tcgcgaaccc gcgaggggga gccaatccca aaaagccgct ctcagttcgg attgcaggct

1260

gcaactcgcc tgcatgaagc cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa

1320

tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgca acacccgaag

1380

tcggtgaggt aacccttacg ggagc

1405

<210> 174

<211> 1483

<212> DNA

<213> Arcanobacterium haemolyticum

<220>

<221> modified_base

<222> (679)..(679)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 174

cgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca agtcgaacga tgaaggctcc tgcttgcggg

60

ggttggatta gtggcgaacg ggtgagtaat acgtgagtaa cctgcccctt tctcttggga

120

taagccttgg aaacgaggtc taatactaga tattctgctt ctgccgcatg gtgggggttg

180

gaaaggtttt ttctggtggg ggatgggctc acggcctatc agcttgttgg tggggtgatg

240

gcctaccaag gcgtcgacgg gtagccggcc tgagagggtg accggccaca ttgggactga

300

gatacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat ggacggaagt

360

ctgatgcagc gaacgccgcg tgggggatga aggctttcgg gttgtaaact ccttttaaca

420

ctgaacaagg cgaaagttga gggtaggtgt tgaataagcg ccggctaact acgtgccagc

480

agccgcggta atacgtaggg cgcgagcgtt gtccggaatt attgggcgta aagagctcgt

540

aggcggtttg tcgcgtctgc tgtgaaagac cggggcttaa ctccggggct gcagtgggta

600

cgggcaggct agagtgcggt aggggtaatt ggaattcctg gtgtagcggt ggaatgcgca

660

gatatcagga ggaacaccna tggcgaaggc aggttactgg gccgttactg acgctgagga

720

gcgaaagcat ggggagcgaa caggattaga taccctggta gtccatgccg taaacgttgg

780

gcactaggtg tggggccttt tccatgggtt ctgtaccgta gctaacgcat taagtgcccc

840

gcctggggag tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc

900

ggcggagcat gcggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc ttaccaaggc ttgacataca

960

ccgggattat gcagagatgt gtgagtcttc ggactggtgt acaggtggtg catggttgtc

1020

gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtcttgt

1080

gttgccagca cgttatggtg gggactcacg agagactgcc ggggttaact cggaggaagg

1140

tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgtcttggg cttcacgcat gctacaatgg

1200

ctggtacaga gggttgcgag cttgtgaggg tgagcgaatc ccttaaagcc agtctcagtt

1260

cggattgggg tctgcaactc gaccccatga agtcggagtc gctagtaatc gcagatcagc

1320

caacgctgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcacg tcacgaaagt

1380

tggtaacacc cgaagcccgt ggcctaactc gtttgagggg gagcggacga aggtgggatt

1440

agccattggg acgaagtcgt aacaaggtag ccgtaccgga agg

1483

<210> 175

<211> 1293

<212> DNA

<213> Arcanobacterium pyogenes

<220>

<221> modified_base

<222> (921)..(921)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 175

catgcagtcg aacgatgaag ccggggcttt ttgttttggt ggattagtgg cgaacgggtg

60

agtaatacgt gagtaacctg cccttgtctt tgggataagc ctgggaaact gggtctaata

120

ccggatattc tgcttttgcc gcatggtggg ggttggaaag attttttgga tggggatggg

180

ctcacggcct atcagcttgt tggtggggtg atggcctacc aaggcgtcga cgggtagccg

240

gcctgagagg gtgaccggcc acattgggac tgagatacgg cccagactcc tacgggaggc

300

agcagtgggg aatattgcac aatggacgca agtctgatgc agcgacgccg cgtgggggat

360

gaaggctttc gggttgtaaa ctcctttcag tacagaagaa gcatttttgt gacggtatgt

420

gcagaagaag cgccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggcgcgagcg

480

ttgtccggaa ttattgggcg taaagagctc gtaggcggtt tgttgcgcct gctgtgaaag

540

accggggctt aacttcgggg ttgcagtggg tacgggcaga ctagagtgtg gtaggggtaa

600

ttggaattcc tggtgtagcg gtggaatgcg cagatatcag gaggaacacc gatggcgaag

660

gcaggttact gggccattac tgacgctgag gagcgaaagc gtgggtagcg aacaggatta

720

gataccctgg tagtccacgc tgtaaacgtt gggcactagg tgtggggcct tttccacggg

780

ttctgcgccg tagctaacgc tttaagtgcc ccgcctgggg agtacggccg caaggttaaa

840

actcaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggcggagca tgcggattaa ttcgatgcaa

900

cgcgaagaac cttaccaagg nttgacatac actgcgatgt gccagagatg tgcagccttc

960

gggtggtgta caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag

1020

tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtcctgtg ttgccagcat gttgtggtgg ggactcacgg

1080

gagactgccg gggttaactc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta

1140

tgtcttgggc ttcacgcatg ctacaatggc cggtacagag ggttgcgagc ctgtgagggt

1200

gagctaatcc cttaaagctg gtctcagttc ggattggggt ctgcaactcg accccatgaa

1260

gtcggagtcg ctagtaatcg cagatcagca acg

1293

<210> 176

<211> 1519

<212> DNA

<213> Arcobacter butzleri

<400> 176

tttatggaga gtttgatcct ggctcagagt gaacgctggc ggcgtgctta acacatgcaa

60

gtcgaacgag aacggattat agcttgctat aattgtcagc taagtggcgc acgggtgagt

120

aatgtatagg taatatgcct cttactaagg gataacaatt ggaaacgatt gctaatacct

180

tatattcctt tttatcaaaa gataaaaagg gaaagattta ttggtaagag attagcctgt

240

attgtatcag ttagttggtg gggtaatggc ctaccaagac gatgacgcat aactggtttg

300

agaggatgat cagtcacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag

360

tggggaatat tgcacaatgg acgaaagtct gatgcagcaa cgccgcgtgg aggatgacac

420

atttcggtgc gtaaactcct tttatataag aagataatga cggtattata tgaataagca

480

ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg tgcaagcgtt actcggaatc

540

actgggcgta aagagcgtgt aggcggattg ataagtttga agtgaaatcc tatagcttaa

600

ctatagaact gctttgaaaa ctgttaatct agaatgtggg agaggtagat ggaatttctg

660

gtgtaggggt aaaatccgta gagatcagaa ggaataccga ttgcgaaggc gatctactgg

720

aacaatattg acgctgagac gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta

780

gtccacgccc taaacgatgt acactagttg ttgtgaggct cgaccttgca gtaatgcagt

840

taacacatta agtgtaccgc ctggggagta cggtcgcaag attaaaactc aaaggaatag

900

acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gacgatacac gaagaacctt

960

acctggactt gacatagtaa gaatgattta gagatagatt agtgtctgct tgcagaaact

1020

tgcatacagg tgctgcacgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1080

gcaacgagcg caaccctcgt ccttagttgc taacagttcg gctgagaact ctaaggagac

1140

tgcctacgca agtaggagga aggtgaggat gacgtcaagt catcatggcc cttacgtcca

1200

gggctacaca cgtgctacaa tggggtatac aaagagcagc aatacggtga cgtggagcaa

1260

atctcaaaaa tgcctcccag ttcggattgt agtctgcaac tcgactacat gaagttggaa

1320

tcgctagtaa tcgtagatca gctatgctac ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtactcac

1380

cgcccgtcac accatgggag ttgaactcat tcgaagcggg gatgctaaag tagctacctt

1440

ccacagtgga ttcagcgact ggggtgaagt cgtaacaagg taaccgtagg agaacctgcg

1500

gttggatcac ctcctttca

1519

<210> 177

<211> 1462

<212> DNA

<213> Arcobacter cryaerophilus

<220>

<221> modified_base

<222> (195)..(195)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (936)..(936)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1098)..(1098)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 177

atggagagtt tgatcctggc tcagagtgaa cgctggcggc gtgcttaaca catgcaagtc

60

gaacgagaac ggattatagc ttgctataat tgtcagctaa gtggcgcacg ggtgagtaat

120

gtataggtaa tatgcctctt actaagggat aacaattgga aacgattgct aataccttat

180

actccttgtt aactnaagtt aataagggaa agatttattg gtaagagatt agcctgtatt

240

gtatcagtta gttggtgggg taatggccta ccaagacaat gacacataac tggtttgaga

300

ggatgatcag tcacactgga actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg

360

ggaatattgc acaatggacg aaagtctgat gcagcaacgc cgcgtggagg atgacacatt

420

tcggtgcgta aactcctttt atatgagaag ataatgacgg tattatatga ataagcaccg

480

gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggggggtgc aagcgttact cggaatcact

540

gggcgtaaag agcatgtagg cggattgata agtttgaagt gaaatcctat agcttaacta

600

tagaactgct ttgaaaactg ttaatctaga atgtgggaga ggtagatgga atttctggtg

660

taggggtaaa atccgtagag atcagaagga ataccgattg cgaaggcgat ctactggaac

720

attattgacg ctgagatgcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc

780

cacgccctaa acgatgtaca ctagttgttg tgagacttga tcttgcagta atgcagttaa

840

cacattaagt gtaccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt aaaactcaaa ggaatagacg

900

gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaatncgaa gatacacgaa gaaccttacc

960

tggacttgac atagtaagaa ctttctagag atagattggt gtctgcttgc agaaacttat

1020

atacaggtgc tgcacggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1080

acgagcgcaa ccctcgtntt tagttgctaa cagttcggct gagaactcta aacagactgc

1140

ctacgcaagt aggaggaagg tgaggacgac gtcaagtcat catggccctt acgtccaggg

1200

ctacacacgt gctacaatgg gatatacaaa gagccgcaat acggtgacgt ggagcaaatc

1260

ttataaaata tctcccagtt cggattgtag tctgcaactc gactacatga agttggaatc

1320

gctagtaatc gtagatcagc tatgctacgg tgaatacgtt cccgggtctt gtactcaccg

1380

cccgtcacac catgggagtc gaactcattc gaagcgggga tgctaaaata gctaccttcc

1440

acagtggatt tggcgactgg gg

1462

<210> 178

<211> 1482

<212> DNA

<213> Arthrobacter agilis

<400> 178

gatcctggct caggatgaac gctggcggcg tgcttaacac atgcaagtcg aacgatgaac

60

ctcacttgtg gggggattag tggcgaacgg gtgagtaaca cgtgagtaac ctgcccttga

120

ctctgggata agcctgggaa accgggtcta atactggata cgaccttctg gcgcatgcca

180

tgttggtgga aagcttttgt ggttttggat ggactcgcgg cctatcagct tgttggtggg

240

gtaatggcct accaaggcga cgacgggtag ccggcctgag agggtgaccg gccacactgg

300

gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc

360

gcaagcctga tgcagcgacg ccgcgtgagg gatgaaggcc ttcgggttgt aaacctcttt

420

cagtagggaa gaagcctgtc ttttgggtgg gtgacggtac ctgcagaaga agcgccggct

480

aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggcgcaag cgttatccgg aattattggg

540

cgtaaagagc tcgtaggcgg tttgtcgcgt ctgccgtgaa agtccggggc ttaactccgg

600

atctgcggtg ggtacgggca gactagagtg cagtagggga gactggaatt cctggtgtag

660

cggtgaaatg cgcagatatc aggaggaaca ccgatggcga aggcaggtct ctgggctgta

720

actgacgctg aggagcgaaa gcatggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat

780

gccgtaaacg ttgggcacta ggtgtggggg acattccacg ttttccgcgc cgtagctaac

840

gcattaagtg ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg

900

gggcccgcac aagcggcgga gcatgcggat taattcgatg caacgcgaag aaccttacca

960

aggcttgaca tgaaccggaa tgatgcagag atgtgtcagc cacttgtggc cggtttacag

1020

gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1080

gcaaccctcg ttccatgttg ccagcgggtt atgccgggga ctcatgggag actgccgggg

1140

tcaactcgga ggaaggtggg gacgacgtca aatcatcatg ccccttatgt cttgggcttc

1200

acgcatgcta caatggccgg tacaaagggt tgcgatactg tgaggtggag ctaatcccaa

1260

aaagccggtc tcagttcgga ttgaggtctg caactcgacc tcatgaagtt ggagtcgcta

1320

gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg

1380

tcaagtcacg aaagttggta acacccgaag ccggtggcct aaccccttgt gggagggagc

1440

cgtcgaaggt gggaccggcg attgggacta agtcgtaaca ag

1482

<210> 179

<211> 1519

<212> DNA

<213> Arthrobacter arilaitensis

<400> 179

ggagagtttg atcctggctc aggatgaacg ctggcggcgt gcttaacaca tgcaagtcga

60

acgatgaagc ccagcttgct gggtggatta gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagtaa

120

cctgcccccg actctgggat aagcccggga aactgggtct aataccggat attacctctt

180

gccgcatggc aggtggtgga aagatttatc ggtgggggat ggactcgcgg cctatcagct

240

tgttggtgag gtaatggctc accaaggcga cgacgggtag ccggcctgag agggtgaccg

300

gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

360

cacaatgggc gaaagcctga tgcagcgacg ccgcgtgagg gatgacggcc ttcgggttgt

420

aaacctcttt cagtagggaa gaagcgaaag tgacggtacc tgcagaagaa gcgccggcta

480

actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggcgcaagc gttatccgga tttattgggc

540

gtaaagagct cgtaggcggt ttgtcgcgtc tgccgtgaaa gtccgaggct caacctcgga

600

tctgcggtgg gtacgggcag actagagtga tgtaggggag actggaattc ctggtgtagc

660

ggtgaaatgc gcagatatca ggaggaacac cgatggcgaa ggcaggtctc tgggcattta

720

ctgacgctga ggagcgaaag catggggagc gaacaggatt agataccctg gtagtccatg

780

ccgtaaacgt tgggcactag gtgtggggga cattccacgt tttccgcgcc gtagctaacg

840

cattaagtgc cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg

900

ggcccgcaca agcggcggag catgcggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccaa

960

ggcttgacat gtgccagacc gcttcagaga tggagtttcc cttcggggct ggttcacagg

1020

tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1080

caaccctcgt tccatgttgc cagcacgtag tggtggggac tcatgggaga ctgccggggt

1140

caactcggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgtc ttgggcttca

1200

cgcatgctac aatggccggt acaatgggtt gcgatactgt gaggtggagc taatccctaa

1260

aagccggtct cagttcggat tggggtctgc aactcgaccc catgaagtcg gagtcgctag

1320

taatcgcaga tcagcaacgc tgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

caagtcacga aagttggtaa cacccgaagc cgatggccta accaccttgt gtggggggag

1440

tcgtcgaagg tgggactggc gattgggact aagtcgtaac aaggtagccg taccggaagg

1500

tgcggctgga tcacctcct

1519

<210> 180

<211> 1468

<212> DNA

<213> Arthrobacter bergerei

<400> 180

ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg atgaccccgt

60

gcttgcacgg gtgattagtg gcgaacgggt gagtaacacg tgagtaacct gcccctgact

120

ctgggataag cccgggaaac tgggtctaat actggatatg acctttaacc gcatggtttt

180

tggtggaaag atttatcggt tggggatgga ctcgcggcct atcagcttgt tggtgaggta

240

atggctcacc aaggcgacga cgggtagccg gcctgagagg gtgaccggcc acactgggac

300

tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatgggcgaa

360

agcctgatgc agcgacgccg cgtgagggat gacggccttc gggttgtaaa cctctttcag

420

tagggaagaa gcgaaagtga cggtacctgc agaagaagcg ccggctaact acgtgccagc

480

agccgcggta atacgtaggg cgcaagcgtt atccggattt attgggcgta aagagctcgt

540

aggcggtttg tcgcgtctgc cgtgaaagtc cgaggctcaa cctcggatct gcggtgggta

600

cgggcagact agagtgatgt aggggagact ggaattcctg gtgtagcggt gaaatgcgca

660

gatatcagga ggaacaccga tggcgaaggc aggtctctgg gcatctactg acgctgagga

720

gcgaaagcat ggggagcgaa caggattaga taccctggta gtccatgccg taaacgttgg

780

gcactaggtg tggggaacat tccacgtttt ccgcgccgta gctaacgcat taagtgcccc

840

gcctggggag tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc

900

ggcggagcat gcggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc ttaccaaggc ttgacatgtt

960

ccagaccgcc tcagagatgg ggtttccctt cggggctggt tcacaggtgg tgcatggttg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa ccctcgttcc

1080

atgttgccag cacgtaaagg tggggactca tgggagactg ccggggtcaa ctcggaggaa

1140

ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgtcttg ggcttcacgc atgctacaat

1200

ggccggtaca atgggttgcg atactgtgag gtggagctaa tccctaaaag ccggtctcag

1260

ttcggattgg ggtctgcaac tcgaccccat gaagtcggag tcgctagtaa tcgcagatca

1320

gcaacgctgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcaa gtcacgaaag

1380

ttggtaacac ccgaagccga tggcctaacc accttgtgtg gagggagtcg tcgaaggtgg

1440

gactggcgat tgggactaag tcgtaaca

1468

<210> 181

<211> 1464

<212> DNA

<213> Arthrobacter globiformis

<400> 181

cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gatgatccgg

60

tgcttgcacc ggggattagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgagtaacc tgcccttgac

120

tctgggataa gcctgggaaa ctgggtctaa taccggatat gactcctcat cgcatggtgg

180

ggggtggaaa gcttttgtgg ttttggatgg actcgcggcc tatcagcttg ttggtgaggt

240

aatggctcac caaggcgacg acgggtagcc ggcctgagag ggtgaccggc cacactggga

300

ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggcga

360

aagcctgatg cagcgacgcc gcgtgaggga tgacggcctt cgggttgtaa acctctttca

420

gtagggaaga agcgaaagtg acggtacctg cagaagaagc gccggctaac tacgtgccag

480

cagccgcggt aatacgtagg gcgcaagcgt tatccggaat tattgggcgt aaagagctcg

540

taggcggttt gtcgcgtctg ccgtgaaagt ccggggctca actccggatc tgcggtgggt

600

acgggcagac tagagtgatg taggggagac tggaattcct ggtgtagcgg tgaaatgcgc

660

agatatcagg aggaacaccg atggcgaagg caggtctctg ggcattaact gacgctgagg

720

agcgaaagca tggggagcga acaggattag ataccctggt agtccatgcc gtaaacgttg

780

ggcactaggt gtgggggaca ttccacgttt tccgcgccgt agctaacgca ttaagtgccc

840

cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag

900

cggcggagca tgcggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttaccaagg cttgacatgg

960

accggaccgc cgcagaaatg tggtttctcc ttttggggcc ggttcacagg tggtgcatgg

1020

ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caaccctcgt

1080

tccatgttgc cagcgcgtaa tggcggggac tcatgggaga ctgccggggt caactcggag

1140

gaaggtgggg acgacgtcaa atcatcatgc cccttatgtc ttgggcttca cgcatgctac

1200

aatggccggt acaaagggtt gcgatactgt gaggtggagc taatcccaaa aagccggtct

1260

cagttcggat tggggtctgc aactcgaccc catgaagtcg gagtcgctag taatcgcaga

1320

tcagcaacgc tgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt caagtcacga

1380

aagttggtaa cacccgaagc cggtggccta accccttgtg ggagggagcc gtcgaaggtg

1440

ggactggcga ttgggactaa gtcg

1464

<210> 182

<211> 1472

<212> DNA

<213> Arthrobacter nicotianae

<220>

<221> modified_base

<222> (608)..(608)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 182

gatcctggct caggatgaac gctggcggcg tgcttaacac atgcaagtcg aacgatgaag

60

cccagcttgc tgggtggatt agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgagta acctgccccc

120

gactctggga taagcccggg aaactgggtc taataccgga tatgacctcg caccgcatgg

180

tgcggggtgg aaagatttat cggtggggga tggactcgcg gcctatcagc ttgttggtga

240

ggtaatggct caccaaggcg acgacgggta gccggcctga gagggtgacc ggccacactg

300

ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg

360

cgcaagcctg atgcagcgac gccgcgtgag ggatgacggc cttcgggttg taaacctctt

420

tcagtaggga agaagcgaaa gtgacggtac ctgcagaaga agcgccggct aactacgtgc

480

cagcagccgc ggtaatacgt agggcgcaag cgttatccgg atttattggg cgtaaagagc

540

tcgtaggcgg tttgtcgcgt ctgccgtgaa agtccgaggc tcaacctcgg atctgcggtg

600

ggtacggnca gactagagtg atgtagggga gactggaatt cctggtgtag cggtgaaatg

660

cgcagatatc aggaggaaca ccgatggcga aggcaggtct ctgggcattt actgacgctg

720

aggagcgaaa gcatggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

780

ttgggcacta ggtgtggggg acattccacg ttttccgcgc cgtagctaac gcattaagtg

840

ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac

900

aagcggcgga gcatgcggat taattcgatg caacgcgaag aaccttacca aggcttgaca

960

tgtgccagac cgctccagag atggggtttc ccttcggggc tggttcacag gtggtgcatg

1020

gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctcg

1080

ttccatgttg ccagcacgta gtggtgggga ctcatgggag actgccgggg tcaactcgga

1140

ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgt cttgggcttc acgcatgcta

1200

caatggccgg tacaatgggt tgcgatactg tgaggtggag ctaatcccta aaagccggtc

1260

tcagttcgga ttggggtctg caactcgacc ccatgaagtc ggagtcgcta gtaatcgcag

1320

atcagcaacg ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcaagtcacg

1380

aaagttggta acacccgaag ccgatggcct aaccacttgt gtgggggagt cgtcgaaggt

1440

gggactggcg attgggacta agtcgtaaca ag

1472

<210> 183

<211> 1345

<212> DNA

<213> Atopobium minutum

<400> 183

tcaggatgaa cgctggcggc gcgcctaaca catgcaagtc gaacgattaa agcatctttt

60

agatgtgtat aaagtggcga acggctgagt aacacgtggg caacctgccc ttttctttgg

120

gatagctacg ggaaaccgtg ggtaataccg aatatttctt gagtgtcgca tggcacacaa

180

gacaaagcgt ctagcggaaa aggatgggcc cgcggcctgt tagcttgttg gtggggtaat

240

ggcctaccaa ggcagttatg ggtagccggg ttgagagacc gaccggccag attgggactg

300

agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tcttgcgcaa tgggggaaac

360

cctgacgcag cgacgccgcg tgcgggatga aggccttcgg gttgtaaacc gctttcagca

420

gggacgaggc cgcaaggtga cggtacctgc agaagaagct ccggctaaat acgtgccagc

480

agccgcggta atacgtatgg agcaagcgtt atccggattc attgggcgta aagcgctcgt

540

aggcggtctg ttaggtcggt aagttaaatc cgggggctca acccccgtcc gcttccgata

600

ccggcagact tgagtttggt aggggaaggt ggaattccta gtgtagcggt ggaatgcgca

660

gatattagga agaacaccgg tggcgaaggc ggccttctgg gccataactg acgctgagga

720

gcgaaagcta ggggagcgaa caggattaga taccctggta gtcctagccg taaacgatgg

780

acactaggtg tggggggatg taccttccgt gccgcagcta acgcattaag tgtcccgcct

840

ggggagtacg accgcaaggt taaaactcaa aggaattgac gggrgcccgc acaagcagcg

900

gagcatgtgg cttaattcga agcaacgcga agaaccttac cagggcttga catttaggtg

960

aagcggcgga aacgtcgtgg ccgaaaggag cctaaacagg tggtgcatgg ctgtcgtcag

1020

ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt cgcatgttgc

1080

cagcaggtca agctgggcac ccgtgcgaga ccgccggcgt caagccggag gaaggtgggg

1140

acgacgtcaa gtcatcatgc cccttatgtc ctgggctgca cacgtgctac aatggtcggc

1200

acagcgggaa gcaaacttgc gaaagtaagc caatccctta aagccggccc cagttcggat

1260

tggaggctgc aacccgcctc catgaagtcg gagttgctag taatcgcgga tcagcacgcc

1320

gcggtgaatg cgttcccggg ccttg

1345

<210> 184

<211> 1517

<212> DNA

<213> Atopobium parvulum

<400> 184

atggagagtt cgatcctggc tcaggatgaa cgctggcggc gcgcctaaca catgcaagtc

60

gaacgattaa agcaccttcg ggtgtgtata aagtggcgaa cggctgagta acacgtgggc

120

aacctgcccc tttcattggg atagccacgg gaaaccgtgg ataataccga atacttcgag

180

acttccgcat ggaagactcg agaaagctcc ggcggagagg gatgggcccg cggcctgtta

240

gcttgttggt ggggtaacgg cctaccaagg caatgatggg tagctgggtt gagagaccga

300

ccagccagat tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaatc

360

ttgcacaatg ggcgaaagcc tgatgcagcg acgccgcgtg cgggatgaag gccttcgggt

420

tgtaaaccgc tttcagcagg gacgaggcga aagtgacggt acctgcagaa gaagccccgg

480

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggggca agcgttatcc ggattcattg

540

ggcgtaaagc gctcgtaggc ggtctgttag gtcgggagtt aaatccgggg gctcaacccc

600

cgctcgctct cgataccggc agacttgagt ttggtagggg aaggtggaat tcctagtgta

660

gcggtggaat gcgcagatat taggaagaac accagtggcg aaggcggcct tctgggccat

720

aactgacgct gaggagcgaa agctagggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcct

780

agccgtaaac gatggacact aggtgtgggg gagtatttct tccgtgccgc agctaacgca

840

ttaagtgtcc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg

900

cccgcacaag cagcggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggg

960

cttgacattt aggtgaagcg gcggaaacgt cgtggccgaa aggagcctaa acaggtggtg

1020

catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttaggttaa gtcctgcaac gagcgcaacc

1080

ctcgtcgtat gttgccagcg gttaggccgg gcacccatac gagaccgccg gcgtcaagcc

1140

ggaggaaggt ggggacgacg tcaagtcatc atgcccctta tgtcctgggc tacacacgtg

1200

ctacaatggc cggcacaatg ggctgccaac ccgcgagggt gagcgaatcc ctaaagccgg

1260

tcccagttcg gattggaggc tgcaacccgc ctccatgaag tcggagttgc tagtaatcgc

1320

ggatcagcac gccgcggtga atgcgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac

1380

ccgagtcgat tgcacccgaa gtcgtcggcc taacctttta ggagggagac gccgaaggtg

1440

tggttggtaa ggggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta ccggaaggtg cggctggatc

1500

acctcctttc tagggag

1517

<210> 185

<211> 1518

<212> DNA

<213> Atopobium rimae

<400> 185

atggagagtt cgatcctggc tcaggatgaa cgctggcggc gcgcctaaca catgcaagtc

60

gaacggttaa agcacctttt aggtgtgtat aaagtggcga acggctgagt aacacgtggg

120

caacctgccc tcctcttggg gatagcctcg ggaaaccgag gataataccc gatacttcaa

180

tgtggccgca tgacgacatt gagaaagctt ttgcggagaa ggatgggccc gcggcctgtt

240

agcttgttgg tggggtagag gcctaccaag gcaatgatgg gtagctgggt tgagagaccg

300

accagccaga ttgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

360

cttgcacaat gggcgaaagc ctgatgcagc gacgccgcgt gcgggacgaa ggccttcggg

420

ttgtaaaccg ctttcagcag ggacgaggcg aaagtgacgg tacctgcaga agaagccccg

480

gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc aagcgttatc cggattcatt

540

gggcgtaaag cgctcgtagg cggtctgtta ggtcgggagt taaatccgga ggctcaacct

600

ccgcccgctc ccgataccgg cagacttgag tttggtaggg gaaggtggaa ttcctagtgt

660

agcggtggaa tgcgcagata ttaggaagaa caccagtggc gaaggcggcc ttctgggcca

720

taactgacgc tgaggagcga aagctagggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

tagctgtaaa cgatggacac taggtgtggg agaatacgtc ttccgtgccg cagctaacgc

840

attaagtgtc ccgcctgggg agtacggccg caaggctaaa actcaaagga attgacgggg

900

acccgcacaa gcagcggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg

960

gcttgacatg taggtgaagc ggcggaaacg tcgtggccga aaggagccta cacaggtggt

1020

gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttaggtta agtcctgcaa cgagcgcaac

1080

cctcgtcgta tattgccagc ggttcggccg ggcacctata cgagaccgcc ggcgtcaagc

1140

cggaggaagg tggggacgac gtcaagtcat catgcccctt atgtcctggg ctacacacgt

1200

gctacaatgg ccggcacaat gagctgccaa cccgcaaggg cgagcgaatc tctaaagccg

1260

gtcccagttc ggattggagg ctgcaacccg cctccatgaa gtcggagttg ctagtaatcg

1320

cggatcagca cgccgcggtg aatgcgttcc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca

1380

cccgagtcga ttgcacccga agtcgtcggc ctaacctttt aggagggaga cgccgaaggt

1440

gtggttggta aggggggtga agtcgtaaca aggtagccgt accggaaggt gcggctggat

1500

cacctccttt ctagggag

1518

<210> 186

<211> 1355

<212> DNA

<213> Atopobium sp. BS2

<400> 186

aaagcacctt cgggtgtgta taaagtggcg aacggctgag taacacgtgg gcaacctgcc

60

cctctcattg ggatagccac gggaaaccgt ggataatacc gaatacttcg agacttccgc

120

atggaagact cgagaaagct ccggcggaga gggatgggcc cgcggcctgt tagcttgttg

180

gtggggtaac ggcctaccaa ggcaatgatg ggtagctggg ttgagagacc gaccagccag

240

attgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tcttgcacaa

300

tgggcgaaag cctgatgcag cgacgccgcg tgcgggatga aggccttcgg gttgtaaacc

360

gctttcagca gggacgaggc gaaagtgacg gtacctgcag aagaagcccc ggctaactac

420

gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggggg caagcgttat ccggattcat tgggcgtaaa

480

gcgctcgtag gcggtctgtt aggtcgggag ttaaatccgg gggctcaacc cccgttcgct

540

cccgataccg gcagacttga gtttggtagg ggaaggtgga attcctagtg tagcggtgga

600

atgcgcagat attaggaaga acaccagtgg cgaaggcggc cttctgggcc ataactgacg

660

ctgaggagcg aaagctaggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc ctagccgtaa

720

acgatggaca ctaggtgtgg gggaatattt cttccgtgcc gcagctaacg cattaagtgt

780

cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

840

agcagcggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag ggcttgacat

900

ttaggtgaag cggcggaaac gtcgtggccg aaaggagcct aaacaggtgg tgcatggctg

960

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttaggtt aagtcctgca acgagcgcaa ccctcgtcgt

1020

atgttgccag cggttaggcc gggcacccat acgagaccgc cggcgtcaag ccggaggaag

1080

gtggggacga cgtcaagtca tcatgcccct tatgtcctgg gctacacacg tgctacaatg

1140

gccggcacaa tgggctgcca acccgcgagg gtgagcgaat ccctaaagcc ggtcccagtt

1200

cggattggag gctgcaaccc gcctccatga agtcggagtt gctagtaatc gcggatcagc

1260

acgccgcggt gaatgcgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acccgagtcg

1320

attgcacccg aagtcgtcgg cctaaccttt tagga

1355

<210> 187

<211> 1487

<212> DNA

<213> Atopobium sp. F0209

<400> 187

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcacgct taacacatgc aagtcgaacg

60

attaaagcac cttcgggtgt gtatagagtg gcgaacggct gagtaacacg tgggcaacct

120

gcccttcagt ttggaatagc tacgggaaac cgtgggtaat accggatgat ccacttccct

180

cgcatgaagg aagtggcaaa gatttatcgc tgaaggatgg gcccgcggcc tgttagcttg

240

ttggtgaggt aacggctcac caaggcagta atgggtagcc gggttgagag accgaccggc

300

cagattggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatcttgcg

360

caatgggcga aagcctgacg cagcgatgcc gcgtgcggga tgaaggcctt cgggtcgtaa

420

accgctttca gcagggacga ggccgcaagg tgacggtacc tgcagaagaa gccccggcta

480

actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggggcgagc gttatccgga ttcattgggc

540

gtaaagcgcg cgtaggcggc ctgttaggtc aggagttaaa tccgggggct caacccccgt

600

ccgctcctga taccggcagg cttgagtctg gtaggggaag gcggaattcc aagtgtagcg

660

gtggaatgcg cagatatttg gaagaacacc ggtggcgaag gcggccttct gggccacgac

720

tgacgctgag gcgcgaaagc taggggagcg aacaggatta gataccctgg tagtcctagc

780

cgtaaacgat ggacactagg tgtgggggga tcatccctcc gtgccgcagc taacgcatta

840

agtgtcccgc ctggggagta cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg acgggggccc

900

gcacaagcag cggagcatgt ggcttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accagggctt

960

gacatatagg tgaagcggtg gaaacaccgt agccgaaagg agcctataca ggtggtgcat

1020

ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccccc

1080

gtcgtatgtt gccagcggtt cggccgggca cccatacgag accgccggcg tcaagccgga

1140

ggaaggtggg gacgacgtca agtcatcatg ccccttatgt cctgggctgc acacgtgcta

1200

caatggccgg cacaatgggc tgccaggtcg cgagaccgag cgaatcccta aagccggccc

1260

cagttcggat tggaggctgc aacccgcctc catgaagtcg gagttgctag taatcgcgga

1320

tcagcacgcc gcggtgaatg cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacccg

1380

agtcgtctgc acccgaagtc gccggcccaa ccttttggag ggaggtgccg aaggtgtgga

1440

gggtaagggg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtaccgg aaggtgc

1487

<210> 188

<211> 1473

<212> DNA

<213> Atopobium sp. ICM42b10

<400> 188

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgcgc ctaacacatg caagtcgaac

60

gattaaagca ccttcgggtg tgtataaagt ggcgaacggc tgagtaacac gtgggcaacc

120

tgcccctctc attgggatag ccacgggaaa ccgtggataa taccgaatac ttcgagtctc

180

ccgcatggaa gactcgagaa agctccggcg gagagggatg ggcccgcggc ctgttagctt

240

gttggtgggg taacggccta ccaaggcaat gatgggtagc tgggttgaga gaccgaccag

300

ccagattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatcttgc

360

acaatgggcg aaagcctgat gcagcgacgc cgcgtgcggg atgaaggcct tcgggttgta

420

aaccgctttc agcagggacg aggcgaaagt gacggtacct gcagaagaag ccccggctaa

480

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggggcaagcg ttatccggat tcattgggcg

540

taaagcgctc gtaggcggtc tgttaggtcg ggagttaaat ccgggggctc aacccccgtt

600

cgctcccgat accggcagac ttgagtttgg taggggaagg tggaattcct agtgtagcgg

660

tggagtgcgc agatattagg aagaacacca gtggcgaagg cggccttctg ggccataact

720

gacgctgagg agcgaaagct aggggagcaa acaggattag ataccctggt agtcctagcc

780

gtaaacgatg gacactaggt gtgggggaat atttcttccg tgccgcagct aacgcattaa

840

gtgtcccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga cgggggcccg

900

cacaagcagc ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccagggcttg

960

acatttaggt gaagcggcgg aaacgtcgtg gccgaaagga gcctaaacag gtggtgcatg

1020

gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgtta ggttaagtcc tgcaacgagc gcaaccctcg

1080

tcgtatgttg ccagcggtta ggccgggcac ccatacgaga ccgccggcgt caagccggag

1140

gaaggtgggg acgacgtcaa gtcatcatgc cccttatgtc ctgggctaca cacgtgctac

1200

aatggccggc acaatgggct gccaacccgc gagggtgagc gaatccctaa agccggtccc

1260

agttcggatt ggaggctgca acccgcctcc atgaagtcgg agttgctagt aatcgcggat

1320

cagcacgccg cggtgaatgc gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccacccga

1380

gtcgattgca cccgaagtcg tcggcctaac cttttaggag ggagacgccg aaggtgtggt

1440

tggtaagggg ggtgaagtcg taacaaggta acc

1473

<210> 189

<211> 1267

<212> DNA

<213> Atopobium sp. ICM57

<400> 189

cgctggcggc gcgcctaaca catgcaagtc gaacgagtgg cgaacggctg agtaacacgt

60

gggcaacctg cccctctcat tgggatagcc acgggaaacc gtggataata ccgaatactg

120

aaaggcggag agggatgggc ccgcggcctg ttagcttgtt ggtggggtaa cggcctacca

180

aggcaatgat gggtagctgg gttgagagac cgaccagcca gattgggact gagacacggc

240

ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atcttgcaca atgggcgaaa gcctgatgca

300

gcgacgccgc gtgcgggatg aaggccttcg ggttgtaaac cgctttcagc agggacgatg

360

acggtacctg cagaagaagc cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg

420

gggcaagcgt tatccggatt cattgggcgt aaagcgctcg taggcggtct gttaggtcgg

480

gagttaaatc cgggggctca acccccgttc gctcccgata ccggcagact tgagtttggt

540

aggggaaggt ggaattccta gtgtagcggt ggaatgcgca gatattagga agaacaccag

600

tggcgaaggc ggccttctgg gccaactgac gctgaggagc gaaagctagg ggagcaaaca

660

ggattagata ccctggtagt cctagccgta aacgatggac actaggtgtg ggggcttccg

720

tgccgcagct aacgcattaa gtgtcccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca

780

aaggaattga cgggggcccg cacaagcagc ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg

840

aagaacctta ccagggcttg acattaacag gtggtgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg

900

tgagatgtta ggttaagtcc tgcaacgagc gcaaccctcg tcgtatgttg ccagcggccg

960

ggcacccata cgagaccgcc ggcgtcaagc cggaggaagg tggggacgac gtcaagtcat

1020

catgcccctt atgtcctggg ctacacacgt gctacaatgg ccggcaatgg gctgccaacc

1080

cgcgagggtg agcgaatccc tccggtccca gttcggatgg aggctgcaac ccgcctccag

1140

aagtcggagt tgctagtaat cgcggatcag cacgccgcgg tgaatgcgtt cccgggcctt

1200

gtacacaccg cccgtcacac cacccgagtc gattgcaccc gaagtcgtcg cctagggaga

1260

cgccgaa

1267

<210> 190

<211> 1521

<212> DNA

<213> Atopobium vaginae

<400> 190

tttgaacgga gagttcgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgcgcc taacacatgc

60

aagtcgaacg attaaagcac cttcgggtgt gtataaagtg gcgaacggct gagtaacacg

120

tgggcaacct gccctttgca ctgggatagc ctcgggaaac cgaggttaat accggatact

180

ccatatatat cgcatgatgt atatgggaaa gctccgacgg caaaggatgg gcccgcggcc

240

tgttagctag ttggtggggt aacggcctac caaggcaatg atgggtagcc gggttgagag

300

accgaccggc cagattggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaatcttgca caatgggcga aagcctgatg cagcgacgcc gcgtgcggga tgaaggcctt

420

cgggttgtaa accgctttca gcagggacga ggccgcaagg tgacggtacc tgcagaagaa

480

gccccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggggcaagc gttatccgga

540

ttcattgggc gtaaagcgcg cgtaggcggt ttgttaggtc aggagttaaa tctgggggct

600

caacccctat ccgctcctga taccggcagg cttgagtctg gtaggggaag gcggaattcc

660

aagtgtagcg gtgaaatgcg cagatatttg gaagaacacc ggtggcgaag gcggccttct

720

gggccacgac tgacgctgag gcgcgaaagc taggggagcg aacaggatta gataccctgg

780

tagtcctagc cgtaaacgat ggacactagg tgtggggaga ttatactttc cgtgccgcag

840

ccaacgcatt aagtgtcccg cctggggagt acggtcgcaa gactaaaact caaaggaatt

900

gacgggggcc cgcacaagca gcggagcatg tggcttaatt cgaagcaacg cgaagaacct

960

taccagggct tgacatttag gtgaagcagt ggaaacactg tggccgaaag gagcctaaac

1020

aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1080

gcgcaaccct tgtcgcatgt tgccagcggt taaagccggg cacccatgcg agaccgccgg

1140

cgttaagccg gaggaaggtg gggacgacgt caagtcatca tgccccttat gtcctgggct

1200

gcacacgtgc tacaatggcc ggcacagagg gctgcaactg cgcgagcaga agcgaatccc

1260

taaagccggt cccagttcgg attggaggct gcaacccgcc tccatgaagt cggagttgct

1320

agtaatcgcg gatcagcacg ccgcggtgaa tgcgttcccg ggccttgtac acaccgcccg

1380

tcacaccacc cgagtcgtct gcacccgaag tcgtcggcct aacctgcaaa ggagggagac

1440

gccgaaggtg tggagggtaa ggggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta ccggaaggtg

1500

cggctggatc acctcctttc t

1521

<210> 191

<211> 1285

<212> DNA

<213> Aurantimonas coralicida

<400> 191

gtaacgcgtg ggaatctacc catccctacg ggatagctcc gggaaactgg agataatacc

60

gtatacgtcc tccgggagaa agatttatcg gggatggatg agcccgcgtt ggattagcta

120

gttggtgggg taatggccta ccaaggcgac gatccatagc tggtctaaga ggatgatcag

180

ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg

240

acaatgggcg caagcctgat ccagccatgc cgcgtgagtg atgaaggccc tagggttgta

300

aagctctttc agtggggacg ataatgacgg tacccacaga agaagccccg gctaacttcg

360

tgccagcagc cgcggtaata cgaagggggc tagcgttgtt cggaattact gggcgtaaag

420

cgcacgtagg cggacattta agtcaggggt gaaatcccgg ggctcaaccc cggaactgcc

480

tctgatactg ggtgtcttga gtgtggtaga ggtgagtgga attgcgagtg tagaggtgaa

540

attcgtagat attcgcagga acaccagtgg cgaaggcggc tcactggacc acaactgacg

600

ctgaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa

660

acgatggaag ctagccgtcg gaggatttat ccttcggtgg cgcagttaac gcattaagct

720

tcccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac

780

aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgcag aaccttacca gctcttgaca

840

tgcctcgacg gtatccggag acggatgcct tccttcggga cgagtgcaca ggtgctgcat

900

ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc

960

gcccttagtt gccagcattc agttgggcac tctaggggga ctgccggtga taagccgaga

1020

ggaaggtggg gatgacgtca agtcctcatg gcccttacgg gctgggctac acacgtgcta

1080

caatggcggt gacagtgggc agccaactcg cgagagtgag ctaatcccaa aaaaccgtct

1140

cagttcggat tgcactctgc aactcgggtg catgaagttg gaatcgctag taatcgtgga

1200

tcagcatgcc acggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggk

1260

agwkgkttmt mmcsgaasat rgtsc

1285

<210> 192

<211> 1390

<212> DNA

<213> Aureimonas altamirensis

<400> 192

ctcagaacga acgctggcgg caggcttaac acatgcaagt cgaacgcacc tttcggggtg

60

agtggcagac gggtgagtaa cgcgtgggaa tctacccttc tctacgggat agctccggga

120

aactggaatt aataccgtat acgtcctgag ggagaaagat ttatcgggga aggatgagcc

180

cgcgttggat tagctagttg gtggggtaaa ggcctaccaa ggcgacgatc catagctggt

240

ctaagaggat gatcagccac attgggactg agacacggcc caaactccta cgggaggcag

300

cagtggggaa tattggacaa tgggcgcaag cctgatccag ccatgccgcg tgagtgatga

360

aggccctagg gttgtaaagc tctttcagtg gggacgataa tgacggtacc cacagaagaa

420

gccccggcta acttcgtgcc agcagccgcg gtaatacgaa gggggctagc gttgttcgga

480

attactgggc gtaaagcgca cgtaggcgga tatttaagtc aggggtgaaa tcccggggct

540

caaccccgga actgcctttg atactgggta tcttgagttc ggaagaggta agtggaattg

600

cgagtgtaga ggtgaaattc gtagatattc gcaggaacac cagtggcgaa ggcggcttac

660

tggtccgata ctgacgctga ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg

720

gtagtccacg ccgtaaacga tggaagctag ccgtcgggtg atttatcact cggtggcgca

780

gcaaacgcat taagcttccc gcctggggag tacggtcgca agattaaaac tcaaaggaat

840

tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgcagaacc

900

ttaccagctc ttgacatgcc acgacgatga ccggagacgg acatcttcct tcgggacgtg

960

gacacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1020

aacgagcgca accctcgccc ttagttgcca gcattgagtt gggcactcta aggggactgc

1080

cggtgataag ccgagaggaa ggtggggatg acgtcaagtc ctcatggccc ttacgggctg

1140

ggctacacac gtgctacaat ggcggtgaca atgggcagcc aactcgcgag agtgcgctaa

1200

tcccaaaaag ccgtctcagt tcggattgca ctctgcaact cgggtgcatg aagttggaat

1260

cgctagtaat cgtggatcag catgccacgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1320

cccgtcacac catgggagtt ggttctaccc gaaggtggtg cgctaaccgc aaggaggcag

1380

ccaaccacgg

1390

<210> 193

<211> 1319

<212> DNA

<213> Auritibacter ignavus

<400> 193

ctggcggcgt gcttaacaca tgcaagtcga acgagtggcg aacgggtgag tatcacgtga

60

gtaacctgcc cttgactctg ggataagcct gggaaactgg gtctaatact ggatatggaa

120

aggcggtttt ggatggactc gcggcctatc agcttgttgg tggggtaatg gcctaccaag

180

gcttcgacgg gtagccggcc tgagagggtg accggccaca ctgggactga gacacggccc

240

agactcctac gggaggcagc agtgggggat attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc

300

gacgtcgcgt gagggatgac ggccttcggg ttgtaaacct ctttcagcag ggaagatgac

360

ggtacctgca gaagaagcac cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggt

420

gcgagcgtta tccggaatta ttgggcgtaa agagctcgta ggcggtttgt cgcgtctgct

480

gtgaaagctc agggcttaac tctgagtttg cagtgggtac gggcagactg gagtgcagta

540

ggggagattg gaattcctgg tgtagcggtg gaatgcgcag atatcaggag gaacaccgat

600

ggcgaaggca ggtctctggg ctgactgacg ctgaggagcg aaagcatggg gagcgaacag

660

gattagatac cctggtagtc catgccgtaa acggtgggcg ctaggtgtga gtcggttcgt

720

gccgtagcta acgcattaag cgccccgcct ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa

780

aggaattgac gggggcccgc acaagcggcg gagcatgtgg attaattcga tgcaacgcga

840

agaaccttac ctgggcttga catatacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

900

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt cttatgttgc cagcacgtgg

960

ggactcatag gagactgccg gggtcaactc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc

1020

atgcccctta tgtcttgggc ttcacgcatg ctacaatggc cggcagaggg ttgcgatact

1080

gtgaggttga gctaatccct tctggtctca gttcggatgg ggtctgcaac tcgaccccag

1140

aagtcggagt cgctagtaat cgcagatcag caatgctgcg gtgaatacgt tcccgggcct

1200

tgtacacacc gcccgtcgag tcacgaaagt tggtaacacc cgaagccggt gcctagggag

1260

ccgtcgaagg tgggactggc gattgggact aagtcgtaac aaggtagccg taccggaag

1319

<210> 194

<211> 1429

<212> DNA

<213> Averyella dalhousiensis

<400> 194

ccaggagcta catgcagtcg agcggtagca caggggagct tgctcctggg tgacgagcgg

60

cggacgggtg agtaatgtct gggaaactgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg

120

tagctaatac cgcataacgt ctacggacca aagtggggga ccttcgggcc tcatgccatc

180

agatgtgccc agatgggatt agctagtagg tggggtaatg gctcacctag gcgacgatcc

240

ctagctggtc tgagaggatg accagccaca ctggaactga gacacggtcg agactcctac

300

gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt

360

gtgtgaagaa ggccttcggg ttgtaaagca ctttcagcga ggaggaaggg ttcagtgtta

420

atagcactgt tcattgacgt tactcgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc

480

cgcggtaata cggagggtgc aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg

540

cggtctgtca agtcggatgt gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca ttcgaaactg

600

gcaggctaga gtcttgtaga ggggggtaga attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag

660

atctggagga ataccggtgg cgaaggcggc cccctggaca aagactgacg ctcaggtgcg

720

aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgtcga

780

cttggaggtt gtgcccttga ggcgtggctt ccggagctaa cgcgttaagt cgaccgcctg

840

gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg

900

agcatgtggt ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc tactcttgac atccagagaa

960

cttagcagag atgctttggt gccttcggga actctgagac aggtgctgca tggctgtcgt

1020

cagctcgtgt tgtgaaatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcctttgt

1080

tgccagcggt tcggccggga actcaaagga gactgccagt gataaactgg aggaaggtgg

1140

ggatgacgtc aagtcatcat ggcccttacg agtagggcta cacacgtgct acaatggcgc

1200

atacaaagag aagcgacctc gcgagagcaa gcggacctca taaagtgcgt cgtagtccgg

1260

attggagtct gcaactcgac tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgta gatcagaatg

1320

ctacggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt

1380

gcaaaagaag taggtagctt aaccttcggg agggcgctac cctgtataa

1429

<210> 195

<211> 1403

<212> DNA

<213> Bacillus aeolius

<400> 195

tggcggcgtg cctaatacat gcaagtcgag cgaacggatg gagagcttgc tctcctgacg

60

ttagcggcgg acgggtgagt aacacgtggg caacctgcct gtaagaccgg gataacttcg

120

ggaaaccgga gctaataccg gataattcct ttcctcgcat gaggaaaggt tgaaaggcgg

180

cttcggctgt cacttacaga tgggcccgcg gcgcattagc tagttggtga ggtaacggct

240

caccaaggcg acgatgcgta gccgacctga gagggtgatc ggccacactg ggactgagac

300

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt ccgcaatgga cgaaagtctg

360

acggagcaac gccgcgtgag cgatgaaggt cttcggatcg taaagctctg ttgttaggga

420

agaacaagta ccgttcgaat aggcggtacc ttgacggtac ctaaccagaa agccacggct

480

aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag cgttgtccgg aattattggg

540

cgtaaagcgc gcgcaggcgg tctcttaagt ctgatgtgaa agcccacggc tcaaccgtgg

600

agggtcattg gaaactggga gacttgagtg cagaagagga gagcggaatt ccatgtgtag

660

cggtgaaatg cgtagagata tggaggaaca ccagtggcga aggcggctct cttgtctgta

720

actgacgctg aggcgcgaaa gcgttgggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac

780

gccgtaaacg atgagtgcta agtgttagag ggtttccgcc ctttagtgct gcagctaacg

840

cattaagcac tccgcctggg gagtacggcc gcaaggctga aactcaaagg aattgacggg

900

ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag

960

gtcttgacat cctctgctac ctctagatag agggttcccc ttcgggggac ggaatgacag

1020

gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgaac

1080

gcaacccttg accttagttg ccagcattca gttgggcact ctaaggtgac tgccggtgac

1140

aaaccggaag aaagtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac

1200

acgtgctaca atgggtggta caaagggctg cgatgccgcg aggctgagcc aatcccaaaa

1260

aaccactctc agttcggatt gcaggctgca actcgcctgc atgaagccgg aatcgctagt

1320

aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca

1380

caccacgaga gtttgcaaca ccc

1403

<210> 196

<211> 1382

<212> DNA

<213> Bacillus aerophilus

<220>

<221> modified_base

<222> (8)..(12)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 196

agcggacnnn nnggagcttg ctcccggatg ttagcggcgg acgggtgagt aacacgtggg

60

taacctgcct gtaagactgg gataactccg ggaaaccgga gctaataccg gatagttcct

120

tgaaccgcat ggttcaagga tgaaagacgg tttcggctgt cacttacaga tggacccgcg

180

gcgcattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatgcgta gccgacctga

240

gagggtgatc ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

300

agggaatctt ccgcaatgga cgaaagtctg acggagcaac gccgcgtgag tgatgaaggt

360

tttcggatcg taaagctctg ttgttaggga agaacaagtg caagagtaac tgcttgcacc

420

ttgacggtac ctaaccagaa agccacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

480

aggtggcaag cgttgtccgg aattattggg cgtaaagggc tcgcaggcgg tttcttaagt

540

ctgatgtgaa agcccccggc tcaaccgggg agggtcattg gaaactggga aacttgagtg

600

cagaagagga gagtggaatt ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaaca

660

ccagtggcga aggcgactct ctggtctgta actgacgctg agagcgaaag cgtggggagc

720

gaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa gtgttagggg

780

gtttccgccc cttagtgctg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacggtcg

840

caagactgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

900

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ctctgataac cctagagata

960

gggctttccc ttcggggacc ggggagggtg atgggaaact gggaaacttg ctcgtgtcgt

1020

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttga tcttagttgc cagcattcag

1080

ttgggcactc taaggtgact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1140

catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggacagaac aaagggctgc

1200

gagaccgcaa ggtttagcca atcccacaaa tctgttctca gttcggatcg cagtctgcaa

1260

ctcgactgcg tgaagctgga atcgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg

1320

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tttgcaacac ccgaagtcgg

1380

tg

1382

<210> 197

<211> 1392

<212> DNA

<213> Bacillus aestuarii

<400> 197

gcggaccaat agaagcttgc ttctgttggt tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggc

60

aacctgcctg taagactggg ataacttcgg gaaaccggag ctaataccgg ataattcatc

120

ccctcgcatg agggggtgct gaaagtcggt tcacgctgac acttacagat gggcccgcgg

180

cgcattagct agttggtgag gtaatggctc accaaggcga cgatgcgtag ccgacctgag

240

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

300

gggaatcttc cacaatggac gaaagtctga tggagcaacg ccgcgtgagc gatgaaggcc

360

ttcgggtcgt aaagctctgt tgttagggaa gaacaagtac cggagtaact gccggtacct

420

tgacggtacc taaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

480

ggtggcaagc gttgtccgga attattgggc gtaaagcgcg cgcaggcggt cctttaagtt

540

gatgtgaaag cccacggctc aaccgtggag ggtcattgga aactggggga cttgagtgca

600

gaagaggaaa gcggaattcc acgtgtagcg gtgaaatgcg tagagatgtg gaggaacacc

660

agtggcgaag gcggctttct ggtctgtaac tgacgctgag gcgcgaaagc gtggggagca

720

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctaag tgttagaggg

780

tttccgccct ttagtgctgc agctaacgca ttaagcactc cgcctgggga gtacggccgc

840

aaggctgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

900

ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcc ttacgacctc cctagagata

960

gggatttccc cttcggggga cggaagtgac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt

1020

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgatcttagt tgccagcatt

1080

cagttgggca ctctaaggtg actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca

1140

aatcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtgtta caatggatgg tacaaagggc

1200

agcgaaaccg cgaggtcgag ccaatcccat aaaaccattc tcagttcgga ttgcaggctg

1260

caactcgcct gcatgaagcc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc cgcggtgaat

1320

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccgaagt

1380

cggtggggta ac

1392

<210> 198

<211> 1505

<212> DNA

<213> Bacillus alcalophilus

<220>

<221> modified_base

<222> (97)..(97)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (203)..(203)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (441)..(441)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 198

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc ggaccaaagg gagcttgctc

60

ccagaggtta gcggcggacg ggtgagtaac acgtggncaa cctgccctgt agactgggat

120

aacatcgaga aatcggtgct aataccggat aatcaaagga atcacatggt tcttttgtaa

180

aagatggctc cggctatcac tangggatgg gcccgcggcg cattagctag ttggtaaggt

240

aatggcttac caaggcgacg atgcgtagcc gacctgagag ggtgatcggc cacactggga

300

ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatcttccg caatggacga

360

aagtctgacg gagcaacgcc gcgtgagtga tgaaggtttt cggatcgtaa agctctgttg

420

ttagggaaga acaagtgccg ntcgaatagg tcggcacctt gacggtacct aaccagaaag

480

ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtggcaagcg ttgtccggaa

540

ttattgggcg taaagcgcgc gcaggcggtc ttttaagtct gatgtgaaat atcggggctc

600

aaccccgagg ggtcattgga aactgggaga cttgagtaca gaagaggaga gtggaattcc

660

acgtgtagcg gtgaaatgcg tagatatgtg gaggaacacc agtggcgaag gcgactctct

720

ggtctgtaac tgacgctgag gcgcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg

780

tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctagg tgttaggggt ttcgatgccc ttagtgccga

840

agttaacaca ttaagcactc cgcctgggga gtacggccgc aaggctgaaa ctcaaaggaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cagtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac

960

cttaccaggt cttgacatcc tttgaccact ctagagatag agctttcccc ttcgggggac

1020

aaagtgacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1080

cgcaacgagc gcaacccttg atcttagttg ccagcattta gttgggcact ctaaggtgac

1140

tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc

1200

tgggctacac acgtgctaca atggatggta caaagggcag cgaaaccgcg aggtcgagcc

1260

aatcccataa agccattctc agttcggatt gtaggctgca actcgcctac atgaagccgg

1320

aattgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccacgaga gtttgtaaca cccgaagtcg gtggggtaac cttttggagc

1440

cagccgccta aggtgggaca gatgattggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtatcgga

1500

aggtg

1505

<210> 199

<211> 1410

<212> DNA

<213> Bacillus amyloliquefaciens

<220>

<221> modified_base

<222> (965)..(965)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1393)..(1393)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1397)..(1398)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 199

tcgagcggac agatgggagc ttgctccctg atgttagcgg cggacgggtg agtaacacgt

60

gggtaacctg cctgtaagac tgggataact ccgggaaacc ggggctaata ccggatggtt

120

gtttgaaccg catggttcag acataaaagg tggcttcggc taccacttac agatggaccc

180

gcggcgcatt agctagttgg tgaggtaacg gctcaccaag gcgacgatgc gtagccgacc

240

tgagagggtg atcggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

300

agtagggaat cttccgcaat ggacgaaagt ctgacggagc aacgccgcgt gagtgatgaa

360

ggttttcgga tcgtaaagct ctgttgttag ggaagaacaa gtgccgttca aatagggcgg

420

caccttgacg gtacctaacc agaaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtaggtgg caagcgttgt ccggaattat tgggcgtaaa gggctcgcag gcggtttctt

540

aagtctgatg tgaaagcccc cggctcaacc ggggagggtc attggaaact ggggaacttg

600

agtgcagaag aggagagtgg aattccacgt gtagcggtga aatgcgtaga gatgtggagg

660

aacaccagtg gcgaaggcga ctctctggtc tgtaactgac gctgaggagc gaaagcgtgg

720

ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt gctaagtgtt

780

agggggtttc cgccccttag tgctgcagct aacgcattaa gcactccgcc tggggagtac

840

ggtcgcaaga ctgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg

900

gtttaattcg aagcaacgcg aagaaactta ccgcggttat acgtcggtgg caagcgttag

960

acagnaatcg tccccttcgg gggcagagtg acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt

1020

gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgatctta gttgccagca

1080

ttcagttggg cactctaagg tgactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt

1140

caaatcatca tgccccttat gacctgggct acacacgtgc tacaatgggc agaacaaagg

1200

gcagcgaaac cgcgaggtta agccaatccc acaaatctgt tctcagttcg gatcgcagtc

1260

tgcaactcga ctgcgtgaag ctggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat gccgcggtga

1320

atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagtttgt aacacccgaa

1380

gtcggtgagg tancctnnag gagccagccg

1410

<210> 200

<211> 1391

<212> DNA

<213> Bacillus anthracis

<220>

<221> modified_base

<222> (9)..(11)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1380)..(1380)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 200

cttgctctnn ngaagttagc ggcggacggg tgagtaacac gtgggtaacc tgcccataag

60

actgggataa ctccgggaaa ccggggctaa taccggataa tattttgaac tgcatggttc

120

gaaattgaaa ggcggcttcg gctgtcactt atggatggac ccgcgtcgca ttagctagtt

180

ggtgaggtaa cggctcacca aggcaacgat gcgtagccga cctgagaggg tgatcggcca

240

cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtaggga atcttccgca

300

atggacgaaa gtctgacgga gcaacgccgc gtgagtgatg aaggctttcg ggtcgtaaaa

360

ctctgttgtt agggaagaac aagtgctagt tgaataagct ggcaccttga cggtacctaa

420

ccagaaagcc acggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgta

480

tccggaatta ttgggcgtaa agcgcgcgca ggtggtttct taagtctgat gtgaaagccc

540

cggctcaacc gtggagggtc attggaaact gggagacttg agtgcagaag aggaaagtgg

600

aattccatgt gtagcggtga aatgcgtaga gatatggagg aacaccagtg gcgaaggcga

660

ctttctggtc tgtaactgac actgaggcgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata

720

ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt gctaagtgtt agagggtttc cgccctttag

780

tgctgaagtt aacgcattaa gcactccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctgaaactca

840

aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg

900

aagaacctta ccaggtcttg acatcctctg aaaaccctag agatagggct tctccttcgg

960

gagcagagtg acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1020

gtcccgcaac gagcgcaacc cttgatctta gttgccatca ttaagttggg cactctaagg

1080

tgactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat

1140

gacctgggct acacacgtgc tacaatggac ggtacaaaga gctgcaagac cgcgaggtgg

1200

agctaatctc ataaaaccgt tctcagttcg gattgtaggc tgcaactcgc ctacatgaag

1260

ctggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat gccgcggtga atacgttccc gggccttgta

1320

cacaccgccc gtcacaccac gagagtttgt aacacccgaa gtcggtgggg taacctttan

1380

ggagccagcc g

1391

<210> 201

<211> 1411

<212> DNA

<213> Bacillus atrophaeus

<400> 201

tcgagcggac agatgggagc ttgctccctg atgttagcgg cggacgggtg agtaacacgt

60

gggtaacctg cctgtaagac tgggataact ccgggaaacc ggggctaata ccggatggtt

120

gtttgaaccg catggttcaa acataaaagg tggcttcggc taccacttac agatggaccc

180

gcggcgcatt agctagttgg tgaggtaacg gctcaccaag gcaacgatgc gtagccgacc

240

tgagagggtg atcggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

300

agtagggaat cttccgcaat ggacgaaagt ctgacggagc aacgccgcgt gagtgatgaa

360

ggttttcgga tcgtaaagct ctgttgttag ggaagaacaa gtaccgttcg aatagggcgg

420

taccttgacg gtacctaacc agaaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtaggtgg caagcgttgt ccggaattat tgggcgtaaa gggctcgcag gcggtttctt

540

aagtctgatg tgaaagcccc cggctcaacc ggggagggtc attggaaact ggggaacttg

600

agtgcagaag aggagagtgg aattccacgt gtagcggtga aatgcgtaga gatgtggagg

660

aacaccagtg gcgaaggcga ctctctggtc tgtaactgac gctgaggagc gaaagcgtgg

720

ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt gctaagtgtt

780

agggggtttc cgccccttag tgctgcagct aacgcattaa gcactccgcc tggggagtac

840

ggtcgcaaga ctgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg

900

gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaggtcttg acatcctctg acaatcctag

960

agataggacg tccccttcgg gggcagagtg acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt

1020

gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgatctta gttgccagca

1080

ttcagttggg cactctaagg tgactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt

1140

caaatcatca tgccccttat gacctgggct acacacgtgc tacaatggac agaacaaagg

1200

gcagcgaaac cgcgaggtta agccaatccc acaaatctgt tctcagttcg gatcgcagtc

1260

tgcaactcga ctgcgtgaag ctggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat gccgcggtga

1320

atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagtttgt aacacccgaa

1380

gtcggtgagg taacctttta ggagccagcc g

1411

<210> 202

<211> 1442

<212> DNA

<213> Bacillus badius

<400> 202

acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtcgagcg gacttgacgg aagcttgctt

60

ccgttcaagt tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggt aacctgcctg taagactggg

120

ataactccgg gaaaccgggg ctaataccgg atattctttt tcttcgcatg aagaagaatg

180

gaaaggcggc ttttaactgt cacttacaga tggacccgcg gcgcattagc tagttggtga

240

ggtaacggct caccaaggca acgatgcgta gccgacctga gagggtgatc ggccacactg

300

ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt ccgcaatgga

360

cgaaagtctg acggagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt tttcggatcg taaagctctg

420

ttgtcaggga agaacaagta cggaagtaac tgtccgtacc ttgacggtac ctgaccagaa

480

agccacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag cgttgtccgg

540

aattattggg cgtaaagcgc gcgcaggcgg cttcttaagt ctgatgtgaa agcccacggc

600

tcaaccgtgg agggtcattg gaaactggga ggcttgagtg cagaagagga gagcggaatt

660

ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaaca ccagtggcga aggcggctct

720

ctggtctgta actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag cgaacaggat tagataccct

780

ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta agtgttggag ggtttccgcc cttcagtgct

840

gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacggcc gcaaggctga aactcaaagg

900

aattgacggg ggccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa

960

ccttaccagg tcttgacatc ccgctgaccg gtctggagac aggcctttct tcggggacag

1020

cggtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1080

gcaacgagcg caacccttga tcttagttgc cagcattcag ttgggcactc taaggtgact

1140

gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct

1200

gggctacaca cgtgctacaa tggatggtac aaagggctgc aagaccgcaa ggtttagcca

1260

atcccataaa accattctca gttcggattg caggctgcaa ctcgcctgca tgaagccgga

1320

atcgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1380

cgcccgtcac aacacgagag tttgcaacac ccgaagtcgg tggggtaacc ttacgggagc

1440

ca

1442

<210> 203

<211> 1389

<212> DNA

<213> Bacillus cereus

<400> 203

tcgagcgaat ggattaagag cttgctctta tgaagttagc ggcggacggg tgagtaacac

60

gtgggtaacc tgcccataag actgggataa ctccgggaaa ccggggctaa taccggataa

120

cattttgaac cgcatggttc gaaattgaaa ggcggcttcg gctgtcactt atggatggac

180

ccgcgtcgca ttagctagtt ggtgaggtaa cggctcacca aggcaacgat gcgtagccga

240

cctgagaggg tgatcggcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

300

gcagtaggga atcttccgca atggacgaaa gtctgacgga gcaacgccgc gtgagtgatg

360

aaggctttcg ggtcgtaaaa ctctgttgtt agggaagaac aagtgctagt tgaataagct

420

ggcaccttga cggtacctaa ccagaaagcc acggctaact acgtgccagc agccgcggta

480

atacgtaggt ggcaagcgtt atccggaatt attgggcgta aagcgcgcgc aggtggtttc

540

ttaagtctga tgtgaaagcc cacggctcaa ccgtggaggg tcattggaaa ctgggagact

600

tgagtgcaga agaggaaagt ggaattccat gtgtagcggt gaaatgcgta gagatatgga

660

ggaacaccag tggcgaaggc gactttctgg tctgtaactg acactgaggc gcgaaagcgt

720

ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga gtgctaagtg

780

ttagagggtt tccgcccttt agtgctgaag ttaacgcatt aagcactccg cctggggagt

840

acggccgcaa ggctgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg

900

tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggtct tgacatcctc tgaaaaccct

960

agagataggg cttctccttc gggagcagag tgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

1020

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgatct tagttgccat

1080

cattaagttg ggcactctaa ggtgactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac

1140

gtcaaatcat catgcccctt atgacctggg ctacacacgt gctacaatgg acggtacaaa

1200

gagctgcaag accgcgaggt ggagctaatc tcataaaacc gttctcagtt cggattgtag

1260

gctgcaactc gcctacatga agctggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt

1320

gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acgagagttt gtaacacccg

1380

aagtcggtg

1389

<210> 204

<211> 1371

<212> DNA

<213> Bacillus circulans

<400> 204

aagcttgctt ttaaagttag cggcggacgg gtgagtaaca cgtgggcaac ctgcctgtaa

60

gactgggata acttcgggaa accggagcta ataccggata atccttttcc tctcatgagg

120

aaaagctgaa agacggttta cgctgtcact tacagatggg cccgcggcgc attagctagt

180

tggtgaggta acggctcacc aaggcgacga tgcgtagccg acctgagagg gtgatcggcc

240

acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtaggg aatcttccgc

300

aatggacgaa agtctgacgg agcaacgccg cgtgagtgat gaaggttttc ggatcgtaaa

360

actctgttgt tagggaagaa caagtacaag agtaactgct tgtaccttga cggtacctaa

420

ccagaaagcc acggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgtt

480

gtccggaatt attgggcgta aagcgcgcgc aggcggtcct ttaagtctga tgtgaaagcc

540

cacggctcaa ccgtggaggg tcattggaaa ctgggggact tgagtgcaga agagaagagt

600

ggaattccac gtgtagcggt gaaatgcgta gagatgtgga ggaacaccag tggcgaaggc

660

gactctttgg tctgtaactg acgctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga

720

taccctggta gtccacgccg taaacgatga gtgctaagtg ttagagggtt tccgcccttt

780

agtgctgcag caaacgcatt aagcactccg cctggggagt acggccgcaa ggctgaaact

840

caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg

900

cgaaaaacct taccaggtct tgacatcctc tgacactcct agagatagga cgttcccctt

960

cgggggacag agtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg

1020

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgat cttagttgcc agcattcagt tgggcactct

1080

aaggtgactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc

1140

ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat ggatggtaca aagggcagca aaaccgcgag

1200

gtcgagcaaa tcccataaaa ccattctcag ttcggattgt aggctgcaac tcgcctacat

1260

gaagctggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt tcccgggcct

1320

tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc cgaagtcggt g

1371

<210> 205

<211> 1351

<212> DNA

<213> Bacillus clausii

<220>

<221> modified_base

<222> (230)..(230)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1341)..(1342)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 205

ggacgggtga gtaacacgtg ggcaacctgc cctttagact gggataactc cgggaaaccg

60

gagctaatac cggataatcc ctttctccac ctggagagag ggtgaaagat ggcttcggct

120

atcactaggg gatgggcccg cggcgcatta tctagttggt aaggtaacgg cttaccaagg

180

caacgatgcg tacccgacct gagagggtga tcggccacac tgggactgan acacggccca

240

gactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttccgcaatg gacgaaagtc tgacggagca

300

acgccgcgtg agtgaggaag gccttcgggt cgtaaagctc tgttgtgagg gaagaagcgg

360

taccgttcga atagggcggt accttgacgg tacctcacca gaaaccacgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaagc

480

gcgcgcagcg gcttcttaag tctgatgtga aatctcgggg ctcaaccccg agcggccatt

540

gaaactgggg agcttgagtg caaagagaga gtggaattcc acgtgtagcg gtgaaatgcg

600

tagagatgtg gaggaacacc agtggcagga ctctctggtc tgtaactgac ctgagcgcga

660

aagcgtggag caaacagatt aataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctagt

720

gttaggggtt tccatgcccg tagtgccaaa gttaacacat taagcactcc gcctggggag

780

tacggccgca aggctgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc agtggagcat

840

gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatcct ttgaccaccc

900

aagagattgg gcttcccctt cgggggcaaa gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

960

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgatc ttagttgcca

1020

gcattcagtt gggcactcta aggtgactgc cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga

1080

cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tgctacaatg gatggtacaa

1140

agggcagcga aaccgcgagg tgaagccaat cccataaagc cattctcagt tcggattgca

1200

ggctgcaact cgcctgcatg aagccggaat tgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg

1260

tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt tgtaacaccc

1320

gaagtcggtg aggcaacctt nnggagccag c

1351

<210> 206

<211> 1411

<212> DNA

<213> Bacillus coagulans

<220>

<221> modified_base

<222> (10)..(10)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 206

tcgtgcggan cttttaaagc ttgcttttaa aaggttagcg gcggacgggt gagtaacacg

60

tgggcaacct gcctgtaaga tcgggataac gccgggaaac cggggctaat accggatagt

120

tttttcctcc gcatggagga aaaaggaaag acggcttctg ctgtcactta cagatgggcc

180

cgcggcgcat tagctagttg gtggggtaac ggctcaccaa ggcaacgatg cgtagccgac

240

ctgagagggt gatcggccac attgggactg agacacggcc caaactccta cgggaggcag

300

cagtagggaa tcttccgcaa tggacgaaag tctgacggag caacgccgcg tgagtgaaga

360

aggccttcgg gtcgtaaaac tctgttgccg gggaagaaca agtgccgttc gaacagggcg

420

gcgccttgac ggtacccggc cagaaagcca cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacgtaggtg gcaagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa agcgcgcgca ggcggcttct

540

taagttgatg tgaaatcttg cggctcaacc gcaagcggtc attggaaact gggaggcttg

600

agtgcagaag aggagagtgg aattccacgt gtagcggtga aatgcgtaga gatgtggagg

660

aacaccagtg gcgaaggcgg ctctctggtc tgtaactgac gctgaggcgc gaaagcgtgg

720

ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt cacgccgtaa acgatgagtg ctaagtgtta

780

gagggtttcc gccctttagt gctgcagcta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg

840

gccgcaaggc tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg

900

tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catcctctga cctccctgga

960

gacagggcct tccccttcgg gggacagagt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

1020

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgacctt agttgccagc

1080

attcagttgg gcactctaag gtgactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg

1140

tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatgga tggtacaaag

1200

ggctgcgaga ccgcgaggtt aagccaatcc cagaaaacca ttcccagttc ggattgcagg

1260

ctgcaacccg cctgcatgaa gccggaatcg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg

1320

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagtttg taacacccga

1380

agtcggtgag gtaaccttac ggagccagcc g

1411

<210> 207

<211> 1483

<212> DNA

<213> Bacillus firmus

<400> 207

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc ggacggatgg gagcttgctc

60

acacgtcagc ggcggacggg tgagtaacac gtgggcaacc tgcctgtaag actgggataa

120

ctccgggaaa ccggggctaa taccggataa tgcttttcct cgcatgagga aaagctgaaa

180

gatggcatct cgctatcact tacagatggg cccgcggcgc attagctagt tggtgaggta

240

acggctcacc aaggcgacga tgcgtagccg acctgagagg gtgatcggcc acactgggac

300

tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtaggg aatcttccgc aatggacgaa

360

agtctgacgg agcaacgccg cgtgagtgat gaaggttttc ggatcgtaaa actctgttgt

420

cagggaagaa caagtaccgg agtaactgcc ggtaccttga cggtacctga ccagaaagcc

480

acggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgtt gtccggaatt

540

attgggcgta aagcgcgcgc aggcggttcc ttaagtctga tgtgaaagcc cccggctcaa

600

ccggggaggg tcattggaaa ctggggaact tgagtgcaga agagaagagt ggaattccac

660

gtgtagcggt gaaatgcgta gagatgtgga ggaacaccag tggcgaaggc gactctttgg

720

tctgtaactg acgctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta

780

gtccacgccg taaacgatga gtgctaagtg ttagagggtt tccgcccttt agtgctgcag

840

caaacgcatt aagcactccg cctggggagt acggccgcaa ggctgaaact caaaggaatt

900

gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct

960

taccaggtct tgacatctcc tgacaaccct agagataggg cgttcccctt cgggggacag

1020

gatgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg

1080

caacgagcgc aacccttgat cttagttgcc agcattcagt tgggcactct aaggtgactg

1140

ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg

1200

ggctacacac gtgctacaat ggatggtaca aagggctgca agaccgcgag gttaagcgaa

1260

tcccataaaa ccattctcag ttcggattgc aggctgcaac tcgcctgcat gaagccggaa

1320

tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc

1380

gcccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc cgaagtcggt ggggtaacct tttggagcca

1440

gccgcctaag gtgggacaga tgattggggt gaagtcgtaa caa

1483

<210> 208

<211> 1529

<212> DNA

<213> Bacillus flexus

<400> 208

gatcctggct caggatgaac gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg agcgaactga

60

ttagaagctt gcttctatga cgttagcggc ggacgggtga gtaacacgtg ggcaacctgc

120

ctgtaagact gggataactc cgggaaaccg gagctaatac cggataacat tttctcttgc

180

ataagagaaa attgaaagat ggtttcggct atcacttaca gatgggcccg cggtgcatta

240

gctagttggt gaggtaacgg ctcaccaagg caacgatgca tagccgacct gagagggtga

300

tcggccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtagggaatc

360

ttccgcaatg gacgaaagtc tgacggagca acgccgcgtg agtgatgaag gctttcgggt

420

cgtaaaactc tgttgttagg gaagaacaag tacaagagta actgcttgta ccttgacggt

480

acctaaccag aaagccacgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca

540

agcgttatcc ggaattattg ggcgtaaagc gcgcgcaggc ggtttcttaa gtctgatgtg

600

aaagcccacg gctcaaccgt ggagggtcat tggaaactgg ggaacttgag tgcagaagag

660

aaaagcggaa ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa caccagtggc

720

gaaggcggct ttttggtctg taactgacgc tgaggcgcga aagcgtgggg agcaaacagg

780

attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgagtgc taagtgttag agggtttccg

840

ccctttagtg ctgcagctaa cgcattaagc actccgcctg gggagtacgg tcgcaagact

900

gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa

960

gcaacgcgaa gaaccttacc aggtcttgac atcctctgac aactctagag atagagcgtt

1020

ccccttcggg ggacagagtg acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgatctta gttgccagca tttagttggg

1140

cactctaagg tgactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca

1200

tgccccttat gacctgggct acacacgtgc tacaatggat ggtacaaagg gctgcaagac

1260

cgcgaggtca agccaatccc ataaaaccat tctcagttcg gattgtaggc tgcaactcgc

1320

ctacatgaag ctggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat gccgcggtga atacgttccc

1380

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagtttgt aacacccgaa gtcggtgggg

1440

taacctttat ggagccagcc gcctaaggtg ggacagatga ttggggtgaa gtcgtaacaa

1500

ggtagccgta tcggaaggtg cggctggat

1529

<210> 209

<211> 1462

<212> DNA

<213> Bacillus fordii

<400> 209

gtgcctaata catcgcaagt cgagcggatg aaagagagct tgctctctgg attcagcggc

60

ggacgggtga gtaacacgtg ggcaacctgc ctgtaagact gggataactc cgggaaaccg

120

gggctaatac cggataactt cttttcccgc atggggagag gttgaaagac ggttatgctg

180

tcacttacag atgggcccgc ggcgcattag ctagttggtg gggtaacggc ctaccaaggc

240

gacgatgcgt agccgacctg agagggtgat cggccacact gggactgaga cacggcccag

300

actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tccgcaatgg acgaaagtct gacggagcaa

360

cgccgcgtga gtgacgaagg ccttcgggtc gtaaaactct gttatcaggg aagaacaagc

420

atcgtttaac tgacggtgcc atgacggtac ctgaccagaa agccacggct aactacgtgc

480

cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag cgttgtccgg aattattggg ccgtaaagcg

540

cgcgcaggcg gcttcttaag tctgatgtga aagcccacgg ctcaaccgtg gagggtcatt

600

ggaaactggg aggcagttgt gcagaagagg agagcggaat tccacgtgta gcggtgaaat

660

gcgtaaagat gtggaggaac accagtggcg aaggcggctc tctggtctgt aactgacgct

720

gaggcgcgaa agcgtgggta gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac

780

gatgagtgct aagtgttagg gggtttccgc cccttagtgc tgcagcaaac gcattaagca

840

ctccgcctgg ggagtacggc cgcaaggctg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac

900

aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca

960

tcccgctgac cggtctggag acagatcttt cccttcgggg acagcggtga caggtggtgc

1020

atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1080

ttgatcttag ttgccagcat tcagttgggc actctaaggt gactgccggt gacaaaccgg

1140

aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg acctgggcta cacacgtgct

1200

acaatggatg gtacagaggg cagcgagacc gcgaggtgga gcgaatccct taaaaccatt

1260

ctcagttcgg attgcaggct gcaactcgcc tgcatgaagc cggaatcgct agtaatcgcg

1320

gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg

1380

agagtttgta acacccgaag tcggtggggt aaccttttgg agccagccgc cgaaggtggg

1440

acagatgatt ggggtgaagt cg

1462

<210> 210

<211> 1485

<212> DNA

<213> Bacillus gelatini

<400> 210

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc ggacggaagg agagcttgct

60

ctctggaagt tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggc aacctgcctc atagatgggg

120

ataacaccga gaaatcggtg ctaataccga ataatagagc ggagcgcatg ctccgcgctt

180

gaaagtcggc tttgagctga cactatgaga tgggcccgcg gcgcattagc tagtaggtga

240

ggtaacggct cacctaggcg acgatgcgta gccgacctga gagggtgatc ggccacactg

300

ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt cggcaatgga

360

cgaaagtctg accgagcaac gccgcgtgag tgatgaaggt tttcggatcg taaaactctg

420

ttgtcaggga agaacaagta cgagagtaac tgctcgtacc ttgacggtac ctgaccagaa

480

agccacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag cgttgtccgg

540

aattattggg cgtaaagcgc gcgcaggcgg ttctttaagt ctgatgtgaa agcccacggc

600

tcaaccgtgg agggtcattg gaaactgggg aacttgagtg caggagagaa aagtggaatt

660

ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaaca ccagtggcga aggcggcttt

720

ttggcctgta actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct

780

ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttgggg ggttccaccc tcagtgctga

840

cgttaacaca ttaagcactc cgcctgggga gtacgaccgc aaggttgaaa ctcaaaggaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cagtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac

960

cttaccaggt cttgacatcc tctgaccact tgagagatca agctttcccc ttcgggggac

1020

agagtgacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1080

cgcaacgagc gcaacccttg accttagttg ccagcattca gttgggcact ctaaggtgac

1140

tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc

1200

tgggctacac acgtgctaca atggatggta caaagggctg cgaaaccgca aggtggagcc

1260

aatcccaaaa agccattctc agttcggatt gtaggctgca actcgcctac atgaagccgg

1320

aattgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccacgaga gtttgtaaca cccgaagtcg gtgaggtaac cttttggagc

1440

cagccgccga aggtgggaca gatgattggg gtgaagtcgt aacaa

1485

<210> 211

<211> 1504

<212> DNA

<213> Bacillus halmapalus

<220>

<221> modified_base

<222> (46)..(46)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (661)..(661)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 211

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc ggactnacac aagcttgctt

60

ttgtaagtta gcggcggacg ggtgagtaac acgtgggcaa cctgccctta agactgggat

120

aacttcggga aaccggagct aataccggat aatataaaga acctcctggt tctttattga

180

aagatggttt cggctatcgc ttatggatgg gcccgcggcg cattagctag ttggtgaggt

240

aacggctcac caagccaacg atgcgtagcc gacctgagag ggtgatcggc cacactggga

300

ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatcttcca caatggacga

360

aagtctgatg gagcaacgcc gcgtgagtga tgaaggcctt cgggtcgtaa agctctgttg

420

ttagggaaga acaagtgcga gagtaactgc tcgcaccttg acggtaccta accagaaagc

480

cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt tgtccggaat

540

tattgggcgt aaagcgcgcg caggtggttt cttaagtctg atgtgaaagc ccacggctca

600

accgtggagg gtcattggaa actggggaac ttgagtgcag aagaggaaag tggaattcca

660

ngtgtagcgg tgaaatgcgt agagatttgg aggaacacca gtggcgaagg cgactttctg

720

gtctgtaact gacactgagg cgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt

780

agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaagt gttagagggt ttccgccctt tagtgctgca

840

gctaacgcat taagcactcc gcctggggag tacggtcgca agactgaaac tcaaaggaat

900

tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc

960

ttaccaggtc ttgacatcct ctgccaaccc tagagatagg gcgttcccct tcgggggaca

1020

gagtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1080

gcaacgagcg caacccttga tcttagttgc cagcattcag ttgggcactc taaggtgact

1140

gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct

1200

gggctacaca cgtgctacaa tggacggtac aaagggcagc aaaaccgcga ggtcgagcca

1260

atcccagaaa accgttctca gttcggattg caggctgcaa ctcgcctgca tgaagccgga

1320

atcgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1380

cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccgaagtcgg tggggtaacc ttttggagcc

1440

agccgcctaa ggtgggacag atgattgggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtatcggaa

1500

ggtg

1504

<210> 212

<211> 1457

<212> DNA

<213> Bacillus halodurans

<400> 212

acgctggcgg cgtgcctaat acatgcaagt cgagcggacc aaagggagct tgctcctgga

60

ggttagcggc gaacgggtga gtaacacgtg ggcaacctgc ctgtaagact gggataacat

120

cgagaaatcg gtgctaatac cggataataa aaagaactgc atggttcttt tttgaaagat

180

ggtttcggct atcacttaca gatgggcccg cggcgcatta gctagttggt ggggtaacgg

240

ctcaccaagg cgacgatgcg tagccgacct gagagggtga tcggccacac tgggactgag

300

acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttccgcaatg gacgaaagtc

360

tgacggagca acgccgcgtg agtgatgaag gttttcggat cgtaaaactc tgttgttagg

420

gaagaacaag tgccgttcga aagggcggca ccttgacggt acctaacgag aaagccacgg

480

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggaattattg

540

ggcgtaaagc gcgcgcaggc ggtctcttaa gtctgatgtg aaagcccccg gctcaaccgg

600

ggagggtcat tggaaactgg gagacttgag tacagaagag gagagtggaa ttccacgtgt

660

agcggtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa caccagtggc gaaggcgact ctctggtctg

720

taactgacgc tgaggcgcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

acgccgtaaa cgatgagtgc taggtgttag gggtttcgac gcccttagtg ccgaagttaa

840

cacattaagc actccgcctg gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg

900

ggggcccgca caagcagtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc

960

aggtcttgac atcctttgac caccctagag atagggcttt ccccttcggg ggacaaagtg

1020

acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

1080

gagcgcaacc cttgacctta gttgccagca ttcagttggg cactctaagg tgactgccgg

1140

tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gacctgggct

1200

acacacgtgc tacaatggat ggtacaaagg gttgcgaagc cgcgaggtga agccaatccc

1260

agaaagccat tctcagttcg gattgcaggc tgcaactcgc ctgcatgaag ccggaattgc

1320

tagtaatcgc ggatcagcat gccgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc

1380

gtcacaccac gagagtttgt aacacccgaa gtcggtgggg taaccttttg gagccagccg

1440

cctaaggtgg gacagat

1457

<210> 213

<211> 1464

<212> DNA

<213> Bacillus herbersteinensis

<400> 213

acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtcgagcg gacatttgag agcttgctct

60

caaatgttag cggcggacgg gtgagtaaca cgtgggtaac ctgcctgtaa gattgggata

120

actccgggaa accggagcta ataccggata acattttgaa ccgcatggtt cgaaattgaa

180

agatggcttt cgrctatcac ttacagatgg acccgcggcg cattagctag ttggtgaggt

240

aatggctcac caaggcgacg atgcgtagcc gacctgagag ggtgatcggc cacactggga

300

ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatcttccg caatggacga

360

aagtctgacg gagcaacgcc gcgtgaacga tgaaggcctt cgggtcgtaa agttctgttg

420

ttagggaaga acaagtacca gagtaactgc tggtaccttg acggtaccta accagaaagc

480

cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt tgtccggaat

540

tattgggcgt aaagcgcgcg caggcggttt tttaagtctg atgtgaaagc ccacggctca

600

accgtggagg gtcattggaa actggagaac ttgagtgcag aagaggagag cggaattcca

660

cgtgtagcgg tgaaatgcgt agagatgtgg aggaacacca gtggcgaagg cggctctctg

720

gtctgtaact gacgctgagg cgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt

780

agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaagt gttagagggt ttccgccctt tagtgctgca

840

gcaaacgcat taagcactcc gcctggggag tacggtcgca agactgaaac tcaaaggaat

900

tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc

960

ttaccaggtc ttgacatcct ctgacaaccc tagagatagg gcgttcccct tcgggggaca

1020

gagtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1080

gcaacgagcg caacccttga tcttagttgc cagcatttag ttgggcactc taaggtgact

1140

gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct

1200

gggctacaca cgtgctacaa tggatggtac aaagggctgc garaccgcga ggttaagcga

1260

atcccataaa accattctca gttcggattg caggctgcaa ctcgcctgca tgaagctgga

1320

atcgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1380

cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccgaagtcgg tggggtaacc gtaaggagcc

1440

agccgcctaa ggtggacaga tgat

1464

<210> 214

<211> 1512

<212> DNA

<213> Bacillus horti

<220>

<221> modified_base

<222> (761)..(763)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 214

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc gagtgaaact gacggaagcc

60

ttcgggtgga agacagtgga tctagcggcg gacgggtgag taacacgtag gcaacctgcc

120

tgtaagatgg ggataactcc gggaaaccgg agctaatacc gaataatcgt tttgctcgca

180

tgagcaaaag gtgaaaggtg gcgcaastac cgcttacaga tgggcctgcg gcgcattagc

240

tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatgcgta gccgacctga gagggtgatc

300

ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctctacggga ggcagcagta gggaatcttc

360

ggcaatggac gaaagtctga ccgagcaacg ccgcgtgagt gaagaaggtt ttcggattgt

420

aaaactctgt tgttagggaa gaacaagtat cggttgaata agccggtacc ctgacggtac

480

ctaacgagaa agccccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggggcaag

540

cgttgtccgg aattattggg cgtaaagcgc gcgcaggcgg tctcttaagt ctgatgtgaa

600

agcccacggc tcaaccgtgg agggtcattg gaaactggga gacttgagtg taggagagga

660

aagcggaatt ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaaca ccagtggcga

720

aggcggcttt ctggcctata actgacgctg aggcgcgaaa nnntggggag caaacaggat

780

tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttaggg gtttcgatac

840

ccttagtgcc gacgctaacg caataagcac tccgcctggg gagtacggcc gcaaggctga

900

aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcagtggag catgtggttt aattcgaagc

960

aacgcgaaga accttaccag gacttgacat ccctctgaat cctctagaga tagaggcgac

1020

cttcgggaca gaggtgacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta atcttagttg ccagcattca gttgggcact

1140

ctaaggtgac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc

1200

ccttatgtcc tgggctacac acgtgctaca atgggcagta caaagggtag cgaagcgcga

1260

ggtggagcca atcccataaa gctgctctca gttcggattg caggctgcaa ctcgcctgca

1320

tgaagccgga attgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggtc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccgaagtcgg tgaggtaacc

1440

ttttggagcc agccgcctaa ggtgggatag atgattgggg tgaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtatcggaa gg

1512

<210> 215

<211> 1437

<212> DNA

<213> Bacillus idriensis

<400> 215

cctaatacat gcaagtcgag cggacttgct ggagcttgct ccagcaggtt agcggcggac

60

gggtgagtaa cacgtgggca acctgcctgt aagactggga taactccggg aaaccggagc

120

taataccgga tagtatcttg aaccgcatgg ttcaagttgg aaagacggtt tcggctgtca

180

cttacagatg ggcccgcggc gcattagcta gttggtgagg taatggctca ccaaggcaac

240

gatgcgtagc cgacctgaga gggtgatcgg ccacactggg actgagacac ggcccagact

300

cctacgggag gcagcagtag ggaatcttcc gcaatggacg aaagtctgac ggagcaacgc

360

cgcgtgagtg atgaaggttt tcggatcgta aaactctgtt gttagggaag aacaagtgcg

420

agagtaactg ctcgcacctt gacggtacct aaccagaaag ccacggctaa ctacgtgcca

480

gcagccgcgg taatacgtag gtggcaagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagcgcgc

540

gcaggcggtt tcttaagtct gatgtgaaag cccccggctc aaccggggag ggtcattgga

600

aactgggaaa cttgagtgca gaagaggaga gtggaattcc acgtgtagcg gtgaaatgcg

660

tagagatgtg gaggaacacc agtggcgaag gcgactctct ggtctgtaac tgacgctgag

720

gcgcgaaagc gtggggagcg aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat

780

gagtgctaag tgttagaggg tttccgccct ttagtgctgc agctaacgca ttaagcactc

840

cgcctgggga gtacggtcgc aagactgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag

900

cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcc

960

tttgccactt ctagagatag aaggttcccc ttcgggggac aaagtgacag gtggtgcatg

1020

gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg

1080

atcttagttg ccagcattca gttgggcact ctaaggtgac tgccggtgac aaaccggagg

1140

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1200

atggatggta caaagggctg cgagaccgcg aggtttagcc aatcccataa aaccattctc

1260

agttcggatt gcaggctgca actcgcctgc atgaagctgg aatcgctagt aatcgcggat

1320

cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga

1380

gtttgcaaca cccgaagtcg gtggggtaac cgcaaggagc cagccagccg cctaagt

1437

<210> 216

<211> 1535

<212> DNA

<213> Bacillus lentus

<400> 216

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

gaatggatgg gagcttgctc ccagaagtta gcggcggacg ggtgagtaac acgtgggcaa

120

cctacctgta agactgggat aacttcggga aaccggagct aataccggat aacttctttc

180

ttctcctgga gaaaggttga aagacggctt cggctgtcac ttacagatgg gcccgcggcg

240

cattagctag ttggtgaggt aacggctcac caaggcaacg atgcgtagcc gacctgagag

300

ggtgatcggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg

360

gaatcttccg caatggacga aagtctgacg gagcaacgcc gcgtgagtga tgaaggtttt

420

cggatcgtaa aactctgtta tcagggaaga acaagtatcg gagtaactgc cggtaccttg

480

acggtacctg accagaaagc cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg

540

tggcaagcgt tgtccggaat tattgggcgt aaagcgcgcg caggcggttt cttaagtctg

600

atgtgaaagc ccacggctca accgtggaag gtcattggaa actgggagac ttgagtgcag

660

aagagaagag cggaattcca cgtgtagcgg tgaaatgcgt agagatgtgg aggaacacca

720

gtggcgaagg cggctctttg gtctgtaact gacgctgagg cgcgaaagcg tggggagcga

780

acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaagt gttagagggt

840

ttccgccctt tagtgctgca gttaacgcat taagcactcc gcctggggag tacggccgca

900

aggctgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatcct ctgaccaccc tagagatagg

1020

gacttcccct tcgggggaca gagtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttaa ccttagttgc cagcattcag

1140

ttgggcactc taaggtgact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1200

catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggatggtac aaagggttgc

1260

aagaccgcga ggtttagcta atcccataaa accattctca gttcggattg caggctgcaa

1320

ctcgcctgca tgaagccgga atcgctagta atcgtggatc agcatgccac ggtgaatacg

1380

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccgaagtcgg

1440

tggggtaacc cttacgggag ccagccgccg aaggtgggac agatgattgg ggtgaagtcg

1500

taacaaggta gcgtatcgga aggtgcggtg gatca

1535

<210> 217

<211> 1548

<212> DNA

<213> Bacillus licheniformis

<400> 217

ggagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtcga

60

gcggaccgac gggagcttgc tcccttaggt cagcggcgga cgggtgagta acacgtgggt

120

aacctgcctg taagactggg ataactccgg gaaaccgggg ctaataccgg atgcttgatt

180

gaaccgcatg gttccaatca taaaaggtgg cttttagcta ccacttacag atggacccgc

240

ggcgcattag ctagttggtg aggtaacggc tcaccaaggc gacgatgcgt agccgacctg

300

agagggtgat cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

360

tagggaatct tccgcaatgg acgaaagtct gacggagcaa cgccgcgtga gtgatgaagg

420

ttttcggatc gtaaaactct gttgttaggg aagaacaagt accgttcgaa tagggcggca

480

ccttgacggt acctaaccag aaagccacgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

540

gtaggtggca agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaagc gcgcgcaggc ggtttcttaa

600

gtctgatgtg aaagcccccg gctcaaccgg ggagggtcat tggaaactgg ggaacttgag

660

tgcagaagag gagagtggaa ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa

720

caccagtggc gaaggcgact ctctggtctg taactgacgc tgaggcgcga aagcgtgggg

780

agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgagtgc taagtgttag

840

agggtttccg ccctttagtg ctgcagcaaa cgcattaagc actccgcctg gggagtacgg

900

tcgcaagact gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt

960

ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc aggtcttgac atcctctgac aaccctagag

1020

atagggcttc cccttcgggg gcagagtgac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt

1080

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgatcttagt tgccagcatt

1140

cagttgggca ctctaaggtg actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca

1200

aatcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtgcta caatgggcag aacaaagggc

1260

agcgaagccg cgaggctaag ccaatcccac aaatctgttc tcagttcgga tcgcagtctg

1320

caactcgact gcgtgaagct ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc cgcggtgaat

1380

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccgaagt

1440

cggtgaggta accttttgga gccagccgcc gaaggtggga cagatgattg gggtgaagtc

1500

gtaacaaggt agccgtatcg gaaggtgcgg ctggatcacc tcctttct

1548

<210> 218

<211> 1404

<212> DNA

<213> Bacillus megaterium

<400> 218

tcgagcgaac tgattagaag cttgcttcta tgacgttagc ggcggacggg tgagtaacac

60

gtgggcaacc tgcctgtaag actgggataa cttcgggaaa ccgaagctaa taccggatag

120

gatcttctcc ttcatgggag atgattgaaa gatggtttcg gctatcactt acagatgggc

180

ccgcggtgca ttagctagtt ggtgaggtaa cggctcacca aggcaacgat gcatagccga

240

cctgagaggg tgatcggcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

300

gcagtaggga atcttccgca atggacgaaa gtctgacgga gcaacgccgc gtgagtgatg

360

aaggctttcg ggtcgtaaaa ctctgttgtt agggaagaac aagtacgaga gtaactgctc

420

gtaccttgac ggtacctaac cagaaagcca cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacgtaggtg gcaagcgtta tccggaatta ttgggcgtaa agcgcgcgca ggcggtttct

540

taagtctgat gtgaaagccc acggctcaac cgtggagggt cattggaaac tggggaactt

600

gagtgcagaa gagaaaagcg gaattccacg tgtagcggtg aaatgcgtag agatgtggag

660

gaacaccagt ggcgaaggcg gctttttggt ctgtaactga cgctgaggcg cgaaagcgtg

720

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag tgctaagtgt

780

tagagggttt ccgcccttta gtgctgcagc taacgcatta agcactccgc ctggggagta

840

cggtcgcaag actgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt

900

ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatcctct gacaactcta

960

gagatagagc gttccccttc gggggacaga gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

1020

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgatc ttagttgcca

1080

gcatttagtt gggcactcta aggtgactgc cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga

1140

cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tgctacaatg gatggtacaa

1200

agggctgcaa gaccgcgagg tcaagccaat cccataaaac cattctcagt tcggattgta

1260

ggctgcaact cgcctacatg aagctggaat cgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg

1320

tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt tgtaacaccc

1380

gaagtcggtg gagtaaccgt aagg

1404

<210> 219

<211> 878

<212> DNA

<213> Bacillus nealsonii

<220>

<221> modified_base

<222> (121)..(121)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 219

gcggacttta aaagcttgct tttaaagtta gcggcggacg ggtgagtaac acgtgggcaa

60

cctgcctgta agactgggat aacttcggga aaccggagct aataccggat aattctttcc

120

nccacatggt ggaaagctga aagacggcat ctcgctgtca cttacagatg ggcccgcggc

180

gcattagcta gttggtgagg taacggctca ccaaggcaac gatgcgtagc cgacctgaga

240

gggtgatcgg ccacactggg actgaaacac ggcccaaact cctacgggag gcagcagtag

300

ggaatcttcc gcaatggacg aaagtctgac ggagcaacgc cgcgtgagtg atgaaggttt

360

tcggatcgta aagctctgtt gttagggaag aacaagtaca agagtaactg cttgtacctt

420

gacggtacct aaccagaaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

480

gtggcaagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagcgcgc gcaggcggtc ctttaagtct

540

gatgtgaaag cccacggctc aaccgtggag ggtcattgga aactggggga cttgagtgca

600

gaagagaaga gtggaattcc acgtgtagcg gtgaaatgcg tagagatgtg gaggaacacc

660

agtggcgaag gcgactcttt ggtctgtaac tgacgctgag gcgcgaaagc gtggggagca

720

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctaag tgttagaggg

780

tttccgccct ttagtgctgc agcaaacgca ttaagcactc cgcctgggga gtacggccgc

840

aaggctgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcaca

878

<210> 220

<211> 950

<212> DNA

<213> Bacillus niabensis

<220>

<221> modified_base

<222> (37)..(37)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (43)..(43)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (80)..(80)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (85)..(85)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (939)..(939)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 220

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttntcc ggnaattatt gggcgtaaag

60

cgcgcgcagg cggttccttn aagtntgatg tgaaagccca cggctcaacc gtggagggtc

120

attggaaact ggggaacttg agtgcagaag aggagagcgg aattccacgt gtagcggtga

180

aatgcgtaga gatgtggagg aacaccagtg gcgaaggcgg ctctctggtc tgtaactgac

240

gctgaggcgc gaaagcgtgg ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta

300

aacgatgagt gctaagtgtt agagggtttc cgccctttag tgctgcagca aacgcattaa

360

gcactccgcc tggggagtac ggtcgcaaga ctgaaactca aaggaattga cggggacccg

420

cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaggtcttg

480

acatcctctg ctacttctag agatagaagg ttcccttcgg ggacagagtg acaggtggtg

540

catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

600

cttgatctta gttgccagca ttcagttggg cactctaagg tgactgccgg tgacaaaccg

660

gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gacctgggct acacacgtgc

720

tacaatggat ggtacaaagg gctgcaaaac cgtgaggtcg agccaatccc ataaaaccat

780

tctcagttcg gattgtaggc tgcaactcgc ctacatgaag ccggaatcgc tagtaatcgc

840

ggatcagcat gccgcggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccac

900

gagagtttgt aacacccgaa gtcggtgagg taacctttng gagccagccg

950

<210> 221

<211> 929

<212> DNA

<213> Bacillus niacini

<220>

<221> modified_base

<222> (76)..(76)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 221

gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa agcgcgcgca

60

ggcggtcctt taagtntgat gtgaaagctc acggctcaac cgtggagggt cattggaaac

120

tgggggactt gagtgcagaa gaggaaagcg gaattccacg tgtagcggtg aaatgcgtag

180

agatgtggag gaacaccagt ggcgaaggcg gctttctggt ctgtaactga cgctgaggcg

240

cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag ttcacgccgt aaacgatgag

300

tgctaagtgt tagagggttt ccgcccttta gtgctgcagc taacgcatta agcactccgc

360

ctggggagta cggccgcaag gctgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg

420

tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatcctta

480

cgacctccct agagataggg atttcccctt cgggggacgg aagtgacagg tggtgcatgg

540

ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttga

600

tcttagttgc cagcattcag ttgggcactc taaggtgact gccggtgaca aaccggagga

660

aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgttacaa

720

tggatggtac aaagggcagc gaaaccgcga ggtcgagcca atcccataaa accattctca

780

gttcggattg caggctgcaa ctcgcctgca tgaagccgga atcgctagta atcgcggatc

840

agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag

900

tttgtaacac ccgaagtcgg tggggtaac

929

<210> 222

<211> 1495

<212> DNA

<213> Bacillus pocheonensis

<400> 222

aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtcga gcgaatcatt aggagcttgc

60

tcctattggt tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggc aacctgcctg taagactggg

120

ataacttcgg gaaaccggag ctaataccgg ataatccttt tcctctcatg agggaaagtt

180

gaaagatggc gtcagctatc acttacagat gggcccgcgg cgcattagct agttggtgag

240

gtaacggctc accaaggcga cgatgcgtag ccgacctgag agggtgatcg gccacactgg

300

gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta gggaatcttc cgcaatggac

360

gaaagtctga cggagcaacg ccgcgtgagc gatgaaggcc ttcgggtcgt aaagctctgt

420

tgttagggaa gaacaagtat cggagtaact gccggtacct tgacggtacc taaccagaaa

480

gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta ggtggcaagc gttgtccgga

540

attattgggc gtaaagcgcg cgcaggcggt cctttaagtc tgatgtgaaa gcccacggct

600

caaccgtgga gggtcattgg aaactggggg acttgagtgc agaagaggaa agtggaattc

660

cacgtgtagc ggtgaaatgc gtagagatgt ggaggaacac cagtggcgaa ggcgactttc

720

tggtctgtaa ctgacgctga ggcgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg

780

gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa gtgttagagg gtttccgccc tttagtgctg

840

cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacggccg caaggctgaa actcaaagga

900

attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa

960

ccttaccagg tcttgacatc ctctgacaat cctagagata ggacgttccc cttcggggga

1020

cagagtgaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc

1080

ccgcaacgag cgcaaccctt gatcttagtt gccagcattc agttgggcac tctaaggtga

1140

ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgac

1200

ctgggctaca cacgtgctac aatggatggt acaaagggct gcaaaaccgc aaggttaagc

1260

caatcccata aaaccattct cagttcggat tgtaggctgc aactcgccta catgaagccg

1320

gaatcgctag taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac

1380

accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac acccgaagtc ggtggggtaa ccgtaaggag

1440

ccagccgcct aaggtgggac agatgattgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgt

1495

<210> 223

<211> 1410

<212> DNA

<213> Bacillus pumilus

<220>

<221> modified_base

<222> (1399)..(1399)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 223

tcgagcgaac agaagggagc ttgctcccgg atgttagcgg cggacgggtg agtaacacgt

60

gggtaacctg cctgtaagac tgggataact ccgggaaacc ggagctaata ccggatagtt

120

ccttgaaccg catggttcaa ggatgaaaga cggtttcggc tgtcacttac agatggaccc

180

gcggcgcatt agctagttgg tggggtaatg gctcaccaag gcgacgatgc gtagccgacc

240

tgagagggtg atcggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

300

agtagggaat cttccgcaat ggacgaaagt ctgacggagc aacgccgcgt gagtgatgaa

360

ggttttcgga tcgtaaagct ctgttgttag ggaagaacaa gtgcgagagt aactgctcgc

420

accttgacgg tacctaacca gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

480

cgtaggtggc aagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag ggctcgcagg cggtttctta

540

agtctgatgt gaaagccccc ggctcaaccg gggagggtca ttggaaactg ggaaacttga

600

gtgcagaaga ggagagtgga attccacgtg tagcggtgaa atgcgtagag atgtggagga

660

acaccagtgg cgaaggcgac tctctggtct gtaactgacg ctgaggagcg aaagcgtggg

720

gagcgaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaagtgtta

780

gggggtttcc gccccttagt gctgcagcta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg

840

gtcgcaagac tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg

900

tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catcctctga caaccctaga

960

gatagggctt tcccttcggg gacagagtga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1020

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgatcttag ttgccagcat

1080

ttagttgggc actctaaggt gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1140

aaatcatcat gccccttatg acctgggcta cacacgtgct acaatggaca gaacaaaggg

1200

ctgcgagacc gcaaggttta gccaatccca taaatctgtt ctcagttcgg atcgcagtct

1260

gcaactcgac tgcgtgaagc tggaatcgct agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa

1320

tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgca acacccgaag

1380

tcggtgaggt aacctttang gagccagccg

1410

<210> 224

<211> 1411

<212> DNA

<213> Bacillus safensis

<220>

<221> modified_base

<222> (1400)..(1400)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 224

gtcgagcgga cagaagggag cttgctcccg gatgttagcg gcggacgggt gagtaacacg

60

tgggtaacct gcctgtaaga ctgggataac tccgggaaac cggagctaat accggatagt

120

tccttgaacc gcatggttca aggatgaaag acggtttcgg ctgtcactta cagatggacc

180

cgcggcgcat tagctagttg gtggggtaat ggctcaccaa ggcgacgatg cgtagccgac

240

ctgagagggt gatcggccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag

300

cagtagggaa tcttccgcaa tggacgaaag tctgacggag caacgccgcg tgagtgatga

360

aggttttcgg atcgtaaagc tctgttgtta gggaagaaca agtgcgagag taactgctcg

420

caccttgacg gtacctaacc agaaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtaggtgg caagcgttgt ccggaattat tgggcgtaaa gggctcgcag gcggtttctt

540

aagtctgatg tgaaagcccc cggctcaacc ggggagggtc attggaaact gggaaacttg

600

agtgcagaag aggagagtgg aattccacgt gtagcggtga aatgcgtaga gatgtggagg

660

aacaccagtg gcgaaggcga ctctctggtc tgtaactgac gctgaggagc gaaagcgtgg

720

ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt gctaagtgtt

780

agggggtttc cgccccttag tgctgcagct aacgcattaa gcactccgcc tggggagtac

840

ggtcgcaaga ctgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg

900

gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaggtcttg acgtcctctg acaacctctg

960

agatagggct ttcccttcgg ggacagagtg acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt

1020

gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgatctta gttgccagca

1080

ttcagttggg cactctaagg tgactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt

1140

caaatcatca tgccccttat gacctgggct acacacgtgc tacaatggac agaacaaagg

1200

gctgcaagac cgcaaggttt agccaatccc ataaatctgt tctcagttcg gatcgcagtc

1260

tgcaactcga ctgcgtgaag ctggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat gccgcggtga

1320

atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagtttgc aacacccgaa

1380

gtcggtgagg taacctttan ggagccagcc g

1411

<210> 225

<211> 1522

<212> DNA

<213> Bacillus simplex

<400> 225

cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc gaatcgatgg

60

gagcttgctc cctgagatta gcggcggacg ggtgagtaac acgtgggcaa cctgcctata

120

agactgggat aacttcggga aaccggagct aataccggat acgttctttt ctcgcatgag

180

agaagatgga aagacggttt acgctgtcac ttatagatgg gcccgcggcg cattagctag

240

ttggtgaggt aatggctcac caaggcgacg atgcgtagcc gacctgagag ggtgatcggc

300

cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatcttccg

360

caatggacga aagtctgacg gagcaacgcc gcgtgaacga agaaggcctt cgggtcgtaa

420

agttctgttg ttagggaaga acaagtacca gagtaactgc tggtaccttg acggtaccta

480

accagaaagc cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt

540

tgtccggaat tattgggcgt aaagcgcgcg caggtggttc cttaagtctg atgtgaaagc

600

ccacggctca accgtggagg gtcattggaa actggggaac ttgagtgcag aagaggaaag

660

tggaattcca agtgtagcgg tgaaatgcgt agagatttgg aggaacacca gtggcgaagg

720

cgactttctg gtctgtaact gacactgagg cgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag

780

ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaagt gttagagggt ttccgccctt

840

tagtgctgca gctaacgcat taagcactcc gcctggggag tacggccgca aggctgaaac

900

tcaaaggaat tgacgggggc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg

960

cgaagaacct taccaggtct tgacatcctc tgacaaccct agagataggg ctttcccctt

1020

cgggggacag agtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg

1080

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgat cttagttgcc agcattcagt tgggcactct

1140

aaggtgactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc

1200

ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat ggatggtaca aagggctgca aacctgcgaa

1260

ggtaagcgaa tcccataaag ccattctcag ttcggattgt aggctgcaac tcgcctacat

1320

gaagccggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt tcccgggcct

1380

tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc cgaagtcggt gaggtaacct

1440

ttatggaagc cagccgccta aggtgggaca gatgattggg gtgaagtcgt aacaaggtag

1500

ccgtatcgga aggtgcggct gg

1522

<210> 226

<211> 971

<212> DNA

<213> Bacillus sonorensis

<400> 226

tcgagcgaac cgacgggagc ttgctccctt aggttagcgg cggacgggtg agtaacacgt

60

gggtaacctg cctgtaagac tgggataact ccgggaaacc ggggctaata ccggatgctt

120

gattgaaccg catggttcaa ttataaaagg tggcttttag ctaccactta cagatggacc

180

cgcggcgcat tagctagttg gtgaggtaac ggctcaccaa ggcgacgatg cgtagccgac

240

ctgagagggt gatcggccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag

300

cagtagggaa tcttccgcaa tggacgaaag tctgacggag caacgccgcg tgagtgatga

360

aggttttcgg atcgtaaaac tctgttgtta gggaagaaca agtaccgttc gaacagggcg

420

gtgccttgac ggtacctaac cagaaagcca cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacgtaggtg gcaagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa agcgcgcgca ggcggtttct

540

taagtctgat gtgaaagccc ccggctcaac cggggagggt cattggaaac tggggaactt

600

gagtgcagaa gaggagagtg gaattccacg tgtagcggtg aaatgcgtag agatgtggag

660

gaacaccagt ggcgaaggcg actctctggt ctgtaactga cgctgaggcg cgaaagcgtg

720

gggagcgaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag tgctaagtgt

780

tagagggttt ccgcccttta gtgctgcagc aaacgcatta agcactccgc ctggggagta

840

cggtcgcaag actgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt

900

ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatcctct gacaccccta

960

gagatagggc t

971

<210> 227

<211> 935

<212> DNA

<213> Bacillus sp. 10403023 MM10403188

<220>

<221> modified_base

<222> (843)..(843)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (926)..(926)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 227

tcgagcggag atttgaaaag cttgcttttc aaatcttagc ggcggacggg tgagtaacac

60

gtgggcaacc tgcccttgag acggggataa ctccgggaaa ccggagctaa taccggataa

120

cacatatctt cgcatgagga tatgttagaa ggtggctttt agctaccact caaggatggg

180

cccgcggcgc attagctagt tggtgaggta acggctcacc aaggcgacga tgcgtagccg

240

acctgagagg gtgatcggcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc

300

agcagtaggg aatcttccgc aatggacgaa agtctgacgg agcaacgccg cgtgagtgat

360

gaaggttttc ggatcgtaaa gctctgttgt tagggaagaa caagtacctg ttgaataagc

420

aggtaccttg acggtaccta accagaaagc cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt

480

aatacgtagg tggcaagcgt tgtccggaat tattgggcgt aaagcgcgcg caggcggttc

540

cttaagtctg atgtgaaagc ccacggctca accgtggagg gtcattggaa actggggaac

600

ttgagtgcag aagaggagag cggaattcca cgtgtagcgg tgaaatgcgt agagatgtgg

660

aggaacacca gtggcgaagg cggctctctg gtctgtaact gacgctgagg cgcgaaagcg

720

tggggagcga acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaagt

780

gttagagggt ttccgccctt tagtgctgca gcaaacgcat taagcactcc gcctggggag

840

tanggtcgca agactgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat

900

gtggtttaat tcgaagcaac gcgaanaacc ttacc

935

<210> 228

<211> 1485

<212> DNA

<213> Bacillus sp. 2008724126

<400> 228

ggctcaggac gaacgctggc ggcgtgccta atacatgcaa gtcgagcgaa tcgaygggag

60

cttgctccct gagattagcg gcggacgggt gagtaacacg tgggcaacct gcctataaga

120

ctgggataac ttcgggaaac cggagctaat accggatacg ttcttytctc gcatgagaga

180

agatggaaag acggtttacg ctgtcactta tagatgggcc cgcggcgcat tagctagttg

240

gtgaggtaat ggctcaccaa ggcgacgatg cgtagccgac ctgagagggt gatcggccac

300

actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtagggaa tcttccgcaa

360

tggacgaaag tctgacggag caacgccgcg tgaacgaaga aggccttcgg gtcgtaaagt

420

tctgttgtta gggaagaaca agtaccagag taactgctgg taccttgacg gtacctaacc

480

agaaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg caagcgttgt

540

ccggaattat tgggcgtaaa gcgcgcgcag gtggttcctt aagtctgatg tgaaagccca

600

cggctcaacc gtggagggtc attggaaact ggggaacttg agtgcagaag aggaaagtgg

660

aattccaagt gtagcggtga aatgcgtaga gatttggagg aacaccagtg gcgaaggcga

720

ctttctggtc tgtaactgac actgaggcgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata

780

ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt gctaagtgtt agagggtttc cgccctttag

840

tgctgcagct aacgcattaa gcactccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctgaaactca

900

aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg

960

aagaacctta ccaggtcttg acatcctctg acaaccctag agatagggct ttccccttcg

1020

ggggacagag tgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt

1080

aagtcccgca acgagcgcaa cccttgatct tagttgccag cattcagttg ggcactctaa

1140

ggtgactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt

1200

atgacctggg ctacacacgt gctacaatgg atggtacaaa gggctgcaaa cctgcgaagg

1260

taagcgaatc ccataaagcc attctcagtt cggattgcag gctgcaactc gcctgcatga

1320

agccggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc ccgggccttg

1380

tacacaccgc ccgtcacacc acgagagttt gtaacacccg aagtcggtga ggtaaccttc

1440

atggagccag ccgcctaagg tgggacagat gattggggtg aagtc

1485

<210> 229

<211> 1495

<212> DNA

<213> Bacillus sp. 2008724139

<400> 229

gttgatcctg gctcaggacg aacgctggcg gcgtgcctaa tacatgcaag tcgagcgaat

60

cgacgggagc ttgctccctg agattagcgg cggacgggtg agtaacacgt gggcaacctg

120

cctataagac tgggataact tcgggaaacc ggagctaata ccggatacgt tcttttctcg

180

catgagagaa gatggaaaga cggtttacgc tgtcacttat agatgggccc gcggcgcatt

240

agctagttgg tgaggtaatg gctcaccaag gcgacgatgc gtagccgacc tgagagggtg

300

atcggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtagggaat

360

cttccgcaat ggacgaaagt ctgacggagc aacgccgcgt gaacgaagaa ggccttcggg

420

tcgtaaagtt ctgttgttag ggaagaacaa gtaccagagt aactgctggt accttgacgg

480

tacctaacca gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc

540

aagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag cgcgcgcagg tggttcctta agtctgatgt

600

gaaagcccac ggctcaaccg tggagggtca ttggaaactg gggaacttga gtgcagaaga

660

ggaaagtgga attccaagtg tagcggtgaa atgcgtagag atttggagga acaccagtgg

720

cgaaggcgac tttctggtct gtaactgaca ctgaggcgcg aaagcgtggg gagcaaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaagtgtta gagggtttcc

840

gccctttagt gctgcagcta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg gccgcaaggc

900

tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga

960

agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catcctctga caaccctaga gatagggctt

1020

tccccttcgg gggacagagt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1080

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgatctt agttgccagc attcagttgg

1140

gcactctaag gtgactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc

1200

atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatgga tggtacaaag ggctgcaaac

1260

ctgcgaaggt aagcgaatcc cataaagcca ttctcagttc ggattgcagg ctgcaactcg

1320

cctgcatgaa gccggaatcg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg aatacgttcc

1380

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagtttg taacacccga agtcggtgag

1440

gtaaccttya tggagccagc cgcctaaggt gggacagatg attggggtga agtcg

1495

<210> 230

<211> 1547

<212> DNA

<213> Bacillus sp. 2_A_57_CT2

<400> 230

ggagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtcga

60

gcggacagat gggagcttgc tccctgaagt cagcggcgga cgggtgagta acacgtgggc

120

aacctgcctg taagactggg ataactccgg gaaaccgggg ctaataccgg ataattcttt

180

ccctcacatg agggaaagct gaaagatggt ttcggctatc acttacagat gggcccgcgg

240

cgcattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcaa cgatgcgtag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc cgcaatggac gaaagtctga cggagcaacg ccgcgtgagt gatgaaggtt

420

ttcggatcgt aaaactctgt tgttagggaa gaacaagtac cggagtaact gccggtacct

480

tgacggtacc taaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

ggtggcaagc gttgtccgga attattgggc gtaaagcgcg cgcaggcggt tccttaagtc

600

tgatgtgaaa gcccccggct caaccgggga gggtcattgg aaactgggga acttgagtgc

660

agaagagaag agtggaattc cacgtgtagc ggtgaaatgc gtagagatgt ggaggaacac

720

cagtggcgaa ggcgactctt tggtctgtaa ctgacgctga ggcgcgaaag cgtggggagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa gtgttagagg

840

gtttccgccc tttagtgctg cagcaaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggctgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc tcctgacaac cctagagata

1020

gggcgttccc cttcggggga caggatgaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc

1080

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gatcttagtt gccagcattc

1140

agttgggcac tctaaggtga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1200

atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca cacgtgctac aatggatggt acaaagggct

1260

gcgagaccgc gaggttaagc gaatcccata aaaccattct cagttcggat tgcaggctgc

1320

aactcgcctg catgaagccg gaatcgctag taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaata

1380

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac acccgaagtc

1440

ggtggggtaa ccttttggag ccagccgcct aaggtgggac agatgattgg ggtgaagtcg

1500

taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcacct cctttct

1547

<210> 231

<211> 1493

<212> DNA

<213> Bacillus sp. 7-16AIA

<400> 231

tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca agtcgagcgg atgacgagga

60

gcttgctcct ctgattcagc ggcggacggg tgagtaacac gtgggcaacc tgcctgtaag

120

actgggataa ctccgggaaa ccggggctaa taccggatag gtgatgtctt cgcatgaaga

180

gatcaggaaa gatggcttcg gctatcactt acagatgggc ccgcggcgca ttagctagtt

240

ggtgaggtaa cggctcacca aggcgacgat gcgtagccga cctgagaggg tgatcggcca

300

cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtaggga atcttccgca

360

atggacgaaa gtctgacgga gcaacgccgc gtgagcgaag aaggtcttcg gatcgtaaag

420

ctctgttgtt agggaagaac aagtaccgtt cgaatagggc ggtaccgtga cggtacctaa

480

ccagaaagcc acggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgtt

540

gtccggaatt attgggcgta aagcgcgcgc aggcggcttc ttaagtctga tgtgaaagcc

600

cgcagctcaa ctgcggaggg tcattggaaa ctgggaagct tgagtgcaga agaggagagt

660

ggaattccac gtgtagcggt gaaatgcgta gagatgtgga ggaacaccag tggcgaaggc

720

ggctctctgg tctgtaactg acgctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga

780

taccctggta gtccacgccg taaacgatga gtgctaagtg ttagagggtt tccgcccttt

840

agtgctgcag ctaacgcatt aagcactccg cctggggagt acggccgcaa ggctgaaact

900

caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg

960

cgaagaacct taccaggtct tgacatcctc tgctacttct agagatagaa ggttcccctt

1020

cgggggacgg agtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg

1080

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgac cttagttgcc agcattcagt tgggcactct

1140

aaggtgactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc

1200

ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat ggacggtaca aagggctgcg aaaccgcgag

1260

gtggagccaa tcccagaaaa ccgttctcag ttcggattgc aggctgcaac tcgcctgcat

1320

gaagccggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt tcccgggcct

1380

tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc cgaagtcggt gaggtaaccg

1440

caaggagcca gccgccgaag gtgggacaga tgattggggt gaagtcgtaa caa

1493

<210> 232

<211> 1503

<212> DNA

<213> Bacillus sp. 9-3AIA

<400> 232

tggcaggacg aacgctggcg gcgtgcctaa tacatgcaag tcgagcgagt gaaacgatca

60

gaagccttcg ggtggacgat cgtggatcta gcggcggacg ggtgagtaac acgtaggcaa

120

cctgcctgta agacggggat aactccggga aaccggagct aataccggat gaaccttcag

180

ctcgcatgag ctggagttga aaggtggcgc aagctaccac ttacagatgg gcctgcggcg

240

cattagctag ttggtgaggt aagggctcac caaggcgacg atgcgtagcc gacctgagag

300

ggtgatcggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg

360

gaatcttcgg caatggacgc aagtctgacc gagcaacgcc gcgtgagtga ggaaggtttt

420

cggattgtaa aactctgttg ttagggaaga acaagtaccg tttgaataag gcggtacctt

480

gacggtacct aacgagaaag ccccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

540

ggggcaagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagcgcgc gcaggcggtt tcttaagtct

600

gatgtgaaag cccacggctc aaccgtggag ggtcattgga aactgggaaa cttgagtgta

660

ggagaggaaa gcggaattcc acgtgtagcg gtgaaatgcg tagagatgtg gaggaacacc

720

agtggcgaag gcggctttct ggcctataac tgacgctgag gcgcgaaagc gtggggagca

780

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctagg tgttaggggt

840

ttcgataccc ttagtgccga cgttaacaca ataagcactc cgcctgggga gtacggccgc

900

aaggctgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cagtggagca tgtggtttaa

960

ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccagga cttgacatcc ctctgaatcc tctagagata

1020

gaggcggcct tcgggacaga ggtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1080

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttaat cttagttgcc agcattcagt

1140

tgggcactct aaggtgactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc

1200

atcatgcccc ttatgtcctg ggctacacac gtgctacaat gggcagtaca acgggtagcg

1260

aagccgtgag gtggagccaa tcccataaag ctgctctcag ttcggattgc aggctgcaac

1320

tcgcctgcat gaagccggaa ttgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagc ttgtaacacc cgaagtcggt

1440

gaggtaacct tttggagcca gccgccgaag gtgggatagg tgattggggt gaagtcgtaa

1500

caa

1503

<210> 233

<211> 1514

<212> DNA

<213> Bacillus sp. AP8

<400> 233

tagagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaatacat gcaagtcgag

60

cgaacggagg agagcttgct ctccgaagtt agcggcggac gggtgagtaa cacgtgggca

120

acctgcctat aagactggga taactccggg aaaccggggc taataccgga tagttctttt

180

ctccwcatgg agaaaagggg aaagatggtt tcggctatca cttatagatg ggcccgcggc

240

gcattagcta gttggtaggg taacggccta ccaaggcgac gatgcgtagc cgacctgaga

300

gggtgatcgg ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtag

360

ggaatcttcc gcaatggacg aaagtctgac ggagcaacgc cgcgtgaacg atgaaggtct

420

tcggatcgta aagttctgtt gttagggaag aacaagtacg agagtaactg ctcgtacctt

480

gacggtacct aaccagaaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

540

gtggcaagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagcgcgc gcaggtggtt ccttaagtct

600

gatgtgaaag cccacggctc aaccgtggaa ggtcattgga aactggggaa cttgagtgca

660

gaagaggaaa gtggaattcc aagtgtagcg gtgaaatgcg tagatatttg gaggaacacc

720

agtggcgaag gcgactttct ggtctgtaac tgacactgag gcgcgaaagc gtggggagca

780

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctaag tgttagaggg

840

tttccgccct ttagtgctgc agctaacgca ttaagcactc cgcctgggga gtacggtcgc

900

aagactgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

960

ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcc tctgccactc ctagagatag

1020

gacgttcccc ttcgggggac agagtgacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg

1080

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg atcttagttg ccagcattca

1140

gttgggcact ctaaggtgac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1200

tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca atggatggta caaagggcag

1260

cgaaaccgcg aggtttagcc aatcccataa agccattctc agttcggatt gtaggctgca

1320

actcgcctac atgaagccgg aatcgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gtttgtaaca cccgaagtcg

1440

gtggggtaac cgcaaggagc cagccgccta aggtgggaca gatgattggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtag ccgt

1514

<210> 234

<211> 1402

<212> DNA

<213> Bacillus sp. B27(2008)

<220>

<221> modified_base

<222> (1389)..(1389)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 234

agcggacaga tgggagcttg ctccctgatg ttagcggcgg acgggtgagt aacacgtggg

60

taacctgcct gtaagactgg gataactccg ggaaaccggg gctaataccg gatggttgtt

120

tgaaccgcat ggttcaaaca taaaaggtgg cttcggctac cacttacaga tggacccgcg

180

gcgcattagc tagttggtga ggtaatggct caccaaggca acgatgcgta gccgacctga

240

gagggtgatc ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

300

agggaatctt ccgcaatgga cgaaagtctg acggagcaac gccgcgtgag tgatgaaggt

360

tttcggatcg taaagctctg ttgttaggga agaacaagta ccgttcgaat agggcggtac

420

cttgacggta cctaaccaga aagccacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

taggtggcaa gcgttgtccg gaattattgg gcgtaaaggg ctcgcaggcg gtttcttaag

540

ttgatgtgaa agcccccggc tcaaccgggg agggtcattg gaaactgggg aacttgagtg

600

cagaagagga gagtggaatt ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaaca

660

ccagtggcga aggcgactct ctggtctgta actgacgctg aggagcgaaa gcgtggggag

720

cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta agtgttaggg

780

ggtttccgcc ccttagtgct gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacggtc

840

gcaagactga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt

900

aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cctctgacaa tcctagagat

960

aggacgtccc cttcgggggc agagtgacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg

1020

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg atcttagttg ccagcattca

1080

gttgggcact ctaaggtgac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1140

tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca atggacagaa caaagggcag

1200

cgaaaccgcg aggttaagcc aatcccacaa atctgttctc agttcggatc gcagtctgca

1260

actcgactgc gtgaagctgg aatcgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac

1320

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gtttgtaaca cccgaagtcg

1380

gtgaggtanc cttttaggag cc

1402

<210> 235

<211> 1411

<212> DNA

<213> Bacillus sp. BT1B_CT2

<220>

<221> modified_base

<222> (1400)..(1400)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 235

gtcgagcgga ccgacgggag cttgctccct taggtcagcg gcggacgggt gagtaacacg

60

tgggtaacct gcctgtaaga ctgggataac tccgggaaac cggggctaat accggatgct

120

tgtttgaacc gcatggttca aacataaaag gtggcttttc gctaccactt acagatggac

180

ccgcggcgca ttagctagtt ggtggggtaa cggctcacca aggcgacgat gcgtagccga

240

cctgagaggg tgatcggcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

300

gcagtaggga atcttccgca atggacgaaa gtctgacgga gcaacgccgc gtgagtgatg

360

aaggttttcg gatcgtaaaa ctctgttgtt agggaagaac aagtaccgtt cgaacagggc

420

ggtaccttga cggtacctaa ccagaaagcc acggctaact acgtgccagc agccgcggta

480

atacgtaggt ggcaagcgtt gtccggaatt attgggcgta aagcgcgcgc aggcggtttt

540

taagtctgat gtgaaagccc ccggctcaac cggggagggt cattggaaac tggggaactt

600

gagtgcagaa gaggagagtg gaattccacg tgtagcggtg aaatgcgtag agatgtggag

660

gaacaccagt ggcgaaggcg actctctggt ctgtaactga cgctgaggcg cgaaagcgtg

720

gggagcgaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag tgctaagtgt

780

tagagggttt ccgcccttta gtgctgcagc aaacgcatta agcactccgc ctggggagta

840

cggtcgcaag actgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt

900

ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatcctct gacaacccta

960

gagatagggc ttccccttcg ggggcagagt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

1020

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgatctt agttgccagc

1080

attcagttgg gcactctaag gtgactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg

1140

tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatggg cagaacaaag

1200

ggcagcgaag ccgcgaggct aagccaatcc cacaaatctg ttctcagttc ggatcgcagt

1260

ctgcaactcg actgcgtgaa gctggaatcg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg

1320

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagtttg taacacccga

1380

agtcggtgag gtaacctttn ggagccagcc g

1411

<210> 236

<211> 1429

<212> DNA

<213> Bacillus sp. GB1.1

<400> 236

ggggaggaga gggactgctc ctgagtcagc ggcggacggg tgagtaacac gtgggcaacc

60

tgcctgtaag actgggataa cttcgggaaa ccggagctaa taccggataa tgcacagcct

120

ctcatgaggc tatgctgaaa gatggtttcg gctatcactt acagatgggc ccgcggcgca

180

ttagctagtt ggtgaggtaa cggctcacca aggcaacgat gcgtagccga cctgagaggg

240

tgatcggcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtaggga

300

atcttccgca atggacgaaa gtctgacgga gcaacgccgc gtgagtgatg aaggttttcg

360

gatcgtaaaa ctctgttgtc agggaagaac aagtgccgga gtaactgccg gcaccttgac

420

ggtacctgac cagaaagcca cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg

480

gcaagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa agcgcgcgca ggcggtctct taagtctgat

540

gtgaaagccc acggctcaac cgtggagggt cattggaaac tgggggactt gagtgcagaa

600

gaggaaagtg gaattccacg tgtagcggtg aaatgcgtag agatgtggag gaacaccagt

660

ggcgaaggcg actttctggt ctgtaactga cgctgaggcg cgaaagcgtg gggagcaaac

720

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag tgctaagtgt tagagggttt

780

ccgcccttta gtgctgcagc aaacgcatta agcactccgc ctggggagta cggccgcaag

840

gctgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc

900

gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatctcct gacaacccta gagatagggc

960

gttccccttc gggggacagg atgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga

1020

gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgatc ttagttgcca gcattaggtt

1080

gggcactcta aggtgactgc cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaaatca

1140

tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tgctacaatg gatggtacaa agggctgcaa

1200

gaccgcgagg ttaagcgaat cccataaaac cattctcagt tcggattgca ggctgcaact

1260

cgcctgcatg aagctggaat cgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg tgaatacgtt

1320

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt tgtaacaccc gaagtcggtg

1380

gggtaacctt tggagccagc cgcctaaggt ggacagagat gggatcctt

1429

<210> 237

<211> 1218

<212> DNA

<213> Bacillus sp. GB9

<220>

<221> modified_base

<222> (1162)..(1162)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 237

ggggggagag aagggactgc tcctgagtca gcggcggacg ggtgagtaac acgtgggcaa

60

cctgcctgta agactgggat aactccggga aaccggggct aataccggat aattctttcc

120

ctcacatgag ggaaagctga aagatggttt cggctatcac ttacagatgg gcccgcggcg

180

cattagctag ttggtgaggt aacggctcac caaggcaacg atgcgtagcc gacctgagag

240

ggtgatcggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg

300

gaatcttccg caatggacga aagtctgacg gagcaacgcc gcgtgagtga tgaaggtttt

360

cggatcgtaa aactctgttg ttagggaaga acaagtaccg gagtaactgc cggtaccttg

420

acggtaccta accagaaagc cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg

480

tggcaagcgt tgtccggaat tattgggcgt aaagcgcgcg caggcggttc cttaagtctg

540

atgtgaaagc ccccggctca accggggagg gtcattggaa actggggaac ttgagtgcag

600

aagagaagag tggaattcca cgtgtagcgg tgaaatgcgt agagatgtgg aggaacacca

660

gtggcgaagg cgactctttg gtctgtaact gacgctgagg cgcgaaagcg tggggagcaa

720

acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaagt gttagagggt

780

ttccgccctt tagtgctgca gcaaacgcat taagcactcc gcctggggag tacggccgca

840

aggctgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

900

tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatctc ctgacaaccc tagagatagg

960

gcgttcccct tcgggggaca ggatgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1020

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttga tcttagttgc cagcattcag

1080

ttgggcactc taaggtgact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1140

catcatgccc cttatgacct gngctacaca cgtgctacaa tggatggtac aaagggctgc

1200

gagaccgcga ggtaagcg

1218

<210> 238

<211> 1413

<212> DNA

<213> Bacillus sp. HU19.1

<400> 238

agctcttcgg agatcagcgg cggacgggtg agtaacacgt gggcaacctg cctgtaagac

60

tgggataact ccgggaaacc ggagctaata ccggatacta tgtcaaaccg catggtttga

120

cattcaaaga cggtttcggc tgtcacttac agatgggccc gcggcgcatt agctagttgg

180

tgaggtaatg gctcaccaag gcgacgatgc gtagccgacc tgagagggtg atcggccaca

240

ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtagggaat cttccgcaat

300

ggacgaaagt ctgacggagc aacgccgcgt gagtgatgaa ggttttcgga tcgtaaaact

360

ctgttgtcag ggaagaacaa gtgccggagt aactgccggc gccttgacgg tacctgacca

420

gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttgtc

480

cggaattatt gggcgtaaag cgcgcgcagg cggtttctta agtctgatgt gaaagccccc

540

ggctcaaccg gggagggtca ttggaaactg ggaaacttga gtgcagaaga ggagagtgga

600

attccacgtg tagcggtgaa atgcgtagag atgtggagga acaccagtgg cgaaggcgac

660

tctctggtct gtaactgacg ctgaggcgcg aaagcgtggg gagcgaacag gattagatac

720

cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaagtgtta gagggtttcc gccctttagt

780

gctgcagcta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg gtcgcaagac tgaaactcaa

840

aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga

900

agaaccttac caggtcttga catcctttgc cacttctaga gatagaaggt tccccttcgg

960

gggacaaagt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1020

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgatctt agttgccagc attcagttgg gcactctaag

1080

gtgactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta

1140

tgacctgggc tacacacgtg ctacaatgga tggtacaaag ggctgcgaga ccgcgaggtt

1200

tagccaatcc cataaaacca ttctcagttc ggattgcagg ctgcaactcg cctgcatgaa

1260

gctggaatcg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1320

acacaccgcc cgtcacacca cgagagtttg caacacccga agtcggtggg gtaaccgcaa

1380

ggagccagcc gcctaaggtg gggtagattg atc

1413

<210> 239

<211> 1428

<212> DNA

<213> Bacillus sp. HU29

<400> 239

acggaaggga gcttgctcat acgtcagcgg cggacgggtg agtaacacgt gggcaacctg

60

cctgtaagac tgggataact ccgggaaacc ggggctaata ccggataatg cttttcctca

120

catgagggaa agctgaaaga tggcttctcg ctatcactta cagatgggcc cgcggcgcat

180

tagctagttg gtgaggtaac ggctcaccaa ggcaacgatg cgtagccgac ctgagagggt

240

gatcggccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtagggaa

300

tcttccgcaa tggacgaaag tctgacggag caacgccgcg tgagtgatga aggttttcgg

360

atcgtaaaac tctgttgtta gggaagaaca agtaccggag taactgccgg taccttgacg

420

gtacctaacc agaaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg

480

caagcgttgt ccggaattat tgggcgtaaa gcgcgcgcag gcggttcctt aagtctgatg

540

tgaaagcccc cggctcaacc ggggagggtc attggaaact ggggaacttg agtgcagaag

600

agaagagtgg aattccacgt gtagcggtga aatgcgtaga gatgtggagg aacaccagtg

660

gcgaaggcga ctctttggtc tgtaactgac gctgaggcgc gaaagcgtgg ggagcaaaca

720

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt gctaagtgtt agagggtttc

780

cgccctttag tgctgcagca aacgcattaa gcactccgcc tggggagtac ggccgcaagg

840

ctgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

900

aagcaacgcg aagaacctta ccaggtcttg acatctcctg acaaccctag agatagggcg

960

ttccccttcg ggggacagga tgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1020

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgatct tagttgccag cattcagttg

1080

ggcactctaa ggtgactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat

1140

catgcccctt atgacctggg ctacacacgt gctacaatgg atggtacaaa gggctgcaag

1200

accgcgaggt taagcgaatc ccataaaacc attctcagtt cggattgcag gctgcaactc

1260

gcctgcatga agccggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc

1320

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acgagagttt gtaacacccg aagtcggtgg

1380

ggtaaccttt tggagccagc cgcctaaggt gggacagatg attgggat

1428

<210> 240

<211> 1418

<212> DNA

<213> Bacillus sp. HU33.1

<400> 240

gatcgctttg gagtcagcgg cggacgggtg agtaacacgt gggcaacctg cctgtaagac

60

tgggataact ccgggaaacc ggagctaata ccggatacta tgtcaaaccg catggtttga

120

cattcaaaga cggtttcggc tgtcacttac agatgggccc gcggcgcatt agctagttgg

180

tgaggtaatg gctcaccaag gcgacgatgc gtagccgacc tgagagggtg atcggccaca

240

ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtagggaat cttccgcaat

300

ggacgaaagt ctgacggagc aacgccgcgt gagtgatgaa ggttttcgga tcgtaaaact

360

ctgttgtcag ggaagaacaa gtgccggagt aactgccggc gccttgacgg tacctgacca

420

gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttgtc

480

cggaattatt gggcgtaaag cgcgcgcagg cggtttctta agtctgatgt gaaagccccc

540

ggctcaaccg gggagggtca ttggaaactg ggaaacttga gtgcagaaga ggagagtgga

600

attccacgtg tagcggtgaa atgcgtagag atgtggagga acaccagtgg cgaaggcgac

660

tctctggtct gtaactgacg ctgaggcgcg aaagcgtggg gagcgaacag gattagatac

720

cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaagtgtta gagggtttcc gccctttagt

780

gctgcagcta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg gtcgcaagac tgaaactcaa

840

aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga

900

agaaccttac caggtcttga catcctttgc cacttctaga gatagaaggt tccccttcgg

960

gggacaaagt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1020

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgatctt agttgccagc attcagttgg gcactctaag

1080

gtgactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta

1140

tgacctgggc tacacacgtg ctacaatgga tggtacaaag ggctgcgaga ccgcgaggtt

1200

tagccaatcc cataaaacca ttctcagttc ggattgcagg ctgcaactcg cctgcatgaa

1260

gctggaatcg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1320

acacaccgcc cgtcacacca cgagagtttg caacacccga agtcggtggg gtaaccgcaa

1380

ggagccagcc gcctaaggtg gggtagatga ttgggatg

1418

<210> 241

<211> 1475

<212> DNA

<213> Bacillus sp. JC6

<400> 241

tagagttttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtcga

60

gcggatctga gggagcttgc tcccaaagat tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggc

120

aacctgccta taagactggg ataacttcgg gaaaccggag ctaataccgg ataatgcttt

180

tggacacatg tccggaagct gaaagatggc ttctcgctat cacttataga tgggcccgcg

240

gcgcattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggca acgatgcgta gccgacctga

300

gagggtgatc ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

agggaatctt ccgcaatgga cgaaagtctg acggagcaac gccgcgtgag tgatgaaggt

420

tttcggatcg taaaactctg ttgttaggga agaacaagta ccggagtaac tgccggtacc

480

ttgacggtac ctaaccagaa agccacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

aggtggcaag cgttgtccgg aattattggg cgtaaagcgc gcgcaggcgg ttctttaagt

600

ctgatgtgaa agcccccggc tcaaccgggg agggtcattg gaaactgggg aacttgagtg

660

cagaagagaa gagcggaatt ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaaca

720

ccagtggcga aggcggctct ttggtctgta actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta agtgttagag

840

ggtttccgcc ctttagtgct gcagcaaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacggcc

900

gcaaggctga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt

960

aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat ccttatgcca tccctagaga

1020

tagggctttc ccttcgggga cataagtgac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt

1080

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgatcttagt tgccagcatt

1140

gagttgggca ctctaaggtg actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca

1200

aatcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtgcta caatggatgg tacaaagggc

1260

agcgaagccg cgaggtgaag cgaatcccat aaaaccattc tcagttcgga ttgtaggctg

1320

caactcgcct acatgaagcc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc cgcggtgaat

1380

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccgaagt

1440

cggtggggta accgtaagga gccagccgcc taagg

1475

<210> 242

<211> 1525

<212> DNA

<213> Bacillus sp. SRC_DSF10

<400> 242

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

gaactgatta gaagcttgct tctatgacgt tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggc

120

aacctgcctg taagactggg ataactccgg gaaaccggag ctaataccgg ataacatttt

180

ctcttgcata agagaaaatt gaaagatggt ttcggctatc acttacagat gggcccgcgg

240

tgcattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcaa cgatgcatag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc cgcaatggac gaaagtctga cggagcaacg ccgcgtgagt gatgaaggct

420

ttcgggtcgt aaaactctgt tgttagggaa gaacaagtac aagagtaact gcttgtacct

480

tgacggtacc taaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

ggtggcaagc gttatccgga attattgggc gtaaagcgcg cgcaggcggt ttcttaagtc

600

tgatgtgaaa gcccacggct caaccgtgga gggtcattgg aaactgggga acttgagtgc

660

agaagagaaa agcggaattc cacgtgtagc ggtgaaatgc gtagagatgt ggaggaacac

720

cagtggcgaa ggcggctttt tggtctgtaa ctgacgctga ggcgcgaaag cgtggggagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa gtgttagagg

840

gtttccgccc tttagtgctg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacggtcg

900

caagactgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ctctgacaac tctagagata

1020

gagcgttccc cttcggggga cagagtgaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc

1080

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gatcttagtt gccagcattt

1140

agttgggcac tctaaggtga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1200

atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca cacgtgctac aatggatggt acaaagggct

1260

gcaagaccgc gaggtcaagc caatcccata aaaccattct cagctcggat tgtaggctgc

1320

aactcgccta catgaagctg gaatcgctag taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaata

1380

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac acccgaagtc

1440

ggtggggtaa cctttatgga gccagccgcc taaggtggga cagatgattg gggtgaagtc

1500

gtaacaaggt aaccgtagcg gccgc

1525

<210> 243

<211> 934

<212> DNA

<213> Bacillus sp. SRC_DSF1

<220>

<221> modified_base

<222> (76)..(76)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (233)..(233)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 243

gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgtta tccggaatta ttgggcgtaa agcgcgcgca

60

ggcggtttct taagtntgat gtgaaagccc acggctcaac cgtggagggt cattggaaac

120

tggggaactt gagtgcagaa gagaaaagcg gaattccacg tgtagcggtg aaatgcgtag

180

agatgtggag gaacaccagt ggcgaaggcg gctttttggt ctgtaactga cgntgaggcg

240

cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag

300

tgctaagtgt tagagggttt ccgcccttta gtgctgcagc taacgcatta agcactccgc

360

ctggggagta cggtcgcaag actgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg

420

tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatcctct

480

gacaactcta gagatagagc gttccccttc gggggacaga gtgacaggtg gtgcatggtt

540

gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgatc

600

ttagttgcca gcattcagtt gggcactcta aggtgactgc cggtgacaaa ccggaggaag

660

gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tgctacaatg

720

gatggtacaa agggctgcaa gaccgcgagg tcaagccaat cccataaaac cattctcagt

780

tcggattgta ggctgcaact cgcctacatg aagctggaat cgctagtaat cgcggatcag

840

catgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt

900

tgtaacaccc gaagtcggtg gagtaaccgt aagg

934

<210> 244

<211> 1526

<212> DNA

<213> Bacillus sp. SRC_DSF2

<400> 244

agagtttgat catggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

gaactgatta gaagcttgct tctatgacgt tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggc

120

aacctgcctg taagactggg ataactccgg gaaaccggag ctaataccgg ataacatttt

180

ctcttgcata agagaaaatt gaaagatggt ttcggctatc acttacagat gggcccgcgg

240

tgcattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcaa cgatgcatag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc cgcaatggac gaaagtctga cggagcaacg ccgcgtgagt gatgaaggct

420

ttcgggtcgt aaaactctgt tgttagggaa gaacaagtac aagagtaact gcttgtacct

480

tgacggtacc taaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

ggtggcaagc gttatccgga attattgggc gtaaagcgcg cgcaggcggt ttcttaagtc

600

tgatgtgaaa gcccacggct caaccgtgga gggtcattgg aaactgggga acttgagtgc

660

agaagagaaa agcggaattc cacgtgtagc ggtgaaatgc gtagagatgt ggaggaacac

720

cagtggcgaa aggcggcttt ttggtctgta actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta agtgttagag

840

ggtttccgcc ctttagtgct gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacggtc

900

gcaagactga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt

960

aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cctctgacaa ctctagagat

1020

agagcattcc ccttcggggg acagagtgac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt

1080

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgatcttagt tgccagcatt

1140

tagttgggca ctctaaggtg actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca

1200

aatcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtgcta caatggatgg tacaaagggc

1260

tgcaagaccg cgaggtcaag ccaatcccat aaaaccattc tcagttcgga ttgtaggctg

1320

caactcgcct acatgaagct ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc cgcggtgaat

1380

acgttcccag gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccgaagt

1440

cggtggggta acctttatgg agccagccgc ctaaggtggg acagatgatt ggggtgaagt

1500

cgtaacaagg taaccgtagc ggccgc

1526

<210> 245

<211> 1525

<212> DNA

<213> Bacillus sp. SRC_DSF6

<400> 245

agagtttgat catggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

gaactgatta gaagcttgct tctatgacgt tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggc

120

aacctgcctg taagactggg ataactccgg gaaaccggag ctaataccgg ataacatttt

180

ctcttgcata agagaaaatt gaaagatggt ttcggctatc acttacagat gggcccgcgg

240

tgcattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcaa cgatgcatag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc cgcaatggac gaaagtctga cggagcaacg ccgcgtgagt gatgaaggct

420

ttcgggtcgt aaaactctgt tgttagggaa gaacaagtac aagagtaact gcttgtacct

480

tgacggtacc taaccagaaa gctacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

ggtggcaagc gttatccgga attattgggc gtaaagcgcg cgcaggcggt ttcttaagtc

600

tgatgtgaaa gcccacggct caaccgtgga gggtcattgg aaactgggga acttgagtgc

660

agaagagaaa agcggaattc cacgtgtagc ggtgaaatgc gtagagatgt ggaggaacac

720

cagtggcgaa ggcggctttt tggtctgtaa ctgacgctga ggcgcgaaag cgtggggagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa gtgttagagg

840

gtttccgccc tttagtgctg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacggtcg

900

caagactgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ctctgacaac tctagagata

1020

gagcattccc cttcggggga cagagtgaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc

1080

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gatcttagtt gccagcattt

1140

agttgggcac tctaaggtga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1200

atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca cacgtgctac aatggatggt acaaagggct

1260

gcaagaccgc gaggtcaagc caatcccata aaaccattct cagttcggat tgtaggctgc

1320

aactcgccta catgaagctg gaatcgctag taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaata

1380

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac acccgaagtc

1440

ggtggggtaa cctttatgga gccagccgcc taaggtggga cagatgattg gggtgaagtc

1500

gtaacaaggt aaccgtagcg gccgc

1525

<210> 246

<211> 1552

<212> DNA

<213> Bacillus sp. oral taxon F26

<400> 246

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

ggagatttaa aagcttgctt ttaaatctta gcggcggacg ggtgagtaac acgtgggcaa

120

cctgccctgt agactgggat aacttcggga aaccgaagct aataccggat aatcgaaggg

180

acctcatggt tctttagtaa aagttgggtt tacctaacac tacaggatgg gcccgcgtcg

240

cattagctag ttggtagggt aatggcctac caaggcgacg atgcgtagcc gacctgagag

300

ggtgatcggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg

360

gaatcttccg caatggacga aagtctgacg gagcaacgcc gcgtgagcga tgaaggcctt

420

cgggtcgtaa agctctgttg ttagggaaga acaagtactg ttcaaatagg gcagtacctt

480

gacggtacct aacgagaaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

540

gtggcaagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagcgcgc gcaggcggtt tcttaagtct

600

gatgtgaaag cccccggctc aaccggggag ggtcattgga aactgggaga cttgagtgca

660

gaagaggaga gtggaattcc atgtgtagcg gtgaaatgcg tagatatatg gaggaacacc

720

agtggcgaag gcgactctct ggtctgtaac tgacgctgag gcgcgaaagc gtggggagca

780

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctagg tgttaggggt

840

ttcgatgccc ttagtgccga agttaacaca ttaagcactc cgcctgggga gtacgaccgc

900

aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cagtggagca tgtggtttaa

960

ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcc ccatgacctc tctagagata

1020

gagatttccc ttcggggaca tgggtgacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg

1080

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg atcttagttg ccagcattaa

1140

gttgggcact ctaaggtgac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1200

tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca atggatggta caaagggctg

1260

cgagaccgcg aggttaagcc aatcccataa agccattctc agttcggatt gtaggctgca

1320

actcgcctac atgaagccgg aattgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gtttgtaaca cccgaagtcg

1440

gtggggtaac ctaagagttt gcggagcaat cttgcttcgt aagcgttgac ctaggagcca

1500

gccgcctaag gtgggacaga tgattggggt gaagtcgtaa caaggtagcc gt

1552

<210> 247

<211> 1478

<212> DNA

<213> Bacillus sp. oral taxon F28

<400> 247

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

gcgggaagct tgcggaatcc ttcgggagga agtgagcgga ccgagcggcg gacgggtgag

120

taacacgtgg gcaacctgcc cgtaagacgg ggataacccc gggaaaccgg ggctaatacc

180

ggataggtga cctttctgca tggaggggtc atgaaaggcg gcggaagccg tcgcttacgg

240

aggggcccgc ggcgcattag ctagttggtg agggaagggc tcaccaaggc gacgatgcgt

300

agccggcctg agagggtgaa cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg

360

gaggcagcag tagggaatct tccgcaatgg acggaagtct gacggagcaa cgccgcgtga

420

gtgaggaagg ccttcgggtc gtaaagctct gttgttcgtg aagaaggggt tggccaggaa

480

atgggccgac attgacggta gcgaaccaga aagccccggc taactacgtg ccagcagccg

540

cggtaacacg tagggggcaa gcgttgtccg gaatgattgg gcgtaaaggg cgcgcaggcg

600

gcctcttaag tctgatgtga aagcccacgg ctcaaccgtg gagggacatt ggaaactggg

660

gggcttgagt gcaggagagg ggagtggaat tccacgtgta gcggtgaaat gcgtagagat

720

gtggaggaac accagtggcg aaggcggctc tctggcctgt gactgacgct gaggcgcgaa

780

agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct

840

aggtgttagg ggggagcacc ccttagtgct gaagtcaaca cattaagcac tccgcctggg

900

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcagtggag

960

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat ccctctgatg

1020

ggttcagaga tggaccgttc cttcgggaca gaggagacag gtggtgcatg gttgtcgtca

1080

gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg acctttgttg

1140

ccagcattaa gttgggcact cagaggtgac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga

1200

tgacgtcaaa tcatcatgcc cctgatgacc tgggcgacac acgtgctaca atgggcggta

1260

cagagggcag cgaagccgcg aggcggagcg aatcccagaa agccgctctc agttcggatt

1320

gcaggctgca actcgcctgc atgaaggagg aattgctagt aatcgcggat cagcatgccg

1380

cggtgaatcc gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gtctgtaaca

1440

cccgaagtcg gtgaggcaac cggaaggagc cagccgcc

1478

<210> 248

<211> 1507

<212> DNA

<213> Bacillus sp. oral taxon F79

<220>

<221> modified_base

<222> (880)..(880)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 248

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

gcttgcatat tgaaagcttg ctttcaatat gcttgagcgg cggacgggtg agtaacacgt

120

gggcaacctg cctgtaagac tgggataact tcgggaaacc ggagctaata ccggataatg

180

cttttgaaca catgttcgaa agctgaaaga tggtttcggc tatcacttac agatgggccc

240

gcggcgcatt agctagttgg tgaggtaacg gctcaccaag gcgacgatgc gtagccgacc

300

tgagagggtg atcggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

360

agtagggaat cttccgcaat ggacgaaagt ctgacggagc aacgccgcgt gagtgatgaa

420

ggttttcgga tcgtaaaact ctgttgttag ggaagaacaa gtaccggagt aactgccggt

480

accttgacgg tacctaacca gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

540

cgtaggtggc aagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag cgcgcgcagg cggtctttta

600

agtctgatgt gaaagccccc ggctcaaccg gggagggtca ttggaaactg ggagacttga

660

gtgcagaaga gaagagcgga attccacgtg tagcggtgaa atgcgtagag atgtggagga

720

acaccagtgg cgaaggcggc tctttggtct gtaactgacg ctgaggcgcg aaagcgtggg

780

gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaagtgtta

840

gagggtttcc gccctttagt gctgcagcaa acgcattaan cactccgcct ggggagtacg

900

gccgcaaggc tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg

960

tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catcctctga caaccctaga

1020

gatagggcgt tccccttcgg gggacagagt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

1080

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgatctt agttgccagc

1140

atttagttgg gcactctaag gtgactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg

1200

tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatgga tggtacaaag

1260

ggcagcaaaa ccgcgaggtc gagccaatcc cataaaacca ttctcagttc ggattgtagg

1320

ctgcaactcg cctacatgaa gccggaatcg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg

1380

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagtttg taacacccga

1440

agtcggtggg gtaaccgtaa ggagccagcc gcctaaggtg ggacagatga ttggggtgaa

1500

gtcgtaa

1507

<210> 249

<211> 1405

<212> DNA

<213> Bacillus sp. tc09

<400> 249

tgcagtcgag cgaatggatt aagagcttgc tcttatgaag ttagcggcgg acgggtgagt

60

aacacgtggg taacctgccc ataagactgg gataactccg ggaaaccggg gctaataccg

120

gataacattg aaccgcatgg ttcgaaattg aaaggcggct tcggctgtca cttatggatg

180

gacccgcgtc gcattagcta gttggtgagg taacggctca ccaaggcaac gatgcgtagc

240

cgacctgaga ggggtcggcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc

300

agcagtaggg aatcttccgc aatggacgaa agtctgacgg agcaacgccg cgtgagtgat

360

gaaggctttc gggtcgtaaa cctgttgtta gggaagaaca agtgctagtt gaataagctg

420

gcaccttgac ggtacctaac cagaaagcca cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacgtaggtg gcaagcgtta tccggatttt gggcgtaaag cgcgcgcagg tggtttctta

540

agtctgatgt gaaagcccac ggctcaaccg tggagggtca ttggaaactg ggagacttga

600

gtgcagaaga ggaaagtgga attccatgtg tgcgggaaat gcgtagagat atggaggaac

660

accagtggcg aaggcgactt tctggtctgt aactgacact gaggcgcgaa agcgtgggga

720

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaacg atagtgctaa gtgttagagg

780

gtttccgccc tttagtgctg aagttaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacggccg

840

caagggtgaa acttaaagga attgacgggg gcccgcacca gcgtggagct gtggtttaat

900

ttgaagcaac gggaagaacc ttaccaggtt ttgacatcct ttgacaaccc tagagatagg

960

ggttttcctt tgggagcaga gtgacaggtg gtgcatggtt gttgtcagcc gtgttggaga

1020

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgatttt agttgccatc attaagttgg

1080

gcactttaag gtgactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggaagacg tcaaacatca

1140

tgcccttatg acctgggcta cccacgtggt acaatggacg gtacaaagag gtgcaagacc

1200

ccgaggggga gctaatttca taaaaccgtt ttcagtttgg attgtagggt gcaacttgcc

1260

tcatgaagcc gaatcgctag taatcgcgga tcagcctgcc gcggggaata cgttcccggg

1320

ccttgtacac cccccccgtc accccccgag agtttgtaac acccgaagtc ggtggggtaa

1380

cctttttgag ccagccgcta aggtg

1405

<210> 250

<211> 725

<212> DNA

<213> Bacillus sp. zh168

<220>

<221> modified_base

<222> (105)..(106)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (112)..(112)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (134)..(135)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 250

cttcggctac cacttacaga tggacccgcg gcgcattagc tagttggtga ggtaacggct

60

caccaaggca acgatgcgta gccgacctga gagggtgatc ggccnnactg gnactgagac

120

acggcccaga ctcnnacggg aggcagcagt agggaatctt ccgcaatgga cgaaagtctg

180

acggagcaac gccgcgtgag tgatgaaggt tttcggatcg taaagctctg ttgttaggga

240

agaacaagta ccgttcgaat agggcggtac cttgacggta cctaaccaga aagccacggc

300

taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg taggtggcaa gcgttgtccg gaattattgg

360

gcgtaaaggg ctcgcaggcg gtttcttaag tctgatgtga aagcccccgg ctcaaccggg

420

gagggtcatt ggaaactggg gaacttgagt gcagaagagg agagtggaat tccacgtgta

480

gcggtgaaat gcgtagagat gtggaggaac accagtggcg aaggcgactc tctggtctgt

540

aactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca

600

cgccgtaaac gatgagtgct aagtgttagg gggtttccgc cccttagtgc tgcagctaac

660

gcattaagca ctccgcctgg ggagtacggt cgcaagactg aaactcaaag gaattgacgg

720

gggcc

725

<210> 251

<211> 1430

<212> DNA

<213> Bacillus sphaericus

<400> 251

taatacatgc aagtcgagcg aacagagaag gagcttgctc ctttgacgtt agcggcggac

60

gggtgagtaa cacgtgggca acctacctta tagtttggga taactccggg aaaccggggc

120

taataccgaa taatctgttt cacctcatgg tgaaatattg aaagacggtt tcggctgtcg

180

ctataggatg ggcccgcggc gcattagcta gttggtgagg taacggctca ccaaggcgac

240

gatgcgtagc cgacctgaga gggtgatcgg ccacactggg actgagacac ggcccagact

300

cctacgggag gcagcagtag ggaatcttcc acaatgggcg aaagcctgat ggagcaacgc

360

cgcgtgagtg aagaaggatt tcggttcgta aaactctgtt gtaagggaag aacaagtaca

420

gtagtaactg gctgtacctt gacggtacct tattagaaag ccacggctaa ctacgtgcca

480

gcagccgcgg taatacgtag gtggcaagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagcgcgc

540

gcaggtggtt tcttaagtct gatgtgaaag cccacggctc aaccgtggag ggtcattgga

600

aactgggaga cttgagtgca gaagaggata gtggaattcc aagtgtagcg gtgaaatgcg

660

tagagatttg gaggaacacc agtggcgaag gcgactatct ggtctgtaac tgacactgag

720

gcgcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat

780

gagtgctaag tgttaggggg tttccgcccc ttagtgctgc agctaacgca ttaagcactc

840

cgcctgggga gtacggtcgc aagactgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag

900

cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcc

960

cgttgaccac tgtagagata tggtttcccc ttcgggggca acggtgacag gtggtgcatg

1020

gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg

1080

atcttagttg ccatcattta gttgggcact ctaaggtgac tgccggtgac aaaccggagg

1140

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1200

atggacgata caaacggttg ccaactcgcg agagggagct aatccgataa agtcgttctc

1260

agttcggatt gtaggctgca actcgcctac atgaagccgg aatcgctagt aatcgcggat

1320

cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga

1380

gtttgtaaca cccgaagtcg gtgaggtaac cttttggagc cagccgccga

1430

<210> 252

<211> 1497

<212> DNA

<213> Bacillus sporothermodurans

<400> 252

ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtcga gcgaacttga tgggagcttg ctccctgaga

60

gttagcggcg gacgggtgag taacacgtgg gtaacctgcc tgtaagactg ggataactcc

120

gggaaaccgg ggctaatacc ggataacttt tttcttcgca tgaaggagaa ttgaaagacg

180

gctttaagct accacttaca gatggacccg cggcgcatta gctagttggt gaggtaacgg

240

ctcaccaagg cgacgatgcg tagccgactt gagagggtga tcggccacac tgggactgag

300

acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttccgcaatg gacgaaagtc

360

tgacggagca acgccgcgtg agtgatgaag gttttcggat cgtaaaactc tgttgttagg

420

gaagaacaag tatcgttcga atagggcggt accttgacgg tacctaacca gaaagccacg

480

gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttgtc cggaattatt

540

gggcgtaaag cgcgcgcagg cggtttctta agtctgatgt gaaagcccac ggctcaaccg

600

tggagggtca ttggaaactg ggagacttga gtgcagaaga gaagagcgga attccacgtg

660

tagcggtgaa atgcgtagag atgtggagga acaccagtgg cgaaggcggc tctttggtct

720

gtaactgacg ctgaggcgcg aaagcgtggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc

780

cacgccgtaa acgatgagtg ctaagtgtta gagggtttcc gccctttagt gctgcagcta

840

acgcattaag cactccgcct ggggagtacg gccgcaaggc tgaaactcaa aggaattgac

900

gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac

960

caggtcttga catcctcttg acctccctag agatagggat ttcccttcgg ggacaagagt

1020

gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1080

cgagcgcaac ccttgacctt agttgccagc attcagttgg gcactctaag gtgactgccg

1140

gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc

1200

tacacacgtg ctacaatgga tggtacaaag ggttgctaga ccgcgaggtt acgccaatcc

1260

cataaaacca ttctcagttc ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa gccggaatcg

1320

ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1380

cgtcacacca cgagagtttg taacacccga agtcggtgag gtaacctttt ggagccagcc

1440

gccgaaggtg ggacagatga ttggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta tcggaag

1497

<210> 253

<211> 965

<212> DNA

<213> Bacillus subtilis

<220>

<221> modified_base

<222> (857)..(857)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (919)..(919)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (929)..(929)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (938)..(938)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 253

ggagcttgct ccctgatgtt agcggcggac gggtgagtaa cacgtgggta acctgcctgt

60

aagactggga taactccggg aaaccggggc taataccgga tggttgtttg aaccgcatgg

120

ttcaaacata aaaggtggct tcggctacca cttacagatg gacccgcggc gcattagcta

180

gttggtgagg taacggctca ccaaggcaac gatgcgtagc cgacctgaga gggtgatcgg

240

ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtag ggaatcttcc

300

gcaatggacg aaagtctgac ggagcaacgc cgcgtgagtg atgaaggttt tcggatcgta

360

aagctctgtt gttagggaag aacaagtacc gttcgaatag ggcggtacct tgacggtacc

420

taaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta ggtggcaagc

480

gttgtccgga attattgggc gtaaagggct cgcaggcggt ttcttaagtc tgatgtgaaa

540

gcccccggct caaccgggga gggtcattgg aaactgggga acttgagtgc agaagaggag

600

agtggaattc cacgtgtagc ggtgaaatgc gtagagatgt ggaggaacac cagtggcgaa

660

ggcgactctc tggtctgtaa ctgacgctga ggagcgaaag cgtggggagc gaacaggatt

720

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa gtgttagggg gtttccgccc

780

cttagtgctg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacggtcg caagactgaa

840

actcaaagga attgacnggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca

900

acgcgaagaa cccttaccng gtcttgacnt cctctganat cctagagata ggacgtcccc

960

ttcgg

965

<210> 254

<211> 1412

<212> DNA

<213> Bacillus thermoamylovorans

<400> 254

tcgagcgaac caataagaag cttgcttttt gttggttagc ggcggacggg tgagtaacac

60

gtgggtaacc tgcctgtaag accgggataa ctccgggaaa ccggtgctaa taccggatag

120

attatctttc cgcctggaga gataaggaaa gatggctttt gccatcactt acagatgggc

180

ccgcggcgca ttagctagtt ggtgaggtaa cggctcacca aggcgacgat gcgtagccga

240

cctgagaggg tgatcggcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

300

gcagtaggga atcttccgca atggacgaaa gtctgacgga gcaacgccgc gtgagcgaag

360

aaggtcttcg gatcgtaaag ctctgttgtt agggaagaac aagtatcgga ggaaatgccg

420

gtaccttgac ggtacctgac gagaaagcca cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacgtaggtg gcaagcgttg tccggattta ttgggcgtaa agcgcgcgca ggcggtcctt

540

taagtctgat gtgaaatctt gcggctcaac cgcaagcggt cattggaaac tgggggactt

600

gagtgcagaa gaggaaagcg gaattccacg tgtagcggtg aaatgcgtag agatgtggag

660

gaacaccagt ggcgaaggcg gctttctggt ctgtaactga cgctgaggcg cgaaagcgtg

720

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag tgctaagtgt

780

tggagggttt ccgcccttca gtgctgcagc taacgcatta agcactccgc ctggggagta

840

cggtcgcaag actgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt

900

ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatctcct gaccgccctg

960

gagacagggt cttcccttcg gggacaggat gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

1020

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttggttct agttgccagc

1080

attcagttgg gcactctaga gcgactgccg gcgacaagtc ggaggaaggt ggggatgacg

1140

tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatgga tggtacaaag

1200

ggcagcgaag cggcgacgca tgagcgaatc ccagaaaacc attctcagtt cggattgcag

1260

gctgcaactc gcctgcatga agccggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt

1320

gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acgagagttt gtaacacccg

1380

aagtcggtga ggtaaccgta aggagccagc cg

1412

<210> 255

<211> 1554

<212> DNA

<213> Bacillus thuringiensis

<400> 255

ttattggaga gtttgatcct ggctcaggat gaacgctggc ggcgtgccta atacatgcaa

60

gtcgagcgaa tggattaaga gcttgctctt atgaagttag cggcggacgg gtgagtaaca

120

cgtgggtaac ctgcctataa gactgggata actccgggaa accggggcta ataccggata

180

acattttgaa ccgcatggtt cgaaattgaa aggcggcttc ggctgtcact tatggatgga

240

cccgcgtcgc attagctagt tggtgaggta acggctcacc aaggcaacga tgcgtagccg

300

acctgagagg gtgatcggcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc

360

agcagtaggg aatcttccgc aatggacgaa agtctgacgg agcaacgccg cgtgagtgat

420

gaaggctttc gggtcgtaaa actctgttgt tagggaagaa caagtgctag ttgaataagc

480

tggcaccttg acggtaccta accagaaagc cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt

540

aatacgtagg tggcaagcgt tatccggaat tattgggcgt aaagcgcgcg caggtggttt

600

cttaagtctg atgtgaaagc ccacggctca accgtggagg gtcattggaa actgggagac

660

ttgagtgcag aagaggaaag tggaattcca tgtgtagcgg tgaaatgcgt agagatatgg

720

aggaacacca gtggcgaagg cgactttctg gtctgtaact gacactgagg cgcgaaagcg

780

tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaagt

840

gttagagggt ttccgccctt tagtgctgaa gttaacgcat taagcactcc gcctggggag

900

tacggccgca aggctgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat

960

gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatcct ctgacaaccc

1020

tagagatagg gcttctcctt cgggagcaga gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

1080

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgatc ttagttgcca

1140

tcatttagtt gggcactcta aggtgactgc cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga

1200

cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tgctacaatg gacggtacaa

1260

agagctgcaa gaccgcgagg tggagctaat ctcataaaac cgttctcagt tcggattgta

1320

ggctgcaact cgcctacatg aagctggaat cgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg

1380

tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt tgtaacaccc

1440

gaagtcggtg gggtaacctt tttggagcca gccgcctaag gtgggacaga tgattggggt

1500

gaagtcgtaa caaggtagcc gtatcggaag gtgcggctgg atcacctcct ttct

1554

<210> 256

<211> 1545

<212> DNA

<213> Bacillus weihenstephanensis

<400> 256

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

ggatggatta agagcttgct cttatgaagt tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggt

120

aacctaccca taagactggg ataactccgg gaaaccgggg ctaataccgg ataatatttt

180

gaactgcata gttcgaaatt gaaaggcggc ttcggctgtc acttatggat ggacccgcgt

240

cgcattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgatgcgtag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

ggggatcttc cgcaatggac gaaagtctga cggagcaacg ccgcgtgagt gatgaaggct

420

ttcgggtcgt aaaactctgt tgttagggaa gaacaagtgc tagttgaata agctggcacc

480

ttgacggtac ctaaccagaa agccacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

aggtggcaag cgttatccgg aattattggg cgtaaagcgc gcgcaggtgg tttcttaagt

600

ctgatgtgaa agcccacggc tcaaccgtgg agggtcattg gaaactggga gacttgagtg

660

cagaagagga aagtggaatt ccatgtgtag cggtgaaatg cgtagagata tggaggaaca

720

ccagtggcga aggcgacttt ctggtctgta actgacactg aggcgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta agtgttagag

840

ggtttccgcc ctttagtgct gaagttaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacggcc

900

gcaaggctga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt

960

aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cctctgaaaa ctctagagat

1020

agagcttctc cttcgggagc agagtgacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg

1080

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg atcttagttg ccatcattaa

1140

gttgggcact ctaaggtgac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1200

tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca atggacggta caaagagctg

1260

caagaccgcg aggtggagct aatctcataa aaccgttctc agttcggatt gtaggctgca

1320

actcgcctac atgaagctgg aatcgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gtttgtaaca cccgaagtcg

1440

gtggggtaac ctttatggag ccagccgcct aaggtgggac agatgattgg ggtgaagtcg

1500

taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcacct ccttt

1545

<210> 257

<211> 1388

<212> DNA

<213> Bacteroidales bacterium ph8

<400> 257

gcagcatgaa agtagcaata cttttgatgg cgaccggcgg acgggtgcgt aacgcgtatg

60

caacctaccc tttacagggg gataacactg agaaatcggt actaataccc cataatattc

120

cgggaggcat ctttcggagt tgaaagcttt ggtggtaaag gatgggcatg cgttgtatta

180

gctagttggt aaggtaacgg cttaccaagg cgacgataca tagggggact gagaggttaa

240

ccccccacat tggtactgag acacggacca aactcctacg ggaggcagca gtgaggaata

300

ttggtcaatg gacggaagtc tgaaccagcc atgccgcgtg caggaagacg gctctatgag

360

ttgtaaactg cttttgtacg agggtaaacg cagatacgtg tatctgcctg aaagtatcgt

420

acgaataagg atcggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg atccaagcgt

480

tatccggatt tattgggttt aaagggtgcg taggcggttt agtaagtcag cggtgaaatt

540

ttggtgctta acaccaaacg tgccgttgat actgctgggc tagagagtag ttgcggtagg

600

cggaatgtat ggtgtagcgg tgaaatgctt agagatcata cagaacaccg attgcgaagg

660

cagcttacca aactatatct gacgttgagg cacgaaagcg tggggagcaa acaggattag

720

ataccctggt agtccacgca gtaaacgatg atagctcgtt gtcggcgata cacagtcggt

780

gactaagaga aatcgataag ctatccacct ggggagtacg ttcgcaagaa tgaaactcaa

840

aggaattgac gggggcccgc acaagcggag gaacatgtgg tttaattcga tgatacgcga

900

ggaaccttac ccgggcttga aagttactga cgattctgga aacaggattt cccttcgggg

960

caggaaacta ggtgctgcat ggttgtcgtc agctcgtgcc gtgaggtgtc gggttaagtc

1020

ccataacgag cgcaacccct actgatagtt gccatcagag cgtttgagcg atcaaacaag

1080

ctgggcactc tatcgggact gccggtgtaa gccgagagga aggtggggat gacgtcaaat

1140

cagcacggcc cttacgtccg gggcgacaca cgtgttacaa tggtaggtac agagggcagc

1200

cacccagtga tggggagcga atctcgaaag cctatctcag ttcggattgg aggctgaaac

1260

tcgcctccat gaagttggat tcgctagtaa tcgcgcatca gccatggcgc ggtgaatacg

1320

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcaa gccatgggag ttgggggtgc ctgaagttcg

1380

tgaccgag

1388

<210> 258

<211> 1285

<212> DNA

<213> Bacteroidales genomosp. P1

<400> 258

atgaacgcta gcggcaggct taacacatgc aagtcgaggg accggcgtaa gggtgcgtaa

60

cgcgtgagca acctgcccgt atcaggggga taaccgatgg aaacgtcgcc taatacccca

120

taataaaagt cagatacgga tgggctcgcg tgacattagc tagttggtgt ggtaacggca

180

caccaaggca acgatgtcta ggggttctga gaggaagacc ccccacactg gaactgagac

240

acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt ggtcaatggg cggaagcctg

300

aaccagccat gccgcgtgaa ggaataaggt ctatggatcg taaacttctt ttgagcggga

360

gcatgagagt accgttcgaa taagcatcgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac

420

ggaggatgca agcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg gtgcgtaggc cgttgtgcaa

480

gtcagaggtg aaatcgcggg gctcaacccc gtgtctgcct ttgatactgt atgacttgaa

540

tgttgttgcc gtgtgaggaa tgagtagtgt agcggtgaaa tgcatagata ttactcagaa

600

caccgattgc gaaggcatct cacgaaacaa attgacgctg aggcacgaaa gcgtgggtat

660

ccaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg atgataacta accgtcggcg

720

agtcggtggc caagcgaaag cgataagtta tccacctggg gagtacgacc gcaaggttga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa catgtggttt aattcgatga

840

tacgcgagga accttacccg ggctcgaacg gtcgaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttggctc aagtgccata acgagcgcaa cccttgtcat tagttgccat

960

cggccgggct ctctaatgag actgccaccg caaggtggag gaaggagtgg atgacgtcaa

1020

atcagcacgg cccttacgtc cggggcgaca cacgtgttac aatggtgacc agagggtagc

1080

cagccggcga cggcgcgcaa atctcagtca tctcagttcg gatggagtct gcaacccgac

1140

tccagaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg gtgcggtgaa tacgttcccg

1200

ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg aaagccgagg gcgcctgaag tccggccggc

1260

ctaaggcgaa cttggtaatt ggggc

1285

<210> 259

<211> 1289

<212> DNA

<213> Bacteroidales genomosp. P2 oral clone MB1_G13

<400> 259

gatgaacgct agcggcaggc ttaacacatg caagtcgagg gaccggcgaa agggtgcgta

60

acgcgtgagt aacatacccg ttacagaggg atagtcgatg gaaacgtcgt ataatacctc

120

atagttaaat gaggtaacgg agtggctcgc gtcccattag ttagttggcg tggtaacggc

180

acaccaagac aacgatgggt aggggttctg agaggaaggt cccccacact ggaactgaga

240

cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat tggtcaatgg gcggaagcct

300

gaaccagcca tgccgcgtgc aggaatagat cctatgggac ataaactgct tttgatactg

360

agcatgagag taagtatcga ataagcatcg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgggggatgc aagcgttatc cggaattatt gggtttaaag ggtgcgtagg ctgtgcggtg

480

cgtctgtggt taaaggcctc tgcttaacgg agcgtatgcc atagaaacgg ccgtgcttga

540

gagtgattgc cgtgggagga atgtgtggtg tagcggtgaa atgcatagat atcacacaga

600

acaccgattg cgaaggcatc tcacgaagtc atctgacgct gaagcacgaa agcgtgggaa

660

tcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgctgtaaac gatgataact aaccgccggc

720

gatcggtggc taagcgaaag cgataagtta tccacctggg gagtacgacc gcaaggttga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa catgtggttt aattcgatga

840

tacgcgagga accttacccg ggctcgaacg gtcgaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc

900

gtgccgtgag gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa cccttgcctg ctgttaccaa

960

cgtacgggga ctcagcaggg actgccaccg taaggtggag gaaggggggg atgacgtcaa

1020

atcagcacgg cccttacgtc cggggcgaca cacgtgtcac aatggcggtc agagagttgc

1080

ttgacagtga tgtttggcta atctataccg tctcagttcg gatggagtct gcaacccgac

1140

tccagaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg gcgcggtgaa tacgttcccg

1200

ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg gaagtcattg gcgcctgaag cttgtccgag

1260

cgagcgaagg cgaaaatggt aactggggc

1289

<210> 260

<211> 1282

<212> DNA

<213> Bacteroidales genomosp. P3 oral clone MB1_G34

<220>

<221> modified_base

<222> (908)..(908)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 260

gatgaacgct tgcggcaggc ataatacatg caagtcgaac gagtggcgga tgggtgagta

60

acgcgtatgc aacctacctc acaccgagaa caagcgactg aaaagttgaa tatctcgtga

120

tgatagttgg tgtgagatgg gcatgcgtat cattagctag ttggcggggt aatagcccac

180

caaggcgacg atgattcggg ggcctgagag ggtggtcccc cacactggga ctgagacacg

240

gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatatcggt caatgggcgg aagcctgaac

300

cagccatgcc gcgtgatgga tgacggcctt agggttgtaa acatcttttc tactagagga

360

cgactgtata gtaggaataa ggatcggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga

420

ggattcgagc gttatccgga tttactgggt ttgaagggtg cgcaggcggg ctcttaagtc

480

agcggtgaaa tgtccgggct taccctgggc cttgccgttg atactgggag tcttggataa

540

gataaggacg gcggaatgcg tagtgtagcg gtgaaatgct tagatattac gtagaagacc

600

gattgcgaag gcagctgtct gggtctatcg acgctcaagc acgaaagcgt gggtagcgaa

660

caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga tcactcgctc ttggcgtgtc

720

aggggctaag cgaaagcgtt aagtgatcca cctggggagt acgaccgcaa ggttgaaact

780

caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gaggaacatg tggtttaatt cgatgatacg

840

cgaggaacct tacctgggct agaacggtcg aggtgctgca tggttgtcgt cagctcgtgc

900

cgtgaggngt cgggttaagt cccataacga gcgcaaccct tatcgtcagt taccatcaat

960

tggggactct ggcgagactg ccggtgcaaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaaatca

1020

gcacggccct tacgtccagg gcgacacacg tgttacaatg ggtagcggag agttgccagc

1080

cagcgatggt gagctaatct atctatcctc agttcggacg gagtctgcaa ctcgactccg

1140

gaagctggat tcgctagtaa tcgcgcatca gccatggcgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1200

ttgtacacac cgcccgtcaa gccatgaaag tcatgggtgc ctgaagttcg tcgcaaccta

1260

gggcaaactt ggtgattagg gc

1282

<210> 261

<211> 1286

<212> DNA

<213> Bacteroidales genomosp. P4 oral clone MB2_G17

<400> 261

gatgaacgct tgcggcaggc ttaatacatg caagtcgaac gagtggcgga tgggtgagta

60

acgcgtatgc aacctacctc gtgtcgagaa aaagtcgact gaaaagtcga ttaaagtttc

120

gtagtgatag ttggcgcgag atgggcatgc gtatcattag ctagttggta gggtaacggc

180

ctaccaaggc gacgatgatt aggggttctg agagggaggt cccccacact gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatat tggtcaatgg gcggaagcct

300

gaaccagcca tgccgcgtga tggacgacgg ccttcgggtt gtaaacatct tttctgctag

360

aggatgactg tatagcagga ataaggatcg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata

420

cggaggatcc gagcgttatc cggatttact gggtttaaag ggtgcgcagg cgggctctta

480

agtcagtggt gaaaagccta ggcttaccct aggtcgtgcc attgatactg ggagtcttgg

540

ataagataag gaaggcggaa tgcgtagtgt agcggtgaaa tgcttagata ttacgtagaa

600

gaccgattgc gaaggcagct ttctgggtct atcgacgctc aagcacgaaa gcgtgggtag

660

cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgatcactc gctcttggcg

720

tgtcaggggc caagcgaaag cgttaagtga tccacctggg agtacggccg caaggctgaa

780

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggaggaac atgtggttta attcgatgat

840

acgcgaggaa ccttacctgg gctagaactg cagaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg

900

tgccgtgagg tgtcgggtta agtcccataa cgagcgcaac ccctatcgtc agttaccatc

960

agctggggac tctggcgaga ctgccggtgc aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1020

tcagcacggc ccttacgtcc agggcgacac acgtgttaca atgggtagca gcgagttgcc

1080

aaccagcaat ggtgcgctaa tctatactac cctcagttcg gacggagtct gcaactcgac

1140

tccggaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg gcgcggtgaa tacgttcccg

1200

ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg aaagtcgtgg gtgcctgaag ttcgtagcga

1260

cctaaggcaa actcaatgat tagggc

1286

<210> 262

<211> 1265

<212> DNA

<213> Bacteroidales genomosp. P5 oral clone MB2_P04

<400> 262

gcataacaca tgcaagtcga gggaccggcg gatgggtgag tagcgcgtac gtaacctacc

60

ttgtacagtg ggataggcat tggaaacggt gtataatacc acgtaatgga agttggtata

120

agatgggcgt gcgtaggatt agatagatgg tagggtaaag gcttaccatg tctatgatct

180

ttaggggttc tgagaggaag gtcccccaca ttgcaactga gatacggtgc aaactcttac

240

gggaggcagc agtgaggaat attggtcaat gggcggaagc ttgaaccagc cataccgcgt

300

gcaggaaggc ggcctatggg ttgtaaactg cttttatatt tgaataggaa attagggtac

360

gaataagtat cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggaggat acgagcgttg

420

tccggattta ttgggtttaa agggtgcgta ggcggttaat taggtctatg gtaaaatagt

480

tatgcttaac atgattatgc tgtggatacc ggttggctag aatataagtg gcgtaggcgg

540

aatgaagcga gtagaggtga cattcataga tatgctttgg aacaccgttc gcgtaggcgg

600

cttacgataa ttgacgctga ggcacgagag cgtgggtatc gaacagaatt agatactctg

660

gtagtccacg ctgtaaacga tgataactat atgtcggcgt gtcggtgtag gagtgaaagc

720

gataagttat ccacctgggg agtacgattg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg

780

gcccgcacaa gcggaggagc atgtggttta attcgatgat acgcgaggaa ccttacccgg

840

gcttgaacgt gcgaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg tgccgtgagg tgtcaggtta

900

agtcctataa cgagcgtaac ccttgttgat agttaccagc gcgtggggac tctattgata

960

ctgccggtgt aagccggagg aaggggggga tgacgtcaaa tcagcacggc ccttacgtcc

1020

ggggcgacac acgtgctaca atggttaaca gagggcagtt atacagagat gtaacacgaa

1080

tctttttagt catagtacgg atggagtctg caactcgact tcagaagatg gattcgctag

1140

taatcgcaga tcagccatgc tgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1200

caagccatgg gagttggtgg tacctaaaga gcgtagcgtt taagggtaat gctaataact

1260

ggggc

1265

<210> 263

<211> 1287

<212> DNA

<213> Bacteroidales genomosp. P6 oral clone MB3_C19

<400> 263

gatgaacgct tgcggcaggc ttaatacatg caagtcgaac gagtggcgga tgggtgagta

60

acgcgtatgc aaccttcctc acaccgagaa aaagtcgact gaaaagttga ataaagtctc

120

gtgatgatag ttggtgtgag atgggcatgc gtatcattag ctagttggta gggtaacggc

180

ttaccaaggc gacgatgatt agggggcctg agagggtggt cccccacact gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatat tggtcaatgg gcggaagcct

300

gaaccagcca tgccgcgtga tggatgacgg ccttagggtt gtaaacatct tttctgctag

360

aggacgactg tatagcagga ataaggatcg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata

420

cggaggattc gagcgttatc cggatttact gggtttaaag ggtgcgcagg cgggctctta

480

agtcagcggt gaaatgtctg ggcttaccct aggaattgcc gttgatactg ggagtcttgg

540

ataagataag gacggcggaa tgcgtagtgt agcggtgaaa tgcttagata ttacgtagaa

600

gaccaattgc gaaggcagct atctgggtct atcgacgctc aagcacgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgatcactc gctcttggcg

720

tgtcaggggc caagcgaaag cgttaagtga tccacctggg gagtacggcc gcaaggctga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa catgtggttt aattcgatga

840

tacgcgagga accttacctg ggctagaacg gtcgaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc

900

gtgccgtgag gtgtcgggtt aagtcccata acgagcgcaa cccttatcgt cagttaccat

960

caattgggga ctctggcgag actgccggtg caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1020

atcagcacgg cccttacgtc cagggcgaca cacgtgttac aatgggtagc agagagttgc

1080

cagccagcga tggtgagcta atctattcta ccctcagttc ggatggagtc tgcaactcga

1140

ctccagaagc tggattcgct agtaatcgcg catcagccat ggcgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcaagccat gaaagtcgtg ggtgcctgaa gttcgtagcg

1260

acctaaggca aactcgatga ttagggc

1287

<210> 264

<211> 1267

<212> DNA

<213> Bacteroidales genomosp. P7 oral clone MB3_P19

<400> 264

gcttaacaca tgcaagtcga gggaccggcg gatgggtgag taacgcgtat gcaatctacc

60

ttttacccgg ggatagccca tggaaacgtg gattaatacc cgatgcataa agtcggtaag

120

agatgagcat gcgttccatt aggaagttgg taaggtaacg gcttaccaat ccgatgatgg

180

atgggggttc tgagaggaag gtcccccaca ctggaattga gatacggtcc agactcctac

240

gggaggcagc agtgaggaat attggtcaat ggtcgtaaga ctgaaccagc caagtcgcgt

300

gaaggaaact gcctatgggt tttcaacttc ttttgtcagg gaagatgccg gtacctgacg

360

aataaggatc ggctaacgcc gtgccagcag ccgcggtaat acggaggatc cgagcgttat

420

ccggatttat tgggtttaaa gggtgcttag gcggcatatt aagttagtgg tcaaatggtc

480

cggctcaacc ggatttcgcc attaaaactg atgtgctaga gattaaacga ggtaggcgga

540

ataagttaag tagcggtgaa atgcatagat ataacttaga actccgatag cgaaggcagc

600

ttaccaggct atctgacgct gaatcacgag agcgtgggta tcgaacagga ttagataccc

660

tggtagtcca cgccgtaaac gatgctcacc ggctctatgc gtgtatgggg ctaatagaaa

720

taattaagtg agccacctgg ggagtacgtc ggcaacgatg aaactcaaag gaattgacgg

780

gggcccgcac aagcggagga acatgtggtt taattcgatg atacgcgagg aaccttaccc

840

gggtttaaat gtacaaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct cgtgccgtga ggtgtcgggt

900

taagtcccat aacgagcgca acccttatga ttagttgcta acggccgagc actctattca

960

cactgccacc gtaaggtgga ggaaggaggg gatgatgtca aatcagcacg gcccttatat

1020

ccggggctac acacgtgtta caatggtcgg cagagggttg catttacgag agtaacagct

1080

aatcccttcg gtcacagttc ggatggagtc tgcgactcga ctccagaagt tggattcgct

1140

agtaatcgca catcagccat ggtgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc

1200

gtcaagccat gggagctgag ggtgcctgaa gttcgtagcg acctagggca aacttggtaa

1260

ctggggc

1267

<210> 265

<211> 1292

<212> DNA

<213> Bacteroidales genomosp. P8 oral clone MB4_G15

<400> 265

gatgaacgct agcggcaggc ctaacacatg caagtcgagg gaccggcgaa cgggtgcgta

60

acgcgtgaac aacttgccgg acacaggggg ataatcgtcg gaaacgtcgt ctaatatccc

120

ataacgaaag gcggtgtctg ataggttcgc gtgacattag ctagtcggtg gggcaacggc

180

ccaccgaggc gacgatgtct aggggttctg agaggaaggc cccccacact gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tgagggatat tggacaatgg gcggaagcct

300

gatccagcca tgccgcgtga aggaataagg cctatgggtc gtaaacttct tttgacgcag

360

agcatgagag tatgcgtcga ataagcatcg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata

420

cggaggatgc gagcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggtgcgtagg ctgttggata

480

agtcagcggt gaaatcacca cgcttaacgt gttgtgtgcc gttgaaactg tctggcttga

540

atgcgctcgt cgtgagagga atgtgtggtg tagcggtgaa atgcatagat atcacacaga

600

acaccgattg cgaaggcatc tcacgagagc gattgacgct gatgcacgaa agcgcgggta

660

tcgaacagga ttagataccc tggtagtccg cgctgtaaac gatgatgact aactgttggt

720

tgatcagtgg tcaagcgaaa gcgttaagtc atccacctgg ggagtacggc cgcaaagctg

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggagga acatgtggtt taattcgatg

840

atacgcgagg aaccttaccc gggctcgaac ggtcgaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgccgtga ggtgtcggct taagtgccat aacgagcgca acccttgccg tcagttgcca

960

tcagctgggg actctgtcgg gactgccacc gcaaggtgga ggaagggggg gatgacgtca

1020

aatcagcacg gcccctacgt ccggggctac acacgtgtta caatggcgac cagaggggtg

1080

ccacccggtg acggggcgcc gatctccgtc gtctcagttc ggatggagtc tgcaacccga

1140

ctccagaagc tggattcgct agtaatcgca catcagccat ggtgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcaagccat gagagccagg ggcgcctgaa gcgcgtaccg

1260

gagcgttcaa gggcgaacca ggtgattggg gc

1292

<210> 266

<211> 1495

<212> DNA

<213> Bacteroides acidifaciens

<400> 266

tatcatggct caagatgaac gctagctaca ggcttaacac atgcaagtcg aggggcagca

60

tgaaagtttg cttgcaaact tttgatggcg accggcgcac gggtgagtaa cacgtatcca

120

acctgcctca tactcgggga tagcctttcg aaagaaagat taatacccga tgtcatagtc

180

ctaccgcatg atgggattat taaagaattt cggtatggga tggggatgcg ttccattagt

240

tagttggcgg ggtaacggcc caccaagaca acgatggata ggggttctga gaggaaggtc

300

ccccacattg gaactgagac acggtccaaa ctctacggga ggcagcagtg aggaatattg

360

gtcaatggac gagagtctga accagccaag tagcgtgaag gatgactgcc ctatgggttg

420

taaacttctt ttatatggga ataaaatgtt ccacgtgtgg gattttgtat gtaccatatg

480

aataaggatc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggaggatc cgagcgttat

540

ccggatttat tgggtttaaa gggagcgtag gtggattgtt aagtcagttg tgaaagtttg

600

cggctcaacc gtaaaattgc agttgaaact ggcagtcttg agtacagtag aggtgggcgg

660

aattcgtggt gtagcggtga aatgcttaga tatcacgaag aactccgatt gcgaaggcag

720

ctcactggac tgcaactgac actgaggctc gaaagtgtgg gtatcaaaca ggattagata

780

ccctggtagt ccacacagta aacgatgaat actcgctgtt tgcgatatac ggcaagcggc

840

caagcgaaag cattaagtat tccacctggg gagtacgccg gcaacggtga aactcaaagg

900

aattgacggg ggccgcacaa gcggaggaac atgtggttta attcgatgat acgcgaggaa

960

ccttacccgg gcttaaattg cacctgaata atgtggaaac atgttagccg taaggcaggt

1020

gtgaaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt aagtgccata

1080

acgagcgcaa cccttatctt cagttactaa caggtcatgc tgaggactct ggagagactg

1140

ccgtcgtaag atgtgaggaa ggtggggatg acgtcaaatc agcacggccc ttacgtccgg

1200

ggctacacac gtgttacaat gggaggtaca gaaggccgct acctggcgac aggatgccaa

1260

tccccaaaac ctctctcagt tcggatcgaa gtctgcaacc cgacttcgtg aagctggatt

1320

cgctagtaat cgcgcatcag ccatggcgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc

1380

gcccgtcaag ccatgaaagc cgggggtacc tgaagtacgt aaccgcaaga tcgtcctagg

1440

gtaaaactgg taattggggc taagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag gtgcg

1495

<210> 267

<211> 1456

<212> DNA

<213> Bacteroides barnesiae

<400> 267

tcaggatgaa cgctagctac aggcttaaca catgcaagtc gaggggcagc gggaagtcag

60

cttgctgact ttgccggcga ccggcgcacg ggtgagtaac acgtatccaa ccttccgcat

120

actctggaat agcctttcga aagaaagatt aatgcccgat ggtatcaaga gattgcatga

180

tatctcgaat aaagattcat cggtatgcga tggggatgcg ttccattagg cagttggcgg

240

ggtaacggcc caccaaaccg acgatggata ggggttctga gaggaaggtc ccccacattg

300

gaactgagac acggtccaaa ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt ggtcaatggg

360

cgagagcctg aaccagccaa gtagcgtgaa ggatgactgc cctacgggtt gtaaacttct

420

tttataaggg aataaagttc tctacgtgta gagttttgta tgtaccttat gaataagcat

480

cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggaggat gcgagcgtta tccggattta

540

ttgggtttaa agggagcgta gacggcggtt taagtcagct gtgaaatggt gcggctcaac

600

cgtagcactg cagttgaaac tggacggctt gagtgcagtt gaggcaggcg gaattcgtgg

660

tgtagcggtg aaatgcttag atatcacgaa gaaccccgat tgcgaaggca gcctgctaag

720

ctgcaactga cgttgaggct cgaaagtgtg ggtatcaaac aggattagat accctggtag

780

tccacacggt aaacgatgga tactcgctgt tggcgatata ctgtcagcgg ccaagtgaaa

840

acgttaagta tcccacctgg ggagtacgcc ggcaacggtg aaactcaaag gaattgacgg

900

gggcccgcac aagcggagga acatgtggtt taattcgatg atacgcgagg aaccttaccc

960

gggcttgaat tgcagacgaa tcatccggag acggatgagc cgcaaggcgt ctgtgaaggt

1020

gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgtcggc ttaagtgcca taacgagcgc

1080

aaccctttcc gccggttact aacaggtgat gctgaggact ccgacggtac tgccatcgta

1140

agatgtgagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcagcacggc ccttacgtcc ggggctacac

1200

acgtgttaca atggggggta cagaaggcag cgaccgggcg accggaagcg aatccctaaa

1260

gcccctctca gttcggactg gagtctgcaa cccgactcca cgaagctgga ttcgctagta

1320

atcgcgcatc agccacggcg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca

1380

agccatgaaa gccgggggta cctgaagtgc gtaaccgcga ggagcgccct agggtaaaac

1440

cggtaattgg ggctaa

1456

<210> 268

<211> 1383

<212> DNA

<213> Bacteroides caccae

<400> 268

tcgaggggca tcagtttggt ttgcttgcaa accaaagctg gcgaccggcg cacgggtgag

60

taacacgtat ccaacctgcc tcatactcgg ggatagcctt tcgaaagaaa gattaatatc

120

cgatagcata tatttcccgc atgggtttta tattaaagaa attcggtatg agatggggat

180

gcgttccatt agtttgttgg cggggtaacg gcccaccaag actacgatgg ataggggttc

240

tgagaggaag gtcccccaca ttggaactga gacacggtcc aaactcctac gggaggcagc

300

agtgaggaat attggtcaat ggacgcgagt ctgaaccagc caagtagcgt gaaggatgac

360

tgccctatgg gttgtaaact tcttttatat gggaataaag tggtccacgt gtggattttt

420

gtatgtacca tatgaataag gatcggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag

480

gatccgagcg ttatccggat ttattgggtt taaagggagc gtaggcggat tgttaagtca

540

gttgtgaaag tttgcggctc aaccgtaaaa ttgcagttga tactggcagt cttgagtgca

600

gtagaggtgg gcggaattcg tggtgtagcg gtgaaatgct tagatatcac gaagaactcc

660

gattgcgaag gcagctcact ggagtgtaac tgacgctgat gctcgaaagt gtgggtatca

720

aacaggatta gataccctgg tagtccacac agtaaacgat gaatactcgc tgtttgcgat

780

atacagtaag cggccaagcg aaagcattaa gtattccacc tggggagtac gccggcaacg

840

gtgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcgga ggaacatgtg gtttaattcg

900

atgatacgcg aggaacctta cccgggctta aattgcaaat gaattatggg gaaacccata

960

cgccgcaagg catttgtggg tgaaatgctt agttgtcacc aagtcgtgcc gtgaggtgtc

1020

ggcttaagtg ccataacgag cgcaaccctt atcttcagtt actaacaggt catgctgagg

1080

actctggaga gactgccgtc gtaagatgtg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcagcac

1140

ggcccttacg tccggggcta cacacgtgtt acaatggggg gtacagaagg ccgctacctg

1200

gtgacaggat gccaatccca aaaacctctc tcagttcgga tcgaagtctg caacccgact

1260

tcgtgaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg gcgcggtgaa tacgttcccg

1320

ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg aaagccgggg gtacctgaag tacgtaaccg

1380

caa

1383

<210> 269

<211> 1377

<212> DNA

<213> Bacteroides cellulosilyticus

<220>

<221> modified_base

<222> (24)..(24)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 269

tcgaggggca gcatgaccta gcantaggtt gatggcgacc ggcgcacggg tgagtaacac

60

gtatccaacc taccggttat tccgggatag cctttcgaaa gaaagattaa taccggatag

120

tataacgaga aggcatcttt ttgttattaa agaatttcga taaccgatgg ggatgcgttc

180

cattagtttg ttggcggggt aacggcccac caagacatcg atggataggg gttctgagag

240

gaaggtcccc cacattggaa ctgagacacg gtccaaactc ctacgggagg cagcagtgag

300

gaatattggt caatggacga gagtctgaac cagccaagta gcgtgaagga tgactgccct

360

atgggttgta aattctttta tatgggaata aagtgagcca cgtgtggctt tttgtatgta

420

ccatacgaat aaggatcggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaggatccga

480

gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgtaggcg gactattaag tcagctgtga

540

aagtttgcgg ctcaaccgta aaattgcagt tgatactggt cgtcttgagt gcagtagagg

600

taggcggaat tcgtggtgta gcggtgaaat gcttagatat cacgaagaac tccgattgcg

660

aaggcagctt actggactgt aactgacgct gatgctcgaa agtgtgggta tcaaacagga

720

ttagataccc tggtagtcca cacagtaaac gatgaatact cgctgtttgc gatatacagc

780

aagcggccaa gcgaaagcat taagtattcc acctggggag tacgccggca acggtgaaac

840

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat tcgatgatac

900

gcgaggaacc ttacccgggc ttaaattgca tctgaataat ttggaaacag attagccgta

960

aggcagatgt gaaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt gtcggcttaa

1020

gtgccataac gagcgcaacc cttatcttta gttactaaca ggtcatgctg aggactctag

1080

agagactgcc gtcgtaagat gtgaggaagg tggggatgac gtcaaatcag cacggccctt

1140

acgtccgggg ctacacacgt gttacaatgg ggggtacaga aggcagctac acagcgatgt

1200

gatgctaatc ccaaaagcct ctctcagttc ggattggagt ctgcaacccg actccatgaa

1260

gctggattcg ctagtaatcg cgcatcagcc acggcgcggt gaatacgttc ccgggccttg

1320

tacacaccgc ccgtcaagcc atgaaagccg ggggtacctg aagtccgtaa ccgcaag

1377

<210> 270

<211> 1531

<212> DNA

<213> Bacteroides clarus

<400> 270

ttacaatgaa gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc

60

aagtcgaggg gcagcggggt tgaagcttgc ttcaaccgcc ggcgaccggc gcacgggtga

120

gtaacacgta tccaacctgc cgataactcc gggatagcct ttcgaaagaa agattaatac

180

cggatggcat agttttcccg catggaataa ctattaaaga atttcggtta tcgatgggga

240

tgcgttccat taggcagttg gcggggtaac ggcccaccaa accgacgatg gataggggtt

300

ctgagaggaa ggtcccccac attggaactg agacacggtc caaactccta cgggaggcag

360

cagtgaggaa tattggtcaa tggacgagag tctgaaccag ccaagtagcg tgaaggatga

420

ctgccctatg ggttgtaaac ttcttttata cgggaataaa gttagccacg tgtggttttt

480

tgcatgtacc gtatgaataa ggatcggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga

540

ggatccgagc gttatccgga tttattgggt ttaaagggag cgtaggcggg gtattaagtc

600

agttgtgaaa gtttgcggct caaccgtaaa attgcagttg atactggtat ccttgagtgc

660

agcagaggtg ggcggaattc gtggtgtagc ggtgaaatgc ttagatatca cgaagaactc

720

cgattgcgaa ggcagctcac tggagtgtaa ctgacgctga tgctcgaaag tgtgggtatc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccaca cagtaaacga tgaatactcg ctgttggcga

840

tacaatgtca gcggccaagc gaaagcatta agtattccac ctggggagta cgccggcaac

900

ggtgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg aggaacatgt ggtttaattc

960

gatgatacgc gaggaacctt acccgggctt gaattgcaac tgacggaatt ggaaacagtt

1020

ctttcttcgg acagttgtga aggtgctgca tggttgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt

1080

cggcttaagt gccataacga gcgcaaccct tatcgatagt taccatcagg tcatgctggg

1140

gactctatcg agactgccgt cgtaagatgt gaggaaggtg gggatgacgt caaatcagca

1200

cggcccttac gtccggggct acacacgtgt tacaatgggg ggtacagaag gcagctacac

1260

ggcgacgtga tgctaatccc caaaacctct ctcagttcgg attggagtct gcaacccgac

1320

tccatgaagc tggattcgct agtaatcgcg catcagccac ggcgcggtga atacgttccc

1380

gggccttgta cacaccgccc gtcaagccat gaaagccggg ggtacctgaa gtacgtaacc

1440

gcaaggagcg tcctagggta aaactggtga ttggggctaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1500

ccggaaggtg cggctggaac acctcctttc t

1531

<210> 271

<211> 1489

<212> DNA

<213> Bacteroides coagulans

<400> 271

ggctcaggac gaacgctggc ggcgtgctta acacatgcaa gtcgaacgat gaagaaaaga

60

atcgaagctt cggcagaaat tcatttcgga ttagtggcag acgggtgagt aacgcgtgag

120

caacctacct cttacaaagg gatagcctcg ggaaaccggg attaatacca tataacattg

180

cgacgaagca tttcgatgca atcaaagcta cggcggtaag agatgggctc gcgtcccatt

240

aaccagatgg tgaggtaacg gctcaccata gtaacgatgg gtaaccggcc tgagagggtg

300

aacggtcaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

360

attgcacaat ggagggaact ctgatgcagc gacgccgcgt gagtgatgaa ggaattcgtt

420

tcgtaaaact ctgttctatg ggaagaaaag gactgtacca taggagaaag ctccggctaa

480

atacgtgcca gcagccgcgg taatacgtat ggagcgagcg ttgtccggaa ttattgggcg

540

taaagggtgc gcaggcggct ttacaagttg gatgtgaaat attgtggctc aaccacaaac

600

gtgcatccaa aactgcaaag cttgagttaa ggagaggtaa gtggaattcc tggtgtagcg

660

gtggaatgcg tagatatcag gaggaatacc ggtggcgaag gcgacttact ggacttaaac

720

tgacgctcag gcacgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc

780

cgtaaacgat gagtgctagg tgttgggggt caaacctcgg tgccgcaagc aaacgcaata

840

agcactccgc ctggggagta cgtgcacaag catgaaactc aaaggaattg acggggaccc

900

gcacaagcag cggagcatgt ggtttaattc gtggctacgc gaagaacctt accagggctt

960

gacatatata tgaggggaca tagagatatg aaaccagtaa gagcttgctc ttaacatata

1020

tacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1080

cgagcgcaac ccttgcaatt agttactaac agatcatgct gaggactcta attggactgc

1140

cgatgataaa tcggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgccctt tatgtcctgg

1200

gctacacacg tgctacaatg gtcggaacaa agaggagcga aatggtgaca tcaagcaaat

1260

ctcaaaaaac cgatcccagt tcggattgta ctctgcaact cgagtacatg aagtcggagt

1320

tgctagtaat cgcggatcag aatgccgcgg tgaatgcgtt cccgggtctt gtacacaccg

1380

cccgtcacac catggaagtt ggcaataccc gaagccgatg gcctaaccgc aaggaaggag

1440

tcgtcgaagg tagggtcaat gactggggtg aagtcgtaac aaggtaacc

1489

<210> 272

<211> 1532

<212> DNA

<213> Bacteroides coprocola

<400> 272

ttacaatgaa gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc

60

aagtcgaggg gcagcatgaa cttagcttgc taagtttgat ggcgaccggc gcacgggtga

120

gtaacacgta tccaaccttc cgtttactca gggatagcct ttcgaaagaa agattaatac

180

ctgatagtat ggtgagattg catgatggca ccattaaaga tttattggta aacgatgggg

240

atgcgttcca ttaggtagta ggcggggtaa cggcccacct agcctgcgat ggataggggt

300

tctgagagga aggtccccca cattggaact gagacacggt ccaaactcct acgggaggca

360

gcagtgagga atattggtca atgggcgaga gcctgaacca gccaagtagc gtgaaggatg

420

aaggtcctac ggattgtaaa cttcttttat acgggaataa agtttcctac gtgtaggatt

480

ttgtatgtac cgtatgaata agcatcggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

aggatgcgag cgttatccgg atttattggg tttaaaggga gcgcagacgg gagattaagt

600

cagttgtgaa agtttgcggc tcaaccgtaa aattgcagtt gatactggtt tccttgagtg

660

cagttgaggc aggcggaatt cgtggtgtag cggtgaaatg cttagatatc acgaagaacc

720

ccgattgcga aggcagcttg ctaaactgta actgacgttc atgctcgaaa gtgtgggtat

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac acggtaaacg atggatactc gctgttggcg

840

atatactgtc agcggccaag cgaaagcatt aagtatccca cctggggagt acgccggcaa

900

cggtgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gaggaacatg tggtttaatt

960

cgatgatacg cgaggaacct tacccgggct taaattgcag acgaattacg aggaaacttg

1020

taagccgcaa ggcgtctgtg aaggtgctgc atggttgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg

1080

tcggcttaag tgccataacg agcgcaaccc tcgtggtcag ttactaacag gttaagctga

1140

gggctctggc cagactgcca tcgtaagatg tgaggaaggt ggggatgacg tcaaatcagc

1200

acggccctta cgtccggggc tacacacgtg ttacaatggg aggtacagaa ggccgctacc

1260

cggcaacggg atgccaatcc ccaaaacctc tctcagttcg gactggagtc tgcaacccga

1320

ctccacgaag ctggattcgc tagtaatcgc gcatcagcca cggcgcggtg aatacgttcc

1380

cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagcca tgaaagccgg gggtacctga agtgcgtaac

1440

cgcaaggagc gccctagggt aaaaccggta attggggcta agtcgtaaca aggtagccgt

1500

accggaaggt gcggctggaa cacctccttt ct

1532

<210> 273

<211> 1535

<212> DNA

<213> Bacteroides coprophilus

<400> 273

ttacaatgaa gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc

60

aagtcgaggg gcagcgggat tgaagcttgc ttcaattgcc ggcgaccggc gcacgggtga

120

gtaacgcgta tccaaccttc cgcttactcg gggatagcct ttcgaaagaa agattaatac

180

ccgatggtat cttaagcacg catgagatta agattaaaga tttatcggta agcgatgggg

240

atgcgttcca ttaggcagtt ggcggggtaa cggcccacca aacctacgat ggataggggt

300

tctgagagga aggtccccca cattggaact gagacacggt ccaaactcct acgggaggca

360

gcagtgagga atattggtca atgggcgaga gcctgaacca gccaagtagc gtgaaggatg

420

acggccctac gggttgtaaa cttcttttgt gcgggaataa aggaacctac gtgtaggttt

480

ttgcatgtac cgtaacgaat aagcatcggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

gaggatgcga gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgtagacg ggtttttaag

600

tcagctgtga aagtttgggg ctcaacctta aaattgcagt tgaaactgga gaccttgagt

660

acggttgagg caggcggaat tcgtggtgta gcggtgaaat gcttagatat cacgaagaac

720

cccgattgcg aaggcagcct gctaagccgc cactgacgtt gaggctcgaa agtgcgggta

780

tcaaacagga ttagataccc tggtagtccg cacggtaaac gatggatact cgctgttggc

840

gatagacagt cagcggccaa gcgaaagcgt taagtatccc acctggggag tacgccggca

900

acggtgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat

960

tcgatgatac gcgaggaacc ttacccgggc ttgaactgca gtggaattat ccggaaacgg

1020

ataagcgagc aatcgccgct gtggaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag

1080

gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa cccttgctgc cagttactaa caggtcatgc

1140

tgaggactct ggcaggactg ccatcgtaag atgcgaggaa ggtggggatg acgtcaaatc

1200

agcacggccc ttacgtccgg ggctacacac gtgttacaat ggggagtaca gagggcagct

1260

accgggcgac cggatgcgaa tcccgaaagc tcctctcagt tcggactgga gtctgcaacc

1320

cgactccacg aagctggatt cgctagtaat cgcgcatcag ccacggcgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaag ccatgaaagc cgggggtacc tgaagtacgt

1440

aaccgcgagg atcgtcctag ggtaaaaccg gtaattgggg ctaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtaccggaa ggtgcggctg gaacacctcc tttct

1535

<210> 274

<211> 1384

<212> DNA

<213> Bacteroides dorei

<400> 274

gaggggcagc atggtcttag cttgctaagg ctgatggcga ccggcgcacg ggtgagtaac

60

acgtatccaa cctgccgtct actcttggcc agccttctga aaggaagatt aatccaggat

120

ggcatcatga gttcacatgt ccgcatgatt aaaggtattt tccggtagac gatggggatg

180

cgttccatta gatagtaggc ggggtaacgg cccacctagt caacgatgga taggggttct

240

gagaggaagg tcccccacat tggaactgag acacggtcca aactcctacg ggaggcagca

300

gtgaggaata ttggtcaatg ggcgatggcc tgaaccagcc aagtagcgtg aaggatgact

360

gccctatggg ttgtaaactt cttttataaa ggaataaagt cgggtatgca tacccgtttg

420

catgtacttt atgaataagg atcggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

480

atccgagcgt tatccggatt tattgggttt aaagggagcg tagatggatg tttaagtcag

540

ttgtgaaagt ttgcggctca accgtaaaat tgcagttgat actggatgtc ttgagtgcag

600

ttgaggcagg cggaattcgt ggtgtagcgg tgaaatgctt agatatcacg aagaactccg

660

attgcgaagg cagcctgcta agctgcaact gacattgagg ctcgaaagtg tgggtatcaa

720

acaggattag ataccctggt agtccacacg gtaaacgatg aatactcgct gtttgcgata

780

tacggcaagc ggccaagcga aagcgttaag tattccacct ggggagtacg ccggcaacgg

840

tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggag gaacatgtgg tttaattcga

900

tgatacgcga ggaaccttac ccgggcttaa attgcactcg aatgatccgg aaacggttca

960

gctagcaata gcgagtgtga aggtgctgca tggttgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt

1020

cggcttaagt gccataacga gcgcaaccct tgttgtcagt tactaacagg tgatgctgag

1080

gactctgaca agactgccat cgtaagatgt gaggaaggtg gggatgacgt caaatcagca

1140

cggcccttac gtccggggct acacacgtgt tacaatgggg ggtacagagg gccgctacca

1200

cgcgagtgga tgccaatccc taaaacccct ctcagttcgg actggagtct gcaacccgac

1260

tccacgaagc tggattcgct agtaatcgcg catcagccac ggcgcggtga atacgttccc

1320

gggccttgta cacaccgccc gtcaagccat gggagccggg ggtacctgaa gtgcgtaacc

1380

gcga

1384

<210> 275

<211> 1382

<212> DNA

<213> Bacteroides eggerthii

<400> 275

tcgaggggca gcatgattga agctgtgctt caattgatgg cgaccggcgc acgggtgagt

60

aacacgtatc caacctgccg ataactcggg gatagccttt cgaaagaaag attaataccc

120

gatagtatag tatttccgca tggtttcact attaaagaat ttcggttatc gatggggatg

180

cgttccatta gatagttggc ggggtaacgg cccaccaagt caacgatgga taggggttct

240

gagaggaagg tcccccacat tggaactgag acacggtcca aactcctacg ggaggcagca

300

gtgaggaata ttggtcaatg gacgagagtc tgaaccagcc aagtagcgtg aaggatgact

360

gccctatggg ttgtaaactt cttttatacg ggaataaagt ggagtatgca tactcctttg

420

tatgtaccgt atgaataagg atcggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

480

atccgagcgt tatccggatt tattgggttt aaagggagcg taggcgggtg cttaagtcag

540

ttgtgaaagt ttgcggctca accgtaaaat tgcagttgat actgggcgcc ttgagtgcag

600

cataggtagg cggaattcgt ggtgtagcgg tgaaatgctt agatatcacg aagaactccg

660

attgcgaagg cagcttactg gactgtaact gacgctgatg ctcgaaagtg tgggtatcaa

720

acaggattag ataccctggt agtccacaca gtaaacgatg aatactcgct gttggcgata

780

cacagtcagc ggccaagcga aagcattaag tattccacct ggggagtacg ccggcaacgg

840

tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggag gaacatgtgg tttaattcga

900

tgatacgcga ggaaccttac ccgggcttaa gttgtgaagg tttgcggctc aaccgtaaca

960

tcgcactgga tactgggcgg cttgagtgta gtatacgtag gcggaagccg tgaggtgtcg

1020

gcttaagtgc cataacgagc gcaaccctta tctatagtta ctatcaggtc atgctgagga

1080

ctctatggag actgccgtcg taagatgtga ggaaggtggg gatgacgtca aatcagcacg

1140

gcccttacgt ccggggctac acacgtgtta caatgggggg tacagaaggc agctacctgg

1200

cgacaggatg ctaatcccta aaacctctct cagttcggat tggagtctgc aacccgactc

1260

catgaagctg gattcgctag taatcgcgca tcagccacgg cgcggtgaat acgttcccgg

1320

gccttgtaca caccgcccgt caagccatga aagccggggg tacctgaagt acgtaaccgc

1380

aa

1382

<210> 276

<211> 1383

<212> DNA

<213> Bacteroides faecis

<400> 276

tcgaggggca gcattccagt ttgcttgcaa actggagatg gcgaccggcg cacgggtgag

60

taacacgtat ccaacctgcc gataactcgg ggatagcctt tcgaaagaaa gattaatacc

120

cgatggcata atagaaccgc atggtttgat tattaaagaa tttcggttat cgatggggat

180

gcgttccatt aggcagttgg tggggtaacg gcccaccaaa ccttcgatgg ataggggttc

240

tgagaggaag gtcccccaca ttggaactga gacacggtcc aaactcctac gggaggcagc

300

agtgaggaat attggtcaat ggacgagagt ctgaaccagc caagtagcgt gaaggatgac

360

tgccctatgg gttgtaaact tcttttatat gggaataaag tgatccacgt gtggattttt

420

gtatgtacca tatgaataag gatcggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag

480

gatccgagcg ttatccggat ttattgggtt taaagggagc gtaggtggac agttaagtca

540

gttgtgaaag tttgcggctc aaccgtaaaa ttgcagttga tactggctgt cttgagtaca

600

gtagaggtgg gcggaattcg tggtgtagcg gtgaaatgct tagatatcac gaagaactcc

660

gattgcgaag gcagctcact ggactgcaac tgacactgat gctcgaaagt gtgggtatca

720

aacaggatta gataccctgg tagtccacac agtaaacgat gaatactcgc tgtttgcgat

780

atacagtaag cggccaagcg aaagcattaa gtattccacc tggggagtac gccggcaacg

840

gtgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcgga ggaacatgtg gtttaattcg

900

atgatacgcg aggaacctta cccgggctta aattgcattt gaatatattg gaaacagtat

960

agtcgtaaga cgaatgtgac tgtgctgcat ggttgtcgtc agctcgtgcc gtgaggtgtc

1020

ggcttaagtg ccataacgag cgcaaccctt atcttcagtt actaacaggt catgctgagg

1080

actctggaga gactgccgtc gtaagatgtg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcagcac

1140

ggcccttacg tccggggcta cacacgtgtt acaatggggg gtacagaagg ccgctacctg

1200

gtgacaggat gctaatccca aaagcctctc tcagttcgga tcgaagtctg caacccgact

1260

tcgtgaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg gcgcggtgaa tacgttcccg

1320

ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg aaagccgggg gtacctgaag tacgtaaccg

1380

caa

1383

<210> 277

<211> 1306

<212> DNA

<213> Bacteroides finegoldii

<220>

<221> modified_base

<222> (1029)..(1029)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1125)..(1125)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1261)..(1261)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1281)..(1281)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 277

aagatggcga ccggcgcacg ggtgagtaac acgtgtccaa cctgccgata actcagggat

60

agcctttcga aagaaagatt aatacctgat ggcataggat tgtcgcatga taatcctatt

120

aaagaatttc ggttatcgat ggggatgcgt tccattaggc agttggtgag gtaacggctc

180

accaaacctt cgatggatag gggttctgag aggaaggtcc cccacattgg aactgagaca

240

cggtccaaac tcctacggga ggcagcagtg aggaatattg gtcaatggac gggagtctga

300

accagccaag tagcgtgaag gatgactgcc ctatgggttg taaacttctt ttatacggga

360

ataaagtgat ccacgggttt ttgtatgtac cgtatgaata aggatcggct aactccgtgc

420

cagcagccgc ggtaatacgg aggatccgag cgttatccgg atttttgggt ttaaagggag

480

cgtagtggat tgttaagtca gttgtgaaag tttgcggctc aaccgtaaaa ttgcagttga

540

tactggcagt cttgatacag taaggtgggc ggaattcgtg gtgtacggtg aaatgcttaa

600

tatcacgaaa actccgattg cgaaggcagc tcactggact gcaactgaca ctgatgctcg

660

aaagtgtggg tatcaaacag gattaatacc ctggtagtcc acacagtaaa cgatgaatac

720

tcgctgtttg cgatatacgg taagcggcca agcgaaagcg ttaagtattc cacctgggga

780

gtacgccggc aacggtgaaa ctcagaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggaggaaca

840

tgtggtttaa ttgtatgata ctcgaggaac cttacccggg cttaaattac ctttgaatta

900

tctggaaaca ggttaaccgt aaggcacagt gaaggttgct gcatggttgt cgtcagctcg

960

tgccgtgagg tgtcggctta agttccataa cgagcgcaac ccttatcttc agttactaac

1020

aggtcatgnt gaggactctg gagagactgc cgtcgtaaga tgtgaggaag gtggggatga

1080

cgtcaaatca gcacggccct tacgtccggg gctacacacg tgttncaatg gggggtacag

1140

aaggcagcta cctggtgaca ggatgctaat cccaaaaacc tctctcagtt cggatcgaag

1200

tctgcaaccc gacttcgtga agctggattc gttagtaatc gcgcatcacc catggcgcgg

1260

ngaatacgtt cccgggcctt nccaccccgc ccctcaagcc atgaaa

1306

<210> 278

<211> 1529

<212> DNA

<213> Bacteroides fluxus

<400> 278

ttacaatgaa gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc

60

aagtcgaggg gcagcatttt tatagcaata taaaagatgg cgaccggcgc acgggtgagt

120

aacacgtatc caacctgccg ataactcggg gataaccctt cgaaagaagg cctaataccc

180

gatggcatat cccttccgcc tggttgggat attaaagaac ttcggttatc gatggggatg

240

cgttccatta gcttgttggc ggggtaacgg cccaccaagg cttcgatgga taggggttct

300

gagaggaagg tcccccacat tggaactgag acacggtcca aactcctacg ggaggcagca

360

gtgaggaata ttggtcaatg gacgagagtc tgaaccagcc aagtagcgtg aaggatgaag

420

gtcctatgga ttgtaaactt cttttatacg ggaataaagt gcagtatgca tactgttttg

480

tatgtaccgt atgaataagg atcggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

540

atccgagcgt tatccggatt tattgggttt aaagggagcg taggcggatg cttaagtcag

600

ttgtgaaagt ttgcggctca accgtaaaat tgcagttgat actgggcgtc ttgagtacag

660

tagaggcagg cggaattcgt ggtgtagcgg tgaaatgctt agatatcacg aagaactccg

720

attgcgaagg cagcctgctg gactgtcact gacgctgatg ctcgaaagtg tgggtatcaa

780

acaggattag ataccctggt agtccacaca gtaaacgatg aatactcgct gttggcgata

840

cacagtcagc ggccaagcga aagcgttaag tattccacct ggggagtacg ccggcaacgg

900

tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggag gaacatgtgg tttaattcga

960

tgatacgcga ggaaccttac ccgggcttga attgcatatg agttatccgg agacggataa

1020

gccgcaaggc atatgtgaag gtgctgcatg gttgtcgtca gctcgtgccg tgaggtgtcg

1080

gcttaagtgc cataacgagc gcaaccctta tcgatagtta ccatcaggtc atgctgggga

1140

ctctgtcgag actgccgtcg taagatgcga ggaaggtggg gatgacgtca aatcagcacg

1200

gcccttacgt ccggggccac acacgtgtta caatgggggg tacagaaggc cgctacacag

1260

cgatgtgatg ccaatcccca aaacccctct cagttcggat tggagtctgc aacccgactc

1320

catgaagctg gattcgctag taatcgcgca tcagccacgg cgcggtgaat acgttcccgg

1380

gccttgtaca caccgcccgt caagccatga aagccggggg tacctgaagt gcgtaaccgc

1440

gaggagcgcc ctagggtaaa actggtgatt ggggctaagt cgtaacaagg tagccgtacc

1500

ggaaggtgcg gctggaacac ctcctttct

1529

<210> 279

<211> 1383

<212> DNA

<213> Bacteroides fragilis

<220>

<221> modified_base

<222> (23)..(23)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 279

tcgaggggca tcaggaagaa agnttgcttt ctttgctggc gaccggcgca cgggtgagta

60

acacgtatcc aacctgccct ttactcgggg atagcctttc gaaagaaaga ttaatacccg

120

atggcataat gattccgcat ggtttcatta ttaaaggatt ccggtaaagg atggggatgc

180

gttccattag gttgttggtg aggtaacggc tcaccaagcc ttcgatggat aggggttctg

240

agaggaaggt cccccacatt ggaactgaga cacggtccaa actcctacgg gaggcagcag

300

tgaggaatat tggtcaatgg gcgctagcct gaaccagcca agtagcgtga aggatgaagg

360

ctctatgggt cgtaaacttc ttttatataa gaataaagtg cagtatgtat actgttttgt

420

atgtattata tgaataagga tcggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggagga

480

tccgagcgtt atccggattt attgggttta aagggagcgt aggtggactg gtaagtcagt

540

tgtgaaagtt tgcggctcaa ccgtaaaatt gcagttgata ctgtcagtct tgagtacagt

600

agaggtgggc ggaattcgtg gtgtagcggt gaaatgctta gatatcacga agaactccga

660

ttgcgaaggc agctcactgg actgcaactg acactgatgc tcgaaagtgt gggtatcaaa

720

caggattaga taccctggta gtccacacag taaacgatga atactcgctg tttgcgatat

780

acagtaagcg gccaagcgaa agcattaagt attccacctg gggagtacgc cggcaacggt

840

gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggagg aacatgtggt ttaattcgat

900

gatacgcgag gaaccttacc cgggcttaaa ttgcagtggt atgatgtggg aacatgtcag

960

tgagcaatca ccgctgtgaa ggtgctgcat ggttgtcgtc agctcgtgcc gtgaggtgtc

1020

ggcttaagtg ccataacgag cgcaaccctt atctttagtt actaacaggt tatgctgagg

1080

actctagaga gactgccgtc gtaagatgtg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcagcac

1140

ggcccttacg tccggggcta cacacgtgtt acaatggggg gtacagaagg cagctagcgg

1200

gtgaccgtat gctaatccca aaagcctctc tcagttcgga tcgaagtctg caacccgact

1260

tcgtgaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccacg gcgcggtgaa tacgttcccg

1320

ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg ggagccgggg gtacctgaag tacgtaaccg

1380

caa

1383

<210> 280

<211> 1431

<212> DNA

<213> Bacteroides galacturonicus

<220>

<221> modified_base

<222> (786)..(786)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1402)..(1402)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 280

tgcaagtcga acgaagcatt taagacagat tacttcggtt tgaagtcttt tatgactgag

60

tggcggacgg gtgagtaacg cgtgggtaac ctgcctcata cagggggata gcagctggaa

120

acggctggta ataccgcata agcgcacagt accacatggt acagtgtgaa aaactccggt

180

ggtatgagat ggacccgcgt ctgattagct tgttggcggg gtaacggccc accaaggcga

240

cgatcagtag ccgacctgag agggtgaccg gccacattgg gactgagaca cggcccagac

300

tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatggag gaaactctga tgcagcgacg

360

ccgcgtgagt gaagaagtag ttcgctatgt aaagctctat cagcagggaa gatagtgacg

420

gtacctgact aagaagctcc ggctaaatac gtgccagcag ccgcggtaat acgtatggag

480

caagcgttat ccggatttac tgggtgtaaa gggagtgtag gtggccaggc aagtcagaag

540

tgaaagcccg gggctcaacc ccgggactgc ttttgaaact gcagggctag agtgcaggag

600

gggcaagtgg aattcctagt gtagcggtga aatgcgtaga tattaggagg aacaccagtg

660

gcgaaggcgg cttgctggac tgtaactgac actgaggctc gaaagcgtgg ggagcaaaca

720

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgaat actaggtgtc ggggcacata

780

agtgcnccgg tgccgcagca aacgcaataa gtattccacc tggggagtac gttcgcaaga

840

atgaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

900

aagcaacgcg aagaacctta ccaagtcttg acatcctctt gaccggtcag taatgtgacc

960

ttttcttcgg aacaagagtg acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1020

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatcctta gtagccagca gtccggctgg

1080

gcactctagg gagactgcca gggataacct ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc

1140

atgcccctta tgacttgggc tacacacgtg ctacaatggc gtaaacaaag tgaagcgaga

1200

gtgtgagctt aagcaaatca caaaaataac gtctcagttc ggattgtagt ctgcaactcg

1260

actacatgaa gctggaatcg ctagtaatcg cagatcagaa tgctgcggtg aatacgttcc

1320

cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtcgg aaatgcccga agtcggtgac

1380

ctaacgtaag aaggagccgc cnaaggcagg tctgataact ggggtgaagt c

1431

<210> 281

<211> 1513

<212> DNA

<213> Bacteroides helcogenes

<400> 281

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg

60

ggcagcattg tcatagcaat atgacagatg gcgaccggcg cacgggtgag taacacgtat

120

ccaacctgcc ttccactcgg gaatagcctt tcgaaagaaa gattaatgcc cgatggcact

180

gaaagaggtc atcctttttc agttaaagaa tttcggtgga agatggggat gcgttccatt

240

agcttgttgg cggggtaacg gcccaccaag gcatcgatgg ataggggttc tgagaggaag

300

gtcccccaca ttggaactga gacacggtcc aaactcctac gggaggcagc agtgaggaat

360

attggtcaat gggcgggagc ctgaaccagc caagtagcgt gaaggatgac tgccctatgg

420

gttgtaaact tcttttataa gggaataaaa cgggccacgt gtggcctttt gcatgtacct

480

tatgaataag gatcggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag gatccgagcg

540

ttatccggat ttattgggtt taaagggagc gcagacgggg tcttaagtca gttgtgaaag

600

tttgcggctc aaccgtaaaa ttgcagttga tactggggct cttgagtgca gtataggcag

660

gcggaattcg tggtgtagcg gtgaaatgct tagatatcac gaagaactcc gattgcgaag

720

gcagcctgct ggactgtaac tgacgttcat gctcgaaagt gcgggtatca aacaggatta

780

gataccctgg tagtccgcac agtaaacgat gaatactcgc tgttggcgat acacagtcag

840

cggccaagcg aaagcgttaa gtattccacc tggggagtac gccggcaacg gtgaaactca

900

aaggaattga cgggggcccg cacaagcgga ggaacatgtg gtttaattcg atgatacgcg

960

aggaacctta cccgggcttg aattgctaat gaatatggcg gaaacgtcat agccgcaagg

1020

cattagtgaa ggtgctgcat ggttgtcgtc agctcgtgcc gtgaggtgtc ggcttaagtg

1080

ccataacgag cgcaaccctt atctatagtt accatcaggc aatgctgggg actctatgga

1140

gactgccgtc gtaagatgtg aggaaggttg ggatgacgtc aaatcagcac ggcccttacg

1200

tccggggcta cacacgtgtt acaatggggg gtacagaagg cagctacaca gcgatgtgat

1260

gctaatccca aaaacctctc tcagttcgga ctggagtctg caacccgact ccacgaagct

1320

ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccacg gcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac

1380

acaccgcccg tcaagccatg aaagccgggg gtacctgaag tgcgtaaccg cgaggagcgc

1440

cctagggtaa aactggtgat tggggctaag tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc

1500

ggctggaaca cct

1513

<210> 282

<211> 1262

<212> DNA

<213> Bacteroides heparinolyticus

<400> 282

tcaggatgaa cgctagctac aggcttaaca catgcaagtc gagggaccgg cgcacgggtg

60

agtaacacgt atccaacctt ccggtaactc cggtatagcc tttcgaaaga aagattaatc

120

ccggatagtt aaagccggtt accgatgggg atgcgttcca ttaggcagtt ggcggggtaa

180

cggcccacca aacctacgat ggataggggt tctgagagga aggtccccca cattggaact

240

gagacacggt ccaaactcct acgggaggca gcagtgagga atattggtca atgggcggaa

300

gcctgaacca gccaagtagc gtgaaggatg actgcctatg ggttgtaaac ttcttttata

360

agggaatatg catgtacctt atgaataagg atcggctaac tccgtgccag cagccgcggt

420

aatacggagg atccgagcgt tatccggatt tattgggttt aaagggagcg taggcgggcg

480

cttaagtcag ctgtgaaagt ttggggctca accttaaaat tgcagttgat actgggtgcc

540

ttgagtgcag tataggcagg cggaattcgt ggtgtagcgg tgaaatgctt agatatcacg

600

aagaactcct attgcgaagg cagcttgctg gagtgactga cgctgatgct cgaaagtgtg

660

ggtatcaaac aggattagat accctggtag tccacacagt aaacgatgaa tactcgctgt

720

ttgcgtgcaa gcggccaagc gaaagcgtta agtattccac ctggggagta cgccggcaac

780

ggtgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg aggaacatgt ggtttaattc

840

gatgatacgc gaggaacctt acccgggctt gaattgtgaa ggtgctgcat ggttgtcgtc

900

agctcgtgcc gtgaggtgtc ggcttaagtg ccataacgag cgcaaccctt atccacagtt

960

accatcagct ggggactctg tggagactgc cgtcgtaaga tggaggaagg gggggatgac

1020

gtcaaatcag cacggccctt acgtccgggg ctacacacgt gttacaatgg ggggcagcag

1080

gcagctcggc ggcgacgccc ggccaatccc tcccctctca gttcggatgg agtctgcaac

1140

ccgactccag aagctggatt cgctagtaat cgcgcatcag ccacggcgcg gtgaatacgt

1200

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaag ccatgaaagc cgggggtacc tgaagtgcgt

1260

ag

1262

<210> 283

<211> 1301

<212> DNA

<213> Bacteroides intestinalis

<400> 283

ttattccggg atagcctttc gaaagaaaga ttaatactgg atagcataac gagaaggcat

60

cttcttgtta ttaaagaatt tcgataatcg atggggatgc gttccattag tttgttggcg

120

gggtaacggc ccaccaagac atcgatggat aggggttctg agaggaaggt cccccacatt

180

ggaactgaga cacggtccaa actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat tggtcaatgg

240

acgagagtct gaaccagcca agtagcgtga aggatgactg ccctatgggt tgtaaacttc

300

ttttatatgg gaataaagtg cagtatgtat actgttttgt atgtaccata cgaataagga

360

tcggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggagga tccgagcgtt atccggattt

420

attgggttta aagggagcgt aggcggatta ttaagtcagt tgtgaaagtt tgcggctcaa

480

ccgtaaaatt gcagttgata ctggtagtct tgagtgcagc agaggtaggc ggaattcgtg

540

gtgtagcggt gaaatgctta gatatcacga agaactccga ttgcgaaggc agcttactgg

600

actgtaactg acgctgatgc tcgaaagtgt gggtatcaaa caggattaga taccctggta

660

gtccacacag taaacgatga atactcgctg tttgcgatat acagcaagcg gccaagcgaa

720

agcattaagt attccacctg gggagtacgc cggcaacggt gaaactcaaa ggaattgacg

780

ggggcccgca caagcggagg aacatgtggt ttaattcgat gatacgcgag gaaccttacc

840

cgggcttaaa ttgcaactga cggatttgga aacagatctt ccttcgggca gttgtgaatt

900

gcgaaggcgg tttactgcag ctcgtgccgt gaggtgtcgg cttaagtgcc ataacgagcg

960

caacccttat ctttagttac taacaggtca tgctgaggac tctagagaga ctgccgtcgt

1020

aagatgtgag gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg cccttacgtc cggggctaca

1080

cacgtgttac aatggggggt acagaaggca gctacacagc gatgtgatgc taatcccaaa

1140

agcctctctc agttcggatt ggagtctgca acccgactcc atgaagctgg attcgctagt

1200

aatcgcgcat cagccacggc gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc

1260

aagccatgaa agccgggggt acctgaagta cgtaaccgca a

1301

<210> 284

<211> 1281

<212> DNA

<213> Bacteroides massiliensis

<400> 284

catgcaagtc gagggaccgg cgcacgggtg agtaacgcgt atccaacctg ccttacactc

60

ttggacagcc ttctgaaagg gagattaata caagatgttt aaagccggtg taagatgggg

120

atgcgttcca ttagatagta ggcggggtaa cggcccacct agtcttcgat ggataggggt

180

tctgagagga aggtccccca cattggaact gagacacggt ccaaactcct acgggaggca

240

gcagtgagga atattggtca atggacgaga gtctgaacca gccaagtagc gtgaaggatg

300

aaggtttatg gattgtaaac ttcttttata cgggaatatg catgtaccgt atgaataagg

360

atcggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg atccgagcgt tatccggatt

420

tattgggttt aaagggagcg tagatgggtt gttaagtcag ttgtgaaagt ttgcggctca

480

accgtaaaat tgcaattgat actggcagtc ttgagtacag ttgaggtagg cggaattcgt

540

ggtgtagcgg tgaaatgctt agatatcacg aagaactccg attgcgaagg cagcttacta

600

acctgactga cattgatgct cgaaagtgtg ggtatcaaac aggattagat accctggtag

660

tccacacggt aaacgatgaa tactcgctgt aggcgagtct gcggccaagc gaaagcatta

720

agtattccac ctggggagta cgccggcaac ggtgaaactc aaaggaattg acgggggccc

780

gcacaagcgg aggaacatgt ggtttaattc gatgatacgc gaggaacctt acccgggctt

840

aaattgtgaa ggtgctgcat ggttgtcgtc agctcgtgcc gtgaggtgtc ggcttaagtg

900

ccataacgag cgcaaccctt gccgatagtt actaacagct gaggactctg tcgggactgc

960

catcgtaaga tggaggaagg tggggatgac gtcaaatcag cacggccctt acgtccgggg

1020

ctacacacgt gttacaatgg ggggcagagg gctgctacca cgcaagtgga tgccaatccc

1080

acctctctca gttcggatga agtctgcaac ccgacttcag aagctggatt cgctagtaat

1140

cgcgcatcag ccacggcgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaag

1200

ccatgggagc cgggggtacc tgaagtgcgt agcgccctag ggtaaaactg gtgactgggg

1260

ctaagtcgta acaaggtaac c

1281

<210> 285

<211> 1377

<212> DNA

<213> Bacteroides nordii

<220>

<221> modified_base

<222> (12)..(13)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 285

tcgaggggca gnnggatgta gcaatacatt gctggcgacc ggcgcacggg tgagtaacac

60

gtatccaacc tgccttttac tcggggatag gctttcgaaa gaaagattaa tacccgatgg

120

tataatattt ccgcatggga ttattattaa agaatttcgg taaaagatgg ggatgcgttc

180

cattaggcag ttggcggggt aacggcccac caaaccttcg atggataggg gttctgagag

240

gaaggtcccc cacattggaa ctgagacacg gtccaaactc ctacgggagg cagcagtgag

300

gaatattggt caatgggcga aagcctgaac cagccaagta gcgtgaagga tgactgccct

360

atgggttgta aacttctttt ataggggaat aaaatgagcc acgtgtggct ttttgtatgt

420

accctatgaa taaggatcgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggaggatccg

480

agcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg gagcgtaggt ggacatgtaa gtcagttgtg

540

aaagtttgcg gctcaaccgt aaaattgcag ttgatactgt gtgtcttgag tacagtagag

600

gtgggcggaa ttcgtggtgt agcggtgaaa tgcttagata tcacgaagaa ctccgattgc

660

gaaggcagct cactggactg ttactgacac tgaggctcga aagtgtgggt atcaaacagg

720

attagatacc ctggtagtcc acacagtaaa cgatgaatac tcgctgtttg cgatatacag

780

caagcggcca agcgaaagca ttaagtattc cacctgggga gtacgccggc aacggtgaaa

840

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggaggaaca tgtggtttaa ttcgatgata

900

cgcgaggaac cttacccggg cttaaattgc atttgaatgt tggggaaacc caacagccgt

960

aaggcaaatg tgagcaggct gcatggtggt cgtcagctcg tgccgtgagg tgtcggctta

1020

agtgccataa cgagcgcaac ccttatcttt agttactaac aggttatgct gaggactcta

1080

gagagactgc cgtcgtaaga tgtgaggaag gtggggatga cgtcaaatca gcacggccct

1140

tacgtccggg gctacacacg tgttacaatg gggggtacag aaggcagcta cctggtgaca

1200

ggatgctaat cccaaaagcc tctctcagtt cggatcgaag tctgcaaccc gacttcgtga

1260

agctggattc gctagtaatc gcgcatcagc cacggcgcgg tgaatacgtt cccgggcctt

1320

gtacacaccg cccgtcaagc catgggagcc gggggtacct gaagtacgta accgcaa

1377

<210> 286

<211> 1485

<212> DNA

<213> Bacteroides oleiciplenus

<400> 286

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg

60

ggcatcagga tgtagcaata cattgctggc gaccggcgca cgggtgagta acacgtatcc

120

aacctaccga ttattccggg atagcctttc gaaagaaaga ttaatactgg atagtataac

180

gagaaggcat ctttttgtta ttaaagaatt tcgataatcg atggggatgc gttccattag

240

tttgttggcg gggtaacggc ccaccaagac ttcgatggat aggggttctg agaggaaggt

300

cccccacatt ggaactgaga cacggtccaa actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat

360

tggtcaatgg gcgagagcct gaaccagcca agtagcgtga aggatgactg ccctatgggt

420

tgtaaacttc ttttatatgg gaataaagtg cagtatgtat actgttttgt atgtaccata

480

tgaataagga tcggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggagga tccgagcgtt

540

atccggattt attgggttta aagggagcgt aggcggaagc ttaagtcagt tgtgaaagtt

600

tgcggctcaa ccgtaaaatt gcagttgata ctgggtttct tgagtgcagt agaggtaggc

660

ggaattcgtg gtgtagcggt gaaatgctta gatatcacga agaactccga ttgcgaaggc

720

agcttactgg actgtaactg acgctgatgc tcgaaagtgt gggtatcaaa caggattaga

780

taccctggta gtccacacag taaacgatga atactcgctg tttgcgatat acagcaagcg

840

gccaagcgaa agcattaagt attccacctg gggagtacgc cggcaacggt gaaactcaaa

900

ggaattgacg ggggcccgca caagcggagg aacatgtggt ttaattcgat gatacgcgag

960

gaaccttacc cgggcttaaa ttgcaactga cgtaggtgga aacatctatt ccttcgggca

1020

gttgtgaagg tgctgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgccgt gaggtgtcgg cttaagtgcc

1080

ataacgagcg caacccttat ctttagttac taacaggtta tgctgaggac tctagagaga

1140

ctgccgtcgt aagatgtgag gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg cccttacgtc

1200

cggggctaca cacgtgttac aatggggggt acagaaggca gctacacggc gacgtgatgc

1260

taatcccaaa aacctctctc agttcggatt ggagtctgca actcgactcc atgaagctgg

1320

attcgctagt aatcgcgcat cagccacggc gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac

1380

accgcccgtc aagccatgaa agccgggggt acctgaagtc cgtaaccgtt aaggagcggc

1440

ctagggtaaa actggtaatt ggggctaagt cgtaacaagg taacc

1485

<210> 287

<211> 1381

<212> DNA

<213> Bacteroides ovatus

<220>

<221> modified_base

<222> (25)..(25)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 287

tcgaggggca gcattttagt ttgcnttgca aactaaagat ggcgaccggc gcacgggtga

60

gtaacacgta tccaacctgc cgataactcg gggatagcct ttcgaaagaa agattaatat

120

ccgatagtat attaaaaccg catggtttta ctattaaaga atttcggtta tcgatgggga

180

tgcgttccat tagtttgttg gcggggtaac ggcccaccaa gactacgatg gataggggtt

240

ctgagaggaa ggtcccccac attggaactg agacacggtc caaactccta cgggaggcag

300

cagtgaggaa tattggtcaa tggacgagag tctgaaccag ccaagtagcg tgaaggatga

360

ctgccctatg ggttgtaaac ttcttttata tgggaataaa gtattccacg tgtggaattt

420

tgtatgtacc atatgaataa ggatcggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga

480

gccgagcgtt atccggattt attgggttta aagggagcgt aggtggattg ttaagtcagt

540

tgtgaaagtt tgcggctcaa ccgtaaaatt gcagttgaaa ctggcagtct tgagtacagt

600

agaggtgggc ggaattcgtg gtgtagcggt gaaatgctta gatatcacga agaactccga

660

ttgcgaaggc agctcactag actgcaactg acactgatgc tcgaaagtgt gggtatcaaa

720

caggattaga taccctggta gtccacacag taaacgatga atactcgctg tttgcgatat

780

acagtaagcg gccaagcgaa agcattaagt attccacctg gggagtacgc cggcaacggt

840

gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggagg aacatgtggt ttaattcgat

900

gatacgcgag gaaccttacc cgggcttaaa ttgcatttga ataatctgga aacaggttag

960

ccgcaaggca aatgtgaatt ggctgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgccgt gaggtgtcgg

1020

cttaagtgcc ataacgagcg caacccttat ctttagttac taacaggtta tgctgaggac

1080

tctagagaga ctgccgtcgt aagatgtgag gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg

1140

cccttacgtc cggggctaca cacgtgttac aatggggggt acagaaggca gctacctggt

1200

gacaggatgc taatcccaaa aacctctctc agttcggatc gaagtctgca acccgacttc

1260

gtgaagctgg attcgctagt aatcgcgcat cagccatggc gcggtgaata cgttcccggg

1320

ccttgtacac accgcccgtc aagccatgaa agccgggggt acctgaagta cgtaaccgca

1380

a

1381

<210> 288

<211> 1531

<212> DNA

<213> Bacteroides pectinophilus

<400> 288

atgagagttt gatcctggct caggatgaac gctggcggcg tgcttaacac atgcaagtcg

60

aacgaagcac ttaatgagat ttcttcggat tgattatttt gtgactgagt ggcggacggg

120

tgagtaacgc gtgggtaacc tgccccagac cgggggataa cagtcggaaa cgactgctaa

180

taccgcataa gcgcacagtg ccgcatggca cagtgtgaaa aactccggtg gtctgggatg

240

gacccgcgtc cgattagtta gttggcgggg taacggccca ccaagaccgc gatcggtagc

300

cgacctgaga gggtgaccgg ccacattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag

360

gcagcagtgg ggaatattgc acaatggagg aaactctgat gcagcgacgc cgcgtgagcg

420

aagaagtatt tcggtatgta aagctctgtc agcagggaag ataatgacgg tacctgacca

480

agaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc aagcgttatc

540

cggatttact gggtgtaaag ggagtgtagg tggctgtgca agtcaggagt gaaagcccgg

600

ggctcaaccc cgggactgct cttgaaactg cgcagcttga gtgcaggagg ggcaggcgga

660

attcctagtg tagcggtgaa atgcgtagat attaggagga acaccggtgg cgaaggcggc

720

ctgctggact gtaactgaca ctgaggctcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac

780

cctggtagtc cacgccgtaa acgatgaata ctaggtgtcg gggctcataa gagcttcggt

840

gccgcagcaa acgcaataag tattccacct ggggagtacg ttcgcaagaa tgaaactcaa

900

aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga

960

agaaccttac caggtcttga catcctcctg aacggaaggt aatgcttccg gtccttcggg

1020

acaggagaga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag

1080

tcccgcaacg agcgcaaccc ctatcctcag tagccagcag tccggctggg cactctgtgg

1140

agactgccgg ggataacccg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat

1200

gacctgggct acacacgtgc tacaatggcg ctcaacaaag ggaagcaatg ccgcgaggcc

1260

gagcaaatcc caaaaacagc gtcccagttc ggactgtagt ctgcaacccg actacacgaa

1320

gctggaatcg ctagtaatcg cgaatcagaa tgtcgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacca tgggagtcgg aaatgcccga agtcagtgac ccaaccgcaa

1440

ggagggagct gccgaaggca ggtctggtaa ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1500

tcggaaggtg cggctggatc acctcctttc t

1531

<210> 289

<211> 1326

<212> DNA

<213> Bacteroides plebeius

<400> 289

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc aagtcgaggg

60

accggcgcac gggtgagtaa cgcgtatcca accttccgta cactcaggga tagcctttcg

120

aaagaaagat taatacctga tggttaaagt cggtgtacga tggggatgcg ttccattagg

180

tagtaggcgg ggtaacggcc cacctagcct acgatggata ggggttctga gaggaaggtc

240

ccccacattg gaactgagac acggtccaaa ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt

300

ggtcaatgga cgagagtctg aaccagccaa gtagcgtgaa ggatgaaggt ctacggattg

360

taaacttctt ttataaggga atatgtatgt accttatgaa taagcatcgg ctaactccgt

420

gccagcagcc gcggtaatac ggaggatgcg agcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg

480

gagcgcagac gggtcgttaa gtcagctgtg aaagtttggg gctcaacctt aaaattgcag

540

ttgatactgg cgtccttgag tgcggttgag gtgtgcggaa ttcgtggtgt agcggtgaaa

600

tgcttagata tcacgaagaa ctccgattgc gaaggcagca cactaagccg actgacgttc

660

atgctcgaaa gtgtgggtat caaacaggat tagataccct ggtagtccac acggtaaacg

720

atggatactc gctgttggcg agtcagcggc ttagcgaaag cgttaagtat cccacctggg

780

gagtacgccg gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa

840

catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttacccg ggcttaaatt gtgaaggtgc

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa

960

ccctcgccgc cagttactaa cagctgagga ctctggcggg actgccatcg taagatggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg cccttacgtc cggggctaca cacgtgttac

1080

aatgggcggc agaaggcagc tacctggcga caggatgcca atcccgccgc tctcagttcg

1140

gatggagtct gcaacccgac tccagaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccacg

1200

gcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg aaagccgggg

1260

gtacctgaag tgcgtagcgc cctagggtaa aaccggtaat tggggctaag tcgtaacaag

1320

gtaacc

1326

<210> 290

<211> 1458

<212> DNA

<213> Bacteroides pyogenes

<400> 290

ttagagtttg atcctggctc aggatgaacg ctagctacag gcttaacaca tgcaagtcga

60

ggggcagcat gaatattggc ttgccaatat ttgatggcga ccggcgcacg ggtgagtaac

120

acgtatccaa ccttccggtt actcggggat aggctttcga aagaaagatt aatacccgat

180

gttgtgtatc tttctcctga ttgatacgcc aaaggattcc ggtaaccgat ggggatgcgt

240

tccattaggc agttggcggg gtaacggccc accaaacctt cgatggatag gggttctgag

300

aggaaggtcc cccacattgg aactgagaca cggtccaaac tcctacggga ggcagcagtg

360

aggaatattg gtcaatggac ggaagtctga accagccaag tagcgtgaag gatgactgcc

420

ctctgggttg taaacttctt ttatacggga ataacatgag gtacgggtac cttattgcat

480

gtaccgttat gaataagcat cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggaggat

540

gcgagcgtta tccggattta ttgggtttaa agggagcgta ggtgggatat taagtcagct

600

gtgaaagttt ggggctcaac cttaaaattg cagttgatac tggttttctt gagtacggta

660

taggtgggcg gaattcgtgg tgtagcggtg aaatgcttag atatcacgaa gaactcctat

720

tgcgaaggca gctcactgga ccggcactga cactgatgct cgaaagtgcg ggtatcaaac

780

aggattagat accctggtag tccgcacagt aaacgatgaa tactcgctgt ttgcgataca

840

cagtaagcgg ccaagcgaaa gcgttaagta ttccacctgg ggagtacgcc ggcaacggtg

900

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggagga acatgtggtt taattcgatg

960

atacgcgagg aaccttaccc gggcttaaat tgcgctggct tttaccggaa acggtatttt

1020

cttcggacca gcgtgaaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgtcggc

1080

ttaagtgcca taacgagcgc aacccttatc tttagttgcc atcaggtttt gctggggact

1140

ctaaagagac tgccgtcgta agatgcgagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcagcacggc

1200

ccttacgtcc ggggctacac acgtgttaca atggggagca cagcaggttg ctacacggcg

1260

acgtgatgcc aatccgtaaa actcctctca gttcggatcg aagtctgcaa cccgacttcg

1320

tgaagctgga ttcgctagta atcgcgcatc agccacggcg cggtgaatac gttcccgggc

1380

cttgtacaca ccgcccgtca agccatgaaa gccgggggta cctgaagtac gtaaccgcaa

1440

ggatcgtcct tagtaaac

1458

<210> 291

<211> 1521

<212> DNA

<213> Bacteroides salanitronis

<400> 291

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgcgg

60

ggcagcggga gcctagcttg ctaggcttgc cggcgaccgg cgcacgggtg agtaacgcgt

120

atccgacctt ccgcacactc cgggccagcc ttccgaaagg aagattaatc ccggatggta

180

tggcgtggct gcatggcagc gccattaaag gagcgatccg gtgtgcgatg ggggtgcgtt

240

ccattagctt gttggcgggg taacggccca ccaaggcgac gatggatagg ggttctgaga

300

ggaaggcccc ccacattggg actgagacac ggcccaaaac tcctacggga ggcagcagtg

360

aggaatattg gtcaatgggc gagagcctga accagccaag tagcgtggag gatgaccgcc

420

ctacgggttg taaactcctt ttataaggga ataaaacctc ccacgtgtgg gagcttgtat

480

gtaccttatg aataagcatc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggaggatg

540

cgagcgttat ccggatttat tgggtttaaa gggagcgtag acgggatgtc aagtcagctg

600

tgaaagtttg cggctcaacc gtaaaattgc agttgaaact ggctttcttg agtgcgttcg

660

aggcaggcgg aattcgtggt gtagcggtga aatgcataga tatcacgaag aaccccgatt

720

gcgaaggcag cctgctaggc cgcaactgac gttgatgctc gaaagtgcgg gtatcaaaca

780

ggattagata ccctggtagt ccgcacggta aacgatgggc actcgctgcc ggcgatatac

840

tgccggcggc ttagcgaaag cgttaagtgc cccacctggg gagtacgccg gcaacggtga

900

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa catgtggttt aattcgatga

960

tacgcgagga accttacccg ggcttgaact gcggatgcat tgcgcggaaa cgcgcaagtg

1020

ggcaaccaca tccgtggagg tgctgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgccgt gaggtgtcgg

1080

cttaagtgcc ataacgagcg caaccccttc cgccagttgc catcaggtta tgctggggac

1140

tctggcggta ctgccatcgt aagatgcgag gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg

1200

cccttacgtc cggggctaca cacgtgttac aatggggggt acagagggcc gccatccggc

1260

gacggagcgc caatccctaa agcccctccc agttcggact ggagcctgca acccggctcc

1320

acgaagctgg attcgctagt aatcgcgcat cagccacggc gcggtgaata cgttcccggg

1380

ccttgtacac accgcccgtc aagccatgaa agccgggggt gcctgaagtg cgtaaccgaa

1440

aggggcgccc tagggtaaaa ccggtgattg gggctaagtc gtaacaaggt agccgtaccg

1500

gaaggtgcgg ctggaacacc t

1521

<210> 292

<211> 970

<212> DNA

<213> Bacteroides salyersiae

<220>

<221> modified_base

<222> (946)..(946)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (948)..(948)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 292

tcgaggggca tcagggtgta gcaatacgcc gctggcgacc ggcgcacggg tgagtaacac

60

gtatccaacc tgccctttac tcggggatag cctttcgaaa gaaagattaa tacccgatgg

120

tataacatga cctcctggtt ttgttattaa agaatttcgg tagaggatgg ggatgcgttc

180

cattaggcag ttggcggggt aacggcccac caaaccttcg atggataggg gttctgagag

240

gaaggtcccc cacattggaa ctgagacacg gtccaaactc ctacgggagg cagcagtgag

300

gaatattggt caatgggcga gagcctgaac cagccaagta gcgtgaagga tgaccgccct

360

atgggttgta aacttctttt atatgggaat aaagtctgcc acgtgtggca ttttgtatgt

420

accatatgaa taaggatcgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggaggatccg

480

agcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg gagcgtaggt ggacatgtaa gtcagttgtg

540

aaagtttgcg gctcaaccgt aaaattgcag ttgatactgc gtgtcttgag tacagtagag

600

gtgggcggaa ttcgtggtgt agcggtgaaa tgcttagata tcacgaagaa ctccgattgc

660

gaaggcagct cactggactg caactgacac tgatgctcga aagtgtgggt atcaaacagg

720

attagatacc ctggtagtcc acacagtaaa cgatgaatac tcgctgtttg cgatatacag

780

taagcggcca agcgaaagca ttaagtattc cacctgggga gtacgccggc aacggtgaaa

840

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggaggaaca tgtggtttaa ttcgatgata

900

cgcgaggaac cttacccggg cttaaattgc aaatgaatat gccggnancg gcatagccgc

960

aaggcatttg

970

<210> 293

<211> 1533

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 1_1_14

<400> 293

ttacaatgaa gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc

60

aagtcgaggg gcagcatttc agtttgcttg caaactggag atggcgaccg gcgcacgggt

120

gagtaacacg tatccaacct gccgataact cggggatagc ctttcgaaag aaagattaat

180

acccgatggt ataatcagac cgcatggtct tgttattaaa gaatttcggt tatcgatggg

240

gatgcgttcc attaggcagt tggtgaggta acggctcacc aaaccttcga tggatagggg

300

ttctgagagg aaggtccccc acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc

360

agcagtgagg aatattggtc aatgggcgca ggcctgaacc agccaagtag cgtgaaggat

420

gactgcccta tgggttgtaa acttctttta tatgggaata aagttttcca cgtgtggaat

480

tttgtatgta ccatatgaat aaggatcggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

gaggatccga gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgtaggtg gacagttaag

600

tcagttgtga aagtttgcgg ctcaaccgta aaattgcagt tgatactggc tgtcttgagt

660

acagtagagg tgggcggaat tcgtggtgta gcggtgaaat gcttagatat cacgaagaac

720

tccgattgcg aaggcagctc actggactgc aactgacact gatgctcgaa agtgtgggta

780

tcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cacagtaaac gatgaatact cgctgtttgc

840

gatatacagt aagcggccaa gcgaaagcat taagtattcc acctggggag tacgccggca

900

acggtgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat

960

tcgatgatac gcgaggaacc ttacccgggc ttaaattgca tttgaatata ttggaaacag

1020

tatagccgta aggcaaatgt gaaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt

1080

gtcggcttaa gtgccataac gagcgcaacc cttatcttta gttactaaca ggtcatgctg

1140

aggactctag agagactgcc gtcgtaagat gtgaggaagg tggggatgac gtcaaatcag

1200

cacggccctt acgtccgggg ctacacacgt gttacaatgg ggggtacaga aggcagctac

1260

ctggtgacag gatgctaatc ccaaaagcct ctctcagttc ggatcgaagt ctgcaacccg

1320

acttcgtgaa gctggattcg ctagtaatcg cgcatcagcc atggcgcggt gaatacgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcaagcc atgaaagccg ggggtacctg aagtacgtaa

1440

ccgcaaggag cgtcctaggg taaaactggt aattggggct aagtcgtaac aaggtagccg

1500

taccggaagg tgcggctgga acacctcctt tct

1533

<210> 294

<211> 1345

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 1_1_30

<400> 294

tggcgaccgg cgcacgggtg agtaacacgt atccaacctg ccgataactc ggggatagcc

60

tttcgaaaga aagattaata tccgatagta tattaaaacc gcatggtttt actattaaag

120

aatttcggtt atcgatgggg atgcgttcca ttagtttgtt ggcggggtaa cggcccacca

180

agactacgat ggataggggt tctgagagga aggtccccca cattggaact gagacacggt

240

ccaaactcct acgggaggca gcagtgagga atattggtca atggacgaga gtctgaacca

300

gccaagtagc gtgaaggatg actgccctat gggttgtaaa cttcttttat atgggaataa

360

agtattccac gtgtggaatt ttgtatgtac catatgaata aggatcggct aactccgtgc

420

cagcagccgc ggtaatacgg aggatccgag cgttatccgg atttattggg tttaaaggga

480

gcgtaggtgg attgttaagt cagttgtgaa agtttgcggc tcaaccgtaa aattgcagtt

540

gaaactggca gtcttgagta cagtagaggt gggcggaatt cgtggtgtag cggtgaaatg

600

cttagatatc acgaagaact ccgattgcga aggcagctca ctagactgca actgacactg

660

atgctcgaaa gtgtgggtat caaacaggat tagataccct ggtagtccac acagtaaacg

720

atgaatactc gctgtttgcg atatacagta agcggccaag cgaaagcatt aagtattcca

780

cctggggagt acgccggcaa cggtgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg

840

gaggaacatg tggtttaatt cgatgatacg cgaggaacct tacccgggct taaattgcat

900

ttgaataatc tggaaacagg ttagccgcaa ggcaaatgtg aaggcagctc acgagactgc

960

aactgacgtg ccgtgaggtg tcggcttaag tgccataacg agcgcaaccc ttatctttag

1020

ttactaacag gttatgctga ggactctaga gagactgccg tcgtaagatg tgaggaaggt

1080

ggggatgacg tcaaatcagc acggccctta cgtccggggc tacacacgtg ttacaatggg

1140

gggtacagaa ggcagctacc tggtgacagg atgctaatcc caaaaacctc tctcagttcg

1200

gatcgaagtc tgcaacccga cttcgtgaag ctggattcgc tagtaatcgc gcatcagcca

1260

tggcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagcca tgaaagccgg

1320

gggtacctga agtacgtaac cgcaa

1345

<210> 295

<211> 1381

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 1_1_6

<220>

<221> modified_base

<222> (1333)..(1333)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1337)..(1338)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 295

aggggcagca tttcagtttg cttgcaaact ggagatggcg accggcgcac gggtgagtaa

60

cacgtatcca acctgccgat aactcgggga tagcctttcg aaagaaagat taatacccga

120

tggtataatg aaaccgcatg gtcttattat taaagaattt cggttatcga tggggatgcg

180

ttccattagg cagttggtga ggtaacggct caccaaacct tcgatggata ggggttctga

240

gaggaaggtc ccccacattg gaactgagac acggtccaaa ctcctacggg aggcagcagt

300

gaggaatatt ggtcaatggg cgcaggcctg aaccagccaa gtagcgtgaa ggatgactgc

360

cctatgggtt gtaaacttct tttatatggg aataaagttt tccacgtgtg gaattttgta

420

tgtaccatat gaataaggat cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggaggat

480

ccgagcgtta tccggattta ttgggtttaa agggagcgta ggtggacagt taagtcagtt

540

gtgaaagttt gcggctcaac cgtaaaattg cagttgatac tggctgtctt gagtacagta

600

gaggtgggcg gaattcgtgg tgtagcggtg aaatgcttag atatcacgaa gaactccgat

660

tgcgaaggca gctcactgga ctgcaactga cactgatgct cgaaagtgtg ggtatcaaac

720

aggattagat accctggtag tccacacagt aaacgatgaa tactcgctgt ttgcgatata

780

cagtaagcgg ccaagcgaaa gcattaagta ttccacctgg ggagtacgcc ggcaacggtg

840

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggagga acatgtggtt taattcgatg

900

atacgcgagg aaccttaccc gggcttaaat tgcatttgaa tatattggaa acagtatagc

960

cgtaaggcaa atgtgaaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgtcggc

1020

ttaagtgcca taacgagcgc aacccttatc tttagttact aacaggtcat gctgaggact

1080

ctagagagac tgccgtcgta agatgtgagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcagcacggc

1140

ccttacgtcc ggggctacac acgtgttaca atggggggta cagaaggcag ctacctggtg

1200

acaggatgct aatcccaaaa gcctctctca gttcggatcg aagtctgcaa cccgacttcg

1260

tgaagctgga ttcgctagta atcgcgcatc agccatggcg cggtgaatac gttcccgggc

1320

cttgtacaca ccncggnntc aagccatgaa agccgggggt acctgaagta cgtaaccgca

1380

a

1381

<210> 296

<211> 1385

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 20_3

<220>

<221> modified_base

<222> (7)..(7)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (19)..(24)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 296

tcgaggnggc agcacaggnn nnnntaccgg gtggcgaccg gcgcacgggt gagtaacgcg

60

tatgcaactt gcctatcaga gggggataac ccggcgaaag tcggactaat accgcatgaa

120

gcaggggccc cgcatgggga tatttgctaa agattcatcg ctgatagata ggcatgcgtt

180

ccattaggca gttggcgggg taacggccca ccaaaccgac gatggatagg ggttctgaga

240

ggaaggtccc ccacattggt actgagacac ggaccaaact cctacgggag gcagcagtga

300

ggaatattgg tcaatgggcg taagcctgaa ccagccaagt cgcgtgaggg atgaaggttc

360

tatggatcgt aaacctcttt tataagggaa taaagtgcgg gacgtgtccc gttttgtatg

420

taccttatga ataaggatcg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggaggatcc

480

gagcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggtgcgtagg cggcctttta agtcagcggt

540

gaaagtctgt ggctcaacca tagaattgcc gttgaaactg ggaggcttga gtatgtttga

600

ggcaggcgga atgcgtggtg tagcggtgaa atgcttagat atcacgcaga accccgattg

660

cgaaggcagc ctgccaagcc atgactgacg ctgatgcacg aaagcgtggg gatcaaacag

720

gattagatac cctggtagtc cacgcagtaa acgatgatca ctagctgttt gcgatacaca

780

gtaagcggca cagcgaaagc gttaagtgat ccacctgggg agtacgccgg caacggtgaa

840

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggacgaac atgtggttta attcgatgat

900

acgcgaggaa ccttacccgg gtttgaacgc attcggaccg aggtggaaac accttttcta

960

gcaatagccg tttgcgaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgtcggc

1020

ttaagtgcca taacgagcgc aacccttgcc actagttact aacaggtgat gctgaggact

1080

ctggtgggac tgccagcgta agctgcgagg aaggcgggga tgacgtcaaa tcagcacggc

1140

ccttacatcc ggggcgacac acgtgttaca atggcgtgga caaagggaag ccacctggcg

1200

acagggagcg aatccccaaa ccacgtctca gttcggatcg gagtctgcaa cccgactccg

1260

tgaagctgga ttcgctagta atcgcgcatc agccatggcg cggtgaatac gttcccgggc

1320

cttgtacaca ccgcccgtca agccatggga gccgggggta cctgaagtcc gtaaccgcga

1380

ggatc

1385

<210> 297

<211> 1382

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 2_1_22

<400> 297

tcgaggggca gcattttagt ttgcttgcaa actgaagatg gcgaccggcg cacgggtgag

60

taacacgtat ccaacctgcc gataactccg ggatagcctt tcgaaagaaa gattaatacc

120

ggatggcata ctaatatcgc atgatatttt tattaaagaa tttcggttat cgatggggat

180

gcgttccatt agtttgttgg cggggtaacg gcccaccaag actacgatgg ataggggttc

240

tgagaggaag gtcccccaca ttggaactga gacacggtcc aaactcctac gggaggcagc

300

agtgaggaat attggtcaat ggacgagagt ctgaaccagc caagtagcgt gaaggatgac

360

tgccctatgg gttgtaaact tcttttatat gggaataaag tattccacgt gtggaatttt

420

gtatgtacca tatgaataag gatcggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag

480

gatccgagcg ttatccggat ttattgggtt taaagggagc gtaggtggat tgttaagtca

540

gttgtgaaag tttgcggctc aaccgtaaaa ttgcagttga aactggcagt cttgagtaca

600

gtagaggtgg gcggaattcg tggtgtagcg gtgaaatgct tagatatcac gaagaactcc

660

gattgcgaag gcagctcact agactgcact gacactgatg ctcgaaagtg tgggtatcaa

720

acaggattag ataccctggt agtccacaca gtaaacgatg aatactcgct gtttgcgata

780

tacagtaagc ggccaagcga aagcattaag tattccacct ggggagtacg ccggcaacgg

840

tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggag gaacatgtgg tttaattcga

900

tgatacgcga ggaaccttac ccgggcttaa attgcatttg aataatctgg aaacaggtta

960

gccgcaaggc aaatgtgaag gtgctgcatg gttgtcgtca gctcgtgccg tgaggtgtcg

1020

gcttaagtgc cataacgagc gcaaccctta tctttagtta ctaacaggtc atgctgagga

1080

ctctagagag actgccgtcg taagatgtga ggaaggtggg gatgacgtca aatcagcacg

1140

gcccttacgt ccggggctac acacgtgtta caatgggggg tacagaaggc agctacctgg

1200

tgacaggatg ctaatcccaa aaacctctct cagttcggat cgaagtctgc aacccgactt

1260

cgtgaagctg gattcgctag taatcgcgca tcagccatgg cgcggtgaat acgttcccgg

1320

gccttgtaca caccgcccgt caagccatga aagccggggg tacctgaagt acgtaaccgc

1380

aa

1382

<210> 298

<211> 945

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 2_1_56FAA

<220>

<221> modified_base

<222> (490)..(490)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (760)..(760)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (775)..(775)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (784)..(785)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (848)..(848)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (867)..(867)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (887)..(888)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (902)..(902)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (909)..(909)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (919)..(919)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (934)..(935)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 298

ttgctggcga ccggcgcacg ggtgagtaac acgtatccaa cctgcccttt actcggggat

60

agcctttcga aagaaagatt aatacccgat agcataatga ttccgcatgg tttcattatt

120

aaaggattcc ggtaaaggat ggggatgcgt tccattaggt tgttggtgag gtaacggccc

180

accaagcctt cgatggatag gggttctgag aggaaggtcc cccacattgg aactgagaca

240

cggtccaaac tcctacggga ggcagcagtg aggaatattg gtcaatgggc gttagcctga

300

accagccaag tagcgtgaag gatgaaggct ctatgggtcg taaacttctt ttatataaga

360

ataaagtgca gtatgtatac tgttttgtat gtattatatg aataaggatc ggctaactcc

420

gtgccagcag ccgcggtaat acggaggatc cgagcgttat ccggatttat tgggtttaaa

480

gggagcgtan gtggactggt aagtcagttg tgaaagtttg cggctcaacc gtaaaattgc

540

agttgatact gtcagtcttg agtacagtag aggtgggcgg aattcgtggt gtagcggtga

600

aatgcttaga tatcacgaag aactccgatt gcgaaggcag ctcactggac tgcaactgac

660

actgatgctc gaaagtgtgg gtatcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacacagta

720

aacgatgaat actcgctgtt tgcgatatac agtaagcggn caagcgaaag cattnaagta

780

ttcnncctgg ggagtacgcc ggcaacggtg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac

840

aagcgganga acatgtggtt taattcnatg atacgcgagg aaccttnncc cgggcttaaa

900

tngcagtgna atgatgtgna aacatgtcag tganncatca ccact

945

<210> 299

<211> 1525

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 2_2_4

<400> 299

tacaatgaag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctag ctacaggctt aacacatgca

60

agtcgagggg cagcatttcg ctagcaatag tgaagatggc gaccggcgca cgggtgagta

120

acacgtatcc aacctgccga taactcgggg atagcctttc gaaagaaaga ttaatatccg

180

atagtatatt aaaaccgcat ggttttacta ttaaagaatt tcggttatcg atggggatgc

240

gttccattag tttgttggcg gggtaacggc ccaccaagac tacgatggat aggggttctg

300

agaggaaggt cccccacatt ggaactgaga cacggtccaa actcctacgg gaggcagcag

360

tgaggaatat tggtcaatgg acgagagtct gaaccagcca agtagcgtga aggatgactg

420

ccctatgggt tgtaaacttc ttttatatgg gaataaagta ttccacgtgt gggattttgt

480

atgtaccata tgaataagga tcggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggagga

540

tccgagcgtt atccggattt attgggttta aagggagcgt aggtggattg ttaagtcagt

600

tgtgaaagtt tgcggctcaa ccgtaaaatt gcagttgaaa ctgggagtct tgagtacagt

660

agaggtgggc ggaattcgtg gtgtagcggt gaaatgctta gatatcacga agaactccga

720

ttgcgaaggc agctcactag actgtcactg acactgatgc tcgaaagtgt gggtatcaaa

780

caggattaga taccctggta gtccacacag taaacgatga atactcgctg tttgcgatat

840

acagtaagcg gccaagcgaa agcattaagt attccacctg gggagtacgc cggcaacggt

900

gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggagg aacatgtggt ttaattcgat

960

gatacgcgag gaaccttacc cgggcttaaa ttgcaaatga ataatctgga aacaggttag

1020

ccgcaaggca tttgtgaagg tgctgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgccgt gaggtgtcgg

1080

cttaagtgcc ataacgagcg caacccttat ctttagttac taacaggtta tgctgaggac

1140

tctagagaga ctgccgtcgt aagatgtgag gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg

1200

cccttacgtc cggggctaca cacgtgttac aatggggggt acagaaggca gctacctggt

1260

gacaggatgc taatcccaaa aacctctctc agttcggatc gaagtctgca acccgacttc

1320

gtgaagctgg attcgctagt aatcgcgcat cagccatggc gcggtgaata cgttcccggg

1380

ccttgtacac accgcccgtc aagccatgaa agccgggggt acctgaagta cgtaaccgca

1440

aggagcgtcc tagggtaaaa ctggtaattg gggctaagtc gtaacaaggt agccgtaccg

1500

gaaggtgcgg ctggaacacc tcctt

1525

<210> 300

<211> 1362

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 315-5

<400> 300

taggcttaac acatgcaagt cgaggggcag cattatctta gcttgctaag atagatggcg

60

accggcgcac gggtgagtaa cacgtatcca accttccggt tactcgggga taggctttcg

120

aaagaaagat taatacccga tgttgcgtat ctttctcctg aaagatacgc caaaggattc

180

cggtaaccga tggggatgcg ttccattagg cagttggcgg ggtaacggcc caccaaacct

240

tcgatggata ggggttctga gaggaaggtc ccccacattg gaactgagac acggtccaaa

300

ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt ggtcaatgga cggaagtctg aaccagccaa

360

gtagcgtgaa ggatgactgc cctctgggtt gtaaacttct tttatacggg aataacatga

420

ggtacgcgta ccttattgca tgtaccgtta tgaataagca tcggctaact ccgtgccagc

480

agccgcggta atacggagga tgcgagcgtt atccggattt attgggttta aagggagcgt

540

aggtgggata ttaagtcagc tgtgaaagtt tggggctcaa ccttaaaatt gcagttgata

600

ctggtttcct tgagtacggt acaggtgggc ggaattcgtg gtgtagcggt gaaatgctta

660

gatatcacga agaactccga tcgcgaaggc agctcaccgg gccggaactg acactgatgc

720

tcgaaagtgc gggtatcaaa caggattaga taccctggta gtccgcacag taaacgatga

780

atactcgctg tttgcgatac acagtaagcg gccaagcgaa agcgttaagt attccacctg

840

gggagtacgc cggcaacggt gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggagg

900

aacatgtggt ttaattcgat gatacgcgag gaaccttacc cgggcttaaa ttgcgctggc

960

ttttaccgga aacggtattt tcttcggacc agcgtgaagg tgctgcatgg ttgtcgtcag

1020

ctcgtgccgt gaggtgtcgg cttaagtgcc ataacgagcg caacccttat ctttagttac

1080

taacagtttt gctgaggact ctaaagagac tgccgtcgta agatgcgagg aaggtgggga

1140

tgacgtcaaa tcagcacggc ccttacgtcc ggggctacac acgtgttaca atggggagca

1200

cagcaggttg ctacacggcg acgtgatgcc aatccgtaaa actcctctca gttcggatcg

1260

aagtctgcaa cccgacttcg tgaagctgga ttcgctagta atcgcgcatc agccacggcg

1320

cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca ag

1362

<210> 301

<211> 1243

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 31SF15

<400> 301

taacacatgc acgtcgaggg accggcgcac gggtgagtaa cacgtatcca acctaccggt

60

tattccggga tagcctttcg aaagaaagat taataccgga tagttaaagt cgataaccga

120

tggggatgcg ttccattagt ttgttggcgg ggtaacggcc caccaagaca tcgatggata

180

ggggttctga gaggaaggtc ccccacattg gaactgagac acggtccaaa ctcctacggg

240

aggcagcagt gaggaatatt ggtcaatgga cgagagtctg aacgagccaa gtagcgtgaa

300

ggatgactgc ctatgggttg taaacttctt ttatatggga atatgtatgt accatacgaa

360

taaggatcgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggaggatccg agcgttatcc

420

ggatttattg ggtttaaagg gagcgtaggc ggactattaa gtcagctgtg aaagtttgcg

480

gctcaaccgt aaaattgcag ttgatactgg tcgtcttgag tgcagtagag gtaggcggaa

540

ttcgtggtgt agcggtgaaa tgcttagata tcacgaagaa ctccgattgc gaaggcagct

600

tactggactg actgacgctg atgctcgaaa gtgtgggtat caaacaggat tagataccct

660

ggtagtccac acagtaaacg atgaatactc gctgtttgcg agcaagcggc caagcgaaag

720

cattaagtat tccacctggg gagtacgccg gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg

780

ggcccgcaca agcggaggaa catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttacccg

840

ggcttaaatt gtgaaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt

900

aagtgccata acgagcgcaa cccttatctt tagttactta cagctgagga ctctagagag

960

actgccgtcg tatgatggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg tcctatcgtc

1020

cggggataca cacgtgttac aatggggggc agaaggcagc tacacagcga tgtgatgcta

1080

atcccacctc tagcagttcg gatggagtct gcaacccgac tccagaagct ggattcgcta

1140

gtaatcgcgc atcagcacgg cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1200

caagccatga aagccggggg tacctgaagt ccgacggcct agg

1243

<210> 302

<211> 1207

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 31SF18

<400> 302

acacatgcaa gtcgagggac cggcgcacgg gtgagtaaca cgtatccaac ctaccggtta

60

ttctgggata gcctttcgaa agaaagatta ataccggata gttaaagtcg ataaccgatg

120

gggatgcgtt ccattagttt gttggcgggg taacggccca ccaagacatc gatggatagg

180

ggttctgaga ggaaggtccc ccacattgga actgagacac ggtccaaact cctacgggag

240

gcagcagtga ggaatattgg tcaatggacg agagtctgaa ccagccaagt agcgtgaagg

300

atgactgcct atgggttgta aacttctttt atatgggaat atgtatgtac catacgaata

360

aggatcggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg aggatccgag cgttatccgg

420

atttattggg tttaaaggga gcgtaggcgg actattaagt cagctgtgaa agtttgcggc

480

tcaaccgtaa aattgcagtt gatactggtc gtcttgagtg cagtagaggt aggcggaatt

540

actggtgtag cggtgaaatg cttagatatc acgaagaact ccgattgcga aggcagctta

600

ctggactgac tgacgctgat gctcgaaagt gtgggtatca aacaggatta gataccctgg

660

tagtccacac agtaaacgat gaatactcgc tgtttgcgag caagcggcca agcgaaagca

720

ttaagtattc cacctgggga gtacgccggc aacggtgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg

780

cccgcacaag cggaggaaca tgtggtttaa ttcgatgata cgcgaggaac cttacccggg

840

cttaaattgt gaaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt gtcggcttaa

900

gtgccataac gagcgcaacc cttatcttta gttactaaca gctgaggact ctagagagac

960

tgccgtcgta agatggagga aggtggggat gacgtcaaat cagcacggcc cttacgtccg

1020

gggctacaca cgtgttacaa tggggggcag aaggcagcta cacagcgatg tgatgctaat

1080

cccacctctc tcagttcgga tggagtctgc aacccgactc cagaagctgg attcgctagt

1140

aatcgcgcat cagccacggc gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc

1200

aagccat

1207

<210> 303

<211> 1254

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 35AE31

<400> 303

caggcttaac acatgcaagt cgagggaccg gcgcacgggt gagtaacacg tatccaacct

60

accggttatt ctgggatagc ctttcgaaag aaagattaat accggatagt taaagtcgat

120

aaccgatggg gatgcgttcc attagtttgt tggcggggta acggcccacc aagacatcga

180

tggatagggg ttctgagagg aaggtccccc acattggaac tgagacacgg tccaaactcc

240

tacgggaggc agcagtgagg aatattggtc aatggacgag agtctgaacc agccaagtag

300

cgtgaaggat gactgcctat gggttgtaaa cttcttttat atgggaatat gtatgtacca

360

tacgaataag gatcggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag gatccgagcg

420

ttatccggat ttattgggtt taaagggagc gtaggcggac tattaagtca gctgtgaaag

480

tttgcggctc aaccgtaaaa ttgcagttga tactggtcgt cttgagtgca gtagaggtag

540

gcggaattcg tggtgtagcg gtgaaatgct tagatatcac gaagaactcc gattgcgaag

600

gcagcttact ggactgactg acgctgatgc tcgaaagtgt gggtatcaaa caggattaga

660

taccctggta gtccacacag taaacgatga atactcgctg tttgcgagca agcggccaag

720

cgaaagcatt aagtattcca cctggggagt acgccggcaa cggtgaaact caaaggaatt

780

gacgggggcc cgcacaagcg gaggaacatg tggtttaatt cgatgatacg cgaggaacct

840

tacccgggct taaattgtga aggtgctgca tggttgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt

900

cggcttaagt gccataacga gcgcaaccct tatctttagt tactaacagc tgaggactct

960

agagagactg ccgtcgtaag atggaggaag gtggggatga cgtcaaatca gcacggccct

1020

tacgtccggg gctacacacg tgttacaatg gggggcagaa ggcagctaca cagcgatgtg

1080

atgctaatcc cacctctctc agttcggatg gagtctgcaa cccgactcca gaagctggat

1140

tcgctagtaa tcgcgcatca gccaggcgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc

1200

gcccgtcaag ccatgaaagc cgggggtacc tgaagtccgt agcggcctag ggta

1254

<210> 304

<211> 1238

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 35AE37

<400> 304

gcttaacaca tgcaagtcga gggaccggcg cacgggtgag taacacgtat ccaacctacc

60

ggttattccg ggatagcctt tcgaaagaaa gattaatacc ggatagttaa agtcgataac

120

cgatggggat gcgttccatt agtttgttgg cggggtaacg gcccaccaag acatcgatgg

180

ataggggttc tgagaggaag gtcccccaca ttggaactga gacacggtcc aaactcctac

240

gggaggcagc agtgaggaat attggtcaat ggacgagagt ctgacccagc caagtagcgt

300

gaaggatgac tgcctatggg ttgtaaactt cttttatatg ggaatatgta tgtaccatac

360

gaataaggat cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggaggat ccgagcgtta

420

tccggattta ttgggtttaa agggagcgta ggcggactat taagtcagct gtgaaagttt

480

gcggctcaac cgtaaaattg cagttgatac tggtcgtctt gagtgcagta gaggtaggcg

540

gaattcgtgg tgtagcggtg aaatgcttag atatcacgaa gaactccgat tgcgaaggca

600

gcttactgga ctgactgacg ctgatgctcg aaagtgtggg tatcaaacag gattagatac

660

cctggtagtc cacacagtaa acgatgaata ctcgctgttt gcgagcaagc ggccaagcga

720

aagcattaag tattccacct ggggagtacg ccggcaacgg tgaaactcaa aggaattgac

780

gggggcccgc acaagcggag gaacatgtgg tttaattcga tgatacgcga ggaaccttac

840

ccgggcttaa attgtgaagg tgctgcatgg ttgtcgtcag ctcgagccgt gaggtgtcgg

900

cttaagtgcc ataacgagcg caacccttat ctttagttac taacagctga ggactctaga

960

gagactgccg tcgtaagatg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcagca cggcccttac

1020

gtccggggct acacacgtgt tacaatgggg ggcagaaggc agctacacag cgatgtgatg

1080

ctaatcccac ctctctcagt tcggatggag tctgcaaccc gactccagaa gctggattcg

1140

ctagtaatcg cgcatcagcc acggcgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc

1200

ccgtcaagcc atgaaagccg ggggtacctg aagtccga

1238

<210> 305

<211> 1229

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 35BE34

<400> 305

tcgagggacc ggcgcacggg tgagtaacac gtatccaacc taccggttat tctgggatag

60

cctttcgaaa gaaagattaa taccggatag ttaaagtcga taaccgatgg ggatgcgttc

120

cattagtttg ttggcggggt aacggcccac caagacatcg atggataggg gttctgagag

180

gaaggtcccc cacattggaa ctgagacacg gtccaaactc ctacgggagg cagcagtgag

240

gaatattggt caatggacga gagtctgaac cagccaagta gcgtgaagga tgactgccta

300

tgggttgtaa acttctttta tatgggaata tgtatgtacc atacgaataa ggatcggcta

360

actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga ggatccgagc gttatccgga tttattgggt

420

ttaaagggag cgtaggcgga ctattaagtc agctgtgaaa gtttgcggct caaccgtaaa

480

attgcagttg atactggtcg tcttgagtgc agtagaggta ggcggaattc gtggtgtagc

540

ggtgaaatgc ttagatatca cgaagaactc cgattgcgaa ggcagcttac tggactgact

600

gacgctgatg ctcgaaagtg tgggtatcaa acaggattag ataccctggt agtccacaca

660

gtaaacgatg aatactcgct gtttgcgagc aagcggccaa gcgaaagcat taagtattcc

720

acctggggag tacgccggca acggtgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc

780

ggaggaacat gtggtttaat tcgatgatac gcgaggaacc ttacccgggc ttaaattgtg

840

aaggtgctgc atggttgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg tcggcttaag tgcctaaacg

900

agcgcaaccc ttatctttag ttactaacag ctgaggactc tagagagact gccgtcgtaa

960

gatggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc agcacggccc ttacgtccgg ggctacacac

1020

gtgttacaat ggggggcaga aggcagctac acagcgatgt gatgctaatc ccacctctct

1080

cagttcggat ggagtctgca acccgactcc agaagctgga ttcgctagta atcgtgcatc

1140

agccacggcg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca agccatgaaa

1200

gccgggggta cctgaagtcc gacggccta

1229

<210> 306

<211> 1250

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 35BE35

<400> 306

acacatgcaa gtcgagggac cggcgcacgg gtgagtaaca cgtatccaac ctaccggtta

60

ttccgggata gcctttcgaa agaaagatta ataccggata gttaaagtcg ataaccgatg

120

gggatgcgtt ccattagttt gttggcgggg taacggccca ccaagacatc gatggatagg

180

ggttctgaga ggaaggtccc ccacattgga actgagacac ggtccaaact cctacgggag

240

gcagcagtga ggaatattgg tcaatggacg agagtctgaa ccagccaagt agcgtgaagg

300

atgactgcct atgggttgta aacttctttt atatgggaat atgtatgtac catacgaata

360

aggatcggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg aggatccgag cgttatccgg

420

atttattggg tttaaaggga gcgtaggcgg actattaagt cagctgtgaa agtttgcggc

480

tcaaccgtaa aattgcagtt gatactggtc gtcttgagtg cagtagaggt aggcggaatt

540

cgtggtgtag cggtgaaatg cttagatatc acgaagaact ccgattgcga aggcagctta

600

ctggactgac tgacgctgat gctcgaaagt gtgggtatca aacatgatta gataccctgg

660

tagtccacac agtaaacgat gaatactcgc tgtttgcgag caagcggcca agcgaaagca

720

ttaagtattc cacctgggga gtacgccggc actggcgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg

780

cccgcacaag cggaggaaca tgtggtttaa ttcgatgata cgcgaggaac cttacccggg

840

cttaaattgt gaaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt gtcggcttaa

900

gtgccataac gagcgcaacc cttatcttta gttactaaca gctgaggact ctagagagac

960

tgccgtcgta agatggagga aggtggggat gacgtcaaat cagcacggcc cttacgtccg

1020

gggctacaca cgtgttacaa tggggggcag aaggcagcta catagcgatg tgatgctaat

1080

cccacctctc tcagttcgga tggagtctgc aacccgactc cagaagctgg attcgctagt

1140

aatcgcgcat cagccacggc gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc

1200

aagccaataa agccgggggt acttgaagtc cgagcggcct agggtaaaac

1250

<210> 307

<211> 1351

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 3_1_19

<220>

<221> modified_base

<222> (301)..(301)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 307

taccgggtgg cgaccggcgc acgggtgagt aacgcgtatg caacttgcct atcagagggg

60

gataacccgg cgaaagtcgg actaataccg catgaagcag gggccccgca tggggatatt

120

tgctaaagat tcatcgctga tagataggca tgcgttccat taggcagttg gcggggtaac

180

ggcccaccaa accgacgatg gataggggtt ctgagaggaa ggtcccccac attggtactg

240

agacacggac caaactccta cgggaggcag cagtgaggaa tattggtcaa tggccgtaag

300

nctgaaccag ccaagtcgcg tgagggatga aggttctatg gatcgtaaac ctcttttata

360

agggaataaa gtgcgggacg tgtcccgttt tgtatgtacc ttatgaataa ggcggctaac

420

tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg ccagcgttat ccggatttat tgggtttaaa

480

gggtgcgtag gcggcctttt aagtcagcgg tgaaagtctg tggctcaacc atagaattgc

540

cgttgaaact ggggggcttg agtatgtttg aggcaggcgg aatgcgtggt gtagcggtga

600

aatgcataga tatcacgcag aaccccgatt gcgaaggcag cctgccaagc cattactgac

660

gctgatgcac gaaagcgtgg ggatcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgcagta

720

aacgatgatc actagctgtt tgcgatacac tgtaagcggc acagcgaaag cgttaagtga

780

tccacctggg gagtacgccg gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

840

agcggaggaa catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttacccg ggtttgaacg

900

cattcggacc gaggtggaaa caccttttct agcaatagcc gtttgcgagg tgctgcatgg

960

ttgtcgtcag ctcgtgccgt gaggtgtcgg cttaagtgcc ataacgagcg caacccttgc

1020

cactagttac taacaggtga tgctgaggac tctggtggga ctgccagcgt aagctgcgag

1080

gaaggcgggg atgacgtcaa atcagcacgg cccttacatc cggggcgaca cacgtgttac

1140

aatggcgtgg acaaagggag gccacctggc gacagggagc gaatccccaa accacgtctc

1200

agttcggatc ggagtctgca acccgactcc gtgaagctgg attcgctagt aatcgcgcat

1260

cagccatggc gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc aagccatggg

1320

agccgggggt acctgaagtc cgtaaccgaa a

1351

<210> 308

<211> 1362

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 3_1_23

<400> 308

gtcgaggggc agcattttag tttgcttgca aactgaagat ggcgaccggc gcacgggtga

60

gtaacacgta tccaacctgc cgataactcc ggaatagcct ttcgaaagaa agattaatac

120

cggatggtat acgaatatcg catgatattt ttattaaaga atttcggtta tcgatgggga

180

tgcgttccat tagtttgttg gcggggtaac ggcccaccaa gactacgatg gataggggtt

240

ctgagaggaa ggtcccccac attggaactg agacacggtc caaactccta cgggaggcag

300

cagtgaggaa tattggtcaa tggggcctga acagccaagt acgtgaaggc ttgggaactt

360

cttttatatg ggaataaagt tttccacgtg tggaattttg tatgtaccat atgaataagg

420

atcggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg atccgagcgt tatccggatt

480

tattgggttt aaagggagcg taggtggatt gttaagtcag ttgtgaaagt ttgcggctca

540

accgtaaaat tgcagttgaa actggcagtc ttgagtacag tagaggtggg cggaattcgt

600

ggtgtagcgg tgaaatgctt agatatcacg aagaactccg attgcgaagg cagctcacta

660

gactgtcact gacactgatg ctcgaaagtg tgggtatcaa acaggattag ataccctggt

720

agtccacaca gtaaacgatg aatactcgct gtttgcgata tacagtaagc ggccaagcga

780

aagcattaag tattccacct ggggagtacg ccggcaacgg tgaaactcaa aggaattgac

840

gggggcccgc acaagcggag gaacatgtgg tttaattcga tgatacgcga ggaaccttac

900

ccgggcttaa attgcaacag aatatattgg aaacagtata gccgtgaagc tgttgtgaat

960

gtgctgcatg gttgtcgtca gctcgtgccg tgaggtgtcg gcttaagtgc cataacgagc

1020

gcaaccctta tctttagtta ctaacaggtc atgctgagga ctctagagag actgccgtcg

1080

taagatgtga ggaaggtggg gatgacgtca aatcagcacg gcccttacgt ccggggctac

1140

acacgtgtta caatgggggg tacagaaggc ggctacctgg tgacaggatg ctaatcccaa

1200

aaacctctct cagttcggat cgaagtctgc aacccgactt cgtgaagctg gattcgctag

1260

taatcgcgca tcagccatgg cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1320

caagccatga aagccggggg tacctgaagt acgtaaccgc aa

1362

<210> 309

<211> 1532

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 3_1_33FAA

<400> 309

tacaatgaag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctag ctacaggctt aacacatgca

60

agtcgagggg cagcatggtc ttagcttgct aaggctgatg gcgaccggcg cacgggtgag

120

taacacgtat ccaacctgcc gtctactctt ggccagcctt ctgaaaggaa gattaatcca

180

ggatgggatc atgagttcac atgtccgcat gattaaaggt attttccggt agacgatggg

240

gatgcgttcc attagatagt aggcggggta acggcccacc tagtcaacga tggatagggg

300

ttctgagagg aaggtccccc acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc

360

agcagtgagg aatattggtc aatgggcgat ggcctgaacc agccaagtag cgtgaaggat

420

gactgcccta tgggttgtaa acttctttta taaaggaata aagtcgggta tgcatacccg

480

tttgcatgta ctttatgaat aaggatcggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

gaggatccga gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgtagatg gatgtttaag

600

tcagttgtga aagtttgcgg ctcaaccgta aaattgcagt tgatactgga tgtcttgagt

660

gcagttgagg caggcggaat tcgtggtgta gcggtgaaat gcttagatat cacgaagaac

720

tccgattgcg aaggcagcct gctaagctgc aactgacatt gaggctcgaa agtgtgggta

780

tcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cacggtaaac gatgaatact cgctgtttgc

840

gatatacggc aagcggccaa gcgaaagcgt taagtattcc acctggggag tacgccggca

900

acggtgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat

960

tcgatgatac gcgaggaacc ttacccgggc ttaaattgca ctcgaatgat ccggaaacgg

1020

ttcagctagc aatagcgagt gtgaaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag

1080

gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa cccttgttgt cagttactaa caggtgatgc

1140

tgaggactct gacaagactg ccatcgtaag atgtgaggaa ggtggggatg acgtcaaatc

1200

agcacggccc ttacgtccgg ggctacacac gtgttacaat ggggggtaca gagggccgct

1260

accacgcgag tggatgccaa tccctaaaac ccctctcagt tcggactgga gtctgcaacc

1320

cgactccacg aagctggatt cgctagtaat cgcgcatcag ccacggcgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaag ccatgggagc cgggggtacc tgaagtgcgt

1440

aaccgcgagg atcgccctag ggtaaaactg gtgactgggg ctaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtaccggaa ggtgcggctg gaacacctcc tt

1532

<210> 310

<211> 1045

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 3_1_40A

<220>

<221> modified_base

<222> (23)..(23)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (31)..(31)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (33)..(33)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (41)..(41)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (730)..(730)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 310

caagtagcgt gaaggatgac tgncctatgg ntntaaactt ntttataaag gaataaagtc

60

gggtatgcat acccgtttgc atgtacttta tgaataagga tcggctaact ccgtgccagc

120

agccgcggta atacggagga tccgagcgtt atccggattt attgggttta aagggagcgt

180

agatggatgt ttaagtcagt tgtgaaagtt tgcggctcaa ccgtaaaatt gcagttgata

240

ctggatatct tgagtgcagt tgaggcaggc ggaattcgtg gtgtagcggt gaaatgctta

300

gatatcacga agaactccga ttgcgaaggc agcctgctaa gctgcaactg acattgaggc

360

tcgaaagtgt gggtatcaaa caggattaga taccctggta gtccacacgg taaacgatga

420

atactcgctg tttgcgatat acggcaagcg gccaagcgaa agcgttaagt attccacctg

480

gggagtacgc cggcaacggt gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggagg

540

aacatgtggt ttaattcgat gatacgcgag gaaccttacc cgggcttaaa ttgcagatga

600

attacggtga aagccgtaag ccgcaaggca tctgtgaagg tgctgcatgg ttgtcgtcag

660

ctcgtgccgt gaggtgtcgg cttaagtgcc ataacgagcg caacccttgt tgtcagttac

720

taacaggttn tgctgaggac tctgacaaga ctgccatcgt aagatgtgag gaaggtgggg

780

atgacgtcaa atcagcacgg cccttacgtc cggggctaca cacgtgttac aatggggggt

840

acagagggcc gctaccacgc gagtggatgc caatcccaaa aacctctctc agttcggact

900

ggagtctgca acccgactcc acgaagctgg attcgctagt aatcgcgcat cagccacggc

960

gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc aagccatggg agccgggggt

1020

acctgaagtg cgtaaccgcg aggag

1045

<210> 311

<211> 1367

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 3_2_5

<220>

<221> modified_base

<222> (1270)..(1270)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1355)..(1355)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 311

tcgaggggca gcacaggtag caataccggg tggcgaccgg cgcacgggtg agtaacgcgt

60

atgcaacttg cctatcagag ggggataacc cggcgaaagt cggactaata ccgcatgaag

120

caggggcccc gcatggggat atttgctaaa gattcatcgc tgatagatag gcatgcgttc

180

cattaggcag ttggcggggt aacggcccac caaaccgacg atggataggg gttctgagag

240

gaaggtcccc cacattggta ctgacacacg gaccaaactc ctacgggagg cagcagtgag

300

gaatattggt caatgggcga aaggctgaac cagccaagtc gcgtgaggga tgaaggttct

360

atggatcgta aacctctttt ataagggaat aaagtgcggg acgtgtcccg ttttgtatgt

420

accttatgaa taaggatcgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggaggatccg

480

agcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg gtgcgtagcg gccttttaag tcacggtgaa

540

agtctgtggc tcaccataaa ttgccgttga aactgggggg cttgagtatg tttgaggcag

600

cggaatgcgt ggtgtacggt gaaatgcata gatatcacgc agaaccccga ttggaaggca

660

gcctgccaag ccattactga cgtgatgcac gaaagcgtgg ggatcaaaca ggattagata

720

ccctggtagt ccacgcataa acgatgatca ctatgtttgc gatacactgt aagcggcaca

780

gcgaaagcgt taagtgatcc acctggggag tacgccggca acggtgaaac tcaaggaatt

840

gacgggggcc cgcacaagcg gagaacatgt ggtttaattg atgatacgcg aggaacctta

900

cccgggtttg aacgcattcg gaccgaggtg gaaacacctt ttctagcaat agccgtttgc

960

gaggtgctgc atggttgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg tcggcttaag tgccataacg

1020

agcgcaaccc ttgccactag ttactaacag gtgatgctga ggactctggt gggactgcca

1080

gcgtaagctg cgaggaaggc ggggatgacg tcaaatcagc acggccctta catccggggc

1140

gacacacgtg ttacaatggc gtggacaaag ggaggccacc tggcgacagg gagcgaatcc

1200

ccaaaccacg tctcagttcg gatcggagtc tgcaacccga ctccgtgaag ctggattcgc

1260

tagtaatcgn gcatcagcca tggcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1320

cgtcaagcca tgggagccgg gggtacctga agtcngtaac cgaaagg

1367

<210> 312

<211> 1386

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 4_1_36

<400> 312

tcgaggggca gcatgaactt agcttgctaa gtttgatggc gaccggcgca cgggtgagta

60

acacgtatcc aacctgccga tgactcgggg atagcctttc gaaagaaaga ttaatacccg

120

atggcatagt tcttccgcat ggtggaacta ttaaagaatt tcggtcatcg atggggatgc

180

gttccattag gttgttggcg gggtaacggc ccaccaagcc ttcgatggat aggggttctg

240

agaggaaggt cccccacatt ggaactgaga cacggtccaa actcctacgg gaggcagcag

300

tgaggaatat tggtcaatgg acgagagtct gaaccagcca agtagcgtga aggatgactg

360

ccctatgggt tgtaaacttc ttttatacgg gaataaagtg aggcacgtgt gcctttttgt

420

atgtaccgta tgaataagga tcggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggagga

480

tccgagcgtt atccggattt attgggttta aagggagcgt aggcggacgc ttaagtcagt

540

tgtgaaagtt tgcggctcaa ccgtaaaatt gcagttgata ctgggtgtct tgagtacagt

600

agaggcaggc ggaattcgtg gtgtagcggt gaaatgctta gatatcacga agaactccga

660

ttgcgaaggc agcttgctgg actgtaactg acgctgatgc tcgaaagtgt gggtatcaaa

720

caggattaga taccctggta gtccacacag taaacgatga atactcgctg tttgcgatat

780

acagtaagcg gccaagcgaa agcgttaagt attccacctg gggagtacgc cggcaacggt

840

gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggagg aacatgtggt ttaattcgat

900

gatacgcgag gaaccttacc cgggcttgaa ttgcaactga atgatgtgga gacttgtcag

960

ccgcaaggca gttgtgaaga tatcacgagg tactgcgatt gcgaagccag ctggctgggc

1020

tttaagtgac actaatggcg caacccttat cgatagttac catcaggtta tgctggggac

1080

tctgtcgaga ctgccgtcgt aagatgtgag gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg

1140

cccttacgtc cggggctaca cacgtgttac aatggggggt acagaaggca gctacacggt

1200

gacgtgatgc taatcccgaa agcctctctc agttcggatt ggagtctgca acccgactcc

1260

atgaagctgg attcgctagt aatcgcgcat cagccacggc gcggtgaata cgttcccggg

1320

ccttgtacac accgcccgtc aagccatgaa agccgggggt acctgaagtg cgtaaccgca

1380

aggagc

1386

<210> 313

<211> 1515

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 4_3_47FAA

<400> 313

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg

60

ggcagcatgg tcttagcttg ctaaggccga tggcgaccgg cgcacgggtg agtaacacgt

120

atccaacctg ccgtctactc ttggacagcc ttctgaaagg aagattaata caagatggca

180

tcatgagtcc gcatgttcac atgattaaag gtattccggt agacgatggg gatgcgttcc

240

attagatagt aggcggggta acggcccacc tagtcttcga tggatagggg ttctgagagg

300

aaggtccccc acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc agcagtgagg

360

aatattggtc aatgggcgca ggcctgaacc agccaagtag cgtgaaggat gactgcccta

420

tgggttgtaa acttctttta taaaggaata aagtcgggta tgtatacccg tttgcatgta

480

ctttatgaat aaggatcggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaggatccga

540

gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgtagatg gatgtttaag tcagttgtga

600

aagtttgcgg ctcaaccgta aaattgcagt tgatactgga tatcttgagt gcagttgagg

660

caggcggaat tcgtggtgta gcggtgaaat gcttagatat cacgaagaac tccgattgcg

720

aaggcagcct gctaagctgc aactgacatt gaggctcgaa agtgtgggta tcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cacggtaaac gatgaatact cgctgtttgc gatatacagc

840

aagcggccaa gcgaaagcgt taagtattcc acctggggag tacgccggca acggtgaaac

900

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat tcgatgatac

960

gcgaggaacc ttacccgggc ttaaattgca gatgaattac ggtgaaagcc gtaagccgca

1020

aggcatctgt gaaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt gtcggcttaa

1080

gtgccataac gagcgcaacc cttgttgtca gttactaaca ggttcgctga ggactctgac

1140

aagactgcca tcgtaagatg tgaggaaggt ggggatgacg tcaaatcagc acggccctta

1200

cgtccggggc tacacacgtg ttacaatggg gggtacagag ggccgctacc acgcgagtgg

1260

atgccaatcc caaaaacctc tctcagttcg gactggagtc tgcaacccga ctccacgaag

1320

ctggattcgc tagtaatcgc gcatcagcca cggcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcaagcca tgggagccgg gggtacctga agtgcgtaac cgcgaggagc

1440

gccctagggt aaaactggtg actggggcta agtcgtaaca aggtagccgt accggaaggt

1500

gcggctggaa cacct

1515

<210> 314

<211> 1533

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. 9_1_42FAA

<400> 314

tacaatgaag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctag ctacaggctt aacacatgca

60

agtcgagggg cagcatggtc ttagcttgct aaggctgatg gcgaccggcg cacgggtgag

120

taacacgtat ccaacctgcc gtctactctt ggccagcctt ctgaaaggaa gattaatcca

180

ggatgggatc atgagttcac atgtccgcat gattaaaggt attttccggt agacgatggg

240

gatgcgttcc attagatagt aggcggggta acggcccacc tagtcaacga tggatagggg

300

ttctgagagg aaggtccccc acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc

360

agcagtgagg aatattggtc aatgggcgat ggcctgaacc agccaagtag cgtgaaggat

420

gactgcccta tgggttgtaa acttctttta taaaggaata aagtcgggta tgcatacccg

480

tttgcatgta ctttatgaat aaggatcggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

gaggatccga gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgtagatg gatgtttaag

600

tcagttgtga aagtttgcgg ctcaaccgta aaattgcagt tgatactgga tgtcttgagt

660

gcagttgagg caggcggaat tcgtggtgta gcggtgaaat gcttagatat cacgaagaac

720

tccgattgcg aaggcagcct gctaagctgc aactgacatt gaggctcgaa agtgtgggta

780

tcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cacggtaaac gatgaatact cgctgtttgc

840

gatatacggc aagcggccaa gcgaaagcgt taagtattcc acctggggag tacgccggca

900

acggtgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat

960

tcgatgatac gcgaggaacc ttacccgggc ttaaattgca ctcgaatgat ccggaaacgg

1020

ttcagctagc aatagcgagt gtgaaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag

1080

gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa cccttgttgt cagttactaa caggtgatgc

1140

tgaggactct gacaagactg ccatcgtaag atgtgaggaa ggtggggatg acgtcaaatc

1200

agcacggccc ttacgtccgg ggctacacac gtgttacaat gggggggtac agagggccgc

1260

taccacgcga gtggatgcca atccctaaaa cccctctcag ttcggactgg agtctgcaac

1320

ccgactccac gaagctggat tcgctagtaa tcgcgcatca gccacggcgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcaa gccatgggag ccgggggtac ctgaagtgcg

1440

taaccgcgag gatcgcccta gggtaaaact ggtgactggg gctaagtcgt aacaaggtag

1500

ccgtaccgga aggtgcggct ggaacacctc ctt

1533

<210> 315

<211> 1489

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. AR20

<400> 315

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc aagtcgaggg

60

gcagcatgaa cttagcttgc taagtttgat ggcgaccggc gcacgggtga gtaacacgta

120

tccaacctgc cgatgactcg gggatagcct ttcgaaagaa agattaatac ccgatggcat

180

agttcttccg catggtagaa ctattaaaga atttcggtca tcgatgggga tgcgttccat

240

taggttgttg gcggggtaac ggcccaccaa gccttcgatg gataggggtt ctgagaggaa

300

ggtcccccac attggaactg agacacggtc caaactccta cgggaggcag cagtgaggaa

360

tattggtcaa tggacgagag tctgaaccag ccaagtagcg tgaaggatga ctgccctatg

420

ggttgtaaac ttcttttata cgggaataaa gtgaggcacg cgtgcctttt tgtatgtacc

480

gtatgaataa ggatcggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga ggatccgagc

540

gttatccgga tttattgggt ttaaagggag cgtaggcgga cgcttaagtc agttgtgaaa

600

gtttgcggct caaccgtaaa attgcagttg atactgggtg tcttgagtac agtagaggca

660

ggcggaattc gtggtgtagc ggtgaaatgc ttagatatca cgaagaactc cgattgcgaa

720

ggcagcctgc tggactgtaa ctgacgctga tgctcgaaag tgtgggtatc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtccaca cagtaaacga tgaatactcg ctgtttgcga tatacagtaa

840

gcggccaagc gaaagcgtta agtattccac ctggggagta cgccggcaac ggtgaaactc

900

aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg aggaacatgt ggtttaattc gatgatacgc

960

gaggaacctt acccgggctt gaattgcaac tgaatgatgt ggagacatgt cagccgcaag

1020

gcagttgtga aggtgctgca tggttgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt cggcttaagt

1080

gccataacga gcgcaaccct tatcgatagt taccatcagg ttatgctggg gactctgtcg

1140

agactgccgt cgtaagatgt gaggaaggtg gggatgacgt caaatcagca cggcccttac

1200

gtccggggct acacacgtgt tacaatgggg ggtacagaag gcagctacac ggcgacgtga

1260

tgctaatccc taaagcctct ctcagttcgg attggagtct gcaacccgac tccatgaagc

1320

tggattcgct agtaatcgcg catcagccac ggcgcggtga atacgttccc gggccttgta

1380

cacaccgccc gtcaagccat gaaagccggg ggtacctgaa gtgcgtaacc gcaaggagcg

1440

ccctagggta aaactggtga ttggggctaa gtcgtaacaa ggtagccgt

1489

<210> 316

<211> 1502

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. AR29

<220>

<221> modified_base

<222> (11)..(12)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (57)..(57)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1000)..(1000)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1008)..(1009)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1023)..(1023)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1026)..(1027)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1033)..(1033)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1038)..(1038)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1045)..(1045)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1057)..(1057)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1060)..(1060)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1068)..(1068)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1091)..(1092)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1097)..(1097)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1125)..(1125)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1127)..(1127)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1135)..(1135)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1137)..(1137)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1144)..(1144)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1155)..(1156)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1306)..(1306)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1350)..(1350)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1435)..(1435)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1480)..(1480)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 316

aataaagttt nnacgtgtgg aattttgtat gtaccatatg aataaggatc ggctaantcc

60

gtgccagcag ccgcggtaat acggaggatc cgagcgttat ccggatttat tgggtttaaa

120

gggagcgtag gtggacagtt aagtcagttg tgaaagtttg cggctcaacc gtaaaattgc

180

agttgatact ggctgtcttg agtacagtag aggtgggcgg aattcgtggt gtagcggtga

240

aatgcttaga tatcacgaag aactccgatt gcgaaggcag ctcactggac tgcaactgac

300

actgatgctc gaaagtgtgg gtatcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacacagta

360

aacgatgaat actcgctgtt tgcgatatac agtaagcggc caagcgaaag cattaagtat

420

tccacctggg gagtacgccg gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

480

agcggaggaa catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttacccg ggcttaaatt

540

gcatttgaat attttggaaa cagtatagcc gtaaggcaaa tgtgaaggtg ctgcatggtt

600

gtcgtcagct cgtgccgtga ggtgtcggct taagtgccat aacgagcgca acccttatct

660

ttagttacta acaggtcatg ctgaggactc tagagagact gccgtcgtaa gatgtgagga

720

aggtggggat gacgtcaaat cagcacggcc cttacgtccg gggctacaca cgtgttacaa

780

tggggggtac agaaggcagc tacctggtga caggatgcta atcccaaaag cctctctcag

840

ttcggatcga agtctgcaac ccgacttcgt gaagctggat tcgctagtaa tcgcgcatca

900

gccatggcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcaa gccatgaaag

960

ccgggggtac ctgaagtacg taaccgcaag aaggcggctn tctggacnnt aactgacgct

1020

gangcnngaa agngtggnga gcaancagga ttagatnccn tggtagtnca cgccgtaaac

1080

gatgagtagt nngtgtnggg gggttacccc cctcggtgcc gcaantnaag cattnantac

1140

tccncctggg aaatnngctc gcaagagtga aaatcaaaag aattgacggg gagccccaca

1200

agtagcggag catgtggttt aatttgaagc aacgcggaaa accttaccta agtttgacat

1260

tccattgacc tttccataat cgaaaatttc ccttcgggga cagtgntaac aggtggggca

1320

tggtttttgt cagctcgtct cgtgaaatgn ggggttaatt cccccaacgc gcccacccct

1380

ttcctttttt tcccaccatt aagttgggca ctctagagag actgccgagg ataantcgga

1440

ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgn ccagggctac acacgtgcta

1500

ca

1502

<210> 317

<211> 715

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. B2

<220>

<221> modified_base

<222> (650)..(650)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 317

taggggttct gagaggaagg tcccccacat tggaactgag acacggtcca aactcctacg

60

ggaggcagca gtgaggaata ttggtcaatg ggcgcaggcc tgaaccagcc aagtagcgtg

120

aaggatgact gccctatggg ttgtaaactt cttttatatg ggaataaagt tttccacgtg

180

tggaattttg tatgtaccat atgaataagg atcggctaac tccgtgccag cagccgcggt

240

aatacggagg atccgagcgt tatccggatt tattgggttt aaagggagcg taggtggaca

300

gttaagtcag ttgtgaaagt ttgcggctca accgtaaaat tgcagttgat actggctgtc

360

ttgagtacag tagaggtggg cggaattcgt ggtgtagcgg tgaaatgctt agatatcacg

420

aagaactccg attgcgaagg cagctcactg gactgcaact gacactgatg ctcgaaagtg

480

tgggtatcaa acaggattag ataccctggt agtccacaca gtaaacgatg aatactcgct

540

gtttgcgata tacagtaagc ggccaagcga aagcattaag tattccacct ggggagtacg

600

ccggcaacgg tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggan gaacatgtgg

660

tttaattcga tgatacgcga ggaaccttac ccgggcttaa attgcatttg aatat

715

<210> 318

<211> 1517

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. D1

<400> 318

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg

60

ggcagcattt tagtttgctt gcaaactaaa gatggcgacc ggcgcacggg tgagtaacac

120

gtatccaacc tgccgataac tcggggatag cctttcgaaa gaaagattaa tatccgatgg

180

tatattaaaa ccgcatggtt ttactattaa agaatttcgg ttatcgatgg ggatgcgttc

240

cattagtttg ttggcggggt aacggcccac caagactacg atggataggg gttctgagag

300

gaaggtcccc cacattggaa ctgagacacg gtccaaactc ctacgggagg cagcagtgag

360

gaatattggt caatggacga gagtctgaac cagccaagta gcgtgaagga tgactgccct

420

atgggttgta aacttctttt atatgggaat aaagtattcc acgtgtggaa ttttgtatgt

480

accatatgaa taaggatcgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggaggatccg

540

agcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg gagcgtaggt ggattgttaa gtcagttgtg

600

aaagtttgcg gctcaaccgt aaaattgcag ttgaaactgg cagtcttgag tacagtagag

660

gtgggcggaa ttcgtggtgt agcggtgaaa tgcttagata tcacgaagaa ctccgattgc

720

gaaggcagct cactagactg caactgacac tgatgctcga aagtgtgggt atcaaacagg

780

attagatacc ctggtagtcc acacagtaaa cgatgaatac tcgctgtttg cgatatacag

840

taagcggcca agcgaaagca ttaagtattc cacctgggga gtacgccggc aacggtgaaa

900

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggaggaaca tgtggtttaa ttcgatgata

960

cgcgaggaac cttacccggg cttaaattgc atttgaataa tctggaaaca ggttagccgc

1020

aaggcaaatg tgaaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg tgccgtgagg tgtcggctta

1080

agtgccataa cgagcgcaac ccttatcttt agttactaac aggtcatgct gaggactcta

1140

gagagactgc cgtcgtaaga tgtgaggaag gtggggatga cgtcaaatca gcacggccct

1200

tacgtccggg gctacacacg tgttacaatg gggggtacag aaggcagcta cctggcgaca

1260

ggatgctaat cccaaaaacc tctctcagtt cggatcgaag tctgcaaccc gacttcgtga

1320

agctggattc gctagtaatc gcgcatcagc catggcgcgg tgaatacgtt cccgggcctt

1380

gtacacaccg cccgtcaagc catgaaagcc gggggtacct gaagtacgta accgcaagga

1440

gcgtcctagg gtaaaactgg taattggggc taagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag

1500

gtgcggctgg aacacct

1517

<210> 319

<211> 1380

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. D20

<220>

<221> modified_base

<222> (8)..(9)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (12)..(12)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 319

ggggcagnnt gnactgtagc ttgctaagtt tgatggcgac cggcgcacgg gtgagtaaca

60

cgtatccaac ctgccgatga ctcggggata gcctttcgaa agaaagatta atacccgatg

120

gcataattct tccgcatggt agaactatta aagaatttcg gtcatcgatg gggatgcgtt

180

ccattaggtt gttggcgggg taacggccca ccaagccttc gatggatagg ggttctgaga

240

ggaaggtccc ccacattgga actgagacac ggtccaaact cctacgggag gcagcagtga

300

ggaatattgg tcaatggacg agagtctgaa ccagccaagt agcgtgaagg atgactgccc

360

tatgggttgt aaacttcttt tatacgggaa taaagtgagg cacgtgtgcc tttttgtatg

420

taccgtatga ataaggatcg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggaggatcc

480

gagcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggagcgtagg cggacgctta agtcagttgt

540

gaaagtttgc ggctcaaccg taaaattgca gttgatactg ggtgtcttga gtacagtaga

600

ggcaggcgga attcgtggtg tagcggtgaa atgcttagat atcacgaaga actccgattg

660

cgaaggcagc ctgctggact gtaactgacg ctgatgctcg aaagtgtggg tatcaaacag

720

gattagatac cctggtagtc cacacagtaa acgatgaata ctcgctgttt gcgatataca

780

gtaagcggcc aagcgaaagc gttaagtatt ccacctgggg agtacgccgg caacggtgaa

840

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggaggaac atgtggttta attcgatgat

900

acgcgaggaa ccttacccgg gcttgaattg caactgaatg atgtggagac atgtcagccg

960

caaggcagtt gtgaaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt

1020

aagtgccata acgagcgcaa cccttatcga tagttaccat caggttatgc tggggactct

1080

gtcgagactg ccgtcgtaag atgtgaggaa ggtggggatg acgtcaaatc agcacggccc

1140

ttacgtccgg ggctacacac gtgttacaat ggggggtaca gaaggcagct acacggtgac

1200

gtgatgctaa tccctaaagc ctctctcagt tcggattgga gtctgcaacc cgactccatg

1260

aagctggatt cgctagtaat cgcgcatcag ccacggcgcg gtgaatacgt tcccgggcct

1320

tgtacacacc gcccgtcaag ccatgaaagc cgggggtacc tgaagtgcgt aaccgcaagg

1380

<210> 320

<211> 1533

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. D22

<400> 320

ttacaatgaa gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc

60

aagtcgaggg gcagcatttt agtttgcttg caaactgaag atggcgaccg gcgcacgggt

120

gagtaacacg tatccaacct gccgataact cggggatagc ctttcgaaag aaagattaat

180

atccgatggt atattaaaac cgcatggttt tactattaaa gaatttcggt tatcgatggg

240

gatgcgttcc attagtttgt tggcggggta acggcccacc aagactacga tggatagggg

300

ttctgagagg aaggtccccc acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc

360

agcagtgagg aatattggtc aatggacgag agtctgaacc agccaagtag cgtgaaggat

420

gactgcccta tgggttgtaa acttctttta tatgggaata aagtattcca cgtgtgggat

480

tttgtatgta ccatatgaat aaggatcggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

gaggatccga gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgtaggtg gattgttaag

600

tcagttgtga aagtttgcgg ctcaaccgta aaattgcagt tgaaactggc agtcttgagt

660

acagtagagg tgggcggaat tcgtggtgta gcggtgaaat gcttagatat cacgaagaac

720

tccgattgcg aaggcagctc actagactgc aactgacact gatgctcgaa agtgtgggta

780

tcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cacagtaaac gatgaatact cgctgtttgc

840

gatatacagt aagcggccaa gcgaaagcat taagtattcc acctggggag tacgccggca

900

acggtgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat

960

tcgatgatac gcgaggaacc ttacccgggc ttaaattgca aatgaataat ctggaaacag

1020

gttagccgca aggcatttgt gaaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt

1080

gtcggcttaa gtgccataac gagcgcaacc cttatcttta gttactaaca ggtcatgctg

1140

aggactctag agagactgcc gtcgtaagat gtgaggaagg tggggatgac gtcaaatcag

1200

cacggccctt acgtccgggg ctacacacgt gttacaatgg ggggtacaga aggcagctac

1260

ctggcgacag gatgctaatc ccaaaaacct ctctcagttc ggatcgaagt ctgcaacccg

1320

acttcgtgaa gctggattcg ctagtaatcg cgcatcagcc atggcgcggt gaatacgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcaagcc atgaaagccg ggggtacctg aagtacgtaa

1440

ccgcaaggag cgtcctaggg taaaactggt aattggggct aagtcgtaac aaggtagccg

1500

taccggaagg tgcggctgga acacctcctt tct

1533

<210> 321

<211> 1040

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. D2

<220>

<221> modified_base

<222> (15)..(15)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (17)..(19)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (33)..(33)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (35)..(36)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (42)..(42)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 321

gcgtgaagga tgaangnnnt atgggtcgta aantnntttt anatgggaat aaagttttcc

60

acgtgtggaa tttgtatgta ccatatgaat aaggatcggc taactccgtg ccagcagccg

120

cggtaatacg gaggatccga gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgtaggtg

180

gattgttaag tcagttgtga aagtttgcgg ctcaaccgta aaattgcagt tgaaactggc

240

agtcttgagt acagtagagg tgggcggaat tcgtggtgta gcggtgaaat gcttagatat

300

cacgaagaac tccgattgcg aaggcagctc actagactgt tactgacact gatgctcgaa

360

agtgtgggta tcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cacagtaaac gatgaatact

420

cgctgtttgc gatatacagt aagcggccaa gcgaaagcat taagtattcc acctggggag

480

tacgccggca acggtgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat

540

gtggtttaat tcgatgatac gcgaggaacc ttacccgggc ttaaattgca acagaatata

600

ttggaaacag tatagccgca aggcagttgt gaaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt

660

gccgtgaggt gtcggcttaa gtgccataac gagcgcaacc cttatcttta gttactaaca

720

ggttatgctg aggactctag agagactgcc gtcgtaagat gtgaggaagg tggggatgac

780

gtcaaatcag cacggccctt acgtccgggg ctacacacgt gttacaatgg ggggtacaga

840

aggcagctac ccggcgacag gatgctaatc ccaaaaacct ctctcagttc ggatcgaagt

900

ctgcaacccg acttcgtgaa gctggattcg ctagtaatcg cgcatcagcc atggcgcggt

960

gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcaagcc atgaaagccg ggggtacctg

1020

aagtacgtaa ccgcaaggag

1040

<210> 322

<211> 1048

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. F-4

<220>

<221> modified_base

<222> (33)..(33)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (42)..(42)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 322

caagtagcgt gaaggatgac tgccctatgg gtngtaaact tnttttatac gggaataaag

60

tgaggcacgt gtgccttttt gtatgtaccg tatgaataag gatcggctaa ctccgtgcca

120

gcagccgcgg taatacggag gatccgagcg ttatccggat ttattgggtt taaagggagc

180

gtaggcggac gcttaagtca gttgtgaaag tttgcggctc aaccgtaaaa ttgcagttga

240

tactgggtgt cttgagtaca gtagaggcag gcggaattcg tggtgtagcg gtgaaatgct

300

tagatatcac gaagaactcc gattgcgaag gcagcttgct ggactgtaac tgacgctgat

360

gctcgaaagt gtgggtatca aacaggatta gataccctgg tagtccacac agtaaacgat

420

gaatactcgc tgtttgcgat atacagtaag cggccaagcg aaagcgttaa gtattccacc

480

tggggagtac gccggcaacg gtgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcgga

540

ggaacatgtg gtttaattcg atgatacgcg aggaacctta cccgggcttg aattgcaact

600

gaatgatgtg gagacatgtc agccgcaagg cagttgtgaa ggtgctgcat ggttgtcgtc

660

agctcgtgcc gtgaggtgtc ggcttaagtg ccataacgag cgcaaccctt atcgatagtt

720

accatcaggt tatgctgggg actctgtcga gactgccgtc gtaagatgtg aggaaggtgg

780

ggatgacgtc aaatcagcac ggcccttacg tccggggcta cacacgtgtt acaatggggg

840

gtacagaagg cagctacacg gtgacgtgat gctaatcccg aaagcctctc tcagttcgga

900

ttggagtctg caacccgact ccatgaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccacg

960

gcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg aaagccgggg

1020

gtacctgaag tgcgtaaccg caaggagc

1048

<210> 323

<211> 627

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. NB-8

<220>

<221> modified_base

<222> (407)..(407)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (490)..(490)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (512)..(512)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (515)..(515)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 323

gaactgagac acggtccaaa ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt ggtcaatgga

60

cgagagtctg aaccagccaa gtagcgtgaa ggatgaaggt tctatggatt gtaaacttct

120

tttatacggg aataaacgga tccacgtgtg gatttttgca tgtaccgtat gaataaggat

180

cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggaggat ccgagcgtta tccggattta

240

ttgggtttaa agggagcgta gatgggttgt taagtcagtt gtgaaagttt gcggctcaac

300

cgtaaaattg caattgatac tggcagtctt gagtacagtt gaggtaggcg gaattcgtgg

360

tgtagcggtg aaatgcttag atatcacgaa gaactccgat tgcgaangca gcttactaac

420

ctgtaactga cattgatgct cgaaagtgtg ggtatcaaac aggattagat accctggtag

480

tccacacggn aaacgatgaa tactcgctgt angcnatata cagtctgcgg ccaagcgaaa

540

gcattaagta ttccacctgg ggagtacgcc cggcacggtg aaactcaaag gaattgacgg

600

gggcccgcac aagcggagga acatgtg

627

<210> 324

<211> 1361

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. WH2

<400> 324

agtcgagggg cagcatgacc tagcaatagg gttgatgggg cgaccggcgc acggtgtgag

60

taacacgtat ccaacctacc ggttattccg ggatagcctt tcgaaagaaa gattaatacc

120

ggatagtata acgagaaggc atcttcttgt tattaaagaa tttcgataac cgatggggat

180

gcgttccatt agtttgttgg cggggtaacg gcccaccaag acatcgatgg ataggggttc

240

tgagaggaag gtcccccaca ttggaactga gacacggtcc aaactcctac gggaggcagc

300

agtgaggaat attggtcaat ggacgagagt ctgaaccagc caagtagcgt gaaggatgac

360

tgccctatgg gttgtaaact tcttttatat gggaataaag tgagccacgt gtggcttttt

420

gtatgtacca tacgaataag gatcggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag

480

gatccgagcg ttatccggat ttattgggtt taaagggagc gtaggcggac tattaagtca

540

gctgtgaaag tttgcggctc aaccgtaaaa ttgcagttga tactggtcgt cttgagtgca

600

gtagaggtag gcggaattcg tggtgtagcg gtgaaatgct tagatatcac gaagaactcc

660

gattgcgaag gcagcttact ggactgtaac tgacgctgat gctcgaaagt gtgggtatca

720

aacaggatta gataccctgg tagtccacac agtaaacgat gaatactcgc tgtttgcgat

780

atacggcaag cggccaagcg aaagcattaa gtattccacc tggggagtac gccggcaacg

840

gtgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcgga ggaacatgtg gtttaattcg

900

atgatacgcg aggaacctta cccgggctta aattgcatat gaatattgtg gaaacagaat

960

agccgcaagg cagatgtgaa ggtgctgcat ggttgtcgtc agctcgtgcc gtgaggtgtc

1020

ggcttaagtg ccataacgag cgcaaccctt atctttagtt actaacaggt catgctgagg

1080

actctagaga gactgccgtc gtaagatgtg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcagcac

1140

ggcccttacg tccggggcta cacacgtgtt acaatggggg gtacagaagg cagctacaca

1200

gcgatgtgat gctaatccca aaagcctctc tcagttcgga ttggagtctg caacccgact

1260

ccatgaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccacg gcgcggtgaa tacgttcccg

1320

ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg aaagccgggg g

1361

<210> 325

<211> 1357

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. XB12B

<400> 325

cgaggggcag catgacctag caataggttg atggcgaccg gcgcacgggt gagtaacacg

60

tatccaacct accggttatt ccgggatagc ctttcgaaag aaagattaat accggatagt

120

ataacgagaa ggcatctttt tgttattaaa gaatttcgat aaccgatggg gatgcgttcc

180

attagtttgt tggcggggta acggcccacc aagacatcga tggatagggg ttctgagagg

240

aaggtccccc acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc agcagtgagg

300

aatattggtc aatggacgag agtctgaacc agccaagtag cgtgaaggat gactgcccta

360

tgggttgtaa acttctttta tatgggaata aagtgagcca cgtgtggctt tttgtatgta

420

ccatacgaat aaggatcggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaggatccga

480

gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgtaggcg gactattaag tcagctgtga

540

aagtttgcgg ctcaaccgta aaattgcagt tgatactggt cgtcttgagt gcagtagagg

600

taggcggaat tcgtggtgta gcggtgaaat gcttagatat cacgaagaac tccgattgcg

660

aaggcagctt actggactgt aactgacgct gatgctcgaa agtgtgggta tcaaacagga

720

ttagataccc tggtagtcca cacagtaaac gatgaatact cgctgtttgc gatatacagc

780

aagcggccaa gcgaaagcat taagtattcc acctggggag tacgccggca acggtgaaac

840

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat tcgatgatac

900

gcgaggaacc ttacccgggc ttaaattgca tctgaataat ttggaaacag attagccgca

960

aggcagatgt gaaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt gtcggcttaa

1020

gtgccataac gagcgcaacc cttatcttta gttactaaca ggtcatgctg aggactctag

1080

agagactgcc gtcgtaagat gtgaggaagg tggggatgac gtcaaatcag cacggccctt

1140

acgtccgggg ctacacacgt gttacaatgg ggggtacaga aggcagctac acagcgatgt

1200

gatgctaatc ccaaaagcct ctctcagttc ggattggagt ctgcaacccg actccatgaa

1260

gctggattcg ctagtaatcg cgcatcagcc acggcgcggt gaatacgttc ccgggccttg

1320

tacacaccgc ccgtcaagcc atgaaagccg ggggtac

1357

<210> 326

<211> 1407

<212> DNA

<213> Bacteroides sp. XB44A

<220>

<221> modified_base

<222> (42)..(42)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 326

gctcaggctt agccatgcaa gtcgaggggc agcatgactt ancaataggt tgatggcgac

60

cggcgcacgg gtgagtaaca cgtatccaac ctgccgatta ttccgggata gcctttcgaa

120

agaaagatta atactggata gcataacgag aaggcatctt cttgttatta aagaatttcg

180

ataatcgatg gggatgcgtt ccattagttt gttggcgggg taacggccca ccaagacatc

240

gatggatagg ggttctgaga ggaaggtccc ccacattgga actgagacac ggtccaaact

300

cctacgggag gcagcagtga ggaatattgg tcaatggacg agagtctgaa ccagccaagt

360

agcgtgaagg atgactgccc tatgggttgt aaacttcttt tgtatgggaa taaagtgagc

420

cacgtgtggc tttttgtatg taccatacga ataaggatcg gctaactccg tgccagcagc

480

cgcggtaata cggaggatcc gagcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggagcgtagg

540

cggattatta agtcagttgt gaaagtttgc ggctcaaccg taaaattgca gttgatactg

600

gtagtcttga gtgcagcaga ggtaggcgga attcgtggtg tagcggtgaa atgcttagat

660

atcacgaaga actccgattg cgaaggcagc ttactggact gtaactgacg ctgatgctcg

720

aaagtgtggg tatcaaacag gattagatac cctggtagtc cacacagtaa acgatgaata

780

ctcgctgttt gcgatataca gcaagcggcc aagcgaaagc attaagtatt ccacctgggg

840

agtacgccgg caacggtgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggaggaac

900

atgtggttta attcgatgat acgcgaggaa ccttacccgg gcttaaattg caactgacgg

960

atttggaaac agatcttcct tcgggcagtt gtgaaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc

1020

gtgccgtgag gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa cccttatctt tagttactaa

1080

caggtcatgc tgaggactct agagagactg ccgtcgtaag atgtgaggaa ggtggggatg

1140

acgtcaaatc agcacggccc ttacgtccgg ggctacacac gtgttacaat ggggggtaca

1200

gaaggcagct acacagcgat gtgatgctaa tcccaaaagc ctctctcagt tcggattgga

1260

gtctgcaacc cgactccatg aagctggatt cgctagtaat cgcgcatcag ccacggcgcg

1320

gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaag ccatgaaagc cgggggtact

1380

tgaagtacgt aaccgcaagg agcgtct

1407

<210> 327

<211> 1261

<212> DNA

<213> Bacteroides stercoris

<400> 327

atggtatagt tttcccgcat gggataatta ttaaagaatt tcggttgtcg atggggatgc

60

gttccattag gcagttggcg gggtaacggc ccaccaaacc tacgatggat aggggttctg

120

agaggaaggt cccccacatt ggaactgaga cacggtccaa actcatacgg gaggcagcag

180

tgaggaatat tggtcaatgg acgagagtct gaaccagcca agtagcgtga aggatgactg

240

ccctatgggt tgtaaacttc ttttatacgg gaataaagtt agccacgtgt ggttttttgt

300

atgtaccgta tgaataagga tcggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggagga

360

tccgagcgtt atccggattt attgggttta aagggagcgt aggcgggttg ttaagtcagt

420

tgtgaaagtt tgcggctcaa ccgtaaaatt gcagttgata ctggcgacct tgagtgcaac

480

agaggtaggc ggaattcgtg gtgtagcggt gaaatgctta gatatcacga agaactccga

540

ttgcgaaggc agcttactgg attgtaactg acgctgatgc tcgaaagtgt gggtatcaaa

600

caggattaga taccctggta gtccacacag taaacgatga atactcgctg ttggcgatat

660

acggtcagcg gccaagcgaa agcattaagt attccacctg gggagtacgc cggcagcggt

720

gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggagg aacatgtggt ttaattcgat

780

gatacgcgag gaaccttacc cgggcttaaa ttgcaactga cggaatcgga aacggttctt

840

tcttcggaca gttgtgaagg tgctgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgccgt gaggtgtcgg

900

cttaagtgcc ataacgagcg caacccttac gggtagttac catcaggtta tgctggggac

960

tctacccgga ctgccgtcgt aagatgtgag gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg

1020

cccttacgtc cggggctaca cacgtgttac aatggggggt acagaaggca gctacacggc

1080

gacgtggtgc taatcccaaa agcctctctc agttcggatt ggagtctgca acccgactcc

1140

atgaagctgg attcgctagt aatcgcgcat cagccacggc gcggtgaata cgttcccggg

1200

ccttgtacac accgcccgtc aagccatgaa agccgggggt acctgaagta cgtaaccgcg

1260

a

1261

<210> 328

<211> 962

<212> DNA

<213> Bacteroides thetaiotaomicron

<220>

<221> modified_base

<222> (754)..(755)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (946)..(948)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (951)..(951)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 328

tcgaggggca gcatttcagt ttgcttgcaa actggagatg gcgaccggcg cacgggtgag

60

taacacgtat ccaacctgcc gataactcgg ggatagcctt tcgaaagaaa gattaatacc

120

cgatggtata atgaaaccgc atggtcttat tattaaagaa tttcggttat cgatggggat

180

gcgttccatt aggcagttgg tgaggtaacg gctcaccaaa ccttcgatgg ataggggttc

240

tgagaggaag gtcccccaca ttggaactga gacacggtcc aaactcctac gggaggcagc

300

agtgaggaat attggtcaat gggcgcaggc ctgaaccagc caagtagcgt gaaggatgac

360

tgccctatgg gttgtaaact tcttttatat gggaataaag ttttccacgt gtggaatttt

420

gtatgtacca tatgaataag gatcggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag

480

gatccgagcg ttatccggat ttattgggtt taaagggagc gtaggtggac agttaagtca

540

gttgtgaaag tttgcggctc aaccgtaaaa ttgcagttga tactggctgt cttgagtaca

600

gtagaggtgg gcggaattcg tggtgtagcg gtgaaatgct tagatatcac gaagaactcc

660

gattgcgaag gcagctcact ggactgcaac tgacactgat gctcgaaagt gtgggtatca

720

aacaggatta gataccctgg tagtccacac agtnncgatg aatactcgct gtttgcgata

780

tacagtaagc ggccaagcga aagcattaag tattccacct ggggagtacg ccggcaacgg

840

tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggag gaacatgtgg tttaattcga

900

tgatacgcga ggaaccttac ccgggcttaa attgcatttg aatatnnntg naacagtata

960

gc

962

<210> 329

<211> 1382

<212> DNA

<213> Bacteroides uniformis

<400> 329

cgaggggcag catgaactta gcttgctaag tttgatggcg accggcgcac gggtgagtaa

60

cacgtatcca acctgccgat gactcgggga tagcctttcg aaagaaagat taatacccga

120

tggcatagtt cttccgcatg gtggaactat taaagaattt cggtcatcga tggggatgcg

180

ttccattagg ttgttggcgg ggtaacggcc caccaagcct tcgatggata ggggttctga

240

gaggaaggtc ccccacattg gaactgagac acggtccaaa ctcctacggg aggcagcagt

300

gaggaatatt ggtcaatgga cgagagtctg aaccagccaa gtagcgtgaa ggatgactgc

360

cctatgggtt gtaaacttct tttatacggg aataaagtga ggcacgtgtg cctttttgta

420

tgtaccgtat gaataaggat cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggaggat

480

ccgagcgtta tccggattta ttgggtttaa agggagcgta ggcggacgct taagtcagtt

540

gtgaaagttt gcggctcaac cgtaaaattg cagttgatac tgggtgtctt gagtacagta

600

gaggcaggcg gaattcgtgg tgtagcggtg aaatgcttag atatcacgaa gaactccgat

660

tgcgaaggca gcttgctgga ctgtaactga cgctgatgct cgaaagtgtg ggtatcaaac

720

aggattagat accctggtag tccacacagt aaacgatgaa tactcgctgt ttgcgatata

780

cagtaagcgg ccaagcgaaa gcgttaagta ttccacctgg ggagtacgcc ggcaacggtg

840

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggagga acatgtggtt taattcgatg

900

atacgcgagg aaccttaccc gggtttgaat tgcaactgaa tgatgtgagt acagtagagc

960

cgcaaggcag ttgtgaaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgtcggc

1020

ttaagtgcca taacgagcgc aacccttatc gatagttacc atcaggttat gctggggact

1080

ctgtcgagac tgccgtcgta agatgtgagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcagcacggc

1140

ccttacgtcc ggggctacac acgtgttaca atggggggta cagaaggcag ctacacggtg

1200

acgtgatgct aatcccgaaa gcctctctca gttcggattg gagtctgcaa cccgactcca

1260

tgaagctgga ttcgctagta atcgcgcatc agccacggcg cggtgaatac gttcccgggc

1320

cttgtacaca ccgcccgtca agccatgaaa gccgggggta cctgaagtgc gtaaccgcaa

1380

gg

1382

<210> 330

<211> 1370

<212> DNA

<213> Bacteroides ureolyticus

<400> 330

gaggaacaac agttggaaac ggctgctaat acctcatact cctatttgac ataagttaaa

60

tagggaaagt cttttcggtg taggatgaga ctatatcgta tcagctagtt ggtaaggtaa

120

tggcttacca aggctatgac gcgtaactgg tctgagagga tgatcagtca cattggaact

180

gagacacggt ccaaactcct acgggaggca gcagtaagga atattgcgca atgggggaaa

240

ccctgacgca gcaacgccgc gtggaggatg acacttttcg gagcgtaaac tccttttatc

300

aggaaagaat aatgacggta cctgatgaat aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg

360

cggtaatacg gggggtgcaa gcgttactcg gaatcactgg gcgtaaagga cgcgtaggcg

420

gattatcaag tcttttgtga aatctagtgg cttaaccact aaactgctta ggaaactgat

480

agtctagagt aggggagagg tagatggaat tcttggtgta ggggtaaaat ccgtagagat

540

caagaagaat acccattgcg aaagcgatct gctggaacct aactgacgct gaggcgtgaa

600

agcgtgggta gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccctaaac gatgtatact

660

agttgttgct ttgctagtca aggcagtaat gcagctaacg cattaagtat accgcctggg

720

gagtacggtc gcaagattaa aactcaaagg aatagacggg gacccgcaca agcggtggag

780

catgtggttt aattcgaaga tacgcgaaga accttacctg gacttgacat cctaaaaaca

840

tctaagagat tagaaagtgc tagtttacta gaatttagtg acaggtgctg cacggctgtc

900

gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cacgtgttta

960

gttgctaaca gctcggctga gcactctaaa cagactgcct tcgtaaggag gaggaaggtg

1020

tggacgacgt caagtcatca tggcccttat gtccagggcg acacacgtgc tacaatgaca

1080

tatacagtaa gacgcaatat cgcaagatgg agcaaatcta taaaatatgt cccagttcgg

1140

attgtggtct gcaactcgac cccatgaagc cggaatcgct agtaatcgta gatcagccat

1200

gctacggtga atacgttccc gggtcttgta ctcaccgccc gtcacaccat ggaagttgat

1260

ctcactcgaa gcagggatgc taaaatagct accttccaca gtggaatcag taactggggt

1320

gaagtcgtaa caaggtaacc gtaggagaac ctgcggttgg atcacctcct

1370

<210> 331

<211> 1388

<212> DNA

<213> Bacteroides vulgatus

<220>

<221> modified_base

<222> (36)..(37)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1072)..(1072)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 331

agtcgagggg cagcatggtc ttagcttgct aagacnngat ggcgaccggc gcacgggtga

60

gtaacacgta tccaacctgc cgtctactct tggacagcct tctgaaagga agattaatac

120

aagatggcat catgagtccg catgttcaca tgattaaagg tattccggta gacgatgggg

180

atgcgttcca ttagatagta ggcggggtaa cggcccacct agtcttcgat ggataggggt

240

tctgagagga aggtccccca cattggaact gagacacggt ccaaactcct acgggaggca

300

gcagtgagga atattggtca atgggcgaga gcctgaacca gccaagtagc gtgaaggatg

360

actgccctat gggttgtaaa cttcttttat aaaggaataa agtcgggtat gcatacccgt

420

ttgcatgtac tttatgaata aggatggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga

480

ggatccgagc gttatccgga tttattgggt ttaaagggag cgtagatgga tgtttaagtc

540

agttgtgaaa gtttgcggct caaccgtaaa attgcagttg atactggata tcttgagtgc

600

agttgaggca ggcggaattc gtggtgtagc ggtgaaatgc ttagatatca cgaagaactc

660

cgattgcgaa ggcagcctgc taagctgcaa ctgacattga ggctcgaaag tgtgggtatc

720

aaacaggatt agataccctg gtagtccaca cggtaaacga tgaatactcg ctgtttgcga

780

tatacgcaag cggccaagcg aaagcgttaa gtattccacc tggggagtac gccggcaacg

840

gtgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcgga ggaacatgtg gtttaattcg

900

atgattcgcg aggaacctta cccggtatta aattgcagat gaattacggt aaaagccgta

960

ggccgcaagg catctgtgaa ttgatactgg gtatcttgac agctcgtgcc gtgaggtgtc

1020

ggcttaagtg ccataacgag cgcaaccctt gttgtcagtt actaacaggt tntgctgagg

1080

actctgacaa gactgccatc gtaagatgtg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcagcac

1140

ggcccttacg tccggggcta cacacgtgtt acaatggggg gtacagaggg ccgctaccac

1200

gcgagtggat gccaatccca aaaacctctc tcagttcgga ctggagtctg caacccgact

1260

ccacgaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccacg gcgcggtgaa tacgttcccg

1320

ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg ggagccgggg gtacctgaag tgcgtaaccg

1380

cgaggagc

1388

<210> 332

<211> 1508

<212> DNA

<213> Bacteroides xylanisolvens

<400> 332

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg

60

ggcagcattt tagtttgctt gcaaactaaa gatggcgacc ggcgcacggg tgagtaacac

120

gtatccaacc tgccgataac tcggggatag cctttcgaaa gaaagattaa tatccgatag

180

tatattaaac cgcatggttt tactattaaa gaatttcggt tatcgatggg gatgcgttcc

240

attagtttgt tggcggggta acggcccacc aagactacga tggatagggg ttctgagagg

300

aaggtccccc acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc agcagtgagg

360

aatattggtc aatggacgag agtctgaacc agccaagtag cgtgaaggat gactgcccta

420

tgggttgtaa acttctttta tatgggaata aagtattcca cgtgtggaat tttgtatgta

480

ccatatgaat aaggatcggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaggatccga

540

gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgtaggtg gattgttaag tcagttgtga

600

aagtttgcgg ctcaaccgta aaattgcagt tgaaactggc agtcttgagt acagtagagg

660

tgggcggaat tcgtggtgta gcggtgaaat gcttagatat cacgaagaac tccgattgcg

720

aaggcagctc actagactgc aactgacact gatgctcgaa agtgtgggta tcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cacagtaaac gatgaatact cgctgtttgc gatatacagt

840

aagcggccaa gcgaaagcat taagtattcc acctggggag tacgccggca acggtgaaac

900

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat tcgatgatac

960

gcgaggaacc ttacccgggc ttaaattgca tttgaataat ctggaaacag gttagccgca

1020

aggcaaatgt gaaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt gtcggcttaa

1080

gtgccataac gagcgcaacc cttatcttta gttactaaca ggtcatgctg aggactctag

1140

agagactgcc gtcgtaagat gtgaggaagg tggggatgac gtcaaatcag cacggccctt

1200

acgtccgggg ctacacacgt gttacaatgg ggggtacaga aggcagctac ctggcgacag

1260

gatgctaatc ccaaaaacct ctctcagttc ggatcgaagt ctgcaacccg acttcgtgaa

1320

gctggattcg ctagtaatcg cgcatcagcc atggcgcggt gaatacgttc ccgggccttg

1380

tacacaccgc ccgtcaagcc atgaaagccg ggggtacctg aagtacgtaa ccgcaaggag

1440

cgtcctaggg taaaactggt aattggggct aagtcgtaac aaggtagccg taccggaagg

1500

tgcggctg

1508

<210> 333

<211> 1481

<212> DNA

<213> Bacteroidetes bacterium oral taxon D27

<400> 333

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agcggcaggc ctaacacatg caagtcgagg

60

ggtagtcccg atttatcggg atgagaccgg cgcacgggtg cgtaacgcgt atgcaatcta

120

ccttatacta agggatagcc cagagaaatt tggattaata ccttatagtt aataaaaaag

180

gcatcttttt aattataaag attaattggt ataagatgag catgcgtccc attagttagt

240

tggtaaggta acggcttacc aagacgatga tgggtagggg tcctgagagg gagatccccc

300

acactggtac tgagacacgg accagactcc tacgggaggc agcagtgagg aatattggtc

360

aatgggcgca agcctgaacc agccatgccg cgtgcaggat gacgcatcta tggtgtgtaa

420

actgcttttg tacaggaaga aacctcccga cgagtcggga cttgacggta ctgtaagaat

480

aaggatcggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaggatccaa gcgttatccg

540

gaatcattgg gcttaaaggg tccgtaggcg gcttaataag tcagcggtga aagtttttgg

600

cttaaccaaa aaattgccat tgatactgtt aggcttgaat ttttgtgaag taactagaat

660

atgtagtgta gcggtgaaat gcttagatat tacatggaat accaattgcg aaggcaggtt

720

actaacaaac gattgacgct gatggacgaa agcgtgggta gcgaacagga ttagataccc

780

tggtagtcca cgccgtaaac gatggatact agctgttcgg gcgtaagctt gagtggctaa

840

gcgaaagtga taagtatccc acctggggag tacgggcgca agcctgaaac tcaaaggaat

900

tgacgggagc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgatgatac gcgaggaacc

960

ttaccagggc ttaaatgtat tttgaccgtt taggaaacta gactttcgca agacaaaata

1020

caaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt gtcaggttaa gtcctataac

1080

gagcgcaacc cctgttgtta gttgccagcg agtcaagtcg ggaactctaa caagactgcc

1140

agtgtaaact gtgaggaagg tggggatgac gtcaaatcat cacggccctt acgtcctggg

1200

ccacacacgt gctacaatgg acggcacaga gagcagctac caggtgactg gatgcgaatc

1260

tataaaaccg ttctcagttc ggatcggagt ctgcaactcg actccgtgaa gctggaatcg

1320

ctagtaatcg gatatcagcc atgatccggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc

1380

ccgtcaagcc atggaagctg ggggtacctg aagtcggtga ccgcaaggag ctgcctaggg

1440

taaaactggt aactagggct aagtcgtaac aaggtagccg t

1481

<210> 334

<211> 1481

<212> DNA

<213> Bacteroidetes bacterium oral taxon F31

<400> 334

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agcggcaggc ctaacacatg caagtcgagg

60

ggtagaggaa gcttgcttcc ttgagaccgg cgcacgggtg cgtaacgcgt atgcaatcta

120

ccttgtacag ggggatagcc cagagaaatt tggattaata cctcatagtg tttaagagtg

180

gcatcacttt tttactaaag ttccaacggt acaagatgag catgcgtccc attagctagt

240

tggtgtggta acggcatacc aaggcaatga tgggtagggg tcctgagagg gaggtccccc

300

acactggtac tgagacacgg accagactcc tacgggaggc agcagtgagg aatattgggc

360

aatggaggca actctgaccc agccatgccg cgtgcaggaa gacggtccta tggattgtaa

420

actgcttttg tacgagaaga aacatcccga cgtgtcggga cttgacggta tcgtaagaat

480

aaggatcggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaggatccaa gcgttatccg

540

gaatcattgg gtttaaaggg tccgtaggcg gtcttataag tcagtggtga aatctcctag

600

ctcaactagg aaactgccat tgatactgta agacttgaat gtttgtgaag taactagaat

660

atgtagtgta gcggtgaaat gcttagatat tacatggaat accaattgcg aaggcaggtt

720

actaacagat gattgacgct gatggacgaa agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc

780

tggtagtcca cgccgtaaac gatggatact agctgttcga gagcaatctt gagtggctaa

840

gcgaaagtga taagtatccc acctggggag tacgcacgca agtgtgaaac tcaaaggaat

900

tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgatgatac gcgaggaacc

960

ttaccagggc ttaaatggga gacgacagtt taggaaacta gactttcttc ggacgtcttt

1020

caaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt gtcaggttaa gtcctataac

1080

gagcgcaacc cctgttgtta gttgccagcg agtaatgtcg ggaactctag caagactgcc

1140

ggtgtaaacc gtgaggaagg tggggatgac gtcaaatcat cacggccctt acgtcctggg

1200

ccacacacgt gctacaatgg caggtacaga gagcagccac ttagcgataa ggagcgaatc

1260

tataaaacct gtctcagttc ggattggagt ctgcaactcg actctatgaa gctggaatcg

1320

ctagtaatcg gatatcagcc atgatccggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc

1380

ccgtcaagcc atggaagctg ggggtacctg aagtcggtga ccgtaaggag ctgcctaggg

1440

taaaactagt aactggggct aagtcgtaac aaggtagccg t

1481

<210> 335

<211> 1477

<212> DNA

<213> Bacteroidetes bacterium oral taxon F44

<400> 335

aagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gcggcaggcc taacacatgc aagtcgaggg

60

gtagaagctt tcgggctttg agaccggcgc acgggtgcgt aacgcgtatg caatctgcct

120

tgtactgagg gatagcccag agaaatttgg attaatacct catggtattt tttgttggca

180

tcaacagatt attaaagaga ttcggtacaa gatgagcatg cgtcccatta gctagttggt

240

atggtaacgg cataccaagg ctacgatggg taggggtcct gagagggaga tcccccacac

300

tggtactgag acacggacca gactcctacg ggaggcagca gtgaggaata ttggtcaatg

360

gtcgcaagac tgaaccagcc atgccgcgtg taggatgaag catctatggt gtgtaaacta

420

cttttgtacg ggaagaaaca ctccctcgtg agggagcttg acggtaccgt aagaataagg

480

atcggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg atccaagcgt tatccggaat

540

cattgggttt aaagggtccg taggcggttt tataagtcag tggtgaaatc cggcagctca

600

actgtcgaac tgccattgat actgtagaac ttgaatcatt gtgaagtaac tagaatatgt

660

agtgtagcgg tgaaatgctt agatattaca tggaatacca attgcgaagg caggttacta

720

acaatgtatt gacgctgatg gacgaaagcg tgggtagcga acaggattag ataccctggt

780

agtccacgcc gtaaacgatg gatactagct gttcggttgt aagattgagt ggctaagcga

840

aagtgataag tatcccacct ggggagtacg ggcgcaagcc tgaaactcaa aggaattgac

900

gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga tgatacgcga ggaaccttac

960

cagggcttaa atgtagtatg acaggtttgg aaacagactt ttcttcggac atattacaag

1020

gtgctgcatg gttgtcgtca gctcgtgccg tgaggtgtca ggttaagtcc tataacgagc

1080

gcaacccctg ttgttagttg ccatcgagta atgtcgggaa ctctaacaag actgccggtg

1140

caaaccgtga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcacg gcccttacgt cctgggctac

1200

acacgtgcta caatggcagg tacagagagc agccacttcg caaggaggag cgaatctata

1260

aagcctgtct cagttcggat tggagtctgc aacccgactc catgaagctg gaatcgctag

1320

taatcggata tcagccatga tccggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

caagccatgg aagctggggg tacctgaagt cggtgaccgc aaggagctgc ctagggtaaa

1440

actggtaact ggggctaagt cgtaacaagg tagccgt

1477

<210> 336

<211> 1316

<212> DNA

<213> Barnesiella intestinihominis

<400> 336

gatgaacgct agcgacaggc ctaacacatg caagtcgagg gaccggcgca cgggtgagta

60

acacgtatgc aatccacctg taacaggggg ataacccgga gaaatccgga ctaatacccc

120

ataattaaag ttggttacag acgagcatgc gctccattag ccagttggcg gggtaacggc

180

ccaccaaagc gacgatggat aggggttctg agaggaaggt cccccacatt ggaactgaga

240

cacggtccaa actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat tggtcaatgg tcggcagact

300

gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg cctacgggtt gtaaacctct tttgtcggag

360

agtatgcaag tatccgaaga aaaagcatcg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata

420

cggaggatgc gagcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggtgcgtagg cggcacgcca

480

agtcagcggt gaaatttccg ggctcaaccc ggagtgtgcc gttgaaactg gcgagctaga

540

gtacacaaga ggcaggcgga atgcgtggtg tagcggtgaa atgcatagat atcacgcaga

600

accccgattg cgaaggcagc ctgctagggt gacagacgct gaggcacgaa agcgtgggta

660

tcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgcagtaaac gatgaatact aactgtttgc

720

gtgtaagcgg tacagcgaaa gcgttaagta ttccacctgg ggagtacgcc ggcaacggtg

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggagga acatgtggtt taattcgatg

840

atacgcgagg aaccttaccc gggctcaaac gcgaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg

900

tgccgtgagg tgtcggctta agtgccataa cgagcgcaac ccctatcgac agttactaac

960

ggccgaggac tctgtcgaga ctgccggcgc aagccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1020

tcagcacggc ccttacgtcc ggggcgacac acgtgttaca atggcaggca gaaggcagcc

1080

agtcagcaat gacgcgcgaa tcccgcctgt ctcagttcgg atggagtctg caacccgact

1140

ccagaagctg gattcgctag taatcgcgca tcagccatgg cgcggtgaat acgttcccgg

1200

gccttgtaca caccgcccgt caagccatgg aagccgggag tacctgaagc atgcagcgta

1260

cgaaggtaat accggtaact ggggctaagt cgtaacaagg tagccgtacc ggaagg

1316

<210> 337

<211> 1461

<212> DNA

<213> Barnesiella viscericola

<400> 337

tcaggatgaa cgctagcgac aggcctaaca catgcaagtc gaggggcagc gcggaggtag

60

caatacttct ggcggcgacc ggcgcacggg tgagtaacac gtatgcaatc tgcctgtaac

120

agggggataa cccggagaaa tccggcctaa taccccataa cgacatatct tcgcatgggg

180

agatgtctaa agagagcaat cttggttaca gatgagcatg cggtccatta gccagttggc

240

ggggtaacgg cccaccaaag cgacgatgga taggggttct gagaggaagg tcccccacat

300

tggaactgag acacggtcca aactcctacg ggaggcagca gtgaggaata ttggtcaatg

360

gtcggcagac tgaaccagcc aagtcgcgtg aaggaagacg gccctacggg ttgtaaactt

420

cttttgtcgg agagtaaagt gcgctacgcg tagcgtattg caagtatccg aagaaaaagc

480

atcggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg atgcgagcgt tatccggatt

540

tattgggttt aaagggtgcg taggcggcac gccaagtcag cggtgaaatg cccgggctta

600

acccgggagc tgccgttgaa actgcgagct agcgtgcaca agaggcaggc ggaatgcgtg

660

gtgtagcggt gaaatgcata gatatcacgc agaaccccga ttgcgaaggc agcctgctag

720

ggtgcaacgg acgctgaggc acgaaagcgt ggggatcgaa caggattaga taccctggta

780

gtccacgcag taaacgatga atactaactg tttgcgatat aatgtaagcg gtacagcgaa

840

agcgttaagt attccacctg gggagtacgc cggcaacggt gaaactcaaa ggaattgacg

900

ggggcccgca caagcggagg aacatgtggt ttaattcgat gatacgcgag gaaccttacc

960

cgggctcaaa cgcaggggga atatgggtga aagtccatag ccagcaatgg tcgcctgcga

1020

ggtgctgcat ggttgtcgtc agctcgtgcc gtgaggtgtc ggcttaagtg ccataacgag

1080

cgcaacccta ttgacagtta ctaacgggtc aagccgagga ctctgtcgag actgccggcg

1140

caagccgcga ggaaggtggg gatgacgtca aatcagcacg gcccttacgt ccggggcgac

1200

acacgtgtta caatggcagg tacagaaggc agccagtcag caatgacgcg cgaatcccga

1260

aaacctgtct cagttcggat tggagtctgc aactcgactc catgaagctg gattcgctag

1320

taatcgcgca tcagccatgg cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

caagccatgg aagccgggag tacctgaagc atgcaaccgc aaggagcgta cgaaggtaat

1440

accggtaact ggggctaagt c

1461

<210> 338

<211> 1492

<212> DNA

<213> Bartonella bacilliformis

<400> 338

ttcaacttga gagtttgatc ctggctcaga acgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgagcg cactcttttt gagtgagcgg cagacgggtg agtaacgcgt gggaatctac

120

ccatctctac ggaataacac agagaaattt gtgctaatac cgtatacgtc cttcgggaga

180

aagatttatc ggagatggat gagcccgcgt tggattagct agttggtgag gtaacggccc

240

accaaggcga cgatccatag ctggtctgag aggatgatca gccacactgg gactgagaca

300

cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggg gcaaccctga

360

tccagccatg ccgcgtgagt gatgaaggcc ttagggttgt aaagctcttt caccggtgaa

420

gataatgacg gtagccggag aagaagcccc ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgaaggggg ctagcgttgt tcggatttac tgggcgtaaa gcgcatgtag gcggatattt

540

aagtcagagg tgaaatccca gggctcaacc ttggaactgc ctttgatact ggatgtctcg

600

agtatggaag aggtgagtgg aattccgagt gtagaggtaa aattcgtaga tattcggagg

660

aacaccagtg gcgaaggcgg ctcactggtc cattactgac gctgaggtgc gaaagcgtgg

720

ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgaat gttagccgtc

780

gggcagttta ctgctcggtg gcgcagctaa cgcgttaaac attccgcctg gggagtacgg

840

tcgcaagatt aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt

900

ttaattcgaa gcaacgcgca gaaccttacc agcccttgac atcccgatcg cggagagtgg

960

agacactttc cttcagttag gctggatcgg agacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

1020

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa ccctcgccct tagttgccag

1080

cattcagttg ggcactctaa ggggactgcc ggtgataagc cgagaggaag gtggggatga

1140

cgtcaagtcc tcatggccct tacgggctgg gctacacacg tgctacaatg gtggtgacag

1200

tgggcagcga aaccgcaagg tcgagctaat ctccaaaagc catctcagtt cggattgcac

1260

tctgcaactc gagtgcatga agtcggaatc gctagtaatc gtggatcagc atgccacggt

1320

gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg gttttacccg

1380

aaggtgctgt gctaaccgca aggaagcagg caaccacggt agggtcagcg actggggtga

1440

agtcgtaaca aggtagccgt aggggaacct gcggctggat cacctccttt ct

1492

<210> 339

<211> 1491

<212> DNA

<213> Bartonella grahamii

<400> 339

tgagagtttg atcctggctc agaacgaacg ctggcggcag gcttaacaca tgcaagtcga

60

gcgcactctt ttagagtgag cggcaaacgg gtgagtaacg cgtgggaatc tacccatctc

120

tacggaataa cacagagaaa tttgtgctaa taccgtatac gtcctttttg gagaaagatt

180

tatcggagat ggatgagccc gcgttggatt agctagttgg tgaggtaacg gctcaccaag

240

gcgacgatcc atagctggtc tgagaggatg atcagccaca ctgggactga gacacggccc

300

agactcctac gggaggcagc agtggggaat attggacaat gggggcaacc ctgatccagc

360

catgccgcgt gagtgatgaa ggccctaggg ttgtaaagct ctttcaccgg tgaagataat

420

gacggtaacc ggagaagaag ccccggctaa cttcgtgcca gcagccgcgg taatacgaag

480

ggggctagcg ttgttcggat ttactgggcg taaagcgcac gtaggcggat atttaagtca

540

gaggtgaaat cccagggctc aaccctggaa ctgcctttga tactggatat cttgagtatg

600

gaagaggtga gtggaattcc gagtgtagag gtaaaattcg tagatattcg gaggaacacc

660

agtggcgaag gcggctcact ggtccattac tgacgctgag gtgcgaaagc gtggggagca

720

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gaatgttagc cgtcgggcgg

780

tttactgctc ggtggcgcag ctaacgcatt aaacattccg cctggggagt acggtcgcaa

840

gattaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

900

cgaagcaacg cgcagaacct taccagccct tgacatcccg atcgcggaag gtggagacac

960

cctccttcag ttaggctgga tcggagacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg

1020

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctcg cccttagttg ccagcattta

1080

gttgggcact ctaaggggac tgccggtgat aagccgagag gaaggtgggg atgacgtcaa

1140

gtcctcatgg cccttacggg ctgggctaca cacgtgctac aatggtggtg acagtgggca

1200

gcgagaccgc gaggtcgagc taatctccaa aagccatctc agttcggatt gcactctgca

1260

actcgagtgc atgaagttgg aatcgctagt aatcgtggat cagcatgcca cggtgaatac

1320

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gttggtttta cccgaaggtg

1380

ctgtgctaac cgcaaggagg caggcaacca cggtagggtc agcgactggg gtgaagtcgt

1440

aacaaggtag ccgtagggga acctgtggct ggatcacctc ctttctaagg a

1491

<210> 340

<211> 1492

<212> DNA

<213> Bartonella henselae

<400> 340

ttcaatatga gagtttgatc ctggctcaga acgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgagcg cactctttta gagtgagcgg caaacgggtg agtaacgcgt gggaatctac

120

ccatctctac ggaataacac agagaaattt gtgctaatac cgtatacgtc cttagggaga

180

aagatttatc ggagatggat gagcccgcgt tggattagct agttggtgag gtaacggctc

240

accaaggcga cgatccatag ctggtctgag aggatgatca gccacactgg gactgagaca

300

cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggg gcaaccctga

360

tccagccatg ccgcgtgagt gatgaaggcc ctagggttgt aaagctcttt caccggtgaa

420

gataatgacg gtaaccggag aagaagcccc ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgaaggggg ctagcgttgt tcggatttac tgggcgtaaa gcgcatgtag gcggatattt

540

aagtcagagg tgaaatccca gggctcaacc ctggaactgc ctttgatact gggtatcttg

600

agtgtggaag aggtgagtgg aattccgagt gtagaggtaa aattcgtaga tattcggagg

660

aacaccagtg gcgaaggcgg ctcactggtc cattactgac gctgaggtgc gaaagcgtgg

720

ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgaat gttagccgtc

780

gggcggttta ctgctcggtg gcgcagctaa cgcgttaaac attccgcctg gggagtacgg

840

tcgcaagatt aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt

900

ttaattcgaa gcaacgcgca gaaccttacc agcccttgac atcccgatcg cggaaggtgg

960

agacaccctc cttcagttag gctggatcgg agacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

1020

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa ccctcgccct tagttgccag

1080

catttggttg ggcactctag ggggactgcc ggtgataagc cgagaggaag gtggggatga

1140

cgtcaagtcc tcatggccct tacgggctgg gctacacacg tgctacaatg gtggtgacag

1200

tgggcagcga gaccgcgagg tcgagctaat ctccaaaagc catctcagtt cggattgcac

1260

tctgcaactc gagtgcatga agtcggaatc gctagtaatc gtggatcagc atgccacggt

1320

gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg gttttacccg

1380

aaggtgctgt gctaaccgca agggggcagg caaccacggt agggtcagcg actggggtga

1440

agtcgtaaca aggtagccgt aggggaacct gtggctggat cacctccttt ct

1492

<210> 341

<211> 1493

<212> DNA

<213> Bartonella quintana

<400> 341

ttcaatatga gagtttgatc ctggctcaga acgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgagcg cactctttta gagtgagcgg caaacgggtg agtaacgcgt gggaatctac

120

ccatctctac ggaataacac agagaaattt gtgctaatac cgtatacgtc cctctgggag

180

aaagatttat cggaggtgga tgagcccgcg ttggattagc tagttggtga ggtaagggct

240

caccaaggcg acgatccata gctggtctga gaggatgatc agccacactg ggactgagac

300

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg ggcaaccctg

360

atccagccat gccgcgtgag tgatgaaggc cctagggttg taaagctctt tcaccggtga

420

agataatgac gttaaccgga gaagaagccc cggctaactt cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacgaagggg gctagcgttg ttcggattta ctgggcgtaa agcgcatgta ggcggatatt

540

taagtcagag gtgaaatccc agggctcaac cctggaactg cctttgatac tggatgtctc

600

gagtgtggaa gaggtgagtg gaattccgag tgtagaggta aaattcgtag atattcggag

660

gaacaccagt ggcgaaggcg gctcactggt ccattactga cgctgaggtg cgaaagcgtg

720

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgaa tgttagccgt

780

cgggtggttt actactcggt ggcgcagcta acgcgttaaa cattccgcct ggggagtacg

840

gtcgcaagat taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg

900

tttaattcga agcaacgcgc agaaccttac cagcccttga catcccgatc gcggaaggtg

960

gagacaccct ccttcagtta ggctggatcg gtgacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct

1020

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca accctcgccc ttagttgcca

1080

tcattaagtt gggcactcta gggggactgc cggtgataag ccgagaggaa ggtggggatg

1140

acgtcaagtc ctcatggccc ttacgggctg ggctacacac gtgctacaat ggtggtgaca

1200

gtgggcagcg agaccgcgag gtcgagctaa tctccaaaag ccatctcagt tcggattgca

1260

ctctgcaact cgagtgcatg aagttggaat cgctagtaat cgtggatcag catgccacgg

1320

tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtt ggttttaccc

1380

gaaggtgctg tgctaaccgc aaggaggcag gcaaccacgg tagggtcagc gactggggtg

1440

aagtcgtaac aaggtagccg taggggaacc tgtggctgga tcacctcctt tct

1493

<210> 342

<211> 1228

<212> DNA

<213> Bartonella tamiae

<400> 342

tttcggagtg agcggcagac gggtgagtaa cacgtgggaa tctacccatc tctacggaat

60

aacacagaga aatttgtgct aataccgtat acgtccttat ggagaaagat ttatcggaga

120

tggatgagcc cgcgttggat tagctagttg gtagggtaaa ggcttaccaa ggcgacgatc

180

catagctggt ctgagaggat gatcagccac actgggactg agacacggcc cagactccta

240

cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa tgggcgaaag cctgatccag ccatgccgcg

300

tgagtgatga aggccctagg gttgtaaagc tctttcaccg gtgaagataa tgacggtaac

360

cggagaagaa gccccggcta acttcgtgcc agcagccgcg gtaatacgaa gggggctagc

420

gttgttcgga tttactgggc gtaaagcgca cgtaggcgga catttaagtc agaggtgaaa

480

tcccagggct caaccctgga actgcctttg atactgggtg tcttgagtat ggaagaggtg

540

agtggaattc cgagtgtaga ggtgaaattc gtagatattc ggaggaacac cagtggcgaa

600

ggcggctcac tggtccatta ctgacgctga ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt

660

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgaatgttag ccgtcggaca gtttactgtt

720

cggtggcgca gctaacgcat taaacattcc gcctggggag tacggtcgca agattaaaac

780

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcccaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac

840

gcgcagaacc ttaccagccc ttgacatccc gatcgcggtt agtggagaca ctttccttca

900

gttaggctgg atcggtgaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

960

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc gcccttagtt gccatcatta agttgggcac

1020

tctaagggga ctgccggtga taagccgaga ggaaggtggg gatgacgtca agtcctcatg

1080

gcccttacgg gctgggctac acacgtgcta caatggtggt gacagtgggc agcgagaccg

1140

cgaggtcgag ctaatctcca aaagccatct cagttcggat tgcactctgc aactcgagtg

1200

catgaagtgg aatcgctagt aatcgtgg

1228

<210> 343

<211> 1324

<212> DNA

<213> Bartonella washoensis

<400> 343

gcaagtcgag cgcactcttt tagagtgagc ggcaaacggg tgagtaacgc gtgggaatct

60

acccctctct acggaataac acagagaaat ttgtgctaat accgtatacg tcccttttgg

120

gagaaagatt tatcggagat ggatgagccc gcgttggatt agctagttgg tgaggtaacg

180

gcccaccaag gcgacgatcc atagctggtc tgagaggatg atcagccaca ctgggactga

240

gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attggacaat gggggcaacc

300

ctgatccagc catgccgcgt gagtgatgaa ggccctaggg ttgtaaagct ctttcaccgg

360

tgaagataat gacggtaacc ggagaagaag ccccggctaa cttcgtgcca gcagccgcgg

420

taatacgaag ggggctagcg ttgttcggat ttactgggcg taaagcgcat gtaggcggac

480

atttaagtca gaggtgaaat cccagggctc aaccctggaa ctgcctttga tactgggtgt

540

cttgagtgtg gaagaggtga gtggaattcc gagtgtagag gtaaaattcg tagatattcg

600

gaggaacacc agtggcgaag gcggctcact ggtccattac tgacgctgag gtgcgaaagc

660

gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gaatgttagc

720

cgtcgggcgg tttactgctc ggtggcgcag ctaacgcgtt aaacattccg cctggggagt

780

acggtcgcaa gattaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg

840

tggtttaatt cgaagcaacg cgcagaacct taccagccct tgacatcccg atcgcggaag

900

gtggagacac cctccttcag ttaggctgga tcggagacag gtgctgcatg gctgtcgtca

960

gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctcg cccttagttg

1020

ccatcattaa gttgggcact ctagggggac tgccggtgat aagccgagag gaaggtgggg

1080

atgacgtcaa gtcctcatgg cccttacggg ctgggctaca cacgtgctac aatggtggtg

1140

acagtgggca gcgagaccgc gaggtcgagc taatctccaa aagccatctc agttcggatt

1200

gcactctgca actcgagtgc atgaagttgg aatcgctagt aatcgtggat cagcatgcca

1260

cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gttggtttta

1320

cccg

1324

<210> 344

<211> 1407

<212> DNA

<213> Bdellovibrio sp. MPA

<400> 344

catgcaagtc gaacggggaa agctttcggg tgagtactag tggcgcacgg gtgagtaacg

60

cgtggataat ctgcctttga gtgggggata actagtcgaa agattagcta ataccgcata

120

agaccacagg aactgaggtt ctaggggtta aaggtttttc gctcatagat gagtccgcgt

180

gagattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgatctctaa ctggtctgag

240

aggatgatca gtcacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagta

300

gggaatattg cacaatggag gaaactctga tgcagcgacg ccgcgtgagt gatgaaggct

360

ttcgggtcgt aaagctctgt cgcaggggaa taacacaatg aatgtaccct gtaagaaagg

420

atcggctaac ttcgtgccag cagccgcggt aagacgaggg atcctagcgt tgttcggaat

480

tattgggcgt aaagcggatg taggtggctt tgtaagtcag gtgtgaaagc ctagggctca

540

accctagaag tgcatctgat actgcgaagc ttgagtgtgg gagaggatag tagaattcct

600

ggtgtagtgg tgaaatacgt agatatcagg aggaataccg gaggcgaagg cggctatctg

660

gcccaacact gacactgaga tccgaaagcg tggggatcaa acaggattag ataccctggt

720

agtccacgcc gtaaacgatg gatacttgtt gttggaggta ttgacccctt cagtgacgaa

780

gctaacgcgt taagtatccc gcctggggag tacggtcgca agattaaaac tcaaagaaat

840

tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgatgcaac gcgaagaacc

900

ttacctaggc ttgacatgta ctggaagact ggcagaaatg tcgtcgcctt cgggccggta

960

cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1020

cgagcgcaac ccctgcattt agttgccagc attcagttgg gcactctaga tggactgccg

1080

gtgttaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcctc atggccctta tgcctagggc

1140

tacacacgtg ctacaatggt ggttacagac ggatgccaaa ccgcaaggtg gagctaatcc

1200

tacaaaagcc atctaagttc agattggtct ctgcaactcg agaccatgaa gttggaatcg

1260

ctagtaatcg cggatcagaa tgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1320

cgtcacacca tgaaagttgg ttgtaccaga agtcgctgcg ctaaccgtaa ggaggcaggc

1380

gcccaaggta tggtcgatga ttggggt

1407

<210> 345

<211> 1289

<212> DNA

<213> Bifidobacteriaceae genomosp. C1

<400> 345

cgctggcggc gtgcttaaca catgcaagtc gagcgagcgg cgaacgggtg agtaatgcgt

60

gactgacctg ccctgaggtt tggaatagct cctggaaacg ggtggtaatg ccggatgttg

120

aaaagtgcct tgggatgggg tcgcgtccta tcaggtagtc ggtggggtag tggcctaccg

180

agcctacgac gggtagccgg cctgagaggg tgaccggcca cattgggact gagatacggc

240

ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcgca atgggggaaa ccctgacgca

300

gcgacgccgc gtgcgggatg gaggccttcg ggttgtgaac cgcttttgtt agggagcatg

360

agtgtacctt tcgaataagg accggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg

420

gtccaagcgc tgtccggaat tattgggcgt aaagggctcg taggcggttc gtcgcgtctg

480

gtgtgaaagc ccattgctta acggtgggtt tgcgctggat acgggcgggc ttgagtgcgg

540

taggggagaa cggaattccc ggtgtaacgg tggaatgtgt agatatcggg aagaacaccg

600

atggcgaagg cagttctctg ggccgactga cgctgaggag cgaaagcgtg gggagcgaac

660

aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacggtgga tgctggatgt ggggcgttct

720

gtgtcggagc taacgcgtta agcatcccgc ctggggagta cggccgcaag gttaaaactc

780

aaagaaattg acgggggccc gcacaagcgg cggagcatgc ggtttaattc gatgcaacgc

840

gaagaacctt acctgggttt gacatgcaca ggtggtgcat ggccgtcgtc agctcgtgtc

900

gtgagatgtt gggtcaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gccctgtgtt gccagcagct

960

gggcactcac gggggaccgc cggggttaac ccggaggagg gtggggatga cgtcaggtca

1020

tcatgcccct tacgtccagg gctacacgca tgctacaatg gccggcagcg ggatgcgatg

1080

tcgtgaggcg gagcggatcc cttccggtct cagttcggac ggagcctgca actcggctcc

1140

ggaaggtgga gtcgctagta atcgcggatc agcaacgccg cggtgaatgc gttcccgggc

1200

cttgtacaca ccgcccgtca agtcatgaaa gtcggcaaca cccgaagccc gtgcctaggg

1260

agcggtcgaa ggtggggctg gtgattggg

1289

<210> 346

<211> 1021

<212> DNA

<213> Bifidobacterium adolescentis

<220>

<221> modified_base

<222> (773)..(773)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (859)..(859)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (975)..(975)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (991)..(992)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1015)..(1015)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 346

tcccaggagc ttgctcctgg gtgagagtgg cgaacgggtg agtaatgcgt gaccgacctg

60

ccccatacac cggaatagct cttggaaacg ggtggtaatg ccggatgctc cagttggatg

120

catgtccttc tgggaaagat tcatcggtat gggatggggt cgcgtcctat cagcttgatg

180

gcggggtaac ggcccaccat ggcttcgacg ggtagccggc ctgagagggc gaccggccac

240

attgggactg agatacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa

300

tgggcgcaag cctgatgcag cgacgccgcg tgcgggatga cggccttcgg gttgtaaacc

360

gcttttgact gggagcaagc ccttcggggt gagtgtacct ttcgaataag caccggctaa

420

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggtgcaagcg ttatccggaa ttattgggcg

480

taaagggctc gtaggcggtt cgtcgcgtcc ggtgtgaaag tccatcgctt aacggtggat

540

ccgcgccggg tacgggcggg cttgagtgcg gtaggggaga ctggaattcc cggtgtaacg

600

gtggaatgtg tagatatcgg gaagaacacc aatggcgaag gcaggtctct gggccgtcac

660

tgacgctgag gagcgaaagc gtggggagcg aacaggatta gataccctgg tagtccacgc

720

cgtaaacggt ggatgctgga tgtggggacc attccacggt ctccgtgtcg ganccaacgc

780

gttaagcatc ccgcctgggg agtacggccg caaggctaaa actcaaagaa attgacgggg

840

gcccgcacaa gcggcgganc atgcggatta attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg

900

gcttgacatg ttcccgacag ccgtagagat acggtctccc ttcggggcgg gttcacaggt

960

ggtgcatggt cgtcntcagc tcgtgtcgtg nnatgttggg ttaagtcccg caacnagcgc

1020

a

1021

<210> 347

<211> 1535

<212> DNA

<213> Bifidobacterium angulatum

<400> 347

tttttgtgga gggttcgatt ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg ggatcggctg gagcttgctc cggccgtgag agtggcgaac gggtgagtaa

120

tgcgtgaccg acctgccccg tacaccggaa tagctcctgg aaacgggtgg taatgccgga

180

tgctccagtc catcgcatgg tggtctggga aagattttat cggtatggga tggggtcgcg

240

tcctatcagg tagtcggcgg ggtaacggcc caccgagcct acgacgggta gccggcctga

300

gagggcgacc ggccacattg ggactgagat acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagcgac gccgcgtgcg ggatgacggc

420

cttcgggttg taaaccgctt ttgttgggga gcaagccttc gggtgagtgt acccttcgaa

480

taagcaccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgca agcgttatcc

540

ggaattattg ggcgtaaaga gctcgtaggc ggttcgtcgc gtccggtgtg aaagtccatc

600

gcttaacggt ggatctgcgc cgggtacggg cgggctggag tgcggtaggg gagactggaa

660

ttcccggtgt aacggtggaa tgtgtagata tcgggaagaa caccaatggc gaaggcaggt

720

ctctgggccg ttactgacgc tgaggagcga aagcgtgggg agcgaacagg attagatacc

780

ctggtagtcc acgccgtaaa cggtggatgc tggatgtggg gcccattcca cgggttccgt

840

gtcggagcta acgcgttaag catcccgcct ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa

900

agaaattgac gggggcccgc acaagcggcg gagcatgcgg attaattcga tgcaacgcga

960

agaaccttac ctgggcttga catgttcccg acagccccag agatggggcc tcccttcggg

1020

gcgggttcac aggtggtgca tggtcgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaaccct cgccccgtgt tgccagcaca tgatggtggg aactcacggg

1140

ggaccgccgg ggttaactcg gaggaaggtg gggatgacgt cagatcatca tgccccttac

1200

gtccagggct tcacgcatgc tacaatggcc ggtacaacgg gatgcgacat ggcgacatgg

1260

agcggatccc tgaaaaccgg tctcagttcg gattggagtc tgcaacccga ctccatgaag

1320

gcggagtcgc tagtaatcgc gaatcagcaa cgtcgcggtg aatgcgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcaagtca tgaaagtggg tagcacccga agccggtggc ccaaccagtt

1440

cgctgggggg agccgtctaa ggtgagactc gtgattggga ctaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtaccggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1535

<210> 348

<211> 1550

<212> DNA

<213> Bifidobacterium animalis

<400> 348

tttttgtgga gggttcgatt ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg ggatccctgg cagcttgctg tcggggtgag agtggcgaac gggtgagtaa

120

tgcgtgacca acctgccctg tgcaccggaa tagctcctgg aaacgggtgg taataccgga

180

tgctccgctc catcgcatgg tggggtggga aatgcttttg cggcatggga tggggtcgcg

240

tcctatcagc ttgttggcgg ggtgatggcc caccaaggcg ttgacgggta gccggcctga

300

gagggtgacc ggccacattg ggactgagat acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagcgac gccgcgtgcg ggatggaggc

420

cttcgggttg taaaccgctt ttgttcaagg gcaaggcacg gtttcggccg tgttgagtgg

480

attgttcgaa taagcaccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgcg

540

agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaagg gctcgtaggc ggttcgtcgc gtccggtgtg

600

aaagtccatc gcctaacggt ggatctgcgc ccgggtacgg gcgggctgga gtgcggtagg

660

ggagactgga attcccggtg taacggtgga atgtgtagat atcgggaaga acaccaatgg

720

cgaaggcagg tctctgggcc gtcactgacg ctgaggagcg aaagcgtggg gagcgaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acggtggatg ctggatgtgg ggccctttcc

840

acgggtcccg tgtcggagcc aacgcgttaa gcatcccgcc tggggagtac ggccgcaagg

900

ctaaaactca aagaaattga cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgcg gattaattcg

960

atgcaacgcg aagaacctta cctgggcttg acatgtgccg gatcgccgtg gagacacggt

1020

ttcccttcgg ggccggttca caggtggtgc atggtcgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc tcgccgcatg ttgccagcgg gtgatgccgg

1140

gaactcatgt gggaccgccg gggtcaactc ggaggaaggt ggggatgacg tcagatcatc

1200

atgcccctta cgtccagggc ttcacgcatg ctacaatggc cggtacaacg cggtgcgaca

1260

cggtgacgtg gggcggatcg ctgaaaaccg gtctcagttc ggatcgcagt ctgcaactcg

1320

actgcgtgaa ggcggagtcg ctagtaatcg cggatcagca acgccgcggt gaatgcgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcaagtc atgaaagtgg gtagcacccg aagccggtgg

1440

cccgaccctt gtggggggag ccgtctaagg tgagactcgt gattgggact aagtcgtaac

1500

aaggtagccg taccggaagg tgcggctgga tcacctcctt tctacggaga

1550

<210> 349

<211> 1056

<212> DNA

<213> Bifidobacterium bifidum

<220>

<221> modified_base

<222> (764)..(764)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (850)..(850)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (919)..(919)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (961)..(961)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (985)..(985)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (989)..(989)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (993)..(993)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1002)..(1002)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1014)..(1014)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1026)..(1026)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1028)..(1029)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1045)..(1045)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 349

ctttgcttgg tggtgagagt ggcgaacggg tgagtaatgc gtgaccgacc tgccccatgc

60

tccggaatag ctcctggaaa cgggtggtaa tgccggatgt tccacatgat cgcatgtgat

120

tgtgggaaag attctatcgg cgtgggatgg ggtcgcgtcc tatcagcttg ttggtgaggt

180

aacggctcac caaggcttcg acgggtagcc ggcctgagag ggcgaccggc cacattggga

240

ctgagatacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggcgc

300

aagcctgatg cagcgacgcc gcgtgaggga tggaggcctt cgggttgtaa acctcttttg

360

tttgggagca agccttcggg tgagtgtacc tttcgaataa gcgccggcta actacgtgcc

420

agcagccgcg gtaatacgta gggcgcaagc gttatccgga tttattgggc gtaaagggct

480

cgtaggcggc tcgtcgcgtc cggtgtgaaa gtccatcgct taacggtgga tctgcgccgg

540

gtacgggcgg gctggagtgc ggtaggggag actggaattc ccggtgtaac ggtggaatgt

600

gtagatatcg ggaagaacac cgatggcgaa ggcaggtctc tgggccgtca ctgacgctga

660

ggagcgaaag cgtggggagc gaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacgg

720

tggacgctgg atgtggggca cgttccacgt gttccgtgtc gganctaacg cgttaagcgt

780

cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaaga aattgacggg ggcccgcaca

840

agcggcggan catgcggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg ggcttgacat

900

gttcccgacg acgccagana tggcgtttcc cttcggggcg ggttcacagg tggtgcatgg

960

ncgtcgtcag ctcgtgtcgt gagangttng ggntaagtcc cncaacgagc gcanccctcg

1020

ccccgngnng ccagcacgtt atggngggga actcac

1056

<210> 350

<211> 1535

<212> DNA

<213> Bifidobacterium breve

<400> 350

tttttgtgga gggttcgatt ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg ggatccatcg ggctttgcct ggtggtgaga gtggcgaacg ggtgagtaat

120

gcgtgaccga cctgccccat gcaccggaat agctcctgga aacgggtggt aatgccggat

180

gctccatcac accgcatggt gtgttgggaa agcctttgcg gcatgggatg gggtcgcgtc

240

ctatcagctt gatggcgggg taacggccca ccatggcttc gacgggtagc cggcctgaga

300

gggcgaccgg ccacattggg actgagatac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg

360

ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat gcagcgacgc cgcgtgaggg atggaggcct

420

tcgggttgta aacctctttt gttagggagc aaggcacttt gtgttgagtg tacctttcga

480

ataagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc aagcgttatc

540

cggaattatt gggcgtaaag ggctcgtagg cggttcgtcg cgtccggtgt gaaagtccat

600

cgcttaacgg tggatccgcg ccgggtacgg gcgggcttga gtgcggtagg ggagactgga

660

attcccggtg taacggtgga atgtgtagat atcgggaaga acaccaatgg cgaaggcagg

720

tctctgggcc gttactgacg ctgaggagcg aaagcgtggg gagcgaacag gattagatac

780

cctggtagtc cacgccgtaa acggtggatg ctggatgtgg ggcccgttcc acgggttccg

840

tgtcggagct aacgcgttaa gcatcccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca

900

aagaaattga cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgcg gattaattcg atgcaacgcg

960

aagaacctta cctgggcttg acatgttccc gacgatccca gagatggggt ttcccttcgg

1020

ggcgggttca caggtggtgc atggtcgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag

1080

tcccgcaacg agcgcaaccc tcgccccgtg ttgccagcgg attgtgccgg gaactcacgg

1140

gggaccgccg gggttaactc ggaggaaggt ggggatgacg tcagatcatc atgcccctta

1200

cgtccagggc ttcacgcatg ctacaatggc cggtacaacg ggatgcgaca gtgcgagctg

1260

gagcggatcc ctgaaaaccg gtctcagttc ggatcgcagt ctgcaactcg actgcgtgaa

1320

ggcggagtcg ctagtaatcg cgaatcagca acgtcgcggt gaatgcgttc ccgggccttg

1380

tacacaccgc ccgtcaagtc atgaaagtgg gcagcacccg aagccggtgg cctaacccct

1440

tgcgggaggg agccgtctaa ggtgaggctc gtgattggga ctaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtaccggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1535

<210> 351

<211> 1051

<212> DNA

<213> Bifidobacterium catenulatum

<220>

<221> modified_base

<222> (817)..(817)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (935)..(935)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (966)..(967)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (978)..(978)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1030)..(1030)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1042)..(1043)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 351

tcgaacggga tccaggcagc ttgctgcctg gtgagagtgg cgaacgggtg agtaatgcgt

60

gaccgacctg ccccatacac cggaatagct cctggaaacg ggtggtaatg ccggatgctc

120

cgactcctcg catggggtgt cgggaaagat ttcatcggta tgggatgggg tcgcgtccta

180

tcaggtagtc ggcggggtaa cggcccaccg agcctacgac gggtagccgg cctgagaggg

240

cgaccggcca cattgggact gagatacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga

300

atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gcgacgccgc gtgcgggatg acggccttcg

360

ggttgtaaac cgcttttgat cgggagcaag ccttcgggtg agtgtacctt tcgaataagc

420

accggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gtgcaagcgt tatccggaat

480

tattgggcgt aaagggctcg taggcggttc gtcgcgtccg gtgtgaaagt ccatcgctta

540

acggtggatc tgcgccgggt acgggcgggc tggagtgcgg taggggagac tggaattccc

600

ggtgtaacgg tggaatgtgt agatatcggg aagaacacca atggcgaagg caggtctctg

660

ggccgttact gacgctgagg agcgaaagcg tggggagcga acaggattag ataccctggt

720

agtccacgcc gtaaacggtg gatgctggat gtggggcccg ttccacgggt tccgtgtcgg

780

agctaacgcg ttaagcatcc cgcctgggga gtacggncgc aaggctaaaa ctcaaagaaa

840

ttgacggggg cccgcacaag cggcggagca tgcggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac

900

cttacctggg cttgacatgt tcccgacagc cgtanagatg cggcctccct tcggggcggg

960

ttcacnntgg tgcatggncg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1020

acgagcgcan cctcgccctg tnngccagca c

1051

<210> 352

<211> 1539

<212> DNA

<213> Bifidobacterium dentium

<400> 352

ttttcgtgga gggttcgatt ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg ggatcccggg ggttcgcctc cgggtgagag tggcgaacgg gtgagtaatg

120

cgtgaccgac ctgccccata caccggaata gctcctggaa acgggtggta atgccggatg

180

ctccggttgg atgcatgtcc ttccgggaaa ggttccatcg gtatgggatg gggtcgcgtc

240

ctatcagctt gatggcgggg taacggccca ccatggcttc gacgggtagc cggcctgaga

300

gggcgaccgg ccacattggg actgagatac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg

360

ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat gcagcgacgc cgcgtgcggg atggaggcct

420

tcgggttgta aaccgctttt gatcgggagc aagcccttcg gggtgagtgt acccttcgaa

480

taagcaccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgca agcgttatcc

540

ggaattattg ggcgtaaagg gctcgtaggc ggttcgtcgc gtccggtgtg aaagcccatc

600

gcttaacggt gggtctgcgc cgggtacggg cgggctggag tgcggtaggg gagactggaa

660

ttcccggtgt aacggtggaa tgtgtagata tcgggaagaa caccaatggc gaaggcaggt

720

ctctgggccg tcactgacgc tgaggagcga aagcgtgggg agcgaacagg attagatacc

780

ctggtagtcc acgccgtaaa cggtggatgc tggatgtggg gcccgttcca cgggttccgt

840

gtcggagcta acgcgttaag catcccgcct ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa

900

agaaattgac gggggcccgc acaagcggcg gagcatgcgg attaattcga tgcaacgcga

960

agaaccttac ctgggcttga catgttcccg acggccgtag agatacggcc tcccttcggg

1020

gcgggttcac aggtggtgca tggtcgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaaccct cgccctgtgt tgccagcacg tcatggtggg aactcacggg

1140

ggaccgccgg ggtcaactcg gaggaaggtg gggatgacgt cagatcatca tgccccttac

1200

gtccagggct tcacgcatgc tacaatggcc ggtacagcgg gatgcgacat ggcgacatgg

1260

agcggatccc tgaaaaccgg tctcagttcg gattggagtc tgcaacccga ctccatgaag

1320

gcggagtcgc tagtaatcgc ggatcagcaa cgccgcggtg aatgcgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcaagtca tgaaagtggg cagcacccga agccggtggc ctaacccttc

1440

tgtgggatgg agccgtctaa ggtgaggctc gtgattggga ctaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtaccggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttctacgg

1539

<210> 353

<211> 1551

<212> DNA

<213> Bifidobacterium gallicum

<400> 353

tttttgtgga gggttcgatt ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg ggatccggcc gagcttgtct tggctggtga gagtggcgaa cgggtgagta

120

atgcgtgacc aacctgcctt gtgcaccgga atagctcctg gaaacgggtg gtaataccgg

180

atgttccgct ccatcgcatg gtggtgtggg aaatgctttt gcggcatggg atggggtcgc

240

gtcctatcag cttgttggcg gggtgacggc ccaccaaggc tttgacgggt agccggcctg

300

agagggtgac cggccacatt gggactgaga tacggcccag actcctacgg gaggcagcag

360

tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcga cgccgcgtgc gggatggagg

420

ccttcgggtt gtaaaccgct tttgattgtc agcaaggcgt cctttcgggg atgttgagtg

480

tagctttcga ataagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc

540

aagcgttatc cggaattatt gggcgtaaag ggctcgtagg cggttcgtcg cgtccggtgt

600

gaaagtccat cgcttaacgg tggatctgcg ccgggtacgg gcgggctgga gtgcggtagg

660

ggagactgga attcccggtg taacggtgga atgtgtagat atcgggaaga acaccaatgg

720

cgaaggcagg tctctgggcc gttactgacg ctgaggagcg aaagcgtggg gagcgaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acggtggatg ctggatgtgg ggcccttttt

840

ccgggtcctg tgtcggagct aacgcgttaa gcatcccgcc tggggagtac ggccgcaagg

900

ctaaaactca aagaaattga cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgcg gattaattcg

960

atgcaacgcg aagaacctta cctgggcttg acatgttccg gatcgcccca gagatggggt

1020

ttcccttcgg ggccggttca caggtggtgc atggtcgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc tcgccgcgtg ttgccagcgg gtcatgccgg

1140

gaactcacgt gggaccgccg gggtcaactc ggaggaaggt ggggatgacg tcagatcatc

1200

atgcccctta cgtccagggc ttcacgcatg ctacaatggc cggtacaacg ggatgcgaca

1260

ccgtgaggtg gggcggatcc ctgaaaaccg gtctcagttc ggatcgcagt ctgcaacccg

1320

actgcgtgaa ggcggagtcg ctagtaatcg cagatcagca acgctgcggt gaatgcgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcaagtc atgaaagtgg gtagcacccg aagccggtgg

1440

cccgaccgcc ttgtgtgggg ggagccgtct aaggtgagac tcgtgattgg gactaagtcg

1500

taacaaggta gccgtaccgg aaggtgcggc tggatcacct cctttctacg g

1551

<210> 354

<211> 1400

<212> DNA

<213> Bifidobacterium infantis

<400> 354

gattctggct caggatgaac gctggcggcg tgcttaacac atgcaagtcg aacgggatcc

60

atcaggcttt gcttggtggt gagagtggcg aacgggtgag taatgcgtga ccgacctgcc

120

ccatacaccg gaatagctcc tggaaacggg tggtaatgcc ggatgctcca gttgatcgca

180

tggtcttctg ggaaagcttt cgcggtatgg gatggggtcg cgtcctatca gcttgacggc

240

ggggtaacgg cccaccgtgg cttcgacggg tagccggcct gagagggcga ccggccacat

300

tgggactgag atacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg

360

ggcgcaagcc tgatgcagcg acgccgcgtg agggatggag gccttcgggt tgtaaacctc

420

ttttatcggg gagcaagcga gagtgagttt acccgttgaa taagcaccgg ctaactacgt

480

gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgca agcgttatcc ggaattattg ggcgtaaagg

540

gctcgtaggc ggttcgtcgc gtccggtgtg aaagtccatc gcttaacggt ggatccgcgc

600

cgggtacggg cgggcttgag tgcggtaggg gagactggaa ttcccggtgt aacggtggaa

660

tgtgtagata tcgggaagaa caccaatggc gaaggcaggt ctctgggccg ttactgacgc

720

tgaggagcga aagccgtggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa

780

acggtggatg ctggatgtgg ggcccgttcc acgggttccg tgtcggagct aacgcgttaa

840

gcatcccgcc tggggagtac ggccgcaagc taaaaactca aagaaattga cgggggcccg

900

cacaagcggc ggagcatgcg gattaattcg atcgaacgcg aagaacctta cctgggcttg

960

acatgttccc gacggtcgta gagatacggc ttcccttcgg ggcgggttca caggtggtgc

1020

atggtcgtcg tcacgtcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1080

tcgccccgtg ttgccagcgg attatgccgg gaactcacgg gggaccgccg gggttaactc

1140

ggaggaaggt ggggatgacg tcagatcatc atgcccctta cgtccagggc ttcacgcatg

1200

ctacaatggc cggtacaacg ggatgcgacg cggcgacgcg gagcggatcc ctgaaaaccg

1260

gtctcagttc ggatcgcagt ctgcaactcg actgcgtgaa ggcggagtcg ctagtaatcg

1320

cgaatcagca acgtcgcggt gaatgcgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcaagtc

1380

atgaaagtgg gtagcacccg

1400

<210> 355

<211> 1013

<212> DNA

<213> Bifidobacterium kashiwanohense

<220>

<221> modified_base

<222> (19)..(19)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (21)..(21)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (29)..(29)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (45)..(47)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (947)..(947)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 355

gcgggatgac gccttcggnt ntaaaccgnt ttgatcggga gcaannncgg gtgagtgtac

60

ctttcgaata agcaccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggtgcaag

120

cgttatccgg aattattggg cgtaaagggc tcgtaggcgg ttcgtcgcgt ccggtgtgaa

180

agtccatcgc ttaacggtgg atctgcgccg ggtacgggcg ggctggagtg cggtagggga

240

gactggaatt cccggtgtaa cggtggaatg tgtagatatc gggaagaaca ccaatggcga

300

aggcaggtct ctgggccgtt actgacgctg aggagcgaaa gcgtggggag cgaacaggat

360

tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg gtggatgctg gatgtggggc ccgttccacg

420

ggttccgtgt cggagctaac gcgttaagca tcccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta

480

aaactcaaag aaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga gcatgcggat taattcgatg

540

caacgcgaag aaccttacct gggcttgaca tgttcccgac cgctccagag atggggcttc

600

ccttcggggc gggttcacag gtggtgcatg gtcgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

660

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctcg ccctgtgttg ccagcacgtc atggtgggaa

720

ctcacggggg accgccgggg tcaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca gatcatcatg

780

ccccttacgt ccagggcttc acgcatgcta caatggccgg tacaacggga tgcgacacgg

840

cgacgtggag cggatccctg aaaaccggtc tcagttcgga ttggagtctg caacccgact

900

ccatgaaggc ggagtcgcta gtaatcgcgg atcagcaacg ccgcggngaa tgcgttcccg

960

ggccttgtac acaccgcccg tcaagtcatg aaagtgggta gcacccgaag ccg

1013

<210> 356

<211> 1346

<212> DNA

<213> Bifidobacterium longum

<400> 356

cttgcttggt ggtgagagtg gcgaacgggt gagtaatgcg tgaccgacct gccccataca

60

ccggaatagc tcctggaaac gggtggtaat gccggatgct ccagttgatc gcatggtctt

120

ctgggaaagc tttcgcggta tgggatgggg tcgcgtccta tcagcttgac ggcggggtaa

180

cggcccaccg tggcttcgac gggtagccgg cctgagaggg cgaccggcca cattgggact

240

gagatacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca atgggcgcaa

300

gcctgatgca gcgacgccgc gtgagggatg gaggccttcg ggttgtaaac ctcttttatc

360

ggggagcagc gagagtgagt ttacccgttg aataagcacc ggcaactacg tgccagcagc

420

cgcggtaata cgtaggtgca agcgttatcc ggaattattg ggcgtaaagg gctcgtaggc

480

ggttcgtcgc gtccggtgtg aaagtccatc gcttaacggt ggatccgcgc cgggtacggg

540

cgggcttgag tgcggtaggg gagactggaa ttcccggtgt aacggtggaa tgtgtagata

600

tcgggaagaa caccaatggc gaaggcaggt ctctgggccg ttactgacgc tgaggagcga

660

aagcgtgggg agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cggtggatgc

720

tggatgtggg gcccgttcca cgggttccgt gtcggagcta acgcgttaag catcccgcct

780

ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa agaaattgac gggggcccgc acaagcggcg

840

gagcatgcgg attaattcga tgcaacgcga agaatcatcg ctgggtctgc gccggttccg

900

ggcgggcttg agtgcgggag tgccgtctgg gatggctggt gtgaggtgca tgggcgtcgt

960

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct cgccccgtgt

1020

tgccagcgga ttatgccggg aactcacggg ggaccgccgg ggttaactcg gaggaaggtg

1080

gggatgacgt cagatcatca tgccccttac gtccagggct tcacgcatgc tacaatggcc

1140

ggtacaacgg gatgcgacgc ggcgacgcgg agcggatccc tgaaaaccgg tctcagttcg

1200

gatcgcagtc tgcaactcga ctgcgtgaag gcggagtcgc tagtaatcgc gaatcagcaa

1260

cgtcgcggtg aatgcgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagtca tgaaagtggg

1320

cagcacccga agccggtggc ctaacc

1346

<210> 357

<211> 1357

<212> DNA

<213> Bifidobacterium pseudocatenulatum

<400> 357

acgggatcca tcaggctttg cttggtggtg agagtggcga acgggtgagt aatgcgtgac

60

cgacctgccc catacaccgg aatagctcct ggaaacgggt ggtaatgccg gatgctccgg

120

cctgccgcat ggtgggctgg gaaagattgt atcggtatgg gatggggtcg cgtcctatca

180

ggtagtcggc ggggtaacgg cccaccgagc ctacgacggg tagccggcct gagagggcga

240

ccggccacat tgggactgag atacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata

300

ttgcacaatg ggcgcaagcc tgatgcagcg acgccgcgtg cgggatgacg gccttcgggt

360

tgtaaaccgc ttttgatcgg gagcaagcct tcggggagtg tacctttcaa taacaccggc

420

taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcaa gcgttatccg gaattattgg

480

gcgtaaaggg ctcgtaggcg gttcgtcgcg tccggtgtga aagtccatcg cttaacggtg

540

gatctgcgcc gggtacgggc gggctggagt gcggtagggg agactggaat tcccggtgta

600

acggtggaat gtgtagatat cgggaagaac accaatggcg aaggcaggtc tctgggccgt

660

tactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca

720

cgccgtaaac ggtggatgct ggatgtgggg cccgttccac gggttccgtg tcggagctaa

780

cgcgttaagc atcccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa gaaattgacg

840

ggggcccgca caagcggcgg atcatgcgga ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc

900

tgggcttgac atgttcccga ccgctccaga gatggggctt cccttcgggg aggctggaat

960

gccgggtgta gcggtggaat agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1020

cgcaaccctc gccctgtgtt gccagcacgt catggtggga actcacgggg gaccgccggg

1080

gtcaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc agatcatcat gccccttacg tccagggctt

1140

cacgcatgct acaatggccg gtacaacggg atgcgacacg gcgacgtgga gcggatccct

1200

gaaaaccggt ctcagttcgg attggagtct gcaacccgac tccatgaagg cggagtcgct

1260

agtaatcgcg gatcagcaac gccgcggtga atgcgttccc gggccttgta cacaccgccc

1320

gtcaagtcat gaaagtgggt agcacccgaa gccggtg

1357

<210> 358

<211> 1527

<212> DNA

<213> Bifidobacterium pseudolongum

<220>

<221> modified_base

<222> (1526)..(1526)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 358

ttcgattctg gctcaggatg aacgctggcg gcgtgcttaa cacatgcaag tcgaacggga

60

tccctggcag cttgctgccg gggtgagagt ggcgaacggg tgagtaatgc gtgaccgacc

120

tgccccatgc accggaatag ctcctggaaa cgggtggtaa tgccggatgt tccacatgag

180

cgcatgcgag tgtgggaaag gcttttgcgg catgggatgg ggtcgcgtcc tatcagcttg

240

ttggtggggt aacggcctac caaggcgttg acgggtagcc ggcctgagag ggcgaccggc

300

cacattggga ctgagatacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca

360

caatgggcgc aagcctgatg cagcgacgcc gcgtgcggga tggaggcctt cgggttgtaa

420

accgcttttg ttcaagggca aggcacggtt tcggccgtgt tgagtggatt gttcgaataa

480

gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggtgcaagc gttatccgga

540

tttattgggc gtaaagggct cgtaggcggt tcgtcgcgtc cggtgtgaaa gtccatcgct

600

taacggtgga tccgcgccgg gtacgggcgg gcttgagtgc ggtaggggag actggaattc

660

ccggtgtaac ggtggaatgt gtagatatcg ggaagaacac caatggcgaa ggcaggtctc

720

tgggccgtta ctgacgctga ggagcgaaag cgtggggagc gaacaggatt agataccctg

780

gtagtccacg ccgtaaacgg tggatgctgg atgtggggcc ctttttccgg gtcctgtgtc

840

ggagctaacg cgttaagcat cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaaga

900

aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag catgcggatt aattcgatgc aacgcgaaga

960

accttacctg ggcttgacat gtgcctgacg atcccggaga cggggtttcc cttcggggcg

1020

ggttcacagg tggtgcatgg tcgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1080

gcaacgagcg caaccctcgc cgcgtgttgc cagcgggtca tgccgggaac tcacgtggga

1140

ccgccggggt taactcggag gaaggtgggg atgacgtcag atcatcatgc cccttacgtc

1200

cagggcttca cgcatgctac aatggccggt acaacggggt gcgacacggt gacgtggggc

1260

ggatccctga aaaccggtct cagttcggat cgcagtctgc aactcgactg cgtgaaggtg

1320

gagtcgctag taatcgcgga tcagcaacgc cgcggtgaat gcgttcccgg gccttgtaca

1380

caccgcccgt caagtcatga aagtgggcag cacccgaaga cggtggccta acccttgtgg

1440

ggggagccgt ctaaggtgag gctcgtgatt gggactaagt cgtaacaagg tagccgtacc

1500

ggaaggtgcg gctggatcac ctcctna

1527

<210> 359

<211> 1380

<212> DNA

<213> Bifidobacterium scardovii

<400> 359

gaacgctggc ggcgtgctta acacatgcaa gtcgaacggg atccggccag cttgctggtt

60

ggtgagagtg gcgaacgggt gagtaatgcg tgaccgacct gccccatgct ccggaatagc

120

tcctggaaac gggtggtaat gccggatggt ccagcatgct gcatggcgtg ttgggaaaga

180

tttatcggcg tgggatgggg tcgcgtccta tcagcttgac ggtggggtga tggcctaccg

240

tggcttcgac gggtagccgg cctgagaggg cgaccggcca cattgggact gagatacggc

300

ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca

360

gcgacgccgc gtgagggatg gaggccttcg ggttgtaaac ctcttttagc agggagcaag

420

gcttcggttg agtgtacctg ttgaataagc accggctaac tacgtgccag cagccgcggt

480

aatacgtagg gtgcaagcgt tatccggaat tattgggcgt aaagggctcg taggcggttc

540

gtcgcgtctg gtgtgaaagt ccatcgctta acggtggatc tgcgccgggt acgggcgggc

600

tggagtgcgg taggggagac tggaattccc ggtgtaacgg tggaatgtgt agatatcggg

660

aagaacacca atggcgaagg caggtctctg ggccgttact gacgctgagg agcgaaagcg

720

tggggagcga acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacggtg gacgctggat

780

gtggggccca ttccacgggt tccgtgtcgg agctaacgcg ttaagcgtcc cgcctgggga

840

gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaagaaa ttgacggggg cccgcacaag cggcggagca

900

tgcggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggg cttgacatgt tcccgacggc

960

cccagagatg gggcttccct tcggggcggg ttcacaggtg gtgcatggtc gtcgtcagct

1020

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca accctcgccc cgtgttgcca

1080

gcattttgga tgggaactca cgggggaccg ccggggttaa ctcggaggaa ggtggggatg

1140

acgtcagatc atcatgcccc tacgtccagg gcttcacgca tgctacaatg gccggtacaa

1200

cgggatgcga catggcgaca tggagcggat ccctgaaaac cggtctcagt tcggattgga

1260

gtctgcaacc cgactccatg aaggcggagt cgctagtaat cgcgaatcag caacgtcgcg

1320

gtgaatgcgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaag tcatgaaagt gggcagcacc

1380

<210> 360

<211> 1363

<212> DNA

<213> Bifidobacterium sp. HM2

<400> 360

gggttcgatt ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcgaac gggtgagtaa tgcgtgaccg acctgcccca tgcaccggaa tagctcctgg

120

aaacgggtgg taatgccgga tgctgaaagg cggcatggga tggggtcgcg tcctatcagc

180

ttgatggcgg ggtaacggcc caccatggct tcgacgggta gccggcctga gagggcgacc

240

ggccacattg ggactgagat acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

300

gcacaatggg cgcaagcctg atgcagcgac gccgcgtgcg ggatgacggc cttcgggttg

360

taaaccgctt ttgatcggga gcatgagtgt acctttcgaa taagcaccgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgca agcgttatcc ggaattattg ggcgtaaagg

480

gctcgtaggc ggttcgtcgc gtccggtgtg aaagtccatc gcttaacggt ggatctgcgc

540

cgggtacggg cgggctggag tgcggtaggg gagactggaa ttcccggtgt aacggtggaa

600

tgtgtagata tcgggaagaa caccaatggc gaaggcaggt ctctgggccg actgacgctg

660

aggagcgaaa gcgtggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

gtggatgctg gatgtggggc gttccgtgtc ggagctaacg cgttaagcat cccgcctggg

780

gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaaga aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag

840

catgcggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg ggcttgacat gcacaggtgg

900

tgcatggtcg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

ccctcgccct gtgttgccag cacgtgggaa ctcacggggg accgccgggg tcaactcgga

1020

ggaaggtggg gatgacgtca gatcatcatg ccccttacgt ccagggcttc acgcatgcta

1080

caatggccgg caacgggatg cgacacggcg acgtggagcg gatccctgcc ggtctcagtt

1140

cggatggagt ctgcaacccg actccagaag gcggagtcgc tagtaatcgc ggatcagcaa

1200

cgccgcggtg aatgcgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagtca tgaaagtggg

1260

tagcacccga agccggtgcc tatggagccg tctaaggtga gactcgtgat tgggactaag

1320

tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc ggctggatca cct

1363

<210> 361

<211> 1245

<212> DNA

<213> Bifidobacterium sp. HMLN12

<220>

<221> modified_base

<222> (28)..(28)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (792)..(792)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1210)..(1210)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1217)..(1217)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1219)..(1219)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1228)..(1228)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1240)..(1241)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 361

aacgggagag gatgcgtgac cgacctgncc catgcaccgg aatagctcct ggaaacgggt

60

ggtaatgccg gatgttccac atgagcgcat gcgagtgtgg gaaaggcttt tgcggcatgg

120

gatggggtcg cgtcctatca gcttgttggt ggggtaacgg cctaccaagg cgttgacggg

180

tagccggcct gagagggcga ccggccacat tgggactgag atacggccca gactcctacg

240

ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggcgcaagcc tgatgcagcg acgccgcgtg

300

cgggatggag gccttcgggt tgtaaaccgc ttttgttcaa gggcaaggca cggtttcggc

360

cgtgttgagt ggattgttcg aataagcacc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

420

acgtagggtg caagcgttat ccggatttat tgggcgtaaa gggctcgtag gcggttcgtc

480

gcgtccggtg tgaaagtcca tcgcttaacg gtggatccgc gccgggtacg ggcgggcttg

540

agtgcggtag gggagactgg aattcccggt gtaacggtgg aatgtgtaga tatcgggaag

600

aacaccaatg gcgaaggcag gtctctgggc cgttactgac gctgaggagc gaaagcgtgg

660

gaagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacggtggat gctggatgtg

720

gggccctttt tccgggtcct gtgtcggagc taacgcgtta agcatcccgc ctggggagta

780

cggccgcaag gntaaaactc aaagaaattg acgggggccc gcacaagcgg cggagcatgc

840

ggattaattc gatgcaacgc gaagaacctt acctgggctt gacatgtgcc tgacgatccc

900

ggagacgggg tttcccttcg gggcgggttc acaggtggtg catggtcgtc agctcgtgtc

960

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc gccgcgtgtt gccagcgggt

1020

catgccggga actcacgtgg gaccgccggg gttaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1080

agatcatcat gccccttacg tccagggctt cacgcatgct acaatggccg gtacaacggg

1140

gtgcgacacg gtgacgtggg gcggatccct gaaaaccggt ctcagttcgg atcgcagtct

1200

gcaactcgan tgctaangng cggagtcnct agtaatcgcn natca

1245

<210> 362

<211> 1405

<212> DNA

<213> Bifidobacterium sp. M45

<220>

<221> modified_base

<222> (1215)..(1215)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 362

gcttaccatg cagtcgaacg ggatcccagg agcttgctcc tgggtgagag tggcgaacgg

60

gtgagtaatg cgtgaccgac ctgccccata caccggaata gctcctggaa acgggtggta

120

atgccggatg ctccagttga atgcatgtcc ttctgggaaa gattttgcgg tatgggatgg

180

ggtcgcgtcc tatcagcttg atggcggggt aacggcccac catggcttcc acgggtagcc

240

ggcctgagag ggcgaccggc cacattggga ctgaaatacg gcccagactc ctacgggagg

300

cagcagtggg gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagcgacgcc gcgtgcggga

360

tgacggcctt cgggttgtaa accgcttttg actgggagca agcccttcgg ggtgagtgta

420

cctttcgaat aagcaccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcaa

480

gcgttatccg gaattattgg gcgtaaaggg ctcgtaagcg gttcgtcgcg tccggtgtga

540

aagtccatcg cttaacggtg gatccgcgcc gggtacgggc gggcttgagt gcggtagggg

600

agactggaat tcccggtgta acggtggaat gtgtagatat cgggaagaac accaatggcg

660

aaggcaggtc tctgggccgt cactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga gcgaacagga

720

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac ggtggatgct ggatgtgggg accattccac

780

ggtctccgtg tcggagccaa cgcgttaagc atcccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct

840

aaaactcaaa gaaattgacg ggggcccgca caagcggcgg agcatgcgga ttaattcgat

900

gcaacgcgaa gaaccttacc tgggcttgac atgttcccga cagccccaga gatggggcct

960

cccttcgggg cgggttcaca ggtggtgcat ggtcgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

1020

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc gccctgtgtt gccagcacgt cgtggtggga

1080

actcacgggg gaccgccggg gtcaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc agatcatcat

1140

gccccttacg tccagggctt cacgcatgct acaatggccg gtacaacggg atgcgacact

1200

gtgaggtgga gcggntccct taaaaccggt ctcagttcgg attggagtct gcaacccgac

1260

tccatgaagg cggagtcgct agtaatcgcg gatcagcaac gccgcggtga atgcgttccc

1320

gggccttgta cacaccgccc gtcaagtcat gaaagtgggt agcacccgaa gccggtggcc

1380

caaccttttg ggggagccgt ctaag

1405

<210> 363

<211> 1267

<212> DNA

<213> Bifidobacterium sp. MSX5B

<400> 363

gctggcggcg tgcttaacac atgcaagtcg aacgagtggc gaacgggtga gtaatgcgtg

60

accgacctgc cccatacacc ggaatagctc ctggaaacgg gtggtaatgc cggatgctga

120

aagtcggtat gggatggggt cgcgtcctat cagcttgatg gcggggtaac ggcccaccat

180

ggcttcgacg ggtagccggc ctgagagggc gaccggccac attgggactg agatacggcc

240

cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag

300

cgacgccgcg tgcgggatga aggccttcgg gttgtaaacc gcttttgatc gggagcatga

360

gtgtaccctt cgaataagca ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg

420

tgcaagcgtt atccggaatt attgggcgta aagggctcgt aggcggttcg tcgcgtccgg

480

tgtgaaagcc catcgcttaa cggtgggtct gcgccgggta cgggcgggct ggagtgcggt

540

aggggagact ggaattcccg gtgtaacggt ggaatgtgta gatatcggga agaacaccaa

600

tggcgaaggc aggtctctgg gccgactgac gctgaggagc gaaagcgtgg ggagcgaaca

660

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacggtggat gctggatgtg gggcgttccg

720

tgtcggagct aacgcgttaa gcatcccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca

780

aagaaattga cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgcg gattaattcg atgcaacgcg

840

aagaacctta cctgggcttg acatgcacag gtggtgcatg gtcgtcgtca gctcgtgtcg

900

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctcg ccctgtgttg ccagcacgtg

960

ggaactcacg ggggaccgcc ggggtcaact cggaggaagg tggggatgac gtcagatcat

1020

catgcccctt acgtccaggg cttcacgcat gctacaatgg ccggcagcgg gatgcgacat

1080

ggcgacatgg agcggatccc tgccggtctc agttcggatg gagtctgcaa cccgactcca

1140

gaaggcggag tcgctagtaa tcgcggatca gcaacgccgc ggtgaatgcg ttcccgggcc

1200

ttgtacacac cgcccgtcaa gtcatgaaag tgggcagcac ccgaagccgg tgcctatgga

1260

gccgtct

1267

<210> 364

<211> 1303

<212> DNA

<213> Bifidobacterium sp. TM-7

<400> 364

tggctcagga tgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca agtcgaacga gtggcgaacg

60

ggtgagtaat gcgtgaccga cctgccccat acaccggaat agctcctgga aacgggtggt

120

aatgccggat gctgaaagtc ggtatgggat ggggtcgcgt cctatcagct tgatggcggg

180

gtaacggccc accatggctt cgacgggtag ccggcctgag agggcgaccg gccacattgg

240

gactgagata cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc

300

gcaagcctga tgcagcgacg ccgcgtgcgg gatgacggcc ttcgggttgt aaaccgcttt

360

tgactgggag catgagtgta cctttcgaat aagcaccggc taactacgtg ccagcagccg

420

cggtaatacg tagggtgcaa gcgttatccg gaattattgg gcgtaaaggg ctcgtaggcg

480

gttcgtcgcg tccggtgtga aagtccatcg cttaacggtg gatccgcgcc gggtacgggc

540

gggcttgagt gcggtagggg agactggaat tcccggtgta acggtggaat gtgtagatat

600

cgggaagaac accaatggcg aaggcaggtc tctgggccga ctgacgctga ggagcgaaag

660

cgtggggagc gaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacgg tggatgctgg

720

atgtggggat ctccgtgtcg gagccaacgc gttaagcatc ccgcctgggg agtacggccg

780

caaggctaaa actcaaagaa attgacgggg gcccgcacaa gcggcggagc atgcggatta

840

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg gcttgacatg cacaggtggt gcatggtcgt

900

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac cctcgccctg

960

tgttgccagc acgtgggaac tcacggggga ccgccggggt caactcggag gaaggtgggg

1020

atgacgtcag atcatcatgc cccttacgtc cagggcttca cgcatgctac aatggccggc

1080

aacgggatgc gacactgtga ggtggagcgg atcccttccg gtctcagttc ggatggagtc

1140

tgcaacccga ctccagaagg cggagtcgct agtaatcgcg gatcagcaac gccgcggtga

1200

atgcgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcaagtcat gaaagtgggt agcacccgaa

1260

gccggtgccc agggagccgt ctaaggtgag actcgtgatt ggg

1303

<210> 365

<211> 1392

<212> DNA

<213> Bifidobacterium thermophilum

<400> 365

tggctcagga tgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca agtcgaacgg gatcctgcaa

60

gcttgcttgc gggtgagagt ggcgaacggg tgagtaatgc gtgaccaacc tgccccatgc

120

tccggaatag ctcctggaaa cgggtggtaa tgccggatgt gccgggctcc tgcatggggg

180

tccgggaaag ctctggcggc gtgggatggg gtcgcgtcct atcagcttgt tggcggggtg

240

agggcccacc aaggcttcga cgggtagccg gcctgagagg gcgaccggcc acattgggac

300

tgagatacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatgggcgca

360

agcctgatgc agcgacgccg cgtgcgggat ggaggccttc gggttgtaaa ccgcttttgt

420

ttgggagcaa gcccttcggg gtgagtgtac ctttcgaata agcaccggct aactacgtgc

480

cagcagccgc ggtaatacgt agggtgcgag cgttatccgg atttattggg cgtaaagggc

540

tcgtaggcgg ttcgtcgcgt ccggtgtgaa agtccatcgc ctaacggtgg atctgcgccg

600

ggtacgggcg ggctggagtg cggtagggga gactggaatt cccggtgtaa cggtggaatg

660

tgtagatatc gggaagaaca ccaatggcga aggcaggtct ctgggccgtt actgacgctg

720

aggagcgaaa gcgtggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

780

gtggatgctg gatgtggggc ccttccacgg gtcccgtgtc ggagccaacg cgttaagcat

840

cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaaga aattgacggg ggcccgcaca

900

agcggcggag catgcggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg ggcttgacat

960

gttcccgacg acggcggaga cgtcgtttcc cttcggggcg ggttcacagg tggtgcatgg

1020

tcgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gtcaagtccc gcaacgagcg caaccctcgc

1080

cccgtgttgc cagcgcgtca tggcgggaac tcacggggga ccgccggggt taacccggga

1140

ggaaggtggg gatgacgtca gatcatcatg ccccttacgt ccagggcttc acgcatgcta

1200

caatggccgg tacaacggga tgcgacatgg cgacatggag cggatccctg aaaaccggtc

1260

tcagttcgga tcggagcctg caacccggct ccgtgaaggc ggagtcgcta gtaatcgcgg

1320

atcagcaacg ccgcggtgaa tgcgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcaagtcatg

1380

aaagtgggca gc

1392

<210> 366

<211> 1412

<212> DNA

<213> Bifidobacterium urinalis

<400> 366

ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg ggatcctttc

60

aagcttgcta ggggggtgag agtggcgaac gggtgagtaa cgcgtgatta acctgccgtg

120

tagtttggaa tagctcctgg aaacgggtgg taatgccgaa tgttccacat gctcgcatgg

180

gtgtgtggga aaacgtttta gtgctatgcg atgggatcgc gtcctatcag cttgttggtg

240

gggtagtggc ctaccaaggc ttcgacgggt agccggcctg agagggcgac cggccacatt

300

gggactgaga tacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg

360

ggggaaccct gatgcagcga cgccgcgtgc gggatgacgg ccttcgggtt gtaaaccgct

420

tttattgggg agcaagcgtg agtgagtgta ccttttgaat aagcaccggc taactacgtg

480

ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcaa gcgttgtccg gaattattgg gcgtaaagag

540

ctcgtaggcg gtttgtcgcg tctggtgtga aagtccatcg cttaacggtg gattggcgct

600

tggtacgggc aggctagagt gtagtagggg agactggaat tctcggtgta acggtggaat

660

gtgtagatat cgggaagaac accaatggcg aaggcaggtc tctgggctat tactgacgct

720

gaggagcgaa agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc tggtaatcca cgccgtaaac

780

ggtggatgct ggatgtgggg ccctttccac gggttctgtg tcggagctaa cgcgttaagc

840

atcccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa gaaattgacg ggggcccgca

900

caagcggcgg agcatgcgga ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc aagacttgac

960

atgttaacga tggcctcaga gatggggtgt ctcttcggag cgttttcaca ggtggtgcat

1020

ggtcgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt

1080

gtcttgtgtt gccagcacgt tatggtggga actcacaaga gaccgccggg gttaactcgg

1140

aggaaggtgg ggatgacgtc agatcatcat gccccttacg tcttgggctt cacgcatgct

1200

acaatggccg gtacagcgag gtgcgatagg gtgacctgga gcggatctct gaaaaccggt

1260

ctcagttcgg atcggagcct gcaactcggc tccgtgaagg tggagtcgct agtaatcgca

1320

gatcagcaac gctgcggtga atgcgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcaagtcat

1380

gaaagtgggc agcacccgaa gccggtggcc ta

1412

<210> 367

<211> 1551

<212> DNA

<213> Bilophila wadsworthia

<400> 367

tcaactggag agtttgattc tggctcagat tgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca

60

agtcgaacgt gaaagtcctt cggggcgagt aaagtggcgc acgggtgagt aacgcgtgga

120

taatctaccc ttaagatggg gataacggct ggaaacggtc gctaataccg aatacgctcc

180

cgattttatc gttgggggga aagatggcct ctgcttgcaa gctatcgctt aaggatgagt

240

ccgcgtccca ttagctagtt ggcggggtaa cggcccacca aggcgacgat gggtagccgg

300

tctgagagga tgaccggcca cactggaact ggaacacggt ccagactcct acgggaggca

360

gcagtgggga atattgcgca atgggcgaaa gcctgacgca gcgacgccgc gtgagggatg

420

aaggttctcg gatcgtaaac ctctgtcagg ggggaagaaa ccccctcgtg tgaataatgc

480

gagggcttga cggtaccccc aaaggaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta

540

atacggaggg tgcaagcgtt aatcggaatc actgggcgta aagcgcacgt aggcggcttg

600

gtaagtcagg ggtgaaatcc cacagcccaa ctgtggaact gcctttgata ctgccaggct

660

tgagtaccgg agagggtggc ggaattccag gtgtaggagt gaaatccgta gatatctgga

720

ggaacaccgg tggcgaaggc ggccacctgg acggtaactg acgctgaggt gcgaaagcgt

780

gggtagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgg gtgctgggtg

840

ctgggatgta tgtctcggtg ccgtagctaa cgcgataagc accccgcctg gggagtacgg

900

tcgcaaggct gaaactcaaa gaaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agtatgtggt

960

ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc caggcttgac atctagggaa cccttcggaa

1020

atgaaggggt gcccttcggg gagccctaag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt

1080

gccgtgaggt gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctatcttca gttgccagca

1140

ggtaaggctg ggcactctgg agagaccgcc ccggtcaacg gggaggaagg tggggacgac

1200

gtcaagtcat catggccctt acgcctgggg ctacacacgt actacaatgg cgcgcacaaa

1260

gggtagcgag accgcgaggt ggagccaatc ccaaaaaacg cgtcccagtc cggattggag

1320

tctgcaactc gactccatga agtcggaatc gctagtaatt cgagatcagc atgctcgggt

1380

gaatgcgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acgaaagtcg gttttacccg

1440

aagccggtga gctaactcgc aagaggagca gccgtctacg gtagggccga tgattggggt

1500

gaagtcgtaa caaggtagcc gtaggggaac ctgcggctgg atcacctcct t

1551

<210> 368

<211> 1296

<212> DNA

<213> Bisgaard Taxon

<400> 368

attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgga cgggtgagta

60

atgcttggga atctggctta tggaggggga taactgcggg aaactgcagc taataccgcg

120

tattgaaagc tgccataaga tgagcccaag tgggattagg tagttggtgg ggtaaaggcc

180

taccaagccg acgatctcta gctggtctga gaggatgacc agccacactg ggactgagac

240

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcgcaatggg ggaaaccctg

300

acgcagccat gccgcgtgaa tgaagaaggc cttcgggttg taaagttctt tcggtaatga

360

ggatgacgtt aattacagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac

420

ggagggtgcg agcgttaatc ggaataactg ggcgtaaagg gcccgcaggc ggacttttaa

480

gtgagatgtg aaatccctgg gcttaaccta ggaactgcat ttcagactgg gagtctagag

540

tactttaggg aggggtagaa ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa

600

taccgaaggc gaaggcagcc ccttgggaat actgacgctc atgtgcgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg ctgtcgattt ggggattggg

720

cttggtgccc gaagctaacg tgataaatcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

780

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

840

aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat cgacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgttgtgaa atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcct ttgttgccag

960

cgatcgggaa ctcaaaggag actgccagtg acaaactgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

agtcatcatg gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggtgca cagagggcgg

1080

cgagacggcg acgttgagcg aatctcagtg catctaagtc cggatggagt ctgcaactcg

1140

actccagaag tcggaatcgc tagtaatcgc aaatcagaat gttgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tgtaccagaa gtagatgctt

1260

agggcgttta ccacggtatg attcatgact ggggtg

1296

<210> 369

<211> 1296

<212> DNA

<213> Bisgaard Taxon

<400> 369

attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgga cgggtgagta

60

atgcttggga atctggctta tggaggggga taactgcggg aaactgcagc taataccgcg

120

tattgaaagc tgccataaga tgagcccaag tgggattagg tagttggtgg ggtaaaggcc

180

taccaagccg acgatctcta gctggtctga gaggatgacc agccacactg ggactgagac

240

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcgcaatggg ggaaaccctg

300

acgcagccat gccgcgtgaa tgaagaaggc cttcgggttg taaagttctt tcggtaatga

360

ggatgacgtt aattacagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac

420

ggagggtgcg agcgttaatc ggaataactg ggcgtaaagg gcccgcaggc ggacttttaa

480

gtgagatgtg aaatccctgg gcttaaccta ggaactgcat ttcagactgg gagtctagag

540

tactttaggg aggggtagaa ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa

600

taccgaaggc gaaggcagcc ccttgggaat actgacgctc atgtgcgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg ctgtcgattt ggggattggg

720

cttggtgccc gaagctaacg tgataaatcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

780

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

840

aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat cgacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgttgtgaa atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcct ttgttgccag

960

cgatcgggaa ctcaaaggag actgccagtg acaaactgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

agtcatcatg gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggtgca cagagggcgg

1080

cgagacggcg acgttgagcg aatctcagtg catctaagtc cggatggagt ctgcaactcg

1140

actccagaag tcggaatcgc tagtaatcgc aaatcagaat gttgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tgtaccagaa gtagatgctt

1260

agggcgttta ccacggtatg attcatgact ggggtg

1296

<210> 370

<211> 1296

<212> DNA

<213> Bisgaard Taxon

<400> 370

attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgga cgggtgagta

60

atgcttggga atctggctta tggaggggga taactgcggg aaactgcagc taataccgcg

120

tattgaaagc tgccataaga tgagcccaag tgggattagg tagttggtgg ggtaaaggcc

180

taccaagccg acgatctcta gctggtctga gaggatgacc agccacactg ggactgagac

240

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcgcaatggg ggaaaccctg

300

acgcagccat gccgcgtgaa tgaagaaggc cttcgggttg taaagttctt tcggtaatga

360

ggatgacgtt aattacagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac

420

ggagggtgcg agcgttaatc ggaataactg ggcgtaaagg gcccgcaggc ggacttttaa

480

gtgagatgtg aaatccctgg gcttaaccta ggaactgcat ttcagactgg gagtctagag

540

tactttaggg aggggtagaa ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa

600

taccgaaggc gaaggcagcc ccttgggaat actgacgctc atgtgcgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg ctgtcgattt ggggattggg

720

cttggtgccc gaagctaacg tgataaatcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

780

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

840

aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat cgacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgttgtgaa atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcct ttgttgccag

960

cgatcgggaa ctcaaaggag actgccagtg acaaactgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

agtcatcatg gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggtgca cagagggcgg

1080

cgagacggcg acgttgagcg aatctcagtg catctaagtc cggatggagt ctgcaactcg

1140

actccagaag tcggaatcgc tagtaatcgc aaatcagaat gttgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tgtaccagaa gtagatgctt

1260

agggcgttta ccacggtatg attcatgact ggggtg

1296

<210> 371

<211> 1296

<212> DNA

<213> Bisgaard Taxon

<400> 371

attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgga cgggtgagta

60

atgcttggga atctggctta tggaggggga taactgcggg aaactgcagc taataccgcg

120

tattgaaagc tgccataaga tgagcccaag tgggattagg tagttggtgg ggtaaaggcc

180

taccaagccg acgatctcta gctggtctga gaggatgacc agccacactg ggactgagac

240

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcgcaatggg ggaaaccctg

300

acgcagccat gccgcgtgaa tgaagaaggc cttcgggttg taaagttctt tcggtaatga

360

ggatgacgtt aattacagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac

420

ggagggtgcg agcgttaatc ggaataactg ggcgtaaagg gcccgcaggc ggacttttaa

480

gtgagatgtg aaatccctgg gcttaaccta ggaactgcat ttcagactgg gagtctagag

540

tactttaggg aggggtagaa ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa

600

taccgaaggc gaaggcagcc ccttgggaat actgacgctc atgtgcgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg ctgtcgattt ggggattggg

720

cttggtgccc gaagctaacg tgataaatcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

780

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

840

aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat cgacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgttgtgaa atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcct ttgttgccag

960

cgatcgggaa ctcaaaggag actgccagtg acaaactgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

agtcatcatg gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggtgca cagagggcgg

1080

cgagacggcg acgttgagcg aatctcagtg catctaagtc cggatggagt ctgcaactcg

1140

actccagaag tcggaatcgc tagtaatcgc aaatcagaat gttgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tgtaccagaa gtagatgctt

1260

agggcgttta ccacggtatg attcatgact ggggtg

1296

<210> 372

<211> 1477

<212> DNA

<213> Blastomonas natatoria

<400> 372

agagtttgat cctggctcag aacgaacgct ggcggcatgc ctaacacatg caagtcgaac

60

gaaggcttcg gccttagtgg cgcacgggtg cgtaacgcgt gggaatctgc ccttgggttc

120

ggaataacag tgagaaatta ctgctaatac cggatgatga cttcggtcca aagatttatc

180

gcccaaggat gagcccgcgt aagattagct agttggtgag gtaaaggctc accaaggcga

240

cgatctttag ctggtctgag aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac

300

tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggc gaaagcctga tccagcaatg

360

ccgcgtgagt gatgaaggcc ttagggttgt aaagctcttt taccagggat gataatgaca

420

gtacctggag aataagctcc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggag

480

ctagcgttgt tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgtag gcggccattc aagtcagagg

540

tgaaagcccg gggctcaacc ccggaactgc ctttgaaact agatggcttg aatcttggag

600

aggcgagtgg aattccgagt gtagaggtga aattcgtaga tattcggaag aacaccagtg

660

gcgaaggcga ctcgctggac aagtattgac gctgaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca

720

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgata actagctgtc cgggttcatg

780

gaacttgggt ggcgcagcta acgcattaag ttatccgcct ggggagtacg gtcgcaagat

840

taaaactcaa aggaattgac gggggcctgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga

900

agcaacgcgc agaaccttac cagcgtttga catgtctagt atgtttccca gagatgggtt

960

acttcagttc ggctggctag aacacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga

1020

gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca accctcgtct ttagttgcca tcatttagtt

1080

gggcactcta aagaaaccgc cggtgataag ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtcc

1140

tcatggccct tacacgctgg gctacacacg tgctacaatg gcggtgacag tgagcagcta

1200

gatcgcgaga tcatgctaat ctcaaaaagc cgtctcagtt cggattgttc tctgcaactc

1260

gagagcatga aggcggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc

1320

ccaggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg gattcacccg aaggcgctgc

1380

gctaacccgc aagggaggca ggcgaccacg gtgggttcag cgactggggt gaagtcgtaa

1440

caaggtagcc gtaggggaac ctgcggctgg atcacct

1477

<210> 373

<211> 1493

<212> DNA

<213> Blautia coccoides

<400> 373

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgagc

60

gaagcgctaa gacagatttc ttcggattga agtctttgtg actgagcggc ggacgggtga

120

gtaacgcgtg ggtaacctgc ctcatacagg gggataacag ttagaaatga ctgctaatac

180

cgcataagcg cacaggaccg catggtctgg tgtgaaaaac tccggtggta tgagatggac

240

ccgcgtctga ttagctagtt ggaggggtaa cggcccacca aggcgacgat cagtagccgg

300

cctgagaggg tgaacggcca cattgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

360

gcagtgggga atattgcaca atgggggaaa ccctgatgca gcgacgccgc gtgaaggaag

420

aagtatctcg gtatgtaaac ttctatcagc agggaagaaa atgacggtac ctgactaaga

480

agccccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggggcaag cgttatccgg

540

atttactggg tgtaaaggga gcgtagacgg aagagcaagt ctgatgtgaa aggctggggc

600

ttaaccccag gactgcattg gaaactgttg ttctagagtg ccggagaggt aagcggaatt

660

cctagtgtag cggtgaaatg cgtagatatt aggaggaaca ccagtggcga aggcggctta

720

ctggacggta actgacgttg aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct

780

ggtagtccac gccgtaaacg atgaatacta ggtgtcgggt ggcaaagcca ttcggtgccg

840

cagcaaacgc aataagtatt ccacctgggg agtacgttcg caagaatgaa actcaaagga

900

attgacgggg acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa

960

ccttaccaag tcttgacatc cctctgaccg tcccgtaacg ggggcttccc ttcggggcag

1020

aggagacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1080

gcaacgagcg caacccttat ccttagtagc cagcacatga tggtgggcac tctagggaga

1140

ctgccgggga taacccggag gaaggcgggg acgacgtcaa atcatcatgc cccttatgat

1200

ttgggctaca cacgtgctac aatggcgtaa acaaagggaa gcgagacagc gatgttgagc

1260

gaatcccaaa aataacgtcc cagttcggac tgcagtctgc aactcgactg cacgaagctg

1320

gaatcgctag taatcgcgga tcagaatgcc gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac

1380

accgcccgtc acaccatggg agtcagtaac gcccgaagtc agtgacctaa ccgaaaggaa

1440

ggagctgccg aaggcgggac cgataactgg ggtgaagtcg taacaaggta acc

1493

<210> 374

<211> 1362

<212> DNA

<213> Blautia glucerasea

<220>

<221> modified_base

<222> (944)..(944)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 374

tggaagcttc ggtggaaata gcttgttcct agtggcggac gggtgagtaa cgcgtgggta

60

acctgcctca cactggggga taacagtcag aaatgactgc taataccgca taagcgcacg

120

ggattgcatg atccagtgtg aaaaactccg gtggtgtgag atggacccgc gttggattag

180

ccagttggca gggtaacggc ctaccaaagc gacgatccat agccggcctg agagggtgga

240

cggccacatt gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

300

tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga aggaagaagt atctcggtat

360

gtaaacttct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctga ctaagaagcc ccggctaact

420

acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg ggcaagcgtt atccggattt actgggtgta

480

aagggagcgt agacggagca gcaagtctga tgtgaaaggc aggggctcaa cccctggact

540

gcattggaaa ctgttgatct tgagtaccgg agaggtaagc ggaattccta gtgtagcggt

600

gaaatgcgta gatattagga ggaacaccag tggcgaaggc ggcttactgg acggtaactg

660

acgttgaggc tcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg

720

taaacgatga atactaggtg tcgggtgcag agccattcgg tgccgcagca aacgcagtaa

780

gtattccacc tggggagtac gttcgcaaga atgaaactca aaggaattga cggggacccg

840

cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaagtcttg

900

acatccctat gaccggcgag taacgtcgcc ttttcttcgg agcngaggag acaggtggtg

960

catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

1020

cctatcctta gtagccagcg gtttggccgg gcactctgag gagactgcca gggataacct

1080

ggaggaaggc ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgatttgggc tacacacgtg

1140

ctacaatggc gtaaacaaag ggaagcgaga gtgtgagctt aagcaaatcc caaaaataac

1200

gtcccagttc ggactgcagt ctgcaactcg actgcacgaa gctggaatcg ctagtaatcg

1260

cggatcagaa tgccgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca

1320

tgggagtcag taacgcccga agtcagtgac cgaaccgaaa gg

1362

<210> 375

<211> 1026

<212> DNA

<213> Blautia glucerasei

<220>

<221> modified_base

<222> (10)..(10)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (37)..(39)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (861)..(861)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (932)..(934)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (941)..(943)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (950)..(951)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (953)..(953)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (957)..(957)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (965)..(965)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (967)..(967)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (970)..(972)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (991)..(992)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1019)..(1019)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 375

cgaacggggn acattttatt ggaagcttcg gctaggnnnt atagcttgtt cctagtggcg

60

gacgggtgag taacgcgtgg gtaacctgcc tcacactggg ggataacagt cagaaatgac

120

tgctaatacc gcataagcgc acgggattgc atgatccagt gtgaaaaact ccggtggtgt

180

gagatggacc cgcgttggat tagccagttg gcagggtaac ggcctaccaa agcgacgatc

240

catagccggc ctgagagggt ggacggccac attgggactg agacacggcc cagactccta

300

cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggggaaac cctgatgcag cgacgccgcg

360

tgaaggaaga agtatctcgg tatgtaaact tctatcagca gggaagaaaa tgacggtacc

420

tgactaagaa gccccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggggcaagc

480

gttatccgga tttactgggt gtaaagggag cgtagacgga gcagcaagtc tgatgtgaaa

540

ggcaggggct caacccctgg actgcattgg aaactgttga tcttgagtac cggagaggta

600

agcggaattc ctagtgtagc ggtgaaatgc gtagatatta ggaggaacac cagtggcgaa

660

ggcggcttac tggacggtaa ctgacgttga ggctcgaaag cgtggggagc aaacaggatt

720

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgaatactag gtgtcgggtg gcagagccat

780

tcggtgccgc agcaaacgca gtaagtattc cacctgggga gtacgttcgc aagaatgaaa

840

ctcaaaggaa ttgacgggga nccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa

900

cgcgaagaac cttaccaagt cttgacatcc cnnngaccgg nnngtaacgn ngncttnctc

960

ttcgnancan nngagacagg tggtgcatgg nngtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttng

1020

gttaag

1026

<210> 376

<211> 1157

<212> DNA

<213> Blautia hansenii

<400> 376

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgagc

60

gaagcactta tcattgactc ttcggaagat ttgatatttg actgagcggc ggacgggtga

120

gtaacgcgtg ggtaacctgc ctcatacagg ggaataacag ttagaaatgg ctgctaatgc

180

cgcataagcg cacaggatcg catggtctgg tgtgaaaaac tgaggtggta tgagatggac

240

ccgcgtctga ttaggtagtt ggtggggtaa cggcctacca agccgacgat cagtagccgg

300

cctgagaggg tgaacggcca cattgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

360

gcagtgggga atattgcaca atgggggaaa ccctgatgca gcgacgccgc gtgaaggaag

420

aagtatctcg gtatgtaaac ttctatcagc agggaagaaa atgacggtac ctgactaaga

480

agccccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggggcaag cgttatccgg

540

atttactggg tgtaaaggga gcgtagacgg aagagcaagt ctgatgtgaa aggctggggc

600

ttaaccccag gactgcattg gaaactgttt ttctagagtg ccggagaggt aagcggaatt

660

cctagtgtag cggtgaaatg cgtagatatt aggaggaaca ccagtggcga aggcggctta

720

ctggacggta actgacgttg aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct

780

ggtagtccac gccgtaaacg atgaatacta ggtgtcgggg tgcaaagcag ttcggtgccg

840

cagcaaacgc aataagtatt ccacctgggg agtacgttcg caagaatgaa actcaaagga

900

attgacgggg acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa

960

ccttaccaag tcttgacatc tgcctgaccg ttccttgacc ggagctttcc ttcgggacag

1020

gcaagacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1080

gcaacgagcg caacccctat ccttagtagc cagcagttcg gctgggcact ctagggagac

1140

tgccggggat aacccgg

1157

<210> 377

<211> 975

<212> DNA

<213> Blautia hydrogenotrophica

<220>

<221> modified_base

<222> (23)..(23)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (947)..(947)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (952)..(953)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (963)..(964)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 377

tttcggttga agttttctat tgnctgagtg gcggacgggt gagtaacgcg tgggtaacct

60

gccctataca gggggataac agttagaaat gactgctaat accgcataag cgcacagctt

120

cgcatgaagc ggtgtgaaaa actgaggtgg tataggatgg acccgcgttg gattagctag

180

ttggtgaggt aacggcccac caaggcgacg atccatagcc ggcctgagag ggtgaacggc

240

cacattggga ctgagacacg gcccaaactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca

300

caatggggga aaccctgatg cagcgacgcc gcgtgaagga agaagtatct cggtatgtaa

360

acttctatca gcagggaaga aagtgacggt acctgactaa gaagccccgg ctaattacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaaggggca agcgttatcc ggatttactg ggtgtaaagg

480

gagcgtagac ggtttggcaa gtctgatgtg aaaggcatgg gctcaacctg tggactgcat

540

tggaaactgt cagacttgag tgccggagag gcaagcggaa ttcctagtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata ttaggaggaa caccagtggc gaaggcggcc tgctggacgg taactgacgt

660

tgaggctcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgctgtaaa

720

cgatgaatac taggtgtcgg gtggcaaagc cattcggtgc cgcagcaaac gcaataagta

780

ttccacctgg ggagtacgtt cgcaagaatg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac

840

aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacca aatcttgaca

900

tccctctgac cgggaagtaa tgttcccttt tcttcggaac agagganaca gnnggtgcat

960

ggnngtcgtc agctc

975

<210> 378

<211> 998

<212> DNA

<213> Blautia luti

<220>

<221> modified_base

<222> (33)..(33)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (765)..(767)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (771)..(775)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (915)..(916)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (929)..(929)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (940)..(940)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (949)..(949)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (958)..(958)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (966)..(968)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (972)..(973)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (975)..(976)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (979)..(979)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (981)..(981)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (984)..(985)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (991)..(992)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 378

tcgaacggga attactttat tgaaacttcg gtngatttaa tttaattcta gtggcggacg

60

ggtgagtaac gcgtgggtaa cctgccttat acagggggat aacagtcaga aatggctgct

120

aataccgcat aagcgcacag agctgcatgg ctcagtgtga aaaactccgg tggtataaga

180

tggacccgcg ttggattagc ttgttggtgg ggtaacggcc caccaaggcg acgatccata

240

gccggcctga gagggtgaac ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg

300

aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcgac gccgcgtgaa

360

ggaagaagta tctcggtatg taaacttcta tcagcaggga agatagtgac ggtacctgac

420

taagaagccc cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggg gcaagcgtta

480

tccggattta ctgggtgtaa agggagcgta gacggtgtgg caagtctgat gtgaaaggca

540

tgggctcaac ctgtggactg cattggaaac tgtcatactt gagtgccgga ggggtaagcg

600

gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag atattaggag gaacaccagt ggcgaaggcg

660

gcttactgga cggtaactga cgttgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

720

accctggtag tccacgccgt aaacgatgaa tactaggtgt cgggnnncat nnnnncttcg

780

gtgccgtcgc aaacgcagta agtattccac ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc

840

aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc

900

gaagaacctt accanntctt gacatcccnc tgaccggatn ctttaatcng gatctttncc

960

ttcggnnnag anngnnacng nggnncatgg nngtcgtc

998

<210> 379

<211> 1393

<212> DNA

<213> Blautia producta

<220>

<221> modified_base

<222> (10)..(10)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (15)..(16)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (42)..(42)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 379

agcgaagcan cttgnncgga tttcttcgga ttgaagtttt tngtgactga gcggcggacg

60

ggtgagtaac gcgtgggtaa cctgcctcat acagggggat aacagttaga aatggctgct

120

aataccgcat aagcgcacag gaccgcatgg tctggtgtga aaaactccgg tggtatgaga

180

tggacccgcg tctgattagc tagttggagg ggtaacggcc caccaaggcg acgatcagta

240

gccggcctga gagggtgaac ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg

300

aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcgac gccgcgtgaa

360

ggaagaagta tctcggtatg taaacttcta tcagcaggga agaaaatgac ggtacctgac

420

taagaagccc cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggg gcaagcgtta

480

tccggattta ctgggtgtaa agggagcgta gacggaagag caagtctgat gtgaaaggct

540

ggggcttaac cccaggactg cattggaaac tgtttttcta gagtgccgga gaggtaagcg

600

gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag atattaggag gaacaccagt ggcgaaggcg

660

gcttactgga cggtaactga cgttgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

720

accctggtag tccacgccgt aaacgatgaa tactaggtgt cgggtggcaa agccattcgg

780

tgccgcagca aacgcaataa gtattccacc tggggagtac gttcgcaaga atgaaactca

840

aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg

900

aagaacctta ccaagtcttg acatccctct gaccggcccg taacggggcc ttcccttcgg

960

ggcagaggag acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1020

gtcccgcaac gagcgcaacc cctatcctta gtagccagca ggtgaagctg ggcactctag

1080

ggagactgcc ggggataacc cggaggaagg cggggacgac gtcaaatcat catgcccctt

1140

atgatttggg ctacacacgt gctacaatgg cgtaaacaaa gggaagcgag acagcgatgt

1200

tgagcaaatc ccaaaaataa cgtcccagtt cggactgcag tctgcaactc gactgcacga

1260

agctggaatc gctagtaatc gcgaatcaga atgtcgcggt gaatacgttc ccgggtcttg

1320

tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtca gtaacgcccg aagttcagtg acccaacctt

1380

ataggaggga gct

1393

<210> 380

<211> 1366

<212> DNA

<213> Blautia schinkii

<400> 380

tgacagagac ttcggttgaa gtcgttataa tcctagtggc ggacgggtga gtaacgcgtg

60

ggtaacctgc ctcacactgg gggataacag tcagaaatga ctgctaatac cgcataagcg

120

cacggggctg catggttcag tgtgaaaaac tccggtggtg tgagatggac ccgcgttgga

180

ttagccagtt ggcagggtaa cggcctacca aagcgacgat ccatagccgg cctgagaggg

240

tggacggcca cattgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga

300

atattgcaca atgggggaaa ccctgatgca gcgacgccgc gtgaaggaag aagtatctcg

360

gtatgtaaac ttctatcagc agggaagaaa atgacggtac ctgactaaga agccccggct

420

aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggggcaag cgtatccgga tttactgggt

480

gtaaagggag cgtagacgga gcagcaagtc tgatgtgaaa ggcgggggct caacccccgg

540

actgcattgg aaactgttga tcttgagtac cggagaggta agcggaattc ctagtgtagc

600

ggtgaaatgc gtagatatta ggaggaacac cagtggcgaa ggcggcttac tggacggtaa

660

ctgacgttga ggctcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg

720

ccgtaaacga tgaatactag gtgtcgggtg gcagagccat tcggtgccgc agcaaacgca

780

gtaagtattc cacctgggga gtacgttcgc aagaatgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga

840

cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaagt

900

cttgacatcc ctatgaccgg tgagtaacgt cacctttcct tcgggacaga ggagacaggt

960

ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc

1020

aacccctatc cttagtagcc agcggtttgg ccgggcactc tgaggagact gccagggata

1080

acctggagga aggcggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgattt gggctacaca

1140

cgtgctacaa tggcgtaaac aaagggaagc gagagtgtga gcttaagcaa atcccaaaaa

1200

taacgtccca gttcggactg cagtctgcaa ctcgactgca cgaagctgga atcgctagta

1260

atcgcggatc agaatgccgc ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac

1320

accatgggag tcagtaacgc ccgaagtcag tgaccgaacc gaaagg

1366

<210> 381

<211> 1015

<212> DNA

<213> Blautia sp. M25

<220>

<221> modified_base

<222> (77)..(77)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 381

gaaggaagaa gtatctcggt atgtaaactt ctatcagcag ggaagataat gacggtacct

60

gactaagaag ccccggncta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggggcgagc

120

gttatccgga tttactgggt gtaaagggag cgtagacggc gtatcaagtc tgatgtgaaa

180

ggcaggggct taacccctgg actgcattgg aaactggtat gcttgagtgc cggaggggta

240

agcggaattc ctagtgtagc ggtgaaatgc gtagatatta ggaggaacac cagtggcgaa

300

ggcggcttac tggacggtaa ctgacgttga ggctcgaaag cgtggggagc aaacaggatt

360

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgaatactag gtgtctggga gcacagctct

420

taggtgccgc cgcaaacgca ttaagtattc cacctgggga gtacgttcgc aagaatgaaa

480

ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa

540

cgcgaagaac cttaccaaat cttgacatcc ctctgacaga gtatgtaatg tacttttcct

600

tcgggacagg ggagacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg

660

ttaagtcccg caacgagcgc aacccctatc cttagtagcc agcaagtaat gttgggcact

720

ctgaggagac tgccagggat aacctggagg aaggcgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc

780

ccttatgatt tgggctacac acgtgctaca atggcgtaaa caaagggaag cgaacctgtg

840

agggtgggca aatctcaaaa ataacgtccc agttcggact gcagtctgca actcgactgc

900

acgaagctgg aatcgctagt aatcgcggat cagaatgccg cggtgaatac gttcccgggt

960

cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtcagtaacg cccgaagtca gtgac

1015

<210> 382

<211> 1372

<212> DNA

<213> Blautia stercoris

<400> 382

tgcaagtcga gcgaagcgct tacgacagaa ccttcggggg aagatgtaag ggactgagcg

60

gcggacgggt gagtaacgcg tgggtaacct gcctcataca gggggataac agttggaaac

120

ggctgctaat accgcataag cgcacggtat cgcatgatac agtgtgaaaa actccggtgg

180

tatgagatgg acccgcgtct gattagctag ttggaggggt aacggcccac caaggcgacg

240

atcagtagcc ggcctgagag ggtgaacggc cacattggga ctgagacacg gcccagactc

300

ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatggggga aaccctgatg cagcgacgcc

360

gcgtgaagga agaagtatct cggtatgtaa acttctatca gcagggaaga aaatgacggt

420

acctgactaa gaagccccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggggca

480

agcgttatcc ggatttactg ggtgtaaagg gagcgtagac ggaagagcaa gtctgatgtg

540

aaaggctggg gcttaacccc aggactgcat tggaaactgt ttttcttgag tgccggagag

600

gtaagcggaa ttcctagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttaggaggaa caccagtggc

660

gaaggcggct tactggacgg taactgacgt tgaggctcga aagcgtgggg agcaaacagg

720

attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgaatac taggtgttgg ggagcaaagc

780

tcttcggtgc cgcagcaaac gcaataagta ttccacctgg ggagtacgtt cgcaagaatg

840

aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag

900

caacgcgaag aaccttacca agtcttgaca tcgatctgac cggttcgtaa tggaaccttt

960

ccttcgggac agagaagaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

1020

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct atcctcagta gccagcaggt gaagctgggc

1080

actctgtgga gactgccagg gataacctgg aggaaggcgg ggacgacgtc aaatcatcat

1140

gccccttatg atttgggcta cacacgtgct acaatggcgt aaacaaaggg aagcgagccc

1200

gcgaggggga gcaaatccca aaaataacgt cccagttcgg actgcagtct gcaactcgac

1260

tgcacgaagc tggaatcgct agtaatcgcg aatcagaatg tcgcggtgaa tacgttcccg

1320

ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtcagta acgcccgaag tc

1372

<210> 383

<211> 1375

<212> DNA

<213> Blautia wexlerae

<220>

<221> modified_base

<222> (12)..(13)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (17)..(17)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (21)..(21)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (27)..(27)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (47)..(47)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (917)..(917)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (958)..(958)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 383

tcgaacggga anntatnttc nattganact tcggtggatt tagattntat ttcgtagtgg

60

cggacgggtg agtaacgcgt gggtaacctg ccttatacag ggggataaca gtcagaaatg

120

gctgctaata ccgcataagc gcacagagct gcatggctca gtgtgaaaaa ctccggtggt

180

ataagatgga cccgcgttgg attagctagt tggtggggta acggcccacc aaggcgacga

240

tccatagccg gcctgagagg gtgaacggcc acattgggac tgagacacgg cccagactcc

300

tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatgggggaa accctgatgc agcgacgccg

360

cgtgaaggaa gaagtatctc ggtatgtaaa cttctatcag cagggaagat agtgacggta

420

cctgactaag aagccccggc taactacgtg ccacagccgc gaagggggca gcgttatccg

480

gatttactgg gtgtaaaggg agcgtagacg gtgtggcaag ttgatgtgaa aggcatgggc

540

tcaacctgtg gatgcattgg aaactgtcat acttgagtgc cggaggggta agcggaattc

600

tagtgtagcg gtgaaatgcg tagatattag gaggaacacc agtggcgaag gcggcttact

660

ggacggtaac tgacgttgag gctcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg

720

tagtccacgc cgtaaacgat gaatactagg tgtcgggtgg caaccttcgg tgccgtcgca

780

aacgcagtaa gtattccacc tggggagtac gttcgcaaga atgaaactca aaggaattga

840

cggggacccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta

900

ccaagtcttg acatccnatt taacgggtct taaaggggcg tttacgttgg ggaaagtntg

960

atatgagagg catgtgctta acctgctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

1020

gagcgcaacc cctatcctca gtagccagca tttaaggtgg gcactctggg gagactgcca

1080

gggataacct ggaggaaggc ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgatttgggc

1140

tacacacgtg ctacaatggc gtaaacaaag ggaagcgaga ttgtgagatg gagcaaatcc

1200

caaaaataac gtcccagttc ggactgtagt ctgcaacccg actacacgaa gctggaatcg

1260

ctagtaatcg cggatcagaa tgccgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt acacaccgcc

1320

cgtcacacca tgggagtcag taacgcccga agtcagtgac ctaactgcaa agaag

1375

<210> 384

<211> 1464

<212> DNA

<213> Bordetella bronchiseptica

<220>

<221> modified_base

<222> (87)..(87)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (160)..(160)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (243)..(243)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (331)..(331)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (380)..(380)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (958)..(958)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1287)..(1287)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1391)..(1391)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1409)..(1409)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 384

aactgaagag tttgatcctg gctcagattg aacgctggcg ggatgcttta cacatgcaag

60

tcggacggca gcacgggctt cggcctngtg gcgagtggcg aacgggtgag taatgtatcg

120

gaacgtgccc agtagcgggg gataactacg cgaaagcgtn gctaataccg catacgccct

180

acgggggaaa gcgggggacc ttcgggcctc gcactattgg agcggccgat atcggattag

240

ctngttggtg gggtaacggc ctaccaaggc gacgatccgt agctggtttg agaggacgac

300

cagccacact gggactgaga cacggcccag nctcctacgg gaggcagcag tggggaattt

360

tggacaatgg gggcaacccn gatccagcca tcccgcgtgt gcgatgaagg ccttcgggtt

420

gtaaagcact tttggcagga aagaaacggc acgggctaat atcctgtgca actgacggta

480

cctgcagaat aagcaccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcaa

540

gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg tgcgcaggcg gttcggaaag aaagatgtga

600

aatcccaggg cttaaccttg gaactgcatt tttaactacc gggctagagt gtgtcagagg

660

gaggtggaat tccgcgtgta gcagtgaaat gcgtagatat gcggaggaac accgatggcg

720

aaggcagcct cctgggataa cactgacgct catgcacgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgccctaaac gatgtcaact agctgttggg gccttcgggc

840

cttggtagcg cagctaacgc gtgaagttga ccgcctgggg agtacggtcg caagattaaa

900

actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggatg atgtggatta attcgatnca

960

acgcgaaaaa ccttacctac ccttgacatg tctggaatcc cgaagagatt tgggagtgct

1020

cgcaagagaa ccggaacaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

1080

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gtcattagtt gctacgaaag ggcactctaa

1140

tgagactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcct catggccctt

1200

atgggtaggg cttcacacgt catacaatgg tcgggacaga gggtcgccaa cccgcgaggg

1260

ggagccaatc ccagaaaccc gatcgtngtc cggatcgcag tctgcaactc gactgcgtga

1320

agtcggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgtcgcggt gaatacgttc ccgggtcttg

1380

tacacaccgc ncgtcacacc atgggagtng gttttaccag aagtagttag cctaaccgca

1440

aggggggcga ttaccacggt agga

1464

<210> 385

<211> 1292

<212> DNA

<213> Bordetella holmesii

<400> 385

attgaacgct ggcgggatgc tttacacatg caagtcggac gagtggcgaa cgggtgagta

60

atgtatcgga acgtgcccgg tagcggggga taactacgcg aaagcgtggc taataccgca

120

tacggaaagg cactattgga gcggccgata tcggattagc tagttggtgg ggtaacggcc

180

taccaaggcg acgatccgta gctggtttga gaggacgacc agtcacactg ggactgagac

240

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatttt ggacaatggg ggcaaccctg

300

atccagccat cccgcgtgtg cgatgaaggc cttcgggttg taaagcactt ttggcaggaa

360

agatgacggt acctgcagaa taagcaccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

420

gtagggtgca agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gtgcgcaggc ggttcggaaa

480

gaaagatgtg aaatcccagg gcttaacctt ggaactgcat ttttaactac cgagctagag

540

tgtgtcagag ggaggtggaa ttccgcgtgt agcagtgaaa tgcgtagata tgcggaggaa

600

caccgatggc gaaggcagcc tcctgggata actgacgctc atgcacgaaa gtgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccctaaacg atgtcaacta gctgttgggg

720

ccttggtagc gcagctaacg cgtgaagttg accgcctggg gagtacggtc gcaagattaa

780

aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggat gatgtggatt aattcgatgc

840

aacgcgaaaa accttaccta cccttgacat gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtcat tagttgctac

960

ggcactctaa tgagactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcct

1020

catggccctt atgggtaggg cttcacacgt catacaatgg tcggcagagg gttgccaacc

1080

cgcgaggggg agccaatccc agccggtcgt agtccggacg cagtctgcaa ctcgactgcg

1140

gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgtcgcg gtgaatacgt tcccgggtct

1200

tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttttacc agaagtagtt gcctagggcg

1260

attaccacgg taggattcat gactggggtg aa

1292

<210> 386

<211> 1464

<212> DNA

<213> Bordetella parapertussis

<220>

<221> modified_base

<222> (87)..(87)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (243)..(243)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (331)..(331)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1229)..(1229)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1371)..(1371)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1391)..(1391)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 386

aactgaagag tttgatcctg gctcagattg aacgctggcg ggatgcttta cacatgcaag

60

tcggacggca gcacgggctt cggcctngtg gcgagtggcg aacgggtgag taatgtatcg

120

gaacgtgccc agtagcgggg gataactacg cgaaagcgta gctaataccg catacgccct

180

acgggggaaa gcgggggacc ttcgggcctc gcactattgg agcggccgat atcggattag

240

ctngttggtg gggtaacggc ctaccaaggc gacgatccgt agctggtttg agaggacgac

300

cagccacact gggactgaga cacggcccag nctcctacgg gaggcagcag tggggaattt

360

tggacaatgg gggcaaccct gatccagcca tcccgcgtgt gcgatgaagg ccttcgggtt

420

gtaaagcact tttggcagga aagaaacggc acgggctaat atcctgtgca actgacggta

480

cctgcagaat aagcaccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcaa

540

gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg tgcgcaggcg gttcggaaag aaagatgtga

600

aatcccaggg cttaaccttg gaactgcatt tttaactacc gggctagagt gtgtcagagg

660

gaggtggaat tccgcgtgta gcagtgaaat gcgtagatat gcggaggaac accgatggcg

720

aaggcagcct cctgggataa cactgacgct catgcacgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgccctaaac gatgtcaact agctgttggg gccttcgggc

840

cttggtagcg cagctaacgc gtgaagttga ccgcctgggg agtacggtcg caagattaaa

900

actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggatg atgtggatta attcgatgca

960

acgcgaaaaa ccttacctac ccttgacatg tctggaatcc cgaagagatt tgggagtgct

1020

cgcaagagaa ccggaacaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

1080

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gtcattagtt gctacgaaag ggcactctaa

1140

tgagactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcct catggccctt

1200

atgggtaggg cttcacacgt catacaatng tcgggacaga gggtcgccaa cccgcgaggg

1260

ggagccaatc ccagaaaccc gatcgtagtc cggatcgcag tctgcaactc gactgcgtga

1320

agtcggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgtcgcggt gaatacgttc ncgggtcttg

1380

tacacaccgc ncgtcacacc atgggagtgg gttttaccag aagtagttag cctaaccgca

1440

aggggggcga ttaccacggt agga

1464

<210> 387

<211> 1533

<212> DNA

<213> Bordetella pertussis

<400> 387

ttgaactgaa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcgggatgct ttacacatgc

60

aagtcggacg gcagcacggg cttcggcctg gtggcgagtg gcgaacgggt gagtaatgta

120

tcggaacgtg cccagtagcg ggggataact acgcgaaagc gtggctaata ccgcatacgc

180

cctacggggg aaagcggggg accttcgggc ctcgcactat tggagcggcc gatatcggat

240

tagctagttg gtggggtaac ggcctaccaa ggcgacgatc cgtagctggt ttgagaggac

300

gaccagccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

ttttggacaa tgggggcaac cctgatccag ccatcccgcg tgtgcgatga aggccttcgg

420

gttgtaaagc acttttggca ggaaagaaac ggcacgggct aatatcctgt gcaactgacg

480

gtacctgcag aataagcacc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggtg

540

caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgtgcgcag gcggttcgga aagaaagatg

600

tgaaatccca gggcttaacc ttggaactgc atttttaact accgggctag agtgtgtcag

660

agggaggtgg aattccgcgt gtagcagtga aatgcgtaga tatgcggagg aacaccgatg

720

gcgaaggcag cctcctggga taacactgac gctcatgcac gaaagtgtgg ggagcaaaca

780

ggattagata ccctggtagt ccacgcccta aacgatgtca actagctgtt ggggccttcg

840

ggccttggta gcgcagctaa cgcgtgaagt tgaccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt

900

aaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg atgatgtgga ttaattcgat

960

gcaacgcgaa aaaccttacc tacccttgac atgtctggaa tcccgaagag atttgggagt

1020

gctcgcaaga gaaccggaac acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtcatta gttgctacga aagggcactc

1140

taatgagact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaagt cctcatggcc

1200

cttatgggta gggcttcaca cgtcatacaa tggtcgggac agagggttgc caacccgcga

1260

gggggagcca atcccagaaa cccggtcgta gtccggatcg cagtctgcaa ctcgactgcg

1320

tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agcatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggtc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggttttac cagaagtagt tagcctaacc

1440

gcaagggggg cgattaccac ggtaggattc atgactgggg tgaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc ttt

1533

<210> 388

<211> 1533

<212> DNA

<213> Borrelia afzelii

<400> 388

gaagagtttg atcctggctt agaactaacg ctggcagtgc gtcttaagca tgcaagtcaa

60

acggaatgta gcaatacatt tagtggcgaa cgggtgagta acgcgtggat gatctaccta

120

tgagatgggg ataactacta gaaatagtag ctaataccga ataaggtcaa ttaatttgtt

180

aattgatgaa aggaagcctt taaagcttcg cttgtagatg agtctgcgtc ttattagtta

240

gttggtgggg taaatgccta ccaagacgat gataagtaac cggcctgaga gggtgaacgg

300

tcacactgga actgagatac ggtccagact cctacgggag gcagcagcta agaatcttcc

360

gcaatgggcg aaagcctgac ggagcgacac tgcgtgaatg aagaaggtcg aaagattgta

420

aaattctttt ataaatgagg aataagcttt gtaggaaatg acaaagcgat gacgttaatt

480

tatgaataag ccccggctaa ttacgtgcca gcagccgcgg taatacgtaa ggggcgagcg

540

ttgttcggga ttattgggcg taaagggtga gtaggcggat atataagtct atgcataaaa

600

taccacagct caactgtgga gctatgttgg aaactatatg tctagagtct gatagaggaa

660

gttagaattc ctggtgtaag ggtggaatct gttgatatca ggaagaatac cggaggcgaa

720

ggcgaacttc tgggtcaaga ctgacgctga gtcacgaaag cgtaggtagc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtctacg ctgtaaacga tgcacacttg gtgttaacta aaagttagta

840

ccgaagctaa cgtgttaagt gtgccgcctg gggagtatgc tcgcaagagt gaaactcaaa

900

ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gatacgcgag

960

gaaccttacc agggcttgac atatatagga tatagttaga gataattatt ccccgtttgg

1020

ggtctatata caggtgctgc atggttgtcg tcagctcgtg ctgtgaggtg ttgggttaag

1080

tcccgcaacg agcgcaaccc ttgttatctg ttaccagcat gtaatgatgg ggactcagat

1140

aagactgccg gtgataagtc ggaggaaggt gaggatgacg tcaaatcatc atggccctta

1200

tgtcctgggc tacacacgtg ctacaatggc ctgtacaaag cgaagcgaaa cagtgatgtg

1260

aagcaaaacg cacaaagcag gtctcagtcc ggattgaagt ctgaaactcg acttcatgaa

1320

gttggaatcg ctagtaatcg tatatcagaa tgatacggtg aatacgttct cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacca cccgagttga ggatacccga agctattatt ctaacccgta

1440

agggaggaag gtatttaagg tatgtttagt gaggggggtg aagtcgtaac aaggtagccg

1500

tactggaaag tgcggctgga tcacctcctt tct

1533

<210> 389

<211> 1533

<212> DNA

<213> Borrelia burgdorferi

<400> 389

gaagagtttg atcctggctt agaactaacg ctggcagtgc gtcttaagca tgcaagtcaa

60

acgggatgta gcaatacatt cagtggcgaa cgggtgagta acgcgtggat gatctaccta

120

tgagatgggg ataactatta gaaatagtag ctaataccga ataaggtcag ttaatttgtt

180

aattgatgaa aggaagcctt taaagcttcg cttgtagatg agtctgcgtc ttattagcta

240

gttggtaggg taaatgccta ccaaggcaat gataagtaac cggcctgaga gggtgaacgg

300

tcacactgga actgagatac ggtccagact cctacgggag gcagcagcta agaatcttcc

360

gcaatgggcg aaagcctgac ggagcgacac tgcgtgaatg aagaaggtcg aaagattgta

420

aaattctttt ataaatgagg aataagcttt gtaggaaatg acaaagtgat gacgttaatt

480

tatgaataag ccccggctaa ttacgtgcca gcagccgcgg taatacgtaa ggggcgagcg

540

ttgttcggga ttattgggcg taaagggtga gtaggcggat atataagtct atgcataaaa

600

taccacagct caactgtgga cctatgttgg aaactatatg tctagagtct gatagaggaa

660

gttagaattt ctggtgtaag ggtggaatct gttgatatca gaaagaatac cggaggcgaa

720

ggcgaacttc tgggtcaaga ctgacgctga gtcacgaaag cgtagggagc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtctacg ctgtaaacga tgcacacttg gtgttaacta aaagttagta

840

ccgaagctaa cgtgttaagt gtgccgcctg gggagtatgc tcgcaagagt gaaactcaaa

900

ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gatacgcgag

960

gaaccttacc agggcttgac atatatagga tatagttaga gataattatt ccccgtttgg

1020

ggtctatata caggtgctgc atggttgtcg tcagctcgtg ctgtgaggtg ttgggttaag

1080

tcccgcaacg agcgcaaccc ttgttatctg ttaccagcat gtaatggtgg ggactcagat

1140

aagactgccg gtgataagtc ggaggaaggt gaggatgacg tcaaatcatc atggccctta

1200

tgtcctgggc tacacacgtg ctacaatggc ctgtacaaag cgaagcgaaa cagtgatgtg

1260

aagcaaaacg cataaagcag gtctcagtcc ggattgaagt ctgaaactcg acttcatgaa

1320

gttggaatcg ctagtaatcg tatatcagaa tgatacggtg aatacgttct cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacca cccgagttga ggatacccga agctattatt ctaacccgta

1440

agggaggaag gtatttaagg tatgtttagt gaggggggtg aagtcgtaac aaggtagccg

1500

tactggaaag tgcggctgga tcacctcctt tct

1533

<210> 390

<211> 1299

<212> DNA

<213> Borrelia crocidurae

<400> 390

cctggcttag aactaacgct ggcagtgcgt cttaagcatg caagtcagac gagtggcgaa

60

cgggtgagta acgcgtggat aatctaccta tgagatgggg ataactatta gaaatagtag

120

ctaataccga ataaggaaag tcgcttgtag atgagtctgc gtcttattag ctagttggta

180

gggtaagagc ctaccaaggc tatgataagt aaccggcctg agagggtgaa cggtcacact

240

ggaactgaga tacggtccag actcctacgg gaggcagcag ctaagaatct tccgcaatgg

300

gcgaaagcct gacggagcga cactgcgtga acgaagaagg tcgaaagatt gtaaagttct

360

tttataaatg aggatgacgt taatttatga ataagccccg gctaattacg tgccagcagc

420

cgcggtaata cgtaaggggc gagcgttgtt cgggattatt gggcgtaaag ggtgagtagg

480

cggatatgca agtctggcgt aaaataccac agctcaactg tggagctatg ctagaaactg

540

catgactaga gtctgatagg ggaagttaga attcctggtg taagggtgga atctgttgat

600

atcaggaaga ataccagagg cgaaggcgaa cttctaggtc aactgacgct gagtcacgaa

660

agcgtaggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcta cgctgtaaac gatgcacact

720

tggtgttaat cggttagtac cgaagctaac gtgttaagtg tgccgcctgg ggagtatgct

780

cgcaagagtg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

840

taattcgatg atacgcgagg aaccttacca gggcttgaca tatacaggtg ctgcatggtt

900

gtcgtcagct cgtgctgtga ggtgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttattg

960

tctgttacca gcatatgggg actcagacga gactgccggt gataagccgg aggaaggtga

1020

ggatgacgtc aaatcatcat ggcccttatg tcctgggcta cacacgtgct acaatggcct

1080

gcaaagcgat gcgaaacagt gatgtgaagc aaaacgcatc aggtctcagt ccagatgaag

1140

tctgaaactc gacttcagaa gttggaatcg ctagtaatcg tatatcagaa tgatacggtg

1200

aatacgttct cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cccgagttga ggatacccga

1260

agctattttc taggaaggta tctaaggtat gtttagtga

1299

<210> 391

<211> 1534

<212> DNA

<213> Borrelia duttonii

<400> 391

gaagagtttg atcctggctt agaactaacg ctggcagtgc gtcttaagca tgcaagtcaa

60

acgggatgta gcaatacatt cagtggcgaa cgggtgagta acgcgtggat aatctaccta

120

tgagatgggg ataactatta gaaatagtag ctaataccga ataaggtcag ttgagatgtc

180

aattgatgaa aggaagcctt taaagcttcg cttgtagatg agtctgcgtc ttattagcta

240

gttggtaggg taagagccta ccaaggctat gataagtaac cggcctgaga gggtgaacgg

300

tcacactgga actgagatac ggtccagact cctacgggag gcagcagcta agaatcttcc

360

gcaatgggcg aaagcctgac ggagcgacac tgcgtgaacg aagaaggtcg aaagattgta

420

aagttctttt ataaatgagg aataagcttt gtaggaaatg acaaggtgat gacgttaatt

480

tatgaataag ccccggctaa ttacgtgcca gcagccgcgg taatacgtaa ggggcgagcg

540

ttgttcggga ttattgggcg taaagggtga gtaggcggat atgcaagtct gtgcgtaaaa

600

taccacagct caactgtgga gctatgctag aaactgcatg actagagtct gataggggaa

660

gttagaattc ctggtgtaag ggtggaatct gttgatatca ggaagaatac cagaggcgaa

720

ggcgaacttc taggtcaaga ctgacgctga gtcacgaaag cgtagggagc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtctacg ctgtaaacga tgcacacttg gtgttaatcg agaggttagt

840

accgaagcta acgtgttaag tgtgccgcct ggggagtatg ctcgcaagag tgaaactcaa

900

aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga tgatacgcga

960

ggaaccttac cagggcttga catatacagg atgtagttag agataactat tccccgtttg

1020

gggtctgtat acaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gctgtgaggt gttgggttaa

1080

gtcccgcaac gagcgcaacc cttattgtct gttaccagca tgtaaagatg gggactcaga

1140

cgagactgcc ggtgataagc cggaggaagg tgaggatgac gtcaaatcat catggccctt

1200

atgtcctggg ctacacacgt gctacaatgg cctgtacaaa gcgatgcgaa acagtgatgt

1260

gaagcaaaac gcataaagca ggtctcagtc cagattgaag tctgaaactc gacttcatga

1320

agttggaatc gctagtaatc gtatatcaga atgatacggt gaatacgttc tcgggccttg

1380

tacacaccgc ccgtcacacc acccgagttg aggatacccg aagctattat tctaacccgc

1440

aagggaggaa ggtatctaag gtatgtttag tgaggggggt gaagtcgtaa caaggtagcc

1500

gtactggaaa gtgtggctgg atcacctcct ttct

1534

<210> 392

<211> 1533

<212> DNA

<213> Borrelia garinii

<400> 392

gaagagtttg atcctggctt agaactaacg ctggcagtgc gtcttaagca tgcaagtcaa

60

acgggatgta gcaatacatc tagtggcgaa cgggtgagta acgcgtggat gatctaccta

120

cgagatgggg ataactatta gaaatagtag ctaataccga ataaagtcaa ttaatttgtt

180

aattgatgaa aggaagcctt taaagcttcg cttgtagatg agtctgcgtc ttattagcta

240

gttggtaggg taaatgccta ccaaggcgat gataagtaac cggcctgaga gggtgaacgg

300

tcacactgga actgagatac ggtccagact cctacgggag gcagcagcta agaatcttcc

360

gcaatgggcg aaagcctgac ggagcgacac tgcgtgaatg aagaaggtcg aaagattgta

420

aaattctttt ataaatgagg aataagcttt gtaggaaatg acaaagtgat gacgttaatt

480

tatgaataag ccccggctaa ttacgtgcca gcagccgcgg taatacgtaa ggggcgagcg

540

ttgttcggga ttattgggcg taaagggtga gtaggcggat atataagtct atgcataaaa

600

taccacagct caactgtgga actatgttgg aaactatatg tctagagtct gatagaggaa

660

gttagaattt ctggtgtaag ggtggaatct gttgatatca gaaagaatac cggaggcgaa

720

ggcgaacttc tgggtcaaga ctgacgctga gtcacgaaag cgtagggagc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtctacg ctgtaaacga tgcacacttg gtgttaacta aaagttagta

840

ccgaagctaa cgtgttaagt gtgccgcctg gggagtatgc tcgcaagagt gaaactcaaa

900

ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gatacgcgag

960

gaaccttacc agggcttgac atatatagga tatagttaga gataattatt ccccgtttgg

1020

ggtctatata caggtgctgc atggttgtcg tcagctcgtg ctgtgaggtg ttgggttaag

1080

tcccgcaacg agcgcaaccc ttgttatctg ttaccagcat gtaatggtgg ggactcagat

1140

aagactgccg gtgataagtc ggaggaaggt gaggatgacg tcaaatcatc atggccctta

1200

tgtcctgggc tacacacgtg ctacaatggc ctgtacaaag cgaagcgaaa cagtgatgtg

1260

aagcaaaacg cataaagcag gtctcagtcc ggattgaagt ctgaaactcg acttcatgaa

1320

gttggaatcg ctagtaatcg tatatcagaa tgatacggtg aatacgttct cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacca cccgagttga ggatacccga agctattatt ctaacccgta

1440

agggaggaag gtatttaagg tatgtttagt gaggggggtg aagtcgtaac aaggtagccg

1500

tactggaaag tgcggctgga tcacctcctt tct

1533

<210> 393

<211> 1273

<212> DNA

<213> Borrelia hermsii

<400> 393

gggtgagtaa cgcgtggata atctacctat gagatgggga taactattag aaatagtagc

60

taataccgaa taaggtcaat tgagatgtta attgatgaaa ggaagccttt aaagcttcgc

120

ttgtagatga gtctgcgtct tattagctag ttggtagggt aaaagcctac caaggctgtg

180

ataagtaacc ggcctgagag ggtgaacggt cacactggaa ctgagatacg gtccagactc

240

ctacgggagg cagcagctaa gaatcttccg caatgggcga aagcctgacg gagcgacact

300

gcgtgaacga agaaggtcga aagattgtaa agttctttta taaatgagga ataagctttg

360

taggaaatga caaagtgatg acgttaattt atgaataagc cccggctaat tacgtgccag

420

cagccgcggt aatacgtaag gggcgagcgt tgttcgggat tattgggcgt aaagggtgag

480

taggcggata tgcaagtcta tgcgtaaaat accacagctc aactgtggga atatgctgga

540

aactgcatga ctagagtctg ataggggaag ttagaattcc tggtgtaagg gtggaatctg

600

ttgatatcag gaagaatacc agaggcgaag gcgaacttct aggtcaagac tgacgctgag

660

tcacgaaagc gtagggagca aacaggatta gataccctgg tagtctacgc tgtaaacgat

720

gcacacttgg tgttaatcga aaggttagta ccgaagctaa cgtgttaagt gtgccgcctg

780

gggagtatgc tcgcaagagt gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg

840

agcatgtggt ttaattcgat gatacgcgag gaaccttacc agggcttgac atatacagga

900

tgtagttaga gataactatt ccccgtttgg ggtctgtata caggtgctgc atggttgtcg

960

tcagctcgtg ctgtgaggtg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttattgtctg

1020

ttaccagcat gtaaagatgg ggactcagac gagactgccg gtgataagcc ggaggaaggt

1080

gaggatgacg tcaaatcatc atggccctta tgtcctgggc tacacacgtg ctacaatggc

1140

ctgtacaaag cgatgcgaaa cagtgatgtg aagcaaaacg cataaagcag gtctcagtcc

1200

agattgaagt ctgaaactcg acttcatgaa gttggaatcg ctagtaatcg tatatcagaa

1260

tgatacggtg aat

1273

<210> 394

<211> 1300

<212> DNA

<213> Borrelia hispanica

<400> 394

tcctggctta gaactaacgc tggcagtgcg tcttaagcat gcaagtcaga cgagtggcga

60

acgggtgagt aacgcgtgga taatctacct atgagatggg gataactatt agaaatagta

120

gctaataccg aataaggaaa gtcgcttgta gatgagtctg cgtcttatta gctagttggt

180

agggtaagag cctaccaagg ctatgataag taaccggcct gagagggtga acggtcacac

240

tggaactgag atacggtcca gactcctacg ggaggcagca gctaagaatc ttccgcaatg

300

ggcgaaagcc tgacggagcg acactgcgtg aacgaagaag gtcgaaagat tgtaaagttc

360

ttttataaat gaggatgacg ttaatttatg aataagcccc ggctaattac gtgccagcag

420

ccgcggtaat acgtaagggg cgagcgttgt tcgggattat tgggcgtaaa gggtgagtag

480

gcggatatgc aagtctagcg taaaatacca cagctcaact gtggagctat gctagaaact

540

gcatgactag agtctgatag gggaagttag aattcctggt gtaagggtgg aatctgttga

600

tatcaggaag aataccagag gcgaaggcga acttctaggt caactgacgc tgagtcacga

660

aagcgtaggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtct acgctgtaaa cgatgcacac

720

ttggtgttaa tcggttagta ccgaagctaa cgtgttaagt gtgccgcctg gggagtatgc

780

tcgcaagagt gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt

840

ttaattcgat gatacgcgag gaaccttacc agggcttgac atatacaggt gctgcatggt

900

tgtcgtcagc tcgtgctgtg aggtgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatt

960

gtctgttacc agcatatggg gactcagacg agactgccgg tgataagccg gaggaaggtg

1020

aggatgacgt caaatcatca tggcccttat gtcctgggct acacacgtgc tacaatggcc

1080

tgcaaagcga tgcgaaacag tgatgtgaag caaaacgcat caggtctcag tccagatgaa

1140

gtctgaaact cgacttcaga agttggaatc gctagtaatc gtatatcaga atgatacggt

1200

gaatacgttc tcgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acccgagttg aggatacccg

1260

aagctatttt ctaggaaggt atctaaggta tgtttagtga

1300

<210> 395

<211> 1526

<212> DNA

<213> Borrelia persica

<400> 395

agtttgatcc tggcttagaa ctaacgctgg cagtgcgtct taagcatgca agtcagacgg

60

gatgtagcaa tacattcagt ggcgaacggg tgagtaacgc gtggataatc tacctatgag

120

atggggataa ctattagaaa tagtagctaa taccgaataa ggtcagttga gatgtcaatt

180

gatgaaagga agcctttaaa gcttcgcttg tagatgagtc tgcgtcttat tagctagttg

240

gtggggtaag agcctaccaa ggctatgata agtaaccggc ctgagagggt gaacggtcac

300

actggaactg agatacggtc cagactccta cgggaggcag cagctaagaa tcttccgcaa

360

tgggcgaaag cctgacggag cgacactgcg tgaacgaaga aggtcgaaag attgtaaagt

420

tcttttataa atgaggaata agctttgtag gaaatgacaa ggtgatgacg ttaatttatg

480

aataagcccc ggctaattac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaagggg cgagcgttgt

540

tcgggattat tgggcgtaaa gggtgagtag gcggatatgc aagtctatgc gtaaaatacc

600

acagctcaac tgtggagcta tgctggaaac tgcatgacta gagtctgata ggggaagtta

660

gaattcctgg tgtaagggtg gaatctgttg atatcaggaa gaataccaga ggcgaaggcg

720

aacttctagg tcaagactga cgctgagtca cgaaagcgta gggagcaaac aggattagat

780

accctggtag tctacgctgt aaacgatgca cacttggtgt taattgagag attagtaccg

840

aagctaacgt gttaagtgtg ccgcctgggg agtatgctcg caagagtgaa actcaaagga

900

attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgat acgcgagaaa

960

ccttaccagg gcttgacata tacaggatgt agttagagat aattattccc cgtttggggt

1020

ctgtatacag gtgctgcatg gttgtcgtca gctcgtgctg tgaggtgttg ggttaagtcc

1080

cgcaacgagc gcaaccctta ttgtctgtta ccagcatgta aagatgggaa ctcagatgag

1140

actgccggtg ataagccgga ggaaggtgag gatgacgtca aatcatcatg gcccttatgc

1200

cctgggctac acacgtgcta caatggcctg tacaaagcga agcgaaacag tgatgtgaag

1260

caaaacgcat taaagcaggt ctcagtccag attgaagtct gaaactcgac ttcatgaagt

1320

tggaatcgct agtaatcgta tatcagcatg atacggtgaa tacgttctcg ggccttgtac

1380

acaccgcccg tcacaccacc cgagttgagg atacccgaag ctattattct aacccgcaag

1440

ggaggaaggt atctaaggta tgtttagtga ggggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1500

ctggaaagtg tggctggatc acctcc

1526

<210> 396

<211> 1525

<212> DNA

<213> Borrelia recurrentis

<400> 396

agtttgatcc tggcttagaa ctaacgctgg cagtgcgtct taagcatgca agtcaaacgg

60

gatgtagcaa tacattcagt ggcgaacggg tgagtaacgc gtggataatc tacctatgag

120

atggggataa ctattagaaa tagtagctaa taccgaataa ggtcagttga gatgtcaatt

180

gatgaaagga agcctttaaa gctttgcttg tagatgagtc tgcgtcttat tagctagttg

240

gtagggtaag agcctaccaa ggctatgata agtaaccggc ctgagagggt gaacggtcac

300

actggaactg agatacggtc cagactccta cgggaggcag cagctaagaa tcttccgcaa

360

tgggcgaaag cctgacggag cgacactgcg tgaacgaaga aggtcgaaag attgtaaagt

420

tcttttataa atgaggaata agctttgtag gaaatgacaa ggtgatgacg ttaatttatg

480

aataagtccc ggctaattac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaagggg cgagcgttgt

540

tcgggattat tgggcgtaaa gggtgagtag gcggatatgc aagtctgtgc gtaaaatacc

600

acagctcaac tgtggagcta tgctagaaac tgcatgacta gagtctgata ggggaagtta

660

gaattcctgg tgtaagggtg gaatctgttg atatcaggaa gaataccaga ggcgaaggcg

720

aacttctagg tcaagactga cgctgagtca cgaaagcgta gggagcaaac aggattagat

780

accctggtag tctacgctgt aaacgatgca cacttggtgt taatcgagag gttagtaccg

840

aagctaacgt gttaagtgtg ccgcctgggg agtatgctcg caagagtgaa actcaaagga

900

attgacgggg gcccgtacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgat acgcgaggaa

960

ccttaccagg gcttgacata tacaggatgt agttagagat aactattccc cgtttggggt

1020

ctgtatacag gtgctgcatg gttgtcgtca gctcgtgctg tgaggtgttg ggttaagtcc

1080

cgcaacgagc gcaaccctta ttgtctgtta ccagcatgta aagatgggga ctcagacgag

1140

actgccggtg ataagccgga ggaaggtgag gatgacgtca aatcatcatg gcccttatgt

1200

cctgggctac acacgtgcta caatggcctg tacaaagcga tgcgaaacag tgatgtgaag

1260

caaaacgcat aaagcaggtc tcagtccaga ttgaagtctg aaactcgact tcatgaagtt

1320

ggaatcgcta gtaatcgtat atcagaatga tacggtgaat acgttctcgg gccttgtaca

1380

caccgcccgt cacaccaccc gagttgagga tacccgaagc tattatttta acccgcaagg

1440

gaggaaggta tctaaggtat gtttagtgag gggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtac

1500

tggaaagtgt ggctggatca cctcc

1525

<210> 397

<211> 1467

<212> DNA

<213> Borrelia sp. NE49

<400> 397

ctggcttaga actaacgctg gcagtgcgtc ttaagcatgc aagtcaaacg gaatgtagca

60

atacattcag tggcgaacgg gtgagtaacg cgtggatgat ctgcctatga gatggggata

120

actattagaa atagtagcta ataccgaata aggtcaatta atttgttaat tgatgaaagg

180

aagcctttaa agcttcgctt gtagatgagt ctgcgtctta ttagctagtt ggtagggtaa

240

atgcctacca aggcgatgat aagtaaccgg cctgagaggg tgaacggtca cactggaact

300

gagatacggt ccagactcct acgggaggca gcagctaaga atcttccgca atgggcgaaa

360

gcctgacgga gcgacactgc gtgaatgaag aaggtcgaaa gattgtaaaa ttcttttata

420

aatgaggaat aagctttgta ggaaatgaca aagtgatgac gttaatttat gaataagccc

480

cggctaatta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaaggg gcgagcgttg ttcgggatta

540

ttgggcgtaa agggtgagta ggcggatata taagtctatg cataaaatac cacagctcaa

600

ctgtggacct atgttggaaa ctatatgtct agagtctgat agaggaagtt agaatttctg

660

gtgtaagggt ggaatctgtt gatatcagaa agaataccgg aggcgaaggc gaacttctgg

720

gtcaagactg acgctgagtc acgaaagcgt agggagcaaa caggattaga taccctggta

780

gtctacgctg taaacgatgc acacttggtg ttaactaaaa gttagtaccg aagctaacgt

840

gttaagtgtg ccgcctgggg agtatgctcg caagagtgaa actcaaagga attgacgggg

900

gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgat acgcgaggaa ccttaccagg

960

gcttgacata tataggatat agttagagat aattattccc cgtttggggt ctatatacag

1020

gtgctgcatg gttgtcgtca gctcgtgctg tgaggtgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1080

gcaacccttg ttatctgtta ccagcatgta atggtgggga ctcagataag actgccggtg

1140

ataagtcgga ggaaggtgag gatgacgtca aatcatcatg gcccttatgt cctgggctac

1200

acacgtgcta caatggcctg tacaaagcga agcgaaacag tgatgtgaag caaaacgcat

1260

aaagcaggtc tcagtccgga ttgaagtctg aaactcgact tcatgaagtt ggaatcgcta

1320

gtaatcgtat atcagaatga tacggtgaat acgttctcgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

cacaccaccc gagttgagga tacccgaagc tattattcta acccgtaagg gaggaaggta

1440

tttaaggtat gtttagtgag gggggtg

1467

<210> 398

<211> 1531

<212> DNA

<213> Borrelia spielmanii

<400> 398

agagtttgat cctggcttag aactaacgct ggcagtgcgt cttaagcatg caagtcaaac

60

gggatgtagc aatacatcta gtggcgaacg ggtgagtaac gcgtggatga tctacctatg

120

agatggggat aactactaga aatagtagct aataccgaat aaggtcaatt aatttgttaa

180

ttgatgaaag gaagccttta aagcttcgct tgtagatgag tctgcgtctt attagttagt

240

tggtggggta aatgcctacc aaggcgatga taagtaaccg gcctgagagg gtgaacggtc

300

acactggaac tgagatacgg tccagactcc tacgggaggc agcagctaag aatcttccgc

360

aatgggcgaa agcctgacgg agcgacactg cgtgaatgaa gaaggtcgaa agattgtaaa

420

attcttttat aaatgaggaa taagctttgt aggaaatgac aaggtgatga cgttaattta

480

tgaataagcc ccggctaatt acgtgccagc agccgcggta atacgtaagg ggcgagcgtt

540

gttcgggatt attgggcgta aagggtgagt aggcggatat ataagtctat gcataaaata

600

ccacagctca actgtggaac tatgttggaa actatatgtc tagagtctga tagaggaagt

660

tagaattcct ggtgtaaggg tggaatctgt tgatatcagg aagaataccg gaggcgaagg

720

cgaacttctg ggtcaagact gacgctgagt cacgaaagcg tagggagcaa acaggattag

780

ataccctggt agtctacgct gtaaacgatg cacacttggt gttaactaaa agttagtacc

840

gaagctaacg tgttaagtgt gccgcctggg gagtatgctc gcaagagtga aactcaaagg

900

aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatga tacgcgagga

960

accttaccag ggcttgacat atataggata tagttagaga taattattcc ccgtttgggg

1020

cctatataca ggtgctgcat ggttgtcgtc agctcgtgct gtgaggtgtt gggttaagtc

1080

ccgcaacgag cgcaaccctt gttatctgtt accagcatgt aatgatgggg actcagataa

1140

gactgccggt gataagtcgg aggaaggtga ggatgacgtc aaatcatcat ggcccttatg

1200

tcctgggcta cacacgtgct acaatggcct gtacaaagcg aagcgaaaca gtgatgtgaa

1260

gcaaaacgca caaagcaggt ctcagtccgg attgaagtct gaaactcgac ttcatgaagt

1320

tggaatcgct agtaatcgta tatcagaatg atacggtgaa tacgttctcg ggccttgtac

1380

acaccgcccg tcacaccacc cgagttgagg atacccgaag ctattattct aacccgtaag

1440

ggaggaaggt atttaaggta tgtttagtga ggggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1500

ctggaaagtg cggctggatc acctcctttc t

1531

<210> 399

<211> 1532

<212> DNA

<213> Borrelia turicatae

<400> 399

agagtttgat cctggcttag aactaacgct ggcagtgcgt cttaagcatg caagtcagac

60

ggaatgtagc aatacattca gtggcgaacg ggtgagtaac gcgtggataa tctacctatg

120

agatggggat aactattaga aatagtagct aataccgaat aaggtcaatt gagatgttaa

180

ttgatgaaag gaagccttta aagcttcgct tgtagatgag tctgcgtctt attagctagt

240

tggtagggta agagcctacc aaggctatga taagtaaccg gcctgagagg gtgaacggtc

300

acactggaac tgagatacgg tccagactcc tacgggaggc agcagctaag aatcttccgc

360

aatgggcgaa agcctgacgg agcgacactg cgtgaacgaa gaaggtcgaa agattgtaaa

420

gttcttttat aaatgaggaa taagctttgt aggaaatgac aaggtgatga cgttaattta

480

tgaataagcc ccggctaatt acgtgccagc agccgcggta atacgtaagg ggcgagcgtt

540

gttcgggatt attgggcgta aagggtgagt aggcggatat gtaagtctat gcgtaaaata

600

ccacagctca actgtggaac tatgctggaa actgcatgac tagagtctga taggggaagt

660

tagaattcct ggtgtaaggg tggaatctgt tgatatcagg aagaatacca gaggcgaagg

720

cgaacttcta ggtcaagact gacgctgagt cacgaaagcg tagggagcga acaggattag

780

ataccctggt agtctacgct gtaaacgatg cacacttggt gttaatcgaa aggttagtac

840

cgaagctaac gtgttaagtg tgccgcctgg ggagtatgct cgcaagagtg aaactcaaag

900

gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg atacgcgagg

960

aaccttacca gggcttgaca tatacaggat gtagttagag ataactattc cccgtttggg

1020

gtctgtatac aggtgctgca tggttgtcgt cagctcgtgc tgtgaggtgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaaccct tattgtctgt taccagcatg taaagatggg gactcagacg

1140

agactgccgg tgataagccg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tggcccttat

1200

gtcctgggct acacacgtgc tacaatggcc tgtacaaagc gatgcgaaac agtgatgtga

1260

agcaaaacgc ataaagcagg tctcagtcca gattgaagtc tgaaactcga cttcatgaag

1320

ttggaatcgc tagtaatcgt atatcagaat gatacggtga atacgttctc gggccttgta

1380

cacaccgccc gtcacaccac ccgagttgag gatacccgaa gctattattc taacccgcaa

1440

gggaggaagg tatctaaggt atgtttagtg aggggggtga agtcgtaaca aggtagccgt

1500

actggaaagt gtggctggat cacctccttt ct

1532

<210> 400

<211> 1533

<212> DNA

<213> Borrelia valaisiana

<400> 400

gaagagtttg atcctggctt agaactaacg ctggcagtgc gtcttaagca tgcaagtcaa

60

acgggatgta gtaatacatc tagtggcgaa cgggtgagta acgcgtggat gatctaccta

120

tgagatgggg ataactacta gaaatagtag ctaataccga ataaggtcaa ttaatttgtt

180

aattgatgaa aggaagcctt taaagcttcg cttgtagatg agtctgcgtc ttattagtta

240

gttggtgggg taaatgccta ccaaggcgat gataagtaac cggcctgaga gggtgaacgg

300

tcacactgga actgagatac ggtccagact cctacgggag gcagcagcta agaatcttcc

360

gcaatgggcg aaagcctgac ggagcgacac tgcgtgaatg aagaaggtcg aaagattgta

420

aaattctttt ataaatgagg aataagcttt gtaggaaatg acaaagtgat gacgttaatt

480

tatgaataag ccccggctaa ttacgtgcca gcagccgcgg taatacgtaa ggggcgagcg

540

ttgttcggga ttattgggcg taaagggtga gtaggcggac atataagtct atgcataaaa

600

taccacagct caactgtgga actatgttgg aaactatatg cctagagtct gatagaggaa

660

gttagaattc ctggtgtaag ggtggaatct gttgatatca ggaagaatac cggaggcgaa

720

ggcgaacttc tgggtcaaga ctgacgctga gtcacgaaag cgtagggagc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtctacg ctgtaaacga tgcacacttg gtgttaactg aaagttagta

840

ccgaagctaa cgtgttaagt gtgccgcctg gggagtatgc tcgcaagagt gaaactcaaa

900

ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gatacgcgag

960

gaaccttacc agggcttgac atatatagga tatagttaga gataattatt ccccgtttgg

1020

ggtctatata caggtgctgc atggttgtcg tcagctcgtg ctgtgaggtg ttgggttaag

1080

tcccgcaacg agcgcaaccc ttgttatctg ttaccagcat gtaatgatgg ggactcagat

1140

aagactgccg gtgataagtc ggaggaaggt gaggatgacg tcaaatcatc atggccctta

1200

tgtcctgggc tacacacgtg ctacaatggc ctgtacaaag cgaagcgaaa cagtgatgtg

1260

aagcaaaacg cataaagcag gtctcagtcc ggattgaagt ctgaaactcg acttcatgaa

1320

gttggaatcg ctagtaatcg tatatcagaa tgatacggtg aatacgttct cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacca cccgagttga ggatacccga agctattatt ctaacccgta

1440

agggaggaag gtatttaagg tatgtttagt gaggggggtg aagtcgtaac aaggtagccg

1500

tactggaaag tgcggctgga tcacctcctt tct

1533

<210> 401

<211> 1512

<212> DNA

<213> Brachybacterium alimentarium

<220>

<221> modified_base

<222> (11)..(12)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 401

agagtttgat nntggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gatgacgacc gagcttgctc ggtctgatta gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagtaa

120

cctgcccccc acttcgggat aacttcgaga aatcgtggct aataccggat atgaacttcc

180

gccgcatggt ggttgttgga aagtttttcg gtgggggatg gactcgcggc ctatcagttt

240

gttggtgagg taatggctca ccaagacgat gacgggtagc cggcctgaga gggcgaccgg

300

ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc

360

acaatgggcg aaagcctgat gcagcgacgc cgcgtgaggg atgacggcct ttgggttgta

420

aacctctttc agtagggaag aagcgagagt gacggtacct gcagaagaag cgccggctaa

480

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggcgcaagcg ttgtccggaa ttattgggcg

540

taaagagctt gtaggtggct tgtcgcgtct gccgtgaaaa cccgaggctc aacctcgggc

600

gtgcggtggg tacgggcagg ctagagtgtg gtaggggaga ctggaactcc tggtgtagcg

660

gtgaaatgcg cagatatcag gaagaacacc gatggcgaag gcaggtctct gggccattac

720

tgacactgag aagcgaaagc atgggtagcg aacaggatta gataccctgg tagtccatgc

780

cgtaaacgtt gggcactagg tgtgggggac attccacgtt ttccgcgccg tagctaacgc

840

attaagtgcc ccgcctgggg agtacggccg caaggctaaa actcaaagga attgacgggg

900

gcccgcacaa gcggcggagc atgctgatta attcgatgca acgcgaagaa ccttaccaag

960

gcttgacatg gaccggacgg ctgcaaaaat gtggctttct tcggactggt tcacaggtgg

1020

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

1080

ccctcgttct atgttgccag cgcgttatgg cggggactca tgggagactg ccggggtcaa

1140

ctcggaggaa ggtggggacg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgtcttg ggcttcaagc

1200

atgctacaat ggtcggtaca atgggttgcg aaactgtgag gtggagcgaa tcctaaaaag

1260

ccggcctcag ttcggattgg ggtctgcaac tcgaccccat gaagtcggag tcgctagtaa

1320

tcgcagatca gcaacgctgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcaa

1380

gtcacgaaag tcggtaacac ccgaagccag tggcccatcc tcgtgaggga gctgtcgaag

1440

gtgggatcgg tgattgggac taagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag gtgcggctgg

1500

atcacctcct tt

1512

<210> 402

<211> 1458

<212> DNA

<213> Brachybacterium conglomeratum

<400> 402

tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca agtcgaacga tgacggtggt

60

gcttgcaccg cctgattagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgagtaacc tgccctccac

120

ttcgggataa cctcgggaaa tcgtggctaa taccggatat gagcactcat cgcatggtgg

180

gtgttggaaa gatttatcgg tgggggatgg actcgcggcc tatcagtttg ttggtgaggt

240

gatggctcac caagacgatg acgggtagcc ggcctgagag ggcgaccggc cacactggga

300

ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggcga

360

aagcctgatg cagcgacgcc gcgtggggga tgacggcctt cgggttgtaa acccctttca

420

gtagggaaga agcgagagtg acggtacctg cagaagaagc gccggctaac tacgtgccag

480

cagccgcggt aatacgtagg gcgcaagcgt tgtccggaat tattgggcgt aaagagcttg

540

taggtggctt gtcgcgtctg ccgtgaaaac ccgaggctca acctcgggcg tgcggtgggt

600

acgggcaggc tagagtgtgg taggggagac tggaactcct ggtgtagcgg tgaaatgcgc

660

agatatcagg aagaacaccg atggcgaagg caggtctctg ggccattact gacactgaga

720

agcgaaagca tgggtagcga acaggattag ataccctggt agtccatgcc gtaaacgttg

780

ggcactaggt gtgggggaca ttccacgttt tccgcgccgt agctaacgca ttaagtgccc

840

cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag

900

cggcggagca tgctgattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttaccaagg cttgacatgc

960

actggacggc tgcagagatg tggctttctt tggactggtg cacaggtggt gcatggttgt

1020

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac cctcgttcta

1080

tgttgccagc acgtaatggt ggggactcat aggagactgc cggggtcaac tcggaggaag

1140

gtggggacga cgtcaaatca tcatgcccct tatgtcttgg gcttcaagca tgctacaatg

1200

gtcggtacaa tgggttgcga aactgtgagg tggagcgaat cccaaaaagc cggcctcagt

1260

tcggattggg gtctgcaact cgaccccatg aagtcggagt cgctagtaat cgcagatcag

1320

caacgctgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaag tcacgaaagt

1380

cggtaacacc cgaagccagt ggcccatcct cgtgagggag ctgtctaagg tgggatcggt

1440

gattgggact aagtcgta

1458

<210> 403

<211> 1512

<212> DNA

<213> Brachybacterium tyrofermentans

<220>

<221> modified_base

<222> (11)..(12)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 403

agagtttgat nntggctcag gatgaacgct ggctgcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gatgacgacc gagcttgctc ggtctgatta gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagtaa

120

cctgcccctc acttcgggat aacctcgaga aattgtggct aataccggat atgaacttcc

180

gccgcatggt ggttgttgga aagtttttcg gtgagggatg gactcgcggc ctatcagttt

240

gttggtgagg taatggctca ccaagacgat gacgggtagc cggcctgaga gggcgaccgg

300

ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc

360

acaatgggcg aaagcctgat gcagcgacgc agcgtggggg atgactgcct tcgggttgta

420

aacctctttc agtagggaag aagcgaaagt gacggtacct gcagaagaag cgccggctaa

480

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggcgcaagcg ttatccgtaa ttattgggcg

540

taaagagctt gtaggtggct tgtcgcgtct gccgtgaaaa cccgaggctc aacctcgggc

600

gtgcggtggg tacgggcagg ctagagtgtg gtaggggaga ctggaactcc tggtgtagcg

660

gtgaaatgcg cagatatcag gaagaacacc gatggcgaag gcaggtctct gggccattac

720

tgacactgag aagcgaaagc atgggtagcg aacaggatta gataccctgg tagtccatgc

780

cgtaaacgtt gggcactaga tgtgggggac attccacgtt ttccgcgtcg tagctaacgc

840

attaagtgcc ccgcctgggg agtacggccg caaggctaaa actcaaagga attgacgggg

900

gcccgcacaa gcggcggagc atgctgatta attcgatgca acgcgaagaa ccttaccaag

960

gcttgacatg gaccggacgg ctgcagaaat gtggctttct tcggactggt tcacaggtgg

1020

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

1080

ccctcgttct atgttgccag cgcgttatgg cggggactca taggagactg ccggggtcaa

1140

ctcggaggaa ggtggggacg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgtcttg ggcttcaagc

1200

atgctacaat ggtcggtaca atgggttgcg aaactgtgag gtggagcgaa tcccaaaaag

1260

ccggcctcag ttcggattgg ggtctgcaac tcgaccccat gaagtcggag tcgctagtaa

1320

tcgcagatca gcaacgctgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcaa

1380

gtcacgaaag tcggtaacac ccgaagccag tggcccatcc tcgtgaggga gctgtctaag

1440

gtgggattgg tgattgggac taagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag gtgcggctgg

1500

atcacctcct tt

1512

<210> 404

<211> 1270

<212> DNA

<213> Brachyspira aalborgi

<400> 404

agcgaacgtt ggcgatgcgt cttaagcatg caagtcgagc gagcggcgaa ctggtgagta

60

acacgtaggt aatctgccgt agagtggggg ataacccatg gaaacatgga ctaataccgc

120

atatagaaag ccgctttacg atgagcctgc ggcctattag cctgttggtg agataaaagc

180

ccaccaaagc tacgataggt agccgacctg agagggtgac cggccacatt gggactgaga

240

tacggcccag actcctacgg gaggcagcag ctgagaatct tccacaatgg acgaaagtct

300

gatggagcga catcgcgtga gggatgaagg ccttcgggtt gtaaaccttg gaaattatcg

360

aagatgacag tagataatgt aagcctcggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

420

taggaggcaa acgttgctcg gatttactgg gcgtaaaggg tgagtaggcg gaactataag

480

tctaaggtga aatatcgaag ctcaacttcg gagacgcctc ggatactgtg gttcttggat

540

attgtagggg atgatggaat tctcggtgta gcggtggaat gtatagatat cgagaagaac

600

acctatagcg aaggcagtca tctgggcata tcgacgctga atcacgaaag ctgggggagc

660

aaacaggctt agataccctg gtagtcccag ccgtaaacgt tgcacactag gtgctcctag

720

gcgtgccgta gctaacgtct taagtgtgcc gcctgaggag tatgcccgca agggtgaaac

780

tcaaagaaat tgacgggtcc ccgcacaagt ggtggagcat gtggtttaat tcgatgatac

840

gcgaaaaacc ttacctgggt ttgaattgca taggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg

900

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttaccctttg ttgctaccga

960

tcgggcactc ttaggggacc gcctacgtta agtaggagga aggtggggat gatgtcaagt

1020

cctcatggcc cttatgtcca gggctacaca cgtgctacaa tggcaaccaa agagaagcga

1080

gaccgcgagg tggagcaaat ctcaagttgc ctcagttcgg atggagtctg aaactcgact

1140

ccagaagttg gaatcactag taatcgtaga tcagaacgct acggtgaata cgttcccggg

1200

gattgtacac accgcccgtc acgccatcgg agttggtttt acctgaagtc gttgcctagg

1260

gcggcgccga

1270

<210> 405

<211> 1506

<212> DNA

<213> Brachyspira pilosicoli

<400> 405

agagtttgat tctggctcag agcgaacgtt ggcgatgcgt cttaagcatg caagtcgagc

60

gggcttattc gggcaactgg ataagttagc ggcgaactgg tgagtaacac gtaggtaatc

120

tgccgtgaag cgggggataa cccatggaaa catggactaa taccgcatat actcttgcta

180

cataagtaga gtagaggaaa gttttttcgc ttcacgatga gcctgcggcc tattagcctg

240

ttggtagggt aatggcctac caaagctacg ataggtagcc gacctgagag ggtgaccggc

300

cacattggga ctgagatacg gcccagactc ctacgggagg cagcagctga gaatcttcca

360

caatggacga aagtctgatg gagcgacatc gcgtgaggga tgaaggcctt cgggttgtaa

420

acctcggaaa ttatcgaaga atgagtgaca gtagataatg taagcctcgg ctaactacgt

480

gccagcagcc gcggtaatac gtaggaggca aacgttgctc ggatttactg ggcgtaaagg

540

gtgagtaggc ggatttataa gtctaaggtg aaagaccgaa gctcaacttc gggaacgcct

600

cggatactgt aagtcttgga tattgtaggg gatgatggaa ttctcggtgt agcggtggaa

660

tgcgcagata tcgagaggaa cacctatagc gaaggcagtc atctgggcat ttatcgacgc

720

tgaatcacga aagctagggg agcaaacagg cttagatacc ctggtagtcc tagccgtaaa

780

cgttgtacac taggtgcttc tatttaaata ggagtgccgt agctaacgtc ttaagtgtac

840

cgcctgagga gtatgcccgc aagggtgaaa ctcaaagaaa ttgacgggtc cccgcacaag

900

tggtggagca tgtggtttaa ttcgatgata cgcgaaaaac cttacctggg tttgaattgt

960

tagatgaatg atttagagat aagtcagacc gcaaggacgt ttaacatagg tgctgcatgg

1020

ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caaccctcac

1080

cctctgttgc taccgagtaa tgtcgagcac tcttagggga ctgcctacgt tcaagtagga

1140

ggaaggtggg gatgatgtca agtcctcatg gcccttatgt ccagggctac acacgtgcta

1200

caatggcaag tacaaagaga agcaagaccg cgaggtggag caaaactcaa aaaagttgcc

1260

tcagttcgga ttggagtctg aaactcgact ccatgaagtt ggaatcacta gtaatcgtag

1320

atcagaacgc tacggtgaat acgttcccgg ggattgtaca caccgcccgt cacgccatcg

1380

gagttggttt tacctgaagc cgttagccta accgcaagga gggcggcgtc gaaggtggga

1440

ctgatgatga gggtgaagtc gtaacaaggc agccgtaccg gaaggtgtgg ctggatcacc

1500

tccttt

1506

<210> 406

<211> 1272

<212> DNA

<213> Brachyspira sp. HIS3

<400> 406

agcgaacgtt ggcgatgcgt cttaagcatg caagtcgagc gagcggcgaa ctggtgagta

60

acacgtaggt aatctgccgt gaagtggggg ataacccatg gaaacatgga ctaataccgc

120

atatagaaag tcgcttcacg atgagcctgc ggcctattag cctgttggta gggtaatggc

180

ctaccaaagc tacgataggt agccgacctg agagggtgac cggccacatt gggactgaga

240

tacggcccag actcmtacgg gaggcagcag ctgagaatct tccacaatgg acgaaagtct

300

gatggagcga catcgcgtga gggatgaagg ccttcgggtt gtaaacctcg gaaattatcg

360

aagatgacag tagataatgt aagcctcggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

420

taggaggcaa acgttgctcg gatttactgg gcgtaaaggg tgagtaggcg gatttataag

480

tctaaggtga aagaccgaag ctcaacttcg ggaacgcctc ggatactgta gatcttggat

540

attgtagggg atgatggaat tctcggtgta gcggtggaat gcgcagatat cgagaggaac

600

acctatagcg aaggcagtca tctgggcata tcgacgctga atcacgaaag ctaggggagc

660

aaacaggctt agataccctg gtagtcctag ccgtaaacgt tgtacactag gtgcttctat

720

aggagtgccg tagctaacgt cttaagtgta ccgcctgagg agtatgcccg caagggtgaa

780

actcaaagaa attgacgggt ccccgcacaa gtggtggagc atgtggttta attcgatgat

840

acgcgaaaaa ccttacctgg gtttgaattg cataggtgct gcatgcctgt cgtcagctcg

900

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac cctcaccctc tgttgctacc

960

gatcgagtac tcttagggga ctgcctacgt caagtaggag gaaggtgggg atgatgtcaa

1020

gtcctcatgg cccttatgtc cagggctaca cacgtgctac aatggcaagc aaagagaagc

1080

aagaccgcga ggtggagcaa aactcaagtt gcctcagttc ggatggagtc tgaaactcga

1140

ctccagaagt tggaatcact agtaatcgta gatcagaacg ctacggtgaa tacgttcccg

1200

gggattgtac acaccgcccg tcacgccatc ggagttggtt ttacctgaag ccgttgccta

1260

gggcggcgtc ga

1272

<210> 407

<211> 1325

<212> DNA

<213> Brachyspira sp. HIS4

<400> 407

agcgaacgtt ggcgatgcgt cttaagcatg caagtcgagc gagcggcgaa ctggtgagta

60

acacgtaggt aatctgccgt gaagtggggg ataacccatg gaaacatgga ctaataccgt

120

atatagaaag tcgcttcacg atgagcctgc ggcctattag cctgttggta gggtaatggc

180

ctaccaaagc tacgataggt agccgacctg agagggtgac cggccacatt gggactgaga

240

tacggcccag actcctacgg gaggcagcag ctgagaatct tccacaatgg acgaaagtct

300

gatggagcga catcgcgtga gggatgaagg ccttcgggtt gtaaacctcg gaaattatcg

360

aagatgacag tagataatgt aagcctcggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

420

taggaggcaa acgttgctcg gatttactgg gcgtaaaggg tgagtaggcg gatttataag

480

tctaaggtga aagaccgaag ctcaacttcg ggaacgcctc ggatactgta gatcttggat

540

attgcagggg atgatggaat tctcggtgta gcggtggaat gcgcagatat cgagaggaac

600

acctatagcg aaggcagtca tctgggcata tcgacgctga atcacgaaag ctaggggagc

660

aaacaggctt agataccctg gtagtcctag ccgtaaacgt tgtacactag gtgcttctat

720

aggagtgccg tagctaacgt cttaagtgta ccgcctgagg agtatgcccg caagggtgaa

780

actcaaagaa attgacgggt ccccgcacaa gtggtggagc atgtggttta attcgatgat

840

acgcgaaaaa ccttacctgg gtttgaattg cataggtgct gcatgcctgt cgtcagctcg

900

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac cctcaccctc tgttgctacc

960

gatcgagtac tcttagggga ctgcctacgt caagtaggag gaaggtgggg atgatgtcaa

1020

gtcctcatgg cccttatgtc cagggctaca cacgtgctac aatggcaagc aaagagaagc

1080

aagaccgcga ggtggagcaa aactcaagtt gcctcagttc ggatggagtc tgaaactcga

1140

ctccagaagt tggaatcact agtaatcgta gatcagaacg ctacggtgaa tacgttcccg

1200

gggattgtac acaccgcccg tcacgccatc ggagttggtt ttacctgaag ccgttgccta

1260

gggcggcgtc gaaggtggga ctgatgatga gggtgaagtc gtaacaaggc agccgtaccg

1320

gaagg

1325

<210> 408

<211> 1278

<212> DNA

<213> Brachyspira sp. HIS5

<400> 408

gaacgttggc gatgcgtctt aagcatgcaa gtcgagcgag cggcgaactg gtgagtaaca

60

cgtaggtaat ctgccgtgaa gtgggggata acccatggaa acatggacta ataccgcata

120

tagaaagtcg cttcacgatg agcctgcggc ctattagcct gttggtaggg taatggccta

180

ccaaagctac gataggtagc cgacctgaga gggtgaccgg ccacattggg actgagatac

240

ggcccagact cctacgggag gcagcagctg agaatcttcc acaatggacg aaagtctgat

300

ggagcgacat cgcgtgaggg atgaaggcct tcgggttgta aacctcggaa attatcgaag

360

atgacagtag ataatgtaag cctcggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

420

gaggcaaacg ttgctcggat ttactgggcg taaagggtga gtaggcggat ttataagtct

480

aaggtgaaag accgaagctc aacttcggga acgcctcgga tactgtagat cttggatatt

540

gtaggggatg atggaattct cggtgtagcg gtggaatgcg cagatatcga gaggaacacc

600

tatagcgaag gcagtcatct gggcatatcg acgctgaatc acgaaagcta ggggagcaaa

660

caggcttaga taccctggta gtcctagccg taaacgttgt acactaggtg cttctatagg

720

agtgccgtag ctaacgtctt aagtgtaccg cctgaggagt atgcccgcaa gggtgaaact

780

caaagaaatt gacgggtccc cgcacaagtg gtggagcatg tggtttaatt cgatgatacg

840

cgaaaaacct tacctgggtt tgaattgcat aggtgctgca tgcctgtcgt cagctcgtgt

900

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct caccctctgt tgctaccgat

960

cgagtactct taggggactg cctacgtcaa gtaggaggaa ggtggggatg atgtcaagtc

1020

ctcatggccc ttatgtccag ggctacacac gtgctacaat ggcaagcaaa gagaagcaag

1080

accgcgaggt ggagcaaaac tcaagttgcc tcagttcgga tggagtctga aactcgactc

1140

cagaagttgg aatcactagt aatcgtagat cagaacgcta cggtgaatac gttcccgggg

1200

attgtacaca ccgcccgtca cgccatcgga gttggtttta cctgaagccg ttgcctaggg

1260

cggcgtcgaa ggtgggac

1278

<210> 409

<211> 1029

<212> DNA

<213> Brevibacillus agri

<220>

<221> modified_base

<222> (9)..(9)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (11)..(11)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (22)..(22)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (58)..(60)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (70)..(70)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 409

aaagttctnt ntcagagacg ancaagtacc gttcgaacag ggcggtacct tgacggtnnn

60

gacgagaaan ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtggcaagcg

120

ttgtccggaa ttattgggcg taaagcgcgc gcaggcggct atgtaagtct ggtgttaaag

180

cccggggctc aaccccggtt cgcatcggaa actgtgtagc ttgagtgcag aagaggaaag

240

cggtattcca cgtgtagcgg tgaaatgcgt agagatgtgg aggaacacca gtggcgaagg

300

cggctttctg gtctgtaact gacgctgagg cgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag

360

ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaggt gttgggggtt tcaataccct

420

cagtgccgca gctaacgcaa taagcactcc gcctggggag tacgctcgca agagtgaaac

480

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac

540

gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatccc gctgaccgtc ctagagatag ggcttccctt

600

cggggcagcg gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt

660

taagtcccgc aacgagcgca acccttatct ttagttgcca gcattcagtt gggcactcta

720

gagagactgc cgtcgacaag acggaggaag gcggggatga cgtcaaatca tcatgcccct

780

tatgacctgg gctacacacg tgctacaatg gctggtacaa cgggaagcta gctcgcgaga

840

gtatgccaat ctcttaaaac cagtctcagt tcggattgca ggctgcaact cgcctgcatg

900

aagtcggaat cgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt

960

gtacacaccg cccgtcacac cacgggagtt tgcaacaccc gaagtcggtg aggtaaccgc

1020

aaggagcca

1029

<210> 410

<211> 1461

<212> DNA

<213> Brevibacillus brevis

<220>

<221> modified_base

<222> (44)..(45)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (54)..(55)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 410

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc gagnntcttc ggannctagc

60

ggcggacggg tgagtaacac gtaggcaacc tgcctctcag actgggataa catagggaaa

120

cttatgctaa taccggatag gtttttggat cgcatgatcc gaaaagaaaa ggcggcttcg

180

gctgtcactg ggagatgggc ctgcggcgca ttagctagtt ggtggggtaa cggcctacca

240

aggcgacgat gcgtagccga cctgagaggg tgaccggcca cactgggact gagacacggc

300

ccagactcct acgggaggca gcagtaggga attttccaca atggacgaaa gtctgatgga

360

gcaacgccgc gtgaacgatg aaggtcttcg gattgtaaag ttctgttgtt agggacgaat

420

aagtaccgtt cgaatagggc ggtaccttga cggtacctga cgagaaagcc acggctaact

480

acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgtt gtccggattt attgggcgta

540

aagcgcgcgc aggcggctat gtaagtctgg tgttaaagcc cggggctcaa ccccggttcg

600

catcggaaac tgtgtagctt gagtgcagaa gaggaaagcg gtattccacg tgtagcggtg

660

aaatgcgtag agatgtggag gaacaccagt ggcgaaggcg gctttctggt ctgtaactga

720

cgctgaggcg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt

780

aaacgatgag tgctaggtgt tgggggtttc aataccctca gtgccgcagc taacgcaata

840

agcactccgc ctggggagta cgctcgcaag agtgaaactc aaaggaattg acgggggccc

900

gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt

960

gacatcccgc tgaccgctct ggagacagag cttcccttcg gggcagcggt gacaggtggt

1020

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1080

ccttatcttt agttgccagc attcagttgg gcactctaga gagactgccg tcgacaagac

1140

ggaggaaggc ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg

1200

ctacaatggt tggtacaacg ggatgctacc tcgcgagagg acgccaatct cttaaaacca

1260

atctcagttc ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg

1320

cggatcagca tgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca

1380

cgggagtttg caacacccga agtcggtgag gtaaccgcaa ggagccagcc gccgaaggtg

1440

gggtagatga ctggggtgaa g

1461

<210> 411

<211> 1419

<212> DNA

<213> Brevibacillus centrosporus

<220>

<221> modified_base

<222> (23)..(23)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (27)..(27)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (156)..(156)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (162)..(162)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (180)..(181)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (198)..(198)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (200)..(200)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (212)..(212)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (321)..(321)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (411)..(411)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (450)..(450)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (478)..(478)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (644)..(644)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (717)..(717)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (870)..(870)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1403)..(1403)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 411

gagagtttga tcctggctca ggncgancgc tggcggcgtg cctaatacat gcaagtcgag

60

cgagtctctt cggaggctag cggcggacgg gtgagtaaca cgtaggcaac ctgcctctca

120

gactgggata acatagggaa acttatgcta ataccngata gngtcttgtc tcgcatgagn

180

naagacggaa aggtagcncn ggctatcact tncggatggg cctgcggcgc attagctagt

240

tggtggggta atggcctacc aaggcgacga tgcgtagccg acctgagagg gtgaccggcc

300

acactgggac tgagacacgg nccagactcc tacgggaggc agcagtaggg aattttccac

360

aatggacgaa agtctgatgg agcaacgccg cgtgaacgat gaaggtcttc ngattgtaaa

420

gttctgttgt tagggacgaa caagtaccgn tcgaataggg cggtaccttg acggtacntg

480

acgagaaagc cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt

540

tgtccggatt tattgggcgt aaagcgcgcg caggcggcta tgtaagtctg gtgttaaagc

600

ccggagctca actccggttc gcatcggaaa ctgtgtagct tgantgcaga agaggaaagc

660

ggtattccac gtgtagcggt gaaatgcgta gagatgtgga ggaacaacag tggcganggc

720

ggctttctgg tctgtaactg acgctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga

780

taccctggta gtccacgccg caaacgatga gtgctaggtg ttgggggttt caataccctc

840

agtgccgcag ctaacgcaat aagcactccn cctggggagt acgctcgcaa gagtgaaact

900

caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg

960

cgaagaacct taccaggtct tgacatcccg ctgaccgctc tggagacaga gcttcccttc

1020

ggggcagcgg tgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt

1080

aagtcccgca acgagcgcaa cccttatttc tagttgccag cattcagttg ggcactctag

1140

agagactgcc gtcgacaaga cggaggaagg cggggatgac gtcaaatcat catgcccctt

1200

atgacctggg ctacacacgt gctacaatgg ttggtacaac gggatgctac ctcgcgagag

1260

gacgccaatc tcttaaaacc aatctcagtt cggattgtag gctgcaactc gcctacatga

1320

agtcggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc ccgggccttg

1380

tacacaccgc ccgtcacacc acnggagttt gcaacaccc

1419

<210> 412

<211> 1486

<212> DNA

<213> Brevibacillus choshinensis

<220>

<221> modified_base

<222> (44)..(44)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (51)..(51)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 412

cgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca agtcgagcga gtcncttcgg nggctagcgg

60

cggacgggtg agtaacacgt aggcaacctg cctctcagac tgggataaca tagggaaact

120

tatgctaata ccggataggt ttttggatcg catgatccga aaagaaaagg cggcttcggc

180

tgtcactggg agatgggcct gcggcgcatt agctagttgg tggggtaacg gcctaccaag

240

gcgacgatgc gtagccgacc tgagagggtg accggccaca ctgggactga gacacggccc

300

agactcctac gggaggcagc agtagggaat tttccacaat ggacgaaagt ctgatggagc

360

aacgccgcgt gaacgatgaa ggtcttcgga ttgtaaagtt ctgttgttag ggacgaacaa

420

gtaccgttcg aatagggcgg taccttgacg gtacctgacg agaaagccac ggctaactac

480

gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg caagcgttgt ccggatttat tgggcgtaaa

540

gcgcgcgcag gcggctatgt aagtctggtg ttaaagcccg gagctcaact ccggttcgca

600

tcggaaactg tgtagcttga gtgcagaaga ggaaagcggt attccacgtg tagcggtgaa

660

atgcgtagag atgtggagga acaccagtgg cgaaggcggc tttctggtct gtaactgacg

720

ctgaggcgcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa

780

acgatgagtg ctaggtgttg ggggtttcaa taccctcagt gccgcagcta acgcaataag

840

cactccgcct ggggagtacg ctcgcaagag tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc

900

acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga

960

catcccgctg accgctctgg agacagagct tcccttcggg gcagcggtga caggtggtgc

1020

atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1080

ttatttctag ttgccagcat tcagttgggc actctagaga gactgccgtc gacaagacgg

1140

aggaaggcgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg acctgggcta cacacgtgct

1200

acaatggttg gtacaacggg atgctacctc gcgaggggac gccaatctct taaaaccaat

1260

ctcagttcgg attgtaggct gcaactcgcc tacatgaagt cggaatcgct agtaatcgcg

1320

gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg

1380

ggagtttgca acacccgaag tcggtgaggt aaccgcaagg agccagccgc cgaaggtggg

1440

gtagatgact ggggtgaagt cgtaacaagg tatccgtacc ggaagg

1486

<210> 413

<211> 1391

<212> DNA

<213> Brevibacillus invocatus

<400> 413

tcgagcgagt cccttcgggg gctagcggcg gacgggtgag taacacgtag gcaacctgcc

60

cgtaagctcg ggataacatg gggaaactca tgctaatacc ggatagggtc ttctctcgca

120

tgagaggaga cggaaaggtg gcgcaagcta ccacttacgg atgggcctgc ggcgcattag

180

ctagttggtg gggtaacggc ctaccaaggc gacgatgcgt agccgacctg agagggtgac

240

cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaattt

300

tccacaatgg acgaaagtct gatggagcaa cgccgcgtga acgatgaagg tcttcggatt

360

gtaaagttct gttgtcagag acaacaagta ccgttcgaac agggcggtac cttgcggtac

420

ctgacgagaa agccacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag

480

cgttgtccgg aattattggg cgtaaagcgc gcgcaggcgg ctatgtaagt ctggtgttaa

540

agcccggggc tcaaccccgg ttcgcatcgg aaactgtgta gcttgagtgc agaagaggaa

600

agcggtattc cacgtgtagc ggtgaaatgc gtagagatgt ggaggaacac cagtggcgaa

660

ggcggctttc tggtctgtaa ctgacgctga ggcgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt

720

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag gtgttggggg tttcaatacc

780

ctcagtgccg cagctaacgc aataagcact ccgcctgggg agtacgctcg caagagtgaa

840

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca

900

acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ccgctgaccg tcctacatat agggcttccc

960

ttcggggcag cggtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg

1020

gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat ctttagttgc cagcattcag ttgggcactc

1080

tagagagact gccgtcgaca agacggagga aggcggggat gacgtcaaat catcatgccc

1140

cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggctggtac aacgggaagc tagctcgcga

1200

gagtatgcca atctcttaaa accagtctca gttcggattg caggctgcaa ctcgcctgca

1260

tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1320

ttgtacacac cgcccgtcac accacgggag tttgcaacac ccgaagtcgg tgaggtaacc

1380

gcaaggagcc a

1391

<210> 414

<211> 1470

<212> DNA

<213> Brevibacillus laterosporus

<220>

<221> modified_base

<222> (231)..(231)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 414

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc gagggtcttc ggaccctagc

60

ggcggacggg tgagtaacac gtaggcaacc tgcctgtaag actgggataa catagggaaa

120

cttatgctaa taccggatag ggttttgctt cgcctgaagc gaaacggaaa gatggcgcaa

180

gctatcactt acagatgggc ctgcggcgca ttagctagtt ggtgaggtaa nggctcacca

240

aggcgacgat gcgtagccga cctgagaggg tgaccggcca cactgggact gagacacggc

300

ccagactcct acgggaggca gcagtaggga attttccaca atggacgaaa gtctgatgga

360

gcaacgccgc gtgaacgatg aaggctttcg ggtcgtaaag ttctgttgtt agggaagaaa

420

cagtgctatt taaataaggt agcaccttga cggtacctaa ccagaaagcc acggctaact

480

acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgtt gtccggaatt attgggcgta

540

aagcgcgcgc aggtggctat gtaagtctga tgttaaagcc cgaggctcaa cctcggttcg

600

cattggaaac tgtgtagctt gagtgcagga gaggaaagtg gtattccacg tgtagcggtg

660

aaatgcgtag agatgtggag gaacaccagt ggcgaaggcg actttctggc ctgtaactga

720

cactgaggcg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt

780

aaacgatgag tgctaggtgt taggggtttc aataccctta gtgccgcagc taacgcaata

840

agcactccgc ctggggagta cgctcgcaag agtgaaactc aaaggaattg acgggggccc

900

gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt

960

gacatcccac tgaccgctct agagatagag cttcccttcg gggcagtggt gacaggtggt

1020

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1080

ccttatcttt agttgccagc attcagttgg gcactctaga gagactgccg tcgacaagac

1140

ggaggaaggc ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg

1200

ctacaatggt tggtacaacg ggatgctact tcgcgagaag atgctaatct cttaaaacca

1260

atctcagttc ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg

1320

cggatcagca tgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca

1380

cgggagtttg caacacccga agtcggtgag gtaaccgtaa ggagccagcc gccgaaggtg

1440

gggtagataa ctggggtgaa gtcgtaacaa

1470

<210> 415

<211> 1486

<212> DNA

<213> Brevibacillus parabrevis

<400> 415

cgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca agtcgagcga gggttttcgg accctagcgg

60

cggacgggtg agtaacacgt aggcaacctg cctctcagac cgggataaca tagggaaact

120

tatgctaata ccggataggt ttttggattg catgatccga aaagaaaaga tggcttcggc

180

tatcactggg agatgggcct gcggcgcatt agctagttgg tggggtaacg gcctaccaag

240

gcgacgatgc gtagccgacc tgagagggtg accggccaca ctgggactga gacacggccc

300

agactcctac gggaggcagc agtagggaat tttccacaat ggacgaaagt ctgatggagc

360

aacgccgcgt gaacgatgaa ggtcttcgga ttgtaaagtt ctgttgtcag ggacgaacac

420

gtgccgttcg aatagggcgg taccttgacg gtacctgacg agaaagccac ggctaactac

480

gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg caagcgttgt ccggatttat tgggcgtaaa

540

gcgcgcgcag gcggctatgt aagtctggtg ttaaagcccg gagctcaact ccggttcgca

600

tcggaaactg tgtagcttga gtgcagaaga ggaaagcggt attccacgtg tagcggtgaa

660

atgcgtagag atgtggagga acaccagtgg cgaaggcggc tttctggtct gtaactgacg

720

ctgaggcgcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa

780

acgatgagtg ctaggtgttg ggggtttcaa taccctcagt gccgcagcta acgcaataag

840

cactccgcct ggggagtacg ctcgcaagag tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc

900

acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga

960

catcccgctg accgctctgg agacagagct tcccttcggg gcagcggtga caggtggtgc

1020

atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1080

ttatctttag ttgccagcat tcagttgggc actctagaga gactgccgtc gacaagacgg

1140

aggaaggcgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg acctgggcta cacacgtgct

1200

acaatggttg gtacaacggg atgctacctc gcgagaggac gccaatctct gaaaaccaat

1260

ctcagttcgg attgtaggct gcaactcgcc tacatgaagt cggaatcgct agtaatcgcg

1320

gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg

1380

ggagtttgca acacccgaag tcggtgaggt aaccgcaagg agccagccgc cgaaggtggg

1440

gtagatgact ggggtgaagt cgtaacaagg tatccgtacc ggaagg

1486

<210> 416

<211> 1486

<212> DNA

<213> Brevibacillus reuszeri

<220>

<221> modified_base

<222> (994)..(994)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 416

cgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca agtcgagcga gtctcttcgg aggctagcgg

60

cggacgggtg agtaacacgt aggcaacctg cctctcagac tgggataaca tagggaaact

120

tatgctaata ccggataggt ttttggaccg catggtccga aaagaaaaga tggcttcggc

180

tatcactggg agatgggcct gcggcgcatt agctagttgg tggggtaacg gcctaccaag

240

gcgacgatgc gtagccgacc tgagagggtg accggccaca ctgggactga gacacggccc

300

agactcctac gggaggcagc agtagggaat tttccacaat ggacgaaagt ctgatggagc

360

aacgccgcgt gaacgatgaa ggtcttcgga ttgtaaagtt ctgttgttag ggacgaataa

420

gtaccgttcg aatagggcgg taccttgacg gtacctgacg agaaagccac ggctaactac

480

gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg caagcgttgt ccggatttat tgggcgtaaa

540

gcgcgcgcag gcggctatgt aagtctggtg ttaaagcccg gagctcaact ccggttcgca

600

tcggaaactg tgtagcttga gtgcagaaga ggaaagcggt attccacgtg tagcggtgaa

660

atgcgtagag atgtggagga acaccagtgg cgaaggcggc tttctggtct gtaactgacg

720

ctgaggcgcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa

780

acgatgagtg ctaggtgttg ggggtttcaa taccctcagt gccgcagcta acgcaataag

840

cactccgcct ggggagtacg ctcgcaagag tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc

900

acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga

960

catcccgctg accgctctgg agacagagct tccnttcggg gcagcggtga caggtggtgc

1020

atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1080

ttatctttag ttgccagcat tcagttgggc actctagaga gactgccgtc gacaagacgg

1140

aggaaggcgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg acctgggcta cacacgtgct

1200

acaatggttg gtacaacggg acgctagccc gcgagggtat gccaatctct taaaaccaat

1260

ctcagttcgg attgtaggct gcaactcgcc tacatgaagt cggaatcgct agtaatcgcg

1320

gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg

1380

ggagtttgca acacccgaag tcggtgaggt aaccgcaagg agccagccgc cgaaggtggg

1440

gtagatgact ggggtgaagt cgtaacaagg tatccgtacc ggaagg

1486

<210> 417

<211> 1477

<212> DNA

<213> Brevibacillus sp. phR

<400> 417

gatcctggct caggacgaac gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg agcgaaggac

60

ttcggtcctt agcggcggac gggtgagtaa cacgtaggca acctgcccgt cagacyggga

120

taacataggg aaacttatgc taataccaga taggtttcts gactgcatgg taggaraagg

180

aaagayggcg caagctgtca cttggggatg ggcctgcggc gcattagctg gttggcgggg

240

taacggccca ccaaggcgac gatgcgtagc cgacctgaga gggtgaccgg ccacactggg

300

actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtag ggaattttcc acaatggacg

360

aaagtctgat ggagcaacgc cgcgtgaacg atgaaggcct tcgggttgta aagttctgtt

420

gtcagggacg aacaagtacc tgttcgaaca gggcggtacc ttgacggtac ctgacgagaa

480

agccacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag cgttgtccgg

540

aattattggg cgtaaagcgc gcgcaggcgg ctatgtaagt ctgatgttaa agcccggggc

600

tcaactccgg ttcgcattgg aaactgcgta gcttgagtgc agaagaggaa agcggtattc

660

cacgtgtagc ggtgaaatgc gtagagatgt ggaggaacac cagtggcgaa ggcggctttc

720

tggtctgtaa ctgacgctga ggcgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg

780

gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag gtgttggggg tttcgatacc ctcagtgccg

840

cagctaacgc aataagcact ccgcctgggg agtacgctcg caagagtgaa actcaaagga

900

attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa

960

ccttaccagg tcttgacatc ccgctgaccg tcctggagac agggcttccc ttcggggcag

1020

cggtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1080

gcaacgagcg caacccttat ctttagttgc cagcattcgg ttgggcactc tagagagact

1140

gccgtcgaca agacggagga aggcggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct

1200

gggctacaca cgtgctacaa tggctggtac aacgggacgc gagcccgcga gggttagcca

1260

atctctgaaa accagtctca gttcggattg caggctgcaa ctcgcctgca tgaagtcgga

1320

atcgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1380

cgcccgtcac accacgagag tttgcaacac ccgaagtcgg tgaggtaacc gcaaggagcc

1440

agccgccgaa ggtggggtag atgattgggg tgaagtc

1477

<210> 418

<211> 1385

<212> DNA

<213> Brevibacillus thermoruber

<220>

<221> modified_base

<222> (1374)..(1374)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 418

tttgaagctt gcttcagaca ggttagcggc ggacgggtga gtaacacgta ggcaacctgc

60

ccgcaagacc gggataacgt agggaaactt acgctaatac cggatagggc accttctcgc

120

atgagagggt gcggaaaggt ggcgcaagct accacttgcg gatgggcctg cggcgcatta

180

gctagttggt ggggtaacgg cctaccaagg cgacgatgcg tagccgacct gagagggtga

240

ccggccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtagggaatt

300

ttccacaatg ggcgaaagcc tgatggagca acgccgcgtg aacgatgaag gtcttcggat

360

tgtaaagttc tgttgtcagg gacgaacaag taccgttcga acagggcggt accttgacgg

420

tacctgacga gaaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc

480

aagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag cgcgcgcagg cggtcgggta agtctgatgt

540

caaagcccgg ggctcaaccc cggtacgcat tggaaactgc tcgacttgag tgcagaagag

600

gaaagcggaa ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa caccagtggc

660

gaaggcggct ttctggtctg taactgcgct gaggcgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

720

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgta ggtgttgggg gtttcaatcc

780

tcagtgccgc agtaacgcaa taagcactcc gcctggggag tacgctcgca agagtgaaac

840

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac

900

gcgaagaacc ttaccggtct tgacatcccg ctgaccgcct agagataggg cttcccttcg

960

gggcagcggt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1020

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcttt agttgccagc attcagttgg gcactctaga

1080

gagactgccg tcgacaagac ggaggaaggc ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta

1140

tgacctgggc tacacacgtg ttacaatggt tggtacaacg ggacgcaagc ccgcgagggt

1200

aagccaatct cttaaaacca gtctcagttc ggattgcagg ctgcaactcg cctgcatgaa

1260

gtcggaatcg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1320

acacaccgcc cgtcacacca cgagagtttg caacacccga agtcggtgag gtanccgcaa

1380

ggagc

1385

<210> 419

<211> 1474

<212> DNA

<213> Brevibacterium aurantiacum

<220>

<221> modified_base

<222> (10)..(10)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (35)..(35)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (418)..(419)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (421)..(421)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 419

ctgcgtgctn aacacatgca agtcgaacgc tgaanccctg gtgcttgcac ggggtggatg

60

agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgagta acctgccccc gacttcggga taagcccggg

120

aaactgggtc taataccgga tatgaccatc actcgcatga gtgatggtgg aaagtttttt

180

cggttgggga tgggctcgcg gcctatcagt ttgttggtga ggtaatggct caccaagacg

240

acgacgggta gccggcctga gagggcgacc ggccacactg ggactgagac acggcccaga

300

ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcgac

360

gcagcgtgcg ggatgacggc cttcgggttg taaaccgctt tcagcaggga agaagccnnt

420

nggggtgacg gtacctgcag aagaagtacc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtagggta caagcgttgt ccggaattat tgggcgtaaa gagctcgtag gtggttggtc

540

acgtctgctg tggaaacgca acgcttaacg ttgcgcgtgc agtgggtacg ggctgactag

600

agtgcagtag gggagtctgg aattcctggt gtagcggtga aatgcgcaga tatcaggagg

660

aacaccggtg gcgaaggcgg gactctgggc tgtaactgac actgaggagc gaaagcatgg

720

ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacgttgggc actaggtgtg

780

ggggacattc cacgttctcc gcgccgtacg taacgcatta agtgccccgc ctggggagta

840

cggtcgcaag gctaaaactc aaaggaattg acgggggccg cacaagcggc ggagcatgcg

900

gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta ccaaggcttg acatacacca gaccgttctg

960

gaaacagttc ctccctttgg ggttggtgta caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1020

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc tcgttctatg ttgccagcac

1080

gtgatggtgg gaactcatag gagactgccg gggtcaactc ggaggaaggt ggggatgacg

1140

tcaaatcatc atgcccttta tgtcttgggc ttcacgcatg ctacaatggc tggtacagag

1200

agatgcgaga ccgcgaggtt ttagcgaatc ccttaaagcc agtctcagtt cggatcgtag

1260

tctgcaattc gactacgtga agtcggagtc gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg

1320

tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcaagt cacgaaagtc ggtaacaccc

1380

gaagccggtg gcccaaccct tgtggagggg gccgtctaag gtgggactgg tgattgggac

1440

taagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag gtgc

1474

<210> 420

<211> 1389

<212> DNA

<213> Brevibacterium casei

<400> 420

tgcagtcgta cgctgaagcc tgtagcttgc accgggtgga tgagtggcga acgggtgagt

60

aacacgtgag taacctgccc ctgacttcgg gataagcccg ggaaactggg tctaataccg

120

gatacgactg ccggacgcat gtctggtggt ggaaagtttt ttcggttggg gatgggctcg

180

cggcctatca gtttgttggt gaggtaatgg ctcaccaaga cgacgacggg tagccggcct

240

gagagggcga ccggccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca

300

gtggggaata ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagcg acgcagcgtg cgggatgacg

360

gccttcgggt tgtaaaccgc tttcagcagg gaagaagcgc aagtgacggt acctgcagaa

420

gaagtaccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggtacg agcgttgtcc

480

ggaattattg ggcgtaaaga gctcgtaggt ggttggtcac gtctgctgtg gaaacgcaac

540

gcttaacgtt gcgcgtgcag tgggtacggg ctgactagag tgcagtaggg gagtctggaa

600

ttcctggtgt agcggtgaaa tgcgcagata tcaggaggaa caccggtggc gaaggcggga

660

ctctgggctg taactgacac tgaggagcga aagcatgggg agcgaacagg attagatacc

720

ctggtagtcc atgccgtaaa cgttgggcac taggtgtggg gggcattcca cgttctccgc

780

gccgtagcta acgcattaag tgccccgcct ggggagtacg gtcgcaaggc taaaactcaa

840

aggaattgac gggggcccgc acaagcggcg gagcatgcgg attaattcga tgcaacgcga

900

agaaccttac caaggcttga catacaccgg accgtcctgg aaacaggtcc tcttctttga

960

agctggtgta caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag

1020

tcccgcaacg agcgcaaccc tcgttctatg ttgccagcac gtgatggtgg gaactcatag

1080

gagactgccg gggtcaactc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccttta

1140

tgtcttgggc ttcacgcatg ctacaatggc tggtacagag agaggcgaac ccgtgagggc

1200

aagcgaatcc cttaaagcca gtctcagttc ggatcgtagt ctgcaattcg actacgtgaa

1260

gtcggagtcg ctagtaatcg cagatcagca acgctgcggt gaatacgttc ccgggccttg

1320

tacacaccgc ccgtcaagtc acgaaagtcg gtaacacccg aagccggtgg cctaaccgta

1380

aggaggggg

1389

<210> 421

<211> 1480

<212> DNA

<213> Brevibacterium epidermidis

<220>

<221> modified_base

<222> (162)..(162)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 421

ctgcgtgctt aacacatgca agtcgaacgc tgaagccgac agcttgctgt tggtggatga

60

gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagtaa cctgcccctg atttcgggat aagcctggga

120

aactgggtct aataccggat acgaccacct gacgcatgtt gngtggtgga aagtttttcg

180

atcggggatg ggctcgcggc ctatcagctt gttggtgggg taatggccta ccaaggcgac

240

gacgggtagc cggcctgaga gggcgaccgg ccacactggg actgagacac ggcccagact

300

cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatggggg aaaccctgat gcagcgacgc

360

agcgtgcggg atgacggcct tcgggttgta aaccgctttc agcagggaag aagcgaaagt

420

gacggtacct gcagaagaag taccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

480

ggtacgagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagagctc gtaggtggtt ggtcacgtct

540

gctgtggaaa cgcaacgctt aacgttgcgc gtgcagtggg tacgggctga ctagagtgca

600

gtaggggagt ctggaattcc tggtgtagcg gtgaaatgcg cagatatcag gaggaacacc

660

ggtggcgaag gcgggactct gggctgtaac tgacactgag gagcgaaagc atggggagcg

720

aacaggatta gataccctgg tagtccatgc cgtaaacgtt gggcactagg tgtgggggac

780

attccacgtt ctccgcgccg tacgtaacgc attaagtgcc ccgcctgggg agtacggtcg

840

caaggctaaa actcaaagga attgacgggg gccgcacaag cggcggagca tgcggattaa

900

ttcgatgcaa cgcgaagaac cttaccaagg cttgacatac actggaccgt tctggaaaca

960

gttcttctct ttggagctgg tgtacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga

1020

gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca accctcgttc tatgttgcca gcacgtgatg

1080

gtgggaactc ataggagact gccggggtca actcggagga aggtggggat gacgtcaaat

1140

catcatgccc tttatgtctt gggcttcacg catgctacaa tggctggtac agagagaggc

1200

gaacccgtga gggtaagcga atcccttaaa gccagtctca gttcggatcg tagtctgcaa

1260

ttcgactacg tgaagtcgga gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg cggtgaatac

1320

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca agtcacgaaa gtcggtaaca cccgaagccg

1380

gtgtcccaac ccttttggga gggggccgtc taaggtggga ctggtgattg ggactaagtc

1440

gtaacaaggt agccgtaccg gaaggtgcgc tggatcacct

1480

<210> 422

<211> 1540

<212> DNA

<213> Brevibacterium frigoritolerans

<400> 422

gtttgatcct ggctcaggac gaacgctggc ggcgtgccta atacatgcaa gtcgagcgaa

60

tcgacgggag cttgctccct gagattagcg gcggacgggt gagtaacacg tgggcaacct

120

gcctataaga ctgggataac ttcgggaaac cggagctaat accggatacg ttcttttctc

180

gcatgagaga agatggaaag acggtttacg ctgtcactta tagatgggcc cgcggcgcat

240

tagctagttg gtgaggtaat ggctcaccaa ggcgacgatg cgtagccgac ctgagagggt

300

gatcggccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtagggaa

360

tcttccgcaa tggacgaaag tctgacggag caacgccgcg tgaacgaaga aggccttcgg

420

gtcgtaaagt tctgttgtta gggaagaaca agtaccagag taactgctgg taccttgacg

480

gtacctaacc agaaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg

540

caagcgttgt ccggaattat tgggcgtaaa gcgcgcgcag gtggttcctt aagtctgatg

600

tgaaagccca cggctcaacc gtggagggtc attggaaact ggggaacttg agtgcagaag

660

aggaaagtgg aattccaagt gtagcggtga aatgcgtaga gatttggagg aacaccagtg

720

gcgaaggcga ctttctggtc tgtaactgac actgaggcgc gaaagcgtgg ggagcaaaca

780

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt gctaagtgtt agagggtttc

840

cgccctttag tgctgcagct aacgcattaa gcactccgcc tggggagtac ggccgcaagg

900

ctgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

960

aagcaacgcg aagaacctta ccaggtcttg acatcctctg acaaccctag agatagggct

1020

ttccccttcg ggggacagag tgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1080

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgatct tagttgccag cattcagttg

1140

ggcactctaa ggtgactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat

1200

catgcccctt atgacctggg ctacacacgt gctacaatgg atggtacaaa gggctgcaaa

1260

cctgcgaagg taagcgaatc ccataaagcc attctcagtt cggattgcag gctgcaactc

1320

gcctgcatga agccggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acgagagttt gtaacacccg aagtcggtga

1440

ggtaaccttc atggagccag ccgcctaagg tgggacagat gattggggtg aagtcgtaac

1500

aaggtagccg tatcggaagg tgcggctgga tcacctcctt

1540

<210> 423

<211> 1515

<212> DNA

<213> Brevibacterium linens

<400> 423

tcaggacgaa cgctggctgc gtgcttaaca catgcaagtc gaacgctgaa gccctggtgc

60

ttgcaccggg gtggatgagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgagtaacc tgcccccgac

120

ttcgggataa gcccgggaaa ctgggtctaa taccggatat gacsaysrmt sgcatswktg

180

rtkgtggaaa gttttttcgg ttggggatgg gctcgcggcc tatcagtttg ttggtgaggt

240

aatggctcac caagacgacg acgggtagcc ggcctgagag ggcgaccggc cacactggga

300

ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatggggga

360

aaccctgatg cagcgacgca gcgtgcggga tgacggcctt cgggttgtaa accgctttca

420

gcagggaaga agcctttcgg ggtgacggta cctgcagaag aagtaccggc taactacgtg

480

ccagcagccg cggtaatacg tagggtacaa gcgttgtccg gaattattgg gcgtaaagag

540

ctcgtaggtg gttggtcacg tctgctgtgg aaacgcaacg cttaacgttg cgcgtgcagt

600

gggtacgggc ttgactagag tgcagtaggg gagtctggaa ttcctggtgt agcggtgaaa

660

tgcgcagata tcaggaggaa caccggtggc gaaggcggga ctctgggctg taactgacac

720

tgaggagcga aagcatgggg agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc atgccgtaaa

780

cgttgggcac taggtgtggg ggacattcca cgttctccgc gccgtagcta acgcattaag

840

tgccccgcct ggggagtacg gtcgcaaggc taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc

900

acaagcggcg gagcatgcgg attaattcga tgcaacgcga agaaccttac caaggcttga

960

ctatacacca gaccgttctg gaaacagttc ctcccctttg gggttggtgt acaggtggtg

1020

catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

1080

ctcgttctat gttgccagca cgtaatggtg ggaactcata ggagactgcc ggggtcaact

1140

cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccttt atgtcttggg cttcacgcat

1200

gctacaatgg ctggtacaga gagatgcgag accgcgaggt tttagcgaat cccttaaagc

1260

cagtctcagt tcggatcgta gtctgcaatt cgactacgtg aagtcggagt cgctagtaat

1320

cgcagatcag caacgctgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaag

1380

tcacgaaagt cggtaacacc cgaagccggt ggcccaaccc ttgtggaggg ggccgtctaa

1440

ggtgggactg gtgattggga ctaagtcgta acaaggtagc cgtaccggaa ggtgcggctg

1500

gatcacctcc tttct

1515

<210> 424

<211> 1527

<212> DNA

<213> Brevibacterium mcbrellneri

<400> 424

tttttgtgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg ctgaagcttg gtgttttcac tgggtggatg agtggcgaac gggtgagtaa

120

cacgtgagta acctgccctt tacttcggga taagcttggg aaactgggtc taataccgga

180

tattctgcgt gatcgtatgg ttgtgtagga aagatttttt ggtaagggat gggctcgcgg

240

cctatcagtt tgttggtggg gtgatggcct accaagacga cgacgggtag ccggcctgag

300

agggcgaccg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

360

gggaatattg cacaatgggg gaaaccctga tgcagcgacg ccgcgtgggg gatgacggcc

420

ttcgggttgt aaacctcttt cagtagggaa gaagcgtaag tgacggtacc tgcagaagaa

480

gtaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggtactagc gttgtccgga

540

attattgggc gtaaagagct cgtaggtggt ttgtcgcgtc tgctgtggaa acgtgccgct

600

taacggtgcg cgtgcagtgg gtacgggcgg actagagtgc agtaggggag tctggaattc

660

ctggtgtagc ggtgaaatgc gcagatatca ggaggaacac cggtggcgaa ggcgggactc

720

tgggctgtta ctgacgctga ggagcgaaag catggggagc gaacaggatt agataccctg

780

gtagtccatg ccgtaaacgt tgggcactag gtgtggggtc cattccacgg attctgcgcc

840

gtagctaacg cattaagtgc cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg

900

aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag catgcggatt aattcgatgc aacgcgaaga

960

accttaccaa ggcttgacat gcactggatc gctgcagaga tgtggttttc tttttgactg

1020

gtgtacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg

1080

caacgagcgc aaccctcgtt ctatgttgcc agcacgtgat ggtgggaact catgggagac

1140

tgccggggtc aactcggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ctttatgtct

1200

tgggcttcac gcatgctaca atggccggta cagagggtgg cgataccgtg aggtggagcg

1260

aatctcttaa agccggtctc agttcggatc gtagtctgca actcgactac gtgaagtcgg

1320

agtcgctagt aatcgcagat cagcaatgct gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac

1380

accgcccgtc aagtcacgaa agtcggtaac acccgaagcc ggtggcctaa ccttttgggg

1440

ggagccgtcg aaggtgggac tggtgattgg gactaagtcg taacaaggta gccgtaccgg

1500

aaggtgcggc tggatcacct cctttct

1527

<210> 425

<211> 1441

<212> DNA

<213> Brevibacterium paucivorans

<400> 425

gaagctggcg gcgtgcttaa cacatgcaag tcgaacgatg aagctctagc ttgctggggt

60

ggattagtgg cgaacgggtg agtaacacgt gagtaacctg ccctttactt cgggataagc

120

ttgggaaact gggtctaata ccggatattc tgcatggtcg gatggttgtg taggaaagat

180

tttttggtaa gggatgggct cgcggcctat cagtttgttg gtggggtgat ggcctaccaa

240

gacgacgacg ggtagccggc ctgagagggc gaccggccac actgggactg agacacggcc

300

cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggggaaac cctgatgcag

360

cgacgccgcg tgggggatga cggccttcgg gttgtaaacc tctttcagta gggaagaagc

420

gaaagtgacg gtacctgcag aagaagtacc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtagggta ctagcgttgt ccggaattat tgggcgtaaa gagctcgtag gtggtttgtc

540

gcgtctgctg tggaaacgtg ccgcttaacg gtgcgcgtgc agtgggtacg ggcggactag

600

agtgcagtag gggagtctgg aattcctggt gtagcggtga aatgcgcaga tatcaggagg

660

aacaccggtg gcgaaggcgg gactctgggc tgttactgac gctgaggagc gaaagcatgg

720

ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacgttgggc actaggtgtg

780

gggtccattc cacggattct gcgccgtagc taacgcatta agtgccccgc ctggggagta

840

cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg cggagcatgc

900

ggattaattc gatgcaacgc gaagaacctt accaaggctt gacatgcact agaccatcgc

960

agagatgtgg ttttcttttt gactggtgta caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1020

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc tcgttctatg ttgccagcac

1080

gtgatggtgg gaactcatgg gagactgccg gggtcaactc ggaggaaggt ggggatgacg

1140

tcaaatcatc atgcccttta tgtcttgggc ttcacgcatg ctacaatggc cggtacagag

1200

ggtggcgata ccgtgaggtg gagcgaatct cttaaagccg gtctcagttc ggatcgtagt

1260

ctgcaactcg actacgtgaa gtcggagtcg ctagtaatcg cagatcagca atgctgcggt

1320

gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcaagtc acgaaagtcg gtaacacccg

1380

aagccggtgg cctaaccctg tgtgggggga gccgtcgaag gtgggactgg tgattgggac

1440

t

1441

<210> 426

<211> 1341

<212> DNA

<213> Brevibacterium sanguinis

<400> 426

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gctgcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgagta acctgcccct gacttcggga taagcccggg

120

aaactgggtc taataccgga tacggaaagt cggttgggga tgggctcgcg gcctatcagt

180

ttgttggtga ggtaatggct caccaagacg acgacgggta gccggcctga gagggcgacc

240

ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

300

gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcgac gcagcgtgcg ggatgacggc cttcgggttg

360

taaaccgctt tcagcaggga agatgacggt acctgcagaa gaagtaccgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtagggtacg agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaaga

480

gctcgtaggt ggttggtcac gtctgctgtg gaaacgcaac gcttaacgtt gcgcgtgcag

540

tgggtacggg ctgactagag tgcagtaggg gagtctggaa ttcctggtgt agcggtgaaa

600

tgcgcagata tcaggaggaa caccggtggc gaaggcggga ctctgggctg actgacactg

660

aggagcgaaa gcatggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

720

ttgggcacta ggtgtggggg tctccgcgcc gtagctaacg cattaagtgc cccgcctggg

780

gagtacggtc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag

840

catgcggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccaa ggcttgacat atacaggtgg

900

tgcatgttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

cctcgttcta tgttgccagc acgtgggaac tcataggaga ctgccggggt caactcggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cctttatgtc ttgggcttca cgcatgctac

1080

aatggctggc aaagagaagc gaacccgtga gggtcagcga atcccttcca gtctcagttc

1140

ggacgtagtc tgcaattcga ctacggaagt cggagtcgct agtaatcgca gatcagcaac

1200

gctgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcaagtcac gaaagtcggt

1260

aacacccgaa gccggtgcct agggggccgt ctaaggtggg actggtgatt gggactaagt

1320

cgtaacaagg tagccgtacc g

1341

<210> 427

<211> 1367

<212> DNA

<213> Brevibacterium sp. H15

<400> 427

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gctgcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgagta acctgcccct gacttcggga taagcccggg

120

aaactgggtc taataccgga tacggaaagt cggttgggga tgggctcgcg gcctatcagt

180

ttgttggtga ggtaatggct caccaagacg acgacgggta gccggcctga gagggcgacc

240

ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

300

gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcgac gcagcgtgcg ggatgacggc cttcgggttg

360

taaaccgctt tcagcaggga agatgacggt acctgcagaa gaagtaccgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtagggtacg agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaaga

480

gctcgtaggt ggttggtcac gtctgctgtg gaaacgcaac gcttaacgtt gcgcgtgcag

540

tgggtacggg ctgactagag tgcagtaggg gagtctggaa ttcctggtgt agcggtgaaa

600

tgcgcagata tcaggaggaa caccggtggc gaaggcggga ctctgggctg actgacactg

660

aggagcgaaa gcatggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

720

ttgggcacta ggtgtggggg tctccgcgcc gtagctaacg cattaagtgc cccgcctggg

780

gagtacggtc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag

840

catgcggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccaa ggcttgacat atacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

ccctcgttct atgttgccag cacgtgggaa ctcataggag actgccgggg tcaactcgga

1020

ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccctttatgt cttgggcttc acgcatgcta

1080

caatggctgg cagagagagg cgaacccgtg agggcaagcg aatcccttcc agtctcagtt

1140

cggacgtagt ctgcaattcg actacggaag tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa

1200

cgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagtca cgaaagtcgg

1260

taacacccga agccggtgcc tagggggccg tctaatgtgg gactggtgat tgggactaat

1320

tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc ggctggatca cctcctt

1367

<210> 428

<211> 1491

<212> DNA

<213> Brevibacterium sp. JC43

<400> 428

tagagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgaa

60

cgatgaagct cctgcttgca ggagtggatt agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgagta

120

acctgcccct gactgcggga taagcccggg aaactgggtc taataccgca tatgacacct

180

ggccgcatgg tctgggtgtg gaaagttttt cggttgggga tgggctcgcg gcctatcagc

240

ttgttggtgg ggtaacggcc taccaaggcg acgacgggta gccggcctga gagggcgacc

300

ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

360

gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcgac gccgcgtgag ggatgacggc cttcgggttg

420

taaacctctt tcagtaggga agaagccttc gggtgacggt acctgcagaa gaagtaccgg

480

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggtaca agcgttgtcc ggaattattg

540

ggcgtaaaga gctcgtaggc ggttcgtcgc gtctgctgtg gaaacgcaag gctcaacctt

600

gcgcgtgcag tgggtacggg cggactagag tgcagtaggg gagtctggaa ttcctggtgt

660

agcggtgaaa tgcgcagata tcaggaggaa caccggtggc gaaggcggga ctctgggctg

720

taactgacgc tgaggagcga aagcatgggg agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

atgccgtaaa cgttgggcac taggtgtggg gctcattcca cgagttccgc gccgcagcta

840

acgcattaag tgccccgcct ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa aggaattgac

900

gggggcccgc acaagcggcg gagcatgcgg attaattcga tgcaacgcga agaaccttac

960

caaggcttga catacactgg aatgtgccag agatggttca gcccttttgg gctggtgtac

1020

aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1080

gcgcaaccct cgttctatgt tgccagcacg tgatggtggg aactcatagg agactgccgg

1140

ggtcaactcg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccctttat gtcttgggct

1200

tcacgcatgc tacaatggtc ggtacaaagg gttgcgatgc cgtgaggtgg agcgaatccc

1260

agaaagccga tctcagttcg gatcgtagtc tgcaactcga ctacgtgaag tcggagtcgc

1320

tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1380

cgtcaagtca cgaaagtcgg taacacccga agccggtggc ccaacccttg tggggggagc

1440

cgtcgaaggt gggactggtg attgggacta agtcgtaaca aggtagccgt a

1491

<210> 429

<211> 1449

<212> DNA

<213> Brevundimonas subvibrioides

<400> 429

agagtttgat cctggctcag agcgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac

60

ggacctctcg gggttagtgg cggacgggtg agtaacacgt gggaacgtgc cttttggttc

120

ggaatagctc ctggaaacgg gtggtaatgc cgaatgtgcc ctttggggga aagatttatc

180

gccattagag cggcccgcgt ctgattagct agttggtgag gtaaaggctc accaaggcta

240

cgatcagtag ctggtctgag aggatgacca gccacattgg gactgagaca cggcccaaac

300

tcctacggga ggcagcagtg gggaatcttg cgcaatgggc gaaagcctga cgcagccatg

360

ccgcgtgtat gatgaaggtc ttaggattgt aaaatacttt caccggtgaa gataatgact

420

gtagccggag aagaagcccc ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgaaggggg

480

ctagcgttgc tcggaattac tgggcgtaaa gggagcgtag gcggacattt aagtcagggg

540

tgaaatccca gagctcaact ctggaactgc ctttgatact gggtgtcttg agtgtgagag

600

aggtatgtgg aactccgagt gtagaggtga aattcgtaga tattcggaag aacaccagtg

660

gcgaaggcga catactggct cattactgac gctgaggctc gaaagcgtgg ggagcaaaca

720

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgatt gctagttgtc gggatgttta

780

catctcggtg acgcagctaa cgcattaagc aatccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt

840

aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa

900

gcaacgcgca gaaccttacc accttttgac atgcctggac cgccagagag atctggcttt

960

cccttcgggg actaggacac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

1020

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct cgccattagt tgccatcatt tagttgggaa

1080

ctctaatggg actgccggtg ctaagccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcctcatg

1140

gcccttacag ggtgggctac acacgtgcta caatggcgac tacagagggt taatccttaa

1200

aagtcgtctc agttcggatt gtcctctgca actcgagggc atgaagttgg aatcgctagt

1260

aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca

1320

caccatggga gttggttcta cccgaaggcg atgcgctaac cgcaaggagg cagtcgacca

1380

cggtagggtc agcgactggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtagggga acctgcggct

1440

ggatcacct

1449

<210> 430

<211> 1493

<212> DNA

<213> Brucella abortus

<400> 430

aacttgagag tttgatcctg gctcagaacg aacgctggcg gcaggcttaa cacatgcaag

60

tcgagcgccc cgcaagggga gcggcagacg ggtgagtaac gcgtgggaac gtaccatttg

120

ctacggaata actcagggaa acttgtgcta ataccgtatg tgcccttcgg gggaaagatt

180

tatcggcaaa tgatcggccc gcgttggatt agctagttgg tggggtaaag gctcaccaag

240

gcgacgatcc atagctggtc tgagaggatg atcagccaca ctgggactga gacacggccc

300

agactcctac gggaggcagc agtggggaat attggacaat gggcgcaagc ctgatccagc

360

catgccgcgt gagtgatgaa ggccctaggg ttgtaaagct ctttcaccgg tgaagataat

420

gacggtaacc ggagaagaag ccccggctaa cttcgtgcca gcagccgcgg taatacgaag

480

ggggctagcg ttgttcggat ttactgggcg taaagcgcac gtaggcggac ttttaagtca

540

ggggtgaaat cccggggctc aaccccggaa ctgcctttga tactggaagt cttgagtatg

600

gtagaggtga gtggaattcc gagtgtagag gtgaaattcg tagatattcg gaggaacacc

660

agtggcgaag gcggctcact ggaccattac tgacgctgag gtgcgaaagc gtggggagca

720

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gaatgttagc cgtcggggtg

780

tttacacttc ggtggcgcag ctaacgcatt aaacattccg cctggggagt acggtcgcaa

840

gattaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

900

cgaagcaacg cgcagaacct taccagccct tgacatcccg gtcgcggtta gtggagacac

960

tatccttcag ttaggctgga ccggagacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg

1020

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctcg cccttagttg ccagcattca

1080

gttgggcact ctaaggggac tgccggtgat aagccgagag gaaggtgggg atgacgtcaa

1140

gtcctcatgg cccttacggg ctgggctaca cacgtgctac aatggtggtg acagtgggca

1200

gcgagcacgc gagtgtgagc taatctccaa aagccatctc agttcggatt gcactctgca

1260

actcgagtgc atgaagttgg aatcgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac

1320

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gttggtttta cccgaaggcg

1380

ctgtgctaac cgcaaggagg caggcgacca cggtagggtc agcgactggg gtgaagtcgt

1440

aacaaggtag ccgtagggga acctgcggct ggatcacctc ctttctaagg aag

1493

<210> 431

<211> 981

<212> DNA

<213> Brucella canis

<400> 431

tgacggtaac cggagaagaa gccccggcta acttcgtgcc agcagccgcg gtaatacgaa

60

gggggctagc gttgttcgga tttactgggc gtaaagcgca cgtaggcgga cttttaagtc

120

aggggtgaaa tcccggggct caaccccgga actgcctttg atactggaag tcttgagtat

180

ggaagaggta agtggaattg cgagtgtaga ggtgaaattc gtagatattc gcaggaacac

240

cagtggcgaa ggcggcttac tggtccatta ctgacgctga ggtgcgaaag cgtggggagc

300

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgaatgttag ccgtcggggt

360

gtttacactt cggtggcgca gctaacgcat taaacattcc gcctggggag tacggtcgca

420

agattaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

480

tcgaagcaac gcgcagaacc ttaccagctc ttgacatgcc tatgaatgtt agtggagaca

540

ctttcagcct ttcggggcgt aggacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt

600

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caaccctcgc ctttagttgc catcatttag

660

ttgggcactc taaagggact gccagtgata agctggagga aggtggggat gacgtcaagt

720

cctcatggcc cttacgggct gggctacaca cgtgctacaa tggtggtgac agtgggcagc

780

gagaccgcga ggtcgagcta atctccaaaa gccatctcag ttcggattgc actctgcaac

840

tcgagtgcat gaagttggaa tcgctagtaa tcgcggatca gaatgccgcg gtgaatacgt

900

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt tggttttacc cgaaggcgct

960

gtgctaaccg caaggaggca g

981

<210> 432

<211> 1485

<212> DNA

<213> Brucella ceti

<400> 432

caacttgaga gtttgatcct ggctcagaac gaacgctggc ggcaggctta acacatgcaa

60

gtcgagcgcc ccgcaagggg agcggcagac gggtgagtaa cgcgtgggaa cgtaccattt

120

gctacggaat aactcaggga aacttgtgct aataccgtat gtgcccttcg ggggaaagat

180

ttatcggcaa atgatcggcc cgcgttggat tagctagttg gtggggtaaa ggctcaccaa

240

ggcgacgatc catagctggt ctgagaggat gatcagccac actgggactg agacacggcc

300

cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa tgggcgcaag cctgatccag

360

ccatgccgcg tgagtgatga aggccctagg gttgtaaagc tctttcaccg gtgaagataa

420

tgacggtaac cggagaagaa gccccggcta acttcgtgcc agcagccgcg gtaatacgaa

480

gggggctagc gttgttcgga tttactgggc gtaaagcgca cgtaggcgga cttttaagtc

540

aggggtgaaa tcccggggct caaccccgga actgcctttg atactggaag tcttgagtat

600

ggtagaggtg agtggaattc cgagtgtaga ggtgaaattc gtagatattc ggaggaacac

660

cagtggcgaa ggcggctcac tggaccatta ctgacgctga ggtgcgaaag cgtggggagc

720

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgaatgttag ccgtcggggt

780

gtttacactt cggtggcgca gctaacgcat taaacattcc gcctggggag tacggtcgca

840

agattaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

900

tcgaagcaac gcgcagaacc ttaccagccc ttgacatccc ggtcgcggtt agtggagaca

960

ctatccttca gttaggctgg accggagaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc

1020

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc gcccttagtt gccagcattc

1080

agttgggcac tctaagggga ctgccggtga taagccgaga ggaaggtggg gatgacgtca

1140

agtcctcatg gcccttacgg gctgggctac acacgtgcta caatggtggt gacagtgggc

1200

agcgagcacg cgagtgtgag ctaatctcca aaagccatct cagttcggat tgcactctgc

1260

aactcgagtg catgaagttg gaatcgctag taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaata

1320

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agttggtttt acccgaaggc

1380

gctgtgctaa ccgcaaggag gcaggcgacc acggtagggt cagcgactgg ggtgaagtcg

1440

taacaaggta gccgtagggg aacctgcggc tggatcacct ccttt

1485

<210> 433

<211> 1500

<212> DNA

<213> Brucella melitensis

<400> 433

aattttcaac ttgagagttt gatcctggct cagaacgaac gctggcggca ggcttaacac

60

atgcaagtcg agcgccccgc aaggggagcg gcagacgggt gagtaacgcg tgggaacgta

120

ccatttgcta cggaataact cagggaaact tgtgctaata ccgtatgtgc ccttcggggg

180

aaagatttat cggcaaatga tcggcccgcg ttggattagc tagttggtgg ggtaaaggct

240

caccaaggcg acgatccata gctggtctga gaggatgatc agccacactg ggactgagac

300

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg cgcaagcctg

360

atccagccat gccgcgtgag tgatgaaggc cctagggttg taaagctctt tcaccggtga

420

agataatgac ggtaaccgga gaagaagccc cggctaactt cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacgaagggg gctagcgttg ttcggattta ctgggcgtaa agcgcacgta ggcggacttt

540

taagtcaggg gtgaaatccc ggggctcaac cccggaactg cctttgatac tggaagtctt

600

gagtatggta gaggtgagtg gaattccgag tgtagaggtg aaattcgtag atattcggag

660

gaacaccagt ggcgaaggcg gctcactgga ccattactga cgctgaggtg cgaaagcgtg

720

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgaa tgttagccgt

780

cggggtgttt acacttcggt ggcgcagcta acgcattaaa cattccgcct ggggagtacg

840

gtcgcaagat taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg

900

tttaattcga agcaacgcgc agaaccttac cagcccttga catcccggtc gcggttagtg

960

gagacactat ccttcagtta ggctggaccg gagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct

1020

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca accctcgccc ttagttgcca

1080

gcattcagtt gggcactcta aggggactgc cggtgataag ccgagaggaa ggtggggatg

1140

acgtcaagtc ctcatggccc ttacgggctg ggctacacac gtgctacaat ggtggtgaca

1200

gtgggcagcg agcacgcgag tgtgagctaa tctccaaaag ccatctcagt tcggattgca

1260

ctctgcaact cgagtgcatg aagttggaat cgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg

1320

tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtt ggttttaccc

1380

gaaggcgctg tgctaaccgc aaggaggcag gcgaccacgg tagggtcagc gactggggtg

1440

aagtcgtaac aaggtagccg taggggaacc tgcggctgga tcacctcctt tctaaggaag

1500

<210> 434

<211> 1390

<212> DNA

<213> Brucella microti

<400> 434

caggcttaac acatgcaagt cgagcgcccc gcaaggggag cggcagacgg gtgagtaacg

60

cgtgggaacg taccatttgc tacggaataa ctcagggaaa cttgtgctaa taccgtatgt

120

gcccttcggg ggaaagattt atcggcaaat gatcggcccg cgttggatta gctagttggt

180

ggggtaaagg ctcaccaagg cgacgatcca tagctggtct gagaggatga tcagccacac

240

tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttggacaatg

300

ggcgcaagcc tgatccagcc atgccgcgtg agtgatgaag gccctagggt tgtaaagctc

360

tttcaccggt gaagataatg acggtaaccg gagaagaagc cccggctaac ttcgtgccag

420

cagccgcggt aatacgaagg gggctagcgt tgttcggatt tactgggcgt aaagcgcacg

480

taggcggact tttaagtcag gggtgaaatc ccggggctca accccggaac tgcctttgat

540

actggaagtc ttgagtatgg tagaggtgag tggaattccg agtgtagagg tgaaattcgt

600

agatattcgg aggaacacca gtggcgaagg cggctcactg gaccattact gacgctgagg

660

tgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg

720

aatgttagcc gtcggggtgt ttacacttcg gtggcgcagc taacgcatta aacattccgc

780

ctggggagta cggtcgcaag attaaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg

840

tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gcagaacctt accagccctt gacatcccgg

900

tcgcggttag tggagacact atccttcagt taggctggac cggagacagg tgctgcatgg

960

ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caaccctcgc

1020

ccttagttgc cagcattcag ttgggcactc taaggggact gccggtgata agccgagagg

1080

aaggtgggga tgacgtcaag tcctcatggc ccttacgggc tgggctacac acgtgctaca

1140

atggtggtga cagtgggcag cgagcacgcg agtgtgagct aatctccaaa agccatctca

1200

gttcggattg cactctgcaa ctcgagtgca tgaagttgga atcgctagta atcgcggatc

1260

agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag

1320

ttggttttac ccgaaggcgc tgtgctaacc gcaaggaggc aggcgaccac ggtagggtca

1380

gcgactgggg

1390

<210> 435

<211> 1489

<212> DNA

<213> Brucella ovis

<400> 435

ttcaacttga gagtttgatc ctggctcaga acgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgagcg ccccgcaagg ggagcggcag acgggtgagt aacgcgtggg aacgtaccat

120

ttgctacgga ataactcagg gaaacttgtg ctaataccgt atgtgccctt cgggggaaag

180

atttatcggc aaatgatcgg cccgcgttgg attagctagt tggtggggta aaggctcacc

240

aaggcgacga tccatagctg gtctgagagg atgatcagcc acactgggac tgagacacgg

300

cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattggac aatgggcgca agcctgatcc

360

agccatgccg cgtgagtgat gaaggcccta gggttgtaaa gctctttcac cggtgaagat

420

aatgacggta accggagaag aagccccggc taacttcgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

aagggggcta gcgttgttcg gatttactgg gcgtaaagcg cacgtaggcg gacttttaag

540

tcaggggtga aatcccgggg ctcaaccccg gaactgcctt tgatactgga agtcttgagt

600

atggtagagg tgagtggaat tccgagtgta gaggtgaaat tcgtagatat tcggaggaac

660

accagtggcg aaggcggctc actggaccat tactgacgct gaggtgcgaa agcgtgggga

720

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatgtt agccgtcggg

780

gtgtttacac ttcggtggcg cagctaacgc attaaacatt ccgcctgggg agtacggtcg

840

caagattaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

900

attcgaagca acgcgcagaa ccttaccagc ccttgacatc ccggtcgcgg ttagtggaga

960

cactatcctt cagttaggct ggaccggaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg

1020

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc tcgcccttag ttgccagcat

1080

tcagttgggc actctaaggg gactgccggt gataagccga gaggaaggtg gggatgacgt

1140

caagtcctca tggcccttac gggctgggct acacacgtgc tacaatggtg gtgacagtgg

1200

gcagcgagca cgcgagtgtg agctaatctc caaaagccat ctcagttcgg attgcactct

1260

gcaactcgag tgcatgaagt tggaatcgct agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa

1320

tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagttggtt ttacccgaag

1380

gcgctgtgct aaccgcaagg aggcaggcga ccacggtagg gtcagcgact ggggtgaagt

1440

cgtaacaagg tagccgtagg ggaacctgcg gctggatcac ctcctttct

1489

<210> 436

<211> 1489

<212> DNA

<213> Brucella sp. 83/13

<400> 436

ttcaacttga gagtttgatc ctggctcaga acgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgagcg ccccgcaagg ggagcggcag acgggtgagt aacgcgtggg aacgtaccat

120

ttgctacgga ataactcagg gaaacttgtg ctaataccgt atgtgcccga aaggggaaag

180

atttatcggc aaatgatcgg cccgcgttgg attagctagt tggtggggta aaggcccacc

240

aaggcgacga tccatagctg gtctgagagg atgatcagcc acactgggac tgagacacgg

300

cccagactct tacgggaggc agcagtgggg aatattggac aatgggcgca agcctgatcc

360

agccatgccg cgtgagtgat gaaggcccta gggttgtaaa gctctttcac cggtgaagat

420

aatgacggta accggagaag aagccccggc taacttcgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

aagggggcta gcgttgttcg gatttactgg gcgtaaagcg cacgtaggcg gacttttaag

540

tcaggggtga aatcccgggg ctcaaccccg gaactgcctt tgatactgga agtcttgagt

600

atggtagagg tgagtggaat tccgagtgta gaggtgaaat tcgtagatat tcggaggaac

660

accagtggcg aaggcggctc actggaccat tactgacgct gaggtgcgaa agcgtgggga

720

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatgtt agccgtcggg

780

gtgtttacac ttcggtggcg cagctaacgc attaaacatt ccgcctgggg agtacggtcg

840

caagattaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

900

attcgaagca acgcgcagaa ccttaccagc ccttgacatc ccggtcgcgg ttagtggaga

960

cactatcctt cagttaggct ggaccggaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg

1020

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc tcgcccttag ttgccagcat

1080

tcagttgggc actctaaggg gactgccggt gataagccga gaggaaggtg gggatgacgt

1140

caagtcctca tggcccttac gggctgggct acacacgtgc tacaatggtg gtgacagtgg

1200

gcagcgagca cgcgagtgtg agctaatctc caaaagccat ctcagttcgg attgcactct

1260

gcaactcgag tgcatgaagt tggaatcgct agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa

1320

tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagttggtt ttacccgaag

1380

gcgctgtgct aaccgcaagg aggtaggcga ccacggtagg gtcagcgact ggggtgaagt

1440

cgtaacaagg tagccgtagg ggaacctgcg gctggatcac ctcctttct

1489

<210> 437

<211> 1412

<212> DNA

<213> Brucella sp. BO1

<400> 437

ctcagaacga acgctggcgg caggcttaac acatgcaagt cgagcgcccc gcaaggggag

60

cggcagacgg gtgagtaacg cgtgggaacg taccatttgc tacggaataa ctcagggaaa

120

cttgtgctaa taccgtatgt gcccgaaagg ggaaagattt atcggcaaat gatcggcccg

180

cgttggatta gctagttggt ggggtaaagg cccaccaagg cgacgatcca tagctggtct

240

gagaggatga tcagccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca

300

gtggggaata ttggacaatg ggcgcaagcc tgatccagcc atgccgcgtg agtgatgaag

360

gccctagggt tgtaaagctc tttcaccggt gaagataatg acggtaaccg gagaagaagc

420

cccggctaac ttcgtgccag cagccgcggt aatacgaagg gggctagcgt tgttcggatt

480

tactgggcgt aaagcgcacg taggcggact tttaagtcag gggtgaaatc ccggggctca

540

accccggaac tgcctttgat actggaagtc ttgagtatgg tagaggtgag tggaattccg

600

agtgtagagg tgaaattcgt agatattcgg aggaacacca gtggcgaagg cggctcactg

660

gaccattact gacgctgagg tgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt

720

agtccacgcc gtaaacgatg aatgttagcc gtcggggtgt ttacacttcg gtggcgcagc

780

taacgcatta aacattccgc ctggggagta cggtcgcaag attaaaactc aaaggaattg

840

acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gcagaacctt

900

accagccctt gacatcccgg tcgcggttag tggagacact atccttcagt taggctggac

960

cggagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1020

gcaacgagcg caaccctcgc ccttagttgc cagcattcag ttgggcactc taaggggact

1080

gccggtgata agccgagagg aaggtgggga tgacgtcaag tcctcatggc ccttacgggc

1140

tgggctacac acgtgctaca atggtggtga cagtgggcag cgagcacgcg agtgtgagct

1200

aatctccaaa agccatctca gttcggattg cactctgcaa ctcgagtgca tgaagttgga

1260

atcgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1320

cgcccgtcac accatgggag ttggttttac ccgaaggcgc tgtgctaacc gcaaggaggc

1380

aggcgaccac ggtagggtca gcgactgggg tg

1412

<210> 438

<211> 1493

<212> DNA

<213> Brucella suis

<400> 438

aacttgagag tttgatcctg gctcagaacg aacgctggcg gcaggcttaa cacatgcaag

60

tcgagcgctc cgcaagggga gcggcagacg ggtgagtaac gcgtgggaac gtaccatttg

120

ctacggaata actcagggaa acttgtgcta ataccgtatg tgcccttcgg gggaaagatt

180

tatcggcaaa tgatcggccc gcgttggatt agctagttgg tggggtaaag gctcaccaag

240

gcgacgatcc atagctggtc tgagaggatg atcagccaca ctgggactga gacacggccc

300

agactcctac gggaggcagc agtggggaat attggacaat gggcgcaagc ctgatccagc

360

catgccgcgt gagtgatgaa ggccctaggg ttgtaaagct ctttcaccgg tgaagataat

420

gacggtaacc ggagaagaag ccccggctaa cttcgtgcca gcagccgcgg taatacgaag

480

ggggctagcg ttgttcggat ttactgggcg taaagcgcac gtaggcggac ttttaagtca

540

ggggtgaaat cccggggctc aaccccggaa ctgcctttga tactggaagt cttgagtatg

600

gtagaggtga gtggaattcc gagtgtagag gtgaaattcg tagatattcg gaggaacacc

660

agtggcgaag gcggctcact ggaccattac tgacgctgag gtgcgaaagc gtggggagca

720

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gaatgttagc cgtcggggtg

780

tttacacttc ggtggcgcag ctaacgcatt aaacattccg cctggggagt acggtcgcaa

840

gattaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

900

cgaagcaacg cgcagaacct taccagccct tgacatcccg gtcgcggtta gtggagacac

960

tatccttcag ttaggctgga ccggagacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg

1020

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctcg cccttagttg ccagcattca

1080

gttgggcact ctaaggggac tgccggtgat aagccgagag gaaggtgggg atgacgtcaa

1140

gtcctcatgg cccttacggg ctgggctaca cacgtgctac aatggtggtg acagtgggca

1200

gcgagcacgc gagtgtgagc taatctccaa aagccatctc agttcggatt gcactctgca

1260

actcgagtgc atgaagttgg aatcgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac

1320

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gttggtttta cccgaaggcg

1380

ctgtgctaac cgcaaggagg caggcgacca cggtagggtc agcgactggg gtgaagtcgt

1440

aacaaggtag ccgtagggga acctgcagct ggatcacctc ctttctaagg aag

1493

<210> 439

<211> 1535

<212> DNA

<213> Bryantella formatexigens

<400> 439

ttttatttga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgagcg aagcatttta aatgaagttt tcggacggaa tttaaaatga ctgagcggcg

120

gacgggtgag taacgcgtgg ataacctgcc ttatacaggg ggataacagc cagaaatggc

180

tgctaatacc gcataagcgc acggtaccgc atggtacagt gtgaaaaact ccggtggtat

240

aagatgggtc cgcgttggat taggcagttg gcggggtaaa ggcccaccaa accgacgatc

300

catagccggc ctgagagggt ggacggccac attgggactg agacacggcc cagactccta

360

cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggggaaac cctgatgcag cgacgccgcg

420

tgggtgaaga agtatttcgg tatgtaaagc cctatcagca gggaagaaaa tgacggtacc

480

tgaccaagaa gccccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggggcaagc

540

gttatccgga tttactgggt gtaaagggag cgtagacggc catgcaagtc tggtgtgaaa

600

ggcgggggct caacccccgg actgcattgg aaactgtatg gcttgagtgc cggagaggta

660

agcggaattc ctggtgtagc ggtgaaatgc gtagatatca ggaggaacac cagtggcgaa

720

ggcggcttac tggacggtaa ctgacgttga ggctcgaaag cgtggggagc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgaataccag gtgtcggggg acacggtcct

840

tcggtgccgc agcaaacgca ctaagtattc cacctgggga gtacgttcgc aagaatgaaa

900

ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa

960

cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcc ggacgaccgg acagtaacgt gtccttccct

1020

tcggggcgtc cgagacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg

1080

ttaagtcccg caacgagcgc aacccctgtt cccagtagcc agcattcagg atgggcactc

1140

tggggagact gccagggata acctggagga aggcggggat gacgtcaaat catcatgccc

1200

cttatgatct gggctacaca cgtgctacaa tggcgtgaac agagggaagc gaacccgcga

1260

gggggagcaa atcccagaaa taacgtccca gttcggattg tagtctgcaa cccggctaca

1320

tgaagctgga atcgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggtc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tcggaaatgc ccgaagtcag tgacccaacc

1440

ggaaggaggg agctgccgaa ggcggggccg gtaactgggg tgaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1535

<210> 440

<211> 1519

<212> DNA

<213> Buchnera aphidicola

<400> 440

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaagc ttaacacatg caagtcgagc

60

ggcatcgaag aaaagtttac ttttctggcg gcgagcggca aacgggtgag taacatctgg

120

ggatctacct aaaagagggg gacaaccatt ggaaacgatg gctaataccg cataatgttt

180

ttaaataaac caaagtaggg gactaaaatt tttagcctta tgcttttaga tgaacccaga

240

cgagattagc ttgatggtaa ggtaatggct taccaaggcg acgatctcta gctggtctga

300

gaggataacc agccacactg gaactgagat acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg ctaaagcctg atgcagctat gccgcgtgta tgaagaaggc

420

cttagggttg taaagtactt tcagcgggga ggaaagaatt atgtctaata tacatatttt

480

gtgacgttac ccgaagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcgag cgttaatcag aattactggg cgtaaagagc acgtaggcgg tttattaagt

600

cagatgtgaa atccctaggc ttaacttagg aactgcattt gaaactaata gactagagtc

660

tcatagaggg aggtagaatt ctaggtgtag cggtgaaatg cgtagatatc tagaggaata

720

cccgtggcga aagcgacctc ctaaatgaaa actgacgctg aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccat gctgtaaacg atgtcgactt ggaggttgtt

840

tcctagagaa gtggcttccg aagctaacgc attaagtcga ccgcctgggg agtacggtcg

900

caaggctaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc catagaattt tttagagata

1020

aaagagtgcc ttagggaact atgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat cctttgttgc catcaggtta

1140

tgctgggaac tcagaggaga ctgccggtta taaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1200

gtcatcatgg cccttacgac cagggctaca cacgtgctac aatggcatat acaaagagat

1260

gcaactctgc gaagataagc aaacctcata aagtatgtcg tagtccggac tggagtctgc

1320

aactcgactc cacgaagtag gaatcgctag taatcgtgga tcagaatgcc acggtgaata

1380

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggttgc aaaagaagca

1440

ggtagcttaa ccagattatt ttattggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg

1500

gtgaagtcgt aacaaggta

1519

<210> 441

<211> 1528

<212> DNA

<213> Bulleidia extructa

<400> 441

tcaaatgaag agtttgatcc tggctcagga taaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca

60

agtcgaacgc cggacaccta gcttgctagg gagaaggagt ggcgaacggg tgagtaatac

120

ataagcaatc tgcccacaaa gactgggata acctctggaa acggggacta ataccggata

180

ggtaggagag aggcatcttt cttctattaa agatgagaag cactagtgga tgagcttatg

240

gcgcattagt tagttggtga ggtaacggcc caccaagacg atgatgcgta gccggcctga

300

gagggtgaac ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

agggaatttt cggcaatggg gggaaccctg accgagcaac gccgcgtgag tgaagacggc

420

cttcgggttg taaagctctg ttgtaagaaa agataaacta ggagaggatc ttagtcagac

480

attatcttac cagaaagcca cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg

540

gcgagcgtta tccggaatta ttgggcgtaa agggtgcgta ggcggtctgt taagttcatg

600

gtcaaattgt ggggctcaac cccatcgcgc catggatact ggcagactag agtattggag

660

aggcaagtgg aattccatgt gtagcggtaa aatgcgtaga tatatggagg aacaccggtg

720

gcgaaggcga cttgctagcc aaagactgac gctgaggcac gaaagcgtgg ggagcaaata

780

ggattagata ccctagtagt ccacgctgta aacgatgaat actaagtatt ggggagactc

840

agtgctgcag ctaacgcatt aagtattccg cctgtggagt atgcacgcaa gtgtgaaaca

900

taaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagtatg tggtttaatt cgacgcaacg

960

cgaagaacct taccaggcct tgacatccct tgcgaagttc tagagatagg atagaggtta

1020

tcaaggagac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaaccct tgtcttcagt taccatcatt aagttgggga ctctggagag

1140

actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgg

1200

cctgggctac acacgtacta caatggctat tacaacgtgg agcgactgtg cgaacagaag

1260

cgaatcactg aaagatagtc tcagttcgga ttggagtctg caactcgact ccatgaagtt

1320

ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc cgcggtgaat acgttctcgg gccttgtaca

1380

caccgcccgt cataccatga gagttggtaa tacccgaagc cggtggccta accgaaagga

1440

aggagccgtc gaaggtagga ctaatgattg gggtcaagtc gtaacaaggt atccctacga

1500

gaacgtgggg atggatcacc tcctttct

1528

<210> 442

<211> 1537

<212> DNA

<213> Burkholderia ambifaria

<400> 442

ttaaactgaa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggcatgcc ttacacatgc

60

aagtcgaacg gcagcacggg tgcttgcacc tggtggcgag tggcgaacgg gtgagtaata

120

catcggaaca tgtcctgtag tgggggatag cccggcgaaa gccggattaa taccgcatac

180

gatccacgga tgaaagcggg ggaccttcgg gcctcgcgct atagggttgg ccgatggctg

240

attagctagt tggtggggta aaggcctacc aaggcgacga tcagtagctg gtctgagagg

300

acgaccagcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

360

aattttggac aatgggcgaa agcctgatcc agcaatgccg cgtgtgtgaa gaaggccttc

420

gggttgtaaa gcacttttgt ccggaaagaa atccttggtt ctaatacagc cgggggatga

480

cggtaccgga agaataagca ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg

540

tgcgagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgtgcgc aggcggtttg ctaagaccga

600

tgtgaaatcc ccgggctcaa cctgggaact gcattggtga ctggcaggct agagtatggc

660

agaggggggt agaattccac gtgtagcagt gaaatgcgta gagatgtgga ggaataccga

720

tggcgaaggc agccccctgg gccaatactg acgctcatgc acgaaagcgt ggggagcaaa

780

caggattaga taccctggta gtccacgccc taaacgatgt caactagttg ttggggattc

840

atttccttag taacgtagct aacgcgtgaa gttgaccgcc tggggagtac ggtcgcaaga

900

ttaaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggatgatgtg gattaattcg

960

atgcaacgcg aaaaacctta cctacccttg acatggtcgg aatcctgctg agaggcggga

1020

gtgctcgaaa gagaaccggc gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1080

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtcct tagttgctac gcaagagcac

1140

tctaaggaga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcctcatgg

1200

cccttatggg tagggcttca cacgtcatac aatggtcgga acagagggtt gccaacccgc

1260

gagggggagc taatcccaga aaaccgatcg tagtccggat tgcactctgc aactcgagtg

1320

catgaagctg gaatcgctag taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaata cgttcccggg

1380

tcttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggtttt accagaagtg gctagtctaa

1440

ccgcaaggag gacggtcacc acggtaggat tcatgactgg ggtgaagtcg taacaaggta

1500

gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcacct cctttcc

1537

<210> 443

<211> 1537

<212> DNA

<213> Burkholderia cenocepacia

<400> 443

ttgaactgaa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggcatgcc ttacacatgc

60

aagtcgaacg gcagcacggg tgcttgcacc tggtggcgag tggcgaacgg gtgagtaata

120

catcggaaca tgtcctgtag tgggggatag cccggcgaaa gccggattaa taccgcatac

180

gatccatgga tgaaagcggg ggaccttcgg gcctcgcgct atagggttgg ccgatggctg

240

attagctagt tggtggggta aaggcctacc aaggcgacga tcagtagctg gtctgagagg

300

acgaccagcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

360

aattttggac aatgggcgaa agcctgatcc agcaatgccg cgtgtgtgaa gaaggccttc

420

gggttgtaaa gcacttttgt ccggaaagaa atccttggct ctaatacagc cgggggatga

480

cggtaccgga agaataagca ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg

540

tgcgagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgtgcgc aggcggtttg ctaagaccga

600

tgtgaaatcc ccgggctcaa cctgggaact gcattggtga ctggcaggct agagtatggc

660

agaggggggt agaattccac gtgtagcagt gaaatgcgta gagatgtgga ggaataccga

720

tggcgaaggc agccccctgg gccaatactg acgctcatgc acgaaagcgt ggggagcaaa

780

caggattaga taccctggta gtccacgccc taaacgatgt caactagttg ttggggattc

840

atttccttag taacgtagct aacgcgtgaa gttgaccgcc tggggagtac ggtcgcaaga

900

ttaaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggatgatgtg gattaattcg

960

atgcaacgcg aaaaacctta cctacccttg acatggtcgg aatcctgctg agaggtggga

1020

gtgctcgaaa gagaaccggc gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1080

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtcct tagttgctac gcaagagcac

1140

tctaaggaga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcctcatgg

1200

cccttatggg tagggcttca cacgtcatac aatggtcgga acagagggtt gccaacccgc

1260

gagggggagc taatcccaga aaaccgatcg tagtccggat tgcactctgc aactcgagtg

1320

catgaagctg gaatcgctag taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaata cgttcccggg

1380

tcttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggtttt accagaagtg gctagtctaa

1440

ccgcaaggag gacggtcacc acggtaggat tcatgactgg ggtgaagtcg taacaaggta

1500

gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcacct cctttcc

1537

<210> 444

<211> 1494

<212> DNA

<213> Burkholderia cepacia

<400> 444

agtttgatcc tggctcagat tgaacgctag cggcatgcct tacacatgca agtcgaacgg

60

cagcacgggt gcttgcacct ggtggcgagt ggcgaacggg tgagtaatac atcggaacat

120

gtcctgtagt gggggatagc ccggcgaaag ccggattaat accgcatacg atctatggat

180

gaaagcgggg gaccttcggg cctcgcgcta tagggttggc cgatggctga ttagctagtt

240

ggtggggtaa aggcctacca aggcgacgat cagtagctgg tctgagagga cgaccagcca

300

cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga attttggaca

360

atgggcgaaa gcctgttcca gcaatgccgc gtgtgtgaag aaggccttcg ggttgtaaag

420

cacttttgtc cggaaagaaa tccttggttc taatacagcc gggggatgac ggtaccggaa

480

gaataagcac cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggt gcgagcgtta

540

atcggaatta ctgggcgtaa agcgtgcgca ggcggtttgc taagaccgat gtgaaatccc

600

cgggctcaac ctgggaactg cattggtgac tggcaggcta gagtatggca gaggggggta

660

gaattccacg tgtagcagtg aaatgcgtag agatgtggag gaataccgat ggcgaaggca

720

gccccctggg ccaatactga cgctcatgca cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

780

accctggtag tccacgccct aaacgatgtc aactagttgt tggggattca tttccttagt

840

aacgtagcta acgcgtgaag ttgaccgcct ggggagtacg gtcgcaagat taaaactcaa

900

aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gatgatgtgg attaattcga tgcaacgcga

960

aaaaccttac ctacccttga catggtcgga atcctgctga gaggtgggag tgctcgaaag

1020

agaaccgata cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1080

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcctt agttgctacg caagagcact ctaaggagac

1140

tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaag tcctcatggc ccttatgggt

1200

agggcttcac acgtcataca atggtcggaa cagagggttg ccaacccgcg agggggagct

1260

aatcccagaa aaccgatcgt agtccggatt gcactctgca actcgagtgc atgaagctgg

1320

aatcgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccatggga gtgggtttta ccagaagtgg ctagtctaac cgcaaggagg

1440

acggtcacca cggtaggatt catgactggg gtgaagtcgt aacaaggtaa ccaa

1494

<210> 445

<211> 1538

<212> DNA

<213> Burkholderia mallei

<400> 445

tgaactgaag agtttgatcc tggctcagat tgaacgctgg cggcatgcct tacacatgca

60

agtcgaacgg cagcacgggc ttcggcctgg tggcgagtgg tgaacgggtg agtaatacat

120

cggaacatgt cctgtagtgg gggatagccc ggcgaaagcc ggattaatac cgcatacgat

180

ctgaggatga aagcggggga ccttcgggcc tcgcgctata gggttggccg atggctgatt

240

agctagttgg tggggtaaag gcctaccaag gcgacgatca gtagctggtc tgagaggacg

300

accagccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

360

tttggacaat gggcgcaagc ctgatccagc aatgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg

420

ttgtaaagca cttttgtccg gaaagaaatc attctggcta atacccggag tggatgacgg

480

taccggaaga ataagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc

540

gagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgtgcgcagg cggtttgcta agaccgatgt

600

gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca ttggtgactg gcaggctaga gtatggcaga

660

ggggggtaga attccacgtg tagcagtgaa atgcgtagag atgtggagga ataccgatgg

720

cgaaggcagc cccctgggcc aatactgacg ctcatgcacg aaagcgtggg gagcaaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgccctaa acgatgtcaa ctagttgttg gggattcatt

840

tccttagtaa cgtagctaac gcgtgaagtt gaccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta

900

aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga tgatgtggat taattcgatg

960

caacgcgaaa aaccttacct acccttgaca tggtcggaag cccgatgaga gttgggcgtg

1020

ctcgaaagag aaccggcgca caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtccttag ttgctacgca agagcactct

1140

aaggagactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc ctcatggccc

1200

ttatgggtag ggcttcacac gtcatacaat ggtcggaaca gagggtcgcc aacccgcgag

1260

ggggagccaa tcccagaaaa ccgatcgtag tccggattgc actctgcaac tcgagtgcat

1320

gaagctggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt tcccgggtct

1380

tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttttacc agaagtggct agtctaaccg

1440

caaggaggac ggtcaccacg gtaggattca tgactggggt gaagtcgtaa caaggtagcc

1500

gtatcggaag gtgcggctgg atcacctcct ttctcgag

1538

<210> 446

<211> 1537

<212> DNA

<213> Burkholderia multivorans

<400> 446

ttgaactgaa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggcatgcc ttacacatgc

60

aagtcgaacg gcagcacggg tgcttgcacc tggtggcgag tggcgaacgg gtgagtaata

120

catcggaaca tgtcctgtag tgggggatag cccggcgaaa gccggattaa taccgcatac

180

gatctacgga tgaaagcggg ggaccttcgg gcctcgcgct atagggttgg ccgatggctg

240

attagctagt tggtggggta aaggcctacc aaggcgacga tcagtagctg gtctgagagg

300

acgaccagcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

360

aattttggac aatgggcgaa agcctgatcc agcaatgccg cgtgtgtgaa gaaggccttc

420

gggttgtaaa gcacttttgt ccggaaagaa atccttggtc ctaatacgat cgggggatga

480

cggtaccgga agaataagca ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg

540

tgcgagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgtgcgc aggcggtctg ttaagacaga

600

tgtgaaatcc ccgggctcaa cctgggaact gcatttgtga ctggcaggct agagtatggc

660

agaggggggt agaattccac gtgtagcagt gaaatgcgta gagatgtgga ggaataccga

720

tggcgaaggc agccccctgg gccaatactg acgctcatgc acgaaagcgt ggggagcaaa

780

caggattaga taccctggta gtccacgccc taaacgatgt caactagttg ttggggattc

840

atttccttag taacgtagct aacgcgtgaa gttgaccgcc tggggagtac ggtcgcaaga

900

ttaaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggatgatgtg gattaattcg

960

atgcaacgcg aaaaacctta cctacccttg acatggtcgg aatcctgaag agattcggga

1020

gtgctcgaaa gagaaccggc gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1080

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtcct tagttgctac gcaagagcac

1140

tctaaggaga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcctcatgg

1200

cccttatggg tagggcttca cacgtcatac aatggtcgga acagagggtt gccaacccgc

1260

gagggggagc taatcccaga aaaccgatcg tagtccggat tgcactctgc aactcgagtg

1320

catgaagctg gaatcgctag taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaata cgttcccggg

1380

tcttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggtttt accagaagtg gctagtctaa

1440

ccgcaaggag gacggtcacc acggtaggat tcatgactgg ggtgaagtcg taacaaggta

1500

gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcacct cctttcc

1537

<210> 447

<211> 1499

<212> DNA

<213> Burkholderia oklahomensis

<400> 447

agattgaacg ctggcggcat gccttacaca tgcaagtcga acggcagcac gggtgcttgc

60

acctggtggc gagtggcgaa cgggtgagta atacatcgga acatgtcctg tagtggggga

120

tagcccggcg aaagccggat taataccgca tacgatctga ggatgaaagc gggggacctt

180

cgggcctcgc gctatagggt tggccgatgg ctgattagct agttggtggg gtaaaggcct

240

accaaggcga cgatcagtag ctggtctgag aggacgacca gccacactgg gactgagaca

300

cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaattttg gacaatgggc gcaagcctga

360

tccagcaatg ccgcgtgtgt gaagaaggcc ttcgggttgt aaagcacttt tgtccggaaa

420

gaaatcctac cgactaatac tgggtgggga tgacggtacc ggaagaataa gcaccggcta

480

actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggtgcgagc gttaatcgga attactgggc

540

gtaaagcgtg cgcaggcggt ttgttaagac cgatgtgaaa tccccgggct caacctggga

600

actgcattgg tgactggcaa gctagagtat ggcagagggg ggtagaattc cacgtgtagc

660

agtgaaatgc gtagagatgt ggaggaatac cgatggcgaa ggcagccccc tgggccaata

720

ctgacgctca tgcacgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg

780

ccctaaacga tgtcaactag ttgttgggga ttcatttcct tagtaacgta gctaacgcgt

840

gaagttgacc gcctggggag tacggtcgca agattaaaac tcaaaggaat tgacggggac

900

ccgcacaagc ggtggatgat gtggattaat tcgatgcaac gcgaaaaacc ttacctaccc

960

ttgacatggt cggaatcctg ctgagaggtg ggagtgctcg aaagagaacc gatacacagg

1020

tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1080

caacccttgt ccttagttgc tacgcaagag cactctaagg agactgccgg tgacaaaccg

1140

gaggaaggtg gggatgacgt caagtcctca tggcccttat gggtagggct tcacacgtca

1200

tacaatggtc ggaacagagg gtcgccaacc cgcgaggggg agccaatccc agaaaaccga

1260

tcgtagtccg gattgcactc tgcaactcga gtgcatgaag ctggaatcgc tagtaatcgc

1320

ggatcagcat gccgcggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat

1380

gggagtgggt tttaccagaa gtggctagtc taaccgcaag gaggacggtc accacggtag

1440

gattcatgac tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtat cggaaggtgc ggctggatc

1499

<210> 448

<211> 1538

<212> DNA

<213> Burkholderia pseudomallei

<400> 448

tgaactgaag agtttgatcc tggctcagat tgaacgctgg cggcatgcct tacacatgca

60

agtcgaacgg cagcacgggc ttcggcctgg tggcgagtgg cgaacgggtg agtaatacat

120

cggaacatgt cctgtagtgg gggatagccc ggcgaaagcc ggattaatac cgcatacgat

180

ctgaggatga aagcggggga ccttcgggcc tcgcgctata gggttggccg atggctgatt

240

agctagttgg tggggtaaag gcctaccaag gcgacgatca gtagctggtc tgagaggacg

300

accagccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

360

tttggacaat gggcgcaagc ctgatccagc aatgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg

420

ttgtaaagca cttttgtccg gaaagaaatc attctggcta atacccggag tggatgacgg

480

taccggaaga ataagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc

540

gagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgtgcgcagg cggtttgcta agaccgatgt

600

gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca ttggtgactg gcaggctaga gtatggcaga

660

ggggggtaga attccacgtg tagcagtgaa atgcgtagag atgtggagga ataccgatgg

720

cgaaggcagc cccctgggcc aatactgacg ctcatgcacg aaagcgtggg gagcaaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgccctaa acgatgtcaa ctagttgttg gggattcatt

840

tccttagtaa cgtagctaac gcgtgaagtt gaccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta

900

aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga tgatgtggat taattcgatg

960

caacgcgaaa aaccttacct acccttgaca tggtcggaag cccgatgaga gttgggcgtg

1020

ctcgaaagag aaccggcgca caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtccttag ttgctacgca agagcactct

1140

aaggagactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc ctcatggccc

1200

ttatgggtag ggcttcacac gtcatacaat ggtcggaaca gagggtcgcc aacccgcgag

1260

ggggagccaa tcccagaaaa ccgatcgtag tccggattgc actctgcaac tcgagtgcat

1320

gaagctggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt tcccgggtct

1380

tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttttacc agaagtggct agtctaaccg

1440

caaggaggac ggtcaccacg gtaggattca tgactggggt gaagtcgtaa caaggtagcc

1500

gtatcggaag gtgcggctgg atcacctcct ttctcgag

1538

<210> 449

<211> 1474

<212> DNA

<213> Burkholderia rhizoxinica

<400> 449

gttgatcctg gctcagattg aacgctggcg gcatgcctta cacatgcaag tcggacggca

60

gcgcgggttt cggcctggcg gcgagtggcg aacgggtgag taagacatcg gaacgtgtcc

120

tggagtgggg gatagcccgg cgaaagccgg attaataccg catacgctct gaggaggaaa

180

gcgggggacc ttagggcctc gcgctcaagg ggcggccgat ggcagattag ctagttggta

240

gggtaaaggc ctaccaaggc gacgatctgt agctggtctg agaggacgac cagccacact

300

gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaattt tggacaatgg

360

gggcaaccct gatccagcaa tgccgcgtgt gtgaagaagg ccttcgggtt gtaaagcact

420

tttgtccgga aagaaaacgg cctggctaat acctgggctg gatgacggta ccggaagaat

480

aagcaccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcga gcgttaatcg

540

gaattactgg gcgtaaagcg tgcgcaggcg gtttgctaag accgatgtga aatccccggg

600

cttaacctgg gaactgcatt ggtgactggc aggctagagt atggcagagg gaggtagaat

660

tccacgtgta gcagtgaaat gcgtagagat gtggaggaat accgatggcg aaggcagcct

720

cctgggccaa tactgacgct catgcacgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc

780

tggtagtcca cgccctaaac gatgtcaact agttgttggg gattcatttc cttagtaacg

840

tagctaacgc gtgaagttga ccgcctgggg agtacggtcg caagattaaa actcaaagga

900

attgacgggg acccgcacaa gcggtggatg atgtggatta attcgatgca acgcgaaaaa

960

ccttacctac ccttgacatg gtcggaaccc tgctgagagg tgggggtgct cgaaagagaa

1020

ccggcgcaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc

1080

ccgcaacgag cgcaaccctt gtccttagtt gctacgcaag agcactctag ggagactgcc

1140

ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcct catggccctt atgggtaggg

1200

cttcacacgt catacaatgg tcggaacaga gggttgccaa cccgcgaggg ggagctaatc

1260

ccagaaaacc gatcgtagtc cggattgcag tctgcaactc gactgcatga agctggaatc

1320

gctagtaatc gcggatcagc atgtcgcggt gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc

1380

ccgtcacacc atgggagtgg gttttaccag aagtggctag tctaaccgca aggaggacgg

1440

tcaccacggt aggattcatg actggggtga agtc

1474

<210> 450

<211> 1537

<212> DNA

<213> Burkholderia sp. 383

<400> 450

ttaaactgaa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggcatgcc ttacacatgc

60

aagtcgaacg gcagcacggg tgcttgcacc tggtggcgag tggcgaacgg gtgagtaata

120

catcggaaca tgtcctgtag tgggggatag cccggcgaaa gccggattaa taccgcatac

180

gatctacgga tgaaagcggg ggaccttcgg gcctcgcgct atagggttgg ccgatggctg

240

attagctagt tggtggggta aaggcctacc aaggcgacga tcagtagctg gtctgagagg

300

acgaccagcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

360

aattttggac aatgggcgaa agcctgatcc agcaatgccg cgtgtgtgaa gaaggccttc

420

gggttgtaaa gcacttttgt ccggaaagaa atccttggcc ctaatacggt cgggggatga

480

cggtaccgga agaataagca ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg

540

tgcgagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgtgcgc aggcggtttg ctaagaccga

600

tgtgaaatcc ccgggctcaa cctgggaact gcattggtga ctggcaggct agagtatggc

660

agaggggggt agaattccac gtgtagcagt gaaatgcgta gagatgtgga ggaataccga

720

tggcgaaggc agccccctgg gccaatactg acgctcatgc acgaaagcgt ggggagcaaa

780

caggattaga taccctggta gtccacgccc taaacgatgt caactagttg ttggggattc

840

atttccttag taacgtagct aacgcgtgaa gttgaccgcc tggggagtac ggtcgcaaga

900

ttaaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggatgatgtg gattaattcg

960

atgcaacgcg aaaaacctta cctacccttg acatggtcgg aattccgctg agaggtggaa

1020

gtgctcgaaa gagaaccggc gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1080

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtcct tagttgctac gcaagagcac

1140

tctaaggaga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcctcatgg

1200

cccttatggg tagggcttca cacgtcatac aatggtcgga acagagggtc gccaacccgc

1260

gagggggagc taatcccaga aaaccgatcg tagtccggat tgcactctgc aactcgagtg

1320

catgaagctg gaatcgctag taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaata cgttcccggg

1380

tcttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggtttt accagaagtg gctagtctaa

1440

ccgcaaggag gacggtcacc acggtaggat tcatgactgg ggtgaagtcg taacaaggta

1500

gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcacct cctttct

1537

<210> 451

<211> 1462

<212> DNA

<213> Burkholderia xenovorans

<400> 451

gaacgctggc ggcatgcctt acacatgcaa gtcgaacggc agcacggggg caaccctggt

60

ggcgagtggc gaacgggtga gtaatacatc ggaacgtgtc ctgtagtggg ggatagcccg

120

gcgaaagccg gattaatacc gcatacgctc tgcggaggaa agcgggggat cttcggacct

180

cgcgctacag gggcggccga tggcagatta gctggttggt ggggtaaagg cctaccaagg

240

cgacgatctg tagctggtct gagaggacga ccagccacac tgggactgag acacggccca

300

gactcctacg ggaggcagca gtggggaatt ttggacaatg ggcgcaagcc tgatccagca

360

atgccgcgtg tgtgaagaag gccttcgggt tgtaaagcac ttttgtccgg aaagaaaacc

420

tctgccctaa tacggtgggg ggatgacggt accggaagaa taagcaccgg ctaactacgt

480

gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgca agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc

540

gtgcgcaggc ggttcgctaa gacagatgtg aaatccccgg gcttaacctg ggaactgcat

600

ttgtgactgg cgggctagag tatggcagag gggggtagaa ttccacgtgt agcagtgaaa

660

tgcgtagaga tgtggaggaa taccgatggc gaaggcagcc ccctgggcca atactgacgc

720

tcatgcacga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccctaaa

780

cgatgtcaac tagttgtcgg gtcttcattg acttggtaac gtagctaacg cgtgaagttg

840

accgcctggg gagtacggtc gcaagattaa aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca

900

agcggtggat gatgtggatt aattcgatgc aacgcgaaaa accttaccta cccttgacat

960

gtatggaagt ctgctgagag gtggatgtgc ccgaaaggga gccataacac aggtgctgca

1020

tggctgtcga cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcacccct

1080

tgtccctagt tgctacgcaa gagcactcca gggagactgc cggtgacaac ccggaggaag

1140

gtggggatga cgtcaagtcc tcatggccct tatgggtagg gcttcacacg tcatacaatg

1200

gtcggaacag agggtcgcca acccgcgagg gggagccaat cccagaaaac cgatcgtagt

1260

ccggatcgca ctctgcaact cgggtgcgtg aagctggaat cgctagtaat cgcggatcag

1320

catgccgcgg tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg

1380

ggttttacca gaagtggcta gtctaaccgc aaggaggacg gtcaccacgg taggattcat

1440

gactgggtga agtcgtaaca ag

1462

<210> 452

<211> 1543

<212> DNA

<213> Burkholderiales bacterium 1_1_47

<400> 452

ttaaacaata gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggaacgct ttacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacgcggg agaagcttgc ttctcccggc gacgagtggc gaacgggtga

120

gtaatacatc ggaacgtgtc cgctcgtggg ggacaaccag ccgaaaggtt ggctaatacc

180

gcatgagttc tacggaagaa agagggggac ccgcaagggc ctctcgcgag cggagcggcc

240

gatgactgat tagccggttg gtgaggtaac ggctcaccaa agcaacgatc agtagctggt

300

ctgagaggac gaccagccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag

360

cagtggggaa ttttggacaa tgggcgcaag cctgatccag ctattccgcg tgtgggatga

420

aggccctcgg gttgtaaacc acttttgtag agaacgaaaa gacaccttcg aataaagggt

480

gttgctgacg gtactctaag aataagcacc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

540

acgtagggtg cgagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gggtgcgcag gcggttgagt

600

aagacagatg tgaaatcccc gagcttaact cgggaatggc atatgtgact gctcgactag

660

agtgtgtcag agggaggtgg aattccacgt gtagcagtga aatgcgtaga tatgtggaag

720

aacaccgatg gcgaaggcag cctcctggga cataactgac gctcaggcac gaaagcgtgg

780

ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgcccta aacgatgtta actagttgtt

840

gggaagtaaa attctcagta acgcagccaa cgcgagaagt taaccgcctg ggaagtacgg

900

tcgcaagact aaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg atgatgtgga

960

ttaattcgat gcaacgcgaa aaaccttacc tacccttgac atgtcaggaa gctcttgtaa

1020

tgagagtgtg cccgcaaggg agcctgaaca caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg

1080

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtcactag ttgctacgaa

1140

agggcactct agtgagactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

ctcatggccc ttatgggtag ggcttcacac gtcatacaat ggtcggaaca gagggcagcg

1260

aagtcgtgag acggagccaa tcccagaaaa ccgatcgtag tccggattgc agtctgcaac

1320

tcgactgcat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaaa caatgggagt ggtgtttacc agaagtcgtt

1440

agcctaaccg caaggagggc ggcgaccacg gtgagcaccg tgactaatgt taagtcgtaa

1500

caaggtagcc gtaccggaag gtgcggctgg atcacctcct ttc

1543

<210> 453

<211> 1481

<212> DNA

<213> Butyricicoccus pullicaecorum

<400> 453

agtttgatcc tggctcagga tgaacgctgg cggcgtgcct aacacatgca agtcgaacgg

60

agttgtttga ggaaatcctt cgggatggaa tcttccaact tagtggcgga cgggtgagta

120

acgcgtgagc aatctgcctt tcagaggggg ataacagccg gaaacggctg ctaataccgc

180

ataatgcatt gaattcgcat gtttttgatg ccaaagattt tatcgctgaa agatgagctc

240

gcgtctgatt agctagttgg cggggtaacg gcccaccaag gcgacgatca gtagccggac

300

tgagaggttg aacggccaca ttgggactga ggacacggcc cagactccta ccgggaggca

360

gcagtgggga atattgcgca atgggggcaa ccctgacgca gcaacgccgc gtgattgatg

420

aaggtcttcg gattgtaaaa atctttaatc agggacgaaa caaatgacgg tacctgaaga

480

ataagctccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggagc aagcgttatc

540

cggatttact gggtgtaaag ggcgtgtagg cgggcttgta agttggaagt gaaatctcgg

600

ggcttaaccc cgaaactgct ttcaaaactg cgagtcttga gtgatggaga ggcaggcgga

660

attcccagtg tagcggtgaa atgcgtagat attgggagga acaccagtgg cgaaggcggc

720

ctgctggaca ttaactgacg ctgaggcgcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac

780

cctggtagtc cacgccgtaa acgatggata ctaggtgtgg gaggtattga ccccttccgt

840

gccggagtta acacaataag tatcccacct ggggagtacg gccgcaaggt tgaaactcaa

900

aggaattgac gggggcccgc acaagcagtg gagtatgtgg tttaattcga agcaacgcgc

960

aagaacctta ccaagtcttg acatcccgat gaccgctcya gagatagggc ttttcttcgg

1020

aacatcggtg acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1080

gtcccgcaac gagcgcaacc cttacgggtt agttgctacg caagagcact ctagccggac

1140

tgccgttgac aaaacggagg aaggtgggga cgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgact

1200

tgggctacac acgtactaca atggcagtca tacagaggga agcaaaaccg cgaggtggag

1260

caaatcccta aaagctgtcc cagttcagat tgcaggctgc aactcgcctg catgaagtcg

1320

gaattgctag taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac

1380

accgcccgtc acaccatgag agccggtaat acccgaagtc cgtagtctaa ccgcaaggag

1440

gacgcggccg aaggtaggac tggtaattgg gacgaagtcg t

1481

<210> 454

<211> 1379

<212> DNA

<213> Butyricimonas virosa

<220>

<221> modified_base

<222> (14)..(14)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 454

ggggcagcgc gggnagtagc aatactctcg ccggcgaccg gcgcacgggt gagtaacacg

60

tgtgcaacca accccgtacc gggagataac ccgcggaaac gtggactaac atcccataag

120

actctagagc cgcatggctc tggatttaaa attccggtgg tacgggacgg gcacgcgcga

180

cattaggtag ttggcggggt aacggcccac caagccgacg atgtctaggg gttctgagag

240

gaaggtcccc cacactggaa ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtgag

300

gaatattggt caatgggcga gagcctgaac cagccaagtc gcgtgaggga agaatggtct

360

atggcctgta aacctctttt gtcaaggaag aataaaaggt acgtgtacct tcttgccagt

420

acttgacgaa taagcatcgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac gggggatgcg

480

agcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg gcgcgtaggc gggacccaag tcagcggtaa

540

aagactgcag ctaaactgta gcacgccgtt gaaactggcg acctcgagac gagacgaggg

600

aggcggaaca agtgaagtag cggtgaaatg cttagatatc acttggaacc ccgatagcga

660

aggcagcttc ccaggctcga tctgacgtga tgcgcgagag cgtgggtagc gaacaggatt

720

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgctcactgg atcttggcga tacactgcca

780

gggttcaagc gaaagtatta agtgagccac ctggggagta cgtcggcaac gatgaaactc

840

aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg aggaacatgt ggtttaattc gatgatacgc

900

gaggaacctt acccgggttt aaatgtattt tgcatttctt ggaaacagga attcccttcg

960

gggctagata caaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt gtcgggttaa

1020

gtcccataac gagcgcaacc cctatcgcca gttgccagcg gctgaggccg ggcactctgt

1080

cgagactgcc accgtaaggt gcgaggaagg cggggatgac gtcaaatcag cacggccctt

1140

acacccgggg cgacacacgt gttacaatgg ccggtacaga gggcagccac ggggtgaccc

1200

ggagcgaatc tctaaagccg gtcgtagttc ggactggagt ctgcaacccg actccacgaa

1260

gttggattcg ctagtaatcg cgcatcagcc atggcgcggt gaatacgttc ccgggccttg

1320

tacacaccgc ccgtcaagcc atggaagccg ggagtacctg aagatcgtga ccgcgagga

1379

<210> 455

<211> 1526

<212> DNA

<213> Butyrivibrio crossotus

<400> 455

tttatatgag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca

60

agtcgaacga agcacttcat aaagcttgct ttaagaagtg acttagtggc ggacgggtga

120

gtaacgcgtg ggtaacctgc cttacacagg gggataacag ttagaaatga ctgctaatac

180

cgcataaaac agcagagtcg catgactcaa ctgtcaaaga tttatcggtg taagatggac

240

ccgcgtctga ttagcttgtt ggtggggtaa cggcctacca aggcgacgat cagtagccgg

300

cctgagaggg tgaacggcca cattgggact gagacacggc ccaaactcct acgggaggca

360

gcagtgggga atattggaca atgggcgaaa gcctgatcca gcgacgccgc gtgagcgatg

420

aagtatttcg gtatgtaaag ctctatcagc agggaagaaa acgacggtac ctgactaaga

480

agccccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggggcaag cgttatccgg

540

atttactggg tgtaaaggga gcgtagacgg catcacaagt cagaagtgaa aatccggggc

600

tcaaccccgg aactgctttt gaaactgtgg agctggagtg caggagaggt aagcggaatt

660

cctagtgtag cggtgaaatg cgtagatatt aggaggaaca ccagtggcga aggcggctta

720

ctggactgta actgacgttg aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct

780

ggtagtccac gccgtaaacg atgaatacta ggtgttgggt ttcataagaa gctcggtgcc

840

ggcgcaaacg cattaagtat tccacctggg gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg

900

aattgacggg gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga

960

accttaccaa gtcttgacat cccgttgacc tgttatgtaa tgtaacatct cttcggagca

1020

acggagacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1080

cgcaacgagc gcaacccttg tccttagtag ccagcagtaa gatgggcact ctagggagac

1140

tgccggggat aactcggagg aaggtgggga cgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgact

1200

tgggctacac acgtgctaca atggcgtaaa caaagggaag cgaacctgtg aaggcaagca

1260

aatcccaaaa ataacgtctc agttcggatt gtagtctgca actcgactac atgaagctgg

1320

aatcgctagt aatcgcagat cagaatgctg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccatggga gtcgtaaatg cccgaagtcg gtgacctaac cgtaaggaag

1440

gagccgccga aggcaggtat gataactggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtatcgga

1500

aggtgcggct ggatcacctc ctttct

1526

<210> 456

<211> 1477

<212> DNA

<213> Butyrivibrio fibrisolvens

<400> 456

tggcggcgtg cctaacacat gcaagtcgaa cggagttatt cgctgatgaa gcttcggcag

60

aatcttgaat aacttagtgg cggacgggtg agtaacgcgt gggtaacctg cctcatacag

120

ggggatagca gttggaaacg actgataaca ccgcataagc gcacagtgtc gcatgacaca

180

gtgtgaaaat atttataggt atgagatgga cccgcgtctg attagctagt tggtgaggta

240

acggcccacc aaggcgacga tcagtagccg gcctgagagg gcggacggcc acattgggac

300

tgagacacgg cccaaactcc tacgggaggc agcagtgggg gatattgcac aatgggcgaa

360

agcctgatgc agcgacgccg cgtgagtgaa gaagtatttc ggtatgtaaa gctctatcag

420

cagggaagaa agacctcgta agaggggatg acggtacctg agtaagaagc cccggctaac

480

tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gggcaagcgt tatccggatt tactgggtgt

540

aaagggagcg tagacggtgt atcaagtctg aagtgaaacc ccacggctca accgtgggct

600

tgctttggaa actggtagac tagagtactg gagaggtaag cggaattcct ggtgtagtag

660

tgaaatgcgt agatatcagg aagaacatca gtggcgaagg cggcttactg gacagcaact

720

gacgttgagg ctcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc

780

gtaaacgatg aatactaggt gttgggagac atagtctttc agtgccggcg ctaacgcaat

840

aagtattcca cctggggagt acgttcgcaa gaatgaaact caaaggaatt gacggggacc

900

cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaaatct

960

tgagatccag atgaatgatg ggtaatgcca tcagtccttc gggacatctg agacaggtgg

1020

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtc aagtcccgca acgagcgcaa

1080

cccttgtcca tagtagccag cagtaagatg ggcactctat ggagactgcc agggataacc

1140

tggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgatttggg ccacacacgt

1200

gctacaatgt cgtaacaaag ggaagcaacc ctgcgaaggt gagcaaatcc caaaaataac

1260

gacccagttc ggactgtagg ctgcaacccg cctgcacgaa gctggaatcg ctagtaatcg

1320

cagatcagaa tgctgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca

1380

tgggagtcgg aaatgcccaa agtcagtggc ctaaccgtaa ggagggagct tgctaaggca

1440

ggtcggataa ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagcc

1477

<210> 457

<211> 1466

<212> DNA

<213> Caldimonas manganoxidans

<400> 457

attgaacgct ggcggcatgc tttacacatg caagtcgaac ggcagcgggt ccttcgggat

60

gccggcgagt ggcgaacggg tgagtaatgc atcggaacgt acccagtcgt gggggataac

120

tactcgaaag agtagctaat accgcatacg acctgagggt gaaagcgggg gaccgcaagg

180

cctcgcgcga ttggagcggc cgatgtcgga ttagctagtt ggtggggtaa aggcttacca

240

aggcgacgat ccgtagctgg tctgagagga cggccagcca cactgggact gagacacggc

300

ccagactcct acgggaggca gcagtgggga attttggaca atgggcgcaa gcctgatcca

360

gccatgccgc gtgcgggaag aaggccttcg ggttgtaaac cgcttttgtc agggaagaaa

420

agctctgggc taatacctcg gagtgatgac ggtacctgaa gaataagcac cggctaacta

480

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggt gcgagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa

540

agcgtgcgca ggcggttgtg caagacagat gtgaaatccc cgggcttaac ctgggaactg

600

catttgtgac tgcacggcta gagtgcggca gagggggatg gaattccgcg tgtagcagtg

660

aaatgcgtag atatgcggag gaacaccgat ggcgaaggca gtcccctggg cctgcactga

720

cgctcatgca cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccct

780

aaacgatgtc aactggttgt tggggattca tttcctcagt aacgaagcta acgcgtgaag

840

ttgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac ggggacccgc

900

acaagcggtg gatgatgtgg tttaattcga tgcaacgcga aaaaccttac ctacccttga

960

catgccagga accctgcaga gatgtggggg tgctcgaaag agagcctgga cacaggtgct

1020

gcatggccgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1080

ccttgccatt agttgctacg aaagggcact ctaatgggac tgccggtgac aaaccggagg

1140

aaggtgggga tgacgtcagg tcctcatggc ccttatgggt agggctacac acgtcataca

1200

atggccggta cagagggctg ccaacccgcg agggggagcc aatcccagaa aaccggtcgt

1260

agtccggatc gcagtctgca actcgactgc gtgaagtcgg aatcgctagt aatcgcggat

1320

cagcatgtcg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga

1380

gcgggttctg ccagaagtgg gtagcctaac cgcaaggagg gcgcttacca cggcagggtt

1440

cgtgactggg gtgaagtcgt aacaag

1466

<210> 458

<211> 1456

<212> DNA

<213> Caminicella sporogenes

<400> 458

tgatcatggc tcaggatgaa cgctggcggc gtgcctaaca catgcaagtc gagcggagct

60

ttaatctttt cagcttagct gaaaagatta aagcttagcg gcggacgggt gagtaacgcg

120

tgggcaacct gccctgtgca gggggataac acatcgaaag gtgtgctaat accccataag

180

actacgatgt cgcatggcat agtagtaaaa gctgaggcgg cacaggatgg gcccgcgtct

240

gattagctag ttggtagggt aacggcctac caaggcaacg atcagtagcc gacctgagag

300

ggtgaacggc cacactggaa ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaatattgca caatggggga aaccctgatg cagcaacgcc gcgtgagcga agaaggcctt

420

cgggtcgtaa agctctgtcc taagggaaga aagatgacgg taccttagga ggaagccccg

480

gctaactacg tgccagcagc cgcggtaaaa cgtagggggc gagcgttatc cggaatgact

540

gggcgtaaag ggtgtgtagg cggccggtaa agtctggggt gaaaggctac ggcttaaccg

600

tagtaagcct tggaaactta tcggcttgag tgcaggagag gagagcggaa ttcctagtgt

660

agcggtgaaa tgcgtagata ttaggaggaa caccagtggc gaaggcggct ctctggactg

720

caactgacgc tgaggcacga aagcgtgggg agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

acgccgtaaa cgatgagtgc taggtgttgg aggttcatac tttcagtgcc gcagttaacg

840

cattaagcac tccgcctggg gagtacggtc gcaagactga aactcaaagg aattgacggg

900

gacccgcaca agcagcggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag

960

gacttgacat ccctgtgaca gcttcttaat cgaagccttc ccttcgggga cacaggagac

1020

aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1080

gcgcaaccct tgtctttagt tgccagcact tagggtgggc actctaaaga gactgccggt

1140

gataaaccgg aggaaggtgg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gttctgggct

1200

acacacgtgc tacaatggct ggtacaaagg gaagcgaagg agtaatccgg agcgaatccc

1260

aaaaagccag tcccagttcg gattgtgggc tgcaactcgc ccacatgaag ccggagttgc

1320

tagtaatcgc gaatcagaat gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc

1380

gtcacaccat gggagcccat ggcacccgaa gtcagtgagt caaccgtaaa ggagacagct

1440

gccgaaggtg aaatgg

1456

<210> 459

<211> 1517

<212> DNA

<213> Campylobacter coli

<400> 459

tttttatgga gagtttgatc ctggctcaga gtgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgaacg atgaagcttc tagcttgcta gaagtggatt agtggcgcac gggtgagtaa

120

ggtatagtta atctgcccta cacaagagga caacagttgg aaacgactgc taatactcta

180

tactcctgct taacacaagt tgagtaggga aagtttttcg gtgtaggatg agactatata

240

gtatcagcta gttggtaagg taatggctta ccaaggctat gacgcttaac tggtctgaga

300

ggatgatcag tcacactgga actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtag

360

ggaatattgc gcaatggggg aaaccctgac gcagcaacgc cgcgtggagg atgacacttt

420

tcggagcgta aactcctttt cttagggaag aattctgacg gtacctaagg aataagcacc

480

ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg caagcgttac tcggaatcac

540

tgggcgtaaa gggcgcgtag gcggattatc aagtctcttg tgaaatctaa tggcttaacc

600

attaaactgc ttgggaaact gatagtctag agtgagggag aggcagatgg aattggtggt

660

gtaggggtaa aatccgtaga tatcaccaag aatacccatt gcgaaggcga tctgctggaa

720

ctcaactgac gctaaggcgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt

780

ccacgcccta aacgatgtac actagttgtt ggggtgctag tcatctcagt aatgcagcta

840

acgcattaag tgtaccgcct ggggagtacg gtcgcaagat taaaactcaa aggaatagac

900

ggggacccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga ggatacgcga agaaccttac

960

ctgggcttga tatcctaaga accttttaga gataagaggg tgctagcttg ctagaactta

1020

gagacaggtg ctgcacggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1080

aacgagcgca acccacgtat ttagttgcta acggttcggc cgagcactct aaatagactg

1140

ccttcgtaag gaggaggaag gtgtggacga cgtcaagtca tcatggccct tatgcccagg

1200

gcgacacacg tgctacaatg gcatatacaa tgagacgcaa taccgcgagg tggagcaaat

1260

ctataaaata tgtcccagtt cggattgttc tctgcaactc gagagcatga agccggaatc

1320

gctagtaatc gtagatcagc catgctacgg tgaatacgtt cccgggtctt gtactcaccg

1380

cccgtcacac catgggagtt gatttcactc gaagccggaa tactaaacta gttaccgtcc

1440

acagtggaat cagcgactgg ggtgaagtcg taacaaggta accgtaggag aacctgcggt

1500

tggatcacct cctttct

1517

<210> 460

<211> 1458

<212> DNA

<213> Campylobacter concisus

<400> 460

aatatggaga gtttgatcct ggctcagagt gaacgctggc ggcgtgccta atacatgcaa

60

gtcgaacgga caagtaagag cttgctctta tgagttagtg gcgcacgggt gagtaatgta

120

tagctaatct gccctacact agaggacaac agttggaaac gactgctaat actctatact

180

cctgtcttac ataagttaga tagggaaagt ttttcggtgt aggatgaggc tatattgtat

240

cagctagttg gtgaggtaat ggctcaccaa ggctatgacg cataactggt ctgagaggat

300

gatcagtcac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtagggaa

360

tattgctcaa tgggggaaac cctgaagcag caacgccgcg tggaggatga cacttttcgg

420

agcgtaaact ccttttgtta gggaagaaca atgacggtac ctaacgaata agcaccggct

480

aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg agggtgcaag cgttactcgg aatcactggg

540

cgtaaaggac gcgtaggcgg attatcaagt ctcttgtgaa atcctatggc ttaaccatag

600

aactgcttgg gaaactgata atctagagtg agggagaggc agatggaatt ggtggtgtag

660

gggtaaaatc cgtagagatc accaggaata cccattgcga aggcgatctg ctggaactca

720

actgacgcta atgcgtgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac

780

gccctaaacg atgtatacta gttgttgcta agctagtctt ggcagtaatg cacctaacgg

840

attaagtata ccgcctgggg agtacggtcg caagattaaa actcaaagga atagacgggg

900

acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagat acgcgaagaa ccttacccgg

960

acttgatatc taacaaatca tctagagata gaagagtgtc tgcttgcaga aatgttaaga

1020

caggtgctgc acggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc acgtcattag ttgctaacag ttcggctgag cactctaatg agactgcctt

1140

cgtaaggagg aggaaggtgt ggacgacgtc aagtcatcat ggcccttatg tccggggcga

1200

cacacgtgct acaatggcat atacaatgag aagcaatatc gcgagatgga gcaaatctat

1260

aaaatatgtc ccagttcgga ttggagtctg caactcgact ccatgaagcc ggaatcgcta

1320

gtaatcgtag atcagccatg ctacggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac tcaccgcccg

1380

tcacaccatg ggagttgatt tcactcgaag ccggaatact aaattagtta ccgtccacag

1440

tggaatcagc gactgggg

1458

<210> 461

<211> 1355

<212> DNA

<213> Campylobacter curvus

<400> 461

gtctgcgaag tcgtaatatt taattgcgaa gcaagtaaat attacatagg gtttctcgct

60

atgggatgag gctatatcgt atcagctagt tggtagggta atggcttacc aaggctatga

120

cgcgtaactg gtctgagagg atgatcagtc acactggaac tgagacacgg tccagactcc

180

tacgggaggc agcagtaggg aatattgctc aatgggggaa accctgaagc agcaacgccg

240

cgtggaggat gacacttttc ggagcgtaaa ctccttttct tggggaagaa atttgacggt

300

acccaaggaa taagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgca

360

agcgttactc ggaatcactg ggcgtaaagg acgcgtaggc ggattatcaa gtctcttgtg

420

aaatccaatg gcttaaccat tgaactgctt gagaaactga taatctagag tgagggagag

480

gcagatggaa ttggtggtgt aggggtaaaa tccgtagaga tcaccaggaa tacccattgc

540

gaaggcgatc tgctggaact caactgacgc taatgcgtga aagcgtgggg agcaaacagg

600

attagatacc ctggtagtcc acgccctaaa cgatgtatac tagttgttgc taagctagtc

660

ttggcagtaa tgcacctaac ggattaagta taccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta

720

aaactcaaag gaatagacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag

780

atacgcgaag aaccttaccc ggacttgata tctaacaaat catctagaga tagaagagtg

840

tctgcttgca gaaatgttaa gacaggtgct gcacggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

900

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccacgtcatt agttgctaac ggttcggccg

960

agcactctaa tgagactgcc ttcgcaagga ggaggaaggt gtggacgacg tcaagtcatc

1020

atggccctta tgtccggggc gacacacgtg ctacaatggc atatacaatg agacgcaata

1080

tcgcgagatg gagcaaatct ataaaatatg tcccagttcg gattggagtc tgcaactcga

1140

ctccatgaag ccggaatcgc tagtaatcgt agatcagcca tgctacggtg aatacgttcc

1200

cgggtcttgt actcaccgcc cgtcacacca tgggagttga tttcactcga agcccaaata

1260

ccaaaccggt tatggtccac agtggaatca gcgactgggg tgaagtcgta acaaggtaac

1320

cgtaggagaa cctgcggttg gatcacctcc tttct

1355

<210> 462

<211> 1521

<212> DNA

<213> Campylobacter fetus

<400> 462

tttttatgga gagtttgatc ctggctcaga gtgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgaacg gagtattaag agagcttgct cttttaatac ttagtggcgc acgggtgagt

120

aatgtatagt taatctgccc tacactggag gacaacagtt agaaatgact gctaatactc

180

catactcctt cttaacataa gttaagtcgg gaaagttttt cggtgtagga tgagactata

240

ttgtatcagc tagttggtaa ggtaatggct taccaaggct ttgacgcata actggtctga

300

gaggatgatc agtcacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

agggaatatt gctcaatggg ggaaaccctg aagcagcaac gccgcgtgga ggatgacact

420

tttcggagcg taaactcctt ttgttaggga agaaccatga cggtacctaa cgaataagca

480

ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg tgcaagcgtt actcggaatc

540

actgggcgta aaggacgcgt aggcggatta tcaagtcttt tgtgaaatct aacagcttaa

600

ctgttaaact gcttgagaaa ctgataatct agagtgaggg agaggcagat ggaattggtg

660

gtgtaggggt aaaatccgta gagatcacca ggaataccca ttgcgaaggc gatctgctgg

720

aactcaactg acgctaatgc gtgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta

780

gtccacgccc taaacgatgt atactagttg ttgctgtgct agtcacggca gtaatgcacc

840

taacggatta agtataccgc ctggggagta cggtcgcaag attaaaactc aaaggaatag

900

acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagatacgc gaagaacctt

960

acctgggctt gatatccaac taatctctta gagataagag agtgctagct tgctagaaag

1020

ttgagacagg tgctgcacgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1080

gcaacgagcg caacccacgt atttagttgc taacagttcg gctgagcact ctaaatagac

1140

tgccttcgca aggaggagga aggtgtggac gacgtcaagt catcatggcc cttatgccca

1200

gggcgacaca cgtgctacaa tggcatatac aatgagatgc aatatcgcga gatggagcaa

1260

atctataaaa tatgtcccag ttcggattgg agtctgcaac tcgactccat gaagccggaa

1320

tcgctagtaa tcgtagatca gccatgctac ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtactcac

1380

cgcccgtcac accatgggag ttgatttcac tcgaagtcgg aatgctaaac tagctaccgc

1440

ccacagtgga atcagcgact ggggtgaagt cgtaacaagg taaccgtagg agaacctgcg

1500

gttggatcac ctcctttcta g

1521

<210> 463

<211> 1515

<212> DNA

<213> Campylobacter gracilis

<400> 463

aatatggaga gtttgatcct ggctcagagt gaacgctggc ggcgtgccta atacatgcaa

60

gtcgaacgga atttaagaga gcttgctctt ttaaatttag tggcgcacgg gtgagtaata

120

tatagctaat ctgccccttg ctggaggaca acagttagaa atgactgcta atactccata

180

ctccttttta ccataagata aatcgggaaa gaatttcggc aagggatgag actatatcgt

240

atcagctagt cggtggggta acggcctacc gaggctatga cgcgtaactg gtctgagagg

300

atgatcagtc acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc agcagtaggg

360

aatattgcgc aatgggggaa accctgacgc agcaacgccg cgtggaggat gacacttttc

420

ggagcgtaaa ctccttttgt tagggaagaa taatgacggt acctaacgaa taagcaccgg

480

ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgca agcgttactc ggaatcactg

540

ggcgtaaagg acgcgtaggc ggattatcaa gtctcttgtg aaatctaacg gcttaaccgt

600

taaactgctt gggaaactga taatctagag taagggagag gcagatggaa ttcttggtgt

660

aggggtaaaa tccgtagata tcaagaagaa tacctattgc gaaggcgatc tgctggaact

720

taactgacgc taatgcgtga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

acgccctaaa cgatgtatac cggttgttgc tgtgctagtc acggcagtaa tccacctaac

840

ggattaagta taccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta aaactcaaag gaatagacgg

900

ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag atacgcgaag aaccttaccc

960

ggacttgata tctaacaaat catccagaga tggaagagtg tctgcttgca gaaatgttaa

1020

gacaggtgct gcacggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1080

cgagcgcaac ccacgtcatt agttgctaac ggttcggccg agcactctaa tgagactgcc

1140

ttcgtaagga ggaggaaggt gtggacgacg tcaagtcatc atggccctta tgtccggggc

1200

gacacacgtg ctacaatggc atatacaata agacgcaata tcgtaagatg gagcaaatct

1260

aaaaaatatg tcccagttcg gattggagtc tgcaactcga ctccatgaag ccggaatcgc

1320

tagtaatcgt agatcagcca tgctacggtg aatacgttcc cgggtcttgt actcaccgcc

1380

cgtcacacca tgggagttga tttcactcga agcgggaatg cgaaattcgc taccctccac

1440

agtggaatca gcgactgggg tgaagtcgta acaaggtaac cgtaggagaa cctgcggttg

1500

gatcacctcc tttct

1515

<210> 464

<211> 1515

<212> DNA

<213> Campylobacter hominis

<400> 464

tttatatgga gagtttgatc ctggctcaga gtgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgaacg aacgaataag agcttgctct tataagttag tggcgcacgg gtgagtaata

120

tatagctaat ctgcctctta gtagaggata acagtcggaa acgattgcta atactctata

180

cttctgcttt acataagtaa agtagagaaa gtttttcgct aagagatgag gctatactgt

240

atcagctagt tggtaaggta acggcttacc aaggctatga cgcataactg gtctgagagg

300

atgatcagtc acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc agcagtaggg

360

aatattgcgc aatgggggaa accctgacgc agcaacgccg cgtggaggat gacacttttc

420

ggagcgtaaa ctccttttat cgggaaagaa taatgacggt acccgatgaa taagcaccgg

480

ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgca agcgttactc ggaatcactg

540

ggcgtaaagg gtgcgtaggt ggattatcaa gtctcttgtg aaatctaata gcttaactat

600

taaattgctt gggaaactga tagtctagag taggggagag gcagatggaa ctcttggtgt

660

aggagtaaaa tccgtagata tcaagaagaa tacctattgc gaaagcgatc tgctagaacc

720

taactgacac tgatgcacga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

acgccctaaa cgatgtatac cggttgttgc tttgctagtc aaggcagtaa tccagctaac

840

gcattaagta taccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta aaactcaaag gaatagacgg

900

ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag atacgcgaag aaccttaccc

960

ggacttgata tctaacaaat catccagaga tggaagagtg tctgcttgca gaaatgttaa

1020

gacaggtgct gcacggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1080

cgagcgcaac ccacgtattt agttgctaac agttaggctg agttctctaa atagactgcc

1140

ttcgtaagga ggaggaaggt gtggacgacg tcaagtcatc atggccctta tgtccggggc

1200

gacacacgtg ctacaatgac atatacaatg agatgcaata tcgcaagatg gagcaaatct

1260

ataaaatatg tcccagttcg gattggagtc tgcaactcga ctccatgaag ccggaatcgc

1320

tagtaatcgt agatcagcca tgctacggtg aatacgttcc cgggtcttgt actcaccgcc

1380

cgtcacacca tgggagttga tttcactcga agcggggatg caaaatttgc taccctccac

1440

agtggaatca gcgactgggg tgaagtcgta acaaggtaac cgtaggagaa cctgcggttg

1500

gatcacctcc tttct

1515

<210> 465

<211> 1519

<212> DNA

<213> Campylobacter jejuni

<400> 465

tttttatgga gagtttgatc ctggctcaga gtgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgaacg atgaagcttt tagcttgcta gaagtggatt agtggcgcac gggtgagtaa

120

ggtatagtta atctgcccta cacaagagga caacagttgg aaacgactgc taatactcta

180

tactcctgct taacacaagt tgagtaggga aagtttttcg gtgtaggatg agactatata

240

gtatcagcta gttggtaagg taatggctta ccaaggctat gacgcttaac tggtctgaga

300

ggatgatcag tcacactgga actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtag

360

ggaatattgc gcaatggggg aaaccctgac gcagcaacgc cgcgtggagg atgacacttt

420

tcggagcgta aactcctttt cttagggaag aattctgacg gtacctaagg aataagcacc

480

ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg caagcgttac tcggaatcac

540

tgggcgtaaa gggcgcgtag gcggattatc aagtctcttg tgaaatctaa tggcttaacc

600

attaaactgc ttgggaaact gatagtctag agtgagggag aggcagatgg aattggtggt

660

gtaggggtaa aatccgtaga tatcaccaag aatacccatt gcgaaggcga tctgctggaa

720

ctcaactgac gctaaggcgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt

780

ccacgcccta aacgatgtac actagttgtt ggggtgctag tcatctcagt aatgcagcta

840

acgcattaag tgtaccgcct ggggagtacg gtcgcaagat taaaactcaa aggaatagac

900

ggggacccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agatacgcga agaaccttac

960

ctgggcttga tatcctaaga accttataga gatatgaggg tgctagcttg ctagaactta

1020

gagacaggtg ctgcacggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1080

aacgagcgca acccacgtat ttagttgcta acggttcggc cgagcactct aaatagactg

1140

ccttcgtaag gaggaggaag gtgtggacga cgtcaagtca tcatggccct tatgcccagg

1200

gcgacacacg tgctacaatg gcatatacaa tgagacgcaa taccgcgagg tggagcaaat

1260

ctataaaata tgtcccagtt cggattgttc tctgcaactc gagagcatga agccggaatc

1320

gctagtaatc gtagatcagc catgctacgg tgaatacgtt cccgggtctt gtactcaccg

1380

cccgtcacac catgggagtt gatttcactc gaagccggaa tactaaacta gttaccgtcc

1440

acagtggaat cagcgactgg ggtgaagtcg taacaaggta accgtaggag aacctgcggt

1500

tggatcacct cctttctag

1519

<210> 466

<211> 1519

<212> DNA

<213> Campylobacter lari

<400> 466

tttttatgga gagtttgatc ctggctcaga gtgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgaacg atgaagcgac tagcttgcta gttgtggatt agtggcgcac gggtgagtaa

120

ggtatagtta atctgcccta cacaagagga caacagttgg aaacggctgc taatactcta

180

tactcctgct taacacaagt tgagtaggga aagtttttcg gtgtaggatg agactatata

240

gtatcagcta gttggtgagg taatggctca ccaaggctat gacgcttaac tggtctgaga

300

ggatgatcag tcacactgga actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtag

360

ggaatattgc gcaatggggg aaaccctgac gcagcaacgc cgcgtggagg atgacacttt

420

tcggagcgta aactcctttt cttagggaag aattctgacg gtacctaagg aataagcacc

480

ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg caagcgttac tcggaatcac

540

tgggcgtaaa gggcgcgtag gcggattatc aagtctcttg tgaaatccaa cggcttaacc

600

gttgaactgc ttgggaaact ggtaatctag agtgggggag aggcagatgg aattggtggt

660

gtaggggtaa aatccgtaga tatcaccaag aatacccatt gcgaaggcga tctgctggaa

720

cttaactgac gctaaggcgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt

780

ccacgcccta aacgatgtat gctagttgtt ggggtgctag tcatctcagt aatgcagcta

840

acgcattaag cataccgcct ggggagtacg gtcgcaagat taaaactcaa aggaatagac

900

ggggacccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agatacgcga agaaccttac

960

ctgggcttga tatcctaaga accttataga gatatgaggg tgctagcttg ctagaactta

1020

gagacaggtg ctgcacggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1080

aacgagcgca acccacgtat ttagttgcta acacttcggg tgagcactct aaatagactg

1140

ccttcgtaag gaggaggaag gtgtggacga cgtcaagtca tcatggccct tatgcccagg

1200

gcgacacacg tgctacaatg gcatatacaa tgagacgcaa taccgcgagg tggagcaaat

1260

ctataaaata tgtcccagtt cggattgttc tctgcaactc gagagcatga agccggaatc

1320

gctagtaatc gtagatcagc catgctacgg tgaatacgtt cccgggtctt gtactcaccg

1380

cccgtcacac catgggagtt gatttcactc gaagccggaa tactaaacta gttaccgtcc

1440

acagtggaat cagcgactgg ggtgaagtcg taacaaggta accgtaggag aacctgcggt

1500

tggatcacct cctttctag

1519

<210> 467

<211> 1515

<212> DNA

<213> Campylobacter rectus

<400> 467

ttaatatgga gagtttgatc ctggctcaga gtgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgaacg gagattaagt agcttgctat ttaatcttag tggcgcacgg gtgagtaata

120

tatagctaat ctgccctaca ctagaggaca acagttggaa acgactgcta atactctata

180

ctccttcttt acataagtta agtcgggaaa gtttttcggt gtaggatgag gctatatcgt

240

atcagctagt tggtagggta acggcctacc aaggctatga cgcgtaactg gtctgagagg

300

atgatcagtc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtaggg

360

aatattgctc aatgggggaa accctgaagc agcaacgccg cgtggaggat gacacttttc

420

ggagcgtaaa ctccttttct tgggaaagaa ttatgacggt acccaaggaa taagcaccgg

480

ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgca agcgttactc ggaatcactg

540

ggcgtaaagg acgcgtaggc ggattatcaa gtctcttgtg aaatctaacg gcttaaccgt

600

taaactgctt gggaaactga taatctagag taagggagag gcagatggaa ttcttggtgt

660

aggggtaaaa tccgtagaga tcaagaagaa tacccattgc gaaagcgatc tgctggaact

720

taactgacgc taatgcgtga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

acgccctaaa cgatgtatac tagttgttgc ttcgctagtc gaggcagtaa tgcacctaac

840

ggattaagta taccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta aaactcaaag gaatagacgg

900

ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag atacgcgaag aaccttaccc

960

ggacttgata tctaacaaat catccagaga tggaagagtg tctgcttgca gaaatgttaa

1020

gacaggtgct gcacggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1080

cgagcgcaac ccacgtcatt agttgctaac ggttcggccg agcactctaa tgagactgcc

1140

ttcgtaagga ggaggaaggt gtggacgacg tcaagtcatc atggccctta tgtccggggc

1200

gacacacgtg ctacaatggc gtatacaata agacgcaata tcgcgagatg gagcaaatct

1260

ataaaatacg tcccagttcg gattggagtc tgcaactcga ctccatgaag ccggaatcgc

1320

tagtaatcgt agatcagcca tgctacggtg aatacgttcc cgggtcttgt actcaccgcc

1380

cgtcacacca tgggagttga tttcactcga agcccaaata ccaaaccggt tatggtccac

1440

agtggaatca gcgactgggg tgaagtcgta acaaggtaac cgtaggagaa cctgcggttg

1500

gatcacctcc tttct

1515

<210> 468

<211> 1515

<212> DNA

<213> Campylobacter showae

<400> 468

ttaatatgga gagtttgatc ctggctcaga gtgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgaacg gagattaagt agcttgctat ttaatcttag tggcgcacgg gtgagtaata

120

tatagctaac ttgcccatta ctaagggaca acagttggaa acgactgcta ataccttata

180

ctccgtatct atataagtag atacgggaaa gtttttcggt aatggatagg gctatatcgt

240

atcagctagt tggtaaggta atggcttacc aaggctatga cgcgtaactg gtctgagagg

300

atgatcagtc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtaggg

360

aatattgctc aatgggggaa accctgaagc agcaacgccg cgtggaggat gacacttttc

420

ggagcgtaaa ctccttttct tgggaaagaa ttatgacggt acccaaggaa taagcaccgg

480

ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgca agcgttactc ggaatcactg

540

ggcgtaaagg acgcgtaggc ggattatcaa gtctcttgtg aaatctaacg gcttaaccgt

600

taaactgctt gggaaactga taatctagag taagggagag gcagatggaa ttcttggtgt

660

aggggtaaaa tccgtagaga tcaagaagaa tacccattgc gaaagcgatc tgctggaact

720

taactgacgc taatgcgtga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

acgccctaaa cgatgtatac tagttgttgc ttcgctagtc gaggcagtaa tgcacctaac

840

ggattaagta taccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta aaactcaaag gaatagacgg

900

ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag atacgcgaag aaccttaccc

960

ggacttgata tctaacaaat catccagaga tggaagagtg tctgcttgca gaaatgttaa

1020

gacaggtgct gcacggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1080

cgagcgcaac ccacgtcatt agttgctaac ggttcggccg agcactctaa tgagactgcc

1140

ttcgcaagga ggaggaaggt gtggacgacg tcaagtcatc atggccctta tgtccggggc

1200

gacacacgtg ctacaatggc atatacaatg agacgcaata tcgcgagatg gagcaaatct

1260

ataaaatatg tcccagttcg gattggagtc tgcaactcga ctccatgaag ccggaatcgc

1320

tagtaatcgt agatcagcca tgctacggtg aatacgttcc cgggtcttgt actcaccgcc

1380

cgtcacacca tgggagttga tttcactcga agcccaaata ccaaaccggt tatggtccac

1440

agtggaatca gcgactgggg tgaagtcgta acaaggtaac cgtaggagaa cctgcggttg

1500

gatcacctcc tttct

1515

<210> 469

<211> 1420

<212> DNA

<213> Campylobacter sp. FOBRC14

<400> 469

agagtgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtcga acggagatta agtagcttgc

60

tatttaatct tagtggcgca cgggtgagta atatatagct aacttgccca ttactaaggg

120

acaacagttg gaaacgactg ctaatacctt atactccgta tctatataag tagatacggg

180

aaagtttttc ggtaatggat agggctatat cgtatcagct agttggtagg gtaatggctt

240

accaaggcta tgacgcgtaa ctggtctgag aggatgatca gtcacactgg aactgagaca

300

cggtccagac tcctacggga ggcagcagta gggaatattg ctcaatgggg gaaaccctga

360

agcagcaacg ccgcgtggag gatgacactt ttcggagcgt aaactccttt tcttggggaa

420

gaaatttgac ggtacccaag gaataagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacggagggt gcaagcgtta ctcggaatca ctgggcgtaa aggacgcgta ggcggattat

540

caagtctctt gtgaaatcca atggcttaac cattgaactg cttgagaaac tgataatcta

600

gagtgaggga gaggcagatg gaattggtgg tgtaggggta aaatccgtag agatcaccag

660

gaatacccat tgcgaaggcg atctgctgga actcaactga cgctaatgcg tgaaagcgtg

720

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccct aaacgatgta tactagttgt

780

tgctaagcta gtcttggcag taatgcacct aacggattaa gtataccgcc tggggagtac

840

ggtcgcaaga ttaaaactca aaggaataga cggggacccg cacaagcggt ggagcatgtg

900

gtttaattcg aagatacgcg aagaacctta cccggacttg atatctaaca aatcatctag

960

agatagaaga gtgtctgctt gcagaaatgt taagacaggt gctgcacggc tgtcgtcagc

1020

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccacgtc attagttgct

1080

aacggttcgg ccgagcactc taatgagact gccttcgcaa ggaggaggaa ggtgtggacg

1140

acgtcaagtc atcatggccc ttatgtccgg ggcgacacac gtgctacaat ggcatataca

1200

atgagacgca atatcgcgag atggagcaaa tctataaaat atgtcccagt tcggattgga

1260

gtctgcaact cgactccatg aagccggaat cgctagtaat cgtagatcag ccatgctacg

1320

gtgaatacgt tcccgggtct tgtactcacc gcccgtcaca ccatgggagt tgatttcact

1380

cgaagcccaa ataccaaacc ggttatggtc cacagtggaa

1420

<210> 470

<211> 1428

<212> DNA

<213> Campylobacter sp. FOBRC15

<400> 470

agtgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac ggagattaag tagcttgcta

60

tttaatctta gtggcgcacg ggtgagtaat atatagctaa cttgcccatt actaagggac

120

aacagttgga aacgactgct aataccttat actccgtgtc tatataagta gatacgggaa

180

agtttttcgg taatggatag ggctatatcg tatcagctag ttggtaaggt aatggcttac

240

caaggctatg acgcgtaact ggtctgagag gatgatcagt cacactggaa ctgagacacg

300

gtccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatattgct caatgggggg aaccctgaag

360

cagcaacgcc gcgtggagga tgacactttt cggagcgtaa actccttttc ttgggaaaga

420

attatgacgg tacccaagga ataagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata

480

cggagggtgc aagcgttact cggaatcact gggcgtaaag gacgcgtagg cggattatca

540

agtctcttgt gaaatctaac ggcttaaccg ttaaactgct tgggaaactg ataatctaga

600

gtaagggaga ggcagatgga attcttggtg taggggtaaa atccgtagag atcaagaaga

660

atacccattg cgaaagcgat ctgctggaac ttaactgacg ctaatgcgtg aaagcgtggg

720

gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccctaa acgatgtata ctagttgttg

780

cttcgctagt cgaggcagta atgcacctaa cggattaagt ataccgcctg gggagtacgg

840

tcgcaagatt aaaactcaaa ggaatagacg gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt

900

ttaattcgaa gatacgcgaa gaaccttacc cggacttgat atctaacaaa tcatccagag

960

atggaagagt gtctgcttgc agaaatgtta agacaggtgc tgcacggctg tcgtcagctc

1020

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccacgtcat tagttgctaa

1080

cggttcggcc gagcactcta atgagactgc cttcgcaagg aggaggaagg tgtggacgac

1140

gtcaagtcat catggccctt atgtccgggg cgacacacgt gctacaatgg cgtatacaat

1200

gagacgcaat atcgcgagat ggagcaaatc tataaaatac gtcccagttc ggattggagt

1260

ctgcaactcg actccatgaa gccggaatcg ctagtaatcg tagatcagcc atgctacggt

1320

gaatacgttc ccgggtcttg tactcaccgc ccgtcacacc atgggagttg atttcactcg

1380

aagcccaaat accaaactgg ttatggtcca cagtggaatc agcgactg

1428

<210> 471

<211> 1505

<212> DNA

<213> Campylobacter sp. oral clone BB120

<400> 471

gagagtttga ttctggctca gagtgaacgc tggcggcgtg cctaatacat gcaagtcgaa

60

cggagattaa atagcttgct atttaatctt agtggcgcac gggtgagtaa tgtatagtta

120

atctgcccca tagtggagga caacagttag aaatgactgc taatactcca tactccttct

180

tatcataagt taagtcggga aagtttttcg ctatgggatg agactatatc gtatcagtta

240

gttggtaagg taatggctta ccaaggctat gacgcgtaac tggtctgaga ggatgatcag

300

tcacattgga actgagacac ggtccaaact cctacgggag gcagcagtag ggaatattgc

360

gcaatggggg aaaccctgac gcagcaacgc cgcgtggagg atgacacttt tcggagcgta

420

aactcctttt gttagggaag aataatgacg gtacctaacg aataagcacc ggctaactcc

480

gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg caagcgttac tcggaatcac tgggcgtaaa

540

ggacgcgtag gcggattatc aagtctcttg tgaaatctag tggcttaacc actaaactgc

600

ttgggaaact gataatctag agtaagggag aggcagatgg aattcttggt gtaggggtaa

660

aatccgtaga gatcaagaag aatacttatt gcgaaggcga tctgctagaa cttaactgac

720

gctaatgcgt gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgcccta

780

aacgatgtat actggttgtt gctatgctag tcatggcagt aatccaccta acggattaag

840

tataccgcct ggggagtacg gtcgcaagat taaaactcaa aggaatagac ggggacccgc

900

acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agatacgcga agaaccttac ccggacttga

960

tatctaacaa atcatctaga gatagaagag tgtctgcttg cagaaatgtt aagacaggtg

1020

ctgcacggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

1080

acccacgtca ttagttgcta acagtttagc tgagcactct aatgagactg ccttcgtaag

1140

gaggaggaag gtgtggacga cgtcaagtca tcatggccct tatgtccagg gcgacacacg

1200

tgctacaatg gcatatacaa tgagatgcaa tatcgcgaga tggagcgaat ctataaaata

1260

tgtcccagtt cggattggag tctgcaactc gactccatga agtcggaatc gctagtaatc

1320

gtagatcagc catgctacgg tgaatacgtt cccgggtctt gtactcaccg cccgtcacac

1380

catgggagtt gatttcactc gaagtcggaa tgctaaacta gctaccgccc acagtggaat

1440

cagcgactgg ggtgaagtcg taacaaggta accgtaggag aacctgcggy tkgawcacct

1500

ccttc

1505

<210> 472

<211> 1695

<212> DNA

<213> Campylobacter sputorum

<220>

<221> modified_base

<222> (8)..(8)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 472

agtgaacnct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac gatgaagtcc tagcttgcta

60

ggatggatta gtggcgcacg ggtgagtaat gtatagctaa tctgccccat agagaggaac

120

aacacttaga aatgagtgct aatacctcat actccaatta tacataagtt taattgggaa

180

atgtagctct taataatata tatcaaagat aatttataaa taaaaagtta taaatataac

240

aataagcttt tttgaagctt tatattaata aagcgaaaaa aaagcaaagc agttagattt

300

aataaatttt tatagcattt aaaaatacaa aagacttaat ttttaaatct aaatataaat

360

tattactaat atttttaata gtcatttaga aatatcttaa tatatattat taagagcttt

420

cgctatggga tgaggctata ttgtatcagc tagttggtaa ggtaatggct taccaaggct

480

atgacgcata actggtctga gaggatgatc agtcacactg gaactgagac acggtccaga

540

ctcctacggg aggcagcagt agggaatatt gctcaatggg ggaaaccctg aagcagcaac

600

gccgcgtgga ggatgacact tttcggagcg taaactcctt ttctttggga agaataatga

660

cggtaccaaa ggaataagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg

720

tgcaagcgtt actcggaatc actgggcgta aaggacgcgt aggtggatag ataagtctct

780

tgtgaaatct agtagcttaa ctactaaact gcttgggaaa ctatctatct agagtaaggg

840

agaggcagat ggaattcttg gtgtaggggt aaaatccgta gatatcaaga ggaatactta

900

ttgcgaaggc gatctgctag aacttaactg acactaatgc gtgaaagcgt ggggagcaaa

960

caggattaga taccctggta gtccacgccc taaacgatgt atactggttg ttgctgtgct

1020

agtcatggca gtaatccacc taacggatta agtataccgc ctggggagta cggtcgcaag

1080

attaaaactc aaaggaatag acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc

1140

gaagatacgc gaagaacctt acccggactt gatatctaac aaatcatcta gagatagaag

1200

agtgtctgct tgcagaaatg ttaagacagg tgctgcacgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt

1260

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccacgt gtttagttgc taacagttag

1320

gctgagcact ctaaacagac tgccttcgta aggaggagga aggtgtggac gacgtcaagt

1380

catcatggcc cttatgtccg gggcgacaca cgtgctacaa tggcatatac aataagacgc

1440

aatatcgcga gatggagcaa atctataaaa tatgtcccag ttcggattgg agtctgcaac

1500

tcgactccat gaagccggaa tcgctagtaa tcgtagatca gccatgctac ggtgaatacg

1560

ttcccgggtc ttgtactcac cgcccgtcac accatgggag ttgatttcac tcgaagccca

1620

aataccaaat tggttatggt ccacagtgga atcagcgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1680

taaccgtagg agaac

1695

<210> 473

<211> 1513

<212> DNA

<213> Campylobacter upsaliensis

<400> 473

tatggagagt ttgatcctgg ctcagagtga acgctggcgg cgtgcctaat acatgcaagt

60

cgaacgatga agcttttagc ttgctagaag tggattagtg gcgcacgggt gagtaaggta

120

tagttaatct gccctacact gggggacaac acttagaaat gagtgctaat accccatact

180

cctatttaac ataagttagg tagggaaagt ttttcggtgt aggatgagac tatatagtat

240

cagctagttg gtaaggtaaa ggcttaccaa ggctatgacg cttaactggt ctgagaggat

300

gatcagtcac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtagggaa

360

tattgcgcaa tgggcgaaag cctgacgcag caacgccgcg tggaggatga cacttttcgg

420

agcgtaaact ccttttcttt gggaagaatt ttgacggtac caaaggaata agcaccggct

480

aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg agggtgcaag cgttactcgg aatcactggg

540

cgtaaagggc gcgtaggcgg attatcaagt ctcttgtgaa atctaatggc ttaaccatta

600

aactgcttgg gaaactgata gtctagagtg agggagaggc agatggaatt ggtggtgtag

660

gggtaaaatc cgtagatatc accaagaata cccattgcga aggcgatctg ctggaactca

720

actgacgcta aggcgcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac

780

gccctaaacg atgtatgcta gttgttgggg tgctagtcat ctcagtaatg cagctaacgc

840

attaagcata ccgcctgggg agtacggtcg caagattaaa actcaaagga atagacgggg

900

acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagat acgcgaagaa ccttacctag

960

gcttgatatc caacaaattc tgtagagata cggaagtgct agcttgctag aatgttgaga

1020

caggtgctgc acggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc tcgtccttag ttgctaacga ttcggtcgag cactctaagg agactgcctt

1140

cgtaaggagg aggaaggtgg ggacgacgtc aagtcatcat ggcccttacg cctagggcga

1200

cacacgtgct acaatggcat atacaatgag acgcaatacc gcgaggtgga gcaaatctat

1260

aaaatatgtc ccagttcgga ttgttctctg caactcgaga gcatgaagcc ggaatcgcta

1320

gtaatcgcaa atcagccatg ttgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac tcaccgcccg

1380

tcacaccatg ggagttgatt tcactcgaag tggaaatact aaactagtta tcccccacag

1440

tggaatcagc gactggggtg aagtcgtaac aaggtaaccg taggagaacc tgcggttgga

1500

tcacctcctt tct

1513

<210> 474

<211> 1508

<212> DNA

<213> Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Yit

<400> 474

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagttgagc

60

ggagatatat ggagcttgct ttatataact tagcagcgaa cgggtgagta acacgtagat

120

aatctatcct atactggggg atagcccgat gaaagttgga ttaataccgc atatagctat

180

atagttgcat gattatgtag tgaaagattt attggtatag gaggagtctg cggcacatta

240

gctagtaggt gaggtaaagg cttacctagg cgacgatgtg tagccggtct gagaggatga

300

acggccacaa tggaactgag acacggtcca tactcctacg ggaggcagca gtggggaata

360

ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagca acgccgcgtg agtgaagaag gttttcggat

420

tgtaaagctc tgttagcagg gaagaggaag gacggtacct gcagaggaag ccacggctaa

480

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtggcaagcg ttgttcggaa taactgggcg

540

taaaggatgc gtaggcggtt aaacaagtta tatgttaaat atataggctt aacctgtaga

600

aagcatataa aactgtttaa ctagagtgca ggagaggtaa gtggaattcc tagtgtagcg

660

gtgaaatgcg tagagattag gaagaacacc agtggcgaag gcgacttact ggactgtaac

720

tgacgctgag gcatgagagc atggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccatgc

780

tgtaaacgat gggtactagg tgtgggttgt gaataacaat tcgtgccgtc gcaaacgcaa

840

taagtacccc gcctgaggag tacgatcgca agattaaaac tcaaaggaat tgacggggac

900

ccgcacaagc agcggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttacctaaac

960

ttgacatacc ttgaattacc ttgtaatgag ggaagctcgc aagagcaagg atacaggtgg

1020

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

1080

cccttgttgt taattgctaa caggttaagc tgagcacttt agcgagacag cctaggttaa

1140

ctaggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttacgtttag ggctacacac

1200

gtgctacaat ggtgagaaca gagagaagca agctagtgat agtgagcaaa acttataaaa

1260

ctcatctcag ttcggattgc aggctgaaac tcgcctgtat gaagatggag ttgctagtaa

1320

tcgcgaatca gaatgtcgcg gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca

1380

ccatgagagt tggcaacacc cgaaacctgt gggctaacca tataggaggc agcagtctaa

1440

ggtggggtca gtgattgggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtaggagaa cctgcggctg

1500

gatcacct

1508

<210> 475

<211> 1541

<212> DNA

<213> Candidatus Sulcia muelleri

<400> 475

acaatgaaga gtttgatcct tgctcaggat aaacgctagc ggagggccta acacatgcaa

60

gtcgaggggc agcaaaaaaa atataagttt acttatattt tttgttggcg accggcaaac

120

gggtgagtaa tacatacgta acttacctta tgctgaggga tagcctgagg aaacttggat

180

taatacctta taaaacaatc ttttataaag aaatattgtt aaaattttag atggcataaa

240

ataggcgtat gtccgattag ttagttggta aggtaatggc ttaccaagac aatgatcggt

300

agggggcctg agagggcgta cccccacatt ggtactgaga cacggaccaa actcctacgg

360

gaggcagcag tgaggaatat tggtcaatgg aggaaactct gaaccagcca ctccgcgtgc

420

aggatgaaag ccttatgggt tgtaaactgc ttttgtatat gaataaaaaa ttctattttt

480

agaaaaaatt gaaggtaata tacgaataag tatcggcaaa ctccgtgcca gcagccgcgg

540

taaaacggag gatacaagcg ttatccggat ttattgggtt taaagggtgc gtaggcggtt

600

ttttaagtca gtagtgaaat cttaaagctt aactttaaaa ttgctattga tactgagaga

660

cttgagttag gttggagtag ctggaatgtg tggtgtagcg gtgaaatgca tagatatcac

720

acagaacacc gatcgcgaaa gcaagttact aagcctatac tgacgctgag gcacgaaagc

780

gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccatgc cgtaaacgat gatcactaac

840

tattggtttt ttataattca gtggtcaagc gaaagtgata agtgatccac ctgagaagta

900

cgaccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaatcgg tggagcatgt

960

ggtttaattc gatgatacgc gaggaacctt accaagactt aaatgtacta cgaataaatt

1020

ggaaacaatt tagtcaaacg acggagtaca aggtgctgca tggttgtcgt cagctcgtgc

1080

cgtgaggtgt taggttaagt cctttaacga gcgcaaccct tatgattagt tgccatcgag

1140

taatgttggg gactctaata agactgccgg cgtaagccga gaggaaggtg gggacgacgt

1200

caaatcatca cggcccttac gtcttgggcc acacacgtgc tacaatggtc ggtacaaaag

1260

gcagcgactg ggtgaccaga agcaaatctc taaagccgat ctcagttcgg attggagtct

1320

gaaactcgac tctatgaagc tggaatcgct agtaatcgcg catcagccat ggcgcggtga

1380

atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcaagccat ggaagttgga agtacctaaa

1440

gtcggtgacc ataaaaggag ctgcctaagg taagtctaat aactagggct aagtcgtaac

1500

aaggtagccg taccggaagg tgcggctgga atatctctgt t

1541

<210> 476

<211> 1504

<212> DNA

<213> Capnocytophaga canimorsus

<400> 476

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agcggcaggc ctaacacatg caagtcgagg

60

ggtagggtgc ttcggcactt gagaccggcg cacgggtgcg taacacgtgt acaatctacc

120

ttttgctaag ggatagcccg aagaaatttg gattaatacc ttatagtatt gtttggtggc

180

atcactaaat aattaaagct ctggtggcaa aagatgagta cgcgtcccat tagctagttg

240

gtgtggtaac ggcataccaa ggctacgatg ggtaggggtc ctgagaggga ggtcccccac

300

actggtactg agacacggac cagactccta cgggaggcag cagtgaggaa tattggacaa

360

tggtcggaag actgatccag ccatgccgcg tgcaggatga cggccttatg ggttgtaaac

420

tgcttttata caggaagaat aaggtctacg cgtagattga tgacggtact gtatgaataa

480

gcatcggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga ggatgcgagc gttatccgga

540

atcattgggt ttaaagggtc cgtaggcggg cttataagtc agaggtgaaa gcactgagct

600

caactgagta actgcctttg aaactgtagg tcttgaatgt ttgtgaagta gctggaatgt

660

gtagtgtagc ggtgaaatgc atagatatta cacagaacac cgattgcgaa ggcatgttac

720

taacaaatta ttgacgctga tggacgaaag cgtggggagc gaacaggatt agataccctg

780

gtagtccacg ctgtaaacga tggatactag ctgtttggga gtaattttga gtggctaagc

840

gaaagtgata agtatcccac ctggggagta cgcacgcaag tgtgaaactc aaaggaattg

900

acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gatgatacgc gaggaacctt

960

accaaggttt aaatgggaaa cgacgtacct agagataggt atttcttcgg acgtttttca

1020

aggtgctgca tggttgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt caggttaagt cctataacga

1080

gcgcaacccc tgctgttagt tgctagcgag ttaagtcgag cactctaacg ggactgccgg

1140

tgcaaaccgt gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca cggcccttac atcttgggct

1200

acacacgtgc tacaatggcc ggtacagcga gcagccactg cgtgagcagg agcgaatcta

1260

taaagccggt cacagttcgg atcggagtct gcaactcgac tccgtgaagc tggaatcgct

1320

agtaatcgga tatcagccat gatccggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc

1380

gtcaagccat ggaagctggg ggtacctgaa gtcggttgcc gcaaggagct gcctagggta

1440

aaactagtga ctggggctaa gtcgtaacaa ggtagccgta ccggaaggtg cggctggaac

1500

acct

1504

<210> 477

<211> 1287

<212> DNA

<213> Capnocytophaga genomosp. C1

<400> 477

gatgaacgct agcggcaggc ctaacacatg caagtcgagg gaccggcgta cgggtgcgta

60

acgcgtatac aatctgcctt tcactggggg atagcccgaa gaaatttgga ttaatacccc

120

atagttaaag gtggtgaaag atgagtatgc gttctattag ctagttggag aggtaacggc

180

tccccaaggc gatgatagat aggggttctg agagggatgt cccccacact ggtactgaga

240

tacggaccag actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat tggacaatgg tcggaagact

300

gatccagcca tgccgcgtgc aggatgacgg cctatgggtt gtaaactgct tttgtaaggg

360

aagatgacgg taccttacga ataagcatcg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata

420

cggaggatgc gagcgttatc cggaatcatt gggtttaaag ggtctgtagg cgggctggta

480

agtcagaggt gaaagcgctt agctcaacta agcaactgcc tttgaaactg ttggtcttga

540

atggttgtga agtagttgga atgtgtagtg tagcggtgaa atgcttagat attacacaga

600

acaccgatag cgaaggcata ttactaacaa tattgacgct gatggacgaa agcgtgggga

660

gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgctgtaaac gatggatact agctgtttgg

720

tattgagtgg ctaagcgaaa gtgataagta tcccacctgg ggagtacgtt cgcaagaatg

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg

840

atacgcgagg aaccttacca aggtttaaat ggtcaaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgccgtga ggtgtcaggt taagccctat aacgagcgca acccctgcca ttagttgcta

960

acgatcgagc cctctaatgg gactgccggt gcaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

aatcatcacg gcccttacat cttgggctac acacgtgcta caatggccgt cagagagcag

1080

ccactgcgtg agcaggcgcg aatctatacg gtcacagttc ggacggagtc tgcaactcga

1140

ctccggaagc tggaatcgct agtaatcgga tatcagccat gatccggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcaagccat ggaagctggg agtacctgaa gacggttgct

1260

gtttagggta aaactagtga ctggggc

1287

<210> 478

<211> 1509

<212> DNA

<213> Capnocytophaga gingivalis

<400> 478

tgaagagttt gatcctggct caggatgaac gctagcggca ggcctaacac atgcaagtcg

60

agggagaagc cctttcgggg gcagaaaccg gcgcacgggt gcgtaacgcg tatgcaacct

120

acctttcaca gggggatagc ccgaagaaat ttggattaat accccataat attattggat

180

ggcatcattt gataattaaa actgcggtgg tgaaagatgg gcatgcgtcc tattagctag

240

ttggagtggt aacggcaccc caaggctacg ataggtaggg gtcctgagag ggagatcccc

300

cacactggta ctgagacagg gaccagactc ctacgggagg cagcagtgag gaatattggt

360

caatggtcgg aagactgaac cagccatgcc gcgtgcagga agaatgcctt atgggttgta

420

aactgctttt atatgggaag aataaggtgt acgtgtacat tgatgacggt accatatgaa

480

taagcatcgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgcg agcgttattc

540

ggaatcattg ggtttaaagg gtctgtaggc gggctattaa gtcagaggtg aaaggtttca

600

gcttaactga gaaattgcct ttgatactgg tagtcttgaa tatctgtgaa gttcttggaa

660

tgtgtagtgt agcggtgaaa tgcttagata ttacacagaa caccgattgc gaaggcaggg

720

gactaacaga caattgacgc tgagagacga aagcgtgggg agcgaacagg attagatacc

780

ctggtagtcc acgctgtaaa cgatggatac tagctgtttg gcgcaagctg agtggctaag

840

cgaaagtgat aagtatccca cctggggagt acgcacgcaa gtgtgaaact caaaggaatt

900

gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgatgatacg cgaggaacct

960

taccaaggtt taaatgggga ctgacaggtg tagagatacg cccttcttcg gacagttttc

1020

aaggtgctgc atggttgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg tcaggttaag ccctataacg

1080

agcgcaaccc ctattgttag ttaccagcac gtaaaggtgg ggactctagc aagactgccg

1140

gtgtaaaccg tgaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc acggccctta catcttgggc

1200

tacacacgtg ctacaatggt cgttacagag agcagccact gcgcgagcag gagcgaatct

1260

ataaagacga tcacagttcg gatcggagtc tgcaactcga ctccgtgaag ctggaatcgc

1320

tagtaatcgg atatcagcca tgatccggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1380

cgtcaagcca tggaagctgg gagtacctga agtcggtcac cgcaaggagc tgcctagggt

1440

aaaaccagtg actggggcta agtcgtaaca aggtagccgt accggaaggt gtggctggaa

1500

cacctcctt

1509

<210> 479

<211> 1417

<212> DNA

<213> Capnocytophaga granulosa

<220>

<221> modified_base

<222> (28)..(28)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 479

aggcctaaca catgcaagtc gagggagnaa gcccttcggg gtagaaaccg gcgcacgggt

60

gcgtaacgcg tatgcaacct acctttcaca gggggatagc ccgaagaaat ttggattaat

120

accccataat attattggat ggcatcattt gataattaaa attacgatgg tgaaagatgg

180

gcatgcgtcc tattagctag ttggagtggt aacggcaccc caaggctacg ataggtaggg

240

gtcctgagag ggagatcccc cacactggta ctgagacagg gaccagactc ctacgggagg

300

cagcagtgag gaatattggt caatggtcgg aagactgaac cagccatgcc gcgtgcagga

360

agaatgcctt atgggttgta aactgctttt atatgggaag aataaggagt acgtgtactt

420

tgatgacggt accatatgaa taagcatcgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac

480

ggaggatgcg agcgttattc ggaatcattg ggtttaaagg gtctgtaggc gggctattaa

540

gtcaggggtg aaaggtttca gcttaactga gaaattgcct ttgatactgg tagtcttgaa

600

aatctgtgaa gttcttggaa tgtgtagtgt agcggtgaaa tgcttagata ttacacagaa

660

caccgattgc gaaggcaggg gactaacaga cgattgacgc tgagagacga aagcgtgggg

720

agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc accctgtaaa cgatggatac tagctgtttg

780

gagtaatttg agtggctaag cgaaagtgat aagtatccca cctggggagt acgcacgcaa

840

gtgtgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

900

cgatgatacg cgaggaacct taccaaggtt taaatggaga ctgacagggg cagagatgcc

960

tttttcttcg gacagttttc aaggtgctgc atggttgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg

1020

tcaggttaag tcctataacg agcgcaaccc ctattgttag ttaccagcac gtagtggtgg

1080

ggactctagc aagactgccg gtgtaaaccg tgaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc

1140

acggccctta catcttgggc tacacacgtg ctacaatggt cgttacagag agcagccact

1200

gcgcgagcag gagcgaatct ataaagacgg tcacagttcg gatcggagtc tgcaactcga

1260

ctccgtgaag ctggaatcgc tagtaatcgg atatcagcca tgatccggtg aatacgttcc

1320

cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagcca tggaagctgg gagtacctga agtcggttgc

1380

cgcaaggagc tgcctagggt aaaaccagtg actgggg

1417

<210> 480

<211> 1518

<212> DNA

<213> Capnocytophaga ochracea

<400> 480

acgatgaaga gtttgatcct ggctcaggat gaacgctagc ggcaggccta acacatgcaa

60

gtcgaggggg aagttacttt cgggtaacag agaccggcgt acgggtgcgt aacgcgtata

120

caatctgcct ttcactgggg gatagcccga agaaatttgg attaataccc catagtatat

180

agggacggca tcgtttttat attaaagctc tggtggtgaa agatgagtat gcgttctatt

240

agctagttgg agaggtaacg gctccccaag gctatgatag ataggggttc tgagagggat

300

gtcccccaca ctggtactga gatacggacc agactcctac gggaggcagc agtgaggaat

360

attggacaat ggtcggaaga ctgatccagc catgccgcgt gcaggatgac tgccttatgg

420

gttgtaaact gcttttgtaa gggaagaata agggctacgc gtagtttgat gacggtacct

480

tacgaataag catcggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag gatgcgagcg

540

ttatccggaa tcattgggtt taaagggtcc gtaggcgggc taataagtca ggggtgaaat

600

cgttcagctc aactgagcaa ctgcctttga aactgttggt cttgaatggt tgtgaagtag

660

ttggaatgtg tagtgtagcg gtgaaatgct tagatattac acagaacacc gatagcgaag

720

gcatattact aacaattaat tgacgctgat ggacgaaagc gtggggagcg aacaggatta

780

gataccctgg tagtccacgc tgtaaacgat ggatactagc tgtttggagt aatctgagtg

840

gctaagcgaa agtgataagt atcccacctg gggagtacgt tcgcaagaat gaaactcaaa

900

ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gatacgcgag

960

gaaccttacc aaggtttaaa tggggactga cagaggtaga gatacctttt tcttcggaca

1020

gttttcaagg tgctgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgccgt gaggtgtcag gttaagtcct

1080

ataacgagcg caacccctgc cattagttgc taacgagtaa ggtcgagccc tctaatggga

1140

ctgccggtgc aaaccgtgag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcacgg cccttacatc

1200

ttgggctaca cacgtgctac aatggccgtt acagagagca gccactgcgt gagcaggcgc

1260

gaatctataa agacggtcac agttcggatc ggagtctgca actcgactcc gtgaagctgg

1320

aatcgctagt aatcggatat cagccatgat ccggtgaata cgttcccggg ccttgtacac

1380

accgcccgtc aagccatgga agctgggggt acctgaagac ggttaccgcg aggagctgtt

1440

tagggtaaaa ctagtgactg gggctaagtc gtaacaaggt agccgtaccg gaaggtgcgg

1500

ctggaacacc tcctttct

1518

<210> 481

<211> 1405

<212> DNA

<213> Capnocytophaga sp. GEJ8

<400> 481

gcctacacat gcaagtcgag ggggaagtta ctttcgggta acagagaccg gcgtacgggt

60

gcgtaacgcg tatacaatct gcctttcact gggggatagc ccgaagaaat ttggattaat

120

accccatagt atagtaatac ggcatcgtga tactattaaa gcttaggtgg tgaaagatga

180

gtatgcgttc tattagttag ttggagaggt aacggctccc caaggcgatg atagataggg

240

gttctgagag ggatgtcccc cacactggta ctgagatacg gaccagactc ctacgggagg

300

cagcagtgag gaatattgga caatggtcgg aagactgatc cagccatgcc gcgtgcagga

360

tgaaggtctt atggattgta aactgctttt gtaagggaag aataagggct acgtgtagtt

420

tgatgacggt accttacgaa taagcatcgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac

480

ggaggatgcg agcgttatcc ggaatcattg ggtttaaagg gtctgtaggc gggctggtaa

540

gtcagaggtg aaagcgctca gctcaactga ggcaactgcc tttgaaactg ttggtcttga

600

atggttgtga aagtagttgg aatgtgtagt gtagcggtga aatgcttaga tattacacag

660

aacaccgata gcgaaggcat attactaaca attgattgac gctgatggac gaaagcgtgg

720

ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccacgctgta aacgatggat actagctgtt

780

tggtcgcgag tttgagtggc taagcgaaag tgataagtat cccacctggg gagtacgttc

840

gcaagaatga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt

900

aattcgatga tacgcgagga accttaccaa ggtttaaatg gggactgaca ggggtagaga

960

tacccttttc ttcggacagt tttcaaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct cgtgccgtga

1020

ggtgtcaggt taagtcctat aacgagcgca acccctgcca ttagttgcta acgagtaagg

1080

tcgagccctc taatgggact gccggtgcaa accgagagga aggtggggat gacgtcaaat

1140

catcacggcc cttacatctt gggctacaca cgtgctacaa tggccgttac agagagcagc

1200

cactgcgtga gcaggcgcga atctataaag acggtcacag ttcggatcgg agtctgcaac

1260

tcgactccgt gaagctggaa tcgctagtaa tcggatatca gccatgatcc ggtgaatacg

1320

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcaa gccatggaag ctgggagtac ctgaagacgg

1380

ttaccgcaag gagctgttag gtaaa

1405

<210> 482

<211> 1450

<212> DNA

<213> Capnocytophaga sp. S1b

<220>

<221> modified_base

<222> (31)..(31)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (83)..(83)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (376)..(376)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (409)..(409)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (449)..(449)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (455)..(455)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (513)..(514)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (523)..(523)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (772)..(772)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1001)..(1003)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1062)..(1062)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1077)..(1077)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1113)..(1113)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1215)..(1215)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1419)..(1419)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1441)..(1441)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 482

acgatgaaga gtttgatcct ggctcaggat naacgctagc ggcaggccta acacatgcaa

60

gtcgaggaga agccttcggg ctnaraccgg cgyacgggtg cgtaacgcgt atacaatctg

120

cctttcactg ggggatagcc cgaagaaatt tggattaata ccccatagta tagtaatacg

180

gcatcgtgat actattaaag cttaggtggt gaaagatgag tatgcgttct attagctagt

240

tggagaggta acggctcccc aaggctatga tagatagggg ttctgagagg gatgtccccc

300

acactggtac tgagatacgg accagactcc tacgggaggc agcagtgagg aatattggac

360

aatggtcgga agactnatcc agccatgccg cgtgcaggat gaaggtctna tggattgtaa

420

actgcttttg taagggaaga ataaggctnc gcgtngtttg atgacggtac cttacgaata

480

agcatcggct aactccgtgc cagcagccgc ggnnatacgg agnatgcgag cgttatccgg

540

aatcattggg tttaaagggt ctgtaggcgg gcttgtaagt cagaggtgaa agcgctcagc

600

tcaactgagc aactgccttt gaaactgttg gtcttgaatg gttgtgaagt agttggaatg

660

tgtagtgtag cggtgaaatg cttagatatt acacagaaca ccgatagcga aggcatatta

720

ctaacaatta attgacgctg atggacgaaa gcgtggggag cgaacaggat tngataccct

780

ggtagtccac gctgtaaacg atggatacta gctgtttggt ttaaggattg agtggctaag

840

cgaaagtgat aagtatccca cctggggagt acgttcgcaa gaatgaaact caaaggaatt

900

gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgatgatacg cgaggaacct

960

taccaaggtt taaatggrga ctgacagggg tagagatacg nnnttcttcg gacagttttc

1020

aaggtgctgc atggttgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg tnaggttaag tcctatnacg

1080

agcgcaaccc ctgccattag ttgctaacga gtnaagtcga gccctctaat gggactgccg

1140

gtgcaaaccg tgaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc acggccctta catcttgggc

1200

tacacacgtg ctacnatggc cgttacagag agcagccact gcgtgagcag gcgcgaatct

1260

ataaagacgg tcacagttcg gatcggagtc tgcaactcga ctccgtgaag ctggaatcgc

1320

tagtaatcgg atatcagcca tgatccggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1380

cgtcaagcca tggaagctgg gagtacctga agacggttnc cgcaaggagc tgtttagggt

1440

naaactagtg

1450

<210> 483

<211> 1442

<212> DNA

<213> Capnocytophaga sp. oral clone AH015

<220>

<221> modified_base

<222> (537)..(537)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 483

ggctcaggat gaacgctagc ggcaggccta acacatgcaa gtcgagggag aagcctttcg

60

gggcagaaac cggcgcacgg gtgcgtaacg cgtatgcaac ctacctttca cagggggata

120

gcccgaagaa atttggatta ataccccata atattgttgg atggcatcat ctgataatta

180

aaactgtggt ggtgaaagat gggcatgcgt cctattagct agttggagtg gtaacggcac

240

cccaaggcta tgataggtag gggtcctgag agggagatcc cccacactgg tactgagaca

300

gggaccagac tcctacggga ggcagcagtg aggaatattg gtcaatggtc ggaagactga

360

accagccatg ccgcgtgcag gaagaatgcc ttatgggttg taaactgctt ttatatggga

420

agaataaggt gtaacgtgta cattgatgac ggtaccatat gaataagcat cggctaactc

480

cgtgccagca gccgcggtaa tacggaggat gcgagcgtta ttcggaatca ttgggtntaa

540

agggtctgta ggcgggctat taagtcaggg gtgaaaggtt tcagcttaac tgagaaattg

600

cctttgatac tggtagtctt gaatatctgt gaagttcttg gaatgtgtag tgtagcggtg

660

aaatgcttag atattacaca gaacaccgat tgcggaggca ggggactaac agacgattga

720

cgctgagaga cgaaagcgtg gggagcgaac aggattmgat accctggtag tccacgctgt

780

aaacgatgga tactagctgt ttggagaaat ttgagtggct aagcgaaagt gataagtatc

840

ccacctgggg agtacgcacg caagtgtgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa

900

gcggtggagc atgtggttta attcgatgat acgcgaggaa ccttaccaag gtytaaatgg

960

agactgacag gggcagagat gcctttttct tcggacagtt ttcaaggtgc tgcatggttg

1020

tcgtcagctc gtgccgtkag gtgtcaggtt aagtcctata acgagcgcaa cccctattgt

1080

tagttaccag cacgtaatgg tggggactcw agcaagactg ccggtgtaaa ccgtgaggaa

1140

ggtggggatg acgtcaaatc atcacggccc ttacatcttg ggctacacac gtgctacaat

1200

ggtcgttaca gagagcagsc actgcgcgag caggagcgaa tctataaaga cggtcacagt

1260

tcggatcgga gtctgcaact cgactccgtg aagctggaat cgctagtaat cggatatcag

1320

ccatgatccg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaag ccatggwagc

1380

tgggggtacc tgaagtcggt tgccgcaagg agctgcctag ggtaaaacca gtgactgggg

1440

ct

1442

<210> 484

<211> 1529

<212> DNA

<213> Capnocytophaga sp. oral clone ASCH05

<220>

<221> modified_base

<222> (974)..(974)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1016)..(1016)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 484

gagagtttga tcatggctca ggatgaacgc tagctacagg cttaacacat gcaagtcgag

60

gggagaggtt accttcgggt aactgaaacc ggcgcacggg tgcgtaacgc gtatacaatc

120

tgcctttcac atagggatag cccgaagaaa tttggattaa tacctaatgg tatataagag

180

cggcatcgtt tttatattaa agctacggtg gtgaaagatg agtatgcgtt ctattagcta

240

gttggagagg taacggctcc ccaaggcgac gatagatagg ggttctgaga gggatgtccc

300

ccacactggt actgagatac ggaccagact cctacgggag gcagcagtga ggaatattgg

360

acaatggtcg gaagactgat ccagccatgc cgcgtgcagg atgaaggtcc tatggattgt

420

aaactgcttt tgtaagggaa gaataaggag tacgtgtact ttgatgacgg taccttacga

480

ataagcatcg gctaactccg tgcccgcagc cgcggtaata cggaggatgc gagcgttatc

540

cggaatcatt gggtttaaag ggtccgtagg cgggctgata agtcagaggt gaaagcgctt

600

agctcaacta agcaactgcc tttgaaactg tcagtcttga atgattgtga agtagttgga

660

atgtgtagtg tagcggtgaa atgcttagat atgacgaaga actccgattg cgaaggcagc

720

ttacgggagc acaactgacg ctgaagctcg aaggtgcggg tatcaaacag gattagatac

780

cctggtagtc cgcacagtaa acgctggatg cccgctgttg gttcattaga gtcagcggcc

840

aagcgaaagt gataagtatc ccacctgggg gagtacgcac gcaagtgtga aactcaaagg

900

aattgacggg ggcccgcaca agccggagga acatgtggtt taattcgatg atacgcgagg

960

aaccttacca aggngttgaa tgggaactga cagaggtaga gatgaagagg cccttncgga

1020

cagttttcaa ggtgctgcat ggttgtcgtc agctcttgcc gtgaggtgtc ggcttaagtg

1080

ccataacgag cgcaacccct tttcttagtt gccatcaggt catgctgggc actctgggaa

1140

tactgccacc gtaaggtgtg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcac ggcccttaca

1200

tcttgggcta cacacgtgct acaatgggct ttaatagagg ggagcgaagc cgcgaggtgg

1260

agcaaacccc agaaacaagc tctcagttcg gatcggagtc tgcaactcga ctccgtgaag

1320

ctggaatcgc tagtaatcgg atatcagcca tgatccggtg aatacgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacaa cgaaagtcgg aagtacccaa agccggtggg gtaaccttcg

1440

ggagccagcc gtctaaggta aagtcgatga ttggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1500

tcggaaggtg cggctggaac acctccttc

1529

<210> 485

<211> 1357

<212> DNA

<213> Capnocytophaga sp. oral clone ID062

<400> 485

gagtttgatt ctggctcagg atgaacgcta gcggcaggcc taacacatgc aagtcgaggg

60

accggcgcac gggtgcgtaa cgcgtatata atctacctta tacagaggga tagcccgaag

120

aaatttggat taatacttca tagttaaagg cggtataaga tgagtatgcg tcctattagc

180

tagttggtat ggtaacggca taccaaggct acgataggta ggggtcctga gagggagatc

240

ccccacactg gtactgagac acggaccaga ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt

300

ggtcaatggg cgagagcctg aaccagccaa gtcgcgtgaa ggatgactgt ctatggattg

360

taaacttctt ttatacggga atatgcatgt accgtatgaa taagcatcgg ctaactccgt

420

gccagcagcc gcggtaatac ggaggatgcg agcgttatcc ggaatcattg ggtttaaagg

480

gtccgtaggc gggctgataa gtcagaggtg aaagcgctta gctcaactaa gcaactgcct

540

ttgaaactgt cagtcttgaa tgattgtgaa gtagttggaa tgtgtagtgt agcggtgaaa

600

tgcttagata ttacacagaa caccgatagc gaaggcatat tactaacaat atcgacgctg

660

atggacgaaa gcgtggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg

720

atggatacta gctgtttgga tatgagtggc taagcgaaag tgataagtat cccacctggg

780

gagtacgcac gcaagtgtga aactcaaagg aattgacggg ggcccgctca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttaccaa ggtttaaatg gtcaaggtgc

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcaggtt aagtcctata acgagcgcaa

960

cccctgccat tagttgctaa cgatcgagcc ctctagtggg actgccggtg caaaccggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcacgg cccttacatc ttgggctaca cacgtgctac

1080

aatggccgtc agagagcagc cactgcgcga gcaggagcga atctatacgg tcacagttcg

1140

gacggagtct gcaactcgac tccggaagct ggaatcgcta gtaatcggat atcaaccatg

1200

atccggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg gaagctgggg

1260

gtacctgaag gcggtcgctg attagggtaa aactagtgac tggggctaag tcgtaacaag

1320

gtagccgtac cggaaggtgc gggtggatca cctcctt

1357

<210> 486

<211> 1509

<212> DNA

<213> Capnocytophaga sp. oral strain A47ROY

<220>

<221> modified_base

<222> (888)..(888)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (895)..(896)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (955)..(955)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (979)..(979)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (999)..(999)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1016)..(1016)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1019)..(1019)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 486

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agcggcaggc ctaacacatg caagtcgagg

60

gggaagttac tttcgggtaa ctgagaccgg cgtacgggtg cgtaacgcgt atacaatctg

120

cctttcactg ggggatagcc cgaagaaatt tggattaata ccccatagta tagtagtgtg

180

gcatcacaca actattaaag ccttggtggt gaaagatgag tatgcgttct attagctagt

240

tggagaggta acggctcccc aaggctacga tagatagggg ttctgagagg gatgtccccc

300

acactggtac tgagatacgg accagactcc tacgggaggc agcagtgagg aatattggac

360

aatggtcgga agactgatcc agccatgccg cgtgcaggat gacggcctta tgggttgtaa

420

actgcttttg taagggaaga ataaggagta cgtgtacttt gatgacggta ccttacgaat

480

aagcatcggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaggatgcga gcgttatccg

540

gaatcattgg gtttaaaggg tccgtaggcg ggctaataag tcagaggtga aagcgcttag

600

ctcaactaag caactgcctt tgaaactgtt ggtcttgaat ggttgtgaag tagttggaat

660

gtgtagtgta gcggtgaaat gcttagatat tacacagaac accgatagcg aaggcatatt

720

actaacaatt aattgacgct gatggacgaa agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc

780

tggtagtcca cgctgtaaac gatggatact agctgtttgg tctaaggatt gagtggctaa

840

gcgaaagtga taagtatccc acctggggag tacgttcgca agaatganac tcaanngaat

900

tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgatgatac gcgangaacc

960

ttcccagggt ttaaatggng actgacagat gtagagatnc ctccttcttc ggacanttnt

1020

caaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt gtcaggttaa gtcctataac

1080

gagcgcaacc cctgccatta gttgctaacg agtaaggtcg agccctctaa tgggactgcc

1140

ggtgcaaacc gtgaggaagg tggggatgac gtcaaatcat cacggccttt acatcttggg

1200

ctacacacgt gctacaatgg ccgttacaga gagcagccac tgcgtgagca ggcgcgaatc

1260

tataaagacg gtcacagttc ggatcggagt ctgcaactcg actccgtgaa gctggaatcg

1320

ctagtaatcg gatatcagcc atgatccggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc

1380

ccgtcaagcc atggaagctg ggagtacctg aagacggtca ccgcaaggag ctgtttaggg

1440

taaaactagt gactggggct aagtcgtaac aaggtagccg taccggaagg tgcggctgga

1500

tcacctccc

1509

<210> 487

<211> 1463

<212> DNA

<213> Capnocytophaga sp. oral strain S3

<220>

<221> modified_base

<222> (33)..(33)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (520)..(520)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1008)..(1008)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 487

taacgatgaa gagtttgatc ctggctcagg atnaacgcta gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgaggg agaagccctt cggggcagaa accggcgcac gggtgcgtaa cgcgtatgca

120

acctaccttt cacaggggga tagcccgaag aaatttggat taatacccca taatattgtt

180

ggatggcatc attttgcaat taaaactgcg gtggtgagag atgggcatgc gtcctattag

240

ctagttggag tggtaacggc accccaaggc tacgataggt aggggtcctg agagggagat

300

cccccacact ggtactgaga cagggaccag actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat

360

tggtcaatgg tcggaagact gaaccagcca tgccgcgtgc aggaagaatg ccttatgggt

420

tgtaaactgc ttttatatgg gaagaataag gtgtacgagt acattgatga cggtaccata

480

tgaataagca tcggctaact ccgtgccagc agccgcggtn atacggagga tgcgagcgtt

540

attcggaatc attgggttta aagggtctgt aggcgggcta ttaagtcagg ggtgaaaggt

600

ttcagcttaa ctgagaaatt gcctttgata ctggtagtct tgaatatctg tgaagttctt

660

ggaatgtgta gtgtagcggt gaaatgctta gatattacac agaacaccga ttgcgaaggc

720

aggggactaa cagacaattg acgctgagag acgaaagcgt ggggagcgaa caggattaga

780

taccctggta gtccacgctg taaacgatgg atactagctg tttgatgata agttgagtgg

840

ctaagcgaaa gtgataagta tcccacctgg ggagtacgca cgcaagtgtg aaactcaaag

900

gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg atacgcgagg

960

aaccttacca aggtttaaat ggggactgac aggtgtagag atacgccntt cttcggacag

1020

ttttcaaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgtcagg ttaagtccta

1080

taacgagcgc aacccctatt gttagttacc agcacgtagt ggtggggact ctagcaagac

1140

tgccggtgta aaccgtgagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcacggc ccttacatct

1200

tgggctacac acgtgctaca atggtcgtta cagagagcag ccactgcgtg agcaggagcg

1260

aatctataaa gacgatcaca gttcggatcg gagtctgcaa ctcgactccg tgaagctgga

1320

atcgctagta atcggatatc agccatgatc cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1380

ccgcccgtca agccatggaa gctgggagta cctgaagtcg gtgaccgcaa ggagctgcct

1440

agggtaaaac cagtgactgg ggc

1463

<210> 488

<211> 1516

<212> DNA

<213> Capnocytophaga sp. oral taxon 338

<400> 488

acgatgaaga gtttgatcct ggctcaggat gaacgctagc ggcaggccta acacatgcaa

60

gtcgagggag aagcccttcg gggcagaaac cggcgcacgg gtgcgtaacg cgtatgcaac

120

ctacctttca cagggggata gcccggagaa atttggatta atatcccata atattgttgg

180

atggcatcat ttggcaatta aagttacgat ggtggaagat gggcatgcgt cctattagct

240

agttggcgag gtaacggctc gccaaggcga cgataggtag gggtcctgag agggagatcc

300

cccacactgg tactgagaca gggaccagac tcctacggga ggcagcagtg aggaatattg

360

gtcaatggtc ggaagactga accagccatg ccgcgtgcag gaaggcggcc ttatgggttg

420

taaactgctt ttatatggga agaataagga gtacgtgtac tttgatgacg gtaccatatg

480

aataagcatc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggaggatg cgagcgttat

540

tcggaatcat tgggtttaaa gggtctgtag gcgggctatt aagtcagggg tgaaatattt

600

cagcttaact gggaaattgc ctttgatact ggtagtcttg aatatttgtg aagtttttgg

660

aatgtgtagt gtagcggtga aatgcataga tattacacag aacaccgatt gcggaggcag

720

gggactaaca aataattgac gctgagagac gagagcgtgg ggagcgaaca ggattagata

780

ccctggtagt ccacgctgta aacgatggat actagctgtt tggtaggaat attgagtggc

840

taagcgaaag tgataagtat cccacctggg gagtacgcac gcaagtgtga aactcaaagg

900

aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatga tacgcgagga

960

accttaccaa ggtttaaatg gtgactgacg tacctagaga tgggtatttc ttcggacagt

1020

tatcaaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct cgtgccgtga ggtgtcaggt taagtcctat

1080

aacgagcgca acccctattg atagttacca gcacgtaaag gtggggactc tattgagact

1140

gccggtgtaa accgtgagga aggtggggat gacgtcaaat catcacggcc cttacatctt

1200

gggctacaca cgtgctacaa tggtcgttac agagagcagc tactgcgtga gcaggtgcga

1260

atcttaaaag acggtcacag ttcggatcgg agtctgcaac tcgactccgt gaagctggaa

1320

tcgctagtaa tcgcatatca gccatgatgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1380

cgcccgtcaa gccatggaag ctgggagtac ctgaagttgg ttaccgcaag gagctaccta

1440

gggtaaaacc agtgactggg gctaagtcgt aacaaggtag ccgtaccgga aggtgtggct

1500

ggaacacctc ctttct

1516

<210> 489

<211> 1518

<212> DNA

<213> Capnocytophaga sputigena

<400> 489

acgatgaaga gtttgatcct ggctcaggat gaacgctagc ggcaggccta acacatgcaa

60

gtcgagggag aggttacctt cgggtaacca aaaccggcgc acgggtgcgt aacgcgtata

120

caatctgcct ttcacatagg gatagcccga agaaatttgg attaatacct aatggtatat

180

aggagcggca tcgtttttat attaaagcta cggtggtgaa agatgagtat gcgttctatt

240

agctagttgg agaggtaacg gctccccaag gcgacgatag ataggggttc tgagagggat

300

gtcccccaca ctggtactga gatacggacc agactcctac gggaggcagc agtgaggaat

360

attggacaat ggtcggaaga ctgatccagc catgccgcgt gcaggatgaa ggtcctatgg

420

attgtaaact gcttttgtaa gggaagaata aggagtacgt gtactttgat gacggtacct

480

tacgaataag catcggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag gatgcgagcg

540

ttatccggaa tcattgggtt taaagggtcc gtaggcgggc tgataagtca gaggtgaaag

600

cgcttagctc aactaagcaa ctgcctttga aactgtcagt cttgaatgat tgtgaagtag

660

ttggaatgtg tagtgtagcg gtgaaatgct tagatattac acagaacacc gatagcgaag

720

gcatattact aacaatttat tgacgctgat ggacgaaagc gtggggagcg aacaggatta

780

gataccctgg tagtccacgc tgtaaacgat ggatactagc tgtttggagc aatctgagtg

840

gctaagcgaa agtgataagt atcccacctg gggagtacgc acgcaagtgt gaaactcaaa

900

ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gatacgcgag

960

gaaccttacc aaggtttaaa tgggaactga cagaggtaga gatacctcct tcttcggaca

1020

gttttcaagg tgctgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgccgt gaggtgtcag gttaagtcct

1080

ataacgagcg caacccctgc cattagttgc taacgagtca agtcgagccc tctagtggga

1140

ctgccggtgc aaaccgtgag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcacgg cccttacatc

1200

ttgggctaca cacgtgctac aatggccgtt acagagagca gccactgcgc gagcaggagc

1260

gaatctataa agacggtcac agttcggatc ggagtctgca actcgactcc gtgaagctgg

1320

aatcgctagt aatcggatat cagccatgat ccggtgaata cgttcccggg ccttgtacac

1380

accgcccgtc aagccatgga agctgggggt acctgaagac ggtcaccgcg aggagctgtt

1440

tagggtaaaa ctagtgactg gggctaagtc gtaacaaggt agccgtaccg gaaggtgcgg

1500

ctggaacacc tcctttct

1518

<210> 490

<211> 1534

<212> DNA

<213> Cardiobacterium hominis

<400> 490

gaactgaaga gtttgattct ggctcagatt gaacgctggc ggcatgctta acacatgcaa

60

gtcgaacgga aacgatggag cttgctccag gcgtcgagtg gcggacgggt gagtaacgca

120

tgggaatctg ccttttgctg ggggataacg tagggaaact tacgctaata ccgcataaga

180

cctaagggtg aaagcggggg accgaaaggc ctcgcggcaa gagatgagcc catgttggat

240

tagctagttg gtggggtaaa ggcctaccaa ggcgacgatc catagctggt ctgagaggat

300

gatcagccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

tattggacaa tggggggaac cctgatccag caatgccgcg tgtgtgaaga aggccttcgg

420

gttgtaaagc actttcagta gggaggaaag gtgcgtagtt aatacctgcg caattgacgt

480

tacctacaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc

540

gagcgttatt cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg cggttgccca agtcagatgt

600

gaaagccccg ggcttaacct gggaactgca tttgaaactg ggcgactaga gtatgaaaga

660

ggaaagcgga atttccagtg tagcagtgaa atgcgtagat attggaagga acaccgatgg

720

cgaaggcagc tttctgggtc gatactgacg ctcatgtgcg aaagcgtggg gagcaaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgccctaa acgatgtcaa ctaggcgtcg ggttgttaaa

840

gactcggtgc cggagctaac gcattaagtt gaccgcctgg ggagtacggc cgcaaggttg

900

aaactcaaag aaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg

960

caacgcgaag aaccttacca ggccttgaca tcctaggaac ttggcagaga tgccttggtg

1020

ccttcgggaa cctagagaca ggtgttgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

1080

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt atccttactt gccagcactt tgggtgggaa

1140

ctgtaaggag actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg

1200

gcccttacgg cctgggctac acacgtgcta caatggtcgg tacagacggt agcgaagccg

1260

cgaggtggag ccaatctgag aaagccgatc gtagtccgga ttgcagtctg caactcgact

1320

gcatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcga atcagcatgt cgcggtgaat acgttcccgg

1380

gtcttgtaca cactgcccgt cacaccatgg gagtttgttg caccagaagc aggtagctta

1440

acttaggagg gcgcttgcca cggtgtggcc gatgactggg gtgaagtcgt aacaaggtaa

1500

ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttt

1534

<210> 491

<211> 1493

<212> DNA

<213> Cardiobacterium valvarum

<400> 491

gcgtgcttaa cacatgcaag tcgaacggaa acgacggagc ttgctccggg cgtcgagtgg

60

cggacgggtg agtaatgcat gggaatctgc cttttgctgg gggataacgt agggaaactt

120

acgctaatac cgcataagac ctgagggtga aagtggggga ccgttaaggc ctcacggcag

180

aagatgagcc catgtcggat tagctagttg gtggggtaaa ggcctaccaa ggcgacgatc

240

cgtagctggt ctgagaggat gatcagccac actgggactg agacacggcc cagactccta

300

cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa tgggggcaac cctgatccag caatgccgcg

360

tgtgtgaaga aggccttcgg gttgtaaagc actttcagca gggaggaaag catcatggtt

420

aacacccatg gtagtgacgt tacctgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc

480

cgcggtaata cggagggtgc aagcgttatt cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg

540

cggctaccta agtcagatgt gaaagccccg ggcttaacct gggaactgca tttgaaactg

600

ggcagctaga gtatgaaaga ggaaagcgga atttccagtg tagcagtgaa atgcgtagat

660

attggaagga acaccgatgg cgaaggcagc tttctgggtc gatactgacg ctcatgtgcg

720

aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccctaa acgatgtcaa

780

ctaggcgtcg ggttgtatag actcggtgcc gcagctaacg cattaagttg accgcctggg

840

gagtacggcc gcaaggttga aactcaaaga aattgacggg gacccgcaca agcggtggag

900

catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccag gccttgacat ccagagaact

960

tagcagagat gctttggtgc cttcgggaac tctgagacag gtgttgcatg gctgtcgtca

1020

gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta tccttacttg

1080

ccagcactta gggtgggaac tgtaaggaga ctgccggtga caagccggag gaaggtgggg

1140

atgacgtcaa gtcatcatgg cccttacggc ctgggctaca cacgtgctac aatggtcggt

1200

acagacggta gcgaagccgc gaggtggagc caatctgaga aagccgatcg tagtccggat

1260

tgcagtctgc aactcgactg catgaagtcg gaatcgctag taatcgcgaa tcagcatgtc

1320

gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac actgcccgtc acaccatggg agtttgttgc

1380

accagaagca ggtagcttaa cgaaagaggg cgcttgccac ggtgtggccg atgactgggg

1440

tgaagtcgta acaaggtaac cgtaggggaa cctgcggttg gatcacctcc tac

1493

<210> 492

<211> 1503

<212> DNA

<213> Carnobacterium divergens

<220>

<221> modified_base

<222> (1)..(1)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (98)..(99)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (234)..(234)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (250)..(250)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (349)..(350)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (541)..(541)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (560)..(560)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (642)..(643)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (777)..(780)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (947)..(947)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (981)..(982)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1037)..(1038)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1043)..(1043)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1067)..(1067)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1114)..(1114)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1401)..(1401)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1424)..(1424)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1500)..(1500)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 492

nttatatgag agtttgatcc tggctcagga cgaacgctgg cggcatgcct aatacatgca

60

agtcgaacgc acgaagttga aaagcttgct tttcgatnna agtaagtggc ggacgggtga

120

gtaacacgtg ggtaacctgc ccataagagg gggataacat tcggaaacgg atgctaatac

180

cgcatatttc aagtgaccgc atggtcgctt gatgaaaggt ggcttcggct accncttatg

240

gatggacccn cggtgcatta gttagttggt gaggtaatgg ctcaccaaga ccatgatgca

300

tagccgacct gagagggtga tcggccacac tgggactgag acacggccnn gactcctacg

360

ggaggcagca gtagggaatc ttccgcaatg gacgaaagtc tgacggagca atgccgcgtg

420

agtgaagaag gttttcggat cgtaaaactc tgttgttaga gaagaacaag gatgagagta

480

actgctcatc ccctgacggt atctaaccag aaagccacgg ctaactacgt gccagcagcc

540

ncggtaatac gtaggtggcn agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc gagcgcaggc

600

ggttctttaa gtctgatgtg aaagcccccg gctcaaccgg gnngggtcat tggaaactgg

660

agaacttgag tgcagaagag gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa tgcgtagata

720

tatggaggaa caccagtggc gaaggcgact ctctggtctg taactgacgc tgaggcnnnn

780

aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgctgtaaa cgatgagtgc

840

taagtgttgg agggtttccg cccttcagtg ctgcagctaa cgcattaagc actccgcctg

900

gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg gggaccngca caagcggtgg

960

agcatgtggt ttaattcgaa nnaacgcgaa gaaccttacc aggtcttgac atcctttgac

1020

cactcgagag atcgagnntt ccnttcgggg acaaagtgac aggtggngca tggttgtcgt

1080

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccncaacga gcgcaaccct tattactagt

1140

tgccagcatt cagttgggca ctctagtgag actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg

1200

gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtgcta caatggatgg

1260

tacaacgagt cgcgaagtcg tgaggccaag ctaatctctt aaagccattc tcagttcgga

1320

ttgtaggctg caactcgcct acatgaagcc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagaacgc

1380

cgcggtgaat acgttcccgg ntcttgtaca caccgcccgt cacnccacga gagtttgtaa

1440

cacccgaagc cggtgaggta accttttagg agccagccgt ctaaggtggg atagataatn

1500

ggg

1503

<210> 493

<211> 1547

<212> DNA

<213> Carnobacterium maltaromaticum

<400> 493

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac

60

gcacgaagtt gaagagcttg ctctttaacc aagtgagtgg cggacgggtg agtaacacgt

120

gggtaacctg cccattagag ggggataaca ttcggaaacg gatgctaata ccgcatagtt

180

tcaggaatcg catgattctt gaaggaaagg tggcttcggc taccactaat ggatggaccc

240

gcggcgtatt atctagttgg tgaggtaatg gctcaccaag gcaatgatac gtagccgacc

300

tgagagggtg atcggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

360

agtagggaat cttccgcaat ggacgaaagt ctgacggagc aacgccgcgt gagtgaagaa

420

ggttttcgga tcgtaaaact ctgttgttaa agaagaacaa ggatgagagt aactgctcat

480

cccctgacgg tatttaacca gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

540

cgtaggtggc aagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag cgagcgcagg cggttcttta

600

agtctgatgt gaaagccccc ggctcaaccg gggagggtca ttggaaactg gagaacttga

660

gtgcagaaga ggagagtgga attccacgtg tagcggtgaa atgcgtagat atgtggagga

720

acaccagtgg cgaaggcgac tctctggtct gtaactgacg ctgaggctcg aaagcgtggg

780

gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaagtgttg

840

gagggtttcc gcccttcagt gctgcagcta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg

900

gccgcaaggc tgaaactcaa aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gagcatgtgg

960

tttaatttgg aagcaacgcg aagaacctta ccaggtcttg acatcctttt gaccacttct

1020

agagatagag cttttccctt cggggacaaa gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

1080

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttatta ctagttgcca

1140

gcatttagtt gggcactcta gtgagactgc cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga

1200

cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tgctacaatg gatggtacaa

1260

cgagtcgcaa ggtcgcgagg ccaagctaat ctcttaaagc cattctcagt tcggattgta

1320

ggctgcaact cgcctacatg aagccggaat cgctagtaat cgcggatcag aacgccgcgg

1380

tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt tgtaacaccc

1440

gaagccggtg aggtaacctt ttaggagcca gccgtctaag gtgggataga taattggggt

1500

gaagtcgtaa caaggtagcc gtatcggaag gtgcggctgg atcacct

1547

<210> 494

<211> 1497

<212> DNA

<213> Catabacter hongkongensis

<400> 494

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gaagttgctc tttgggaagc cctcgggtgg aactgtgagt atacttagtg gcggacgggt

120

gagtaacgcg tgagcaatct gccctgcaat gggggacaac agttggaaac gactgctaat

180

accgcataag accacgaaac cgcatggttt agaggtaaaa ggattcattc gatgcaggat

240

gagctcgcgt cccattagat agttggtgag gtaacggccc accaagtcaa cgatgggtag

300

ccgacctgag agggtgatcg gccacattgg aactgagaaa cggtccaaac tcctacggga

360

ggcagcagtg gggaatattg ggcaatgggg gaaaccctga cccagcaacg ccgcgtgaag

420

gaagaaggcc ttcgggttgt aaacttttgt cctatgggac gaaaaaaatg acggtaccat

480

aggaggaagc tccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gagcaagcgt

540

tgtccggaat tactgggcgt aaagggtgcg taggtggcca tgtaagtcag gtgtgaaaga

600

ccggggctca accccggggt tgcacttgaa actgtgtggc ttgagtacag gagagggaag

660

tggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattagg aggaacacca gtggcgaagg

720

cgactttctg gactgtaact gacactgagg cacgaaagcg tggggagcaa acaggattag

780

ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg gatactaggt gtggggggcg atagtcctcc

840

gtgccgaagc taacgcatta agtatcccgc ctggggagta cgatcgcaag gttgaaactc

900

aaaggaattg acgggggccc gcacaagcag cggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc

960

gaagaacctt accaaggctt gacatcctct gacgcatata gagatatatg ttcccttcgg

1020

ggcagagaga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag

1080

tcccgcaacg agcgcaaccc ttgttgctag ttgccagcac gtaaaggtgg gaactctagt

1140

gagactgccg gggacaactc ggaggaaggt ggggacgacg tcaaatcatc atgcccctta

1200

tgtcttgggc tacacacgtg ctacaatggc cggtacaaag ggcagcgacc tcgtaagagt

1260

aagcgaatct caaaaagccg gccccagttc ggattgtggg ctgcaacccg cccacatgaa

1320

gtcggagttg ctagtaatcg cgaatcagca tgtcgcggtg aatgcgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacca cggaagttgg gagcacccga agccagtggc ttaaccgtaa

1440

ggagagagct gtcgaaggtg agatcaatga ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtaacc

1497

<210> 495

<211> 1485

<212> DNA

<213> Catenibacterium mitsuokai

<400> 495

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcgccgtgc ctaatacatg caagtcgaac

60

gaatctcctt cggaagataa gtgcgaacgg gtgagtaata cataggtaac ctgcccctgt

120

gcgggggata acaggaggaa actcctgcta ataccgcata gccatgagca ccgcatggag

180

ctcatgccaa atatccttca cgggatagcg cagggatgga cctatggcgc attagctagt

240

tggcggggca acggcccacc aaggcaacga tgcgtagccg gcctgagagg gcggacggcc

300

acattgggac tgagacacgg cccagactct acgggaggca gcagtaggga attttcggca

360

atgggggaaa ccctgaccga gcaacgccgc gtgagcgaag aaggcttcgg gtcgtaaagc

420

tctgttgtaa aggaagaacg tcggacacag gaaatggtgt gcgagtgacg gtactttacc

480

agaaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat ccgtaggtgc cgaccgttat

540

ccggaatcat tggccgtaaa gagggagcag gcggccgcaa gggtctgtgg tgaaagaccg

600

aagctaaact tcggtaagcc atggaaaccg ggcggctaga gtgcggaaga ggatcgtgga

660

attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat atatggagga acaccagtgg cgaagcgacg

720

gtctgggccg caactgacgc tcattcccga aaccgtgggg agccaatggc attagatacc

780

ctagtagtcc acgccgtaaa cgatggtcac taagtgtcgg gggtcaaacc ccggtgctgc

840

agtcaacgca ataagtgacc cgcctgagta gtacgttcgc aagaatgaaa ctcaaaggaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac

960

cttaccaggt cttgacatcg atctaaaagg gatggagaca tcctcatagc tatagagaag

1020

acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

1080

gagcgcaacc cctgtcgcca gttaccatca ttgagttggg gactctggcg agactgcctc

1140

tgcaaggagg aggaaggcgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg acctgggcca

1200

cacacgtgct acaatggacg ggacagaggg aagcgaaggc gcgagcgcaa gcggacccca

1260

gaaacccgtt cccagttcgg actgcagtct gcaactcgac tgcacgaagc cggaatcgct

1320

agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttctcg ggccttgtac acaccgccgt

1380

cacaccatga gagttggcaa cacccgaagg cggcggccca acccgcaagg agggagctgt

1440

ctaaggtggg gctgatgatt ggggtgaagt cgtaacaagg taacc

1485

<210> 496

<211> 1292

<212> DNA

<213> Catonella genomosp. P1 oral clone MB5_P12

<400> 496

gatgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgaac gagtggcgga cgggtgagta

60

acgcgtgggc aacctgccct atacaggggg atagcagctg gaaacggctg gtaagaccgc

120

ataaggaaat caggtatagg atggacccgc gtccgattag ccagttggca gggtaaaagc

180

ctaccaaagc gacgatcggt agccggactg agaggtcggg cggccacatt gggactgaga

240

cacggcccaa actcctacgg gaggcagcag tgggggatat tgcacaatgg aggaaactct

300

gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg

360

aagatgacgg tacctgacta agaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtagggggc aagcgttatc cggatttact gggtgtaaag ggagcgcagg cggttttgca

480

agttgagagt ggaagcaggg ggctcaaccc cctgactgct cccaaaactg taaaacttga

540

gtatgggaga ggcaggcgga attcctagtg tagcggtgaa atgcttagat attaggaaga

600

acaccggtgg cgaaggcggc ctgctggacc aactgacgct gaggctcgaa agcgtgggta

660

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgctgtaaac gatgaatact aggtgctggg

720

atttcggtgc cgtcgcaaac gcattaagta ttccacctgg ggagtacgtt cgcgagaatg

780

aagctcaagg gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgacg

840

caacgcgaag aaccttaccc ggtcttgaga tcgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctattt ttagtagcca

960

gcggccgggc actctaaaga gactgccgag gataactcgg aggaaggcgg ggatgacgtc

1020

aaatcatcat gccccttatg accggggcta cacacgtgct acaatgtcag tcagagggaa

1080

gcgaaggcgt gagtcggagc aaatctcagg ctgcctcagt tcggatgtag tctgcaactc

1140

gactacagaa gctggaatcg ctagtaatcg caaatcagaa tgttgcggtg aatacgttcc

1200

cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtcgg aaatgcccga agtcagtgcc

1260

taaggagctg ccgaaggcag gtctggtgac tg

1292

<210> 497

<211> 1553

<212> DNA

<213> Catonella morbi

<400> 497

atgagagttt gatcctggct caggacgaac gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg

60

aacgaaccgc gactgagtgc ttgcacttgg tcaaggtgag tggcgaacgg gtgagtaaca

120

cgtgggtaac ctacctcata gtgggggata acagtcggaa acgactgcta ataccgcata

180

ggacatggga tcacatgatt ctgtgaggaa aggtggcgca agctatcgct aagagatgga

240

cccgcggtgc attagctagt tggtagggta agggcctacc aaggcgatga tgcatagccg

300

acctgagagg gtgatcggcc acattgggac tgagacacgg cccaaactcc tacgggaggc

360

agcagtaggg aatcttccgc aatggacgca agtctgacgg agcaacgccg cgtgagtgaa

420

gaaggtcttc ggatcgtaaa gctctgttgt tagagaagaa cagcgcatag agtaactgct

480

atgcgtgtga cggtatctaa ccagaaagcc acggctaact acgtgccagc agccgcggta

540

atacgtaggt ggcgagcgtt gtccggattt attgggcgta aagggagtgt aggcggtctt

600

ttaagtctga tgtgaaagcc cacggctcaa ccgtggaggg tcattggaaa ctgggagact

660

tgagtgcaga agaggagagc ggaattccat gtgtagcggt gaaatgcgta gatatatgga

720

ggaacaccag tggcgaaggc ggctctctgg tctgtaactg acgctgaggc tcgaaagcgt

780

ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga gtgctaagtg

840

ttggaggggt tccacccttc agtgctggag ttaacgcaat aagcactccg cctggggagt

900

acggccgcaa ggctgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg

960

tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggtct tgacatcccg acgaccgctc

1020

tagagataga gtttttcttc ggaacgtcgg tgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

1080

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctataac tagttgccag

1140

cattgagatg gggactctag ttagactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac

1200

gtcaaatcat catgcccctt atgacctggg ctacacacgt gctacaatgg atggtacaac

1260

gagcagcgaa ctcgcgaggg taagcgaatc tctaaaagcc attctcagtt cggattgtag

1320

tctgcaactc gactacatga agccggaatc gctagtaatc gcggatcagc acgccgcggt

1380

gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc acgagagttt gtaacacccg

1440

aagccggtgg cctaaccttt taggagggag ccgtcgaagg tgggatagat gattggggtg

1500

aagtcgtaac aaggtagccg tatcggaagg tgcggctgga tcacctcctt tct

1553

<210> 498

<211> 1366

<212> DNA

<213> Catonella sp. oral clone FL037

<400> 498

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgcc taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcggac gggtgagtaa cgcgtgggta acctgccccg tacaggggga tagcgtcggg

120

aaactgacgg taagaccgca tagggaaaac tggtatggga tggacccgcg tccgattagc

180

cagttggcag ggtaaaggcc taccaaagct tcgatcggta gccggactga gaggtcggac

240

ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt gggggatatt

300

gcacaatgga ggaaactctg atgcagcgac gccgcgtgag tgaagaagtg ctccggcatg

360

taaagctctt tcagcaggga agatgacggt acctgaataa gaagccccgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtagggggca agcgttatcc ggatttactg ggtgtaaagg

480

gagcgcaggc ggtctggcaa gttgagagtg gaagcagggg gctcaacccc ctgactgctc

540

ccaaaactgt tggactggag tatgggagag gcaggcggaa ttcctagtgt agcggtgaaa

600

tgctcagata ttaggaagaa caccggtggc gaaggcggcc tgctggacca actgacgctg

660

aggctcgaga gcgtggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgaatacta ggtgccggga tttcggtgcc gtcgcaaacg cattgagtat tccacctggg

780

gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg aattgacggg gacccgcgca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttacccg gtcttgagat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctgttct tagtagccag cggccgggca ctctaaggag actgccgggg ataacccgga

1020

ggaaggcggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga cttgggcgac acacgtgcta

1080

caatggcgta caaagggaag cgagctcgtg agagtaagcg aaactcaaaa cgtctcagtt

1140

cggatgtagt ctgcaacccg actacagaag ctggaatcgc tagtaatcgc agatcagcat

1200

gctgcggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtcggt

1260

aatgcccgaa gccagtaacc agggagctgt cgaaggcagg actgataact ggggtgaagt

1320

cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgcg gctggaacac ctcctt

1366

<210> 499

<211> 1403

<212> DNA

<213> Cedecea davisae

<400> 499

cggacgggtg agtaatgtct ggggatctgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg

60

tagctaatac cgcataacgt cgcaagacca aagaggggga ccttcgggcc tcttgccatc

120

ggatgaaccc agatgggatt agctagtagg tggggtaatg gctcacctag gcgacgatcc

180

ctagctggtc tgagaggatg accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac

240

gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt

300

gtgtgaagaa ggccttcggg ttgtaaagca ctttcagcga ggaggaaggc attaaggtta

360

ataacctyrg tgattgacgt tactcgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc

420

cgcggtaata cggagggtgc aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg

480

cggtttgtta agtcggatgt gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca ttcgaaactg

540

gcaagcttga gtcttgtaga ggggggtaga attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag

600

atctggagga ataccggtgg cgaaggcggc cccctggaca aagactgacg ctcaggtgcg

660

aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgtcga

720

cttggaggtt gtgcccttga ggcgtggctt ccggagctaa cgcgttaagt cgaccgcctg

780

gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg

840

agcatgtggt ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc tactcttgac atccagagaa

900

ctttccagag atggattggt gccttcggga actctgagac aggtgctgca tggctgtcgt

960

cagctcgtgt tgtgaaatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcctttgt

1020

tgccagcggt tcggccggga actcaaagga gactgccagt gataaactgg aggaaggtgg

1080

ggatgacgtc aagtcatcat ggcccttacg agtagggcta cacacgtgct acaatggcgc

1140

atacaaagag aagcgacctc gcgagagcaa gcggacctca taaagtgcgt cgtagtccgg

1200

attggagtct gcaactcgac tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgta gatcagaatg

1260

ctacggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt

1320

gcaaaagaag taggtagctt aaccttcggg agggcgctta ccactttgtg attcatgact

1380

ggggtgaagt cgtaccaagg taa

1403

<210> 500

<211> 1444

<212> DNA

<213> Cellulosimicrobium funkei

<400> 500

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gatgatgccc agcttgctgg

60

gtggattagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgagtaacc tgcccttgac ttcgggataa

120

ctccgggaaa ccggggctaa taccggatat gagccgccyt cgcatggggg tggttggaaa

180

gtttttcggt cagggatggg ctcgcggcct atcagcttgt tggtggggtg atggcctacc

240

aaggcgacga cgggtagccg gcctgagagg gcgaccggcc acactgggac tgagacacgg

300

cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatgggcgaa agcctgatgc

360

agcgacgccg cgtgagggat gaaggccttc gggttgtaaa cctctttcag cagggaagaa

420

gcgcaagtga cggtacctgc agaagaagcg ccggctaact acgtgccagc agccgcggta

480

atacgtaggg cgcaagcgtt gtccggaatt attgggcgta aagagctcgt aggcggtttg

540

tcgcgtctgg tgtgaaaact cgaggctcaa cctcgagctt gcatcgggta cgggcagact

600

agagtgcggt aggggagact ggaattcctg gtgtagcggt ggaatgcgca gatatcagga

660

ggaacaccga tggcgaaggc aggtctctgg gccgcaactg acgctgagga gcgaaagcat

720

ggggagcgaa caggattaga taccctggta gtccatgccg taaacgttgg gcactaggtg

780

tggggctcat tccacgagtt ccgtgccgca gcaaacgcat taagtgcccc gcctggggag

840

tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat

900

gcggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc ttaccaaggc ttgacatgca cgggaagcca

960

ccagagatgg tggtctcttt ggacactcgt gcacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

1020

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa ccctcgtccc atgttgccag

1080

cgggttatgc cggggactca tgggagactg ccggggtcaa ctcggaggaa ggtggggatg

1140

acgtcaaatc atcatgcccc ttatgtcttg ggcttcacgc atgctacaat ggccggtaca

1200

aagggctgcg ataccgtaag gtggagcgaa tcccaaaaag ccggtctcag ttcggattgg

1260

ggtctgcaac tcgaccccat gaagtcggag tcgctagtaa tcgcagatca gcaacgctgc

1320

ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcaa gtcacgaaag tcggtaacac

1380

ccgaagccca tggcccaacc gttcgcgggg ggagtggtcg aaggtgggac tggcgattgg

1440

gact

1444

<210> 501

<211> 1470

<212> DNA

<213> Cetobacterium somerae

<400> 501

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct gacagaatgc ttaacacatg caagtcgatt

60

cgatttacct tcgggtattg aggatggcgg acgggtgagt aacgcgtaag gaacttgcct

120

cttggtctgg gacaactgtt ggaaacgaca gctaataccg gatattatga gattctcgca

180

tgggaaactt atgaaagcta tatgcgccaa gagagagcct tgcgttccat tagctagttg

240

gtggggtaac ggcccaccaa ggcgacgatg gatagccggc ctgagagggt gaacggccac

300

aaggggactg agacacggcc cttactccta cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa

360

tgggccacaa gcctgatcca gcaattctgt gtgcacgatg aaggtcttcg gattgtaaag

420

tgctttcagt tgggaagaag aaagtgacgg taccaacaga agaagcgacg gctaaatacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtatgtcgc aagcgttatc cggatttatt gggcgtaaag

540

cgcgtctagg cggaaaaata agtctgatgt taaaatgcgg ggctcaactc cgtattgcgt

600

tggaaactgt ttttctagag tactggagag gtgggcggaa ctacaagtgt agaggtgaaa

660

ttcgtagata tttgtaggaa tgccgatgga gaagtcagct cactggacag atactgacgc

720

taaagcgcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa

780

cgatgatcac taggtgttgg gggtcgaacc tcagcgccca agctaacgcg ataagtgatc

840

cgcctgggga gtacgcacgc aagtgtgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag

900

cggtggagca tgtggtttaa ttcgacgcaa cgcgagaaac cttaccagcg tttgacatcc

960

taagaagttt ccagagatgg attcgtgccg gcttgccgga acttagtgac aggtggtgca

1020

tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc

1080

tattgtatgt tgctaccatt aagttgagca ctcatgcgat actgcctgcg atgagcagga

1140

ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg ccccttatac gctgggctac acacgtgcta

1200

caatgggcag tacagagagt tgccaacccg cgagggtgag ctaatctctt aaagctgttc

1260

ttagttcgga ttgtactctg caactcgagt acatgaagtt ggaatcgcta gtaatcgcaa

1320

atcagcatgt tgcggtgaat acgttctcgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccacga

1380

gagttggttg cacctgaagt agcaggccta accgtaagga gggatgttcc taaggtgtga

1440

ttagcgattg gggtgaagtc gtaacaaggt

1470

<210> 502

<211> 1549

<212> DNA

<213> Chlamydia muridarum

<400> 502

ctgagaattt gatcttggtt cagattgaac gctggcggcg tggatgaggc atgcaagtcg

60

aacggaacaa ttgcttcggt gattgtttag tggcggaagg gttagtaatg catagataat

120

ttgtccttaa cttgggaata acggttggaa acggccgcta ataccgaatg tggcgtagat

180

taggcatcta aattacgtta aagaagggga tcttcggacc tttcggttaa gggagagtct

240

atgtgatatc agctagttgg tggggtaaag gcctaccaag gctatgacgt ctaggcggat

300

tgagagattg gccgccaaca ctgggactga gacactgccc agactcctac gggaggctgc

360

agtcgagaat ctttcgcaat ggacggaagt ctgacgaagc gacgccgcgt gtgtgatgaa

420

ggctctaggg ttgtaaagca ctttcgcttg ggaataagag aagacggtta atacccgttg

480

gatttgagcg taccaggtaa agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc tgcggtaata

540

cggagggtgc tagcgttaat cggatttatt gggcgtaaag ggcgtgtagg cggaaaggta

600

agttagttgt caaatctcgg ggctcaaccc cgaatcggca tctaaaacta tttttctaga

660

gggtagatgg agaaaaggga atttcacgtg tagcggtgaa atgcgtagat atgtggaaga

720

acaccagtgg cgaaggcgct tttctaattt atacctgacg ctaaggcgcg aaagcaaggg

780

gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cttgccgtaa acgatgcata cttgatgtgg

840

atggtctcaa ccccatccgt gtcggagcta acgcgttaag tatgccgcct gaggagtaca

900

ctcgcaaggg tgaaactcaa aagaattgac gggggcccgc acaagcagtg gagcatgtgg

960

tttaattcga tgcaacgcga aggaccttac ctgggtttga catgcatatg accgcggcag

1020

aaatgtcgtt ttccgcaagg acatatgcac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgc

1080

cgtgaggtgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcgttagt tgccagcact

1140

tagggtggga actctaacga gactgcctgg gttaaccagg aggaaggcga ggatgacgtc

1200

aagtcagcat ggcccttatg cccagggcga cacacgtgct acaatggcca gtacagaagg

1260

tagcaagatc gcgagatgga gcaaatcctc aaagctggcc ccagttcgga ttgtagtctg

1320

caactcgact acatgaagtc ggaattgcta gtaatggcgt gtcagccata acgccgtgaa

1380

tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacatcatg ggagttggtt ttaccttaag

1440

tcgttgactc aacccgcaag ggggagaggc gcccaaggtg aggctgatga ctgggatgaa

1500

gtcgtaacaa ggtagcccta ccggaaggtg gggctggatc acctccttt

1549

<210> 503

<211> 1553

<212> DNA

<213> Chlamydia psittaci

<400> 503

ttttctgaga atttgatctt ggttcagatt gaacgctggc ggcgtggatg aggcatgcaa

60

gtcgaacgga ataatgactt cggttgttat ttagtggcgg aagggttagt aatacataga

120

taatctgtcc tcaacttggg aataacggtt ggaaacgacc gctaataccg aatgtggtat

180

gtttaggcat ctaaaacata ttaaagaagg ggatcttcgg acctttcggt tgagggagag

240

tctatgggat atcagcttgt tggtggggta atggcctacc aaggctttga cgtctaggcg

300

gattgagaga ttgaccgcca acactgggac tgagacactg cccagacttc tacggaaggc

360

tgcagtcgag aatctttcgc aatggacgaa agtctgacga agcgacgccg cgtgtgtgat

420

gaaggctcta gggttgtaaa gcactttcgc ttgggaataa gagagattgg ctaatatcca

480

atcgatttga gcgtaccagg taaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agctgcggta

540

atacggaggg tgctagcgtt aatcggattt attgggcgta aagggcgtgt aggcggaaag

600

gaaagttaga tgttaaatct tggggctcaa ccccaagcca gcatctaata ctatctttct

660

agagggtaga tggagaaaag ggaattccac gtgtagcggt gaaatgcgta gatatgtgga

720

agaacaccag tggcgaaggc gcttttctaa tttacacctg acgctaaggc gcgaaagcaa

780

ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccttgccg taaacgatgc atacttgatg

840

tggatagtct caaccctatc cgtgtcgtag ctaacgcgtt aagtatgccg cctgaggagt

900

acactcgcaa gggtgaaact caaaagaatt gacgggggcc cgcacaagca gtggagcatg

960

tggtttaatt cgatgcaacg cgaagaacct tacctgggct tgacatgtat ttgaccgcgg

1020

cagaaatgtc gttttccgca aggacagata cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg

1080

tgccgtgagg tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcgtt agttgccaac

1140

acttagggtg ggaactctaa cgagactgcc tgggttaacc aggaggaagg cgaggatgac

1200

gtcaagtcag catggccctt atgcccaggg ctacacacgt gctacaatgg ccagtacaga

1260

aggtagcaat atcgtgagat ggagcaaatc ctcaaagctg gccccagttc ggattgtagt

1320

ctgcaactcg actacatgaa gtcggaattg ctagtaatgg cgtgtcagct ataacgccgt

1380

gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacatc atgggagttg gttttgcctt

1440

aagtcgttga ctcaacctgc aaaggagaga ggcgcccaag gtgaggctga tgactgggat

1500

gaagtcgtaa caaggtagcc ctaccggaag gtggggctgg atcacctcct ttt

1553

<210> 504

<211> 1554

<212> DNA

<213> Chlamydia trachomatis

<400> 504

ttttctgaga atttgatctt ggttcagatt gaacgctggc ggcgtggatg aggcatgcaa

60

gtcgaacgga gcaattgttt cggcaattgt ttagtggcgg aagggttagt aatgcataga

120

taatttgtcc ttaacttggg aataacggtt ggaaacggcc gctaataccg aatgtggcga

180

tatttgggca tccgagtaac gttaaagaag gggatcttag gacctttcgg ttaagggaga

240

gtctatgtga tatcagctag ttggtggggt aaaggcctac caaggctatg acgtctaggc

300

ggattgagag attggccgcc aacactggga ctgagacact gcccagactc ctacgggagg

360

ctgcagtcga gaatctttcg caatggacgg aagtctgacg aagcgacgcc gcgtgtgtga

420

tgaaggctct agggttgtaa agcactttcg cttgggaata agagaaggcg gttaataccc

480

gctggatttg agcgtaccag gtaaagaagc accggctaac tccgtgccag cagctgcggt

540

aatacggagg gtgctagcgt taatcggatt tattgggcgt aaagggcgtg taggcggaaa

600

ggtaagttag ttgtcaaaga tcggggctca accccgagtc ggcatctaat actatttttc

660

tagagggtag atggagaaaa gggaatttca cgtgtagcgg tgaaatgcgt agatatgtgg

720

aagaacacca gtggcgaagg cgcttttcta atttatacct gacgctaagg cgcgaaagca

780

aggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccttgcc gtaaacgatg catacttgat

840

gtggatggtc tcaaccccat ccgtgtcgga gctaacgcgt taagtatgcc gcctgaggag

900

tacactcgca agggtgaaac tcaaaagaat tgacgggggc ccgcacaagc agtggagcat

960

gtggtttaat tcgatgcaac gcgaaggacc ttacctgggt ttgacatgta tatgaccgcg

1020

gcagaaatgt cgttttccgc aaggacatat acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

1080

gtgccgtgag gtgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcgt tagttgccag

1140

cacttagggt gggaactcta acgagactgc ctgggttaac caggaggaag gcgaggatga

1200

cgtcaagtca gcatggccct tatgcccagg gcgacacacg tgctacaatg gccagtacag

1260

aaggtagcaa gatcgtgaga tggagcaaat cctcaaagct ggccccagtt cggattgtag

1320

tctgcaactc gactacatga agtcggaatt gctagtaatg gcgtgtcagc cataacgccg

1380

tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacat catgggagtt ggttttacct

1440

taagtcgttg actcaacccg caagggagag aggcgcccaa ggtgaggctg atgactagga

1500

tgaagtcgta acaaggtagc cctaccggaa ggtggggctg gatcacctcc tttt

1554

<210> 505

<211> 1407

<212> DNA

<213> Chlamydiales bacterium NS11

<400> 505

ggtatggggg caactccata tagtggcgca agggttagta atacatagat aatctgcctc

60

tgacctggga ataacggctg gaaacggcca tacatagata atctacctct gacctgggaa

120

taacggctgg aaacggccgc taataccgaa tgaggtggca taaggcatct tgtgcttatc

180

aatgcggggg atcgaaagac ctcgtggtta gagaagagtc tatgggatat cagctagttg

240

gtgaggtaat ggctcaccaa ggctaagacg tctaggcgga ttgagagatt gaccgccaac

300

actgggactg agacactgcc cagactccta cgggaggctg cagtcgagaa tctttcgcaa

360

tgggcgcaag cctgacgaag cgacgccgtg tgagcgaaga aggccttcgg gttgtaaagc

420

tctttcgcta gggaacaaga gatataggac aataccctat agatttgatg gtacttggta

480

aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ctgcggtaat acggagggtg caagcattga

540

tcggaattac tgggcgtaaa gggcgcgtag gcggcagaat aagtcagatg tgaaattccg

600

gggctcaacc ccggagctgc atttgaaact attcaactag aggacagtta gggtaaacgg

660

aattccacgt gtagcggtga aatgcgtaga tatgtggaag aacaccggtg gtgaagacgg

720

tttactgggc tgatactgac gctgaggcgc gaaagcatgg ggagcaaaca ggattagata

780

ccctggtagt cctagcctta aacgatgtat actaggagta ggtgggctca acccccactg

840

taccggagct aacgcattaa gtatgccgcc tggggagtac gctcgcaagg gtgaaactca

900

aaagaattga cgggggcccg cacaagcagt ggagcatgtg gtttaattcg atgcaacgcg

960

aagaacctta cctaggctcg aaatgtagag gacgatatca gagatgatat ttcccgaaag

1020

ggtctctata taggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg tttggttaag

1080

tccagcaacg agcgcaaccc ttatcgttag ttgccaacac gtaaaggcgg gaactctaac

1140

gagactgcct gggttaacca ggaggaaggt gaggatgacg tcaagtccgc atggccttta

1200

tgtccagggc tacacacgtg ctacaatggt cggtacagaa ggcagcgaaa ccgcaaggcg

1260

aagcaaatcc ggaaaaaccg atctcagttc agattgtagt ctcaactcgg ctacatgaag

1320

ttggaattgc tagtaatggc gtgtcagcaa caacgccgtg aatacgttcc cgggccttgt

1380

acacactgcc cgtcacatca tgggagt

1407

<210> 506

<211> 1334

<212> DNA

<213> Chlamydiales bacterium NS13

<400> 506

tagtggcgca agggttagta atacatggat aatccacctc tcacgtagga ataacggctg

60

gaaacggccg ctaataccga atgaggtggc ttaaggcatc ttaccatagt caaagcgggg

120

gatcgaaaga cctcgcggtt agagaggagt tcatgagata tcagctagtt ggtgaggtaa

180

tggctcacca aggctaagac gtctaggcgg attgagagat tgaccgccaa cactgggact

240

gagacactgc ccagactcct acgggaggct gcagtcgaga atcttgcgca atgggcgcaa

300

gcctgacgaa gcgacgccgt gtgagcgaag aaggccttca ggttgtaaag ctctttcgct

360

agggaacaag agagtcggga taataatcag atgacttgat ggtacttggt aaagaagcac

420

cggctaactc cgtgccagca gctgccgtac taccgagggt gcaagcattg atcggaatta

480

ctgcgcgtaa agggcgcgta cgccgcagga taagtcagat gtgaaattcc ggggctcaac

540

cccggagctg catttgaaac tctcttgcta gaggacagtt agggtaaacg gaattccacg

600

tgtagcggtg aaatgcgtag atatgtggaa gaacaccagt ggtgaagacg gttttctggg

660

ctggaactga cgctgaggcg cgggagctag gggagcaaac aggattagat accctggtag

720

tcctagccgt aaacgatgca tactggatgt agggaggctc aacccttatt gtatcggagc

780

taacgcgtta agtatgccgc ctggggagta cgcccgcaag ggtgaaactc aaaagaattg

840

acgggggccc gcacaagcag tggagcatgt ggtttaattc gatgcaacgc gaagaacctt

900

acccaggctc gaagtgtaga gaacaagcgc agagatgcgg tgtctcttcg ggacatctat

960

ataggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gccgtgaggt gttgggttaa gtcccgcaac

1020

gagcgcaacc cttattgtca gttgccaacg cgtaaaggcg gggactctgg caagactgcc

1080

taggttaact aggaggaagg tgaggatgac gtcaagtccg catggccctt atgtccgggg

1140

ctacacacgt gctacaatgg tcgatacaga gggctgcgaa gccgcgaggc ggagcaaatc

1200

cgataaaacc gatctcagtt cagattgcag tctcaactcg actacatgaa gttggaattc

1260

ctagtaaagg cgtgtcagct acagcgccgt gaatacgttc ccgggccttg tagacaccgc

1320

ccgtcacatc atgg

1334

<210> 507

<211> 1337

<212> DNA

<213> Chlamydiales bacterium NS16

<400> 507

tagtggcgga agggttagta atacatgagt aacctacctc taacctgggg ataacggttg

60

gaaacggccg ctaataccga atgaggagac gaggggaatg ctcatggctt caaagtaggg

120

gatcttgaag ggaccttgcg gtaggagaga ggggtatggg atatcagcta gttggtgtgg

180

taaaggcgca ccaaggctaa gacgtctagg cggattgaga ggttgaccgc caacactggg

240

actgagacac tgcccagact cctacgggag gctgcagtcg agaatctttc gcaatgggcg

300

aaagcgtgac gaagcgacgc cgtgtggacg atgaaggcct tcgggttgta aagtcctttc

360

gccagggaac aagaaaaatt aactaataac ttatcaattt gagcgtacta ggtaaagaag

420

caccggctaa ctccgtgcca gcagctgcgg taatacggag ggtgcaagca ttaatcggat

480

ttattgggcg taaagagcgc gtaggcgggc aagcaagtca gatgtgaaat tccggagctc

540

aactccggag ctgcatttga aactacttgt ctagaggatg gacggagaaa acggaattcc

600

acgtgtagcg gtgaaatgcg tagatatgtg gaagaacacc ggtggcgaag gcggttttct

660

agtttattcc tgacgctgag gcgcgagagc aaggggagca aacagggtta gataccctgg

720

tagtccttgc cgtaaacgtt gcatacttga tgtatttggg ctcaaccccg actgtgtcga

780

acctaacgcg ataagtatac cacctgagga gtacgctcgc aagggtgaaa ctcaaaagaa

840

ttgacggggg cccgcacaag cagtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa cgcgaagaac

900

cttacccagg cttgacatat agaagaccac atcagaaatg ttgtctcccg caagggcttt

960

tgtacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgccgtga ggtgttgggt taagtcccgc

1020

aacgagcgca acccttgtca ttagttgcca acatttcgtg atggggactc taatgagact

1080

gcctgggtta actaggagga aggtgaggat gacgtcaagt ccgcatggcc tttatgtctg

1140

gggctacaca cgtgctacaa tggtcgatac agaaggcagc gaagccgcaa ggtggagcaa

1200

atcctcaaaa ccgatctcag ttcggataga agtctgcaac tcgacttctt gaagttggaa

1260

ttgctagtaa tgacgtgtca gcaataacgt cgtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1320

cgcccgtcac atcacgg

1337

<210> 508

<211> 1548

<212> DNA

<213> Chlamydophila pecorum

<400> 508

ctgagaattt gatcttggtt cagattgaac gctggcggcg tggatgaggc atgcaagtcg

60

aacggaataa tggcttcggc tattatttag tggcggaagg gttagtaata catagataat

120

ttgtcttaac ttgggaataa cggttggaaa cggccgctaa taccgaatgt ggtgtgttta

180

ggcatctaaa ttacattaaa gaaggggatc ttcggacctt tcggttaaga gaaagtctgt

240

gggatatcag cttgttggtg gggtaatggc ctaccaaggc tatgacgtct aggcggattg

300

agagattgac cgccaacact gggactgaga cactgcccag actcctacgg gaggctgcag

360

tcgagaatct ttcgcaatgg acgaaagtct gacgaagcga cgccgcgtgt gtgatgaagg

420

ctctagggtt gtaaagcact ttcgcctggg aataagagag attggctaat atccaattga

480

tttgagcgta ccaggtaaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagctg cggtaatacg

540

gagggtgcta gcgttaatcg gatttattgg gcgtaaaggg cgtgtaggcg gaaaggaaag

600

ttagatgtca aatcttgagg ctcaacctca agtcggcatc taatactatc tttctagagg

660

ttggatggag aaaagggaat tccacgtgta gcggtgaaat gcgtagatat gtggaagaac

720

accagtggcg aaggcgcttt tctaattttt cctgacgcta aggcgcgaaa gcaaggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtcctt gctgtaaacg atgcatactt gatgtggatg

840

gtctcaaccc catccgtgtc ggagctaacg cgttaagtat gccgcctgag gagtacactc

900

gcaagggtga aactcaaaag aattgacggg ggcccgcaca agcagtggag catgtggttt

960

aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg ggcttgacat gtatttgacc gcggcagaaa

1020

tgtcgttttc cgtaaggaca gatacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgccgt

1080

gaggtgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cgttagttgc cagcactttg

1140

ggtgggaact ctaacgagac tgcctgggtt aaccaggagg aaggcgagga tgacgtcaag

1200

tcagcatggc ccttatgtcc agggcgacac acgtgctaca atgggtagta cagaaggtag

1260

caagatcgtg agatggagca aatccttaaa gctatcctca gttcggattg tagtctgcaa

1320

ctcggctaca tgaagtcgga attgctagta atggcgtgtc agccataacg ccgtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca catcatggga gttggtttca ccttaagtcg

1440

ttgactcaac ctatttttag gagggaggcg cccaaggtga ggctgatgac tgggatgaag

1500

tcgtaacaag gtagccctac cggaaggtgg ggctggatca cctccttt

1548

<210> 509

<211> 1552

<212> DNA

<213> Chlamydophila pneumoniae

<400> 509

ctgagaattt gatcttagtt cagattgaac gctggcggcg tggatgaggc atgcaagtcg

60

aacggaataa tgacttcggt tgttatttag tggcggaagg gttagtagta catagataat

120

ctgccctcaa cttggggata acggttggaa acgatcgcta ataccgaatg tagtgtaatt

180

aggcatctaa tatatattaa agaaggggat cttcggacct ttcggttgag gaagagttta

240

tgcgatatca gcttgttggt ggggtaaaag cccaccaagg cgatgacgtc taggcggatt

300

gagagattga ccgccaacac tgggactgag acactgccca gactcctacg ggaggctgca

360

gtcgagaatc tttcgcaatg gacgaaagtc tgacgaagcg acgccgcgtg tgtgatgaag

420

gccttagggt tgtaaagcac tttcgcctgg gaataagaga gattggctaa tatccaatcg

480

atttgagcgt accaggtaaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagct gcggtaatac

540

ggagggtgct agcgttaatc ggatttattg ggcgtaaagg gcgtgtaggc ggaaaggaaa

600

gttagatgtt aaattttggg gctcaacccc aagtcagcat ttaaaactat ctttctagag

660

gatagatggg gaaaagggaa ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tgtggaagaa

720

caccagtggc gaaggcgctt ttctaattta tacctgacgc taaggcgcga aagcaagggg

780

agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc ttgccgtaaa cgatgcatac ttgatgtgga

840

tggtctcaac cccatccgtg tcggagctaa cgtgttaagt atgccgcctg aggagtacac

900

tcgcaagggt gaaactcaaa agaattgacg ggggcccgca caagcagtgg agcatgtggt

960

ttaattcgat gcaacgcgaa ggaccttacc tggacttgac atgtatttga caactgtaga

1020

aatacagctt tccgcaagga cagatacaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgcc

1080

gtgaggtgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt atcgttagtt gccagcactt

1140

agggtgggaa ctctaacgag actgcctggg ttaaccagga ggaaggcgag gatgacgtca

1200

agtcagcatg gcccttatgt ccagggcgac acacgtgcta caatggttag tacagaaggt

1260

agcaagatcg tgagatggag caaatcctaa aagctagccc cagttcggat tgtagtctgc

1320

aactcgacta catgaagtcg gaattgctag taatggcgtg tcagccataa cgccgtgaat

1380

acgttctcgg gccttgtaca caccgcccgt cacatcatgg gagttggttt taccttaagt

1440

cgttgactca acctatttat aggagagagg cgcccaaggt gaggctgatg actgggatga

1500

agtcgtaaca aggtagccct accggaaggt ggggctggat cacctccttt tt

1552

<210> 510

<211> 1548

<212> DNA

<213> Chlamydophila psittaci

<400> 510

ctgagaattt gatcttggtt cagattgaac gctggcggcg tggatgaggc atgcaagtcg

60

aacggaataa tgacttcggt tgttatttag tggcggaagg gttagtaata catagataat

120

ctgtcctcaa cttgggaata acggttggaa acgaccgcta ataccgaatg tggtatgttt

180

aggcatctaa agcatattaa agaaggggat cttcggacct ttcggttgag ggagagtcta

240

tgggatatca gcttgttggt ggggtaatgg cctaccaagg ctttgacgtc taggcggatt

300

gagagattga ccgccaacac tgggactgag acactgccca gacttctacg gaaggctgca

360

gtcgagaatc tttcgcaatg gacgaaagtc tgacgaagcg acgccgcgtg tgtgatgaag

420

gctctagggt tgtaaagcac tttcgcttgg gaataagaga gattggctaa tatccaatcg

480

atttgagcgt accaggtaaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagct gcggtaatac

540

ggagggtgct agcgttaatc ggatttattg ggcgtaaagg gcgtgtaggc ggaaaggaaa

600

gttagatgtt aaatcttggg gctcaacccc aagccagcat ctaatactat ctttctagag

660

ggtagatgga gaaaagggaa ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tgtggaagaa

720

caccagtggc gaaggcgctt ttctaattta cacctgacgc taaggcgcga aagcaagggg

780

agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc ttgccgtaaa cgatgcatac ttgatgtgga

840

tagtctcaac cctatccgtg tcgtagctaa cgcgttaagt atgccgcctg aggagtacac

900

tcgcaagggt gaaactcaaa agaattgacg ggggcccgca caagcagtgg agcatgtggt

960

ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc tgggcttgac atgtatttga ccgcggcaga

1020

aatgtcgttt tccgcaagga cagatacaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgcc

1080

gtgaggtgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt atcgttagtt gccaacactt

1140

agggtgggaa ctctaacgag actgcctggg ttaatcagga ggaaggcgag gatgacgtca

1200

agtcagcatg gcccttatgc ccagggctac acacgtgcta caatggccag tacagaaggt

1260

agcaatatcg tgagatggag caaatcctca aagctggccc cagttcggat tgtagtctgc

1320

aactcgacta catgaagtcg gaattgctag taatggcgtg tcagctataa cgccgtgaat

1380

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacatcatgg gagttggttt tgccttaagt

1440

cgttgactca acctgcaaag gagagaggcg cccaaggtga ggctgatgac tgggatgaag

1500

tcgtaacaag gtagccctac cggaaggtgg ggctggatca cctccttt

1548

<210> 511

<211> 1419

<212> DNA

<213> Chloroflexi genomosp. P1

<400> 511

gatgaacgct ggcggcgtgc ttaatacatg caagtcgaac gggtgcagcg atgtaccagt

60

ggcgaacggg tgagtaacac gttggtgacc tgccccaaag aggggaatac cgcttggaaa

120

cgagcgacaa aaccgcataa gctatcggga gtcagagagc cgatagtaaa agaggaatct

180

actttgggag gggcctgcgg cccatcagct agttggagag gtaacggctc accaaggcga

240

agacgggtag gggacctgag agggtgatcc cccacaatgg aactgaaaca cggtccatac

300

acctacgggt ggcagcagta gggaatattg ctaaatgggc gaaagcctga agcagcaacg

360

ccgcgtgaac gaagaaggcc ttcgggtcgt aaagttcttt tacgtgggaa gaggaaggac

420

agtaccacgg gaataagtct cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa aacgtaggag

480

gcgagcgtta tccggattta ctgggcgtaa agagcgtgta ggaggcaaaa caagacggat

540

gtgaaagccc ccggcttaac cgggggaggt cgtacgtgac tgtagagcta gagtgagtta

600

gaggtaagcg gaactccggg agtagtggtg aaatgcgtag atatccggaa gaacatcaga

660

ggcgaaagcg gcttactggg acttaactga cactgagacg cgaaagccag ggtagcaaac

720

gggattagag accccggtag tcctggctgt aaacgatgta gactggacgt tttcggggta

780

aaagctgaga gtgtcgaagc gaacgcgata agtctaccgc ctggggagta cggtcgcagg

840

attaaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcag cggagcgtgt ggtttaattc

900

gatgatacac gaagaacctt accggggttt gacatacagg tagtaagaag gcgaaagccg

960

gatgaccctt acgggggagc ctgaacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1020

agatgttcgg ttaagtccgc taacgagcgc aacccttgtc gcgtgttaca agtgtcacgc

1080

gagaccgccg gtagaaagcc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcagc atggccttta

1140

tatcccgggc tacacacacg ctacaatggc cggtacagag ggtagcgaag ccgcgaggcg

1200

gagccaatcc tgaaaagccg gtcgtagttc agattgcagg ctgcaactcg cctgcatgaa

1260

gatggagttg ctagtaaccg taggtcagcg atactacggt gaatacgttc ccgggccttg

1320

tacacaccgc ccgtcacgtc atgggagttg gcaacacctg aagccggtat cctgaccgag

1380

aggagggagc cgtcaaaggt ggggttgatg attggggtg

1419

<210> 512

<211> 1334

<212> DNA

<213> Christensenella minuta

<400> 512

ggctcaggac gaacgctggc ggcgtgctta acacatgcaa gtcgaacgag tggcggacgg

60

gtgagtaacg cgtgagcaac ctgccctgca acgggggaca acagttggaa acgactgcta

120

ataccgcatg agaaaagtcg atgcaggatg ggctcgcgtc ccattagata gttggtgagg

180

taacggccca ccaagtcaac gatgggtagc cgacctgaga gggtgatcgg ccacactgga

240

actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg gcaatggggg

300

aaaccctgac ccagcaacgc cgcgtgaggg aagaaggtct tcggattgta aacctttgtc

360

ctatgggacg atgacggtac cataggagga agctccggct aactacgtgc cagcagccgc

420

ggtaatacgt agggagcaag cgttgtccgg aattactggg cgtaaagggt gcgtaggtgg

480

tcatgtaagt cagatgtgaa agaccggggc ttaaccccgg ggttgcattt gaaactgtgt

540

gacttgagta caggagaggg aagtggaatt cctagtgtag cggtgaaatg cgtagatatt

600

aggaggaaca ccagtggcga aggcgacttt ctggactgac tgacactgag gcacgaaagc

660

gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat ggatactagg

720

tgtggggcgt tccgtgccga agcaaacgca ttaagtatcc cgcctgggga gtacgatcgc

780

aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cagcggagca tgtggtttaa

840

ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaagg cttgacatcg acaggtggtg catggttgtc

900

gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttattgcta

960

gttgccagcg cgcgggaact ctagtgagac tgccggggac aactcggagg aaggtgggga

1020

cgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtct tgggctacac acgtgctaca atggccggca

1080

aagggcagcg aacccgtaag gggaagcgaa tctcaaccgg tcccagttcg gatgtgggct

1140

gcaacccgcc cacagaagtc ggagttgcta gtaatcgcga atcagcatgt cgcggtgaat

1200

gcgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacgg aagttgggag cacccgaagc

1260

cagtgcttag agagctgtcg aaggtgagat caatgactgg ggtgaagtcg taacaaggta

1320

gccgtatcgg aagg

1334

<210> 513

<211> 1544

<212> DNA

<213> Chromobacterium violaceum

<400> 513

tgaactgaag agtttgatcc tggctcagat tgaacgctgg cggcatgctt tacacatgca

60

agtcgaacgg taacagggtg cttgcaccgc tgacgagtgg cgaacgggtg agtaatgcgt

120

cggaatgtac cgtgtaatgg gggatagctc ggcgaaagcc ggattaatac cgcatacgcc

180

ctgaggggga aagcggggga tcgaaagacc tcgcgttata cgagcagccg acgtctgatt

240

agctagttgg tgaggtaaga gctcaccaag gcgacgatca gtagcgggtc tgagaggatg

300

atccgccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

360

tttggacaat gggggcaacc ctgatccagc catgccgcgt gtctgaagaa ggccttcggg

420

ttgtaaagga cttttgtcag ggaggaaatc ccgctggtta atacccggcg gggatgacag

480

tacctgaaga ataagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc

540

gagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgtgcgcagg cggttgtgca agtctgatgt

600

gaaagccccg ggcttaacct gggaacggca ttggagactg cacagctaga gtgcgtcaga

660

ggggggtaga attccacgtg tagcagtgaa atgcgtagag atgtggagga ataccgatgg

720

cgaaggcagc cccctgggat gacactgacg ctcatgcacg aaagcgtggg gagcaaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgccctaa acgatgtcaa ctagctgttg ggggtttgaa

840

tccttggtag cgtagctaac gcgtgaagtt gaccgcctgg ggagtacggc cgcaaggtta

900

aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga tgatgtggat taattcgatg

960

caacgcgaaa aaccttacct gctcttgaca tgtacggaac ttgccagaga tggcttggtg

1020

cccgaaaggg agccgtaaca caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtcattag ttgccatcat tcagttgggc

1140

actctaatga gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcctcat

1200

ggcccttatg agcagggctt cacacgtcat acaatggtcg gtacagaggg ttgccaagcc

1260

gcgaggtgga gctaatctca gaaaaccgat cgtagtccgg atcgcactct gcaactcgag

1320

tgcgtgaagt cggaatcgct agtaatcgca gatcagcatg ctgcggtgaa tacgttcccg

1380

ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgagtt tcaccagaag tgggtaggct

1440

aaccgcaagg aggccgctta ccacggtggg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1500

tagccgtagg ggaacctgcg gctggatcac ctcctttcta gaga

1544

<210> 514

<211> 1480

<212> DNA

<213> Chryseobacterium anthropi

<400> 514

ctagagtttg atcctggctc aggatgaacg ctagcgggag gcctaacaca tgcaagccga

60

gcggtagagt ttcttcggaa acttgagagc ggcgcacggg tgcgtaacac gtgtgcaacc

120

tacctttatc tgggggatag cctttcgaaa ggaagattaa taccccataa tataatgatt

180

ggcatcaatt attattgaaa actccggtgg atagagatgg gcacgcgcaa gattagatag

240

ttggtgaggt aacggctcac caagtcaatg atctttaggg gtcctgagag ggagatcccc

300

cacactggta ctgagacacg gaccagactc ctacgggagg cagcagtgag gaatattgga

360

caatgggtga gagcctgatc cagccatccc gcgtgaagga wgacggtcct atggattgta

420

aacttctttt gtacagggat aaacctactc tcgtgagggt agctgaaggt actgtacgaa

480

taagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgca agcgttatcc

540

ggatttattg ggtttaaagg gtccgtaggc ggacttgtaa gtcagtggtg aaatctcata

600

gcttaactat gaaactgcca ttgatactgc aggtcttgag taaatttgaa gtggctggaa

660

taagtagtgt agcggtgaaa tgcatagata ttacttagaa caccaattgc gaaggcaggt

720

cactaagatt taactgacgc tgatggacga aagcgtgggg agcgaacagg attagatacc

780

ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgctaac tcgtttttgg attttcggat tcagagacca

840

agcgaaagtg ataagttagc cacctgggga gtacgtccgc aaggatgaaa ctcaaaggaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cggtggatta tgtggtttaa ttcgatgata cgcgaggaac

960

cttaccaaga cttaaatggg aattgacagg tctagaaata gaccctcctt cgggcaattt

1020

ccaaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg tgccgtgagg tgttaggtta agtcctgcaa

1080

cgagcgcaac ccctgtcact agttgcyawc attyagttgr ggactctagt gagactgcct

1140

acgcaagtag agaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc acggccctta cgtcttgggc

1200

cacacacgta atacaatggc cggtacagag ggcagctacc aggtgactgg atgcaaatct

1260

cgaaagccgg tctcagttcg gattggagtc tgcaactcga ctctatgaag ctggaatcgc

1320

tagtaatcgc gcatcagcca tggcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1380

cgtcaagcca tggaagtctg gggtacctga agtcggtgac cgtaaaagga gctgcctagg

1440

gtaaaacagg taactagggc taagtcgtaa caaggtagcc

1480

<210> 515

<211> 1519

<212> DNA

<213> Chryseobacterium gleum

<400> 515

atacaatgga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gcgggaggcc taacacatgc

60

aagctgagcg gtagagatct ttcgggatct tgagagcggc gtacgggtgc ggaacacgtg

120

tgcaacctgc ctttatcagg gggatagcct ttcgaaagga agattaatac cccataatat

180

attgagtggc atcacttaat attgaaaact ccggtggata gagatgggca cgcgcaagat

240

tagatagttg gtgaggtaac ggctcaccaa gtctgcgatc tttagggggc ctgagagggt

300

gatcccccac actggtactg agacacggac cagactccta cgggaggcag cagtgaggaa

360

tattggacaa tgggtgcgag cctgatccag ccatcccgcg tgaaggacga cggccctatg

420

ggttgtaaac ttcttttgta tagggataaa cctactctcg tgagagtagc tgaaggtact

480

atacgaataa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga gggtgcaagc

540

gttatccgga tttattgggt ttaaagggtc cgtaggcgga tctgtaagtc agtggtgaaa

600

tctcacagct taactgtgaa actgccattg atactgcagg tcttgagtgt tgttgaagta

660

gctggaataa gtagtgtagc ggtgaaatgc atagatatta cttagaacac caattgcgaa

720

ggcaggttac taagcaacaa ctgacgctga tggacgaaag cgtggggagc gaacaggatt

780

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgctaactcg tttttgggct ttcgggttca

840

gagactaagc gaaagtgata agttagccac ctggggagta cgaacgcaag tttgaaactc

900

aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggattatgt ggtttaattc gatgatacgc

960

gaggaacctt accaaggctt aaatgggaaa tgacaggctt agaaataggc ttttcttcgg

1020

acatttttca aggtgctgca tggttgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt taggttaagt

1080

cctgcaacga gcgcaacccc tgtcactagt tgccatcatt aagttgggga ctctagtgag

1140

actgcctacg caagtagaga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcacg gcccttacgc

1200

cttgggccac acacgtaata caatggccgg tacagagggc agctacactg cgaagtgatg

1260

caaatctcga aagccggtct cagttcggat tggagtctgc aactcgactc tatgaagctg

1320

gaatcgctag taatcgcgca tcagccatgg cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca

1380

caccgcccgt caagccatgg aagtctgggg tacctgaagt cggtgaccgt aacaggagct

1440

gcctagggta aaacaggtaa ctagggctaa gtcgtaacaa ggtagccgta ccggaaggtg

1500

cggctggaac atctcattt

1519

<210> 516

<211> 1483

<212> DNA

<213> Chryseobacterium hominis

<400> 516

tttgatccct ggctcaggat gaacgctagc gggaggccta acacatgcaa gccgagcggt

60

atttgttctt cggaacagag agagcggcgc acgggtgcgg aacacgtgtg caacctgcct

120

ttatctgggg gatagccttt cgaaaggaag attaataccc cataatatat tgagtggcat

180

catttgatat tgaaaactcc ggtggataga gatgggcacg cgcaagatta gatagttggt

240

gaggtaacgg ctcaccaagt caatgatctt tagggggcct gagagggtga tcccccacac

300

tggtactgag acacggacca gactcctacg ggaggcagca gtgaggaata ttggacaatg

360

ggttagcgcc tgatccagcc atcccgcgtg aaggacgacg gccctatggg ttgtaaactt

420

cttttgtata gggataaacc tactctcgtg agagtagctg aaggtactat acgaataagc

480

accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg gtgcaagcgt tatccggatt

540

tattgggttt aaagggtccg taggcggatc tgtaagtcag tggtgaaatc tcacagctta

600

actgtgaaac tgccattgat actgcaggtc ttgagtaaat ttgaagtggc tggaataagt

660

agtgtagcgg tgaaatgcat agatattact tagaacacca attgcgaagg caggtcacta

720

agatttaact gacgctgatg gacgaaagcg tggggagcga acaggattag ataccctggt

780

agtccacgcc gtaaacgatg ctaactcgtt tttggggytt cggcttcaga gactaagcga

840

aagtgataag ttagccacct ggggagtacg ttcgcaagaa tgaaactcaa aggaattgac

900

gggggcccgc acaagcggtg gattatgtgg tttaattcga tgatacgcga ggaaccttac

960

caagacttaa atgggaaatg acagatttag aaatagatcc ttcttcggac atttttcaag

1020

gtgctgcatg gttgtcgtca gctcgtgccg tgaggtgtta ggttaagtcc tgcaacgagc

1080

gcaacccctg tcactagttg ctagcattaa gttgaggact ctagtgagac tgcctacgca

1140

agtagagagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcacggc ccttacgtct tgggccacac

1200

acgtaataca atggccggta cagagggcag ctacacagcg atgtgatgca aatctcgaaa

1260

gccggtctca gttcggattg gagtctgcaa ctcgactcta tgaagctgga atcgctagta

1320

atcgcgcatc agccatggcg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca

1380

agccatggaa gtctggggta cctgaagtcg gtgaccgtaa aaggagctgc ctagggtaaa

1440

acaggtaact agggctaagt cgtaacaagg tagccgtacc cga

1483

<210> 517

<211> 1399

<212> DNA

<213> Citrobacter amalonaticus

<220>

<221> modified_base

<222> (915)..(915)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 517

tcgacggtaa caggaagcag cttgctgctt tgctgacgag tggcggacgg gtgagtaatg

60

tctgggaaac tgcccgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcataa

120

tgtcgcaaga ccaaagaggg ggaccttcgg gcctcttgcc atcggatgtg cccagatggg

180

attagctagt tggtgaggta acggctcacc aaggcgacga tccctagctg gtctgagagg

240

atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

300

aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtatgaa gaaggccttc

360

gggttgtaaa gtactttcag cggggaggaa ggggttaagg ttaataacct tagccattga

420

cgttacccgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg

480

tgcaagcgtt aatggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtctgt caagtcggat

540

gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg cattcgaaac tggcaggctt gagtctcgta

600

gaggggggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccggt

660

ggcgaaggcg gccccctgga cgaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac

720

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgtc tatttggagg ttgtgccctt

780

gaggtgtggc ttccggagct aacgcgttaa atagaccgcc tggggagtac ggccgcaagg

840

ttaaaactca aatgaattga agggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

900

atgcaagcgt taatnggata cctggtcttg acatccacag aacttggcag agatgccttg

960

gtgccttcgg gaactgtgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gttgtgaaat

1020

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg gtccggccgg

1080

gaactcaaag gagactgcca gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc

1140

atggccctta cgaccagggc tacacacgtg ctacaatggc atatacaaag agaagcgacc

1200

tcgcgagagc aagcggacct cataaagtat gtcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg

1260

actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg tggatcagaa tgccacggtg aatacgttcc

1320

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgcaaaaga agtaggtagc

1380

ttaaccttcg ggagggcgc

1399

<210> 518

<211> 1396

<212> DNA

<213> Citrobacter braakii

<220>

<221> modified_base

<222> (940)..(940)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (976)..(976)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 518

tcgaacggta gcacagagga gcttgctcct tgggtgacga gtggcggacg ggtgagtaat

60

gtctgggaaa ctgcccgatg gagggggata actactggaa acggtagcta ataccgcata

120

acgtcgcaag accaaagagg gggaccttcg ggcctcttgc catcggatgt gcccagatgg

180

gattagctag taggtggggt aacggctcac ctaggcgacg atccctagct ggtctgagag

240

gatgaccagc cacactggaa ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtggg

300

gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagccatgcc gcgtgtatga agaaggcctt

360

cgggttgtaa agtactttca gcgaggagga aggcgttgtg gttaataacc gcaacgattg

420

acgttactcg cagaagaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

480

gtgcaagcgt taatcggaat tactgggcgt aaagcgcacg caggcggtct gtcaagtcgg

540

atgtgaaatc cccgggctca acctgggaac tgcatccgaa actggcaggc tagagtcttg

600

tagagggggg tagaattcca ggtgtagcgg tgaaatgcgt agagatctgg aggaataccg

660

gtggcgaagg cggccccctg gacaaagact gacgctcagg tgcgaaagcg tggggagcaa

720

acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg tcgacttgga ggttgtgccc

780

ttgaggcgtg gcttccggag ctaacgcgtt aagtcgaccg cctggggagt acggccgcaa

840

ggttaaaact caaatgaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

900

cgatgcaacg cgaagaacct tacctactct tgacatccan ggaacttacc agagatggtt

960

tggtgccttc gggaancgtg agacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgttgtgaa

1020

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcct ttgttgccag cggtccggcc

1080

gggaactcaa aggagactgc cagtgataaa ctggaggaag gtggggatga cgtcaagtca

1140

tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga

1200

cctcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact

1260

cgactccatg aagtcggaat cgctagtaat cgtggatcag aatgccacgg tgaatacgtt

1320

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta

1380

gcttaacctt cgggag

1396

<210> 519

<211> 1393

<212> DNA

<213> Citrobacter farmeri

<220>

<221> modified_base

<222> (951)..(951)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1369)..(1370)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 519

aacaggaagc agcttgctgc tttgctgacg agtggcggac gggtgagtaa tgtctgggaa

60

actgcccgat ggagggggat aactactgga aacggtagct aataccgcat aatgtcgcaa

120

gaccaaagag ggggaccttc gggcctcttg ccatcggatg tgcccagatg ggattagctt

180

gttggtgagg taacggctca ccaaggcgac gatccctagc tggtctgaga ggatgaccag

240

ccacactgga actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc

300

acaatgggcg caagcctgat gcagccatgc cgcgtgtatg aagaaggcct tcgggttgta

360

aagtactttc agcggggagg aaggggatgt ggttaataac cgcattcatt gacgttaccc

420

gcagaagaag caccggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag ggtgcaagcg

480

ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgcac gcaggcggtc tgtcaagtcg gatgtgaaat

540

ccccgggctc aacctgggaa ctgcattcga aactggcagg cttgagtctc gtagaggggg

600

gtagaattcc aggtgtagcg gtgaaatgcg tagagatctg gaggaatacc ggtggcgaag

660

gcggccccct ggacgaagac tgacgctcag gtgcgaaagc gtggggagca aacaggatta

720

gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gtctatttgg aggttgtgcc cttgaggcgt

780

ggcttccgga gctaacgcgt taaatagacc gcctggggag tacggccgca aggttaaaac

840

tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgatgcaac

900

gcgaagaacc ttacctggtc ttgacatcca cagaacttgt cagagatgcc naggtgcctt

960

cgggaactgt gagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgttgtga aatgttgggt

1020

taagtcccgc aacgagcgca acccttatcc tttgttgcca gcggtccggc cgggaactca

1080

aaggagactg ccagtgataa actggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc atcatggccc

1140

ttacgaccag ggctacacac gtgctacaat ggcatataca aagagaagcg acctcgcgag

1200

agcaagcgga cctcataaag tatgtcgtag tccggattgg agtctgcaac tcgactccat

1260

gaagtcggaa tcgctagtaa tcgtggatca gaatgccacg gtgaatacgt tcccgggcct

1320

tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgcaaa agaagtagnn tagcttaacc

1380

ttcgggaggg cgc

1393

<210> 520

<211> 1398

<212> DNA

<213> Citrobacter freundii

<220>

<221> modified_base

<222> (19)..(19)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1376)..(1381)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 520

tcgaacggta gcacagagng agcttgctcc ttgggtgacg agtggcggac gggtgagtaa

60

tgtctgggaa actgcccgat ggagggggat aactactgga aacggtagct aataccgcat

120

aacgtcgcaa gaccaaagag ggggaccttc gggcctcttg ccatcggatg tgcccagatg

180

ggattagcta gtaggtgggg taacggctca cctaggcgac gatccctagc tggtctgaga

240

ggatgaccag ccacactgga actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg

300

ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat gcagccatgc cgcgtgtatg aagaaggcct

360

tcgggttgta aagtactttc agcgaggagg aaggtgttga ggttaataac ctcagcgatt

420

gacgttactc gcagaagaag caccggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag

480

ggtgcaagcg ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgcac gcaggcggtc tgtcaagtcg

540

gatgtgaaat ccccgggctc aacctgggaa ctgcatccga aactggcagg ctagagtctt

600

gtagaggggg gtagaattcc aggtgtagcg gtgaaatgcg tagagatctg gaggaatacc

660

ggtggcgaag gcggccccct ggacaaagac tgacgctcag gtgcgaaagc gtggggagca

720

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gtcgacttgg aggttgtgcc

780

cttgaggcgt ggcttccgga gctaacgcgt taagtcgacc gcctggggag tacggccgca

840

aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

900

tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctactc ttgacatcca gagaacttag cagagatgct

960

ttggtgcctt cgggaactct gagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgttgtga

1020

aatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttatcc tttgttgcca gcggttcggt

1080

cgggaactca aaggagactg ccagtgataa actggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1140

atcatggccc ttacgagtag ggctacacac gtgctacaat ggcatataca aagagaagcg

1200

acctcgcgag agcaagcgga cctcataaag tatgtcgtag tccggattgg agtctgcaac

1260

tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgtggatca gaatgccacg gtgaatacgt

1320

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgcaaa agaagnnnnn

1380

ngcttaacct tcgggagg

1398

<210> 521

<211> 1397

<212> DNA

<213> Citrobacter gillenii

<400> 521

gtcgaacggt agcacagagg agcttgctcc ttgggtgacg agtggcggac gggtgagtaa

60

tgtctgggaa actgcccgat ggagggggat aactactgga aacggtagct aataccgcat

120

aacgtcgcaa gaccaaagag ggggaccttc gggcctcttg ccatcggatg tgcccagatg

180

ggattagcta gtaggtgggg taacggctca cctaggcgac gatccctagc tggtctgaga

240

ggatgaccag ccacactgga actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg

300

ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat gcagccatgc cgcgtgtatg aagaaggcct

360

tcgggttgta aagtactttc agcgaggagg aaggggatgt ggttaataac cgcattcatt

420

gacgttactc gcagaagaag caccggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag

480

ggtgcaagcg ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgcac gcaggcggtc tgtcaagtcg

540

gatgtgaaat ccccgggctc aacctgggaa ctgcatccga aactggcagg ctagagtctt

600

gtagaggggg gtagaattcc aggtgtagcg gtgaaatgcg tagagatctg gaggaatacc

660

ggtggcgaag gcggccccct ggacaaagac tgacgctcag gtgcgaaagc gtggggagca

720

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gtcgacttgg aggttgttcc

780

cttgaggagt ggcttccgga gctaacgcgt taagtcgacc gcctggggag tacggccgca

840

aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

900

tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctactc ttgacatcca cggaatttag cagatatgct

960

ttagtgcctt cgggaaccgt gagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgagttgcga

1020

agagttgggt aagaacccgc aacgagcgca acccttatcc tttgttgcca gcggttcggc

1080

cgggaactca aaggagactg ccagtgataa actggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1140

atcatggccc ttacgagtag ggctacacac gtgctacaat ggcatataca aagagaagcg

1200

acctcgcgag agcaagcgga cctcataaag tatgtcgtag tccggattgg agtctgcaac

1260

tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgtagatca gaatgctacg gtgaatacgt

1320

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgcaaa agaagtaggt

1380

agcttaacct tcgggag

1397

<210> 522

<211> 1387

<212> DNA

<213> Citrobacter koseri

<400> 522

acaggaagca gcttgctgct tcgctgacga gtggcggacg ggtgagtaat gtctgggaaa

60

ctgcctgatg gagggggata actactggaa acggtagcta ataccgcata acgtcgcaag

120

accaaagagg gggaccttcg ggcctcttgc catcagatgt gcccagatgg gattagcttg

180

ttggtggggt aacggctcac caaggcgacg atccctagct ggtctgagag gatgaccagc

240

cacactggaa ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca

300

caatgggcgc aagcctgatg cagccatgcc gcgtgtatga agaaggcctt cgggttgtaa

360

agtactttca gcggggagga aggtgttgtg gttaataacc gcagcaattg acgttacccg

420

cagaaaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg tgcaagcgtt

480

aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtctg ttaagtcaga tgtgaaatcc

540

ccgggctcaa cctgggaact gcattgatac tggcaggctt gagtctcgta gaggggggta

600

gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccggt ggcgaaggcg

660

gccccctgga cgaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

720

accctggtag tccacgccgt aaacgatgtc gacttggagg ttgtgccctt gaggcgtggc

780

ttccggagct aacgcgttaa gtcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg ttaaaactca

840

aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg atgcaacgcg

900

aagaacctta cctggtcttg acatccacag aacttggcag agatgactta gatgcgtaag

960

gcacgggctc aaccgtgctg catggctgtc gtcagctcgt gttgtgaaat gtagaggggg

1020

gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg gttaggccgg gaactcaaag

1080

gagactgcca gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atggccctta

1140

cgaccagggc tacacacgtg ctacaatggc atatacaaag agaagcgacc tcgcgagagc

1200

aagcggacct cataaagtat gtcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg actccatgaa

1260

gtcggaatcg ctagtaatcg tggatcagaa tgccacggtg aatacgttcc cgggccttgt

1320

acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgcaaaaga agtaggtagc ttaacctccg

1380

ggagggc

1387

<210> 523

<211> 1394

<212> DNA

<213> Citrobacter murliniae

<400> 523

acggtagcac agaggagctt gctccttggg tgacgagtgg cggacgggtg agtaatgtct

60

gggaaactgc ccgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt

120

cgcaagacca aagaggggga ccttcgggcc tcttgccatc ggatgtgccc agatgggatt

180

agctagtagg tggggtaacg gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg

240

accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

300

attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtatgaagaa ggccttcggg

360

ttgtaaagta ctttcagcga ggaggaaggt gttgtggtta ataaccgcag caattgacgt

420

tactcgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc

480

aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg cggtctgtca agtcggatgt

540

gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca tccgaaactg gcaggctaga gtcttgtaga

600

ggggggtaga attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga ataccggtgg

660

cgaaggcggc cccctggaca aagactgacg ctcaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag

720

gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgtcga cttggaggtt gtgcccttga

780

ggcgtggctt ccggagctaa cgcgttaagt cgaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt

840

aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat

900

gcaacgcgaa gaaccttacc tactcttgac atccagagaa gtttgcagag atgcgaacgt

960

gccttcggga gctctgagac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt tgtgaaatgt

1020

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcctttgt tgccagcggt ccggccggga

1080

actcaaagga gactgccagt gataaactgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat

1140

ggcccttacg agtagggcta cacacgtgct acaatggcat atacaaagag aagcgacctc

1200

gcgagagcaa gcggacctca taaagtatgt cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac

1260

tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgtg gatcagaatg ccacggtgaa tacgttcccg

1320

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaaaagaag taggtagctt

1380

aaccttcggg aggg

1394

<210> 524

<211> 1542

<212> DNA

<213> Citrobacter rodentium

<400> 524

aaattgaaga gtttgatcat ggctcagatt gaacgctggc ggcaggccta acacatgcaa

60

gtcgaacggt aacaggaagc agcttgctgc tttgctgacg agtggcggac gggtgagtaa

120

tgtctgggaa actgcccggt ggagggggat aactactgga aacggtagct aataccgcat

180

aacgtcgcaa gaccaaagag ggggaccttc gggcctcttg ccaccggatg tgcccagatg

240

ggattagctt gttggtgagg taacggctca ccaaggcgac gatccctagc tggtctgaga

300

ggatgaccag ccacactgga actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg

360

ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat gcagccatgc cgcgtgtatg aagaaggcct

420

tcgggttgta aagtactttc agcggggagg aagggattgt ggttaataac cgcagtcatt

480

gacgttaccc gcagaagaag caccggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag

540

ggtgcaagcg ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgcac gcaggcggtc tgtcaagtcg

600

gatgtgaaat ccccgggctc aacctgggaa ctgcattcga aactggcagg cttgagtctc

660

gtagaggggg ggggaattcc aggtgtagcg gtgaaatgcg tagagatctg gaggaatacc

720

ggtggcgaag gcggccccct ggacgaagac tgacgctcag gtgcgaaagc gtggggagca

780

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gtctacttgg aggttgtgcc

840

cctgaggcgt ggcttccgga gctaacgcgt taagtagacc gcctggggag tacggccgca

900

aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctggtc ttgacatcca gagaactttc cagagatgga

1020

ttggtgcctt cgggaactct gagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgttgtga

1080

aatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttatcc tttgttgcca gcggtccggc

1140

cgggaactca aaggagactg ccagtgataa actggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

atcatggccc ttacgaccag ggctacacac gtgctacaat ggcatataca aagagaagcg

1260

acctcgcgag agcaagcgga cctcataaag tatgtcgtag tccggattgg agtctgcaac

1320

tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgtggatca gaatgccacg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgcaaa agaagtaggt

1440

agcttaacct ccgggagggc gcttaccact ttgtgattca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtaacc gtaggggaac ctgcggttgg atcacctcct ta

1542

<210> 525

<211> 1326

<212> DNA

<213> Citrobacter sedlakii

<400> 525

cttgctctcg ggtgacgagt ggcggacggg tgagtaatgt ctgggaaact gcccgatgga

60

gggggataac tactggaaac ggtagctaat accgcataat gtcgcaagac caaagagggg

120

gaccttcggg cctcttgcca tcggatgtgc ccagatggga ttagcttgtt ggtgaggtaa

180

tggctcacca aggcgacgat ccctagctgg tctgagagga tgaccagcca cactggaact

240

gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca atgggcgcaa

300

gcctgatgca gccatgccgc gtgtgtgaag aaggccttcg ggttgtaaag cactttcagc

360

ggggaggaag gcgatgcggt taataaccgt gttgattgac gttacccgca gaagaagcac

420

cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggt gcaagcgtta atcggaatta

480

ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtctgt caagtcggat gtgaaatccc cgggctcaac

540

ctgggaactg cattcgaaac tggcaggctt gagtcttgta gaggggggta gaattccagg

600

tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccggt ggcgaaggcg gccccctgga

660

caaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag

720

tcacgccgta aacgatgtcg acttggaggt tgtgcccttg aggcgtggct tccggagcta

780

acgcgttaag tcgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt taaaactcaa atgaattgac

840

gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga tgcaacgcga agaaccttac

900

ctggtcttga catccacgga atttggcaga gatgccttag tgccttcggg aaccgtgaga

960

caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg ttgggttaag tcccgcaacg

1020

agcgcaaccc ttatcctttg ttgccagcgg tccggccggg aactcaaagg agactgccag

1080

tgataaactg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tggcccttac gaccagggct

1140

acacacgtgc tacaatggca tatacaaaga gaagcgacct cgcgagagca agcggacctc

1200

ataaagtatg tcgtagtccg gattggagtc tgcaactcga ctccatgaag tcggaatcgc

1260

tagtaatcgt ggatcagaat gccacggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc

1320

gtcaca

1326

<210> 526

<211> 967

<212> DNA

<213> Citrobacter sp. 30_2

<220>

<221> modified_base

<222> (8)..(10)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (762)..(762)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (776)..(776)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (926)..(926)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (940)..(940)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (945)..(945)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 526

gcacagannn agcttgctcc ttgggtgacg agtggcggac gggtgagtaa tgtctgggaa

60

actgcccgat ggagggggat aactactgga aacggtagct aataccgcat aacgtcgcaa

120

gaccaaagag ggggaccttc gggcctcttg ccatcggatg tgcccagatg ggattagcta

180

gtaggtgggg taacggctca cctaggcgac gatccctagc tggtctgaga ggatgaccag

240

ccacactgga actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc

300

acaatgggcg caagcctgat gcagccatgc cgcgtgtatg aagaaggcct tcgggttgta

360

aagtactttc agcgaggagg aaggtgttga ggttaataac ctcagcaatt gacgttactc

420

gcagaagaag caccggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag ggtgcaagcg

480

ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgcac gcaggcggtc tgtcaagtcg gatgtgaaat

540

ccccgggctc aacctgggaa ctgcatccga aactggcagg ctagagtctt gtagaggggg

600

gtagaattcc aggtgtagcg gtgaaatgcg tagagatctg gaggaatacc ggtggcgaag

660

gcggccccct ggacaaagac tgacgctcag gtgcgaaagc gtggggagca aacaggatta

720

gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gtcgacttgg angttgtgcc cttgangcgt

780

ggcttccgga gctaacgcgt taagtcgacc gcctggggag tacggccgca aggttaaaac

840

tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgatgcaac

900

gcgaagaacc ttacctactc ttgacntcca gagaacttan caganatgct ttggtgcctt

960

cgggaac

967

<210> 527

<211> 1383

<212> DNA

<213> Citrobacter sp. KMSI-3

<220>

<221> modified_base

<222> (926)..(927)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (934)..(934)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (948)..(948)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (964)..(964)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1059)..(1059)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1364)..(1364)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 527

gcacagagag cttgctctcg ggtgacgagt ggcggacggg tgagtaatgt ctgggaaact

60

gcccgatgga gggggataac tactggaaac ggtagctaat accgcataat gtcgcaagac

120

caaagagggg gaccttcggg cctcttgcca tcggatgtgc ccagatggga ttagctagta

180

ggtggggtaa cggctcacct aggcgacgat ccctagctgg tctgagagga tgaccagcca

240

cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca

300

atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtatgaag aaggccttcg ggttgtaaag

360

tactttcagc gaggaggaag gcgttgtggt taataacctt agtgattgac gttactcgca

420

gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggt gcaagcgtta

480

atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtctgt caagtcggat gtgaaatccc

540

cgggctcaac ctgggaactg catccgaaac tggcaggcta gagtcttgta gaggggggta

600

gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccggt ggcgaaggcg

660

gccccctgga caaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

720

accctggtag tccacgccgt aaacgatgtc acttggaggt tgtgcccttg aggcgtggct

780

tccggagcta acgcgttaag tcgaccgcct ggggagtacg gcgcaaggtt aaaactcaaa

840

tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gcaacgcgaa

900

gaaccttacc tactcttgac atccanngaa yttngcagag atgctttngt gccttcggga

960

actntgagac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt tgtgaaatgt tgggttaagt

1020

cccgcaacga gcgcaaccct tatcctttgt tgccagcgnt tcggtcggga actcaaagga

1080

gactgccagt gataaactgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat ggcccttacg

1140

agtagggcta cacacgtgct acaatggcat atacaaagag aagcgacctc gcgagagcaa

1200

gcggacctca taaagtatgt cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac tccatgaagt

1260

cggaatcgct agtaatcgtg gatcagaatg ccacggtgaa tacgttcccg ggccttgtac

1320

acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaaaagaag tagntagctt aaccttcggg

1380

agg

1383

<210> 528

<211> 1022

<212> DNA

<213> Citrobacter werkmanii

<220>

<221> modified_base

<222> (13)..(15)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (17)..(17)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (19)..(21)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (30)..(30)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (34)..(34)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (78)..(78)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 528

gtactttcag cgnnngnann ngttgtggtn aatnaccgca gcaattgacg ttactcgcag

60

aagaagcacc gggctaantc cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggt gcaagcgtta

120

atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtctgt caagtcggat gtgaaatccc

180

cgggctcaac ctgggaactg catccgaaac tggcaggcta gagtcttgta gaggggggta

240

gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccggt ggcgaaggcg

300

gccccctgga caaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

360

accctggtag tccacgccgt aaacgatgtc gacttggagg ttgtgccctt gaggcgtggc

420

ttccggagct aacgcgttaa gtcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg ttaaaactca

480

aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg atgcaacgcg

540

aagaacctta cctactcttg acatccagag aacttagcag agatgctttg gtgccttcgg

600

gaactctgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gttgtgaaat gttgggttaa

660

gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg gttaggccgg gaactcaaag

720

gagactgcca gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atggccctta

780

cgagtagggc tacacacgtg ctacaatggc atatacaaag agaagcgacc tcgcgagagc

840

aagcggacct cataaagtat gtcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg actccatgaa

900

gtcggaatcg ctagtaatcg tggatcagaa tgccacggtg aatacgttcc cgggccttgt

960

acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgcaaaaga agtaggtagc ttaaccttcg

1020

gg

1022

<210> 529

<211> 1266

<212> DNA

<213> Citrobacter youngae

<400> 529

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgaacg gtagcacaga gagcttgctc tcgggtgacg agtggcggac gggtgagtaa

120

tgtctgggaa actgcccgat ggagggggat aactactgga aacggtagct aataccgcat

180

aacgtcgcaa gaccaaagag ggggaccttc gggcctcttg ccatcggatg tgcccagatg

240

ggattagctt gttggtgggg taacggctca ccaaggcgac gatccctagc tggtctgaga

300

ggatgaccag ccacactgga actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg

360

ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat gcagccatgc cgcgtgtatg aagaaggcct

420

tcgggttgta aagtactttc agcgaggagg aaggcgttgt ggttaataac cgcagcgatt

480

gacgttactc gcagaagaag caccggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag

540

ggtgcaagcg ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgcac gcaggcggtc tgttaagtca

600

gatgtgaaat ccccgggctc aacctgggaa ctgcatttga aactggcagg cttgagtctc

660

gtagaggggg gtagaattcc aggtgtagcg gtgaaatgcg tagagatctg gaggaatacc

720

ggtggcgaag gcggccccct ggacgaagac tgacgctcag gtgcgaaagc gtggggagca

780

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gtctatttgg aggttgtgcc

840

cttgaggcgt ggcttccgga gctaacgcgt taaatagacc gcctggggag tacggccgca

900

aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctggtc ttgacatcca cagaagtttt cagagatgag

1020

aacgtgcctt cgggaactgt gagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgttgtga

1080

aatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttatcc tttgttgcca gcggttaggc

1140

cgggaactca aaggagactg ccagtgataa actggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

atcatggccc ttacgaccag ggctacacac gtgctacaat ggcatataca aagagaagcg

1260

acctcg

1266

<210> 530

<211> 1436

<212> DNA

<213> Cloacibacillus evryensis

<400> 530

cgcgtcgcga cgctggcggc gtgcctaaca catgcaagtc gaacgaagac catagaggag

60

cttgcgttaa tatggtttta gtggcggacg ggtgagtaac gcgtgaggac ttgtcgagta

120

cagggggaca acaggtggaa acgtctgcta ataccccata agccttcggg taaaaggagc

180

gatccggtac acgagagact cgcgttctat cagctagtag gtggggtaac ggcccaccca

240

ggccaagacg gatagccgga ctgagaggtc gatcggccac actggaactg agacacggtc

300

cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgggcaa tgggggaaac cctgacccag

360

cgacgccgcg tgagtgaaga aatccctcgg gatgtaaaac tctgttgtgt gggaagataa

420

tgacggtacc acacgaggaa gccccggcaa actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

480

gggggcgagc gttgttcgga attactgggc gtaaagcgca cgcaggcgga ccagtaagtc

540

tgtcgtcaaa ggcggaggct caaccttcgt tccacgatag atactgcggg tctagagtat

600

gtgagaggga agtggaattc ccggtgtagc ggtgaaatgc gtagatatcg ggaggaacac

660

cagtggcgaa ggcggcttcc tggcacacaa ctgacgctca tgtgcgaaag ccagggcagc

720

gaacgggatt agataccccg gtagtcctgg ccgtaaacga tggatactgg gtgtgggtga

780

agcagttcat ccgtgccgta gttaacgcgt taagtatccc gcctggggac tacggtcgca

840

agactgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcac gtggtttaat

900

tcgatgcaaa ccgaagaacc ttacctgggt ttgacatact accggtactg acctgaaagg

960

gaagggaccc cagcttgctg gggaagtaga acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt

1020

gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctatagcca gttgctaaca

1080

agtgaagttg agcactctgg cgagactgcc gccgacaagg cggaggaagg tggggatgac

1140

gtcaagtcat catggccttt atgcccaggg cgacacacgt gctacaatgg acggcacaaa

1200

aggcagctta ctagcgatag ttggcgaatc ctaaaaagcc gttcccagtt cggattgcag

1260

tctgaaaccc gactgcatga agccggaatc gctagtaatc gcagatcagc caagctgcgg

1320

tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac cacccgagtt gggggcaccc

1380

gaagccgcag gcttaacccg taagggaaag aagcgtctaa ggtgcgccga gtaagg

1436

<210> 531

<211> 975

<212> DNA

<213> Clostridiaceae bacterium END-2

<220>

<221> modified_base

<222> (738)..(738)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (856)..(856)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (917)..(917)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (926)..(926)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (946)..(946)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (952)..(952)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (954)..(954)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (958)..(958)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (967)..(969)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 531

gattatttcg gtaagaagta ctttatgact gagtggcgga cgggtgagta acgcgtggat

60

aacctgcctc atacaggggg ataacagtta gaaatgactg ctaataccgc ataagcgcac

120

agtgctgcat ggcacagtgc gaaaagctcc ggcggtatga gatggatccg cgtttgatta

180

gctagttggt ggggtaaagg cctaccaagg cgacgatcaa tagccgacct gagagggtga

240

ccggccacat tgggactgag acacggccca aactcctacg ggaggcagca gtggggaata

300

ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagcg acgccgcgtg aaggaagaag tatttcggta

360

tgtaaacttc tatcagcagg gaagaaaatg acggtacctg actaagaagc cccggctaat

420

tacgtgccag cagccgcggt aatacgtaag gggcaagcgt tatccggatt tactgggtgt

480

aaagggagcg tagacggcag tgcaagtctg atgtgaaagc ccggggctca accccgggac

540

tgcattggaa actgtgcagc tagagtgtcg gagaggtaag tggaattcct agtgtagcgg

600

tgaaatgcgt agatattagg aggaacacca gtggcgaagg cggcttactg gacgataact

660

gacgttgagg ctcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc

720

gtaaacgatg aatactangt gtcgggcgcc aaaggcgttc ggtgccgcag caaacgcaat

780

aagtattcca cctggggagt acgttcgcaa gaatgaaact caaaggaatt gacggggacc

840

cgcacaagcg gtggancatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaagtct

900

tgacatctgc ctgaccnggt ccgtanagga cccttccttc gggacnggca ananaggngg

960

tgcatgnnng tcgtc

975

<210> 532

<211> 990

<212> DNA

<213> Clostridiaceae bacterium JC13

<220>

<221> modified_base

<222> (896)..(896)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (904)..(904)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (924)..(924)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (934)..(934)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (942)..(942)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (968)..(968)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (970)..(970)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (983)..(984)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 532

gaagtgaaga tagcttgcta ttggaactta gtggcgaacg ggtgagtaac acgtagataa

60

cctgcctgta tgaccgggat aacagttgga aacgactgct aataccggat aggcagagag

120

gaggcatctc ttctctgtta aagttgggac acaacgcaaa cagatggatc tgcggtgcat

180

tagctagttg gtgaggtaac ggcccaccaa ggcgatgatg catagccggc ctgagagggc

240

gaacggccac attgggactg agacacggcc caaactccta cgggaggcag cagtagggaa

300

ttttcggcaa tgggggaaac cctgaccgag caatgccgcg tgagtgaaga cggccttcgg

360

gttgtaaagc tctgttgtaa gggaagaacg gcatagagag ggaatgctct atgagtgacg

420

gtaccttacc agaaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg

480

caagcgttat ccggaattat tgggcgtaaa gggtgcgtag gcggcgagat aagtctgagg

540

taaaagcccg tggctcaacc acggtaagcc ttggaaactg tctggctgga gtgcaggaga

600

ggacaatgga attccatgtg tagcggtaaa atgcgtagat atatggagga acaccagtgg

660

cgaaggcggt tgtctggcct gtaactgacg ctgaagcacg aaagcgtggg gagcaaatag

720

gattagatac cctagtagtc cacgccgtaa acgatgagaa ctaagtgttg gggaaactca

780

gtgctgcagt taacgcaata agttctccgc ctggggagta tgcacgcaag tgtgaaactc

840

aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagtatgt ggtttaattc gacgcnacgc

900

gaanaacctt accaggcctt gacntggtat caanggccct anagataggg agatagttat

960

ggtacacncn ggtggtgcat ggnngtcgtc

990

<210> 533

<211> 1480

<212> DNA

<213> Clostridiales bacterium 9400853

<400> 533

tagagtttga tcctggctca ggatgaacgc tggcggcgtg cctaacacat gcaagtcgag

60

cgagaagtta ctcaatgaat cttcggaaga attgagtaat ggaaagcggc ggacgggtga

120

gtaacgcgtg ggcaacctgc ctttcacaga gggatagcca aaggaaactt tgattaaaac

180

ctcataaagc cggaatagtg cataatatac cggccaaaga tttatcggtg aaagatgggc

240

ccgcgtctga ttagctagtt ggtggggtaa cggctcacca aggcaacgat cagtagccga

300

cctgagaggg tgatcggcca cattggaact gagacacggt ccaaactcct acgggaggca

360

gcagtgggga atattgcaca atgggcgcaa gcttgatgca gcaacgccgc gtgaacgaag

420

aaggccttcg ggtcgtaaag ttctgtccat agggaagaaa caaatgacgg tacctatgga

480

ggaagccccg gctaaatacg tgccagcagc cgcggtaata cgtatggggc aagcgttatc

540

cggaattatt gggcgtaaag agtgcgtagg tggtggctta agcgcagggt ttaaggcaat

600

ggcttaacta ttgttcgcct tgcgaactgg gtcacttgag tacaggagag gaaagcggaa

660

ttcctagtgt agcggtgaaa tgcatagata ttaggaggaa caccggtggc gaaggcggct

720

ttctggactg caactgacac tgaggcacga aagcgtgggt agcaaacagg attagatacc

780

ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgagcac taggtgtcgg ccaataaagg tcggtgccgc

840

agttaacgca ttaagtgctc cgcctgggga gtacgcacgc aagtgtaaaa ctcaaaggaa

900

ttgacgggga cccgcacaag cagcggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac

960

cttaccagag cttgacatcc ctctgacaga tccttaatcg gattcttctt cggacagagg

1020

agacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1080

acgagcgcaa cccttatcat tagttgccat cattaagttg ggcactctag tgagactgcc

1140

ggggacaact cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgttctggg

1200

ctacacacgt gctacaatgg tcggtacaga aagcagcgaa accgtgaggt gaagccaatc

1260

tccaaaaccg atctcagttc ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa gtcggagttg

1320

ctagtaatcg cagatcagaa tgctgcggtg aatgcgttcc cgggtcttgt acacaccgcc

1380

cgtcacacca tggaagttgg gggtgcccga agttggacaa taaatcgttt acctaaggca

1440

aaaccaatga ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1480

<210> 534

<211> 1489

<212> DNA

<213> Clostridiales bacterium 9403326

<400> 534

tagagtttga tcctggctca ggataaacgc tggcggcgtg cgtaacacat gcaagtcgaa

60

cgagaatgtg ctgacggatc cttagggtga agatagcaca ggacagtggc ggatgggtga

120

gtaacgcgta agaaacctgc ctttcacacc gggatagcag ctggaaacgg ctattaatac

180

cggatgacac tttttccccg catgaggaag aggttaaaga atttcggtga aagatggtct

240

tgcgtctgat tagctagttg gtggggtaac ggcctaccaa ggcgacgatc agtagccggc

300

ctgagagggt gtacggccac attgggactg agacacggcc caaactccta cgggaggcag

360

cagtggggaa ttttgcacaa tggaggaaac tctgatgcag cgacgccgcg tgaacgaaga

420

aggtcttcgg attgtaaagt tctgtcctgg gtgaagataa tgacggtaac tcaggaggaa

480

gccccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggggcgagc gttgttcgga

540

attattgggc gtaaagggta cgtaggcggt ttgttaagtt tggcgttaaa tcacggggct

600

caaccccgtt cagcgttgaa aactggcaaa cttgagtagt agaggggaca gtggaattcc

660

tagtgtagcg gtgaaatgcg tagagattag gaagaatacc ggtggcgaag gcgactgtct

720

ggatacatac tgacgctcag gtacgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg

780

tagtccacgc cctaaacgat gagtgctagg tgtcgggtgt caaagcccgg tgccgccgtt

840

aacacattaa gcactccgcc tggggagtac gcacgcaagt gtgaaactca aaggaattga

900

cggggacccg cacaagtagc ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta

960

ccagggcttg acataacagt gacgggttaa gagattaacc gttcccttcg gggacactgc

1020

tacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1080

cgagcgcaac ccttgtcgtt agttgccagc attaagttgg ggactctagc gagactgccg

1140

gtgataaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccttta tgtcctgggc

1200

tacacacgtg ctacaatggc cgaaaacagc gtgaagcaac ctcgtgagag caagcgaacc

1260

acgaaaagtc ggtctcagtt cggactgtag gctgcaactc gcctacacga agtcggagtt

1320

actagtaatc gcgaatcagc atgtcgcggt gaatgcgttc ccgggtcttg tacacaccgc

1380

ccgtcacacc atggaagttg gtaatacccg aagccgctga gcgaacctat gacgcaggcg

1440

tcgaaggtag gatcaatgac tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgta

1489

<210> 535

<211> 1335

<212> DNA

<213> Clostridiales bacterium SY8519

<400> 535

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgcc taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcggac gggtgagtaa cgcgtggata acctgcctca aacaggggga taacagccgg

120

aaacggctgc taataccgca taagaaaaag tggtttgaga tggatccgcg tctgattagt

180

tagttggcgg ggtaacggcc caccaaggcg acgatcagta gccggcctga gagggtgaac

240

ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

300

gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcaac gccgcgtgag cgaagaagta tttcggtatg

360

taaagctcta tcagcaggga agatgacggt acctgactaa gaagctccgg ctaaatacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtatggagca agcgttatcc ggatttactg ggtgtaaagg

480

gagcgcaggc ggtggcgcaa gtctgatgtg aaaacccggg gcccaacccc gggactgcat

540

tggaaactgc gtgacttgag tgtcggaggg gtaagtggaa ttcctagtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata ttaggaggaa caccagtggc gaaggcggct tactggacga actgacgctg

660

aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgaatacta ggtgttggca tgtcagtgcc gcagcaaacg cattaagtat tccacctggg

780

gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gccttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccttgtgta tagtagccag cggccgggca ctctatacag actgccaggg acaacctgga

1020

ggaaggcggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgg cctgggcgac acacgtgcta

1080

caatggcgta cagagggagg craagccgcg aggtggagcg aatcccaaaa cgtctcagtt

1140

cggatgcagg ctgcaacccg cctgcagaag ctggaatcgc tagtaatcgc agatcagcat

1200

gctgcggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtcgga

1260

aatgcccgaa gccggtaccc agggagccgt cgaaggcagg tctgataact ggggtgaagt

1320

cgtaacaagg tagcc

1335

<210> 536

<211> 1319

<212> DNA

<213> Clostridiales bacterium oral clone P4PA_66 P1

<400> 536

gacgaacgct ggcggcgcgc ctaacacatg caagtcgagc gagcggcgga cgggtgagta

60

acgcgtgagc aacctacctt ttacaggggg ataacgtccc gaaagggacc ctaataccgc

120

atgagcaaag ccggtaaaag atgggctcgc gtccgattag atagttggtg aggtaacggc

180

ccaccaagtc aacgatcggt agccgacctg agagggtgat cggccacatt ggaactgaga

240

cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgggcaatgg gggaaaccct

300

gacccagcga cgccgcgtga aggaagacgg ccttcgggtt gtaaacttct gttcttggtg

360

aagaagacgg taaccaagga ggaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtagggggc gagcgttgtc cggaatgatt gggcgtaaag ggcgcgtagg cggctacgga

480

agtctggagt ggaagtccta ttttcaaggt aggaattgct ttggaaactc cgcagcttga

540

gtgcaggaga ggttatcgga attcccggtg tagcggtgaa atgcatagag atcgggagga

600

acaccagtgg cgaaggcggg taactggact gactgacgct gaggcgcgaa agtgtgggga

660

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cactgtaaac gatgaatgct aggtgtaggt

720

gcatctgtgc cgtcgtaaac acaataagca ttccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcagcgga gcatgtggtt taattcgaag

840

caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca tcgacaggtg gtgcatggat gtcgtcagct

900

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgcca atagttacta

960

acggctgagg actctattgg gactgccgtg gacaacacgg aggaaggtgg ggacgacgtc

1020

aaatcatcat gccccttatg acctgggcta cacacgtgct acaatggtcg ccaaagagga

1080

gcaaagccgc aaggcggagc ggatctcaag cgatctcagt tcagatgtgg gctgcaaccc

1140

gcccacagaa gtcggagttg ctagtaatcg cgaatcagca tgtcgcggtg aatacgttcc

1200

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagttga tagcgcccga aggcagaagg

1260

tagccatctg acgaaggcga gattaatgac tggggtgaag tcgtaacagg gtagccgta

1319

<210> 537

<211> 1487

<212> DNA

<213> Clostridiales bacterium oral taxon 093

<400> 537

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcatgct taacacatgc aagtcgaacg

60

agctgattcc ttcgggatga aagcgagtgc gaacgggtga gtaatgtatg agtaacctgc

120

ctctgtctac gggataacat ttggaaacaa gtgctaatac ggtataagac cacagcaccg

180

catggtgcag gggtaaaaga tttatcggac agagatggac tcatatccca ttagctagtt

240

ggtgagataa tagcccacca aggcgacgat gggtagccga gctgagaggc tgatcggcca

300

cattggaact gaaacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgggca

360

atggaggaaa ctctgaccca gcaatgccgc gtgagcgatg aaggtcatcg attgtaaagc

420

tcttttcctg ggaacgaaac aaatgacggt acccagggaa taagccccgg ctaactacgt

480

gccagcagcc gcggtaatac gtagggggcg agcgttgtcc ggaatgactg ggcgtaaagg

540

gtgcgtaggt ggtttaataa gttagaagtg taatacccgg gcttaactcg ggtgctgctt

600

ctaaaactgt taggcttgag tgtagtagag gaaagcggaa ttcaatgtgt agcggtggaa

660

tgcgtagata tattgaagaa catcagtggc gaaggcggct ttctggacta taactgacac

720

tgaggcacga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctagtagtcc acgccgtaaa

780

cgatggatac tagatgcagg aggtattcac tccttctgtg tcgcagctaa cgcaataagt

840

atcccgcctg gggagtacga tcgcaagatt aaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca

900

caagcagcgg aacatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa aaaccttacc aagacttgac

960

atcagtatga ctatcataga aatatggtat ctcgcaagag catactgaca ggtggtgcat

1020

ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt aggttaagtc ctgcaacgag cgcaaccctt

1080

ataactagtt gccaatatta agttaggaac tctagttaga ctgccgtggt caacacggag

1140

gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttacgtc ttgggctaca cacgtgctac

1200

aatggctatt acaaagagtt gcaagttggt aacagcaagc taatctcaaa aaaatagtct

1260

cagttcggat tgtgggctgc aacccgccca catgaagtcg gagttgctag taatcccgaa

1320

tcagcatgtc ggggtgaatg cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc acgccatggg

1380

agttggtagt acccaaagtc ggtgagctaa ccgcaaggaa gcagccgcct aaggtaagat

1440

caatgactgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtatcgg aaggtgc

1487

<210> 538

<211> 1532

<212> DNA

<213> Clostridiales bacterium oral taxon F32

<400> 538

agagtttgat cctggctcag gataaacgct ggcggcgcac ataagacatg caagtcgaac

60

gaaagtcgtt gtatatgaaa ttgactaaga atttagattt atctagaaga tgagaatgta

120

gattatacaa caatggcttt agtggcggac tggtgagtaa tacgtaagca acctgcctat

180

tagaggggaa taacaattag aaatgattga taataccgca tatgccatag tcatcacatg

240

atgatagtgg gaaaggagta atccgctgat agatgggctt acgcctgatt agatagttgg

300

tagggtaatg gcctaccaag tctgcgatca gtagccgaac tgagaggttg aacggccaca

360

ttgggactga gatacggccc agactcctac gggaggcagc agtcgggaat attgcgcaat

420

ggaggaaact ctgacgcagt gacgccgcgt gcaggaagaa ggttttcgga ttgtaaactg

480

ctttagacag ggaagataaa agacagtacc tgtaaaataa gctccggcta actacgtgcc

540

agcagccgcg gtaatacgta gggagcgagc gttatccgga tttattgggt gtaaagggtg

600

cgtagacggg aaattaagtt atttgtgaaa tccctcggct taaccgagga actgcaacta

660

aaactgattt tcttgagtat tggagaggaa agtggaattc ctagtgtagc ggtgaaatgc

720

gtagatatta ggaggaacac cagtggcgaa ggcgactttc tggacaataa ctgacgttga

780

ggcacgaaag tgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccaca ctgtaaacga

840

tggatactag gtgtagggtg tgataaacgc tctgtgccgt cgctaacgca gtaagtatcc

900

cacctgggga gtacgaccgc aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag

960

cagtggagta tgtggtttaa ttcgacgcaa cgcgaagaac cttaccaggg cttgacatat

1020

acaggaatat gctagagata gtatagctct tcggagcctg tatacaggtg gtgcatggtt

1080

gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctatct

1140

ttagttacca gcgagtaatg tcgggaactc tagagagact gccggtgtta aatcggagga

1200

aggtggggac gacgtcaaat catcatgccc tttatgtcct gggctacaca cgtactacaa

1260

tggctattac aaagggaagc aatacagcaa tgtggagcaa aactcaaaaa aatagtctca

1320

gttcggattg aaggctgaaa ttcgccttca tgaagctgga attgctagta atggcaggtc

1380

agcatactgc cgtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgagag

1440

ttggggatac ccgaagcctg tgagctaact tttagaggca gcagtcgaag gtagaatcaa

1500

tgattggggt gaagtcgtaa caaggtagcc gt

1532

<210> 539

<211> 1474

<212> DNA

<213> Clostridiales bacterium ph2

<400> 539

tggctcagga ttaacgctgg cggcgtgcat aacacatgca tgttgaacga gaatctcttt

60

gacagatcct tcgggtgacg acagagagag gaaagtagcg gatgggtgag taacacgtaa

120

ggaacctgcc atgcacaggg ggatagcagc cggaaacgac tattaatacc ccatgacacc

180

tcactttcgc atgaaagaga ggtcaaagat ttatcggtgt gtgatggcct tgcgtctgat

240

tagcttgttg gtggggtaaa ggcctaccaa ggcgatgatc agtagccggc ttgagagagt

300

gtacggccac attgggattg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

ttttgcacaa tggaggaaac tctgatgcag cgacgccgcg tgaacgaaga aggtcttcgg

420

attgtaaagt tctgtcctgg acgaagataa tgacggtaat ccaggaggaa gccccggcta

480

actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggggcgagc gttgtccgga atgattgggt

540

gtaaagggta cgcaggcggt ctattaagtt tgacgtgaaa gcccggggct caacctcggc

600

aagcgttgaa aactggtaga cttgaatagt ggaagggaca gtggaattcc tagtgtagcg

660

gtgaaatgcg tagagattag gaagaatacc aatggcgaaa gcaactgtct ggacacatat

720

tgacgctgag gtacgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc

780

cgtaaacgct gagtgctagg tgttgggggt caaacctcgg tgccgacgtt aacacattaa

840

gcactccacc tggggagtac gcacgcaagt gtgaaactca aaggaattga cggggacccg

900

cacaagtagc ggagcatgtg gtttaattcg acgcaacgcg aagaacctta ccaaggcttg

960

acataaaacg gaccggtgta gagatacacc ytctcttcgg agctgtttta caggtggtgc

1020

atggttgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1080

ctgtcgttag ttaccagcaa gtaaagttgg ggactctaac gagactgccg gtgataaacc

1140

ggaggaaggt ggggacgacg tcaaatcatc atgcccttta tgtcttgggc tacacacgtg

1200

ctacaatggt tgggaacaaa gcgcagcaag gtcgcgaggc caagcgaatc gcagaaaacc

1260

aatctcagtt cggattggag gctgcaaccc gcctccatga agtcggagtt actagtaatc

1320

gtggatcagc atgccacggt gaatgcgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc

1380

atggaagttg gtaatacccg aagtcgctga gcgaaccgca aggaagcagg cgccgaaggt

1440

aggatcaatg actggggtga agtcgtaaca agta

1474

<210> 540

<211> 1523

<212> DNA

<213> Clostridiales genomosp. BVAB3

<400> 540

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggagctttga ggaagtgctt gcacagaatt aaagcttagt ggcggacggg tgagtaacgc

120

gtgaggaacc tgcctttcac agtggaataa caacgggaaa ccgttgctaa tggcgcatga

180

catcgcattg aggcatctca gagcgattaa aggagaaatc cggtgaaaga tggactcgcg

240

tccgattagc tagttggtga ggtaacggcc caccaaggcg acgatcggta gccgaactga

300

gaggttgatc ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gggcaatggg cgaaagcctg acccagcaac gccgcgtgaa gtatgaaggc

420

cttcgggttg taaacttctt tgatcaggga agaaacaaat gacggtacct gaaaaacaag

480

ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtggcgagcg ttatccggat

540

ttactgggtg taaagggcgt gcaggcgggc tgataagtca gatgtgaaat ccccgagctt

600

aactcgggaa ctgcatctga tactgttggt cttgagtgct ggagaggata gtggaattcc

660

tagtgtagcg gtaaaatgcg cagatattag gaggaacacc agtggcgaag gcggctatct

720

ggacagtaac tgacgctgag gcgcgaaagc gtgggtagca aacaggatta gataccctgg

780

tagtccacgc cgtaaacgat gattactagg tgtaggaggt atcgacccct tctgtgccgg

840

agttaacaca ataagtaatc cacctgggga gtacggccgc aaggttgaaa ctcaaaggaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cagtggagta tgtggtttaa ttcgacgcaa cgcgaagaac

960

cttaccaggg tttgacatcc cttgaacgat gtagagatac ataattccct tcggggacaa

1020

ggagacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg

1080

caacgagcgc aacccctatt gccagttgcc atcatttagt tgggcactca ggcgagactg

1140

ccgttgataa aacggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatatcctg

1200

ggctacacac gtactacaat ggctacaaca gagagcagcg acgtcgcgag gcgaagcaaa

1260

tccccaaatg tagtctcagt tcggattgca ggctgcaact cgcctgcatg aagccggaat

1320

tgctagtaat ggcaggtcag catactgccg tgaatacgtt ctcgggcctt gtacacaccg

1380

cccgtcacac catgagagtc agtaacaccc gaagtcagta gtctaaccgc aagggggacg

1440

ctgccgaagg tgggaccgat aattggggtg aagtcgtaac aaggtagccg tatcggaagg

1500

tgcggctgga tcacctcctt tct

1523

<210> 541

<211> 1020

<212> DNA

<213> Clostridiales bacterium 1_7_47FAA

<220>

<221> modified_base

<222> (14)..(15)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (969)..(969)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (974)..(974)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (977)..(977)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (983)..(985)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 541

gaacgaagca tccnnatagg aagttttcgg atggaatatg ggatgactga gtggcggacg

60

ggtgagtaac gcgtggataa cctgcctcac actgggggat aacagttaga aatggctgct

120

aataccgcat aagcgcacag taccgcatgg tacggtgtga aaaacccagg tggtgtgaga

180

tggatccgcg tctgattagc cagttggcgg ggtaacggcc caccaaagcg acgatcagta

240

gccgacctga gagggtgacc ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg

300

aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg cgaaagcctg atgcagcgac gccgcgtgag

360

tgaagaagta tctcggtatg taaagctcta tcagcaggga agaaaatgac ggtacctgac

420

taagaagccc cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggg gcaagcgtta

480

tccggattta ctgggtgtaa agggagcgta gacggcgatg caagtctgaa gtgaaagccc

540

ggggctcaac cccgggactg ctttggaaac tgtgtggctg gagtgcagga gaggtaagtg

600

gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag atattaggag gaacaccagt ggcgaaggcg

660

gcttactgga ctgtaactga cgttgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

720

accctggtag tccacgccgt aaacgatgaa tgctaggtgt cggggggcaa agcccctcgg

780

tgccgccgct aacgcaataa gcattccacc tggggagtac gttcgcaaga atgaaactca

840

aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg

900

aagaacctta ccaagtcttg acatccccct gaccggacag taacgtgtcc cttccttcgg

960

gacagggana cagnggngca tgnnntcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc

1020

<210> 542

<211> 1435

<212> DNA

<213> Clostridiales sp. SM4/1

<400> 542

gacgaattga ctgagtggcg gacgggtgag taacgcgtgg gtaacctgcc tcacactggg

60

ggacaacagc tggaaacggc tgctaatacc gcataagcgc acagcttcgc atgaagcagt

120

gtgaaaaact ccggtggtgt gagatggacc cgcgtctgat tagctagttg gtaaggtaac

180

ggcttaccaa ggcgacgatc agtagccgac ctgagagggt gaccggccac attgggactg

240

agacacggcc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggggaaac

300

cctgatgcag cgacgccgcg tgagtgaaga agtatttcgg tatgtaaagc tctatcagca

360

gggaagaaaa tgacggtacc tgactaagaa gccccggcta actacgtgcc agcagccgcg

420

gtaatacgta gggggcaagc gttatccgga tttactgggt gtaaagggag cgtagacggc

480

gaagcaagtc tgaagtgaaa gcccggggct caaccgcggg actgctttgg aaactgtttt

540

gctagagtgc tggagaggta agtggaattc ctagtgtagc ggtgaaatgc gtagatatta

600

ggaggaacac cagtggcgaa ggcggcttac tggacagtaa ctgacgttga ggctcgaaag

660

cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgaatactag

720

gtgttggtga gcaaagctca tcggtgccgt cgcaaacgca ataagtattc cacctgggga

780

gtacgttcgc aagaatgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggagca

840

tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaagt cttgacatcg gaatgaccgg

900

aacttaaccg ttccttttct tcggaacatt ccagacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

960

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc ctaagtagcc

1020

agcagttcgg ctgggcactc ttgggagact gccagggata acctggagga aggtggggat

1080

gacgtcaaat catcatgccc cttatgattt gggctacaca cgtgctacaa tggcgtaaac

1140

aaagggaagc gaagctgtga agctgagcaa atctcaaaaa taacgtctca gttcggattg

1200

tagtctgcaa ctcgactaca tgaagctgga atcgctagta atcgcggatc agaatgccgc

1260

ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tcagtaacgc

1320

ccgaagtcag tgacccaacc gcaaggaggg agctgccgaa ggcgggaccg ataactgggg

1380

tgaagtcgta acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1435

<210> 543

<211> 1297

<212> DNA

<213> Clostridiales sp. SS3/4

<400> 543

gatgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgaac gagtggcgga cgggtgagta

60

acgcgtgggt aacctgcctc atacaggggg ataacggtta gaaatgactg ctaataccgc

120

ataagaaaaa gtggtatgag atggacccgc gtctgattag ctagttggtg gggtaacggc

180

ccaccaaggc gacgatcagt agccgacctg agagggtgac cggccacatt gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tgggggatat tgcacaatgg aggaaactct

300

gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg

360

aagatgacgg tacctgacta agaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtagggggc aagcgttatc cggatttact gggtgtaaag ggagcgtaga cggcgacgca

480

agtctgaagt gaaatacccg ggctcaacct gggaactgct ttggaaactg tgttgctaga

540

gtgctggaga ggtaagcgga attcctagtg tagcggtgaa atgcgtagat attaggaaga

600

acaccagtgg cgaaggcggc ttactggaca gactgacgtt gaggctcgaa agcgtgggga

660

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatact aggtgttggt

720

gcatcggtgc cgccgcaaac gcaataagta ttccacctgg ggagtacgtt cgcaagaatg

780

aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag

840

caacgcgaag aaccttacca aatcttgaca tcgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctattg tcagtagcca

960

gcagctgggc actctgatga gactgccagg gataacctgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1020

aaatcatcat gccccttatg atttgggcta cacacgtgct acaatggcgt acaaagagaa

1080

gcgagcctgc gagggggagc aaatctcaaa acgtctcagt tcggatgtag tctgcaactc

1140

gactacagaa gctggaatcg ctagtaatcg cagatcagaa tgctgcggtg aatacgttcc

1200

cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtcgg aaatgcccga agccagtacc

1260

cagggagctg tcgaaggcag gtctgataac tggggtg

1297

<210> 544

<211> 1378

<212> DNA

<213> Clostridiales sp. SSC/2

<220>

<221> modified_base

<222> (13)..(13)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 544

ccttatttga ttnttcttcg gaactgaaga tttggtgatt gagtggcgga cgggtgagta

60

acgcgtgggt aacctgccct gtacaggggg ataacagtca gaaatgactg ctaataccgc

120

ataagaccac agcaccgcat ggtgcagggg taaaaactcc ggtggtacag gatggacccg

180

cgtctgatta gctggttggt gaggtaacgg ctcaccaagg cgacgatcag tagccggctt

240

gagagagtga acggccacat tgggactgag acacggccca aactcctacg ggaggcagca

300

gtggggaata ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagcg acgccgcgtg agtgaagaag

360

tatctcggta tgtaaagctc tatcagcagg gaagaaaatg acggtacctg actaagaagc

420

cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gggcaagcgt tatccggaat

480

tactgggtgt aaagggtgcg taggtggtat ggcaagtcag aagtgaaaac ccagggctta

540

actctgggac tgcttttgaa actgtcagac tgagtgcagg agaggtaagc ggaattccta

600

gtgtagcggt gaaatgcgta gatattagga ggaacatcag tggcgaaggc ggcttactgg

660

actgaaactg acactgaggc acgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta

720

gtccacgccg taaacgatga atactaggtg tcggggccgt agaggcttcg gtgccgcagc

780

caacgcagta agtattccac ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc aaaggaattg

840

acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt

900

acctggtctt gacatccttc tgaccggtcc ttaaccgggc gtttgcgtcg ggacaggagt

960

gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1020

cgagcgcaac ccctatcttt agtagccagc atataaggtg ggcactctag agagactgcc

1080

agggataacc tggaggaagg tggggacgac gtcaaatcat catgcccctt atgaccaggg

1140

ctacacacgt gctacaatgg cgtaaacaga gggaagcagc ctcgtgagag tgagcaaatc

1200

ccaaaaataa cgtctcagtt cggattgtag tctgcaactc gactacatga agctggaatc

1260

gctagtaatc gcgaatcaga atgtcgcggt gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc

1320

ccgtcacacc atgggagtca gtaacgcccg aagtcagtga cccaaccgta aggaggga

1378

<210> 545

<211> 1510

<212> DNA

<213> Clostridium acetobutylicum

<400> 545

tttaaattga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgagcg gggaacttcg gttcccagcg gcggacgggt gagtaacacg tgggtaacct

120

acctcatagt ggggaatagc ctttcgaaag gaagattaat accgcataat actcgagaat

180

cgcatgattc ttgagccaaa ggatttattc gctatgagat ggacccgcgg cgcattagct

240

tgttggtgag gtaacggctc accaaggctt cgatgcgtag ccgacctgag agggtgatcg

300

gccacattgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

360

cacaatgggg gaaaccctga tgcagcaacg ccgcgtgagt gatgaaggtc ttcggatcgt

420

aaaactctgt cttatgggac gataatgacg gtaccatagg aggaagccac ggctaactac

480

gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg caagcgttgt ccggatttac tgggcgtaaa

540

ggatgtgtag gcggatattt aagtgagatg tgaaatcccc gggcttaact tgggggctgc

600

atttcaaact ggatgtctgg agtgcaggag aggaaggcag aattcctagt gtagcggtga

660

aatgcgtaga gattaggaag aataccagtg gcgaaggcgg ccttctggac tgtaactgac

720

gctgaggcat gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta

780

aacgatgaat actaggtgta ggaggtatcg actccttctg tgccgcagtt aacacaataa

840

gtattccgcc tgggaagtac ggtcgcaaga ttaaaactca aaggaattga cggggacccg

900

cacaagcagc ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta cctagacttg

960

acatctcctg aattagtccg taatggatga agtcccttcg gggacaggat gacaggtggt

1020

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1080

ccttatcatt agttgctaac atttagttga gcactctagt gagactgccc gggttaaccg

1140

ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgtctagggc tacacacgtg

1200

ctacaatggt ggggacaaaa agatgcaata ccgcaaggtg gagcaaaact caaaacccca

1260

tcccagttcg gattgtaggc tgaaactcgc ctacatgaag ccggagttgc tagtaatcgc

1320

gaatcagaat gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat

1380

gagagtcggc aacacccgaa gcccgtgagg taaccttttg gaaccagcgg tcgaaggtgg

1440

ggttgataat tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtag gagaacctgc ggctggatca

1500

cctcctttct

1510

<210> 546

<211> 1470

<212> DNA

<213> Clostridium aerotolerans

<220>

<221> modified_base

<222> (1082)..(1083)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1085)..(1089)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 546

cgcgtgctta acacatgcaa gtcgagcgaa gcattttaaa ggaagttttc ggatggaatt

60

taagatgact tagcggcgga cgggtgagta acgcgtgggt aacctgcctc atacaggggg

120

ataacagtta gaaatgactg ctaataccgc ataagcgcac agtgctgcat agcacagtgt

180

gaaaaactcc ggtggtatga gatggacccg cgtctgatta ggtagttggt gaggtaacgg

240

cccaccaagc cgacgatcag tagccgacct gagagggtga ccggccacat tgggactgag

300

acacggccca aactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttggacaatg ggggaaaccc

360

tgatccagcg acgccgcgtg agtgaagaag tatttcggta tgtaaagctc tatcagcagg

420

gaagaaaatg acggtacctg actaagaagc cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt

480

aatacgtagg gggcaagcgt tatccggatt tactgggtgt aaagggagcg tagacggctc

540

tgcaagtctg gagtgaaagc cggggctcaa ccccgggact gctttggaaa ctgtggagct

600

agagtgcagg agaggtaagt ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta gatattagga

660

ggaacaccag tggcgaaggc ggcttactgg actgtaactg acgttgaggc tcgaaagcgt

720

ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga atactaggtg

780

ttggggagca aagctcttcg gtgccgccgc taacgcaata agtattccac ctggggagta

840

cgttcgcaag aatgaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt

900

ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaagtctt gacatcggaa tgaccgtctc

960

gtaacggaga cctcccttcg gggcattcca gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

1020

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt agtagccagc

1080

anntnnnnnt gggcactctg gggagactgc cagggataac ctggaggaag gtggggatga

1140

cgtcaaatca tcatgcccct tatgatttgg gctacacacg tgctacaatg gcgtaaacaa

1200

agggaagcaa aggagcgatc tggagcaaat cccaaaaata acgtctcagt tcggattgta

1260

gtctgcaact cgactacatg aagctggaat cgctagtaat cgcagatcag aatgctgcgg

1320

tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtt ggtaacgccc

1380

gaagtcagtg acccaaccgt aaggagggag ctgccgaagg cgggactgat aactggggtg

1440

aagtcgtaac aaggtagccg tatcggaagg

1470

<210> 547

<211> 1289

<212> DNA

<213> Clostridium aldenense

<220>

<221> modified_base

<222> (139)..(139)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (676)..(676)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 547

ggtgagtaac gcgtggataa cctgcctcac actgggggat aacagttaga aatggctgct

60

aataccgcat aagcgcacag taccgcatgg gacggtgtga aaaacccagg tggtgtgaga

120

tggatccgcg tctgattanc cagttggcgg ggtaacggcc caccaaagcg acgatcagta

180

gccgacctga gagggtgacc ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg

240

aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagcgac gccgcgtgag

300

tgaaaaaata tctcggtatg taaagctcta tcagcaggaa aaaggataaa aacccggcta

360

actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggggcaagc gttatccgga tttactgggt

420

gtaaagggag cgtagacggc gacgcaagtc tggagtgaaa gcccggggcc caaccccggg

480

actgctttgg aaactgtgct gctggagtgc agagaggtaa gtggaattcc tagtgtacgg

540

tgaaatgcgt aatattagag gaacaccagt ggcgaaggcg gcttactgga ctgtaactga

600

cgttgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt

660

aaacgatgaa tgctangtgt cggggggcaa agcccttcgg tgccgccgct aacgcaataa

720

gcattccacc tggggagtac gttcgcaaga atgaaactca aaggaattga ccgggacccg

780

cacaagcggt ggaccatgtg ctttaattcg aaacaacgcg aaaaacctta ccaagtcttg

840

acatccccct gaccggtccg taacggggcc tttccttcgg gacaggggag acaggtggtg

900

catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

960

cttatcctta gtagccagca cgtcgtggtg ggcactctag ggagactgcc agggataacc

1020

tggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgatttggg ctacacacgt

1080

gctacaatgg cgtaaacaaa gggaggcgac cctgcgaagg taagcaaatc ccaaaaataa

1140

cgtcccagtt cggactgtag tctgcaaccc gactacacga agctggaatc gctagtaatc

1200

gcggatcaga atgccgcggt gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc

1260

atgggagtca gcaacgcccg aagtcagtg

1289

<210> 548

<211> 1482

<212> DNA

<213> Clostridium aldrichii

<220>

<221> modified_base

<222> (47)..(47)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (145)..(145)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (367)..(367)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (946)..(946)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 548

cggcgtgctt aacacatgca agtcgagcgg aaatacattg aagattnatc ggatatgtat

60

tttagcggcg gacgggtgag taacgcgtgg gcaatctgcc tcacacaggg gaataacact

120

gggaaactag tgctaatacc gcatnatata gtgaagtggc atcactttac tatcaaagga

180

gcaatccggt gtgagatgag cccgcgtccg attagctagt tggtggggta acggcccacc

240

aaggcgacga tcggtagccg aactgagagg ttgatcggcc acattgggac tgagacacgg

300

cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcgc aatgggggaa accctgacgc

360

agcaacnccg cgtgaaggat gaaggttttc ggattgtaaa cttctttgat tggggacgat

420

aatgacggta cccaaaaaac aagccacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

taggtggcaa gcgttgtccg gaattactgg gtgtaaaggg cgtgtaggcg gggatgcaag

540

tcagatgtga aattccgaag ctcaacttcg gcgctgcatc tgaaactgta tctcttgagt

600

gctggagagg aaagcggaat tcctagtgta gcggtgaaat gcgtagatat taggaggaac

660

accagtggcg aaggcggctt tctggacagt aactgacgct gaggcgcgaa agcgtgggga

720

gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatggatact aggtgtagga

780

ggtatcgacc ccttctgtgc cggagttaac acaataagta tcccacctgg ggagtacggc

840

cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcagtgga gtatgtggtt

900

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca gggcttgaca taccantgac gtacttagag

960

ataggtattc ccttcgggac aatggataca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc

1020

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct gttgttagtt gccatcatta

1080

agttgggcac tctagcgaga ctgccggtga caaatcggag gaaggtgggg acgacgtcaa

1140

atcatcatgc cccttatgtc ctgggctaca cacgtactac aatggctatt acagagggaa

1200

gcgaagccgc gaggtggagc aaatctccaa aaatagtccc agttcagatt gcaggctgaa

1260

actcgcctgc atgaagtcgg aattgctagt aatggcaggt cagcatactg ccgtgaatac

1320

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatgaga gtctgcaaca cccgaagtca

1380

gtagtctaac tgtaaagagg acgctgccga aggtggggcc gatgattggg gtgaagtcgt

1440

aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct ggatcacctc ct

1482

<210> 549

<211> 1481

<212> DNA

<213> Clostridium algidicarnis

<400> 549

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgagc

60

gaagttattc cttcggggat aacttagcgg cggacgggtg agtaacacgt gggtaacctg

120

cctcatagag ggggatagcc ttccgaaagg aagattaata ccccataaca tagcattatc

180

gcatgataaa gttattaaag gagtaatccg ctatgagatg gacccgcggc gcattagcta

240

gttggtgagg taacggctca ccaaggccac gatgcgtagc cgacctgaga gggtgatcgg

300

ccacattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc

360

acaatgggcg aaagcctgat gcagcaacgc cgcgtgagtg atgaaggcct tcgggtcgta

420

aagctctgtc ttcggggacg ataatgacgg tacccgagga ggaagccacg gctaactacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttgtc cggatttact gggcgtaaag

540

ggagcgtagg cggatactta agtgggatgt gaaatacccg ggctcaaccc gggtgctgca

600

ttccaaactg ggtatctaga gtgtgggaga ggaaagtgga attcctagtg tagcggtgaa

660

atgcgtagag attaggaaga acaccagtgg cgaaggcgac tttctggacc ataactgacg

720

ctgaggctcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa

780

acgatggata ctaggtgtgg gggataccaa tcctccgtgc cgtcgttaac acactaagta

840

tcccgcctgg ggagtacgat cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac

900

aagcagcgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacct agacttgaca

960

tctcctgaat tacctgtaat tagggaagcc cttcggggca ggaagacagg tggtgcatgg

1020

ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat

1080

tgttagttgc taccatttag ttgagcactc tagcgagact gcctgggtta accaggagga

1140

aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgtcta gggctacaca cgtgctacaa

1200

tggcgagtac aacgagatgc aatatcgtga ggtggagcaa aactcaaaaa actcgtccca

1260

gttcggattg taggctgaaa ctcgcctaca tgaagccgga gttgctagta atcgcgaatc

1320

agaatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgagag

1380

ttggcaatac ccgaagtccg tgcgctaacg cgtaagcgag gcagcggccg aaggtagggt

1440

cagcgattgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtaggag a

1481

<210> 550

<211> 1502

<212> DNA

<213> Clostridium algidixylanolyticum

<400> 550

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgagc

60

gaagcgattt taaggaagcc ttcgggtgga attagaattg acttagcggc ggacgggtga

120

gtaacgcgtg ggtaacctgc ctcatacagg gggataacag ttagaaatga ctgctaatac

180

cgcataagcg cacagtgctg catagcacag tgtgaaaaac tccggtggta tgagatggac

240

ccgcgtctga ttaggtagtt ggtgaggtaa cggcccacca agccgacgat cagtagccga

300

cctgagaggg tgaccggcca cattgggact gagacacggc ccaaactcct acgggaggca

360

gcagtgggga atattggaca atgggggaaa ccctgatcca gcgacgccgc gtgactgaag

420

aagtatttcg gtatgtaaag gtctatcagc agggaagaaa atgacggtac ctgactaaga

480

agccccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggggcaag cgttatccgg

540

atttactggg tgtaaaggga gcgtagacgg ctctgcaagt ctggagtgaa agcccggggc

600

tcaaccccgg gactgctttg gaaactgtgg agctagagtg caggagaggt aagtggaatt

660

cctagtgtag cggtgaaatg cgtagatatt aggaggaaca ccagtggcga aggcggctta

720

ctggactgta actgacgttg aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct

780

ggtagtccac gccgtaaacg atgaatacta ggtgtcgggg agcaaagctc ttcggtgccg

840

tcgctaacgc aataagtatt ccacctgggg agtacgttcg caagaatgaa actcaaagga

900

attgacgggg acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa

960

ccttaccaag tcttgacatc ggaatgacag ccttataact aaggtctccc tacggggcat

1020

tctagacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1080

gcaacgagcg caacccttat ccttagtagc cagcagttcg gctgggcact ctggggagac

1140

tgccagggat aacctggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgatt

1200

tgggctacac acgtgctaca atggcgtaaa caaagggaag cgaaggagcg atctggagca

1260

aaccccaaaa ataacgtctc agttcggatt gtagtctgca actcgactac atgaagctgg

1320

aatcgctagt aatcgcagat cagaatgctg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccatggga gttggtaacg cccgaagtca gtgacccaac cgtaaggagg

1440

gagctgccga aggcgggact gataactggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtatcgga

1500

ga

1502

<210> 551

<211> 1454

<212> DNA

<213> Clostridium aminovalericum

<220>

<221> modified_base

<222> (465)..(466)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (572)..(573)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (774)..(774)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 551

ttaacacatg caagtcaacg gagttaatca agcgcgaagt cttcggatgg aagcttgtta

60

acttagtggc ggacgggtga gtaacgcgtg ggtaacctgc cttatacagg gggataacag

120

ccggaaacgg ttgctaatac cgcataagca tacagtgccg catggtacag tgtgaaaaag

180

attaagttca acttcgttca actctggtat aagatggacc cgcgtctgat tagctagttg

240

gtgaggtaat ggctcaccaa tggcgacgat cagtagccgg cttgagagag tgaccggcca

300

cattgggact gagacacggc ccaaactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca

360

atgggggaaa ccctgatgca gcgacgccgc gtgagtgaag aagtatttcg gtatgtaaag

420

ctctatcagc agggacgata atgacggtac ctgactaaga agccnnggct aactacgtgc

480

cagcagccgc ggtaatacgt agggggcaag cgttatccgg atttactggg tgtaaaggga

540

gcgtagacgg tctggtaagt caggtgtgaa anncccgggg ctcaaccccg gattgcactt

600

gaaactaccc gactagagtg caggagaggt aagtggaatt cctagtgtag cggtgaaatg

660

cgtagatatt aggaggaaca ccagtggcga aggcggctta ctggactgta actgacgttg

720

aggctcgaaa gcgtggggag cgaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgcngtaaac

780

gatgaatact aggtgttggg gtccataagg acttcggtgc cgtcgcaaac gcaataagta

840

ttccacctgg ggagtacgtt cgcaagaatg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac

900

aagcgtggga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca

960

tccctctgac cggtccgtaa tgggaccttt ccttcgggac agaggaacag gtggtgcatg

1020

gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccccta

1080

tctttagtag ccagcagttc ggctgggcac tctagagaga ctgccaggga taacctggag

1140

gaaggcgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgat ctgggctaca cacgtgctac

1200

aatggtgact acaaagagaa gcaaagctgt gaagtggagc caatctcaaa aaggtcatct

1260

cagttcggat tgtagtctgc aactcgacta catgaagctg gaatcgctag taatcgcaga

1320

tcagaatgct gtggtgaata cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc acaccatggg

1380

agttggatat gcccgaagtc agtgacccaa ccgtaaggag ggagctgccg aaggtggagc

1440

caatgactgg ggtg

1454

<210> 552

<211> 1485

<212> DNA

<213> Clostridium amygdalinum

<400> 552

ctcaggatga acgctggcgg cgtgcttaac acatgcaagt cgagcgaagc agttttaagg

60

aagttttcgg atggaattaa aattgactga gcggcggacg ggtgagtaac gcgtgggtaa

120

cctgcctcat acagggggat aacagttgga aacgactgct aataccgcat aagcgcacag

180

tgctgcatgg cacggtgtga aaaactccgg tggtatgaga tggacccgcg tctgattagg

240

tagttggtgg ggtaacggcc caccaagccg acgatcagta gccgacctga gagggtgacc

300

ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

360

ggacaatggg ggaaaccctg atccagcgac gccgcgtgac tgaagaagta tttcggtatg

420

taaaggtcta tcagcaggga agaaaatgac ggtacctgac taagaagccc cggctaacta

480

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggg gcaagcgtta tccggattta ctgggtgtaa

540

agggagcgta gacggcgatg caagtctgga gtgaaagccc ggggctcaac cccgggactg

600

ctttggaaac tgtgttgcta gagtgcagga gaggtaagtg gaattcctag tgtagcggtg

660

aaatgcgtag atattaggag gaacaccagt ggcgaaggcg gcttactgga ctgtaactga

720

cgttgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt

780

aaacgatgaa tactaggtgt tggggagcaa agctcttcgg tgccgccgct aacgcaataa

840

gtattccacc tggggagtac gttcgcaaga atgaaactca aaggaattga cggggacccg

900

cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaagtcttg

960

acatcggaat gaccggtccg taacggggcc ttcccttcgg ggcattccag acaggtggtg

1020

catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

1080

cttatcctta gtagccagca gtacggctgg gcactctggg gagactgcca gggataacct

1140

ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgatttgggc tacacacgtg

1200

ctacaatggc gtaaacaaag ggaagcgaag gagtgatccg gagcaaatct caaaaataac

1260

gtctcagttc ggattgtagt ctgcaactcg actacatgaa gctggaatcg ctagtaatcg

1320

cggatcagaa tgccgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca

1380

tgggagttgg taacgcccga agtcagtgac ccaaccgtaa ggagggagct gccgaaggcg

1440

ggactgataa ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta tcgga

1485

<210> 553

<211> 1504

<212> DNA

<213> Clostridium argentinense

<400> 553

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc

60

gatgaagctt ccttcgggaa gtggattagc ggcggacggg tgagtaacac gtgggtaacc

120

tgcctctaag aggggaatag cctcccgaaa gggagattaa taccgcataa agtatgaagg

180

tcgcatgact tttataccaa aggagtaatc cgctatgaga tggacccgcg gcgcattagc

240

tagttggtga ggtaagggct caccaaggca acgatgcgta gccgacctga gagggtgatc

300

ggccacattg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

360

gcgcaatggg ggaaaccctg acgcagcaac gccgcgtgaa tgaagaaggc cttagggttg

420

taaagttctg tcatatggga agataatgac ggtaccatat gaggaagcca cggctaacta

480

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgttg tccggattta ctgggcgtaa

540

aggatgcgta ggcggacatt taagtcagat gtgaaatacc cgggctcaac ttgggtgctg

600

catttgaaac tgggtgtcta gagtgcagga gaggaaagcg gaattcctag tgtagcggtg

660

aaatgcgtag agattaggaa gaacaccagt ggcgaaggcg gctttctgga ctgtaactga

720

cgctgaggca tgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt

780

aaacgatgaa tactaggtgt aggaggtatc gaccccttct gtgccgcagt taacacaata

840

agtattccgc ctggggagta cgatcgcaag attaaaactc aaaggaattg acgggggccc

900

gcacaagcag cggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt acctagactt

960

gacatcccct gaattacctg taatgaggga agcccttcgg ggcagggaga caggtggtgc

1020

atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1080

ttatcattag ttgctaccat taagttgagc actctagtga gactgcccgg gttaaccggg

1140

aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg tctagggcta cacacgtgct

1200

acaatggttg gtacaacaag atgcaagacc gcgaggtgga gctaaactta aaaaaccaac

1260

ccagttcgga ttgtaggctg aaactcgcct acatgaagcc ggagttgcta gtaatcgcga

1320

atcagcatgt cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga

1380

gagctggtaa cacccgaagt ccgtgaggta accgtaagga gccagcgccg aaggtgggat

1440

tagtgattgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtaggag aacctgcggt tggatcacct

1500

cctt

1504

<210> 554

<211> 1387

<212> DNA

<213> Clostridium asparagiforme

<400> 554

tcgaacgaag cattttagat gaagttttcg gatggattct gagatgactg agtggcggac

60

gggtgagtaa cacgtggata acctgcctca cactggggga caacagttag aaatgactgc

120

taataccgca taagcgcaca gtaccgcatg gtacggtgtg aaaaactccg gtggtgtgag

180

atggatccgc gtctgattag ccagttggcg gggtaacggc ccaccaaagc gacgatcagt

240

agccgacctg agagggtgac cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg

300

gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgaaagcct gatgcagcga cgccgcgtga

360

gtgaagaagt atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagataatga cggtacctga

420

ctaagaagcc ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg ggcaagcgtt

480

atccggattt actgggtgta aagggagcgt agacggcatg gcaagtctga agtgaaaacc

540

cagggctcaa ccctgggact gctttggaaa ctgtcaagct agagtgcagg agaggtaagt

600

ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta gatattagga ggaacaccag tggcgaaggc

660

ggcttactgg actgtaactg acgttgaggc tcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga

720

taccctggta gtccacgccg taaacgatga gtgctaggtg ttggggggca aagcccttcg

780

gtgccgtcgc aaacgcaata agcactccac ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc

840

aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc

900

gaaaaacctt accaagtctt gacatcctct tgaccggcgt gtaacggcgc ctttccttcg

960

ggacaagaga gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1020

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt agtagccagc attaagatgg gcactctagg

1080

gagactgcca gggacaacct ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta

1140

tgatttgggc tacacacgtg ctacaatggc gtaaacaaag ggaagcgacc ctgcgaaggt

1200

gagcaaatct caaaaataac gtcccagttc ggactgtagt ctgcaacccg actacacgaa

1260

gctggaatcg ctagtaatcg cgaatcagaa tgtcgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt

1320

acacaccgcc cgtcacacca tgggagtcag caacgcccga agtcagtgac ccaaccgaaa

1380

ggaggga

1387

<210> 555

<211> 1508

<212> DNA

<213> Clostridium baratii

<400> 555

gagagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaacacat gcaagtcgag

60

cgatgaagtt tccttcggga aacggattag cggcggacgg gtgagtaaca cgtgggtaac

120

ctgcctcata gaggggaata gcctcccgaa agggagatta ataccgcata acattgcagt

180

ttcgcatgaa acagcaatta aaggagcaat ccgctatgag atggacccgc ggcgcattag

240

ctagttggta aggtaatggc ttaccaaggc gacgatgcgt agccgacctg agagggtgat

300

cggccacatt gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcaa cgccgcgtga gtgatgacgg tcttcggatt

420

gtaaagctct gtctttgggg acgataatga cggtacccaa ggaggaagcc acggctaact

480

acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt ggcgagcgtt gtccggattt actgggcgta

540

aagggagcgt aggcggattt ttaagtggga tgtgaaatac ccgggctcaa cctgggtgct

600

gcattccaaa ctgggaatct agagtgcagg aggggagagt ggaattccta gtgtagcggt

660

gaaatgcgta gagattagga agaacaccag tggcgaaggc gactctctgg actgtaactg

720

acgctgaggc tcgaaagcgt ggggagcgaa caggattaga taccctggta gtccacgccg

780

taaacgatga atactaggtg taggggtttc aacacctctg tgccgccgct aacgcattaa

840

gtattccgcc tggggagtac ggtcgcaaga ttaaaactca aaggaattga cgggggcccg

900

cacaagtagc ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta cctagacttg

960

acatcctctg cattaccctt aatcggggaa gttccttcgg gaacagagtg acaggtggtg

1020

catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

1080

cctattgtta gttgctacca ttaagttgag cactctagcg agactgcctg ggttaaccag

1140

gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gtctagggct acacacgtgc

1200

tacaatggca agtacagaga gatgctatac cgcgaggtgg agctaaactt caaaacttgt

1260

ctcagttcgg attgtaggct gaaactcgcc tacatgaagc tggagttgct agtaatcgcg

1320

aatcagcatg tcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg

1380

agagttggca atacccaaag ttcgtgagct aacgcgtaag cgaggcagcg acctaaggta

1440

gggtcagcga ttggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta ggagaacctg cggctggatc

1500

acctcctt

1508

<210> 556

<211> 1364

<212> DNA

<213> Clostridium bartlettii

<400> 556

tcgagcgatt ctcttcggag aagagcggcg gacgggtgag taacgcgtgg gtaacctgcc

60

ctgtacacac ggataacata ccgaaaggta tgctaatacg ggataacata agaaattcgc

120

atgtttttct tatcaaagct ccggcggtac aggatggacc cgcgtctgat tagctagttg

180

gtgaggtaat ggctcaccaa ggcgacgatc agtagccgac ctgagagggt gatcggccac

240

attggaactg agacacggtc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa

300

tgggcgaaag cctgatgcag caacgccgcg tgagcgatga aggccttcgg gtcgtaaagc

360

tctgtcctca aggaagataa tgacggtact tgaggaggaa gccccggcta actacgtgcc

420

agcagccgcg gtaatacgta gggggctagc gttatccgga tttactgggc gtaaagggtg

480

cgtaggcggt cttttaagtc aggagtgaaa ggctacggct caaccgtagt aagctcttga

540

aactggagga cttgagtgca ggagaggaga gtggaattcc tagtgtagcg gtgaaatgcg

600

tagatattag gaggaacacc agtagcgaag gcggctctct ggactgtaac tgacgctgag

660

gcacgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat

720

gagtactagc tgtcggaggt tacccccttc ggtggcgcag ctaacgcatt aagtactccg

780

cctggggagt acgctcgcaa gagtgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagta

840

gcggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct tacctaagct tgacatcctt

900

ttgaccgatg cctaatcgca tctttccctt cggggacaga agtgacaggt ggtgcatggt

960

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgcc

1020

tttagttgcc atcattaagt tgggcactct agagggactg ccagggataa cctggaggaa

1080

ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgcttag ggctacacac gtgctacaat

1140

gggtggtaca gagggcagcg aagtcgtgag gccaagctaa tcccttaaag ccattctcag

1200

ttcggattgt aggctgaaac tcgcctacat gaagctggag ttactagtaa tcgcagatca

1260

gaatgctgcg gtgaatgcgt tcccgggtct tgtacacccc gcccgtcaca ccatgggagt

1320

tgggggcgcc cgaagccggc tagctaacct tttaggaagc ggtc

1364

<210> 557

<211> 1505

<212> DNA

<213> Clostridium beijerinckii

<400> 557

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgagc

60

gatgaagttc cttcgggaac ggattagcgg cggacgggtg agtaacacgt gggtaacctg

120

cctcatagag gggaatagcc tttcgaaagg aagattaata ccgcataaga ttgtagtgcc

180

acatggcata gcaattaaag gagtaatccg ctatgagatg gacccgcgtc gcattagcta

240

gttggtgagg taacggctca ccaaggcgac gatgcgtagc cgacctgaga gggtgatcgg

300

ccacattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc

360

acaatggggg aaaccctgat gcagcaacgc cgcgtgagtg atgacggtct tcggattgta

420

aagctctgtc ttcagggacg ataatgacgg tacctgagga ggaagccacg gctaactacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttgtc cggatttact gggcgtaaag

540

ggagcgtagg tggatattta agtgggatgt gaaatactcg ggcttaacct gggtgctgca

600

ttccaaactg gatatctaga gtgcaggaga ggaaagtaga attcctagtg tagcggtgaa

660

atgcgtagag attaggaaga ataccagtgg cgaaggcgac tttctggact gtaactgaca

720

ctgaggctcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa

780

acgatgaata ctaggtgtag gggttgtcat gacctctgtg ccgccgctaa cgcattaagt

840

attccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca

900

caagcagcgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc tagacttgac

960

atctcctgaa ttactcttaa tcggggaagc ccttcggggc aggaagacag gtggtgcatg

1020

gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta

1080

ttgttagttg ctaccattta gttgagcact ctagcgagac tgcccgggtt aaccgggagg

1140

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtct agggctacac acgtgctaca

1200

atggctggta cagagagatg ctaaaccgcg aggtggagcc aaactttaaa accagtctca

1260

gttcggattg taggctgaaa ctcgcctaca tgaagctgga gttgctagta atcgcgaatc

1320

agaatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgagag

1380

ttggcaatac ccaaagttcg tgagctaacg cgtaagcggg gcagcgacct aaggtagggt

1440

cagcgattgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtaggag aacctgcggc tggatcacct

1500

ccttt

1505

<210> 558

<211> 1329

<212> DNA

<213> Clostridium bifermentans

<220>

<221> modified_base

<222> (1316)..(1316)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1320)..(1321)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 558

gatctcttcg gagagagcgg cggacgggtg agtaacgcgt gggtaacctg ccctgtacac

60

acggataaca taccgaaagg tatactaata cgggataaca tatgaaagtc gcatggcttt

120

tgtatcaaag ctccggcggt acaggatgga cccgcgtctg attagctagt tggtaaggta

180

atggcttacc aaggcaacga tcagtagccg acctgagagg gtgatcggcc acactggaac

240

tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatgggcgaa

300

agcctgatgc agcaacgccg cgtgagcgat gaaggccttc gggtcgtaaa gctctgtcct

360

caaggaagat aatgacggta cttgaggagg aagccccggt aactactgcc ccggatacag

420

ggggtcggaa ttactgggcg taaagggtgc gtaggtggtt ttttaagtca gaagtgaaag

480

gctacggctc aaccgtagta agcttttgaa actagagaac ttgagtgcag gagaggagag

540

tagaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattagg aggaatacca gtagcgaagg

600

cggctctctg gactgtaact gacactgagg cacgaaagcg tggggagcaa acaggattag

660

ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtactaggt gtcgggggtt acccccctcg

720

gtgccgcagc taacgcatta agtactccgc ctgggaagta cgctcgcaag agtgaaactc

780

aaaggaattg acggggaccc gcacaagtag cggagcatgt ggtttaattc aaagctacgc

840

gaagaacctt acctaagctt gacatccggc tacgcctcac ccgaagtgag cttttccatc

900

tggggaagtg gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt

960

taagtcccgc aacgagcgca acccttgcct ttagttgcca gcattaagtt gggcactcta

1020

gagggactgc cgaggataac tcggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct

1080

tatgcttagg gctacacacg tgctacaatg ggtggtacag agggttgcca agccgcgagg

1140

tggagctaat cccttaaagc cattctcagt tcggattgta ggctgaaact cgcctacatg

1200

aagctggagt tactagtaat cgcagatcag aatgctgcgg tgaatgcgtt cccgggtctt

1260

gtacacaccg cccgtcacac catggaagtt gggggcgccc gaagccggtt agctancctn

1320

ntaggaagc

1329

<210> 559

<211> 1377

<212> DNA

<213> Clostridium bolteae

<220>

<221> modified_base

<222> (13)..(13)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 559

gaagcaatta aanggaagtt ttcggatgga atttgattga ctgagtggcg gacgggtgag

60

taacgcgtgg ataacctgcc tcacactggg ggataacagt tagaaatgac tgctaatacc

120

gcataagcgc acagtaccgc atggtacggt gtgaaaaact ccggtggtgt gagatggatc

180

cgcgtctgat tagccagttg gcggggtaac ggcccaccaa agcgacgatc agtagccgac

240

ctgagagggt gaccggccac attgggactg agacacggcc caaactccta cgggaggcag

300

cagtggggaa tattgcacaa tgggcgaaag cctgatgcag cgacgccgcg tgagtgaaga

360

agtatttcgg tatgtaaagc tctatcagca gggaagaaaa tgacggtacc tgactaagaa

420

gccccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggggcaagc gttatccgga

480

tttactgggt gtaaagggag cgtagacggc gaagcaagtc tgaagtgaaa acccagggct

540

caaccctggg actgctttgg aaactgtttt gctagagtgt cggagaggta agtggaattc

600

ctagtgtagc ggtgaaatgc gtagatatta ggaggaacac cagtggcgaa ggcggcttac

660

tggacgataa ctgacgttga ggctcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg

720

gtagtccacg ccgtaaacga tgaatgctag gtgttggggg gcaaagccct tcggtgccgt

780

cgcaaacgca gtaagcattc cacctgggga gtacgttcgc aagaatgaaa ctcaaaggaa

840

ttgacgggga cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac

900

cttaccaagt cttgacatcc ttttgaccgg cgtgtaacgg cgccttccct tcggggcaag

960

agagacaggt ggtgcatggc cgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg

1020

caacgagcgc aacccttatc cttagtagcc agcaggtaga gctgggcact ctagggagac

1080

tgccagggat aacctggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgatt

1140

tgggctacac acgtgctaca atggcgtaaa caaagggaag caagacagtg atgtggagca

1200

aatcccaaaa ataacgtccc agttcggact gtagtctgca acccgactac acgaagctgg

1260

aatcgctagt aatcgcgaat cagaatgtcg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca

1320

ccgcccgtca caccatggga gtcagcaacg cccgaagtca gtgacccaac tcgcaag

1377

<210> 560

<211> 1355

<212> DNA

<213> Clostridium botulinum

<400> 560

tgaagcttcc ttcgggaagt ggattagcgg cggacgggtg agtaacacgt gggtaacctg

60

cctcaaagtg ggggatagcc ttccgaaagg aagattaata ccgcataaca taagagaatc

120

gcatgatttt cttatcaaag atttattgct ttgagatgga cccgcggcgc attagctagt

180

tggtaaggta acggcttacc aaggcaacga tgcgtagccg acctgagagg gtgatcggcc

240

acattggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcgc

300

aatgggggaa accctgacgc agcaacgccg cgtgggtgag aaggtcttcg gattgtaacc

360

tgttttctgg gacgataatg acggtaccag aggaggaagc cacggctaac tacgtgccag

420

cagccgcggt aatacgtagg tggcgagcgt tgtccggatt tactgggcgt aaagggtgcg

480

taggcggatg tttaagtggg atgtgaaatc cccgggctta acctgggggc tgcattccaa

540

actggatatc tagagtgcag gagaggaaag cggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt

600

agagattagg aagaacacca gtggcgaagg cggctttctg gactgtaact gacgctgagg

660

cacgaaagcg tgggtagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg

720

gatactaggt gtagggggta tcaactcccc ctgtgccgca gttaacacaa taagtatccc

780

gcctggggag tacggtcgca agagtaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc

840

agcggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaaaaacc ttacctggac ttgacatccc

900

ttgcatagcc tagagatagg tgaagccctt cggggcaagg agacaggagg tgcatgggtg

960

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttaggtt aagtcctgca acgagcgcaa cccttgttat

1020

tagttgctac cattaagttg agcactctaa tgagactgcc tgggtaacca ggaggaaggt

1080

ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgtccagggc tacacacgtg ctacaatggt

1140

aggtacaata agacgcaaga ccgtgaggtg gagcaaaact tataaaacct atctcagttc

1200

ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa gctggagttg ctagtaatcg cgaatcagaa

1260

tgtcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgagagctgg

1320

taacacccga agtccgtgag gtaaccgtaa ggagc

1355

<210> 561

<211> 1366

<212> DNA

<213> Clostridium butyricum

<400> 561

tcgagcgatg aagctccttc gggagtggat tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggt

60

aacctgcctc atagagggga atagcctttc gaaaggaaga ttaataccgc ataagattgt

120

agtaccgcat ggtacagcaa ttaaaggagt aatccgctat gagatggacc cgcgtcgcat

180

tagctagttg gtgaggtaac ggctcaccaa ggcgacgatg cgtagccgac ctgagagggt

240

gatcggccac attgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

300

tattgcacaa tgggggaaac cctgatgcag caacgccgcg tgagtgatga cggtcttcgg

360

attgtaaagc tctgtcttta gggacgataa tgacggtacc taaggaggaa gccacggcta

420

actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta ggtggcaagc gttgtccgga tttactgggc

480

gtaaagggag cgtaggtgga tatttaagtg ggatgtgaaa tacccgggct taacctgggt

540

gctgcattcc aaactggata tctagagtgc aggagaggaa aggagaattc ctagtgtagc

600

ggtgaaatgc gtagagatta ggaagaatac cagtggcgaa ggcgcctttc tggactgtaa

660

ctgacactga ggctcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg

720

ccgtaaacga tgaatactag gtgtaggggt tgtcatgacc tctgtgccgc cgctaacgca

780

ttaagtattc cgcctgggga gtacggtcgc aagattaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg

840

cccgcacaag cagcggacat gtggtttaat tgaagcaacg cgaagaacct tacctagact

900

tgacatctcc tgaattctct gtaatggaga agccacttcg gtggcaggaa gacaggtggt

960

gcatggttgt ggtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1020

ccttattgtt agttgctccc atttagttga gcactctagc gagactgccc gggttaaccg

1080

ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgtctagggc tacacacgtg

1140

ctacaatggt cggtacaatg agatgcaacc tcgcgagagt gagcaaaact ataaaaccga

1200

tctcagttcg gattgtaggg tgaaactcgc ctacatgaag ctggagttgc tagtaatcgc

1260

gaatcagaat gtcgcggaga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat

1320

gagagttggc aatacccaaa gttcgtgagc taaccgcaag gaggca

1366

<210> 562

<211> 1473

<212> DNA

<213> Clostridium cadaveris

<400> 562

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgagc

60

gagggagcac cttcgggtgt gaactagcgg cggacgggtg agtaacacgt gggcaacctg

120

ccttacagag ggggatagcc ttccgaaagg aagattaata ccgcatatta tgatttttct

180

gcatgggaaa gtcatgaaag gagcaatccg ctgtaagatg ggcccgcggc gcattagcta

240

gttggtgagg taagggctca ccaaggcgac gatgcgtagc cgacctgaga gggtgatcgg

300

ccacattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc

360

acaatggggg aaaccctgat gcagcaacgc cgcgtgagtg atgacggcct tcgggttgta

420

aagctctgtc ttcagggacg ataatgacgg tacctgagga ggaagccacg gctaactacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc gagcgttatc cggatttact gggcgtaaag

540

gatgcgtagg tggaatttta agtgggatgt gaaatacccg ggctcaacct gggaactgca

600

ttccaaactg gaattctaga gtgcaggaga ggaaagcgga attcctagtg tagcggtgaa

660

atgcgtagag attaggaaga acaccagtgg cgaaggcggc tttctggact gtaactgaca

720

ctgaggcatg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa

780

acgatgggta ctaggtgtag gggtttcgat acctctgtgc cgccgtaaac acaataagta

840

ccccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac

900

aagtagcgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacct agacttgaca

960

tgtcctgaat tacctgtaat aagggaagct ctttcgggag caggaacaca ggtggtgcat

1020

ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct

1080

atagttagtt gctaacagta agatgagcac tctagctaga ctgccgtggt taacgcggag

1140

gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgtc tagggctaca cacgtgctac

1200

aatggcgaga acaaagagaa gcaagaccgc gaggtggagc aaaactcata aaactcgtcc

1260

cagttcggat tgcaggctgc aactcgcctg catgaagccg gagttactag taatcgcgaa

1320

tcagaatgtc gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatgag

1380

agttggcaat acccaaagtc cgtgaggtaa ccgaaaggag ccagcggcct aaggtagggt

1440

cagcgattgg ggtgaagtcg taacaaggta acc

1473

<210> 563

<211> 1499

<212> DNA

<213> Clostridium carboxidivorans

<400> 563

ttgatcctgg ctcaggacga acgctggcgg cgtgcttaac acatgcaagt cgagcgatga

60

aatcccttcg gggatggatt agcggcggac gggtgagtaa cacgtgggca acctgcctca

120

aagtggggga tagccttccg aaagggagat taataccgca taacattagt ttttcacatg

180

aaatactaat taaaggagta atccgctttg agatgggccc gcggcgcatt agctagttgg

240

tgaggtaacg gctcaccaag gccacgatgc gtagccgacc tgagagggtg atcggccaca

300

ttggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat

360

gggcgaaagc ctgatgcagc aacgccgcgt gagtgatgaa ggccttcggg ttgtaaagct

420

ctgtctttgg ggacgataat gacggtaccc aaggaggaag ccacggctaa ctacgtgcca

480

gcagccgcgg taatacgtag gtggcgagcg ttgtccggat ttactgggcg taaaggatgc

540

gtaggcggat gtttaagtca gatgtgaaaa tcccgagctt aacttgggaa ctgcatttga

600

aactggatat ctagagtgcg ggagaggaga atggaattcc tagtgtagcg gtgaaatgcg

660

tagagattag gaagaacacc agtggcgaag gcgattctct ggaccgtaac tgacgctgag

720

gcatgaaagc gtgggtagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat

780

gaatactagg tgtaggaggt atcgactcct tctgtgccgc agctaacgca ataagtattc

840

cgcctgggaa gtacgatcgc aagattaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag

900

cagcggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttacctaga cttgacatcc

960

cctgaattac ctgtaatgag ggaagccctt cggggcaggg agacaggtgg tgcatggttg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttaggtt aagtcctgca acgagcgcaa cccttatcat

1080

tagttgctac cattaagttg agcactctag tgagactgcc cgggttaacc gggaggaagg

1140

tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgtctaggg ctacacacgt gctacaatgg

1200

tgagtacaga aagatgcaag accgtgaggt ggagcaaaac ttttaaaact catctcagtt

1260

cggattgtag gctgaaactc gcctacatga agctggagtt gctagtaatc gcgaatcagc

1320

atgtcgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgagagctg

1380

gcaacacccg aagtccgtga ggtaaccgta aggagccagc ggccgaaggt ggggttagta

1440

attggggtga agtcgtaaca aggtagccgt aggagaacct gcggctggat cacctcctt

1499

<210> 564

<211> 1458

<212> DNA

<213> Clostridium carnis

<220>

<221> modified_base

<222> (1)..(3)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (92)..(92)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (96)..(97)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (606)..(607)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (837)..(837)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (930)..(944)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1172)..(1172)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1360)..(1360)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 564

nnntaggtga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taacacatgc

60

aagtcgagcg aggggagttt cttcggaaac cnaacnnagc ggcggacggg tgagtaacac

120

gtgggcaacc tgccttgtag aggggaatag ccttccgaaa ggaagattaa taccgcataa

180

tattgcagct tcgcatgaag cagtaattaa aggagcaatc cgctacaaga tgggcccgcg

240

gcgcattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatgcgta gccgacctga

300

gagggtgatc ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcaac gccgcgtgag tgatgaaggt

420

tttcggatcg taaagctctg tcttcgggga cgataatgac ggtacccgag gaggaagcca

480

cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgttg tccggattta

540

ctgggcgtaa agggagcgta ggcggacttt taagtgagat gtgaaatacc cgggctcaac

600

ctgggnnctg catttcaaac tggaagtcta gagtgcagga gaggagagtg gaattcctag

660

tgtagcggtg aaatgcgtag agattaggaa gaacaccagt ggcgaaggcg actctctgga

720

ctgtaactga cgctgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag

780

tccacgccgt aaacgatgaa tactaggtgt aggggttgtc atgacctctg tgccgcngct

840

aacgcattaa gtattccgcc tggggagtac ggtcgcaaga ttaaaactca aaggaattga

900

cgggggcccg cacaagcagc ggagcatgtn nnnnnnnnnn nnnnaacgcg aagaacctta

960

cctagacttg acatctcctg cattactctt aatcgaggaa gtcctttcgg ggacaggatg

1020

acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

1080

gagcgcaacc cttattgtta gttgctacca tttagttgag cactctagcg agactgcccg

1140

ggttaaccgg gaggaaggtg gggatgacgt cnaatcatca tgccccttat gtctagggct

1200

acacacgtgc tacaatggca agtacaaaga gatgcaatac cgcgaggtgg agctaaacta

1260

taaaacttgt ctcagttcgg attgtaggct gaaactcgcc tacatgaagc tggagttgct

1320

agtaatcgcg aatcagcatg tcgcggtgaa tacgttcccn ggccttgtac acaccgcccg

1380

tcacaccatg agagttggca atacccaaag ttcgtgagct aaccgcaagg aggcagcgac

1440

ctaaggtagg gtcagcga

1458

<210> 565

<211> 1012

<212> DNA

<213> Clostridium celatum

<220>

<221> modified_base

<222> (14)..(14)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (40)..(42)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (63)..(63)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (107)..(107)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (109)..(109)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (111)..(111)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 565

gggtgtaaag ctcngtcttc agggacgata atgacggtan nngaggagga agccacggct

60

aantacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcgag cgttgtncng natttactgg

120

gcgtaaaggg agcgtaggcg gacttttaag tgagatgtga aatacccggg ctcaacttgg

180

gtgctgcatt tcaaactgga agtctagagt gcaggagagg agaatggaat tcctagtgta

240

gcggtgaaat gcgtagagat taggaagaac accagtggcg aaggcgattc tctggactgt

300

aactgacgct gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

360

cgccgtaaac gatgaatact aggtgtaggg gttgtcatga cctctgtgcc gccgctaacg

420

cattaagtat tccgcctggg gagtacggtc gcaagattaa aactcaaagg aattgacggg

480

ggcccgcaca agcagcggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccta

540

gacttgacat ctcctgaatt acccgtaact ggggaagtcg cttcggcgac aggaagacag

600

gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

660

gcaaccccta ttgttagttg ctaccattaa gttgagcact ctagcgagac tgcccgggtt

720

aaccgggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtct agggctacac

780

acgtgctaca atggcaagta caaagagaag caagaccgcg aggtggagca aaactcaaaa

840

acttgtctca gttcggattg taggctgaaa ctcgcctaca tgaagctgga gttgctagta

900

atcgcgaatc agcatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac

960

accatgagag ttggcaatac ccaaagtgcg tgatctgact cgcaagagag ga

1012

<210> 566

<211> 1435

<212> DNA

<213> Clostridium celerecrescens

<400> 566

catgcaagtc gagcgaagcg atttcaagga agttttcgga cggaattgaa attgactgag

60

cggcggacgg gtgagtaacg cgtgggtaac ctgcctcata cagggggata acagttggaa

120

acgactgcta ataccgcata agcacacagt gccgcatggt acggtgtgaa aaactccggt

180

ggtatgagat ggacccgcgt ctgattaggt agttggtgag gtaacggccc accaagccga

240

cgatcagtag ccgacctgag agggtgaccg gccacattgg gactgagaca cggcccaaac

300

tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggg gaaaccctga tccagcgacg

360

ccgcgtgagt gaagaagtat ttcggtatgt aaagctctat cagcagggaa gaaaatgacg

420

gtacctgact aagaagcccc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggggg

480

caagcgttat ccggatttac tgggtgtaaa gggagcgtag acggcactgc aagtctggag

540

tgaaagcccg gggctcaacc ccgggactgc tttggaaact gtggtgctgg agtgcaggag

600

aggtaagtgg aattcctagt gtagcggtga aatgcgtaga tattaggagg aacaccagtg

660

gcgaaggcgg cttactggac tgtaactgac gttgaggctc gaaagcgtgg ggagcaaaca

720

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgaat actaggtgtt ggggagcaaa

780

gctcttcggt gccgccgcta acgcaataag tattccacct ggggagtacg ttcgcaagaa

840

tgaaactcaa aggaatttga cggggacccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

900

aagcaacgcg aagaacctta ccaagtcttg acatcggaat gaccgggatg taacgatccc

960

ttccctacgg ggcattccag acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1020

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatcctta gtagccagca agttaagttg

1080

ggcactctgg ggagactgcc agggataacc tggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat

1140

catgcccctt atgatttggg ctacacacgt gctacaatgg cgtaaacaaa gggaagcaaa

1200

ggagcgatct ggagcaaacc ccaaaaataa cgtctcagtt cggattgtag tctgcaactc

1260

gactacatga agctggaatc gctagtaatc gcggatcaga atgccgcggt gaatacgttc

1320

ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg gtaacgcccg aagtcagtga

1380

cccaaccgta aggagggagc tgccgaaggc gggactgata actggggtga agtcg

1435

<210> 567

<211> 1500

<212> DNA

<213> Clostridium cellulosi

<220>

<221> modified_base

<222> (1380)..(1381)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 567

tttgatcctg gctcaggacg aacgctggcg gcgtgcctaa cacatgcaag tcgagcggag

60

atagtacttc ggttctatct tagcggcgga cgggtgagta acgcgtgagc aacctgccct

120

gagcacgggg atagcgtctg gaaacggacg gtaataccgc ataatgtacg ttggaggcat

180

ctccgatgta ccaaaggagg aatccactca aggatgggct cgcgtccgat taggtagttg

240

gtgaggtaac ggcccaccaa gcctgcgatc ggtagccgga ctgagaggtt gtacggccac

300

attgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa

360

tggaggaaac tctgatgcag cgacgccgcg tgagggaaga aggtcttcgg attgtaaacc

420

tctgtctttc gggacgaagg aagtgacggt accgaaagag gaagccacgg ctaactacgt

480

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggcg agcgttgtcc ggaattactg ggtgtaaagg

540

gtgcgtaggc gggttgtcaa gttggatgtg aaatctctgg gcttaactca gaggttgcat

600

tcaaaactgg cgatcttgag tgaggtagag gcaggcggaa ttcccggtgt agcggtgaaa

660

tgcgtagata tcgggaggaa caccagtggc gaaggcggcc tgctgggcct taactgacgc

720

tgaggcgcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc atgctgtaaa

780

cgatgattgc taggtgtggg tggactgacc ccatccgtgc cggagttaac acaataagca

840

tcccacctgg ggagtacggc cgcaaggctg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac

900

aagcagtgga gtatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca

960

tccaccgaat ccggaagaga ttctggagtg cccttcgggg agcggtgaga caggtggtgc

1020

atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1080

ttgttaatag ttgctacgca agagcactct attaagactg ccgttgataa aacggaggaa

1140

ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtactacaat

1200

ggccgccaac aaagggaagc aataccgcga ggtggagcga atccccaaaa gcggtcccag

1260

ttcagattgc aggctgcaac ccgcctgcat gaagacggaa ttgctagtaa tcgcggatca

1320

gcatgccgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgagagn

1380

nggcaacacc cgaagtcgtt tgcgtaaccg aaaggagcgc ggcgccgaag gtgggatcgg

1440

tgattggggt gaagtcgtaa caaggtagcc gtatcggaag gtgcggctgg atcacctcct

1500

<210> 568

<211> 1283

<212> DNA

<213> Clostridium chauvoei

<400> 568

tgggcaacct gccttgtaga ggggaatagc cttccgaaag gaagattaat accgcataat

60

attgcagctt cgcatggagc agtaattaaa ggagcaatcc gctacaagat gggcccgcgg

120

cgcattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgatgcgtag ccgacctgag

180

agggtgatcg gccacattgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

240

gggaatattg cacaatgggg gaaaccctga tgcagcaacg ccgcgtgagt gatgaaggtt

300

ttcggatcgt aaagctctgt cttcagggac gataatgacg gtacctgagg aggaagccac

360

ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg cgagcgttgt ccggattttt

420

tgggcgtaaa gggagcgtag gcggacttgt aagtgagatg tgaaataccc gggctcaact

480

tgggtgctgc atttcaaact ggaagtctag agtgcaggag aggagagtgg aattcctagt

540

gtagcggtga aatgcgtaga gattaggaag aacaccagtg gcgaaggcga ctctctggac

600

tgtaactgac gctgaggctc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt

660

ccacgccgta aacgatggat actaggtgtg ggaggtatca actccttccg tgccgccgtt

720

aacacattaa gtatcccgcc tggggagtac ggtcgcaaga ttaaaactca aaggaattga

780

cgctagcccg cacaagcagc ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta

840

cctagacttg acatctcctg cattactctt aatcgaggaa gtctcttcgg agacaggatg

900

acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

960

gagcgcaacc cttattgtta gttgctacca tttagttgag cactctagcg agactgcccg

1020

ggttaaccgg gaggaaggtg gtagtgacgt caaatcatca tgccccttat gtctagggct

1080

acacacgtgc tagaatggca agtacaacga gatgcaatac cgcgaggtgg agctaaacta

1140

taaaacttgt ctcagttcgg attgtaggct gaaactcgcc tacatgaagc tggagttgct

1200

agtaatcgcg aatcagcatg tcgcggtgaa tacgttcccg agccttgtac acaccgcccg

1260

tcacaccatg agagttggca ata

1283

<210> 569

<211> 1383

<212> DNA

<213> Clostridium citroniae

<220>

<221> modified_base

<222> (12)..(14)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 569

acgaagcaat tnnnaatgaa gttttcggat ggatttctga ttgactgagt ggcggacggg

60

tgagtaacgc gtggataacc tgcctcacac tgggggataa cagttagaaa tggctgctaa

120

taccgcataa gcgcacagta ccgcatggta cggtgtgaaa aactccggtg gtgtgagatg

180

gatccgcgtc tgattagtta gttggcgggg taacggccca ccaagacagc gatcagtagc

240

cgacctgaga gggtgaccgg ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag

300

gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg aaagcctgat gcagcgacgc cgcgtgagtg

360

aagaagtatt tcggtatgta aagctctatc agcagggaag aaaatgacgg tacctgacta

420

agaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc aagcgttatc

480

cggatttact gggtgtaaag ggagcgtaga cggcgaagca agtctggagt gaaaacccag

540

ggctcaaccc tgggactgct ttggaaactg ttttgctaga gtgtcggaga ggtaagtgga

600

attcctagtg tagcggtgaa atgcgtagat attaggagga acaccagtgg cgaaggcggc

660

ttactggacg ataactgacg ttgaggctcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac

720

cctggtagtc cacgccgtaa acgatgaatg ctaggtgttg gggggcaaag cccttcggtg

780

ccgtcgcaaa cgcaataagc attccacctg gggagtacgt tcgcaagaat gaaactcaaa

840

ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa

900

gaaccttacc aagtcttgac atccccctga ccggtcggta aagcggcctt tccttcggga

960

caggggagac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1020

cccgcaacga gcgcaaccct tatccttagt agccagcagg taaagctggg cactctaggg

1080

agactgccag ggataacctg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat

1140

gatttgggct acacacgtgc tacaatggcg taaacaaagg gaagcgaccc tgcgaaggca

1200

agcaaatccc aaaaataacg tcccagttcg gactgtagtc tgcaacccga ctacacgaag

1260

ctggaatcgc tagtaatcgc gaatcagaat gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta

1320

cacaccgccc gtcacaccat gggagtcagc aacgcccgaa gtcagtgacc caaccgaaag

1380

gag

1383

<210> 570

<211> 1560

<212> DNA

<213> Clostridium clariflavum

<400> 570

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc ggtcctgcat tcaacattga

60

gtattcagct gacgttggag attgagccgg cgtcaagcag aaacaaccat atactatgat

120

atgtttaaag tttctgcttc acgctgaata aagtgccaac acaaaaagga gctgagtatt

180

gaatgttgaa tgcaggatag cggcggacgg gtgagtaacg cgtgggtaat ctgcctcaca

240

cagggggata acactgggaa actagtgcta ataccgcata acataacgag gtggcatcac

300

tttgttatca aaggagcaat ccggtgtgag atgagcccgc gtccgattag ctagttggtg

360

aggtaacggc tcaccaaggc gacgatcggt agccgaactg agaggttgat cggccacatt

420

gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcgcaatgg

480

gggaaaccct gacgcagcaa cgccgcgtga aggaagaagg tcttcggatt gtaaacttct

540

ttggttgggg acgataatga cggtacccaa ggaacaagcc acggctaact acgtgccagc

600

agccgcggta atacgtaggt ggcgagcgtt gtccggaatt actggatgta aagggcgcgt

660

aggcggggat gcaagtcaga tgtgaaattc cggggctcaa ccccggcgct gcatctgaaa

720

ctgtatttct tgagtgttgg agaggaaagc ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta

780

gagattagga ggaacaccag tggcgaaggc ggctttctgg acagtaactg acgctgaggc

840

gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatgg

900

atactaggtg taggaggtat cgaccccttc tgtgccggag ttaacacaat aagtatccca

960

cctggggagt acggccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagca

1020

gtggagtatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccagggct tgacatccct

1080

ctgacagctc tagagatagg gcttctcttc ggagcagagg agacaggtgg tgcatggttg

1140

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgttgt

1200

tagttgccat cattaagttg ggcactctaa cgagactgcc ggtgataaat cggaggaagg

1260

tggggacgac gtcaaatcat catgcccctt atgtcctggg ctacacacgt actacaatgg

1320

ctgctacaaa gggaagcgag accgcgaggt ggagcaaatc cccaaaagca gtcccagttc

1380

agattgcagg ctgaaactcg cctgcatgaa gtcggaattg ctagtaatgg caggtcagca

1440

tactgccgtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgagagtctg

1500

caacacccga agtcagtagt ctaaccgaga ggagggcgct gccgaaggtg gggcagatga

1560

<210> 571

<211> 1475

<212> DNA

<213> Clostridium clostridiiformes

<220>

<221> modified_base

<222> (534)..(534)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (917)..(917)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (954)..(954)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1010)..(1010)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1453)..(1453)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1471)..(1471)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 571

aacatgagag tttgatcctg gctcaggatc aacgctggcg gcgtgcctaa cacatgcaag

60

tcgaacgaag caattaagat gaagttttcg gatggaatct tgattgactg agtggcggac

120

gggtgagtaa cgcgtggata acctgcctca cactggggga taacagttag aaatgactgc

180

taataccgca taagcgcaca gtgccgcatg gcagtgtgtg aaaaactccg gtagtgtgag

240

atggatccgc gtctgattag ccagttggcg gggtaacggc ccaccaaagc gacgatcagt

300

agccgacctg agagggtgac cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg

360

gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgaaagcct gatgcagcga cgccgcgtga

420

gtgaagaagt atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctga

480

ctaagaagcc ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg ggcnagcgtt

540

atccggattt actgggtgta aagggagcgt agacggcgaa gcaagtctga agtgaaaacc

600

cagggctcaa ccctggcact gctttggaaa ctgttttgct agagtgtcgg agaggtaagt

660

ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta gatattagga ggaacaccag tggcgaaggc

720

ggcttactgg acgataactg acgttgaggc tcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga

780

taccctggta gtccacgccg taaacgatga atgctaggtg ttggggggca aagccttcgg

840

tgccgccgca aacgcagtaa gcattccacc tggggagtac gttcgcaaga atgaaactca

900

aaggaattga cgggganccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagnaacgcg

960

aagaacctta ccaagtcttg acatccccct gacggccggt aacgcggccn ttcttcggga

1020

caggggagac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaaccct tatccttagt agccagcagg taaagctggg cactctaggg

1140

agactgccag ggataacctg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat

1200

gatttgggct acacacgtgc tacaatggcg taaacaaagg gaagcgagac agtgatgtgg

1260

agcaaatccc aaaaataacg tcccagttcg gactgtagtc tgcaacccga ctacacgaag

1320

ctggaatcgc tagtaatcgc gaatcagaat gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta

1380

cacaccgccc gtcacaccat gggagtcagc aacgcccgaa gtcagtgacc caaccgaaag

1440

gagggagctg ccnaaggcgg ggcaggtaac ngggg

1475

<210> 572

<211> 1370

<212> DNA

<213> Clostridium clostridioforme

<400> 572

attaagatga agttttcgga tggaatcttg attgactgag tggcggacgg gtgagtaacg

60

cgtggataac ctgcctcaca ctgggggata acagttagaa atgactgcta ataccgcata

120

agcgcacagt gccgcatggc agtgtgtgaa aaactccggt ggtgtgagat ggatccgcgt

180

ctgattagcc agttggcggg gtaacggccc accaaagcga cgatcagtag ccgacctgag

240

agggtgaccg gccacattgg gactgagaca cggcccaaac tcctacggga ggcagcagtg

300

gggaatattg cacaatgggc gaaagcctga tgcagcgacg ccgcgtgagt gaagaagtat

360

ttcggtatgt aaagctctat cagcagggaa gaaaagacgg tacctgctaa gaagccccgg

420

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggggca agcgttatcc ggatttactg

480

ggtgtaaagg gagcgtagac ggcgaagcaa gtctgaagtg aaaacccagg gctcaaccct

540

gggactgctt tggaaactgt tttgctagag tgtcggagag gtaagtggaa ttcctagtgt

600

agcggtgaaa tgcgtagata ttaggaggaa caccagtggc gaaggcggct tactggacga

660

taactgacgt tgaggctcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

720

acgccgtaaa cgatgaatgc taggtgttgg ggggcaaagc ccttcggtgc cgccgcaaac

780

gcagtaagca ttccacctgg ggagtacgtt cgcaagaatg aaactcaaag gaattgacgg

840

ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacca

900

agtcttgaca tccccctgac gggccggtaa cgcgggcgtt tcattgggta gaggtagaca

960

ggtggagcat gggcgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1020

cgcaaccctt atccttagta gccagcacgt gaaggtgggc actctaggga gactgccagg

1080

gataacctgg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg atttgggcta

1140

cacacgtgct acaatggcgt aaacaaaggg aagcgagaca gtgatgtgga gcaaatccca

1200

aaaataacgt cccagttcgg actgtagtct gcaacccgac tacacgaagc tggaatcgct

1260

agtaatcgcg aatcagaatg tcgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg

1320

tcacaccatg ggagtcagca acgcccgaag tcagtgaccc aaccgaaagg

1370

<210> 573

<211> 1521

<212> DNA

<213> Clostridium coccoides

<400> 573

tttgagtttg atcctggctc aggatgaacg ctggcggcgt gcttaacaca tgcaagtcga

60

gcgaagcgct aagacagatt tcttcggatt gaagtctttg tgactgagcg gcggacgggt

120

gagtaacgcg tgggtaacct gcctcataca gggggataac agttagaaat gactgctaat

180

accgcataag cgcacaggac cgcatggtct ggtgtgaaaa actccggtgg tatgagatgg

240

acccgcgtct gattagctag ttggaggggt aacggcccac caaggcgacg atcagtagcc

300

ggcctgagag ggtgaacggc cacattggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg

360

cagcagtggg gaatattgca caatggggga aaccctgatg cagcgacgcc gcgtgaagga

420

agaagtatct cggtatgtaa acttctatca gcagggaaga aaatgacggt acctgactaa

480

gaagccccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggggca agcgttatcc

540

ggatttactg ggtgtaaagg gagcgtagac ggaagagcaa gtctgatgtg aaaggctggg

600

gcttaacccc aggactgcat tggaaactgt tgttctagag tgccggagag gtaagcggaa

660

ttcctagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttaggaggaa caccagtggc gaaggcggct

720

tactggacgg taactgacgt tgaggctcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc

780

ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgaatac taggtgtcgg gtggcaaagc cattcggtgc

840

cgcagcaaac gcaataagta ttccacctgg ggagtacgtt cgcaagaatg aaactcaaag

900

gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag

960

aaccttacca agtcttgaca tccctctgac cgtcccgtaa cgggggcttc ccttcggggc

1020

agaggagaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc

1080

ccgcaacgag cgcaaccctt atccttagta gccagcacat gatggtgggc actctaggga

1140

gactgccggg gataacccgg aggaaggcgg ggacgacgtc aaatcatcat gccccttatg

1200

atttgggcta cacacgtgct acaatggcgt aaacaaaggg aagcgagaca gcgatgttga

1260

gcgaatccca aaaataacgt cccagttcgg actgcagtct gcaactcgac tgcacgaagc

1320

tggaatcgct agtaatcgcg gatcagaatg ccgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac

1380

acaccgcccg tcacaccatg ggagtcagta acgcccgaag tcagtgacct aaccgaaagg

1440

aaggagctgc cgaaggcggg accgataact ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtatc

1500

ggaaggtgcg gctggatccc c

1521

<210> 574

<211> 1462

<212> DNA

<213> Clostridium cochlearium

<220>

<221> modified_base

<222> (1)..(2)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (289)..(289)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (523)..(523)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (930)..(943)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (967)..(967)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1136)..(1136)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1213)..(1213)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1363)..(1363)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1383)..(1383)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1458)..(1458)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 574

nnttaaattg agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg

60

caagtcgagc gatgaagctt ccttcgggaa gtggattagc ggcggacggg tgagtaacac

120

gtgggcaacc tgcctcaaag aggggaatag ccctccgaaa ggaggattaa taccgcataa

180

agttagagtt tcgcatgaaa ctttaaccaa aggagtaatc tgctttgaga tgggcccgcg

240

tcccattagc tagttggtaa ggtaatggct taccaaggca acgatgggna gccgacctga

300

gagggtgatc ggccacattg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcgcaatggg ggaaaccctg acgcagcaac gccgcgtggg tgatgaaggt

420

tttcggatcg taaaaccctg ttttctggga cgataatgac ggtaccagat gaggaagcca

480

cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg gcnagcgttg tccggattta

540

ctgggcgtaa agggtgcgta ggcggatgct taagtgagat gtgaaatacc taggcttaac

600

ttaggggctg catttcaaac tgggcatcta gagtacagga gagggaaacg gaattcctag

660

tgtagcggtg aaatgcgtag agattaggaa gaacaccagt ggcgaaggcg gtttcctgga

720

ctgtaactga cgctgaggca cgaaagcgtg ggtagcaaac aggattagat accctggtag

780

tccacgccgt aaacgatgaa tactaggtgt aggagggtcc aaccttctgt gccgcagtta

840

acacattaag tattccgcct ggggagtacg gtcgcaagac taaaactcaa aggaattgac

900

gggggcccgc acaagcagcg gagcatgtgn nnnnnnnnnn nnnaacgcga agaaccttac

960

ctggacntga catcccctga attactcgta actgaggaaa tctcttcgga gacagggaga

1020

caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc ttattattag ttgctaccat taagttgagc actctaatga gactgnccgg

1140

gtgaaccggg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg tccagggcta

1200

cacacgtgct acnatggtgg gtacagagag aagcgatacc gcgaggtgga gcaaatctca

1260

aaaacccatc ccagttcgga ttgcaggctg aaactcgcct gcatgaagcc ggagttgcta

1320

gtaatcgcaa atcagaatgt tgcggtgaat acgttcccgg gcnttgtaca caccgcccgt

1380

canaccatga gagttggcaa cacccgaagt ccgtgaggta accgtaagga gccagcggcc

1440

gaaggtgggg ttaatgantg gg

1462

<210> 575

<211> 1489

<212> DNA

<213> Clostridium cocleatum

<400> 575

ctcaggatga acgctggcgg cgtgcctaat acatgcaagt cgaacgcggg cacttgtgcc

60

cgagtggcga acgggtgagt aatacataag taacctggcc tttacagggg gataactgct

120

ggaaacggta gctaagaccg cataggtagg gacactgcat ggtgaccgta ttaaaagtgc

180

tgcaaggcac tggtagagga tggacttatg gcgcattagc tggttggtga ggtaacggct

240

caccaaggcg acgatgcgta gccgacctga gagggtgacc ggccacactg ggactgagac

300

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatttt cggcaatggg gggaaccctg

360

accgagcaac gccgcgtgaa ggaagaagga attcgttctg taaacttctg ttataaagga

420

agaaaggcgg atggaggaaa tgacatccga gtgacggtac tttatgagaa agccacggct

480

aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag cgttatccgg aattattggg

540

cgtaaagagg gagcaggcgg cagcaaaggt ctgtggtgaa agactgaagc ttaacttcag

600

taagccatag aaaccaggca gctagagtgc aggagaggat cgtggaattc catgtgtagc

660

ggtgaaatgc gtagatatat ggaggaacac cagtggcgaa ggcgacgatc tggcctgtaa

720

ctgacgctca gtcccgaaag cgtggggagc aaataggatt agatacccta gtagtccacg

780

ccgtaaacga tgagtactaa gtgttggaag tcaaatttca gtgctgcagt taacgcagta

840

agtactccgc ctgagtagta gcttcgcaag aatgaaactc aaaggaattg acgggggccc

900

gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt

960

gacatactca taaaggatcc agagatggat agatagttat atgagataca ggtggtgcat

1020

ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt

1080

atcgttagtt accatcatta agttggggac tctagcgaga ctgccagtga caagctggag

1140

gaaggcgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca cacgtgctac

1200

aatggatggt gcagagggaa gcgaagccgc gaggcgaagc aaaacccata aaaccattct

1260

cagttcggat tgtagtctgc aactcgacta catgaagttg gaatcgctag taatcgcgaa

1320

tcagcatgtc gcggtgaata cgttctcggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatgag

1380

agttgataac acccgaagcc ggtggcctaa ccgaaaggaa ggagctgtct aaggtgggat

1440

tgatgattgg ggtgaagtcg taacaaggta tccctacggg aacgtgggg

1489

<210> 576

<211> 1451

<212> DNA

<213> Clostridium colicanis

<220>

<221> modified_base

<222> (729)..(729)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (873)..(873)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 576

agtcgagcga tgaaattttc ttcggaaatg gattagcggc ggacgggtga gtaacacgtg

60

ggtaacctgc cctatagaga gggatagcct tccgaaaggg agattaatac ctcataatat

120

cctagtatcg catgatacat ggattaaagg agcaatccgc tataggatgg acccgcggcg

180

cattagctag ttggtgaggt aacggctcac caaggcgacg atgcgtagcc gacctgagag

240

ggtgatcggc cacattggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg

300

gaatattgca caatggggga aaccctgatg cagcaacgcc gcgtgagtga tgacggtctt

360

cggattgtaa agctctgtct ttagggacga taatgacggt acctaaggag gaagccacgg

420

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttactg

480

ggcgtaaagg gagcgtaggc ggatctttaa gtgggatgtg aaatactcgg gctcaacctg

540

ggggctgcat tccaaactgg ggatctagag tacaggaggg gagagtggaa ttcctagtgt

600

agcggtgaaa tgcgtagaga ttaggaagaa caccagtggc gaaggcgact ctctggactg

660

taactgacgc tgaggctcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

720

acgccgtana cgatgaatac taggtgtagg gggtgtcaac tccccctgtg ccgccgctaa

780

cgcattaagt attccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt aaaactcaaa ggaattgacg

840

ggggcccgca caagtagcgg agcatgtggt ttnattcgac gcacgcgaag aacttaccta

900

gacttgacat cttctgcatt acccttaatc ggggaagttc cttcggggac agaatgacag

960

gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1020

gcaaccctta ttgttagttg ctaccattta gttgagcact ctagcgagac tgcccgggtt

1080

aaccgggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtct agggctacac

1140

acgtgctaca atggccggta cagaaagacg cgataccgcg aggtggagca aaactttaaa

1200

accggtctca gttcggattg taggctgaaa ctcgcctaca tgaagctgga gttactagta

1260

atcgcgaatc agcatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac

1320

accatgagag ttggcaatac ccaaagttcg tgagctaacc gcaaggaggc agcgacctaa

1380

ggtagggtca gcgattgggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtaggagaa cctgcggctg

1440

gatcacctcc t

1451

<210> 577

<211> 1473

<212> DNA

<213> Clostridium colinum

<400> 577

cggcgtgcct aacacatgca agtcgagcgg agttttatgg gagcttgctt ttataaaact

60

tagcggcgga cgggtgagta acgcgtgggt aacctgccct atacacaggg ataacattga

120

gaaattgatg ctaatacctg ataagccaac agtaggcatc tacaagttgg aaaaactgag

180

gtggtatagg aggggcccgc gtctgattag ctagttggtg gggtaaaggc ctaccaaggc

240

gacgatcagt agccgacctg agagggtgat cggccacatt ggaactgaga cacggtccaa

300

actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcaa

360

cgccgcgtga aggaagaagt atttcggtat gtaaacttct atcgacaggg aagaaataaa

420

tgacggtacc tgaataagaa gcaccggcta aatacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

480

tggtgcaagc gttatccgga tttactgggt gtaaagggtg agtaggcggt tatgcaagtc

540

atatgtgaaa ttctggggct caacctcagg gctgcataag aaactgtgta actagagtac

600

aggagaggta agcggaattc ctagtgtagc ggtgaaatgc gtagatatta ggaagaacac

660

cggtggcgaa ggcggcttac tggactgaaa ctgacgctga gtcacgaaag cgtggggagc

720

gaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag gtgttgggaa

780

gagattctcg gtgccgcagc aaacgcaata agcactccac ctggggagta cgaccgcaag

840

gttgaaactc aaaggaattg acggggaccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

900

aagcaacgcg aagaacctta cctaaacttg acatcccgat gacaatctgt gtaatgcaga

960

ctttcttcgg aacatcggtg acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1020

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctattctta gtagccagca wttcggatgg

1080

gcactctagg gagactgccg tggataacac ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc

1140

atgcccctta tgtttagggc tacacacgtg ctacaatggc tgtaacaaag tgaagcaaga

1200

tagtgatatg gagcaaagca caaaaaagca gtcccagttc ggattgtagt ctgcaactcg

1260

actacatgaa gttggaatcg ctagtaatcg cgaatcagaa tgtcgcggtg aatacgttcc

1320

cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagttgg aagcgcccga agcctgtgac

1380

ctaaccgcaa ggaggagcag tcgaaggtga agccagtgac tggggtgaag tcgtaacaag

1440

gtagccgtat cggaaggtgc gctgatcacc tcc

1473

<210> 578

<211> 1365

<212> DNA

<213> Clostridium difficile

<220>

<221> modified_base

<222> (1347)..(1347)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1352)..(1353)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 578

ttgagcgatt tacttcggta aagagcggcg gacgggtgag taacgcgtgg gtaacctacc

60

ctgtacacac ggataacata ccgaaaggta tgctaatacg ggataatata tttgagaggc

120

atctcttgaa tatcaaaggt gagccagtac aggatggacc cgcgtctgat tagctagttg

180

gtaaggtaac ggcttaccaa ggcgacgatc agtagccgac ctgagagggt gatcggccac

240

attggaactg agacacggtc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa

300

tgggcgaaag cctgatgcag caacgccgcg tgagtgatga aggccttcgg gtcgtaaaac

360

tctgtcctca aggaagataa tgacggtact tgaggaggaa gccccggcta actacgtgcc

420

agcagccgcg gtaatacgta gggggctagc gttatccgga tttactgggc gtaaagggtg

480

cgtaggcggt ctttcaagtc aggagtgaaa ggctacggct caaccgtagt aagctcttga

540

aactgggaga cttgagtgca ggagaggaga gtggaattcc tagtgtagcg gtgaaatgcg

600

tagatattag gaggaacacc agttgcgaag gcggctctct ggactgtaac tgacgctgag

660

gcacgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc tgtaaacgat

720

gagtactagg tgtcgggggt tacccccttc ggtgccgcag ctaacgcatt aagtactccg

780

cctgggaagt acgctcgcaa gagtgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagta

840

gcggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct tacctaagct tgacatccca

900

atgacatctc cttaatcgga aagttccctt cggggagatt ggggacagag gggaattgct

960

tgtgtagcgc tggtatgggg agatattggg ataagtcccg caacgagcgc aacccttgtc

1020

tttagttgcc atcattaagt tgggcactct agagagactg ccagggataa cctggaggaa

1080

ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgcttag ggctacacac gtgctacaat

1140

gggtagtaca gagggttgcc aagccgtaag gtggagctaa tcccttaaag ctactctcag

1200

ttcggattgt aggctgaaac tcgcctacat gaagctggag ttactagtaa tcgcagatca

1260

gaatgctgcg gtgaatgcgt tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgggagt

1320

tggagacgcc cgaagccgat tatctancct tnngaagaag tcgtc

1365

<210> 579

<211> 1379

<212> DNA

<213> Clostridium disporicum

<220>

<221> modified_base

<222> (14)..(14)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (28)..(29)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 579

tcgagcgagt ggangttctt cggaacanna gctagcggcg gacgggtgag taacacgtgg

60

gcaacctgcc tcatagaggg gaatagcctc ccgaaaggga gattaatacc gcataagatt

120

gtagcttcgc atgaagtagc aattaaagga gcaatccgct atgagatggg cccgcggcgc

180

attagctagt tggtgaggta acggctcacc aaggcgacga tgcgtagccg acctgagagg

240

gtgatcggcc acattgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

300

aatattgcac aatgggggaa accctgatgc agcaatgccg cgtgagtgat gacggccttc

360

gggttgtaaa gctctgtctt cggggacgat aatgacggta cccgaggagg aagccacggc

420

taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg taggtggcaa gcgttgtccg gatttactgg

480

gcgtaaaggg agcgtaggcg gatttttaag tgagatgtga aatacccggg cttaacttgg

540

gtgctgcatt tcaaactgga agtctagagt gcaggagagg agaagggaat tcctagtgta

600

gcggtgaaat gcgtagagat taggaagaac accagtggcg aaggcgcttc tctggactgt

660

aactgacgct gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

720

cgccgtaaac gatgaatact aggtgtaggg gttgtcatga cctctgtgcc gccgctaacg

780

cattaagtat tccgcctggg gagtacggtc gcaagattaa aactcaaagg aattgacggg

840

ggcccgcaca agcagcggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccta

900

gacttgacat ctcctgaatt acccgtaact ggggaagtcg cttcggcgac aggaagacag

960

taggtgcatg gaagtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1020

gcaaccctta ttgttagttg ctaccattta gttgagcact ctagcgagac tgcccgggtt

1080

aaccgggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtct agggctacac

1140

acgtgctaca atggcaagta caaagagaag caagaccgcg aggtggagca aaactcaaaa

1200

acttgtctca gttcggattg taggctgaaa ctcgcctaca tgaagctgga gttgctagta

1260

atcgcgaatc agcatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac

1320

accatgagag ttggcaatac ccaaagtgcg tgatctaact cgcaagagag gaagcgccc

1379

<210> 580

<211> 1473

<212> DNA

<213> Clostridium estertheticum

<400> 580

cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc gatgcgatcc

60

ttcggggtca attagcggcg gacgggtgag taacacgtgg gtaacctgcc tcaaagaggg

120

gaatagcctc ccgaaaggga gattaatacc gcataatatg ttttgatcgc atgatcttaa

180

catcaaagga atttttcgga atttcacttt gagatggacc cgcggcgcat tagctagttg

240

gtgaggtaaa ggcccaccaa ggcaacgatg cgtagccgac ctgagagggt gatcggccac

300

attggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcgcaa

360

tgggggaaac cctgacgcag caacgccgcg tgaatgatga aggccttcgg gttgtaaagt

420

tctgtcttct gggacgataa tgacggtacc agaggaggaa gccacggcta actacgtgcc

480

agcagccgcg gtaatacgta ggtggcaagc gttgtccgga tttactgggc gtaaaggatg

540

cgtaggcgga catttaagtc agatgtgaaa tacccgagct taacttgggt gctgcatttg

600

aaactgggtg tctagagtgc aggagaggta agtggaattc ctagtgtagc ggtgaaatgc

660

gtagagatta ggaagaacac cagtggcgaa ggcgacttac tggactgtaa ctgacgctga

720

ggcatgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga

780

tgaatactag gtgtcggggg tcgaacctcg gtgccgccgt taacacatta agtattccgc

840

ctggggagta cgatcgcaag attaaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcag

900

cggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt acctagactt gacatccctt

960

gcataactca gagatgagtg aagtccttcg ggacaaggtg acaggtggtg catggttgtc

1020

gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatcatta

1080

gttgctacca ttaagttgag cactctagtg agactgcccg ggttaaccgg gaggaaggtg

1140

gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gtctagggct acacacgtgc tacaatggtg

1200

agtacaaaga gatgcaagac cgcaaggtgg agccaaactc aaaaactcat cccagttcgg

1260

attgtaggct gcaactcgcc tacatgaagc cggagttgct agtaatcgcg aatcagcatg

1320

tcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg agagttggta

1380

acacccgaag tccgtgaggt aaccgtaagg agccagcggc cgaaggtggg atcgatgatt

1440

ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtagg aga

1473

<210> 581

<211> 1465

<212> DNA

<213> Clostridium fallax

<220>

<221> modified_base

<222> (1)..(3)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (164)..(164)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (238)..(238)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (337)..(338)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (421)..(421)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (523)..(523)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (858)..(858)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (935)..(935)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (939)..(945)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1151)..(1151)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1171)..(1172)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1360)..(1360)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1461)..(1462)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 581

nnntaaattg agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg

60

caagtcgagc gagagagttt tcttcggaaa actatctagc ggcggacggg tgagtaacac

120

gtgggtaacc tgcctcatag agggggatag cctcccgaaa gggngattaa taccgcataa

180

catcatttta gcgcatgctc aaatgatcaa aggagtaatc cgctatgaga tggacccncg

240

gcgcattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcc acgatgcgta gccgacctga

300

gagggtgatc ggccacattg ggactgagac acggccnnga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcaac gccgcgtgag tgatgacggc

420

nttcgggttg taaagctctg tctttaggga cgataatgac ggtacctaag gaggaagcca

480

cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg gcnagcgttg tccggattta

540

ctgggcgtaa agggagcgta ggtggattct taagtgagat gtgaaatacc cgggcttaac

600

ttgggtcctg catttcaaac tgggaatcta gagtgcagga gaggaaagtg gaattcctag

660

tgtagcggtg aaatgcgtag agattaggaa gaacaccagt ggcgaaggcg actttctgga

720

ctgtaactga cactgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag

780

tccacgccgt aaacgatgga tactaggtgt gggaggtatc aactccttcc gtgccgccgt

840

taacacatta agtatccngc ctggggagta cggtcgcaag attaaaactc aaaggaattg

900

acggggaccc gcacaagcag cggagcatgt ggttnaatnn nnnnnaacgc gaagaacctt

960

acctagactt gacatctcct gaattactct taatcgagga agcccttcgg ggacaggaag

1020

acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

1080

gagcgcaacc cttattgtta gttgctacca tttagttgag cactctagcg agactgcccg

1140

ggttaaccgg naggaaggtg gggatgacgt nnaatcatca tgccccttat gtctagggct

1200

acacacgtgc tacaatggct ggtacaaaga gaagcaagac cgtgaggtgg agcaaaactc

1260

aaaaaccagt cccagttcgg attgtaggct gaaactcgcc tacatgaagc cggagttgct

1320

agtaatcgcg aatcagcatg tcgcggtgaa tacgttcccn ggtcttgtac acaccgcccg

1380

tcacaccatg agagttggca atacccgaag tctgtgagct aacctgtaaa gggggcaacg

1440

gccgaaggta gggtcagcga nnggg

1465

<210> 582

<211> 1011

<212> DNA

<213> Clostridium favososporum

<220>

<221> modified_base

<222> (8)..(8)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (855)..(855)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (929)..(929)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (943)..(943)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (945)..(947)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (949)..(949)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (991)..(991)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 582

gcgatgantt tccttcggga aacggattag cggcggacgg gtgagtaaca cgtgggtaac

60

ctgccttata gtgggggata gcctttcgaa aggaagatta ataccgcata agattgtagt

120

atcgcatgat atagcaatta aaggagcaat ccgctataag atggacccgc gtcgcattag

180

ctagttggtg aggtaatggc tcaccaaggc gacgatgcgt agccgacctg agagggtgat

240

cggccacatt gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

300

tgcacaatgg gcgaaagcct gatgcagcaa cgccgcgtga gtgatgacgg ccttcgggtt

360

gtaaaactct gtcttcaggg acgataatga cggtacctga ggaggaagcc acggctaact

420

acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgtt gtccggattt actgggcgta

480

aagggagcgt aggcggatgt ttaagtggga tgtgaaatac tcgggctcaa cttgagtgct

540

gcattccaaa ctggatatct agagtgcagg agaggaaagg agaattccta gtgtagcggt

600

gaaatgcgta gagattagga agaataccag tggcgaaggc gcctttctgg actgtaactg

660

acgctgaggc tcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg

720

taaacgatga atactaggtg taggggttgt catgacctct gtgccgccgc taacgcatta

780

agtattccgc ctggggagta cggtcgcaag attaaaactc aaaggaattg acgggggccc

840

gcacaagcag cggancatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt acctagactt

900

gacatctcct gaattactct gtaatggang aagctcttcg gancnnnana caggtggtgc

960

atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ntgggttaag tcccgcaacg a

1011

<210> 583

<211> 1439

<212> DNA

<213> Clostridium felsineum

<400> 583

aacgctggcg gcgtgcttaa cacatgcaag tcgagcgggg aacttcggtt cccagcggcg

60

gacgggtgag taacacgtgg gtaacctgcc tcatagtggg gaatagcctt ccgaaaggaa

120

gattaatacc gcataatact cggaaatcac atgatttctg agccaaagga tttattcgct

180

atgagatgga cccgcggcgc attagcttgt tggtgaggta acggctcacc aaggcttcga

240

tgcgtagccg acctgagagg gtgatcggcc acattggaac tgagacacgg tccagactcc

300

tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatgggggaa accctgatgc agcaacgccg

360

cgtgagtgat gaaggtcttc ggatcgtaaa actctgtctt atgggacgat gatgacggta

420

ccataggagg aagccacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg taggtggcaa

480

gcgttgtccg gatttactgg gcgtaaagga tgtgtaggcg gatatttaag tgagatgtga

540

aatccccggg cttaacttgg gggctgcatt tcaaactgga tgtctggagt gcaggagagg

600

aaggcagaat tcctagtgta gcggtgaaat gcgtagagat taggaagaat accagtggcg

660

aaggcggcct tctggactgt aactgacgct gaggcatgaa agcgtgggga gcaaacagga

720

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatact aggtgtagga ggtatcgact

780

ccttctgtgc cgcagttaac acaataagta ttccgcctgg gaagtacggt cgcaagatta

840

aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcagcgga gcatgtggtt taattcgaag

900

caacgcgaag aaccttacct agacttgaca tctcctgaat tagtccgtaa tggatgaagt

960

cccttcgggg acaggatgac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

1020

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcattagt tgctaacatt tagttgagca

1080

ctctagtgag actgcccggg ttaaccggga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg

1140

ccccttatgt ctagggctac acacgtgcta caatggtagg gacaaaaaga tgctataccg

1200

caaggtggag ctaaactcaa aaccctatcc cagttcggat tgtaggctga aactcgccta

1260

catgaagccg gagttgctag taatcgcgaa tcagaatgtc gcggtgaata cgttcccggg

1320

tcttgtacac accgcccgtc acaccatgag agtcggcaac acccgaagcc cgtgaggtaa

1380

ccttttggaa ccagcggtcg aaggtggggt tgatgattgg ggtgaagtcg taacaaggt

1439

<210> 584

<211> 1481

<212> DNA

<213> Clostridium frigidicarnis

<400> 584

agagtttgat cctggctcag gatgaatgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgagc

60

gagagagtct cttcggagac aatagcggcg gacgggtgag taacacgtgg gcaacctgcc

120

ttgtagtggg ggatagccct ccgaaaggag gattaatacc gcatattgtc acattgaggc

180

atctcaaagt gatgaaagga gtaatccgct acaagatggg cccgcggcgc attagctagt

240

tggtgaggta acggctcacc aaggcgacga tgcgtagccg acctgagagg gtgatcggcc

300

acattgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac

360

aatgggggaa accctgatgc agcaacgccg cgtgagtgat gaaggtcttc ggattgtaaa

420

gctctgtctt cggggacgat aatgacggta cccgaggagg aagccacggc taactacgtg

480

ccagcagccg cggtaatacg taggtggcaa gcattatccg gatttactgg gcgtaaaggg

540

tgcgtaggcg gatttttaag tgagatgtga aatacccggg ctcaacctgg gggctgcatt

600

tcaaactgga aatctagagt gcaggagagg aaagtggaat tcctagtgta gcggtgaaat

660

gcgtagagat taggaagaac accagtggcg aaggcgactt tctggactgt aactgacgct

720

gaggcacgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac

780

gatggatact aggtgtggga ggtttaactc cttccgtgcc gccgttaaca cattaagtat

840

cccgcctggg gagtacggtc gcaagattaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

900

agtagcggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccta gacttgacat

960

gtcctgaatt accagtaatg tgggaagtcc ttcggggaca ggaacacagg tggtgcatgg

1020

ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat

1080

tgttagttgc taccattaag ttgagcactc tagcgagact gcctgggata accaggagga

1140

aggcggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgtcta gggctacaca cgtgctacaa

1200

tggcaagtac aaagagatgc aagaccgcga ggtggagcta aactcataaa acttgtctca

1260

gttcggattg taggctgaaa ctcgcctaca tgaagctgga gttactagta atcgcgaatc

1320

agaatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgagag

1380

ttggcaatac ccaacgtccg tgagctaacc tgtaagggag gcagcggcct aaggtagggt

1440

cagcgattgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtaggag a

1481

<210> 585

<211> 1483

<212> DNA

<213> Clostridium gasigenes

<400> 585

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc

60

gagaggagtt cttcggaacg aatctagcgg cggacgggtg agtaacacgt gggcaaccta

120

ccttatagag gggaatagcc ttccgaaagg aagattaata ccgcataaca ttgcagtttc

180

gcatgaaaca gcaattaaag gagaaatccg ctataagatg ggcccgcggc gcattagcta

240

gttggtgagg taaaggctca ccaaggcgac gatgcgtagc cgacctgaga gggtgatcgg

300

ccacattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc

360

acaatggggg aaaccctgat gcagcaacgc cgcgtgagtg atgaaggttt tcggatcgta

420

aaactctgtc tttggggacg ataatgacgg tacccaagga ggaagccacg gctaactacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttgtc cggatttact gggcgtaaag

540

ggagcgtagg tggattttta agtgaggtgt gaaatactcg ggctcaaccc gagaactgca

600

tttcaaactg gaaatctaga gtgcaggaga ggaaagtgga attcctagtg tagcggtgaa

660

atgcgtagat attaggaaga acaccagtgg cgaaggcgac tttctggact gtaactgaca

720

ctgaggctcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa

780

acgatgaata ctaggtgtgg gggttgtcat gacctccgtg ccgccgctaa cgcattaagt

840

attccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca

900

caagcagcgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc tagacttgac

960

atctcctgaa ttacccgtaa ttggggaagt ggcttcggcc acaggaagac aggtggtgca

1020

tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct

1080

tattgttagt tgccatcatt tagttgggca ctctagcgag actgcccggg ttaaccggga

1140

ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgt ctagggctac acacgtgcta

1200

caatggcaag tacaaagaga agcaagaccg cgaggtggag ccaaactata aaacttgtct

1260

cagttcggat tgcaggctga aactcgcctg catgaagctg gagttgctag taatcgcgaa

1320

tcagcatgtc gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacgag

1380

agttggcaat acccaaagtt cgtgagctaa cccgcaaggg aggcagcgac ctaaggtagg

1440

gtcagcgatt ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtagg aga

1483

<210> 586

<211> 1359

<212> DNA

<213> Clostridium ghonii

<400> 586

tcgagcgaac ccttcggggt gagcggcgga cgggtgagta acgcgtgggt aacctgccct

60

gtacacacgg ataacatacc gaaaggtatg ctaatacggg ataacatatg agagtcgcat

120

ggcttttgta tcaaagctcc ggcggtacag gatggacccg cgtctgatta gctagttggt

180

aaggtaacgg cttaccaagg caacgatcag tagccgacct gagagggtga tcggccacat

240

tggaactgag acacggtcca aactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg

300

ggcgaaagcc tgatgcagca acgccgcgtg agcgatgaag gccttcgggt cgtaaagctc

360

tgtcctcaag gaagataatg acggtacttg aggaggaagc cccggctaac tacgtgccag

420

cagccgcggt aatacgtagg gggctagcgt tatccggaat tactgggcgt aaagggtgcg

480

taggcggtct ttcaagccag aagtgaaagg ctacggctca accgtagtaa gcttttggaa

540

ctgtaggact tgagtgcagg agaggagagt ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta

600

gatattagga ggaacaccag tagcgaaggc ggctctctgg actgtaactg acgctgaggc

660

acgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga

720

gtactaggtg tcgggggtta cccccctcgg tgccgcagct aacgcattaa gtactccgcc

780

tgggaagtac gctcgcaaga gtgaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagtagc

840

ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta cctaagcttg acatcccatt

900

gacctctccc taatcggaga tttcccttcg gggacagtgg tgacaggtgg tgcatggctg

960

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttggggt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgcctt

1020

tagttgccag cattaagttg ggcactctag agggactgcc gaggataact cggaggaagg

1080

tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgcttaggg ctacacacgt gctacaatgg

1140

gtggtacaga gggttgccaa gccgtgaggt ggagctaatc ccttaaagcc attctcagtt

1200

cggattgtag gctgaaactc gcctacatga agctggagtt actagtaatc gcagatcaga

1260

atgctgcggt gaatgcgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg

1320

ggggcgcccg aagccggtta gctaaccttt taggaagcg

1359

<210> 587

<211> 1333

<212> DNA

<213> Clostridium glycolicum

<400> 587

ttcggagaag agcggcggac gggtgagtaa cgcgtgggta acctgcctca tacacatgga

60

taacataccg aaaggtatgc taatacagga taacataaga gattcgcatg tttctcttat

120

caaagctccg gcggtatgag atggacccgc gtctgattag ctagttggta aggtaatggc

180

ttaccaaggc gacgatcagt agccgacctg agagggtgat cggccacatt ggaactgaga

240

cacggtccaa actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgaaagcct

300

gatgcagcaa cgccgcgtga gtgatgaagg ccttcgggtc gtaaaactct gtcctcaagg

360

aagataatga cggtacttga ggaggaagcc ccggctaact acgtgccagc agccgcggta

420

atacgtaggg ggctagcgtt atccggttta ctgggcgtaa agggtgcgta ggtggtttct

480

taagtcagga gtgaaaggta cggcttaacc gtagtaagct cttgaaactg ggaaacttga

540

gtgcaggaga ggaaagtgga attcctagtg tagcggtgaa atgcgtagat attaggagga

600

acaccagtag cgaaggcggc tttctggact gtaactgaca ctgaggcacg aaagcgtggg

660

gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagta ctaggtgtcg

720

ggggttaccc ccctcggtgc cgcagctaac gcattaagta ctccgcctgg ggagtacgct

780

cgcaagagtg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagtagcgga gcatgtggtt

840

taattcgaag caacgcgaag aaccttacct aagcttgaca tccttttgac cgatgcctaa

900

tcgcattttt cccttcgggg acagaagtga caggtggggc atgggagtcg tcagctcgtg

960

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgcctttag ttgccagcat

1020

taagttgggc actctagagg gactgccagg gataacctgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1080

aaatcatcat gccccttatg cttagggcta cacacgtgct acaatgggtg gtacagaggg

1140

cagccaagtc gtgaggccga gctaatccct taaagccatt ctcagttcgg attgtaggct

1200

gaaactcgcc tacatgaagc tggagttact agtaatcgca gatcagaatg ctgcggtgaa

1260

tgcgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg gaagttgggg gcgcccgaag

1320

ccacttagct aac

1333

<210> 588

<211> 956

<212> DNA

<213> Clostridium glycyrrhizinilyticum

<220>

<221> modified_base

<222> (907)..(907)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (935)..(935)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 588

tcgaacgaag cactttaccg gatttcttcg gaatgaaagt tttgtgactg agtggcggac

60

gggtgagtaa cgcgtgggta acctgcctca tacaggggga taacagttag aaatgactgc

120

taataccgca taagaccaca ggattgcatg gtccggtggt aaaaactccg gtggtatgag

180

atggacccgc gtctgattag gtagttggtg gggtaacggc ttaccaagcc gacgatcagt

240

agccgacctg agagggtgac cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg

300

gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga

360

gcgatgaagt atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctga

420

ctaagaagca ccggctaaat acgtgccagc agccgcggta atacgtatgg tgcaagcgtt

480

atccggattt actgggtgta aagggagcgt agacggagag gcaagtctga tgtgaaaacc

540

cggggctcaa ccccgggact gcattggaaa ctgtttttct agagtgtcgg agaggtaagt

600

ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta gatattagga ggaacaccag tggcgaaggc

660

ggcttactgg acgatgactg acgttgaggc tcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga

720

taccctggta gtccacgccg taaacgatga ctgctaggtg tcgggaggca aagcctttcg

780

gtgccgcagc aaacgcaata agcagtccac ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc

840

aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc

900

gaagaanctt acctgccctt gacatccggc tgacnggcga gtaatgtcgc ctttcc

956

<210> 589

<211> 1465

<212> DNA

<213> Clostridium haemolyticum

<400> 589

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc gatgaaactt ccttcgggaa

60

gtggattagc ggcggacggg tgagtaacac gtgggtaacc tgcctcaaag agggggatag

120

cctcccgaaa gggagattaa taccgcataa cattatttta tggcatcata gaataatcaa

180

aggagcaatc cgctttgaga tggacccgcg gcgcattagc tagttggtga ggtaagggct

240

caccaaggcg acgatgcgta gccgacctga gagggtgatc ggccacattg gaactgagac

300

acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcgcaatggg ggaaaccctg

360

acgcagcaac gccgcgtgag tgatgaaggt tttcggatcg taaaactctg tctttaggga

420

cgataatgac ggtacctaag gaggaagcca cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacgtaggtg gcaagcgttg tccggattta ctgggcgtaa agagtatgta ggtgggtgct

540

taagtcagat gtgaaattcc cgggcttaac ctgggcgctg catttgaaac tgggcatcta

600

gagtgcagga gaggaaagtg gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag agattaggaa

660

gaacaccagt ggcgaaggcg actttctgga ctgtaactga cactgagata cgaaagcgtg

720

ggtagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgaa tactaggtgt

780

cggggggtac caccctcggt gccgcagcaa acgcattaag tattccgcct ggggagtacg

840

gtcgcaagat taaaactcaa aggaattgac ggggacccgc acaagcagcg gagcatgtgg

900

tttaattcga agcaacgcga agaaccttac ctagacttga catctcctga attactctta

960

atcgaggaag tcccttcggg gacaggaaga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1020

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttattgttag ttgctactat

1080

taagttaagc actctaacga gactgccgcg gttaacgtgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1140

aaatcatcat gccccttatg tctagggcta cacacgtgct acaatggctg gtacaacgag

1200

cagcaaaccc gcgaggggga gcaaaacttg aaagccagtc ccagttcgga ttgtaggctg

1260

aaactcgcct acatgaagtt ggagttgcta gtaatcgcga atcagcatgt cgcggtgaat

1320

acgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagccggtaa cacccgaagc

1380

ccgtgaggta accgtaagga gccagcggtc gaaggtggga ttggtgattg gggtgaagtc

1440

gtaacaaggt agccgtagga gaacc

1465

<210> 590

<211> 1384

<212> DNA

<213> Clostridium hathewayi

<220>

<221> modified_base

<222> (19)..(19)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (939)..(939)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (942)..(942)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (980)..(980)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 590

gtcgagcgaa gcggtttcna tgaggttttc ggatggattt gaaattgact tagcggcgga

60

cgggtgagta acgcgtgggt aacctgcctt acactggggg ataacagtta gaaatgactg

120

ctaataccgc ataagcgcac agggccgcat ggtccggtgt gaaaaactcc ggtggtgtaa

180

gatggacccg cgtctgatta ggtagttggt ggggtaacgg cccaccaagc cgacgatcag

240

tagccgacct gagagggtga ccggccacat tgggactgag acacggccca aactcctacg

300

ggaggcagca gtggggaata ttggacaatg ggcgaaagcc tgatccagcg acgccgcgtg

360

agtgaagaag tatttcggta tgtaaagctc tatcagcagg gaagaaaatg acggtacctg

420

actaagaagc cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacagggg caagcgtccg

480

gattactggg tgtaaaggga gcgtaacggt ttagcaagtt gaagtgaaag cccggggctc

540

aaccccggta ctgctttgga aactgttaga cttgagtgca ggagaggtaa gtggaattct

600

agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattagg aggaacacca gtggcgaagg cggcttactg

660

gactgtaact gacgttgagg ctcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt

720

agtccacgcc gtaaacgatg aatactaggt gtcggggggc aaagcccttc ggtgccgccg

780

caaacgcaat aagtattcca cctggggagt acgttcgcaa gaatgaaact caaaggaatt

840

gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct

900

taccaagtct tgacatccca ttgaaaacaa gtttatccng antactctgt gcagaggggg

960

cgaaaacggt ggagcaagtn tgaagtcaac gcgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1020

acgagcgcaa cccttatcct tagtagccag cgagtagagt cgggcactct ggggagactg

1080

ccagggataa cctggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgatttg

1140

ggctacacac gtgctacaat ggcgtaaaca aagggaggca aaggagcgat ccggagcaaa

1200

ccccaaaaat aacgtctcag ttcggattgc aggctgcaac tcgcctgcat gaagctggaa

1260

tcgctagtaa tcgcgaatca gaatgtcgcg gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc

1320

gcccgtcaca ccatgggagt tggtaacgcc cgaagtcagt gacccaaccg caaggaggga

1380

gctg

1384

<210> 591

<211> 1393

<212> DNA

<213> Clostridium hiranonis

<400> 591

acatgcaagt cgagcgattc tcttcggaga agagcggcgg acgggtgagt aacgcgtggg

60

taacctgccc tgtacacacg gataacatac cgaaaggtat gctaatacgg gataatatat

120

aagagtcgca tgacttttat atcaaagatt tttcggtaca ggatggaccc gcgtctgatt

180

agcttgttgg cggggtaacg gcccaccaag gcgacgatca gtagccgacc tgagagggtg

240

atcggccaca ttggaactga gacacggtcc aaactcctac gggaggcagc agtggggaat

300

attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc aacgccgcgt gagcgatgaa ggccttcggg

360

tcgtaaagct ctgtcctcaa ggaagataat gacggtactt gaggaggaag ccccggctaa

420

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggggctagcg ttatccggat ttactgggcg

480

taaagggtgc gtaggcggtc tttcaagtca ggagttaaag gctacggctc aaccgtagta

540

agctcctgat actgtctgac ttgagtgcag gagaggaaag cggaattccc agtgtagcgg

600

tgaaatgcgt agatattggg aggaacacca gtagcgaagg cggctttctg gactgtaact

660

gacgctgagg cacgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgct

720

gtaaacgatg agtactagtt gtcggaggtt accccttcgg tgccgcagct aacgcattaa

780

gtactccgcc tggggagtac gcacgcaagt gtgaaactca aaggaattga cggggacccg

840

cacaagtagc ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta cctaggcttg

900

acatccttct gaccgaggac taatctcctc tttccctccg gggacagaag tgacaggtgg

960

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

1020

cccttgtctt tagttgccat cattaagttg ggcactctag agagactgcc agggataacc

1080

tggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgcctaggg ctacacacgt

1140

gctacaatgg gtggtacaga gggcagccaa gccgtgaggt ggagcaaatc ccttaaagcc

1200

attctcagtt cggattgtag gctgaaactc gcctacatga agctggagtt actagtaatc

1260

gcagatcaga atgctgcggt gaatgcgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc

1320

atgggagttg gagacacccg aagccgacta tctaaccttt tgggagaagt cgtccccctc

1380

gaatcaatac ccc

1393

<210> 592

<211> 1460

<212> DNA

<213> Clostridium histolyticum

<400> 592

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgagc gatgaagttc ccttcgggga

60

acggattagc ggcggacggg tgagtaacac gtgggtaacc tgcctcaaag agggggatag

120

cctcccgaaa gggagattaa taccgcataa tatcttttta atgcatgtta gaaagattaa

180

aggagcaatc cgctttgaga tggacccgcg gcgcattagc tagttggtga ggtaacggct

240

caccaaggcg acgatgcgta gccgacctga gagggtgatc ggccacattg ggactgagac

300

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcgcaatggg ggaaaccctg

360

acgcagcaac gccgcgtgag tgatgaaggt cttcggatcg taaagctctg tcttcaggga

420

cgataatgac ggtacctgag gaggaagcca cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacgtaggtg gcaagcgttg tccggattta ttgggcgtaa agcatgcgta ggcggatatt

540

taagtgggat gtgaaatccc ggggcttaac cccggtgctg catttcaaac tggatatcta

600

gagtgcagga gaggaaagcg gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag atattaggaa

660

gaacaccagt ggcgaaggcg gctttctgga ctgtaactga cgctgaggca tgaaagcgtg

720

ggtagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatggg tactaggtgt

780

cggggtttca atactccggt gccgcagtta acacattaag taccccgcct ggggagtacg

840

atcgcaagat taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagtagcg gagcatgtgg

900

tttaattcga agcaacgcga agaaccttac ctgggcttga catcccgaga atcctgtgga

960

aacataggag tgcccttcgg ggaactcggt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

1020

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac cctttgttgt tagttgctac

1080

cattaagttg agcactctag caagactgcc tgggtaacca ggaggaaggt ggggatgacg

1140

tcaaatcatc atgcccctta tgtccagggc tacacacgtg ctacaatggt tggtacagag

1200

agaagcaaga ccgtgaggtg gagccaatct cacaaagcca atctcagttc ggattgtagg

1260

ctgcaactcg cctacatgaa gctggagtta ctagtaatcg cgaatcagaa tgtcgcggtg

1320

aatgcgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgagagttgg taacacccga

1380

agtccgtgag gtaaccgtaa ggagccagcg gccgaaggtg ggatcgatga ttggggtgaa

1440

gtcgtaacag gtaaccgtaa

1460

<210> 593

<211> 1400

<212> DNA

<213> Clostridium hylemonae

<400> 593

tcgaacgaag caatactgtg tgaagagatt agcttgctaa gatcagaact ttgtattgac

60

tgagtggcgg acgggtgagt aacgcgtggg caacctgcct tacacagggg gataacagct

120

agaaatggct gctaataccg cataagacct cagtaccgca tggtagaggg gtaaaaactc

180

cggtggtgta agatgggccc gcgtctgatt aggtagttgg tagggtaacg gcctaccaag

240

ccgacgatca gtagccgacc tgagagggtg accggccaca ttgggactga gacacggccc

300

aaactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggggaaacc ctgatgcagc

360

gacgccgcgt gaaggatgaa gtatttcggt atgtaaactt ctatcagcag ggaagaagat

420

gacggtaccg actaagaagc cggctaacta cgtgccacag ccgcggtaat acgtaggggg

480

caagcgttat ccggatttac tgggtgtaaa gggagcgtag acggcatggc aagtctgaag

540

tgaaagcccg gggctcaacc ccgggactgc tttggaaact gtcaggctag agtgtcggag

600

aggcaagtgg aattcctagt gtagcggtga aatgcgtaga tattaggagg aacaccagtg

660

gcgaaggcgg cttgctggac gatgactgac gttgaggctc gaaagcgtgg ggagcaaaca

720

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgatt actaggtgtc gggaagcaaa

780

gcttttcggt gccgcagcca acgcaataag taatccacct ggggagtacg ttcgcaagaa

840

tgaaactcaa aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga

900

agcaacgcga agaaccttac ctgatcttga catccccggc atgaaaagtc tgaagtactc

960

tttcttcgga acaccggtga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

1020

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatctttag tagccagcat ttgaggtggg

1080

cactctagag agactgccag ggataacctg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca

1140

tgccccttat gaccagggct acacacgtgc tacaatggcg taaacaaagg gaagcgaccc

1200

tgtgaaggca agcaaatccc aaaaataacg tctcagttcg gattgtagtc tgcaactcga

1260

ctacatgaag ctggaatcgc tagtaatcgc gaatcagaat gtcgcggtga atacgttccc

1320

gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtcagt aacgcccgaa gccggtgacc

1380

taaccgaaag gaaggagccg

1400

<210> 594

<211> 994

<212> DNA

<213> Clostridium indolis

<220>

<221> modified_base

<222> (944)..(944)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (961)..(961)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 594

cggatggaat tccttaatga ctgagtggcg gacgggtgag taacgcgtgg ggaacctgcc

60

ctatacaggg ggataacagc tggaaacggc tgctaatacc gcataagcgc acagaatcgc

120

atgattcggt gtgaaaagct ccggcagtat aggatggtcc cgcgtctgat tagctggttg

180

gcggggtaac ggcccaccaa ggcgacgatc agtagccggc ttgagagagt ggacggccac

240

attgggactg agacacggcc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa

300

tggggggaac cctgatgcag cgacgccgcg tgagtgaaga agtatttcgg tatgtaaagc

360

tctatcagca gggaagaaaa aagacggtac ctgactaaga agccccggct aactacgtgc

420

cagcagccgc ggtaatacgt agggggcaag cgttatccgg aattactggg tgtaaagggt

480

gcgtaggtgg catggtaagt cagaagtgaa agcccggggc ttaaccccgg gactgctttt

540

gaaactgtca tgctggagtg caggagaggt aagcggaatt cctagtgtag cggtgaaatg

600

cgtagatatt aggaggaaca ccagtggcga aggcggctta ctggactgtc actgacactg

660

atgcacgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgaatacta ggtgtcgggg ccgtagaggc ttcggtgccg cagcaaacgc agtaagtatt

780

ccacctgggg agtacgttcg caagaatgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa

840

gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc

900

taactgaccg gttcgtaatg ggacctttcc ttcgggacag ttanacaggt ggtgcatggt

960

ngtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaa

994

<210> 595

<211> 1401

<212> DNA

<213> Clostridium innocuum

<220>

<221> modified_base

<222> (15)..(16)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1395)..(1395)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 595

tcgaacgaag tcttnnggaa gcttgcttcc aaaaagactt agtggcgaac gggtgagtaa

60

cacgtaggta acctgcccat gtgtccggga taactgctgg aaacggtagc taaaaccgga

120

taggtatacg gagcgcatgc tctgtatatt aaagcgccca tcaaggcgtg aacatggatg

180

gacctgcggc gcattagcta gttggtgagg taacggccca ccaaggcgat gatgcgtagc

240

cggcctgaga gggtaaacgg ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag

300

gcagcagtag ggaattttcg tcaatggggg aaaccctgaa cgagcaatgc cgcgtgagtg

360

aagaaggtct tcggatcgta aagctctgtt gtaagtgaag aacggctcat agaggaaatg

420

ctatgggagt gacggtagct taccagaaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

480

taatacgtag gtggcaagcg ttatccggaa tcattgggcg taaagggtgc gtaggtggcg

540

tactaagtct gtagtaaaag gcaatggctc aaccattgta agctatggaa actggtatgc

600

tggagtgcag aagagggcga tggaattcca tgtgtagcgg taaaatgcgt agatatatgg

660

aggaacacca gtggcgaagg cggtcgcctg gtctgtaact gacactgagg cacgaaagcg

720

tggggagcaa ataggattag ataccctagt agtccacgcc gtaaacgatg agaactaagt

780

gttggaggaa ttcagtgctg cagttaacgc aataagttct ccgcctgggg agtatgcacg

840

caagtgtgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagt atgtggttta

900

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg ccttgacatg gaaacaaata ccctagagat

960

agggggataa ttatggatca cacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1020

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcgca tgttaccagc atcaagttgg

1080

ggactcatgc gagactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc

1140

atgcccctta tggcctgggc tacacacgta ctacaatggc gaccacaaag agcagcgaca

1200

cagtgatgtg aagcgaatct cataaaggtc gtctcagttc ggattgaagt ctgcaactcg

1260

acttcatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg cagatcagca tgctgcggtg aatacgttct

1320

cgggccttgt acacaccgcc cgtcaaacca tgggagtcag taatacccga agccggtggc

1380

ataaccgtaa ggagngagcc g

1401

<210> 596

<211> 310

<212> DNA

<213> Clostridium irregulare

<220>

<221> modified_base

<222> (44)..(44)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (59)..(59)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (265)..(266)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 596

gacccgcgtc tgattagcta gttggtaagg taacggctta ccanggcgac gatcactanc

60

cgacctgaga gggtgatcgg ccacattgga actgaaacac ggtccaaact cctacgggag

120

gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg aaagcctgat gcaccaacgc cgcgtgagcg

180

atgaaggcct tcgggtcgta aagctctgtc ctcaaggaag ataatgacgg tacttgaaga

240

ggaagccccg gctaactacg tgccnncagc cgcggtaata cgtagggggc tagcgttatc

300

cggaattact

310

<210> 597

<211> 1023

<212> DNA

<213> Clostridium isatidis

<220>

<221> modified_base

<222> (923)..(923)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (940)..(940)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (967)..(967)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 597

cgaggtgatt ccttcgggaa tgaacctagc ggcggacggg tgagtaacac gtgggtaacc

60

tgccttatag aggggaatag cctcccgaaa gggagattaa taccgcataa tattgaagct

120

tcgcatgaag tttcaatcaa aggagcaatc cgctataaga tgggcccgcg gcgcattagc

180

tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatgcgta gccgacctga gagggtgatc

240

ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

300

gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcaac gccgcgtgag tgatgaaggt tttcggatcg

360

taaagctctg tcttcaggga cgataatgac ggtacctgag gaggaagcca cggctaacta

420

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg gcgagcgttg tccggattta ctgggcgtaa

480

agggagcgta ggcggacttt taagtgagat gtgaaatact cgggctcaac ccgggggctg

540

catttcaaac tgaaagtcta gagtgcagga gaggagagtg gaattcctag tgtagcggtg

600

aaatgcgtag agattaggaa gaacaccagt ggcgaaggcg gctctctgga ctgtaactga

660

cgctgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt

720

aaacgatgaa tactaggtgt aggggttgtc atgacctctg tgccgccgct aacgcattaa

780

gtattccgcc tggggagtac ggtcgcaaga ttaaaactca aaggaattga cgggggcccg

840

cacaagcagc ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta cctagacttg

900

acatctcctg cattaccctt aanccgggga agtcccttcn gggacaggat gacaggtggt

960

gcatggntgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1020

ccc

1023

<210> 598

<211> 1462

<212> DNA

<213> Clostridium kluyveri

<400> 598

ttaaaataag agtttgatcc tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgcct aacacatgca

60

agtcgagcga ggaagcccct tcgggggtgg aatagcggcg gacgggtgag taacacgtgg

120

gtaacctgcc tcaaagaggg ggatagcctc ccgaaaggga gattaatacc gcatagaagg

180

taaaaatcgc atgataaatg ccttaaagga gcaatccgct ttgagatggg cccgcgtcgc

240

attagctagt tggagggata aaagcccccc aaggcgacga tgcgtagccg acctgagagg

300

gtgaacggcc acattggaac tgagatacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

360

aatattgcac aatgggggaa accctgatgc agcaacgccg cgtgagtgaa gaaggttttc

420

ggatcgtaaa gctctgtcat ccgggacgat aatgacggta ccggaagagg aagccacggc

480

taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg taggtggcga gcgttgtccg gaattactgg

540

gcgtaaaggg tgtgcaggcg gatatttaag tgagatgtga aagacccggg cttaacccgg

600

gcagtgcatt tcaaactgga tatctagagt gcaggagagg agaacggaat tcctagtgta

660

gcggtgaaat gcgtagagat taggaagaac accagtggcg aaggcggttc tctggactgt

720

aactgacgct gaggcacgaa agcgtgggta gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

780

cgccgtaaac gatgagtact aggtgtaggg ggtatcgacc ccccctgtgc cgcagtaaac

840

acaataagta ctccgcctgg gaagtacgat cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg

900

ggacccgcac aagcagcgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacct

960

ggacttgaca tcccctgaat gactcgtaat ggaggaagcc ctacggggca gggagacagg

1020

tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttag gttaagtcct gcaacgagcg

1080

caacccctgt cgttagttgc cagcacgtaa aggtgggcac cctaacgaga ctgccgcggt

1140

taacgtggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgtc cagggcaaca

1200

cacgtgctac aatgggcaga acagagagaa gcaataccgc gaggaggagc aaatctcaaa

1260

aactgccccc agttcggatt gcaggctgaa acccgcctgc atgaagttgg agttgctagt

1320

aatcgcgaat cagcatgtcg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca

1380

caccatgaga gctggcaaca cccgaagtcc gtagtctaac caaggaggac gcggccgaag

1440

gtggggttag tgattggggt ga

1462

<210> 599

<211> 1361

<212> DNA

<213> Clostridium lactatifermentans

<400> 599

agagcttcgg caggatttct atctatctta gtggcggacg ggtgagtaac gtgtgggcaa

60

cctgccctgt actggggaat aatcattgga aacgatgact aataccgcat gtggtcctcg

120

gaaggcatct tctgaggaag aaaggattta ttcggtacag gatgggcccg catctgatta

180

gctagttggt gagataacag cccaccaagg cgacgatcag tagccgacct gagagggtga

240

tcggccacat tgggactgag acacggccca aactcctacg ggaggcagca gtggggaata

300

ttgcacaatg ggcgaaagcc tgatgcagca acgccgcgtg aaggatgaag ggtttcggct

360

cgtaaacttc tatcaatagg gaagaaataa atgacggtac ctaaataaga agccccggct

420

aactacggcc agcagccgcg gtaatactag ggggcaagcg ttatccggaa ttactgggtg

480

taaagggagc gtaggcggca tggtaagcca gatgtgaaag ccttgggctt aacccgagga

540

ttgcatttgg aactatcaag ctagagtaca ggagaggaaa gcggaattcc tagtgtagcg

600

gtgaaatgcg tagatattag gaagaacacc agtggcgaag gcggctttct ggactgaaac

660

tgacgctgag ctcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc

720

gtaaacgatg agtgctaggt gtcggggagg aatcctcggt gccgcagcta acgcaataag

780

cactccacct ggggagtacg accgcgaggt tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc

840

acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caaggcttga

900

catcccgatg accgctctag agatagagct tctcttcgta gcatcggtga ccgggggtgc

960

atgggagtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1020

ttatcttcag tagccatcat tcagttgggc actctggaga gactgccgtg gataacacgg

1080

aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg tcttgggcta cacacgtgct

1140

acaatggctg gtaacaaagt gacgcaagac ggcgacgtta agcaaatcac aaaaacccag

1200

tcccagttcg gattgtagtc tgcaactcga ctacatgaag ctggaatcgc tagtaatcgc

1260

gaatcagcat gtcgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat

1320

gggagttgga agcacccgaa gtcggtgacc taaccgtaag g

1361

<210> 600

<211> 1381

<212> DNA

<213> Clostridium lavalense

<220>

<221> modified_base

<222> (17)..(19)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 600

tcgaacgaag cattttnnna tgaagttttc ggatggattc tgagatgact gagtggcgga

60

cgggtgagta acacgtggat aacctgcctc acactggggg acaacagtta gaaatgactg

120

ctaataccgc ataagcgcac agtaccgcat ggtacagtgt gaaaaactcc ggtggtgtga

180

gatggatccg cgtctgatta gccagttggc ggggtaacgg cccaccaaag cgacgatcag

240

tagccgacct gagagggtga ccggccacat tgggactgag acacggccca aactcctacg

300

ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggcgaaagcc tgatgcagcg acgccgcgtg

360

agtgaagaag tatttcggta tgtaaagctc tatcagcagg gaagataatg acggtacctg

420

actaagaagc cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gggcaagcgt

480

tatccggatt tactgggtgt aaagggagcg tagacggcat ggcaagtctg aagtgaaaac

540

ccagggctca accctgggac tgctttggaa actgtcaagc tagagtgcag gagaggtaag

600

tggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattagg aggaacacca gtggcgaagg

660

cggcttactg gactgtaact gacgttgagg ctcgaaagcg tggggagcaa acaggattag

720

ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaggt gttggggggc aaagcccttc

780

ggtgccgtcg caaacgcaat aagcactcca cctggggagt acgttcgcaa gaatgaaact

840

caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg

900

cgaagaacct taccaagtct tgacatcctc ttgaccggcg tgtaacggcg cctttccttc

960

gggacaagag agacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt

1020

aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcct tagtagccag caataagatg ggcactctag

1080

ggagactgcc agggacaacc tggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt

1140

atgatttggg ctacacacgt gctacaatgg cgtaaacaaa gggaagcgac cctgcgaagg

1200

tgagcaaatc tcaaaaataa cgtcccagtt cggactgtag tctgcaaccc gactacacga

1260

agctggaatc gctagtaatc gcgaatcaga atgtcgcggt gaatacgttc ccgggtcttg

1320

tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtca gcaacgcccg aagtcagtga cccaactcgc

1380

a

1381

<210> 601

<211> 1505

<212> DNA

<213> Clostridium leptum

<400> 601

cgacgctggc ggcgtgccta acacatgcaa gtcgaacgga gttaaattcg acacccgagt

60

atccggccgg gaggcggggt gctgggggtt ggatttaact tagtggcgga cgggtgagta

120

acgcgtgagt aacctgcctt tcagaggggg ataacgttct gaaaagaacg ctaataccgc

180

ataacatcaa tttatcgcat gataggttga tcaaaggagc aatccgctgg aagatggact

240

cgcgtccgat tagccagttg gcggggtaac ggcccaccaa agcgacgatc ggtagccgga

300

ctgagaggtt gaacggccac attgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag

360

cagtggggga tattgcacaa tgggggaaac cctgatgcag caacgccgcg tgagggaaga

420

aggttttcgg attgtaaacc tctgttctta gtgacgataa tgacggtagc taaggagaaa

480

gctccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggagcgagc gttgtccgga

540

tttactgggt gtaaagggtg cgtaggcggc gaggcaagtc aggcgtgaaa tctatgggct

600

taacccataa actgcgcttg aaactgtctt gcttgagtga agtagaggta ggcggaattc

660

ccggtgtagc ggtgaaatgc gtagagatcg ggaggaacac cagtggcgaa ggcggcctac

720

tgggctttaa ctgacgctga agcacgaaag catgggtagc aaacaggatt agataccctg

780

gtagtccatg ccgtaaacga tgattactag gtgtgggggg tctgaccccc tccgtgccgc

840

agttaacaca ataagtaatc cacctgggga gtacggccgc aaggttgaaa ctcaaaggaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cagtggagta tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac

960

cttaccaggt cttgacatcc gtctaacgaa gcagagatgc attaggtgcc cttcggggaa

1020

aggcgagaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc

1080

ccgcaacgag cgcaaccctt gtttctagtt gctacgcaag agcactctag agagactgcc

1140

gttgacaaaa cggaggaagg tggggacgac gtcaaatcat catgcccctt atgacctggg

1200

ccacacacgt actacaatgg ctgtaaacag agggaagcaa agccgcgagg tggagcaaaa

1260

ccctaaaagc agtcccagtt cggatcgcag gctgcaaccc gcctgcgtga agtcggaatt

1320

gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc

1380

ccgtcacacc atgggagccg gtaatacccg aagccagtag ttcaaccgca aggagagcgc

1440

tgtcgaaggt aggattggcg actggggtga agtcgtaaca aggtagccgt atcggaaggt

1500

gcggc

1505

<210> 602

<211> 1500

<212> DNA

<213> Clostridium limosum

<400> 602

tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca agtcgagcga tgaagcttcc

60

ttcgggaagt ggattagcgg cggacgggtg agtaacacgt gggtaacctg cctcaaagag

120

ggggatagcc ttccgaaagg aagattaata ccgcataata tcatttcaat gcatgttgaa

180

atgattaaag gagtaatccg ctttgagatg gacccgcggc gcattagcta gttggtgagg

240

taacggctca ccaaggcgac gatgcgtagc cgacctgaga gggtgatcgg ccacattggg

300

actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc gcaatggggg

360

aaaccctgac gcagcaacgc cgcgtgagtg atgacggtct tcggattgta aagctctgtt

420

ttcagggacg ataatgacgg tacctgagga ggaagccacg gctaactacg tgccagcagc

480

cgcggtaata cgtaggtggc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag catgcgtagg

540

cggatactta agtgggatgt gaaatcccgg ggctcaaccc cggtgctgca ttccaaactg

600

ggtatctaga gtacaggaga ggaaagcgga attcctagtg tagcggtgaa atgcgtagag

660

attaggaaga acaccagtgg cgaaggcggc tttctggact gtaactgacg ctgaggcatg

720

aaagcgtggg tagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagta

780

ctaggtgtcg gggtttcaat acttcggtgc cgcagttaac acattaagta ctccgcctgg

840

gaagtacgat cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagtagcgga

900

gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacct gggcttgaca tcccaagaat

960

cctgtggaaa cacgggagtg cccttcgggg aacttggtga caggtggtgc atggttgtcg

1020

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgttgttag

1080

ttgctaccat taagttgagc actctagcaa gactgcctgg gtaaccagga ggaaggtggg

1140

gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgt ccagggctac acacgtgcta caatggttgg

1200

tacaaagaga agcaagaccg tgaggtggag caaatctcat aaaaccaatc tcagttcgga

1260

ttgtaggctg aaactcgcct acatgaagct ggagttacta gtaatcgcga atcagaatgt

1320

cgcggtgaat gcgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagttggtaa

1380

cacccgaagt ccgtgaggta accgcaagga gccagcggcc gaaggtggga tcgatgattg

1440

gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtagga gaacctgcgg ctggatcacc tcctttctga

1500

<210> 603

<211> 1387

<212> DNA

<213> Clostridium magnum

<220>

<221> modified_base

<222> (816)..(816)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 603

ggacgggtga gtaacacgtg ggtaacctgc ctcaaagagg gggatagcct cccgaaaggg

60

agattaatac cgcataacat tagtttttcg catgaagaac taattaaagg agtaatccgc

120

tttgagatgg acccgcggcg cattagctag ttggtgaggt aaaggctcac caaggcgacg

180

atgcgtagcc gacctgagag ggtgatcggc cacattggaa ctgagacacg gtccagactc

240

ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggcga aagcctgatg cagcaacgcc

300

gcgtgagtga tgaaggcctt cgggttgtaa agctctgtct tttgggacga taatgacggt

360

accaaaggag gaagccacgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggcg

420

agcgttgtcc ggatttactg ggcgtaaagg tagcgtaggc ggatatttaa gtgagatgtg

480

aaatacccga gcttaacttg ggtagctgca tttcaaactg gatatctaga gtgcgggaga

540

ggagaatgga attcctagtg tagcggtgaa atgcgtagag attaggaaga acaccagtgg

600

cgaaggcgat tctctggacc gtaactgacg ctgaggcatg aaagcgtggg tagcaaacag

660

gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagta ctaggtgtag gagggtccaa

720

ccttctgtgc cgcagttaac acaataagta ctccgcctgg gaagtacgat cgcaagatta

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcanggac atgtggttta attcgaagca

840

acgcgaagaa ccttacctgg acttgacatc ccctgaatag tgcagagatg catgaagctt

900

cgggcaggag acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttaggttaa

960

gtcctgcaac gagcgcaacc cctatcatta gttgctacca ttaagttgag cactctagtg

1020

agactgcccg ggttaaccgg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat

1080

gccagggcta cacacgtgct acaatggtag gtacagagag atgcaagacc gcgaggtgga

1140

gcaaaactca aaaacctatc ccagttcgga ttgtaggctg caactcgcct acatgaagcc

1200

ggagttgcta gtaatcgcga atcagaatgt cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca

1260

caccgcccgt cacaccatga gagctggcaa cacccgaagt ccgtgaggta accgtgaaag

1320

gagccagcgg aaaggtgggg ttagtgattg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtagga

1380

ctcgctg

1387

<210> 604

<211> 1498

<212> DNA

<213> Clostridium malenominatum

<400> 604

gtttgatcct ggctcaggac gaacgctggc ggcgtgccta acacatgcaa gtcgagcgat

60

gatatccctt cggggattga ttagcggcgg acgggtgagt aacacgtggg taacctgcct

120

caaagagggg gatagccctc cgaaaggagg attaataccg cataaagttg agagttcgca

180

tgaacattca accaaaggag caatccgctt tgagatggac ccgcgtccca ttagctagtt

240

ggtgaggtaa tagctcacca aggcgacgat gggtagccga cctgagaggg tgatcggcca

300

cattggaact gagatacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcgca

360

atgggggaaa ccctgacgca gcaacgccgc gtgggcgacg aaggtcttcg gattgtaaag

420

ccctgtcttc tgggacgata atgacggtac cagaggagga agccacggct aactacgtgc

480

cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag cgttgtccgg aattactggg cgtaaagggt

540

gcgtaggcgg atatttaagt gggatgtgaa atacctgagc tcaactcggg tgctgcattc

600

caaactggat atctagagtg caggagagga gaatggaatt cctagtgtag cggtgaaatg

660

cgtagagatt aggaagaaca ccagtggcga aggcgattct ctggactgta actgacgctg

720

aggcacgaaa gcgtgggtag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaact

780

atgaatacta ggtgtagggg ggaacctccc tctgtgccgc agttaacaca ataagtattc

840

cgcctgggga gtacggtcgc aagactaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag

900

cagcggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttacctgaa cttgacatcc

960

cctgcattac tcgtaatgga ggaaatccct tcggggacag ggagacaggt ggtgcatggt

1020

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatt

1080

attagttgct accattaagt tgagcactct aatgagactg cccgggttaa ccgggaggaa

1140

ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgttcag ggctacacac gtgctacaat

1200

ggtgagaaca acgagacgca agaccgcaag gtggagcaaa cctcaaaaac tcatcccagt

1260

tcggattgta ggctgaaact cgcctacatg aagccggagt tgctagtaat cgcgaatcag

1320

catgtcgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgagagtt

1380

ggcaacaccc gaagtccgtg aggtaaccgt aaggagccag cggccgaagg tggggtcaat

1440

gattggggtg aagtcgtaac aaggtagccg taggagaacc tgcggctgga tcacctcc

1498

<210> 605

<211> 1347

<212> DNA

<213> Clostridium mayombei

<400> 605

tcgagcgatt ctcttcggag aagagcggcg gacgggtgag taacgcgtgg gtaacctgcc

60

tcatacacat ggataacata ccgaaaggta tgctaataca ggataacata agagattcgc

120

atgtttctct tatcaaagct ccggcggtat gagatggacc cgcgtctgat tagctagttg

180

gtaaggtaat ggcttaccaa ggcgacgatc agtagccgac ctgagagggt gatcggccac

240

attggaactg agacacggtc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa

300

tgggcgaaag cctgatgcag caacgccgcg tgagtgatga aggccttcgg gtcgtaaaac

360

tctgtcctca aggaagataa tgacggtact tgaggaggaa gccccggcta actacgtgcc

420

agcagccgcg gtaatacgta gggggctagc gttatccgga tttactgggc gtaaagggtg

480

cgtaggtggt ttcttaagtc aggagtgaaa ggtacggctt aaccgtagta agctcttgaa

540

actgggaaac ttgagtgcag gagaggaaag tggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt

600

agatattagg aggaacacca gtagcgaagg cggctttctg gactgtaact gacactgagg

660

cacgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg

720

agtactaggt gtcgggggtt acccccctcg gtgccgcagc taacgcatta agtactccgc

780

ctggggagta cgctcgcaag agtgaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagtag

840

cggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt acctaagctt gacatccttt

900

tgaccgatgc ctaatcgcat ttttcccttc ggggacagaa gtgacaggtg gtgcatggat

960

gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgcct

1020

ttagttgcca gcattaagtt gggcactcta gagggactgc cagggataac ctggaggaag

1080

gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgcttagg gctacacacg tgctacaatg

1140

ggtggtacag agggcagcca agtcgtgagg ccgagctaat cccttaaagc cattctcagt

1200

tcggattgta ggctgaaact cgcctacatg aagctggagt tactagtaat cgcagatcag

1260

aatgctgcgg tgaatgcgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac cacggaagtt

1320

gggggcgccc gaagcctact tagctaa

1347

<210> 606

<211> 1363

<212> DNA

<213> Clostridium methylpentosum

<400> 606

ttgttttggt gaagcccttc ggggtggaac cggctcaact tagtggcgga cgggtgagta

60

acacgtgagc aacctgcctt acagagggga ataacgtttg gaaacgaacg ctaataccgc

120

ataacataac gggatcgcat gattttgtta tcaaagattt tatcgctgta agatgggctc

180

gcgtctgatt agatagttgg tgaggtaatg gctcaccaag tcgacgatca gtagccggac

240

tgagaggttg aacggccaca ttgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

300

agtggggaat attgcacaat gggggaaacc ctgatgcagc gacgccgcgt gaaggaagaa

360

ggccttcggg ttgtaaactt ctgtcttcag ggacgataat gacggacctg ggggaagctc

420

cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggga gcgagcgttg tccggaatta

480

ctgggtgtaa agggagcgta ggcgggattg caagttgaat gtgaaatcta tgggcttaac

540

ccataaactg cgttcaaaac tgcagttctt gagtgaagta gaggcaggcg gaattcctag

600

tgtagcggtg aaatgcgtag atattaggag gaacaccagt ggcgaaggcg gcctgctggg

660

ctttaactga cgctgaggct cgaaagcgtg ggtagcaaac aggattagat accctggtag

720

tccacgctgt aaacgatgat tactaggtgt aggggggtca accttctgtg ccggagttaa

780

cacaataagt aatccacctg gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg

840

ggggcccgca caagcagtgg agtatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc

900

aggtcttgac atccaactaa cgaagtagag atacattaga cgcccttcgg ggaaagttga

960

gacaggtgga gcatgggcgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1020

cgagcgcaac ccttacattt agttgctacg caagagcact ctagatggac tgccgttgac

1080

aaaacggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac

1140

acgtactaca atggctatta acagagggaa gcaatactgt gaagtggagc aaacccctaa

1200

aaatagtctc agttcggatt gtaggctgca actcgcctac atgaagccgg aattgctagt

1260

aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca

1320

caccatgaga gttggcaaca cccgaagtca gtagtctaac cgc

1363

<210> 607

<211> 1392

<212> DNA

<213> Clostridium nexile

<400> 607

tcgaacgaag cgcttaaatg gatttcttcg gattgaagtt tttgtgactg agtggcggac

60

gggtgagtaa cgcgtgggta acttgcctca tacaggggga taacagttag aaatgactgc

120

taataccgca taagcgcaca gtgctgcatg gcacagtgtg aaaaactccg gtggtatgag

180

atggacccgc gtctgattag ctagttggtg gggtaacggc ctaccaaggc gacgatcagt

240

agccggcctg agagggtgaa cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg

300

gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga

360

gcgaagaagt atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctga

420

ctaagaagca ccggctaaat acgtgccagc agccgcggta atacgtatgg tgcaagcgtt

480

atccggattt actgggtgta aagggagcgt agacggttgt gtaagtctga tgtgaaagcc

540

cggggctcaa ccccgggact gcattggaaa ctatgtaact agagtgtcgg agaggtaagc

600

ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta gatattagga ggaacaccag tggcgaaggc

660

ggcttactgg acgatcactg acgttgaggc tcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga

720

taccctggta gtccacgccg taaacgatga ctactaggtg tcggggagca aagctcttcg

780

gtgccgcagc aaacgcaata agtagtccac ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc

840

aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc

900

gaagaacctt acctggtctt gacatcccgg tgaccggcaa gtaatgttgc ctttccttcg

960

ggacaccggt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1020

agtcccgcaa cgagcgcaac ccctatcttc agtagccagc atttaaggtg ggcactctgg

1080

agagactgcc agggataacc tggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt

1140

atgaccaggg ctacacacgt gctacaatgg cgtaaacaaa gggaagcgaa cctgtgaggg

1200

gaagcaaatc tcaaaaataa cgtctcagtt cggattgtag tctgcaactc gactacatga

1260

agctggaatc gctagtaatc gcgaatcagc atgtcgcggt gaatacgttc ccgggtcttg

1320

tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtca gtaacgcccg aagtcagtga cccaaccgta

1380

aggagggagc tg

1392

<210> 608

<211> 1493

<212> DNA

<213> Clostridium novyi

<400> 608

gagagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaacacat gcaagtcgag

60

cgatgaagct tccttcggga agtggattag cggcggacgg gtgagtaaca cgtgggtaac

120

ctgcctcaaa gagtgggata gcctcccgaa agggagatta ataccgcata acattatttt

180

acggcatcgt agaataatca aaggagcaat ccgctttgag atggacccgc ggcgcattag

240

ctagttggtg aggtaacggc tcaccaaggc aacgatgcgt agccgacctg agagggtgat

300

cggccacatt ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tgcgcaatgg gggaaaccct gacgcagcaa cgccgcgtga gtgatgaagg ttttcggatc

420

gtaaaactct gtcattaggg acgataatga cggtacctaa tgaggaagcc acggctaact

480

acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgtt gtccggattt actgggcgta

540

aagagtatgt aggtgggcat ttaagtcaga tgtgaaattc ccgggcttaa cctgggagct

600

gcatttgata ctgggtgtct agagtgcagg agaggaaagt ggaattccta gtgtagcggt

660

gaaatgcgta gagattagga agaacaccag tggcgaaggc gactttctgg actgtaactg

720

acactgagat acgaaagcgt gggtagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg

780

taaacgatga atactaggtg tcggggggta ccaccctcgg tgccgcagca aacgcattaa

840

gtattccgcc tggggagtac ggtcgcaaga ttaaaactca aaggaattga cggggacccg

900

cacaagcagc ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta cctagacttg

960

acatctcctg aattactcgt aactgaggaa gtcccttcgg ggacaggaag acaggtggtg

1020

catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

1080

cttattgtta gttgctacta ttaagttaag cactctaacg agactgccgc ggttaacgtg

1140

gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gtctagggct acacacgtgc

1200

tacaatggct ggtacaacga gcagcaatcc cgcgaggggg agcaaaactt gaaagccagt

1260

cccagttcgg attgtaggct gaaactcgcc tacatgaagt tggagttgct agtaatcgcg

1320

aatcagcatg tcgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccatg

1380

agagccggta acacccgaag cccgtgaggt aaccgtaagg agccagcggt cgaaggtggg

1440

attggtgatt ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtagg agaacctgcg gct

1493

<210> 609

<211> 1391

<212> DNA

<213> Clostridium orbiscindens

<220>

<221> modified_base

<222> (16)..(16)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 609

tcgaacgggg tgctcntgac ggaggattcg tccaacggat tgagttacct agtggcggac

60

gggtgagtaa cgcgtgagga acctgccttg gagaggggaa taacactccg aaaggagtgc

120

taataccgca tgatgcagtt gggtcgcatg gctctgactg ccaaagattt atcgctctga

180

gatggcctcg cgtctgatta gctagtaggc ggggtaacgg cccacctagg cgacgatcag

240

tagccggact gagaggttga ccggccacat tgggactgag acacggccca gactcctacg

300

ggaggcagca gtggggaata ttgggcaatg ggcgcaagcc tgacccagca acgccgcgtg

360

aaggaagaag gctttcgggt tgtaaacttc ttttgtcggg gacgaaacaa atgacggtac

420

ccgacgaata agccacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag

480

cgttatccgg atttactggg tgtaaagggc gtgtaggcgg gattgcaagt cagatgtgaa

540

aactgggggc tcaacctcca gcctgcattt gaaactgtag ttcttgagtg ctggagaggc

600

aatcggaatt ccgtgtgtag cggtgaaatg cgtagatata cggaggaaca ccagtggcga

660

aggcggattg ctggacagta actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag caaacaggat

720

tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atggatacta ggtgtggggg gtctgacccc

780

ctccgtgccg cagttaacac aataagtatc ccacctgggg agtacgatcg caaggttgaa

840

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagt atgtggttta attcgaagca

900

acgcgaagaa ccttaccagg tgtgtgtaac cggcgagtga agcagagatg cattaggtgc

960

ccttcgggga aagtggagac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

1020

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tattgttagt tgctacgcaa gagcactcta

1080

gcgagactgc cgttgacaaa acggaggaag gtggggacga cgtcaaatca tcatgcccct

1140

tatgtcctgg gccacacacg tactacaatg gtggttaaca gagggaggca ataccgcgag

1200

gtggagcaaa tccctaaaag ccatcccagt tcggattgca ggctgaaacc cgcctgtatg

1260

aagttggaat cgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt

1320

gtacacaccg cccgtcacac catgagagtc gggaacaccc gaagtccgta gcctaaccgc

1380

aaggagggcg c

1391

<210> 610

<211> 1342

<212> DNA

<213> Clostridium oroticum

<400> 610

cggattgaaa gagtgttgcg actgagcggc ggacgggtga gtaacgcgtg ggtaacctgc

60

ctcatacagg gggataacag ttagaaatga ctgctaatac cgtataagac cacggtgccg

120

catggcacag tggtaaaaac tccggtggta tgagatggac ccgcgtctga ttagctagtt

180

ggtagggtaa cggcttacca aggcgacgat cagtagccga cctgagaggg tgaccggcca

240

cattgggact gagacacggc ccaaactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca

300

atgggggaaa ccctgatgca gcgacgccgc gtgaaggatg aagtatttcg gtatgtaaac

360

ttctatcagc agggaagaaa atgacggtac ctgactaaga agccccggct aactacgtgc

420

cagcagccgc ggtaatacgg gggagcgcgg atttactggg tgtaaaggga gcgtagacgg

480

tgatgcaagt tgatgtgaaa acccggggct caaccccggg actgcattgg aaactgtgtg

540

actagagtgt cggagaggta agtggaattc ctagtgtagc ggtgaaatgc gtagatatta

600

ggaggaacac cagtggcgaa ggcggcttac tggacgatga ctgacgttga ggctcgaaag

660

cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgaatactag

720

gtgtcgggtg gcaaagccat tcggtgccgc agcaaacgca gtaagtattc cacctgggga

780

gtacgttcgc aagaatgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggagca

840

tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttacctgct cttgacatcc cgctgagctg

900

tcaaggaagc ggacatgccg ttgggggtgt ggagacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

960

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc tttagtagcc

1020

agcggtcagg ccgggcactc tagagagact gccagggata acctggagga aggtggggat

1080

gacgtcaaat catcatgccc cttatgagca gggctacaca cgtgctacaa tggcgtaaac

1140

aaagggaggc aatactgtga agtggagcaa atcccaaaaa taacgtctca gttcggattg

1200

tagtctgcaa ctcgactaca tgaagctgga atcgctagta atcgcgaatc agaatgtcgc

1260

ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag ttggtaacgc

1320

ccgaagtcag tgacccaacc gc

1342

<210> 611

<211> 1377

<212> DNA

<213> Clostridium paraputrificum

<400> 611

gtcgagcgat gaagttcctt cgggaacgga ttagcggcgg acgggtgagt aacacgtggg

60

caacctgcct tatagagggg aatagccttc cgaaaggaag attaataccg cataagattg

120

tagcttcgca tgaagcagca attaaaggag caatccgcta taagatgggc ccgcggcgca

180

ttagctagtt ggtgaggtaa cggctcacca aggcgacgat gcgtagccga cctgagaggg

240

tgatcggcca cattgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga

300

atattgcaca atgggggaaa ccctgatgca gcaacgccgc gtgagtgatg acggccttcg

360

ggttgtaaag ctctgtcttt ggggacgata atgacggtac ccaaggagga agccacggct

420

aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag cgttgtccgg atttactggg

480

cgtaaaggga gcgtaggcgg atttttaagt gggatgtgaa atacccgggc tcaacctggg

540

tgctgcattc caaactggaa atctagagtg caggagggga aagtggaatt cctagtgtag

600

cggtgaaatg cgtagagatt aggaagaaca ccagtggcga aggcgacttt ctggactgta

660

actgacgctg aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac

720

gccgtaaacg atgaatacta ggtgtagggg ttgtcatgac ctctgtgccg ccgctaacgc

780

attaagtatt ccgcctgggg agtacggtcg caagattaaa actcaaagga attgacgggg

840

gcccgcacaa gtagcggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttacctag

900

acttgacatc tcctgaatta ccatgtaatg tgggaagtcc cttcggggac aggaagacag

960

gtggtgcatg ggtgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1020

gcaaccctta ttgttagttg ctaccattta gttgagcact ctagcgagac tgcccgggtt

1080

aaccgggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtct agggctacac

1140

acgtgctaca atggccggta caacgagatg caataccgtg aggtggagca aaactataaa

1200

accggtctca gttcggattg taggctgaaa ctcgcctaca tgaagctgga gttactagta

1260

atcgcgaatc agaatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac

1320

accatgagag ttggcaatac ccaaagttgg tgatctaacc cgtaagggag gaagcca

1377

<210> 612

<211> 1374

<212> DNA

<213> Clostridium perfringens

<400> 612

tcgagcgatg aagtttcctt cgggaaacgg attagcggcg gacgggtgag taacacgtgg

60

gtaacctgcc tcatagagtg gaatagcctt ccgaaaggaa gattaatacc gcataatgtt

120

gaaagatggc atcatcattc aaccaaagga gcaatccgct atgagatgga cccgcggcgc

180

attagctagt tggtggggta acggcctacc aaggcgacga tgcgtagccg acctgagagg

240

gtgatcggcc acattgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

300

aatattgcac aatgggggaa accctgatgc agcaacgccg cgtgagtgat gaaggttttc

360

ggatcgtaaa gctctgtctt tggggaagat aatgacggta cccaaggagg aagccacggc

420

taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg taggtggcga gcgttatccg gatttactgg

480

gcgtaaaggg agcgtaggcg gatgattaag tgggatgtga aatacccggg ctcaacttgg

540

gtgctgcatt ccaaactggt tatctagagt gcaggagagg agagtggaat tcctagtgta

600

gcggtgaaat gcgtagagat taggaagaac accagtggcg aaggcgactc tctggactgt

660

aactgacgct gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

720

cgccgtaaac gatgaatact aggtgtgggg gtttcaacac ctccgtgccg ccgctaacgc

780

attaagtatt ccgcctgggg agtacggtcg caagattaaa actcaaagga attgacgggg

840

acccgcacaa gtagcggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttacctac

900

acttgacatc ccttgcatta ctcttaatcg aggaggacca ttagggggga tgggaaatag

960

ccgggctcaa cttgggtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1020

caacccttgt cgttagttac taccattaag ttgaggactc tagcgagact gcctgggtta

1080

accaggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgtgta gggctacaca

1140

cgtgctacaa tggctggtac agagagatgc aataccgcga ggtggagcca aacttaaaaa

1200

ccagtctcag ttcggattgt aggctgaaac tcgcctacat gaagctggag ttactagtaa

1260

tcgcgaatca gaatgtcgcg gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca

1320

ccatgagagt tggcaatacc cgaagtccgt gagctaaccg caaggaggca gcgg

1374

<210> 613

<211> 1523

<212> DNA

<213> Clostridium phytofermentans

<400> 613

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggagttttta aatggaagtc ctcggatgga agtttagaaa cttagtggcg gacgggtgag

120

taacgcgtgg gtaacctgcc tcatacaggg ggataacagt cggaaacgat tgctaaaacc

180

gcataacata gcgaaaccgc atgattttgc tatcaaatat ttataggtat gagatggacc

240

cgcgtctgat tagctagttg gtggggtaat ggcctaccaa ggcgacgatc agtagccggc

300

ttgagagagt gaccggccac attgggactg agacacggcc caaactccta cgggaggcag

360

cagtggggaa tattggacaa tgggggaaac cctgatccag cgacgccgcg tgagtgaaga

420

agtatttcgg tatgtaaagc tctatcagca gggaagataa tgacagtacc tgactaagaa

480

gccccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggggcaagc gttatccgga

540

tttactgggt gtaaagggag cgtaggtggt aggtcaagtc agatgtgaaa gcccagggct

600

caaccctggg actgcatttg aaactggctt actagagtgc aggagaggta agtggaattc

660

ctagtgtagc ggtgaaatgc gtagatatta ggaggaacac cagtggcgaa ggcggcttac

720

tggactgtaa ctgacactga ggctcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg

780

gtagtccacg ccgtaaacga tgaatactag ctgtcggggc tatcatggct tcggtggcgc

840

agctaacgca ataagtattc cacctgggga gtacgttcgc aagaatgaaa ctcaaaggaa

900

ttgacgggga cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac

960

cttaccaagt cttgacatcc ctctgacaac cgagtaacgt cggtcttcct tcgggacaga

1020

ggtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg

1080

caacgagcgc aacccctatc tttagtagcc agcagttcgg ctgggcactc tagagagact

1140

gccagggata acctggagga aggcggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgattt

1200

gggctacaca cgtgctacaa tggtgactac aaagagaagc aagcctgcga gggggagcaa

1260

atctcaaaaa ggtcatccca gttcggattg tactctgcaa ctcgagtaca tgaagctgga

1320

atcgctagta atcgcgaatc agaatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac

1380

cgcccgtcac accatgggag taggtaacgc ccgaagtcag tgacccaacc gtaaggaggg

1440

agctgccgaa ggcgggatct ataactgggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtatcggaa

1500

ggtgcggctg gatcacctcc ttt

1523

<210> 614

<211> 1482

<212> DNA

<213> Clostridium piliforme

<400> 614

agagtttgat catggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc

60

ggggatataa tagcgttaat cgctaatata ttctagcggc ggacgggtga gtaacgcgtg

120

ggtaacctgc cctatacact gggataacat cgagaaatcg gtgctaatac cggataagct

180

aacagtaagg catcttatag ttagaaaaac tgaggtggta taggaggggc ccgcgtctga

240

ttagctagtt ggtgtggtaa aagcatacca aggcgacgat cagtagccga cctgagaggg

300

tgatcggcca cattggaact gagacacggt ccaaactcct acgggaggca gcagtgggga

360

atattgcaca atggggggaa ccctgatgca gcaacgccgc gtgaaggaag aagtatttcg

420

gtatgtaaac ttctatcgac agggaagaaa aaaatgacgg tacctgaata agaagcaccg

480

gctaaatacg tgccagcagc cgcggtaata cgtatggtgc aagcgttatc cggatttact

540

gggtgtaaag ggtgagtagg cggttagata agtcatatgt gaaattctgg ggctcaactc

600

cagcgctgca taagaaacta tttaactaga gtacaggaga ggtaagcgga attcctagtg

660

tagcggtgaa atgcgtagat attaggaaga acaccggtgg cgaaggcggc ttactggact

720

gaaactgacg ctgagtcacg aaagcgtggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc

780

cacgctgtaa acgatgagtg ctaggtgttg ggaagaaatt ctcggtgccg cagcaaacgc

840

aataagcact ccacctgggg agtacgaccg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg

900

acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttacctaa

960

acttgacata ccattgacag gctacgtaaa gtagctttcc ttcggggcaa tggatacagg

1020

tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1080

caacccctat tcttagtagc cagcactttg ggtgggcact ctaaggagac tgccgtggat

1140

aacacggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgttt agggctacac

1200

acgtgctaca atggctataa caaagtgaag cgagacagtg atgtggagca aagcacataa

1260

aagtagtccc agttcggatt gtagtctgca actcgactac atgaagttgg aatcgctagt

1320

aatcgcgaat cagaatgtcg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca

1380

caccatggga gttggaagca cccgaagcct gtgacctaac cgtaagggag gagcagtcga

1440

aggtgaagcc agtgactggg gtgaagtcgt aacaaggtaa cc

1482

<210> 615

<211> 1487

<212> DNA

<213> Clostridium putrefaciens

<400> 615

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgagc

60

gaagttattc cttcgggaat aacttagcgg cggacgggtg agtaacacgt gggtaacctg

120

cctcatagag ggggatagcc ttccgaaagg aagattaata ccccataaca tagcattatc

180

gcatgataaa gttattaaag gagtaatccg ctatgagatg gacccgcggc gcattagcta

240

gttggtgagg taacggctca ccaaggccac gatgcgtagc cgacctgaga gggtgatcgg

300

ccacattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc

360

acaatgggcg aaagcctgat gcagcaacgc cgcgtgagtg atgaaggcct tcgggtcgta

420

aagctctgtc ttcggggacg ataatgacgg tacccgagga ggaagccacg gctaactacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttgtc cggatttact gggcgtaaag

540

ggagcgtagg cggatactta agtgggatgt gaaatacccg ggctcaaccc gggtgctgca

600

ttccaaactg ggtatctaga gtgtgggaga ggaaagtgga attcctagtg tagcggtgaa

660

atgcgtagat attaggaaga acaccagtgg cgaaggcgac tttctggacc ataactgacg

720

ctgaggctcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa

780

acgatggata ctaggtgtgg gggataccaa tcctccgtgc cgtcgttaac acactaagta

840

tcccgcctgg ggagtacgat cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac

900

aagcagcgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacct agacttgaca

960

tctcctgaat tacctgtaat tagggaagcc cttcggggca ggaagacagg tggtgcatgg

1020

ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat

1080

tgttagttgc taccatttag ttgagcactc tagcgagact gcctgggtta accaggagga

1140

aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgtcta gggctacaca cgtgctacaa

1200

tggcgagtac aacgagacgc aataccgcga ggtggagcaa aactcaaaaa actcgtccca

1260

gttcggattg taggctgaaa ctcgcctaca tgaagccgga gttgctagta atcgcgaatc

1320

agaatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgagag

1380

ttggcaatac ccgaagtccg tgtgctaacg cgtaagcgag gcagcggccg aaggtagggt

1440

cagcgattgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtagaag aacctgc

1487

<210> 616

<211> 1477

<212> DNA

<213> Clostridium quinii

<400> 616

tttatcctga ctcagacgaa cgcttggcgg cgtgcctaac acatgcaagt cgagcgagga

60

gattccttcg ggatgatcct agcggcggac gggtgagtaa cacgtgggca acctgcctca

120

tagagaggaa tagcctcccg aaagggagat taatacctca taacattgca gtttgcatgg

180

gacagcaatt aaaggagcaa tccgctatga gatgggcccg cggcgcatta gctagttggt

240

gaggtaacgg ctcaccaagg cgacgatgcg tagccgacct gagagggtga tcggccacat

300

tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg

360

ggggaaaccc tgatgcagca acgccgcgtg agtgatgacg gccttcgggt tgtaaagctc

420

tgtcttcagg gacgataatg acggtacctg aggaggaagc cacggctaac tacgtgccag

480

cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt tgtccggatt tactgggcgt aaagggagcg

540

taggcggact tttaagtgag atgtgaaata cccgggctca acctgggtgc tgcatttcaa

600

actggaagtc tagagtgcag gagaggagag tggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt

660

agagattagg aagaacacca gtggcgaagg cgactctctg gactgtaact gacgctgagg

720

ctcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg

780

aatactaggt gtaggggttg tcgatgacct ctgtgccgcc gtaacgcatt aagtattccg

840

cctggggagt acggtcgcaa gattaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagca

900

gcggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct tacctagact tgacatctcc

960

tgaattactc ttaatcgagg aagtcttcag acagggaaga caggttgtgc atggttgtcg

1020

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttattgttag

1080

ttgctaccat ttagttgagc actctagcga gactgcccgg gttaaccggg aggaaggtgg

1140

ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg tctagggcta cacacgtgct acaatggcaa

1200

gtacaaagag aagcaagacc gcgaggtgga gcaaaactca aaaacttgtc tcagttcgga

1260

ttgtaggctg aaactcgcct acatgaagct ggagttgcta gtaatcgcga atcagcatgt

1320

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagttggcaa

1380

tacccaaagt tggtggtcta acctgaagga ggaagccacc taaggtaggg tcagcgattg

1440

gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtagag aaccttg

1477

<210> 617

<211> 1040

<212> DNA

<213> Clostridium ramosum

<220>

<221> modified_base

<222> (7)..(9)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (12)..(12)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (18)..(18)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (20)..(20)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (22)..(22)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (27)..(27)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (31)..(31)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (43)..(43)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 617

gcgtgannng angttttngn tntaaantct ntataaagga agnacggcgg ctacaggaaa

60

tggtagccga gtgacggtac tttattagaa agccacggct aactacgtgc cagcagccgc

120

ggtaatacgt aggtggcaag cgttatccgg aattattggg cgtaaagagg gagcaggcgg

180

cagcaagggt ctgtggtgaa agcctgaagc ttaacttcag taagccatag aaaccaggca

240

gctagagtgc aggagaggat cgtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat

300

ggaggaacac cagtggcgaa ggcgacgatc tggcctgcaa ctgacgctca gtcccgaaag

360

cgtggggagc aaataggatt agatacccta gtagtccacg ccgtaaacga tgagtactaa

420

gtgttggatg tcaaagttca gtgctgcagt taacgcaata agtactccgc ctgagtagta

480

cgttcgcaag aatgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt

540

ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatactca taaaggctcc

600

agagatggag agatagctat atgagataca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc

660

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt atcgttagtt accatcatta

720

agttggggac tctagcgaga ctgccagtga caagctggag gaaggcgggg atgacgtcaa

780

atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca cacgtgctac aatggatggt gcagagggaa

840

gcgaagccgc gaggtgaagc aaaacccata aaaccattct cagttcggat tgtagtctgc

900

aactcgacta catgaagttg gaatcgctag taatcgcgaa tcagcatgtc gcggtgaata

960

cgttctcggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacgag agttgataac acccgaagcc

1020

ggtggcctaa ccgcaaggaa

1040

<210> 618

<211> 1505

<212> DNA

<213> Clostridium rectum

<400> 618

gagagtttga tcctggctca ggatgaacgc tgacagaatg cttaacacat gcaagtctag

60

cttgatcctt cgggtgatgg tggcggacgg gtgagtaacg cgtaaagaac ttgccctgca

120

gtctgggaca acatttggaa acgaatgcta ataccggata ttatgtgagt ttcgcatgaa

180

attcatatga aagctatatg cgctgcagga gagctttgcg tcctattagc tagttggtga

240

ggtaacggct caccaaggcg atgataggta gccggcctga gagggtgaac ggccacaagg

300

ggactgagac acggccctta ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatgga

360

ccaaaagtct gatccagcaa ttctgtgtgc acgatgaagt tttcggaatg taaagtgctt

420

tcagttggga cgaagtaagt gacggtacca acagaagaag cgacggctaa atacgtgcca

480

gcagccgcgg taatacgtat gtgcaagcgt tatccggatt tattgggcgt aaagcgcgtc

540

gtaggcggtt tggtaagtct gatgtgaaaa tgcggggctc aactccgtat tgcgttggaa

600

actgtccaaa ctagagtact ggagaggtgg gcggaactac aagtgtagag gtgaaattcg

660

tagatatttg taggaatgcc gatggggaag ccagcccact ggacagatac tgacgctaaa

720

gcgcgaaagc gtgggtagca aacaggatta gataccctgg cctggtagtc cacgccgtaa

780

acgatgatta ctaggtgttg ggggtcgaac ctcagcgccc aagctaacgc gataagtaat

840

ccgcctgggg agtacgtacg caagtatgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa

900

gcggtggagc atgtggttta attcgacgca acgcgaggaa ccttaccagc gtttgacatc

960

ctaagaaatt agcagagatg cttttgtgcc ttcgggggaa cttagtgaca ggtggtgcat

1020

ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct

1080

ttcgtatgtt gccatcatta agttgggcac tcatgcgata ctgcctgcga tcagcaggag

1140

gaaggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgc cccttatacg ctgggctaca cacgtgctac

1200

aatgggtagt acagagagtc gcaaacctgc gagggggagc taatctcaga aaactattct

1260

cagttcggat tgtactctgc aactcgagta catgaagttg gaatcgctag taatcgcaaa

1320

tcagctatgt tgcggtgaat acgttctcgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccacga

1380

gagttggttg cacctgaagt agcaggccta accgcaagga gggatgctcc gagggtgtga

1440

ttagcgattg gggtgaagtc gtaacaaggt atccgtacgg gaacgtgcgg ctggatcacc

1500

tcctt

1505

<210> 619

<211> 1326

<212> DNA

<213> Clostridium saccharogumia

<400> 619

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtcgaacg

60

agtggcgaac gggtgagtaa gacataagta acctgccctt tacaggggga taactattgg

120

aaacgatagc taagaccgca tagtaaaact ggtagaggat ggacttatgg cgcattagct

180

ggttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgatgcgtag ccgacctgag agggtgaccg

240

gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta gggaattttc

300

ggcaatgggg ggaaccctga ccgagcaacg ccgcgtgaag gaggaaggtc ttcggactgt

360

aaacttctgt tataaaggaa gatgacggta ctttatgagg aagccacggc taactacgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg taggtggcaa gcgttatccg gaattattgg gcgtaaagag

480

ggagcaggcg gcagcaaggg tctgtggtga aagactgaag cttaacttca gtaagccata

540

gaaaccgggc agctagagtg caggagagga tcgtggaatt ccatgtgtag cggtgaaatg

600

cgtagatata tggaggaaca ccagtggcga aggcgacgat ctggcctgac tgacgctcag

660

tcccgaaagc gtggggagca aataggatta gataccctag tagtccacgc cgtaaacgat

720

gagtactaag tgttgggatc tcagtgctgc agttaacgca gtaagtactc cgcctgagta

780

gtacgttcgc aagaatgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca

840

tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatat acaggtggtg

900

catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

960

cttatcgtta gttaccatca tggggactct agcgagactg ccagtgacaa gctggaggaa

1020

ggcggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat

1080

ggatggcaga gggaagcgaa gccgcgaggt ggagcgaaac ccagccattc tcagttcgga

1140

tgtagtctgc aactcgacta cagaagttgg aatcgctagt aatcgcgaat cagcatgtcg

1200

cggtgaatac gttctcgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatgaga gttgataaca

1260

cccgaagccg gtgcctaggg agctgtctaa ggtgggattg atgattgggg tgaagtcgta

1320

acaagg

1326

<210> 620

<211> 1519

<212> DNA

<213> Clostridium saccharolyticum

<400> 620

agagttcgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgagc

60

gaagcacttt taaggaagtt ttcggatgga attaaaagtg actgagcggc ggacgggtga

120

gtaacgcgtg ggtaacctgc ctcatacagg gggataacag ttggaaacga ctgctaatac

180

cgcataagca cacagtgccg catggtacgg tgtgaaaaac tccggtggta tgagatggac

240

ccgcgtctga ttaggtagtt ggtgaggtaa cggcccacca agccgacgat cagtagccga

300

cctgagaggg tgaccggcca cattgggact gagacacggc ccaaactcct acgggaggca

360

gcagtgggga atattggaca atgggggaaa ccctgatcca gcgacgccgc gtgagtgaag

420

aagtatttcg gtatgtaaag ctctatcagc agggaagaaa atgacggtac ctgactaaga

480

agccccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggggcaag cgttatccgg

540

atttactggg tgtaaaggga gcgtagacgg cactgcaagt ctggagtgaa agcccggggc

600

tcaaccccgg gactgctttg gaaactgtgg tgctggagtg caggagaggt aagtggaatt

660

cctagtgtag cggtgaaatg cgtagatatt aggaggaaca ccagtggcga aggcggctta

720

ctggactgta actgacgttg aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct

780

ggtagtccac gccgtaaacg atgaatacta ggtgttgggg agcaaagctc ttcggtgccg

840

ccgctaacgc aataagtatt ccacctgggg agtacgttcg caagaatgaa actcaaagga

900

attgacgggg acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa

960

ccttaccaag tcttgacatc ggaatgaccg gtccgtaacg gggccttccc ttcggggcat

1020

tccagacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1080

gcaacgagcg caacccttat ccttagtagc cagcagttcg gctgggcact ctggggagac

1140

tgccagggat aacctggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgatt

1200

tgggctacac acgtgctaca atggcgtaaa caaagggaag caaaggagcg atctggagca

1260

aaccccaaaa ataacgtctc agttcggatt gtagtctgca actcgactac atgaagctgg

1320

aatcgctagt aatcgcggat cagaatgccg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccatggga gttggtaacg cccgaagtca gtgacccaac cgtaaggagg

1440

gagctgccga aggcgggact gataactggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtatcgga

1500

aggtgcggct ggatcacct

1519

<210> 621

<211> 1519

<212> DNA

<213> Clostridium sardiniense

<400> 621

tttaaattga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taacacatgc

60

aagtcgagcg atgaagtttc cttcgggaaa cggattagcg gcggacgggt gagtaacacg

120

tgggtaacct gcctcataga ggggaatagc cttccgaaag gaagattaat accgcataac

180

attgcagttt cgcatgaaac agcaattaaa ggagcaatcc gctatgagat ggacccgcgg

240

cgcattagct agttggtaag gtaatggctt accaaggcga cgatgcgtag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacattgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

360

gggaatattg cacaatgggg gaaaccctga tgcagcaacg ccgcgtgagt gatgacggtc

420

ttcggattgt aaagctctgt ctttggggac gataatgacg gtacccaagg aggaagccac

480

ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg caagcgttgt ccggatttac

540

tgggcgtaaa gggagcgtag gcggattttt aagtgggatg tgaaataccc gggctcaacc

600

tgggtgctgc attccaaact gggaatctag agtgcaggag gggagagtgg aattcctagt

660

gtagcggtga aatgcgtaga gattaggaag aacaccagtg gcgaaggcga ctctctggac

720

tgtaactgac gctgaggctc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt

780

ccacgccgta aacgatgaat actaggtgta ggggtttcga tacctctgtg ccgccgctaa

840

cgcattaagt attccgcctg gggagtacgg tcgcaagatc aaaactcaaa ggaattgacg

900

ggggcccgca caagtagcgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc

960

tagacttgac atcttctgca ttacccttaa tcggggaagt cctttcgggg acagaatgac

1020

aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1080

gcgcaacccc tattgttagt tgctaccatt aagttgagca ctctagcgag actgcccggg

1140

ttaaccggga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgt ctagggctac

1200

acacgtgcta caatggcaag tacagagaga tgcaataccg tgaggtggag ctaaacttca

1260

aaacttgtct cagttcggat tgtaggctga aactcgccta catgaagctg gagttactag

1320

taatcgcgaa tcagcatgtc gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc

1380

acaccatgag agttggcaat acccaaagtt cgtgagctaa cgcgtaagcg aggcagcgac

1440

ctaaggtagg gtcagcgatt ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtagg agaacctgcg

1500

gctggatcac ctcctttct

1519

<210> 622

<211> 1470

<212> DNA

<213> Clostridium sartagoforme

<400> 622

ggctcaggac gaacgctggc ggcgtgccta acacatgcaa gtcgagcgag gagattccct

60

tcggggatga acctagcggc ggacgggtga gtaacacgtg ggcaacctgc cttatagagg

120

ggaatagcct tccgaaagga agattaatac cgcataacat tacattttcg catgaagaag

180

taattaaagg agtaatccgc tataagatgg gcccgcggcg cattagctag ttggtgaggt

240

aacggctcac caaggcgacg atgcgtagcc gacctgagag ggtgatcggc cacattggga

300

ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatggggga

360

aaccctgatg cagcaacgcc gcgtgagtga tgaaggtctt cggatcgtaa agctctgtct

420

tcagggacga taatgacggt acctgaggag gaagccacgg ctaactacgt gccagcagcc

480

gcggtaatac gtaggtggcg agcgttgtcc ggatttactg ggcgtaaagg gagcgtaggc

540

ggatttttaa gtgagatgtg aaatacccgg gctcaacttg ggtgctgcat ttcaaactgg

600

aagtctagag tgcaggagag gagagtggaa ttcctagtgt agcggtgaaa tgcgtagaga

660

ttaggaggaa caccagtggc gaaggcgact ctctggactg taactgacgc tgaggctcga

720

aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgaatac

780

taggtgtagg ggttgtcatg acctctgtgc cgccgcaaac gcattaagta ttccgcctgg

840

ggagtacggt cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcagcgga

900

gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacct agacttgaca tctcctgaat

960

tactcttaat cgaggaagtc ccttcgggga caggaagaca ggtggtgcat ggttgtcgtc

1020

agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt attgttagtt

1080

gctaccatta agttgagcac tctagcaaga ctgcccgggt taaccgggag gaaggtgggg

1140

atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgtc tagggctaca cacgtgctac aatggcaagt

1200

acaaaaagat gcaataccgc aaggtggagc taaacttaaa aacttgtctc agttcggatt

1260

gtaggctgaa actcgcctac atgaagctgg agttgctagt aatcgcgaat cagaatgtcg

1320

cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatgaga gttggcaata

1380

cccaaagttc gtgagctaac ccgtaaggga ggcagcgacc taaggtaggg tcagcgaatg

1440

gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtagga

1470

<210> 623

<211> 1529

<212> DNA

<213> Clostridium scindens

<400> 623

gagagtttga tcctggctca ggatgaacgc tggcggcgtg cctaacacat gcaagtcgaa

60

cgaagcgcct ggccccgact tcttcggaac gaggagcctt gcgactgagt ggcggacggg

120

tgagtaacgc gtgggcaacc tgccttgcac tgggggataa cagccagaaa tggctgctaa

180

taccgcataa gaccgaagcg ccgcatggcg cggcggccaa agccccggcg gtgcaagatg

240

ggcccgcgtc tgattaggta gttggcgggg taacggccca ccaagccgac gatcagtagc

300

cgacctgaga gggtgaccgg ccacattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag

360

gcagcagtgg ggaatattgc acaatggggg aaaccctgat gcagcgacgc cgcgtgaagg

420

atgaagtatt tcggtatgta aacttctatc agcagggaag aagatgacgg tacctgacta

480

agaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc aagcgttatc

540

cggatttact gggtgtaaag ggagcgtaga cggcgatgca agccagatgt gaaagcccgg

600

ggctcaaccc cgggactgca tttggaactg cgtggctgga gtgtcggaga ggcaggcgga

660

attcctagtg tagcggtgaa atgcgtagat attaggagga acaccagtgg cgaaggcggc

720

ctgctggacg atgactgacg ttgaggctcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac

780

cctggtagtc cacgccgtaa acgatgacta ctaggtgtcg ggtggcaagg ccattcggtg

840

ccgcagcaaa cgcaataagt agtccacctg gggagtacgt tcgcaagaat gaaactcaaa

900

ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa

960

gaaccttacc tgatcttgac atcccgatgc caaagcgcgt aacgcgctct ttcttcggaa

1020

catcggtgac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaacccc tatcttcagt agccagcatt ttggatgggc actctggaga

1140

gactgccagg gagaacctgg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg

1200

accagggcta cacacgtgct acaatggcgt aaacaaaggg aggcgaaccc gcgagggtgg

1260

gcaaatccca aaaataacgt ctcagttcgg attgtagtct gcaactcgac tacatgaagt

1320

tggaatcgct agtaatcgcg aatcagaatg tcgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac

1380

acaccgcccg tcacaccatg ggagtcagta acgcccgaag ccggtgaccc aacccgtaag

1440

ggagggagcc gtcgaaggtg ggaccgataa ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1500

tcggaaggtg cggctggatc acctccttc

1529

<210> 624

<211> 1507

<212> DNA

<213> Clostridium septicum

<400> 624

agagtttgat catggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc

60

gaggggagtt tcttcggaaa caaacctagc ggcggacggg tgagtaacac gtgggcaacc

120

tgccttgtag aggggaatag cctcccgaaa gggagattaa taccgcataa cattgcagct

180

tcgcatggag cagcaattaa aggagtaatc cgctacaaga tgggcccgcg gcgcattagc

240

tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatgcgta gccgacctga gagggtgatc

300

ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

360

gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcaac gccgcgtgag tgatgaaggt tttcggatcg

420

taaagctctg tcttcaggga cgataatgac ggtacctgag gaggaagcca cggctaacta

480

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg gcgagcgttg tccggattta ctgggcgtaa

540

agggagcgta ggcggacttt taagtgagat gtgaaatacc cgggctcaac ctgggggctg

600

catttcaaac tggaagtcta gagtgcagga gaggagagtg gaattcctag tgtagcggtg

660

aaatgcgtag agattaggaa gaacaccagt ggcgaaggcg actctctgga ctgtaactga

720

cgctgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt

780

aaacgatgga tactaggtgt gggaggtatc aactccttcc gtgccgccgt taacacatta

840

agtatcccgc ctggggagta cggtcgcaag attaaaactc aaaggaattg acgggggccc

900

gcacaagcag cggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt acctagactt

960

gacatctcct gcattactct taatcgagga agtcccttcg gggacaggat gacaggtggt

1020

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1080

ccttattgtt agttgctacc atttagttga gcactctagc gagactgccc gggttaaccg

1140

ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgtctagggc tacacacgtg

1200

ctacaatggc aagtacaacg agatgcaata ccgygaggtg gagctaaact ataaaacttg

1260

tctcagttcg gattgtaggc tgaaactcgc ctacatgaag ctggagttgc tagtaatcgc

1320

gaatcagcat gtcgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat

1380

gagagttggc aatacccaaa gttcgtgagc taaccgcaag gaggcagcga cctaaggtag

1440

ggtcagcgat tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtag gagaacctgc ggctggatca

1500

cctcctt

1507

<210> 625

<211> 1364

<212> DNA

<213> Clostridium sordellii

<220>

<221> modified_base

<222> (12)..(12)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 625

gtcgagcgat cncttcggag agagcggcgg acgggtgagt aacgcgtggg taacctgccc

60

tgtacacacg gataacatac cgaaaggtat actaatacgg gataacatat gaaagtcgca

120

tggcttttgt atcaaagctc cggcggtaca ggatggaccc gcgtctgatt agctagttgg

180

taaggtaatg gcttaccaag gcaacgatca gtagccgacc tgagagggtg atcggccaca

240

ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat

300

gggcgaaagc ctgatgcagc aacgccgcgt gagcgatgaa ggccttcggg tcgtaaagct

360

ctgtcctcaa ggaagataat gacggtactt gaggaggaag ccccggctaa ctacgtgcca

420

gcagccgcgg taatacgtag ggggctagcg ttatccggaa ttactgggcg taaagggtgc

480

gtaggtggtt ttttaagtca gaagtgaaag gctacggctc aaccgtagta agcttttgaa

540

actagagaac ttgagtgcag gagaggagag tagaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt

600

agatattagg aggaatacca gtagcgaagg cggctctctg gactgtaact gacactgagg

660

cacgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg

720

agtactaggt gtcgggggtt acccccctcg gtgccgcagc taacgcatta agtactccgc

780

ctgggaagta cgctcgcaag agtgaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagtag

840

cggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt acctaagctt gacatcccac

900

tgacctctcc ctaatcggag atttcccttc ggggacagtg gtgacaggtg gagcatggaa

960

gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttggga ttagtcccgc aacgagcgca acccttgcct

1020

ttagttgcca gcattaagtt gggcactcta gagggactgc cgaggataac tcggaggaag

1080

gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgcttagg gctacacacg tgctacaatg

1140

ggtggtacag agggttgcca agccgcgagg tggagctaat cccttaaagc cattctcagt

1200

tcggattgta ggctgaaact cgcctacatg aagctggagt tactagtaat cgcagatcag

1260

aatgctgcgg tgaatgcgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catggaagtt

1320

gggggcgccc gaagccggtt agctaacctt ttaggaagcg gccg

1364

<210> 626

<211> 1378

<212> DNA

<213> Clostridium sp. 7_2_43FAA

<400> 626

tcgagcgaga ggagttcctt cgggaacaaa tctagcggcg gacgggtgag taacacgtgg

60

gcaacctgcc ttgtagaggg gaatagcctt ccgaaaggaa gattaatacc gcataatatt

120

acattttcgc atgaagaagt aattaaagga gcaatccgct acaagatggg cccgcggcgc

180

attagctagt tggtgaggta acggctcacc aaggcgacga tgcgtagccg acctgagagg

240

gtgatcggcc acattgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

300

aatattgcac aatgggggaa accctgatgc agcaacgccg cgtgagtgat gaaggtcttc

360

ggatcgtaaa gctctgtctt cagggacgat aatgacggta cctgaggagg aagccacggc

420

taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg taggtggcga gcgttgtccg gatttactgg

480

gcgtaaaggg agcgtaggcg gatttttaag tgagatgtga aatacccggg ctcaacttgg

540

gtgctgcatt tcaaactgga agtctagagt gcaggagagg agagtggaat tcctagtgta

600

gcggtgaaat gcgtagagat taggaagaac accagtggcg aaggcgactc tctggactgt

660

aactgacgct gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

720

cgccgtaaac gatgaatact aggtgtaggg gttgtcatga cctctgtgcc gccgcaaacg

780

cattaagtat tccgcctggg gagtacggtc gcaagattaa aactcaaagg aattgacggg

840

ggcccgcaca agcagcggac catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccta

900

gacttgacat ctcctgcatt actcttaatc gaggaagtcc tttcggggac aggatgacag

960

gtgctgcatg ttaaactgga agtctagagt gcaggagtgg ggtgaggacc tccaagtagc

1020

gcaaccctta ttgttagttg ctaccattta gttgagcact ctagcgagac tgcccgggtt

1080

aaccgggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtct agggctacac

1140

acgtgctaca atggcaagta caaagagatg cgataccgcg aggtggagct aaactataaa

1200

acttgtctca gttcggattg taggctgaaa ctcgcctaca tgaagctgga gttgctagta

1260

atcgcgaatc agaatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac

1320

accatgagag ttggcaatac ccaaagttcg tgagctaacc cgtaagggag gcagcgac

1378

<210> 627

<211> 1390

<212> DNA

<213> Clostridium sp. D5

<220>

<221> modified_base

<222> (1252)..(1252)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1302)..(1302)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 627

tcgagcgaag cgctttactt agatttcttc ggattgaaga gtgttgcgac tgagcggcgg

60

acgggtgagt aacgcgtggg taacctgcct catacagggg gataacagtt agaaatgact

120

gctaataccg cataagacca cagtaccgca tggtacagtg ggaaaaactc cggtggtatg

180

agatggaccc gcgtctgatt agctagttgg taaggtaacg gcttaccaag gcgacgatca

240

gtagccgacc tgagagggtg accggccaca ttgggactga gacacggccc aaactcctac

300

gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggggaaacc ctgatgcagc gacgccgcgt

360

gaaggatgaa gtatttcggt atgtaaactt ctatcagcag ggaagaaaat gacggtacct

420

gactaagaag ccccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggggcaagcg

480

ttatccggat ttactgggtg taaagggagc gtagacggtt atgtaagtct gatgtgaaaa

540

cccggggctc aaccccggga ctgcattgga aactatgtaa ctagagtgtc ggagaggtaa

600

gtggaattcc tagtgtagcg gtgaaatgcg tagatattag gaggaacacc agtggcgaag

660

gcggcttact ggacgatgac tgacgttgag gctcgaaagc gtggggagca aacaggatta

720

gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gcatactagg tgtcgggtgg caaagccatt

780

cggtgccgca gcaaacgcaa taagtatgcc acctggggag tacgttcgca agaatgaaac

840

tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttatt tcaaagcaac

900

gcgaagaatc ttacctgctc ttgacatccc cctgaccggc gcgtaatggt gcctttcctt

960

cgggacaggg gagacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt

1020

taagtcccgc aacgagcgca acccttatct ttagtagcca gcggttcggc cgggcactct

1080

agagagactg ccagggataa cctggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc

1140

ttatgagcag ggttacacac gtgctacaat ggcgtaaaca aagggaggca atcccgcgag

1200

gttgagcaaa tcccaaaaat aacgtttcac ttcggatcgt agtgtgcaac tngattacac

1260

gaagctggca ttcatagtaa tcgggaatca gaatgtcgcg gngaatacgt tcccgggtct

1320

tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt tggtaacgcc cgaagtcagt gacccaaccg

1380

taaggaggga

1390

<210> 628

<211> 1381

<212> DNA

<213> Clostridium sp. HGF2

<220>

<221> modified_base

<222> (15)..(15)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 628

tcgaacgaag tttcnaggaa gcttgcttcc aaagagactt agtggcgaac gggtgagtaa

60

cacgtaggta acctgcccat gtgtccggga taactgctgg aaacggtagc taaaaccgga

120

taggtatacg gagcgcatgc tctgtatatt aaagcgccca tcaaggcgtg aacatggatg

180

gacctgcggc gcattagcta gttggtgagg taacggccca ccaaggcgat gatgcgtagc

240

cggcctgaga gggtaaacgg ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag

300

gcagcagtag ggaattttcg tcaatggggg aaaccctgaa cgagcaatgc cgcgtgagtg

360

aagaaggtct tcggatcgta aagctctgtt gtaagtgaag aacggctcat agaggaaatg

420

ctatgggagt gacggtagct taccagaaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

480

taatacgtag gtggcaagcg ttatccggaa tcattgggcg taaagggtgc gtaggtggcg

540

tactaagtct gtagtaaaag gcaatggctc aaccattgta agctatggaa actggtatgc

600

tggagtgcag aagagggcga tggaattcca tgtgtagcgg taaaatgcgt agatatatgg

660

aggaacacca gtggcgaagg cggtcgcctg gtctgtaact gacactgagg cacgaaagcg

720

tggggagcaa ataggattag ataccctagt agtccacgcc gtaaacgatg agaactaagt

780

gttggaggaa ttcagtgctg cagttaacgc aataagttct ccgcctgggg agtatgcacg

840

caagtgtgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagt atgtggttta

900

attcgaagca acgcgaaaac cttaccaggc cttgacatgg aaaccctaga gataggggga

960

taattatgga tcacacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg

1020

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc gcatgttacc agcatcaagt tggggactca

1080

tgcgagactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc

1140

ttatggcctg ggctacacac gtactacaat ggcgaccaca aagagcagcg acttggtgac

1200

aagaagcgaa tctcataaag gtcgtctcag ttcggattga agtctgcaac tcgacttcat

1260

gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcagatca gcatgctgcg gtgaatacgt tctcgggcct

1320

tgtacacacc gcccgtcaaa ccatgggagt cagtaatacc cgaagccggt ggcataaccg

1380

t

1381

<210> 629

<211> 1274

<212> DNA

<213> Clostridium sp. HPB-46

<400> 629

agtcgagcgg gaaacttcgg tttccagcgg cggacgggtg agtaacacgt gggcaacctg

60

cctcacaatg agggatagcc ttccgaaagg aagattaata cctcataaca caagagaaac

120

gcatgtttct cttgccaaag aatttcgttg tgagatgggc ccgcggcgca ttagcttgtt

180

ggtgaggtaa cggctcacca aggctgcgat gcgtagccga cctgagaggg tgatcggcca

240

cattggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca

300

atggaggaaa ctctgatgca gcaacgccgc gtgagtgatg aaggtcttcg gattgtaaag

360

ctctgtcttc tgggacgata atgacggcac cagaggagga agccacggct aactacgtgc

420

cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag cgttgtccgg atttactggg cgtaaaggat

480

gtgtaggcgg atatttaagt gagatgtgaa atccccaggc tcaacttggg ggctgcattt

540

caaactggat atctagagtg caggagagga aagcggaatt cctagtgtag cggtgaaatg

600

cgtagagatt aggaagaaca tcagtggcga aggcggcttt ctggactgta actgacgctg

660

aggcatgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgaatacta ggtgtaggag gtatcgactc cttctgtgcc gcagttaaca caataagtat

780

tccgcctggg gagtacggtc gcaagattaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

840

agcagcggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccca gacttgacat

900

ctcctgaatt aatcgtaatt gatgaaatcc cttcggggac aggaagacag gtggtgcatg

960

gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta

1020

tcattagttg ctaacattaa gttgagcact ctagtgagac tgcccgggtt aaccgggagg

1080

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtct ggggctacac acgtgctaca

1140

atggtgggaa caaagagatg caataccgca aggtggagcc aaacttcaag acccatccca

1200

gttcggattg taggctgaaa ctcgcctaca tgaagctgga gtgtagtaat cgcgaatcag

1260

agtgtagcgg tgaa

1274

<210> 630

<211> 1358

<212> DNA

<213> Clostridium sp. JC122

<400> 630

cgatgaagct ccttcgggag tgaattagcg gcggacgggt gagtaacacg tgggtaacct

60

gcctcataga ggggaatagc cttccgaaag ggagattaat accgcataac atagcactac

120

cgcatggtag agttatcaaa ggagcaatcc gctatgagat ggacccgcgg cgcattagct

180

agttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgatgcgtag ccgacctgag agggtgatcg

240

gccacattgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

300

cgcaatgggg gaaaccctga cgcagcaacg ccgcgtgagt gaagaaggcc ttagggttgt

360

aaagctctgt catatgggaa gataatgacg gtaccataag aggaagccac ggctaactac

420

gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg cgagcgttgt ccggatttac tgggcgtaaa

480

ggatgcgtag gcggatattt aagtgggatg tgaaatcccc gagcttaact cgggggctgc

540

attccaaact ggatatctag agtgtcggag gggaaagtgg aattcctagt gtagcggtga

600

aatgcgtaga gattaggaag aacaccagtg gcgaaggcga ctttctggac gataactgac

660

gctgaggcat gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta

720

aacgatgaat actaggtgta ggaggtatcg actccttctg tgccgcagtt aacacattaa

780

gtattccgcc tggggagtac gatcgcaaga ttaaaactca aaggaattga cgggggcccg

840

cacaagcagc ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta cctagacttg

900

acatctcctg cattactctt aacagaggaa gtccttcggg acaggatgac aggtggtgca

960

tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct

1020

tatcattagt tgctaccatt aagttgagca ctctagtgag actgcccggg ttaaccggga

1080

ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgt ctagggctac acacgtgcta

1140

caatggtagg tacaacaaga tgcaataccg tgaggtggag ctaaactcaa aaacctatcc

1200

cagttcggat tgtaggctga aactcgccta catgaagccg gagttgctag taatcgcgaa

1260

tcagcatgtc gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatgag

1320

agccgataac acccgaagtc cgtgaggtaa ccgtaagg

1358

<210> 631

<211> 1345

<212> DNA

<213> Clostridium sp. L2-50

<400> 631

cttgcactga tccgatcgag tggcggacgg gtgagtaacg cgtgggtaac ctgcctcata

60

caggggaata acagttggaa acggctgcta aaaccgcata agcgcacagt atcgcatgat

120

acagtgtgaa aaactccggt ggtatgagat ggacccgcgt ctgattagct agttggtgag

180

gtaacggccc accaaggcaa cgatcagtag ccggcctgag agggtgaacg gccacattgg

240

gactgagaca cggcccaaac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggg

300

gaaaccctga tgcagcgacg ccgcgtgagt gatgaagtat ttcggtatgt aaagctctat

360

cagcagggaa gataatgacg gtacctgact aagaagcacc ggctaaatac gtgccagcag

420

ccgcggtaat acgtatggtg caagcgttat ccggatttac tgggtgtaaa gggtgcgtag

480

gtggtgagac aagtctgaag tgaaaatccg gggcttaacc ccggaactgc tttggaaact

540

gcctgactag agtacaggag aggtaagtgg aattcctagt gtagcggtga aatgcgtaga

600

tattaggagg aacaccagtg gcgaaggcga cttactggac tgctactgac actgaggcac

660

gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgaat

720

actaggtgtc ggggcccaaa gggcttcggt gccgcaggga cgcaataagt attccacctg

780

gggagtacgt tcgcaagaat gaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg

840

agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc aagtcttgac atcctgctga

900

ccgttcctta accggaattt tccttcggga cagcagagac aggtggggca tggttgtcgt

960

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc tatttccagt

1020

agccagcagt cagatgggca ctctggagag actgccgggg ataacccgga ggaaggtggg

1080

gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga tttgggctac acacgtgcta caatggcagt

1140

tacaaagaga agcgaaactg tgaagtggag caaacctcaa aaaggctgtc tcagttcgga

1200

ttgtagtctg caactcgact acatgaagct ggaatcgcta gtaatcgcag atcagaatgc

1260

tgcggtgaat acgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtcggaaa

1320

cgcccgaagt cagtgaccca accgc

1345

<210> 632

<211> 1464

<212> DNA

<213> Clostridium sp. LMG 16094

<400> 632

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc gaggggagtt cttcggaaca

60

aacctagcgg cggacgggtg agtaacacgt gggcaacctg cctcaaagag gggaatagcc

120

tcccgaaagg gagattaata ccgcataaag ttattttttc gcatgaagag ataaccaaag

180

gagcaatccg ctttgagatg ggcccgcggc gcattagcta gttggtgagg taacggctca

240

ccaaggcgac gatgcgtagc cgacctgaga gggtgatcgg ccacattgga actgagacac

300

ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc gcaatggggg aaaccctgac

360

gcagcaacgc cgcgtgagcg atgaaggtct tcggattgta aagctctgtc ttttgggacg

420

ataatgacgg taccaaagga ggaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

480

cgtaggtggc aagcgttgtc cggatttact gggcgtaaag agtatgtagg cggacattta

540

agtcagatgt gaaattcccg ggcttaacct gggagctgca tttgatactg ggtgtctaga

600

gtgcaggaga ggaaagtgga attcctagtg tagcggtgaa atgcgtagag attaggaaga

660

acaccagtgg cgaaggcgac tttctggact gtaactgacg ctgagatacg aaagcgtggg

720

gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgaata ctaggtgtcg

780

gagggtacca ccttcggtgc cgcagcaaac gcaataagta ttccgcctgg ggagtacggt

840

cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcagcgga gcatgtggtt

900

taattcgaag caacgcgaag aaccttacct agacttgaca tctcctgaat tactcgtaac

960

agaggaagcc cttcggggca ggaagacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1020

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat tgttagttgc taccattaag

1080

ttgagcactc tagcaagact gcctgggtta accaggagga aggtggggat gacgtcaaat

1140

catcatgscc cttatgtcta gggctacaca cgtgctacaa tggtcggtac aaaaagatgc

1200

aaacccgtga gggggagcta aacttaaaaa ccgatcccag ttcggattgt aggctgaaac

1260

tcgcctacat gaagttggag ttgctagtaa tcgcgaatca gcatgtcgcg gtgaatacgt

1320

tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgagagc cggtaacacc cgaagcccgt

1380

gaggtaaccg waaggagcca gcggtcgaag gtgggattgg tgattggggt gaagtcgtaa

1440

caaggtagcc gtaggagaac ctgc

1464

<210> 633

<211> 1045

<212> DNA

<213> Clostridium sp. M62/1

<220>

<221> modified_base

<222> (967)..(968)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (977)..(977)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (984)..(985)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1010)..(1010)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1014)..(1015)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 633

aacgaagcgg tttagcggaa gttttcggat ggaagttaaa ctgactgagt ggcggacggg

60

tgagtaacgc gtgggtaacc tgcctcacac agggggacaa cagctagaaa tggctgctaa

120

taccgcataa gcgcacagct tcgcatgaag cagtgtgaaa aactccggtg gtgtgagatg

180

gacccgcgtc tgattagctg gttggtgagg taacggctca ccaaggcgac gatcagtagc

240

cgacctgaga gggtgaccgg ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag

300

gcagcagtgg ggaatattgc acaatggggg aaaccctgat gcagcgacgc cgcgtgagtg

360

aagaagtatt tcggtatgta aagctctatc agcagggaag agaatgacgg tacctgacta

420

agaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc aagcgttatc

480

cggatttact gggtgtaaag ggagcgtaga cggcttagca agtctgaagt gaaagcccgg

540

ggctcaaccc cgggactgct ttggaaactg ttaagctgga gtgctggaga ggtaagcgga

600

attcctagtg tagcggtgaa atgcgtagat attaggagga acaccagtgg cgaaggcggc

660

ttactggaca gtaactgacg ttgaggctcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac

720

cctggtagtc cacgccgtaa acgatgaata ctaggtgttg gtgggcaaag cccatcggtg

780

ccgtcgcaaa cgcaataagt attccacctg gggagtacgt tcgcaagaat gaaactcaaa

840

ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa

900

gaaccttacc aagtcttgac atcccactga ccggacagta atgtgtcctt ctcttcggag

960

cagtggnnac aggtggngca tggnngtcgt cagctcgtgt cgtgagatgn tggnnaagtc

1020

ccgcaacgag cgcaaccctt atcct

1045

<210> 634

<211> 935

<212> DNA

<213> Clostridium sp. MLG055

<220>

<221> modified_base

<222> (776)..(776)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (890)..(891)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (893)..(893)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (895)..(895)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (910)..(912)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 634

acttagtggc gaacgggtga gtaacacgta gataacctgc ctgtatgacc gggataacag

60

ttggaaacga ctgctaatac cggataggca gagaggaggc atctcttctc tgttaaagtt

120

gggatacaac gcaaacagat ggatctgcgg tgcattagct agttggtgag gtaacggccc

180

accaaggcga tgatgcatag ccggcctgag agggcgaacg gccacattgg gactgagaca

240

cggcccaaac tcctacggga ggcagcagta gggaattttc ggcaatgggg gaaaccctga

300

ccgagcaatg ccgcgtgagt gaagacggcc ttcgggttgt aaagctctgt tgtaagggaa

360

gaacggcata gagagggaat gctctatgag tgacggtacc ttaccagaaa gccacggcta

420

actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta ggtggcaagc gttatccgga attattgggc

480

gtaaagggtg cgtaggcggc gagataagtc tgaggtaaaa gcccgtggct caaccacggt

540

aagccttgga aactgtctgg ctggagtgca ggagaggaca atggaattcc atgtgtagcg

600

gtaaaatgcg tagatatatg gaggaacacc agtggcgaag gcggttgtct ggcctgtaac

660

tgacgctgaa gcacgaaagc gtggggagca aataggatta gataccctag tagtccacgc

720

cgtaaacgat gagaactaag tgttggggaa actcagtgct gcagttaacg caatangttc

780

tccgcctggg ggagtatgca cgcaagtgtg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac

840

aagcggtgga gtatgtggtt taattcgacg caacgcgaag aaccttaccn ngncntgaca

900

tggtatcaan nncctagaga tagggagata gttat

935

<210> 635

<211> 1364

<212> DNA

<213> Clostridium sp. MT4 E

<400> 635

catgcacgtc gagcgactct tctggagaga gcggcggacg ggagagcacg cgagggtacc

60

tgccctgtca cacggataac actaccgaaa ggtatactaa tacggggact aacatactga

120

aagtcgcatg gcttttgtat caaagctccg gcggtacagg atggacccgc gtctgattag

180

ctagttggta aggtaatggc ttaccaaggc aacgatcagt agccgacctt gagaagggtg

240

aatcgggcca ctactggaaa tgaagacacg ggtccaagac tcctactggg gaggcagcag

300

tggggaatat tgcacaatgg gcgaaagcct gatgcagcaa cgccgcgtga gcggatgaag

360

gccttcgggt cgtaaagctc tgtcctcaag gaagataatg acgggtactt tgaggaggaa

420

gccccgggct aactacgtgc cagcagccgc gggtaatacg gtagggggct agcgttatcc

480

gggaaattac tgggcgtaaa gggtgcggta aggtggtttt tttaagtcag aagtgaaagg

540

ctacggctca accggtagta agctttttga aactagagaa ctttgagtgc aggagaggag

600

agtagaattc ctagtgtagc ggtgaaatgc gtaaatttag gaggaatacc agtagcgaag

660

gcggcttctc tggacttgta actgacactg aggccgaaag cgggggagca acaggattag

720

atccctggta gtcccgccgt aaacgatgag tactagggtg tcgggggtta cccccctcgg

780

tgccgcagct aacgcattaa gtactccgcc tgggaagtac gctcgcaaga gtaaactcaa

840

aggaattgac cgggacccgc acaaagtagc ggagcatgtg gtttaattcg aagcaaacgc

900

gaagaacctt acctaagctt gacatcccac tgacctctcc ctaaatcgga gatttccctt

960

cggggccagt ggtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg

1020

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgcc tttagttgcc agcattaagt tgggcactct

1080

agagggactg ccgaggataa ctcggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc

1140

ttatgcttag ggctacacca ccgtgctaca atgggtggta cagagggttg ccaagccgcg

1200

aaggtggagc taatccctta aagccattct cagttcggat tgtaggctga aactcgccta

1260

catgaagctg gagttactag taatcgcaat cagaatgctg cggtgatgcg ttcccgggtc

1320

ttgtacacac cgcccgtcac accattggaa gttggggcgc caga

1364

<210> 636

<211> 1205

<212> DNA

<213> Clostridium sp. NMBHI-1

<400> 636

aaagggagat taataccgca taatgtatga gaatcgcatg atttttgtac caaaggagca

60

atccgctatg agatggaccc gcggcgcatt agctagttgg tgaggtaaag gctcaccaag

120

gcgacgatgc gtagccgacc tgagagggtg atcggccaca ttggaactga gacacggtcc

180

agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcgcaat gggggaaacc ctgacgcagc

240

aacgccgcgt gaatgaagaa ggccttaggg ttgtaaagtt ctgtcatatg ggaagataat

300

gacggtacca tatgaggaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

360

gtggcaagcg ttgtccggat ttactgggcg taaaggatgc gtaggcggac atttaagtca

420

gatgtgaaat acccgggctc aacttgggtg ctgcatttga aactgggtgt ctagagtgca

480

ggagaggaaa gcggaattcc tagtgtagcg gtgaaatgcg tagagattag gaagaacacc

540

agtggcgaag gcggctttct ggactgtaac tgacgctgag gcatgaaagc gtggggagca

600

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gaatactagg tgtaggaggt

660

atcgacccct tctgtgccgc agttaacaca ataagtattc cgcctgggga gtacgatcgc

720

aagattaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cagcggagca tgtggtttaa

780

ttcgaagcaa cgcgaagaac cttacctaga cttgacatcc cctgaattac ctgtaatgag

840

ggaagccctt cggggcaggg agacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag

900

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcat tagttgctac cattaagttg

960

agcactctag tgagactgcc cgggttaacc gggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat

1020

catgcccctt atgtctaggg ctacacacgt gctacaatgg ttggtacaat aagatgcaat

1080

accgcgaggt ggagctaaac ttataaaacc aatcccagtt cggattgtag gctgaaactc

1140

gcctacatga agccgggagt tgctagtaat cgcgaatcag catgtcgcgg tgaatacgtt

1200

cccgg

1205

<210> 637

<211> 1389

<212> DNA

<213> Clostridium sp. NML 04A032

<400> 637

tcgacggggt gcctatgata gaggattcgt ccaattgatt aggctaccta gtggcggacg

60

ggtgagtaac gcgtgagtaa cctgccttgg agtggggaat aacagtccga aaggactgct

120

aataccgcat gatgcagcga ggtcgcatgg ccttgctgcc aaagatttat cgctctgaga

180

tggactcgcg tctgattagc tggttggcgg ggtaacggcc caccaaggcg acgatcagta

240

gccggactga gaggttggcc ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg

300

aggcagcagt ggggaatatt gggcaatggg cgcaagcctg acccagcaac gccgcgtgaa

360

ggaagaaggc tctcgggttg taaacttctt ttatcaggga cgaaagaaat gacggtacct

420

gatgaataag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtggcaagcg

480

ttatccggat ttactgggtg taaagggcgt gtaggcggga aagcaagtca ggcgtgaaaa

540

ctatgggctc aacccatagc ctgcgtttga aactgttttt cttgagtgtc ggagaggcaa

600

tcggaattcc gtgtgtagcg gtgaaatgcg tagatatacg gaggaacacc agtggcgaag

660

gcggattgct ggacgataac tgacgctgag gcgcgaaagc gtggggagca aacaggatta

720

gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat ggatactagg tgtggggggt ctgaccccct

780

ccgtgccgca gttaacacaa taagtatccc acctggggag tacgatcgca aggttgaaac

840

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagtat gtggtttaat tcgaagcaac

900

gcgaagaacc ttaccagggc ttgacatcgt actaacgaag cagacatgca ttagatgccc

960

ttcggggaaa gtatagacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

1020

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccccta ttgttagttg ctacgcaaga gcactctagc

1080

gagactgccg ttgacaaaac ggaggaaggt ggggacgacg tcaaatcatc atgcccctta

1140

tgtcctgggc cacacacgta ctacaatggc ggtcaacaga gggaggcaat accgcgaggt

1200

ggagcaaatc cctaaaagcc gtcccagttc ggattgcagg ctgaaacccg cctgcatgaa

1260

gttggaatcg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1320

acacaccgcc cgtcacacca tgagagtcgg gaacacccga agtccgtagc ctaaccgcaa

1380

ggggggcgc

1389

<210> 638

<211> 1031

<212> DNA

<213> Clostridium sp. SS2/1

<220>

<221> modified_base

<222> (16)..(16)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (26)..(27)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 638

cgtgagtgaa gaagtnttct cggtanntaa agctctatca gcagggaaga aaatgacggt

60

acctgactaa gaagccccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggggca

120

agcgttatcc ggaattactg ggtgtaaagg gtgcgtaggt ggtatggcaa gtcagaagtg

180

aaaacccagg gcttaactct gggactgctt ttgaaactgt cagactagag tgcaggagag

240

gtaagcggaa ttcctagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttaggaggaa catcagtggc

300

gaaggcggct tactggactg aaactgacac tgaggcacga aagcgtgggg agcaaacagg

360

attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgaatac taggtgtcgg ggccgtagag

420

gcttcggtgc cgcagccaac gcagtaagta ttccacctgg ggagtacgtt cgcaagaatg

480

aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag

540

caacgcgaag aaccttacct ggtcttgaca tccttctgac cggtccttaa ccggactttt

600

ccttcgggac aggagtgaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

660

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct atctttagta gccagcatat aaggtgggca

720

ctctagagag actgccaggg ataacctgga ggaaggtggg gacgacgtca aatcatcatg

780

ccccttatga ccagggctac acacgtgcta caatggcgta aacagaggga agcagcctcg

840

tgagagtgag caaatcccaa aaataacgtc tcagttcgga ttgtagtctg caactcgact

900

acatgaagct ggaatcgcta gtaatcgcga atcagaatgt cgcggtgaat acgttcccgg

960

gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtcagtaa cgcccgaagt cagtgaccca

1020

accgtaagga g

1031

<210> 639

<211> 1375

<212> DNA

<213> Clostridium sp. SY8519

<400> 639

tttatggagt ttgatcctgg ctcaggatga acgctggcgg cgtgcctaac acatgcaagt

60

cgaacgagtg gcggacgggt gagtaacgcg tggataacct gcctcaaaca gggggataac

120

agccggaaac ggctgctaat accgcataag aaaaagtggt ttgagatgga tccgcgtctg

180

attagttagt tggcggggta acggcccacc aaggcgacga tcagtagccg gcctgagagg

240

gtgaacggcc acattgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

300

aatattgcac aatgggggaa accctgatgc agcaacgccg cgtgagcgaa gaagtatttc

360

ggtatgtaaa gctctatcag cagggaagat gacggtacct gactaagaag ctccggctaa

420

atacgtgcca gcagccgcgg taatacgtat ggagcaagcg ttatccggat ttactgggtg

480

taaagggagc gcaggcggtg gcgcaagtct gatgtgaaaa cccggggccc aaccccggga

540

ctgcattgga aactgcgtga cttgagtgtc ggaggggtaa gtggaattcc tagtgtagcg

600

gtgaaatgcg tagatattag gaggaacacc agtggcgaag gcggcttact ggacgaactg

660

acgctgaggc tcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg

720

taaacgatga atactaggtg ttggcatgtc agtgccgcag caaacgcatt aagtattcca

780

cctggggagt acgttcgcaa gaatgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg

840

gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggcct tgacatcgac

900

aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

960

gcgcaaccct tgtgtatagt agccagcggc cgggcactct atacagactg ccagggacaa

1020

cctggaggaa ggcggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatggcctg ggcgacacac

1080

gtgctacaat ggcgtacaga gggaggcaaa gccgcgaggt ggagcgaatc ccaaaacgtc

1140

tcagttcgga tgcaggctgc aacccgcctg cagaagctgg aatcgctagt aatcgcagat

1200

cagcatgctg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga

1260

gtcggaaatg cccgaagccg gtacccaggg agccgtcgaa ggcaggtctg ataactgggg

1320

tgaagtcgta acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1375

<210> 640

<211> 1267

<212> DNA

<213> Clostridium sp. TM-40

<400> 640

acatgcaagt cggacgagtg gcgaacgggt gagtaagaca taagcaacct gcccctgtga

60

gggggataac tgctggaaac ggcagctaag accgcatagt aaattagcac agggatgggc

120

ttatgacgca ttagccagct ggtgaggtaa cggctcacca gggcgacgat gcgtagccgg

180

cctgagaggg tggacggcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

240

gcagtaggga attttcggca atgggcgaaa gcctgaccga gcaacgccgc gtgaaggaag

300

aagtcattcg tgatgtaaac ttctgttatg aaggaagatg acggtacttc atgaggaagc

360

cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg tggcgagcgt tatccggaat

420

cattgggcgt aaagagggag caggcggcag tgcaggtctg cggtgaaaga ccggagctaa

480

acttcggtaa gccgtggaaa ccgcacagct agagagcatc agaggatcgc ggaattccat

540

gtgtagcggt gaaatgcgta gatatatgga ggaacaccag tggcgaaggc ggcggtctgg

600

ggtggctgac gctcagtccc gaaagcgtgg ggagcaaata ggattagata ccctagtagt

660

ccacgccgta aacgatgagt gctaagtgtt ggggcctcag tgctggagtt aacgcaataa

720

gcactccgcc tgagtagtac gttcgcaaga atgaaactca aaggaattga cgggggcccg

780

cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaggtcttg

840

acatgcacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

900

cgcaacgagc gcaacccctg ttgccagttg ccagcatggg gactctggcg agactgcctc

960

tgcaaggagg aggaaggcgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg acctgggcta

1020

cacacgtgct acaatggacg gcagagggag gcgaagccgc gaggtggagc gaaacccagc

1080

cgttcacagt tcggatgcag tctgcaactc gactgcagaa gctggaatcg ctagtaatcg

1140

cgaatcagca tgtcgcggtg aatacgttct cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca

1200

tgagagttgg taacacccga agccggtgcc cagggagctg tctaaggtgg gactgatgat

1260

tggggtg

1267

<210> 641

<211> 1320

<212> DNA

<213> Clostridium sp. YIT 12069

<400> 641

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgaac gagtggcgga cgggtgagta

60

acgcgtgagc aacctgcctc aaagaggggg ataacgtctg gaaacggacg ctaataccgc

120

atgaccaaag ccgctttgag atgggctcgc gtctgattag ctagttggtg gggtaaaggc

180

ctaccaaggc gacgatcagt agccggactg agaggttgaa cggccacatt gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tgggggatat tgcacaatgg gggaaaccct

300

gatgcagcaa cgccgcgtga aggaagacgg ttttcggatt gtaaacttct gttcttagtg

360

acgatgacgg tagctaagga gaaagctccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtagggagc gagcgttgtc cggaattact gggtgtaaag ggagcgtagg cgggagatca

480

agtcagatgt gaaaactatg ggctcaaccc ataacctgca tttgaaactg ttcttcttga

540

gtgaagtaga ggcaggcgga attccgagtg tagcggtgaa atgcgtagat attcggagga

600

acaccagtgg cgaaggcggc ctgctgggct tactgacgct gaggctcgaa agcatgggga

660

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca tgccgtaaac gatgattact aggtgtgggg

720

tattccgtgc cggagttaac acaataagta atccacctgg ggagtacggc cgcaaggttg

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcagtgga gtatgtggtt taattcgaag

840

caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca tcgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgtca ttagttgcta

960

cagcactcta atgagactgc cgttgacaaa acggaggaag gtggggacga cgtcaaatca

1020

tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tactacaatg gccgtcagag ggaagcaata

1080

ctgtgaagtg gagcaaaccc ctacggtccc agttcagatg caggctgcaa cccgcctgca

1140

gaagtcggaa ttgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt tcccgggcct

1200

tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagc cggtaatacc cgaagtcggt gtctaggacg

1260

ccgccgaagg taggattggc gactggggtg aagtcgtaac aaggtagccg tatcggaagg

1320

<210> 642

<211> 1319

<212> DNA

<213> Clostridium sp. YIT 12070

<400> 642

gacgaacgct gtcggcgcgc ctaacacatg caagtcgaac gagtggcgga cgggtgagta

60

acgcgtgagt aacctgcctt tcagaggggg ataacgtctg gaaacggacg ctaataccgc

120

ataaccaaag ccgctgaaag atggactcgc gtccaattag ctagttggtg aggtaacggc

180

ccaccaaggc gacgattggt agccggactg agaggttgaa cggccacatt gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct

300

gatgcagcga cgccgagtga gggaagaagg ttttcggatt gtaaacctct gtccttggtg

360

aagatgacgg taaccaagga ggaagctacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtagc gagcgttgtc cggaattact gggtgtaaag ggagcgtagg cgggattgca

480

agttgaatgt taaatctatg ggctcaaccc atagccgcgt tcaaaactgc agttcttgag

540

tgaagtagag gcaggcggaa ttcctagtgt agcggtgaaa tgcgtaaata ttaggaggaa

600

caccagtggc gaaggcggcc tgctgggctt actgacgctg aggctcgaaa gcgtgggtag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg atgattacta ggtgtggggg

720

cttccgtgcc ggagttaaca caataagtaa tccacctggg gagtacgacc gcaaggttga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcagtggag tatgtggttt aattcgaagc

840

aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttacgtt tagttgctac

960

agcactctag acggactgcc gttgacaaaa cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat

1020

catgcccctt atgacctggg ctacacacgt actacaatgg ctatcagagg gaagcaagat

1080

ggtgacatgg agcaaacccc tatagtctca gttcggatgc aggctgcaac ccgcctgcag

1140

aagccggaat tgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt

1200

gtacacaccg cccgtcacac catgagagtt ggcaacaccc gaagccgatg tctaggacgt

1260

cgtcgaaggt ggggttgatg attggggtga agtcgtaaca aggtagccgt atcggaagg

1319

<210> 643

<211> 1522

<212> DNA

<213> Clostridium sphenoides

<220>

<221> modified_base

<222> (1)..(7)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1455)..(1455)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1513)..(1514)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 643

nnnnnnngag agtttgatcc tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca

60

agtcgagcga agcgattcaa atgaagtttc ggacggattt tgaattgact tagcggcgga

120

cgggtgagta acgcgtgggt aacctgcctc atacaggggg ataacagtcg gaaacgactg

180

ctaataccgc ataacacaca gtgccgcatg gtacggtgtg aaaaactccg gtggtatgag

240

atggacccgc gtctgattag gtagttggtg aggtaacggc ccaccaagcc gacgatcagt

300

agccgacctg agagggtgac cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg

360

gaggcagcag tggggaatat tggacaatgg gggaaaccct gatccagcga cgccgcgtga

420

gtgaagaagt atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctga

480

ctaagaagcc ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg ggcaagcgtt

540

atccggattt actgggtgta aagggagcgt agacggcact gcaagtctgg agtgaaagcc

600

cggggctcaa ccccggactg ctttggaaac tgtggtgcta gagtgcagga gaggtaagtg

660

gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag atattaggag gaacaccagt ggcgaaggcg

720

gcttactgga ctgtaactga cgttcgaggc tcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga

780

taccctggta gtccacgccg taaacgatga atactaggtg ttggggagca aagctcttcg

840

gtgccgccgg taacgcaata agtattccac ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc

900

aaaggaattg acggggaccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg

960

aagaccttac caagtcttga catcggaatg accgggatgt aacgatccct tcccttcggg

1020

gcatccagac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaaccct tatccttagt agccagcaag tcaagctggg cactctgggg

1140

agactgccag ggataacctg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat

1200

gatttgggct acacacgtgc tacaatggcg taaacaaagg gaagcaaagg agcgatctgg

1260

agcaaacccc aaaaataacg tctcagttcg gattgtagtc tgcaactcga ctacatgaag

1320

ctggaatcgc tagtaatcgc ggatcagaat gccgcggtga atacgttccc gggtcttgta

1380

cacaccgccc gtcacaccat gggagttggt aacgcccgaa gtcagtgacc caaccgtaag

1440

gagggagctg ccgangggac tgataactgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtatcgg

1500

aaggtgcggc tgnntcacct cc

1522

<210> 644

<211> 1367

<212> DNA

<213> Clostridium spiroforme

<220>

<221> modified_base

<222> (41)..(42)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 644

agcaatgctc gagtggcgaa cgggtgagta atacataagt nncctgccct agacaggggg

60

ataactgctg gaaacggcag ctaagaccgc ataggtatgg acactgcatg gtgaccatat

120

taaaagtgcc aaggcactgg tagaggatgg acttatggcg cattagctgg ttggtgaggt

180

aacggctcac caaggcgacg atgcgtagcc gacctgagag ggtgaccggc cacactggga

240

ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaattttcgg caatgggggg

300

aaccctgacc gagcaacgcc gcgtgaagga agaaggaatt cgttctgtaa acttctgtta

360

taaaggaaga acggcggata tagggaatga tatccgagtg acggtacttt atgagaaagc

420

cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg tggcgagcgt tatccggaat

480

tattgggcgt aaagagggag caggcggcgg cagaggtctg tggtgaaaga ctgaagctta

540

acttcagtaa gccatagaaa ccgggctgct agagtgcagg agaggatcgt ggaattccat

600

gtgtagcggt gaaatgcgta gatatatgga ggaacaccag tggcgaaggc gacggtctgg

660

cctgtaactg acgctcattc ccgaaagcgt ggggagcaaa taggattaga taccctagta

720

gtccacgccg taaacgatga gtactaagtg ttgggagtca aatttcagtg ctgcagttaa

780

cgcaataagt actccgcctg agtagtacgt tcgcaagaat gaaactcaaa ggaattgacg

840

ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gagcgttacc

900

aggtcttgac atccggatga agacctcata aatgagggct tcagtaagcc atagaaaccg

960

ggctgctgga gtccagcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc

1020

aacccttgtc gctagttacc atcattaagt tggggactct agcgagactg ccagtgacaa

1080

gctggaggaa ggcggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac

1140

gtgctacaat ggatggagca gagggaagcg aagccgcgag gtgaagcaaa acccataaaa

1200

ccattctcag ttcggattgt agtctgcaac tcgactacat gaagttggaa tcgctagtaa

1260

tcgcgaatca gcatgtcgcg gtgaatacgt tctcgggcct tgtacacacc gcccgtcaca

1320

ccatgagagt tgataacacc cgaagccggt ggcctaaccg caaggag

1367

<210> 645

<211> 1516

<212> DNA

<213> Clostridium sporogenes

<400> 645

ttaaaattga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgagcg atgaagcttc cttcgggaag tggattagcg gcggacgggt gagtaacacg

120

tgggtaacct gcctcaaagt gggggatagc cttccgaaag gaagattaat accgcataac

180

ataagagaat cgcatgattt tcttatcaaa gatttattgc tttgagatgg acccgcggcg

240

cattagctag ttggtaaggt aacggcttac caaggcaacg atgcgtagcc gacctgagag

300

ggtgatcggc cacattggaa ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaatattgcg caatggggga aaccctgacg cagcaacgcc gcgtgggtga tgaaggtctt

420

cggattgtaa agccctgttt tctgggacga taatgacggt accagaggag gaagccacgg

480

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggcg agcgttgtcc ggatttactg

540

ggcgtaaagg gtgcgtaggc ggatgtttaa gtgggatgtg aaatccccgg gcttaacctg

600

ggggctgcat tccaaactgg atatctagag tgcaggagag gaaagcggaa ttcctagtgt

660

agcggtgaaa tgcgtagaga ttaggaagaa caccagtggc gaaggcggct ttctggactg

720

taactgacgc tgaggcacga aagcgtgggt agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

acgccgtaaa cgatggatac taggtgtagg gggtatcaac tccccctgtg ccgcagttaa

840

cacaataagt atcccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt aaaactcaaa ggaattgacg

900

ggggcccgca caagcagcgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc

960

tggacttgac atcccttgca tagcctagag ataggtgaag cccttcgggg caaggagaca

1020

ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt aggttaagtc ctgcaacgag

1080

cgcaaccctt gttattagtt gctaccatta agttgagcac tctaatgaga ctgcctgggt

1140

aaccaggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtcc agggctacac

1200

acgtgctaca atggtaggta caataagacg caagaccgtg aggtggagca aaacttataa

1260

aacctatctc agttcggatt gtaggctgca actcgcctac atgaagctgg agttgctagt

1320

aatcgcgaat cagaatgtcg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca

1380

caccatgaga gctggtaaca cccgaagtcc gtgaggtaac cgtaaggagc cagcggccga

1440

aggtgggatt agtgattggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtaggaga acctgcggct

1500

ggatcacctc ctttct

1516

<210> 646

<211> 1400

<212> DNA

<213> Clostridium sporosphaeroides

<220>

<221> modified_base

<222> (1)..(2)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (832)..(832)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (836)..(836)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (862)..(862)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (922)..(922)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (926)..(926)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1141)..(1141)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1169)..(1169)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1272)..(1274)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1278)..(1278)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1293)..(1293)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1375)..(1375)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1380)..(1381)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 646

nntgaactta gcttagtggc ggacgggtga gtaacgcgtg agtawcctgc ctttcrgagg

60

gggatamcgt tcctgaaaac aacgctaata ccgcataata tattggtgtc gcatggcacc

120

ggtatcaaag gagcaatccg ctgcaagatg gactcgcgtc cgatyagcca gtkgatkggg

180

taaaggccca ccaaagcgac gatcggtagc cgggttgaga gactgaacgg ccacattggg

240

actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg gggatattgc acaatggagg

300

aaactctgat gcagcaatgc cgcgtgaggg aagacggtct tcggattgta aacctctgtc

360

cttggtgaag ataatgacgg tagccaagga ggaagctccg gctaactacg tgccagcagc

420

cgcggtaata cgtagggagc aagcgttgtc cggatttact gggtgtaaag ggtgcgtagg

480

cggctcttta agtcgggcgt gaaagctgtg ggcttaaccc acaaattgcg ttcgaaactg

540

gagggcttga gtgaagtaga ggtaggcgga attcccggtg tagcggtgaa atgcgtagag

600

atcgggagga acaccagtgg cgaaggcggc ctactgggct ttaactgacg ctgaggcacg

660

aaagcatggg tagcaaacag gattagatac cctggtagtc catgccgtaa acgatgatta

720

ctaggtgtgg ggggtctgac cccttccgtg ccggagttaa cacaataagt aatccacctg

780

gggagtacgg ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca cnagcngtgg

840

agtatgtggt ttaattcgaa gnaacgcgaa gaaccttacc aggtgttgac atccaactaa

900

cgaggcagag atgcattagg tngctncggg gaaagttgag acaggtggtc catggttgtc

960

gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtgatta

1020

gttstacgca agagcactct aatcagactg ccgttgacaa aacggaggaa ggtggggacg

1080

acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtactacaat ggtcgccaac

1140

ngagggaagc caagccgcga ggtggagcna acccccaaaa gcgatctcag ttcggattgt

1200

aggctgcaac ccgcctacat gaagttggaa ttgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg

1260

gcgaatacgt tnnngggnct tgtacacacc gcncgtcaca ccatgggagc cggtaatacc

1320

cgaagccaat agtctaaccg caaggaggac gttgtcgaag gtaggattgg cgacnggggn

1380

naagtcgtaa caaggtaacc

1400

<210> 647

<211> 1518

<212> DNA

<213> Clostridium stercorarium

<400> 647

tgatcctggc tcaggacgaa cgctggcggc gtgcctaaca catgcaagtc gaacgggatc

60

cgtgttacgg aggtctttgg accgaagtgg catggtgaga gtggcggacg ggcgagtaac

120

gcgtgagcaa cctgccctat gctgggggat aacaccggga aaccggtgct aataccgcat

180

aagaccacag tgacgcatgt cacagtggta aaagctgagg cggcatagga tgggctcgcg

240

tccgattagc tagttggtag ggtaacggcc taccaaggcg acgatcggta gccggactga

300

gaggttggcc ggccgcattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcgcaatggg ggaaaccctg acgcagcgac gccgcgtgga ggaagaaggc

420

ctttgggttg taaactcctt tgatcgggga cgaagatgac ggtacccgaa gaacaagcca

480

cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg gcgagcgttg tccggaatta

540

ctgggtgtaa agggcgtgta ggcggggtgc caagtcaggt gtgaaatacc ggggcttaac

600

ctcgggggtg catctgaaac tggtgctctt gagtgccgga gaggaaagcg gaattcccag

660

tgtagcggtg aaatgcgtag atattgggag gaacaccagt ggcgaaggcg gctttctgga

720

cggtaactga cgctgaggcg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag

780

tccacgctgt aaacgatgga tactaggtgt aggaggtatc gaccccttct gtgccgtagt

840

taacacaata agtatcccac ctggggagta cggccgcaag gctgaaactc aaaggaattg

900

acgggggccc gcacaagcag tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt

960

accagggctt gacatccccc tgacggatgt agagatacat cttctccgca aggagcaggg

1020

gagacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1080

aacgagcgca acccttgtcg ttagttgcca gcagtaagat gggcactcta acgagactgc

1140

cggcgagaag tcggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgtcctgg

1200

gctacacacg tgctacaatg gcgactacag agggaagcaa atccgcgagg aggagcaaat

1260

cccgaaaggt cgtcccagtt cggattgcag gctgcaactc gcctgcatga agccggaatt

1320

gctagtaatg gcaggtcagc atctgccgtg aatacgttcc cgggctttgt acacaccgcc

1380

cgtcacacca tgagagctgg caacacccga agccggtagc ctaaccgaga ggggggcgcc

1440

gtcgaaggtg gggtcagtga ttggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta tcggaaggtg

1500

cggctggatc acctcctt

1518

<210> 648

<211> 1437

<212> DNA

<213> Clostridium sticklandii

<220>

<221> modified_base

<222> (47)..(49)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (71)..(71)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (90)..(90)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (169)..(169)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (309)..(309)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (339)..(339)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (346)..(346)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (361)..(361)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (426)..(426)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (457)..(457)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (480)..(480)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (494)..(494)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (511)..(511)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (520)..(520)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (568)..(569)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (808)..(808)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (811)..(811)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (857)..(857)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1040)..(1040)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1058)..(1058)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1065)..(1065)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1117)..(1117)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1143)..(1144)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1173)..(1173)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1246)..(1246)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1308)..(1308)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1342)..(1342)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 648

tatttgagag tttgatcctg gctcaggatg aacgctggcg gcgtgcnnna cacatgcaag

60

tcgaaaatgc nagcggcgga cgggtgcgtn acacgtgggt aacctgcccc tatcactggg

120

ataacacact gaaaagtgtg ctaataccag ataacataag cttttggcnt cattagctta

180

tcaaagaatt tcggataggg atgggcccgc gtctgattag ctagttggtg aggtaacggc

240

tcaccaaggc aacgatcagt agccgacctg agagggtgat cggccacact ggaactgaga

300

cacggtccng actcctacgg gaggcagcag tggggaatnt tgcacnatgg gcgaaagcct

360

natgcagcaa cgccgcgtga gcgatgaagg ccttcgggtc gtaaagctct gtcctatggg

420

aagatnatga cggtaccata ggaggaagcc ccggctnact acgtgccagc agccgcggtn

480

atacgtaggg ggcnagcgtt atccggaatt nctgggcgtn aagggtgcgt aggcggttta

540

tcaagtcagg ggtgaaaggc tacggctnna ccgtagtgag cctctgaaac tggtgaactt

600

gagtgtagga gaggaaagtg gaattcccag tgtagcggtg aaatgcgtag atattgggag

660

gaacaccagt ggcgaaggcg actttctgga ctacaactga cgctgaggca cgaaagcgtg

720

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacgatgag tactaggtgt

780

cggctgtcaa aggtcggtgc cggcgttnac ncattaagta ctccgcctgg ggagtacgct

840

cgcaagagtg aaactcnaag gaattgacgg ggacccgcac aagtagcgga gcatgtggtt

900

taattcgaag caacgcgaag aaccttacct aggcttgaca tccctttgca aagyccttaa

960

ccggrctcct yttsttcgsa aracaaaggt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

1020

tgtcgtgaga tgttgggttn agtcccgcaa cgagcgcnac ccctnttttt agttgccatc

1080

agttaggctg ggcactctag aaagactgcc gaggacnact cggaggaagg tggggatgac

1140

gtnnaatcat catgcccctt atgcttaggg ctncacacgt gctacaatgg ctgttacaaa

1200

gggctgcgag accgcgaggt ggagccaatc ccagaaaaac agtctnagtt cggattgtag

1260

gctgaaactc gcctacatga agccggagtt actagtaatc gcagatcnga atgctgcggt

1320

gaatgcgttc ccgggtcttg tncacaccgc ccgtcacacc atggaagttg ggggcaccca

1380

aagttagtta tccaacctta cgggggaggc tacctaaggt gaattcaatg actgggg

1437

<210> 649

<211> 1447

<212> DNA

<213> Clostridium straminisolvens

<220>

<221> modified_base

<222> (56)..(56)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 649

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc ggagatatat tgaagnttta

60

tcggatatat atcttagcgg cggacgggtg agtaacgcgt gggtaacctg cctcatacag

120

ggggataaca cagggaaact tgtgctaata ccgcataaca taacgaggcg gcatcgcttt

180

gttatcaaag gagcaatccg gtatgagatg ggcccgcgtc cgattagcta gttggtgagg

240

taacggctca ccaaggcgac gatcggtagc cgaactgaga ggttgatcgg ccacattggg

300

actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc gcaatggggg

360

aaaccctgac gcagcaacgc cgcgtgaagg aagaaggcct tcgggttgta aacttctttg

420

attggggacg aagaaagtga ctgtacccaa aaaacaagcc acggctaact acgtgccagc

480

agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgtt gtccggaatt actgggtgta aagggcgtgt

540

aggcggggat gcaagtcaga tgtgaaattc cggggcttaa ccccggcgct gcatctgaaa

600

ctgtatctct tgagtgctgg agaggaaagc ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta

660

gatattagga ggaacaccag tggcgaaggc ggctttctgg acagtaactg acgctgaggc

720

gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatgg

780

atactaggtg taggaggtat cgaccccttc tgtgccggag ttaacacaat aagtatccca

840

cctggggagt acggccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagca

900

gtggagtatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccagggct tgacatccct

960

tgaaagtcct agagatagga tttctcttcg gagcaaggag acaggtggtg catggttgtc

1020

gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctgttgtta

1080

gttgccatca ttaagttggg cactctagcg agactgccgg tgacaaatcg gaggaaggtg

1140

gggacgacgt caaatcatca tgccccttat gtcctgggct acacacgtac tacaatggct

1200

gttacaaagg gaagctaagc cgcgaggtgg agcaaatccc caaaggcagc cccagttcag

1260

attgcaggct gaaactcgcc tgcatgaagt cggaattgct agtaatggca ggtcagcata

1320

ctgccgtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg agagtctgca

1380

acacccgaag tcagtagtct aaccgcaagg aggacgctgc cgaaggtggg gccgatgatt

1440

ggggtga

1447

<210> 650

<211> 1504

<212> DNA

<213> Clostridium subterminale

<400> 650

agagggttga tcatggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaacacat gcaagtcgag

60

cgatgaagcc cttcggggtg aattagcggc ggacgggtga gtaacacgtg ggtaacctgc

120

cttatagagg gggatagcct tccgaaagga agattaatac cgcataatat gtttttatcg

180

catggtagaa acatcaaagg agcaatccgc tataagatgg acccgcggcg cattagctag

240

ttggtgaggt aacggcccac caaggcgacg atgcgtagcc gacctgagag ggtgatcggc

300

cacattggaa ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgcg

360

caatggggga aaccctgacg cagcaacgcc gcgtgaatga agaaggcctt agggttgtaa

420

agttctgttt tctgggacga taatgacggt accagaggag gaagccaggg ctaactacgt

480

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttactg ggcgtaaagg

540

atgcgtaggc ggatgtttaa gtgagatgtg aaatacccga gctcaacttg ggtgctgcat

600

ttcaaactgg atatctagag tgcaggagag gaaagcggaa ttcctagtgt agcggtgaaa

660

tgcgtagaga ttaggaagaa caccagtggc gaaggcggct ttctggactg taactgacgc

720

tgaggcatga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa

780

cgatgaatac taggtgtagg aggtatcgac tccttctgtg ccgcagttaa cacaataagt

840

attccgcctg gggagtacga tcgcaagatt aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca

900

caagcagcgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc tagacttgac

960

atctcctgaa ttacccttaa tcggggaagc ccttcggggc aggaagacag gtggtgcatg

1020

gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta

1080

tcattagttg ctaccattaa gttgagcact ctagtgagac tgccacggtt aacgtggagg

1140

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtct agggctacac acgtgctaca

1200

atggtgaata caaatagatg caataccgcg aggtggagcc aaactataaa attcatccca

1260

gttcggattg tagtctgaaa ctcgactaca tgaagccgga gttgctagta atcgcgaatc

1320

agcatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgagag

1380

ctggtaacac ccgaagtccg tgaggtaacc gtaaggagcc agcggccgaa ggtgggatta

1440

gtgattgggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtaggagaa cctgcggttg gatcaccttc

1500

ctta

1504

<210> 651

<211> 1504

<212> DNA

<213> Clostridium sulfidigenes

<400> 651

tgagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc

60

gatgaagccc ttcggggtga attagcggcg gacgggtgag taacacgtgg gtaacctgcc

120

ttatagaggg ggatagcctt ccgaaaggaa gattaatacc gcatgaaatg tttttatcgc

180

atggtagaaa catcaaagga gtaatccgct ataagatgga cccgcggcgc attagctagt

240

tggtgaggta acggcccacc aaggcgacga tgcgtagccg acctgagagg gtgatcggcc

300

acattggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcgc

360

aatgggggaa accctgacgc agcaacgccg cgtgaatgaa gaaggcctta gggttgtaaa

420

gttctgtttt ctgggacgat aatgacggta ccagaggagg aagccacggc taactacgtg

480

ccagcagccg cggtaatacg taggtggcaa gcgttgtccg gatttactgg gcgtaaagga

540

tgcgtaggcg gatgtttaag tgagatgtga aatacccgag ctcaacttgg gtgctgcatt

600

tcaaactgga tatctagagt gcaggagagg aaagcggaat tcctagtgta gcggtgaaat

660

gcgtagagat taggaagaac accagtggcg aaggcggctt tctggactgt aactgacgct

720

gaggcatgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac

780

gatgaatact aggtgtagga ggtatcgact ccttctgtgc cgcagttaac acaataagta

840

ttccgcctgg ggagtacgat cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac

900

aagcagcgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacct agacttgaca

960

tctcctgaat tacccttaac cggggaaagc ttcggggcag gaagacaggt ggtgcatggt

1020

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc

1080

attagttgct accattaagt tgagcactct agtgagactg ccacggttaa cgtggaggaa

1140

ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgtctag ggctacacac gtgctacaat

1200

ggtgaataca aatagatgca ataccgcgag gtggagccaa actataaaat tcatcccagt

1260

tcggattgta gtctgaaact cgactacatg aagccggagt tgctagtaat cgcgaatcag

1320

catgtcgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgagagct

1380

ggtaacaccc gaagtccgtg aggtaaccgt aaggagccag cggccgaagg tgggattagt

1440

gattggggtg aagtcgtaac aaggtagccg taggagaacc tgcggctgga tcacctcctt

1500

tcta

1504

<210> 652

<211> 1384

<212> DNA

<213> Clostridium symbiosum

<400> 652

gaacgaagcg atttaacgga agttttcgga tggaagttga attgactgag tggcggacgg

60

gtgagtaacg cgtgggtaac ctgccttgta ctgggggaca acagttagaa atgactgcta

120

ataccgcata agcgcacagt atcgcatgat acagtgtgaa aaactccggt ggtacaagat

180

ggacccgcgt ctgattagct agttggtaag gtaacggctt accaaggcga cgatcagtag

240

ccgacctgag agggtgaccg gccacattgg gactgagaca cggcccaaac tcctacggga

300

ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc gaaagcctga tgcagcgacg ccgcgtgagt

360

gaagaagtat ttcggtatgt aaagctctat cagcagggaa gaaaatgacg gtacctgact

420

aagaagcccc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggggg caagcgttat

480

ccggatttac tgggtgtaaa gggagcgtag acggtaaagc aagtctgaag tgaaagcccg

540

cggctcaact gcgggactgc tttggaaact gtttaactgg agtgtcggag aggtaagtgg

600

aattcctagt gtagcggtga aatgcgtaga tattaggagg aacaccagtg gcgaaggcga

660

cttactggac gataactgac gttgaggctc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata

720

ccctggtagt ccacgccgta aacgatgaat actaggtgtt ggggagcaaa gctcttcggt

780

gccgtcgcaa acgcagtaag tattccacct ggggagtacg ttcgcaagaa tgaaactcaa

840

aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga

900

agaaccttac caggtcttga catcgatccg acgggggagt aacgtcccct tcccttcggg

960

gcggagaaga aaggtggtgc atggagtgtc ggagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag

1020

tcccgcaacg agcgcaaccc ttattctaag tagccagcgg ttcggccggg aactcttggg

1080

agactgccag ggataacctg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat

1140

gatctgggct acacacgtgc tacaatggcg taaacaaaga gaagcaagac cgcgaggtgg

1200

agcaaatctc aaaaataacg tctcagttcg gactgcaggc tgcaactcgc ctgcacgaag

1260

ctggaatcgc tagtaatcgc gaatcagaat gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta

1320

cacaccgccc gtcacaccat gggagtcagt aacgcccgaa gtcagtgacc caaccgcaag

1380

gagg

1384

<210> 653

<211> 1378

<212> DNA

<213> Clostridium tertium

<400> 653

gtcgagcgag aggagttcct tcgggaacaa atctagcggc ggacgggtga gtaacacgtg

60

ggcaacctgc cttgtagagg ggaatagcct tccgaaagga agattaatac cgcataacat

120

tacattttcg catgaagaag taattaaagg agcaatccgc tacaagatgg gcccgcggcg

180

cattagctag ttggtgaggt aacggctcac caaggcgacg atgcgtagcc gacctgagag

240

ggtgatcggc cacattggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg

300

gaatattgca caatggggga aaccctgatg cagcaacgcc gcgtgagtga tgaaggtttt

360

cggatcgtaa agctctgtct tcagggacga taatgacggt acctgaggag gaagccacgg

420

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggcg agcgttgtcc ggatttactg

480

ggcgtaaagg gagcgtaggc ggatttttaa gtgagatgtg aaatacccgg gctcaacttg

540

ggtgctgcat ttcaaactgg aagtctagag tgcaggagag gagagtggaa ttcctagtgt

600

agcggtgaaa tgcgtagaga ttaggaagaa caccagtggc gaaggcgact ctctggactg

660

taactgacgc tgaggctcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

720

acgccgtaaa cgatgaatac taggtgtagg ggttgtcatg acctctgtgc cgccgcaaac

780

gcattaagta ttccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg

840

gggcccgcac aagcagcgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacct

900

agacttgaca tctcctgcat tactcttaat cgaggaagtc ccttcgggga caggatgaca

960

ggtggtgcat gggcgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1020

cgcaaccctt attgttagtt gctaccattt agttgagcac tctagcgaga ctgcccgggt

1080

taaccgggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgtc tagggctaca

1140

cacgtgctac aatggcaagt acaaagagat gcgataccgc gaggtggagc taaactataa

1200

aacttgtctc agttcggatt gtaggctgaa actcgcctac atgaagctgg agttgctagt

1260

aatcgcgaat cagaatgtcg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca

1320

caccatgaga gttggcaata cccaaagttc gtgagctaac ccgtaaggga ggcagcga

1378

<210> 654

<211> 1515

<212> DNA

<213> Clostridium tetani

<400> 654

taaattgaga gtttgatcct ggctcaggac gaacgctggc ggcgtgctta acacatgcaa

60

gtcgagcgat gaagcttcct tcgggaagtg gattagcggc ggacgggtga gtaacacgtg

120

ggcaacctgc ctcaaagagg ggaatagccc tccgaaagga ggattaatac cgcataaagt

180

taaggtttcg catgaaactt taaccaaagg agtaatctgc tttgagatgg gcccgcgccc

240

cattagctag ttggtaaggt aatggcttac caaggcgacg atgggtagcc gacctgagag

300

ggtgatcggc cacattggaa ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaatattgcg caatggggga aaccctgacg cagcaacgcc gcgtgggtga tgaaggtttt

420

cggatcgtaa aaccctgttt tctgggacga taatgacggt accagatgag gaagccacgg

480

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttactg

540

ggcgtaaagg gtgcgtaggc ggatgcttaa gtgagatgtg aaatacctaa gcttaactta

600

ggggctgcat ttcaaactgg gcatctagag tacaggagag ggaaacggaa ttcctagtgt

660

agcggtgaaa tgcgtagaga ttaggaagaa caccagtggc gaaggcggtt tcctggactg

720

taactgacgc tgaggcacga aagcgtgggt agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

acgccgtaaa cgatgaatac taggtgtagg agggtccaac cttctgtgcc gcagttaaca

840

cattaagtat tccgcctggg gagtacggtc gcaagactaa aactcaaagg aattgacggg

900

ggcccgcaca agcagcggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccta

960

gacttgacat accctgaatt actcgtaact gaggaagtcc cttcggggac agggatacag

1020

gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1080

gcaaccctta ttattagttg ctaccattaa gttgagcact ctaatgagac tgcctgggtg

1140

aaccaggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtct agggctacac

1200

acgtgctaca atggtcggta cagagagacg caagaccgcg aggtggagca aatctcaaaa

1260

accgatccca gttcggattg caggctgaaa ctcgcctgca tgaagccgga gttgctagta

1320

atcgcaaatc agaatgttgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac

1380

accatgagag ttggcaacac ccgaagtccg tgaggtaacc gtaaggagcc agcggccgaa

1440

ggtggggtta atgattgggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtaggagaa cctgcggctg

1500

gatcacctcc tttct

1515

<210> 655

<211> 1521

<212> DNA

<213> Clostridium thermocellum

<400> 655

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc

60

ggggatatac ggaaggttta ccggaagtat atcctagcgg cggacgggtg agtaacgcgt

120

gggtaaccta cctcatacag ggggataaca cagggaaacc tgtgctaata ccgcataata

180

taacggggcg gcatcgtcct gttatcaaag gagaaatccg gtatgagatg ggcccgcgtc

240

cgattagctg gttggtgagg taacggctca ccaaggcgac gatcggtagc cgaactgaga

300

ggttggtcgg ccacattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg

360

ggaatattgc gcaatggggg aaaccctgac gcagcaacgc cgcgtgaagg aagaaggcct

420

tcgggttgta aacttctttg attggggacg aaggaagtga cggtacccaa agaacaagcc

480

acggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt ggcgagcgtt gtccggaatt

540

actgggtgta aagggcgcgt aggcggggat gcaagtcaga tgtgaaattc cggggcttaa

600

ccccggcgct gcatctgaaa ctgtatctct tgagtgctgg agaggaaagc ggaattccta

660

gtgtagcggt gaaatgcgta gatattagga ggaacaccag tggcgaaggc ggctttctgg

720

acagtaactg acgctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta

780

gtccacgccg taaacgatgg atactaggtg taggaggtat cgaccccttc tgtgccggag

840

ttaacacaat aagtatccca cctggggagt acggccgcaa ggttgaaact caaaggaatt

900

gacgggggcc cgcacaagca gtggagtatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct

960

taccagggct tgacatccct ctgacagctc tagagatagg gcttcccttc ggggcagagg

1020

agacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1080

acgagcgcaa cccttgtcgt tagttgccag cacgttaagg tgggcactct agcgagactg

1140

ccggcgacaa gtcggaggaa ggtggggacg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgtcctg

1200

ggctacacac gtactacaat ggctgctaca aagggaagcg ataccgcgag gtggagcaaa

1260

tccccaaaag cagtcccagt tcggattgca ggctgaaact cgcctgcatg aagtcggaat

1320

tgctagtaat ggcaggtcag catactgccg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1380

cccgtcacac catgagagtc tgcaacaccc gaagtcagta gtctaaccgt aaggagggcg

1440

ctgccgaagg tggggcagat gattggggtg aagtcgtaac aaggtagccg tatcggaagg

1500

tgcggctgga tcacctcctt t

1521

<210> 656

<211> 1360

<212> DNA

<213> Clostridium tyrobutyricum

<400> 656

agcgatgaaa ccccttcggg ggtggattag cggcggacgg gtgagtaaca cgtgggtaac

60

ctgcctcaaa gtgggggata gccttccgaa aggaagatta ataccgcata aagccaagtt

120

tcacatggaa tttggatgaa aggagtaatt cgctttgaga tggacccgcg gcgcattagt

180

tagttggtgg ggtaatggcc taccaagaca gcgatgcgta gccgacctga gagggtgatc

240

ggccacattg gaactgagat acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

300

gcacaatggg cgaaagcctg atgcagcaac gccgcgtgag tgatgaaggt cttcggattg

360

taaagctctg tcttttggga cgataatgac ggtaccaaag gaggaagcca cggctaacta

420

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg gcgagcgttg tccggattta ctgggcgtaa

480

agggtgcgta ggcggatgtt taagtgagat gtgaaatacc cgggcttaac ttgggtgctg

540

catttcaaac tggatatcta gagtgcagga gaggagaatg gaattcctag tgtagcggtg

600

aaatgcgtag agattaggaa gaacaccagt ggcgaaggcg attctctgga ctgtaactga

660

cgctgaggca cgaaagcgtg ggtagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt

720

aaacgatgag tactaggtgt aggaggtatc gaccccttct gtgccgcagt aaacacatta

780

agtactccgc ctgggaagta cgatcgcaag attaaaactc aaaggaattg acgggggccc

840

gcacaagcag cggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt acctggactt

900

gacatcccct gaataaccta gagataggcg aagcccttcg gggcagggag acaggtggtg

960

catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttaggttaa gtcctgcaac gagcgcaacc

1020

cttattgtta gttgctaaca ttcagttgag cactctaacg agactgccgc ggttaacgcg

1080

gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gtccagggca acacacgtgc

1140

tacaatgggc agaacaaaga gaagcaatac cgcgaggtgg agccaaactc aaaaactgct

1200

ctcagttcgg attgcaggct gaaactcgcc tgcatgaagc tggagttgct agtaatcgcg

1260

aatcagcatg tcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg

1320

agagctggca acacccgaag tccgtagtct aacgtaagag

1360

<210> 657

<211> 1482

<212> DNA

<213> Clostridium viride

<220>

<221> modified_base

<222> (746)..(746)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 657

gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggagccatct ggaacaagtt

60

ttcggacaag ggaaagatgt gcttagtggc ggacgggtga gtaacgcgtg agtaacctgc

120

cttggagtgg ggaataacac atcgaaaggt gtgctaatac cgcatgatgc aacgggatcg

180

catggttctg ttgccaaaga tttatcgctc tgagatggac tcgcgtctga ttagctagtt

240

ggtgaggtaa tggctcacca aggcgacgat cagtagccgg actgagaggt tgaccggcca

300

cattgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgggca

360

atgggcgcaa gcctgaccca gcaacgccgc gtgaaggaag aaggccctcg ggttgtaaac

420

ttcttttatt cgagacgaaa caaatgacgg taccgaatga ataagccacg gctaactacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttatc cggatttact gggtgtaaag

540

ggcgtgtagg cgggactgca agtcagatgt gaaattccag ggctcaactc tggacctgca

600

tttgaaactg tagttcttga gtgatggaga ggcaggcgga attccgagtg tagcggtgaa

660

atgcgtagat attcggagga acaccagtgg cgaaggcggc ctgctggaca ttaactgacg

720

ctgaggcgcg aaagcgtggg gagcanacag gattagatac cctggtagtc cacgctgtaa

780

acgatggata ctaggtgtgg ggggactgac cccttccgtg ccgcagttaa cacaataagt

840

atcccacctg gggagtacga tcgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca

900

caagcggtgg agtatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc agggcttgac

960

atccctctga ccggtctaga gataggccct ccctcggggc agaggtgaca ggtggtgcat

1020

ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct

1080

attgttagtt gctacgcaag agcactctag cgagactgcc gttgacaaaa cggaggaagg

1140

tggggacgac gtcaaatcat catgcccctt atgtcctggg ctacacacgt actacaatgg

1200

cgcttaacag agggaggcaa taccgcgagg tggagcaaac ccctaaaagg cgtcccagtt

1260

cggattgcag gctgaaaccc gcctgtatga agttggaatc gctagtaatc gcggatcagc

1320

atgccgcggt gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc atgagagtcg

1380

ggaacacccg aagtccgtag cctaacagca atgagggcgc ggccgaaggt gggttcgata

1440

attggggtga agtcgtaaca aggtagccgt atcggaaggt gc

1482

<210> 658

<211> 1441

<212> DNA

<213> Clostridium xylanolyticum

<220>

<221> modified_base

<222> (830)..(830)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1001)..(1001)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1386)..(1386)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 658

gatcctggct caggatgaac gctggcggcg tgcttaacac atgcaagtcg agcgaagcat

60

tttaaaggaa gttttcggat ggaatttaga atgacttagc ggcggacggg tgagtaacgc

120

gtgggtaacc tgcctcatac agggggataa cagttagaaa tgactgctaa taccgcataa

180

gcgcacagtg ctgcatagta cagtgtgaaa aactccggtg gtatgagatg gacccgcgtc

240

tgattaggta gttggtgagg taacggccca ccaagccgac gatcagtagc cgacctgaga

300

gggtgaccgg ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag gcagcagtgg

360

ggaatattgg acaatggggg aaaccctgat ccagcgacgc cgcgtgagtg aagaagtatt

420

tcggtatgta aagctctatc agcagggaag aaaatgacgg tacctgacta agaagccccg

480

gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc aagcgttatc cggatttact

540

gggtgtaaag ggagcgtaga cggctctgca agtctggagt gaaagcccgg ggctcaaccc

600

cgggactgct ttggaaactg tggagctaga gtgcaggaga ggtaagtgga attcctagtg

660

tagcggtgaa atgcgtagat attaggagga acaccagtgg cgaaggcggc ttactggact

720

gtaactgacg ttgaggctcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc

780

cacgccgtaa acgatgaata ctaggtgttg gggagcaaag ctcttcggtn ccgccgctaa

840

cgcaataagt attccacctg gggagtacgt tcgcaagaat gaaactcaaa ggaattgacg

900

gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc

960

aagtcttgac atcggaatga ccgtctcgta acggagacct nccttcgggg cattccagac

1020

aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1080

gcgcaaccct tatccttagt agccagcatg twatggtggg cactctgggg agactgccag

1140

ggataacctg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gatttgggct

1200

acacacgtgc tacaatggcg taaacaaagg gaagcaaagg agcgatctgg agcaaatccc

1260

aaaaataacg tctcagttcg gattgtagtc tgcaactcga ctacatgaag ctggaatcgc

1320

tagtaatcgc agatcagaat gctgcggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc

1380

gtcacnccat gggagttggt aacgcccgaa gtcagtgacc caaccgtaag gagggagctg

1440

c

1441

<210> 659

<211> 1357

<212> DNA

<213> Collinsella aerofaciens

<220>

<221> modified_base

<222> (766)..(766)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 659

acggcacccc tctccggagg gaagcgagtg gcgaacggct gagtaacacg tggagaacct

60

gccccctccc ccgggatagc cgcccgaaag gacgggtaat accggatacc cccgggcgcc

120

gcatggcgcc cgggctaaag ccccgacggg aggggatggc tccgcggccc atcaggtaga

180

cggcggggtg acggcccacc gtgccgacaa cgggtagccg ggttgagaga ccgaccggcc

240

agattgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatcttgcgc

300

aatgggggga accctgacgc agcgacgccg cgtgcgggac ggaggccttc gggtcgtaaa

360

ccgctttcag cagggaagag tcaagactgt acctgcagaa gaagccccgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtagggggcg agcgttatcc ggattcattg ggcgtaaagc

480

gcgcgtaggc ggcccggcag gccgggggtc gaagcggggg gctcaacccc ccgaagcccc

540

cggaacctcc gcggcttggg tccggtaggg gagggtggaa cacccggtgt agcggtggaa

600

tgcgcagata tcgggtggaa caccggtggc gaaggcggcc ctctgggccg agaccgacgc

660

tgaggcgcga aagctggggg agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc cagccgtaaa

720

cgatggacgc tgggtgtggg gggacgatcc ccccgtgccg cagccnacgc attaagcgtc

780

ccgcctgggg agtacggccg caaggctaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa

840

gcagcggagc atgtggctta attcgaagca acgcgaagaa ccttacggcg catccccccg

900

aggcccacgg ggggtccgcc gcgtgggtca gaggagcgca tacgggaggt gcatggttgt

960

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccccgccgcg

1020

tgttgccatc gggtgatgcc gggaacccac gcgggaccgc cgccgtcaag gcggaggagg

1080

gcggggacga cgtcaagtca tcatgcccct tatgccctgg gctgcacacg tgctacaatg

1140

gccggtacag agggatgcca ccccgcgagg gggagcggat cccggaaagc cggccccagt

1200

tcggattggg ggctgcaacc cgcccccatg aagtcggagt tgctagtaat cgcggatcag

1260

catgccgcgg tgaatgcgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac cacccgagtc

1320

gtctgcaccc gaagtcgccg gcccaaccgc aaggggg

1357

<210> 660

<211> 1340

<212> DNA

<213> Collinsella intestinalis

<400> 660

gaacggcacc caccctcggg tggaagcgag tggcgaacgg ctgagtaaca cgtggagaac

60

ccgccccctc ctccgggata gcctcgggaa accgtgggta ataccggatg accccgcagg

120

gccgcatggc cccgcgggca aagcccagac gggaggggat ggctccgcgg cccatcaggt

180

agacggcggg gtgacggccc accgtgccga cgacgggtag ccgggttgag agaccgaccg

240

gccagattgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatcttg

300

cgcaatgggg ggaaccctga cgcagcgacg ccgcgtgcgg gacgaaggcc ctcgggtcgt

360

aaaccgcttt cagcaggatg agacaagacg gtacctgcag aagaagcccc ggctaactac

420

gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggggg cgagcgttat ccggattcat tgggcgtaaa

480

gcgcgcgtag gcggcccggc aggcaggggg tcaaatggcg gggctcaacc ccgtcccgcc

540

ccctgaaccg ccgggctcgg gtccggtagg ggagggtgga acacccggtg tagcggtgga

600

atgcgcagat atcgggtgga acaccggtgg cgaaggcggc cctctgggcc gagaccgacg

660

ctgaggcgcg aaagctgggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc ccagccgtaa

720

acgatggacg ctaggtgtgg ggggacgatc cctccgtgcc gcagccaacg cattaagcgt

780

cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

840

agcagcggag catgtggctt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag ggcttgacat

900

gaccgtgaag ccggggagac ccggtggccg agaggagcgg tcacaggtgg tgcatggctg

960

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgtttggat aacggcggcg aaggccgcaa cccccgccgc

1020

atgttgccag cacctcgggt gggcacccat gcgggaccgc cggagtcaat ccggaggagg

1080

gcggggacga cgtcaagtca tcatgcccct tatgccctgg gctgcacacg tgctacaatg

1140

gccggtacag cgggatgcga tggcgcgagc cggagcggat ccctgaaagc cggccccagt

1200

tcggattggg ggctgcaacc cgcccccatg aagtcggagt tgctagtaat cgcggatcag

1260

catgccgcgg tgaatgcgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac cacccgagtc

1320

gtctgcaccc gaagtcgccg

1340

<210> 661

<211> 1264

<212> DNA

<213> Collinsella stercoris

<220>

<221> modified_base

<222> (1223)..(1224)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 661

gccccctcct ccgggatagc ctcgggaaac cgtgggtaat accggatgac cccggcaggc

60

cgcatggccg gccgggcaaa gcccagacgg gaggggatgg ctccgcggcc catcaggtag

120

acggcggggt gacggcccac cgtgccgacg acgggtagcc gggttgagag accgaccggc

180

cagattggga ctgagacacg gcccacactc ctacgggagg cagcagtggg gaatcttgcg

240

caatgggggg aaccctgacg cagcgacgcc gcgtgcggga cgaaggccct cgggtcgtaa

300

accgctttca gcggaacaaa cgtgcagaag aagccccggc taactacgtg ccagcagccg

360

cggtatacgt agggggcgag cgttatccgg attcattggg cgtaaagcgc gcgtagcggc

420

ccggcaggca gggggtcaaa tggcggggct caaccccgtc ccgccccctg aaccgccggg

480

ctcggtccgg taggggaggg tggaacaccc ggtgtacggt ggaatgcgca gatatcgggt

540

ggaacaccgg tggcgaagcg gcctctgggc cgaaccgacg ctgagcgcga aagctggggg

600

agcgaacagg attaaatacc ctggtagtcc cagccgtaaa cgatggacgc taggtgtggg

660

aggggaaccc ttccgtgccg cagcccacgc attaggcgtc ccgcctgggg agtacggccg

720

caaggctaaa actccaagga attgactggg ggccctcaaa gcagcggagc atgtggctta

780

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg gcttgacatg cgcgtgaagc cggggagacc

840

cggtggccga gaggagcgcg cacaggtggt gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

900

tgtttggtta agtccagcaa cgagcgcaac ccccgccgca tgttgccagc acctcgggtg

960

ggcacccatg cgggaccgcc ggagtcaatc cggaggaggg cggggacgac gtcaagtcat

1020

catgcccctt atgccctggg ctgcacacgt gctacaatgg ccggtacagc gggatgcgat

1080

ggcgcgagcc ggagcggatc cctgaaagcc ggccccagtt cggattgggg gctgcaaccc

1140

gcccccatga agtcggagtt gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt gaatgcgttc

1200

ccgggccttg tacacaccgc ccnncacacc acccgagtcg tctgcacccg aagtcgccgg

1260

ccca

1264

<210> 662

<211> 1356

<212> DNA

<213> Collinsella tanakaei

<400> 662

tcatggctca ggatgaacgc tggcggcgcg cctaacacat gcaagtcgaa cgagtggcga

60

acggctgagt aacacgtgga gaacctgccc cctcctcggg gatagccgcg ggaaaccgcg

120

ggtaacaccc gacgaccaaa tgagggaggg gatggctccg cggcccatca ggtagacggc

180

ggggtaacgg cccaccgtgc cgacaacggg tagccgggtt gagagaccga ccggccagat

240

tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaatc ttgcgcaatg

300

ggggcaaccc tgacgcagcg acgccgcgtg cgggacgaag gccttcgggt cgtaaaccgc

360

tttcagcagg gacgaagacg gtacctgcag aagaagcccc ggctaactac gtgccagcag

420

ccgcggtaat acgtaggggg cgagcgttat ccggattcat tgggcgtaaa gcgcgcgtag

480

gcggccgcgt aggcgggggg tcaaatcccg gggctcaacc ccggtccgcc ccccgaaccc

540

cgcggctcgg gtccggtagg ggagggtgga attcccggtg tagcggtgga atgcgcagat

600

atcgggagga acaccggtgg cgaaggcggc cctctgggcc gaccgacgct gaggcgcgaa

660

agctggggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtccc agccgtaaac gatggacgct

720

aggtgtgggg gcctccgtgc cgcagccaac gcattaagcg tcccgcctgg ggagtacggc

780

cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcagcgga gcatgtggct

840

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca gggcttgaca tgcacaggtg gtgcatggct

900

gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccccgccg

960

catgttgcca gcagctgggc acccatgcgg gaccgccggc gtcaagccgg aggagggcgg

1020

ggacgacgtc aagtcatcat gccccttatg ccctgggctg cacacgtgct acaatggccg

1080

gcagcgggat gcgatggcgc gagccggagc ggatccctcc cggccccagt tcggatgggg

1140

gctgcaaccc gcccccagaa gtcggagttg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg

1200

aatgcgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cccgagtcgt ctgcacccga

1260

agccgccgcc cagggaggcg tcgaaggtgt ggagggtgag gggggtgaag tcgtaacaag

1320

gtagccgtac gggaacgtgc ggctggatca cctcct

1356

<210> 663

<211> 1505

<212> DNA

<213> Comamonadaceae bacterium NML000135

<400> 663

attgaacgct ggcggcatgc tttacacatg caagtcgaac ggtaacatgg gtgcttgcac

60

ctgatgacga gtggcgaacg ggtgagtaat acatcggaac atgcccaatt gtgggggata

120

gctcggcgaa agccggatta ataccgcata agatctacgg atgaaagcag gggaccttcg

180

ggccttgcgc gattggagtg gccgatggca gattaggtag ttggtggggt aaaggcctac

240

caagcctgcg atctgtagct ggtctgagag gacgaccagc cacactggga ctgagacacg

300

gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaattttgga caatgggcgc aagcctgatc

360

cagcaatgcc gcgtgcagga cgaaggcctt cgggttgtaa actgcttttg tgcagaacga

420

aaaatctctg gttaatacct ggggatcatg acggtactgc aagaataagc accggctaac

480

tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gtgcgagcgt taatcggaat tactgggcgt

540

aaagcgtgcg caggcggcga tgcaagaccg atgtgaaatc cccgggctca acctgggaac

600

tgcattagtg actgcattgc tggagtgcgg cagaggggga tggaattccg cgtgtagcag

660

tgaaatgcgt agatatgcgg aggaacaccg atggcgaagg caatcccctg ggcctgcact

720

gacgctcatg cacgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc

780

ctaaacgatg tcaactggtt gttggggatt catttcttca gtaacgaagc taacgcgtga

840

agttgaccgc ctggggagta cggtcgcaag actaaaactc aaaggaattg acggggaccc

900

gcacaagcgg tggatgatgt ggtttaattc gatgcaacgc gaaaaacctt acccaccttt

960

gacatgtacg gaacttgcca gagatggctt ggtgctcgaa agagagccgt aacacaggtg

1020

ctgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

1080

acccttgtca ttagttgcca tcatttagtt gggcactcta atgagactgc cggtgataaa

1140

ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtcc tcatggccct tataggtggg gctacacacg

1200

tcatacaatg gccggtacaa agggcagcca acccgcgagg gggagccaat cccataaagc

1260

cggtcgtagt ccggatcgca gtctgcaact cgactgcgtg aagtcggaat cgctagtaat

1320

cgtggatcag catgtcacgg tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac

1380

catgggagcg ggttctgcca gaagtaggta gcttaaccgt aaggagggcg cttaccacgg

1440

cagggctcgt gactggggtg aagtcgtaac aaggtagccg taccggaagg tgcggctgga

1500

tcacc

1505

<210> 664

<211> 1450

<212> DNA

<213> Comamonadaceae bacterium NML790751

<400> 664

tacacatgca agtcgaacgg taacatgggt gcttgcacct gatgacgagt ggcgaacggg

60

tgagtaatac atcggaacat gcccaattgt gggggatagc tcggcgaaag ccggattaat

120

accgcataag atctacggat gaaagcaggg gaccttcggg ccttgcgcga ttggagtggc

180

cgatggcaga ttaggtagtt ggtggggtaa aggcctacca agcctgcgat ctgtagctgg

240

tctgagagga cgaccagcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

300

gcagtgggga attttggaca atgggcgcaa gcctgatcca gcaatgccgc gtgcaggacg

360

aaggccttcg ggttgtaaac tgcttttgta cagaacgaaa agtctctggt taatacctgg

420

ggaacatgac ggtactgtaa gaataagcac cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacgtagggt gcgagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa agcgtgcgca ggcggcgatg

540

caagaccgat gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg cattagtgac tgcattgctg

600

gagtgcggca gagggggatg gaattccgcg tgtagcagtg aaatgcgtag atatgcggag

660

gaacaccgat ggcgaaggca atcccctggg cctgcactga cgctcatgca cgaaagcgtg

720

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccct aaacgatgtc aactggttgt

780

tggggattca tttcttcagt aacgaagcta acgcgtgaag ttgaccgcct ggggagtacg

840

gtcgcaagac taaaactcaa aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gatgatgtgg

900

tttaattcga tgcaacgcga aaaaccttac ccacctttga catgtacgga acttgccaga

960

gatggcttgg tgctcgaaag agagccgtaa cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg

1020

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcatt agttgccatc

1080

atttagttgg gcactctaat gagactgccg gtgataaacc ggaggaaggt ggggatgacg

1140

tcaagtcctc atggccctta taggtggggc tacacacgtc atacaatggc cggtacaaag

1200

ggcagccaac ccgcgagggg gagccaatcc cataaagccg gtcgtagtcc ggatcgcagt

1260

ctgcaactcg actgcgtgaa gtcggaatcg ctagtaatcg tggatcagca tgtcacggtg

1320

aatacgttcc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagcggg ttctgccaga

1380

agtaggtagt cttaaccgta aggagggcgc ttaccacggc agggctcgtg actggggtga

1440

agtcgtaaca

1450

<210> 665

<211> 1485

<212> DNA

<213> Comamonadaceae bacterium NML910035

<400> 665

aacgctggcg gcatgcttta cacatgcaag tcgaacggta acatgggtgc ttgcacctga

60

tgacgagtgg cgaacgggtg agtaatacat cggaacatgc ccaattgtgg gggatagctc

120

ggcgaaagcc ggattaatac cgcataagat ctacggatga aagcagggga ccttcgggcc

180

ttgcgcgatt ggagtggccg atggcagatt aggtagttgg tggggtaaag gcctaccaag

240

cctgcgatct gtagctggtc tgagaggacg accagccaca ctgggactga gacacggccc

300

agactcctac gggaggcagc agtggggaat tttggacaat gggcgcaagc ctgatccagc

360

aatgccgcgt gcaggacgaa ggccttcggg ttgtaaactg cttttgtaca gaacgaaaag

420

tctctggtta atacctgggg atcatgacgg tactgtaaga ataagcaccg gctaactacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc gagcgttaat cggaattact gggcgtaaag

540

cgtgcgcagg cggcgatgca agaccgatgt gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca

600

ttagtgactg cattgctgga gtgcggcaga gggggatgga attccgcgtg tagcagtgaa

660

atgcgtagat atgcggagga acaccgatgg cgaaggcaat cccctgggcc tgcactgacg

720

ctcatgcacg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccctaa

780

acgatgtcaa ctggttgttg gggattcatt tcttcagtaa cgaagctaac gcgtgaagtt

840

gaccgcctgg ggagtacggt cgcaagacta aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac

900

aagcggtgga tgatgtggtt taattcgatg caacgcgaaa aaccttaccc acctttgaca

960

tgtacggaac ttgccagaga tggcttggtg ctcgaaagag agccgtaaca caggtgctgc

1020

atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1080

ttgtcattag ttgccatcat taagttgggc actctaatga gactgccggt gataaaccgg

1140

aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcctcat ggcccttata ggtggggcta cacacgtcat

1200

acaatggccg gtacaaaggg caggcaaccc gcgaggggga gcaaatccca taaagccggt

1260

cgtagtccgg atcgcagtct gcaactcgac tgcgtgaagt cggaatcgct agtaatcgtg

1320

gatcagcatg tcacggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccatg

1380

ggagcgggtt ctgccagaag taggtagctt aaccgtaagg agggcgctta ccacggcagg

1440

gctcgtgact ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtacc ggaag

1485

<210> 666

<211> 1480

<212> DNA

<213> Comamonadaceae bacterium NML910036

<400> 666

attgaacgct ggcggcatgc tttacacatg caagtcgaac ggtaacatgg gtgcttgcac

60

ctgatgacga gtggcgaacg ggtgagtaat acatcggaac atgcccaatt gtgggggata

120

gctcggcgaa agccggatta ataccgcata agatctacgg atgaaagcag gggaccttcg

180

ggccttgcgc gattggagtg gccgatggca gattaggtag ttggtggggt aaaggcctac

240

caagcctgcg atctgtagct ggtctgagag gacggccagc cacactggga ctgagacacg

300

gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaattttgga caatgggcgc aagcctgatc

360

cagcaatgcc gcgtgcagga cgaaggcctt cgggttgtaa actgcttttg tacagaacga

420

aaagtctctg gttaatacct ggggatcatg acggtactgt aagaataagc accggctaac

480

tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gtgcgagcgt taatcggaat tactgggcgt

540

aaagcgtgcg caggcggcga tgcaagaccg atgtgaaatc cccgggctca acctgggaac

600

tgcattagtg actgcattgc tggagtgcgg cagaggggga tggaattccg cgtgtagcag

660

tgaaatgcgt agatatgcgg aggaacaccg atggcgaagg caatcccctg ggcctgcact

720

gacgctcatg cacgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc

780

ctaaacgatg tcaactggtt gttggggatt catttcttca gtaacgaagc taacgcgtga

840

agttgaccgc ctggggagta cggtcgcaag actaaaactc aaaggaattg acggggaccc

900

gcacaagcgg tggatgatgt ggtttaattc gatgcaacgc gaaaaacctt acccaccttt

960

gacatgtacg gaacttgcca gagatggctt ggtgctcgaa agagagccgt aacacaggtg

1020

ctgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

1080

acccttgtca ttagttgcca tcattaagtt gggcactcta atgagactgc cggtgataaa

1140

ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtcc tcatggccct tataggtggg gctacacacg

1200

tcatacaatg gccggtacaa agggcagcca acccgcgagg gggagcaaat cccataaagc

1260

cggtcgtagt ccggatcgca gtctgcaact cgactgcgtg aagtcggaat cgctagtaat

1320

cgtggatcag catgtcacgg tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac

1380

catgggagcg ggttctgcca gaagtaggta gcttaaccgt aaggagggcg cttaccacgg

1440

cagggctcgt gactggggtg aagtcgtaac aaggtagccg

1480

<210> 667

<211> 1499

<212> DNA

<213> Comamonadaceae bacterium oral taxon F47

<400> 667

agagtttgat cctggctcag attgaacgct ggcggcatgc tttacacatg caagtcgaac

60

ggcagcggag aggtgcttgc acttctgccg gcgagtggcg aacgggtgag taatgtatcg

120

gaacgtgccc agtagtgggg gataactact cgaaagagtg gctaataccg catgagatct

180

ctggatgaaa gcgggggacc gtaaggcctc gcgctactgg agcggccgat atcagattag

240

gtagttggtg gggtaaaggc ctaccaagcc tgcgatctgt agctggtttg agaggacgac

300

cagccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaattt

360

tggacaatgg gcgcaagcct gatccagcaa tgccgcgtgc aggacgaagg ccttcgggtt

420

gtaaactgct tttgtacaga acgaaaagct cttctctaat acaggggggt aatgacggta

480

ctgtaagaat aagcgccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcga

540

gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg tgcgcaggcg gttttgtaag acagaggtga

600

aatccccggg cttaacctgg gaactgcctt tgtgactgca aggcttgagt gcggcagagg

660

gggatggaat tccgcgtgta gcagtgaaat gcgtagatat gcggaggaac accgatggcg

720

aaggcagtcc cctgggcctg cactgacgct catgcacgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgccctaaac gatgtcaact ggttgttgga atttattttt

840

tcagtaacgt tgctaacgcg tgaagttgac cgcctgggga gtacggccgc aaggttgaaa

900

ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggatga tgtggtttaa ttcgatgcaa

960

cgcgaaaaac cttacccacc tttgacatgg caggaagttt ccagagatgg attcgtgctc

1020

gcaagagagc ctgcacacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg ccattagttg ctacgaaagg gcactctaat

1140

gggactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcctc atggccctta

1200

taggtggggc tacacacgtc atacaatggc cggtacaaag ggtagccaac ccgcgagggg

1260

gagccaatcc cgcaaagccg gtcgtagtcc ggatcgcagt ctgcaactcg actgcgtgaa

1320

gtcggaatcg ctagtaatcg tggatcagca tgtcacggtg aatacgttcc cgggtcttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacca tgggagcggg ttctgccaga agtggttagc ctaaccgcaa

1440

ggagggcgat caccacggca gggttcgtga ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgt

1499

<210> 668

<211> 1521

<212> DNA

<213> Comamonas sp. NSP5

<400> 668

agagtttgat cctggctcag attgaacgct ggcggcatgc tttacacatg caagtcgaac

60

ggtaacaggc cgcaaggtgc tgacgagtgg cgaacgggtg agtaacacat cggaacgtgc

120

ccagttgtgg gggataacta ctcgaaagag tagctaatac cgcatgagaa cttaggttga

180

aagcagggga ccgcaagacc ttgcgcaaac agagcggccg atggcagatt aggtagttgg

240

tgggataaag gcttaccaag ccgacgatct gtagctggtc tgagaggacg accagccaca

300

ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat ttgggacaat

360

gggcgcaagc ctgatccagc aatgccgcgt gcaggatgaa ggccttcggg ttgtaaactg

420

ctttggtacg gaacgaaaaa gctctggtta atacctgggg cccatgacgg taccgtaaga

480

ataagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc aagcgttaat

540

cggaattact gggcgtaaag cgtgcgcagg cggttatgta agacagaggt gaaatccccg

600

ggctcaacct gggaactgcc tttgtgactg catagctgga gtgcggcaga gggggatgga

660

attccgcgtg tagcagtgaa atgcgtagat atgcggagga acaccgatgg cgaaggcaat

720

cccctgggcc tgcactgacg ctcatgcacg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac

780

cctggtagtc cacgccctaa acgatgtcaa ctggttgttg ggtattcact ttctcagtaa

840

cgaagctaac gcgtgaagtt gaccccctgg ggagtacggc cccaaggtta aaactcaaag

900

gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga tgatgtggtt taattcgatg caacgcgaaa

960

aaccttaccc acctttgaca tgtacggaac cctttagaga tagaggggtg ctcgaaagag

1020

aaccgtaaca caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag

1080

tcccgcaacg agcgcaaccc ttgccattag ttgctacgaa agggcactct aatgggactg

1140

ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc ctcatggccc ttataggtgg

1200

ggctacacac gtcatacaat ggccggtaca aagggtagcc aacccgcgag gtggagctaa

1260

tcccataaag ccggtcgtag tccggatcgc agtctgcaac tcgactgcgt gaagtcggaa

1320

tcgctagtaa tcgtggatca gaatgtcacg gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc

1380

gaccgtcaca ccatgggagc gggttctgcc agaagtaggt agcctaaccg taaggagggc

1440

gcttaccacg gcggggttcg tgactggggt gaagtcgtaa caaggtagcc gtatcggaag

1500

gtgcggctgg atcacctcct t

1521

<210> 669

<211> 1464

<212> DNA

<213> Conchiformibius kuhniae

<400> 669

attgaacgct ggcggcatgc tttacacatg caagtcggac ggcagcrsgg aggagcttgc

60

ttctykgsyg gcgagtggcg aacgggtgag taacgcattg gaacgtaccg gatagagggg

120

gataacttgc cgaaaggtaa gctaataccg catacgcctt gagagggaaa gcgggggact

180

ctttgagcct cgcgctatcc gagcggccaa tgtctgatta gctagttggt ggggtaaaag

240

cctaccaagg cgacgatcag tagcgggtct gagaggatga tccgccacac tgggactgag

300

acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaatt ttggacaatg ggcgcaagcc

360

tgatccagcc atgccgcgtg tctgaagaag gccttcgggt tgtaaaggac ttttgtacgg

420

gaagaaaagg gtggtgctaa tatcgctgcc tcatgacggt accgtaagaa taagcaccgg

480

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgcg agcgttaatc ggaattactg

540

ggcgtaaagc gggcgcagac ggttacttaa gcaagatgtg aaatccccga gcttaacttg

600

ggaactgcgt tttgaactgg gtagctagag tgtgtcagag gggggtagaa ttccacgtgt

660

agcagtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa taccgatggc gaaggcagcc ccctgggata

720

acactgacgt tcatgcccga aagcgtgggt agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

acgccctaaa cgatgtcgat tagctgttgg ggtacttgat accttagtag cgtagctaac

840

gcgtgaaatc gaccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg

900

ggacccgcac aagcggtgga tgatgtggat taattcgatg caacgcgaag aaccttacct

960

ggtcttgaca tgtacggaag agcttagaga taggcttgtg ccttcgggaa ccgtaacaca

1020

ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1080

cgcaaccctt gtcatcagtt gccatcatta agttgggcac tctgatgaga ctgccggtga

1140

caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcctcatgg cccttatgac cagggcttca

1200

cacgtcatac aatggtcggt acaaagggta gccaagccgc gaggcggagc caatcccaga

1260

aaaccgatcg tagtccggat tgcactctgc aactcgagtg catgaagtcg gaatcgctag

1320

taatcgcagg tcagcatact gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc

1380

acaccatggg agtgggggat accagaattg ggtagggtaa ccatttggag cccgcttaac

1440

acggtatgct tcatgactgg ggtg

1464

<210> 670

<211> 1486

<212> DNA

<213> Coprobacillus cateniformis

<400> 670

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac

60

gcactgattt tatcagtgag tggcgaacgg gtgagtaata cataagtaac ctgccctcat

120

gagggggata actattagaa atgatagcta agaccgcata ggtgaagggg tcgcatgacc

180

gcttcattaa atacccgtat ggatagcagg aggatggact tatggcgcat tagctggttg

240

gtgaggtaac ggctcaccaa ggcgacgatg cgtagccgac ctgagagggt ggacggccac

300

actgggactg agacacggcc cagactctac gggaggcagc agtagggaat tttcggcaat

360

gggggaaacc ctgaccgagc aacgccccgt gaggcaagaa gtatttcggt atgtaaacct

420

ctgttataaa ggaagaacgg tatgaatagg aaatgattca taagtgacgg tactttatga

480

gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc gaccgttatc

540

cggaatcatt ggccgtaaag agggagcagg cggcaataga ggtctgcggt gaaagcctga

600

agctaaactt cagtaagccg tggaaaccaa atagctagag tgcagtagag gatcgtggaa

660

ttccatgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tatggaggaa caccagtggc gaaggcgacg

720

atctgggctg caactgacgc tcagtcccga aaccgtgggg agcaaatagg attagatacc

780

ctagtagtcc aacgccgtaa acgatgagta ctaagtgttg ggggtcaaac ctcagtgctg

840

cagttaacgc aataagtact acgcctgagt agtacgttcg caagaatgaa actcaaagga

900

attgacgggg gcccgcacaa aaggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa

960

ccttaccagg tcttgacata cctctaaagg ctctagagat agagagatag ctatagggga

1020

tacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1080

cgagcgcaac ccttgtcgct agttaccatc attaagttgg ggactctagc gagactgcct

1140

ctgcaaggag gaggaaggcg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gacctgggct

1200

acacacgtgc tacaatggac ggatcaaagg gaagcgaagc cgcgaggtgg agcgaaaccc

1260

aaaaacccgt tctcagttcg gactgcagtc tgcaactcga ctgcacgaag ttggaatcgc

1320

tagtaatcgc gaatcagaat gtcgcggtga atacgttctc gggccttgta cacaccgccc

1380

gtcacaccat gagagttggt aacacccgaa gccggtggct taaccgcaag gagagagctg

1440

tctaaggtgg gactgatgat tagggtgaag tcgtaacaag gtaacc

1486

<210> 671

<211> 977

<212> DNA

<213> Coprobacillus sp. 29_1

<220>

<221> modified_base

<222> (30)..(30)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 671

attcataagt gacggtactt tatgagaaan ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

60

taatacgtag gtggcgagcg ttatccggaa tcattgggcg taaagaggga gcaggcggca

120

atagaggtct gcggtgaaag cctgaagcta aacttcagta agccgtggaa accaaatagc

180

tagagtgcag tagaggatcg tggaattcca tgtgtagcgg tgaaatgcgt agatatatgg

240

aggaacacca gtggcgaagg cgacgatctg ggctgcaact gacgctcagt cccgaaagcg

300

tggggagcaa ataggattag ataccctagt agtccacgcc gtaaacgatg agtactaagt

360

gttgggggtc aaacctcagt gctgcagtta acgcaataag tactccgcct gagtagtacg

420

ttcgcaagaa tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg

480

tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catacctcta aaggctctag

540

agatagagag atagctatag gggatacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

600

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt cgctagttac catcattaag

660

ttggggactc tagcgagact gcctctgcaa ggaggaggaa ggcggggatg acgtcaaatc

720

atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat ggacggatca aagggaagcg

780

aagccgcgag gtggagcgaa acccaaaaac ccgttctcag ttcggactgc agtctgcaac

840

tcgactgcac gaagttggaa tcgctagtaa tcgcgaatca gaatgtcgcg gtgaatacgt

900

tctcgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgagagt tggtaacacc cgaagccggt

960

ggcttaaccg caaggag

977

<210> 672

<211> 1383

<212> DNA

<213> Coprobacillus sp. D7

<220>

<221> modified_base

<222> (7)..(8)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 672

cagtcgnncg cgagcacttg tgctcgagtg gcgaacgggt gagtaataca taagtaacct

60

gccctagaca gggggataac tattggaaac gatagctaag accgcatagg tacggacact

120

gcatggtgac cgtattaaaa gtgcctcaaa gcactggtag aggatggact tatggcgcat

180

tagctggttg gcggggtaac ggcccaccaa ggcgacgatg cgtagccgac ctgagagggt

240

gaccggccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtagggaa

300

ttttcggcaa tgggggaaac cctgaccgag caacgccgcg tgaaggaaga aggttttcgg

360

attgtaaact tctgttataa aggaagaacg gcggctacag gaaatggtag ccgagtgagg

420

tactttatta gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc

480

aagcgttatc cggaattatt gggcgtaaag agggagcagg cggcagcaag ggtctgtggt

540

gaaagcctga agcttaactt cagtaagcca tagaaaccag gcagctagag tgcaggagag

600

gatcgtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tatggaggaa caccagtggc

660

gaaggcgacg atctggcctg caactgacgc tcagtcccga aagcgtgggg agcaaatagg

720

attagatacc ctagtagtcc acgccgtaaa cgatgagtac taagtgttgg atgtcaaagt

780

tcagtgctgc agttaacgca ataagtactc cgcctgagta gtacgttcgc aagaatgaaa

840

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa

900

cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatac tcataaaggc tccagagatg gagagatagc

960

tatatgagat acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1020

gtcccgcaac gagcgcaacc cttatcgtta gttaccatca ttaagttggg gactctagcg

1080

agactgccag tgacaagctg gaggaaggcg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat

1140

gacctgggct acacacgtgc tacaatggat ggtgcagagg gaagcgaagc cgcgaggtga

1200

agcaaaaccc ataaaaccat tctcagttcg gattgtagtc tgcaactcga ctacatgaag

1260

ttggaatcgc tagtaatcgc gaatcagcat gtcgcggtga atacgttctc gggccttgta

1320

cacaccgccc gtcacaccac gagagttgat aacacccgaa gccggtggcc taaccgcaag

1380

gaa

1383

<210> 673

<211> 989

<212> DNA

<213> Coprococcus catus

<220>

<221> modified_base

<222> (743)..(743)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (947)..(947)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (965)..(965)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 673

gatgaagagc ttgcttttca aagttagtgg cggacgggtg agtaacgcgt gggtaacctg

60

cctcatacag gggaatagca gctggaaacg gctgataaaa ccgcataagc gcacagtgcc

120

gcatggcaca gtgtgaaaaa ctccggtggt atgagatgga cccgcgtctg attagcttgt

180

tggcggggta acggcccacc aaggcgacga tcagtagccg gcctgagagg gtgatcggcc

240

acattgggac tgagacacgg cccaaactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac

300

aatgggggaa accctgatgc agcgacgccg cgtgaaggaa gaagtatctc ggtatgtaaa

360

cttctatcag cagggaagat aatgacggta cctgactaag aagccccggc taactacgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg tagggggcaa gcgttatccg gatttactgg gtgtaaaggg

480

agcgtaggcg gcggagcaag tcagaagtga aagcccgggg ctcaaccccg ggacggcttt

540

tgaaactgcc ctgcttgatt tcaggagagg taagcggaat tcctagtgta gcggtgaaat

600

gcgtagatat taggaggaac accagtggcg aaggcggctt actggactga caatgacgct

660

gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac

720

gatgaatact aggtgtcggg gcntcataag agcttcggtg ccgcagcaaa cgcaataagt

780

attccacctg gggagtacgt tcgcaagaat gaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca

840

caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc aggccttgac

900

atcccggtga ccgacccgta atggggtctt ctctacggag cactggngac aggtggtgca

960

tggtngtcgt cagctcgtgt cgtgagatg

989

<210> 674

<211> 1370

<212> DNA

<213> Coprococcus comes

<400> 674

gattcttcgg atgaagaggt ttgtgactga gtggcggacg ggtgagtaac gcgtgggtaa

60

cctgcctcat acagggggat aacagttaga aatgactgct aataccgcat aagaccacgg

120

agccgcatgg ctccgtggga aaaactccgg tggtatgaga tggacccgcg tctgattagg

180

tagttggtgg ggtaacggcc taccaagcca acgatcagta gccgacctga gagggtgacc

240

ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

300

gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcgac gccgcgtgag cgaagaagta tttcggtatg

360

taaagctcta tcagcaggaa gaaaatgacg gtacctgact aagaagcacc ggctaaatac

420

gtgccagcag ccgcggtaat acgtatggtg caagcgttat ccggatttac tgggtgtaaa

480

gggagcgtag acggctgtgt aagtctgaag tgaaagcccg gggctcaacc ccgggactgc

540

tttggaaact atgcagctag agtgtcggag aggtaagtgg aattcccagt gtagcggtga

600

aatgcgtaga tattgggagg aacaccagtg gcgaaggcgg cttactggac gatgactgac

660

gttgaggctc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta

720

aacgatgact actaggtgtc ggggagcaaa gctcttcggt gccgcagcaa acgcaataag

780

tagtccacct ggggagtacg ttcgcaagaa tgaaactcaa aggaattgac ggggacccgc

840

acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac ctgctcttga

900

catcccggtg accggcgtgt aatgacgcct tttcttcgga acaccggtga caggtggtgc

960

atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1020

ttatcttcag tagccagcaa ttcggatggg cactctggag agactgccag ggataacctg

1080

gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gagcagggct acacacgtgc

1140

tacaatggcg taaacaaagg gaagcgagcc tgcgagggta agcaaatctc aaaaataacg

1200

tctcagttcg gattgtagtc tgcaactcga ctacatgaag ctggaatcgc tagtaatcgc

1260

gaatcagcat gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat

1320

gggagttggt aacgcccgaa gtcagtgacc caaccgtaag gagggagctg

1370

<210> 675

<211> 1440

<212> DNA

<213> Coprococcus eutactus

<400> 675

gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gattgaagct ggagcttgct

60

ccggccgatt tagtggcgga cgggtgagta acgcgtgggt aacctgcctc atacaggggg

120

atagcagttg gaaacgactg gtaaaaccgc ataagcgcac rgtatcgcat gatacagtgt

180

gaaaacactc cggtggtatg agatggaccc gcgtctgatt agctagttgg tgaggtaacg

240

gcccaccaag gcgacgatca gtagccggcc tgagagggtg aacggccaca ttgggactga

300

gacacggccc aaactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggggaaacc

360

ctgatgcagc gacgccgcgt gagtgaagaa gtatttcggt atgtaaagct ctatcagcag

420

ggaagataat gacggtacct gactaagaag caccggctaa atacgtgcca gcagccgcgg

480

taatacgtat ggtgcaagcg ttatccggat ttactgggtg taaagggtgc gtaggtggca

540

aggcaagtct gaagtgaaaa tccggggctc aaccccggaa ctgctttgga aactgtttag

600

ctagagtaca ggagaggtaa gtggaattcc tagtgtagcg gtgaaatgcg tagatattag

660

gaggaacacc agtggcgaag gcgacttact ggactgctac tgacactgag gcacgaaagc

720

gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gaatactagg

780

tgttgggttc caaagggact cggtgccgtc gcaaacgcat taagtattcc acctggggag

840

tacgttcgca agaatgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat

900

gtggtttaat tcgaagcaac gcgaaaaacc ttaccaagtc ttgacatcct gatgacggtt

960

ccttaaccgg aacttctctt cggagcatca gagacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

1020

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctattt ccagtagcca

1080

gcagtaagat gggcactctg gagagactgc cggggataac ccggaggaag gtggggatga

1140

cgtcaaatca tcatgcccct tatgatttgg gctacacacg tgctacaatg gcagttacaa

1200

agagaagcra acctgtgaag gcgagcaaac ctcaaaaagg ctgtctcagt tcggattgta

1260

gtctgcaact cgactacatg aagctggaat cgctagtaat cgcagatcag catgctgcgg

1320

tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtc ggtaacgccc

1380

gaagtcagtg acccaaccgc aaggagggag ctgccgaagg caggatcgat aactggggtg

1440

<210> 676

<211> 1440

<212> DNA

<213> Coprococcus sp. ART55/1

<400> 676

gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gattgaagct ggagcttgct

60

ccggccgatt tagtggcgga cgggtgagta acgcgtgggt aacctgcctc atacaggggg

120

atagcagttg gaaacgactg gtaaaaccgc ataagcgcac ggtrtcgcat gayacagtgt

180

gaaaacactc cggtggtatg agatggaccc gcgtctgatt agctagttgg tgaggtaacg

240

gcccaccaag gcgacgatca gtagccggcc tgagagggtg aacggccaca ttgggactga

300

gacacggccc aaactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggggaaacc

360

ctgatgcagc gacgccgcgt gagtgatgaa gtatttcggt atgtaaagct ctatcagcag

420

ggaagataat gacggtacct gactaagaag caccggctaa atacgtgcca gcagccgcgg

480

taatacgtat ggtgcaagcg ttatccggat ttactgggtg taaagggtgc gtaggtggca

540

aggcaagtct gaagtgaaaa tccggggctc aaccccggaa ctgctttgga aactgtttag

600

ctagagtaca ggagaggtaa gtggaattcc tagtgtagcg gtgaaatgcg tagatattag

660

gaggaacacc agtggcgaag gcgacttact ggactgctac tgacactgag gcacgaaagc

720

gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gaatactagg

780

tgttgggttc caaaggaact cggtgccgtc gcaaacgcat taagtattcc acctggggag

840

tacgttcgca agaatgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat

900

gtggtttaat tcgaagcaac gcgaaaaacc ttaccaagtc ttgacatcct gatgacggtt

960

ccttaaccgg aacttttctt cggaacatca gagacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

1020

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctattt ccagtagcca

1080

gcagtaagat gggcactctg gagagactgc cggggataac ccggaggaag gtggggatga

1140

cgtcaaatca tcatgcccct tatgatttgg gctacacacg tgctacaatg gcagttacaa

1200

agagaagcaa acctgtgaag gcgagcaaac ctcaaaaagg ctgtctcagt tcggattgta

1260

gtctgcaact cgactacatg aagctggaat cgctagtaat cgcagatcag catgctgcgg

1320

tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtc ggtaacgccc

1380

gaagtcagtg acccaaccgc aaggagggag ctgccgaagg caggatcgat aactggggtg

1440

<210> 677

<211> 1370

<212> DNA

<213> Coriobacteriaceae bacterium BV3Ac1

<400> 677

acatgcaagt cgaacgatta aagcaccttc gggtgtgtat agagtggcga acggctgagt

60

aacacgtggg caacctgccc ttcagttcgg aatagctacg ggaaaccgtg ggtaataccg

120

gatgatccac ctccctcgca tgaaggaggt ggcaaagatt tatcgctgaa ggatgggccc

180

gcggcctgtt agcttgttgg tgaggtaacg gctcaccaag gcagtaatgg gtagccgggt

240

tgagagaccg accggccaga ttgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

300

agtggggaat cttgcgcaat gggcgaaagc ctgacgcagc gatgccgcgt gcgggatgaa

360

ggccttcggg tcgtaaaccg ctttcagcag ggacgaggcc gcaaggtgac ggtacctgca

420

gaagaagccc cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggg gcgagcgtta

480

tccggattca ttgggcgtaa agcgcgcgta ggcggcctgt taggtcaaga gttaaatccg

540

ggggctcaac ccccgtccgc tcctgatacc ggcaggcttg agtctggtag gggaaggcgg

600

aattccaagt gtagcggtgg aatgcgcaga tatttggaag aacaccggtg gcgaaggcgg

660

ccttctgggc cacgactgac gctgaggcgc gaaagctagg ggagcaaaca ggattagata

720

ccctggtagt cctagccgta aacgatggac actaggtgtg gggggaacat ccctccgtgc

780

cgcagctaac gcattaagtg tcccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag

840

gaattgacgg gggcccgcac aagcagcgga gcatgtggct taattcgaag caacgcgaag

900

aaccttacca gggcttgaca tataggtgaa gcggtggaaa caccgtagcc gaaaggagcc

960

tatacaggtg gtgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1020

aacgagcgca acccccgtcg tatgttgcca gcggttcggc cgggcaccca tacgagaccg

1080

ccggcgtcaa gccggaggaa ggtggggacg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgtcctg

1140

ggctgcacac gtgctacaat ggccggcaca atgggctgcc aagtcgcaag accgagcgaa

1200

tccctaaagc cggccccagt tcggattgga ggctgcaacc cgcctccatg aagtcggagt

1260

tgctagtaat cgcggatcag cacgccgcgg tgaatgcgtt cccgggcctt gtacacaccg

1320

cccgtcacac cacccgagtc gtctgcaccc gaagtcgccg gcccaacctt

1370

<210> 678

<211> 1491

<212> DNA

<213> Coriobacteriaceae bacterium JC110

<400> 678

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgaac

60

gatgaaaccg cccccgggcg gacatgaagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgaccgacc

120

tgccccccgc ccagggacag ccccccgaaa gggggattaa tacctggtac tccgggagcg

180

gcgcatgccg cccccgggaa agctctcgcg gcgggggatg gggtcgcggc ccatcaggta

240

gacggcgggg cagaggccca ccgtgccgac gacgggtagc cgggttgaga gaccgaccgg

300

ccacattggg actgagatac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaattttgc

360

gcaatggggg caaccctgac gcagcaacgc cgcgtgcggg acgaaggcgt ccgcgtcgta

420

aaccgctttc agcggggaac acctaacgag ggtacccgca gaagaagccc cggctaaata

480

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtatggg gcgagcgtta tccggattca ttgggcgtaa

540

agcgcgcgta ggcggagcgc taagcgggac ctctaacccg agggctcaac ccccggccgg

600

gtcccgaact ggcgctctcg agtgcggtag gggagagcgg aattcccggt gtagcggtgg

660

aatgcgcaga tatcgggaag aacaccgacg gcgaaggcag ctctctgggc cgaaactgac

720

gctgaggcgc gaaagctggg ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt cccagccgta

780

aacgatgggc gctaggtgtg ggggatgaga tcccccgtgc cgcagccaac gcattaagcg

840

ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac

900

aagcagcgga gcatgtggct taattcgaag caacgcgaag aaccttacca gggcttgaca

960

tgcaggtgaa gcggcggaga cgccgtggcc gagaggagcc tgcacaggtg gtgcatggct

1020

gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctgccc

1080

cgtgttgcca gcattcagtt ggggactcgc gggggactgc cggcgtcaag ccggaggaag

1140

gtggggacga cgtcaagtca tcatgcccct tatgccctgg gccgcacacg tgctacaatg

1200

gccggtacag agggttgcga ccccgcgagg gggagcggat cccgcaaagc cggccccagt

1260

tcggatcgga ggctgcaacc cgcctccgtg aagccggagt tgctagtaat cgcggatcag

1320

cacgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac cacccgagtc

1380

gtctgcaccc gaagccgccg gccgaaccct ttcaggggcg gaggcgtcga aggtgtggag

1440

ggtgaggggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtaccgga aggtgcggct g

1491

<210> 679

<211> 1464

<212> DNA

<213> Coriobacteriaceae bacterium phI

<400> 679

gatcctggct caggatgaac gctggcggcg cgcctaacac atgcaagtcg agcggcaccc

60

tgcttcggca ggaagcgagc ggcgaacggc tgagtaacac gtgaccaacc tgccctgcgc

120

acggggacag ccgcgggaaa ccgcgggtga tacccggtgg ccccgggggg acgcatgtcc

180

ccagcgggca tagctccggc ggcgcgggat ggggtcgcgg cccatcaggt agttggtagg

240

gtgacggcct accaagccga ctacgggtag ccgggttgag agaccgaccg gccagattgg

300

gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatcttg cgcaatgggg

360

ggaaccctga cgcagcgacg ccgcgtgcgg gatggaggcc ttcgggtcgt gaaccgcttt

420

cagcagggac gagactgacg gtacctgcag aagaagcccc ggctaactac gtgccagcag

480

ccgcggtaat acgtaggggg cgagcgttat ccggattcat tgggcgtaaa gcgcgcgtag

540

gcggccgcgc aggcgggggg tcaaatcccg gggctcaacc ccgggccgcc ccccgaaccg

600

cgcggcttgg gtccggcagg ggagggtgga acgcccggtg tagcggtgga atgcgcagat

660

atcgggcgga acaccggtgg cgaaggcggc cctctgggcc ggcaccgacg ctgaggcgcg

720

agagccgggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc ccggccgtaa acgatggacg

780

ctaggtgtgg ggacgttgga gtctccgtgt gccgcagcca acgcattaag cgtcccgcct

840

ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcagcg

900

gagcatgtgg cttaattcga agcaacgcga agaaccttac ccgcgcttga catggcggtg

960

aagcggcgga gacgccgtgg ccgagaggag ccgccacagg tggtgcatgg ctgtcgtcag

1020

ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccccgc cgcgtgttgc

1080

catcgggtga tgccgggaac ccacgcggga ccgccgccgc caaggcggag gagggcgggg

1140

acgacgtcaa gtcatcatgc cccttatgcg cggggctgca cacgtgctac aatggcaggt

1200

acagagggtt gccaccccgc gagggggagc ggatcccgaa agcctgcccc agttcggacc

1260

gggggctgca acccgccccc gcgaagtcgg agttgctagt aatcgcggat cagcatgccg

1320

cggtgaatgc gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccacccga gtcgtctgca

1380

cccgaagccg ccggcccaac ctcgtgaggg aggcgtcgaa ggtgtggagg gcgagggggg

1440

tgaagtcgta acaaggtagc cgta

1464

<210> 680

<211> 1497

<212> DNA

<213> Gordonibacter pamelaeae

<400> 680

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgaac

60

gattaagacg gctccggccg tgaatagagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgaccaacc

120

tgccccctac cccgggataa cgcaaggaaa cctgcgctaa taccggatac tccttcccct

180

gctcctgcag gggtcgggaa agcccagacg gtaggggatg gggtcgcggc ccattaggta

240

gacggcgggg caacggccca ccgtgcctgc gatgggtagc cgggttgaga gaccgaccgg

300

ccacattggg actgagatac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaattttgc

360

gcaatggggg gaaccctgac gcagcaacgc cgcgtgcggg atgaaggcct tcgggttgta

420

aaccgctttc agcagggaag atagtgacgg tacctgcaga agaagccccg gctaactacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc gagcgttatc cggattcatt gggcgtaaag

540

cgcgcgtagg cggcccgtca agcggaacct ctaacccgag ggctcaaccc ccggtcgggt

600

tccgaactgg caggctcgag tttggtagag gaagatggaa ttcccggtgt agcggtggaa

660

tgcgcagata tcgggaagaa caccgatggc gaaggcagtc ttctgggcca tcaactgacg

720

ctgaggcgcg aaagctgggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc ccagccgtaa

780

acgatgggtg ctaggtgtgg ggggatcatc cctccgtgcc gcagccaacg cattaagcac

840

cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

900

agcagcggag catgtggctt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag ggcttgacat

960

gctagtgaag ccggggaaac ccggtggccg agaggagcta gcgcaggtgg tgcatggctg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatcgt

1080

atgttgccag cattgagttg gggactcata cgagactgcc ggcgtcaagc cggaggaagg

1140

tggggacgac gtcaagtcat catgcccttt atgccctggg ctgcacacgt gctacaatgg

1200

ccggtacaac gggccgcgac ctggcgacag gaagcgaatc cctcaaagcc ggccccagtt

1260

cggatcggag gctgcaaccc gcctccgtga agtcggagtt gctagtaatc gcggatcagc

1320

atgccgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acccgagtcg

1380

tctgcacccg aagccgccgg ccgaacccgc aaggggcgga ggcgtcgaag gtgtggaggg

1440

taaggggggt gaagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag gtgcggctgg atcacct

1497

<210> 681

<211> 1522

<212> DNA

<213> Corynebacterium accolens

<400> 681

tttttgtgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaaggccct gcttgcaggg tactcgagtg gcgaacgggt gagtaacacg

120

tgggtgatct gccctgcact tcgggataag cttgggaaac tgggtctaat accggatagg

180

aaccatcttt agtgtggtgg ttggaaagtt ttttcggtgt aggatgagct cgcggcctat

240

cagcttgttg gtggggtaat ggcctaccaa ggcggcgacg ggtagccggc ctgagagggt

300

gtacggccac attgggactg agatacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag cgacgccgcg tgggggatga aggccttcgg

420

gttgtaaact cctttcgcta gggacgaagc tttttgtgac ggtacctaga taagaagcac

480

cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggt gcgagcgttg tccggaatta

540

ctgggcgtaa agggctcgta ggtggtttgt cgcgtcgtct gtgaaattct ggggcttaac

600

tccgggcgtg caggcgatac gggcataact tgagtgctgt aggggtaact ggaattcctg

660

gtgtagcggt gaaatgcgca gatatcagga ggaacaccga tggcgaaggc aggttactgg

720

gcagttactg acgctgagga gcgaaagcat gggtagcgaa caggattaga taccctggta

780

gtccatgccg taaacggtgg gcgctaggtg tgagggtctt tctacgactt tcgtgccgta

840

gctaacgcat taagcgcccc gcctggggag tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat

900

tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat gtggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc

960

ttacctgggc ttgacataca ccagatcgct gcagagatgt agtttccctt tgtggttggt

1020

gtacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1080

acgagcgcaa cccttgtctt atgttgccag catttggttg gggactcatg agagactgcc

1140

ggggttaact cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgtccaggg

1200

cttcacacat gctacaatgg tcggtacaac gcgctgcgac actgtgaggt ggagcgaatc

1260

gctgaaagcc ggccttagtt cggattgggg tctgcaactc gaccccatga agtcggagtc

1320

gctagtaatc gcagatcagc aatgctgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1380

cccgtcacgt catgaaagtt ggtaacaccc gaagccggtg gcctaaacgt gttagggagc

1440

cgtcgaaggt gggatcggcg attgggacga agtcgtaaca aggtacccgt accggaaggt

1500

gcgggtggat cacctccttt ct

1522

<210> 682

<211> 1530

<212> DNA

<213> Corynebacterium ammoniagenes

<400> 682

tttttgtgga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaaggcctg tacttgtaca ggtactcgag tggcgaacgg gtgagtaaca

120

cgtgggtgat ctgccctgca ctatgggata agcttgggaa actgggtcta ataccatata

180

ggaccacttc ttggatgttg tggtggaaag cttttgcggt gtgggatgag cctgcggcct

240

atcagcttgt tggtggggta atggcctacc aaggcggcga cgggtatccg gcctgagagg

300

gtgtacggac acattgggac tgagatacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

360

aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agcgacgccg cgtgggggat gacggccttc

420

gggttgtaaa ctcctttcgc tatcgacgaa gccaccttgg gtggtgacgg taggtagata

480

agaagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc aagcgttgtc

540

cggaattact gggcgtaaag agctcgtagg tggtttgtcg cgtcgtctgt gaaatcccgg

600

ggcttaactt cgggcgtgca ggcgatacgg gcataacttg agtgctgtag gggagactgg

660

aattcctggt gtagcggtga aatgcgcaga tatcaggagg aacaccgatg gcgaaggcag

720

gtctctgggc agtaactgac gctgaggagc gaaagcatgg gtagcgaaca ggattagata

780

ccctggtagt ccatgccgta aacggtgggc gctaggtgta gggggcttcc acgtcttctg

840

tgccgtagct aacgcattaa gcgccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca

900

aaggaattga cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgtg gattaattcg atgcaacgcg

960

aagaacctta cctgggcttg acatatacag gattgggcta gagatagttc gtcccttgtg

1020

gtctgtatac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaaccct tgtcttatgt tgccagcacg tgatggtggg gactcatgag

1140

aaactgccgg ggttaactcg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat

1200

gtccagggct tcacacatgc tacaatggtc gatacaatgg gcagcgacat cgtgaggtgg

1260

agcgaatccc tgaaagtcgg ccttagttcg gattggggtc tgcaactcga ccccatgaag

1320

tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa tgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcacgtca tgaaagttgg taacacccga agccagtggc ctaaacttgt

1440

tagggagctg tcgaaggtgg gatcggcgat tgggacgaag tcgtaacaag gtagccgtac

1500

cggaaggtgc ggctggatca cctcctttct

1530

<210> 683

<211> 1529

<212> DNA

<213> Corynebacterium amycolatum

<400> 683

ttttgatgga gggtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaaggctcc agcttgctgg ggtacacgag tggcgaacgg gtgagtaaca

120

cgtgggtgac ctgccctgca cttcgggata agcctgggaa actgggtcta ataccggata

180

ggaccatggt gtggatactg tggtggaaag ttttttcggt gtgggatggg cccgcggcct

240

atcagcttgt tggtggggta atggcctacc aaggcggcga cgggtagccg gcctgagagg

300

gtggacggcc acattgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

360

aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agcgacgccg cgtgggggat gacggccttc

420

gggttgtaaa ctcctttcac catcgacgaa gggtttctga cggtagatgg agaagaagca

480

ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg tgcgagcgtt gtccggaatt

540

actgggcgta aagagctcgt aggtggtttg tcgcgtcgtc tgtgaaattc cggggcttaa

600

ctccgggcgt gcaggcgata cgggcataac ttgagtactg taggggagac tggaattcct

660

ggtgtagcgg tgaaatgcgc agatatcagg aggaacaccg gtggcgaagg cgggtctctg

720

ggcagtaact gacgctgagg agcgaaagca tggggagcga acaggattag ataccctggt

780

agtccatgcc gtaaacggtg ggcgctaggt gtgggtttcc ttccacggga tccgtgccgt

840

agctaacgca ttaagcgccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cggcggagca tgtggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac

960

cttacctggg cttgacatat acaggatcgc gccagagatg gtgtttccct tgtggcttgt

1020

atacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1080

acgagcgcaa cccttgtctt atgttgccag cacgtgatgg tggggactcg taagagactg

1140

ccggggttaa ctcggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgtccag

1200

ggcttcacac atgctacaat ggtcggtaca gtgggttgcc agtccgtgag ggcgagctaa

1260

tcccgtaaag ccggtctcag ttcggatcgg ggtctgcaac tcgaccccgt gaagtcggag

1320

tcgctagtaa tcgcagatca gcaacgctgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1380

cgcccgtcac gtcatgaaag tcggtaacac ccgaagccag tggcctaaca cttttttgtg

1440

ggggagctgt cgaaggtggg attggcgatt gggacgaagt cgtaacaagg tagccgtacc

1500

ggaaggtgcg gctggatcac ctcctttct

1529

<210> 684

<211> 1469

<212> DNA

<213> Corynebacterium appendicis

<400> 684

cgtgcttaac acatgcaagt cggaacggaa aggcctctgc ttgcaggggt actcgagtgg

60

cgaacgggtg agtaacacgt gggtgatctg ccctgcactt cgggataagc ctgggaaact

120

gggtctaata ccggatagga cgatggtttg gatgccattg tggaaagttt tttcggtgtg

180

ggatgagctc gcggcctatc agcttgttgg tggggtaatg gcctaccaag gcgtcgacgg

240

gtagccggcc tgagagggtg tacggccaca ttgggactga gatacggccc agactcctac

300

gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc gacgccgcgt

360

gggggatgac ggccttcggg ttgtaaactc ctttcgtcag ggacgaagcg aaagtgacgg

420

tacctggata agaagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc

480

gagcgttgtc cggaattact gggcgtaaag agctcgtagg tggtttgtcg cgtcgtttgt

540

ggaataccgc agcttaactg cggggttgca ggcgatacgg gcataacttg agtgctgtag

600

gggagactgg aattcctggt gtagcggtgg aatgcgcaga tatcaggagg aacaccgatg

660

gcgaaggcag gtctctgggc agtaactgac gctgaggagc gaaagcatgg gtagcgaaca

720

ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacggtgggc gctaggtgtg agtcccttcc

780

acggggttcg tgccgtagct aacgcattaa gcgccccgcc tggggagtac ggccgcaagg

840

ctaaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgtg gattaattcg

900

atgcaacgcg aagaacctta cctgggcttg acatacaccg gaccgggcca gagatggtct

960

ttcccttgtg gctggtgtac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

1020

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtcttatgt tgccagcatt tggttgggga

1080

ctcatgagag actgccgggg ttaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg

1140

ccccttatgt ccagggcttc acacatgcta caatggtcgg tacaacgcgc agcgatactg

1200

tgaggtggag ctaatcgcct aaagccggcc ttagttcgga ttggggtctg caactcgacc

1260

ccatgaagtc ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa tacgttcccg

1320

ggccttgtac acaccgcccg tcacgtcatg aaagttggta acacccgaag ccagcggccc

1380

aaacgtgtta gggagctgtc gaaggtggga tcggcgattg ggacgaagtc gtaacaaggt

1440

agccgtaccg gaaggtgcgg ctggatcac

1469

<210> 685

<211> 1420

<212> DNA

<213> Corynebacterium argentoratense

<220>

<221> modified_base

<222> (776)..(776)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1061)..(1061)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1365)..(1365)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 685

cgaacggaaa ggcctaagac ttgcttgggt actcgagtgg cgaacgggcc cattaacacg

60

tgagtgatct gccctcaact tcgggataag cctgggaaac tgggtctaat actggatagg

120

accatccttt agtgtgtgat ggtggaaagt tttttcggtt ggggatgagc tcgcggccta

180

tcagcttgtt ggtggggtaa tggcctacca aggcgtcgac gggtagccgg cctgacaggg

240

tgtacggcca cattgggact gagacacggc ccagactcct acaggaggca gcagtgggga

300

atattgcaca atgggcggaa gcctgatgca gcgacgccgc gtgagggatg acggccttcg

360

ggttgtaaac ctctttcgac agggacgaag cttttgtgac ggtgacctgt ataagaaagc

420

accggctaac tacgtgccaa gcagccgcgg taatacgtta cgggtgcgag cgttgtccgg

480

aattactggg cgtaaagagc tcgtagcgtg gtttgtcgcg tcgtctgtga aattccgggg

540

cttaactccg ggcgtgcagg cgatacgggc ataacttgag tgctgtaggg gagactggaa

600

ttcctggtgt aacggtgaaa tgcgcatata tcaggaggaa caccgatggc gaaagcaggt

660

ctctgggcag taactgacgc tgaggagcga aagcatgggg agcgaacagg attagatacc

720

ctggtagttc atgccgtaaa cggtgggcgc taggtgtagg ggacttccac gtcttntgtg

780

ccgtagctaa cgcattaagc gccccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa

840

ggaattgacg ggggcccgca caagcggcgg agcatgtgga ttaattcgat gcaacgcgaa

900

gaaccttacc tgggcttgac atatacagga tcgctgcaga gatgtagttt cccttgtggt

960

ctgtatacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1020

cgcaacgagc gcaacccttg tcttatgttg ccagcacact ntggtgggga ctcatgagag

1080

actgccgggg ttaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgt

1140

ccagggcttc acacatgcta caatggtcgg tacaacgcgc tgcgagcctg tgagggtgag

1200

cgaatcgctg aaagccggcc tcagttcgga ttggggtctg caactcgacc ccatgaagtc

1260

ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac

1320

acaccgcccg tcaagtcacc gaaagttggt aacacccgaa aaccngtggc ctaacccttg

1380

tggagggagc tgtcgaaggt gggattcggc gattggtcta

1420

<210> 686

<211> 1482

<212> DNA

<213> Corynebacterium atypicum

<400> 686

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgtac ggaaaggccc tgcttttgtg

60

gggtgctcga gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgggtga tctgccctgt acttcgggat

120

aagcttggga aactgggtct aataccggat aggactgcgc tgtgggtggt gtggtggaaa

180

gctttttgcg gtatgggatg agctcgcggc ctatcagttt gttggtgggg taatggccta

240

ccaaggcgtc gacgggtagc cggcctgaga gggtgatcgg ccacattggg actgagatac

300

ggcccagact cctgcgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat

360

gcagcgacgc cgcgtggggg atgacggcct tcgggttgta aacctctttc gactatgacg

420

aagccttttt ggtgacggta gtggtagaag aagcaccggc taactacgtg ccagcagccg

480

cggtaatacg tagggtgcga gcgttgtccg gatttactgg gcgtaaaggg ctcgtaggtg

540

gtttgtcgcg tcgtctgtga aattccgggg cttaacttcg ggcgtgcagg cgatacgggc

600

ataacttgag tgctgtaggg gtaactggaa ttcctggtgt agcggtggaa tgcgcagata

660

tcaggaggaa caccgatggc gaaggcaggt tactgggcag ttactgacgc tgaggagcga

720

aagcatgggg agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc atgctgtcaa cggtgggcgc

780

taggtgtggg gatcttccac ggtccctgtg ccgtagctaa cgttttaagc gccccgcctg

840

gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggcgg

900

agcatgtgga ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc tgggtttgat atacatcaga

960

tcgggccaga gatggtcttt ccctttgtgg ttggtgtaca ggtggtgcat ggttgtcgtc

1020

agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gtcttgtgtt

1080

gccagcattt ggttggggac tcacgagaga ctgccggggt gaactcggag gaaggtgggg

1140

atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgtc cagggcttca cacatgctac aatggtcggt

1200

acagtaggtt gcgataccgt gaggtggagc taatcctcgt gaaagccggt cgtagttcgg

1260

attgaggtct gcaactcgac ctcatgaagt cggagtcgct agtaatcgca gatcagcagt

1320

gctgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacgtcat gaaagtcggt

1380

aacacccgaa gcccacggcc taaccttgtt gtaagggggg agtggtcgaa ggtgggatcg

1440

gcgattggga cgaagtcgta acaaggtagc cgtaccggaa gg

1482

<210> 687

<211> 1522

<212> DNA

<213> Corynebacterium aurimucosum

<400> 687

tttttgtgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaaggcctc agcttgctgg ggtactcgag tggcgaacgg gtgagtaaca

120

cgtgggtgat ctgccttgca ctctgggata agcttgggaa actgggtcta ataccggata

180

tgaactgcct ttagtgtggt ggttggaaag ttttttcggt gcaagatgag ctcgcggcct

240

atcagcttgt tggtggggta atggcctacc aaggcgtcga cgggtagccg gcctgagagg

300

gtgtacggcc acattgggac tgagatacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

360

aatattgcac aatgggcgga agcctgatgc agcgacgccg cgtgggggat gacggccttc

420

gggttgtaaa ctcctttcga cagggacgaa gcgttatgtg acggtacctg tataagaagc

480

accggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gtgcgagcgt tgtccggaat

540

tactgggcgt aaagagctcg taggtggttt gtcgcgtcgt ctgtgaaatt ccggggctta

600

acttcgggcg tgcaggcgat acgggcataa cttgagtgct gtaggggaga ctggaattcc

660

tggtgtagcg gtgaaatgcg cagatatcag gaggaacacc gatggcgaag gcaggtctct

720

gggcagttac tgacgctgag gagcgaaagc atgggtagca aacaggatta gataccctgg

780

tagtccatgc cgtaaacggt gggcgctagg tgtagggggc ttccacgtct tctgtgccgt

840

agctaacgca ttaagcgccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cggcggagca tgtggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac

960

cttacctggg cttgacatac accagattgc tgcagagatg tagtgtccct tgtggttggt

1020

gtacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1080

acgagcgcaa cccttgtctt atgttgccag catttggttg gggactcatg agagactgcc

1140

ggggttaact cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgtccaggg

1200

cttcacacat gctacaatgg tcggtacaac gcgcagcgac actgtgaggt ggagcgaatc

1260

gctgaaagcc ggccttagtt cggattgggg tctgcaactc gaccccatga agtcggagtc

1320

gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1380

cccgtcacgt catgaaagtt ggtaacaccc gaagccagtg gcctaaactt gttagggagc

1440

tgtcgaaggt gggatcggcg attgggacga agtcgtaaca aggtacccgt accggaaggt

1500

gcgggtggat cacctccttt ct

1522

<210> 688

<211> 1327

<212> DNA

<213> Corynebacterium bovis

<400> 688

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta

60

acacgtgggt gatctgccct gcactctggg ataagcctgg gaaactgggt ctaataccgg

120

atagggaaag cggtgcagga tgagcccgcg gcctatcagc ttgttggtgg ggtaatggcc

180

taccaaggcg gcgacgggta gccggcctga gagggtgtac ggccacattg ggactgagac

240

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg

300

atgcagcgac gccgcgtggg ggatgacggc cttcgggttg taaacccctt tcggcaggga

360

cgatgacggt acctgcataa gaagcaccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

420

gtagggtgcg agcgttgtcc ggaattactg ggcgtaaaga gctcgtaggt ggtttgtcgc

480

gtcgtctgtg aaatcccggg gcttaactcc gggcgtgcag gcgatacggg caaacttgag

540

tgctgtaggg gagactggaa ttcctggtgt agcggtgaaa tgcgcagata tcaggaggaa

600

caccgatggc gaaggcaggt ctctgggcag actgacgctg aggagcgaaa gcatgggtag

660

cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg gtgggcgcta ggtgtgggga

720

tttccgtgcc gtagctaacg cattaagcgc cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag catgtggatt aattcgatgc

840

aacgcgaaga accttacctg ggcttgacat gcacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtctt gtgttgccag

960

cacgtgggga ctcgcgagag actgccgggg ttaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

aatcatcatg ccccttatgt ccagggcttc acacatgcta caatggtcgg cagtgggttg

1080

cgatgccgcg aggctcagct aatcccttcc ggtctcagtt cggatggagt ctgcaactcg

1140

actccagaag tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttcc

1200

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca tgaaagttgg taacacccga agccggtgcc

1260

cagggagccg tcgaaggtgg gatcggcgat tgggacgaag tcgtaacaag gtagccgtac

1320

cggaagg

1327

<210> 689

<211> 1497

<212> DNA

<213> Corynebacterium canis

<400> 689

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgtac ggaaaggccc tggctttggt

60

tggggtgctc gagtggcgaa cgggtgagta acacgtgggt gatctgccct gcactttggg

120

ataagcctgg gaaactgggt ctaatactgg ataggaccat gcttttgtgt gtcatggtgg

180

aaaggcttct gttttggggg ctggtgtggg atgagcttgc ggcctatcag cttgttggtg

240

gggtaatggc ctaccaaggc gtcgacgggt agccggcctg agagggtgta cggccacatt

300

gggactgaga tacggcccag actcctgcgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg

360

gcgcaagcct gatgcagcga cgccgcgtga gggatgacgg ccttcgggtt gtaaacctct

420

ttcgctgggg acgaagcttt tttggtgacg gtacctggag aagaagcacc ggctaactac

480

gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggtg cgagcgttgt ccggaattac tgggcgtaaa

540

gagctcgtag gtggtttgtc gcgtcgtctg tgaaattccg gggcttaact tcgggcgtgc

600

aggcgatacg ggcataactt gagtgctgta ggggagactg gaattcctgg tgtagcggtg

660

aaatgcgcag atatcaggag gaacaccgat ggcgaaggca ggtctctggg cagtaactga

720

cgctgaggag cgaaagcatg ggtagcgaac aggattagat accctggtag tccatgccgt

780

aaacggtggg cgctaggtgt gggggtcttc cacgacttct gtgccgtagc taacgcttta

840

agcgccccgc ctggggagta cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg acgggggccc

900

gcacaagcgg cggagcatgt ggattaattc gatgcaacgc gaagaacctt acctgggctt

960

gacatatgca ggatcgcgcc agagatggtg tttcccttgt ggcttgtata caggtggtgc

1020

atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1080

ttgtcttatg ttgccagcac gtgatggtgg ggactcatga gagactgccg gggtcaactc

1140

ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgtccagggc ttcacacatg

1200

ctacaatggt cggtacagtg ggttgcgaga ccgtgaggtg gagcgaatcc ctttgaaagc

1260

cggcctcagt tcggattggg gtctgcaact cgaccccatg aagtcggagt cgctagtaat

1320

cgcagatcag caatgctgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcacg

1380

tcatgaaagt tggtaacacc cgaagcccat ggcctaacca gcgtttgctg gggggagtgg

1440

tcgaaggtgg gattggcgat tgggacgaag tcgtaacaag gtagccgtac cggaagg

1497

<210> 690

<211> 1343

<212> DNA

<213> Corynebacterium casei

<220>

<221> modified_base

<222> (364)..(364)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (369)..(369)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (409)..(409)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (463)..(463)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (608)..(608)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 690

aacgggtgag taacacgtgg gtgatctgcc ctgcactttg ggataagctt gggaaactgg

60

gtctaatacc gaatatgacc acttcttgga tgttgtggtg gaaagctttt gcggtgtggg

120

atgagcctgc ggcctatcag cttgttggtg gggtaatggc ctaccaaggc ggcgacgggt

180

atccggcctg agagggtgta cggacacatt gggactgaga tacggcccag actcctacgg

240

gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcga cgccgcgtgg

300

gggatgaagg ccttcgggtt gtaaactcct ttcgctatcg acgaagccac ttgtggtgac

360

ggtnggtana taagaagcac cggctaacta cgtgccagca gccgcggtna tacgtagggt

420

gcaagcgttg tccggaatta ctgggcgtaa agagctcgtg ggnggtttgt cgcgtcgtct

480

gtgaaatccc ggggcttaac ttcgggcgtg caggcgatac gggcataact tgagtgctgt

540

aggggagact ggaattactg gtgttgcggg gaaatgcgca tatatcaaga cgaacaccta

600

tggcgaangc aggtctctgg gcagtaactg actctgagga gcgaaagcat gggtagcgaa

660

caggattaga taccctggta gtccatgccg taaacggtgg gcgctaggtg tagggggctt

720

ccacgtcttc tgtgccgtag ctaacgcatt aagcgccccg cctggggagt acggccgcaa

780

ggctaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gcggagcatg tggattaatt

840

cgatgcaacg cgaagaacct tacctgggct tgacatgtac cggattgggc tagagatagt

900

ctttcccttg tggtcggtat acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

960

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtcttat gttgccagca cgttatggtg

1020

ggaactcatg agagactgcc ggggttaact cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat

1080

catgcccctt atgtccaggg cttcacacat gctacaatgg tcgatacaat gggcagcgac

1140

atcgtgaggt gaagcgaatc cctgaaagtc ggccttagtt cggattgggg tctgcaactc

1200

gaccccatga agtcggagtc gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg tgaatacgtt

1260

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacgt catgaaagtt ggtaacaccc gaagccagtg

1320

gcctaaactt gttagggagc tgt

1343

<210> 691

<211> 1404

<212> DNA

<213> Corynebacterium confusum

<400> 691

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

gaaaggcttc agcttgctgg agtactcgag tggcgaacgg gtgagtaaca cgtgggtgat

120

ctgccctgca cttcgggata agcctgggaa actgggtcta ataccggata ggaccgcact

180

ttggtgtgtg tggtggaaag ttttttcggt gtaggatgag cccgcggcct atcagcttgt

240

tggtggggta atggcctacc aaggcggcga cgggtagccg gcctgagagg gtggacggcc

300

acattgggac tgagatacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac

360

aatgggcgga agcctgatgc agcgacgccg cgtgggggat gacggccttc gggttgtaaa

420

ctcctttcgc cagggacgaa gcgtttttgt gacggtacct ggataagaag caccggctaa

480

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggtgcgagcg ttgtccggaa ttactgggcg

540

taaagagctc gtaggtggtt tgtcgcgtcg tctgtgaaat tccggggctt aactccgggc

600

gtgcaggcga tacgggcagg cttgagtact gtaggggtaa ctggaattcc tggtgtagcg

660

gtgaaatgcg cagatatcag gaggaacacc gatggcgaag gcaggttact gggcagttac

720

tgacgctgag gagcgaaagc atgggtagcg aacaggatta gataccctgg tagtccatgc

780

cgtaaacggt gggcgctagg tgtgagaccc ttccacgggt tttgtgccgt agctaacgca

840

ttaagcgccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg

900

cccgcacaag cggcggagca tgtggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggg

960

cttgacatat ttaggttcgc ggcagagatg tcgtttccct ttgtggcctt tatacaggtg

1020

gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

1080

acccttgtct tatgttgcca gcatttggtt ggggactcat gagagactgc cggggttaac

1140

tcggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgtccagg gcttcacaca

1200

tgctacaatg gtcaatacaa tgcgttgcga cactgtgagg tggagctaat cgcttaaagt

1260

tggccttagt tcggattggg gtctgcaact cgaccccatg aagtcggagt cgctagtaat

1320

cgcagatcag caatgctgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcacg

1380

tcatgaaagt tggtaacacc cgaa

1404

<210> 692

<211> 1483

<212> DNA

<213> Corynebacterium coyleae

<220>

<221> modified_base

<222> (29)..(29)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (51)..(51)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (59)..(59)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (108)..(108)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (362)..(362)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (959)..(959)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (962)..(962)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 692

atgaacgctg gcggcgtgct taacacatnc aagtcgaacg gaaaggcctc ngcttgcang

60

ggtactcgag tggcgaacgg gtgagtaaca cgtgggtgat ctgccccnca cttcgggata

120

agcctgggaa actgggtcta ataccggata ggaccacttc ttggaggttg tggtggaaag

180

ttttttcggt gtgggatgag ctcgcggcct atcagcttgt tggtggggta atggcctacc

240

aaggcgtcga cgggtagccg gcctgagagg gtgtacggcc acattgggac tgagatacgg

300

cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc

360

ancgacgccg cgtgggggat gacggccttc gggttgtaaa ctcctttcgc tagggacgaa

420

gcgcaagtga cggtacctag agaagaagca ccggctaact acgtgccagc agccgcggta

480

atacgtaggg tgcgagcgtt gtccggaatt actgggcgta aagagctcgt aggtggtttg

540

tcgcgtcgtt tgtgtaagcc cgcagcttaa ctgcgggact gcaggcgata cgggcataac

600

ttgagtgctg taggggagac tggaattcct ggtgtagcgg tggaatgcgc agatatcagg

660

aggaacaccg atggcgaagg caggtctctg ggcagtaact gacgctgagg agcgaaagca

720

tggggagcga acaggattag ataccctggt agtccatgcc gtaaacggtg ggcgctaggt

780

gtgagtccct tccacggggt tcgtgccgta gctaacgcat taagcgcccc gcctggggag

840

tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat

900

gtggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctgggc ttgacataca ccagatcgnc

960

gnagagatgc gctttccctt tgtggttggt gtacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

1020

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtctt atgttgccag

1080

cacgtgatgg tggggactca tgagagactg ccggggttaa ctcggaggaa ggtggggatg

1140

acgtcaaatc atcatgcccc ttatgtccag ggcttcacac atgctacaat ggtcggtaca

1200

acgcgtttgc gagcctgtga gggtgtgcta atcgctgaaa gccggcctta gttcggattg

1260

gggtctgcaa ctcgacccca tgaagtcgga gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg

1320

cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca cgtcatgaaa gttggtaaca

1380

cccgaagcca gtggcctgtc atgggagctg tcgaaggtgg gatcggcgat tgggacgaag

1440

tcgtaacaag gtagccgtac cggaatgcgg ctggatcacc tcc

1483

<210> 693

<211> 1529

<212> DNA

<213> Corynebacterium diphtheriae

<400> 693

tttttatgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaaggccta gcttgctagg tactcgagtg gcgaacgggt gagtaacacg

120

tgggtgatct gcctcgtact tcgggataag cctgggaaac tgggtctaat actggatagg

180

accatgcttt agtgtgtgtg gtggaaagtt ttttcggtac gagatgagcc cgcggcctat

240

cagcttgttg gtggggtaat ggcctaccaa ggcgtcgacg ggtagccggc ctgagagggt

300

ggacggccac attgggactg agatacggcc cagactccta ctggaggcag cagtggggaa

360

tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag cgacgccgcg tgggggatga cggccttcgg

420

gttgtaaacc tctttcgcta gggacgaagc ttttgtgacg gtacctagat aagaagcacc

480

ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggtg cgagcgttgt ccggaattac

540

tgggcgtaaa gagctcgtag gtggtttgtc gcgtcgtctg tgaaattccg gggcttaact

600

tcgggcgtgc aggcgatacg ggcataactt gagtgctgta ggggagactg gaattcctgg

660

tgtagcggtg gaatgcgcag atatcaggag gaacaccgat ggcgaaggca ggtctctggg

720

cagtaactga cgctgaggag cgaaagcatg gggagcgaac aggattagat accctggtag

780

tccatgccgt aaacggtggg cgctaggtgt gagggtcttc cacgactttc gtgccgtagc

840

taacgcatta agcgccccgc ctggggagta cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg

900

acgggggccc gcacaagcgg cggagcatgt ggattaattc gatgcaacgc gaagaacctt

960

acctgggctt gacatatgca ggatcggcgt agtgatacgt tttcccttgt ggtctgtata

1020

caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc ttgtcttatg ttgccagcac gtgatggtgg ggactcatga gagactgccg

1140

gggttaactc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgtccagggc

1200

ttcacacatg ctacaatggt cggtacaacg cgctgcgagc ctgtgagggt gagcgaatcg

1260

ctgaaagccg gcctcagttc ggattggggt ctgcaactcg accccatgaa gtcggagtcg

1320

ctagtaatcg cagatcagca acgctgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc

1380

ccgtcacgtc atgaaagttg gtaacacccg aagccagtgg cctaaccctt gtggggggag

1440

ctgtcgaagg tgggatcggc gattgggacg aagtcgtaac aaggtagccg taccggaagg

1500

tgcggctgga tcacctcctt tctaaggag

1529

<210> 694

<211> 1420

<212> DNA

<213> Corynebacterium durum

<400> 694

ctcaggacga acgctggcgg cgtgcttaac acatgcaagt cgaacgaaaa gccctgccac

60

cttggtggtg ggtactcgag tggcgaacgg gtgagtaaca cgtgggtgat ctgccccgca

120

ctgtgggata agcctgggaa actgggtcta ataccacata cgaccatggc gtaggggtca

180

tggtggaaag ccttattgcg gtgtgggatg agcccgcggc ctatcagctt gttggtgggg

240

taatggccta ccaaggcggc gacgggtagc cggcctgaga gggtggacgg ccacattggg

300

actgagacac ggcccagact ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggcgc

360

aagcctgatg cagcgacgcc gcgtggggga tkgaaggctt cgggttgtaa actcctttcg

420

cccgggacga agcccacctg gtgggtgacg gtaccgtgga gaagaagcac cggctaacta

480

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggt gcaagcgttg tccggattta ctgggcgtaa

540

agagctcgta ggtggtgtgt cgcgtcgtct gtgaaattcc ggggcttaac tccgggcgtg

600

caggcgatac gggcacgact agagtgctgt aggggtaact ggaattcctg gtgtagcggt

660

gaaatgcgca gatatcagga ggaacaccga tggcgaaggc aggttactgg gcagttactg

720

acgctgagga gcgaaagcat ggggagcgaa caggattaga taccctggta gtccatgctg

780

taaacggtgg gcgctaggtg tgggctgtgt gtttgcagtc tgtgccgtag ctaacgcatt

840

aagcgccccg cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact caaaggaatt gacgggggcc

900

cgcacaagcg gcggagcatg tggattaatt cgatgcaacg cgaagaacct tacctgggtt

960

tgacatgcac cagatcggcg tagagatacg tcctcccttg tggttggtgc acaggtggtg

1020

catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

1080

cttgtcttat gttgccagca catttttggt ggggactcat gagaaactgc cggggtcaac

1140

tcggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgccctt tatacccagg gcttcacaca

1200

tgctacaatg gtcggtacaa cgggttgcga cactgtgaag tgaagctaat ctctgaaagc

1260

cggcctcagt tcggattggg gtctgcaact cgaccccatg aagtcggagt cgctagtaat

1320

cgcagatcag caacgctgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcacg

1380

tcatgaaagt tggtaacacc cgaagcccat ggcctaacca

1420

<210> 695

<211> 1524

<212> DNA

<213> Corynebacterium efficiens

<400> 695

ttttgtggag agtttgatcc tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca

60

agtcgaacga tgaagccctg cttgcagggt ggattagtgg cgaacgggtg agtaacacgt

120

gggtgatctg ccccgcactt cgggataagc ctgggaaact gggtctaata ccggatacga

180

ccccctggta ggtcaggggg tggaaagatt ttatcggtgt gggatgagcc tgcggcctat

240

cagcttgttg gtggggtaat ggcctaccaa ggcgtcgacg ggtagccggc ctgagagggt

300

gatcggccac attgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag cgacgccgcg tgggggatga cggccttcgg

420

gttgtaaact cctttcgaca gggacgaagc ttttgtgacg gtacctgtag aagaagcacc

480

ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggtg cgagcgttgt ccggaattac

540

tgggcgtaaa gagctcgtag gtggtttgtc gcgtcgtctg tgaaatcccg gggcttaact

600

tcgggcgtgc aggcgatacg ggcataactt gagtgctgta ggggagactg gaattcctgg

660

tgtagcggtg aaatgcgcag atatcaggag gaacaccaat ggcgaaggca ggtctctggg

720

cagtaactga cgctgaggag cgaaagcatg ggtagcgaac aggattagat accctggtag

780

tccatgccgt aaacggtggg cgctaggtgt aggggacttc cacgtcttct gtgccgcagc

840

taacgcatta agcgccccgc ctggggagta cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg

900

acgggggccc gcacaagcgg cggagcatgt ggattaattc gatgcaacgc gaagaacctt

960

acctgggctt gacatacact agatcgctgc agagatgtag cttcccttgt ggctggtgta

1020

caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc ttgtcttatg ttgccatcac gtgatggtgg gcactcatga gagactgccg

1140

gggttaactc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgtccagggc

1200

ttcacacatg ctacaatggt cggtacagcg agttgccaca ccgtgaggtg gagctaatct

1260

ctcaaagccg gcctcagttc ggattggggt ctgcaactcg accccatgaa gtcggagtcg

1320

ctagtaatcg cagatcagca acgctgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc

1380

ccgtcacgtc atgaaagttg gtaacacccg aagccagtgg cccaacccgt aaggggggga

1440

gctgtcgaag gtgggatcgg cgattgggac gaagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag

1500

gtgcggctgg atcacctcct ttct

1524

<210> 696

<211> 1475

<212> DNA

<213> Corynebacterium falsenii

<400> 696

cgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca agtcgaacgg aaaggccctt gcttgcaggg

60

gtactcgagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgggtgatc tgccttgtac ttcgggataa

120

gcctgggaaa ctgggtctaa taccggatag gaccatgctt tagtgtgtgt ggtggaaagt

180

tttttcggta caagatgagc ccgcggccta tcagcttgtt ggtggggtaa tggcctacca

240

aggcgacgac gggtagccgg cctgagaggg tgtacggcca cattgggact gagacacggc

300

ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca

360

gcgacgccgc gtgagggatg acggccttcg ggttgtaaac ctctttcgct agggaagaag

420

ccacttgtgg tgacggtacc tggataagaa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg

480

gtaatacgta gggtgcgagc gttgtccgga attactgggc gtaaagagct cgtaggtggt

540

ttgtcgcgtc gtctgtgaaa tcccggggct taactccggg cgtgcaggcg atacgggcat

600

aactggagtg ctgtagggga gactggaatt cctggtgtag cggtgaaatg cgcagatatc

660

aggaggaaca ccgatggcga aggcaggtct ctgggcagta actgacgctg aggagcgaaa

720

gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg gtgggcgcta

780

ggtgtgggga tctttctacg atttccgtgc cgtagctaac gcattaagcg ccccgcctgg

840

ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga

900

gcatgtggat taattcgatg caacgcgaag aaccttacct gggcttgaca tatgcaggat

960

cgctgcagag atgtagtttc ccttgtggtc tgtatacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag

1020

ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt cttgtgttgc

1080

cagcacgtta tggtggggac tcgcgagaga ctgccggggt taactcggag gaaggtgggg

1140

atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgtc cagggcttca cacatgctac aatggtcggt

1200

acagagggtc gcgataccgt gaggtggagc taatccctga aagccggtct cagttcggat

1260

tggagtctgc aactcgactc catgaagtcg gagtcgctag taatcgcaga tcagcaacgc

1320

tgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacgtcatga aagttggtaa

1380

cacccgaagc cagtggccca aactcgttag ggagctgtcg aaggtgggat cggcgattgg

1440

gacgaagtcg taacaaggta gccgtaccgg aaggt

1475

<210> 697

<211> 1489

<212> DNA

<213> Corynebacterium flavescens

<400> 697

atcgtggaga gtttgatcct ggctcaggac gaacactggc ggcgtgctta acacatgcaa

60

gtcgaacgga aagaccccta gcttgctggg ggtactcgag tggcgaacgg gtgagtaaca

120

cgtgggtgat ctgccctgca cttcgggata agcttgggaa actgggtcta ataccggata

180

tgaacggtct ttggtgtgat tgttggaaag attttttcgg tgtgggatga gctcgcggcc

240

tatcagcttg ttggtggggt aatggcctac caaggcgtcg acgggtagcc ggcctgagag

300

ggtgtacggc cacattggga ctgagatacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagcgacgcc gcgtggggga tgaaggcctt

420

cgggttgtaa actcctttcg ctagggacga agcctttttt aaggtgacgg tacctggata

480

agaagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc aagcgttgtc

540

cggaattact gggcgtaaag agctcgtagg tggtttgtcg cgtcgtctgt gaaattccgg

600

ggcttaactc cgggcgtgca ggcgatacgg gcataacttg agtgctgtag gggagactgg

660

aattcctggt gtagcggtga aatgcgcaga tatcaggagg aacaccgatg gcgaaggcag

720

gtctctgggc agtaactgac gctgaggagc gaaagcatgg gtagcgaaca ggattagata

780

ccctggtagt ccatgccgta aacggtgggc gctaggtgta gggggcttcc acgtcttctg

840

tgccgtagct aacgcattaa gcgccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca

900

aaggaattga cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgtg gattaattcg atgcaacgcg

960

aagaacctta cctgggcttg acatatgcag gattgggtca gagatggctt gtcccttgtg

1020

gtctgtatac aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaaccct tgtcttatgt tgccagcacg ttatggtggg gactcatgag

1140

agactgccgg ggttaactcg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat

1200

gtccagggct tcacacatgc tacaatggtc ggtacaatgc gttgcgatac tgtgaggtgg

1260

agcgaatcgt gtaaagccgg ccttagttcg gattggggtc tgcaactcga ccccatgaag

1320

tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa tgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcacgtca tgaaagttgg taacacccga agccagtggc ctaaacttgt

1440

tagggagctg tcgaaggtgg gatcggcgat tgggacgaag tcgtaacaa

1489

<210> 698

<211> 1529

<212> DNA

<213> Corynebacterium genitalium

<400> 698

tttttgtgga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaaggccga agcttgcttc ggtactcgag tggcgaacgg gtgagtaaca

120

cgtgggtgat ctgccctgca ctttgggata agcctgggaa actgggtcta ataccagata

180

ggaccacgtc ttggatggtg tggtggaaag ttttttcggt gtgggatgag ctcgcggcct

240

atcagcttgt tggtggggta atggcctacc aaggcgtcga cgggtagccg gcctgagagg

300

gtgtacggcc acattgggac tgagatacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

360

aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agcgacgccg cgtgggggat gacggccttc

420

gggttgtaaa ctcctttcgc cagggacgaa gcgtcagtga cggtacctgg ataagaagca

480

ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg tgcgagcgtt gtccggaatt

540

actgggcgta aagagctcgt aggtggtttg tcgcgtcgtt tgtgtaatac cgcagcttaa

600

ctgcggggtt gcaggcgata cgggcataac ttgagtgctg taggggagac tggaattcct

660

ggtgtagcgg tggaatgcgc agatatcagg aggaacaccg atggcgaagg caggtctctg

720

ggcagtaact gacgctgagg agcgaaagca tgggtagcga acaggattag ataccctggt

780

agtccatgcc gtaaacggtg ggcgctaggt gtgagtccct tccacggggt tcgtgccgta

840

gctaacgcat taagcgcccc gcctggggag tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat

900

tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat gtggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc

960

ttacctgggc ttgacataca ccggatcgct gcagagatgt agcttccctt gtggctggtg

1020

tacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1080

cgagcgcaac ccttgtctta tgttgccagc atttggttgg ggactcatga gagactgccg

1140

gggttaactc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgtccagggc

1200

ttcacacatg ctacaatggt cggtacaacg cgcagctact tcgtgaggag gcgctaatcg

1260

ctctaaagcc ggccttagtt cggattgggg tctgcaactc gaccccatga agtcggagtc

1320

gctagtaatc gtagatcagc aacgctgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1380

cccgtcacgt catgaaagtt ggtaacaccc gaagccagtg gcccaaactt gttagggagc

1440

tgtcgaaggt gggatcggcg attgggacga agtcgtaaca aggtagccgt accggaaggt

1500

gcggctggat cacctccttt ctaaggagc

1529

<210> 699

<211> 1466

<212> DNA

<213> Corynebacterium glaucum

<400> 699

ggcgtgctaa cacatgcaag tcgaacggaa aggccgaagc ttgctttggt actcgagtgg

60

cgaacgggtg agtaacacgt gggtgatctg ccctgcactt tgggataagc ctgggaaact

120

gggtctaata ccagatagga ccacggtgtg gtgatcgtgg tggaaagttt tttcggtgtg

180

ggatgagctc gcggcctatc agcttgttgg tggggtaatg gcctaccaag gcgtcgacgg

240

gtagccggcc tgagagggtg tacggccaca ttgggactga gatacggccc agactcctac

300

gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc gacgccgcgt

360

gggggatgac ggccttcggg ttgtaaactc ctttcgccaa agacgaattt tgacggtatt

420

tggagaagaa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggtgcgagc

480

gttgtccgga attactgggc gtaaagagct cgtaggtggt ttgtcgcgtc gtttgtggaa

540

taccggggct taacttcggg gttgcatacg atacgggcat aacttgagtg ctgtagggga

600

gactggaatt cctggtgtag cggtgaaatg cgcagatatc aggaggaaca ccgatggcga

660

aggcaggtct ctgggcagta actgacgctg aggagcgaaa gcatggggag cgaacaggat

720

tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg gtgggcgcta ggtgtgagtc ccttccacgg

780

ggttcgtgcc gtagctaacg cattaagcgc cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa

840

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag catgtggatt aattcgatgc

900

aacgcgaaga accttacctg ggcttgacat acaccagatc gccgcagaga tgtggtttcc

960

cttgtggttg gtgtacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg

1020

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc ttatgttgcc agcatgttgt ggtggggact

1080

catgagagac tgccggggtt aactcggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc

1140

ccttatgtcc agggcttcac acatgctaca atggtcggta caacgcgctt gcgagcctgt

1200

gagggtgagc gaatcgctga aagccggtcg tagttcggat tggggtctgc aactcgaccc

1260

catgaagtcg gagtcgctag taatcgcaga tcagcaacgc tgcggtgaat acgttcccgg

1320

gccttgtaca caccgcccgt cacgtcatga aagttggtaa cacccgaagc cagtggcctg

1380

tcaaaaggag ctgtcgaagg tgggatcggc gattgggacg aagtcgtaac aaggtagccg

1440

taccggaagg tgcggctgga tcacct

1466

<210> 700

<211> 1533

<212> DNA

<213> Corynebacterium glucuronolyticum

<400> 700

ttttgttgga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaaggctcc agcttgctgg ggtgctcgag tggcgaacgg gtgagtaaca

120

cgtaagtgat ctgccctgca ctgggggata agcttgggaa actgggtcta ataccctata

180

ggaccgcatc gtggttggtg tggtggaaag gtttttctgg tgtgggatga gcttgcggcc

240

tatcagcttg ttggtggggt aatggcctac caaggcggcg acgggtagcc ggcctgagag

300

ggtgtgcggc cacattggga ctgagatacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaattttgca caatgggcgg aagcctgatg cagcgacgcc gtgtggggga tgaaggcctt

420

cgggttgtaa actcctttcg tcagggacga agtttttttg acggtacctg gataagaagc

480

accggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gtgcgagcgt tgtccggatt

540

tactgggcgt aaagggctcg taggtggtgt gtcgcgtcgt ctgtgtaatc caggggctta

600

acttttggtt ggcaggcgat acgggcattg cttgagtgct gtaggggaga ctggaattcc

660

tggtgtagcg gtgaaatgcg cagatatcag gaggaacacc gatggcgaag gcaggtctct

720

gggcagttac tgacgctgag gagcgagagc atgggtagcg aacaggatta gataccctgg

780

tagtctatgc tgtaaacggt gggcgctagg tgtgagtccc ttccacgggg tttgtgccgt

840

agctaacgct ttaagcgccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cggcggagca tgtggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac

960

cttacctggg cttgacatat gtgagattgg gctagagata gttcgtccct tgtggctcat

1020

ttacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1080

acgagcgcaa cccttgtctt atgttgccag cacgttgtgg tggggactcg tgagagactg

1140

ccggggttaa ctcggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgtccag

1200

ggcttcacac atgctacaat ggctggtaca gtgcgtgtgc gacaccgtga ggtggagcta

1260

atcgcgaaag ccagtctcag ttcggattgg ggtctgcaac tcgaccccat gaagtcggag

1320

tcgctagtaa tcgcagatca gcagtgctgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1380

cgcccgtcac gtcatgaaag ttggtaacac ccgaagccca tggcccaacc ggttttccgg

1440

ggggagtggt cgaaggtggg attggcgatt gggacgaagt cgtaacaagg tagccgtacc

1500

ggaaggtgcg gctggatcac ctcctttcta agg

1533

<210> 701

<211> 1525

<212> DNA

<213> Corynebacterium glutamicum

<400> 701

tgtggagagt ttgatcctgg ctcaggacga acgctggcgg cgtgcttaac acatgcaagt

60

cgaacgctga aaccggagct tgctttggtg gatgagtggc gaacgggtga gtaacacgtg

120

ggtgatctgc cctacacttt gggataagcc tgggaaactg ggtctaatac cgaatattca

180

caccaccgta ggggtggtgt ggaaagcctt gtgcggtgtg ggatgagcct gcggcctatc

240

agcttgttgg tggggtaatg gcctaccaag gcgtcgacgg gtagccggcc tgagagggtg

300

tacggccaca ttgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

360

attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc gacgccgcgt gggggatgaa ggccttcggg

420

ttgtaaactc ctttcgctag ggacgaagcc ttttaggtga cggtacctgg agaagaagca

480

ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg tgcgagcgtt gtccggaatt

540

actgggcgta aagagctcgt aggtggtttg tcgcgtcgtc tgtgaaatcc cggggcttaa

600

cttcgggcgt gcaggcgata cgggcataac ttgagtgctg taggggagac tggaattcct

660

ggtgtagcgg tgaaatgcgc agatatcagg aggaacacca atggcgaagg caggtctctg

720

ggcagtaact gacgctgagg agcgaaagca tgggtagcga acaggattag ataccctggt

780

agtccatgcc gtaaacggtg ggcgctaggt gtaggggtct tccacgactt ctgtgccgca

840

gctaacgcat taagcgcccc gcctggggag tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat

900

tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat gtggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc

960

ttacctgggc ttgacatgga ccggatcggc gtagagatac gttttccctt gtggtcggtt

1020

cacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1080

cgagcgcaac ccttgtctta tgttgccagc acattgtggt gggtactcat gagagactgc

1140

cggggttaac tcggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgtccagg

1200

gcttcacaca tgctacaatg gtcggtacag cgagttgcca caccgtgagg tggagctaat

1260

ctcttaaagc cggcctcagt tcggattggg gtctgcaact cgaccccatg aagtcggagt

1320

cgctagtaat cgcagatcag caacgctgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc

1380

gcccgtcacg tcatgaaagt tggtaacacc cgaagccagt ggcccaacct tttagggggg

1440

agctgtcgaa ggtgggatcg gcgattggga cgaagtcgta acaaggtagc cgtaccggaa

1500

ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1525

<210> 702

<211> 1489

<212> DNA

<213> Corynebacterium hansenii

<400> 702

gctggcggcg tgcttaacac atgcaagtcg aacggtaagg ccccagcttg ctggggtaca

60

cgagtggcga acgggtgagt aacacgtggg tgacctgccc cgcacttcgg gataagcctg

120

ggaaactggg tctaataccg gataggaccg catcgttggg atgtggtgga aagttttttc

180

ggtgtgggat gggcccgcgg cctatcagct tgttggtggg gtaatggcct accaaggcgg

240

cgacgggtag ccggcctgag agggtggacg gccacattgg gactgagaca cggcccagac

300

tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc ggaagcctga tgcagcgacg

360

ccgcgtgggg gatgacggcc ttcgggttgt aaactccttt caccatcgac gaaggttttc

420

tgacggtaga tggagaagaa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

480

gggtgcgagc gttgtccgga attactgggc gtaaagagct cgtaggtggt ttgtcgcgtc

540

gtctgtgaaa ttccggggct caactccggg cgtgcaggcg atacgggcat aacttgagta

600

ctgtagggga gactggaatt cctggtgtag cggtgaaatg cgcagatatc aggaggaaca

660

ccggtggcga aggcgggtct ctgggcagta actgacgctg aggagcgaaa gcatgggtag

720

cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg gtgggcgcta ggtgtagggg

780

tcttccacga cttctgtgcc gtagctaacg cattaagcgc cccgcctggg gagtacggcc

840

gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag catgtggatt

900

aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg ggcttgacat gtacgggatc gggccagaga

960

tggtctttcc cttgtggctc gtatacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1020

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc ttatgttgcc agcacgttat

1080

ggtggggact cgtgagaaac tgccggggtc aactcggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1140

tcatcatgcc ccttatgtcc agggcttcac acatgctaca atggtcggta cagtgggttg

1200

cgatgccgtg aggcggagct aatcccttaa agccggtctc agttcggatc ggggtctgca

1260

actcgacccc gtgaagtcgg agtcgctagt aatcgcagat cagcaacgct gcggtgaata

1320

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acgtcatgaa agtcggtaac acccgaagcc

1380

agtggcccaa ccttttttgg ggggagctgt cgaaggtggg atcggcgatt gggacgaagt

1440

cgtaacaagg tagccgtacc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctttct

1489

<210> 703

<211> 1460

<212> DNA

<213> Corynebacterium imitans

<400> 703

aacgctggcg gcgtgcttaa cacatgcaag tcgaacggaa aggccgaagc ttgcttcggt

60

actcgagtgg cgaacgggtg agtaacacgt gggtgatctg ccctgtactt cgggataagc

120

ttgggaaact gggtctaata ccggatatga caatctcttg gatggggttg tggaaagctt

180

ttgcggtatg ggatgagctc gcggcctatc agcttgttgg tggggtaatg gcctaccaag

240

gcgtcgacgg gtagccggcc tgagagggtg tacggccaca ttgggactga gatacggccc

300

agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc

360

gacgccgcgt gggggatgac ggccttcggg ttgtaaactc ctttcgcaac cgacgaagct

420

tttgtgacgg taggttgaga agaagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

480

cgtagggtgc gagcgttgtc cggaattact gggcgtaaag agctcgtagg tggtttgtcg

540

cgtcgtttgt ggaataccgc agcttaactg cggggttgca ggcgatacgg gcataacttg

600

agtgctgtag gggagactgg aattcctggt gtagcggtgg aatgcgcaga tatcaggagg

660

aacaccgatg gcgaaggcag gtctctgggc agtaactgac gctgaggagc gaaagcatgg

720

ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacggtgggc gctaggtgtg

780

agtcccttcc acggggttcg tgccgtagct aacgcattaa gcgccccgcc tggggagtac

840

ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgtg

900

gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctgggcttg acatacaccg gatcgctgca

960

gagatgtagc ttccctttgt ggctggtgta caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1020

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtcttatg ttgccagcat

1080

ttggttgggg actcatgaga gactgccggg gttaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1140

aaatcatcat gccccttatg tccagggctt cacacatgct acaatggtcg gtacaacgcg

1200

tttgcgagct cgtgagggtg ggctaatcgc tgaaagccgg tcgtagttcg gattggggtc

1260

tgcaactcga ccccatgaag tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg

1320

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca tgaaagttgg taacacccga

1380

agcccatggc ccaaacgtgt tagggagtgg tcgaaggtgg gatcggcgat tgggacgaag

1440

tcgtaacaag gtagccgtac

1460

<210> 704

<211> 1532

<212> DNA

<213> Corynebacterium jeikeium

<400> 704

tttttatgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaaggctcc ttgcttgcaa ggggtactcg agtggcgaac gggtgagtaa

120

cacgtgggtg atctgccttg cacttcggga taagcctggg aaactgggtc taataccgga

180

taggaccatg ctttagtgtg tgtggtggaa agttttttcg gtgcaagatg agcccgcggc

240

ctatcagctt gttggtgggg taatggccta ccaaggcgac gacgggtagc cggcctgaga

300

gggtgtacgg ccacattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg

360

ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat gcagcgacgc cgcgtggggg atgacggcct

420

tcgggttgta aactcctttc gctagggaag aagccactgt gtggtgacgg tacctggata

480

agaagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc gagcgttgtc

540

cggaattact gggcgtaaag agctcgtagg tggtttgtcg cgtcgtctgt gaaatcccgg

600

ggcttaactt cgggcgtgca ggcgatacgg gcataactag agtgctgtag gggagactgg

660

aattcctggt gtagcggtga aatgcgcaga tatcaggagg aacaccgatg gcgaaggcag

720

gtctctgggc agttactgac gctgaggagc gaaagcatgg gtagcgaaca ggattagata

780

ccctggtagt ccatgccgta aacggtgggc gctaggtgtg ggggttttat ttacgattcc

840

cgtgccgtag ctaacgcatt aagcgccccg cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact

900

caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gcggagcatg tggattaatt cgatgcaacg

960

cgaagaacct tacctgggct tgacatacac cggatcgctg cagagatgta gtttcccttg

1020

tggctggtgt acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1080

gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtcttgt gttgccagca cgttatggtg gggactcgcg

1140

agagactgcc ggggttaact cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt

1200

atgtccaggg cttcacacat gctacaatgg tcggtacagt gggttgcgat accgtgaggt

1260

ggagctaatc ccttaaagcc ggtctcagtt cggattggag tctgcaactc gactccatga

1320

agtcggagtc gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg tgaatacgtt cccgggcctt

1380

gtacacaccg cccgtcgcgt catgaaagtt ggtaacaccc gaagccagtg gcccaaactt

1440

gttagggagc tgtcgaaggt gggattggcg attgggacga agtcgtaaca aggtagccgt

1500

accggaaggt gcggctggat cacctccttt ct

1532

<210> 705

<211> 1400

<212> DNA

<213> Corynebacterium kroppenstedtii

<220>

<221> modified_base

<222> (1077)..(1077)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 705

cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggaaaggccc

60

tgcttgcagg gtgctcgagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgggtgatc tgccccttac

120

tttgggataa gcctgggaaa ctgggtctaa tactggatag gaccatgctg taggtggtgt

180

ggtggaaaga ttttttcggt aagggatgag ctcgcggcct atcagcttgt tggtggggta

240

atggcctacc aaggcgtcga cgggtagccg gcctgagagg gtggacggcc acattgggac

300

tgagatacgg cccagattcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatgggcgca

360

agcctgatgc agcgacgccg cgtgggggat gacggccttc gggttgtaaa ctcctttcag

420

ccatgacgaa gcccttgtgg tgacggtagt ggtagaagaa gcaccggcta actacgtgcc

480

agcagccgcg gtaatacgta gggtgcgagc gttgtccgga attactgggc gtaaagagct

540

cgtaggtggt ctgtcgcgtc atttgtgaaa gcccggggct taactccggg ttggcaggtg

600

atacgggcat gactggagta ctgtagggga gactggaatt cctggtgtag cggtgaaatg

660

cgcagatatc aggaggaaca ccggtggcga aggcgggtct ctgggcagta actgacgctg

720

aggagcgaaa gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

780

gtgggcgcta ggtgtgggtt tccttccacg ggatccgtgc cgtagctaac gcattaagcg

840

ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac

900

aagcggcgga gcatgtggat taattcgatg caacgcgaag aaccttacct gggcttgaca

960

tgcactggat gcggccagag atggttgttc cctttgtggc tggtgtgcag gtggtgcatg

1020

gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccnttg

1080

tctcgtgttg ccagcatttg gttggggact cgcgggagac tgccggggtt aactcggagg

1140

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtcc agggcttcac acatgctaca

1200

atggctggta cagagagttg cgataccgtg aggtggggct aatctcttaa agccagtctc

1260

agttcggatt ggagtctgca actcgactcc atgaagtcgg agtcgctagt aatcgcagat

1320

cagcaatgct gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acgtcatgaa

1380

agttggtaac acccgaagcc

1400

<210> 706

<211> 1532

<212> DNA

<213> Corynebacterium lipophiloflavum

<400> 706

tttttgtgga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaaggccac agcttgctgt ggtactcgag tggcgaacgg gtgagtaaca

120

cgtgggtgat ctgccctgta cttcgggata agcttgggaa actgggtcta ataccggata

180

tgaccacttt ttggatgggg tggtggaaag cttttgcggt atgggatgag ctcgcggcct

240

atcagcttgt tggtggggta atggcctacc aaggcgtcga cgggtagccg gcctgagagg

300

gtgtacggcc acattgggac tgagatacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

360

aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agcgacgccg cgtgggggat gacggccttc

420

gggttgtaaa ctcctttcgc cagggacgaa gcgtaagtga cggtacctgg ataagaagca

480

ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg tgcgagcgtt gtccggaatt

540

actgggcgta aagagctcgt aggtggtttg tcgcgtcgtt tgtgtaagtc cacggcttaa

600

ctgtgggatg gcaggcgata cgggcataac ttgagtgctg taggggagac tggaattcct

660

ggtgtagcgg tgaaatgcgc agatatcagg aggaacaccg atggcgaagg caggtctctg

720

ggcagtaact gacgctgagg agcgaaagca tgggtagcga acaggattag ataccctggt

780

agtccatgcc gtaaacggtg ggcgctaggt gtgagtccct tccacggggt tcgtgccgta

840

gctaacgcat taagcgcccc gcctggggag tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat

900

tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat gtggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc

960

ttacctgggc ttgacataca ccggatcggg ctagagatag tctttccctt gtggctggtg

1020

tacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1080

cgagcgcaac ccttgtctta tgttgccagc acgtgatggt ggggactcat gagagactgc

1140

cggggttaac tcggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgtccagg

1200

gcttcacaca tgctacaatg gtcggtacaa cgcgtgtgcg acactgtgag gtgaagctaa

1260

tcgctctaaa gccggtcgta gttcggattg gggtctgcaa ctcgacccca tgaagtcgga

1320

gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1380

ccgcccgtca cgtcatgaaa gttggtaaca cccgaagcca gtggcctaaa cgtgttaggg

1440

agctgtcgaa ggtgggatcg gcgattggga cgaagtcgta acaaggtagc cgtaccggaa

1500

ggtgcggctg gatcacctcc tttctaagga gc

1532

<210> 707

<211> 1334

<212> DNA

<213> Corynebacterium macginleyi

<400> 707

gagtttgatc mtggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgggtg atctgccctg cacttcggga taagcttggg

120

aaactgggtc taataccgga tagggaaagt cggtgtagga tgagctcgcg gcctatcagc

180

ttgttggtgg ggtaatggcc taccaaggcg gcgacgggta gccggcctga gagggtgtac

240

ggccacattg ggactgagat acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

300

gcacaatggg cgcaagcctg atgcagcgac gccgcgtggg ggatgaaggc cttcgggttg

360

taaactcctt tcgctaggga cgatgacggt acctagataa gaagcaccgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgcg agcgttgtcc ggaattactg ggcgtaaagg

480

gctcgtaggt ggtttgtcgc gtcgtctgtg aaattctggg gcttaactcc gggcgtgcag

540

gcgatacggg caaacttgag tgctgtaggg gtaactggaa ttcctggtgt agcggtgaaa

600

tgcgcagata tcaggaggaa caccgatggc gaaggcaggt tactgggcag actgacgctg

660

aggagcgaaa gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gctgtaaacg

720

gtgggcgcta ggtgtgaggg ttctcgtgcc gtagctaacg cattaagcgc cccgcctggg

780

gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag

840

catgtggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg ggcttgacat atacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccttgtctt atgttgccag catggggact catgagagac tgccggggtt aactcggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtcc agggcttcac acatgctaca

1080

atggtcggca acgcgttgcg acactgtgag gtggagcgaa tcgctgccgg tcttagttcg

1140

gatggggtct gcaactcgac cccagaagtc ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcaatg

1200

ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacgtcatg aaagttggta

1260

acacccgaag ccggtgccta gggagccgtc gaaggtggga ttggcgattg ggacgaagtc

1320

gtaacaaggt akcc

1334

<210> 708

<211> 1336

<212> DNA

<213> Corynebacterium mastitidis

<400> 708

gagtttgatc mtggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgggtg atctgccctc aacttcggga taagcttggg

120

aaactgggtc taataccgga tagggaaagt cggttgggga tgagctcgcg gcctatcagc

180

ttgttggtgg ggtaatggcc taccaaggcg tcgacgggta gccggcctga gagggtgtac

240

ggccacattg ggactgagat acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

300

gcacaatggg cgcaagcctg atgcagcgac gccgcgtggg ggatgaaggc cttcgggttg

360

taaactcctt tcgctaccga cgatgacggt aggtggagaa gaagcaccgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgcg agcgttgtcc ggatttactg ggcgtaaaga

480

gctcgtaggt ggtttgtcgc gtcgtctgtg aaattccggg gcttaacttc gggcgtgcag

540

gcgatacggg caaacttgag tgctgtaggg gtaactggaa ttcctggtgt agcggtggaa

600

tgcgcagata tcaggaggaa caccgatggc gaaggcaggt tactgggcag actgacgctg

660

aggagcgaaa gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gctgtaaacg

720

gtgggcgcta ggtgtgagcc ggtttgtgcc gtagctaacg cattaagcgc cccgcctggg

780

gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag

840

catgtggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg ggcttgacat atacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccttgtctt atgttgccag cacgtgggga ctcatgagag actgccgggg ttaactcgga

1020

ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgt ccagggcttc acacatgcta

1080

caatggtcgg cagtaggttg cgataccgtg aggtggagct aatcctgttc ggccttagtt

1140

cggatggggt ctgcaactcg accccagaag tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa

1200

cgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca tgaaagttgg

1260

taacacccga aaaccatgcc tagggagtgg ttgaaggtgg gattggcgat tgggacgaag

1320

tcgtaacaag gtakcc

1336

<210> 709

<211> 1559

<212> DNA

<213> Corynebacterium matruchotii

<400> 709

tttttttgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaaggcccc cacttttttg gtgggggtgc tcgagtggcg aacgggtgag

120

taacacgtgg gtgatctgcc ctgcacttcg ggataagctt gggaaactgg gtctaatacc

180

ggataggacc atggtttagt gtctcatggt ggaaagatta ttgttttggt gcaggatgag

240

ctcgcggcct atcagcttgt tggtggggta atggcctacc aaggcgtcga cgggtagccg

300

gcctgagagg gtggacggcc acattgggac tgagatacgg cccagactcc tacgggaggc

360

agcagtgggg aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agcgacgccg cgtgggggat

420

gacggccttc gggttgtaaa ctcctttcgt tagggacgaa gccrcacctk ttttgggtgt

480

ggtgacggta cctttgttaa gaagcaccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

540

gtagggtgcg agcgttgtcc ggaattactg ggcgtaaaga gctcgtaggt ggtttgttgc

600

gtcgtctgtg aaattccggg gcttaacttc ggggtggcag gcgatacggg cataactaga

660

gtgctgtagg ggagactgga attcctggtg tagcggtgga atgcgcagat atcaggagga

720

acaccgatgg cgaaggcagg tctctgggca gtaactgacg ctgaggagcg aaagcatggg

780

gagcgaacag gattagatac cctggtagtc catgctgtaa acggtgggcg ttaggtgtgg

840

ggaccggttt ggtttctgtg ccgtagctaa cgcattaagc gccccgcctg gggagtacgg

900

ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggcgg agcatgtgga

960

ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc tgggtttgac atgcaccaga cggttgtaga

1020

gatacgtacc tccctttgtg gttggtgtgc aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt

1080

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtcttatgt tgccagcact

1140

ttgggtgggg actcatgaga gactgccggg gttaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1200

aaatcatcat gccctttatg cccagggctt cacacatgct acaatggtta gtacaacgcg

1260

ctgcaaacct gtgagggtga gcgaatcgct gaaagctaat ctcagttcgg attggggtct

1320

gcaactcgac cccatgaagt cggagtcgct agtaatcgca gatcagcaat gctgcggtga

1380

atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacgtcat gaaagttggt aacacccgaa

1440

gcccatggcc taaccaccgt tttttggtgg ggggagtggt cgaaggtggg attggcgatt

1500

gggacgaagt cgtaacaagg tagccgtacc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctttct

1559

<210> 710

<211> 1400

<212> DNA

<213> Corynebacterium minutissimum

<220>

<221> modified_base

<222> (49)..(52)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (59)..(61)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (188)..(188)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (426)..(427)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (832)..(832)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (884)..(884)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1395)..(1396)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 710

acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg gaaaggccnn nngcttgcnn

60

ngggtactcg agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgggtg atctgccttg cactctggga

120

taagcttggg aaactgggtc taataccgga taggaaccgt ctttagtgtg gtggttggaa

180

agtttttncg gtgcaagatg agctcgcggc ctatcagctt gttggtgggg taatggccta

240

ccaaggcgtc gacgggtagc cggcctgaga gggtgtacgg ccacattggg actgagatac

300

ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg gaagcctgat

360

gcagcgacgc cgcgtggggg atgacggcct tcgggttgta aactcctttc gacagggacg

420

aagcgnnagt gacggtacct gtataagaag caccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

480

taatacgtag ggtgcgagcg ttgtccggaa ttactgggcg taaagagctc gtaggtggtt

540

tgtcgcgtcg tctgtgaaat tccggggctt aactccgggc gtgcaggcga tacgggcata

600

acttgagtgc tgtaggggag actggaattc ctggtgtagc ggtgaaatgc gcagatatca

660

ggaggaacac cgatggcgaa ggcaggtctc tgggcagtta ctgacgctga ggagcgaaag

720

catgggtagc gaacaggatt agataccctg gtagtccatg ccgtaaacgg tgggcgctag

780

gtgtaggggg cttccacgtc ttctgtgccg tagctaacgc attaagcgcc cngcctgggg

840

agtacggccg caaggctaaa actcaaagga attgacgggg gccngcacaa gcggcggagc

900

atgtggatta attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg gcttgacata caccagatcg

960

ctgcagagat gtagtttccc ttgtggttgg tgtacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

1020

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgtct tatgttgcca

1080

gcatttggtt ggggactcat gagagactgc cggggttaac tcggaggaag gtggggatga

1140

cgtcaaatca tcatgcccct tatgtccagg gcttcacaca tgctacaatg gtcggtacaa

1200

cgcgcagcga cactgtgagg tggagcgaat cgctgaaagc cggtcttagt tcggattggg

1260

gtctgcaact cgaccccatg aagtcggagt cgctagtaat cgtagatcag caatgctgcg

1320

gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcacg tcatgaaagt tggtaacacc

1380

cgaacgcagt ggctnnaact

1400

<210> 711

<211> 1459

<212> DNA

<213> Corynebacterium mucifaciens

<220>

<221> modified_base

<222> (354)..(354)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (385)..(385)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1092)..(1092)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 711

ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggaaaggccc aagcttgctt gggtactcga

60

gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgggtga tctgccctgc acttcgggat aagcctggga

120

aactgggtct aataccggat aggacgatgg tttggatgcc attgtggaaa gttttttcgg

180

tgtgggatga gctcgcggcc tatcagcttg ttggtggggt aatggcctac caaggcgtcg

240

acgggtagcc ggcctgagag ggtgtacggc cacattggga ctgagatacg gcccagactc

300

ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagngacgcc

360

gcgtggggga tgacggcctt cgggntgtaa actcctttcg ctagggacga agcgttttgt

420

gacggtacct ggagaagaag caccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

480

ggtgcgagcg ttgtccggaa ttactgggcg taaagagctc gtaggtggtt tgtcgcgtcg

540

tttgtgtaag cccgcagctt aactgcggga ctgcaggcga tacgggcata acttgagtgc

600

tgtaggggag actggaattc ctggtgtagc ggtggaatgc gcagatatca ggaggaacac

660

cgatggcgaa ggcaggtctc tgggcagtaa ctgacgctga ggagcgaaag catgggtagc

720

gaacaggatt agataccctg gtagtccatg ccgtaaacgg tgggcgctag gtgtgagtcc

780

cttccacggg gttcgtgccg tagctaacgc attaagcgcc ccgcctgggg agtacggccg

840

caaggctaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggcggagc atgtggatta

900

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg gcttgacata caccagatcg ccgtagagat

960

acggtttccc tttgtggttg gtgtacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1020

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc ttatgttgcc agcagctgat

1080

ggtggggact cntgagagac tgccggggtt aactcggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1140

tcatcatgcc ccttatgtcc agggcttcac acatgctaca atggtcggta caacgcgcat

1200

gcgagcctgt gaggtggagc gaatcgctga aagccggtcg tagttcggat tggggtctgc

1260

aactcgaccc catgaagtcg gagtcgctag taatcgcaga tcagcaacgc tgcggtgaat

1320

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacagtcatg aaagttggta acacccgaag

1380

ccagtggcct gttacaggga gctgtgtcga aggtgggatc ggcgattggg acgaagtcgt

1440

aacaaggtag ccgtaccgg

1459

<210> 712

<211> 1443

<212> DNA

<213> Corynebacterium propinquum

<220>

<221> modified_base

<222> (16)..(16)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 712

ctgctcagga cgaacnctgg cggcgtgctt aacacatgca agtcgaacgg aaaggccttt

60

tcggaggtac tcgagtggcg aacgggtgag taacacgtgg gtgatctgcc ctgcactctg

120

ggataagcct gggaaactgg gtctaatacc ggataggact gcactttagt gtgtgtggtg

180

gaaagttttt tcggtgtagg atgagcccgc ggcctatcag cttgttggtg gggtaatggc

240

ctaccaaggc ggcgacgggt agccggactg agaggttggt cggccacatt gggactgaga

300

tacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct

360

gatgcagcga cgccgcgtgg gggatgacgg ccttcgggtt gtaaactcct ttcgccaggg

420

acgaagcgtt ttgtgacggt acctggagaa gaagcaccgg ctaactacgt gccagcagcc

480

gcggtaatac gtagggtgca agcgttgtcc ggaattactg ggcgtaaaga gctcgtaggt

540

ggtttgtcgc gtcgtctgtg aaattccaca gcttaactgt gggcgtgcag gcgatacggg

600

ctgacttgag tactgtaggg gtaactggaa ttcctggtgt agcggtgaaa tgcgcagata

660

tcaggaggaa caccgatggc gaaggcaggt tactgggcag ttactgacgc tgaggagcga

720

aagcatgggt agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc atgccgtaaa cggtgggcgc

780

taggtgtagg ggccttttgg ggtttctgtg ccgtagctaa cgcattaagc gccccgcctg

840

gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggcgg

900

agcatgtgga ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc tgggcttgac atacaccaga

960

tcgctgcaga gatgtagttt cccttgtggc tggtgtacag gtggtgcatg gctgtcgtca

1020

gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg tcttatgttg

1080

ccagcacgtt atggtgggga ctcatgagag actgccgggg ttaactcgga ggaaggtggg

1140

gacgacgtca agtcatcatg ccccttatgt ccagggcttc acacatgcta caatggccgg

1200

tacaatgcgc agcgagcctg tgagggtgag ctaatcgctt aaagccggtc ttagttcgga

1260

ttggggtctg caactcgacc ccatgaagtc ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcaatg

1320

ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacgtcatg aaagttggta

1380

acacccgaag ccggtggctc aaactcggtt tagggagccg tcgaaggtgg gatcggcgat

1440

tgg

1443

<210> 713

<211> 1483

<212> DNA

<213> Corynebacterium pseudodiphtheriticum

<400> 713

cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggaaaggcct

60

cttcggaggt actcgagtgg cgaacgggtg agtaacacgt gggtgatctg ccctgcactc

120

tgggataagc ctgggaaact gggtctaata ccggatagga ccatgcttta gtgtgtgtgg

180

tggaaagttt tttcggtgta ggatgagccc gcggcctatc agcttgttgg tggggtaatg

240

gcctaccaag gcggcgacgg gtagccggac tgagaggttg gtcggccaca ttgggactga

300

gatacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc

360

ctgatgcagc gacgccgcgt gggggatgac ggccttcggg ttgtaaactc ctttcggcag

420

ggacgaagcg ttttgtgacg gtacctggag aagaagcacc ggctaactac gtgccagcag

480

ccgcggtaat acgtagggtg caagcgttgt ccggaattac tgggcgtaaa gagctcgtag

540

gtggtttgtc acgtcgtctg tgaaattcca cagcttaact gtgggcgtgc aggcgatacg

600

ggctgacttg agtactgtag gggtaactgg aattcctggt gtagcggtga aatgcgcaga

660

tatcaggagg aacaccgatg gcgaaggcag gttactgggc agttactgac gctgaggagc

720

gaaagcatgg gtagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacggtgggc

780

gctaggtgta gggacctttt ggggtttctg tgccgtagct aacgcattaa gcgccccgcc

840

tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggc

900

ggagcatgtg gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctgggcttg acatacactg

960

gatcgctgca gagatgtagt ttcccttgtg gctagtgtac aggtggtgca tggctgtcgt

1020

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtcttatgt

1080

tgccagcacg ttatggtggg gactcatgag agactgccgg ggttaactcg gaggaaggtg

1140

gggacgacgt caagtcatca tgccccttat gtccagggct tcacacatgc tacaatggcc

1200

ggtacaatgc gcagcgagcc tgtgagggtg agctaatcgc ttaaagctgg tcttagttcg

1260

gattggggtc tgcaactcga ccccatgaag tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa

1320

tgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca tgaaagttgg

1380

taacacccga agccggtggc tcaaactcgt ttagggagcc gtcgaaggtg ggatcggcga

1440

ttgggacgaa gtcgtaacaa ggtagccgta ccggaaggtg cgg

1483

<210> 714

<211> 1529

<212> DNA

<213> Corynebacterium pseudogenitalium

<400> 714

tttttgtgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaaggccct gcttgcaggg tactcgagtg gcgaacgggt gagtaacacg

120

tgggtgatct gccctgcact tcgggataag cctgggaaac tgggtctaat accggatagg

180

agccattttt agtgtgatgg ttggaaagtt ttttcggtgt aggatgagct cgcggcctat

240

cagcttgttg gtggggtaat ggcctaccaa ggcggcgacg ggtagccggc ctgagagggt

300

ggacggccac attgggactg agatacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag cgacgccgcg tgggggatga cggccttcgg

420

gttgtaaact cctttcgcta gggacgaagc tttttgtgac ggtacctaga taagaagcac

480

cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggt gcgagcgttg tccggaatta

540

ctgggcgtaa agggctcgta ggtggtttgt cgcgtcgtct gtgaaattcc ggggcttaac

600

tccgggcgtg caggcgatac gggcataact tgagtactgt aggggtaact ggaattcctg

660

gtgtagcggt gaaatgcgca gatatcagga ggaacaccga tggcgaaggc aggttactgg

720

gcagttactg acgctgagga gcgaaagcat gggtagcgaa caggattaga taccctggta

780

gtccatgccg taaacggtgg gcgctaggtg tgagggtctt ttcacgactt tcgtgccgta

840

gctaacgcat taagcgcccc gcctggggag tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat

900

tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat gtggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc

960

ttacctgggc ttgacataca ctggatcggg ctagagatag tctttccctt tgtggctggt

1020

gtacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1080

acgagcgcaa cccttgtctt atgttgccag catttggttg gggactcatg agagactgcc

1140

ggggtcaact cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgtccaggg

1200

cttcacacat gctacaatgg tcggtacaac gcgcagcgac actgtgaggt ggagcgaatc

1260

gctgaaagcc ggccttagtt cggattgggg tctgcaactc gaccccatga agtcggagtc

1320

gctagtaatc gcagatcagc aatgctgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1380

cccgtcacgt catgaaagtt ggtaacaccc gaagccggtg gcccaaactt gttagggagc

1440

cgtcgaaggt gggatcggcg attgggacga agtcgtaaca aggtacccgt accggaaggt

1500

gcgggtggat cacctccttt ctaaggagc

1529

<210> 715

<211> 1396

<212> DNA

<213> Corynebacterium pseudotuberculosis

<220>

<221> modified_base

<222> (827)..(827)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (879)..(879)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 715

acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg gaaaggcccc ttcgggggtg

60

ctcgagtggc gaacgggtga gtaacacgtg ggtgatctgc ctcgtactct gggataagcc

120

tgggaaactg ggtctaatac tggataggac cgcactttag tgtgtgtggt ggaaagtttt

180

ttcggtacga gatgagcccg cggcctatca gcttgttggt ggggtaatgg cctaccaagg

240

cgtcgacggg tagccggcct gagagggtgg acggccacat tgggactgag atacggccca

300

gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggcgcaagcc tgatgcagcg

360

acgccgcgtg agggatgacg gccttcgggt tgtaaacctc tttcgacagg gacgaagctt

420

tttgtgacgg tacctgtata agaagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

480

cgtagggtgc gagcgttgtc cggaattact gggcgtaaag agctcgtagg tggtttgtcg

540

cgtcgtctgt gaaattccgg ggcttaactc cgggcgtgca ggcgatacgg gcataacttg

600

agtgctgtag gggagactgg aattcctggt gtagcggtgg aatgcgcaga tatcaggagg

660

aacaccgatg gcgaaggcag gtctctgggc agtaactgac gctgaggagc gaaagcatgg

720

ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacggtgggc gctaggtgtg

780

agggtcttcc acgactttcg tgccgtagct aacgcattaa gcgcccngcc tggggagtac

840

ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga cgggggccng cacaagcggc ggagcatgtg

900

gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctgggcttg acatatacaa gatcggcgta

960

gagatacgtt ttcccttgtg gtttgtatac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt

1020

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtcttatgt tgccagcacg

1080

tgatggtggg gactcatgag agactgccgg ggttaactcg gaggaaggtg gggatgacgt

1140

caaatcatca tgccccttat gtccagggct tcacacatgc tacaatggtc ggtacaacgc

1200

gttgcgagcc tgtgagggtg agcgaatcgc tgaaagccgg cctcagttcg gattggggtc

1260

tgcaactcga ccccatgaag tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg

1320

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca tgaaagttgg taacacccga

1380

acgccatggc ccaacc

1396

<210> 716

<211> 1409

<212> DNA

<213> Corynebacterium pyruviciproducens

<400> 716

acgctggcgg cgtgcttaac acatgcaagt cgaacggaaa ggcctcagct tgctggggtg

60

ctcgagtggc gaacgggtga gtaacacgta ggtgatctgc ctttcacttc gggataagct

120

tgggaaactg ggtctaatac cggatattca ctatgccgtg gttggtgtgg tggaaagctt

180

ttgcggtggg agatgagctt gcggcctatc agcttgttgg tggggtaatg gcctaccaag

240

gcggcgacgg gtagccggcc tgagagggtg tgcggccaca ttgggactga gatacggccc

300

agactcctac gggaggcagc agtggggaat tttgcacaat gggcggaagc ctgatgcagc

360

gacgccgtgt gggggatgaa ggccttcggg ttgtaaactc ctttcgtcag ggacgaagtt

420

tgtttgacgg tacctggata agaagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

480

cgtagggtgc gagcgttgtc cggatttact gggcgtaaag ggctcgtagg tggtgtgttg

540

cgtcgtctgt gtaatccagg ggcttaactt ttggttggca ggcgatacgg gcattgcttg

600

agtgctgtag gggagactgg aattcctggt gtagcggtga aatgcgcaga tatcaggagg

660

aacaccgatg gcgaaggcag gtctctgggc agttactgac gctgaggagc gagagcatgg

720

gtagcgaaca ggattagata ccctggtagt ctatgctgta aacggtgggc gctaggtgtg

780

agcctcttcc acggggtttg tgccgtagct aacgctttaa gcgccccgcc tggggagtac

840

ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgtg

900

gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctgggcttg acataggcag gatgggcgca

960

gagatgtgtc gtccctttgt ggtctgttta caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1020

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtcttatg ttgccagcac

1080

gttgtggtgg ggactcgtga gagactgccg gggttaactc ggaggaaggt ggggatgacg

1140

tcaaatcatc atgcccctta tgtccagggc ttcacacatg ctacaatggt tggtacagtg

1200

cgtgagcaac atcgtgaggt ggagctaatc gctaaagcca gtctcagttc ggattggggt

1260

ctgcaactcg acctcatgaa gtcggagtcg ctagtaatcg cagatcagca gtgctgcggt

1320

gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacgtc atgaaagttg gtaacacccg

1380

aagcccatgg cctaaccggt tttgccggg

1409

<210> 717

<211> 1395

<212> DNA

<213> Corynebacterium renale

<220>

<221> modified_base

<222> (830)..(830)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (882)..(882)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1391)..(1391)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 717

acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg gaaaggccac tgcttgcagt

60

ggtactcgag tggcgaacgg gtgagtaaca cgtgggtgat ctgccctgta ctttgggata

120

agcctgggaa actgggtcta ataccggata ggaccatcgt ttagtgtcgg tggtggaaag

180

cttttgcggt acgggatgag ctcgcggcct atcagcttgt tggtggggta atggcctacc

240

aaggcgtcga cgggtagccg gcctgagagg gtggacggcc acattgggac tgagatacgg

300

cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc

360

agcgacgccg cgtgagggat gacggccttc gggttgtaaa cctctttcgc tagggacgaa

420

gcttttgtga cggtacctag agaagaagca ccggctaact acgtgccagc agccgcggta

480

atacgtaggg tgcgagcgtt gtccggattt actgggcgta aagagctcgt aggtggtttg

540

tcgcgtcgtc tgtgaaattc cggggcttaa ctccgggcgt gcaggcgata cgggcataac

600

ttgagtactg taggggagac tggaattcct ggtgtagcgg tggaatgcgc agatatcagg

660

aggaacaccg atggcgaagg caggtctctg ggcagttact gacactgagg agcgaaagca

720

tgggtagcga acaggattag ataccctggt agtccatgcc gtaaacggtg ggcgctaggt

780

gtgagaccct tccacgggtt ttgtgccgta gctaacgcat taagcgcccn gcctggggag

840

tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc cngcacaagc ggcggagcat

900

gtggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctgggt ttgacataca ccagaccggg

960

ccagagatgg tctttccctt tgtggttggt gtacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

1020

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgta acgagcgcaa cccttgtctt atgttgccag

1080

cacgttgtgg tggggactca tgagagactg ccggggttaa ctcggaggaa ggtggggatg

1140

acgtcaaatc atcatgcccc ttatgtccag ggcttcacac atgctacaat ggtcggtaca

1200

acgcgtgtgc tacttcgtga ggagatgcta atcgctgaaa gccggcctta gttcggattg

1260

gggtctgcaa ctcgacccca tgaagtcgga gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg

1320

cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca cgtcatgaaa gttggtaaca

1380

cccgaacgcc ntggc

1395

<210> 718

<211> 1320

<212> DNA

<213> Corynebacterium resistens

<400> 718

aaagtttttt cggtacgaga tgagcccgcg gcctatcagc ttgttggtgg ggtaatggcc

60

taccaaggcg acgacgggta gccggcctga gagggtgtac ggccacattg ggactgagac

120

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg cggaagcctg

180

atgcagcgac gccgcgtgag ggatgacggc cttcgggttg taaacctctt tcgctaggga

240

agaagccttt ttggtgacgg tacctggata agaagcaccg gctaactacg tgccagcagc

300

cgcggtaata cgtagggtgc aagcgttgtc cggaattact gggcgtaaag agctcgtagg

360

tggtttgtcg cgtcgttagt gaaagcccgg ggcttaactc cgggtctgct ggcgatacgg

420

gcataacttg agtgctgtag gggagactgg aattcctggt gtagcggtgg aatgcgcaga

480

tatcaggagg aacaccgatg gcgaaggcag gtctctgggc agtaactgac gctgaggagc

540

gaaagcatgg gtagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacggtgggc

600

gctaggtgtg ggggtttttc acgacttccg tgccgtagct aacgcattaa gcgccccgcc

660

tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggc

720

ggagcatgtg gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctgggcttg acatatacgg

780

gatcggcgta gagatacgtt ttcccttgtg gctcgtatac aggtggtgca tggttgtcgt

840

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtcttgtgt

900

tgccagcacg ttatggtggg gactcgcgag agactgccgg ggttaactcg gaggaaggtg

960

gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gtccagggct tcacacatgc tacaatggtc

1020

ggtacagtgg gttgcgatgc cgtgaggtgg agctaatccc ttaaagccgg tctcagttcg

1080

gattggagtc tgcaactcga ctccatgaag tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa

1140

cgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca tgaaagttgg

1200

taacacccga agccagtggc ccaaactcgt tagggagctg tcgaaggtgg gatcggcgat

1260

tgggacgaag tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc ggctggatca cctcctttct

1320

<210> 719

<211> 1457

<212> DNA

<213> Corynebacterium riegelii

<400> 719

atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg gaaaggccca agcttgcttg

60

ggtactcgag tggcgaacgg gtgagtaaca cgtgggtgat ctgccctgca cttcgggata

120

agcctgggaa actgggtcta ataccggata ggaccacttc gtagktgttg tggtggaaag

180

ttttttcggt gtgggatgag ctcgcggcct atcagcttgt tggtggggta atggcctacc

240

aaggcgtcga cgggtagccg gcctgagagg gtgtacggcc acattgggac tgagatacgg

300

cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatgggcgga agcctgatgc

360

agcgacgccg cgtgggggat gacggccttc gggttgtaaa ctcctttcgc caaagacgaa

420

ttttgacggt atttggagaa gaagcaccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

480

gtagggtgcg agcgttgtcc ggaattactg ggcgtaaaga gctcgtaggt ggtttgtcgc

540

gtcgtttgtg gaagtccacg gcttaactgt gggactgcag gcgatacggg cataacttga

600

gtgctgtagg ggagactgga attcctggtg tagcggtgaa atgcgcagat atcaggagga

660

acaccgatgg cgaaggcagg tctctgggca gtaactgacg ctgaggagcg aaagcatggg

720

gagcgaacag gattagatac cctggtagtc catgccgtaa acggtgggcg ctaggtgtga

780

gtcccttcca cggggttcgt gccgtagcta acgcattaag cgccccgcct ggggagtacg

840

gccgcaaggc taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggcg gagcatgtgg

900

attaattcga tgcaacgcga agaaccttac ctgggcttga catacaccgg atcgctgcag

960

agatgtagtt tcccttgtgg ctggtgtaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc

1020

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gtcttatgtt gccagcacgt

1080

gatggtgggg acttatgaga aactgccggg gttaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1140

aaatcatcat gccccttatg tccagggctt cacacatgct acaatggtcg gtacaacgcg

1200

cagctacctc gtgaggggac gcgaatcgct gaaagccggc cttagttcgg attggggtct

1260

gcaactcgac cccatgaagt cggagtcgct agtaatcgca gatcagcaac gctgcggtga

1320

atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacgtcat gaaagttggt aacacccgaa

1380

gccagtggcc tgtcaaaagg agctgtcgaa ggtgggatcg gcgattggga caagtcgtaa

1440

caaggtagcc gtaccgg

1457

<210> 720

<211> 1469

<212> DNA

<213> Corynebacterium simulans

<400> 720

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggaaaggcct cagcttgctg

60

gggtactcga gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgggtga tctgccttgc acttcgggat

120

aagcttggga aactgggtct aataccggat aggacagctg tttagtgtca gttgtggaaa

180

gttttttcgg tgcaagatga gctcgcggcc tatcagcttg ttggtggggt aatggcctac

240

caaggcgtcg acgggtagcc ggcctgagag ggtggacggc cacattggga ctgagatacg

300

gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggcgg aagcctgatg

360

cagcgacgcc gcgtggggga tgaaggcctt cgggttgtaa actcctttcg acagggacga

420

agcttttgtg acggtacctg tataagaagc accggctaac tacgtgccag cagccgcggt

480

aatacgtagg gtgcgagcgt tgtccggaat tactgggcgt aaagagctcg taggtggttt

540

gtcgcgtcgt ctgtgaaatt ccggggctta actccgggcg tgcaggcgat acgggctgac

600

ttgagtgctg taggggagac tggaattcct ggtgtagcgg tgaaatgcgc agatatcagg

660

aggaacaccg atggcgaagg caggtctctg ggcagtaact gacgctgagg agcgaaagca

720

tgggtagcga acaggattag ataccctggt agtccatgcc gtaaacggtg ggcgctaggt

780

gtagggggct tccacgtctt ctgtgccgta gctaacgcat taagcgcccc gcctggggag

840

tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat

900

gtggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctgggc ttgacatata gcggatcgct

960

gcagagatgt agtttccctt tgtggtcgtt atacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

1020

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtctt atgttgccag

1080

catttggttg gggactcatg agagactgcc ggggtcaact cggaggaagg tggggatgac

1140

gtcaaatcat catgcccctt atgtccaggg cttcacacat gctacaatgg tcggtacaac

1200

gcgcagcgac actgtgaggt ggagcgaatc gctgaaagcc ggccttagtt cggattgggg

1260

tctgcaactc gaccccatga agtcggagtc gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg

1320

tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacgt catgaaagtt ggtaacaccc

1380

gaagccagtg gctcaaactc gttagggagc tgtcgaaggt gggatcggcg attgggacga

1440

agtcgtaaca aggtagccgt accggaagg

1469

<210> 721

<211> 1323

<212> DNA

<213> Corynebacterium singulare

<220>

<221> modified_base

<222> (922)..(922)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1086)..(1086)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 721

acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg gaaaggccct agcttgctga

60

ggtgctcgag tggcgaacgg gtgagtaaca cgtgggtgat ctgccttgta ctctgggata

120

agcttgggaa actgggtcta ataccggata ggaactgcct ttagtgtggt ggttggaaag

180

ttttttcggt gcaagatgag ctcgcggcct atcagcttgt tggtggggta atggcctacc

240

aaggcgtcga cgggtagccg gcctgagagg gtgtacggcc acattgggac tgagatacgg

300

cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatgggcgga agcctgatgc

360

agcgacgccg cgtgggggat gacggccttc gggttgtaaa ctcctttcga cagggacgaa

420

gctttttgtg acggtacctg tataagaagc accggctaac tacgtgccag cagccgcggt

480

aatacgtagg gtgcgagcgt tgtccggaat tactgggcgt aaagagctcg taggtggttt

540

gtcgcgtcgt ctgtgaaatt ccggggctta actccgggcg tgcaggcgat acgggcataa

600

cttgagtgct gtaggggaga ctggaattcc tggtgtagcg gtgaaatgcg cagatatcag

660

gaggaacacc gatggcgaag gcaggtctct gggcagttac tgacgctgag gagcgaaagc

720

atgggtagcg aacaggatta gataccctgg tagtccatgc cgtaaacggt gggcgctagg

780

tgtagggggc ttccacgtct tctgtgccgt agctaacgca ttaagcgccc cgcctgggga

840

gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggcggagca

900

tgtggattaa ttcgatgcaa cncgaagaac cttacctggg cttgacatac accagatcgc

960

tgcagagatg tagtttccct tgtggttggt gtacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

1020

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtctt atgttgccag

1080

catttngttg gggactcatg agagactgcc ggggttaact cggaggaagg tggggatgac

1140

gtcaaatcat catgcccctt atgtccaggg cttcacacat gctacaatgg tcggtacaac

1200

gcgcagcgac actgtgaggt ggagcgaatc gctgaaagcc ggtcttagtt cggattgggg

1260

tctgcaactc gaccccatga agtcggagtc gctagtaatc gtagatcagc aatgctgcgg

1320

tga

1323

<210> 722

<211> 1475

<212> DNA

<213> Corynebacterium sp. 1 ex sheep

<400> 722

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggaaaggccc ctagcttgct

60

gggggtactc gagtggcgaa cgggtgagta acacgtgggt gatctgccct gcacttcggg

120

ataagcctgg gaaactgggt ctaataccgg ataggagcca tctttggtgt gatggttgga

180

aagttttttc ggtgtaggat gagcctgcgg cctatcagct tgttggtggg gtaatggcct

240

accaaggcgt cgacgggtag ccggcctgag agggtgtacg gccacattgg gactgagata

300

cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga

360

tgcagcgacg ccgcgtgggg gatgacggcc ttcgggttgt aaactccttt cgccagggac

420

gaagcgtttt gtgacggtac ctggataaga agcaccggct aactacgtgc cagcagccgc

480

ggtaatacgt agggtgcgag cgttgtccgg aattactggg cgtaaagagc tcgtaggtgg

540

tttgtcgcgt cgtctgtgaa atcccggggc ttaacttcgg gcgtgcaggc gatacgggca

600

taacttgagt gctgtagggg agactggaat tcctggtgta gcggtgaaat gcgcagatat

660

caggaggaac accgatggcg aaggcaggtc tctgggcagt aactgacgct gaggagcgaa

720

agcatgggta gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca tgccgtaaac ggtgggcgct

780

aggtgtgagt cccttccacg gggttcgtgc cgtagctaac gcattaagcg ccccgcctgg

840

ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga

900

gcatgtggat taattcgatg caacgcgaag aaccttacct gggcttgaca tgtaccagat

960

cgccatagag atatggtttc ccttgtggct ggttcacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag

1020

ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cttatgttgc

1080

cagcacgtag tggtggggac tcatgagaga ctgccggggt caactcggag gaaggtgggg

1140

atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgtc cagggcttca cacatgctac aatggtcggt

1200

acaacgcgca gcgagactgt gaggttaagc gaatcgctga aagccggcct tagttcggat

1260

tggggtctgc aactcgaccc catgaagtcg gagtcgctag taatcgcaga tcagcaatgc

1320

tgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacgtcatga aagttggtaa

1380

cacccgaagc cagtggccca aactcgttta gggagctgtc gaaggtggga tcggcgattg

1440

ggacgaagtc gtaacaaggt agccgtaccg gaagg

1475

<210> 723

<211> 1491

<212> DNA

<213> Corynebacterium sp. L-2012475

<400> 723

gaacgctggc ggcgtgctta acacatgcaa gtcgaacgga aaggctcaag cttgcttggg

60

tactcgagtg gcgaacgggt gagtaacacg tgggtgatct gccctgcact ttgggataag

120

cctgggaaac tgggtctaat accggatagg accatcgttt agtgtcggtg gtggaaagtt

180

tttcggtgtg ggatgagctc gcggcctatc agcttgttgg tggggtaatg gcctaccaag

240

gcgtcgacgg gtagccggcc tgagagggtg tacggccaca ttgggactga gatacggccc

300

agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc

360

gacgccgcgt gggggatgac ggccttcggg ttgtaaactc ctttcgccaa ggacgaagag

420

gaattgacgg tacttggata agaagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

480

cgtagggtgc gagcgttgtc cggaattact gggcgtaaag agctcgtagg tggtttgtcg

540

cgtcgtttgt ggaataccgc agcttaactg tggggttgca ggcgatacgg gcataacttg

600

agtgctgtag gggagactgg aattcctggt gtagcggtga aatgcgcaga tatcaggagg

660

aacaccgatg gcgaaggcag gtctctgggc agtaactgac gctgaggagc gaaagcatgg

720

gtagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacggtgggc gctaggtgtg

780

agtcccttcc acggggttcg tgccgtagct aacgcattaa gcgccccgcc tggggagtac

840

ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgtg

900

gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctgggcttg acatacaccg gatcgggcta

960

gagatagtct ttcccttgtg gctggtgtac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt

1020

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtcttatgt tgccagcacg

1080

tgatggtggg gactcatgag agactgccgg ggttaactcg gaggaaggtg gggatgacgt

1140

caaatcatca tgccccttat gtccagggct tcacacatgc tacaatggtc ggtacaacgc

1200

gcagcttccc tgtgaggggg tgcgaatcgc tgaaagccgg tcgtagttcg gattggggtc

1260

tgcaactcga ccccatgaag tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg

1320

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca tgaaagttgg taacacccga

1380

agccagtggc ccaaacgtgt tagggagctg tcgaaggtgg gatcggcgat tgggacgaag

1440

tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc ggctggatca ccttctttct a

1491

<210> 724

<211> 1445

<212> DNA

<213> Corynebacterium sp. NML 93-0481

<400> 724

catgcaagtc gaacggaaag gctccagctt gctggggtac tcgagtggcg aacgggtgag

60

taacacgtgg gtgatctgcc ctgcacttcg ggataagcct gggaaactgg gtctaatacc

120

ggataggacc acttctttga ggttgtggtg gaaagttttt tcggtgtggg atgagctcgc

180

ggcctatcag cttgttggtg gggtaatggc ctaccaaggc gtcgacgggt agccggcctg

240

agagggtgta cggccacatt gggactgaga tacggcccag actcctacgg gaggcagcag

300

tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcga cgccgcgtgg gggatgacgg

360

ccttcgggtt gtaaactcct ttcgtcaggg acgaagcgaa agtgacggta cctggataag

420

aagcaccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcga gcgttgtccg

480

gaattactgg gcgtaaagag ctcgtaggtg gtttgtcgcg tcgtttgtgg aataccgcag

540

cttaactgtg gggttgcagg cgatacgggc ataacttgag tgctgtaggg gagactggaa

600

ttcctggtgt agcggtggaa tgcgcagata tcaggaggaa caccgatggc gaaggcaggt

660

ctctgggcag taactgacgc tgaggagcga aagcatgggt agcgaacagg attagatacc

720

ctggtagtcc atgccgtaaa cggtgggcgc taggtgtgag tcccttccac ggggttcgtg

780

ccgtagctaa cgcattaagc gccccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa

840

ggaattgacg ggggcccgca caagcggcgg agcatgtgga ttaattcgat gcaacgcgaa

900

gaaccttacc tgggcttgac atacaccgga ccgggccaga gatggtcttt cccttgtggc

960

tggtgtacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1020

cgcaacgagc gcaacccttg tcttatgttg ccagcatttg gttggggact catgagagac

1080

tgccggggtt aactcggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtcc

1140

agggcttcac acatgctaca atggtcggta caacgcgttg ctacttcgtg aggagatgct

1200

aatcgctaaa agccggcctt agttcggatt ggggtctgca actcgacccc atgaagtcgg

1260

agtcgctagt aatcgcagat cagcaacgct gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac

1320

accgcccgtc acgtcatgaa agttggtaac acccgaagcc agtggcctaa actcgttagg

1380

gagctgtcga aggtgggatc ggcgattggg acgaagtcgt aacaaggtag ccgtaccgga

1440

aggtg

1445

<210> 725

<211> 1457

<212> DNA

<213> Corynebacterium sp. NML 97-0186

<400> 725

catgcaagtc gaacggaaag gccagtgctt gcactggtac tcgagtggcg aacgggtgag

60

taacacgtgg gtgatctgcc ctcaactccg ggataagcct gggaaactgg gtctaatact

120

ggataggacc acatcgtagg tggtgtggtg gaaagcgttt gtagcggttg gggatgagct

180

cgcggcctat cagcttgttg gtggggtaat ggcctaccaa ggcggcgacg ggtagccggc

240

ctgagagggt gtacggtcac attgggactg agatacggcc cagactccta cgggaggcag

300

cagtggggaa tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag cgacgccgcg tgggggatga

360

cggccttcgg gttgtaaacc tctttcgacc gtgacgaagc ctttggtgac ggtagcggta

420

gaagaagcac cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggt gcgagcgttg

480

tccggattta ctgggcgtaa agggctcgta ggtggtttgt cgcgtcgtct gtgaaattcc

540

ggggctcaac tccgggcgtg caggcgatac gggcataact tgagtactgc aggggtaact

600

ggaattcctg gtgtagcggt ggaatgcgca gatatcagga ggaacaccga tggcgaaggc

660

aggttactgg gcagttactg acgctgagga gcgaaagcat gggtagcgaa caggattaga

720

taccctggta gtccatgctg tcaacggtgg gcgctaggtg tgagaccctt ccacgggttt

780

tgtgccgtag ctaacgtttt aagcgccccg cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact

840

caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gcggagcatg tggattaatt cgatgcaacg

900

cgaagaacct tacctgggtt tgacatacac tggatcgcct cggagacggg gtttcccttt

960

gtggtcggtg tacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1020

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcctg tgttgccagc acgttgtggt ggggactcac

1080

gggagactgc cggggtgaac tcggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct

1140

tatgtccagg gcttcacaca tgctacaatg gtcggtacaa caggttgcga taccgtgagg

1200

tggagctaat ccttttaaag ccggcctcag ttcggattgg ggtctgcaac tcgaccccat

1260

gaagtcggag tcgctagtaa tcgcagatca gcagtgctgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1320

ttgtacacac cgcccgtcac gtcatgaaag tcggtaacac ccgaagccca cggcccaacc

1380

cttgtggggg gagtggtcga aggtgggatc ggcgattggg acgaagtcgt aacaaggtag

1440

ccgtaccgga aggtgcg

1457

<210> 726

<211> 1453

<212> DNA

<213> Corynebacterium sp. NML 99-0018

<400> 726

catgcaagtc gaacggaaag gcctctagct tgctaggggt actcgagtgg cgaacgggtg

60

agtaacacgt gggtgatctg ccctgcactt tgggataagc ttgggaaact gggtctaata

120

ccgaatatga ccattgtttg gatgcgatgg tggaaagctt ttgcggtgtg ggatgagcct

180

gcggcctatc agcttgttgg tggggtaatg gcctaccaag gcggcgacgg gtatccggcc

240

tgagagggtg tacggacaca ttgggactga gatacggccc agactcctac gggaggcagc

300

agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc gacgccgcgt gggggatgac

360

ggccttcggg ttgtaaactc ctttcgccag ggacgaagcg tttttgtgac ggtacctgga

420

taaraagcac cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggt gcgagcgttg

480

tccggaatta ctgggcgtaa agagctcgta ggtggtttgt cgcgtcgtct gtgaaatccc

540

ggggcttaac ttcgggcgtg caggcgatac gggcataact tgagtgctgt aggggagact

600

ggaattcctg gtgtagcggt gaaatgcgca ratatcagga ggaacaccga tggcgaaggc

660

aggtctctgg gcagtaactg acgctgagga gcgaaagcat gggtagcgaa caggattaga

720

taccctggta gtccatgccg taaacggtgg gcgctaggtg tagggggctt ccacgtcttc

780

tgtgccgtag ctaacgcatt aagcgccccg cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact

840

caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gcggagcatg tggattaatt cgatgcaacg

900

cgaagaacct tacctgggct tgacatgtac aggatcgggc tagagatagt ctttcccttg

960

tggtctgtat acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1020

gtcccgcaac gagcgcaayc cttgtcttat gttgccagca cgttatggtg gggactcatg

1080

agagactgcc ggggttaact cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt

1140

atgtccaggg cttcacacat gctacaatgg tcgatacagt gggcagcgac atcgtgaggt

1200

ggagcgaatc cctgaaagtc ggccttagtt cggattgggg tctgcaactc gaccccatga

1260

agtcggagtc gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg tgaatacgtt cccgggcctt

1320

gtacacaccg cccgtcacgt catgaaagtt ggtaacaccc gaagccagtg gcctaaactt

1380

gttagggagc tgtcgaaggt gggatcggcg attgggacga agtcgtaaca aggtagccgt

1440

accggaaggt gcg

1453

<210> 727

<211> 1522

<212> DNA

<213> Corynebacterium striatum

<400> 727

tttttgtgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaaggcctg cagcttgctg cgggtactcg agtggcgaac gggtgagtaa

120

cacgtgggtg atctgccttg cacttcggga taagcttggg aaactgggtc taataccgga

180

taggacagct gtttagtgtc agttgtggaa agttttttcg gtgcaagatg agctcgcggc

240

ctatcagctt gttggtgggg taatggccta ccaaggcgtc gacgggtagc cggcctgaga

300

gggtgtacgg ccacattggg actgagatac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg

360

ggaatattgc acaatgggcg gaagcctgat gcagcgacgc cgcgtggggg atgaaggcct

420

tcgggttgta aactcctttc gacagggacg aagcgtaagt gacggtacct gtataagaag

480

caccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggtgcgagcg ttgtccggaa

540

ttactgggcg taaagagctc gtaggtggtt tgtcgcgtcg tctgtgaaat tccggggctt

600

aactccgggc gtgcaggcga tacgggctga cttgagtgct gtaggggaga ctggaattcc

660

tggtgtagcg gtgaaatgcg cagatatcag gaggaacacc gatggcgaag gcaggtctct

720

gggcagtaac tgacgctgag gagcgaaagc atgggtagcg aacaggatta gataccctgg

780

tagtccatgc cgtaaacggt gggcgctagg tgtagggggc ttccacgtct tctgtgccgt

840

agctaacgca ttaagcgccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cggcggagca tgtggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac

960

cttacctggg cttgacatat acaagacagg cgtagagata cgtcctccct tgtggtttgt

1020

atacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1080

acgagcgcaa cccttgtctt atgttgccag catttggttg gggactcatg agagactgcc

1140

ggggtcaact cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgtccaggg

1200

cttcacacat gctacaatgg tcggtacaac gcgcagcgac actgtgaggt ggagcgaatc

1260

gctgaaagcc ggccttagtt cggattgggg tctgcaactc gaccccatga agtcggagtc

1320

gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1380

cccgtcacgt catgaaagtt ggtaacaccc gaagccagtg gctcaaactc gttagggagc

1440

tgtcgaaggt gggatcggcg attgggacga agtcgtaaca aggtagccgt accggaaggt

1500

gcggctggat cacctccttt ct

1522

<210> 728

<211> 1468

<212> DNA

<213> Corynebacterium sundsvallense

<400> 728

gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggaaaggcca gtgcttgcac

60

tggtgctcga gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagtga tctgccctgc actttgggat

120

aagcctggga aactgggtct aataccggat aggaccatgc tttagatggt gtggtggaaa

180

gttttttcgg tgtgggatga gcttgcggcc tatcagcttg ttggtggggt aatggcctac

240

caaggcgtcg acgggtagcc ggcctgagag ggtgtacggc cacattggga ctgagatacg

300

gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg

360

cagcgacgcc gcgtggggga tgacggcctt cgggttgtaa actcctttcg caactgacga

420

agctttgtgt gacggtaggt tgagaagaag caccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

480

taatacgtag ggtgcgagcg ttgtccggaa ttactgggcg taaagagctc gtaggtggtt

540

tgtcgcgtcg tgtgtgaaat tccggggctt aacttcgggg ttgcatacga tacgggcata

600

acttgagtgc tgtaggggag actggaattc ctggtgtagc ggtgaaatgc gcagatatca

660

ggaggaacac cgatggcgaa ggcaggtctc tgggcagtaa ctgacgctga ggagcgaaag

720

catggggagc gaacaggatt agataccctg gtagtccatg ccgtaaacgg tgggcgctag

780

gtgtgaggcc cttccacggg tttcgtgccg tagctaacgc attaagcgcc ccgcctgggg

840

agtacggccg caaggctaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggcggagc

900

atgtggatta attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg gcttgacata caccgaatcg

960

ctgcagagat gtggtttccc ttgtggttgg tgtacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

1020

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgtct tatgttgcca

1080

gcatgttgtg gtgggcactt atgagagact gccggggtta actcggagga aggtggggat

1140

gacgtcaaat catcatgccc cttatgtcca gggcttcaca catgctacaa tggtcggtac

1200

aacgcgcagc tacctcgtga ggggacgcga atcgctgaaa gccggtcgta gttcggattg

1260

gggtctgcaa ctcgacccca tgaagtcgga gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg

1320

cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca cgtcatgaaa gttggtaaca

1380

cccgaagcca gtggcctgtg aaaaggagct gtcgaaggtg ggatcggcga ttgggacgaa

1440

gtcgtaacaa ggtagccgta ccggaagg

1468

<210> 729

<211> 1522

<212> DNA

<213> Corynebacterium tuberculostearicum

<400> 729

tttttgtgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaaggccct gcttgcaggg tactcgagtg gcgaacgggt gagtaacacg

120

tgggtgatct gccctgcact tcgggataag cctgggaaac tgggtctaat accggatagg

180

agccattttt agtgtgatgg ttggaaagtt ttttcggtgt aggatgagct cgcggcctat

240

cagcttgttg gtggggtaat ggcctaccaa ggcggcgacg ggtagccggc ctgagagggt

300

ggacggccac attgggactg agatacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag cgacgccgcg tgggggatga cggccttcgg

420

gttgtaaact cctttcgcta gggacgaagc tttttgtgac ggtacctaga taagaagcac

480

cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggt gcgagcgttg tccggaatta

540

ctgggcgtaa agggctcgta ggtggtttgt cgcgtcgtct gtgaaattcc ggggcttaac

600

tccgggcgtg caggcgatac gggcataact tgagtactgt aggggtaact ggaattcctg

660

gtgtagcggt gaaatgcgca gatatcagga ggaacaccga tggcgaaggc aggttactgg

720

gcagttactg acgctgagga gcgaaagcat gggtagcgaa caggattaga taccctggta

780

gtccatgccg taaacggtgg gcgctaggtg tgagggtctt ttcacgactt tcgtgccgta

840

gctaacgcat taagcgcccc gcctggggag tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat

900

tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat gtggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc

960

ttacctgggc ttgacataca ccggatcggg ctagagatag tctttccctt tgtggctggt

1020

gtacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1080

acgagcgcaa cccttgtctt atgttgccag catttggttg gggactcatg agagactgcc

1140

ggggtcaact cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgtccaggg

1200

cttcacacat gctacaatgg tcggtacaac gcgcagcgac actgtgaggt ggagcgaatc

1260

gctgaaagcc ggccttagtt cggattgggg tctgcaactc gaccccatga agtcggagtc

1320

gctagtaatc gcagatcagc aatgctgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1380

cccgtcacgt catgaaagtt ggtaacaccc gaagccggtg gcccaaactt gttagggagc

1440

cgtcgaaggt gggatcggcg attgggacga agtcgtaaca aggtacccgt accggaaggt

1500

gcgggtggat cacctccttt ct

1522

<210> 730

<211> 1502

<212> DNA

<213> Corynebacterium tuscaniae

<220>

<221> modified_base

<222> (674)..(674)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 730

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggaaaggccc aagcttgctt gggtgctcga gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgggtga

120

tctgccctgc acttcgggat aagcctggga aactgggtct aataccggat aggaccatcg

180

tgttgtggcg gtggtggaaa gttttttcgg tgtgggatga gctcgcggcc tatcagcttg

240

ttggtggggt aatggcctac caaggcgtcg acgggtagcc ggcctgagag ggtgtacggc

300

cacattggga ctgagatacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca

360

caatgggcgc aagcctgatg cagcgacgcc gcgtggggga tgacggcctt cgggttgtaa

420

actcctttcg ccagggacga agcgttatgt gacggtacct ggataagaag caccggctaa

480

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggtgcgagcg ttgtccggaa ttactgggcg

540

taaagagctc gtaggtggtt tgtcgcgtcg tttgtgtaat accgcagctt aactgtgggg

600

ttgcaggcga tacgggcata acttgagtgc tgtaggggag actggaattc ctggtgtagc

660

ggtggaatgc gcanatatca ggaggaacac cgatggcgaa ggcaggtctc tgggcagtaa

720

ctgacgctga ggagcgaaag catgggtagc gaacaggatt agataccctg gtagtccatg

780

ccgtaaacgg tgggcgctag gtgtgagtcc cttccacggg gttcgtgccg tagctaacgc

840

attaagcgcc ccgcctgggg agtacggccg caaggctaaa actcaaagga attgacgggg

900

gcccgcacaa gcggcggagc atgtggatta attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg

960

gcttgacata caccggatcg ctgcagagat gtagtttccc ttgtggctgg tgtacaggtg

1020

gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

1080

acccttgtct tatgttgcca gcatttggtt ggggactcat gagagactgc cggggttaac

1140

tcggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgtccagg gcttcacaca

1200

tgctacaatg gtcggtacaa cgcgcagcta ctctgtgagg ggatgcgaat cgctgaaagc

1260

cggccttagt tcggattggg gtctgcaact cgaccccatg aagtcggagt cgctagtaat

1320

cgcagatcag caacgctgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcacg

1380

tcatgaaagt tggtaacacc cgaagccagt ggcctaaacg tgttagggag ctgtcgaagg

1440

tgggatcggc gattgggacg aagtcgtaac aaggtagccg taccggaagg tgcggctgga

1500

tc

1502

<210> 731

<211> 1508

<212> DNA

<213> Corynebacterium ulcerans

<400> 731

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggaaaggccc cttcgggggt actcgagtgg cgaacgggtg agtaacacgt gggtgatctg

120

cctcgtactc tgggataagc ctgggaaact gggtctaata ctggatagga ccgcacttta

180

gtgtgtgtgg tggaaagttt tttcggtacg agatgagccc gcggcctatc agcttgttgg

240

tggggtaatg gcctaccaag gcgtcgacgg gtagccggcc tgagagggtg gacggccaca

300

ttgggactga gatacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat

360

gggcgcaagc ctgatgcagc gacgccgcgt gagggatgac ggcctcgggt tgtaaacctc

420

tttcgacagg gacgaagctt ttgtgacggt acctgtataa gaagcaccgg ctaactacgt

480

gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgcg agcgttgtcc ggaattactg ggcgtaaaga

540

gctcgtaggt ggtttgtcgc gtcgtctgtg aaattccggg gcttaactcc gggcgtgcag

600

gcgatacggg cataacttga gtgctgtagg ggagactgga attcctggtg tagcggtgga

660

atgcgcagat atcaggagga acaccgatgg cgaaggcagg tctctgggca gtaactgacg

720

ctgaggagcg aaagcatggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc catgccgtaa

780

acggtgggcg ctaggtgtga gggtcttcca cgactttcgt gccgtagcta acgcattaag

840

cgccccgcct ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc

900

acaagcggcg gagcatgtgg attaattcga tgcaacgcga agaaccttac ctgggcttga

960

catatacaag atcggcgtag agatacgttt tcccttgtgg tttgtataca ggtggtgcat

1020

ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt

1080

gtcttatgtt gccagcacgt tatggtgggg actcatgaga gactgccggg gttaactcgg

1140

aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg tccagggctt cacacatgct

1200

acaatggtcg gtacaacgcg ttgcgagcct gtgagggtga gcgaatcgct gaaagccggc

1260

ctcagttcgg attggggtct gcaactcgac cccatgaagt cggagtcgct agtaatcgca

1320

gatcagcaac gctgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacgtcat

1380

gaaagttggt aacacccgaa gcccatggcc caaccagttt gtctgggggg agtggtcgaa

1440

ggtgggatcg gcgattggga cgaagtcgta acaaggtagc cgtaccggaa ggtgcggctg

1500

gatcacct

1508

<210> 732

<211> 1401

<212> DNA

<213> Corynebacterium urealyticum

<220>

<221> modified_base

<222> (830)..(830)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (882)..(882)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 732

acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg gaaaggcccc tgcttgcagg

60

gtactcgagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgggtgatc tgcccttcac ttcgggataa

120

gcctgggaaa ctgggtctaa taccggatag gaccaatctt tagtgtggtt ggtggaaagt

180

tttttcggtg gaggatgagc ccgcggccta tcagcttgtt ggtggggtaa tggcctacca

240

aggcgacgac gggtagccgg cctgagaggg tggacggcca cattgggact gagacacggc

300

ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca atgggcggaa gcctgatgca

360

gcgacgccgc gtgagggatg acggccttcg ggttgtaaac ctctttcgct agggaagaag

420

ccttcgggtg acggtacctg gataagaagc accggctaac tacgtgccag cagccgcggt

480

aatacgtagg gtgcgagcgt tgtccggaat tactgggcgt aaagagctcg taggtggttt

540

gtcgcgtcgt ctgtgaaatt ccggggctta actccgggcg tgcaggcgat acgggcaaac

600

tggagtgctg taggggagac tggaattcct ggtgtagcgg tggaatgcgc agatatcagg

660

aggaacaccg atggcgaagg caggtctctg ggcagttact gacactgagg agcgaaagca

720

tgggtagcga acaggattag ataccctggt agtccatgcc gtaaacggtg ggcgctaggt

780

gtggggattt ttcacgattt ccgtgccgta gctaacgcat taagcgcccn gcctggggag

840

tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc cngcacaagc ggcggagcat

900

gtggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctgggc ttgacataca ccggatcgct

960

gcagagatgt agtttccctt cggggctggt gtacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

1020

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgta acgagcgcaa cccttgtctt gtgttgccag

1080

cacgttgtgg tggggactca caagagactg ccggggttaa ctcggaggaa ggtggggatg

1140

acgtcaaatc atcatgcccc ttatgtccag ggcttcacac atgctacaat ggtcgataca

1200

gtgggttgcg atgccgtgag gtggagctaa tccctgaaag tcggcctcag ttcggattgg

1260

agtctgcaac tcgactccat gaagtcggag tcgctagtaa tcgcagatca gcaacgctgc

1320

ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcgc gtcatgaaag ttggtaacac

1380

ccgaacgcag tggcctaaac t

1401

<210> 733

<211> 1480

<212> DNA

<213> Corynebacterium ureicelerivorans

<400> 733

ggcgtgctta acacatgcaa gtcgaacgga aaggcccaag cttgcttggg tactcgagtg

60

gcgaacgggt gagtaacacg tgggtgatct gccctgcact tcgggataag cctgggaaac

120

tgggtctaat actggatagg accacttctt ggatgttgtg gtggaaagtt ttttcggtgt

180

gggatgagct cgcggcctat cagcttgttg gtggggtaat ggcctaccaa ggcgtcgacg

240

ggtagccggc ctgagagggt gtacggccac attgggactg agatacggcc cagactccta

300

cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag cgacgccgcg

360

tgggggatga cggccttcgg gttgtaaact cctttcgcta gggacgaagc gtttttgtga

420

cggtacctgg agaagaagca ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg

480

tgcagcgttg tccggaatta ctgggcgtaa agagctcgta ggtggtttgt cgcgtcgttt

540

gtgtaagccc gcagcttaac tgcgggactg caggcgatac gggcataact tgagtgctgt

600

aggggagact ggaattcctg gtgtagcggt ggaatgcgca gatatcagga ggaacaccga

660

tggcgaaggc aggtctctgg gcagtaactg acgctgagga gcgaaagcat gggtagcgaa

720

caggattaga taccctggta gtccatgccg taaacggtgg gcgctaggtg tgagtccctt

780

ccacggggtt cgtgccgtag ctaacgcatt aagcgccccg cctggggagt acggccgcaa

840

ggctaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gcggagcatg tggattaatt

900

cgatgcaacg cgaagaacct tacctgggct tgacatacac cagatcgtcg tagagatacg

960

gtttcccttt gtggttggtg tacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1020

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtctta tgttgccagc acgttatggt

1080

ggggactcgt gagagactgc cggggttaac tcggaggaag gtggggatga cgtcaaatca

1140

tcatgcccct tatgtccagg gcttcacaca tgctacaatg gtcggtacaa cgcgcatgcg

1200

agcctgtgag ggtgagcgaa tcgctgtaaa gccggtcgta gttcggattg gggtctgcaa

1260

ctcgacccca tgaagtcgga gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg cggtgaatac

1320

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca cgtcatgaaa gttggtaaca cccgaagcca

1380

gtggcctgtc atgggagctg tcgaaggtgg gatcggcgat tgggacgaag tcgtaacaag

1440

gtagccgtac cggaaggtgc ggctggatca cctcctttct

1480

<210> 734

<211> 1436

<212> DNA

<213> Corynebacterium variabile

<400> 734

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggaaaggccc tgcttgcagg

60

gtactcgagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgggtgatc tgccctgcac ttcgggataa

120

gcctgggaaa ctgggtctaa taccggatag gaccatcgtt tagtgtcggt ggtggaaagt

180

ttttcggtgc aggatgagct cgcggcctat cagcttgttg gtggggtaat ggcctaccaa

240

ggcgtcgacg ggtagccggc ctgagagggt ggacggccac attgggactg agacacggcc

300

cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa ttgggcgcaa gcctgatgca

360

gcgacgccgc gtgggggatg aaggccttcg ggttgtaaac tcctttcaac catgacgaag

420

cattatgtga cggtagtggt agaagaagca ccggctaact acgtgccagc agccgcggta

480

atacgtaggg tgcgagcgtt gtccggaatt actgggcgta aagagctcgt aggtggtttg

540

tcgcgtcgtc tgtgaaattc cggggcttaa ctccgggcgt gcaggcgata cgggcataac

600

ttgagtgctg taggggagac tggaattcct ggtgtagcgg tgaaatgcgc agatatcagg

660

aggaacaccg atggcgaagg caggtctctg ggcagtaact gacgctgagg agcgaaagca

720

tgggtagcga acaggattag ataccctggt agtccatgcc gtaaacggtg ggcgctaggt

780

gtgggggtct tccacgactt ctgtgccgta gctaacgcat taagcgcccc gcctggggag

840

tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat

900

gtggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctgggc ttgacatatg ccggatcgrc

960

gcagagatgc gttttccctt gtggtcggta tacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

1020

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcttg tgttgccagc

1080

acgttatggt ggggactcgc gagagactgc cggggttaac tcggaggaag gtggggatga

1140

cgtcaaatca tcatgcccct tatgtccagg gcttcacaca tgctacaatg gtcggtacag

1200

tgggttgcta caccgtgagg tggtgctaat cccttaaagc cggtctcagt tcggattgga

1260

gtctgcaact cgactccatg aagtcggagt cgctagtaat cgcagatcag caacgctgcg

1320

gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcacg tcatgaaagt tggtaacacc

1380

cgaagccagt ggcccaaact cgttagggag ctgtcgaagg tgggatcggc gattgg

1436

<210> 735

<211> 1362

<212> DNA

<213> Corynebacterium xerosis

<220>

<221> modified_base

<222> (185)..(185)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 735

agtcgaacgg taaggcccca gcttgctggg gtacacgagt ggcgaacggg tgagtaacac

60

gtgggtgacc tgccccgcac ttcgggataa gcctgggaaa ctgggtctaa taccggatag

120

gaccgcaccg tgagggtgtg gtggaaagtt tttcggtgtg ggatgggccc gcggcctatc

180

agctngttgg tggggtaatg gcctaccaag gcggcgacgg gtagccggcc tgagagggtg

240

gacggccaca ttgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

300

attgcacaat gggcggaagc ctgatgcagc gacgccgcgt gggggatgac ggccttcggg

360

ttgtaaactc ctttcaccat cgacgaaggt tttctgacgg tagatggaga agaagcaccg

420

gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc gagcgttgtc cggaattact

480

gggcgtaaag agctcgtagg tggtttgtcg cgtcgtctgt gaaattccgg ggcttaactc

540

cgggcgtgca ggcgatacgg gcataacttg agtactgtag gggagactgg aattcctggt

600

gtagcggtga aatgcgcaga tatcaggagg aacaccggtg gcgaaggcgg gtctctgggc

660

agtaactgac gctgaggagc gaaagcatgg gtagcgaaca ggattagata ccctggtagt

720

ccatgccgta aacggtgggc gctaggtgta ggggtcttcc acgacttctg tgccgtagct

780

aacgcattaa gcgccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga

840

cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgtg gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta

900

cctgggcttg acatatacgg gaccgggcca gagatggtcc ttcccttgtg gctcgtatac

960

aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1020

gcgcaaccct tgtcttatgt tgccagcacg taatggtggg gactcgtgag aaactgccgg

1080

ggtcaactcg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gtccagggct

1140

tcacacatgc tacaatggtc ggtacagtgg gttgcgatgc cgtgaggtgg agctaatccc

1200

tgaaagccgg tctcagttcg gatcggggtc tgcaactcga ccccgtgaag tcggagtcgc

1260

tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1320

cgtcacgtca tgaaagtcgg taacacccga agccagtggc cc

1362

<210> 736

<211> 1544

<212> DNA

<213> Coxiella burnetii

<400> 736

tttaattgaa gagtttgatt ctggctcaga ttgaacgcta gcggcatgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gcagcgcggg gagcttgctc cctggcggcg agtggcggac gggtgagtaa

120

tgcgtaggaa tctaccttgt agtgggggat aacctgggga aactcgggct aataccgcat

180

aatctctttg gagcaaagcg ggggatcttc ggacctcgtg ctataagatg agcctacgtc

240

ggattagctt gttggtgggg taatggccta ccaaggcgac gatccgtagc tggtctgaga

300

ggacgatcag ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg

360

ggaatattgg acaatggggg aaaccctgat ccagcaatgc cgcgtgtgtg aagaaggcct

420

tcgggttgta aagcactttc ggtggggaag aaattctcaa gggtaatatc cttgggcgtt

480

gacgttaccc acagaagaag cactggctaa ctctgtgcca gcagccgcgg taatacagag

540

agtgcaagcg ttaatcggaa tcactgggcg taaagcgcgc gtaggtggat atttaagtcg

600

gatgtgaaag ccctgggctt aacctgggaa ttgcatccga tactgggtat cttgagtatg

660

gtagagggaa gtggaatttc cggtgtagcg gtgaaatgcg tagatatcgg aaagaacacc

720

agtggcgaag gcgacttcct ggaccaatac tgacactgag gcgcgaaagc gtggggagca

780

aacaggatta gagaccctgg tagtccacgc cgtcaacgat gagaactagc tgttgggaag

840

ttcacttctt agtagcgaag ctaacgcgtt aagttctccg cctggggagt acggccgcaa

900

ggttaaaact caaagaaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

960

cgatgcaacg cgaaaaacct tacctaccct tgacatcctc ggaacttgtc agagatgatt

1020

tggtgccttc gggaaccgag tgacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1080

atgttgggtt aagtcccgta acgagcgcaa ccctcgtcct tagttgccag cgagtcaagt

1140

cgggaactct aaggagactg ccggtgataa accggaggaa ggtggggatg atgtcaagtc

1200

atcatggccc ttacgggtag ggctacacac gtgctacaat gggcagtaca aagggttgcc

1260

aagccgcgag gtggagctaa tcccagaaaa ctgctcgtag tccggattgg agtctgcaac

1320

tcgactccat gaagttggaa tcgctagtaa tcgcgaatca gcatgtcgcg gtgaatacgt

1380

tctcgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gaattgtacc agaagcgggt

1440

aggctaacct tcgggaggcc gctcaccacg gtatgatcca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtagcc gtaggggaac ctgcggctgg atcacctcct tact

1544

<210> 737

<211> 1507

<212> DNA

<213> Cronobacter malonaticus

<400> 737

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac

60

ggtaacagag agcagcttgc tgctctgctg acgagtggcg gacgggtgag taatgtctgg

120

gaaactgcct gatggagggg gataactact ggaaacggta gctaataccg cataacgtct

180

tcggaccaaa gtgggggacc ttcgggcctc atgccatcag atgtgcccag atgggattag

240

ctagtaggtg gggtaaaggc tcacctaggc gacgatccct agctggtctg agaggatgac

300

cagccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcca tgccgcgtgt atgaagaagg ccttcgggtt

420

gtaaagtact ttcagcgagg aggaagggat tgtggttaat aaccgcagtc attgacgtta

480

ctcgcagaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa

540

gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg cacgcaggcg gtttgttaag tcagatgtga

600

aatccccggg ctcaacctgg gaactgcatt tgaaactggc aagcttgagt ctcgtagagg

660

ggggtagaat tccaggtgta gcggtgaaat gcgtagagat ctggaggaat accggtggcg

720

aaggcggccc cctggacgaa gactgacgct caggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgtcgact tggaggttgt gcccttgagg

840

cgtggcttcc ggagctaacg cgttaagtcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

900

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

960

aacgcgaaga accttacctg gtcttgacat ccagagaatc ctgcagagat gcgggagtgc

1020

cttcgggaac tctgagacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta tcctttgttg ccagcacgta atggtgggaa

1140

cccaaaggag actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg

1200

gcccttacga ccagggctac acacgtgcta caatggcgca tacaaagaga agcgaactcg

1260

cgagagcaag cggacctcat aaagtgcgtc gtagtccgga ttggagtctg caactcgact

1320

ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgtgg atcagaatgc cacggtgaat acgttcccgg

1380

gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttg caaaagaagt aggtagctta

1440

accttcggga gggcgcttac cactttgtga ttcatgactg gggtgaagtc gtaacaaggt

1500

agccgta

1507

<210> 738

<211> 1542

<212> DNA

<213> Cronobacter sakazakii

<400> 738

aattgaagag tttgatcatg gctcagattg aacgctggcg gcaggcctaa cacatgcaag

60

tcgaacggta acagggagta gcttgctgct ctgctgacga gtggcggacg ggtgagtaat

120

gtctgggaaa ctgcctgatg gagggggata actactggaa acggtagcta ataccgcata

180

acgtctacgg accaaagtgg gggaccttcg ggcctcatgc catcagatgt gcccagatgg

240

gattagctag taggtggggt aacggctcac ctaggcgacg atccctagct ggtctgagag

300

gatgaccagc cacactggaa ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagccatgcc gcgtgtatga agaaggcctt

420

cgggttgtaa agtactttca gcggggagga aggcgttgtg gttaataacc acagcgattg

480

acgttacccg cagaagaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

540

gtgcaagcgt taatcggaat tactgggcgt aaagcgcacg caggcggtct gttaagtcag

600

atgtgaaatc cccgggctca acctgggaac tgcatttgaa actggcaggc ttgagtctcg

660

tagagggggg tagaattcca ggtgtagcgg tgaaatgcgt agagatctgg aggaataccg

720

gtggcgaagg cggccccctg gacgaagact gacgctcagg tgcgaaagcg tggggagcaa

780

acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg tcgacttgga ggttgtgccc

840

ttgaggcgtg gcttccggag ctaacgcgtt aagtcgaccg cctggggagt acggccgcaa

900

ggttaaaact caaatgaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

960

cgatgcaacg cgaagaacct tacctggtct tgacatccag agaatcctgc agagatgcgg

1020

gagtgccttc gggaactctg agacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgttgtgaa

1080

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcct ttgttgccag cggttcggcc

1140

gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca

1200

tcatggccct tacgaccagg gctacacacg tgctacaatg gcgcatacaa agagaagcga

1260

cctcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt gcgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact

1320

cgactccatg aagtcggaat cgctagtaat cgtggatcag aatgccacgg tgaatacgtt

1380

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta

1440

gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac

1500

aaggtaaccg taggggaacc tgcggttgga tcacctcctt ac

1542

<210> 739

<211> 312

<212> DNA

<213> Cronobacter turicensis

<220>

<221> modified_base

<222> (293)..(294)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 739

ctcaaaggag actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg

60

gcccttacga ccagggctac acacgtgcta caatggcaga tacaaagaga agcgacctcg

120

cgagagcaag cggaactcat aaagtgtgtc gtagtccgga ttggagtctg caactcgact

180

ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgtag atcagaatgc cacggtgaat acgttcccgg

240

gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttg caaaagaagt agnnagctta

300

accttcggga gg

312

<210> 740

<211> 1448

<212> DNA

<213> Cryptobacterium curtum

<400> 740

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgcgcc taacacatgc aagtcgaacg

60

attaaaccgc ccttgggcgg atatacagtg gcgaacgggt gagtaacgcg tgaccaacct

120

tccccccgca tcgggacaac ccggggaaac ccgggctaat accggatatg ccgggtatgg

180

cgcatgtcat acccaggaaa gcttttgcgg cgggggatgg ggtcgcgtcc catcaggtag

240

acggcggggt agtagcccac cgtgccaacg acgggtagcc gggttgagag accgaccggc

300

cacattggga ctgagatacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatcttgcg

360

caatggggga aaccctgacg cagcgacgcc gcgtgcggga tggaggcctt cgggccgtga

420

accgctttca gcagggaaga cattaaggac ggtacctgca gaagaagccc cggctaacta

480

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggg gcgagcgtta tccggattca ttgggcgtaa

540

agcgcgcgca ggcggcgcac caggcgggat ctcgaaaccg ggggctcaac ctccgggcgg

600

atcccgaacc ggtgtgctcg agtgcggtag aggaagtcgg aattcccggt gtagcggtga

660

aatgcgcaga tatcgggaag aacaccgatg gcgaaggcag acttctgggc cgacactgac

720

gctcaggcgc gaaagctggg ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt cccagccgta

780

aacgatgggc actaggtgtg gggggcattt gccttccgtg ccgcagctaa cgcattaagt

840

gccccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca

900

caagcagcgg agcatgtggc ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc agggcttgac

960

atgtaggtga agcgacagag atgtcgcagc cgaaaggagc ctacacaggt ggtgcatggc

1020

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccctgcc

1080

gcatgttgcc agcatttagt tggggactca tgcgggaccg ccggcggcaa gccggaggaa

1140

ggcggggacg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgccctg ggctgcacac gtgctacaat

1200

ggccggcaca acgggatgca aaggcgcgag cccaagcgga tcccccaaag ccggtcccag

1260

ttcggatcgg aggctgcaac ccgcctccgt gaagccggag ttgctagtaa tcgcggatca

1320

gcatgccgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccacccgagt

1380

cgtctgcacc cgaagtcgcc ggccgaaccc ttttgggacg gaggcgccga aggcgcgggg

1440

gataaggg

1448

<210> 741

<211> 1400

<212> DNA

<213> Cupriavidus metallidurans

<400> 741

catgcaagtc gaacggcagc gcggacttcg gtctggcggc gagtggcgaa cgggtgagta

60

atacatcgga acgtaccctg ttgtggggga taactagtcg aaagattagc taataccgca

120

tacgacctga gggtgaaagt gggggaccgc aaggcctcac gcagcaggag cggccgatgt

180

ctgattagct agttggtggg gtaaaggccc accaaggcga cgatcagtag ctggtctgag

240

aggacgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

300

gggaattttg gacaatgggg gcaaccctga tccagcaatg ccgcgtgtgt gaagaaggcc

360

ttcgggttgt aaagcacttt tgtccggaaa gaaatcgcgc tggttaatac ctggcgtgga

420

tgacggtacc ggaagaataa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

480

gggtgcgagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgtg cgcaggcggt tttgtaagac

540

aggcgtgaaa tccccgggct taacctggga attgcgcttg tgactgcaag gctagagtgc

600

gtcagagggg ggtagaattc cacgtgtagc agtgaaatgc gtagagatgt ggaggaatac

660

cgatggcgaa ggcagccccc tgggacgtga ctgacgctca tgcacgaaag cgtggggagc

720

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccctaaacga tgtcaactag ttgttgggga

780

ttcattttct cagtaacgta gctaacgcgt gaagttgacc gcctggggag tacggtcgca

840

agattaaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggatgat gtggattaat

900

tcgatgcaac gcgaaaaacc ttacctaccc ttgacatgcc actaacgaag cagagatgca

960

ttaggtgccc gaaagggaaa gtggacacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg

1020

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg tctctagttg ctacgcaaga

1080

gcactctaga gagactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcctc

1140

atggccctta tgggtagggc ttcacacgtc atacaatggt gcgtacagag ggttgccaac

1200

ccgcgagggg gagctaatcc cagaaaacgc atcgtagtcc ggatcgtagt ctgcaactcg

1260

actacgtgaa gctggaatcg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg aatacgttcc

1320

cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttttgccaga agtagttagc

1380

ctaaccgcaa ggagggcgat

1400

<210> 742

<211> 1507

<212> DNA

<213> Cytophaga xylanolytica

<400> 742

gtttgatcct ggctcaggat gaacgctagc gacaggccta acacatgcaa gtcgaggggc

60

agcacgtctt cggatggtgg cgaccggcgc acgggtgagt aacgcgtatg taacctgcct

120

acaacagggg gatagctcgc tgaaaagcga attaagaccg cataagacca cgctttcgca

180

tgttagcgtg gtaaaatatt tataggttgt agatgggcat gcgtgacatt agctagttgg

240

taaggtaacg gcttaccaag gcaacgatgt ctaggggttc tgagaggaag gtcccccaca

300

ctggtactga gacacggacc agactcctac gggaggcagc agtgaggaat attggtcaat

360

gggcgagagc ctgaaccagc catgtcgcgt gcaggatgac ggccctacgg gttgtaaact

420

gcttttgtac gggaagaaaa aacgccacgt gtggtgtctt gccggtaccg tacgaataag

480

gatcggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag gatccgagcg ttatccggat

540

ttattgggtt taaagggtgc gtaggcggga gattaagtca gtggtgaaag tttgcggctc

600

aaccgtaaaa ttgccattga tactggtttt cttgagtaca gttgaggtag gcggaatgtg

660

gtgtgtagcg gtgaaatgct tagatatacc acagaacacc gattgcgaag gcagcttact

720

aaagtgtaac tgacgctgat gcacgaaagc gtggggatca aacaggatta gataccctgg

780

tagtccacgc agtaaacgat gatcactcgt tgtttgcgat acattgcaag tgaccaagag

840

aaatcgataa gtgatccacc tggggagtac ggccgcaagg ctgaaactca aaggaattga

900

cgggggcccg cacaagcgga ggaacatgtg gtttaattcg atgatacgcg aggaacctta

960

cctgggttta aatggggagt gacagctgcc gaaaggtggt cttcttcgga cactcttcaa

1020

ggtgctgcat ggttgtcgtc agctcgtgcc gtgaggtgtc gggttaagtc ccataacgag

1080

cgcaacccac gtcgttagtt gccatcaggt satgctgggc actctaacga gactgccggt

1140

gtaaaccgcg aggaaggtgt ggatgacgtc aaatcagcac ggcccttaca tccagggcta

1200

cacacgtgtt acaatggccg gtacagaggg ctgctaccat gcgaatggat gctaatccta

1260

aaaaccggtc ccagttcgga ttggagtctg caacccgact ccatgaagct ggattcgcta

1320

gtaatcgcgc atcagccatg gcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg

1380

tcaagccatg gaagctgagg gtacctaaag tctgtcaccg taaggagcgg cctagggtaa

1440

aattggtaac tggggctaag tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc ggctggatca

1500

cctcctt

1507

<210> 743

<211> 1325

<212> DNA

<213> Deferribacteres sp. oral clone JV001

<400> 743

ggagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc gtaacacatg caagttgaac

60

gagtagcgga cgggtgagta caacatgaga agctgtcctt cagcgggggg caacgtctgg

120

aagcggacgc taatacccca tagtaaaggc gcgacgggag gtactcgtgt cctatcagct

180

agttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgacgggtag ccggcctgag agggtgaccg

240

gccacactgg aactgagata cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

300

ggcaatggga ggaatcctga cccagcgacg ccgcgtgaac gaagacggcc ttcgggttgt

360

aaagttcttt tatgtgggaa gatgacggta ccacatgaat aagccccggc taactacgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg tagggggcga gcgttgtccg gaattactgg gcgtaaaggg

480

cacgcaggct gtgcttcaag tcagctgtaa aaggatgcgg cttaaccgtg ttatgcagtt

540

gagactgagg tgctggagta ccggagaggc aagtggaatt cccagtgtag cggtgaaatg

600

cgtagatatt gggaagaaca tcggtggcga aggcgacttg ctggacggac tgacgctgag

660

gtgcgaaagc cagggtagcg aacgggatta gataccccgg tagtcctggc tgtaaacgat

720

gaatgctagg tgtgcgagtt ggtgtgccgc agttaacgcg ataagcattc cgcctgggga

780

gtacggtcgc aagattgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca

840

cgtggtttaa ttcgatgcaa accgaagaac cttacctggg tttgacatgc acaggtgctg

900

catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

960

cctgcgatta gttgccagcg gccgggcact ctaatgggac tgccatcgac aagatggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatggc ccttatgtcc agggcgacac acgtgctaca

1080

atggccggca gagggaagcg aggctgtgag gttgagcgga tcccctccgg tctcagttcg

1140

gatgaagtct gcaattcgac ttcagaagct ggaatcgcta gtaatcgcag atcagccaag

1200

ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacc cgagccgggt

1260

gtacccgaag ccggtgccta aggagccgtc gaaggtgtgt ctggtgaggg gggtgaagtc

1320

gtaac

1325

<210> 744

<211> 1325

<212> DNA

<213> Deferribacteres sp. oral clone JV006

<400> 744

ggagtttgat catggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc gtaacacatg caagttgaac

60

gagtagcgga cgggtgagta aagcatgaga atctgtcctg tcgaggggga taacgttcgg

120

aaacggaccc taatacccca tagtaaaggc gcggcaggag gagctcgtgt cctatcagct

180

agttggtgag gtaacggctc accaaggctt cgacgggtag ccggcctgag agggtgaccg

240

gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

300

ggcaatggga gaaatcctga cccagcgacg ccgcgtgaac gaagacggcc ttcgggttgt

360

aaagttcttt tatgtgggaa gatgacggta ccacatgaat aagccccggc taactacgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg tagggggcga gcgttgtccg gaattactgg gcgtaaaggg

480

cacgcaggct gtgcttcaag tcagctgtaa aaggatgcgg cttaaccgtg ttatgcagtt

540

gagactgagg tgctggagta ccggagaggc aagtggaatt cccagtgtag cggtgaaatg

600

cgtagatatt gggaagaaca tcggtggcga aggcgacttg ctggacggac tgacgctgag

660

gtgcgaaagc cagggtagcg aacgggatta gataccccgg tagtcctggc cgtaaacgat

720

gaatgctagg tgtgcgagtt ggtgtgccgc agttaacgcg ataagcattc cgcctgggga

780

gtacggtcgc aagattgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca

840

cgtggtttaa ttcgatgcaa accgaagaac cttacctggg tttgacatgc acaggtgctg

900

catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

960

cctgcgatta gttgccagcg atcgggcact ctaatgggac tgccatcgac aagatggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatggc ccttatgtcc agggcgacac acgtgctaca

1080

atggccggca gagggaagcg acactgcgag gtgaagcgga tcccatccgc tctcagttcg

1140

gatgaagtct gcaattcgac ttcagaagtt ggaatcgcta gtaatcgcag atcaaccaag

1200

ctgcggtgaa tccgtccccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacc cgagccgggt

1260

gtacccgagg ccggtgccta aggagccgtc gaaggtgtgt ctggtgaggg gggtgaagtc

1320

gtaac

1325

<210> 745

<211> 1325

<212> DNA

<213> Deferribacteres sp. oral clone JV023

<400> 745

ggagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc gtaacacatg caagttgaac

60

gagtagcgga cgggtgagta aagcatgaga atctgtcctg ccgaggggga taacgttcgg

120

aaacggaccc taatacccca tagtaaaggc gcggcaggag gagctcgtgt cctatcagct

180

ggttggtgag gtaagggctc accaaggctt cgacgggtag ccggcctgag agggtgaccg

240

gccacactgg aactgagaga cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

300

ggcaatggga ggaatcctga cccagcgacg ccgcgtgaac gaagacggcc ttcgggttgt

360

aaagttcttt tatgtgggaa gatgacggta ccacatgaat aagccccggc taactacgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg tagggggcga gcgttgtccg gaattactgg gcgtaaaggg

480

cacgcaggct gtgcttcaag tcagctgtaa aaggatgcgg cttaaccgtg ttatgcagtt

540

gagactgagg tgctggagta ccggagaggc aagtggaatt cccagtgtag cggtgaaatg

600

cgtagatatt gggaagaaca tcggtggcga aggcgacttg ctggacggac tgacgctgag

660

gtgcgaaagc cagggtagcg aacgggatta gataccccgg tagtcctggc ggtaaacgat

720

gaatgctagg tgtgcgagtt ggtgtgccgc agttaacgcg ataagcattc cgcctgggga

780

gtacggtcgc aagattgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca

840

cgtggtttaa ttcgatgcaa accgaagaac cttacctggg tttgacatgc acaggtgctg

900

catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

960

cctgcgatta gttgctaacg gccgagcact ctaatgggac tgccatcgac aagatggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatggc ccttatgtcc agggcgacac acgtgctaca

1080

atggccggca gagggaagcg aggctgtgag gttgagcgga tcccctccgg tcacagttcg

1140

gatgaagtct gcaattcgac ttcagaagct ggaatcgcta gtaatcgcag atcagccaag

1200

ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacc cgagccgggt

1260

gtacccgaag ccggtgccta aggagccgtc gaaggtgtgt ctggtgaggg gggtgaagtc

1320

gtaac

1325

<210> 746

<211> 1502

<212> DNA

<213> Deinococcus radiodurans

<400> 746

tttatggaga gtttgatcct ggctcagggt gaacgctggc ggcgtgctta agacatgcaa

60

gtcgaacgcg gtcttcggac cgagtggcgc acgggtgagt aacacgtaac tgacctaccc

120

agaagtcacg aataactggc cgaaaggtcc gctaatacgt gatgtggtga tgcaccgtgg

180

tgcatcacta aagatttatc gcttctggat ggggttgcgt tccatcagct ggttggtggg

240

gtaaaggcct accaaggcga cgacggatag ccggcctgag agggtggccg gccacagggg

300

cactgagaca cgggtcccac tcctacggga ggcagcagtt aggaatcttc cacaatgggc

360

gcaagcctga tggagcgacg ccgcgtgagg gatgaaggtt ttcggatcgt aaacctctga

420

atctgggacg aaagagcctt agggcagatg acggtaccag agtaatagca ccggctaact

480

ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg tgcaagcgtt acccggaatc actgggcgta

540

aagggcgtgt aggcggaaat ttaagtctgg ttttaaagac cggggctcaa cctcggggat

600

ggactggata ctggatttct tgacctctgg agaggtaact ggaattcctg gtgtagcggt

660

ggaatgcgta gataccagga ggaacaccaa tggcgaaggc aagttactgg acagaaggtg

720

acgctgaggc gcgaaagtgt ggggagcaaa ccggattaga tacccgggta gtccacaccc

780

taaacgatgt acgttggcta agcgcaggat gctgtgcttg gcgaagctaa cgcgataaac

840

gtaccgcctg ggaagtacgg ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca

900

caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc aggtcttgac

960

atgctaggaa ctttgcagag atgcagaggt gcccttcggg gaacctagac acaggtgctg

1020

catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

1080

cttgccttta gttgtcagca ttcagttgga cactctagag ggactgccta tgaaagtagg

1140

aggaaggcgg ggatgacgtc tagtcagcat ggtccttacg tcctgggcga cacacgtgct

1200

acaatgggta ggacaacgcg cagcaaaccc gcgagggtaa gcgaatcgct aaaacctatc

1260

cccagttcag atcggagtct gcaactcgac tccgtgaagt tggaatcgct agtaatcgcg

1320

ggtcagcata ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg

1380

ggagtagatt gcagttgaaa ccgccgggag cttaacggca ggcgtctaga ctgtggttta

1440

tgactggggt gaagtcgtaa caaggtaact gtaccggaag gtgcggttgg atcacctcct

1500

tt

1502

<210> 747

<211> 1333

<212> DNA

<213> Deinococcus sp. R-43890

<400> 747

ggtgaacgct ggcggcgtgc ttaagacatg caagtcgaac gagatcttcg gatctagtgg

60

cgcacgggtg agtatcgcgt gactgacctg ccccaaagtt ccgaataact ggctgaaagg

120

tcagctaata cggaatgtgc agcatcctcg tgtggatgtt gtaaaggcta tgaccgcttt

180

gggatggggt tgcgttccat cagctagttg gtggggtaaa ggcccaccaa ggcgacgacg

240

gataaccggc ctgagagggt ggccggtcac aggggcactg agacacgggt cccactccta

300

cgggaggcag cagttaggaa tcttccccaa tggacgaaag tctgagggag cgacgccgcg

360

tgagggatga aggttttcgg atcgtaaacc tctgaatctg ggacgaaaga ccgggacaac

420

cggagatgac ggtaccagag taatagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat

480

acggagggtg caagcgttac ccggaatcac tgggcgtaaa gggcgtgtag gcggcatcac

540

aagtctggtt ttaaagcctg cggctcaacc gcagagatgg actggagact gtgaagctag

600

acctctggag agagaactgg aattcctggt gtagcggtgg aatgcgtaga taccaggagg

660

aacaccgatg gcgaaggcag gttcttggac agaaggtgac gctgaggcgc gaaagtgtgg

720

ggagcaaacc ggattagata cccgggtagt ccacacccta aacgatgtac gttggcctac

780

agcaggatgc tgttgtgggc gaagctaacg cgataaacgt accgcctggg aagtacggcc

840

gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt

900

aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat ccatagaagc tcccggagac

960

gggagcgtgc ccttcgggga gctatgagac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt

1020

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc taccttcagt tgccagcatt

1080

cagttgggca ctctgacggg actgcctatg aaagtaggag gaaggcgggg atgacgtcta

1140

gtcagcatgg tccttacgac ctgggctaca cacgtgctac aatggatggt acaacgcgca

1200

gccaactcgc gagagtgagc gaatcgccaa aagccatccc cagttcagat cggagtctgc

1260

aactcgactc cgtgaagttg gaatcgctag taatcrcggg tcagcatacc gsgrtgaata

1320

cgttcccggg cct

1333

<210> 748

<211> 1526

<212> DNA

<213> Delftia acidovorans

<400> 748

agagtttgat cctggctcag attgaacgct ggcggcatgc cttacacatg caagtcgaac

60

ggtaacaggt cttcggacgc tgacgagtgg cgaacgggtg agtaatacat cggaacgtgc

120

ccagtcgtgg gggataacta ctcgaaagag tagctaatac cgcatacgat ctgaggatga

180

aagcggggga ccttcgggcc tcgcgcgatt ggagcggccg atggcagatt aggtagttgg

240

tgggataaaa gcttaccaag ccgacgatct gtagctggtc tgagaggacg accagccaca

300

ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat tttggacaat

360

gggcgaaagc ctgatccagc aatgccgcgt gcaggatgaa ggccttcggg ttgtaaactg

420

cttttgtacg gaacgaaaaa gcttctccta atacgagagg cccatgacgg taccgtaaga

480

ataagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc gagcgttaat

540

cggaattact gggcgtaaag cgtgcgcagg cggttatgta agacagatgt gaaatccccg

600

ggctcaacct gggaactgca tttgtgactg catggctaga gtacggtaga gggggatgga

660

attccgcgtg tagcagtgaa atgcgtagat atgcggagga acaccgatgg cgaaggcaat

720

cccctggacc tgtactgacg ctcatgcacg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac

780

cctggtagtc cacgccctaa acgatgtcaa ctggttgttg ggaattagtt ttctcagtaa

840

cgaagctaac gcgtgaagtt gaccgcctgg ggagtacggc cgcaaggttg aaactcaaag

900

gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga tgatgtggtt taattcgatg caacgcgaaa

960

aaccttaccc acctttgaca tggcaggaag tttccagaga tggattcgtg ctcgaaagag

1020

aacctgcaca caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag

1080

tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtcattag ttgctacatt cagttgggca ctctaatgag

1140

actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcctcatg gcccttatag

1200

gtggggctac acacgtcata caatggctgg tacagagggt tgccaacccg cgagggggag

1260

ctaatcccat aaaaccagtc gtagtccgga tcgcagtctg caactcgact gcgtgaagtc

1320

ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc cgcggtgaat acgttcccgg gtcttgtaca

1380

caccgcccgt cacaccatgg gagcgggtct cgccagaagt aggtagccta accgcaagga

1440

gggcgcttac cacggcgggg ttcgtgactg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtatcg

1500

gaaggtgcgg ctggatcacc tccttt

1526

<210> 749

<211> 1394

<212> DNA

<213> Dermabacter hominis

<400> 749

catgcaagtc gaacgatgaa gctgtgcttg cacagtggat tagtggcgaa cgggtgagta

60

acacgtgagt aacctgccct tcactttggg ataactccga gaaatcgggg ctaataccgg

120

atatgactac tggccgcatg gttggtggtg gaaagttttt cggtgaggga tgggctcgcg

180

gcctatcagt ttgttggtga ggtagtggct caccaaggcg atgacgggta gccggcctga

240

gagggcgacc ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

300

ggggaatatt gcacaatggg cgaaagcctg atgcagcgac gccgcgtggg ggatgacggc

360

cttcgggttg taaacctctt tcagcaagga agaagcgaaa gtgacggtac ttgcagaaga

420

agcgccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggcgcaag cgttgtccgg

480

aattattggg cgtaaagagc ttgtaggtgg cttgtcgcgt ctgccgtgaa aacccgaggc

540

ttaaccttgg gcgtgcggtg ggtacgggca ggctagagtg cggtagggga gactggaatt

600

cctggtgtag cggtgaaatg cgcagatatc aggaggaaca ccgatggcga aggcaggtct

660

ctgggccgtt actgacactg agaagcgaaa gcatggggag cgaacaggat tagataccct

720

ggtagtccat gccgtaaacg ttgggcacta ggtgtgggga gcattccacg ttttccgcgc

780

cgtagctaac gcattaagtg ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag

840

gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga gcatgcggat taattcgatg caacgcgaag

900

aaccttacca aggcttgaca tgcactggat cgctgcagag atgtggtttt ctttggactg

960

gtgcacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg

1020

caacgagcgc aaccctcgtt ccatgttgcc agcacttcgg gtggggactc atgggagact

1080

gccggggtca actcggagga aggtggggac gacgtcaaat catcatgccc cttatgtctt

1140

gggcttcacg cgtgctacaa tggtcggtac aatgggttgc gatactgtga ggtggagcta

1200

atcccaaaaa gccggtctca gttcggattg gggtctgcaa ctcgacccta tgaagtcgga

1260

gtcgctagta atcgcagatc agcaatgctg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1320

ccgcccgtca agtcacgaaa gtcggtaaca cccgaagccg atggcccaag cttttgcggg

1380

gagtcgtcga aggt

1394

<210> 750

<211> 1520

<212> DNA

<213> Dermacoccus sp. Ellin185

<220>

<221> modified_base

<222> (434)..(435)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 750

tttctacgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg atgaagcacc agcttgctgg tgtggattag tggcgaacgg gtgagtaaca

120

cgtgagtaac ctgcccctca ctctgggata agcctgggaa actgggtcta atactggata

180

cgaccgatct ccgcatggag tgttggtgga aagtttttgt ggtgggggat ggactcgcgg

240

cctatcagct tgttggtggg gtaatggcct accaaggcga cgacgggtag ccggcctgag

300

agggcgaccg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

360

gggaatattg cacaatgggc gaaagcctga tgcagcgacg ccgcgtgagg gatgacggcc

420

ttcgggttgt aaannttcac cagggacgaa gctaacgtga cggtacctgg agaagaagca

480

ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg tgcggcgttg tccggaatta

540

ttgggcgtaa agagcttgta ggcggtctgt cgcgtctgct gtgaaagacc ggggcttaac

600

tccggttctg cagtgggtac gggcagacta gagtgtggta ggggagactg gaattcctgg

660

tgtagcggtg aaatgcgcag atatcaggag gaacaccgat ggcgaaggca ggtctctggg

720

ccattactga cgctgagaag cgaaagcatg gggagcgaac aggattagat accctggtag

780

tccatgccgt aaacgttggg cgctaggtgt gggactcatt ccacgagttc cgtgccgcag

840

ctaacgcatt aagcgccccg cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact caaaggaatt

900

gacgggggcc cgcacaagcg gcggagcatg cggattaatt cgatgcaacg cgaagaacct

960

taccaaggct tgacatacac cggaatcatg cagagatgtg tgcgtcttcg gactggtgta

1020

caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc tcgttccatg ttgccagcac ttcgggtggg gactcatggg agactgccgg

1140

ggtcaactcg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gtcttgggct

1200

tcacgcatgc tacaatggcc ggtacagagg gttgcgaaac cgtgaggtgg agctaatccc

1260

aaaaaaccgg tctcagttcg gattggggtc tgcaactcga ccccatgaag tcggagtcgc

1320

tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1380

cgtcaagtca cgaaagtcgg taacacccga agccggtggc ctaacccttg tggggggagc

1440

cgtcgaaggt gggactggcg attgggacta agtcgtaaca aggtagccgt accggaaggt

1500

gcggctggat cacctccttt

1520

<210> 751

<211> 1522

<212> DNA

<213> Desmospora activa

<400> 751

gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg agcggaccga tggagagctt gctctcttga

60

agtcagcggc gaacgggtga gtaacacgtg ggcaacctgc ccgcaagact gggataactc

120

cgggaaaccg gggctaatac cggatacgat cttccctcgc atgagagaag atggaaaggc

180

ggcatcacgc tgtcacttgc ggatgggccc gcggcgcatt agctagttgg tgaggtagtg

240

gctcaccaag gcgacgatgc gtagccgacc tgagagggtg accggccaca ctgggactga

300

gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtagggaat tttcgtcaat gggcgcaagc

360

ctgaacgagc aacgccgcgt gagtgaggac ggctttcggg ttgtaaagct ctgttcttcg

420

ggaagaacga cagaagggtg aataatcctt ttgtgtgacg gtaccggaga agaaagcccc

480

ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggggg caagcgttgt ccggaattat

540

tgggcgtaaa gcgcgcgcag gcggcctgtt aagtcggatg tgaaagacca cggctcaacc

600

gtgggggtgc atccgaaact ggcgggcttg agtgcaggag aggggagtgg aattcccggt

660

gtagcggtgg aatgcgtaga gatcgggagg aacaccagtg gcgaaggcgg ctctctggcc

720

tgtaactgac gctgaggcgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt

780

ccacgccgta aacgatgagt gctaggtgtt gggggtttca cgccctctgt gccgaaggta

840

acccaataag cactccgcct ggggagtacg gccgcaaggc tgaaactcaa aggaattgac

900

gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac

960

cagggcttga catcccgctg accccttcag agatgaaggt tcccttcggg gcagcggaga

1020

caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttcag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc ttatcgttag ttgccagcac ctcgggtggg cactctagcg agacagccgg

1140

tgaaagccgg aggaaggtgg ggatgaggtc aaatcatcat gccccttatg tcctgggcaa

1200

cacacgtgct acaatggctg gtacaacggg tcgcgaagcc gcgaggtgga gccaatccca

1260

aaaaaccagt ctcagttcgg atcgcaggct gcaactcgcc tgcgtgaagc tggaatcgct

1320

agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg

1380

tcacaccacg agagtttgca acacccgaag tcggtgaggg aacccttttg ggacccagcc

1440

gccgaaggtg gggcagatga ttggggtgaa gtcgtaacaa ggtatcccta ccggaaggtg

1500

gggctggatc acctcctttc ta

1522

<210> 752

<211> 1455

<212> DNA

<213> Desmospora sp. 8437

<400> 752

agcggcggac gggtgagtaa cacgtgggca acctgcccgc aagaccggga taactccggg

60

aaaccggggc taataccgga tgatgcctct tcctgcatgg gaggatgctg aaaggcggcc

120

tttggctgtc acttgcggat gggcccgcgg cgcattagct ggttggtgag gtaacggctc

180

accaaggcga cgatgcgtag ccgacctgag agggtgatcg gccacactgg gactgagaca

240

cggcccagac tcctacggga ggcagcagta gggaattttc cgcaatgggc gcaagcctga

300

cggagcaacg ccgcgtgagt gaggacggct ttcgggttgt aaaactctgt tcttcgggaa

360

gaacggtcga agggtgaaca atcctttggc gtgacggtac cggaggagaa agccccggct

420

aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggggcaag cgttgtccgg aattattggg

480

cgtaaagcgc gcgcaggcgg cctgttaagt ctggtgtgaa agaccacggc tcaaccgtgg

540

ggtggcatca gaaactggcg ggcttgagtg caggagagga gagtggaatt cccggtgtag

600

cggtggaatg cgtagagatc gggaggaaca ccagtggcga aggcgactct ctggcctgta

660

actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccac

720

gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttgggg gtttccgccc tctgtgccga aggtaaccca

780

ataagcactc cgcctgggga gtacggccgc aaggctgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg

840

cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggg

900

cttgacatcc cgctgaccgg tgtagagata caccttccct tcggggcagc ggtgacaggt

960

ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttcagtcccg caacgagcgc

1020

aacccttgtc gtcagttgcc agcacatgat ggtgggcact ctggcgagac agccggtgaa

1080

agccggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgtcct gggctacaca

1140

cgtgctacaa tggccggtac aacgggcagc gaacccgtga gggggagcca atcccaaaaa

1200

accggtctca gttcggatcg caggctgcaa ctcgcctgcg tgaagctgga atcgctagta

1260

atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatccg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac

1320

accacgagag tctgcaacac ccgaagtcgg tgaggtaacc ttcgggaacc agccgccgaa

1380

ggtggggcag atgattgggg tgaagtcgta acaaggtatc cctaccggaa ggtggggatg

1440

gatcacctcc tttct

1455

<210> 753

<211> 1456

<212> DNA

<213> Desulfitobacterium frappieri

<220>

<221> modified_base

<222> (968)..(968)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 753

cactgagtgc taaacgttag ttagtggcgg acgggtgagt aacgcgtgga taacctacct

60

agtagaccgg gacaaccctt ggaaacgagg gctaataccg gatgagctta attagtggca

120

tcactgatta aggaaagatg gcctctgaag atgctatcgt tagtagatgg atccgcgtct

180

gattagctag ttggtggggt aaaggcctac caaggcgacg atcagtagcc ggcctgagag

240

ggtgaacggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg

300

gaatcttccg caatggacga aagtctgacg gagcaacgcc gcgtgtacga cgaaggcctt

360

cgggttgtaa agtactgtct tcagggacga acggtaagta tgtaaataat gtacttacat

420

gacggtacct gaggaggaag ccccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

480

ggggcaagcg ttgtccggaa tcattgggcg taaagggcgc gtaggcggat acttaagtct

540

ggtgtgaaaa cctagggctc aaccctggga ctgcatcgga aactgggtat cttgaggaca

600

ggagaggaaa gtggaattcc acgtgtagcg gtgaaatgcg tagatatgtg gaggaacacc

660

agtggcgaag gcgactttct ggactgtaac tgacgctgag gcgcgaaagc gtggggagca

720

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctagg tgtagagggt

780

atcgacccct tctgtgccgc agttaacaca ctaagcactc cgcctgggga gtacggccgc

840

aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

900

ttcgacgcaa cgcgaagaac cttaccaagg cttgacatcc atagaatcct gtggaaacat

960

gggagtgncc ttcggggagc tatgagacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg

1020

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccccta tgtttagttg ctaacgcgta

1080

atggtgagca ctctagacag actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca

1140

aatcatcatg ccccttatgt cttgggctac acacgtgcta caatggccag tacagacgga

1200

agcgaagccg tgaggtgaag ccaatccgag aaagctggtc tcagttcgga ttgttctctg

1260

caactcgaga acatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcag gtcagcatac tgcggtgaat

1320

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga aagtctgcaa cacccgaagc

1380

cggtgaggta acccgaaagg gagctagccg tcgaaggtgg ggccgatgat tggggtgaag

1440

tcgtaacaag gtatcc

1456

<210> 754

<211> 1554

<212> DNA

<213> Desulfitobacterium hafniense

<400> 754

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgaac

60

ggagagctca ataagcttgc ttagagagtt cttagtggcg gacgggtgag taacgcgtgg

120

ataacctacc tagtagaccg ggacaaccct tggaaacgag ggctaatacc ggataagctt

180

aattagtggc atcactgatt aaggaaagat ggcctctgaa gatgctatcg ttagtagatg

240

gatccgcgtc tgattagcta gttggtgggg taaaggccta ccaaggcgac gatcagtagc

300

cggcctgaga gggtgaacgg ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag

360

gcagcagtgg ggaatcttcc gcaatggacg aaagtctgac ggagcaacgc cgcgtgtacg

420

acgaaggcct tcgggttgta aagtactgtc ttcagggacg aacggtaagt atgtaaagaa

480

tgtacttaca tgacggtacc tgaggaggaa gccccggcta actacgtgcc agcagccgcg

540

gtaatacgta gggggcaagc gttgtccgga atcattgggc gtaaagggcg cgtaggcgga

600

tacttaagtc tggtgtgaaa acctagggct caaccctggg actgcatcgg aaactgggta

660

tcttgaggac aggagaggaa agtggaattc cacgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatgt

720

ggaggaacac cagtggcgaa ggcgactttc tggactgtaa ctgacgctga ggcgcgaaag

780

cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag

840

gtgtagaggg tatcgacccc ttctgtgccg cagttaacac actaagcact ccgcctgggg

900

agtacggccg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc

960

atgtggttta attcgacgca acgcgaagaa ccttaccaag gcttgacatc catagaatcc

1020

tgtggaaaca tgggagtgcc cttcggggag ctatgagaca ggtggtgcat ggttgtcgtc

1080

agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct atgtttagtt

1140

gctaacgcgt aatggtgagc actctagaca gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg

1200

ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg tcttgggcta cacacgtgct acaatggcca

1260

gtacagacgg aagcgaagcc gtgaggtgaa gccaatccga gaaagctggt ctcagttcgg

1320

attgttctct gcaactcgag aacatgaagt cggaatcgct agtaatcgca ggtcagcata

1380

ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg aaagtctgca

1440

acacccgaag ccggtgaggt aacccgaaag ggagctagcc gtcgaaggtg gggccgatga

1500

ttggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta tcggaaggtg cggctggatc acct

1554

<210> 755

<211> 1557

<212> DNA

<213> Desulfobulbus sp. oral clone CH031

<400> 755

gagagtttga tyctggctca gaacgaacgc tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgaa

60

cgcgaacggg acttcggttc ctagtagagt ggcgcacggg tgagtaacgc gtagataacc

120

tgtcttcata tccggaataa cacgccgaaa ggggtactaa taccggatgt tcttgcattt

180

cacaggtaag gcaaggaaag gtggcctctg attcaagcta ctgtatgaag aggggtctgc

240

gtaccattag ctagtaggtg gggtaatggc ctacctaggc gacgatggtt agcgggtctg

300

agaggatgat ccgccacact ggcactggaa tacgggccag actcctacgg gaggcagcag

360

tgaggaatat tgcgcaatgg gggcaaccct gacgcagcga cgccgcgtga gtgaggaagg

420

tcttcggatc gtaaagctct gtcaagaggg aagaagtgca aggcagcgaa taactgtttt

480

gtttgacggt acctctaaag gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac

540

ggagggtgcg agcgttgttc ggaatcactg ggcgtagagg gcgcgcaggc gggctgtcaa

600

gtcagatgtg aaatcccacg gcttaactgt ggacgtgcat ttgaaactgg cagtcttgag

660

taccagaggg gaatgtggaa ttcccggtgt agaggtgaaa ttcgtagata tcgggaggaa

720

taccggtggc gaaggcgaca ttctggctgg atactgacgc tgaggcgcga aagcgtgggg

780

agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgtgaac tagatgcagg

840

gggtgttgat cccctctgtg tcgcggctaa cgcattaagt tcaccgcctg gggagtacgg

900

tcgcaagatt aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg ggtatgtggt

960

ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc tggtcttgac atcccggaga cgcccatgaa

1020

agtgggtggt gccttctttg aaggaatccg gagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct

1080

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgcct tcagttgcca

1140

gcggttcggc cgggcactct gaagggactg ccggtgtcaa accggaggaa ggtggggatg

1200

acgtcaagtc ctcatggccc ttatgaccag ggctacacac gtactacaat ggccggtaca

1260

aaggggagcg acattgcgaa atggagccaa tcccgcaaag ccggtctcag tccggattgg

1320

agtctgcaac tcgactccat gaagttggaa tcgctagtaa tcgtggatca gcatgccacg

1380

gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgggagt cggttgtacc

1440

agaagcagtt gagctaaccg caagggggca ggctgccaag gtacggctgg taactggggt

1500

gaagtcgtaa cagggtagcc ctaggggaac ctggggctgg atcacctcct taagggc

1557

<210> 756

<211> 1431

<212> DNA

<213> Desulfotomaculum nigrificans

<220>

<221> modified_base

<222> (1)..(1)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (43)..(46)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (66)..(66)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (186)..(186)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (415)..(415)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (419)..(419)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (615)..(615)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (619)..(619)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (891)..(891)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (897)..(897)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (906)..(906)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1420)..(1420)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 756

natagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg ccnnnnacat gcaagtcgaa

60

cggggntgaa tgaagcttgg cgatttctaa acctagtggc ggacgggtga gtaacgcgtg

120

gataacctgc ctggtagacc gggataacag ctggaaacgg ctgctaatac cggatacgct

180

cttggngccg catggtgccg agaggaaagg ggagccgcta tcagatggat ccgcgtccca

240

ttagctggtt ggtggtgtag cggaccacca aggcgacgat gggtagccgg cctgagaggg

300

cgaccggcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga

360

atcttccgca atgggcgaaa gctgacggag caacgccgcg tgagggaaga aggcntcgng

420

ttgtaaacct ctgtcctaaa ggaagaaaga aatgacggta ctttaggaag aatgacggta

480

ctttaggagg aagccccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaaaacg tagggggcga

540

gcgttgtccg gaattactgg gcgtaaaggg cgcgtaggtg gtccattaag ttagaggtga

600

aagtgcgggg cttancccng tgattgcctc tgatactggt ggacttgagt gcaggagagg

660

ggagcggaat tcccagtgta gcggtgaaat gcgtagatat tgggaggaac accagtggcg

720

aaggcggctc tctggactgc aactgacact gaggcgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aggtgttgcg ggtatcgacc

840

cctgcagtgc cgcagtaaac acaataagca ctccgcctgg ggagtacggt ngcaagnctg

900

aaactnaaag gaattgacgg ggccccgcac aagcggtgga gtatgtggtt taattcgacg

960

caacgcgaag aaccttacca gggcttgaca tcccgcgcac cactctagag atagagggtt

1020

ctgccttagg gtagacgcgc agacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1080

atgttgggtt aagtcccgca acgcgcgcaa cccctaacat tagttgccag cgatagagac

1140

ggggactcta atgtgactgc cgttgacaaa acggaggaag gtggggatga cgtcaaatca

1200

tcatgcccct tatgtcctgg gctacacacg tactacaatg gccggtacta acggatgcga

1260

atggcgtgag ccggagcaaa actgagaaag ccggtctcag ttcggattgt agtctgcaac

1320

tcgactacat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcaggtca gcatactgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgaaagn tgacaacacc c

1431

<210> 757

<211> 1548

<212> DNA

<213> Desulfovibrio desulfuricans

<400> 757

attagagttt gatcctggct cagattgaac gctggcggcg tgcttaacac atgcaagtcg

60

aacgcgaaag ggacttcggt cctgagtaaa gtggcgcacg ggtgagtaac gcgtggataa

120

tctgccctta tgatcgggat aacagttgga aacggctgct aataccggat acgctcaaaa

180

tgaacttttt gaggaaagat ggcctctgct tgtatgctat cacgtaagga tgagtccgcg

240

tcccattagc ttgttggcgg ggtaacggcc caccaaggca tcgatgggta gccgatttga

300

gaggatgatc ggccacactg gaactgaaac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcgcaatggg cgaaagcctg acgcagcgac gccgcgtgag ggatgaaggt

420

tttcggatcg taaacctctg tcagaaggga agaaactacg ttgtgctaat cagcagcgta

480

ctgacggtac cttcaaagga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgtaggctg tagtgtaagt

600

caggggtgaa atcccacggc tcaaccgtgg aactgccttt gatactgcac aacttgaatc

660

cgggagaggg tggcggaatt ccaggtgtag gagtgaaatc cgtagatatc tggaggaaca

720

tcagtggcga aggcggccac ctggaccggt attgacgctg aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg atggatgcta gatgtcgggg

840

agtattcttc ggtgtcgtag ttaacgcgtt aagcatcccg cctggggagt acggtcgcaa

900

ggctgaaact caaagaaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagtatg tggtttaatt

960

cgatgcaacg cgaagaacct tacctaggtt tgacatccac ggaaccctcc cgaaaaggag

1020

gggtgccctt cggggagccg tgagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1080

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccctatg gatagttgcc agcaagtaat

1140

gttgggcact ctattcagac tgcccgggtt aaccgggagg aaggtgggga cgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgcct agggctacac acgtactaca atggcgcgca caaaggggag

1260

cgagaccgcg aggtggagcc aatcccaaaa aacgcgtccc agtccggatt gcagtctgca

1320

actcgactgc atgaagttgg aatcgctagt aattcgagat cagcatgctc gggtgaatgc

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaaa gtcggtttta cccgaagccg

1440

gtgagccaac cagcaatgga ggcagccgtc tacggtaggg ccgatgattg gggtgaagtc

1500

gtaacaaggt agccgtaggg gaacctgcgg ctggatcacc tccttaat

1548

<210> 758

<211> 1394

<212> DNA

<213> Desulfovibrio fairfieldensis

<400> 758

tcgaacgcga aagagacttc ggtctcgagt agagtggcgc acgggtgagt aacgcgtgga

60

taatctgccc tcatgaccgg gataacagtt ggaaacggct gctaataccg gatacgctct

120

gaatgaactt ttaggggaaa gacggcctct gcttgcaagc tgtcgtatga ggatgagtcc

180

gcgtcccatt agctagttgg cggggtaacg gcccaccaag gcaacgatgg gtagccgatc

240

tgagaggatg atcggccaca ctggaactga aacacggtcc agactcctac gggaggcagc

300

agtggggaat attgcgcaat gggcgaaagc ctgacgcagc gacgccgcgt gagggatgaa

360

ggttttcgga tcgtaaacct ctgtcagaag ggaagaaagt gcgtggtgct aatcagccgc

420

gcattgacgg taccttcaaa ggaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata

480

cggagggtgc aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcacgtagg ctgttgtgta

540

agtcaggggt gaaatcccac ggctcaaccg tggaactgcc cttgatactg catgacttga

600

atccgggaga gggtggcgga attccaggtg taggagtgaa atccgtagat atctggagga

660

acatcagtgg cgaaggcggc cacctggacc ggtattgacg ctgaggtgcg aaagcgtggg

720

gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgctgtaa acgatggatg ctagatgtcg

780

gggagtattc ttcggtgtcg tagttaacgc gttaagcatc ccgcctgggg agtacggtcg

840

caaggctgaa actcaaagaa attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagt atgtggttta

900

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctag gtttgacatc tggggaaccc tcccgaaaag

960

gaggggtgcc cttcggggag ccccaagaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc

1020

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct atgcatagtt gccagcaagt

1080

gaagttgggc actctatgca gactgcccgg gttaaccggg aggaaggtgg ggacgacgtc

1140

aagtcatcat ggcccttaca cctagggcta cacacgtact acaatggcgc gcacaaaggg

1200

gagcgagacc gcgaggtgga gccaatccca aaaaacgcgt cccagtccgg attgcagtct

1260

gcaactcgac tgcatgaagt cggaatcgct agtaattcga gatcagcatg ctcgggtgaa

1320

tgcgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg aaagtcggtt ttacccgaag

1380

ccggtgagcc aacc

1394

<210> 759

<211> 1053

<212> DNA

<213> Desulfovibrio piger

<220>

<221> modified_base

<222> (44)..(44)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (49)..(50)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (699)..(699)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (713)..(713)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (861)..(861)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (893)..(894)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (941)..(942)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (959)..(960)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (965)..(965)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (974)..(974)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (979)..(980)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1009)..(1010)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1018)..(1019)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1023)..(1023)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1030)..(1030)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1042)..(1042)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 759

cgcgaaggga cttcggtccc gagtaaagtg gcgcacgggt gagnaacann tggataatct

60

gcctctatga tggggataac agttggaaac gactgctaat accgaatacg ctcatgatga

120

actttgtgag gaaaggtggc ctctgcttgc aagctatcgc atagagatga gtccgcgtcc

180

cattagctag ttggtggggt aacggcctac caaggcaacg atgggtagcc gatctgagag

240

gatgatcggc cacactggaa ctgaaacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtggg

300

gaatattgcg caatgggcga aagcctgacg cagcgacgcc gcgtgaggga tgaaggtctt

360

cggatcgtaa acctctgtca gaagggaaga aactagggtg ctctaatcat catcctactg

420

acggtacctt caaaggaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

480

gtgcaagcgt taatcggaat cactgggcgt aaagcgcacg taggctgtta tgtaagtcag

540

gggtgaaatc ccacggctca accgtggaac tgcccttgat actgcacgac ttgaatccgg

600

gagagggtgg cggaattcca ggtgtaggag tgaaatccgt agatatctgg aggaacatca

660

gtggcgaagg cggccacctg gaccggtatt gacgctgang tgcgaaagcg tgnggagcaa

720

acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg gatgctggat gtcgggatgt

780

atgtctcggt gtcgtagtta acgcgttaag catcccgcct ggggagtacg gtcgcaaggc

840

tgaaactcaa agaaattgac nggggcccgc acaagcggtg gagtatgtgg ttnnattcga

900

tgcaacgcga agaaccttac ctaggtttga catctgggga nncctcccga aaaggaggnn

960

tgccnttcgg gganccccnn acaggtgctg catggctgtc gtcagctcnn gtcgtgannt

1020

gtnggttaan tcccgcaacg ancgcacccc tat

1053

<210> 760

<211> 1027

<212> DNA

<213> Desulfovibrio sp. 3_1_syn3

<220>

<221> modified_base

<222> (8)..(8)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (12)..(15)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (21)..(21)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 760

ggatcgtnaa cnnnntcaga ngggaagaaa gtgcgtggtg ctaatcagcc gcgcattgac

60

ggtaccttca aaggaagcac cgggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg

120

tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgt aggctgttgt gtaagtcagg

180

ggtgaaatcc cacggctcaa ccgtggaact gcccttgata ctgcatgact tgaatccggg

240

agagggtggc ggaattccag gtgtaggagt gaaatccgta gatatctgga ggaacatcag

300

tggcgaaggc ggccacctgg accggtattg acgctgaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa

360

caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgg atgctagatg tcggggagta

420

ttcttcggtg tcgtagttaa cgcgttaagc atcccgcctg gggagtacgg tcgcaaggct

480

gaaactcaaa gaaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agtatgtggt ttaattcgat

540

gcaacgcgaa gaaccttacc taggtttgac atctggggaa ccctcccgaa aaggaggggt

600

gcccttcggg gagccccaag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

660

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctatgcata gttgccagca agtgaagttg

720

ggcactctat gcagactgcc cgggttaacc gggaggaagg tggggacgac gtcaagtcat

780

catggccctt acacctaggg ctacacacgt actacaatgg cgcgcacaaa ggggagcgag

840

accgcgaggt ggagccaatc ccaaaaaacg cgtcccagtc cggattgcag tctgcaactc

900

gactgcatga agtcggaatc gctagtaatt cgagatcagc atgctcgggt gaatgcgttc

960

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acgaaagtcg gttttacccg aagccggtga

1020

gccaacc

1027

<210> 761

<211> 1542

<212> DNA

<213> Desulfovibrio vulgaris

<400> 761

agagtttgat tctggctcag attgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgcgc

60

gtgaaaggac ttcggtccga gtaaagcggc gcacgggtga gtaacgcgtg gatgatctac

120

ccatgagtta ggaataacgg ctggaaacgg tcgctaatac caaatacgct ccgatttcaa

180

cttcggggga aaggtggcct ctgcttgcaa gctactgctc atggatgagt ccgcgtccca

240

ttagctagtt ggtggggtaa cggcccacca aggcgacgat gggtagccgg tctgagagga

300

tgaccggcca cactgggact ggaacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga

360

atattgcgca atgggcgaaa gcctgacgca gcgacgccgc gtgagggatg aaggtcctcg

420

gatcgtaaac ctctgtcagg agggaagaac cgccacggtg ctaatcagcc gtggtctgac

480

ggtacctcca aaggaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggt

540

gcgagcgtta atcggaatca ctgggcgtaa agcgcacgta ggctgcttgg taagtcaggg

600

gtgaaagccc gcggctcaac cgcggaattg cctttgatac tgccgagcta gagtccggga

660

gagggtagtg gaattccagg tgtaggagtg aaatccgtag agatctggag gaacatcagt

720

ggcgaaggcg actacctgga ccggtactga cgctgaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac

780

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgga tgctaggtgt cggggccttg

840

agcttcggtg ccgtagttaa cgcgttaagc atcccgcctg gggagtacgg tcgcaaggct

900

gaaactcaaa gaaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agtatgtggt ttaattcgat

960

gcaacgcgaa gaaccttacc taggtttgac atccggaaga ccttcccgaa aaggaagggt

1020

gcccttcggg gaattccgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gccgtgaggt

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctattgcca gttgctacca ggtaatgctg

1140

ggcactctgg tgagactgcc ccggttaacg gggaggaagg tggggacgac gtcaagtcat

1200

catggccctt acgcctaggg ctacacacgt actacaatgg cgcatacaaa gggcagcgat

1260

accgcgaggt ggagccaatc ccaaaaagtg cgtcccagtc cggattgcag tctgcaactc

1320

gactgcatga agttggaatc gctagtaatt cgagatcagc atgctcgggt gaatgcgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acgaaagttg gttttacccg acaccggtga

1440

gctaaccagc aatggaggca gccgtctacg gtagggccga tgattggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtagcc gtaggggaac ctgcggctgg atcacctcct tt

1542

<210> 762

<211> 965

<212> DNA

<213> Dialister invisus

<220>

<221> modified_base

<222> (9)..(10)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (12)..(12)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (16)..(17)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (20)..(22)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (43)..(49)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (700)..(700)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (716)..(716)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (785)..(785)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (940)..(940)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (944)..(944)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (954)..(954)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 762

gaaaagacnn anagannttn nncttttcag aattgagtgg cannnnnnng agtaacacgt

60

aaacaacctg ccttcaggat ggggacaaca gacggaaacg actgctaata ccgaataagt

120

tccaagagcc gcatggccca tggaagaaaa ggtggcctct acctgtaagc tatcgcctga

180

agaggggttt gcgtctgatt agctggttgg aggggtaacg gcccaccaag gcgacgatca

240

gtagccggtc tgagaggatg aacggccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac

300

gggaggcagc agtggggaat cttccgcaat gggcgaaagc ctgacggagc aacgccgcgt

360

gagtgatgac ggccttcggg ttgtaaaact ctgtgatccg ggacgaaaag gcagagtgcg

420

aagaacaaac tgcattgacg gtaccggaaa agcaagccac ggctaactac gtgccagcag

480

ccgcggtaat acgtaggtgg caagcgttgt ccggaattat tgggcgtaaa gcgcgcgcag

540

gcggcttccc aagtccctct taaaagtgcg gggcttaacc ccgtgatggg aaggaaactg

600

ggaagctgga gtatcggaga ggaaagtgga attcctagtg tagcggtgaa atgcgtagag

660

attaggaaga acaccggtgg cgaaggcgac tttctggacn aaaaactgac gctgangcgc

720

gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatggat

780

actangtgta ggaggtatcg acccctcctg tgccggagtt aacgcaataa gtatcccgcc

840

tgggaaagta cgatcgcaag attaaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg

900

tggagtatgt ggtttaattc gacgcaacgc gaagaacctn accnggtctt gacnttgatc

960

gcgat

965

<210> 763

<211> 1565

<212> DNA

<213> Dialister micraerophilus

<400> 763

tggagagttt gatcctggct caggacgaac gctggcggcg tgcttaacac atgcaagtcg

60

aacgagagga catgaaaagc ttgcttttta tgaaatctag tggcaaacgg gtgagtaaca

120

cgtaaacaac ctgccttcaa gatggggaca acagacggaa acgactgcta ataccgaata

180

cgatccgaaa gtcgcatgac atttggatga aagggtggcc tatcgaagaa gctatcgctt

240

gaagaggggt ttgcgtccga ttaggtagtt ggtgaggtaa cggcccacca agccgacgat

300

cggtagccgg tctgagagga tgaacggcca cactggaact gagacacggt ccagactcct

360

acgggaggca gcagtgggga atcttccgca atggacgaaa gtctgacgga gcaacgccgc

420

gtgagtgaag acggccttcg ggttgtaaag ctctgtgatt cgggacgaaa ggccatatgt

480

gaataatata tggaaatgac ggtaccgaaa aagcaagcca cggctaacta cgtgccagca

540

gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa agcgcgcgca

600

ggcggtcact taagtccatc ttagaagtgc ggggcttaac cccgtgatgg gatggaaact

660

gggagactgg agtatcggag aggaaagtgg aattcctagt gtagcggtga aatgcgtaga

720

tattaggaag aacaccggtg gcgaaggcga ctttctggac gaaaactgac gctgaggcgc

780

gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatggat

840

actaggtgta ggaggtatcg accccttctg tgccggagtt aacgcaataa gtatcccgcc

900

tgggaagtac gatcgcaaga ttaaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt

960

ggagtatgtg gtttaattcg acgcaacgcg aagaacctta ccaagtcttg acattgatcg

1020

ccattccaag agattggaag ttctccttcg ggagacgaga aaacaggtgg tgcacggctg

1080

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatctt

1140

ttgttgccag cacgtagagg tgggaactca gaagagaccg ccgcagacaa tgcggaggaa

1200

ggtggggatg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgacttg ggctacacac gtactacaat

1260

gggctttaac aaagagcagc gaaaccgcga ggtggagcga aactcaaaaa caagccccca

1320

gttcagatcg caggctgcaa ctcgcctgcg tgaagcagga atcgctagta atcgcgggtc

1380

agcataccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac actatgagag

1440

tcggaaacac ccgaagccgg tgaggtaacc gcaaggagcc agccgtcgaa ggtggggctg

1500

atgattggag tgaagtcgta acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc

1560

tttct

1565

<210> 764

<211> 1328

<212> DNA

<213> Dialister microaerophilus

<400> 764

tggagagttt gatcctggct caggacgaac gctggcggcg tgcttaacac atgcaagtcg

60

aacgagagga catgaaaagc ttgcttttta tgaaatctag tggcaaacgg gtgagtaaca

120

cgtaaacaac ctgccttcaa gatggggaca acagacggaa acgactgcta ataccgaata

180

cgatccgaaa gtcgcatgac atttggatga aagggtggcc tatcgaagaa gctatcgctt

240

gaagaggggt ttgcgtccga ttaggtagtt ggtgaggtaa cggcccacca agccgacgat

300

cggtagccgg tctgagagga tgaacggcca cactggaact gagacacggt ccagactcct

360

acgggaggca gcagtgggga atcttccgca atggacgaaa gtctgacgga gcaacgccgc

420

gtgagtgaag acggccttcg ggttgtaaag ctctgtgatt cgggacgaaa ggccatatgt

480

gaataatata tggaaatgac ggtaccgaaa aagcaagcca cggctaacta cgtgccagca

540

gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa agcgcgcgca

600

ggcggtcact taagtccatc ttagaagtgc ggggcttaac cccgtgatgg gatggaaact

660

gggagactgg agtatcggag aggaaagtgg aattcctagt gtagcggtga aatgcgtaga

720

tattaggaag aacaccggtg gcgaaggcga ctttctggac gaaaactgac gctgaggcgc

780

gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatggat

840

actaggtgta ggaggtatcg accccttctg tgccggagtt aacgcaataa gtatcccgcc

900

tgggaagtac gatcgcaaga ttaaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt

960

ggagtatgtg gtttaattcg acgcaacgcg aagaacctta ccaagtcttg acattgatcg

1020

ccattccaag agattggaag ttctccttcg ggagacgaga aaacaggtgg tgcacggctg

1080

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatctt

1140

ttgttgccag cacgtagagg tgggaactca gaagagaccg ccgcagacaa tgcggaggaa

1200

ggtggggatg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgacttg ggctacacac gtactacaat

1260

gggctttaac aaagagcagc gaaaccgcga ggtggagcga aactcaaaaa caagccccca

1320

gttcagat

1328

<210> 765

<211> 1547

<212> DNA

<213> Dialister pneumosintes

<400> 765

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

gaaagagatg aaagagcttg ctcttttatt aatttcagtg gcaaacgggt gagtaacacg

120

taaacaacct gccttaagga tggggataac agacggaaac gactgctaat accgaatacg

180

ttctaagcat cgcatggtgc atagaagaaa gggtggcctc tacaagaaag ctatcgcctt

240

aagaggggtt tgcgactgat taggtagttg gtgaggtaac ggctcaccaa gccgacgatc

300

agtagccggt ctgagaggat gaacggccac actggaactg agacacggtc cagactccta

360

cgggaggcag cagtggggaa tcttccgcaa tggacgaaag tctgacggag caacgccgcg

420

tgaacgaaga aggtcttcgg attgtaaagt tctgtgattc gggacgaaag ggtttgtggt

480

gaataatcat agacattgac ggtaccgaaa aagcaagcca cggctaacta cgtgccagca

540

gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa agcgcgcgca

600

ggcggtttct taagtccatc ttaaaagcgt ggggctcaac cccatgaggg gatggaaact

660

gggaagctgg agtatcggag aggaaagtgg aattcctagt gtagcggtga aatgcgtaga

720

gattaggaag aacaccggtg gcgaaggcga ctttctagac gaaaactgac gctgaggcgc

780

gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatggat

840

actaggtgta ggaggtatcg acccctcctg tgccggagtt aacgcaataa gtatcccgcc

900

tgggaagtac gatcgcaaga ttaaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt

960

ggagtatgtg gtttaattcg acgcaacgcg aagaacctta ccaagccttg acattgatcg

1020

caatccatag aaatatggag ttcttcttcg gaagacgaga aaacaggtgg tgcacggctg

1080

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatttc

1140

ctgttaccag cacgtaaagg tggggactca ggagagaccg ccgcggacaa cgcggaggaa

1200

ggcggggatg acgtcaagtc atcatgcccc ttatggcttg ggctacacac gtactacaat

1260

gggtgccaac aaagagaagc gaaatcgcga gatggagcgg acctcataaa cgcaccccca

1320

gttcagattg caggctgcaa ctcgcctgca tgaagtagga atcgctagta atcgcgggtc

1380

agcataccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac actatgagag

1440

ttagagacac ccgaagccgg tgaggtaacc gcaagggacc agccgtctaa ggtggagctg

1500

atgattggag tgaagtcgta acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcgg

1547

<210> 766

<211> 1396

<212> DNA

<213> Dialister propionicifaciens

<400> 766

aaaagactgc tcttttcgat ccagtggcaa acgggtgagt aacacgtaaa caacctgcct

60

tcaggatggg gacaacagac ggaaacgact gctaataccg aatacgttcc acgggccgca

120

tgacctgtgg aagaaagggt agcctctacc tgtaagctat cgcctgaaga ggggtttgcg

180

tctgattagg cagttggtgg ggtaacggcc caccaaacca acgatcagta gccggtctga

240

gaggatgaac ggccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

300

ggggaatctt ccgcaatgga cgaaagtctg acggagcaac gccgcgtgag tgaagacggc

360

cttcgggttg taaagctctg tgatccggga cgaaagagcc tgaggttaat agcctaagga

420

agtgacggta ccggaaaagc aagccacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

taggtggcaa gcgttgtccg gaattattgg gcgtaaagcg cgcgcaggcg gcttcctaag

540

tccatcttaa aagtgcgggg cttaaccccg tgatgggatg gaaactggga agctggagta

600

tcggagagga aagtggaatt cctagtgtag cggtgaaatg cgtagagatt aggaagaaca

660

ccggtggcga aggcgacttt ctggacgaaa actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag

720

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atggatacta ggtgtaggag

780

gtatcgaccc cttctgtgcc ggagttaacg caataagtat cccgcctggg aagtacgatc

840

gcaagattaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag tatgtggttt

900

aattcgacgc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat tgatcgcaat tttcagaaat

960

gagaagttct ccttcgggag acgagaaaac aggtggtgca cggctgtcgt cagctcgtgt

1020

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc tatcatttgt tgccagcacg

1080

taaaggtggg gactcaaatg agaccgccgc agacaatgcg gaggaaggtg gggatgacgt

1140

caagtcatca tgccccttat gacctgggct acacacgtac tacaatgggt gtcaacaaag

1200

agaagcgaaa gggcgacctg gagccaacct caaaaacaca cccccagttc agatcgcagg

1260

ctgcaactcg cctgcgtgaa gcaggaatcg ctagtaatcg cgggtcagca taccgcggtg

1320

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacta tgagagtcag aaacacccga

1380

agccggtgag gtaacc

1396

<210> 767

<211> 1547

<212> DNA

<213> Dialister sp. oral taxon 502

<400> 767

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

gaaagagatg aaagagcttg ctcttttatt aatttcagtg gcaaacgggt gagtaacacg

120

taaacaacct gccttaggga tggggataac agacggaaac gactgctaat accgaatacg

180

ttctaagcat cgcatgatgc atagaagaaa gggtggcctc tacaagaaag ctatcgcctt

240

aagaggggtt tgcgactgat taggtagttg gtgaggtaac ggctcaccaa gccgacgatc

300

agtagccggt ctgagaggat gaacggccac actggaactg agacacggtc cagactccta

360

cgggaggcag cagtggggaa tcttccgcaa tggacgaaag tctgacggag caacgccgcg

420

tgaacgaaga aggtcttcgg attgtaaagt tctgtgattc gggacgaaag ggtaaatagt

480

gaataactat agacattgac ggtaccgaaa aagcaagcca cggctaacta cgtgccagca

540

gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa agcgcgcgca

600

ggcggtttct taagtccatc ttaaaagcgt ggggctcaac cccatgaggg gatggaaact

660

gggaagctgg agtatcggag aggaaagtgg aattcctagt gtagcggtga aatgcgtaga

720

gattaggaag aacaccggtg gcgaaggcga ctttctagac gaaaactgac gctgaggcgc

780

gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatggat

840

actaggtgta ggaggtatcg acccctcctg tgccggagtt aacgcaataa gtatcccgcc

900

tgggaagtac gatcgcaaga ttaaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt

960

ggagtatgtg gtttaattcg acgcaacgcg aagagcctta ccaggtcttg acattgatcg

1020

cgatctgcag aaatgcggag ttcttcttcg gaagacgaga aaacaggtgg tgcacggctg

1080

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctgtcat

1140

ttgttgccag cacgtaaagg tggggactca aatgagaccg ccgcggacaa cgcggaggaa

1200

ggcggggacg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtactacaat

1260

gggtgtcaac aaagagaagc gaacccgcga gggagagcaa agctcaaaaa cacaccccca

1320

gttcagatcg caggctgcaa cccgcctgcg tgaagtagga atcgctagta atcgcgggtc

1380

agcataccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac actatgagag

1440

tcagaaacac ccgaagccgg tgaggtaacc gcaaggagcc agccgtcgaa ggcggagctg

1500

atgattggag tgaagtcgta acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcgg

1547

<210> 768

<211> 1325

<212> DNA

<213> Dialister succinatiphilus

<400> 768

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcaaa cgggtgagta

60

acacgtaaac aacctgcctt caggatgggg acaacagacg gaaacgactg ctaataccga

120

atacggaaag tcgcctgaag aggggtttgc gtctgattag gcagttggtg aggtaacggc

180

ccaccaaacc tacgatcagt agccggtctg agaggatgaa cggccacact ggaactgaga

240

cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatct tccgcaatgg gcgaaagcct

300

gacggagcaa cgccgcgtga gtgatgacgg ccttcgggtt gtaaagctct gtgatcgggg

360

acgatgacgg tacccgaata gcaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtggc aagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag cgcgcgcagg cggctttcta

480

agtccatctt aaaagtgcgg ggcttaaccc cgtgatggga tggaaactgg gaagctggag

540

tatcggagag gaaagtggaa ttcctagtgt agcggtgaaa tgcgtagaga ttaggaagaa

600

caccggtggc gaaggcgact ttctggacga actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgaatacta ggtgtaggag

720

cttctgtgcc ggagctaaca caataagtat tccgcctggg aagtacgatc gcaagattaa

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag tatgtggttt aattcgacgc

840

aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat taacaggtgg tgcacggctg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatctt atgttaccag

960

cacgtgggga ctcatgagag accgccgcgg acaacgcgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

agtcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtacta caatgggtgt caaagagaag

1080

cgaaaccgcg aggtggagcg aacctcaaca cccccagttc agatgcaggc tgcaacccgc

1140

ctgcagaagt aggaatcgct agtaatcgcg ggtcagcata ccgcggtgaa tacgttcccg

1200

ggccttgtac acaccgcccg tcacactatg agagtcggaa acacccgaag ccggtaggta

1260

gccagccgtc gaaggtggag ctgatgattg gagtgaagtc gtaacaaggt agccgtatcg

1320

gaagg

1325

<210> 769

<211> 1433

<212> DNA

<213> Dietzia natronolimnaea

<400> 769

gcttacacat gcagtcgaac ggtaaggccc tttcgggggt acacgagtgg cgaacgggtg

60

agtaacacgt gggtaatctg ccctgcactt cgggataagc ctgggaaacc gggtctaata

120

ccggatatga gctcctgccg catggtgggg gttggaaagt ttttcggtgc aggatgagtc

180

cgcggcctat cagcttgttg gtggggtaat ggcctaccaa ggcgacgacg ggtagccggc

240

ctgagagggt gatcggccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag

300

cagtggggaa tattgcacaa tgggcgaaag cctgatgcag cgacgccgcg tgggggatga

360

cggtcttcgg attgtaaact cctttcagta gggacgaagc gaaagtgacg gtacctgcag

420

aagaagcacc ggccaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggtg caagcgttgt

480

ccggaattac tgggcgtaaa gagctcgtag gcggtttgtc acgtcgtctg tgaaatcctc

540

cagctcaact gggggcgtgc aggcgatacg ggcagacttg agtactacag gggagactgg

600

aattcctggt gtagcggtga aatgcgcaga tatcaggagg aacaccggtg gcgaaggcgg

660

gtctctgggt agtaactgac gctgaggagc gaaagcatgg ggagcaaaca ggattagata

720

ccctggtagt ccatgccgta aacggtgggc gctaggtgtg gggtccttcc acggattccg

780

tgccgtagct aacgcattaa gcgccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca

840

aaggaattga cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgtg gattaattcg atgcaacgcg

900

aagaacctta cctaggcttg acatatacag gacgacggca gagatgtcgt ttcccttgtg

960

gcttgtatac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1020

cccgcaacga gcgcaacccc tgtctcatgt tgccagcacg ttatggtggg gactcgtgag

1080

agactgccgg ggtcaactcc ggatgaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgccccctt

1140

atgtctaggg cttcacatat gctacaatgg ctagtacaga gggctgcgag accgcgaggt

1200

ggagcgaatc ccttaaagct agtctcagtt cggattgggg tctgcaactc gaccccatga

1260

agtcggagtc gctagtaatc gcagatcagc attgctgcgg tgaatacgtt cccgggcctt

1320

gtacacaccg cccgtcacgt catgaaagtc ggtaacaccc gaagccggtg gcctaaccct

1380

tgtggaggga gccgtcgaag gtgggatcgg cgattgggac gaagtcgaac aag

1433

<210> 770

<211> 1483

<212> DNA

<213> Dietzia sp. BBDP51

<400> 770

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggtaaggccc ttcggggtac acgagtggcg aacgggtgag taacacgtgg gtaatctgcc

120

ctgcacttcg ggataagcct gggaaactgg gtctaatacc ggatatgaac tcctgccgca

180

tggtgggggt tggaaagttt ttcggtgcag gatgagtccg cggcctatca gcttgttggt

240

ggggtaatgg cctaccaagg cgacgacggg tagccggcct gagagggtga tcggccacac

300

tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg

360

ggcgaaagcc tgatgcagcg acgccgcgtg ggggatgacg gtcttcggat tgtaaacccc

420

tttcagtagg gacgaagcgc aagtgacggt acctgcagaa gaagcaccgg ctaactacgt

480

gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgcg agcgttgtcc ggaattactg ggcgtaaaga

540

gctcgtaggc ggtttgtcac gtcgtctgtg aaatccctcg gcttaaccgg gggcgtgcag

600

gcgatacggg cagacttgag tactacaggg gagactggaa ttcctggtgt agcggtgaaa

660

tgcgcagata tcaggaggaa ccaccggtgg cgaagggcgg gtctcttggg tagtaactga

720

cgctgaggag cgaaaagcat gggttagcga acaggattag ataccctggg tagtccatgc

780

cgtaaaacgg tgggcgctag gtgtggggtc cttccacgga ttccgtgccg tagctaacgc

840

attaagcgcc ccgcctgggg agtacggccg caaggctaaa actcaaagga attgacgggg

900

gcccgcacaa gcggcggagc atgtggatta attcgatgca acgcgaagaa ccttacctag

960

gcttgacata tacaggacga cggcagagat gtcgtttccc ttgtggcttg tatacaggtg

1020

gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

1080

acccctgtct catgttgcca gcacgttatg gtggggactc gtgagagact gccggggtca

1140

actcggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgtcta gggcttcaca

1200

catgctacaa tggctagtac agagggctgc gataccgcga ggtggagcga atcccttaaa

1260

gctggtctca gttcggattg gggtctgcaa ctcgacccca tgaagtcgga gtcgctggta

1320

atcgcagatc agcaacgctg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca

1380

cgtcatgaaa gtcggtaaca cccgaagccg gtggcctaac ccttgtggag ggagccgtcg

1440

aaggtgggat cggcgattgg gacgaagtcg taacaaggta acc

1483

<210> 771

<211> 1467

<212> DNA

<213> Dietzia sp. CA149

<400> 771

ttaactgcag tcgacggtaa ggccccttcg ggggtacacg agtggcgaac gggtgagtaa

60

cacgtgggta atctgccctg cacttcggga taagcttggg aaactgggtc taataccgga

120

tatgaactcc tgccgcatgg tgggggttgg aaagtttttc ggtgcaggat gagcccgcgg

180

cctatcagct tgttggtggg gtaatggcct accaaggcga cgacgggtag ccggcctgag

240

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

300

gggaatattg cacaatgggc gaaagcctga tgcagcgacg ccgcgtgggg gatgacggtc

360

ttcggattgt aaaccccttt cagtagggac gaagcgcaag tgacggtacc tgcagaagaa

420

gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggtgcgagc gttgtccgga

480

attactgggc gtaaagagct cgtaggcggt ttgtcacgtc gtctgtgaaa tccctcggct

540

taaccggggg cgtgcaggcg atacgggcag acttgagtac tacaggggag actggaattc

600

ctggtgtagc ggtgaaatgc gcagatatca ggaggaacac cggtggcgaa ggcgggtctc

660

tgggtagtaa ctgacgctga ggagcgaaag catgggtagc gaacaggatt agataccctg

720

gtagtccatg ccgtaaacgg tgggcgctag gtgtggggtc cttccacgga ctccgtgccg

780

tagctaacgc attaagcgcc ccgcctgggg agtacggccg caaggctaaa actcaaagga

840

attgacgggg gcccgcacaa gcggcggagc atgtggatta attcgatgca acgcgaagaa

900

ccttacctag gcttgacatc ctttgaccct tctagagata gaagtttccc cttcggggga

960

caaagtgaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc

1020

ccgcaacgag cgcaaccctt aagcttagtt gccatcatta agttgggcac tctaagttga

1080

ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgat

1140

ttgggctaca cacgtgctac aatggacaat acaaagggca gcgaaaccgc gaggtcaagc

1200

aaatcccata aagttgttct cagttcggat tgtagtctgc aactcgacta catgaagctg

1260

gaatcgctag taatcgtaaa tcagcatgct acggtgaata cgttcccggg tcttgtacac

1320

accgcccgtc acgtcatgaa agtcggtaac acccgaagcc ggtggcctaa cccttgtgga

1380

gggagccgtc gaaggtggga tcggcgattg ggacgaagtc gtaacaaggt agccgtaccg

1440

gaaggtgcgg ctggatcaaa tccataa

1467

<210> 772

<211> 1472

<212> DNA

<213> Dietzia timorensis

<400> 772

ggggtgctta cacatgcagt cgaacggtaa ggcccttcgg ggtacacgag tggcgaacgg

60

gtgagtaaca cgtgggtaat ctgccctgca cttcgggata agcctgggaa actgggtcta

120

ataccggata ttcagcttct gccgcatggt ggttgttgga aagtttttcg gtgcaggatg

180

tgcccgcggc ctatcagctt gttggtgggg taatggccta ccaaggcgac gacgggtagc

240

cggcctgaga gggtgatcgg ccacattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag

300

gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat gcagcgacgc cgcgtgaggg

360

atgacggtct tcggattgta aacctctttc ggcagggacg aagcgcaagt gacggtacct

420

gcagaagaag caccggccaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggtgcaagcg

480

ttgtccggaa ttactgggcg taaagagctc gtaggcggtt tgtcgcgtcg tctgtgaaat

540

cctacagctt aactgtgggc gtgcaggcga tacgggcaga cttgagtact acaggggaga

600

ctggaattcc tggtgtagcg gtgaaatgcg cagatatcag gaggaacacc ggtggcgaag

660

gcgggtctct gggtagtaac tgacgctgag gagcgaaagc atgggtagcg aacaggatta

720

gataccctgg tagtccatgc cgtaaacggt gggcgctagg tgtgggtttc cttccacggg

780

atccgtgccg cagctaacgc attaagcgcc ccgcctgggg agtacggccg caaggctaaa

840

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggcggagc atgtggatta attcgatgca

900

acgcgaagaa ccttacctgg gcttgacata tacaggacga cggcagagat gtcgtttccc

960

ttgtggcttg tatacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt

1020

taagtcccgc aacgagcgca acccttgtct catgttgcca gcaattcggt tggggactcg

1080

tgagagactg ccggggtcaa ctcggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc

1140

ttagtccagg gcttcacaca tgctacaatg gccggtacag agggctgcga tactgtaaag

1200

tggagcgaat ctcttaaagc cggtctcagt tcggattggg gtctgcaact cgaccccatg

1260

aagtcgagtc gctagtaatc gcagatcagc aatgctgcgg tgaatacgtt cccgggcctt

1320

gtacacaccg cccgtcacgt catgagagtc ggtaacaccc gaagccggtg gcctaaccct

1380

tgtgggggga gccgtcgaag gtgggatcgg cgattgggac gaagtcgtaa caaggtaccc

1440

gtaccggagg gtgcggctgg atcaaatcaa ta

1472

<210> 773

<211> 1392

<212> DNA

<213> Dorea formicigenerans

<400> 773

gtcgagcgaa gcacttaagt ttgattcttc ggatgaagac ttttgtgact gagcggcgga

60

cgggtgagta acgcgtgggt aacctgcctc atacaggggg ataacagtta gaaatggctg

120

ctaataccgc ataagaccac agtactgcat ggtacagtgg taaaaactcc ggtggtatga

180

gatggacccg cgtctgatta ggtagttggt gaggtaacgg cccaccaagc cgacgatcag

240

tagccgacct gagagggtga ccggccacat tgggactgag acacggccca gactcctacg

300

ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggcgaaagcc tgatgcagcg acgccgcgtg

360

aaggatgaag tatttcggta tgtaaacttc tatcagcagg gaagaaaatg acggtacctg

420

actaagaagc cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gggcaagcgt

480

tatccggatt tactgggtgt aaagggagcg tagacggctg tgcaagtctg aagtgaaagg

540

catgggctca acctgtggac tgctttggaa actgtgcagc tagagtgtcg gagaggtaag

600

tggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattagg aggaacacca gtggcgaagg

660

cggcttactg gacgatgact gacgttgagg ctcgaaagcg tggggagcaa acaggattag

720

ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg actgctaggt gtcgggtagc aaagctattc

780

ggtgccgcag ctaacgcaat aagcagtcca cctggggagt acgttcgcaa gaatgaaact

840

caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg

900

cgaagaacct tacctgatct tgacatcccg atgaccgctt cgtaatggaa gcttttcttc

960

ggaacatcgg tgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt

1020

aagtcccgca acgagcgcaa cccttatctt cagtagccag catttaggat gggcactctg

1080

gagagactgc cagggataac ctggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct

1140

tatgaccagg gctacacacg tgctacaatg gcgtaaacaa agggaagcag agccgcgagg

1200

ccgagcaaat ctcaaaaata acgtctcagt tcggattgta gtctgcaact cgactacatg

1260

aagctggaat cgctagtaat cgcagatcag aatgctgcgg tgaatacgtt cccgggtctt

1320

gtacacaccg cccgtcacac catgggagtc agtaacgccc gaagtcagtg acccaaccga

1380

aaggagggag ct

1392

<210> 774

<211> 1392

<212> DNA

<213> Dorea longicatena

<220>

<221> modified_base

<222> (13)..(13)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (18)..(19)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (21)..(22)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (24)..(25)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (41)..(41)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 774

gtcgagcgaa gcngcttnng nnannagatt cttcggatga nttcctttgt gactgagcgg

60

cggacgggtg agtaacgcgt gggtaacctg cctcatacag ggggataaca gttagaaatg

120

actgctaata ccgcataaga ccacggtacc gcatggtaca gtggtaaaaa ctccggtggt

180

atgagatgga cccgcgtctg attaggtagt tggtggggta acggcctacc aagccgacga

240

tcagtagccg acctgagagg gtgaccggcc acattgggac tgagacacgg cccagactcc

300

tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatggaggaa actctgatgc agcgacgccg

360

cgtgaaggat gaagtatttc ggtatgtaaa cttctatcag cagggaagaa aatgacggta

420

cctgactaag aagccccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggggcaa

480

gcgttatccg gatttactgg gtgtaaaggg agcgtagacg gcacggcaag ccagatgtga

540

aagcccgggg ctcaaccccg ggactgcatt tggaactgct gagctagagt gtcggagagg

600

caagtggaat tcctagtgta gcggtgaaat gcgtagatat taggaggaac accagtggcg

660

aaggcggctt gctggacgat gactgacgtt gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga

720

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgactgct aggtgtcggg tggcaaagcc

780

attcggtgcc gcagctaacg caataagcag tccacctggg gagtacgttc gcaagaatga

840

aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc

900

aacgcgaaga accttacctg atcttgactt cccgatgacc gcttcgtaat ggaagtcttt

960

cttcggaaca tcggtgacag tgggggcatg gatgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

1020

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccccta tcttcagtag ccagcaggtt aagctgggca

1080

ctctggagag actgccaggg ataacctgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg

1140

ccccttatga ccagggctac acacgtgcta caatggcgta aacaaagaga agcgaactcg

1200

cgagggtaag caaatctcaa aaataacgtc tcagttcgga ttgtagtctg caactcgact

1260

acatgaagct ggaatcgcta gtaatcgcag atcagaatgc tgcggtgaat acgttcccgg

1320

gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtcagtaa cgcccgaagt cagtgaccca

1380

accgtaagga gg

1392

<210> 775

<211> 1529

<212> DNA

<213> Dysgonomonas gadei

<400> 775

acaaagaaga gtttgatcct ggctcaggat gaacgctagc gataggccta acacatgcaa

60

gtcgaggggc agcatagggt agcaatactt tgatggcgac cggcgcacgg gtgagtaacg

120

cgtatgcaac ctacctataa caggggaata acccggagaa attcggacta ataccgcata

180

aaacaggggc tccgcatgga gatatttgtt aaagatttat cggttataga tgggcatgcg

240

ttccattagc cagttggtga ggtaacggct caccaaagca acgatggata ggggaactga

300

gaggtttgtc ccccacactg gaactgagac acggaccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

gaggaatatt ggtcaatggg cgagagcctg aaccagccaa atcgcgtgaa ggaagactgc

420

cttatgggtt gtaaacttct tttatacagg aataaaaaga gttacgtgta acttattgca

480

tgtactgtat gaataagcat cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggaggat

540

gcgagcgtta tccggattta ttgggtttaa agggtgcgca ggcgggaact taagtcagcg

600

gtgaaatctc gacgcttaac gtcgaaactg ccgttgaaac tgggtttctt gagtatagat

660

gaagtaggcg gaattcgttg tgtagcggtg acatgcttag atataacgag gaactccgat

720

tgcgtaggca gcttactaag ctataactga cgctcaagca cgaaagcgtg gggatcaaac

780

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgat tactagttgt atgcgatata

840

ccgtatgtga ctaagcgaaa gcgataagta atccacctgg ggagtacgcc ggcaacggtg

900

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggagga acatgtggtt taattcgatg

960

atacgcgagg aaccttaccc gggcttgaaa tgcagaagaa taacgttgaa agatgttagc

1020

cagcaatggc ttctgtgtag gtgctgcatg gttgtcgtca gctcgtgccg tgaggtgtcg

1080

gcttaagtgc cataacgagc gcaacccaca ttgttagtta ctaacaggtc aagctgagga

1140

ctctaacaag actgccgtcg taagatgcga ggaaggtgtg gatgacgtca aatcagcacg

1200

gcccttacgt ccggggcgac acacgtgtta caatgggtgg tacaaagggc agctacttgg

1260

tgacaagatg ctaatctcca aagccactcc cagttcggat cggagtctgc aactcgactc

1320

cgtgaagctg gattcgctag taatcgcgca tcagccatgg cgcggtgaat acgttcccgg

1380

gccttgtaca caccgcccgt caagccatgg aagctggggg tatctgaagt gcgtaaccgc

1440

aaggagcgtc ctagggtaaa accggtgact ggggctaagt cgtaacaagg tagccgtacc

1500

ggaaggtgcg gctggaacac ctcctttct

1529

<210> 776

<211> 1003

<212> DNA

<213> Dysgonomonas mossii

<220>

<221> modified_base

<222> (879)..(879)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (972)..(974)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (979)..(981)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (991)..(992)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 776

agtcgagggg cagcatagag tagcaatact ttgatggcga ccggcgcacg ggtgagtaac

60

acgtatgcaa cctacctaca tcaggggaat aacccggaga aattcggact aataccgcat

120

aatacaggga tgccgcatgg caatatttgt taaagattta tcggatgtag atgggcatgc

180

gttccattag ctagttggta aggtaacggc ttaccaaggc aacgatggat aggggaactg

240

agaggtttgt cccccacact ggaactgaga cacggaccag actcctacgg gaggcagcag

300

tgaggaatat tggtcaatgg acgagagtct gaaccagcca aatcgcgtga aggaagactg

360

ccctacgggt tgtaaacttc ttttgtacag gaataaaaga cattacgtgt aatgtattgc

420

atgtactgta cgaataagca tcggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggagga

480

tgcgagcgtt atccggattt attgggttta aagggtgcgc aggcgggatt ttaagtcagc

540

ggtgaaattt tcaggctcaa cctgaacact gccgttgaaa ctgggattct tgagtatgga

600

tgaagtaggc ggaattcgtt gtgtagcggt gacatgctta gatataacga ggaactccga

660

ttgcgtaggc agcttactaa gccataactg acgctcaagc acgaaagcgt ggggatcaaa

720

caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga ttactagttg tttgcgatat

780

accgtaagtg actaagcgaa agcgataagt aatccacctg gggagtacgc cggcaacggt

840

gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggang aacatgtggt ttaattcgat

900

gatacgcgag gaaccttacc cgggcttgaa atgtacctga ccgtccttga aaagggactt

960

ctagcaatag cnnnatgtnn ngctgcatgg nngtcgtcag ctc

1003

<210> 777

<211> 1547

<212> DNA

<213> Edwardsiella tarda

<400> 777

tttaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgagcg gtagcaggga gaaagcttgc tttctccgct gacgagcggc ggacgggtga

120

gtaatgtctg gggatctgcc tgatggaggg ggataactac tggaaacggt agctaatacc

180

gcataacgtc gcaagaccaa agtgggggac cttcgggcct catgccatca gatgaaccca

240

gatgggatta gctagtaggt ggggtaatgg ctcacctagg cgacgatccc tagctggtct

300

gagaggatga ccagccacac tggaactgag acacggtcca gactcctacg ggaggcagca

360

gtggggaata ttgcacaatg ggcgcaagcc tgatgcagcc atgccgcgtg tatgaagaag

420

gccttcgggt tgtaaagtac tttcagtagg gaggaaggtg tgaacgttaa tagcgctcac

480

aattgacgtt acctacagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac

540

ggagggtgca agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gcacgcaggc ggtttgttaa

600

gttggatgtg aaatccccgg gcttaacctg ggaactgcat ccaagactgg caagctagag

660

tctcgtagag ggaggtagaa ttccaggtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tctggaggaa

720

taccggtggc gaaggcggcc tcctggacga agactgacgc tcaggtgcga aagcgtgggg

780

agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgctgtaaa cgatgtcgat ttggaggttg

840

tgcccttgag gcgtggcttc cgaagctaac gcgttaaatc gaccgcctgg ggagtacggc

900

cgcaaggtta aaactcaaat gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

960

taattcgatg caacgcgaag aaccttacct actcttgaca tccagcgaat cctgtagaga

1020

tacgggagtg ccttcgggaa cgctgagaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtt

1080

gtgaaatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt atcctttgtt gccagcggtt

1140

cggccgggaa ctcaaaggag actgccagtg ataaactgga ggaaggtggg gatgacgtca

1200

agtcatcatg gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggcgta tacaaagaga

1260

agcgaactcg cgagagcaag cggacctcat aaagtacgtc gtagtccgga ttggagtctg

1320

caactcgact ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgtgg atcagaatgc cacggtgaat

1380

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttg caaaagaagt

1440

aggtagctta accttcggga gggcgcttac cactttgtga ttcatgactg gggtgaagtc

1500

gtaacaaggt aaccgtaggg gaacctgcgg ttggatcacc tccttac

1547

<210> 778

<211> 999

<212> DNA

<213> Eggerthella lenta

<220>

<221> modified_base

<222> (33)..(36)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (57)..(57)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (119)..(119)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (788)..(788)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (848)..(848)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (860)..(860)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (877)..(877)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (887)..(887)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (891)..(891)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (899)..(899)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (933)..(934)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (961)..(961)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (963)..(963)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (978)..(978)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (980)..(980)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (983)..(983)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 778

cctcgggcgg acatgaagtg gcgaacgggt gannnncacg tgaccaacct gcccccngct

60

ccgggacaac cttgggaaac cgaggctaat accggatact ccctcccctg ctcctgggng

120

ggtcgggaaa gcccaggcgg agggggatgg ggtcgcggcc cattaggtag taggcggggt

180

aacggcccac ctagcccgcg atgggtagcc gggttgagag accgaccggc cacattggga

240

ctgagatacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaattttgcg caatggggga

300

aaccctgacg cagcaacgcc gcgtgcggga cgacggcctt cgggttgtaa accgctttca

360

gcagggaaga aattcgacgg tacctgcaga agaagctccg gctaactacg tgccagcagc

420

cgcggtaata cgtagggagc gagcgttatc cggattcatt gggcgtaaag agcgcgtagg

480

cggcctctca agcgggatct ctaatccgag ggctcaaccc ccggccggat cccgaactgg

540

gaggctcgag ttcggtagag gcaggcggaa ttcccggtgt agcggtggaa tgcgcagata

600

tcgggaagaa caccgatggc gaaggcagcc tgctgggccg caactgacgc tgaggcgcga

660

aagctagggg agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc tagccgtaaa cgatggatac

720

taggtgtggg gggctccgcc ctccgtgccg cagccaacgc attaagtatc ccgcctgggg

780

agtacggncg caaggctaaa actcaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cagcggagca

840

tgtggctnaa ttcgaagcan cgcgaagaac cttaccnggg cttgacntgg nacgtgaanc

900

cggggaaacc cggtggccga gaggagcgtc cgnnagtggt gcatggctgt cgtcagctcg

960

ngncgtgaga tgttgggntn agntcccgca acgagcgca

999

<210> 779

<211> 1429

<212> DNA

<213> Eggerthella sinensis

<400> 779

gatgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgaac gattaaaccg tcctcggacg

60

gacatagagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgaccaacc tgccccccgc tccgggacaa

120

ccttgggaaa ccgaggctaa taccggatac tcctcgcccc cctcctgggg ggcccgggaa

180

agcccagacg gcgggggatg gggtcgcggc ccattaggta gacggcgggg taacggccca

240

ccgtgcctgc gatgggtagc cgggttgaga gaccgaccgg ccacattggg actgagatac

300

ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaattttgc gcaatggggg aaaccctgac

360

gcagcaacgc cgcgtgcggg atgacggcct tcgggttgta aaccgctttc agcagggaag

420

aaattcgacg gtacctgcag aagaagctcc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtagggag cgagcgttat ccggattcat tgggcgtaaa gagcgcgtag gcggcctttc

540

aagcgggatc tctaatccga gggctcaacc cccggccgga tcccgaactg ggaggctcga

600

gttcggtaga ggcaggcgga attcccggtg tagcggtgga atgcgcagat atcgggaaga

660

acaccgatgg cgaaggcagc ctgctgggcc gaaactgacg ctgaggcgcg aaagctaggg

720

gagcgaacag gattagatac cctggtagtc ctagccgtaa acgatgggcg ctaggtgtgg

780

ggagggtcat cctctccgtg cccgcagcta acgcattaag cgccccgcct ggggagtacg

840

gccgcaaggc taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcagcg gagcatgtgg

900

cttaattcga agcaacgcga agaaccttac cagggcttga catgctagtg aagccgggga

960

aacccggtgg ccgagaggag ctagcgcagg tggtgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt

1020

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat cgcatgttgc cagcattcag

1080

ttggggactc atgcgagact gccggcgtca agccggagga aggtggggac gacgtcaagt

1140

catcatgccc tttatgccct gggctgcaca cgtgctacaa tggccggtac aacgggctgc

1200

gaactcgcga gagtgagcga atcccttaaa gccggcccca gttcggatcg gaggctgcaa

1260

cccgcctccg tgaagtcgga gttgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg

1320

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacccgag tcgtctgcac ccgaagccgc

1380

cggccgaacc cgcaaggggc ggaggcgtcg aaggtgtgga gggtaaggg

1429

<210> 780

<211> 1346

<212> DNA

<213> Eggerthella sp. 1_3_56FAA

<220>

<221> modified_base

<222> (123)..(123)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1329)..(1329)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 780

accgccctcg ggcggacatg aagtggcgaa cgggtgagta acacgtgacc aacctgcccc

60

cctctccggg acaaccttgg gaaaccgagg ctaataccgg atactccctc ccctgctcct

120

ggnggggtcg ggaaagccca ggcggagggg gatggggtcg cggcccatta ggtagtaggc

180

ggggtaacgg cccacctagc ccgcgatggg tagccgggtt gagagaccga ccggccacat

240

tgggactgag atacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaatt ttgcgcaatg

300

ggggaaaccc tgacgcagca acgccgcgtg cgggacgacg gccttcgggt tgtaaaccgc

360

tttcagcagg gaagaaattc aggcctgcag aagaagctcc ggctaactac gtgccagcag

420

ccgcggtaat acgtagggag cgagcgttat ccggattcat tgggcgtaaa gagcgcgtag

480

gcggcctctc aagcgggatc tctaatccga gggctcaacc cccggccgga tcccgaactg

540

ggaggctcga gttcggtaga ggcaggcgga attcccggtg tagcggtgga atgcgcagat

600

atcgggaaga acaccgatgg cgaaggcagc ctgctgggcc gcaactgacg ctgaggcgcg

660

aaagctaggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc ctagccgtaa acgatggata

720

ctaggtgtgg ggggctccgc cctccgtgcc gcagccaacg cattaagtat cccgcctggg

780

gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcagcggag

840

catgtggctt agttcgaagc aacgcgaaga acctcaccag gcctgatccc gaactggaag

900

ccggggaaac ccggtggccg agaggaacgt ccgcaggtgg tgcatggctg tcgtcagctc

960

gtgtcgtgac atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctgcccc atgttgccag

1020

cattaggttg gggactcatg ggggactgcc ggcgtcaagc cggaggaagg tggggacgac

1080

gtcaagtcat catgcccttt atgccctggg ctgcacacgt gctacaatgg ccggtacaac

1140

gggctgcgag accgcgaggt cgagcgaatc cctcaaagcc ggccccagtt cggatcggag

1200

gctgcaaccc gcctccgtga agtcggagtt gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt

1260

gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acccgagtcg tctgcacccg

1320

aagccgccnt ccgaacccgc aagggg

1346

<210> 781

<211> 1430

<212> DNA

<213> Eggerthella sp. HGA1

<400> 781

gaacgctggc ggcgtgccta acacatgcaa gtcgaacgat gaaaccgccc tcgggcggac

60

atgaagtggc gaacgggtga gtaacacgtg accaacctgc ccccctctcc gggacaacct

120

tgggaaaccg aggctaatac cggatactcc ctcccctgct cctgcagggg tcgggaaagc

180

ccaggcggag ggggatgggg tcgcggccca ttaggtagta ggcggggtaa cggcccacct

240

agcccgcgat gggtagccgg gttgagagac cgaccggcca cattgggact gagatacggc

300

ccagactcct acgggaggca gcagtgggga attttgcgca atgggggcaa ccctgacgca

360

gcaacgccgc gtgcgggacg acggccttcg ggttgtaaac cgctttcagc agggaagaaa

420

ttcgacggta cctgcagaag aagctccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

tagggagcga gcgttatccg gattcattgg gcgtaaagag cgcgtaggcg gcctctcaag

540

cgggatctct aatccgaggg ctcaaccccc ggccggatcc cgaactggga ggctcgagtt

600

cggtagaggc aggcggaatt cccggtgtag cggtggaatg cgcagatatc gggaagaaca

660

ccgatggcga aggcagcctg ctgggccgca actgacgctg aggcgcgaaa gctaggggag

720

cgaacaggat tagataccct ggtagtccta gccgtaaacg atggatacta ggtgtggggg

780

gctccgccct ccgtgccgca gccaacgcat taagtatccc gcctggggag tacggccgca

840

aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc agcggagcat gtggcttaat

900

tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccagggc ttgacatgga cgtgaagccg gggaaacccg

960

gtggccgaga ggagcgtccg caggtggtgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

1020

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ctgccccatg ttgccagcat taggttgggg

1080

actcatgggg gactgccggc gtcaagccgg aggaaggtgg ggacgacgtc aagtcatcat

1140

gccctttatg ccctgggctg cacacgtgct acaatggccg gtacaacggg ctgcgagacc

1200

gcgaggtcga gcgaatccct caaagccggc cccagttcgg atcggaggct gcaacccgcc

1260

tccgtgaagt cggagttgct agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg

1320

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacc cgagtcgtct gcacccgaag ccgccggccg

1380

aacccgcaag gggcggaggc gtcgaaggtg tggagggtaa ggggggtgaa

1430

<210> 782

<211> 753

<212> DNA

<213> Eggerthella sp. YY7918

<220>

<221> modified_base

<222> (122)..(122)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (197)..(197)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (341)..(341)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (431)..(431)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (508)..(508)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (602)..(602)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (620)..(621)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (623)..(623)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (627)..(627)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (670)..(670)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (676)..(676)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (709)..(709)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (739)..(739)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 782

ctacccttct cttcgggaca accttgggaa accgaggcta ataccgaata ctccggtgag

60

tgcgcatgca cacgccggga aagctttcgc ggagaaggat ggggtcgcgg cccatcaggt

120

anacggcggg gtagcggccc accgtgcttt tgacgggtag ccgggttgag agaccgaccg

180

gccacattgg gactganata cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaattttg

240

cgcaatgggg gaaaccctga cgcagcaccg ccgcgtgcgg gatgaaggcc ttcgggtcgt

300

aaaccgcttt cagcagggaa gaaattcgac ggtacctgca naagaagccc cggctaacta

360

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggg gcgagcgtta tccggattca ttgggcgtaa

420

agcgcgcgta ngcggccgcc taagcgggac ctctaacctt ggggctcaac ctcaagccgg

480

gttccgaact gggtggctcg agtttggnag aggaagatgg aattcccggt gtagcggtgg

540

aatgcgcaga tatcgggaag aacaccgatg gcgaaggcag tcttctgggc tcataactga

600

cnctgaagcg cgaaagctan ngnagcnaac aggattagat accctggtag tcctagccgt

660

aaacgatggn cactangtgt ggggagatac tctttccgtg ccgaagcana cgcattaagt

720

gccccgcctg gggagtacng ccgcaaggct aaa

753

<210> 783

<211> 1510

<212> DNA

<213> Ehrlichia chaffeensis

<400> 783

tcaaacttga gagtttgatc ctggctcaga acgaacgctg gcggcaagcc taacacatgc

60

aagtcgaacg gacaattgct tataaccttt tggttataaa taattgttag tggcagacgg

120

gtgagtaatg cgtaggaatc tacctagtag tatggaatag ccattagaaa tgatgggtaa

180

tactgtataa tccctgcggg ggaaagattt atcgctatta gatgagccta cgttagatta

240

gctagttggt aaggtaatgg cttaccaagg ctatgatcta tagctggtct gagaggacga

300

tcagccacac tggaactgag atacggtcca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata

360

ttggacaatg ggcgaaagcc tgatccagct atgccgcgtg agtgaagaag gccttcgggt

420

tgtaaaactc tttcaatagg gaagataatg acggtaccta tagaagaagt cccggcaaac

480

tctgtgccag cagccgcggt aatacggagg gggcaagcgt tgttcggaat tattgggcgt

540

aaagggcacg taggtggact agtaagttaa aagtgaaata ccaaggctta actttggagc

600

ggcttttaat actgctagac tagaggtcga aagaggatag cggaattcct agtgtagagg

660

tgaaattcgt agatattagg aggaacacca gtggcgaaag cggctatctg gttcgatact

720

gacactgagg tgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgct

780

gtaaacgatg agtgctaaat gtgaggattt tatctttgta ttgtagctaa cgcgttaagc

840

actccgcctg gggactacgg tcgcaagact aaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca

900

caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gcaacgcgaa aaaccttacc actttttgac

960

atgaaggtcg tatccctcct aataggggga gtcagttcgg ctggacctta cacaggtgct

1020

gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1080

cctcatcctt agttaccaac aggtaatgct gggcactcta aggaaactgc cagtgataaa

1140

ctggaggaag gtggggatga tgtcaagtca gcacggccct tataaggtgg gctacacacg

1200

tgctacaatg gcaactacaa taggtcgcga gaccgcaagg tttagctaat ccataaaagt

1260

tgtctcagtt cggattgttc tctgcaactc gagagcatga agtcggaatc gctagtaatc

1320

gtggatcatc atgccacggt gaatacgttc tcgggtcttg tacacactgc ccgtcacgcc

1380

atgggaattg gcttaactcg aagctggtgt gctaaccgca aggaagcagc catttaaggt

1440

tgggttagtg actagggtga agtcgtaaca aggtagctgt aggtgaacct gcggctggat

1500

tacctccttt

1510

<210> 784

<211> 1546

<212> DNA

<213> Eikenella corrodens

<400> 784

ttgaacataa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggcatgct ttacacatgc

60

aagtcgaacg gcagcggggt agtgcttgca ctactgtccg gcgagtggcg aacgggtgag

120

taatatatcg gaacgtaccg agtaatgggg gataaccaat cgaaagattg gctaataccg

180

catacgtcct acgggagaaa gcgggggatc gcaagacctc gcgttattcg agcggccgat

240

aactgattag ctagttggtg gggtaaaggc ctaccaaggc gacgatcagt agcgggtctg

300

agaggacgat ccgccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

360

tggggaattt tggacaatgg gggcaaccct gatccagcca tgccgcgtgt atgaagaagg

420

ccttcgggtt gtaaagtact tttgttaggg aagaaaaggg aagtgctaat accacttttt

480

gctgacggta cctaaagaat aagcaccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

tagggtgcga gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg agcgcagacg gttatttaag

600

caggatgtga aatccccggg cttaacctgg gaactgcgtt ctgaactgga tagctagagt

660

gtgtcagagg ggggtagaat tccacgtgta gcagtgaaat gcgtagagat gtggaggaat

720

accgatggcg aaggcagccc cctgggataa cactgacgtt catgctcgaa agcgtgggta

780

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccctaaac gatgtcgatt agctgttggg

840

caacttgatt gcttagtagc gtagctaacg cgtgaaatcg accgcctggg gagtacggtc

900

gcaagattaa aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggat gatgtggatt

960

aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg gtcttgacat gtacggaacc ttccagagac

1020

ggaagggtgc cttcgggagc cgtaacacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg

1080

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg tcattagttg ccatcattta

1140

gttgggcact ctaatgagac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcctcatggc ccttatgacc agggcttcac acgtcataca atggtcggta cagagggtag

1260

ccaagccgcg aggtggagcc aatcccagaa aaccgatcgt agtccggatt gcactctgca

1320

actcgagtgc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcaggt cagcatactg cggtgaatac

1380

gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggggata ccagaagcag

1440

gtagggtaac cgcaaggagc ccgcttgcca cggtatgctt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtag ccgtagggga acctgcggct ggatcacctc ctttct

1546

<210> 785

<211> 1533

<212> DNA

<213> Enhydrobacter aerosaccus

<400> 785

taaactgaag agtttgatca tggctcagat tgaacgctgg cggcaggctt aacacatgca

60

agtcgaacga tgattatcta gcttgctaga tatgattagt ggcggacggg tgagtaacat

120

ttaggaatct gcctagtagt gggggatagc tcggggaaac tcgaattaat accgcatacg

180

acctacgggt gaaagggggc gcaagctctt gctattagat gagcctaaat cagattagct

240

agttggtggg gtaaaggccc accaaggcga cgatctgtaa ctggtctgag aggatgatca

300

gtcacaccgg aactgagaca cggtccggac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

360

gacaatgggg gcaaccctga tccagccatg ccgcgtgtgt gaagaaggcc ttttggttgt

420

aaagcacttt aagcagggag gagaggctaa tggttaatac ccattagatt agacgttacc

480

tgcagaataa gcaccggcta actctgtgcc agcagccgcg gtaatacaga gggtgcgagc

540

gttaatcgga attactgggc gtaaagcgag tgtaggtggc tcattaagtc acatgtgaaa

600

tccccgggct taacctggga actgcatgtg atactggtgg tgctagaata tgtgagaggg

660

aagtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata ccgatggcga

720

aggcagcttc ctggcataat attgacactg agattcgaaa gcgtgggtag caaacaggat

780

tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtctacta gccgttgggg tccttgagac

840

tttagtggcg cagttaacgc gataagtaga ccgcctgggg agtacggccg caaggttaaa

900

actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgca

960

acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacata gtgagaatcc tgcagagatg cgggagtgcc

1020

ttcgggaatt cacatacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg

1080

gttaagtccc gcaacgagcg caaccctttt ccttatttgc cagcgggtta agccgggaac

1140

tttaaggata ctgccagtga caaactggag gaaggcgggg acgacgtcaa gtcatcatgg

1200

cccttacgac cagggctaca cacgtgctac aatggtaggt acagagggtt gctacacagc

1260

gatgtgatgc taatctcaaa aagcctatcg tagtccggat tggagtctgc aactcgactc

1320

catgaagtcg gaatcgctag taatcgcaga tcagaatgct gcggtgaata cgttcccggg

1380

ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtctattgc accagaagta ggtagcctaa

1440

cgcaagaggg cgcttaccac ggtgtggtcg atgactgggg tgaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtaggggaa cctgcggctg gatcacctcc tta

1533

<210> 786

<211> 1396

<212> DNA

<213> Enterobacter aerogenes

<220>

<221> modified_base

<222> (9)..(9)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (13)..(13)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 786

gcggtaacnc aanaagagct tgctctcggg tgacgagcgg cggacgggtg agtaatgtct

60

gggaaactgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt

120

cgcaagacca aagtggggga ccttcgggcc tcatgccatc agatgtgccc agatgggatt

180

agctagtagg tggggtaatg gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg

240

accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

300

attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtatgaagaa ggccttcggg

360

ttgtaaagta ctttcagcga ggaggaaggc gttaaggtta ataaccttgg cgattgacgt

420

tactcgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cgggggtgca

480

agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gcacgcaggc ggtctgtcaa gtcggatgtg

540

aaatccccgg gctcaacctg ggaactgcat tcgaaactgg caggctagag tcttgtagag

600

gggggtagaa ttccaggtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tctggaggaa taccggtggc

660

gaaggcggcc ccctggacaa agactgacgc tcaggtgcga aagcgtgggg agcaaacagg

720

attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgtcgac ttggaggttg tgcccttgag

780

gcgtggcttc cggagctaac gcgttaagtc gaccgcctgg ggagtacggc cgcaaggtta

840

aaactcaaat gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg

900

caacgcgaag aaccttacct actcttgaca tccagagaac ttagcagaga tgctttggtg

960

ccttcgggaa ctctgagaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtt gtgaaatgtt

1020

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt atcctttgtt gccagcgatt aggtcgggaa

1080

ctcaaaggag actgccagtg ataaactgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg

1140

gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggcata tacaaagaga agcgacctcg

1200

cgagagcaag cggacctcat aaagtatgtc gtagtccgga ttggagtctg caactcgact

1260

ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgtag atcagaatgc tacggtgaat acgttcccgg

1320

gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttg caaaagaagt aggtagctta

1380

accttcggga gggcgc

1396

<210> 787

<211> 597

<212> DNA

<213> Enterobacter asburiae

<400> 787

cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag

60

ccatgccgcg tgtatgaaga aggccttcgg gttgtaaagt actttcagcg gggaggaagg

120

cgataaggtt aataaccttg tcgattgacg ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc

180

gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa

240

gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc

300

attcgaaact ggcaggctag agtcttgtag aggggggtag aattccaggt gtagcggtga

360

aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg gcgaaggcgg ccccctggac aaagactgac

420

gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta

480

aacgatgtcg acttggaggt tgtgcccttg aggcgtggct tccggagcta acgcgttaag

540

tcgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt taaaactcaa tgaattgacg ggggccc

597

<210> 788

<211> 1495

<212> DNA

<213> Enterobacter cancerogenus

<400> 788

attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgarc ggtarcacag agagcttgct

60

ctcgggtgac gagyggcgga cgggtgagta atgtctggga aactgcctga tggaggggga

120

taactactgg aaacggtagc taataccgca taacgtcgca agaccaaaga gggggacctt

180

cgggcctctt gccatcagat gtgcccagat gggattagct agtaggtggg gtaacggctc

240

acctaggcga cgatccctag ctggtctgag aggatgacca gccacactgg aactgagaca

300

cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc gcaascctga

360

tgcagccatg ccgcgtgtat gaagaaggcc ttcgggttgt aaagtacttt cagcggggag

420

gaaggcgata aggttaataa ccttgtcgat tgacgttacc cgcagaaraa gcaccggcta

480

actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc

540

gtaaagcgca cgcaggcggt ctgtcaagtc ggatgtgaaa tccccgggct caacctggga

600

actgcattcg aaactggcag gctagagtct tgtagagggg ggtagaattc caggtgtagc

660

ggtgaaatgc gtagagatct ggaggaatac cggtggcgaa ggcggccccc tggacaaaga

720

ctgacgctca ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg

780

ccgtaaacga tgtcgacttg gaggttgtgc ccttgaggcg tggcttccgg agctaacgcg

840

ttaagtcgac cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg

900

cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctact

960

cttgacatcc agagaactta gcagagatgc tttggtgcct tcgggaactc tgagacaggt

1020

gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgttgtg aaatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc

1080

aacccttatc ctttgttgcc agcggtcmgg ccgggaactc aaaggagact gccagtgata

1140

aactggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc cttacgagta gggctacaca

1200

cgtgctacaa tggcgcatac aaagagaagc gacctcgcga gagcaagcgg acctcataaa

1260

gtgcgtcgta gtccggattg gagtctgcaa ctcgactcca tgaagtcgga atcgctagta

1320

atcgtagatc agaatgctac ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac

1380

accatgggag tgggttgcaa aagaagtagg tagcttaacc tycgggaggg cgcttaccac

1440

tttgtgattc atgactgggg tgaagtcgta acaaggtaac cgtaggggaa cctgc

1495

<210> 789

<211> 1395

<212> DNA

<213> Enterobacter cloacae

<400> 789

tcgaacggta gcacagagag cttgctctcg ggtgacgagt ggcggacggg tgagtaatgt

60

ctgggaaact gcctgatgga gggggataac tactggaaac ggtagctaat accgcataac

120

gtcgcaagac caaagagggg gaccttcggg cctcttgcca tcagatgtgc ccagatggga

180

ttagctagta ggtggggtaa cggctcacct aggcgacgat ccctagctgg tctgagagga

240

tgaccagcca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga

300

atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtatgaag aaggccttcg

360

ggttgtaaag tactttcagc ggggaggaag ggagtaaggt taataacctt gttcattgac

420

gttacccgca gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggt

480

gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtctgt caagtcggat

540

gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg cattcgaaac tggcaggctg gagtcttgta

600

gaggggggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccggt

660

ggcgaaggcg gccccctgga caaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac

720

aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacgatgtc gacttggagg ttgttccctt

780

gaggagtggc ttccggagct aacgcgttaa gtcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg

840

ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

900

atgcaacgcg aagaacctta cctactcttg acatccagag aacttagcag aaatgctttg

960

gtgccttcgg gaactctgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gttgtgaaat

1020

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg gtccggccgg

1080

gaactcaaag gagactgcca gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc

1140

atggccctta cgagtagggc tacacacgtg ctacaatggc atatacaaag agaagcgacc

1200

tcgcgagagc aagcggacct cataaagtat gtcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg

1260

actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg tggatcagaa tgccacggtg aatacgttcc

1320

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgcaaaaga agtaggtagc

1380

ttaaccttcg ggagg

1395

<210> 790

<211> 1362

<212> DNA

<213> Enterobacter cowanii

<220>

<221> modified_base

<222> (982)..(983)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 790

ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac ggtaacagga agcagcttgc tgcttgctga

60

cgagtggcgg acgggtgagt aatgtctggg aaactgcctg atggaggggg ataactactg

120

gaaacggtag ctaataccgc ataacgtcgc aagaccaaag agggggacct tcgggcctct

180

tgccatcaga tgtgcccaga tgggattagc tagtaggtgg ggtaacggct cacctaggcg

240

acgatcccta gctggtctga gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga

300

ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat

360

gccgcgtgta tgaagaaggc cttcgggttg taaagtactt tcagcgggga ggaaggcgat

420

gggttaataa ccgcgtcgat tgacgttacc cgcagaagaa gcaccggcta actccgtgcc

480

agcagccgcg gtaatacgga gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgca

540

cgcaggcggt ctgtcaagtc ggatgtgaaa tccccgggct caacctggga actgcatccg

600

aaactggcag gcttgagtct cgtagagggg ggtagaattc caggtgtagc ggtgaaatgc

660

gtagagatct ggaggaatac cggtggcgaa ggcggccccc tggacgaaga ctgacgctca

720

ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga

780

tgtcgacttg gaggttgtgc ccttgaggcg tggcttccgg agctaacgcg ttaagtcgac

840

cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag

900

cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggt cttgacatcc

960

acagaacttt ccagagatgg annggtgcct tcgggaactg tgagacaggt gctgcatggc

1020

tgtcgtcagc tcgtgttgtg aaatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc

1080

ctttgttgcc agcggttagg ccgggaactc aaaggagact gccagtgata aactggagga

1140

aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc cttacgacca gggctacaca cgtgctacaa

1200

tggcgcatac aaagagaagc aatctcgcga gagcaygcgg acctcataaa gtgcgtcgta

1260

gtccggattg gagtctgcaa ctcgactcca tgaagtcgga atcgctagta atcgtgaatc

1320

agaatgtcac ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cg

1362

<210> 791

<211> 943

<212> DNA

<213> Enterobacter hormaechei

<400> 791

gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa

60

gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc

120

atccgaaact ggcaggctag agtcttgtag aggggggtag aattccaggt gtagcggtga

180

aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg gcgaaggcgg ccccctggac aaagactgac

240

gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta

300

aacgatgtcg acttggaggt tgtgcccttg aggcgtggct tccggagcta acgcgttaag

360

tcgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc

420

acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga tgcaacgcga agaaccttac ctactcttga

480

catccagaga acttagcaga gatgctttgg tgccttcggg aactctgaga caggtgctgc

540

atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

600

ttatcctttg ttgccagcga ttcggtcggg aactcaaagg agactgccag tgataaactg

660

gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tggcccttac gagtagggct acacacgtgc

720

tacaatggca tatacaaaga gaagcgacct cgcgagagca agcggacctc ataaagtatg

780

tcgtagtccg gattggagtc tgcaactcga ctccatgaag tcggaatcgc tagtaatcgt

840

ggatcagaat gccacggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat

900

gggagtgggt tgcaaaagaa gtaggtagct taaccttcgg gag

943

<210> 792

<211> 1390

<212> DNA

<213> Enterobacter sp. 247BMC

<400> 792

gcacagagag cttgctctcg ggtgacgagt ggcggacggg tgagtaatgt ctgggaaact

60

gcctgatgga gggggataac tactggaaac ggtagctaat accgcataac gtcgcaagac

120

caaagagggg gaccttcggg cctcttgcca tcagatgtgc ccagatggga ttagctagta

180

ggtggggtaa cggctcacct aggcgacgat ccctagctgg tctgagagga tgaccagcca

240

cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca

300

atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtatgaag aaggccttcg ggttgtaaag

360

tactttcagc ggggaggaag gcgataaggt taataacctt gtccattgac gttacccgca

420

gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggt gcaagcgtta

480

atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtctgt caagtcggat gtgaaatccc

540

cgggctcaac ctgggaactg cattcgaaac tggcaggctg gagtcttgta gaggggggta

600

gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccggt ggcgaaggcg

660

gccccctgga caaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

720

accctggtag tccacgctgt aaacgatgtc gacttggagg ttgttccctt gaggagtggc

780

ttccggagct aacgcgttaa gtcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg ttaaaactca

840

aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg atgcaacgcg

900

aagaacctta cctactcttg acatccagag aacttagcag agatgctttg gtgccttcgg

960

gaactctgat acagtgtgaa atcgccgggc tccagctcgt gttgtgaaat gttgggttaa

1020

gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg gtccggccgg gaactcaaag

1080

gagactgcca gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atggccctta

1140

cgagtagggc tacacacgtg ctacaatggc atatacaaag agaagcgacc tcgcgagagc

1200

aagcggacct cataaagtat gtcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg actccatgaa

1260

gtcggaatcg ctagtaatcg tggatcagaa tgccacggtg aatacgttcc cgggccttgt

1320

acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgcaaaaga agtaggtagc ttaaccttcg

1380

ggagggcgct

1390

<210> 793

<211> 1532

<212> DNA

<213> Enterobacter sp. 638

<400> 793

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc

60

ggtagcacag ggagcttgct cctgggtgac gagcggcgga cgggtgagta atgtctggga

120

aactgcctga tggaggggga taactactgg aaacggtagc taataccgca taacgtcgca

180

agaccaaaga gggggacctt cgggcctctt gccatcagat gtgcccagat gggattagct

240

agtaggtggg gtaatggctc acctaggcga cgatccctag ctggtctgag aggatgacca

300

gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

360

cacaatgggc gcaagcctga tgcagccatg ccgcgtgtat gaagaaggcc ttcgggttgt

420

aaagtacttt cagcgaggag gaaggcattg tggttaataa ccacagtgat tgacgttact

480

cgcagaagaa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga gggtgcaagc

540

gttaatcgga attactgggc gtaaagcgca cgcaggcggt ctgtcaagtc ggatgtgaaa

600

tccccgggct caacctggga actgcattcg aaactggcag gctagagtct tgtagagggg

660

ggtagaattc caggtgtagc ggtgaaatgc gtagagatct ggaggaatac cggtggcgaa

720

ggcggccccc tggacaaaga ctgacgctca ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgtcgacttg gaggttgttc ccttgaggag

840

tggcttccgg agctaacgcg ttaagtcgac cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa

900

ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa

960

cgcgaagaac cttacctact cttgacatcc agagaactta gcagagatgc tttggtgcct

1020

tcgggaactc tgagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgttgtg aaatgttggg

1080

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc ctttgttgcc agcggttcgg ccgggaactc

1140

aaaggagact gccagtgata aactggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc

1200

cttacgagta gggctacaca cgtgctacaa tggcatatac aaagagaagc gacctcgcga

1260

gagcaagcgg acctcacaaa gtatgtcgta gtccggatcg gagtctgcaa ctcgactccg

1320

tgaagtcgga atcgctagta atcgtagatc agaatgctac ggtgaatacg ttcccgggcc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggttgcaa aagaagtagg tagcttaacc

1440

ttcgggaggg cgcttaccac tttgtgattc atgactgggg tgaagtcgta acaaggtaac

1500

cgtaggggaa cctgcggttg gatcacctcc tt

1532

<210> 794

<211> 943

<212> DNA

<213> Enterobacter sp. JC163

<220>

<221> modified_base

<222> (88)..(88)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (126)..(126)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (129)..(129)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (148)..(148)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (233)..(233)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (475)..(476)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (489)..(490)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (494)..(494)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (497)..(498)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (507)..(508)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (511)..(511)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (527)..(527)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (624)..(624)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (628)..(628)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (781)..(781)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (927)..(927)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 794

ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta

60

aagcgcacgc aggcggtctg tcaagtcnga tgtgaaatcc ccgggctcaa cctgggaact

120

gcattngana ctggcaggct ggagtctngt agaggggggt agaattccag gtgtagcggt

180

gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg tggcgaaggc ggccccctgg acnaagactg

240

acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgctg

300

taaacgatgt cgacttggag gttgttccct tgaggagtgg cttccggagc taacgcgtta

360

agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc

420

gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gatgcaacgc gaagaacctt acctnntctt

480

gacatccann gaanttnnca gagatgnntt ngtgccttcg ggaactntga gacaggtgct

540

gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

600

ccttatcctt tgttgccagc grtncggncg ggaactcaaa ggagactgcc agtgataaac

660

tggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catggccctt acgasyaggg ctacacacgt

720

gctacaatgg cryatacaaa gagaagcgac ctcgcgagag caagcggacc tcataaagtr

780

ngtcgtagtc cggattggag tctgcaactc gactccatga agtcggaatc gctagtaatc

840

gtggatcaga atgccacggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc

900

atgggagtgg gttgcaaaag aagtagntag cttaaccttc ggg

943

<210> 795

<211> 920

<212> DNA

<213> Enterobacter sp. SCSS

<220>

<221> modified_base

<222> (59)..(60)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (100)..(102)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (107)..(110)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (124)..(124)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (153)..(153)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (179)..(179)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (216)..(216)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (282)..(282)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (295)..(295)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (300)..(300)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (309)..(309)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (314)..(314)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (319)..(319)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (910)..(911)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 795

aatacggagg gtgcaagcgt taatcggaat tactgggcgt aaagcgcacg caggcggtnn

60

gtcaagtcag atgtgaaatc cccgggctca acctgggaan nngcatnnnn aactggtcag

120

gctngagtct cgtagagggg ggtagaattc cangtgtagc ggtgaaatgc gtagagatnt

180

ggaggaatac cggtggcgaa ggcggccccc tggacnaaga ctgacgctca ggtgcgaaag

240

cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg cngtaaacga tgtcnatttn

300

gaggttgtnc cctngaggng tggcttccgg agctaacgcg ttaaatagac cgcctgggga

360

gtacggccgc aaggttaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca

420

tgtggtttaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggt cttgacatcc acagaacttg

480

gcagagatgc ttgggtgcct tcgggaactg tgagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc

540

tcgtgttgtg aaatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc ctttgttgcc

600

agcggttcgg ccgggaactc aaaggagact gccagtgata aaccggagga aggtggggat

660

gacgtcaagt catcatggcc cttacgacta gggctacaca cgtgctacaa tggcgtatac

720

aaagagaagc gacctcgcga gagcaagcgg acctcataaa gtatgtcgta gtccggattg

780

gagtctgcaa ctcgactcca tgaagtcgga atcgctagta atcgtagatc agaatgccac

840

ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggttgcaa

900

aagaagtagn ntagcttaac

920

<210> 796

<211> 1377

<212> DNA

<213> Enterobacter sp. TSE38

<220>

<221> modified_base

<222> (1357)..(1363)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 796

gcacagagag cttgctctcg ggtgacgagt ggcggacggg tgagtaatgt ctgggaaact

60

gcctgatgga gggggataac tactggaaac ggtagctaat accgcataac gtcgcaagac

120

caaagagggg gaccttcggg cctcttgcca tcagatgtgc ccagatggga ttagctagta

180

ggtggggtaa tggctcacct aggcgacgat ccctagctgg tctgagagga tgaccagcca

240

cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca

300

atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtatgaag aaggccttcg ggttgtaaag

360

tactttcagc ggggaggaag gtgttgtggt taataaccac agcaattgac gttacccgca

420

gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggt gcaagcgtta

480

atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtctgt caagtcggat gtgaaatccc

540

cgggctcaac ctgggaactg cattcgaaac tggcaggcta gagtcttgta gaggggggta

600

gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccggt ggcgaaggcg

660

gccccctgga caaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

720

accctggtag tccacgccgt aaacgatgtc gacttggagg ttgtgccctt gaggcgtggc

780

ttccggagct aacgcgttaa gtcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg ttaaaactca

840

aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg atgcaacgcg

900

aagaacctta cctactcttg actccagaga acttcagaat gattgggcct tcgggaactc

960

tgagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgttgtg aaatgttggg ttaagtcccg

1020

caacgagcgc aacccttatc ctttgttgcc agcggtccgg ccgggaactc aaaggagact

1080

gccagtgata aactggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc cttacgagta

1140

gggctacaca cgtgctacaa tggcgcatac aaagagaagc gaactcgcga gagcaagcgg

1200

acctcataaa gtgcgtcgta gtccggattg gagtctgcaa ctcgactcca tgaagtcgga

1260

atcgctagta atcgtagatc agaatgctac ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1320

cgcccgtcac accatgggag tgggttgcaa aagaagnnnn nnncttaacc ttcggga

1377

<210> 797

<211> 1546

<212> DNA

<213> Enterobacteriaceae bacterium 9_2_54FAA

<400> 797

tttaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgagcg gtagcacaag agagcttgct ctctgggtga cgagcggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtag ctaataccgc

180

atgacgtctt cggaccaaag tgggggacct tcgggcctca cgccatcaga tgtgcccaga

240

tgggattagc tagtaggtgg ggtaatggct cacctaggcg acgatctcta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgta tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagtactt tcagcgagga ggaaggcatt aaggttaata accttggtga

480

ttgacgttac tcgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg ttgattaagt

600

cagatgtgaa atccccgagc ttaacttggg aactgcattt gaaactggtc agctagagtc

660

ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg atgtcgactt ggaggttgtg

840

cccttgaggc gtggcttccg gagctaacgc gttaagtcga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctac tcttgacatc cagagaattt gctagagata

1020

gcttagtgcc ttcgggaact ctgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcgaataa

1140

tgtcgggaac tcaaaggaga ctgccggtga taaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1200

gtcatcatgg cccttacgag tagggctaca cacgtgctac aatggcatat acaaagagaa

1260

gcgaactcgc gagagcaagc ggacctcata aagtatgtcg tagtccggat tggagtctgc

1320

aactcgactc catgaagtcg gaatcgctag taatcgtaga tcagaatgct acggtgaata

1380

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggttgc aaaagaagta

1440

ggtagcttaa ccttcgggag ggcgcttacc actttgtgat tcatgactgg ggtgaagtcg

1500

taacaaggta accgtagggg aacctgcggt tggatcacct ccttac

1546

<210> 798

<211> 1314

<212> DNA

<213> Enterobacteriaceae bacterium CF01Ent-1

<400> 798

tggctcagat tgaacgctgg cggcaggcct aacacatgca agtcgagcga gcggcggacg

60

ggtgagtaat gtctgggaaa ctgcccgatg gagggggata actactggaa acggtagcta

120

ataccgcata accaaagttg ccatcggatg tgcccagatg ggattagcta gtaggtgggg

180

taatggctca cctaggcgac gatccctagc tggtctgaga ggatgaccag ccacactgga

240

actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg

300

caagcctgat gcagccatgc cgcgtgtatg aagaaggcct tcgggttgta aagtactttc

360

agcgaggagg atgacgttac tcgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc

420

ggtaatacgg agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg

480

tctgtcaagt cggatgtgaa atccccgggc tcaacctggg aactgcattc gaaactggca

540

ggctagagtc ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc

600

tggaggaata ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaac tgacgctcag gtgcgaaagc

660

gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gtcgacttgg

720

aggttgtgcg tggcttccgg agctaacgcg ttaagtcgac cgcctgggga gtacggycgc

780

aaggttaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

840

ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctact cttgacatcg acaggtgctg catggctgtc

900

gtcagctcgt gttgtgaaat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt

960

gttgccagcg gccgggaact caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga

1020

tgacgtcaag tcatcatggc ccttacgagt agggctacac acgtgctaca atggcgcaca

1080

aagagaagcg acctcgcgag agcaagcgga cctcattgcg tcgtagtccg gatggagtct

1140

gcaactcgac tccagaagtc ggaatcgcta gtaatcgtag atcagaatgc tacggtgaat

1200

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttg caaaagaagt

1260

aggtgcttag ggcgcttacc actttgtgat tcatgactgg ggtgaagtcg taac

1314

<210> 799

<211> 1485

<212> DNA

<213> Enterobacteriaceae bacterium Smarlab 3302238

<400> 799

tagagtttga tcctggctca gattgaacgc tggcggcagg cctaacacat gcaagtcgaa

60

cggcagcaca gaagagcttg ctctttgggt ggcgagtggc ggacgggtga gtaatgtctg

120

ggaaactgcc cgatggaggg ggataactac tggaaacggt agctaatacc gcataacgtc

180

gcgagaccaa agtgggggac cttcgggcct cacaccatcg gatgtgccca gatgggatta

240

gctagtaggt ggggtaacgg ctcacctagg cgacgatccc tagctggtct gagaggatga

300

ccagccacac tggaactgag acacggtcca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata

360

ttgcacaatg ggcgcaagcc tgatgcagcc atgccgcgtg tatgaagaag gccttcgggt

420

tgtaaagtac tttcagcggg gaggaaggcg atgtggttaa taaccgcgtc gattgacgtt

480

acccgcagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgca

540

agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gcacgcaggc ggtctgtcaa gtcggatgtg

600

aaatccccgg gcttaacctg ggaactgcat tcgaaactgg caggctagag tcttgtagag

660

gggggtagaa ttccaggtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tctggaggaa taccggtggc

720

gaaggcggcc ccctggacaa agactgacgc tcaggtgcga aagcgtgggg agcaaacagg

780

attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgtcgac ttggaggctg ttcccctgag

840

gagtggcttc cggagctaac gcgttaagtc gaccgcctgg ggagtacggc cgcaaggtta

900

aaactcaaat gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg

960

caacgcgaag aaccttacct actcttgaca tccacggaat ttggcagaga tgccttagtg

1020

ccttcgggaa ccgtgagaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtt gtgaaatgtt

1080

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt atcctttgtt gccagcgatt cggtcgggaa

1140

ctcaaaggag actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg

1200

gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggcgca tacaaagaga agcgacctcg

1260

cgagagcaag cggacctcat aaagtgcgtc gtagtccgga tcggagtctg caactcgact

1320

ccgtgaagtc ggaatcgcta gtaatcgtgg atcagaatgc cacggtgaat acgttcccgg

1380

gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttg caaaagaagt aggtagctta

1440

accttcggga gggcgcttac cactttgtga ttcatgactg gggtg

1485

<210> 800

<211> 1403

<212> DNA

<213> Enterococcus avium

<400> 800

tttctttcac cggagcttgc tccaccgaaa gaaaaggagt ggcgaacggg tgagtaacac

60

gtgggtaacc tgcccatcag aaggggataa cacttggaaa caggtgctaa taccgtataa

120

caatcgaaac cgcatggttt cggtttgaaa ggcgcttttg cgtcactgat ggatggaccc

180

gcggtgcatt agctagttgg tgaggtaacg gctcaccaag gcaacgatgc atagccgacc

240

tgagagggtg atcggccaca ttgggactga gacacggccc aaactcctac gggaggcagc

300

agtagggaat cttcggcaat ggacgcaagt ctgaccgagc aacgccgcgt gagtgaagaa

360

ggttttcgga tcgtaaaact ctgttgttag agaagaacaa ggatgagagt agaatgttca

420

tcccttgacg gtatctaacc agaaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtaggtgg caagcgttgt ccggatttat tgggcgtaaa gcgagcgcag gcggtttctt

540

aagtctgatg tgaaagcccc cggctcaacc ggggagggtc attggaaact gggaaacttg

600

agtgcagaag aggagagtgg aattccatgt gtagcggtga aatgcgtaga tatatggagg

660

aacaccagtg gcgaaggcgg ctctctggtc tgtaactgac gctgaggctc gaaagcgtgg

720

ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt gctaagtgtt

780

ggagggtttc cgcccttcag tgctgcagct aacgcattaa gcactccgcc tggggagtac

840

gaccgcaggt tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gacatgtggt

900

ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc aggtcttgac atcctttgac cactctagag

960

atagagcttc cccttcgggg gcaaagtgac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt

1020

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tattgttagt tgccatcatt

1080

tagttgggca ctctagcgag actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca

1140

aatcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtgcta caatgggaag tacaacgagt

1200

cgcgaagtcg cgaggctaag ctaatctctt aaagcttctc tcagttcgga ttgtaggctg

1260

caactcgcct acatgaagcc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc cgcggtgaat

1320

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccgaagt

1380

cggtgaggta accttttgga gcc

1403

<210> 801

<211> 1483

<212> DNA

<213> Enterococcus caccae

<400> 801

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac gcttcttttc taccgagtgc

60

ttgcactcat ttgaaaagag gagtggcgga cgggtgagta acacgtgggt aacctaccca

120

tcagaggggg ataacacttg gaaacaggtg ctaataccgc ataatagtcg acaccgcatg

180

gtgttgattt gaaagacgct ttcgggtgtc actgatggat ggacccgcgg tgcattagct

240

agttggtgag gtaacggctc accaaggcca tgatgcatag ccgacctgag agggtgatcg

300

gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta gggaatcttc

360

ggcaatggac gaaagtctga ccgagcaacg ccgcgtgagt gaagaaggtt ttcggatcgt

420

aaaactctgt tgttagagaa gaacaagtag gagagtaact gctcttacct tgacggtatc

480

taaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta ggtggcaagc

540

gttgtccgga tttattgggc gtaaagcgag cgcaggcggt ttcttaagtc tgatgtgaaa

600

gcccccggct caaccgggga gggtcattgg aaactgggag acttgagtgc agaagaggag

660

agtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat ggaggaacac cagtggcgaa

720

ggcgactctc tggtctgtaa ctgacgctga ggctcgaaag cgtggggagc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa gtgttggagg gtttccgccc

840

ttcagtgctg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg caaggttgaa

900

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca

960

acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ctttgaccac tcgagagatc gagctttccc

1020

ttcggggaca aagtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg

1080

gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat tgttagttgc catcattcag ttgggcactc

1140

tagcgagact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc

1200

cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tgggaagtac aacgagtcgc taggccgcga

1260

ggtcatgcaa atctcttaaa gcttctctca gttcggattg taggctgcaa ctcgcctaca

1320

tgaagccgga atcgctagta atcgcggatc agcacgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac accacgaaag tttgtaacac ccgaagtcgg tgaggtaacc

1440

cttgtggagc cagccgccta aggtgggata gatgattggg gtg

1483

<210> 802

<211> 1559

<212> DNA

<213> Enterococcus casseliflavus

<400> 802

tatgagagtt tgatcctggc tcaggacgaa cgctggcggc gtgcctaata catgcaagtc

60

gaacgctttt tctttcaccg gagcttgctc caccgaaaga aaaagagtgg cgaacgggtg

120

agtaacacgt gggtaacctg cccatcagaa ggggataaca cttggaaaca ggtgctaata

180

ccgtataaca ctattttccg catggaagaa agttgaaagg cgcttttgcg tcactgatgg

240

atggacccgc ggtgcattag ctagttggtg aggtaacggc tcaccaaggc aacgatgcat

300

agccgacctg agagggtgat cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg

360

gaggcagcag tagggaatct tcggcaatgg acgaaagtct gaccgagcaa cgccgcgtga

420

gtgaagaagg ttttcggatc gtaaaactct gttgttagag aagaacaagg atgagagtaa

480

aacgttcatc ccttgacggt atctaaccag aaagccacgg ctaactacgt gccagcagcc

540

gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc gagcgcaggc

600

ggtttcttaa gtctgatgtg aaagcccccg gctcaaccgg ggagggtcat tggaaactgg

660

gagacttgag tgcagaagag gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa tgcgtagata

720

tatggaggaa caccagtggc gaaggcggct ctctggtctg taactgacgc tgaggctcga

780

aagcgtgggg agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgagtgc

840

taagtgttgg agggtttccg cccttcagtg ctgcagcaaa cgcattaagc actccgcctg

900

gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg

960

agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc aggtcttgac atcctttgac

1020

cactctagag atagagcttc cccttcgggg gcaaagtgac aggtggtgca tggttgtcgt

1080

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tattgttagt

1140

tgccatcatt tagttgggca ctctagcgag actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg

1200

gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtgcta caatgggaag

1260

tacaacgagt tgcgaagtcg cgaggctaag ctaatctctt aaagcttctc tcagttcgga

1320

ttgtaggctg caactcgcct acatgaagcc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc

1380

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa

1440

cacccgaagt cggtgaggta acctttttgg agccagccgc ctaaggtggg atagatgatt

1500

ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctttct

1559

<210> 803

<211> 1397

<212> DNA

<213> Enterococcus durans

<400> 803

tcgtacgctt ctttttccac cggagcttgc tccaccggaa aaagaagagt ggcgaacggg

60

tgagtaacac gtgggtaacc tgcccatcag aaggggataa cacttggaaa caggtgctaa

120

taccgtataa caatcgaaac cgcatggttt tgatttgaaa ggcgctttcg ggtgtcgctg

180

atggatggac ccgcggtgca ttagctagtt ggtgaggtaa cggctcacca aggccacgat

240

gcatagccga cctgagaggg tgatcggcca cattgggact gagacacggc ccaaactcct

300

acgggaggca gcagtaggga atcttcggca atggacgaaa gtctgaccga gcaacgccgc

360

gtgagtgaag aaggttttcg gatcgtaaaa ctctgttgtt agagaagaac aaggatgaga

420

gtaactgttc atcccttgac ggtatctaac cagaaagcca cggctaacta cgtgccagca

480

gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgttg tccggattta ttgggcgtaa agcgagcgca

540

ggcggtttct taagtctgat gtgaaagccc ccggctcaac cggggagggt cattggaaac

600

tgggagactt gagtgcagaa gaggagagtg gaattccatg tgtagcggtg aaatgcgtag

660

atatatggag gaacaccagt ggcgaaggcg gctctctggt ctgtaactga cgctgagctc

720

gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt

780

gctaagtgtt ggagggtttc cgcccttcag tgctgcagct aacgcattaa gcactccgcc

840

tggggagtac gaccgcaagg ttgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt

900

ggatcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaaactta ccaggtcttg acatcctttg

960

accactctag agatagagct tccccttcgg gggcaaagtg acaggtggtg catggttgtc

1020

gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttattgtta

1080

gttgccatca ttcagttggg cactctagca agactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg

1140

gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gacctgggct acacacgtgc tacaatggga

1200

agtacaacga gtcgcgaagt cgcgaggcta agctaatctc ttaaagcttc tctcagttcg

1260

gattgtaggc tgcaactcgc ctacatgaag ccggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcac

1320

gccgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagtttgt

1380

aacacccgaa gtcggtg

1397

<210> 804

<211> 1421

<212> DNA

<213> Enterococcus faecalis

<220>

<221> modified_base

<222> (1411)..(1411)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 804

gtcgaacgct tctttcctcc cgagtgcttg cactcaattg gaaagaggag tggcggacgg

60

gtgagtaaca cgtgggtaac ctacccatca gagggggata acacttggaa acaggtgcta

120

ataccgcata acagtttatg ccgcatggca taagagtgaa aggcgctttc gggtgtcgct

180

gatggatgga cccgcggtgc attagctagt tggtgaggta acggctcacc aaggccacga

240

tgcatagccg acctgagagg gtgatcggcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc

300

tacgggaggc agcagtaggg aatcttcggc aatggacgaa agtctgaccg agcaacgccg

360

cgtgagtgaa gaaggttttc ggatcgtaaa actctgttgt tagagaagaa caaggacgtt

420

agtaactgaa cgtcccctga cggtatctaa ccagaaagcc acggctaact acgtgccagc

480

agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgtt gtccggattt attgggcgta aagcgagcgc

540

aggcggtttc ttaagtctga tgtgaaagcc cccggctcaa ccggggaggg tcattggaaa

600

ctgggagact tgagtgcaga agaggagagt ggaattccat gtgtagcggt gaaatgcgta

660

gatatatgga ggaacaccag tggcgaaggc ggctctctgg tctgtaactg acgctgagct

720

cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag

780

tgctaagtgt tggagggttt ccgcccttca gtgctgcagc aaacgcatta agcactccgc

840

ctggggagta cgaccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg

900

tggagcatgt ggcttcagtc gcagtaatac gaagaacctt accaggtctt gacatccttt

960

gaccactcta gagatagagc tttcccttcg gggacaaagt gacaggtggt gcatggttgt

1020

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttattgtt

1080

agttgccatc atttagttgg gcactctagc gagactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt

1140

ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatggg

1200

aagtacaacg agtcgctaga ccgcgaggtc atgcaaatct cttaaagctt ctctcagttc

1260

ggattgcagg ctgcaactcg cctgcatgaa gccggaatcg ctagtaatcg cggatcagca

1320

cgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagtttg

1380

taacacccga agtcggtgag gtaacctttt nggagccagc c

1421

<210> 805

<211> 1422

<212> DNA

<213> Enterococcus faecium

<220>

<221> modified_base

<222> (1411)..(1411)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 805

tcgtacgctt ctttttccac cggagcttgc tccaccggaa aaagaggagt ggcgaacggg

60

tgagtaacac gtgggtaacc tgcccatcag aaggggataa cacttggaaa caggtgctaa

120

taccgtataa caatcgaaac cgcatggttt tgatttgaaa ggcgctttcg ggtgtcgctg

180

atggatggac ccgcggtgca ttagctagtt ggtgaggtaa cggctcacca aggccacgat

240

gcatagccga cctgagaggg tgatcggcca cattgggact gagacacggc ccaaactcct

300

acgggaggca gcagtaggga atcttcggca atggacgaaa gtctgaccga gcaacgccgc

360

gtgagtgaag aaggttttcg gatcgtaaaa ctctgttgtt agagaagaac aaggatgaga

420

gtaactgttc atcccttgac ggtatctaac cagaaagcca cggctaacta cgtgccagca

480

gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgttg tccggattta ttgggcgtaa agcgagcgca

540

ggcggtttct taagtctgat gtgaaagccc ccggctcaac cggggagggt cattggaaac

600

tgggagactt gagtgcagaa gaggagagtg gaattccatg tgtagcggtg aaatgcgtag

660

atatatggag gaacaccagt ggcgaaggcg gctctctggt ctgtaactga cgctgaggct

720

cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag

780

tgctaagtgt tggagggttt ccgcccttca gtgctgcagc taacgcatta agcactccgc

840

ctggggagta cgaccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg

900

tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatccttt

960

gaccactcta gagatagagc ttccccttcg ggggcaaagt gacaggtggt gcatggttgt

1020

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttattgtt

1080

agttgccatc attcagttgg gcactctagc aagactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt

1140

ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatggg

1200

aagtacaacg agttgcgaag tcgcgaggct aagctaatct cttaaagctt ctctcagttc

1260

ggattgcagg ctgcaactcg cctgcatgaa gccggaatcg ctagtaatcg cggatcagca

1320

cgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagtttg

1380

taacacccga agtcggtgag gtaacctttt nggagccagc cg

1422

<210> 806

<211> 1254

<212> DNA

<213> Enterococcus gallinarum

<400> 806

agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgggta acctgcccat cagaagggga taacacttgg

60

aaacaggtgc taataccgta taacgaaagt cactgatgga tggacccgcg gtgcattagc

120

tagttggtga ggtaacggct caccaaggcc acgatgcata gccgacctga gagggtgatc

180

ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

240

cggcaatgga cgaaagtctg accgagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt tttcggatcg

300

taaaactctg ttgttagaga agatgacggt atctaaccag aaagccacgg ctaactacgt

360

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc

420

gagcgcaggc ggtttcttaa gtctgatgtg aaagcccccg gctcaaccgg ggagggtcat

480

tggaaactgg gagacttgag tgcagaagag gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa

540

tgcgtagata tatggaggaa caccagtggc gaaggcggct ctctggtctg actgacgctg

600

aggctcgaaa gcgtggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

660

atgagtgcta agtgttggag cttcagtgct gcagcaaacg cattaagcac tccgcctggg

720

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

780

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

840

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

900

cccttattgt tagttgccat catgggcact ctagcgagac tgccggtgac aaaccggagg

960

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1020

atgggaagca acgagttgcg aagtcgcgag gctaagctaa tctcttcttc tctcagttcg

1080

gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagcc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc

1140

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa

1200

cacccgaagt cggtaggtag ccagccgcct aaggtgggat agatgattgg ggtg

1254

<210> 807

<211> 1295

<212> DNA

<213> Enterococcus gilvus

<400> 807

acgctttttc tttcaccgga gcttgctcca ccgaaagaaa aggagtggcg aacgggtgag

60

taacacgtgg gtaacctgcc catcagaagg ggataacact tggaaacagg tgctaatacc

120

gtataacaat agaaaccgca tggtttctat ttgaaaggcg cttttgcgtc actgatggat

180

ggacccgcgg tgcattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcaa cgatgcatag

240

ccgacctgag agggtgatcg gccacattgg gactgagaca cggcccaaac tcctacggga

300

ggcagcagta gggaatcttc ggcaatggac gaaagtctga ccgagcaacg ccgcgtgagt

360

gaagaaggtt ttcggatcgt aaaactctgt tgttagagaa gaacaaggat gagagtaaaa

420

tgttcatccc ttgacggtat ctgaccagaa agccacggct aactacgtgc cagcagccgc

480

ggtaatacgt aggtggcaag cgttgtccgg atttattggg cgtaaagcga gcgcaggcgg

540

tttcttaagt ctgatgtgaa agcccccggc tcaaccgggg agggtcattg gaaactggga

600

aacttgagtg cagaagagga gagtggaatt ccatgtgtag cggtgaaatg cgtagatata

660

tggaggaaca ccagtggcga aggcggctct ctggtctgta actgacgctg aggctcgaaa

720

gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta

780

agtgttggag ggtttccgcc cttcagtgct gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

840

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

900

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cctttgacca

960

ctctagagat agagcttccc cttcgggggc aaagtgacag gtggtgcatg gttgtcgtca

1020

gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta ttgttagttg

1080

ccatcattta gttgggcact ctagcgagac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga

1140

tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca atgggaagta

1200

caacgagtcg cgaagtcgcg aggctaagct aatctcttaa agcttctctc agttcggatt

1260

gtaggctgca actcgcctac atgaagccgg aatcg

1295

<210> 808

<211> 1295

<212> DNA

<213> Enterococcus hawaiiensis

<400> 808

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta

60

acacgtgggt aacctgccca tcagaagggg ataacacttg gaaacaggtg ctaataccgt

120

ataatgaaag tcactgatgg atggacccgc ggtgcattag ctagttggtg aggtaacggc

180

tcaccaaggc aacgatgcat agccgacctg agagggtgat cggccacatt gggactgaga

240

cacggcccaa actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tcggcaatgg acgaaagtct

300

gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc gtaaaactct gttgttagag

360

aagatgacgg tatctaacca gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtggc aagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag cgagcgcagg cggtttctta

480

agtctgatgt gaaagccccc ggctcaaccg gggagggtca ttggaaactg ggaaacttga

540

gtgcagaaga ggagagtgga attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat atatggagga

600

acaccagtgg cgaaggcggc tctctggtct gactgacgct gaggctcgaa agcgtgggga

660

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aagtgttgga

720

gcttcagtgc tgcagctaac gcattaagca ctccgcctgg ggagtacgac cgcaaggttg

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag

840

caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca tcgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttattg ttagttgcca

960

tcatgggcac tctagcgaga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1020

atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca cacgtgctac aatgggaagc aacgagtcgc

1080

gaagtcgcga ggctaagcta atctcttctt ctctcagttc ggatgtaggc tgcaactcgc

1140

ctacagaagc cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcacg ccgcggtgaa tacgttcccg

1200

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta acacccgaag tcggtaggta

1260

gccagccgcc taaggtggga tagatgattg gggtg

1295

<210> 809

<211> 1395

<212> DNA

<213> Enterococcus hirae

<220>

<221> modified_base

<222> (950)..(950)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 809

gtcgaacgct tctttttcca ccggagcttg ctccaccgga aaaagaggag tggcgaacgg

60

gtgagtaaca cgtgggtaac ctgcccatca gaaggggata acacttggaa acaggtgcta

120

ataccgtata acaatcaaaa ccgcatggtt ttgatttgaa aggcgctttc gggtgtcgct

180

gatggatgga cccgcggtgc attagctagt tggtgaggta acggctcacc aaggccacga

240

tgcatagccg acctgagagg gtgatcggcc acattgggac tgagacacgg cccaaactcc

300

tacgggaggc agcagtaggg aatcttcggc aatggacgaa agtctgaccg agcaacgccg

360

cgtgagtgaa gaaggttttc ggatcgtaaa actctgttgt tagagaagaa caaggatgag

420

agtaactgtt catcccttga cggtatctaa ccagaaagcc acggctaact acgtgccagc

480

agccgcggta atacgtaggg gcacttcgga tttattgggc gtaaagcgag cgcaggcggt

540

ttcttaagtc tgatgtgaaa gcccccggct caaccgggga gggtcattgg aaactgggag

600

acttgagtgc agaagaggag agtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat

660

ggaggaacac cagtggcgaa ggcggctctc tggtctgtaa ctgacgctga ggctcgaaag

720

cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa

780

gtgttggagg gtttccgccc ttcagtgctg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg

840

agtacgaccg caggttgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggacca

900

tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagata gttgccaggc gttgtccgcn ttttactggt

960

ctagagatag agcttcccct tcgggggcaa agtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

1020

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatt gttagttgcc

1080

atcattcagt tgggcactct agcaagactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg

1140

acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat gggaagtaca

1200

acgagtcgcg aagtcgcgag gctaagctaa tctcttaaag cttctctcag ttcggattgc

1260

aggctgcaac tcgcctgcat gaagccggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcacgccgcg

1320

gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc

1380

cgaagtcggt gaggt

1395

<210> 810

<211> 1559

<212> DNA

<213> Enterococcus italicus

<400> 810

ttttatgaga gtttgatcct ggctcaggac gaacgctggc ggcgtgccta atacatgcaa

60

gttgaacgct tctttcttat cgaacttcgg ttcaccaaga aagaagagta gcgaacgggt

120

gagtaacacg tgggtaacct gcccatcagc gggggataac acttggaaac aggtgctaat

180

accgcataat actttttctc tcatgagtga aagttgaaag gcgcttttgc gtcactgatg

240

gatggacccg cggtgcatta gctagttggt agggtaacgg cctaccaagg caacgatgca

300

tagccgacct gagagggtga tcggccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg

360

ggaggcagca gtagggaatc ttcggcaatg gacgaaagtc tgaccgagca acgccgcgtg

420

agtgaagaag gttttcggat cgtaaaactc tgttgttaga gaagaacaag gatgagaaga

480

gaatgttcat cccttgacgg tatctaacca gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc

540

cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag cgagcgcagg

600

cggttcttta agtctgatgt gaaagccccc ggctcaaccg gggagggtca ttggaaactg

660

gggaacttga gtgcagaaga ggagagtgga attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat

720

atatggagga acaccagtgg cgaaggcggc tctctggtct gtaactgacg ctgaggctcg

780

aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg

840

ctaagtgttg gagggtttcc gcccttcagt gctgcagcta acgcattaag cactccgcct

900

ggggagtacg accgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg

960

gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catcctttga

1020

ccactctaga gatagagctt tcccttcggg gacaaagtga caggtggtgc atggttgtcg

1080

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttattgttag

1140

ttgccatcat ttagttgggc actctagcga gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg

1200

ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg acctgggcta cacacgtgct acaatgggaa

1260

gtacaacgag ttgcgaagtc gcgaggctaa gctaatctct taaagcttct ctcagttcgg

1320

attgtaggct gcaactcgcc tacatgaagc cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcacg

1380

ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta

1440

acacccgaag tcggtgaggt aaccttttgg agccagccgc ctaaggtggg atagatgatt

1500

ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctttct

1559

<210> 811

<211> 1529

<212> DNA

<213> Enterococcus mundtii

<400> 811

acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtcgaacg cttcttttcc caccggagct

60

tgctccaccg ggaaaagagg agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgggta acctgcccat

120

cagaagggga taacacttgg aaacaggtgc taataccgta taacaatcga aaccgcatgg

180

tttcgttttg aaaggcgctt tacggtgccg ctgatggatg gacccgcggt gcattagcta

240

gttggtgagg taacggctca ccaaggccac gatgcatagc cgacctgaga gggtgatcgg

300

ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag gcagcagtag ggaatcttcg

360

gcaatggacg aaagtctgac cgagcaacgc cgcgtgagtg aagaaggttt tcggatcgta

420

aaactctgtt gttagagaag aacaagggtg agagtaactg ttcacccctt gacggtatct

480

aaccagaaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtggcaagcg

540

ttgtccggat ttattgggcg taaagcgagc gcaggcggtt tcttaagtct gatgtgaaag

600

cccccggctc aaccggggag ggtcattgga aactgggaga cttgagtgca gaagaggaga

660

gtggaattcc atgtgtagcg gtgaaatgcg tagatatatg gaggaacacc agtggcgaag

720

gcggctctct ggtctgtaac tgacgctgag gctcgaaagc gtggggagca aacaggatta

780

gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctaag tgttggaggg tttccgccct

840

tcagtgctgc agctaacgca ttaagcactc cgcctgggga gtacgaccgc aaggttgaaa

900

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa

960

cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcc tttgaccact ctagagatag agcttcccct

1020

tcgggggcaa agtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg

1080

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatt gttagttgcc atcatttagt tgggcactct

1140

agcaagactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc

1200

ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat gggaagtaca acgagtcgcg aagtcgcgag

1260

gctaagctaa tctcttaaag cttctctcag ttcggattgt aggctgcaac tcgcctacat

1320

gaagccggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcacgccgcg gtgaatacgt tcccgggcct

1380

tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc cgaagtcggt gaggtaacct

1440

ttttggagcc agccgcctaa ggtgggatag atgattgggg tgaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctc

1529

<210> 812

<211> 1396

<212> DNA

<213> Enterococcus raffinosus

<220>

<221> modified_base

<222> (8)..(8)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (13)..(13)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 812

cgaacgcntt ttntttcacc ggagcttgct ccaccgaaag aaaaggagtg gcgaacgggt

60

gagtaacacg tgggtaacct gcccatcaga aggggataac acttggaaac aggtgctaat

120

accgtataac aatagaaacc gcatggtttc tatttgaaag gcgcttttgc gtcactgatg

180

gatggacccg cggtgcatta gctagttggt gaggtaacgg ctcaccaagg caacgatgca

240

tagccgacct gagagggtga tcggccacat tgggactgag acacggccca aactcctacg

300

ggaggcagca gtagggaatc ttcggcaatg gacgaaagtc tgaccgagca acgccgcgtg

360

agtgaagaag gttttcggat cgtaaaactc tgttgttaga gaagaacaag gatgagagta

420

gaatgttcat cccttgacgg tatctaacca gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc

480

cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag cgagcgcagg

540

cggtttctta agtctgatgt gaaagccccc ggctcaaccg gggagggtca ttggaaactg

600

ggaaacttga gtgcagaaga ggagagtgga attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat

660

atatggagga acaccagtgg cgaaggcggc tctctggtct gtaactgacg ctgaggctcg

720

aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg

780

ctaagtgttg gagggtttcc gcccttcagt gctgcagcta acgcattaag cactccgcct

840

ggggagtacg accgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggcg

900

gtaatacgtg ggtggcaagc gttaacgcga agaaccttac caggtcttga catcctttga

960

ccactctaga gatagagctt ccccttcggg ggcaaagtga caggtggtgc atggttgtcg

1020

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttattgttag

1080

ttgccatcat ttagttgggc actctagcga gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg

1140

ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg acctgggcta cacacgtgct acaatgggaa

1200

gtacaacgag tcgcgaagtc gcgaggctaa gctaatctct taaagcttct ctcagttcgg

1260

attgtaggct gcaactcgcc tacatgaagc cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcacg

1320

ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta

1380

acacccgaag tcggtg

1396

<210> 813

<211> 876

<212> DNA

<213> Enterococcus sp. BV2CASA2

<220>

<221> modified_base

<222> (34)..(34)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (41)..(41)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (47)..(47)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (247)..(247)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (850)..(850)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (853)..(853)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 813

atttattggg cgtaaagcga gcgcaggcgg tttnttaagt ntgatgngaa agcccccggc

60

tcaaccgggg agggtcattg gaaactggga gacttgagtg cagaagagga gagtggaatt

120

ccatgtgtag cggtgaaatg cgtagatata tggaggaaca ccagtggcga aggcggctct

180

ctggtctgta actgacgctg aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct

240

ggtagtncac gccgtaaacg atgagtgcta agtgttggag ggtttccgcc cttcagtgct

300

gcagcaaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg

360

aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga

420

accttaccag gtcttgacat cctttgacca ctctagagat agagctttcc cttcggggac

480

aaagtgacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

540

cgcaacgagc gcaaccctta ttgttagttg ccatcattta gttgggcact ctagcgagac

600

tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc

660

tgggctacac acgtgctaca atgggaagta caacgagtcg ctagaccgcg aggtcatgca

720

aatctcttaa agcttctctc agttcggatt gcaggctgca actcgcctgc atgaagccgg

780

aatcgctagt aatcgcggat cagcacgccg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

840

ccgcccgtcn cancacgaga gtttgtaaca cccgaa

876

<210> 814

<211> 1262

<212> DNA

<213> Enterococcus sp. CCRI-16620

<400> 814

gaaaagagga gtggcggacg ggtgagtaac acgtgggtaa cctacccatc agagggggat

60

aacacttgga aacaggtgct aataccgcat aatagtcgac accgcatggt gttgatttga

120

aagacgcttt cgggtgtcac tgatggatgg acccgcggtg cattagctag ttggtgaggt

180

aacggctcac caaggccatg atgcatagcc gacctgagag ggtgatcggc cacactggga

240

ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatcttcgg caatggacga

300

aagtctgacc gagcaacgcc gcgtgagtga agaaggtttt cggatcgtaa aactctgttg

360

ttagagaaga acaagtagga gagtaactgc tcttaccttg acggtatcta accagaaagc

420

cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt tgtccggatt

480

tattgggcgt aaagcgagcg caggcggttt cttaagtctg atgtgaaagc ccccggctca

540

accggggagg gtcattggaa actgggagac ttgagtgcag aagaggagag tggaattcca

600

tgtgtagcgg tgaaatgcgt agatatatgg aggaacacca gtggcgaagg cgactctctg

660

gtctgtaact gacgctgagg ctcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt

720

agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaagt gttggagggt ttccgccctt cagtgctgca

780

gctaacgcat taagcactcc gcctggggag tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat

840

tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc

900

ttaccaggtc ttgacatcct ttgaccactc gagagatcga gctttccctt cggggacaaa

960

gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1020

aacgagcgca acycctattg ttagttgcca tcatttagtt gggcactcta gcgagactgc

1080

cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg

1140

gctacacacg tgctacaatg ggaagtacaa cgagtcgcta ggccgcgagg tcatgcaaat

1200

ctcttaaagc ttctctcagt tcggattgta ggctgcaact cgcctacatg aagccggaat

1260

cg

1262

<210> 815

<211> 1522

<212> DNA

<213> Enterococcus sp. F95

<400> 815

agggtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac

60

gcttctttcc tcccgagtgc ttgcactcaa ttggaaagag gagtggcgga cgggtgagta

120

acacgtgggt aacctaccca tcagaggggg ataacacttg gaaacaggtg ctaataccgc

180

ataacagttt atgccgcatg gcataagagt gaaaggcgct ttcgggtgtc gctgatggat

240

ggacccgcgg tgcattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcca cgatgcatag

300

ccgacctgag agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga

360

ggcagcagta gggaatcttc ggcaatggac gaaagtctga ccgagcaacg ccgcgtgagt

420

gaagaaggtt ttcggatcgt aaaactctgt tgttagagaa gaacaaggac gttagtaact

480

gaacgtcccc tgacggtatc taaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg

540

gtaatacgta ggtggcaagc gttgtccgga tttattgggc gtaaagcgag cgcaggcggt

600

ttcttaagtc tgatgtgaaa gcccccggct caaccgggga gggtcattgg aaactgggag

660

acttgagtgc agaagaggag agtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat

720

ggaggaacac cagtggcgaa ggcggctctc tggtctgtaa ctgacgctga ggctcgaaag

780

cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa

840

gtgttggagg gtttccgccc ttcagtgctg cagcaaacgc attaagcact ccgcctgggg

900

agtacgaccg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc

960

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ctttgaccac

1020

tctagagata gagctttccc ttcggggaca aagtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag

1080

ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat tgttagttgc

1140

catcatttag ttgggcactc tagcgagact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat

1200

gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tgggaagtac

1260

aacgagtcgc tataccgcga ggtcatgcaa atctcttaaa gcttctctca gttcggattg

1320

caggctgcaa ctcgcctgca tgaagccgga atcgctagta atcgcggatc agcacgccgc

1380

ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac

1440

ccgaagtcgg tgaggtaacc tttttggagc cagccgccta aggtgggata gatgattggg

1500

gtgaagtcgt aacaaggtag cc

1522

<210> 816

<211> 1406

<212> DNA

<213> Enterococcus sp. RfL6

<400> 816

tcacttgaaa agaagagtgg cggacggggt gagtaacacg tgggtaacct gccccatcag

60

agggggataa gacttggaaa caggtgctaa taccgcataa tagtcgacac cgcatggtgt

120

tgatttgaaa gacgctttcg ggtgtcactg atggatggac ccgcggtgca ttagctagtt

180

ggtgaggtaa cggctcacca aggccatgat gcatagccga cctgagaggg tgatcggcca

240

cactgggact gagacacggc cagactccta cgggaggcag cagtagggaa tcttcggcaa

300

tggacgaagt ctgaccgagc aacgccgcgt gagtgaagaa ggttttcgga tcgtaaaact

360

ctgttgttag agaagaacaa gtgggagagt aactgctccc gccttgacgg tatctaacca

420

gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttgtc

480

cggatttatt gggcgtaaag cgagcgcagg cggtttctta agtctgatgt gaaagccccc

540

ggctcaaccg gggagggtca ttggaaactg ggagacttga gtgcagaaga ggagagttga

600

attccatgtg tagcgtgaaa tgcgtagata tatggaggaa caccagtggc gaaggcgact

660

ctctggtctg taactgacgc tgaggctcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc

720

ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgagtgc taagtgttgg agggtttccg cccttcagtg

780

ctgcagctaa cgcattaagc actccgcctg gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa

840

ggaattkacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgga

900

gaaccttacc aggtcttgac atcctttgac cactctagag atagagcttt cccttcgggg

960

acaaagtgac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1020

cccgcaacga gcgcaaccct tattgttagt tgccatcatt cagttgggca ctctagcgag

1080

actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga

1140

cctgggctac acacgtgcta caatgggaag tacaacgagt cgctaggccg cgaggtcatg

1200

caaatctctt aaagcttctc tcagttcgga ttgtaggctg caactcgcct acatgaagcc

1260

ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca

1320

caccgcccgt cacaccacga aagtttgtaa cacccgaagt cggtgaggta accttttgga

1380

gccagccgcc taaggtggga tagatg

1406

<210> 817

<211> 1295

<212> DNA

<213> Enterococcus thailandicus

<400> 817

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgtac gagtggcgaa cgggtgagta

60

acacgtgggt aacctgccca tcagaagggg ataacacttg gaaacaggtg ctaataccgt

120

ataacgaaag tcgctgatgg atggacccgc ggtgcattag ctagttggtg aggtaacggc

180

tcaccaaggc cacgatgcat agccgacctg agagggtgat cggccacatt gggactgaga

240

cacggcccaa actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tcggcaatgg acgaaagtct

300

gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc gtaaaactct gttgttagag

360

aagatgacgg tatctaacca gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtggc aagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag cgagcgcagg cggtttctta

480

agtctgatgt gaaagccccc ggctcaaccg gggagggtca ttggaaactg ggagacttga

540

gtgcagaaga ggagagtgga attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat atatggagga

600

acaccagtgg cgaaggcgac tctctggtct gactgacgct gaggctcgaa agcgtgggga

660

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aagtgttgga

720

gcttcagtgc tgcagctaac gcattaagca ctccgcctgg ggagtacgac cgcaaggttg

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag

840

caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca tcgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttattg ttagttgcca

960

tcatgggcac tctagcaaga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1020

atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca cacgtgctac aatgggaagc aacgagtcgc

1080

gaagtcgcga ggctaagcta atctcttctt ctctcagttc ggatgtaggc tgcaactcgc

1140

ctacagaagc cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcacg ccgcggtgaa tacgttcccg

1200

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg aaagtttgta acacccgaag tcggtaggta

1260

gccagccgcc taaggtggga tagatgattg gggtg

1295

<210> 818

<211> 1543

<212> DNA

<213> Eremococcus coleocola

<400> 818

atgagagttt gatcctggct caggacgaac gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg

60

aacgcactga cggagaactt gttctcttaa cgtgagtggc ggacgggtga gtaacacgtg

120

ggaaacctac ccttgagcgg gggataacgg tcggaaacga tcgctaatac cgcataacag

180

caatcatcgc ctgatggttg attgaaagat ggctctgcta tcactcaagg atgggcccgc

240

ggtgcattag ctagttggta aggtaacggc ttaccaaggc catgatgcat agccgacctg

300

agagggtaat cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg gaggcagcag

360

tagggaatct tccgcaatgg acgcaagtct gacggagcaa cgccgcgtgt gtgaagaagg

420

ttttcggatc gtaaagcact gttattagcc aagaacaccc ctagtagtaa ctggctaggg

480

attgacggta actaatcaga aagccacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

taggtggcaa gcgttgtccg gatttattgg gcgtaaaggg agcgcaggcg gtgacttaag

600

tctgatgtga aagcccacgg cttaaccgtg gagggtcatt ggaaactggg tcacttgagt

660

acagaagagg aaagcggaat tccatgtgta gcggtgaaat gcgtagatat atggaggaac

720

accagtggcg aaggcggctt tctggtctga tactgacgct gaggctcgaa agcgtgggga

780

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aagtgttgga

840

gggtttccac ccttcagtgc tggcgttaac gcaataagca ctccgcctgg ggagtacggt

900

cgcaagactg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

960

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca tcctatgacc actctagaga

1020

tagagtttct cttcggagca tagagacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat aactagttgc cagcattcag

1140

atggggactc tagttagact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1200

catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggacgatac aacgagcagc

1260

aaactcgcga gggcaagcga atctcttaaa gtcgttctca gttcggattg caggctgcaa

1320

ctcgcctgca tgaagccgga atcgctagta atcgtggatc agcacgccac ggtgaatccg

1380

ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccgaagccgg

1440

tggcctaacc tatgagggag ccgtcgaagg tgggatagat gattggggtg aagtcgtaac

1500

aaggtagccg tatcggaagg tgcggctgga tcacctcctt tct

1543

<210> 819

<211> 1504

<212> DNA

<213> Erysipelothrix inopinata

<400> 819

ggctcaggat gaacgctggc ggcgtgccta atacatgcaa gtcgaacgaa gttcgaaact

60

agcttgctag attcgaaact tagtggcgaa cgggtgagta atacataagc aacctgcctc

120

tatgcctggg ataacagatg gaaacgtctg ctaataccgg atacgttaat cgaagacatc

180

ttcgattaat taaagttggg atacaacaca aagagatggg cttatggcgc attagttagt

240

tggtgaggta acggctcacc aagacgatga tgcgtagccg acctgagagg gtgaccggcc

300

acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtaggg aattttcggc

360

aatgggggaa accctgaccg agcaacgccg cgtgagtgaa gaaggccttc gggttgtaaa

420

gctctgttgt aagggaagaa caagtatgag agggaatgct cgtactatga cggtacctta

480

ccagaaagcc acggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt ggcgagcgtt

540

atccggaatt attgggcgta aagggagcgc aggcggttta ttaagtttat ggtgaaagtt

600

cggggcttaa ccccgtgatg ccatagaaac tggtagacta gagtgcagga gaggttagtg

660

gaattccatg tgtagcggta aaatgcgtag atatatggag gaacaccagt ggcgaaggcg

720

gctaactggc ctgtaactga cgctgaggct cgaaagcgtg gggagcaaat aggattagat

780

accctagtag tccacgccgt aaacgatgga tactaagtgt tggatagaat tcagtgctgt

840

agttaacgca ataagtatcc cgcctgggga gtatgcgcgc aagcgtaaaa ctcaaaggaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cggtggagta tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac

960

cttaccaggt cttgacatac cgcgcaaaag catagagata tgtaatagtt atggcggata

1020

caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc ttgtcttcag ttaccatcat taagttgggg actctggaga gactgccggt

1140

gataaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg atctgggcta

1200

cacacgtact acaatggcgt atacagaggg aagcgaagca gtgatgtgga gcgaatctca

1260

gaaagtacgt ctcagttcgg attggagtct gcaactcgac tccatgaagt cggaatcgct

1320

agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttctcg ggccttgtac acaccgcccg

1380

tcaaaccatg agagttggta atacccgaag ccggtggcct aaccctgtaa agggagggag

1440

ccgtcgaagg taggaccgat gattggggtt aagtcgtaac aaggtatccc taccggaagg

1500

tggg

1504

<210> 820

<211> 1545

<212> DNA

<213> Erysipelothrix rhusiopathiae

<400> 820

aaatggagag tttgatcctg gctcaggatg aacgctggcg gcgtgcctaa tacatgcaag

60

tcgaacgaag tgaagaggag cttgctcctt ggaacttagt ggcgaacggg tgagtaatac

120

ataagcaacc tgcctcgatg cctgggataa cagagggaaa cttctgctaa taccggatac

180

gttaatctaa gacatcttag attaattaaa gatgggatac atcacaacga gatgggctta

240

tggcgcatta gttagttggt aaggtaacgg cttaccaaga cgatgatgcg tagccgacct

300

gagagggtga ccggccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca

360

gtagggaatt ttcggcaatg ggggaaaccc tgaccgagca acgccgcgtg agtgaagacg

420

gccttcgggt tgtaaagctc tgttgtaagg gaagaacgat aggaagaggg aatgcttctt

480

atatgacggt accttaccag aaagccacgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

540

gtaggtggca agcgttatcc ggaattattg ggcgtaaagg gagcgcaggc ggtttatcaa

600

gtttatggtt aaagttcggg gcttaacccc gtgatgccat agaaactggt agactagagt

660

gcaggagagg ttagtggaat tccatgtgta gcggtaaaat gcgtagatat atggaggaac

720

accagtggcg aaggcggcta actggcctgt aactgacgct gaggctcgaa agcgtgggga

780

gcaaatagga ttagataccc tagtagtcca cgccgtaaac gatggatact aagtgttgga

840

gaaattcagt gctgtagtta acgcaataag tatcccgcct ggggagtatg cgcgcaagcg

900

taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagtatgtgg tttaattcga

960

agcaacgcga agaaccttac caggtcttga cataccgcgc aaaagcacag agatgtgtaa

1020

tagttatggc ggatacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg

1080

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc tttagttacc agcattaagt tggggactct

1140

aaagagactg ccggtgataa accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc

1200

ttatgatctg ggctacacac gtactacaat ggcgtataca gagggcagcg aagcagcgat

1260

gcggagcgaa tctcagaaag tacgtctcag ttcggattgg agtctgcaac tcgactccat

1320

gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcggatca gaatgccgcg gtgaatacgt tctcgggcct

1380

tgtacacacc gcccgtcaaa ccatgagagt tggtaatacc cgaagccggt ggcctaacct

1440

agtttactag gagggagccg tcgaaggtag gatcgatgat tggggttaag tcgtaacaag

1500

gtatccctac cggaaggtgg ggatggatca cctcctttct aagga

1545

<210> 821

<211> 1479

<212> DNA

<213> Erysipelothrix tonsillarum

<400> 821

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac

60

gaagtgaaga ggagcttgct ccttggaact tagtggcgaa cgggtgagta atacataagc

120

aacctgcctc gatgcctggg ataacagagg gaaacttctg ctaataccgg atacgttaat

180

ctaagacatc ttagattaat taaagatggg atacatcaca acgagatggg cttatggcgc

240

attagttagt tggtaaggta acggcttacc aagacgatga tgcgtagccg acctgagagg

300

gtgaccggcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtaggg

360

aattttcggc aatgggggaa accctgaccg agcaacgccg cgtgagtgaa gacggcctta

420

gggttgtaaa gctctgttgt aagggaagaa caataagaag agggaatgct tcttatatga

480

cggtacctta ccagaaagcc acggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt

540

ggcaagcgtt atccggaatt attgggcgta aagggagcgc aggcggttta tcaagtttat

600

ggttaaagtt cggggcttaa ccccgtgatg ccatagaaac tggtagacta gagtgcagga

660

gaggttagtg gaattccatg tgtagcggta aaatgcgtag atatatggag gaacaccagt

720

ggcgaaggcg gctaactggc ctgtaactga cgctgaggct cgaaagcgtg gggagcaaat

780

aggattagat accctagtag tccacgccgt aaacgatgga tactaagtgt tggagaaatt

840

cagtgctgta gttaacgcaa taagtatccc gcctggggag tatgcgcgca agcgtaaaac

900

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagtat gtggtttaat tcgaagcaac

960

gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatacc gcgcaaaagc acagagatgt gtaatagtta

1020

tggcggatac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaaccct tgtctttagt taccagcatt aagttgggga ctctaaagag

1140

actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga

1200

tctgggctac acacgtacta caatggcgta tacagagggc agcgaagcag cgatgcggag

1260

cgaatctcag aaagtacgtc tcagttcgga ttggagtctg caactcgact ccatgaagtc

1320

ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagaatgc cgcggtgaat acgttctcgg gccttgtaca

1380

caccgcccgt caaaccatga gagttggtaa tacccgaagc cggtggccta acctagttta

1440

ctaggaggga gccgtcgaag gtaggatcga tgattgggg

1479

<210> 822

<211> 1387

<212> DNA

<213> Erysipelotrichaceae bacterium 3_1_53

<220>

<221> modified_base

<222> (935)..(936)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1381)..(1381)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 822

tctctaggaa gcttgcttcc aaagagactt agtggcgaac gggtgagtaa cacgtaggta

60

acctgcccat gtgtctggga taactgctgg aaacggtagc taaaaccgga taggtatacg

120

gagcgcatgc tctgtatatt aaagcaccct tcaaggtgtg aacatggatg gacctgcggc

180

gcattagcta gttggtgagg taacggccca ccaaggcgat gatgcgtagc cggcctgaga

240

gggtaaacgg ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag gcagcagtag

300

ggaattttcg tcaatggggg gaaccctgaa cgagcaatgc cgcgtgagtg aagaaggtct

360

tcggatcgta aagctctgtt gtaagtgaag aacggctcat aggaaatgct atgggagtga

420

ggtagcttac cagaaagcca cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg

480

gcaagcgtta tccggaatca ttgggcgtaa agggtgcgta ggtggcgtac taagtctgta

540

gtaaaaggca atggtcaacc attgtaagct atggaaactg gtaggctaga gtgcagaaga

600

gggcgatgga attccatgtg tagcggtaaa atgcgtagat atatggagga acaccagtgg

660

cgaaggcggt cgcctggtct gtaactgaca ctgaggcacg aaagcgtggg gagcaaatag

720

gattagatac cctagtagtc cacgccgtaa acgatgagaa ctaagtgttg gaggaattca

780

gtgctgcagt taacgcaata agttctccgc ctggggagta tgcacgcaag tgtgaaactc

840

aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagtatgt ggtttaattc gaagcaacgc

900

gaagaacctt accaggcctt gacatggaaa caaannccct agagataggg agataaatat

960

ggatcacaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc

1020

ccgcaacgag cgcaaccctt gtcgcatgtt accagcatca agttggggac tcatgcgaga

1080

ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatggc

1140

ctgggctaca cacgtactac aatggcgacc acaaagagca gcgacttggt gacaagaagc

1200

gaatctcata aaggccgtct cagttcggat tgaagtctgc aactcgactt catgaagtcg

1260

gaatcgctag taatcgcaga tcagcatgct gcggtgaata cgttctcggg ccttgtacac

1320

accgcccgtc aaaccatggg agtcagtaat acccgaagcc ggtggcataa ccgtaaggag

1380

ngagccg

1387

<210> 823

<211> 1357

<212> DNA

<213> Erysipelotrichaceae bacterium 5_2_54FAA

<220>

<221> modified_base

<222> (14)..(14)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1311)..(1312)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 823

tccaaagaga cttngtgggg aacgggtgag taacacgtag gtaacctgcc catgtgcccg

60

ggataactgc tggaaacggt agctaaaacc ggataggtat gagggaggca tcttcctcat

120

attaaagcac cttcgggtgt gaacatggat ggacctgcgg cgcattagct ggttggtgag

180

gtaacggccc accaaggcga tgatgcgtag ccgacctgag agggtgaacg gccacattgg

240

gactgagaca cggcccaaac tcctacggga ggcagcagta gggaattttc gtcaatgggg

300

ggaaccctga acgagcaatg ccgcgtgtgt gaagaaggtc ttcggatcgt aaagcactgt

360

tgtaagtgaa gaatgccata tagaggaaat gctatgtggg tgacggagct taccagaaag

420

ccacggtaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt tatccggaat

480

cattgggcgt aaagggtgcg taggtggcac gataagtctg aagtaaaagg caacagctca

540

actgttgtat gctttggaaa ctgtcgagct agagtgcaga agagggcgat ggaattccat

600

gtgtagcggt aaaatgcgta gatatatgga ggaacaccag tggcgaaggc ggtcgcctgg

660

tctgtaactg acactgatgc acgaaagcgt ggggagcaaa taggattaga taccctagta

720

gtccacgccg taaacgatga gaactaagtg ttggagagat tcagtgctgc agttaacgca

780

ataagttctc cgcctgggga gtatgcacgc aagtgtgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg

840

cccgcacaag cggtggagta tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggc

900

cttgacatgt atataaatga tctagaaata gaaagatagc tatatatcac acaggtggtg

960

catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

1020

cttgtcttct gttaccagca ttaagttggg gactcaggag agactgccgg tgacaaaccg

1080

gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat ggcctgggct acacacgtac

1140

tacaatggcg cctacaaaga gcagcgacac cgcgaggtgg agcgaatctc ataaagggcg

1200

tctcagttcg gattgaagtc tgcaactcga cttcatgaag tcggaatcgc tagtaatcgc

1260

agatcagcat gctgcggtga atacgttctc gggccttgta cacaccgccc nncaaaccat

1320

gggagttggt aatacccgaa gccggtggca taaccgc

1357

<210> 824

<211> 1545

<212> DNA

<213> Escherichia albertii

<400> 824

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacaggaa acagcttgct gtttcgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg aaactgcccg atggaggggg ataactactg gaaacggtag ctaataccgc

180

ataacgtcgc aagaccaaag agggggacct tagggcctct tgccatcgga tgtgcccaga

240

tgggattagc ttgttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgta tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagtactt tcagcgggga ggaagggagt aaagttaata cctttgctca

480

ttgacgttac ccgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg ttgattaagt

600

cagatgtgaa atccccgggc tcaacctggg aactgcatct gatactggtc agcttgagtc

660

tcgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacgaag actgacgctc atgtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtcgactt ggaggttgtg

840

cccttgaggc gtggcttccg gagctaacgc gttaagtcga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc cacggaagtt ttcagagatg

1020

agaatgtgcc ttcgggaacc gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcggtccg

1140

gccgggaact caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgacc agggctacac acgtgctaca atggcgcata caaagagaag

1260

cgacctcgcg agagcaagcg gacctcataa agtgcgtcgt agtccggatt ggagtctgca

1320

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtggat cagaatgcca cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca aaagaagtag

1440

gtagcttaac cttcgggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttac

1545

<210> 825

<211> 1403

<212> DNA

<213> Escherichia coli

<220>

<221> modified_base

<222> (20)..(20)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 825

gtcgaacggt aacaggaagn cagcttgctg ctttgctgac gagtggcgga cgggtgagta

60

atgtctggga aactgcctga tggaggggga taactactgg aaacggtagc taataccgca

120

taacgtcgca agaccaaaga gggggacctt cgggcctctt gccatcggat gtgcccagat

180

gggattagct agtaggtggg gtaaaggctc acctaggcga cgatccctag ctggtctgag

240

aggatgacca gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg

300

gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagccatg ccgcgtgtat gaagaaggcc

360

ttcgggttgt aaagtacttt cagcggggag gaagggagta aagttaatac ctttgctcat

420

tgacgttacc cgcagaagaa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga

480

gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgca cgcaggcggt ttgttaagtc

540

agatgtgaaa tccccgggct caacctggga actgcatctg atactggcaa gcttgagtct

600

cgtagagggg ggtagaattc caggtgtagc ggtgaaatgc gtagagatct ggaggaatac

660

cggtggcgaa ggcggccccc tggacgaaga ctgacgctca gtgcgaaagc gtggggagca

720

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gtcgacttgg aggttgtgcc

780

cttgaggcgt ggcttcggag ctaacgcgtt aagtcgaccg cctggggagt acggccgcaa

840

ggttaaaact caaatgaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

900

cgatgcaacg cgaagaacct tacctggtct tgacatccac ggaagttttc agagatgaga

960

atgtgccttc gggaaccgtg agacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgttgtgaa

1020

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcct ttgttgccag cggtccggcc

1080

gggaactcaa aggagactgc cagtgataaa ctggaggaag gtggggatga cgtcaagtca

1140

tcatggccct tacgaccagg gctacacacg tgctacaatg gcgcatacaa agagaagcga

1200

cctcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt gcgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact

1260

cgactccatg aagtcggaat cgctagtaat cgtggatcag aatgccacgg tgaatacgtt

1320

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta

1380

gcttaacctt cgggagggcg cta

1403

<210> 826

<211> 1395

<212> DNA

<213> Escherichia fergusonii

<220>

<221> modified_base

<222> (14)..(16)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 826

tcgaacggta acannnagca gcttgctgct ttgctgacga gtggcggacg ggtgagtaat

60

gtctgggaaa ctgcctgatg gagggggata actactggaa acggtagcta ataccgcata

120

acgtcgcaag accaaagagg gggaccttcg ggcctcttgc catcggatgt gcccagatgg

180

gattagcttg taggtggggt aacggctcac ctaggcgacg atccctagct ggtctgagag

240

gatgaccagc cacactggaa ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtggg

300

gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagccatgcc gcgtgtatga agaaggcctt

360

cgggttgtaa agtactttca gcggggagga agggagtaaa gttaatacct ttgctcattg

420

acgttacccg cagaagaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

480

gtgcaagcgt taatcggaat tactgggcgt aaagcgcacg caggcggttt gttaagtcag

540

atgtgaaatc cccgggctca acctgggaac tgcatctgat actggcaagc ttgagtctcg

600

tagagggggg tagaattcca ggtgtagcgg tgaaatgcgt agagatctgg aggaataccg

660

gtggcgaagg cggccccctg gacgaagact gacgctcagg tgcgaaagcg tggggagcaa

720

acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg tcgacttgga ggttgtgccc

780

ttgaggcgtg gcttccggag ctaacgcgtt aagtcgaccg cctggggagt acggccgcaa

840

ggttaaaact caaatgaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

900

cgatgcaacg cgaaaaacct tacctggtct tgacatccac agaactttcc agagatggat

960

gcgtaacgtg caggaaggcg gtttgtgaag tcagatgctg tcgtcagctc gtgttgtgaa

1020

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcct ttgttgccag cggtccggcc

1080

gggaactcaa aggagactgc cagtgataaa ctggaggaag gtggggatga cgtcaagtca

1140

tcatggccct tacgaccagg gctacacacg tgctacaatg gcgcatacaa agagaagcga

1200

cctcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt gcgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact

1260

cgactccatg aagtcggaat cgctagtaat cgtggatcag aatgccacgg tgaatacgtt

1320

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta

1380

gcttaacctt cggga

1395

<210> 827

<211> 1517

<212> DNA

<213> Escherichia hermannii

<400> 827

ctccagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc

60

gaacggtaac aggaagcagc ttgctgcttc gctgacgagt ggcggacggg tgagtaatgt

120

ctgggaaact gcctgatgga gggggataac tactggaaac ggtagctaat accgcataac

180

gtcgcaagac caaagagggg gaccttcggg cctcttgcca tcagatgtgc ccagatggga

240

ttagctagta ggtggggtaa cggctcacct aggcgacgat ccctagctgg tctgagagga

300

tgaccagcca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga

360

atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtatgaag aaggccttcg

420

ggttgtaaag tactttcagc ggggaggaag gcgatgcggt taataaccgc gtcgattgac

480

gttacccgca gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggt

540

gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtctgt caagtcggat

600

gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg catccgaaac tggcaggctt gagtctcgta

660

gaggggggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccggt

720

ggcgaaggcg gccccctgga cgaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac

780

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgtc gacttggagg ttgtgccctt

840

gaggcgtggc ttccggagct aacgcgttaa gtcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg

900

ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

960

atgcaacgcg aagaacctta cctggtcttg acatccacag aactttccag agatggattg

1020

gtgccttcgg gaactgtgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gttgtgaaat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg gttaggccgg

1140

gaactcaaag gagactgcca gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc

1200

atggccctta cgaccagggc tacacacgtg ctacaatggc gcatacaaag agaagcaatc

1260

tcgcgagagc tagcggacct cataaagtgc gtcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg

1320

actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg tgaatcagaa tgtcacggtg aatacgttcc

1380

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgcaaaaga agtaggtagc

1440

ttaaccttcg ggagggcgct taccactttg tgattcatga ctggggtgaa gtcgtaacaa

1500

ggtaaccgta ggggaac

1517

<210> 828

<211> 1542

<212> DNA

<213> Escherichia sp. 1_1_43

<400> 828

aaattgaaga gtttgatcat ggctcagatt gaacgctggc ggcaggccta acacatgcaa

60

gtcgaacggt aacaggaaac agcttgctgt ttcgctgacg agtggcggac gggtgagtaa

120

tgtctgggaa actgcctgat ggagggggat aactactgga aacggtagct aataccgcat

180

aacgtcgcaa gaccaaagag ggggaccttc gggcctcttg ccatcggatg tgcccagatg

240

ggattagcta gtaggtgggg taacggctca cctaggcgac gatccctagc tggtctgaga

300

ggatgaccag ccacactgga actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg

360

ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat gcagccatgc cgcgtgtatg aagaaggcct

420

tcgggttgta aagtactttc agcggggagg aagggagtaa agttaatacc tttgctcatt

480

gacgttaccc gcagaagaag caccggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag

540

ggtgcaagcg ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgcac gcaggcggtt tgttaagtca

600

gatgtgaaat ccccgggctc aacctgggaa ctgcatctga tactggcaag cttgagtctc

660

gtagaggggg gtagaattcc aggtgtagcg gtgaaatgcg tagagatctg gaggaatacc

720

ggtggcgaag gcggccccct ggacgaagac tgacgctcag gtgcgaaagc gtggggagca

780

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gtcgacttgg aggttgtgcc

840

cttgaggcgt ggcttccgga gctaacgcgt taagtcgacc gcctggggag tacggccgca

900

aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctggtc ttgacatcca cggaagtttt cagagatgag

1020

aatgtgcctt cgggaaccgt gagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgttgtga

1080

aatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttatcc tttgttgcca gcggtccggc

1140

cgggaactca aaggagactg ccagtgataa actggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

atcatggccc ttacgaccag ggctacacac gtgctacaat ggcgcataca aagagaagcg

1260

acctcgcgag agcaagcgga cctcataaag tgcgtcgtag tccggattgg agtctgcaac

1320

tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgtggatca gaatgccacg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgcaaa agaagtaggt

1440

agcttaacct tcgggagggc gcttaccact ttgtgattca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtaacc gtaggggaac ctgcggttgg atcacctcct ta

1542

<210> 829

<211> 1530

<212> DNA

<213> Escherichia sp. 4_1_40B

<400> 829

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac

60

ggtaacagga aacagcttgc tgtttcgctg acgagtggcg gacgggtgag taatgtctgg

120

gaaactgcct gatggagggg gataactact ggaaacggta gctaataccg cataacgtcg

180

caagaccaaa gagggggacc ttcgggcctc ttgccatcgg atgtgcccag atgggattag

240

ctagtaggtg gggtaacggc tcacctaggc gacgatccct agctggtctg agaggatgac

300

cagccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcca tgccgcgtgt atgaagaagg ccttcgggtt

420

gtaaagtact ttcagcgggg aggaagggag taaagttaat acctttgctc attgacgtta

480

cccgcagaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa

540

gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg cacgcaggcg gtttgttaag tcagatgtga

600

aatccccggg ctcaacctgg gaactgcatc tgatactggc aagcttgagt ctcgtagagg

660

ggggtagaat tccaggtgta gcggtgaaat gcgtagagat ctggaggaat accggtggcg

720

aaggcggccc cctggacgaa gactgacgct caggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgtcgact tggaggttgt gcccttgagg

840

cgtggcttcc ggagctaacg cgttaagtcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

900

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

960

aacgcgaaga accttacctg gtcttgacat ccacggaagt tttcagagat gagaatgtgc

1020

cttcgggaac cgtgagacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta tcctttgttg ccagcggtcc ggccgggaac

1140

tcaaaggaga ctgccagtga taaactggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgg

1200

cccttacgac cagggctaca cacgtgctac aatggcgcat acaaagagaa gcgacctcgc

1260

gagagcaagc ggacctcata aagtgcgtcg tagtccggat tggagtctgc aactcgactc

1320

catgaagtcg gaatcgctag taatcgtgga tcagaatgcc acggtgaata cgttcccggg

1380

ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggttgc aaaagaagta ggtagcttaa

1440

ccttcgggag ggcgcttacc actttgtgat tcatgactgg ggtgaagtcg taacaaggta

1500

accgtagggg aacctgcggt tggatcacct

1530

<210> 830

<211> 1334

<212> DNA

<213> Escherichia sp. B4

<400> 830

gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcggac gggtgagtaa tgtctgggaa actgcctgat ggagggggat aactactgga

120

aacggtagct aataccgcat aaccaaagtt gccatcggat gtgcccagat gggattagct

180

agtaggtggg gtaacggctc acctaggcga cgatccctag ctggtctgag aggatgacca

240

gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

300

cacaatgggc gcaagcctga tgcagccatg ccgcgtgtat gaagaaggcc ttcgggttgt

360

aaagtacttt cagcggggag gatgacgtta cccgcagaag aagcaccggc taactccgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg

480

cacgcaggcg gtttgttaag tcagatgtga aatccccggg ctcaacctgg gaactgcatc

540

tgatactggc aagcttgagt ctcgtagagg ggggtagaat tccaggtgta gcggtgaaat

600

gcgtagagat ctggaggaat accggtggcg aaggcggccc cctggacgaa ctgacgctca

660

ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga

720

tgtcgacttg gaggttgtgc gtggcttccg gagctaacgc gttaagtcga ccgcctgggg

780

agtacggccg caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc

840

atgtggttta attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc gacaggtgct

900

gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccttatcctt tgttgccagc ggccgggaac tcaaaggaga ctgccagtga taaactggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgg cccttacgac cagggctaca cacgtgctac

1080

aatggcgcac aaagagaagc gaactcgcga gagcaagcgg acctcattgc gtcgtagtcc

1140

ggatggagtc tgcaactcga ctccagaagt cggaatcgct agtaatcgtg gatcagaatg

1200

ccacggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt

1260

gcaaaagaag taggtgctta gggcgcttac cactttgtga ttcatgactg gggtgaagtc

1320

gtaacaaggt aacc

1334

<210> 831

<211> 1397

<212> DNA

<213> Escherichia vulneris

<400> 831

agtcgaacgg tagcacagag agcttgctct cgggtgacga gtggcggacg ggtgagtaat

60

gtctgggaaa ctgcctgatg gagggggata actactggaa acggtagcta ataccgcata

120

acgtcgcaag accaaagagg gggaccttcg ggcctcttgc catcagatgt gcccagatgg

180

gattagctag taggtggggt aacggctcac ctaggcgacg atccctagct ggtctgagag

240

gatgaccagc cacactggaa ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtggg

300

gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagccatgcc gcgtgtatga agaaggcctt

360

cgggttgtaa agtactttca gcggggagga aggcgataag gttaataacc ttgtcgattg

420

acgttacccg cagaagaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

480

gtgcaagcgt taatcggaat tactgggcgt aaagcgcacg caggcggtct gtcaagtcgg

540

atgtgaaatc cccgggctca acctgggaac tgcattcgaa actggcaggc tggagtcttg

600

tagagggggg tagaattcca ggtgtagcgg tgaaatgcgt agagatctgg aggaataccg

660

gtggcgaagg cggccccctg gacaaagact gacgctcagg tgcgaaagcg tggggagcaa

720

acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacgatg tcgacttgga ggttgttccc

780

ttgaggagtg gcttccggag ctaacgcgtt aagtcgaccg cctggggagt acggccgcaa

840

ggttaaaact caaatgaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

900

cgatgcaacg cgaagaacct tacctactct tgacatccag agaacttagc agagatgctt

960

tggtgccttc gggacgcacg caggcggtct gtcaagtcgg atgtcagctc gtgttgtgaa

1020

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcct ttgttgccag cggtccggcc

1080

gggaactcaa aggagactgc cagtgataaa ctggaggaag gtggggatga cgtcaagtca

1140

tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga

1200

cctcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact

1260

cgactccatg aagtcggaat cgctagtaat cgtggatcag aatgccacgg tgaatacgtt

1320

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta

1380

gcttaacctt cgggagg

1397

<210> 832

<211> 1497

<212> DNA

<213> Ethanoligenens harbinense

<400> 832

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgcgc ctaacacatg caagtcgagc

60

ggagtccttc gggacttagc ggcggacggg tgagtaacgc gtgagcaacc tggccttcag

120

agggggataa cgtctggaaa cggacgctaa taccgcatga catggcggag tcgcatggct

180

ctgccatcaa aggagtaatc cgctgaggga tgggctcgcg tccgattagg tagttggtga

240

ggtaacggct caccaagccc gcgatcggta gccggactga gaggttggcc ggccacattg

300

ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt gggggatatt gcacaatgga

360

ggaaactctg atgcagcgac gccgcgtgag ggaagaaggt cttcggattg taaacctctg

420

tctttgggga cgaatcaatg acggtaccca aggaggaagc cacggctaac tacgtgccag

480

cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt tgtccggaat tactgggtgt aaagggtgcg

540

caggcggggc ggcaagttgg atgtgaaaac tccgggctca acccggagcc tgcattcaaa

600

actgtcgctc ttgagtgaag tagaggcagg cggaattccc ggtgtagcgg tgaaatgcgt

660

agatatcggg aggaacacca gtggcgaagg cggcctgctg ggcttttact gacgctgagg

720

cacgaaagca tgggtagcaa acaggattag ataccctggt agtccatgcc gtaaacgatg

780

attgctaggt gtggggggtc tgaccccttc cgtgccggag ttaacacaat aagcaatcca

840

cctggggagt acgggtcgca aggttgaaac tcaaaggaat tgacgggggc tcgcacaagc

900

agtggagtat gtggtttgat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatcca

960

ccgaatcccc cagagattgg ggagtgccct tcggggagcg gtgagacagg tggtgcatgg

1020

ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt

1080

gaatagttgc tacgaaagag cactctattc agaccgccgt tgacaaaacg gaggaaggtg

1140

gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gacctgggct acacacgtac tacaatggcc

1200

atcaacagag ggaagcaagg ccgcgaggtg gagcgaaccc ctaaaaatgg tctcagctca

1260

gattgcaggc tgaaacccgc ctgcatgaag atggaattgc tagtaatcgc ggatcagcat

1320

gccgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gagagccggg

1380

gacacccgaa gtcggttggg taaccgtaag gagcccgccg ccgaaggtgg aatcggtaat

1440

tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtat cggaaggtgc ggctggatca cctccta

1497

<210> 833

<211> 1318

<212> DNA

<213> Eubacteriaceae bacterium P4P_50 P4

<400> 833

gatgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgaac gagtggcgga cgggtgagta

60

acacgtaagt aatcaaccta taacacacga ataactaata gaaatgttag ctaatacgag

120

ataaacaaag gcggttatag acgagcttgc gtctgattag ctagttggtg gggtaagagc

180

ctaccaaggc gacgatcagt agccgacctg agagggtgaa cggccacatt ggaactgaga

240

gacggtccaa actcctacgg gaggcagcag tgggggatat tgcacaatgg ggggaaccct

300

gatgcagcaa cgccgcgtga acgaagaagg ccctagggtc gtaaagttct gtcgtatggg

360

aagatgacag taccatacaa gaaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtagggggc aagcgttatc cggaattact gggcgtaaag ggtgcgtagg cggcttgtta

480

agtcaaggtt aaaaggcagt agctcaacta ctgttcggcc ttgaaactat taagcttgag

540

tataggagag gaaagtggaa ttcccagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttgggaggaa

600

taccggtggc gaaggcgact ttctggacta actgacgctg aggcacgaaa gtgtgggtag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac accgtaaacg atgaacacta ggtgtcggga

720

tctcggtgcc ggcgcaaacg caataagtgt tccgcctggg gagtacgttc gcaagaataa

780

aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agtagcggag catgtggttt aattcgaagc

840

aacgcgaaga accttaccta agcttgacat gcacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctattaa tagttgccag

960

tgcgcaggca ctctagtaag acagttaggg ataacctaaa ggaaggtggg gatgacgtca

1020

aatcatcatg ccccttatgc ttagggctac acacgtgcta caatggccgt caaagagaag

1080

cgaatctgtg aagaagagca aacctgaaac ggtccaagtt cggatgtagg ctgaaactcg

1140

cctacagaag tcggagttac tagtaatcgc aaatcagaat gttgcggtga atgcgttccc

1200

gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagctgag ggcacccaaa gtcagtatct

1260

aagaagctgc ctaaggtgaa cttagtaact ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgta

1318

<210> 834

<211> 1527

<212> DNA

<213> Eubacterium barkeri

<220>

<221> modified_base

<222> (617)..(618)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1473)..(1473)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1475)..(1479)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1488)..(1493)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1504)..(1512)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 834

tttaattgag agtttgatcc tggctcagga cgaacgctgg cggtatgctt aacacatgca

60

agtcgaacga gaagcttttt atggatcctt cgggagaaat aagagtggaa agtggcgaac

120

gggtgagtaa cgcgtgggta acctgcctca tggaaaggaa tagcctcggg aaactgggag

180

taaagcctta tattattaag acatcgcatg gtgttttaat gaaaactccg gtgccatgag

240

atggacccgc gtcccattag ctagttggtg agataacagc ccaccaaggc aacgatgggt

300

aaccggtctg agagggcgaa cggtcacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg

360

gaggcagcag tggggaatat tgcgcaatgg gggcaaccct gacgcagcaa taccgcgtga

420

gtgaagaagg ttttcggatc gtaaaactct tttattgggg aagaagaagt gacggtaccc

480

aatgaagaag tcccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gggacaagcg

540

ttgtccggaa tcactgggcg taaagggcgc gtaggcggtt ttataagtca gatgtgaaag

600

gtaccggctc aaccggnnac gtgcatttga aactgtaaga cttgagtact ggagaggcaa

660

gtggaattcc tagtgtagcg gtgaaatgcg tagatattag gaggaacacc ggtggcgaag

720

gcggcttgct ggacagatac tgacgctgag gtgcgaaagc gtggggagcg aacaggatta

780

gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gatgactagg tgttggggaa actcagtgcc

840

gcagttaaca cattaagtca tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg

900

aattgacggg gacccgcaca agcagcggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga

960

accttaccag gccttgacat cctctgacca tcctagagat aggagatttc cttcgggaac

1020

agagagacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1080

cgcaacgagc gcaacccttg cctttagttg ccagcattaa gttgggcact ctaaagggac

1140

tgccgtagac aatacggagg aaggtgggga cgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatggcc

1200

tgggctacac acgtgctaca atgggttggg acaaagggaa gcgaagccgc gaggtgaagc

1260

caatcccata aaacaacccc cagttcggat tgcaggctga aacccgcctg catgaagttg

1320

gagttgctag taatcgcaga tcagaatgct gcggtgaatg cgttcccggg tcttgtacac

1380

accgcccgtc acaccacgag agttggcaac acccgaagcc agtgagcgaa ccgcaaggac

1440

gcagctgtcg aaggtggggt cagtaattgg ggngnnnnng taacaagnnn nnngtatcgg

1500

aagnnnnnnn nngatcacct cctttct

1527

<210> 835

<211> 1538

<212> DNA

<213> Eubacterium biforme

<400> 835

tggagagttt gatcctggct caggatgaac gctggcggca tgcctaatac atgcaagtcg

60

aacgagagga aggaaagctt gcttttctga atctagtggc gaacgggtga gtaacacgta

120

ggtaacctgc ccatgtgccc gggataactt ctggaaacgg atgctaaaac cggataggta

180

gcagacaagc atttgactgc tattaaagtg gctaaggcca tgaacatgga tggacctgcg

240

gtgcattagc tagttggtga ggtaacggcc caccaaggcg acgatgcata gccggcctga

300

gagggcggac ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt

360

agggaatttt cgtcaatggg gggaaccctg aacgagcaat gccgcgtgag tgaggaaggt

420

cttcggatcg taaagctctg ttgtaagaga aaaacgacat tcatagggaa tgatgagtga

480

gtgatggtat cttaccagaa agtcacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

aggtggcgag cgttatccgg aatgattggg cgtaaagggt gcgtaggtgg cagaacaagt

600

ctggagtaaa aggtatgggc tcaacccgta ctggctctgg aaactgttca gctagagaac

660

agaagaggac ggcggaactc catgtgtagc ggtaaaatgc gtagatatat ggaagaacac

720

cggtggcgaa ggcggccgtc tggtctgttg ctgacactga agcacgaaag cgtggggagc

780

aaataggatt agatacccta gtagtccacg ccgtaaacga tgagaactag gtgttggggg

840

aataactcag tgccgcagtt aacgcaataa gttctccgcc tggggagtat gcacgcaagt

900

gtgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagtatgtg gtttaattcg

960

aagcaacgcg aagaacctta ccaggccttg acatcccttg cagaggtata gagatatatc

1020

cgaggttatc aaggagacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg tgatatgtta ctaacattga gttgaggact

1140

catatcagac tgccggtgat aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc

1200

ccttatggcc tgggctacac acgtactaca atggcgtcta caaagagcgg caagcctgtg

1260

aaggcaagcg aatctcataa aggacgtctc agttcggatt gaagtctgca acccgacttc

1320

atgaagctgg aatcgctagt aatcgcgaat cagcatgtcg cggtgaatac gttctcgggc

1380

cttgtacaca ccgcccgtca aaccatggga gttggtaatg cccgaagccg gtggcataac

1440

ctttcgagga gtgagccgtc gaaggcagga ccgatgactg gggttaagtc gtaacaaggt

1500

atccctacgg gaacgtgggg atggatcacc tcctttct

1538

<210> 836

<211> 1438

<212> DNA

<213> Eubacterium brachy

<400> 836

gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgagc gagaagtttt gaaaagattc

60

ttcggatgaa atttaaaatg gaaagcggcg gacgggtgag taacgcgtag gcaaccatac

120

aaagggatag catttggaaa cgaatattaa taccttatga aacttaacta gtgcatgcta

180

ggtaggtcaa agatttatcg gtatgggatg ggcctgcgtc tgactgccct tagctagttg

240

gtgaggtaac ggctcaccaa ggcgacgatc agtagccgac ctgagagggt gaacggccac

300

attggaactg agacacggtc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa

360

tgggggaaac cctgatgcag caacgccgcg tgaacgatga aggcctttgg gtcgtaaagt

420

tctgttctag gtgatgaaaa ctgacagtaa cctaggagaa agccccggct aactccgtgc

480

cagcagccgc ggtaatactg gagggggcaa gcgttatccg gaattattgg gcgtaaaggg

540

tacgtaggtg gccttttaag cgtagggtat aaggcaatgg ctcaaccatt gttcgcccta

600

tgaactggaa ggcttgagtg caggagagga aagcggaatt cctagtgtag cggtggaatg

660

catagatatt aggaggaaca tcagcggcga aggcggcttt ctggactgca actgacactg

720

aggtacgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

780

atgagcacta ggtgtcgggg tcgtaaggct tcggtgccgt agttaacgca ttaagtgctc

840

cgcctgggga gtacgcacgc aagtgtgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag

900

cagcggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgagaacc ttaccaggac ttgacatcct

960

tctgaccggt ctttaatagg acctttcttt tgacagaaga gacaggtggt gcatggttgt

1020

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcatt

1080

agttgccatc attaagttgg gcactctagt gagactgccg gggacaactc ggaggaaggt

1140

ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgttctgggc tacacacgtg ctacaatggc

1200

tggtacaaag agaagcaaga ccgcaaggtg gagcaaagct caaaaaccag ccccagttcg

1260

gattgtaggc tgaaactcgc ctacatgaag tcggagttgc tagtaatcgc agatcagaat

1320

gctgcggtga atgcgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat ggaagttggg

1380

ggcgcccaaa gttggcagat aaatatgcta cctaaggtga aaccaatgac tggggtga

1438

<210> 837

<211> 1472

<212> DNA

<213> Eubacterium budayi

<400> 837

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc

60

gatgaagttt ccttcgggaa acggattagc ggcggacggg tgagtaacac gtgggtaacc

120

tgcctcatag aggggaatag cctcccgaaa gggagattaa taccgcataa cattgcagtt

180

tcgcatgaaa cagcaattaa aggagcaatc cgctatgaga tggacccgcg gcgcattagc

240

tagttggtaa ggtaatggct taccaaggcg acgatgcgta gccgacctga gagggtgatc

300

ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

360

gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcaac gccgcgtgag tgatgacggt cttcggattg

420

taaagctctg tctttgggca cgataatgac gtacccaagg aggaagccac ggctaactac

480

gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgc cgaacgttgt ccggatttac tggccgtaaa

540

gggagcgtag gcggattttt aagtgggatg tgaaataccc gggctcaacc tgggtgctgc

600

attccaaact gggaatctag agtgcaggag gggagagtgg aattcctagt gtagcggtga

660

aatgcgtaga gattaggaag aacaccagtg gcgaaggcga ctctctggac tgtaactgac

720

gctgaggctc gaaacgtggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa

780

acgatgaata ctaggtgtag gggtttcaac acctctgtgc cgccctaacg cattaagtat

840

tccgcctggg gagtacggtc gcaagattaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

900

agtagcggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccta gacttgacat

960

cctctgcatt acccttaatc ggggaagttc cttcgggaac agagtgacag gtggtgcatg

1020

gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccccta

1080

ttgttagttg ctaccattaa gttgagcact ctagcgagac tgcctgggtt aaccaggagg

1140

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtct agggctacac acgtgctaca

1200

atggcaagta cagagagatg caataccgcg aggtggagct aaacttcaaa acttgtctca

1260

gttcggattg taggctgaaa ctcgcctaca tgaagctgga gttactagta atcgcgaatc

1320

agcatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgagag

1380

ttggcaatac ccaaagttcg tgagctaacg cgtaagcagg cagctaccta aggtagggtc

1440

agcgattggg gtgaagtcgt aacaaggtaa cc

1472

<210> 838

<211> 1338

<212> DNA

<213> Eubacterium callanderi

<400> 838

cttcgggtga cattagaact ggaaagtggc gaacgggtga gtaacgcgtg ggtaacctgc

60

cctatggaaa ggaatagcct cgggaaactg ggagtaaagc cttatattat ggttttgtcg

120

catggcaaga tcatgaaaac tccggtgcca taggatggac ccgcgtccca ttagctagtt

180

ggtgagataa cagcccacca aggcgacgat gggtaaccgg tctgagaggg cgaacggtca

240

cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcgca

300

atgggggcaa ccctgacgca gcaataccgc gtgagtgaag aaggttttcg gatcaaagct

360

ctgttattgg ggaagaagaa tgacggtaga gaaccgctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

420

taatacgtag gggacaagcg tttccggaat gactgggcgt aaagggcgcg taggcggtct

480

attaagttga tgtgaaaggt accggctcaa ccggtgaagt gcattggaaa ctggtaactt

540

gagtattgga gaggcaagtg gaattcctag tgtacggtga aatgcgtaat attaggagga

600

acaccagtgg cgaaggcggc ttgctggaca aatactgacg ctgagtgcga aagcgtgggg

660

agcgaacagg atcagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgaatgc taggtgttgg

720

ggaaactcag tgccgcagtt aacacaataa gcattccgcc tggggagtac gaccgccagg

780

ttgaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcagc ggagcatgtg gtttaattcg

840

aagcaacgcg aagaagctta ccattggtaa ctggcagact tgagtcttgg agagggaaag

900

tttccttcgg gaacagagag acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

960

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctgccttta gttgccagca ttaagttggg

1020

cactctagag ggactgccgt agacaatacg gaggaaggtg gggacgacgt caaatcatca

1080

tgccccttat gacctgggct acacacgtgc tacaatggtc tgaacagagg gccgcgaagc

1140

cgcgaggtga agcaaatccc ttaaaacaga tcccagttcg gattgcaggc tgcaactcgc

1200

ctgcatgaag ttggagttgc tagtaatcgc ggatcagaat gccgcggtga atgcgttccc

1260

gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagttggc aacacccgaa gcctgtgaga

1320

gaaccgcaag gactcagc

1338

<210> 839

<211> 1524

<212> DNA

<213> Eubacterium cellulosolvens

<220>

<221> modified_base

<222> (1492)..(1492)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 839

tgagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgagc

60

taagcactct ggaagattcc ttcgggatga ttccttagtg acttagcggc ggacgggtga

120

gtaacgcgtg ggcaacctgc cttgtacagg gggataacag ttagaaatga ctgctaatac

180

cgcataagcg cacagcatgg catcatgcag tgtgaaaaac tccggtggta caagatgggc

240

ccgcgttgga ttagcttgtt ggtggggtaa cggcccacca aggcgacgat ccatagccgg

300

actgagaggt cgaacggcca cattgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

360

gcagtgggga atattgcaca atggaggaaa ctctgatgca gcgacgccgc gtgagtgatg

420

aagtatttcg gtatgtaaag ctctatcagc agggaagaaa ttgacggtac ctgactaaga

480

agccccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggggcaag cgttatccgg

540

atttactggg tgtaaaggga gcgtagacgg cgatgcaagt ctgaagtgaa aacctggggc

600

tcaaccccag gattgctttg gaaactgtat tgctagagta ccggaggggt aagcggaatt

660

cctagtgtag cggtgaaatg cgtagatatt aggaggaaca ccggtggcga aggcggctta

720

ctggacggca actgacgttg aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct

780

ggtagtccac gccgtaaacg atgaatacta ggtgtcagca ggcaaagcct gttggtgccg

840

ccgctaacgc attaatgtat tccacctggg gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg

900

aattgacggg gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga

960

accttaccaa atcttgacat ccctctgaca gatccttaat cggatccttc cttcgggaca

1020

gaggagacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1080

cgcaacgagc gcaaccctta tccttagtag ccagcaggtc aagctgggca ctctggggag

1140

actgccaggg agaacctgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga

1200

tttgggctac acacgtgcta caatggcgtg aacagaggga agcgaagccg cgaggcctgg

1260

caaatctcaa aaaacacgtc ccagttcgga ctgtagtctg caactcgact acacgaagct

1320

ggaatcgcta gtaatcgcag atcagaatgc tgcggtgaat acgttcccgg gtcttgtaca

1380

caccgcccgt cacaccatgg gagttggtaa tgcccgaagt ctgtgaccca accgcaagga

1440

gggagcagcc gaaggcaggg ccagtaactg gggtgaagtc gtaacaaggt anccgtatcg

1500

gaaggtgccg gctggatcac cttt

1524

<210> 840

<211> 1362

<212> DNA

<213> Eubacterium contortum

<400> 840

cggattgaag agttttgcga ctgagcggcg gacgggtgag taacgcgtgg gtaacctgcc

60

tcatacaggg ggataacagt tagaaatgac tgctaatacc gcataagacc acggtaccgc

120

atggtaccgt gggaaaaact ccggtggtat gagatggacc cgcgtctgat tagctagttg

180

gtaaggtaac ggcttaccaa ggcgacgatc agtagccgac ctgagagggt gaccggccac

240

attgggactg agacacggcc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa

300

tgggggaaac cctgatgcag cgacgccgcg tgaaggatga agtatttcgg tatgtaaact

360

tctatcagca gggaagaaaa tgacggtacc tgactaagaa gccccggcta actacgtgcc

420

agcagccgcg gtaatacgta gggggcaagc gttatccgga tttactgggt gtaaagggag

480

cgtagacggt tatgtaagtc tgatgtgaaa acccggggct caaccccggg actgcattgg

540

aaactatgta actagagtgt cggagaggta agtggaattc ctagtgtagc ggtgaaatgc

600

gtagatatta ggaggaacac cagtggcgaa ggcggcttac tggacgatga ctgacgttga

660

ggctcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga

720

tgcatactag gtgtcgggtg gcaaagccat tcggtgccgc agcaaacgca ataagtatgc

780

cacctgggga gtacgttcgc aagaatgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag

840

cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttacctgct cttgacatcc

900

ccctgaccgg cgcgtaatgg tgcctttcct tcgggacagg gctagtggag gggtgaagtt

960

cgtagacagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc

1020

tttagtagcc agcggttcgg ccgggcactc tagagagact gccagggata acctggagga

1080

aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgagca gggctacaca cgtgctacaa

1140

tggcgtaaac aaagggaggc gaagccgcga ggtggagcaa atcccaaaaa taacgtctca

1200

gttcggattg tagtctgcaa ctcgactaca tgaagctgga atcgctagta atcgcgaatc

1260

agaatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag

1320

ttggtaacgc ccgaagtcag tgacccaacc gtaaggaggg ag

1362

<210> 841

<211> 1446

<212> DNA

<213> Eubacterium coprostanoligenes

<400> 841

gtgtgcctaa cacatacaag tcagtcgacg agcttgacga acgattcttc ggatgaattc

60

tgatatgact gagtggcgga cgggtgagta acgcgtgagc aacctgccct tcagaggggg

120

atagcgtctg gaaacggacg gtaataccgc ataatgtaca atgatggcat cattgatgta

180

ccaaagctat tgcgctgaag gatgggctcg cgtctgatta gatagttggt ggggtaacgg

240

cctaccaagt cgacgatcag tagccggact gagaggttga acggccacat tgggactgag

300

acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggcgcaagcc

360

tgatgcagca acgccgcgtg gaggaagacg gttttcggat tgtaaactcc tgttcttagt

420

gaagaaaaat gacggtagct aaggagcaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

480

taatacgtag gtggcaagcg ttgtccggaa ttactgggtg taaagggagc gcaggcgggg

540

gagcaagtca gctgtgaaat ctatgggctt aacccataaa ctgcagttga aactgttctt

600

cttgagtgaa gtagaggttg gcggaattcc gagtgtagcg gtgaaatgcg tagatattcg

660

gaggaacacc ggtggcgaag gcggccaact gggcttttac tgacgctgag gctcgaaagt

720

gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacac tgtaaacgat gataactagg

780

tgtagggggt ctgacccctt ctgtgccgca gctaacgcaa taagttatcc acctggggag

840

tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc agtggattat

900

gtggtttaat tcgatgcaac gcgaagaacc ttaccagcac ttgacatcca actaacgaaa

960

tagagatata ttaggtgccc ctcggggaaa gttgagacag gtggtgcatg gttgtcgtca

1020

gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccctg ccattagttg

1080

ctacgcaaga gcactctaat gggaccgcta ccgacaaggt ggaggaaggt ggggatgacg

1140

tcaaatcatc atgcccctta tgtgctgggc tacacacgta atacaatggt cgttaacaaa

1200

gagaagcaat accgcgaggt ggagcaaaac ttcaaaaacg atctcagttc ggactgtagg

1260

ctgaaactcg cctgcacgaa gttggaattg ctagtaatcg tggatcagca tgccacggtg

1320

aatacgttcc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagccgg taatacccga

1380

agtcagtagt ctaaccttaa tggaggacgc tgccgaaggt aggattggcg actggggtga

1440

agtcgt

1446

<210> 842

<211> 1541

<212> DNA

<213> Eubacterium cylindroides

<400> 842

tggagagttt gatcctggct caggatgaac gctggcggca tgcctaatac atgcaagtcg

60

aacggaccga agggaaagct tgcttttcct gaagtcagtg gcgaacgggt gagtaacacg

120

taggtaacct gcccatgtgc ccgggacaac gcctggaaac gggtgctaaa accggatagg

180

tagagagatc gcatgaactt tctattaaag gggctacggc cctgaacatg gatggacctg

240

cggtgcatta gctagttggt gaggtaacgg cccaccaagg cgacgatgca tagccgacct

300

gagagggcga acggccacat tgggactgag acacggccca aactcctacg ggaggcagca

360

gtagggaatt ttcgtcaatg gggggaaccc tgaacgagca atgccgcgtg agtgaagacg

420

gtcttcggat tgtaaagctc tgttgcgaga gaaaaacgac acggataggg aatgatccgt

480

gggtgatggt atctcgccag aaagtcacgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

540

gtaggtggcg agcgttatcc ggaatgattg ggcgtaaagg gtgcgtaggc ggcccgttaa

600

gtctggagtc aaagccggca gctcaactgt cgtacgcttt ggaaactggc gggctggagt

660

gcagaagagg gcgatggaac tccatgtgta gcggtaaaat gcgtagatat atggaagaac

720

accagtggcg aaggcggtcg cctggtctgc aactgacgct gaagcacgaa agcgtgggga

780

gcaaatagga ttagataccc tagtagtcca cgccgtaaac gatgagaact aagtgttggg

840

ggaataactc agtgctgcag ttaacgcaat aagttctccg cctggggagt atgcacgcaa

900

gtgtgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagtatg tggtttaatt

960

cgaagcaacg cgaagaacct taccaggcct tgacatcccg ggcaagggcg tagagatacg

1020

ccggaggcta tcccggtgac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

1080

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtgatatgt tactaccagt aagatgagga

1140

ctcatatcag actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg

1200

ccccttatgg cctgggctac acacgtacta caatggcgca tacaaagagc agcgaacccg

1260

tgagggcagg cgaatctcgc aaagtgcgtc tcagttcgga ttgaagtctg caacccgact

1320

tcatgaagtt ggaatcgcta gtaatcgcga atcagcatgt cgcggtgaat acgttctcgg

1380

gccttgtaca caccgcccgt caaaccatgg gagttggtaa tacccgaagc cggtggcata

1440

acccattcag ggagtgagcc gtcgaaggta ggatcgatga ctggggttaa gtcgtaacaa

1500

ggtatcccta cgggaacgtg gggatggatc acctcctttc t

1541

<210> 843

<211> 1470

<212> DNA

<213> Eubacterium desmolans

<220>

<221> modified_base

<222> (1)..(1)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (32)..(32)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (275)..(275)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (401)..(401)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (575)..(575)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (580)..(580)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (602)..(602)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (917)..(919)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (957)..(958)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (980)..(980)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1017)..(1017)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1026)..(1026)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1039)..(1039)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1080)..(1080)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1180)..(1181)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1196)..(1196)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1374)..(1375)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 843

ntttttagag agtttgatcc tggctcagga tnaacgctgg cggcgtgcct aacacatgca

60

agtcgaacgg agttattttg gaaatctctt cggagatgga attcataact tagtggcgga

120

cgggtgagta acgcgtgagc aatctgcctt taggtggggg ataacagtcg gaaacggctg

180

ctaataccgc ataatacgtt ttgggggcat ccttgaaacg tcaaagattt attgccttta

240

gatgagctcg cgtctgatta gctggttggc ggggnaacgg cccaccaagg cgacgatcag

300

tagccggact gagaggttga acggccacat tgggactgag acacggccca gactcctacg

360

ggaggcagca gtggggaata ttgcgcaatg ggggaaaccc ngacgcagca acgccgcgtg

420

attgaagaag gccttcgggt tgtaaagatc tttaatcagg gacgaatttt gacggtacct

480

gaagaataag ctccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggagcaagcg

540

ttatccggat ttactgggtg taaagggcgc gcagncgggn cggcaagttg ggagtgaaat

600

cngggggctt aacccccgaa ctgctttcaa aactgctggt cttgagtgat ggagaggcag

660

gcggaattcc gtgtgtagcg gtgaaatgcg tagatatacg gaggaacacc agtggcgaag

720

gcggcctgct ggacattaac tgacgctgag gcgcgaaagc gtggggagca aacaggatta

780

gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat ggatactagg tgtgggaggt attgacccct

840

tccgtgccgc agttaacaca ataagtatcc cacctgggga gtacggccgc aaggttgaaa

900

ctcaaaggaa ttgacgnnng cccgcacaag cagtggagta tgtggtttaa ttcgaannaa

960

cgcgaagaac cttaccaggn cttgacatcc cggtgaccgt cctagagata ggacttncct

1020

tcgggncaac ggtgacagnt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggn

1080

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttacg gttagttgat acgcaagatc actctagccg

1140

gactgccgtt gacaaaacgg aggaaggtgg ggacgacgtn naatcatcat gccccntatg

1200

acctgggcta cacacgtact acaatggcag tcatacagag ggaagcaaaa tcgcgaggtg

1260

gagcaaatcc ctaaaagctg tcccagttca gattgcaggc tgcaacccgc ctgcatgaag

1320

tcggaattgc tagtaatcgc ggatcagcat gccgcggtga atacgttccc gggnnttgta

1380

cacaccgccc gtcacaccat gagagccgtc aatacccgaa gtccgtagcc taaccgcaag

1440

gggggcgcgg ccgaaggtag gggtggtaat

1470

<210> 844

<211> 1013

<212> DNA

<213> Eubacterium dolichum

<220>

<221> modified_base

<222> (10)..(10)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (14)..(14)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (49)..(49)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (74)..(76)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 844

atcgtaaagn tctntgtaag agaaaaacga tggatatagg aaatgatgnc caagtgatgg

60

tatcttacca gaannnacgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca

120

agcgttatcc ggaatgattg ggcgtaaagg gtgcgtaggt ggtgcattaa gtctgaagta

180

aaagccagca gctcaactgc tgtaagcttt ggaaactggt gtactagagt gcaggagagg

240

gcgatggaat tccatgtgta gcggtaaaat gcgtagatat atggaggaac accagtggcg

300

aaggcggtcg cctggcctgt aactgacact gaggcacgaa agcgtgggga gcaaatagga

360

ttagataccc tagtagtcca cgccgtaaac gatgagaact aagtgttgga gagattcagt

420

gctgcagtta acgcaataag ttctccgcct ggggagtatg cacgcaagtg tgaaactcaa

480

aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagtatgtgg tttaattcga agcaacgcga

540

agaaccttac caggccttga catggatata aatgttctag agatagaaag atagctatat

600

atcacacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

660

gcaacgagcg caacccttgt cgcatgttac cagcattcag ttggggactc atgtgagact

720

gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatggcct

780

gggctacaca cgtactacaa tggcgtctac aaagaggagc gacacagtga tgtgaagcaa

840

atctcataaa ggacgtctca gttcggattg aagtctgcaa ctcgacttca tgaagtcgga

900

atcgctagta atcgcagatc agcatgctgc ggtgaatacg ttctcgggcc ttgtacacac

960

cgcccgtcaa accatgggag ttggtaatac ccgaagccgg tggcataacc gca

1013

<210> 845

<211> 1394

<212> DNA

<213> Eubacterium eligens

<220>

<221> modified_base

<222> (19)..(20)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (44)..(45)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1382)..(1382)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 845

tcgaacgaag catttaggnn acagattatt tcggtatgaa gttnnttatg actgagtggc

60

ggacgggtga gtaacgcgtg ggtaacctgc cttgtactgg gggatagcag ctggaaacgg

120

ctggtaatac cgcataagcg cacaatgttg catgacatgg tgtgaaaaac tccggtggta

180

taagatggac ccgcgtctga ttagctagtt ggtgagataa cagcccacca aggcgacgat

240

cagtagccga cctgagaggg tgaccggcca cattgggact gagacacggc ccagactcct

300

acgggaggca gcagtgggga atattgcaca atggaggaaa ctctgatgca gcgacgccgc

360

gtgagtgaag aagtaattcg ttatgtaaag ctctatcagc agggaagata gtgacggtac

420

ctgactaaga agctccggct aaatacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt atggagcaag

480

cgttatccgg atttactggg tgtaaaggga gtgtaggtgg ccatgcaagt cagaagtgaa

540

aatccggggc tcaaccccgg aactgctttt gaaactgtaa ggctggagtg caggaggggt

600

gagtggaatt cctagtgtag cggtgaaatg cgtagatatt aggaggaaca ccagtggcga

660

aggcggctca ctggactgta actgacactg aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat

720

tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgaatacta ggtgtcgggg cccataaggg

780

cttcggtgcc gcagcaaacg caataagtat tccacctggg gagtacgttc gcaagaatga

840

aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc

900

aacgcgaaga accttaccaa gtcttgacat cccttactgc gggtaaagag agtgtcgttg

960

cctagggaca gtggagacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

1020

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccccta tccttagtag ccagcagtaa gatgggcact

1080

ctagggagac tgccagggat aacctggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc

1140

ccttatgact tgggctacac acgtgctaca atggcgtaaa caaagtgaag cgaagtcgtg

1200

aggccaagca aatcacaaaa ataacgtctc agttcggatt gtagtctgca actcgactac

1260

atgaagctgg aatcgctagt aatcgcagat cagaatgctg cggtgaatac gttcccgggt

1320

cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtcgaaaatg cccgaagtcg gtgacctaac

1380

gnaagaagga gccg

1394

<210> 846

<211> 1319

<212> DNA

<213> Eubacterium fissicatena

<220>

<221> modified_base

<222> (23)..(23)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (43)..(45)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (887)..(887)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 846

ggattgaaga gtgttgcgac ggngcggcgg acgggtgagt gannngtggg taacctgcct

60

catacagggg gataacagtt agaaatgact gctaataccg cataagacca cggtaccgca

120

tggtacagtg ggaaaaactc cggtggtatg agatggaccc gcgtctgatt agctagttgg

180

taaggtaacg gcttaccaag gcgacgatca gtagccgacc tgagagggtg accggccaca

240

ttgggactga gacacggccc aaactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat

300

gggggaaacc ctgatgcagc gacgccgcgt gaaggatgaa gtatttcggt atgtaaactt

360

ctatcagcag ggaagaaaat gacggtacct gactaagaag ccccggctaa ctacgtgcca

420

gcagccgcgg taatacgtag ggggcaagcg ttatccggat ttactgggtg taaagggagc

480

gtagacggtt atgtaagtct gatgtgaaaa cccggggctc aaccccggga ctgcattgga

540

aactatgtaa ctagagtgtc ggagaggtaa gtggaattcc tagtgtagcg gtgaaatgcg

600

tagatattag gaggaacacc agtggcgaag gcggcttact ggacgatcac tgacgttgag

660

gctcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat

720

gaatactagt gtcgggtggc aaagccattc ggtgccgcag caaacgcaat aagtattcca

780

cctggggagt acgttcgcaa gaatgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg

840

gtggacatgt ggtttaattg aagcaacgcg atagggtgca agcgctntcc agaccacact

900

gaccggcgtg taatggcgcc ttcccttcgg ggcagtggag acaggtggtg catggttgtc

960

gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatcttta

1020

gtagccagcg gtttggccgg gcactctaga gagactgcca gggataacct ggaggaaggt

1080

ggggaggacg tcaaatcatc atgcccctta tgagcagggc tacacacgtg ctacaatggc

1140

gtaaacaaag ggaggcaata ccgcgaggtt gagcaaatcc caaaaataac gtctcagttc

1200

ggattgtagt ctgcaactcg actacatgaa gctggaatcg ctagtaatcg cgaatcagaa

1260

tgtcgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt acacaccccc cgtcacacca tgggagttg

1319

<210> 847

<211> 937

<212> DNA

<213> Eubacterium hadrum

<220>

<221> modified_base

<222> (83)..(83)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (890)..(890)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (903)..(903)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (923)..(923)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 847

acgaaacacc ttatttgatt ttcttcggaa ctgaagattt ggtgattgag tggcggacgg

60

gtgagtaacg cgtgggtaac ctnccctgta cagggggata acagtcagaa atgactgcta

120

ataccgcata agaccacagc accgcatggt gcaggggtaa aaactccggt ggtacaggat

180

ggacccgcgt ctgattagct ggttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgatcagtag

240

ccggcttgag agagtgaacg gccacattgg gactgagaca cggcccaaac tcctacggga

300

ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggg gaaaccctga tgcagcgacg ccgcgtgagt

360

gaagaagtat ctcggtatgt aaagctctat cagcagggaa gaaaatgacg gtacctgact

420

aagaagcccc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggggg caagcgttat

480

ccggaattac tgggtgtaaa gggtgcgtag gtggtatggc aagtcagaag tgaaaaccca

540

gggcttaact ctgggactgc ttttgaaact gtcagactgg agtgcaggag aggtaagcgg

600

aattcctagt gtagcggtga aatgcgtaga tattaggagg aacatcagtg gcgaaggcgg

660

cttactggac tgaaactgac actgaggcac gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata

720

ccctggtagt ccacgccgta aacgatgaat actaggtgtc ggggccgtag aggcttcggt

780

gccgcagcca acgcagtaaa gtattccacc tggggagtac gttcgcaaga atgaaactca

840

aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcn aagcaacgcg

900

aanaacctta cctggtcttg acntccttct gaccggt

937

<210> 848

<211> 1342

<212> DNA

<213> Eubacterium hallii

<400> 848

caccttttga gattcttcgg atgatcgatt ggtgactgag tggcggacgg gtgagtaacg

60

cgtgggtaac ctgccctgta cagggggata acagctggaa acggctgcta ataccgcata

120

agcgcacgag gagacatctc ctagtgtgaa aaactccggt ggtacaggat gggcccgcgt

180

ctgattagct ggttggcagg gtaacggcct accaaggcaa cgatcagtag ccggtctgag

240

aggatgaacg gccacattgg aactgagaca cggtccaaac tcctacggga ggcagcagtg

300

gggaatattg cacaatgggg gaaaccctga tgcagcaacg ccgcgtgagt gaagaagtat

360

ttcggtatgt aaagctctat cagcagggaa gataatgacg gtacctgact aagaagctcc

420

ggctaaatac gtgccagcag ccgcggtaat acgtatggag caagcgttat ccggatttac

480

tgggtgtaaa gggtgcgtag gtggcagtgc aagtcagatg tgaaaggccg gggctcaacc

540

ccggagctgc atttgaaact gctcggctag agtacaggag aggcaggcgg aattcctagt

600

gtagcggtga aatgcgtaga tattaggagg aacaccagtg gcgaaggcgg cctgctggac

660

tgttactgac actgaggcac gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt

720

cacgccgtaa acgatgaata ctaggtgtcg gggccgtata ggcttcggtg ccgccgcaac

780

gcagtaagta ttccacctgg ggagtacgtt ggcaagaatg aaactcaaag gaattgacgg

840

ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aagcttacca

900

ggtcttgaca tccttgtgac cgcaccttaa tcggggcttt ccttcgggac agaagagaca

960

ggtggtgcat ggttgttgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1020

cgcaacccct attttcagta gccagcaggt aaggctgggc actctggaga gactgccagg

1080

gataacctgg aggaaggtgg ggacgacgtc aaatcatcat gccccttatg atctgggcga

1140

cacacgtgct acaatggcgg tcacagagtg aggcgaaccc gcgaggggga gcaaaccaca

1200

aaaaggccgt cccagttcgg actgtagttt gcaacccgac tacccgaagc tggaatcgct

1260

agtaatcgcg aatcagaatg tcgcggtgaa tacgttcccg ggttttgtac cccccccccg

1320

tcacaccctg ggagttggaa at

1342

<210> 849

<211> 1494

<212> DNA

<213> Eubacterium infirmum

<400> 849

gatgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc gagaagtaaa gaaatgaagc

60

ttcggtagat ttcattatgg aaagcggcgg acgggtgagt aacgcgtagg caacctgccc

120

tgtacagggg gatagccacc cgaaaaggtg attaataccc catgatgcaa gagatacaca

180

tgtatcactt gtcaaagatt tatcggtatg ggatgggcct gcgtctgatt agctagttgg

240

tagggtaacg gcttaccaag gcaacgatca gtagccgacc tgagagggtg atcggccaca

300

ttggaactga gacacggtcc aaactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat

360

gggggaaacc ctgatgcagc aacgccgcgt gaaggaagaa ggccttcggg ttgtaaactt

420

ctgtcctagg ggaagaaaca aatgacatta cccttggagg aagccccggc taactacgtg

480

ccagcagccg cgggtaatac gtagggggcg agcgttatcc ggaattattg ggcgtaaaga

540

gtgcgtaggt ggcatcttaa gcgcagggtt taaggcaatg gctcaaccat tgttcgcctt

600

gcgaactggg gtgcttgagt gcaggagggg aaagtggaat tcctagtgta gcggtgaaat

660

gcgtagatat taggaggaac accagtggcg aaggcgactt tctggactgt tactgacact

720

gaggcacgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac

780

gatgagcact aggtgtcggg gtcgcaagac ttcggtgccg cagttaacgc attaagtgct

840

ccgcctggga agtacgcacg caagtgtaaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa

900

gcagcggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg aacttgacat

960

cctcttgaca gatccttaat cggattcttc ttcggacaag agagacaggt ggtgcatggt

1020

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgcc

1080

attagttgcc atcatttagt tgggcactct agtgggactg ccggggaaaa ctcggaggaa

1140

ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgttctg ggctacacac gtgctacaat

1200

ggccggtaca acaggcagcg aacccgtgag ggggagcgaa tcccaaaagc cggtcccagt

1260

tcggactgta ggctgcaact cgcctacacg aagttggagt tgctagtaat cgcggatcag

1320

aatgccgcgg tgaatgcgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catggaagtt

1380

gggggtgccc gaagtcggtt atttaatcta tcgcctaagg caaaaccaat gactggggtg

1440

aagtcgtaac caaggtagcc cgtatcggaa ggtgccggct ggatcacctc ctta

1494

<210> 850

<211> 1377

<212> DNA

<213> Eubacterium limosum

<220>

<221> modified_base

<222> (1310)..(1310)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 850

gaacgagaag atcagttaag aaccttcggg ggaataagtg attggaaagt ggcgaacggg

60

tgagtaacgc gtgggtaacc tgccctatgg aaaggaatag cctcgggaaa ctgggagtaa

120

agccttatat tatggagaga tcgcatggtc atttcatgaa aactccggtg ccataggatg

180

gacccgcgtc ccattagcta gttggtgaga taacagccca ccaaggcgac gatgggtaac

240

cggtctgaga gggcgaacgg tcacactgga actgagacac ggtccagact cctacgggag

300

gcagcagtgg ggaatattgc gcaatggggg caaccctgac gcagcaatac cgcgtgagtg

360

aagaaggttt tcggatcgta aagctctgtt attggggaag aaaacatgac ggtacccaat

420

gaggaagtcc cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggg acaagcgttg

480

tccggaatga ctgggcgtaa agggcgcgta ggcggtctga taagtcagat gtgaaaggta

540

ccggctcaac cggtgacgtg catttgaaac tgtcagactt gagtattgga gaggcaagtg

600

gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag atattaggag gaacaccagt ggcgaaggcg

660

gcttgctgga caaatactga cgctgaggtg cgaaagcgtg gggagcgaac aggattagat

720

accctggtag tccacgccgt aaacgatgaa tgctaggtgt tggggaaact cagtgccgca

780

gttaacacaa taagcattcc gcctggggag tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat

840

tgacggggac ccgcacaagc agcggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc

900

ttaccaggtc ttgacgtcct ctgacaatcc cagagatggg acgtttcctt cgggaacaga

960

gagacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1020

aacgagcgca acccctgcct ttagttgcca gcattgagtt gggcactcta gagggactgc

1080

cgtagacaat acggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgccctt tatgacctgg

1140

gctacacacg tgctacaatg gtctgatcag agggccgcga aaccgcgagg tgaagcaaat

1200

cccttaaaac agatcccagt tcggattgca ggctgcaatt cgcctgcatg aagttggagt

1260

tgctagtaat cgcggatcag aatgccgcgg tgaatgcgtt cccgggtctn gtacacaccg

1320

cccgtcacac cacgagagtt ggcaacaccc gaagcctgtg agagaaccgc aaggact

1377

<210> 851

<211> 1488

<212> DNA

<213> Eubacterium moniliforme

<400> 851

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc gatgaarttt ccttcgggaa

60

atggattagc ggcggacggg tgagtaacac gtgggtaacc tgccttgtag aggggaatag

120

ccttccgaaa ggaagattaa taccgcataa tattgtactt tcgcatgaaa gaacaattaa

180

aggagcaatc cgctacaaga tggacccgcg gcgcattagc tagttggtaa ggtaatggct

240

taccaaggcg acgatgcgta gccgacctga gagggtgatc ggccacattg ggactgagac

300

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg ggaaaccctg

360

atgcagcaac gccgcgtgag tgatgacggt cttcggattg taaagctctg tctttgggga

420

cgataatgac ggtacccaag gaggaagcca cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacgtaggtg gcgagcgttg tccggattta ctgggcgtaa agggagcgta ggcggattct

540

taagtgggat gtgaaatact cgggcttaac ctgagtgctg cattccaaac tgggaatcta

600

gagtgcagga ggggagagtg gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag agattaggaa

660

gaacaccagt ggcgaaggcg actctctgga ctgtaactga cgctgaggct cgaaagcgtg

720

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgaa tactaggtgt

780

aggggtttca acacctctgt gccgccgcta acgcattaag tattccgcct ggggagtacg

840

gtcgcaagat taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagtagcg gagcatgtgg

900

tttaattcga agcaacgcga agaaccttac ctagacttga catcttctgc attaccctta

960

atcggggaag ttccttcggg aacagaatga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1020

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ctattgttag ttgctaccat

1080

taagttgagc actctagcga gactgcccgg gttaaccggg aggaaggtgg ggatgacgtc

1140

aaatcatcat gccccttatg tctagggcta cacacgtgct acaatggcaa gtacagagag

1200

atgcaatacc gtgaggtgga gctaaacttc aaaacttgtc tcagttcgga ttgtaggctg

1260

aaactcgcct acatgaagct ggagttacta gtaatcgcga atcagcatgt cgcggtgaat

1320

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagttggcaa tacccaaagt

1380

tcgtgagcta acgcgtaagc ggggcagcga cctaaggtag ggtcagcgat tggggtgaag

1440

tcgtaacaag gtagccgtag gagaacctgc ggctggatca cctccttt

1488

<210> 852

<211> 1471

<212> DNA

<213> Eubacterium multiforme

<400> 852

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc

60

gatgaagttt cttcgggaaa cggattagcg gcggacgggt gagtaacacg tgggtaacct

120

gccttgtaga gggaaatagc cttccgaaag gaagattaat accgcataat attgtacctt

180

cgcatgaagg aacaattaaa ggagcaatcc gctacaagat ggacccgcgg cgcattagct

240

agttggtaag gtaatggctt accaaggcga cgatgcgtag ccgacctgag agggtgatcg

300

gccacattgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

360

cacaatgggg gaaaccctga tgcagcaacg ccgcgtgagt gatgacggtc ttcggattgt

420

aaagctctgt ctttgggacg ataatgacgt acccaagaag gaagccacgg ctaactacgt

480

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggcg agcgttgtcc ggatttactg ggcgtaaagg

540

gagcgtaggc ggattcttaa gtgggatgtg aaatactcgg gctcaacctg agtgctgcat

600

tccaaactgg gaatctagag tgcaggaggg gagagtggaa ttcctagtgt agcggtgaaa

660

tgcgtagaga ttaggaagaa caccagtggc gaaggcgact ctctggactg taactgacgc

720

tgaggctcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa

780

cgatgaatac taggtgtagg ggtttaaaca cctctgtgcc gccctaacgc attaagtatt

840

ccgcctggga gtacggtcgc aagattaaaa ctcaaagaaa ttgacggggg cccgcacaag

900

tagcggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttacctaga cttgacatct

960

tctgcattac ccttaatcgg ggaagttctt cgggaacaga atgacaggtg gtgcatggtt

1020

gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctattg

1080

ttagttgcta ccattaagtt gagcactcta gcgagactgc ccgggttaac cgggaggaag

1140

gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgtctagg gctacacacg tgctacaatg

1200

gcaagtacag agagatgcaa taccgtgagt ggagctaaac ttcaaaactt gtctcagttc

1260

ggattgtagg ctgaaactcg cctacatgaa gctggagtta ctagtaatcg cgaatcagca

1320

tgtcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgagagttgg

1380

caatacccaa agttcgtgag ctaacgcgta agcaggggca gccacctaag gtagggtcag

1440

ccatttgggt gaagtcgtta acaaggtaac c

1471

<210> 853

<211> 1477

<212> DNA

<213> Eubacterium nitritogenes

<400> 853

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc

60

gatgaagttt ccttcgggaa acggattacc gccggacggg tgagtaacac gtgggtaacc

120

tgcctcatag aggggaatag cctcccgaaa gggagattaa taccgcataa cattgcagtt

180

tcgcatgaaa cagcaattaa aggagcaatc cgctatgaga tggacccgcg gcgcattagc

240

tagttggtaa ggtaatggct taccaaggcg acgatgcgta gccgacctga gagggtgatc

300

ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

360

gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcaac gccgcgtgag tgatgacggt cttcggattg

420

taaagctctg tctttgggac gataatgacg tacccaagga ggaagccacg gctaactacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc gagcgttgtc cggatttact gggcgtaaag

540

ggagcgtagg cggattttta agtgggatgt gaaatacccg ggctcaacct gggtgctgca

600

ttccaaactg ggaatctaga gtgcaggagg ggagagtgga attcctagtg tagcggtgaa

660

atgcgtagag attaggaaga acaccagtgg cgaaggcgac tctctggact gtaactgacg

720

ctgaggctcg aaagcgtggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa

780

acgataaata ctaggtgtag gggtttaaac acctctgtgc cgccctaacg cattaagtat

840

cccgcctggg aagtacggtc gcaagattaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

900

agtagcggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccta gacttgacat

960

cctctgcatt acccttaatc ggggaagttc ttcgggaaca gagtgacagg tggtgcatgg

1020

ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat

1080

tgttagttgc taccattaag ttgagcactc tagcgagact gcctgggtta accaggagga

1140

aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgtcta gggctacaca cgtgctacaa

1200

tggcaagtac agagagatgc aataccgcga ggtggagcta aacttcaaaa ctcgtctcag

1260

ttcggattgt aggctgaaac tcgcctacat gaagctggag ttactagtaa tccgcgaatc

1320

agcatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgagag

1380

ttggcaatac ccaaagttcg tgagctaacg cgtaagcagg ggcagccacc taaggtaggg

1440

ttcagccatt tggcctgaag tgcgtaacaa ggtaacc

1477

<210> 854

<211> 1351

<212> DNA

<213> Eubacterium nodatum

<400> 854

gatgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagttgagc gagaaatcac ttaaagaagc

60

ttcggtagac ttaagagatg gagagcagcg gacgggtgag gaacgcgtgg gaaacctgcc

120

cttgacagga ggatagccga gagaaatttc gatttaatac ttcataaagc agagcattcg

180

catggatgaa ctgccaaaga attatcggtc aaggatggtc cagcgtctga ttagctggtt

240

ggtaaggtac cggcttacca aggcgacgat cagtagccgg cctgagaggg tgaacggcca

300

cattggaact gagacacggt ccagactcta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa

360

tgggcgaagc ctgatgcagc aacgccgcgt gaaggaagaa ggctttcgag tcgtaaactt

420

ctgtccaaag ggaagaataa tgacggtacc tttgaagaaa gccccggcta actacgtgcc

480

agcagccgcg gtaatacgta gggggcgagc gttatccgga attactgggc gtaaagagta

540

tgtaggtggt taagtaagcg tagggtttaa ggcgacagcc caactgtcgt atgccccgcg

600

agctgtttaa cttgagtaca ggaggggaag gcggaattcc tagtgtagcg ctgaaatgcg

660

tagatattag gaggaacacc agtggcgaag gcggccttct ggactgtaac tgacactgag

720

atacgaaagc gtgggtagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat

780

gagcactagg tgtcgggctc gcaagagttc ggtgccggag caaacgcatt aagtgctccg

840

cctggggagt acgcacgcaa gtgtgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagca

900

gcggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggact tgacatccca

960

ctgaaagctc ggttaaaact gagcccttct tcggaacagt ggagacaggt ggtgcatggt

1020

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgcc

1080

gttagttgcc atcattaagt tgggcactct aatgggactg ccggggagaa cccggaggaa

1140

ggcggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgttctg ggctacacac gtgctacaat

1200

ggccgtcaca gagggaagcg agagagcgat cttaagcgaa accaaaaagg cggtcccagt

1260

tcggactgca ggctgcaact cgcctgcacg aagccggagt tgctagtaat cgcggatcag

1320

aatgtcgcgg tgaatgcgtt cccgggtctt g

1351

<210> 855

<211> 1386

<212> DNA

<213> Eubacterium ramulus

<220>

<221> modified_base

<222> (1339)..(1339)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 855

gcactttacc tgatttcctt cggggatgat tgttctgtga ctgagtggcg gacgggtgag

60

taacgcgtgg ataacctgcc tcacacaggg ggataacagt tggaaacggc tgctaatacc

120

gcataagcgc acagcaccgc atggtgcagt gtgaaaaact ccggtggtgt gagatggatc

180

cgcgtctgat tagcttgttg gcggggtaac ggcccaccaa ggcgacgatc agtagccggc

240

ctgagagggc gaccggccac attgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag

300

cagtggggaa tattgcacaa tgggggaaac cctgatgcag cgacgccgcg tgagcgatga

360

agtatttcgg tatgtaaagc tctatcagca gggaagataa tgacggtacc tgactaagaa

420

gctccggcta aatacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta tggagcaagc gttatccgga

480

tttactgggt gtaaagggag cgtaggcggt cctgcaagtc tgatgtgaaa ggccggggct

540

caaccccggg actgcattgg aaactgtagg actagagtgt cggaggggta agtggaattc

600

ctagtgtagc ggtgaaatgc gtagatatta ggaggaacac cagtggcgaa ggcggcttac

660

tggacgacta ctgacgctga ggctcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg

720

gtagtccacg ccgtaaacga tgaatactag gtgttggcag gtaagacctg tcggtgccgc

780

agcaaacgca ataagtattc cacctgggga gtacgttcgc aagaatgaaa ctcaaaggaa

840

ttgacgggga cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac

900

cttaccaagt cttgacctcc cggtgacaga tgaaagaccg ggttttccct tcggggcacc

960

ggtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg

1020

caacgagcgc aacccttatc cccagtagcc agcatttcgg atgggcactc tgtggagact

1080

gccagggaca acctggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgactt

1140

gggctacaca cgtgctacaa tggcgtaaac aaagggaagc gagaccgcga ggtggagcaa

1200

atcccaaaaa taacgtccca gttcggattg tagtctgcaa ctcgactaca tgaagctgga

1260

atcgctagta atcgcagatc agaatgctgc ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac

1320

cgcccgtcac accatgggna gtcggaaatg cccgaagccg gtggcctaac cgcaaggaag

1380

gagccg

1386

<210> 856

<211> 1387

<212> DNA

<213> Eubacterium rectale

<400> 856

tcgaacgaag cactttattt gatttccttc gggactgatt attttgtgac tgagtggcgg

60

acgggtgagt aacgcgtggg taacctgcct tgtacagggg gataacagtt ggaaacggct

120

gctaataccg cataagcgca cagcatcgca tgatgcagtg tgaaaaactc cggtggtata

180

agatggaccc gcgttggatt agctagttgg tgaggtaacg gcccaccaag gcgacgatcc

240

atagccgacc tgagagggtg accggccaca ttgggactga gacacggccc aaactcctac

300

gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgaaagc ctgatgcagc gacgccgcgt

360

gagcgaagaa gtatttcggt atgtaaagct ctatcagcag ggaagataat gacggtacct

420

gactaagaag caccggctaa atacgtgcca gcagccgcgg taatacgtat ggtgcaagcg

480

ttatccggat ttactgggtg taaagggagc gcaggcggtg cggcaagtct gatgtgaaag

540

cccggggctc aaccccggta ctgcattgga aactgtcgta ctagagtgtc ggaggggtaa

600

gcggaattcc tagtgtagcg gtgaaatgcg tagatattag gaggaacacc agtggcgaag

660

gcggcttact ggacgataac tgacgctgag gctcgaaagc gtggggagca aacaggatta

720

gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gaatactagg tgttgggaag cattgcttct

780

cggtgccgtc gcaaacgcag taagtattcc acctggggag tacgttcgca agaatgaaac

840

tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac

900

gcgaagaacc ttaccaagtc ttgacatcct tctgaccggt acttaaccgt accttctctt

960

cggagcagga gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt

1020

taagtcccgc aacgagcgca acccttatct ttagtagcca gcggtccggc cgggcactct

1080

agagagactg ccagggataa cctggaggaa ggcggggatg acgtcaaatc atcatgcccc

1140

ttatgacttg ggctacacac gtgctacaat ggcgtaaaca aagggaagca aagctgtgaa

1200

gccgagcaaa tctcaaaaat aacgtctcag ttcggactgt agtctgcaac ccgactacac

1260

gaagctggaa tcgctagtaa tcgcagatca gaatgctgcg gtgaatacgt tcccgggtct

1320

tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt tgggaatgcc cgaagccagt gacctaaccg

1380

aaaggaa

1387

<210> 857

<211> 929

<212> DNA

<213> Eubacterium ruminantium

<220>

<221> modified_base

<222> (12)..(15)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (36)..(36)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 857

tcgaacgaag annnnctgga gtgcttgcac ttgganggac tgagtggcgg acgggtgagt

60

aacgcgtggg taacctgcct tatacagggg gataacagtt ggaaacgact gctaataccg

120

cataagcgca cggtatcgca tgatacagtg tgaaaaactc cggtggtata agatggaccc

180

gcgtctgatt agcttgttgg tgaggtaacg gcccaccaag gcgacgatca gtagccggcc

240

tgagagggtg aacggccaca ttgggactga gacacggccc aaactcctac gggaggcagc

300

agtggggaat attgcacaat gggggaaacc ctgatgcagc gacgccgcgt gagtgatgaa

360

gtatttcggt atgtaaaact ctatcagcag ggaagataat gacggtacct gactaagaag

420

caccggctaa atacgtgcca gcagccgcgg taatacgtat ggtgcaagcg ttatccggat

480

ttactgggtg taaagggtgc gtaggtggta tggcaagtca gaagtgaaag gctggggctc

540

aaccccggga ctgcttttga aactgtcaaa ctagagtaca ggagaggaaa gcggaattcc

600

tagtgtagcg gtgaaatgcg tagatattag gaggaacacc agtggcgaag gcggctttct

660

ggactgaaac tgacactgag gcacgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg

720

tagtccacgc cgtaaacgat gaatactagg tgtcgggcag catagctgtt cggtgccgca

780

gcaaacgcat taagtattcc acctggggag tacgttcgca agaatgaaac tcaaaggaat

840

tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc

900

ttaccaggtc ttgacatccc gatgaccgc

929

<210> 858

<211> 1384

<212> DNA

<213> Eubacterium saburreum

<220>

<221> modified_base

<222> (17)..(18)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1375)..(1375)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 858

tcgaacgaag ctgttannag gaagtcttcg gatggaattt taacagactt agtggcggac

60

gggtgagtaa cgcgtggata acctgcctta tacaggggga taacggagag aaatttccgc

120

taagaccgca taagaccaca gcaccgcatg gtgcaggggt aaaatattaa taggtataag

180

atggatccgc gtccgattag cttgttggtg aggtagaggc tcaccaaggc gacgatcggt

240

agccggcctg agagggtgaa cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg

300

gaggcagcag tggggaatat tggacaatgg gggaaaccct gatccagcga cgccgcgtga

360

gtgaagaagt atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctga

420

ctaagaagcc ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg ggcaagcgtt

480

atccggattt actgggtgta aagggagcgc agacggccaa gcaagtctga agtgaaatgc

540

atgggctcaa cccatgaatt gctttggaaa ctgttggctt gagtgtcgga ggggtaagcg

600

gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag atattaggag gaacaccgga ggcgaaggcg

660

gcttactgga cgacaactga cgttgaggct cgaaggcgtg gggagcaaac aggattagat

720

accctggtag tccacgcagt aaacgatgaa tacttggtgt cggggagata aactcttcgg

780

tgccgcaagc aaacgcatta agtattccac ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc

840

aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc

900

gaagaacctt accaaatctt gacatactct tgaatagttt tgtaatgaga ctagtctttc

960

gggacaaggg atacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt

1020

aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtcgt cagtagccag cagtaagatg ggcactctga

1080

cgagacagcc ggagataatc cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt

1140

atgatttggg ctacacacgt gctacaatgg cgtaaacaaa gtgaagcaag accgcgaggt

1200

taagcaaatc acagaaataa cgtctcagtt cggattgtag tctgcaactc gactatatga

1260

agccggaatc gctagtaatc gcagatcaga atgctgcggt gaatacgttc ccgggtcttg

1320

tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtca tcaatgcccg aagtcagtga cctanccgta

1380

agga

1384

<210> 859

<211> 1343

<212> DNA

<213> Eubacterium saphenum

<400> 859

gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgagc gagaaactac atgcagacac

60

ttcggtagaa gcgagtagcg gaaagcggcg gacgggtgag taacgcgtgg caacctgccc

120

ttcacagagg tatagcctcg ggaaaccggg attaaaacca cataaaatca taggttcgca

180

tgaaccaaag gtcaaagatt tatcggtgaa ggatgggcct gcgtctgatt agctggttgg

240

tagggtaaaa gcctaccaag gcgacgatca gtagccgacc tgagagggtg atcggccaca

300

ttggaactga gacacggtcc aaactctacg ggaggcagca gtgggggata ttgcacaatg

360

ggggaaaccc tgatgcagca acgccgcgtg aggtatgaag gcctttgggt tgtaagcctc

420

tgtcctaggg gaagaaaaaa atgacggtac ccgaggagga agccccggct aactacgtgc

480

cagcagccgc ggtaatacgt agggggcaag cgttatccgg aattattggg cgtaaagagt

540

gcgtaggtgg tctactaagc gcggggtgaa aggcaatggc tcaaccattg ttagccttgc

600

gaactggcag acttgagtgc aagagaggaa agcggaattc ctagtgtagc ggtgaaatgc

660

gcagatatta ggaggaacac cggcggcgaa ggcggctttc tggattgtaa ctgacactga

720

ggcacgaaag cgtgggtagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga

780

cgagcactag gtgtcgggac atgagtctcg gtgccgcagt taacgcaata agtgtccgcc

840

tggggagtac gcacgcaagt gtaaaactca aaggaattga cggggacctg cgcaagcagc

900

ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaagacttg acatccctct

960

gacgtaccct taatcgggta tttcttcgga cagaggagac aggtggtgca tggttgtcgt

1020

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtctttagt

1080

tgccatcatt aagttgggca ctctaaagag actgccgggg aaactcggag gaaggtgggg

1140

atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgtc ttgggctaca cacgtgctac aatggccggt

1200

acaaagagaa gcgataccgc aagggggagc aaatcttaaa aaccggtccc agttcggatt

1260

gcaggctgca actcgcctgc atgaagtcgg agttgctagt aatcgcagat cagaatgctg

1320

cggtgaatgc gttcccgggt ctt

1343

<210> 860

<211> 1368

<212> DNA

<213> Eubacterium siraeum

<220>

<221> modified_base

<222> (901)..(901)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 860

gtcgaacggt gaagaggagc ttgctcctcg gaacagtggc ggacgggtga gtaacacgtg

60

agcaacctgg ctctaagagg gggacaacag ttggaaacga ctgctaatac cgcataacgt

120

atcgggatgg catcttcctg ataccaaaga ttttatcgct tagagatggg ctcgcgtctg

180

attagatagt tggcggggta acggcccacc aagtcgacga tcagtagccg gactgagagg

240

ttgaacggcc acattgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

300

gatattggac aatgggggca accctgatcc agcgacgccg cgtgagggaa gaaggttttc

360

ggattgtaaa cctctgttga cggagaaaaa aatgatggta tccgtttaga aagccacggc

420

taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg taggtggcaa gcgttgtccg gaattactgg

480

gtgtaaaggg agtgtaggcg ggatatcaag tagaagtgaa aattacgggc tcaactcgta

540

acctgctttt gaaactgaca ttcttgagtg aagtagaggc aagcggaatt cctagtgtag

600

cggtgaaatg cgtagatatt aggaggaaca ccagtggcga aggcggcttg ctgggctttt

660

actgacgctg aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac

720

gccgtaaacg atgattacta ggtgtggggg gattgacccc ttccgtgccg gagtaaacac

780

aataagtaat ccacctgggg agtacgaccg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg

840

gcccgcacaa gcagtggagt atgtggttta attcgacgca acgcgaagaa ccttaccagt

900

nataagtgaa aattaccggc tcaactcgta agcttttcct taaggggaca taattgaggg

960

aggtagaggc aagcggaaag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1020

caacccttat cattagttgc tacgcaagag cactctaatg agactgccgt tgacaaaacg

1080

gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccctttat gacctgggct acacacgtac

1140

tacaatggcg tttaacaaag agaagcaaag ccgcgaggca gagcaaatct ccaaaaaacg

1200

tctcagttcg gattgtaggc tgcaactcgc ctacatgaag tcggaattgc tagtaatcgt

1260

aggtcagcat actacggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcaaaccat

1320

gagagttggc aacacccgaa gtcggtagtc taaccgcaag gaggacgc

1368

<210> 861

<211> 965

<212> DNA

<213> Eubacterium sp. 3_1_31

<220>

<221> modified_base

<222> (39)..(39)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (41)..(41)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (842)..(842)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (875)..(875)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (904)..(904)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (915)..(915)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (934)..(934)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 861

tttaggaagc ttgcttccaa agagacttag tggcgaacng ntgagtaaca cgtaggtaac

60

ctgcccatgt gcccgggata actgctggaa acggtagcta aaaccggata ggtatgaggg

120

aggcatcttc ctcatattaa agcaccttcg ggtgtgaaca tggatggacc tgcggcgcat

180

tagctggttg gtgaggtaac ggcccaccaa ggcgatgatg cgtagccgac ctgagagggt

240

gaacggccac attgggactg agacacggcc caaactccta cgggaggcag cagtagggaa

300

ttttcgtcaa tggggggaac cctgaacgag caatgccgcg tgtgtgaaga aggtcttcgg

360

atcgtaaagc actgttgtaa gtgaagaatg ccatatagag gaaatgctat gtgggtgacg

420

gtagcttacc agaaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg

480

caagcgttat ccggaatcat tgggcgtaaa gggtgcgtag gtggcacgat aagtctgaag

540

taaaaggcaa cagctcaact gttgtatgct ttggaaactg tcgagctaga gtgcagaaga

600

gggcgatgga attccatgtg tagcggtaaa atgcgtagat atatggagga acaccagtgg

660

cgaaggcggt cgcctggtct gtaactgaca ctgatgcacg aaagcgtggg gagcaaatag

720

gattagatac cctagtagtc cacgccgtaa acgatgagaa ctaagtgttg gagagattca

780

gtgctgcagt taacgcaata agttctccgc ctggggagta tgcacgcaag tgtgaaactc

840

anaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggantatgt ggtttaattc gaagcaacgc

900

gaanaacctt accangcctt gacatggata taantgttct agagatagaa agatagctat

960

atatc

965

<210> 862

<211> 1229

<212> DNA

<213> Eubacterium sp. AS15b

<400> 862

tgagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgaac

60

gagtggcgga cgggtgagta acgcgtaagt aatcaacctg tgacacacgg ataactgata

120

gaaatgtcag ctaatacgag atgaacaaag gcggtcacag acgagcttgc gtctgattag

180

ctagttggtg gggtaagagc ctaccaaggc gacgatcagt agccggcctg agagggtgaa

240

cggccacatt ggaactgaga cacggtccaa actcctacgg gaggcagcag tgggggatat

300

tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ccctagggtc

360

gtaaagctct gtcgtatggg aagatgactg taccatacaa gaaagccccg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc aagcgttatc cggaattact gggcgtaaag

480

ggtgcgtagg cggctagtta agtcgaggtt aaaaggcagt agctcaacta ctgttgggcc

540

ttgaaactaa ttagcttgag tataggagag gaaagtggaa ttcccggtgt ggcggtgaaa

600

tgcgtagata tcgggaggaa taccggtggc gaaggcgact ttctggacta actgacgctg

660

aggcacgaaa gcgtgggtag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgaacacta ggtgtcggga tttcggtgcc ggcgcaaacg caataagtgt tccgcctggg

780

gagtacgttc gcaagaataa aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agtagcggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccta agcttgacat gcacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctattga tagttgccag tgcgtaggca ctctatcaag acagttatgg ataacataaa

1020

ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgc ttagggctac acacgtgcta

1080

caatggctgt caaagagaag caaggtcgca aggcggagca aacctgaagc agtccaagtt

1140

cggatgtggg ctgaaactcg cccacagaag tcggagttac tagtaatcgc gaatcagaat

1200

gtcgcggtga atgcgttccc gggtcttgt

1229

<210> 863

<211> 1253

<212> DNA

<213> Eubacterium sp. OBRC9

<220>

<221> modified_base

<222> (1234)..(1234)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 863

agtggcggac gggtgagtaa cgcgtaagta atcaacctgt gacacacgga taactgatag

60

aaatgtcagc taatacgaga tgaacaaagg cggtcacaga cgagcttgcg tctgattagc

120

tagttggtgg ggtaagagcc taccaaggcg acgatcagta gccggcctga gagggtgaac

180

ggccacattg gaactgagac acggtccaaa ctcctacggg aggcagcagt gggggatatt

240

gcacaatggg gggaaccctg atgcagcaac gccgcgtgag tgaagaaggc cctagggtcg

300

taaagctctg tcgtatggga agatgactgt accatacaag aaagccccgg ctaactacgt

360

gccagcagcc gcggtaatac gtagggggca agcgttatcc ggaattactg ggcgtaaagg

420

gtgcgtaggc ggctagttaa gtcgaggtta aaaggcagtg gctcaactac tgttgggcct

480

tgaaactaat tagcttgagt ataggagagg aaagtggaat tcccggtgta gcggtgaaat

540

gcgtagatat cgggaggaat accggtggcg aaggcgactt tctggactaa ctgacgctga

600

ggcacgaaag cgtgggtagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga

660

tgaacactag gtgtcgggat ttcggtgccg gcgcaaacgc aataagtgtt ccgcctgggg

720

agtacgttcg caagaataaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gtagcggagc

780

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttacctaa gcttgacatg cacaggtggt

840

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

900

ccctattgat agttgccagt acgtaggcac tctattaaga cagttatgga taacataaag

960

gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgct tagggctaca cacgtgctac

1020

aatggctgtc aaagagaagc aaggtcgtaa ggcggagcaa acctgaagca gtccaagttc

1080

ggatgtgggc tgaaactcgc ccacagaagt cggagttact agtaatcgcg aatcagaatg

1140

tcgcggtgaa tgcgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagctgagg

1200

gtacccaaag tcagtatcta agaagctgcc taangtaaac ttagtgactg ggg

1253

<210> 864

<211> 1371

<212> DNA

<213> Eubacterium sp. WAL 14571

<220>

<221> modified_base

<222> (925)..(925)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1268)..(1268)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 864

tcgagcgaga agccattgac tgaaacttcg gtagaaggat atggtggaaa gcggcggacg

60

ggtgagtaac gcgtaggcaa cctgcccctt acagagggat agccattgga aacgatgatt

120

aaaacctcat aacgcatccc ccccacatgg aggggaagcc aaagattcat cggtaaggga

180

tgggcctgcg tctgattagc ttgttggcgg ggtaacggcc caccaaggcg acgatcagta

240

gccgacctga gagggtgatc ggccacattg gaactgagac acggtccaaa ctcctacggg

300

aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg cgaaagcctg atgcagcaac gccgcgtgag

360

ggatgaaggc cttcgggtcg taaacctctg tccttgggga agaaacaaat gacggtaccc

420

atggaggaag ccccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggggcgagcg

480

ttatccggaa ttattgggcg taaagagtgc gtaggtggtt acctaagcgc agggtctaag

540

gcaatggctc aaccattgtt cgccctgcga actgggctac ttgagtgcag gagaggaaag

600

cggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattagg aggaacacca gtggcgaagg

660

cggctttctg gactgttact gacactgagg cacgaaagcg tggggagcaa acaggattag

720

ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agcactaggt gtcggggccg caaggcttcg

780

gtgccgcagt taacgcatta agtgctccgc ctggggagta cgcacgcaag tgtgaaactc

840

aaaggaattg acggggaccc gcacaagcag cggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc

900

gaagaagctt aaccagtgtt cgccntccga actgggctac ctaaccggat ccttcttcgg

960

acagtggaga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag

1020

tcccgcaacg agcgcaaccc ttgccattag ttgccatcat tcagttgggc actctaatgg

1080

gactgccggg gacaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg

1140

ttctgggcta cacacgtgct acaatggccg gtacagcaag aagcaaaacc gcgaggtgga

1200

gcaaatctca aaaaccggtc ccagttcgga ctgcaggctg aaacccgcct gcacgaagcc

1260

ggagttgnta gtaatcgtgg atcagaatgc cacggtgaat gcgttcccgg gtcttgtaca

1320

caccgcccgt cacaccatgg aagttggggg tgcccgaagc cggcagggaa a

1371

<210> 865

<211> 1363

<212> DNA

<213> Eubacterium sp. oral clone GI038

<400> 865

gagtttgatt ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgcc taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcggac gggtgagtaa cgcgtgggca acctgcccca taccggggga tagcagttgg

120

aaacggctgg taaaaccgca taagaaaaag tggtatggga tgggcccgcg tctgattagc

180

cagttggtga ggtaacggct caccaaagcg acgatcagta gccggcctga gagggcggac

240

ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt gggggatatt

300

gcacaatgga ggaaactctg atgcagcgac gccgcgtgag tgaagaagta tttcggtatg

360

taaagctcta tcagcaggga agatgacggt acctgagtaa gaagctccgg ctaaatacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtatggagca agcgttatcc ggatttactg ggtgtaaagg

480

gagcgcagac ggatatgcaa gtctgaagtg aaaccccacg gctcaaccgt gggcttgctt

540

tggaaactgt agatctagag tactggagag gtaagcggaa ttcctggtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata tcaggaagaa catcggcggc gaaggcggct tactggacag actgacgttg

660

aggctcgaag gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagcccac gcggtaaacg

720

atgaatacta ggtgttggga tttcagtgcc gaagcaaacg tgataagtat tccacctggg

780

gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag accttgaatc gacaggtggt

900

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccttgcgtat agtagccagc aattgggaac tctatacgga ctgccgggga taacccggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatggt ctgggctaca cacgtgctac

1080

aatgtcgcag agggaagcga aagggtgacc tgaagcgaat ctcaaaacga cccagttcgg

1140

atgcaggctg caacccgcct gcagaagctg gaatcgctag taatcgcgaa tcagcatgtc

1200

gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtcgggaat

1260

gcccgaagcc ggtacctaag gagccgtcga aggcaggccg gatgactggg gtgaagtcgt

1320

aacaaggtag ccgtaggaga acctgcggct ggaacacctc ctt

1363

<210> 866

<211> 1364

<212> DNA

<213> Eubacterium sp. oral clone IR009

<400> 866

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcgg gcggcatgct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcggac gggtgagtaa cgcgtggata acctgcctta tacaggggga taacggagag

120

aaatttccgc taagaccgca taagaaaatt aggtataaga tggatccgcg tccgattagc

180

ttgttggtga ggtagaggct caccaaggcg acgatcggta gccggcccga gagggtgaac

240

ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

300

ggacaatggg ggaaaccctg atccagcgac gccgcgtgag tgaagaagta tttcggtatg

360

taaagctcta tcagcaggga agatgacggt acctgactaa gaagccccgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtagggggca agcgttatcc ggatttactg ggtgtaaagg

480

gagcgcagac ggccaagcaa gtctgaagtg aaatgcatgg gctcaaccca tgaattgctt

540

tggaaactgt taggcttgag tgtcggaggg gtaagcggaa ttcctagtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata ttaggaggaa caccggaggc gaaggcggct tactggacga actgacgttg

660

aggctcgaag gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gcagtaaacg

720

atgaatactt ggtgtcgggg cttcggtgcc gcagcaaacg cattaagtat tccacctggg

780

gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccaa atcttgacat atacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccttgtcgt cagtagccag catgggaact ctgacgagac agccggagat aatccggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgatt tgggctacac acatgctaca

1080

atggcgtaca aagtgaagca agaccgcgag gttaagcaaa tcacagaacg tctcagttcg

1140

gatgtagtct gcaactcgac tatagaagcc ggaatcgcta gtaatcgcag atcagaatgc

1200

tgcggtgaat acgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtcatcaa

1260

tgcccgaagt cagtacctaa ggagctgccg aaggcaggga ggataactgg ggtgaagtcg

1320

taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggt tggatcacct cctt

1364

<210> 867

<211> 1360

<212> DNA

<213> Eubacterium sp. oral clone JH012

<400> 867

ggagtttgat cctggctcag gaggaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc

60

gagcggcgga cgggtgagta acgcgtaggc aacctgccct ttgcacaggg atagcctcgg

120

gaaaccggga ttaaaacctg ataatcaaat taggcaaagg atgggcctgc gtctgattag

180

cttgttggtg aggtaacggc tcaccaaggc gacgatcagt agccgacctg agagggtaaa

240

cggccacatt ggaactgaga cacggtccaa actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

300

tgcacaatgg gcgaaagcct gatgcagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg cccttgggtc

360

gtaaaactct gttgagaggg aagatgacgg tacctcttga ggaagccccg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc gagcgttatc cggaattatt gggcgtaaag

480

agtgcgtagg tggttatcta agcgtggggt gaaaggcagt ggcttaacca ttgtaagcct

540

tgcgaactgg atagcttgag tgcaggaggg gaaagtggaa ttcctagtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata ttaggaggaa caccggtggc gaaggcggct ttctggactg actgacactg

660

aggcacgaaa gcgtgggtag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgagcacta ggtgttgggg cctcagtgcc gcagttaacg caataagtgc tccgcctggg

780

gagtacgcac gcaagtgtaa aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcagcggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gacttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccttgtcaa tagttgccag catgggcact ctattgagac tgccgtggat aacacggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgttt tgggctacac acgtgctaca

1080

atggccggca acgagaagca agaccgcaag gtggagcaaa acttaaccgg tcccagttcg

1140

gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagat ggagttgcta gtaatcgcag atcagaatgc

1200

tgcggtgaat gcgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatgg aagttggggg

1260

tgcccgaagt cggttaggag ctgccgaagg caaaaccaat gactggggtg aagtcgtaac

1320

aaggtagccg tatcggaagg tgcggctgga tcacctcctt

1360

<210> 868

<211> 1365

<212> DNA

<213> Eubacterium sp. oral clone JI012

<400> 868

ggagtttgat tctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gagtggcgga cgggtgagta acgcgtgggc aacctgcctt atacaggggg ataacagaga

120

gaaatttccg ctaatacccc ataagaaaag ttggtataag atggacccgc gtctgattag

180

ctggttggtg aggtaaaggc tcaccaaggc gacgatcagt agccggcctg agagggtgaa

240

cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

300

tggacaatgg ggggaaccct gatccagcga cgccgcgtga gtgaagaagt atttcggtat

360

gtaaagctct atcagcaggg aagatgacgg tacctgacta agaagccccg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc aagcgttatc cggatttact gggtgtaaag

480

ggagcgtaga cggtactgca agtctggagt gaaacccgcg ggctcaacct gcggcatgct

540

ttggaaactg tggtactgga gtgtcggaga ggtaagcgga attcccagtg tagcggtgaa

600

atgcgtagat attgggaaga acacctgggg cgaaggcggc ttactggacg aactgacgtt

660

gaggctcgaa ggcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgcagtaaac

720

gatgaatact aggtgtcggg atttcggtgc cgtcgcaaac gcaataagta ttccacctgg

780

ggagtacgtt cgcaagaatg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga

840

gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacca agtcttgaca tatacaggtg

900

gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

960

acccttgtga tcagtagcca gcatggggac tctgatcaga cagccggaga taatccggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgat ttgggctaca cacgtgctac

1080

aatggcggac aaagagaagc gagtgtgcga acataagcaa acctcaagcc gtctcagttc

1140

ggatgtagtc tgcaactcga ctatagaagc tggaatcgct agtaatcgca aatcagaatg

1200

ttgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtcatca

1260

atgcccgaag tcagtaccta aggagctgcc gaaggcaggg aggataactg gggtgaagtc

1320

gtaacaaggt agccgtatcg gaaggtgcgg ctggatcacc tcctt

1365

<210> 869

<211> 1364

<212> DNA

<213> Eubacterium sp. oral clone JN088

<400> 869

gagtttgatt ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgcc taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcggac gggtgagtaa cacgtgggta acctgcctta tggaggggga taacagagag

120

aaatcactgc taataccgca taagaaaagt cgccataaga tggacccgcg tctgattagc

180

cagttggcag ggtaaaagcc taccaaagca acgatcagta gccgatctga gaggatgacc

240

ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

300

gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcgac gccgcgtgag tgaagaagta tttcggtatg

360

taaagctcta tcagcaggga agatgacagt acctgactaa taagccccgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtatggggcg agcgttatcc ggatttactg ggtgtaaagg

480

gagcgtagac ggaatggcaa gtctgaagtg aaatacccgg gctcaacctg gggactgctt

540

tggaaactgt tgttctacag tgttggagag gtaagtggaa ttcctggtgt agcggtgaaa

600

tgcgtatata tcaagaagaa caccggaggc gaaggcggct tactggacaa actgacgttg

660

aggctcgaaa gcgtggggat caaacaggat tagataccct ggtattccac gctgtaaacg

720

atgaatacta ggtgtcgggg tctcggtgcc gtcgctaacg caataagtat tccacctggg

780

gagtacgttc gcaagaatga aactcatagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccaa gtcttgagat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctatagt tagtatccag catgggcact ctaactagac tgccagggat aacctggagg

1020

aaggcgggga tgacgtccaa tcatcatgcc ccttatgact tgggctacac acgtgctaca

1080

atggcgtaca aagggaagcg agagggtgac cttaagcaaa tctcaaaacg tctcagttcg

1140

gatgtagtct gcaacccgac tacagaagct ggaatcgcta gtaatcgcag atcagcatgc

1200

tgcggtgaat acgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagttggtaa

1260

tgcccgaagt cagttcccag ggagctgccg aaggcaggac tgatgactgg ggtgaagtca

1320

taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcacct cctt

1364

<210> 870

<211> 1354

<212> DNA

<213> Eubacterium sp. oral clone JS001

<400> 870

ggagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc

60

gagcggcgga cgggtgagta acgcgtaggc aacctaccct tcacccaggg acagcctccg

120

gaaacgggga ttaatacctg atgaccaaag ttggtgaggg atgggcctgc gtctgattag

180

ttagttggtg aggtaacggc tcaccaaggc gacgatcagt agccgacctg agagggtgac

240

cggccacatt ggaactgaga cacggtccag actcctgcgg gaggcagcag tggggaatat

300

tgcacaatgg gcgaaagcct gatgcagcaa cgccgcgtga aggatgaagg tccttggatt

360

gtaaacttct gtccataggg aagatgacgg tacctatgga ggaagccccg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc aagcgttatc cggaattatt gggcgtaaag

480

cgtgcgtagg cggcttttta agcgtggggt ttaaggctat ggctcaacca tagtatgccc

540

tgcgaactgg aaggcttgag tacaggagag gaaagcggaa ttcctagtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata ttaggaggaa caccagtggc gaaggcggct ttctggactg actgacgctg

660

aggtacgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg

720

atgagcacta ggtgtcgggg cttcggtgcc gcagttaacg caataagtgc tccgcctggg

780

gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcagcggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gacttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccttgttac tagttgccat catgggcact ctagtgagac tgccggggac aactcggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgttc tgggctacac acgtgctaca

1080

atggctggca aagagaagcg agaccgtgag gtggagcaaa actcaccagc cccagttcgg

1140

atgcaggctg caactcgcct gcagaagccg gagttgctag taatcgcaga tcagaatgct

1200

gcggtgaatg cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc acaccatgga agttgggggc

1260

gcccgaagtt ggtattacct aaggcgaaac cgatgactgg ggtgaagtcg taacaaggta

1320

gccgtaggag aacctgcggc tggatcacct cctt

1354

<210> 871

<211> 1427

<212> DNA

<213> Eubacterium sp. oral clone OH3A

<220>

<221> modified_base

<222> (11)..(11)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 871

tcgacgaagg natatatagg aagtcttcgg atggaatatg tataacttag tggcggacgg

60

gtgagtaacg cgtaagtaat caacctgtga cacacggata actgatagaa atgtcagcta

120

atacgagatg aactgtttaa attgggaaat ggaaacagca aagcgaaagc ggtcacagac

180

gagcttgcgt ctgattagct agttggtggg gtaagagcct accaaggcga cgatcagtag

240

ccggcctgag agggtgaacg gccacattgg aactgagaca cggtccaaac tcctacggga

300

ggcagcagtg ggggatattg cacaatgggg ggaaccctga tgcagcaacg ccgcgtgagt

360

gaagaaggcc ctagggtcgt aaagctctgt cgtatgggaa gaaacaaatg actgtaccat

420

acaagaaagc cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gggcaagcgt

480

tatccggaat tactgggcgt aaagggtgcg taggcggcta gttaagtcga ggttaaaagg

540

cagtagctca actactgttg ggccttgaaa ctaattagct tgagtatagg agaggaaagt

600

ggaattcccg gtgtagcggt gaaatgcgta gatatcggga ggaataccgg tggcgaaggc

660

gactttctgg actataactg acgctgaggc acgaaagcgt gggtagcaaa caggattaga

720

taccctggta gtccacgccg taaacgatga acactaggtg tcgggaggaa tttcggtgcc

780

ggcgcaaacg caataagtgt tccgcctggg gagtacgttc gcaagaataa aactcaaagg

840

aattgacggg gacccgcaca agtagcggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga

900

accttaccta agcttgacat ggggatgaaa agcaatgtaa agttgtaatg atactttcgg

960

gtatacatcc cacacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt

1020

taagtcccgc aacgagcgca acccctattg atagttgcca gtgcgttaag ataggcactc

1080

tatcaagaca gttatggata acataaagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc

1140

cttatgctta gggctacaca cgtgctacaa tggctgtaac aaagagaagc aaagtcgcaa

1200

ggcggagcaa acctgaaaaa agcagtccaa gttcggattg tgggctgaaa ctcgcccaca

1260

tgaagtcgga gttactagta atcgcgaatg agaatgtcgc ggtgaatgcg ttcccgggtc

1320

ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag ctgagggtac ccaaagtcag tgatctaacg

1380

taagaagaag ctgcctaagg taaagttagt gactgggggg aagtcgt

1427

<210> 872

<211> 1356

<212> DNA

<213> Eubacterium tenue

<220>

<221> modified_base

<222> (1343)..(1343)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1349)..(1349)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 872

tcgagcgatt ctcttcggag aagagcggcg gacgggtgag taacgcgtgg gtaacctgcc

60

ctgtacacac ggataacata ccgaaaggta tgctaatacg agatgatata taattgttgc

120

atgattttta tatcaaagct tttgcggtac aggatggacc cgcgtctgat tatctagttg

180

gtaaggtaac ggcttaccag ggcgacgatc agtagccgac ctgagagggt gatcggccac

240

actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa

300

tgggcgaaag cctgatgcag caacgccgcg tgagcgatga aggccttcgg gtcgtaaagc

360

tctgtcctca aggaagataa tgacggtact tgaggaggaa gccccggcta actacgtgcc

420

agcagccgcg gtaatacgta gggggctagc gttatccgga attactgggc gtaaagggtg

480

cgtaggcggt ctttcaagcc agaagtgaaa ggctacggct caaccgtagt aagcttttgg

540

aactgtagac ttgagtgcag gagaggagag tggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt

600

agatattagg aggaacacca gtagcgaagc ggctctctgg actgtactga cgctgaggca

660

cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag

720

tactagtgtc gggggttacc cccctcggtg ccgcagctaa cgcattaagt actccgcctg

780

ggaagtacgc tcgcaagagt gaaactcaca ggaattgacg gggacccgca caagtagcgg

840

atcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa caaccttacc taaacttgac atccccttga

900

cctctcccgt atcggatatt tcccgtcggg gacagtggtg acaggtggtg catgattgcc

960

gtcagctcgt gtcgtgagat gatgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgccttta

1020

gttgccagca ttaagttggg cactctagag ggactgccga ggataactcg gaggaaggtg

1080

gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gcttagggct acacacgtgc tacaatgggt

1140

ggtacagagg gttgccaaac cgtgaggtgg agctaatccc ttaaagccat tctcagttcg

1200

gattgtaggc tgaaactcgc ctacatgaag ctggagttac tagtaatcgc agatcagaat

1260

gctgcggtga atgcgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagttggg

1320

ggcgcccgaa gccggttagc tancctttng gaagcg

1356

<210> 873

<211> 1486

<212> DNA

<213> Eubacterium tortuosum

<220>

<221> modified_base

<222> (1)..(1)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (123)..(123)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (347)..(347)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (970)..(970)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1026)..(1026)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1051)..(1051)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 873

ncaaatggag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctgg cggcatgcct aatacatgca

60

agtcgaacga agtcaattga aagcttgctt ttaaaagact tagtggcgaa cgggtgagta

120

acncgtaggt aacctaccca tgtaactggg ataactgctg gaaacggtag ctaaaaccgg

180

ataggtaaga ttgaggcatc ttaatcttat gaaaaaagct ttcgggcttt gaacatggat

240

ggacctgcgg cgcattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcga tgatgcgtag

300

ccgacctgag agggtgaacg gccacattgg gactgagaca cggcccnaac tcctacggga

360

ggcagcagta gggaattttc gtcaatgggg ggaaccctga acgagcaatg ccgcgtgagt

420

gaagaaggtc ttcggatcgt aaagctctgt tgtaagtgaa gaaagatgta tataggaaat

480

gatatacaag tgacggtagc ttaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg

540

gtaatacgta ggtggcaagc gttatccgga atcattgggc gtaaagggtg cgtaggtggt

600

acattaagtc tgaagtaaaa ggcatcagct caactgatgt tagctttgga aactgatgaa

660

ctagagtgca gaagagggca atggaattcc atgtgtagcg gtaaaatgcg tagatatatg

720

gaggaacacc agtggcgaag gcggttgcct ggtctgtaac tgacactgat gcacgaaagc

780

gtggggagca aataggatta gataccctag tagtccacgc cgtaaacgat gagaactaag

840

tgttggggaa actcagtgct gcagttaacg caataagttc tccgcctggg gagtatgcac

900

gcaagtgtga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag tatgtggttt

960

aattcgaagn aacgcgaaga accttaccag gccttgacat ggatgtaaaa gccctagaga

1020

tagggnaata ggtatacatc acacaggtgg ngcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1080

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtcac atgttaccaa tattaagtta

1140

gggactcatg tgagactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat

1200

catgcccctt atggcctggg ctacacacgt actacaatgg cgactacaaa gagcagcgaa

1260

cctgcgaagg caagcgaatc tcataaaggt cgtctcagtt cggattgaag tctgcaactc

1320

gacttcatga agtcggaatc gctagtaatc gcagatcagc atgctgcggt gaatacgttc

1380

tcgggccttg tacacaccgc ccgtcaaacc atgggagttg gtaatacccg aagccggtgg

1440

cataaccgca aggagtgagc cgtcgaaggt aggaccgatg actggg

1486

<210> 874

<211> 1378

<212> DNA

<213> Eubacterium ventriosum

<400> 874

caccttggac agaatccttc gggaggaaga ccattgtgac tgagtggcgg acgggtgagt

60

aacgcgtggg taacctgcct tgtacagggg gataacagtt ggaaacgact gctaataccg

120

cataagcgca cagtaccgca tggtacggtg tgaaaaactc cggtggtaca agatggaccc

180

gcgtctgatt agctagttgg tgaggtaacg gcccaccaag gcgacgatca gtagccgact

240

tgagagagtg atcggccaca ttgggactga gacacggccc aaactcctac gggaggcagc

300

agtagggaat attgcacaat gggggaaacc ctgatgcagc gacgccgcgt gaagaagaag

360

tatttcggta tgtaaacttc tatcagcaag gaagaaaatg acggtacttg actaagaagc

420

cccggctaaa tacgtgccag cagccgcggt aatacgtatg gggcaagcgt tatccggatt

480

tactgggtgt aaagggagcg taggcggcat ggcaagtcag aagtgaaagc ctggggctca

540

accccggaat tgcttttgaa actgtcaggc tagagtgtcg gaggggtaag cggaattcct

600

agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattagg aggaacaccg gtggcgaagg cggcttactg

660

gacgattact gacgctgagg ctcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt

720

agtccacgcc gtaaacgatg aatactacgt gtcgggggac aatagttcct cggtgccgaa

780

gcaaacgcat taagtattcc acctggggag tacgttcgca agaatgaaac tcaaaggaat

840

tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc

900

ttacctgctc ttgacatccc actgacaggt cagtaatgtg accctttcct cggaacagtg

960

gagacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1020

aacgagcgca acccttgtct ttagtagcca gcagtccggc tgggcactct agagagactg

1080

ccagggataa cctggaggaa ggcggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttacgagcag

1140

ggctacacac gtgctacaat ggcgtaaaca aagggaagcg accccgtgag ggcaagcaaa

1200

tctcaaaaat aacgtctcag ttcggattgt agtctgcaac tcgactacat gaagctggaa

1260

tcgctagtaa tcgcgaatca gaatgtcgcg gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc

1320

gcccgtcaca ccatgggagt tggatatgcc cgaagtcagt gacccaaccg taaggagg

1378

<210> 875

<211> 1496

<212> DNA

<213> Eubacterium xylanophilum

<220>

<221> modified_base

<222> (1)..(2)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (267)..(267)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (366)..(366)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (551)..(552)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (618)..(618)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (634)..(635)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (854)..(854)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (972)..(973)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1201)..(1202)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1391)..(1392)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1409)..(1409)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1448)..(1448)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1456)..(1456)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 875

nnaatttgag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca

60

agtcgaacga agcatctctc ccgaagattg aagtagcttg ctacagattg attcatttga

120

gatgacttag tggcggacgg gtgagtaacg cgtgggtaac ctgcctcata gagggggaca

180

acagttggaa acgactgcta ataccgcata acatgtgact gtcacatgac agacacatca

240

aagcttttgc gctatgagat ggacccncgt ctgattagct agttggtaag gtaacggctt

300

accaaggcga cgatcagtag ccggcttgag agagtgaacg gccacattgg gactgagaca

360

cggccnagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggg gaaaccctga

420

tgcagcgacg ccgcgtgagt gaagaagtat ttcggtatgt aaagctctat cagcagggaa

480

gataatgacg gtacctgact aagaagcccc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

540

acgtaggggg nnagcgttat ccggatttac tgggtgtaaa gggagcgtag gtggcaaggc

600

aagtcagatg tgaaatgncg gggctcaacc ccgnnactgc atttgaaact gtctagctag

660

agtgcaggag aggtaagtgg aattcctagt gtagcggtga aatgcataga tattaggagg

720

aacaccagtg gcgaaggcgg cttactggac tgtaactgac actgaggctc gaaagcgtgg

780

ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgaat actaggtgtc

840

ggggcccaca gggnttcggt gccgcagcaa acgcattaag tattccacct ggggagtacg

900

ttcgcaagaa tgaaactcaa aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gagcatgtgg

960

attaattcga annaacgcga agaaccttac caagtcttga catcctgctg accgttcctt

1020

agtcggaact tctcttcgga gcagcagaga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1080

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttattcttag tagccagcat

1140

tttggatggg cactctaggg agactgccgg agacaatccg gaggaaggtg gggatgacgt

1200

nnaatcatca tgccccttat gacttgggct tcacacgtgc tacaatggtg actacaaagt

1260

gaagcgaccc tgtgaaggta agccaaccac aaaaaggtca tctcagttcg gattgtagtc

1320

tgcaactcga ctacatgaag ctggaatcgc tagtaatcgc aaatcagcat gttgcggtga

1380

atacgttccc nngtcttgta cacaccgcnc gtcacaccat gggagttgga tatgcccgaa

1440

gccggtgncc caaccntaag gagggagccg tcgaaggtgg agccaatgac tggggt

1496

<210> 876

<211> 1536

<212> DNA

<213> Eubacterium yurii

<400> 876

ttttaattga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgcc taacacatgc

60

aagtcgaacg aagtatatat atgaagtctt cggatggaat ataaataact tagtggcgga

120

cgggtgagta acgcgtaagt aatcaacctg tgacacacgg ataactgata gaaatgtcag

180

ctaatacgag atgaactgtt tagattggga aatggaaaca gcaaagcgaa agcggtcaca

240

gacgagcttg cgtctgatta gctagttggt ggggtaagag cctaccaagg cgacgatcag

300

tagccggcct gagagggtga acggccacat tggaactgag acacggtcca aactcctacg

360

ggaggcagca gtgggggata ttgcacaatg gggggaaccc tgatgcagca acgccgcgtg

420

agtgaagaag gccctagggt cgtaaagctc tgtcgtatgg gaagaaacaa atgactgtac

480

catacaagaa agccccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggggcaag

540

cgttatccgg aattactggg cgtaaagggt gcgtaggcgg ctagttaagt cgaggttaaa

600

aggcagtagc tcaactactg ttgggccttg aaactaatta gcttgagtat aggagaggaa

660

agtggaattc ccggtgtagc ggtgaaatgc gtagatatcg ggaggaatac cggtggcgaa

720

ggcgactttc tggactataa ctgacgctga ggcacgaaag cgtgggtagc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgaacactag gtgtcgggag gaatttcggt

840

gccggcgcaa acgcaataag tgttccgcct ggggagtacg ttcgcaagaa taaaactcaa

900

aggaattgac ggggacccgc acaagtagcg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga

960

agaaccttac ctaagcttga catggggatg aaaagcaatg taaagttgta atgatacttt

1020

cgggtataca tcccacacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccccta ttgatagttg ccagtgcgtt atggtaggca

1140

ctctatcaag acagttatgg ataacataaa ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg

1200

ccccttatgc ttagggctac acacgtgcta caatggctgt aacaaagaga agcaaggtcg

1260

caaggcggag caaacctgaa aaaagcagtc caagttcgga ttgtgggctg aaactcgccc

1320

acatgaagtc ggagttacta gtaatcgcga atcagaatgt cgcggtgaat gcgttcccgg

1380

gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagctgaggg tacccaaagt cagtgatcta

1440

acgaaagaag aagctgccta aggtaaactt agtgactggg gtgaagtcgt aacaaggtag

1500

ccgtatcgga aggtgcggct ggatcacctc ctttct

1536

<210> 877

<211> 1534

<212> DNA

<213> Ewingella americana

<400> 877

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc

60

ggcagcggga agtagcttgc tactttgccg gcgagcggcg gacgggtgag taatgtctgg

120

gaaactgcct gatggagggg gataactact ggaaacggta gctaataccg catgacctcg

180

aaagagcaaa gtgggggacc ttcgggcctc acgccatcgg atgtgcccag atgggattag

240

ctagtaggtg aggtaatggc tcacctaggc gacgatccct agctggtctg agaggatgac

300

cagccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcca tgccgcgtgt gtgaagaagg ccttcgggtt

420

gtaaagcact ttcagcgagg aggaaggcgt taaggttaat aaccttagcg attgacgtta

480

ctcgcagaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa

540

gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg cacgcaggcg gtttgttaag tcagatgtga

600

aatccccgag cttaacttgg gaactgcatt tgaaactggc aagctagagt cttgtagagg

660

ggggtagaat tccaggtgta gcggtgaaat gcgtagagat ctggaggaat accggtggcg

720

aaggcggccc cctggacaaa gactgacgct caggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgctgtaaac gatgtcgatt tggaggttgt gggcttgacc

840

cgtggcttcc ggagctaacg cgttaaatcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

900

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

960

aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat ccagagaatt cgctagagat agcttagtgc

1020

cttcgggaac tctgagacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta tcctttgttg ccagcgagta atgtcgggaa

1140

ctcaaaggag actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg

1200

gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggcata tacaaagaga agcgaactcg

1260

cgagagcaag cggacctcat aaagtatgtc gtagtccgga ttggagtctg caactcgact

1320

ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgtag atcagaatgc tacggtgaat acgttcccgg

1380

gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttg caaaagaagt aggtagctta

1440

accttcggga gggcgcttac cactttgtga ttcatgactg gggtgaagtc gtaacaaggt

1500

aaccgtaggg gaacctgcgg ttggatcacc tcct

1534

<210> 878

<211> 1412

<212> DNA

<213> Exiguobacterium acetylicum

<220>

<221> modified_base

<222> (1360)..(1362)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1364)..(1365)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 878

gcgcaggaag ctgacggaac tcttcggagg gaaggcagtg gaatgagcgg cggacgggtg

60

agtaacacgt aaggaacctg cctcaaggat tgggataact ccgagaaatc ggagctaata

120

ccggatagtt caacggaccg catggtccgc tgatgaaagg cgctccggcg tcaccttgag

180

atggccttgc ggtgcattag ctagttggtg gggtaacggc ccaccaaggc gacgatgcat

240

agccgacctg agagggtgat cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg

300

gaggcagcag tagggaatct tccacaatgg acgaaagtct gatggagcaa cgccgcgtga

360

gtgatgaagg ttttcggatc gtaaaactct gttgtaaggg aagaacacgt acgagaggga

420

atgctcgtac cttgacggta ccttacgaga aagccacggc taactacgtg ccagcagccg

480

cggtaatacg taggtggcaa gcgttgtccg gaattattgg gcgtaaagcg cgcgcaggcg

540

gccttttaag tctgatgtga aagcccccgg ctcaaccggg gagggccatt ggaaactgga

600

aggcttgagt acagaagaga agagtggaat tccacgtgta gcggtgaaat gcgtagagat

660

gtggaggaac accagtggcg aaggcgactc tttggtctgt aactgacgct gaggcgcgaa

720

agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct

780

aggtgttggg gggtttccgc ccctcagtgc tgaagctaac gcattaagca ctccgcctgg

840

ggagtacggc cgcaaggctg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga

900

gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacca actcttgaca tcccattgac

960

cgcttgagag atcaagtttt cccttcgggg acaatggtga caggtggtgc atggttgtcg

1020

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ctatccttag

1080

ttgccagcat tcagttgggc actctaggga gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg

1140

ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg agttgggcta cacacgtgct acaatggacg

1200

gtacaaaggg cagcgagacc gcgaggtgga gccaatccca taaagccgtt cccagttcgg

1260

attgcaggct gcaactcgcc tgcatgaagt cggaatcgct agtaatcgca ggtcagcata

1320

ctgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccn nnannccacg agagtttgca

1380

acacccgaag ccggtgaggt aaccgcaagg ag

1412

<210> 879

<211> 1505

<212> DNA

<213> Facklamia hominis

<220>

<221> modified_base

<222> (344)..(344)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (364)..(365)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (638)..(638)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (652)..(652)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 879

cgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca agtcgaacga acggagctag gaactgaacc

60

cggcaaagtt agtggcgcac gggtgagtaa cacgtggaga acctaccctt ttgcggggga

120

taaccattgg aaacgatgac taataccgca tagaatcgca gatcgcatga tcaacgaagg

180

aaagacggct tcggctgtcg caaaaggatg gctccgcggt gcattagcta gatggtgggg

240

taacggccta ccatggcaat gatgcatagc cgacctgaga gggtgatcgg ccacattggg

300

actgagacac ggcccaaact cctacgggag gcagcagtag ggantcttcc gcaatgggcg

360

caannctgac ggagcaacgc cgcgtgtgtg aagaaggtct tcggatcgta aagcactgtt

420

gttagagaag aacgaccgct agagtaactg ttagcggagt gacggtatct aaccagaaag

480

ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtggcaagcg ttgtccggat

540

ttattgggcg taaagggagc gcaggcggtg acttaagtct gatgtgaaag cccacggctc

600

aaccgtggag ggtcattgga aactgggtca cttgagtnca gaagaggaaa gnggaattcc

660

atgtgtagcg gtgaaatgcg tagatatatg gaggaacacc agtggcgaag gcgactttct

720

ggtctgtaac tgacgctgag gctcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg

780

tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctaag tgttggaggg tttccaccct tcagtgctgg

840

agttaacgca ataagcactc cgcctgggga gtacggccgc aaggctgaaa ctcaaaggaa

900

ttgacgggga cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac

960

cttaccaggt cttgacatct cttgcatagc ctagagatag gtgaagccct tcggggcaag

1020

aagacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1080

aacgagcgca acccttatca ctagttgcca gcattcagat ggggactcta gtgagactgc

1140

cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg

1200

gctacacacg tgctacaatg gatggtacaa cgagcagcga actcgcaagg gcaagcgaat

1260

ctcttaaagc cattctcagt tcggattgtt ctctgcaact cgagaacatg aagccggaat

1320

cgctagtaat cgcggatcag cacgccgcgg tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg

1380

cccgtcacac cacgagagtt tgtaacaccc gaagccggtg gcctaacttt atgaagccgt

1440

cgaaggtggg acagatgatt ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgcg

1500

gctgg

1505

<210> 880

<211> 1367

<212> DNA

<213> Faecalibacterium prausnitzii

<400> 880

tcgaacgagc gagagagagc ttgctttctc agagcgagtg gcgaacgggt gagtaacgcg

60

tgaggaacct gcctcaaaga gggggacaac agttggaaac gactgctaat accgcataag

120

cccacaggtc ggcatcgagc agagggaaaa ggagcaatcc gctttgagat ggcctcgcgt

180

ccgattagct agttggtgag gtaacggccc accaaggcaa cgatcggtag ccggactgag

240

aggttgaacg gccacattgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

300

gggaatattg cacaatgggg gaaaccctga tgcagcgacg ccgcgtggag gaagaaggtc

360

ttcggattgt aaactcctgt tgttgaggaa gataatgacg gtactcaaca aggaagtgac

420

ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaaa acgtaggtca caagcgttgt ccggaattac

480

tgggtgtaaa gggagcgcag gcgggaagac aagttggaag tgaaatctat gggctcaacc

540

cataaactgc tttcaaaact gtttttcttg agtagtgcag aggtaggcgg aattcccggt

600

gtagcggtgg aatgcgtaga tatcgggagg aacaccagtg gcgaaggcgg cctactgggc

660

accaactgac gctgaggctc gaaagtgtgg gtagcaaaca ggattagata ccctggtagt

720

ccacaccgta aacgatgatt actaggtgtt ggaggattga ccccttcagt gccgcagtta

780

acacaataag taatccacct ggggagtacg accgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac

840

gggggcccgc acaagcagtg gagtatgtgg tttaattcga cgcaacgcga agaaccttac

900

caagtcttga catcctgcga cgatgctgga aacagtattt tccttcggga cgcagagaca

960

ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1020

cgcaaccctt actgtcagtt actacgcaag aggactctgg caggactgcc gttgacaaaa

1080

cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccttt atgacttggg ctacacacgt

1140

actacaatgg cgttaaacaa agagaagcaa gaccgcgagg tggagcaaaa ctcagaaaca

1200

acgtcccagt tcggactgca ggctgcaact cgcctgcacg aagtcggaat tgctagtaat

1260

cgtggatcag catgccacgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac

1320

catgagagcc ggggggaccc gaagtcggta gtctaaccgc aaggagg

1367

<210> 881

<211> 1530

<212> DNA

<213> Filifactor alocis

<400> 881

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gaacgactat taacagaacc tttcggggcg aagaatatag aagttagtgg cggacgggtg

120

cgtaacgcgt gggtaatctg cctttgtcaa aggaataact attcgaaaga atagctaaaa

180

ccgtataaca tattaatagg gcatcctaat aatatcaaaa ctgaggtgga caaagatgag

240

cccgcgtctg attagctagt tggtgagata aaagcccacc aaggcaacga tcagtagccg

300

acctgagagg gtgaacggcc acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc

360

agcagtgggg aatattgcac aatgggggga accctgatgc agcaacgccg cgtgagtgaa

420

gaaggcattc gtgtcgtaaa actctgtagt aggggaagaa agaaatgaca gtaccctaaa

480

agaaagcccc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggggg caagcgttat

540

ccggaataac tgggcgtaaa gggtgcgcag gtggtttaac aagttagtgg tgaaaggcat

600

aggctcaacc aatgtaagcc attaaaactg tttaacttga gtgcaggaga ggaaagtgga

660

attcctagtg tagcggcgaa atgcgtagat attaggagga ataccagtgg cgaaggcgac

720

tttctggact gcaactgact ctgaggcacg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac

780

cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagta ctaggtgtcg agtgaagaac tcggtgccga

840

agttaacaca ttaagtactc cgcctgggga gtacgctcgc aagagtaaaa ctcaaaggaa

900

ttgacgggga cccgcacaag cagcggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac

960

cttacctaaa cttgacatac caatgacagc cttttaatcg aggactttta ccttcgggta

1020

gacaatggat acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1080

gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtcgata gttaccagca gtaagatggg gactctatcg

1140

agacagctaa ggacaactta gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat

1200

gtttagggct acacacgtgc tacaatggtc attacagaga gaagcgaaac tgcgaagtca

1260

agcaaacctc aaaaagatga tccaagttcg gattgtaggc tgaaactcgc ctacatgaag

1320

ttggagttgc tagtaatcgc gaatcagaat gtcgcggtga atgcgttccc gggtcttgta

1380

cacaccgccc gtcacaccat gggagtttgg ggggcccaaa gtcagcgact caaccgcaag

1440

gagagagctg cccaaggcaa aacaaatgac tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtat

1500

cggaaggtgc ggctggatca cctcctttct

1530

<210> 882

<211> 1450

<212> DNA

<213> Filifactor villosus

<400> 882

gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gggcgaatta tatcggaggt

60

cttcgggcca aagagataat aagctagtgg cggacgggtg cgtaacgtgt gggtaatctg

120

cctttgtcat aggaataact gcttgaaaaa gtagctaata ccaaataaca tatcgtatag

180

gcatctataa gatatcaaag agaaatcgga caaagatgag cccgcatctg attagctggt

240

tggtagggta aaagcctacc aaggcgacga tcagtagccg gcctgagagg gtgaacggcc

300

acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac

360

aatgggggga accctgatgc agcaacgccg cgtgagtgaa gaaggctttc gagtcgtaaa

420

actctgttgt aagggaagat aatgacggta ccttaaaaga aagccccggc taactacgtg

480

ccagcagccg cggtaatacg tagggggcaa gcgttatccg gaataactgg gcgtaaaggg

540

tgcgcaggtg gtctgtcaag ttagtggtga aaggcatagg ctcaaccaat gtaagccatt

600

aaaactgacg gacttgagtg caggagagga aagtggaatt cctagtgtag cggtgaaatg

660

cgtagatatt aggaggaata ccggtggcga aggcgacttt ctggactgta actgacactg

720

aggcacgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

780

atgagtacta ggtgtcggga ggaatctcgg tgccgaagtt aacacattaa gtactccgcc

840

tggggagtac gctcgcaaga gtaaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcagc

900

ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta cctaaacttg acataccgat

960

gccgattcgg taatgcgaat tttcctttcg gggacattgg atacaggtgg tgcatggttg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtcaa

1080

tagttgccag catataaggt ggggactcta ttgagacagc taaggacaac ttagaggaag

1140

gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgtttagg gctacacacg tgctacaatg

1200

gtcattacag agggaagcga gattgtgaaa tggagcaaac cccaaaaaga tgatctaagt

1260

tcggattgta ggctgaaact cgcctacatg aagttggagt tgctagtaat cgcaaatcaa

1320

aatgttgcgg tgaatgcgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtt

1380

cggggggccc aaagtcagtg agcaaaccgc gagggtgcag ctgcctaagg caaaacgaat

1440

gactggggtg

1450

<210> 883

<211> 1525

<212> DNA

<213> Finegoldia magna

<400> 883

ttaaattgag agtttgatcc tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca

60

agtcgaacgg gatttagtaa acagaagctt cggtggaaga ttactaatga gagtggcgaa

120

cgggtgagta acgcgtgagc aacctgccta tgacagtggg atagcctcgg gaaaccggga

180

ttaataccgc ataaaatcgt agaaacacat gttttaacgg tcaaagattt atcggtcata

240

gatgggctcg cgtctgatta gctagttggt gagataacag cccaccaagg cgacgatcag

300

tagccggtct gagaggatga acggccacat tggaactgag acacggtcca aactcctacg

360

ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagcg acgccgcgtg

420

aacgaagaag gtattcgtat cgtaaagttc tgtcctatgg gaagataatg acagtaccat

480

agaagaaagc tccggctaaa tacgtgccag cagccgcggt aatacgtatg gagcgagcgt

540

tgtccggaat tattgggcgt aaagggtacg caggcggttt aataagtcga atgttaaaga

600

tcggggctca accccgtaaa gcattggaaa ctgataaact tgagtagtgg agaggaaagt

660

ggaattccta gtgtagtggt gaaatacgta gatattagga ggaataccag tagcgaaggc

720

gactttctgg acacaaactg acgctgaggt acgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga

780

taccctggta gtccacgccg taaacgatga atgctaggtg ttgggggtca aacctcggtg

840

ccgaagttaa cacattaagc attccgcctg gggagtacgc acgcaagtgt gaaactcaaa

900

ggaattgacg gggacccgca caagcagcgg agcatgtggt ttaattcgat gcaacgcgaa

960

gaaccttacc agggcttgac atgtgggtga aaggtataga gatatacccc tctctttatg

1020

agacatccat acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1080

gtcccgcaac gagcgcaacc cctatactta gttaccagcg agtaatgtcg gggactctaa

1140

gtagactgcc gatgacaaat cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccttt

1200

atgtcctggg ctacacacgt gctacaatgg ttggtacaga gggaagctat atagtgatat

1260

aatgcaaaac tccaaagcca atcccagttc ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa

1320

gtcggagttg ctagtaatcg cggatcagaa tgtcgcggtg aatgcgttcc cgggtcttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacca tgggagttga taatacccga agcctgtgac ctaattgagg

1440

agcagtcgaa ggtaggattg atgactgggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtatcggaa

1500

ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1525

<210> 884

<211> 1291

<212> DNA

<213> Flavobacteriaceae genomosp. C1

<400> 884

gatgaacgct agcgggaggc ctaacacatg caagctgagc gagcggcgta cgggtgcgga

60

acacgtgtgc gacctgcctt tatctggggg atagcctttc gaaaggaaga ttaatactcc

120

ataatgaaag gcggatagag atgggcacgc gcaagattag ctagttggtg aggtaacggc

180

tcaccaaggc aatgatcttt agggggcctg agagggtgat cccccacact ggtactgaga

240

cacggaccag actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat tggtcaatgg gtgcaagcct

300

gaaccagcca tcccgcgtga aggacgactg cctatgggtt gtaaacttct tttgtatagg

360

gatatgaagg tactatacga ataagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata

420

cggagggtgc aagcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggtccgtagg cggacttata

480

agtcagtggt gaaatcctgt cgcttaacga tagaactgcc attgatactg taagtcttga

540

gtatatttga ggtagctgga ataagtagtg tagcggtgaa atgcatagat attacttaga

600

acaccaattg cgaaggcagg ttaccaagat aactgacgct gagggacgaa agcgtgggga

660

gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgctaact cgtttttgga

720

gcttcagaga ccaagcgaaa gtgataagtt agccacctgg ggagtacgct cgcaagagtg

780

aaactcaaag gagttgacgg gggcccgcac aagcggtgga ttatgtggtt taattcgatg

840

atacgcgagg aaccttacca agacttaaat ggtcaaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgccgtga ggtgttaggt taagtcctgc aacgagcgca acccctgtca ctagttgcca

960

tcatggggac tctagtgaga ctgcctacgc aagtaggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1020

tcatcacggc ccttacgtct tgggccacac acgtaataca atggccggca gagggcagct

1080

acacagcgat gtgatgcaaa tctcgccggt ctcagttcgg atggagtctg caactcgact

1140

ctagaagctg gaatcgctag taatcgcgca tcagccatgg cgcggtgaat acgttcccgg

1200

gccttgtaca caccgcccgt caagccatgg aagctggggg tacctgaagt cggtaccagg

1260

agctgcctag ggtaaaacta gtaactaggg c

1291

<210> 885

<211> 1480

<212> DNA

<213> Flavobacterium sp. NF2-1

<400> 885

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agcggcaggc ttaacacatg caagtcgagg

60

ggtaggagaa gcttgctttt ctgagaccgg cgcacgggtg cgtaacgcgt atgcaatcta

120

cctttcacag agggatagcc cagagaaatt tggattaata ccttatagta ttatagaatg

180

gcatcatttt ataattaaag atttatcggt gaaagatgag catgcgtccc attagctagt

240

tggtatggta acggcatacc aaggcaacga tgggtagggg tcctgagagg gagatccccc

300

acactggtac tgagacacgg accagactcc tacgggaggc agcagtgagg aatattggac

360

aatgggcgca agcctgatcc agccatgccg cgtgcaggat gacggtccta tggattgtaa

420

actgctttta tacaggaaga aacccctcta cgtgtagaga cttgacggta ctgtaagaat

480

aaggatcggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaggatccaa gcgttatccg

540

gaatcattgg gtttaaaggg tccgtaggcg gtcagataag tcagtggtga aagcccatcg

600

ctcaacggtg gaacggccat tgatactgtc tgacttgaat tattaggaag taactagaat

660

atgtagtgta gcggtgaaat gcttagagat tacatggaat accaattgcg aaggcaggtt

720

actactaata tattgacgct gatggacgaa agcgtgggta gcgaacagga ttagataccc

780

tggtagtcca cgccgtaaac gatggatact agctgttggg cgcaagttca gtggctaagc

840

gaaagtgata agtatcccac ctggggagta cgaacgcaag tttgaaactc aaaggaattg

900

acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gatgatacgc gaggaacctt

960

accaaggctt aaatgtagat tgaccggttt ggaaacagat ctttcgcaag acaatttaca

1020

aggtgctgca tggttgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt caggttaagt cctataacga

1080

gcgcaacccc tgttgttagt tgccagcgag tcatgtcggg aactctaacg agactgccag

1140

tgcaaactgt gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca cggcccttac gccttgggct

1200

acacacgtgc tacaatggcc ggtacagaga gcagccactg ggtgaccagg agcgaatcta

1260

taaaaccggt cacagttcgg atcggagtct gcaactcgac tccgtgaagc tggaatcgct

1320

agtaatcgga tatcagccat gatccggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc

1380

gtcaagccat ggaagctggg ggtgcctgaa gtcggtgacc gcaaggagct gcctagggta

1440

aaactggtaa ctagggctaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1480

<210> 886

<211> 1465

<212> DNA

<213> Flavonifractor plautii

<400> 886

cgctggcggc gtgcttaaca catgcaagtc gaacggggtg ctcatgacgg aggattcgtc

60

caatggattg agttacctag tggcggacgg gtgagtaacg cgtgaggaac ctgccttgga

120

gaggggaata acactccgaa aggagtgcta ataccgcatg aagcagttgg gtcgcatggc

180

tctgactgcc aaagatttat cgctctgaga tggcctcgcg tctgattagc tagtaggcgg

240

ggtaacggcc cacctaggcg acgatcagta gccggactga gaggttgacc ggccacattg

300

ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gggcaatggg

360

cgcaagcctg acccagcaac gccgcgtgaa ggaagaaggc tttcgggttg taaacttctt

420

ttgtcgggga cgaaacaaat gacggtaccc gacgaataag ccacggctaa ctacgtgcca

480

gcagccgcgg taatacgtag gtggcaagcg ttatccggat ttactgggtg taaagggcgt

540

gtaggcggga ttgcaagtca gatgtgaaaa ctgggggctc aacctccagc ctgcatttga

600

aactgtagtt cttgagtgct ggagaggcaa tcggaattcc gtgtgtagcg gtgaaatgcg

660

tagatatacg gaggaacacc agtggcgaag gcggattgct ggacagtaac tgacgctgag

720

gcgcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat

780

ggatactagg tgtggggggt ctgaccccct ccgtgccgca gttaacacaa taagtatccc

840

acctggggag tacgatcgca aggttgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc

900

ggtggagtat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccagggc ttgacatccc

960

actaacgagg cagagatgcg ttaggtgccc ttcggggaaa gtggagacag gtggtgcatg

1020

gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta

1080

ttgttagttg ctacgcaaga gcactctagc gagactgccg ttgacaaaac ggaggaaggt

1140

ggggacgacg tcaaatcatc atgcccctta tgtcctgggc cacacacgta ctacaatggt

1200

ggttaacaga gggaggcaat accgcgaggt ggagcaaatc cctaaaagcc atcccagttc

1260

ggattgcagg ctgaaacccg cctgtatgaa gttggaatcg ctagtaatcg cggatcagca

1320

tgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgagagtcgg

1380

gaacacccga agtccgtagc ctaaccgcaa ggagggcgcg gccgaaggtg ggttcgataa

1440

ttggggtgaa gtcgtaacaa ggtag

1465

<210> 887

<211> 1467

<212> DNA

<213> Flexispira rappini

<220>

<221> modified_base

<222> (1062)..(1062)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1075)..(1075)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 887

agagtttgat cctggctcag agtgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac

60

gatgaagctt ctagcttgct agaagtggat tagtggcgca cgggtgagta atgcataggt

120

tatgtgccct ttagtctggg atagccactg gaaacggtga ttaatactgg atactcccta

180

cgggggaaag gtttttcgct aaaggatcag cctatgtcct atcagcttgt tggtgaggta

240

atggctcacc aaggctatga cgggtatccg gcctgagagg gtgatcggac acactggaac

300

tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtaggg aatattgctc aatgggggaa

360

accctgaagc agcaacgccg cgtggaggat gaaggtttta ggattgtaaa ctccttttgt

420

aagagaagat tatgacggta tcttacgaat aagcgccggc taactccgtg ccagcagccg

480

cggtaatacg gagggtgcaa gcgttactcg gaatcactgg gcgtaaagag cgcgtaggcg

540

ggtggtcaag tcagatgtga aatcctgtag cttaactaca gaactgcatt tgaaactgac

600

catctagagt atgggagagg taggtggaat tcttggtgta ggggtaaaat ccgtagagat

660

caagaggaat actcattgcg aaggcgacct gctggaacat tactgacgct gatgcgcgaa

720

agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccctaaac gatgaatgct

780

agttgttgcc ctgcttgtca gggcagtaat gcagctaacg cattaagcat tccgcctggg

840

gagtacggtc gcaagattaa aactcaaagg aatagacggg gacccgcaca agcggtggag

900

catgtggttt aattcgaagc tacgcgaaga actcttacct aggcttgaca ttgatagaat

960

ccgctagaga tagtggagtg ctggcttgcc agagcttgaa aacaggtgct gcacggctgt

1020

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cngagcgcaa ccctnggtcc

1080

cttagttgct agcagttcgg ctgagcactc taaggagact gccttcgtaa ggaggaggaa

1140

ggtgaggacg acgtcaagtc atcatggccc ttacgcctag ggctacacac gtgctacaat

1200

gggacataca aaaagatgca ataccgcgag gtggagcaaa tctctaaaat gtctctcagt

1260

tcggattgta gtctgcaact cgactacata aagctggaat cgctagtaat cgtgaatcag

1320

caatgtcacg gtgaatacgt tcccgggtct tgtactcacc gcccgtcaca ccatgggagt

1380

tgtattcgcc ttaagtcggg atactaaatt ggttaccgcc cacggcggat gcagcgactg

1440

gggtgaagtc gtaacaaggt aaccgta

1467

<210> 888

<211> 1541

<212> DNA

<213> Flexistipes sinusarabici

<400> 888

agagtttgat cctggctcag aacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcaggg

60

ggaatcctcc cttcggggag gtagtacacc ggcgcacggg tgagtaacgc gtgagtgacc

120

tacccattag acctggataa cccggcgaaa gttgggctaa gacaggatgt gttaatacac

180

ttcatggtgt attgataaag gcaggtttcg gcttgtgcta atggatgggc tcgcgtctga

240

ttagctagtt ggtaaggtaa aggcttacca aggcgacgat cattaggcgg cctgagaggg

300

tggtcgccca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga

360

attttgcgca atgggcgaga gcctgacgca gcgacgccgc gtggacgagg aaggccttcg

420

ggtcgtaaag tcctttttta cgggaagaaa gttattaaca gtaactggtt aatatttgac

480

ggtaccgtaa gaataagccc cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggg

540

gcgagcgttg ttcggaatta ctgggcgtaa agcgtacgta ggcggcgtgg taagtcggag

600

gttaaaggct acggctcaac cgtagtaggg cctttgatac tatcatgcta gagtgtcgga

660

gggggtagcg gaattccctg tgtagcggtg aaatgcgtag atatagggaa gaacaccagt

720

agcgaaggcg gctacctggc cgatcactga cgctgaggta cgagagcgtg ggtagcaaac

780

aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacgatgga cgctaggtgt tggaggaacc

840

gaccccttca gtgccgaagc caacgcgtta agcgtcccgc ctggggagta cgaccgcaag

900

gttaaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcacgt ggtttaattc

960

gatgctaacc gaagaacctt acctggtctt gacatcctcc ggagggacta gagatagttc

1020

tgtgcccgcc tttggcggga gcggagagac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgc

1080

cgtgaggtgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc tattcatagt tgccatcggt

1140

aaggccgggc actctatgga tactgcccgt gataaacggg aggaaggtgg ggacgacgtc

1200

aagtcatcat ggcctttatg accagggcta cacacgtgct acaatggtac gtacagaggg

1260

cagcgaagcc gcgaggtgta gcgaatccct aaaagcgtgc cttagttcgg attgtagtct

1320

gcaattcgac tacatgaagg cggaatcgct agtaatcgca ggtcagcaaa actgcggtga

1380

atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac gggagttggt tgtacctgaa

1440

gccggtggcc caactgcgga gggagccgtt tatggtatga ctggcaactg gggtgaagtc

1500

gtaacaaggt agccgtaccg gaaggtgtgg ctggatcacc t

1541

<210> 889

<211> 1530

<212> DNA

<213> Francisella novicida

<400> 889

ttaaactgaa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gtggcatgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacaggtc ttcggatgct gacgagtggc ggacgggtga gtaacgcgta

120

ggaatctgcc catttgaggg ggataccagt tggaaacgac tgttaatacc gcataatatc

180

tgtggattaa aggtggcttt cgggctgtcg cagatggatg agcctgcgtt ggattagcta

240

gttggtgggg taagggccca ccaaggctac gatccatagc tgatttgaga ggatgatcag

300

ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg

360

acaatggggg caaccctgat ccagcaatgc catgtgtgtg aagaaggccc tagggttgta

420

aagcacttta gttggggagg aaagcctcaa ggttaatagc cttgggggag gacgttaccc

480

aaagaataag caccggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacgggg ggtgcaagcg

540

ttaatcggaa ttactgggcg taaagggtct gtaggtggtt tgttaagtca gatgtgaaag

600

cccagggctc aaccttggaa ctgcatttga tactggcaaa ctagagtacg gtagaggaat

660

ggggaatttc tggtgtagcg gtgaaatgcg tagagatcag aaggaacacc aatggcgaag

720

gcaacattct ggaccgatac tgacactgag ggacgaaagc gtggggatca aacaggatta

780

gataccctgg tagtccacgc tgtaaacgat gagtactagc tgttggagtc ggtgtaaagg

840

ctctagtggc gcagctaacg cgataagtac tccgcctggg gactacggcc gcaaggctaa

900

aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

960

aacgcgaaga accttacctg gtcttgacat cctgcgaact ttctagagat agattggtgc

1020

cttcgggaac gcagtgacag gtgctgcacg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccccta ttgatagtta ccatcattaa gttgggtact

1140

ctattgagac tgccgctgac aaggcggagg aaggtgggga cgacgtcaag tcatcatggc

1200

ccttacgacc agggctacac acgtgctaca atgggtatta cagagggctg cgaaggtgcg

1260

agctggagcg aaactcaaaa aggtactctt agtccggatt gcagtctgca actcgactgc

1320

atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcaggt cagaatactg cggtgaatac gttcccgggt

1380

cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgct ccagaagtag atagcttaac

1440

gaatgggcgt ttaccacgga gtgattcatg actggggtga agtcgtaaca aggtagccgt

1500

aggggaacct gcggctggat cacctcctta

1530

<210> 890

<211> 1518

<212> DNA

<213> Francisella philomiragia

<400> 890

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggtggcatgc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggtaacaggt cttcggatgc tgacgagtgg cggacgggtg agtaacgcgt aggaatctgc

120

ccatttgagg gggataccag ttggaaacga ctgttaatac cgcataatat ctgtggatta

180

aaggtggctt aggctgccgc agatggatga gcctgcgttg gattagctag ttggtggggt

240

aagggcctac caaggctacg atccatagct gatttgagag gatgatcagc cacattggga

300

ctgagacacg gcccaaactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgga caatggggga

360

aaccctgatc cagcaatgcc atgtgtgtga agaaggctct agggttgtaa agcactttag

420

ttggggagga aagcctataa gttaatagct tgtaggaagg acgttaccca aagaataagg

480

accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggggg gtccgagcgt taatcggaat

540

tactgggcgt aaagggtctg taggtggttt gttaagtcag atgtgaaagc ccagggctca

600

accttggaac tgcatttgat actggcaaac tagagtatgg tagaggaatg gggaatttct

660

ggtgtagcgg tgaaatgcgt agagatcaga aggaacacca atggcgaagg caacattctg

720

gaccaatact gacactgagg gacgaaagcg tggggatcaa acaggattag ataccctggt

780

agtccacgct gtaaacgatg agtactagct gttggattcg gtgtaaagga tctagtggcg

840

cagctaacgc gttaagtact ccgcctgggg actacggccg caaggctaaa actcaaagga

900

attgacgggg acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgca acgcgaagaa

960

ccttacctgg tcttgacatc ctgcgaactt tctagagata gattggtgcc ttcgggaacg

1020

cagtgacagg tgctgcacgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt gaaatgttgg gttaagtccc

1080

gcaacgagcg caacccctat tgatagttac catcattaag ttgggtactc tattgagact

1140

gccgctgaca aggcggagga aggtggggac gacgtcaagt catcatggcc cttacgacca

1200

gggctacaca cgtgctacaa tgggtattac agagggctgc gaaggtgcga gctggagcga

1260

aactcagaaa ggtactctta gtccggattg cagtctgcaa ctcgactgca tgaagtcgga

1320

atcgctagta atcgcaggtc agaatactgc ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac

1380

cgcccgtcac accatgggag tgggttgctc cagaagtaga tagcttaacg aatgggcgtt

1440

taccacggag tgattcatga ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta ggggaacctg

1500

cggctggatc acctcctt

1518

<210> 891

<211> 1530

<212> DNA

<213> Francisella tularensis

<400> 891

ttaaactgaa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gtggcatgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacaggtc ttaggatgct gacgagtggc ggacgggtga gtaacgcgta

120

ggaatctgcc catttgaggg ggataccagt tggaaacgac tgttaatacc gcataatatc

180

tgtggattaa aggtggcttt cgggctgtcg cagatggatg agcctgcgtt ggattagcta

240

gttggtgggg taagggccca ccaaggctac gatccatagc tgatttgaga ggatgatcag

300

ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg

360

acaatggggg caaccctgat ccagcaatgc catgtgtgtg aagaaggccc tagggttgta

420

aagcacttta gttggggagg aaagcctcaa ggttaatagc cttgggggag gacgttaccc

480

aaagaataag caccggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacgggg ggtgcaagcg

540

ttaatcggaa ttactgggcg taaagggtct gtaggtggtt tgttaagtca gatgtgaaag

600

cccagggctc aaccttggaa ctgcatttga tactggcaaa ctagagtacg gtagaggaat

660

ggggaatttc tggtgtagcg gtgaaatgcg tagagatcag aaggaacacc aatggcgaag

720

gcaacattct ggaccgatac tgacactgag ggacgaaagc gtggggatca aacaggatta

780

gataccctgg tagtccacgc tgtaaacgat gagtactagc tgttggagtc ggtgtaaagg

840

ctctagtggc gcagctaacg cgataagtac tccgcctggg gactacggcc gcaaggctaa

900

aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

960

aacgcgaaga accttacctg gtcttgacat cctgcgaact ttctagagat agattggtgc

1020

cttcgggaac gcagtgacag gtgctgcacg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccccta ttgatagtta ccatcattaa gttgggtact

1140

ctattaagac tgccgctgac aaggcggagg aaggtgggga cgacgtcaag tcatcatggc

1200

ccttacgacc agggctacac acgtgctaca atgggtatta cagagggctg cgaaggtgcg

1260

agctggagcg aaactcaaaa aggtactctt agtccggatt gcagtctgca actcgactgc

1320

atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcaggt cagaatactg cggtgaatac gttcccgggt

1380

cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgct ccagaagtag atagcttaac

1440

gaatgggcgt ttaccacgga gtgattcatg actggggtga agtcgtaaca aggtagccgt

1500

aggggaacct gcggctggat cacctcctta

1530

<210> 892

<211> 1445

<212> DNA

<213> Fulvimonas sp. NML 060897

<400> 892

gcctaacaca tgcaagtcga acggcagcac agtggagctt gctccatggg tggcgagtgg

60

cggacgggtg agtaaggcat cgggatctac ccagacgtgg gggataacgt agggaaactt

120

acgctaatac cgcatacgtc ctacgggaga aagcggggga ccttcgggcc tcgcgcggct

180

ggacgaaccg atgtgcgatt agctagttgg tggggtaaag gctcaccaag gcgacgatcg

240

ctagctggtc tgagaggatg atcagccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac

300

gggaggcagc agtggggaat attggacaat gggcgcaagc ctgatccagc aatgccgcgt

360

gtgtgaagaa ggccttcggg ttgtaaagca cttttatcag gagcgaaata ctgccggcta

420

atacccggcg gggctgacgg tacctgagga ataagcaccg gctaacttcg tgccagcagc

480

cgcggtaata cgaagggtgc aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgtgcgtagg

540

cggttcttta agtctgctgt gaaatccccg ggctcaacct gggaatggca gtggatactg

600

gggagctaga gtgtgataga ggatggtgga attcccggtg tagcggtgaa atgcgtagag

660

atcgggagga acatcagtgg cgaaggcggc catctggatc aacactgacg ctgaggcacg

720

aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccctaa acgatgcgaa

780

ctggatgttg gtctcaactc ggagatcagt gtcgaagcta acgcgttaag ttcgccgcct

840

ggggagtacg gtcgcaagac tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg

900

gagtatgtgg tttaattcga tgcaacgcga agaaccttac ctggccttga catgtccgga

960

atcctgcaga gatgcgggag tgccttcggg aatcggaaca caggtgctgc atggctgtcg

1020

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtccttag

1080

ttgccagcac gtaatggtgg gaactctaag gagactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt

1140

ggggatgacg tcaagtcatc atggccctta cggccagggc tacacacgta ctacaatggt

1200

cggtacagag ggttgcaata ccgcgaggtg gagccaatcc cagaaagccg atcccagtcc

1260

ggatcggagt ctgcaactcg actccgtgaa gtcggaatcg ctagtaatcg cagatcagct

1320

atgctgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtga

1380

gctgctccag aagccgttag tctaaccgca agggggacga cgaccacgga gtggttcatg

1440

actgg

1445

<210> 893

<211> 1308

<212> DNA

<213> Fusobacterium canifelinum

<400> 893

tggctcagga tgaacgctga cagaatgctt aacacatgca agtctactgt ggcggacggg

60

tgagtaacgc gtaaagaact tgcctcacag ctagggacaa catttggaaa cgaatgctaa

120

tacctaatat tgaaaggcgc tgtgagagag ctttgcgtcc cattagctag ttggagaggt

180

aacggctcac caaggcgatg atgggtagcc ggcctgagag ggtgatcggc cacaagggga

240

ctgagacacg gcccttactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgga caatggacca

300

agtctgatcc agcaattctg tgtgcacgat gaagtttttc ggaatgtaaa gtgctttcag

360

ttgggaagat gacggtacca acagaagaag tgacggctaa atacgtgcca gcagccgcgg

420

taatacgtat gtcacaagcg ttatccggat ttattgggcg taaagcgcgt ctaggtggtt

480

atgtaagtct gatgtgaaaa tgcagggctc aactctgtat tgcgttggaa actgtgtaac

540

tagagtactg gagaggtaag cggaactaca agtgtagagg tgaaattcgt agatatttgt

600

aggaatgccg atggggaagc cagcttactg gacagactga cgctgaagcg cgaaagcgtg

660

ggtagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgat tactaggtgt

720

tggggcctca gcgcccaagc aaacgcgata agtaatccgc ctggggagta cgtacgcaag

780

tatgaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc

840

gacgcaacgc gaggaacctt accagcgttt gacatcgaca ggtggtgcat ggctgtcgtc

900

agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct ttcgtatgtt

960

accatcatgg ggactcatgc gatactgcct acgatgagta ggaggaaggt ggggatgacg

1020

tcaagtcatc atgcccctta tacgctgggc tacacacgtg ctacaatggg tagcagagag

1080

ctgcaaagcc gtgaggtgga gctaatctca gctattctta gttcggatgt actctgcaac

1140

tcgagtacag aagttggaat cgctagtaat cgcgaatcag caatgtcgcg gtgaatacgt

1200

tctcgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt tggttgcacc tgaagtagca

1260

gcctagggat gctccgaggg tgtgattagc gattggggtg aagtcgta

1308

<210> 894

<211> 1294

<212> DNA

<213> Fusobacterium genomosp. C1

<400> 894

gatgaacgct gacagaatgc ttaacacatg caagtcaacg agtggcggac gggtgagtaa

60

cgcgtaaaga acttgcctca cagctaggga caacatttag aaatgaatgc taatacctga

120

tattgaaagg cactgtgaga gagctttgcg tcccattagc tagttggaga ggtaacagct

180

caccaaggcg atgatgggta gccggcctga gagggtgaac ggccacaagg ggactgagac

240

acggccctta ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatgga cgagagtctg

300

atccagcaat tccgtgtgca cgatgaagtt tttcggaatg taaagtgctt tcagttggga

360

agatgacggt accaacagaa gaagtgacgg ctaaatacgt gccaacagcc gcggtaatac

420

gtatgtcacg agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaagc gcgcctaggt ggttatgtaa

480

gtctgatgtg aaaatgcagg gctcaactct gtattgcgtt ggaaactgta taactagagt

540

actggagagg taagcggaac tacaagtgta gaggtgaaat tcgtagatat ttgtaggaat

600

gccgatgggg aagccagctt actggacaga ctgacgctaa agcgcgagag cgtgggtagc

660

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ctgtaaacga tgattactag gtgttggggc

720

ctcagcgccc aagcaaacgc gataagtaat ccgcctgggg agtacgtacg caagtatgaa

780

actcaaagga attgacgtgg acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgacgca

840

acgcgaggaa ccttaccagc gtttgacatc gacaggtggt gcatggctgt cgtcagctcg

900

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctttcgta tgttaccatc

960

atggggactc acgcgatact gcctacgatg agtaggagga aggtggggat gacgtcaagt

1020

cattatgccc cttatacgct gggctacaca cgtgctacaa tgggtagcag agagttgcaa

1080

agccgtgagg tgaagctaat ctcagctatt tttagttcgg atgtactctg caactcgagt

1140

acagaagttg gaatcgctag taatcgcgaa tcagcaatgt cgcggtgaat acgttctcgg

1200

gtcttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagttggttg cacctgaagt agcggcctag

1260

ggatgctccg agggtgtgat tagcgattgg ggtg

1294

<210> 895

<211> 1294

<212> DNA

<213> Fusobacterium genomosp. C2

<400> 895

gatgaacgct gacagaatgc ttaacacatg caagtcaact ggtggcggac gggtgagtaa

60

cgcgtaaaga acttgcctca cagctaggga caacatttag aaatgaatgc taatacctga

120

tattgaaagg cactgtgaga gagctttgcg tcccattagc tagttggaga ggtaacagct

180

caccaaggcg atgatgggta gccggcctga gagggtgaac ggccacaagg ggactgagac

240

acggccctta ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatgga cgagagtctg

300

atccagcaat tctgtgtgca cgatgaagtt tttcggaatg caaagtgctt tcagttggga

360

agatgacggt accaacagaa gaagtgacgg ctaaatacgt gccagcagcc gcggtaatat

420

gtatgtcacg agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaagc gcgtctaggt ggttatgtaa

480

gtctgatgtg aaaatgcagg gctcaactct gtattgcgtt ggaaactgtg taactagagt

540

actggagagg taagcggaac tacaagtgta gaggtgaaat tcgtagatat ttgtaggaat

600

gccgatgggg aagccagctt actggacaga ctgacgctaa agcgcgaaag cgtgggtagc

660

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ctgtaaacga tgattactag gtgttggggc

720

ctcagcgccc aagcaaacgc gataagtaat ccgcctgggg agtacgtacg caagtatgaa

780

actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgacgca

840

acgcgaggaa ccttaccagc gtttgacatc gacaggtggt gcatggctgt cgtcagctcg

900

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctttcgta tgttaccatc

960

atggggactc atgcgatact gcctacgatg agtaggagga aggtggggat gacgtcaagt

1020

catcatgccc cttatacact gggctacaca cgtgctacaa tgggtagcag agggttgcaa

1080

agccgtgagg tgaagctaat ctcggctatt cttagttcgg atgtactctg caactcgagt

1140

acagaagttg gaatcgctag taatcgcgaa tcagcaatgt cgcggtgaat acgttctcgg

1200

gtcttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagttggttg cacctgaagt agcagcctag

1260

ggatgctccg agggtgtgat tagcgattgg ggtg

1294

<210> 896

<211> 1509

<212> DNA

<213> Fusobacterium gonidiaformans

<400> 896

gaacgaagag tttgatcctg gctcaggatg aacgctgaca gaatgcttaa cacatgcaag

60

tcgactcgag tcttcggact tgggtggcgg acgggtgagt aacgcgtaaa gaacttgcct

120

catagtctgg gacaacatct ggaaacggat gctaataccg gatattatgc tttcttcgca

180

tggaggaagt atgaaagcta tatgcgctat gagagagctt tgcgtcccat tagctagttg

240

gtgaggtaac ggcccaccaa ggcgatgatg ggtagccggc ctgagagggt gaacggccac

300

aaggggactg agacacggcc cttactccta cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa

360

tggaccaaaa gtctgatcca gcaattctgt gtgcacgatg acgtttttcg gaatgtaaag

420

tgctttcagt cgggaagaag caagtgacgg taccgacaga agaagcgacg gctaaatacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtatgtcgc aagcgttatc cggatttatt gggcgtaaag

540

cgcgtctagg cggcaaggaa agtctgatgt gaaaatgcgg ggctcaactc cgtattgcgt

600

tggaaactgc cttactagag tactggagag gtaggcggaa ctacaagtgt agaggtgaaa

660

ttcgtagata tttgtaggaa tgccgatggg gaagccagcc tactggacag atactgacgc

720

taaagcgcga aagcgtgggt agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgctgtaaa

780

cgatgattac taggtgttgg gggtcaaacc tcagcgccca agctaacgcg ataagtaatc

840

cgcctgggga gtacgtacgc aagtatgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag

900

cggtggagca tgtggtttaa ttcgacgcaa cgcgaggaac cttaccagcg tttgacatcc

960

tacaaagagt gcagagatgc gcttgtgctt cttcggaaga atgtagtgac aggtggtgca

1020

tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc

1080

tatcgtatgt taccagcctt tagttgggga ctcatgcgat actgcctgcg acgagcagga

1140

ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg ccccttatac gctgggctac acacgtgcta

1200

caatgggtag tacagagagc ggcgaacccg cgagggggag caaatctcag aaaactattc

1260

ttagttcgga ttgtactctg caactcgagt acatgaagtt ggaatcgcta gtaatcgcaa

1320

atcagcaatg ttgcggtgaa tacgttctcg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg

1380

agagttggtt gcacctgaag tagcaggcct aaccgtaagg aaggatgctc cgagggtgtg

1440

gttagcgatt ggggtgaagt cgtaacaagg tatccgtacg ggaacgtgcg gatggatcac

1500

ctcctttct

1509

<210> 897

<211> 1671

<212> DNA

<213> Fusobacterium mortiferum

<400> 897

aaaaaagtat tgacgaaaaa tattatttgt ggtaatatat accttgtccg cgagagagcg

60

gaactgatga ataaggacat tagcaacaga atagagaaag acaattaatg caaacacaac

120

aataaattgg tgtaaaacaa tcagtaaatt ttactgagtt atatagattg aacgaagagt

180

ttgatcctgg ctcaggatga acgctgacag aatgcttaac acatgcaagt ctacttgatc

240

cttcgggtga tggtggcgga cgggtgagta acgcgtaaag aacttgccct gcagtctggg

300

acaacatttg gaaacgaatg ctaataccgg atattatgtg agtttcgcat gaaattcata

360

tgaaagctat atgcgctgca ggagagcttt gcgtcctatt agctagttgg tgaggtaacg

420

gctcaccaag gcgatgatag gtagccggcc tgagagggtg aacggccaca aggggactga

480

gacacggccc ttactcctac gggaggcagc agtggggaat attggacaat ggaccaaaag

540

tctgatccag caattctgtg tgcacgatga agtttttcgg aatgtaaagt gctttcagtt

600

gggacgaagt aagtgacggt accaacagaa gaagcgacgg ctaaatacgt gccagcagcc

660

gcggtaatac gtatgtcgca agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaagc gcgtctaggc

720

ggtttggtaa gtctgatgtg aaaatgcggg gctcaactcc gtattgcgtt ggaaactgtc

780

aaactagagt actggagagg tgggcggaac tacaagtgta gaggtgaaat tcgtagatat

840

ttgtaggaat gccgatgggg aagccagccc actggacaga tactgacgct aaagcgcgaa

900

agcgtgggta gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgattact

960

aggtgttggg ggtcgaacct cagcgcccaa gctaacgcga taagtaatcc gcctggggag

1020

tacgtacgca agtatgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat

1080

gtggtttaat tcgacgcaac gcgaggaacc ttaccagcgt ttgacatcct aagaaattag

1140

cagagatgct tttgtgcccc ttcgggggaa cttagtgaca ggtggtgcat ggctgtcgtc

1200

agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct ttcgtatgtt

1260

gccatcatta agttgggcac tcatgcgata ctgcctgcga tgagcaggag gaaggtgggg

1320

atgacgtcaa gtcatcatgc cccttatacg ctgggctaca cacgtgctac aatgggtagt

1380

acagagagtc gcaaacctgc gagggggagc taatctcaga aaactattct cagttcggat

1440

tgtactctgc aactcgagta catgaagttg gaatcgctag taatcgcaaa tcagctatgt

1500

tgcggtgaat acgttctcgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagttggttg

1560

cacctgaagt agcaggccta accgcaagga gggatgctcc gagggtgtga ttagcgattg

1620

gggtgaagtc gtaacaaggt atccgtacgg gaacgtgcgg atggatcacc t

1671

<210> 898

<211> 1473

<212> DNA

<213> Fusobacterium naviforme

<400> 898

tagagtttga tcatggctca ggatgaacgc tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgaa

60

cgagagctac aggaggaagt tttcggatgg aatccggtag atcgagtggc ggacgggtga

120

gtaacgcgtg gggaacctgc ctcatacagg gggataacag ttggaaacga ctgttaatac

180

cgcataagac cacagagtcg catgactcag gggtaaaaac tccggtggta tgagatggac

240

ccgcgttcga ttagccagtt ggcggggtaa cggcccacca aagcgacgat cgatagccga

300

tttgagagaa tgaccggcca cattgggact gagacacggc ccaaactcct acgggaggca

360

gcagtgggga atattgcaca atggggggaa ccctgatgca gcgacgccgc gtgagtgaag

420

aagtatttcg gtatgtaaag ctctatcagc agggaagaag atgacggtac ctgagtaaga

480

agccccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggggcaag cgttatccgg

540

atttactggg tgtaaaggga gcgcagacgg ctatgcaagt ctgaagtgaa agcccggggc

600

tcaaccccgg gactgctttg gaaactgtgy agctagagtg tcggagaggt agcagaattc

660

ccagtgtagc ggtgaaatgc gtagatattg ggaagaatac cggtggcgaa ggcgcttact

720

ggacgataac tgacgttcag gctcgaaggc gtggggagca aacaggatta gataccctgg

780

tagtccacgc ggtaaacgat gaatactagg tgttggcatc caaaggatgt cggtgccgtc

840

gcaaacgcaa taagtattcc acctggggag tacgttcgca agaatgaaac tcaaaggaat

900

tgacggggac ccgcacaagc agtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc

960

ttaccaagtc ttgacatccc gatgaccggc ctgtaaagag gccttctctt cggagcattg

1020

gagacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1080

aacgagcgca acccctattg ccagtagcca gcaggtaaag ctgggcactc tggcgagact

1140

gcctgggata accaggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgattt

1200

gggcaacaca cgtgctacaa tggcgtaaac agagagaagc gaaggagcga tccggagcga

1260

atctaaaaat aacgtctcag ttcggactgc agtctgcaac tcgactgcac gaagctggaa

1320

ttgctagtaa tcgcgaatca gcatgtcgcg gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc

1380

gcccgtcaca ccatgggagt cagcaacgcc cgaagtcagt gacccaacct tagggaggga

1440

gctgccgaag gcggggcgga taactggggt gaa

1473

<210> 899

<211> 1330

<212> DNA

<213> Fusobacterium necrogenes

<220>

<221> modified_base

<222> (43)..(43)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (167)..(167)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (189)..(189)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (243)..(243)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (258)..(258)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (261)..(261)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (302)..(302)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (314)..(314)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (361)..(361)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (632)..(632)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (846)..(846)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (887)..(887)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (900)..(900)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (902)..(902)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (914)..(914)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (997)..(997)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1074)..(1074)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1091)..(1091)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1139)..(1139)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1172)..(1172)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 899

tggtggcgga cgggtgagta acgcgtaaag aacttgccct gcngtctggg acaacatttg

60

gaaacgaatg ctaataccgg atattatgtg agtttcgcat gaaattcata tgaaagctat

120

atgcgctgtg ggagagcttt gcgtcctatt agctagttgg tgaggtnacg gctcaccaag

180

gcgatgatng gtagccggcc tgagagggtg aacggccaca aggggactga gacacggccc

240

ttnctcctac gggaggcngc ngtggggaat attggacaat ggaccaaaag tctgatccag

300

cnattctgtg tgcncgatga agtttttcgg aatgtaaagt gctttcagtt gggacgaagt

360

nagtgacggt accaacagaa gaagcgacgg ctaaatacgt gccagcagcc gcggtaatac

420

gtatgtcgca agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaagc gcgtctaggc ggtttggtaa

480

gtctgatgtg aaaatgcggg gctcaactcc gtattgcgtt ggaaactgcc aaactagagt

540

actggagagg tgggcggaac tacaagtgta gaggtgaaat tcgtagatat ttgtaggaat

600

gccgatgggg aagccagccc actggacaga tnctgacgct aaagcgcgaa agcgtgggta

660

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgattact aggtgttggg

720

ggtcgaacct cagcgcccaa gctaacgcga taagtaatcc gcctggggag tacgtacgca

780

agtatgaaac tcaaaggaat tgacggggac cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

840

cgacgnaacg cgaggaacct taccagcgtt tgacatccta agaaatnagc agagatgctn

900

tngtgcttcg gggnaactta gtgacaggtg gtgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga

960

gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctntcg tatgttgcca tcattaagtt

1020

gggcactcat gcgatactgc ctgcgatgag caggaggaag gtggggatga cgtnaagtca

1080

tcatgcccct natacgctgg gctacacacg tgctacaatg ggtagtacag agagtcgcna

1140

acctgcgagg gggagctaat ctcagaaaac tnttctcagt tcggattgta ctctgcaact

1200

cgagtacatg aagttggaat cgctagtaat cgcaaatcag ctatgttgcg gtgaatacgt

1260

tctcgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt tggttgcacc tgaagtagca

1320

ggcctaaccg

1330

<210> 900

<211> 1487

<212> DNA

<213> Fusobacterium necrophorum

<400> 900

tttgatcctg gctcaggatg aacgctgaca gaatgcttaa cacatgcaag tcgactcgag

60

tcttcggact tgggtggcgc acgggtgagt aacgcgtaaa gaacttgcct cttagaccgg

120

gacaacatct ggaaacggat gctaataccg gatattatgg ttttttcgca tggaggaatc

180

atgaaagcta gatgcgctaa gagagagctt tgcgtcccat tagctagttg gtgaggtaac

240

ggcccaccaa ggcaatgatg ggtagccggc ctgagagggt gaacggccac aaggggactg

300

agacacggcc cttactccta cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa tggaccacaa

360

gtctgatcca gcaattctgt gtgcacgatg acgtttttcg gaatgtaaag tgctttcagt

420

cgggaagaag tcagtgacgg taccgacaga agaagcgacg gctaaatacg tgccagcagc

480

cgcggtaata cgtatgtcgc aagcgttatc cggatttatt gggcgtaaag cgcgtctagg

540

cggcaaggaa agtctgatgt gaaaatgcgg agctcaactc cgtatggcgt tggaaactgc

600

cttactagag tactggagag gtaggcggaa ctacaagtgt agaggtgaaa ttcgtagata

660

tttgtaggaa tgccgatggg gaagccagcc tactggacag atactgacgc taaagcgcga

720

aagcgtgggt agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgctgtaaa cgatgattac

780

taggtgttgg gggtcaaacc tcagcgccca agctaacgcg ataagtaatc cgcctgggga

840

gtacgtacgc aagtatgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga ccgcacaagc ggtggagcat

900

gtggtttaat tcgacgcaac gcgaggaacc ttaccagcgt ttgacatcct acgaacggag

960

cagagatgcg ccggtgccct ttcgggggaa cgtagtgaca ggtggtgcat ggctgtcgtc

1020

agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct atcgtatgtt

1080

accatccttc agttggggac tcatgcgata ctgcctgcga cgagcaggag gaaggtgggg

1140

atgacgtcaa gtcatcatgc cccttatacg ctgggctaca cacgtgctac aatgggtagt

1200

acagagagcg gcaaacccgc gagggggagc aaatctcaga aaactattct tagttcggat

1260

ggtactctgc aactcgagta catgaagttg gaatcgctag taatcgcaaa tcagcaatgt

1320

tgcggtgaat acgttctcgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtgggttg

1380

caactgaagt agcaggccta accttaggga aggatgctcc gagggtgtgg ttagcgattg

1440

gggtgaagtc gtaacaaggt atccgtacgg gaacgtgcgg ctggatc

1487

<210> 901

<211> 1523

<212> DNA

<213> Fusobacterium nucleatum

<400> 901

ttgaacgaag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctga cagaatgctt aacacatgca

60

agtctacttg aatttgggtt ttttaacttc gatttgggtg gcggacgggt gagtaacgcg

120

taaagaactt gcctcacagc tagggacaac atttggaaac gaatgctaat acctgatatt

180

atgattatag ggcatcctag aattatgaaa gctatatgcg ctgtgagaga gctttgcgtc

240

ccattagcta gttggagagg taacggctca ccaaggcgat gatgggtagc cggcctgaga

300

gggtgaacgg ccacaagggg actgagacac ggcccttact cctacgggag gcagcagtgg

360

ggaatattgg acaatggacc gagagtctga tccagcaatt ctgtgtgcac gatgacgttt

420

ttcggaatgt aaagtgcttt cagttgggaa gaaaaaaatg acggtaccaa cagaagaagt

480

gacggctaaa tacgtgccag cagccgcggt aatacgtatg tcacgagcgt tatccggatt

540

tattgggcgt aaagcgcgtc taggtggtta tgtaagtctg atgtgaaaat gcagggctca

600

actctgtatt gcgttggaaa ctgtgtaact agagtactgg agaggtaagc ggaactacaa

660

gtgtagaggt gaaattcgta gatatttgta ggaatgccga tggggaagcc agcttactgg

720

acagatactg acgctgaagc gcgaaagcgt gggtagcaaa caggattaga taccctggta

780

gtccacgccg taaacgatga ttactaggtg ttgggggtcg aacctcagcg cccaagcaaa

840

cgcgataagt aatccgcctg gggagtacgt acgcaagtat gaaactcaaa ggaattgacg

900

gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgac gcaacgcgag gaaccttacc

960

agcgtttgac atcttaggaa tgagacagag atgtttcagt gtcccttcgg ggaaacctaa

1020

agacaggtgg tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1080

acgagcgcaa cccctttcgt atgttaccat cattaagttg gggactcatg cgatactgcc

1140

tacgatgagt aggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catgcccctt atacgctggg

1200

ctacacacgt gctacaatgg gtagaacaga gagttgcaaa gccgtgaggt ggagctaatc

1260

tcagaaaact attcttagtt cggattgtac tctgcaactc gagtacatga agttggaatc

1320

gctagtaatc gcgaatcagc aatgtcgcgg tgaatacgtt ctcgggtctt gtacacaccg

1380

cccgtcacac cacgagagtt ggttgcacct gaagtagcag gcctaaccgt aaggagggat

1440

gttccgaggg tgtgattagc gattggggtg aagtcgtaac aaggtatccg tacgggaacg

1500

tgcggatgga tcacctcctt tct

1523

<210> 902

<211> 1509

<212> DNA

<213> Fusobacterium periodonticum

<400> 902

ttgaacgaag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctga cagaatgctt aacacatgca

60

agtctacttg aacttcggtt tgggtggcgg acgggtgagt aacgcgtaaa gaacttgcct

120

cacagttagg gacaacattt ggaaacgaat gctaatacct gatattatga ttttagggca

180

tcctaagatt atgaaagcta tatgcgctgt gagagagctt tgcgtcccat tagctagttg

240

gagaggtaac ggctcaccaa ggcgatgatg ggtagccggc ctgagagggt gaacggccac

300

aaggggactg agacacggcc cttactccta cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa

360

tggaccaaga gtctgatcca gcaattctgt gtgcacgatg acgtttttcg gaatgtaaag

420

tgctttcagt tgggaagaaa aaaatgacgg taccaacaga agaagtgacg gctaaatacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtatgtcac aagcgttatc cggatttatt gggcgtaaag

540

cgcgtctagg tggttatgta agtctgatgt gaaaatgcag ggctcaactc tgtattgcgt

600

tggaaactgc atgactagag tactggagag gtaagcggaa ctacaagtgt agaggtgaaa

660

ttcgtagata tttgtaggaa tgccgatggg gaagccagct tactggacag atactgacgc

720

taaagcgcga aagcgtgggt agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa

780

cgatgattac taggtgttgg gggtcgaacc tcagcgccca agctaacgcg ataagtaatc

840

cgcctgggga gtacgtacgc aagtatgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag

900

cggtggagca tgtggtttaa ttcgacgcaa cgcgaggaac cttaccagcg tttgacatct

960

taggaatgag acagagatgt ttcagtgtcc cttcggggaa acctaaagac aggtggtgca

1020

tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc

1080

tttcgtatgt taccatcatt aagttgggga ctcatgcgat actgcctgcg atgagcagga

1140

ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg ccccttatac gctgggctac acacgtgcta

1200

caatgggtag tacagagagt cgcaaagccg cgaggtggag ctaatctcag aaaactattc

1260

ttagttcgga ttgtactctg caactcgagt acatgaagtt ggaatcgcta gtaatcgcga

1320

atcagcaatg tcgcggtgaa tacgttctcg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg

1380

agagttggtt gcacctgaag tagcaggcct aaccgtaagg agggatgctc cgagggtgtg

1440

attagcgatt ggggtgaagt cgtaacaagg tatccgtacg ggaacgtgcg gatggatcac

1500

ctcctttct

1509

<210> 903

<211> 1453

<212> DNA

<213> Fusobacterium russii

<220>

<221> modified_base

<222> (1)..(2)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (298)..(298)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (321)..(322)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (511)..(511)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (885)..(885)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (893)..(893)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (895)..(895)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (901)..(901)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (926)..(928)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1159)..(1160)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1375)..(1375)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1449)..(1450)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 903

nngaacgaag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctga cagaatgctt aacacatgca

60

agtcaacttg aacttcggtt tgggtggcgg acgggtgagt aacgcgtaaa gaacttgcct

120

cacagactgg gacaacattt ggaaacgaat gctaagaccg gatattatga attcattgca

180

tgatgaagtc atgaaagcta taagcgctgt gagagagctt tgcgtcccat tagctagttg

240

gagaggtaac ggctcaccaa ggcgatgatg ggtagccggc ctgagagggt gaacggcnac

300

aaggggactg agacacggcc nntactccta cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa

360

tggaccaaga gtctgatcca gcaattctgt gtgcacgatg aagtttttcg gaatgtaaag

420

tgctttcagt tgggaagaag aaagtgacgg taccaacaga agaagcgacg gctaaatacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtatgctgc nagcgttatc cggatttatt gggcgtaaag

540

cgcgtctagg cggctagata agtctgatgt gaaaatgcgg ggctcaactc cgtattgcgt

600

tggaaactgt atagctagag tactggagag gtaagcggaa ctacaagtgt agaggtgaaa

660

ttcgtagata tttgtaggaa tgccgatggg gaagccagct tactggacag atactgacgc

720

tgaagcgcga aagcgtgggt agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa

780

cgatgattac taggtgttgg gggtcgaacc tcagcgccca agcaaacgcg ataagtaatc

840

cgcctgggga gtacgtacgc aagtatgaaa ctcaaaggaa ttgangggga ccngnacaag

900

nggtggagca tgtggtttaa ttcgannnaa cgcgaggaac cttaccagcg tttgacatcc

960

tactaagggc tcagagatga gcttgtgctc cttcgggaga aagtagagac aggtggtgca

1020

tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc

1080

tttcgtatgt taccatcatt aagttgggga ctcatgcgat actgcctgcg atgagcagga

1140

ggaaggtggg gatgacgtnn agtcatcatg ccccttatac gctgggctac acacgtgcta

1200

caatgggtag aacagagagt ggcgaagctg tgaagtggag caaatctcag aaaactattc

1260

ttagttcgga ttgtactctg caactcgagt acatgaagtt ggaatcgcta gtaatcgcaa

1320

atcagcaatg ttgcggtgaa tacgttctcg ggtcttgtac acaccgcccg tcacnccacg

1380

agagttggtt gcacctgaag taacaggcct aaccgaaagg agggatgttc cgagggtgtg

1440

attagcgann ggg

1453

<210> 904

<211> 1522

<212> DNA

<213> Fusobacterium sp. 11_3_2

<400> 904

ttgaacgaag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctga cagaatgctt aacacatgca

60

agtcaacttg aatttgggtt tttaacttag atttgggtgg cggacgggtg agtaacgcgt

120

aaagaacttg cctcacagct agggacaaca tttagaaatg aatgctaata cctgatatta

180

tgattttaag gcatcttaga attatgaaag ctataagcac tgtgagagag ctttgcgtcc

240

cattagctag ttggagaggt aacagctcac caaggcgatg atgggtagcc ggcctgagag

300

ggtgaacggc cacaagggga ctgagacacg gcccttactc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaatattgga caatggaccg agagtctgat ccagcaattc tgtgtgcacg atgaagtttt

420

tcggaatgta aagtgctttc agttgggaag aaagaaatga cggtaccaac agaagaagtg

480

acggctaaat acgtgccagc agccgcggta atacgtatgt cacgagcgtt atccggattt

540

attgggcgta aagcgcgtct aggtggttat gtaagtctga tgtgaaaatg cagggctcaa

600

ctctgtattg cgttggaaac tgtataacta gagtactgga gaggtaagcg gaactacaag

660

tgtagaggtg aaattcgtag atatttgtag gaatgccgat ggggaagcca gcttactgga

720

cagatactga cgctaaagcg cgaaagcgtg ggtagcaaac aggattagat accctggtag

780

tccacgctgt aaacgatgat tactaggtgt tgggggtcga acctcagcgc ccaagcaaac

840

gcgataagta atccgcctgg ggagtacgta cgcaagtatg aaactcaaag gaattgacgg

900

ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgacg caacgcgagg aaccttacca

960

gcgtttgaca tcttaggaat gagatagaga tatttcagtg tcccttcggg gaaacctaaa

1020

gacaggtggt gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1080

cgagcgcaac ccctttcgta tgttaccatc attaagttgg ggactcatgc gatactgcct

1140

acgatgagta ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atgcccctta tacgctgggc

1200

tacacacgtg ctacaatggg tagaacagag agttgcaaag ccgtgaggtg aagctaatct

1260

cagaaaacta ttcttagttc ggattgtact ctgcaactcg agtacatgaa gttggaatcg

1320

ctagtaatcg cgaatcagca atgtcgcggt gaatacgttc tcgggtcttg tacacaccgc

1380

ccgtcacacc acgagagttg gttgcacctg aagtagcagg cctaaccgta aggagggatg

1440

ctccgagggt gtgattagcg attggggtga agtcgtaaca aggtatccgt acgggaacgt

1500

gcggatggat cacctccttt ct

1522

<210> 905

<211> 1496

<212> DNA

<213> Fusobacterium sp. 12_1B

<400> 905

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct gacagaatgc ttaacacatg caagtctact

60

tgatccttcg ggtgaaggtg gcggacgggt gagtaacgcg taaagaactt gccttacaga

120

ctgggacaac atttggaaac gaatgctaat accggatatt atgattgggt cgcatgatct

180

ggttatgaaa gctatatgcg ctgtgagaga gctttgcgtc ccattagtta gttggtgagg

240

taacggctca ccaagacgat gatgggtagc cggcctgaga gggtgaacgg ccacaagggg

300

actgagacac ggcccttact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg acaatggacc

360

aaaagtctga tccagcaatt ctgtgtgcac gatgaagttt ttcggaatgt aaagtgcttt

420

cagttgggaa gaagtcagtg acggtaccaa cagaagaagc gacggctaaa tacgtgccag

480

cagccgcggt aatacgtatg tcgcaagcgt tatccggatt tattgggcgt aaagcgcgtc

540

taggcggctt agtaagtctg atgtgaaaat gcggggctca accccgtatt gcgttggaaa

600

ctgctaaact agagtactgg agaggtaggc ggaactacaa gtgtagaggt gaaattcgta

660

gatatttgta ggaatgccga tggggaagcc agcctactgg acagatactg acgctaaagc

720

gcgaaagcgt gggtagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga

780

ttactaggtg ttgggggtcg aacctcagcg cccaagctaa cgcgataagt aatccgcctg

840

gggagtacgt acgcaagtat gaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg

900

agcatgtggt ttaattcgac gcaacgcgag gaaccttacc agcgtttgac atcccaagaa

960

gttaacagag atgttttcgt gcctcttcgg aggaacttgg tgacaggtgg tgcatggctg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctttcgt

1080

atgttaccat cattaagttg gggactcatg cgagactgcc tgcgatgagc aggaggaagg

1140

tggggatgac gtcaagtcat catgcccctt atacgctggg ctacacacgt gctacaatgg

1200

gtagtacaga gagctgcaaa cctgcgaggg taagctaatc tcataaaact attcttagtt

1260

cggattgtac tctgcaactc gagtacatga agttggaatc gctagtaatc gcaaatcagc

1320

tatgttgcgg tgaatacgtt ctcgggtctt gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt

1380

ggttgcacct gaagtaacag gcctaaccgt aaggagggat gttccgaggg tgtgattagc

1440

gattggggtg aagtcgtaac aaggtatccg tacgggaacg tgcggatgga tcacct

1496

<210> 906

<211> 1509

<212> DNA

<213> Fusobacterium sp. 1_1_41FAA

<400> 906

ttgaacgaag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctga cagaatgctt aacacatgca

60

agtctacttg aacttcggtt tgggtggcgg acgggtgagt aacgcgtaaa gaacttgcct

120

cacagttagg gacaacattt ggaaacgaat gctaatacct gatattatga ttttagggca

180

tcctaagatt atgaaagcta tatgcgctgt gagagagctt tgcgtcccat tagctagttg

240

gagaggtaac ggctcaccaa ggcgatgatg ggtagccggc ctgagagggt gaacggccac

300

aaggggactg agacacggcc cttactccta cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa

360

tggaccaaaa gtctgatcca gcaattctgt gtgcacgatg acgtttttcg gaatgtaaag

420

tgctttcagt tgggaagaaa aaaatgacgg taccaacaga agaagtgacg gctaaatacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtatgtcac aagcgttatc cggatttatt gggcgtaaag

540

cgcgtctagg tggttatgta agtctgatgt gaaaatgcag ggctcaactc tgtattgcgt

600

tggaaactgc atgactagag tactggagag gtaagcggaa ctacaagtgt agaggtgaaa

660

ttcgtagata tttgtaggaa tgccgatggg gaagccagct tactggacag atactgacgc

720

taaagcgcga aagcgtgggt agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa

780

cgatgattac taggtgttgg gggtcgaacc tcagcgccca agctaacgcg ataagtaatc

840

cgcctgggga gtacgtacgc aagtatgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag

900

cggtggagca tgtggtttaa ttcgacgcaa cgcgaggaac cttaccagcg tttgacatct

960

taggaatgag acagagatgt ttcagtgtca cttcggtgaa acctaaagac aggtggtgca

1020

tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc

1080

tttcgtatgt taccatcatt aagttgggga ctcatgcgat actgcctgcg atgagcagga

1140

ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg ccccttatac gctgggctac acacgtgcta

1200

caatgggtag tacagagagt cgcaaagccg cgaggtggag ctaatctcag aaaactattc

1260

ttagttcgga ttgtactctg caactcgagt acatgaagtt ggaatcgcta gtaatcgcga

1320

atcagcaatg tcgcggtgaa tacgttctcg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg

1380

agagttggtt gcacctgaag tagcaggcct aaccgcaagg agggatgctc cgagggtgtg

1440

attagcgatt ggggtgaagt cgtaacaagg tatccgtacg ggaacgtgcg gatggatcac

1500

ctcctttct

1509

<210> 907

<211> 1494

<212> DNA

<213> Fusobacterium sp. 2_1_31

<400> 907

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct gacagaatgc ttaacacatg caagtctact

60

tgaacttcgg tttgggtggc ggacgggtga gtaacgcgta aagaacttgc ctcacagtta

120

gggacaacat ttggaaacga atgctaatac ctgatattat gattttaggg catcctaaga

180

ttatgaaagc tatatgcgct gtgagagagc tttgcgtccc attagctagt tggagaggta

240

acggctcacc aaggcgatga tgggtagccg gcctgagagg gtgaacggcc acaaggggac

300

tgagacacgg cccttactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattggac aatggaccaa

360

aagtctgatc cagcaattct gtgtgcacga tgacgttttt cggaatgtaa agtgctttca

420

gttgggaaga aaaaaatgac ggtaccaaca gaagaagtga cggctaaata cgtgccagca

480

gccgcggtaa tacgtatgtc acaagcgtta tccggattta ttgggcgtaa agcgcgtcta

540

ggtggttatg taagtctgat gtgaaaatgc agggctcaac tctgtattgc gttggaaact

600

gcatgactag agtactggag aggtaagcgg aactacaagt gtagaggtga aattcgtaga

660

tatttgtagg aatgccgatg gggaagccag cttactggac agatactgac gctaaagcgc

720

gaaagcgtgg gtagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgatt

780

actaggtgtt gggggtcgaa cctcagcgcc caagctaacg cgataagtaa tccgcctggg

840

gagtacgtac gcaagtatga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggag

900

catgtggttt aattcgacgc aacgcgagga accttaccag cgtttgacat cttaggaatg

960

agacagagat gtttcagtgt cacttcggtg aaacctaaag acaggtggtg catggctgtc

1020

gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctttcgtat

1080

gttaccatca ttaagttggg gactcatgcg atactgccta cgatgagtag gaggaaggtg

1140

gggatgacgt caagtcatca tgccccttat acgctgggct acacacgtgc tacaatgggt

1200

agtacagaga gtcgcaaagc cgcgaggtgg agctaatctc agaaaactat tcttagttcg

1260

gattgtactc tgcaactcga gtacatgaag ttggaatcgc tagtaatcgc gaatcagcaa

1320

tgtcgcggtg aatacgttct cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagttgg

1380

ttgcacctga agtagcaggc ctaaccgtaa ggagggatgc tccgagggtg tgattagcga

1440

ttggggtgaa gtcgtaacaa ggtatccgta cgggaacgtg cggatggatc acct

1494

<210> 908

<211> 1522

<212> DNA

<213> Fusobacterium sp. 3_1_27

<400> 908

ttgaacgaag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctga cagaatgctt aacacatgca

60

agtcaacttg aatttgggtt tttaacttag gtttgggtgg cggacgggtg agtaacgcgt

120

aaagaacttg cctcacagct agggacaaca tttggaaacg aatgctaata cctaatatta

180

tgataatagg gcatcctata attatgaaag ctataagcgc tgtgagagag ctttgcgtcc

240

cattagctag ttggagaggt aacggctcac caaggcgatg atgggtagcc ggcctgagag

300

ggtgatcggc cacaagggga ctgagacacg gcccttactc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaatattgga caatggacca agagtctgat ccagcaattc tgtgtgcacg atgaagtttt

420

tcggaatgta aagtgctttc agttgggaag aaaaaaatga cggtaccaac agaagaagtg

480

acggctaaat acgtgccagc agccgcggta atacgtatgt cacgagcgtt atccggattt

540

attgggcgta aagcgcgtct aggtggttat gtaagtctga tgtgaaaatg cagggctcaa

600

ctctgtattg cgttggaaac tgtataacta gagtactgga gaggtaagcg gaactacaag

660

tgtagaggtg aaattcgtag atatttgtag gaatgccgat ggggaagcca gcttactgga

720

cagatactga cgctgaagcg cgaaagcgtg ggtagcaaac aggattagat accctggtag

780

tccacgccgt aaacgatgat tactaggtgt tgggggtcga acctcagcgc ccaagcaaac

840

gcgataagta atccgcctgg ggagtacgta cgcaagtatg aaactcaaag gaattgacgg

900

ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgacg caacgcgagg aaccttacca

960

gcgtttgaca tcttaggagt gagatagaga tatttcagtg tcccttcggg gaaacctaaa

1020

gacaggtggt gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1080

cgagcgcaac ccctttcgta tgttaccatc attaagttgg ggactcatgc gatactgcct

1140

acgatgagta ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atgcccctta tacgctgggc

1200

tacacacgtg ctacaatggg tagaacagag agttgcaaag ctgtgaagtg gagctaatct

1260

cagaaaacta ttcttagttc ggattgtact ctgcaactcg agtacatgaa gttggaatcg

1320

ctagtaatcg cgaatcagca atgtcgcggt gaatacgttc tcgggtcttg tacacaccgc

1380

ccgtcacacc acgagagttg gttgcacctg aagtagcagg cctaaccgta aggagggatg

1440

ctccgagggt gtgattagcg attggggtga agtcgtaaca aggtatccgt acgggaacgt

1500

gcggatggat cacctccttt ct

1522

<210> 909

<211> 1522

<212> DNA

<213> Fusobacterium sp. 3_1_33

<400> 909

ttgaacgaag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctga cagaatgctt aacacatgca

60

agtcaacttg aatttgggtt tttaacttag atttgggtgg cggacgggtg agtaacgcgt

120

aaagaacttg cctcacagct agggacaaca tttagaaatg aatgctaata cctgatatta

180

tgattttaag gcatcttaga attatgaaag ctataagcac tgtgagagag ctttgcgtcc

240

cattagctag ttggagaggt aacagctcac caaggcgatg atgggtagcc ggcctgagag

300

ggtgaacggc cacaagggga ctgagacacg gcccttactc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaatattgga caatggaccg agagtctgat ccagcaattc tgtgtgcacg atgaagtttt

420

tcggaatgta aagtgctttc agttgggaag aaaaaaatga cggtaccaac agaagaagtg

480

acggctaaat acgtgccagc agccgcggta atacgtatgt cacgagcgtt atccggattt

540

attgggcgta aagcgcgtct aggtggttat gtaagtctga tgtgaaaatg cagggctcaa

600

ctctgtattg cgttggaaac tgtataacta gagtactgga gaggtaagcg gaactacaag

660

tgtagaggtg aaattcgtag atatttgtag gaatgccgat ggggaagcca gcttactgga

720

cagatactga cgctaaagcg cgaaagcgtg ggtagcaaac aggattagat accctggtag

780

tccacgctgt aaacgatgat tactaggtgt tgggggtcga acctcagcgc ccaagcaaac

840

gcgataagta atccgcctgg ggagtacgta cgcaagtatg aaactcaaag gaattgacgg

900

ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgacg caacgcgagg aaccttacca

960

gcgtttgaca tcttaggaat gagatagaga tatttcagtg tcccttcggg gaaacctaaa

1020

gacaggtggt gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1080

cgagcgcaac ccctttcgta tgttaccatc attaagttgg ggactcatgc gatactgcct

1140

acgatgagta ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atgcccctta tacgctgggc

1200

tacacacgtg ctacaatggg tagaacagag agttgcaaag ccgtgaggtg aagctaatct

1260

cagaaaacta ttcttagttc ggattgtact ctgcaactcg agtacatgaa gttggaatcg

1320

ctagtaatcg cgaatcagca atgtcgcggt gaatacgttc tcgggtcttg tacacaccgc

1380

ccgtcacacc acgagagttg gttgcacctg aagtagcagg cctaaccgta aggagggatg

1440

ctccgagggt gtgattagcg attggggtga agtcgtaaca aggtatccgt acgggaacgt

1500

gcggatggat cacctccttt ct

1522

<210> 910

<211> 1513

<212> DNA

<213> Fusobacterium sp. 3_1_36A2

<400> 910

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct gacagaatgc ttaacacatg caagtcaact

60

tgaatttggg tttttaactt aggtttgggt ggcggacggg tgagtaacgc gtaaagaact

120

tgcctcacag ctagggacaa catttggaaa cgaatgctaa tacctaatat tatgataata

180

gggcatccta taattatgaa agctataagc gctgtgagag agctttgcgt cccattagct

240

agttggagag gtaacggctc accaaggcga tgatgggtag ccggcctgag agggtgatcg

300

gccacaaggg gactgagaca cggcccttac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

360

gacaatggac caagagtctg atccagcaat tctgtgtgca cgatgaagtt tttcggaatg

420

taaagtgctt tcagttggga agaaagaaat gacggtacca acagaagaag tgacggctaa

480

atacgtgcca gcagccgcgg taatacgtat gtcacgagcg ttatccggat ttattgggcg

540

taaagcgcgt ctaggtggtt atgtaagtct gatgtgaaaa tgcagggctc aactctgtat

600

tgcgttggaa actgtataac tagagtactg gagaggtaag cggaactaca agtgtagagg

660

tgaaattcgt agatatttgt aggaatgccg atggggaagc cagcttactg gacagatact

720

gacgctgaag cgcgaaagcg tgggtagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc

780

gtaaacgatg attactaggt gttgggggtc gaacctcagc gcccaagcaa acgcgataag

840

taatccgcct ggggagtacg tacgcaagta tgaaactcaa aggaattgac ggggacccgc

900

acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga cgcaacgcga ggaaccttac cagcgtttga

960

catcttagga tgagatagag atatttcagt gtcccttcgg ggaaacctaa agacaggtgg

1020

tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

1080

cccctttcgt atgttaccat cattaagttg gggactcatg cgatactgcc tacgatgagt

1140

aggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catgcccctt atacgctggg ctacacacgt

1200

gctacaatgg gtagaacaga gagtcgcaaa gctgtgaagt ggagctaatc tcagaaaact

1260

attcttagtt cggattgtac tctgcaactc gagtacatga agttggaatc gctagtaatc

1320

gcgaatcagc aatgtcgcgg tgaatacgtt ctcgggtctt gtacacaccg cccgtcacac

1380

cacgagagtt ggttgcacct gaagtagcag gcctaaccgt aaggagggat gctccgaggg

1440

tgtgattagc gattggggtg aagtcgtaac aaggtatccg tacgggaacg tgcggatgga

1500

tcacctcctt tct

1513

<210> 911

<211> 1369

<212> DNA

<213> Fusobacterium sp. 3_1_5R

<400> 911

ggaaacggat gctaataccg gatattatgc tttcttcgca tggaggaagt atgaaagcta

60

tatgcgctat gagagagctt tgcgtcccat tagctagttg gtgaggtaac ggcccaccaa

120

ggcgatgatg ggtagccggc ctgagagggt gaacggccac aaggggactg agacacggcc

180

cttactccta cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa tggaccaaaa gtctgatcca

240

gcaattctgt gtgcacgatg acgtttttcg gaatgtaaag tgctttcagt cgggaagaag

300

caagtgacgg taccgacaga agaagcgacg gctaaatacg tgccagcagc cgcggtaata

360

cgtatgtcgc aagcgttatc cggatttatt gggcgtaaag cgcgtctagg cggcaaggaa

420

agtctgatgt gaaaatgcgg ggctcaactc cgtattgcgt tggaaactgc cttactagag

480

tactggagag gtaggcggaa ctacaagtgt agaggtgaaa ttcgtagata tttgtaggaa

540

tgccgatggg gaagccagcc tactggacag atactgacgc taaagcgcga aagcgtgggt

600

agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgctgtaaa cgatgattac taggtgttgg

660

gggtcaaacc tcagcgccca agctaacgcg ataagtaatc cgcctgggga gtacgtacgc

720

aagtatgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

780

ttcgacgcaa cgcgaggaac cttaccagcg tttgacatcc tacaaagagt gcagagatgc

840

gcttgtgctt cttcggaaga atgtagtgac aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt

900

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc tatcgtatgt taccagcctt

960

tagttgggga ctcatgcgat actgcctgcg acgagcagga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

agtcatcatg ccccttatac gctgggctac acacgtgcta caatgggtag tacagagagc

1080

ggcgaacccg cgagggggag caaatctcag aaaactattc ttagttcgga ttgtactctg

1140

caactcgagt acatgaagtt ggaatcgcta gtaatcgcaa atcagcaatg ttgcggtgaa

1200

tacgttctcg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagttggtt gcacctgaag

1260

tagcaggcct aaccgtaagg aaggatgctc cgagggtgtg gttagcgatt ggggtgaagt

1320

cgtaacaagg tatccgtacg ggaacgtgcg gatggatcac ctcctttct

1369

<210> 912

<211> 1301

<212> DNA

<213> Fusobacterium sp. AC18

<400> 912

tcaggatgaa cgctgacaga atgcttaaca catgcaagtc aactggtggc ggacgggtga

60

gtaacgcgta aagaacttgc ctcacagata gggacaacat ttggaaacga atgctaatac

120

ctgatattga aaggcgctgt gagagagctt tgcgtcccat tagctagttg gagaggtaac

180

ggctcaccaa ggcgatgatg ggtagccggc ctgagagggt gatcggccac aaggggactg

240

agacacggcc cttactccta cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa tggaccaagt

300

ctgatccagc aattctgtgt gcacgatgaa gtttttcgga atgtaaagtg ctttcagttg

360

ggaagatgac ggtaccaaca gaagaagtga cggctaaata cgtgccagca gccgcggtaa

420

tacgtatgtc acaagcgtta tccggattta ttgggcgtaa agcgcgtcta ggtggttatg

480

taagtctgat gtgaaaatgc agggctcaac tctgtattgc gttggaaact gtgtaactag

540

agtactggag aggtaagcgg aactacaagt gtagaggtga aattcgtaga tatttgtagg

600

aatgccgatg gggaagccag cttactggac agactgacgc tgaagcgcga aagcgtgggt

660

agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgattac taggtgttgg

720

ggcctcagcg cccaagcaaa cgcgataagt aatccgcctg gggagtacgt acgcaagtat

780

gaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgac

840

gcaacgcgag gaaccttacc agcgtttgac atcgacaggt ggtgcatggc tgtcgtcagc

900

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccctttc gtatgttacc

960

atcatgggga ctcatgcgat actgcctgcg atgagcagga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

agtcatcatg ccccttatac gctgggctac acacgtgcta caatgggtag cagagagtcg

1080

caaagccgtg aggtggagct aatctcagct attcttagtt cggatgtact ctgcaactcg

1140

agtacagaag ttggaatcgc tagtaatcgc gaatcagcaa tgtcgcggtg aatacgttct

1200

cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagttgg ttgcacctga agtagcagcc

1260

tagggatgct ccgagggtgt gattagcgat ggggtgaagt c

1301

<210> 913

<211> 1300

<212> DNA

<213> Fusobacterium sp. ACB2

<400> 913

tggctcagga tgaacgctga cagaatgctt aacacatgca agtcaactgg tggcggacgg

60

gtgagtaacg cgtaaagaac ttgcctcaca gctagggaca acatttagaa atgaatgcta

120

atacctgata ttgaaaggca ctgtgagaga gctttgcgtc ccattagcta gttggagagg

180

taacagctca ccaaggcgat gatgggtagc cggcctgaga gggtgaacgg ccacaagggg

240

actgagacac ggcccttact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg acaatggacg

300

agagtctgat ccagcaattc tgtgtgcacg atgaagtttt tcggaatgta aagtgctttc

360

agttgggaag atgacggtac caacagaaga agtgacggct aaatacgtgc cagcagccgc

420

ggtaatacgt atgtcacgag cgttatccgg atttattggg cgtaaagcgc gtctaggtgg

480

ttatgtaagt ctgatgtgaa aatgcagggc tcaactctgt attgcgttgg aaactgtata

540

actagagtac tggagaggta agcggaacta caagtgtaga ggtgaaattc gtagatattt

600

gtaggaatgc cgatggggaa gccagcttac tggacagact gacgctaaag cgcgaaagcg

660

tgggtagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacgatg attactaggt

720

gttggggcct cagcgcccaa gcaaacgcga taagtaatcc gcctggggag tacgtacgca

780

agtatgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

840

tcgacgcaac gcgaggaacc ttaccagcgt ttgacatcga caggtggtgc atggctgtcg

900

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ctttcgtatg

960

ttaccatcat ggggactcat gcgatactgc ctacgatgag taggaggaag gtggggatga

1020

cgtcaagtca tcatgcccct tatacgctgg gctacacacg tgctacaatg ggtagcagag

1080

agttgcaaag ccgtgaggtg aagctaatct cagctattct tagttcggat gtactctgca

1140

actcgagtac agaagttgga atcgctagta atcgcgaatc agcaatgtcg cggtgaatac

1200

gttctcgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gttggttgca cctgaagtag

1260

cagcctaggg atgctccgag ggtgtgatta gcgattgggg

1300

<210> 914

<211> 1364

<212> DNA

<213> Fusobacterium sp. AS2

<400> 914

ggctcaggat gaacgctgac agaatgctta acacatgcaa gtcaacttga acttcggttt

60

gggtggcgga cgggtgagta acgcgtaaag aacttgcctc acagataggg acaacatttg

120

gaaacgaatg ctaatacctg atattatgat tttagggcat cctaggatta tgaaagctat

180

atgcgctgtg agagagcttt gcgtcccatt agctagttgg agaggtaacg gctcaccaag

240

gcgatgatgg gtagccggcc tgagagggtg atcggccaca aggggactga gacacggccc

300

ttactcctac gggaggcagc agtggggaat attggacaat ggaccaagag tctgatccag

360

caattctgtg tgcacgatga agtttttcgg aatgtaaagt gctttcagtt gggaagaaaa

420

aaatgacggt accaacagaa gaagtgacgg ctaaatacgt gccagcagcc gcggtaatac

480

gtatgtcaca agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaagc gcgtctaggt ggttatataa

540

gtctgatgtg aaaatgcagg gctcaactct gtattgcgtt ggaaactgtg taactagagt

600

actggagagg taagcggaac tacaagtgta gaggtgaaat tcgtagatat ttgtaggaat

660

gccgatgggg aagccagctt actggacaga tactgacgct gaagcgcgaa agcgtgggta

720

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgattact aggtgttggg

780

ggtcgaacct cagcgcccaa gcaaacgcga taagtaatcc gcctggggag tacgtacgca

840

agtatgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

900

tcgacgcaac gcgaggaacc ttaccagcgt ttgacatctt aggaatgaga cagagatgtt

960

tcagtgtccc ttcggggaaa cctaaagaca ggtggtgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc

1020

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct ttcgtatgtt accatcatta

1080

agttggggac tcatgcgata ctgcctgcga tgagcaggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1140

gtcatcatgc cccttatacg ctgggctaca cacgtgctac aatgggtagt acagagagtc

1200

gcaaagccgt gaggtggagc taatctcaga aaactattct tagttcggat tgtactctgc

1260

aactcgagta catgaagttg gaatcgctag taatcgcgaa tcagcaatgt cgcggtgaat

1320

acgttctcgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagt

1364

<210> 915

<211> 1387

<212> DNA

<213> Fusobacterium sp. CM1

<400> 915

gaacgctgac agaatgctta acacatgcaa gtcaacttga atttgggttt ttaacttaga

60

tttgggtggc ggacgggtga gtaacgcgta aagaacttgc ctcacagcta gggacaacat

120

ttagaaatga atgctaatac ctgatattat gattttaagg catcttagaa ttatgaaagc

180

tatatgcact gtgagagagc tttgcgtccc attagctagt tggagaggta acagctcacc

240

aaggcgatga tgggtagccg gcctgagagg gtgaacggcc acaaggggac tgagacacgg

300

cccttactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattggac aatggaccga gagtctgatc

360

cagcaattct gtgtgcacga tgaagttttt cggaatgtaa agtgctttca gttgggaaga

420

aagaaatgac ggtaccaaca gaagaagtga cggctaaata cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacgtatgtc acgagcgtta tccggattta ttgggcgtaa agcgcgtcta ggtggttatg

540

taagtctgat gtgaaaatgc agggctcaac tctgtattgc gttggaaact gtgtaactag

600

agtactggag aggtaagcgg aactacaagt gtagaggtga aattcgtaga tatttgtagg

660

aatgccgatg gggaagccag cttactggac agatactgac gctaaagcgc gaaagcgtgg

720

gtagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgctgta aacgatgatt actaggtgtt

780

gggggtcgaa cctcagcgcc caagcaaacg cgataagtaa tccgcctggg gagtacgtac

840

gcaagtatga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggag catgtggttt

900

aattcgacgc aacgcgagga accttaccag cgtttgacat cttaggaatg agatagagat

960

atttcagtgt cccttcgggg aaacctaaag acaggtggtg catggctgtc gtcagctcgt

1020

gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctttcgtat gttaccatca

1080

ttaagttggg gactcatgcg atactgccta cgatgagtag gaggaaggtg gggatgacgt

1140

caagtcatca tgccccttat acgctgggct acacacgtgc tacaatgggt agaacagaga

1200

gttgcaaagc cgtgaggtga agctaatctc agaaaactat tcttagttcg gattgtactc

1260

tgcaactcga gtacatgaag ttggaatcgc tagtaatcgc gaatcagcaa tgtcgcggtg

1320

aatacgttct cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagttgg ttgcacctga

1380

agtagca

1387

<210> 916

<211> 1385

<212> DNA

<213> Fusobacterium sp. CM21

<400> 916

cgctgacaga atgcttaaca catgcaagtc aacttgaatt tgggttttta acttaggttt

60

gggtggcgga cgggtgagta acgcgtaaag aacttgcctc acaggtaggg acaacatttg

120

gaaacgaatg ctaataccta atattatgat aatagggcat cctataatta tgaaagctat

180

aagcgctgtg agagagcttt gcgtcccatt agctagttgg agaggtaacg gctcaccaag

240

gcgatgatgg gtagccggcc tgagagggtg atcggccaca aggggactga gacacggccc

300

ttactcctac gggaggcagc agtggggaat attggacaat ggaccgagag tctgatccag

360

caattctgtg tgcacgatga agtttttcgg aatgtaaagt gctttcagtt gggaagaaac

420

aaatgacggt accaacagaa gaagtgacgg ctaaatacgt gccagcagcc gcggtaatac

480

gtatgtcacg agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaagc gcgtctaggt ggttatgtaa

540

gtctgatgtg aaaatgcagg gctcaactct gtattgcgtt ggaaactgta taactagagt

600

actggagagg taagcggaac tacaagtgta gaggtgaaat tcgtagatat ttgtaggaat

660

gccgatgggg aagccagctt actggacaga tactgacgct gaagcgcgaa agcgtgggta

720

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgattact aggtgttggg

780

ggtcgaacct cagcgcccaa gcaaacgcga taagtaatcc gcctggggag tacgtacgca

840

agtatgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

900

tcgacgcaac gcgaggaacc ttaccagcgt ttgacatctt aggaatgaga cagagatgtt

960

tcagtgtccc ttcggggaaa cctaaagaca ggtggtgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc

1020

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct ttcgtatgtt accatcatta

1080

agttggggac tcatgcgata ctgcctacga tgagtaggag gaagggtggg ggatgacgtc

1140

aagtcatcat gccccttata cgctgggcta cacacgtgct acaatgggta gaacagagag

1200

tcgcaaagct gtgaagtgga gctaatctca gaaaactatt cttagttcgg attgtactct

1260

gcaactcgag tacatgaagt tggaatcgct agtaatcgcg aatcagcaat gtcgcggtga

1320

atacgttctc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagttggt tgcacctgaa

1380

gtagc

1385

<210> 917

<211> 1210

<212> DNA

<213> Fusobacterium sp. CM22

<220>

<221> modified_base

<222> (975)..(975)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1090)..(1090)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 917

gtggcggacg ggtgagtaac gcgtaaagaa cttgcctcac agatagggac aacatttgga

60

aacgaatgct aatacctgat attgaaaggc actgtgagag agctttgcgt cccattagct

120

agttggagag gtaacggctc accaaggcga tgatgggtag ccggcctgag agggtgatcg

180

gccacaaggg gactgagaca cggcccttac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

240

gacaatggac caagtctgat ccagcaattc tgtgtgcacg atgaagtttt tcggaatgta

300

aagtgctttc agttgggaag atgacggtac caacagaaga agtgacggct aaatacgtgc

360

cagcagccgc ggtaatacgt atgtcacaag cgttatccgg atttattggg cgtaaagcgc

420

gtctaggtgg ttatgtaagt ctgatgtgaa aatgcagggc tcaactctgt attgcgttgg

480

aaactgtgta actagagtac tggagaggta agcggaacta caagtgtaga ggtgaaattc

540

gtagatattt gtaggaatgc cgatggggaa gccagcttac tggacagact gacgctgaag

600

cgcgaaagcg tgggtagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg

660

attactaggt gttggggcct cagcgcccaa gcaaacgcga taagtaatcc gcctggggag

720

tacgtacgca agtatgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat

780

gtggtttaat tcgacgcaac gcgaggaacc ttaccagcgt ttgacatcga caggtggtgc

840

atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

900

ctttcgtatg ttaccatcat ggggactcat gcgatactgc ctgcgatgag caggaggaag

960

gtggggatga cgtcnagtca tcatgcccct tatacgctgg gctacacacg tgctacaatg

1020

ggtagcagag agtcgcaaag ccgtgaggtg aagctaatct cagctattct tagttcggat

1080

gtactctgcn actcgagtac agaagttgga atcgctagta atcgcgaatc agcaatgtcg

1140

cggtgaatac gttctcgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gttggttgca

1200

cctgaagtag

1210

<210> 918

<211> 1496

<212> DNA

<213> Fusobacterium sp. D12

<400> 918

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct gacagaatgc ttaacacatg caagtcgact

60

cgagtcttcg gacttgggtg gcgcacgggt gagtaacgcg taaagaactt gcctcttaga

120

ccgggacaac atctggaaac ggatgctaat accggatatt atggtttttt cgcatggagg

180

aatcatgaaa gctagatgcg ctaagagaga gctttgcgtc ccattagcta gttggtgagg

240

taacggccca ccaaggcaat gatgggtagc cggcctgaga gggtgaacgg ccacaagggg

300

actgagacac ggcccttact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg acaatggacc

360

gcaagtctga tccagcaatt ctgtgtgcac gatgacgttt ttcggaatgt aaagtgcttt

420

cagtcgggaa gaagtcagtg acggtaccga cagaagaagc gacggctaaa tacgtgccag

480

cagccgcggt aatacgtatg tcgcaagcgt tatccggatt tattgggcgt aaagcgcgtc

540

taggcggcaa ggaaagtctg atgtgaaaat gcggagctca actccgtatg gcgttggaaa

600

ctgccttact agagtactgg agaggtaggc ggaactacaa gtgtagaggt gaaattcgta

660

gatatttgta ggaatgccga tggggaagcc agcctactgg acagatactg acgctaaagc

720

gcgaaagcgt gggtagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatga

780

ttactaggtg ttgggggtca aacctcagcg cccaagctaa cgcgataagt aatccgcctg

840

gggagtacgt acgcaagtat gaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg

900

agcatgtggt ttaattcgac gcaacgcgag gaaccttacc agcgtttgac atcctacgaa

960

cggagcagag atgcgccggt gccctttcgg gggaacgtag tgacaggtgg tgcatggctg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatcgt

1080

atgttaccat ccttcagttg gggactcatg cgatactgcc tgcgacgagc aggaggaagg

1140

tggggatgac gtcaagtcat catgcccctt atacgctggg ctacacacgt gctacaatgg

1200

gtagtacaga gagcagcaaa cccgcgaggg ggagcaaatc tcagaaaact attcttagtt

1260

cggattgtac tctgcaactc gagtacatga agttggaatc gctagtaatc gcaaatcagc

1320

aatgttgcgg tgaatacgtt ctcgggtctt gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt

1380

ggttgcacct gaagtagcag gcctaacctt agggaaggat gctccgaggg tgtggttagc

1440

gattggggtg aagtcgtaac aaggtatccg tacgggaacg tgcggatgga tcacct

1496

<210> 919

<211> 1362

<212> DNA

<213> Fusobacterium sp. oral clone ASCF06

<220>

<221> modified_base

<222> (16)..(16)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 919

gagtttgatt ttggcncagg attaacgctg acgaatgctt aacacatgca agtctactgg

60

tggcggacgg gtgagtaacg cgtaaagaac ttgcctcaca gttagggaca acatttggaa

120

acgaatgcta atacctgata ttgaaaggcg ctgtgagaga gctttgcgtc ccattagcta

180

gttggagagg taacggctca ccaaggcgat gatgggtagc cggcctgaga gggtgaacgg

240

ccacaagggg actgagacac ggcccttact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg

300

acactggaca aagtctgatc cagcaattcg tgtgcacgat gacgtttttc ggaatgtaaa

360

gtgctttcag ttgggaagat gacggtacca acagaagaag tgacggctaa atacgtgcca

420

gcagccgcgg taatacgtat gtcacaagcg ttatccggat ttattgggcg taaagcgcgt

480

ctaggtggtt atgtaagtct gatgtgaaaa tgcagggctc aactctgtat tgcgttggaa

540

actgcatgac tagagtactg gagaggtaag cggaactaca agtgtagagg tgaaattcgt

600

agatatttgt aggaatgccg atggggaagc cagcttactg gacagactga cgctaaagcg

660

cgaaagcgtg ggtagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt acacgatgat

720

tactaggtgt tggggactca gcgcccaagc taacgcgata agtaatccgc ctggggagta

780

cgtacgcaag tatgaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt

840

ggtttaattc gacgcaacgc gaggaacctt accagcgttt gacatcgaca ggtggtgcat

900

ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct

960

tttgtatgtt accatcagtt ggggactcat gcgatactgc ctgcgatgag caggaggaag

1020

gtggggatga cgtcaagtca tcatgcccct tatacgctgg gctacacacg tgctacaatg

1080

ggtagcagag agtcgcaaag ccgcgaggtg gagctaatct cagctattct tagttcggat

1140

gtactctgca actcgagtac agaagttgga atcgctagta atcgcgaatc agcaatgtcg

1200

cggtgaatac gttctcgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gttggttgca

1260

cctgaagtag cagcctaggg atgctccgag ggtgtgatta gcgattgggg tgaagtcgta

1320

acaaggtatc cgtacgggaa cgtgcggctg gaacacctcc tt

1362

<210> 920

<211> 1558

<212> DNA

<213> Fusobacterium sp. oral clone ASCF11

<220>

<221> modified_base

<222> (623)..(623)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (852)..(852)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (884)..(884)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (947)..(947)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 920

gagagtttga ttctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaatacat gcaagtcgaa

60

cgagagcgac cggtgcttgc actgatcaat ctagtggcga acgggtgagt aacacgtggg

120

taacctgccc atcagagggg gataacattc ggaaacggat gctaaaaccg cataggttct

180

ttagtcgcat gactgaagaa ggaaaagagg cttcggcttc tgctgatgga tggacccgcg

240

gtgcattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg atgatgcata gccgacctga

300

gagggtgatc ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt

360

agggaatctt ccgcaatgga cgcaagtctg acggagcaac gccgcgtgag tgaagaagga

420

tttcggttcg taaaactctg ttgttagaga agaacagcgc atagagtaac tgttatgcgt

480

gtgacggtat ctaaccagaa agccacggct aaatacgtgc cagcagcccg cggtaatacc

540

gtatgtcaca agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaagc gcgtctaggt ggttatgtaa

600

cgtctgatgt gaaaatgcag ggnctcaact ctgtattgcg ttggaaactg catgactaga

660

gtactggaga ggtaagcgga actacaagtg tcagaggtga aattcgtaga tatttgtagg

720

aatgccgatg gggaaagccc agcttactgg acagatactg acgctaaagc gcgaaagcgt

780

gggtagcaaa caggattaga taccctgggt agtccacccc gtaaacgatg attactaggt

840

gttgggggtc gnacctcagc gcccaagcta acgcgataag taanaccgcc tggggagtac

900

gtacgcaagt atgaaactca aaggaattga ccggggaccc gcacaangcg gtggagcatg

960

tggtttaatt cgacgcaacg cgaggaacct taccagcgtt tgacatctta ggaatgagac

1020

agagatgttt cagtgtcact tcggtgaaac gctaaagacc aggtggtgca tggctggtcg

1080

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ctttcgtatg

1140

ttaccatcat taagttgggg actcatgcga tactgcctac gatgagtagg aggaaggtgg

1200

ggatgacgtc aagtcatcat gccccttata cgctgggcta cacacgtgct acaatgggta

1260

gtacagagag tcgcaaagcc gtgaggtgga gctaatctca gaaaactatt cttagttcgg

1320

attgtactct gcaactcgag tacatgaagt tggaatcgct agtaatcgcg aatcagcaat

1380

gtcgcggtga atacgttctc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagttggt

1440

tgcacctgaa gtagcaggcc taaccgtaag gagggatgct ccgagggtgt gattagcgat

1500

tggggtgaag tcgtaacaag gtatccgtac gggaacgtgc ggctggatca cctccttc

1558

<210> 921

<211> 1511

<212> DNA

<213> Fusobacterium ulcerans

<400> 921

ttgaacgaag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctga cagaatgctt aacacatgca

60

agtctacttg atccttcggg tgaaggtggc ggacgggtga gtaacgcgta aagaacttgc

120

cttacagact gggacaacat ttggaaacga atgctaatac cggatattat gattgggtcg

180

catgatctgg ttatgaaagc tatatgcgct gtgagagagc tttgcgtccc attagttagt

240

tggtgaggta acggctcacc aagacgatga tgggtagccg gcctgagagg gtgaacggcc

300

acaaggggac tgagacacgg cccttactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattggac

360

aatggaccaa aagtctgatc cagcaattct gtgtgcacga tgaagttttt cggaatgtaa

420

agtgctttca gttgggaaga agtcagtgac ggtaccaaca gaagaagcga cggctaaata

480

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtatgtc gcaagcgtta tccggattta ttgggcgtaa

540

agcgcgtcta ggcggcttag taagtctgat gtgaaaatgc ggggctcaac cccgtattgc

600

gttggaaact gctaaactag agtactggag aggtaggcgg aactacaagt gtagaggtga

660

aattcgtaga tatttgtagg aatgccgatg gggaagccag cctactggac agatactgac

720

gctaaagcgc gaaagcgtgg gtagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta

780

aacgatgatt actaggtgtt gggggtcgaa cctcagcgcc caagctaacg cgataagtaa

840

tccgcctggg gagtacgtac gcaagtatga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca

900

agcggtggag catgtggttt aattcgacgc aacgcgagga accttaccag cgtttgacat

960

cccaagaagt taacagagat gttttcgtgc ctcttcggag gaacttggtg acaggtggtg

1020

catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

1080

cctttcgtat gttaccatca ttaagttggg gactcatgcg agactgcctg cgatgagcag

1140

gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tgccccttat acgctgggct acacacgtgc

1200

tacaatgggt agtacagaga gctgcaaacc tgcgagggta agctaatctc ataaaactat

1260

tcttagttcg gattgtactc tgcaactcga gtacatgaag ttggaatcgc tagtaatcgc

1320

aaatcagcta tgttgcggtg aatacgttct cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca

1380

cgagagttgg ttgcacctga agtaacaggc ctaaccgtaa ggagggatgt tccgagggtg

1440

tgattagcga ttggggtgaa gtcgtaacaa ggtatccgta cgggaacgtg cggatggatc

1500

acctcctttc t

1511

<210> 922

<211> 1503

<212> DNA

<213> Fusobacterium varium

<400> 922

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct gacagaatgc ttaacacatg caagtctact

60

tgatccttcg ggtgaaggtg gcggacgggt gagtaacgcg taaagaactt gccttacaga

120

ctgggacaac atttggaaac gaatgctaat accggatatt atgactgagt cgcatgattt

180

ggttatgaaa gctatatgcg ctgtgagaga gctttgcgtc ccattagtta gttggtgagg

240

taacggctca ccaagacgat gatgggtagc cggcctgaga gggtgaacgg ccacaagggg

300

actgagacac ggcccttact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg acaatggacc

360

aaaagtctga tccagcaatt ctgtgtgcac gatgaagttt ttcggaatgt aaagtgcttt

420

cagttgggaa gaagtcagtg acggtaccaa cagaagaagc gacggctaaa tacgtgccag

480

cagccgcggt aatacgtatg tcgcaagcgt tatccggatt tattgggcgt aaagcgcgtc

540

taggcggttt agtaagtctg atgtgaaaat gcggggctca accccgtatt gcgttggaaa

600

ctgctaaact agagtactgg agaggtaggc ggaactacaa gtgtagaggt gaaattcgta

660

gatatttgta ggaatgccga tggggaagcc agcctactgg acagatactg acgctaaagc

720

gcgaaagcgt gggtagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga

780

ttactaggtg ttgggggtcg aacctcagcg cccaagctaa cgcgataagt aatccgcctg

840

gggagtacgt acgcaagtat gaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg

900

agcatgtggt ttaattcgac gcaacgcgag gaaccttacc agcgtttgac atcccaagaa

960

gttaacagag atgttttcgt gcctcttcgg aggaacttgg tgacaggtgg tgcatggctg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctttcgt

1080

atgttaccat cattaagttg gggactcatg cgagactgcc tgcgatgagc aggaggaagg

1140

tggggatgac gtcaagtcat catgcccctt atacgctggg ctacacacgt gctacaatgg

1200

gtagtacaga gagctgcaaa cctgcgaggg taagctaatc tcataaaact attcttagtt

1260

cggattgtac tctgcaactc gagtacatga agttggaatc gctagtaatc gcaaatcagc

1320

tatgttgcgg tgaatacgtt ctcgggtctt gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt

1380

ggttgcacct gaagtaacag gcctaaccgt aaggagggat gttccgaggg tgtgattagc

1440

gattggggtg aagtcgtaac aaggtatccg tacgggaacg tgcggatgga tcacctcctt

1500

tct

1503

<210> 923

<211> 1535

<212> DNA

<213> Gardnerella vaginalis

<400> 923

ttttcgtgga gggttcgatt ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg ggatctgacc agcttgctgg ttggtgagag tggcgaacgg gtgagtaatg

120

cgtgaccaac ctgccccatg ctccagaata gctcttggaa acgggtggta atgctggatg

180

ctccaacttg acgcatgtct tgttgggaaa gtgtttagtg gcatgggatg gggtcgcgtc

240

ctatcagctt gtaggcgggg taatggccca cctaggcttc gacgggtagc cggcctgaga

300

gggcggacgg ccacattggg actgagatac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg

360

ggaatattgc gcaatggggg aaaccctgac gcagcgacgc cgcgtgcggg atgaaggcct

420

tcgggttgta aaccgctttt gattgggagc aagctttcgg gtgagtgtac ctttcgaata

480

agcgccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggcgcaag cgttatccgg

540

aattattggg cgtaaagagc ttgtaggcgg ttcgtcgcgt ctggtgtgaa agcccatcgc

600

ttaacggtgg gtctgcgccg ggtacgggcg ggctagagtg cagtagggga gactggaatt

660

cccggtgtaa cggtggaatg tgtagatatc gggaagaaca ccaatggcga aggcaggtct

720

ctgggctgtt actgacgctg agaagcgaaa gcgtggggag cgaacaggat tagataccct

780

ggtagtccac gccgtaaacg gtggacgctg gatgtggggc ccattccacg ggttccgtgt

840

cggagctaac gcgttaagcg tcccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag

900

aaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga gcatgcggat taattcgatg caacgcgaag

960

aaccttacct gggcttgaca tgtgcctgtc gactgcagag atgtggtttc ccttcggggc

1020

aggttcacag gtggtgcatg gtcgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1080

cgcaacgagc gcaaccctcg ccctgtgttg ccagcgggtt atgccgggaa ctcacggggg

1140

accgccgggg ttaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca gatcatcatg ccccttacgt

1200

ccagggcttc acgcatgcta caatggccgg tacaacggga tgcgacatgg tgacatggag

1260

cggatccctt aaaaccggtc tcagttcgga tcgtagtctg caactcgact acgtgaaggc

1320

ggagtcgcta gtaatcgcga atcagcaacg tcgcggtgaa tgcgttcccg ggccttgtac

1380

acaccgcccg tcaagtcatg aaagtgggca gcacccgaag ccggtggcct aacccttttg

1440

ggatggagcc gtctaaggtg aggctcgtga ttgggactaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1500

ccggaaggtg cggctggatc acctcctttc tacgg

1535

<210> 924

<211> 1557

<212> DNA

<213> Gemella haemolysans

<400> 924

ttggagagtt tgatcctggc tcaggacgaa cgctggcggc gtgcctaata catgcaagtc

60

gagcgaggtt tttctggtgc ttgcaccgga aaaacttagc ggcgaacggg tgagtaacac

120

gtaaagaacc tgcctcatag actgggacaa ctattggaaa cgatagctaa taccggataa

180

cagcattaac tgcatggttg atgtttaaaa gttggttttg ctaacactat gagatggctt

240

tgcggtgcat tagctagttg gtggggtaaa ggcctaccaa ggcgacgatg catagccgac

300

ctgagagggt agatcggcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

360

gcagtaggga atcttccgca atgggcgaaa gcctgacgga gcaacgccgc gtgagtgaag

420

aaggatttcg gttcgtaaag ctctgttgtt agggaagaat gattgtgtag taactataca

480

cagtagagac ggtacctaac cagaaagcca cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa

540

tacgtaggtg gcaagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa agcgcgcgca ggtggtttaa

600

taagtctgat gtgaaagccc acggctcaac cgtggagggt cattggaaac tgttaaactt

660

gagtgcagga gagaaaagtg gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag agattaggag

720

gaacaccagt ggcgaaggcg gctttttggc ctgtaactga cactgaggcg cgaaagcgtg

780

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag tgctaagtgt

840

tggtctcata agagatcagt gctgcagcta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg

900

accgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gagcatgtgg

960

tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caagtcttga catactgtga ggacacaaga

1020

gattgtgttg ttctgacctt tggttagaca cagatacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag

1080

ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat atctagttgc

1140

cagcagtaag atggggactc tagatagact gccagtgata aactggagga aggtggggat

1200

gacgtcaaat catcatgccc cttatgactt gggctacaca cgtgctacaa tggataggaa

1260

caaagagaag cgagctcgcg agagtaagca aacctcacaa aactattctc agttcggatt

1320

gtagtctgca actcgactac atgaagctgg aatcgctagt aatcgcgaat cagaatgtcg

1380

cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gtttgtaaca

1440

cccgaagacg gtggcctaac cttttaggag ggagccggtc acggtgggac agatgattgg

1500

ggtgaagtcg taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcacct cctttct

1557

<210> 925

<211> 1560

<212> DNA

<213> Gemella morbillorum

<400> 925

tttatttgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgagcg aagtttttct ggtgcttgca ctagaaaaac ttagcggcga acgggtgagt

120

aacacgtaaa gaacctgcct catagactgg gacaactatt ggaaacgata gctaataccg

180

gataacagta tttctcgcat gagagatatt taaaagttgg ttatgctaac actatgagat

240

ggctttgcgg tgcattagct agttggtggg taaaggccta ccaaggcgac gatgcatagc

300

cgacctgaga gggtgatcgg ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag

360

gcagcagtag ggaatcttcc gcaatgggcg aaagcctgac ggagcaacgc cgcgtgagtg

420

aagaaggatt tcggttcgta aagctctgtt gttagggaag aatggatatg tagtaactat

480

acatgtaaga gacggtacct aaccagaaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

540

taatacgtag gtggcaagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagcgcgc gcaggtggtt

600

taataagtct gatgtgaaag cccacggctc aaccgtggag ggtcattgga aactgttaaa

660

cttgagtgca ggagagaaaa gtggaattcc tagtgtagcg gtgaaatgcg tagagattag

720

gaggaacacc agtggcgaag gcggcttttt ggcctgtaac tgacactgag gcgcgaaagc

780

gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctaag

840

tgttggtctc ataagagatc agtgctgcag ctaacgcatt aagcactccg cctggggagt

900

acgaccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg

960

tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaagtct tgacatactg tgaggacaca

1020

agagattgtg ttgttctgac ctatggttag acacagatac aggtggtgca tggttgtcgt

1080

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatatctagt

1140

tgccagcagt aagatgggga ctctagatag actgccagtg ataaactgga ggaaggtggg

1200

gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga cttgggctac acacgtgcta caatggatag

1260

gaacaaagag aagcgagctc gcgagagtca gccaacctca taaaactatt ctcagttcgg

1320

attgtagtct gcaactcgac tacatgaagc tggaatcgct agtaatcgcg aatcagaatg

1380

tcgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta

1440

acacccgaag acggtggcct aacctttaag gagggagccg gtcacggtgg gacagatgat

1500

tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtat cggaaggtgc ggctggatca cctcctttct

1560

<210> 926

<211> 1560

<212> DNA

<213> Gemella morbillorum

<400> 926

tttatttgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgagcg aagtttttct ggtgcttgca ctagaaaaac ttagcggcga acgggtgagt

120

aacacgtaaa gaacctgcct catagactgg gacaactatt ggaaacgata gctaataccg

180

gataacagta tttctcgcat gagagatatt taaaagttgg ttatgctaac actatgagat

240

ggctttgcgg tgcattagct agttggtggg taaaggccta ccaaggcgac gatgcatagc

300

cgacctgaga gggtgatcgg ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag

360

gcagcagtag ggaatcttcc gcaatgggcg aaagcctgac ggagcaacgc cgcgtgagtg

420

aagaaggatt tcggttcgta aagctctgtt gttagggaag aatggatatg tagtaactat

480

acatgtaaga gacggtacct aaccagaaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

540

taatacgtag gtggcaagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagcgcgc gcaggtggtt

600

taataagtct gatgtgaaag cccacggctc aaccgtggag ggtcattgga aactgttaaa

660

cttgagtgca ggagagaaaa gtggaattcc tagtgtagcg gtgaaatgcg tagagattag

720

gaggaacacc agtggcgaag gcggcttttt ggcctgtaac tgacactgag gcgcgaaagc

780

gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctaag

840

tgttggtctc ataagagatc agtgctgcag ctaacgcatt aagcactccg cctggggagt

900

acgaccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg

960

tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaagtct tgacatactg tgaggacaca

1020

agagattgtg ttgttctgac ctatggttag acacagatac aggtggtgca tggttgtcgt

1080

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatatctagt

1140

tgccagcagt aagatgggga ctctagatag actgccagtg ataaactgga ggaaggtggg

1200

gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga cttgggctac acacgtgcta caatggatag

1260

gaacaaagag aagcgagctc gcgagagtca gccaacctca taaaactatt ctcagttcgg

1320

attgtagtct gcaactcgac tacatgaagc tggaatcgct agtaatcgcg aatcagaatg

1380

tcgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta

1440

acacccgaag acggtggcct aacctttaag gagggagccg gtcacggtgg gacagatgat

1500

tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtat cggaaggtgc ggctggatca cctcctttct

1560

<210> 927

<211> 1557

<212> DNA

<213> Gemella sanguinis

<400> 927

ttggagagtt tgatcctggc tcaggacgaa cgctggcggc gtgcctaata catgcaagtc

60

gagcgaagtt tttctggtgc ttgcactaga aaaacttagc ggcgaacggg tgagtaacac

120

gtaaagaacc tgcctcatag acggggacaa ctattggaaa cgatagctaa taccggataa

180

cagcataaat cgcatgatat atgtttaaaa gttggtttcg gctaacacta tgagatggct

240

ttgcggtgca ttagctagtt ggtggggtaa aggcctacca aggcgacgat gcatagccga

300

cctgagaggg tgatcggcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

360

gcagtaggga atcttccgca atgggcgaaa gcctgacgga gcaacgccgc gtgagtgaag

420

aaggatttcg gttcgtaaag ctctgttgtt agggaagaat gattgtgtag taactataca

480

cagtagagac ggtacctaac cagaaagcca cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa

540

tacgtaggtg gcaagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa agcgcgcgca ggtggtttaa

600

taagtctgat gtgaaagccc acggctcaac cgtggagggt cattggaaac tgttaaactt

660

gagtgcagga gagaaaagtg gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag agattaggag

720

gaacaccagt ggcgaaggcg gctttttggc ctgtaactga cactgaggcg cgaaagcgtg

780

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag tgctaagtgt

840

tggtctcata agagatcagt gctgcagcta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg

900

accgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gagcatgtgg

960

tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caagtcttga catactgtga ggacacaaga

1020

gattgtgttg ttctgacctt tggttagaca cagatacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag

1080

ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat gtctagttgc

1140

cagcagtaag atggggactc tagacagact gccagtgata aactggagga aggcggggat

1200

gacgtcaaat catcatgccc cttatgactt gggctacaca cgtgctacaa tggataggaa

1260

caaagagaag ctaactcgcg agagcaagca aacctcataa aactattctc agttcggatt

1320

gtagtctgca actcgactac atgaagctgg aatcgctagt aatcgcgaat cagaatgtcg

1380

cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gtttgtaaca

1440

cccgaagacg gtggcctaac ctttaaggag ggagccggtc acggtgggac agatgattgg

1500

ggtgaagtcg taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcacct cctttct

1557

<210> 928

<211> 1403

<212> DNA

<213> Gemella sp. WAL 1945J

<400> 928

cgaactttaa gagtgcttgc acacttaaag ttagcggcga acgggtgagt aacacgtaaa

60

gaacctacct tatagacagg gacaactatt ggaaacgata gctaatacct gataagaaag

120

aaactcgcat gagagaagtt cgaaagtcgg agcaatctga cactataaga tggctttgcg

180

gtgcattagc tagttggtag ggtaaaagcc taccaaggcg acgatgcata gccgacctga

240

gagggtgatc ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

300

agggaatctt ccgcaatgga cgcaagtctg acggagcaac gccgcgtgag tgaagaagga

360

tttcggttcg taaaactctg ttgttaggga agaaaaaatg tataataact atatacaaaa

420

gagacggtac ctaaccagaa agccacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

480

aggtggcaag cgttgtccgg aattattggg cgtaaagcgc gcgcaggtgg tttagaaagt

540

ctgatgtgaa agcccacggc tcaaccgtgg agggtcattg gaaactaata aacttgagtg

600

caggagagaa aagtggaatt cctagtgtag cggtgaaatg cgtagagatt aggaggaaca

660

ccggtggcga aagcggcttt ttggcctgca actgacactg aggcgcgaaa gcgtggggag

720

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta agtgttggag

780

tcaaaagact tcagtgctgc cagcaaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgatcg

840

caagattgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggagt atgtggttta

900

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccaag tcttgacata cagtgaagat ataagaaatt

960

atattgtttt aatgtttaca ttaaacactg atacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

1020

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatatc tagttaccag

1080

cagtaagatg gggactctag atagactgcc agtgacaaac tggaggaagg tggggatgac

1140

gtcaaatcat catgcccctt atgacttggg ctacacacgt actacaatgg ataggaacaa

1200

agagaagcga cctcgcaaga gcaagccaac ctcagaaaac tattctcagt tcggattgta

1260

ggctgcaact cgcctacatg aagctggaat cgctagtaat cgcgaatcag aatgtcgcgg

1320

tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt tgtaacacct

1380

gaagacggtg gcctaaccgt aag

1403

<210> 929

<211> 1364

<212> DNA

<213> Gemella sp. oral clone ASCE02

<220>

<221> modified_base

<222> (221)..(221)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (729)..(729)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 929

gagtttgatc ttggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtcgagcg

60

agcggcgaac aggtgagtaa cacgtaaaga aagtgcctca tagactggga caactattgg

120

aaacgatagc taataccgga taacaaaaga cactatgaga tggctttgcg gtgcattagc

180

tagttggtgg ggtaaaggct taccaaggcg acgatgcata nccgacctga gagggtgatc

240

ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

300

ccgcaatggg cgaaagcctg acggagcaac gccgcgtgag tgaagaagga tttcggttcg

360

taaagctctg ttgttaggga agaagacggt acctaaccag aaagtcacgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaagc

480

gcgcgcaggt ggtttaataa gtctgatgtg aaagcccacg gctcaaccgt ggagggtcat

540

tggaaactgt taaacttgag tgcaggagag aaaagtggaa ttcctagtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagaga ttaggaggaa caccagtggc gaaggcggct ttttggcctg actgacactg

660

aggcgcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgagtgcnt agtgttggtc gatcagtgct gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

780

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccaa gtcttgacat atacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccttatatc tagttgccag catggggact ctagatagac tgccagtgat aaactggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgact tgggctacac acgtgctaca

1080

atggatagca aagagaagcg agctcgcgag agtaagcaaa cctcacctat tctcagttcg

1140

gatgtagtct gcaactcgac tacagaagct ggaatcgcta gtaatcgcga atcagaatgt

1200

cgcggtgaat acgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa

1260

cacccgaaga cggtgcctag ggagccggtc acggtgggac agatgattgg ggtgaagtcg

1320

taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggc tggaacacct cctt

1364

<210> 930

<211> 1362

<212> DNA

<213> Gemella sp. oral clone ASCF04

<220>

<221> modified_base

<222> (823)..(823)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (837)..(837)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (845)..(845)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (849)..(849)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1001)..(1001)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1059)..(1059)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 930

gagtttgatt atggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtcgagcg

60

agcggcgaac gggtgagtaa cacgtaaaga acctgcctca tagactggga caactattgg

120

aaacgatagc taataccgga taacaaaaga cactatgaga tggctttgcg gtgcattagc

180

tagttggtgg ggtaaaggcc taccaaggcg acgatgcata gccgacctga gagggtgatc

240

ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

300

ccgcaatggg cgaaagcctg acggagcaac gccgcgtgag tgaagaagga tttcggttcg

360

taaagctctg ttgttaggga agaagacggt acctaaccag aaagccacgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaagc

480

gcgcgcaggt ggtttaataa gtctgatgtg aaagcccacg gctcaaccgt ggagggtcat

540

tggaaactgt taaacttgag tgcaggagag aaaagtggaa ttcctagtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagaga ttaggaggaa caccagtggc gaaggcggct tgttggcctg actgacactg

660

aggcgcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgagtgcta agtgttggtc gatcagtgct gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

780

gagtacgacc gccaggttga aactgaaagg aattcccggg ganccgcacg cggtggngca

840

tgtgntttna ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaagt cttgacatat gcaggtggtg

900

catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

960

cttatatcta gttgccagca tggggactct agatagactg ncagtgataa actggaggaa

1020

ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgactng ggctacacac gtgctacaat

1080

ggatagcaaa gagaagcgag ctcgcgagag taagcaaacc tcacctattc tcagttcgga

1140

tgtagtctgc aactcgacta cagaagctgg aatcgctagt aatcgcgaat cagaatgtcg

1200

cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gtttgtaaca

1260

cccgaagacg gtgcctaggg atccggtcac ggtgggacag atgattgggg tgaagtcgta

1320

acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg gaacacctcc tt

1362

<210> 931

<211> 1340

<212> DNA

<213> Gemella sp. oral clone ASCF12

<220>

<221> modified_base

<222> (140)..(140)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (161)..(161)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (331)..(331)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (693)..(693)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 931

acgctggcgg cgtgcctaat acatgcaagt cgagcgagcg gcgaacgggt gagtaacacg

60

taaagaacct gcctcataga cggggacaac tattggaaac gatagctaat accggataac

120

aaaagacact atgagatggn tttgcggtgc attagctagt nggtggggta aaggcctacc

180

aaggcgacga tgcatagccg acctgagagg gtgatcggcc acactgggac tgagacacgg

240

cccagactcc tacgggaggc agcagtaggg aatcttccgc aatgggcgaa agcctgacgg

300

agccacgccg tgtgagtgaa gaaggatttc nggtcgtaaa gctctgttgt tagggaagaa

360

gacggtacct aaccagaaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

420

gtggcaagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagcgcgc gcaggtggtt taataagtct

480

gatgtgaaag cccacggctc aaccgtggag ggtcattgga aactgttaaa cttgagtgca

540

ggagagaaaa gtggaattcc tagtgtagcg gtgaaatgcg tagagattag gaggaacacc

600

agtggcgaag gcggcttttt ggcctgactg acactgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa

660

caggattaga taccctggta gtccacgccg tanacgatga gtgctaagtg ttggtcgatc

720

agtgctgcag ctaacgcatt aagcactccg cctggggagt acgaccggaa ggttgaaact

780

caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg

840

cgaagaacct taccaagtct tgacatatac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt

900

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc tatgtctagt tgccagcatg

960

gggactctag acagactgcc agtgataaac tggaggaagg cggggatgac gtcaaatcat

1020

catgcccctt atgacttggg ctacacacgt gctacaatgg atagcaaaga gaagctaact

1080

cgcgagagca agcaaacctc atctattctc agttcggatg tagtctgcaa ctcgactaca

1140

gaagctggaa tcgctagtaa tcgcgaatca gaatgtcgcg gtgaatacgt tcccgggtct

1200

tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc cgaagacggt gcctagggag

1260

ccggtcacgg tgggacagac gattggggtg aagtcgtaac aaggtagccg tatcggaagg

1320

tgcggctgga acacctcctt

1340

<210> 932

<211> 1367

<212> DNA

<213> Gemmiger formicilis

<220>

<221> modified_base

<222> (10)..(12)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1359)..(1360)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 932

aacggagtcn nngaggagct tgcttttctt gatttagtgg cgaacgggtg agtaacgcgt

60

gagtaacctg ccctggagtg ggggacaaca gttggaaacg actgctaata ccgcataagc

120

ccacggtgcc gcatggcact gagggaaaag gatttattcg cttcaggatg gactcgcgtc

180

caattagcta gttggtgagg taacggccca ccaaggcgac gattggtagc cggactgaga

240

ggttgaacgg ccacattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg

300

gggatattgc acaatggggg aaaccctgat gcagcgacgc cgcgtggagg aagaaggttt

360

tcggattgta aactcctgtc gttagggacg ataatgacgg tacctaacaa gaaagcaccg

420

gctaactacg tgccagcagc cgcggtaaaa cgtagggtgc aagcgttgtc cggaattact

480

gggtgtaaag ggagcgcagg cggaccggca agttggaagt gaaatccatg ggctcaaccc

540

gtgaattgct ttcaaaactg ctggccttga gtagtgcaga ggtaggtgga attcccggtg

600

tagcggtgga atgcgtagat atcgggagga acaccagtgg cgaaggcgac ctactgggca

660

ccaactgacg ctgaggctcg aaagcatggg tagcaaacag gattagatac cctggtagtc

720

catgccgtaa acgatgatta ctaggtgttg gaggattgac cccttcagtg ccgcagttaa

780

cacaataagt aatccacctg gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg

840

ggggcccgca caagcagtgg agtatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc

900

aggtcttgac atccgatgca tagtgcagag atgcatgaag tccttcggga catcgagaca

960

gatggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1020

cgcaaccctt attgccagtt actacgcaag aggactctgg cgagactgcc gttgacaaaa

1080

cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccttt atgacctggg ctacacacgt

1140

actacaatgg cgtttaacaa agagaagcaa gaccgcgagg tggagcaaaa ctcagaaaca

1200

acgtctcagt tcagattgca ggctgcaact cgcctgcatg aagtcggaat tgctagtaat

1260

cgcggatcag catgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac

1320

catgagagcc ggggggaccc gaagtcggta gtctaaccnn aaggagg

1367

<210> 933

<211> 1553

<212> DNA

<213> Geobacillus kaustophilus

<400> 933

gagagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaatacat gcaagtcgag

60

cggaccaaat cggagcttgc tctgatttgg tcagcggcgg acgggtgagt aacacgtggg

120

caacctgccc gcaagaccgg gataactccg ggaaaccgga gctaataccg gataacaccg

180

aagaccgcat ggtctttggt tgaaaggcgg cctttggctg tcacttgcgg atgggcccgc

240

ggcgcattag ctagttggtg aggtaacggc tcaccaaggc gacgatgcgt agccggcctg

300

agagggtgac cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

360

tagggaatct tccgcaatgg gcgaaagcct gacggagcga cgccgcgtga gcgaagaagg

420

ccttcgggtc gtaaagctct gttgtgaggg acgaaggagc gccgttcgaa gagggcggcg

480

cggtgacggt acctcacgag gaagccccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

540

gtagggggcg agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaagc gcgcgcaggc ggttccttaa

600

gtctgatgtg aaagcccacg gctcaaccgt ggagggtcat tggaaactgg gggacttgag

660

tgcaggagag gagagcggaa ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa

720

caccagtggc gaaggcggct ctctggcctg caactgacgc tgaggcgcga aagcgtgggg

780

agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgagtgc taagtgttag

840

aggggtcaca ccctttagtg ctgcagctaa cgcgataagc actccgcctg gggagtacgg

900

ccgcaaggct gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt

960

ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc aggtcttgac atcccctgac aacccaagag

1020

attgggcgtt cccccttcgg gggacagggt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

1080

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac cctcgcctct agttgccagc

1140

acgaaggtgg gcactctaga gggactgccg gcgacaagtc ggaggaaggt ggggatgacg

1200

tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatggg cggtacaaag

1260

ggctgcgaac ccgcgagggg gagcgaatcc caaaaagccg ctctcagttc ggattgcagg

1320

ctgcaactcg cctgcatgaa gccggaatcg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg

1380

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagcttg caacacccga

1440

agtcggtgag gtaaccctta cgggagccag ccgccgaagg tggggcaagt gattggggtg

1500

aagtcgtaac aaggtagccg taccggaagg tgcggctgga tcacctcctt tct

1553

<210> 934

<211> 1517

<212> DNA

<213> Geobacillus sp. E263

<400> 934

agtttgatcc tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca agtcgagcgg

60

accaaatcgg agcttgctct gatttggtca gcggcggacg ggtgagtaac acgtgggcaa

120

cctgcccgca agaccgggat aactccggga aaccggagct aataccggat aacaccgaag

180

accgcatggt ctttggttga aaggcggcct ttggctgtca cttgcggatg ggcccgcggc

240

gcattagcta gttggtgagg taacggctca ccaaggcgac gatgcgtagc cggcctgaga

300

gggtgaccgg ccacactggg actgagacac ggcccagacc cctacgggag gcagcagtag

360

ggaatcttcc gcaatgggcg aaagcctgac ggagcgacgc cgcgtgagcg aagaaggcct

420

tcgggtcgta aagctctgtt gtgagggacg aaggagcgcc gttcgaagag ggcggcgcgg

480

tgacggtacc tcacgaggaa gccccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

gggggcgagc gttgtccgga attattgggc gtaaagcgcg cgcaggcggt tccttaagtc

600

tgatgtgaaa gcccacggct caaccgtgga gggtcattgg aaactggggg acttgagtgc

660

aggagaggag agcggaattc cacgtgtagc ggtgaaatgc gtagagatgt ggaggaacac

720

cagtggcgaa ggcggctctc tggcctgcaa ctgacgctga ggcgcgaaag cgtggggagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa gtgttagagg

840

ggtcacaccc tttagtgctg cagctaacgc gataagcact ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggctgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ccctgacaac ccaagagatt

1020

gggcgttccc ccttcggggg gacagggtga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1080

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc tcgcctctag ttgccagcac

1140

gaaggtgggc actctagagg gactgccggc gacaagtcgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1200

aaatcatcat gccccttatg acctgggcta cacacgtgct acaatgggcg gtacaaaggg

1260

ctgcgaaccc gcgaggggga gcgaatccca aaaagccgct ctcagttcgg attgcaggct

1320

gcaactcgcc tgcatgaagc cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa

1380

tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagcttgca acacccgaag

1440

tcggtgaggt aacccgcaag ggagccagcc gccgaaggtg gggcaagtga ttggggtgaa

1500

gtcgtaacaa ggtaacc

1517

<210> 935

<211> 1546

<212> DNA

<213> Geobacillus sp. WCH70

<400> 935

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

ggaccgaacg gaagcttgct tctgttcggt tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggt

120

aacctgcccg taagaccggg ataactccgg gaaaccgggg ctaataccgg ataacaccga

180

agaccgcatg gtctttggtt gaaaggtggc ttttgctacc acttacggat gggcccgcgg

240

cgcattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgatgcgtag ccggcctgag

300

agggtgaccg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc cgcaatggac gaaagtctga cggagcgacg ccgcgtgagc gaagaaggtc

420

ttcggatcgt aaagctctgt tgttagggaa gaagaagtac cgttcgaata gggcggtacg

480

gtgacggtac ctaacgagaa agccccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

agggggcgag cgttgtccgg aattattggg cgtaaagcgc gcgcaggcgg tcccttaagt

600

ctgatgtgaa agcccacggc tcaaccgtgg agggtcattg gaaactgggg gacttgagtg

660

cagaagagga gagcggaatt ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaaca

720

ccagtggcga aggcggctct ctggtctgta actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta agtgttagag

840

ggattaaacc ctttagtgct gtagctaacg cgttaagcac tccgcctggg gagtacggcc

900

gcaaggctga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt

960

aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cccctgacaa ccctggagac

1020

agggcgttcc cccttcgggg gggacagggt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

1080

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac cctcgcccct agttgccagc

1140

attcagttgg gcactctagg gggactgccg gctaaaagtc ggaggaaggt ggggatgacg

1200

tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatggg cggtacaaag

1260

ggctgcgaac ccgcgagggg gagcgaatcc caaaaagccg ctctcagttc ggattgcagg

1320

ctgcaactcg cctgcatgaa gccggaatcg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg

1380

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagcttg caacacccga

1440

agtcggtgag gtaacccgta agggagccag ccgccgaagg tggggcaagt gattggggtg

1500

aagtcgtaac aaggtagccg taccggaagg tgcggctgga tcacct

1546

<210> 936

<211> 1523

<212> DNA

<213> Geobacillus stearothermophilus

<400> 936

acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtcgagcg gaccggattg gggcttgcct

60

tgattcggtc agcggcggac gggtgagtaa cacgtgggca acctgcccgc aagaccggga

120

taactccggg aaaccggagc taataccgga taacaccgaa gaccgcatgg tcttcggttg

180

aaaggcggcc tttgggctgt cacttgcgga tgggcccgcg gcgcattagc tagttggtga

240

ggtaacggct caccaaggcg acgatgcgta gccggcctga gagggtgacc ggccacactg

300

ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt ccgcaatggg

360

cgaaagcctg acggagcgac gccgcgtgag cgaagaaggc cttcgggtcg taaagctctg

420

ttgtgaggga cgaaggagcg ccgttcgaag agggcggcgc ggtgacggta cctcacgaga

480

aagccccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggggcga gcgttgtccg

540

gaattattgg gcgtaaagcg cgcgcaggcg gtctcttaag tctgatgtga aagcccacgg

600

ctcaaccgtg gagggtcatt ggaaactggg ggacttgagg gcaggagagg agagcggaat

660

tccacgtgta gcggtgaaat gcgtagagat gtggaggaac accagtggcg aaggcggctc

720

tctggcctgc acctgacgct gaggcgcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc

780

tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aagtgttaga ggggtcacac cctttagtgc

840

tgcagctaac gcgataagca ctccgcctgg ggagtacggc cgcaaggctg aaactcaaag

900

gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag

960

aaccttacca ggtcttgaca tcccctgaca acccaagaga ttgggcgttc ccccttcggg

1020

gggacagggt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1080

agtcccgcaa cgagcgcaac cctcgcctct agttgccagc attcggttgg gcactctaga

1140

gggactgccg gcgacaagtc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta

1200

tgacctgggc tacacacgtg ctacaatggg cggtacaaag ggctgcgaac ccgcgagggg

1260

gagcgaatcc caaaaagccg ctctcagttc ggattgcagg ctgcaactcg cctgcatgaa

1320

gccggaatcg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacca cgagagcttg caacacccga agtcggtgag gtaaccctta

1440

cgggagccag ccgccgaagg tggggcaagt gattggggtg aagtcgtaac aaggtagccg

1500

taccggaagg tgcggctgga tca

1523

<210> 937

<211> 1561

<212> DNA

<213> Geobacillus thermocatenulatus

<400> 937

tcttttggag agtttgatcc tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgcyt aatacatgca

60

agtcgagcgg accgaacggg agcttgctct cgtttggtca gcggcggacg ggtgagtaac

120

acgtgggcaa cctgcccgca agaccgggat aactccggga aaccggagct aataccggat

180

aacaccgaag accgcatggt ctttggttga aaggcggcct ttggctgtca cttgcggatg

240

ggcccgcggc gcattagcta gttggtgagg taacggctca ccaaggcgac gatgcgtagc

300

cggcctgaga gggtggacgg ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag

360

gcagcagtag ggaatcttcc gcaatgggcg aaagcctgac ggagcgacgc cgcgtgagcg

420

aagaaggcct tcgggtcgta aagctctgtt gtgagggacg aaggagcgcc gttcgaagag

480

ggcggcgcgg tgacggtacc tcacgagaaa gccccggcta actacgtgcc agcagccgcg

540

gtaatacgta gggggcgagc gttgtccgga attattgggc gtaaagcgcg cgcaggyggc

600

cccttaagtc tgatgtgaaa gcccacggct caaccgtgga gggtcattgg aaactggggg

660

gcttgagggc aggagaggag agcggaattc cacgtgtagc ggtgaaatgc gtagagatgt

720

ggaggaacac cagtggcgaa ggcggctctc tggcctgcaa ctgacgctga ggcgcgaaag

780

cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa

840

gtgttagagg ggtcacaccc tttagtgctg cagctaacgc gataagcact ccgcctgggg

900

agtacggccg caaggctgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc

960

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ccctgacaac

1020

ccaagagatt gggcgttccc ccttcggggg gacagggtga caggtggtgc atggttgtcg

1080

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc tcgcctctag

1140

ttgccagcat tcaggtgggc actctagagg gactgccggc gacaagtcgg aggaaggtgg

1200

ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg acctgggcta cacacgtgct acaatgggcg

1260

gtacaaaggg ctgcgaaccc gcgaggggga gcgaatccca aaaagccgct ctcagttcgg

1320

attgcaggct gcaactcgcc tgcatgaagc cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcatg

1380

ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagcttgca

1440

acacccgaag tcggtgaggc aacccgcaag ggagccagcc gccgaaggtg gggcaagtga

1500

ttggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta ccggaaggtg cggctggatc acctcctttc

1560

t

1561

<210> 938

<211> 1551

<212> DNA

<213> Geobacillus thermodenitrificans

<400> 938

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

ggaccgaacg agagcttgct cttgttcggt cagcggcgga cgggtgagta acacgtgggc

120

aacctgcccg caagaccggg ataactccgg gaaaccggag ctaataccgg ataacaccaa

180

agaccgcatg gtctttggtt gaaaggcggc ttcggctgcc acttgcggat gggcccgcgg

240

cgcattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgatgcgtag ccggcctgag

300

agggtgaccg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc cgcaatggac gaaagtctga cggagcgacg ccgcgtgagc gaagaaggcc

420

ttcgggtcgt aaaagctctg ttgtgaggga cgaaggagcg ccgtttgaat aaggcggcgc

480

gggggacggt acctcacgaa aaagcccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

540

cgtagggggc gagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag gggcccgcag gcggtccttt

600

aagtctgatg tgaaagccca cggctcaacc gtggagggtc attggaaact gggggacttg

660

agtgcaggag aggagagcgg aattccacgt gtagcggtga aatgcgtaga gatgtggagg

720

aacaccagtg gcgaaggcgg ctctctggcc tgtaactgac gctgaggcgc gaaagcgtgg

780

ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt gctaagtgtt

840

agaggggtca caccctttag tgctgtagct aacgcgataa gcactccgcc tggggagtac

900

ggccgcaagg ctgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg

960

gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaggtcttg acatcccctg acaacccaag

1020

agattgggcg ttcccccttc ggggggacag ggtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

1080

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgcc tctagttgcc

1140

agcattcagt tgggcactct agagggactg ccggctaaaa gtcggaggaa ggtggggatg

1200

acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat gggcggtaca

1260

aagggctgcg aacccgcgag ggggagcgaa tcccaaaaag ccgctctcag ttcggattgc

1320

aggctgcaac tcgcctgcat gaagccggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg

1380

gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagc ttgcaacacc

1440

cgaagtcggt gaggtaaccc ttacgggagc cagccgccga aggtggggca agtgattggg

1500

gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtaccgga aggtgcggct ggatcacctc c

1551

<210> 939

<211> 1562

<212> DNA

<213> Geobacillus thermoglucosidasius

<400> 939

ctctttggag agtttgatcc tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca

60

agtcgagcgg accgggcggg agcttgcttc cgcttggtta gcggcggacg ggtgagtaac

120

acgtgggtaa cctgcccgta agaccgggat aactccggga aaccggggct aataccggat

180

aacaccgaag accgcatggt cttcggttga aaggcggctt cggctgccac ttacggatgg

240

gcccgcggcg cattagctag ttggtgaggt aacggctcac caaggcgacg atgcgtagcc

300

ggcctgagag ggtgaccggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg

360

cagcagtagg gaatcttccg caatggacga aagtctgacg gagcgacgcc gcgtgagcga

420

agaaggtctt cggatcgtaa agctctgttg ttagggaaga agaagtgccg ttcgaacagg

480

gcggcacggt gacggtacct aacgagaaag ccccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

540

taatacgtag ggggcgagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagcgcgc gcaggcggtc

600

ccttaagtct gatgtgaaag cccacggctt aaccgtggag ggtcattgga aactggggga

660

cttgagtgca gaagaggaga gcggaattcc acgtgtagcg gtgaaatgcg tagagatgtg

720

gaggaacacc agtggcgaag gcggctctct ggtctgtaac tgacgctgag gcgcgaaagc

780

gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctaag

840

tgttagaggg gttattccct ttagtgctgt agctaacgcg ttaagcactc cgcctgggga

900

gtacggccgc aaggctgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca

960

tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcc cctgacaacc

1020

ctggagacag ggcgttcctc ccttgcggga ggacagggtg acaggtggtg catggttgtc

1080

gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc ctcgccccta

1140

gttgccagca ttcagttggg cactctaggg ggactgccgg ctaaaagtcg gaggaaggtg

1200

gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gacctgggct acacacgtgc tacaatgggc

1260

ggtacaaagg gctgcgaacc cgcgaggggg agcgaatccc aaaaagccgc tctcagttcg

1320

gattgcaggc tgcaactcgc ctgcatgaag ccggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat

1380

gccgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagcttgc

1440

aacacccgaa gtcggtgagg taacccgcaa gggagccagc cgccgaaggt ggggcaagtg

1500

attggggtga agtcgtaaca aggtagccgt accggaaggt gcggctggat cacctccttt

1560

ct

1562

<210> 940

<211> 1546

<212> DNA

<213> Geobacillus thermoleovorans

<400> 940

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

ggaccaaatc ggagcttgct ctgatttggt cagcggcgga cgggtgagta acacgtgggc

120

aacctgcccg caagaccggg ataactccgg gaaaccggag ctaataccgg ataacaccga

180

agaccgcatg gtctttggtt gaaaggcggc ctttggctgt cacttgcgga tgggcccgcg

240

gcgcattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatgcgta gccggcctga

300

gagggtgacc ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

agggaatctt ccgcaatggg cgaaagcctg acggagcgac gccgcgtgag cgaagaaggc

420

cttcgggtcg taaagctctg ttgtgaggga cgaaggagcg ccgttcgaag agggcggcgc

480

ggtgacggta cctcacgagg aagccccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

tagggggcga gcgttgtccg gaattattgg gcgtaaagcg cgcgcaggcg gttccttaag

600

tctgatgtga aagcccacgg ctcaaccgtg gagggtcatt ggaaactggg ggacttgagt

660

gcaggagagg agagcggaat tccacgtgta gcggtgaaat gcgtagagat gtggaggaac

720

accagtggcg aaggcggctc tctggcctgc aactgacgct gaggcgcgaa agcgtgggga

780

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aagtgttaga

840

ggggtcacac cctttagtgc tgcagctaac gcgataagca ctccgcctgg ggagtacggc

900

cgcaaggctg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

960

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca tcccctgaca acccaagaga

1020

ttgggcgttc ccccttcggg gggacagggt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

1080

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac cctcgcctct agttgccagc

1140

acgaaggtgg gcactctaga gggactgccg gcgacaagtc ggaggaaggt ggggatgacg

1200

tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatggg cggtacaaag

1260

ggctgcgaac ccgcgagggg gagcgaatcc caaaaagccg ctctcagttc ggattgcagg

1320

ctgcaactcg cctgcatgaa gccggaatcg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg

1380

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagcttg caacacccga

1440

agtcggtgag gcaacccgca agggagccag ccgccgaagg tggggcaagt gattggggtg

1500

aagtcgtaac aaggtagccg taccggaagg tgcggctgga tcacct

1546

<210> 941

<211> 1555

<212> DNA

<213> Geobacter bemidjiensis

<400> 941

aaactggaga gtttgatcct ggctcagaac gaacgctggc ggcgtgctta acacatgcaa

60

gtcgaacggg atccagagct tgctctggtg agagtggcgc acgggtgagt aacgcgtgga

120

taacctgccc tggtatctgg aataacatct cgaaaggggt gctaataccg gataagccta

180

cggagccttc ggtctctgca ggaaaaggtg gcctctattt ataagctacc gtatcaggat

240

gggtccgcgt accattagct agttggtagg gtaatggcct accaaggcta cgatggttag

300

ctggtctgag aggatgatca gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga

360

ggcagcagtg gggaattttg cgcaatgggg gaaaccctga cgcagcaacg ccgcgtgagt

420

gatgaaggct ttcgggtcgt aaagctctgt cagtagggaa gaaatgaaaa cggttaatac

480

ccgtttttct tgacggtacc tacaaaggaa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg

540

gtaatacgga gggtgcaagc gttgttcgga tttattgggc gtaaagcgcg tgtaggcggt

600

ttcttaagtc tgatgtgaaa gccctgggct caacccagga agtgcattgg atactgggag

660

acttgaatac gggagagggt agtggaattc ctagtgtagg agtgaaatcc gtagatatta

720

ggaggaacac cggtggcgaa ggcggctacc tggaccgata ttgacgctga gacgcgaaag

780

cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagaactag

840

gtgttgcggg tattgacccc tgcagtgccg cagctaacgc attaagttct ccgcctggga

900

agtacggtcg caagactaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc

960

atgtggttta attcgacgca acgcgcagaa ccttacctgg gcttgacatc tgcggaacct

1020

ccccgaaacg ggagggtgcc ttcgggagcc gcaagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag

1080

ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat ccttagttgc

1140

catcatttag ttgggcactc taaggagact gccggtgtca aaccggagga aggtggggat

1200

gacgtcaagt cctcatggcc cttatgtcca gggctacaca cgtgctacaa tggccggtac

1260

aaagagcagc gataccgcga ggtggagcca atctcaaaaa gccggtctca gttcggattg

1320

gagtctgcaa ctcgactcca tgaagttgga atcgctagta atcgcggatc agcacgccgc

1380

ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgggag tcggttggtc

1440

ccgaagtgcg tgagctaacc cgcaagggag gcagcgtcct aaggaatggc cggtgactgg

1500

ggtgaagtcg taacaaggta gccgtagggg aacctgcggc tggatcacct ccttt

1555

<210> 942

<211> 1485

<212> DNA

<213> Gloeobacter violaceus

<400> 942

aaaatggaga gtttgatcct ggctcaggat gaacgctggc ggcgtgctta acacatgcaa

60

gtcgaacgag atcttcggat cgagtggcgg acgggtgagt aacacgtggg aatctgccct

120

caggaggggg ataacggccg gaaacggccg ctaatacccc atatgccgca aggtgaaatg

180

aatttcgcct gaggatgagc ccgcgtctga ttagctagtt ggtggggtaa tggcctacca

240

aggctacgat cagtagctgg tctgagagga tgatcagcca cactgggact gagacacggc

300

ccagactcct acgggaggca gcagtgggga attttccgca atgggcgaaa gcctgacgga

360

gcaacgccgc gtgggtgatg aaggcccgtg ggtcgtaaag cccttttgtc agggacgaaa

420

cctgacggta cctgacgaat aagcatcggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

gaggatgcaa gcgttatccg gaattattgg gcgtaaagcg tacgtaggcg gccagccaag

540

tctggggtca aagcccgcag cctaactgcg gaaaggccct ggaaactggt tggctagagt

600

gcggtagggg caaggggaat tcccggtgta gcggtgaaat gtggagatat cgggaagaac

660

accagcggcg aaagcgcctt gctggaccgc aactgacgct gaggtacgaa agccagggga

720

gcaaatggga ttagataccc cagtagtcct ggccgtaaac gatggacact aggtgttgcg

780

cgtatcgacc cgtgcagtgc cgtagctaac gcgttaagtg tcccgcctgg ggagtacgca

840

cgcaagtgtg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

900

taattcgatg caacgcgaag aaccttacca gggcttgaca tgtcgcgaat ctcgcggaaa

960

cgtgggagtg ccttcgggaa cgcgaacaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc

1020

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc gtcgtcagtt gccatcattc

1080

agttgggcac tctggcgaga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1140

gtcagcatgg ctcttacgtc ctgggctaca cacgtgctac aatggttcgg ataaagggtc

1200

gcaatctcgc gagggggagc caatcccata aaccgaatct cagttcggat tgcaggctgc

1260

aactcgcctg catgaagtcg gaatcgctag taatcgcagg tcagcatact gcggtgaata

1320

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatgga agctggtcat gcccgaagtc

1380

ggtattctaa ccgcaaggag ggagccgccg aaggcggggc cggtgactgg ggtgaagtcg

1440

taacaaggta gccgtaccgg aaggtgcggc tggatcacct ccttt

1485

<210> 943

<211> 1447

<212> DNA

<213> Gluconacetobacter azotocaptans

<400> 943

agcgaacgct ggcggcatgc ttaacacatg caagtcgcac gaacctttcg gggttagtgg

60

cggacgggtg agtaacgcgt agggatctgt ccatgggtgg gggataacct cgggaaactg

120

aggctaatac cgcatgacac ctgagggtca aaggcgtaag tcgcctgtgg aggaacctgc

180

gttcgattag ctggttggtg gggtaaaggc ctaccaaggc gatgatcgat agctggtctg

240

agaggatgat cagccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

300

tggggaatat tggacaatgg gcgcaagcct gatccagcaa tgccgcgtgt gtgaagaagg

360

tcttcggatt gtaaagcact ttcgacgggg acgatgatga cggtacccgt agaagaagcc

420

ccggctaact tcgtgccacg tgccgcggta atacgaaggg ggctagcgtt gctcggaatg

480

actgggcgta aagggcgcgt aggcggtttg gacagtcaga tgtgaaattc ctgggcttaa

540

cctgggggct gcatttgata cgtacagact agagtgtgag agagggttgt ggaattccca

600

gtgtagaggt gaaattcgta gatattggga agaacaccgg tggcgaaggc ggcaacctgg

660

ctcataactg acgctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta

720

gtccacgctg taaacgatgt gtgctggatg ttgggtggct tagccactca gtgtcgtagt

780

taacgcgata agcacaccgc ctggggagta cggccgcaag gttgaaactc aaaggaattg

840

acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gcagaacctt

900

accagggctt gacatgggga ggctgtgttc agagatgagc atttcccgca agggacctcc

960

tgcacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1020

aacgagcgca accctcgcct ttagttgcca gcatgtttgg gtgggcactc taaaggaact

1080

gccggtgaca agccggagga aggtggggat gacgtcaagt cctcatggcc cttatgtcct

1140

gggctacaca cgtgctacaa tggcggtgac agtgggaagc caggcagcga tgccgagctg

1200

atctcaaaaa gccgtctcag ttcggattgc actctgcaac tcgggtgcat gaagttggaa

1260

tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc

1320

gcccgtcaca ccatgggagt tggtttgacc ttaagccggt gagcgaaccc agcaatgggg

1380

cgcagccgac cacggtcggg tcagcgactg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtaggg

1440

gaactgc

1447

<210> 944

<211> 1486

<212> DNA

<213> Gluconacetobacter diazotrophicus

<400> 944

agagtttgat cctggctcag agcgaacgct ggcggcatgc ttaacacatg caagtcgcac

60

gaacctttcg gggttagtgg cggacgggtg agtaacgcgt agggatctgt ccatgggtgg

120

gggataactc cgggaaactg gagctaatac cgcatgacac ctgagggtca aaggcgcgag

180

tcgcctgtgg aggaacctgc gttcgattag ctagttggtg gggtaaaggc ctaccaaggc

240

gatgatcgat agctggtctg agaggatgat cagccacact gggactgaga cacggcccag

300

actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tggacaatgg gcgcaagcct gatccagcaa

360

tgccgcgtgt gtgaagaagg tcttcggatt gtaaagcact ttcgacgggg acgatgatga

420

cggtacccgt agaagaagcc ccggctaact tcgtgccagc agccgcggta atacgaaggg

480

ggctagcgtt gctcggaatg actgggcgta aagggcgcgt aggcggtttg gacagtcaga

540

tgtgaaattc ctgggcttaa cctgggggct gcatttgata cgtacagact agagtgtgag

600

agagggttgt ggaattccca gtgtagaggt gaaattcgta gatattggga agaacaccgg

660

tggcgaaggc ggcaacctgg ctcataactg acgctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa

720

caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt gtgctggatg ttgggtggct

780

tagcccctca gtgtcgtagt taacgcgata agcacaccgc ctggggagta cggccgcaag

840

gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc

900

gaagcaacgc gcagaacctt accagggctt gacatgggga ggctgcagtc agagatggct

960

gtttcccgca agggacctcc tgcacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga

1020

gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca accctcgcct ttagttgcca gcatgattgg

1080

gtgggcactc taaaggaact gccggtgaca agccggagga aggtggggat gacgtcaagt

1140

cctcatggcc cttatgtcct gggctacaca cgtgctacaa tggcggtgac agtgggaagc

1200

caggcagcga tgccgagctg atctcaaaaa gccgtctcag ttcggattgc actctgcaac

1260

tcgagtgcat gaaggtggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt

1320

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt tggtttgacc ttaagccggt

1380

gagcgaaccc agcaatgggg cgcagccgac cacggtcggg tcagcgactg gggtgaagtc

1440

gtaacaaggt agccgtaggg gaacctgcgg ctggatcacc tccttt

1486

<210> 945

<211> 1484

<212> DNA

<213> Gluconacetobacter entanii

<220>

<221> modified_base

<222> (10)..(11)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 945

gagtttgatn ntggctcaga gcgaacgctg gcggcatgct taacacatgc aagtcgcacg

60

aacctttcgg ggttagtggc ggacgggtga gtaacgcgta gggatctgtc catgggtggg

120

ggataacctt gggaaaccga ggctaatacc gcatgacacc tgagggtcaa aggcgcaagt

180

cgcctgtgga ggaacctgcg ttcgattagc tagttggtgg ggtaaaggcc taccaaggcg

240

atgatcgata gctggtctga gaggatgatc agccacactg ggactgagac acggcccaga

300

ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg cgcaagcctg atccagcaat

360

gccgcgtgtg tgaagaaggt tttcggattg taaagcactt tcagcgggga cgatgatgac

420

ggtacccgca gaagaagccc cggctaactt cgtgccagca gccgcggtaa tacgaagggg

480

gcaagcgttg ctcggaatga ctgggcgtaa agggcgcgta ggcggttgtt acagtcagat

540

gtgaaattcc cgggcttaac ctgggggctg catttgatac gtggcgacta gagtgtgaga

600

gagggttgtg gaattcccag tgtagaggtg aaattcgtag atattgggaa gaacaccggt

660

ggcgaaggcg gcaacctggc tcatgactga cgctgaggcg cgaaagcgtg gggagcaaac

720

aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacgatgtg tgctggatgt tgggtggctt

780

ggccattcag tgtcgtagtt aacgcgataa gcacaccgcc tggggagtac ggccgcaagg

840

ttgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

900

aagcaacgcg cagaacctta ccagggcttg acatgcggag gctgtgtcca gagatgggca

960

tttctcgcaa gagacctcca gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1020

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa ccctcgcctt tagttgccag cacgtctggg

1080

tgggcactct aaaggaactg ccggtgacaa gccggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1140

ctcatggccc ttatgtcctg ggctacacac gtgctacaat ggcggtgaca gtgggaagcc

1200

aggcagcgat gccgagcgga tctccaaaag ccgtctcagt tcggattgca ctctgcaact

1260

cgagtgcatg aaggtggaat cgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg tgaatacgtt

1320

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtt ggtttgacct taagccggtg

1380

agcgaaccgc aaggacgcag ccgaccacgg tcgggtcagc gactggggtg aagtcgtaac

1440

aaggtagccg taggggaacc tgcggctgga tcacctcctt tcaa

1484

<210> 946

<211> 1482

<212> DNA

<213> Gluconacetobacter europaeus

<400> 946

gagtttgatc atggctcaga gcgaacgctg gcggcatgct taacacatgc aagtcgcacg

60

aacctttcgg ggttagtggc ggacgggtga gtaacgcgta gggatctgtc catgggtggg

120

ggataacttt gggaaactga agctaatacc gcatgacacc tgagggtcaa aggcgcaagt

180

cgcctgtgga ggaacctgcg ttcgattagc tagttggtgg ggtaaaggcc taccaaggcg

240

atgatcgata gctggtctga gaggatgatc agccacactg ggactgagac acggcccaga

300

ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg cgcaagcctg atccagcaat

360

gccgcgtgtg tgaagaaggt tttcggattg taaagcactt tcagcgggga cgatgatgac

420

ggtacccgca gaagaagccc cggctaactt cgtgccagca gccgcggtaa tacgaagggg

480

gcaagcgttg ctcggaatga ctgggcgtaa agggcgcgta ggcggttgac acagtcagat

540

gtgaaattcc tgggcttaac ctgggggctg catttgatac gtggcgacta gagtgtgaga

600

gagggttgtg gaattcccag tgtagaggtg aaattcgtag atatttggga agaacaccgg

660

tggcgaaggc ggcaacctgg ctcatgactg acgctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa

720

caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt gtgctggatg ttgggtgact

780

ttgtcattca gtgtcgtagt taacgcgata agcacaccgc ctggggagta cggccgcaag

840

gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc

900

gaagcaacgc gcagaacctt accagggctt gacatgcgga ggccgtgtcc agagatgggc

960

atttctcgca agagacctcc agcacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga

1020

gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca accctcgcct ttagttgcca tcacgtctgg

1080

gtgggcactc taaaggaact gccggtgaca agccggagga aggtggggat gacgtcaagt

1140

cctcatggcc cttatgtcct gggctacaca cgtgctacaa tggcggtgac agtgggaagc

1200

caggtagcga taccgagccg atctcaaaaa gccgtctcag ttcggattgc actctgcaac

1260

tcgagtgcat gaaggtggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt

1320

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt tggtttgacc ttaagccggt

1380

gagcgaaccg caaggacgca gccgaccacg gtcgggtcag cgactggggt gaagtcgtaa

1440

caaggtagcc gtaggggaac ctgcggctgg atcacctcct tt

1482

<210> 947

<211> 1481

<212> DNA

<213> Gluconacetobacter hansenii

<400> 947

gagtttgatt atggctcaga gcgaacgctg gcggcatgct taacacatgc aagtcgcacg

60

aacctttcgg ggttagtggc ggacgggtga gtaacgcgta gggatctgtc catgggtggg

120

ggataacttt gggaaactga agctaatacc gcatgacacc tgagggtcaa aggcgcgagt

180

cgcctgtgga ggaacctgcg ttcgattagc tagttggtgg ggtaaaggcc taccaaggcg

240

atgatcgata gctggtctga gaggatgatc agccacactg ggactgagac acggcccaga

300

ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg cgcaagcctg atccagcaat

360

gccgcgtgtg tgaagaaggt tttcggattg taaagcactt tcagcgggga cgatgatgac

420

ggtacccgca gaagaagccc cggctaactt cgtgccagca gccgcggtaa tacgaagggg

480

gcaagcgttg ctcggaatga ctgggcgtaa agggcgcgta ggcggttgtt acagtcagat

540

gtgaaattcc cgggcttaac ctgggggctg catttgatac gtgacgacta gagtgtgaga

600

gagggttgtg gaattcccag tgtagaggtg aaattcgtag atattgggaa gaacaccggt

660

ggcgaaggcg gcaacctggc tcatgactga cgctgaggcg cgaaagcgtg gggtgcaaac

720

aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacgatgtg tgctggatgt tggatggctt

780

ggccattcgg tgtcgtagtt aacgcgataa gcacaccgcc tggggagtac ggccgcaagg

840

ttgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

900

aagcaacgcg cagaacctta ccaggacttg acatgcggag gctgtgtcca gagatgggca

960

tttctcgcaa gagacctcca gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1020

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa ccctcgcctt tagttgccag cacgtctggg

1080

tgggcactct aaaggaactg ccggtgacaa gccggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1140

ctcatggccc ttatgtcctg ggctacacac gtgctacaat ggcggtgaca gtgggaagcc

1200

aggcagcgat gccgagcgga tctccaaaag ccgtctcagt tcggattgca ctctgcaact

1260

cgagtgcatg aaggtggaat cgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg tgaatacgtt

1320

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtt ggtttgacct taagccggtg

1380

agcgaaccgc aaggacgcag ccgaccacgg tcgggtcagc gactggggtg aagtcgtaac

1440

aaggtagccg taggggaacc tgcggctgga tcacctcctt t

1481

<210> 948

<211> 1447

<212> DNA

<213> Gluconacetobacter johannae

<400> 948

agcgaacgct ggcggcatgc ttaacacatg caagtcgcac gaacctttcg gggttagtgg

60

cggacgggtg agtaacgcgt agggatctgt ccatgggtgg gggataacct cgggaaactg

120

aggctaatac cgcatgacac ctgagggtca aaggcgtaag tcgcctgtgg aggaacctgc

180

gttcgattag ctagttggtg gggtaaaggc ctaccaaggc gatgatcgat agctggtctg

240

agaggatgat cagccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

300

tggggaatat tggacaatgg gcgcaagctg atccagcaat gccgcgtgtg tgaagaaggt

360

cttcggattg taaagcactt tcgacgggga cgatgatgac ggtacccgta gaagaagccc

420

cggctaactt cgtgccagca gccgcggtaa tacgaagggg gctagcgttg ctcggaatga

480

ctgggcgtaa agggcgcgta ggcggtttgg acagtcagat gtgaaattcc tgggcttaac

540

ctgggggctg catttgatac gtatagacta gagtgtgaga gagggttgtg gaattcccag

600

tgtagaggtg aaattcgtag atattgggaa gaacaccggt ggcgaaggcg gcaacctggc

660

tcataactga cgctgaggcg cgaaagggtg gggagcaaac aggattagat accctggtag

720

tccacgctgt aaacgatgtg tgctggatgt tgggtggctt agccactcag tgtcgtagtt

780

aacgcgataa gcacaccgcc tggggagtac ggccgcaagg ttgaaactca aaggaattga

840

cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg cagaacctta

900

ccagggcttg acatggggag gctgtgagca gagatgttca tttcccgcaa gggacctcct

960

gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1020

acgagcgcaa ccctcgcctt tagttgccag catgtttggg tgggcactct aaaggaactg

1080

ccggtgacaa gccggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc ctcatggccc ttatgtcctg

1140

ggctacacac gtgctacaat ggcggtgaca gtgggaagcc aggcagcgat gccgagctga

1200

tctcaaaaag ccgtctcagt tcggattgca ctctgcaact cgggtgcatg aagttggaat

1260

cgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1320

cccgtcacac catgggagtt ggtttgacct taagccggtg agcgaaccca gcaatggggc

1380

gcagccgacc acggtcgggt cagcgactgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtagggg

1440

aacctgc

1447

<210> 949

<211> 1449

<212> DNA

<213> Gluconacetobacter oboediens

<400> 949

tgagtttgat cctggctcag agcgaatgct ggcggcatgc ttaacacatg caagtcgcac

60

gaacctttcg gggttagtgg cggacgggtg agtaacgcgt agggatctat ccacgggtgg

120

gggataactt tgggaaactg aagctaatac cgcatgacac ctgagggtca aaggcgcaag

180

tcgcctgtgg aggaacctgc gttcgattag ctagttggtg gggtaaaggc ctaccaaggc

240

gatgatcgat agctggtctg agaggatgat cagccacact gggactgaga cacggcccag

300

actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tggacaatgg gcgcaagcct gatccagcaa

360

tgccgcgtgt gtgaagaagg ttttcggatt gtaaagcact ttcagcgggg atgatgatga

420

cggtacccgc agaagaagcc ccggctaact tcgtgccagc agccgcggta atacgaaggg

480

ggcaagcgtt gctcggaatg actgggcgta aagggcgcgt aggcggttga cacagtcaga

540

tgtgaaattc ccgggcttaa cctgggggct gcatttgata cgtggcgact agagtgtgag

600

agagggttgt ggaattccca gtgtagaggt gaaattcgta gatattggga agaacaccgg

660

tggcgaaggc ggcaacctgg ctcatgactg acgctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa

720

caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt gtgctggatg ttgggtgact

780

ttgtcattca gtgtcgtagt taacgcgata agcacaccgc ctggggagta cggccgcaag

840

gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc

900

gaagcaacgc gcagaacctt accagggctt gacatgcgga ggccgtgtcc agagatgggc

960

atttctcgca agagacctcc agcacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga

1020

gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca accctcgcct ttagttgcca tcacgtctgg

1080

gtgggcactc taaaggaact gccggtgaca agccggagga aggtggggat gacgtcaagt

1140

cctcatggcc cttatgtcct gggctacaca cgtgctacaa tggcggtgac agtgggaagc

1200

caggtggtga caccgagccg atctcaaaaa gccgtctcag ttcggattgc actctgcaac

1260

tcgagtgcat gaaggtggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt

1320

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt tggtttgacc ttaagccggt

1380

gagcgaaccg caaggacgca gccgaccacg gtcgggtcag cgactggggt gaagtcgtaa

1440

caaggtagc

1449

<210> 950

<211> 1493

<212> DNA

<213> Gluconacetobacter xylinus

<400> 950

atgaacctga gagtttgatc ctggctcaga gcgaacgctg gcggcatgct taacacatgc

60

aagtcgcacg aacctttcgg ggttagtggc ggacgggtga gtaacgcgta gggatctgtc

120

catgggtggg ggataacttt gggaaactga agctaatacc gcatgacacc tgagggtcaa

180

aggcgcaagt cgcctgtgga ggaacctgcg ttcgattagc tagttggtgg ggtaaaggcc

240

taccaaggcg atgatcgata gctggtctga gaggatgatc agccacactg ggactgagac

300

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg cgcaagcctg

360

atccagcaat gccgcgtgtg tgaagaaggt tttcggattg taaagcactt tcagcgggga

420

cgatgatgac ggtacccgca gaagaagccc cggctaactt cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacgaagggg gcaagcgttg ctcggaatga ctgggcgtaa agggcgcgta ggcggttgac

540

acagtcaggt gtgaaattcc cgggcttaac ctggggtctg catttgatac gtggcgacta

600

gagtgtgaga gagggttgtg gaattcccag tgtagaggtg aaattcgtag atattgggaa

660

gaacaccggt ggcgaaggcg gcaacctggc tcatgactga cgctgaggcg cgaaagcgtg

720

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacgatgtg tgctggatgt

780

tgggtgactt tgtcattcag tgtcgtagtt aacgcgataa gcacaccgcc tggggagtac

840

ggccgcaagg ttgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg

900

gtttaattcg aagcaacgcg cagaacctta ccagggcttg acatgcggag gctgtgtcca

960

gagatgggca tttctcgcaa gagacctcca gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

1020

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa ccctcgcctt tagttgccat

1080

cacgtttggg tgggcactct aaaggaactg ccggtgacaa gccggaggaa ggtggggatg

1140

acgtcaagtc ctcatggccc ttatgtcctg ggctacacac gtgctacaat ggcggtgaca

1200

gtgggaagcc aggtggtgac accgagccga tctcaaaaag ccgtctcagt tcggattgca

1260

ctctgcaact cgagtgcatg aaggtggaat cgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg

1320

tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtt ggtttgacct

1380

taagccggtg agcgaacccg caaggggcgc agccgaccac ggtcgggtca gcgactgggg

1440

tgaagtcgta acaaggtagc cgtaggggaa cctgcggctg gatcacctcc ttt

1493

<210> 951

<211> 1472

<212> DNA

<213> Gordonia bronchialis

<400> 951

ggacgaacgc tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgaa cggaaaggcc cagcttgctg

60

ggtactcgag tggcgaacgg gtgagtaaca cgtgggtgat ctgcccctga ctttgggata

120

agcctgggaa actgggtcta ataccggata tgaccttaca tcgcatggtg tttggtggaa

180

agcttttgcg gttggggatg ggcccgcggc ctatcagctt gttggtgggg taatggccta

240

ccaaggcgac gacgggtagc cgacctgaga gggtgatcgg ccacactggg actgagacac

300

ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat

360

gcagcgacgc cgcgtgaggg atgacggcct tcgggttgta aacctctttc accagggacg

420

aagcgtgagt gacggtacct ggagaagaag caccggccaa ctacgtgcca gcagccgcgg

480

taatacgtag ggtgcgagcg ttgtccggaa ttactgggcg taaagagctc gtaggcggtt

540

tgtcgcgtcg tctgtgaaat tctgcagctt aactgtaggc gtgcaggcga tacgggcaga

600

cttgagtact acaggggaga ctggaattcc tggtgtagcg gtgaaatgcg cagatatcag

660

gaggaacacc ggtggcgaag gcgggtctct gggtagtaac tgacgctgag gagcgaaagc

720

gtgggtagcg aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacggt gggtactagg

780

tgtggggttc atttcacgga atccgtgccg tagctaacgc attaagtacc ccgcctgggg

840

agtacggccg caaggctaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggcggagc

900

atgtggatta attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg gtttgacata caccagacgc

960

ggctagagat agtcgttccc ttgtggttgg tgtacaggtg gtgcatggct gtcgtcagct

1020

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgtcc tgtattgcca

1080

gcgggttatg ccggggactt gcaggagact gccggggtca actcggagga aggtggggat

1140

gacgtcaagt catcatgccc cttatgtcca gggcttcaca catgctacaa tggccggtac

1200

agagggctgc gataccgtga ggtggagcga atcccttaaa gccggtctca gttcggatcg

1260

gggtctgcaa ctcgaccccg tgaagtcgga gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg

1320

cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca cgtcatgaaa gtcggtaaca

1380

cccgaagccg gtggcctaac cccttgtggg agggagctgt cgaaggtggg atcggcgatt

1440

gggacgaagt cgtaacaagg tagccgtacc gg

1472

<210> 952

<211> 1298

<212> DNA

<213> Gordonia polyisoprenivorans

<400> 952

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta

60

acacgtgggt gatctgcccc tgactttggg ataagcctgg gaaactgggt ctaataccgg

120

atatggaaag gcggttgggg atgggcccgc ggcctatcag cttgttggtg gggtaatggc

180

ctaccaaggc gacgacgggt agccgacctg agagggtgat cggccacact gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct

300

gatgcagcga cgccgcgtga gggatgacgg ccttcgggtt gtaaacctct ttcagcaggg

360

acgatgacgg tacctgcaga agaagcaccg gccaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtagggtgc gagcgttgtc cggaattact gggcgtaaag agctcgtagg cggtttgtcg

480

cgtcgtctgt gaaattctgc agcttaactg taggcgtgca ggcgatacgg gcagacttga

540

gtactacagg ggagactgga attcctggtg tagcggtgaa atgcgcagat atcaggagga

600

acaccggtgg cgaaggcggg tctctgggta gactgacgct gaggagcgaa agcgtgggta

660

gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac ggtgggtact aggtgtgggt

720

tgatccgtgc cgtagctaac gcattaagta ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga gcatgtggat taattcgatg

840

caacgcgaag aaccttacct gggtttgaca tatacaggtg gtgcatggct gtcgtcagct

900

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgtcc tgtattgcca

960

gcggccgggg acttgcagga gactgccggg gtcaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1020

aagtcatcat gccccttatg tccagggctt cacacatgct acaatggccg gcagagggct

1080

gcgataccgt gaggtggagc gaatcccttc cggtctcagt tcggacgggg tctgcaactc

1140

gaccccggaa gtcggagtcg ctagtaatcg cagatcagca acgctgcggt gaatacgttc

1200

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacgtc atgaaagtcg gtaacacccg aagccggtgc

1260

ctagggagct gtcgaaggtg ggatcggcga ttgggacg

1298

<210> 953

<211> 1485

<212> DNA

<213> Gordonia sp. KTR9

<220>

<221> modified_base

<222> (11)..(11)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (415)..(415)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1483)..(1483)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 953

agagtttgat ncctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgaa

60

cggaaaggcc cagcttgctg ggtactcgag tggcgaacgg gtgagtaaca cgtgggtgat

120

ctgccctgca ctctgggata agcctgggaa actgggtcta ataccggata tgaccaactg

180

tcgcatggtg gttggtggaa agcttttgcg gtgtgggatg ggcccgcggc ctatcagctt

240

gttggtgggg taatggccta ccaaggcgac gacgggtagc cgacctgaga gggtgatcgg

300

ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc

360

acaatgggcg caagcctgat gcagcgacgc cgcgtgaggg atgacggcct tcggnttgta

420

aacctctttc accagggacg aagcgtgagt gacggtacct ggagaagaag caccggccaa

480

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggtgcgagcg ttgtccggaa ttactgggcg

540

taaagagctc gtaggcggtt tgtcgcgtcg tctgtgaaat tctgcaactc aattgtaggc

600

gtgcaggcga tacgggcaga cttgagtact acaggggaga ctggaattcc tggtgtagcg

660

gtgaaatgcg cagatatcag gaggaacacc ggtggcgaag gcgggtctct gggtagtaac

720

tgacgctgag gagcgaaagc gtgggtagcg aacaggatta gataccctgg tagtccacgc

780

cgtaacggtg ggtactaggt gtgggttcct tttcacggga tccgtgccgt agctaacgca

840

ttaagtaccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg

900

cccgcacaag cggcggagca tgtggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggg

960

tttgacatac accagacgcg gctagagata gtcgttccct tgtggttggt gtacaggtgg

1020

tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

1080

cccttgtcct gtattgccag cgggttatgc cggggacttg caggagactg ccggggtcaa

1140

ctcggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgtccag ggcttcacac

1200

atgctacaat ggctggtaca gagggctgcg ataccgtgag gtggagcgaa tcccttaaag

1260

ccagtctcag ttcggattgg ggtctgcaac tcgaccccat gaagtcggag tcgctagtaa

1320

tcgcagatca gcaacgctgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac

1380

gtcatgaaag tcggtaacac ccgaagccgg tggcctaacc ccttgtggga gggagctgtc

1440

gaaggtggga tcggcgattg ggacgaagtc gtaaccaagg tancc

1485

<210> 954

<211> 1430

<212> DNA

<213> Gordonia sputi

<400> 954

tgcaagtcga acggaaaggc ccagcttgct gggtactcga gtggcgaacg ggtgagtaac

60

acgtgggtga tctgcccctg actttgggat aagcctggga aactgggtct aataccggat

120

attcattttt cctcgcatgg ggatttgtgg aaagcttttg cggttgggga tgggcccgcg

180

gcctatcagc ttgttggtgg ggtaatggcc taccaaggcg acgacgggta gccgacctga

240

gagggtgatc ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

300

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagcgac gccgcgtgag ggatgacggc

360

cttcgggttg taaacctctt tcagctccga cgaagcgcaa gtgacggtag gagcagaaga

420

agcaccggcc aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggtgcaag cgttgtccgg

480

aattactggg cgtaaagagc tcgtaggcgg tttgtcgcgt cgtctgtgaa attctgcagc

540

ttaactgcag gcgtgcaggc gatacgggca gacttgagta ctacagggga gactggaatt

600

cctggtgtag cggtgaaatg cgcagatatc aggaggaaca ccggtggcga aggcgggtct

660

ctgggtagta actgacgctg aggagcgaaa gcgtgggtag cgaacaggat tagataccct

720

ggtagtccac gccgtaaacg gtgggtacta ggtgtgggtt tcatttcacg gaatccgtgc

780

cgtagctaac gcattaagta ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag

840

gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga gcatgtggat taattcgatg caacgcgaag

900

aaccttacct gggtttgaca tacaccagac gcagtcagag atggctgttc ccttgtggtt

960

ggtgtacagg tggtgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1020

gcaacgagcg caacccttgt cctgtattgc cagcgggtta tgccggggac ttgcaggaga

1080

ctgccggggt caactcggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgc cccttatgtc

1140

cagggcttca cacatgctac aatggctggt acagagggct gcgagaccgt gaggtggagc

1200

gaatccctta aagccagtct cagttcggat tggggtctgc aactcgaccc catgaagtcg

1260

gagtcgctag taatcgcaga tcagcaacgc tgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca

1320

caccgcccgt cacgtcatga aagtcggtaa cacccgaagc cggtggccta acccttgtgg

1380

agggagctgt cgaaggtggg atcggcgatt gggacgaagt cgtaacaagg

1430

<210> 955

<211> 1467

<212> DNA

<213> Gordonia terrae

<220>

<221> modified_base

<222> (444)..(445)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 955

gagtttgatc atggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

gaaaggccca gcttgctggg tactcgagtg gcgaacgggt gagtaacacg tgggtgatct

120

gccctgcact ctgggataag cctgggaaac tgggtctaat accggatatg accaactgtc

180

gcatggtggt tggtggaaag cttttgcggt gtgggatggg cccgcggcct atcagcttgt

240

tggtggggta atggcctacc aaggcgacga cgggtagccg acctgagagg gtgatcggcc

300

acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac

360

aatgggcgca agcctgatgc agcgacgccg cgtgagggat gacggccttc gggttgtaaa

420

cctctttcac cagggacgaa gcgnnagtga cggtacctgg agaagaagca ccggccaact

480

acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg tgcgagcgtt gtccggaatt actgggcgta

540

aagagctcgt aggcggtttg tcgcgtcgtc tgtgaaattc tgcaactcaa ttgcaggcgt

600

gcaggcgata cgggcagact tgagtactac aggggagact ggaattcctg gtgtagcggt

660

gaaatgcgca gatatcagga ggaacaccgg tggcgaaggc gggtctctgg gtagtaactg

720

acgctgagga gcgaaagcgt gggtagcgaa caggattaga taccctggta gtccacgccg

780

taaacggtgg gtactaggtg tgggttcctt ttcacgggat ccgtgccgta gctaacgcat

840

taagtacccc gcctggggag tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc

900

ccgcacaagc ggcggagcat gtggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctgggt

960

ttgacataca ccagacgcgg ctagagatag tcgttccctt gtggttggtg tacaggtggt

1020

gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1080

ccttgtcctg tattgccagc gggttatgcc ggggacttgc aggagactgc cggggtcaac

1140

tcggaggaag gtggggatga cgtcaagtca tcatgcccct tatgtccagg gcttcacaca

1200

tgctacaatg gctggtacag agggctgcga taccgtgagg tggagcgaat cccttaaagc

1260

cagtctcagt tcggattggg gtctgcaact cgaccccatg aagtcggagt cgctagtaat

1320

cgcagatcag caacgctgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcacg

1380

tcatgaaagt cggtaacacc cgaagccggt ggcctaaccc cttgtgggag ggagctgtcg

1440

aaggtgggat cggcgattgg gacgaag

1467

<210> 956

<211> 1497

<212> DNA

<213> Gordonibacter pamelaeae

<400> 956

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgaac

60

gattaagacg gctccggccg tgaatagagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgaccaacc

120

tgccccctac cccgggataa cgcaaggaaa cctgcgctaa taccggatac tccttcccct

180

gctcctgcag gggtcgggaa agcccagacg gtaggggatg gggtcgcggc ccattaggta

240

gacggcgggg caacggccca ccgtgcctgc gatgggtagc cgggttgaga gaccgaccgg

300

ccacattggg actgagatac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaattttgc

360

gcaatggggg gaaccctgac gcagcaacgc cgcgtgcggg atgaaggcct tcgggttgta

420

aaccgctttc agcagggaag atagtgacgg tacctgcaga agaagccccg gctaactacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc gagcgttatc cggattcatt gggcgtaaag

540

cgcgcgtagg cggcccgtca agcggaacct ctaacccgag ggctcaaccc ccggtcgggt

600

tccgaactgg caggctcgag tttggtagag gaagatggaa ttcccggtgt agcggtggaa

660

tgcgcagata tcgggaagaa caccgatggc gaaggcagtc ttctgggcca tcaactgacg

720

ctgaggcgcg aaagctgggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc ccagccgtaa

780

acgatgggtg ctaggtgtgg ggggatcatc cctccgtgcc gcagccaacg cattaagcac

840

cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

900

agcagcggag catgtggctt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag ggcttgacat

960

gctagtgaag ccggggaaac ccggtggccg agaggagcta gcgcaggtgg tgcatggctg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatcgt

1080

atgttgccag cattgagttg gggactcata cgagactgcc ggcgtcaagc cggaggaagg

1140

tggggacgac gtcaagtcat catgcccttt atgccctggg ctgcacacgt gctacaatgg

1200

ccggtacaac gggccgcgac ctggcgacag gaagcgaatc cctcaaagcc ggccccagtt

1260

cggatcggag gctgcaaccc gcctccgtga agtcggagtt gctagtaatc gcggatcagc

1320

atgccgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acccgagtcg

1380

tctgcacccg aagccgccgg ccgaacccgc aaggggcgga ggcgtcgaag gtgtggaggg

1440

taaggggggt gaagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag gtgcggctgg atcacct

1497

<210> 957

<211> 1549

<212> DNA

<213> Gracilibacter thermotolerans

<400> 957

cctaccatgc agtcgagcgg agatttcttc ggcactgaac attctagtag tatgacgcaa

60

acaaagcgtc atgaagaaac accattggtg tatatgataa gataaaagtt tcttcatcac

120

gcgttaataa agtgccaaca caaacatcaa gagaaattag agaaaagaat gtattagaat

180

gttgagtgct gaagaaatct tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggc aacctgcctc

240

gaagaggggg ataacaccga gaaatcggtg ctaataccgc ataacataca cagaccgcat

300

ggtgagtgta tcaaaggaga aatccgcttt gagatgggcc cgcggctgat tagctagttg

360

gtaaggtaac ggcttaccaa ggcgacgatc agtagccgac ctgagagggt gaccggccac

420

actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcgcaa

480

tgggggaaac cctgacgcag caacgccgcg tggaggaaga aggtcttcgg attgtaaact

540

cctgtcttct gggacgaaga atgacggtac cagaggagga agccacggct aactacgtgc

600

cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcgag cgttgtccgg aattactggg cgtaaagggc

660

gcgtaggcgg ttttttaagt cagatgtgaa aacccagggc ttaactctgg gattgcattt

720

gaaactggaa ggcttgagtg caggagaggt aagtggaatt cctagtgtag cggtgaaatg

780

cgtagatatt aggaggaaca ccagtggcga aggcgactta ctggactgta actgacgctg

840

aggcgcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

900

atggatacta ggtgtgggag gtgtcgaccc cttccgtgcc gcagtaaacg caataagtat

960

cccgcctggg gagtacggcc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

1020

agcagcggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gacttgacat

1080

cccctgaatt actcgtaacg gaggaagtcc ttcgggacag ggagacaggt ggtgcatggt

1140

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccctatt

1200

gctagttgcc atcattaagt tgggcactct agtgagactg ccggagacaa ttcggaggaa

1260

ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgttctg ggctacacac gtgctacaat

1320

gggtgtaaca acgagaagcg agctagtgat agcaagccaa cctctaaaaa gcaccctcag

1380

ttcggattgt aggctgaaac ccgcctacat gaagttggag ttgctagtaa tcgcgaatca

1440

gcatgtcgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt

1500

tggaagcacc cgaagccggt gacttaaccg caaggagaga gcctcgaag

1549

<210> 958

<211> 1527

<212> DNA

<213> Gramella forsetii

<400> 958

atgaagagtt tgatcctggc tcaggatgaa cgctagcggc aggcctaaca catgcaagtc

60

gaacggtaac agggattgct tgcaatccgc tgacgagtgg cgcacgggtg cgtaacgcgt

120

atacaatctg cctttaagcg gggaatagcc catggaaacg tggattaata ccccatagta

180

ttatgatttc acctgggatt ataattaaac atttatggct taaagatgag tatgcgtcct

240

attagttagt tggtaaggta acggcttacc aagacagcga taggtagggg tcctgagagg

300

gagatccccc acactggtac tgagacacgg accagactcc tacgggaggc agcagtgagg

360

aatattggac aatggaggca actctgatcc agccatgccg cgtgcaggaa gacggcccta

420

tgggttgtaa actgctttta tacgggaaga accacatcta cgtgtagatg cttgacggta

480

ccgtatgaat aaggaccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtccaa

540

gcgttatccg gaatcattgg gtttaaaggg tccgtaggcg gaataataag tcagtggtga

600

aagtctgcag ctcaactgta gaattgccat tgatactgtt gttcttgaat tattatgaag

660

tggttggaat aagtagtgta gcggtgaaat gcatagatat tacttagaac acctattgcg

720

aaggcagatc actaataata tattgacgct gagggacgaa agcgtaggta gcgaacagga

780

ttagataccc tggtagtcta cgccgtaaac gatggttact agctgtccgg cctaattgag

840

ggctgggtgg ttaagcgaaa gtgataagta acccacctgg ggagtacgtt cgcaagaatg

900

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg

960

atacgcgagg aaccttacca gggcttaaat gcagtctgac aggtctggaa acagactttt

1020

cttcggacag attgcaaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgtcagg

1080

ttaagtccta taacgagcgc aacccctgtg gttagttgcc agcgagtaat gtcgggaact

1140

ctagccagac tgccggtgca aaccgcgagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcacggc

1200

ccttacgtcc tgggccacac acgtgctaca atggtaggga cagagggcag ctaccccgcg

1260

aggggatgcg aatcttcaaa ccctatcaca gttcggatcg cagtctgcaa ctcgactgcg

1320

tgaagctgga atcgctagta atcgcatatc agccatgatg cggtgaatac gttcccgggc

1380

cttgtacaca ccgcccgtca agccatggaa gctgggggta cctgaagtcc gtcaccgtaa

1440

ggagcggcct agggtaaaac tggtaactgg ggctaagtcg taacaaggta gccgtaccgg

1500

aaggtgcggc tggaacacct cctttct

1527

<210> 959

<211> 1548

<212> DNA

<213> Granulicatella adiacens

<400> 959

atgagagttt gatcctggct caggacgaac gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg

60

aacgagagcg accggtgctt gcactggtca atctagtggc gaacgggtga gtaacacgtg

120

ggtaacctgc ccatcagagg gggataacat ccggaaacgg atgctaaaac cgcataggtc

180

ttcgaaccgc atggtttgaa gaggaaaaga ggcgcaagct tctgctgatg gatggacccg

240

cggtgcatta gctagttggt gaggtaacgg ctcaccaagg ccgtgatgca tagccgacct

300

gagagggtga tcggccacat tgggactgag acacggccca aactcctacg ggaggcagca

360

gtagggaatc ttccgcaatg gacgcaagtc tgacggagca acgccgcgtg agtgaagaag

420

gttttcggat cgtaaaactc tgttgttaga gaagaacaag tgctagagta actgttagcg

480

ccttgacggt atctaaccag aaagccacgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

540

gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc gagcgcaggc ggttccttaa

600

gtctgatgtg aaagcccccg gctcaaccgg ggagggtcat tggaaactgg ggaacttgag

660

tgcagaagag gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tatggaggaa

720

caccagtggc gaaggcgact ctctggtctg taactgacgc tgaggctcga aagcgtgggt

780

agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgagtgc taagtgttgg

840

agggtttccg cccttcagtg ctgcagttaa cgcattaagc actccgcctg gggagtacga

900

ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt

960

ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc aagtcttgac atcctttgac cactctagag

1020

atagagcttt cccttcgggg acaaagtgac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt

1080

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tattactagt tgccagcatt

1140

cggttgggca ctctagtgag actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca

1200

aatcatcatg ccccttatga cttgggctac acacgtgcta caatggatgg tacaacgagc

1260

agcgaactcg cgagggtaag cgaatctctt aaagccattc tcagttcgga ttgtaggctg

1320

caactcgcct acatgaagcc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc cgcggtgaat

1380

acgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccaaagt

1440

cggtgaggta accatttgga gccagccgcc taaggtggga tagatgattg gggtgaagtc

1500

gtaacaaggt agccgtatcg gaaggtgcgg ctggatcacc tcctttct

1548

<210> 960

<211> 1227

<212> DNA

<213> Granulicatella elegans

<400> 960

gtcgaacgag tggcgaacgg gtgagtaaca cgtgggtaac ctgcccatca gagggggata

60

acattcggaa acggatgcta aaaccgcata gggaaaactg ctgatggatg gacccgcggt

120

gcattagcta gttggtgagg taacggctca ccaaggccgt gatgcatagc cgacctgaga

180

gggtgatcgg ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag gcagcagtag

240

ggaatcttcc gcaatggacg caagtctgac ggagcaacgc cgcgtgagtg aagaaggatt

300

tcggttcgta aaactctgtt gttagagaag atgacggtat ctaaccagaa agccacggct

360

aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag cgttgtccgg atttattggg

420

cgtaaagcga gcgcaggcgg tcaattaagt ctgatgtgaa agcccccggc tcaaccgggg

480

agggtcattg gaaactggtt gacttgagtg cagaagagga gagtggaatt ccatgtgtag

540

cggtgaaatg cgtagatata tggaggaaca ccagtggcga aggcgactct ctggtctgac

600

tgacgctgag gctcgaaagc gtgggtagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc

660

cgtaaacgat gagtgctaag tgttggagct tcagtgctgc agttaacgca ttaagcactc

720

cgcctgggga gtacgaccgc aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag

780

cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaagt cttgacatcg

840

acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

900

gagcgcaacc cttattacta gttgccagca tgggcactct agtgagactg ccggtgacaa

960

accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacttg ggctacacac

1020

gtgctacaat ggatggcaac gagcagcgaa ctcgcgaggg taagcgaatc tcttccattc

1080

tcagttcgga tgtaggctgc aactcgccta cagaagccgg aatcgctagt aatcgcggat

1140

cagcacgccg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga

1200

gtttgtaaca cccaaagtcg gtaggta

1227

<210> 961

<211> 1512

<212> DNA

<213> Granulicatella paradiacens

<400> 961

agtttgatca tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca agtcgaacga

60

gagcgaccgg tgcttgcact ggtcaatcta gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgggtaa

120

cctgcccatc agagggggat aacattcgga aacggatgct aaaaccgcat aggtcttcga

180

accgcatggt ttgaagagga aaagaggcgc aagcttctgc tgatggatgg acccgcggtg

240

cattagctag ttggtgaggt aacggctcac caaggccgtg atgcatagcc gacctgagag

300

ggtgatcggc cacattggga ctgagacacg gcccaaactc ctacgggagg cagcagtagg

360

gaatcttccg caatggacgc aagtctgacg gagcaacgcc gcgtgagtga agaaggtttt

420

cggatcgtaa aactctgttg ttagagaaga acaagtgcta gagtaactgt tagcgccttg

480

acggtatcta accagaaagc cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg

540

tggcaagcgt tgtccggatt tattgggcgt aaagcgagcg caggcggttc cttaagtctg

600

atgtgaaagc ccccggctca accggggagg gtcattggaa actggggaac ttgagtgcag

660

aagaggagag tggaattcca tgtgtagcgg tgaaatgcgt agatatatgg aggaacacca

720

gtggcgaagg cgactctctg gtctgtaact gacgctgagg ctcgaaagcg tgggtagcaa

780

acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaagt gttggagggt

840

ttccgccctt cagtgctgca gttaacgcat taagcactcc gcctggggag tacgaccgca

900

aggttgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaagtc ttgacatcct ttgaccactc tagagataga

1020

gctttccctt cggggacaaa gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga

1080

gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttatta ctagttgcca gcattgagtt

1140

gggcactcta gtgagactgc cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaaatca

1200

tcatgcccct tatgacttgg gctacacacg tgctacaatg gatggtacaa cgagcagcga

1260

actcgcgagg gtaagcgaat ctcttaaagc cattctcagt tcggattgta ggctgcaact

1320

cgcctacatg aagccggaat cgctagtaat cgcggatcag cacgccgcgg tgaatacgtt

1380

cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt tgtaacaccc aaagtcggtg

1440

aggtaacctt ttggagccag ccgcctaagg tgggatagat gattggggtg aagtcgtaac

1500

aaggtagccg ta

1512

<210> 962

<211> 1445

<212> DNA

<213> Granulicatella sp. M658/99/3

<220>

<221> modified_base

<222> (73)..(73)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (180)..(180)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 962

acgctggcgg cgtgcctaat acatgcaagt cgaacgcagt ttcattcacc gagtgcttgc

60

actcaccgaa tgnactgagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgggtaacc tgcccatcag

120

tgggggataa cagtcggaaa cgactgctaa taccgcatga ttttcaacac cgcatggtgn

180

tgaaataaaa gacggctttg ctgtcgctga tggatggacc cgcggcgtat tagctagttg

240

gtgaggtaac ggctcaccaa ggcaatgata cgtagccggc ctgagagggt aatcggccac

300

attgggactg agacacggcc caaactccta cgggaggcag cagtagggaa tcttccgcaa

360

tggacgaaag tctgacggag caacgccgcg tgagtgaaga aggttttcgg atcgtaaaac

420

tctgttgtta gagaagaaca acctcttgag taactgtaag aggtctgacg gtatctaacc

480

agaaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg caagcgttgt

540

ccggatttat tgggcgtaaa gcgagtgcag gcggttcctt aagtctgatg tgaaagccca

600

cggcttaacc gtggagggtc attggaaact ggggaacttg agtgcagaag aggagagtgg

660

aattccatgt gtagcggtgg aatgcgtaga tatatggagg aacaccagtg gcgaaggcga

720

ctctctggtc tgtaactgac gctgaggctc gaaagcgtgg gtagcaaaca ggattagata

780

ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt gctaggtgtt ggagggtttc cgcccttcag

840

tgccgcagtt aacgcattaa gcactccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctgaaactca

900

aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg

960

aagaacctta ccaagtcttg acatcctttg accactctag agatagagct ttcccttcgg

1020

ggacaaagtg acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1080

gtcccgcaac gagcgcaacc cttatcatta gttgccagca ttcagttggg cactctagtg

1140

atactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcagca tgccccttat

1200

gacttgggct acacacgtgc tacaatggat ggtacaacga gcagcaaacc cgcgagggca

1260

agcgaatctc ttaaagccat tctcagttcg gattgttctc tgcaactcga gaacatgaag

1320

ccggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcac gccgcggtga atacgttccc gggtcttgta

1380

cacaccgccc gtcacaccac gagagtttgt aacacccaaa gtcggtgagg taacccttct

1440

gggag

1445

<210> 963

<211> 1510

<212> DNA

<213> Granulicatella sp. oral clone ASC02

<220>

<221> modified_base

<222> (743)..(743)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (902)..(902)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (998)..(998)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1013)..(1013)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 963

gagagtttga ttctggctca ggatgaacgc tgacagaatg cttaacacat gcaagtctac

60

ttgaacttcg gtttgggtgg cggacgggtg agtaacgcgt aaagaacttg cctcacagtt

120

agggacaaca tttggaaacg aatgctaata cctgatatta tgattttagg gcatcctaag

180

attatgaaag ctatatacgc tgtgagagag ctttgcgtcc cattagctag ttggagaggt

240

aacggctcac caaggcgatg atgggtagcc ggcctgagag ggtgaacggc cacaagggga

300

ctgagacacg gcccttactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgga caatggacca

360

aaagtctgat ccagcaattc tgtgtgcacg atgacgtttt tcggaatgta aagtgctttc

420

agttgggaag aaaaaaatga cggtaccaac agaagaagtg acggctaact acgtgccagc

480

agccgcggta atacgtatgt ggcaagcgtt gtccggattt attgggcgta aagcgagcgc

540

aggcggtcaa ttaagtctga tgtgaaagcc cccggctcaa ccggggaggg tcattggaaa

600

ctggttgact tgagtgcaga agaggagagt ggaattccat gtgtaagcgg tgaaatgcgt

660

agatatatgg aggaacacca gtggcgaagg cgactctctg gtctgtaact gaccgctgag

720

cgctcgaaag cgtgggtagc aanacaggat tagatacccc tggtagtcca cgccgtaaac

780

gatgagtgct aagtgttgga gggtttccgc ccttcagtgc tgcagttacc gcattaagca

840

ctccgcctgg ggagtacgac cgccaaggtt gaaactcaaa ggaattgagc ggggacccgc

900

ancaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaagtcttg

960

acatcctttg accactctag agatagagct ttcccttncg gggacaaagt gancaggtgg

1020

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

1080

cccttattac tagttgccag cattgagttg ggcactctag tgagactgcc ggtgacaaac

1140

cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgacttggg ctacacacgt

1200

gctacaatgg atggtacaac gagcagcgaa ctcgcgaggg taagcgaatc tcttaaagcc

1260

attctcagtt cggattgtag gctgcaactc gcctacatga agccggaatc gctagtaatc

1320

gcggatcagc acgccgcggt gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc

1380

acgagagttt gtaacaccca aagtcggtga ggtaacctta aggagccagc cgcctaaggt

1440

gggatagatg attggggtga agtcgtaaca aggtagccgt atcggaaggt gcggctggaa

1500

cacctccttc

1510

<210> 964

<211> 1327

<212> DNA

<213> Granulicatella sp. oral clone ASCA05

<220>

<221> modified_base

<222> (136)..(136)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (159)..(160)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (427)..(427)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (702)..(702)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 964

tggcggcgtg cctaatacat gcaagtcgaa cgagtggcga acgggtgagt aacacgtggg

60

taacctgccc atcagagggg gataacattc ggaaacggat gctaaaaccg catagggaaa

120

actgctgatg gatggntccg cggtgcatta gctagttgnn gaggtaacgg ctcaccaagg

180

cgatgatgca tagccgacct gagagggtga tcggccacat tgggactgag acacggccca

240

aactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttccgcaatg gacgcaagtc tgacggagcc

300

cgccgtttga gtgaagaagg atttcggttc gtaaaactct gttgttagag accatgacgg

360

tatctaacca gaaagccacg gctaactacg cgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc

420

aagcgtngtc cggatttatt gggcgtaaag cgagcgcagg cggtcaatta agtctgatgt

480

gaaagccccc ggctcaaccg gggagggtca ttggaaactg gttgacttga gtgcagaaga

540

ggagagtgga attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat atatggagga acaccagtgg

600

cgaaggcgac tctctggtct gactgacgct gaggctcgaa agcgtgggta gcaaacagga

660

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct anatgttgga gctacagtgc

720

tgcagttaac gcattaagca ctccgcctgg ggagtacgac cgcaaggttg aaactcaaag

780

gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag

840

aaccttacca agtcttgaca tcgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga

900

gatgttggtt aagtccgcaa cgagcgcaac ccttattact agttgccagc atgggcactc

960

tagtgagact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc

1020

cttatgactt gggctacaca cgtgctacaa tggatggcaa cgagcagcga actcgcgagg

1080

gtaagcgaat ctcttccatt ctcagttcgg atgtaggctg caactcgcct acagaagccg

1140

gaatcgctag taatcgcgga tcagcacgcc gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac

1200

accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac acccaaagtc ggtaggtagc cagccgccta

1260

aggtgggata gatgattggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct

1320

ggaacac

1327

<210> 965

<211> 1560

<212> DNA

<213> Granulicatella sp. oral clone ASCB09

<220>

<221> modified_base

<222> (887)..(887)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (907)..(907)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (993)..(993)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1055)..(1055)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 965

gagagtttga tcatggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaatacat gcaagtcgaa

60

cgagaagcga ccggtgcttg cactggtcaa tctagtggcg aacgggtgag taacacgtgg

120

gtaacctgcc catcagaggg ggataacatt cggaaacgga tgctaaaacc gcataggttc

180

tttagtcgca tgactgaaga aggaaaagag gcttcggctt ctgctgatgg atggacccgc

240

ggtgcattag ctagttggtg aggtaacggc tcaccaaggc gatgatgcat agccgacctg

300

agagggtgat cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg gaggcagcag

360

tagggaatct tccgcaatgg acgcaagtct gacggagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg

420

atttcggttc gtaaaacttc tgttgttaga gaagaacagc gcatagagta actgttatgc

480

gtgtgacggt atctaaccag aaagccacgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

540

gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc gagcgcaggc ggtcaattaa

600

gtctgatgtg aaagcccccg gctcaaccgg ggagggtcat tggaaactgg ttgacttgag

660

tgcagaagag gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tatggaggaa

720

caccagtggc gaaggcgact ctctggtctg taactgacgc tgaggctcga aagcgtgggt

780

agcaaacagg attagatacc cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaagtgttg

840

gagggtttcc gcccttcagt gctgcagtta acgcattaag cactccngcc tgggtgagta

900

cgaccgncaa ggttgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg

960

tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct tanccaagtc ttgacatcct ttgaccactc

1020

tagagataga gctttccctt cggggacaaa gtgancaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

1080

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcag caaaccacat tattactagt

1140

tgccagcatt gagttgggca ctctagcgag actgccaggt aacaaacccg gaggaaggtg

1200

gggatgacag tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatggc

1260

tggtacaacg agttgcaagt cggtgacggc aagctaatct cttaaagcca gtctcagttc

1320

ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg cggatcagca

1380

cgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagtttg

1440

taacacccga agtcggtgag gtaacctttt aggagccagc cgcctaaggt gggatagatg

1500

attggggtga agtcgtaaca aggtagccgt atcggaaggt gcggttggaa cacctccttc

1560

<210> 966

<211> 1331

<212> DNA

<213> Granulicatella sp. oral clone ASCG05

<220>

<221> modified_base

<222> (1154)..(1154)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 966

gcgtgcctaa tacatgcaag tcgaacgagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgggtaacc

60

tgcccatcag agggggataa cattcggaaa cggatgctaa aaccgcatag ggaaaactgc

120

tgatggatgg acccgcggtg cattagctag ttggtgaggt aacggctcac caaggccgtg

180

atgcatagcc gacctgagag ggtgatcggc cacattggga ctgagacacg gcccaaactc

240

ctacgggagg cagcagtagg gaatcttccg caatggacgc aagtctgacg gagcaacgcc

300

gcgtgagtga agaaggtttt cggatcgtaa aactctgttg ttagagaaga tgacggtatc

360

taaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta ggtggcaagc

420

gttgtccgga tttattgggc gtaaagcgag cgcaggcggt tccttaagtc tgatgtgaaa

480

gcccccggct caaccgggga gggtcattgg aaactgggga acttgagtgc agaagaggag

540

agtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat ggaggaacac cagtggcgaa

600

ggcgactctc tggtctgact gacgctgagg ctcgaaagcg tgggtagcaa acaggattag

660

ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaagt gttggagctt cagtgcttca

720

gttaacgcat taagcactcc gcctggggag tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat

780

tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc

840

ttaccaagtc ttgacatcga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

900

ttgggttaag tcccgcggcg agcgcaaccc ttattactag ttgccagcat gggcactcta

960

gtgagactgc cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct

1020

tatgacttgg gctacacacg tgctacaatg gatggcaacg agcagcgaac tcgcgagggt

1080

aagcgaatct cttccattct cagttcggat gtaggctgca actcgcctac agaagccgga

1140

atcgctagta atcncggatc agcacgccgc ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac

1200

cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccaaagtcgg taggtagcca gccgcctaag

1260

gtgggataga tgattggggt gaagtcgtaa caaggtagcc gtatcggaag gtgcggctgg

1320

aacacctcct t

1331

<210> 967

<211> 1488

<212> DNA

<213> Grimontia hollisae

<400> 967

ctaattgaag agtttgatca tggctcagat tgaacgctgg cggcaggcct aacacatgca

60

agtcgagcgg cagcgacatg aacaatcctt cgggtgcgtt catgggcggc gagcggcgga

120

cgggtgagta aaggctggga acctgccctg acgaggggga taaccactgg aaacggtggc

180

taataccgca taatgtcttc ggaccaaaga gggggacttt cgggcctctc gcgtcaggat

240

gggcccagtt gggattagct ggttggtggg gtaaaggctc accaaggcga cgatccctag

300

ctggtttgag aggatgatca gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga

360

ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagccatg ccgcgtgtgt

420

gaagaaggcc ttcgggttgt aaagcacttt cagccgtgag gaaggtagcg tagttaatac

480

ctgcgttact tgacgttagc ggcagaagaa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg

540

gtaatacgga gggtgcgagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgca tgcaggcggt

600

ctgttaagca agatgtgaaa gccccgggct taacctggga gtggcatttt gaactggcag

660

gctagagtct tgtagagggg ggtagaattt caggtgtagc ggtgaaatgc gtagagatct

720

gaaggaatac cggtggcgaa ggcggccccc tggacaaaga ctgacgctca gatgcgaaag

780

cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ctgtaaacga tgtctacttg

840

gaggctgtgg tctagaaccg tggctttcgg agctaacgcg ttaagtagac cgcctgggga

900

gtacggtcgc aagattaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca

960

tgtggtttaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctact cttgacatcc tcagaagccg

1020

gaagagattc tggtgtgcct tcgggaactg agagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc

1080

tcgtgttgtg aaatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc cttgtttgcc

1140

agcacttcgg gtgggaactc cagggagact gccggtgata aaccggagga aggtggggac

1200

gacgtcaagt catcatggcc cttacgagta gggctacaca cgtgctacaa tggtgcatac

1260

agagggcagc gagaccgcga ggtggagcga atcccagaaa gtgcatcgta gtccggattg

1320

gagtctgcaa ctcgactcca tgaagtcgga atcgctagta atcgtggatc agaatgccac

1380

ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggctgcac

1440

cagaagtaga tagcttaacc ttcgggaggg cgtttaccac ggtgtggt

1488

<210> 968

<211> 1425

<212> DNA

<213> Haematobacter sp. BC14248

<400> 968

cgaacgctgg cggcaggcct aacacatgca agtcgagcgg ggacttcggt cctagcggcg

60

gacgggtgag taacgcgtgg gaacgtgccc tttgcttcgg aatagccccg ggaaactggg

120

agtaataccg gatgagccct ttgggggaaa gatttatcgg cgaaggatcg gcccgcgttg

180

gattaggtag ttggtggggt aatggcctac caagccgacg atccatagct ggtttgagag

240

gatgatcagc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg

300

gaatcttaga caatggggga aaccctgatc tagccatgcc gcgtgagcga tgaaggcctt

360

agggttgtaa agctctttca ccggggaaga taatgacggt acccggagaa gaagccccgg

420

ctaactccgt gctagcagcc gcggtaatac ggagggggct agcgttgttc ggaattactg

480

ggcgtaaagc gcacgtaggc ggatcggtaa gtcagaggtg aaatcccggg gctcaacccc

540

ggaactgcct ttgaaactcc cggtcttgag gtcgagagag gtgagtggaa ttccgagtgt

600

agaggtgaaa ttcgtagata ttcggaggaa caccagtggc gaaggcggct cactggctcg

660

atactgacgc tgaggtgcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

720

acgccgtaaa cgatgaatgc cagtcgtcgg gtagcatgct attcggtgac acacctaacg

780

gattaagcat tccgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa aactcaaagg aattgacggg

840

ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgcaga accttaccaa

900

cccttgacat gggcgtcgcg ggaccagaga tggttctttc agttcggctg gacgccacac

960

aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tcggttaagt ccggcaacga

1020

gcgcaaccca cactcccagt tgccatcatt cagttgggca ctctgggaga actgccgatg

1080

ataagtcgga ggaaggtgtg gatgacgtca agtcctcatg gcccttacgg gttgggctac

1140

acacgtgcta caatggtggt gacaatgggt taatccccaa aagccatctc agttcggatt

1200

ggggtctgca actcgacccc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcgtaa cagcatgacg

1260

cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga attgggtcta

1320

cccgacgacg gtgcgccaac ctcgcaagag gaagcagccg gccacggtag gctcagtgac

1380

tggggggaag tcgtaacaag gtggccgtag gggaacctgc ggttg

1425

<210> 969

<211> 1543

<212> DNA

<213> Haemophilus aegyptius

<400> 969

ttgaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgaacg gtagcaggag aaagcttgct ttcttgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgcttggg aatctggctt atggaggggg ataacgacgg gaaactgtcg ctaataccgc

180

gtagtgtcga gagacgaaag tgcgggactg agaggccgca tgccatagga tgagcccaag

240

tgggattagg tagttggtgg ggtaaaggtc taccaagcct gcgatctcta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcgcaatggg gggaaccctg acgcagccat gccgcgtgaa tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagttctt tcggtattga ggaaggttga tgtgttaata gcacatcaaa

480

ttgacgttaa atacagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcgag cgttaatcgg aataactggg cgtaaagggc acgcaggcgg ttatttaagt

600

gaggtgtgaa agccctgggc ttaacctagg aattgcattt cagactgggt aactagagta

660

ctttagggag gggtagaatt ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaata

720

ccgaaggcga aggcagcccc ttgggaatgt actgacgctc atgtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg ctgtcgattt gggggttggg

840

gtttaactct ggcgcccgta gctaacgtga taaatcgacc gcctggggag tacggccgca

900

aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctactc ttgacatcct aagaagagct cagagatgag

1020

cttgtgcctt cgggaactta gagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgttgtga

1080

aatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttatcc tttgttgcca gcgacttggt

1140

cgggaactca aaggagactg ccagtgataa actggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

atcatggccc ttacgagtag ggctacacac gtgctacaat ggcgtataca gagggaagcg

1260

aagctgcgag gtggagcgaa tctcataaag tacgtctaag tccggattgg agtctgcaac

1320

tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcgaatca gaatgtcgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgtacc agaagtagat

1440

agcttaacct tttggagggc gtttaccacg gtatgattca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtaacc gtaggggaac ctgcggttgg atcacctcct tac

1543

<210> 970

<211> 1544

<212> DNA

<213> Haemophilus ducreyi

<400> 970

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgaacg gtagcacgaa ggggcttgct ccttgggtga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgcttggg aatctggctt atggaggggg ataactacgg gaaactgtag ctaataccgc

180

gtaatatctt cggattaaag ggtgggacct tcgggccacc tgccataaga tgagcccaag

240

tgggattagg tagttggtta ggtaaaggct gaccaagccg acgatctcta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg ggaaaccctg atgcagccat gccgcgtgaa tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagttctt tcggtgatga ggaaggcagt tttgttaata gcaaaattga

480

ttgacgttag tcacagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcgag cgttaatcgg aataactggg cgtaaagggc acgcaggcgg ttgattaagt

600

gagatgtgaa agccccgggc ttaacctggg aattgcattt catactggtc aactagagta

660

ctttagggag gggtagaatt ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaata

720

ccgaaggcga aggcagcccc ttgggaatat actgacgctc atgtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg atgtcgattt gggggttggt

840

ctttaagact ggcgcccgaa gctaacgtga taaatcgacc gcctggggag tacggccgca

900

aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctactc ttgacatcca tagaagaact cagagatgag

1020

tttgtgcctt cgggaactat gtgacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgttgtga

1080

aatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttatcc tttgttgcca gcatgtagtg

1140

atgggaactc aaaggagact gccagtgata aactggagga aggtggggat gacgtcaagt

1200

catcatggcc cttacgagta gggctacaca cgtgctacaa tggcgtatac agagggcggc

1260

aaacctgcaa aggggagcga atctcacaaa gtacgtctaa gtccggattg gagtctgcaa

1320

ctcgactcca tgaagtcgga atcgctagta atcgcaaatc agaatgttgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggttgtac cagaagtaga

1440

tagcttaacc ttcgggaggg cgtttaccac ggtatgattc atgactgggg tgaagtcgta

1500

acaaggtaac cgtaggggaa cctgcggttg gatcacctcc ttac

1544

<210> 971

<211> 1281

<212> DNA

<213> Haemophilus genomosp. P2 oral clone MB3_C24

<400> 971

caggcttaac acatgcaagt cgaacgagtg gcggacgggt gagtaatgct tgggaatctg

60

gcttatggag ggggataacg acgggaaact atcgctaata ccgcgtagtg aaagatgcca

120

taggatgagc ccaagtggga ttaggtagtt ggtggggtaa aggcctacca agccgacgat

180

ctctagctgg tctgagagga tgaccagcca caccgggact gagacacggc ccggactcct

240

acgggaggca gcagtgggga atattgcgca atgggggcaa ccctgacgca gccatgccgc

300

gtgaatgaag aaggccttcg ggttgtaaag ttctttcggt gacgaggatg acgttaatca

360

cagaagaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg atgcgagcgt

420

taatcggaat aactgggcgt aaagggcacg caggcggcta tttaagtgag gtgtgaaatc

480

cccgggctta acctgggaat tgcatttcag actgggtagc tagagtactt tagggagggg

540

tagaattcca cgtgtagcgg tgaaatgcgt agagatgtgg aggaataccg aaggcgaagg

600

cagccccttg ggaatactga cgctcatgtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

660

accctggtag tccacgctgt aaacgctgtc gatttgggga ttgggcttgg tgcccgaagc

720

taacgtgata aatcgaccgc ctggggagta cggccgcaac gttaaaactc aaatgaattg

780

acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gatgcaacgc gaagaacctt

840

acctactctt gacatcgaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtt gtgaaatgtt

900

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt atcctttgtt gccagcgatc gggaactcaa

960

aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca tcatggccct

1020

tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcgtacagag ggcgacgaag ccgcgaggtg

1080

gagtgaatct cactacgtct aagtccggat ggagtctgca actcgactcc agaagtcgga

1140

atcgctagta atcgcgaatc agaatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1200

cgcccgtcac accatgggag tgggttgtac cagaagtaga tgcttagggc gtttaccacg

1260

gtatgattca tgactggggt g

1281

<210> 972

<211> 1296

<212> DNA

<213> Haemophilus genomosp. P3 oral clone MB3_C38

<400> 972

attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgga cgggtgagta

60

atgcttggga atctggctta tggaggggga taacgacggg aaactgtcgc taataccgcg

120

tagagaaaga tgccatagga tgagcccaag tgggattagg tagttggtgg ggtaatagcc

180

taccaagccg acgatctcta gctggtctga gaggatgacc agccacaccg ggactgagac

240

acggcccgga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcgcaatggg ggcaaccctg

300

acgcagccat gccgcgtgaa tgaagaaggc cttcgggttg taaagttctt tcggtattga

360

ggatgacgtt aaatacagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac

420

ggagggtgcg agcgttaatc ggaataactg ggcgtaaagg gcacgcaggc ggacttttaa

480

gtgaggtgtg aaatccccgg gcttaacctg ggaattgcat ttcagactgg gagtctagag

540

tactttaggg aggggtagaa ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa

600

taccgaaggc gaaggcagcc ccttgggaat actgacgctc atgtgcgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg ctgtcgattt ggggattggg

720

cttggtgccc gaagctaacg tgataaatcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

780

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

840

aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat cgacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgttgtgaa atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcct ttgttgccag

960

cgatcgggaa ctcaaaggag actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

agtcatcatg gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggcgta cagagggcga

1080

cgaagccgcg aggtggagtg aatctcacta cgtctaagtc cggatggagt ctgcaactcg

1140

actccagaag tcggaatcgc tagtaatcgc gaatcagaat gtcgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tgtaccagaa gtagatgctt

1260

agggcgttta ccacggtatg attcatgact ggggtg

1296

<210> 973

<211> 1486

<212> DNA

<213> Haemophilus haemolyticus

<400> 973

gctcagattg aacgctggcg gcaggcttaa cacatgcaag tcgaacggta gcaggagaaa

60

gcttgctttc ttgctgacga gtggcggacg ggtgagtaat gcttgggaat ctggcttatg

120

gagggggata actacgggaa actgtagcta ataccgcgta gtgtcgagag acgaaagtgc

180

gggaccgcaa ggccgcatgc catgagatga gcccaagtgg gattaggtag ttggtggggt

240

aaaggcctac caagcctgcg atctctagct ggtctgagag gatggccagc cacactggaa

300

ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgcg caatgggggg

360

aaccctgacg cagccatgcc gcgtgaatga agaaggcctt cgggttgtaa agttctttcg

420

gtattgagga aggagtgtat gttaatagca tacattattg acgttaaata cagaagaagc

480

accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg gtgcgagcgt taatcggaat

540

aactgggcgt aaagggcacg caggcggtta tttaagtgag gtgtgaaagc cccgggctta

600

acctgggaat tgcatttcag actgggtaac tagagtactt tagggagggg tagaattcca

660

cgtgtagcgg tgaaatgcgt agagatgtgg aggaataccg aaggcgaagg cagccccttg

720

ggaatgtact gacgctcatg tgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt

780

agtccacgct gtaaacgctg tcgatttggg gattgggctt aaagcttggt gcccgtagct

840

aacgtgataa atcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg ttaaaactca aatgaattga

900

cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg atgcaacgcg aagaacctta

960

cctactcttg acatccatgg aattctgtag agatacggga gtgccttcgg gaaccatgag

1020

acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gttgtgaaat gttgggttaa gtcccgcaac

1080

gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg attcggtcgg gaactcaaag gagactgcca

1140

gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atggccctta cgagtagggc

1200

tacacacgtg ctacaatggc gtatacagag ggtggcgaaa ctgcgaggtg gagcgaatct

1260

cagaaagtac gtctaagtcc ggattggagt ctgcaactcg actccatgaa gtcggaatcg

1320

ctagtaatcg cgaatcagaa tgtcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1380

cgtcacacca tgggagtggg ttgtaccaga agtagatagc ttaaccgcaa ggggggcgtt

1440

taccacggta tgattcatga ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtaac

1486

<210> 974

<211> 1544

<212> DNA

<213> Haemophilus influenzae

<400> 974

ttgaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgaacg gtagcaggag aaagcttgct ttcttgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgcttggg aatctggctt atggaggggg ataacgacgg gaaactgtcg ctaataccgc

180

gtattatcgg aagatgaaag tgcgggactg agaggccgca tgccatagga tgagcccaag

240

tgggattagg tagttggtgg ggtaaatgcc taccaagcct gcgatctcta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcgcaatggg gggaaccctg acgcagccat gccgcgtgaa tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagttctt tcggtattga ggaaggttga tgtgttaata gcacatcaaa

480

ttgacgttaa atacagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcgag cgttaatcgg aataactggg cgtaaagggc acgcaggcgg ttatttaagt

600

gaggtgtgaa agccctgggc ttaacctagg aattgcattt cagactgggt aactagagta

660

ctttagggag gggtagaatt ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaata

720

ccgaaggcga aggcagcccc ttgggaatgt actgacgctc atgtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg ctgtcgattt ggggattggg

840

cttagagctt ggtgcccgta gctaacgtga taaatcgacc gcctggggag tacggccgca

900

aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctactc ttgacatcct aagaagagct cagagatgag

1020

cttgtgcctt cgggaactta gagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgttgtga

1080

aatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttatcc tttgttgcca gcgacttggt

1140

cgggaactca aaggagactg ccagtgataa actggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

atcatggccc ttacgagtag ggctacacac gtgctacaat ggcgtataca gagggaagcg

1260

aagctgcgag gtggagcgaa tctcataaag tacgtctaag tccggattgg agtctgcaac

1320

tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcgaatca gaatgtcgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgtacc agaagtagat

1440

agcttaacct tttggagggc gtttaccacg gtatgattca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtaacc gtaggggaac ctgcggttgg atcacctcct tact

1544

<210> 975

<211> 1424

<212> DNA

<213> Haemophilus parahaemolyticus

<400> 975

cccaatgcaa gtcgaacggt aacagggatt agcttgctaa tttgctgacg agtggcggac

60

gggtgagtaa tgcttgggaa tctggcttat ggagggggat aactacggga aactgtagct

120

aataccgcgt aaaatcttcg gattaaaggg tgggactttc gggccacctg ccataagatg

180

agcccaagtg ggattaggta gttggttagg taaaggctga ccaagccgac gatctctagc

240

tggtctgaga ggatgaccag ccacactgga actgagacac ggtccagact cctacgggag

300

gcagcagtgg ggaatattgc acaatggggg gaaccctgat gcagccatgc cgcgtgaatg

360

aagaaggcct tcgggttgta aagttctttc ggtgacgagg aaggttgata ggttaatagc

420

ctatcaaatt gacgttaatc acagaagaag caccggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg

480

taatacgggg ggtgcgagcg ttaatcggaa taactgggcg taaagggcac gcaggcggtg

540

acttaagtga gatgtgaaag ccccgggctt aacctgggaa ttgcatttca tactgggtcg

600

ctagagtact ttagggaggg gtagaattcc acgtgtagcg gtgaaatgcg tagagatgtg

660

gaggaatacc gaaggcgaag gcagcccctt gggaatgtac tgacgctcat gtgcgaaagc

720

gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc tgtaaacgat gtcgatttgg

780

ggattgggct ttgagcttgg tgcccgtagc taacgtgata aatcgaccgc ctggggagta

840

cggccgcaag gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt

900

ggtttaattc gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccatg gaatcttgta

960

gagatacgag agtgccttcg ggaaccatga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg

1020

tgttgtgaaa tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt tgttgccagc

1080

gattaggtcg ggaactcaaa ggagactgcc agtgataaac tggaggaagg tggggatgac

1140

gtcaagtcat catggccctt acgagtaggg ctacacacgt gctacaatgg cgtatacaga

1200

gggaagcgag cctgcgaggg ggagcaaatc tcagaaagta cgtctaagtc cggattggag

1260

tctgcaactc gactccatga agtcggaatc gctagtaatc gcgaatcaga atgtcgcggt

1320

gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtgg gttgtaccag

1380

aagtagatag cttaaccttc gggagggcgt tacccacggt agat

1424

<210> 976

<211> 1543

<212> DNA

<213> Haemophilus parainfluenzae

<400> 976

ttgaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacatgaa gaagcttgct tctttgatga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgcttggg aatctagctt atggaggggg ataactacgg gaaactgtag ctaataccgc

180

gtagtatcgg aagatgaaag tgtgggacct tcgggccaca tgccatagga tgagcccaag

240

tgggattagg tagttggtga ggtaaaggct caccaagccg acgatctcta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcgcaatggg ggcaaccctg acgcagccat gccgcgtgaa tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagttctt tcggtagcga ggaaggcatt tagtttaata gactaggtga

480

ttgacgttaa ctacagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcgag cgttaatcgg aataactggg cgtaaagggc acgcaggcgg tgacttaagt

600

gaggtgtgaa agccccgggc ttaacctggg aattgcattt catactgggt cgctagagta

660

ctttagggag gggtagaatt ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaata

720

ccgaaggcga aggcagcccc ttgggaatgt actgacgctc atgtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg atgtcgattt gggggttgag

840

ctttaagctt ggcgcccgta gctaacgtga taaatcgacc gcctggggag tacggccgca

900

aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctactc ttgacatcca gagaacattc cagagatgga

1020

ttggtgcctt cgggaactct gagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgttgtga

1080

aatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttatcc tttgttgcca gcgattcggt

1140

cgggaactca aaggagactg ccggtgataa accggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

atcatggccc ttacgagtag ggctacacac gtgctacaat ggcgtataca gagggaagcg

1260

agagtgcgag ctggagcgaa tctcacaaag tacgtctaag tccggattgg agtctgcaac

1320

tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcaaatca gaatgttgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgtacc agaagtagat

1440

agcttaacct tcgggggggc gtttaccacg gtatgattca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtaacc gtaggggaac ctgcggttgg atcacctcct tac

1543

<210> 977

<211> 1471

<212> DNA

<213> Haemophilus paraphrophaemolyticus

<220>

<221> modified_base

<222> (16)..(16)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (29)..(29)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (50)..(50)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (81)..(81)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (85)..(85)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (132)..(132)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (366)..(366)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (368)..(368)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (478)..(478)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (488)..(488)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (497)..(497)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (499)..(500)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (505)..(505)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (624)..(624)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (653)..(653)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (666)..(666)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (785)..(785)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (838)..(838)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (959)..(959)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1084)..(1084)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1161)..(1161)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1262)..(1262)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1452)..(1452)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 977

tgaagagttt gatcanggct cagattganc gctggcggca ggcttaacan atgcaagtcg

60

aacggtaaca gggattagct ngctnattgc tgacgagtgg cggacgggtg agtaatgctt

120

gggaatctgg cntatggagg gggataacta cgggaaactg tagctaatac cgcgtaatat

180

cggaagatta aagggtggga ctttcgggcc acctgccata agatgagccc aagtgggatt

240

aggtagttgg ttaggtaaag gctgaccaag ccgacgatct ctagctggtc tgagaggatg

300

accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

360

attgcncnat ggggggaacc ctgatgcagc catgccgcgt gaatgaagaa ggccttcggg

420

ttgtaaagtt ctttcggtga cgaggaaggt tgataggtta atagcctatc aaattgangt

480

taattacnga agaagcncnn gctanctccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc

540

gagcgttaat cggaataact gggcgtaaag ggcacgcagg cggtgactta agtgagatgt

600

gaaagccccg ggcttaacct gggnattgca tttcatactg ggtcgctaga gtnctttagg

660

gagggntaga attccacgtg tagcggtgaa atgcgtagag atgtggagga ataccgaagg

720

cgaaggcagc cccttgggaa tgtactgacg ctcatgtgcg aaagcgtggg gagcaaacag

780

gattngatac cctggtagtc cacgctgtaa acgatgtcga tttggggatt gggctttnag

840

cttggtgccc gtagctaacg tgataaatcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

900

aactcaaatg aattgacggg ggccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgna

960

acgcgaagaa ccttacctac tcttgacatc catggaatct tgtagagata cgagagtgcc

1020

ttcgggaacc atgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt gaaatgttgg

1080

gttnagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcggtttg gccgggaact

1140

caaaggagac tgccagtgat naactggagg aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatggc

1200

ccttacgagt agggctacac acgtgctaca atggcgtata cagagggaag caatcctgcg

1260

anggggagca aatctcagaa agtacgtcta agtccggatt ggagtctgca actcgactcc

1320

atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcgaat cagaatgtcg cggtgaatac gttcccgggc

1380

cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgta ccagaagtag atagcttaac

1440

cgcaaggggg gngtttacca cggtatgatt c

1471

<210> 978

<211> 1394

<212> DNA

<213> Haemophilus parasuis

<400> 978

taacacatgc aagtcgaacg gtagcaggaa gaagcttgct tctttgctga cgagtggcgg

60

acgggtgagt aatgcttggg aatctggctt atggaggggg ataactacgg gaaactgtag

120

ctaataccgc gtagtatctt cagatgaaag ggtgggaccg caaggccagt tgccataaga

180

tgagcccaag tgggattagg tagttggtgg ggtaaaggcc taccaagccg acgatctcta

240

gctggtctga gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg

300

aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg gggaaccctg atgcagccat gccgcgtgaa

360

tgaagaaggc cttcgggttg taaagttctt tcggtgatga ggaagggtag tgttttaata

420

gaacattaca ttgacgttag tcacagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc

480

ggtaatacgg agggtgcgag cgttaatcgg aatgactggg cgtaaagggc acgcaggcgg

540

tgacttaagt gagatgtgaa agccccgagc ttaacttggg aattgcattt catactgggt

600

tgctagagta ttttagggag gggtagaatt ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg

660

tggaggaata ccgaaggcga aggcagcccc ttgggaaaat actgacgctc atgtgcgaaa

720

gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg ctgtcgattt

780

ggggattggg cttagagctt ggtgcccgta gctaacgtga taaatcgacc gcctggggag

840

tacggccgca aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat

900

gtggtttaat tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctactc ttgacatcct aagaagaact

960

cagagatgag tttgtgcctt cgggaactta gagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct

1020

cgtgttgtga aatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttatcc tttgttgcca

1080

gcgattcggt cgggaactca aaggagactg ccagtgataa actggaggaa ggtggggatg

1140

acgtcaagtc atcatggccc ttacgagtag ggctacacac gtgctacaat ggtgcataca

1200

gagggtgacg aagccgcgag gtggagtgaa tctcagaaag tgcatctaag tccggattgg

1260

agtctgcaac tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcgaatca gaatgtcgcg

1320

gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgtacc

1380

agaagtagat agct

1394

<210> 979

<211> 1543

<212> DNA

<213> Haemophilus somnus

<400> 979

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacgggga gggagattac tttctctgct gacgagtggc ggacgggtga

120

gtaaagcttg ggaatctggc gaatggaggg ggatagccac gggaaactgt gggtaatacc

180

gcgtaatgtc taaggaccaa aggggtggga ctgagaggcc acctgccatt tgatgagccc

240

aagtgggatt aggtagttgg tgaggtaagg gctcaccaag ctgacgatct ctagctggtc

300

tgagaggatg gccagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc

360

agtggggaat attgcgcaat ggggggaacc ctgacgcagc catgccgcgt gaatgaagaa

420

ggccttcggg ttgtaaagtt ctttcggtga tgaggaaggc gattagttta agagattaat

480

tgattgacga taatcacaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata

540

cggagggtgc gagcgttaat cggaatgact gggcgtaaag ggcacgcagg tggtgactta

600

agtgaggtgt gaaatccccg ggcttaacct gggaacagca tttcagactg ggtgactaga

660

gtactttagg gaggggtaga attccacgtg tagcggtgaa atgcgtagag atgtggagga

720

ataccgaagg cgaaggcagc cccttgggaa gatactgacg ctcgagtgcg aaagcgtggg

780

gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgctgtaa acgatgtcga tttggggatt

840

gggtgaacac ttggtgcccg aagctaacgt gataaatcga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctac tcttgacatc ctaagaagcc gccagagatg

1020

gtggtgtgcc tacgggagct tagagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcatgtta

1140

gggtgggaac tcaaaggaga ctgccggtga taaactggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1200

gtcatcatgg cccttacgag tagggctaca cacgtgctac aatggcgtat acagagggag

1260

gcgagcctgc gagggtaagc gaagctcaga aagtacgtct aagtccggat tggagtctgg

1320

aactcgactc catgaagtcg gaatcgctag taatcgcgga tcagaatgtc gcggtgaata

1380

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggttgt accagaagta

1440

gatagcttaa cgaaaggggg cgtttaccac ggtatggttc atgactgggg tgaagtcgta

1500

acaaggtaac cgtaggggaa cctgcggttg gatcacctcc tta

1543

<210> 980

<211> 1393

<212> DNA

<213> Haemophilus sp. 70334

<400> 980

gcaagtcgaa cggtagcagg agaaagcttg ctttcttgct gacgagtggc ggacgggtga

60

gtaatgcttg ggaatctggc ttatggaggg ggataactac gggaaactgt agctaatacc

120

gcgtaatatc gaaagattaa agtgtgggac cttcgggcca catgccatgg gatgagccca

180

agtgggatta ggtagttggt ggggtaaagg cctaccaagc ctgcgatctc tagctggtct

240

gagaggatgg ccagccacac tggaactgag acacggtcca gactcctacg ggaggcagca

300

gtggggaata ttgcgcaatg gggggaaccc tgacgcagcc atgccgcgtg aatgaagaag

360

gccttcgggt tgtaaagttc tttcggtatt gaggaaggtt gatgtgttaa tagtacatct

420

tattgacgtt aaatacagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac

480

ggagggtgcg agcgttaatc ggaataactg ggcgtaaagg gcacgcaggc ggttatttaa

540

gtgaggtgtg aaagccccgg gcttaacctg ggaattgcat ttcagactgg gtaactagag

600

tactttaggg aggggtagaa ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa

660

taccgaaggc gaaggcagcc ccttgggaat gtactgacgc tcatgtgcga aagcgtgggg

720

agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgctgtaaa cgctgtcgat ttggggattg

780

ggcttagagc ttggtgcccg tagctaacgt gataaatcga ccgcctgggg agtacggccg

840

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

900

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctac tcttgacatc cagagaactt tccagagatg

960

gattggtgcc ttcgggaact ctgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1020

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcgatttg

1080

gtcgggaact caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1140

tcatcatggc ccttacgagt agggctacac acgtgctaca atggcgtata cagagggtgg

1200

cgaaactgcg aggtggagcg aatctcagaa agtacgtcta agtccggatt ggagtctgca

1260

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcgaat cagaatgtcg cggtgaatac

1320

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgta ccagaagtag

1380

atagcttaac cgc

1393

<210> 981

<211> 1513

<212> DNA

<213> Haemophilus sp. HK445

<400> 981

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggtaacaggr gaaagcttgc tttcttgctg acgagtggcg gacgggtgag taatgcttgg

120

gaatctggct tacggagggg gataactgcg ggaaactgca gctaataccg cgtaatatct

180

taggattaaa gggggcrttt gctccagccg tgagatgagc ccaagtggga ttaggtagtt

240

ggtgaggtaa tggctcacca agcctgcgat ctctagctgg tctgagagga tggccagcca

300

caccgggact gagacacggc ccggactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcgca

360

atggggggaa ccctgacgca gccatgccgc gtgaatgaag aaggccttcg ggttgtaaag

420

ttctttcggt gacgaggaag gtacttaggt taatacccta agyaattgac gttaatcaca

480

gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggt gcgagcgtta

540

atcggaataa ctgggcgtaa agggcacgca ggcggatttt taagtgaggt gtgaaagccc

600

ckggcttaac ctgggaattg catttcagac tgggaatcta gagtacttta gggaggggta

660

gaattccacg tgtagcggtg aaatgcgtag agatgtggag gaataccgaa ggcgaaggca

720

gccccttggg aatgtactga cgctcatgtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

780

accctggtag tccacgctgt aaacgctgtc gatttggggg ttgggcttta agcttggcgc

840

ccgtagctaa cgtgataaat cgaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa

900

tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gcaacgcgaa

960

gaaccttacc tactcttgac atccagagaa gagactagag atagtcttgt gccttcggga

1020

gctttgagac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt tgtgaaatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaaccct tatcctttgt tgccagcgat taggtcggga actcaaagga

1140

gactgccggt gataaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat ggcccttacg

1200

agtagggcta cacacgtgct acaatggcgt atacagaggg aagcgaagca gcgatgtgga

1260

gcgaatctca taaagtgcgt ctaagtccgg attggagtct gcaactcgac tccatgaagt

1320

cggaatcgct agtaatcgcg aatcagaatg tcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac

1380

acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gtaccagaag tagatagctt aaccttcggg

1440

ggggcgttta ccacggtatg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg taaccgtagg

1500

ggaacctgcg gct

1513

<210> 982

<211> 1361

<212> DNA

<213> Haemophilus sp. oral clone ASCA07

<220>

<221> modified_base

<222> (1337)..(1337)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 982

gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcggac gggtgagtaa tgcttgggaa tctggcttat ggagggggat aactacggga

120

aactgtagct aataccgcgt agtgaaagat gccatgagat gagcccaagt gggattaggt

180

agttggtggg gtaaaggcct accaagcctg cgatctctag ctggtctgag aggatggcca

240

gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

300

cgcaatgggg ggaaccctga cgcagccatg ccgcgtgaat gaagaaggcc ttcgggttgt

360

aaagttcttt cggtattgag gatgacgtta aatacagaag aagcaccggc taactccgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcga gcgttaatcg gaataactgg gcgtaaaggg

480

cacgcaggcg gttatttaag tgaggtgtga aagcccccgg cttaacctgg gaattgcatt

540

tcagacggga taactagagt actttaggga ggggtagaat cccacgtgta gcggtgaaat

600

gcgtagagat gtggaggaat acccggggcg aaggcagccc cttgggaata ctgacgctca

660

tgtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ctgtaaacgc

720

tgtcgatttg gggattgggc ttggtgcccg tagctaacgt gataaatcga ccgcctgggg

780

agtacggccg caaggttaaa actcaaatga attgaccggg gcccgcacaa gccgtggagc

840

atgtggttta attcgatgca acgcgaagaa ccttacctac tcttgacatc gacaggtgct

900

gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

cttatccttt gttgccagcg atcgggaact caaaggagac tgccgtgata aacggaggaa

1020

ggtgggatga cgtcaagtca tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg

1080

gcgtacagag ggtggcgaaa ctgcgaggtg gagcgaatct cagtacgtct aagtccggat

1140

ggagtctgca actcgactcc agaagtcgga atcgctagta atcgcgaatc agaatgtcgc

1200

ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggttgtac

1260

cagaagtaga tgcttagggc gtttaccacg gtatgattca tgactggggt gaagtcgtaa

1320

caaggtaacc gtagggnaac ctgcggctgg atcacctcct t

1361

<210> 983

<211> 1329

<212> DNA

<213> Haemophilus sp. oral clone ASCG06

<220>

<221> modified_base

<222> (579)..(579)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 983

gagtttgatt atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcgaac gggtgagtga tgcttgggaa tctggcttat ggagggggat aactacggga

120

aactgtagct aataccgcga ggtgaaagat gccatgggat gagcccaagt gggattaggt

180

agttggtggg gtaaaggcct accaagcctg cgatctctag ctggtctgag aggatggcca

240

gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

300

cgcaatgggg ggaaccctga cgcagccatg ccgcgtgaat gaagaagcct tcgggtgtaa

360

agttctttcg gtattgagga tgacgttaaa tacagaagaa gcaccggcta actccgtgcc

420

agcagccgcg gtaatacgga gggtgcgagc gttaatcgga ataactgggc gtaaagggca

480

cgcaggcggt tatttaagtg aggtgtgaaa gccccgggct taacctggga attgcatttc

540

agactgggta actagagtac tttagggagg ggtagaatnc cacgtgtagc ggtgaaatgc

600

gtagagatgt ggaggaatac cgaaggcgaa ggcagcccct tgggaatact gacgcacaag

660

tgccaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacgtgc

720

cgatttgggg attgggcttg gtccccgtag ctaacgtgat aatcgaccgc ctggggagta

780

cggccgcaag gttaaaaccc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt

840

ggtttaattc gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatcgaca ggtgctgcat

900

ggctgtcgtc agctcgtgtt gtgaaatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt

960

atcctttgtt gccagcgatc gggaactcaa aggagactgc cagtgataaa ctggaggaag

1020

gtggggatga cgtcaagtca tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg

1080

gcgtacagag ggtggcgaag ctgcgaggtg gagcgaatct cagtacgtct aagtccggat

1140

ggagtctgca actcgactcc agaagtcgga atcgctagta atcgcgaatc agaatgtcgc

1200

ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggttgtac

1260

cagaagtaga tgcttagggc gtttaccacg gtatgattca tgactggggt gaagtcgtaa

1320

caaggtaac

1329

<210> 984

<211> 1536

<212> DNA

<213> Haemophilus sp. oral clone BJ021

<400> 984

ttaagagttt gatcatggct cagattgaac gctggcggca ggcttaacac atgcaagtcg

60

aacggtaaca gggattagct tgctaatttg ctgacgagtg gcggacgggt gagtaatgct

120

tgggaatctg gcttatggag ggggataact acgggaaact gtagctaata ccgcgtaaaa

180

tcttcggatt aaagggtggg actttcgggc cacctgccat gagatgagcc caagtgggat

240

taggtagttg gttaggtaaa ggctgaccaa gccgacgatc tctagctggt ctgagaggat

300

gaccagccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

tattgcacaa tggggggaac cctgatgcag ccatgccgcg tgaatgaaga aggccttcgg

420

gttgtaaagt tctttcggtg acgaggaagg ttggtatgtt aatagcatat caaattgacg

480

ttaatcacag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggggggtg

540

cgagcgttaa tcggaataac tgggcgtaaa gggcacgcag gcggtgactt aagtgagatg

600

tgaaagcccc gggcttaacc tgggaattgc atttcatact gggtcgctag agtactttag

660

ggaggggtag aattccacgt gtagcggtga aatgcgtaga gatgtggagg aataccgaag

720

gcgaaggcag ccccttggga atgtactgac gctcatgtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca

780

ggattagata ccctggtagt ccacgctgta aacgatgtcg atttggggat tgggctttaa

840

gcttggtgcc cgtagctaac gtgataaatc gaccgcctgg ggagtacggc cgcaaggtta

900

aaactcaaat gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg

960

caacgcgaag aaccttacct actcttgaca tccatggaat cttgtagaga tacgagagtg

1020

ccttcgggaa ccatgagaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtt gtgaaatgtt

1080

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt atcctttgtt gccagcggtt aggccgggaa

1140

ctcaaaggag actgccagtg ataaactgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg

1200

gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggcgta tacagaggga agcaatcctg

1260

cgagggggag caaatctcag aaagtgcgtc taagtccgga ttggagtctg caactcgact

1320

ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcga atcagaatgt cgcggtgaat acgttcccgg

1380

gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttg taccagaagt agatagctta

1440

accgcaaggg gggcgtttac cacggtatga ttcatgactg gggtgaagtc gtaacaaggt

1500

aaccgtaggg gaacctgcgg ctggaacacc tccttc

1536

<210> 985

<211> 1533

<212> DNA

<213> Haemophilus sp. oral clone BJ095

<400> 985

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggtagcagga gaaagcttgc tttcttgctg acgagtggcg gacgggtgag taatgcttgg

120

gaatctggct tatggagggg gataactacg ggaaactgca gctaataccg cgtagtatcg

180

gaagatgaaa gtgcgggacc gcaaggccgc atgccatgag atgagcccaa gtgggattag

240

gtagttggtg gggtaaaggc ctaccaagcc tgcgatctct agctggtctg agaggatggc

300

cagccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tgcgcaatgg ggggaaccct gacgcagcca tgccgcgtga atgaagaagg ccttcgggtt

420

gtaaagttct ttcggtattg aggaaggagt gtatgttaat agcatacatt attgacgtta

480

aatacagaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcga

540

gcgttaatcg gaataactgg gcgtaaaggg cacgcaggcg gttatttaag tgaggtgtga

600

aagccctggg cttaacctgg gaattgcatt tcagactggg taactagagt actttaggga

660

ggggtagaat tccacgtgta gcggtgaaat gcgtagagat gtggaggaat accgaaggcg

720

aaggcagccc cttgggaatg tactgacgct catgtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgctgtaaac gatgtcgatt tggggattgg gctttaagct

840

tggtgcccgt agctaacgtg ataaatcgac cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa

900

ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa

960

cgcgaaaaac cttacctact cttgacatcc atggaatcct gtagagatac gggagtgcct

1020

tcgggaacca tgagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgttgtg aaatgttggg

1080

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc ctttgttgcc agcgatccgg tcgggaactc

1140

aaaggagact gccagtgata aactggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc

1200

cttacgagta gggctacaca cgtgctacaa tggcgtatac agagggtggc gatgccgcga

1260

ggtggagcga atctcagaaa gtacgtctaa gtccggattg gagtctgcaa ctcgactcca

1320

tgaagtcgga atcgctagta atcgcgaatc agaatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggttgtac cagaagtaga cagcttaacc

1440

gcaagggggg cgtttaccac ggtatgattc atgactgggg tgaagtcgta acaaggtaac

1500

cgtargggaa cctgcggctg gatcacctcc ttc

1533

<210> 986

<211> 1364

<212> DNA

<213> Haemophilus sp. oral clone JM053

<400> 986

gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcggac gggtgagtaa tgcttgggaa tctggcttat ggagggggat aacgacggga

120

aactgtcgct aataccgcgt agagaaagat gccatgagat gagcccaagt gggattaggt

180

agttggtggg gtaaaggcct accaagccga cgatctctag ctggtctgag aggatgacca

240

gccacaccgg gactgagaca cggcccggac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

300

cgcaatgggg gcaaccctga cgcagccatg ccgcgtgaat gaagaaggcc ttcgggttgt

360

aaagttcttt cggtgacgag gatgacgtta atcacagaag aagcaccggc taactccgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcga gcgttaatcg gaataactgg gcgtaaaggg

480

cacgcaggcg gctatttaag tgaggtgtga aatccccggg cttaacctgg gaattgcatt

540

tcagactggg tagctagagt actttaggga ggggtagaat tccacgtgta gcggtgaaat

600

gcgtagagat gtggaggaat accgaaggcg aaggcagccc cttgggaata ctgacgctca

660

tgtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ctgtaaacgc

720

tgtcgatttg gggattgggc ttggtgcccg tagctaacgt gataaatcga ccgcctgggg

780

agtacggccg caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc

840

atgtggttta attcgatgca acgcgaagaa ccttacctac tcttgacatc gacaggtgct

900

gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccttatcctt tgttgccagc gatcgggaac tcaaaggaga ctgccggtga taaaccggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgg cccttacgag tagggctaca cacgtgctac

1080

aatggcgtac agagggtgac gaagccgcga ggtggagtga atctcagtac gtctaagtcc

1140

ggatggagtc tgcaactcga ctccagaagt cggaatccta gtaatcgcga atcagaatgt

1200

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttg

1260

taccagaagt agatgcttag ggcgtttacc acggtatgat tcatgactgg ggtgaagtcg

1320

taacaaggta accgtagggg aacctgcggt tggatcacct cctt

1364

<210> 987

<211> 1528

<212> DNA

<213> Haemophilus sp. oral taxon 851

<400> 987

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggtagcagga gaaagcttgc tttcttgctg acgagtggcg gacgggtgag taatgcttgg

120

gaatctggct tatggagggg gataactacg ggaaactgta gctaataccg cgtagtatcg

180

gaagatgaaa gtgcgggacc gcaaggccgc atgccatgag atgagcccaa gtgggattag

240

gtagttggtg gggtaaaggc ctaccaagcc tgcgatctct agctggtctg agaggatggc

300

cagccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tgcgcaatgg ggggaaccct gacgcagcca tgccgcgtga atgaagaagg ccttcgggtt

420

gtaaagttct ttcggtattg aggaaggttg atgtgttaat agtacatcaa attgacgtta

480

aatacagaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcga

540

gcgttaatcg gaataactgg gcgtaaaggg cacgcaggcg gttatttaag tgaggtgtga

600

aagccccggg cttaacctgg gaattgcatt tcagactggg taactagagt actttaggga

660

ggggtagaat tccacgtgta gcggtgaaat gcgtagagat gtggaggaat accgaaggcg

720

aaggcagccc cttgggaatg tactgacgct catgtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgctgtaaac gctgtcgatt tggggattgg gcttaaagct

840

tggtgcccgt agctaacgtg ataaatcgac cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa

900

ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa

960

cgcgaagaac cttacctact cttgacatcc agagaacttt ccagagatgg attggtgcct

1020

tcgggaactc tgagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgttgtg aaatgttggg

1080

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc ctttgttgcc agcgatttgg tcgggaactc

1140

aaaggagact gccagtgata aactggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc

1200

cttacgagta gggctacaca cgtgctacaa tggcgtatac agagggtggc gaagctgcga

1260

ggtggagcga atctcagaaa gtacgtctaa gtccggattg gagtctgcaa ctcgactcca

1320

tgaagtcgga atcgctagta atcgcgaatc agaatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggttgtac cagaagtaga tagcttaacc

1440

gcaagggggg cgtttaccac ggtatgattc atgactgggg tgaagtcgta acaaggtaac

1500

cgtaggggaa cctgcggttg gatcacct

1528

<210> 988

<211> 1522

<212> DNA

<213> Haemophilus sputorum

<400> 988

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggtaacagga agaaagcttg ctttctttgc tgacgagtgg cggacgggtg agtaatgctt

120

gggaatctgg cttatggagg gggataacta cgggaaactg tagctaatac cgcgtaatat

180

cgagagatta aagggtggga ccgcaaggcc acctgccatg agatgagccc aagtgggatt

240

aggtagttgg tgaggtaaag gctcaccaag ccgacgatct ctagctggtc tgagaggatg

300

accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

360

attgcacaat ggggggaacc ctgatgcagc catgccgcgt gaatgaagaa ggccttcggg

420

ttgtaaagtt ctttcggtag cgaggaaggc atttagttta atagactaga tgattgacgt

480

taactacaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggggggtgc

540

gagcgttaat cggaataact gggcgtaaag ggcacgcagg cggtgactta agtgagatgt

600

gaaagccccg ggcttaacct gggaattgca tttcatactg ggtcgctaga gtactttagg

660

gaggggtaga attccacgtg tagcggtgaa atgcgtagag atgtggagga ataccgaagg

720

cgaaggcagc cccttgggaa tgtactgacg ctcatgtgcg aaagcgtggg gagcaaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgctgtaa acgatgtcga tttgggggtt gggctttaag

840

cttggcgccc gtagctaacg tgataaatcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

900

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

960

aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat ccagagaact ttccagagat ggattggtgc

1020

cttcgggaac tctgagacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta tcctttgttg ccagcgatta ggtcgggaac

1140

tcaaaggaga ctgccggtga taaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgg

1200

cccttacgag tagggctaca cacgtgctac aatggcgtat acagagggaa gcaatcctgc

1260

gagggggagc aaatctcaca aagtacgtct aagtccggat tggagtctgc aactcgactc

1320

catgaagtcg gaatcgctag taatcgcaaa tcagaatgtt gcggtgaata cgttcccggg

1380

ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggttgt accagaagta gatagcttaa

1440

ccttcggggg ggcgtttacc acggtatgat tcatgactgg ggtgaagtcg taacaaggta

1500

accgtagggg aacctgcggt tg

1522

<210> 989

<211> 1421

<212> DNA

<213> Hafnia alvei

<220>

<221> modified_base

<222> (421)..(421)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (538)..(538)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1359)..(1359)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 989

catgcaagtc gagcggtagc acaagagagc ttgctctctg ggtgacgagc ggcggacggg

60

tgagtaatgt ctgggaaact gcctgatgga gggggataac tactggaaac ggtagctaat

120

accgcatgac gtcttcggac caaagtgggg gaccttcggg cctcacgcca tcagatgtgc

180

ccagatggga ttagctagta ggtggggtaa tggctcacct aggcgacgat ctctagctgg

240

tctgagagga tgaccagcca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca

300

gcagtgggga atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtatgaag

360

aaggccttcg ggttgtaaag tactttcagc gaggaggaag gcattaaggt taataacctt

420

ngtgattgac gttactcgca gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacggagggt gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggttngt

540

taagtcagat gtgaaatccc cgagcttaac ttgggaactg catttgaaac tggcaagcta

600

gagtcttgta gaggggggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag

660

gaataccggt ggcgaaggcg gccccctgga caaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg

720

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacgatgtc gacttggagg

780

ttgtgccctt gaggcgtggc ttccggagct aacgcgttaa gtcgaccgcc tggggagtac

840

ggccgcaagg ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg

900

gtttaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctactcttg acatccagag aatttgctag

960

agatagctta gtgccttcgg gaactctgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt

1020

gttgtgaaat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg

1080

agtcatgtcg ggaactcaaa ggagactgcc ggtgataaac cggaggaagg tggggatgac

1140

gtcaagtcat catggccctt acgagtaggg ctacacacgt gctacaatgg catatacaaa

1200

gagaagcgaa ctcgcgagag caagcggacc tcataaagta tgtcgtagtc cggattggag

1260

tctgcaactc gactccatga agtcggaatc gctagtaatc gtagatcaga atgctacggt

1320

gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacanc atgggagtgg gttgcaaaag

1380

aagtaggtag cttaaccttc gggagggcgc ttaccacttt g

1421

<210> 990

<211> 1533

<212> DNA

<213> Halomonas elongata

<400> 990

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc

60

ggaaacgatc ctagcttgct aggaggcgtc gagcggcgga cgggtgagta atgcatagga

120

atctgcccgg tagtggggga taacttgagg aaactcaagc taataccgca tacgccctac

180

gggggaaagc aggggctctt cggaccttgc gctatcggat gagcttatgt cggattagct

240

ggttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgatccgtag ctggtctgag aggatgatca

300

gccacatcgg gactgagaca cggcccgaac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

360

gacaatgggg gcaaccctga tccagccatg ccgcgtgtgt gaagaaggcc ctcgggttgt

420

aaagcacttt cagcgaggaa gaatgcttgt cggttaatac ccggcaaggg agacatcact

480

cgcagaagaa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga gggtgcgagc

540

gttaatcgga attactgggc gtaaagcgtg cgtaggcggc ttgataagcc ggttgtgaaa

600

gccccgggct caacctggga acggcatccg gaactgttag gctagagtgc aggagaggaa

660

ggtagaattc ccggtgtagc ggtgaaatgc gtagagatcg ggaggaatac cagtggcgaa

720

ggcggccttc tggactgaca ctgacgctga ggtacgaaag cgtgggtagc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgtcgactag ccgttggggt cctcgagacc

840

tttgtggcgc agttaacgca ctaagtcgac cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa

900

ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa

960

cgcgaagaac cttacctacc cttgacatcg tgcgaacttt ccagagatgg attggtgcct

1020

tcgggagcgc acagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgttgtg aaatgttggg

1080

ttaagtcccg taacgagcgc aacccttgtc cctatttgcc agcgattcgg tcgggaactc

1140

tagggagact gccggtgaca aaccggagga aggtggggac gacgtcaagt catcatggcc

1200

cttacgggta gggctacaca cgtgctacaa tggccggtac aatgggttgc aaagcggcga

1260

cgtggagcta atctcataaa gccggtctca gtccggatcg gagtctgcaa ctcgactccg

1320

tgaagtcgga atcgctagta atcgtgcatc agaatggcac ggtgaatacg ttcccgggcc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tggactgcac cagaagtggt tagcctaact

1440

tcggagggcg atcaccacgg tgtggttcat gactggggtg aagtcgtaac aaggtagccg

1500

taggggaacc tgcggctgga tcacctcctt aat

1533

<210> 991

<211> 1296

<212> DNA

<213> Halomonas johnsoniae

<400> 991

attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc gagcggcgga cgggtgagta

60

atgcatagga atctgcccga tagtggggga taacctgggg aaacccaggc taataccgca

120

tacggaaagc cgctatcgga tgagcctatg tcggattagc tagttggtga ggtaaaggct

180

caccaaggcg acgatccgta gctggtctga gaggatgatc agccacatcg ggactgagac

240

acggcccgaa ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg gggaaccctg

300

atccagccat gccgcgtgtg tgaagaaggc cctcgggttg taaagcactt tcagtgagga

360

agaagacatc actcacagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac

420

ggagggtgcg agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gcgcgtaggt ggcttgataa

480

gccggttgtg aaagccccgg gctcaacctg ggaacggcat ccggaactgt caagctagag

540

tgcaggagag gaaggtagaa ttcccggtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tcgggaggaa

600

taccagtggc gaaggcggcc ttctggactg actgacactg aggtgcgaaa gcgtgggtag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtcgacca gccgttgggt

720

actttgtggc gaagttaacg cgataagtcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

780

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

840

aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat cgacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgttgtgaa atgttgggtt aagtcccgta acgagcgcaa cccttgtcct tatttgccag

960

cgcgcgggaa ctctaaggag actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gacgacgtca

1020

agtcatcatg gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggtcgg caaagggttg

1080

ccaactcgcg agagtgagcc aatcccgacc gatctcagtc cggacggagt ctgcaactcg

1140

actccggaag tcggaatcgc tagtaatcgt ggatcagaat gccacggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtggac tgcaccagaa gtggttgcct

1260

agggcgatca ccacggtgtg gttcatgact ggggtg

1296

<210> 992

<211> 1430

<212> DNA

<213> Halorubrum lipolyticum

<400> 992

aggccattgc tattgggatt cgatttagcc atgctagtcg cacgagttca gactcgtggc

60

gaatagctca gtaacacgtg gccaaactac ccttcggagc acaataccct cgggaaactg

120

aggctaatag tgcataccac agtccacctg gaatgaggac tgtgccaaac gctccggcgc

180

cgaaggatgt ggctgcggcc gattaggtag acggtggggt aacggcccac cgtgccaata

240

atcggtacgg gtcatgagag tgagaacccg gagacggaat ctgagacaag attccgggcc

300

ctacggggcg cagcaggcgc gaaaccttta cactgcacgc cagtgcgata agggaatccc

360

aagtgcgtag gcatagagcc tacgcttttg tccaccgtag ggaggtggac gaataagggc

420

tgggcaagac cggtgccagc cgccgcggta ataccggcag cccgagtgat ggccgatctt

480

attgggccta aagcgtccgt agctggccgc acaagtccat cggaaaatcc acccgctcaa

540

cgggtgggcg tccggtggaa actgtgtggc ttgggaccgg aaggcgcgac gggtacgtcc

600

ggggtaggag tgaaatcccg taatcctgga cggaccgccg atggcgaaag cacgtcgcga

660

ggacggatcc gacagtgagg gacgaaagcc agggtctcga accggattag atacccgggt

720

agtcctggcc gtaaacaatg tctgttaggt gtggctccca ctacgagtgg gtgctgtgcc

780

gtagggaagc cgctaaacag accgcctggg aagtacgtcc gcaaggatga aacttaaagg

840

aattggcggg ggagcactac aaccggagga gcctgcggtt taattggact caacgccgga

900

catctcacca gcatcgactg taataatgac gatcaggttg atgaccttat ccgagtttca

960

gagaggaggt gcatggccgc cgtcagctcg taccgtgagg cgtcctgtta agtcaggcaa

1020

cgagcgagac ccgcatcctt acttgccagc agcactgcga agtggctggg gacagtaggg

1080

agaccgccgt ggccaacacg gaggaaggaa cgggcaacgg taggtcagta tgccccgaat

1140

gtgctgggca acacgcgggc tacaatggtc gagacaaagg gttccaactc cgaaaggaga

1200

cggtaatctc agaaactcga tcgtagttcg gattgtgggc tgcaactcgc ccacatgaag

1260

ctggattcgg tagtaatcgc gtgtcacaag cgcgcggtga atacgtccct gctccttgca

1320

cacaccgccc gtcaaagcac ccgagtgagg tccggatgag gcgcgtcaca cgcgtcgaat

1380

ctgggcttcg caagggggct taagtcgtaa caaggtagcc gtaggggaat

1430

<210> 993

<211> 1506

<212> DNA

<213> Helicobacter bilis

<400> 993

tttatggaga gtttgatcct ggctcagagt gaacgctggc ggcgtgccta atacatgcaa

60

gtcgaacgat gaagcttcta gcttgctaga agtggattag tggcgcacgg gtgagtaatg

120

cataggttat gtgcccttta gtctgggata gccactggaa acggtgatta atactggata

180

ctccctacgg gggaaaggtt tttcgctaaa ggatcagcct atgtcctatc agcttgttgg

240

tgaggtaatg gctcaccaag gctatgacgg gtatccggcc tgagagggtg atcggacaca

300

ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtagggaat attgctcaat

360

gggggaaacc ctgaagcagc aacgccgcgt ggaggatgaa ggttttagga ttgtaaactc

420

cttttgttag agaagattat gacggtatct aacgaataag caccggctaa ctccgtgcca

480

gcagccgcgg taatacggag ggtgcaagcg ttactcggaa tcactgggcg taaagagcgc

540

gtaggcgggt ggtcaagtca gatgtgaaat cctgtagctt aactacagaa ctgcatttga

600

aactgaccat ctagagtatg ggagaggtag gtggaattct tggtgtaggg gtaaaatccg

660

tagagatcaa gaggaatact cattgcgaag gcgacctgct ggaacattac tgacgctgat

720

gcgcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cctaaacgat

780

gaatgctagt tgttgccctg cttgtcaggg cagtaatgca gctaacgcat taagcattcc

840

gcctggggag tacggtcgca agattaaaac tcaaaggaat agacggggac ccgcacaagc

900

ggtggagcat gtggtttaat tcgaagctac gcgaagaacc ttacctaggc ttgacattga

960

tagaatccgc tagagatagt ggagtgctgg cttgccagag cttgaaaaca ggtgctgcac

1020

ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc

1080

gtccttagtt gctagcagct cggctgagca ctctaaggag actgccttcg taaggaggag

1140

gaaggtgagg acgacgtcaa gtcatcatgg cccttacgcc tagggctaca cacgtgctac

1200

aatgggacat acaaaaagat gcaataccgc gaggtggagc aaatctctaa aatgtctctc

1260

agttcggatt gtagtctgca actcgactac atgaagctgg aatcgctagt aatcgtgaat

1320

cagccatgtc acggtgaata cgttcccggg tcttgtactc accgcccgtc acaccatggg

1380

agttgtattc gccttaagtc gggatactaa attggttacc gcccacggcg gatgcagcga

1440

ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtaaccgta ggtgaacctg cggttggatc acctcctttc

1500

tagaga

1506

<210> 994

<211> 1499

<212> DNA

<213> Helicobacter canadensis

<400> 994

ttctatggag agtttgatcc tggctcagag tgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca

60

agtcgaacga tgaagcttct agcttgctag aagtggatta gtggcgcacg ggtgagtaat

120

gcataggtta tgtgcccttt agtctgggat agccactgga aacggtgatt aatactagat

180

actccctacg ggggaaagtt tttcgctaaa ggatcagcct atgtcctatc agcttgttgg

240

tgaggtaatg gctcaccaag gctatgacgg gtatccggcc tgagagggtg atcggacaca

300

ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtagggaat attgctcaat

360

gggggaaacc ctgaagcagc aacgccgcgt ggaggatgaa ggttttcgga ttgtaaactc

420

cttttgttag agaagattat gacggtatct aacgaataag caccggctaa ctccgtgcca

480

gcagccgcgg taatacggag ggtgcaagcg ttactcggaa tcactgggcg taaagagcgc

540

gtaggcgggg tagcaagtca gatgtgaaat cctatggctt aaccatagaa ctgcatttga

600

aactgttact ctagagtatg ggagaggtag gtggaattct tggtgtaggg gtaaaatccg

660

tagagatcaa gaggaatact cattgcgaag gcgacctgct ggaacattac tgacgctgat

720

gcgcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cctaaacgat

780

gaatgctagt tgttgtgagg cttgtccttg cagtaatgca gctaacgcat taagcattcc

840

gcctggggag tacggtcgca agattaaaac tcaaaggaat agacggggac ccgcacaagc

900

ggtggagcat gtggtttaat tcgaagatac gcgaagaacc ttacctaggc ttgacattga

960

tagaatctac tagagatagt ggagtgccct tttagggagc ttgaaaacag gtgctgcacg

1020

gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctcg

1080

tccttagttg ctagcagttt ggctgagcac tctaaggaga ctgccttcgt aaggaggagg

1140

aaggtgagga tgacgtcaag tcatcatggc ccttacgcct agggctacac acgtgctaca

1200

atggggtgca caaagagaag caatactgcg aagtggagcc aatctctaaa acatctctca

1260

gttcggattg tagtctgcaa ctcgactaca tgaagctgga atcgctagta atcgtgaatc

1320

agccatgtca cggtgaatac gttcccgggt cttgtactca ccgcccgtca caccatggga

1380

gttgtattcg ccttaagtcg gaatactaaa ctagttaccg cccacggcgg atgcagcgac

1440

tggggtgaag tcgtaacaag gtaaccgtag gtgaacctgc ggttggatca cctcctttc

1499

<210> 995

<211> 1502

<212> DNA

<213> Helicobacter cinaedi

<400> 995

ttttatggag agtttgatcc tggctcagag tgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca

60

agtcgaacga tgaagctttt agcttgctag aagtggatta gtggcgcacg ggtgagtaat

120

gcataggtta tgtgcccttt agtctgggat agccactgga aacggtgatt aatactggat

180

actccctacg ggggaaaggt ttttcgctaa aggatcagcc tatgtcctat cagcttgttg

240

gtgaggtaat ggctcaccaa ggctatgacg ggtatccggc ctgagagggt gatcggacac

300

actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtagggaa tattgctcaa

360

tgggggaaac cctgaagcag caacgccgcg tggaggatga aggttttagg attgtaaact

420

ccttttgtaa gagaagatta tgacggtatc ttacgaataa gcaccggcta actccgtgcc

480

agcagccgcg gtaatacgga gggtgcaagc gttactcgga atcactgggc gtaaagagtg

540

cgtaggcggg tagtcaagtc agatgtgaaa tcctgtagct taactacaga actgcatttg

600

aaactgacta tctagagtat gggagaggta ggtggaattc ttggtgtagg ggtaaaatcc

660

gtagagatca agaggaatac tcattgcgaa ggcgacctgc tggaacatta ctgacgctga

720

tgcgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccctaaacga

780

tgaatgctag ttgttgccct gcttgtcagg gcagtaatgc agctaacgca ttaagcattc

840

cgcctgggga gtacggtcgc aagattaaaa ctcaaaggaa tagacgggga cccgcacaag

900

cggtggagca tgtggtttaa ttcgagtata cgcgaagaac cttacctagg cttgacattg

960

atagaatccg ctagagatag tggagtgttg gcttgccaga gcttgaaaac aggtgctgca

1020

cggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct

1080

cgtccttagt tgctagcagc tcggctgagc actctaagga gactgccttc gtaaggagga

1140

ggaaggtgag gacgacgtca agtcatcatg gcccttacgc ctagggctac acacgtgcta

1200

caatgggaca tacaaaaaga tgcaatatcg cgagatggag caaatctcta aaatgtctct

1260

cagttcggat tgtagtctgc aactcgacta cataaagctg gaatcgctag taatcgcaaa

1320

tcagcaatgt tgcggtgaat acgttcccgg gtcttgtact caccgcccgt cacaccatgg

1380

gagttgtatt cgccttaagt cgggatacta aattggttac cgcccacggc ggatgcagcg

1440

actggggtga agtcgtaaca aggtaaccgt aggtgaacct gcggttggat cacctccttt

1500

ct

1502

<210> 996

<211> 1508

<212> DNA

<213> Helicobacter pullorum

<400> 996

ttttatggag agtttgatcc tggctcagag tgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca

60

agtcgaacga tgaagctttt agcttgctag aagtggatta gtggcgcacg ggtgagtaat

120

gcataggtta tgtgcccttt agtctgggat agccactgga aacggtgatt aatactagat

180

actccctacg ggggaaagtt tttcgctaaa ggatcagcct atgtcctatc agcttgttgg

240

tgaggtaatg gctcaccaag gctatgacgg gtatccggcc tgagagggtg atcggacaca

300

ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtagggaat attgctcaat

360

gggggaaacc ctgaagcagc aacgccgcgt ggaggatgaa ggttttcgga ttgtaaactc

420

cttttgttag agaagataat gacggtatct aacgaataag caccggctaa ctccgtgcca

480

gcagccgcgg taatacggag ggtgcaagcg ttactcggaa tcactgggcg taaagagcgc

540

gtaggcgggg tagtaagtca gatgtgaaat cctatggctt aaccatagaa ctgcatttga

600

aactactact ctagagtatg ggagaggtag gtggaattct tggtgtaggg gtaaaatccg

660

tagagatcaa gaggaatact cattgcgaag gcgacctgct ggaacattac tgacgctgat

720

gcgcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cctaaacgat

780

gaatgctagt tgttgtgagg cttgtccttg cagtaatgca gctaacgcat taagcattcc

840

gcctggggag tacggtcgca agattaaaac tcaaaggaat agacggggac ccgcacaagc

900

ggtggagcat gtggtttaat tcgatgatac gcgaagaacc ttacctaggc ttgacattga

960

tagaatctgc tagagatagc ggagtgctgg cttgccagag cttgaaaaca ggtgctgcac

1020

ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc

1080

gtccttagtt gctagcagtt cggctgagca ctctaaggag actgccttcg taaggaggag

1140

gaaggtgagg atgacgtcaa gtcatcatgg cccttacgcc tagggctaca cacgtgctac

1200

aatggggtgt acaaagagaa gcaatactgc gaagtggagc caatctctaa aacatctctc

1260

agttcggatt gtagtctgca actcgactac atgaagctgg aatcgctagt aatcgcaaat

1320

cagccatgtt gcggtgaata cgttcccggg tcttgtactc accgcccgtc acaccatggg

1380

agttgtattc gccttaagtc ggaatactaa actagttacc gcccacggcg gatgcagcga

1440

ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtaaccgta ggtgaacctg cggttggatc acctcctttc

1500

aagagaaa

1508

<210> 997

<211> 1550

<212> DNA

<213> Helicobacter pylori

<400> 997

atcaaaaaac aaaagagctt taggacaaac acttttatgg agagtttgat cctggctcag

60

agtgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac gatgaagctt tctagcttgc

120

tagaaggctg attagtggcg cacgggtgag taacgcatag gtcatgtgcc tcttagtttg

180

ggatagccat tggaaacgat gattaatacc agatactccc tacgggggaa agatttatcg

240

ctaagagatc agcctatgtc ctatcagctt gttggtaagg taatggctta ccaaggctat

300

gacgggtatc cggcctgaga gggtgaacgg acacactgga actgagacac ggtccagact

360

cctacgggag gcagcagtag ggaatattgc tcaatggggg aaaccctgaa gcagcaacgc

420

cgcgtggagg atgaaggttt taggattgta aactcctttt gttagagaag ataatgacgg

480

tatctaacga ataagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc

540

aagcgttact cggaatcact gggcgtaaag agcgcgtagg cgggatagtc agtcaggtgt

600

gaaatcctat ggcttaacca tagaactgca tttgaaacta ctattctaga gtgtgggaga

660

ggtaggtgga attcttggtg taggggtaaa atccgtagag atcaagagga atactcattg

720

cgaaggcgac ctgctggaac attactgacg ctgattgcgc gaaagcgtgg ggagcaaaca

780

ggattagata ccctggtagt ccacgcccta aacgatggat gctagttgtt ggagggctta

840

gtctctccag taatgcagct aacgcattaa gcatcccgcc tggggagtac ggtcgcaaga

900

ttaaaactca aaggaataga cggggacccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

960

aagatacacg aagaacctta cctaggcttg acattgagag aatccgctag aaatagtgga

1020

gtgtctggct tgccagacct tgaaaacagg tgctgcacgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caaccccctt tcttagttgc taacaggtca

1140

tgctgagaac tctaaggata ctgcctccgt aaggaggagg aaggtgggga cgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgcct agggctacac acgtgctaca atggggtgca caaagagaag

1260

caatactgcg aagtggagcc aatcttcaaa acatctctca gttcggattg taggctgcaa

1320

ctcgcctgca tgaagctgga atcgctagta atcgcaaatc agccatgttg cggtgaatac

1380

gttcccgggt cttgtactca ccgcccgtca caccatggga gttgtgtttg ccttaagtca

1440

ggatgctaaa ttggctactg cccacggcac acacagcgac tggggtgaag tcgtaacaag

1500

gtaaccgtag gtgaacctgc ggttggatca cctcctttct agagaaaagc

1550

<210> 998

<211> 1456

<212> DNA

<213> Helicobacter sp. None

<400> 998

tagtgaacgc tggcggcgtg cctaatacat gcaagtcgaa cgatgaagct tttagcttgc

60

tagaagtgga ttagtggcgc acgggtgagt aatgcatagg ttatgtgccc tttagtctgg

120

gatagccact ggaaacggtg attaatactg gatactccct gcgggggaaa ggtttttcgc

180

tagaggatca gcctatgtcc tatcagcttg ttggtgaggt aatggctcac caagactatg

240

acgggtatcc ggcctgagag ggtgatcgga cacactggaa ctgagacacg gtccagactc

300

ctacgggagg cagcagtagg gaatattgct caatggggga aaccctgaag cagcaacgcc

360

gcgtggagga tgaaggtttt aggattgtaa actccttttg taagagaaga ttatgacggt

420

atcttacgaa taagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgta

480

agcgttactc ggaatcactg ggcgtaaaga gtgcgtaggc gggtagtcaa gtcagatgtg

540

aaatcctgta gcttaactac agaactgcat ttgaaactga ctatctagag tatgggagag

600

gtaggtggaa ttcttggtgt aggggtaaaa tccgtagaga tcaagaggaa tactcattgc

660

gaaggcgacc tgctggaaca ttactgacgc tgatgcgcga aagcgtgggg agcaaacagg

720

attagatacc ctggtagtcc acgccctaaa cgatgaatgc tagttgttgc cctgcttgtc

780

agggcagtaa tgcagctaac gcattaagca ttccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta

840

aaactcaaag gaatagacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag

900

ctacgcgaag aaccttacct aggcttgaca ttgatagaat ctgctagaga tagcggagtg

960

ctggcttgcc agagcttgaa aacaggtgct gcacggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1020

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac cctcgtcctt agttgttagc agctcggctg

1080

agcactctaa ggagactgcc ttcgcaagga ggaggaaggt gaggacgacg tcaagtcatc

1140

atggccctta cgcctagggc tacacacgtg ctacaatggg acatacaaaa agatgcaata

1200

tcgcgagatg gagcaaatct ctaaaatgtc tctcagttcg gattgtagtc tgcaactcga

1260

ctacataaag ctggaatcgc tagtaatcgc aaatcagcaa tgttgcggtg aatacgttcc

1320

cgggtcttgt actcaccgcc cgtcacacca tgggagttgt attcgcctta agtcgggata

1380

ctaaattggt taccgcccac ggcggatgca gcgactgggg tgaagtcgta acaaggtaac

1440

cgtgtcatag ttgttt

1456

<210> 999

<211> 1507

<212> DNA

<213> Helicobacter winghamensis

<400> 999

ttttatggag agtttgatcc tggctcagag tgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca

60

agtcgaacga tgaagcttct agcttgctag aagtggatta gtggcgcacg ggtgagtaat

120

gcataggtta tgtgcccttt agtctgggat agccactgga aacggtgatt aataccggat

180

attccctacg ggggaaaggt ttttcgctaa aggatcagcc tatgtcctat cagcttgttg

240

gtgaggtaat ggctcaccaa ggctatgacg ggtatccggc ctgagagggt gatcggacac

300

actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtagggaa tattgctcaa

360

tgggggaaac cctgaagcag caacgccgcg tggaggatga aggttttcgg attgtaaact

420

ccttttgtta gagaagatta tgacggtatc taacgaataa gcaccggcta actccgtgcc

480

agcagccgcg gtaatacgga gggtgcaagc gttactcgga atcactgggc gtaaagagcg

540

cgtaggcggg ataataagtc agatgtgaaa tcctatggct taaccataga actgcatttg

600

aaactattat tctagagtat gggagaggta ggtggaattc ttggtgtagg ggtaaaatcc

660

gtagagatca agaggaatac tcattgcgaa ggcgacctgc tggaacatta ctgacgctga

720

tgcgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccctaaacga

780

tgaatgctag ttgttggggt gcttgtcact ccagtaatgc agctaacgca ttaagcattc

840

cgcctgggga gtacggtcgc aagattaaaa ctcaaaggaa tagacgggga cccgcacaag

900

cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagata cgcgaagaac cttacctagg cttgacattg

960

atagaatccg ctagagatag tggagtgcta gcttgctaga acttgaaaac aggtgctgca

1020

cggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct

1080

cgtccttagt tgctaactat tcggtagagc actctaagga gactgccttc gtaaggagga

1140

ggaaggtgag gatgacgtca agtcatcatg gcccttacgc ctagggctac acacgtgcta

1200

caatggtatg tacaaagaga agcaataccg cgaggtggag caaatctata aaacatatct

1260

cagttcggat tgtagtctgc aactcgacta catgaagctg gaatcgctag taatcgcaaa

1320

tcagcaatgt tgcggtgaat acgttcccgg gtcttgtact caccgcccgt cacaccatgg

1380

gagttgtatt cgccttaagt cggaatgcca aactggctac cgcccacggc ggatgcagcg

1440

actggggtga agtcgtaaca aggtaaccgt aggtgaacct gcggttggat cacctccttt

1500

caagaga

1507

<210> 1000

<211> 1510

<212> DNA

<213> Heliobacterium modesticaldum

<400> 1000

gatcctggct caggacgaac gctggcggca tgcctaacac atgcaagtcg aacggagagc

60

tgaagtttcg atggaggctc ttagtggcgg acgggtgagt aacgcgtgga taacctgcct

120

gagagtgggg gataacagcc cgaaagggct gctaataccg cataacgttg tccggggaca

180

tccccggata accaaaggag caatccgctg tcagatgggt ccgcgtccga ttagctagtt

240

ggcggggtaa gagcccacca aggcaacgat cggtagccgg cctgagaggg tgaacggcca

300

cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atcttccgca

360

atgggcgaaa gcctgacgga gcaatgccgc gtgggggacg aaggtcttcg gattgtaaac

420

ccttgtcttc agggaagaag aatgacggta cctgaggagg aagccccggc taactacgtg

480

ccagcagccg cggtaatacg tagggggcga gcgttgtccg gaattactgg gcgtaaagcg

540

cgtgcaggcg gacctttaag tctgaggtga aagaccggag ctcaactccg gggcggcctt

600

ggaaactgga ggtcttgagg gatggagagg acagtggaat tcccggtgta gcggtgaaat

660

gcgtagatat cgggaggaac cccagtggcg aaggcgactg tctggacatt acctgacgct

720

gaggcgcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac

780

gatgagtgct aggtgttggg ggtatcgacc cctccagtgc cgcagtcaac acaataagca

840

ctccgcctgg ggagtacggc cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac

900

aagcggtgga gcatgtggtt taattcgacg caacgcgaag aaccttacca aggcttgaca

960

tcctccgaac cttgcagaga tgcgagggtg cccttcgggg agcggagaga caggtggtgc

1020

atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1080

ttatcctcag ttgccagcga gagagacggg gactctgggg agactgcccg ggacgaccgg

1140

gaggaaggcg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gtcttgggct acacacgtgc

1200

tacaatgggc ggtacaaacc gaggcgaagc cgcgaggcgg agcgaaccgg agaaagccgc

1260

tcacagttcg gattgctctc tgcaactcga gagcatgaag gcggaatcgc tagtaatcgc

1320

gggtcagcat accgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac

1380

gaaagtcggc aacacccgaa gtcggtgcgc taaccgcaag gaggcagccg ccgaaggtgg

1440

ggtcgatgat tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtat cggaaggtgc ggctggatca

1500

cctcctttct

1510

<210> 1001

<211> 1528

<212> DNA

<213> Herbaspirillum seropedicae

<400> 1001

agagtttgat cctggctcag attgaacgct ggcggcatgc cttacacatg caagtcgaac

60

ggcagcatag gagcttgctc ctgatggcga gtggcgaacg ggtgagtaat atatcggaac

120

gtgccctaga gtgggggata actagtcgaa agattagcta ataccgcata cgatctacgg

180

atgaaagtgg gggatcgcaa gacctcatgc tcctggagcg gccgatatct gattagctag

240

ttggtggggt aaaagcctac caaggcgacg atcagtagct ggtctgagag gacgaccagc

300

cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaattttgga

360

caatgggggc aaccctgatc cagcaatgcc gcgtgagtga agaaggcctt cgggttgtaa

420

agctcttttg tcagggaaga aacggttttg gctaatatcc agaactaatg acggtacctg

480

aagaataagc accggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gtgcaagcgt

540

taatcggaat tactgggcgt aaagcgtgcg caggcggttg tgtaagacag atgtgaaatc

600

cccgggctca acctgggaat tgcatttgtg actgcacggc tagagtgtgt cagagggggg

660

tagaattcca cgtgtagcag tgaaatgcgt agatatgtgg aggaataccg atggcgaagg

720

cagccccctg ggataacact gacgctcatg cacgaaagcg tggggagcaa acaggattag

780

ataccctggt agtccacgcc ctaaacgatg tctactagtt gtcgggtctt aattgacttg

840

gtaacgcagc taacgcgtga agtagaccgc ctggggagta cggtcgcaag attaaaactc

900

aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggatgatgt ggattaattc gatgcaacgc

960

gaaaaacctt acctaccctt gacatggtcg gaatcctgaa gagatttggg agtgctcgaa

1020

agagaaccgg cgcacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt

1080

taagtccccg caacgagcgc aacccttgtc attagttgct acgaaagggc actctaatga

1140

gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcctcat ggcccttatg

1200

ggtagggctt cacacgtcat acaatggtac atacagaggg ccgccaaccc gcgagggggg

1260

agctaatccc agaaagtgta tcgtagtccg gattggagtc tgcaactcga ctccatgaag

1320

ttggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta

1380

cacaccgccc gtcacaccat gggagcgggt tttaccagaa gtgggtagcc taaccgtaag

1440

gagggcgctc accacggtag gattcgtgac tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtat

1500

cggaaggtgc ggctggatca cctccttt

1528

<210> 1002

<211> 1489

<212> DNA

<213> Herbaspirillum sp. JC206

<400> 1002

agagtttgat cctggctcag attgaacgct ggcggcatgc cttacacatg caagtcgaac

60

ggcagcgcgg gcttcggcct ggcggcgagt ggcgaacggg tgagtaatat atcggaacgt

120

gccctagagt gggggataac tagtcgaaag attagctaat accgcatacg atctacggat

180

gaaagtgggg gaccgcaagg cctcacgctc ctggagcggc cgatatctga ttagctagtt

240

ggtggggtaa aggcctacca aggcgacgat cagtagctgg tctgagagga cgaccagcca

300

cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga attttggaca

360

atgggggcaa ccctgatcca gcaatgccgc gtgtgtgaag aaggccttcg ggttgtaaag

420

cacttttgtc tgggaagaaa tcccttgggc taatacctcg aggggatgac ggtaccggaa

480

gaataagcac cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggt gcgagcgtta

540

atcggaatta ctgggcgtaa agcgtgcgca ggcggttgtg caagacagat gtgaaatccc

600

cgggcttaac ctgggaactg catttgtgac tgcacggcta gagtgtgtca gaggggggta

660

gaattccacg tgtagcagtg aaatgcgtag agatgtggag gaataccgat ggcgaaggca

720

gccccctggg ataacactga cgctcatgca cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

780

accctggtag tccacgccct aaacgatgtc tactagttgt cgggtcttaa ttgacttggt

840

aacgcagcta acgcgtgaag tagaccgcct ggggagtacg gtcgcaagat taaaactcaa

900

aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gatgatgtgg attaattcga tgcaacgcga

960

aaaaccttac ctacccttga catggtcgga atcctccaga gatgggggag tgcccgaaag

1020

ggaaccgacg cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1080

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcatt agttgctacg aaagggcact ctaatgagac

1140

tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaag tcctcatggc ccttatgggt

1200

agggcttcac acgtcataca atggtacata cagagggccg ccaacccgcg agggggagct

1260

aatcccagaa agtgtatcgt agtccggatt gcagtctgca actcgactgc atgaagttgg

1320

aatcgctagt aatcgcggat cagcatgtcg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccatggga gcgggtttta ccagaagtgg gtagcctaac cgcaaggagg

1440

gcgcttacca cggtaggatt cgtgactggg gtgaagtcgt aacaaggta

1489

<210> 1003

<211> 1361

<212> DNA

<213> Histophilus somni

<400> 1003

ctttctctgc tgacgagtgg cggacgggtg agtaaagctt gggaatctgg cgaatggagg

60

gggatagcca cgggaaactg tgggtaatac cgcgtaaggt ctaaggacta aaggggtggg

120

actgagaggc cacctgccat ttgatgagcc caagtgggat taggtagttg gtgaggtaag

180

ggctcaccaa gctgacgatc tctagctggt ctgagaggat ggccagccac actggaactg

240

agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcgcaa tggggggaac

300

cctgacgcag ccatgccgcg tgaatgaaga aggccttcgg gttgtaaagt tctttcggtg

360

atgaggaagg cgattagttt aagagattaa ttgattgacg ataatcacag aagaagcacc

420

ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg cgagcgttaa tcggaatgac

480

tgggcgtaaa gggcacgcag gtggtgactt aagtgaggtg tgaaatcccc gggcttaacc

540

tgggaacagc atttcagact gggtgactag agtactttag ggaggggtag aattccacgt

600

gtagcggtga aatgcgtaga gatgtggagg aataccgaag gcgaaggcag ccccttggga

660

agatactgac gctcgagtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt

720

ccacgctgta aacgatgtcg atttggggat tgggtgaata cttggtgccc gaagctaacg

780

tgataaatcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa aactcaaatg aattgacggg

840

ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccta

900

ctcttgacat cctaagaagc cgccagagat ggtggtgtgc ctacgggagc ttagagacag

960

gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1020

gcaaccctta tcctttgttg ccagcatgtt agggtgggaa ctcaaaggag actgccggtg

1080

ataaactgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg gcccttacga gtagggctac

1140

acacgtgcta caatggcgta tacagaggga ggcgagcctg cgagggtaag cgaagctcag

1200

aaagtacgtc taagtccgga ttggagtctg gaactcgact ccatgaagtc ggaatcgcta

1260

gtaatcgcgg atcagaatgt cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1320

cacaccatgg gagtgggttg taccagaagt agatagctta a

1361

<210> 1004

<211> 1332

<212> DNA

<213> Holdemania filiformis

<400> 1004

gcgaacgggt gagtaataca taagcaatct gcccatcggc ctgggataac agttggaaac

60

gactgctaat accggatagg tgatgaagag gcatctctcg atcattaaag ttgggataca

120

acacggatgg atgagcttat ggcgtattag ctagtaggtg aggtaacggc tcacctaggc

180

gatgatacgt agccgacctg agagggtgac cggccacatt gggactgaga cacggcccaa

240

actcctacgg gaggcagcag tagggaattt tcggcaatgg gcgaaagcct gaccgagcaa

300

cgccgcgtga gtgaagaagg ccttcgggtt gtaaagctct gttgtgaagg aagaacggct

360

catacaggga atggtatggg agtgacggta ctttaccaga aacccggcta actacgtgcc

420

acagccgcgg taatacgtag gtggcgagcg ttatccggaa ttattgggcg taaagggtgc

480

gcaggcggtt tgttaagttt aaggtgaaag cgtggggctt aaccccatat agtaaaactg

540

acagactaag tacaggagag ggcaatggaa ttccatgtgt agcggtaaaa tgcgtagata

600

tatggaggaa caccagtggc gaaggcggtt gcctggcctg taactgacgc tcatgcacga

660

aagcgtgggg agcaatagat taatacccta tagtccacgc cgtaaacgat gagaactaag

720

tgttggggaa actcatgctg cagttaacgc aataagttct ccgcctgggg agtatgcacg

780

caagtgtgaa actcagagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagt atgtggttta

840

attcgacgca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ccctgcaaag acatagagat

900

atgttggagg ttatcaggga gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

960

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcttt agttgctaac attaagttga

1020

ggactctaga gagactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc

1080

atgcccctta tgacctgggc tacacacgta ctacaatggc ggatacaacg agaagcaaga

1140

cagtgatgtg gagcaaaact cagaaagtcc gtctcagttc ggattgaagt ctgcaacccg

1200

acttcatgaa gccggaatcg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg aatacgttct

1260

cgggccttgt acacaccgcc cgtcaaacca tgagagttgg caatacccga agccggtggc

1320

ctaacctcgc aa

1332

<210> 1005

<211> 1510

<212> DNA

<213> Hydrogenoanaerobacterium saccharovorans

<400> 1005

gagtttgatc atggctcagg acgaacgctg gcggcgcgcc taacacatgc aagtcgaacg

60

gaactgttcg gatgaagttt tcggatggat gaagaacagt ttagtggcgg acgggtgagt

120

aacacgtgag caacctgcct ttcagagggg aataacattc ggaaacgaat gctaataccg

180

cataatgcaa cgagatggca tcatcttgct gccaaagatt tatcgctgaa agatgggctc

240

gcgcccgatt agctagttgg tgaggtaatg gcccaccaag gcaacgatcg gtagccggac

300

tgagaggttg atcggccaca ttgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

360

agtgggggat attgcacaat gggcgaaagc ctgatgcagc gacgccgcgt gagggaagac

420

ggttttcgga ttgtaaacct ctgtcttcag ggacgataat gacggtacct gaggaggaag

480

caccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggtgcaagcg ttgtccggaa

540

ttactgggtg taaagggagc gtaggcggga ttgtaagttg gatgtgtaat gtaccggctc

600

aaccggtaac ttgcattcaa aactgcagtt cttgagtgaa gtagaggcag gcggaattcc

660

tagtgtagcg gtgaaatgcg tagatattag gaggaacacc agtggcgaag gcggcctgct

720

gggcttttac tgacgctgag gctcgaaagc atgggtagca aacaggatta gataccctgg

780

tagtccatgc cgtaaacgat gattactagg tgtgggtgtg caagcatccg tgccgcagct

840

aacgcaataa gtaatccacc tggggagtac ggccgcaagg ctgaaactca aaggaattga

900

cgggggcccg cacaagcagt ggattatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta

960

ccaggtcttg acatcccttg cataccatag agatatggga agcccttcgg ggcaaggaga

1020

caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc ttactattag ttgctacgca agagcactct aataggactg ccgttgacaa

1140

aacggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac

1200

gtaatacaat gacgataaac agagggtagc gaagccgcga ggtggagcca atccccaaaa

1260

gtcgtctcag ttcggattgc aggctgcaac tcgcctgcat gaagtcggaa ttgctagtaa

1320

tcgcaggtca gcatactgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca

1380

ccatgggagt cggtaacacc cgaagccagt agtctaaccg caaggaggac gctgccgaag

1440

gtgggattga tgactggggt gaagtcgtaa caaggtagcc gtatcggaag gtgcggctgg

1500

atcacctcct

1510

<210> 1006

<211> 1507

<212> DNA

<213> Hyperthermus butylicus

<400> 1006

actccggttg atcctgccgg acccgaccgc tatcggggtg ggactaagcc atgggagtcg

60

tgcgcccccg gatgcggggg cgcggcggac ggctgagtaa cacgtggcta acctaccctc

120

gggacgggga taaccccggg aaactggggc taatccccga taggcgaggg ggcctggaac

180

gggtccctcg ccgaaagggc gcgcggagct tccccgcgcg ccgcccgagg atggggctgc

240

ggcccatcag gtagttggcg gggtaacggc ccgccaagcc gataacgggt aggggccgtg

300

ggagcgggac cccccagatg ggcactgaga caagggccca ggccctacgg ggcgcaccag

360

gcgcgaaacc tccgcaatgc gggcaaccgt gacggggtca ccccgagtgc cgccgataag

420

gcggctgttc cccgctgtaa gaaggcgggg gagtaagcgg ggggcaagtc tggtgtcagc

480

cgccgcggta ataccagccc cgcgagcggt cgggatgctt actgggccta aagcgcccgt

540

agccggcccg gtaagtcccc ccctaaagcc ccgggctcaa cccggggagt gggggggata

600

ctaccgggct agggggcggg agaggccgag ggtactcccg gggtaggggc gaaatccgat

660

aatcccggga ggaccaccag tggcgaaggc gctcggctgg aacgcgcccg acggtgaggg

720

gcgaaagccg ggggagcaaa ccggattaga tacccgggta gtcccggctg taaacgatgc

780

gggctaggtg ttgggcgggc ttggagcccg cccagtgccg cagggaagcc gttaagcccg

840

ccgcctgggg agtacggccg caaggctgaa acttaaagga attggcgggg gagcaccaca

900

aggggtggag cctgcggctt aattggagtc aacgccggga atcttaccgg gggcgacagc

960

aggatgacgg ccaggctgac gaccttgccc gacgcgctga gaggaggtgc atggccgtcg

1020

ccagctcgtg ccgtgaggtg tccggttaag tccggcaacg agcgagaccc ccacccctag

1080

ttgctacccc gggggccacc ccgggggcac actaggggga ctgccgccgt ccaaggcgga

1140

ggaaggaggg ggccacggca ggtcagcatg ccccgaatcc cccgggctgc acgcgggcta

1200

caatggcggg gacagcggga tccgaccccg aaagggggag gcaatccctt aaaccccgcc

1260

gcagttggga tcgagggctg caactcgccc tcgtgaacgc ggaatcccta gtaaccgcgc

1320

gttagcatcg cgcggtgaat acgtccctgc tccttgcaca caccgcccgt cgctccaccc

1380

gagcggggga ggggtgaggc cctgcccctg ggggcaaccc cgggggtggg gtcgaacccc

1440

tcccccgcga ggggggagaa gtcgtaacaa ggtagccgta ggggaacctg cggctggatc

1500

acctcct

1507

<210> 1007

<211> 1333

<212> DNA

<213> Hyphomicrobium sulfonivorans

<400> 1007

gagtttgatc ctggctcaga acgaacgatg gcggcaggcc taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcagac gggtgagtaa cgcgcgggaa ccttcccaat ggtgcggaat agcccaggga

120

aacttggagt aataccgcat aaggaaagtc gccattggat gggcccgcgt cgattagcta

180

gttggtaggg taacggccta ccaaggcgac gatccgtagc tggtttgaga gaatgaccag

240

ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatcttgg

300

acaatgggcg caagcctgat ccagccatgc cgcgtgagtg acgaaggcct tagggttgta

360

aagctctttt gccggggacg atgacggtac ccggagaata agtcccggct aacttcgtgc

420

cagcagccgc ggtaatacga aggggactag cgttgttcgg aattactggg cgtaaagcgc

480

acgtaggcgg attattaagt caggggtgaa atcccggggc tcaacctcgg aactgccttt

540

gatactggta atctagagtc cgatagaggt gggtggaatt cctagtgtag aggtgaaatt

600

cgtagatatt aggaagaaca ccagtggcga aggcggccca ctggatcgac tgacgctgag

660

gtgcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat

720

ggatgctagc cgtcggcatg tcggtggcgc agctaacgca ttaagcatcc cgcctgggga

780

gtacggccgc aaggttaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca

840

tgtggtttaa ttcgacgcaa cgcgaagaac cttaccagct cttgacatgc acaggtgctg

900

catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

960

ctcgccatta gttgccatca tgggcactct agtgggactg ccggtgataa gccggaggaa

1020

ggtggggatg acgtcaagtc atcatggccc ttacgggctg ggctacacac gtgctacaat

1080

ggcggtcagt gggcagcaac acagcgatgt gaagctaatc tcagccgtct cagttcggat

1140

ggtctctgca actcgagacc agaagttgga atcgctagta atcgcggatc agcatgccgc

1200

ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag ttggttctac

1260

ccgaaggcga tcgctaggca gtcgaccacg gtagggtcag cgactggggt gaagtcgtaa

1320

caaggtaacc gta

1333

<210> 1008

<211> 1448

<212> DNA

<213> Hyphomonas neptunium

<400> 1008

agagtttgat tctggctcag aacgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac

60

gatatagtgg cagacgggtg agtaacgcgt gggaacgtac ctttcactac ggaatagctc

120

tgggaaactg gtggtaatac cgtatacgcc cttaggggga aagatttatc ggtgaaagat

180

cggcccgcgt tggattagct agttggtgag gtaatggctc acaaaggcga cgatccatag

240

ctggtctgag aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga

300

ggcagcagtg gggaatcttg cacaatgggc gaaagcctga tgcagccatg ccgcgtgaat

360

gatgaaggcc ttagggttgt aaaattcttt cgtcagggat gataatgacc gtacctgaag

420

aagaagcccc ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgaaggggg ctagcgttgt

480

tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgtag gcggactttt aagtcaggtg tgaaatcccg

540

aggctcaacc tcggaactgc atttgaaact ggaagtctgg agatcaggag aggttagcgg

600

aataccgagt gtagaggtga aattcgtaga tattcggtgg aacaccagtg gcgaaggcgg

660

ctaactggac tgatactgac gctgaggtgc gaaagtgtgg ggagcaaaca ggattagata

720

ccctggtagt ccacaccgta aacgatgaga gctagttgtt ggcaggcatg cctgtcggtg

780

acgcagttaa cacattaagc tctccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa

840

gaaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgca

900

gaaccttacc tacccttgac atgtctagta tggtttccgg agacggattc cttcagttcg

960

gctggctaga acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt

1020

aagtcccgca acgagcgcaa ccctcatcct tagttgccat cacgtttggg tgggcactct

1080

aaggaaactg ccggtggcaa gccggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc ctcatggccc

1140

ttacgggtag ggctacacac gtgctacaat ggcagtgaca atgggataat cccaaaaagc

1200

tgtctcagtt cggattgtcg tctgcaactc gacggcatga aggtggaatc gctagtaatc

1260

gtggatcagc atgccacggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacatc

1320

atgggaattg gttctacccg aagatcgtgc gctaacttcg gaggcagcga gccacggtag

1380

gatcagtaac tgggatgaag tcgtaacaag gtagccgtag gggaacctgc ggctggatca

1440

cctccttt

1448

<210> 1009

<211> 1287

<212> DNA

<213> Ignatzschineria indica

<400> 1009

ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgga cgggtgagta atgcatagga atctaccttt

60

tagtctagga taactacccg aaagggtggc taatactgga tgtgtaaagg cgctaagaga

120

tgagcctatg tgggattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatctcta

180

gctggtttga gaggatgatc agccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg

240

aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg cgaaagcctg atccagcaat accgcgtgtg

300

tgaagaaggc cctagggttg taaagcactt ttgttaggga gaatgatgtt acctaaagaa

360

taagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgca agcgttaatc

420

ggaattactg ggcgtaaagg gcgcgtaggt ggtatcttaa gttgggtgtg aaatccccgg

480

gctcaacctg ggaattgcat ccaaaactgg ggtgctagag tgtggtagag ggtagcggaa

540

tttctggtgt agcggtgaaa tgcgtagata tcagaaggaa catcaatggc gaaggcagct

600

acctgggcca actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct

660

ggtagtccac gctataaacg atgacaactt gttgatgggg cttcgttgac ggagctaacg

720

cgttaagttg tccgcctggg gagtacggtc gcaaggctga aactcaaagg aattgacggg

780

gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg

840

gtcttgacat cgacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttcggtt

900

aagtccggca acgagcgcaa cccttgtcct tatttgccag cacgtgggaa ctctaaggag

960

actgccggtg ataaaccgga ggaaggtagg gacgacgtca agtcatcatg gcccttatga

1020

ccagggctac acacgtgcta caatggtcgg caatgggttg ccaaaccgcg aggtggagct

1080

aatcccaccc gatcccagtc cggatgtagt ctgcaactcg actacagaag tcggaatcgc

1140

tagtaatcgt ggatcagaat gccacggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc

1200

gtcacaccat ggaagttgat tgctccagaa gtaggtgctt agggcgctta ccacggagtg

1260

gtcgatgact ggggtgaagt cgtaaca

1287

<210> 1010

<211> 1317

<212> DNA

<213> Ignatzschineria sp. NML 95-0260

<400> 1010

acgctggcgg tatgcttaac acatgcaagt cgaacgagtg gcggacgggt gagtaatgca

60

taggaatcta ccttttagtc taggataact acccgaaagg gtggctaata ctggatgtgt

120

aaaggcgcta agagatgagc ctatgtggga ttagctagtt ggtgaggtaa tggctcacca

180

aggcgacgat ctctagctgg tttgagagga tgatcagcca cactgggact gagacacggc

240

ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattggaca atgggcgcaa gcctgatcca

300

gcaataccgc gtgtgtgaag aaggccctag ggttgtaaag cacttttgtt agggagaatg

360

atgttaccta aagaataagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

420

gtgcaagcgt taatcggaat tactgggcgt aaagggcgcg taggtggtac tttaagttgg

480

gtgtgaaatc cccgggctca acctgggaat tgcatccaaa actggggtgc tagagtgtgg

540

tagagggtag cggaatttct ggtgtagcgg tgaaatgcgt agatatcaga aggaacatca

600

atggcgaagg cagctacctg ggccaactga cgctgaggcg cgaaagcgtg gggagcaaac

660

aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacgatgac aacttgttga tggggcttcg

720

ttgacggagc taacgcgtta agttgtccgc ctggggagta cggtcgcaag gctgaaactc

780

aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gatgcaacgc

840

gaagaacctt acctggtctt gacatcgaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc

900

gtgagatgtt cggttaagtc cggcaacgag cgcaaccctt gtccttattt gccagcacgt

960

gggaactcta aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtagggacga cgtcaagtca

1020

tcatggccct tatgaccagg gctacacacg tgctacaatg gtcggcaatg ggttgccaag

1080

ccgcgaggtg gagctaatct catccgatcc cagtccggat gtagtctgca actcgactac

1140

agaagtcgga atcgctagta atcgtggatc agaatgccac ggtgaatacg ttcccgggtc

1200

ttgtacacac cgcccgtcac accatggaag ttgattgctc cagaagtagg tgcttagggc

1260

gcttaccacg gagtggtcga tgactggggt gaagtcgtaa caaggtagcc gtagggg

1317

<210> 1011

<211> 1469

<212> DNA

<213> Ignicoccus islandicus

<220>

<221> modified_base

<222> (1377)..(1380)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1011

cggacccgac cgctatcggg gtaaggctaa gccatgggag tcgaacgccc gccgccgcgg

60

gcgtggcgga cggctgagta acacgtggct aacctaccct cgggaggggg ataacaccgg

120

gaaactggtg ctaatccccc ataggggcgg tggcctggaa gggtaccgcc ccgaaagggg

180

gaggcggggg ttatcgccgc ctctccgccc gaggatgcgg ctgcgcccta tcaggtagtt

240

ggcggggtaa cggcccgcca agcctaagac gggtaggggc cgtgggagcg ggagccccca

300

gatgggcact gagacaaggg cccaggccct acggggcgca ccaggcgcga aaactcgcca

360

atgcgggcaa ccgtgacggg gttaccccga gtgcccccat tacgggggct tttccccgct

420

gtaaacaggc gggggtaata agcggggggc aagtctggtg tcagccgccg cggtaatacc

480

agccccgcga gtggtcggga cgtttattgg gcctaaagcg cccgtagccg gcctggtagg

540

tcccctccta aaacccgggg ctcaaccccg ggggtggagg ggaaaccacc aggctagggg

600

gcgggagagg ccgagggtac tcccggggta ggggcgaaat ccgataatcc cgggaggacc

660

gccagtggcg aaggcgctcg gctggaacgc gcccgacggt gaggggcgaa agccggggga

720

gcgaaccgga ttagataccg ggtagtcccg gctgtaaacg atgcgggcta ggtgttgggt

780

gggcttcgag cccgcccagt gccgcaggga agccgttaag cccgccgcct ggggagtacg

840

gccgcaaggc tgaaacttaa aggaattggc gggggagcac cacaaggggt ggcaggtgcg

900

gcttaattgg agtcaacgcc gggaacctca ccgggggcga cagcaggatg aaggtcaggc

960

tgaagacctt acctgacgcg ctgagaggag gtgcatggcc gtcgccagct cgtgccgtga

1020

ggtgtccggt taagtccggc aacgagcgag acccccaccc ctacttgcta cccggggctc

1080

cggccccggg gcacagtagg gggactgccg ccgtataagg cggaggaagg agggggctat

1140

ggcaggtcag catgccccga aacccccggg ctgcacgcgg gctacaatgg cggggacagc

1200

gggttgcgac cccgaaaggg ggagcaaatc cctcaaaccc cgccgaggtt gggatcgagg

1260

gctgcaactc gccctcgtga acgcggaatc cctagtaacc gcacgttagc atcgtgcggt

1320

gaacacgtcc ctgctccttg cacacaccgc ccgtcgctcc acccgagggg acgggtnnnn

1380

aggcccccgt agggaaactc ccgggtatcc tcgaactccc tcctctcgag gggggagaag

1440

tcgtaacaag gtagccgtag gggaacctg

1469

<210> 1012

<211> 1414

<212> DNA

<213> Inquilinus limosus

<400> 1012

ttgaatcctg gctcagaacg aacgctggcg gcaggcctaa cacatgcaag tcgaacgccc

60

cgcaagggga gtggcgcacg ggtgagtaac acgtgggaac ctaccttctg gtacggaaca

120

accaagggaa actttggcta ataccgtata cgacctccgg gtgaaagatt tatctgccgg

180

aagaggggcc ccgcgtccga ttaggtagtt ggtggggtaa ccggcctacc aagccgacga

240

tcggtagctg gtctgagagg atgaccagcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc

300

tacgggaggc agcagtgggg aatattggac aatgggcgca agcctgatcc agccatgccg

360

cgtgagtgat gaaggccttc gggttgtaaa gctctttcac ccacgacgat gatgacggta

420

gtgggagaag aagccccggc taacttcgtg ccagcagccg cggtaatacg aagggggcaa

480

gcgttgttcg gaatgactgg gcgtaaaggg cgcgtaggcg gttcgttgcg tcagatgtga

540

aagccccggg ctcaacctgg gaactgcatt tgatacgggc gggcttgaat ccaagagagg

600

gtggtggaat tcccagtgta gaggtgaaat tcgtagatat tgggaagaac accagtggcg

660

aaggcggcca cctggcttgg cattgacgct gaggcgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

720

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgtgtgct agccgtcggg cagcttgctg

780

ttcggtggcg cagctaacgc gataagcaca ccgcctgggg agtacggtcg caagattaaa

840

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca

900

acgcgcagaa ccttaccaac ccttgacatg gggagtgtgg gcctgagaga tcgggtccgg

960

gtccttcagt tcggctggct cccacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt

1020

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caaccctcct cttcagttgc catcattgag

1080

ttgggcactc tggagatact gccggtgaca agccggagga aggcggggat gacgtcaagt

1140

cctcatggcc cttacgggtt gggctacaca cgtgctacaa tggcggtgac agtgggcagc

1200

gaaggggcga cctggagcta atccccaaaa gccgtctcag ttcggattgc actctgcaac

1260

tcgggtgcat gaagttggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcacgccgcg gtgaatacgt

1320

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt tggttttacc cgaagacggt

1380

gcgctgaccc gcaagggagg cagccggcca cggt

1414

<210> 1013

<211> 1473

<212> DNA

<213> Janibacter limosus

<400> 1013

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggtgaagctc cagcttgctg

60

gagtggatca gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagcaa cctgccccag actctggaat

120

aagcgctgga aacggcgtct aatactggat acgagaccaa cctgcatggg tatggtctgg

180

aaagtttttc ggtttgggat gggctcgcgg cctatcagct tgttggtgag gtaatggctc

240

accaaggcga cgacgggtag ccggcctgag agggcgaccg gccacactgg gactgagaca

300

cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc gaaagcctga

360

tgcagcgacg ccgcgtgagg gatgacggcc ttcgggttgt aaacctcttt cagcagggaa

420

gaagcgaaag tgacggtacc tgcagaagaa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg

480

gtaatacgta gggtgcgagc gttgtccgga attattgggc gtaaagagct tgtaggcggt

540

ttgtcgcgtc tgctgtgaaa atccggggct caaccccgga cttgcagtgg gtacgggcag

600

actagagtgt ggtaggggag actggaattc ctggtgtagc ggtgaaatgc gcagatatca

660

ggaggaacac cgatggcgaa ggcaggtctc tgggccacta ctgacgctga gaagcgaaag

720

catggggagc gaacaggatt agataccctg gtagtccatg ccgtaaacgt tgggaactag

780

gtgtgggtct cattccacga gatccgtgcc gcagctaacg cattaagttc cccgcctggg

840

gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag

900

catgcggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccaa ggcttgacat ataccggaaa

960

cttccagaga tggttgcccc ttttaggtcg gtatacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

1020

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aaccctcgtt ctatgttgcc

1080

agcacgtaat ggtggggact catggaagac tgccggggtc aactcggagg aaggtgggga

1140

tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtct tgggcttcac gcatgctaca atggccggta

1200

caaagggctg cgaaaccgca aggtggagcg aatcccaaaa aaccggtctc agttcggatt

1260

ggggtctgca actcgacccc atgaagtcgg agtcgctagt aatcgcagat cagcaacgct

1320

gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc aagtcacgaa agtcggtaac

1380

acccgaagcc ggtggcccaa cccttgtggg gggagccgtc gaaggtggga ctggcgattg

1440

ggactaagtc gtaacaaggt agccgtaccg gaa

1473

<210> 1014

<211> 1389

<212> DNA

<213> Janibacter melonis

<400> 1014

cgaacggtga actttggagc ttgctctaag gggatcagtg gcgaacgggt gagtaacacg

60

tgagtaacct gccccggact ctggaataag cgctggaaac ggcgtctaat accggatacg

120

agacgcaacc gcatggttag tgtctggaaa gtttttcggt ctgggatgga ctcgcggcct

180

atcagcttgt tggtgaggta atggctcacc aaggcgacga cgggtagccg gcctgagagg

240

gcgaccggcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

300

aatattgcac aatgggcgaa agcctgatgc agcgacgccg cgtgagggat gacggccttc

360

gggttgtaaa cctctttcag cagggaagaa gcgaaagtga cggtacctgc agaagaagca

420

ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg tgcgagcgtt gtccggaatt

480

attgggcgta aagagcttgt aggcggtttg tcgcgtctgc tgtgaaaatc cggggctcaa

540

ccccggactt gcagtgggta cgggcagact agagtgtggt aggggagact ggaattcctg

600

gtgtagcggt gaaatgcgca gatatcagga ggaacaccga tggcgaaggc aggtctctgg

660

gccactactg acgctgagaa gcgaaagcat ggggagcgaa caggattaga taccctggta

720

gtccatgccg taaacgttgg gcgctaggtg tgggactcat tccacgagtt ccgtgccgca

780

gctaacgcat taagcgcccc gcctggggag tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat

840

tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat gcggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc

900

ttaccaaggc ttgacatata ccggaaacat ccagagatgg gtgccccttt tggtcggtat

960

acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

1020

gagcgcaacc ctcgttctat gttgccagca cgtgatggtg gggactcata ggagactgcc

1080

ggggtcaact cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgtcttggg

1140

cttcacgcat gctacaatgg ccggtacaaa gggctgcgat accgcaaggt ggagcgaatc

1200

ccaaaaaacc ggtctcagtt cggattgggg tctgcaactc gaccccatga agtcggagtc

1260

gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1320

cccgtcaagt cacgaaagtc ggtaacaccc gaagccggtg gcccaaccct tgtgggggga

1380

gccgtcgaa

1389

<210> 1015

<211> 1496

<212> DNA

<213> Janthinobacterium sp. SY12

<400> 1015

tagagtttga tcatggctca gattgaacgc tggcggcatg ccttacacat gcaagtcgaa

60

cggcagcacg gagcttgctc tggtggcgag tggcgaacgg gtgagtaata tatcggaacg

120

taccctggag tgggggataa cgtagcgaaa gttacgctaa taccgcatac gatctacgga

180

tgaaagtggg ggatcgcaag acctcatgct cgtggagcgg ccgatatctg attagctagt

240

tggtagggta aaagcctacc aaggcatcga tcagtagctg gtctgagagg acgaccagcc

300

acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aattttggac

360

aatgggcgaa agcctgatcc agcaatgccg cgtgagtgaa gaaggccttc gggttgtaaa

420

gctcttttgt cagggaagaa acggtgaggg ctaatatccc ttgctaatga cggtacctga

480

agaataagca ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg tgcaagcgtt

540

aatcggaatt actgggcgta aagcgtgcgc aggcggcttt gtaagtctga tgtgaaatcc

600

ccgggctcaa cctgggaatt gcattggaga ctgcaaggct agaatctggc agaggggggt

660

agaattccac gtgtagcagt gaaatgcgta gatatgtgga ggaacaccga tggcgaaggc

720

agccccctgg gtcaagattg acgctcatgc acgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga

780

taccctggta gtccacgccc taaacgatgt ctactagttg tcgggtctta attgacttgg

840

taacgcagct aacgcgtgaa gtagaccgcc tggggagtac ggtcgcaaga ttaaaactca

900

aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggatgatgtg gattaattcg atgcaacgcg

960

aaaaacctta cctacccttg acatggctgg aatccctgag agattgggga gtgctcgaaa

1020

gagaaccagt acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt

1080

aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtcat tagttgctac gaaagggcac tctaatgaga

1140

ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcctcatgg cccttacggg

1200

tagggcttca cacgtcatac aatggtacat acagagcgcc gccaacccgc gagggggagc

1260

taatcgcaga aagtgtatcg tagtccggat tgtagtctgc aactcgactg catgaagttg

1320

gaatcgctag taatcgcgga tcagcatgtc gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac

1380

accgcccgtc acaccatggg agcgggtttt accagaagta ggtagcttaa ccgcaaggag

1440

ggcgcttacc acggtaggat tcgtgactgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgta

1496

<210> 1016

<211> 1478

<212> DNA

<213> Johnsonella ignava

<220>

<221> modified_base

<222> (37)..(37)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (86)..(86)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (408)..(408)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (452)..(452)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (477)..(477)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (480)..(480)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1338)..(1338)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1016

tgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca agtcgancgg agactttttc agtgcaacct

60

tcggggagca agagaagtct tagtgncgga cgggtgagta acgcgtgggc aacctgcctc

120

gcaccgtggg ataacagggg gaagctcctg ctaataccgc ataaagtata tagacgcatg

180

tcaatataca aaaagggata ccggtgagag atgggcccgc gtccgattag atagttggca

240

ggatagcagc ctaccaagtc aacgatcggt agccggcttg agagagtgga cggccacact

300

gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tggacaatgg

360

gggcaaccct gatccagcga cgccgcgtga gtgaagaagt atctcggnac gtaaagctct

420

atcagcaggg aagaaaaaag acggtacctg antaagaagc cccggctaac tacgtgncan

480

cagccgcggt aatacgtagg gggcaagcgt tatccggaat tactgggtgt aaagggagcg

540

tagacggcta tgcaagtctg gagtgaaatg ccggggctca accccggagc tgctctggaa

600

actgcgtggc ttgagtgtcg gaggggcagg cggaattccc agtgtagcgg tgaaatgcgt

660

agatattggg aggaacaccg gcggcgaagg cggcctgctg gacgacaact gacgttgagg

720

ctcgaaggcg tgggtagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgca gtaaacgatg

780

aatactaggt gtcggggagt taaatttccg gtgccggcgc aaacgcaata agtattccac

840

ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg

900

tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaagcctt gacatgccgg

960

tgaaggggga gtaaaatcct ctgccccttg gggcaccgga cacaggtggt gcatggttgt

1020

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac cctcattccc

1080

ggtagccagc agtaagatgg ggactccggg gagactgccg aggaagactc ggaggaaggc

1140

ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tggtttgggc tacacacgtg ctacaatggc

1200

gcagacagag ggaagcaagg ccgcgaggca gagcaaatct caaaaactgc gtctcagttc

1260

ggattgcagg ctgcaactcg cctgcatgaa gccggaatcg ctagtaatcg cagatcagaa

1320

tgctgcggtg aatacgtncc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtcgg

1380

caatgcccga agtcagtggc ccaaccgtaa ggagggagct gccgaaggca gggcggatga

1440

ccggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta tcggaagg

1478

<210> 1017

<211> 1523

<212> DNA

<213> Jonquetella anthropi

<400> 1017

gagagtttga tcctggctca ggataaacgc tggcggcgtg cttaacacat gcaagttgga

60

cgggaatact cgaggaagag acttcggtta attttttggg tatgagagta gcggacgggt

120

gagtaatgca taagaatcta tccatcagag ggggacaact gcgggaaacc ggagctaata

180

ccccgtaagc cggaaggtga aagggagcaa tccgctgatg gaggagcttg tgtcctatca

240

ggtagttggt gaggtaagag ctcaccaagc cgaagacggg tagccgggct gagaggttgt

300

acggccacat tggaactgag agacggtcca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata

360

ttgggcaatg ggcgaaagcc tgacccagcg acgccgcgtg agggaagacg gccttcgggt

420

tgtaaacctc tgttgcaggg gaagaaggaa gtgacggtac cctgcgagga agctccggca

480

aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggagcgag cgttatccgg aattactggg

540

cgtaaagggc gcgtaggcgg aatgacaagt cagcaagtga aagcgtgggg ctcaacccca

600

tgatgcggct gaaactgtta ttctagaggc atggagaggc aaacggaatt cccggtgtag

660

cggtgaaatg cgtagatatc gggaagaaca ccagtggcga aggcggtttg ctggccatga

720

actgacgctc atagcgcgaa agctagggta gcaaacggga ttagataccc cggtagtcct

780

agcagtaaac gatgtatgct gggtgtgggt gtagcgatac atccgtgccg aagttaacgc

840

gataagcata ccgcctgggg agtacggtcg caagattgaa actcaaagga attgacgggg

900

gcccgcacaa gcggtggagc acgtggttta attcgatgca aaccgaagaa ccttacctgg

960

gcttgacatg taaggaaagg tgtatggaga cgtacaagtg tactgcttcg gtagtacgcc

1020

ttacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg

1080

caacgagcgc aacccctatt gccagttgct aacaggtaga gctgagcact caggcgagac

1140

tgccgccgac aaggtggagg aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatggc ccttatgccc

1200

agggccacac acatgctaca atggccggta caaagggaag cgaggctgcg aagcggagcg

1260

aaccccaaaa gccggtccca gttcggattg cagtctgcaa ctcgactgca tgaagttgga

1320

atcgctagta atcgcgaatc agcgaagtcg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccatccga gttggatgca ctccaagtcg gtatctcaac cgcaaggggg

1440

gagccgccca aagtgtgtct ggtgaggagg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtaccgga

1500

aggtgcggct ggatcacctc ctt

1523

<210> 1018

<211> 1414

<212> DNA

<213> Kerstersia gyiorum

<400> 1018

gcgggatgct ttacacatgc aagtcgaacg gcagcacgag gagcttgctc cttggtggcg

60

agtggcgaac gggtgagtaa tatatcggaa catgcccagt agcgggggat aactactcga

120

aagagtggct aataccgcat acgtcctacg ggagaaagca ggggaccttc gggccttgca

180

ctattggagt ggccgagatc ggattagcta gttggtgggg taaaggccta ccaaggcgac

240

gatccgtagc tggtttgaga ggacgaccag ccacactggg actgagacac ggcccagact

300

cctacgggag gcagcagtgg ggaattttgg acaatggggg aaaccctgat ccagccatcc

360

cgcgtgtgcg atgaaggcct tcgggttgta aagcactttt gtcaggaaag aaatcgcccg

420

ggataatacc tcgggtggat gacggtacct gaagaataag caccggctaa ctacgtgcca

480

gcagccgcgg taatacgtag ggtgcaagcg ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgtgc

540

gcaggcggtt cggaaagaaa gatgtgaaat cccagggctt aaccttggaa ctgcattttt

600

aactaccggg ctagagtgtg tcagaggggg gtggaattcc gcgtgtagca gtgaaatgcg

660

tagatatgcg gaggaacacc gatggcgaag gcagccccct gggataacac tgacgctcat

720

gcacgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cctaaacgat

780

gtcaactagc tgttggggcc ttcgggcctt agtagcgcag ctaacgcgtg aagttgaccg

840

cctggggagt acggtcgcaa gattaaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg

900

gtggatgatg tggattaatt cgatgcaacg cgaaaaacct tacctaccct tgacatgtct

960

ggaatcccga agagatttgg gagtgctcgc aagagaaccg gaacacaggt gctgcatggc

1020

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc

1080

attagttgct acgaaagggc actctaatga gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg

1140

ggatgacgtc aagtcctcat ggcccttatg ggtagggctt cacacgtcat acaatggtcg

1200

ggacagaggg ttgccaaacc gcgaggtgga gctaatctca gaaacccgat cgtagtccgg

1260

attgtagtct gcaactcgac tacatgaagt cggaatcgct agtaatcgcg gatcagaatg

1320

tcgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt

1380

ctaccagaag tagttagcct aaccgcaagg aggg

1414

<210> 1019

<211> 1541

<212> DNA

<213> Kingella denitrificans

<400> 1019

ttgaacataa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggcatgct ttacacatgc

60

aagtcggacg gcagcggggg tgcttgcacc tgccggcgag tggcgaacgg gtgagtaaca

120

tattggaatg taccgagtag tgggggataa ccaatcgaaa gattggctaa taccgcatac

180

gtcctgaggg ggaaagcagg ggatcttcgg accttgcgct atttgagcag ccaatatctg

240

attagctagt tggtggggta aaggcccacc aaggcgacga tcagtagcgg gtctgagagg

300

atgatccgcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

360

aattttggac aatgggggca accctgatcc agccatgccg cgtgtctgaa gaaggccttc

420

gggttgtaaa ggacttttgt tagggaagaa aagggaagtg ttaataccac tttttgttga

480

cggtacctaa agaataagca ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg

540

tgcgagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgagcgc agacggttac ttaagcagga

600

tgtgaaatcc ccgggctcaa cctgggaact gcgttctgaa ctgggtagct agagtatgtc

660

agaggggggt agaattccac gtgtagcagt gaaatgcgta gagatgtgga ggaataccga

720

tggcgaaggc agccccctgg gataatactg acgttcatgc tcgaaagcgt gggtagcaaa

780

caggattaga taccctggta gtccacgccc taaacgatgt cgattagctg ttgggcaact

840

tgattgctta gtagcgtagc taacgcgtga aatcgaccgc ctggggagta cggtcgcaag

900

attaaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggatgatgt ggattaattc

960

gatgcaacgc gaagaacctt acctggtctt gacatgtacg gaagaactca gagacgagtt

1020

tgtgccttcg ggagccgtaa cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1080

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcatt agttgccatc atttagttgg

1140

gcactctaat gagactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcctc

1200

atggccctta tgaccagggc ttcacacgtc atacaatggt cggtacagag ggtagccaag

1260

ccgcgaggtg gagccaatcc cagaaaaccg atcgtagtcc ggattgcact ctgcaactcg

1320

agtgcatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg caggtcagca tactgcggtg aatacgttcc

1380

cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ggataccaga agtaggtagg

1440

gtaaccgcaa ggagcccgct taccacggta tgcttcatga ctggggtgaa gtcgtaacaa

1500

ggtagccgta ggggaacctg cggctggatc acctcctttc t

1541

<210> 1020

<211> 1288

<212> DNA

<213> Kingella genomosp. P1 oral cone MB2_C20

<400> 1020

cgctggcggc atgctttaca catgcaagtc gaacgagtgg cgaacgggtg agtaagatat

60

tggaacgtac cgagtaatgg gggataacta tccgaaagga tagctaatac cgcatacgga

120

aagacgttat tcgagcggcc aataactgat tagctagttg gaggggtaaa ggcccaccaa

180

ggcgacgatc agtagcgggt ctgagaggat gatccgccac actgggactg agacacggcc

240

cagactccta cgggaggcag cagtggggaa ttttggacaa tgggcgcaag cctgatccag

300

ccatgccgcg tgtctgaaga aggccttcgg gttgtaaagg acttttgtta gggaagatga

360

cggtacctaa agaataagca ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg

420

tgcgagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgagcgc agacggttta ttaagcaaga

480

tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcgttttgaa ctggtaggct agagtatgtc

540

agaggggggt agaattccac gtgtagcagt gaaatgcgta gatatcaaga agaataccta

600

ttgcgaaggc gatctgctgg aactactgac gctaatgcgt gaaagcgtgg ggagcaaaca

660

ggattagata ccctggtagt ccacgcccta aacgatgtat accggttgtt gctgcggcag

720

taatccacct aacggattaa gtataccgcc tggggagtac ggtcgcaaga ttaaaactca

780

aaggaataga cggggacccg cacaagcggt ggatgatgtg gattaattcg atgcaacgcg

840

aagaacctta cctggtcttg acatgcacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg

900

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg tcattagttg ccaccatggg

960

cactctaatg agactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcctca

1020

tggcccttat gaccagggct tcacacgtca tacaatggtc ggcagagggt agccaaaccg

1080

cgaggtggag ccaatctcag ccgatcgtag tccggatgca ctctgcaact cgagtgcaga

1140

agtcggaatc gctagtaatc gcaggtcagc atactgcggt gaatacgttc ccgggtcttg

1200

tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtgg gggataccag aagtaggtgg ctaggccgct

1260

taccacggta tgtttcatga ctggggtg

1288

<210> 1021

<211> 1541

<212> DNA

<213> Kingella kingae

<400> 1021

ttgaacataa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggcatgct ttacacatgc

60

aagtcggacg gcagcacgag tacttgtact tggtggcgag tggcgaacgg gtgagtaata

120

tattggaacg taccgagtaa tgggggataa ctatccgaaa ggatagctaa taccgcatac

180

gctttgagaa ggaaagcagg ggatcttcgg accttgcgtt attcgagcgg ccaataactg

240

attagctagt tggtggggta agggcccacc aaggcgacga tcagtagtgg gtctgagagg

300

atgatccgcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

360

aattttggac aatgggcgaa agcctgatcc agccatgccg cgtgtctgaa gaaggccttc

420

gggttgtaaa ggacttttgt tagggaagaa aaggttgatg ctaatatcat taactgatga

480

cggtacctaa agaataagca ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg

540

tgcgagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgagcgc agacggttag ttaagcaaga

600

tgtgaaatcc ccgagctcaa cttgggaact gcgttttgaa ctggctagct agagtgtgtc

660

agaggggggt agaattccac gtgtagcagt gaaatgcgta gagatgtgga ggaataccga

720

tggcgaaggc agccccctgg gataacactg acgttcatgc tcgaaagcgt gggtagcaaa

780

caggattaga taccctggta gtccacgccc taaacgatgt caattagctg ttgggcaact

840

tgattgctta gtagcgtagc taacgcgtga aattgaccgc ctggggagta cggtcgcaag

900

attaaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggatgatgt ggattaattc

960

gatgcaacgc gaagaacctt acctggtctt gacatgtacg gaagagagta gagatactct

1020

tgtgccttcg ggagccgtag cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1080

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcatt agttgccatc attaagttgg

1140

gcactctaat gagactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcctc

1200

atggccctta tgaccagggc ttcacacgtc atacaatggt cggtacagag ggtagccaag

1260

ccgcgaggtg gagccaatcc cagaaaaccg atcgtagtcc ggattgcact ctgcaactcg

1320

agtgcatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg caggtcagca tactgcggtg aatacgttcc

1380

cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ggataccaga agtagatagg

1440

gtaaccgcaa ggagcccgtt taccacggta tgtttcatga ctggggtgaa gtcgtaacaa

1500

ggtagccgta ggggaacctg cggctggatc acctcctttc t

1541

<210> 1022

<211> 1547

<212> DNA

<213> Kingella oralis

<400> 1022

aacataagag tttgatcctg gctcagattg aacgctggcg gcatgcttta cacatgcaag

60

tcgaacggca gcacgaaaga gcttgctctt ttggtggcga gtggcgaacg ggtgagtaat

120

gcatcggaac gtaccgagta atgggggata actatccgaa aggatagcta ataccgcata

180

cgctttgaga aggaaagtgg gggctcttcg gacctcacgt tattcgagcg gccgatgtct

240

gattagctag ttggtggggt aaaggcctac caaggcgacg atcagtagcg ggtctgagag

300

gatgatccgc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaattttgga caatgggcgc aagcctgatc cagccatgcc gcgtgtctga agaaggcctt

420

cgggttgtaa aggacttttg ttagggaaga aaaggatagt gttaatacca ttatctgctg

480

acggtaccta aagaataagc accggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg

540

gtgcgagcgt taatcggaat tactgggcgt aaagcgagcg cagacggttt attaagcaag

600

atgtgaaatc cccgagctta acttgggaac tgcgttttga actggtaagc tagagtatgt

660

cagagggggg tagaattcca cgtgtagcag tgaaatgcgt agagatgtgg aggaataccg

720

atggcgaagg cagccccctg ggataatact gacgttcatg ctcgaaagcg tgggtagcaa

780

acaggattag ataccctggt agtccacgcc ctaaacgatg tcaattagct gttgggcaac

840

atgattgctt agtagcgtag ctaacgcgtg aaattgaccg cctggggagt acggtcgcaa

900

gattaaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggatgatg tggattaatt

960

cgatgcaacg cgaagaacct tacctggtct tgacatgtac ggaatcttcc agagacggaa

1020

gagtgccttc gggagccgta acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1080

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtcat tagttgccac cattcagttg

1140

ggcactctaa tgagactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcct

1200

catggccctt atgaccaggg cttcacacgt catacaatgg tcggtacaga gggtagccaa

1260

gccgcgaggt ggagccaatc tcagaaaacc gatcgtagtc cggattgcac tctgcaactc

1320

gagtgcatga agtcggaatc gctagtaatc gcaggtcagc atactgcggt gaatacgttc

1380

ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtgg gggataccag aagtaggtag

1440

gctaaccgca aggaggccgc ttaccacggt atgtttcatg actggggtga agtcgtaaca

1500

aggtagccgt aggggaacct gcggctggat cacctccttt ctagaga

1547

<210> 1023

<211> 1360

<212> DNA

<213> Kingella sp. oral clone ID059

<400> 1023

gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggcatgct ttacacatgc aagtcggacg

60

agtggcgaac gggtgagtaa tatattggaa cgtaccgagt agtgggggat aactaagcga

120

aagtttggct aataccgcat acggaaaggc gctatttgag cggccaatat ctgattagct

180

agttggtggg gtaagggctt accaaggcga tgatcagtag cgggtctgag aggatgatcc

240

gccacactgg gactgagaga cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaattttg

300

gacaatgggg gcaaccctga tccagccatg ccgcgtgtct gaagaaggcc ttcgggttgt

360

aaaggacttt tgttagggaa gatgacggta cctaaagaat aagcaccggc taactacgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcga gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg

480

agcgcagacg gttatttaag tcagatgtga aatccccgag cttaacttgg gaactgcgtt

540

tgaaactggg taactagagt atgtcagagg ggggtagaat tccacgtgta gcagtgaaat

600

gcgtagagat gtggaggaat accgatggcg aaggcagccc cctgggataa ctgacgttca

660

tgctcgaaag cgtgggtagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccctaaacga

720

tgtcaattag ctgttggtgc attagtagcg aagctaacgc gtgaaattga ccgcctgggg

780

agtacggtcg caagattaaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcgatggatg

840

atgtggatta attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatg cacaggtgct

900

gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccttgtcatt agttgccatc atgggcactc taatgagact gccggtgaca aaccggagga

1020

aggtggggat gacgtcaagt cctcatggcc cttatgacca gggcttcaca cgtcatacaa

1080

tggtcggcag agggtagcca agccgcgagg tggagccaat cccaaccgat cgtagtccgg

1140

atgcactctg caactcgagt gcagaagtcg gaatcgctag taatcgcagg tcagcatact

1200

gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggggat

1260

accagaagta ggtgaatagt tcgcttacca cggtatgttt catgactggg gtgaagtcgt

1320

aacaaggtag ccgtagggga acctgcggct ggaacacctc

1360

<210> 1024

<211> 1021

<212> DNA

<213> Klebsiella oxytoca

<220>

<221> modified_base

<222> (741)..(742)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (969)..(969)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (974)..(975)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (985)..(985)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1001)..(1001)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1024

gcacagagag cttgctctcg ggtgacgagt ggcggacggg tgagtaatgt ctgggaaact

60

gcctgatgga gggggataac tactggaaac ggtagctaat accgcataac gtcgcaagac

120

caaagagggg gaccttcggg cctcttgcca tcagatgtgc ccagatggga ttagctagta

180

ggtggggtaa cggctcacct aggcgacgat ccctagctgg tctgagagga tgaccagcca

240

cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca

300

atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtatgaag aaggccttcg ggttgtaaag

360

tactttcagc ggggaggaag ggagtaaggt taataacctt gttcattgac gttacccgca

420

gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggt gcaagcgtta

480

atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtctgt caagtcggat gtgaaatccc

540

cgggctcaac ctgggaactg cattcgaaac tggcaggctg gagtcttgta gaggggggta

600

gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccggt ggcgaaggcg

660

gccccctgga caaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

720

accctggtag tccacgctgt nncgatgtcg acttggaggt tgttcccttg aggagtggct

780

tccggagcta acgcgttaag tcgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt taaaactcaa

840

atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga tgcaacgcga

900

agaaccttac ctactcttga catccagaga acttagcaga gatgctttgg tgccttcggg

960

aactctgana cagnngctgc atggntgtcg tcagctcgtg ntgtgaaatg ttgggttaag

1020

t

1021

<210> 1025

<211> 1399

<212> DNA

<213> Klebsiella pneumoniae

<400> 1025

tcgagcggta gcacagagag cttgctctcg ggtgacgagc ggcggacggg tgagtaatgt

60

ctgggaaact gcctgatgga gggggataac tactggaaac ggtagctaat accgcataac

120

gtcgcaagac caaagtgggg gaccttcggg cctcatgcca tcagatgtgc ccagatggga

180

ttagctagta ggtggggtaa cggctcacct aggcgacgat ccctagctgg tctgagagga

240

tgaccagcca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga

300

atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtgtgaag aaggccttcg

360

ggttgtaaag cactttcagc ggggaggaag gcgttaaggt taataacctt gtcgattgac

420

gttacccgca gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggt

480

gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtctgt caagtcggat

540

gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg cattcgaaac tggcaggcta gagtcttgta

600

gaggggggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccggt

660

ggcgaaggcg gccccctgga caaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac

720

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgtc gatttggagg ttgtgccctt

780

gaggcgtggc ttccggagct aacgcgttaa atcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg

840

ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

900

atgcaacgcg aagaacctta cctggtcttg acatccacag aactttaggc ggtctgtcta

960

gtcgcatgtg gaactgtgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gttgtgaaat

1020

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg gttcggccgg

1080

gaactcaaag gagactgcca gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc

1140

atggccctta cgaccagggc tacacacgtg ctacaatggc atatacaaag agaagcgacc

1200

tcgcgagagc aagcggacct cataaagtat gtcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg

1260

actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg tagatcagaa tgctacggtg aatacgttcc

1320

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgcaaaaga agtaggtagc

1380

ttaaccttcg ggagggcgc

1399

<210> 1026

<211> 1277

<212> DNA

<213> Klebsiella sp. AS10

<400> 1026

cagattgaac gctggcggca ggcctaacac atgcaagtcg aacgagtggc ggacgggtga

60

gtaatgtctg ggaaactgcc tgatggaggg ggataactac tggaaacggt agctaatacc

120

gcataaccaa agttgccatc agatgtgccc agatgggatt agctagtagg tggggtaacg

180

gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg accagccaca ctggaactga

240

gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc

300

ctgatgcagc catgccgcgt gtatgaagaa ggccttcggg ttgtaaagta ctttcagcgg

360

ggaggatgac gttacccgca gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa

420

tacggagggt gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtctgt

480

caagtcggat gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg cattcgaaac tggcaggctg

540

gagtcttgta gaggggggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag

600

gaataccggt ggcgaaggcg gccccctgga caaactgacg ctcaggtgcg aaagcgtggg

660

gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgctgtaa acgatgtcga cttggaggtt

720

gttagtggct tccggagcta acgcgttaag tcgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt

780

taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga

840

tgcaacgcga agaaccttac ctactcttga catcgacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag

900

ctcgtgttgt gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc

960

cagcggccgg gaactcaaag gagactgcca gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg

1020

tcaagtcatc atggccctta cgagtagggc tacacacgtg ctacaatggc atacaaagag

1080

aagcgacctc gcgagagcaa gcggacctca ttatgtcgta gtccggatgg agtctgcaac

1140

tcgactccag aagtcggaat cgctagtaat cgtggatcag aatgccacgg tgaatacgtt

1200

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggtg

1260

cttagggcgc ttaccac

1277

<210> 1027

<211> 1398

<212> DNA

<213> Klebsiella sp. Co9935

<400> 1027

tcgaacggta gcacagagag cttgctctcg ggtgacgagt ggcggacggg tgagtaatgt

60

ctgggaaact gcccgatgga gggggataac tactggaaac ggtagctaat accgcataac

120

gtcgcaagac caaagagggg gaccttcggg cctcttgcca tcggatgtgc ccagatggga

180

ttagcttgta ggtgaggtaa cggctcacct aggcgacgat ccctagctgg tctgagagga

240

tgaccagcca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga

300

atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtatgaag aaggccttcg

360

ggttgtaaag tactttcagc ggggaggaag ggagtgaggt taataacctt attcattgac

420

gttacccgca gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggt

480

gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtctgt caagtcggat

540

gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg cattcgaaac tggcaggctg gagtcttgta

600

gaggggggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccggt

660

ggcgaaggcg gccccctgga caaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac

720

aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacgatgtc gacttggagg ttgttccctt

780

gaggagtggc ttccggagct aacgcgttaa gtcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg

840

ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

900

atgcaacgcg aagaacctta cctactcttg acatccagag aatttagcag agatgctttg

960

gtgccttcgg gaaccgtgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gttgtgaaat

1020

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg attcggtcgg

1080

gaactcaaag gagactgcca gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc

1140

atggccctta cgagtagggc tacacacgtg ctacaatggc atatacaaag agaagcgacc

1200

tcgcgagagc aagcggacct cataaagtat gtcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg

1260

actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg tggatcagaa tgccacggtg aatacgttcc

1320

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgcaaaaga agtaggtagc

1380

ttaaccttcg ggagggcg

1398

<210> 1028

<211> 1282

<212> DNA

<213> Klebsiella sp. OBRC7

<400> 1028

tggctcagat tgaacgctgg cggcaggcct aacacatgca agtcgaacga gtggcggacg

60

ggtgagtaat gtctgggaaa ctgcctgatg gagggggata actactggaa acggtagcta

120

ataccgcata accaaagttg ccatcagatg tgcccagatg ggattagcta gtaggtgggg

180

taacggctca cctaggcgac gatccctagc tggtctgaga ggatgaccag ccacactgga

240

actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg

300

caagcctgat gcagccatgc cgcgtgtatg aagaaggcct tcgggttgta aagtactttc

360

agcggggagg atgacgttac ccgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc

420

ggtaatacgg agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg

480

tctgtcaagt cggatgtgaa atccccgggc tcaacctggg aactgcattc gaaactggca

540

ggctggagtc ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc

600

tggaggaata ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaac tgacgctcag gtgcgaaagc

660

gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc tgtaaacgat gtcgacttgg

720

aggttgttag tggcttccgg agctaacgcg ttaagtcgac cgcctgggga gtacggccgc

780

aaggttaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

840

ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctact cttgacatcg acaggtgctg catggctgtc

900

gtcagctcgt gttgtgaaat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt

960

gttgccagcg gccgggaact caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga

1020

tgacgtcaag tcatcatggc ccttacgagt agggctacac acgtgctaca atggcataca

1080

aagagaagcg acctcgcgag agcaagcgga cctcattatg tcgtagtccg gatggagtct

1140

gcaactcgac tccagaagtc ggaatcgcta gtaatcgtgg atcagaatgc cacggtgaat

1200

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttg caaaagaagt

1260

aggtgcttag ggcgcttacc ac

1282

<210> 1029

<211> 1237

<212> DNA

<213> Klebsiella sp. SP-BA

<220>

<221> modified_base

<222> (358)..(358)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (369)..(370)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1029

aagtcgagcg agcggcggac gggtgagtaa tgtctgggaa actgcctgat ggagggggat

60

aactactgga aacggtagct aataccgcat aatcaaagat gccatcagat gtgcccagat

120

gggattagct agtaggtggg gtaacggctc acctaggcga cgatccctag ctggtctgag

180

aggatgacca gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg

240

gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagccatg ccgcgtgtgt gaagaaggcc

300

ttcgggttgt aaagcacttt cagcggggag gatgacgtta cccgcagaag aagcaccngc

360

taactccgnn ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg

420

gcgtaaagcg cacgcaggcg gtctgtcaag tcggatgtga aatccccggg ctcaacctgg

480

gaactgcatt cgaaactggc aggctagagt cttgtagagg ggggtagaat tccaggtgta

540

gcggtgaaat gcgtagagat ctggaggaat accggtggcg aaggcggccc cctggacaaa

600

ctgacgctca ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg

660

ccgtaaacga tgtcgatttg gaggttgtgc gtggcttccg gagctaacgc gttaaatcga

720

ccgcctgggg agtacggccg caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa

780

gcggtggagc atgtggttta attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc

840

gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa tgttgggtta agtcccgcaa

900

cgagcgcaac ccttatcctt tgttgccagc ggccgggaac tcaaaggaga ctgccagtga

960

taaactggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgg cccttacgac cagggctaca

1020

cacgtgctac aatggcatac aaagagaagc gacctcgcga gagcaagcgg acctcattat

1080

gtcgtagtcc ggatggagtc tgcaactcga ctccagaagt cggaatcgct agtaatcgta

1140

gatcagaatg ctacggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg

1200

ggagtgggtt gcaaaagaag taggtgctta gggcgct

1237

<210> 1030

<211> 1509

<212> DNA

<213> Klebsiella sp. SRC_DSD11

<400> 1030

ccgcagagtt tgatcctggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc

60

gagcggtagc acagagagct tgctctcggg tgacgagcgg cggacgggtg agtaatgtct

120

gggaaactgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt

180

cgcaagacca aagtggggga ccttcgggcc tcatgccatc agatgtgccc agatgggatt

240

agctagtagg tggggtaacg gctcacctag gcgacgatcc ctagccggtc tgagaggatg

300

accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

360

attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg

420

ttgtaaagca ctttcagcgg ggaggaaggc gtcaaggtta ataaccttgg cgattgacgt

480

tacccgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc

540

aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg cggtctgtca agtcggatgt

600

gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca ttcgaaactg gcaggctaga gtcttgtaga

660

ggggggtaga attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga ataccggtgg

720

cgaaggcggc cccctggaca aagactgacg ctcaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgtcga tttggaggtt gtgcccttga

840

ggcgtggctt ccggagctaa cgcgttaaat cgaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt

900

aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat

960

gcaacgcgaa gaaccttacc tggtcttgac atccacagaa ctttccagag atggattggt

1020

gccttcggga actgtgagac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt tgtgaaatgt

1080

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcctttgt tgccagcggt ccggccggga

1140

actcaaagga gactgccagt gataaactgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat

1200

ggcccttacg accagggcta cacacgtgct acaatggcat atacaaagag aagcgacctc

1260

gcgagagcaa gcggacctca taaagtatgt cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac

1320

tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgta gatcagaatg ctacggtgaa tacgttcccg

1380

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaaaagaag taggtagctt

1440

aaccttcggg agggcgctta ccactttgtg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1500

taaccgtag

1509

<210> 1031

<211> 1006

<212> DNA

<213> Klebsiella sp. SRC_DSD12

<220>

<221> modified_base

<222> (952)..(952)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (957)..(957)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (962)..(962)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (971)..(973)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (984)..(985)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (995)..(995)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1031

tcgagcggta gcacagagag cttgctctcg ggtgacgagc ggcggacggg tgagtaatgt

60

ctgggaaact gcctgatgga gggggataac tactggaaac ggtagctaat accgcataat

120

gtcgcaagac caaagtgggg gaccttcggg cctcatgcca tcagatgtgc ccagatggga

180

ttagctagta ggtggggtaa cggctcacct aggcgacgat ccctagctgg tctgagagga

240

tgaccagcca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga

300

atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtgtgaag aaggccttcg

360

ggttgtaaag cactttcagc ggggaggaag gcggtgaggt taataacctt gtcgattgac

420

gttacccgca gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggt

480

gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtctgt caagtcggat

540

gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg cattcgaaac tggcaggcta gagtcttgta

600

gaggggggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccggt

660

ggcgaaggcg gccccctgga caaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac

720

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgtc gatttggagg ttgtgccctt

780

gaggcgtggc ttccggagct aacgcgttaa atcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg

840

ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

900

atgcaacgcg aagaacctta cctggtcttg acatccacag aactttccag anatggnttg

960

gngccttcgg nnntgtgaga cagnngctgc atggntgtcg tcagct

1006

<210> 1032

<211> 1504

<212> DNA

<213> Klebsiella sp. SRC_DSD15

<400> 1032

agagtttgat cctggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc

60

ggtagcacag agagcttgct ctcgggtgac gagcggcgga cgggtgagta atgtctggga

120

aactgcctga tggaggggga taactactgg aaacggtagc taataccgca taacgtcgca

180

agaccaaagt gggggacctt cgggcctcat gccatcagat gtgcccagat gggattagct

240

agtaggtggg gtaacggctc acctaggcga cgatccctag ccggtctgag aggatgacca

300

gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

360

cacaatgggc gcaagcctga tgcagccatg ccgcgtgtgt gaagaaggcc ttcgggttgt

420

aaagcacttt cagcggggag gaaggcgtca aggttaataa ccttggcgat tgacgttacc

480

cgcagaagaa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga gggtgcaagc

540

gttaatcgga attactgggc gtaaagcgca cgcaggcggt ctgtcaagtc ggatgtgaaa

600

tccccgggct caacctggga actgcattcg aaactggcag gctagagtct tgtagagggg

660

ggtagaattc caggtgtagc ggtgaaatgc gtagagatct ggaggaatac cggtggcgaa

720

ggcggccccc tggacaaaga ctgacgctca ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgtcgatttg gaggttgtgc ccttgaggcg

840

tggcttccgg agctaacgcg ttaaatcgac cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa

900

ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa

960

cgcgaagaac cttacctggt cttgacatcc acagaacttt ccagagatgg attggtgcct

1020

tcgggaactg tgagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgttgtg aaatgttggg

1080

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc ctttgttgcc agcggtccgg ccgggaactc

1140

aaaggagact gccagtgata aactggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc

1200

cttacgacca gggctacaca cgtgctacaa tggcatatac aaagagaagc gacctcgcga

1260

gagcaagcgg acctcataaa gtatgtcgta gtccggattg gagtctgcaa ctcgactcca

1320

tgaagtcgga atcgctagta atcgtagatc agaatgctac ggtgaatacg ttcccgggcc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggttgcaa aagaagtagg tagcttaacc

1440

ttcgggaggg cgcttaccac tttgtgattc atgactgggg tgaagtcgta acaaggtaac

1500

cgta

1504

<210> 1033

<211> 1506

<212> DNA

<213> Klebsiella sp. SRC_DSD1

<400> 1033

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc

60

ggtagcacag agagcttgct ctcgggtgac gagcggcgga cgggtgagta atgtctggga

120

aactgcctga tggaggggga taactactgg aaacggtagc taataccgca taatgtcgca

180

agaccaaagt gggggacctt cgggcctcat gccatcagat gtgcccagat gggattagct

240

agtaggtggg gtaacggctc acctaggcga cgatccctag ctggtctgag aggatgacca

300

gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

360

cacaatgggc gcaagcctga tgcagccatg ccgcgtgtgt gaagaaggcc ttcgggttgt

420

aaagcacttt cagcggggag gaaggcggtg aggttaataa cctcatcgat tgacgttacc

480

cgcagaagaa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga gggtgcaagc

540

gttaatcgga attactgggc gtaaagcgca cgcaggcggt ctgtcaagtc ggatgtgaaa

600

tccccgggct caacctggga actgcattcg aaactggcag gctagagtct tgtagagggg

660

ggtagaattc caggtgtagc ggtgaaatgc gtagagatct ggaggaatac cggtggcgaa

720

ggcggccccc tggacaaaga ctgacgctca ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgtcgatttg gaggttgtgc ccttgaggcg

840

tggcttccgg agctaacgcg ttaaatcgac cgcctggggg agtacggccg caaggttaaa

900

actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgca

960

acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc cacagaactt tccagagatg gattggtgcc

1020

ttcgggaact gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt gaaatgttgg

1080

gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcggtccg gccgggaact

1140

caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatggc

1200

ccttacgacc agggctacac acgtgctaca atggcatata caaagagaag cgacctcgcg

1260

agagcaagcg gacctcataa agtatgtcgt agtccggatt ggagtctgca actcgactcc

1320

atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtagat cagaatgcta cggtgaatac gttcccgggc

1380

cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca aaagaagtag gtagcttaac

1440

cttcgggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg gtgaagtcgt aacaaggtaa

1500

ccgtag

1506

<210> 1034

<211> 1506

<212> DNA

<213> Klebsiella sp. SRC_DSD2

<400> 1034

agagtttgat cctggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc

60

ggtagcacag agagcttgct ctcgggtgac gagcggcgga cgggtgagta atgtctggga

120

aactgcctga tggaggggga taactactgg aaacggtagc taataccgca taacgtcgca

180

agaccaaagt gggggacctt cgggcctcat gccatcagat gtgcccagat gggattagct

240

agtaggtggg gtaacggctc acctaggcga cgatccctag ccggtctgag aggatgacca

300

gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

360

cacaatgggc gcaagcctga tgcagccatg ccgcgtgtgt gaagaaggcc ttcgggttgt

420

aaagcacttt cagcggggag gaaggcgtca aggttaataa ccttggcgat tgacgttacc

480

cgcagaagaa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga gggtgcaagc

540

gttaatcgga attactgggc gtaaagcgca cgcaggcggt ctgtcaagtc ggatgtgaaa

600

tccccgggct caacctggga actgcattcg aaactggcag gctagagtct tgtagagggg

660

ggtagaattc caggtgtagc ggtgaaatgc gtagagatct ggaggaatac cggtggcgaa

720

ggcggccccc tggacaaaga ctgacgctca ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgtcgatttg gaggttgtgc ccttgaggcg

840

tggcttccgg agctaacgcg ttaaatcgac cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa

900

ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa

960

cgcgaagaac cttacctggt cttgacatcc acagaacttt ccagagatgg attggtgcct

1020

tcgggaactg tgagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgttgtg aaatgttggg

1080

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc ctttgttgcc agcggtccgg ccgggaactc

1140

aaaggagact gccagtgata aactggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc

1200

cttacgacca gggctacaca cgtgctacaa tggcatatac aaagagaagc gacctcgcga

1260

gagcaagcgg acctcataaa gtatgtcgta gtccggattg gagtctgcaa ctcgactcca

1320

tgaagtcgga atcgctagta atcgtagatc agaatgctac ggtgaatacg ttcccgggcc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggttgcaa aagaagtagg tagcttaacc

1440

ttcgggaggg cgcttaccac tttgtgattc atgactgggg tgaagtcgta acaaggtaac

1500

cgtagc

1506

<210> 1035

<211> 1497

<212> DNA

<213> Klebsiella sp. SRC_DSD6

<400> 1035

agagtttgat cctggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc

60

ggtagcacag agagcttgct ctcgggtgac gagcggcgga cgggtgagta atgtctggga

120

aactgcctga tggaggggga taactacgga aacggtagct aataccgcat aatgtcgcaa

180

gaccaaagtg ggggaccttc gggcctcatg ccatcagatg tgcccagatg ggattagcta

240

gtaggtgggg taacggctca cctaggcgac gatccctagc tggtctgaga ggatgaccag

300

ccacactgga actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc

360

acaatgggcg caagcctgat gcagccatgc cgcgtgtgtg aagaaggcct tcgggttgta

420

aagcactttc agcggggagg aaggcgttaa ggttaataac cttggcgatt gacgttaccc

480

gcagaagaag caccggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag ggtgcaagcg

540

ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgcac gcaggcggtc tgtcaagtcg gatgtgaaat

600

ccccgggctc aacctgggaa ctgcattcga aactggcagg ctagagtctt gtagaggggg

660

tagaattcca ggtgtagcgg tgaaatgcgt agagatctgg gggaataccg gtggcgaagc

720

ggccccctgg acaaagactg acgctcagtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

780

accctggtag tcccgccgta aacatgtcga tttggaggtt gtgcccttga ggcgtggctt

840

ccggagctaa cgcgttaaat cgacccctgg ggagtacggc cgcaaggtta aaactcaaat

900

gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt aattcgatgc aacgcgaaga

960

accttacctg gtcttgacat ccacagaact ttccagagat ggattggtgc ctcgggaact

1020

gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt gaaatgttgg gttaagtccc

1080

gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcggttag gccgggaact caaaggagac

1140

tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatggc ccttacgacc

1200

agggctacac acgtgctaca atggcatata caaagagaag cgacctcgcg agagcaagcg

1260

gacctcataa agtatgtcgt agtccggatt ggagtctgca actcgactcc atgaagtcgg

1320

aattgctagt aatcgtagat cagaatgcta cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca aaagaagtag gtagcttaac cttcgggagg

1440

gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg gtgaaatcgt aacaaggtag ccgtagc

1497

<210> 1036

<211> 1420

<212> DNA

<213> Klebsiella sp. enrichment culture clone SRC_DSD25

<400> 1036

tcgggtgacg agcggcggac gggtgagtaa tgtctgggaa actgcctgat ggagggggat

60

aactactgga aacggtagct aataccgcat aatgtcgcaa gaccaaagtg ggggaccttc

120

gggcctcatg ccatcagatg tgcccagatg ggattagcta gtaggtgggg taacggctca

180

cctaggcgac gatccctagc tggtctgaga ggatgaccag ccacactgga actgagacac

240

ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat

300

gcagccatgc cgcgtgtgtg aagaaggcct tcgggttgta aagcactttc agcggggagg

360

aaggcgttaa ggttaataac cttggcgatt gacgttaccc gcagaagaag caccggctaa

420

ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag ggtgcaagcg ttaatcggaa ttactgggcg

480

taaagcgcac gcaggcggtc tgtcaagtcg gatgtgaaat ccccgggctc aacctgggaa

540

ctgcattcga aactggcagg ctagagtctt gtagaggggg gtagaattcc aggtgtagcg

600

gtgaaatgcg tagagatctg ggggaatacc ggtggcgaaa gcggccccct ggacaaagac

660

tgacgctcag tgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc

720

gtaaacgatg tcgatttgga ggttgtgccc ttgaggcgtg gcttccggag ctaacgcgtt

780

aaatcgaccg cctggggagt acggccgcaa ggttaaaact caaatgaatt gacgggggcc

840

cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgatgcaacg cgaagaacct tacctggtct

900

tgacatccac agaactttcc agagatggat tggtgccttc gggaactgtg agacaggtgc

960

tgcatggctg tcgtcagctc gtgttgtgaa atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

1020

cccttatcct ttgttgccag cggttaggcc gggaactcaa aggagactgc cagtgataaa

1080

ctggaggaag gtggggatga cgtcaagtca tcatggccct tacgaccagg gctacacacg

1140

tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga cctcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt

1200

atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact cgactccatg aagtcggaat tgctagtaat

1260

cgtagatcag aatgctacgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac

1320

catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt

1380

tgtgattcat gactggggtg aaatcgtaac aaggtagccg

1420

<210> 1037

<211> 934

<212> DNA

<213> Klebsiella variicola

<220>

<221> modified_base

<222> (705)..(706)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1037

cggtagcaca gagagcttgc tctcgggtga cgagcggcgg acgggtgagt aatgtctggg

60

aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtag ctaataccgc ataatgtcgc

120

aagaccaaag tgggggacct tcgggcctca tgccatcaga tgtgcccaga tgggattagc

180

tggtaggtgg ggtaacggct cacctaggcg acgatcccta gctggtctga gaggatgacc

240

agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

300

gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgtg tgaagaaggc cttcgggttg

360

taaagcactt tcagcgggga ggaaggcggt gaggttaata acctcatcga ttgacgttac

420

ccgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg agggtgcaag

480

cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tctgtcaagt cggatgtgaa

540

atccccgggc tcaacctggg aactgcattc gaaactggca ggctagagtc ttgtagaggg

600

gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata ccggtggcga

660

aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtnngagc aaacaggatt

720

agataccctg gtagtccacg ctgtaaacga tgtcgatttg gaggttgtgc ccttgaggcg

780

tggcttccgg agctaacgcg ttaaatcgac cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa

840

ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa

900

cgcgaagaac cttacctggt cttgacatcc acag

934

<210> 1038

<211> 1387

<212> DNA

<213> Kluyvera ascorbata

<220>

<221> modified_base

<222> (964)..(965)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1038

gcacagagag cttgctcttg ggtgacgagt ggcggacggg tgagtaatgt ctgggaaact

60

gcccgatgga gggggataac tactggaaac ggtagctaat accgcataac gtcgcaagac

120

caaagtgggg gaccttcggg cctcacacca tcggatgtgc ccagatggga ttagctagta

180

ggtgaggtaa tggctcacct aggcgacgat ccctagctgg tctgagagga tgaccagcca

240

cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca

300

atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtatgaag aaggccttcg ggttgtaaag

360

tactttcagc gaggaggaag gcgttaaggt taataacctt aacgattgac gttactcgca

420

gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggt gcaagcgtta

480

atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtctgt caagtcggat gtgaaatccc

540

cgggctcaac ctgggaactg cattcgaaac tggcaggcta gagtcttgta gaggggggta

600

gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccggt ggcgaaggcg

660

gccccctgga caaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

720

accctggtag tccacgccgt aaacgatgtc tatttgaagg ttgttccctt gaggagtggc

780

tttcggagct aacgcgttaa atagaccgcc tggggagtac ggccgcaagg ttaaaactca

840

aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg atgcaacgcg

900

aagaacctta cctactcttg acatccagag aaattgggag agatgctttc gcgccttcgg

960

ggtnnatgag acagtggctg catgggtgtc gtcagctcgt gttgtgaaat gttgggttaa

1020

gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg gttcggccgg gaactcaaag

1080

gagactgcca gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atggccctta

1140

cgagtagggc tacacacgtg ctacaatggc atatacaaag agaagcgacc tcgcgagagc

1200

aagcggacct cataaagtat gtcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg actccatgaa

1260

gtcggaatcg ctagtaatcg tagatcagaa tgctacggtg aatacgttcc cgggccttgt

1320

acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgcaaaaga agtaggtagc ttaaccttcg

1380

ggagggc

1387

<210> 1039

<211> 1395

<212> DNA

<213> Kluyvera cryocrescens

<400> 1039

tcgaacggta gcacagagag cttgctcttg ggtgacgagt ggcggacggg tgagtaatgt

60

ctgggaaact gcccgatgga gggggataac tactggaaac ggtagctaat accgcataac

120

gtcgcaagac caaagtgggg gaccttcggg cctcacacca tcggatgtgc ccagatggga

180

ttagctagta ggtggggtaa tggctcacct aggcgacgat ccctagctgg tctgagagga

240

tgaccagcca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga

300

atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtatgaag aaggccttcg

360

ggttgtaaag tactttcagc gaggaggaag gcattaaggt taataacctt ggtgattgac

420

gttactcgca gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggt

480

gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtctgt caagtcggat

540

gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg cattcgaaac tggcaggcta gagtcttgta

600

gaggggggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccggt

660

ggcgaaggcg gccccctgga caaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac

720

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgtc gacttggagg ttgtgccctt

780

gaggcgtggc ttccggagct aacgcgttaa gtcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg

840

ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

900

atgcaacgcg aagaacctta cctactcttg acatccagag aacttagcag acatgctttg

960

gtgccttcgg gaactctgag acagcaggcg gtcggtcaag tcggatgtga attcccaagg

1020

ctcggcttag gacccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg gttcggccgg

1080

gaactcaaag gagactgcca gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc

1140

atggccctta cgagtagggc tacacacgtg ctacaatggc atatacaaag agaagcgacc

1200

tcgcgagagc aagcggacct cataaagtat gtcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg

1260

actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg tagatcagaa tgctacggtg aatacgttcc

1320

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgcaaaaga agtaggtagc

1380

ttaaccttcg ggagg

1395

<210> 1040

<211> 1482

<212> DNA

<213> Kocuria marina

<400> 1040

agagtttgat catggctcag gaccaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gctgaagctt ggtgcttgca ctgggtggat gagtggcgaa cgggtgagta atacgtgagt

120

aacctgccct tgactctggg ataagcctgg gaaactgggt ctaatactgg atatgacctc

180

ctgtcgcatg gtggggggtg gaaagggttt gtactggttg tggatgggct cacggcctat

240

cagcttgttg gtggggtaat ggcctaccaa ggcgacgacg ggtatccggc ccgagagggt

300

gaccggccac cctgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag cgacgccgcg tgagggatga cggccttcgg

420

gttgtaaacc tctttcagca cggaagaagc gaaagtgacg gtacgtgcag aagaagcgcc

480

ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaaggcg caagcgttgt ccggaattat

540

tgggcgtaca gagctcgtag gcggtttgtc gcgtctgctg tgaaagcccg gggcttaacc

600

ccgggtgtgc agtgggtacg ggcagacttg agtgcagtag gggagactgg aactcctggt

660

gtagcggtga aatgcgcaca tatcaggaag aacaccgatg gcgaaggcag gtctctgggc

720

tgttactgac gctgacgagc taaagcatgg ggagcgaact ggattggata ccctggtagt

780

ccatgccgta aacattgggc actaggtgtg ggggacattc cacgttttcc gcgccgtagc

840

taacgcatta agtgccccgc ctggggagta cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg

900

acaggcgccc gtacaagggg cggggcatgg ggattatttg gatgcaactc gaagaacttt

960

tccagggctt gacatacacc ggatcggctc agagatgagt ttccctcctt ttggggctgg

1020

tgtacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct ggtgtcgtga gatgtggggt taagtcccgc

1080

aacgagcgca accctcgttc tatgttgcca gcacgtgatg gtggggactc ataggagact

1140

gccggggtca actcggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgtctt

1200

gggcttcacg catgctacaa tggccagtac aatgggttgc gataccgtga ggtggagcta

1260

atcccaaaaa gctggtctca gttcggatcg tggtctgcaa ctcgaccacg tgaagtcgga

1320

gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1380

ccgcccgtca agtcacgaaa gttggtaaca cccgaagccg gtggcctaac ccttgtgggg

1440

ggagccgtcg aaggtgggac tggcgattgg gactaagtcg ta

1482

<210> 1041

<211> 1419

<212> DNA

<213> Kocuria palustris

<400> 1041

ggcggcgtct tacacatgca gtcgaacgct gaagcaccag cttgctggtg tggatgagtg

60

gcgaacgggt gagtaatacg tgagtaacct gcccttgact ctgggataag cccgggaaac

120

tgggtctaat actggatgct acatgtcacc gcatggtggt gtgtggaaag ggtttactgg

180

tcttggatgg gctcacggcc tatcagcttg ttggtgaggt aatggctcac caaggcgacg

240

acgggtagcc ggcctgagag ggtgaccggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc

300

ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggcga aagcctgatg cagcgacgcc

360

gcgtgaggga tgacggcctt cgggttgtaa acctctttca gcagggaaga agccacaagt

420

gacggtacct gcagaagaag cgccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

480

ggcgcaagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagagctc gtaggcggtt tgtcgcgtct

540

gctgtgaaag cccggggctt aaccccgggt gtgcagtggg tacgggcaga ctagagtgca

600

gtaggggaga ctggaattcc tggtgtagcg gtggaatgcg cagatatcag gaggaacacc

660

gatggcgaag gcaggtctct gggctgttac tgacgctgag gagcgaaagc atggggagcg

720

aacaggatta gataccctgg tagtccatgc cgtaaacgtt gggcactagg tgtgggggac

780

attccacgtt ttccgcgccg tagctaacgc attaagtgcc ccgcctgggg agtacggccg

840

caaggctaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggcggagc atgcggatta

900

attcgatgca acgcgaagaa ccttaccaag gcttgacata taccggatcg ttccagagat

960

ggttcttccc ctttggggtc ggtatacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1020

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caaccctcgt tccatgttgc cagcacgtga

1080

tggtggggac tcatgggaga ctgccggggt caactcggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1140

atcatcatgc cccttatgtc ttgggcttca cgcatgctac aatggccggt acaaagggtt

1200

gcgatactgt gaggtggagc taatcccaaa aagccggtct cagttcggat tgaggtctgc

1260

aactcgacct catgaagtcg gagtcgctag taatcgcaga tcagcaacgc tgcggtgaat

1320

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt caagtcacga aagtcggtaa cacccgaagc

1380

cggtggccca acccttgtgg agggagccgt cgaaggtgg

1419

<210> 1042

<211> 1454

<212> DNA

<213> Kocuria rhizophila

<400> 1042

ggacgaacgc tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgaa cgctgaagct tggtgcttgc

60

actgggtgga tgagtggcga acgggtgagt aatacgtgag taacctgccc ttgactctgg

120

gataagcctg ggaaactggg tctaatactg gatacgacat gtcaccgcat ggtggtgtgt

180

ggaaagggtt ttactggttt tggatgggct cacggcctat cagcttgttg gtggggtaat

240

ggctcaccaa ggcgacgacg ggtagccggc ctgagagggt gaccggccac actgggactg

300

agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggcggaag

360

cctgatgcag cgacgccgcg tgagggatga cggccttcgg gttgtaaacc tctttcagca

420

cggaagaagc gaaagtgacg gtacgtgcag aagaagcgcc ggctaactac gtgccagcag

480

ccgcggtaat acgtagggcg caagcgttgt ccggaattat tgggcgtaaa gagctcgtag

540

gcggtttgtc gcgtctgctg tgaaagcccg gggcttaacc ccgggtgtgc agtgggtacg

600

ggcagacttg agtgcagtag gggagactgg aattcctggt gtagcggtga aatgcgcaga

660

tatcaggagg aacaccgatg gcgaaggcag gtctctgggc tgttactgac gctgaggagc

720

gaaagcatgg ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacgttgggc

780

actaggtgtg gggaacattc cacgttttcc gcgccgtagc taacgcatta agtgccccgc

840

ctggggagta cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg

900

cggagcatgc ggattaattc gatgcaacgc gaagaacctt accaaggctt gacatacacc

960

ggaccgggcc agagatggtc tttccccctt gtggggctgg tgtacaggtg gtgcatggtt

1020

gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca accctcgttc

1080

tatgttgcca gcacgtgatg gtggggactc ataggagact gccggggtca actcggagga

1140

aggtgaggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgtctt gggcttcacg catgctacaa

1200

tggccagtac aatgggttgc gatgccgcga ggtggagcta atcccaaaaa gctggtctca

1260

gttcggatcg tggtctgcaa ctcgaccacg tgaagtcgga gtcgctagta atcgcagatc

1320

agcaacgctg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca agtcacgaaa

1380

gttggtaaca cccgaagccg gtggcctaac ccttgtgggg ggagccgtcg aaggtgggac

1440

tggcgattgg gact

1454

<210> 1043

<211> 1481

<212> DNA

<213> Kocuria rosea

<400> 1043

atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcttaacaca tgcaagtcga acgatgatgc

60

ccagcttgct gggcggatta gtggcgaacg ggtgagtaat acgtgagtaa cctgcccttg

120

actctgggat aagcctggga aactgggtct aatactggat actacctctt accgcatggt

180

gggtggtgga aagggtttta ctggttttgg atgggctcac ggcctatcag cttgttggtg

240

gggtaatggc tcaccaagcc gacgacgggt agccggcctg agagggtgac cggccacact

300

gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg

360

gcggaagcct gatgcagcga cgccgcgtga gggatgacgg ccttcgggtt gtaaacctct

420

ttcagtaggg aagaagcgag agtgacggta cctgcagaag aagcgccggc taactacgtg

480

ccagcagccg cggtaatacg tagggcgcaa gcgttgtccg gaattattgg gcgtaaagag

540

ctcgtaggcg gtttgtcgcg tctgctgtga aagcccgggg cttaaccccg ggtctgcagt

600

gggtacgggc agactagagt gcagtagggg agactggaat tcctggtgta gcggtgaaat

660

gcgcagatat caggaggaac accgatggcg aaggcaggtc tctgggctgt tactgacgct

720

gaggagcgaa agcatgggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca tgccgtaaac

780

gttgggcact aggtgtgggg gacattccac gttttccgcg ccgtagctaa cgcattaagt

840

gccccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca

900

caagcggcgg agcatgcgga ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc aaggcttgac

960

attcaccgga ccgccccaga gatggggttt cccttcgggg ctggtggaca ggtggtgcat

1020

ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc

1080

gttctatgtt gccagcacgt gatggtgggg actcatagga gactgccggg gtcaactcgg

1140

aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg tcttgggctt cacgcatgct

1200

acaatggccg gtacaaaggg ttgcgatact gtgaggtgga gctaatccca aaaagccggt

1260

ctcagttcgg attgaggtct gcaactcgac ctcatgaagt cggagtcgct agtaatcgca

1320

gatcagcaac gctgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcaagtcac

1380

gaaagttggt aacacccgaa gccggtggcc taaccccttg tgggagggag ccgtcgaagg

1440

tgggactggc gattgggact aagtcgtaac aaggtagccg t

1481

<210> 1044

<211> 1333

<212> DNA

<213> Kocuria varians

<220>

<221> modified_base

<222> (1040)..(1040)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1044

cgctgaagct tggtgcttgc actgggtgga tgagtggcga acgggtgagt aatacgtgag

60

taacctgccc ttaactctgg gataagcctg ggaaactggg tctaatactg gatatgacat

120

gtcactgcat ggtggcgtgt ggaaagggtt ttactggttt tggatgggct cacggcctat

180

cagcttgttg gtggggtaat ggcccaccaa ggcgacgacg ggtagccggc ctgagagggt

240

gaccggccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

300

tattgcacaa tgggcgaaag cctgatgcag cgacgccgcg tgagggatga cggccttcgg

360

gttgtaaacc tctttcagca cggaagaagc gagagtgacg gtacgtgcag aagaagcgcc

420

ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggcg caagcgttgt ccggaattat

480

tgggcgtaaa gagctcgtag gcggtttgtc gcgtctgctg tgaaagcccg gggcttaacc

540

ccgggtgtgc agtgggtacg ggcagacttg agtgcagtag gggagactgg aattcctggt

600

gtagcggtga aatgcgcaga tatcaggaag aacaccgatg gcgaaggcag gtctctgggc

660

tgttactgac gctgaggagc gaaagcatgg ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt

720

ccatgccgta aacgttgggc actaggtgtg ggggacattc cacgttttcc gcgccgtagc

780

taacgcatta agtgccccgc ctggggagta cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg

840

acgggggccc gcacaagcgg cggagcatgc ggattaattc gatgcaacgc gaagaacctt

900

accaaggctt gacatacacc ggaccggtcc agagatggat cttccccctt gtggggctgg

960

tgtacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtaa gatgttgggt taagtcccgc

1020

aacgagcgca accctcgttn tatgttgcca gcacgtgatg gtggggactc ataggagact

1080

gccggggtca actcggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgtctt

1140

gggcttcacg catgctacaa tggccggtac aatgggttgc gataccgtga ggtggagcta

1200

atcccaaaaa gccggtctca gttcggatcg tggtctgcaa ctcgaccacg tgaagtcgga

1260

gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1320

ccgcccgtca agt

1333

<210> 1045

<211> 1493

<212> DNA

<213> Lachnobacterium bovis

<220>

<221> modified_base

<222> (85)..(85)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1045

gagtttgatc atggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

aagcacatta tttgaattct tcggnaggaa gataatgcga ctgagtggcg gacgggtgag

120

taacgcgtgg gtaacctgcc atgtacaggg ggacaacagt tggaaacggc tgctaatacc

180

gcataagcgc acgagattgc atgatctagt gtgaaaaact ccggtggtat atgatggacc

240

cgcgtctgat tagctagttg gtaaggtaac ggcttaccaa ggcgacgatc agtagccgac

300

ctgagagggt gaccggccac attgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag

360

cagtggggaa tattgcacaa tgggcgaaag cctgatgcag cgacgccgcg tgaacgaaga

420

agtatttcgg tatgtaaagt tctatcagca gggaagaaaa aatgacggta cctgactaag

480

aagccccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggggcaa gcgttatccg

540

gatttactgg gtgtaaaggg agcgcaggcg gcccggcaag tctgatgtga aaacccaagg

600

ctcaaccatg ggattgcatt ggaaactgtc gagctagagt atcggagggg taagtggaat

660

tcctagtgta gcggtgaaat gcgtagatat taggaggaac accagtggcg aaggcggctt

720

actggacgat aactgacgct gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc

780

tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatact aggtgtcggg tgttatgaac attcggtgcc

840

ggcgcaaacg caataagtat tccacctggg gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg

900

aattgacggg gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga

960

accttaccaa gtcttgacat cccaatgaca agctatgtaa tgtagcctct cttcggagca

1020

ttggagacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1080

cgcaacgagc gcaacccttg tccttagtag ccagcagtaa gatgggcact ctagggagac

1140

tgccagggat aacctggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgact

1200

tgggctacac acgtgctaca atggcgtaaa caaagtgaag cgagatggtg acattaagca

1260

aatcacaaaa ataacgtctc agttcggact gtagtctgca actcgactac acgaagctgg

1320

aatcgctagt aatcgcagat cagaatgctg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccatggga gttggtaatg cccgaagccg gtgacctaac cgtaaggaag

1440

gagccgtcga aggcaggatc gataactggg gtgaagtcgt aacaaggtaa cca

1493

<210> 1046

<211> 1518

<212> DNA

<213> Lachnospira multipara

<400> 1046

tttgatcctg gctcaggatg aacgctggcg gcgtgcttaa cacatgcaag tcgaacgaag

60

caacwtatca cgattccttc gggatgacga tttgttgact gagtggcgga cgggtgagta

120

acgcgtgggt aacctgcctt atacaggggg atagcagctg gaaacggctg ataataccgc

180

ataagcgcac ggcatcgcat gatgcagtgt gaaaaactcc ggtggtataa gatggacccg

240

cgtctgatta gctagttggt gaggtaacgg cccaccaagg caacgatcag tagccgacct

300

gagagggtga ccggccacat tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca

360

gtggggaata ttgcacaatg gaggaaactc tgatgcagcg acgccgcgtg agcgaagaag

420

tatttcggta tgtaaagctc tatcagcagg gaagataatg acggtacctg actaagaagc

480

tccggctaaa tacgtgccag cagccgcggt aatacgtatg gagcaagcgt tatccggatt

540

tactgggtgt aaagggagtg taggtggcaa agcaagtcag tagtgaaaat ccggggctca

600

acctcggaac tgctattgaa actgtttagc tagagtgcag gagaggtaag tggaattcct

660

agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattagg aggaacacca gtggcgaagg cggcttactg

720

gactgtaact gacactgagg ctcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt

780

agtccacgcc gtaaacgatg aatactaggt gttgggtctc ataagagatt cggtgccgca

840

gctaacgcaa taagtattcc acctggggag tacgttcgca agaatgaaac tcaaaggaat

900

tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc

960

ttacctagtc ttgacatccc gatgaccrag tatgtaatgt actctttctt cggaacatcg

1020

gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1080

aacgagcgca acccctattt ctagtagcca gcagttcggc tgggcactct agagagactg

1140

ccagggataa cctggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgactag

1200

ggctacacac gtgctacaat ggcgtaaaca aagtgaagcg agagtgtgag cttaagcaaa

1260

tcacaaaaat aacgtctcag ttcggattgt agtctgcaac tcgactacat gaagctggaa

1320

tcgctagtaa tcgcagatca gaatgctgcg gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc

1380

gcccgtcaca ccatgggagt cgaaaatgcc cgaagtcggt gacctaacgt aagaaggagc

1440

cgccgaaggc aggtttgata actggggtga agtcgtaaca aggtagccgt atcggaaggt

1500

gcggctggat cacctcct

1518

<210> 1047

<211> 1383

<212> DNA

<213> Lachnospira pectinoschiza

<220>

<221> modified_base

<222> (11)..(12)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (14)..(14)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (22)..(23)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (30)..(31)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (37)..(40)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1047

cgaagcattt nncnacggat tnnttcggan ntgaagnnnn ttatgactga gtggcggacg

60

ggtgagtaac gcgtgggtaa cctgcctcac acagggggat agcagttgga aacggctgat

120

aataccgcat aagcgcacag taccgcatgg tacagtgtga aaaactccgg tggtgtgaga

180

tggacccgcg tctgattagc ttgttggcag ggtaacggcc taccaaggca acgatcagta

240

gccgacctga gagggtgacc ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg

300

aggcagcagt ggggaatatt gcacaatgga ggaaactctg atgcagcgac gccgcgtgag

360

tgaagaagta attcgttatg taaagctcta tcagcaggga agatagtgac ggtacctgac

420

taagaagctc cggctaaata cgtgccagca gccgcggtaa tacgtatgga gcaagcgtta

480

tccggattta ctgggtgtaa agggagtgta ggtggcatca caagtcagaa gtgaaagccc

540

ggggctcaac cccgggactg cttttgaaac tgtggagctg gagtgcagga gaggcaagtg

600

gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag atattaggag gaacaccagt ggcgaaggcg

660

gcttgctgga ctgtaactga cactgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

720

accctggtag tccacgccgt aaacgatgaa tactaggtgt cggggctcat aagagcttcg

780

gtgccgcagc aaacgcaata agtattccac ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc

840

aaaggaattg acggggaccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg

900

aagaacctta ccaagtcttg acatcctctt gcccggtcag taatgtgacc ttttcttcgg

960

aacaagagtg acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1020

gtcccgcaac gagcgcaacc cctattctta gtagccagca tataaggtgg gcactctagg

1080

aagactgcca gggataacct ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta

1140

tgacttgggc tacacacgtg ctacaatggc gtaaacaaag tgaagcgaga gtgtgagctt

1200

aagcaaatca caaaaataac gtctcagttc ggattgtagt ctgcaactcg actacatgaa

1260

gctggaatcg ctagtaatcg cgaatcagaa tgtcgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt

1320

acacaccgcc cgtcacacca tgggagtcgg aaatgcccga agtcggtgac ctaacgaaag

1380

aag

1383

<210> 1048

<211> 1519

<212> DNA

<213> Lachnospiraceae bacterium 1_1_57FAA

<400> 1048

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc

60

gaagcacttt gcttagattc ttcggatgaa gaggattgtg actgagcggc ggacgggtga

120

gtaacgcgtg ggtaacctgc ctcatacagg gggataacag ttagaaatga ctgctaatac

180

cgcataagac cacagcaccg catggtgcgg gggtaaaaac tccggtggta tgagatggac

240

ccgcgtctga ttagctagtt ggtaaggtaa cggcttacca aggcgacgat cagtagccga

300

cctgagaggg tgaccggcca cattgggact gagacacggc ccaaactcct acgggaggca

360

gcagtgggga atattgcaca atgggggaaa ccctgatgca gcgacgccgc gtgagcgaag

420

aagtatttcg gtatgtaaag ctctatcagc agggaagaaa atgacggtac ctgactaaga

480

agcaccggct aaatacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt atggtgcaag cgttatccgg

540

atttactggg tgtaaaggga gcgtagacgg atgggcaagt ctgatgtgaa aacccggggc

600

tcaaccccgg gactgcattg gaaactgttc atctagagtg ctggagaggt aagtggaatt

660

cctagtgtag cggtgaaatg cgtagatatt aggaggaaca ccagtggcga aggcggctta

720

ctggacagta actgacgttg aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct

780

ggtagtccac gccgtaaacg atgactacta ggtgtcgggt ggcaaagcca ttcggtgccg

840

cagcaaacgc aataagtagt ccacctgggg agtacgttcg caagaatgaa actcaaagga

900

attgacgggg acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa

960

ccttacctgc tcttgacatc ccgctgaccg gacggtaatg cgtccttccc ttcggggcag

1020

cggagacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1080

gcaacgagcg caacccctat ctttagtagc cagcggccag gccgggcact ctagagagac

1140

tgccggggat aacccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgagc

1200

agggctacac acgtgctaca atggcgtaaa caaagggaag cgagaccgcg aggtggagca

1260

aatcccaaaa ataacgtctc agttcggatt gtagtctgca actcgactac atgaagctgg

1320

aatcgctagt aatcgcgaat cagaatgtcg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccatggga gtcagtaacg cccgaagtca gtgacccaac cgtaaggagg

1440

gagctgccga aggcgggacc gataactggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtatcgga

1500

aggtgcggct ggatcacct

1519

<210> 1049

<211> 1384

<212> DNA

<213> Lachnospiraceae bacterium 1_4_56FAA

<220>

<221> modified_base

<222> (33)..(33)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (229)..(229)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1049

tcgaacgaag cactttaccg gatttcttcg gantgaaagt tttgtgactg agtggcggac

60

gggtgagtaa cgcgtgggta acctgcctca tacaggggga taacagttag aaatgactgc

120

taataccgca taagaccaca ggattgcatg gtccggtggt aaaaactccg gtggtatgag

180

atggacccgc gtctgattag ctagttggtg gggtaacggc ttaccaagnc gacgatcagt

240

agccgacctg agagggtgac cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg

300

gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga

360

gcgatgaagt atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaagac ggtacctgct

420

aagaagcacc ggctaaatac gtgccagcag ccgcggtaat acgtatggtg caagcgttat

480

ccggatttac tgggtgtaaa gggagcgtag acggagaggc aagtctgatg tgaaaacccg

540

gggctcaacc ccgggactgc attggaaact gtttttctag agtgtcggag aggtaagtgg

600

aattcctagt gtagcggtga aatgcgtaga tattaggagg aacaccagtg gcgaaggcgg

660

cttactggac gatgactgac gttgaggctc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata

720

ccctggtagt ccacgccgta aacgatgact gctaggtgtc gggaggcaaa gcctttcggt

780

gccgcagcaa acgcaataag cagtccacct ggggagtacg ttcgcaagaa tgaaactcaa

840

aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga

900

agaaccttac ctgcccttga catccggctg actggcgagt aatgtcgcct ttccttcggg

960

acagccgaga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag

1020

tcccgcaacg agcgcaaccc ttatctttag tagccagcat ttcggatggg cactctagag

1080

agactgccag ggataacctg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat

1140

gggcagggct acacacgtgc tacaatggcg taaacaaagg gaggcaagcc tgcgagggtg

1200

agcaaatccc aaaaataacg tctcagttcg gattgtagtc tgcaactcga ctacatgaag

1260

ctggaatcgc tagtaatcgc gaatcagaat gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta

1320

cacaccgccc gtcacaccat gggagttggt aacgcccgaa gtcagtgacc caaccgtaag

1380

gagg

1384

<210> 1050

<211> 1528

<212> DNA

<213> Lachnospiraceae bacterium 2_1_46FAA

<400> 1050

gagagtttga tcctggctca ggatgaacgc tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgaa

60

cgaagcgctt tcgattgaat cttcggagga aagaggaagt gactgagtgg cggacgggtg

120

agtaacgcgt gggtaacctg cctcatacag ggggataaca gttagaaatg gctgctaata

180

ccgcataagc atacagcacc gcatggtgca gtgtgaaaaa ctccggtggt atgagatgga

240

cccgcgtctg attaggtagt tggtggggta acggcctacc aagccgacga tcagtagccg

300

acctgagagg gtgaccggcc acattgggac tgagacacgg cccaaactcc tacgggaggc

360

agcagtgggg aatattgcac aatgggggaa accctgatgc agcgacgccg cgtgaaggaa

420

gaagtatttc ggtatgtaaa cttctatcag cagggaagaa aatgacggta cctgactaag

480

aagccccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggggcaa gcgttatccg

540

gatttactgg gtgtaaaggg agcgtagacg gaagtgcaag tctgaagtga aagcccgggg

600

ctcaaccccg tgactgcttt ggaaactgtg cttctagagt gtcggagagg taagcggaat

660

tcctagtgta gcggtgaaat gcgtagatat taggaggaac atcagtggcg aaggcggctt

720

actggacgat aactgacgtt gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc

780

tggtagtcca cgccgtaaac gatgactact aggtgtcggg gtacaaagta cttcggtgcc

840

gcagccaacg caataagtag tccacctggg gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg

900

aattgacggg gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga

960

accttacctg gtcttgacat ctccctgact ggacagtaat gtgtcctttc tttcgggaca

1020

gggaagacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1080

cgcaacgagc gcaaccccta tcttcagtag ccagcaagta aagttgggca ctctggagag

1140

actgccaggg ataacctgga ggaaggtggg gacgacgtca aatcatcatg ccccttatga

1200

ccagggctac acacgtgcta caatggcgta aacaaaggga agcaagcatg tgagtgtgag

1260

caaatctcaa aaataacgtc tcagttcgga ttgtagtctg caactcgact acatgaagct

1320

ggaatcgcta gtaatcgcga atcagaatgt cgcggtgaat acgttcccgg gtcttgtaca

1380

caccgcccgt cacaccatgg gagttggtaa cgcccgaagt cagtgaccta accgaaagga

1440

aggagctgcc gaaggtggga ctgataactg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtatcg

1500

gaaggtgcgg ctggatcacc tcctttct

1528

<210> 1051

<211> 1361

<212> DNA

<213> Lachnospiraceae bacterium 2_1_58FAA

<400> 1051

cgaagcactt ttgcggattt cttcggattg aagcaattgt gactgagcgg cggacgggtg

60

agtaacgcgt gggtaacctg cctcatacag ggggataaca gttggaaacg gctgctaata

120

ccgcataagc gcacagtacc gcatggtacc gtgtgaaaaa ctccggtggt atgagatgga

180

cccgcgtctg attagctagt tggtggggta acggcctacc aaggcgacga tcagtagccg

240

acctgagagg gtgaccggcc acattgggac tgagacacgg cccaaactcc tacgggaggc

300

agcagtgggg aatattgcac aatgggggaa accctgatgc agcgacgccg cgtgagcgat

360

aagtatttcg gtatgtaaag ctctatcagc agggaagaaa atgacggtac ctgctaagaa

420

gccgctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg ggcaagcgtt atccggattt

480

actgggtgta aagggagcgt agacggcatg gcaagccaga tgtgaaagcc cggggctcaa

540

ccccgggact gcatttggaa ctgtcaggct agagtgtcgg agaggaaagc ggaattccta

600

gtgtagcggt gaaatgcgta gatattagga ggaacaccag tggcgaaggc ggctttctgg

660

acgatgactg acgttgaggc tcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta

720

gtccacgccg taaacgatga atactaggtg tcgggtggca aagccattcg gtgccgcagc

780

aaacgcaata agtattccac ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc aaaggaattg

840

atggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt

900

acctggtctt gacatccctc tgaccgctct ttaatcggag ctttccttcg ggacagagga

960

gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1020

cgagcgcaac ccctatcttt agtagccagc atttaagatg ggcactctag agagactgcc

1080

agggataacc tggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgaccaggg

1140

ctacacacgt gctacaatgg cgtaaacaaa gggaagcgag cccgcgaggg ggagcaaatc

1200

ccaaaaataa cgtctcagtt cggattgtag tctgcaactc gactacatga agctggaatc

1260

gctagtaatc gcgaatcaga atgtcgcggt gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc

1320

ccgtcacacc atgggagtca gtaacgcccg aagtcagtga c

1361

<210> 1052

<211> 1373

<212> DNA

<213> Lachnospiraceae bacterium 3_1_57FAA_CT1

<400> 1052

aggaagtttt cggatggaat cggcgtaact tagtggcgga cgggtgagta acgcgtggga

60

aacctgccct gtaccggggg ataacactta gaaataggtg ctaataccgc ataagcgcac

120

agcttcacat gaggcagtgt gaaaaactcc ggtggtacag gatggtcccg cgtctgatta

180

gccagttggc agggtaacgg cctaccaaag cgacgatcag tagccggcct gagagggtga

240

acggccacat tgggactgag acacggccca aactcctacg ggaggcagca gtggggaata

300

ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagcg acgccgcgtg agtgaagaag tatttcggta

360

tgtaaagctc tatcagcagg gaagaaaatg acggtacctg actaagaagc cccggcaact

420

acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg ggcaagcgtt atccggattt actgggtgta

480

aagggagcgt agacggcatg acaagccaga tgtgaaaacc cagggctcaa ccctgggact

540

gcatttggaa ctgccaggct ggagtgcagg agaggtaagc ggaattccta gtgtagcggt

600

gaaatgcgta gatattagga ggaacaccag tggcgaaggc ggcttactgg actgtaactg

660

acgttgaggc tcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgcgg

720

taaacgatga ttgctaggtg taggtgggta tggacccatc ggtgccgcag ctaacgcaat

780

aagcaatcca cctggggagt acgttcgcaa gaatgaaact caaaggaatt gacggggacc

840

cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaagtct

900

tgacatccca atgacgtgtc cgtaacgggg cattctcttc ggagcattgg agacaggggg

960

agcatggcgg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

1020

cccttatcct tagtagccag caggtaaagc tgggcactct agggagactg ccggggataa

1080

cccggaggaa ggcggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgatttg ggctacacac

1140

gtgctacaat ggcgtaaaca aagggaagcg agacagtgat gttgagcaaa tcccagaaat

1200

aacgtctcag ttcggattgt agtctgcaac tcgactacat gaagctggaa tcgctagtaa

1260

tcgcgaatca gcatgtcgcg gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca

1320

ccatgggagt tggaaatgcc cgaagcctgt gacctaaccg caagggagga gca

1373

<210> 1053

<211> 1370

<212> DNA

<213> Lachnospiraceae bacterium 4_1_37FAA

<400> 1053

attcttcgga aggaagctca agtgactgag tggcggacgg gtgagtaacg cgtgggtaac

60

ctgcctcata cagggggata acagttagaa atgactgcta ataccgcata agcacacgtg

120

atcgcatgat cgagtgtgaa aaactccggt ggtatgagat ggacccgcgt ctgattagct

180

tgttggtggg gtaacggccc accaaggcga cgatcagtag ccggcctgag agggtgaacg

240

gccacattgg gactgagaca cggcccaaac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

300

cacaatgggg gaaaccctga tgcagcgacg ccgcgtgaag gatgaagtat ttcggtatgt

360

aaacttctat cagcagggaa gaaaatgacg gtacctgact aagaagcccc ggctaactac

420

gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggggg caagcgttat ccggatttac tgggtgtaaa

480

gggagcgtag acggcagtgc aagtctgaag tgaaagcccg gggctcaacc ccgggactgc

540

tttggaaact gtgcagctgg agtgtcggag aggcaagcgg aattcctagt gtagcggtga

600

aatgcgtaga tattaggagg aacaccagtg gcgaaggcgg cttgctggac gataactgac

660

gttgaggctc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta

720

aacgatgact actaggtgtc ggggagcaaa gctcttcggt gccgcagcca acgcaataag

780

tagtccacct ggggagtacg ttcgcaagaa tgaaactcaa aggaattgac ggggacccgc

840

acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac ctgctcttga

900

catccctctg aacgctcatt aatcgggctc ttccccgggg ctgcttggga aacggtgcag

960

ctggagtgtc ggagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1020

ctatcttcag tagccagcat taaggatggg cactctggag agactgccag ggataacctg

1080

gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gagcagggct acacacgtgc

1140

tacaatggcg taaacaaagg gaagcagagt cgtgaggccg agcaaatccc aaaaataacg

1200

tctcagttcg gattgtagtc tgcaactcga ctacatgaag ctggaatcgc tagtaatcgc

1260

gaatcagaat gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat

1320

gggagtcagt aacgcccgaa gtcagtgacc caaccgtaag gagggagctg

1370

<210> 1054

<211> 1357

<212> DNA

<213> Lachnospiraceae bacterium 5_1_57FAA

<400> 1054

cgaagcgcct ggccccgact tcttcggaat gaggagcctt gcgactgagt ggcggacggg

60

tgagtaacgc gtgggcaacc tgccttgcac tgggggataa cagccagaaa tggctgctaa

120

taccgcataa gaccgaagcg ccgcatgggg cagcggccaa agccccggcg gtgcaagatg

180

ggcccgcgtc tgattaggta gttggcgggg taacggccca ccaagccgac aatcagtagc

240

cgacctgaga gggtgaccgg ccacattggg actgagacac ggcccacact cctacgggag

300

gcagcagtgg ggaatattgc acaatggggg aaaccctgat gcagcgacgc cgcgtgaagg

360

atgaagtatt tcggtatgta aacttctatc accagggaag aaaatgacgg tacctgacta

420

agaagccccg gctaactacg tgccacagcc gcggtaatac gtagggggca agcgttatcc

480

ggatttactg ggtgtaaagg gagcgtaacg gcgatgcaag ccaatgtgaa agcccggggc

540

tcaaccccgg gactgcattt ggaactgcgt ggctggagtg tcgagaggca ggcggaattc

600

tagtgtacgg tgaaatgcgt aatattagag gaacaccagt ggcgaagcgg cctgctggac

660

atgactgacg ttgaggctcg aaagcgtggg gagcacagga ttaataccct ggtagtccac

720

gccgtaacga tgactactag tgtcgggtgg aaggccattc gtgccgcagc aacgcaataa

780

gtagtccacc tggggagtac gttcgcaaga atgaaactca aggaattgac gggaccccac

840

aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacct gatcttgaca

900

tcccgatgcc aaagcgcgta acgcgctctt tcttcggaac atcggtgaca ggtggtgcat

960

ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct

1020

atcttcagta gccagcattc cggatgggca ctctggagag actgccaggg acaacctgga

1080

ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga ccagggctac acacgtgcta

1140

caatggcgta aacaaaggga ggcgaacccg cgagggtggg caaatcccaa aaataacgtc

1200

tcagttcgga ttgtagtctg caactcgact acatgaagct ggaatcgcta gtaatcgcga

1260

atcagaatgt cgcggtgaat acgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatgg

1320

gagtcagtaa cgcccgaagc cggtgaccca acccgca

1357

<210> 1055

<211> 1537

<212> DNA

<213> Lachnospiraceae bacterium 5_1_63FAA

<400> 1055

ttgaacatga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg aaacacctta tttgattttc ttcggaactg aagatttggt gattgagtgg

120

cggacgggtg agtaacgcgt gggtaacctg ccctgtacag ggggataaca gtcagaaatg

180

actgctaata ccgcataaga ccacagcacc gcatggtgca ggggtaaaaa ctccggtggt

240

acaggatgga cccgcgtctg attagctggt tggtgaggta acggctcacc aaggcgacga

300

tcagtagccg gcttgagaga gtgaacggcc acattgggac tgagacacgg cccaaactcc

360

tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatgggggaa accctgatgc agcgacgccg

420

cgtgagtgaa gaagtatctc ggtatgtaaa gctctatcag cagggaagaa aatgacggta

480

cctgactaag aagccccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggggcaa

540

gcgttatccg gaattactgg gtgtaaaggg tgcgtaggtg gtatggcaag tcagaagtga

600

aaacccaggg cttaactctg ggactgcttt tgaaactgtc agactggagt gcaggagagg

660

taagcggaat tcctagtgta gcggtgaaat gcgtagatat taggaggaac atcagtggcg

720

aaggcggctt actggactga aactgacact gaggcacgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatact aggtgtcggg gccgtagagg

840

cttcggtgcc gcagccaacg cagtaagtat tccacctggg gagtacgttc gcaagaatga

900

aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc

960

aacgcgaaga accttacctg gtcttgacat ccttctgacc ggtccttaac cggacctttc

1020

cttcgggaca ggagagacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccccta tctttagtag ccagcatata aggtgggcac

1140

tctagagaga ctgccaggga taacctggag gaaggtgggg acgacgtcaa atcatcatgc

1200

cccttatgac cagggctaca cacgtgctac aatggcgtaa acagagggaa gcagcctcgt

1260

gagagtgagc aaatcccaaa aataacgtct cagttcggat tgtagtctgc aactcgacta

1320

catgaagctg gaatcgctag taatcgcgaa tcagaatgtc gcggtgaata cgttcccggg

1380

tcttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtcagtaac gcccgaagtc agtgacccaa

1440

ccgtaaggag ggagctgccg aaggcgggac cgataactgg ggtgaagtcg taacaaggta

1500

gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcacct cctttct

1537

<210> 1056

<211> 1370

<212> DNA

<213> Lachnospiraceae bacterium 6_1_63FAA

<400> 1056

cgaagcactt atcattgact cttcggaaga tttgatattt gactgagcgg cggacgggtg

60

agtaacgcgt gggtaacctg cctcatacag gggaataaca gttagaaatg gctgctaatg

120

ccgcataagc gcacaggacc gcatggtctg gtgtgaaaaa ctgaggtggt atgagatgga

180

cccgcgtctg attaggtagt tggtggggta acggcctacc aagccgacga tcagtagccg

240

gcctgagagg gtgaacggcc acattgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc

300

agcagtgggg aatattgcac aatgggggaa accctgatgc agcgacgccg cgtgaaggaa

360

gaagtatctc ggtatgtaaa cttctatcag cagggaagaa aatgacggta cctgactaag

420

aagccccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggggcaa gcgttatccg

480

gatttactgg gtgtaaaggg agcgtagacg gaagagcaag tctgatgtga aaggctgggg

540

cttaacccca ggactgcatt ggaaactgtt tttctagagt gccggagagg taagcggaat

600

tcctagtgta gcggtgaaat gcgtagatat taggaggaac accagtggcg aaggcggctt

660

actggacggt aactgacgtt gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc

720

tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatact aggtgtcggg gtgcaaagca gttcggtgcc

780

gcagcaaacg caataagtat tccacctggg gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg

840

aattgacggg gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga

900

agctttacta ggtgtaaagg gagcctagac ggtacatcaa ctgtgatgtg aaaggcgaca

960

ggcaagacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1020

cgcaacgagc gcaaccccta tccttagtag ccagcagtcc ggctgggcac tctagggaga

1080

ctgccgggga taacccggag gaaggcgggg acgacgtcaa atcatcatgc cccttatgat

1140

ttgggctaca cacgtgctac aatggcgtaa acaaagggaa gcgaagcggt gacgcttagc

1200

aaatctcaaa aataacgtcc cagttcggac tgcagtctgc aactcgactg cacgaagctg

1260

gaatcgctag taatcgcgaa tcagaatgtc gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac

1320

accgcccgtc acaccatggg agtcagtaac gcccgaagtc agtgacccaa

1370

<210> 1057

<211> 1527

<212> DNA

<213> Lachnospiraceae bacterium 8_1_57FAA

<400> 1057

gagagtttga tcctggctca ggatgaacgc tggcggcgtg cctaacacat gcaagtcgag

60

cgaagcactt tgcttagatt cttcggatga agaggattgt gactgagcgg cggacgggtg

120

agtaacgcgt gggtaacctg cctcatacag ggggataaca gttagaaatg actgctaata

180

ccgcataaga ccacagcacc gcatggtgcg ggggtaaaaa ctccggtggt atgagatgga

240

cccgcgtctg attagctagt tggtaaggta acggcttacc aaggcgacga tcagtagccg

300

acctgagagg gtgaccggcc acattgggac tgagacacgg cccaaactcc tacgggaggc

360

agcagtgggg aatattgcac aatgggggaa accctgatgc agcgacgccg cgtgagcgaa

420

gaagtatttc ggtatgtaaa gctctatcag cagggaagaa aatgacggta cctgactaag

480

aagcaccggc taaatacgtg ccagcagccg cggtaatacg tatggtgcaa gcgttatccg

540

gatttactgg gtgtaaaggg agcgtagacg gatgggcaag tctgatgtga aaacccgggg

600

ctcaaccccg ggactgcatt ggaaactgtt catctagagt gctggagagg taagtggaat

660

tcctagtgta gcggtgaaat gcgtagatat taggaggaac accagtggcg aaggcggctt

720

actggacagt aactgacgtt gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc

780

tggtagtcca cgccgtaaac gatgactact aggtgtcggg tggcaaagcc attcggtgcc

840

gcagcaaacg caataagtag tccacctggg gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg

900

aattgacggg gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga

960

accttacctg ctcttgacat cccgctgacc ggacggtaat gcgtccttcc cttcggggca

1020

gcggagacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1080

cgcaacgagc gcaaccccta tctttagtag ccagcggcca ggccgggcac tctagagaga

1140

ctgccgggga taacccggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgag

1200

cagggctaca cacgtgctac aatggcgtaa acaaagggaa gcgagaccgc gaggtggagc

1260

aaatcccaaa aataacgtct cagttcggat tgtagtctgc aactcgacta catgaagctg

1320

gaatcgctag taatcgcgaa tcagaatgtc gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac

1380

accgcccgtc acaccatggg agtcagtaac gcccgaagtc agtgacccaa ccgtaaggag

1440

ggagctgccg aaggcgggac cgataactgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtatcgg

1500

aaggtgcggc tggatcacct cctttct

1527

<210> 1058

<211> 1387

<212> DNA

<213> Lachnospiraceae bacterium 9_1_43BFAA

<220>

<221> modified_base

<222> (13)..(13)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1058

tcgaacgaag cancttgaat ggaattcttc ggaaggaagc tcaagtgact gagtggcgga

60

cgggtgagta acgcgtgggt aacctgcctc atacaggggg ataacagtta gaaatgactg

120

ctaataccgc ataagcacac gtgatcgcat gatcgagtgt gaaaaactcc ggtggtatga

180

gatggacccg cgtctgatta gcttgttggt ggggtaacgg cccaccaagg cgacgatcag

240

tagccggcct gagagggtga acggccacat tgggactgag acacggccca aactcctacg

300

ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagcg acgccgcgtg

360

aaggatgaag tatttcggta tgtaaacttc tatcagcagg gaagaaaatg acggtacctg

420

actaagaagc cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gggcaagcgt

480

tatccggatt tactgggtgt aaagggagcg tagacggcag tgcaagtctg aagtgaaagc

540

ccggggctca accccgggac tgctttggaa actgtgcagc tggagtgtcg gagaggcaag

600

cggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattagg aggaacacca gtggcgaagg

660

cggcttgctg gacgataact gacgttgagg ctcgaaagcg tggggagcaa acaggattag

720

ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg actactaggt gtcggggagc aaagctcttc

780

ggtgccgcag ccaacgcaat aagtagtcca cctggggagt acgttcgcaa gaatgaaact

840

caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg

900

cgaagaacct tacctgctat tgacatccct ctgaccgctc tttaatccgg gggttccacc

960

cggggactgg tttggaaagg ggcatggtgg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt

1020

aagtcccgca acgagcgcaa cccctatctt cagtagccag cattaaggat gggcactctg

1080

gagagactgc cagggataac ctggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct

1140

tatgagcagg gctacacacg tgctacaatg gcgtaaacaa agggaagcag agtcgtgagg

1200

ccgagcaaat cccaaaaata acgtctcagt tcggattgta gtctgcaact cgactacatg

1260

aagctggaat cgctagtaat cgcgaatcag aatgtcgcgg tgaatacgtt cccgggtctt

1320

gtacacaccg cccgtcacac catgggagtc agtaacgccc gaagtcagtg acccaaccgt

1380

aaggagg

1387

<210> 1059

<211> 1483

<212> DNA

<213> Lachnospiraceae bacterium A4

<400> 1059

agagtttgat catggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggactcatat tgaaacctag tgatgtatga gttagtggcg gacgggtgag taacgcgtgg

120

agaacctgcc gtatactggg ggataacact tagaaatagg tgctaatacc gcataagcgc

180

acagcttcgc atgaagcagt gtgaaaaact ccggtggtat acgatggatc cgcgtctgat

240

tagcttgttg gcggggtaaa ggcccaccaa ggcgacgatc agtagccggc ctgagagggt

300

gaacggccac attgggactg agacacggcc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

tattgcacaa tgggggaaac cctgatgcag cgacgccgcg tgagtgaaga agtatttcgg

420

tacgtaaagc tctatcagca gggaagaaaa tgacggtacc tgactaagaa gccccggcta

480

actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggggcaagc gttatccgga tttactgggt

540

gtaaagggag cgtagacggc agcgcaagtc tggagtgaaa tcccatggct taaccatgga

600

actgctttgg aaactgtgca gctggagtgc aggagaggta agcggaattc ctagtgtagc

660

ggtgaaatgc gtagatatta ggaggaacac cagtggcgaa ggcggcttac tggactgtaa

720

ctgacgttga ggctcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg

780

ctgtaaacga tgattactag gtgttggggg accaaggtcc ttcggtgccg tcgcaaacgc

840

attaagtaat ccacctgggg agtacgttcg caagaatgaa actcaaagga attgacgggg

900

acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttacctgg

960

tcttgacatc ccagtgacgc atgagtaaag tcatgtttcc ttcgggacac tggagacagg

1020

tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1080

caacccctat ttccagtagc cagcatgtaa agatgggcac tctggagaga ctgcctagga

1140

taactaggag gaaggcgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgat cagggctaca

1200

cacgtgctac aatggcgtaa acaaagggaa gcaaagcggt gacgccaagc aaatcccaaa

1260

aataacgtct cagttcggat tgtagtctgc aactcgacta catgaagctg gaatcgctag

1320

taatcgcgaa tcagaatgtc gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc

1380

acaccatggg agtcggaaat gcccgaagtc agtgacctaa ccgaaaggga ggagctgccg

1440

aaggtggagc cggtaactgg ggtgaagtcg taacaaggta acc

1483

<210> 1060

<211> 1485

<212> DNA

<213> Lachnospiraceae bacterium DJF VP30

<220>

<221> modified_base

<222> (485)..(485)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1060

agagtttgat catggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggagtcatcc tctgtcaaag cttcggcaga gacttggtta acttagtggc ggacgggtga

120

gtaacgcgtg ggtaacctgc catgtacagg gggataacac ttagaaatag gtgctaaaac

180

cgcataagcg cacggtaccg catggtacag tgtgaaaaac tccggtggta catgatggac

240

ccgcgtctga ttagccagtt ggcagggtaa cggcctacca aagcgacgat cagtagccgg

300

cctgagaggg tgaacggcca cattgggact gagacacggc ccaaactcct acgggaggca

360

gcagtgggga atattgcaca atgggggaaa ccctgatgca gcgacgccgc gtgagtgaag

420

aagtatttcg gtatgtaaag ctctatcagc aggaagaaat caatgcggta cctgactaag

480

aagcnccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggggcaa gcgttatccg

540

gatttactgg gtgtaaaggg agcgtagacg gcatggcaag tctgaagtga aaggccaggg

600

ctcaaccctg ggactgcttt ggaaactgtc aggctggagt gcaggagagg taagtggaat

660

tcctagtgta gcggtgaaat gcgtagatat taggaggaac accagtggcg aaggcggctt

720

actggactgt aactgacgtt gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc

780

tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatact aggtgtcggg gagtatagac ttttcggtgc

840

cgcagccaac gcaataagta ttccacctgg ggagtacgtt cgcaagaatg aaactcaaag

900

gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag

960

aaccttacct ggtcttgaca tcccgatgac cggacagtaa tgtgtccttt tcttcggaac

1020

attggagaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc

1080

ccgcaacgag cgcaacccct atcttcagta gccagcaagt aaagttgggc actctggaga

1140

gactgccggg gataacccgg aggaaggcgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg

1200

accagggcta cacacgtgct acaatggcgt aaacagaggg aagcgagagc gtgagctgga

1260

gcaaatccca aaaataacgt cccagttcgg attgtagtct gcaactcgac tacatgaagc

1320

tggaatcgct agtaatcgcg aatcagcatg tcgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac

1380

acaccgccgt cacaccatgg gagtcggaaa tgcccgaagt cggtgaccta accgtaagga

1440

aggagccgcc gaagcaggtc tgataactgg ggtgaagtcg taaca

1485

<210> 1061

<211> 1255

<212> DNA

<213> Lachnospiraceae bacterium ICM62

<400> 1061

acgctggcgg cgtgcttaac acatgcaagt cgaacgagtg gcggacgggt gagtaacgcg

60

tggataacct gccttataca gggggataac ggagagaaat ttccgctaac accgcataag

120

aaaattaggt ataagatgga tccgcgtccg attagctagt tggtgaggta aaggcccacc

180

aaggcgacga tcggtagccg gcctgagagg gtgaacggcc acattgggac tgagacacgg

240

cccaaactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattggac aatgggggaa accctgatcc

300

agcgacgccg cgtgagtgaa gaagtatttc ggtatgtaaa gctctatcag cagggaagat

360

gacggtacct gactaagaag ccccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

420

ggggcaagcg ttatccggat ttactgggtg taaagggagc gcagacggca atgcaagtct

480

gaagtgaaag gcgtgggctc aacccatgaa ctgctttgga aactgtatag cttgagtgtc

540

ggaggggtaa gcggaattcc tagtgtagcg gtgaaatgcg tagatattag gaggaacacc

600

ggaggcgaag gcggcttact ggacgaactg acgttgaggc tcgaaggcgt ggggagcaaa

660

caggattaga taccctggta gtccacgcag taaacgatga atacttggtg tcggggcttc

720

ggtgccgcag ctaacgcatt aagtattcca cctggggagt acgttcgcaa gaatgaaact

780

caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg

840

cgaagaacct taccaaatct tgacatatac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt

900

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtcgtcagt agccagcatg

960

ggcactctga cgagacagcc ggagataatc cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat

1020

catgcccctt atgatttggg ctacacacgt gctacaatgg cgtacaaagt gaagcaaagc

1080

cgcgaggcca agcaaatcac aaaacgtctc agttcggatg tagtctgcaa ctcgactata

1140

gaagctggaa tcgctagtaa tcgcagatca gaatgctgcg gtgaatacgt tcccgggtct

1200

tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt catcaatgcc cgaagtcagt accta

1255

<210> 1062

<211> 1406

<212> DNA

<213> Lachnospiraceae bacterium MSX33

<400> 1062

ggcgtgctta acacatgcaa gtcgaacgaa gctgcccaaa ggaagttttc ggatggaatt

60

taggtagact tagtggcgga cgggtgagta acgcgtggat aacctgcctt atacaggggg

120

ataacggaga gaaatttccg ctaacaccgc ataagaccac agcaccgcat ggtgcagggg

180

taaaatattt ataggtataa gatggatccg cgtccgatta gctagttggt gaggtaaagg

240

cccaccaagg cgacgatcgg tagccggcct gagagggtga acggccacat tgggactgag

300

acacggccca aactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttggacaatg ggggaaaccc

360

tgatccagcg acgccgcgtg agtgaagaag tatttcggta tgtaaagctc tatcagcagg

420

gaagaaaatg acggtacctg actaagaagc cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt

480

aatacgtagg gggcaagcgt tatccggatt tactgggtgt aaagggagcg cagacggcaa

540

tgcaagtctg aagtgaaagg cgtgggctca acccatgaac tgctttggaa actgtatagc

600

ttgagtgtcg gaggggtaag cggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattagg

660

aggaacaccg gaggcgaagg cggcttactg gacgacaact gacgttgagg ctcgaaggcg

720

tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgca gtaaacgatg aatacttggt

780

gtcggggagg taaactcttc ggtgccgcaa gctaacgcat taagtattcc acctggggag

840

tacgttcgca agaatgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat

900

gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaaatc ttgacatact cttgaatagc

960

tttgtaatga agctagtcct tcgggacaag ggatacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

1020

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc gtcagtagcc

1080

agcagtaaga tgggcactct gacgagacag ccggagataa tccggaggaa ggtggggatg

1140

acgtcaaatc atcatgcccc ttatgatttg ggctacacac gtgctacaat ggcgtaaaca

1200

aagtgaagca aagccgcgag gtcaagcaaa tcacaaaaat aacgtctcag ttcggattgt

1260

agtctgcaac tcgactatat gaagctggaa tcgctagtaa tcgcagatca gaatgctgcg

1320

gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt catcaatgcc

1380

cgaagtcagt gacctaaccg taagga

1406

<210> 1063

<211> 1536

<212> DNA

<213> Lachnospiraceae bacterium oral taxon 107

<400> 1063

ttttatatga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg aagctgctta aaggaagttt tcggatggaa tttaggtaga cttagtggcg

120

gacgggtgag taacgcgtgg ataacctgcc ttatacaggg ggataacgga gagaaatttc

180

cgctaacacc gcataagacc acagcaccgc atggtgcagg ggtaaaatat ttataggtat

240

aagatggatc cgcgtccgat tagctagttg gtgaggtaga ggctcaccaa ggcgacgatc

300

ggtagccggc ctgagagggt gaacggccac attgggactg agacacggcc caaactccta

360

cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa tgggggaaac cctgatccag cgacgccgcg

420

tgagtgaaga agtatttcgg tatgtaaagc tctatcagca gggaagaaaa tgacggtacc

480

tgactaagaa gccccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggggcaagc

540

gttatccgga tttactgggt gtaaagggag cgcagacggc aatgcaagtc tgaagtgaaa

600

ggcgtgggct caacccatga actgctttgg aaactgtata gcttgagtgt cggaggggta

660

agcggaattc ctagtgtagc ggtgaaatgc gtagatatta ggaggaacac cggaggcgaa

720

ggcggcttac tggacgacaa ctgacgttga ggctcgaagg cgtggggagc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtccacg cagtaaacga tgaatacttg gtgtcggaga ggtaaactct

840

tcggtgccgc aagctaacgc attaagtatt ccacctgggg agtacgttcg caagaatgaa

900

actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca

960

acgcgaagaa ccttaccaaa tcttgacata ctcttgaata gtcttgtaat gagactagtc

1020

cttcgggaca agggatacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg tcgtcagtag ccagcagtaa gatggggact

1140

ctgacgagac agccggagat aatccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc

1200

ccttatgatt tgggctacac acgtgctaca atggcgtaaa caaagtgaag caaagctgcg

1260

aagccaagca aatcacaaaa ataacgtctc agttcggatt gtagtctgca actcgactat

1320

atgaagctgg aatcgctagt aatcgcagat cagaatgctg cggtgaatac gttcccgggt

1380

cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtcatcaatg cccgaagtca gtgacctaac

1440

cgtaaggaag gagctgccga aggcagggag gataactggg gtgaagtcgt aacaaggtag

1500

ccgtatcgga aggtgcggct ggatcacctc ctttct

1536

<210> 1064

<211> 1487

<212> DNA

<213> Lachnospiraceae bacterium oral taxon F15

<400> 1064

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gaagcattta gaagttttcg gacggaagaa tgacttagtg gcggacgggt gagtaacgcg

120

tgggtaacct gccttataca gggggataac agttggaaac gactgctaat accgcataac

180

ccgatagagt cgcatgactt agtcggaaaa gatttatcgg tataagatgg acccgcgtct

240

gattagctag ttggtgaggt aatggcccac caaggcgacg atcagtagcc ggcttgagag

300

agtgaacggc cacattggga ctgagacacg gcccaaactc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaatattgca caatggggga aaccctgatg cagcaacgcc gcgtgaagga tgaagtattt

420

cggtatgtaa acttctatca gcagggaaga aattgacggt acctgactaa gaagccccgg

480

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggggca agcgttatcc ggatttactg

540

ggtgtaaagg gagcgtaggc ggcaatgcaa gtccgatgtg aaagcccggg gctcaacccc

600

gggactgcat tagaaactgt gttgctagag tgcaggagag gtaagtggaa ttcctagtgt

660

agcggtgaaa tgcgtagata ttaggaggaa caccagtggc gaaggcgact tactggactg

720

aaactgacgc tgaggctcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

acgccgtaaa cgatgaatac taggtgtcgg ggcccatccg ggcttcggtg ccgcggctaa

840

cgcaataagt attccacctg gggagtacgt tcgcaagaat gaaactcaaa ggaattgacg

900

gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc

960

aagtcttgac atcccattga ccgtcccgta acggggactt ctcttcggag caatggagac

1020

aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1080

gcgcagccct tatctttagt agccagcatt taaggtgggc actctagaga gactgccggg

1140

gataacccgg aggaaggcgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg atttgggcta

1200

cacacgtgct acaatggcgt aaacaaaggg aagcaacagg gtgacctcaa gcaaatccca

1260

aaaataacgt cccagttcgg attgtagtct gcaactcgac tacatgaagc tggaatcgct

1320

agtaatcgcg gatcagaatg ccgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg

1380

tcacaccatg ggagtcggaa atgcccgaag tcagtgaccc aaccgcaagg agggagctgc

1440

cgaaggtgga gccgataact ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgt

1487

<210> 1065

<211> 1330

<212> DNA

<213> Lachnospiraceae genomosp. C1

<400> 1065

gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gaatggcgga cgggtgagta

60

acgcgtgggt aacctgcctc atacaggggg ataacagttg gaaacgactg ttaataccgc

120

ataagaaaaa gtggtatgag atggacccgc gttcgattag ccagttggcg gggtaacggc

180

ccaccaaagc gacgatcgat agccgatctg agaggatgac cggccacatt gggactgaga

240

cacggcccaa actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct

300

gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg

360

aagatgacgg tacctgagta agaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtagggggc aagcgttatc cggatttact gggtgtaaag ggagcgcaga cggctctgca

480

agtctgaagt gaaagcccgc ggcttaaccg cgggactgct ttggaaactg caaggcttga

540

gtatcggagg ggcaggcgga attcctagtg tagcggtgaa atgcgtagat attaggaaga

600

acaccggtgg cgaaggcggc ctgctggacg aactgacgtt gaggctcgaa ggcgtgggga

660

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgcggtaaac gatgaatact aggtgttggt

720

gcatcggtgc cgtcgcaaac gcaataagta ttccacctgg ggagtacgtt cgcaagaatg

780

aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcagtgga gcatgtggtt taattcgaag

840

caacgcgaag aaccttacca aatcttgaca tcgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctattg ccggtagcca

960

gcagctgggc actccggcga gactgcccgg gataaccggg aggaaggcgg ggatgacgtc

1020

aaatcatcat gccccttatg atttgggcaa cacacgtgct acaatggcgt tcaaagagaa

1080

gcgagaacgc gagtttaagc aaagctcaaa acgtctcagt tcggatgcag tctgcaactc

1140

gactgcagaa gctggaattg ctagtaatcg cgaatcagca tgtcgcggtg aatacgttcc

1200

cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtcag caacgcccga agtcggtacc

1260

cagggagctg ccgaaggcgg ggcggataac tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtat

1320

cggaaggtgc

1330

<210> 1066

<211> 1406

<212> DNA

<213> Lactobacillus acidipiscis

<220>

<221> modified_base

<222> (69)..(69)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (461)..(461)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (651)..(651)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (678)..(678)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (828)..(828)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1221)..(1221)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1223)..(1223)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1242)..(1242)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1247)..(1247)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1268)..(1268)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1282)..(1282)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1287)..(1287)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1321)..(1321)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1386)..(1386)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1066

acgctggcgg cgtgcctaat acatgcaagt cgaacgcaat ctttgaccaa tgagtgcttg

60

cactcagcng tcaaagtgcg agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgggca atctgcccaa

120

aagtggggga taacacttgg aaacaggtgc taataccgca tcaaccggct gaccgcatgg

180

tcggccgggc aaagacggcg tcagctgtcg cttttggatg agcccgcggc gtattaacta

240

gttggtaagg taacggctta ccaaggtgat gatacgtagc cgaactgaga ggttgatcgg

300

ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag gcagcagtag ggaatcttcc

360

acaatggacg caagtctgat ggagcaacgc cgcgtgtatg aagaaggtct tcggatcgta

420

aaatactgtt gtcagagaag aacacgtgat agagtaactg ntatggcgct gacggtatct

480

gaccagcaag tcacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtggcaagcg

540

ttgtccggat ttattgggcg taaagggaac gcaggcggtc ttttaagtct gatgtgaaag

600

ccttcggctt aaccggagaa gtgcattgga aactggaaga cttgagtgca naagaggaga

660

gtggaactcc atgtgtancg gtgaaatgcg taaatatatg gaagaacacc agtggcgaaa

720

gcggctctct ggtctgtaac tgacgctgag gttcgaaagc gtggggagcg aacaggatta

780

gataccctgg tagtccacgc tgtaaacgat gaatgctagg tgttggangg tttccgccct

840

tcggtgccgc agctaacgca ctaagcattc cgcctgggga gtacgatcgc aagattgaaa

900

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa

960

cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatct tttgaccatc tgagagatca gaatttccct

1020

tcggggacaa aatgacaggt ggtgcatggc tgtcgtccag ctcgtgttcg tgagatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta ttgtcagttg ccagcattca gttgggcact

1140

ctggcgagac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatgcc

1200

ccttatgacc tgggctacac ncntgctaca atggacgata cnacgantcg cgagaccgcg

1260

aggtttanct aatctctgaa antcgtnctc agttcggatc gtaggctgca actcgcctac

1320

ntgaagtcgg aatcgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggc

1380

cttgtncaca ccgcccgtca caccat

1406

<210> 1067

<211> 1421

<212> DNA

<213> Lactobacillus acidophilus

<400> 1067

agcgagctga accaacagat tcacttcggt gatgacgttg ggaacgcgag cggcggatgg

60

gtgagtaaca cgtggggaac ctgccccata gtctgggata ccacttggaa acaggtgcta

120

ataccggata agaaagcaga tcgcatgatc agcttataaa aggcggcgta agctgtcgct

180

atgggatggc cccgcggtgc attagctagt tggtagggta acggcctacc aaggcaatga

240

tgcatagccg agttgagaga ctgatcggcc acattgggac tgagacacgg cccaaactcc

300

tacgggaggc agcagtaggg aatcttccac aatggacgaa agtctgatgg agcaacgccg

360

cgtgagtgaa gaaggttttc ggatcgtaaa gctctgttgt tggtgaagaa ggatagaggt

420

agtaactggc ctttatttga cggtaatcaa ccagaaagtc acggctaact acgtgccagc

480

agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgtt gtccggattt attgggcgta aagcgagcgc

540

aggcggaaga ataagtctga tgtgaaagcc ctcggcttaa ccgaggaact gcatcggaaa

600

ctgtttttct tgagtgcaga agaggagagt ggaactccat gtgtagcggt ggaatgcgta

660

gatatatgga agaacaccag tggcgaaggc ggctctctgg tctgcaactg acgctgaggc

720

tcgaaagcat gggtagcgaa caggattaga taccctggta gtccatgccg taaacgatga

780

gtgctaagtg ttgggaggtt tccgcctctc agtgctgcag ctaacgcatt aagcactccg

840

cctggggagt acgaccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg

900

gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggtct tgacatctaa

960

tgcaatccgt agagatacgt atttcccttc ggggacacta agacaggtgg tgcatggctg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtcat

1080

tagttgccag cattaagttg ggcactctaa tgagactgcc ggtgacaaac cggaggaagg

1140

tggggatgac gtcaagtcat catgcccctt atgacctggg ctacacacgt gctacaatgg

1200

acagtacaac gaggagcaag cctgcgaagg caagcgaatc tcttaaagct gttctcagtt

1260

cggactgcag tctgcaactc gactgcacga agctggaatc gctagtaatc gcggatcagc

1320

acgccgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtct

1380

gcaatgccca aagccggtgg cctaaccttc gggaaggagc c

1421

<210> 1068

<211> 1515

<212> DNA

<213> Lactobacillus alimentarius

<220>

<221> modified_base

<222> (1)..(1)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (82)..(82)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (214)..(214)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (217)..(217)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (260)..(260)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (359)..(360)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (765)..(765)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (767)..(767)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (957)..(957)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (992)..(992)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1068

ntaatatgag agtttgatcc tggctcagga cgaacgctgg cggcatgcct aatacatgca

60

agtcgaacga actttcctat tnattgatgc ttgcatcatg atttagatct aagtgagtgg

120

cggacgggtg agtaacacgt gggtaacctg cccagaagtg ggggataaca tttggaaaca

180

agtgctaata ccgcataaca acattaaaca catnttnttt gtttaaaaga tggttttgct

240

atctcttctg gatggacccn cggcgtatta gctagttggt gaggtaatag ctcaccaagg

300

cgatgatacg tagccgacct gagagggtaa tcggccacat tgggactgag acacggccnn

360

aactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttccacaatg gacgaaagtc tgatggagca

420

atgccgcgtg agtgaagaag gttttcggat cgtaaaactc tgttgttgaa gaagaacata

480

tgtgagagta actgttcacg tactgacggt attcaaccag aaagccacgg ctaactacgt

540

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaaga

600

gaatgtaggc ggttcattaa gtttgaagtg aaagccctcg gctcaaccga ggaagtgctt

660

cgaaaactgg tgaacttgag tgcagaagag gaaagtggaa ctccatgtgt agcggtggaa

720

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct ttctngnctg taactgacgc

780

tgagattcga aagcatgggt agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc atgccgtaaa

840

cgatgagtgc taagtgttgg agggtttccg cccttcagtg ctgcagctaa cgcattaagc

900

actccgcctg gggagtacga tcgcaagatt gaaactcaaa ggaattgacg ggggccngca

960

caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gnaacgcgaa gaaccttacc aggtcttgac

1020

ataccatgaa aagctaagag attagtcttt cccttcgggg acatggatac aggtggtgca

1080

tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct

1140

tattatcagt tgccagcatt cagttgggca ctctggtgag actgccggtg ataaaccgga

1200

ggaaggtggg gacgacgtca aatcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtgcta

1260

caatggtcgg tacaacgtgt tgcgaactcg cgagggcaag caaatcactt aaaaccgatc

1320

tcagttcgga ttgcaggctg caactcgcct gcatgaagct ggaatcgcta gtaatcgcgg

1380

atcagcatgc cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga

1440

gagtttgtaa cacccaaagt cggtggggta acccttcggg gaactagccg cctaaggtgg

1500

gacaaatgat taggg

1515

<210> 1069

<211> 1561

<212> DNA

<213> Lactobacillus amylolyticus

<400> 1069

tgagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtcga

60

gcgagcagaa ctaacagatc tacttcggta gtgacgtttc ggaagcgagc ggcggatggg

120

tgagtaacac gtgggtaacc tgcccttaag tctgggatac cacttggaaa caggtgctaa

180

taccggataa caacaagtgc tgcatggcac ttgcttgaaa ggcggcgcaa gctgtcgcta

240

aaggatggac ccgcggtgca ttagctagtt ggtaaggtaa cggcttacca aggcaacgat

300

gcatagccga gttgagagac tgatcggcca cattgggact gagacacggc ccaaactcct

360

acgggaggca gcagtaggga atcttccaca atgggcgaaa gcctgatgga gcaacgccgc

420

gtgagtgaag aaggttttcg gatcgtaaag ctctgttgtt ggtgaagaag gatagaggta

480

gtaactggcc tttatttgac ggtaatcaac cagaaagtca cggctaacta cgtgccagca

540

gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgttg tccggattta ttgggcgtaa agcgagcgca

600

ggcggagaaa taagtctgat gtgaaagccc tcggcttaac cggggaattg catcggaaac

660

tgtttttctt gagtgcagaa gaggagagtg gaactccatg tgtagcggtg gaatgcgtag

720

atatatggag gaacaccagt ggcgaaggcg gctctctggt ctgtaactga cgctgaggct

780

cgaaagcatg ggtagcgaac aggattagat accctggtag tccatgccgt aaacgatgag

840

tgctaagtgt tgggaggctt ccgcctctca gtgctgcagc taacgcatta agcactccgc

900

ctggggagta cgaccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg

960

tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatctagc

1020

gcaatccgta gagatacgga gttcccttcg gggacgctaa gacaggtggt gcatggctgt

1080

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcatt

1140

agttgccagc attaagttgg gcactctaat gagactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt

1200

ggggacgacg tcaagtcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatggg

1260

cagtacaacg agaagcaagc ctgcgaaggc aagcgaatct ctgaaagctg ttctcagttc

1320

ggactgcagt ctgcaactcg actgcacgaa gctggaatcg ctagtaatcg cggatcagca

1380

cgccgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtctg

1440

caatgcccga agccggtggc ctaaccttcg ggaaggagcc gtctaaggca gggcagatga

1500

ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta ggagaacctg cggctggatc acctcctttc

1560

t

1561

<210> 1070

<211> 1575

<212> DNA

<213> Lactobacillus amylovorus

<400> 1070

tttaaaatga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgagcg agcggaacca acagatttac ttcggtaatg acgttgggaa agcgagcggc

120

ggatgggtga gtaacacgtg gggaacctgc ccctaagtct gggataccat ttggaaacag

180

gtgctaatac cggataataa agcagatcgc atgatcagct tttgaaaggc ggcgtaagct

240

gtcgctaagg gatggccccg cggtgcatta gctagttggt aaggtaacgg cttaccaagg

300

cgacgatgca tagccgagtt gagagactga tcggccacat tgggactgag acacggccca

360

aactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttccacaatg gacgcaagtc tgatggagca

420

acgccgcgtg agtgaagaag gttttcggat cgtaaagctc tgttgttggt gaagaaggat

480

agaggtagta actggccttt atttgacggt aatcaaccag aaagtcacgg ctaactacgt

540

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc

600

gagcgcaggc ggaaaaataa gtctaatgtg aaagccctcg gcttaaccga ggaactgcat

660

cggaaactgt ttttcttgag tgcagaagag gagagtggaa ctccatgtgt agcggtggaa

720

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct ctctggtctg caactgacgc

780

tgaggctcga aagcatgggt agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc atgccgtaaa

840

cgatgagtgc taagtgttgg gaggtttccg cctctcagtg ctgcagctaa cgcattaagc

900

actccgcctg gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca

960

caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc aggtcttgac

1020

atctagtgca atctgtagag atacggagtt cccttcgggg acgctaagac aggtggtgca

1080

tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct

1140

tgttattagt tgccagcatt aagttgggca ctctaatgag actgccggtg acaaaccgga

1200

ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtgcta

1260

caatgggcag tacaacgaga agcaagcctg cgaaggcaag cgaatctctg aaagctgttc

1320

tcagttcgga ctgcagtctg caactcgact gcacgaagct ggaatcgcta gtaatcgcgg

1380

atcagcacgc cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg

1440

gagtctgcaa tgcccaaagc cggtggccta accttcggga aggagccgtc taaggcaggg

1500

cagatgactg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtagga gaacctgcgg ctggatcacc

1560

tcctttctaa ggaag

1575

<210> 1071

<211> 938

<212> DNA

<213> Lactobacillus antri

<220>

<221> modified_base

<222> (16)..(16)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (18)..(18)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (20)..(21)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (603)..(603)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (642)..(642)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (661)..(661)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (699)..(699)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (768)..(768)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (777)..(777)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (798)..(798)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (836)..(836)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (844)..(844)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (855)..(855)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (913)..(913)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (916)..(916)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (918)..(919)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (931)..(931)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1071

tgcactgaat tgacgntngn ntcccagtga gcggcggacg ggtgagtaac acgtgggcaa

60

cctgccctga agcgggggat aacatctgga aacaggtgct aataccgcat aacaacgaaa

120

accacatggt tttcgtttca aagatggttt cggctatcac ttcaggatgg gcccgcggtg

180

cattagctag ttggtaaggt aacggcttac caaggcgatg atgcatagcc gagttgagag

240

actgatcggc cacaatggaa ctgagacacg gtccatactc ctacgggagg cagcagtagg

300

gaatcttcca caatgggcgc aagcctgatg gagcaacacc gcgtgagtga agaagggttt

360

cggctcgtaa agctctgttg ttggagaaga acgtgcgtga gagtaactgt tcacgcagtg

420

acggtatcca accagaaagt cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg

480

tggcaagcgt tatccggatt tattgggcgt aaagcgagcg caggcggttg cttaggtctg

540

atgtgaaagc cttcggctta accgaagaag tgcatcggaa accgggcgac ttgagtgcag

600

aanaggacag tggaactcca tgtgtagcgg tggaatgcgt anatatatgg aagaacacca

660

ntggcgaagg cggctgtctg gtctgcaact gacgctgang ctcgaaagca tgggtagcga

720

acaggattag ataccctggt agtccatgcc gtaaacgatg agtgctangt gttgganggt

780

ttccgccctt cagtgccnga gctaacgcat taagcactcc gcctggggag tacgancgca

840

aggntgaaac tcaanggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

900

tcgaagctac gcnaanannt taccaggtct ngacatct

938

<210> 1072

<211> 1430

<212> DNA

<213> Lactobacillus brevis

<400> 1072

gaacgagctt ccgttgaatg acgtgcttgc actgatttca acaatgaagc gagtggcgaa

60

ctggtgagta acacgtggga aatctgccca gaagcagggg ataacacttg gaaacaggtg

120

ctaataccgt ataacaacaa aatccgcatg gattttgttt gaaaggtggc ttcggctatc

180

acttctggat gatcccgcgg cgtattagtt agttggtgag gtaaaggccc accaagacga

240

tgatacgtag ccgacctgag agggtaatcg gccacattgg gactgagaca cggcccaaac

300

tcctacggga ggcagcagta gggaatcttc cacaatggac gaaagtctga tggagcaatg

360

ccgcgtgagt gaagaagggt ttcggctcgt aaaactctgt tgttaaagaa gaacaccttt

420

gagagtaact gttcaagggt tgacggtatt taaccagaaa gccacggcta actacgtgcc

480

agcagccgcg gtaatacgta ggtggcaagc gttgtccgga tttattgggc gtaaagcgag

540

cgcaggcggt tttttaagtc tgatgtgaaa gccttcggct taaccggaga agtgcatcgg

600

aaactgggag acttgagtgc agaagaggac agtggaactc catgtgtagc ggtggaatgc

660

gtagatatat ggaagaacac cagtggcgaa ggcggctgtc tagtctgtaa ctgacgctga

720

ggctcgaaag catgggtagc gaacaggatt agataccctg gtagtccatg ccgtaaacga

780

tgagtgctaa gtgttggagg gtttccgccc ttcagtgctg cagctaacgc attaagcact

840

ccgcctgggg agtacgaccg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa

900

gcggtggagc atgtggttta attcgaagct acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc

960

ttctgccaat cttagagata agacgttccc ttcggggaca gaatgacagg tggtgcatgg

1020

ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat

1080

tatcagttgc cagcattcag ttgggcactc tggtgagact gccggtgaca aaccggagga

1140

aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa

1200

tggacggtac aacgagtcgc gaagtcgtga ggctaagcta atctcttaaa gccgttctca

1260

gttcggattg taggctgcaa ctcgcctaca tgaagttgga atcgctagta atcgcggatc

1320

agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgagag

1380

tttgtaacac ccaaagccgg tgagataacc ttcgggagtc agccgtctaa

1430

<210> 1073

<211> 1578

<212> DNA

<213> Lactobacillus buchneri

<400> 1073

tttaagatga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgaacg cgtcttggtc aatgaagttg agtgcttgca tttaactgat ttgacattaa

120

gacgagtggc gaactggtga gtaacacgtg ggtaacttgc cccgaagcgg gggataacat

180

ttggaaacag gtgctaatac cgcataacaa caaaaaccac atggtttttg tttaaaagat

240

ggtttcggct atcactttgg gatggacccg cggcgtatta gctagttggt gaggtaatgg

300

ctcaccaagg caatgatacg tagccgacct gagagggtaa tcggccacat tgggactgag

360

acacggccca aactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttccacaatg gacgaaagtc

420

tgatggagca acgccgcgtg agtgatgaag ggtttcggct cgtaaaactc tgttgttgga

480

gaagaacggg tgtcagagta actgttgaca tcgtgacggt atccaaccag aaagccacgg

540

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg

600

ggcgtaaagc gagcgcaggc ggttttttag gtctgatgtg aaagccttcg gcttaaccgg

660

agaagtgcat cggaaaccgg gagacttgag tgcagaagag gacagtggaa ctccatgtgt

720

agcggtgaaa tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct gtctggtctg

780

caactgacgc tgaggctcga aagcatgggt agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc

840

atgccgtaaa cgatgagtgc taagtgttgg agggtttccg cccttcagtg ctgcagctaa

900

cgcattaagc actccgcctg gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg

960

ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gctacgcgaa gaaccttacc

1020

aggtcttgac atcttctgct aacctaagag attaggcgtt cccttcgggg acggaatgac

1080

aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1140

gcgcaaccct tattgtcagt tgccagcatt tagttgggca ctctggcgag actgccggtg

1200

acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga cctgggctac

1260

acacgtgcta caatggacgg tacaacgagt cgcgaaaccg cgaggtcaag ctaatctctt

1320

aaagccgttc tcagttcgga ttgtaggctg caactcgcct acatgaagtt ggaatcgcta

1380

gtaatcgtgg atcagcatgc cacggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1440

cacaccatga gagtttgtaa cacccaaagc cggtgaggta accttcgggg gccagccgtc

1500

taaggtggga cagatgatta gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtagga gaacctgcgg

1560

ctggatcacc tcctttct

1578

<210> 1074

<211> 1573

<212> DNA

<213> Lactobacillus casei

<400> 1074

tttatatgag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca

60

agtcgaacga gttctcgttg atgatcggtg cttgcaccga gattcaacat ggaacgagtg

120

gcggacgggt gagtaacacg tgggtaacct gcccttaagt gggggataac atttggaaac

180

agatgctaat accgcataga tccaagaacc gcatggttct tggctgaaag atggcgtaag

240

ctatcgcttt tggatggacc cgcggcgtat tagctagttg gtgaggtaac ggctcaccaa

300

ggcgatgata cgtagccgaa ctgagaggtt gatcggccac attgggactg agacacggcc

360

caaactccta cgggaggcag cagtagggaa tcttccacaa tggacgcaag tctgatggag

420

caacgccgcg tgagtgaaga aggctttcgg gtcgtaaaac tctgttgttg gagaagaatg

480

gtcggcagag taactgttgt cggcgtgacg gtatccaacc agaaagccac ggctaactac

540

gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg caagcgttat ccggatttat tgggcgtaaa

600

gcgagcgcag gcggtttttt aagtctgatg tgaaagccct cggcttaacc gaggaagcgc

660

atcggaaact gggaaacttg agtgcagaag aggacagtgg aactccatgt gtagcggtga

720

aatgcgtaga tatatggaag aacaccagtg gcgaaggcgg ctgtctggtc tgtaactgac

780

gctgaggctc gaaagcatgg gtagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccatgccgta

840

aacgatgaat gctaggtgtt ggagggtttc cgcccttcag tgccgcagct aacgcattaa

900

gcattccgcc tggggagtac gaccgcaagg ttgaaactca aaggaattga cgggggcccg

960

cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaggtcttg

1020

acatcttttg atcacctgag agatcaggtt tccccttcgg gggcaaaatg acaggtggtg

1080

catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

1140

cttatgacta gttgccagca tttagttggg cactctagta agactgccgg tgacaaaccg

1200

gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gacctgggct acacacgtgc

1260

tacaatggat ggtacaacga gttgcgagac cgcgaggtca agctaatctc ttaaagccat

1320

tctcagttcg gactgtaggc tgcaactcgc ctacacgaag tcggaatcgc tagtaatcgc

1380

ggatcagcac gccgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat

1440

gagagtttgt aacacccgaa gccggtggcg taaccctttt agggagcgag ccgtctaagg

1500

tgggacaaat gattagggtg aagtcgtaac aaggtagccg taggagaacc tgcggctgga

1560

tcacctcctt tct

1573

<210> 1075

<211> 1544

<212> DNA

<213> Lactobacillus catenaformis

<220>

<221> modified_base

<222> (67)..(67)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (319)..(319)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (327)..(328)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (373)..(373)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (581)..(581)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (602)..(605)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (639)..(639)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (753)..(756)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (920)..(921)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1432)..(1432)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1473)..(1473)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1479)..(1479)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1488)..(1496)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1505)..(1529)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1075

tggagagttt gatcctggct caggatgaac gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg

60

aacgggntgc cattaggcac tagtggcgaa cgggtgagga gcacatgggg aacctgcccg

120

tcagaggggg acaacagctg gaaacggctg ctaagaccgc ataggctcaa ggagggcatc

180

ctcgttgagt taaagtgtcc tttcggggac agctgacgga tggacctgtg gcgcattagc

240

tagttggcgg ggtaaaggcc caccaaggcg acgatgcgta gccggcctga gagggcggac

300

ggccacactg ggactgagnc acggccnnga ctcctgcggg aggcagcagt agggaatttt

360

cggcaatggg ggnaaccctg accgagcaac gccgcgtgag tgaggaaggc cttcgggctg

420

taaagctctg ttgcagagga agaacgggag agcgaggaaa tgcgcttttc gtgacggtac

480

tctgcgagaa agccacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcgag

540

cgttatccgg aatcattggg cgtaaagagg gagcaggcgg nacgcgaagg tccgtagtaa

600

annnngaagc taaacttcgg gcggctatgg aaaccgcgnc gcctggagtg cggaagagga

660

actcggaatt ccatgtgtag cggtgaaatg cgtagatata tggaggaaca ccggtggcga

720

aggcggcggt ctggtccggc actgacgctc agnnnngaaa gcgtggggag caaataggat

780

tagataccct agtagtccac gctgtaaacg atcgatacca ggtgtcggga gtcacatccc

840

ggtgccgaag ccaacgcatt aagtatcgcg cctgagtagt acgtccgcaa ggatgaaact

900

caaaggaatt gacgggggcn ngcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg

960

cgaagaacct taccaggcct tgacatcgat ccgatcgcgc ggagacgcgc gagaccttgc

1020

cgaaagggaa ggaggagaag acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctgccgcca gttgccagca ttcaggatgg

1140

ggactctggc gggactgccc ctgtaagggg gaggaaggcg gggatgacgt caaatcatca

1200

tgccccttat ggcctgggct acacacgtgc tacaatggac ggagcagagg gaggcgaagc

1260

cgcgaggcgg agcggagccc agaaacccgt tcacagttcg gactgcagcc tgcaactcgg

1320

ctgcacgaag ctggaatcgc tagtaatcgc agatcagcat gctgcggtga atacgttccc

1380

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gagagtcggc aacgcccgaa gncggcggcc

1440

caaccccgta aggggaggga gcagtcaaag gcngggcana tgattggnnn nnnnnngtaa

1500

caagnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnng atcacctcct ttct

1544

<210> 1076

<211> 1573

<212> DNA

<213> Lactobacillus coleohominis

<400> 1076

tgagagtttg atcctggctc aggatgaacg ccggcggtgt gcctaataca tgcaagtcga

60

acgcgttggc ccgactgatt gatgatgctt gcatcagatt gacgacggtt taccaacgag

120

tggcggacgg gtgagtaaca cgtaggcaac ctgcccagaa gcgggggaca acatttggaa

180

acaagtgcta ataccgcata acaacgaaaa ctgcctggtt ttcgtttaaa agatggtttc

240

ggctatcact tctggatggg cctgcggcgc attagctagt tggtaaggca acggcttacc

300

aaggcagtga tgcgtagccg agttgagaga ctgatcggcc acaatggaac tgagacacgg

360

tccatactcc tacgggaggc agcagtaggg aatcttccac aatgggcgca agcctgatgg

420

agcaacaccg cgtgagtgaa gaagggtttc ggctcgtaaa actctgttgt tgaagaagaa

480

cgtgcgtgag agtaactgtt cacgcagtga cggtattcaa ccagaaagtc acggctaact

540

acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgtt atccggattt attgggcgta

600

aagcgagcgc aggcggtttt ctaagtctga tgtgaaagcc ttcggcttaa ccggagaagg

660

gcatcggaaa ctggataact tgagtgcaag agaggacagt ggaactccat gtgtagcggt

720

ggaatgcgta gatatatgga agaacaccag tggcgaaggc ggctgtctag cttgcaactg

780

acgctgaggc tcgaaagcat gggtagcgaa caggattaga taccctggta gtccatgccg

840

taaacgatga gtgctaggtg ttggagggtt tccgcccttc agtgccggag ctaacgcatt

900

aagcactccg cctggggagt acgaccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc

960

cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagctacg cgaagaacct taccaggtct

1020

tgacatcttg cgccaacctc agagatgagg cgttcccttc ggggacgcaa tgacaggtgg

1080

tgcatggtcg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

1140

cccttgttac tagttgccag cattcagttg ggcactctag tgagactgcc ggtgacaaac

1200

cggaggaagg tggggacgac gtcagatcat catgcccctt atgacctggg ctacacacgt

1260

gctacaatgg acggtacaac gagcagcgaa ctcgcaaggg ccagctaatc tcttaaaacc

1320

gttctcagtt cggactgcag tctgcaactc gactgcacga agtcggaatc gctagtaatc

1380

gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc

1440

atgggagttt gcaatgccca aagccggtgg cctaaccttc gggaaggagc cgtctaaggc

1500

agggcagatg actggggtga agtcgtaaca aggtagccgt aggagaacct gcggctggat

1560

cacctccttt cta

1573

<210> 1077

<211> 1518

<212> DNA

<213> Lactobacillus coryniformis

<220>

<221> modified_base

<222> (1)..(2)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (116)..(116)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (150)..(151)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (220)..(220)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (247)..(247)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (263)..(263)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (362)..(363)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (464)..(464)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (573)..(573)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (639)..(639)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (763)..(763)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (790)..(790)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (792)..(793)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (960)..(960)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (995)..(995)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1080)..(1080)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1181)..(1181)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1391)..(1391)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1416)..(1416)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1430)..(1430)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1436)..(1436)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1497)..(1497)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1511)..(1511)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1514)..(1515)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1077

nnttatatga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgaacg cactgacgtc gaccgaagct gcttgcagtg gacgttgatt gacgtnagtg

120

gcggacgggt gagtaacacg tgggtaaccn ncccttaagt gggggataac atttggaaac

180

agatgctaat accgcataac cattcagacc acatggtctn aatgtaaaag acggcctttg

240

gctgtcnctt ttggacggac ccncggcgta ttagttagtt ggtaaggtaa cggcttacca

300

agacaatgat acgtagccga cctgagaggg taatcggcca cattgggact gagacacggc

360

cnnaactcct acgggaggca gcagtaggga atcttccaca atggacgaaa gtctgatgga

420

gcaacgccgc gtgagtgaag aaggttttag gatcgtaaaa ctcngttgtt ggagaagaac

480

agggactaga gtaactgtta gtcctttgac ggtatccaac cagaaagcca cggctaacta

540

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg gcnagcgttg tccggattta ttgggcgtaa

600

agcgagcgca ggcggttttt taagtctgat gtgaaagcnt tcggcttaac cgaagaagtg

660

cattagaaac tggraaactt gagtgcagaa gaggacagtg gaactccatg tgtagcggtg

720

aaatgcgtag atatatggaa gaacaccagt ggcgaaggcg gcngtctggt ctgtaactga

780

cgctgaggcn cnnaagtatg gggagcgaac aggattagat accctggtag tccataccgt

840

aaacgatgaa tgctaagtgt tggagggttt ccgcccttca gtgctgcagc taacgcatta

900

agcattccgc ctggggagta cgaccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccn

960

gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagnaacgc gaagaacctt accaggtctt

1020

gacatccttt gaccactgta gagatacagc tttcccttcg gggacaaagt gacaggtggn

1080

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1140

ccttatgact agttgccagc atttagttgg gcactctagt nagactgccg gtgacaaacc

1200

ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcagc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg

1260

ctacaatggt cggtacaacg agttgcgaac ccgcgagggt aagctaatct cttaaagccg

1320

atctcagttc ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa gccggaatcg ctagtaatcg

1380

cggatcagca ngccgcggtg aatacgttcc cgggcnttgt acacaccgcn cgtcanacca

1440

tgagagtttg taacacccga agtcggtggg gtaacccttt tagggaacta gccgccnaag

1500

gtgggacaga ngannggg

1518

<210> 1078

<211> 1562

<212> DNA

<213> Lactobacillus crispatus

<400> 1078

tgagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtcga

60

gcgagcggaa ctaacagatt tacttcggta atgacgttag gaaagcgagc ggcggatggg

120

tgagtaacac gtggggaacc tgccccatag tctgggatac cacttggaaa caggtgctaa

180

taccggataa gaaagcagat cgcatgatca gcttttaaaa ggcggcgtaa gctgtcgcta

240

tgggatggcc ccgcggtgca ttagctagtt ggtaaggtaa aggcttacca aggcgatgat

300

gcatagccga gttgagagac tgatcggcca cattgggact gagacacggc ccaaactcct

360

acgggaggca gcagtaggga atcttccaca atggacgcaa gtctgatgga gcaacgccgc

420

gtgagtgaag aaggttttcg gatcgtaaag ctctgttgtt ggtgaagaag gatagaggta

480

gtaactggcc tttatttgac ggtaatcaac cagaaagtca cggctaacta cgtgccagca

540

gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgttg tccggattta ttgggcgtaa agcgagcgca

600

ggcggaagaa taagtctgat gtgaaagccc tcggcttaac cgaggaactg catcggaaac

660

tgtttttctt gagtgcagaa gaggagagtg gaactccatg tgtagcggtg gaatgcgtag

720

atatatggaa gaacaccagt ggcgaaggcg gctctctggt ctgcaactga cgctgaggct

780

cgaaagcatg ggtagtgaac aggattagat accctggtag tccatgccgt aaacgatgag

840

tgctaagtgt tgggaggttt ccgcctctca gtgctgcagc taacgcatta agcactccgc

900

ctggggagta cgaccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg

960

tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatctagt

1020

gccatttgta gagatacaaa gttcccttcg gggacgctaa gacaggtggt gcatggctgt

1080

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgttatt

1140

agttgccagc attaagttgg gcactctaat gagactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt

1200

ggggatgacg tcaagtcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatggg

1260

cagtacaacg agaagcgagc ctgcgaaggc aagcgaatct ctgaaagctg ttctcagttc

1320

ggactgcagt ctgcaactcg actgcacgaa gctggaatcg ctagtaatcg cggatcagca

1380

cgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtctg

1440

caatgcccaa agccggtggc ctaaccttcg ggaaggagcc gtctaaggca gggcagatga

1500

ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta ggagaacctg cggctggatc acctcctttc

1560

ta

1562

<210> 1079

<211> 1559

<212> DNA

<213> Lactobacillus curvatus

<400> 1079

aagtttgatt atagctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtcgaacg

60

cactctcgtt agattgaaga agcttgcttc tgattgataa catttgagtg agtggcggac

120

gggtgagtaa cacgtgggta acctgcccta aagtggggga taacatttcg gaaacagatg

180

ctaataccgc ataaaaccta acaccgcatg gtgcaaggtt gaaagatggt ttcggctatc

240

actttaggat ggacccgcgg tgcattagtt agttggtgag gtaaaggctc accaagaccg

300

tgatgcatag ccgacctgag agggtaatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac

360

tcctacggga ggcagcagta gggaatcttc cacaatggac gaaagtctga tggagcaacg

420

ccgcgtgagt gaagaaggtt ttcggatcgt aaaactctgt tgttggagaa gaacgtattt

480

gatagtaact gatcaggtag tgacggtatc caaccagaaa gccacggcta actacgtgcc

540

agcagccgcg gtaatacgta ggtggcaagc gttgtccgga tttattgggc gtaaagcgag

600

cgcaggcggt ttcttaagtc tgatgtgaaa gccttcggct caaccgaaga agtgcatcgg

660

aaactgggaa acttgagtgc agaagaggac agtggaactc catgtgtagc ggtgaaatgc

720

gtagatatat ggaagaacac cagtggcgaa ggcggatgtc tggtctgtaa ctgacgctga

780

ggctcgaaag catgggtagc aaacaggatt agataccctg gtagtccatg ccgtaaacga

840

tgagtgctag gtgttggagg gtttccgccc ttcagtgccg cagctaacgc attaagcact

900

ccgcctgggg agtacgaccg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa

960

gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc

1020

ctttgaccac tctagagata gagctttccc ttcggggaca aagtgacagg tggtgcatgg

1080

ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat

1140

tactagttgc cagcatttag ttgggcactc tagtgagact gccggtgaca aaccggagga

1200

aggtggggac gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa

1260

tggatggtac aacgagtcgc gagaccgcga ggtttagcta atctcttaaa accattctca

1320

gttcggattg taggctgcaa ctcgcctaca tgaagccgga atcgctagta atcgcggatc

1380

agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgagag

1440

tttgtaacac ccaaagccgg tgaggtaacc ttcgggagcc agccgtctaa ggtgggacag

1500

atgattaggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtagagaac ctgcggctgg atcacctct

1559

<210> 1080

<211> 1568

<212> DNA

<213> Lactobacillus delbrueckii

<400> 1080

ttcaaattga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgagcg agctgaattc aaagatccct tcggggtgat ttgttggacg ctagcggcgg

120

atgggtgagt aacacgtggg caatctgccc taaagactgg gataccactt ggaaacaggt

180

gctaataccg gataacaaca tgaatcgcat gattcaagtt tgaaaggcgg cgcaagctgt

240

cactttagga tgagcccgcg gcgcattagc tagttggtgg ggtaaaggcc taccaaggca

300

atgatgcgta gccgagttga gagactgatc ggccacattg ggactgagac acggcccaaa

360

ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt ccacaatgga cgcaagtctg atggagcaac

420

gccgcgtgag tgaagaaggt cttcggatcg taaagctctg ttgttggtga agaaggatag

480

aggcagtaac tggtctttat ttgacggtaa tcaaccagaa agtcacggct aactacgtgc

540

cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag cgttgtccgg atttattggg cgtaaagcga

600

gcgcaggcgg aatgataagt ctgatgtgaa agcccacggc ttaaccgtgg aactgcatcg

660

gaaactgtca ttcttgagtg cagaagagga gagtggaact ccatgtgtag cggtggaatg

720

cgtagatata tggaagaaca ccagtggcga aggcggctct ctggtctgca actgacgctg

780

aggctcgaaa gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

840

atgagcgcta ggtgttgggg actttccggt tctcagtgcc gcagcaaacg cgttaagcgc

900

tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

960

agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat

1020

cctgcgctac acctagagat aggtggttcc cttcggggac gcagagacag gtggtgcatg

1080

gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg

1140

tctttagttg ccatcattaa gttgggcact ctaaagagac tgccggtgac aaaccggagg

1200

aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1260

atgggcagta caacgagaag cgaacccgcg agggtaagcg gatctcttaa agctgctctc

1320

agttcggact gcaggctgca actcgcctgc acgaagctgg aatcgctagt aatcgcggat

1380

cagcacgccg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggaa

1440

gtctgcaatg cccaaagtcg gtgagataac ctttatagga gtcagccgcc taaggcaggg

1500

cagatgactg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtagga gaacctgcgg ctggatcacc

1560

tcctttct

1568

<210> 1081

<211> 1464

<212> DNA

<213> Lactobacillus dextrinicus

<220>

<221> modified_base

<222> (394)..(394)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (397)..(397)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (781)..(781)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1081

ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtcga acgagtttgc ttttaatgaa ggcggtgctt

60

gcaccaactg atttaaaaat aaacgagtgg cggacgggtg agtaacacgt gggtaaccta

120

ccctaaagtg ggggataaca tttggaaaca gatgctaata ccgcataata tcaaaaacca

180

catggttttt aattgaaaga cggcgtaagc tgtcactttt ggatggaccc gcggcgtatt

240

agctagttgg tgaggtaacg gctcaccaag gcgatgatac gtagccgacc tgagagggtg

300

atcggccaca ttgggactga gacacggccc aaactcctac gggaggcagc agtagggaat

360

cttccacaat ggacgaaagt ctgatggagc aacnccncgt gagtgaagaa ggttttcgga

420

tcgtaaaact ctgttattgg agaagaacgt atttggtagt aactggccag atagtgacgg

480

tatccaatca gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc

540

aagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag cgagtgcagg cggtttttta agtctgatgt

600

gaaagccttc ggcttaaccg aagaaatgca ttggaaactg ggaaacttga gtgcagaaga

660

ggagagtgga actccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat atatggaaga acaccagtgg

720

cgaaggcggc tctctggtct gtaactgacg ctgaggctcg aaagcgtggg tagcaaacag

780

nattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaagtgttg gagggtttcc

840

gcccttcagt gctgcagcta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg accgcaaggt

900

tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga

960

agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catctagcgc caatcctaga gataggacgt

1020

tcccttcggg gacgctaaga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttattatcag ttgccagcat ttagttgggc

1140

actctggtga gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat

1200

gccccttatg acctgggcta cacacgtgct acaatggcta gtacaacgag ttgcgagacc

1260

gcgaggtcaa gctaatctct aaaagctagt ctcagttcgg attgtaggct gcaactcgcc

1320

tacatgaagt tggaatcgct agtaatcgcg gatcagcacg ccgcggtgaa tacgttcccg

1380

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg agagtttgta acacccgaag ccggtggagt

1440

aacccgtaag ggagctagcc gtct

1464

<210> 1082

<211> 1517

<212> DNA

<213> Lactobacillus farciminis

<220>

<221> modified_base

<222> (1)..(2)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (154)..(154)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (297)..(297)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (360)..(361)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (551)..(552)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (571)..(571)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (761)..(761)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (956)..(958)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (993)..(993)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1136)..(1136)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1410)..(1410)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1414)..(1414)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1428)..(1430)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1082

nntaatatga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcatgcc taatacatgc

60

aagtcgaacg aaccatcctg aagattgaag cttgcttcat gattcagacc ttggtgagtg

120

gcggacgggt gagtaacacg tgggtaacct gccnaaaagt gggggataac atttggaaac

180

aagtgctaat accgcataac aactactttc acatgatcgt agcttgaaag atggctctgc

240

tatcgctttt ggatggaccc gcggcgtatt agctagttgg tgaggtaata gctcacnaag

300

gcaatgatac gtagccgacc tgagagggta atcggccaca ttgggactga gacacggccn

360

naactcctac gggaggcagc agtagggaat cttccacaat gggcgaaagc ctgatggagc

420

aatgccgcgt gagtgaagaa ggttttcgga tcgtaaaact ctgttgttga agaagaacat

480

gcgtgagagt aactgttcac gtactgacgg tattcaacca gaaagctacg gctaactacg

540

tgccagcagc nncggtaata cgtaggtggc nagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag

600

agaatgtagg cggtttatta agtttgaagt gaaagccctc ggctcaaccg aggaagtgct

660

tcgaaaactg gtaaacttga gtgcagaaga ggaaagtgga actccatgtg tagcggtgga

720

atgcgtagat atatggaaga acaccagtgg cgaaggcggc nttctggtct gtaactgacg

780

ctgagattcg aaagcatggg tagcaaacag gattagatac cctggtagtc catgccgtaa

840

acgatgagtg ctaagtgttg gagggtttcc gcccttcagt gctgcagcta acgcattaag

900

cactccgcct ggggagtacg atcgcaagat tgaaactcaa aggaattgac gggggnnngc

960

acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agnaacgcga agaaccttac caggtcttga

1020

cataccatga caaactaaga gattagtctt tcccttcggg gacatggata caggtggtgc

1080

atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcnaccc

1140

ttattatcag ttgccagcat tcagttgggc actctggtga gactgccggt gacaaaccgg

1200

aggaaggtgg ggacgacgtc aaatcatcat gccccttatg acctgggcta cacacgtgct

1260

acaatggtcg gtacaacgtg ttgcgaactc gcgagggcaa gcaaatcact taaaaccgat

1320

ctcagttcgg attgcaggct gcaactcgcc tgcatgaagc tggaatcgct agtaatcgcg

1380

gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccn ggcnttgtac acaccgcnnn tcacaccatg

1440

agagtttgta acacccaaag tcggtggggt aacccttcgg ggaactagcc gcctaaggtg

1500

ggacaaatga ttagggt

1517

<210> 1083

<211> 1419

<212> DNA

<213> Lactobacillus fermentum

<220>

<221> modified_base

<222> (1405)..(1405)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1083

tggcccaatt gattgatggt gcttgcacct gattgatttt ggtcgccaac gagtggcgga

60

cgggtgagta acacgtaggt aacctgccca gaagcggggg acaacatttg gaaacagatg

120

ctaataccgc ataacagcgt tgttcgcatg aacaacgctt aaaagatggc ttctcgctat

180

cacttctgga tggacctgcg gtgcattagc ttgttggtgg ggtaatggcc taccaaggcg

240

atgatgcata gccgagttga gagactgatc ggccacaatg ggactgagac acggcccata

300

ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt ccacaatggg cgcaagcctg atggagcaac

360

accgcgtgag tgaagaaggg tttcggctcg taaagctctg ttgttaaaga agaacacgta

420

tgagagtaac tgttcatacg ttgacggtat ttaaccagaa agtcacggct aactacgtgc

480

cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag cgttatccgg atttattggg cgtaaagaga

540

gtgcaggcgg ttttctaagt ctgatgtgaa cttcggctta accggagaag tgcatcggaa

600

actggataac ttgagtgcag aagagggtag tggaactcca tgtgtagcgg tggaatgcgt

660

agatatatgg aagaacacca gtggcgaagg cggctacctg gtctgcaact gacgctgaga

720

ctcgaaagca tgggtagcga acaggattag ataccctggt agtccatgcc gtaaacgatg

780

agtgctagtg ttggagggtt tccgcccttc agtgccggag ctaacgcatt aagcactccg

840

cctggggagt acgaccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg

900

gtggagcatg tggtttaatt cgaagctacg catccaacct taccaggtct tgacatcttg

960

cgcccaccct agagataggg cgtttccttc gggaacgcaa tgacaggtgg tgcatggtcg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgttac

1080

tagttgccag cattaagttg ggcactctag tgagactgcc ggtgacaaac cggaggaagg

1140

tggggacgac gtcagatcat catgcccctt atgacctggg ctacacacgt gctacaatgg

1200

acggtacaac gagtcgcgaa ctcgcgaggg caagcaaatc tcttaaaacc gttctcagtt

1260

cggactgcag gctgcaactc gcctgcacga agtcggaatc gctagtaatc gcggatcagc

1320

atgccgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgagagttt

1380

gtaacaccca aagtcggtgg ggtanccttt taggagcca

1419

<210> 1084

<211> 995

<212> DNA

<213> Lactobacillus gasseri

<220>

<221> modified_base

<222> (43)..(43)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (50)..(50)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (918)..(918)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (976)..(976)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (984)..(984)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1084

gagcttgcct agatgaattt ggtgcttgca ccaaatgaaa ctngatacan gcgagcggcg

60

gacgggtgag taacacgtgg gtaacctgcc caagagactg ggataacacc tggaaacaga

120

tgctaatacc ggataacaac actagacgca tgtctagagt ttaaaagatg gttctgctat

180

cactcttgga tggacctgcg gtgcattagc tagttggtaa ggtaacggct taccaaggca

240

atgatgcata gccgagttga gagactgatc ggccacattg ggactgagac acggcccaaa

300

ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt ccacaatgga cgcaagtctg atggagcaac

360

gccgcgtgag tgaagaaggg tttcggctcg taaagctctg ttggtagtga agaaagatag

420

aggtagtaac tggcctttat ttgacggtaa ttacttagaa agtcacggct aactacgtgc

480

cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag cgttgtccgg atttattggg cgtaaagcga

540

gtgcaggcgg ttcaataagt ctgatgtgaa agccttcggc tcaaccggag aattgcatca

600

gaaactgttg aacttgagtg cagaagagga gagtggaact ccatgtgtag cggtggaatg

660

cgtagatata tggaagaaca ccagtggcga aggcggctct ctggtctgca actgacgctg

720

aggctcgaaa gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

780

atgagtgcta agtgttggga ggtttccgcc tctcagtgct gcagctaacg cattaagcac

840

tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

900

agcggtggag catgtggntt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat

960

ccagtgcaaa cctaanagat tagnagttcc cttcg

995

<210> 1085

<211> 1373

<212> DNA

<213> Lactobacillus gastricus

<400> 1085

tatatggagt ttgatcctgg ctcaggatga acgccggcgg tgtgcctaat acatgcaagt

60

cgaacgagtg gcggacgggt gagtaacacg taggtaacct gcccagaagc gggggataac

120

atctggaaac aggtgctaat accgcataac aaaagtcact tctggatgga cctgcggcgc

180

attagcttgt tggtagggta atggcctacc aaggcagtga tgcgtagccg agttgagaga

240

ctgatcggcc acaatgggac tgagacacgg cccatactcc tacgggaggc agcagtaggg

300

aatcttccac aatgggcgca agcctgatgg agcaacaccg cgtgagtgaa gaagggtttc

360

ggctcgtaaa gctctgttgt tgaagaagat gacggtattc aaccagaaag tcacggctaa

420

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtggcaagcg ttatccggat ttattgggcg

480

taaagagagt gcaggcggtt tcttaagtct gatgtgaaag ccttcggctc aaccgaagaa

540

gtgcatcgga aactgggaga cttgagtaca gaagagggca gtggaactcc atgtgtagcg

600

gtggaatgcg tagatatatg gaagaacacc agtggcgaag gcggctgcct ggtctgactg

660

acgctgagac tcgaaagcat gggtagcgaa caggattaga taccctggta gtccatgccg

720

taaacgatga gtgctaggtg ttggagcttc agtgccggag ctaacgcatt aagcactccg

780

cctggggagt acgaccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg

840

gtggagcatg tggtttaatt cgaagctacg cgaagaacct taccaggtct tgacatcgac

900

aggtggtgca tggtcgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

960

gcgcaaccct tgttactagt tgccagcatg ggcactctag tgagactgcc ggtgacaaac

1020

cggaggaagg tggggacgac gtcagatcat catgcccctt atgacctggg ctacacacgt

1080

gctacaatgg acggcaacga gtcgcgaact cgcgagggca agcaaatctc ttccgttctc

1140

agttcggatg caggctgcaa ctcgcctgca gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcggatca

1200

gcatgccgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgagagt

1260

ttgtaacacc caaagtcggt gggtagccag ccgcctaagg tgggacagat gattagggtg

1320

aagtcgtaac aaggtagccg taggagaacc tgcggctgga tcacctcctt tct

1373

<210> 1086

<211> 1287

<212> DNA

<213> Lactobacillus genomosp. C1

<400> 1086

agtggcgaac tggtgagtaa cacgtgggta acctgccctg aagtggggga taacacttgg

60

aaacaggtgc taataccgca taacgaaagt cacttttgga tggacccgcg gcgtattagc

120

ttgttggtga ggtaacggct caccaaggcc atgatacgta gccgacctga gagggtaatc

180

ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

240

ccacaatgga cgaaagtctg atggagcaac gccgcgtgag tgatgaaggg tttcggctcg

300

taaaactctg ttgttggaga agatgacggt atccaaccag aaagccacgg ctaactacgt

360

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc

420

gagcgcaggc ggttttttag gtctgatgtg aaagccttcg gcttaaccgg agaagggcat

480

cggaaaccgg gagacttgag tgcagaagag gacagtggaa ctccatgtgt agcggtgaaa

540

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct gtctggtctg actgacgctg

600

aggctcgaaa gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

660

atgagtgcta agtgttggag cttcagtgct gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

720

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

780

catgtggttt aattcgatgc tacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

840

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

900

cccttattgt cagttgccag catgggcact ctggcgagac tgccggtgac aaaccggagg

960

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1020

atggacggca acgagtcgcg aaaccgcgag gtcaagctaa tctcttccgt tctcagttcg

1080

gatgccggct gcaactcgcc tgcagaagtt ggaatcgcta gtaatcgtgg atcagcatgc

1140

cacggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagtttgtaa

1200

cacccaaagc cggtaggtaa ccagccgtct aaggtgggac agatgattag ggtgaagtcg

1260

taacaaggta gccgtaggag aacctgc

1287

<210> 1087

<211> 1254

<212> DNA

<213> Lactobacillus genomosp. C2

<400> 1087

agtggcgaac tggtgagtaa cacgtgggta acctgccctg aagtagggga taacacttgg

60

aaacaggtgc taataccgta taacaaaagt cactttagga tggacccgcg gcgtattagc

120

ttgttggtga ggtaacggct caccaaggca atgatacgta gccgacctga gagggtaatc

180

ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

240

ccacaatgga cgaaagtctg atggagcaac gccgcgtgag tgatgaaggg tttcggctcg

300

taaaactctg ttgttggaga agatgacggt atccaaccag aaagccacgg ctaactacgt

360

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc

420

gagcgcaggc ggttttttag gtctgatgtg aaagccttcg gcttaaccgg agaagtgcat

480

cggaaaccgg gagacttgag tgcagaagag gacagtggaa ctccatgtgt agcggtgaaa

540

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct gtctggtctg actgacgctg

600

aggctcgaaa gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

660

atgagtgcta agtgttggag cttcagtgct gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

720

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

780

catgtggttt aattcgatgc tacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

840

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

900

cccttattgt tagttgccag catgggcact ctagcaagac tgccggtgac aaaccggagg

960

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1020

atggacggca acgagtcgcg aaaccgcgag gtcaagctaa tctcttccgt tctcagttcg

1080

gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagtt ggaatcgcta gtaatcgtgg atcagcatgc

1140

cacggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagtttgtaa

1200

cacccaaagc cggtaggtaa ccagccgtct aaggtgggac agatgattag ggtg

1254

<210> 1088

<211> 1016

<212> DNA

<213> Lactobacillus helveticus

<220>

<221> modified_base

<222> (797)..(799)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (979)..(979)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (983)..(986)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1000)..(1000)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1088

gtcgagcgag cagaaccagc agatttactt cggtaatgac gctggggacg cgagcggcgg

60

atgggtgagt aacacgtggg gaacctgccc catagcctgg gataccactt ggaaacaggt

120

gctaataccg gataagaaag cagatcgcat gatcagctta taaaaggcgg cgtaagctgt

180

cgctatggga tggccccgcg gtgcattagc tagttggtaa ggtaacggct taccaaggca

240

atgatgcata gccgagttga gagactgatc ggccacattg ggactgagac acggcccaaa

300

ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt ccacaatgga cgcaagtctg atggagcaac

360

gccgcgtgag tgaagaaggt tttcggatcg taaagctctg ttgttggtga agaaggatag

420

aggtagtaac tggcctttat ttgacggtaa tcaaccagaa agtcacggct aactacgtgc

480

cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag cgttgtccgg atttattggg cgtaaagcga

540

gcgcaggcgg aagaataagt ctgatgtgaa agccctcggc ttaaccgagg aactgcatcg

600

gaaactgttt ttcttgagtg cagaagagga gagtggaatt ccatgtgtag cggtggaatg

660

cgtagatata tggaagaaca ccagtggcga aggcgactct ctggtctgca actgacgctg

720

aggctcgaaa gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

780

atgagtgcta agtgttnnng gtttccgcct ctcagtgctg cagctaacgc atttaagcac

840

tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

900

agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga acccttacca ggtcttgaca

960

tctagtgcca tcctaagana ttnnnnttcc cttcggggan gctaagacag gtggtg

1016

<210> 1089

<211> 1572

<212> DNA

<213> Lactobacillus hilgardii

<400> 1089

tgagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtcga

60

acgcgtcttg gtcaatgaag ttgagtgctt gcatttaact gatttgacat taagacgagt

120

ggcgaactgg tgagtaacac gtgggtaact tgccccgaag cgggggataa catttggaaa

180

caggtgctaa taccgcataa caacaaaaac cacatggttt ttgtttaaaa gatggtttcg

240

gctatcactt tgggatggac ccgcggcgta ttagctagtt ggtgaggtaa tggctcacca

300

aggcaatgat acgtagccga cctgagaggg taatcggcca cattgggact gagacacggc

360

ccaaactcct acgggaggca gcagtaggga atcttccaca atggacgaaa gtctgatgga

420

gcaacgccgc gtgagtgatg aagggtttcg gctcgtaaaa ctctgttgtt ggagaagaac

480

gggtgtcaga gtaactgttg acatcgtgac ggtatccaac cagaaagcca cggctaacta

540

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgttg tccggattta ttgggcgtaa

600

agcgagcgca ggcggttttt taggtctgat gtgaaagcct tcggcttaac cggagaagtg

660

catcggaaac cgggagactt gagtgcagaa gaggacagtg gaactccatg tgtagcggtg

720

aaatgcgtag atatatggaa gaacaccagt ggcgaaggcg gctgtctggt ctgcaactga

780

cgctgaggct cgaaagcatg ggtagcgaac aggattagat accctggtag tccatgccgt

840

aaacgatgag tgctaagtgt tggagggttt ccgcccttca gtgctgcagc taacgcatta

900

agcactccgc ctggggagta cgaccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc

960

gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gatgctacgc gaagaacctt accaggtctt

1020

gacatcttct gctaacctaa gagattaggc gttcccttcg gggacggaat gacaggtggt

1080

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1140

ccttattgtc agttgccagc atttagttgg gcactctggc gagactgccg gtgacaaacc

1200

ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg

1260

ctacaatgga cggtacaacg agtcgcgaaa ccgcgaggtc aagctaatct cttaaagccg

1320

ttctcagttc ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa gttggaatcg ctagtaatcg

1380

tggatcagca tgccacggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca

1440

tgagagtttg taacacccaa agccggtgag gtaaccttcg ggggccagcc gtctaaggtg

1500

ggacagatga ttagggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta ggagaacctg cggctggatc

1560

acctcctttc ta

1572

<210> 1090

<211> 1718

<212> DNA

<213> Lactobacillus hominis

<400> 1090

tacacatgga gttccactct cctcttctgc actcaagttc aacagtttct gatgcaattc

60

tccggttgag ccgaaggctt tcacatcaga cttattgaac cgcctgcact cgctttacgc

120

ccaataaatc cggacaacgc ttgccaccta cgtagagttt gatcatggct caggacgaac

180

gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg agcgagcttg cctagatgat ttcggtgctt

240

gcaccgaatg aaactagata caagcgagcg gcggacgggt gagtaacacg tgggtaacct

300

gcccaagaga ctgggataac acctggaaac agatgctaat accggataac aacatctagc

360

gcatgctaga agtttgaaag atgggtttct atcactcttg gatggacctg cggtgcatta

420

gctagttggt aaggtaacgg cttaccaagg caatgatgca tagccgagtt gagagactga

480

tcggccacat tgggactgag acacggccca aactcctacg ggaggcagca gtagggaatc

540

ttccacaatg gacgcaagtc tgatggagca acgccgcgtg agtgaagaag ggtttcggct

600

cgtaaagctc tgttggtggt gaagaaagat agaggtagta actggccttt atttgacggt

660

aatcacctag aaagtcacgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca

720

agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc gagtgcaggc ggttcaataa gtctgatgtg

780

aaagccttcg gctcaaccgg agaattgcat cagaaactgt tgaacttgag tgcagaagag

840

gagagtggaa ctccatgtgt agcggtggaa tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc

900

gaaggcggct ctctggtctg caactgacgc tgaggctcga aagcatgggt agcgaacagg

960

attagatacc ctggtagtcc atgccgtaaa cgatgagtgc taagtgttgg gaggtttccg

1020

cctctcagtg ctgcagctaa cgcattaagc actccgcctg gggagtacga ccgcaaggtt

1080

gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa

1140

gcaacgcgaa gaaccttacc aggtcttgac atccagtgca aacctaagag attaggtgtt

1200

cccttcgggg acgctgagac aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

1260

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtcattagt tgccatcatt aagttgggca

1320

ctctaatgag actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg

1380

ccccttatga cctgggctac acacgtgcta caatggacgg tacaacgaga agcgaacctg

1440

cgaaggcaag cggatctctg aaagccgttc tcagttcgga ctgtaggctg caactcgcct

1500

acacgaagct ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc cgcggtgaat acgttcccgg

1560

gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagtctgtaa cacccaaagc cggtgagata

1620

accattaaag gagtcagccg tctaaggtag gacagatgat tagggtgaag tcgtaacaag

1680

gtagccgtag gagaacctgc ggttggatca cctcctta

1718

<210> 1091

<211> 1572

<212> DNA

<213> Lactobacillus iners

<400> 1091

aaattgagag tttgatcctg gctcaggacg aacgctggcg gcgtgcctaa tacatgcaag

60

tcgagcgagt ctgccttgaa gatcggagtg cttgcactct gtgaaacaag atacaggcta

120

gcggcggacg ggtgagtaac acgtgggtaa cctgcccaag agatcgggat aacacctgga

180

aacagatgct aataccggat aataacagat gatgcctatc aactgtttaa aagatggttc

240

tgctatcact cttggatgga cctgcggtgc attagctagt tggtagggta acggcctacc

300

aaggcgatga tgcatagccg agttgagaga ctgatcggcc acattgggac tgagacacgg

360

cccaaactcc tacgggaggc agcagtaggg aatcttccac aatggacgca agtctgatgg

420

agcaacgccg cgtgagtgaa gaagggtttc ggctcgtaaa gctctgttgt tggtgaagaa

480

ggacaggggt agtaactgac ctttgtttga cggtaatcaa ttagaaagtc acggctaact

540

acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgtt gtccggattt attgggcgta

600

aagcgagtgc aggcggctcg ataagtctga tgtgaaagcc ttcggctcaa ccggagaatt

660

gcatcagaaa ctgtcgagct tgagtacaga agaggagagt ggaactccat gtgtagcggt

720

gaaatgcgta gatatatgga agaacaccgg tggcgaaggc ggctctctgg tctgttactg

780

acgctgaggc tcgaaagcat gggtagcgaa caggattaga taccctggta gtccatgccg

840

taaacgatga gtgctaagtg ttgggaggtt tccgcctctc agtgctgcag ctaacgcatt

900

aagcactccg cctggggagt acgaccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc

960

cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggtct

1020

tgacatccat agccagtcta agagattaga tgttcccttc ggggactatg agacaggtgg

1080

tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

1140

cccttgtcat tagttgccag cattaagttg ggcactctaa tgagactgcc ggtgacaaac

1200

cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catgcccctt atgacctggg ctacacacgt

1260

gctacaatgg acggtacaac gagaagcgac cctgtgaagg caagcggatc tctgaaagcc

1320

gttctcagtt cggattgcag gctgcaactc gcctgcatga agctggaatc gctagtaatc

1380

gcaaatcagc acgttgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc

1440

atgagagtct gtaacgcccg aagccggcgg gataaccgaa aggagtcagc cgtctaaggc

1500

gggacagatg attagggtga agtcgtaaca aggtagccgt aggagaacct gcggctggat

1560

cacctccttt ct

1572

<210> 1092

<211> 1567

<212> DNA

<213> Lactobacillus jensenii

<400> 1092

ttcaaaatga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgagcg agcttgccta tagaaattct tcggaatgga catagataca agctagcggc

120

ggatgggtga gtaacgcgtg ggtaacctgc ccttaagtct gggataccat ttggaaacag

180

atgctaatac cggataaaag ctactttcgc atgaaagaag tttaaaaggc ggcgtaagct

240

gtcgctaaag gatggacctg cgatgcatta gctagttggt aaggtaacgg cttaccaagg

300

cgatgatgca tagccgagtt gagagactga tcggccacat tgggactgag acacggccca

360

aactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttccacaatg gacgaaagtc tgatggagca

420

acgccgcgtg agtgaagaag gttttcggat cgtaaagctc tgttgttggt gaagaaggat

480

agaggtagta actggccttt atttgacggt aatcaaccag aaagtcacgg ctaactacgt

540

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc

600

gagcgcaggc ggattgataa gtctgatgtg aaagccttcg gctcaaccga agaactgcat

660

cagaaactgt caatcttgag tgcagaagag gagagtggaa ctccatgtgt agcggtggaa

720

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct ctctggtctg taactgacgc

780

tgaggctcga aagcatgggt agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc atgccgtaaa

840

cgatgagtgc taagtgttgg gaggtttccg cctctcagtg ctgcagctaa cgcattaagc

900

actccgcctg gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca

960

caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc aggtcttgac

1020

atcctttgac cacctaagag attaggtttt cccttcgggg acaaagagac aggtggtgca

1080

tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct

1140

tgttaatagt tgccagcatt aagttgggca ctctattgag actgccggtg acaaaccgga

1200

ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtgcta

1260

caatgggcag tacaacgaga agcgaacctg tgaaggcaag cggatctctt aaagctgttc

1320

tcagttcgga ctgtaggctg caactcgcct acacgaagct ggaatcgcta gtaatcgcgg

1380

atcagcacgc cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga

1440

gagtttgtaa cacccaaagt cggtgaggta acctttggag ccagccgcct aaggtgggac

1500

agatgattag ggtgaagtcg taacaaggta gccgtaggag aacctgcggc tggatcacct

1560

cctttct

1567

<210> 1093

<211> 1651

<212> DNA

<213> Lactobacillus johnsonii

<400> 1093

agctaaacga taaaaagctc attttcaaaa ggaaaatgag agtttgatcc tggctcagga

60

cgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca agtcgagcga gcttgcctag atgattttag

120

tgcttgcact aaatgaaact agatacaagc gagcggcgga cgggtgagta acacgtgggt

180

aacctgccca agagactggg ataacacctg gaaacagatg ctaataccgg ataacaacac

240

tagacgcatg tctagagttt gaaagatggt tctgctatca ctcttggatg gacctgcggt

300

gcattagcta gttggtaagg taacggctta ccaaggcaat gatgcatagc cgagttgaga

360

gactgatcgg ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag gcagcagtag

420

ggaatcttcc acaatggacg aaagtctgat ggagcaacgc cgcgtgagtg aagaagggtt

480

tcggctcgta aagctctgtt ggtagtgaag aaagatagag gtagtaactg gcctttattt

540

gacggtaatt acttagaaag tcacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

600

gtggcaagcg ttgtccggat ttattgggcg taaagcgagt gcaggcggtt caataagtct

660

gatgtgaaag ccttcggctc aaccggagaa ttgcatcaga aactgttgaa cttgagtgca

720

gaagaggaga gtggaactcc atgtgtagcg gtggaatgcg tagatatatg gaagaacacc

780

agtggcgaag gcggctctct ggtctgcaac tgacgctgag gctcgaaagc atgggtagcg

840

aacaggatta gataccctgg tagtccatgc cgtaaacgat gagtgctaag tgttgggagg

900

tttccgcctc tcagtgctgc agctaacgca ttaagcactc cgcctgggga gtacgaccgc

960

aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

1020

ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcc agtgcaaacc taagagatta

1080

ggtgttccct tcggggacgc tgagacaggt ggtgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1140

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc attagttgcc atcattaagt

1200

tgggcactct aatgagactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1260

atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat ggacggtaca acgagaagcg

1320

aacctgcgaa ggcaagcgga tctcttaaag ccgttctcag ttcggactgt aggctgcaac

1380

tcgcctacac gaagctggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcacgccgcg gtgaatacgt

1440

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgagagt ctgtaacacc caaagccggt

1500

gggataacct ttataggagt cagccgtcta aggtaggaca gatgattagg gtgaagtcgt

1560

aacaaggtag ccgtaggaga acctgcggct ggatcacctc ctttctaagg aaggcgaaag

1620

atgatggaga gtgcgagagc actaagagaa g

1651

<210> 1094

<211> 1555

<212> DNA

<213> Lactobacillus kalixensis

<400> 1094

ttgatcctgg ctcaggacga acgctggcgg cgtgcctaat acatgcaagt cgagcgaaca

60

gaagcagcag aattacttcg gtaaggacgc tgtggaagtt agcggcggat gggtgagtaa

120

cacgtgggta acctaccctt aagactggga taccacttgg aaacaggtgc taataccgga

180

taggagtatg agctgcatgg cttatacttt aaaggcggcg aaagctgtca ctaaaggatg

240

gacccgcggt gcattagcta gttggtaagg taacggctta ccaaggcgac gatgcatagc

300

cgagttgaga gactgatcgg ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag

360

gcagcagtag ggaatcttcc acaatggacg caagtctgat ggagcaacgc cgcgtgagtg

420

aagaaggttt tcggatcgta aagctctgtt gttggtgaag aaggatatag gtagtaactg

480

gcctatattt gacggtaatc aaccagaaag tcacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

540

taatacgtag gtggcaagcg ttgtccggat ttattgggcg taaagcgagc gcaggcggag

600

aaataagtct gatgtgaaag cccacggctc aaccgtggaa ctgcatcgga aactgttttt

660

cttgagtgca gaagaggaga gtggaactcc atgtgtagcg gtggaatgcg tagatatatg

720

gaagaacacc agtggcgaag gcggctctct ggtctgcaac tgacgctgag gctcgaaagc

780

atgggtagcg aacaggatta gataccctgg tagtccatgc cgtaaacgat gagtgctaag

840

tgttgggagg tttccgcctc tcagtgctgc agctaacgca ttaagcactc cgcctgggga

900

gtacgaccgc aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca

960

tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatct agtgccattc

1020

taagagatta gaagttccct tcggggacgc taagacaggt ggtgcatggc tgtcgtcagc

1080

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc attagttgcc

1140

agcattaagt tgggcactct aatgagactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg

1200

acgtcaagtc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat gggcagtaca

1260

acgagaagca agccggtgac ggcaagcgaa tctcttaaag ctgttctcag ttcggactgc

1320

agtctgcaac tcgactgcac gaagctggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcacgccgcg

1380

gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt ctgcaatgcc

1440

caaagccggt ggcctaaccg taaggaagga gccgtctaag gcagggcaga tgactggggt

1500

gaagtcgtaa caaggtagcc gtaggagaac ctgcggctgg atcacctcct tttct

1555

<210> 1095

<211> 1552

<212> DNA

<213> Lactobacillus kefiranofaciens

<400> 1095

agtttgattc ttgctcagga cgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca agtcgagcga

60

gcggaaccag cagaatcact tcggtgagga cgctgggaaa gcgagcggcg gatgggtgag

120

taacacgtgg ggaacctgcc cttaagtctg ggataccact tggaaacagg tgctaatacc

180

ggataagaaa gcagttcgca tgaacagctt ttaaaaggcg gcgcaagctg tcgctaaagg

240

atggacccgc ggtgcattag ctagttggta aggtaacggc ctaccaaggc agtgatgcat

300

agccgagttg agagactgat cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg

360

gaggcagcag tagggaatct tccacaatgg acgcaagtct gatggagcaa cgccgcgtga

420

gtgaagaagg ttttcggacc gtaaagctct gttgttggtg aagaaggata gaggtagtaa

480

ctggccttta tttgacggta atcaaccaga aagtcacggc taactacgtg ccagcagccg

540

cggtaatacg taggtggcaa gcgttgtccg gatttattgg gcgtaaagcg agcgcaggcg

600

gaagaataag tctgatgtga aagccctcgg cttaaccgag gaattgcatc ggaaactgtt

660

tttcttgagt gcagaagagg agagtagaac tccatgtgta gcggtggaat gcgtagatat

720

atggaagaat accagtggcg aaggcggctc tctggtctgc aactgacgct gaggctcgaa

780

agcatgggta gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca tgccgtaaac gatgagtgct

840

aagtgttggg aggcttccgc ctctcagtgc tgcagctaac gcattaagca ctccgcctgg

900

ggagtacgac cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga

960

gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca tctagtgcca

1020

tttgtagaga tacaaagttc ccttcgggga cgctaagaca ggtggtgcat ggctgtcgtc

1080

agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gttattagtt

1140

gccagcatta agttgggcac tctaatgaga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg

1200

atgacgtcaa gtcatcatgc cccttatgac ctgggctaca cacgtgctac aatgggcagc

1260

acaacgagca gcgagcctgc aaaggcaagc aaatctctga aagctgttct cagttcggac

1320

tgcagtctgc aactcgactg cacgaagctg gaatcgctag taatcgcgga tcagcacgcc

1380

gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtctgcaat

1440

gcccaaagcc ggtggcctaa ccgcaaggaa ggagccgtct aaggcagggc agatgactgg

1500

ggtgaagtcg taacaaggta gccgtaggag aacctgcggc tggatcacct ct

1552

<210> 1096

<211> 1456

<212> DNA

<213> Lactobacillus kefiri

<400> 1096

gtcgaacgcg tttccgttat tgattttagg tgcttgcatt tagaatgatt taacacggaa

60

acgagtggcg aactggtgag taacacgtgg gtaacctgcc cttgaagtag gggataacac

120

ttggaaacag gtgctaatac cgtataacaa ccaaaaccac atggttttgg tttaaaagat

180

ggcttcggct atcactttag gatggacccg cggcgtatta gcttgttggt aaggtaatgg

240

cctaccaagg caatgatacg tagccgacct gagagggtaa tcggccacat tgggactgag

300

acacggccca aactcctacg ggaggcagca gtatggaatc ttccacaatg gacgaaagtc

360

tgatggagca acgccgcgtg agtgatgaag ggtttcggct cgtaaaactc tgttgttgga

420

gaagaacagg tgtcagagta actgttgaca tcttgacggt atccaaccag aaagccacgg

480

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg

540

ggcgtaaagc gagcgcaggc ggtttcttag gtctgatgtg aaagccttcg gcttaaccgg

600

agaagtgcat cggaaaccag gagacttgag tgcagaagag gacagtggaa ctccatgtgt

660

agcggtgaaa tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct gtctggtctg

720

taactgacgc tgaggctcga aagcatgggt agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

atgccgtaaa cgatgagtgc taagtgttgg agggtttccg cccttcagtg ctgcagctaa

840

cgcattaagc actccgcctg gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg

900

ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gctacgcgaa gaaccttacc

960

aggtcttgac atcttctgcc aacctaagag attaggcgtt cccttcgggg acagaatgac

1020

aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1080

gcgcaaccct tattgttagt tgccagcatt cagttgggca ctctagcaag actgccggtg

1140

acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga cctgggctac

1200

acacgtgcta caatggacgg tacaacgagt cgcgaaaccg cgaggtcaag ctaatctctt

1260

aaagccgttc tcagttcgga ttgcaggctg caactcgcct gcatgaagtt ggaatcgcta

1320

gtaatcgtgg atcagcatgc cacggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

cacaccatga gagtttgtaa cacccaaagc cggtgaggta accttcgggg accagccgtc

1440

taaggtggac agatga

1456

<210> 1097

<211> 1522

<212> DNA

<213> Lactobacillus kimchii

<400> 1097

gacgaacgct ggcggcatgc ctaatacatg caagtcgaac gaaccatcct gaagattgaa

60

gcttgcttca tgattcagac cttggtgagt ggcggacggg tgagtaacac gtgggtaacc

120

tgcccagaag tgggggataa catttggaaa caagtgctaa taccgcataa caacttagat

180

cacatgatct ttgtttaaaa gatggttttg ctatctcttc tggatggacc cgcggcgtat

240

tagctagttg gtgaggtaat agctcaccaa ggcgatgata cgtagccgac ctgagagggt

300

aatcggccac attgggactg agacacggcc caaactccta cgggaggcag cagtagggaa

360

tcttccacaa tggacgaaag tctgatggag caatgccgcg tgagtgaaga aggttttcgg

420

atcgtaaaac tctgttgttg aagaagaaca tatgtgagag taactgttca cgtactgacg

480

gtattcaacc agaaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg

540

caagcgttgt ccggatttat tgggcgtaaa gagaatgtag gcggtttatt aagtttgaag

600

tgaaagccct cggctcaacc gaggaagtgc ttcgaaaact ggtaaacttg agtgcagaag

660

aggaaagtgg aactccatgt gtagcggtgg aatgcgtaga tatatggaag aacaccagtg

720

gcgaaggcgg ctttctggtc tgtaactgac gctgagattc gaaagcatgg gtagcaaaca

780

ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacgatgagt gctaagtgtt ggagggtttc

840

cgcccttcag tgctgcagct aacgcattaa gcactccgcc tggggagtac gatcgcaaga

900

ttgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

960

aagcaacgcg aagaacctta ccaggtcttg acataccatg aaaagcttag agataagtct

1020

ttcccttcgg ggacatggat acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttattatca gttgccagca ttcagttggg

1140

cactctggtg agactgccgg tgataaaccg gaggaaggtg gggacgacgt caaatcatca

1200

tgccccttat gacctgggct acacacgtgc tacaatggtc ggtacaacgt gctgcgaact

1260

cgcgagggca agcaaatcac ttaaaaccga tctcagttcg gattgtaggc tgcaactcgc

1320

ctacatgaag ctggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat gccgcggtga atacgttccc

1380

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gagagtttgt aacacccaaa gtcggtgggg

1440

taacccttcg gggaactagc cgcctaaggt gggacaaatg attagggtga agtcgtaaca

1500

aggtagccgt aggagaacct gc

1522

<210> 1098

<211> 1479

<212> DNA

<213> Lactobacillus leichmannii

<400> 1098

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc gagctgaatt caaagatccc

60

ttcggggtga tttgttggay gctagcggcg gatgggtgag taacacgtgg gcaatctgcc

120

ctaaagactg ggataccact tggaaacagg tgctaatacc ggataacaac atgaatcgca

180

tgattcaagt ttgaaaggcg gcgcaagctg tcactttagg atgagcccgc ggcgcattag

240

ctagttggtg gggtaaaggc ctaccaaggc aatgatgcgt agccgagttg agagactgat

300

cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg gaggcagcag tagggaatct

360

tccacaatgg acgcaagtct gatggagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg tyttcggatc

420

gtaaagctct gttgttggtg aagaaggata gaggcagtaa ctggtcttta tttgacggta

480

atcaaccaga aagtcacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg taggtggcaa

540

gcgttgtccg gatttattgg gcgtaaagcg agcgcaggcg gaatgataag tctgatgtga

600

aagcccacgg ctcaaccgtg gaactgcatc ggaaactgtc attcttgagt gcagaagagg

660

agagtggaac tccatgtgta gcggtggaat gcgtagatat atggaagaac accagtggcg

720

aaggcggctc tctggtctgc aactgacgct gaggctcgaa agcatgggta gcgaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca tgccgtaaac gatgagcgct aggtgttggg gactttccgg

840

tcctcagtgc cgcagcaaac gcattaagcg ctccgcctgg ggagtacgac cgcaaggttg

900

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag

960

caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca tcctgcgcta cacytagaga targtggttc

1020

ccttcgggga cgcagagaca ggtggtgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

1080

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gtctttagtt gccatcatta agttgggcac

1140

tctaaagaga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgc

1200

cccttatgac ctgggctaca cacgtgctac aatgggcagt acaacgagaa gcraacccgc

1260

gagggtaagc ggatctctta aagctgytct cagttcggac tgcaggctgc aactcgcctg

1320

cacgaagctg gaatcgctag taatcgcgga tcagcacgcc gcggtgaata cgttcccggg

1380

ccttgtacac accgcccgtc acaccatgga agtctgcaat gcccaaagtc ggtgsgataa

1440

cctttatagg agtcagccgc ctaaggcagg gcagatgac

1479

<210> 1099

<211> 1308

<212> DNA

<213> Lactobacillus mucosae

<400> 1099

agcgagtggc ggacgggtga gtaacacgta ggtaacctgc cccaaagcgg gggataacat

60

ttggaaacag atgctaatac cgcataacaa tttgaatcgc atgattcaaa tttaaaagat

120

ggcttcggct atcactttgg gatggacctg cggcgcatta gcttgttggt agggtaacgg

180

cctaccaagg ctgtgatgcg tagccgagtt gagagactga tcggccacaa tggaactgag

240

acacggtcca tactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttccacaatg ggcgcaagcc

300

tgatggagca acaccgcgtg agtgaagaag ggtttcggct cgtaaagctc tgttgttaga

360

gaagaacgtg cgtgagagca actgttcacg cagtgacggt atctaaccag aaagtcacgg

420

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttatcc ggatttattg

480

ggcgtaaagc gagcgcaggc ggtttgataa gtctgatgtg aaagcctttg gcttaaccaa

540

agaagtgcat cggaaactgt cagacttgag tgcagaagag gacagtggaa ctccatgtgt

600

agcggtggaa tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct gtctggtctg

660

caactgacgc tgaggctcga aagcatgggt agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc

720

atgccgtaaa cgatgagtgc taggtgttgg agggtttccg cccttcagtg ccgcagctaa

780

cgcattaagc actccgcctg gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg

840

ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gctacgcgga agaaccttac

900

caggtcttga catcttgcgc caaccctaga gatagggcgt ttccttcggg aacgcaatga

960

caggtggtgc atggtcgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1020

agcgcaaccc ttgttactag ttgccagcat tcagttgggc actctagtga gactgccggt

1080

gacaaaccgg aggaaggtgg ggacgacgtc agatcatcat gccccttatg acctgggcta

1140

cacacgtgct acaatggacg gtacaacgag tcgcgaactc gcgagggcaa gctaatctct

1200

taaaaccgtt ctcagttcgg actgcaggct gcaactcgcc tgcacgaagt cggaatcgct

1260

agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgt

1308

<210> 1100

<211> 1022

<212> DNA

<213> Lactobacillus murinus

<220>

<221> modified_base

<222> (989)..(989)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (998)..(1001)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1003)..(1004)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1011)..(1012)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1100

cttctttatc accgagtgct tgcactcacc gataaagagt tgagtggcga acgggtgagt

60

aacacgtggg caacctgccc aaaagagggg gataacactt ggaaacaggt gctaataccg

120

cataaccata gttaccgcat ggtaactatg taaaaggtgg ctatgctacc gcttttggat

180

gggcccgcgg cgcattagct agttggtgag gtaaaggctt accaaggcaa tgatgcgtag

240

ccgaactgag aggttgatcg gccacattgg gactgagaca cggcccaaac tcctacggga

300

ggcagcagta gggaatcttc cacaatgggc gaaagcctga tggagcaacg ccgcgtgggt

360

gaagaaggtc ttcggatcgt aaaaccctgt tgttagagaa gaaagtgcgt gagagtaact

420

gttcacgttt cgacggtatc taaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg

480

gtaatacgta ggtggcaagc gttatccgga tttattgggc gtaaagggaa cgcaggcggt

540

cttttaagtc tgatgtgaaa gccttcggct taaccggagt agtgcattgg aaactgggag

600

acttgagtgc agaagaggag agtggaactc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat

660

ggaagaacac cagtggcgaa agcggctctc tggtctgtaa ctgacgctga ggttcgaaag

720

cgtgggtagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgaatgctaa

780

gtgttggagg gtttccgccc ttcagtgctg cagctaacgc aataagcatt ccgcctgggg

840

agtacgaccg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc

900

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ttctgacaat

960

cctagagata ggactttccc ttcggggana gaatgacnnn ngnncatggt nntcgtcagc

1020

tc

1022

<210> 1101

<211> 1556

<212> DNA

<213> Lactobacillus nodensis

<400> 1101

cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc gaactctggt

60

ttttgaacga tggtgcttgc accggagtga ttaaacattt gagtgagcgg cggatgggtg

120

agtaacacgt gggtaacctg ccctaaagtg ggggataaca tttggaaaca agtgctaata

180

ccgcataaca acatttacca catggtttat gtttgaaaga tggttctgct atcgctttag

240

gatggacccg cggtgcatta gttagttggt gaggtaacgg ctcaccaaga ccgtgatgca

300

tagccgacct gagagggtaa tcggccacat tgggactgag acacggccca aactcctacg

360

ggaggcagca gtagggaatc ttccacaatg gacgaaagtc tgatggagca acgccgcgtg

420

agtgaagaag gttttcggat cgtaaaactc tgttgttgaa gaagaacatg cgtgagagta

480

actgttcatg tattgacggt attcaaccag aaagccacgg ctaactacgt gccagcagcc

540

gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc gagcgtaggc

600

ggtttattaa gtctgatgtg aaagccctcg gctcaaccga ggaagtgcat cggaaactgg

660

taaacttgag tgcagaagag gagagtggaa ctccatgtgt agcggtggaa tgcgtagata

720

tatggaagaa catcagtggc gaaggcggct ctctggtctg taactgacgc tgaggttcga

780

aagcgtgggt agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgagtgc

840

taagtgttgg agggtttccg cccttcagtg ctgcagctaa cgcattaagc actccgcctg

900

gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg

960

agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc aggtcttgac atatcttgaa

1020

acactaagag attagttttt cccttcgggg acaagaatac aggtggtgca tggttgtcgt

1080

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tattactagt

1140

tgccagcatt tagttgggca ctctagtgag actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg

1200

gacgacgtca aatcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtgcta caatggtcgg

1260

tacaacgtgc tgcgaactcg cgagggtaag caaatcactt aaaaccgatc tcagttcgga

1320

ttgtaggctg caactcgcct acatgaagct ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc

1380

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagtttgtaa

1440

cacccaaagc cggtggggta ccttttagga gctagccgtc taaggtggga caaatgatta

1500

gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtagga gaacctgcgg ctggatcacc tcctac

1556

<210> 1102

<211> 1556

<212> DNA

<213> Lactobacillus oeni

<400> 1102

tagattttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaatacat gcaagtcgaa

60

cgcagaattt ccaccgagtg cttgcactca ccggaaattc tgagtggcga acgggtgagt

120

aacacgtggg taacctgccc aaaagagggg gataacactt ggaaacaggt gctaataccg

180

cataacaaca aaaaccgcct ggtttttgtt tcaaagatgg tttcggctgt cacttttgga

240

tggacccgcg gcgtattagc tagttggtaa ggtaacggct taccaaggca gtgatacgta

300

gccgaactga gaggttgatc ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg

360

aggcagcagt agggaatctt ccacaatgga cgaaagtctg atggagcaac gccgcgtgag

420

tgaagaaggt tttcggatcg taaaactctg ttgttagaga agaacgtgtg tgagagtaac

480

tgttcatgca gtgacggtat ctaaccagaa agccacggct aactacgtgc cagcagccgc

540

ggtaatacgt aggtggcaag cgttgtccgg atttattggg cgtaaaggga acgcaggcgg

600

tcttttaagt ctgatgtgaa agccttcggc ttaaccgaag tcgtgcattg gaaactgaga

660

gacttgagtg cagaagagga gagtggaact ccatgtgtag cggtgaaatg cgtagatata

720

tggaagaaca ccagtggcga aagcggctct ctggtctgta actgacgctg aggttcgaaa

780

gcatgggtag caaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg atgaatgcta

840

agtgttggag ggtttccgcc cttcagtgct gcagctaacg cattaagcat tccgcctggg

900

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

960

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cttttgctaa

1020

cctgagagat caggcgttcc cttcggggac aaaatgacag gtggtgcatg gttgtcgtca

1080

gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta ttactagttg

1140

ccagcattca gttgggcact ctagtgagac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga

1200

tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca atggacggta

1260

caacgagtcg cgaaaccgcg aggtttagct aatctcttaa aaccgttctc agttcggatt

1320

gcaggctgca actcgcctgc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcggat cagcatgccg

1380

cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatgaga gtttgtaaca

1440

cccaaagccg gtgcggtaac cttttaggaa ccagccgtct aaggtgggac agatgattgg

1500

ggtgaagtcg taacaaggta gccgtaggag aacctgcggc tggaccacct acttaa

1556

<210> 1103

<211> 1579

<212> DNA

<213> Lactobacillus oris

<400> 1103

ttttatatga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgccg gcggtgtgcc taatacatgc

60

aagtcgagcg cactggccca acagaaatga cgtgcttaca ctgatttgac gttggattcc

120

cagtgagcgg cggacgggtg agtaacacgt gggcaacctg ccccaaagcg ggggataaca

180

tttggaaaca ggtgctaata ccgcataact tggaaaacca catggttttc caataaaaga

240

tggtttcggc tatcactttg ggatgggccc gcggtgcatt agctagttgg taaggtaacg

300

gcttaccaag gcgatgatgc atagccgagt tgagagactg atcggccaca atggaactga

360

gacacggtcc atactcctac gggaggcagc agtagggaat cttccacaat gggcgcaagc

420

ctgatggagc aacaccgcgt gagtgaagaa gggtttcggc tcgtaaaact ctgttgttgg

480

agaagaacgt gcgtaagagt aactgtttac gcagtgacgg tatccaacca gaaagtcacg

540

gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttatc cggatttatt

600

gggcgtaaag cgagcgcagg cggttgctta ggtctgatgt gaaagccttc ggcttaaccg

660

aagaagtgca tcggaaaccg ggcgacttga gtgcagaaga ggacagtgga actccatgtg

720

tagcggtgga atgcgtagat atatggaaga acaccagtgg cgaaggcggc tgtctggtct

780

gcaactgacg ctgaggctcg aaagcatggg tagcgaacag gattagatac cctggtagtc

840

catgccgtaa acgatgagtg ctaggtgttg gagggtttcc gcccttcagt gccgaagcta

900

acgcattaag cactccgcct ggggagtacg accgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac

960

gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agctacgcga agaaccttac

1020

caggtcttga catcttgcgc caacctcaga gatgaggcgt tcccttcggg gacgcaaaga

1080

caggtggtgc atggtcgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1140

agcgcaaccc ttgttactag ttgccagcat tcagttgggc actctagtga gactgccggt

1200

gacaaaccgg aggaaggtgg ggacgacgtc agatcatcat gccccttatg acctgggcta

1260

cacacgtgct acaatggccg gtacaacgag cagctaaccc gcgagggtgt gcaaatctct

1320

taaagccggt ctcagttcgg actgcagtct gcaactcgac tgcacgaagt cggaatcgct

1380

agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg

1440

tcacaccatg gaagtttgta acgcccaaag tcggtggcct aaccatttgg agggagccgc

1500

ctaaggcggg acagatgact ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtagg agaacctgcg

1560

gctggatcac ctcctttct

1579

<210> 1104

<211> 1518

<212> DNA

<213> Lactobacillus parabrevis

<400> 1104

gacgaacgct ggcggcatgc ctaatacatg caagtcgaac gagcttccgt tgaatgacgt

60

gcttgcactg atttyaacaa tgaagcgagt ggcgaactgg tgagtaacac gtgggtaact

120

tgcccagaag caggggataa cacttggaaa caggtgctaa taccgtataa caacagaaac

180

cgcatggttt ctgtttgaaa ggtggtttcg gctatcactt ctggatggac ccgcggcgta

240

ttagttagtt ggtgaggtaa aggcccacca agacaatgat acgtagccga cctgagaggg

300

taatcggcca cattgggact gagacacggc ccaaactcct acgggaggca gcagtaggga

360

atcttccaca atggacgaaa gtctgatgga gcaatgccgc gtgagtgaag aagggtttcg

420

gctcgtaaaa ctctgttgtt aaagaagaac actcttgaga gtaactgttc aggagttgac

480

ggtatttaac cagaaagcca cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg

540

gcaagcgttg tccggattta ttgggcgtaa agcgagcgca ggcggtttct taagtctgat

600

gtgaaagcct tcggcttaac cggagaagtg catcggaaac tgggagactt gagtgcagaa

660

gaggacagtg gaactccatg tgtagcggtg gaatgcgtag atatatggaa gaacaccagt

720

ggcgaaggcg gctgtctagt ctgtaactga cgctgaggct cgaaagcatg ggtagcaaac

780

aggattagat accctggtag tccatgccgt aaacgatgag tgctaggtgt tggagggttt

840

ccgcccttca gtgccgcagc taacgcatta agcactccgc ctggggagta cgaccgcaag

900

gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc

960

gaagctacgc gaagaacctt accaggtctt gacatactat gcaaatccta gagataggac

1020

gttcccttcg gggacatgga tacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1080

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttattatc agttgccagc attaagttgg

1140

gcactctggt gagactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc

1200

atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatgga cggtacaacg agtygcgaag

1260

tcgtgaggct aagctaatct cttaaagccg ttctcagttc ggattgtagg ctgcaactcg

1320

cctacatgaa gttggaatcg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg aatacgttcc

1380

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgagagtttg taacacccaa agccggtgag

1440

ataaccttcg ggagtcagcc gtctaaggtg ggacagatga ttagggtgaa gtcgtaacaa

1500

ggtagccgta ggagaacc

1518

<210> 1105

<211> 1556

<212> DNA

<213> Lactobacillus parabuchneri

<400> 1105

ttgatcctgg ctcaggacga acgctggcgg cgtgcctaat acatgcaagt cgaacgcgtc

60

ttggttattg atgttaagtg cttgcattta actgatttaa cattgagacg agtggcgaac

120

tggtgagtaa cacgtgggta acctgccctt gaagtagggg ataacacttg gaaacaggtg

180

ctaataccgt ataacaacca aaaccacctg gttttggttt aaaagatggc ttcggctatc

240

actttaggat ggacccgcgg cgtattagct tgttggtaag gtaacggcct accaaggcaa

300

tgatacgtag ccgacctgag agggtaatcg gccacattgg gactgagaca cggcccaaac

360

tcctacggga ggcagcagta gggaatcttc cacaatggac gaaagtctga tggagcaacg

420

ccgcgtgagt gatgaagggt ttcggctcgt aaaactctgt tgttggagaa gaacaggtgt

480

gagagtaact gttcacatct tgacggtatc caaccagaaa gccacggcta actacgtgcc

540

agcagccgcg gtaatacgta ggtggcaagc gttgtccgga tttattgggc gtaaagcgag

600

cgcaggcggt ttcttaggtc tgatgtgaaa gccttcggct taaccggaga agtgcatcgg

660

aaaccaggag acttgagtgc agaagaggac agtggaactc catgtgtagc ggtgaaatgc

720

gtagatatat ggaagaacac cagtggcgaa ggcggctgtc tggtctgtaa ctgacgctga

780

ggctcgaaag catgggtagc gaacaggatt agataccctg gtagtccatg ccgtaaacga

840

tgagtgctaa gtgttggagg gtttccgccc ttcagtgctg cagctaacgc attaagcact

900

ccgcctgggg agtacgaccg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa

960

gcggtggagc atgtggttta attcgatgct acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc

1020

ttctgccaac ctaagagatt aggcgttccc ttcggggaca gaatgacagg tggtgcatgg

1080

ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat

1140

tgttagttgc cagcattcag ttgggcactc tagcaagact gccggtgaca aaccggagga

1200

aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa

1260

tggacggtac aacgagtcgc gaaaccgcga ggtcaagcta atctcttaaa gccgttctca

1320

gttcggattg taggctgcaa ctcgcctaca tgaagttgga atcgctagta atcgtggatc

1380

agcatgccac ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgagag

1440

tttgtaacac ccaaagccgg tgaggtaacc ttcggggacc agccgtctaa ggtgggacag

1500

atgattaggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtaggagaa cctgcggctg gatcac

1556

<210> 1106

<211> 1410

<212> DNA

<213> Lactobacillus paracasei

<220>

<221> modified_base

<222> (1402)..(1402)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1106

tcgttgatga tcggtgcttg caccgagatt caacatggaa cgagtggcgg acgggtgagt

60

aacacgtggg taacctgccc ttaagtgggg gataacattt ggaaacagat gctaataccg

120

catagatcca agaaccgcat ggttcttggc tgaaagatgg cgtaagctat cgcttttgga

180

tggacccgcg gcgtattagc tagttggtga ggtaatggct caccaaggcg atgatacgta

240

gccgaactga gaggttgatc ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg

300

aggcagcagt agggaatctt ccacaatgga cgcaagtctg atggagcaac gccgcgtgag

360

tgaagaaggc tttcgggtcg taaaactctg ttgttggaga agaatggtcg gcagagtaac

420

tgttgtcggc gtgacggtat ccaaccagaa agccacggct aactacgtgc cagcagccgc

480

ggtaatacgt aggtggcaag cgttatccgg atttattggg cgtaaagcga gcgcaggcgg

540

ttttttaagt ctgatgtgaa agccctcggc ttaaccgagg aagcgcatcg gaaactggga

600

aacttgagtg cagaagagga cagtggaact ccatgtgtag cggtgaaatg cgtagatata

660

tggaagaaca ccagtggcga aggcggctgt ctggtctgta actgacgctg aggctcgaaa

720

gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg atgaatgcta

780

ggtgttggag ggtttccgcc cttcagtgcc gcagctaacg cattaagcat tccgcctggg

840

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggac

900

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa cttaccaggt cttgacatct tttgatcacc

960

tgagagatcc cgttacccat tggggggcaa aatgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

1020

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatg actagttgcc

1080

agcatttagt tgggcactct agtaagactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg

1140

acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat ggatggtaca

1200

acgagttgcg agaccgcgag gtcaagctaa tctcttaaag ccattctcag ttcggactgt

1260

aggctgcaac tcgcctacac gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcacgccgcg

1320

gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgagagt ttgtaacacc

1380

cgaagccggt ggcgtaaccc tntagggagc

1410

<210> 1107

<211> 1396

<212> DNA

<213> Lactobacillus parakefiri

<220>

<221> modified_base

<222> (51)..(51)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1107

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac gcgtcttggc naatgatttt

60

aggtgcttgc acttgaaaga tttgacattg agacgagtgg cgaactggtg agtaacacgt

120

gggtaacctg cccttgaagt aggggataac acttggaaac aggtgctaat accgtataac

180

aaccaaaacc acctggtttt ggtttaaaag acggcttcgg ctgtcacttt aggatggacc

240

cgcggcgtat tagcttgttg gtaaggtaac ggcctaccaa ggcaatgata cgtagccgac

300

ctgagagggt aatcggccac attgggactg agacacggcc caaactccta cgggaggcag

360

cagtagggaa tcttccacaa tggacgaaag tctgatggag caacgccgcg tgagtgatga

420

agggtttcgg ctcgtaaaac tctgttgttg gagaagaacc gttgtcagag caactgttga

480

cagcttgacg gtatccaacc agaaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

540

acgtaggtgg caagcgttgt ccggatttat tgggcgtaaa gcgagcgcag gcggtttttt

600

aggtctgatg tgaaagcctt cggcttaacc ggagaagtgc atcggaaacc gggagacttg

660

agtgcagaag aggacagtgg aactccatgt gtagcggtga aatgcgtaga tatatggaag

720

aacaccagtg gcgaaggcgg ctgtctggtc tgtaactgac gctgaggctc gaaagcatgg

780

gtagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacgatgagt gctaagtgtt

840

ggagggtttc cgcccttcag tgctgcagct aacgcattaa gcactccgcc tggggagtac

900

gaccgcaagg ttgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg

960

gtttaattcg atgctacgcg aagaacctta ccaggtcttg acatcttctg ccaacctaag

1020

agattaggcg ttcccttcgg ggacagaatg acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt

1080

gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttattgtta gttgccagca

1140

ttcagttggg cactctagca agactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt

1200

caaatcatca tgccccttat gacctgggct acacacgtgc tacaatggac ggtacaacga

1260

gtcgcgaaac cgcgaggtca agctaatctc ttaaagccgt tctcagttcg gattgtaggc

1320

tgcaactcgc ctacatgaag ttggaatcgc tagtaatcgt ggatcagcat gccacggtga

1380

atacgttccc ggcctt

1396

<210> 1108

<211> 1308

<212> DNA

<213> Lactobacillus pentosus

<400> 1108

gagtttgatc atggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtcgaacg

60

agtggcgaac tggtgagtaa cacgtgggaa acctgcccag aagcggggga taacacctgg

120

aaacagatgc taataccgca taacgaaagt cacttttgga tggtcccgcg gcgtattagc

180

tagatggtga ggtaacggct caccatggca atgatacgta gccgacctga gagggtaatc

240

ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

300

ccacaatgga cgaaagtctg atggagcaac gccgcgtgag tgaagaaggg tttcggctcg

360

taaaactctg ttgttaaaga agatgacggt atttaaccag aaagccacgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc

480

gagcgcaggc ggttttttaa gtctgatgtg aaagccttcg gctcaaccga agaagtgcat

540

cggaaactgg gaaacttgag tgcagaagag gacagtggaa ctccatgtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct gtctggtctg actgacgctg

660

aggctcgaaa gtatgggtag caaacaggat tagataccct ggtagtccat accgtaaacg

720

atgaatgcta agtgttggag cttcagtgct gcagctaacg cattaagcat tccgcctggg

780

gagtacggcc gcaaggctga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc tacgcgaaga accttaccag gtcttgacat atacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccttattat cagttgccag catgggcact ctggtgagac tgccggtgac aaaccggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1080

atggatggca acgagttgcg aactcgcgag agtaagctaa tctcttccat tctcagttcg

1140

gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc

1200

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagtttgtaa

1260

cacccaaagt cggtgggtaa ccagccgcct aaggtgggac agatgatt

1308

<210> 1109

<211> 1554

<212> DNA

<213> Lactobacillus perolens

<400> 1109

tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca agtcgaacga ggtttgatca

60

gtttgcggtg gtgcttgcat caccaattac cgattaaacc gagtggcgga cgggtgagta

120

acacgtgggt aacctgccct tcagcagggg ataacatttg gaaacagatg ctaataccgt

180

ataaccacgg agaccgcatg gtctccgggt aaaagatggc gaaagctatc actgagggat

240

ggacccgcgg cgtattagcc agttggtggg gtaatggcct accaaagcga tgatacgtag

300

ccgacctgag agggtaatcg gccacattgg gactgagaca cggcccaaac tcctacggga

360

ggcagcagta gggaatcttc cacaatggac gcaagtctga tggagcaacg ccgcgtgagt

420

gaagaaggct ttcgggtcgt aaaactctgt tattgaagaa gaacgtgtgt gagagtaact

480

gctcatgcag tgacggtatt caaccagaaa gtcacggcta actacgtgcc agcagccgcg

540

gtaatacgta ggtggcaagc gttgtccgga tttattgggc gtaaagcgag tgcaggcggt

600

tttttaagtc tgatgtgaaa gccttcggct taaccgaaga agtgcatcgg aaagtgggaa

660

acttgagtgc agaagaggag agtggaactc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat

720

ggaagaacac cagtggcgaa ggcggctctc tggtctgtaa ctgacgctga ggctcgaaag

780

cgtgggtagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgaatactaa

840

gtgttggggg gtttccgccc ctcagtgctg cagctaacgc attaagtatt ccgcctgggg

900

agtacgaccg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc

960

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ttctgccaag

1020

ctgagagatc agccgttcct tcggggacag aatgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

1080

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatg attagttgcc

1140

agcattcagt tgggcactct agtcagactg ccggtgacaa accggaggaa ggcggggatg

1200

acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat gggtggtaca

1260

acgagcagcg agaccgcgag gtcaagcgaa tctctaaaaa ccatcctcag ttcggattgt

1320

aggctgcaac tcgcctacat gaagctggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcacgccgcg

1380

gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgagagt ttgtaacacc

1440

caaagccggt aggacaaccg caaggagtca gccgtctaag gtgggacaaa tgattagggt

1500

gaagtcgtaa caaggtagcc gtaggagaac ctgcggctgg atcacctcct ttct

1554

<210> 1110

<211> 900

<212> DNA

<213> Lactobacillus plantarum

<220>

<221> modified_base

<222> (19)..(19)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (32)..(32)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (44)..(44)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (74)..(74)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (87)..(87)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (99)..(99)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (123)..(123)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (133)..(134)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (151)..(151)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (153)..(153)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (203)..(203)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (382)..(382)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (882)..(884)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (886)..(888)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1110

gccgcggtaa tacgtaggng caagcgttgt cnggattatt gggngtaaag cgagcgcagg

60

cggtttttta agtntgatgt gaaagcnttc ggctcaacng aagaagtgca tcggaaaact

120

ggnaaacttg agnncagaag aggacagtgg nanctccatg tgtagcggtg aaatgcgtag

180

atatatggaa gaacaccagt ggngaaggcg gctgtctggt ctgtaactga cgctgaggct

240

cgaaagtatg ggtagcaaac aggattagat accctggtag tccataccgt aaacgatgaa

300

tgctaagtgt tggagggttt ccgcccttca gtgctgcagc taacgcatta agcattccgc

360

ctggggagta cggccgcaag gntgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg

420

tggagcatgt ggtttaattc gaagctacgc gaagaacctt accaggtctt gacatactat

480

gcaaatctaa gagattagac gttcccttcg gggacatgga tacaggtggt gcatggttgt

540

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttattatc

600

agttgccagc attaagttgg gcactctggt gagactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt

660

ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatgga

720

tggtacaacg agttgcgaac tcgcgagagt aagctaatct cttaaagcca ttctcagttc

780

ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg cggatcagca

840

tgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cnnnannnca tgagagtttg

900

<210> 1111

<211> 1395

<212> DNA

<213> Lactobacillus pontis

<400> 1111

agtgagcggc ggacgggtga gtaacacgtg ggcaacctgc cctggagcgg gggataacat

60

ttggaaacag atgctaatac cgcataataa tcaaaaccac atggttttga tttcaaagat

120

ggcttcggct atcactccag gatgggcccg cggtgcatta gctagttggt aaggtaacgg

180

cttaccaagg cgatgatgca tagccgagtt gagagactga tcggccacaa tggaactgag

240

acacggtcca tactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttccacaatg ggcgcaagcc

300

tgatggagca acaccgcgtg agtgaagaag ggtttcggct cgtaaaactc tgttgttgaa

360

gaagaacgtg cgtgagagta actgttcatg cagtgacggt attcaaccag aaagtcacgg

420

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttatcc ggatttattg

480

ggcgtaaagc gagcgcaggc ggttacttaa gtctgatgtg aaagccttcg gcttaaccga

540

agaagtgcat cggaaactgg gtgacttgag tgcagaagag gacagtggaa ctccatgtgt

600

agcggtggaa tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct gtctggtctg

660

caactgacgc tgaggctcga aagcatgggt agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc

720

atgccgtaaa cgatgagtgc taggtgttgg agggtttccg cccttcagtg ccggagctaa

780

cgcattaagc actccgcctg gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg

840

ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gctacgcgaa gaaccttacc

900

aggtcttgac atcttgcgct aacctaagag attaggcgtt cccttcgggg acgcaatgac

960

aggtggtgca tggtcgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1020

gcgcaaccct tgttactagt tgccagcatt cagttgggca ctctagtgag actgccggtg

1080

acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca gatcatcatg ccccttatga cctgggctac

1140

acacgtgcta caatggtcgg tacaacgagt cgctaacccg cgagggcaag ctaatctctt

1200

aaagccgatc tcagttcgga ctgtaggctg caactcgcct acacgaagtc ggaatcgcta

1260

gtaatcgcgg atcagcatgc cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1320

cacaccatgg aagtttgtaa cgcccaaagt cggtggccta accatttgga gggagccgcc

1380

taaggcggga cagat

1395

<210> 1112

<211> 1580

<212> DNA

<213> Lactobacillus reuteri

<400> 1112

ttttatatga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgccg gcggtgtgcc taatacatgc

60

aagtcgtacg cactggccca actgattgat ggtgcttgca cctgattgac gatggattac

120

cagtgagtgg cggacgggtg agtaacacgt aggtaacctg ccccggagcg ggggataaca

180

tttggaaaca gatgctaata ccgcataaca acaaaagcca catggctttt gtttgaaaga

240

tggctttggc tatcactctg ggatggacct gcggtgcatt agctagttgg taaggtaacg

300

gcttaccaag gcgatgatgc atagccgagt tgagagactg atcggccaca atggaactga

360

gacacggtcc atactcctac gggaggcagc agtagggaat cttccacaat gggcgcaagc

420

ctgatggagc aacaccgcgt gagtgaagaa gggtttcggc tcgtaaagct ctgttgttgg

480

agaagaacgt gcgtgagagt aactgttcac gcagtgacgg tatccaacca gaaagtcacg

540

gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttatc cggatttatt

600

gggcgtaaag cgagcgcagg cggttgctta ggtctgatgt gaaagccttc ggcttaaccg

660

aagaagtgca tcggaaaccg ggcgacttga gtgcagaaga ggacagtgga actccatgtg

720

tagcggtgga atgcgtagat atatggaaga acaccagtgg cgaaggcggc tgtctggtct

780

gcaactgacg ctgaggctcg aaagcatggg tagcgaacag gattagatac cctggtagtc

840

catgccgtaa acgatgagtg ctaggtgttg gagggtttcc gcccttcagt gccggagcta

900

acgcattaag cactccgcct ggggagtacg accgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac

960

gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agctacgcga agaaccttac

1020

caggtcttga catcttgcgc taaccttaga gataaggcgt tcccttcggg gacgcaatga

1080

caggtggtgc atggtcgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1140

agcgcaaccc ttgttactag ttgccagcat taagttgggc actctagtga gactgccggt

1200

gacaaaccgg aggaaggtgg ggacgacgtc agatcatcat gccccttatg acctgggcta

1260

cacacgtgct acaatggacg gtacaacgag tcgcaagctc gcgagagtaa gctaatctct

1320

taaagccgtt ctcagttcgg actgtaggct gcaactcgcc tacacgaagt cggaatcgct

1380

agtcctcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg

1440

tcacaccatg ggagtttgta acgcccaaag tcggtggcct aacctttatg gagggagccg

1500

cctaaggcgg gacagatgac tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtag gagaacctgc

1560

ggctggatca cctcctttct

1580

<210> 1113

<211> 1429

<212> DNA

<213> Lactobacillus rhamnosus

<400> 1113

gtcgaacgag ttctgattat tgaaaggtgc ttgcatcttg atttaatttt gaacgagtgg

60

cggacgggtg agtaacacgt gggtaacctg cccttaagtg ggggataaca tttggaaaca

120

gatgctaata ccgcataaat ccaagaaccg catggttctt ggctgaaaga tggcgtaagc

180

tatcgctttt ggatggaccc gcggcgtatt agctagttgg tgaggtaacg gctcaccaag

240

gcaatgatac gtagccgaac tgagaggttg atcggccaca ttgggactga gacacggccc

300

aaactcctac gggaggcagc agtagggaat cttccacaat ggacgcaagt ctgatggagc

360

aacgccgcgt gagtgaagaa ggctttcggg tcgtaaaact ctgttgttgg agaagaatgg

420

tcggcagagt aactgttgtc ggcgtgacgg tatccaacca gaaagccacg gctaactacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttatc cggatttatt gggcgtaaag

540

cgagcgcagg cggtttttta agtctgatgt gaaagccctc ggcttaaccg aggaagtgca

600

tcggaaactg ggaaacttga gtgcagagga cagtggaact ccatgtgtag cggtgaaatg

660

cgtagatata tggaagaaca ccagtggcga aggcggctgt ctggtctgta actgacgctg

720

aggctcgaaa gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

780

atgaatgcta gtgttggagg gtttccgccc ttcagtgccg cagctaacgc attaagcatt

840

ccgcctgggg agtacgaccg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa

900

gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc

960

ttttgatcac ctgagagatc aggttgcccg tgtggggcga aaatgacagg tggtgcatgg

1020

ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat

1080

gactagttgc cagcatttag ttgggcactc tagtaagact gccggtgaca aaccggagga

1140

aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa

1200

tggatggtac aacgagttgc gagaccgcga ggtcaagcta atctcttaaa gccattctca

1260

gttcggactg taggctgcaa ctcgcctaca cgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc

1320

agcacgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgagag

1380

tttgtaacac ccgaagccgg tggcgtaacc cttttaggga gcgagccgt

1429

<210> 1114

<211> 1452

<212> DNA

<213> Lactobacillus rogosae

<400> 1114

tcaggatgaa cgctggcggc gtgcttaaca catgcagtcg aacgaagcat ttaagacaga

60

ttacttcggt ttgaagtctt ttatgactga gtggcggacg ggtgagtaac gcgtgggtaa

120

cctgcctcat acagggggat agcagctgga aacggctggt aataccgcat aagcgcacag

180

taccacatgg tacagtgtga aaaactccgg tggtatgaga tggacccgcg tctgattagc

240

ttgttggcgg ggtaacggcc caccaaggcg acgatcagta gccgacctga gagggtgacc

300

ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

360

gcacaatgga ggaaactctg atgcagcgac gccgcgtgag tgaagaagta gttcgctatg

420

taaagctcta tcagcaggga agatagtgac ggtacctgac taagaagctc cggctaaata

480

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtatgga gcaagcgtta tccggattta ctgggtgtaa

540

agggagtgta ggtggccagg caagtcagaa gtgaaagccc ggggctcaac cccgggactg

600

cttttgaaac tgcagggcta gagtgcagga ggggcaagtg gaattcctag tgtagcggtg

660

aaatgcgtag atattaggag gaacaccagt ggcgaaggcg gcttgctgga ctgtaactga

720

cactgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt

780

aaacgatgaa tactaggtgt cggggcacat aagtgctccg gtgccgcagc aaacgcaata

840

agtattccac ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc aaaggaattg acggggaccc

900

gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaagtctt

960

gacatcctct tgaccggtca gtaatgtgac cttttcttcg gaacaagagt gacaggtggt

1020

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1080

ccttatcctt agtagccagc agttcggctg ggcactctag ggagactgcc agggataacc

1140

tggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgacttggg ctacacacgt

1200

gctacaatgg cgtaaacaaa gtgaagcgag agtgtgagct taagcaaatc acaaaaataa

1260

cgtctcagtt cggattgtag tctgcaactc gactacatga agctggaatc gctagtaatc

1320

gcagatcaga atgctgcggt gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc

1380

atgggagtcg gaaatgcccg aagtcggtga cctaacgtaa gaagagccgc cgaagcaggt

1440

ctgataactg gg

1452

<210> 1115

<211> 1561

<212> DNA

<213> Lactobacillus ruminis

<400> 1115

ttgagagttt gatcctggct caggacgaac gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg

60

aacgaagctt tctttcaccg aatgcttgca ttcaccgaaa gaagcttagt ggcgaacggg

120

tgagtaacac gtaggcaacc tgcccaaaag agggggataa cacttggaaa caggtgctaa

180

taccgcataa ccatgaacac cgcatgatgt tcatgtaaaa gacggctttt gctgtcactt

240

ttggatgggc ctgcggcgta ttaacttgtt ggtggggtaa cggcctacca aggtgatgat

300

acgtagccga actgagaggt tgatcggcca cattgggact gagacacggc ccaaactcct

360

acgggaggca gcagtaggga atcttccaca atggacgaaa gtctgatgga gcaacgccgc

420

gtgaatgaag aaggccttcg ggtcgtaaaa ttctgttgtc agagaagaac gtgcgtgaga

480

gtaactgttc acgtattgac ggtatctgac cagaaagcca cggctaacta cgtgccagca

540

gccgcggtaa tacgtaggtg gcgagcgttg tccggattta ttgggcgtaa agggaacgca

600

ggcggtcttt taagtctgat gtgaaagcct tcggcttaac cgaagtagtg cattggaaac

660

tggaagactt gagtgcagaa gaggagagtg gaactccatg tgtagcggtg aaatgcgtag

720

atatatggaa gaacaccagt ggcgaaagcg gctctctggt ctgtaactga cgctgaggtt

780

cgaaagcgtg ggtagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag

840

tgctaagtgt tggagggttt ccgcccttca gtgctgcagc taacgcatta agcactccgc

900

ctggggagta cggtcgcaag actgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg

960

tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatcttct

1020

gacaattcca gagatggaac gttcccttcg gggacagaat gacaggtggt gcatggttgt

1080

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttattgtc

1140

agttgccatc attaagttgg gcactctggc gagactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt

1200

ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatgga

1260

cggtacaacg agtcgctaac tcgcgagggc aagctaatct cttaaagccg ttctcagttc

1320

ggattgcagg ctgcaactcg cctgcatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg cgaatcagca

1380

tgtcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgagagtttg

1440

taacacccaa agtcggtggg gtaacctttt ggagccagcc gcctaaggtg ggacagatga

1500

ttggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta ggagaacctg cggctggatc acctcctttc

1560

t

1561

<210> 1116

<211> 1579

<212> DNA

<213> Lactobacillus sakei

<400> 1116

gggaattcga ttgagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaatacat

60

gcaagtcgaa cgcactctcg tttagattga aggagcttgc tcctgattga taaacatttg

120

agtgagtggc ggacgggtga gtaacacgtg ggtaacctgc cctaaagtgg gggataacat

180

ttggaaacag atgctaatac cgcataaaac ctaacaccgc atggtgtagg gttgaaagat

240

ggtttcggct atcactttag gatggacccg cggtgcatta gttagttggt gaggtaaagg

300

ctcaccaaga ccgtgatgca tagccgacct gagagggtaa tcggccacac tgggactgag

360

acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttccacaatg gacgaaagtc

420

tgatggagca acgccgcgtg agtgaagaag gttttcggat cgtaaaactc tgttgttgga

480

gaagaatgta tctgatagta actgaccagg tagtgacggt atccaaccag aaagccacgg

540

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg

600

ggcgtaaagc gagcgcaggc ggtttcttaa gtctgatgtg aaagccttcg gctcaaccga

660

agaagtgcat cggaaactgg gaaacttgag tgcagaagag gacagtggaa ctccatgtgt

720

agcggtgaaa tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct gtctggtctg

780

taactgacgc tgaggctcga aagcatgggt agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

840

atgccgtaaa cgatgagtgc taggtgttgg agggtttccg cccttcagtg ccgcagctaa

900

cgcattaagc actccgcctg gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg

960

ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc

1020

aggtcttgac atcctttgac cactctagag atagagcttt cccttcgggg acaaagtgac

1080

aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1140

gcgcaaccct tattactagt tgccagcatt tagttgggca ctctagtgag actgccggtg

1200

acaaaccgga ggaaggtggg gacgacgtca aatcatcatg ccccttatga cctgggctac

1260

acacgtgcta caatggatgg tacaacgagt tgcgagaccg cgaggtttag ctaatctctt

1320

aaaaccattc tcagttcgga ttgtaggctg caactcgcct acatgaagcc ggaatcgcta

1380

gtaatcgcgg atcagcatgc cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1440

cacaccatga gagtttgtaa cacccaaagc cggtgaggta accttcgggg agccagccgt

1500

ctaaggtggg acagatgatt agggtgaagt cgtaacaagg tagccgtagg agaacctgcg

1560

gctggatcac ctcctttct

1579

<210> 1117

<211> 1566

<212> DNA

<213> Lactobacillus salivarius

<400> 1117

tttaaaatga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgaacg aaactttctt acaccgaatg cttgcattca ccgtaagaag ttgagtggcg

120

gacgggtgag taacacgtgg gtaacctgcc taaaagaagg ggataacact tggaaacagg

180

tgctaatacc gtatatctct aaggatcgca tgattcttag atgaaagatg gttctgctat

240

cgcttttaga tggacccgcg gcgtattaac tagttggtgg ggtaacggcc taccaaggtg

300

atgatacgta gccgaactga gaggttgatc ggccacattg ggactgagac acggcccaaa

360

ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt ccacaatgga cgcaagtctg atggagcaac

420

gccgcgtgag tgaagaaggt cttcggatcg taaaactctg ttgttagaga agaacacgag

480

tgagagtaac tgttcattcg atgacggtat ctaaccagca agtcacggct aactacgtgc

540

cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag cgttgtccgg atttattggg cgtaaaggga

600

acgcaggcgg tcttttaagt ctgatgtgaa agccttcggc ttaaccggag tagtgcattg

660

gaaactggaa gacttgagtg cagaagagga gagtggaact ccatgtgtag cggtgaaatg

720

cgtagatata tggaagaaca ccagtggcga aagcggctct ctggtctgta actgacgctg

780

aggttcgaaa gcgtgggtag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

840

atgaatgcta ggtgttggag ggtttccgcc cttcagtgcc gcagctaacg caataagcat

900

tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

960

agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat

1020

cctttgacca cctaagagat taggctttcc cttcggggac aaagtgacag gtggtgcatg

1080

gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg

1140

ttgtcagttg ccagcattaa gttgggcact ctggcgagac tgccggtgac aaaccggagg

1200

aaggtgggga cgacgtcaag tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1260

atggacggta caacgagtcg cgagaccgcg aggtttagct aatctcttaa agccgttctc

1320

agttcggatt gtaggctgca actcgcctac atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcgaat

1380

cagcatgtcg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatgaga

1440

gtttgtaaca cccaaagccg gtggggtaac cgcaaggagc cagccgtcta aggtgggaca

1500

gatgattggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtaggaga acctgcggct ggatcacctc

1560

ctttct

1566

<210> 1118

<211> 1558

<212> DNA

<213> Lactobacillus saniviri

<400> 1118

gatcatggct caggatgaac gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg aacgagttct

60

ggttaatgat ggcggtgctt gcaccaatag atttaacatt tgaacgagtg gcggacgggt

120

gagtaacacg tgggtaacct gccctaaagt gggggataac atttggaaac agatgctaat

180

accgcataaa tcttggaacc tcatggttcc aagctgaaag atggcgtaag ctatcgcttt

240

tggatggacc cgcggcgtat tagctagttg gtgaggtaaa ggctcaccaa ggcgatgata

300

cgtagccgac ctgagagggt gatcggccac attgggactg agacacggcc caaactccta

360

cgggaggcag cagtagggaa tcttccacaa tggacgaaag tctgatggag caacgccgcg

420

tgagtgaaga aggttttcgg atcgtaaaac tctgttgttg gagaagaacg tacgtgagag

480

taactgttca cgtagtgacg gtatccaacc agaaagccac ggctaactac gtgccagcag

540

ccgcggtaat acgtaggtgg caagcgttat ccggatttat tgggcgtaaa gcgagcgcag

600

gcggtttctt aagtctgatg tgaaagccct cggctcaacc gaggaagtgc atcggaaact

660

gggaaacttg agtgcagaag aggacagtgg aactccatgt gtagcggtgg aatgcgtaga

720

tatatggaag aacaccagtg gcgaaggcgg ctgtctggtc tgtaactgac gctgaggctc

780

gaaagcatgg gtagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacgatgaat

840

actaagtgtt ggagggtttc cgcccttcag tgctgcagct aacgcattaa gtattccgcc

900

tggggagtac gaccgcaagg ttgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt

960

ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaggtcttg acatcttctg

1020

ctattctaag agattagaag ttcccttcgg ggacagaatg acaggtggtg catggttgtc

1080

gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatgacta

1140

gttgccagca ttaagttggg cactctaatc agactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg

1200

gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gacctgggct acacacgtgc tacaatggat

1260

ggtacaacga gtcgcaaaac cgcgaggtta agctaatctc ttaaagccat tctcagtccg

1320

gactgtaggc tgcaactcgc ctacacgaag tcggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat

1380

gccgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gagagtttgt

1440

aacacccgaa gccggtgggg taacctttta ggagctagcc gtctaaggtg ggacagatga

1500

ttagggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta ggagaacctg cggctggatc acctccta

1558

<210> 1119

<211> 1562

<212> DNA

<213> Lactobacillus senioris

<400> 1119

gagtttgatc atggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtcgaacg

60

cgtcttggtg aatgatcggc ggtgcttgca ccaaagagat ttcacaatga gacgagtggc

120

gaactggtga gtaacacgtg gggaacctgc ccataagcag gggataacac ttggaaacag

180

gtgctaatac cgtataacaa tgtaaaccgc atggtttaca tttgaaagat ggtttcggct

240

atcacttatg gatggacccg cggcgcatta gctagttggt gaggtaacgg ctcaccaagg

300

caatgatgcg tagccgacct gagagggtaa tcggccacat tgggactgag acacggccca

360

aactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttccacaatg gacgaaagtc tgatggagca

420

acgccgcgtg agtgaagaag ggtttcggct cgtaaaactc tgttgttgga gaagaacatg

480

gatgagagta actgttcatt tattgacggt atccaaccag aaagccacgg ctaactacgt

540

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc

600

gagcgcaggc ggtcttttaa gtctgatgtg aaagccttcg gcttaaccgg agaagtgcat

660

cggaaactgg gagacttgag tgcagaagag gacagtggaa ctccatgtgt agcggtgaaa

720

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct gtctggtctg taactgacgc

780

tgaggctcga aagcatgggt agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc atgccgtaaa

840

cgatgagtgc taagtgttgg agggtttccg cccttcagtg ctgcagctaa cgcattaagc

900

actccgcctg gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca

960

caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc aggtcttgac

1020

atcttctgct aacccaagag attgggcgtt cccttcgggg acggaatgac aggtggtgca

1080

tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct

1140

tattgttagt tgccagcatt tagttgggca ctctagcaag actgccggtg acaaaccgga

1200

ggaaggtggg gatgacgtca agtcctcatg ccccttatga cctgggctac acacgtgcta

1260

caatggacgg tacaacgagt cgcgaaaccg cgaggtcaag ctaatctctt aaagccgttc

1320

tcagttcgga ttgcaggctg caactcgcct gcatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgtgg

1380

atcagcatgc cacggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga

1440

gagtttgtaa cacccaaagc cggtggggta accttttagg agccagccgt ctaaggtggg

1500

acagatgatt agggtgaagt cgtaacaagg tagccgtagg agaacctgcg gctcacctcc

1560

ta

1562

<210> 1120

<211> 1617

<212> DNA

<213> Lactobacillus sp. 66c

<400> 1120

gagttccact ctcctcttct gcactcaaga atgacagttt ccgatgcagt tccacggttg

60

agccgtgggc tttcacatca gacttatcat tccgcctgcg ctcgctttac gcccaataaa

120

tccggacaac gcttgccacc tacgtagagt ttgatcatgg ctcaggacga acgctgggcg

180

gcgtgcctaa tacatgcaag tcgagcgagc tgaattcaca gatcccttcg gagtgacgtg

240

ttggacgcta gcggcggatg ggtgagtaac acgtgggcaa tctgccctaa agactgggat

300

accacttgga aacaggtgct aataccggat aacaatgatg gttgcatgac cattatttga

360

aaggcggcgc aagctgtcac tttaggatga gcccgcggtg cattagctag ttggtgaggt

420

aacggctcac caaggccatg atgcatagcc gagttgagag actgatcggc cacattggga

480

ctgagacacg gcccaaactc ctacgggagg cagcagtagg gaatcttcca caatggacgc

540

aagtctgatg gagcaacgcc gcgtgagtga agaaggtttt cggatcgtaa agctctgttg

600

ttggtgaaga aggatgtgag tagcaactgg ctcatatttg acggtaatca accagaaagt

660

cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt tgtccggatt

720

tattgggcgt aaagcgagcg caggcggaat gataagtctg atgtgaaagc ccacggctca

780

accgtggaac tgcatcggaa actgtcattc ttgagtgcag aagaggagag tggaactcca

840

tgtgtagcgg tggaatgcgt agatatatgg aagaacacca gtggcgaagg cggctctctg

900

gtctgcaact gacgctgagg ctcgaaagca tgggtagcga acaggattag ataccctggt

960

agtccatgcc gtaaacgatg agcgctaggt gttggggact ttccggtcct cagtgccgca

1020

gcaaacgcat taagcgctcc gcctggggag tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat

1080

tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc

1140

ttaccaggtc ttgacatcct gagaccgtta tagagatata attttccctt cggggactca

1200

gagacaggtg gtgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1260

aacgagcgca acccttgtct ttagttgcca gcattaagtt gggcactcta gagagactgc

1320

cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca tcatgcccct tatgacctgg

1380

gctacacacg tgctacaatg ggcagtacaa cgagaagcga acctgcgaag gcaagcggat

1440

ctcttaaagc tgttctcagt tcggactgca ggctgcaact cgcctgcacg aagctggaat

1500

cgctagtaat cgcggatcag cacgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1560

cccgtcacac catggaagtc tgcaatgccc aaagtcggtg ggataaccct tttggaa

1617

<210> 1121

<211> 1409

<212> DNA

<213> Lactobacillus sp. BT6

<220>

<221> modified_base

<222> (8)..(8)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (14)..(14)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (40)..(40)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1121

tgattatntg aaanggtgct tgcatcttga tttaattttn gaacgagtgg cggacgggtg

60

agtaacacgt gggtaacctg cccttaagtg ggggataaca tttggaaaca gatgctaata

120

ccgcataaat ccaagaaccg catggttctt ggctgaaaga tggcgtaagc tatcgctttt

180

ggatggaccc gcggcgtatt agctagttgg tgaggtaacg gctcaccaag gcaatgatac

240

gtagccgaac tgagaggttg atcggccaca ttgggactga gacacggccc aaactcctac

300

gggaggcagc agtagggaat cttccacaat ggacgcaagt ctgatggagc aacgccgcgt

360

gagtgaagaa ggctttcggg tcgtaaaact ctgttgttgg agaagaatgg tcggcagagt

420

aactgttgtc ggcgtgacgg tatccaacca gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc

480

cgcggtaata ctaggtggca agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaagc gagcgcaggc

540

ggttttttaa gtctgatgtg aaagccctcg gcttaaccga ggaagtgcat cggaaactgg

600

aaacttgagt gcagaagagg acagtggaac tccatgtgta gcggtgaaat gcgtagatat

660

atggaagaac accagtggcg aaggcggctg tctggtctgt aactgacgct gagctcgaaa

720

gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg atgaatgcta

780

ggtgttggag ggtttccgcc cttcagtgcc gcagctaacg cattaagcat tccgcctggg

840

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggggagc

900

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ttttgatcac

960

ctgagagatc aggtttcccc ttcgggggca aaatgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag

1020

ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat gactagttgc

1080

cagcatttag ttgggcactc tagtaagact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat

1140

gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggatggtac

1200

aacgagttgc gagaccgcga ggtcaagcta atctcttaaa gccattctca gttcggactg

1260

taggctgcaa ctcgcctaca cgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agcacgccgc

1320

ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgagag tttgtaacac

1380

ccgaagccgg tggcgtaacc cttttaggg

1409

<210> 1122

<211> 1238

<212> DNA

<213> Lactobacillus sp. KLDS 1.0701

<400> 1122

agcggcggat gggtgagtaa cacgtgggga acctgcccca tagtctggga taccacttgg

60

aaacaggtgc taataccgga taagaaaagt cgctatggga tggccccgcg gtgcattagc

120

tagttggtag ggtaacggcc taccaaggca atgatgcata gccgagttga gagactgatc

180

ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

240

ccacaatgga cgaaagtctg atggagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt tttcggatcg

300

taaagctctg ttgttggtga agatgacggt aatcaaccag aaagtcacgg ctaactacgt

360

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc

420

gagcgcaggc ggaagaataa gtctgatgtg aaagccctcg gcttaaccga ggaactgcat

480

cggaaactgt ttttcttgag tgcagaagag gagagtggaa ctccatgtgt agcggtggaa

540

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct ctctggtctg actgacgctg

600

aggctcgaaa gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

660

atgagtgcta agtgttggga tctcagtgct gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

720

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

780

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

840

tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

900

cccttgtcat tagttgccag catgggcact ctaatgagac tgccggtgac aaaccggagg

960

aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1020

atggacagca acgaggagca agcctgcgaa ggcaagcgaa tctcttctgt tctcagttcg

1080

gatgcagtct gcaactcgac tgcagaagct ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc

1140

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtctgcaa

1200

tgcccaaagc cggtgcctaa ggagccgtct aaggcagg

1238

<210> 1123

<211> 1237

<212> DNA

<213> Lactobacillus sp. KLDS 1.0702

<400> 1123

agtggcgaac tggtgagtaa cacgtgggaa acctgcccag aagcggggga taacacctgg

60

aaacagatgc taataccgca taacgaaagt cacttttgga tggtcccgcg gcgtattagc

120

tagatggtgg ggtaacggct caccatggca atgatacgta gccgacctga gagggtaatc

180

ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

240

ccacaatgga cgaaagtctg atggagcaac gccgcgtgag tgaagaaggg tttcggctcg

300

taaaactctg ttgttaaaga agatgacggt atttaaccag aaagccacgg ctaactacgt

360

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc

420

gagcgcaggc ggttttttaa gtctgatgtg aaagccttcg gctcaaccga agaagtgcat

480

cggaaactgg gaaacttgag tgcagaagag gacagtggaa ctccatgtgt agcggtgaaa

540

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct gtctggtctg actgacgctg

600

aggctcgaaa gtatgggtag caaacaggat tagataccct ggtagtccat accgtaaacg

660

atgaatgcta agtgttggag cttcagtgct gcagctaacg cattaagcat tccgcctggg

720

gagtacggcc gcaaggctga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

780

catgtggttt aattcgaagc tacgcgaaga accttaccag gtcttgacat atacaggtgg

840

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

900

cccttattat cagttgccag catgggcact ctggtgagac tgccggtgac aaaccggagg

960

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1020

atggatggca acgagttgcg aactcgcgag agtaagctaa tctcttccat tctcagttcg

1080

gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc

1140

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagtttgtaa

1200

cacccaaagt cggtgggtaa ccagccgcct aaggtgg

1237

<210> 1124

<211> 1236

<212> DNA

<213> Lactobacillus sp. KLDS 1.0703

<400> 1124

agtggcgaac tggtgagtaa cacgtgggaa acctgcccag aagcggggga taacacctgg

60

aaacagatgc taataccgca taacgaaagt cacttttgga tggtcccgcg gcgtattagc

120

tagatggtgg ggtaacggct caccatggca atgatacgta gccgacctga gagggtaatc

180

ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

240

ccacaatgga cgaaagtctg atggagcaac gccgcgtgag tgaagaaggg tttcggctcg

300

taaaactctg ttgttaaaga agatgacggt atttaaccag aaagccacgg ctaactacgt

360

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc

420

gagcgcaggc ggttttttaa gtctgatgtg aaagccttcg gctcaaccga agaagtgcat

480

cggaaactgg gaaacttgag tgcagaagag gacagtggaa ctccatgtgt agcggtgaaa

540

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct gtctggtctg actgacgctg

600

aggctcgaaa gtatgggtag caaacaggat tagataccct ggtagtccat accgtaaacg

660

atgaatgcta agtgttggag cttcagtgct gcagctaacg cattaagcat tccgcctggg

720

gagtacggcc gcaaggctga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

780

catgtggttt aattcgaagc tacgcgaaga accttaccag gtcttgacat atacaggtgg

840

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

900

cccttattat cagttgccag catgggcact ctggtgagac tgccggtgac aaaccggagg

960

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1020

atggatggca acgagttgcg aactcgcgag agtaagctaa tctcttccat tctcagttcg

1080

gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc

1140

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagtttgtaa

1200

cacccaaagt cggtgggtaa ccagccgcct aaggtg

1236

<210> 1125

<211> 1264

<212> DNA

<213> Lactobacillus sp. KLDS 1.0704

<400> 1125

gcggcgtgct atacatgcag tcgaacgagt ggcgaactgg tgagtaacac gtgggaaacc

60

tgcccagaag cgggggataa cacctggaaa cagatgctaa taccgcataa cgaaagtcac

120

ttttggatgg tcccgcggcg tattagctag atggtggggt aacggctcac catggcaatg

180

atacgtagcc gacctgagag ggtaatcggc cacattggga ctgagacacg gcccaaactc

240

ctacgggagg cagcagtagg gaatcttcca caatggacga aagtctgatg gagcaacgcc

300

gcgtgagtga agaagggttt cggctcgtaa aactctgttg ttaaagaaga tgacggtatt

360

taaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta ggtggcaagc

420

gttgtccgga tttattgggc gtaaagcgag cgcaggcggt tttttaagtc tgatgtgaaa

480

gccttcggct caaccgaaga agtgcatcgg aaactgggaa acttgagtgc agaagaggac

540

agtggaactc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat ggaagaacac cagtggcgaa

600

ggcggctgtc tggtctgact gacgctgagg ctcgaaagta tgggtagcaa acaggattag

660

ataccctggt agtccatacc gtaaacgatg aatgctaagt gttggagctt cagtgctgca

720

gctaacgcat taagcattcc gcctggggag tacggccgca aggctgaaac tcaaaggaat

780

tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagctac gcgaagaacc

840

ttaccaggtc ttgacatata caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

900

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttattatcag ttgccagcat gggcactctg

960

gtgagactgc cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct

1020

tatgacctgg gctacacacg tgctacaatg gatggcaacg agttgcgaac tcgcgagagt

1080

aagctaatct cttccattct cagttcggat gtaggctgca actcgcctac agaagtcgga

1140

atcgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1200

cgcccgtcac accatgagag tttgtaacac ccaaagtcgg tgggtaacca gccgcctaag

1260

gtgg

1264

<210> 1126

<211> 1240

<212> DNA

<213> Lactobacillus sp. KLDS 1.0705

<400> 1126

agtggcgaac tggtgagtaa cacgtgggaa acctgcccag aagcggggga taacacctgg

60

aaacagatgc taataccgca taacgaaagt cacttttgga tggtcccgcg gcgtattagc

120

tagatggtgg ggtaacggct caccatggca atgatacgta gccgacctga gagggtaatc

180

ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

240

ccacaatgga cgaaagtctg atggagcaac gccgcgtgag tgaagaaggg tttcggctcg

300

taaaactctg ttgttaaaga agatgacggt atttaaccag aaagccacgg ctaactacgt

360

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc

420

gagcgcaggc ggttttttaa gtctgatgtg aaagccttcg gctcaaccga agaagtgcat

480

cggaaactgg gaaacttgag tgcagaagag gacagtggaa ctccatgtgt agcggtgaaa

540

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct gtctggtctg actgacgctg

600

aggctcgaaa gtatgggtag caaacaggat tagataccct ggtagtccat accgtaaacg

660

atgaatgcta agtgttggag cttcagtgct gcagctaacg cattaagcat tccgcctggg

720

gagtacggcc gcaaggctga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

780

catgtggttt aattcgaagc tacgcgaaga accttaccag gtcttgacat atacaggtgg

840

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

900

cccttattat cagttgccag catgggcact ctggtgagac tgccggtgac aaaccggagg

960

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1020

atggatggca acgagttgcg aactcgcgag agtaagctaa tctcttccat tctcagttcg

1080

gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc

1140

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagtttgtaa

1200

cacccaaagt cggtgggtaa ccagccgcct aaggtgggac

1240

<210> 1127

<211> 1236

<212> DNA

<213> Lactobacillus sp. KLDS 1.0707

<400> 1127

agtggcggac gggtgagtaa cacgtaggta acctgcccag aagcggggga caacatttgg

60

aaacagatgc taataccgca taacaaaagt cacttctgga tggacctgcg gtgcattagc

120

ttgttggtgg ggtaacggcc taccaaggcg atgatgcata gccgagttga gagactgatc

180

ggccacaatg ggactgagac acggcccata ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

240

ccacaatggg cgcaagcctg atggagcaac accgcgtgag tgaagaaggg tttcggctcg

300

taaagctctg ttgttaaaga agatgacggt atttaaccag aaagtcacgg ctaactacgt

360

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaaga

420

gagtgcaggc ggttttctaa gtctgatgtg aaagccttcg gcttaaccgg agaagtgcat

480

cggaaactgg ataacttgag tgcagaagag ggtagtggaa ctccatgtgt agcggtggaa

540

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct acctggtctg actgacgctg

600

agactcgaaa gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

660

atgagtgcta ggtgttggag cttcagtgcc ggagctaacg cattaagcac tccgcctggg

720

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

780

catgtggttt aattcgaagc tacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

840

tgcatggtcg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

900

cccttgttac tagttgccag catgggcact ctagtgagac tgccggtgac aaaccggagg

960

aaggtgggga cgacgtcaga tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1020

atggacggca acgagtcgcg aactcgcgag ggcaagcaaa tctcttccgt tctcagttcg

1080

gatgcaggct gcaactcgcc tgcagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc

1140

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagtttgtaa

1200

cacccaaagt cggtgggtag ccagccgcct aaggtg

1236

<210> 1128

<211> 1237

<212> DNA

<213> Lactobacillus sp. KLDS 1.0709

<400> 1128

agtggcggac gggtgagtaa cacgtaggta acctgcccag aagcggggga caacatttgg

60

aaacagatgc taataccgca taacaaaagt cacttctgga tggacctgcg gtgcattagc

120

ttgttggtgg ggtaacggcc taccaaggcg atgatgcata gccgagttga gagactgatc

180

ggccacaatg ggactgagac acggcccata ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

240

ccacaatggg cgcaagcctg atggagcaac accgcgtgag tgaagaaggg tttcggctcg

300

taaagctctg ttgttaaaga agatgacggt atttaaccag aaagtcacgg ctaactacgt

360

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaaga

420

gagtgcaggc ggttttctaa gtctgatgtg aaagccttcg gcttaaccgg agaagtgcat

480

cggaaactgg ataacttgag tgcagaagag ggtagtggaa ctccatgtgt agcggtggaa

540

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct acctggtctg actgacgctg

600

agactcgaaa gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

660

atgagtgcta ggtgttggag cttcagtgcc ggagctaacg cattaagcac tccgcctggg

720

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

780

catgtggttt aattcgaagc tacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

840

tgcatggtcg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

900

cccttgttac tagttgccag catgggcact ctagtgagac tgccggtgac aaaccggagg

960

aaggtgggga cgacgtcaga tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1020

atggacggca acgagtcgcg aactcgcgag ggcaagcaaa tctcttccgt tctcagttcg

1080

gatgcaggct gcaactcgcc tgcagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc

1140

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagtttgtaa

1200

cacccaaagt cggtgggtag ccagccgcct aaggtgg

1237

<210> 1129

<211> 1236

<212> DNA

<213> Lactobacillus sp. KLDS 1.0711

<400> 1129

agtggcggac gggtgagtaa cacgtaggta acctgcccag aagcggggga caacatttgg

60

aaacagatgc taataccgca taacaaaagt cacttctgga tggacctgcg gtgcattagc

120

ttgttggtgg ggtaatggcc taccaaggcg atgatgcata gccgagttga gagactgatc

180

ggccacaatg ggactgagac acggcccata ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

240

ccacaatggg cgcaagcctg atggagcaac accgcgtgag tgaagaaggg tttcggctcg

300

taaagctctg ttgttaaaga agatgacggt atttaaccag aaagtcacgg ctaactacgt

360

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaaga

420

gagtgcaggc ggttttctaa gtctgatgtg aaagccttcg gcttaaccgg agaagtgcat

480

cggaaactgg ataacttgag tgcagaagag ggtagtggaa ctccatgtgt agcggtggaa

540

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct acctggtctg actgacgctg

600

agactcgaaa gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

660

atgagtgcta ggtgttggag cttcagtgcc ggagctaacg cattaagcac tccgcctggg

720

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

780

catgtggttt aattcgaagc tacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

840

tgcatggtcg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

900

cccttgttac tagttgccag catgggcact ctagtgagac tgccggtgac aaaccggagg

960

aaggtgggga cgacgtcaga tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1020

atggacggca acgagtcgcg aactcgcgag ggcaagcaaa tctcttccgt tctcagttcg

1080

gatgcaggct gcaactcgcc tgcagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc

1140

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagtttgtaa

1200

cacccaaagt cggtgggtag ccagccgcct aaggtg

1236

<210> 1130

<211> 1238

<212> DNA

<213> Lactobacillus sp. KLDS 1.0712

<400> 1130

agcggcggat gggtgagtaa cacgtgggga acctgcccca tagtctggga taccacttgg

60

aaacaggtgc taataccgga taagaaaagt cgctatggga tggccccgcg gtgcattagc

120

tagttggtaa ggtaaaggct taccaaggcg atgatgcata gccgagttga gagactgatc

180

ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

240

ccacaatgga cgcaagtctg atggagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt tttcggatcg

300

taaagctctg ttgttggtga agatgacggt aatcaaccag aaagtcacgg ctaactacgt

360

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc

420

gagcgcaggc ggaagaataa gtctgatgtg aaagccctcg gcttaaccga ggaactgcat

480

cggaaactgt ttttcttgag tgcagaagag gagagtggaa ctccatgtgt agcggtggaa

540

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct ctctggtctg actgacgctg

600

aggctcgaaa gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

660

atgagtgcta agtgttggga tctcagtgct gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

720

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

780

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

840

tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

900

cccttgttat tagttgccag catgggcact ctaatgagac tgccggtgac aaaccggagg

960

aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1020

atgggcagca acgagaagcg agcctgcgaa ggcaagcgaa tctctgctgt tctcagttcg

1080

gatgcagtct gcaactcgac tgcagaagct ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc

1140

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtctgcaa

1200

tgcccaaagc cggtgcctaa ggagccgtct aaggcagg

1238

<210> 1131

<211> 1237

<212> DNA

<213> Lactobacillus sp. KLDS 1.0713

<400> 1131

agtggcggac gggtgagtaa cacgtaggta acctgcccag aagcggggga caacatttgg

60

aaacagatgc taataccgca taacaaaagt cacttctgga tggacctgcg gtgcattagc

120

ttgttggtgg ggtaatggcc taccaaggcg atgatgcata gccgagttga gagactgatc

180

ggccacaatg ggactgagac acggcccata ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

240

ccacaatggg cgcaagcctg atggagcaac accgcgtgag tgaagaaggg tttcggctcg

300

taaagctctg ttgttaaaga agatgacggt atttaaccag aaagtcacgg ctaactacgt

360

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaaga

420

gagtgcaggc ggttttctaa gtctgatgtg aaagccttcg gcttaaccgg agaagtgcat

480

cggaaactgg ataacttgag tgcagaagag ggtagtggaa ctccatgtgt agcggtggaa

540

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct acctggtctg actgacgctg

600

agactcgaaa gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

660

atgagtgcta ggtgttggag cttcagtgcc ggagctaacg cattaagcac tccgcctggg

720

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

780

catgtggttt aattcgaagc tacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

840

tgcatggtcg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

900

cccttgttac tagttgccag catgggcact ctagtgagac tgccggtgac aaaccggagg

960

aaggtgggga cgacgtcaga tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1020

atggacggca acgagtcgcg aactcgcgag ggcaagcaaa tctcttccgt tctcagttcg

1080

gatgcaggct gcaactcgcc tgcagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc

1140

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagtttgtaa

1200

cacccaaagt cggtgggtag ccagccgcct aaggtgg

1237

<210> 1132

<211> 1237

<212> DNA

<213> Lactobacillus sp. KLDS 1.0716

<400> 1132

agtggcggac gggtgagtaa cacgtaggta acctgcccca aagcggggga taacatttgg

60

aaacagatgc taataccgca taacaaaagt cactttggga tggacctgcg gcgcattagc

120

ttgttggtag ggtaacggcc taccaaggct gtgatgcgta gccgagttga gagactgatc

180

ggccacaatg gaactgagac acggtccata ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

240

ccacaatggg cgcaagcctg atggagcaac accgcgtgag tgaagaaggg tttcggctcg

300

taaagctctg ttgttagaga agatgacggt atctaaccag aaagtcacgg ctaactacgt

360

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaagc

420

gagcgcaggc ggtttgataa gtctgatgtg aaagcctttg gcttaaccaa agaagtgcat

480

cggaaactgt cagacttgag tgcagaagag gacagtggaa ctccatgtgt agcggtggaa

540

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct gtctggtctg actgacgctg

600

aggctcgaaa gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

660

atgagtgcta ggtgttggag cttcagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

720

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

780

catgtggttt aattcgaagc tacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

840

tgcatggtcg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

900

cccttgttac tagttgccag catgggcact ctagtgagac tgccggtgac aaaccggagg

960

aaggtgggga cgacgtcaga tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1020

atggacggca acgagtcgcg aactcgcgag ggcaagctaa tctcttccgt tctcagttcg

1080

gatgcaggct gcaactcgcc tgcagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc

1140

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagtttgcaa

1200

cacccaaagt cggtgggtag ctagccgcct aaggtgg

1237

<210> 1133

<211> 1252

<212> DNA

<213> Lactobacillus sp. KLDS 1.0718

<400> 1133

atacatgcaa gtcgaacgag tggcggacgg gtgagtaaca cgtaggtaac ctgccccaaa

60

gcgggggata acatttggaa acagatgcta ataccgcata acaaaagtca ctttgggatg

120

gacctgcggc gcattagctt gttggtaggg taacggccta ccaaggctgt gatgcgtagc

180

cgagttgaga gactgatcgg ccacaatgga actgagacac ggtccatact cctacgggag

240

gcagcagtag ggaatcttcc acaatgggcg caagcctgat ggagcaacac cgcgtgagtg

300

aagaagggtt tcggctcgta aagctctgtt gttagagaag atgacggtat ctaaccagaa

360

agtcacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag cgttatccgg

420

atttattggg cgtaaagcga gcgcaggcgg tttgataagt ctgatgtgaa agcctttggc

480

ttaaccaaag aagtgcatcg gaaactgtca gacttgagtg cagaagagga cagtggaact

540

ccatgtgtag cggtggaatg cgtagatata tggaagaaca ccagtggcga aggcggctgt

600

ctggtctgac tgacgctgag gctcgaaagc atgggtagcg aacaggatta gataccctgg

660

tagtccatgc cgtaaacgat gagtgctagg tgttggagct tcagtgccgc agctaacgca

720

ttaagcactc cgcctgggga gtacgaccgc aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg

780

cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcta cgcgaagaac cttaccaggt

840

cttgacatcg acaggtggtg catggtcgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

900

gtcccgcaac gagcgcaacc cttgttacta gttgccagca tgggcactct agtgagactg

960

ccggtgacaa accggaggaa ggtggggacg acgtcagatc atcatgcccc ttatgacctg

1020

ggctacacac gtgctacaat ggacggcaac gagtcgcgaa ctcgcgaggg caagctaatc

1080

tcttccgttc tcagttcgga tgcaggctgc aactcgcctg cagaagtcgg aatcgctagt

1140

aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca

1200

caccatgaga gtttgcaaca cccaaagtcg gtgggtagct agccgcctaa gg

1252

<210> 1134

<211> 1237

<212> DNA

<213> Lactobacillus sp. KLDS 1.0719

<400> 1134

agtggcggac gggtgagtaa cacgtgggta acctgcctaa aagaagggga taacacttgg

60

aaacaggtgc taataccgta tatcgaaagt cgcttttaga tggacccgcg gcgtattaac

120

tagttggtgg ggtaacggcc taccaaggtg atgatacgta gccgaactga gaggttgatc

180

ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

240

ccacaatgga cgcaagtctg atggagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt cttcggatcg

300

taaaactctg ttgttagaga agatgacggt atctaaccag caagtcacgg ctaactacgt

360

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagg

420

gaacgcaggc ggtcttttaa gtctgatgtg aaagccttcg gcttaaccgg agtagtgcat

480

tggaaactgg aagacttgag tgcagaagag gagagtggaa ctccatgtgt agcggtgaaa

540

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaagcggct ctctggtctg actgacgctg

600

aggttcgaaa gcgtgggtag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

660

atgaatgcta ggtgttggag cttcagtgcc gcagctaacg caataagcat tccgcctggg

720

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

780

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

840

tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

900

cccttgttgt cagttgccag catgggcact ctggcgagac tgccggtgac aaaccggagg

960

aaggtgggga cgacgtcaag tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1020

atggacggca acgagtcgca agaccgcgag gtttagctaa tctcttccgt tctcagttcg

1080

gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcga atcagcatgt

1140

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagtttgtaa

1200

cacccaaagc cggtgggtag ccagccgtct aaggtgg

1237

<210> 1135

<211> 1364

<212> DNA

<213> Lactobacillus sp. oral clone HT002

<400> 1135

gagtttgatt ctggctcagg atgaacgccg gcggtgtgcc taatacatgc aagtcgaacg

60

agtggcggac gggtgagtaa cacgtaggta acctgcccgg aagcggggga caacatttgg

120

aaacagatgc taataccgca taacaaaagt cacttctgga tggacctgcg gtgcattagc

180

ttgttggtgg ggtaacggct taccaaggcg atgatgcata gccgagttga gagactgatc

240

ggccacaatg gaactgagac acggtccata ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

300

ccacaatggg cgcaagcctg atggagcaac accgcgtgag tgaagaaggg tttcggctcg

360

taaagctctg ttgttggaga agatgacggt atccaaccag aaagtcacgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc

480

gagtgcaggc ggttcaataa gtctgatgtg aaagccttcg gctcaaccgg agaattgcat

540

cagaaactgt tgaacttgag tgcagaagag gagagtggaa ctccatgtgt agcggtggaa

600

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct ctctggtctg actgacgctg

660

aggctcgaaa gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

720

atgagtgcta agtgttggga tctcagtgct gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

780

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc gacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccttgtcat tagttgccat catgggcact ataatgagac tgccggtgac aaaccggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1080

atggacggca acgagaagcg aacctgcgaa ggcaagcgga tctctgccgt tctcagttcg

1140

gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagct ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc

1200

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagtctgtaa

1260

cacccaaagc cggtggatag tcagccgtct aaggtaggac agatgattag ggtgaagtcg

1320

taacaaggta gccgtaggag aacctgcggc tggatcacct cctt

1364

<210> 1136

<211> 1361

<212> DNA

<213> Lactobacillus sp. oral clone HT070

<400> 1136

gagtttgatt ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtcgagcg

60

agcggcggat gggtgagtaa cacgtgggga acctgcccca gagtctggga taccacttgg

120

aaacaggtgc taataccgga taagaaaagt cgctcaggga tggccccgcg gtgcattagc

180

tagttggcaa ggtaacggcc taccaaggca atgatgcata gccgagttga gagactgatc

240

ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

300

ccacaatgga cgcaagtctg atggagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt tttcggatcg

360

taaagctctg ttgttggtga agatgacggt aatcaaccag aaagtcacgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc

480

gagcgcaggc ggaaaaataa gtctaatgtg aaagccctcg gcttaaccga ggaattgcat

540

cggaaactgt ttttcttgag tgcagaagag gagagtggaa ctccatgtgt agcggtggaa

600

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct ctctggtctg actgacgctg

660

aggctcgaaa gcatgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg

720

atgagtgcta agtgttggga tctcagtgct gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

780

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccttgttat tagttgccag catgggcact ctaatgagac tgccggtgac aaaccggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1080

atggacagca acgagcagcg agcctgcgaa ggcaagcgaa tctctgctgt tctcagttcg

1140

gatgcagtct gcaactcgac tgcagaagct ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc

1200

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtctgcaa

1260

tgcccaaagc cggtgcctaa ggagccgtct aaggcagggc agatgactgg ggtgaagtcg

1320

tacaaggtag ccgtaggaaa cctgcggctg gacacctcct t

1361

<210> 1137

<211> 994

<212> DNA

<213> Lactobacillus sp. oral taxon 052

<220>

<221> modified_base

<222> (43)..(43)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (45)..(45)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (633)..(633)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (635)..(635)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (637)..(637)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (727)..(727)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (876)..(876)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (944)..(945)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (978)..(978)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (984)..(986)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1137

cgcactggcc caactgagat gacgtgcttg cactgatttg acnanggatt accagtgagt

60

ggcggacggg tgagtaacac gtaggcaacc tgcccaagag cgggggataa catttggaaa

120

caagtgctaa taccgcataa gattgatgac cacatggtca tcaatttaaa gatggcttcg

180

gctatcactc ttggatgggc ctgcggtgca ttagctagtt ggtaaggtaa cggcttacca

240

aggcagtgat gcatagccga gttgagagac tgatcggcca caatgggact gagacacggc

300

ccatactcct acgggaggca gcagtaggga atcttccaca atgggcgcaa gcctgatgga

360

gcgacaccgc gtgagtgaag aagggtttcg gctcgtaaag ctctgttgtt gaagaagaac

420

gtgcgtgaga gtaactgttc acgcagtgac ggtattcaac cagaaagtca cggctaacta

480

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgtta tccggattta ttgggcgtaa

540

agcgagcgca ggcggttttc taagtctgat gtgaaagcct tcggcttaac cgaagaaggg

600

catcggaaac tggatgactt gagtgcagaa gangncngtg gaactccatg tgtagcggtg

660

gaatgcgtag atatatggaa gaacaccagt ggcgaaggcg gctgcctagt ctgcaactga

720

cgctgangct cgaaagcatg ggtagcgaac aggattagat accctggtag tccatgccgt

780

aaacgatgag tgctaggtgt tggagggttt ccgcccttca gtgccgcagc taacgcaata

840

agcactccgc ctggggagta cgaccgcaag gttganctca aaggaattga cgggggcccg

900

cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagctacgcg agannttacc aggtcttgac

960

atcttgcgct aacctaanag attnnngttc cctt

994

<210> 1138

<211> 1557

<212> DNA

<213> Lactobacillus tucceti

<220>

<221> modified_base

<222> (1548)..(1548)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1138

ttaagagttt gatttaggct caggacgaac gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg

60

agcgaactct ggtaactgaa cgatgggtgc ttgcaccgga gtgatgatac atttgagtga

120

gcggcggatg ggtgagtaac acgtgggtaa cctgccctaa agtgggggat aacatctgga

180

aacaggtgct aataccgcat aacaacattt accacatggt ttatgtttga aagatggttc

240

tgctatcgct ttaggatgga cccgcggcgt attagctagt tggtgaggta acggctcacc

300

aaggcaatga tacgtagccg acctgagagg gtaatcggcc acattgggac tgagacacgg

360

cccaaactcc tacgggaggc agcagtaggg aatcttccac aatggacgaa agtctgatgg

420

agcaacgccg cgtgagtgaa gaaggttttc ggatcgtaaa actctgttgt tgaagaagaa

480

catgcgtgag agtaactgtt catgtattga cggtattcaa ccagaaagcc acggctaact

540

acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgtt gtccggattt attgggcgta

600

aagcgagcgt aggcggttta ttaagtctga tgtgaaagcc ctcggctcaa ccgaggaagt

660

gcatcggaaa ctggtaaact tgagtgcaga agaggaaagt ggaactccat gtgtagcggt

720

ggaatgcgta gatatatgga agaacaccag tggcgaaggc ggctttctgg tctgtaactg

780

acgctgaggt tcgaaagcgt gggtagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg

840

taaacgatga gtgctaagtg ttggagggtt tccgcccttc agtgctgcag ctaacgcatt

900

aagcactccg cctggggagt acgaccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc

960

cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggtct

1020

tgacatatct tgaaagtcta agagattaga ggttcccttc ggggacaaga atacaggtgg

1080

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

1140

cccttattac tagttgccag cattaagttg ggcactctag tgagactgcc ggtgacaaac

1200

cggaggaagg tggggacgac gtcaaatcat catgcccctt atgacctggg ctacacacgt

1260

gctacaatgg tcggtacaac gtgctgcgaa ctcgcgaggg taagcaaatc acttaaaacc

1320

gatctcagtt cggattgcag gctgcaactc gcctgcatga agctggaatc gctagtaatc

1380

gtggatcagc atgccacggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc

1440

atgagagttt gtaacaccca aagccggtgg ggtaaccttt taggagctag ccgtctaagg

1500

tgggacaaat gattagggtg aagtcgtaac aaggtagccg taggagancc tgcggct

1557

<210> 1139

<211> 1561

<212> DNA

<213> Lactobacillus ultunensis

<400> 1139

tgagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtcga

60

gcgagcggaa ccagcagatc tgcttcggca gtgacgctgg gaaagcgagc ggcggatggg

120

tgagtaacac gtggggaacc tgccccaaag tctgggatac cacttggaaa caggtgctaa

180

taccggataa gaaagcagat cgcatgatca gcttttaaaa ggcggcgtaa gctgtcgcta

240

tgggatggcc ccgcggtgca ttagctagtt ggtagagtaa cggcctacca aggcaatgat

300

gcatagccga gttgagagac tgatcggcca cattgggact gagacacggc ccaaactcct

360

acgggaggca gcagtaggga atcttccaca atggacgcaa gtctgatgga gcaacgccgc

420

gtgagtgaag aaggttttcg gatcgtaaag ctctgttgtt ggtgaagaag gatagaggta

480

gtaactggcc tttatttgac ggtaatcaac cagaaagtca cggctaacta cgtgccagca

540

gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgttg tccggattta ttgggcgtaa agcgagcgca

600

ggcggaaaaa taagtctaat gtgaaagccc tcggcttaac cgaggaactg catcggaaac

660

tgtttttctt gagtgcagaa gaggagagtg gaactccatg tgtagcggtg gaatgcgtag

720

atatatggaa gaacaccagt ggcgaaggcg gctctctggt ctgcaactga cgctgaggct

780

cgaaagcatg ggtagcgaac aggattagat accctggtag tccatgccgt aaacgatgag

840

tgctaagtgt tgggaggttt ccgcctctca gtgctgcagc taacgcatta agcactccgc

900

ctggggagta cgaccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg

960

tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatctagt

1020

gccatcttca gagatgaaga gttcccttcg gggacgctaa gacaggtggt gcatggctgt

1080

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgttatt

1140

agttgccagc attaagttgg gcactctaat gagactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt

1200

ggggatgacg tcaagtcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatggg

1260

cagtacaacg agaagcgagc ctgcgaaggc aagcgaatct ctgaaagctg ttctcagttc

1320

ggactgcagt ctgcaactcg actgcacgaa gctggaatcg ctagtaatcg cggatcagca

1380

cgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtctg

1440

caacgcccaa agccggtggc ctaaccgaaa ggaaggagcc gtctaaggca gggcagatga

1500

ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta ggagaacctg cggctggatc acctcctttc

1560

t

1561

<210> 1140

<211> 1410

<212> DNA

<213> Lactobacillus vaginalis

<400> 1140

gggggataac atctggaaac aggtgctaat accgcataac aacgaaaacc acatggtttt

60

cgtttcaaag atggtttcgg ctatcacttc aggatgggcc cgcggtgcat tagctagttg

120

gtaaggtaac ggcttaccaa ggcaatgatg catagccgag ttgagagact gatcggccac

180

aatggaactg agacacggtc catactccta cgggaggcag cagtagggaa tcttccacaa

240

tgggcgcaag cctgatggag caacaccgcg tgagtgaaga agggtttcgg ctcgtaaagc

300

tctgttgttg gagaagaacg tgcgtgagag taactgttca cgcagtgacg gtatccaacc

360

agaaagtcac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg caagcgttat

420

ccggatttat tgggcgtaaa gcgagcgcag gcggttgctt aggtctgatg tgaaagcctt

480

cggcttaacc gaagaagggc atcggaaacc gggcgacttg agtgcagaag aggacagtgg

540

aactccatgt gtagcggtgg aatgcgtaga tatatggaag aacaccagtg gcgaaggcgg

600

ctgtctggtc tgcaactgac gctgaggctc gaaagcatgg gtagcgaaca ggattagata

660

ccctggtagt ccatgccgta aacgatgagt gctaggtgtt ggagggtttc cgcccttcag

720

tgccggagct aacgcattaa gcactccgcc tggggagtac gaccgcaagg ttgaaactca

780

aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagctacgcg

840

aagaacctta ccaggtcttg acatcttgcg ctaacctaag agattaggcg ttcccttcgg

900

ggacgcaatg acaggtggtg catggtcgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

960

gtcccgcaac gagcgcaacc cttgttacta gttgccagca ttcagttggg cactctagtg

1020

agactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggacgacgt cagatcatca tgccccttat

1080

gacctgggct acacacgtgc tacaatggac ggtacaacga gttgcgaact cgcgagagta

1140

agctaatctc ttaaagccgt tctcagttcg gactgtaggc tgcaactcgc ctacacgaag

1200

tcggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat gccgcggtga atacgttccc gggccttgta

1260

cacaccgccc gtcacaccat ggaagtttgc aatgcccaaa gtcggtggcc taaccatttg

1320

gagggaaccg cctaaggcag ggcagatgac tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtag

1380

gagaacctgc ggctggatca cctcctttct

1410

<210> 1141

<211> 1503

<212> DNA

<213> Lactobacillus vini

<400> 1141

agagtttgat tatggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac

60

gagacttttt atttgatgct tgcatctttt aaaaagttga gtggcgaacg ggtgagtaac

120

acgtgggtaa cctgccttaa agtgggggat aacacttgga aacaggtgct aataccgcat

180

aaccatcaaa accgcctggt tttgatgtta aagatggttc tgctatcgct ttaagatgga

240

cccgcggcgt attagctagt tggtgaggta acggcttacc aaggcaatga tacgtagccg

300

aactgagagg ttgatcggcc acattgggac tgagacacgg cccaaactcc tacgggaggc

360

agcagtaggg aatcttccac aatggacgaa agtctgatgg agcaacgccg cgtgagtgaa

420

gaaggttttc ggatcgtaaa actctgttgt cagagaagaa cgtgtgtgag agtaactgtt

480

cacgcagtga cggtatctga ccagaaagtc acggctaact acgtgccagc agccgcggta

540

atacgtaggt ggcaagcgtt gtccggattt attgggcgta aagggaacgc aggcggtctt

600

ttaagtctga tgtgaaagcc ttcggcttaa ccgaagtcgg gcattggaaa ctgggagact

660

tgagtgcaga agaagagagt ggaactccat gtgtagcggt gaaatgcgta gatatatgga

720

agaacaccag tggcgaaagc ggctctctgg tctgtaactg acgctgaggt tcgaaagcgt

780

gggtagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga atgctaagtg

840

ttggagggtt tccgcccttc agtgccgcag ctaacgcatt aagcattccg cctggggagt

900

acgatcgcaa gattgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg

960

tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggtct tgacatcttt tgctaacctg

1020

agagatcagg tgttcccttc ggggacaaaa tgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

1080

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttattgt tagttgccag

1140

catttagttg ggcactctaa cgagactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac

1200

gtcaaatcat catgcccctt atgacctggg ctacacacgt gctacaatgg acggtacaac

1260

gagtcgcaag accgcgaggt caagctaatc tctgaaaacc gttctcagtt cggattgcag

1320

gctgcaactc gcctgcatga agtcggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt

1380

gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgagagttt gtaacaccca

1440

aagccggtgg ggtaaccttt gggagccagc cgtctaaggt gggacagatg attggggtga

1500

aga

1503

<210> 1142

<211> 1450

<212> DNA

<213> Lactobacillus vitulinus

<400> 1142

gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac gggaatcttc ggattccagt

60

ggcgaacggg tgaggaatac ataggtaacc tgcccctccg agggggacaa cagacggaaa

120

catctgctaa gaccgcatag ccacagggaa ggcatcttcc ctgtgccaaa tgtcctttcg

180

gggacagcgg ggggatggac ctatgccgca ttagctggtt ggcggggcaa cggcccacca

240

aggcgacgat gcgtagccgg cctgagaggg cggacggcca cactgggact gagacacggc

300

ccagactcct acgggaggca gcagtaggga attttcggca atgggggaaa ccctgaccga

360

gcaacgccgc gtgaacgatg aaggccttcg ggtcgtaaag ttctgttgcg aaggaagaac

420

gccggtgtca ggaaatgggc gccgggtgac ggtacttcgc atagaaagcc acggctaact

480

acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt ggcgagcgtt atccggaatc attgggcgta

540

aagagggagc aggcggcgat acaggtctgt ggtgaaattc cgaagctaaa cttcggccag

600

ccaaagaaac cggatcgcta gagtgcggaa gaggatcgtg gaattccatg tgtagcggtg

660

aaatgcgtag atatatggag gaacaccagt ggcgaaggcg acggtctggg ccgcaactga

720

cgctcattcc cgaaagcgtg gggagcaaat aggattagat accctagtag tccacgccgt

780

aaacgatcga tactaagtgt cgggggtcaa acctcggtgc tggagtcaac gcaataagta

840

tcgcgcctga gtagtacgtt cgcaagaatg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac

900

aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca

960

tcgatccaaa agggacggaa acgtccccat agctatggag aagacaggtg gtgcatggtg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctgtcgc

1080

cagttgccag cattgagttg gggactctgg cgagactgcc tctgcaagga ggaggaaggc

1140

ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc cacacacgtg ctacaatgga

1200

cggagcagag ggaagcgaag cggcgacgcc aagcggatcc cagaaacccg ttctcagttc

1260

ggactgcagt ctgcaactcg actgcacgaa gctggaatcg ctagtaatcg cggatcagca

1320

tgccgcggtg aatacgttct cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgagagtcgg

1380

caacacccga agccggtggc tcaacccttc tgggagggag ctgtctaagg tggggccgat

1440

gattggggtg

1450

<210> 1143

<211> 1419

<212> DNA

<213> Lactobacillus zeae

<400> 1143

cgagttttgg tcgatgaacg gtgcttgcat cgtgattcaa cttaaaacga gtggcggacg

60

ggtgagtaac acgtgggtaa cctgccctta agtgggggat aacatttgga aacagatgct

120

aataccgcat aaatccaaga accgcatggt tcttggctga aagatggcgt aagctatcgc

180

ttttggatgg acccgcggcg tattagctag ttggtgaggt aacggctcac caaggcgatg

240

atacgtagcc gaactgagag gttgatcggc cacattggga ctgagacacg gcccaaactc

300

ctacgggagg cagcagtagg gaatcttcca caatggacgc aagtctgatg gagcaacgcc

360

gcgtgagtga agaaggcttt cgggtcgtaa aactctgttg ttggagaaga atggtcggca

420

gagtaactgt tgtcggcgtg acggtatcca accagaaagc cacggctaac tacgtgccag

480

cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt tatccggatt tattgggcgt aaagcgagcg

540

caggcggttt tttaagtctg atgtgaaagc cctcggctta accgaggaag cgcatcggaa

600

actgggaaac ttgagtgcag aagaggacag tggaactcca tgtgtagcgg tgaaatgcgt

660

agatatatgg aagaacacca gtggcgaagg cggctgtctg gtctgtaact gacgctgagc

720

tcgaaagcat gggtagcgaa caggattaga taccctggta gtccatgccg taaacgatga

780

atgctaggtg ttggagggtt tccgcccttc agtgccgcag ctaacgcatt aagcattccg

840

cctggggagt acgaccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg

900

gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggtct tgacgtcttt

960

tgatcacctg agagatcagg tttccccttc gggggcaaaa tgacaggtgg tgcatggttg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatgac

1080

tagttgccag cattcagttg ggcactctag taagactgcc ggtgacaaac cggaggaagg

1140

tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgacctggg ctacacacgt gctacaatgg

1200

atggtacaac gagttgcgag accgcgaggt caagctaatc tcttaaagcc attctcagtt

1260

cggactgtag gctgcaactc gcctacacga agtcggaatc gctagtaatc gcggatcagc

1320

acgccgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgagagttt

1380

gtaacacccg aagccggtgg cgtaaccctt ttagggagc

1419

<210> 1144

<211> 1485

<212> DNA

<213> Lactococcus garvieae

<400> 1144

aacgctggcg gcgtgcctaa tacatgcaag tcgagcgatg attaaagata gcttgctatt

60

tttatgaaga gcggcgaacg ggtgagtaac gcgtgggaaa tctgccgagt agcgggggac

120

aacgtttgga aacgaacgct aataccgcat aacaatgaga atcgcatgat tcttatttaa

180

aagaagcaat tgcttcacta cttgatgatc ccgcgttgta ttagctagtt ggtagtgtaa

240

aggactacca aggcgatgat acatagccga cctgagaggg tgatcggcca cactgggact

300

gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtaggga atcttcggca atgggggcaa

360

ccctgaccga gcaacgccgc gtgagtgaag aaggttttcg gatcgtaaaa ctctgttgtt

420

agagaagaac gttaagtaga gtggaaaatt acttaagtga cggtatctaa ccagaaaggg

480

acggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt cccaagcgtt gtccggattt

540

attgggcgta aagcgagcgc aggtggtttc ttaagtctga tgtaaaaggc agtggctcaa

600

ccattgtgtg cattggaaac tgggagactt gagtgcagga gaggagagtg gaattccatg

660

tgtagcggtg aaatgcgtag atatatggag gaacaccgga ggcgaaagcg gctctctggc

720

ctgtaactga cactgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag

780

tccacgccgt aaacgatgag tgctagctgt agggagctat aagttctctg tagcgcagct

840

aacgcattaa gcactccgcc tggggagtac gaccgcaagg ttgaaactca aaggaattga

900

cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta

960

ccaggtcttg acatactcgt gctatcctta gagataagga gttccttcgg gacacgggat

1020

acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

1080

gagcgcaacc cttattacta gttgccatca ttaagttggg cactctagtg agactgccgg

1140

tgataaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gacctgggct

1200

acacacgtgc tacaatggat ggtacaacga gtcgccaacc cgcgagggtg cgctaatctc

1260

ttaaaaccat tctcagttcg gattgcaggc tgcaactcgc ctgcatgaag tcggaatcgc

1320

tagtaatcgc ggatcagcac gccgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc

1380

gtcacaccac ggaagttggg agtacccaaa gtaggttgcc taaccgcaag gagggcgctt

1440

cctaaggtaa gaccgatgac tggggtgaag tcgtaacaag gtagc

1485

<210> 1145

<211> 1554

<212> DNA

<213> Lactococcus lactis

<400> 1145

ctttatttga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagttgagcg ctgaaggttg gtacttgtac cgactggatg agcagcgaac gggtgagtaa

120

cgcgtgggga atctgccttt gagcggggga caacatttgg aaacgaatgc taataccgca

180

taaaaacttt aaacacaagt tttaagtttg aaagatgcaa ttgcatcact caaagatgat

240

cccgcgttgt attagctagt tggtgaggta aaggctcacc aaggcgatga tacatagccg

300

acctgagagg gtgatcggcc acattgggac tgagacacgg cccaaactcc tacgggaggc

360

agcagtaggg aatcttcggc aatggacgaa agtctgaccg agcaacgccg cgtgagtgaa

420

gaaggttttc ggatcgtaaa actctgttgg tagagaagaa cgttggtgag agtggaaagc

480

tcatcaagtg acggtaacta cccagaaagg gacggctaac tacgtgccag cagccgcggt

540

aatacgtagg tcccgagcgt tgtccggatt tattgggcgt aaagcgagcg caggtggttt

600

attaagtctg gtgtaaaagg cagtggctca accattgtat gcattggaaa ctggtagact

660

tgagtgcagg agaggagagt ggaattccat gtgtagcggt gaaatgcgta gatatatgga

720

ggaacaccgg tggcgaaagc ggctctctgg cctgtaactg acactgaggc tcgaaagcgt

780

ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga gtgctagatg

840

tagggagcta taagttctct gtatcgcagc taacgcaata agcactccgc ctggggagta

900

cgaccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt

960

ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatactcg tgctattcct

1020

agagatagga agttccttcg ggacacggga tacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

1080

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctattgtt agttgccatc

1140

attaagttgg gcactctaac gagactgccg gtgataaacc ggaggaaggt ggggatgacg

1200

tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatgga tggtacaacg

1260

agtcgcgaga cagtgatgtt tagctaatct cttaaaacca ttctcagttc ggattgtagg

1320

ctgcaactcg cctacatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg cggatcagca cgccgcggtg

1380

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cgggagttgg gagtacccga

1440

agtaggttgc ctaaccgcaa ggagggcgct tcctaaggta agaccgatga ctggggtgaa

1500

gtcgtaacaa ggtagccgta tcggaaggtg cggctggatc acctcctttc taag

1554

<210> 1146

<211> 1440

<212> DNA

<213> Lactococcus raffinolactis

<400> 1146

agttgaacgc ttgattttca ccgaagcttg cttcaccgaa aatcaagagt agcgaacggg

60

tgagtaacgc gtgggtaacc tacctatcag cgggggataa ctattggaaa cgatagctaa

120

taccgcataa caatgttgga tgcatattcg acatttgaaa gtaccaaatg gtacactgag

180

agatggaccc gcgttgtatt agctagttgg tagtgtaatg gactaccaag gcgatgatac

240

atagccgacc tgagagggtg atcggccaca ttgggactga gacacggccc aaactcctac

300

gggaggcagc agtagggaat cttcggcaat ggacgaaagt ctgaccgagc aacgccgcgt

360

gagtgaagaa ggttttcgga tcgtaaaact ctgttgttag agaagaacgt tgcatagagt

420

ggaaaattat gcaagtgacg gtatctaacc agaaagggac ggctaactac gtgccagcag

480

ccgcggtaat acgtaggtcc cgagcgttgt ccggatttat tgggcgtaaa gcgagcgcag

540

gtggtttaat aagtctgatg taaaaggcag tggctcaacc attgtgtgca ttggaaactg

600

ttagacttga gtgcagtaga ggagagtgga attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat

660

atatggagga acaccggtgg cgaaagcggc tctctggact gtcactgaca ctgaggctcg

720

aaagcgtggg tagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg

780

ctagttgttt ggggctatcc agccctaagt gacgcagcaa acgcattaag cactccgcct

840

ggggagtacg accgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg

900

gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catactcgtg

960

ctattcctag agataggaag ttccttcggg acacgggata caggtggtgc atggttgtcg

1020

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ctattgttag

1080

ttgccatcat taagttgggc actctagcga gactgccggt aataaaccgg aggaaggtgg

1140

ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg acctgggcta cacacgtgct acaatggttg

1200

gtacaacgag tcgcaaggca gtgatgtcaa gctaatctct taaagccaat ctcagttcgg

1260

attgtaggct gcaactcgcc tacatgaagt cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcacg

1320

ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta

1380

atacccaaag ccggtgagct aaccttttag gaggcagccg tctaaggtag gatagatgat

1440

<210> 1147

<211> 1281

<212> DNA

<213> Lactonifactor longoviformis

<400> 1147

gagtttgatt atggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcggac gggtgagtaa cgcgtggata acctgcctca tacaggggga taacagttag

120

aaatgactgc taataccgca taagaaaagg cggtatgaga tggatccgcg tttgattagc

180

tagttggtgg ggtaaaggcc taccaaggcg acgatcaata gccgacctga gagggtgacc

240

ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

300

gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcgac gccgcgtgaa ggaagaagta tttcggtatg

360

taaacttcta tcagcaggga agatgacggt acctgactaa gaagccccgg ctaattacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaaggggca agcgttatcc ggatttactg ggtgtaaagg

480

gagcgtagac ggcagtgcaa gtctgatgtg aaagcccggg gctcaacccc gggactgcat

540

tggaaactgt gcagctagag tgtcggagag gtaagtggaa ttcctagtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata ttaggaggaa caccagtggc gaaggcggct tactggacga actgacgttg

660

aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgaatacta ggtgtcgggc gttcggtgcc gcagcaaacg caataagtat tccacctggg

780

gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccaa gtcttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccttatcct tagtagccag cagctgggca ctctagggag actgccaggg acaacctgga

1020

ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga tttgggctac acacgtgcta

1080

caatggcgta caaagggaag cgaaggggtg acctgaagca aatcccaaaa cgtctcagtt

1140

cggatgtagt ctgcaactcg actacagaag ctggaatcgc tagtaatcgc gaatcagaat

1200

gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtcgga

1260

tatgcccgaa gccggtaccg a

1281

<210> 1148

<211> 1544

<212> DNA

<213> Laribacter hongkongensis

<400> 1148

tgaacgaaag agtttgatcc tggctcagat tgaacgctgg cggcatgctt tacacatgca

60

agtcgaacgg taacagggac ttcggtctgc tgacgagtgg cgaacgggtg agtaatgcat

120

cggaacgtac cgagtaatgg gggataacgc atcgaaaggt gtgctaatac cgcatacgcc

180

ctgaggggga aagcggggga tcgaaagacc tcgcgttatt cgagcggccg atgccggatt

240

agctagttgg tggggtaaag gctcaccaag gcgacgatcc gtagcaggtc tgagaggatg

300

atctgccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

360

tttggacaat gggggcaacc ctgatccagc catgccgcgt gtctgaagaa ggccttcggg

420

ttgtaaagga cttttgtcag ggaggaaatc cttaaggcta atacccttgg gggatgacag

480

tacctgaaga ataagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc

540

aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgtgcgcagg cggtttgaaa agtcagctgt

600

gaaagccccg ggctcaacct gggaactgcg gttgaaactc tcaagctaga gtgcgtcaga

660

ggggggtgga attccacgtg tagcagtgaa atgcgtagag atgtggagga acaccaatgg

720

cgaaggcagc cccctgggat gacactgacg ctcatgcacg aaagcgtggg gagcaaacag

780

gattagataa cctggtagtc cacgccctaa acgatgtcga ctagccgttg gagatttcgg

840

tttctggtgg cgcagctaac gcgtgaagtc gaccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta

900

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga tgatgtggat taattcgatg

960

caacgcgaaa aaccttacct ggtcttgaca tgtaccgaac ctcgaagaga tttgagggtg

1020

cccgaaaggg agcggtaaca caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtcattag ttgccagcat taagttgggc

1140

actctaatga gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcctcat

1200

ggcccttatg accagggctt cacacgtcat acaatggtcg gtacagaggg tcgctaagcc

1260

gcgaggtagt gccaatctca taaaaccgat cgtagtccgg atcgcagtct gcaactcgac

1320

tgcgtgaagt cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcatg tcgcggtgaa tacgttcccg

1380

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtggaat ccgccagaag tgggtagggt

1440

aaccgtaagg agcccgctta ccacggtagg tttcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1500

tagccgtagg ggaacctgcg gctggatcac ctcctttcta gaga

1544

<210> 1149

<211> 1534

<212> DNA

<213> Lautropia mirabilis

<400> 1149

ttgaactgaa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggcatgct ttacacatgc

60

aagtcgaacg gcagcgcggg cttcggcctg gcggcgagtg gcgaacgggt gagtaataca

120

tcggaacgtg cccagtagtg ggggatagct cggcgaaagc cggattaata ccgcatacga

180

cctgagggtg aaagcggggg atcttcggac ctcgcgctat tggagcggcc gatggcagat

240

tagctagttg gtggggtaaa ggcctaccaa ggcgacgatc tgtagctggt ctgagaggac

300

gaccagccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

ttttggacaa tgggcgaaag cctgatccag caatgccgcg tgtgtgatga aggccttcgg

420

gttgtaaagc acttttggcg ggaacgaaaa ggactgtgcc aataccacgg ttcgatgacg

480

gtacccgcag aataagcacc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggtg

540

caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gagtgcgcag gcggttttgc aagaccgatg

600

tgaaatcccc gggcttaacc tgggaactgc attggtgact gcaaggctag agtgtgtcag

660

agggaggtgg aattccgcat gtagcagtga aatgcgtaga tatgcggagg aacaccgatg

720

gcgaaggcag cctcctggga taacactgac gctcatgcac gaaagcgtgg ggagcaaaca

780

ggattagata ccctggtagt ccacgcccta aacgatgtct actagttgtc ggggattaat

840

ttccttggta acgcagctaa cgcgtgaagt agaccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt

900

aaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg atgatgtgga ttaattcgat

960

gcaacgcgaa aaaccttacc tacgcttgac atgtccggaa ccctgaagag atttgggggt

1020

gctcgaaaga gagccggaac acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatcatta gttgctacgc aagggcactc

1140

taatgagact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaagt cctcatggcc

1200

cttatgtgta gggcttcaca cgtcatacaa tggtcggtac agagggttgc gaagccgcga

1260

ggtggagcca atcccaaaaa accgatcgta gtccggattg cagtctgcaa ctcgactgca

1320

tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggtc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggttttac cagaagtagg tagcttaacc

1440

gcaaggaggg cgcttaccac ggtagggctc atgactgggg tgaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtaccggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttc

1534

<210> 1150

<211> 1491

<212> DNA

<213> Lautropia sp. oral clone AP009

<400> 1150

agagtttgat tatggctcag attgaacgct ggcggcatgc tttacacatg caagtcgaac

60

ggcagcgcgg gcttcggcct ggcggcgagt ggcgaacggg tgagtaatac atcggaacgt

120

gcccagtagt gggggatagc tcggcgaaag ccggattaat accgcatacg acctgagggt

180

gaaagcgggg gatcttcgga cctcgcgcta ttggagcggc cgatggcaga ttagctggtt

240

ggtggggtaa aggcctacca aggcgacgat ctgtagctgg tctgagagga cgaccagcca

300

cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga attttggaca

360

atgggcgcaa gcctgatcca gcaatgccgc gtgtgtgatg aaggccttcg ggttgtaaag

420

cacttttggc gggaacgaaa aggactgtgc caataccacg gttcgatgac ggtacccgca

480

gaataagcac cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggt gcgagcgtta

540

atcggaatta ctgggcgtaa agagtgcgca ggcggttttg caagaccgat gtgaaatccc

600

cgggcttaac ctgggaactg cattggtgac tgcaaggcta gagtgtgtca gagggaggtg

660

gaactccgca tgtagcagtg aaatgcgtag atatgcggaa gaacaccgat ggcgaaggca

720

gcctcctggg ataacactga cgctcatgca cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

780

accctggtag tccacgccct aaacgatgtc tactagttgt cggggattaa tttccttggt

840

aacgcagcta acgcgtgaag tagaccgcct ggggagtacg gtcgcaagat taaaactcaa

900

aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gatgatgtgg attaattcga tgcaacgcga

960

aaaaccttac ctacgcttga catgtccgga accttggaga gattcgaggg tgcccgaaag

1020

ggaaccggaa cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1080

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcatt agttgctacg caagggcact ctaatgagac

1140

tgccggtgac aaacckgagk aaggtgggga tgacgtcaag tcctcatggc ccttatgtgt

1200

agggcttcac acgtcataca atggtcggta cagagggttg ccaagccgcg aggtggagcc

1260

aatcccacaa aaccgatcgt agtccggatt gcagtctgca actcgactgc atgaagtcgg

1320

aatcgctagt aatcgcggwt cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccatggga gtgggtttta ccagaagtag gtagcttaac cgcaaggggg

1440

gcgcttacca cggtagggct catgactggg gtgaagtcgt aacaaggtaa c

1491

<210> 1151

<211> 1467

<212> DNA

<213> Legionella hackeliae

<220>

<221> modified_base

<222> (8)..(8)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (23)..(24)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (31)..(31)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (42)..(42)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (70)..(71)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (74)..(74)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (82)..(82)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (112)..(112)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (149)..(149)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (158)..(158)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (164)..(164)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (174)..(174)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (210)..(210)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (216)..(216)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (243)..(243)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (359)..(359)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (414)..(414)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (420)..(420)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (447)..(447)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (466)..(466)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (471)..(471)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (502)..(502)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (525)..(525)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (546)..(546)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (565)..(565)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (583)..(584)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (592)..(592)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (596)..(596)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (613)..(613)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (625)..(625)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (629)..(629)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (632)..(632)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (646)..(646)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (686)..(686)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (734)..(734)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (739)..(739)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (833)..(833)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (879)..(879)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (938)..(938)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (950)..(952)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (961)..(961)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (976)..(976)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (986)..(986)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1085)..(1085)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1110)..(1110)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1205)..(1205)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1268)..(1268)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1280)..(1280)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1288)..(1288)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1294)..(1294)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1344)..(1344)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1151

agagtttnat cctggctcag atnnaacgct ngcggcatgc tnaacacatg caagtcgaac

60

ggcagcatgn nctngctggc tnggaagatg gcgagtggcg aacgggtgag tnacgcgtag

120

gaatrtgcct taaagagggg gacaacctng ggaaactnag gctnataccg catnatttct

180

gaggaaaaaa gctggggacc gcaaggcctn gcgctnaaag attagcctgc gtccgattag

240

ctngttggtg gggtaagggc ctaccaaggc gacgatcggt agctggtctg agaggatgat

300

cagccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatnt

360

tggacaatgg ggggaaccct ratccagcaa tgccgcgtgt gtgaagaagg cctnagggtn

420

gtaaagcact ttcagtgggg aggaganrag gttaggttaa gagctngact naaggacgca

480

cccacagaag aagcaccggc tnactccgtg ccagcagccg cggtnatacg gagggtgcaa

540

gcgttnatcg gaattactgg gcgtnaaggg tgcgtaggtg gtnnaataag tnagtngtga

600

aatccctrgg ctnaacctgg gaatngcanc tnagactgtt agactngagt ataggagagg

660

gtagtggaat ttccggtgta gcggtnaaat gcgtagagat cggaaggaac accagtggcg

720

aaggcggcta cctngcctna tactgacact gaggcacgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgctgtaaac gatgtcaact agctrttggt ctnataaatg

840

agattagtgg cgcagcaaac gcgataagtt gaccgcctng ggagtacggt cgcaagatya

900

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtnga gcatgtggtn nnattcgatg

960

naacgcgaag aacctnacct accctngaca tacagtgaat gatgcagaga tgcatyagtg

1020

ccttcgggaa cactgataca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

1080

gggtnaagtc ccgtaacgag cgcaaccctn gtccttagtt gccagcgcgt agaggcggga

1140

actctaggga gactgccggt gacaaaccgg aggaaggcgg ggatgacgtc aagtcatcat

1200

rgccnttacg ggtagggcta cacacgtgct acaatggccg gtacagaggg aagcgaaggg

1260

gcgacctnga gcaaatcctn aaaagctngt cgtngtccgg attggagtct gcaactcgac

1320

tccatgaagt cggaatcgct agtnatcgcg aatcagcatg tcgcggtgaa tacgttcccg

1380

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaccagaag tagatagtct

1440

aaccttcggg gggacgtrta ccacggt

1467

<210> 1152

<211> 1473

<212> DNA

<213> Legionella longbeachae

<220>

<221> modified_base

<222> (13)..(14)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (29)..(30)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (37)..(37)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (48)..(48)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (84)..(84)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (88)..(88)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (92)..(92)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (137)..(137)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (164)..(164)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (170)..(170)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (177)..(177)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (216)..(216)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (222)..(222)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (236)..(236)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (249)..(249)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (365)..(365)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (420)..(420)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (464)..(464)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (471)..(471)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (478)..(479)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (508)..(508)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (552)..(552)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (571)..(571)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (590)..(590)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (598)..(598)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (619)..(619)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (740)..(740)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (745)..(745)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (765)..(765)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (846)..(846)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (885)..(885)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (906)..(906)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (944)..(944)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (956)..(958)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (982)..(982)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (992)..(992)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1091)..(1091)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1116)..(1116)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1211)..(1211)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1274)..(1274)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1300)..(1300)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1374)..(1374)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1152

aactgaagag ttnnatcctg gctcagatnn aacgctngcg gcatgctnaa cacatgcaag

60

tcgaacggca gcatgaccta gctngctngg tngatggcga gtgccgaacg ggtgagtaac

120

gcgtaggaat rtgcctnaaa gactgggata acttggggaa actnaagctn ataccgnatg

180

atgtctgagg acgaaagctg gggaccttcg ggcctngcgc tnaaagatta gcctgngtcc

240

gatyagctng ttggtggggt aagggcctac caaggcgacg atcggtagct ggtctgagag

300

gatgaccagc cacactggaa ctgagacacg gtccaggctc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaatnttgga caatgggggc aaccctratc cagcaatgcc gcgtgtgtga agaaggcctn

420

agggtygtaa agcactttca gtggggagga gggtygatag gtgnagagct natggatnng

480

acgttaccca cagaagaagc accggctnac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

540

gtgctagcgt tnatcggaat tactgggcgt naagcgtgcg taggtggttn attaagtnat

600

ctgtgaaatc cctrggctna acctgggcag gtcagatgat actggttgac tcgagtatgg

660

gagagggtag tggaatttcc ggtgtagcgg tgaaatgcgt agagatcgga aggaacacca

720

gtggcgaagg cggctacctn gcctnatact gacactgagg cacgnaagcg tggggagcaa

780

acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg tcaactagct rttggatata

840

tgaatntrtt tagtggcgca gcaaacgcga taagtwgacc gcctngggag tacggtcgca

900

agayynaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtngagcat gtggtnnnat

960

tcgatgcaac gcgaagaacc tnacctaccc tngacataca gtgaatgatg cagagatgca

1020

tyagtgcctt cgggaacact gatacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga

1080

gatgttgggt naagtcccgt aacgagcgca accctngtcc ttagttgcca gcacgtaaag

1140

gtgggaactc taaggagact gccggtgaca aaccggagga aggcggggat gacgtcaagt

1200

catcatrgcc nttacgggta gggctacaca cgtgctacaa tggacgatac agagggaagc

1260

gaaggggtga cctngagcca atcttagaaa gtygttcgtn gtccggattg gagtctgcaa

1320

ctcgactcca tgaagtcgga atcgctagta atcgcgaatc agcatgtcgc ggtnaatacg

1380

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggctgcac cagaagtaga

1440

tagtctaacc ttcgggggga cgtgtaccac ggt

1473

<210> 1153

<211> 1546

<212> DNA

<213> Legionella pneumophila

<400> 1153

tgaactgaag agtttgatcc tggctcagat tgaacgctgg cggcatgctt aacacatgca

60

agtcgaacgg cagcattgtc tagcttgcta gacagatggc gagtggcgaa cgggtgagta

120

acgcgtagga atatgccttg aagaggggga caacttgggg aaactcaagc taataccgca

180

taatgtctga ggacgaaagc tggggacctt cgggcctggc gctttaagat tagcctgcgt

240

ccgattagct agttggtggg gtaagggcct accaaggcga cgatcggtag ctggtctgag

300

aggatgacca gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg

360

gggaatattg gacaatgggg gcaaccctga tccagcaatg ccgcgtgtgt gaagaaggcc

420

tgagggttgt aaagcacttt cagtggggag gagggttgat aggttaagag ctgattaact

480

ggacgttacc cacagaagaa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga

540

gggtgcgagc gttaatcgga attactgggg gtaaagggtg cgtaggtggt tgattaagtt

600

atctgtgaaa ttcctgggct taacctggga cggtcagata atactggttg actcgagtat

660

gggagagggt agtggaattt ccggtgtagc ggtgaattgc gtagagatcg gaaggaacac

720

cagtggcgaa ggcggctacc tggcctaata ctgacactga ggcacgaaag cgtggggagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ctgtaaacga tgtcaactag ctgttggtta

840

tatgaaaata attagtggcg cagcaaacgc gataagttga ccgcctgggg agtacggtcg

900

caagattaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctac ccttgacata cagtgaattt tgcagagatg

1020

cattagtgcc ttcgggaaca ctgatacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gtaacgagcg caacccttat ccttagttgc cagcatgtga

1140

tggtggggac tctaaggaga ctgccggtga caaaccggag gaaggcgggg atgacgtcaa

1200

gtcatcatgg cccttacggg tagggctaca cacgtgctac aatggccgat acagagggcg

1260

gcgaaggggc gacctggagc aaatccttaa aagtcggtcg tagtccggat tggagtctgc

1320

aactcgactc catgaagtcg gaatcgctag taatcgcgaa tcagcatgtc gcggtgaata

1380

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggttgc accagaagta

1440

gatagtctaa ccttcggggg gacgtttacc acggtgtggt tcatgactgg ggtgaagtcg

1500

taacaaggta gccgtagggg aacctgcggc tggatcacct ccttac

1546

<210> 1154

<211> 1362

<212> DNA

<213> Legionella sp. D3923

<400> 1154

catgcttaac acatgcaagt cgaacggcag cacggtctag cttgctagat gggtggcgag

60

tggcgaacgg gtgagtaacg cgtaggaata tgccttaaag tttgggataa catggggaaa

120

ctcatgctaa taccggatga gctctgagga ggaaagctgg ggaccgtaag gcctggcgct

180

ttaagattag cctgcgtccg attagctagt tggtggggta agggcctacc aaggcgacga

240

tcggtagctg gtctgagagg atgaccagcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc

300

tacgggaggc agcagtgggg aatattggac aatgggggca accctgatcc agcaatgccg

360

cgtgtgtgaa gaaggcctga gggttgtaaa gcactttcag tggggaggag gattgattgg

420

ttaagagctg attgattgga cgttacccac agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc

480

agccgcggta atacggaggg tgcgagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagggtgcgt

540

aggtggttgt ataagttagc tgtgaaatcc ccgggctcaa cctgggcagg tcagctaaga

600

ctgtatgact cgagtatagg agagggtagt ggaatttccg gtgtagcggt gaaatgcgta

660

gagatcggaa ggaacaccag tggcgaaggc ggctacctgg cctaatactg acactgaggc

720

acgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt

780

caactagttg ttggccttat gaatgaggtt agtgacgcag caaacgcgat aagttgaccg

840

cctggggagt acggtcgcaa gattaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg

900

gtggagcatg tggtttaatt cgatgcaacg cgaagaacct tacctaccct tgacatacag

960

tgaactttgc agagatgcat tggtgccttc gggagcactg atacaggtgc tgcatggctg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgta acgagcgcaa cccttatcct

1080

tagttgccag cgcgtgatgg tgggaactct aaggagactg ccggtgacaa accggaggaa

1140

ggcggggatg acgtcaagtc atcatggccc ttacgggtag ggctacacac gtgctacaat

1200

ggccggtaca gagggcagcg aaggggcgac ctggagcaaa tcttgtaaag ctggtcgtag

1260

tccggattgg agtctgcaac tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcgaatca

1320

gcatgtcgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gc

1362

<210> 1155

<211> 1203

<212> DNA

<213> Legionella sp. D4088

<400> 1155

catgcttaac acatgcaagt cgaacgagtg gcgaacgggt gagtaatgcg taggaatatg

60

ccttgaagag ggggataacc cggggaaact cgggctaata ccgcataatg aaaggcgctt

120

taagattagc ctacgtccga ttagctagtt ggtggggtaa gggcctacca aggctgtgat

180

cggtagctgg tctgagagga tggacagcca cactgggact gagacacggc ccagactcct

240

acgggaggca gcagtgggga atattggaca atggggggaa ccctgatcca gcaatgccgc

300

gtgtgtgaag aaggcctgag ggttgtaaag cactatcggt ggggaggatg acgttaccca

360

cagaagaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg gtgcgagcgt

420

taatcggaat tactgggcgt aaagggtgcg taggtggttt tttaagttat ctgtgaaatt

480

cctgggctta acctgggctg gtcagataag actggaagac ttgagtatgg gagagggcag

540

tggaatttcc ggtgtagcgg tgaaatgcgt agagatcgga aggaacacca gtggcgaagg

600

cggctgcctg gcctgactga cactgaggca cgaaagcgtg ggtagcgaac aggattagat

660

accctggtag tccacgctgt aaacgatgtc aactagctgt tggctagtta gtggcgcagc

720

aaacgcgata agttgaccgc ctggggagta cggtcgcaag actaaaactc aaaggaattg

780

acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gatgcaacgc gaagaacctt

840

acctaccctt gacatataca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

900

gggttaagtc ccgtaacgag cgcaaccctt attcctagtt accagcacgt ggggactcta

960

gggagactgc cggtgacaaa ccggaggaag gcggggacga cgtcaagtca tcatggccct

1020

tacgggtagg gctacacacg tgctacaatg gacggcagag ggcggcgaag gggcgacctg

1080

gagcgaatcc ttactgttcg tagtccggat ggagtctgga actcgactcc agaagtcgga

1140

atcgctagta atcgcgaatc agcatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1200

cgc

1203

<210> 1156

<211> 1423

<212> DNA

<213> Legionella sp. H63

<400> 1156

aagtcgaacg gcagcatttt ctagcttgct aggaagatgg cgagtggcga acgggtgagt

60

aacgcgtagg aatatgcctt aaagaggggg ataacatggg gaaactcatg ctaataccgc

120

ataatttctt aggaaaaaag ctggggaccg taaggcctgg cgctttaaga ttagcctgcg

180

tccgattagc tagttggtgg ggtaagggcc taccaaggcg acgatcggta gctggtctga

240

gaggatggcc agccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

300

ggggaatatt ggacaatggg gggaaccctg atccagcaat gccgcgtgtg tgaagaaggc

360

ctgagggttg taaagcactt tcagtgggga ggagtgattg ataggttaag agctaattga

420

ttggacgtta cccacagaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

gagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaaggg tgcgtaggtg gtttggtaag

540

ttagttgtga aatccctggg cttaacctgg gaactgcaac taagactgtc agactcgagt

600

ataggagagg gtagtggaat ttccggtgta gcggtgaaat gcgtagagat cggaaggaac

660

accagtggcg aaggcggcta cctggcctaa tactgacact gaggcacgaa agcgtgggga

720

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgctgtaaac gatgtcaact agctgttggt

780

cttataaatg agattagtgg cgcagcaaac gcgataagtt gaccgcctgg ggagtacggt

840

cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

900

taattcgatg caacgcgaag aaccttacct acccttgaca tacagtgaac tttgcagaga

960

tgcattggtg ccttcgggag cactgataca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc

1020

gtgagatgtt gggttaagtc ccgtaacgag cgcaaccctt gtccttagtt gccagcatgt

1080

aatggtgggg actctaagga gactgccggt gacaaaccgg aggaaggcgg ggatgacgtc

1140

aagtcatcat ggcccttacg ggtagggcta cacacgtgct acaatggccg gtacagaggg

1200

cagcgaaggg gtgacctgga gcaaatcttt taaagctggt cgtagtccgg attggagtct

1260

gcaactcgac tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgcg aatcagcatg tcgcggtgaa

1320

tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaccagaag

1380

tagatagtct aacctttggg gggacgttta ccacggtgtg att

1423

<210> 1157

<211> 1508

<212> DNA

<213> Legionella sp. NML 93L054

<400> 1157

ggctcagatt gaacgctggc ggcatgctta acacatgcaa gtcgaacggc agcatggtcc

60

agcttgctgg actgatggcg agtggcgaac gggtgagtaa tgcgtaggaa tatgccttga

120

agagggggat aacccgggga aactcgggct aataccgcat aatctcttag gaggaaagct

180

ggggacctta tggcctggcg ctttaagatt agcctacgtc cgattagcta gttggtgggg

240

taagggccta ccaaggctgt gatcggtagc tggtctgaga ggatggacag ccacactggg

300

actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg acaatggggg

360

gaaccctgat ccagcaatgc cgcgtgtgtg aagaaggcct gagggttgta aagcactatc

420

ggtggggagg aagtttgatt ggttaagagc tgattggatt gacgttaccc acagaagaag

480

caccggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag ggtgcgagcg ttaatcggaa

540

ttactgggcg taaagggtgc gtaggtggtt ttttaagtta tctgtgaaat tcctgggctt

600

aacctgggct ggtcagataa gactggaaga cttgagtatg ggagagggca gtggaatttc

660

cggtgtagcg gtgaaatgcg tagagatcgg aaggaacacc agtggcgaag gcggctgcct

720

ggcctgatac tgacactgag gcacgaaagc gtgggtagcg aacaggatta gataccctgg

780

tagtccacgc tgtaaacgat gtcaactagc tgttggcttt atagataaag ttagtggcgc

840

agcaaacgcg ataagttgac cgcctgggga gtacggtcgc aagactaaaa ctcaaaggaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa cgcgaagaac

960

cttacctacc cttgacatac agtggagctt gcagagatgc gagtgtgcct ttgggaacac

1020

tgatacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg

1080

taacgagcgc aacccttatt cctagttacc agcacgtgat ggtggggact ctagggagac

1140

tgccggtgac aaaccggagg aaggcgggga cgacgtcaag tcatcatggc ccttacgggt

1200

agggctacac acgtgctaca atggacggta cagagggcgg cgaaggggcg acctggagcg

1260

aatccttaaa agctgttcgt agtccggatt ggagtctgga actcgactcc atgaagtcgg

1320

aatcgctagt aatcgcgaat cagcatgtcg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccatggga gtgggctgca ccagaagtag atagtctaac cttcgggggg

1440

acgtttacca cggtgtggtt catgactggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtagggga

1500

acctgcgg

1508

<210> 1158

<211> 1362

<212> DNA

<213> Legionella steelei

<400> 1158

catgcttaac acatgcaagt cgaacggcag catgatctag cttgctagat tgatggcgag

60

tggcgaacgg gtgagtaacg cgtaggaata tgccttgaag tgggggacaa cttggggaaa

120

ctcaagctaa taccgcataa tgtctaagga cgaaagctgg ggaccttagg gcctggcgct

180

ttaagattag cctgcgtccg attagctagt tggtggggta agggcctacc aaggcgacga

240

tcggtagctg gtctgagagg atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc

300

tacgggaggc agcagtgggg aatattggac aatgggggca accctgatcc agcaatgccg

360

cgtgtgtgaa gaaggcctga gggttgtaaa gcactttcag tagggaggag gattgctagg

420

ttaagagcta agtgattgga cgttacctac agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc

480

agccgcggta atacggaggg tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgtgcgt

540

aggtggttaa ttaagttatc tgtgaaatcc ctgggcttaa cctgggcagg tcagatgata

600

ctggttgact cgagtatggg agagggtagt ggaatttccg gtgtagcggt gaaatgcgta

660

gagatcggaa ggaacaccag tggcgaaggc ggctacctgg cctaatactg acactgaggc

720

acgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatgt

780

caactagctg ttggttatat gaaaataatt agtggcgcag caaacgcgat aagttgaccg

840

cctggggagt acggtcgcaa gattaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg

900

gtggagcatg tggtttaatt cgatgcaacg cgaagaacct tacctaccct tgacatacag

960

tgaattttgc agagatgcat tagtgccttc gggaacactg atacaggtgc tgcatggctg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgta acgagcgcaa cccttgtcct

1080

tagttgccag cacgtaatgg tgggaactct aaggagactg ccggtgacaa accggaggaa

1140

ggcggggacg acgtcaagtc atcatggccc ttacgggtag ggctacacac gtgctacaat

1200

gggtgataca gagggaagcg aaggggtgac ctggagctaa tcttagaaag tcgctcgtag

1260

tccggattgg agtctgcaac tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcgaatca

1320

gcatgtcgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gc

1362

<210> 1159

<211> 1482

<212> DNA

<213> Leminorella grimontii

<400> 1159

ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac ggcagcggga agtagcttgc tactttgccg

60

gcgagtggcg gacgggtgag taatgtctgg gaaactgccc gatggagggg gataactact

120

ggaaacggta gctaataccg catgacgtct tcggaccaaa gagggggacc ttagggcctc

180

ttgccatcgg atgtgcccag atgggattag ctagtaggcg gggtaatggc ccacctaggc

240

gacgatccct agctggtctg agaggatgac cagccacact gggactgaga cacggcccag

300

actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcca

360

tgccgcgtgt gtgaagaagg ccttcgggtt gtaaagcact ttcagcgagg aggaaggggt

420

tgtatttaat acatgcaatc attgacgtta ctcgcagaag aagcaccggc taactccgtg

480

ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg

540

cacgcaggcg gttgattaag ttagatgtga aatccccggg cttaacctgg gaactgcatt

600

taaaactggt cagctagagt cttgtagagg ggggtagaat tccacgtgta gcggtgaaat

660

gcgtagagat gtggaggaat accggtggcg aaggcggccc cctggacaaa gactgacgct

720

caggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgctgtaaac

780

gatgtcgatt tggaggttgt gcccttgagg cgtggcttcc ggagctaacg cgttaaatcg

840

accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca

900

agcggtggag catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat

960

ccagagaact tagcagagat gctttggtgc cttcgggaac tctgagacag gtgctgcatg

1020

gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta

1080

tcctttgttg ccagcggttc ggccgggaac tcaaaggaga ctgccagtga taaactggag

1140

gaaggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgg cccttacgag tagggctaca cacgtgctac

1200

aatggcgtat acaaagagaa gcgacctcgc gagagcaagc ggacctcata aagtacgtcg

1260

tagtccggat tggagtctgc aactcgactc catgaagtcg gaatcgctag taatcgcgga

1320

tcagaatgcc gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg

1380

agtgggttgc aaaagaagta ggtagcttaa ccttcggggg ggcgcttacc actttgtgat

1440

ccatgactgg ggtgaagtcg taacaaggta accgtagggg aa

1482

<210> 1160

<211> 1516

<212> DNA

<213> Leminorella richardii

<400> 1160

attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac ggtagcagga agaagcttgc

60

ttctttgctg acgagtggcg gacgggtgag taatgtctgg gaaactgccc gatggagggg

120

gataactact ggaaacggta gctaataccg cataacgtct tcggaccaaa gtgggggacc

180

ttcgggcctc acaccatcgg atgtgcccag atgggattag ctagtaggcg gggtaatggc

240

ccaccctagg cgacgatccc tagctggtct gagaggatga ccagccacac tgggactgag

300

acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggcgcaagcc

360

tgatgcagcc atgccgcgtg tgtgaagaag gccttcgggt tgtaaagcac tttcagcgag

420

gaggaagggt gtggagttaa taacttcatg cattgacgtt actcgcagaa gaagcaccgg

480

ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgca agcgttaatc ggaattactg

540

ggcgtaaagc gcacgcaggc ggttgattaa gtcagatgtg aaatccccgg gctcaacctg

600

ggaactgcat ttgaaactgg tcagctagag tcttgtagag gggggtagaa ttccacgtgt

660

agcggtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa taccggtggc gaaggcggcc ccctggacaa

720

agactgacgc tcaggtgcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

acgctgtaaa cgatgtcgac ttggaggttg ttcccttgag gagtggcttc cggagctaac

840

gcgttaagtc gaccgcctgg ggagtacggc cgcaaggtta aaactcaaat gaattgacgg

900

gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg caacgcgaag aaccttacct

960

actcttgaca tccagagaag tttgcagaga tgcgaatgtg ccttcgggaa ctctgagaca

1020

ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtt gtgaaatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1080

cgcaaccctt atcctttgtt gccagcggtt cggccgggaa ctcaaaggag actgccagtg

1140

ataaactgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg gcccttacga gtagggctac

1200

acacgtgcta caatggcgta tacaaagaga agcgacctcg cgagagcaag cggacctcac

1260

aaagtacgtc gtagtccgga ttggagtctg caactcgact ccatgaagtc ggaatcgcta

1320

gtaatcgcgg atcagaatgc cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

cacaccatgg gagtgggatg caaaagaagt aggtagctta accttcgggg gggcgcttac

1440

cactttgtgt ttcatgactg gggtgaagtc gtaacaaggt aaccgtaggg gaacctgcgg

1500

ttggatcacc tcctta

1516

<210> 1161

<211> 1511

<212> DNA

<213> Leptospira borgpetersenii

<400> 1161

aacacggaga gtttgatcct ggctcagaac taacgctggc ggcgcgtctt aaacatgcaa

60

gtcaagcgga gtagcaatac tcagcggcga acgggtgagt aacacgtggg taatcttcct

120

ccgagtctgg gataactttc cgaaagggga gctaatactg gatagtcccg agaggtcata

180

ggatttttcg ggtaaagatt tattgctcgg agatgagccc gcgcccgatt agctagttgg

240

tgaggtaatg gctcaccaag gcgacgatcg gtagccggcc tgagagggtg ttcggccaca

300

atggaactga gacacggtcc atactcctac gggaggcagc agttaagaat cttgctcaat

360

ggggggaacc ctgaaagcag cgacgccgcg tgaacgatga aaggtcttcg gattgtaaag

420

ttcaataagc agggaaaaat aagcagcgat gtgatgatgg tacctgccta aagcaccggc

480

taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tatggtgcaa gcgttgttcg gaatcattgg

540

gcgtaaaggg tgcgtaggcg gacatgtaag tcaggtgtga aaactgcggg ctcaactcgc

600

agcctgcact tgaaactatg tgtctggagt ttgggagagg caagtggaat tccaggtgta

660

gcggtgaaat gcgtagatat ctggaggaac accagtggcg aaggcgactt gctggcctaa

720

aactgacgct gaggcacgaa agcgtgggta gtgaacggga ttagataccc cggtaatcca

780

cgccctaaac gttgtctacc agttgttggg ggttttaacc ctcagtaacg aacctaacgg

840

attaagtaga ccgcctgggg actatgctcg caagagtgaa actcaaagga attgacgggg

900

gtccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgat acgcgaaaaa cctcacctag

960

gcttgacatg gagtggaatc atgtagagat acatgagcct tcgggccgct tcacaggtgc

1020

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

1080

ccctcacctt atgttgccat cattcagttg ggcactcgta aggaactgcc ggtgacaaac

1140

cggaggaagg cggggatgac gtcaaatcct catggccttt atgtctaggg caacacacgt

1200

gctacaatgg ccggtacaaa gagtagccaa ctcgcgaggg ggagctaatc tcaaaaagcc

1260

ggtcccagtt cggattggag tctgcaactc gactccatga agtcggaatc gctagtaatc

1320

gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc ccggaccttg tacacaccgc ccgtcacacc

1380

acctgagtgg ggagcacccg aagtggtctt tgccaaccgc aaggaagcag actactaagg

1440

tgaaactcgt gaagggggtg aagtcgtaac aaggtagccg tatcggaagg tgcggctgga

1500

tcacctcctt t

1511

<210> 1162

<211> 1293

<212> DNA

<213> Leptospira broomii

<400> 1162

aactaacgct ggcggcgcgt cttaaacatg caagtcgagc gagcggcgaa cgggtgagta

60

acacgtgggt aatcttcctc cgagtctggg ataactttcc gaaaggaaag ctaataccgg

120

atagttaaag ttgcttggag atgagcccgc ggccgattag ctagttggtg aggtaatggc

180

tcaccaaggc gacgatcggt agccggcctg agagggtgtc cggccacaat ggaactgaga

240

cacggtccat actcctacgg gaggcagcag ttaagaatct tgctcaatgg gggaaaccct

300

gaagcagcga cgccgcgtga acgaagaagg tcttcggatt gtaaagttca ttaagcaggg

360

aaaatgatgg tacctgccta aagcaccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

420

tatggtgcaa gcgttgttcg gaatcattgg gcgtaaaggg tgcgtaggcg gatttgtaag

480

tcaggtgtga aaactgcggg ctcaacccgt ggcctgcact tgaaactaca agtctggagt

540

ttgggagagg caagtggaat tccaggtgta gcggtgaaat gcgtagatat ctggaggaac

600

accagtggcg aaggcgactt gctggctcaa ctgacgctga ggcacgaaag cgtgggtagt

660

aaacgggatt agataccccg gtaatccacg ccctaaacgt tgtctaccag ttgttggggc

720

ctcagtaacg aacctaacgg attaagtaga ccgcctgggg actatgctcg caagagtgaa

780

actcaaagga attgacgggg gtccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgat

840

acgcgaaaaa cctcacctgg gcttgacatg cacaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg

900

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctatcgta tgttgctacc

960

atgggcactc gtacgaaact gccggtgaca aaccggagga aggcggggat gacgtcaaat

1020

cctcatggcc tttatgtcca gggccacaca cgtgctacaa tggccgacag agggtcgcca

1080

actcgcaaga gggagctaat ctctatcggt cccagttcgg atggggtctg caactcgacc

1140

ccagaagtcg gaatcgctag taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaata cgttcccgga

1200

ccttgtacac accgcccgtc acaccacctg agtggggagc acccgaagtg gtttgttaga

1260

cagactacta aggtgaaact cgtaaagggg gtg

1293

<210> 1163

<211> 1508

<212> DNA

<213> Leptospira interrogans

<400> 1163

aacacggaga gtttgatcct ggctcagaac taacgctggc ggcgcgtctt aaacatgcaa

60

gtcaagcgga gtagcaatac tcagcggcga acgggtgagt aacacgtggg taatcttcct

120

ctgagtctgg gataactttc cgaaagggaa gctaatactg gatggtcccg agagatcata

180

agatttttcg ggtaaagatt tattgctcgg agatgagccc gcgtccgatt agctagttgg

240

tgaggtaaag gctcaccaag gcgacgatcg gtagccggcc tgagagggtg ttcggccaca

300

atggaatgag acacggtcca tactcctacg ggaggcagca gttaagaatc ttgctcaatg

360

gggggaaccc tgaagcagcg acgccgcgtg aacgatgaag gtcttcggat tgtaaagttc

420

agtaagcagg gaaaaataag cagcaatgtg atgatggtac ctgcctaaag caccggctaa

480

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtat ggtgcaagcg ttgttcggaa tcattgggcg

540

taaagggtgc gtaggcggac atgtaagtca ggtgtgaaaa ctgcgggctc aactcgcagc

600

ctgcacttga aactatgtgt ctggagtttg ggagaggcaa gtggaattcc aggtgtagcg

660

gtgaaatgcg tagatatctg gaggaacacc agtggcgaag gcgacttgct ggcctaaaac

720

tgacgctgag gcacgaaagc gtgggtagtg aacgggatta gataccccgg taatccacgc

780

cctaaacgtt gtctaccagt tgttgggggt tttaaccctc agtaacgaac ctaacggatt

840

aagtagaccg cctggggact atgctcgcaa gagtgaaact caaaggaatt gacgggggtc

900

cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgatgatacg cgaaaaacct cacctaggct

960

tgacatggag tggaatcatg tagagataca tgagccttcg ggccgcttca caggtgctgc

1020

atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1080

tcaccttatg ttgccatcat tcagttgggc actcgtaagg aactgccggt gacaaaccgg

1140

aggaaggcgg ggatgacgtc aaatcctcat ggcctttatg tctagggcaa cacacgtgct

1200

acaatggccg gtacaaaggg tagccaactc gcgaggggga gctaatctca aaaatccggt

1260

cccagttcgg attggagtct gcaactcgac tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgcg

1320

gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg gaccttgtac acaccgcccg tcacaccacc

1380

tgagtgggga gcacccgaag tggtctttgc caaccgcaag gaagcagact actaaggtga

1440

aactcgtgaa gggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtat cggaaggtgc ggctggatca

1500

cctccttt

1508

<210> 1164

<211> 1348

<212> DNA

<213> Leptospira licerasiae

<400> 1164

caagtcgagc ggagtagcaa tacttagcgg cgaacgggtg agtaacacgt gggtaatctt

60

cctccgaatc tgggataact ttccgaaagg aaagctaata ccggatagtt ctattggatc

120

acaggatttg atagataaag gtttactgtt cggagatgag cccgcggccg attagctagt

180

tggtgaggta atggctcacc aaggcgacga tcggtagccg gcctgagagg gtgtccggcc

240

acaatggaac tgagacacgg tccatactcc tacgggaggc agcagttaag aatcttgctc

300

aatgggcgca agcctgaagc agcgacgccg cgtgaacgaa gaaggtcttc ggattgtaaa

360

gttcagtaag cagggaaaaa taagcagcaa tgtgatgatg gtacctgcct aaagcaccgg

420

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtatggtgca agcgttgttc ggaatcattg

480

ggcgtaaagg gtgcgtaggc ggacatgtaa gtcaggtgtg aaaactgggg gctcaaccct

540

cagcctgcac ttgaaactat gtgtctggag tttgggagag gcaagtggaa ttccaggtgt

600

agcggtgaaa tgcgtagata tctggaggaa caccagtggc gaaggcgact tgctggctca

660

aaactgacgc tgaggcacga aagcgtgggt agtaaacggg attagatacc ccggtaatcc

720

acgccctaaa cgttgtctac cagttgttgg gggttttaac cctcagtaac gaacctaacg

780

gattaagtag accgcctggg gactatgctc gcaagagtga aactcaaagg aattgacggg

840

ggtccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatga tacgcgaaaa acctcacctg

900

ggcttgacat ggagtggaat catatagaga tatatgagcc ttcgggccgc ttcacaggtg

960

ctgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

1020

acccctatcg tatgttgcta ccatttagtt gggcactcgt acgaaactgc cggtgacaaa

1080

ccggaggaag gcggggatga cgtcaaatcc tcatggcctt tatgtccagg gccacacacg

1140

tgctacaatg gccgatacag agggttgcca actcgcaaga gggagctaat ctctaaaagt

1200

cggtcccagt tcggattgga gtctgcaact cgactccatg aagtcggaat cgctagtaat

1260

cgcggatcag catgccgcgg tgaatacgtt cccggacctt gtacacaccg cccgtcacac

1320

cacctgagtg gggagcaccc gaagtggt

1348

<210> 1165

<211> 1510

<212> DNA

<213> Leptotrichia buccalis

<400> 1165

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct gacagaatgc ttaacacatg caagtctttg

60

gcgaatctgt gcttgcacag gctagccaag gcggacgggt gagtaacgcg taaagaactt

120

accctgcaga cagggataac agacggaaac gactgataat acctgataca attgccagca

180

cgcatgtgcc cggcaatgaa aagtgatgct gcaggagagc tttgcgtcct attagcttgt

240

tggtgaggta atggctcacc aaggcgatga taggtagccg gcctgagagg gtgaacggcc

300

acaaggggac tgagatacgg cccttactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattggac

360

aatgggggca accctgatcc agcaattctg tgtgcatgaa gaaggttttc ggattgtaaa

420

gtgctttcag cagggaagaa gaaagtgacg gtacctgcag aagaagcgac ggctaaatac

480

gtgccagcag ccgcggtaat acgtatgtcg caagcgttat ccggaattat tgggcataaa

540

gggcatctag gcggccagac aagtctgggg tgaaaacttg cggctcaacc gcaagcctgc

600

cctggaaact gtttggctag agtgctggag aggtggacgg aactgcacga gtagaggtga

660

aattcgtaga tatgtgcagg aatgccgatg atgaagatag ttcactggac ggtaactgac

720

gctgaagtgc gaaagctggg ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt cccagccgta

780

aacgatgatt actgggtgtg ggcatgaaga gtgtccgtgc cgaagctaat gcgataagta

840

atccgcctgg ggagtacggc cgcaaggctg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac

900

aagcggtgga gcatgtggtt taattcgacg caacgcgagg aaccttacca gatcttgaca

960

tcctacgaat gcctgtgaga acaggcagtg ccttcgggaa cgtagagaca ggtggtgcat

1020

ggctgtcgac agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct

1080

atcgctagtt gccatcatta agttggggac tctagcgaga ctgcctgcga agagcaggag

1140

gaaggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgc cccttatgat ctgggctaca cacgtgctac

1200

aatggccggt acaaagagct gcaaaacggt aacgtttagc caatctttaa agccggtcca

1260

agttcggatt gaagtctgca actcgacttc atgaagccgg aatcgctagt aatcgcagat

1320

cagcaatgct gcggtgaata cgttctcggg tcttgtacac accgcccgtc acaccacgag

1380

agttgtttgc acctgaagcc gccggtccaa ccgtaaggag gaaggcgtct aaggtgtgga

1440

tagtgattgg ggtgaagtcg taacaaggta tccgtaccgg aaggtgcgga tggatcacct

1500

cctttctaag

1510

<210> 1166

<211> 1294

<212> DNA

<213> Leptotrichia genomosp. C1

<400> 1166

gatgaacgct gacagaatgc ttaacacatg caagtctggc gagcggcgga cgggtgagta

60

acgcgtaagg aacttgccct gcagtcaggg ataacagacg gaaacgactg ataagacctg

120

gtaaagaaaa tgctgcagga gagccttgcg tcctattagc ttgttggtgg ggtaacggcc

180

caccaaggca atgataggta gccggcctga gagggtggac ggccacaagg ggactgagat

240

acggccctta ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg ggcaaccctg

300

atccagcaat tctgtgtgca cgatgaaggt tttcggattg taaagtgctt tcagcaggga

360

agatgacggt acctgcagaa gaagcgacgg ctaaatacgt gccagcagcc gcggtaatac

420

gtatgtcgca agcgttatcc ggaattattg ggcataaagg gcatctaggc ggccagataa

480

gtctggggtg aaaacttgcg gctcaaccgc aagcctgccc tggaaactat gtggctagag

540

tactggagag gtggacggaa ctgcacgagt agaggtgaaa ttcgtagata tgtgcaggaa

600

tgccgatggt gaagatagtt cactggacgg actgacgctg aagtgcgaaa gctaggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccta gctgtaaacg atgattactg ggtgtgggca

720

tgtccgtgcc gaagctaatg cgataagtaa tccgcctggg gagtacggcc gcaaggctga

780

aactcaaagg aatagacggg gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgacgc

840

aacgcgagga accttaccag atcttgacat cgacaggtgg tgcatggctg tcgacagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctattgc tagttgccat

960

catgggaact ctagcaagac tgcctgcgaa gagcaggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1020

tcatcatgcc ccttatgatc tgggctacac acgtgctaca atggccggca gagagccgca

1080

aggcggcaac gccaagccaa tctttccggt ccaagttcgg atgaagtctg caactcgact

1140

tcagaagctg gaatcgctag taatcgcaga tcagcaatgc tgcggtgaat acgttctcgg

1200

gtcttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagttgtctg cacctgaagc tgccgtccag

1260

gaaagcatct aaggtgtgga tagtgattgg ggtg

1294

<210> 1167

<211> 1515

<212> DNA

<213> Leptotrichia goodfellowii

<400> 1167

ttgaatgaag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctga cagaatgctt aacacatgca

60

agtcgatggg gaagaattaa cttgttaatt tggtaaccat ggcggacggg tgagtaacgc

120

gtaaagaact tacctttcag actgggataa cagagggaaa cttctgataa gaccggatat

180

aattaattga ttgcatgaga gattaatgaa aagagatgct gaaagagagc tttgcgtcct

240

attagctagt tggtaaggta acggcttacc aaggcgatga taggtagccg gcctgagagg

300

gtggacggcc acaaggggac tgagatacgg cccttactct tacgggaggc agcagtgggg

360

aatattggac aatggaggag actctgatcc agcaattctg tgtgcacgaa gaaggttttc

420

ggattgtaaa gtgctttcag tggggaagaa ggaagtgacg gtacccacag aagaagcgac

480

ggctaaatac gtgccagcag ccgcggtaat acgtatgtcg cgagcgttat ccggaattat

540

tgggcataaa gggcatctag gcggacgatc aagtcagggg tgaaaacttg cggctcaact

600

gtaagcttgc ctttgaaact gattgtctag agtattggaa aggtgggcgg aactacacga

660

gtagaggtga aattcgtaga tatgtgtagg aatgccgatg atgaagatag ctcactggac

720

gataactgac gctgaagtgc gaaagctagg ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt

780

cctagctgta aacgatgatc actgggtgtg ggcaggaaga ctgtctgtgc cgaagcaaat

840

gcgataagtg atccgcctgg ggagtacgac cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg

900

ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgacg caacgcgagg aaccttacca

960

gatcttgaca tcctacgaac atgtatgagg atacatggtg ccttcgggaa cgtagagaca

1020

ggtggtgcat ggctgtcgac agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1080

cgcaaccctt atcgttagtt accatcatta agttggggac tctagcgaga ctgcctgcga

1140

agagcaggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgc cccttatgat ctgggctaca

1200

cacgtgctac aatgggcagt acagagagga gcgagatagt gatatggagc gaatcttgaa

1260

agctgttcta agttcggatt gaagtctgca actcgacttc atgaagttgg aatcgctagt

1320

aatcgcaaat cagcaatgtt gcggtgaata cgttctcggg tcttgtacac accgcccgtc

1380

acaccacgag agttgtttgc acctgaagtt actggtctaa cttaggagga aggtacctaa

1440

ggtgtgaata gtgattgggg tgaagtcgta acaaggtatc cgtaccggaa ggtgcggatg

1500

gatcacctcc tttct

1515

<210> 1168

<211> 1507

<212> DNA

<213> Leptotrichia hofstadii

<400> 1168

tgaagagttt gatcctggct caggatgaac gctgacagaa tgcttaacac atgcaagtct

60

ttggcgaatc tgtgcttgca caggctagcc aaggcggacg ggtgagtaac gcgtaaagaa

120

cttgccctgc agacagggat aacagacgga aacgactgac aacacctgat acagttgccg

180

gcacgcatgt gcctggcaat gaaaagagat gctgcgggag agctttgcgt cctattagct

240

tgttggcggg gtaacggccc accaaggcga tgataggtag ccggcctgag agggtgaacg

300

gccacaaggg gactgagata cggcccttac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

360

gacaatgggg gcaaccctga tccagcaatt ctgtgtgcac gatgaaggtt ttcggattgt

420

aaagtgcttt cagcagggaa gaaggaagtg acggtacctg cagaagaagc gacggctaaa

480

tacgtgccag cagccgcggt aatacgtatg tcgcaagcgt tatccggaat tattgggcat

540

aaagggcatc taggcggcca ggcaagtctg gggtgaaaac ttgcggctca accgcaagcc

600

tgccctggaa actgcctggc tagagtgctg gagaggtgga cggaactgca cgagtagagg

660

tgaaattcgt agatatgtgc aggaatgccg atgatgaaga tagttcactg gacggcaact

720

gacgctgaag tgcgaaagct gggggagcga acaggattag ataccctggt agtcccagcc

780

gtaaacgatg attactgggt gtgggcatga agagtgtccg tgccgaagca aatgcgataa

840

gtaatccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctgaaactca aaggaattga cggggacccg

900

cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg acgcaacgcg aggaacctta ccagatcttg

960

acatcccacg tatgcctgcg agagcgggca gtgccttcgg gaacgtggag acaggtggtg

1020

catggctgtc gacagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

1080

cctatcgcca gttgccatca ttaagttggg gactctggcg agactgcctg cgaagagcag

1140

gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tgccccttat gatctgggct acacacgtgc

1200

tacaatggcc ggtacagaga gctgcgaagc ggcaacgccc agcgaatctt caaagccggt

1260

ccaagttcgg attgaagtct gcaactcgac ttcatgaagc tggaatcgct agtaatcgca

1320

gatcagcaat gctgcggtga atacgttctc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccac

1380

gagagttgtc tgcacctgaa gctgccggtc taaccgcaag gaggaaggca tctaaggtgt

1440

ggacagtgat tggggtgaag tcgtaacaag gtatccgtac cggaaggtgc ggatggatca

1500

cctcctt

1507

<210> 1169

<211> 1485

<212> DNA

<213> Leptotrichia shahii

<400> 1169

gagtttgaty ctggctcagg atgaacgctg acagaatgct taacacatgc aagtctttgg

60

cgaagctgcg cttgcgcaga cgagccaagg cggacgggtg agtaacgcgt aaggaacttg

120

ccctgcagac agggataaca gacggaaacg actgacaaga cctgatacag ttgccggcac

180

gcatgtgcct ggcgatgaaa ggagacgctg caggagagcc ttgcgtccta ttagcttgtt

240

ggcggggtaa tggcccacca aggcgatgat aggtagccgg cctgagaggg tggacggcca

300

caaggggact gagatacggc ccttactcct acgggaggca gcagtgggga atattggaca

360

atgggggcaa ccctgatcca gcaattctgt gtgcacgaag aaggttttcg gattgtaaag

420

tgctttcagc agggaagaag aaagtgacgg tacctgcaga agaagcgacg gctaaatacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtatgtcgc gagcgttatc cggaattatt gggcataaag

540

ggcatctagg cggccctgta agtctagggt gaaaacctgc ggctcaaccg caggcctgcc

600

ccggaaacta cagggctaga gtgctggaga ggtggacgga actgcacgag tagaggtgaa

660

attcgtagat atgtgcagga atgccgatga tgaagatagt tcactggacg gcaactgacg

720

ctgaagtgcg aaagctaggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc ctagctgtaa

780

acgatgatta ctgggtgtgg gcatgaagag tgtccgtgcc gaagctaatg cgataagtaa

840

tccgcctggg gagtacggcc gcaaggctga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca

900

agcggtggag catgtggttt aattcgacgc aacgcgagga accttaccag atcttgacat

960

cctgcgaagg cctgcgagag caggccgtgc cttcgggaac gcagagacag gtggtgcatg

1020

gctgtcgaca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccccta

1080

tcgctagttg ccatcattag gttggggact ctagcgagac tgcctgcgaa gagcaggagg

1140

aaggcgggga tgacgtcaag tcatcatgcc ccttatgatc tgggctacac acgtgctaca

1200

atggccggta caaagagctg ccaggcggca acgccaagcg aatctttaaa gccggtccaa

1260

gttcggattg aagcctgcaa ctcggcttca tgaagctgga atcgctagta atcgcagatc

1320

agcaatgctg cggtgaatac gttctcgggt cttgtacaca ccgccgtcac accacgagag

1380

ttgtctgcac ctgaagccgc cggtccaacc gaaaggagga aggcgtctaa ggtgtggaca

1440

gtgattgggg tgaagtcgta acaaggtatc cgtaccggaa ggtgc

1485

<210> 1170

<211> 1506

<212> DNA

<213> Leptotrichia sp. neutropenicPatient

<400> 1170

tggagagttt gatcctggct caggatgaac gctgacagaa tgcttaacac atgcaagtca

60

ttggcgaagc tgcgcttgcg cagtctagcc aaggcggacg ggtgagtaac gcgtaaggaa

120

cttgccctgc agacagggat aacagacgga aacgactgat aacacctggt attgtcaggc

180

tggcgcatgc cggcctgatg aaaggagacg ctgcaggaga gccttgcgtc ctattagcta

240

gttggtgggg taacggccca ccaaggcgat gataggtagc cggcctgaga gggtgaacgg

300

ccacaagggg actgagatac ggcccttact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg

360

acaatggggg caaccctgat ccagcaattc tgtgtgcacg aagaaggttt tcggattgta

420

aagtgctttc agcagggaag aagaaagtga cggtacctgc agaagaagcg acggctaaat

480

acgtgccagc agccgcggta atacgtatgt cgcaagcgtt atccggaatt attgggcata

540

aagggcatct aggccgccct gtaagtctag ggtgaaaacc tgcggctcaa ccgcaggcct

600

gccccggaaa ctacagggct agagtatcgg agaggtggac ggaactgcac gagtagaggt

660

gaaattcgta gatatgtgca ggaatgccga tgatgaagat agttcactgg acggtaactg

720

acgctgaagt gcgaaagcta ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtcctagctg

780

taaacgatga ttactgggtg tgggcatgaa gagtgtccgt gccgaagcaa atgcgataag

840

taatccgcct ggggagtacg gccgcaaggc tgaaactcaa aggaattgac ggggacccgc

900

acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga cgcaacgcga ggaaccttac cagatcttga

960

catcctgcga atgcccgtga gaacgggcag tgccttcggg aacgcagaga caggtggtgc

1020

atggctgtcg acagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1080

ctatcgttag ttgccatcat taagttgggg actctagcga gactgcctgc gaagagcagg

1140

aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat gccccttatg atctgggcta cacacgtgct

1200

acaatggccg gtacagagag cagccaggcg gcaacgccga gcgaatcttt aaagccggtc

1260

caagttcgga ttgaagcctg caactcggct tcatgaagct ggaatcgcta gtaatcgcag

1320

atcagcaatg ctgcggtgaa tacgttctcg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg

1380

agagttgtct gcacctgaag ctgctggtcc aaccgcaagg aggaaggcat ctaaggtgtg

1440

gatagtgatt ggggtgaagt cgtaacaagg tatccgtacc ggaaggtgcg gytggatcac

1500

ctcctt

1506

<210> 1171

<211> 1363

<212> DNA

<213> Leptotrichia sp. oral clone GT018

<400> 1171

gagtttgatt ctggctcagg atgaacgctg acagaatgct taacacatgc aagtctggcg

60

agcggcggac gggtgagtaa cgcgtaagga acttgccctg cagtcaggga taacagacgg

120

aaacgactga taagacctgg taaagaaaat gctgcaggag agccttgcgt cctattagct

180

tgttggtggg gtaacggccc accaaggcga tgataggtag ccggcctgag agggtggacg

240

gccacaaggg gactgagata cggcccttac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

300

gacaatgggg gcaaccctga tccagcaatt ctgtgtgcac gatgaaggtt ttcggattgt

360

aaagtgcttt cagcagggaa gatgacggta cctgcagaag aagcgacggc taactacgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg tatgtcgcaa gcgttatccg gaattattgg gcataaaggg

480

catctaggcg gccagataag tctggggtga aaacttgcgg ctcaaccgca agcctgccct

540

ggaaactatg tggctagagt actggagagg tggacggaac tgcacgagta gaggtgaaat

600

tcgtagatat gtgcaggaat gccgatgatg aagatagttc actggacgga ctgacgctga

660

agtgcgaaag ctaggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtcctag ctgtaaacga

720

tgattactgg gtgtgggcat gtccgtgccg aagctaatgc gataagtaat ccgcctgggg

780

agtacggccg caaggctgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggagc

840

atgtggttta attcgacgca acgcgaggaa ccttaccaga tcttgacatc gacaggtggt

900

gcatggctgt cgacagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccctattgct agttgccatc atgggaactc tagcaagact gcctgcgaag agcaggagga

1020

aggtggggat gacgtcaagt catcatgccc cttatgatct gggctacaca cgtgctacaa

1080

tggctggcag agagatgcga cgcagcaatg ccaagccaac ctctccagtc caagttcgga

1140

tgaagcctgc aactcggctt cagaagttgg aatcgctagt aatcgcggat cagcaatgcc

1200

gcggtgaata cgttctcggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacgag agttgtctgc

1260

acctgaagct gccgtctaag aaggcatcta aggtgtggac agtgattggg gtgaagtcgt

1320

aacaaggtat ccgtaccgga aggtgcggct ggatcacctc ctt

1363

<210> 1172

<211> 1362

<212> DNA

<213> Leptotrichia sp. oral clone GT020

<400> 1172

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg acagaatgct taacacatgc aagtctttgc

60

aaggcggacg ggtgagtaac gcgtaaagaa cttgccctgc agtctgggat aacagacgga

120

aacgactgat aaaacctgat atagaaaatg ctgcaggaga gctttgcgtc ctattagctt

180

gttggtgggg taatggccca ccaaggcaat gataggtagc cggcctgaga gggtgaccgg

240

ccacaagggg actgagatac ggcccttact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg

300

acaatggggg caaccctgat ccagcaattc tgtgtgcacg aagaaggttt tcggattgta

360

aagtgctttc agcagggaag atgactgtac ctgcagaaga agcgacggct aaatacgtgc

420

cagcagccgc ggtaatacgt atgtcgcaag cgttatccgg aattattggg cataaagggc

480

atctaggcgg ccagataagt ctggggtgaa aacttgcggc tcaaccgcaa gcctgccctg

540

gaaactatat ggctagagta ctggagaggt ggacggaact gcacgagtag aggtgaaatt

600

cgtagatatg tgcaggaatg ccgatgatga agatagttca ctggacggac tgacgctgaa

660

gtgcgaaagc taggggagca aacaggatta gataccctgg tagtcctagc tgtaaacgat

720

gattactggg tgtgggcatg tctgtgccga agctaatgcg ataagtaatc cgcctgggga

780

gtacggccgc aaggctgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggagca

840

tgtggtttaa ttcgacgcaa cgcgaggaac cttaccagat cttgacatcg acaggtggtg

900

catggctgtc gacagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

960

cctatcgtta gttgccatca tgggaactct agcgagactg cctgcgaaga gcaggaggaa

1020

ggtggggatg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgatctg ggctacacac gtgctacaat

1080

ggccggcaaa aagctgcaaa acggtaacgt ttagccaatc tttccggtcc aagttcggat

1140

gaagtctgca actcgacttc agaagctgga atcgctagta atcgcagatc agcaatgctg

1200

cggtgaatac gttctcgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gttgtctgca

1260

cctgaagctg ccgtctaaga aggtatctaa ggtgtggata gtgattgggg tgaagtcgta

1320

acaaggtatc cgtaccggaa ggtgcggctg gatcacctcc tt

1362

<210> 1173

<211> 1363

<212> DNA

<213> Leptotrichia sp. oral clone HE012

<400> 1173

gagtttgatt ctggctcagg atgaacgctg acagaatgct taacacatgc aagtctggcg

60

agcggcggac gggtgagtaa cgcgtaaaga acttgccctg cagacaggga taacagacgg

120

aaacgactga taacacctga tacagaaaat gctgcgggag agctttgcgt cctattagct

180

tgttggtgag gtaacggctc accaaggcga tgataggtag ccggcctgag agggtgaacg

240

gccacaaggg gactgagata cggcccttac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

300

gacaatgggg gcaaccctga tccagcaatt ctgtgtgcac gaagaaggtt ttcggattgt

360

aaagtgcttt cagcagggaa gatgacggta cctgcagaag aagcgacggc taattacgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg tatgtcgcaa gcgttatccg gaattattgg gcataaaggg

480

catctaggcg gccagacaag tctggggtga aaacttgcgg ctcaaccgca agcctgccct

540

ggaaactgtt tggctagagt gctggagagg tggacggaac tgcacgagta gaggtgaaat

600

tcgtagatat gtgcaggaat accgatgatg aagatagttc actggacgga ctgacgctga

660

agtgcgaaag ctaggggagc gaacaggatt agataccctg gtagtcctag ctgtaaacga

720

tgattactgg gtgtggacat gtccgtgccg aagcaaatgc gataattaat ccgcctgggg

780

agtacggccg caaggctgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggagc

840

atgtggttta attcgacgca acgcgaggaa ccttaccaga tcttgacatc gacaggtggt

900

gcatggctgt cgacagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccctatcgtt agttaccatc atggggactc tagcgagact gcctgcgaag agcaggagga

1020

aggtggggat gacgtcaagt catcatgccc cttatgatct gggctacaca cgtgctacaa

1080

tggccggcag agagctgcga agcggcaacg cccagcgaat ctttccggtc caagttcgga

1140

tgaagtctgc aactcgactt cagaagctgg aatcgctagt aatcgcagat cagcaatgct

1200

gcggtgaata cgttctcggg tcttgtacac accgcccgtc acaccacgag agttgtttgc

1260

acctgaagct gccgtctagg aaggcatcta atgtgtggat agtgattggg gtgaagtcgt

1320

aacaaggtat ccgtaccgga aggtgcggtt ggaacacctc ctt

1363

<210> 1174

<211> 1362

<212> DNA

<213> Leptotrichia sp. oral clone IK040

<400> 1174

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg acagaatgct taacacatgc aagtcgatgg

60

atggcggacg ggtgagtaac gcgtaaagaa cttgccggat ggaccgggat aacagctgga

120

aacggctggc aagaccggat actgaaaatg ccgtccgaga gctttgcgtc ctattagctg

180

gttggtaagg tgacggctta ccaaggcgat gataggtagc cggcctgaga gggtggacgg

240

ccacaagggg actgagatac ggcccttact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg

300

acaatggggg caaccctgat ccagcaattc tgtgtgcacg aagaaggttt tcggatcgta

360

aagtgctttc agcagggagg atgactgtac ctgcagaaga agcgacggct aaatacgtgc

420

cagcagccgc ggtaatacgt atgtcgcgag cgttatccgg aattattggg cataaagggc

480

atctaggcgg ccgggtaagt ccggggtgaa aactgctggc tcaaccagca gcctgccttg

540

gaaactaccc ggcttgagtg ctggagaggt ggacggaact gcacgagtag aggtgaaatt

600

cgtagatatg tgcaggaatg ccgatgatga agatagttca ctggacggac tgacgctgaa

660

gtgcgaaagc taggggagcg aacaggatta gataccctgg tagtcctagc tgtaaacgat

720

gattactggg tgtgggcatg tccgtgccga agctaatgcg ataagtaatc cgcctgggga

780

gtacggccgc aaggctgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggagca

840

tgtggtttaa ttcgacgcaa cgcgaggaac cttaccagat cttgacatcg acaggtggtg

900

catggctgtc gacagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

960

cctatcgcta gttgccatca tggggactct agcgagactg cctgcgaaga gcaggaggaa

1020

ggtggggatg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgatctg ggctacacac gtgctacaat

1080

ggctggcaga gagatgcgac gcagcaatgc caagccaacc tctccagtcc aagttcggat

1140

gaagcctgca actcggcttc agaagttgga atcgctagta atcgcggatc agcaatgccg

1200

cggtgaatac gttctcgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gttgtctgca

1260

cctgaagctg ccgtctaaga aggcatctaa ggtgtggaca gtgattgggg tgaagtcgta

1320

acaaggtatc cgtaccggaa ggtgcggctg gaacacctcc tt

1362

<210> 1175

<211> 1293

<212> DNA

<213> Leptotrichia sp. oral clone P2PB_51 P1

<400> 1175

gatgaacgct gacagaatgc ttaacacatg caagtcgatg gatggcggac gggtgagtaa

60

cgcgtaagga acttacctgc gggactggga taacggaggg aaacttctga caagaccgga

120

taaagaaagc gcctgcggag agtcttgcgt cctattagct agttggttgg gtaacggctg

180

accaaggcga agataggtag ccggcctgag agggtggacg gccacaaggg gactgagata

240

cggcccttac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggg gcaaccctga

300

tccagcaatt ctgtgtgcac gaagaaggtt ttcggattgt aaagtgcttt cagcagggaa

360

gatgacggta cctgcagaag aagcgacggc taaatacgtg ccagcagccg cggtaatacg

420

tatgtcgcga gcgttatccg gaattattgg gcataaaggg catctaggcg gcctaacaag

480

tcaggggtga aaacctgcgg ctcaaccgca ggcctgcctt tgaaactgta aggctggagt

540

accggagagg tggacggaac tgcacgagta gaggtgaaat tcgtagatat gtgcaggaat

600

gccgatgatg aagatagtcc actggacgga ctgacgctga agtgcgaaag ccgggggagc

660

gaacaggatt agataccctg gtagtcccgg ccgtaaacga tgattactgg gtgtgggcat

720

gtctgtgccg aagcgaatgc gataagtaat ccgcctgggg agtacggccg caaggctgga

780

actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgacgca

840

acgcgaggaa ccttaccaga tcttgacatc gacaggtggt gcatggctgt cgacagctcg

900

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac cctttttgct agttaccatc

960

atggggactc tagcgagact gcctgcgaag agcaggagga aggtggggat gacgtcaagt

1020

catcatgccc cttatgatct gggctacaca cgtgctacaa tgggctgcag agaggagcga

1080

ggtggtgaca cggagcgaat cttgcagttc gaagttcgga tgaagtctgc aactcgactt

1140

cagaagttgg aatcgctagt aatcgcggat cagcaatgcc gcggtgaata cgttctcggg

1200

tcttgtacac accgcccgtc acaccacgag agttgtctgc acctgaagtt actgtctagg

1260

aaggtaccta aggtgtggat agtgattggg gtg

1293

<210> 1176

<211> 1432

<212> DNA

<213> Leptotrichia sp. oral taxon 223

<400> 1176

gatgaacgct gacagaatgc ttaacacatg caagtctttg gcgaatctgc gcttgcccag

60

gctagccaag gcggacgggt gagtagcgcg taaagaactt gccctgcaga cagggataac

120

agacggaaac gactgacaac acctgatacg gttgccggca cgcatgtgcc aggcaatgaa

180

aagcgatgct gcaggagagc tttgcgtcct attagcttgt tggtgaggta acggctcacc

240

aaggcgacga taggtagccg gcctgagagg gtgaacggcc acaaggggac tgagatacgg

300

cccttactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattggac aatgggggca accctgatcc

360

agcaattctg tgtgcacgaa gaaggctttc gggctgtaaa gtgctttcag cagagaagaa

420

gcaagtgacg gtacctgcag aagaagcgac ggctaaatac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtatgccg caagcgttat ccggaattat tgggcataaa gggcatctag gcggccaggc

540

aagtctgggg tgaaaacctg cggctcaacc gcaggcctgc cctggaaact gcgtggctag

600

agtgctggag aggtggacgg aactgcacga gtagaggtga aattcgtaga tatgtgcagg

660

aatgccgatg atgaagatag ttcactggac ggcaactgac gctgaagtgc gaaagccggg

720

ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt cccggccgta aacgatgatt actgggtgtg

780

ggcatgaaga gtgtccgtgc cgaagctaat gcgataagta atccgcctgg ggagtacggc

840

cgcaaggctg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

900

taattcgacg caacgcgagg aaccttacca gatcttgaca tcctgcggat gcccgtgaga

960

gcgggcagtg ccctcgggaa cgcagagaca ggtggtgcat ggctgtcgac agctcgtgtc

1020

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct atcgccagtt gccatcatta

1080

ggttggggac tctggcgaga ctgcctgcga agagcaggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1140

gtcatcatgc cccttatgat ctgggctaca cacgtgctac catggccggt acagagagct

1200

gcgaggcggc gacgccaagc gaacctgcaa agccggtcca agttcggatt gaagcctgca

1260

actcggcttc atgaagctgg aatcgctagt aatcgcagat cagcaatgct gcggtgaata

1320

cgttctcggg tcttgtacac accgcccgtc acaccacgag agctgtctgc acctgaagcc

1380

gccggtccaa ccgcaagggg gaaggcgtct aaggtgtgga cagtgattgg gg

1432

<210> 1177

<211> 1450

<212> DNA

<213> Leuconostoc carnosum

<400> 1177

cgcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac gcacagcgaa aggtgcttgc acctttcaag

60

tgagtggcga acgggtgagt aacacgtgga caacctgcct caaggctggg gataacattt

120

ggaaacagat gctaataccg aataaaactt agtatcgcat gataccaggt taaaaggcgc

180

tacggcgtca cctagagatg gatccgcggt gcattagtta gttggtgggg taaaggccta

240

ccaagacaat gatgcatagc cgagttgaga gactgatcgg ccacattggg actgagacac

300

ggcccaaact cctacgggag gctgcagtag ggaatcttcc acaatgggcg aaagcctgat

360

ggagcaacgc cgcgtgtgtg atgaaggctt tcgggtcgta aagcactgtt gtatgggaag

420

aaaagttaag gtagggaatg accttagcct gacggtacca taccagaaag ggacggctaa

480

atacgtgcca gcagccgcgg taatacgtat gtcccgagcg ttatccggat ttattgggcg

540

taaagcgagc gcagacggtt ggttaagtct gatgtgaaag cccggagctc aactccggaa

600

aggcattgga aactggttaa cttgagtgca gtagaggtaa gtggaactcc atgtgtagcg

660

gtggaatgcg tagatatatg gaagaacacc agcggcgaag gcggcttact ggactgtaac

720

tgacgttgag gctcgaaagt gtgggtagca aacaggatta gataccctgg tagtccacac

780

cgtaaacgat gaacactagg tgttaggagg tttccgcctc ttagtgccga agctaacgca

840

ttaagtgttc cgcctgggga gtacgaccgc aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga

900

cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggt

960

cttgacatcc tttgaagctt ttagaaatag aagtgttctc ttcggagaca aagtgacagg

1020

tggtgcatgg tcgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1080

caacccttat tgttagttgc cagcattcag atgggcactc tagcgagact gccggtgaca

1140

aaccggagga aggcggggac gacgtcagat catcatgccc cttatgacct gggctacaca

1200

cgtgctacaa tggcgtatac aacgagttgc caacctgcga aggtgagcta atctcttaaa

1260

gtacgtctca gttcggactg cagtctgcaa ctcgactgca cgaagtcgga atcgctagta

1320

atcgcggatc agcacgccgc ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac

1380

accatggaag tttgtaatgc ccaaagccgg tggcctaacc gtaaggaggg aaccgtctaa

1440

ggcaggacag

1450

<210> 1178

<211> 1576

<212> DNA

<213> Leuconostoc citreum

<400> 1178

gaattcacta gtgattagag tttgattaat ggctcaggat gaacgctggc ggcgtgccta

60

atacatgcaa gtcgaacgcg cagcgagagg tgcttgcacc tttcaagcga gtggcgaacg

120

ggtgagtaac acgtggataa cctgcctcaa ggctggggat aacatttgga aacagatgct

180

aataccgaat aaaacttagt atcgcatgat atcaagttaa aaggcgccac ggcgtcacct

240

agagatggat ccgcggtgca ttagttagtt ggtggggtaa aggcttacca agacgatgat

300

gcatagccga gttgagagac tgatcggcca cattgggact gagacacggc ccaaactcct

360

acgggaggct gcagtaggga atcttccaca atgggcgcaa gcctgatgga gcaacgccgc

420

gtgtgtgatg aaggctttcg ggtcgtaaag cactgttgta tgggaagaaa tgctaaaata

480

gggaatgatt ttagtttgac ggtaccatac cagaaaggga cggctaaata cgtgccagca

540

gccgcggtaa tacgtatgtc ccgagcgtta tccggattta ttgggcgtaa agcgagcgca

600

gacggttgat taagtctgat gtgaaagccc ggagctcaac tccggaatgg cattggaaac

660

tggttaactt gagtgttgta gaggtaagtg gaactccatg tgtagcggtg gaatgcgtag

720

atatatggaa gaacaccagt ggcgaaggcg gcttactgga caacaactga cgttgaggct

780

cgaaagtgtg ggtagcaaac aggattagat aaccctggta gtccacaccg taaacgatga

840

atactaggtg ttaggaggtt tccgcctctt agtgccgaag ctaacgcatt aagtattccg

900

cctggggagt acgaccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg

960

gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggtct tgacatcctt

1020

tgaagctttt agagatagaa gtgttctctt cggagacaaa gtgacaggtg gtgcatggtc

1080

gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttattg

1140

ttagttgcca gcattcagtt gggcactcta gcgagactgc cggtgacaaa ccggaggaag

1200

gcggggacga cgtcagatca tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tgctacaatg

1260

gcgtatacaa cgagttgcca acctgcgaag gtgagctaat ctcttaaagt acgtctcagt

1320

tcagactgca gtctgcaact cgactgcacg aagtcggaat cgctagtaat cgcggatcag

1380

cacgccgcgg tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtt

1440

tgtaatgccc aaagccggtg gcctaacctt cgggagggag ccgtctaagg caggacagat

1500

gactggggtg aagtcgtaac aaggtaaccg taaatcgaat ttcccgcggc cgccatggcg

1560

gccggagctg ratcgc

1576

<210> 1179

<211> 1554

<212> DNA

<213> Leuconostoc gasicomitatum

<400> 1179

tttaaattga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgaacg cacagcgaaa ggtgcttgca cctttcaagt gagtggcgaa cgggtgagta

120

acacgtggat aacctacctc aaggttgggg ataacatttg gaaacagatg ctaataccga

180

ataaaactta gtatcgcatg ataccaggtt aaaaggcgct acggcgtcac ctagagatgg

240

atccgcggtg cattagttag ttggtggggt aaaggcttac caagacaatg atgcatagcc

300

gagttgagag actgatcggc cacattggga ctgagacacg gcccaaactc ctacgggagg

360

ctgcagtagg gaatcttcca caatgggcga aagcctgatg gagcaacgcc gcgtgtgtga

420

tgaaggcttt cgggtcgtaa agcactgttg tatgggaaga acagctagag tagggaatga

480

ctttagtttg acggtaccat accagaaagg gacggctaaa tacgtgccag cagccgcggt

540

aatacgtatg tcccgagcgt tatccggatt tattgggcgt aaagcgagcg cagacggtta

600

attaagtctg atgtgaaagc ccggagctca actccggaaa ggcattggaa actggttaac

660

ttgagtgcag tagaggtaag tggaactcca tgtgtagcgg tggaatgcgt agatatatgg

720

aagaacacca gcggcgaagg cggcttactg gactgtaact gacgttgagg ctcgaaagtg

780

tgggtagcaa acaggattag ataccctggt agtccacacc gtaaacgatg aacactaggt

840

gttaggaggt ttccgcctct tagtgccgaa gctaacgcat taagtgttcc gcctggggag

900

tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat

960

gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatcct ttgaagcttt

1020

tagagataga agtgttctct tcggagacaa agtgacaggt ggtgcatggt cgtcgtcagc

1080

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatt gttagttgcc

1140

agcattcaga tgggcactct agcgagactg ccggtgacaa accggaggaa ggcggggacg

1200

acgtcagatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat ggcgtataca

1260

acgagttgcc aacctgtgaa ggtgagctaa tctcttaaag tacgtctcag ttcggactgc

1320

agtctgcaac tcgactgcac gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcacgccgcg

1380

gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt ttgtaatgcc

1440

caaagccggt ggcctaaccg taaggaggga accgtctaag gcaggacaga tgactggggt

1500

gaagtcgtaa caaggtagcc gtaggagaac ctgcggctgg atcacctcct ttct

1554

<210> 1180

<211> 1474

<212> DNA

<213> Leuconostoc inhae

<400> 1180

ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtcga acgcacagcg aaaggtgctt gcacctttca

60

agtgagtggc gaacgggtga gtaacacgtg gataacctac ctcaaggttg gggataacat

120

ttggaaacag atgctaatac cgaatgagac ttcttgttgc atgacaggaa gttaaaaggc

180

gctacggcgt cgcctagaga tggatccgcg gtgcattagt tagttggtgg ggtaaaggcc

240

taccaagaca atgatgcata gccgagttga gagactgatc ggccacattg ggactgagac

300

acggcccaaa ctcctacggg aggctgcagt agggaatctt ccacaatggg cgaaagcctg

360

atggagcaac gccgcgtgtg tgatgaaggc tttcgggtcg taaagcactg ttgtatggga

420

agaacagcta gagtagggaa tgactttagt ttgacggtac cataccagaa agggacggct

480

aaatacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt atgtcccgag cgttatccgg atttattggg

540

cgtaaagcga gcgcagacgg ttgattaagt ctgatgtgaa agcccggagc tcaactccgg

600

aaaggcattg gaaactggtc aacttgagtg cagtagaggt aagtggaact ccatgtgtag

660

cggtggaatg cgtagatata tggaagaaca ccagcggcga aggcggctta ctggactgta

720

actgacgttg aggctcgaaa gtgtgggtag caaacaggat tagataccct ggtagtccac

780

accgtaaacg atgaacacta ggtgttagga ggtttccgcc tcttagtgcc gaagctaacg

840

cattaagtgt tccgcctggg gagtacgacc gcaagttgaa actcaaagga attgacgggg

900

acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg

960

tcttgacatc ctttgaagct tttagagata gaagtgttct cttcggagac aaagtgacag

1020

gtggtgcatg gtcgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1080

gcaaccctta ttgttagttg ccagcattca gatgggcact ctagcgagac tgccggtgac

1140

aaaccggagg aaggcgggga cgacgtcaga tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac

1200

acgtgctaca atggcgtata caacgagttg ccaacctgtg aaggtgagct aatctcttaa

1260

agtacgtctc agttcggact gcagtctgca actcgactgc acgaagtcgg aatcgctagt

1320

aatcgcggat cagcacgccg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca

1380

caccatggga gtttgtaatg cccaaagccg gtggcctaac cgtaaggagg gaaccgtcta

1440

aggcaggaca gatgactggg gtgaagtcgt aaca

1474

<210> 1181

<211> 1558

<212> DNA

<213> Leuconostoc kimchii

<400> 1181

ttaaattgag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca

60

agtcgaacgc gcagcgagag gtgcttgcac ctttcaagcg agtggcgaac gggtgagtaa

120

cacgtggata acctgcctca aggctgggga taacatttgg aaacagatgc taataccgaa

180

taaaacttag tatcgcatga tataaagtta aaaggcgcta cggcgtcacc tagagatgga

240

tccgcggtgc attagttagt tggtgaggta aaggctcacc aagacaatga tgcatagccg

300

agttgagaga ctgatcggcc acattgggac tgagacacgg cccaaactcc tacgggaggc

360

tgcagtaggg aatcttccac aatgggcgca agcctgatgg agcaacgccg cgtgtgtgat

420

gaaggctttc gggtcgtaaa gcactgttgt atgggaagaa cagctagaat agggaatgat

480

tttagtgtga cggtaccata ccagaaaggg acggctaaat acgtgccagc agccgcggta

540

atacgtatgt cccgagcgtt atccggattt attgggcgta aagcgagcgc agacggttgt

600

ttaagtctga tgtgaaagcc cggagctcaa ctccggaaag gcattggaaa ctggacaact

660

tgagtgcagt agaggtaagt ggaactccat gtgtagcggt ggaatgcgta gatatatgga

720

agaacaccag cggcgaaggc ggcttactgg actgtaactg acgttgaggc tcgaaagtgt

780

gggtagcaaa caggattaga taccctggta gtccacaccg taaacgatga acactaggtg

840

ttaggaggtt tccgcctctt agtgccgaag ctaacgcatt aagtgttccg cctggggagt

900

acgaccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg

960

tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggtct tgacatcctt tgaagctttt

1020

agagatagaa gtgttctctt cggagacaaa gtgacaggtg gtgcatggtc gtcgtcagct

1080

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttattg ttagttgcca

1140

gcattcagat gggcactcta gcgagactgc cggtgacaaa ccggaggaag gcggggacga

1200

cgtcagatca tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tgctacaatg gcgtatacaa

1260

cgagttgcca acctgcgaag gtgagctaat ctcttaaagt acgtctcagt tcggactgca

1320

gtctgcaact cgactgcacg aagtcggaat cgctagtaat cgcggatcag cacgccgcgg

1380

tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtt tgtaatgccc

1440

aaagccggtg gcctaaccgt aaggagggaa ccgtctaagg caggacagat gactggggtg

1500

aagtcgtaac aaggtagccg taggagaacc tgcggctgga tcacctcctt tctaagga

1558

<210> 1182

<211> 1451

<212> DNA

<213> Leuconostoc lactis

<400> 1182

ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac gcgcagcgaa aggtgcttgc acctttcaag

60

cgagtggcga acgggtgagt aacacgtgga taacctgcct caaggctggg gataacattt

120

ggaaacagat gctaataccg aataaaactt agtatcgcat gatacaaagt tgaaaggcgc

180

tacggcgtca cctagagatg ggtccgcggt gcattagtta gttggtgggg taaaggccta

240

ccaagacaat gatgcatagc cgagttgaga gactgatcgg ccacattggg actgagacac

300

ggcccaaact cctacgggag gctgcagtag ggaatcttcc acaatgggcg aaagcctgat

360

ggagcaacgc cgcgtgtgtg atgaaggctt tagggtcgta aagcactgtt gtatgggaag

420

aaatgctaga atagggaatg attctagttc gacggtacca taccagaaag ggacggctaa

480

atacgtgcca gcagccgcgg taatacgtat gtcccgagcg ttatccggat ttattgggcg

540

taaagcgagc gcagacggtt gattaagtct gatgtgaaag cccggagctc aactccggaa

600

tggcattgga aactggttaa cttgagtgtt gtagaggtaa gtggaactcc atgtgtagcg

660

gtggaatgcg tagatatatg gaagaacacc agtggcgaag gcggcttact ggacaacaac

720

tgacgttgag gctcgaaagt gtgggtagca aacaggatta gataccctgg tagtccacac

780

cgtaaacgat gaatactagg tgttaggagg tttccgcctc ttagtgccga agctaacgca

840

ttaagtattc cgcctgggga gtacgaccgc aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga

900

cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggt

960

cttgacatcc tttgaagctt ctagagatag aagtgttctc ttcggagaca aagtgacagg

1020

tggtgcatgg tcgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1080

caacccttat tgttagttgc cagcattcag ttgggcactc tagcgagact gccggtgaca

1140

aaccggagga aggcggggac gacgtcagat catcatgccc cttatgacct gggctacaca

1200

cgtgctacaa tggcgtatac aacgagttgc caacccgcga gggtgagcta atctcttaaa

1260

gtacgtctca gttcggactg cagtctgcaa ctcgactgca cgaagtcgga atcgctagta

1320

atcgcggatc agcacgccgc ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac

1380

accatgggag tttgtaatgc ccaaagccgg tggcctaacc ttatggaggg agccgtctaa

1440

ggcaggacag a

1451

<210> 1183

<211> 1555

<212> DNA

<213> Leuconostoc mesenteroides

<400> 1183

ttcaaattga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgaacg catagcgaaa ggtgcttgca cctttcaagt gagtggcgaa cgggtgagta

120

acacgtggac aacctgcctc aaggctgggg ataacatttg gaaacagatg ctaataccga

180

ataaaactta gtgtcgcatg acacaaagtt aaaaggcgct tcggcgtcac ctagagatgg

240

atccgcggtg cattagttag ttggtggggt aaaggcctac caagacaatg atgcatagcc

300

gagttgagag actgatcggc cacattggga ctgagacacg gcccaaactc ctacgggagg

360

ctgcagtagg gaatcttcca caatgggcga aagcctgatg gagcaacgcc gcgtgtgtga

420

tgaaggcttt cgggtcgtaa agcactgttg tatgggaaga acagctagaa taggaaatga

480

ttttagtttg acggtaccat accagaaagg gacggctaaa tacgtgccag cagccgcggt

540

aatacgtatg tcccgagcgt tatccggatt tattgggcgt aaagcgagcg cagacggttt

600

attaagtctg atgtgaaagc ccggagctca actccggaat ggcattggaa actggttaac

660

ttgagtgcag tagaggtaag tggaactcca tgtgtagcgg tggaatgcgt agatatatgg

720

aagaacacca gtggcgaagg cggcttactg gactgcaact gacgttgagg ctcgaaagtg

780

tgggtagcaa acaggattag ataccctggt agtccacacc gtaaacgatg aacactaggt

840

gttaggaggt ttccgcctct tagtgccgaa gctaacgcat taagtgttcc gcctggggag

900

tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat

960

gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatcct ttgaagcttt

1020

tagagataga agtgttctct tcggagacaa agtgacaggt ggtgcatggt cgtcgtcagc

1080

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatt gttagttgcc

1140

agcattcaga tgggcactct agcgagactg ccggtgataa accggaggaa ggcggggacg

1200

acgtcagatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat ggcgtataca

1260

acgagttgcc aacccgcgag ggtgagctaa tctcttaaag tacgtctcag ttcggattgt

1320

agtctgcaac tcgactacat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcacgccgcg

1380

gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt ttgtaatgcc

1440

caaagccggt ggcctaacct tttaggaagg agccgtctaa ggcaggacag atgactgggg

1500

tgaagtcgta acaaggtagc cgtaggagaa cctgcggctg gatcacctcc tttct

1555

<210> 1184

<211> 1448

<212> DNA

<213> Leuconostoc pseudomesenteroides

<400> 1184

gcggcgtgcc taatacatgc aagtcgaacg cacagcgaaa ggtgcttgca cctttcaagt

60

gagtggcgaa cgggtgagta acacgtggac aacctgcctc aaggctgggg ataacatttg

120

gaaacagatg ctaataccga ataaaactca gtgtcgcatg acacaaagtt aaaaggcgct

180

ttggcgtcac ctagagatgg atccgcggtg cattagttag ttggtggggt aaaggcctac

240

caagacaatg atgcatagcc gagttgagag actgatcggc cacattggga ctgagacacg

300

gcccaaactc ctacgggagg ctgcagtagg gaatcttcca caatgggcga aagcctgatg

360

gagcaacgcc gcgtgtgtga tgaaggcttt cgggtcgtaa agcactgttg tatgggaaga

420

acagctagaa tagggaatga ttttagtttg acggtaccat accagaaagg gacggctaaa

480

tacgtgccag cagccgcggt aatacgtatg tcccgagcgt tatccggatt tattgggcgt

540

aaagcgagcg cagacggtta attaagtctg atgtgaaagc ccggagctca actccggaat

600

ggcattggaa actggttaac ttgagtgcag tagaggtaag tggaactcca tgtgtagcgg

660

tggaatgcgt agatatatgg aagaacacca gtggcgaagg cggcttactg gactgtaact

720

gacgttgagg ctcgaaagtg tgggtagcaa acaggattag ataccctggt agtccacacc

780

gtaaacgatg aacactaggt gttaggaggt ttccgcctct tagtgccgaa gctaacgcat

840

taagtgttcc gcctggggag tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat tgacggggac

900

ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc

960

ttgacatcct ttgaagcttt tagagataga agtgttctct tcggagacaa agtgacaggt

1020

ggtgcatggt cgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc

1080

aacccttatt gttagttgcc agcattcaga tgggcactct agcgagactg ccggtgacaa

1140

accggaggaa ggcggggacg acgtcagatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac

1200

gtgctacaat ggcgtataca acgagttgcc aacccgcgag ggtgagctaa tctcttaaag

1260

tacgtctcag ttcggattgt agtctgcaac tcgactacat gaagtcggaa tcgctagtaa

1320

tcgcggatca gcacgccgcg gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca

1380

ccatgggagt ttgtaatgcc caaagccggt ggcctaacct tttaggggga gccgtctaag

1440

gcaggaca

1448

<210> 1185

<211> 1549

<212> DNA

<213> Listeria grayi

<400> 1185

gagagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaatacat gcaagtcgaa

60

cgaatgacct taggagcttg ctcctttggt cgttagtggc ggacgggtga gtaacacgtg

120

ggcaacctgc ctgtaagatt gggataactc cgggaaaccg gagctaatac cgaataataa

180

tcagctccgc atggagcggg tttgaaaggc ggcttcggct gtcacttaca gatgggcccg

240

cggtgcatta gctagttggt ggggtaaagg cctaccaagg cgacgatgca tcgccgacct

300

gagagggtga tcggccacac tgggactgag acacggccca gactcctccg ggaggcagca

360

gtagggaatc ttccgcaatg gacgaaagtc tgacggagca acgccgcgtg tgtgaagaag

420

gttttcggat cgtaaagcac tgttgttaga gaagaacaag gataagagta actgcttgtc

480

ccttgacggt atctaaccag aaagccacgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

540

gtaggtggca agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaagc gcgcgcaggc ggtttcttaa

600

gtctgatgtg aaagcccccg gcttaaccgg ggagggtcat tggaaactgg gagacttaga

660

gtgcagaaga ggagagtgga attccatgtg tagcggtgaa atgccgagat atatggagga

720

acaccagtgg cgaaggcgac tctctggtct gtaactgacg ctgaggcgcg aaagcgtggg

780

gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaagtgtta

840

gggggtttcc gccccttagt gctgcagcta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg

900

accgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg

960

tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catcctttga ccactctgga

1020

gacagagctt tcccttcggg gacaaagtga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1080

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgattttag ttgccagcat

1140

ttagttgggc actctaaagt gactgacggt gcaagccgga ggaaggtggg gatgacgtca

1200

aatcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtgcta caatggatga tacaaagggt

1260

cgcgaagccg cgaggtgaag ctaatcccat aaaatcattc tcagttcgga ttgtaggctg

1320

caactcgcct acatgaagcc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc cgcggtgaat

1380

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccgaagt

1440

cggtagggta acctttatgg agccagccgc cgaaggtggg acagataatt ggggtgaagt

1500

cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctttct

1549

<210> 1186

<211> 1514

<212> DNA

<213> Listeria innocua

<400> 1186

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac

60

gaacggagga agagcttgct cttccaatgt tagtggcgga cgggtgagta acacgtgggc

120

aacctgcccg taagttgggg ataactccgg gaaaccgggg ctaataccga atgatagagt

180

gtgacgcatg tcacactctt gaaagatggt ttcggctatc gcttacagat gggcccgcgg

240

tgcattagct agttggtagg gtaaaggcct accaaggcaa cgatgcatag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc cgcaatggac gaaagtctga cggagcaacg ccgcgtgtat gaagaaggtt

420

ttcggatcgt aaagtactgt tgttagagaa gaacaaggat aagagtaact gcttgtccct

480

tgacggtatc taaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

ggtggcaagc gttgtccgga tttattgggc gtaaagcgcg cgcaggcggt cttttaagtc

600

tgatgtgaaa gcccccggct taaccgggga gggtcattgg aaactggaag actggagtgc

660

agaagaggag agtggaattc cccgtgtatc gctgaaatgc gtagatatgt ggaggaacac

720

cagtggcgaa ggcgactctc tggtctgtaa ctgacgctga ggcgcgaaag cgtggggagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa gtgttagggg

840

gtttccgccc cttagtgctg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg

900

caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ctttgaccac tctggagaca

1020

gagctttccc ttcggggaca aagtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttga ttttagttgc cagcatttag

1140

ttgggcactc taaagtgact gccggtgcaa gccggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc

1200

atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat ggatggtaca aagggtcgcg

1260

aagccgcgag gtggagccaa tcccataaaa ccattctcag ttcggattgt aggctgcaac

1320

tcgcctacat ggagccggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc cgaagtcggt

1440

agggtaacct ttatggagcc agccgccgaa ggtgggacag ataattgggg tgaagtcgta

1500

acaaggtaac cgta

1514

<210> 1187

<211> 1487

<212> DNA

<213> Listeria ivanovii

<220>

<221> modified_base

<222> (251)..(251)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (533)..(533)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (573)..(573)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (593)..(593)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (602)..(602)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (621)..(621)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (629)..(630)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (654)..(654)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (742)..(742)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (829)..(829)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (853)..(853)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (887)..(887)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (968)..(968)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (983)..(983)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1025)..(1025)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1052)..(1052)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1057)..(1057)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1060)..(1060)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1091)..(1091)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1171)..(1171)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1193)..(1193)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1325)..(1325)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1371)..(1371)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1401)..(1401)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1444)..(1444)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1187

gagagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaatacat gcaagtcgaa

60

cgaacggagg aagagcttgc tcttccaatg ttagtggcgg acgggtgagt aacacgtggg

120

caacctgcct gtaagttggg gataactccg ggaaaccggg gctaataccg aatgataagt

180

agtgacgcat gtcatcactt tgaaagatgg tttcgctatc gcttacagat gggcccgcgg

240

tgcattagct ngttggtagg gtaaaggcct accaaggcaa cgatgcatag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc cgcaatggac gaaagtctga cggagcaacg ccgcgtgtat gaagaaggtt

420

ttcggatcgt aaagtactgt tgttagagaa gaacaaggat aagagtaact gcttgtccct

480

tgacggtatc taaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtnatacgta

540

ggtggcaagc gttgtccgga tttattgggc gtnaagcgcg cgcaggcggt ctnttaagtc

600

tnatgtgaaa gcccccggct naaccgggnn gggtcattgg aaactggaag actngagtgc

660

agaagaggag agtggaattc cacgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatgt ggaggaacac

720

cagtggcgaa ggcgactctc tngtctgtaa ctgacgctga ggcgcgaaag cgtggggagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctna gtgttagggg

840

gtttccgccc ctnagtgctg cagctaacgc attaagcact ccgcctnggg agtacgaccg

900

caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

960

ttcgaagnaa cgcgaagaac ctnaccaggt cttgacatcc tttgaccact ctggagacag

1020

agctntcctt cggggacaaa gtgacaggtg gngcatngtn gtcgtcagct cgtgtcgtga

1080

gatgttgggt naagtcccgc aacgagcgca acccttgatt ttagttgcca gcatttagtt

1140

gggcactcta aagtgactgc cggtgcaagc nggaggaagg tggggatgac gtnaaatcat

1200

catgcccctt atgacctggg ctacacacgt gctacaatgg atggtacaaa gggtcgcgaa

1260

gccgcgaggt ggagccaatc ccataaaacc attctcagtt cggattgtag gctgcaactc

1320

gcctncatga agccggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt naatacgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ncgtcacacc acgagagttt gtaacacccg aagtcggtag

1440

ggtnaccttt taggagccag ccgccgaagg tgggacagat gattggg

1487

<210> 1188

<211> 1556

<212> DNA

<213> Listeria monocytogenes

<400> 1188

attttaaaga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgaacg aacggaggaa gagcttgctc ttccaaagtt agtggcggac gggtgagtaa

120

cacgtgggca acctgcctgt aagttgggga taactccggg aaaccggggc taataccgaa

180

tgatagaatg tggcgcatgc cacgcttttg aaagatggtt tcggctatcg cttacagatg

240

ggcccgcggt gcattagcta gttggtaggg taatggccta ccaaggcaac gatgcatagc

300

cgacctgaga gggtgatcgg ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag

360

gcagcagtag ggaatcttcc gcaatggacg aaagtctgac ggagcaacgc cgcgtgtatg

420

aagaaggttt tcggatcgta aagtactgtt gttagagaag aacaaggata agagtaactg

480

cttgtccctt gacggtatct aaccagaaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

540

taatacgtag gtggcaagcg ttgtccggat ttattgggcg taaagcgcgc gcaggcggtc

600

ttttaagtct gatgtgaaag cccccggctt aaccggggag ggtcattgga aactggaaga

660

ctggagtgca gaagaggaga gtggaattcc acgtgtagcg gtgaaatgcg tagatatgtg

720

gaggaacacc agtggcgaag gcgactctct ggtctgtaac tgacgctgag gcgcgaaagc

780

gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctaag

840

tgttaggggg tttccgcccc ttagtgctgc agctaacgca ttaagcactc cgcctgggga

900

gtacgaccgc aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca

960

tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcc tttgaccact

1020

ctggagacag agctttccct tcggggacaa agtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

1080

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgat tttagttgcc

1140

agcatttagt tgggcactct aaagtgactg ccggtgcaag ccggaggaag gtggggatga

1200

cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tgctacaatg gatagtacaa

1260

agggtcgcga agccgcgagg tggagctaat cccataaaac tattctcagt tcggattgta

1320

ggctgcaact cgcctacatg aagccggaat cgctagtaat cgtggatcag catgccacgg

1380

tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt tgtaacaccc

1440

gaagtcggta gggtaacctt tatggagcca gccgccgaag gtgggacaga taattggggt

1500

gaagtcgtaa caaggtagcc gtatcggaag gtgcggctgg atcacctcct ttctaa

1556

<210> 1189

<211> 1555

<212> DNA

<213> Listeria welshimeri

<400> 1189

tattttaaag agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg

60

caagtcgaac gaacggagga agagcttgct cttccaaagt tagtggcgga cgggtgagta

120

acacgtgggc aacctgcctg taagttgggg ataactccgg gaaaccgggg ctaataccga

180

ataataagtg gtggcgcatg ccacggcttt gaaagatggt ttcggctatc gcttacagat

240

gggcccgcgg tgcattagct agttggtagg gtaatggcct accaaggcaa cgatgcatag

300

ccgacctgag agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga

360

ggcagcagta gggaatcttc cgcaatggac gaaagtctga cggagcaacg ccgcgtgtat

420

gaagaaggtt ttcggatcgt aaagtactgt tgttagagaa gaacaaggat aagagtaact

480

gcttgtccct tgacggtatc taaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg

540

gtaatacgta ggtggcaagc gttgtccgga tttattgggc gtaaagcgcg cgcaggcggt

600

cttttaagtc tgatgtgaaa gcccccggct taaccgggga gggtcattgg aaactggaag

660

actggagtgc agaagaggag agtggaattc cacgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatgt

720

ggaggaacac cagtggcgaa ggcgactctc tggtctgtaa ctgacgctga ggcgcgaaag

780

cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa

840

gtgttagggg gtttccgccc cttagtgctg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg

900

agtacgaccg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc

960

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ctttgaccac

1020

tctggagaca gagctttccc ttcggggaca aagtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag

1080

ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttaa ttttagttgc

1140

cagcatttag ttgggcactc taaagtgact gccggtgcaa gccggaggaa ggtggggatg

1200

acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat ggatggtaca

1260

aagggtcgcg aagccgcgag gtggagccaa tcccataaaa ccattctcag ttcggattgt

1320

aggctgcaac tcgcctacat gaagccggaa tcgctagtaa tcgtggatca gcatgccacg

1380

gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc

1440

cgaagtcggt agggtaacct ttatggagcc agccgccgaa ggtgggacag ataattgggg

1500

tgaagtcgta acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1555

<210> 1190

<211> 1247

<212> DNA

<213> Luteococcus sanguinis

<400> 1190

aacgggtgag taacacgtga gtaacctgcc ccaaactctg ggataacagt cggaaacggc

60

tgctaatacc ggatatggaa aggcggtttg ggatggactc gcggcctatc agcttgttgg

120

tgaggtagtg gctcaccaag gcttcgacgg gtagccggcc tgagagggcg accggccaca

180

ttgggactga gatacggccc aaactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat

240

gggcgaaagc ctgatgcagc aacgccgcgt gcgggatgac ggccttcggg ttgtaaaccg

300

ctttcagcgc agacgatgac ggtatgcgca gaagaagcac cggccaacta cgtgccagca

360

gccgcggtga tacgtagggt gcgagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa agagcttgta

420

ggcggtttgt tgcgtcagaa gtgaaaactc agggcttaac cctgagcctg cttctgatac

480

gggcagacta gaggaagtta ggggagaacg gaattcctgg tggagcggtg gaatgcgcag

540

atatcaggag gaacaccggt ggcgaaggcg gttctctggg actcctgacg ctgagaagcg

600

aaagcgtggg gagcaaacag gcttagatac cctggtagtc cacgccgtaa acggtgggta

660

ctaggtgtgg gtcgatccgt gccgcagcta acgcattaag taccccgcct ggggagtacg

720

gccgcaaggc taaaactcaa aggaattgac ggggccccgc acaagcggcg gagcatgcgg

780

attaattcga tgcaacgcga agaaccttac ctgggtttga catgcacagg tggtgcatgg

840

ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caaccctcgt

900

ccaatgttgc cagcggccgg ggactcattg gagaccgccg gggtcaactc ggaggaaggt

960

ggggatgacg tcaagtcatc atgcccctta tgtccagggc ttcacgcatg ctacaatggc

1020

cggcaaaggg ctgcgaacct gcaagggtga gcgaatccca accggtctca gttcggatgg

1080

ggtctgcaac tcgaccccag aagtcggagt cgctagtaat cgcagatcag caacgctgcg

1140

gtgaatacgt tcccggggct tgtacacacc gcccgtcaag tcatgaaagt cggtaacacc

1200

cgaagccggt gcctagggag ccgtcgaagg tgggaccggt aattagg

1247

<210> 1191

<211> 1438

<212> DNA

<213> Lutispora thermophila

<400> 1191

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgaac ggagatggtg ggatagcttg

60

ctattttatc atcttagtgg cggacgggtg agtaacacgt gggcaacctg ccctaaagag

120

ggggataaca ccgagaaatc ggtgctaata ccgcatgaaa ttagagtttc gcatgaagct

180

ttaatcaaag gagcaatccg ctttaggatg ggcccgcgtc tgattagcta gttggtgagg

240

taacggctca ccaaggcgac gatcagtagc cgatctgaga ggatgaccgg ccacactgga

300

actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatggggg

360

aaaccctgat gcagcaacgc cgcgtggagg aagaaggtct tcggattgta aactcctgtc

420

ttctgggacg aaatatgacg gtaccagagg aggaagccac ggctaactac gtgccagcag

480

ccgcggtaat acgtaggtgg cgagcgttgt ccggaattac tgggcgtaaa gggcgcgtag

540

gcggcctgtt aagtcagatg tgaaaacccc gggctcaacc tggggagtgc atttgaaact

600

gatgggctag agtgtcggag agggaagcgg aattcctagt gtagcggtga aatgcgtaga

660

tattaggagg aacaccagtg gcgaaggcgg ctttctggac gataactgac gctgaggcgc

720

gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgctgta aacgatggat

780

actaggtgtg ggaggtatcg accccttccg tgccgcagta aacgcaataa gtatcccgcc

840

tggggagtac ggccgcaagg ttgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcagc

900

ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccagagcttg acatctcctg

960

catagtccgt aatgggatga agtccttcgg gacaggaaga caggtggtgc atggttgtcg

1020

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatacttag

1080

ttgccatcat taagttgggc actctaagta gactgccgga gacaattcgg aggaaggtgg

1140

ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg ttctgggcta cacacgtgct acaatgggta

1200

taacaacggg aagcaagcca gtgatggtaa gcaaatccct aaaaagtact cccagttcag

1260

attgttctct gaaactcgag aacatgaagt cggagttgct agtaatcgcg aatcagcatg

1320

tcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagttggaa

1380

gcacccgaag ccggtgactt aaccgcaagg agagagccgt cgaaggtgaa gccaatga

1438

<210> 1192

<211> 1356

<212> DNA

<213> Lysinibacillus fusiformis

<400> 1192

ggggaaaccg gggctaatac cgaataatct gtttcacctc atggtgaaac actgaaagac

60

ggtttcggct gtcgctatag gatgggcccg cggcgcatta gctagttggt gaggtaacgg

120

ctcaccaagg cgacgatgcg tagccgacct gagagggtga tcggccacac tgggactgag

180

acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttccacaatg ggcgaaagcc

240

tgatggagca acgccgcgtg agtgaagaag gatttcggtt cgtaaaactc tgttgtaagg

300

gaagaacaag tacagtagta actggctgta ccttgacggt accttattag aaagccacgg

360

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggaattattg

420

ggcgtaaagc gcgcgcaggt ggtttcttaa gtctgatgtg aaagcccacg gctcaaccgt

480

ggagggtcat tggaaactgg gagacttgag tgcagaagag gatagtggaa ttccaagtgt

540

agcggtgaaa tgcgtagaga tttggaggaa caccagtggc gaaggcgact atctggtctg

600

taactgacac tgaggcgcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

660

acgccgtaaa cgatgagtgc taagtgttag ggggtttccg ccccttagtg ctgcagctaa

720

cgcattaagc actccgcctg gggagtacgg tcgcaagact gaaactcaaa ggaattgacg

780

ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc

840

aggtcttgac atcccgttga ccactgtaga gatatggttt ccccttcggg ggcaacggtg

900

acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

960

gagcgcaacc cttgatctta gttgccatca tttagttggg cactctaagg tgactgccgg

1020

tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gacctgggct

1080

acacacgtgc tacaatggac gatacaaacg gttgccaact cgcgagaggg agctaatccg

1140

ataaagtcgt tctcagttcg gattgtaggc tgcaactcgc ctacatgaag ccggaatcgc

1200

tagtaatcgc ggatcagcat gccgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc

1260

gtcacaccac gagagtttgt aacacccgaa gtcggtgagg taaccttttg gagccagccg

1320

ccgaaggtgg gatagatgat tggggtgaag tcgtaa

1356

<210> 1193

<211> 1541

<212> DNA

<213> Lysinibacillus sphaericus

<400> 1193

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

gaacagagaa ggagcttgct cctttgacgt tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggc

120

aacctacctt atagtttggg ataactccgg gaaaccgggg ctaataccga ataatctatt

180

tcacctcatg gtgaattatt gaaagacggt ttcggctgtc gctataggat gggcccgcgg

240

cgcattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgatgcgtag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc cacaatgggc gaaagcctga tggagcaacg ccgcgtgagt gaagaaggat

420

ttcggttcgt aaaactctgt tgtaagggaa gaacaagtac agtagtaact ggctgtacct

480

tgacggtacc ttattagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

ggtggcaagc gttgtccgga attattgggc gtaaagcgcg cgcaggtggt ttcttaagtc

600

tgatgtgaaa gcccacggct caaccgtgga gggtcattgg aaactgggag acttgagtgc

660

agaagaggat agtggaattc caagtgtagc ggtgaaatgc gtagagattt ggaggaacac

720

cagtggcgaa ggcgactatc tggtctgtaa ctgacactga ggcgcgaaag cgtggggagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa gtgttagggg

840

gtttccgccc cttagtgctg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacggtcg

900

caagactgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ccgttgacac tgtaagatat

1020

ggtttcccct tcgggggcac ggtgacaggt ggtgcatgga ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caaccttgat cttagttgcc atcatttagt

1140

tgggcactct aaggtgactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc

1200

atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat ggacgataca aacggttgcc

1260

aactcgcgag agggagctaa tccgataaag tcgttctcag ttcggattgt aggctgcaac

1320

tcgcctacat gaagccggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gtccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc cgaagtcggt

1440

gaggtaacct tttggagcca gccgccgaag gtgggataga tgattggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtagcc gtatcggaag gtgcggctgg atcacctcct t

1541

<210> 1194

<211> 1547

<212> DNA

<213> Macrococcus caseolyticus

<400> 1194

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

gaacggacga gagtgcttgc actctctgat gttagcggcg gacgggtgag taacacgtgg

120

gtaacctacc tataagactg ggataacttc gggaaaccgg agctaatacc ggataatatt

180

tagcttcgca tgaagcaata gtgaaagacg gttctgctgt cacttataga tggacccgcg

240

gtgtattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggca acgatacata gccgacctga

300

gagggtgatc ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

agggaatctt ccgcaatgga cgaaagtctg acggagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt

420

tttcggatcg taaaactctg ttgtaaggga agaacaagta cgttagtaac tgaacgtacc

480

ttgacggtac cttaccagaa agccacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

aggtggcaag cgttatccgg aattattggg cgtaaagcgc gcgtaggcgg tctcttaagt

600

ctgatgtgaa agcccccggc tcaaccgggg agggtcattg gaaactggga gacttgagtg

660

cagaagagga gagtggaatt ccatgtgtag cggtgaaatg cgcagagata tggaggaaca

720

ccagtggcga aggcggctct ctggtctgta actgacgctg aggtgcgaaa gcgtggggat

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta agtgttgggg

840

ggtttccgcc cctcagtgct gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacggtc

900

gcaagactga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggag catgtggttt

960

aattcgaagc aacgcgaaga accttaccaa atcttgacat cctttgacaa ctctagagat

1020

agagctttcc ccttcggggg acaaagtgac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt

1080

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatctttagt tgccatcatt

1140

aggttgggca ctctagagag actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca

1200

aatcatcatg ccccttatga tttgggctac acacgtgcta caatggatgg tacaaagggc

1260

agcaaaaccg cgaggtcaag caaatcccat aaaaccattc tcagttcgga ttgtagtctg

1320

caactcgact acatgaagct ggaatcgcta gtaatcgtag atcagcatgc tacggtgaat

1380

acgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccgaagc

1440

cggtggagta accttttagg agctagccgt cgaaggtggg acagatgatt ggggtgaagt

1500

cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgcg gctggatcac ctccttt

1547

<210> 1195

<211> 1516

<212> DNA

<213> Mannheimia haemolytica

<400> 1195

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggtagcacat aggagtttgc tccttgggtg acgagtggcg gacgggtgag taatgcttgg

120

gaatctggct tatggagggg gataactact ggaaacggta gctaataccg cgtaatgtct

180

taggactaaa gggtgggacc atttggccac ctgccataag atgagcccaa gtgggattag

240

gtagttggtg aggtaaaggc tcaccaagcc cgcgatctct agctggtctg agaggatgac

300

cagccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcca tgccgcgtga atgaagaagg ccttcgggtt

420

gtaaagttct ttcggtgacg aggaaggcga ttgttttaat agaacagtcg attgacgtta

480

atcacagaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gggggtgcga

540

gcgttaatcg gaataactgg gcgtaaaggg cacgcaggcg gttgtttaag tgaggtgtga

600

aagccccggg cttaacctgg gaattgcatt tcagactgaa caactagagt actttaggga

660

ggggtagaat tccacgtgta gcggtgaaat gcgtagagat gtggaggaat accgaaggcg

720

aaggcagccc cttggaaatg tactgacgct catgtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gctgtcgatt tggggattgg ggtttaactc

840

tggtgcccgt agctaacgtg ataaatcgac cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa

900

ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa

960

cgcgaagaac cttacctact cttgacatcc atggaatctt gtagagatat gagagtgcct

1020

tcgggaacca tgagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgttgtg aaatgttggg

1080

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc ctttgttgcc agcgattagg tcgggaactc

1140

aaaggagact gccggtgata aaccggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc

1200

cttacgagta gggctacaca cgtgctacaa tggcgtatac agagggcggc gagccagcga

1260

tggggagcga atctcagaaa gtacgtctaa gtccggattg gagtctgcaa ctcgactcca

1320

tgaagtcgga atcgctagta atcgcaaatc agaatgttgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggttgtac cagaagtaga tagcttaacc

1440

gaaagggggg cgtttaccac ggtatgattc atgactgggg tgaagtcgta acaaggtaac

1500

cgtaggggaa cctgcg

1516

<210> 1196

<211> 1300

<212> DNA

<213> Marvinbryantia formatexigens

<400> 1196

tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgag cgagcggcgg acgggtgagt aacgcgtgga

60

taacctgcct tatacagggg gataacagcc agaaatggct gctaataccg cataagaaaa

120

agtggtataa gatgggtccg cgttggatta ggcagttggc ggggtaaagg cccaccaaac

180

cgacgatcca tagccggcct gagagggtgg acggccacat tgggactgag acacggccca

240

gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagcg

300

acgccgcgtg ggtgaagaag tatttcggta tgtaaagccc tatcagcagg gaagatgacg

360

gtacctgacc aagaagcccc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggggg

420

caagcgttat ccggatttac tgggtgtaaa gggagcgtag acggccatgc aagtctggtg

480

tgaaaggcgg gggctcaacc cccggactgc attggaaact gtatggcttg agtgccggag

540

aggtaagcgg aattcctggt gtagcggtga aatgcgtaga tatcaggagg aacaccagtg

600

gcgaaggcgg cttactggac ggactgacgt tgaggctcga aagcgtgggg agcaaacagg

660

attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgaatac caggtgtcgg ggcttcggtg

720

ccgcagcaaa cgcactaagt attccacctg gggagtacgt tcgcaagaat gaaactcaaa

780

ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa

840

gaaccttacc aggtcttgac atcgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

900

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccctgtt cccagtagcc agcatatggg

960

cactctgggg agactgccag ggataacctg gaggaaggcg gggatgacgt caaatcatca

1020

tgccccttat gatctgggct acacacgtgc tacaatggcg tgcagaggga agcgaacccg

1080

cgagggggag caaatcccag aacgtcccag ttcggatgta gtctgcaacc cggctacaga

1140

agctggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc ccgggtcttg

1200

tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtcg gaaatgcccg aagtcagtac ccagggagct

1260

gccgaaggcg gggccggtaa ctggggtgaa gtcgtaacaa

1300

<210> 1197

<211> 1450

<212> DNA

<213> Massilia sp. CCUG 43427A

<400> 1197

acgctggcgg catgctttac acatgcaagt cgaacggtaa cagggagctt gctccgctga

60

cgagtggcga acgggtgagt aatatatcgg aacgtaccca gaagtggggg ataacgtagc

120

gaaagttacg ctaataccgc atacgatcca cggatgaaag taggggacct tcgggcctta

180

tgcttttgga gcggccgata tctgattagc tagttggtag ggtaaaggcc taccaaggcg

240

acgatcagta gctggtctga gaggacgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga

300

ctcctacggg aggcagcagt ggggaatttt ggacaatggg cgcaagcctg atccagcaat

360

gccgcgtgag tgaagaaggc cttcgggttg taaagctctt ttgtcaggga agaaacggta

420

gaggctaata tcctttgcta atgacggtac ctgaagaata agcaccggct aactacgtgc

480

cagcagccgc ggtaatacgt agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgt

540

gcgcaggcgg ttttgtaagt ctgacgtgaa atccccgggc tcaacctggg aattgcgttg

600

gagactgcaa ggctagaatc tggcagaggg gggtagaatt ccacgtgtag cagtgaaatg

660

cgtagagatg tggaggaaca ccgatggcga aggcagcccc ctgggtcaag attgacgctc

720

atgcacsaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccctaaacg

780

atgtctacta gttgtcgggt tttaattaac ttggtaacgc agctaacgcg tgaagtagac

840

cgcctgggga gtacggtcgc aagattaaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag

900

cggtggatga tgtggattaa ttcgatgcaa cgcgaaaaac cttacctacc cttgacatgt

960

acggaatgcc gaagagattt ggcagtgctc gaaagagaac cgtaacacag gtgctgcatg

1020

gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg

1080

tcattagttg ctacattcag ttgagcactc taatgagact gccggtgaca aaccggagga

1140

aggtggggat gacgtcaagt cctcatggcc cttatgggta gggcttcaca cgtcatacaa

1200

tggtacatac agagggccgc caacccgcga gggggagcta atcccagaaa gtgtatcgta

1260

gtccggatcg tagtctgcaa ctcgactacg tgaagttgga atcgctagta atcgcggatc

1320

agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag

1380

cgggttttac cagaagtagg tagcttaacc gcaaggaggg cgcttaccac ggtaggattc

1440

gtgactgggg

1450

<210> 1198

<211> 1342

<212> DNA

<213> Megamonas funiformis

<400> 1198

ctttgacata agcttccgct tgaagatgag cttgcgtctg attagctagt tggtgagggt

60

aaaggcccac caaggcgacg atcagtagcc ggtctgagag gatgaacggc cacattggga

120

ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatcttccg caatgggcga

180

aagcctgacg gagcaacgcc gcgtgaacga tgaaggtctt aggatcgtaa agttctgttg

240

ttagggacga aggataagga ttataataca gtctttgttt gacggtacct aacgaggaag

300

ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gcggcaagcg ttgtccggaa

360

ttattgggcg taaagggagc gcaggcggga aactaagcgg atcttaaaag tgcggggctc

420

aaccccgtga tggggtccga actggttttc ttgagtgcag gagaggaaag cggaattccc

480

agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattggg aagaacacca gtggcgaagg cggctttctg

540

gactgtaact gacgctgagg ctcgaaagct agggtagcga acgggattag ataccccggt

600

agtcctagcc gtaaacgatg gatactaggt gtgggaggta tcgactcctt ccgtgccgga

660

gttaacgcaa taagtatccc gcctggggag tacggccgca aggttgaaac tcaaaggaat

720

tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagtat gtggtttaat tcgacgcaac gcgaagaacc

780

ttaccaagac ttgacattga ttgaaagact tagagataag ttccttctct tcggagaaca

840

agaaaacagg tggtgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

900

gcaacgagcg caacccctat actatgttgc cagcatttcg gatgggaact catagtagac

960

tgccgcggac aacgcggagg aaggcgggga tgacgtcaag tcatcatgcc ccttacgtct

1020

tgggctacac acgtactaca atgggatgaa cagagggaag cgaaatcgcg aggtggagcg

1080

gatccctaaa agcatctctc agttcggatt gtaggctgaa actcgcctac atgaagtcgg

1140

aatcgctagt aatcgcaggt cagcatactg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1200

ccgcccgtca caccacgaaa gtcattcaca cccgaagccg gctaagggcc tatggtaccg

1260

accgtctaag gtgggggcga tgattggggt gaagtcgtaa caaggtagcc gtatcggaag

1320

gtgcggctgg atcacctcct ta

1342

<210> 1199

<211> 1518

<212> DNA

<213> Megamonas hypermegale

<400> 1199

cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggggtgttta

60

tttcggtaaa caccaagtgg cgaacgggtg agtaacgcgt aagcaatcta ccttcaagat

120

ggggacaaca cttcgaaagg ggtgctaata ccgaatgaat gagagatgac cgcatggata

180

tttctctaaa ggaggcctct gaaaatgctt ccgcttgaag atgagcttgc gtctgattag

240

ctagttggtg agggtaaagg cccaccaagg cgacgatcag tagccggtct gagaggatga

300

acggccacat tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaatc

360

ttccgcaatg ggcgaaagcc tgacggagca acgccgcgtg aacgaagaag gtcttaggat

420

cgtaaagttc tgttgttagg ggcgaagggc aacattttga ataagggtgt tgtttgacgg

480

tacttaacga ggaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggcggc

540

aagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag ggagcgcagg cgggaagtta agcggacttt

600

aaaagtgcgg ggctcaaccc cgtgaggggg tccgaactga ctttcttgag tgcaggagag

660

ggaagcggaa ttcctagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttaggaagaa caccagtggc

720

gaaggcggct ttctggactg taactgacgc tgaggctcga aagctagggt agcgaacggg

780

attagatacc ccggtagtcc tagccgtaaa cgatggatac taggtgtggg aggtatcgac

840

cccttccgtg ccggagttaa cgcaataagt atcccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt

900

gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agtatgtggt ttaattcgac

960

gcaacgcgaa gaaccttacc aagacttgac atcgactgac gtagttagag ataagtattt

1020

ttacttcggt aaacaggaag acaggtggtg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctatactat gttgccagca cgtaaaggtg

1140

ggaactcata gtagactgcc gcggacaacg cggaggaagg cggggatgac gtcaagtcat

1200

catgcccctt acgtcttggg ctacacacgt actacaatgg gatgaacaga gggaagcgaa

1260

gtcgcgaggc agagcggaac cctaaaagca tctctcagtt cggattgcag gctgaaactc

1320

gcctgcatga agtcggaatc gctagtaatc gcaggtcagc atactgcggt gaatacgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acgaaagtca ttcacacccg aagccggcta

1440

agggccgaaa ggaaccgacc gtcgaaggtg ggggcgatga ttggggtgaa gtcgtaacaa

1500

ggtagccgta tcggaagg

1518

<210> 1200

<211> 1530

<212> DNA

<213> Megasphaera elsdenii

<220>

<221> modified_base

<222> (895)..(895)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1200

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gagaagagat gagaagcttg cttcttatcg attcgagtgg caaacgggtg agtaacgcgt

120

aagcaacctg cccttcagat ggggacaaca gctggaaacg gctgctaata ccgaatacgt

180

tctttttgtc gcatggcaga gagaagaaag ggaggctctt cggagctttc gctgaaggag

240

gggcttgcgt ctgattagct agttggaggg gtaacggccc accaaggcga cgatcagtag

300

ccggtctgag aggatgaacg gccacattgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga

360

ggcagcagtg gggaatcttc cgcaatggac gaaagtctga cggagcaacg ccgcgtgaac

420

gatgacggcc ttcgggttgt aaagttctgt tatacgggac gaatggcgta cgacggtcaa

480

tacccgtcgt aagtgacggt accgtaagag aaagccacgg ctaactacgt gccagcagcc

540

gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaagg gcgcgcaggc

600

ggcgtcgtaa gtcggtctta aaagtgcggg gcttaacccc gtgaggggac cgaaactgcg

660

atgctagagt atcggagagg aaagcggaat tcctagtgta gcggtgaaat gcgtagatat

720

taggaggaac accagtggcg aaagcggctt tctggacgac aactgacgct gaggcgcgaa

780

agccagggga gcaaacggga ttagataccc cggtagtcct ggcggtaaac gatggatact

840

aggtgtagga ggtatcgacc ccttctgtgc cggagttaac gcaataagta tcccngcctg

900

gggagtacgg ccgcaaaggc tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg

960

gagtatgtgg tttaattcga cgcacgcgaa gaaccttacc aagccttgac attgattgct

1020

atgggtagag atacccagtt cctcttcgga ggacaagaaa acaggtggtg cacggctgtc

1080

gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctatcttct

1140

gttaccagcg agttaagtcg gggactcagg agagactgcc gcagacaatg cggaggaagg

1200

cggggatgac gtcaagtcat catgcccctt atggcttggg ctacacacgt actacaatgg

1260

ctcttaatag agggaagcga aggagcgatc cggagcaaac cccaaaaaca gagtcccagt

1320

tcggattgca ggctgcaact cgcctgcatg aagcaggaat cgctagtaat cgcaggtcag

1380

catactgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac cacgaaagtc

1440

attcacaccc gaagccggtg aggtaacctt ttggagccag ccgtcgaagg tgggggcgat

1500

gattggggtg aagtcgtaac aaggtaaccg

1530

<210> 1201

<211> 1328

<212> DNA

<213> Megasphaera genomosp. C1

<400> 1201

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcaaa cgggtgagta

60

acgcgtaaac aacctgccct acggatgggg acaacagctg gaaacggctg ctaataccga

120

atacggaaag tcgccggagg aggggtttgc gtctgattag ctagttggag gggtaacggc

180

ccaccaaggc gacgatcagt agccggtctg agaggatgaa cggccacatt ggaactgaga

240

cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatct tccgcaatgg gcgaaagcct

300

gacggagcaa cgccgcgtga gtgaagacgg ccttcgggtt gtaaagctct gttatacggg

360

acgatgacgg taccgtaaga gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtggc aagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag ggcgcgcagg cggcttctta

480

agtctgtctt aaaagtgcgg ggcttaaccc cgtgatggga tggaaactgg gaagctagag

540

tatcggagag gaaagcggaa ttcctagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttaggaggaa

600

caccagtggc gaaagcggct ttctggacga actgacgctg aggcgcgaaa gccaggggag

660

cgaacgggat tagatacccc ggtggtcctg gccgtaaacg atgggtacta ggtgtaggag

720

cttctgtgcc ggagttaacg caataagtac cccgcctggg gagtacggcc gcaaggttga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag tatgtggttt aattcgacgc

840

aacgcgaaga accttaccaa gccttgacat taacaggtgg tgcacggctg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatctt ctgttaccag

960

cacgtgggga ctcaggagag actgccgcag acaatgcggg ggaaggcggg gatgacgtca

1020

agtcatcatg ccccttatgg cttgggctac acacgtacta caatggctct tagagggagg

1080

cgaaggagcg atccggagca aaccccaaga gtctcagttc ggatgtaggc tgcaactcgc

1140

ctacagaagc aggaatcgct agtaatcgca ggtcagcata ctgcggtgaa tacgttcccg

1200

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg aaagtcattc acacccgaag ccggtaggta

1260

gccagccgtc gaaggtgggg gcgatgattg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtatcg

1320

gaaggtgc

1328

<210> 1202

<211> 1567

<212> DNA

<213> Megasphaera genomosp. type_1

<400> 1202

tggagagttt gatcctggct caggacgaac gctggcggcg tgcttaacac atgcaagtcg

60

aacgagagga catgggaagc ttgcttccta tgaaatcgag tggcaaacgg gtgagtaacg

120

cgtaaacaac ctgcccttcg gatggggata acagccggaa acggctgcta ataccgaata

180

cgatcttttc gtcgcatgac ggaaagaaga aaggatggcc tctatacaaa gctatcgccg

240

aaggaggggt ttgcgtctga ttagctggtt ggaggggtaa cggcccaaca aggcgatgat

300

cagtagccgg tctgagagga tgaacggcca cattgggact gagacacggc ccagactcct

360

acgggaggca gcagtgggga atcttccgca atggacgaaa gtctgacgga gcaacgccgc

420

gtgagtgaag aaggtcttcg gattgtaaaa gctctgttat acgggacgaa aaagacggat

480

gccaacagta tccgtccgtg acggtaccgt aagagaaagc cacggctaac tacgtgccag

540

cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt tgtccggaat tattgggcgt aaagggcgcg

600

caggcggttc ggtaagtctg tcttaaaagt gcggggctta accccgtgag gggacggaaa

660

ctgtcgaact tgagtgtcgg agaggaaagc ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta

720

gatattagga ggaacaccgg tggcgaaagc ggctttctgg acgacaactg acgctgaggc

780

gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatgg

840

atactaggtg taggaggtat cgaccccttc tgtgccgtag ttaacgctat aagtatcccg

900

cctggggagt acggccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg

960

gtggagtatg tggtttaatt cgacgcaacg cgaagaacct taccaagcct tgacattgat

1020

cgcaattttc agagatgaga agttcctctt cggaggacga gaaaacaggt ggtgcacggc

1080

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccctatc

1140

ttctgttacc agcacgtaag ggtggggact caggagagac tgccgcagac aatgcggagg

1200

aaggcgggga tgacgtcaag tcatcatgcc ccttatggct tgggctacac acgtactaca

1260

atggctctaa atagagggaa gcgaaggagc gatccggagc aaaacccaaa aacagagtcc

1320

cagttcggat tgcaggctgc aactcgcctg catgaagcag gaatcgctag taatcgcagg

1380

tcagcatact gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacgaa

1440

agtcattcac acccgaagcc ggtgaggtaa ccgcaaggag ccagccgtcg aaggtggggg

1500

cgatgattgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcacct

1560

cctttct

1567

<210> 1203

<211> 1554

<212> DNA

<213> Megasphaera micronuciformis

<400> 1203

tggagagttt gatcctggct caggacgaac gctggcggcg tgcttaacac atgcaagtcg

60

aacgagagcg tagagaaagc ttgctttttc tacaatctag tggcaaacgg gtgagtaacg

120

cgtaaacaac ctgccctacg gatggggaca acagctggaa acggctgcta ataccgaata

180

cgttccgaaa gtcgcatgac tgtcggaaga aaggatggcc tctatttata agctatcgcc

240

ggaggagggg tttgcgtctg attagctagt tggaggggta acggcccacc aaggcgacga

300

tcagtagccg gtctgagagg atgaacggcc acattggaac tgagacacgg tccagactcc

360

tacgggaggc agcagtgggg aatcttccgc aatgggcgaa agcctgacgg agcaacgccg

420

cgtgagtgaa gacggccttc gggttgtaaa gctctgttat acgggacgaa taatcttgtg

480

gttaataccc ataagaagtg acggtaccgt aagagaaagc cacggctaac tacgtgccag

540

cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt tgtccggaat tattgggcgt aaagggcgcg

600

caggcggctt cttaagtctg tcttaaaagt gcggggctta accccgtgat gggatggaaa

660

ctgggaagct cagagtatcg gagaggaaag cggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt

720

agatattagg aggaacacca gtggcgaaag cggctttctg gacgaaaact gacgctgagg

780

cgcgaaagcc aggggagcga acgggattag ataccccggt agtcctggcc gtaaacgatg

840

ggtactaggt gtaggaggta tcgacccctt ctgtgccgga gttaacgcaa taagtacccc

900

gcctggggag tacggccgca aggttgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc

960

ggtggagtat gtggtttaat tcgacgcaac gcgaagaacc ttaccaagcc ttgacattga

1020

tcgcaaggag tagagatact ctgttcttct tcggaagacg agaaaacagg tggtgcacgg

1080

ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat

1140

cttctgttac cagcacgtaa cggtggggac tcaggagaga ctgccgcaga caatgcggag

1200

gaaggcgggg atgacgtcaa gtcatcatgc cccttatggc ttgggctaca cacgtactac

1260

aatggctctt aatagaggga ggcgaaggag cgatccggag caaaccccaa aaacagagtc

1320

tcagttcgga ttgtaggctg caactcgcct acatgaagca ggaatcgcta gtaatcgcag

1380

gtcagcatac tgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga

1440

aagtcattca cacccgaagc cggtgaggta accgcaagga gccagccgtc gaaggtgggg

1500

gcgatgattg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtatcg gaaggtgcgg ctgg

1554

<210> 1204

<211> 1419

<212> DNA

<213> Megasphaera sp. BLPYG-07

<400> 1204

atcctagagt ttgatcatgg ctcaaggacg aacgctggcg gcgtgcttaa caacatgcaa

60

gtcgaacgag aagagatgag aagcttgctt cttattgatt cgagtggcaa acgggtgagt

120

aacgcgtaag caacctgccc tctagatggg gacaacagct ggaaacggct gctaataccg

180

aatacgttct ttctgtcgca tggcagaagg aagaaaggga ggctcttcgg agctttcgct

240

ggaggagggg cttgcgtctg attagctagt tggaggggta acggcccacc aaggcgacga

300

tcagtagccg gtctgagagg atgaacgcca catggacacc tgagacacgg cccagactcc

360

tacgggaggc agcagtgggg aatcttccgc aatggacgaa agtctgacgg agcaacgccg

420

cgtgaacgat gacggccttc gggttgtaaa gttctgttat acgggacgaa tggtacgacg

480

gtcaataccc gtcgtaagtg acggtaccgt aagagaaagc cacggctaac tacggtgcca

540

gcagccgcgc gtaatacgta ggtggcaagc gttgtcggat tattgggcgt aagggcgcgc

600

aggcggcgtc gtaagtcggt cttaaaagtg cggggcttaa ccccgtgagg ggaccgaaac

660

tgcgatgcta gagtatcgga gaggaaagcg gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag

720

atattaggag gaacaccagt ggcgaaagcg gctttctgga cgacaactga cgctgaggcg

780

cgaaagccag gggagcaaac gggattagat accccggtag tcctggccgt aaacgtggat

840

actggtgtag gaggtatcga ccccttctgt gccggagtta acgcaataag tatcccgcct

900

ggggagtacg gccgcaaggc tgaaactcaa aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt

960

ggagtatgtg gtttaattcg acgcaacgcg aagaacctta ccaagccttg acattgattg

1020

ctaagggtag agataccctg ttcctcttcg gaggacaaga aaacaggtgg tgcacggctg

1080

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatctt

1140

ctgttaccag cgggttaagt cggggactca ggagagactg ccgcagacaa tgcggaggaa

1200

ggcggggatg acgtcaagtc atcatgcccc ttatggcttg ggctacacac gtactacaat

1260

ggctcttaat agagggaagc gaaggagcga tccggagcaa accccaaaaa cagagtccca

1320

gttcggattg caggctgcaa cccgcctgca tgaagcagga atcgctagta atcgcaggtc

1380

agcaaaatac ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacaca

1419

<210> 1205

<211> 1566

<212> DNA

<213> Megasphaera sp. UPII 199-6

<400> 1205

tggagagttt gatcctggct caggacgaac gctggcggcg tgcttaacac atgcaagtcg

60

aacgagagga catgggaagc ttgcttccta tgaaatcgag tggcaaacgg gtgagtaacg

120

cgtaaacaac ctgcccttcg gatggggata acagccggaa acggctgcta ataccgaata

180

cgatcttttc gtcgcatgac ggaaagaaga aaggatggcc tctatacaaa gctatcgccg

240

aaggaggggt ttgcgtctga ttagctggtt ggaggggtaa cggcccaaca aggcgatgat

300

cagtagccgg tctgagagga tgaacggcca cattgggact gagacacggc ccagactcct

360

acgggaggca gcagtgggga atcttccgca atggacgaaa gtctgacgga gcaacgccgc

420

gtgagtgaag aaggtcttcg gattgtaaag ctctgttata cgggacgaaa aagacggatg

480

ccaacagtat ccgtccgtga cggtaccgta agagaaagcc acggctaact acgtgccagc

540

agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgtt gtccggaatt attgggcgta aagggcgcgc

600

aggcggttcg gtaagtctgt cttaaaagtg cggggcttaa ccccgtgagg ggacggaaac

660

tgtcgaactt gagtgtcgga gaggaaagcg gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag

720

atattaggag gaacaccggt ggcgaaagcg gctttctgga cgacaactga cgctgaggcg

780

cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgga

840

tactaggtgt aggaggtatc gaccccttct gtgccgtagt taacgctata agtatcccgc

900

ctggggagta cggccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg

960

tggagtatgt ggtttaattc gacgcaacgc gaagaacctt accaagcctt gacattgatc

1020

gcaattttca gagatgagaa gttcctcttc ggaggacgag aaaacaggtg gtgcacggct

1080

gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctatct

1140

tctgttacca gcacgtaagg gtggggactc aggagagact gccgcagaca atgcggagga

1200

aggcggggat gacgtcaagt catcatgccc cttatggctt gggctacaca cgtactacaa

1260

tggctctaaa tagagggaag cgaaggagcg atccggagca aaacccaaaa acagagtccc

1320

agttcggatt gcaggctgca actcgcctgc atgaagcagg aatcgctagt aatcgcaggt

1380

cagcatactg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaaa

1440

gtcattcaca cccgaagccg gtgaggtaac cgcaaggagc cagccgtcga aggtgggggc

1500

gatgattggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct ggatcacctc

1560

ctttct

1566

<210> 1206

<211> 1496

<212> DNA

<213> Metallosphaera sedula

<400> 1206

attccggttg atcctgccgg acccgatcgc tataggggta gggctaagcc atgggagtcg

60

tacgctctcg ggaagagggc gtggcggacg gctgagtaac acgtggctaa cctgcccttg

120

ggatctggat aaccccggga aactggggct aatccggagc gggcaaggga atctggaatg

180

atctcttgcc taaaagcctc tcggctgatc ccgtcgagag gcgcccaagg atggggctgc

240

ggcccatcag gctgttgggg gagtaaaggt cccccaaacc gataacgggt aggggccgtg

300

ggagcgggag cccccagttg ggcactgaga caagggccca ggccctacgg ggcgcaccag

360

gcgcggaacg tccccaatgc gggaaaccgt gagggcgtta cccctagtgc cctcgcaaga

420

gggcttttct ccactccaga aaggtggagg aataagcggg gggcaagact ggtgtcagcc

480

gccgcggtaa taccagcccc gcgagtgatc gggacgttta ttgggcttaa agcgcccgta

540

gccggcctgt aaagtcaccg tttaaagacc cgggctcaac tcggggaacg gcggtgatac

600

ttacaggcta gggggcggga gaggtcggag gtactcccgg agtaggggcg aaatcctcag

660

atcccgggag gaccaccagt ggcgaaagcg tccggctaga acgcgcccga cggtgagggg

720

cgaaagccgg ggtagcaaat aggattagat accctagtag tcccggctgt agacgatgca

780

ggctaggtgt cgcgtaggct ttgtgcctgc gcggtgccgc aggaaaactg gtaagcccgc

840

cgcctgggga gtacggccgc aaggctgaaa cttaaaggaa ttggcggggg agcaccacaa

900

ggggtggaac ctgcggctca attggagtca acgcctggaa tctcaccggg ggagaccgca

960

ggatgacggc caggctaacg accttgccag actcgcggag aggaggtgca tggccgtcgc

1020

cagctcgtgt tgtgaaatgt ccggttaagt ccggcaacga gcgagacccc cacttctagt

1080

tggtaaccgt ctctccggag acggtccaca ctagaaggac tgccggtgtt aaaccggagg

1140

aaggaggggg ccacggcagg tcagcatgcc ccgaaacttc cgggccgcac gcgggttaca

1200

atggcaggga cagcgggatc cgaccccgag aggggaaggc aatcccgcaa accctgcctc

1260

agttgggatc gagggctgaa actcgccctc gtgaacgagg aatccctagt aaccgcgggt

1320

caacaacccg cggtgaatac gtccctgctc cttgcacaca ccgcccgtcg ctccacccga

1380

gtggagggga agtgaggcct cttgcccctc ggggtgggag gtcgagcttc tcctccgcga

1440

ggggggagaa gtcgtaacaa ggtagccgta ggggaacctg cggctggatc acctca

1496

<210> 1207

<211> 1376

<212> DNA

<213> Methanobacterium formicicum

<220>

<221> modified_base

<222> (619)..(619)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1207

gattaagcca tgcaagtcga acgatccttc ggggtcgtgg cgtacggctc agtaacacgt

60

ggataaccta accttaggac tgggataacc ctgggaaact ggggataata ccggatatgt

120

agggctgcct ggaatggttc cctattgaaa tgttccgacg cctaaggatg gatctgcggc

180

agattaggta gttggcgggg taaatgccca ccaagccagt aatctgtacg ggttgtgaga

240

gcaagagccc ggagatggaa cctgagacaa ggttccaggc cctacggggc gcagcaggcg

300

cgaaacctcc gcaatgcacg aaagtgcgac gggggaaacc caagtgccac tcttaacggg

360

gtggcttttc ttaagtgtaa aaagcttttg gaataagagc tgggcaagac cggtgccagc

420

cgccgcggta acaccggcag ctcaagtggt ggccgttttt attgggccta aagcgttcgt

480

agccggcttg ataagtctct ggtgaaatct cacggcttaa ccgtgagaat tgctggagat

540

actattaggc ttgaggccgg gagaggttag cggtactccc ggggtagggg tgaaatccta

600

taatcccggg aggaccacnt gtggcgaagg cggctaactg gaacgggcct gacggtgagt

660

aacgaaagcc aggggcgcga accggattag atacccgggt agtcctggcc gtaaacgatg

720

tggacttggt gttgggatgg ctccgagctg ccccagtgcc gaagggaagc tgttaagtcc

780

accgcctggg aagtacggtc gcaagactga aacttaaagg aattggcggg ggagcaccac

840

aacgcgtgga gcctgcggtt taattggatt caacgccgga catctcacca ggggcgacag

900

cagaatgata gccaggttga tgaccttgct tgacaagctg agaggaggtg catggccgcc

960

gtcagctcgt accgtgaggc gtcctgttaa gtcaggcaac gagcgagacc cacgccctta

1020

gttaccagcg gatccttcgg gatgccgggc acactaaggg gaccgccagt gataaactgg

1080

aggaaggagt ggacgacggt aggtccgtat gccccgaatc ccctgggcta cacgcgggct

1140

acaatggtta ggacaatggg ttccgacact gaaaggtgga ggtaatctcc taaacctggc

1200

cttagttcgg attgagggct gtaactcgcc ctcatgaagc tggaatgcgt agtaatcgcg

1260

tgtcataacc gcgcggtgaa tacgtccctg ctccttgcac acaccgcccg tcacgccacc

1320

caaaaagggt ttggatgagg ccatagtctt tggttatggt cgaatctagg ttcttt

1376

<210> 1208

<211> 1359

<212> DNA

<213> Methanobrevibacter acididurans

<220>

<221> modified_base

<222> (988)..(988)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1208

gatttctgtt tgatcctggc agaagctact gctattggga ttcgattaag ccatgcaagt

60

cgaaagaatt tatattcttg gcgtacggct cagtaacacg tggataacct acccttagga

120

ctgggataac tctgggaaac tggagataat actggataga tgatttttcc tgtaattggt

180

attttgttga aatgtttttt cgcctaagga tgggtctgcg gccgattagg tagttggtga

240

ggtaatggct taccaagccg tttatcggta cgggttgtga gagcaagagc ccggagatgg

300

aacctgagac aaggttccag gccctacggg gcgcagcagg cgctaaacct ccgcaatgtg

360

agcaatcgcg acggggggat cccaagtgcc attcttaacg ggatggcttt tcttaagtgt

420

aaagagcttt tggaataaga gctgggcaag accggtgcca gccgccgcgg taacacccgg

480

cagctctagt ggtagctgtt tttattgggc ctaaagcgtt cgtagccggt ttaataagtc

540

tttggtgaaa tcctgttttt taactatggg aattgctgag gatactgtta ggcttgaggt

600

cgggagaggt tagcggtact cccagggtag gggtgaaatc ctgtaatcct gggaggacca

660

cctgtggcga aggcggctaa ctggaacgaa cctgacggtg agggacgaaa gctaggggcg

720

cgaaccggat tagatacccg ggtagtccta gccgtaaacg atgcggactg ggtgttggga

780

tggctttgag ctgtttcggt gccgaaggga agctgttaag tccgccgcct gggaagtacg

840

gtcgcaagac tgaaacttaa aggaattggc gggggagcac cacaacgcgt ggagcctgcg

900

gtttaattgg attcaacgcc ggagatctca ccaggggcga cagcagtatg atggccaggt

960

tgatggcctt gcttgacaag ctgaaganga ggtgcatggc ccgccgtcag ctcgtaccgt

1020

gaggagtcct gttaagtcag gcaacgagcg agaccccacg ctcttagtta ccagcgggat

1080

ccttttttgg atgccgggca cactaagggg accgccagtg ataaactgga ggaaggagtg

1140

gacgacggta ggtccgtatg ccccgaatcc cctgggctac acgcgggcta caatggctga

1200

gacaatgggt tacgacgctg aaaagcggag ttaatcctct aaacttagtc gtagttcgga

1260

ttgagggctg taactcgccc tcatgaagct ggaatgcgta gtaatcgcgt gtcacaatcg

1320

cgcggtgaat acgtccctgc tccttgcaca caccgcccg

1359

<210> 1209

<211> 1268

<212> DNA

<213> Methanobrevibacter arboriphilus

<400> 1209

gctcagtaac acgtggataa cctaccctta ggactgggat aaccctggga aactggggct

60

aatactggat agatggtttt tttcctgtaa tggtatttcg tctaaatgtt ttttttcgcc

120

taaggatggg tctgcggccg attaggttgt tggttaggta atggcttacc aagccgttta

180

tcggtacggg ttgtgagagc aagagcccgg agatggaacc tgagacaagg ttccaggccc

240

tacggggcgc agcaggcgcg aaacctccgc aatgtgagaa atcgcgacgg ggggacccca

300

agtgccattc ttaacgggat ggcttttctt aagtgtaaaa agcttttgga ataagagctg

360

ggcaagaccg gtgccagccg ccgcggtaac accggcagct ctagtggtgg ccagttttat

420

tgggcctaaa gcgttcgtag ccggtttatt aagtctctgg tgaaatcccg tagcttaact

480

atgggaattg ctggagatac tagtagactt gaggtcggga gaggttagag gtactcccag

540

ggtaggggtg aaatcctgta atcctgggag gaccacctgt ggcgaaggcg tctaactgga

600

acgaacctga cggtgaggga cgaaagctag gggcgcgaac cggattagat acccgggtag

660

tcctagccgt aaacgatgcg gacttggtgt tagaatggct ttgagccgct ctagtgccga

720

agggaagctg ttaagtccgt cgcctgggaa gtacggtcgc aagactgaaa cttaaaggaa

780

ttggcggggg agcaccacaa cgcgtggagc ctgcggttta attggattca acgccggaca

840

tctcaccagg ggcgacagca gtatgatggc caggttgatg gccttgcttg acaagctgag

900

aggaggtgca tggccgccgt cagctcgtac cgtgaggcgt cctgttaagt caggcaacga

960

gcgagaccca cgcccttagt taccagcgga tccttttttt tggatgccgg gcacactaag

1020

gggaccgcca gtgataaatt ggaggaagga gtggacgacg gtaggtccgt atgccccgaa

1080

tcccctgggc aacacgcggg ctacaatggc tgagacaatg ggttccgaca ttgaaaagtg

1140

gaggtaatcc tctaaactta gtcgtagttc ggattgaggg ctgtaactcg ccctcatgaa

1200

gctggaatgc gtagtaatcg cgtgtcataa tcgcgcggtg aatacgtccc tgctccttgc

1260

acacaccg

1268

<210> 1210

<211> 1364

<212> DNA

<213> Methanobrevibacter curvatus

<220>

<221> modified_base

<222> (1272)..(1272)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1289)..(1289)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1210

atttatttcg tggcgtacgg ctcagtaaca cgtggataac ctacccttag gactaggata

60

accctgggaa actggggcta atactggata ggtgattttt cctgcaatgg tatttcattt

120

aaatgttctt atgttcgcct aaggatgggt ctgcggccga ttaggttgtt ggtggggtaa

180

tggcttacca agccgattat cggtacgggt tgtgagagca agagcccgga gatggaacct

240

gagacaaggt tccaggccct acggggcgca gcaggcgcga aacctccgca atgtgagcaa

300

tcgcgacggg gggatcccaa gtgccattct taaaagggat ggcttttcat aagtgtaaaa

360

agcttttgga ataagagctg gcaagaccgg tgccagccgc cgcggtaaca ccggcagctc

420

tagtggtagc catttttatt gggcctaaag cgttcgtagc cggtttaata agtctttggt

480

gaaagcctac agcttagctg tgggaattgc tggagatact attagacttg aggtcgggag

540

aggttagagg tactcccagg gtaggggtga aatcctgtaa tcctgggagg accacctgtg

600

gcgaaggcgt ctaactggaa cgaacctgac ggtgagggac gagagctagg ggcgcgagcc

660

ggattagata cccgggcagt cctagccgta aacgatgtgg acttggtgtt gggatggctt

720

tgagctgttt cagtgccgaa gggaagctgt taagtccacc gcctgggaag tacggtcgca

780

agactgaaac ttaaaggaat tggcggggga gcaccacaac gcgtggagcc tgcggtttaa

840

ttggattcta cgccggacat ctcaccaggg gcgacagcag tatgatggcc aggttgatgg

900

tcttgcttga caagctgaga ggaggtgcat ggccgccgtc agctcgtacc gtgaggcgtc

960

ctgttaagtc aggcaacgag cgagacccac gcccttagtt accagcggat ccttcgggat

1020

gccgggcaca ctaaggggac cgccagtgat aaactggagg aaggagtgga cgacggtagg

1080

tccgtatgcc ccgaatcccc tgggcaacac gcgggctaca atggctaaga caatgagttc

1140

cgccactgga aagtgaaggt aatctcctaa acttagtcgt agtacggatt gagggctgta

1200

actcgccctc atgaagctgg aatgcgtagt aatcgcgtgt cataatcgcg cggtgaatac

1260

gtccctgctc cntgcacaca ccgcccgtna caccacccaa aaagggctgg gatgaggctt

1320

tgatcttagg ttaaattcga atctcggttt tttgaggagg gtga

1364

<210> 1211

<211> 1314

<212> DNA

<213> Methanobrevibacter cuticularis

<220>

<221> modified_base

<222> (431)..(431)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (966)..(966)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1211

aggctactgc tattggggtt cgaataagcc atgcaagtcg aacgaattta tattcgtggc

60

atacggctca gtaacacgtg gataacctac ccttaggact agaataaccc tgggaaactg

120

gggctaatac tggatagatg atttttcctg caatggtatt tcgtttaaat gttttttcgc

180

ctaaggatgg gtctgcggcc gaataggtag ttggttaggt aatggcttac caagccgctt

240

atcggtacgg gttgtgagag caagagcccg gagatggaac ctgagacaag gttccaggcc

300

ctacggggcg cagcaggcgc gaaacctccg caatgtgaga aatcgcgacg gggggacccc

360

aagtgccatt cttaacggga tggcatttgt gaggtgtaaa aagcttcaag aataagagct

420

gggcaagacc nggtgccagc cgccgcggta acaccggcag ctctagtggt agccattttt

480

attgggccta aagcgttcgt agccggttta ataagtctct ggtgaaatcc tgtagcttaa

540

ctattggaat tgctggagat actattagac ttgaggtcgg gagaggttag aggtactccc

600

agggtagggg tgaaatcctg taatcctggg aggaccacct gtggcgaagg cgtctaactg

660

gaacgaacct gacggtgagg gacgaaagct aggggcgcga accgggttag atacccgggt

720

agtcctagcc gtaagcgatg cggacttggt gttggaatgg ctttgagccg ctccagtgcc

780

gaagggaagc tgttaagtcc gccgcctggg aagtacggtc gcaagactga aacttaaagg

840

aattggcggg ggagcactca acgcgtggag cctgcggttt aattggattc aacgccggac

900

atctcaccag gggcgacagc agtatgatgg ccaggttgat ggccttgctt gacaagctga

960

gaggangtgc atggccgccg tcagctcgta ccgtgaggcg tcctgttaag tcgggcaacg

1020

agcgagaccc acgcccttag ttaccagcgg atccttttgg atgccgggca cactaagggg

1080

accgccagtg ataaactgga ggaaggagtg gacgacggta ggtccgtatg ccccgaatcc

1140

cctgggcaac acgcgggcta caatggctaa gacaatgggt tccgacactg gaaagtggag

1200

gtaatcctct aaacttagtc gtagttcgga ttgagggctg taacccgccc ccatgaagct

1260

ggaatgcgta gtaatcgcgt gtcataatcg cgcggtgaat acgtccctgc tcct

1314

<210> 1212

<211> 1363

<212> DNA

<213> Methanobrevibacter filiformis

<220>

<221> modified_base

<222> (1017)..(1017)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1212

aatttatatt cgtggcgtac ggctcagtaa cacgtggata acctaccctt aggaccagga

60

taactctgga aactggagct aatactggat aggcgatttt tcctgcaatt ggtatttcgt

120

ttaaatgttt tttcgcctga ggatgggtct gcgttcgatt agattgttgg taaggtaatg

180

gcttaccaag tcgattatcg gtacgggttg tgagagcaag agcctggaga tggaacctga

240

gacaaggttc caggccctac ggggcgcagc aggcgcgaaa cctccgcaat gtgagaaatc

300

gcgacggggg gaccccaagw gccattctta acgggatggc ttttcttaag tgtaaaaagc

360

ttttggaata agagctgggc aagaccgggc cagccgccgc ggtaacaccg gcagctctag

420

tggtagccat ttttattggg cctaaagcgt tcgtagctgg tttaataagt ctttggtgaa

480

atcctatagc ttaactgtgg gaattgctgg ggatactatt agacttgagg tcgggagagg

540

ttagcggtac tctcagggta ggggtgaaat cctgtaatcc tgagaggacc acctgtggcg

600

aaggcggcta actggaacga acctgacggt gagggacgaa agccaggggc gcgaaccgga

660

ttagataccc gggtagtcct ggccgtaaac gatgcggact tggtgttagg atggtcttga

720

gccgttctag tgccgaaggg aagctgttaa gtccgccgcc tgggaagtac ggtcgcaaga

780

ctgaaactta aaggaattgg cgggggagca ccacaacgcg tggagcctgc ggtttaattg

840

gattcaacgc cggacatctc accaggggcg acagccgtat gatagccagg ttgatgatct

900

tgcttgacaa gctgagagga ggtgcatggc cgccgtcagc tcgtaccgtg aggcgtcctg

960

ttaagtcagg caacgagcga gacccacgcc cttagttacc aacagatcct ttattgnatg

1020

ctgggcacac taaggggacc gccagtgata aactggagga aggagtggac gacggtaggt

1080

ccgtatgccc cgaatcccct gggcaacacg cgggctacaa tggctaagac aatgggttcc

1140

gacattgaaa agtggaggta atcccctaaa cttggtcgta gttcggattg agggctgtaa

1200

ctcgccctca tgaagctgga atgcgtagta atcgcgtgtc ataatcgcgc ggtgaatacg

1260

tccctgctcc ttgcgcacac cgcccgtcac accacccaaa aagggcttgg atgaggcttt

1320

aatctttggt taaattcgaa tctaggtttt ttgaggaggg tga

1363

<210> 1213

<211> 1328

<212> DNA

<213> Methanobrevibacter gottschalkii

<400> 1213

tgctactgct attgggattc gattaagcca tgcaagtcga acgagtttag gctcgtggcg

60

tacggctcag taacacgtgg ataacctacc cttaggactg ggataacctt gggaaactga

120

ggataatact ggataggcaa tttttcctgt aatggttttt tgtttaaatg ttttttcgcc

180

taaggatggg tctgcggccg attaggtagt tggttaggta atggcttacc aagcctttga

240

tcggtacggg ttgtgggagc aagagcccgg agatggaacc tgagacaagg ttccaggccc

300

tacggggtgc agcaggcgcg aaacctccgc aatgtgagaa atcgcgacgg ggggatccca

360

agtgctattc ttaacgggat agcttttctt tagtgtaaag agcttttgga ataagagctg

420

ggcaagaccg gtgccagccg ccgcggtaac accggcagct ctagtggtag cagtttttat

480

tgggcctaaa gcgtccgtag ccggtttaat aagtctctgg tgaaatcctg tagcttaact

540

atgggaattg ctggagatac tattggactt gagaccggga gaggttagag gtactcccag

600

ggtagaggtg aaattctgta atcctgggag gaccgcctgt tgcgaaggcg tctgactgga

660

acggttctgc cggtgaggga cgaaagttag gggcgcgaac cggattagat acccgggtag

720

tcctaactgt aaacgatgcg gacttggtgt tggggtggct ttgagctgct tcagtgccga

780

agggaagctg ttaagtccgc cgcctgggaa gtacggtcgc gagactgata cttaraagaa

840

ttggcggggg agcaccacaa cacgtggagc ctgcggttta attggattca acgccggaca

900

tctcaccaga ggcgacagct gtatgatagc caggttgatg actttgcttg actagctgag

960

aggaggtgca tggccgccgt cagctcgtac cgtgaggcgt cctgttaagt caggcaacga

1020

gcgagaccca cgcccttagt taccagcttg tccttttttt ggatgatagg gcacactaag

1080

gggaccgcct atgataaata ggaggaagga gtggacgacg gtaggtccgt atgccccgaa

1140

tcctctgggc aacacgcggg ctacaatggc tgggacaatg ggttccgaca ccgaaaggtg

1200

gaggtaatcc tctaaactta gtcgtagttc ggattgagga ctgtaactcg ttctcatgaa

1260

gctggaatgc gtagtaatcg cgtatcacta ttgcgcggtg aatacgtccc ttggtccttg

1320

cacacacc

1328

<210> 1214

<211> 1262

<212> DNA

<213> Methanobrevibacter millerae

<400> 1214

gctcagtaac acgtggataa cctaccctta ggaccgggat aaccttggga aactgaggat

60

aatactggat aggcaattat tcctggaatg gttttttgtt taaatgtttt ttcgcctaag

120

gatgggtctg cggccgatta ggtagttggt taggtaacgg cttaccaagc cattgatcgg

180

tacgggttgt gagagcaaga gcccggagat ggaacctgag acaaggttcc aggccctacg

240

gggtgcagca ggcgcgaaac ctccgcaatg tgagaaatcg cgacgggggg atcccaagtg

300

ccattcttaa cgggatggct tttcattagt gtaaagagct tttggaataa gggctgggca

360

agaccggtgc cagccgccgc ggtaacaccg gcagctctag tggtagcagt ttttattggg

420

cctaaagcgt ccgtagccgg tttaataagt ctctggtgaa atcctgtagc ttaactgtgg

480

gaattgctgg agatactatt agacttgaga ccgggagagg ttagaggtac tcccagggta

540

gaggtgaaat tctgtaatcc tgggaggacc gcctgttgcg aaggcgtcta actggaacgg

600

ttctgacggt gagggacgaa agttaggggc gcgaaccgga ttagataccc gggtagtcct

660

aaccgtaaac gatgcggact tggtgttggg gtggctttga gctgctccag tgccgaaggg

720

aagctgttaa gtccgccgcc tgggaagtac ggtcgcaaga ctgaaactta aaggaattgg

780

cgggggagca ccacaacgcg tggagcctgc ggtttaattg gattcaacgc cggacatctc

840

accagaggcg acagctgtat gatggccaag ctgatgactt tgcttgacta gctgagagga

900

ggtgcatggc cgccgtcagc tcgtaccgtg aggcgtcctg ttaagtcagg caacgagcga

960

gacccacgcc cttagttacc agcggatcct tttttggatg ccgggcacac taaggggacc

1020

gcctatgata aataggagga aggagtggac gacggtaggt ccgtatgccc cgaatcctct

1080

gggcaacacg cgggctacaa tggctgagac aatgggttcc gacaccgaaa ggtggaggta

1140

atcctctaaa cttagtcgta gttcggattg aggactgtaa ctcgttctca tgaagctgga

1200

atgcgtagta atcgcgtatc actattgcgc ggtgaatacg ttcctgctcc ttgcacacac

1260

cg

1262

<210> 1215

<211> 1266

<212> DNA

<213> Methanobrevibacter olleyae

<400> 1215

tgctcagtaa cacgtggata acctaccctt aggactggga taaccctggg aaactggggc

60

taataccgga tagatgattt ttttcctgta atggtgtttt gtttaaatgt ttttttttcg

120

cctaaggatg ggtctgcggc agattaggta gttggttggg taatggctta ccaagcctat

180

gatctgtacg ggttgtgaga gcaagagccc ggagatggaa cctgagacaa ggttccaggc

240

cctacggggc gcagcaggcg cgaaacctcc gcaatgtgag aaatcgcgac ggggggatcc

300

caagtgccat tcttaacggg atggcttttc ttaagtgtaa aaagcttttg gaataagagc

360

tgggcaagac cggtgccagc cgccgcggta acaccggcag ctctagtggt agctgttttt

420

attgggccta aagcgttcgt agccggtttg gtaagtcact ggtgaaatcc tgtagcttaa

480

ctatgggaat tgctggtgat actgttgaac ttgaggtcgg gagaggttag cggtactccc

540

agggtagagg tgaaattctg taatcctggg aggaccacct gtggcgaagg cggctaactg

600

gaacgaacct gacggtgagg gacgaaagct aggggcgcga accggattag atacccgggt

660

agtcctagcc gtaaacgatg cggacttggt gttgggatgg ctttgagccg ctccggtgcc

720

gaagggaagc tgttaagtcc gccgcctggg aagtacggtc gcaagactga aacttaaagg

780

aattggcggg ggagcaccac aacgcgtgga gcctgcggtt taattggatt caacgccgga

840

catctcacca ggagcgacag ctgtatgatt accaggctga tgaccttgtt tgactagctg

900

agaggaggtg catggccgcc gtcagctcgt accgtgaggc gtcctgttaa gtcaggcaac

960

gagcgagacc acgcccttag ttaccatcag attctttgga atgctgggca cactaagggg

1020

accgccagtg ataaattgga ggaaggagtg gacgacggta ggtccgtatg ccccgaatcc

1080

cctgggctac acgcgggcta caatggctgg gacaatgggt tccgacgccg aaaggtggag

1140

gtaatctttt aaacctagtc gtagttcgga ttgagggctg taactcgccc tcatgaagct

1200

ggaatgcgta gtaatcgcgt gtcacaatcg cgcggtgaat acgtccctgc tccttgcaca

1260

caccga

1266

<210> 1216

<211> 1475

<212> DNA

<213> Methanobrevibacter oralis

<400> 1216

ccggttgatc ctgccagatg ctactgcyat tgggattcga ttaagccatg caagtcgaac

60

gagtttagac tcgtggcgta cggctcagta acacgtggat aacctaccct taggactggg

120

ataaccctgg gaaactgggg ataatactgg ataggcaatt agtcctgtaa tggttttttg

180

tttaaatgtt ttttcgccta aggatgggtc tgcggccgat taggtagttg gttaggtaat

240

ggcttaccaa gccgttgatc ggtacgggtt gtgagagcaa gagcccggag atggaacctg

300

agacaaggtt ccaggcccta cggggcgcag caggcgcgaa acctccgcaa tgtgagaaat

360

cgcgacgggg ggatcccaag tgccattctt aacgggatgg cttttcatta gtgtaaagag

420

cttttggaat aagagctggg caagaccggt gccagccgcc gcggtaacac cggcagttct

480

agtggtagca gttattattg ggcctaaagc gtccgtagcc ggtttaataa gtctctggtg

540

aaatcctgta gcttaactat gggaattgct ggagatacta ttagacttga gatcgggaga

600

ggttagaggt actcccaggg tagaggtgaa attctgtaat cctgggagga ccgcctgttg

660

cgaaggcgtc taactggaac gattctgacg gtgagggacg aaagttaggg gcgcgaaccg

720

gattagatac ccgggtagtc ctaactgtaa acgatgcgga cttggtgttg ggatggcttt

780

gagctgtctc agtgccgaag ggaagctgtt aagtccgccg cctgggaagt acggtcgcaa

840

gactgaaact taaaggaatt ggcgggggag caccacaacg cgtggagcct gcggtttaat

900

tggattcaac gccggacatc tcaccagagg cgacagctgt atgatagcca ggttgatgac

960

tttgcttgac tagctgagag gaggtgcatg gccgccgtca gctcgtaccg tgaggcgtcc

1020

tgttaagtca ggcaacgagc gagacccacg cccttagtta ccagcggatt cttttttttg

1080

aagccgggca cactaggggg accgcctatg ataaatagga ggaaggagtg gacgacggta

1140

ggtccgtatg ccccgaatcc acagggyaac acgcgggcta caatggctga gacaatgggt

1200

tccgacaccg aaaggtggag gtaatcctct aaacttagtc gtagtccgga ttgaggactg

1260

taactcgttc tcatgaagct ggaatgcgta gtaatcgcgt gtcacaatcg cgcggtgaat

1320

acgtccctgc tccttgcaca caccgcccgt cacgccaccc aaaaagggat tggatgagga

1380

tgtaatgttt tttgttatat tcgaatctag tttttttaag gagggcgaag tcgtaacaag

1440

gtacggctag gggaacctgc ggctggatca cctcc

1475

<210> 1217

<211> 1260

<212> DNA

<213> Methanobrevibacter ruminantium

<400> 1217

gctcagtaac acgtggataa cctaccctta ggactgggat aaccctggga aactggggct

60

aataccggat agataatttt tcctggaatg gtattttgtt taaatgtttt ttcgcctaag

120

gatgggtctg cggcagatta ggtagttggt taggtaatgg cttaccaagc ctatgatctg

180

tacgggttgt gagagcaaga gcccggagat ggaacctgag acaaggttcc aggccctacg

240

gggcgcagca ggcgcgaaac ctccgcaatg tgagaaatcg cgacgggggg atcccaagtg

300

ccattcttaa cgggatggct tttcttaagt gtaaaaagct tttggaataa gagctgggca

360

agaccggtgc cagccgccgc ggtaacaccg gcagctctag tggtagctac ttttattggg

420

cctaaagcgt tcgtagccgg tttgataagt cactggtgaa atcctatagc ttaactgtgg

480

gaattgctgg tgatactgtt gaacttgagg tcgggagagg ttagcggtac tcccagggta

540

gaggtgaaat tctgtaatcc tgggaggacc acctgtggcg aaggcggcta actggaacga

600

acctgacggt gagggacgaa agccaggggc gcgaaccgga ttagataccc gggtagtcct

660

ggccgtaaac gatgcggact tggtgttggg atggctttga gccgctccgg tgccgaaggg

720

aagctgttaa gtccgccgcc tgggaagtac ggtcgcaaga ctgaaactta aaggaattgg

780

cgggggagca ccacaacgcg tggagcctgc ggtttaattg gattcaacgc cggacatctc

840

accaggagcg acagctgtat gattaccagg ctgatgacct tgtttgacta gctgagagga

900

ggtgcatggc cgccgtcagc tcgtaccgtg aggcgtcctg ttaagtcagg caacgagcga

960

gacccacgcc cttagttacc atcagattct ccggaatgct gggcacacta aggggaccgc

1020

cagtgataaa ctggaggaag gagtggacga cggtaggtcc gtatgccccg aatcccctgg

1080

gctacacgcg ggctacaatg gctgggacaa tgggttccga cgccgaaagg cgaaggcaat

1140

cttttaaacc tagtcgtagt tcggattgag ggctgtaact cgccctcatg aagctggaat

1200

gcgtagtaat cgcgtgtcac aatcgcgcgg tgaatacgtc cctgctcctt gcacacaccg

1260

<210> 1218

<211> 1485

<212> DNA

<213> Methanobrevibacter smithii

<400> 1218

ttcaattctg tttgatcctg gcagatgcta ctgctattgg gattcgatta agccatgcaa

60

gtcgaacgag tttaggctcg tggcgtacgg ctcagtaaca cgtggataac ctacccttag

120

gactgggata accctgggaa actggggata atactggata ggcaattatt cctgtaatgg

180

ttttttgttt aaatgttttt tcgcctaagg atgggtctgc ggccgattag gtagttggtt

240

aggtaatggc ttaccaagcc tttgatcggt acgggttgtg agagcaagag cccggagatg

300

gaacctgaga caaggttcca ggccctacgg ggtgcagcag gcgcgaaacc tccgcaatgt

360

gagaaatcgc gacgggggga tcccaagtgc cattcttaac gggatggctt ttcattagtg

420

taaagagctt ttggaataag agctgggcaa gaccggtgcc agccgccgcg gtaacaccgg

480

cagctctagt ggtagcagtt tttattgggc ctaaagcgtc cgtagccggt ttaataagtc

540

tctggtgaaa tcctgcagct taactgtggg aattgctgga gatactatta gacttgagat

600

cgggagaggt tagaggtact cccagggtag aggtgaaatt ctgtaatcct gggaggaccg

660

cctgttgcga aggcgtctga ctggaacgat tctgacggtg agggacgaaa gctaggggcg

720

cgaaccggat tagatacccg ggtagtccta gctgtaaacg atgcggactt ggtgttgggg

780

tggctttgag ctgtcccagt gccgaaggga agctgttaag tccgccgcct gggaagtacg

840

gtcgcaagac tgaaacttaa aggaattggc gggggagcac cacaacgcgt ggagcctgcg

900

gtttaattgg attcaacgcc ggacatctca ccagaggcga cagctgtatg atagccaggt

960

tgatgacttt gcttgactag ctgagaggag gtgcatggcc gccgtcagct cgtaccgtga

1020

ggcgtcctgt taagtcaggc aacgagcgag acccacgctc ttagttacca gcggatcctt

1080

ttttggatgc cgggcacact aaggggaccg cctatgataa ataggaggaa ggagtggacg

1140

acggtaggtc cgtatgcccc gaatcctctg ggcaacacgc gggctacaat ggctgagaca

1200

atgggttccg acgccgaaag gcggaggtaa tcctctaaac ttagtcgtag ttcggattga

1260

ggactgtaac tcgttctcat gaagctggaa tgcgtagtaa tcgcgtgtca caatcgcgcg

1320

gtgaatacgt ccctgctcct tgcacacacc gcccgtcacg ccacccaaaa agggattgga

1380

tgaggatgta atgttttgtt atattcgaat ctagtttttt taaggagggc gaagtcgtaa

1440

caaggtagcc gtaggggaac ctgcggctgg atcacctcct tacac

1485

<210> 1219

<211> 1268

<212> DNA

<213> Methanobrevibacter thaueri

<220>

<221> modified_base

<222> (6)..(8)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (607)..(607)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (610)..(611)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (868)..(868)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1124)..(1124)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1255)..(1255)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1258)..(1258)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1219

aagccnnnca agtcgaacga atttagattc gtggcgtacg gctcagtaac acgtggataa

60

cctaccctta ggaccgggat aaccttggga aactgaggat aatactggat aggcaatttt

120

tcctgtaatg gttttttgtt taaatgtttt ttcgcctaag gatgggtctg cggccgatta

180

ggtagttggt taggtaatgg cttaccaagc cgttgatcrg aacgggttgt gagagcaaga

240

gcccggagat ggaacctgag acaaggttcc aggccctacg gggcgcagca ggcgcgaaac

300

ctccgcaatg tgagaaatcg cgacgggggg atcccaagtg ccattcttaa cgggatggct

360

tttcattagt gtaaagagct tttggaataa gagctgggca agaccggtgc cagccgccgc

420

ggtaacaccg gcagctctag tggtaacaat ttttattggg cctaaagcgt ccgtagccgg

480

tttaataagt ctctggtgaa atcctgtagc ttaactgtgg gaattgctgg agatactatt

540

agacttgaga ccgggagagg ttagaggtac tcccagggta gaggtgaaat tctgtaatcc

600

tgggagnacn ncctgttgcg aaggcgtcta actggaacgg ttctgacggt gagggacgaa

660

agttaggggc gcgaaccgga ttagataccc gggtagtcct aactgtaaac gatgcggact

720

tggtgttggg gtggctttga gctgctccag tgccgaaggg aagctgttaa gtccgccgcc

780

tgggaagtac ggtcgcaaga ctgaaactta aaggaattgg cgggggagca ccacaacgcg

840

tggagcctgc ggtttaattg gattcaangc cggacatctc accagaggcg acagctgtat

900

gatagccagg ytgatgactt tgcttgacta gctgagagga ggtgcatggc cgccgtcagc

960

tcgtaccgtg aggcgtcccg ttaagtcagg caacgagcga gacccacgcc cttagttacc

1020

agcttatccc ctcggggatg atgggcacac taaggggacc gcctatgata aataggagga

1080

aggagtggac gacggtaggt ccgtatgccc cgaatcctct gggnaacacg cgggctacaa

1140

tggctgagac aatgggttcc gacaccgaaa ggtggaggta atcctctaaa cttagtcgta

1200

gttcggattg aggactgtaa ctcgttctca tgaagctgga atgcgtagta atcgngtntc

1260

accattgc

1268

<210> 1220

<211> 1335

<212> DNA

<213> Methanobrevibacter woesei

<220>

<221> modified_base

<222> (32)..(32)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1220

tgctactgct attgggattc gattaagcca tncaagttga acgaatttag attcgtggcg

60

tacggctcag taacacgtgg ataacctacc cttaggactg ggataactct gggaaactgg

120

ggataatacc ggataggcaa tttttcctgt aatggttttt tgtttaaatg ttttttttcg

180

cctaaggatg ggtctgcggc agattaggta gttggttagg taatggctta ccaagccgtt

240

gatctgtacg ggttgtgaga gcaagagccc ggagatggaa cctgagacaa ggttccaggc

300

cctacggggc gcagcaggcg cgaaacctcc gcaatgtgag aaatcgcgac ggggggatcc

360

caagtgccat tcttaacggg atggcttttc attagtgtaa agagcttttg gaataagagc

420

tgggcaagac cgttgccaac cgccgcggta acaccgtcag ctctagtggt agcagttttt

480

attgggccta aagcgtccgt agccggttta ttaagtctct ggtgaaatcc tgtagcttaa

540

ctgtgggaat tgctggagat actagtagac ttgagatcgg gagaggttag aggtactccc

600

agggtagagg tgaaattctg taatcctggg aggaccgcct gtggcgaagg cgtctagctg

660

gaacgattct gccggtgagg gacgaaagct aggggcgcga accggattag atacccgggt

720

agtcctagct gtaaacgatg cggacttggt gttgggatgg ctttgagctg ctccagtgcc

780

gaagggaagc tgttaagtcc gccgcctggg aagtacggtc gcaagactga aacttaaagg

840

aattggcggg ggagcaccac aacgcgtgga gcctgcggtt taattggatt caacgccgga

900

catctcacca gaggcgacag ctgtatgatg accagtttga tgagcttgtt tgactagctg

960

agaggaggtg catggccgcc gtcagctcgt accgtgaggc gtcctgttaa gtcaggcaac

1020

gagcgagacc cacgccctta gttaccagcg gattctagtg aatgccgggc acactagggg

1080

gaccgcctgt gataaatagg aggaaggagt ggacgacggt aggtccgtat gccccgaatc

1140

ctctgggcaa cacgcgggct acaatggatg agacaatggg ttccgacgcc gaaaggtgga

1200

ggtaatcctc taaacttatt cgtagttcgg attgaggact gtaactcgtt ctcatgaagc

1260

tggaatgcgt agtaatcgcg tgtcataatc gcgcggtgaa tacgtccctg ctccttggac

1320

acaccgcccg tcacg

1335

<210> 1221

<211> 1366

<212> DNA

<213> Methanobrevibacter wolinii

<220>

<221> modified_base

<222> (27)..(27)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1221

agctactgct attgggattc gattaancca tacaagatga acgaactttt tggttcgtgg

60

cgtacggctc agtaacacgt ggataaccta cccttaggac tgggataact ccgggaaact

120

ggggataata ctggataggc aatttttcct gtaatggttt tttgtttaaa tgttttttcg

180

cctaaggatg ggtctgcggc agattaggtt gttggttggg taatggctta ccaagcctat

240

aatctgtacg ggttgtgaga gcaagagccc ggagatggaa cctgagacaa ggttccaggc

300

cctacggggc gcagcaggcg cgaaacctcc gcaatgtgag aaatcgcgac ggggggatcc

360

caagtgctat tcttaacggg gtagcttttc ttaagtgtaa agagcttttg gaataagagc

420

tgggcaagac cggtgccagc cgccgcggta acaccggcag ctctagtggt agctgttttt

480

attgggcctg aagcgttcgt agccggtttg ataagtctct ggtgaaatct tgtagcttaa

540

ctgtgggaat tgctggagat actattaggc ttgagatcgg gagaggtcag aggtactcct

600

ggggtagggg tgaaatcctg taatcctagg aggaccacct gtggcgaagg cgtctgacta

660

gaacgattct gacggtgagg aacgaaagct aggggcgcga accggattag atacccgggt

720

agtcctagcc gtaaactatg cggacttggt gtgagggtgg ctttgagccg tcctggtgcc

780

gaagggaagc tgttaagtcc gccgcctggg aagtacggtc gcaagactga aacttaaagg

840

aattgtcggg ggagcaccac aacgcgtgga gcctgcggtt taattggatt caacgccgga

900

gatctcacca gcggcgacag cagtatgatt atcaggctga tgaccttatt tgacaagctg

960

agaggaggtg catggccgcc gtcatctcgt gccgtgaggc gtcctgttaa gtcaggcaac

1020

gagcgagacc cacgctctta gttaccagca tgttactttg gtaatgatgg ggacactaag

1080

gggaccgcca gtgataaatt ggaggaagga gtggacgacg gtaggtccgt atgccccgaa

1140

tccgctgggc tacacgcggg ctacaatggc agagacaatg ggttccgacg ctgaaaagcg

1200

gtggtaatct tttaaacttt gtcgtagttc ggattgaggg ctgtaactcg tcctcatgaa

1260

gctggaatgc gtagtaatcg cgtgtcataa tcgcgcggtg aatacgtccc tgctccttgg

1320

acacaccgac cgtcacgcca cccaaaaagg gcttggttga ggcttt

1366

<210> 1222

<211> 1261

<212> DNA

<213> Methanosphaera stadtmanae

<400> 1222

gctcagtaac acgtggataa cttaccctta ggaccgggat aactttggga aactgaagat

60

aatactggat attaggttat gcctggaatg gtttaccttt gaaatgtatt tttcgcctaa

120

ggatagatct gcggctgatt aggtcgttgg tggggtaatg gcccaccaag ccgatgatcg

180

gtacgggttg tgagagcaag agcccggaga tggaacctga gacaaggttc cagaccctac

240

ggggtgcagc aggcgcgaaa cctccgcaat gtacgcaagt gcgacggggg gatcccaagt

300

gttattctta acagaataac ttttcattag tgtaaaaagc ttttagaata agagctgggc

360

aagaccggtg ccagccgccg cggtaacacc ggcagctcaa gtggtagctg tttttattgg

420

gcctaaagcg ttcgtagccg gtttgataag tctttggtga aagcttgtag cttaactata

480

agaattgctg aagatactgt cagacttgaa gtcgggagag gttagaggta ctaccggggt

540

aggggtgaaa tcctataatc ctgggaggac cacctgtggc gaaggcgtct aactggaacg

600

atcttgacgg tgagtaacga aagccagggg cgcgaaccgg attagatacc cgggtagtcc

660

tggccgtaaa cgatgtggac ttggtgttgg aatggcctcg agttgttccg gtgccgaagg

720

gaagctgtta agtccaccgc ctgggaagta cggtcgcaag actgaaactt aaaggaattg

780

gcgggggagc accacaacgc gtggagcctg cggtttaatt ggattcaacg ccggacatct

840

caccaggagc gacagcagaa tgataatcag gttgatgacc ttatttgact agctgagagg

900

aggtgcatgg ccgccgtcag ctcgtactgt gaagcgtcct gttaagtcag gcaacgagcg

960

agacccacgc ccttagttac caacacaatc tctggattgg tgggcacact agggggaccg

1020

ccagtgataa actggaggaa ggagtggacg acggtaggtc cgtatgcccc gaatctcctg

1080

ggctacacgc gggctacaat ggctatggca atgggtttct gcactgaaaa gtgatggtaa

1140

tctcctaaac atagtcttag ttcggattga gggctgtaac tcgccctcat gaagctggaa

1200

tgcgtagtaa tcgcatgtca caaccgtgcg gtgaatacgt ccctgctcct tgcacacacc

1260

g

1261

<210> 1223

<211> 1347

<212> DNA

<213> Methylobacterium extorquens

<400> 1223

ccttagagtt tgatcctggc tcagagcgaa ctcttgcggc aggcttaaca catgcaagtc

60

gaacgggctt cttcggaagt cagtggcaga cgggtgagta acacgtggga acgtgccctt

120

cggttcggaa taactcaggg aaacttgagc taataccgga tacgcccttt tggggaaagg

180

ttgactgccg aaggatcggc ccgcgtctga ttagcttgtt ggtggggtaa cggcctacca

240

aggcgacgat cagtagctgg tctgagagga tgatcagcca cactgggact gagacacggc

300

ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattggaca atgggcgcaa gcctgatcca

360

gccatgccgc gtgagtgatg aaggccttag ggttgtaaag ctcttttgtc cgggacgata

420

atgacggtac cggaagaata agccccggct aacttcgtgc cagcagccgc ggtaatacga

480

agggggctag cgttgctcgg aatcactggg cgtaaagggc gcgtaggcgg ccgattaagt

540

cgggggtgaa agcctgtggc tcaaccacag aattgccttc gatactggtt ggcttgagac

600

cggaagagga cagcggaact gcgagtgtag aggtgaaatt cgtagatatt cgcaagaaca

660

ccagtggcga aggcggctgt ctggtccggt tctgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag

720

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgaatgcca gccgttggcc

780

tgcttgcagg tcagtggcgc cgctaacgca ttaagcattc cgcctgggga gtacggtcgc

840

aagattaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

900

ttcgaagcaa cgcgcagaac cttaccatcc cttgacatgg catgttaccc cgagagatcg

960

gggatcctct tcggaggcgt gcacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1020

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccacgtc cttagttgcc atcattcagt

1080

tgggcactct agggagactg ccggtgataa gccgcgagga aggtgtggat gacgtcaagt

1140

cctcatggcc cttacgggat gggctacaca cgtgctacaa tggcggtgac agagggacgc

1200

gaaaccgcga ggttgagcaa atccccaaaa gccgtctcag ttcggattgc actctgcaac

1260

tcgggtgcat gaaggcggaa tcgctagtaa tcgtggatca gcacgccacg gtgaatacgt

1320

tcccgggcct tgcaaaaacc gcccgtc

1347

<210> 1224

<211> 1335

<212> DNA

<213> Methylobacterium podarium

<400> 1224

tgagtttgat catggctcag agcgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgaac

60

gagtggcaga cgggtgagta acacgtggga acgtgccctt cggttcggaa taactcaggg

120

aaacttgagc taataccgga tacggaaagc tgccgaagga tcggcccgcg tctgattagc

180

ttgttggtgg ggtaacggcc taccaaggcg acgatcagta gctggtctga gaggatgatc

240

agccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

300

ggacaatggg cgcaagcctg atccagccat gccgcgtgag tgatgaaggc cttagggttg

360

taaagctctt ttgtccggga cgatgacggt accggaagaa taagccccgg ctaacttcgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gaagggggct agcgttgctc ggaatcactg ggcgtaaagg

480

gcgcgtaggc ggccgattaa gtcgggggtg aaagcctgtg gctcaaccac agaattgcct

540

tcgatactgg ttggcttgag accggaagag gacagcggaa ctgcgagtgt agaggtgaaa

600

ttcgtagata ttcgcaagaa caccagtggc gaaggcggct gtctggtccg tctgacgctg

660

aggcgcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgaatgcca gccgttggtc ggtcagtggc gccgctaacg cattaagcat tccgcctggg

780

gagtacggtc gcaagattaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgcaga accttaccat cccttgccat gcacaggtgc

900

tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccacgtcct tagttgccat catgggcact ctagggagac tgccggtgat aagccggagg

1020

aaggtgtgga tgacgtcaag tcctcatggc ccttacggga tgggctacac acgtgctaca

1080

atggcggtca gagggaggcg aaggggcgac ctggagcaaa tcccggccgt ctcagttcgg

1140

atgcactctg caactcgggt gcagaaggcg gaatcgctag taatcgtgga tcagcacgcc

1200

acggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agttggtctt

1260

acccgacggc gctcgccagg caggcgacca cggtagggtc agcgactggg gtgaagtcgt

1320

aacaaggtaa ccgta

1335

<210> 1225

<211> 1516

<212> DNA

<213> Methylobacterium radiotolerans

<400> 1225

agagtttgat cctggctcag gctggaacac ctcctcagag tttgatcatg gctcagagcg

60

aacgctggcg gcaggcttaa cacatgcaag tcgagcgggc ccttcggggt cagcggcgga

120

cgggtgagta acgcgtggga acgtgccttc tggttcggaa taaccctggg aaactagggc

180

taataccgga tacgcccttt ttggggaaag gtttactgcc ggaagatcgg cccgcgtctg

240

attagcttgt tggtggggta acggcctacc aaggcgacga tcagtagctg gtctgagagg

300

atgatcagcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

360

aatattggac aatgggcgca agcctgatcc agccatgccg cgtgagtgat gaaggcctta

420

gggttgtaaa gctcttttat ccgggacgat aatgacggta ccggaggaat aagccccggc

480

taacttcgtg ccagcagccg cggtaatacg aagggggcta gcgttgctcg gaatcactgg

540

gcgtaaaggg cgcgtaggcg gcgttttaag tcgggggtga aagcctgtgg ctcaaccaca

600

gaatggcctt cgatactggg acgcttgagt atggtagagg ttggtggaac tgcgagtgta

660

gaggtgaaat tcgtagatat tcgcaagaac accggtggcg aaggcggcca actggaccat

720

tactgacgct gaggcgcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

780

cgccgtaaac gatgaatgcc agctgttggg gtgcttgcac cgcagtagcg cagctaacgc

840

tttgagcatt ccgcctgggg agtacggtcg caagattaaa actcaaagga attgacgggg

900

gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgcagaa ccttaccatc

960

ctttgacatg gcgtgttacc cagagagatt tggggtccac ttcggtggcg cgcacacagg

1020

tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1080

caacccacgt ccttagttgc catcattcag ttgggcactc tagggagact gccggtgata

1140

agccgcgagg aaggtgtgga tgacgtcaag tcctcatggc ccttacggga tgggctacac

1200

acgtgctaca atggcggtga cagtgggagg cgaaggagcg atctggagca aatccccaaa

1260

agccgtctca gttcggattg cactctgcaa ctcgagtgca tgaaggcgga atcgctagta

1320

atcgtggatc agcatgccac ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac

1380

accatgggag ttggtcttac ccgacggcgc tgcgccaacc gcgaggaggc aggcgaccac

1440

ggtagggtca gcgactgggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtaggggaa cctgcggctg

1500

gatcacctcc ttagag

1516

<210> 1226

<211> 1334

<212> DNA

<213> Methylobacterium sp. 1sub

<400> 1226

gagtttgatc ctggctcaga gcgaacgctg gcggcaggct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcagac gggtgagtaa cacgtgggaa cgtgcccttc ggttcggaat aactcaggga

120

aacttgagct aataccggat acggaaagct gccgaaggat cggcccgcgt ctgattagct

180

tgttggtggg gtaacggcct accaaggcga cgatcagtag ctggtctgag aggatgatca

240

gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

300

gacaatgggc gcaagcctga tccagccatg ccgcgtgagt gatgaaggcc ttagggttgt

360

aaagctcttt tgtccgggac gatgacggta ccggaagaat aagccccggc taacttcgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg aagggggcta gcgttgctcg gaatcactgg gcgtaaaggg

480

cgcgtaggcg gccgattaag tcgggggtga aagcctgtgg ctcaaccaca gaattgcctt

540

cgatactggt tggcttgaga ccggaagggg acagcggaac tgcgagtgta gaggtgaaat

600

tcgtagatat tcgcaagaac accagtggcg aaggcggctg tctggtccgt ctgacgctga

660

ggcgcgaaag cgtggggagc aaacgggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga

720

tgaatgccag ccgctggccg gtcagtggcg ccgctaacgc attaagcatt ccgcctgggg

780

agtacggtcg caagattaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc

840

atgtggttta attcgaagca acgcgcagaa ccttaccatc ccttgacatg cacaggtgct

900

gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccacgtcctt agttgccatc atgggcactc tagggagact gccggtgata agccggagga

1020

aggtgtggat gacgtcaagt cctcatggcc cttacgggat gggctacaca cgtgctacaa

1080

tggcggtcag tgggacgcga aaccgcgagg ttgagcaaat ccccgccgtc tcagttcgga

1140

tgcactctgc aactcgggtg cagaaggcgg aatcgctagt aatcgtggat cagcacgcca

1200

cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gttggtctta

1260

cccgacggcg ctcgccaggc aggcgaccac ggtagggtca gcgactgggg tgaagtcgta

1320

acaaggtaac cgta

1334

<210> 1227

<211> 1334

<212> DNA

<213> Methylobacterium sp. MM4

<400> 1227

gagtttgatc atggctcaga gcgaacgctg gcggcaggct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcagac gggtgagtaa cacgtgggaa cgtgcccttc ggttcggaat aactcaggga

120

aacttgagct aataccggat acggaaagct gccgaaggat cggcccgcgt ctgattagct

180

tgttggtggg gtaacggcct accaaggcga cgatcagtag ctggtctgag aggatgatca

240

gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

300

gacaatgggc gcaagcctga tccagccatg ccgcgtgagt gatgaaggcc ttagggttgt

360

aaagctcttt tgtccgggac gatgacggta ccggaagaat aagccccggc taacttcgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg aagggggcta gcgttgctcg gaatcactgg gcgtaaaggg

480

cgcgtaggcg gccgattaag tcgggggtga aagcctgtgg ctcaaccaca gaattgcctt

540

cgatactggt tggcttgaga ccggaagagg acagcggaac tgcgagtgta gaggtgaaat

600

tcgtagatat tcgcaagaac accagtggcg aaggcggctg tctggtccgt ctgacgctga

660

ggcgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga

720

tgaatgccag ccgttggccg gtcagtggcg ccgctaacgc attaagcatt ccgcctgggg

780

agtacggtcg caagattaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc

840

atgtggttta attcgaagca acgcgcagaa ccttaccatc ccttgacatg cacaggtgct

900

gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccacgtcctt agttgccatc atgggcactc tagggagact gccggtgata agccggagga

1020

aggtgtggat gacgtcaagt cctcatggcc cttacgggat gggctacaca cgtgctacaa

1080

tggcggtcag tgggacgcga aaccgcgagg ttgagcgaat ccccgccgtc tcagttcgga

1140

tgcactctgc aactcgggtg cagaaggcgg aatcgctagt aatcgtggat cagcacgcca

1200

cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gttggtctta

1260

cccgacggcg ctcgccaggc aggcgaccac ggtagggtca gcgactgggg tgaagtcgta

1320

acaaggtaac cgta

1334

<210> 1228

<211> 1475

<212> DNA

<213> Methylocella silvestris

<400> 1228

agagtttgat cctggctcag aacgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac

60

gctgtagcaa tacagagtgg cagacgggtg agtaacacgt gggaacatac ccttcggttc

120

ggaacaactc agggaaactt gagctaatac cggatacgcc ctttggggga aagatttatc

180

gccgaaggat tggcccgcgt ctgattagct agttggcggg gtaatggccc accaaggcga

240

cgatcagtag ctggtctgag aggatgatca gccacattgg gactgagaca cggcccaaac

300

tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggc gcaagcctga tccagccatg

360

ccgcgtgagt gatgaaggcc ttagggttgt aaagctcttt tacctgggaa gataatgacg

420

gtaccaggag aataagcccc ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgaaggggg

480

ctagcgttgt tcggatttac tgggcgtaaa gcgcacgtag gcggatcttt aagtcagggg

540

tgaaatcccg gggctcaacc tcggaactgc ctttgatact ggggatctcg agtccgggag

600

aggtgagcgg aactgcgagt gtagaggtga aattcgtaga tattcgcaag aacaccagtg

660

gcgaaggcgg ctcactggcc cggtactgac gctgaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca

720

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatggat gctagccgtt aggcagcttg

780

ctgcttagtg gcgcagttaa cgctttaagc atcccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt

840

aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa

900

gcaacgcgca gaaccttacc agctcttgac atgtccggtt tggtttccag agatggattc

960

cttcagttag gctggccgga acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1020

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa ccctcgccct tagttgccat catttagttg

1080

ggcactctag ggggactgcc ggtgataagc cgagaggaag gtggggatga cgtcaagtcc

1140

tcatggccct tacgggctgg gctacacacg tgctacaatg gcggtgacag tgggatgcta

1200

aggggcgacc cctcgcaaat ctcaaaaagc cgtctcagtt cggattgcgc tctgcaactc

1260

gagcgcatga aggtggaatc gctagtaatc gtagatcaga acgctacggt gaatacgttc

1320

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg gttctacccg aaggcgtttt

1380

cttaaccgca aggagagagg cgaccacggt agggtcagcg actggggtga agtcgtaaca

1440

aggtagccgt aggggaacct gcggctggat cacct

1475

<210> 1229

<211> 1351

<212> DNA

<213> Methylophilus sp. ECd5

<220>

<221> modified_base

<222> (77)..(77)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1012)..(1012)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1229

tggcggaatg ctttacacat gcaagtcgaa cggcagcacg ggagcttgct cctggtggcg

60

agtggcgaac gggtgantaa tatatcggaa cgtatccaat aatgggggat aactaatcga

120

aaggttggct aataccgcat acgccctacg ggggaaagct agggaccttc gggcctggcg

180

ttaatggagc ggccgatatc tgattagcta gttggtgagg taaaagctca ccaaggcgac

240

gatcagtagc tggtctgaga ggacgaccag ccacactgga actgagacac ggtccagact

300

cctacgggag gcagcagtgg ggaattttgg acaatgggcg caagcctgat ccagccattc

360

cgcgtgagtg aagaaggcct tcgggttgta aagctctttc gcaagggaag aaagattatc

420

ctctaacata ggatgattat gacggtacct tgataagaag caccggctaa ctacgtgcca

480

gcagccgcgg taatacgtag ggtgcgagcg ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgtgc

540

gcaggctgtt ttgtaagtca gatgtgaaat ccctgagctc aacttaggaa ctgcgtttga

600

aactacaaga ctagaatatg tcagaggggg gtagaattcc acgtgtagca gtgaaatgcg

660

tagagatgtg gaggaatacc aatggcgaag gcagccccct gggataatat tgacgctcat

720

gcacgaaagc gtggggagca accaggatta gatacctggt agtccacgcc ctaaacgatg

780

tttactagtt gttggtggag taaaatccat gagtaacgca gctaacgcgt gaagtagacc

840

gcctggggag tacggtcgca agattaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc

900

ggtggattat gtggattaat tcgatgcaac gcgaaaaacc ttacctggcc ttgacatgcc

960

actaacgaag cagagatgca ttaggtgctc gaaagagaaa gtggacacag gngctgcatg

1020

gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg

1080

ccaataattg ccatcattta gttgggcact ttattgggac tgccggtgac aaaccggagg

1140

aaggtgggga tgacgtcaag tcctcatggc ccttatggcc agggcttcac acgtaataca

1200

atggtcggta cagagagttg ccaacccgcg agggggagcc aatctcagaa agccgatcgt

1260

agtccggatt gcaggctgca actcgcctgc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcggat

1320

cagcatgtcg cggtgaatac gttcccgggc c

1351

<210> 1230

<211> 1472

<212> DNA

<213> Microbacterium chocolatum

<220>

<221> modified_base

<222> (176)..(179)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1230

tgcttacaac atgcaagtcg aacggtgaag ccaagattgc ttggtggatc agtggcgaac

60

gggtgagtaa cacgtgagca kcctgccctg aactctggga taagcgctgg aaacggcgtc

120

taatactgga tatgagctgc ggaggcatct tcgtggttgg aaagattttt cggttnnnna

180

tgggctcgcg gcctatcagc ttgttggtga ggtaatggct caccaaggcg tcgacgggta

240

gccggcctga gagggtgacc ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctctacggga

300

ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc ggaagcttga tgcagcaacg ccgcgtgagg

360

gatgacggct tcgggttgta aacctctttt agcagggaag aagcgaaagt gacggtacct

420

gcagaaaaag cgccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggcgcaaccg

480

ttatccggaa ttattgggcg taaagagctc gtaggcggtt tgtcgcgtct gctgtgaaat

540

cccgaggctc aacctcgggt gtgcagtggg tacgggcaga ctagagtgcg gtaggggaga

600

ttggaattcc tggtgtagcg gtggaatgcg cagatatcag gaggaacacc gatggcgaag

660

gcagatctct gggccgtaac tgacgctgag gagcgaaagg gtggggagca aagaggctta

720

gataccctgg tagtccaccc cgtaaacgtt gggaactagt tgtggggtcc attcctcgga

780

ttccgtgacg cagctaacgc attaagttcc ccgcctgggg agtacggccg caaggctaaa

840

actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggcggagc atgcggatta attcgatgca

900

acgcgaagaa ccttaccaag gcttgacata cacgagaacg ctgcagaaat gtagaactct

960

ttggacactc gtgaacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg

1020

ttaagtcccg caacgagcgc aaccctcgtt ctatgttgcc agcacgtaat ggtgggaact

1080

catgggatac tgccggggtc aactcggagg aaggtggggt agacgtcaaa tcatcatgcc

1140

ccttatgtct tgggcttcac gcatgctaca atggccggta caaagggctg caataccgcg

1200

aggtggagcg aatcccaaaa agccggtccc agttcggatt gaggtctgca actcgacctc

1260

atgaagtcgg agtcgctagt aatcgcagat cagcaacgct gcggtgaata cgttcccggg

1320

tcttgtacac accgcccgtc aagtcatgaa agtcggtaac acctgaagcc ggtggcccaa

1380

cccttgtgga gggagccgtc gaaggtggga tcggtaatta ggactaagtc gtaacaaggt

1440

agccgtaccg gaaggtgcgc tggatcacct cc

1472

<210> 1231

<211> 1475

<212> DNA

<213> Microbacterium flavescens

<400> 1231

gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggtgaagcag agcttgctct

60

gtggatcagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgagcaacc tgccccggac tctgggataa

120

gcgctggaaa cggcgtctaa tactggatat gaatcgcgac cgcatggtca gtggttggaa

180

agatttttcg gtctgggatg ggctcgcggc ctatcagctt gttggtgagg taatggctca

240

ccaaggcgtc gacgggtagc cggcctgaga gggtgaccgg ccacactggg actgagacac

300

ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg gaagcctgat

360

gcagcaacgc cgcgtgaggg acgacggcct tcgggttgta aacctctttt agcaaggaag

420

aagcgaaagt gacggtactt gcagaaaaag cgccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

480

taatacgtag ggcgcaagcg ttatccggaa ttattgggcg taaagagctc gtaggcggtt

540

tgtcgcgtct gctgtgaaaa cccgaggctc aacctcgggc ctgcagtggg tacgggcaga

600

ctagagtgcg gtaggggaga ttggaattcc tggtgtagcg gtggaatgcg cagatatcag

660

gaggaacacc gatggcgaag gcagatctct gggccgtaac tgacgctgag gagcgaaagg

720

gtggggagca aacaggctta gataccctgg tagtccaccc cgtaaacgtt gggaactagt

780

tgtggggtcc attccacgga ttccgtgacg cagctaacgc attaagttcc ccgcctgggg

840

agtacggccg caaggctaaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggcggagc

900

atgcggatta attcgatgca acgcgaagaa ccttaccaag gcttgacata cacgagaacg

960

ctgcagaaat gtagaactct ttggacactc gtgaacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

1020

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aaccctcgtt ctatgttgcc

1080

agcacgtaat ggtgggaact catgggatac tgccggggtc aactcggagg aaggtgggga

1140

tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtct tgggcttcac gcatgctaca atggccggta

1200

caaagggctg caataccgta aggtggagcg aatcccaaaa agccggtccc agttcggatt

1260

gaggtctgca actcgacctc atgaagtcgg agtcgctagt aatcgcagat cagcaacgct

1320

gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc aagtcatgaa agtcggtaac

1380

acctgaagcc ggtggcccaa cccttgtgga gggagccgtc gaaggtggga tcggtaatta

1440

ggactaagtc gtaacaaggt agccgtaccg gaagg

1475

<210> 1232

<211> 1317

<212> DNA

<213> Microbacterium gubbeenense

<220>

<221> modified_base

<222> (71)..(71)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (98)..(98)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (132)..(132)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (188)..(188)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (197)..(197)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1232

acagttggaa acagctgcta ataccggata cgcacgagaa ccgcatggtt actcgtggga

60

aagatttttc ngttcgggag gggctcgcgt cctatcanct tgttggtgag gtagtggctc

120

accaaggcgt cnacgggtag ccggcctgag agggtgaccg gccacactgg gactgagaca

180

cggcccanac tcctacngga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga

240

tgcagcaacg ccgcgtgagg gacgacggcc ttcgggttgt aaacctcttt tagttgggaa

300

gaagccttcg ggtgacggta ccttcagaaa aagcaccggc taactacgtg ccagcagccg

360

cggtaatacg tagggtgcaa gcgttatccg gaattattgg gcgtaaagag ctcgtaggcg

420

gtttgtcacg tctgctgtga aaactggagg ctcaacttcc agcttgcagt gggtacgggc

480

agacttgagt gcggtagggg agattggaat tcctggtgta gcggtggaat gcgcagatat

540

caggaggaac accgatggcg aaggcagatc tctgggcccg taactgacgc tgaggagcga

600

aagagtgggg agcaaacagg cttagatacc ctggtagtcc actccgtaaa cgttgggaac

660

tagttgtggg ggcctttcta cggtctccgt gacgcagcta acgcattaag ttccccgcct

720

ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa aggaattgac ggggacccgc acaagcggcg

780

gagcatgcgg attaattcga tgcaacgcga agaaccttac caaggcttga catataccgg

840

aaacggcttg gaaacagtcg cccccttgtg gtcggtatac aggtggtgca tggttgtcgt

900

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaaag tcccgcaacg agcgcaaccc tcgttctatg

960

ttgccagcac gttatggtgg gaactcatgg aatactgccg gggtcaactc ggaggaaggt

1020

ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgtcttgggc ttcacgcatg ctacaatggc

1080

cggtacaatg ggctgcgata ccgtgaggtg gagcgaatcc caaaaagccg gtcccagttc

1140

ggattgtagt ctgcaactcg actacatgaa gtcggagtcg ctagtaatcg cagatcagca

1200

acgctgcggt gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcaagtc atgaaagtcg

1260

gtaacacctg aagccggtgg cctaacccct tgtgggaggg agctgtcgaa ggtggga

1317

<210> 1233

<211> 1479

<212> DNA

<213> Microbacterium lacticum

<400> 1233

tttgcaaagc gtttgtggcg tgcttaacac atgcatatcg aacggtgaag gcggagcttg

60

ctctgctgga tcagtggcga acgggtgagt aacacgtgag caatctgccc ctgactctgg

120

gataagcgct ggaaacggcg tctaatactg gatacgagct gcgaaggcat cttcagcagc

180

tggaaagaay ttcggtcagg gatgagctcg cggcctatca gcttgttggt gaggtaacgg

240

ctcaccaagg cgtcgacggg tagccggcct gagagggtga ccggccacac tgggactgag

300

acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggcgaaagcc

360

tgatgcagca acgccgcgtg agggacgacg gccttcgggt tgtaaacctc ttttagcagg

420

gaagaagcga aagtgacggt acctgcagaa aaagcgccgg ctaactacgt gccagcagcc

480

gcggtaatac gtagggcgca agcgttatcc ggaattattg ggcgtaaaga gctcgtaggc

540

ggtttgtcgc gtctgctgtg aaaccccgag gctcaacctc gggcctgcag tgggtacggg

600

cagactagag tgcggtagrg gagattggaa ttcctggtgt agcggtggaa tgcgcagata

660

tcaggaggaa caccgatggc gaaggcagat ctctgggccg taactgacgc tgaggagcga

720

aagggtgggg agcaaacagg cttagatacc ctggtagtcc accccgtaaa cgttgggaac

780

tagttgtggg gtccattcca cggattccgt gacgcagcta acgcattaag ttccccgcct

840

ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa aggaattgac ggggacccgc acaagcggcg

900

gagcatgcgg attaattcga tgcaacgcga agaaccttac caaggcttga catatacgag

960

aacgggccag aaatggtcaa ctctttggac actcgtaaac aggtggtgca tggttgtcgt

1020

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct cgttctatgt

1080

tgccagcacg tcatggtggg aactcatgga atactgccgg ggtcaactcg gaggaaggtg

1140

aggatgacgt caaatcatca tgccccttat gtcttgggct tcacgcatgc tacaatggcc

1200

ggtacaatgg gctgcaatac cgcaaggtgg agcgaatccc aaaaagccgg tcccagttcg

1260

gattgaggtc tgcaactcga cctcatgaag tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa

1320

cgctgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcaagtca tgaaagtcgg

1380

taacacctga agccggtggc ccaacccttg tggagggagc cgtcgaaggt gggatcggta

1440

attaggacta agtcgtaaca aggtagccgt accggaagg

1479

<210> 1234

<211> 1475

<212> DNA

<213> Microbacterium oleivorans

<400> 1234

gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggtgaagcag agcttgctct

60

gtggatcagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgagcaacc tgcccctgac tctgggataa

120

gcgctggaaa cggcgtctaa tactggatat gagctgcgac cgcatggtca gcagttggaa

180

agatttttcg gtctgggatg ggctcacggc ctatcagctt gttggtgagg taatggctca

240

ccaaggcgtc gacgggtagc cggcctgaga gggtgaccgg ccacactggg actgagacac

300

ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg aaagcctgat

360

gcagcaacgc cgcgtgaggg atgacggcct tcgggttgta aacctctttt agcagggaag

420

aagcgaaagt gacggtacct gcagaaaaag cgccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

480

taatacgtag ggcgcaagcg ttatccggaa ttattgggcg taaagagctc gtaggcggtt

540

tgtcgcgtct gctgtgaaat cccgaggctc aacctcgggt ctgcagtggg tacgggcaga

600

ctagagtgcg gtaggggaga ttggaattcc tggtgtagcg gtggaatgcg cagatatcag

660

gaggaacacc gatggcgaag gcagatctct gggccgttac tgacgctgag gagcgaaagg

720

gtggggagca aacaggctta gataccctgg tagtccaccc cgtaaacgtt gggaactagt

780

tgtggggtcc attccacgga ttccgtgacg cagctaacgc attaagttcc ccgcctgggg

840

agtacggccg caaggctaaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggcggagc

900

atgcggatta attcgatgca acgcgaagaa ccttaccaag gcttgacata tacgagaacg

960

ggccagaaat ggtcaactct ttggacactc gtaaacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

1020

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aaccctcgtt ctatgttgcc

1080

agcacgtaat ggtgggaact catgggatac tgccggggtc aactcggagg aaggtgggga

1140

tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtct tgggcttcac gcatgctaca atggccggta

1200

caaagggctg caataccgtg aggtggagcg aatcccaaaa agccggtccc agttcggatt

1260

gaggtctgca actcgacctc atgaagtcgg agtcgctagt aatcgcagat cagcaacgct

1320

gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc aagtcatgaa agtcggtaac

1380

acctgaagcc ggtggcccaa cccttgtgga gggagccgtc gaaggtggga ttggtaatta

1440

ggactaagtc gtaacaaggt agccgtaccg gaagg

1475

<210> 1235

<211> 1467

<212> DNA

<213> Microbacterium oxydans

<400> 1235

tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgaa cggtgaacac ggagcttgct ctgtgggatc

60

agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgagca acctgcccct gactctggga taagcgctgg

120

aaacggcgtc taatactgga tatgtgacgt gaccgcatgg tctgcgtctg gaaagaattt

180

cggttgggga tgggctcgcg gcctatcagc ttgttggtga ggtaatggct caccaaggcg

240

tcgacgggta gccggcctga gagggtgacc ggccacactg ggactgagac acggcccaga

300

ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagcaac

360

gccgcgtgag ggacgacggc cttcgggttg taaacctctt ttagcaggga agaagcgaaa

420

gtgacggtac ctgcagaaaa agcgccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

480

agggcgcaag cgttatccgg aattattggg cgtaaagagc tcgtaggcgg tttgtcgcgt

540

ctgctgtgaa atccggaggc tcaacctccg gcctgcagtg ggtacgggca gactagagtg

600

cggtagggga gattggaatt cctggtgtag cggtggaatg cgcagatatc aggaggaaca

660

ccgatggcga aggcagatct ctgggccgta actgacgctg aggagcgaaa gggtggggag

720

caaacaggct tagataccct ggtagtccac cccgtaaacg ttgggaacta gttgtggggt

780

ccattccacg gattccgtga cgcagctaac gcattaagtt ccccgcctgg ggagtacggc

840

cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggcgga gcatgcggat

900

taattcgatg caacgcgaag aaccttacca aggcttgaca tatacgagaa cgggccagaa

960

atggtcaact ctttggacac tcgtaaacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg

1020

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctcg ttctatgttg ccagcacgta

1080

atggtgggaa ctcatgggat actgccgggg tcaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca

1140

aatcatcatg ccccttatgt cttgggcttc acgcatgcta caatggccgg tacaaagggc

1200

tgcaataccg cgaggtggag cgaatcccaa aaagccggtc ccagttcgga ttgaggtctg

1260

caactcgacc tcatgaagtc ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa

1320

tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcaagtcatg aaagtcggta acacctgaag

1380

ccggtggcct aacccttgtg gagggagccg tcgaaggtgg gatcggtaat taggactaag

1440

tcgtaacaag gtagccgtac cggaagg

1467

<210> 1236

<211> 1490

<212> DNA

<213> Microbacterium paraoxydans

<400> 1236

tagagtttga tcctggctca ggatgaacgc tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgaa

60

cggtgaacac ggagcttgct ctgtgggatc agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgagca

120

acctgcccct gactctggga taagcgctgg aaacggcgtc taatactgga tatgtgacgt

180

gaccgcatgg tctgcgtttg gaaagatttt tcggttgggg aggggctcgc ggcctatcag

240

cttgttggtg aggtaatggc tcaccaaggc gtcgacgggt agccggcctg agagggtgac

300

cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tgcacaatgg gcgaaagcct gatgcagcaa cgccgcgtga gggatgacgg ccttcgggtt

420

gtaaacctct tttagcaggg aagaagcgaa agtgacggta cctgcagaaa aagcgccggc

480

taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggcgcaa gcgttatccg gaattattgg

540

gcgtaaagag ctcgtaggcg gtttgtcgcg tctgctgtga aatcccgagg ctcaacctcg

600

ggcctgcagt gggtacgggc agactagagt gcggtagggg agattggaat tcctggtgta

660

gcggtggaat gcgcagatat caggaggaac accgatggcg aaggcagatc tctgggccgt

720

aactgacgct gaggagcgaa agggtgggga gcaaacaggc ttagataccc tggtagtcca

780

ccccgtaaac gttgggaact agttgtgggg tccattccac ggattccgtg acgcagctaa

840

cgcattaagt tccccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg

900

gggacccgca caagcggcgg agcatgcgga ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc

960

aaggcttgac atatacgaga acgggccaga aatggtcaac tctttggaca ctcgtaaaca

1020

ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1080

cgcaaccctc gttctatgtt gccagcacgt aatggtggga actcatggga tactgccggg

1140

gtcaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg tcttgggctt

1200

cacgcatgct acaatggccg gtacaaaggg ctgcaatacc gtgaggtgga gcgaatccca

1260

aaaagccggt cccagttcgg attgaggtct gcaactcgac ctcatgaagt cggagtcgct

1320

agtaatcgca gatcagcaac gctgcggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc

1380

gtcaagtcat gaaagtcggt aacacctgaa gccggtggcc taacccttgt ggagggagct

1440

gtcgaaggtg ggatcggtaa ttaggactaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1490

<210> 1237

<211> 1474

<212> DNA

<213> Microbacterium phyllosphaerae

<400> 1237

gctgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggtgaagccc agcttgctgg

60

gtggatcagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgagcaatc tgcccctgac tctgggataa

120

gcgctggaaa cggcgtctaa tactggatac gaacagcgac cgcatggtca gttgttggaa

180

agaatttcgg tcagggatga gctcgcggcc tatcagcttg ttggtgaggt aatggctcac

240

caaggcgtcg acgggtagcc ggcctgagag ggtgaccggc cacactggga ctgagacacg

300

gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg

360

cagcaacgcc gcgtgaggga cgacggcctt cgggttgtaa acctctttta gcagggaaga

420

agcgaaagtg acggtacctg cagaaaaagc gccggctaac tacgtgccag cagccgcggt

480

aatacgtagg gcgcaagcgt tatccggaat tattgggcgt aaagagctcg taggcggttt

540

gtcgcgtctg ctgtgaaatc ccgaggctca acctcgggtc tgcagtgggt acgggcagac

600

tagagtgcgg taggggagat tggaattcct ggtgtagcgg tggaatgcgc agatatcagg

660

aggaacaccg atggcgaagg cagatctctg ggccgtaact gacgctgagg agcgaaaggg

720

tggggagcaa acaggcttag ataccctggt agtccacccc gtaaacgttg ggaactagtt

780

gtggggtcca ttccacggat tccgtgacgc agctaacgca ttaagttccc cgcctgggga

840

gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggcggagca

900

tgcggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttaccaagg cttgacatat acgagaacgg

960

gccagaaatg gtcaactctt tggacactcg taaacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

1020

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca accctcgttc tatgttgcca

1080

gcacgtaatg gtgggaactc atgggatact gccggggtca actcggagga aggtggggat

1140

gacgtcaaat catcatgccc cttatgtctt gggcttcacg catgctacaa tggccggtac

1200

aaagggctgc aataccgtaa ggtggagcga atcccaaaaa gccggtccca gttcggattg

1260

aggtctgcaa ctcgacctca tgaagtcgga gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg

1320

cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca agtcatgaaa gtcggtaaca

1380

cctgaagccg gtggcctaac ccttgtggag ggagccgtcg aaggtgggat cggtaattag

1440

gactaagtcg taacaaggta gccgtaccgg aagg

1474

<210> 1238

<211> 1460

<212> DNA

<213> Microbacterium schleiferi

<400> 1238

tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgaa cggtgaagca gagcttgctc tgtggatcag

60

tggcgaacgg gtgagtaaca cgtgagcaat ctgcccctga ctctgggata agcgctggaa

120

acggcgtcta ataccggata cgagctgcga aggcatcttc agcagctgga aagaatttcg

180

gtcagggatg agctcgcggc ctatcagctt gttggtgagg taacggctca ccaagccgtc

240

gacgggtagc cggcctgaga gggtgaccgg ccacactggg actgagacac ggcccagact

300

cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg aaagcctgat gcagcaacgc

360

cgcgtgaggg acgacggcct tcgggttgta aacctctttt agcaggaaag aagcgaaagt

420

gacggtacct gcagaaaaag cgccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

480

ggcgcaagcg ttatccggaa ttattgggcg taaagagctc gtaggcggtc tgtcgcgtct

540

gctgtgaaaa cccgaggctc aacctcgggc ctgcagtggg tacgggcaga ctagagtgcg

600

gtaggggaga ttggaattcc tggtgtagcg gtggaatgcg cagatatcag gaggaacacc

660

gatggcgaag gcagatctct gggccgtaac tgacgctgag gagcgaaagg gtggggagca

720

aacaggctta gataccctgg tagtccaccc cgtaaacgtt gggaactagt tgtggggtcc

780

attccacgga ttccgtgacg cagctaacgc attaagttcc ccgcctgggg agtacggccg

840

caaggctaaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggcggagc atgcggatta

900

attcgatgca acgcgaagaa ccttaccaag gcttgacata tacgagaacg ggccagaaat

960

ggtcaactct ttggacactc gtaaacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1020

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aaccctcgtt ctatgttgcc agcacgtaat

1080

ggtgggaact catgggatac tgccggggtc aactcggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1140

tcatcatgcc ccttatgtct tgggcttcac gcatgctaca atggccggta caaagggctg

1200

caataccgcg aggtggagcg aatcccaaaa agccggtccc agttcggatt gaggtctgca

1260

actcgacctc atgaagtcgg agtcgctagt aatcgcagat cagcaacgct gcggtgaata

1320

cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc aagtcatgaa agtcggtaac acctgaagcc

1380

ggtggcccaa cccttgtgga gggagccgtc gaaggtggga tcggtaatta ggactaagtc

1440

gtaacaaggt agccgtaccg

1460

<210> 1239

<211> 1475

<212> DNA

<213> Microbacterium sp. 768

<400> 1239

gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggtgaagccc agcttgctgg

60

gtggatcagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgagcaacc tgcccctgac tctgggataa

120

gcgctggaaa cggcgtctaa tactggatac gaaccacagt cgcatggctc gtggttggaa

180

agattttttg gttggggatg ggctcgcggc ctatcagctt gttggtgagg taatggctca

240

ccaaggcgtc gacgggtagc cggcctgaga gggtgaccgg ccacactggg actgagacac

300

ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat

360

gcagcaacgc cgcgtgaggg atgacggcct tcgggttgta aacctctttt agcaaggaag

420

aagcgaaagt gacggtactt gcagaaaaag cgccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

480

taatacgtag ggcgcaagcg ttatccggaa ttattgggcg taaagagctc gtaggcggtt

540

tgtcgcgtct gctgtgaaat cccgaggctc aacctcgggc ctgcagtggg tacgggcaga

600

ctagagtgcg gtaggggaga ttggaattcc tggtgtagcg gtggaatgcg cagatatcag

660

gaggaacacc gatggcgaag gcagatctct gggccgtaac tgacgctgag gagcgaaagg

720

gtggggagca aacaggctta gataccctgg tagtccaccc cgtaaacgtt gggaactagt

780

tgtggggtcc tttccacgga ttccgtgacg cagctaacgc attaagttcc ccgcctgggg

840

agtacggccg caaggctaaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggcggagc

900

atgcggatta attcgatgca acgcgaagaa ccttaccaag gcttgacata cacgagaaca

960

ccctagaaat aggggactct ttggacactc gtgaacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

1020

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aaccctcgtt ctatgttgcc

1080

agcacgtaat ggtgggaact catgggatac tgccggggtc aactcggagg aaggtgggga

1140

tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtct tgggcttcac gcatgctaca atggccggta

1200

caaagggctg caataccgtg aggtggagcg aatcccaaaa agccggtccc agttcggatt

1260

gaggtctgca actcgacctc atgaagtcgg agtcgctagt aatcgcagat cagcaacgct

1320

gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc aagtcatgaa agtcggtaac

1380

acctgaagcc ggtggcccaa cccttgtgga gggagccgtc gaaggtggga tcggtaatta

1440

ggactaagtc gtaacaaggt agccgtaccg gaagg

1475

<210> 1240

<211> 1474

<212> DNA

<213> Microbacterium sp. oral strain C24KA

<400> 1240

aggatgaacg ctggcggcgt gcttaacaca tgcaagtcga acggtgaagg cccagcttgc

60

tgggtggatc agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgagca atctgcccct gactctggga

120

taagcgctgg aaacggcgtc taatactgga tatgaaccgt ggaggcatct tcaacggttg

180

gaaagatttt ttggtcaggg atgagctcgc ggcctatcag cttgttggtg aggtaatggc

240

tcaccaaggc gtcgacgggt agccggcctg agagggtgac cggccacact gggactgaga

300

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct

360

gatgcagcaa cgccgcgtga gggacgacgg ccttcgggtt gtaaacctct tttagcaggg

420

aagaagcgaa agtgacggta cctgcagaaa aagcgccggc taactacgtg ccagcagccg

480

cggtaatacg tagggcgcaa gcgttatccg gaattattgg gcgtaaagag ctcgtaggcg

540

gtttgtcgcg tctgctgtga aatcccgagg ctcaacctcg ggtctgcagt gggtacgggc

600

agactagagt gcggtagggg agattggaat tcctggtgta gcggtggaat gcgcagatat

660

caggaggaac accgatggcg aaggcagatc tctgggccgt aactgacgct gaggagcgaa

720

agggtgggga gcaaacaggc ttagataccc tggtagtcca ccccgtaaac gttgggaact

780

agttgtgggg tccattccac ggattccgtg acgcagctaa cgcattaagt tccccgcctg

840

gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcggcgg

900

agcatgcgga ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc aaggcttgac atatacgaga

960

acgctgcaga aatgtagaac tctttggaca ctcgtaaaca ggtggtgcat ggttgtcgtc

1020

agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc gttctatgtt

1080

gccagcacgt aatggtggga actcatggga tactgccggg gtcaactcgg aggaaggtgg

1140

ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg tcttgggctt cacgcatgct acaatggccg

1200

gtacaaaggg ctgcaatacc gtaaggtgga gcgaatccca aaaagccggt cccagttcgg

1260

attgaggtct gcaactcgac ctcatgaagt cggagtcgct agtaatcgca gatcagcaac

1320

gctgcggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcaagtcat gaaagtcggt

1380

aacacctgaa gccggtggcc caacccttgt ggagggagcc gtcgaaggtg ggatcggtaa

1440

ttaggactaa gtcgtaacaa ggtagccgta ccgg

1474

<210> 1241

<211> 1474

<212> DNA

<213> Microbacterium testaceum

<400> 1241

gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggtgaagcca agcttgcttg

60

gtggatcagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgagcaacc tgccctggac tctgggataa

120

gcgctggaaa cggcgtctaa tactggatat gagctcctat cgcatggtgg gggttggaaa

180

gatttttcgg tctgggatgg gctcgcggcc tatcagcttg ttggtgaggt aatggctcac

240

caaggcgtcg acgggtagcc ggcctgagag ggtgaccggc cacactggga ctgagacacg

300

gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggcgg aagcctgatg

360

cagcaacgcc gcgtgaggga tgacggcctt cgggttgtaa acctctttta gcagggaaga

420

agcgagagtg acggtacctg cagaaaaagc gccggctaac tacgtgccag cagccgcggt

480

aatacgtagg gcgcaagcgt tatccggaat tattgggcgt aaagagctcg taggcggttt

540

gtcgcgtctg ctgtgaaatc ccgaggctca acctcgggcc tgcagtgggt acgggcagac

600

tagagtgcgg taggggagat tggaattcct ggtgtagcgg tggaatgcgc agatatcagg

660

aggaacaccg atggcgaagg cagatctctg ggccgtaact gacgctgagg agcgaaaggg

720

tggggagcaa acaggcttag ataccctggt agtccacccc gtaaacgttg ggaactagtt

780

gtggggacca ttccacggtt tccgtgacgc agctaacgca ttaagttccc cgcctgggga

840

gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggcggagca

900

tgcggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttaccaagg cttgacatat acgagaacgg

960

gccagaaatg gtcaactctt tggacactcg taaacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

1020

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca accctcgttc tatgttgcca

1080

gcacgtaatg gtgggaactc atgggatact gccggggtca actcggagga aggtggggat

1140

gacgtcaaat catcatgccc cttatgtctt gggcttcacg catgctacaa tggccggtac

1200

aaagggctgc aataccgtga ggtggagcga atcccaaaaa gccggtccca gttcggattg

1260

aggtctgcaa ctcgacctca tgaagtcgga gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg

1320

cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca agtcatgaaa gtcggtaaca

1380

cctgaagccg gtggcccaac ccttgtggag ggagccgtcg aaggtgggat cggtaattag

1440

gactaagtcg taacaaggta gccgtaccgg aagg

1474

<210> 1242

<211> 1497

<212> DNA

<213> Micrococcus antarcticus

<400> 1242

tcagaacgaa cgctggcggc gtgcttaaca catgcaagtc gaacgatgaa gcccagcttg

60

ctgggtggat tagtggcgaa cgggtgagta acacgtgagt aacctgccct tgactctagg

120

ataagcccgg gaaactgggt ctaatactgg ataggaacgt ctaccgcatg gtgggtgttg

180

gaaagaattt cggtcatgga tggactcgcg gcctatcagc ttgttggtga ggtaatggct

240

caccaaggcg acgacgggta gccggcctga gagggtgacc ggccacactg ggactgagac

300

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg cgaaagcctg

360

atgcagcgac gccgcgtgag ggatgacggc cttcgggttg taaacctctt tcagtaggga

420

agaagcgaaa gtgacggtac ctgcagaaga agcaccggct aactacgtgc cagcagccgc

480

ggtaatacgt agggtgcgag cgttatccgg aattattggg cgtaaagagc tcgtaggcgg

540

tttgtcgcgt ctgtcgtgaa agtccggggc ttaaccccgg atctgcggtg ggtacgggca

600

gactagagtg cagtagggga gactggaatt cctggtgtag cggtggaatg cgcagatatc

660

aggaggaaca ccgatggcga aggcaggtct ctgggctgta actgacgctg aggagcgaaa

720

gcatggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg ttgggcacta

780

ggtgtgggga acattccacg ttttccgcgc cgcagctaac gtattaggtg ccccgcctgg

840

ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga

900

gcatgcggat taattcgatg caacgcgaag aaccttacca aggcttgaca tgttctcgat

960

cgccgtagag atacggtttc ccctttgggg cgggttcaca ggtggtgcat ggttgtcgtc

1020

agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc gttccatgtt

1080

gccagcactt cgggtgggga ctcatgggag actgccgggg tcgactcgga ggaaggtggg

1140

gacgacgtca aatcatcatg ccccttatgt cttgggcttc acgcatgcta caatggccgg

1200

tacaatgggt tgcgatactg tgaggtggag ctaatcccaa aaagccggtc tcagttcgga

1260

ttggggtctg caactcgacc ccatgaagtc ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcaacg

1320

ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcaagtcacg aaagtcggta

1380

acacccgaag ccggtggcct aacccttgtg gagggggccg tcgaaggtgg gaccagcgat

1440

tgggactaag tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc ggctggatca cctcctt

1497

<210> 1243

<211> 1632

<212> DNA

<213> Micrococcus luteus

<400> 1243

ttacggagag tttgatcctg gctcaggatg aacgctggcg gcgtgcttaa cacatgcaag

60

tcgaacgatg aagcccagct tgctgggtgg attagtggcg aacgggtgag taacacgtga

120

gtaacctgcc cttaactctg ggataagcct gggaaactgg gtctaatacc ggataggagc

180

gtccaccgca tggtgggtgt tggaaagatt tatcggtttt ggatggactc gcggcctatc

240

agcttgttgg tgaggtaatg gctcaccaag gcgacgacgg gtagccggcc tgagagggtg

300

accggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

360

attgcacaat gggcgaaagc ctgatgcagc gacgccgcgt gagggatgac ggccttcggg

420

ttgtaaacct ctttcagtag ggaagaagcg aaagtgacgg tacctgcaga agaagcaccg

480

gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc gagcgttatc cggaattatt

540

gggcgtaaag agctcgtagg cggtttgtcg cgtctgtcgt gaaagtccgg ggcttaaccc

600

cggatctgcg gtgggtacgg gcagactaga gtgcagtagg ggagactgga attcctggtg

660

tagcggtgga atgcgcagat atcaggagga acaccgatgg cgaaggcagg tctctgggct

720

gtaactgacg ctgaggagcg aaagcatggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc

780

catgccgtaa acgttgggca ctaggtgtgg ggaccattcc acggtttccg cgccgcagct

840

aacgcattaa gtgccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga

900

cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgcg gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta

960

ccaaggcttg acatgttccc gatcgccgta gagatacgat ttcccctttg gggcgggttc

1020

acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

1080

gagcgcaacc ctcgttccat gttgccagca cgtaatggtg gggactcatg ggagactgcc

1140

ggggtcaact cggaggaagg tgaggacgac gtcaaatcat catgcccctt atgtcttggg

1200

cttcacgcat gctacaatgg ccggtacaat gggttgcgat actgtgaggt ggagctaatc

1260

ccaaaaagcc ggtctcagtt cggattgggg tctgcaactc gaccccatga agtcggagtc

1320

gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1380

cccgtcaagt cacgaaagtc ggtaacaccc gaagccggtg gcctaaccct tgtgggaggg

1440

agccgtcgaa ggtgggacca gcgattggga ctaagtcgta acaaggtagc cgtaccggaa

1500

ggtgcggctg gatcacctcc tttctaagga gcatcagtgc ccgttgcatc accgcgtgtg

1560

tgatggcggg ttgctcatgg gtggaacatc aatgaatggt gccagtggtg gtgccggcag

1620

tgctcgagta cg

1632

<210> 1244

<211> 1472

<212> DNA

<213> Micrococcus lylae

<400> 1244

gatcctggct caggatgaac gctggcggcg tgcttaacac atgcaagtcg aacgatgaag

60

ctccagcttg ctggggtgga ttagtggcga acgggtgagt aacacgtgag taacctgccc

120

ttgactctgg gataagcctt ggaaacgggg tctaataccg gataggagca ttcaccgcat

180

ggtgggtgtt ggaaagaatt tcggtcttgg atggactcgc ggcccatcag cttgttggtg

240

aggtaatggc tcaccaaggc gacgacgggt agccggcctg agagggtgac cggccacact

300

gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg

360

gcgcaagcct gatgcagcga cgccgcgtga gggatgacgg ccttcgggtt gtaaacctct

420

ttcagtaggg aagaagcgaa agtgacggta cctgcagaag aagcaccggc taactacgtg

480

ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcga gcgttatccg gaattattgg gcgtaaagag

540

ctcgtaggcg gtttgtcgcg tctgccgtga aagtccgggg cttaactccg gatctgcggt

600

gggtacgggc agactagagt gcagtagggg agactggaat tcctggtgta gcggtggaat

660

gcgcagatat caggaggaac accgatggcg aaggcaggtc tctgggctgt aactgacgct

720

gaggagcgaa agcatgggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca tgccgtaaac

780

gtttggcact aggtgtgggg gccattccac ggtttccgcg ccgcagctaa cgcattaagt

840

gccccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca

900

caagcggcgg agcatgcgga ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc aaggcttgac

960

atgttctcgt tcgccgtaga gatacggttt cccctttggg gcgggttcac aggtggtgca

1020

tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc

1080

tgttctatgt tgccagcacg tgatggtggg gactcatggg agactgccgg ggtcaactcg

1140

gaggaaggtg gggacgacgt caaatcatca tgccccttat gtcttgggct tcacgcatgc

1200

tacaatggcc ggtacaatgg gttgcgatac tgtgaggtgg agctaatccc aaaaagccgg

1260

tctcagttcg gattggggtc tgcaactcga ccccatgaag ttggagtcgc tagtaatcgc

1320

agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagtca

1380

cgaaagtcgg taacacccga agccggtggc ctaacccttg tggaaggagc cgtcgaaggt

1440

gggactggcg attgggacta agtcgtaaca ag

1472

<210> 1245

<211> 1469

<212> DNA

<213> Micrococcus sp. 185

<220>

<221> modified_base

<222> (977)..(977)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1245

cgctggcggc gtgcttaaca catgcaagtc gaacgatgaa gcccagcttg ctgggtggat

60

tagtggcgaa cgggtgagta acacgtgagt aacctgccct taactctggg ataagcctgg

120

gaaactaggt ctaataccgg ataggagcgc ctaccgcatg gtgggtgttg gaaagattta

180

tcggttttgg atggactcgc ggcctatcag cttgttggtg aggtaatggc tcaccaaggc

240

gacgacgggt agccggcctg agagggtgac cggccacact gggactgaga cacggcccag

300

actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgaaagcct gatgcagcga

360

cgccgcgtga gggatgacgg ccttcgggtt gtaaacctct ttcagtaggg aagaagcgaa

420

agtgacggta cctgcagaag aagcaccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

tagggtgcga gcgttatccg gaattattgg gcgtaaagag ctcgtaggcg gtttgtcgcg

540

tctgtcgtga aagtccgggg cttaaccccg gatctgcggt gggtacgggc agactagagt

600

gcagtagggg agactggaat tcctggtgta gcggtggaat gcgcagatat caggaggaac

660

accgatggcg aaggcaggtc tctgggctgt aactgacgct gaggagcgaa agcatgggga

720

gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca tgccgtaaac gttgggcact aggtgtgggg

780

accattccac ggtttccgcg ccgcagctaa cgcattaagt gccccgcctg gggagtacgg

840

ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggcgg agcatgcgga

900

ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc aaggcttgac atgttctcga tcgccgtaga

960

gatacggttt ccccttnggg gcgggttcac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt

1020

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct cgttccatgt tgccagcacg

1080

taatggtggg gactcatggg agactgccgg ggtcaactcg gaggaaggtg aggacgacgt

1140

caaatcatca tgccccttat gtcttgggct tcacgcatgc tacaatggcc ggtacaatgg

1200

gttgcgatac tgtgaggtgg agctaatccc aaaaagccgg tctcagttcg gattggggtc

1260

tgcaactcga ccccatgaag tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg

1320

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagtca cgaaagttgg taacacccga

1380

agccggtggc ctaacccttg tggggggagc cgtcgaaggt gggaccagcg attgggacta

1440

agtcgtaaca aggtagccgt accggaagg

1469

<210> 1246

<211> 1502

<212> DNA

<213> Microcystis aeruginosa

<400> 1246

ttcatcatgg agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg

60

caagtcgaac gggaatcttc ggattctagt ggcggacggg tgagtaacgc gtaagaatct

120

aacttcagga cggggacaac agttggaaac gactgctaat acccgatatg ccgcgaggtg

180

aaacctaatt ggcctgaaga agagcttgcg tctgattagc tagttggtgg ggtaagagcc

240

taccaaggcg acgatcagta gctggtctga gaggatgagc agccacactg ggactgagac

300

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatttt ccgcaatggg cgaaagcctg

360

acggagcaac gccgcgtgag ggaggaaggt ctttggattg taaacctctt ttctcaagga

420

agaagttctg acggtacttg aggaatcagc ctcggctaac tccgtgccag cagccgcggt

480

aatacggggg aggcaagcgt tatccggaat tattgggcgt aaagcgtccg caggtggtca

540

gccaagtctg ctgtcaaatc aggttgctta acgacctaaa ggcggtggaa actggcagac

600

tagagagcag taggggtagc aggaattccc agtgtagcgg tgaaatgcgt agagattggg

660

aagaacatcg gtggcgaaag cgtgctactg ggctgtatct gacactcagg gacgaaagct

720

aggggagcga aagggattag atacccctgt agtcctagcc gtaaacgatg gatactaggc

780

gtggcttgta tcgacccgag ccgtgccgaa gctaacgcgt taagtatccc gcctggggag

840

tacgcacgca agtgtgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagtat

900

gtggtttaat tcgatgcaac gcgaagaacc ttaccaagac ttgacatgtc gcgaaccctg

960

gtgaaagctg ggggtgcctt cgggagcgcg aacacaggtg gtgcatggct gtcgtcagct

1020

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca accctcgttc ttagttgcca

1080

gcattaagtt ggggactcta aggagactgc cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga

1140

cgtcaagtca gcatgcccct tacgtcttgg gcgacacacg tactacaatg gtcgggacaa

1200

agggcagcga actcgcgaga gccagcgaat cccagcaaac ccggcctcag ttcagattgc

1260

aggctgcaac tcgcctgcat gaaggaggaa tcgctagtaa tcgccggtca gcatacggcg

1320

gtgaattcgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatggaagc tggtcacgcc

1380

cgaagtcatt acctcaaccg caaggagggg gatgcctaag gcagggctag tgactggggt

1440

gaagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag gtgtggctgg atcacctcct taaagggaga

1500

cc

1502

<210> 1247

<211> 1543

<212> DNA

<213> Mitsuokella jalaludinii

<400> 1247

tgatcctggc tcaggacgaa cgctggcggc gtgcttaaca catgcaagtc gtacgagacg

60

attgaaagct tgcttttgaa agtcgagtgg caaacgggtg agtaacgcgt agacaacctg

120

ccgtaaagat ggggacaaca gttcgaaagg actgctaata ccgaatgttg tagagtttcc

180

gcatgggaat cctactaaag gtggcctcta cttgtaagct atcgctttac gatgggtctg

240

cgtctgatta gctagttggt ggggtaacgg cctaccaagg cgacgatcag tagccggtct

300

gagaggatga acggccacat tggaactgag acacggtcca gactcctacg ggaggcagca

360

gtggggaatc ttccgcaatg ggcgcaagcc tgacggagca acgccgcgtg agtgaagaag

420

ggtttcgact cgtaaagctc tgttgtcggg gacgaatgtg gagatggtga ataaccattt

480

ccaatgacgg tacctgacga ggaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

540

cgtaggtggc gagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag ggagcgcagg cgggaaggta

600

agtctatctt aaaagtgcgg ggctcaaccc cgtgagggga tggaaactat ctttcttgag

660

tgcaggagag gaaagcggaa ttcctagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttaggaggaa

720

caccagtggc gaaggcggct ttctggactg taactgacgc tgaggctcga aagcgtgggg

780

agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgaatgc taggtgtagg

840

aggtatcgac ccctcctgtg ccggagttaa cgcaataagc attccgcctg gggagtacgg

900

ccgcaaggct gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agtatgtggt

960

ttaattcgac gcaacgcgaa gaaccttacc agggcttgac attgagtgaa agggctagag

1020

atagttccct ctcttcggag acacgaaaac aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt

1080

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc tatcctttgt tgccagcacg

1140

caatggtggg aactcaaagg agactgccgc ggacaacgcg gaggaaggcg gggatgacgt

1200

caagtcatca tgccccttat gtcctgggct acacacgtac tacaatggga tggacagaga

1260

gcagcgaagc cgcgaggcca agcgaacccc ataaaccatc tcccagttcg gattgcaggc

1320

tgcaacccgc ctgcatgaag ttggaatcgc tagtaatcgc aggtcagcat actgcggtga

1380

atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac ggaagtcatt cacacccgaa

1440

gccggcaggc taaccgcaag gaggcagccg tctaaggtgg gggcgatgac tggggtgaag

1500

tcgtaacaag gtagccgtat cggaaggtgc ggctggatca ctc

1543

<210> 1248

<211> 1559

<212> DNA

<213> Mitsuokella multacida

<400> 1248

tggagagttt gatcctggct caggacgaac gctggcggcg tgcttaacac atgcaagtcg

60

aacgagacga ttgaaagctt gcttttgaaa gtcgagtggc aaacgggtga gtaacgcgta

120

gacaacctgc cgtaaagatg gggacaacag tccgaaagga ctgctaatac cgaatgttgt

180

ggaacttccg catgggagct ctactaaaga tggcctctac ttgtaagcta tcgctttacg

240

atgggtctgc gtctgattag ctagttggtg gggtaatggc ttaccaaggc gacgatcagt

300

agccggtctg agaggatgaa cggccacatt ggaactgaga cacggtccag actcctacgg

360

gaggcagcag tggggaatct tccgcaatgg gcgcaagcct gacggagcaa cgccgcgtga

420

gtgaagaagg gtttcgactc gtaaagctct gttgtcgggg acgaatgtgg agatggtgaa

480

taaccatttc caatgacggt acctgacgag gaagccacgg ctaactacgt gccagcagcc

540

gcggtaatac gtaggtggcg agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaagg gagcgcaggc

600

gggagatcaa gtctatctta aaagtgcggg gctcaacccc gtgaggggat ggaaactggt

660

cttcttgagt gcaggagagg aaagcggaat tcctagtgta gcggtgaaat gcgtagatat

720

taggaggaac accagtggcg aaggcggctt tctggactgt aactgacgct gaggctcgaa

780

agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatgct

840

aggtgtagga ggtatcgacc cctcctgtgc cggagttaac gcaataagca ttccgcctgg

900

ggagtacggc cgcaaggctg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga

960

gtatgtggtt taattcgacg caacgcgaag aaccttacca gggcttgaca ttgagtgaaa

1020

gagctagaga tagctccctc tcttcggaga cacgaaaaca ggtggtgcat ggctgtcgtc

1080

agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct atcctttgtt

1140

gccagcacgt aatggtggga actcaaagga gactgccgcg gacaacgcgg aggaaggcgg

1200

ggatgacgtc aagtcatcat gccccttatg tcctgggcta cacacgtact acaatgggat

1260

ggacagagag cagcgaagcc gcgaggccaa gcgaacccca taaaccatct cccagttcgg

1320

attgcaggct gcaacccgcc tgcatgaagt tggaatcgct agtaatcgca ggtcagcata

1380

ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg gaagtcattc

1440

acacccgaag ccggcaggct aaccgcaagg aggcagccgt ctaaggtggg ggcgatgact

1500

ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctttct

1559

<210> 1249

<211> 1224

<212> DNA

<213> Mitsuokella sp. oral taxon 521

<400> 1249

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagacaatta aaagcttgct

60

tttaaacgtc gagtggcaaa cgggtgagta acgcgtagac aacctgccgc aaagatgggg

120

acaacagttc gaaaggactg ctaataccga atgttctgga agttccgcat ggaaactcca

180

gcaaagatgg cctctacttg taagcgatcg ctttgcgatg ggtctgcgtc tgattagcta

240

gttggcaggg caacggccta ccaaggcgac gatcagtagc cggtctgaga ggatgaacgg

300

ccacattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatcttcc

360

gcaatgggcg aaagcctgac ggagcaacgc cgcgtgagtg aagaaggtct tcggatcgta

420

aagctctgtt gccggggacg acatgtaggc agtgcgaaca gcattgtgta atgacggtac

480

ccggcgagga agccacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcgag

540

cgttgtccgg aattattggg cgtaaaggga gcgcaggcgg gcgagtaagt ctttcttaaa

600

agtgcggggc tcaaccccgt gaggggagag aaactactca tcttgagtgc aggagaggaa

660

agcggaattc ctagtgtagc ggtgaaatgc gtagatatta ggaagaacac cagtggcgaa

720

ggcggctttc tggactgtaa ctgacgctga ggctcgaaag ccaggggagc gaacgggatt

780

agataccccg gtagtcctgg ccgtaaacga tgaatgctag gtgtaggggg tatcgacccc

840

tcctgtgccg gagttaacgc aataagcatt ccgcctgggg agtacggtcg caagactgaa

900

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagt atgtggttta attcgacgcc

960

acgcgatgaa ccttaccagg gcttgacatt gagtgacaga cttagagaca agtcattctc

1020

ttcggagaca cgaaaactgg tggtgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgtagg

1080

gttagttccg cacgagcgca ccccctattc tctgttgcca gcacgcgaag gtgggaactc

1140

aaaggaaact gccgccgaac cagccggaga aaggcgggga atacgtcagt tatcatgccc

1200

cctagttcgt ggctacaccg ttca

1224

<210> 1250

<211> 1210

<212> DNA

<213> Mitsuokella sp. oral taxon G68

<400> 1250

gacgaacgct ggcggcgtgc ttcaacacat gcaagtcgaa cgagacaatt aaaagcttgc

60

ttttcaaacg tccgagtggc aaacgggtga gtcaacgcgt agacaacctg ccgcaaagat

120

ggggacaaca gttccgaaag gactgctaat accgaatgtt cctggaagtt cccgcatgga

180

aactcccagc aaagatggcc tcctacttgt aagcgatccg ctttgcgatg ggtcctgcgt

240

cctgattagc tagttggtga ggtaacggcc taccaaggcg acgatcagta gccggtcctg

300

agaggatgaa cggccacatt gggactgaga cacggcccag actccctacg ggaggcagca

360

gtggggaatc cttccgcaat gggcgaaagc ctgacggagc aacgccgcgt gagtgaagaa

420

ggtccttcgg atccgtaaag ctctgttgcc ggggacgagt gtaggcaatg caaacagcat

480

tgtgtaatga cggtacccgg cgaggaagcc acggctaact acgtgccagc agccgcggta

540

atacgtaggt ggcgagcgtt gtccggaatt attgggcgta aagggagcgc aggcgggcga

600

gtaagtcttt cttaaaagtg cggggctcaa ccccgtgagg ggagagaaac tactcatctt

660

gagtgcagga gaggaaggcg gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag atattaggaa

720

gaacaccagt ggcgaaggcg gctttctgga ctgtaactga cgctgaggct cgaaagccag

780

gggagcgaac gggattagat accccggtag tcctggccgt aaacgatgaa tgctaggtgt

840

agggggtatc gacccctcct gtgccggagt taacgcaata agcattccgc ctggggagta

900

cggtagcaag actgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagtatgt

960

ggtttaattc gacgcaacgc gaagaactta ccaggtcttg acatagagtg acagacttag

1020

agacaagtca ttctcttcgg agacacgaga acagggtggt gcatggctgt cgtcagctcg

1080

tgtcgtgaga tgtttgggtt agttccgcca cgagcgcacg cctattctct gttgccagca

1140

ctgcgatggt gggaactcga ggagacgcgc cgacacgccg aggaggcggg atagttagta

1200

gcatccctag

1210

<210> 1251

<211> 1544

<212> DNA

<213> Mobiluncus curtisii

<400> 1251

tttttttgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg atgaagccgc agcttgctgt ggtggattag tggcgaacgg gcgagtaaca

120

cgtgagtaac ctgtcctttt ctttgggata acggctggaa acggctgcta atactggata

180

ttcaggcgtc accgcatggt ggtgtttgga aaggtttttt ctgggattgg gtgggctcgc

240

ggcctatcag cttgttggtg gggtgatggc ttaccaaggc tttgacgggt agccggcctg

300

agagggtggt cggtcgcact gggactgaga tacggcccag actcctacgg gaggcagcag

360

tggggaatat tgcacaatgg acgaaagttt gatgcagcga cgccgcgtgg agggtgtagg

420

ccttcgggtt gtgaactcct ttttctcgcg aaaaaggcac agttttggct gtgttgatgg

480

tagtggggga agaagcgccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggcgc

540

gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag agctcgtagg tggttcgtcg cgtctgtcgt

600

gaaagccagc agcttaactg ttggtctgcg gtgggtacgg gcgggcttga gtgcggtagg

660

ggtgactgga attcctggtg tagcggtgga atgcgcagat atcaggagga acaccgatgg

720

cgaaggcagg tcactgggcc gttactgaca ctgaggagcg aaagcgtggg gagcgaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgctgtaa acgttgggaa ctaggtgtgg ggatgctatc

840

ctgtgtttct gcgccgtagc taacgcatta agttccccgc ctggggagta cggtcgcaag

900

gctaaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg cggagcatgc ggattaattc

960

gatgcaacgc gaagaacctt accaaggctt gacatacact gcgatggttc cagagatggg

1020

ccagccttcg gggtggtgta caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgcctcatg ttgccagcgg ttcggccggg

1140

gactcgtgag ggactgccgg ggttaactcg gaggagggtg gggatgacgt caaatcatca

1200

tgccccttat gtcttgggct tcacgcatgc tacaatggcc agtacagagg gttgcgatac

1260

cgtgaggtgg ggctaatctc ttaaagctgg tctcggttcg gattggggtc tgcaactcga

1320

ccccatgaag ttggagtcgc tagtaatcgc agatcagcat tgctgcggtg aatacgttct

1380

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca cgaaagttgg taacacccga agcccgtggc

1440

ttaactcttt ttgaggggga gcggtcgaag gtgggattgg cgattgggac gaagtcgtaa

1500

caaggtagcc gtaccggaag gtgcggctgg atcacctcct ttct

1544

<210> 1252

<211> 1542

<212> DNA

<213> Mobiluncus mulieris

<400> 1252

ttttgttgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg atgaagccgc agcttgctgt ggtggattag tggcgaacgg gcgagtaaca

120

cgtgagtaac ctgtcctttt ctttgggata acggctggaa acggctgcta atactggata

180

ttcaggctgc atcgcatggt gtggtttgga aaggtttttt ctggaatggg gtgggctcgc

240

ggcctatcag cttgttggtg gggtgatggc ttaccaaggc tttgacgggt agccggcctg

300

agagggtggt cggtcgcact gggactgaga tacggcccag actcctacgg gaggcagcag

360

tggggaatat tgcacaatgg acggaagttt gatgcagcga cgccgcgtgg agggtgtagg

420

ccttcgggtt gtgaactcct ttttctcgtg aaaaaggcat gcttttgggt gtgttgatgg

480

tagcggggga agaagcgccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggcgc

540

gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag agctcgtagg tggttcgtcg cgtctgtcgt

600

gaaagccagc agcttaactg ttggtctgcg gtgggtacgg gcgggcttga gtgcggtagg

660

ggtgactgga attcctggtg tagcggtgga atgcgcagat atcaggagga acaccgatgg

720

cgaaggcagg tcactgggcc gttactgacg ctgaggagcg aaagcgtggg gagcgaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgctgtaa acgttgggaa ctaggtgtgg ggatgctatc

840

ctgtgtttct gcgccgtagc taacgcatta agttccccgc ctggggagta cggccgcaag

900

gctaaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg cggagcatgc ggattaattc

960

gatgcaacgc gaagaacctt accaaggctt gacatacact gcgacatgcc agagatggtg

1020

tggccttcgg ggtggtgtac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

1080

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgcctcatgt tgccagcacg ttatggtggg

1140

gactcgtgag ggactgccgg ggttaactcg gaggagggtg gggatgacgt caaatcatca

1200

tgccccttat gtcttgggct tcacgcatgc tacaatggcc agtacagagg gttgcgatac

1260

cgtgaggtgg ggctaatctc ttaaagctgg tctcggttcg gattggggtc tgcaactcga

1320

ccccatgaag ttggagtcgc tagtaatcgc agatcagcat tgctgcggtg aatacgttct

1380

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca cgaaagttgg taacacccga agcccgtggc

1440

ctagcctttt tggggggagc ggtcgaaggt gggattggcg attgggacga agtcgtaaca

1500

aggtagccgt accggaaggt gcggctggat cacctccttt ct

1542

<210> 1253

<211> 1532

<212> DNA

<213> Moellerella wisconsensis

<400> 1253

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc

60

ggtaacagga agaagcttgc ttctttgctg acgagcggcg gacgggtgag taatgtatgg

120

ggatctgcct gacagagggg gataactact ggaaacggta gctaataccg cataatctct

180

aaggagcaaa gcaggggacc ttcgggcctt gcgctgtcgg atgaacccat atgggattag

240

ctagtaggtg gggtaacggc tcacctaggc gacgatctct agctggtctg agaggatgat

300

cagccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcca tgccgcgtgt atgaagaagg ccttagggtt

420

gtaaagtact ttcagtcggg aggaaggcgt tgatattaat actatcagcg attgacgtta

480

ccgacagaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gggggtgcaa

540

gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg cacgcaggcg gttgattaag ttagatgtga

600

aatccccggg cttaacctgg gaatggcatc taaaactggt cagctagagt cttgtagagg

660

ggggtagaat tccatgtgta gcggtgaaat gcgtagagat gtggaggaat accggtggcg

720

aaggcggccc cctggacaaa gactgacgct caggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgctgtaaac gatgtcgatt tggaggttgt tcccttgagg

840

agtggcttcc ggagctaacg cgttaaatcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

900

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

960

aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat ccagagaatt tagcagagat gctttagtgc

1020

cttcgggaac tctgagacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta tcctttgttg ccagcacgta atggtgggaa

1140

ctcaagggag actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg

1200

gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggcgca tacaaagaga agcgaactcg

1260

cgagagccag cggaactcat aaagtgcgtc gtagtccgga ttggagtctg caactcgact

1320

ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgtag atcagaatgc tacggtgaat acgttcccgg

1380

gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttg caaaagaagt aggtagctta

1440

accttcgggg gggcgcttac cactttgtga ttcatgactg gggtgaagtc gtaacaaggt

1500

aaccgtaggg gaacctgcgg ttggatcacc tt

1532

<210> 1254

<211> 1455

<212> DNA

<213> Mogibacterium diversum

<220>

<221> modified_base

<222> (792)..(793)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1254

acgctggcgg cgtgcctaat acatgcaagt cgagcgagat gttagcgcat gaaccttcgg

60

gggattatgc taacggacag cggcggacgg tgtgagtaac gcgtaggcaa cctgcccctg

120

acagagggat agccattgga aacgatgatt aaaaccatca tgacaccgta gaagcacatg

180

cttcatcggt caaagattta tcggtcaggg atgggcctgc gtctgattaa ctagttggtg

240

aggtaacggc tcaccaaggt gacgatcagt agccgacctg agagggtgat cggccacatt

300

ggaactgaga cacggtccaa acttctacgg aaggcagcag tagggaatct tgcacaatgg

360

gcgaaagcct gatgcagcaa cgccgcgtga aggatgaagg ccttcgggtt gtaaacttct

420

gttctaaggg aagaaacaaa tgacggtacc ttaggagcaa gccccggcta actacgtgcc

480

agcagccgcg gtaatacgta gggggcaagc gttatccgga attattgggc gtaaagagtg

540

cgtaggtggt tacctaagcg caaggtttaa tttagaggct caacctctac ttgccttgcg

600

aactgggcta ctttagtgca ggaggggaaa gcggaattcc tagtgtagcg gtgaaatgcg

660

tagatattag gaggaacacc agcggctgaa ggtcggtctt tctggactgt aactgacact

720

gaggcacgaa agcgtgggta gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac

780

gatgagcact anntgttggg cccgttaggg ctcagtgccg cagttaacgc aataagtgct

840

ccgcctgggg agtacgctcg caagagtaaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa

900

gcagcggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg gcttgacatc

960

ctgctgacag gaccttaacc ggtcccttct tcggacagca gagacaggtg gtgcatggtt

1020

gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgtcg

1080

ctagttacta acattcagtt gaggactcta gcgagactgc cgaggtcaac tcggaggaag

1140

gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgttctgg gctacacacg tgctacaatg

1200

gtcggtacaa tgagaggcaa tactgtgaag tggagcaaat caccaaaacc gatcccagtt

1260

cggattgtag gctgcaactc gcctacatga agttggagtt gctagtaatc gcagatcaga

1320

atgctgcggt gaatgcgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc atggaagttg

1380

ggggtgccca aagtcgttta attaatctat cgcctaaggc aaaaccaatg actggggtga

1440

agtcgtaaca aggta

1455

<210> 1255

<211> 1478

<212> DNA

<213> Mogibacterium neglectum

<400> 1255

agtttgatca tggctcagga tgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca agtcgagcga

60

gatgttagcg catgaacctt cgggggatta tgctaacgga aagcggcgga cgggtgagta

120

acgcgtaggc aacctgcccc tgacagaggg atagccattg gaaacgatga ttaaaacctc

180

atgacaccga tgaagcacat gcttcatcgg tcaaagattt atcggtcagg gatgggcctg

240

cgtctgatta actagttggt gaggtaacgg ctcaccaagg tgacgatcag tagccgacct

300

gagagggtga tcggccacat tggaactgag acacggtcca aacttctacg gaaggcagca

360

gtagggaatc ttgcacaatg ggcgaaagcc tgatgcagca acgccgcgtg aaggatgaag

420

gccttcgggt tgtaaacttc tgttctaagg gaagaaacaa atgacggtac cttaggagca

480

agccccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggggcaag cgttatccgg

540

aattattggg cgtaaagagt gcgtaggtgg ttacctaagc gcaaggttta atttagaggc

600

tcaacctcta cttgccttgc gaactgggct acttgagtgc aggaggggaa agcggaattc

660

ctagtgtagc ggtgaaatgc gtagatatta ggaggaacac cagcggcgaa ggcggctttc

720

tggactgtaa ctgacactga ggcacgaaag cgtgggtagc aaacaggatt agataccctg

780

gtagtccacg ccgtaaacga tgagcactag gtgttgggcc cgttaggctc agtgccgcag

840

ttaacgcaat aagtgctccg cctggggagt acgctcgcaa gagtaaaact caaaggaatt

900

gacggggacc cgcacaagca gcggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct

960

taccagggct tgacatcctg ctgacaggac cttaaccggt cccttcttcg gacagcagag

1020

acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

1080

gagcgcaacc cttgtcgcta gttactaaca ttcagttgag gactctagcg agactgccga

1140

ggtcaactcg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gttctgggct

1200

acacacgtgc tacaatggtc ggtacaatgg gatgcaatac tgtgaagtgg agcaaatcac

1260

caaaaccgat cccagttcgg attgtaggct gcaactcgcc tacatgaagt tggagttgct

1320

agtaatcgca gatcagaatg ctgcggtgaa tgcgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg

1380

tcacaccatg ggaagttggg ggtgcccaaa gtcggttaat taatctatcg cctaaggcaa

1440

aaccaatgac tggggtgaag tcgtaacaag gtaaccgt

1478

<210> 1256

<211> 1466

<212> DNA

<213> Mogibacterium pumilum

<220>

<221> modified_base

<222> (946)..(947)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1256

ttgatcctgg ctcaggatga acgctggcgg cgtgcctaat acatgcaagt cgagcgagat

60

gttagtgcat gaacttcggg ggattatatt aacggacagc ggcggacggg tgagtaacgc

120

gtaggcaacc tgcccttgac agagggatag ccattggaaa cgatgattaa aacctcataa

180

caccgtagaa gcacatgctt caacggtcaa agatttatcg gtcagggatg ggcctgcgtc

240

tgattaacta gttggtgagg taacggctca ccaaggtgac gatcagtagc cgacctgaga

300

gggtgatcgg ccacattgga actgagacac ggtccaaact tctacggaag gcagcagtag

360

ggaatcttgc acaatggcga aagcctgatg cagcaacgcc gcgtgaagga tgaaggcttc

420

gggttgtaaa cttctgttct aagggaagaa acaaatgacg gtaccttagg agcaagcccc

480

ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggggg caagcgttat ccggaattat

540

tgggcgtaaa gagtgcgtag gtggttacct aagcgcaagg tttaatttag aggctcaacc

600

tctacttgcc ttgcgaactg ggctacttga gtgcaggagg ggaaagcgga attcctagtg

660

tagcggtgaa atgcgtagat attaggagga acaccagcgg cgaaggcggc tttctggact

720

gtaactgaca ctgaggcacg aaagcgtggg tagcaaacag gattagatac cctggtagtc

780

cacgccgtaa acgatgagca ctaggtgttg ggtccgttag gctcagtgcc gcagttaacg

840

caataagtgc tccgcctggg gagtacgctc gcaagagtaa aactcaaagg aattgacggg

900

gacccgcaca agcagcggac atgtggttta attcgaagca acgcgnnaga accttaccag

960

ggcttgacat cctgctgaca ggatcttaac cgatcccttc ttcggacagc agagacaggt

1020

ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc

1080

aacccttgtc gctagttact aacattcagt tgaggactct agcgagactg ccgaggtcaa

1140

ctcggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgttctg ggctacacac

1200

gtgctacaat ggtcggtaca atgagaggca atactgcgaa gtggagcgaa tcaccaaaac

1260

cgatcccagt tcggattgta ggctgcaact cgcctacatg aagttggagt tgctagtaat

1320

cgcagatcag aatgctgcgg tgaatgcgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac

1380

catggaagtt gggggtgccc gaagtcggct aattaatctg tcgcctaagg caaaaccaat

1440

gactggggtg aagtcgtaac aaggta

1466

<210> 1257

<211> 1480

<212> DNA

<213> Mogibacterium timidum

<400> 1257

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

gagaagcttg gaaatgacgc ttcggttgaa tttccaagcg gacagcggcg gacgggtgag

120

taacgcgtag gcaacctgcc cctgtacaga gggatagcca ttggaaacga tgattaaaac

180

ctcatgacac cgtagtagca catgctacat cggtcaaaga tttatcggtc agggatgggc

240

ctccgtctga ttaactggtt ggtgaggtaa cggctcacca aggtgacgat cagtagccga

300

cctgagaggg tgatcggcca cattggaact gagacacggt ccaaacttct acggaaggca

360

gcagtaggga atcttgcaca atgggcgtaa gcctgatgca gcaacgccgc gtgaaggatg

420

aaggcttcgg gttgtaaact tctgttctaa gggaagaaag aaatgacggt accttaggag

480

caagccccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggggca agcgttatcc

540

ggaattattg ggcgtaaaga gtgcgtaggt ggttacctaa gcgcaaggtt taaattagag

600

gctcaacctc tacatgcctt gcgaactggg ctacttgagt gcaggagggg aaagcggaat

660

tcctagtgta gcggtgaaat gcgtagatat taggaggaac accggcggcg aaggcggctt

720

tctggactgt aactgacact gaggcacgaa agcgtgggta gcaaacagga ttagataccc

780

tggtagtcca cgccgtaaac gatgagcact aggtgttggg tccgttagga ctcagtgccg

840

cagttaacgc aataagtgtc cgcctgggag tacgctcgca agagtaaact caaggaattg

900

acgggcaccc gcacaagcag gggagcttgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt

960

accagggctt gacatcctgc tgacagaacc ttaatcggtt ttttcttcgg acagcagaga

1020

caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc ttgtcgctag ttactaacat tcagttgagg actctagcga gactgccgag

1140

gtcaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg ttctgggcta

1200

cacacgtgct acaatggtcg gtacaatgag atgcaatact gcgaagtgga gcgaaacacc

1260

aaaaccgatc ccagttcgga ttgtaggctg caactcgcct acatgaagtc ggagttgcta

1320

gtaatcgcag atcagaatgc tgcggtgaat gcgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt

1380

cacaccatgg aagttggggg tgcccaaagt cggttaatta atctatcgcc taaggcaaaa

1440

ccaatgactg gggtgaagtc gtaacaaggt acccgtagga

1480

<210> 1258

<211> 1400

<212> DNA

<213> Mollicutes bacterium pACH93

<400> 1258

gcaagtcgaa cgaagaacta gcttgctagt tcttagtggc gaacgggtga gtaatacata

60

aataatctgt ccatatgact gggataacta ttggaaacga tagctaatac cggataggtt

120

aattgaaggc atcttcgatt aattaaagta ggttttctac acaaatggat gagtttatgg

180

cgcattagtt agttggtggg gtaacggcct accaagacga tgatgcgtag ccgacctgag

240

agggtgaccg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

300

gggaattttc ggcaatgggc gcaagcctga ccgagcaacg ccgcgtgagt gattaaggcc

360

ttcgggttgt aaagctctgt tgtaagggaa gaaaaatcag tagaggaaat gatactgatc

420

agacggtacc ttaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

480

ggtggcaagc gttatccgga attattgggc gtaaagggtg cgtaggcggt ttattaagtc

540

tatggtgaaa gtgcggggct caaccccgta tggccataga aactgataga ctagagtgca

600

ggagagggca atggaattcc atgtgtagcg gtaaaatgcg tagatatatg gaggaacacc

660

agtggcgaag gcggttgcct ggcctgtaac tgacgctgaa gcacgaaagc gtggggagca

720

aataggatta gataccctag tagtccacgc cgtaaacgat gaatactaag tgttggagaa

780

attcagtgct gcagttaacg caataagtat tccgcctggg gagtatgcac gcaagtgtga

840

aactcaaagg aattgacggg accccgcaca agcggtggat tatgttgttt aattcgacgc

900

aacgcgaaga accttaccag gccttgacat actcagcaaa accctagaga tagggtggag

960

gttatctggg atacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag acgttgggtt

1020

aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtctt tagttaccat cattcagttg gggactctag

1080

agagactgcc ggtgataaac cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt

1140

atggcctggg ctacaaacgt aatacaatgg cgtatacaaa gggatgcgaa agggtgacct

1200

ggagcaaaac tcacaaagta cgtctcagtt cagattggag tctgcaactc gactccatga

1260

aggcggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc tcggggtttg

1320

tacacaccgc ccgtcaaacc atgagagttg gtaatacccg aagccggtgg cctaacctag

1380

taataggagg gagccgtcga

1400

<210> 1259

<211> 1555

<212> DNA

<213> Moorella thermoacetica

<400> 1259

gtttgatcct ggctcaggac aaacgctggc ggcgtgccta acacatgcaa gtcgagcggt

60

ctttaattgg ggaaatcttc ggatggaacc gattaaagat agcggcggac gggtgagtaa

120

cgcgtgggta atctaccctt cagactggga taacaccggg aaactggtgc taataccgga

180

tacggtctac gggaggcatc ttctgtagaa gaaaggtggc gcaagctacc gctgaaggat

240

gagcccgcgt cccattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgatgggtag

300

ccggcctgag agggtggtcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga

360

ggcagcagtg gggaatcttg cgcaatgggc gaaagcctga cgcagcaacg ccgcgtgagc

420

gatgaaggcc ttcgggttgt aaagctctgt catcagggac gaagtcttaa aggcgaatag

480

cctttaaggt gacggtacct gaggaggaag ccccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

540

taaaacgtag ggggcgagcg ttgtccggaa ttactgggcg taaagggcgt gtaggcggcc

600

tggcaagtca gatgtgaaaa accccggctt aaccgggggc atgcatttga aactgccggg

660

cttgagggca ggagaggaga gtggaattcc cggtgtagcg gtgaaatgcg tagatatcgg

720

gaggaacacc agtggcgaag gcgactctct ggcctggccc tgacgctgag gcgcgaaagc

780

gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gggtactagg

840

tgtaggaggt atcgacccct tctgtgccgc agtaaacaca ataagtaccc cgcctgggga

900

gtacggccgc aaggctgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca

960

tgtggtttaa ttcgacgcaa cgcgaagaac cttaccgggg tttgacatcc tgcgaacctg

1020

gtggaaacac tggggtgccc ttcggggaac gcagagacag gtggtgcatg gttgtcgtca

1080

gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccccta cctttagttg

1140

ccagcgggta aagccgggca ctctaaaggg actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg

1200

gatgacgtca aatcatcatg ccccttatat cccgggctac acacgtgcta caatggcctg

1260

tacaaagggg tgcgaaggag cgatccggag cgaatcccaa aaagcaggtc tcagttcgga

1320

ttgcaggctg caactcgcct gcatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc

1380

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga aagctggcaa

1440

cacccgaagc cggtgaccta acccgcgagg gaaggagccg tctaaggtgg ggctggtgat

1500

tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtat cggaaggtgc ggctggatca cctcc

1555

<210> 1260

<211> 1532

<212> DNA

<213> Moraxella catarrhalis

<400> 1260

ttaaactgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgaacg aagttaggaa gcttgcttct gatacttagt ggcggacggg tgagtaatgc

120

ttaggaatct gcctagtagt gggggataac ttggggaaac ccaagctaat accgcatacg

180

acctacgggt gaaagggggc ttttagctct cgctattaga tgagcctaag tcggattagc

240

tggttggtgg ggtaaaggcc taccaaggcg acgatctgta gctggtctga gaggatgatc

300

agccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

360

ggacaatggg cgaaagcctg atccagccat gccgcgtgtg tgaagaaggc cttttggttg

420

taaagcactt taagtgggga ggaaaagctt atggttaata cccataagcc ctgacgttac

480

ccacagaata agcaccggct aactctgtgc cagcagccgc ggtaatacag agggtgcaag

540

cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc gcgtaggtgg ttatttaagt cagatgtgaa

600

agccccgggc ttaacctggg aactgcatct gatactggat aactagagta ggtgagaggg

660

gagtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata ccgatggcga

720

aggcagctcc ctggcatcat actgacactg aggtgcgaaa gcgtgggtag caaacaggat

780

tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtctacca gtcgttgggt cttttaaaga

840

cttagtgacg cagttaacgc aataagtaga ccgcctgggg agtacggccg caaggttaaa

900

actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgca

960

acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacata gtgagaatct tgcagagatg cgagagtgcc

1020

ttcgggaatt cacatacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg

1080

gttaagtccc gcaacgagcg caaccctttt ccttagttac cagcgactcg gtcgggaact

1140

ctaaggatac tgccagtgac aaactggagg aaggcgggga cgacgtcaag tcatcatggc

1200

ccttacgacc agggctacac acgtgctaca atggttggta caaagggttg ctacacagcg

1260

atgtgatgct aatctcaaaa agccaatcgt agtccggatt ggagtctgca actcgactcc

1320

atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcagat cagaatgctg cggtgaatac gttcccgggc

1380

cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gttgatctca ccagaagtgg ttagcctaac

1440

gcaagagggc gatcaccacg gtggggtcga tgactggggt gaagtcgtaa caaggtagcc

1500

gtaggggaac ctgcggctgg atcacctcct ta

1532

<210> 1261

<211> 1501

<212> DNA

<213> Moraxella lincolnii

<400> 1261

attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgaac gaagaggtct agcttgctag

60

actgattagt ggcgaacggg tgagtaacat ttaggaatct accttataga gggggatagc

120

tcggggaaac tcgaattaat accgcatacg acctacgggt gaaagggggc gcaagctctt

180

gctataagat gagcctaaac cagattagct agttggtggg gtaaaggcct accaaggcga

240

cgatctgtag ctggtctgag aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac

300

tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggc gaaagcctga tccagccatg

360

ccgcgtgtgt gaagaaggcc ttatggttgt aaagcacttt taagtgggga gaaaagctta

420

tggataacac ccataggttc tgacgttacc cacagaataa gcaccggcta actctgtgcc

480

agcagccgcg gtaatacaga gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgag

540

cgtaggtggt ttattaagtc agatgtgaaa tccctgggct taacctagga actgcatctg

600

atactgataa actagagtag gtgagaggaa agtagaattc caggtgtagc ggtgaaatgc

660

gtagagatct ggaggaatac cgatggcgaa ggcagctttc tggcatcata ctgacactga

720

ggttcgaaag cgtgggtagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga

780

tgtctaccag tcgttgggtc ttttaaaggc ttagtgacgc agttaacgcg ataagtagac

840

cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag

900

cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggt cttgacatag

960

tgagaatctt gcagagatgc gagagtgcct ttgggaattc acatacaggt gctgcatggc

1020

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttttc

1080

cttagttacc agcgacttgg tcggggactt taaggacact gccagtgaca aactggagga

1140

aggcggggac gacgtcaagt catcatggcc cttacgacca gggctacaca cgtgctacaa

1200

tggtaggtac agagggcagc tacacggcga cgtgatgcca atctcaaaaa gcctatctta

1260

gtccagattg gagtctgcaa ctcgactcca tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc

1320

agaatgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag

1380

ttgattgcac cagaagtggt tagcctaact taggagggcg atcaccacgg tgtggttaat

1440

gactggggtg aagtcgtaac aaggtagccg taggggaacc tgcggctgga tcacctcctt

1500

a

1501

<210> 1262

<211> 1522

<212> DNA

<213> Moraxella osloensis

<400> 1262

tagagtttga tcatggctca gattgaacgc tggcggcagg cttaacacat gcaagtcgaa

60

cgatgactct ctagcttgct agagatgatt agtggcggac gggtgagtaa catttaggaa

120

tctacctagt agtgggggat agctcgggga aactcgaatt aataccgcat acgacctacg

180

ggtgaaaggg ggcgcaagct cttgctatta gatgagccta aatcagatta gctagttggt

240

ggggtaaagg cccaccaagg cgacgatctg taactggtct gagaggatga tcagtcacac

300

cggaactgag acacggtccg gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttggacaatg

360

ggggcaaccc tgatccagcc atgccgcgtg tgtgaagaag gccttttggt tgtaaagcac

420

tttaagcagg gaggagaggc taatggttaa tacccattag attagacgtt acctgcagaa

480

taagcaccgg ctaactctgt gccagcagcc gcggtaatac agagggtgcg agcgttaatc

540

ggaattactg ggcgtaaagc gagtgtaggt ggctcattaa gtcacatgtg aaatccccgg

600

gcttaacctg ggaactgcat gtgatactgg tggtgctaga atatgtgaga gggaagtaga

660

attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga ataccgatgg cgaaggcagc

720

ttcctggcat aatattgaca ctgagattcg aaagcgtggg tagcaaacag gattagatac

780

cctggtagtc cacgccgtaa acgatgtcta ctagccgttg gggtccttga gactttagtg

840

gcgcagttaa cgcgataagt agaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa

900

tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gcaacgcgaa

960

gaaccttacc tggtcttgac atagtgagaa tctttcagag atgagagagt gccttcggga

1020

actcacatac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaaccct tttccttatt tgccagcggg ttaagccggg aactttaagg

1140

atactgccag tgacaaactg gaggaaggcg gggacgacgt caagtcatca tggcccttac

1200

gaccagggct acacacgtgc tacaatggta ggtacagagg gttgctacac agcgatgtga

1260

tgctaatctc aaaaagccta tcgtagtccg gattggagtc tgcaactcga ctccatgaag

1320

tcggaatcgc tagtaatcgc ggatcagaat gccgcggtga atacgttccc gggccttgta

1380

cacaccgccc gtcacaccat gggagtctat tgcaccagaa gtaggtagcc taacgaaaga

1440

gggcgcttac cacggtgtgg tcgatgactg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtaggg

1500

gaacctgcgg ttggatcacc tc

1522

<210> 1263

<211> 1450

<212> DNA

<213> Moraxella sp. 16285

<400> 1263

attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgaac gatrgaacct agcttgctag

60

gggaaatagt ggcgaacggg tgagtaacat ttaggaaact gccttataga gggggatagc

120

tcggggaaac tcgaattaat accgcatacg tcctacggga gaaaggagct ttagggttct

180

gctataagat gtgcctaaat tagattagct agatggtgag gtaaaggctc accatggcga

240

cgatctataa ctggtcttag aggatgatca gtcacaccgg aactgagaca cggtccggac

300

tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggg gcaaccctga tccagccatg

360

ccgcgtgtgt gaagaaggtc ataagattgt aaagcacttt aagcagggag gaagagccag

420

tggagaaaca cactggtggt gacgttacct gcagaataag caccggctaa ctctgtgcca

480

gcagccgcgg taatacagag ggtgcgagcg ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgggt

540

gcaggtggtg cactaagtca tatgtgaaag ccctgggctt aacctaggaa cagcatatga

600

tactggtgaa ctagagtata tgagaggraa gtagaattcc aggtgtagcg gtgaaatgcg

660

tagagatctg gaggaatacc gatggcgaag gcagctttct ggcacaatac tgacactcag

720

acccgaaagc gtgggtagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat

780

gtctactagc cgttggrgct catgaagcyt tagtggcgca gctaacgcga taagtagacc

840

gcctggggag tacggccgca aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc

900

ggtggagcat gtggtttaat tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctggtc ttgacatagt

960

gagratccta cagagatgtg ggagtgccyt hgggaaytca catacaggtg ctgcatggct

1020

gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttatcc

1080

ttacttgcta gcrggtarag cygagaactg taaggagact gccagtgaca aactggagga

1140

aggcggggac gacgtcaagt catcatggcc cttacgacca gggctacaca cgtgctacaa

1200

tggtaggtac agagggcagc tacacagcga tgtgatgcga atctcaaaaa gcctatcgta

1260

gtccggattg gagtctgcaa ctcgactyca tgaagtcgga atcgctagta atcgcagatc

1320

agaatgctgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag

1380

tctattgcac cagaagtagg tagcctaacg caagagggcg cttaccacgg tgtggtcgat

1440

gactggggtg

1450

<210> 1264

<211> 1226

<212> DNA

<213> Moraxella sp. GM2

<400> 1264

ctggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc aagtcgaacg agtggcggac

60

gggtgagtaa catttaggaa tctgcctagt agtgggggat agctcgggga aactcgaatt

120

aataccgcat acggaaagtt gctattagat gagcctaaat cagattagct agttggtggg

180

gtaaaggccc accaaggcga cgatctgtaa ctggtctgag aggatgatca gtcacaccgg

240

aactgagaca cggtccggac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggg

300

gcaaccctga tccagccatg ccgcgtgtgt gaagaaggcc ttttggttgt aaagcacttt

360

aagcagggag gaagacgtta cctgcagaat aagcaccggc taactctgtg ccagcagccg

420

cggtaataca gagggtgcga gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg agtgtaggtg

480

gctcattaag tcacatgtga aatccccggg cttaacctgg gaactgcatg tgatactggt

540

gggctagaat atgtgagagg gaagtagaat tccaggtgta gcggtgaaat gcgtagagat

600

ctggaggaat accgatggcg aaggcagctt cctggcataa ttgacactga gattcgaaag

660

cgtgggtagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgtctactag

720

ccgttggggc tttagtggcg cagttaacgc gataagtaga ccgcctgggg agtacggccg

780

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

840

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacata tacaggtgct gcatggctgt

900

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttttcctt

960

atttgccagc ggccgggaac tttaaggata ctgccagtga caaactggag gaaggcgggg

1020

acgacgtcaa gtcatcatgg cccttacgac cagggctaca cacgtgctac aatggtaggc

1080

agagggttgc tacacagcga tgtgatgcta atctcaacct atcgtagtcc ggatggagtc

1140

tgcaactcga ctccagaagt cggaatcgct agtaatcgca gatcagaatg ctgcggtgaa

1200

tacgttcccg ggccttgtac acaccg

1226

<210> 1265

<211> 1402

<212> DNA

<213> Morganella morganii

<400> 1265

tcgggcggta acagggagaa gcttgcttct ctgctgacga gcggcggacg ggtgagtaat

60

gtatggggat ctgcctgatg gcgggggata actactggaa acggtagcta ataccgcata

120

atgtcttcgg accaaagcgg gggacctccg ggcctcgcgc catcagatga acccatatgg

180

gattagctag taggtgaggt aacggcttac ctaggcgacg atccctagct ggtctgagag

240

gatgatcagc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg

300

gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagccatgcc gcgtgtatga agaaggcctt

360

cgggttgtaa agtactttca gtcgggagga aggtggtaag gttaataacc ttggcaattg

420

acgttaccga cagaagaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

480

gtgcaagcgt taatcggaat tactgggcgt aaagcgcacg caggcggttg attgagtcag

540

atgtgaaatc cccgggctta acccgggaat tgcatctgat actggtcagc tagagtcttg

600

tagagggggg tagaattcca tgtgtagcgg tgaaatgcgt agagatgtgg aggaataccg

660

gtggcgaagg cggccccctg gacaaagact gacgctcagg tgcgaaagcg tggggagcaa

720

acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacgatg tcgacttgga ggttgtgccc

780

ttgaggcgtg gcttccggag ctaacgcgtt aagtcgaccg cctggggagt acggccgcaa

840

ggttaaaact caaatgaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

900

cgatgcaacg cgaagaacct tacctactct tgacatccag agaactttcc agacatggat

960

tggagccttc gggaactctg agacggttaa cccgggaatt gcatctgata gtgttgtgaa

1020

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcct ttgttgccag cgcgtgatgg

1080

cgggaactca aaggagactg ccggtgataa accggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1140

atcatggccc ttacgagtag ggctacacac gtgctacaat ggcgtataca aagggaagcg

1200

accccgcgag ggcaagcgga actcataaag tacgtcgtag tccggattgg agtctgcaac

1260

tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgtagatca gaatgctacg gtgaatacgt

1320

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgcaaa agaagtaggt

1380

agcttaacct ccgggagggc gc

1402

<210> 1266

<211> 1495

<212> DNA

<213> Morganella sp. JB-T16

<400> 1266

attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgggc ggtaacaggg agaagcttgc

60

ttctctgctg acgagcggcg gacgggtgag taatgtatgg ggatctgcct gatggagggg

120

gataactact ggaaacggta gctaataccg cataatgtct ccggaccaaa gcgggggacc

180

ttcgggcctc gcaccatcag atgaacccat atgggattag ctagtaggtg aggtaatggc

240

tcacctaggc gacgatctct agctggtctg agaggatgat cagccacact gggactgaga

300

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct

360

gatgcagcca tgccgcgtgt atgaagaagg ccttagggtt gtaaagtact ttcagtcggg

420

aggaaggtgt tgagtttaat atgctcagca attgacgtta ccgacagaag aagcaccggc

480

taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg

540

gcgtaaagcg cacgcaggcg gttgattaag tcagatgtga aatccccggg ctcaacccgg

600

gaattgcatc tgagactggt cagctagagt cttgtagagg ggggtagaat tccatgtgta

660

gcggtgaaat gcgtagagat gtggaggaat accggtggcg aaggcggccc cctggacaaa

720

gactgacgct caggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

780

cgctgtaaac gatgtcgact tggaggttgt gcccttgagg cgtggcttcc ggagctaacg

840

cgttaagtcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa aactcaaatg aattgacggg

900

ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccta

960

ctcttgacat ccagagaact tagcagagat gctttggtgc cttcgggaac tctgagacag

1020

gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1080

gcaaccctta tcctttgttg ccagcrcgta atggygggaa ctcaaaggag actgccggtg

1140

ataaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg gcccttacga gtagggctac

1200

acacgtgcta caatggcgta tacaaaggga agcgacctcg cgagagcaag cggaactcac

1260

aaagtacgtc gtagtccgga ttggagtctg caactcgact ccatgaagtc ggaatcgcta

1320

gtaatcgtag atcagaatgc tacggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

cacaccatgg gagtgggttg caaaagaagt aggtagctta accttcggga gggcgcttac

1440

cactttgtga ttcatgactg gggtgaagtc gtaacaaggt aaccgtaggg gaacc

1495

<210> 1267

<211> 1427

<212> DNA

<213> Morococcus cerebrosus

<400> 1267

atgcaagtcg gacggcagca cagagaagct tgcttcttgg gtggcgagtg gcgaacgggt

60

gagtaacata tcggaacgta ccgagcagtg ggggataact aatcgaaaga ttagctaata

120

ccgcatatat tctgaggaag aaagcagggg accatttggc cttgcgctgt ttgagcggcc

180

gatatctgat tagctagttg gtggggtaaa ggcctaccaa ggcgacgatc agtagcgggt

240

ctgagaggat gatccgccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag

300

cagtggggaa ttttggacaa tgggcgaaag cctgatccag ccatgccgcg tgtctgaaga

360

aggccttcgg gttgtaaagg acttttgtca gggaagaaaa gggcggggtt aatacccctg

420

tctgatgacg gtacctgaag aataagcacc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtagggtg cgagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgggcgcag acggttactt

540

aagcaggatg tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc gttctgaact gggtgactag

600

agtgtgtcag agggaggtag aattccacgt gtagcagtga aatgcgtaga gatgtggagg

660

aataccgatg gcgaaggcag cctcctggga taacactgac gttcatgccc gaaagcgtgg

720

gtagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgcccta aacgatgtcg attagctgtt

780

gggcagcatg actgcttagt agcgaagcta acgcgtgaaa tcgaccgcct ggggagtacg

840

gtcgcaagat taaaactcaa aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gatgatgtgg

900

attaattcga tgcaacgcga agaaccttac ctggtcttga catgtacgga atcctccaga

960

gacggaggag tgccttcggg agccgtaaca caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg

1020

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtcattag ttgccatcat

1080

taagttgggc actctaatga gactgccggt gacaagccgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1140

aagtcctcat ggcccttatg accagggctt cacacgtcat acaatggtcg gtacagaggg

1200

tagccaagcc gcgaggtgga gccaatctca caaaaccgat cgtagtccgg attgcactct

1260

gcaactcgag tgcatgaagt cggaatcgct agtaatcgca ggtcagcata ctgcggtgaa

1320

tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtggggg ataccagaag

1380

taggtagggt aaccgcaagg agcccgctta ccacggtatg cttcatg

1427

<210> 1268

<211> 1331

<212> DNA

<213> Moryella indoligenes

<400> 1268

gcgtgcttaa cacatgcaag tcgaacgagt ggcggacggg tgagtaacgc gtggggaacc

60

tgcctcatac agggggataa cagttggaaa cgactgttaa taccgcataa gaaaaagtgg

120

tatgagatgg acccgcgttc gattagccag ttggcggggt aacggcccac caaagcgacg

180

atcgatagcc gatttgagag aatgaccggc cacattggga ctgagacacg gcccaaactc

240

ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggggg aaccctgatg cagcgacgcc

300

gcgtgagtga agaagtattt cggtatgtaa agctctatca gcagggaaga tgacggtacc

360

tgagtaagaa gccccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggggcaagc

420

gttatccgga tttactgggt gtaaagggag cgcagacggc tatgcaagtc tgaagtgaaa

480

gcccggggct caaccccggg actgctttgg aaactgtgta gctagagtgt cggagaggta

540

agcagaattc ccagtgtagc ggtgaaatgc gtagatattg ggaagaatac cggtggcgaa

600

ggcggcttac tggacgaact gacgttcagg ctcgaaggcg tggggagcaa acaggattag

660

ataccctggt agtccacgcg gtaaacgatg aatactaggt gttggcatgt cggtgccgtc

720

gcaaacgcaa taagtattcc acctggggag tacgttcgca agaatgaaac tcaaaggaat

780

tgacggggac ccgcacaagc agtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc

840

ttaccaagtc ttgacatcga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

900

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ctattgccag tagccagcag ctgggcactc

960

tggcgagact gcctgggata accaggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc

1020

cttatgattt gggcaacaca cgtgctacaa tggcgtacag agagaagcga aggagcgatc

1080

cggagcgaat ctaaaacgtc tcagttcgga tgcagtctgc aactcgactg cagaagctgg

1140

aattgctagt aatcgcgaat cagcatgtcg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca

1200

ccgcccgtca caccatggga gtcagcaacg cccgaagtca gtacccaggg agctgccgaa

1260

ggcggggcgg ataactgggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggttg

1320

gatcacctcc t

1331

<210> 1269

<211> 1526

<212> DNA

<213> Mycobacterium abscessus

<400> 1269

ttttgtttgg agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg

60

caagtcgaac ggaaaggccc ttcggggtac tcgagtggcg aacgggtgag taacacgtgg

120

gtgatctgcc ctgcactctg ggataagcct gggaaactgg gtctaatacc ggataggacc

180

acacacttca tggtgagtgg tgcaaagctt ttgcggtgtg ggatgagccc gcggcctatc

240

agcttgttgg tggggtaatg gcccaccaag gcgacgacgg gtagccggcc tgagagggtg

300

accggccaca ctgggactga gatacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

360

attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc gacgccgcgt gagggatgac ggccttcggg

420

ttgtaaacct ctttcagtag ggacgaagcg aaagtgacgg tacctacaga agaaggaccg

480

gccaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtcc gagcgttgtc cggaattact

540

gggcgtaaag agctcgtagg tggtttgtcg cgttgttcgt gaaaactcac agcttaactg

600

tgggcgtgcg ggcgatacgg gcagactaga gtactgcagg ggagactgga attcctggtg

660

tagcggtgga atgcgcagat atcaggagga acaccggtgg cgaaggcggg tctctgggca

720

gtaactgacg ctgaggagcg aaagcgtggg tagcgaacag gattagatac cctggtagtc

780

cacgccgtaa acggtgggta ctaggtgtgg gtttccttcc ttgggatccg tgccgtagct

840

aacgcattaa gtaccccgcc tggggagtac ggtcgcaaga ctaaaactca aaggaattga

900

cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgtg gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta

960

cctgggtttg acatgcacag gacgtatcta gagataggta ttcccttgtg gcctgtgtgc

1020

aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1080

gcgcaaccct tgtcctatgt tgccagcggg taatgccggg gactcgtagg agactgccgg

1140

ggtcaactcg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tgccccttat gtccagggct

1200

tcacacatgc tacaatggcc agtacagagg gctgcgaagc cgtaaggtgg agcgaatccc

1260

ttaaagctgg tctcagttcg gattggggtc tgcaactcga ccccatgaag tcggagtcgc

1320

tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1380

cgtcacgtca tgaaagtcgg taacacccga agccagtggc ctaacctttt ggagggagct

1440

gtcgaaggtg ggatcggcga ttgggacgaa gtcgtaacaa ggtagccgta ccggaaggtg

1500

cggctggatc acctcctttc taagga

1526

<210> 1270

<211> 1433

<212> DNA

<213> Mycobacterium africanum

<400> 1270

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggaaaggtct cttcggagat

60

actcgagtgg cgaacgggtg agtaacacgt gggtgatctg ccctgcactt cgggataagc

120

ctgggaaact gggtctaata ccggatagga ccacgggatg catgtcttgt ggtggaaagc

180

gctttagcgg tgtgggatga gcccgcggcc tatcagcttg ttggtggggt gacggcctac

240

caaggcgacg acgggtagcc ggcctgagag ggtgtccggc cacactggga ctgagatacg

300

gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg

360

cagcgacgcc gcgtggggga tgacggcctt cgggttgtaa acctctttca ccatcgacga

420

aggtccgggt tctctcggat tgacggtagg tggagaagaa gcaccggcca actacgtgcc

480

agcagccgcg gtaatacgta gggtgcgagc gttgtccgga attactgggc gtaaagagct

540

cgtaggtggt ttgtcgcgtt gttcgtgaaa tctcacggct taactgtgag cgtgcgggcg

600

atacgggcag actagagtac tgcaggggag actggaattc ctggtgtagc ggtggaatgc

660

gcagatatca ggaggaacac cggtggcgaa ggcgggtctc tgggcagtaa ctgacgctga

720

ggagcgaaag cgtggggagc gaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacgg

780

tgggtactag gtgtgggttt ccttccttgg gatccgtgcc gtagctaacg cattaagtac

840

cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

900

agcggcggag catgtggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg ggtttgacat

960

gcacaggacg cgtctagaga taggcgttcc cttgtggcct gtgtgcaggt ggtgcatggc

1020

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc

1080

tcatgttgcc agcacgtaat ggtggggact cgtgagagac tgccggggtc aactcggagg

1140

aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatgcc ccttatgtcc agggcttcac acatgctaca

1200

atggccggta caaagggctg cgatgccgcg aggttaagcg aatccttaaa agccggtctc

1260

agttcggatc ggggtctgca actcgacccc gtgaagtcgg agtcgctagt aatcgcagat

1320

cagcaacgct gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acgtcatgaa

1380

agtcggtaac acccgaagcc agtggcctaa ccctcgggag ggagctgtcg aag

1433

<210> 1271

<211> 1376

<212> DNA

<213> Mycobacterium alsiensis

<400> 1271

ttttgggagt ttgatcctgg ctcaggacga acgctggcgg cgtgcttaac acatgcaagt

60

cgaacgagtg gcgaacgggt gagtaacacg tgggtaatct gccctgcact tcgggataag

120

cctgggaaac tgggtctaat accgaatagg gaaaggcggt gtgggatggg cccgcggcct

180

atcagcttgt tggtggggtg acggcctacc aaggcgacga cgggtagccg gcctgagagg

240

gtgtccggcc acactgggac tgagatacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

300

aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agcgacgccg cgtgggggat gacggccttc

360

gggttgtaaa cctctttcac catcgacgat gacggtaggt ggagaagaag caccggccaa

420

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggtgcgagcg ttgtccggaa ttactgggcg

480

taaagagctc gtaggtggtt tgtcgcgttg ttcgtgaaat ctcacggctt aactgtgagc

540

gtgcgggcga tacgggcaga ctggagtact gcaggggaga ctggaattcc tggtgtagcg

600

gtggaatgcg cagatatcag gaggaacacc ggtggcgaag gcgggtctct gggcagactg

660

acgctgagga gcgaaagcgt ggggagcgaa caggattaga taccctggta gtccacgccg

720

taaacggtgg gtactaggtg tgggttgatc cgtgccgtag ctaacgcatt aagtaccccg

780

cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg

840

gcggagcatg tggattaatt cgatgcaacg cgaagaacct tacctgggtt tgacatgtgc

900

aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

960

gcgcaaccct tgtctcatgt tgccagcggc cggggactcg tgagagactg ccggggtcaa

1020

ctcggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgtccag ggcttcacac

1080

atgctacaat ggccggcaaa gggctgcgat gccgcaaggt taagcgaatc ctttccggtc

1140

tcagttcgga cggggtctgc aactcgaccc cggaagtcgg agtcgctagt aatcgcagat

1200

cagcaacgct gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acgtcatgaa

1260

agtcggtaac acccgaagcc agtgcctagg gagctgtcga aggtgggatc ggcgattggg

1320

acgaagtcgt aacaaggtag ccgtaccgga aggtgcggct ggatcacctc ctttct

1376

<210> 1272

<211> 1537

<212> DNA

<213> Mycobacterium avium

<400> 1272

tttgtttgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaaggcctc ttcggaggta ctcgagtggc gaacgggtga gtaacacgtg

120

ggcaatctgc cctgcacttc gggataagcc tgggaaactg ggtctaatac cggataggac

180

ctcaagacgc atgtcttctg gtggaaagct tttgcggtgt gggatgggcc cgcggcctat

240

cagcttgttg gtggggtgac ggcctaccaa ggcgacgacg ggtagccggc ctgagagggt

300

gtccggccac actgggactg agatacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag cgacgccgcg tgggggatga cggccttcgg

420

gttgtaaacc tctttcacca tcgacgaagg tccgggtttt ctcggattga cggtaggtgg

480

agaagaagca ccggccaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg tgcgagcgtt

540

gtccggaatt actgggcgta aagagctcgt aggtggtttg tcgcgttgtt cgtgaaatct

600

cacggcttaa ctgtgagcgt gcgggcgata cgggcagact agagtactgc aggggagact

660

ggaattcctg gtgtagcggt ggaatgcgca gatatcagga ggaacaccgg tggcgaaggc

720

gggtctctgg gcagtaactg acgctgagga gcgaaagcgt ggggagcgaa caggattaga

780

taccctggta gtccacgccg taaacggtgg gtactaggtg tgggtttcct tccttgggat

840

ccgtgccgta gctaacgcat taagtacccc gcctggggag tacggccgca aggctaaaac

900

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat gtggattaat tcgatgcaac

960

gcgaagaacc ttacctgggt ttgacatgca caggacgcgt ctagagatag gcgttccctt

1020

gtggcctgtg tgcaggtggt gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1080

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtctca tgttgccagc gggtaatgcc ggggactcgt

1140

gagagactgc cggggtcaac tcggaggaag gtggggatga cgtcaagtca tcatgcccct

1200

tatgtccagg gcttcacaca tgctacaatg gccggtacaa agggctgcga tgccgtaagg

1260

ttaagcgaat ccttttaaag ccggtctcag ttcggattgg ggtctgcaac tcgaccccat

1320

gaagtcggag tcgctagtaa tcgcagatca gcaacgctgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac gtcatgaaag tcggtaacac ccgaagccag tggcctaacc

1440

cttttgggag ggagctgtcg aaggtgggat cggcgattgg gacgaagtcg taacaaggta

1500

gccgtaccgg aaggtgcggc tggatcacct cctttct

1537

<210> 1273

<211> 1468

<212> DNA

<213> Mycobacterium chelonae

<400> 1273

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggaaaggccc ttcggggtac

60

tcgagtggcg aacgggtgag taacacgtgg gtgatctgcc ctgcactctg ggataagcct

120

gggaaactgg gtctaatacc ggataggacc acacacttca tggtgagtgg tgcaaagctt

180

ttgcggtgtg ggatgagccc gcggcctatc agcttgttgg tggggtaatg gcccaccaag

240

gcgacgacgg gtagccggcc tgagagggtg accggccaca ctgggactga gatacggccc

300

agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc

360

gacgccgcgt gagggatgac ggccttcggg ttgtaaacct ctttcagtag ggacgaagcg

420

aaagtgacgg tacctacaga agaaggaccg gccaactacg tgccagcagc cgcggtaata

480

cgtagggtcc gagcgttgtc cggaattact gggcgtaaag agctcgtagg tggtttgtcg

540

cgttgttcgt gaaaactcac agcttaactg tgggcgtgcg ggcgatacgg gcagactaga

600

gtactgcagg ggagactgga attcctggtg tagcggtgga atgcgcagat atcaggagga

660

acaccggtgg cgaaggcggg tctctgggca gtaactgacg ctgaggagcg aaagcgtggg

720

tagcgaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acggtgggta ctaggtgtgg

780

gtttccttcc ttgggatccg tgccgtagct aacgcattaa gtaccccgcc tggggagtac

840

ggtcgcaaga ctaaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgtg

900

gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctgggtttg acatgcgcag gacgtatcta

960

gagataggta ttcccttgtg gcctgcgtgc aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt

1020

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtcctatgt tgccagcggg

1080

taatgccggg gactcgtagg agactgccgg ggtcaactcg gaggaaggtg gggatgacgt

1140

caagtcatca tgccccttat gtccagggct tcacacatgc tacaatggcc agtacagagg

1200

gctgcgaagc cgcaaggtgg agcgaatccc ttaaagctgg tctcagttcg gattggggtc

1260

tgcaactcga ccccatgaag tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg

1320

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca tgaaagtcgg taacacccga

1380

agccagtggc ctaacctttt ggagggagct gtcgaaggtg ggatcggcga ttgggacgaa

1440

gtcgtaacaa ggtagccgta ccggaagg

1468

<210> 1274

<211> 1481

<212> DNA

<213> Mycobacterium colombiense

<400> 1274

catgcaagtc gaacggaaag gcctcttcgg aggtactcga gtggcgaacg ggtgagtaac

60

acgtgggcaa tctgccctgc acttcgggat aagcctggga aactgggtct aataccggat

120

aggaccttta gacgcatgtc ttttggtgga aagcttttgc ggtgtgggat gggcccgcgg

180

cctatcagct tgttggtggg gtgatggcct accaaggcga cgacgggtag ccggcctgag

240

agggtgtccg gccacactgg gactgagata cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

300

gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagcgacg ccgcgtgggg gatgacggcc

360

ttcgggttgt aaacctcttt caccatcgac gaaggtccgg gttttctcgg attgacggta

420

ggtggagaag aagcaccggc caactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcga

480

gcgttgtccg gaattactgg gcgtaaagag ctcgtaggtg gtttgtcgcg ttgttcgtga

540

aatctcacgg cttaactgtg agcgtgcggg cgatacgggc agactagagt actgcagggg

600

agactggaat tcctggtgta gcggtggaat gcgcagatat caggaggaac accggtggcg

660

aaggcgggtc tctgggcagt aactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga gcgaacagga

720

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac ggtgggtact aggtgtgggt ttccttcctt

780

gggatccgtg ccgtagctaa cgcattaagt accccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct

840

aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggcgg agcatgtgga ttaattcgat

900

gcaacgcgaa gaaccttacc tgggtttgac atgcacagga cgcgtctaga gataggcgtt

960

cccttgtggc ctgtgtgcag gtggtgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

1020

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg tctcatgttg ccagcgggta atgccgggga

1080

ctcgtgagag actgccgggg tcaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg

1140

ccccttatgt ccagggcttc acacatgcta caatggccgg tacaaagggc tgcgatgccg

1200

taaggttaag cgaatccttt taaagccggt ctcagttcgg attggggtct gcaactcgac

1260

cccatgaagt cggagtcgct agtaatcgca gatcagcaac gctgcggtga atacgttccc

1320

gggccttgta cacaccgccc gtcacgtcat gaaagtcggt aacacccgaa gccagtggcc

1380

taaccttttg gagggagctg tcgaaggtgg gatcggcgat tgggacgaag tcgtaacaag

1440

gtagccgtac cggaaggtgc ggctggatca cctccttttc t

1481

<210> 1275

<211> 1475

<212> DNA

<213> Mycobacterium elephantis

<400> 1275

agtttgatcc tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca agtcgaacgg

60

aaaggcccct tcgggggtgc tcgagtggcg aacgggtgag taacacgtgg gtgatctgcc

120

ctgcactttg ggataagcct gggaaactgg gtctaatacc gaatacaccc tgctggtcgc

180

atggcctggt gggggaaagc ttttgcggtg tgggatgggc ccgcggccta tcagcttgtt

240

ggtggggtga tggcctacca aggcgacgac gggtagccgg cctgagaggg tgtccggcca

300

cactgggact gagatacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca

360

atgggcgcaa gcctgatgca gcgacgccgc gtgggggatg acggccttcg ggttgtaaac

420

ccctttcagt atcgacgaag ccgtgaggtg acggtaggta cagaagaagc accggccaac

480

tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gtgcgagcgt tgtccggaat tactgggcgt

540

aaagagctcg taggtggttt gtcgcgttgt ccgtgaaaac tcacagctta actgtgggcg

600

tgcgggcgat acgggcagac tggagtactg caggggagac tggaattcct ggtgtagcgg

660

tggaatgcgc agatatcagg aggaacaccg gtggcgaagg cgggtctctg ggcagtaact

720

gacgctgagg agcgaaagcg tggggagcga acaggattag ataccctggt agtccacgcc

780

gtaaacggtg ggtactaggt gtgggtttcc ttccttggga tccgtgccgt agctaacgca

840

ttaagtaccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg

900

cccgcacaag cggcggagca tgtggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggg

960

tttgacatgc acaggacgcg tctagagata ggcgttccct tgtggcctgt gtgcaggtgg

1020

tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

1080

cccttgtctc atgttgccag cacgtgatgg tggggactcg tgagagactg ccggggtcaa

1140

ctcggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgtccag ggcttcacac

1200

atgctacaat ggccggtaca aagggctgcg atgccgtgag gtggagcgaa tcctttcaaa

1260

gccggtctca gttcggatcg gggtctgcaa ctcgaccccg tgaagtcgga gtcgctagta

1320

atcgcagatc agcaacgctg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca

1380

cgtcatgaaa gtcggtaaca cccgaagccg gtggcctaac ccgcaaggga gggagccgtc

1440

gaaggtggga tcggcgattg ggacgaagtc gtaac

1475

<210> 1276

<211> 1485

<212> DNA

<213> Mycobacterium gordonae

<400> 1276

tagagtttga atcatggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcttaacaca tgcaagtcga

60

acggtaaggc ccttcggggt acacgagtgg cgaacgggtg agtaacacgt gggtaatctg

120

ccctgcacat cgggataagc ctgggaaact gggtctaata ccgaatagga ccacagaaca

180

catgtcctgt ggtggaaagc ttttgcggtg tgggatgggc ccgcggccta tcagcttgtt

240

ggtggggtga tggcccacca aggcgacgac gggtagccgg cctgagaggg tgtccggcca

300

cactgggact gagatacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca

360

atgggcgaaa gcctgatgca gcgacgccgc gtgggggatg acggccttcg ggttgtaaac

420

ctctttcacc atcgacgaag gttcgggttt tctcggattg acggtaggtg gagaagaagc

480

accggccaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gtgcgagcgt tgtccggaat

540

tactgggcgt aaagagctcg taggtggttt gtcgcgttgt tcgtgaaatc tcacggctta

600

actgtgagcg tgcgggcgat acgggcagac ttgagtactg caggggagac tggaattcct

660

ggtgtagcgg tggaatgcgc agatatcagg aggaacaccg gtggcgaagg cgggtctctg

720

ggcagtaact gacgctgagg agcgaaagcg tggggagcga acaggattag ataccctggt

780

agtccacgcc gtaaacggtg ggtactaggt gtgggtttcc ttccttggga tccgtgccgt

840

agctaacgca ttaagtaccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaagaaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cggcggagca tgtggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac

960

cttacctggg tttgacatgc acaggacgcc ggcagagatg tcggttccct tgtggcctgt

1020

gtgcaggtgg tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1080

acgagcgcaa cccttgtctc atgttgccag cgggtaatgc cggggactcg tgagagactg

1140

ccggggtcaa ctcggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgtccag

1200

ggcttcacac atgctacaat ggccggtaca gagggctgcg atgccgcgag gttaagcgaa

1260

tccttttaaa gccggtctca gttcggatcg gggtctgcaa ctcgaccccg tgaagtcgga

1320

gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1380

ccgcccgtca cgtcatgaaa gtcggtaaca cccgaagcca gtggcctaac cctttgggag

1440

ggagctgtcg aaggtgggat cggcgattgg gacgaagtcg taaca

1485

<210> 1277

<211> 1495

<212> DNA

<213> Mycobacterium intracellulare

<400> 1277

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggaaaggccc cttcgggggt actcgagtgg cgaacgggtg agtaacacgt gggcaatctg

120

ccctgcactt cgggataagc ctgggaaact gggtctaata ccggatagga cctttaggcg

180

catgtcttta ggtggaaagc ttttgcggtg tgggatgggc ccgcggccta tcagcttgtt

240

ggtggggtga tggcctacca aggcgacgac gggtagccgg cctgagaggg tgtccggcca

300

cactgggact gagatacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca

360

atgggcgcaa gcctgatgca gcgacgccgc gtgggggatg acggccttcg ggttgtaaac

420

ctctttcacc atcgacgaag gtccgggttt tctcggattg acggtaggtg gagaagaagc

480

accggccaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gtgcgagcgt tgtccggaat

540

tactgggcgt aaagagctcg taggtggttt gtcgcgttgt tcgtgaaatc tcacggctta

600

actgtgagcg tgcgggcgat acgggcagac tagagtactg caggggagac tggaattcct

660

ggtgtagcgg tggaatgcgc agatatcagg aggaacaccg gtggcgaagg cgggtctctg

720

ggcagtaact gacgctgagg agcgaaagcg tggggagcga acaggattag ataccctggt

780

agtccacgcc gtaaacggtg ggtactaggt gtgggtttcc ttccttggga tccgtgccgt

840

agctaacgca ttaagtaccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cggcggagca tgtggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac

960

cttacctggg tttgacatgc acaggacgcg tctagagata ggcgttccct tgtggcctgt

1020

gtgcaggtgg tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1080

acgagcgcaa cccttgtctc atgttgccag cgggtaatgc cggggactcg tgagagactg

1140

ccggggtcaa ctcggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgtccag

1200

ggcttcacac atgctacaat ggccggtaca aagggctgcg atgccgcaag gttaagcgaa

1260

tccttttaaa gccggtctca gttcggattg gggtctgcaa ctcgacccca tgaagtcgga

1320

gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1380

ccgcccgtca cgtcatgaaa gtcggtaaca cccgaagcca gtggcctaac ccttgggagg

1440

gagctgtcga aggtgggatc ggcgattggg acgaagtcgt aacaaggtag ccgta

1495

<210> 1278

<211> 1469

<212> DNA

<213> Mycobacterium kansasii

<400> 1278

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggaaaggtct cttcggagac

60

actcgagtgg cgaacgggtg agtaacacgt gggcaatctg ccctgcacac cgggataagc

120

ctgggaaact gggtctaata ccggatagga ccacttggcg catgccttgt ggtggaaagc

180

ttttgcggtg tgggatgggc ccgcggccta tcagcttgtt ggtggggtga cggcctacca

240

aggcgacgac gggtagccgg cctgagaggg tgtccggcca cactgggact gagatacggc

300

ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca

360

gcgacgccgc gtgggggatg acggccttcg ggttgtaaac ctctttcacc atcgacgaag

420

gtccgggttc tctcggattg acggtaggtg gagaagaagc accggccaac tacgtgccag

480

cagccgcggt aatacgtagg gtgcgagcgt tgtccggaat tactgggcgt aaagagctcg

540

taggtggttt gtcgcgttgt tcgtgaaatc tcacggctta actgtgagcg tgcgggcgat

600

acgggcagac tagagtactg caggggagac tggaattcct ggtgtagcgg tggaatgcgc

660

agatatcagg aggaacaccg gtggcgaagg cgggtctctg ggcagtaact gacgctgagg

720

agcgaaagcg tggggagcga acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacggtg

780

ggtactaggt gtgggtttcc ttccttggga tccgtgccgt agctaacgca ttaagtaccc

840

cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag

900

cggcggagca tgtggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggg tttgacatgc

960

acaggacgcg tctagagata ggcgttccct tgtggcctgt gtgcaggtgg tgcatggctg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtctc

1080

atgttgccag cgggtaatgc cggggactcg tgagagactg ccggggtcaa ctcggaggaa

1140

ggtggggatg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgtccag ggcttcacac atgctacaat

1200

ggccggtaca aagggctgcg atgccgcgag gttaagcgaa tccttttaaa gccggtctca

1260

gttcggatcg gggtctgcaa ctcgaccccg tgaagtcgga gtcgctagta atcgcagatc

1320

agcaacgctg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca cgtcatgaaa

1380

gtcggtaaca cccgaagcca gtggcctaac cctcgggagg gagctgtcga aggtgggatc

1440

ggcgattggg acgaagtcgt aacaaggta

1469

<210> 1279

<211> 1314

<212> DNA

<213> Mycobacterium lacus

<400> 1279

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta

60

acacgtgggt gatctgccct gcacttcggg ataagcctgg gaaactgggt ctaataccgg

120

atagggaaag gcggtgtggg atgagcccgc ggcctatcag cttgttggtg gggtgacggc

180

ctaccaaggc gacgacgggt agccggcctg agagggtgtc cggccacact gggactgaga

240

tacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct

300

gatgcagcga cgccgcgtgg gggatgacgg ccttcgggtt gtaaacctct ttcaccatcg

360

acgatgacgg tagatggaga agaagcaccg gccaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtagggtgc gagcgttgtc cggaattact gggcgtaaag agctcgtagg tggtttgtcg

480

cgttgttcgt gaaatctcac ggcttaactg tgagcgtgcg ggcgatacgg gcagactgga

540

gtactgcagg ggagactgga attcctggtg tagcggtgga atgcgcagat atcaggagga

600

acaccggtgg cgaaggcggg tctctgggca gactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga

660

gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac ggtgggtact aggtgtgggt

720

tgatccgtgc cgtagctaac gcattaagta ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga gcatgtggat taattcgatg

840

caacgcgaag aaccttacct gggtttgaca tgtgcaggtg gtgcatggct gtcgtcagct

900

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgtct catgttgcca

960

gcggccgggg actcgtgaga gactgccggg gtcaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1020

aagtcatcat gccccttatg tccagggctt cacacatgct acaatggccg gcaaagggct

1080

gcgatgccgc gaggttaagc gaatcctttc cggtctcagt tcggacgggg tctgcaactc

1140

gaccccggaa gtcggagtcg ctagtaatcg cagatcagca acgctgcggt gaatacgttc

1200

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacgtc atgaaagtcg gtaacacccg aagccagtgc

1260

ctagggagct gtcgaaggtg ggatcggcga ttgggacgaa gtcgtaacaa ggta

1314

<210> 1280

<211> 1553

<212> DNA

<213> Mycobacterium leprae

<400> 1280

tttgtttgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaaggtctc taaaaaatct tttttagaga tactcgagtg gcgaacgggt

120

gagtaacacg tgggtaatct gccctgcact tcagggataa gcttgggaaa ctgggtctaa

180

taccggatag gacttcaagg cgcatgtctt gtggtggaaa gctttttgcg gtgcaggatg

240

ggcccgcggc ctatcagctt gttggtgggg tgacggccta ccaaggcgac gacgggtagc

300

cggcctgaga gggtgtacgg ccacactggg actgagatac ggcccagact cctacgggag

360

gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat gcagcgacgc cgcgtggggg

420

atgacggctt tcgggttgta aacctctttc accatcgacg aaggtctggg ttttctcgga

480

ttgacggtag gtggagaaga agcaccggcc aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

agggtgcgag cgttgtccgg aattactggg cgtaaagagc tcgtaggtgg tttgtcgcgt

600

tgttcgtgaa atctcacggc ttaactgtga gcgtgcgggc gatacgggca gactggagta

660

ctgcagggga gactggaatt cctggtgtag cggtggaatg cgcagatatc aggaggaaca

720

ccagtggcga aggcgggtct ctgggcagta actgacgctg aggagcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg gtgggtacta ggtgtgggtt

840

tccttccttg ggatccgtgc cgtagctaac gcattaagta ccccgcctgg ggagtacggc

900

cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga gcatgtggat

960

taattcgatg caacgcgaag aaccttacct gggtttgaca tgcacaggat gcgtctagag

1020

ataggcactc ccttgtggcc tgtgtgcagg tggtgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt ctcatgttgc cagcacgtaa

1140

tggtggggac tcgtgagaga ctgccgcggt caactcggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1200

gtcatcatgc cccttatgtc cagggcttca cacatgctac aatggccggt acaaagggct

1260

gcgatgccgc aaggttaagc gaatcctttt aaagccggtc tcagttcgga tcggggtctg

1320

caactcgacc ccgtgaagtc ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa

1380

tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacgtcatg aaagtcggta acacccgaag

1440

ccagtggcct aaccctcggg agggagctgt ccaaggtggg atcggcgatt gggacgaagt

1500

cgtaacaagg tagccgtacc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctttcta agg

1553

<210> 1281

<211> 1538

<212> DNA

<213> Mycobacterium lepromatosis

<400> 1281

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggaaaggtct cttaatactt aaacctatta aagatactcg agtggcgaac gggtgagtaa

120

cacgtgggta atctaccctg cacttcaggg ataagcctgg gaaaccgggt ctaataccgg

180

ataggacttc aaggcgcatg tcttgtggtg gaaagctttt gcggtgcggg atgggcccgc

240

ggcctatcag cttgttggtg gggtgacggc ctaccaaggc gacgacgggt agccggcctg

300

agagggtgtc cggccacact gggactgaga tacggcccag actcctacgg gaggcagcag

360

tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcga cgccgcgtgg gggatgacgg

420

ctttcgggtt gtaaacctct ttcaccattg acgaagatct gggttttctc ggattgacgg

480

taggtggaga agaagcaccg gccaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc

540

gagcgttgtc cggaattact gggcgtaaag agctcgtagg tggtttgtcg cgttgttcgt

600

gaaatctcac ggcttaactg tgagcgtgcg ggcgatacgg gcagactgga gtactgcagg

660

ggagactgga attcctggtg tagcggtgga atgcgcagat atcaggagga acaccggtgg

720

cgaaggcggg tctctgggca gtaactgacg ctgaggagcg aaagcgtggg gagcgaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acggtgggta ctaggtgtgg gtttccttcc

840

ttgggatccg tgccgtagct aacgcattaa gtaccccgcc tggggagtac ggccgcaagg

900

ctaaaactca aaggaattga cggggcccgc acaagcggcg gagcatgtgg attaattcga

960

tgcaacgcga agaaccttac ctgggtttga catgcacagg acgcgtctag agataggcgt

1020

tcctttttgg cctgtgtgca ggtggtgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

1080

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gtctcatgtt gccagcacgt aatggtgggg

1140

actcgtgaga gactgccgcg gtcaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat

1200

gccccttatg tccagggctt cacacatgct acaatggccg gtacaaaggg ctgcgatgcc

1260

gcaaggttaa gcgaatcctt attaaagccg gtctcagttc ggatcggggt ctgcaactcg

1320

accccgtgaa gccggagtcg ctagtaatcg cagatcagca acgctgcggt gaatacgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacgtc atgaaagtcg gtaacacccg aagccagtgg

1440

cctaaccctc gggagggagc tgtcgaaggt gggatcggcg attgggacga agtcgtaaca

1500

aggtagccgt accggaaggt gcggttggat cacctcct

1538

<210> 1282

<211> 1310

<212> DNA

<213> Mycobacterium mageritense

<400> 1282

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta

60

acacgtgggt gatctgccct gcactttggg ataagcctgg gaaactgggt ctaataccga

120

atagggaaag gcggtgtggg atgggcccgc ggcctatcag cttgttggtg gggtgatggc

180

ctaccaaggc gacgacgggt agccggcctg agagggtgac cggccacact gggactgaga

240

tacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct

300

gatgcagcga cgccgcgtga gggatgacgg ccttcgggtt gtaaacctct ttcagcaaga

360

cgatgacggt atgtgcagaa gaaggaccgg ccaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

420

gtagggtccg agcgttgtcc ggaattactg ggcgtaaaga gctcgtaggt ggtttgtcgc

480

gttgttcgtg aaaactcaca gcttaactgt gggcgtgcgg gcgatacggg cagactggag

540

tactgcaggg gagactggaa ttcctggtgt agcggtggaa tgcgcagata tcaggaggaa

600

caccggtggc gaaggcgggt ctctgggcag actgacgctg aggagcgaaa gcgtggggag

660

cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg gtgggtacta ggtgtgggtt

720

gatccgtgcc gtagctaacg cattaagtac cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag catgtggatt aattcgatgc

840

aacgcgaaga accttacctg ggtttgacat gtgcaggtgg tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtctc atgttgccag

960

cacgtgggga ctcgtgagag actgccgggg tcaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

agtcatcatg ccccttatgt ccagggcttc acacatgcta caatggccgg caaagggctg

1080

cgatgccgtg aggtggagcg aatcctttcc ggtctcagtt cggacggggt ctgcaactcg

1140

accccggaag tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttcc

1200

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca tgaaagtcgg taacacccga agccggtgcc

1260

tagggagccg tcgaaggtgg gatcggcgat tgggacgaag tcgtaacaag

1310

<210> 1283

<211> 1471

<212> DNA

<213> Mycobacterium mantenii

<400> 1283

tggttcagga cgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca agtcgaacgg aaaggcctct

60

tcggaggtac tcgagtggcg aacgggtgag taacacgtgg gcaatctgcc ctgcacttcg

120

ggataagcct gggaaactgg gtctaatacc gaataggacc acttggcgca tgccttgtgg

180

tggaaagctt ttgcggtgtg ggatgggccc gcggcctatc agcttgttgg tggggtgatg

240

gcctaccaag gcgacgacgg gtagccggcc tgagagggtg tccggccaca ctgggactga

300

gatacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc

360

ctgatgcagc gacgccgcgt gggggatgac ggccttcggg ttgtaaacct ctttcaccat

420

cgacgaaggc tcactttgtg ggttgacggt aggtggagaa gaagcaccgg ccaactacgt

480

gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgcg agcgttgtcc ggaattactg ggcgtaaaga

540

gctcgtaggt ggtttgtcgc gttgttcgtg aaatctcacg gcttaactgt gagcgtgcgg

600

gcgatacggg cagactagag tactgcaggg gagactggaa ttcctggtgt agcggtggaa

660

tgcgcagata tcaggaggaa caccggtggc gaaggcgggt ctctgggcag taactgacgc

720

tgaggagcga aagcgtgggg agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa

780

cggtgggtac taggtgtggg tttccttcct tgggatccgt gccgtagcta acgcattaag

840

taccccgcct ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc

900

acaagcggcg gagcatgtgg attaattcga tgcaacgcga agaaccttac ctgggtttga

960

catgcacagg acgcgtctag agataggcgt tcccttgtgg cctgtgtgca ggtggtgcat

1020

ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt

1080

gtctcatgtt gccagcgggt aatgccgggg actcgtgaga gactgccggg gtcaactcgg

1140

aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat gccccttatg tccagggctt cacacatgct

1200

acaatggccg gtacaaaggg ctgcgatgcc gtaaggttaa gcgaatcctt ttaaagccgg

1260

tctcagttcg gattggggtc tgcaactcga ccccatgaag tcggagtcgc tagtaatcgc

1320

agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca

1380

tgaaagtcgg taacacccga agccagtggc ctaacccttt gggagggagc tgtcgaaggt

1440

gggatcggcg attgggacga agtcgtaaca a

1471

<210> 1284

<211> 1535

<212> DNA

<213> Mycobacterium marinum

<400> 1284

tttgtttgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaaggtctc ttcggagata ctcgagtggc gaacgggtga gtaacacgtg

120

ggcgatctgc cctgcacttc gggataagcc tgggaaactg ggtctaatac cggataggac

180

cacgggattc atgtcctgtg gtggaaagct tttgcggtgt gggatgggcc cgcggcctat

240

cagcttgttg gtggggtaac ggcctaccaa ggcgacgacg ggtagccggc ctgagagggt

300

gtccggccac actgggactg agatacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag cgacgccgcg tgggggatga cggccttcgg

420

gttgtaaacc tctttcacca tcgacgaagg ttcgggtttt ctcggattga cggtaggtgg

480

agaagaagca ccggccaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg tgcgagcgtt

540

gtccggaatt actgggcgta aagagctcgt aggtggtttg tcgcgttgtt cgtgaaatct

600

cacggcttaa ctgtgagcgt gcgggcgata cgggcagact agagtactgc aggggagact

660

ggaattcctg gtgtagcggt ggaatgcgca gatatcagga ggaacaccgg tggcgaaggc

720

gggtctctgg gcagtaactg acgctgagga gcgaaagcgt ggggagcgaa caggattaga

780

taccctggta gtccacgccg taaacggtgg gtactaggtg tgggtttcct tccttgggat

840

ccgtgccgta gctaacgcat taagtacccc gcctggggag tacggccgca aggctaaaac

900

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat gtggattaat tcgatgcaac

960

gcgaagaacc ttacctgggt ttgacatgca caggacgcgt ctagagatag gcgttccctt

1020

gtggcctgtg tgcaggtggt gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1080

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtctca tgttgccagc acgtaatggt ggggactcgt

1140

gagagactgc cggggtcaac tcggaggaag gtggggatga cgtcaagtca tcatgcccct

1200

tatgtccagg gcttcacaca tgctacaatg gccggtacaa agggctgcga tgccgcgagg

1260

ttaagcgaat cctttaaagc cggtctcagt tcggatcggg gtctgcaact cgaccccgtg

1320

aagtcggagt cgctagtaat cgcagatcag caacgctgcg gtgaatacgt tcccgggcct

1380

tgtacacacc gcccgtcacg tcatgaaagt cggtaacacc cgaagccagt ggcctaaccc

1440

tttgggaggg agctgtcgaa ggtgggatcg gcgattggga cgaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtaccggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1535

<210> 1285

<211> 1484

<212> DNA

<213> Mycobacterium microti

<400> 1285

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggaaaggtct cttcggagat

60

actcgagtgg cgaacgggtg agtaacacgt gggtgatctg ccctgcactt cgggataagc

120

ctgggaaact gggtctaata ccggatagga ccacgggatg catgtcttgt ggtggaaagc

180

gctttagcgg tgtgggatga gcccgcggcc tatcagcttg ttggtggggt gacggcctac

240

caaggcgacg acgggtagcc ggcctgagag ggtgtccggc cacactggga ctgagatacg

300

gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg

360

cagcgacgcc gcgtggggga tgacggcctt cgggttgtaa acctctttca ccatcgacga

420

aggtccgggt tctctcggat tgacggtagg tggagaagaa gcaccggcca actacgtgcc

480

agcagccgcg gtaatacgta gggtgcgagc gttgtccgga attactgggc gtaaagagct

540

cgtaggtggt ttgtcgcgtt gttcgtgaaa tctcacggct taactgtgag cgtgcgggcg

600

atacgggcag actagagtac tgcaggggag actggaattc ctggtgtagc ggtggaatgc

660

gcagatatca ggaggaacac cggtggcgaa ggcgggtctc tgggcagtaa ctgacgctga

720

ggagcgaaag cgtggggagc gaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacgg

780

tgggtactag gtgtgggttt ccttccttgg gatccgtgcc gtagctaacg cattaagtac

840

cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

900

agcggcggag catgtggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg ggtttgacat

960

gcacaggacg cgtctagaga taggcgttcc cttgtggcct gtgtgcaggt ggtgcatggc

1020

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc

1080

tcatgttgcc agcacgtaat ggtggggact cgtgagagac tgccggggtc aactcggagg

1140

aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatgcc ccttatgtcc agggcttcac acatgctaca

1200

atgaccggta caaagggctg cgatgccgcg aggttaagcg aatccttaaa agccggtctc

1260

agttcggatc ggggtctgca actcgacccc gtgaagtcgg agtcgctagt aatcgcagat

1320

cagcaacgct gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acgtcatgaa

1380

agtcggtaac acccgaagcc agtggcctaa ccctcgggag ggagctgtcg aaggtgggat

1440

cggcgattgg gacgaagtcg taacaaggta gccgtaccgg aagg

1484

<210> 1286

<211> 1273

<212> DNA

<213> Mycobacterium neoaurum

<400> 1286

tggcgaacgg gtgagtaaca cgtgggtgat ctgccctgca ctttgggata agcctgggaa

60

actgggtcta ataccgaata tgatcatcgg cttcatggtc ggtggtggaa agcttttgcg

120

gtgtgggatg ggcccgcggc ctatcagctt gttggtgggg taatggccta ccaaggcgac

180

gacgggtagc cggcctgaga gggtgaccgg ccacactggg actgagatac ggcccagact

240

cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat gcagcgacgc

300

cgcgtgaggg atgacggcct tcgggttgta aacctctttc agcacagacg aagcgcaagt

360

gacggtatgt gcagaagaag gaccggccaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

420

ggtccgagcg ttgtccggaa ttactgggcg taaagagctc gtaggtggtt tgtcgcgttg

480

ttcgtgaaaa ctcacagctt aactgtgggc gtgcgggcga tacgggcaga ctagagtact

540

gcaggggaga ctggaattcc tggtgtagcg gtggaatgcg cagatatcag gaggaacacc

600

ggtggcgaag gcgggtctct gggcagtaac tgacgctgag gagcgaaagc gtggggagcg

660

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacggt gggtactagg tgtgggtttc

720

cttccttggg atccgtgccg tagctaacgc attaagtacc ccgcctgggg agtacggccg

780

caaggctaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggcggagc atgtggatta

840

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg gtttgacatg cacaggacgc tggtagagat

900

atcagttccc ttgtggcctg tgtgcaggtg gtgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga

960

gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgtcc tatgttgcca gcgggttatg

1020

ccggggactc gtaggagact gccggggtca actcggagga aggtggggat gacgtcaagt

1080

catcatgccc cttatgtcca gggcttcaca catgctacaa tggccggtac aaagggctgc

1140

gatgccgtga ggtggagcga atcctttcaa agccggtctc agttcggatc ggggtctgca

1200

actcgacccc gtgaagtcgg agtcgctagt aatcgcagat cagcaacgct gcggtgaata

1260

cgttcccggg cct

1273

<210> 1287

<211> 1523

<212> DNA

<213> Mycobacterium parascrofulaceum

<400> 1287

tttgtttgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaaggtctc ttcggagata ctcgagtggc gaacgggtga gtaacacgtg

120

ggcaatctgc cctgcacttc gggataagcc tgggaaactg ggtctaatac cggataggac

180

cacttggcgc atgccttgtg gtggaaagct tttgcggtgt gggatgggcc cgcggcctat

240

cagctagttg gtggggtgat ggcctaccaa ggcgacgacg ggtagccggc ctgagagggt

300

gtccggccac actgggactg agatacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag cgacgccgcg tgggggatga cggccttcgg

420

gttgtaaacc tctttcagca gggacgaagc gcaagtgacg gtacctgcag aagaagcacc

480

ggccaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggtg cgagcgttgt ccggaattac

540

tgggcgtaaa gagctcgtag gtggtttgtc gcgttgttcg tgaaaaccgg gggcttaacc

600

ctcggcgtgc gggcgatacg ggcagactag agtactgcag gggagactgg aattcctggt

660

gtagcggtgg aatgcgcaga tatcaggagg aacaccggtg gcgaaggcgg gtctctgggc

720

agtaactgac gctgaggagc gaaagcgtgg ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt

780

ccacgccgta aacggtgggt actaggtgtg ggtttccttc cttgggatcc gtgccgtagc

840

taacgcatta agtaccccgc ctggggagta cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg

900

acgggggccc gcacaagcgg cggagcatgt ggattaattc gatgcaacgc gaagaacctt

960

acctgggttt gacatgcaca ggacgcgtct agagataggc gttcccttgt ggcctgtgtg

1020

caggtggtgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc ttgtctcatg ttgccagcgg gtaatgccgg ggactcgtga gagactgccg

1140

gggtcaactc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atgcccctta tgtccagggc

1200

ttcacacatg ctacaatggc cggtacaaag ggctgcgatg ccgcaaggtt aagcgaatcc

1260

ttttaaagcc ggtctcagtt cggatcgggg tctgcaactc gaccccgtga agtcggagtc

1320

gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1380

cccgtcacgt catgaaagtc ggtaacaccc gaagccagtg gcctaaccct tgggagggag

1440

ctgtcgaagg tgggatcggc gattgggacg aagtcgtaac aaggtagccg taccggaagg

1500

tgcggctgga tcacctcctt tct

1523

<210> 1288

<211> 1417

<212> DNA

<213> Mycobacterium paraterrae

<400> 1288

tgcttaacac atgcaagtcg aacggaaagg ccctttcggg ggtactcgag tggcgaacgg

60

gtgagtaaca cgtgggtgat ctgccctgca ctttgggata agcctgggaa actgggtcta

120

ataccgaata ggaccacgcg cttcatggtg tgtggtggaa agcttttgcg gtgtgggatg

180

ggcccgcggc ctatcagctt gttggtgggg taatggccta ccaaggcgac gacgggtagc

240

cggcctgaga gggtgtccgg ccacactggg actgagatac ggcccagact cctacgggag

300

gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat gcagcgacgc cgcgtggggg

360

atgacggcct tcgggttgta aacctctttc agtatcggcg aagctccagg attcttcttg

420

gggtgacagt aggtacagaa gaagcaccgg ccaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

480

gtagggtgcg agcgttgtcc ggaattactg ggcgtaaaga gctcgtaggt ggtttgtcac

540

gttgtccgtg aaaactcaca gcttaactgt gggcgtgcgg gcgatacggg cagactggag

600

tactgtaggg gagactggaa ttcctggtgt agcggtggaa tgcgcagata tcaggaggaa

660

caccggtggc gaaagcgggt ctctgggcag taactgacgc tgaggagcga aagcgtgggg

720

agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cggtgggtac taggtgtggg

780

tttccttcct ttagggatcc gtgccgtagc taacgcatta agtaccccgc ctggggagta

840

cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg cggagcatgt

900

ggattaattc gatgcaacgc gaagaacctt acctgggttt gacatgcaca ggacgccggt

960

agagatatcg gttcccttgt ggcctgtgtg caggtggtgc atggctgtcg tcagctcgtg

1020

tcgtgagatg ctgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtctcatg ttgccagcac

1080

gttatggtgg ggactcgtga gagactgccg gggtcaactc ggaggaaggt ggggatgacg

1140

tcaagtcatc atgcccctta tgtccagggc ttcacacatg ctacaatggc cggtacaaag

1200

ggctgcgatc ccgtgagggt tagcgaatcc tttaaagccg gtctcagttc ggattggggt

1260

ctgcaactcg accccatgaa gtcggagtcg ctagtaatcg cagatcagca acgctgcggt

1320

gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacgtc atgaaagtcg gtaacacccg

1380

aagccggtgg cctaaccctt gtggagggag ccgtcga

1417

<210> 1289

<211> 1486

<212> DNA

<213> Mycobacterium phlei

<400> 1289

tagagtttga tcatggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgaa

60

cggaaaggcc ccttcggggg tactcgagtg gcgaacgggt gagtaacacg tgggtgatct

120

gccctgcact ctgggataag cctgggaaac tgggtctaat accggataca cccttctggt

180

tgcatggctg ggaggggaaa gcttttgcgg tgtgggatgg gcccgcggcc tatcagcttg

240

ttggtggggt gatggcctac caaggcgacg acgggtagcc ggcctgagag ggtgtccggc

300

cacactggga ctgagatacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca

360

caatgggcgc aagcctgatg cagcgacgcc gcgtggggga tgacggcctt cgggttgtaa

420

acccctttca gtagggacga agcgtgagtg acggtaccta cagaagaagc accggccaac

480

tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gtgcgagcgt tgtccggaat tactgggcgt

540

aaagagctcg taggtggttt gtcgcgttgt tcgtgaaaac tcacagctta actgtgggcg

600

tgcgggcgat acgggcagac tagagtactg caggggagac tggaattcct ggtgtagcgg

660

tggaatgcgc agatatcagg aggaacaccg gtggcgaagg cgggtctctg ggcagtaact

720

gacgctgagg agcgaaagcg tggggagcga acaggattag ataccctggt agtccacgcc

780

gtaaacggtg ggtactaggt gtgggtttcc ttccttggga tccgtgccgt agctaacgca

840

ttaagtaccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg

900

cccgcacaag cggcggagca tgtggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggg

960

tttgacatgc acaggacgac ggcagagatg tcgtttccct tgtggcctgt gtgcaggtgg

1020

tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

1080

cccttgtctc atgttgccag cacgttatgg tggggactcg tgagagaccg ccggggtcaa

1140

ctcggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgtccag ggcttcacac

1200

atgctacakt ggccggtaca aagggctgcg atgccgtgag gtggagcgaa tcctttcaaa

1260

gccggtctca gttcggatcg gggtctgcaa ctcgaccccg tgaagtcgga gtcgctagta

1320

atcgcagatc agcaacgctg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca

1380

cgtcatgaaa gtcggtaaca cccgaagccg gtggcctaac cccttgtggg agggagccgt

1440

cgaaggtggg atcggcgatt gggacgaagt cgtaacaagg agccgc

1486

<210> 1290

<211> 1522

<212> DNA

<213> Mycobacterium seoulense

<400> 1290

gagagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgaa

60

cggaaaggcc ccttcggggg tactcgagtg gcgaacgggt gagtaacacg tgggcaatct

120

gccctgcact tcgggataag cctgggaaac tgggtctaat accgaatagg accacttggc

180

gcatgccttg tggtggaaag cttttgcggt gtgggatggg cccgcggcct atcagcttgt

240

tggtggggtg atggcctacc aaggcgacga cgggtagccg gcctgagagg gtgtccggcc

300

acactgggac tgagatacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac

360

aatgggcgca agcctgatgc agcgacgccg cgtgggggat gacggccttc gggttgtaaa

420

cctctttcac catcgacgaa ggtccgggtt tctcggattg acggtaggtg gagaagaagc

480

accggccaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gtgcgagcgt tgtccggaat

540

tactgggcgt aaagagctcg taggtggttt gtcgcgttgt tcgtgaaatc tcacggctta

600

actgtgagcg tgcgggcgat acgggcagac tagagtactg caggggagac tggaattcct

660

ggtgtagcgg tggaatgcgc agatatcagg aggaacaccg gtggcgaagg cgggtctctg

720

ggcagtaact gacgctgagg agcgaaagcg tggggagcga acaggattag ataccctggt

780

agtccacgcc gtaaacggtg ggtactaggt gtgggtttcc ttccttggga tccgtgccgt

840

agctaacgca ttaagtaccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cggcggagca tgtggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac

960

cttacctggg tttgacatgc acaggacgcg tctagagata ggcgttccct tgtggcctgt

1020

gtgcaggtgg tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1080

acgagcgcaa cccttgtctc atgttgccag cgggtaatgc cggggactcg tgagagactg

1140

ccggggtcaa ctcggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgtccag

1200

ggcttcacac atgctacaat ggccggtaca aagggctgcg atgccgcaag gttaagcgaa

1260

tccttttaaa gccggtctca gttcggatcg gggtctgcaa ctcgaccccg tgaagtcgga

1320

gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1380

ccgcccgtca cgtcatgaaa gtcggtaaca cccgaagcca gtggcctaac ccttgggagg

1440

gagctgtcga aggtgggatc ggcgattgga cgaagtcgta acaaggtagc cgtaccggaa

1500

ggtgcggctg gatcacctcc tt

1522

<210> 1291

<211> 1525

<212> DNA

<213> Mycobacterium smegmatis

<400> 1291

ttgtttggag agtttgatcc tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca

60

agtcgaacgg aaaggccctt tcgggggtac tcgagtggcg aacgggtgag taacacgtgg

120

gtgatctgcc ctgcactttg ggataagcct gggaaactgg gtctaatacc gaatacaccc

180

tgctggtcgc atggcctggt aggggaaagc ttttgcggtg tgggatgggc ccgcggccta

240

tcagcttgtt ggtggggtga tggcctacca aggcgacgac gggtagccgg cctgagaggg

300

tgaccggcca cactgggact gagatacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga

360

atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gcgacgccgc gtgagggatg acggccttcg

420

ggttgtaaac ctctttcagc acagacgaag cgcaagtgac ggtatgtgca gaagaaggac

480

cggccaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggt ccgagcgttg tccggaatta

540

ctgggcgtaa agagctcgta ggtggtttgt cgcgttgttc gtgaaaactc acagcttaac

600

tgtgggcgtg cgggcgatac gggcagacta gagtactgca ggggagactg gaattcctgg

660

tgtagcggtg gaatgcgcag atatcaggag gaacaccggt ggcgaaggcg ggtctctggg

720

cagtaactga cgctgaggag cgaaagcgtg gggagcgaac aggattagat accctggtag

780

tccacgccgt aaacggtggg tactaggtgt gggtttcctt ccttgggatc cgtgccgtag

840

ctaacgcatt aagtaccccg cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact caaaggaatt

900

gacgggggcc cgcacaagcg gcggagcatg tggattaatt cgatgcaacg cgaagaacct

960

tacctgggtt tgacatgcac aggacgccgg cagagatgtc ggttcccttg tggcctgtgt

1020

gcaggtggtg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

1080

gagcgcaacc cttgtctcat gttgccagca cgttatggtg gggactcgtg agagactgcc

1140

ggggtcaact cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catgcccctt atgtccaggg

1200

cttcacacat gctacaatgg ccggtacaaa gggctgcgat gccgtgaggt ggagcgaatc

1260

ctttcaaagc cggtctcagt tcggatcggg gtctgcaact cgaccccgtg aagtcggagt

1320

cgctagtaat cgcagatcag caacgctgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc

1380

gcccgtcacg tcatgaaagt cggtaacacc cgaagccggt ggcctaaccc ttgtggaggg

1440

agccgtcgaa ggtgggatcg gcgattggga cgaagtcgta acaaggtagc cgtaccggaa

1500

ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1525

<210> 1292

<211> 1478

<212> DNA

<213> Mycobacterium sp. 1761

<400> 1292

gaacgctggc ggcgtgctta acacatgcaa gtcgaacgtg aaggcttcct tcggcatagt

60

cgagtggcga acgggtgagt aacacgtggg tgatctgccc tgcacttcgg gataagcttg

120

ggaaactggg tctaataccg gatagacgct gctacccgca tgccttttgg tggaaagctt

180

ttgcggtgtg ggatgggccc gcggcctatc agcttgttgg tgaggtaacg gcctaccaag

240

gcgacgacgg gtagccggcc tgagagggtg tccggccaca ctgggactga gatacggccc

300

agactcctac cgggagcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc

360

gacgccgcgt gggggatgac ggccttcggg tggtaaacct ctttcaccat cgacgaaggt

420

cctggtcttc tccgattgac ggtaggtgga gaagaagcac cggccaacta cgtgccagca

480

gccgcggtaa tacgtagggt gcgagcgttg tccggaatta ctgggcgtaa agagctcgta

540

ggtggtttgt cgcgttgttc gtgaaatctc acggcttaac tgtgagcgtg cgggcgatac

600

gggcagacta gagtactgca ggggagactg gaattcctgg tgtagcggtg gaatgcgcag

660

atatcaggag gaacaccggt ggcgaaggcg ggtctctggg cagtaactga cgctgaggag

720

cgaaagcgtg gggagcgaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacggtggg

780

tactaggtgt gggtttcctt ccttgggatc cgtgccatag ctaacgcatt aagtaccccg

840

cctgaggagt acggccgcaa ggctaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcaccagcg

900

gcggagcatg tggattaatt cgatgcaacg cgaagaacct tacctgggtt tgacatgcac

960

aggacgcgtc tagagatagg cgttcccttg tggcctgtgt gcaggtggtg catggctgtc

1020

gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtttcat

1080

gttgccagcg ggtaatgccg gggactcgtg agagactgcc ggggtcaact cggaggaagg

1140

tggggatgac gtcaagtcat catgcccctt atgtccaggg cttcacacat gctacaatgg

1200

ccggtacaaa gggccgcgat gccgcgaggt taagcgaatc cttttaaagc cggtctcagt

1260

tcggatcggg gtctgcaact cgaccccgtg aagtcggagt cgctagtaat cgcagatcag

1320

caacgctgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacccc gcccgtcacg tcatgaaagt

1380

cggtaacacc cgaagccagt ggcctaaccc ctccggaggg agctgtcgaa ggtgggatcg

1440

gcgattggga cgaagtcgta acaaggtagc cgtaccgg

1478

<210> 1293

<211> 1507

<212> DNA

<213> Mycobacterium sp. 1776

<400> 1293

ctggcggcgt gcttaacaca tgcaagtcga acggaaaggc ccctttcgga aggtactcga

60

gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgggtga tctgccctgc acttcgggat aagcctggga

120

aactgggtct aataccggat aggaccacct gtcgcatggt gtgtggtgga aagcttttgc

180

ggtgtgggat gggcccgcgg cctatcaact tgttggtggg gtgatggcct accaaggcga

240

cgacgggtag ccggcctgag agggtgtccg gccacactgg gactgagata cggcccagac

300

tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagcgacg

360

ccgcgtgggg gatgacggcc ttcgggttgt aaacctcttt caccatcgac gaagctgcgg

420

gttttctcct ggtgacagta tgtggagaag aagcaccggc caactacgtg ccagcagccg

480

cggtaatacg tagggtgcaa gcgttgtccg gaattactgg gcgtaaagag ctcgtaggtg

540

gtttgtcccg ttgttcgtga aatgacacag cttaactgtg ggcgtgcggg cgatacgggc

600

atactgtagt actgcagggg agactggaat tcctggtgta gcggtggaat gcgcagatat

660

caggaggaac accggtggcg aaggcgggtc tctgggcagt aactgacgct gaggagcgaa

720

agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac ggtgggtact

780

aggtgtgggt ttctttccta aggatccgtg ccgtagctaa cgcattaaat accccgcctg

840

gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggcgg

900

agcatgtgga ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc tgggtttgac atgcacagga

960

cgcgtctaga gataggcgtt cccttgtggc ctgtgtgcag gtggtgcatg gctgtcgtca

1020

gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctcg tctcatgttg

1080

ccagcgcgtg atggcgggga ctcgtgagag actgccgggg tcaactcgga ggaaggtggg

1140

gatgacgtca agtcatcatg ccccttatgt ccagggcttc acacatgcta caatggccgg

1200

tacaaagggc tgcgatgccg tgaggttaaa ccaatccttg taaagccggt ctcagttcgg

1260

atcggggtct gcaactcgac cccgtgaagt cgaagtcgct agtaatcgca gatcagcaac

1320

gctgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacgtcat gaaagtcggt

1380

aacacccgaa gccggtggcc taacccgttt gggagggagc cgtcgaaggt gggatcgacg

1440

attgggacga agtcgtaaca aggtagccgt accggaaggt gctgctgata aacccacctc

1500

aataaaa

1507

<210> 1294

<211> 1487

<212> DNA

<213> Mycobacterium sp. 1781

<400> 1294

catgccgggc tgctaccatg caagtcgacg gaaggcccct ttcggggggt actcgagtgg

60

cgaacgggtg agtaacacgt gggtgatctg ccctgcactt cgggataagc ttgggaaact

120

gggtctaata ccggatagga ccacatgtcg catggtgtgt ggtggaaagc ttttgcggtg

180

tgggatgggc ccgcggccta tcagcttgtt ggtggggtga tggcctacca aggcgacgac

240

gggtagccgg cctgagaggg tgtccggcca cactgggact gagatacggc ccagactcct

300

acgggaggca gcagtgggga atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gcgacgccgc

360

gtgggggatg acggccttcg ggttgtaaac ctctttcacc atcgacgaag ctgcgggttt

420

tctcgtggtg acggtaggtg gagaagaagc accggccaac tacgtgccag cagccgcggt

480

aatacgtagg gtgcgagcgt tgtccggaat tactgggcgt aaagagctcg taggtggttt

540

gtcgcgttgt tcgtggaatg ccacagctta actgtgggcg tgcgggcgat acgggcagac

600

tggagtactg caggggagac tggaattcct ggtgtagcgg tggaatgcgc agatatcagg

660

aggaacaccg gtggcgaagg cgggtctctg ggcagtaact gacgctgagg agcgaaagcg

720

tggggagcga acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacggtg ggtactaggt

780

gtgggttctt tcctaaggat ccgtgccgta gctaacgcat taagtacccc gcctggggag

840

tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggg cccgcacaag cggcgggagc

900

atgtggatta attcgatgca acgcggaaga acctttacct gggtttgaca tgcacaggac

960

gcgtctagag ataggcgttt cccttgtggc ctgtgtgcag gtggtgcatg gctgtcgtca

1020

gctcgtgtcg tggagatgtt gggttaaggt cccgcaacga ggcgcaaccc ttgtctcatg

1080

ttgccagcgc gtgatgggcg ggacctcgtg gagaagactg cctggggtca cctcggagga

1140

aggtggggga tgacgtccaa gtcatcatgc cccttatgtc cagggcttca cacatgccta

1200

caatggccgg tacaaagggc tgcgatgccg tgaggattta agcgaatcct tgttaaagct

1260

cggtcttcga gttcggaatt cggggtctgc aactcgaccc cgtgaagtcg gagtcgctag

1320

taatcgcaga tcagcaacgc tgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

cacgtcatga aagtcggtaa cacccgaagc cggtggccta acccgtttgg gagggagccg

1440

tcgaaggtgg gatcggcgat tggacgaagt cgtaacaagt agcttca

1487

<210> 1295

<211> 1472

<212> DNA

<213> Mycobacterium sp. 1791

<400> 1295

gaacgctggc ggcgtgctta acacatgcaa gtcgaacgga aaggtccttc gggcctactc

60

gagtggcgaa cgggtgagta acacgtgggc aatctgccct gcacttcggg ataagcttgg

120

gaaactgggt ctaataccgg gtagaccgcg tcatgcatgt ccggtggtgg aaagcttttg

180

cggtgtggga tgggcccgcg gcctatcagc ttgttggtgg ggtgatggcc taccaaggcg

240

acgacgggta gccggcctga gagggtgtcc ggccacactg ggactgagat acggcccaga

300

ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagcgac

360

gccgcgtggg ggatgacggc cttcgggttg taaacctctt tcaccatcga cgaaggttcc

420

ggttttcttc ggattgacgg taggtggaga agaagcaccg gccaactacg tgccagcagc

480

cgcggtaata cgtagggtgc gagcgttgtc cggaattact gggcgtaaag agctcgtagg

540

tggtttgtcg cgttgttcgt gaaatctcac ggcttaactg tgagcgtgcg ggcgatacgg

600

gcagacttga gtactgcagg ggagactgga attcctggtg tagcggtgga atgcgcagat

660

atcaggagga acaccggtgg cgaaggcggg tctctgggca gtaactgacg ctgaggagcg

720

aaagcgtggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acggtgggta

780

ctaggtgtgg gtttccttcc ttgggatccg tgccgtagct aacgcattaa gtaccccgcc

840

tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggc

900

ggagcatgtg gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctgggtttg acatgcacag

960

gacgccggca gagatgtcgg ttcccttgtg gcctgtgtgc aggtggtgca tggctgtcgt

1020

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtctcatgt

1080

tgccagcggg taatgccggg gactcgtgag agactgccgg ggtcaactcg gaggaaggtg

1140

gggatgacgt caagtcatca tgccccttat gtccagggct tcacacatgc tacaatggcc

1200

ggtacaaagg gctgcgatgc cgcgaggtta agcgaatcct tttaaagccg gtctcagttc

1260

ggatcggggt ctgcaactcg accccgtgaa gtcggagtcg ctagtaatcg cagatcagca

1320

acgctgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacgtc atgaaagtcg

1380

gtaacacccg aagcccgtgg cctaacccgt tttggaggga gctgtcgaag gtgggatcgg

1440

cgattgggac gaagtcgtaa caaggtagcc gt

1472

<210> 1296

<211> 1486

<212> DNA

<213> Mycobacterium sp. 1797

<400> 1296

gaacgctggc ggcgtgctta acacatgcaa gtcgaacgtg aaggcttcct tcggcatagt

60

cgagtggcga acgggtgagt aacacgtggg tgatctgccc tgcacttcgg gataagcctg

120

ggaaactggg tctaataccg gatagacgct gctacccgca tgccttgtgg tggaaagctt

180

ttgcggtgtg ggatgggccc gcggcctatc agcttgttgg tgaggtaatg gcttaccaag

240

gcgacgacgg gtagccggcc tgagagggtg tccggccaca ctgggactga gatacggccc

300

agactcctac cggaagcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc

360

gacgccgcgt gagggatgac ggccttcggg ttgtaaacct ccttcaccat cgacgaatga

420

tctgagtttt tctcggattg acggtaggtg gagaagaagc accggccaac tacgtgccag

480

cagccgcggt aatacgtagg gtgcgagcgt tgtccggaat tactgggcgt aaagagctcg

540

taggtggttt gtcgcgttgt tcgtgaaatc tcacggctta actgtgagcg tgcgggcgat

600

acgggcagac tagagtactg caggggagac tggaattcct ggtgtagcgg tggaatgcgc

660

agatatcagg aggaacaccg gtggcgaagg cgggtctctg ggcagtaact gacgctgagg

720

agcgaaagcg tggggagcga acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacggtg

780

ggtactaggt gtgggtttcc ttccttggga tccgtgccgt agctaacgca ttaagtaccc

840

cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag

900

cggcggagca tgtggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggg tttgacatgc

960

acaggacgcg tctagagata ggcgttccct tgtggcctgt gtgcaggtgg tgcatggctg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtctc

1080

atgttgccag cgggtaatgc cggggactcg tgagagactg ccggggtcaa ctcggaggaa

1140

ggtggggatg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgtccag ggcttcacac atgctacaat

1200

ggccggtaca aagggctgcg atgccgtaag gttaagcgaa tccttttaaa gccggtctca

1260

gttcggattg gggtctgcaa ctcgacccca tgaagtcgga gtcgctagta atcgcagatc

1320

agcaacgctg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca cgtcatgaaa

1380

gtcggtaaca cccgaagccg gtggcctaac cctctctgga gggagccgtc gaaggtggga

1440

tcggcgattg ggacgaagtc gtaacaaggt agccgtaccg gaaggt

1486

<210> 1297

<211> 1328

<212> DNA

<213> Mycobacterium sp. AQ1GA4

<400> 1297

ggtgagtaac acgtgggtga tctgccctgc actttgggat aagcctggga aactgggtct

60

aataccgaat aggactccgg actgcatggt ctggggtgga aagcttttgc ggtgtgggat

120

gggcccgcgg cctatcagct tgttggtggg gtgatggcct accaaggcga cgacgggtag

180

ccggcctgag agggtgtccg gccacactgg gactgagata cggcccagac tcctacggga

240

ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagcgacg ccgcgtgggg

300

gatgacggcc ttcgggttgt aaacctcttt cgcctacgac gaagcgtaag tgacggtagt

360

aggagaagaa gcaccggcca actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggtgcgagc

420

gttgtccgga attactgggc gtaaagagct cgtaggtggt ttgtcgcgtt gttcgtgaaa

480

actcacagct taactgtggg cgtgcgggcg atacgggcag actggagtac tgcaggggag

540

actggaattc ctggtgtagc ggtggaatgc gcagatatca ggaggaacac cggtggcgaa

600

ggcgggtctc tgggcagtaa ctgacgctga ggagcgaaag cgtggggagc gaacaggatt

660

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacgg tgggtactag gtgtgggttt ccttccttgg

720

gatccgtgcc gtagctaacg cattaagtac cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag catgtggatt aattcgatgc

840

aacgcgaaga accttacctg ggtttgacat gcacaggacg actgcagaga tgtggtttcc

900

cttgtggcct gtgtgcaggt ggtgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg

960

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc tcatgttgcc agcacgttat ggtggggact

1020

cgtgagagac tgccggggtc aactcggagg aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatgcc

1080

ccttatgtcc agggcttcac acatgctaca atggccggta caaagggctg cgatgccgtg

1140

aggtggagcg aatccttgtt aaagccggtc tcagttcgga tcggggtctg caactcgacc

1200

ccgtgaagtc ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa tacgttcccg

1260

ggccttgtac acaccgcccg tcacgtcatg aaagtcggta acacccgaag ccggtggcct

1320

aacccttg

1328

<210> 1298

<211> 1513

<212> DNA

<213> Mycobacterium sp. B10-07.09.0206

<400> 1298

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggaaaggccc ykytygsrgg

60

gtgctcgagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgggtgatc tgccctgcac ttcgggataa

120

gcttgggaaa ctgggtctaa taccggatag gactccgaga tgcatgtctt ggggtggaaa

180

gctttttgcg gtgtgggatg ggcccgcggc ctatcagctt gttggtgggg tgatggccta

240

ccaaggcgac gacgggtagc cggcctgaga gggtgtccgg ccacactggg actgagatac

300

ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat

360

gcagcgacgc cgcgtggggg atgacggcct tcgggttgta aacctctttc accatcgacg

420

aagctgccgc tttttgtggt ggtgacggta ggtggagaag aagcaccggc caactacgtg

480

ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcga gcgttgtccg gaattactgg gcgtaaagag

540

ctcgtaggtg gtttgtcgcg ttgttcgtga aattccctgg cttaactggg ggcgtgcggg

600

cgatacgggc agactggagt actgcagggg agactggaat tcctggtgta gcggtggaat

660

gcgcagatat caggaggaac accggtggcg aaggcgggtc tctgggcagt aactgacgct

720

gaggagcgaa agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac

780

ggtgggtact aggtgtgggt ttccttcctt gggatccgtg ccgtagctaa cgcattaagt

840

accccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca

900

caagcggcgg agcatgtgga ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc tgggtttgac

960

atgcacagga cgcwycyaga gatrggkgtt cccttgtggc ctgtgtgcag gtggtgcatg

1020

gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg

1080

tctcatgttg ccagcgcgtg atggcgggga ctcgtgagag actgccgggg tcaactcgga

1140

ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg ccccttatgt ccagggcttc acacatgcta

1200

caatggccgg tacaaagggc tgcgatgccg tgaggtttag cgaatccttt aaagccggtc

1260

tcagttcgga tcggggtctg caactcgacc ccgtgaagtc ggagtcgcta gtaatcgcag

1320

atcagcaatg ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacgtcatg

1380

aaagtcggta acacccgaag cccatggcct aacccgcaag ggagggagtg gtcgaaggtg

1440

ggatcggcga ttgggacgaa gtcgtaacaa ggtagccgta ccggaaggtg cggctggatc

1500

acctcctttc taa

1513

<210> 1299

<211> 1402

<212> DNA

<213> Mycobacterium sp. GN-10546

<400> 1299

catgcaagtc gaacggaaag gccctttcgg gggtactcga gtggcgaacg ggtgagtaac

60

acgtgggtga tctgccctgc actttgggat aagcctggga aactgggtct aataccgaat

120

aggaccgcat gcttcatggt gtgtggtgga aagcttttgc ggtgtgggat gggcccgcgg

180

cctatcagct tgttggtggg gtaatggcct accaaggcga cgacgggtag ccggcctgag

240

agggtgtccg gccacactgg gactgagata cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

300

gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagcgacg ccgcgtgggg gatgacggcc

360

ttcgggttgt aaacctcttt cagtatcggc gaagctccgg gatttttctt ggggtgacgg

420

taggtacaga agaagcaccg gccaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc

480

gagcgttgtc cggaattact gggcgtaaag agctcgtagg tggtttgtca cgttgtccgt

540

gaaaactcac agcttaactg tgggcgtgcg ggcgatacgg gcagactgga gtactgtagg

600

ggagactgga attcctggtg tagcggtgga atgcgcagat atcaggagga acaccggtgg

660

cgaaggcggg tctctgggca gtaactgacg ctgaggagcg aaagcgtggg gagcgaacag

720

gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acggtgggta ctaggtgtgg gtttccttcc

780

tttagggatc cgtgccgtag ctaacgcatt aagtaccccg cctggggagt acggccgcaa

840

ggctaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gcggagcatg tggattaatt

900

cgatgcaacg cgaagaacct tacctgggtt tgacatgcac aggacgccag cagagatgtt

960

ggttcccttg tggcctgtgt gcaggtggtg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1020

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtctcat gttgccagca cgttatggtg

1080

gggactcgtg agagactgcc ggggtcaact cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat

1140

catgcccctt atgtccaggg cttcacacat gctacaatgg ccggtacaaa gggctgcgat

1200

cccgtgaggg ttagcgaatc ctttaaagcc ggtctcagtt cggattgggg tctgcaactc

1260

gaccccatga agtcggagtc gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg tgaatacgtt

1320

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacgt catgaaagtc ggtaacaccc gaagccggtg

1380

gcctaaccct tgtggaggga gc

1402

<210> 1300

<211> 1390

<212> DNA

<213> Mycobacterium sp. GN-10827

<400> 1300

tgcaagtcga acggaaaggc cccttcgggg gtgctcgagt ggcgaacggg tgagtaacac

60

gtgggtgatc tgccctgcac tttgggataa gcctgggaaa ctgggtctaa taccgaatac

120

accctgctgg tcgcatggcc tggtggggga aagcttttgc ggtgtgggat gggcccgcgg

180

cctatcagct tgttggtggg gtgatggcct accaaggcga cgacgggtag ccggcctgag

240

agggtgtccg gccacactgg gactgagata cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

300

gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagcgacg ccgcgtgggg gatgacggcc

360

ttcgggttgt aaaccccttt cagtatcgac gaagccgtga ggtgacggta ggtacagaag

420

aagcaccggc caactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcga gcgttgtccg

480

gaattactgg gcgtaaagag ctcgtaggtg gtttgtcgcg ttgtccgtga aaactcacag

540

cttaactgtg ggcgtgcggg cgatacgggc agactggagt actgcagggg agactggaat

600

tcctggtgta gcggtggaat gcgcagatat caggaggaac accggtggcg aaggcgggtc

660

tctgggcagt aactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc

720

tggtagtcca cgccgtaaac ggtgggtact aggtgtgggt ttccttcctt gggatccgtg

780

ccgtagctaa cgcattaagt accccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa

840

ggaattgacg ggggcccgca caagcggcgg agcatgtgga ttaattcgat gcaacgcgaa

900

gaaccttacc tgggtttgac atgcacagga cgcgtctaga gataggcgtt cccttgtggc

960

ctgtgtgcag gtggtgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1020

cgcaacgagc gcaacccttg tctcatgttg ccagcacgtg atggtgggga ctcgtgagag

1080

actgccgggg tcaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg ccccttatgt

1140

ccagggcttc acacatgcta caatggccgg tacaaagggc tgcgatgccg tgaggtggag

1200

cgaatccttt caaagccggt ctcagttcgg atcggggtct gcaactcgac cccgtgaagt

1260

cggagtcgct agtaatcgca gatcagcaac gctgcggtga atacgttccc gggccttgta

1320

cacaccgccc gtcacgtcat gaaagtcggt aacacccgaa gccggtggcc taacccgcaa

1380

gggagggagc

1390

<210> 1301

<211> 1383

<212> DNA

<213> Mycobacterium sp. GN-11124

<400> 1301

tcgaacggaa aggccctttc gggggtgctc gagtggcgaa cgggtgagta acacgtgggt

60

gatctgccct gcacttcggg ataagcctgg gaaactgggt ctaataccgg ataggaccac

120

ggtctgcatg gattgtggtg gaaagctttt gcggtgtggg atgggcccgc ggcctatcag

180

cttgttggtg gggtgatggc ctaccaaggc gacgacgggt agccggcctg agagggtgtc

240

cggccacact gggactgaga tacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

300

tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcga cgccgcgtgg gggatgacgg ccttcgggtt

360

gtaaacccct ttcaataggg acgaagcgca agtgacggta cctatagaag aagcaccggc

420

caactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcga gcgttgtccg gaattactgg

480

gcgtaaagag ctcgtaggtg gtttgtcgcg ttgtccgtga aaactcacag cttaactgtg

540

ggcgtgcggg cgatacgggc agactggagt actgcagggg agactggaat tcctggtgta

600

gcggtggaat gcgcagatat caggaggaac accggtggcg aaggcgggtc tctgggcagt

660

aactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca

720

cgccgtaaac ggtgggtact aggtgtgggt ttccttcctt gggatccgtg ccgtagctaa

780

cgcattaagt accccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg

840

ggggcccgca caagcggcgg agcatgtgga ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc

900

tgggtttgac atgcacagga cgccggcaga gatgtcggtt cccttgtggc ctgtgtgcag

960

gtggtgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1020

gcaacccttg tctcatgttg ccagcgggta atgccgggga ctcgtgagag actgccgggg

1080

tcaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg ccccttatgt ccagggcttc

1140

acacatgcta caatggccgg tacaaagggc tgcgatgccg tgaggtggag cgaatccttt

1200

caaagccggt ctcagttcgg atcggggtct gcaactcgac cccgtgaagt cggagtcgct

1260

agtaatcgca gatcagcaac gctgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc

1320

gtcacgtcat gaaagtcggt aacacccgaa gccggtggcc taaccccttg tgggagggag

1380

ccg

1383

<210> 1302

<211> 1404

<212> DNA

<213> Mycobacterium sp. GN-9188

<400> 1302

catgcaagtc gaacggaaag gccctttcgg gggtactcga gtggcgaacg ggtgagtaac

60

acgtgggtga tctgccctgc actttgggat aagcctggga aactgggtct aataccgaat

120

atgatcatgc gcctcatggt gtgtggtgga aagcttttgc ggtgtgggat gggcccgcgg

180

cctatcagct tgttggtggg gtaatggcct accaaggcga cgacgggtag ccggcctgag

240

agggtgtccg gccacactgg gactgagata cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

300

gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagcgacg ccgcgtgggg gatgacggcc

360

ttcgggttgt aaacctcttt cagtatcggc gaagctccag ggttttcttt ggggtgacgg

420

taggtacaga agaagcaccg gccaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc

480

gagcgttgtc cggaattact gggcgtaaag agctcgtagg tggtttgtcg cgttgtccgt

540

gaaaactcac agctcaactg tgggcgtgcg ggcgatacgg gcagactgga gtactgtagg

600

ggagactgga attcctggtg tagcggtgga atgcgcagat atcaggagga acaccggtgg

660

cgaaggcggg tctctgggca gtaactgacg ctgaggagcg aaagcgtggg gagcgaacag

720

gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acggtgggta ctaggtgtgg gtttccttcc

780

tttagggatc cgtgccgtag ctaacgcatt aagtaccccg cctggggagt acggccgcaa

840

ggctaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gcggagcatg tggattaatt

900

cgatgcaacg cgaagaacct tacctgggtt tgacatgcac aggacgccgg tagagatatc

960

ggttcccttg tggcctgtgt gcaggtggtg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

1020

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtctcat gttgccagca cgttatggtg

1080

gggactcgtg agagactgcc ggggtcaact cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat

1140

catgcccctt atgtccaggg cttcacacat gctacaatgg ccggtacaaa gggctgcgat

1200

accgtgaggt ttagcgaatc ctttaaagcc ggtctcagtt cggatcgggg tctgcaactc

1260

gaccccgtga agtcggagtc gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg tgaatacgtt

1320

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacgt catgaaagtc ggtaacaccc gaagccggtg

1380

gcctaaccct tgtggaggga gccg

1404

<210> 1303

<211> 1386

<212> DNA

<213> Mycobacterium sp. GR-2007-210

<400> 1303

agtcgaacgg aaaggccctt cggggtactc gagtggcgaa cgggtgagta acacgtgggt

60

gatctgccct gcactttggg ataagcctgg gaaactgggt ctaataccga atacaccctg

120

ctggccgcat ggtctggtgg gggaaagctt ttgcggtgtg ggatgggccc gcggcctatc

180

agcttgttgg tgaggttacg gctcaccaag gcgacgacgg gtagccggcc tgagagggtg

240

atcggccaca ctgggactga gatacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

300

attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc gacgccgcgt gggggatgac ggccttcggg

360

ttgtaaacct ctttcagtag ggacgaagcg caagtgacgg tacctacaga agaaggaccg

420

gccaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtcc gagcgttgtc cggaattact

480

gggcgtaaag agctcgtagg tggtttgtcg cgttgttcgt gaaaaccggg ggcttaaccc

540

tcggcgtgcg ggcgatacgg gcagacttga gtactgcagg ggagactgga attcctggtg

600

tagcggtgga atgcgcagat atcaggagga acaccggtgg cgaaggcggg tctctgggca

660

gtaactgacg ctgaggagcg aaagcgtggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc

720

cacgccgtaa acggtgggta ctaggtgtgg gtttccttcc ttgggatccg tgccgtagct

780

aacgcattaa gtaccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca aagaaattga

840

cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgtg gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta

900

cctgggtttg acatgcacag gacgccggca gagatgtcgg ttcccttgtg gcctgtgtgc

960

aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1020

gcgcaaccct tgtctcatgt tgccagcacg ttatggtggg gactcgtgag agactgccgg

1080

ggtcaactcg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tgccccttat gtccagggct

1140

tcacacatgc tacaatggcc ggtacaaagg gctgcgatgc cgtgaggtgg agcgaatcct

1200

ttcaaagccg gtctcagttc ggatcggggt ctgcaactcg accccgtgaa gtcggagtcg

1260

ctagtaatcg cagatcagca acgctgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc

1320

ccgtcacgtc atgaaagtcg gtaacacccg aagccggtgg cctaacccct tgtgggaggg

1380

agccgt

1386

<210> 1304

<211> 1484

<212> DNA

<213> Mycobacterium sp. HE5

<400> 1304

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggaaaggccc ttcggggtac tcgagtggcg aacgggtgag taacacgtgg gtgatctgcc

120

ctgcactttg ggataagcct gggaaactgg gtctaatacc gaataggacc gcatgcttca

180

tggtgtgtgg tggaaagctt ttgcggtgtg ggatgggccc gcggcctatc agcttgttgg

240

tggggtaatg gcctaccaag gcgacgacgg gtagccggcc tgagagggtg accggccaca

300

ctgggactga gatacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat

360

gggcgcaagc ctgatgcagc gacgccgcgt gagggatgac ggccttcggg ttgtaaacct

420

ctttcagcag ggacgaagcg caagtgacgg tacctgcaga agaaggaccg gccaactacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtcc gagcgttgtc cggaattact gggcgtaaag

540

agctcgtagg tggtttgtcg cgttgttcgt gaaaactcac agcttaactg tgggcgtgcg

600

ggcgatacgg gcagactgga gtactgcagg ggagactgga attcctggtg tagcggtgga

660

atgcgcagat atcaggagga acaccggtgg cgaaggcggg tctctgggca gtaactgacg

720

ctgaggagcg aaagcgtggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa

780

acggtgggta ctaggtgtgg gtttccttcc ttgggatccg tgccgtagct aacgcattaa

840

gtaccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga cgggggcccg

900

cacaagcggc ggagcatgtg gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctgggtttg

960

acatgcacag gacgccggca gagatgtcgg ttcccttgtg gcctgtgtgc aggtggtgca

1020

tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct

1080

tgtctcatgt tgccagcacg ttatggcggg gactcgtgag agactgccgg ggtcaactcg

1140

gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tgccccttat gtccagggct tcacacatgc

1200

tacaatggcc ggtacaaagg gctgcgatgc cgtgaggtgg agcgaatcct ttcaaagccg

1260

gtctcagttc ggatcggggt ctgcaactcg accccgtgaa gtcggagtcg ctagtaatcg

1320

cagatcagca acgctgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacgtc

1380

atgaaagtcg gtaacactcg aagccggtgg cctaacccct tgtgggaggg agccgtcgaa

1440

ggtgggatcg gcgattggga cgaagtcgta acaaggtagc cgta

1484

<210> 1305

<211> 1470

<212> DNA

<213> Mycobacterium sp. NLA001000736

<400> 1305

agtttgatca tggttcagga cgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca agtcgaacgg

60

aaaggcccct tcgggggtgc tcgagtggcg aacgggtgag taacacgtgg gtgatctgcc

120

ctgcactctg ggataagcct gggaaactgg gtctaatacc ggataggacc gcgcatcgca

180

tggtgtgtgg tggaaagctt ttgcggtgtg ggatgggccc gcggcctatc agcttgttgg

240

tggggttatg gcctaccaag gcgacgacgg gtagccggcc tgagagggtg tccggccaca

300

ctgggactga gatacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat

360

gggcggaagc ctgatgcagc gacgccgcgt gagggatgac ggccttcggg ttgtaaacct

420

ctttcagcct cgacgaagcg caagtgacgg taggggcaga agaagcaccg gccaactacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc gagcgttgtc cggaattact gggcgtaaag

540

agctcgtagg tggtttgtcg cgtcgtccgt gaaatcccat ggcttaactg tgggcgtgcg

600

ggcgatacgg gcagacttga gtactgcagg ggagactgga attcctggtg tagcggtgga

660

atgcgcagat atcaggagga acaccggtgg cgaaggcggg tctctgggca gtaactgacg

720

ctgaggagcg aaagcgtggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa

780

acggtgggta ctaggtgtgg gtttccttcc ttgggatccg tgccgtagct aacgcattaa

840

gtaccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga cgggggcccg

900

cacaagcggc ggagcatgtg gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctgggtttg

960

acatgcacag gacgactgca gagatgtggt ttcccttgtg gyctgtgtac aggtggtgca

1020

tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct

1080

tgttccatgt tgccagcgcg taatggcggg gactcatggg agactgccgg ggtcaactcg

1140

gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tgccccttat gtccagggct tcacacatgc

1200

tacaatggcc ggtacaaagg gctgcgatgc cgtgaggtgg agcgaatcct ttcaaagccg

1260

gtctcagttc ggatcggggt ctgcaactcg accccgtgaa gtcggagtcg ctagtaatcg

1320

cagatcagca acgctgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacgtc

1380

atgaaagtcg gtaacacccg aagccagtgg cctaaccctt tgggggggag ctgtcgaagg

1440

tgggatcggc gattgggacg aagtcgtaac

1470

<210> 1306

<211> 1465

<212> DNA

<213> Mycobacterium sp. W

<400> 1306

gagagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgaa

60

cggaaaggcc ccttcggggg tactcgagtg gcgaacgggt gagtaacacg tgggcaatct

120

gccctgcact tcgggataag cctgggaaac tgggtctaat accggatagg acctttaggc

180

gcatgtcttt aggtggaaag cttttgcggt gtgggatggg cccgcggcct atcagcttgt

240

tggtggggtg atggcctacc aaggcgacga cgggtagccg gcctgagagg gtgtccggcc

300

acactgggac tgagatacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac

360

aatgggcgca agcctgatgc agcgacgccg cgtgggggat gacggccttc gggttgtaaa

420

cctctttcac catcgacgaa ggtccgggtt ttctcggatt gacggtaggt ggagaagaag

480

caccggccaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggtgcgagcg ttgtccggaa

540

ttactgggcg taaagagctc gtaggtggtt tgtcgcgttg ttcgtgaaat ctcacggctt

600

aactgtgagc gtgcgggcga tacgggcaga ctagagtact gcaggggaga ctggaattcc

660

tggtgtagcg gtggaatgcg cagatatcag gaggaacacc ggtggcgaag gcgggtctct

720

gggcagtaac tgacgctgag gagcgaaagc gtggggagcg aacaggatta gataccctgg

780

tagtccacgc cgtaaacggt gggtactagg tgtgggtttc cttccttggg atccgtgccg

840

tagctaacgc attaagtacc ccgcctgggg agtacggccg caaggctaaa actcaaagga

900

attgacgggg gcccgcacaa gcggcggagc atgtggatta attcgatgca acgcgaagaa

960

ccttacctgg gtttgacatg cacaggacgc gtctagagat aggcgttccc ttgtggcctg

1020

tgtgcaggtg gtgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1080

aacgagcgca acccttgtct catgttgcca gcgggtaatg ccggggactc gtgagagact

1140

gccggggtca actcggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatgccc cttatgtcca

1200

gggcttcaca catgctacaa tggccggtac aaagggctgc gatgccgcaa ggttaagcga

1260

atccttttaa agccggtctc agttcggatt ggggtctgca actcgacccc atgaagtcgg

1320

agtcgctagt aatcgcagat cagcaacgct gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac

1380

accgcccgtc acgtcatgaa agtcggtaac acccgaagcc agtggcctaa cccttgggag

1440

ggagctgtcg aaggtgggat cggcg

1465

<210> 1307

<211> 1540

<212> DNA

<213> Mycobacterium tuberculosis

<400> 1307

tttgtttgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaaggtctc ttcggagata ctcgagtggc gaacgggtga gtaacacgtg

120

ggtgatctgc cctgcacttc gggataagcc tgggaaactg ggtctaatac cggataggac

180

cacgggatgc atgtcttgtg gtggaaagcg ctttagcggt gtgggatgag cccgcggcct

240

atcagcttgt tggtggggtg acggcctacc aaggcgacga cgggtagccg gcctgagagg

300

gtgtccggcc acactgggac tgagatacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

360

aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agcgacgccg cgtgggggat gacggccttc

420

gggttgtaaa cctctttcac catcgacgaa ggtccgggtt ctctcggatt gacggtaggt

480

ggagaagaag caccggccaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggtgcgagcg

540

ttgtccggaa ttactgggcg taaagagctc gtaggtggtt tgtcgcgttg ttcgtgaaat

600

ctcacggctt aactgtgagc gtgcgggcga tacgggcaga ctagagtact gcaggggaga

660

ctggaattcc tggtgtagcg gtggaatgcg cagatatcag gaggaacacc ggtggcgaag

720

gcgggtctct gggcagtaac tgacgctgag gagcgaaagc gtggggagcg aacaggatta

780

gataccctgg tagtccacgc cgtaaacggt gggtactagg tgtgggtttc cttccttggg

840

atccgtgccg tagctaacgc attaagtacc ccgcctgggg agtacggccg caaggctaaa

900

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggcggagc atgtggatta attcgatgca

960

acgcgaagaa ccttacctgg gtttgacatg cacaggacgc gtctagagat aggcgttccc

1020

ttgtggcctg tgtgcaggtg gtgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt

1080

taagtcccgc aacgagcgca acccttgtct catgttgcca gcacgtaatg gtggggactc

1140

gtgagagact gccggggtca actcggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatgccc

1200

cttatgtcca gggcttcaca catgctacaa tggccggtac aaagggctgc gatgccgcga

1260

ggttaagcga atccttaaaa gccggtctca gttcggatcg gggtctgcaa ctcgaccccg

1320

tgaagtcgga gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg cggtgaatac gttcccgggc

1380

cttgtacaca ccgcccgtca cgtcatgaaa gtcggtaaca cccgaagcca gtggcctaac

1440

cctcgggagg gagctgtcga aggtgggatc ggcgattggg acgaagtcgt aacaaggtag

1500

ccgtaccgga aggtgcggct ggatcacctc ctttctaagg

1540

<210> 1308

<211> 1475

<212> DNA

<213> Mycobacterium ulcerans

<400> 1308

ctggcggcgt gcttaacaca tgcaagtcga acggaaaggt ctcttcggag atactcgagt

60

ggcgaacggg tgagtaacac gtgggcgatc tgccctgcac ttcgggataa gcctgggaaa

120

ctgggtctaa taccggatag gaccacggga ttcatgtcct gtggtggaaa gcttttgcgg

180

tgtgggatgg gcccgcggcc tatcagcttg ttggtggggt aacggcctac caaggcgacg

240

acgggtagcc ggcctgagag ggtgtccggc cacactggga ctgagatacg gcccagactc

300

ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagcgacgcc

360

gcgtggggga tgacggcctt cgggttgtaa acctctttca ccatcgacga aggttcgggt

420

tttctcggat tgacggtagg tggagaagaa gcaccggcca actacgtgcc agcagccgcg

480

gtaatacgta gggtgcgagc gttgtccgga attactgggc gtaaagagct cgtaggtggt

540

ttgtcgcgtt gttcgtgaaa tctcacggct taactgtgag cgtgcgggcg atacgggcag

600

actagagtac tgcaggggag actggaattc ctggtgtagc ggtggaatgc gcagatatca

660

ggaggaacac cggtggcgaa ggcgggtctc tgggcagtaa ctgacgctga ggagcgaaag

720

cgtggggagc gaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacgg tgggtactag

780

gtgtgggttt ccttccttgg gatccgtgcc gtagctaacg cattaagtac cccgcctggg

840

gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag

900

catgtggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg ggtttgacat gcacaggacg

960

cgtctagaga taggcgttcc cttgtggcct gtgtgcaggt ggtgcatggc tgtcgtcagc

1020

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc tcatgttgcc

1080

agcacgtaat ggtggggact cgtgagagac tgccggggtc aactcggagg aaggtgggga

1140

tgacgtcaag tcatcatgcc ccttatgtcc agggcttcac acatgctaca atggccggtg

1200

caaagggctg cgatgccgcg aggttaagcg aatcctttaa cgccggtctc agttcggatc

1260

ggggtctgca actcgacccc gtgaagtcgg agtcgctagt aatcgcagat cagcaacgct

1320

gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acgtcatgaa agtcggtaac

1380

acccgaagcc agtggcctaa ccctttggga gggagctgtc gaaggtggga tcggcgattg

1440

ggacgaagtc gtaacaaggt agccgtaccg gaagg

1475

<210> 1309

<211> 1471

<212> DNA

<213> Mycobacterium vulneris

<400> 1309

gttcaggacg aacgctggcg gcgtgcttaa cacatgcaag tcgaacggaa aggcctcttc

60

ggaggtactc gagtggcgaa cgggtgagta acacgtgggc aatctgccct gcacttcggg

120

ataagcctgg gaaactgggt ctaataccgg ataggacctt tagacgcatg tcttttggtg

180

gaaagctttt gcggtgtggg atgggcccgc ggcctatcag cttgttggtg gggtgacggc

240

ctaccaaggc gacgacgggt agccggcctg agagggtgtc cggccacact gggactgaga

300

tacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct

360

gatgcagcga cgccgcgtgg gggatgacgg ccttcgggtt gtaaacctct ttcaccatcg

420

acgaaggttc gggttttctc ggattgacgg taggtggaga agaagcaccg gccaactacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc gagcgttgtc cggaattact gggcgtaaag

540

agctcgtagg tggtttgtcg cgttgttcgt gaaatctcac ggcttaactg tgagcgtgcg

600

ggcgatacgg gcagactaga gtactgcagg ggagactgga attcctggtg tagcggtgga

660

atgcgcagat atcaggagga acaccggtgg cgaaggcggg tctctgggca gtaactgacg

720

ctgaggagcg aaagcgtggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa

780

acggtgggta ctaggtgtgg gtttccttcc ttgggatccg tgccgtagct aacgcattaa

840

gtaccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga cgggggcccg

900

cacaagcggc ggagcatgtg gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctgggtttg

960

acatgcacag gacgcgtcta gagataggcg ttcccttgtg gcctgtgtgc aggtggtgca

1020

tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct

1080

tgtctcatgt tgccagcggg taatgccggg gactcgtgag agactgccgg ggtcaactcg

1140

gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tgccccttat gtccagggct tcacacatgc

1200

tacaatggcc ggtacaaagg gctgcgatgc cgcaaggtta agcgaatcct tttaaagccg

1260

gtctcagttc ggattggggt ctgcaactcg accccatgaa gtcggagtcg ctagtaatcg

1320

cagatcagca acgctgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacgtc

1380

atgaaagtcg gtaacacccg aagccagtgg cctaaccttt tggagggagc tgtcgaaggt

1440

gggatcggcg attgggacga agtcgtaaca a

1471

<210> 1310

<211> 1346

<212> DNA

<213> Mycoplasma agalactiae

<400> 1310

gatgaacgct ggctgtgtgc ctaatacatg catgtcgagc gatgatagca atatcatagc

60

ggcgaatggg tgagtaacac gtactcaacg taccttttag attgggatag cggatggaaa

120

catccgataa taccgaatac ttattatttt tgcatgaaag taatataaaa ggaagcgttt

180

gcttcgctag aagatcggag tgcgcaacat tagctagttg gtgaggtaac ggcccaccaa

240

ggcgatgatg tttagcgggg ttgagagatt gatccgccac actgggactg agatacggcc

300

cagactccta cgggaggcag cagtagggaa tattccacaa tggacgaaag tctgatggag

360

cgacacagcg tgcaggatga aggccctatg ggttgtaaac tgctgtggtt agggaagaaa

420

aagtagcgta ggaaatgacg ctaccttgac ggtacctgat tagaaagcaa cggctaacta

480

tgtgccagca gccgcggtaa tacataggtt gcaagcgtta tccgaaatta ttgggcgtaa

540

agcgtctgta ggttgtttgt taagtctggc gttaaatttt ggggctcaac cccaaaacgc

600

gttggatact ggcagactag agttatgtag aggttagcgg aattccttgt gaagcggtga

660

aatgcgtaga tataaggaag aacatcaata tggcgaaggc agctaactgg gcatacactg

720

acactgagag acgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccc

780

taaacgatga tcattagttg atggggaact catcgacgca gctaacgcat taaatgatcc

840

gcctgagtag tacgttcgca agaataaaac ttaaaggaat tgacggggat ccgcacaagc

900

ggtggagcat gtggtttaat ttgaagatac gcgtagaacc ttacccactc ttgacatctt

960

ctgcaaagct atggagacat agtggaggtt aacagaatga cagatggtgc atggttgtcg

1020

tcagctcgtg tcgtgagatg ttcggttaag tcctgcaacg agcgcaaccc ttatccttag

1080

ttactaccat ttagttgagc actctaagga gactgcccga gtaatcggga ggaaggtggg

1140

gacgacgtca aatcatcatg cctcttacga gtggggctac acacgtgcta caatggacgg

1200

tacaaagaga agcgaagtgg tgacatggag caaacctcaa aaaaccgttc tcagttcgga

1260

ttgaagtctg caactcgact tcatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgtag atcagctacg

1320

ctacggtgaa tacgttctcg ggtctt

1346

<210> 1311

<211> 1339

<212> DNA

<213> Mycoplasma amphoriforme

<400> 1311

ttgatcctgg ctcaggatta acgctggcgg catgcctaat acatgcaagt cgatcgagag

60

gcgaacgggt gagtaacacg tatccaattt accccatagc ggggataact agtcgaaaga

120

ttagctaata ccgcataact aaagttacta tgggataagg gtgcggcata tcagctagtt

180

ggtgaggtaa cggcccacca aggcaatgac gtgtagttat gctgagaggt agaataacca

240

caatggaact gagacacggt ccatactcct acgggaggca gcagtaggga atttttcaca

300

atggacgaaa gtctgatgga gcaatgccgc gtgaacgatg aaggtcttgt gattgtaaag

360

ttcttttatt taggaagatg accgtactat ttgaataagt aacgactaac tatgtgccag

420

cagtcgcggt aatacatagg ttgcaagcgt tatccggatt tattgggcgt aaaacaagcg

480

caggcggatt agaaagtctg gtgttaaaat cactgcttaa cggttgaatg cattggaaac

540

ttctagtcta gagtgtggta gagagttctg gaactccatg tggagcggtg gaatgcgtag

600

atatatggaa gaacaccagc tgcgaaggcg agaacttagg ccaactgacg cttaggcttg

660

aaagtgtggg gagcaaatag gattagatac cctagtagtc cacaccgtaa acgatggatg

720

ttaaacgtcg gggcctcggt gttgcagtta acacattaaa catcctgcct gggtagtaca

780

ttcgcaagaa tgaaactcaa aggaattgac ggggacccgc acaagtggtg gagcatgttg

840

cttaattcga cggtacacga aaaaccttac ctagacttga catcgacagg tggtgcatgg

900

ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccg caacgcgcaa cccttatcgt

960

tagttatcta acgagactgc caacgcaagt tggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat

1020

catgccttat gtctagggct gcaaacgtgc tacaatggcc aacaaacagt taccaaaccg

1080

taaggtggtg agtatctgct tggtctcagt tcggatgagg gctgcaattc gccctcagaa

1140

gtcggaatca ctagtaatcg cgaatcagct atgtcgcggt gaatacgttc tcgggtcttg

1200

tacacaccgc ccgtcaaact acgagagttg atagtgtcta aaaccgtgtg ctaagcgcat

1260

gtctaggaca agattaatga ttggagttaa gtcgtaacaa ggtaccccta cgagaacgtg

1320

ggggtggatc acctccttt

1339

<210> 1312

<211> 1525

<212> DNA

<213> Mycoplasma arthritidis

<400> 1312

atatttttaa gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gctgtgtgcc taatacatgc

60

atgtcgagcg gaagtagcaa tactttagcg gcgaatgggt gagtaacacg tgcttaatct

120

accctttaga ctggaataac taatggaaac attggctaat gccggatgcg catggaatcg

180

catgattccg ttgtgaaagg agcctcaaag ctccactaga ggatgagggt gcggaacatt

240

agcttgttgg tgaggtaacg gcccaccaag gcaatgatgt ttagccgggt cgagagactg

300

aacggccaca ttgggactga gatacggccc aaactcctac gggaggcagc agtagggaat

360

attccacaat gagcgaaagc ttgatggagc gacacagcgt gcacgatgac ggtcttcgga

420

ttgtaaagtg ctgttatagg ggaagaacac ttagttgagg aaatgcttct aagctgacgg

480

taccctgtca gaaagcgatg gctaactatg tgccagcagc cgcggtaata cataggtcgc

540

aagcgttatc cggaattatt gggcgtaaag cgttcgtagg ctgtttatta agtctggagt

600

taaatcccag ggctcaaccc tggctcgctt tggatactgg taaactagag ttagatagag

660

gtaagcggaa ttccatgtga agcggtgaaa tgcgtagata tatggaagaa caccaaaggc

720

gaaggcagct tgctgggtct atactgacgc tgagggacga aagcgtgggg agcaaacagg

780

attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgatcat tagtcggtgg attaatcact

840

gacgcagcta acgcattaaa tgatccgcct gagtagtatg ctcgcaagag tgaaacttaa

900

aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaatttga agatacgcgg

960

agaaccttac ccactcttga catccttcgc aaagctatag agatatagtg gaggttaacg

1020

gagtgacaga tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgtttg gtcaagtcct

1080

gcaacgagcg caacccctat ctttagttac taacgagtca tgtcgaggac tctagagata

1140

ctgcctgggt aactgggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc tcttacgagt

1200

ggggcaacac acgtgctaca atggtcggta caaagagaag caatatggcg acatggagca

1260

aatctcaaaa agccgatctc agttcggatt ggagtctgca attcgactcc atgaagtcgg

1320

aatcgctagt aatcgcagat cagctatgct gcggtgaata cgttctcggg tcttgtacac

1380

accgcccgtc acaccatggg agctggtaat acccaaagtc ggtttgctaa cctcggaggc

1440

gactgcctaa ggtaggactg gtgactgggg tgaagtcgta acaaggtatc cctacgagaa

1500

cgtggggatg gatcacctcc tttct

1525

<210> 1313

<211> 1474

<212> DNA

<213> Mycoplasma bovoculi

<400> 1313

ctcgctgtgt gcctaataca tgcatgttga acggaatatt ttagcttgct aaaatattta

60

gtagcgaatg ggtgagtaac acgtacctaa tctaccttta ggttcgggat aacttttgga

120

aacaagagct aatacctgat atagtttatt ttcgcatgaa gataaataaa aaggagcttc

180

acggcttcgc ctagaaatga gggtgcggaa cattagttag ttggtgaggt aatggctcac

240

caagacgatg atgtttagcg gggccaagag gttgtaccgc cacactggga ctgagatacg

300

gcccagactc ctacgggagg cagcagtaag gaattttcca caatgagcga aagcttgatg

360

gagcgacaca gcgtgcacga tgaagtcttt agggatgtaa agtgctgtta taaggaaaga

420

aaaaattaaa taggaaatga tttaatcttg acggtacctt attagaaagc gacggcaaac

480

tatgtgccag cagccgcggt aatacatagg tcgcaagcgt tatccggaat tattgggcgt

540

aaagcgtccg taggtgtttt gttaagttta aggttaaata ctgaagctca acttcagccc

600

gctttagata ctggcaaaat agaattatga agaggttagc ggaattccta gtggagcggt

660

ggaatgcgta gatattagga agaacaccaa taggcgaagg cagctaactg gtcataaatt

720

gacactaagg gacgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgct

780

gtaaacgatg atcattagtt ggtggtaata atcactagca cagctaacgc gataaatgat

840

ccgcctgagt agtatgctcg caagagtgaa acttaaagga attgacggga acccgcacaa

900

gcggtggagc atgtggttta atttgaagat acgcggagaa ccttacccac tcttgacatc

960

cttgcaaagc tatagagata tagtagaggt taacaagatg acagatggtg catggttgtc

1020

gtcagctcgt gtcgtgagat gttaggttaa gtcctgcaac gagcgcaacc cctttcttta

1080

gttactaaca ttaagttgag gactctagag acactgccag cgtaagctgg aggaaggtgg

1140

ggatgacgtc aaatcatcat gcctcttacg agtggggcaa cacacgtgct acaatggcta

1200

ctacaaagag aagcaaaacg gtgacgtcca gcaaatctca aaaaagtagt cccagttcgg

1260

attgaagtct gcaactcgac ttcatgaagt cggaatcgct agtaatcgca ggtcagctat

1320

actgcggtga atacgttctc gggttttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagttggt

1380

aatacccaaa gtcggttagt taacttcgga gactgctgcc taaggtagga ctgatgactg

1440

gggtgaagtc gtaacaaggt atccctacga gaac

1474

<210> 1314

<211> 1459

<212> DNA

<213> Mycoplasma faucium

<400> 1314

ctggctgtgt gcctaataca tgcatgtcga gcggaagtag caatacttta gcggcgaatg

60

ggtgagtaac acgtgcttaa tctacctttt agattggaat acctaatgga aacattggtt

120

aatgccggat acgcatgaaa tcgcatgatt tcgttgtgaa aggagcgttt gctccgctaa

180

aagatgaggg tgcggaacat tagctagttg gtgaggtaat ggcccaccaa ggctatgatg

240

tttagccggg tcgagagact gaacggccac attgggactg agatacggcc caaactccta

300

cgggaggcag cagtagggaa tattccacaa tgagcgaaag cttgatggag cgacacagcg

360

tgcacgatga aggccctcgg gttgtaaagt gctgttgcaa gggaagaaca cttagttgag

420

gaaatgcaac taagctgacg gtaccttgtt agaaagcgat ggctaactat gtgccagcag

480

ccgcggtaat acataggtcg caagcgttat ccggaattat tgggcgtaaa gcgttcgtag

540

gctgtttatt aagtctggag tcaaatccca gggctcaacc ctggctcgct ttggatactg

600

gtaaactaga gttggataga ggtaagcgga attccatgtg aagcggtgaa atgcgtagat

660

atatggaaga acaccaaagg cgaaggcagc ttactgggtc tatactgacg ctgagggacg

720

aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgatca

780

ttagtcggtg ggagccactg acgcagctaa cgcattaaat gatccgcctg agtagtatgc

840

tcgcaagagt gaaacttaaa ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt

900

ttaatttgaa gatacgcgga gaaccttacc cactcttgac atcctttgca aagctataga

960

gatatagtgg aggttaacag agtgacagat ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1020

agatgtttgg tcaagtcctg caacgagcgc aacccctatc tttagttact aacgagtcat

1080

gttgaggact ctagagatac tgcctgggta actgggagga aggtggggat gacgtcaaat

1140

catcatgcct cttacgagtg gggcaacaca cgtgctacaa tggtcggtac aaagagacgc

1200

aatacggtga cgtggagcaa atctcaaaaa gccgatctca gttcggattg aagtctgcaa

1260

ttcgacttca tgaagtcgga atcgctagta atcgcagatc agctatgctg cggtgaatac

1320

gttctcgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gctggtaata cccaaagtcg

1380

gtttgctaac ctcggaggcg actgcctaag gtaggactgg tgactggggt gaagtcgtaa

1440

caaggtatcc ctacgagaa

1459

<210> 1315

<211> 1517

<212> DNA

<213> Mycoplasma fermentans

<400> 1315

attttttcga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gctgtgtgcc taatacatgc

60

atgtcgagcg aaggtagcaa taccttagcg gcgaatgggt gagtaacacg tgctcaacgt

120

acccttcagt ttggcatagc gactggaaac agtcgataat ttcaaatact cgtagttttc

180

gcatgaagat tacggaaaag aagcgtttgc ttcgctggag gagcggggtg cgtaacatta

240

gctagttggt gaggtaacgg cccaccaagg cgatgatgtt tagcggggtt gagagactga

300

accgccacac tgggactgag atacggccca gactcctacg ggaggcagca gtagggaata

360

ttccacaatg ggcgaaagcc tgatggagcg acacagcgtg aaggatgaag gtcctatgga

420

ttgtaaactt ctgtggtaag ggaagaaaag acagaatagg aaatgatttt gttttgacgg

480

taccttatta gaaagcaacg gctaactatg tgccagcagc cgcggtaata cataggttgc

540

aagcgttatc cggaattatt gggcgtaaag cgtctgtagg ttgtttgtta agtctggcgt

600

taaattttgg ggctcaaccc caaaacgcgt tggatactgg caggctagag ttgtgtagag

660

gttagcggaa ttccttgtga agcggtgaaa tgcgtagata taaggaagaa caccaagatg

720

gcgaaggcag ctaactggac atatactgac actgagagac gaaagcgtgg ggagcaaaca

780

ggattagata ccctggtagt ccacgcccta aacgatgatc attagctgat ggggaactca

840

tcggcgcagc taacgcatta aatgatccgc ctgagtagta cgttcgcaag aataaaactt

900

aaaggaattg acggggatcc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattt gaagatacgc

960

gtagaacctt acccactctt gacatcttct gcaaagctat ggagacatag tggaggttaa

1020

cagaatgaca gatggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt tggttaagtc

1080

ctgcaacgag cgcaaccctt atccttagtt actaccattc agttgaggac tctaaggaga

1140

ctgcccgagt aatcgggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc tcttacgagt

1200

ggggcaacac acgtgctaca atggccggta caaagagaag cgaagtggtg acatggagca

1260

aacctcaaaa aaccggtctc agttcggatt gtagtctgca actcgactac atgaagtcgg

1320

aatcgctagt aatcgtagat cagctacgct acggtgaata cgttctcggg tcttgtacac

1380

accgcccgtc aaaccatggg agctggtaat gcccgaagtc ggtttataaa caaactgcct

1440

aaggcaggac tggtgactgg ggttaagtcg taacaaggta tccctacgag aacgtgggga

1500

tggatcacct cctttct

1517

<210> 1316

<211> 1545

<212> DNA

<213> Mycoplasma flocculare

<400> 1316

gcaatcatga gagtttgatc ctagctcagg atgaacgcta gctgtgtgct taatacatgc

60

atttgaacgg gatagtattt tagttttact aaagtattgt tttagtagca aatgggtgag

120

taacacgtac ctaacctacc ttttggactg ggataaccat tggaaacagt ggctaatacc

180

ggatataata aaaattcaca tgaattttta tgaaaaggag cgaaaataag ctccaccaaa

240

aaatgggggt gcgcaacatt agttagttgg tagggtaaag gcctaccaag acgatgatgt

300

ttagcggggc caagaggttg taccgccaca ctgggattga gatacggccc agactcctac

360

gggaggcagc agtaaggaat attccacaat gagcgaaagc ttgatggagc gacacagcgt

420

gcaggatgaa gtctttaggt atgtaaactg ctgttgtaag ggaagaaaaa aattaggtag

480

ggaatgatct aatcttgacg gtaccttact agaaagcgac ggcaaactat gtgccagcag

540

ccgcggtaat acataggtcg caagcgttat ccggaattat tgggcgtaaa gcgttcgtag

600

gttttttgtt aagtttaagg ttaaatgcta aagctcaact ttagtccgct ttagatactg

660

gcaaaataga attatgaaga ggttagcgga attcctagtg gagtggtgga atacgtagat

720

attaggaaga acaccaatag gcgaaggcag ctaactggtc atatattgac actgagggac

780

gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgatc

840

attagttggt ggcagaagtc actagcgcag ctaacgcgtt aaatgatccg cctgagtagt

900

atgctcgcaa gagtgaaact taaaggaatt gacgggaacc cgcacaagcg gtggagcatg

960

tggtttaatt tgaggatacg cgtagaacct tacccactct tgacattctc gcaaaactat

1020

agagatatag cggaggctaa cgagattaca gatggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc

1080

gtgagatgtt aggttaagtc ctgcaacgag cgcaaccctt ttctttagtt gctaacatta

1140

agttgagaac cctagagata ctgccggtgt aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1200

tcatcatgcc tcttacgagt ggggcaacac acgtgctaca atggctacta caaagagcag

1260

caaaacagtg atgtcaagct aatctcaaaa aagtagtctc agttcggatt gaagtctgca

1320

actcgacttc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcaggt cagctatact gcggtgaata

1380

cgttctcggg ttttgtacac accgcccgtc acaccatggg agttggtaat gcccaaagtc

1440

ggtgagttaa cctcggagac cattgcctaa ggcaggaccg atgactgggg tgaagtcgta

1500

acaaggtatc cctacgagaa cgtggggatg gaacacctcc tttct

1545

<210> 1317

<211> 1521

<212> DNA

<213> Mycoplasma genitalium

<400> 1317

ttttttctga gagtttgatc ctggctcagg attaacgctg gcggcatgcc taatacatgc

60

aagtcgatcg gaagtagcaa tactttagag gcgaacgggt gagtaacacg tatccaatct

120

accttataat gggggataac tagttgaaaa actagctaat accgcataag aactttagtt

180

cgcatgaatt aaagttgaaa ggacctgcaa gggttcgtta tttgatgagg gtgcgccata

240

tcagctagtt ggtagggtaa tggcctacca aggcaatgac gtgtagctat gctgagaagt

300

agaatagcca caatgggact gagacacggc ccatactcct acgggaggca gcagtaggga

360

atttttcaca atgagcgaaa gcttgatgga gcaatgccgc gtgaacgatg aaggtctttt

420

tgattgtaaa gttcttttat ttgggaagaa tgactctagc aggcaatggc tggagtttga

480

ctgtaccact ttgaataagt gacgactaac tatgtgccag cagtcgcggt aatacatagg

540

tcgcaagcgt tatccggatt tattgggcgt aaagcaagcg caggcggatt gaaaagtctg

600

gtgttaaagg cagctgctta acagttgtat gcattggaaa ctatcagtct agagtgtggt

660

agggagtttt ggaatttcat gtggagcggt gaaatgcgta gatatatgaa ggaacaccag

720

tggcgaaggc gaaaacttag gccattactg acgcttaggc ttgaaagtgt ggggagcaaa

780

taggattaga taccctagta gtccacaccg taaacgatag atactagctg tcggagcgat

840

cccttcggta gtgaagttaa cacattaagt atctcgcctg ggtagtacat tcgcaagaat

900

gaaactcaaa cggaattgac ggggacccgc acaagtggtg gagcatgttg cttaattcga

960

cggtacacga aaaaccttac ctagacttga catccttggc aaagttatgg aaacataatg

1020

gaggttaacc gagtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg

1080

gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cgttagttac attgtttaac gagactgcta

1140

atgtaaattg gaggaaggaa gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gtctagggct

1200

gcaaacgtgc tacaatggcc aatacaaaca gtagccaact tgtaaaagtg agcaaatctg

1260

aaaagttggt ctcagttcgg attgagggct gcaattcgtc ctcatgaagc tggaatcact

1320

agtaatcgcg aatcagctat gtcgcggtga atacgttctc gggtcttgta cacaccgccc

1380

gtcaaactat gaaagctggt aatatttaaa aacgtgttgc taacctttat tggaagcgca

1440

tgtcaaggat agcaccggtg attggagtta agtcgtaaca aggtacccct acgagaacgt

1500

gggggtggat cacctccttt c

1521

<210> 1318

<211> 1521

<212> DNA

<213> Mycoplasma hominis

<400> 1318

tttttataag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctgg ctgtgtgcct aatacatgca

60

tgtcgagcga ggttagcaat aacctagcgg cgaatgggtg agtaacacgt gcttaatcta

120

ccttttagat tggaataccc attggaaaca atggctaatg ccggatacgc atggaaccgc

180

atggttccgt tgtgaaaggc gctgtaaggc gccactaaaa gatgagggtg cggaacatta

240

gttagttggt gaggtaatgg cccaccaaga ctatgatgtt tagccgggtc gagagactga

300

acggccacat tgggactgag atacggccca aactcctacg ggaggcagca gtagggaata

360

ttccacaatg agcgaaagct tgatggagcg acacagcgtg cacgatgaag gtcttcggat

420

tgtaaagtgc tgttataagg gaagaacatt tgcaatagga aatgattgca gactgacggt

480

accttgtcag aaagcgatgg ctaactatgt gccagcagcc gcggtaatac ataggtcgca

540

agcgttatcc ggaattattg ggcgtaaagc gttcgtaggc tgtttgttaa gtctggagtt

600

aaatcccggg gctcaacccc ggctcgcttt ggatactagc aaactagagt tagatagagg

660

taagcggaat tccatgtgaa gcggtgaaat gcgtagatat atggaagaac accaaaggcg

720

aaggcagctt actgggtcta tactgacgct gagggacgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgatcatt agtcggtgga gaatcactga

840

cgcagctaac gcattaaatg atccgcctga gtagtatgct cgcaagagtg aaacttaaag

900

gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taatttgaag atacacggaa

960

aaccttaccc actcttgaca tccttcgcaa agctatagag atatagtgga ggttatcgga

1020

gtgacagatg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgtttggt caagtcctgc

1080

aacgagcgca acccctatct ttagttacta acattaagtt gaggactcta gagatactgc

1140

ctgggtaact gggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcctctt acgagtgggg

1200

ccacacacgt gctacaatgg tcggtacaaa gagaagcaat atggcgacat ggagcaaatc

1260

tcaaaaagcc gatctcagtt cggattggag tctgcaattc gactccatga agtcggaatc

1320

gctagtaatc gcagatcagc tatgctgcgg tgaatacgtt ctcgggtctt gtacacaccg

1380

cccgtcacac catgggagct ggtaataccc aaagtcggtt tgctaacctc ggaggcgacc

1440

gcctaaggta ggactggtga ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtatcccta cgagaacgtg

1500

gggatggatc acctcctttc t

1521

<210> 1319

<211> 1510

<212> DNA

<213> Mycoplasma orale

<400> 1319

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggctgtgtgc ctaatacatg catgtcgagc

60

ggaagtagca atactttagc ggcgaatggg tgagtaacac gtgcttaatc taccttttag

120

attggaatac ctaatggaaa cattggttaa tgccggatac gcatgaagtc gcatgacttc

180

gttgtgaaag gagcgtttgc tccgctaaga gatgagggtg cggaacatta gctagttggt

240

gaggtaatgg cccaccaagg ctatgatgtt tagccgggtc gagagactga acggccacat

300

tgggactgag atacggccca aactcctacg ggaggcagca gtagggaata ttccacaatg

360

agcgaaagct tgatggagcg acacagcgtg cacgatgaag gccctcgggt tgtaaagtgc

420

tgttgcaagg gaagaacagt tagttgagga aatgcttcta atctgacggt accttgttag

480

aaagcgacgg ctaactatgt gccagcagcc gcggtaatac ataggtcgca agcgttatcc

540

ggaattattg ggcgtaaagc gttcgtaggc tgtttattaa gtctggagtc aaatcccagg

600

gctcaaccct ggctcgcttt ggatactggt aaactagagt tagatagagg taagcggaat

660

tccatgtgga gcggtgaaat gcgtagatat atggaagaac accaaaggcg aaggcagctt

720

actgggtcta tactgacgct gagggacgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc

780

tggtagtcca cgctgtaaac gatgatcatt agtcggtgga aaactactga cgcagctaac

840

gcattaaatg atccgcctga gtagtatgct cgcaagagtg aaacttaaag gaattgacgg

900

ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taatttgaag atacgcggag aaccttaccc

960

actcttgaca tcccctgcaa agctatagag atatagtaga ggttaacagg gtgacagatg

1020

gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgtttggt caagtcctgc aacgagcgca

1080

acccctatct ttagttacta acgagtcatg tcgaggactc tagagatact gcctgggtaa

1140

ccgggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcctc ttacgagtgg ggctacacac

1200

gtgctacaat ggtcggtaca aagagaagca atatggcgac atggagcaaa tctcaaaaag

1260

ccgatctcag ttcggattga agtctgcaat tcgacttcat gaagtcggaa tcgctagtaa

1320

tcgcagatca gctacgctgc ggtgaatacg ttctcgggtc ttgtacacac cgcccgtcac

1380

accatgggag ctggtaatac ccaaagtcgg tttgctaacc tcggaggcga ctgcctaagg

1440

taggactggt gactggggtg aagtcgtaac aaggtatccc tacgagaacg tgcggctgga

1500

tcacctcctt

1510

<210> 1320

<211> 1475

<212> DNA

<213> Mycoplasma ovipneumoniae

<400> 1320

ctatctgtgt gcttaataca tgcatgttga acggaatatg ttagcttgct aatatattta

60

gtagcaaatg ggtgagtaac acgtacctaa cctacctttt ggaccgggat aaccattgga

120

aacagcggct aataccagat acgataaaaa aatgcatgtt tttttattaa aagaagcctt

180

taaagcttca ccaaaaaatg ggggtgcgca acattagtta gttggtaggg taaaggccta

240

ccaagacgat gatgtttagc ggggccaaga ggctgtaccg ccacactggg attgagatac

300

ggcccagact cctacgggag gcagcagtaa ggaatattcc acaatgagcg aaagcttgat

360

ggagcgacac agagtgcagg atgaagtctt tagggatgta aactgctgtt gtaagggaag

420

aaaaaactag ataggaaatg atttagtctt gacggtacct tattagaaag tgacggcaaa

480

ctatgtgcca gcagccgcgg taatacatag gtcgcaagcg ttatccggaa ttattgggcg

540

taaagcgtcc gcaggttttt tgttaagttt aaggttaaat gctaaagctc aactttagtt

600

cgctttagat actgacaaaa tagaattatg aagaggttag cggaattcct agtggagcgg

660

tggaatgcgt agatattagg aagaacacca ataggcgaag gcagctaact ggtcatatat

720

tgacactaat ggacgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc

780

cgtaaacgat gatcattagt tggtggcaaa agtcactagc acagctaacg cgttaaatga

840

tccgcctgag tagtatgctc gcaagagtga aacttaaagg aattgacggg aacccgcaca

900

agcggtggag catgtggttt aatttgaaga tacgcgtaga accttaccca ctcttgacat

960

cctcgcaaaa ctatagagat atagcggagg ctaacgagat gacagatggt gcatggttgt

1020

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttaggtta agtcctgcaa cgagcgcaac ccttttcttt

1080

agttgctaac attaagttga gaaccctaga gatactgccg gtgcaaaccg gaggaaggcg

1140

gggatgacgt caaatcatca tgcctcttac gagtggggca acacacgtgc tacaatggct

1200

actacaaaga gcagcgaaac agtgatgtca agctaatctc aaaaaagtag tctcagttcg

1260

gattgaagtc tgcaactcga cttcatgaag tcggaatcgc tagtaatcgc aggtcagcta

1320

tactgcggtg aatacgttct cgggttttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagttgg

1380

taatgcccaa agtcggtgag ttaacctcgg agaccattac ctaaggcagg accgatgact

1440

ggggtgaagt cgtaacaagg tatccctacg agaac

1475

<210> 1321

<211> 1516

<212> DNA

<213> Mycoplasma penetrans

<400> 1321

tcaattttaa gagtttgatc ctggctcagg attaacgcta gcgggatgcc taatacatgc

60

aagtcggacg aagcacttgt gcttagtggc gaacgggtga gtaacacgta tctaacatac

120

cttttagtgg gggataactg gttgaaaaac tagctaatac cgcataggac attactatcg

180

catgagaaaa tgtttaaagt tgcgtttgca acgctttaag attgaggtgt ggcatatcag

240

atagttggta gggtaacggc ctaccaagtc tatgacgtgt agctgtgctg agaggcaaaa

300

cagccacaat ggaactgaga cacggtccat acttctacgg gaggcagcag tagggaattt

360

ttcacaatgg gcgcaagcct gatggagcaa tcccgcgtga acgacgaagg ttttttaaat

420

tgtaaagttc ttttattggg gacgaattgt aagaagagga aatgcttttt atttgactgt

480

accctttgaa taagtatcgg ctaactatgt gccagcagcc gcggtaatac ataggatgca

540

agcgttatcc ggatttactg ggcgtaaagc gagcgcaggc ggatttacaa gtctggtgtt

600

aaatatagct gcccaacagt tatatgcatt ggaaactgta agtctagagt gcagtagaga

660

gttttggaac tccatgtgga gcggtggaat gcgtagatat atggaagaac accagaggcg

720

aaggcgaaaa cttaggctgt tactgacgct taggctcgaa agtgtgggga gcaaatagga

780

ttagataccc tagtagtcca caccgtaaac gatggtaatt aaatcttggt acgggatgta

840

tcaggattgc agttaacaca ttaaattacc cgcctgggta gtacattcgc aagaatgaaa

900

ctcaaacgga attgacgggg acccgcacaa gtggtggagc atgttgctta attcgacgat

960

acacgtaaaa ccttacctgg gtttgacatc ctctgcaaag ctatagagat atagtggagg

1020

ttaacagagt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1080

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcgtt agttacttca tctagcgaga ctgccagcgt

1140

aagctggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ctttatatcc agggccgcaa

1200

acgtgctaca atggtcggta caaactgttg ccaatcagca atgaggagct aatcagagaa

1260

agccgatctc agttcggatc gagggctgca attcgtcctc gtgaagttgg aatcactagt

1320

aatcgcaaat cagccatgtt gcggtgaata cgttctcggg tcttgtacac accgcccgtc

1380

aaactatgag agctggtaat acctaaaacc gttaagctaa cctcgtgagg cttgcgtcta

1440

gggtaggact ggtaattgga gttaagtcgt aacaaggtac ccctacggga atgtgggggt

1500

ggatcacctc ctttct

1516

<210> 1322

<211> 1559

<212> DNA

<213> Mycoplasma pneumoniae

<400> 1322

tgttctttca aaactggatg caatctgtca atttttctga gagtttgatc ctggctcagg

60

attaacgctg gcggcatgcc taatacatgc aagtcgatcg aaagtagtaa tactttagag

120

gcgaacgggt gagtaacacg tatccaatct accttataat gggggataac tagttgaaag

180

actagctaat accgcataag aactttggtt cgcatgaatc aaagttgaaa ggacctgcaa

240

gggttcgtta tttgatgagg gtgcgccata tcagctagtt ggtggggtaa cggcctacca

300

aggcaatgac gtgtagctat gctgagaagt agaatagcca caatgggact gagacacggc

360

ccatactcct acgggaggca gcagtaggga atttttcaca atgagcgaaa gcttgatgga

420

gcaatgccgc gtgaacgatg aaggtcttta agattgtaaa gttcttttat ttgggaagaa

480

tgactttagc aggtaatggc tagagtttga ctgtaccatt ttgaataagt gacgactaac

540

tatgtgccag cagtcgcggt aatacatagg tcgcaagcgt tatccggatt tattgggcgt

600

aaagcaagcg caggcggatt gaaaagtctg gtgttaaagg cagctgctta acagttgtat

660

gcattggaaa ctattaatct agagtgtggt agggagtttt ggaatttcat gtggagcggt

720

gaaatgcgta gatatatgaa ggaacaccag tggcgaaggc gaaaacttag gccattactg

780

acgcttaggc ttgaaagtgt ggggagcaaa taggattaga taccctagta gtccacaccg

840

taaacgatag atactagctg tcggggcgat cccctcggta gtgaagttaa cacattaagt

900

atctcgcctg ggtagtacat tcgcaagaat gaaactcaaa cggaattgac ggggacccgc

960

acaagtggtg gagcatgttg cttaattcga cggtacacga aaaaccttac ctagacttga

1020

catccttggc aaagttatgg aaacataatg gaggttaacc gagtgacagg tggtgcatgg

1080

ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat

1140

cgttagttac attgtctagc gagactgcta atgcaaattg gaggaaggaa gggatgacgt

1200

caaatcatca tgccccttat gtctagggct gcaaacgtgc tacaatggcc aatacaaaca

1260

gtcgccagct tgtaaaagtg agcaaatctg taaagttggt ctcagttcgg attgagggct

1320

gcaattcgtc ctcatgaagt cggaatcact agtaatcgcg aatcagctat gtcgcggtga

1380

atacgttctc gggtcttgta cacaccgccc gtcaaactat gaaagctggt aatatttaaa

1440

aacgtgttgc taaccattag gaagcgcatg tcaaggatag caccggtgat tggagttaag

1500

tcgtaacaag gtacccctac gagaacgtgg gggtggatca cctcctttct aatggagtt

1559

<210> 1323

<211> 1466

<212> DNA

<213> Mycoplasma putrefaciens

<400> 1323

ctggcggcat gcctaataca tgcaagtcga acgggggtgc ttgcacccca gtggcgaacg

60

ggtgagtaac acgtatctaa cctaccttat agcgggggat aacttttgga aacgaaagat

120

aataccgcat gtgaatctta ttatcgcatg agaaaagatt gaaagaaccg tttggttcac

180

tatgagatgg ggatgcggcg tattagctag taggtgaggt aatggctcac ctaggcgatg

240

atacgtagcc gaactgagag gttgatcggc cacattggga ctgagatacg gcccagactc

300

ctacgggagg cagcagtagg gaatttttca caatggacga aagtctgatg aagcaatgcc

360

gcgtgagtga tgacggcctt cgggttgtaa agctctgttg taagggaaga aaaaataaag

420

taggaaatgc ctttatattg acggtacctt accagaaagc cacggctaac tatgtgccag

480

cagccgcggt aatacatagg tggcaagcgt tatccggatt tattgggcgt atagggtgcg

540

taggcggttg tgcaagtttg aggttaaagt ccggagctca actccggttc gccttgaaaa

600

ctgcattact agaatacaag agaggtaagc ggaattccat gtgtagcggt gaaatgcgta

660

gatatatgga agaacacctg tggcgaaagc ggcttactgg tttgttattg acgctgaggc

720

acgaaagcgt ggggagcaaa taggattaga taccctagta gtccacgccg taaacgatga

780

gtactaggtg ttgggtgaac tcagcgccgc agctaacgca ttaagtactc cgcctgagta

840

gtatgctcgc aagagtgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag tggtggagca

900

tgtggtttaa ttcgaagcaa cacgaagaac cttaccaggg cttgacatcc agtgcaaagc

960

tatagagata tagtagaggt taacattgag acaggtggtg catggttgtc gtcagttcgt

1020

gccgtgaggt gttgggttaa gtcccgcaac gaacgcaacc cttgtcgtta gttactaaca

1080

ttaagttgag gactctaacg agactgctag tgtaagctag aggaaggtgg ggatgacgtc

1140

aaatcatcat gccccttatg tcctgggcta cacacgtgct acaatggctg gtacaaagag

1200

tcgcaatctc gcgaggggga gctaatctca aaaaaccagt ctcagttcgg attgaagtct

1260

gcaactcgac ttcatgaagc cggaatcact agtaatcgcg aatcagctat gtcgcggtga

1320

atacgttctc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagttggt aataccagaa

1380

gtgggtagct taaccgcaag gagagcgcct cccaaggtag gactagcgat tggggtgaag

1440

tcgtaacaag gtatccgtac gggaac

1466

<210> 1324

<211> 1474

<212> DNA

<213> Mycoplasma salivarium

<220>

<221> modified_base

<222> (152)..(152)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (188)..(188)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (329)..(330)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (486)..(486)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (541)..(541)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (553)..(554)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (760)..(760)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (890)..(891)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (896)..(952)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1041)..(1041)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1168)..(1168)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1437)..(1437)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1439)..(1439)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1470)..(1470)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1324

aattttaaga gtttgatcct ggctcaggat gaacgctggc tgtgtgccta atacatgcat

60

gtcgagcgga agtagcaata ctttagcggc gaatgggtga gtaacacgtg cttaatctac

120

ctcttagatt ggaataccta atggaaacat tngttaatgc cggatacgca tggagtcgca

180

tgactccntt gtgaaagggg cctttaaagc tccactaaga gatgagggtg cggaacatta

240

gctagttggt gaggtaacgg cccaccaagg ctatgatgtt tagccgggtc gagagactga

300

acggccacat tgggactgag atacggccnn aactcctacg ggaggcagca gtagggaata

360

ttccacaatg agcgaaagct tgatggagcg acacagcgtg cacgatgaag gtcttatgga

420

ttgtaaagtg ctgttgctag ggaagaaaaa gtagttgagg aaatgcttct acattgacgg

480

tacctngtta gaaagcgatg gctaactatg tgccagcagc cgcggtaata cataggtcgc

540

nagcgttatc cgnnattatt gggcgtaaag cgttcgtagg ctgtttatta agtctggagt

600

caaatcccag ggctcaaccc tggctcgctt tggatactgg taaactagag ttggatagag

660

gtaagcggaa ttccatgtga agcggtgaaa tgcgtagata tatggaagaa caccaaaggc

720

gaaggcagct tactgggttt atactgacgc tgaggaacgn aagcgtgggg agcaaacagg

780

attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgatcat tagtcggcag agaactgttg

840

acgcagctaa cgcattaaat gatccgcctg agtagtatgc tcgcaagagn naaacnnnnn

900

nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nntacgcgga

960

gaaccttacc cactcttgac atccttcgca aagctataga gatatagtgg aggttaacgg

1020

agtgacagat ggtgcatggt ngtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgtttgg tcaagtcctg

1080

caacgagcgc aacccctatc tttagttact aacgagtcat gtcgaggact ctagagatac

1140

tgcctgggta actgggagga aggtgggnat gacgtcaaat catcatgcct cttacgagtg

1200

gggcaacaca cgtgctacaa tggtcggtac aaagagaagc aatatggcga catggagcaa

1260

atctcaaaaa gccgatctca gttcggattg aagtctgcaa ttcgacttca tgaagtcgga

1320

atcgctagta atcgcagatc agctatgctg cggtgaatac gttctcgggt cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccatggga gctggtaata cccaaagtcg gtttgctaac cgtccgngna

1440

ggcgactgcc taaggtagga ctggtgactn gggt

1474

<210> 1325

<211> 1290

<212> DNA

<213> Mycoplasmataceae genomosp. P1 oral clone MB1_G23

<400> 1325

gattaacgct ggcggtacgt ctaatacatg caagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta

60

acacgtaggt aacctgccta caagttgggg ataacacaag gaaacttgtg ctaataccga

120

ataattaaag ctgcttgaag aggggcctgc ggcgcattag ttagttggta aggtaatggc

180

ttaccaagac gatgatgcgt agctggactg agaggttgaa cagccacatt gggactgaga

240

aacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagagaatct tcggcaatgg gggaaaccct

300

gaccgagcga taccgcgtga gtgatgaaat acttcggtat gtaaaattct tttattaaag

360

aagatgacgt tatttaatga ataagtcccg gctaactatg tgccagcagc cgcggtaata

420

cataggggac gagcgttatc cggaataatt gggcgtaaag ggtgcgtagg cggtgtgtta

480

agttcaaggt ttaatcgtag ggctcaaccc tatatcgctt tgaaaactgg cacactagag

540

taagatagag gcaagtggaa ttccatgtgt agcggtaaaa tgcgtaaata tatggcagaa

600

caccagaggc gaaggcggct tgctgggtct accgacgctg aggcacgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagcacta aaagtcgggt

720

tcggctttca agttaacgcg ataagtgctc cgcctgagta gtacgtacgc aagtataaaa

780

ctcaaaggaa ttggcgggac ctcgcacaag cggtggatca tgttgtttaa ttcgttgata

840

cgcgatgaac cttaccaggc cttgacatat acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt

900

gtcgtgagat gttaggttaa gtcctgcaac gagcgcaact cttattgcta tttgccatca

960

tgggcactat agtgagactg ccagtgataa actggaggaa ggtgggaatg acgtcaaatc

1020

atcatgcccc ttatggcctg ggccacaaac gtgatacaat ggttgtcaaa aggatgctag

1080

aaagtgattt taggcaaatc cttacaatct cagttcggat gaagtctgca actcgacttc

1140

agaagtcgga atcgctagta atcgtagatc agaacgctac ggtgaatacg ttctcgaggt

1200

ttgcacacac cgcccgtcaa accacgaaag ttaacaatac ccaaaaccgg tgcctaagga

1260

gccgtctaag gtagggttaa tgattggggt

1290

<210> 1326

<211> 1484

<212> DNA

<213> Myroides odoratimimus

<400> 1326

agcggcaggc ctaacacatg caagtcgagg ggtagaaaga gcttgctttt ttgagaccgg

60

cgcacgggtg agtaacgcgt atgcaaccta ccttatacag gggaatagcc cgaagaaatt

120

cggattaatg ctccatggtt tatcgatatg gcatcgtatt gataataaag atttatcggt

180

ataagatggg catgcgtatc attagctagt tggtgtggta acggcatacc aaggcaacga

240

tgattagggg tcctgagagg gagatccccc acactggtac tgagacacgg accagactcc

300

tacgggaggc agcagtgagg aatattggtc aatggaggca actctgaacc agccatgccg

360

cgtgcaggat gacggtccta tggattgtaa actgcttttg tacaggaaga aacctcccta

420

cgagtaggga cttgacggta ctgtaagaat aaggatcggc taactccgtg ccagcagccg

480

cggtaatacg gaggatccga gcgttatccg gaattattgg gtttaaaggg ttcgtaggcg

540

gctttgtaag tcagtggtga aatttcctag cttaactagg acactgccat tgatactgca

600

gagcttgaat aatatggaag taactagaat atgtagtgta gcggtgaaat gcttagatat

660

tacatggaat accaattgcg aaggcaggtt actacgtatt tattgacgct gatgaacgaa

720

agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatggatact

780

agctgttcgg ttttcggact gagtggctaa gcgaaagtga taagtatccc acctggggag

840

tacgttcgca agaatgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat

900

gtggtttaat tcgatgatac gcgaggaacc ttaccagggc ttaaatgtag attgacagat

960

ttggaaacag atttttcttc ggacaattta caaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt

1020

gccgtgaggt gtcaggttaa gtcctataac gagcgcaacc cctattgtta gttaccagcg

1080

cgtagaggcg gggactctag caagactgcc ggtgcaaacc gtgaggaagg tggggatgac

1140

gtcaaatcat cacggccctt acgtcctggg ctacacacgt gctacaatgg caagtacaga

1200

aagcagctac ctggcaacag gatgcgaatc tccaaagctt gtctcagttc ggattggagt

1260

ctgcaactcg actctatgaa gctggaatcg ctagtaatcg gatatcagcc atgatccggt

1320

gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcaagcc atggaagctg ggggtacctg

1380

aagtcggtga ccgcaaggag ctgcctaggg taaaactagt aactagggct aagtcgtaac

1440

aaggtagccg taccggaagg tgcggctgga tcacctcctt tcta

1484

<210> 1327

<211> 1481

<212> DNA

<213> Myroides sp. MY15

<400> 1327

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agcggcaggc ctaacacatg caagtcgagg

60

ggtatattga gcttgcttaa tagagaccgg cgcacgggtg agtaacgcgt atgcaaccta

120

ccttctacag gggaatagcc cgaagaaatt cggattaatg ctccatggtt taattgaatg

180

gcatcattta attaataaag atttatcggt agaagatggg catgcgtatc attagctagt

240

tggtgtggta acggcatacc aaggcgacga tgattagggg tcctgagagg gagatccccc

300

acactggtac tgagacacgg accagactcc tacgggaggc agcagtgagg aatattggtc

360

aatggaggca actctgaacc agccatgccg cgtgcaggat gacggtccta tggattgtaa

420

actgcttttg tacaggaaga aacctcgcta cgagtagcga tttgacggta ctgtaagaat

480

aaggatcggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaggatccga gcgttatccg

540

gaattattgg gtttaaaggg ttcgtaggcg gttggataag tcagtggtga aatttcttag

600

cttaactaag acccggccat tgatactgtt tgacttgaat agtatggaag taactagaat

660

atgtagtgta gcggtgaaat gcttagatat tacatggaat accaattgcg aaggcagggt

720

tactacgtac ttattgacgc tgatgaacga aagcgtgggg agcgaacagg attagatacc

780

ctggtagtcc acgccgtaaa cgatggatac tagctgttcg gttttcggac tgagtggcta

840

agcgaaagtg ataagtatcc cacctgggga gtacgttcgc aagaatgaaa ctcaaaggaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgata cgcgaggaac

960

cttaccaggg cttaaatgta gattgacagg tttggaaaca gacttttctt cggacaattt

1020

acaaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg tgccgtgagg tgtcaggtta agtcctataa

1080

cgagcgcaac ccctattgtt agttaccatc gagtaatgtc gggaactcta gcaagactgc

1140

cggtgcaaac cgtgaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcacggccct tacgtcctgg

1200

gctacacacg tgctacaatg gtcagtacag aaagcagcta cctggcgaca ggatgcgaat

1260

ctcaaaagct gatcacagtt cggattggag tctgcaactc gactccatga agctggaatc

1320

gctagtaatc ggatatcagc catgatccgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1380

cccgtcaagc catggaagct gggggtacct gaagtcggtg accgcaagga gctgcctagg

1440

gtaaaactag taactagggc taagtcgtaa caaggtaacc a

1481

<210> 1328

<211> 1545

<212> DNA

<213> Neisseria bacilliformis

<400> 1328

ttgaacataa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggcatgct ttacacatgc

60

aagtcggacg gcagcacaga gaagcttgct tcttgggtgg cgagtggcga acgggtgagt

120

aacgcatcgg aacgtaccga gtaatggggg ataactgtcc gaaaggacag ctaataccgc

180

atacgccctg agggggaaag cgggggatct taggacctcg cgttattcga gcggccgatg

240

tctgattagc tggttggcgg ggtaaaggcc caccaaggcg acgatcagta gcgggtctga

300

gaggatgatc cgccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatttt ggacaatggg cgcaagcctg atccagccat gccgcgtgtc tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaaggactt ttgtcaggga agaaaagggg catgttaata ccgtgctctg

480

atgacggtac ctgaagaata agcaccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

agggtgcgag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgg gcgcagacgg ttacttaagc

600

gggatgtgaa atccccgggc tcaacccggg aactgcgttc cgaactgggt ggctagagtg

660

tgtcagaggg gggtagaatt ccacgtgtag cagtgaaatg cgtagagatg tggaggaata

720

ccgatggcga aggcagcccc ctgggataac actgacgttc atgcccgaaa gcgtgggtag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccctaaacg atgtcgatta gctgttgggg

840

cacttgatgc cttagtagcg tagctaacgc gtgaaatcga ccgcctgggg agtacggtcg

900

caagattaaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggatg atgtggatta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatg tacggaacct tccagagacg

1020

gaagggtgcc ttcgggagcc gtaacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt cattagttgc catcatttgg

1140

ttgggcactc taatgagact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaagt

1200

cctcatggcc cttatgacca gggcttcaca cgtcatacaa tggtcggtac agagggtagc

1260

caagccgcga ggcggagcca atcccagaaa accgatcgta gtccggattg cactctgcaa

1320

ctcgagtgca tgaagtcgga atcgctagta atcgcaggtc agcatactgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggggatac cagaagcagg

1440

taggctaacc gcaagggggc cgcttgccac ggtatgcttc atgactgggg tgaagtcgta

1500

acaaggtagc cgtaggggaa cctgcggctg gatcacctcc tttct

1545

<210> 1329

<211> 1549

<212> DNA

<213> Neisseria cinerea

<400> 1329

tgaacataag agtttgatcc tggctcagat tgaacgctgg cggcatgctt tacacatgca

60

agtcggacgg cagcacagag aagcttgctt cttgggtggc gagtggcgaa cgggtgagta

120

acatatcgga acgtaccgag tagtggggga taactgatcg aaagatcagc taataccgca

180

tacgtcttga gagggaaagc aggggacctt cgggccttgc gctattcgag cggccgatat

240

ctgattagct agttggtggg gtaaaggcct accaaggcga cgatcagtag cgggtctgag

300

aggatgatcc gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

360

gggaattttg gacaatgggc gcaagcctga tccagccatg ccgcgtgtct gaagaaggcc

420

ttcgggttgt aaaggacttt tgtcagggaa gaaaaggctg ttgctaatat cagcggctga

480

tgacggtacc tgaagaataa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

gggtgcgagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgag cgcagacggt tacttaagca

600

ggatgtgaaa tccccgggct caacctggga actgcgttct gaactgggtg actagagtgt

660

gtcagaggga ggtagaattc cacgtgtagc agtgaaatgc gtagagatgt ggaggaatac

720

cgatggcgaa ggcagcctcc tgggataaca ctgacgttca tgctcgaaag cgtgggtagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccctaaacga tgtcaattag ctgttgggca

840

acttgattgt tcagtagcgt agctaacgcg tgaaattgac cgcctgggga gtacggtcgc

900

aagattaaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggatga tgtggattaa

960

ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggt cttgacatgt acggaatcct ccagagacgg

1020

aggagtgcct tcgggagccg taacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1080

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc attagttgcc atcattcagt

1140

tgggcactct aatgagactg ccggtgacaa gccggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

ctcatggccc ttatgaccag ggcttcacac gtcatacaat ggtcggtaca gagggtagcc

1260

aagccgcgag gtggagccaa tctcacaaaa ccgatcgtag tccggattgc actctgcaac

1320

tcgagtgcat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcaggtca gcatactgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggggatacc agaagtaggt

1440

aggataaccg caaggggtcc gcttaccacg gtatgcttca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtagcc gtaggggaac ctgcggctgg atcacctcct ttctagaga

1549

<210> 1330

<211> 1544

<212> DNA

<213> Neisseria elongata

<400> 1330

ttgaacataa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggcatgct ttacacatgc

60

aagtcggacg gcagcggggt agtgcttgca ctactgccgg cgagtggcga acgggtgagt

120

aatatattgg aacgtaccga gtaatggggg ataaccaatc gaaagattgg ctaataccgc

180

atacgctctg aggaggaaag caggggacct tcgggccttg cgttattcga gcggccaata

240

tctgattagc tagttggtgg ggtaaaggcc taccaaggcg acgatcagta gcgggtctga

300

gaggatgatc cgccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatttt ggacaatggg cgcaagcctg atccagccat gccgcgtgtc tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaaggactt ttgttaggga agaaaaggaa cggttaatac ccgtttctgc

480

tgacggtacc taaagaataa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

gggtgcgagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgag cgcagacggt tacttaagca

600

ggatgtgaaa tccccgggct caacctggga actgcgttct gaactgggta gctagagtat

660

gtcagagggg ggtagaattc cacgtgtagc agtgaaatgc gtagagatgt ggaggaatac

720

cgatggcgaa ggcagccccc tgggataata ctgacgttca tgctcgaaag cgtgggtagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccctaaacga tgtcgattag ctgttgggca

840

gcttgactgc ttagtagcgt agctaacgcg tgaaatcgac cgcctgggga gtacggtcgc

900

aagattaaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggatga tgtggattaa

960

ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggt cttgacatgt acggaacctt ccagagacgg

1020

aagggtgcct tcgggagccg taacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1080

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc attagttgcc atcatttagt

1140

tgggcactct aatgagactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

ctcatggccc ttatgaccag ggcttcacac gtcatacaat ggtcggtaca aagggtagcc

1260

aagccgcgag gcggagccaa tctcataaaa ccgatcgtag tccggattgc actctgcaac

1320

tcgagtgcat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcaggtca gcatactgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggggatacc agaagtaggt

1440

agggtaaccg taaggagccc gcttaccacg gtatgcttca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtagcc gtaggggaac ctgcggctgg atcacctcct ttct

1544

<210> 1331

<211> 1549

<212> DNA

<213> Neisseria flavescens

<400> 1331

tgaacataag agtttgatcc tggctcagat tgaacgctgg cggcatgctt tacacatgca

60

agtcggacgg cagcacagag aagcttgctt cttgggtggc gagtggcgaa cgggtgagta

120

atatatcgga acgtaccgag taatggggga taactaatcg aaagattagc taataccgca

180

tattctctga ggaggaaagc aggggacctt cgggccttgc gttattcgag cggccgatat

240

ctgattagct agttggtggg gtaaaggcct accaaggcga cgatcagtag cgggtctgag

300

aggatgatcc gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

360

gggaattttg gacaatgggc gcaagcctga tccagccatg ccgcgtgtct gaagaaggcc

420

ttcgggttgt aaaggacttt tgtcagggaa gaaaaggctg ttgctaatat cgacagctga

480

tgacggtacc tgaagaataa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

gggtgcgagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgag cgcagacggt tacttaagca

600

ggatgtgaaa tccccgggct caacctggga actgcgttct gaactgggtg actagagtgt

660

gtcagaggga ggtagaattc cacgtgtagc agtgaaatgc gtagagatgt ggaggaatac

720

cgatggcgaa ggcagcctcc tgggataaca ctgacgttca tgctcgaaag cgtgggtagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccctaaacga tgtcaattag ctgttgggca

840

acttgattgc ttagtagcgt agctaacgcg tgaaattgac cgcctgggga gtacggtcgc

900

aagattaaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggatga tgtggattaa

960

ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggt cttgacatgt acggaatcct ccagagacgg

1020

aggagtgcct tcgggagccg taacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1080

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc attagttgcc atcatttagt

1140

tgggcactct aatgagactg ccggtgacaa gccggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

ctcatggccc ttatgaccag ggcttcacac gtcatacaat ggtcggtaca gagggtagcc

1260

aagccgcgag gtggagccaa tctcacaaaa ccgatcgtag tccggattgc actctgcaac

1320

tcgagtgcat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcaggtca gcatactgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggggatacc agaagtaggt

1440

agggtaaccg caaggagccc gcttaccacg gtatgcttca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtagcc gtaggggaac ctgcggctgg atcacctcct ttctagaga

1549

<210> 1332

<211> 1278

<212> DNA

<213> Neisseria genomosp. P2 oral clone MB5_P15

<400> 1332

attgaacgct ggcggcatgc tttacacatg caagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta

60

acatattgga acgtaccgag tagtggggga taactaatcg aaagattagc taataccgca

120

tacggaaaga cgctatttga gcggccaata tcggattagc tagttggtgg ggtaaaggcc

180

taccaaggcg acgatccgta gcgggtctga gaggacgatc cgccgcattg ggactgagac

240

acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt ggggaatttt ggacaatggg ggcaaccctg

300

atccagccat gccgcgtgtc tgaagaaggc cttcgggttg taaaggactt ttgctaggga

360

agatgacggt acctaaagaa taagcaccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

420

gtagggtgcg agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gagcgcagac ggtttgtcaa

480

gcaggatgtg aaatccccga gctcaacttg ggaactgcgt tctgaactgg caggctagag

540

tatgtcagag gggggtagaa ttccacgtgt agcagtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa

600

taccgatggc gaaggcagcc ccctggggta actgacgttc atgctcgaaa gcgtgggtag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccctaaacg atgtcaatta gctgttgggc

720

gcttagtagc gaagctaacg cgtgaaattg accgcctggg gagtacggtc gcaagattaa

780

aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggat gatgtggatt aattcgatgc

840

aacgcgaaga accttacctg gtcttgacat gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtcat tagttgccat

960

catgggcact ctaatgagac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1020

tcctcatggc ccttatgacc agggcttcac acgtcataca atggttggca gagggtagcc

1080

aaatcgcgag atggagccaa tcccagccaa tcgtagtccg gatgcactct gcaactcgag

1140

tgcagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcag gtcagcatac tgcggtgaat acgttcccgg

1200

gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtggggga taccagaagt aggtggctag

1260

gccgcttacc acggtatg

1278

<210> 1333

<211> 1553

<212> DNA

<213> Neisseria gonorrhoeae

<400> 1333

gattgaacat aagagtttga tcctggctca gattgaacgc tggcggcatg ctttacacat

60

gcaagtcgga cggcagcaca gggaagcttg cttctcgggt ggcgagtggc gaacgggtga

120

gtaacatatc ggaacgtacc gggtagcggg ggataactga tcgaaagatc agctaatacc

180

gcatacgtct tgagagggaa agcaggggac cttcgggcct tgcgctatcc gagcggccga

240

tatctgatta gctggttggc ggggtaaagg cccaccaagg cgacgatcag tagcgggtct

300

gagaggatga tccgccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca

360

gtggggaatt ttggacaatg ggcgcaagcc tgatccagcc atgccgcgtg tctgaagaag

420

gccttcgggt tgtaaaggac ttttgtcagg gaagaaaagg ccgttgccaa tatcggcggc

480

cgatgacggt acctgaagaa taagcaccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

540

gtagggtgcg agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gggcgcagac ggttacttaa

600

gcaggatgtg aaatccccgg gctcaacccg ggaactgcgt tctgaactgg gtgactcgag

660

tgtgtcagag ggaggtggaa ttccacgtgt agcagtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa

720

taccgatggc gaaggcagcc tcctgggata acactgacgt tcatgtccga aagcgtgggt

780

agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccctaaa cgatgtcaat tagctgttgg

840

gcaacttgat tgcttggtag cgtagctaac gcgtgaaatt gaccgcctgg ggagtacggt

900

cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga tgatgtggat

960

taattcgatg caacgcgaag aaccttacct ggttttgaca tgtgcggaat cctccggaga

1020

cggaggagtg ccttcgggag ccgtaacaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc

1080

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gtcattagtt gccatcattc

1140

ggttgggcac tctaatgaga ctgccggtga caagccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1200

gtcctcatgg cccttatgac cagggcttca cacgtcatac aatggtcggt acagagggta

1260

gccaagccgc gaggcggagc caatctcaca aaaccgatcg tagtccggat tgcactctgc

1320

aactcgagtg catgaagtcg gaatcgctag taatcgcagg tcagcatact gcggtgaata

1380

cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggggat accagaagta

1440

ggtagggtaa ccgcaaggag cccgcttacc acggtatgct tcatgactgg ggtgaagtcg

1500

taacaaggta gccgtagggg aacctgcggc tggatcacct cctttctaga gaa

1553

<210> 1334

<211> 1549

<212> DNA

<213> Neisseria lactamica

<400> 1334

tgaacataag agtttgatcc tggctcagat tgaacgctgg cggcatgctt tacacatgca

60

agtcggacgg cagcggggta gtgcttgcac tactgccggc gagtggcgaa cgggtgagta

120

acatatcgga acgtaccggg cagtggggga taactgatcg aaagatcagc taataccgca

180

tattttctga ggaagaaagc aggggacctt cgggccttgc gctatccgag cggccgatat

240

ctgattagct ggttggcggg gtaaaggccc accaaggcga cgatcagtag cgggtctgag

300

aggacgatcc gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

360

gggaattttg gacaatgggc gcaagcctga tccagccatg ccgcgtgtct gaagaaggcc

420

ttcgggttgt aaaggacttt tgtcggggaa gaaaaggtcg gggttaatac cctcggctga

480

tgacggtacc cgaagaataa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

gggtgcgagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcggg cgcagacggt tacttaagca

600

ggatgtgaaa tccccgggct caacccggga attgcgttct gaactgggtg gctagagtgt

660

gtcagaggga ggtagaattc cacgtgtagc agtgaaatgc gtagagatgt ggaggaatac

720

cgatggcgaa ggcagcctcc tgggataaca ctgacgttca tgcccgaaag cgtgggtagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccctaaacga tgtcgattag ctgttgggca

840

gcctgactgc ttggtagcga agctaacgcg tgaaatcgac cgcctgggga gtacggtcgc

900

aagattaaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggatga tgtggattaa

960

ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacccggt tttgacatgt acggaatcct ccggagacgg

1020

gggagtgcct tcgggagccg taacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1080

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc attagttgcc atcattcagt

1140

tgggcactct aatgagactg ccggtgacaa gccggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

ctcatggccc ttatgaccgg ggcttcacac gtcatacaat ggtcggtaca gagggtagcc

1260

aagccgcgag gcggagccaa tctcacaaaa ccgatcgtag tccggattgc actctgcaac

1320

tcgagtgcat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcaggtca gcatactgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggggatacc agaagcaggt

1440

aggctaaccg caaggaggcc gcttgccacg gtatgcttca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtagcc gtaggggaac ctgcggctgg atcacctcct ttctagaga

1549

<210> 1335

<211> 1529

<212> DNA

<213> Neisseria macacae

<400> 1335

agagtttgat cctggctcag attgaacgct ggcggcatgc tttacacatg caagtcggac

60

ggcagcacag agaagcttgc ttcttgggtg gcgagtggcg aacgggtgag taacatatcg

120

gaacgtaccg agcagtgggg gataactaat cgaaagatta gctaataccg catatattct

180

gaggaagaaa gcaggggacc atttggcctt gcgctgtttg agcggccgat atctgattag

240

ctagttggtg gggtaaaggc ctaccaaggc gacgatcagt agcgggtctg agaggatgat

300

ccgccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaattt

360

tggacaatgg gcgcaagcct gatccagcca tgccgcgtgt ctgaagaagg ccttcgggtt

420

gtaaaggact tttgtcaggg aagaaaaggg cggggttaat acccctgtct gatgacggta

480

cctgaagaat aagcaccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcga

540

gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg ggcgcagacg gttacttaag caggatgtga

600

aatccccggg ctcaacctgg gaactgcgtt ctgaactggg tgactagagt gtgtcagagg

660

gaggtagaat tccacgtgta gcagtgaaat gcgtagagat gtggaggaat accgatggcg

720

aaggcagcct cctgggataa cactgacgtt catgcccgaa agcgtgggta gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgccctaaac gatgtcgatt agctgttggg cagcatgact

840

gcttagtagc gaagctaacg cgtgaaatcg accgcctggg gagtacggtc gcaagattaa

900

aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggat gatgtggatt aattcgatgc

960

aacgcgaaga accttacctg gtcttgacat gtacggaacc ctccagagac ggaggggtgc

1020

cttcgggagc cgtaacacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg tcattagttg ccatcattaa gttgggcact

1140

ctaatgagac tgccggtgac aagccggagg aaggtgggga tgacgtcaag tcctcatggc

1200

ccttatgacc agggcttcac acgtcataca atggtcggta cagagggtag ccaagccgcg

1260

aggtggagcc aatctcacaa aaccgatcgt agtccggatt gcactctgca actcgagtgc

1320

atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcaggt cagcatactg cggtgaatac gttcccgggt

1380

cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggggata ccagaagtag gtagggtaac

1440

cgcaaggagc ccgcttacca cggtatgctt catgactggg gtgaagtcgt aacaaggtag

1500

ccgtagggga acctgcggct ggatcacct

1529

<210> 1336

<211> 1549

<212> DNA

<213> Neisseria meningitidis

<400> 1336

tgaacataag agtttgatcc tggctcagat tgaacgctgg cggcatgctt tacacatgca

60

agtcggacgg cagcacagag aagcttgctt ctcgggtggc gagtggcgaa cgggtgagta

120

acatatcgga acgtaccgag tagtggggga taactgatcg aaagatcagc taataccgca

180

tacgtcttga gagagaaagc aggggacctt cgggccttgc gctattcgag cggccgatat

240

ctgattagct agttggtggg gtaaaggcct accaaggcga cgatcagtag cgggtctgag

300

aggatgatcc gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

360

gggaattttg gacaatgggc gcaagcctga tccagccatg ccgcgtgtct gaagaaggcc

420

ttcgggttgt aaaggacttt tgtcagggaa gaaaaggctg ttgctaatat cagcggctga

480

tgacggtacc tgaagaataa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

gggtgcgagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcggg cgcagacggt tacttaagca

600

ggatgtgaaa tccccgggct caacccggga actgcgttct gaactgggtg actcgagtgt

660

gtcagaggga ggtagaattc cacgtgtagc agtgaaatgc gtagagatgt ggaggaatac

720

cgatggcgaa ggcagcctcc tgggacaaca ctgacgttca tgcccgaaag cgtgggtagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccctaaacga tgtcaattag ctgttgggca

840

acctgattgc ttggtagcgt agctaacgcg tgaaattgac cgcctgggga gtacggtcgc

900

aagattaaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggatga tgtggattaa

960

ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggt cttgacatgt acggaatcct ccggagacgg

1020

aggagtgcct tcgggagccg taacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1080

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc attagttgcc atcattcagt

1140

tgggcactct aatgagactg ccggtgacaa gccggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

ctcatggccc ttatgaccag ggcttcacac gtcatacaat ggtcggtaca gagggtagcc

1260

aagccgcgag gcggagccaa tctcacaaaa ccgatcgtag tccggattgc actctgcaac

1320

tcgagtgcat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcaggtca gcatactgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggggatacc agaagtaggt

1440

aggataacca caaggagtcc gcttaccacg gtatgcttca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtagcc gtaggggaac ctgcggctgg atcacctcct ttctagaga

1549

<210> 1337

<211> 1547

<212> DNA

<213> Neisseria mucosa

<400> 1337

aacataagag tttgatcctg gctcagattg aacgctggcg gcatgcttta cacatgcaag

60

tcggacggca gcacagagaa gcttgcttct tgggtggcga gtggcgaacg ggtgagtaac

120

atatcggaac gtaccgagca gtgggggata actaatcgaa agattagcta ataccgcata

180

tattctgagg aagaaagcag gggaccattt ggccttgcgc tgtttgagcg gccgatatct

240

gattagctag ttggtggggt aaaggcctac caaggcgacg atcagtagcg ggtctgagag

300

gatgatccgc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaattttgga caatgggcgc aagcctgatc cagccatgcc gcgtgtctga agaaggcctt

420

cgggttgtaa aggacttttg tcagggaaga aaaggatagg gttaataccc ctgtctgatg

480

acggtacctg aagaataagc accggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg

540

gtgcgagcgt taatcggaat tactgggcgt aaagcgggcg cagacggtta cttaagcagg

600

atgtgaaatc cccgggctca acctgggaac tgcgttctga actgggtgac tagagtgtgt

660

cagagggagg tagaattcca cgtgtagcag tgaaatgcgt agagatgtgg aggaataccg

720

atggcgaagg cagcctcctg ggataacact gacgttcatg cccgaaagcg tgggtagcaa

780

acaggattag ataccctggt agtccacgcc ctaaacgatg tcgattagct gttgggcagc

840

ttgactgctt agtagcgaag ctaacgcgtg aaatcgaccg cctggggagt acggtcgcaa

900

gattaaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggatgatg tggattaatt

960

cgatgcaacg cgaagaacct tacctggtct tgacatgtac ggaaccctcc agagacggag

1020

gggtgccttc gggagccgta acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1080

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtcat tagttgccat cattaagttg

1140

ggcactctaa tgagactgcc ggtgacaagc cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcct

1200

catggccctt atgaccaggg cttcacacgt catacaatgg tcggtacaga gggtagccaa

1260

gccgcgaggt ggagccaatc tcacaaaacc gatcgtagtc cggattgcac tctgcaactc

1320

gagtgcatga agtcggaatc gctagtaatc gcaggtcagc atactgcggt gaatacgttc

1380

ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtgg gggataccag aagtaggtag

1440

ggtaaccgca aggagcccgc ttaccacggt atgcttcatg actggggtga agtcgtaaca

1500

aggtagccgt aggggaacct gcggctggat cacctccttt ctagaga

1547

<210> 1338

<211> 1352

<212> DNA

<213> Neisseria pharyngis

<400> 1338

cacagagaag cttgcttctt gggtggcgag tggcgaacgg gtgagtaaca tatcggaacg

60

taccgagcag tgggggataa ctaatcgaaa gattagctaa taccgcatat attctgagga

120

agaaagcagg ggaccatttg gccttgcgct gtttgagcgg ccgatatctg attagctggt

180

tggtggggta aaggcctacc aaggcgacga tcagtagcgg gtctgagagg atgatccgcc

240

acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aattttggac

300

aatgggcgca agcctgatcc agccatgccg cgtgtctgaa gaaggccttc gggttgtaaa

360

ggacttttgt cagggaagaa aaggacaggg ttaatacccc tgtctgatga cggtacctga

420

agaataagca ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg tgcgagcgtt

480

aatcggaatt actgggcgta aagcgggcgc agacggttac ttaagcagga tgtgaaatcc

540

ccgggctcaa cctgggaact gcgttctgaa ctgggtgact agagtgtgtc agagggaggt

600

agaattccac gtgtagcagt gaaatgcgta gagatgtgga ggaataccga tggcgaaggc

660

agcctcctgg gataacactg acgttcatgc ccgaaagcgt gggtagcaaa caggattaga

720

taccctggta gtccacgccc taaacgatgt cgattagctg ttgggcagct tgactgctta

780

gtagcgaagc taacgcgtga aatcgaccgc ctggggagta cggtcgcaag attaaaactc

840

aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggatgatgt ggattaattc gatgcaacgc

900

gaagaacctt acctggtctt gacatgtacg gaaccctcca gagacggagg ggtgccttcg

960

ggagccgtaa cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1020

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcatt agttgccatc attaagttgg gcactctaat

1080

gagactgccg gtgacaagcc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcctc atggccctta

1140

tgaccagggc ttcacacgtc atacaatggt cggtacagag ggtagccaag ccgcgaggtg

1200

gagccaatct cacaaaaccg atcgtagtcc ggattgcact ctgcaactcg agtgcatgaa

1260

gtcggaatcg ctagtaatcg caggtcagca tactgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt

1320

acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg gg

1352

<210> 1339

<211> 1545

<212> DNA

<213> Neisseria polysaccharea

<400> 1339

ttgaacataa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggcatgct ttacacatgc

60

aagtcggacg gcagcacaga gaagcttgct tcttgggtgg cgagtggcga acgggtgagt

120

aacatatcgg aacgtaccga gtagtggggg ataactgatc gaaagatcag ctaataccgc

180

atacgtcttg agagggaaag caggggacct tcggaccttg cgctattcga gcggccgata

240

tctgattagc tagttggtgg ggtaaaggcc taccaaggcg acgatcagta gcgggtctga

300

gaggatgatc cgccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatttt ggacaatggg cgcaagcctg atccagccat gccgcgtgtc tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaaggactt ttgtcaggga agaaaaggct gttgctaata tcagcggctg

480

atgacggtac ctgaagaata agcaccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

agggtgcgag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgg gcgcagacgg ttacttaagc

600

aggatgtgaa atccccgggc tcaacccggg aactgcgttc tgaactgggt gactcgagtg

660

tgtcagaggg aggtagaatt ccacgtgtag cagtgaaatg cgtagagatg tggaggaata

720

ccgatggcga aggcagcctc ctgggataac actgacgttc atgcccgaaa gcgtgggtag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccctaaacg atgtcaatta gctgttgggc

840

aacttgattg cttggtagcg tagctaacgc gtgaaattga ccgcctgggg agtacggtcg

900

caagattaaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggatg atgtggatta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatg tacggaatcc tccagagacg

1020

gaggagtgcc ttcgggagcc gtaacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt cattagttgc catcattcgg

1140

ttgggcactc taatgagact gccggtgaca agccggagga aggtggggat gacgtcaagt

1200

cctcatggcc cttatgacca gggcttcaca cgtcatacaa tggtcggtac agagggtagc

1260

caagccgcga ggtggagcca atctcacaaa accgatcgta gtccggattg cactctgcaa

1320

ctcgagtgca tgaagtcgga atcgctagta atcgcaggtc agcatactgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggggatac cagaagtggg

1440

taggataacc gcaaggggtc cgcttaccac ggtatgcttc atgactgggg tgaagtcgta

1500

acaaggtagc cgtaggggaa cctgcggctg gatcacctcc tttct

1545

<210> 1340

<211> 1549

<212> DNA

<213> Neisseria sicca

<400> 1340

tgaacataag agtttgatcc tggctcagat tgaacgctgg cggcatgctt tacacatgca

60

agtcggacgg cagcacagag aagcttgctt cttgggtggc gagtggcgaa cgggtgagta

120

acatatcgga acgtaccgag cagtggggga taactaatcg aaagattagc taataccgca

180

tatcttctga ggaagaaagc aggggaccat ttggccttgc gctgtttgag cggccgatat

240

ctgattagct agttggtggg gtaaaggcct accaaggcga cgatcagtag cgggtctgag

300

aggatgatcc gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

360

gggaattttg gacaatgggc gcaagcctga tccagccatg ccgcgtgtct gaagaaggcc

420

ttcgggttgt aaaggacttt tgtcagggaa gaaaagggcg gggttaatac ccctgtctga

480

tgacggtacc tgaagaataa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

gggtgcgagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcggg cgcagacggt tacttaagca

600

ggatgtgaaa tccccgggct caacttggga actgcgttct gaactgggtg actagagtgt

660

gtcagaggga ggtagaattc cacgtgtagc agtgaaatgc gtagagatgt ggaggaatac

720

cgatggcgaa ggcagcctcc tgggataaca ctgacgttca tgcccgaaag cgtgggtagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccctaaacga tgtcgattag ctgttgggca

840

gcatgactgc ttagtagcga agctaacgcg tgaaatcgac cgcctgggga gtacggtcgc

900

aagattaaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggatga tgtggattaa

960

ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggt cttgacatgt acggaaccct ccagagacgg

1020

aggggtgcct tcgggagccg taacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1080

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc attagttgcc atcattaagt

1140

tgggcactct aatgagactg ccggtgacaa gccggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

ctcatggccc ttatgaccag ggcttcacac gtcatacaat ggtcggtaca gagggtagcc

1260

aagccgcgag gtggagccaa tctcacaaaa ccgatcgtag tccggattgc actctgcaac

1320

tcgagtgcat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcaggtca gcatactgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggggatacc agaagtaggt

1440

agggtaaccg caaggagccc gcttaccacg gtatgcttca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtagcc gtaggggaac ctgcggctgg atcacctcct ttctagaga

1549

<210> 1341

<211> 1254

<212> DNA

<213> Neisseria sp. KEM232

<400> 1341

ctttacacat gcaagtcgga cgagtggcga acgggtgagt aatgtattgg aacgtaccga

60

gtaatggggg ataaccaatc gaaagattgg ctaataccgc atacggaaag gcgttattcg

120

agcggccaat atctgattag ctggttggtg gggtaaaggc ctaccaaggc gacgatcagt

180

agcgggtctg agaggatgat ccgccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg

240

gaggcagcag tggggaattt tggacaatgg gcgcaagcct gatccagcca tgccgcgtgt

300

ctgaagaagg ccttcgggtt gtaaaggact tttgtcaggg aagatgacgg tacctgaaga

360

ataagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc gagcgttaat

420

cggaattact gggcgtaaag cgggcgcaga cggtttgtta agcaggatgt gaaatccccg

480

ggctcaaccc gggaactgcg ttctgaactg gcaggctaga gtgtgtcaga ggggggtaga

540

attccacgtg tagcagtgaa atgcgtagag atgtggagga ataccgatgg cgaaggcagc

600

cccctgggat aactgacgtt catgcccgaa agcgtgggta gcaaacagga ttagataccc

660

tggtagtcca cgccctaaac gatgtcgatt agctgttggg cgcttagtag cgtagctaac

720

gcgtgaaatc gaccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg

780

ggacccgcac aagcggtgga tgatgtggat taattcgatg caacgcgaag aaccttacct

840

ggtcttgaca tgcacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt

900

taagtcccgc aacgagcgca acccttgtca ttagttgcca tcatgggcac tctaatgaga

960

ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcctcatgg cccttatgac

1020

cagggcttca cacgtcatac aatggtcggc agagggtagc caagccgcga ggcggagcca

1080

atcccagccg atcgtagtcc ggatgcactc tgcaactcga gtgcagaagt cggaatcgct

1140

agtaatcgca ggtcagcata ctgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg

1200

tcacaccatg ggagtggggg ataccagaag caggtggcta ggccgcttgc cacg

1254

<210> 1342

<211> 1406

<212> DNA

<213> Neisseria sp. SMC-A9199

<400> 1342

gcaagtcgga cggcagcgag gaagtgcttg cacttctgtc ggcgagtggc gaacgggtga

60

gtaacatatc ggaacgtacc gagtagtggg ggataactaa tcgaaagatt agctaatacc

120

gcatacgtct tgagagagaa agcaggggac cttcgggcct tgcgctattc gagcggccga

180

tatctgatta gctagttggt ggggtaaagg cccaccaagg cgacgatcag tagcgggtct

240

gagaggatga tccgccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca

300

gtggggaatt ttggacaatg ggcgcaagcc tgatccagcc atgccgcgtg tatgaagaag

360

gccttcgggt tgtaaagtac ttttgtcagg gaagaaaagg ccggtgttaa taccattggc

420

tcatgacggt acctgaagaa taagcaccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

480

gtagggtgcg agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gagcgcagac ggtttgttaa

540

gcaggatgtg aaatccccgg gctcaacctg ggaactgcgt tctgaactgg caagctagag

600

tgtgtcagag gggggtagaa ttccacgtgt agcagtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa

660

taccgatggc gaaggcagcc ccctgggata acactgacgt tcatgctcga aagcgtgggt

720

agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccctaaa cgatgtcaat tagctgttgg

780

gcaacttgat tgcttagtag cgtagctaac gcgtgaaatt gaccgcctgg ggagtacggt

840

cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga tgatgtggat

900

taattcgatg caacgcgaag aaccttacct ggtcttgaca tgtacggaat cctccagaga

960

cggaggagtg ccttcgggag ccgtaacaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc

1020

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gtcattagtt gccatcattc

1080

agttgggcac tctaatgaga ctgccggtga caagccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1140

gtcctcatgg cccttatgac cagggcttca cacgtcatac aatggtcggt acagagggta

1200

gccaagccgc gaggtggagc caatctcaca aaaccgatcg tagtccggat tgcactctgc

1260

aactcgagtg catgaagtcg gaatcgctag taatcgcagg tcagcatact gcggtgaata

1320

cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggggat accagaagta

1380

ggtaggataa ccttcgggag tccgct

1406

<210> 1343

<211> 1363

<212> DNA

<213> Neisseria sp. TM10_1

<220>

<221> modified_base

<222> (1352)..(1352)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1343

cacagagaag cttgcttctt gggtggcgag tggcgaacgg gtgagtaaca tatcggaacg

60

taccgagcag tgggggataa ctaatcgaaa gattagctaa taccgcatat cttctgagga

120

agaaagcagg ggaccatttg gccttgcgct gtttgagcgg ccgatatctg attagctagt

180

tggtggggta aaggcctacc aaggcgacga tcagtagcgg gtctgagagg atgatccgcc

240

acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aattttggac

300

aatgggcgca agcctgatcc agccatgccg cgtgtctgaa gaaggccttc gggttgtaaa

360

ggacttttgt cagggaagaa aagggcgggg ttaatacccc tgtctgatga cggtacctga

420

agaataagca ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg tgcgagcgtt

480

aatcggaatt actgggcgta aagcgggcgc agacggttac ttaagcagga tgtgaaatcc

540

ccgggctcaa cctgggaact gcgttctgaa ctgggtgact agagtgtgtc agagggaggt

600

agaattccac gtgtagcagt gaaatgcgta gagatgtgga ggaataccga tggcgaaggc

660

agcctcctgg gataacactg acgttcatgc ccgaaagcgt gggtagcaaa caggattaga

720

taccctggta gtccacgccc taaacgatgt cgattagctg ttgggcagca tgactgctta

780

gtagcgaagc taacgcgtga aatcgaccgc ctggggagta cggtcgcaag attaaaactc

840

aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggatgatgt ggattaattc gatgcaacgc

900

gaagaacctt acctggtctt gacatgtacg gaatcctcca gagacggagg agtgccttcg

960

ggagccgtaa cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1020

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcatt agttgccatc attaagttgg gcactctaat

1080

gagactgccg gtgacaagcc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcctc atggccctta

1140

tgaccagggc ttcacacgtc atacaatggt cggtacagag ggtagccaag ccgcgaggcg

1200

gagccaatct cacaaaaccg atcgtagtcc ggattgcact ctgcaactcg agtgcatgaa

1260

gtcggaatcg ctagtaatcg caggtcagca tactgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt

1320

acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg gngatacaga agt

1363

<210> 1344

<211> 1499

<212> DNA

<213> Neisseria sp. oral clone AP132

<400> 1344

agagtttgat atggctcaga ttgaacgctg gcggcatgct ttacacatgc aagtcggacg

60

gcagcgggga gtgcttgcac tctgccggcg agtggcgaac gggtgagtaa tgcatcggaa

120

cgtaccgagt aatgggggat aactgtccga aaggacagct aataccgcat acgccctgag

180

ggggaaagcg ggggatctta ggacctcgcg ttattcgagc ggccgatgtc tgattagcta

240

gttggtgggg taaaggccta ccaaggcgac gatcagtagc gggtctgaga ggacgatccg

300

ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaattttgg

360

acaatgggcg caagcctgat ccagccatgc cgcgtgtctg aagaaggcct tcgggttgta

420

aaggactttt gtcagggaag aaaaggcggg tgctaatacc atctgctgat gacggtacct

480

gaagaataag caccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggtgcgagcg

540

ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgggc gcagacggtt acttaagcag gatgtgaaat

600

ccccgggctc aacctgggaa ctgcgttctg aactgggtga ctagagtgtg tcagagggag

660

gtagaattcc acgtgtagca gtgaaatgcg tagagatgtg gaggaatacc gatggcgaag

720

gcagcctcct gggataacgc tgacgttcat gcccgaaagc gtgggtagca aacaagatta

780

gataccctgg tagtccacgc cctaaacgat gtcgattagc tgctgggcag cttgactgct

840

tagtagcgaa gctaacgcgt gaaatcgacc gcctggggag tacggtcgca agattaaaac

900

tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggatgat gtggattaat tcgatgcaac

960

gcgaagaacc ttacctggtc ttgacatgta cggaaccctc cagagacgga ggggtgcctt

1020

cgggagccgt aacacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt

1080

taagtcccgc aacgagcgca acccttgtca ttagttgcca tcattaagtt gggcactcta

1140

atgagactgc cggtgacaag ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtcc tcatggccct

1200

tatgaccagg gcttcacacg tcatacaatg gtcggtacag agggtagcca agccgcgagg

1260

tggagccaat ctcacaaaac cgatcgtagt ccggattgca ctctgcaact cgagtgcgtg

1320

aagtcggaat cgctagtaat cgcaggtcag catactgcgg tgaatacgtt cccgggtctt

1380

gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggggatacca gaagtaggta gggtaaccgc

1440

aaggagcccg cttaccacgg tatgcttcat gactggggtg aagtcgtaac aagggtarc

1499

<210> 1345

<211> 1363

<212> DNA

<213> Neisseria sp. oral clone JC012

<400> 1345

gagtttgatt ctggctcaga ttgaacgcgg gcgccatgct ttacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcgaac gggtgagtaa catattggaa cgtaccgagt aaagggggat aactatccga

120

aaggatagct aataccgcat acggaaagac gttattcgag cggccaatat ctgattagct

180

agttggtggg gtaaaggcct accaaggcga cgatcagtag cgggtctgag aggacgatcc

240

gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaattttg

300

gacaatgggc gcaagcctga tccagccatg ccgtgtgtct gaagaaggcc ttcgggttgt

360

aaaggacttt tgttagggaa gatgacggta cctaaagaat aagcaccggc taactacgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcga gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg

480

agcgcagacg gtttgttaag caggatgtga aatccccagg ctcaacttgg gaactgcgtt

540

ctgaactggc aagctagagt gtgtcagagg ggggtagaat tccacgtgta gcagtgaaat

600

gcgtagagat gtggaggaat accgatggcg aaggcagccc cctgggataa ctgacgttca

660

tgctcgaaag cgtgggtagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccctaaacga

720

tgtcaattag ctgttgggcg cttagtagcg tagctaacgc gtgaaattga ccgcctgggg

780

agtacggtcg caagattaaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggatg

840

atgtggatta attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatg cacaggtgct

900

gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccttgtcatt agttgccatc atgggcactc taatgagact gccggtgaca aaccggagga

1020

aggtggggat gacgtcaagt cctcatggcc cttatgacca gggcttcaca cgtcatacaa

1080

tggtcggcag agggtcgcca agccgcgagg tggagccaat ctcacccgat cgtagtccgg

1140

atgcactctg caactcgagt gcagaagtcg gaatcgctag taatcgcagg tcagcatact

1200

gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggggat

1260

accagaagta ggtggctagg ccgcttacca cggtatgttt catgactggg gtgaagtcgt

1320

aacaaggtag ccgtagggga acctgcggct ggaacacctc ctt

1363

<210> 1346

<211> 1473

<212> DNA

<213> Neisseria sp. oral strain B33KA

<400> 1346

gattgaacgc tggcggcatg ctttacacat gcaagtcgga cggcagcaca gagaagcttg

60

cttcttgggt ggcgagtggc gaacgggtga gtaatgtatt ggaacgtacc gagtaatggg

120

ggataaccaa tcgaaagatt ggctaatacc gcatacgtcc tgagggggaa agcgggggat

180

cttcggacct cgcgttattc gagcggccaa tatctgatta gctggttggt ggggtaaagg

240

cctaccaagg cgacgatcag tagcgggtct gagaggatga tccgccacac tgggactgag

300

acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaatt ttggacaatg ggcgcaagcc

360

tgatccagcc atgccgcgtg tctgaagaag gccttcgggt tgtaaaggac ttttgtcagg

420

gaagaaaagg cttttgataa taccaggagc tgatgacggt acctgaagaa taagcaccgg

480

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgcg agcgttaatc ggaattactg

540

ggcgtaaagc gggcgcagac ggtttgttaa gcaggatgtg aaatccccgg gctcaacccg

600

ggaactgcgt tctgaactgg caggctagag tgtgtcagag gggggtagaa ttccacgtgt

660

agcagtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa taccgatggc gaaggcagcc ccctgggata

720

acactgacgt tcatgcccga aagcgtgggt agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

acgccctaaa cgatgtcgat tagctgttgg gcagcttgac tgcttagtag cgtagctaac

840

gcgtgaaatc gaccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg

900

ggacccgcac aagcggtgga tgatgtggat taattcgatg caacgcgaag aaccttacct

960

ggtcttgaca tgtacggaat cctccagaga cggaggagtg ccttcgggag ccgtaacaca

1020

ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1080

cgcaaccctt gtcattagtt gccatcatta agttgggcac tctaatgaga ctgccggtga

1140

caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcctcatgg cccttatgac cagggcttca

1200

cacgtcatac aatggtcggt acagagggta gccaagccgc gaggcggagc caatcccaga

1260

aaaccgatcg tagtccggat tgcactctgc aactcgagtg catgaagtcg gaatcgctag

1320

taatcgcagg tcagcatact gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc

1380

acaccatggg agtgggggat accagaagca ggtaggctaa ccgcaaggag gccgcttgcc

1440

acggtatgct tcatgactgg ggtgaagtcg taa

1473

<210> 1347

<211> 1545

<212> DNA

<213> Neisseria sp. oral taxon 014

<400> 1347

ttgaacataa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggcatgct ttacacatgc

60

aagtcggacg gcagcggggt agtgcttgca ctactgccgg cgagtggcga acgggtgagt

120

aacatatcgg aacgtaccga gcagtggggg ataactaatc gaaagattag ctaataccgc

180

atatattctg aggaagaaag caggggacct ttgggccttg cgctgtttga gcggccgata

240

tctgattagc tggttggtgg ggtaaaggcc taccaaggcg acgatcagta gcgggtctga

300

gaggatgatc cgccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatttt ggacaatggg ggcaaccctg atccagccat gccgcgtgtc tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaaggactt ttgtccggga agaaaagcgc gatgttaata ccattgcgtg

480

ctgacggtac cggaagaata agcaccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

agggtgcgag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgg gcgcagacgg ttacttaagc

600

aggatgtgaa atccccgggc tcaacctggg aattgcgttc tgaactgggt ggctagagtg

660

tgtcagaggg gggtagaatt ccacgtgtag cagtgaaatg cgtagagatg tggaggaata

720

ccgatggcga aggcagcccc ctgggatagc actgacgttc atgcccgaaa gcgtgggtag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccctaaacg atgtcgatta gctgttgggc

840

aacttgattg cttggtagcg aagctaacgc gtgaaatcga ccgcctgggg agtacggtcg

900

caagattaaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggatg atgtggatta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatg tacggaacct tccggagacg

1020

gaagggtgcc ttcgggagcc gtaacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt cattagttgc catcatttgg

1140

ttgggcactc taatgagact gccggtgaca agccggagga aggtggggat gacgtcaagt

1200

cctcatggcc cttatgacca gggcttcaca cgtcatacaa tggtcggtac agagggtagc

1260

caagccgcga ggtggagcca atcccaaaaa accgatcgta gtccggattg cactctgcaa

1320

ctcgagtgca tgaagtcgga atcgctagta atcgcaggtc agcatactgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggggatac cagaagcagg

1440

taggctaacc gcaagggggc cgcttgccac ggtatgcttc atgactgggg tgaagtcgta

1500

acaaggtagc cgtaggggaa cctgcggctg gatcacctcc tttct

1545

<210> 1348

<211> 1549

<212> DNA

<213> Neisseria subflava

<400> 1348

tgaacataag agtttgatcc tggctcagat tgaacgctgg cggcatgctt tacacatgca

60

agtcggacgg cagcacagag aagcttgctt cttgggtggc gagtggcgaa cgggtgagta

120

atatatcgga acgtaccgag taatggggga taactaatcg aaagattagc taataccgca

180

tattctctga ggaggaaagc aggggacctt cgggccttgc gttattcgag cggccgatat

240

ctgattagct agttggtggg gtaaaggcct accaaggcga cgatcagtag cgggtctgag

300

aggatgatcc gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

360

gggaattttg gacaatgggc gcaagcctga tccagccatg ccgcgtgtct gaagaaggcc

420

ttcgggttgt aaaggacttt tgtcagggaa gaaaaggctg ttgctaatac cgacagctga

480

tgacggtacc tgaagaataa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

gggtgcgagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgag cgcagacggt tacttaagca

600

ggatgtgaaa tccccgggct caacctggga actgcgttct gaactgggtg actagagtgt

660

gtcagaggga ggtagaattc cacgtgtagc agtgaaatgc gtagagatgt ggaggaatac

720

cgatggcgaa ggcagcctcc tgggataaca ctgacgttca tgctcgaaag cgtgggtagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccctaaacga tgtcaattag ctgttgggca

840

acttgattgc ttagtagcgt agctaacgcg tgaaattgac cgcctgggga gtacggtcgc

900

aagattaaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggatga tgtggattaa

960

ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggt cttgacatgt acggaatcct ccagagacgg

1020

aggagtgcct tcgggaaccg taacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1080

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc attagttgcc atcatttagt

1140

tgggcactct aatgagactg ccggtgacaa gccggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

ctcatggccc ttatgaccag ggcttcacac gtcatacaat ggtcggtaca gagggtagcc

1260

aagccgcgag gtggagccaa tctcacaaaa ccgatcgtag tccggattgc actctgcaac

1320

tcgagtgcat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcaggtca gcatactgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggggatacc agaagtaggt

1440

agggtaaccg caaggagccc gcttaccacg gtatgcttca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtagcc gtaggggaac ctgcggctgg atcacctcct ttctagaga

1549

<210> 1349

<211> 1495

<212> DNA

<213> Neorickettsia risticii

<400> 1349

atttgagagt ttgatcctgg ctcagaacga acgctagcgg taggcttaac acatgcaagt

60

cgaacggaat cagggctgct tgcagccttg gtcccgtggc agacgggtgc gtaacgcgtg

120

ggaacttgcc tggtagtagg gaataaccag tggaaacatt gggcaacacc ctatacgccc

180

tgagggggaa aatttattgc tatcagatag gcccgcgtta gattagctag ttggtggggt

240

aatggcctac caaggcgacg atctatagct ggtctgagag gatgatcagc cacactggaa

300

ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtgag gaatattgga caatgggcga

360

aagcctgatc cagccatacc gcatgagtga tgaaggccct tgggttgtaa agctctttta

420

gtggggaaga taatgacggt acccacagaa gaagtcccgg ctaactccgt gccagcagcc

480

gcggtaatac ggagggggct agcgttgttc ggaattactg ggcgtaaagg gtgcgtaggc

540

ggtcccgtaa gttaggtgtg aaatccttgg gcttaaccca agaactgcat ttaaaactgt

600

gggactcgaa cgtgagagag ggcaatggaa tttttggtgt aggggtgaaa tccgtagata

660

tcaagaggaa cgtcaggggc gaaagcgatt gcctggatca cagttgacgc tgaggcacga

720

aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgctgtaaa cgatgagtgt

780

taaaagtggg ttattttatc tgctttgtag ctaacgcgtt aaacactccg cctggggact

840

acggtcgcaa gactaaaact caaaggaatt gacggggact cgcacaagcg gtggagtatg

900

tggtttaatt cgatgcaacg cgaaaaacct taccatacct tgacatgtgg attgtatccc

960

tctgaaggga gggagtcagt tcggctggat ccaacacagg tgttgcatgg ctgtcgtcag

1020

ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caaccctcat ccttagttgc

1080

cagcggttcg gccgggaact ttaaggaaac tgccagtgac aagctggagg aaggtgggga

1140

cgacgtcaag tcatcatggc ccttatggta tgggctacac acgtactaca atggcaacta

1200

caatgagcta gctacaccgt aaggtgacgc caatctctta aaggttgtct cagtacggat

1260

tgccttctgc aactcgaagg catgaagttg gaatcgctag taatcgcaga tcagcatgct

1320

gcggtgaata cgttctcggg tcttgtacac actgcccgtc aggccatggg agttcatctt

1380

actcgaagct agtgagctga ccgcaaggag gcagctatct acggtggggt gggtgactgg

1440

ggttaagtcg taacaaggta gccgtaggtg aacctgcggc tggattacct ccttt

1495

<210> 1350

<211> 1495

<212> DNA

<213> Neorickettsia sennetsu

<400> 1350

atttgagagt ttgatcctgg ctcagaacga acgctagcgg taggcttaac acatgcaagt

60

cgaacggaat caaagctgct tgcagccttg gtcccgtggc agacgggtgc gtaacgcgtg

120

ggaacttgcc tggtagtagg gaataaccag tggaaacatt gggcaacacc ctatacgccc

180

tgagggggaa aatttattgc tatcagatag gcccgcgtta gattagctag ttggtggggt

240

aatggcctac caaggcgacg atctatagct ggtctgagag gatgatcagc cacactggaa

300

ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtgag gaatattgga caatgggcga

360

aagcctgatc cagccatacc gcatgagtga tgaaggccct tgggttgtaa agctctttta

420

gtggggaaga tagtgacggt acccacagaa gaagtcccgg ctaactccgt gccagcagcc

480

gcggtaatac ggagggggct agcgttgttc ggaattactg ggcgtaaagg gtgcgtaggc

540

ggtcccgtaa gttaggtgtg aaatccttgg gcttaaccca ggaactgcat ttaaaactgc

600

gggactcgaa cgtgagagag ggcaatggaa tttttggtgt aggggtgaaa tccgtagata

660

tcaagaggaa cgtcaggggc gaaagcgatt gcctggatca cagttgacgc tgaggcacga

720

aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgctgtaaa cgatgagtgt

780

taaaagtggg ttattttatc tgctttgtag ctaacgcgtt aaacactccg cctggggact

840

acggtcgcaa gactaaaact caaaggaatt gacggggact cgcacaagcg gtggagtatg

900

tggtttaatt cgatgcaacg cgaaaaacct taccatacct tgacatgtgg atcgtatccc

960

tctgaaggga gggagtcagt tcggctggat ccaacacagg tgttgcatgg ctgtcgtcag

1020

ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caaccctcat ccttagttgc

1080

cagcggttcg gccgggaact ttaaggaaac tgccagtgac aagctggagg aaggtgggga

1140

cgacgtcaag tcatcatggc ccttatggta tgggctacac acgtactaca atggcaacta

1200

caatgggcta gctacaccgt aaggtgatgc aaatctccta aaagttgtct cagtacggat

1260

tgccttctgc aactcgaagg catgaagttg gaatcgctag taatcgcaga tcagcatgct

1320

gcggtgaata cgttctcggg tcttgtacac actgcccgtc aggccatggg agttcatctt

1380

actcgaagct agtgagctga ccgcaaggag gcagctatct acggtggggt gggtgactgg

1440

ggttaagtcg taacaaggta gccgtaggtg aacctgcggc tggattacct ccttt

1495

<210> 1351

<211> 1530

<212> DNA

<213> Nocardia brasiliensis

<400> 1351

tcttcaacgg agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg

60

caagtcgagc ggtaaggccc ttcggggtac acgagcggcg aacgggtgag taacacgtgg

120

gtgatctgcc tcgcacttcg ggataagcct gggaaactgg gtctaatacc ggatatgacc

180

tttcagtgca tgctgttggg tggaaagatt tatcggtgcg agatgggccc gcggcctatc

240

agcttgttgg cggggtaacg gcccaccaag gcgacgacgg gtagccgacc tgagagggtg

300

accggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

360

attgcacaat gggcggaagc ctgatgcagc gacgccgcgt gagggatgac ggccttcggg

420

ttgtaaacct ctttcgacag ggacgaagcg caagtgacgg tacctgtaga agaagcaccg

480

gccaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc gagcgttgtc cggaattact

540

gggcgtaaag agcttgtagg cggtttgtcg cgtcgtccgt gaaaacttgg ggctcaaccc

600

caagcttgcg ggcgatacgg gcagacttga gtacttcagg ggagactgga attcctggtg

660

tagcggtgaa atgcgcagat atcaggagga acaccggtgg cgaaggcggg tctctgggaa

720

gtaactgacg ctgagaagcg aaagcgtggg tagcgaacag gattagatac cctggtagtc

780

cacgccgtaa acggtgggta ctaggtgtgg gtttccttcc acgggatccg tgccgtagct

840

aacgcattaa gtaccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga

900

cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgtg gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta

960

cctgggtttg acatacaccg gaaacctgca gagatgtagg cccccttgtg gtcggtgtac

1020

aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1080

gcgcaaccct tgtcctgtgt tgccagcgga ttatgccggg gactcgcagg agactgccgg

1140

ggtcaactcg gaggaaggtg gggacgacgt caagtcatca tgccccttat gtccagggct

1200

tcacacatgc tacaatggcc ggtacagagg gctgcgatac cgtgaggtgg agcgaatccc

1260

ttaaagccgg tctcagttcg gatcggggtc tgcaactcga ccccgtgaag ttggagtcgc

1320

tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1380

cgtcacgtca tgaaagtcgg taacacccga agccggtggc ctaacccctt gtgggaggga

1440

gccgtcgaag gtgggattgg cgattgggac gaagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag

1500

gtgcggctgg atcacctcct ttctaaggag

1530

<210> 1352

<211> 1434

<212> DNA

<213> Nocardia cyriacigeorgica

<400> 1352

ttaacacatg caagtcgagc ggtaaggccc ttcggggtac acgagcggcg aacgggtgag

60

taacacgtgg gtgatctgcc tcgcactctg ggataagcct gggaaactgg gtctaatacc

120

ggatatgacc ttacatcgca tggtgtttgg tggaaagatt tatcggtgcg agatgggccc

180

gcggcctatc agcttgttgg tggggtaatg gcctaccaag gcgacgacgg gtagccggcc

240

tgagagggcg accggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

300

agtggggaat attgcacaat gggcgaaagc ctgatgcagc gacgccgcgt gagggatgac

360

ggccttcggg ttgtaaacct ctttcgacag ggacgaagcg caagtgacgg tacctgtaga

420

agaagcaccg gccaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc gagcgttgtc

480

cggaattact gggcgtaaag agcttgtagg cggcttgtcg cgtcgatcgt gaaaacttgg

540

ggctcaaccc caagcttgcg gtcgatacgg gcaggcttga gtacttcagg ggagactgga

600

attcctggtg tagcggtgaa atgcgcagat atcaggagga acaccggtgg cgaaggcggg

660

tctctgggaa gtaactgacg ctgagaagcg aaagcgtggg tagcgaacag gattagatac

720

cctggtagtc cacgccgtaa acggtgggta ctaggtgtgg gtttccttcc acgggatccg

780

tgccgtagct aacgcattaa gtaccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca

840

aaggaattga cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgtg gattaattcg atgcaacgcg

900

aagaacctta cctgggtttg acatacaccg gaaacctgca gagatgtagg cccccttgtg

960

gtcggtgtac aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1020

cccgcaacga gcgcaaccct tatcttatgt tgccagcgcg taatggcggg gactcgtgag

1080

agactgccgg ggtcaactcg gaggaaggtg gggacgacgt caagtcatca tgccccttat

1140

gtccagggct tcacacatgc tacaatggcc ggtacagagg gctgcgatac cgtgaggtgg

1200

agcgaatccc ttaaagccgg tctcagttcg gatcggggtc tgcaactcga ccccgtgaag

1260

ttggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1320

acacaccgcc cgtcacgtca tgaaagtcgg taacacccga agccggtggc ctaacccctt

1380

gtgggaggga gccgtcgaag gtgggatcgg cgattgggac gaagtcgtaa caag

1434

<210> 1353

<211> 1522

<212> DNA

<213> Nocardia farcinica

<400> 1353

cttcaacgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgagcg gtaaggccct tcggggtaca cgagcggcga acgggtgagt aacacgtggg

120

tgatctgccc tgtacttcgg gataagcctg ggaaactggg tctaataccg gatatgacct

180

tacatcgcat ggtgtttggt ggaaagattt atcggtacag gatgggcccg cggcctatca

240

gcttgttggt ggggtaatgg cctaccaagg cgacgacggg tagccggcct gagagggcga

300

ccggccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata

360

ttgcacaatg ggcgaaagcc tgatgcagcg acgccgcgtg agggatgacg gccttcgggt

420

tgtaaacctc tttcgacagg gacgaagcgc aagtgacggt acctgtagaa gaagcaccgg

480

ccaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgcg agcgttgtcc ggaattactg

540

ggcgtaaaga gcttgtaggc ggtttgtcgc gtcgtccgtg aaaacttggg gctcaactcc

600

aagcttgcgg gcgatacggg cagacttgag tactgcaggg gagactggaa ttcctggtgt

660

agcggtgaaa tgcgcagata tcaggaggaa caccggtggc gaaggcgggt ctctgggcag

720

taactgacgc tgagaagcga aagcgtgggt agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

acgccgtaaa cggtgggcgc taggtgtggg tttccttcca cgggatccgt gccgtagcta

840

acgcattaag cgccccgcct ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa aggaattgac

900

gggggcccgc acaagcggcg gagcatgtgg attaattcga tgcaacgcga agaaccttac

960

ctgggtttga catacaccgg aaacctgcag agatgtaggc ccccttgtgg tcggtgtaca

1020

ggtggtgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1080

cgcaaccttg tcctgtgttg ccagcgcgtt atggcgggga ctcgcaggag actgccgggg

1140

tcaactcgga ggaaggtggg gacgacgtca agtcatcatg ccccttatgt ccagggcttc

1200

acacatgcta caatggccgg tacagagggc tgcgataccg tgaggtggag cgaatccctt

1260

aaagccggtc tcagttcgga tcggggtctg caactcgacc ccgtgaagtt ggagtcgcta

1320

gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg

1380

tcacgtcatg aaagtcggta acacccgaag ccggtggcct aaccccttgt gggagggagc

1440

cgtcgaaggt gggatcggcg attgggacga agtcgtaaca aggtagccgt accggaaggt

1500

gcggctggat cacctccttt ct

1522

<210> 1354

<211> 1328

<212> DNA

<213> Nocardia puris

<400> 1354

aacacatgca agtcgagcga gcggcgaacg ggtgagtaac acgtgggtga tctgccctgc

60

actctgggat aagcctggga aactgggtct aataccggat atggaaagtc ggtgcaggat

120

gggcccgcgg cctatcagct tgttggtggg gtaatggcct accaaggcga cgacgggtag

180

ccggcctgag agggcgaccg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga

240

ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc ggaagcctga tgcagcgacg ccgcgtgagg

300

gatgacggcc ttcgggttgt aaacctcttt cgacagggac gatgacggta cctgtagaag

360

aagcaccggc caactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcga gcgttgtccg

420

gaattactgg gcgtaaagag cttgtaggcg gcttgtcgcg tcgatcgtga aaacttgggg

480

ctcaacccca agcttgcggt cgatacgggc aggcttgagt actgcagggg agactggaat

540

tcctggtgta gcggtgaaat gcgcagatat caggaggaac accggtggcg aaggcgggtc

600

tctgggcaga ctgacgctga gaagcgaaag cgtgggtagc gaacaggatt agataccctg

660

gtagtccacg ccgtaaacgg tgggcgctag gtgtgggttg atccgtgccg tagctaacgc

720

attaagcgcc ccgcctgggg agtacggccg caggctaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg

780

cccgcacaag cggcggagca tgtggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggg

840

tttgacatat acaggtggtg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

900

gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtcctgt gttgccagca attggggact cgcaggagac

960

tgccggggtc aactcggagg aaggtgggga cgacgtcaag tcatcatgcc ccttatgtcc

1020

agggcttcac acatgctaca atggccggca gagggctgcg ataccgtgag gtggagcgaa

1080

tcccttccgg tctcagttcg gacggggtct gcaactcgac cccggaagtt ggagtcgcta

1140

gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg

1200

tcacgtcatg aaagtcggta acacccgaag ccggtgccca gggagccgtc gaaggtggga

1260

tcggcgattg ggacgaagtc gtaacaaggt agccgtaccg gaaggtgcgg ctggatcacc

1320

tcctttct

1328

<210> 1355

<211> 1375

<212> DNA

<213> Nocardia sp. 01-Je-025

<400> 1355

cggtaaggcc cttcggggta cacgagcggc gaacgggtga gtaacacgtg ggtgatctgc

60

ctcgcacttc gggataagcc tgggaaactg ggtctaatac cggatatgac cgactagtgc

120

atgctggttg gtggaaagat ttatcggtgc gagatgggcc cgcggcctat cagcttgttg

180

gtgaggtaac ggctcaccaa ggcgacgacg ggtagccgac ctgagagggt gaccggccac

240

actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa

300

tgggcgaaag cctgatgcag cgacgccgcg tggaggatga cggccttcgg gttgtaaact

360

cctttcgaca gggacgaagc gaaagtgacg gtacctgtag aagaagcacc gggccaacta

420

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggt gcgagcgttg tccggaatta ctgggcgtaa

480

agagcttgta ggcggtctgt cgcgtcttct gtgaaaactt ggggctcaac cttaagcttg

540

caggcgatac gggcagacta gagtacttca ggggagactg gaattcctgg tgtagcggtg

600

aaatgcgcag atatcaggag gaacaccggt ggcgaaggcg ggtctctggg aagtaactga

660

cgctgagaag cgaaagcatg ggtagcaaac aggattagat accctggtag tccatgccgt

720

aaacggtggg tactaggtgt gggtttcctt ccacgggatc cgtgccgyag ctaacgcatt

780

aagtaccccg cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact caaagaaatt gacgggggcc

840

cgcacaagcg gcggagcatg tggattaatt cgatgcaacg cgaagaacct tacctgggtt

900

tgacatacac cggaaacctg cagagatgta ggcccccttg tggtcggtgt acaggtggtg

960

catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

1020

cttatcttat gttgccagcg cgtaatggcg gggactcgtg agagactgcc ggggtcaact

1080

cggaggaagg tggggacgac gtcaagtcat catgcccctt atgtccaggg cttcacacat

1140

gctacaatgg ccagtacaga gggctgcgag accgcgaggt ggagcgaatc ccttaaagct

1200

ggtctcagtt cggatcgggg tctgcaactc gaccccgtga agttggagtc gctagtaatc

1260

gcagatcagc aacgctgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacgt

1320

catgaaagtc ggtaacaccc gaagccggtg gcctaacccc ttgtgggagg gagcc

1375

<210> 1356

<211> 1528

<212> DNA

<213> Nocardiopsis dassonvillei

<400> 1356

tttatggaga gtttgatcct ggctcaggac gaacgctggc ggcgtgctta acacatgcaa

60

gtcgagcggt aaggcccttc ggggtacacg agcggcgaac gggtgagtaa cacgtgagca

120

acctgcccct gactctggga taagcggtgg aaacgccgtc taataccgga tacgacccgc

180

cacctcatgg tggagggtgg aaagtttttc ggtcagggat gggctcgcgg cctatcagct

240

tgttggtggg gtaacggcct accaaggcga ttacgggtag ccggcctgag agggcgaccg

300

gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctgcggga ggcagcagtg gggaatattg

360

cgcaatgggc gaaagcctga cgcagcgacg ccgcgtgggg gatgacggcc ttcgggttgt

420

aaacctcttt taccaccaac gcaggcttcc agttctctgg aggttgacgg taggtgggga

480

ataaggaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtcc gagcgttgtc

540

cggaattatt gggcgtaaag agctcgtagg cggcgtgtcg cgtctgctgt gaaagaccgg

600

ggcttaactc cggttctgca gtggatacgg gcatgctaga ggtaggtagg ggagactgga

660

attcctggtg tagcggtgaa atgcgcagat atcaggagga acaccggtgg cgaaggcggg

720

tctctgggcc ttacctgacg ctgaggagcg aaagcatggg gagcgaacag gattagatac

780

cctggtagtc catgccgtaa acgttgggcg ctaggtgtgg ggactttcca cggtttccgc

840

gccgtagcta acgcattaag cgccccgcct ggggagtacg gccgcaggct aaaactcaag

900

gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga gcattgttgc ttaattcgac gcagcgcgaa

960

gaaccttacc aaggtttgac atcacccgtg gactcgcaga gatgtgaggt catttagttg

1020

gcgggtgaca ggtggggcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttagtcc

1080

cgcaacgagc gcaatccttg ttcatgttgt cagcatgtat ggtggggact cttgggagac

1140

tggccggggt caactcggag aagggtgggg atgacgtcag tctcatgccc cttatgtctg

1200

ggctgcaaac atgctacaat ggccggtaca atgggcgtgc gatacgtaag gtggagcgaa

1260

tccctaaaag ccggtctcag ttcggattgg ggtctgcaac tcgaccccat gaaggtggag

1320

tcgctagtaa tcgcggatca gcaacgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1380

cgcccgtcac gtcatgaaag tcggcaacac ccgaaacttg cggcctaacc ccttgtggga

1440

gggagtgagt gaaggtgggg ctggcgattg ggacgaagtc gtaacaaggt agccgtaccg

1500

gaaggtgcgg ctggatcacc tcctttct

1528

<210> 1357

<211> 1486

<212> DNA

<213> Novosphingobium aromaticivorans

<400> 1357

aacttgagag tttgatcctg gctcagaacg aacgctggcg gcatgcctaa cacatgcaag

60

tcgaacgaac ccttcggggt tagtggcgca cgggtgcgta acgcgtggga atctgccctt

120

tgcttcggaa taacagttag aaatgactgc taataccgga tgatgtcttc ggaccaaaga

180

tttatcggca agggatgagc ccgcgtagga ttaggtagtt ggtggggtaa aggcctacca

240

agccgacgat ccttagctgg tctgagagga tgatcagcca cactgggact gagacacggc

300

ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattggaca atgggcgcaa gcctgatcca

360

gcaatgccgc gtgagtgatg aaggccttcg ggtcgtaaag ctcttttacc agggatgata

420

atgacagtac ctggagaata agctccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

480

agggagctag cgttgttcgg aattactggg cgtaaagcgc acgtaggcgg ctactcaagt

540

cagaggtgaa agcccggggc tcaaccccgg aactgccttt gaaactaggt agctggaatc

600

ttggagaggt cagtggaatt ccgagtgtag aggtgaaatt cgtagatatt cggaagaaca

660

ccagtggcga aggcgactga ctggacaagt attgacgctg aggtgcgaaa gcgtggggag

720

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgataacta gctgtccggt

780

cacttggtga ttgggtggcg cagctaacgc attaagttat ccgcctgggg agtacggtcg

840

caagattaaa actcaaagga attgacgggg gcctgcacaa gcggtggagc atgtggttta

900

attcgaagca acgcgcagaa ccttaccagc gtttgacatc ccgcgctact tccagagatg

960

gaaggttccc ttcggggacg cggtgacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt

1020

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caaccctcgt ccttagttgc catcatttag

1080

ttgggcactc taaggaaacc gccggtgata agccggagga aggtggggat gacgtcaagt

1140

cctcatggcc cttacacgct gggctacaca cgtgctacaa tggcggtgac agtgggcagc

1200

aagcacgcga gtgtgagcta atctccaaaa gccgtctcag ttcggattgt tctctgcaac

1260

tcgagagcat gaaggcggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt

1320

tcccaggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt tgggttcacc cgaaggcgtt

1380

gcgctaactc gcaagagagg caggcgacca cggtgggctt agcgactggg gtgaagtcgt

1440

aacaaggtag ccgtagggga acctgcggct ggatcacctc ctttct

1486

<210> 1358

<211> 1529

<212> DNA

<213> Oceanobacillus caeni

<400> 1358

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

gctggaagct aatttcatcc cttcgggatg aaattagtgg aaagagcggc ggacgggtga

120

gtaacacgtg ggcaacctac ctataagact gggataactc gcggaaacgt gagctaatac

180

cggataatac tttttattgc ataataagga gtttgaaagg cggcgtaagc tgtcacttat

240

agatgggccc gcggcgcatt agctagttgg tgaggtaaag gctcaccaag gcaacgatgc

300

gtagccgacc tgagagggtg atcggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac

360

gggaggcagc agtagggaat cttccgcaat ggacgaaagt ctgacggaac aacgccgcgt

420

gagtgaagaa ggttttcgga tcgtaaaact ctgttgttag ggaagaacaa gtcaggtagt

480

aactgacctg accttgacgg tacctaacca gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc

540

cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag cgctcgcagg

600

cggtctttta agtctgatgt gaaagcccac ggcttaaccg tggagggtca ttggaaactg

660

gaggacttga gtgcagaaga ggagagtgga attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagag

720

atatggagga acaccagtgg cgaaggcgac tctctggtct gtaactgacg ctgaggagcg

780

aaagcgtggg tagcgaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg

840

ctaggtgtta gggggtttcc gccccttagt gctgaagtta acgcattaag cactccgcct

900

ggggagtacg gccgcaaggc tgaaactcaa aagaattgac ggggacccgc acaagcggtg

960

gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catcctttcg

1020

acctccctag agatagggat ttcccttcgg ggacgaaagt gacaggtggt gcatggttgt

1080

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgatctt

1140

agttgccagc attaagttgg gcactctaag gtgactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt

1200

ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatgga

1260

tggtacaaag ggcagcgaaa ccgcaaggtc aagcaaatcc cataaaacca ttctcagttc

1320

ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa gccggaatcg ctagtaatcg cggatcagca

1380

tgccgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagttgg

1440

taacacccga agtcggtgag gtaacctttt ggagccagcc gccgaaggtg ggaccaatga

1500

ttggggtgaa gtcgtaacaa ggtaaccca

1529

<210> 1359

<211> 1347

<212> DNA

<213> Oceanobacillus sp. Ndiop

<400> 1359

tcctggcaag aagatgaaag gcggctttta gctgtcactt acagatgggc ccgcggcgca

60

ttagctagtt ggtgaggtaa cggctcacca aggcgacgat gcgtagccga cctgagaggg

120

tgatcggcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtaggga

180

atcttccgca atggacgaaa gtctgacgga gcaacgccgc gtgagtgatg aaggttttcg

240

gatcgtaaaa ctctgttgtc agggaagaac aagtgcgaga gtaactgctc gcaccttgac

300

ggtacctgac cagaaagcca cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg

360

gcaagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa agcgctcgca ggcggtcttt taagtctgat

420

gtgaaagccc acggcttaac cgtggagggt cattggaaac tggaggactt gagtacagaa

480

gaggagagtg gaattccacg tgtagcggtg aaatgcgtag agatgtggag gaacaccagt

540

ggcgaaggcg actctctggt ctgtaactga cgctgaggag cgaaagcgtg gggagcgaac

600

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag tgctaggtgt tagggggttt

660

ccgcccctta gtgctgaagt taacgcatta agcactccgc ctggggagta cggccgcaag

720

gctgaaactc aaaagaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc

780

gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatcctct gaccacccta gagataggga

840

tttcccttcg gggacagagt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

900

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgatctt agttgccagc attcagttgg

960

gcactctaag gtgactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc

1020

atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatgga tggaacaaag ggaagcgaaa

1080

accgcgaggt caagcaaatc ccataaaacc attctcagtt cggattgcag gctgcaactc

1140

gcctgcatga agccggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc

1200

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acgagagttg gtaacacccg aagtcggtga

1260

ggtaaccttt tggagccagc cgccgaaggt gggactaatg attggggtga agtcgtaaca

1320

aggtagccgt atcggaaggt gcggctg

1347

<210> 1360

<211> 1487

<212> DNA

<213> Ochrobactrum anthropi

<400> 1360

ttcaacttga gagtttgatc ctggctcaga acgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgagcg ccccgcaagg ggagcggcag acgggtgagt aacgcgtggg aacgtacctt

120

ttgctacgga ataactcagg gaaacttgtg ctaataccgt atgtgccctt cgggggaaag

180

atttatcggc aaaggatcgg cccgcgttgg attagctagt tggtgaggta aaggctcacc

240

aaggcgacga tccatagctg gtctgagagg atgatcagcc acactgggac tgagacacgg

300

cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattggac aatgggcgca agcctgatcc

360

agccatgccg cgtgagtgat gaaggcccta gggttgtaaa gctctttcac cggtgaagat

420

aatgacggta accggagaag aagccccggc taacttcgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

aagggggcta gcgttgttcg gatttactgg gcgtaaagcg cacgtaggcg gacttttaag

540

tcaggggtga aatcccgggg ctcaaccccg gaactgcctt tgatactgga agtcttgagt

600

atggtagagg tgagtggaat tccgagtgta gaggtgaaat tcgtagatat tcggaggaac

660

accagtggcg aaggcggctc actggaccat tactgacgct gaggtgcgaa agcgtgggga

720

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatgtt agccgttggg

780

gagtttactc ttcggtggcg cagctaacgc attaaacatt ccgcctgggg agtacggtcg

840

caagattaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

900

attcgaagca acgcgcagaa ccttaccagc ccttgacata ccggtcgcgg acacagagat

960

gtgtctttca gttcggctgg accggataca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc

1020

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc gcccttagtt gccagcattt

1080

agttgggcac tctaagggga ctgccggtga taagccgaga ggaaggtggg gatgacgtca

1140

agtcctcatg gcccttacgg gctgggctac acacgtgcta caatggtggt gacagtgggc

1200

agcgagcacg cgagtgtgag ctaatctcca aaagccatct cagttcggat tgcactctgc

1260

aactcgagtg catgaagttg gaatcgctag taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaata

1320

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agttggtttt acccgaaggc

1380

gctgtgctaa ccgcaaggag gcaggcgacc acggtagggt cagcgactgg ggtgaagtcg

1440

taacaaggta gccgtagggg aacctgcggc tggatcacct cctttct

1487

<210> 1361

<211> 1493

<212> DNA

<213> Ochrobactrum intermedium

<400> 1361

aacttgagag tttgatcctg gctcagaacg aacgctggcg gcaggcttaa cacatgcaag

60

tcgagcgccc cgcaagggga gcggcagacg ggtgagtaac gcgtgggaac gtaccatttg

120

ctacggaata actcagggaa acttgtgcta ataccgtatg agcccgaaag gggaaagatt

180

tatcggcaaa tgatcggccc gcgttggatt agctagttgg tggggtaaag gcctaccaag

240

gcgacgatcc atagctggtc tgagaggatg atcagccaca ctgggactga gacacggccc

300

agactcctac gggaggcagc agtggggaat attggacaat gggcgcaagc ctgatccagc

360

catgccgcgt gagtgatgaa ggccctaggg ttgtaaagct ctttcaccgg tgaagataat

420

gacggtaacc ggagaagaag ccccggctaa cttcgtgcca gcagccgcgg taatacgaag

480

ggggctagcg ttgttcggat ttactgggcg taaagcgcac gtaggcgggc taataagtca

540

ggggtgaaat cccggggctc aaccccggaa ctgcctttga tactgttagt cttgagtatg

600

gtagaggtga gtggaattcc gagtgtagag gtgaaattcg tagatattcg gaggaacacc

660

agtggcgaag gcggctcact ggaccattac tgacgctgag gtgcgaaagc gtggggagca

720

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gaatgttagc cgttggggag

780

tttactcttc ggtggcgcag ctaacgcatt aaacattccg cctggggagt acggtcgcaa

840

gattaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

900

cgaagcaacg cgcagaacct taccagccct tgacatcccg atcgcggtta gtggagacac

960

tatccttcag ttcggctgga tcggagacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg

1020

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctcg cccttagttg ccagcattca

1080

gttgggcact ctaaggggac tgccggtgat aagccgagag gaaggtgggg atgacgtcaa

1140

gtcctcatgg cccttacggg ctgggctaca cacgtgctac aatggtggtg acagtgggca

1200

gcgagcacgc gagtgtgagc taatctccaa aagccatctc agttcggatt gcactctgca

1260

actcgagtgc atgaagttgg aatcgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac

1320

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gttggtttta cccgaaggcg

1380

ctgtgctaac cgcaaggagg caggcgacca cggtagggtc agcgactggg gtgaagtcgt

1440

aacaaggtag ccgtagggga acctgcggct ggatcacctc ctttctaagg aag

1493

<210> 1362

<211> 1396

<212> DNA

<213> Ochrobactrum pseudintermedium

<400> 1362

gagagtttga tcctggctca gaacgaacgc tggcggcagg cttaacacat gcaagtcgag

60

cgcgtagcaa tacgagcggc agacgggtga gtaacgcgtg ggaatctacc catcactagg

120

gaataactca gggaaacttg tgctaatacc ctatacgacc gagaggtgaa agatttatcg

180

gtgatggatg agcccgcgtt ggattagcta gttggtgggg taaaggccta ccaaggcgac

240

gatccatagc tggtctgaga ggatgatcag ccacactggg actgagacac ggcccagact

300

cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg acaatgggcg caagcctgat ccagccatgc

360

cgcgtgagtg atgaaggccc tagggttgta aagctctttc accggtgaag ataatgacgg

420

taaccggaga agaagccccg gctaacttcg tgccagcagc cgcggtaata cgaagggggc

480

tagcgttgtt cggatttact gggcgtaaag cgcacgtagg cgggctaata agtcaggggt

540

gaaatcccgg ggctcaaccc cggaactgcc tttgatactg ttagtcttga gtatggaaga

600

ggtgagtgga attccgagtg tagaggtgaa atttgtagat attcggagga acaccagtgg

660

cgaaggcggc tcactggtcc attactgacg ctgaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag

720

gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgaatg ttagccgttg gggagtttac

780

tcttcggtgg cgcagctaac gcattaaaca ttccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta

840

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taatttgaag

900

caacgcgcag aaccttacca gcccttgaca tcccgatcgc ggttagtgga gacactttcc

960

ttcagttcgg ctggatcgga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1020

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac cctcgccctt agttgccagc attcagttgg

1080

gcactctaag gggactgccg gtgataagcc gagaggaagg tggggatgac gtcaagtcct

1140

catggccctt acgggctggg ctacacacgt gctacaatgg tggtgacagt gggcagcgag

1200

cacgcgagtg tgagctaatc tccaaaagcc atctcagttc ggattgcact ctgcaactcg

1260

agtgcatgaa gttggaatcg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg aatacgttcc

1320

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagttgg ttttacccga aggcgctgtg

1380

ctaaccgcaa ggaggc

1396

<210> 1363

<211> 1317

<212> DNA

<213> Odoribacter laneus

<400> 1363

gatgaacgct agcgacaggc ttaacacatg caagtcgagg gaccggcgca cgggtgagta

60

acgcgtatgc aacctgcctt tgacagaggg atagcccatg gaaacgtgga ttaatacctc

120

atagttaaaa gtggtcaaag atgggcatgc gtcctattag gcagttggcg gggtaacggc

180

ccaccaaacc gatgataggt aggggttctg agaggaaggt cccccacact ggtactgaga

240

cacggaccag actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat tggtcaatgg tcgagagact

300

gaaccagcca agtcgcgtga gggatgactg cctatgggtt gtaaacctct tttctactgg

360

gagatgacag tacagtagga ataagcatcg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata

420

cggaggatgc gagcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggtgcgtagg cggctttata

480

agttagtggt aaaatttcgg agcttcactc cggtccgcca ttaaaactgt agagctagag

540

aatggacgag gtaggcggaa taagttaagt agcggtgaaa tgcatagata taacttagaa

600

ctccgatagc gaaggcagct taccagacca actgacgctg atgcacgaga gcgtgggtag

660

cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgctcaccg gcccttagcg

720

agttaggggt taattgaaag aattaagtga gccacctggg gagtacgtcg gcaacgatga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa catgtggttt aattcgatga

840

tacgcgagga accttacctg ggtttaaatg tacaaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc

900

gtgccgtgag gtgtcgggtt aagtcccata acgagcgcaa cccttaccgt tagttgctaa

960

catatgagca ctctagcggg actgccaccg taaggtggag gaaggggggg atgacgtcaa

1020

atcagcacgg cccttacatc cagggcgaca cacgtgttac aatggccatc agcgggtagc

1080

taccgggtga ccggatgcaa atctcgatgg tctaagttcg gatggagtct gcaacccgac

1140

tccagaagtt ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg gcgcggtgaa tacgttcccg

1200

ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg gaagctggga gtacctgaag tccgtatcgg

1260

cctagggtaa taccggtaac tggggctaag tcgwaacaag gtagccgtac cggaagg

1317

<210> 1364

<211> 1368

<212> DNA

<213> Odoribacter splanchnicus

<400> 1364

tcgaggggca gcatgaggta gcaatacctt gatggcgacc ggcgcacggg tgagtaacgc

60

gtatgcaacc tgcctgatac cggggtatag cccatggaaa cgtggattaa caccccatag

120

tacttttatc ctgcctggga tgggagttaa atgtttaagg tatcggatgg gcatgcgtcc

180

tattagttag ttggcggggt aacagcccac caagacgatg ataggtaggg gttctgagag

240

gaaggtcccc cacattggaa ctgagacacg gtccaaactc ctacgggagg cagcagtgag

300

gaatattggt caatggacgt aagtctgaac cagccaagtc gcgtgaggga agactgccct

360

atgggttgta aacctctttt ataagggaag aataagttct actgtaatga tgcctgtact

420

gataagcatc ggctatctgc cagcagccgc ggtaatacgg aggatgcgag cgttatccgg

480

atttattggg tttaaagggt gcgtaggcgg tttattaagt tagtggttaa atatttgagc

540

taaactcaat tgtgccatta atactggtaa actggagtac agacgaggta ggcggaataa

600

gttaagtagc ggtgaaatgc atagatataa cttaaactcc gatagcgaag gcagcttacc

660

agactgtaac tgacgtgatg cacgagagcg tgggtagcga acaggattag ataccctggt

720

agtccacgcc gtaaacgatg ctcactggtt ctgtgcgata tattgtacgg gattaagcga

780

aagtattaag tgagccacct ggggagtacg tcggcaacga tgaaactcaa aggaattgac

840

gggggcccgc acaagcggag gaacatgtgg tttaattcga tgatacgcga ggaaccttac

900

ctgggtttaa atgggaaatg ccgtatttgg aaacagatat tctcttcgga gcgtttttca

960

aggtgctgca tggttgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt cgggttaagt cccataacga

1020

gcgcaaccct taccgttagt tgctagcatg taatgatgag cactctaacg ggactgccac

1080

cgtaaggtga gaggaaggcg gggatgacgt caaatcagca cggcccttac acccagggct

1140

acacacgtgt tacaatggcc ggtacagagg gccgctacca ggtgactgga tgccaatctc

1200

aaaagccggt cgtagttcgg attggagtct gtaacccgac tccatgaagt tggattcgct

1260

agtaatcgcg catcagccat ggcgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc

1320

gtcaagccat ggaagccggg ggtgcctgaa gtccgtaacc gcgaggat

1368

<210> 1365

<211> 1398

<212> DNA

<213> Okadaella gastrococcus

<400> 1365

tgaagcttgg tgcttgcacc gagcggatga gttgcgaacg ggtgagtaac gcgtaggtaa

60

cctgcctctt agcgggggat aactattgga aacgatagct aataccgcat aaaagacgat

120

atcgcatgat attgatttga aaggtgcaat tgcatcacta agagatggac ctgcgttgta

180

ttagctagtt ggtgaggtaa cggctcacca aggcgacgat acatagccga cctgagaggg

240

tgatcggcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtaggga

300

atcttcggca atgggggcaa ccctgaccga gcaacgccgc gtgagtgaag aaggttttcg

360

gatcgtaaag ctctgttgta agagaagaac gagtgtgaga gtggaaagtt cacactgtga

420

cggtaactta ccagaaaggg acggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt

480

cccgagcgtt atccggattt attgggcgta aagcgagcgc aggcggttag ataagtctga

540

agttaaaggc tgtggcttaa ccatagtacg ctttggaaac tgtttaactt gagtgcagaa

600

ggggagagtg gaattccatg tgtagcggtg aaatgcgtag atatatggag gaacaccggt

660

ggcgaaagcg gctctctggt ctgtaactga cgctgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac

720

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag tgctaggtgt tgggtccttt

780

ccgggactca gtgccgcagc taacgcatta agcactccgc ctggggagta cgaccgcaag

840

gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggaacatgt ggtttaattc

900

gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatccctc tgaccgctct agagatagag

960

ttttccttcg ggacagaggt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1020

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctattgtt agttgccatc attgagttgg

1080

gcactctagc gagactgccg gtaataaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc

1140

atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatggc tggtacaacg agtcgcgagt

1200

cggtgacggc aagctaatct cttaaagcca gtctcagttc ggattgtagg ctgcaactcg

1260

cctacatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg cggatcagca cgccgcggtg aatacgttcc

1320

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagtttg taacacccga agtcggtgag

1380

gtaaccgtaa ggagccag

1398

<210> 1366

<211> 1489

<212> DNA

<213> Oligella ureolytica

<400> 1366

attgaacgct agcgggatgc tttacacatg caagtcgaac ggcagcacag aggaacttgt

60

tccttgggtg gcgagtggcg gacgggtgag taatgtatcg gaacgtgccc agtagtgggg

120

gataactacg cgaaagcgtg gctaataccg catattctct acggaggaaa gggggggatc

180

atttgacctc tcgctattgg agcggccgat attagattag ctagttggtg gggtaacggc

240

ctaccaaggc agtgatctat agctggtttg agaggacgac cagccacact gggactgaga

300

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaattt tcgacaatgg ggggaaccct

360

gatcgagcca tcccgcgtgt gggacgaagg ccttcgggtt gtaaaccact tttctcaacg

420

aagaaaagtc ttaggctaat accttaagat gctgacggta gttgaggaat aagcaccggc

480

taactatgtg ccagcagccg cggtaataca tagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg

540

gcgtaaaggg tgcgcaggcg gcttggaaag aacggtgtga aatcccgggg ctcaacctcg

600

gaactgcact attaactatc aagctagagt atgtcagagg ggggtggaat tccgcgtgta

660

gcagtgaaat gcgtagatat gcggaggaac accaatggcg aaggcagccc cctgggataa

720

tactgacgct caggcacgaa agcgtgggta gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

780

cgccctaaac gatgtcaact agctgttggg ccggttacgg cttagtagcg cagctaacgc

840

gtgaagttga ccgcctgggg actacggtcg caagactaaa actcaaagga attgacgggg

900

acccgcacaa gcggtggatg atgtggatta attcgatgca acgcgaaaaa ccttacctac

960

ccttgacatg cctggaagct ttaagagatt aaagtgtgct cgcaagagaa ccggtgcaca

1020

ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1080

cgcaaccctt gtcattagtt gctacgtaag agcactctag tgagactgcc ggtgacaaac

1140

cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcct catggccctt atgggtaggg cttcacacgt

1200

catacaatgg tcgggacaga gggttgccaa gccgcgaggt ggagctaatc tcttaaaccc

1260

gatcgtagtc cggattgcag gctgcaactc gcctgcatga agtcggaatc gctagtaatc

1320

gcagatcaga atgctgcggt gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc

1380

atgggagtgg gttttaccag aagtagttag tctaaccgca agggggacga ttaccacggt

1440

aggattcatg actggggtga agtcgtaaca aggtagccgt accggaagg

1489

<210> 1367

<211> 1486

<212> DNA

<213> Oligella urethralis

<400> 1367

ttgatcctgg ctcagattga acgctagcgg gatgctttac acatgcaagt cgaacggcag

60

catgagagag cttgctctct tgatggcgag tggcggacgg gtgagtaatg tatcggaacg

120

tgcccggtag tgggggataa ctacgcgaaa gcgtagctaa taccgcatat tctctacgga

180

ggaaagaggg ggatcgtaag acctcttgct accggagcgg ccgatatcag attagctagt

240

tggtggggta acggcctacc aaggcggtga tctgtagctg gtttgagagg acgaccagcc

300

acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aattttcgac

360

aatgggggga accctgatcg agccatctcg cgtgtgggac gaaggccttc gggttgtaaa

420

ccacttttct caacgaagaa aagtcttagg ctaatacctt aagatgctga cggtagttga

480

ggaataagca ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg tgcgagcgtt

540

aatcggaatt actgggcgta aagggtgcgc aggcggcttg gaaagaacgg tgtgaaatcc

600

cggggctcaa cctcggaact gcactattaa ctgccaagct agagtatgtc agaggggggt

660

ggaattccgc gtgtagcagt gaaatgcgta gatatgcgga ggaacaccga tggcgaaggc

720

agccccctgg gatggtactg acgctcaggc acgaaagcgt gggtagcgaa caggattaga

780

taccctggta gtccacgccc taaacgatgt caactagctg ttgggccggt tacggcttag

840

tagcgcagct aacgcgtgaa gttgaccgcc tggggactac ggtcgcaaga ctaaaactca

900

aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggatgatgtg gattaattcg atgcaacgcg

960

aaaaacctta cctacccttg acatgcccgg aagcttcaag agattggagt gtgctcgcaa

1020

gagaaccgga gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt

1080

aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtcat tagttgctac gaaagggcac tctaatgaga

1140

ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcctcatgg cccttatggg

1200

tagggcttca cacgtcatac aatggtcagg acagcgggtt gccaagccgc gaggtggagc

1260

taatctctta aacctgatcg tagtccggat tgcaggctgc aactcgcctg catgaagtcg

1320

gaatcgctag taatcgcaga tcagaatgct gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac

1380

accgcccgtc acaccatggg agtgggtttt accagaagta gttagcctaa ccgcaaggag

1440

ggcgattacc acggtaggat tcatgactgg ggtgaagtcg taacaa

1486

<210> 1368

<211> 1327

<212> DNA

<213> Olsenella genomosp. C1

<400> 1368

gatgaacgct ggcggcgcgc ctaacacatg caagtcgaac gagtggcgaa cggctgagta

60

acacgtgggc aatctgccct ttgcatcggg acagcctcgg gaaaccgtgg ttaataccgg

120

atactgaaag gcggcaaggg atgggcccgc gccctgttag cttgttggtg gggtaaaagc

180

ctaccaaggc aatgatgggt agccgggttg agagaccgac cggccagatt gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatct tgcacaatgg gcgaaagcct

300

gatgcagcga cgccgcgtgc gggatgaagg ccttcgggtt gtaaaccgct ttcagcaggg

360

acgatgacgg tacctgcaga agaagccccg gctaactatg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtagggagc aagcgttatc cggattcatt gggcgtaaag cgcgcgtagg ctgcccagta

480

ggtcgagagt taaatccggg ggctcaaccc ccgtccgctc ccgataccgc tgggttcgag

540

tctggtaggg gaaggtggaa ttcccagtgt agcggtggaa tgcgcagata ttgggaagaa

600

caccggtggc gaaggcggcc ttctgggcca actgacgctg aggcgcgaaa gctaggggag

660

cgaacaggat tagataccct ggtagtccta gccgtaaacg atgggcacta ggtgtgggga

720

tttccgtgcc gacgctaacg cattaagtgc cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcagcggag catgtggctt aattcgaagc

840

aacgcgaaga accttaccag ggcttgacac tacaggtggt gcatggctgt cgtcagctcg

900

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac cctcgtcgca tgttgccagc

960

ggccgggcac ccatgcgaga ccgccggcgt taagccggag gaaggtgggg acgacgtcaa

1020

gtcatcatgc cctctatgtc ctgggctgca cacgtgctac aatggccggc agcggggtgc

1080

cactgcgcga gcacaagcga atccctccgg tcccagttcg gatggaggct gcaacccgcc

1140

tccagaagtc ggagttgcta gtaatcgcgg atcagcacgc cgcggtgaat gcgttcccgg

1200

gccttgtaca caccgcccgt cacaccaccc gagtcgtctg cacccgaagt cgtcgcctag

1260

ggaggcgccg aaggtgtgga aggtaagggg ggtgaagtcg taacaaggta accgtaagag

1320

aacctgc

1327

<210> 1369

<211> 1428

<212> DNA

<213> Olsenella profusa

<400> 1369

gatgaacgct ggcggcgcgc ctaacacatg caagtcgaac ggttaaagca tcttcggatg

60

tgcataaagt ggcgaacggc tgagtaacac gtgggcaacc tgcccctcgc atcgggacag

120

cctcgggaaa ccgtggttaa taccggatac tccgccaccc ccgcatgggg gaggcgggaa

180

agcccagacg gcgagggatg ggcccgcggc ctgttagctt gttggtgggg cagtggccca

240

ccaaggcgat gatgggtagc cgggttgaga gaccgaccgg ccagattggg actgagacac

300

ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatcttgc acaatgggcg aaagcctgat

360

gcagcgacgc cgcgtgcggg acgaaggcct tcgggtcgta aaccgctttc agcagggacg

420

aggccgcaag gtgacggtac ctgcagaaga agccccggct aactacgtgc cagcagccgc

480

ggtaatacgt agggggcgag cgttatccgg attcattggg cgtaaagcgc gcgtaggcgg

540

cctgctaggt cgggagtcaa atccgggggc tcaacccccg tccgctcccg ataccggctg

600

gcttgagtct ggtaggggaa ggtggaattc ccagtgtagc ggtggaatgc gcagatattg

660

ggaagaacac cggtggcgaa ggcggccttc tgggccacga ctgacgctga ggcgcgaaag

720

ctaggggagc gaacaggatt agataccctg gtagtcctag ccgtaaacga tggacactag

780

gtgtgggcgg attgtccgtc cgtgccgcag ccaacgcatt aagtgtcccg cctggggagt

840

acggccgcaa ggctaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagca gcggagcatg

900

tggcttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccagggct tgacatctag gtgaagcggc

960

ggagacgccg tggccgagag gagcctagac aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt

1020

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct cgtcgcatgt tgccagcggt

1080

tcggccgggc acccatgcga gaccgccggc gtcaagccgg aggaaggtgg ggacgacgtc

1140

aagtcatcat gccccttatg tcctgggctg cacacgtgct acaatggccg gcacaatggg

1200

ctgccaccgc gcgagcggga gcgaatcccc aaagccggcc ccagttcgga ctggaggctg

1260

caacccgcct ccacgaagtc ggagttgcta gtaatcgcgg atcagcacgc cgcggtgaat

1320

gcgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccaccc gagtcgtctg cacccgaagt

1380

cgtcggccca acccgcaagg gagggaggcg ccgaaggtgt ggaaggta

1428

<210> 1370

<211> 1489

<212> DNA

<213> Olsenella sp. F0004

<400> 1370

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgcgcc taacacatgc aagtcgaacg

60

gttaaagccc cttcgggggt gcatagagtg gcgaacggct gagtaacacg tgggcaacct

120

gccccccgca ccgggacagc ctcgggaaac cgtggttaat accggatact ccgccacccc

180

cgcatggggg cggcgggaaa gcccaggcgg agggggatgg gcccgcggcc tgttagctcg

240

ttggcggggt aacggcccac caaggcgatg atgggtagcc gggttgagag accgaccggc

300

cagattggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatcttgca

360

caatgggcga aagcctgatg cagcgacgcc gcgtgcggga cgaaggcctt cgggtcgtaa

420

accgctttca gcagggacga ggccgaaagg tgacggtacc tgcagaagaa gccccggcta

480

actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggggcgagc gttatccgga ttcattgggc

540

gtaaagcgcg cgcaggcggc ctgctcggtc gggagtcaaa tccgggggct caacccccgc

600

ccgctcccga taccggcggg cttgagtctg gtaggggaag gcggaattcc cagtgtagcg

660

gtggaatgcg cagatattgg gaagaacacc ggtggcgaag gcggccttct gggccacgac

720

tgacgctgag gcgcgaaagc taggggagcg aacaggatta gataccctgg tagtcctagc

780

cgtaaacgat ggacactagg tgtgggggga ggatccctcc gtgccgcagc caacgcatta

840

agtgtcccgc ctggggagta cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg acgggggccc

900

gcacaagcag cggagcatgt ggcttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accagggctt

960

gacatgcggg tgaagcggcg gagacgccgt ggccgagagg agcccgcaca ggtggtgcat

1020

ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccccc

1080

gtcgcatgtt gccagcggtt aggccgggca cccatgcgag accgccggcg tcaagccgga

1140

ggaaggtggg gacgacgtca agtcatcatg ccccttatgt cctgggctgc acacgtgcta

1200

caatggccgg cacagcgggc cgccaccgcg cgagcgggag cgaatcccca aagccggccc

1260

cagttcggat tggaggctgc aacccgcctc catgaagtcg gagttgctag taatcgcgga

1320

tcagcacgcc gcggtgaatg cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacccg

1380

agtcgtctgc acccgaagtc gccggcccaa cccgcgaggg ggggaggcgc cgaaggtgtg

1440

gagggtaagg ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtacc ggaaggtgc

1489

<210> 1371

<211> 1503

<212> DNA

<213> Olsenella sp. oral taxon 809

<400> 1371

agagttcgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgcgc ctaacacatg caagtcgaac

60

ggttaagacg ccttcgggcg tgtataaagt ggcgaacggc tgagtaacac gtgggcaacc

120

tgcccctcgc accgggacag cctcgggaaa ccgtggttaa taccggatac tccgcgcacc

180

ccgcatgggg cgcgcgggaa agcccagacg gcgagggatg ggcccgcggc ctgttagcta

240

gttggcgggg caacggccca ccaaggcgat gatgggtagc cgggttgaga gaccgaccgg

300

ccagattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatcttgc

360

acaatgggcg aaagcctgat gcagcgacgc cgcgtgcggg acgaaggcct tcgggtcgta

420

aaccgctttc agcagggacg aggccgcaag gtgacggtac ctgcagaaga agccccggct

480

aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggggcgag cgttatccgg attcattggg

540

cgtaaagcgc gcgtaggcgg cctgttaggt cgggagttaa atccgggggc tcaacccccg

600

tccgctcccg ataccggcgg gcttgagtct ggtaggggaa ggcggaattc ccagtgtagc

660

ggtggaatgc gcagatattg ggaagaacac cggtggcgaa ggcggccttc tgggccacga

720

ctgacgctga ggcgcgaaag ctaggggagc gaacaggatt agataccctg gtagtcctag

780

ccgtaaacga tggacactag gtgtgggggg acgatccctc cgtgccgcag ccaacgcatt

840

aagtgtcccg cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact caaaggaatt gacgggggcc

900

cgcacaagca gcggagcatg tggcttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccagggct

960

tgacatctag gtgaagcggc ggagacgccg tggccgagag gagcctagac aggtggtgca

1020

tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct

1080

cgtcgcatgt tgccagcggt ccggccgggc acccatgcga gaccgccggc gtcaagccgg

1140

aggaaggtgg ggacgacgtc aagtcatcat gccccttatg tcctgggctg cacacgtgct

1200

acaatggccg gcacaatggg ctgccaccgc gcgagcggga gcgaatcccc aaagccggcc

1260

ccagttcgga ctggaggctg caacccgcct ccacgaagtc ggagttgcta gtaatcgcgg

1320

atcagcacgc cgcggtgaat gcgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccaccc

1380

gagtcgtctg cacccgaagt cgtcggccca acccgcgagg gggggaggcg ccgaaggtgt

1440

ggagggtaag gggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc ggctggatca

1500

cct

1503

<210> 1372

<211> 1503

<212> DNA

<213> Olsenella uli

<400> 1372

agagttcgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgcgc ctaacacatg caagtcgaac

60

ggttaaagcc ccttcggggg tgcataaagt ggcgaacggc tgagtaacac gtgggcaacc

120

tgcccctcgc accgggacag cctcgggaaa ccgtggttaa taccggatac tcccgcaccc

180

ccgcatgggg gcgcggggaa agcccagacg gcgagggatg ggcccgcggc ctgttagctc

240

gttggcgggg taacggccca ccaaggcgat gatgggtagc cgggttgaga gaccgaccgg

300

ccagattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatcttgc

360

gcaatgggcg gaagcctgac gcagcgacgc cgcgtgcggg aaggaggcct tcgggtcgta

420

aaccgctttc agcagggacg aggccgcgag gtgacggtac ctgcagaaga agccccggct

480

aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggggcaag cgttatccgg attcattggg

540

cgtaaagcgc gcgtaggcgg cctgttaggt cgggagtcaa atccgggggc tcaacccccg

600

cccgctcccg ataccggcgg gcttgagtct ggcaggggaa ggcggaattc caagtgtagc

660

ggtggaatgc gcagatattt ggaagaacac cggtggcgaa ggcggccttc tgggccacga

720

ctgacgctga ggcgcgaaag ctaggggagc gaacaggatt agataccctg gtagtcctag

780

ccgtaaacga tggacactag gtgtgggggg acgatccctc cgtgccgcag ccaacgcatt

840

aagtgtcccg cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact caaaggaatt gacgggggcc

900

cgcacaagca gcggagcatg tggcttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccagggct

960

tgacatccag gtgaagcggc ggaaacgccg tggccggaag gagcctggac aggtggtgca

1020

tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc

1080

cgtcgcatgt tgccagcggt ccggccgggc acccatgcga gaccgccggc gtcaagccgg

1140

aggaaggtgg ggacgacgtc aagtcatcat gccccttatg ccctgggctg cacacgtgct

1200

acaatggccg gcacagcggg ccgccaccgc gcgagcggga gcgaatcccc aaagccggcc

1260

ccagttcgga ctggaggctg caacccgcct ccacgaagtc ggagttgcta gtaatcgcgg

1320

atcagcacgc cgcggtgaat gcgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccaccc

1380

gagtcgtctg cacccgaagt cgtcggccca acccgcgagg gggggaggcg ccgaaggtgt

1440

ggagggtaag gggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc ggctggatca

1500

cct

1503

<210> 1373

<211> 1551

<212> DNA

<213> Opitutus terrae

<400> 1373

agagtttgat cctggctcag aatgaacgct ggcggcgtgg ttaagacatg caagtcgaac

60

ggtttttccg gtgtagcaat acatcggaaa gacagtggcg aacgggtgcg taacacgtga

120

acaatctacc tccaaatggg gaatagctcg gcgaaagccg gattaatacc gcatgtggtt

180

gcttctcgca tgagaggtat accaaagtcg gggaccgcaa ggcctgacgt taggagagga

240

gttcgcggcc tatcagctag ttggcgaggt aacggctcac caaggcaaag acgggtagct

300

ggtctgagag gatgatcagc cacactggaa ctgagacacg gtccagacac ctacgggtgg

360

cagcagtttc gaatcattca caatgggcga aagcctgatg gtgcgacgcc gcgtgaggga

420

tgaaggtctt cggattgtaa acctctgtca ccggggaaga aacgctttat attaatcgta

480

taaagcctga cttaacccgg agaggaagca gtggctaact ctgtgccagc agccgcggta

540

atacagagac tgcgagcgtt attcggattc actgggcgta aagggtgcgc aggcggccgg

600

gtgtgtgggg cgtgaaagcc tggagcttaa ctccagaatt gcgcctcaaa ctacacggct

660

agagcattgg agagggtagc ggaattcacg gtgtagcagt gaaatgcgta gatatcgtga

720

ggaacaccag aggcgaaggc ggctacctgg acaattgctg acgctcaggc acgaaagcgt

780

ggggagcaaa agggattaga tacccctgta gtccacgccc taaacggtgc acactaggtc

840

ttggcggatt cgacccctcc agggccccag ctaacgcgtt aagtgtgccg cctgaggact

900

acggccgcaa ggctaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagtatg

960

tggctcaatt cgatgcaacg cgaagaacct taccaagcct tgacatgcat tggacaggcg

1020

ctgaaaggcg ccctcccttc ggggccggtg cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg

1080

tgtcgtgaga tgttgcgtta agtcgcgcaa cgagcgcaac ccctgtcctt agttgccatc

1140

attcagttgg gcactctagg gagacaaacc ctctttgagg gtgggaaggt ggggatgacg

1200

tcaagtcagg atggccctta cggcttgggc tgcacacgta ctacaatgcc cggtacagag

1260

ggacgcaata ccgcgaggtg gagcaaatcc tcaaaaccgg gcccagttca gattgtagtc

1320

tgcaactcga ctacatgaag ttggaatcgc tagtaatggc gcatcagcta cggcgccgtg

1380

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca tgaaagccgg tttcgcccga

1440

agtgcgtttg ccaaccagca atggaggcgg cgccctaagg tgaggctggt gattgggacg

1500

aagtcgtaac aaggtagccg taggggaacc tgcggctgga tcacctcctt t

1551

<210> 1374

<211> 1443

<212> DNA

<213> Oribacterium sinus

<400> 1374

ggaaagcttc ggccggaaga tacgttatct agtggcggac gggtgagtaa cacgtgggta

60

acctgcctta tggaggggga taacagagag aaatcactgc taataccgca taagcacaca

120

gtaccgcatg gtacagggtg aaaagattta tcgccataag atggacccgc gtctgattag

180

ccagttggca gggtaaaagc ctaccaaagc aacgatcagt agccgatctg agaggatgac

240

cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

300

tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt atttcggtat

360

gtaaagctct atcagcaggg aagataatga cagtacctga ctaagaagcc ccggctaact

420

acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg ggcaagcgtt atccggattt actgggtgta

480

aagggagcgt agacggaatg gcaagtctga agtgaaatac ccgggctcaa cctgggaact

540

gctttggaaa ctgttgttct agagtgttgg agaggtaagt ggaattcctg gtgtagcggt

600

gaaatgcgta gatatcagga agaacaccgg aggcgaaggc ggcttactgg acaataactg

660

acgttgaggc tcgaaagcgt ggggatcaaa caggattaga taccctggta gtccacgctg

720

taaacgatga atactaggtg tcggggtgca aagcatctcg gtgccgtcgc taacgcaata

780

agtattccac ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc aaaggaattg acggggaccc

840

gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaagtctt

900

gagatcccat tgacagagta tgtaatgtac tttcccttcg gggcaatggt gacaggtggt

960

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1020

ccctatagtt agtagccagc agtaagatgg gcactctaac tagactgcca gggataacct

1080

ggaggaaggc ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacttgggc tacacacgtg

1140

ctacaatggc gtaaacaaag ggaagcaaga gggtgacctt aagcaaatct caaaaataac

1200

gtctcagttc ggactgtagt ctgcaacccg actacacgaa gctggaatcg ctagtaatcg

1260

cagatcagca tgctgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca

1320

tgggagttgg taatgcccga agtcagtgtc ccaagaaagg gagctgccga aggcaggact

1380

gatgactggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct ggatcacctc

1440

ctt

1443

<210> 1375

<211> 1378

<212> DNA

<213> Oribacterium sp. ACB1

<400> 1375

gatatgttat ctagtggcgg acgggtgagt aacacgtggg taacctgcct tatggagggg

60

gataacagag agaaatcact gctaataccg cataagcaca cattgccgca tggcagagtg

120

tgaaaagatt tatcgccata agatggaccc gcgtctgatt agccagttgg cagggtaaaa

180

gcctaccaaa gcaacgatca gtagccgatc tgagaggatg accggccaca ttgggactga

240

gacacggccc aaactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggggaaacc

300

ctgatgcagc gacgccgcgt gagtgaagaa gtatttcggt atgtaaagct ctatcagcag

360

ggaagataat gacagtacct gactaagaag ccccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

420

taatacgtag ggggcaagcg ttatccggat ttactgggtg taaagggagc gtagacggaa

480

tggcaagtct gaagtgaaaa ccccgggctc aacctgggga ctgctttgga aactgttgtt

540

ctagagtgtt ggagaggtaa gtggaattcc tggtgtagcg gtgaaatgcg tagatatcag

600

gaagaacacc ggaggcgaag gcggcttact ggacaataac tgacgttgag gctcgaaagc

660

gtggggatca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc tgtaaacgat gaatactagg

720

tgtcggggtg caaagcatct cggtgccgtc gctaacgcaa taagtattcc acctggggag

780

tacgttcgca agaatgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat

840

gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaagtc ttgagatccc attgacagag

900

tgtgtaatgc actttccctt cggggcaatg gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

960

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctatag ttagtagcca

1020

gcagtaagat gggcactcta actagactgc cagggataac ctggaggaag gcggggatga

1080

cgtcaaatca tcatgcccct tatgacttgg gctacacacg tgctacaatg gcgtaaacaa

1140

agggaagcaa gagggtgacc ttaagcaaat ctcaaaaata acgtctcagt tcggactgta

1200

gtctgcaacc cgactacacg aagctggaat cgctagtaat cgcagatcag catgctgcgg

1260

tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtt ggtaatgccc

1320

gaagtcagtg ttccaaaaga ggaagctgcc gaaaggcagg actgatgact ggggtgaa

1378

<210> 1376

<211> 1436

<212> DNA

<213> Oribacterium sp. ACB7

<220>

<221> modified_base

<222> (45)..(45)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (164)..(164)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1376

gcggcgtgcc taacacatgc aagtcgaacg agatgcgtat tgganagctt cggccggaag

60

atgcgttatc tagtggcgga cgggtgagta acacgtgggt aacctgcctt atggaggggg

120

ataacagaga gaaatcactg ctaataccgc ataagcacac agtnccgcat ggcagagtgt

180

gaaaagattt atcgccataa gatggacccg cgtctgatta gccagttggc agggtaaaag

240

cctaccaaag caacgatcag tagccgatct gagaggatga ccggccacat tgggactgag

300

acacggccca aactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggggaaaccc

360

tgatgcagcg acgccgcgtg agtgaagaag tatttcggta tgtaaagctc tatcagcagg

420

gaagataatg acagtacctg actaagaagc cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt

480

aatacgtagg gggcaagcgt tatccggatt tactgggtgt aaagggagcg tagacggagt

540

ggcaagtctg aagtgaaaac cctgggctta acctggggac tgctttggaa actgttaatc

600

tagagtgttg gagaggtaag tggaattcct ggtgtagcgg tgaaatgcgt agatatcagg

660

aagaacaccg gaggcgaagg cggcttactg gacaataact gacgttgagg ctcgaaagcg

720

tggggatcaa acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacgatg aatactaggt

780

gtcggggagc aaagcttctc ggtgccgtcg ctaacgcaat aagtattcca cctggggagt

840

acgttcgcaa gaatgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg

900

tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaagtct tgagatccca ttgacagagt

960

gtgtaatgca ttttcccttc ggggcaatgg tgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

1020

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatagt tagtagccag

1080

cagtaagatg ggcactctaa ctagactgcc agggataacc tggaggaagg cggggatgac

1140

gtcaaatcat catgcccctt atgacttggg ctacacacgt gctacaatgg cgtaaacaaa

1200

gggaagcaag agggtgacct taagcaaatc tcaaaaataa cgtctcagtt cggactgtag

1260

tctgcaaccc gactacacga agctggaatc gctagtaatc gcagatcagc atgctgcggt

1320

gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg gtaatgcccg

1380

aagtcagtgt cccaagagag ggagctgccg aaggcaggac tgatgactgg ggtgaa

1436

<210> 1377

<211> 1372

<212> DNA

<213> Oribacterium sp. CM12

<400> 1377

gctcaggatg aacgctggcg gcgtgcctaa cacatgcaag tcgaacgaga tgcttatcgg

60

aaagcttcgg ccggaagata cgttatctag tggcggacgg gtgagtaaca cgtgggtaac

120

ctgccttatg gagggggata acagagagaa atcactgcta ataccgcata agcacacagt

180

accgcatggt acagggtgaa aagatttatc gccataagat ggacccgcgt ctgattagcc

240

agttggcagg gtaaaagcct accaaagcaa cgatcagtag ccgatctgag aggatgaccg

300

gccacattgg gactgagaca cggcccaaac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

360

cacaatgggg gaaaccctga tgcagcgacg ccgcgtgagt gaagaagtat ttcggtatgt

420

aaagctctat cagcagggaa gataatgaca gtacctgact aagaagcccc ggctaactac

480

gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggggg caagcgttat ccggatttac tgggtgtaaa

540

gggagcgtag acggaatggc aagtctgaag tgaaataccc gggctcaacc tgggaactgc

600

tttggaaact gttgttctag agtgttggag aggtaagtgg aattcctggt gtagcggtga

660

aatgcgtaga tatcaggaag aacaccggag gcgaaggcgg cttactggac aataactgac

720

gttgaggctc gaaagcgtgg ggatcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgctgta

780

aacgatgaat actaggtgtc ggggtgcaaa gtatctcggt gccgtcgcta acgcaataag

840

tattccacct ggggagtacg ttcgcaagaa tgaaactcaa aggaattgac ggggacccgc

900

acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caagtcttga

960

gatcccattg acagagtatg taatgtactt tcccttcggg gcaatggtga caggtggtgc

1020

atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1080

ctatagttag tagccagcag taagatgggc actctaacta gactgccagg gataacctgg

1140

aggaaggcgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg acttgggcta cacacgtgct

1200

acaatggcgt aaacaaaggg aagcaagagg gtgaccttaa gcaaatctca aaaataacgt

1260

ctcagttcgg actgtagtct gcaacccgac tacacgaagc tggaatcgct agtaatcgca

1320

gatcagcatg ctgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tc

1372

<210> 1378

<211> 1425

<212> DNA

<213> Oribacterium sp. ICM51

<400> 1378

caggatgaac gctggcggcg tgcctaacac atgcaagtcg aacgagatgc gtatcggaaa

60

gcttcggccg gaagatacgt tatctagtgg cggacgggtg agtaacacgt gggtaacctg

120

ccttatggag ggggataaca gagagaaatc actgctaata ccgcataagc acacagtacc

180

gcatggtaca gggtgaaaag atttatcgcc ataagatgga cccgcgtctg attagccagt

240

tggcagggta aaagcctacc aaagcaacga tcagtagccg atctgagagg atgaccggcc

300

acattgggac tgagacacgg cccaaactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac

360

aatgggggaa accctgatgc agcgacgccg cgtgagtgaa gaagtatttc ggtatgtaaa

420

gctctatcag cagggaagat aatgacagta cctgactaag aagccccggc taactacgtg

480

ccagcagccg cggtaatacg tagggggcaa gcgttatccg gatttactgg gtgtaaaggg

540

agcgtagacg gaatggcaag tctgaagtga aatacccggg ctcaacctgg gaactgcttt

600

ggaaactgtt gttctagagt gttggagagg taagtggaat tcctggtgta gcggtgaaat

660

gcgtagatat caggaagaac accggaggcg aaggcggctt actggacaat aactgacgtt

720

gaggctcgaa agcgtgggga tcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgctgtaaac

780

gatgaatact aggtgtcggg gtgcaaagca tctcggtgcc gtcgctaacg caataagtat

840

tccacctggg gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca

900

agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccaa gtcttgagat

960

cccattgaca gagtatgtaa tgtactttcc cttcggggca atggtgacag gtggtgcatg

1020

gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccccta

1080

tagttagtag ccagcagtaa gatgggcact ctaactagac tgccagggat aacctggagg

1140

aaggcgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgact tgggctacac acgtgctaca

1200

atggcgtaaa caaagggaag caagagggtg accttaagca aatctcaaaa ataacgtctc

1260

agttcggact gtagtctgca acccgactac acgaagctgg aatcgctagt aatcgcagat

1320

cagcatgctg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga

1380

gttggtaatg cccgaagtca gtgtcccaag aaagggagct gccga

1425

<210> 1379

<211> 1259

<212> DNA

<213> Oribacterium sp. OBRC12

<400> 1379

tcaggatgaa cgctggcggc gtgcctaaca catgcaagtc gaacgagtgg cggacgggtg

60

agtaacacgt gggtaacctg ccttatggag ggggataaca gagagaaatc actgctaata

120

ccgcataaga aaagtcgcca taagatggac ccgcgtctga ttagccagtt ggcagggtaa

180

aagcctacca aagcaacgat cagtagccga tctgagagga tgaccggcca cattgggact

240

gagacacggc ccaaactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca atgggggaaa

300

ccctgatgca gcgacgccgc gtgagtgaag aagtatttcg gtatgtaaag ctctatcagc

360

agggaagatg acagtacctg actaagaagc cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt

420

aatacgtagg gggcaagcgt tatccggatt tactgggtgt aaagggagcg tagacggaat

480

ggcaagtctg aagtgaaata cccgggctca acctgggaac tgctttggaa actgttgttc

540

tagagtgttg gagaggtaag tggaattcct ggtgtagcgg tgaaatgcgt agatatcagg

600

aagaacaccg gaggcgaagg cggcttactg gacaaactga cgttgaggct cgaaagcgtg

660

gggatcaaac aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacgatgaa tactaggtgt

720

cggggtctcg gtgccgtcgc taacgcaata agtattccac ctggggagta cgttcgcaag

780

aatgaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc

840

gaagcaacgc gaagaacctt accaagtctt gagatcgaca ggtggtgcat ggttgtcgtc

900

agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct atagttagta

960

gccagcatgg gcactctaac tagactgcca gggataacct ggaggaaggc ggggatgacg

1020

tcaaatcatc atgcccctta tgacttgggc tacacacgtg ctacaatggc gtacaaaggg

1080

aagcaagagg gtgaccttaa gcaaatctca aaacgtctca gttcggatgt agtctgcaac

1140

ccgactacag aagctggaat cgctagtaat cgcagatcag catgctgcgg tgaatacgtt

1200

cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtt ggtaatgccc gaagtcagt

1259

<210> 1380

<211> 1523

<212> DNA

<213> Oribacterium sp. oral taxon 078

<400> 1380

aatgagagtt cgatcctggc tcaggatgaa cgctggcggc gtgcctaaca catgcaagtc

60

gaacggagtc cagcctttaa gaccttcggg tcaaagaggg gaagactgag tggcggacgg

120

gtgagtaaca cgtgggcaac ctggctcata gagggggata acagagagaa atttctgcta

180

ataccgcata agcacacact gccacatggc agagggtgaa aagagaatcg ctatgagatg

240

gacccgcgtc tgattagcca gttggcaggg taagagccta ccaaagcgac gatcagtagc

300

cgatctgaga ggatgaacgg ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag

360

gcagcagtgg gggatattgc acaatggggg gaaccctgat gcagcgacgc cgcgtgagtg

420

aagaagtatt tcggtatgta aagctctatc agcagggaag ataatgacag tacctgaata

480

agaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc aagcgttatc

540

cggatttact gggtgtaaag ggagcgtaga cggaatggca agtctgaagt gaaatgcccg

600

ggctcaaccc gggaactgct ttggaaactg tcgatctgga gtgttggaga ggtaagtgga

660

attcctggtg tagcggtgaa atgcgtagag atcaggaaga acaccggagg cgaaggcggc

720

ttactggaca aagactgacg ttgaggctcg aaagcgtggg aagcaaacag gattagatac

780

cctggtagtc cacgccgtaa acgatgaata ctaggtgtcg gtctccgaag gagatcggtg

840

ccgacgcaaa cgcaataagt attccacctg gggagtacgt tcgcaagaat gaaactcaaa

900

ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa

960

gaaccttacc aggtcttgag atcccgatga cagaagatgt aatgcctttt cccttcgggg

1020

cattggagac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaaccct tatcgtcagt agccagcagt aagatgggca ctctgatgag

1140

actgccgggg ataacccgga ggaaggcggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga

1200

cctgggcgac acacgtgcta caatggcgga aacagaggga agcgaggggg cgacccggag

1260

caaatctcaa aaataccgtc tcagttcgga ctgcagtctg caactcgact gcacgaagcc

1320

ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc cgcggtgaat ccgttcccgg gtcttgtaca

1380

caccgcccgt cacaccatgg gagtcggtaa tgcccgaagt cagtgaccca aaagagggag

1440

ctgccgaagg caggacagat aactggggtg aagtcgtaac aaggtagccg tatcggaagg

1500

tgcggctgga tcacctcctt tct

1523

<210> 1381

<211> 1497

<212> DNA

<213> Oribacterium sp. oral taxon 102

<400> 1381

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgcc taacacatgc aagtcgaacg

60

gggttctata tcggaagttt tcggatggaa gagataggac ccagtggcgg acgggtgagt

120

aacacgtggg taacctgcct catagagggg gataacagag agaaatcact gctaataccg

180

cataagcaca cgggatcgca tgatcctggg tgaaaagatt tatcgctatg agatggactc

240

gcgtctgatt agctggttgg cggggtaaag gcccaccaag gcgacgatca gtagccgatc

300

tgagaggatg gccggccaca ttgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

360

agtgggggat attgcacaat ggagggaact ctgatgcagc aacgccgcgt gagtgaagaa

420

gtatttcggt atgtaaagct ctatcagcag ggaagatgat gacagtacct gaataagaag

480

ccccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggggcaagcg ttatccggat

540

ttactgggtg taaagggagc gtagacggcg aagcaagtct gaagtgaaaa tccggggctc

600

aactccggaa gtgctttgga aactgttttg atagagtgtc ggagaggtaa gtggaattcc

660

tggtgtagcg gtgaaatgcg tagatatcag gaagaacacc ggaggcgaag gcggcttact

720

ggacgataac tgacgttgag gctcgaaagc gtgggaagca aacaggatta gataccctgg

780

tagtccacgc cgtaaacgat gaatactagg tgtcgggggc gaagcccttc ggtgccgtcg

840

caaacgcaat aagtattcca cctggggagt acgttcgcaa gaatgaaact caaaggaatt

900

gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct

960

taccaagtct tgacatccca ttgacagagc atgtaatgtg ctttcccctc ggggcaatgg

1020

agacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1080

acgagcgcaa cccctatatt cagtagccag cagtaagatg ggcactctgg agagactgcc

1140

agggataacc tggaggaagg cggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgacttggg

1200

cgacacacgt gctacaatgg cgtaaacaaa gggaagcgag ctcgcgagag taagcgaaac

1260

tcaaaaataa cgtctcagtt cggactgtag tctgcaaccc gactacacga agctggaatc

1320

gctagtaatc gcagatcagc atgctgcggt gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc

1380

ccgtcacacc atgggagtcg gtaatgcccg aagccagtga accaagagag ggagctgtcg

1440

aaggcaggac tgataactgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtatcgg aaggtgc

1497

<210> 1382

<211> 1527

<212> DNA

<213> Oribacterium sp. oral taxon 108

<400> 1382

tttattatga gagttcgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgcc taacacatgc

60

aagtcgaacg agatgcgtat cggaaagctt cggccggaag atacgttatc tagtggcgga

120

cgggtgagta acacgtgggt aacctgcctt atggaggggg ataacagaga gaaatcactg

180

ctaataccgc ataagcacac attgccgcat ggcagagtgt gaaaagattt atcgccataa

240

gatggacccg cgtctgatta gccagttggc agggtaaaag cctaccaaag caacgatcag

300

tagccgatct gagaggatga ccggccacat tgggactgag acacggccca aactcctacg

360

ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagcg acgccgcgtg

420

agtgaagaag tatttcggta tgtaaagctc tatcagcagg gaagataatg acagtacctg

480

actaagaagc cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gggcaagcgt

540

tatccggatt tactgggtgt aaagggagcg tagacggaat ggcaagtctg aagtgaaaac

600

cctgggctca acctggggac tgctttggaa actgttgttc tagagtgttg gagaggtaag

660

tggaattctt ggtgtagcgg tgaaatgcgt agatatcagg aagaacaccg gaggcgaagg

720

cggcttactg gacaataact gacgttgagg ctcgaaagcg tggggatcaa acaggattag

780

ataccctggt agtccacgct gtaaacgatg aatactaggt gtcggggagc aaagcatctc

840

ggtgccgtcg ctaacgcaat aagtattcca cctggggagt acgttcgcaa gaatgaaact

900

caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg

960

cgaagaacct taccaagtct tgagatccca ttgacagagt gtgtaatgca ttttcccttc

1020

ggggcaatgg tgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt

1080

aagtcccgca acgagcgcaa cccctatagt tagtagccag cagtaagatg ggcactctaa

1140

ctagactgcc agggataacc tggaggaagg cggggatgac gtcaaatcat catgcccctt

1200

atgacttggg ctacacacgt gctacaatgg cgtaaacaaa gggaagcaag agggtgacct

1260

taagcaaatc tcaaaaataa cgtctcagtt cggactgtag tctgcaaccc gactacacga

1320

agctggaatc gctagtaatc gcagatcagc atgctgcggt gaatacgttc ccgggtcttg

1380

tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg gtaatgcccg aagtcaatgt tccaagagag

1440

gaagctgccg aaggcaggac tgatgactgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtatcgg

1500

aaggtgcggc tggatcacct cctttct

1527

<210> 1383

<211> 1506

<212> DNA

<213> Orientia tsutsugamushi

<400> 1383

tcaaacttaa gagtttgatc ctggctcaga acgaacgctg gcggcatgcc taacacatgc

60

aagtcgaacg aattaatgct gagcttgctt agcattaatt agtggcaaac gggtgagtaa

120

cacgtgggaa tctgcccatc agtacggaat aacatttaga aataagtgct aataccgtat

180

gccctctaca aggaggaaag atttatcgct gatggatgag cccgcggcag attaggtagt

240

tggtaaggta atggcttacc aagcctgtga tctgtagctg gtctgagagg acgaacagcc

300

acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacggggggc agcagtgggg aatattggac

360

aatgggcgaa agcctgatcc agcaatgccg cgtgagtgat gaaggcctta gggttgtaaa

420

gctcttttag tagggatgat aatgacagta cctacagaaa aagccccggc taactccgtg

480

ccagcagccg cggtaagacg gagggggcta gcgttgttcg gaattactgg gcgtaaaggg

540

cgcgtaggcg gtttaataag ttaggagtga aatcccgggg cttaaccctg gaactgcttc

600

taaaactgtt aggctagagt gtggtagagg atgatggaat ttctagtgta gaggtaaaat

660

tcttagatat tagaaggaac accagtggcg aaagctgtca tctgggccat tactgacgct

720

gaggcgcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgctgtaaac

780

gatgagtgct agatattggg ggatttttct ttcagtttcg tagctaacgc attaagcact

840

ccgcctgggg agtacggtcg caagattaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa

900

gcggtggagc atgcggttta attcgatgat ccgcgaaaaa ccttaccaac tcttgacatg

960

gtagtcgcga aaaatggaga catttttctt cagtttggct ggactacaca caggtgttgc

1020

atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1080

ttattcttat ttgccagcgg gtaatgccgg gaactatagg aaaactgccg gtgctaagcc

1140

ggaggaaggt ggggatgagg tcaagtcatc atggccctta tgagttgggc tacacgcgtg

1200

ctacaatggt acctacagaa tgatgcaata cggtaacgtg gagctaatca ttaaaaggta

1260

tctcagttcg gattgcactc tgcaactcga gtgcatgaag tcggaatcgc tagtaatcgc

1320

ggatcagcat gccgcggtga atacgttctc gggccttgta cacactgccc gtcgcaccat

1380

gggagtcagt ggtacctgaa gttggtgagc taacgtaaga ggcagctaac cacggtagaa

1440

ctggtgactg gggtaaagtc gtaacaaggt agccgtaggg gaacctgcgg ctggattacc

1500

tccttt

1506

<210> 1384

<211> 1451

<212> DNA

<213> Ornithinibacillus bavariensis

<400> 1384

ccttcggggt gaaagtagtg gatcgagcgg cggacgggtg agtaacacgt gggcaacctg

60

cctgtaagac tgggataact cgcggaaacg cgagctaata ccggataata ctttttatca

120

catggtaaga agatgaaagg cggcgtaagc tgtcacttac agatgggccc gcggcgcatt

180

agctagttgg tgaggtaacg gctcaccaag gcgacgatgc gtagccgacc tgagagggtg

240

atcggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtagggaat

300

cttccgcaat ggacgaaagt ctgacggagc aacgccgcgt gagtgatgaa ggttttcgga

360

ttgtaaaact ctgttgttag ggaagaacaa gtacaagagt aactgcttgt accttgacgg

420

tacctaacca gaaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc

480

gagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag cgcgcgcagg cggttcttta agtctgatgt

540

gaaagcccac ggcttaaccg tggagggtca ttggaaactg gaggacttga gtgcagaaga

600

ggagagtgga attccacgtg tagcggtgaa atgcgtagag atgtggagga acaccagtgg

660

cgaaggcgac tctctggtct gtaactgacg ctgaggcgcg aaagcgtggg gagcgaacag

720

gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaggtgtta gggggtttcc

780

gccccttagt gctgaagtta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg gccgcaaggc

840

tgaaactcaa aagaattgac gggggccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa

900

gcaacgcgaa gaaccttacc aggtcttgac atcctctgac caccctagag atagggcttt

960

cccttcgggg acagagagac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

1020

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgatcttagt tgccagcatt cagttgggca

1080

ctctaaggtg actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg

1140

ccccttatga cctgggctac acacgtgcta caatggatgg tacaaagggc agcgaagccg

1200

cgaggtgaag caaatcccat aaaaccattc tcagttcgga ttgcaggctg caactcgcct

1260

gcatgaagcc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc cgcggtgaat acgttcccgg

1320

gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagttggtaa cacccgaagt cggtgaggta

1380

accttttgga gccagccgcc taaggtggga ccaatgattg gggtgaagtc gtaacaaggt

1440

agccgtgtcg a

1451

<210> 1385

<211> 1504

<212> DNA

<213> Ornithinibacillus sp. 7-10AIA

<400> 1385

tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca agtcgagcga gtgaaattaa

60

ctgatccctt cggggtgacg ttaatggatc tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggc

120

aacctgcctg taagactggg ataactcgcg gaaacgtgag ctaataccgg ataacacttc

180

gaaccacatg gtttgaagat gaaaggcggc gcaagctgtc acttacagat gggcccgcgg

240

cgcattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgatgcgtag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc cgcaatggac gaaagtctga cggagcaacg ccgcgtgagt gatgaaggtt

420

ttcggattgt aaaactctgt tgttagggaa gaacaagtac aatagtaact gattgtacct

480

tgacggtacc taaccagaaa gccccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

gggggcaagc gttgtccgga attattgggc gtaaagcgcg cgcaggcggt cctttaagtc

600

tgatgtgaaa gcccacggct taaccgtgga gggtcattgg aaactggagg acttgagtgc

660

agaagaggag agtggaattc cacgtgtagc ggtgaaatgc gtagagatgt ggaggaacac

720

cagtggcgaa ggcgactctc tggtctgtaa ctgacgctga ggcgcgaaag cgtggggagc

780

gaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag gtgttagggg

840

gtttccgccc cttagtgctg aagttaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggctgaa actcaaaaga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ctctgaccac cctagagata

1020

gggctttccc ttcggggaca gagtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat tcttagttgc cagcatttag

1140

ttgggcactc taaggagact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1200

catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggatggtac aaagggcagc

1260

aaaaccgcga ggtcgagcaa atcccataaa accattctca gttcggattg caggctgcaa

1320

ctcgcctgca tgaagccgga atcgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag ttggtaacac ccgaagtcgg

1440

tgaggtaacc ttttggagcc agccgcctaa ggtgggacca atgattgggg tgaagtcgta

1500

acaa

1504

<210> 1386

<211> 1420

<212> DNA

<213> Oscillibacter sp. G2

<220>

<221> modified_base

<222> (72)..(72)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1386

ggacctggct caggacgaac gctggcggcg tgcttaacac atgcaagtcg aacggagcac

60

ccttgaatga gntttcggyc aaaggaaagg aatgcttagt ggcggactgg tgagtaacgc

120

gtgaggaacc tgcctttcag agggggacaa cagctggaaa cggctgctaa taccgcatga

180

cgcattcgga tggcatcatc tgaatgccaa agatttatcg ctgaaagatg gcctcgcgtc

240

tgattagata gttggcgggg taacggccca ccaagtcgac gatcagtagc cggactgaga

300

ggttgaccgg ccacattggg actgagatac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg

360

ggaatattgg gcaatgggcg caagcctgac ccagcaacgc cgcgtgaagg aagaaggctt

420

tcgggttgta aacttctttt aagagggaag agcagaagac ggtacctctt gaataagcca

480

cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgttg tccggattta

540

ctgggtgtaa agggcgtgca gccgggtgyg caagtcagat gtgaaatctc agggctcaac

600

cctgaaactg catttgaaac tgtgygtctt gagtgccgga gaggtaatcg gaattccttg

660

tgtagcggtg aaatgcgtag atataaggaa gaacaccagt ggcgaaggcg gattactgga

720

cggtaactga cggtgaggcg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag

780

tccacgctgt aaacgatcaa tactaggtgt gcggggactg accccctgcg tgccggagtt

840

aacacaataa gtattgcacc tggggagtac gatcgcaagg ttgaaactca aaggaattga

900

cgggggcccg cacaagcggt ggattatgtg gtttaattcg aagcaacgcg agaaccttac

960

caggtcttga catcctgcta cgagtagaga tacatcaggt gcccttcggg gaaagcagag

1020

acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

1080

gagcgcaacc cctattgtta gttgctacgc aagagcactc tagcgagact gccgttgaca

1140

aaacggagga aggtggggac gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct gggctacaca

1200

cgtaatacaa tggcggagaa caaagggatg caaagccgcg aggcagagcg aaccccaaaa

1260

agccgtccca gttcggatcg caggctgcaa cccgcctgcg tgaagtcgga atcgctagta

1320

atcgtgggtc agcataccac ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac

1380

accatgagag tcgggaacac ccgaagtccg tagcctaacc

1420

<210> 1387

<211> 1534

<212> DNA

<213> Oscillibacter valericigenes

<400> 1387

atttatagag agtttgatcc tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca

60

agtcgaacgg agcacccttg attgaggttt cggccaaatg agaggaatgc ttagtggcgg

120

actggtgagt aacgcgtgag gaacctgcct ttcagagggg gacaacagtt ggaaacgact

180

gctaataccg catgatacat ttgggcgaca tcgcttgaat gtcaaagatt tatcgctgaa

240

agatggcctc gcgtctgatt agatagttgg tgaggtaacg gcccaccaag tcgacgatca

300

gtagccggac tgagaggttg accggccaca ttgggactga gatacggccc agactcctac

360

gggaggcagc agtggggaat attgggcaat ggacgcaagt ctgacccagc aacgccgcgt

420

gaaggaagaa ggctttcggg ttgtaaactt cttttaaggg ggaagagtag aagacggtac

480

cccttgaata agccacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag

540

cgttgtccgg atttactggg tgtaaagggc gtgtagccgg gaaggtaagt cagatgtgaa

600

atctgggggc tcaacctcca aactgcattt gaaactactt ttcttgagta tcggagaggt

660

aatcggaatt ccttgtgtag cggtgaaatg cgtagatata aggaagaaca ccagtggcga

720

aggcggatta ctggacgaca actgacggtg aggcgcgaaa gcgtggggag caaacaggat

780

tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg atcaatacta ggtgtgcggg gactgacccc

840

ctgcgtgccg cagttaacac aataagtatt gcacctgggg agtacgatcg caaggttgaa

900

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggatt atgtggttta attcgaagca

960

acgcgaagaa ccttaccagg acttgacatc ctactaacga ggtagagata cgtcaggtgc

1020

ccttcgggga aagtagagac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

1080

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc tattgttagt tgctacgcaa gagcactcta

1140

gcgagactgc cgttgacaaa acggaggaag gtggggacga cgtcaaatca tcatgcccct

1200

tatgtcctgg gctacacacg taatacaatg gcggtcaaca gagggatgca aagccgtgag

1260

gtggagcgaa cccctaaaag ccgtctcagt tcggatcgca ggctgcaact cgcctgcgtg

1320

aagtcggaat cgctagtaat cgcggatcag aatgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt

1380

gtacacaccg cccgtcacac catgagagtc gggaacaccc gaagtccgta gcctaacagc

1440

aatgagggcg cggccgaagg tgggtttgat aattggggtg aagtcgtaac aaggtagccg

1500

tatcggaagg tgcggctgga tcacctcctt tcta

1534

<210> 1388

<211> 1450

<212> DNA

<213> Oscillospira guilliermondii

<400> 1388

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggagcgccaa ggaaggagtt

60

ttcggacaac ggatttggct gcttagtggc ggactggtga gtaacgcgtg aggaacctgc

120

ccttgagtgg gggacaacgg ttggaaacga ctgctaatac cgcatgatgt attgtcggga

180

catcccggcg ataccaaaga tttatcgctc aaggatggcc tcgcgtctga ttagatagtt

240

ggtgaggtaa cggctcacca agtcgacgat cagtagccgg actgagaggt tggccggcca

300

cattgggact gagatacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgggca

360

atggacgcaa gtctgaccca gcaacgccgc gtgaaggaag aaggctttcg ggttgtaaac

420

ttcttttaag ggggaagagc agaagacggt accccttgaa taagccacgg ctaactacgt

480

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggcg agcgttgtcc ggatttactg ggtgtaaagg

540

gcgtgcagcc gggtctgcaa gtcagatgtg aaatccacgg gcttaacccg tgaactgcat

600

ttgaaactgc gggtcttgag tatcggagag gtaatcggaa ttcctggtgt agcggtgaaa

660

cgcgtagata tcaggaagaa caccagtggc gaaggcggat tactggacga caactgacgg

720

tgaggcgcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgctgtaaa

780

cgatcaatac taggtgtgcg gggactaacc cctcgcgtgc cggagtcaac acaataagta

840

ttgcacctgg ggagtacgat cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac

900

aagcggtgga ttatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacca aggcttgaca

960

tggagaggct cggcttagag ataggtcttt cccttcgggg acttctcaca caggtggtgc

1020

atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1080

ctattgttag ttgctacgca agagcactct agcgagactg ccgttgacaa aacggaggaa

1140

ggtggggacg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgtcttg ggctacacac gtaatacaat

1200

ggcggataca aagggatgcg aaaccgcgag gtggagcgaa ccccgaaaag ccgtctcagt

1260

tcggatcgca ggctgcaacc cgcctgcgtg aagtcggaat cgctagtaat cgtgggtcag

1320

cataccacgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgagagtc

1380

gggaacaccc gaagtccgta gcctaaccgc aaggggggcg cggccgaagg tgggttcgat

1440

aattggggtg

1450

<210> 1389

<211> 1539

<212> DNA

<213> Oxalobacter formigenes

<400> 1389

tgaactgaag agtttgatcc tggctcagat tgaacgctgg cggcatgctt tacacatgca

60

agtcgaacgg cagcatgggg gcaaccctga tggcgagtgg cgaacgggtg agtaatatat

120

cggaacgtac ccaagagtgg gggacaacca gtcgaaagat tggctaatac cgcatacgat

180

ctaaggatga aagtggggga ccttcgggcc tcacgctcct ggagcggccg atagctgatt

240

agctagttgg tggggtaaag gcctaccaag gcgatgatca gtagctggtc tgagaggacg

300

atcagccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

360

tttggacaat gggggaaacc ctgatccagc aatgccgcgt gagtgaagaa ggccttcggg

420

ttgtaaagct cttttgtcag ggaagaaatt gattgggcta atatcccgat tagatgacgg

480

tacctgaaga ataagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc

540

gagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgtgcgcagg cggttgtgta agacagatgt

600

gaaatgcccg ggctcaacct gggaattgca tttgtgactg cacggctaga gtgtgtcaga

660

ggggggtaga attccacgtg tagcagtgaa atgcgtagat atgtggagga ataccgatgg

720

cgaaggcagc cccctgggat aacactgacg ctcatgcacg aaagcgtggg gagcaaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgccctaa acgatgtcga ctagttgttg ggtcttaatt

840

gacttagtaa cgcagctaac gcgtgaagtc gaccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta

900

aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga tgatgtggat taattcgatg

960

caacgcgaaa aaccttacct acccttgaca tgtcaggaat cccgaagaga tttgggagtg

1020

ctcgaaagag agcctgaaca caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtcattag ttgctacgaa agggcactct

1140

aatgaaactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc ctcatggccc

1200

ttatgggtag ggcttcacac gtcatacaat ggtgcataca gagggttgcc aacccgagag

1260

ggggagctaa tctcagaaag tgcatcgtag tccggattga agtctgcaac tcgacttcat

1320

gaagttggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgtcgcg gtgaatacgt tcccgggtct

1380

tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagc gggttttacc agaagtaggt agcttaaccg

1440

taaggagggc gcttaccacg gtaggattcg tgactggggt gaagtcgtaa caaggtagcc

1500

gtatcggaag gtgcggctgg atcacctcct ttctagaga

1539

<210> 1390

<211> 1523

<212> DNA

<213> Paenibacillus barcinonensis

<400> 1390

aacgctggcg gcatgcctaa tacatgcaag tcgagcggac ttgaagagaa gcttgcttct

60

ctgatggtta gcggcggacg ggtgagtaac acgtaggcaa cctgccctca agcttgggac

120

aactaccgga aacggtagct aataccgaat acttgttttc ttcgcctgaa gagaactgga

180

aagacggagc aatctgtcac ttgaggatgg gcctgcggcg cattagctag ttggtgaggt

240

aacggctcac caaggcgacg atgcgtagcc gacctgagag ggtgatcggc cacactggga

300

ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatcttccg caatgggcga

360

aagcctgacg gagcaatgcc gcgtgagtga tgaaggtttt cggatcgtaa agctctgttg

420

ccagggaaga acgcttggga gagtaactgc tcccaaggtg acggtacctg agaagaaagc

480

cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gggcaagcgt tgtccggaat

540

tattgggcgt aaagcgcgcg caggcggtca tgtaagtctg gtgtttaatc ccggggctca

600

accccggatc gcactggaaa ctgggtgact tgagtgcaga agaggagagt ggaattccac

660

gtgtagcggt gaaatgcgta gagatgtgga ggaacaccag tggcgaaggc gactctctgg

720

gctgtaactg acgctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta

780

gtccacgccg taaacgatga atgctaggtg ttaggggttt cgataccctt ggtgccgaag

840

ttaacacatt aagcattccg cctggggagt acggtcgcaa gactgaaact caaaggaatt

900

gacggggacc cgcacaagca gtggagtatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct

960

taccaggtct tgacatccaa ctaacgaggt agagatacgt taggtgccct tcggggaaag

1020

ttgagacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1080

gcaacgagcg caacccttga tcttagttgc cagcatttcg gatgggcact ctaaggtgac

1140

tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc

1200

tgggctacac acgtactaca atggccggta caacgggcag tgaaaccgcg aggtggaacg

1260

aatcctaaaa agccggtctc agttcggatt gcaggctgca actcgcctgc atgaagtcgg

1320

aattgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccacgaga gtttataaca cccgaagtcg gtggggtaac cgcaaggagc

1440

cagccgccga aggtgggata gatgattggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtatcgga

1500

aggtgcggct ggatcacctc ttt

1523

<210> 1391

<211> 931

<212> DNA

<213> Paenibacillus barengoltzii

<220>

<221> modified_base

<222> (891)..(891)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1391

gcggagttta tcgggagctt gctcctgata aacttagcgg cggacgggtg agtaacacgt

60

aggcaacctg cccgtaagac tgggataact accggaaacg gtagctaata ccggatacgc

120

aagtctctcg catgaggggc ttgggaaagg cggagcaatc tgtcacttac ggatgggcct

180

gcggcgcatt agctagttgg tggggtaacg gctcaccaag gcgacgatgc gtagccgacc

240

tgagagggtg aacggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

300

agtagggaat cttccgcaat ggacgaaagt ctgacggagc aacgccgcgt gagtgatgaa

360

ggttttcgga tcgtaaagct ctgttgccag ggaagaacgt ccgttagagt aactgctaac

420

ggagtgacgg tacctgagaa gaaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

480

cgtagggggc gagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag cgcgcgcagg cggctgttta

540

agtctggtgt ttaatcctgg ggctcaaccc cgggtcgcac tggaaactgg acagcttgag

600

tgcagaagag gagagtggaa ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa

660

caccagtggc gaaggcgact ctctgggctg taactgacgc tgaggcgcga aagcgtgggg

720

agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgaatgc taggtgttag

780

gggtttcgat acccttggtg ccgaagttaa cacattaagc attccgcctg gggagtacgg

840

ccgcaaggct gaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcagtgg ngtatgtggt

900

ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc a

931

<210> 1392

<211> 968

<212> DNA

<213> Paenibacillus chibensis

<400> 1392

gcggacttga tggagagctt gctctcctga tggttagcgg cggacgggtg agtaacacgt

60

aggcaacctg cctgcaagac cgggataacc cacggaaacg tgagctaata ccggatatct

120

catttcctct cctgagggaa tgatgaaaga cggagcaatc tgtcacttgc ggatgggcct

180

gcggcgcatt agctagttgg tgaggtaacg gctcaccaag gcgacgatgc gtagccgacc

240

tgagagggtg aacggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

300

agtagggaat cttccgcaat gggcgaaagc ctgacggagc aacgccgcgt gagtgatgaa

360

ggttttcgga tcgtaaagct ctgttgccag ggaagaacgt ccggtagagt aactgctatc

420

ggagtgacgg tacctgagaa gaaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

480

cgtagggggc aagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag cgcgcgcagg cggtcattta

540

agtctggtgt ttaaggccaa ggctcaacct tggttcgcac tggaaactgg gtgacttgag

600

tgcagaagag gagagtggaa ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tgtggaggaa

660

caccagtggc gaaggcgact ctctgggctg taactgacgc tgaggcgcga aagcgtgggg

720

agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgaatgc taggtgttag

780

gggtttcgat acccttggtg ccgaagttaa cacattaagc attccgcctg gggagtacgg

840

tcgcaagact gaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcagtgg agtatgtggt

900

ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc aggtcttgac atccctctga ccggtctaga

960

gatagacc

968

<210> 1393

<211> 1408

<212> DNA

<213> Paenibacillus cookii

<220>

<221> modified_base

<222> (8)..(8)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1393

cggagttngt tttgaaagct tgctttcaaa acaacttagc ggcggacggg tgagtaacac

60

gtaggcaacc tgccccttag actgggataa ctaccggaaa cggtagctaa taccggataa

120

tttctttttt ctcctgaagg aagaatgaaa gacggagcaa tctgtcactg agggatgggc

180

ctgcggcgca ttagctagtt ggtggggtaa cggcccacca aggcgacgat gcgtagccga

240

cctgagaggg tgaacggcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

300

gcagtaggga atcttccgca atggacgaaa gtctgacgga gcaacgccgc gtgagtgatg

360

aaggttttcg gatcgtaaag ctctgttgcc agggaagaac gtccggtaga gtaactgcta

420

ccggagtgac ggtacctgag aagaaagccc cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacgtagggg gcaagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa agcgcgcgca ggcggtcatt

540

taagtctggt gtttaaacct tgggctcaac ctaaggtcgc actggaaact gggtgacttg

600

agtacagaag aggaaagtgg aattccacgt gtagcggtga aatgcgtaga tatgtggagg

660

aacaccagtg gcgaaggcga ctttctgggc tgtaactgac gctgaggcgc gaaagcgtgg

720

ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt gctaggtgtt

780

aggggtttcg atacccttgg tgccgaagtt aacacagtaa gcactccgcc tggggagtac

840

ggtcgcaaga ctgaaactca aaggaattga ggggacccgc acaagcagtg gagtatgtgg

900

tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catccctctg aatccactag

960

agatagtggc ggccttcggg acagaggaga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1020

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttaactttag ttgccagcag

1080

gtaaggctgg gcactctaga gtgactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg

1140

tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgta ctacaatggc cggtacaacg

1200

ggaagcgaag ccgcgaggtg gagccaatcc catcaaagcc ggtctcagtt cggattgcag

1260

gctgcaactc gcctgcatga agtcggaatt gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt

1320

gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc acgagagttt acaacacccg

1380

aagtcggtgg ggtaacccgc aagggagc

1408

<210> 1394

<211> 1455

<212> DNA

<213> Paenibacillus durus

<220>

<221> modified_base

<222> (103)..(103)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (141)..(142)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1394

agcggcggac gggtgagtaa cacgtaggca acctgcccct tggactggga taactaccgg

60

aaacggtagc taataccgga taattcctct tagctcctgc tangaggctg aaaggcggag

120

caatctgtca ccaagggatg nncctgcggc gcattagcta gttggtgggg taacggctca

180

ccaaggcgac gatgcgtagc cgacctgaga gggtgaacgg ccacactggg actgagacac

240

ggcccagact cctacgggag gcagcagtag ggaatcttcc gcaatgggcg aaagcctgac

300

ggagcaacgc cgcgtgagtg atgaaggttt tcggatcgta aagctctgtt gccagggaag

360

aacgtcttgt agagtaactg ctacaagagt gacggtacct gagaagaaag ccccggctaa

420

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggggcaagcg ttgtccggaa ttattgggcg

480

taaagcgcgc gcaggcggct gtttaagtct ggtgtttaaa ccatgggctc aacctgtggt

540

cgcactggaa actggacagc ttgagtgcag aagaggaaag tggaattcca cgtgtagcgg

600

tgaaatgcgt agagatgtgg aggaacacca gtggcgaagg cgactttctg ggctgtaact

660

gacgctgagg cgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc

720

gtaaacgatg agtgctaggt gttaggggtt tcgataccct tggtgccgaa gttaacacag

780

taagcactcc gcctggggag tacggtcgca agactgaaac tcaaaggaat tgacggggac

840

ccgcacaagc agtggagtat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc

900

ttgacatccc tctgaatcgt ctagagatga tggcgcggcc ttcgggacag aggagacagg

960

tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1020

caacccttga ctttagttgc cagcaggtca agctgggcac tctagagtga ctgccgagtg

1080

acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga cctgggctac

1140

acacgtacta caatggccgg tacaacggga agcgaagcgc gaggcgggag ccaatcttag

1200

aaagccggtc tcagttcgga ttgcaggctg caactcgcct gcatgaagtc ggaattgcta

1260

gctaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgca atgacgttcc cgggtcttgt acacaccgcc

1320

cgtcacacca cgagagttta caacacccga agtcggtggg gtaaccgcaa ggagccagcc

1380

gccgaagtgg ggtagatgat tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtat cggaaggtgc

1440

ggctggatca cctcc

1455

<210> 1395

<211> 1440

<212> DNA

<213> Paenibacillus glucanolyticus

<220>

<221> modified_base

<222> (179)..(179)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (198)..(198)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (446)..(446)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (532)..(532)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (535)..(535)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (595)..(595)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (597)..(597)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (729)..(729)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (818)..(818)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (902)..(902)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (953)..(953)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (966)..(966)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1072)..(1072)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1125)..(1125)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1363)..(1363)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1400)..(1400)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1395

gagagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaatacat gcaagtcgag

60

cggacttgat ggagtgcttg cactcttgag agttagcggc ggacgggtga gtaacacgta

120

ggcaacctgc cctcaagact gggataacta ccggaaacgg tagctaatac cggataatnt

180

attacatagc attatgtnat aatgaaagac ggagcaatct gtcacttggg gatgggcctg

240

cggcgcatta gctagttggt ggggtaacgg cccaccaagg cgacgatgcg tagccgacct

300

gagagggtga acggccacac tgggactgag acacggccca gtctcctacg ggaggcagca

360

gtagggaatc ttccgcaatg ggcgaaaaac tgacggagca acgccgcgtg agtgatgaag

420

gttttcggat cgtaaagctc tgttgncaag gaagaacgtc ttctagagta actgttatga

480

gagtgacggt acttgagaag aaagccccgg ctaactacgt gccagcagcc gnggnaatac

540

gtagggggca agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaagc gcgcgcaggc ggtcntntaa

600

gtctggtgtt taaacccggg gctcaacttc gggtcgcact ggaaactggg ggacttgagt

660

gcagaagagg agagtggaat tccacgtgta gcggtgaaat gcgtagatat gtggaggaac

720

accagtggng aaggcgactc tctgggctgt aactgacgct gaggcgcgaa agcgtgggga

780

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgttnaa acgatgaatg ctaggtgtta

840

ggggtttcga tacccttggt gccgaagtta acacattaag cattccgcct ggggagtacg

900

gncgcaagca ctgaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcagt ggngtatgtg

960

gtttanttcg aagcaacgcg aagaacctta ccaagtcttg acatccctct gaatctgcta

1020

gagatagagg cggccttcgg gacagaggag acaggtggtg catggttgtc gncagctcgt

1080

gtcgtgagat gttgggttat gtcccgcaac gagcgcaacc cttgntttta gttgccagca

1140

ctaagggtgg gcactctaga atgactgccg gtgacaaacc ggaggaaggc ggcgtatgac

1200

gtcaaatcat catgcccctt atgacttggg ctacacacgt actacaatgg ctggtacaac

1260

gggaagcgaa gccgcgaggt ggagccaatc ctataaaagc cagtctcagc tcggattgca

1320

ggctgcaact cgcctgcatg aagtcggaat tgctagtaat cgnggatcag catgccgcgg

1380

tgaatacgtt cccgggtctn gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt tacaacaccc

1440

<210> 1396

<211> 1395

<212> DNA

<213> Paenibacillus lactis

<400> 1396

ggagtgcttg cactcctgag atttagcggc ggacgggtga gtaacacgta ggcaacctgc

60

cctcaagact gggataacta ccggaaacgg tagctaatac cggataggat atttggctgc

120

atggccgaat atggaaaggc ggagcaatct gtcacttgag gatgggcctg cggcgcatta

180

gctagttggt ggggtaatgg cctaccaagg cgacgatgcg tagccgacct gagagggtga

240

acggccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtagggaatc

300

ttccgcaatg gacgaaagtc tgacggagca acgccgcgtg agtgatgaag gttttcggat

360

cgtaaagctc tgttgccagg gaagaacgcc agagagagta actgctcttt gggtgacggt

420

acctgagaag aaagccccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggggca

480

agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaagc gcgcgcaggc ggttctttaa gtctggtgtt

540

taaacccgga gcttaacttc gggacgcact ggaaactggg gaacttgagt gcagaagagg

600

agagtggaat tccacgtgta gcggtgaaat gcgtagatat gtggaggaac accagtggcg

660

aaggcgactc tctgggctgt aactgacgct gaggcgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

720

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatgct aggtgttagg ggtttcgata

780

cccttggtgc cgaagttaac acattaagca ttccgcctgg ggagtacggt cgcaagactg

840

aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcagtgga gtatgtggtt taattcgaag

900

caacgcgaag aagcttacca ggtcttgaca tccctttgac ccctctagag atagaggttt

960

ccttcgggac agaggagaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

1020

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gatcttagtt gccagcacgt aatggtgggc

1080

actctaaggt gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat

1140

gccccttatg acctgggcta cacacgtact acaatggctg gtacaacggg aagcgaagcc

1200

gcgaggtgga gccaatccta aaaagccagt ctcagttcgg attgcaggct gcaactcgcc

1260

tgcatgaagt cggaattgct agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg

1320

ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttaca acacccgaag tcggtggggt

1380

aaccgcaagg agcca

1395

<210> 1397

<211> 1505

<212> DNA

<213> Paenibacillus lautus

<220>

<221> modified_base

<222> (1118)..(1118)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1397

cgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca agtcgagcgg acttgatgga gtgcttgcac

60

tcctgaaggt tagcggcgga cgggtgagta acacgtaggc aacctgccct caagactggg

120

ataactaccg gaaacggtag ctaataccgg ataatttatt tcacagcatt gtggaataat

180

gaaagacgga gcaatctgtc acttggggat gggcctgcgg cgcattagct agttggtggg

240

gtaacggccc accaaggcga cgatgcgtag ccgacctgag agggtgaacg gccacactgg

300

gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta gggaatcttc cgcaatgggc

360

gaaagcctga cggagcaacg ccgcgtgagt gatgaaggtt ttcggatcgt aaagctctgt

420

tgccaaggaa gaacgtcttc tagagtaact gctaggagag tgacggtact tgagaagaaa

480

gccccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggggcaagc gttgtccgga

540

attattgggc gtaaagcgcg cgcaggcggt tctttaagtc tggtgtttaa acccgaggct

600

caacttcggg tcgcactgga aactggggga cttgagtgca gaagaggaga gtggaattcc

660

acgtgtagcg gtgaaatgcg tagatatgtg gaggaacacc agtggcgaag gcgactctct

720

gggctgtaac tgacgctgag gcgcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg

780

tagtccacgc cgtaaacgat gaatgctagg tgttaggggt ttcgataccc ttggtgccga

840

agttaacaca ttaagcattc cgcctgggga gtacggtcgc aagactgaaa ctcaaaggaa

900

ttgacgggga cccgcacaag cagtggagta tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac

960

cttaccaagt cttgacatcc ctctgaatcc tctagagata gaggcggcct tcgggacaga

1020

ggtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg

1080

caacgagcgc aacccttgat tttagttgcc agcacttngg gtgggcactc tagaatgact

1140

gccggtgaca aaccggagga aggcggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgactt

1200

gggctacaca cgtactacaa tggctggtac aacgggaagc gaagccgcga ggtggagcca

1260

atcctataaa agccagtctc agttcggatt gcaggctgca actcgcctgc atgaagtcgg

1320

aattgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccacgaga gtttacaaca cccgaagtcg gtggggtaac ccgcaaggga

1440

gccagccgcc gaaggtgggg tagatgattg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtatcg

1500

gaagg

1505

<210> 1398

<211> 1500

<212> DNA

<213> Paenibacillus pabuli

<220>

<221> modified_base

<222> (77)..(77)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1398

gatcctggct caggacgaac gctggcggca tgcctaatac atgcaagtcg agcggagttg

60

agagaaagct tgctttnttg atacttagcg gcggacgggt gagtaacacg taggcaacct

120

gccctcaagt ttgggacaac taccggaaac ggtagctaat accgaatagt tgttttcttc

180

gcctgaagag aactggaaag acggagcaat ctgtcacttg gggatgggcc tgcggcgcat

240

tagctagttg gtggggtaac ggctcaccaa ggcgacgatg cgtagccgac ctgagagggt

300

gatcggccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtagggaa

360

tcttccgcaa tgggcgaaag cctgacggag caatgccgcg tgagtgatga aggttttcgg

420

atcgtaaagc tctgttgcca gggaagaacg cttgggagag taactgctct caaggtgacg

480

gtacctgaga agaaagcccc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggggg

540

caagcgttgt ccggaattat tgggcgtaaa gcgcgcgcag gcggtcattt aagtctggtg

600

tttaatcccg gggctcaacc ccggatcgca ctggaaactg ggtgacttga gtgcagaaga

660

ggagagtgga attccacgtg tagcggtgaa atgcgtagat atgtggagga acaccagtgg

720

cgaaggcgac tctctgggct gtaactgacg ctgaggcgcg aaagcgtggg gagcaaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaggtgtta ggggtttcga

840

tacccttggt gccgaagtta acacattaag cactccgcct ggggagtacg gtcgcaagac

900

tgaaactcaa aggaattgac ggggacccgc acaagcagtg gagtatgtgg tttaattcga

960

agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catccctctg accggtacag agatgtacct

1020

ttccttcggg acagaggaga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg

1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgatcttag ttgccagcac ttcgggtggg

1140

cactctaagg tgactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca

1200

tgccccttat gacctgggct acacacgtac tacaatggcc ggtacaacgg gctgtgaagc

1260

cgcgaggtgg aacgaatcct aaaaagccgg tctcagttcg gattgcaggc tgcaactcgc

1320

ctgcatgaag tcggaattgc tagtaatcgc ggatcagcat gccgcggtga atacgttccc

1380

gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagtttat aacacccgaa gtcggtgggg

1440

taaccgcaag gagccagccg ccgaaggtgg gatagatgat tggggtgaag tcgtaacaag

1500

<210> 1399

<211> 1491

<212> DNA

<213> Paenibacillus polymyxa

<400> 1399

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc ggggttaatt agaagcttgc

60

ttctaactaa cctagcggcg gacgggtgag taacacgtag gcaacctgcc cacaagactg

120

ggataactac cggaaacggt agctaatacc cgatgcctcc ttttcctgca tgggagaagg

180

aggaaaggcg gagcaatctg tcacttgtgg atgggcctgc ggcgcattag ctagttggtg

240

gggtaaaggc ctaccaaggc gacgatgcgt agccgacctg agagggtgat cggccacact

300

gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tccgcaatgg

360

gcgaaagcct gacggagcaa cgccgcgtga gtgatgaagg ttttcggatc gtaaagctct

420

gttgccaggg aagaacgtct tgtagagtaa ctgctacaag agtgacggta cctgagaaga

480

aagccccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggggcaa gcgttgtccg

540

gaattattgg gcgtaaagcg cgcgcaggcg gctctttaag tctggtgttt aatcccgagg

600

ctcaacttcg ggtcgcactg gaaactgggg agcttgagtg cagaagagga gagtggaatt

660

ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaaca ccagtggcga aggcgactct

720

ctgggctgta actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct

780

ggtagtccac gccgtaaacg atgaatgcta ggtgttaggg gtttcgatac ccttggtgcc

840

gaagttaaca cattaagcat tccgcctggg gagtacggtc gcaagactga aactcaaagg

900

aattgacggg gacccgcaca agcagtggag tatgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga

960

accttaccag gtcttgacat ccctctgacc ggtctagaga taggaccttt ccttcgggac

1020

agaggagaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc

1080

ccgcaacgag cgcaaccctt atgcttagtt gccagcaggt caagctgggc actctaagca

1140

gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg

1200

acctgggcta cacacgtact acaatggccg gtacaacggg aagagcgaag gagcgatctg

1260

gagccaatcc tagaaaagcc ggtctcagtt cggattgtag gctgcaactc gcctacatga

1320

agtcggaatt gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc ccgggtcttg

1380

tacacaccgc ccgtcacacc acgagagttt acaacacccg aagtcggtga ggtaaccgca

1440

aggagccagc cgccgaaggt ggggtagatg attggggtga agtcgtaaca a

1491

<210> 1400

<211> 968

<212> DNA

<213> Paenibacillus popilliae

<220>

<221> modified_base

<222> (51)..(52)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (54)..(54)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (59)..(59)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (112)..(112)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (114)..(114)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1400

cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gggcaagcgt nntncggant

60

tattgggcgt aaagcgcgcg caggcggtca tttaagtctg gtgtttaaac cntngggctc

120

aacctaaggt cgcactggaa actgggtgac ttgagtacag aagaggaaag tggaattcca

180

cgtgtagcgg tgaaatgcgt agatatgtgg aggaacacca gtggcgaagg cgactttctg

240

ggctgtaact gacgctgagg cgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt

300

agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaggt gttaggggtt tcgataccct tggtgccgaa

360

gttaacacag taagcactcc gcctggggag tacggtcgca agactgaaac tcaaaggaat

420

tgacggggac ccgcacaagc agtggagtat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc

480

ttaccaggtc ttgacatccc tctgaatcca ctagagatag tggcggcctt cgggacagag

540

gagacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

600

aacgagcgca acccttaact ttagttgcca gcaggtaagg ctgggcactc tagagtgact

660

gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct

720

gggctacaca cgtactacaa tggccggtac aacgggaagc gaagccgcga ggtggagcca

780

atcccatcaa agccggtctc agttcggatt gcaggctgca actcgcctgc atgaagtcgg

840

aattgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca

900

ccgcccgtca caccacgaga gtttacaaca cccgaagtcg gtggggtaac ccgcaaggga

960

gccagccg

968

<210> 1401

<211> 1496

<212> DNA

<213> Paenibacillus sp. CIP 101062

<400> 1401

tacatgcaag tcgagcggag ttaatcggga gcttgctcct ggttgactta gcggcggacg

60

ggtgagtaac acgtaggcaa cctgcccgta agaccgggat aactagcgga aacgttagct

120

aataccggat aatcaagttt ctcgcatggg ggacttggga aaggcggagc aatctgtcac

180

ttacggatgg gcctgcggcg cattagctag ttggtggggt aacggctcac caaggcgacg

240

atgcgtagcc gacctgagag ggtgaacggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc

300

ctacgggagg cagcagtagg gaatcttccg caatggacga aagtctgacg gagcaacgcc

360

gcgtgagtga agaaggtttt cggatcgtaa agctctgttg ccagggaaga acgtccgcta

420

gagtaactgc tagcggagtg acggtacctg agaagaaagc cccggctaac tacgtgccag

480

cagccgcggt aatacgtagg gggcaagcgt tgtccggaat tattgggcgt aaagcgcgcg

540

caggcggcta tttaagtctg gtgtttaatc ctggggctca accccgggtc gcactggaaa

600

ctgggtggct tgagtgcaga agaggagagt ggaattccac gtgtagcggt gaaatgcgta

660

gagatgtgga ggaacaccag tggcgaaggc gactctctgg gctgtaactg acgctgaggc

720

gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga

780

atgctaggtg ttaggggttt cgataccctt ggtgccgaag ttaacacatt aagcattccg

840

cctggggagt acggtcgcaa gactgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagca

900

gtggagtatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggtct tgacatcccc

960

ctgaccggta cagagatgta cctttccttc gggacagggg agacaggtgg tgcatggttg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgactt

1080

tagttgccag caggtcaagc tgggcactct agagtgactg ccggtgacaa accggaggaa

1140

ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtactacaat

1200

ggctggtaca acgggaagcg aaggagcgat ccggagcgaa tcctaaaaag ccagtctcag

1260

ttcggattgc aggctgcaac tcgcctgcat gaagtcggaa ttgctagtaa tcgcggatca

1320

gcatgccgcg gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt

1380

ttacaacacc cgaagtcggt gaggtaaccg caaggagcca gccgccgaag gtggggtaga

1440

tgattggggt gaagtcgtaa caaggtagcc gtatcggaag gtgcggttgg atcacc

1496

<210> 1402

<211> 965

<212> DNA

<213> Paenibacillus sp. HGF5

<220>

<221> modified_base

<222> (913)..(913)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1402

ggagtgcttg cactcctgag atttagcggc ggacgggtga gtaacacgta ggcaacctgc

60

cctcaagact gggataacta ccggaaacgg tagctaatac cggataggat atttggctgc

120

atggccgaat atggaaaggc ggagcaatct gtcacttgag gatgggcctg cggcgcatta

180

gctagttggt ggggtaatgg cctaccaagg cgacgatgcg tagccgacct gagagggtga

240

acggccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtagggaatc

300

ttccgcaatg gacgaaagtc tgacggagca acgccgcgtg agtgatgaag gttttcggat

360

cgtaaagctc tgttgccagg gaagaacgcc agagagagta actgctcttt gggtgacggt

420

acctgagaag aaagccccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggggca

480

agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaagc gcgcgcaggc ggttctttaa gtctggtgtt

540

taaacccgga gcttaacttc gggacgcact ggaaactggg gaacttgagt gcagaagagg

600

agagtggaat tccacgtgta gcggtgaaat gcgtagatat gtggaggaac accagtggcg

660

aaggcgactc tctgggctgt aactgacgct gaggcgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

720

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatgct aggtgttagg ggtttcgata

780

cccttggtgc cgaagttaac acattaagca ttccgcctgg ggagtacggt cgcaagactg

840

aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcagtgga gtatgtggtt taattcgaag

900

caacgcgaag aancttacca ggtcttgaca tccctttgac ccctctagag atagaggttt

960

ccttc

965

<210> 1403

<211> 1556

<212> DNA

<213> Paenibacillus sp. HGF7

<400> 1403

ttatcggaga gtttgatcct ggctcaggac gaacgctggc ggcgtgccta atacatgcaa

60

gtcgagcgga cttgatgaga agcttgcttc tctgagagtt agcggcggac gggtgagtaa

120

cacgtaggca acctgcctgt aagatcggga taactaccgg aaacggtagc taagaccgga

180

taatcggtat ctccgcatgg ggagatcgtg aaacacggag caatctgtgg cttacggatg

240

ggcctgcggc gcattagcta gttggtgagg taacggctca ccaaggcgac gatgcgtagc

300

cgacctgaga gggtgaacgg ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag

360

gcagcagtag ggaatcttcc gcaatggacg caagtctgac ggagcaacgc cgcgtgagtg

420

atgaaggttt tcggatcgta aagctctgtt gccagggaag aacgccaagg agagtaactg

480

ctctttgggt gacggtacct gagaagaaag ccccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

540

taatacgtag ggggcaagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagcgcgc gcaggcggtt

600

ttttaagtct ggtgtttaat cccgaggctc aacctcggtt cgcaccggaa actgggagac

660

tggagtgcag gagaggaaag tggaattcca cgtgtagcgg tgaaatgcgt agagatgtgg

720

aggaacacca gtggcgaagg cgactttctg gcctgtaact gacgctgagg cgcgaaagcg

780

tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg catgctaggt

840

gttaggggtt tcgataccct tggtgccgaa gttaacacag taagcatgcc gcctggggag

900

tacgctcgca agagtgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc agtggagtat

960

gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatccc tctgaccggc

1020

ttagagataa gcctttcctt cgggacagag gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

1080

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgaac ttagttgcca

1140

gcaggttaag ctgggcactc taagttgact gccggtgaca aaccggagga aggcggggat

1200

gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtactacaa tggccggtac

1260

aacgggaagc gaaggagcga tctggagcca atcctagaaa agccggtctc agttcggatt

1320

gcaggctgca actcgcctgc atgaagtcgg aattgctagt aatcgcggat cagcatgccg

1380

cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gtttacaaca

1440

cccgaagtcg gtgaggtaac cgcaaggggc cagccgccga aggtggggta gatgattggg

1500

gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct ggatcacctc ctttct

1556

<210> 1404

<211> 1434

<212> DNA

<213> Paenibacillus sp. JC66

<400> 1404

atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcstaataca tgcaagtcga gcggagcata

60

tcgcgatctt cggatggcaa tacgcttagc ggcgaacggg tgagtaacac gtaggcaacc

120

tgcctgtaag atcgggataa cttgcggaaa cgtgagctaa taccggatgt gcttgagtcc

180

acgcctgtgg gtttaaggaa agacggagca atctgtcact tacagatggg cctgcggcgc

240

attagctagt tggtgaggta acggctcacc aaggcgacga tgcgtagccg acctgagagg

300

gtgaccggcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtaggg

360

aatcttcggc aatggacgga agtctgaccg agcaacgccg cgtgagtgaa gaaggttttc

420

ggatcgtaaa actctgttgc cagagaagaa cgccaaggag agtaactgct ctttgggtga

480

cggtatctga gaagaaagcc ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg

540

ggcaagcgtt gtccggaatt attgggcgta aagcgcgcgc aggcggtgaa ttaagtctga

600

tgtttaaacc cggggctcaa cctcgggtcg cattggaaac tggttgactg gagtgcagga

660

gaggaaagtg gaattccacg tgtagcggtg aaatgcgtag agatgtggag gaacaccagt

720

ggcgaaggcg actttctggc ctgtaactga cgctgaggcg cgaaagcgtg gggagcaaac

780

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgaa tgctaggtgt caggggtttc

840

gatacccttg gtgccgaagt taacacatta agcattccgc ctggggagta cggtcgcaag

900

actgaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcag tggagtatgt ggtttaattc

960

gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatccctt tgaccggtgc agagatgtgc

1020

ctttccttcg ggacagagga gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1080

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgatgct agttgccagc attcagttgg

1140

gcactctagg atgactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc

1200

atgcccctta tgacctgggc tacacacgta ctacaatggc cggtacaacg ggcagcgaag

1260

gagcgatctg gagcgaatcc caaaaagccg gtctcagttc ggattgcagg ctgcaactcg

1320

cctgcatgaa gtcggaattg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg aatacgttcc

1380

cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagttta caacacccga agtc

1434

<210> 1405

<211> 1522

<212> DNA

<213> Paenibacillus sp. R-27413

<400> 1405

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc ggagcttagc cttcctttgg

60

aaggctytgg cttagcggcg gacgggtgag taacacgtag gcaacctgcc cgtaagaccg

120

ggataacttg cggaaacgtg agctaatacc ggatagatag gaagagcgca tgctyttctt

180

aggaaagacg gagcaatctg tcacttacgg atgggcctgc ggcgcattag ctagttggtg

240

gggtaaaggc ctaccaaggc gacgatgcgt agccgacctg agagggtgac cggccacact

300

gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tcggcaatgg

360

acggaagtct gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc gtaaaactct

420

gttgccagag aagaaagcta aggagagtca ctgctctttg gttgacggta tctgagaaga

480

aagccccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggggcaa gcgttgtccg

540

gaattattgg gcgtaaagcg cgcgcaggcg gctgagtaag tctggtgttt aaacctgggg

600

ctcaacctcg ggtcgcattg gaaactgctt ggctggagtg caggagagga aagtggaatt

660

ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaaca ccagtggcga aggcgacttt

720

ctggcctgta actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct

780

ggtagtccac gccgtaaacg atgaatgcta ggtgtcaggg gtttcgatac ccttggtgcc

840

gaagttaaca cattaagcat tccgcctggg gagtacggtc gcaagactga aactcaaagg

900

aattgacggg gacccgcaca agcagtggag tatgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga

960

accttaccag gtcttgacat ccctctgacc gtyctagaga tagggcttcc cttcggggca

1020

gaggagacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1080

cgcaacgagc gcaacccttg atcttagttg ccagcattga gttgggcact ctaggatgac

1140

tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc

1200

tgggctacac acgtactaca atggccggta caacgggcag cgaaggagcg atccggagcg

1260

aatcccaaaa agccggtctc agttcggatt gcaggctgca actcgcctgc atgaagtcgg

1320

aattgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccacgaaa gtttacaaca cctgaagtcg gtgaggtaac cgcaaggagc

1440

cagccgccga aggtggggta gatgattggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtatcgga

1500

aggtgcggct ggatcacctc ct

1522

<210> 1406

<211> 1004

<212> DNA

<213> Paenibacillus sp. R-27422

<220>

<221> modified_base

<222> (31)..(33)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (54)..(54)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1406

agagagagta actgctcttt gggtgacggt nnngagaaga aagccccggc taantacgtg

60

ccagcagccg cggtaatacg tagggggcaa gcgttgtccg gaattattgg gcgtaaagcg

120

cgcgcaggcg gttctttaag tctggtgttt aaacccggag cttaacttcg ggacgcactg

180

gaaactgggg aacttgagtg cagaagagga gagtggaatt ccacgtgtag cggtgaaatg

240

cgtagatatg tggaggaaca ccagtggcga aggcgactct ctgggctgta actgacgctg

300

aggcgcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

360

atgaatgcta ggtgttaggg gtttcgatac ccttggtgcc gaagttaaca cattaagcat

420

tccgcctggg gagtacggtc gcaagactga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca

480

agcagtggag tatgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat

540

ccctttgacc cctctagaga tagaggtttc cttcgggaca gaggagacag gtggtgcatg

600

gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg

660

atcttagttg ccagcacgta atggtgggca ctctaaggtg actgccggtg acaaaccgga

720

ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtacta

780

caatggctgg tacaacggga agcgaagccg cgaggtggag ccaatcctaa aaagccagtc

840

tcagttcgga ttgcaggctg caactcgcct gcatgaagtc ggaattgcta gtaatcgcgg

900

atcagcatgc cgcggtgaat acgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccacga

960

gagtttacaa cacccgaagt cggtggggta accgcaagga gcca

1004

<210> 1407

<211> 1515

<212> DNA

<213> Paenibacillus sp. oral taxon F45

<400> 1407

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcatgc ctaatacatg caagtcgagc

60

ggagttgacg agaagcttgc ttctctgatg cttagcggcg gacgggtgag taacacgtag

120

gcaacctgcc tttcagactg ggataacttc cggaaacgga tgctaatacc ggatacatcg

180

tttcttcgca tgaagagacg aggaaagacg gcgcaagctg tcactgagag atggacctgc

240

ggcgcattag ctagttggtg gggtaatggc ccaccaaggc gacgatgcgt agccgacctg

300

agagggtgaa cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

360

tagggaatct tccacaatgg gcgaaagcct gatggagcaa tgccgcgtga gtgatgaagg

420

ttttcggatc gtaaagctct gttgccaggg aagaacgttt cgtagagtaa ctgctgcgga

480

agtgacggta cctgagaaga aagccccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

tagggggcaa gcgttgtccg gaattattgg gcgtaaagcg cgtgcaggcg gcttcttaag

600

ttgggtgttt aagaccgggg ctcaaccccg gctcgcaccc aaaactggga agcttgagtg

660

taggagagga aagtggaatt ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaaca

720

ccagtggcga aggcgacttt ctggcctata actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttcggg

840

gtttcgatac cctgggtgcc gaagttcacg cattaagcac tccgcctggg gagtacggcc

900

gcaaggctga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcagtggag tatgtggttt

960

aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat ccctctgacc ggtctagaga

1020

tagaccttcc cttcggggta gaggagacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg

1080

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg actttagttg ccagcatttc

1140

ggatgggcac tctagagtga ttgccggtga caaaccggag gaaggcgggg atgacgtcaa

1200

atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca cacgtactac aatggccggt acagagggtc

1260

gcgaagccgc gaggtggagc caatcccaga aagccggtct cagttcggat tgcaggctgc

1320

aactcgcctg catgaagtcg gaattgctag taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaata

1380

cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttacaac acccgaagtc

1440

ggtgaggtaa ccgcaaggag ccagccgccg aaggtggggt agatgattgg ggtgaagtcg

1500

taacaaggta gccgt

1515

<210> 1408

<211> 1541

<212> DNA

<213> Paenibacillus timonensis

<400> 1408

gacgaacgct ggcggcgtac ctaatacatg caagtcgagc ggagttaatc gggagcttgc

60

tcctgattag cttagcggcg gacgggtgag taacacgtag gcaacctgcc cgtaagactg

120

ggataactac cggaaacggt agctaatacc ggatacgcaa attcctcgca tgggggattt

180

gggaaaggcg gagcaatctg tcacttacgg atgggcctgc ggcgcattag ctagttggtg

240

aggtaacggc tcaccaaggc gacgatgcgt agccgacctg agagggtgaa cggccacact

300

gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tccgcaatgg

360

acgaaagtct gacggagcaa cgccgcgtga gtgatgaagg ttttcggatc gtaaagctct

420

gttgccaggg aagaacgtcc tctagagtaa ctgctagggg agtgacggta cctgagaaga

480

aagccccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggggcga gcgttgtccg

540

gaattattgg gcgtaaagcg cgcgcaggcg gctgtttaag tctggtgttt aatcctgggg

600

ctcaactccg ggtcgcactg gaaactgggc agcttgagtg cagaagagga gagtggaatt

660

ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaaca ccagtggcga aggcgactct

720

ctgggctgta actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct

780

ggtagtccac gccgtaaacg atgaatgcta ggtgttaggg gtttcgatac ccttggtgcc

840

gaagttaaca cattaagcat tccgcctggg gagtacggcc gcaaggctga aactcaaagg

900

aattgacggg gacccgcaca agcagtggag tatgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga

960

accttaccag gtcttgacat ccccctgacc ggtctagaga taggcctttc cttcgggaca

1020

ggggagacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1080

cgcaacgagc gcaacccttg actttagttg ccagcaggta aggttgggca ctctagagtg

1140

actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgg

1200

cctgggctac acacgtacta caatggccgg tacaacggga agcgaagccg cgaggtggag

1260

cgaatcctag aaaagccggt ctcagttcgg attgcaggct gcaactcgcc tgcatgaagt

1320

cggaattgct agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac

1380

acaccgcccg tcacaccacg agagtttaca acacccgaag tcggtgaggt aacctgagct

1440

accccaaaaa gtgaagatta tgctgcgaag cgtattccga gtacttttcg gggaccccgg

1500

tttggagcca gccgccgaag gtggggtaga tgattggggt g

1541

<210> 1409

<211> 1504

<212> DNA

<213> Pantoea agglomerans

<400> 1409

agagtttgat ccctggctca gattgaacgc tggcggcagg cctaacacat gcaagtcgaa

60

cggtagcaca gagagcttgc tctcgggtga cgagtggcgg acgggtgagt aatgtctggg

120

aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtag ctaataccgc ataacgtcgc

180

aagaccaaag agggggacct tcgggcctct tgccatcaga tgtgcccaga tgggattagc

240

tagtaggtgg ggtaacggct cacctaggcg acgatcccta gctggtctga gaggatgacc

300

agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

360

gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgta tgaagaaggc cttcgggttg

420

taaagtactt tcagcgggga ggaaggtgtt gtggttaata accgcagcaa ttgacgtacc

480

cgcagaagaa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga gggtgcaagc

540

gttaatcgga attactgggc gtaaagcgca cgcaggcggt ctgtcaagtc ggatgtgaaa

600

tccccgggct caacctggga actgcattcg aaactggcag gctagagtct tgtagagggg

660

ggtagaattc caggtgtagc ggtgaaatgc gtagagatct ggaggaatac cggtggcgaa

720

ggcggccccc tggacaaaga ctgacgctca ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgtcgacttg gaggttgtgc ccttgaggcg

840

tggcttccgg agctaacgcg ttaagtcgac cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa

900

ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa

960

cgcgaagaac cttacctact cttgacatcc agagaacttt ccagagatgg tttggtgcct

1020

tcgggaactc tgagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgttgtg aaatgttggg

1080

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc ctttgttgcc agcggtccgg ccgggaactc

1140

aaaggagact gccagtgata aactggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc

1200

cttacgagta gggctacaca cgtgctacaa tggcgcatac aaagagaagc gaactcgcga

1260

gagcaagcgg acctcataaa gtgcgtcgta gtccggattg gagtctgcaa ctcgactcca

1320

tgaagtcgga atcgctagta atcgtagatc agaatgctac ggtgaatacg ttcccgggcc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggttgcaa aagaagtagg tagcttaacc

1440

ttcgggaggg cgcttaccac tttgtgattc atgactgggg tgaagtcgta acaaggtaac

1500

cgta

1504

<210> 1410

<211> 1542

<212> DNA

<213> Pantoea ananatis

<400> 1410

taaattgaag agtttgatca tggctcagat tgaacgctgg cggcaggcct aacacatgca

60

agtcggacgg tagcacagag gagcttgctc ctctggtgac gagtggcgga cgggtgagta

120

atgtctgggg atctgcccga tagaggggga taaccactgg aaacggtggc taataccgca

180

taacgtcgca agaccaaaga gggggacctt cgggcctctc actatcggat gaacccagat

240

gggattagct agtaggcggg gtaacggccc acctaggcga cgatccctag ctggtctgag

300

aggatgacca gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg

360

gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagccatg ccgcgtgtat gaagaaggcc

420

ttcgggttgt aaagtacttt cagcggggag gaaggcgatg tggttaataa ccgcattgat

480

tgacgttacc cgcagaagaa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga

540

gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgca cgcaggcggt ctgttaagtc

600

agatgtgaaa tccccgggct taacctggga actgcatttg aaactggcag gcttgagtct

660

cgtagagggg ggtagaattc caggtgtagc ggtgaaatgc gtagagatct ggaggaatac

720

cggtggcgaa ggcggccccc tggacgaaga ctgacgctca ggtgcgaaag cgtggggagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgtcgacttg gaggttgttc

840

ccttgaggag tggcttccgg agctaacgcg ttaagtcgac cgcctgggga gtacggccgc

900

aaggttaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

960

ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctact cttgacatcc acggaatttg gcagagatgc

1020

cttagtgcct tcgggaaccg tgagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgttgtg

1080

aaatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc ctttgttgcc agcgattcgg

1140

tcgggaactc aaaggagact gccggtgata aaccggagga aggtggggat gacgtcaagt

1200

catcatggcc cttacgagta gggctacaca cgtgctacaa tggcgcatac aaagagaagc

1260

gacctcgcga gagcaagcgg acctcataaa gtgcgtcgta gtccggatcg gagtctgcaa

1320

ctcgactccg tgaagtcgga atcgctagta atcgtggatc agaatgccac ggtgaatacg

1380

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggttgcaa aagaagtagg

1440

tagcttaacc ttcgggaggg cgcttaccac tttgtgattc atgactgggg tgaagtcgta

1500

acaaggtaac cgtaggggaa cctgcggttg gatcacctcc tt

1542

<210> 1411

<211> 1344

<212> DNA

<213> Pantoea brenneri

<400> 1411

ggacgggtga gtaatgtctg gggatctgcc cgatagaggg ggataaccac tggaaacggt

60

ggctaatacc gcataacgtc gcaagaccaa agagggggac cttcgggcct ctcactatcg

120

gatgaaccca gatgggatta gctagtaggc ggggtaatgg cccacctagg cgacgatccc

180

tagctggtct gagaggatga ccagccacac tggaactgag acacggtcca gactcctacg

240

ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggcgcaagcc tgatgcagcc atgccgcgtg

300

tatgaagaag gccttcgggt tgtaaagtac tttcagcggg gaggaaggcg atgyggttaa

360

taaccgcgtc gattgacgtt acccgcagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc

420

gcggtaatac ggagggtgca agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gcacgcaggc

480

ggtctgttaa gtcagatgtg aaatccccgg gcttaacctg ggaactgcat ttgaaactgg

540

caggcttgag tctygtagag gggggtagaa ttccaggtgt agcggtgaaa tgcgtagaga

600

tctggaggaa taccggtggc gaaggcggcc ccctggacra agactgacgc tcaggtgcga

660

aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgtcgac

720

ttggaggttg ttcccttgag gagtggcttc cggagctaac gcgttaagtc gaccgcctgg

780

ggagtacggc cgcaaggtta aaactcaaat gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga

840

gcatgtggtt taattcgatg caacgcgaag aaccttacct actcttgaca tccagcgaac

900

tttccagaga tggattggtg ccttcgggaa cgctgagaca ggtgctgcat ggctgtcgtc

960

agctcgtgtt gtgaaatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt atcctttgtt

1020

gccagcgatt cggtcgggaa ctcaaaggag actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg

1080

gatgacgtca agtcatcatg gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggcgca

1140

tacaaagaga agcgacctcg cgagagcaag cggacctcac aaagtgcgtc gtagtccgga

1200

tcggagtctg caactcgact ccgtgaagtc ggaatcgcta gtaatcgtgg atcagaatgc

1260

cacggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttg

1320

caaaagaagt aggtagctta acct

1344

<210> 1412

<211> 1422

<212> DNA

<213> Pantoea citrea

<400> 1412

attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac ggtagcacag aggagcttgc

60

tccttgggtg acgagtggcg gacgggtgag taatgtctgg gaaactgcct gatggrgggg

120

gataactact ggaaacggta gctaataccg cataacgtcg caagaccaaa gtgggggacc

180

ttcgggcctc acaccatcgg atgtgcccag atgggattag ctagtaggtg gggtaacggc

240

tcacctaggc gacgatccct agctggtctg agaggatgac cagccacact ggaactgaga

300

cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct

360

gatgcagcca tgccgcgtgt atgaagaagg ccttcgggtt gtaaagtact ttcagtcagg

420

aggaagggtg tagtcttaaa cggctatgca ttgacgttac tgacagaaga agcaccggct

480

aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg

540

cgtaaagcgc acgcaggcgg tctgtcaagt cggatgtgaa atccccgggc tcaacccggg

600

aactgcattc gaaactggca ggctagagtc ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag

660

cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag

720

actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac

780

gccgtaaacg atgtcgactt ggaggttgtg cccttgaggy gtggcttccg gagctaacgc

840

gttaagtcga ccgcctgggg agtacggccg caaggttaaa actcaaatga attgacgggg

900

gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgca acgcgaagaa ccttacctac

960

tcttgacatc cagagaactt agcagagatg ctttggtgcc ttcgggaact ctgagacagg

1020

tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1080

caacccctat cctttgttgc cagcgattcg gtcgggaact caaaggagac tgccggtgat

1140

aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatggc ccttacgagt agggctacac

1200

acgtgctaca atggcgcata caaagagaag cgacctcgcg agagcaagcg gacctcataa

1260

agtgcgtcgt agtccggatt ggagtctgca actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt

1320

aatcgtagat cagaatgcta cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca

1380

caccatggga gtgggttgca aaagaagtag atagcttaac ct

1422

<210> 1413

<211> 1344

<212> DNA

<213> Pantoea conspicua

<400> 1413

ggacgggtga gtaatgtctg gggatctgcc cgatagaggg ggataaccac tggaaacggt

60

ggctaatacc gcataacgtc gcaagaccaa agagggggac cttcgggcct ctcactatcg

120

gatgaaccca gatgggatta gctagtaggc ggggtaatgg cccacctagg cgacgatccc

180

tagctggtct gagaggatga ccagccacac tggaactgag acacggtcca gactcctacg

240

ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggcgcaagcc tgatgcagcc atgccgcgtg

300

tatgaagaag gccttcgggt tgtaaagtac tttcagcggg gaggaaggcg atgcggttaa

360

taaccgcgtc gattgacgtt acccgcagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc

420

gcggtaatac ggagggtgca agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gcacgcaggc

480

ggtctgttaa gtcagatgtg aaatccccgg gcttaacctg ggaactgcat ttgaaactgg

540

caggcttgag tctcgtagag gggggtagaa ttccaggtgt agcggtgaaa tgcgtagaga

600

tctggaggaa taccggtggc gaaggcggcc ccctggacga agactgacgc tcaggtgcga

660

aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgtcgac

720

ttggaggttg ttcccttgag gagtggcttc cggagctaac gcgttaagtc gaccgcctgg

780

ggagtacggc cgcaaggtta aaactcaaat gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga

840

gcatgtggtt taattcgatg caacgcgaag aaccttacct actcttgaca tccagcgaac

900

ttggcagaga tgccttggtg ccttcgggaa cgctgagaca ggtgctgcat ggctgtcgtc

960

agctcgtgtt gtgaaatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt atcctttgtt

1020

gccagcgatt cggtcgggaa ctcaaaggag actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg

1080

gatgacgtca agtcatcatg gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggcgca

1140

tacaaagaga agcgacctcg cgagagcaag cggacctcac aaagtgcgtc gtagtccgga

1200

tcggagtctg caactcgact ccgtgaagtc ggaatcgcta gtaatcgtgg atcagaatgc

1260

cacggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttg

1320

caaaagaagt aggtagctta acct

1344

<210> 1414

<211> 1344

<212> DNA

<213> Pantoea septica

<400> 1414

ggacgggtga gtaatgtctg ggaaactgcc cgatggaggg ggataactac tggaaacggt

60

agctaatacc gcataacgtc gcragaccaa agtgggggac cttcgggcct cacaccatcg

120

gatgtgccca gatgggatta gctagtaggt ggggtaacgg ctcacctagg cgacgatccc

180

tagctggtct gagaggatga ccagccacac tggaactgag acacggtcca gactcctacg

240

ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggcgcaagcc tgatgcagcc atgccgcgtg

300

tatgaagaag gccttcgggt tgtaaagtac tttcagcggg gaggaaggcg atgyggttaa

360

taaccgcgtc gattgacgtt acccgcagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc

420

gcggtaatac ggagggtgca agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gcacgcaggc

480

ggtctgtcaa gtcggatgtg aaatccccgg gcttaacctg ggaactgcat tcgaaactgg

540

caggctagag tcttgtagag gggggtagaa ttccaggtgt agcggtgaaa tgcgtagaga

600

tctggaggaa taccggtggc gaaggcggcc ccctggacaa agactgacgc tcaggtgcga

660

aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgtcgac

720

ttggaggctg tttccttgag aagtggcttc cggagctaac gcgttaagtc gaccgcctgg

780

ggagtacggc cgcaaggtta aaactcaaat gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga

840

gcatgtggtt taattcgatg caacgcgaag aaccttacct actcttgaca tccagagaac

900

ttgscagaga tgscctggtg ccttcgggaa ctctgagaca ggtgctgcat ggctgtcgtc

960

agctcgtgtt gtgaaatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt atcctttgtt

1020

gccagcgatt cggtcgggaa ctcaaaggag actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg

1080

gatgacgtca agtcatcatg gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggcgca

1140

tacaaagaga agcgacctcg cgagagcaag cggacctcat aaagtgcgtc gtagtccgga

1200

tcggagtctg caactcgact ccgtgaagtc ggaatcgcta gtaatcgtgg atcagaatgc

1260

cacggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttg

1320

caaaagaagt aggtagctta acct

1344

<210> 1415

<211> 1491

<212> DNA

<213> Papillibacter cinnamivorans

<220>

<221> modified_base

<222> (449)..(449)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (454)..(454)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (589)..(589)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1427)..(1427)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1415

gatcctggct caggacgaac gctggcggcg tgcctaacac atgcaagtcg aacgaaaata

60

ccaaagcagc aatgcggggg tattttagtg gcggacgggt gagtaacgcg tgagcaatct

120

gccttttgga gggggatacc gactggaaac ggtcgttaat accgcataac gtatatggac

180

gacatcgtcc gtataccaaa ggagcaatcc gccgaaagat gagctcgcgt ctgattagct

240

agttggcggg gtaaaggccc accaaggcga cgatcagtag ccggactgag aggttgaacg

300

gccacattgg gactgagata cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

360

ggcaatgggc gaaagcctga cccagcaacg ccgcgtcaag gaagaaggcc ttcgggttgt

420

aaacttcttt taccagggaa gaagaagtnc ggtncctgga aaacaagcca cggctatcta

480

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgttg tccggattta ctgggtgtaa

540

agggcgcgta ggcggcattg caagtcagat gtgaaatgcc ggggcttanc cccggagctg

600

catttgaaac tgtagagctt gagtgatgga gaggcaggcg gaattcctag tgtagcggtg

660

aaatgcgtag atattaggag gaacaccagt ggcgaaggcg gcctgctgga cattaactga

720

cgctgaggcg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgctgt

780

aaacgatgga tactaggtgt gggaggtctg accccttccg tgccggagtt aacacaataa

840

gtatcccacc tggggagtac gatcgcaagg ttgaaactca aaggaattga cgggggcccg

900

cacaagcagt ggagtatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaggatttg

960

acatcctact aacgaggtag agatacgtca ggtgcccttc ggggaaagta gagacaggtg

1020

gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

1080

acccttattg ctagttgcta cgcaagagca ctctagcgag actgccgttg acaaaacgga

1140

ggaaggcggg gacgacgtca aatcatcatg ccccttatgt cctgggctac acacgtacta

1200

caatggcggt taacagaggg aagcaagaca gtgatgtgga gcaaatccct aaaaaccgtc

1260

tcagttcgga tcgcaggctg caacccgcct gcgtgaagtc ggaattgcta gtaatcgcgg

1320

atcagcatgc cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatga

1380

gagtcgggaa tacccgaagt ccgtagtcta accgcaaggg ggacgcngcc gaaggtaggt

1440

tcgataattg gggtgaagtc gtaacaaggt aaccgtatcg gaaggtgcgg c

1491

<210> 1416

<211> 1349

<212> DNA

<213> Parabacteroides distasonis

<400> 1416

accgggtggc gaccggcgca cgggtgagta acgcgtatgc aacttgccta tcagaggggg

60

ataacccggc gaaagtcgga ctaataccgc atgaagcagg ggccccgcat ggggatattt

120

gctaaagatt catcgctgat agataggcat gcgttccatt aggcagttgg cggggtaacg

180

gcccaccaaa ccgacgatgg ataggggttc tgagaggaag gtcccccaca ttggtactga

240

gacacggacc aaactcctac gggaggcagc agtgaggaat attggtcaat gggcgtaagc

300

ctgaaccagc caagtcgcgt gagggatgaa ggttctatgg atcgtaaacc tcttttataa

360

gggaataaag tgcgggacgt gtcccgtttt gtatgtacct tatgaataag gatcggctaa

420

ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag gatccgagcg ttatccggat ttattgggtt

480

taaagggtgc gtaggcggcc ttttaagtca gcggtgaaag tctgtggctc aaccatagaa

540

ttgccgttga aactgggagg cttgagtatg tttgaggcag gcggaatgcg tggtgtagcg

600

gtgaaatgct tagatatcac gcagaacccc gattgcgaag gcagcctgcc aagccatgac

660

tgacgctgat gcacgaaagc gtggggatca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc

720

agtaaacgat gatcactagc tgtttgcgat acacagtaag cggcacagcg aaagcgttaa

780

gtgatccacc tggggagtac gccggcaacg gtgaaactca aaggaattga cgggggcccg

840

cacaagcgga ggaacatgtg gtttaattcg atgatacgcg aggaacctta cccgggtttg

900

aacgcattca gttcccgttg gaaatgggag ttttgagtat gttcgagtca ggcggaatgc

960

gtggtttagc ggtgaaatgc tcaggaggtg tcggcttaag tgccataacg agcgcaaccc

1020

ttgccactag ttactaacag gtgatgctga ggactctggt gggactgcca gcgtaagctg

1080

cgaggaaggc ggggatgacg tcaaatcagc acggccctta catccggggc gacacacgtg

1140

ttacaatggc gtggacaaag ggaagccacc tggcgacagg gagcgaatcc ccaaaccacg

1200

tctcagttcg gatcggagtc tgcaacccga ctccgtgaag ctggattcgc tagtaatcgc

1260

gcatcagcca tggcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagcca

1320

tgggagccgg gggtacctga agtccgtaa

1349

<210> 1417

<211> 1383

<212> DNA

<213> Parabacteroides goldsteinii

<400> 1417

aggggcagca cgatgtagca atacattggt ggcgaccggc gcacgggtga gtaacgcgta

60

tgcaacctac ctatcagagg ggaataaccc ggcgaaagtc ggactaatac cgcataaaac

120

aggggttcca catggaaata tttgttaaag aattatcgct gatagatggg catgcgttcc

180

attagatagt tggtgaggta acggctcacc aagtccacga tggatagggg ttctgagagg

240

aaggtccccc acactggtac tgagacacgg accagactcc tacgggaggc agcagtgagg

300

aatattggtc aatgggcgag agcctgaacc agccaagtcg cgtgaaggat gaaggatcta

360

tggtttgtaa acttctttta tatgggaata aagtgaggaa cgtgttcctt tttgtatgta

420

ccatatgaat aagcatcggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaggatgcga

480

gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg tgcgtaggtg gttaattaag tcagcggtga

540

aagtttgtgg ctcaaccata aaattgccgt tgaaactggt tgacttgagt atatttgagg

600

taggcggaat gcgtggtgta gcggtgaaat gcatagatat cacgcagaac tccgattgcg

660

aaggcagctt actaaactat aactgacact gaagcacgaa agcgtgggga tcaaacagga

720

ttagataccc tggtagtcca cgcagtaaac gatgattact agctgtttgc gatacacagt

780

aagcggcaca gcgaaagcgt taagtaatcc acctggggag tacgccggca acggtgaaac

840

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat tcgatgatac

900

gcgaggaacc ttacccgggt ttgaacgcat tcggaccgga gtggaaacac ttcttctagc

960

aatagccgtt tgcgaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt

1020

aagtgccata acgagcgcaa cccttatcac tagttactaa caggtcatgc tgaggactct

1080

agtgagactg ccagcgtaag ctgtgaggaa ggtggggatg acgtcaaatc agcacggccc

1140

ttacatccgg ggcgacacac gtgttacaat ggtggggaca aagggcagct accgggcgac

1200

aggatgctaa tctccaaacc ccatctcagt tcggatcgaa gtctgcaacc cgacttcgtg

1260

aagctggatt cgctagtaat cgcgcatcag ccatggcgcg gtgaatacgt tcccgggcct

1320

tgtacacacc gcccgtcaag ccatgggagt tgggggtacc taaagtccgt aaccgcaagg

1380

atc

1383

<210> 1418

<211> 1326

<212> DNA

<213> Parabacteroides gordonii

<400> 1418

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gcgacaggct taacacatgc aagtcgaggg

60

accggcgcac gggtgagtaa cgcgtatgca acctacctat cagaggggga taacccggcg

120

aaagtcggac taataccgca taaataaagt tgctgataga tgggcatgcg ttccattaga

180

tagttggtaa ggtaacggct taccaagtct gcgatggata ggggttctga gaggaaggtc

240

ccccacactg gtactgagac acggaccaga ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt

300

ggtcaatggg cgagagcctg aaccagccaa gtcgcgtgaa ggatgaagga ttatggttcg

360

taaacttctt ttataaggga atatgtatgt accttatgaa taaggatcgg ctaactccgt

420

gccagcagcc gcggtaatac ggaggatccg agcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg

480

gtgcgtaggt ggtttattaa gtcagcggtg aaagtttgtg gctcaaccat aaaattgccg

540

ttgaaactgg ttaacttgag tatatttgag gtaggcggaa tgcgtggtgt agcggtgaaa

600

tgcatagata tcacgcagaa ctccaattgc gaaggcagct tactaaacta actgacactg

660

aagcacgaaa gcgtggggat caaacaggat tagataccct ggtagtccac gcagtaaacg

720

atgattacta ggagtttgcg agtaagctct acagcgaaag cgttaagtaa tccacctggg

780

gagtacgccg gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa

840

catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttacccg ggtttgaacg cgcgaggtgc

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa

960

cccttatctt tagttactaa cagctgagga ctctaaagag actgccagcg taagctggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg cccttacatc cggggcgaca cacgtgttac

1080

aatggtgggc aaagggcagc tacacagcga tgtgatgcta atctccccca tctcagttcg

1140

gacgaagtct gcaacccgac ttcggaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg

1200

gcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg ggagttgggg

1260

gtacctaaag tccgtatcgg cctagggtaa aaccgatgac tggggctaag tcgtaacaag

1320

gtaacc

1326

<210> 1419

<211> 1344

<212> DNA

<213> Parabacteroides johnsonii

<400> 1419

gaccggcgca cggtggagta acgcgtatgc tacttaccta tcagaggggg atagcccggc

60

gaaaggcgga ttaatactcc ataaaacagg ggttccgcat gggactattt gttaaagatt

120

catcgctgat agataggcat gcgttccatt aggcagttgg cggggtaacg gcccaccaaa

180

ccgacgatgg ataggggttc tgagaggaag gtcccccaca ttggtactga gacacggacc

240

aaactcctac gggaggcagc agtgaggaat attggtcaat ggccgagagg ctgaaccagc

300

caagtcgcgt gaaggatgaa ggatctatgg tttgtaaact tcttttatag gggaataaag

360

tgtgggacgt gtcccatttt gtatgtaccc tatgaataag catcggctaa ctccgtgcca

420

gcagccgcgg taatacggag gtgcgagcgt tatccggatt tattgggttt aaagggtgcg

480

taggtggtaa tttaagtcag cggtgaaagt ttgtggctca accataaaat tgccgttgaa

540

actgggttac ttgagtgtgt ttgaggtagg cggaatgcgt ggtgtagcgg tgaaatgcat

600

agatatcacg cagaactcca attgcgaagg cagcttacta aaccataact gacactgaag

660

cacgaaagcg tgggtatcaa acaggattag ataccctggt agtccacgca gtaaacgatg

720

attactagga gtttgcgata cacagtaagc tctacagcga aagcgttaag taatccacct

780

ggggagtacg ccggcaacgg tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggag

840

aacatgtggt ttaattcgat gatacgcgag gaaccttacc cgggtttgaa cgtagtcaga

900

ccggccttga aagaggtctt ctagcaatag ctgattacga ggtgctgcat ggttgtcgtc

960

agctcgtgcc gtgaggtgtc ggcttaagtg ccataacgag cgcaaccctt atcactagtt

1020

actaacaggt taagctgagg actctggtga gactgccagc gtaagctgtg aggaaggtgg

1080

ggatgacgtc aaatcagcac ggcccttaca tccggggcga cacacgtgtt acaatggcat

1140

ggacaaaggg cagctacctg gcgacaggat gctaatctct aaaccatgtc tcagttcgga

1200

tcggagtctg caactcgact ccgtgaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg

1260

gcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg ggagccgggg

1320

gtacctgaag tccgtaaccg caag

1344

<210> 1420

<211> 1374

<212> DNA

<213> Parabacteroides merdae

<400> 1420

atgatttgta gcaatacaga ttgatggcga ccggcgcacg ggtgagtaac gcgtatgcaa

60

cttacctatc agagggggat agcccggcga aagtcggatt aataccccat aaaacagggg

120

tcccgcatgg gaatatttgt taaagattca tcgctgatag ataggcatgc gttccattag

180

gcagttggcg gggtaacggc ccaccaaacc gacgatggat aggggttctg agaggaaggt

240

cccccacatt ggtactgaga cacggaccaa actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat

300

tggtcaatgg ccgagaggct gaaccagcca agtcgcgtga aggaagaagg atctatggtt

360

tgtaaacttc ttttataggg gaataaagtg gaggacgtgt ccttttttgt atgtacccta

420

tgaataagca tcggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggagga tgcgagcgtt

480

atccggattt attgggttta aagggtgcgt aggtggtgat ttaagtcagc ggtgaaagtt

540

tgtggctcaa ccataaaatt gccgttgaaa ctgggttact tgagtgtgtt tgaggtaggc

600

ggaatgcgtg gtgtagcggt gaaatgcata gatatcacgc agaactccga ttgcgaaggc

660

agcttactaa accataactg acactgaagc acgaaagcgt ggggatcaaa caggattaga

720

taccctggta gtccacgcag taaacgatga ttactaggag tttgcgatac aatgtaagct

780

ctacagcgaa agcgttaagt aatccacctg gggagtacgc cggcaacggt gaaactcaaa

840

ggaattgacg ggggcccgca caagcggagg aacatgtggt ttaattcgat gatacgcgag

900

gaaccttacc cgggtttgaa cgtagtctga ccggctcaac cataaaactt ccagcaatag

960

cagattacga ggtgctgcat ggttgtcgtc agctcgtgcc gtgaggtgtc ggcttaagtg

1020

ccataacgag cgcaaccctt atcactagtt actaacaggt gaagctgagg actctggtga

1080

gactgccagc gtaagctgtg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcagcac ggcccttaca

1140

tccggggcga cacacgtgtt acaatggcat ggacaaaggg cagctacctg gcgacaggat

1200

gctaatctcc aaaccatgtc tcagttcgga tcggagtctg caactcgact ccgtgaagct

1260

ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg gcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac

1320

acaccgcccg tcaagccatg ggagccgggg gtacctgaag tccgtaaccg caag

1374

<210> 1421

<211> 973

<212> DNA

<213> Parabacteroides sp. D13

<220>

<221> modified_base

<222> (9)..(12)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (17)..(17)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (21)..(21)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1421

ttgtatgtnn nnatgantaa ngatcggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga

60

ggatccgagc gttatccgga tttattgggt ttaaagggtg cgtaggcggc cttttaagtc

120

agcggtgaaa gtctgtggct caaccataga attgccgttg aaactggggg gcttgagtat

180

gtttgaggca ggcggaatgc gtggtgtagc ggtgaaatgc atagatatca cgcagaaccc

240

cgattgcgaa ggcagcctgc caagccatta ctgacgctga tgcacgaaag cgtggggatc

300

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg cagtaaacga tgatcactag ctgtttgcga

360

tacactgtaa gcggcacagc gaaagcgtta agtgatccac ctggggagta cgccggcaac

420

ggtgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg aggaacatgt ggtttaattc

480

gatgatacgc gaggaacctt acccgggttt gaacgcattc ggaccgaggt ggaaacacct

540

tttctagcaa tagccgtttg cgaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt

600

gtcggcttaa gtgccataac gagcgcaacc cttgccacta gttactaaca ggtgatgctg

660

aggactctgg tgggactgcc agcgtaagct gcgaggaagg cggggatgac gtcaaatcag

720

cacggccctt acatccgggg cgacacacgt gttacaatgg cgtggacaaa gggaggccac

780

ctggcgacag ggagcgaatc cccaaaccac gtctcagttc ggatcggagt ctgcaacccg

840

actccgtgaa gctggattcg ctagtaatcg cgcatcagcc atggcgcggt gaatacgttc

900

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcaagcc atgggagccg ggggtacctg aagtccgtaa

960

ccgaaaggat cgg

973

<210> 1422

<211> 1481

<212> DNA

<213> Parabacteroides sp. NS31-3

<400> 1422

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agcgacaggc ttaacacatg caagtcgagg

60

ggcagcatag aagtagcaat actttggtgg cgaccggcgc acgggtgagt aacgcgtatg

120

caacctacct atcagagggg aataacccgg cgaaagtcgg actaataccg cataaaacag

180

gggcaccgca tggtgatatt tgttaaagaa attcgctgat agatgggcat gcgttccatt

240

aggtagttgg tgaggtaacg gctcaccaag ccgacgatgg ataggggaac tgagaggttg

300

gtcccccaca ctggtactga gacacggacc agactcctac gggaggcagc agtgaggaat

360

attggtcaat gggcgggagc ctgaaccagc caagtcgcgt gaaggaagaa ggatctatgg

420

ttcgtaaact tcttttgcag gggaataaag tgcgggacgt gtcctgtttt gtatgtaccc

480

tgagaataag gatcggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag gatccgagcg

540

ttatccggat ttattgggtt taaagggtgc gtaggtggtt tgataagtca gcggtgaaag

600

tttgcagctt aactgtaaaa atgccgttga aactgtcgga cttgagtgta aatgaggtag

660

gcggaatgcg tggtgtagcg gtgaaatgca tagatatcac gcagaactcc gattgcgaag

720

gcagcttact aagctacaac tgacactgaa gcacgaaagc gtggggatca aacaggatta

780

gataccctgg tagtccacgc agtaaacgat gattactagc tgtttgcgat acacagtaag

840

cggcacagcg aaagcgttaa gtaatccacc tggggagtac gccggcaacg gtgaaactca

900

aaggaattga cgggggcccg cacaagcgga ggaacatgtg gtttaattcg atgatacgcg

960

aggaacctta cccgggtttg aacgtaggga gacaggggtg gaaacatcct tttcagcaat

1020

gactgcctac gaggtgctgc atggttgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg tcggcttaag

1080

tgccataacg agcgcaaccc ttatttccag ttactaacag gtgatgctga ggactctgga

1140

gagactgcca gcgtaagctg tgaggaaggt ggggatgacg tcaaatcagc acggccctta

1200

catccggggc gacacacgtg ttacaatggt aaggacaaag ggcagctacc gggcgaccgg

1260

atgcgaatct ctaaacctta tctcagttcg gatcggagtc tgcaactcga ctccgtgaag

1320

ctggattcgc tagtaatcgc gcatcagcca tggcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcaagcca tgggagccgg gggtacctga agttcgtaac cgtaaggatc

1440

gacctagggt aaaactggtg actggggcta agtcgtaaca a

1481

<210> 1423

<211> 1537

<212> DNA

<213> Parachlamydia sp. UWE25

<400> 1423

tgagaatttg atcttggttc agattgaatg ctgacagcgt ggatgaggca tgcaagtcga

60

acgaaacctt cgggtttagt ggcggaaggg ttagtaagac atggataact tgcctttaac

120

tctgggataa cggttggaaa cgaccgctaa taccggatag ggtgaaaaga agacatcttt

180

tttttattaa agtgggggat cgcaagacct cgcggttaaa gagaggtcca tgggatatca

240

gctagttggt gtggtaaagg cgcaccaagg ctaagacgtc taggcggatt gagagattga

300

ccgccaacac tgggactgag aactgcccag actcctacgg gaggctgcag tcgagaatca

360

ttcgcaatgg gcgaaagcct gacgatgcga cgctgtgtga gtgaagaagg ccttagggtc

420

gtaaagctct ttcgcctggg aacaagatga gctggctaac atccagtgat tttgagcgta

480

ccaggtaaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagctg cggtaatacg gagggtgcaa

540

gcattaatcg gatttattgg gcgtaaaggg cgcgtaggcg ggggtgtcag tcagatgtga

600

aatcccgagg ctcaacctcg gaacagcatt tgaaactaca tctctagagg gtaggcggag

660

aaaacggaat tccacaagta gcggtgaaat gcgtagatat gtggaagaac accggtggcg

720

aaggcggttt tctagcttat acctgacgct aaagcgcgaa agcaagggga tcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcct tgccgtaaac tatgtatact tggtgtaact ggactcaacc

840

ctagttgtgc cgtagctaac gcgttaagta taccgcctgg ggagtacagt cgcaaggctg

900

aaactcaaaa gaattgacgg ggacccgcac aagcagtgga gcatgtggtt taattcgatg

960

caacgcgaag aaccttaccc agacttgaca tgtagtagac cggtctagaa ataggccttt

1020

ccttcgggac tgctacacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgccg tgaggtgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta tcattagttg ccaacattta aggtgggaac

1140

tctaatgaga ctgcctgggt taaccaggag gaaggtgagg atgacgtcaa gtccgcatgg

1200

cccttatgtc tggggctaca cacgtgctac aatggtcggt acaaaaggca gcgaagccgc

1260

gaggtgaagc aaatcccgaa agccggcccc agttcagatt gtagtctgca actcgactac

1320

atgaagacgg aattgctagt aatggcgagt cagcaacatc gccgtgaata cgttcccggg

1380

tcttgtacac accgcccgtc acatcatggg agttggtttt acccgaatcc gctggcttaa

1440

ccgcaaggga agaggcgtgt aaggtgaggc cgatgactgg gatgaagtcg taacaaggta

1500

gccctaccgg aaggtggggc tggatcacct cctttaa

1537

<210> 1424

<211> 1463

<212> DNA

<213> Paracoccus denitrificans

<400> 1424

caacttgaga gtttgatcct ggctcagaac gaacgctggc ggcaggccta acacatgcaa

60

gtcgagcgaa cccttcgggg ttagcggcgg acgggtgagt aacgcgtggg aatatgccct

120

ttgctacgga atagccccgg gaaactggga gtaataccgt atacgccctt tgggggaaag

180

atttatcggc aaaggattag cccgcgttgg attaggtagt tggtggggta atggcctacc

240

aagccgacga tccatagctg gtttgagagg atgatcagcc acactgggac tgagacacgg

300

cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatcttagac aatgggggca accctgatct

360

agccatgccg cgtgagtgat gaaggcccta gggttgtaaa gctctttcag ctgggaagat

420

aatgacggta ccagcagaag aagccccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

gagggggcta gcgttgttcg gaattactgg gcgtaaagcg cacgtaggcg gaccggaaag

540

ttgggggtga aatcccgggg ctcaacctcg gaactgcctt caaaactatc ggtctggagt

600

tcgagagagg tgagtggaat tccgagtgta gaggtgaaat tcgtagatat tcggaggaac

660

accagtggcg aaggcggctc actggctcga tactgacgct gaggtgcgaa agcgtgggga

720

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatgcc agtcgtcggg

780

cagcatgctg ttcggtgaca cacctaacgg attaagcatt ccgcctgggg agtacggtcg

840

caagattaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

900

attcgaagca acgcgcagaa ccttaccaac ccttgacatc gcaggaccgc tccagagatg

960

gagttttctc gtaagagacc tgtggacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt

1020

gagatgttcg gttaagtccg gcaacgagcg caacccacac tcttagttgc cagcatttgg

1080

ttgggcactc taagagaact gccgatgata agtcggagga aggtgtggat gaagtcaagt

1140

cctcatggcc cttacgggtt gggctacaca cgtgctacaa tggtggtgac agtgggttaa

1200

tccccaaaag ccatctcagt tcggattggg gtctgcaact cgaccccatg aagttggaat

1260

cgctagtaat cgcggaacag catgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1320

cccgtcacac catgggagtt gggtctaccc gacggccgtg cgctaaccag caatggaggc

1380

agcggaccac ggtaggctca gcgactgggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtaggggaa

1440

cctgcggctg gatcacctcc ttt

1463

<210> 1425

<211> 1430

<212> DNA

<213> Paracoccus marcusii

<400> 1425

cagaacgaac gctggcggca ggcttaacac atgcaagtcg agcgagacct tcgggtctag

60

cggcggacgg gtgagtaacg cgtgggaacg tgcccttctc tacggaatag ccccgggaaa

120

ctgggagtaa taccgtatac gccctttggg ggaaagattt atcggagaag gatcggcccg

180

cgttggatta ggtagttggt ggggtaatgg cccaccaagc cgacgatcca tagctggttt

240

gagaggatga tcagccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca

300

gtggggaatc ttagacaatg ggggcaaccc tgatctagcc atgccgcgtg agtgatgaag

360

gccttagggt tgtaaagctc tttcagctgg gaagataatg acggtaccag cagaagaagc

420

cccggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg gggctagcgt tgttcggaat

480

tactgggcgt aaagcgcacg taggcggact ggaaagtcag aggtgaaatc ccagggctca

540

accttggaac tgcctttgaa actatcagtc tggagttcga gagaggtgag tggaattccg

600

agtgtagagg tgaaattcgt agatattcgg aggaacacca gtggcgaagg cggctcactg

660

gctcgatact gacgctgagg tgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt

720

agtccacgcc gtaaacgatg aatgccagac gtcggcaagc atgcttgtcg gtgtcacacc

780

taacggatta agcattccgc ctggggagta cggtcgcaag attaaaactc aaaggaattg

840

acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gcagaacctt

900

accaaccctt gacatggcag gaccgctgga gagattcagc tttctcgtaa gagacctgca

960

cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttcggtta agtccggcaa

1020

cgagcgcaac ccacgtccct agttgccagc attcagttgg gcactctatg gaaactgccg

1080

atgataagtc ggaggaaggt gtggatgacg tcaagtcctc atggccctta cgggttgggc

1140

tacacacgtg ctacaatggt ggtgacagtg ggttaatccc caaaagccat ctcagttcgg

1200

attgtcctct gcaactcgag ggcatgaagt tggaatcgct agtaatcgcg gaacagcatg

1260

ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagttggtt

1320

ctacccgacg acgctgcgct aaccttcggg gggcaggcgg ccacggtagg atcagcgact

1380

ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtagg ggaacctgcg gctggatcac

1430

<210> 1426

<211> 1500

<212> DNA

<213> Paraprevotella clara

<400> 1426

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agcggcaggc ctaacacatg caagtcgagg

60

gaggagcttt cgggcttcga ccggcgtacg ggtgcgtaac gcgtatacaa tctgcctttc

120

acatagggat agcccgaaga aatttggatt aatacctaat ggtatatagg gatggcatca

180

tttttatatt aaagctgagg cggtgaaaga tgagtatgcg ttctattagc tagttggaga

240

ggtaacggct ccccaaggct acgatagata ggggttctga gagggatatc ccccacactg

300

gtactgagat acggaccaga ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt ggacaatggt

360

cggaagactg atccagccat gccgcgtgca ggaagacggc cttatgggtt gtaaactgct

420

tttgcagggg aagaataagg agtacgtgta ctttgatgac ggtactctgc gaataagcat

480

cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggaggat gcgagcgtta tccggaatca

540

ttgggtttaa agggtccgta ggcgggctaa taagtcagag gtgaaagcgc tcagctcaac

600

tgagcaactg cctttgaaac tgttagtctt gaatggttgt gaagtagttg gaatgtgtag

660

tgtagcggtg aaatgcttag atattacaca gaacaccgat agcgaaggca tattactaac

720

aattaattga cgctgatgga cgaaagcgtg gggagcgaac aggattagat accctggtag

780

tccacgctgt aaacgatgga tactagctgt ttggttgtaa gactgagtgg ctaagcgaaa

840

gtgataagta tcccacctgg ggagtacgca cgcaagtgtg aaactcaaag gaattgacgg

900

gggcccgcac aagcggagga acatgtggtt taattcgatg atacgcgagg aaccttacca

960

aggtttaaat ggagactgac aggtgtagag atacgctttt cttcggacag ttttcaaggt

1020

gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgtcagg ttaagtccta taacgagcgc

1080

aacccctgcc attagttgct agcgagtcga gtcgagcact ctagtgggac tgccggtgca

1140

aaccgtgagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcacggc ccttacatct tgggctacac

1200

acgtgctaca atggtcgtta cagagagcag ccactgcgtg agcaggcgcg aatctataaa

1260

gacgatcaca gttcggatcg gagtctgcaa ctcgactccg tgaagctgga atcgctagta

1320

atcggatatc agccatgatc cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca

1380

agccatggaa gctgggggta cctgaagacg gtcaccgaaa ggagctgttt agggtaaaac

1440

tagtgactgg ggctaagtcg taacaaggta gccgtaccgg aaggtgcggc tggaacacct

1500

<210> 1427

<211> 1532

<212> DNA

<213> Paraprevotella xylaniphila

<400> 1427

tacaatggag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctag ctacaggctt aacacatgca

60

agtcgagggg cagcatgaac ttagcttgct aagtttgatg gcgaccggcg cacgggtgag

120

taacgcgtat ccaacctgcc ctttacgcgg ggatagcctt ctgaaaggaa gtttaatacc

180

cgatgaattc gtttagtcgc atggcttgat gaataaagat ttatcagtaa aggatgggga

240

tgcgtcccat tagcttgttg gcggggtaac ggcccaccaa ggcgacgatg ggtaggggtt

300

ctgagaggaa ggtcccccac attggaactg agacacggtc caaactccta cgggaggcag

360

cagtgaggaa tattggtcaa tgggcgcgag cctgaaccag ccaagtagcg tggaggacga

420

cggccctacg ggttgtaaac tccttttata aggggataaa gttggccatg tatggccatt

480

tgcaggtacc ttatgaataa gcatcggcta attccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga

540

agatgcgagc gttatccgga tttattgggt ttaaagggag cgtaggcggg cagtcaagtc

600

agcggtcaaa tggcgcggct caaccgcgtt ccgccgttga aactggcagc cttgagtatg

660

cacagggtac atggaattcg tggtgtagcg gtgaaatgct tagatatcac gaggaactcc

720

gatcgcgcag gcattgtacc ggggcattac tgacgctgag gctcgaaggt gcgggtatca

780

aacaggatta gataccctgg tagtccgcac agtaaacgat gaatgcccgc tgtcggcgac

840

atagtgtcgg cggccaagcg aaagcgttaa gcattccacc tggggagtac gccggcaacg

900

gtgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcgga ggaacatgtg gtttaattcg

960

atgatacgcg aggaacctta cccgggcttg aatcgcaggt gcatgggccg gagacggccc

1020

tttccttcgg gactcctgcg aaggtgctgc atggttgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg

1080

tcggcttaag tgccataacg agcgcaaccc ccctccccag ttgccatcgg gtaatgccgg

1140

gcactttggg gacactgcca ccgcaaggtg cgaggaaggt ggggatgacg tcaaatcagc

1200

acggccctta cgtccggggc gacacacgtg ttacaatggg gggtacagag ggccgctgcc

1260

cggtgacggt tggccaatcc ctaaagcccc tctcagttcg gactggagtc tgcaacccga

1320

ctccacgaag ctggattcgc tagtaatcgc gcatcagcca tggcgcggtg aatacgttcc

1380

cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagcca tgaaagccgg gggtgcctga agtccgtgac

1440

cgcgagggtc ggcctagggt aaaaccggtg attggggcta agtcgtaaca aggtagccgt

1500

accggaaggt gcggctggaa cacctccttt ct

1532

<210> 1428

<211> 1532

<212> DNA

<213> Parascardovia denticolens

<400> 1428

tttttgtgga gggttcgatt ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg ggatcctctc cagcttgctg ggggggtgag agtggcgaac gggtgagtaa

120

tgcgtgacta acctgcctca tggtctggaa tagctcctgg aaacgggtgg taatgccgga

180

tggtccaact ttccgcatgg tttgttggga aagcttttgc gccatgggat ggggtcgcgt

240

cctatcagct tgttggtggg gtgttggcct accaaggctt cgacgggtag ccggcctaag

300

agggcgaccg gccacattgg gactgagata cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

360

gggaatattg cacaatgggg ggaaccctga tgcagcgacg ccgcgtgcgg gatggaggcc

420

ttcgggtcgt gaaccgcttt tacaggggag caagctttcg ggtgagttaa ctttgtgaat

480

aagcaccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcaa gcgttgtccg

540

gatttattgg gcgtaaaggg ctcgtaggcg gttcgtcgcg tctggtgtga aagcccgctg

600

cttaacggtg ggtttgcgtt ggatacgggc gggcttgagt gcagtagggg agactggaat

660

tctcggtgta acggtggaat gtgtagatat cgggaagaac acctatggcg aaggcaggtc

720

tctgggctgt tactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc

780

tggtagtcca cgctgtaaac ggtggacgct ggatgtgggg cccatttcca cgggttccgt

840

gtcggagcta acgcgttaag cgtcccgcct ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa

900

agaaattgac gggggcccgc acaagcggcg gagcatgcgg attaattcga tgcaacgcga

960

agaaccttac cagggcttga catgttgacg atcgcctcag agatggggct tcccttcggg

1020

gcgtcttcac aggtggtgca tggtcgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaaccct cgctttgtgt tgccagcggg tcgtgccggg tactcgcaag

1140

ggaccgccgg ggttaactcg gaggaaggtg gggatgacgt cagatcatca tgccccttac

1200

gtcctgggct tcacgcatgc tacaatggcc ggtacagcgg gatgcgatgc cgtgaggcgg

1260

agcggatcct gtaaaaccgg tctcagttcg gatcggagcc tgcaactcgg ctccgtgaag

1320

gtggagtcgc tagtaatcgc ggatcagcaa cgccgcggtg aatgcgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcaagtca tgaaagtggg cagcacccga agccggtggc ctaacccttg

1440

tggggggagc cgtctaaggt gaggtccgcg attgggacta agtcgtaaca aggtagccgt

1500

accggaaggt gcggctggat cacctccttt ct

1532

<210> 1429

<211> 1026

<212> DNA

<213> Parasutterella excrementihominis

<220>

<221> modified_base

<222> (864)..(864)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (935)..(935)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (969)..(970)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (980)..(980)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (982)..(982)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1011)..(1011)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1429

acgcggagag aagcttgctt ctctccggcg acgagtggcg aacgggtgag taatacatcg

60

gaacgtgtcc gctcgtgggg gacaaccagc cgaaaggttg gctaataccg catgagttct

120

acggaagaaa gagggggacc cgcaagggcc tctcgcgagc ggagcggccg atgactgatt

180

agccggttgg tgaggtaacg gctcaccaaa gcaacgatca gtagctggtc tgagaggacg

240

accagccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

300

tttggacaat gggcgcaagc ctgatccagc tattccgcgt gtgggatgaa ggccctcggg

360

ttgtaaacca cttttgtaga gaacgaaaag acaccttcta ataaagggtg ttgctgacgg

420

tactctaaga ataagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc

480

gagcgttaat cggaattact gggcgtaaag ggtgcgcagg cggttgagta agacagatgt

540

gaaatccccg agcttaactc gggaatggca tatgtgactg ctcgactaga gtgtgtcaga

600

gggaggtgga attccacgtg tagcagtgaa atgcgtagat atgtggaaga acaccgatgg

660

cgaaggcagc ctcctgggac ataactgacg ctcaggcacg aaagcgtggg gagcaaacag

720

gattagatac cctggtagtc cacgccctaa acgatgttaa ctagttgttg ggaagtaaaa

780

ttctcagtaa cgcagccaac gcgagaagtt aaccgcctgg gaagtacggt cgcaagacta

840

aaactcaaag gaattgacgg gganccgcac aagcggtgga tgatgtggat taattcgatg

900

caacgcgaaa aaccttacct acccttgaca tgtcnggaag ctcttgtaat gagagtgtgc

960

ccgcaaggnn cctgaacacn gntgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc ntgagatgtt

1020

gggtta

1026

<210> 1430

<211> 1320

<212> DNA

<213> Parasutterella secunda

<400> 1430

attgaacgct ggcggcatgc tttacacatg caagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta

60

atacatcgga acgtgtcctg ttgtggggga taactactcg aaagagtagc taataccgca

120

taaggaaagg cgcagttgga gcggccgatg actgattagc tagttggtgg ggtaaaggcc

180

taccaaggcg acgatcagta gctggtctga gaggacgacc agccacattg ggactgagac

240

acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt ggggaatttt ggacaatggg ggcaaccctg

300

atccagccat gccgcgtgcg ggaagaaggc cttcgggttg taaaccgctt ttgttaggaa

360

cgatgacggt acctaaagaa taagcaccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

420

gtagggtgcg agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gtgcgcaggc ggttgggtaa

480

gacaggtgtg aaatccccga gcttaacttg ggaactgcac ttgtgactgc tcaactagag

540

tatgtcagag ggaggtggaa ttccaagtgt agcagtgaaa tgcgtagata tttggaagaa

600

caccgatggc gaaggcagcc tcctgggata actgacgctc atgcacgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccctaaacg atgtcaacta gttgttgggc

720

gcttagtaac acagctaacg cgagaagttg accgcctggg gagtacggtc gcaagattaa

780

aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggat gatgtggatt aattcgatgc

840

aacgcgaaaa accttaccta gccttgacat gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtcac tagttgctac

960

agcactctag tgaaactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcct

1020

catggccctt atggctaggg cctcacacgt catacaatgg tcggcagagg gcagcgaagc

1080

tgtgaagtgg agccaatccc arccgatcgt agtccggatg cagtctgcaa ctcgactgca

1140

gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt tcccgggtct

1200

tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt ggggttcacc agaaggcgtt gcctagggcg

1260

gcgaccacgg tgggtttcat gactggggtg aagtcgtaac aaggtagcag taccggaagg

1320

<210> 1431

<211> 1487

<212> DNA

<213> Parvimonas micra

<400> 1431

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gtgatttttg tggaaattct ttcgggaatg gaaatgaaat gaaagtggcg aacgggtgag

120

taacacgtga gcaacctacc ttacacaggg ggatagccgt tggaaacgac gattaatacc

180

gcatgagacc acagaatcgc atgatatagg ggtcaaagat ttatcggtgt aagaagggct

240

cgcgtctgat tagctagttg gaagggtaaa ggcctaccaa ggcgacgatc agtagccggt

300

ctgagaggat gaacggccac attggaactg agacacggtc caaactccta cgggaggcag

360

cagtggggaa tattgcacaa tggggggaac cctgatgcag cgacgccgcg tgagcgaaga

420

aggttttcga atcgtaaagc tctgtcctat gagaagataa tgacggtatc ataggaggaa

480

gccccggcta aatacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta tggggcgagc gttgtccgga

540

attattgggc gtaaagggta cgtaggcggt tttttaagtc aggtgtgaaa gcgtgaggct

600

taacctcatt aagcacttga aactggaaga cttgagtgaa ggagaggaaa gtggaattcc

660

tagtgtagcg gtgaaatgcg tagatattag gaggaatacc ggtggcgaag gcgactttct

720

ggacttttac tgacgctcag gtacgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg

780

tagtccacgc cgtaaacgat gaatgctagg tgttgggagt caaatctcgg tgccgaagtt

840

aacacattaa gcattccgcc tggggagtac ggtggcaaca ctgaaactca aaggaattga

900

cggggacccg cacaagcagc ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta

960

ccaaggcttg acatatagtt gagttattga gaaattgata agtccctcgg gacaactata

1020

caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc ttatcttcag ttgccagcac gtagaggtgg gaactctgga gagactgccg

1140

atgacaaatc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccttta tgtcttgggc

1200

tacacacgtg ctacaatggt tggtacaacg agaagcgaga tagagatgtt aagcgaaact

1260

ctaaaaacca atctcagttc ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa gtcggagttg

1320

ctagtaatcg cgaatcagaa tgtcgcggtg aatgcgttcc cgggtcttgt acacaccgcc

1380

cgtcacacca tgggagttgg caatacccga agccgccgat ctaaccgcaa ggaggaaggc

1440

gtcgaaggta gggttaatga ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtaacc

1487

<210> 1432

<211> 1530

<212> DNA

<213> Parvimonas sp. oral taxon 110

<400> 1432

ttttaataga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg tgatttttgt ggaaagccct tcggggacgg aagcgaaatg aaagtggcga

120

acgggtgagt aacacgtgag caacctacct tacacagggg gatagccgtt ggaaacgacg

180

attaataccg catgagacca caaagccaca tggcttaggg gtaaaagatt tatcggtgta

240

agatgggctc gcgtctgatt agctagttgg aagggtaaag gcctaccaag gcaacgatca

300

gtagccggtc tgagaggatg aacggccaca ttggaactga gacacggtcc aaactcctac

360

gggaggcagc agtggggaat attgcacaat ggggggaacc ctgatgcagc gacgccgcgt

420

gagcgaagaa ggttttcgaa tcgtaaagct ctgtcctatg agaagataat gacggtatca

480

taggaggaag ccccggctaa atacgtgcca gcagccgcgg taatacgtat ggggcgagcg

540

ttgtccggaa ttattgggcg taaagggtac gtaggcggcc ttttaagtca ggtgtgaaag

600

cgtgaggctt aacctcatta agcacttgaa actggaaggc ttgagtgaag gagaggaaag

660

tggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattagg aggaataccg gtggcgaagg

720

cgactttctg gacttttact gacgctcagg tacgaaagcg tggggagcaa acaggattag

780

ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg aatgctaggt gttgggagtc aaatctcggt

840

gccgaagtta acacattaag cattccgcct ggggagtacg gtggcaacac tgaaactcaa

900

aggaattgac ggggacccgc acaagcagcg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga

960

agaaccttac caaggcttga catatagttg agttattgag aaattgataa gtccctcggg

1020

acaactatac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaaccct tatcttcagt taccagcatg taatgatggg gactctggag

1140

agactgccga tgacaaatcg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccctttat

1200

gtcttgggct acacacgtgc tacaatggtt ggtacaacga gaagctagac agtgatgtta

1260

agcaaaactc taaaaaccaa tctcagttcg gattgtaggc tgcaactcgc ctacatgaag

1320

tcggagttgc tagtaatcgc gaatcagaat gtcgcggtga atgcgttccc gggtcttgta

1380

cacaccgccc gtcacaccat gggagttggc aatacccgaa gccgccgatc taaccgcaag

1440

gaggaaggcg tcgaaggtag ggttaatgac tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtat

1500

cggaaggtgc ggctggatca cctcctttct

1530

<210> 1433

<211> 1475

<212> DNA

<213> Pasteurella bettyae

<220>

<221> modified_base

<222> (29)..(29)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (127)..(127)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (130)..(130)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (203)..(203)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (290)..(290)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (354)..(354)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (369)..(369)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (371)..(371)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (627)..(627)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (963)..(963)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1264)..(1265)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1433

attgaagagt ttgatcatgg ctcagattna acgctggcgg caggcttaac acatgcaagt

60

cgaacggtag cayaggggag cttgctccct gggtgacgag tggcggacgg gtgagtaatg

120

cttgggnatn tggcttatgg agggggataa ctacgggaaa ctgtagctaa taccgcgtaa

180

tgtctacgga ctaaagggtg ggnctatttg gccacctgcc atgagatgag cccaagtggg

240

attaggtagt tggtggggta aaggcctacc aagccgacga tctctagctn gtctgagagg

300

atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcngtgggg

360

aatattgcnc natgggggga accctgatgc agccatgccg cgtgaatgaa gaaggccttc

420

gggttgtaaa gttctttcgg tgatgaggaa ggcaggtatt ttaatagaat acttgattga

480

cgttaatcac agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg

540

tgcgagcgtt aatcggaata actgggcgta aagggcatgc aggcggttgt ttaagtgaga

600

tgtgaaagcc ccgggcttaa cctgggnatt gcatttcaga ctggacagct agagtacttt

660

agggaggggt agaattccac gtgtagcggt gaaatgcgta gagatgtgga ggaataccga

720

aggcgaaggc agccccttgg gaatgtactg acgctcatat gcgaaagcgt ggggagcaaa

780

caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgatttgggg attgagcaat

840

aagcttggtg cgcgaagcta acgtgataaa tcgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt

900

taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga

960

tgnaacgcga agaaccttac ctactcttga catccataga agaactcaga gatgagtttg

1020

tgccttcggg agctatgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg

1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcctttg ttgccagcga catggtcggg

1140

aactcaaagg agactgccag tgataaactg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca

1200

tggcccttac gagtagggct acacacgtgc tacaatggtg catacagagg gaagcgagcc

1260

tgcnnggggg agcgaatctc agaaagtgca tctaagtccg gattggagtc tgcaactcga

1320

ctccatgaag tcggaatcgc tagtaatcgc aaatcagaat gttgcggtga atacgttccc

1380

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tgtaccagaa gtagatagct

1440

taacggaaac gggggcgttt accacggtat gattc

1475

<210> 1434

<211> 1544

<212> DNA

<213> Pasteurella dagmatis

<400> 1434

ttgaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgaacg gtagcaggaa gaaagcttgc tttctttgct gacgagtggc ggacgggtga

120

gtaatgcttg ggaatctggc ttatggaggg ggataactgt gggaaactgc agctaatacc

180

gcgtagtatc gagagatgaa agggtgggac cttcgggcca cctgccataa gatgagccca

240

agtgggatta ggtagttggt ggggtaaagg cctaccaagc cgacgatctc tagctggtct

300

gagaggatga ccagccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca

360

gtggggaata ttgcgcaatg gggggaaccc tgacgcagcc atgccgcgtg aatgaagaag

420

gccttcgggt tgtaaagttc tttcggtaat gaggaagggg tattattgaa tagataatat

480

cattgacgtt aattacagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac

540

ggagggtgcg agcgttaatc ggaataactg ggcgtaaagg gcacgcaggc ggacttttaa

600

gtgagatgtg aaatccccga gcttaacttg ggaactgcat ttcagactgg gagtctagag

660

tactttaggg aggggtagaa ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa

720

taccgaaggc gaaggcagcc ccttgggaat gtactgacgc tcatgtgcga aagcgtgggg

780

agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgctgtaaa cgctgtcgat ttggggattg

840

tgctttatgc atggtgcccg aagctaacgt gataaatcga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctac tcttgacatc caaagaaggc cgtagagata

1020

tggctgtgcc ttcgggaact ttgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcgatttg

1140

gtcgggaact caaaggagac tgccagtgac aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgagt agggctacac acgtgctaca atggtgcata cagagggcgg

1260

cgagacggcg acgttgagcg aatctcagaa agtgcatcta agtccggatt ggagtctgca

1320

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcaaat cagaatgttg cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgta ccagaagtag

1440

atagcttaac cttcgggagg gcgtttacca cggtatgatt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc ctta

1544

<210> 1435

<211> 1545

<212> DNA

<213> Pasteurella multocida

<400> 1435

ttgaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgaacg gtagcaggaa gaaagcttgc tttctttgct gacgagtggc ggacgggtga

120

gtaatgcttg ggaatctggc ttatggaggg ggataactgt gggaaactgc agctaatacc

180

gcgtattctc tgaggaggaa agggtgggac cttagggcca cctgccataa gatgagccca

240

agtgggatta ggtagttggt ggggtaaagg cctaccaagc ctgcgatctc tagctggtct

300

gagaggatga ccagccacac tggaactgag acacggtcca gactcctacg ggaggcagca

360

gtggggaata ttgcgcaatg gggggaaccc tgacgcagcc atgccgcgtg aatgaagaag

420

gccttcgggt tgtaaagttc tttcggtaat gaggaaggga tgttgttaaa tagatagcat

480

cattgacgtt aattacagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac

540

ggagggtgcg agcgttaatc ggaataactg ggcgtaaagg gcacgcaggc ggacttttaa

600

gtgagatgtg aaatccccga gcttaacttg ggaactgcat ttcagactgg gagtctagag

660

tactttaggg aggggtagaa ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa

720

taccgaaggc gaaggcagcc ccttgggaat gtactgacgc tcatgtgcga aagcgtgggg

780

agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgctgtaaa cgctgtcgat ttggggattg

840

ggctatatgc ttggtgcccg aagctaacgt gataaatcga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctac tcttgacatc ctaagaagag ctcagagatg

1020

agcttgtgcc ttcgggaact tagagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcgattcg

1140

gtcgggaact caaaggagac tgccagtgac aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggt ccttacgagt agggctacac acgtgctaca atggtgcata cagagggcag

1260

cgagagtgcg agcttgagcg aatctcagaa agtgcatcta agtccggatt ggagtctgca

1320

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcaaat cagaatgttg cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgta ccagaagtag

1440

atagcttaac cttcgggagg gcgtttacca cggtatgatt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttac

1545

<210> 1436

<211> 1434

<212> DNA

<213> Pediococcus acidilactici

<400> 1436

tcgaacgaac ttccgttaat tgatcaggac gtgcttgcac tgaatgagat tttaatatga

60

agtgagtggc ggacgggtga gtaacacgtg ggtaacctgc ccagaagcag gggataacac

120

ctggaaacag atgctaatac cgtataacag agaaaaccgc ctggttttct tttaaaagat

180

ggctctgcta tcacttctgg atggacccgc ggcgcattag ctagttggtg aggtaacggc

240

tcaccaaggc gatgatgcgt agccgacctg agagggtaat cggccacatt gggactgaga

300

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tccacaatgg acgcaagtct

360

gatggagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg gtttcggctc gtaaagctct gttgttaaag

420

aagaacgtgg gtgagagtaa ctgttcaccc agtgacggta tttaaccaga aagccacggc

480

taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg taggtggcaa gcgttatccg gatttattgg

540

gcgtaaagcg agcgcaggcg gtcttttaag tctaatgtga aagttcggct caaccgaaga

600

agtgcattgg aaactgggag acttgagtgc agaagaggac agtggaactc catgtgtagc

660

ggtgaaatgc gtagatatat ggaagaacac cagtggcgaa ggcggctgtc tggtctgtaa

720

ctgacgctga ggctcgaaag catgggtagc gaacaggatt agataccctg gtagtccatg

780

ccgtaaacga tgattactaa gtgttggagg gtttccgccc ttcagtgctg cagctaacgc

840

attaagtaat ccgcctgggg agtacgaccg caaggttgaa actcaaaaaa attgacgggg

900

gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagct acgcgaagaa ccttaccagg

960

tcttgacatc ttctgccaac ctaagagatt aggcgttccc ttcggggaca gaatgacagg

1020

tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1080

caacccttat tactagttgc cagcattcag ttgggcactc tagtgagact gccggtgaca

1140

aaccggagga aggtggggac gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct gggctacaca

1200

cgtgctacaa tggatggtac aacgagttgc gaaaccgcga ggtttagcta atctcttaaa

1260

accattctca gttcggactg taggctgcaa ctcgcctaca cgaagtcgga atcgctagta

1320

atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac

1380

accatgagag tttgtaacac ccaaagccgg tggggtaacc ttttaggagc tagc

1434

<210> 1437

<211> 984

<212> DNA

<213> Pediococcus pentosaceus

<400> 1437

gtcgaacgaa cttccgttaa ttgattatga cgtacttgta ctgattgaga ttttaacacg

60

aagtgagtgg cgaacgggtg agtaacacgt gggtaacctg cccagaagta ggggataaca

120

cctggaaaca gatgctaata ccgtataaca gagaaaaccg catggttttc ttttaaaaga

180

tggctctgct atcacttctg gatggacccg cggcgtatta gctagttggt gaggtaaagg

240

ctcaccaagg cagtgatacg tagccgacct gagagggtaa tcggccacat tgggactgag

300

acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttccacaatg gacgcaagtc

360

tgatggagca acgccgcgtg agtgaagaag ggtttcggct cgtaaagctc tgttgttaaa

420

gaagaacgtg ggtaagagta actgtttacc cagtgacggt atttaaccag aaagccacgg

480

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttatcc ggatttattg

540

ggcgtaaagc gagcgcaggc ggtcttttaa gtctaatgtg aaagccttcg gctcaaccga

600

agaagtgcat tggaaactgg gagacttgag tgcagaagag gacagtggaa ctccatgtgt

660

agcggtgaaa tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct gtctggtctg

720

caactgacgc tgaggctcga aagcatgggt agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

atgccgtaaa cgatgattac taagtgttgg agggtttccg cccttcagtg ctgcagctaa

840

cgcattaagt aatccgcctg gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa agaattgacg

900

ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gctacgcgaa gaaccttacc

960

aggtcttgac atcttctgac agtc

984

<210> 1438

<211> 1393

<212> DNA

<213> Peptococcus niger

<400> 1438

gcctaataca tgcaagtcga acggacgagg aaagagacct cttcggagtg acctttcccg

60

agttagtggc ggatgggtga gtaacgcgtg agtgacctgc ccagcagtgg ggaataacag

120

tgagaaatca ttgctaatac cgcatatctt acaagtgctt catggtacct gtaagaaaga

180

cggccttcgt gctgtcgctg ttggatggac tcgcgtctga ttagccagtt ggtggggtaa

240

cggcctacca aagcaatgat cagtagccgg cctgagaggg tgaacggcca cattgggact

300

gagacacggc ccaaactcct acgggaggca gcagtgggga atcttccgca atgggcgcaa

360

gcctgacgga gcaatgccgc gtgagtgaag aaggccttcg ggttgtaaaa ctctgtcctc

420

atccaagaga ggggaaggta gtaactgacc tttccaggac ggtagatgag gaggaagccc

480

cggctaacta tgtgccagca gccgcggtaa aacatagggg gcaagcgttg tccggaatca

540

ctgggcgtaa agggcgcgca ggcggtctgt taagtcagat gtgaaaggtt agggctcaac

600

cctgaacgtg catctgatac tggcagactt gagtatggaa gaggtaagtg gaattcctag

660

tgtagcggtg aaatgcgtag atattaggag gaacaccagt ggcgaaggcg acttactggg

720

ccataactga cgctgaggcg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag

780

tccacgccgt aaacgatggg tactaggtgt cggaggtttc aagaccgtcg gtgccgcagt

840

taacacaata agtaccccgc ctggggagta cggtcgcaag actgaaactc aaaggaattg

900

acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gacgcaacgc gaagaacctt

960

accaagactt gacatcctgc tgccgagtga tgtaatgtca cttttccttc gggacagcag

1020

agacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1080

acgagcgcaa cccttgtcgt cagttgccat cattaagttg ggcactctga cgagactgcc

1140

gcagacaatg cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgtcttggg

1200

ctacacacgt gctacaatgg tcggtacaga gggcagcgaa ggagcgatcc ggagccaatc

1260

tcacaaagcc gatcccagtt cggattgcag gctgcaactc gcctgcatga agtcggaatg

1320

cgtagtaatc gcaggtcagc atactgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc

1380

ccgtcacacc acg

1393

<210> 1439

<211> 1366

<212> DNA

<213> Peptococcus sp. oral clone JM048

<400> 1439

gagtttgatt ctggctcagg atgaacgctg gcggcatgcc taacacatgc aagttgaacg

60

agtagcgaac gggtgagtaa cgcgtgggca accaacctta cactggggga taacacagag

120

aaatttgtgc taataccgca taagaaaaag tggtgtaaga cgggcccgcg tctgattagt

180

tagttggtga ggtaaaagct taccaaggca acgatcagta gccgacctga gagggtgatc

240

ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt gggggatatt

300

gcacaatgga gggaactctg atgcagcaat gccgcgtgaa ggaagaaggt tttcggattg

360

taaacttcta tcagcaggga agatgacggt acttgactaa gaagccccgg ctaactatgt

420

gccagcagcc gcggtaatac atagggggca agcgttatcc ggaatgactg ggtgtaaagg

480

gtgcgtaggc ggtaaggtaa gtctgatgtg aaagactggg gctcaactcc aggggtgcat

540

tggaaactat gttactagag tacaggagag ggaagcggaa ttcctagtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata ttaggaggaa caccggtggc gaaggcggct ttctggactg actgacgctg

660

aggcacgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg

720

atgagtgcta ggtgctggcc ggtcggtgcc gaagttaacg caataagcac tccacctggg

780

gagtacggcc gcaaggctga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag atcttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttaggtt aagtcctgta acgagcgcaa

960

cccttatgtt tagtagccag cggccgggca ctctgaacag actgccgtgg agaacacgga

1020

ggaaggcggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga tctgggctac acacgtgcta

1080

caatggcgga caaagggaag cgaaggggag acctggagcg aatccgagtc cgtcccagtt

1140

cggatgtagt ctgcaactcg actacagaag ttggaatcgc tagtaatcgc agatcagcat

1200

gctgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagttggg

1260

agtgcccaaa agcagtgtcc aggaagctgt ctaaggcaag accgatgact ggggtgaagt

1320

cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctt

1366

<210> 1440

<211> 1541

<212> DNA

<213> Peptococcus sp. oral taxon 167

<400> 1440

gagtttgatc ctggctcagg acaaacgctg gcggcatgcc taacacatgc aagtcgaacg

60

gacagaacag agaagctttt cggagtggaa ctggaaagtt agtggcggat gggtgagtaa

120

cgcgtggaca acctaccttg taaaggggaa taacctcgag aaatcgaagc taatacccca

180

taataacctt gattcgcatg aagcaaggag gaaaggcggc cttagagctg tcgatagaag

240

atgggtccgc gtctgattag ctagttggtg aggtaaaggc tcaccaaggc gacgatcagt

300

agccggcctg agagggtgaa cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg

360

gaggcagcag tggggaatct tccgcaatgg gcgaaagcct gacggagcaa tgccgcgtga

420

gtgaagaagg ccttcgggtt gtaaaactct gtcctagacg aagagagagt attgtgagta

480

actgacaatg ctaggacggt agactaggag gaagccccgg ctaactatgt gccagcagcc

540

gcggtaaaac atagggggca agcgttgtcc ggaatcactg ggcgtaaagg gcgcgcaggc

600

ggtaaattaa gtcaggtgtg aaagttcggg gctcaacccc gtgattgcac ctgatactga

660

taaactagag tgttggagag gtaagtggaa ttcctagtgt agcggtggaa tgcgtagata

720

ttaggaggaa caccagtggc gaaggcgact tactggccaa taactgacgc tgaggcgcga

780

aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgagtac

840

taggtgttgg ttgtttcgaa acaatcggtg ccgcagtaaa cacaataagt actccgcctg

900

gggagtacgg tcgcaagact gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg

960

agcatgtggt ttaattcgac gcaacgcgaa gaaccttacc aagacttgac atcctcttgc

1020

cgggatatgt aatgtatcct tttcttcgga acaagagaga caggtggtgc atggttgtcg

1080

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgttgttag

1140

ttgccatcat taagttgggc actctaacaa gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg

1200

ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg tcttgggcta cacacgtgct acaatggtcg

1260

gtacagaggg cagcaagaga gtgatcttga gcgaatctca aaaagccgat cccagttcgg

1320

attgtaggct gcaactcgcc tacatgaagt cggaatcgct agtaatcgca ggtcagcata

1380

ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg aaagttggta

1440

acatccgaag ccggtgatct aacctgcaaa ggaggaagcc gcccacggtg ggatcgatga

1500

ttggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta tcggaaggtg c

1541

<210> 1441

<211> 1384

<212> DNA

<213> Peptoniphilus asaccharolyticus

<220>

<221> modified_base

<222> (146)..(146)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (182)..(184)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (416)..(416)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (448)..(448)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (620)..(620)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (649)..(649)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (890)..(890)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1208)..(1208)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1441

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgcgc ttaacacatg caagtcgagc

60

gatgaagctt taacagattc cttcgggatg aagataaagc ggattagcgg cggacgggtg

120

agtaacacgt gagtaacctg cctttnacat cgggatagcc tcgggaaacc gggattaata

180

cnnnataaaa tcctacatac acatgtacat aggttcaaaa ctacggtggt cttagatgga

240

ctcgcgtccc attagctagt tggtggagta aaagcctacc aaggcgacga tgggtagccg

300

gcctgagagg gtgaccggcc acattggaac tgagaaacgg tccaaactct acgggaggca

360

gcagtgggga atattgcaca atggaggaaa ctctgatgca gcgacgccgc gtgaangaag

420

aaggccttcg ggcagtaaag gtcttttnta tgggaagata atgacggtac cataaggaaa

480

agcaccggct gcatacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggggctag cgttgtccgg

540

aatcactggg cgtaaagggt tcgcaggcgg aaatgcaagt cagatgtaaa aggcagtagc

600

ttaactactg taagcatttn aaactgtata tcttgagaag tgtagaggna agtggaattt

660

ttagtgtagc ggtgaaatgc gtagatatta aaaagaatac cggtggcgaa ggcgacttac

720

tgggcacatt ctgacgctga ggaacgaaag cgtgggtagc aaacaggatt agataccctg

780

gtagtccacg ctgtaaacga tgagtgctag gtgtcggcaa aagtcggtgc cgcagttaac

840

acattaagca ctccgcctgg ggagtacgtg cgcaagtatg aaactcaaan gaatcaaagg

900

aatcgacggg gacccgcaca agcagcggag atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa

960

ccttaccagg gcttgacata tagaggacat atttagagat aaataattct tcttcggaag

1020

cctctataca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc

1080

ccgcaacggg cgcaaccctt atatctagtt gccagcattt cggatgggaa ctctagatag

1140

actgccgatg acaaatcgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccctatatgc

1200

cctgggcnac acacgtgcta caatggaagg tacaaaggga agccaaatcg cgaggtggag

1260

caaacctcaa aaagcctttc ccagttcgga ttgttctctg caactcgagt acatgaagct

1320

ggagttgcta gtaatcgtag atcagaatgc tgcggtgaat gcgttcccgg gtcttgtaca

1380

cacc

1384

<210> 1442

<211> 1386

<212> DNA

<213> Peptoniphilus duerdenii

<400> 1442

acagatccct tcggggtgaa gatgaaatgg attagcggcg gacgggtgag taacacgtga

60

gtaacctgcc tttgacattg ggatagcctc gggaaactgg gattaatacc aaatgatact

120

atttgaccac atggttggat agtcaaagaa attcggtcaa agatggactc gcggctgatt

180

agctagttgg tgaggtaacg gcccaccaag gcgacgatca gtagccggcc tgagagggtg

240

accggccaca ttggaactga gacacggtcc aaactcctac gggaggcagc agtggggaat

300

attgcacaat gggggaaacc ctgatgcagc gacgccgcgt gagcgaagaa ggccttcggg

360

tcgtaaagct cttttatgag ggaagataat gacggtacct caagaaaaag ccccggctaa

420

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggggctagcg ttgtccggaa tcactgggcg

480

taaagggttc gcaggcggaa taacaagtca gatgtgaaag gcatgggctc aacccatgta

540

agcatttgaa actgtaattc ttgagaagtg gagaggtaag tggaattcct agtgtagcgg

600

tgaaatgcgt agatattagg aggaatacct gtggcgaagg cgacttactg gacacaaatc

660

tgacgctgag gaacgaaagc gtgggtagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc

720

cgtaaacgat gagtgctagg tgtcggggga gacctcggtg ccggcgttaa cacaataagc

780

actccgcctg gggagtacgt gcgcaagcat gaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca

840

caagcagcgg agcatgtggt ttaattcgac gcaacgcgaa gaaccttacc agggcttgac

900

atactgagga cgtacttaga gataagtatt ctccttcggg agcctcaata caggtggtgc

960

atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttcagttaag tctggcaacg agcgcaaccc

1020

ttacctttag ttaccagcat ttcggatggg gactctaaag ggactgccga tgataaatcg

1080

gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccctatat gccctgggct acacacgtgc

1140

tacaatggtc ggaacagagg gaagcaacag agcgatctca agcaaatctc ataaatccga

1200

tcccagttcg gattgcactc tgcaactcga gtgcatgaag tcggagttgc tagtaatcgc

1260

agatcagcat gctgcggtga atgcgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat

1320

gggagcctgt aatacccgaa gccggtgagc caaccgcaag gaggcagccg tcgaaggtag

1380

gatagg

1386

<210> 1443

<211> 1476

<212> DNA

<213> Peptoniphilus harei

<400> 1443

gacgaacgct ggcggcgcgc ttaacacatg caagtcgagc gatgaaatct tgacagatcc

60

ttcggggtga agataagatg gattagcggc ggacgggtga gtaacacgtg agtaacctgc

120

cttagacatt gggatagcct cgggaaaccg ggattaatac caaatgaaat cataggtgcc

180

catgcactaa tgatcaaaac tccggtggtc taagatggac tcgcgtccca ttagctagtt

240

ggtgaggtaa cggcccacca aggcgacgat gggtagccgg cctgagaggg tgaacggcca

300

cattggaact gagaaacggt ccaaactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca

360

atggagggaa ctctgatgca gcgacgccgc gtgaacgatg aaggctttcg agtcgtaaag

420

ttcttttata tgggaagata atgacggtac cataagaaaa agccccggct aactacgtgc

480

cagcagccgc ggtaatacgt agggggctag cgttgtccgg aatcactggg cgtaaagggt

540

tcgcaggcgg aaatgcaagt cagatgtaaa aggcagtagc ttaactactg taagcatttg

600

aaactgcata tcttgagaag agtagaggta agtggaattt ttagtgtagc ggtgaaatgc

660

gtagatatta aaaagaatac cggtggcgaa ggcgacttac tgggctcatt ctgacgctga

720

ggaacgaaag cgtgggtagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ctgtaaacga

780

tgagtgctag gtatcggaat aattcggtgc cgcagttaac acattaagca ctccgcctgg

840

ggagtacgtg cgcaagcatg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcagcgga

900

gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacca gggcttgaca tactgaggac

960

cggtatagag atataccctc ttcttcggaa gcctcaatac aggtggtgca tggttgtcgt

1020

cagctcgtgt cgtgagatgt tcagttaagt ctggcaacga gcgcaacccc tatctttagt

1080

taccagcatt tcggatgggg actctaaaga gactgccgat gataaatcgg aggaaggtgg

1140

ggatgacgtc aaatcatcat gccctatatg ccctgggcta cacacgtgct acaatggaag

1200

atacaaaggg aagcgagata gtgatattaa gccaacctca aaaagtcttt ctcagttcgg

1260

attgtactct gcaactcgag tacatgaaga tggagttgct agtaatcgca gatcagcatg

1320

ctgcggtgaa tgcgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccatg gaagcttgta

1380

atacccgaag cctgcgagcg aaccttaggg aagcagcagt cgaaggtagg ataggtgact

1440

ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtatc ggaagg

1476

<210> 1444

<211> 1423

<212> DNA

<213> Peptoniphilus indolicus

<220>

<221> modified_base

<222> (162)..(162)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1214)..(1214)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1444

cgcgcctaac acatgcaagt cgagcgatga agacataacc gacaccttcg ggaagaagtt

60

aagttggatt agcggcggac gggtgagtaa cacgtgagta acctgccttt gacacggggg

120

atagccaccg gaaacggtga ttaatacccg atgaaatcgt antgacacat gtcataacga

180

tcaaagtgaa ttagcggtca aagatggact cgcgtctgat taattagttg gtgaggtaac

240

ggctcaccaa gatagcgatc agtagccggc ctgagagggt gaacggccac attggaactg

300

agaaacggtc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggggaaac

360

cctgatgcag cgacgccgcg tgagcgaaga aggatttcga ttcgtaaagc tctgtcctat

420

gggaagataa tgacggtacc ataggaggaa gccccggcta actacgtgcc agcagccgcg

480

gtaatacgta gggggcgagc gttgtccgga atcactgggc gtaaagggtt cgcaggcggt

540

ttagaaagtc agatgtgaaa ggcgagggct caaccctcgt aagcatttga aacttctaaa

600

cttgagtagt gaagaggtaa gtggaattcc tagtgtagcg gtgaaatgcg tagatattag

660

gaggaatacc ggtggcgaag gcgacttact ggtcacaaac tgacgctgag gaacgaaagc

720

gtgggtagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctagg

780

tgtccggagg atttcggtgc cgcagttaac acaataagca ctccgcctgg ggagtacgtg

840

cgcaagcatg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcagcgga gcatgtggtt

900

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca gggcttgaca taatattgac ccctctagag

960

atagaggttt cccttcgggg acagtattac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt

1020

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tacctttagt tgccagcatg

1080

taaagatggg aactctaaag ggactgccga tgataaatcg gaggaaggtg gggatgacgt

1140

caaatcatca tgccctttat gtcctgggct acacacgtgc tacaatggtc ggaacaaaga

1200

gcgggcaagc tagngatagc aagcgaatct caaaaagccg atctcagttc ggattgttct

1260

ctgcaactcg agaacatgaa gtcggagttg ctagtaatcg cagatcagaa tgctgcggtg

1320

aatgcgttcc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagttgg caatacccga

1380

agtcgtcgag ctaaccgcaa ggaagcagac gccgaaggta ggg

1423

<210> 1445

<211> 1480

<212> DNA

<213> Peptoniphilus ivorii

<400> 1445

gacgaacgct ggcggcgcgc ctaacacatg caagtcgagc gatgaacctc ttcggatccc

60

ttcggggtga agaagagcgg attagcggcg gacgggtgag taacgcgtga ggaacctgcc

120

tctcacaacg ggatagcctc gggaaaccgg gattaatacc gtatgagacc acagtaacgc

180

ctgttacagt ggttaaagtc acagcggtga gagatggcct cgcgtctgat tagctagttg

240

gtggggtaac ggcctaccaa ggctgcgatc agtaaccggc ctgagagggt gaacggtcac

300

attggaactg agacacggtc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa tcttgcacaa

360

tgggggcaac cctgatgcag cgacgccgcg tgagcgatga aggctttcga gtcgtaaagc

420

tctgtcctat gggaagataa tgacggtacc ataggaggaa gccccggcta actacgtgcc

480

agcagccgcg gtaatacgta gggggcgagc gttgtccgga attactgggc gtaaagggtt

540

cgcaggcggc tcggcaagtc cgatgtaaaa ggcgaaggct taaccttcgy aagcatcgga

600

aactgtcgag cttgagtgaa ggagaggcaa gtggaattcc tagtgtagcg gtggaatgcg

660

tagatattag gaggaatacc ggtggcgaag gcgacttgct ggacttcaac tgacgctgag

720

gaacgaaagc gtgggtagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc tgtaaacgat

780

gagtgctagg tgtcgggggt caaacctcgg tgccgtcgtt aacacaataa gcactccgcc

840

tggggagtac gtgcgcaagc atgaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcagc

900

ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccgggacttg aaatattgtc

960

gccaatttta gagataaaat gttttcttcg gaaacggcaa tacaggtggt gcatggttgt

1020

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttactttc

1080

agttgccagc gcattatggc gggaactctg gaaggactgc cgatgataaa tcggaggaag

1140

gtggggatga cgtcaaatca tcatgccctt tatgtcccgg gctacacacg tgctacaatg

1200

gtcggtacag agggcagcga gacagcgatg ttaagcgaat ctcaaaaagc cgatcccagt

1260

tcggattgca ggctgcaact cgcctgcatg aagtcggagt tgctagtaat cgcggatcag

1320

aatgccgcgg tgaatgcgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtt

1380

ggcaataccc gaagccagcg agccaaccgt aaggaggcag ctgtcgaagg tagggttaat

1440

gactggggtg aagtcgtaac aaggtagccg tatcggaagg

1480

<210> 1446

<211> 1531

<212> DNA

<213> Peptoniphilus lacrimalis

<400> 1446

ttttaattga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgcgct taacacatgc

60

aagtcgagcg atgaaatctt aacagaaccc ttcggggcga agataagacg gattagcggc

120

ggacgggtga gtaacacgtg agtaacctgc cttttacaca gggatagcct cgggaaaccg

180

ggattaaaac ctgatgaaac tatcaaatca catgattaag aaagttaaaa ctccggtggt

240

aaaagatgga ctcgcgtccc attagctagt tggtgaaggt aacggcccac caaggcaacg

300

atgggtagcc ggcctgagag ggtgaacggc cacattggaa ctgagaaacg gtccaaactc

360

ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatggggga aaccctgatg cagcgacgcc

420

gcgtgagcga agaaggcctt cgggtcgtaa agctctttta tatgggaaga taatgacggt

480

accataagaa aaagccccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggggct

540

agcgttgtcc ggaatcactg ggcgtaaagg gttcgcaggc ggcaatgcaa gtcagatgta

600

aaaggcaaag gctcaacctt tgtaagcatc tgaaactgta tagcttgaga agtgtagagg

660

caagtggaat ttttagtgta gcggtgaaat gcgtagatat taaaaagaat accggtggcg

720

aaggcgactt gctgggcaca atctgacgct gaggaacgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aggtgtcggt ataaatcggt

840

gccgcagtta acacaataag cactccgcct ggggagtacg tgcgcaagca tgaaactcaa

900

aggaattgac ggggacccgc acaagcagcg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga

960

agaaccttac cagggcttga catataagag acgaacttag agataagttt tcttcttcag

1020

aagcccttat acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1080

gtcccgcaac gagcgcaacc cttattacta gttaccagca tttcggatgg ggactctaga

1140

aagactgccg atgataaatc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgccctata

1200

tgccctgggc aacacacgtg ctacaatggc cgtaacaaag agaagcgaaa tcgcaaggtc

1260

aagcaaacct caaaaagacg gtctcagttc ggattgttct ctgcaactcg agaacatgaa

1320

gtcggagttg ctagtaatcg cagatcagaa tgctgcggtg aatgcgttcc cgggtcttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacca tgggagcttg taatacccga agcctgtgag ctaaccgcaa

1440

gggagcagca gtcgaaggta ggacaagtga ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1500

tcggaaggtg cggctggatc acctcctttc t

1531

<210> 1447

<211> 1386

<212> DNA

<213> Peptoniphilus sp. JC140

<400> 1447

attagcggcg gacgggtgag taacacgtga gtaacctgcc ttagacattg ggatagcctc

60

gggaaaccgg gattaatacc gaataacatc acatagacac atgtcattgt gatcaaaact

120

ccggtggtct aagatggact cgcgtcccat tagctagttg gtagggtaac ggcctaccaa

180

ggcgacgatg ggtagccggc ctgagagggt gaacggccac attggaactg agaaacggtc

240

caaattccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggggaaac cctgatgcag

300

cgacgccgcg tgaacgaaga aggctttcga gtcgtaaagt tcttttatat gggaagataa

360

tgacggtacc ataagaaaaa gccccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

420

gggggctagc gttgtccgga atcactgggc gtaaagggtt cgcaggcgga aatgcaagtc

480

agatgtaaaa ggcagtagct taactactgt aagcatttga aactgcatat cttgagaaga

540

gtagaggtaa gtggaatttt tagtgtagcg gtgaaatgcg tagatattaa aaagaatacc

600

ggtggcgaag gcgacttact gggctcatct gacgctgagg aacgaaagcg tgggtagcaa

660

acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacgatg agtgctaggt gtcggcgtaa

720

gtcggtgccg cagttaacac aataagcact ccgcctgggg agtacgtgcg caagcatgaa

780

actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcagcggagc atgtggttta attcgaagca

840

acgcgaagaa ccttaccaag gcttgacata ctgaggaaag acttagagat aagtccctct

900

cttcggagac ctcaatacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

960

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta tctttagttg ccagcatttc ggatgggaac

1020

tctaaagaga ctgccgatga taaatcggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc

1080

cctatatgcc ttgggctaca cacgtgctac aatggaaggt acaaagggaa gcaaaatagt

1140

gatattaagc aaacctcaaa aagcctttct cagttcggat tgtactctgc aactcgagta

1200

catgaagatg gagttgctag taatcgcaga tcagaatgct gcggtgaatg cgttcccggg

1260

tcttgtacac accgcccgtc acaccatggg agcttgtaat acccgaagcc tgcgagcgaa

1320

ccgtaaggaa gcagcagtcg aaggtaggat aagtgactgg ggtgaagtcg taacaaggta

1380

gccgta

1386

<210> 1448

<211> 1414

<212> DNA

<213> Peptoniphilus sp. gpac007

<220>

<221> modified_base

<222> (365)..(365)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (378)..(378)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (516)..(516)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (624)..(624)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1448

atgcaagtcg agcgatgaac attgaatgwt cccttcgggg tgatttcgat cggattagcg

60

gcgaacgggt gagtaacgcg tgaggaacct gcctcttaca acgggatagc ctcgggaaac

120

cgggattaat accgtataag actccgacat ctcctggtga tgaagtcaaa gcgttagcgg

180

taagagatgg cctcgcgtct gattagttag ttggcggggt aacggcccac caagacgacg

240

atcagtaacc ggcctgagag ggtgaacggt cacattggaa ctgagacacg gtccaaactc

300

ctacgggagg cagcagtggg gaatcttgca caatgggggc aaccctgatg cagcgacgcc

360

gcktngagcg atgaaggntt tcgaatcgta aagctctgtc ctatgggaag ataatgacgg

420

taccwtggga ggaagccccg gctaactack tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc

480

gagcgttgtc cggaattact gggcgtaaag gkttcncags cggccatggc aaagtccgat

540

gtaaaaggcg aargctcaac cttcgtaagc atcggraact gtcaagcttg agtgaaggag

600

aggcaagtgg aattcctagt gtanccggtg gaatgcgtag atattaggag gaataccggt

660

ggcgaaggcg acttgctgga cttcaactga cgctgaggaa cgaaagcgtg ggtagcaaac

720

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag tgctaggtgt cgggggtcaa

780

acctcggtgc cgccgttaac acaataagca ctccgcctgg ggagtacgtg cgcaagcatg

840

aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcagcgga gcatgtggtt taattcgaag

900

caacgcgaag aaccttacca ggacttgaaa tactagcgcc cgctttagag ataaagtttt

960

ttcttcggaa acgctaatac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

1020

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tacttttagt tgccagcacg taatggtggg

1080

aactctaaag ggactgccga tgataaatcg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca

1140

tgccctttat gtcctgggct acacacgtgc tacaatggtc ggtacagagg gcagcgaaag

1200

agcgatctca agcgaatctc aaaaagccga tcccagttcg gattgcaggc tgcaactcgc

1260

ctgcatgaag tcggagttgc tagtaatcgc gaatcagaat gtcgcggtga atgcgttccc

1320

gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagttggc aatacccgaa gccagcgagc

1380

ccaaccgcaa cggagcagct gtcgaatgta gggt

1414

<210> 1449

<211> 1453

<212> DNA

<213> Peptoniphilus sp. gpac018A

<400> 1449

gacgaacgct ggcggcgcgc ctaacacatg caagtcgagc gatgaaagtc gttctgatcc

60

ttcgggtgat gaacttctgg attagcggcg aacgggtgag taacgcgtga ggaacctgcc

120

tcttacaacg ggatagcctc gggaaaccgg gattaatacc gtataagact ccgacatctc

180

atgatgatga agtcaaagcg ttagcggtaa gagatggcct cgcgtctgat tagctggttg

240

gcggggtaac ggcccaccaa ggcgacgatc agtaaccggc ctgagagggt gaacggtcac

300

attggaactg agacacggtc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa tcttgcacaa

360

tgggggcaac cctgatgcag cgacgccgcg tgagcgattg aaggttttcg aatcgtaaag

420

ctctgtccta tgggaagata atgacggtac cataggagga agccccggct aactacgtgc

480

cagcagccgc ggtaatacgt agggggcgag cgttgtccgg aattactggg cgtaaagggt

540

tcgcaggcgg catggcaagt ccgatgtaaa aggcgaaggc tcaaccttcg taagcatcgg

600

aaactgtcaa gcttgagtga aggagaggca agtggaattc ctagtgtagc ggtggaatgc

660

gtagatatta ggaggaatac cggtggcgaa ggcgacttgc tggacttcaa ctgacsgtga

720

gaaacgaaag cgtgggtagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga

780

tgagtgctag gtgtcggggt caaacctcgg tgccgccgtt aacacaataa gcactccgcc

840

tggggagtac gtgcgcaagc atgaaactca aaggaattgg acgggggacc cgcacaaagc

900

agcggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggac ttgaaatact

960

agcgcccgct ttagagataa agttttttct tcggaaacgc taatacaggt ggtgcatggt

1020

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttact

1080

tttagttgcc agcacgtaat ggtgggaact ctaaagggac tgccgatgat aaatcggagg

1140

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ctttatgtcc tgggctacac acgtgctaca

1200

atggtcggta cagagggcag cgaacgagcg atcgcaagcg aatctcaaaa agccgatccc

1260

agttcggatt gcaggctgca actcgcctgc atgaagtcgg agttgctagt aatcgcagat

1320

cagaatgctg cggtgaatgc gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga

1380

gttggcaata cccgaagcca gcgagccaac cgyaaggagg cagctgtcga aggtagggtt

1440

aatgactggg gtg

1453

<210> 1450

<211> 1459

<212> DNA

<213> Peptoniphilus sp. gpac077

<220>

<221> modified_base

<222> (473)..(473)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (553)..(553)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1450

gacgaacgct ggcggcgcgc ttaacacatg caagtcgagc gatgaaatct taacagaacc

60

cttcggggcg aagataagac ggattagcgg cggacgggtg agtaacacgt gagtaacctg

120

ccttttacac agggatagcc tcgggaaacc gggattaaaa cctgatgaaa ctatcaaatc

180

acatgattaa gaaagttaaa actccggtgg taaaagatgg actcgcgtcc cattagctag

240

ttggttgaag gtaacggcca ccaaggcaac gatgggtagc cggcctgaga gggtgaacgg

300

ccacattgga actgagaaac ggtccaaact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc

360

acaatggggg aaaccctgat gcagcgacgc cgcgtgagcg aagaaggcct tcgggtcgta

420

aagctcttta tatatgggaa gataatgacg gtaccataag aaaaagcccc ggntaactac

480

gtagccagca gccgcggtaa tacgtagggg gctagacgtt gtccggaatc actgggacgt

540

aaagggttcg cangcggcaa tgcaagtcag atgtaaaaag gcaaaggctc aaacatttgt

600

aagcatctga aactgtatag cttgaacttt aaggcgccaa gggaattttc tagtcaccgg

660

taaaacgccg tagatataaa gagaaatccc gtggccgaag gcgacctctg gggcaacaaa

720

tctggaccct gaggaacgaa agcttgggga ccaaacagga taagataccc ctggtagtcc

780

acgccgtaaa cgatgagtgc taggtgtcgg tataaatcgg tcccgcagtt aacacaataa

840

gcactccgcc ctggggagta cgtgcgcaag catgaaactc aaaggaattg acggggaccc

900

gcacaagcag cggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accagggctt

960

gacatataag agacgaactt agagataagt tttcttcttc ggaagccctt atacaggtgg

1020

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

1080

cccttattac tagttaccag catttcggat ggggactcta gaaagactgc cgatgataaa

1140

tcggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccta tatgccctgg gcaacacacg

1200

tgctacaatg gccgtaacca aagagaagcg aaatcgccaa ggtcaagcaa acctcaaaaa

1260

gacggtctca gttcggattg ttctctgcaa ctcgagaaca tgaagtcgga gttgctagta

1320

atcgcagatc agaatgctgc ggtgaatgcg ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac

1380

accatgggag cttgtaatac ccgaagcctg tgagctaacc gcaaggaagc agcagtcgaa

1440

gtagacaagt gactgggtg

1459

<210> 1451

<211> 1445

<212> DNA

<213> Peptoniphilus sp. gpac148

<220>

<221> modified_base

<222> (1437)..(1437)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1451

gacgaacgct ggcggcgcgc ctaacacatg caagtcgagc gatgaaattt taacggatct

60

tttcggagag aagataaaat ggattagcgg cggacgggtg agtaacacgt gaggaacctg

120

cctttcacaa ggggatagcc tcgggaaacc gggattaata ccctatgata caatcaagtc

180

tcctgattta attgttaaag tgatagcggt gaaagatggc ctcgcgtctg attagctagt

240

tggtgagata aaagcccacc aaggcgatga tcagtaaccg gcctgagagg gtgaacggtc

300

acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac

360

aatggaggga actctgatgc agcgacgccg cgtgagcgat gaaggctttc gagtcgtaaa

420

gctctgtcct atgggaagat aatgacggta ccataggagg aagccccggc taactacgtg

480

ccagcagccg cggtaatacg tagggggcga gcgttgtccg gaatcactgg gcgtaaaggg

540

ttcgcaggcg gtttaccaag tccgatgtga aaggcatggg cttaacccat gtaagcatta

600

gaaactggta aacttgagtt aaggagaggt aagtggaatt cctagtgtag cggtgaaatg

660

cgtagatatt aggaagaata ccggtggcga aggcgactta ctggacttaa actgacgctg

720

aggaacgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg

780

atgagtgcta ggtgtcgggg gaactcggtg ccgcagttaa cacattaagc actccgcctg

840

gggagtacgt gcgcaagcat gaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcagcgg

900

agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc aaggctagac attttactgc

960

ccggtctaga gataggccct ttcttcggaa cagtaaaaca ggtggtgcat ggttgtcgtc

1020

agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc acctttagtt

1080

gccagcatgt aacgatggga actctaaagg gactgccgat gataaatcgg aggaaggtgg

1140

ggatgacgtc aaatcatcat gccctttatg ccttgggcta cacacgtgct acaatggtcg

1200

gtacacagag cagcttagga gcgatctgaa gcgaatctca aaaagccgat ctcagttcgg

1260

attgcaggct gcaactcgcc tgcatgaagt cggagttgct agtaatcgcg aatcagaatg

1320

tcgcggtgaa tgcgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagttggta

1380

atacccgaag ccgccgagct aaccgtttgg asgcaggcgt cgaaggtagg atcaatnact

1440

gggtg

1445

<210> 1452

<211> 1533

<212> DNA

<213> Peptoniphilus sp. oral taxon 386

<400> 1452

tttcaattga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgcgcc taacacatgc

60

aagtcgagcg atgaaaagga tttggagttc ttcgggacaa agaaaccttg gattagcggc

120

ggacgggtga gtaacacgtg agtaacctgc ctttgacatg gggatagcct cgggaaaccg

180

tgattaatac ccaataacat ttccaagtcg catgacatgg gaatcaaagc gtttagcggt

240

caaagatgga ctcgcgtctg attaattagt tggtgaggta acggctcacc aagatagcga

300

tcagtagccg gcctgagagg gtgaacggcc acattggaac tgagagacgg tccaaactcc

360

tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatgggggga accctgatgc agcgacgccg

420

cgtgagcgaa gaaggttttc gaatcgtaaa gctctgtcct atgggaagat aatgacggta

480

ccataggagg aagccccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggggcta

540

gcgttgtccg gaatcactgg gcgtaaaggg ttcgcaggcg gaaaagcaag tcaggtgtga

600

aaggcgaggg cttaaccctc gtaagcattt gaaactgttt ttcttgagat gtggagaggt

660

aagtggaatt cctagtgtag cggtgaaatg cgtagatatt aggaggaata ccggtggcga

720

aggcgactta ctggacacaa actgacgctg aggaacgaaa gcgtggggag caaacaggat

780

tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg atgagtgcta ggtgtcggga gtaatctcgg

840

tgccgcagta aacacaataa gcactccgcc tggggagtac gtacgcaagt atgaaactca

900

aaggaattga cggggacccg cacaagcagc ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg

960

aagaacctta ccagggcttg acatatagcg gacatattta gagataaata cttttcttcg

1020

gaaaccgcta tacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1080

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttaccttt agttgccagc atgtaaagat gggaactcta

1140

aagggactgc cgatgataaa tcggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccta

1200

tatgccctgg gctacacacg tgctacaatg gtcggaacaa agggtagcaa acttgtgaaa

1260

gtaagcaaat ctcaaaaagc cgatctcagt tcggattgtt ctctgcaact cgagaacatg

1320

aagtcggagt tgctagtaat cgcagatcag aatgctgcgg tgaatgcgtt cccgggtctt

1380

gtacacaccg cccgtcacac catgggagtt ggcaataccc gaagcctgtg agctaacctt

1440

aggggagcag cagtcgaagg tagggttaat gactggggtg aagtcgtaac aaggtagccg

1500

tatcggaagg tgcggctgga tcacctcctt tct

1533

<210> 1453

<211> 1531

<212> DNA

<213> Peptoniphilus sp. oral taxon 836

<400> 1453

ttttaattga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgcgct taacacatgc

60

aagtcgagcg atgaaatctt aacagaaccc ttcggggcga agataagacg gattagcggc

120

ggacgggtga gtaacacgtg agtaacctgc cttttacaca gggatagcct cgggaaaccg

180

ggattaaaac ctgatgaaac tatcaaatca catgattaag aaagttaaaa ctccggtggt

240

aaaagatgga ctcgcgtccc attagctagt tggtgaaggt aacggcccac caaggcaacg

300

atgggtagcc ggcctgagag ggtgaacggc cacattggaa ctgagaaacg gtccaaactc

360

ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatggggga aaccctgatg cagcgacgcc

420

gcgtgagcga agaaggcctt cgggtcgtaa agctctttta tatgggaaga taatgacggt

480

accataagaa aaagccccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggggct

540

agcgttgtcc ggaatcactg ggcgtaaagg gttcgcaggc ggcaatgcaa gtcagatgta

600

aaaggcaaag gctcaacctt tgtaagcatc tgaaactgta tagcttgaga agtgtagagg

660

caagtggaat ttttagtgta gcggtgaaat gcgtagatat taaaaagaat accggtggcg

720

aaggcgactt gctgggcaca atctgacgct gaggaacgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aggtgtcggt ataaatcggt

840

gccgcagtta acacaataag cactccgcct ggggagtacg tgcgcaagca tgaaactcaa

900

aggaattgac ggggacccgc acaagcagcg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga

960

agaaccttac cagggcttga catataagag acgaacttag agataagttt tcttcttcgg

1020

aagcccttat acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1080

gtcccgcaac gagcgcaacc cttattacta gttaccagca tttcggatgg ggactctaga

1140

aagactgccg atgataaatc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgccctata

1200

tgccctgggc aacacacgtg ctacaatggc cgtaacaaag agaagcgaaa tcgcaaggtc

1260

aagcaaacct caaaaagacg gtctcagttc ggattgttct ctgcaactcg agaacatgaa

1320

gtcggagttg ctagtaatcg cagatcagaa tgctgcggtg aatgcgttcc cgggtcttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacca tgggagcttg taatacccga agcctgtgag ctaaccgcaa

1440

ggaagcagca gtcgaaggta ggacaagtga ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1500

tcggaaggtg cggctggatc acctcctttc t

1531

<210> 1454

<211> 1476

<212> DNA

<213> Peptostreptococcaceae bacterium ph1

<400> 1454

tgatcctggc tcaggacgaa cgctggcggc gtgcctaaca catgcaagtc gagcgatgaa

60

accttaacag actccttcgg gatgaagatt aggtggatta gcggcggacg ggtgagtaac

120

acgtgagtaa cctgcctttg acacagggat agccatggga aaccgtgatt aataccagat

180

gaaatctaaa ctacacatgt agcaaagatc aaagcgacca agcggtcaaa gatggactcg

240

cgcctgatta gctagttggt gagataaaag ctcaccaagg caacgatcag tagccggcct

300

gagagggtga ccggccacat tggaactgag acacggtcca aactcctacg ggaggcagca

360

gtggggaata ttgcacaatg gggggaaccc tgatgcagcg acgccgcgtg agcgaagaag

420

ggattcgttt cgtaaagctc tgtcctatgg gaagataatg acggtaccat agaagaaagc

480

cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gggcgagcgt tgtccggaat

540

cactgggcgt aaagggttcg caggcggata aacaagtcaa gagtaaaagg catgggctta

600

acccatgtaa gctattgaaa ctgtctatct tgagatgtgg agaggtaagt ggaattacta

660

gtgtagcggt gaaatgcgta gatattagta ggaataccag tagcgaaggc gacttactgg

720

acacaaactg acgctgagga acgaaagcgt gggtagcaaa caggattaga taccctggta

780

gtccacgctg taaacgatga gtgctaggtg tcggcaaaag tcggtgccgc agtaaacgca

840

ataagcactc cgcctgggga gtacgtgcgc aagcatgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga

900

cccgcacaag cagcggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggg

960

cttgacatat aggtgaaaag cttagagata agtaataccc ttcggggaca gctatacagg

1020

tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1080

caacccttac ctttagttac cagcaagtaa agttggggac tctagaggga ctgccgatga

1140

taaatcggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cctatatgcc ctgggcaaca

1200

cacgtgctac aatggtcgga acaaagggaa gcgaagtcgt gaggcgaagc aaaacccata

1260

aaaccgatct cagttcggat tgttctctgc aactcgagaa catgaagtcg gagttgctag

1320

taatcgcaga tcagaatgct gcggtgaatg cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc

1380

acaccatggg agttatcaat acccgaagcc tgtgagctaa caataagaag cagcagtcga

1440

aggtagggag aatgactggg gtgaagtcgt aacaag

1476

<210> 1455

<211> 1473

<212> DNA

<213> Peptostreptococcus anaerobius

<220>

<221> modified_base

<222> (64)..(64)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1455

gatgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgagc gcgtctgatt tgatgcttgc

60

attnatgaaa gatgagcggc ggacgggtga gtaacgcgtg ggtaacctgc cctatacaca

120

tggataacat actgaaaagt ttactaatac atgataatat atatttacgg catcgtagat

180

atatcaaagt gttagcggta taggatggac ccgcgtctga ttagctagtt ggtgagataa

240

ctgcccacca aggcgacgat cagtagccga cctgagaggg tgatcggcca cattggaact

300

gagacacggt ccaaactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca atgggcgcaa

360

gcctgatgca gcaacgccgc gtgaacgatg aaggtcttcg gatcgtaaag ttctgttgca

420

ggggaagata atgacggtac cctgtgagga agccccggct aactacgtgc cagcagccgc

480

ggtaatacgt agggggctag cgttatccgg atttactggg cgtaaagggt gcgtaggtgg

540

tctttcaagt cggtggttaa aggctacggc tcaaccgtag ttagcctccg aaactggaag

600

acttgagtgc aggagaggaa agtggaattc ccagtgtagc ggtgaaatgc gtagatattg

660

ggaggaacac cagtagcgaa ggcggctttc tggactgcaa ctgacactga ggcacgaaag

720

cgtgggtagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ctgtaaacga tgagtactag

780

gtgtcggggg ttacccccct cggtgccgca gctaacgcat taagtactcc gcctggggag

840

tacgcacgca agtgtgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagt agcggagcat

900

gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttacctaagc ttgacatccc ttagaccggt

960

gtttaatcac accttccctt cggggctgag gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

1020

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgtct ttagttgcca

1080

gcattcagtt gggcactcta gagagactgc cagggataac ctggaggaag gtggggatga

1140

cgtcaaatca tcatgcccct tatgcttagg gctacacacg tgctacaatg ggtggtacag

1200

agggttgcca aaccgtgagg tggagctaat cccttaaagc cattctcagt tcggattgta

1260

ggctgaaact cgcctacatg aagctggagt tactagtaat cgcagatcag aatgctgcgg

1320

tgaatgcgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtc ggaaacaccc

1380

gaagccgatt atccaaccgc aaggaggaag tcgtcgaagg tggcgtcgat aactggggtg

1440

aagtcgtaac aaggtagccg tatcggaagg tgc

1473

<210> 1456

<211> 1427

<212> DNA

<213> Peptostreptococcus micros

<400> 1456

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gtgatttttg tggaaagccc

60

ttcggggacg gaagcgaaat gaaagtggcg aacgggtgag taacacgtga gcaacctacc

120

ttacacaggg ggatagccgt tggaaacgac gattaatacc gcatgagacc acaaagccac

180

atggcttagg ggtaaaagat ttatcggtgt aagatgggct cgcgtctgat tagctagttg

240

gaagggtaaa ggcctaccaa ggcaacgatc agtagccggt ctgagaggat gaacggccac

300

attggaactg agacacggtc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa

360

tggggggaac cctgatgcag cgacgccgcg tgagcgaaga aggttttcga atcgtaaagc

420

tctgtcctat gagaagataa tgacggtatc ataggaggaa gccccggcta aatacgtgcc

480

agcagccgcg gtaatacgta tggggcgagc gttgtccgga attattgggc gtaaagggta

540

cgtaggcggc ctattaagtc aggtgtgaaa gcgtgaggct taacctcatt aagcacttga

600

aactggaagg cttgagtgaa ggagaggaaa gtggaattcc tagtgtagcg gtgaaatgcg

660

tagatattag gaggaatacc ggtggcgaag gcgactttct ggacttttac tgacgctcag

720

gtacgaaagc gtggggagca acaggattac gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat

780

gaatgctagg tgttgggagt caaatctcgg tgccgaagtt aacacattaa gcattccgcc

840

tggggagtac ggtggcaaca ctgaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcagc

900

ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaaggcttg acatatagtt

960

gagttattga gaaattgata agtccctcgg gacaactata caggtggtgc atggttgtcg

1020

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcttcag

1080

ttaccagcat gtaatgatgg ggactctgga gagactgccg atgacaaatc ggaggaaggt

1140

ggggatgacg tcaaatcatc atgcccttta tgtcttgggc tacacacgtg ctacaatggt

1200

tggtacaacg agaagctaga cagtgatgtt aagcaaaact ctaaaaacca atctcagttc

1260

ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa gtcggagttg ctagtaatcg cgaatcagaa

1320

tgtcgcggtg aatgcgttcc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagttgg

1380

caatacccga agccgccgat ctaaccgcaa ggaggaaggc gtcgaag

1427

<210> 1457

<211> 1353

<212> DNA

<213> Peptostreptococcus sp. 9succ1

<220>

<221> modified_base

<222> (91)..(91)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1457

aaatggatta gcggcggacg ggtgagtaac acgtgagtaa cctgcctttg acatggggat

60

agcctcggga aaccgggatt aatacccaat naaactgtaa gatcgcatga tcaatcagtc

120

aaaatgtcta gtggtcaaag atggactcgc gtcccattag ctagttggtg agataaaagc

180

tcaccaaggc gacgatgggt agccggcctg agagggtgaa cggccacatt ggaactgaga

240

cacggtccaa actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct

300

gatgcagcga cgccgcgtga gcgaagaagg ctttcgagtc gtaaagctct gtcctatggg

360

aagatagtga cggtaccata ggaggaagcc ccggctaact acgtgccagc agccgcggta

420

atacgtaggg ggctagcgtt gtccggaatt actgggcgta aagggttcgc aggcggcaat

480

gcaagtcagg tgtgaaagac ggaggctcaa cctccgcaag catttgaaac tgcatagctt

540

gagatgtgga gaggtaagtg gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag atattaggag

600

gaataccggt ggcgaaggcg acttactgga cacaaactga cgctgaggaa cgaaagcgtg

660

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacgatgag tgctaggtgt

720

cggagcaatt cggtgccgta gttaacacaa taagcactcc gcctggggag tacgtacgca

780

agtatgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc agcggagcat gtggtttaat

840

tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatata gtgggatatt ctagagatag

900

aatagactct tcggagactg ctaaacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

960

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttacc tttagttgcc agcatgtaaa

1020

gatggggact ctagagggac tgccgatgat aaatcggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1080

tcatcatgcc ctatatgacc tgggctacac acgtgctaca atggtcggta taaagagaag

1140

caagatagtg atattaagca aacctcaaaa agccgatctc agttcggatt gtaggctgca

1200

actcgcctac atgaagtcgg agttgctagt aatcgcagat cagaatgctg cggtgaatgc

1260

gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gttggcaata cccgaagccg

1320

gtgacctaac cgcaaggaag gagccgtcga agg

1353

<210> 1458

<211> 1327

<212> DNA

<213> Peptostreptococcus sp. P4P_31 P3

<400> 1458

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta

60

acacgtgagc aacctacctt acacaggggg atagccgttg gaaacgacga ttaataccgc

120

atgagcaaag tcggtgtaag atgggctcgc gtctgattag ctagttggaa gggtaaaggc

180

ctaccaaggc aacgatcagt agccggtctg agaggatgaa cggccacatt ggaactgaga

240

cacggtccaa actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg ggggaaccct

300

gatgcagcga cgccgcgtga gcgaagaagg ttttcgaatc gtaaagctct gtcctatgag

360

aagatgacgg tatcatagga ggaagccccg gctaaatacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtatggggc gagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag ggtacgtagg cggcctttta

480

agtcaggtgt gaaagcgtga ggcttaacct cattaagcac ttgaaactgg aaggcttgag

540

tgaaggagag gaaagtggaa ttcctagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttaggaggaa

600

taccggtggc gaaggcgact ttctggactt actgacgctc aggtacgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgaatgcta ggtgttggga

720

tctcggtgcc gaagttaaca cattaagcat tccgcctggg gagtacggtg gcaacactga

780

aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcagcggag catgtggttt aattcgaagc

840

aacgcgaaga accttaccaa ggcttgacat atacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatctt cagttaccag

960

catatgggga ctctggagag actgccgatg ataaatcgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

aatcatcatg ccctttatgt cttgggctac acacgtgcta caatggttgg caacgagaag

1080

caagatagtg atgtcaagca aaactctacc aatctcagtt cggatgtagg ctgcaactcg

1140

cctacagaag tcggagttgc tagtaatcgc aaatcagaat gttgcggtga atgcgttccc

1200

gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagttggc aatacccgaa gccgccatct

1260

aggaaggcgt cgaaggtagg gttaatgact ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtatc

1320

ggaaggt

1327

<210> 1459

<211> 1333

<212> DNA

<213> Peptostreptococcus sp. oral clone AP24

<400> 1459

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgttg gcgacgtgcc taacacatgc aagtcgagcg

60

agcggcggac gggtgagtaa tacatgagca acctgccttg gacagaggga tagccgtggg

120

aaaccgcgat taatacctca taagcaaagt cggtccaaga tggactcatg acccattagc

180

tagttggtga gataacagcc caccaaggcg acgatgggta gccggcttga gagagtgacc

240

ggccacattg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

300

gcacaatgga ggaaactctg atgcagcgac gtcgcgtgag cgaagaaggt tttcgaatcg

360

taaagctctg tcctatggga agaagacggt accatagaag aaagccccgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtagggggcg aacgttatcc ggaatgattg ggcgtaaagg

480

gtacgtaggc ggacctgtaa gtcaggtgtg aaaggcatgg gctcaaccca tgtaagcact

540

tgaaactgcg ggccttgagg gaaggagagg taagtggaat tcctagtgta gcggtgaaat

600

gcgtagatat taggaggaat accggtggcg aaggcgactt actggactta ctgacgctga

660

ggtacgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaatgg

720

tgagtgctag gtgtcgggat ctcggtgccg acgttaacac attaagcact ccgcctgggg

780

agtacgcacg caagtgtgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcagcggagc

840

atgtggttta attcgatgca acgcgaaaaa ccttaccagg acttgacata tacaggtggt

900

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccctattctt agttactaac agctgaggac tctaaggaga ctgccggtga caaaccggag

1020

gaagatgggg atgacgtcaa atcatcatgc cctttatgtc ctgggctaca cacgtgctac

1080

aatggtcggc agaaggaagc gagatagcga tatcgagcga acccccccga tcccagttcg

1140

gatgttctct gcaactcgag aacagaagcc ggagttgcta gtaattgcga atcagcatgt

1200

cgcagtgaat gcgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagttggtaa

1260

tacccgaagc ctgtagccaa gcagcagtcg aaggtaggat caatgactgg ggtgaagtcg

1320

taacaaggta acc

1333

<210> 1460

<211> 1334

<212> DNA

<213> Peptostreptococcus sp. oral clone FJ023

<400> 1460

cggcgcgtct taagcatgca agtcgaacga gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagcaa

60

cctaccttac acagggggat agccgttgaa aacgacgatt aataccgcat gagaaaagtc

120

ggtgtaagat gggctcgcgt ctgattagct agttggaagg gtaaaggcct accaaggcaa

180

cgatcagtag ccggtctgag aggatgaacg gccacattgg aactgagaca cggtccaaac

240

tcctaaggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggg ggaaccctga tgcagcgacg

300

ccgcgtgagc gaagaaggtt ttcgaatcgt aaagctctgt cctatgagaa gatgacggta

360

tcataggagg aagccccggc taaatacgtg ccagcagccg cggtaatacg tatggggcga

420

gcgttgtccg gaattattgg gcgtaaaggg tacgtaggcg gcctattaag tcaggtgtga

480

aagcgtgagg cttaacctca ttaagcactt gaaactggaa ggcttgagtg aaggagagga

540

aagtggaatt cctagtgtag cggtgaaatg cgtagatatt aggaggaata ccggtggcga

600

aggcgacttt ctggacttac tgacgctcag gtacgaaagc gtggggagca aacaggatta

660

gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctagg tgttgggatc tcggcgccga

720

agttaacaca ttaagcattc cgcctgggga gtacggtggc aacactgaaa ctcaaaggaa

780

ttgacgggga cccgcacaag cagcagagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac

840

cttaccaagg cttgacatat acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat

900

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatcttca gttaccagca cgtggggact

960

ctggagagac tgccgatgac aaatcggaag aaggtgggga tgacatcaaa tcatcatgcc

1020

ctttatgtct tgggctacac acgtgctaca atggttggca acgagagact agacagtgat

1080

gttaagcaaa actctaccaa tctcagttcg gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagtc

1140

ggagttgcta gtaatcgcga atcagaatgt cgcggtgaac gcgttcccgg gtcttgtaca

1200

caccgcccgt cacaccatgg gagttggcaa tacccgaagc cgccatctag gaaggcgtcg

1260

aaggtagggt taatgactgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggt

1320

tggatcacct cctt

1334

<210> 1461

<211> 1432

<212> DNA

<213> Peptostreptococcus stomatis

<400> 1461

ctgagcaaaa ccaagcggcg gacgggtgag taacgcgtgg gtaacctgcc ctatacacat

60

ggataacata ctgaaaagtt tactaataca tgataatata tatttgcggc atcgcagata

120

tatcaaagtg ttagcggtat aggatggacc cgcgtctgat tagctagttg gtgagataac

180

tgcccaccaa ggcgacgatc agtagccgac ctgagagggt gatcggccac attggaactg

240

agacacggtc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggcgaaag

300

cctgatgcag caacgccgcg tgaacgatga aggtcttcgg atcgtaaagt tctgttgcag

360

gggaagataa tgacggtacc ctgtgaggaa gccccggcta actacgtgcc agcagccgcg

420

gtaatacgta gggggctagc gttatccgga tttactgggc gtaaagggtg cgtaggtggt

480

ccttcaagtc ggtggttaaa ggctacggct caaccgtagt aagccgccga aactggagga

540

cttgagtgca ggagaggaaa gtggaattcc cagtgtagcg gtgaaatgcg tagatattgg

600

gaggaacacc agtagcgaag gcggctttct ggactgcaac tgacactgag gcacgaaagc

660

gtgggtagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc tgtaaacgat gagtactagg

720

tgtcgggggt tacccccctc ggtgccgcag ctaacgcatt aagtactccg cctggggagt

780

acgcacgcaa gtgtgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagta gcggagcatg

840

tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct tacctaagct tgacatccct cggacaggtg

900

tttaatcaca cccttccttc gggactgagg tgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

960

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtctt tagttgccag

1020

cattcagttg ggcactctag agagactgcc agggataacc tggaggaagg tggggatgac

1080

gtcaaatcat catgcccctt atgcttaggg ctacacacgt gctacaatgg gtggtacaga

1140

gggttgccaa accgtgaggt ggagccaatc ccttaaagcc attctcagtt cggattgtag

1200

gctgaaactc gcctacatga agctggagtt actagtaatc gcagatcaga atgctgcggt

1260

gaatgcgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc acgggagtcg gaaacacccg

1320

aagccgatta tccaaccgca aggaggaagt cgtcgaaggt ggcgtcgata actggggtga

1380

agtcgtaaca aggtagccgt atcggaaggt gcggctggat cacctccttt ct

1432

<210> 1462

<211> 1511

<212> DNA

<213> Phascolarctobacterium faecium

<220>

<221> modified_base

<222> (50)..(50)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1382)..(1382)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1477)..(1477)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1462

atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaacaca tgcaagtcgn acggagaatt

60

ttatttcggt agaattctta gtggcgaacg ggtgagtaac gcgtaggcaa cctacccttt

120

agacggggac aacattccga aaggagtgct aataccggat gtgatcatcg tgccgcatgg

180

caggatgaag aaagatggcc tctacaagta agctatcgct aaaggatggg cctgcgtctg

240

attagctagt tggtagtgta acggactacc aaggcgatga tcagtagccg gtctgagagg

300

atgaacggcc acattgggac tgagacacgg cccaaactcc tacgggaggc agcagtgggg

360

aatcttccgc aatggacgaa agtctgacgg agcaacgccg cgtgagtgat gaaggatttc

420

ggtctgtaaa gctctgttgt ttatgacgaa cgtgcagtgt gtgaacaatg cattgcaatg

480

acggtagtaa acgaggaagc cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg

540

tggcgagcgt tgtccggaat tattgggcgt aaagagcatg taggcggctt aataagtcga

600

gcgtgaaaat gcggggctca accccgtatg gcgctggaaa ctgttaggct tgagtgcagg

660

agaggaaagg ggaattccca gtgtagcggt gaaatgcgta gatattggga ggaacaccag

720

tggcgaaggc gcctttctgg actgtgtctg acgctgagat gcgaaagcca gggtagcgaa

780

cgggattaga taccccggta gtcctggccg taaacgatgg gtactaggtg taggaggtat

840

cgaccccttc tgtgccggag ttaacgcaat aagtaccccg cctggggagt acggccgcaa

900

ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagtatg tggtttaatt

960

cgacgcaacg cgaagaacct taccaaggct tgacattgat tgaacgctct agagatagag

1020

atttcccttc ggggacaaga aaacaggtgg tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1080

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatcct atgttaccag caagtaaagt

1140

tggggactca tgggagactg ccagggacaa cctggaggaa ggcggggatg acgtcaagtc

1200

atcatgcccc ttatgtcttg ggctacacac gtactacaat ggtcggaaac agagggaagc

1260

gaagccgcga ggcagagcaa accccagaaa cccgatctca gttcggatcg caggctgcaa

1320

cccgcctgcg tgaagtcgga atcgctagta atcgcaggtc agcatactgc ggtgaatacg

1380

tncccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgaaag ttggtaacac ccgaagccgg

1440

tgaggtaacc tattaggagc cagccgtcta aggtggngcc gatgattggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtag c

1511

<210> 1463

<211> 1449

<212> DNA

<213> Phascolarctobacterium sp. YIT 12068

<400> 1463

ttcttagtgg cgaacgggtg agtaacgcgt gggcaacctg ccctctagat ggggacaaca

60

tcccgaaagg ggtgctaata ccgaatgtga cagcaatctc gcatgaggat gctgtgaaag

120

atggcctcta tttataagct atcgctagag gatgggcctg cgtctgatta gctagttggt

180

ggggtaacgg cctaccaagg cgatgatcag tagccggtct gagaggatga acggccacat

240

tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaatc ttccgcaatg

300

ggcgaaagcc tgacggagca atgccgcgtg agtgatgaag gaattcgttc cgtaaagctc

360

ttttgtttat gacgaatgtg cagattgtga ataatgatct gtaatgacgg tagtaaacga

420

ataagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc gagcgttgtc

480

cggaattatt gggcgtaaag agcatgtagg cggtttttta agtctggagt gaaaatgcgg

540

ggctcaaccc cgtatggctc tggatactgg aagacttgag tgcaggagag gaaaggggaa

600

ttcccagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttgggaggaa caccagtggc gaaggcgcct

660

ttctggactg tgtctgacgc tgagatgcga aagccagggt agcgaacggg attagatacc

720

ccggtagtcc tggccgtaaa cgatgggtac taggtgtagg aggtatcgac cccttctgtg

780

ccggagttaa cgcaataagt accccgcctg gggagtacgt ccgcaaggat gaaactcaaa

840

ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agtatgtggt ttaattcgac gcaacgcgaa

900

gaaccttacc aaggcttgac attgaatgac cgctccagag atggagcttt cccttcgggg

960

acatgaaaac aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1020

cccgcaacga gcgcaacccc tatcctatgt taccagcggg taatgccggg gactcatagg

1080

agactgccaa ggacaacttg gaggaaggcg gggatgacgt caagtcatca tgccccttat

1140

gtcttgggct acacacgtac tacaatggtc ggcaacagag ggaagcaaag ccgtgaggca

1200

gagcaaaccc cagaaacccg atcccagttc ggattgcagg ctgcaactcg cctgcatgaa

1260

gtcggaatcg ctagtaatcg caggtcagca tactgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1320

acacaccgcc cgtcacacca cgaaagttgg taacacccga agccggtggg gtaaccgtaa

1380

ggagccagcc gtctaaggtg gggccgatga ttggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1440

tcggaaggt

1449

<210> 1464

<211> 1610

<212> DNA

<213> Phascolarctobacterium succinatutens

<400> 1464

gacgaacgct ggcggcatgc ctaacacatg caagtcgaac ggagaaagtt caacaccaag

60

tatttcatcc gctgaagtgt agcggtaaaa attgcgaagc aatttttact acgcattaaa

120

agcatgaact aacacggtgg ttgaagtatt aggtgttgaa ctttcttagt ggcgaacggg

180

tgagtaacgc gtgggcaacc tgccctctag atggggacaa catcccgaaa ggggtgctaa

240

taccgaatgt gacagcaatc tcgcatgagg atgctgtgaa agatggcctc tatttataag

300

ctatcgctag aggatgggcc tgcgtctgat tagctagttg gtggggtaac ggcctaccaa

360

ggcgatgatc agtagccggt ctgagaggat gaacggccac attgggactg agacacggcc

420

cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tcttccgcaa tgggcgaaag cctgacggag

480

caatgccgcg tgagtgatga aggaattcgt tccgtaaagc tcttttgttt atgacgaatg

540

tgcagattgt aaataatgat ctgtaatgac ggtagtaaac gaataagcca cggctaacta

600

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg gcgagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa

660

agagcatgta ggcggttttt taagtctgga gtgaaaatgc ggggctcaac cccgtatggc

720

tctggatact ggaagacttg agtgcaggag aggaaagggg aattcccagt gtagcggtga

780

aatgcgtaga tattgggagg aacaccagtg gcgaaggcgc ctttctggac tgtgtctgac

840

gctgagatgc gaaagccagg gtagcgaacg ggattagata ccccggtagt cctggccgta

900

aacgatgggt actaggtgta ggaggtatcg accccttctg tgccggagtt aacgcaataa

960

gtaccccgcc tggggagtac gtccgcaagg atgaaactca aaggaattga cgggggcccg

1020

cacaagcggt ggagtatgtg gtttaattcg acgcaacgcg aagaacctta ccaaggcttg

1080

acattgaatg accgctccag agatggagct ttcccttcgg ggacatgaaa acaggtggtg

1140

catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

1200

cctatcctat gttaccagcg ggtaatgccg gggactcata ggagactgcc aaggacaact

1260

tggaggaagg cggggatgac gtcaagtcat catgcccctt atgtcttggg ctacacacgt

1320

actacaatgg tcggcaacag agggaagcaa agccgtgagg cagagcaaac cccagaaacc

1380

cgatcccagt tcggattgca ggctgcaact cgcctgcatg aagtcggaat cgctagtaat

1440

cgcaggtcag catactgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac

1500

cacgaaagtt ggtaacaccc gaagccggtg gggtaaccgt aaggagccag ccgtctaagg

1560

tggggccgat gattggggtg aagtcgtaac aaggtagccg tatcggaagg

1610

<210> 1465

<211> 1276

<212> DNA

<213> Phenylobacterium zucineum

<400> 1465

ctggcggcag gcctaataca tgcaagtcga gcgagcggcg gacgggtgag taacgcgtgg

60

gaatgtgccc tttggtacgg aacaacacag ggaaacttgt gctaataccg tatgtggaaa

120

gtcgccattg gagcagcccg cgttggatta ggtagttggt gaggtaaagg ctcaccaagc

180

cgacgatcca tagctggtct gagaggatga tcagccacac tgggactgag acacggccca

240

gactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttgcgcaatg ggcgaaagcc tgacgcagcc

300

atgccgcgtg aatgatgaag gtcttaggat tgtaaaattc tttcaccggg gaagatgacg

360

gtacccggag aagaagtccc ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgaaggggg

420

ctagcgttgc tcggaattac tgggcgtaaa gggcgcgtag gcggatgttt aagtcggggg

480

tgaaagcccg gggctcaacc tcggaattgc cttcgatact ggacatcttg agtacgggag

540

aggtgagtgg aactccgagt gtagaggtga aattcgtaga tattcggaag aacaccagtg

600

gcgaaggcga ctcactggcc cgactgacgc tgaggcgcga aagcgtgggg agcaaacagg

660

attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgagtgc tagttgtcgg catgtcggtg

720

acgcagctaa cgcattaagc actccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt aaaactcaag

780

ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgca

840

gaaccttacc accttttgac atgcacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

900

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aaccctcgcc attagttgcc atcatgggca

960

ctctaatggg accgccggtg gtaagccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcctcatg

1020

gcccttacgg ggtgggctac acacgtgcta caatggcgac cagagggttg cgatgctgcg

1080

aagcggagct aatccctgtc gtctcagttc ggatgcactc tgcaactcga gtgcagaagt

1140

cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac

1200

acaccgcccg tcgcaccatg ggagttggct ttacccgaag gcggtcgcta ggcagccgac

1260

cacggtaggg tcagcg

1276

<210> 1466

<211> 1428

<212> DNA

<213> Photorhabdus asymbiotica

<400> 1466

acatgcaagt cgagcggtaa caggaaagtg cttgcacttt tgctgacgag cggcggacgg

60

gtgagtaatg tctggggatc tgcccgaggg cgggggataa ccactggaaa cggtggctaa

120

taccgcatga tgtcgcgaga ccaaagtggg ggacctgaaa gggcctcacg ccctcggatg

180

aacccagatg ggattagcta gtaggtaggg taatggccta cctaggcgac gatccctagc

240

tggtctgaga ggatgaccag ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag

300

gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat gcagccatgc cgcgtgtatg

360

aagcaggcct tcgggttgta aagtactttc agcggggagg aagggtttgg cctgaagagg

420

gttaaatttt gacgttaccc gcagaagaag caccggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg

480

taatacggag ggtgcaagcg ttaatcggaa tgactgggcg taaagcgcac gcaggcggtc

540

aattaagtta gatgtgaaat ccccgggctc aacctgggaa tggcatctaa gactggttgg

600

ctagagtctc gtagaggggg gtagaattcc atgtgtagcg gtgaaatgcg tagagatgtg

660

gaggaatacc ggtggcgaag gcggccccct ggacgaagac tgacgctcat gtgcgaaagc

720

gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc tgtaaacgat gtcgatttgg

780

aggttgtggc ctagagctgt ggcttccgga gctaacgcgt taaatcgacc gcctggggag

840

tacggccgca aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat

900

gtggtttaat tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctactc ttgacatcca gagaagacct

960

cagagatgag gttgtgcctt cgggagctct gagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct

1020

cgtgttgtga aatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttatcc tttgttgcca

1080

gcacgttgag gtgggaactc aaaggagact gccggtgata aaccggagga aggtggggat

1140

gacgtcaagt catcatggcc ctgacgagta gggctacaca cgtgctacaa tggcggatac

1200

aaagtgaagc gacctcgcga gagcaagcgg aacacacaaa gtctgtcgta gtccggattg

1260

gagtctgcaa ctcgactcca tgaagtcgga atcgctagta atcgtagatc agcatgctac

1320

ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggtggcaa

1380

aagaagtcgg tagcctaacc gcgagggggg cgctgaccac tttgtgat

1428

<210> 1467

<211> 1501

<212> DNA

<213> Pigmentiphaga daeguensis

<400> 1467

ctggctcaga ttgaacgcta gcggcatgcc ttacacatgc aagtcgaacg gcagcgcgga

60

cttcggtctg gcggcgagtg gcgaacgggt gagtaatgca tcggaacgta cccagtagcg

120

ggggataact acgcgaaagc gtagctaata ccgcatacgc cctacggggg aaaggggggg

180

atcgcaagac ctctcactat tggagcggcc gatgtcggat tagctagttg gtggggtaaa

240

ggcctaccaa ggcgacgatc cgtagctggt ttgagaggac gaccagccac actgggactg

300

agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa ttttggacaa tgggggcaac

360

cctgatccag ccatgccgcg tgtgcgaaga aggccttcgg gttgtaaagc acttttggcg

420

ggaaagaaac ggcgccggct aatacctggc gtaactgacg gtacccgcag aataagcacc

480

ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggtg caagcgttaa tcggaattac

540

tgggcgtaaa gcgtgcgcag gcggttcgga aagaaagatg tgaaatccca gggctcaacc

600

ttggaactgc atttttaact cccgaactag agtgtgtcag agggaggtgg aattccacgt

660

gtagcagtga aatgcgtaga tatgtggagg aacaccgatg gcgaaggcag cctcctggga

720

taacactgac gctcatgcac gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt

780

ccacgcccta aacgatgtca actagctgtt gggttcttcg gagcttggta gcgcagctaa

840

cgcgtgaagt tgaccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt aaaactcaaa ggaattgacg

900

gggacccgca caagcggtgg atgatgtgga ttaattcgat gcaacgcgaa aaaccttacc

960

tacccttgac atgtctggaa tcccgaagag atttgggagt gctcgaaaga gaaccggaac

1020

acaggtgctg catggccgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

1080

gagcgcaacc cttgtcatta gttgctacga aagggcactc taatgagact gccggtgaca

1140

aaccggagga aggtggggat gacgtcaggt cctcatggcc cttatgggta gggcttcaca

1200

cgtcatacaa tggtcgggac agagggctgc caacccgcga gggggagcca atcccagaaa

1260

cccgatcgta gtccggattg cagtctgcaa ctcgactgca tgaagtcgga atcgctagta

1320

atcgcggatc agcatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac

1380

accatgggag tgggttctac cagaagtagg tagcctaacc gcaaggaggg cgcttaccac

1440

ggtagggttc atgactgggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg

1500

g

1501

<210> 1468

<211> 1506

<212> DNA

<213> Planomicrobium koreense

<400> 1468

gacgaacgct ggcggcatgc ctaatacatg caagtcgagc ggaacgttgg gagcttgctc

60

ccttcgttta gcggcggacg ggtgagtaac acgtgggcaa cctgccctgc agatcgggat

120

aactccggga aaccggtgct aataccgaat agttttttgc ccctcctggg gcggaacgga

180

aagacggttt cggctgtcac tgcaggatgg gcccgcggcg cattagctag ttggtggggt

240

aacggcccac caaggcgacg atgcgtagcc gacctgagag ggtgatcggc cacactggga

300

ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatcttccg caatggacga

360

aagtctgacg gagcaatgcc gcgtgagtga cgaaggtttt cggatcgtaa aactctgttg

420

taagggaaga acaagtacca agtaactact ggtaccttga cggtacctta ccagaaagcc

480

acggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgtt gtccggaatt

540

attgggcgta aagcgcgcgc aggcggtccc ttaagtctga tgtgaaagcc cacggctcaa

600

ccgtggaggg tcattggaaa ctgggggact tgagtgcaga agaggaaagt ggaattccat

660

gtgtagcggt gaaatgcgta gagatgtgga ggaacaccag tggcgaaggc gactttctgg

720

tctgtaactg acgctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta

780

gtccacgccg taaacgatga gtgctaagtg ttagggggtt tccgcccctt agtgctgcag

840

ctaacgcatt aagcactccg cctggggagt acggccgcaa ggctgaaact caaaggaatt

900

gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct

960

taccaggtct tgacatcccg ctgaccgcct aggagactag gctttccctt cggggacagc

1020

ggtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg

1080

caacgagcgc aacccttgat cttagttgcc agcattcagt tgggcactct aaggtgactg

1140

ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg

1200

ggctacacac gtgctacaat ggacggtaca aagggctgca aacccgcgag ggggagccaa

1260

tcccagaaaa ccgttctcag ttcggattgc aggctgcaac tcgcctgcat gaagccggaa

1320

tcgctagtaa tcgtggatca gcatgccacg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc

1380

gcccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc cgaagtcggt gaggtaacca cttgtggagc

1440

cagccgccga aggtgggaca gatgattggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtatcgga

1500

aggtgc

1506

<210> 1469

<211> 1499

<212> DNA

<213> Plesiomonas shigelloides

<400> 1469

gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc aagtcgagcg

60

gtaacacaga ggagcttgct ccttgggtga cgagcggcgg acgggtgagt aatgcctggg

120

gatctgcccg atagaggggg ataactacgg gaaactgtag ctaataccgc ataatgtcta

180

cggaccaaag tgggggcttt cggacctcat gctatcggat gaacccaggt gggattagct

240

agttggtgag gtaatggctc accaaggcga cgatctctaa ctggtttgag agaatgacca

300

gtcacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

360

cacaatgggc gcaagcctga tgcagccatg ccgcgtgtgt gaagaaggcc ttcgggttgt

420

aaagcacttt cagcggggag gaagggtcac tagttaatac ctagtggcat tgacgttact

480

cgcagaagaa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga gggtgcaagc

540

gttaatcgga attactgggc gtaaagcgca cgcaggcggt ttgttaagtc agatgtgaaa

600

tccccgagct caacttggga actgcatttg aaactggcaa gctagagtct tgtagagggg

660

ggtagaattc caggtgtagc ggtgaaatgc gtagagatct ggaggaatac cggtggcgaa

720

ggcggccccc tggacaaaga ctgacgctca ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtccacg ctgtaaacga tgtcgatttg gaggttgtgc ccttgaggcg

840

tggcttccgg agctaacgcg ttaaatcgac cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa

900

ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa

960

cgcgaagaac cttacctact cttgacatcc acagaacttt ccagagatgg attggtgcct

1020

tcgggaactc tgagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgttgtg aaatgttggg

1080

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc ctttgttgcc agcgattcgg tcgggaactc

1140

aaaggagact gccggtgata aaccggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc

1200

cttacgagta gggctacaca cgtgctacaa tggcatatac aaagggcggc aagctagcga

1260

tagtgagcga atcccataaa gtatgtcgta gtccggattg gagtctgcaa ctcgactcca

1320

tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agaatgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggttgcaa aagaagtagg tagcttaacc

1440

ttcgggaggg cgcttaccac tttgtgattc atgactgggg tgaagtcgta acaaggtaa

1499

<210> 1470

<211> 1296

<212> DNA

<213> Porphyromonadaceae bacterium NML 060648

<400> 1470

caggcttaac acatgcaagt cgagggaccg gcgcacgggt gagtaacgcg tatgcaacct

60

acctatcaga ggggaataac ccggcgaaag tcggactaat accgcataaa taaagtcgct

120

gatagatggg catgcgttcc attaggtagt tggtgaggta acggctcacc aagccgacga

180

tggatagggg aactgagagg ttggtccccc acactggtac tgagacacgg accagactcc

240

tacgggaggc agcagtgagg aatattggtc aatgggcggg agcctgaacc agccaagtcg

300

cgtgaaggaa gaaggattat ggttcgtaaa cttcttttgc aggggaatat gtatgtaccc

360

tgagaataag gatcggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag gatccgagcg

420

ttatccggat ttattgggtt taaagggtgc gtaggtggtt tgataagtca gcggtgaaag

480

tttgcagctt aactgtaaaa atgccgttga aactgtcgga cttgagtgta aatgaggtag

540

gcggaatgcg tggtgtagcg gtgaaatgca tagatatcac gcagaactcc gattgcgaag

600

gcagcttact aagctaactg acactgaagc acgaaagcgt ggggatcaaa caggattaga

660

taccctggta gtccacgcag taaacgatga ttactagctg tttgcgagta agcggcacag

720

cgaaagcgtt aagtaatcca cctggggagt acgccggcaa cggtgaaact caaaggaatt

780

gacgggggcc cgcacaagcg gaggaacatg tggtttaatt cgatgatacg cgaggaacct

840

tacccgggtt tgaacgtacg aggtgctgca tggttgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt

900

cggcttaagt gccataacga gcgcaaccct tatttycagt tactaacagc tgaggactct

960

ggagagactg ccagcgtaag ctggaggaag gtggggatga cgtcaaatca gcacggccct

1020

tacatccggg gcgacacacg tgttacaatg gtaagcaaag ggcagctacc gggcgaccgg

1080

atgcgaatct ctcttatctc agttcggacg gagtctgcaa ctcgactccg gaagctggat

1140

tcgctagtaa tcgcgcatca gccatggcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1200

cgcccgtcaa gccatgggag ccgggggtac ctgaagttcg tatcgaccta gggtaaaact

1260

ggtgactggg gctaagtcgt aacaaggtag ccgtac

1296

<210> 1471

<211> 1531

<212> DNA

<213> Porphyromonas asaccharolytica

<400> 1471

acaatggaga gtttgactct ggctcaggat gaacgctagc gataggctta acacatgcaa

60

gtcgaggggc agcgagatgt agcaatacgt cgtcggcgac cggcgaatgg gtgagtaaca

120

cgtatgcaac ttacctctta gtggtgaata acccgatgaa agtcggacta atacaccata

180

tactccttag atcccatgag aagaggagga aagattaatc gctaagagat gggcctgcgt

240

tccattagct agttggtaag gtaacggctt accaaggcaa cgatggatag ggggactgag

300

aggttgaccc cccacattga cactgagata cgggtcaaac tcctacggga ggcagcagtg

360

aggaatattg gtcaatgggc gagagcctga accagccaag tcgcgtgaag gaagactgcc

420

cgcaagggtt gtaaacttct tttgtatggg attaaagtca cctacgtgta ggtgtttgca

480

gttaccatac gaataagcat cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggaggat

540

gcgagcgtta tccggaatta ttgggtttaa agggtgcgta ggttgcaagg gaagtcaggg

600

gtgaaaagct gtagctcaac tatggtcttg cctttgaaac tctctagcta gagtgtactg

660

gaggtacgtg gaacgtgtgg tgtagcggtg aaatgcatag atatcacaca gaactccgat

720

tgcgcaggca gcgtactaca ttacaactga cactgaagca cgaaagcgtg ggtatccaac

780

aggattagat accctggtag tccacgcagt aaacgatgaa tactagatct atgcgatata

840

cagtatgggt ctaagcgaaa gcgataagta ttccacctgg ggagtacgcc ggcaacggtg

900

aaactcaaag agattggcgg gggtccgcac aagcggagga acatgtggtt taattcgatg

960

atacgcgagg aaccttaccc gggattgaaa tgtagatgca tgaggctgag aggtctcttc

1020

ccttcggggc ttctatgtag gtgctgcatg gttgtcgtca gctcgtgccg tgaggtgtcg

1080

gcttaagtgc cataacgagc gcaacccgcg tcgatagtta ctaacgagtc aagtcgagga

1140

ctctatcgag acagccgtcg taagacgtga ggaaggagcg gatgacgtca aatcagcacg

1200

gcccttacat ccggggcgac acacgtgtta caatggtagg gacagcgagc agccatctgg

1260

tgacagagag ctaatctata aaccctatcc cagttcggat cggagtctgc aactcgactc

1320

tgtgaagctg gattcgctag taatcgcgca tcagccatgg cgcggtgaat acgttcccgg

1380

accttgcaca caccgcccgt caagccatgg gagtcggggg tacctgaaga gcgtgaccgt

1440

cacaggagcg cttgagggta aaactggtga ctggggctaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1500

ccggaaggtg cggctggaac acctcctttc t

1531

<210> 1472

<211> 1533

<212> DNA

<213> Porphyromonas endodontalis

<400> 1472

acaatggaga gtttgatcct ggctcaggat gaacgctagc gataggctta acacatgcaa

60

gtcgaggggc agcattattt tagcttgcta agatagatgg cgaccggcgc acgggtgcgt

120

aacgcgtatg caacctgcct gtaattaggg aataacccgg tgaaagtcgg actaataccc

180

tatattcttc tttctccgca tggaggagga cggaaagatt tattgattac agatgggcat

240

gcgtcccatt agctggttgg taaggtaacg gcttaccaag gcaacgatgg gtagggggac

300

tgagaggttg accccccaca ctggtactga gacacggacc agactcctac gggaggcagc

360

agtgaggaat attggtcaat gggcgagagc ctgaaccagc caagtcgcgt gaaggacgac

420

ggttctatgg attgtaaact tcttttgtag aggaataatg gcagctacgt gtagctgaga

480

tgcatgtact ctacgaataa gtatcggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga

540

ggatacgagc gttatccgga attattgggt ttaaagggtg cgtaggtggc gtattaagtc

600

agtggtgaaa agctgcagct caactgtagt cttgccgttg aaactgatat gctagagagg

660

agacgaggta tgcggaatgt gtggtgtagc ggtgaaatgc atagatatca cacagaacgc

720

cgattgcgaa ggcagcgtac caggctccgt ctgacactga agcacgaaag cgtggggatc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg cagtaaacga tgaatactag atttttgcga

840

tatactgtaa gagtctaagc gaaagcgata agtattccac ctggggagta cgccggcaac

900

ggtgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg aggaacatgt ggtttaattc

960

gatgatacgc gaggaacctt acccgggatt gaaatttaga tgatggcaga tgagagtttg

1020

ctttccttcg ggacatctaa gtaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt

1080

gtcggcttaa gtgccataac gagcgcaacc cgcgtcgata gttactaaca ggttatgctg

1140

aggactctat cgagacagcc gtcgtaagac gcgaggaagg ggcggatgac gtcaaatcag

1200

cacggccctt acatccgggg cgacacacgt gttacaatgg cagggacaaa gggaagcgac

1260

atggtgacat gaagcggatc tccaaaccct gtcccagttc ggatcggagt ctgcaactcg

1320

actccgtgaa gctggattcg ctagtaatcg cgcatcagcc atggcgcggt gaatacgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcaagcc atggaagttg ggagtacctg aagagcgtaa

1440

ccgcaagggg cgcttaaggg taataccagt gactggggct aagtcgtaac aaggtagccg

1500

taccggaagg tgcggctgga atacctcctt tct

1533

<210> 1473

<211> 1475

<212> DNA

<213> Porphyromonas gingivalis

<400> 1473

acagtggaga gtttgatcct ggctcaggat gaacgctagc gataggctta acacatgcaa

60

gtcgaggggc agcatgatct tagcttgcta aggttgatgg cgaccggcgc acgggtgcgt

120

aacgcgtatg caacttgcct tacagagggg gataacccgt tgaaagacgg actaaaaccg

180

catacacttg tattattgca tgatattaca aggaaatatt tatagctgta agataggcat

240

gcgtcccatt agcttgttgg tgaggtaacg gctcaccaag gcgacgatgg gtaggggaac

300

tgagaggttt atcccccaca ctggtactga gacacggacc agactcctac gggaggcagc

360

agtgaggaat attggtcaat gggcgagagc ctgaaccagc caagtcgcgt gaaggaagac

420

agtcctaagg attgtaaact tcttttatac gggaataacg ggcgatacga gtattgcatt

480

gaatgtaccg taagaataag catcggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag

540

gatgcgagcg ttatccggat ttattgggtt taaagggtgc gtaggttgtt cggtaagtca

600

gcggtgaaac ctgagcgctc aacgttcagc ctgccgttga aactgccggg cttgagttca

660

gtggcggcag gcggaattcg tggtgtagcg gtgaaatgca tagatatcac gaggaactcc

720

gattgcgaag gcagcttgcc atactgcgac tgacactgaa gcacgaaggc gtgggtatca

780

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc agtaaacgat gattactagg agtttgcgat

840

ataccgtcaa gcttccacag cgaaagcgtt aagtaatcca cctggggagt acgccggcaa

900

cggtgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gaggaacatg tggtttaatt

960

cgatgatacg cgaggaacct tacccgggat tgaaatgtag atgacggatg gtgaaaaccg

1020

tcttcccttc ggggcttcta tgtaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg tgccgtgagg

1080

tgtcggctta agtgccataa cgagcgcaac ccacatcggt agttactaac agttttcgct

1140

gaggactcta ccgagactgc cgtcgtaagg cgtgaggaag gtgtggatga cgtcaaatca

1200

gcacggccct tacatccggg gcgacacacg tgttacaatg ggagggacaa agggcagcta

1260

ccgggcgacc ggatgcgaat ctctaaaccc ttccccagtt cggatcggag tctgcaactc

1320

gactccgtga agctggattc gctagtaatc gcgcatcagc catggcgcgg tgaatacgtt

1380

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcaagc catgggagtc gggggtacct gaagggcgta

1440

accgcaaggg gcgcactagg gtaataccgg tgact

1475

<210> 1474

<211> 1476

<212> DNA

<213> Porphyromonas levii

<220>

<221> modified_base

<222> (31)..(31)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (49)..(49)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (341)..(341)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (541)..(541)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (645)..(645)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (811)..(811)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (963)..(963)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (973)..(974)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1021)..(1023)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1116)..(1116)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1293)..(1293)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1448)..(1448)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1474

acaatggaga gtttgatcct ggctcaggat naacgctagc gataggctna acacatgcaa

60

gtcgaggggt aacatgggag tagcttgctg cttctgatga cgaccggcgg atgggtgagt

120

aacgcgtatg caacttgcct cttagtgggg aataacccgg agaaatccgg actaataccg

180

catacactta gttatccgca tggatgatta aggaaagatt tattgctaag agataggcat

240

gcgttccatt agttagttgg tgaggtaacg gctcaccaag gcatcgatgg ataggggagc

300

tgagaggctt atcccccaca ttgggactga gacacggccc naactcctac gggaggcagc

360

agtgaggaat attggtcaat ggaggaaact ctgaaccagc caagtcgcgt gaaggatgac

420

tgtcctatgg attgtaaact tctttagtag gcgagtaaac gtaggtacga gtacctacct

480

gcaagtagcc taagaataag tatcggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag

540

natacgagcg ttatccggat ttattgggtt taaagggtgc gtaggtggca gattaagtca

600

gtggtgaaaa gctgtggctc aaccatagtc ttgccgttga aactngtttg cttgagtaca

660

gttgatgtag gcggaatgcg tagtgtagcg gtgaaatgca tagatattac gcagaactcc

720

gattgcgaag gcagcttaca aaagtgtaac tgacactgat gcacgaaagc gtgggtatca

780

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc ngtaaactat gattactcag agtatgcgat

840

ataatgtatg ctctcaagcg aaagcattaa gtaatccacc tggggagtac gtcggcaacg

900

atgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcgga ggaacatgtg gtttaattcg

960

atnatacgcg agnnacctta cctgggattg aaatgtatag gacaggggat ggaaacattc

1020

nnnttctctt cggagactta tatgtaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct cgtgccgtga

1080

ggtgtcggct taagtgccat aacgagcgca accctnatcg ttagttacta gcaggtagtg

1140

ctgaggactc tagcgagact gccgtcgtaa gacgagagga aggtggggat gacgtcaaat

1200

cagcacggcc cttatatcca gggcgacaca cgtgttacaa tggtgaggac aaagggtagc

1260

tacctggtga caggatgcca atctccaaac ctnatctcag ttcggatcga agtctgcaac

1320

tcgacttcgt gaagctggat tcgctagtaa tcgcgcatca gccatggcgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcaa gccatgggag ctgggggtac ctgaagtacg

1440

tgaccgcnag gagcgtccga gggtaagacc ggtgac

1476

<210> 1475

<211> 1473

<212> DNA

<213> Porphyromonas macacae

<220>

<221> modified_base

<222> (31)..(31)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (49)..(49)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (174)..(174)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (392)..(392)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (440)..(440)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (455)..(455)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (475)..(475)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (507)..(507)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (530)..(530)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (544)..(544)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1318)..(1318)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1408)..(1408)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1475

acagagaaga gtttgatcct ggctcaggat naacgctagc gataggctna acacatgcaa

60

gtcgaggggc agcatggtct tagcttgcta agattgatgg cgaccggcgc acgggtgcgt

120

aacgcgtatg taacttgcct gatagaaagg gataacccgg tgaaagtcgg actnatacct

180

tatggtcttg ggttattgca tgatgattca agtaaagatt aattgctatc agataggcat

240

gcgttccatt agttggttgg tgaggtaacg gctcaccaag gctacgatgg ataggggaat

300

gagaggttta tcccccacac tggtactgag acacggacca gactcctacg ggaggcagca

360

gtgaggaata ttggtcaatg ggcgagagcc tnaaccagcc acgtcgcgtg aaggaagacg

420

gttctatgga ttgtaaactn cttttatagg ggatnaagtt atccacgtgt ggatntttgc

480

aagtacccta tgaataagca tcggctnact ccgtgccagc agccgcggtn atacggagga

540

tgcnagcgtt atccggattt attgggttta aagggtgcgt aggtggcctg ataagtcggg

600

ggtgaaaagc tgtggctcaa ccacagtctt gccttcgaaa ctgtttggct tgagtataga

660

tgaagtaggc ggaatttgtg gtgtagcggt gaaatgcata gatatcacga ggaactccga

720

ttgcgaaggc agcttactaa gttatgactg acactgaagc acgaaagcgt gggtatcaaa

780

caggattaga taccctggta gtccacgcag taaacgatga taactgggcg tatgcgatat

840

acagtatgct cctgagcgaa agcgttaagt tatccacctg gggagtacgc cggcaacggt

900

gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggagg aacatgtggt ttaattcgat

960

gatacgcgag gaaccttacc cgggattgaa atttagcgga ctatgtatga aagtacatat

1020

cctgtcacaa ggccgctaag taggtgctgc atggttgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg

1080

tcggcttaag tgccataacg agcgcaaccc acgttgtcag ttactatcgg gtaaagccga

1140

ggactctgac aagactgccg tcgtaaggcg cgaggaaggt gtggatgacg tcaaatcagc

1200

acggccctta catccggggc gacacacgtg ttacaatggt ggggacaaag ggcagctact

1260

tggtgacaag atgcgaatct ccaaacccca tcccagttcg gatcgtagtc tgcaactnga

1320

ctatgtgaag ctggattcgc tagtaatcgc gcatcagcca tggcgcggtg aatacgttcc

1380

cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagnca tgggagtcgg gagtacctaa agcacgtaac

1440

cgcgaggggc gtgtcagggt aataccggtg act

1473

<210> 1476

<211> 1486

<212> DNA

<213> Porphyromonas somerae

<400> 1476

tggctcagga tgaacgctag cgataggctt aacacatgca agtcgagggg taacatggag

60

agaagcttgc ttcactctga tgacgaccgg cggatgggtg agtaacgcgt atgcaacttg

120

cctcttagtg ggggataacc cggagaaatc cggactaata ccgcatattc ttaatttctc

180

gcatgagtta ttaaggaaag atttattgct aagagatagg catgcgttcc attagttagt

240

tggtgaggta acggctcacc aaggcatcga tggatagggg agctgagagg ctgatccccc

300

acattgggac tgagacacgg cccaaactcc tacgggaggc agcagtgagg aatattggtc

360

aatggaggaa actctgaacc agccaagtcg cgtgaaggat gacggtccta tggattgtaa

420

acttctttag taggtgagta aggataggta cgtgtaccta ttagaaagta gcctaagaat

480

aagtatcggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaggatacga gcgttatccg

540

gatttattgg gtttaaaggg tgcgtaggtg gctgattaag tcagtggtga aaagctatgg

600

ctcaaccata gtcttgccgt tgatactggt tagcttgagt gtagatgatg taggcggaat

660

gcgtagtgta gcggtgaaat gcatagatat tacgcagaac tccgattgcg aaggcagctt

720

acaaaactac tactgacact gaggcacgaa agcgtgggta tcaaacagga ttagataccc

780

tggtagtcca cgccgtaaac tatgattact cagagtatgc gatatacagt atgctctcaa

840

gcgaaagcat taagtaatcc acctggggag tacgtcggca acgatgaaac tcaaaggaat

900

tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat tcgatgatac gcgaggaacc

960

ttacctggga ttgaaatgta taggctggca actggaaaca gatgctgttc acttcggtga

1020

cttatatgta ggtgctgcat ggttgtcgtc agctcgtgcc gtgaggtgtc ggcttaagtg

1080

ccataacgag cgcaaccctt atcgttagtt gctaacaggt taagctgagg actctggcga

1140

gactgccgtc gtaaggcgag aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcagcac ggcccttata

1200

tccagggcga cacacgtgtt acaatggtga ggacaaaggg tagctacctg gtgacaggat

1260

gccaatctcc aaacctcatc tcagttcgga tcgaagtctg caactcgact tcgtgaagct

1320

ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg gcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac

1380

acaccgcccg tcaagccatg gaagctgggg gtacctgaag tgcgtgaccg cgaggagcgt

1440

ccgagggtaa gaccggtgac tggggctaag tcgtaacaag gtaacc

1486

<210> 1477

<211> 1482

<212> DNA

<213> Porphyromonas sp. UQD 301

<400> 1477

gctcaggatg aacgctagcg ataggcttaa cacatgcaag tcgaggggca gcatggtctt

60

agcttgctaa gactgatggc gaccggcgca cgggtgcgta acgcgtatgc aacttgcctt

120

acagaggggg ataacccgtt gaaagacgga ctaacaccgc atatgctcag gggtctgcat

180

gggcctttga ggaaatattt atagctgtaa gataggcatg cgtcccatta gcttgttggt

240

gaggtaacgg ctcaccaagg caacgatggg taggggaact gagaggttta tcccccacac

300

tggtactgag acacggacca gactcctacg ggaggcagca gtgaggaata ttggtcaatg

360

ggcgagagcc tgaaccagcc aagtcgcgtg aaggatgaag gccctatggg tcgtaaactt

420

cttttatacg ggaataacga gccttacggg tagggcgctg aatgtaccgt aggaataagc

480

atcggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg atgcgagcgt tatccggatt

540

tattgggttt aaagggtgcg taggttgctt ggtaagtcag cggtgaaaac tgaacgctca

600

acgttcagcg tgccgttgaa actgtcaggc ttgagtgcag tggcggcagg cggaattcgt

660

ggtgtagcgg tgaaatgcat agatatcacg aggaactccg attgcgaagg cagcttgcca

720

tactgtaact gacactgaag cacgaaggcg tgggtatcaa acaggattag ataccctggt

780

agtccacgca gtaaacgatg attactagga gtttgcgata taccgataag cttccacagc

840

gaaagcgtta agtaatccac ctggggagta cgccggcaac ggtgaaactc aaaggaattg

900

acgggggccc gcacaagcgg aggaacatgt ggtttaattc gatgatacgc gaggaacctt

960

acccgggatt gaaatgtaga tgacagatgg tgaaagccgt tcttccttcg ggacatctat

1020

gtaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt gtcggcttaa gtgccataac

1080

gagcgcaacc cacattggta gttactaaca ggtcaagctg aggactctac cgagactgcc

1140

gtcgtaaggc gcgaggaagg tgtggatgac gtcaaatcag cacggccctt acatccgggg

1200

cgacacacgt gttacaatgg gagggacaaa gggcagctac cgggcgaccg gatgcgaatc

1260

tcgaaaccct tccccagttc ggatcggagt ctgcaactcg actccgtgaa gctggattcg

1320

ctagtaatcg cgcatcagcc atggcgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc

1380

ccgtcaagcc atgggagtcg ggggtacctg aaggacgtaa ccgcaagggg cgtactaggg

1440

taataccggt gactggggct aagtcgtaac aaggtaaccg ta

1482

<210> 1478

<211> 1509

<212> DNA

<213> Porphyromonas sp. oral clone BB134

<400> 1478

gagagtttga ttctggctca ggatgaacgc tagcgatagg cttaacacat gcaagtcgag

60

gggcagcatt attttagctt gctaagatag atggcgaccg gcgcacgggt gcgtaacgcg

120

tatgcaacct gcctgtaatt agggaataac ccggtgaaag tcggactaat accctatatt

180

cttctttttc cgcatgggga aagacggaaa gatttattga ttacagatgg gcatgcgtcc

240

cattagctcg ttggtaaggt aacggcttac caaggcaacg atgggtaggg ggactgagag

300

gttgaccccc cacactggta ctgagacacg gaccagactc ctacgggagg cagcagtgag

360

gaatattggt caatgggcga gagcctgaac cagccaagtc gcgtgaagga cgacggttct

420

atggattgta aacttctttt gtagaggaat aatggcagct acgcgtagct gagatgcatg

480

tactctacga ataagtatcg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggaggatac

540

gagcgttatc cggaattatt gggtttaaag ggtgcgtagg tggcgtatta agtcagtggt

600

gaaaagctgc agctcaactg tagtcttgcc gttgaaactg atatgctaga gaggagacga

660

ggtatgcgga atgtgtggtg tagcggtgaa atgcatagat atcacacaga acgccgattg

720

cgaaggcagc gtaccaggct ccgtctgaca ctgaagcacg aaagcgtggg gatcaaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgcagtaa acgatgaata ctagattttt gcgatatagt

840

gtaagagtct aagcgaaagc gataagtatt ccacctgggg agtacgccgg caacggtgaa

900

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggaggaac atgtggttta attcgatgat

960

acgcgaggaa ccttacccgg gattgaaatt tagatggtgg cagatgagag tttgctttcc

1020

ttcgggacat ctaagtaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgtcggc

1080

ttaagtgcca taacgagcgc aacccgcgtc gatagttact aacaggttaa gctgaggact

1140

ctatcgagac agccgtcgta agacgtgagg aaggggcgga tgacgtcaaa tcagcacggc

1200

ccttacatcc ggggcgacac acgtgttaca atggcaggga caaagggaag cgacatggtg

1260

acatgaagcg gatctccaaa ccctgtccca gttcggatcg gagtctgcaa ctcgactccg

1320

tgaagctgga ttcgctagta atcgcgcatc agccatggcg cggtgaatac gttcccgggc

1380

cttgtacaca ccgcccgtca agccatggaa gttgggagta cctgaagagc gtaaccggaa

1440

ggggcgctta agggtaatac cagtgactgg ggctaagtcg taacaaggta gccgtaccgg

1500

aaggtgcgg

1509

<210> 1479

<211> 1465

<212> DNA

<213> Porphyromonas sp. oral clone F016

<220>

<221> modified_base

<222> (629)..(629)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1479

cctggctcag gatgaacgct agcgataggc ttaacacatg caagtcgagg ggcagcatta

60

ttttagcttg ctaagataga tggcgaccgg cgcacgggtg cgtaacgcgt atgcaacctg

120

cctgtaatta gggaataacc cggtgaaagt cggactaata ccctatattc atcgttaacc

180

gcatggttgg tgatggaaag atttattgat tacagatggg catgcgtccc attagctagt

240

tggtaaggta acggcttacc aaggcaacga tgggtagggg gactgagagg ttgacccccc

300

acactggtac tgagacacgg accagactcc tacgggaggc agcagtgagg aatattggtc

360

aatgggcgga agcctgaacc agccaagtcg cgtgaaggaa gacggttcta tggattgtaa

420

acttcttttg tagaggaata atggcagcta cgtgtagctg agatgcatgt actctacgaa

480

taagtatcgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggaggatacg agcgttatcc

540

ggaattattg ggtttaaagg gtgcgtaggt ggcgtattaa gtcagtggtg aaaagctgca

600

gctcaactgt agtcttgccg ttgaaactna tatgctagag aggagacgag gtatgcggaa

660

tgtgtggtgt agcggtgaaa tgcatagata tcacacagaa cgccgattgc gaaggcagcg

720

taccaggctc cgtctgacac tgaagcacga aagcgtgggg atcaaacagg attagatacc

780

ctggtagtcc acgcagtaaa cgatgaatac tagatttttg cgatatacag taagagtcta

840

agcgaaagcg ataagtattc cacctgggga gtacgccggc aacggtgaaa ctcaaaggaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cggaggaaca tgtggtttaa ttcgatgata cgcgaggaac

960

cttacccggg attgaaattt agatggcggc agatgagagt ttgctttcct tcgggacatc

1020

taagtaagtg ctgcatggtt gtcgtcagct cgtgccgtga ggtgtcggct taagtgccat

1080

aacgagcgca acccgcgttg atagttacta acaggttaag ctgaggactc tatcgagaca

1140

gccgtcgtaa gacgagagga aggggcggat gacgtcaaat cagcacggcc cttacatccg

1200

gggcgacaca cgtgttacaa tggcagggac aaagggaagc gacatggtga catgaagcgg

1260

atctccaaac cctgtcccag ttcggatcgg agtctgcaac tcgactccgt gaagctggat

1320

tcgctagtaa tcgcgcatca gccatggcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1380

cgcccgtcaa gccatggaag ttgggagtac ctgaagagcg taaccgcaag gggcgcttaa

1440

gggtaatacc agtgactggg gctaa

1465

<210> 1480

<211> 1286

<212> DNA

<213> Porphyromonas sp. oral clone P2PB_52 P1

<220>

<221> modified_base

<222> (1230)..(1230)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1480

gatgaacgct agcgataggc ttaacacatg caagtcgagg gaccggcgca cgggtgcgta

60

acgcgtatgc aacctgcctg taattaggga ataacccggt gaaagtcgga ctaataccct

120

atattgaaag ttgattacag atgggcatgc gtcccattag ctagttggta aggtaacggc

180

ttaccaaggc aacgatgggt agggggactg agaggttgac cccccacact ggtactgaga

240

cacggaccag actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct

300

gaaccagcca agtcgcgtga aggacgacgg tttatggatt gtaaacttct tttgtagagg

360

aatatgcatg tactctacga ataagtatcg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata

420

cggaggatac gagcgttatc cggaattatt gggtttaaag ggtgcgtagg tggcatatta

480

agtcagtggt gaaaagctgc agctcaactg tagtcttgcc gttgaaactg atatgctaga

540

gaggagacga ggtatgcgga atgtgtggtg tagcggtgaa atgcatagat atcacacaga

600

acgccgattg cgaaggcagc gtaccaggct ctctgacact gaagcacgaa agcgtgggga

660

tcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgcagtaaac gatgaatact agatttttgc

720

gtgtaagagt ctaagcgaaa gcgataagta ttccacctgg ggagtacgcc ggcaacggtg

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggagga acatgtggtt taattcgatg

840

atacgcgagg aaccttaccc gggattgaaa ttagtaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgccgtga ggtgtcggct taagtgccat aacgagcgca acccgcgtcg atagttacta

960

acagctgagg actctatcga gacagccgtc gtaagacgga ggaaggggcg gatgacgtca

1020

aatcagcacg gcccttacat ccggggcgac acacgtgtta caatggcagg caaagggaag

1080

cgacatggtg acatgaagcg gatctcccct gtcccagttc ggacggagtc tgcaactcga

1140

ctccggaagc tggattcgct agtaatcgcg catcagccat ggcgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcaagccan ggagttggga gtacctgaag agcgtagcgc

1260

ttaagggtaa taccagtgac tggggc

1286

<210> 1481

<211> 1285

<212> DNA

<213> Porphyromonas sp. oral clone P4GB_100 P2

<400> 1481

gatgaacgct agcgataggc ttaacacatg caagtcgagg gaccggcgca cgggtgcgta

60

acgcgtatgc aacctgcctg taattaggga ataacccggt gaaagtcgga ctaataccct

120

atattgaaag ttgattacag atgggcatgc gtcccattag ctggctggta aggtaacggc

180

ttaccaaggc aacgatgggt agggggactg agaggttgac ctcccacact ggtactgaga

240

cacggaccag actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct

300

gaaccagcca agtcgcgtga aggacgacgg tttatggatt gtaaacttct tttgtagagg

360

aatatgcatg tactctacga ataagtatcg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata

420

cggaggatac gagcgttatc cggaattatt gggtttaaag ggtgcgtagg tggcgtatta

480

agtcagtggt gaaaagctgc agctcaactg tagtcttgcc gttgaaactg atatgctaga

540

gaggagacga ggtatgcgga atgtgtggtg tagcggtgaa atgcatagat atcacacaga

600

acgccgattg cgaaggcagc gtaccaggct ctctgacact gaagcacgaa agcgtgggga

660

tcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgtagtaaac gatgaatact agatttttgc

720

gtgtaagagt ctaagcgaaa gcgataagta ttccacctgg ggagtacgcc ggcaacggtg

780

aaactcaaag gaattgaggg ggcccgcaca agcggaggaa catgtggttt aattcgatga

840

tacgcgagga acttaccggg gattgaattt agtaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg

900

tgccgtgagg tgtcggctta agtgccataa cgagcgcaac ccgcgtcgat agttactaac

960

agctgaggac tctatcgaga cagccgtcgt aagacggagg aaggggcgga tgacgtcaaa

1020

tcagcacggc ccttacatcc ggggcgacac acgtgttaca atggcaggca aagggaagcg

1080

acatggtgac atgaagcgga tctcccctgt cccagttcgg acggagtctg caactcgact

1140

ccggaagctg gattcgctag taatcgcgca tcagccatgg cgcggtgaat acgttcccgg

1200

gccttgtaca caccgcccgt caagccatgg gagtcggggg tacctgaagg gcgtagcgca

1260

ctagggtaat accggtgact ggggc

1285

<210> 1482

<211> 1532

<212> DNA

<213> Porphyromonas uenonis

<400> 1482

acaatggaga gtttgactct ggctcaggat gaacgctagc gataggctta acacatgcaa

60

gtcgaggggc agcgagatgt agcaatacgt cgtcggcgac cggcgaatgg gtgagtaaca

120

cgtatgcaac ttacctctta gtggtgaata actcgatgaa agtcggacta atacaccata

180

ctctccttag atcacatgag aagaggagga aagattaatc gctaagagat aggcctgcgt

240

tccattagct agttggtaag gtaacggctt accaaggcaa cgatggatag ggggactgag

300

aggttgaccc cccacattga cactgagata cgggtcaaac tcctacggga ggcagcagtg

360

aggaatattg gtcaatgggc gagagcctga accagccaag tcgcgtgaag gaagactgcc

420

cgcaagggtt gtaaacttct tttgtatggg attaaagtcg tctacgtgta gacgtttgca

480

gttaccatac gaataagcat cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggaggat

540

gcgagcgtta tccggaatta ttgggtttaa agggtgcgta ggttgcaagg gaagtcaggg

600

gtgaaaagct atagctcaac tatggtcttg cctttgaaac tctctagcta gagtgtactg

660

gaggtacgtg gaacgtgtgg tgtagcggtg aaatgcatag atatcacaca gaactccgat

720

tgcgcaggca gcgtactaca ttacaactga cactgaagca cgaaagcgtg ggtatcaaac

780

aggattagat accctggtag tccacgcagt aaacgatgaa tactagatct atgcgatatg

840

acagtatggg tctaagcgaa agcgataagt attccacctg gggagtacgc cggcaacggt

900

gaaactcaaa gagattggcg ggggtccgca caagcggagg aacatgtggt ttaattcgat

960

gatacgcgag gaaccttacc cgggattgaa atgtagatgc atgaggctga gaggtctctt

1020

cccttcgggg cttctatgta ggtgctgcat ggttgtcgtc agctcgtgcc gtgaggtgtc

1080

ggcttaagtg ccataacgag cgcaacccgc gtcgatagtt actaacgagt taagtcgagg

1140

actctatcga gacagccgtc gtaagacgag aggaaggagc ggatgacgtc aaatcagcac

1200

ggcccttaca tccggggcga cacacgtgtt acaatggtag ggacagcgag cagccatctg

1260

gcgacagaga gctaatctat aaaccctatc ccagttcgga tcggagtctg caactcgact

1320

ctgtgaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg gcgcggtgaa tacgttcccg

1380

gaccttgcac acaccgcccg tcaagccatg ggagtcgggg gtacctgaag agcgtgaccg

1440

tcacaggagc gcttgagggt aaaactggtg actggggcta agtcgtaaca aggtagccgt

1500

accggaaggt gcggctggaa cacctccttt ct

1532

<210> 1483

<211> 1495

<212> DNA

<213> Prevotella albensis

<400> 1483

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg

60

ggaaacgaca gagagtgctt gcacactttg ggcgtcgacc ggcgaatggg tgagtaacgc

120

gtatccaacc tgcccttgac agagggatag cccagtgaaa actgaattaa tacctcatgt

180

cctcctccga cggcatcaga cgaggagtaa agatttatcg gtcaaggatg gggatgcgtc

240

tgattaggta gtaggcgggg taacggccca cctagccgac gatcagtagg ggttctgaga

300

ggaaggtccc ccacattggt actgagacac ggaccaaact cctacgggag gcagcagtga

360

ggaatattgg tcaatgggcg gaagcctgaa ccagccaagt agcgtgcagg acgacggccc

420

tatgggttgt aaactgcttt tataggggaa taaagttatc cacgtgtgga tatttgcatg

480

taccctatga ataaggaccg gctaattccg tgccagcagc cgcggtaata cggaaggtcc

540

gggcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggagcgtagg cggtatatta agcgtgttgt

600

gaaatgtagg tgctcaacat ctgacttgca gcgcgaactg gtttacttga gtacgcacaa

660

cgtaggcgga attcgtcgtg tagcggtgaa atgcttagat atgacgaaga actccgattg

720

cgaaggcagc ttacgggagc gccactgacg ctgaagctcg aaagtgcggg tatcgaacag

780

gattagatac cctggtagtc cgcacggtaa acgatggatg cccgctctga gtccttttgg

840

atttggggcc aagcgaaagc attaagcatc ccacctgggg agtacgccgg caacggtgaa

900

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggaggaac atgtggttta attcgatgat

960

acgcgaggaa ccttacccgg gcttgaattg caggagaacg atccagagat ggtgaggccc

1020

ttcggggctc ctgtgaaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgtcggc

1080

ttaagtgcca taacgagcgc aacccctctc cttagttgcc atcaggtaat gctgggcact

1140

ctggggacac tgccaccgta aggtgtgagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcagcacggc

1200

ccttacgtcc ggggctacac acgtgttaca atggcgtgta cagagagttg gtgacatgca

1260

aatgtcatct aatcctaaaa gcacgtctca gttcggactg gggtctgcaa cccgacccca

1320

cgaagctgga ttcgctagta atcgcgcatc agccatggcg cggtgaatac gttcccgggc

1380

cttgtacaca ccgcccgtca agccatgaaa gccgggggtg cctgaagtcc gtgaccggaa

1440

ggatcggcct agggcaaaac tggtaattgg ggctaagtcg taacaaggta gccgt

1495

<210> 1484

<211> 1491

<212> DNA

<213> Prevotella amnii

<400> 1484

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agctataggc ttaacacatg caagtcgagg

60

ggcagcatat agattgcttg caatttatga tggcgaccgg cgcacgggtg agtaacgcgt

120

atccaaccta cccattacta gggaataacc cagcgaaagt tggcctaatg ccctatgtag

180

tcgtttgatc gcctgagatt tcgacgaaag atttatcggt attggatggg gatgcgtctg

240

attagcttgt tggcggggta aaggcccacc aaggcgacga tcagtagggg ttctgagagg

300

aaggtccccc acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc agcagtgagg

360

aatattggtc aatgggcgag agcctgaacc agccaagtag cgtgcaggat gacggcccta

420

tgggttgtaa actgctttta tatgggaata aagtgaggga cgtgtccctt attgcatgta

480

ccatatgaat aaggaccggc taattccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaaggtccag

540

gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgtaggct gtttgttaag cgtgttgtga

600

aatgtaagag ctcaactttt agattgcagc gcgaactggc agacttgagt gcgcacaacg

660

taggcggaat tcatggtgta gcggtgaaat gcttagatat catgacgaac tccgattgcg

720

aaggcagctt acgggagcgc aactgacgct aaagctcgaa ggtgcgggta tcgaacagga

780

ttagataccc tggtagtccg cacagtaaac gatggatgcc cgctgttagc acctagtgtt

840

agcggctaag cgaaagcatt aagcatccca cctggggagt acgccggcaa cggtgaaact

900

caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gaggaacatg tggtttaatt cgatgatacg

960

cgaggaacct tacccgggct tgaattgcag atgtttatat cagagatgat atattccctt

1020

cggggcattt gtgaaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt

1080

aagtgccata acgagcgcaa cccctttttt tagttgccat caggtagtgc tgggcactct

1140

agagatactg ccaccgtaag gtgtgaggaa ggtggggatg acgtcaaatc agcacggccc

1200

ttacgtccgg ggctacacac gtgttacaat gggtggtaca gagagttggt tgtacgcaag

1260

tgcgatctaa tcctaaaaac cattctcagt tcggactggg gtctgcaacc cgaccccacg

1320

aagctggatt cgctagtaat cgcgcatcag ccatggcgcg gtgaatacgt tcccgggcct

1380

tgtacacacc gcccgtcaag ccatgaaagc cgggggtgcc tgaagttcgt gaccgtaagg

1440

atcgacctag ggcaaaactg gtaattgggg ctaagtcgta acaaggtaac c

1491

<210> 1485

<211> 1537

<212> DNA

<213> Prevotella bergensis

<400> 1485

ttacaatgga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc

60

aagtcgaggg gaaacggcat ttggtgcttg caccatttgg acgtcgaccg gcgcacgggt

120

gagtaacgcg tatccaacct gcccataagt agggtataac ccgcagaaat gcggactaat

180

cccctatgtt gttcaaagac ggcatcagat ttgaaccaaa ggcttgccgc ttatggatgg

240

ggatgcgtcc gattagcttg ttggtgaggt aacggctcac caaggcttcg atcggtaggg

300

gttctgagag gaaggccccc cacataggaa ctgagacacg gtcctaactc ctacgggagg

360

cagcagtgag gaatattggt caatgggcga gagcctgaac cagccaagta gcgtgcagga

420

cgacggccct atgggttgta aactgctttt atgcggggat aaccggcctc acgtgtgagg

480

ccctgcaggt accgcatgaa taaggaccgg ctaattccgt gccagcagcc gcggtaatac

540

ggaaggtccg ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg gagcgtaggc cgtgggttaa

600

gtgtgttgtg aaatccggtt gctcaacatc cggtttgcag cgcatactgt cccacttgag

660

tgcgcacaac gcaggcggaa ttcgtcgtgt agcggtgaaa tgcttagata tgacgaggaa

720

ccccgattgc gaaggcagct tgcgggagcg caactgacgc ttaagctcga aggtgcgggt

780

atcaaacagg attagatacc ctggtagtcc gcacggtaaa cgatggatgc ccgctgtttg

840

ccctttttgg gcatgcggcc aagcgaaagc attaagcatc ccacctgggg agtacgccgg

900

caacggtgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggaggaac atgtggttta

960

attcgatgat acgcgaggaa ccttacccgg gcttgaactg ccagtgaacg atacagagat

1020

gttgaggccc ttcggggcgc tggtggaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg

1080

aggtgtcggc ttaagtgcca taacgagcgc aacccttttc cacagttgcc atcaggtcat

1140

gctgggcact ctgtggatac tgccgccgca aggtgtgagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1200

tcagcacggc ccttacgtcc ggggctacac acgtgttaca atggggggca cagcgtgccg

1260

tacgtgcgca agcacgttcc aatcatgaaa tcccccctca gttcggactg gggtctgcaa

1320

cccgacccca cgaagctgga ttcgctagta atcgcgcatc agccatggcg cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca agccatgaaa gccgggggtg cctgaagtcc

1440

gtaaccgcaa ggggcggcct agggcaagac cggtgattgg ggctaagtcg taacaaggta

1500

gccgtaccgg aaggtgcggc tggaacacct cctttct

1537

<210> 1486

<211> 1533

<212> DNA

<213> Prevotella bivia

<400> 1486

ttacaatgga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctataggct taacacatgc

60

aagtcgaggg gcagcgaata gatagcttgc tatttatgtc ggcgaccggc gcacgggtga

120

gtaacgcgta tccaacctac ccataactaa gggataaccc agcgaaagtt ggactaatac

180

cttatgtatt cgtttgatct catgagatta cgaataaaga tttatcggtt atggatgggg

240

atgcgtctga ttagcttgtt ggcggggtaa cggcccacca aggcaacgat cagtaggggt

300

tctgagagga aggtccccca cattggaact gagacacggt ccaaactcct acgggaggca

360

gcagtgagga atattggtca atggacgcaa gtctgaacca gccaagtagc gtgcaggatg

420

acggccctat gggttgtaaa ctgcttttat atggggataa agtggggaac gtgttccctt

480

ttgcaggtac catatgaata aggaccggct aattccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

aaggttcggg cgttatccgg atttattggg tttaaaggga gcgtaggccg tttggtaagc

600

gtgttgtgaa atgtagtagc tcaacttcta gattgcagcg cgaactgtca gacttgagtg

660

cgcacaacgt aggcggaatt catggtgtag cggtgaaatg cttagatatc atgaagaact

720

ccgattgcga aggcagctta cgggagcgca actgacgctg aagctcgaag gtgcgggtat

780

cgaacaggat tagataccct ggtagtccgc acagtaaacg atggatgccc gctgttagca

840

cctagtgtta gcggctaagc gaaagcatta agcatcccac ctggggagta cgccggcaac

900

ggtgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg aggaacatgt ggtttaattc

960

gatgatacgc gaggaacctt acccgggctt gaattgcaga tgaacgattt agagataatg

1020

aggtccttcg ggacatctgt gaaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt

1080

gtcggcttaa gtgccataac gagcgcaacc cctttcttta gttgccatca ggttctgctg

1140

ggcactctgg agatactgcc accgtaaggt gtgaggaagg tggggatgac gtcaaatcag

1200

cacggccctt acgtccgggg ctacacacgt gttacaatgg gtggtacaga tagttggtcg

1260

tgtgcaaata cgatctaatc cttaaaacca ttctcagttc ggactggggt ctgcaacccg

1320

accccacgaa gctggattcg ctagtaatcg cgcatcagcc atggcgcggt gaatacgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcaagcc atgaaagccg ggggtgcctg aagttcgtga

1440

ccgtaaggat cgacctaggg caaaactggt aattggggct aagtcgtaac aaggtagccg

1500

taccggaagg tgcggctgga acacctcctt tct

1533

<210> 1487

<211> 1493

<212> DNA

<213> Prevotella brevis

<400> 1487

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg

60

ggcatcattt cgaaagcttg cttttgaaga tggcgaccgg cgcacgggtg agtaacgcgt

120

atccaacctt ccccttagta gggcatagcc cggcgaaagt cggattaata ccctatgttc

180

tttayggatg gcatctgaaa taaagcaaag atttatcgct aagggatggg gatgcgtctg

240

attaggttgt tggcggggta acggcccacc aagcctacga tcagtagggg ttctgagagg

300

aaggtccccc acattggtac tgagacacgg accaaactcc tacgggaggc agcagtgagg

360

aatattggtc aatgggcgag agcctgaacc agccaagtag cgtgcaggat gacggcccta

420

tgggttgtaa actgcttttg tcaggggata aaaaagrraa cgtgttyyct attgcatgta

480

cctgaagaat aaggaccggc taattccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaaggtccag

540

gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgcaggct ggagattaag cgtgacgtga

600

aatgccgcgg ctcaaccgtg gaagtgcgtc gcgaactggt ttccttgagt gtattcgacg

660

tcagcggaat tcgtggtgta gcggtgaaat gcttagatat cacgaagaac tccgattgcg

720

aaggcagctg gcgaggctat aactgacgct aaagctcgaa ggtgcgggta tcgaacagga

780

ttagataccc tggtagtccg cacggtaaac gatggatgcc cgctgttggc gatatacggt

840

cagcggccaa gcgaaagcgt taagcatccc acctggggag tacgccggca acggtgaaac

900

tcaaaggawt tgacsggggc ccgcacaagc ggasgaacat gtggtttaat tcgatgatac

960

gcgaggaacc ttacccgggc ttgaactgca ggcgaacgat tcagagatga tgaggccctt

1020

cggggcgcct gtggakgtgc tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt

1080

aagtgccata acgagcgcaa cccctctctt cagttgccat caggtgawgc tgggcactct

1140

ggagacactg ccaccgtaag gtgtgaggaa ggtggggatg acgtcaaatc agcacggccc

1200

ttacgtccgg ggctacacac gtgttacaat gggaggtaca gagagacggt gtcyygcaar

1260

rtgcatcaaa tccttaaagc cttcctcagt tcggattggg gtctgcaacc cgaccccatg

1320

aagctggatt cgctagtaat cgcgcatcag ccatggcgcg gtgaatacgt tcccgggcct

1380

tgtacacacc gcccgtcaag ccatgaaagc cgggggcgct tgaagtccgt gaccgcaagg

1440

atcggcctag agcgaaactg gtaattgggg ctaagtcgta acaaggtagc cgt

1493

<210> 1488

<211> 1537

<212> DNA

<213> Prevotella buccae

<400> 1488

ttacaatgga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gctacaggct taacacatgc

60

aagtcgaggg gcagcatgcc ggttgcttgc aaccggtgat ggcgaccggc gcacgggtga

120

gtaacgcgta tccaaccttc ccgcgaccaa gggataacct gccgaaaggc agactaatac

180

cttatgtcct cctttgaagg catctgacga ggagcaaaga tccgtcggtc acggatgggg

240

atgcgtccga ttagcttgtt ggcggggcaa cggcccacca aggcatcgat cggtaggggt

300

tctgagagga aggcccccca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca

360

gcagtgagga atattggtca atgggcggaa gcctgaacca gccaagtagc gtgcaggacg

420

acggccctac gggttgtaaa ctgcttttat gcggggataa agttgcccac gcgtgggttt

480

ttgcaggtac cgcatgaata aggaccggct aattccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

aaggtccggg cgttatccgg atttattggg tttaaaggga gcgcaggccg ccgtgcaagc

600

gtgccgtgaa aagcagcggc ccaaccgctg ccctgcggcg cgaactgctt ggcttgagtg

660

cgccggaagc gggcggaatt cgtggtgtag cggtgaaatg cttagatatc acgaagaacc

720

ccgattgcga aggcagcccg ctgtggcgcc actgacgctg aggctcgaag gtgcgggtat

780

cgaacaggat tagataccct ggtagtccgc acggtaaacg atggataccc gctgtccggc

840

ccgtacggtc tgggcggcca agcgaaagcg ttaagtatcc cacctgggga gtacgccggc

900

aacggtgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggaggaaca tgtggtttaa

960

ttcgatgata cgcgaggaac cttacccggg cttgaattgc aggagaatga ttcagagatg

1020

atgaagtccc tcgggactcc tgtgaaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct cgtgccgtga

1080

ggtgtcggct caagtgccat aacgagcgca acccctctcc gcagttgcca tcgggtgatg

1140

ccgggcactc tgcggacact gccgccgcaa ggtgcgagga aggtggggat gacgtcaaat

1200

cagcacggcc cttacgtccg gggccacaca cgtgttacaa tggccggtac agagggctgt

1260

ccgcgcgcaa gtgcgggtga atcccctaaa tccggtccca gttcggactg gggtctgcaa

1320

cccgacccca cgaagctgga ttcgctagta atcgcgcatc agccatggcg cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca agccatgaaa gccgggggtg cctgaagtcc

1440

gtgaccgcga gggtcggcct agggcaaaac cggtgattgg ggctaagtcg taacaaggta

1500

gccgtaccgg aaggtgcggc tggaacacct cctttct

1537

<210> 1489

<211> 1264

<212> DNA

<213> Prevotella buccalis

<400> 1489

ggctcaggat gaacgctagc tacaggctta acacatgcaa gtcgcaggac tggcgcacgg

60

gtgagtaacg cgtatccaac cttcccatga ccacgggata acccgttgaa agacggacta

120

ataccgtatg actaaagcgg tgatggatgg ggatgcgtct gattagcttg ttggcggggt

180

aacggcccac caaggcgacg atcagtaggg gttctgagag gaaggtcccc cacattggaa

240

ctgagacacg gtccaaactc ctacgggagg cagcagtgag gaatattggt caatgggcga

300

gagcctgaac cagccaagta gcgtgcagga tgacggccta tgggttgtaa actgctttta

360

tgcggggata tgcaggtacc gcatgaataa ggaccggcta attccgtgcc agcagccgcg

420

gtaatacgga aggtccgggc gttatccgga tttattgggt ttaaagggag cgtaggccgc

480

caggtaagcg tgttgtgaaa tgtaccggct caaccggtga attgcagcgc gaactgtctg

540

gcttgagtgc acggtaagca ggcggaattc atggtgtagc ggtgaaatgc ttagatatca

600

tgaagaactc cgattgcgaa ggcagcttgc tgcagtgact gacgctgatg ctcgaaggtg

660

cgggtatcaa acaggattag ataccctggt agtccgcacg gtaaacgatg gatgcccgct

720

gtccgccggc gggtggccaa gcgaaagcgt taagcatccc acctggggag tacgccggca

780

acggtgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat

840

tcgatgatac gcgaggaacc ttacccgggc ttgaactgtg gaggtgctgc atggttgtcg

900

tcagctcgtg ccgtgaggtg tcggcttaag tgccataacg agcgcaaccc cttttttcag

960

ttgccatcag ctgggcactc tggagatact gccaccgcaa ggtggaggaa ggtggggatg

1020

acgtcaaatc agcacggccc ttacgtccgg ggctacacac gtgttacaat ggggcacaga

1080

gtgttggctt aacgcaagtt tggtctaatc ttctgtctcc cagttcggat ggggtctgca

1140

acccgacccc agaagctgga ttcgctagta atcgcgcatc agccatggcg cggtgaatac

1200

gttcccrggc cttgtacaca ccgcccgtca agccatgaaa gccgggggtg cctgaagtcc

1260

gtag

1264

<210> 1490

<211> 862

<212> DNA

<213> Prevotella copri

<220>

<221> modified_base

<222> (185)..(185)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (637)..(637)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (836)..(836)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1490

cgtatccaac ctgcccacca cttggggata accttgcgaa agtaagacta atacccaatg

60

acgtctctag aagacatctg aaagagatta aagatttatc ggtgatggat ggggatgcgt

120

ctgattagct tgttggcggg gtaacggccc accaaggcaa cgatcagtag gggttctgag

180

agganggtcc cccacattgg aactgagaca cggtccaaac tcctacggga ggcagcagtg

240

aggaatattg gtcaatggac gagagcctga accagccaag tagcgtgcag gatgacggcc

300

ctatgggttg taaactgctt ttataaggga ataaagtgag tctcgtgaga ctttttgcat

360

gtaccttatg aataaggacc ggctaattcc gtgccagcag ccgcggtaat acggaaggtc

420

cgggcgttat ccggatttat tgggtttaaa gggagcgtag gccggagatt aagcgtgttg

480

tgaaatgtag acgctcaacg tctgcactgc agcgcgaact ggtttccttg agtacgcaca

540

aagtgggcgg aattcgtggt gtagcggtga aatgcttaga tatcacgaag aactccgatt

600

gcgaaggcag ctcactggag cgcaactgac gctgaanctc gaaagtgcgg gtatcgaaca

660

ggattagata ccctggtagt ccgcacggta aacgatggat gcccgctgtt ggtctgaata

720

ggtcagcggc caagcgaaag cattaagcat cccacctggg gagtacgccg gcaacggtga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa catgtggttt aattcnatga

840

tacgcgagga accttacccg gg

862

<210> 1491

<211> 1473

<212> DNA

<213> Prevotella corporis

<220>

<221> modified_base

<222> (32)..(32)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (444)..(444)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (480)..(480)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (879)..(879)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1024)..(1024)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1114)..(1115)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1420)..(1420)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1491

tacaatggag agtttgatcc tggctcagga tnaacgctag ctacaggctt aacacatgca

60

agtcgagggg aaacggcatt aagtgcttgc actttttgga cgtcgaccgg cgcacgggtg

120

agtaacgcgt atccaacctg ccccttacca gggaataacc cgttgaaaga cggactaatg

180

ccctatggag tcctttgacg gcatcagatt aggactaaag attcatcggt atgggatggg

240

gatgcgtctg attagcttgt tggcggggta acggcccacc aaggcatcga tcagtagggg

300

ttctgagagg aaggtccccc acataggaac tgagacacgg tcctaactcc tacgggaggc

360

agcagtgagg aatattggtc aatgggcgct agcctgaacc agccaagtag cgtgcaggat

420

gacggcccta tgggttgtaa actnctttta tgcggggata aagtcaccca cgtgtgggtn

480

tttgcaggta ccgcatgaat aaggaccggc taattccgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

gaaggtccgg gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agtgtaggcg gcctgttaag

600

cgtgttgtga aatgtagatg ctcaacatct gaactgcagc gcgaactggc tggcttgagt

660

acacgcaacg tgggcggaat tcatggtgta gcggtgaaat gcttagatat catgaggaac

720

tcctattgcg aaggcagctc acgggagtgt cactgacgct taagctcgaa ggtgcgggta

780

tcaaacagga ttagataccc tggtagtccg cacggtaaac gatggatgcc cgctgttggc

840

gctttgcgtc agcggctaag cgaaagcatt aagcatccna cctggggagt acgccggcaa

900

cggtgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gaggaacatg tggtttaatt

960

cgatgatacg cgaggaacct tacccgggct tgaattgcag aggaaagatc cagagatggt

1020

gatncccttc ggggtctctg tgaaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg tgccgtgagg

1080

tgtcggctta agtgccataa cgagcgcaac cccnntttcc ggttgccatc aggtgatgct

1140

gggcactccg gggacactgc caccgtaagg tgtgaggaag gtggggatga cgtcaaatca

1200

gcacggccct tacgtccggg gctacacacg tgttacaatg gccggtacag agggcaggtg

1260

caatgcaaat tgcatcaaat ctataaatcc ggtctcagtt cggactgggg tctgcaaccc

1320

gaccccacga agctggattc gctagtaatc gcgcatcagc catggcgcgg tgaatacgtt

1380

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcaagc catgaaagcn gggggtgcct gaagttcgta

1440

accgcaagga gcgacctagg gcaaaactgg tga

1473

<210> 1492

<211> 1483

<212> DNA

<213> Prevotella dentalis

<400> 1492

tggctcagga tgaacgctgg ctacaggctt aacacatgca agtcgagggg cagcatggcg

60

gatgcttgca tctgccgatg gcgaccggcg cacgggtgag taacgcgtat ccaacctacc

120

ttcaagcagg ggacaatccg tagaaatgcg gtctgatacc ctatgtattc caacgaggtc

180

ctccgtgttg gaagaaaggt ttatccgctt gttgatgggg atgcgtccga ttagcttgtt

240

ggcggggcaa cggcccacca aggcaacgat cggtaggggt tctgagagga aggtccccca

300

cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgagga atattggtca

360

atgggcgtaa gcctgaacca gccaagtagc gtgcaggatg acggccctat gggttgtaaa

420

ctgcttttat acggggataa agtgcgccac gtgtggtgtt ttgcaggtac cgtatgaata

480

aggaccggct aattccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg aaggtccggg cgttatccgg

540

atttattggg tttaaaggga gcgtaggccg catgtcaagc gtgttgtgaa atgcaggtgc

600

tcaacacctg gattgcagcg cgaactgtcg tgcttgagtg tgcgcaacgt tggcggaatt

660

cgtcgtgtag cggtgaaatg cttagatatg acgaggaacc ccgattgcga aggcagctga

720

cgggagcata actgacgctg aagctcgaag gtgcgggtat cgaacaggat tagataccct

780

ggtagtccgc acggtaaacg atggatgccc gccgtccgcc cttttattgg gcgtgtggcc

840

aagcgaaagc attaagcatc ccacctgggg agtacgccgg caacggtgaa actcaaagga

900

attgacgggg gcccgcacaa gcggaggaac atgtggttta attcgatgat acgcgaggaa

960

ccttacccgg gcttgaattg cagaggaacg atccagagat ggtgaggccc ttcggggctt

1020

ctgcgaaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgtcggc tcaagtgcca

1080

taacgagcgc aacccctctc cgcagttgcc atcgggtcat gccgggcact ctgtggacac

1140

tgccgccgca aggtgtgagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcagcacggc ccttacgtcc

1200

ggggctacac acgtgttaca atggggggca cagcaagccg gccgcgtgca aacgcggtcc

1260

aatcctgaaa tcccccctca gttcggactg gggtctgcaa cccgacccca cgaagctgga

1320

ttcgctagta atcgcgcatc agccatggcg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1380

ccgcccgtca agccatgaaa gccgggggtg cctgaagtcc gtgaccggaa ggatcggcct

1440

agggcaaaac tggtgattgg ggctaagtcg taacaaggta acc

1483

<210> 1493

<211> 1535

<212> DNA

<213> Prevotella denticola

<400> 1493

ttacagtgga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gctacaggct taacacatgc

60

aagtcgaggg gaaacggcat tgagtgcttg cactgaatgg acgtcgaccg gcgcacgggt

120

gagtaacgcg tatccaacct tcccgttact gcgggataac ctgccgaaag gcagactaat

180

accgcatgtt cttcgatgac ggcatcagat tcgaagcaaa gatccgtcgg taacggaggg

240

ggatgcgtct gattagctag ttggcggggc gacggcccac caaggcgacg atcagtaggg

300

gttctgagag gaaggtcccc cacattggaa ctgagacacg gtccaaactc ctacgggagg

360

cagcagtgag gaatattggt caatgggcgg aagcctgaac cagccaagta gcgtgcagga

420

tgacggccct acgggttgta aactgctttt atgcggggat aaagtgaggg acgcgtccct

480

ttttgcaggt accgcatgaa taaggaccgg ctaattccgt gccagcagcc gcggtaatac

540

ggaaggtccg ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg gagcgtaggc cggggattaa

600

gtgtgttgtg aaatgtaggc gcccaacgtc tgacttgcag cgcatactgg ttcccttgag

660

tacgcgcaac gccggcggaa ttcgtcgtgt agcggtgaaa tgcttagata tgacgaagaa

720

ccccgattgc gaaggcagcc ggcgggagcg caactgacgc tgaagctcga aggtgcgggt

780

atcgaacagg attagatacc ctggtagtcc gcacggtaaa cgatggatgc ccgctgtcgg

840

cgccttgcgc cggcggccaa gcgaaagcgt taagcatccc acctggggag tacgccggca

900

acggtgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat

960

tcgatgatac gcgaggaacc ttacccgggc ttgaatcgca ggagaacgat acagagatgt

1020

tgaggtcctt cgggactcct gcgaaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag

1080

gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa cccctctccc cagttgccat cgggtgatgc

1140

cgggcactcc ggggacactg ccgccgcaag gtgcgaggaa ggcggggatg acgtcaaatc

1200

agcacggccc ttacgtccgg ggctacacac gtgttacaat ggccggcaca gagtgccggt

1260

gcggcgcgag ccgcatccaa tcttgaaaac cggtctcagt tcggactggg gtctgcaacc

1320

cgaccccacg aagctggatt cgctagtaat cgcgcatcag ccacggcgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaag ccatgaaagc cgggagtgcc tgaagtccgt

1440

gaccgcgagg atcggcctag ggcaaaactg gtgattgggg ctaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtaccggaa ggtgcggctg gaacacctcc tttct

1535

<210> 1494

<211> 1535

<212> DNA

<213> Prevotella disiens

<400> 1494

ttacaatgga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctataggct taacacatgc

60

aagtcgaggg gaaacggcag agagtgcttg cacactttgg acgtcgaccg gcgcacgggt

120

gagtaacgcg tatccaacct gccctttact tggggataac ccgttgaaag acggactaat

180

acccaatgat attcattgat gacatctgat ttgaattaaa gatttatcgg tataggatgg

240

ggatgcgtct gattagcttg ttggtgaggt aacggctcac caaggccacg atcagtaggg

300

gttctgagag gaaggtcccc cacattggaa ctgagacacg gtccaaactc ctacgggagg

360

cagcagtgag gaatattggt caatggacga gagtctgaac cagccaagta gcgtgcagga

420

tgacggccct atgggttgta aactgctttt gtttgggaat aatcgacatt acgtgtaatg

480

ttttgcatgt accattcgaa taaggaccgg ctaattccgt gccagcagcc gcggtaatac

540

ggaaggtcca ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg gagtgtaggc ggttggttaa

600

gcgtgttgtg aaatgtagat gctcaacatc tgacttgcag cgcgaactgg ctgacttgag

660

tacacacaac gtaggcggaa ttcatggtgt agcggtgaaa tgcttagata tcatgaagaa

720

ctccgattgc gaaggcagct tacgggagtg ttactgacgc ttaagctcga aggtgcgggt

780

atcgaacagg attagatacc ctggtagtcc gcacagtaaa cgatggatgc ccgctgttag

840

cacctggtgt tagcggctaa gcgaaagcat taagcatccc acctggggag tacgccggca

900

acggtgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat

960

tcgatgatac gcgaggaacc ttacccgggc ttgaattgta ggagcacgat acagagatgt

1020

tgaggtcctt cgggactcct atgaaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag

1080

gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa cccctttcct tagttgccat caggtaatgc

1140

tgggcactct gaggatactg ccaccgtaag gtgtgaggaa ggtggggatg acgtcaaatc

1200

agcacggccc ttacgtccgg ggctacacac gtgttacaat ggccggtaca gaatgttggt

1260

tgcatgtaaa tgtaatctaa tctttaaagc cggtcccagt tcggactgag gtctgcaacc

1320

cgacctcacg aagctggatt cgctagtaat cgcgcatcag ccatggcgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaag ccatgaaagc cgggggtgcc tgaagttcgt

1440

aaccgcaagg agcgacctag ggcaaaactg gtaattgggg ctaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtaccggaa ggtgcggctg gaacacctcc tttct

1535

<210> 1495

<211> 1310

<212> DNA

<213> Prevotella genomosp. C1

<400> 1495

gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgcgg gaccggcgca cgggtgagta

60

acgcgtatcc aacctgccct tcaccacggg ataacccggc gaaagtcgga ctaataccgt

120

atgttgaaag gcggtgaggg atggggatgc gtccgattag cttgacggcg gggtaacggc

180

ccaccgtggc gacgatcggt aggggttctg agaggaaggt cccccacact ggaactgaga

240

cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat tggtcaatgg gcggaagcct

300

gaaccagcca agtagcgtgc aggatgacgg cctatgggtt gtaaactgct tttatgcggg

360

gatatgcagg taccgcatga ataaggaccg gctaattccg tgccagcagc cgcggtaata

420

cggaaggtcc gggcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggagcgtagg ccgcccctta

480

agcgtgttgt gaaatgcggg tgctcaacat ccgacttgca gcgcgaactg gggggcttga

540

gtgcgccgaa agtaggcgga attcgtggtg tagcggtgaa atgcttagat atcacgaaga

600

actccgattg cgaaggcagc ttactgtagt gactgacgct gatgctcgaa agcgtgggta

660

tcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgcggtaaac gatggatgct cgttgtcggc

720

cggtcggtga ccaagcgaaa gcgttaagca tcccacctgg ggagtacgcc ggcaacggtg

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggagga acatgtggtt taattcgatg

840

atacgcgagg aaccttaccc gggcttgaac tgcggaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgccgtga ggtgtcggct taagtgccat aacgagcgca acccccgtct tcagttgcca

960

tcggccgggc actctggaga tactgccacc gcaaggtgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

aatcagcacg gcccttacgt ccggggctac acacgtgtta caatggcgca cagagagtcg

1080

gtggcatgcg agtgccatcc aatcctttgc gtctcagttc ggatggggtc tgcaacccga

1140

ccccagaagc tggattcgct agtaatcgcg catcagccat ggcgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcaagccat gaaagccggg ggcgcctgaa gtccgtgtcg

1260

gcctagggtg aaaccggtga ttggggctaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1310

<210> 1496

<211> 1318

<212> DNA

<213> Prevotella genomosp. C2

<400> 1496

gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg gaccggcgca cgggtgagta

60

acgcgtatcc aaccttccca taactaagga ataccccgta gaaatgcggc ctaatccctt

120

atggttaaag tcggttatgg atggggatgc gtctgattag cttgctggcg gggtaacggc

180

ccaccagggc atcgatcagt aggggttctg agaggaaggt cccccacatt ggaactgaga

240

cacggtccaa actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct

300

gaaccagcca agtagcgtgc aggatgacgg cctatgggtt gtaaactgct ttttaagggg

360

aatatgcatg tacccttaga ataaggaccg gctaattccg tgccagcagc cgcggtaata

420

cggaaggtcc aggtgttatc cggatttatt gggtttaaag ggagcgtagg ccgcaggtta

480

agtgtgttgt gaaaagcagt cgcccaacgt ctgccttgca gcgcaaactg tcctgcttga

540

gtgcgcacaa cgcaggcgga atccgtcgtg tagcggtgaa atgcttagat atgacgaaga

600

actccgattg cgaaggcagc ttgcgggagc gactgacgct gaagctcgaa agtgcgggta

660

tcgaacagga ttagataccc tggtagtccg cacggtaaac gctggatgcc cgtttttggc

720

tagtcagaga ccaagcgaaa gcattaagca tcccacctgg ggagtacgcc ggcaacggtg

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggagga acatgtggtt taattcgatg

840

atacgcgagg aaccttaccc gggcttgaat tgtgaaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgccgtga ggtgtcggct taagtgccat aacgagcgca acccctttct tcagttgcca

960

tcggccgggc actctgtaga tactgccgcc gtaaggtgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

aatcagcacg gcccttacgt ccggggctac acacgtgtta caatgggggg cagcgagcgg

1080

gatgccgcaa ggtcattcaa atcaaccccc ctcagttcgg atggggtctg caacccgacc

1140

ccagaagctg gattcgctag taatcgcgca tcagccatgg cgcggtgaat acgttcccgg

1200

gccttgtaca caccgcccgt caagccatga aagccggggg tgcctgaagt ccgttcggcc

1260

tagggcaaaa ctggtaattg gggctaagtc gtaacaaggt agccgtaccg gaaggtgc

1318

<210> 1497

<211> 1286

<212> DNA

<213> Prevotella genomosp. P7 oral clone MB2_P31

<400> 1497

gatgaacgct ggctacaggc ttaacacatg caagtcgagg gaccggcgca cgggtgagta

60

acgcgtatcc aaccttcccg tcactgcggg ataacctgcc gaaaggcaga ctaataccgc

120

atggctaaag gcggtgacgg acggggatgc gtctgattag ctggttggcg gggcgacggc

180

ccaccaaggc tacgatcagt aggggttctg agaggaaggt cccccacatt ggaactgaga

240

cacggtccaa actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat tggtcaatgg gcgcaagcct

300

gaaccagcca agtagcgtgc aggacgacgg cctatgggtt gtaaactgct tttgtacggg

360

gatatgcagg taccgtacga ataaggaccg gctaattccg tgccagcagc cgcggtaata

420

cggaaggtcc gggcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggagcgtagg ccggggatta

480

agtgtgttgt gaaatgtaga cgctcaacgt ctgacttgca gcgcatactg gttcccttga

540

gtacgcacaa cgttggcgga attcgtcgtg tagcggtgaa atgcttagat atgacgaaga

600

actccgattg cgaaggcagc tgacgggggc gactgacgct taagctcgaa ggtgcgggta

660

tcgaacagga ttagataccc tgctagtccg cacggtaaac gatggatgcc cgctgttggt

720

atatcagcgg ctaagcgaaa gcattaagca tcccacctgg ggagtacgcc ggcaacggtg

780

gaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggagga acatgtggtt taattcgatg

840

atacgcgagg aaccttaccc gggcttgaat tgtgaaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgccgtga ggtgtcggct taagtgccat aacgagcgca acccctctct tcagttgcca

960

tcagctgggc actctggaga cactgccacc gtaaggtgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

aatcagcacg gcccttacgt ccggggctac acacgtgtta caatggccgg cagagggacg

1080

gtgcaacgca agttgcatcc aatcttgccg gtcccagttc ggatggggtc tgcaacccga

1140

ccccagaagc tggattcgct agtaatcgcg catcagccat ggcgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcaagccat gaaagccggg ggtgcctgaa gtccgttcgg

1260

cctagggcaa aactggtgat tggggc

1286

<210> 1498

<211> 1287

<212> DNA

<213> Prevotella genomosp. P8 oral clone MB3_P13

<400> 1498

gatgaacgct ggctacaggc ttaacacatg caagtcgagg gaccggcgaa tgggtgagta

60

acgcgtatcc aacctgcccc cggccggggt ataacccgtc gaaaggcggc ctaatccccc

120

atgccgaaag ccggccgggg atggggatgc gtccgattag cttgctggcg gggtaacggc

180

ccaccagggc ttcgatcggt aggggttctg agaggaaggt cccccacact ggtactgaga

240

cacggaccag actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat tggtcaatgg gcgcaagcct

300

gaaccagcca agtagcgtgc gggatgaagg cctatgggtc gtaaaccgct ttttcacggg

360

gatatgcagg taccgtgcga ataaggaccg gctaattccg tgccagcggc cgcggtaata

420

cggaaggtcc tggcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggagcgcagg ccgcccctta

480

agcgtgttgt gaaaaccggg cgcccaacgc ccggcgtgca gcgcgaactg gggggcttga

540

gtgcgcgcga cgccggcgga attcgtcgtg tagcggtgaa atgcttagat atgacgagga

600

accccgattg cgaaggcagc cggcgagggc gactgacgct gatgctcgaa ggcgcgggta

660

tcgaacagga ttagatacca tggtagtccg cgctgtaaac gatggatgcc cgccgccggc

720

atgtcggcgg ccaagcgaaa gcgttaagca tcccacctgg ggagtacgcc ggcaacggtg

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggagga acatgtggtt taattcgatg

840

atacgcgagg aaccttaccc gggcttgaac tgcggaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgccgtga ggtgtcggct caagtgccat aacgagcgca acccctctcc gcagttgcca

960

tcggccgggc actctgcgga cactgccgcc gcaaggtgga ggaaggtggg gacgacgtca

1020

aatcagcacg gcccttacgt ccggggctac acacgtgtta caatggccgg cagagagccg

1080

tccgggcgcg agcccggtcc aatccctccg gcctcagttc ggatggggtc tgcaacccga

1140

ccccagaagc tggattcgct agtaatcgcg catcagccat ggcgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcaagccat gaaagccggg ggcgcctgaa gtccgtgtcg

1260

gcctagggcg ataccggtga ttggggc

1287

<210> 1499

<211> 1282

<212> DNA

<213> Prevotella genomosp. P9 oral clone MB7_G16

<400> 1499

gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg gaccggcgca cgggtgagta

60

acgcgtatcc aaccttcccg ctgcaggggg ataacccggt gaaagccgga ctaatacccc

120

ataatcaaag cggcagcgga tggggatgcg tccgattagt tagttggtga ggtaacggct

180

caccaaggct ttgatcggta ggggttctga gaggaaggcc ccccacattg ggactgagac

240

acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt ggtcaatggg cgcaagcctg

300

aaccagccaa gtagcgtgga ggacgactgc ctatgggttg taaactcctt ttatgcgggg

360

atatgcaggt accgcatgaa taaggaccgg ctaattccgt gccagcagcc gcggtaatac

420

ggaaggtccg ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg gagcgcagac tgcttgtcaa

480

gcgtgcagtg aaacgccgtg gcccaaccac ggtcctgctg cgcgaactgg cttgcttgag

540

tgggaggtac gcggaattcg tggtgtagcg gtgaaatgct tagatatcac gaggaactcc

600

gattgtgaag gcagcgtacc atatccactg acgtttaggc tcgaaggtgc gggtatcgaa

660

caggattaga taccctggta gtccgcacag taaaccatgg atgctcgctg tcggcgtgcc

720

ggtggcctag cgaaagcgtt aagcatccca cctggggagt acgccggcaa cggtgaaact

780

caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gaggaacatg tggtttaatt cgatgatacg

840

cgaggaacct tacccgggct tgaattgtga aggtgctgca tggttgtcgt cagctcgtgc

900

cgtgaggtgt cggcttaagt gccataacga gcgcaacccc tctgcgtagt tgccatcggc

960

cgggcactct gcgcacactg ccaccgcaag gtggaggaag gtggggatga cgtcaaatca

1020

gcacggccct tacgtccggg gctacacacg tgttacaatg gcaggcagcg agtcgggagc

1080

atgcaaatgt tctccaatcc cccctgcctc agttcggatg gggtctgcaa cccgacccca

1140

gaagctggat ccgctagtaa tcgcgcatca gccatggcgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1200

ttgtacacac cgcccgtcaa gccatgaaag ccgggggcgc ctgaagtccg tgtcggccta

1260

gggcgagacc ggtgattggg gc

1282

<210> 1500

<211> 1502

<212> DNA

<213> Prevotella heparinolytica

<400> 1500

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc aagtcgaggg

60

gcagcatggg cttagcttgc taagcccgat ggcgaccggc gcacgggtga gtaacacgta

120

tccaaccttc cggtaactcc ggtatagcct ttcgaaagaa agattaatcc cggatagtat

180

ggtgattccg catggtttct ccattaaagg attccggtta ccgatgggga tgcgttccat

240

taggcagttg gcggggtaac ggcccaccaa acctacgatg gataggggtt ctgagaggaa

300

ggtcccccac attggaactg agacacggtc caaactccta cgggaggcag cagtgaggaa

360

tattggtcaa tgggcggaag cctgaaccag ccaagtagcg tgaaggatga ctgccctatg

420

ggttgtaaac ttcttttata agggaataat tgtgggtacg cgtacccatt tgcatgtacc

480

ttatgaataa ggatcggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga ggatccgagc

540

gttatccgga tttattgggt ttaaagggag cgtaggcggg cgcttaagtc agctgtgaaa

600

gtttggggct caaccttaaa attgcagttg atactgggtg ccttgagtgc agtataggca

660

ggcggaattc gtggtgtagc ggtgaaatgc ttagatatca cgaagaactc ctattgcgaa

720

ggcagcttgc tggagtgtaa ctgacgctga tgctcgaaag tgtgggtatc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtccaca cagtaaacga tgaatactcg ctgtttgcga tatactgcaa

840

gcggccaagc gaaagcgtta agtattccac ctggggagta cgccggcaac ggtgaaactc

900

aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg aggaacatgt ggtttaattc gatgatacgc

960

gaggaacctt acccgggctt gaattgcaac cgaattatcc ggaaacgggt aagccgcaag

1020

gcggttgtga aggtgctgca tggttgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt cggcttaagt

1080

gccataacga gcgcaaccct tatccacagt taccatcagg tgatgctggg gactctgtgg

1140

agactgccgt cgtaagatgc gaggaagggg gggatgacgt caaatcagca cggcccttac

1200

gtccggggct acacacgtgt tacaatgggg ggtacagcag gcagctcggc ggcgacgccc

1260

ggccaatccc taaatcccct ctcagttcgg actggagtct gcaacccgac tccacgaagc

1320

tggattcgct agtaatcgcg catcagccac ggcgcggtga atacgttccc gggccttgta

1380

cacaccgccc gtcaagccat gaaagccggg ggtacctgaa gtgcgtaacc gtccaggagc

1440

gccctagggt aaaaccggtg attggggcta agtcgtaaca aggtagccgt accggaaggt

1500

gc

1502

<210> 1501

<211> 1266

<212> DNA

<213> Prevotella histicola

<400> 1501

ggctcaggat gaacgctagc tacaggctta acacatgcaa gtcgagggac cggcgcacgg

60

gtgagtaacg cgtatccaac cttcccatga ctaagggata acctgccgaa aggcagacta

120

ataccttatr gttaaagtcg gttatggatg gggatgcgtc tgattagctt gttggcgggg

180

taacggccca ccaaggcrac gatcagtagg ggttctgaga ggaaggtccc ccacattgga

240

actgagacac ggtccaaact cctacgggag gcagcagtga ggaatattgg tcaatgggcg

300

agagcctgaa ccagccaagt agcgtgcagg atgacggcct atgggttgta aactgctttt

360

gtatggggat atgcaggtac catacgaata aggaccggct aattccgtgc cagcagccgc

420

ggtaatacgg aaggtccggg cgttatccgg atttattggg tttaaaggga gcgtaggctg

480

gagattaagt gtgttgtgaa atgtagacgc tcaacgtctg acttgcagcg catactggtt

540

tccttgagta cgcacaacgt tggcggaatt cgtcgtgtag cggtgaaatg cttagatatg

600

acgaagaact ccgattgcga aggcagctga cgggagcgac tgacgctgaa gctcgaaggt

660

gcgggtatcg aacaggatta gataccctgg tagtccgcac agtaaacgat ggatgcccgc

720

tgttggtata tcagcggcta agcgaaagca ttaagcatcc cacctgggga gtacgccggc

780

aacggtgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggaggaaca tgtggtttaa

840

ttcgatgata cgcgaggaac cttacccggg cttgaattgt gaaggtgctg catggttgtc

900

gtcagctcgt gccgtgaggt gtcggcttaa gtgccataac gagcgcaacc cctgtcttta

960

gttgccatca gctgggcact ctggagatac tgccaccgta aggtggagga aggtggggat

1020

gacgtcaaat cagcacggcc cttacgtccg gggctacaca cgtgttacaa tggccggcag

1080

agggacggtg taatgtaaat tgcatccaat cttgccggtc ccagttcgga tggggtctgc

1140

aacccgaccc cagaagctgg attcgctagt aatcgcgcat cagccatggc gcggtgaata

1200

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc aagccatgaa agccgggggt gcctgaagtc

1260

cgtacc

1266

<210> 1502

<211> 1364

<212> DNA

<213> Prevotella intermedia

<400> 1502

gatgaacgct agctataggc ttaacacatg caagtcgagg ggaaacggca ttatgtgctt

60

gcacattctg gacgtcgacc ggcgcacggg tgagtatcgc gtatccaacc ttccctccac

120

tcggggatac cccgttgaaa gacggcctaa tacccgatgt tgtccacata tggcatctga

180

cgtggaccaa agattcatcg gtggaggatg gggatgcgtc tgattagctt gttggtgcgg

240

gtaacggccc accaaggcga cgatcagtag gggttctgag aggaaggtcc cccacattgg

300

aactgagaca cggtccaaac tcctacggga ggcagcagtg aggaatattg gtcaatggac

360

ggaagtctga accagccaag tagcgtgcag gattgacggc cctatgggtt gtaaactgct

420

tttgttgggg agtaaagtgg ggcacgcgtg cccttttgca tttacccttc gaataaggac

480

cggctaattc cgtgccagca gccgcggtaa tacggaaggt ccaggcgtta tccggattta

540

ttgggtttaa agggagtgta ggcggtctgt taagcgtgtt gtgaaattta ggtgctcaac

600

atctaacttg cagcgcgaac tggcggactt gagtgcacgc aacgtatgcg gaattcatgg

660

tgtagcggtg aaatgcttag atatcatgac gaactccgat tgcgaaggca gcgtacggga

720

gtgttactga cgcttaagct cgaaggtgcg ggtatcgaac aggattagat accctggtag

780

tccgcacggt aaacgatgga tgcccgctgt tagcgcctgg cgttagcggc taagcgaaag

840

cattaagcat cccacctggg gagtacgccg gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg

900

ggcccgcaca agcggaggaa catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttacccg

960

ggcttgaatt gcagacgcag gatacagaga tgttgactcc cttcggggcg tctgtgaagg

1020

tgctgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgccgt gaggtgtcgg cttaagtgcc ataacgagcg

1080

caaccccttt ccttagttgc catcaggtga tgctgggcac tctggggata ctgccaccgc

1140

aaggtgtgag gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg cccttacgtc cggggctaca

1200

cacgtgttac aatggccggt acagagggac ggtgcgatgc aaatcgcatc caatcttgaa

1260

agccggtccc agttcggact gaggtctgca acccgacctc acgaagctgg attcgctagt

1320

aatcgcgcat cagccatggc gcggtgaata cgttcccggg cctt

1364

<210> 1503

<211> 1200

<212> DNA

<213> Prevotella loescheii

<400> 1503

taacgcgtat ccaacctgcc cttcaccacg ggataacccg gcgaaagtcg gactaatacc

60

gtatgttgaa agcggtgarg gatggggatg cgtccgatta gctkgacggc ggggtaacgg

120

cccaccgtgg ctacgatcgg taggggttct gagaggaagg tcccccacac tggaactgag

180

acacggtcca gactcctacg ggaggcagca gtgaggaata ttggtcaatg ggcgtaagcc

240

tgaaccagcc aagtagcgtg caggatgacg gcctatgggt tgtaaactgc ttttatgcgg

300

ggatatgcag gtaccgcatg aataaggacc ggctaattcc gtgccagcag ccgcggtaat

360

acggaaggtc cgggcgttat ccggatttat tgggtttaaa gggagcgtag gccgcgcctt

420

aagcgtgttg tgaaatccgg gtgctcaaca tccggcttgc agcgcgaact ggggcgcttg

480

agtgcgcwga aagtaggcgg aattcgtggt gtagcggtga aatgcttaga tatcacgagg

540

aactccgatt gcgaaggcag cctactgtag cgactgacgc tgatgctcga aagcgtgggt

600

atcgaacagg attagatacc ctggtagtcc acgcggtaaa cgatggatgc tcgttgtcgg

660

ccggtcggtg accaagcgaa agcgttaagc atcccacctg gggagtacgc cggcaacggt

720

gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggagg aacatgtggt ttaattcgat

780

gatacgcgag gaaccttacc cgggcttgaa ctgcggaggt gctgcatggt tgtcgtcagc

840

tcgtgccgtg aggtgtcggc ttaagtgcca taacgagcgc aacccccgtc ttcagttgcc

900

atcggccggg cactctggag atactgccac cgcaaggtgg aggaaggtgg ggatgacgtc

960

aaatcagcac ggcccttacg tccggggcta cacacgtgtt acaatggcgc acagagagtc

1020

ggtggcatgc gaatgccatc caatcctctg cgtctcagtt cggatggggt ctgcaacccg

1080

accccagaag ctggattcgc tagtaatcgc gcatcagcca tggcgcggtg aatacgttcc

1140

cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagcca tgaaagccgg gggcgcctga agtccgtacc

1200

<210> 1504

<211> 1520

<212> DNA

<213> Prevotella maculosa

<400> 1504

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg

60

ggaaacgatg agagagcttg ctctcttagg tgtcgaccgg cgcacgggtg agtaacgcgt

120

atccaacctg cctctgacca agggataacc cgtcgaaagt cggactaata ccttatgcag

180

tcgtcggaag tcatctgatg acgacgaaag atttcatcgg tgagggatgg ggatgcgtct

240

gattagcttg ttggcggggt aacggcccac caaggcaacg atcagtaggg gttctgagag

300

gaaggtcccc cacattggaa ctgagacacg gtccaaactc ctacgggagg cagcagtgag

360

gaatattggt caatgggcgc gagcctgaac cagccaagta gcgtgcagga tgacggccct

420

atgggttgta aactgctttt atgcggggat aaagtgaggg acgtgtcctt cattgcaggt

480

accgcatgaa taaggaccgg ctaattccgt gccagcagcc gcggtaatac ggaaggtccg

540

ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg gagcgtaggc cgtggattaa gcgtgttgtg

600

aaatgtagac gctcaacgtc tgacttgcag cgcgaactgg tccacttgag tgtgcacaac

660

gcaggcggaa ttcgtcgtgt agcggtgaaa tgcttagata tgacgaagaa ccccgattgc

720

gaaggcagct tgcgggagca cgactgacgc tgaagctcga aagtgcgggt atcgaacagg

780

attagatacc ctggtagtcc gcacggtaaa cgatggatgc ccgttgtcag gctgtatcag

840

tctggtgacc aagcgaaagc attaagcatc ccacctgggg agtacgccgg caacggtgaa

900

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggaggaac atgtggttta attcgatgat

960

acgcgaggaa ccttacccgg gcttgaattg cagacgaacg attcagagat gaagaggccc

1020

ttcggggcgt ctgtgaaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgtcggc

1080

ttaagtgcca taacgagcgc aacccctatt ctcggttgcc atcgggtaat gccgggcact

1140

ccgtggagac tgccaccgta aggtgtgagg aaggtgggga cgacgtcaaa tcagcacggc

1200

ccttacgtcc ggggctacac acgtgttaca atggccggta cagcgagtcg gccgcatgca

1260

aatgcggtcc aatcctgaaa gccggtccca gttcggaccg gggtctgcaa cccgaccccg

1320

cgaagccgga ttcgctagta atcgcgcatc agccatggcg cggtgaatac gttcccgggc

1380

cttgtacaca ccgcccgtca agccatgaaa gccgggggtg cctgaagtcc gttaccgcga

1440

gggtcggcct aaggcaaaac cggtgattgg ggctaagtcg taacaaggta gccgtaccgg

1500

aaggtgcggc tggaacacct

1520

<210> 1505

<211> 1534

<212> DNA

<213> Prevotella marshii

<400> 1505

ttacaatgta gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc

60

aagtcgcggg gcagcatggg gattgcttgc aatctctgat ggcgaccggc gcacgggtga

120

gtaacacgta tccaacctgc ctattaccac ggtataaccc gatgaaagtc ggcctaatcc

180

cgtatgtagt cttccaatgg catcagcagt agacgaaagg tttagcggta atggatgggg

240

atgcgtccga ttagctagtc ggtgaggtaa cggctcaccg aggcaacgat cggtaggggt

300

tctgagagga aggtccccca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca

360

gcagtgagga atattggtca atgggcgaga gcctgaacca gccaagtagc gtgcaggatg

420

acggccttat gggttgtaaa ctgcttttat gcgaggataa agttacccac gtgtgggtgt

480

ttgcaggtat cgcatgaata aggaccggct aattccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

aaggttctgg cgttatccgg atttattggg tttaaaggga gcgtaggctg ttttttaagc

600

gtgttgtgaa atgtaccggc tcaaccggtg atgtgcagcg cgaactggaa gacttgagtg

660

tgttgtaagt aggcggaatt cgtggtgtag cggtgaaatg cttagatatc acgaggaact

720

ccgattgcgt aggcagctta ctgtctcact actgacgctg atgctcgaaa gcgcgggtat

780

cgaacaggat tagataccct ggtagtccgc gcggtaaacg atggatgctc gttgttggta

840

tatatatatc agtgacttag cgaaagcgtt aagcatccca cctggggagt acgccggcaa

900

cggtgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gaggaacatg tggtttaatt

960

cgatgatacg cgaggaacct tacccgggct tgaactgccg gcgaacgatt cagagatgat

1020

gaggcctttc ggggcgccgg tggaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg tgccgtgagg

1080

tgtcggctta agtgccataa cgagcgcaac ccctttttat agttgccatc gggtaatgcc

1140

gggcactctg tagatactgc caccgtaagg tgtgaggaag gtggggatga cgtcaaatca

1200

gcacggccct tacgtccggg gctacacacg tgttacaatg gcgcatacag agagttggtt

1260

gtatgtaaat acggtctaat cttgaaagtg cgtctcagtt cggactgggg tctgcaaccc

1320

gaccccacga agctggattc gctagtaatc gcgcatcagc catggcgcgg tgaatacgtt

1380

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcaagc catgaaagcc gggggcgcct gaagtccgtg

1440

accgcgaggg tcggcctagg gtgaaaccgg tgattggggc taagtcgtaa caaggtagcc

1500

gtaccggaag gtgcggctgg aacacctcct ttct

1534

<210> 1506

<211> 1535

<212> DNA

<213> Prevotella melaninogenica

<400> 1506

ttacaatgga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc

60

aagttgaggg gaaacggcat tgagtgcttg cactctttgg acgtcgaccg gcgcacgggt

120

gagtaacgcg tatccaacct tcccattact gtgggataac ctgccgaaag gcagactaat

180

accgcatagt cttcgatgac ggcatcagat ttgaagtaaa gatttatcgg taatggatgg

240

ggatgcgtct gattagcttg ttggcggggt aacggcccac caaggcaacg atcagtaggg

300

gttctgagag gaaggtcccc cacattggaa ctgagacacg gtccaaactc ctacgggagg

360

cagcagtgag gaatattggt caatggacgg aagtctgaac cagccaagta gcgtgcagga

420

tgacggccct atgggttgta aactgctttt gtatggggat aaagttaggg acgtgtccct

480

atttgcaggt accatacgaa taaggaccgg ctaattccgt gccagcagcc gcggtaatac

540

ggaaggtcca ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg gagcgtaggc tggagattaa

600

gtgtgttgtg aaatgtagac gctcaacgtc tgaattgcag cgcatactgg tttccttgag

660

tacgcacaac gttggcggaa ttcgtcgtgt agcggtgaaa tgcttagata tgacgaagaa

720

ctccgattgc gaaggcagct gacgggagcg caactgacgc ttaagctcga aggtgcgggt

780

atcaaacagg attagatacc ctggtagtcc gcacagtaaa cgatggatgc ccgctgttgg

840

tacctggtat cagcggctaa gcgaaagcat taagcatccc acctggggag tacgccggca

900

acggtgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat

960

tcgatgatac gcgaggaacc ttacccgggc ttgaattgca gaggaaggat ttagagataa

1020

tgacgccctt cggggtctct gtgaaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag

1080

gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa cccctctctt cagttgccat caggttaagc

1140

tgggcactct ggagacactg ccaccgtaag gtgtgaggaa ggtggggatg acgtcaaatc

1200

agcacggccc ttacgtccgg ggctacacac gtgttacaat ggccggtaca gagggacggt

1260

gtaatgcaaa ttgcatccaa tcttgaaagc cggtcccagt tcggactggg gtctgcaacc

1320

cgaccccacg aagctggatt cgctagtaat cgcgcatcag ccatggcgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaag ccatgaaagc cgggggtgcc tgaagtccgt

1440

gaccgcaagg atcggcctag ggcaaaactg gtgattgggg ctaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtaccggaa ggtgcggctg gaacacctcc tttct

1535

<210> 1507

<211> 1517

<212> DNA

<213> Prevotella micans

<400> 1507

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg

60

ggcagcataa ttattgcttg caataattga tggcgaccgg cgcacgggtg agtatcgcgt

120

atccaacttt cccataacta ggggataatc cgtcgaaagg cggtctaata ctctatgttg

180

tctatttatg gcctcatatt tagacgaaag atttatcggt tatggttagg gatgcgtccg

240

attaggtagt aggcggggta atagcccacc tagcctacga tcggtagggg ttctgcgagg

300

aaggtccccc acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc agcagtgagg

360

aatattggtc aatggacgcg agtctgaacc agccaagtag cgtgcaggat gacggcccta

420

tgggttgtaa actgctttta tgcgggaata aagtgattta cgtgtatatc attgcatgta

480

ccgcatgaat aaggaccggc taattccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaaggttcgg

540

gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgtaggct gaatattaag cgtgttgtga

600

aatgtagttg ctcaacatct gcactgcagc gcgaactggt attcttgagt gtgcgcgacg

660

taggcggaat tcgtggtgta gcggtgaaat gcttagatat cacgaagaac tccgattgcg

720

aaggcagctt acgagagcac aactgacgct taagctcgaa ggtgcgggta tcgaacagga

780

ttagataccc tggtagtccg cacagtaaac gatggatgcc cgctattgga cttttagttc

840

agtggctaag cgaaagcgtt aagcatccca cctggggagt acgccggcaa cggtgaaact

900

caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gaggaacatg tggtttaatt cgatgatacg

960

cgaggaacct tacccgggct tgaactgccg gtgaacgata cagagatgtt gaggcccttc

1020

ggggcgccgg tggaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg tgccgtgagg tgtcggctta

1080

agtgccataa cgagcgcaac cccattttct agttgccatc gggtaatgcc gggcactctg

1140

gagatactgc caccgtaagg tgtgaggaag gttgggatga cgtcaaatca gcacggccct

1200

tacgtccggg gctacacacg tgttacaatg gcgcatacag agtgtcggtt gtatgtaaat

1260

gcaatccaat cttgaaagtg cgtctcagtt cggactgggg tctgcaaccc gaccccacga

1320

agctggattc gctagtaatc gcgcatcagc catggcgcgg tgaatacgtt cccgggcctt

1380

gtacacaccg cccgtcaagc catgaaagcc gggggtgcct gaagtccgtg accgcaaggg

1440

tcggcctagg gcaaaaccgg tgattggggc taagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag

1500

gtgcggctgg aacacct

1517

<210> 1508

<211> 1537

<212> DNA

<213> Prevotella multiformis

<400> 1508

ttacagtgga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gctacaggct taacacatgc

60

aagtcgaggg gaaacggcgt tgagtgctcg cactcttcgg acgtcgaccg gcgcacgggt

120

gagtaacgcg tatccaacct tcccgtcact gcgggataac ctgccgaaag gcagactaat

180

accgcatggc cttcactgac ggcatcagag gtgaagtaaa gctttttagc ggtgacggac

240

ggggatgcgt ctgattagct ggttggcggg gcgacggccc accaaggcta cgatcagtag

300

gggttctgag aggaaggtcc cccacattgg aactgagaca cggtccaaac tcctacggga

360

ggcagcagtg aggaatattg gtcaatgggc ggaagcctga accagccaag tagcgtgcag

420

gaggacggcc ctacgggttg taaactgctt ttatgcgggg ataaagtgag ggacgcgtcc

480

ctttttgcag gtaccgcatg aataaggacc ggctaattcc gtgccagcag ccgcggtaat

540

acggaaggtc cgggcgttat ccggatttat tgggtttaaa gggagcgtag gccggggatt

600

aagtgtgttg tgaaatgtag gcgctcaacg tctgatgtgc agcgcatact ggttcccttg

660

agtacgcgca acgccggcgg aattcgtcgt gtagcggtga aatgcttaga tatgacgaag

720

aaccccgatt gcgaaggcag ccggcgggag cgcaactgac gctgaagctc gaaggtgcgg

780

gtatcgaaca ggattagata ccctggtagt ccgcacggta aacgatggat gcccgctctc

840

ggcgcctggc gccgggggcc aagcgaaagc gttaagcatc ccacctgggg agtacgccgg

900

caacggtgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggaggaac atgtggttta

960

attcgatgat acgcgaggaa ccttacccgg gcttgaattg caggagaacg atacagagat

1020

gttgaggtcc ttcgggactc ctgcgaaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg

1080

aggtgtcggc tcaagtgcca taacgagcgc aacccctctc cccagttgcc atcgggttat

1140

gccgggcact ccggggacac tgccgccgca aggtgcgagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1200

tcagcacggc ccttacgtcc ggggctacac acgtgttaca atggccggta cagagggctg

1260

gcgctccgcg aggcgcgccg aatctataaa gccggtctca gttcggactg gggtctgcaa

1320

cccgacccca cgaagctgga ttcgctagta atcgcgcatc agccacggcg cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca agccatgaaa gccgggggtg cctgaagtcc

1440

gtgaccgcga ggatcggcct agggcaaaac tggtgattgg ggctaagtcg taacaaggta

1500

gccgtaccgg aaggtgcggc tggaacacct cctttct

1537

<210> 1509

<211> 1516

<212> DNA

<213> Prevotella multisaccharivorax

<400> 1509

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agctacaggc ctaacacatg caagtcgagg

60

ggaaacgaag cgggagcttg cttctgctgt cgtcgaccgg cgcacgggtg agtaacgcgt

120

atccaacctg gcctgaggta agggataatc cgcagaaatg tggtctaata ccttatgtgc

180

tcctatgagg tcatctgaag aggagcaaag atttatcgcc ttaggatggg gatgcgtctg

240

attagatagt tggcggggca acggcccacc aagtcatcga tcagtagggg ttctgagagg

300

aaagtccccc acattggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgagg

360

aatattggtc aatgggcgag agcctgaacc agccaagtag cgtgcaggat gacggcccta

420

tgggttgtaa actgctttta tgcgggtata aaggagcata cgtgtatgtt tttgcagtta

480

ccgcatgaat aaggaccggc taattccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaaggttctg

540

gtgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgcaggct gtcagataag cgtgttgtga

600

aatgcggttg ctcaacatcc gcactgcagc gcgaactgtt tgacttgagt acgcacgacg

660

ttggtggaat ttgccgtgta gcggtgaaat gcttagatat ggcgaagaac tccgattgcg

720

aaggcagctg acgggagcgc tactgacgct catgctcgaa agtgcgggta tcgaacagga

780

ttagataccc tggtagtccg cacggtaaac gctggatgcc cgctatatgc ccctttaggg

840

tatgtggcca agtgaaaacg ttaagcatcc cacctgggga gtacgccggc aacggtgaaa

900

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggaggaaca tgtggtttaa ttcgatgata

960

cgcgaggaac cttacccggg cttgaattgc tgaggaaggc ttcagagatg gagctgccct

1020

tcggggcttc agtgaaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct cgtgccgtga ggtgtcggct

1080

taagtgccat aacgagcgca acccttttct tcagttgcca tcaggtagtg ctgggccctc

1140

tggagatact gccgccgtaa ggtgtgagga aggtggggat gacgtcaaat cagcacggcc

1200

cttacgtccg gggctacaca cgtgttacaa tgggtggtac agcgagcagg gttaccgcaa

1260

ggtatcccga atcattaaat ccgccctcag ttcggactgg ggtctgcaac ccgaccccac

1320

gaagctggat tcgctagtaa tcgcgcatca gccatggcgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1380

ttgtacacac cgcccgtcaa gccatgaaag ccggggggtg cctgaagtcc gtgaccgcaa

1440

ggatcggcct agggcaaaaa cttgggtaat tgggggctaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1500

ccggaaggtg cggctg

1516

<210> 1510

<211> 1268

<212> DNA

<213> Prevotella nanceiensis

<400> 1510

ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc aagtcgaggg accggcgcac

60

gggtgagtaa cgcgtatcca acctacccaa tactcaggca taacccgttg aaagacggac

120

taattcctga tggttaaagt cggtattgga tggggatgcg tctgattagt ttgttggtga

180

ggtaacggct caccaagact tcgatcagta ggggttctga gaggaaggtc ccccacattg

240

gaactgagac acggtccaaa ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt ggtcaatgga

300

tggaaatctg aaccagccaa gtagcgtgca ggatgacggc ctatgggttg taaactgctt

360

ttatgtgaga atatgcatgt atcacatgaa taaggaccgg ctaattccgt gccagcagcc

420

gcggtaatac ggaaggtcca ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg gtgcgtaggc

480

cgtttgataa gcgtgctgtg aaatatagtg gctcaacctc tatcgtgcag cgcgaactgt

540

tgaacttgag tgcgtagtag gtaggcggaa ttcgtggtgt agcggtgaaa tgcttagata

600

tcacgaagaa ctccgattgc gaaggcagct taccgtaacg actgacgctt aagcacgaag

660

gtgcgggtat cgaacaggat tagataccct ggtagtccgc acagtaaacg atggatgctc

720

gctgttggcc ggtcagtggc ttagcgaaag cgttaagcat cccacctggg gagtacgccg

780

gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa catgtggttt

840

aattcgatga tacgcgagga accttacccg ggcttgaact gtggaggtgc tgcatggttg

900

tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa ccccttttct

960

tagttgccat cagctgggca ctctgggaat actgccaccg taaggtggag gaaggtgggg

1020

atgacgtcaa atcagcacgg cccttacgtc cggggctaca cacgtgttac aatggcgcac

1080

agagtgttgg tttcatgcaa atgagatcta atcttctgcg tctcagttcg gatggggtct

1140

gcaacccgac cccagaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg gcgcggtgaa

1200

tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg aaagccgggg gcgcctaaag

1260

tccgtacc

1268

<210> 1511

<211> 1520

<212> DNA

<213> Prevotella nigrescens

<400> 1511

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggctacaggc ttaacacatg caagtcgtgg

60

ggaaacggca ttatgtgctt gcacattctg gacgtcgacc ggcgcacggg tgagtatcgc

120

gtatccaacc tgccccttac ttggggatac cccgttgaaa gacggcctaa tacccgatgt

180

gtttcattga cggcatccga tatgaaacaa aggttttccg gtaagggatg gggatgcgtc

240

tgattagcta gttggcgggg caacggccca ccaaggcgac gatcagtagg ggttctgaga

300

ggaaggtccc ccacattgga actgagacac ggtccaaact cctacgggag gcagcagtga

360

ggaatattgg tcaatggacg caagtctgaa ccagccaagt agcgtgcagg atgacggccc

420

tatgggttgt aaactgcttt tatgtgggaa taaattggcg cacgtgtgcg ccattgcatg

480

tacctcatga ataaggaccg gctaattccg tgccagcagc cgcggtaata cggaaggtcc

540

gggcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggagtgtagg cggtctgtta agcgtgttgt

600

gaaatttagg tgctcaacat ttaacttgca gcgcgaactg tcagacttga gtacacgcag

660

cgcaggcgga attcatggtg tagcggtgaa atgcttagat atcatgagga actccgatcg

720

cgaaggcagc ctgcgggagt gttactgacg cttaagctcg aaggtgcggg tatcgaacag

780

gattagatac cctggtagtc cgcactgtaa acgatggatg cccgccgttg gcgccctgcg

840

cctgcggcca agcgaaagca ttaagcatcc cacctgggga gtacgccggc aacggtgaaa

900

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggaggaaca tgtggtttaa ttcgatgata

960

cgcgaggaac cttacccggg cttgaattgc agtcgcagcc cacagagacg tgggcttccc

1020

ttcggggcgt ctgtgaaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgtcggc

1080

ttaagtgcca taacgagcgc aacccccttt cccagttgcc atcgggttat gccgggcact

1140

ctggggacac tgccaccgca aggtgcgagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcagcacggc

1200

ccttacgtcc ggggctacac acgtgttaca atggccggta cagagggacg gtgcaatgca

1260

agttgcatcc aatcttgaaa tccggtccca gttcggactg gggtctgcaa cccgacccca

1320

cgaagctgga ttcgctagta atcgcgcatc agccatggcg cggtgaatac gttcccgggc

1380

cttgtacaca ccgcccgtca agccatgaaa gccgggggtg cctgaagttc gtgaccgcga

1440

ggagcgacct agggcaagac cggtgattgg ggctaagtcg taacaaggta gccgtaccgg

1500

aaggtgcggc tggaacacct

1520

<210> 1512

<211> 1539

<212> DNA

<213> Prevotella oralis

<400> 1512

ttacaatgta gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc

60

aagtcgcggg gcatcatgga ggttgttttc aacttttgat ggcgaccggc gcacgggtga

120

gtaacgcgta tccaaccttc ccattactac ggcatacccc gttgaaaggc ggcctaattc

180

cgtatgcagt ccgaagcagt catctaattt ggacgaaagg tatattctat cggtaatgga

240

tggggatgcg tccgattagc cagccggcgg ggtaacggcc caccggggca tcgatcggta

300

ggggttctga gaggaaggtc ccccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg

360

aggcagcagt gaggaatatt ggtcaatggg cgtaagcctg aaccagccaa gtagcgtgca

420

ggatgacggc cctatgggtt gtaaactgct tttatgcggg gataaagttg gggacgtgtc

480

cctttttgca ggtaccgcat gaataaggac cggctaattc cgtgccagca gccgcggtaa

540

tacggaaggt ccgggcgtta tccggattta ttgggtttaa agggagcgta ggcagttttt

600

taagcgtgct gtgaaatgta ccggctcaac cggtgatgtg cagcgcgaac tgggaatctt

660

gagtacgcag taagcaggcg gaattcgtgg tgtagcggtg aaatgcttag atatcacgaa

720

gaactccgat tgcgtaggca gcttgctgta gcgtaactga cgctgaagct cgaaagtgcg

780

ggtatcgaac aggattagat accctggtag tccgcacggt aaacgatgga tgcccgctgt

840

cggccttttt tggtcggtgg ccaagcgaaa gcgttaagca tcccacctgg ggagtacgcc

900

ggcaacggtg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggagga acatgtggtt

960

taattcgatg atacgcgagg aaccttaccc gggcttgaac tgccattgac ttgaatagag

1020

atattcattc ccttcggggc attggtggag gtgctgcatg gttgtcgtca gctcgtgccg

1080

tgaggtgtcg gcttaagtgc cataacgagc gcaacccctt ttttcagttg ccatcggtta

1140

aagccgggca ctctgtgaat actgccgccg taaggtgtga ggaaggtggg gatgacgtca

1200

aatcagcacg gcccttacgt ccggggctac acacgtgtta caatggcgcg tacagcgagt

1260

cggccgtatg taaatgcggt ccaatcctta aaacgtgcct cagttcggac tggggtctgc

1320

aacccgaccc cacgaagctg gattcgctag taatcgcgca tcagccatgg cgcggtgaat

1380

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt caagccatga aagccggggg tgcctgaagt

1440

ccgtgaccgc aagggtcggc ctaaggcaat actggtaatt ggggctaagt cgtaacaagg

1500

tagccgtacc ggaaggtgcg gctggaacac ctcctttct

1539

<210> 1513

<211> 1536

<212> DNA

<213> Prevotella oris

<400> 1513

ttacaatgga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gctacaggct taacacatgc

60

aagtcgaggg gaaacgacgg ggaagcttgc ttccccgggc gtcgaccggc gcacgggtga

120

gtaacgcgta tccaacctgc ctctgactga gggataaccc gtcgaaagtc ggcctaatac

180

ctcatggcat cgtctgcggg catccaacga cgattaaaga tttcatcggt cagggatggg

240

gatgcgtctg attagcttgt tggcggggta acggcccacc aaggctacga tcagtagggg

300

ttctgagagg aaggtccccc acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc

360

agcagtgagg aatattggtc aatgggcgag agcctgaacc agccaagtag cgtgcaggat

420

gacggcccta tgggttgtaa actgctttta tgcggggata aagtgaggga cgtgtccttc

480

attgcaggta ccgcatgaat aaggaccggc taattccgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

gaaggtccgg gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgtaggcc gtggattaag

600

cgtgttgtga aatgcaggtg ctcaacgtct gcactgcagc gcgaactggt ccacttgagt

660

gtgcgcaacg caggcggaat tcgtcgtgta gcggtgaaat gcttagatat gacgaagaac

720

tccgattgcg aaggcagctt gcgggagcac aactgacgct gaagctcgaa agtgcgggta

780

tcgaacagga ttagataccc tggtagtccg cacggtaaac gatggatgcc cgttgtcagg

840

ctgtttcagc ctggtgacca agcgaaagca ttaagcatcc cacctgggga gtacgccggc

900

aacggtgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggaggaaca tgtggtttaa

960

ttcgatgata cgcgaggaac cttacccggg cttgaattgc agacgaaggc ttcagagatg

1020

aagcggccct tcggggcgtc tgtgaaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct cgtgccgtga

1080

ggtgtcggct taagtgccat aacgagcgca acccctttct tcagttgcca tcaggtgatg

1140

ctgggcactc tggagacact gccaccgcaa ggtgtgagga aggtggggat gacgtcaaat

1200

cagcacggcc cttacgtccg gggctacaca cgtgttacaa tggccggtac agagagttga

1260

ttttgtgcaa acacgatcta atccttaaat ccggtcccag ttcggactgg ggtctgcaac

1320

ccgaccccac gaagctggat tcgctagtaa tcgcgcatca gccatggcgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcaa gccatgaaag ccgggggtgc ctgaagtctg

1440

tgaccgcaag gaacggccta gggcaaaacc ggtgattggg gctaagtcgt aacaaggtag

1500

ccgtaccgga aggtgcggct ggaacacctc ctttct

1536

<210> 1514

<211> 1513

<212> DNA

<213> Prevotella oulorum

<220>

<221> modified_base

<222> (3)..(3)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1514

acnatggaga gtttgatcct ggctcaggat gaacgctagc tacaggctta acacatgcaa

60

gtcgagggga aacgatgacg agagcttgct ctcttaggcg tcgaccggcg cacgggtgag

120

taacgcgtat ccaacctgcc cattacaggg gaataacctt gcgaaagtaa gactaatgcc

180

ccatggtatt ctcagcagac atctaatgag gattaaagat ttatcggtaa tggatgggga

240

tgcgtctgat tagcttgttg gcggggtaac ggcccaccaa ggcaacgatc agtaggggtt

300

ctgagaggaa ggtcccccac attggaactg agacacggtc caaactccta cgggaggcag

360

cagtgaggaa tattggtcaa tgggcgagag cctgaaccag ccaagtagcg tgcaggaaga

420

cggccctatg ggttgtaaac tgcttttata ggggaataaa gtgatctacg tgtagtttat

480

tgtatgtacc ctatgaataa ggaccggcta attccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga

540

aggttcgggc gttatccgga tttattgggt ttaaagggag cgtaggccgt agattaagcg

600

tgttgtgaaa tgtagatgct caacatctga cttgcagcgc gaactggttt acttgagtgt

660

gcacaacgta ggcggaattc gtcgtgtagc ggtgaaatgc ttagatatga cgaagaactc

720

cgattgcgaa ggcagcttac gggagcacaa ctgacgctga agctcgaagg tgcgggtatc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccgca cagtaaacgc tggatgcccg ctgttggctc

840

attagagtca gcggccaagc gaaagcatta agcatcccac ctggggagta cgccggcaac

900

ggtgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg aggaacatgt ggtttaattc

960

gatgatacgc gaggaacctt acccgggctt gaattgcaga cgaacgattc agagatgaag

1020

aggcccttcg gggcgtctgt gaaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt

1080

gtcggcttaa gtgccataac gagcgcaacc ccttttctta gttgccatca ggtcatgctg

1140

ggcactctgg gaatactgcc accgtaaggt gtgaggaagg tggggatgac gtcaaatcag

1200

cacggccctt acgtccgggg ctacacacgt gttacaatgg ccggtacaga gggcaggttg

1260

catgtaaatg cgatcgaatc ttaaaagccg gtcccagttc ggactgaggt ctgcaacccg

1320

acctcacgaa gctggattcg ctagtaatcg cgcatcagcc atggcgcggt gaatacgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcaagcc atgaaagccg ggggtgccta aagtccgtta

1440

ccgcaaggat cggcctaggg caaaactggt aattggggct aagtcgtaac aaggtagccg

1500

taccggaagg tgc

1513

<210> 1515

<211> 1519

<212> DNA

<213> Prevotella pallens

<400> 1515

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agctataggc ttaacacatg caagtcgagg

60

ggaaacggca ttatgtgctt gcacattttg gacgtcgacc ggcgcacggg tgagtatcgc

120

gtatccaacc tgccctttac ttggggatac cccgttgaaa gacggcctaa tacccgatgt

180

aattcattga tggcatcaga tatgaataaa agatttatcg gtaaaggatg gggatgcgtc

240

tgattagctt gttggtgagg taaaggctca ccaaggcaac gatcagtagg ggttctgaga

300

ggaaggtccc ccacattgga actgagacac ggtccaaact cctacgggag gcagcagtga

360

ggaatattgg tcaatgggcg caagcctgaa ccagccaagt agcgtgcagg aagacggccc

420

tatgggttgt aaactgcttt tatacgagaa taatttgatg cacgtgtgcg ttattgcatg

480

tatcgtatga ataaggaccg gctaattccg tgccagcagc cgcggtaata cggaaggtcc

540

aggcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggagtgtagg cggtttgtta agcgtgttgt

600

gaaatttagg tgctcaacat ttaacttgca gcgcgaactg tcagacttga gtacacgcaa

660

cgtatgcgga attcatggtg tagcggtgaa atgcttagat atcatgaaga actccgattg

720

cgaaggcagc atacgggagt gtaactgacg cttaagctcg aaggtgcggg tatcgaacag

780

gattagatac cctggtagtc cgcacagtaa acgatggatg cccgctgtta gcgcctggcg

840

ttagcggcta agcgaaagca ttaagcatcc cacctgggga gtacgccggc aacggtgaaa

900

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggaggaaca tgtggtttaa ttcgatgata

960

cgcgaggaac cttacccggg cttgaattgc agaggaatta tttagagata aatatgccct

1020

tcggggtctc tgtgaaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct cgtgccgtga ggtgtcggct

1080

taagtgccat aacgagcgca accccttttc ttagttgcca tcaggtaatg ctgggcactc

1140

tgggaacact gccaccgcaa ggtgtgagga aggtggggat gacgtcaaat cagcacggcc

1200

cttacgtccg gggctacaca cgtgttacaa tggccggtac agagggatgg tgtaatgtaa

1260

attgcatcaa atcttaaaag ccggtcccag ttcggactga ggtctgcaac ccgacctcac

1320

gaagctggat tcgctagtaa tcgcgcatca gccatggcgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1380

ttgtacacac cgcccgtcaa gccatgaaag ccgggggtgc ctgaagttcg taaccgtaag

1440

gagcgaccta gggcaaaact ggtaattggg gctaagtcgt aacaaggtag ccgtaccgga

1500

aggtgcggct ggaacacct

1519

<210> 1516

<211> 1534

<212> DNA

<213> Prevotella ruminicola

<400> 1516

ttacaatgaa gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc

60

aagtcgaggg gcatcagatc gaaagcttgc ttttgatgct ggcgaccggc gcacgggtga

120

gtaacgcgta tccaaccttc cctatagtag agaatagccc ggcgaaagtc ggattaatgc

180

tctatgttgt atttagagga catctgaaga ataccaaagg tttaccgcta taggatgggg

240

atgcgtctga ttaggtagta ggcggggtaa cggcccacct agccgacgat cagtaggggt

300

tctgagagga aggtccccca cattggaact gagacacggt ccaaactcct acgggaggca

360

gcagtgagga atattggtca atggacggaa gtctgaacca gccaagtagc gtgcaggatg

420

acggccctat gggttgtaaa ctgcttttat atagggataa agtcggggac gtgtccccgt

480

ttgtaggtac tatatgaata aggaccggct aattccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

aaggtccagg cgttatccgg atttattggg tttaaaggga gcgcaggctg atgattaagc

600

gtgacgtgaa atgtagccgc tcaacggctg aactgcgtcg cgaactggtt atcttgagtg

660

agttcgatgt tggcggaatt cgtggtgtag cggtgaaatg cttagatatc acgaagaact

720

ccgattgcga aggcagccaa caaggccttt actgacgcta aagctcgaag gtgcgggtat

780

cgaacaggat tagataccct ggtagtccgc acggtaaacg atggatgccc gctgtttgcg

840

atatactgtg agcggccaag agaaatcgtt aagcatccca cctggggagt acgccggcaa

900

cggtgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gaggaacatg tggtttaatt

960

cgatgatacg cgaggaacct tacccgggct tgaactgcca gcgaacgatt cagagatgat

1020

gaggtccttc gggacgctgg tggaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg tgccgtgagg

1080

tgtcggctta agtgccataa cgagcgcaac ccttttcttt agttgccatc aggtaatgct

1140

gggcactctg gagatactgc caccgtaagg tgtgaggaag gtggggatga cgtcaaatca

1200

gcacggccct tacgtccggg gctacacacg tgttacaatg gggggtacag agagtcggat

1260

atacgcaagt atgttctaat ccttaaagcc ttcctcagtt cggattgggg tctgcaaccc

1320

gaccccatga agctggattc gctagtaatc gcgcatcagc catggcgcgg tgaatacgtt

1380

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcaagc catgaaagcc gggggcgctt gaagtccgtg

1440

accgcaagga tcggcctaga gcgaaactgg taattggggc taagtcgtaa caaggtagcc

1500

gtaccggaag gtgcggctgg aacacctcct ttct

1534

<210> 1517

<211> 1493

<212> DNA

<213> Prevotella salivae

<400> 1517

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg

60

ggaaacgaca ttgaagcttg cttcgatggg cgtcgaccgg cgcacgggtg agtaacgcgt

120

atccaacctg cctctgacta agggataacc cggcgaaagt cggactaata ccttatgagg

180

ttttcagcag acatctaacg aaaacgaaag atttatcggt cagtgatggg gatgcgtctg

240

attagcttgt tggcggggta acggcccacc aaggcaacga tcagtagggg ttctgagagg

300

aaggtccccc acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc agcagtgagg

360

aatattggtc aatgggcgag agcctgaacc agccaagtag cgtgcaggat gacggcccta

420

tgggttgtaa actgctttta tgtggggata aagtgagcta cgtgtagttt attgcaggta

480

ccacatgaat aaggaccggc taattccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaaggtccag

540

gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgtaggcc gtggattaag cgtgttgtga

600

aatgtagacg ctcaacgtct gaattgcagc gcgaactggt tcacttgagt atgcacaacg

660

taggcggaat tcgtcgtgta gcggtgaaat gcttagatat gacgaagaac tccgattgcg

720

aaggcagctt acgggagcac aactgacgct gaagctcgaa ggtgcgggta tcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtccg cacagtaaac gatggatgcc cgttgttagt tcacttatga

840

attagcgacc aagcgaaagc attaagcatc ccacctgggg agtacgccgg caacggtgaa

900

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggaggaac atgtggttta attcgatgat

960

acgcgaggaa ccttacccgg gcttgaattg cagacgaacg attcagagat gatgaggccc

1020

ttcggggcgt ctgtgaaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgtcggc

1080

ttaagtgcca taacgagcgc aacccctttt ttcagttgcc atcaggtgat gctgggcact

1140

ctggagatac tgccaccgta aggtgtgagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcagcacggc

1200

ccttacgtcc ggggctacac acgtgttaca atggccggta cagagcgttg gtcgtgtgca

1260

aatacgatct aatccttaaa gccggtccca gttcggactg gggtctgcaa cccgacccca

1320

cgaagctgga ttcgctagta atcgcgcatc agccatggcg cggtgaatac gttcccgggc

1380

cttgtacaca ccgcccgtca agccatgaaa gccgggggtg cctgaagtct gtgaccgcaa

1440

ggaacggcct agggcaaaac tggtgattgg ggctaagtcg taacaaggta acc

1493

<210> 1518

<211> 1327

<212> DNA

<213> Prevotella sp. BI-42

<220>

<221> modified_base

<222> (529)..(529)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1518

tgagtttgat cctggctcag gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg

60

gaccggcgca cgggtgagta acgcgtatcc aacctgccca ccacttgggg ataaccttgc

120

gaaagtaaga ctaataccca atgattaaag tcggtgatgg atggggatgc gtctgattag

180

cttgttggcg gggtaacggc ccaccaaggc aacgatcagt aggggttctg agaggaaggt

240

cccccacatt ggaactgaga cacggtccaa actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat

300

tggtcaatgg acgagagtct gaaccagcca agtagcgtgc aggatgacgg cctatgggtt

360

gtaaactgct tttataaggg aatatgcatg taccttatga ataaggaccg gctaattccg

420

tgccagcagc cgcggtaata cggaaggtcc gggcgttatc cggatttatt gggtttaaag

480

ggagcgtagg ccggagatta agcgtgttgt gaaatgtaga cgctcaacnt ctgcactgca

540

gcgcgaactg gtttccttga gtacgcacaa agtgggcgga attcgtggtg tagcggtgaa

600

atgcttagat atcacgaaga actccgattg cgaaggcagc tcactggagc gactgacgct

660

gaagctcgaa agtgcgggta tcgaacagga ttagataccc tggtagtccg cacggtaaac

720

gatggatgcc cgctgttggt cggtcagcgg ccaagcgaaa gcattaagca tcccacctgg

780

ggagtacgcc ggcaacggtg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggagga

840

acatgtggtt taattcgatg atacgcgagg aaccttaccc gggcttgaat tgtgaaggtg

900

ctgcatggat gtcgtcagct cgtgccgtga ggtgtcggct taagtgccat aacgagcgca

960

acccctctcc ttagttgcca tcagctgggc actctgggga cactgccacc gtaaggtgga

1020

ggaaggtggg gatgacgtca aatcagcacg gcccttacgt ccggggctac acacgtgtta

1080

caatggcagg cagagagacg gtcccttgca aaatggatca aatccttcct gtctcagttc

1140

ggatggggtc tgcaacccga ccccagaagc tggattcgct agtaatcgcg catcagccat

1200

ggcgcggtga atacgtcccg ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg aaagccgggg

1260

gcgcctaaag tccgtgcggc ctagggcgaa actggtaatt ggggctaagt cgtaacaagg

1320

tagccgt

1327

<210> 1519

<211> 1459

<212> DNA

<213> Prevotella sp. CM38

<400> 1519

ctcaggatga acgctagcta caggcttaac acatgcaagt cgcggggcag catgggggtt

60

gcttgcaacc cctgatggcg accggcgcac gggtgagtaa cgcgtatcca acctgccctt

120

caccacggga taacccggcg aaagtcggac taataccgta tgttgtccat tgacggcatc

180

cgatttggac gaaaggctta gcggtgaggg atggggatgc gtccgattag ctcgacggcg

240

gggtaacggc ccaccgtggc aacgatcggt aggggttctg agaggaaggt cccccacact

300

ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat tggtcaatgg

360

gcggaagcct gaaccagcca agtagcgtgc aggatgacgg ccctatgggt tgtaaactgc

420

ttttatgcgg ggataaaggg gcccacgtgt gggtttttgc aggtaccgca tgaataagga

480

ccggctaatt ccgtgccagc agccgcggta atacggaagg tccgggcgtt atccggattt

540

attgggttta aagggagcgt aggccgcccc ttaagcgtgt tgtgaaatgc gggtgctcaa

600

catccgactt gcagcgcgaa ctggggggct tgagtgcgcc gaaagtaggc ggaattcgtg

660

gtgtagcggt gaaatgctta gatatcacga agaactccga ttgcgaaggc agcttactgt

720

agcgcaactg acgctgatgc tcgaaagcgt gggtatcgaa caggattaga taccctggta

780

gtccacgcgg taaacgatgg atgctcgttg tcggcctttg aggccggtga ccaagcgaaa

840

gcgttaagca tcccacctgg ggagtacgcc ggcaacggtg aaactcaaag gaattgacgg

900

gggcccgcac aagcggagga acatgtggtt taattcgatg atacgcgagg aaccttaccc

960

gggcttgaac tgcggcggaa cgattccgag aggatgaggc ccttcggggc tgccgcggag

1020

gtgctgcatg gttgtcgtca gctcgtgccg tgaggtgtcg gcttaagtgc cataacgagc

1080

gcaacccccg tcttcagttg ccatcggatg atgccgggca ctctggagat actgccaccg

1140

caaggtgtga ggaaggtggg gatgacgtca aatcagcacg gcccttacgt ccggggctac

1200

acacgtgtta caatggcgca tacagagagt aggtggcatg cgagtgccat ccaatcctta

1260

aagtgcgtct cagttcggac tggggtctgc aacccgaccc cacgaagctg gattcgctag

1320

taatcgcgca tcagccatgg cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

caagccatga aagccggggg cgcctgaagt ccgtgaccgc gagggtcggc ctagggtgaa

1440

accggtgatt ggggctaag

1459

<210> 1520

<211> 1452

<212> DNA

<213> Prevotella sp. ICM1

<400> 1520

aggatgaacg ctagctacag gcttaacaca tgcaagtcga ggggaaacgg cattgagtgc

60

ttgcactctt tggacgtcga ccggcgcacg ggtgagtaac gcgtatccaa ccttcccatt

120

actgtgggat aacctgccga aaggcagact aataccgcat agtcttcgat gacggcatca

180

gatttgaagt aaagatttat cggtaatgga tggggatgcg tctgattagc ttgttggcgg

240

ggtaacggcc caccaaggcg acgatcagta ggggttctga gaggaaggtc ccccacattg

300

gaactgagac acggtccaaa ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt ggtcaatgga

360

cggaagtctg aaccagccaa gtagcgtgca ggatgacggc cctatgggtt gtaaactgct

420

tttgtatggg gataaagtta gggacgtgtc cctatttgca ggtaccatac gaataaggac

480

cggctaattc cgtgccagca gccgcggtaa tacggaaggt ccaggcgtta tccggattta

540

ttgggtttaa agggagcgta ggctggagat taagtgtgtt gtgaaatgta gacgctcaac

600

gtctgaattg cagcgcatac tggttttctt gagtacgcac aacgttggcg gaattcgtcg

660

tgtagcggtg aaatgcttag atatgacgaa gaactccgat tgcgaaggca gctgacggga

720

gcgcaactga cgcttaagct cgaaggtgcg ggtatcaaac aggattagat accctggtag

780

tccgcacagt aaacgatgga tgcccgctgt tggtacctgg tatcagcggc taagcgaaag

840

cattaagcat cccacctggg gagtacgccg gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg

900

ggcccgcaca agcggaggaa catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttacccg

960

ggcttgaatt gcagaggaag gatttagaga taatgacgcc cttcggggcc tctgtgaagg

1020

tgctgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgccgt gaggtgtcgg cttaagtgcc ataacgagcg

1080

caacccctct cttcagttgc catcaggtta agctgggcac tctggagaca ctgccaccgt

1140

aaggtgtgag gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg cccttacgtc cggggctaca

1200

cacgtgttac aatggccggt acagagggat ggtgtaatgc aaattgcatc aaatcttgaa

1260

agccggtccc agttcggact ggggtctgca acccgacccc acgaagctgg attcgctagt

1320

aatcgcgcat cagccatggc gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc

1380

aagccatgaa agccgggggt gcctgaagtc cgtgaccgca aggatcggcc tagggcaaac

1440

tggtgattgg gg

1452

<210> 1521

<211> 1458

<212> DNA

<213> Prevotella sp. ICM55

<400> 1521

acgctagcta caggcttaac acatgcaagt cgaggggaaa cgacattgaa gcttgcttcg

60

atgggcgtcg accggcgcac gggtgagtaa cgcgtatcca acctgcctct gactaaggga

120

taacccggcg aaagtcggac taatacctta tgaggttttc agcagacatc taatgaaaac

180

gaaagattta tcggtcagtg atggggatgc gtctgattag cttgttggcg gggtaacggc

240

ccaccaaggc aacgatcagt aggggttctg agaggaaggt cccccacatt ggaactgaga

300

cacggtccaa actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct

360

gaaccagcca agtagcgtgc aggatgacgg ccctatgggt tgtaaactgc ttttatgtgg

420

ggataaagtg agctacgtgt agtttattgc aggtaccaca tgaataagga ccggctaatt

480

ccgtgccagc agccgcggta atacggaagg tccaggcgtt atccggattt attgggttta

540

aagggagcgt aggccgtgga ttaagcgtgt tgtgaaatgt agacgctcaa cgtctgaatt

600

gcagcgcgaa ctggttcact tgagtatgca caacgtaggc ggaattcgtc gtgtagcggt

660

gaaatgctta gatatgacga agaactccga ttgcgaaggc agcttacggg agcacaactg

720

acgctgaagc tcgaaggtgc gggtatcaaa caggattaga taccctggta gtccgcacag

780

taaacgatgg atgcccgttg ttagttcact taagaattag cgaccaagcg aaagcattaa

840

gcatcccacc tggggagtac gccggcaacg gtgaaactca aaggaattga cgggggcccg

900

cacaagcgga ggaacatgtg gtttaattcg atgatacgcg aggaacctta cccgggcttg

960

aattgcagac gaacgattca gagatgatga ggcccttcgg ggcgtctgtg aaggtgctgc

1020

atggttgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg tcggcttaag tgccataacg agcgcaaccc

1080

cttttttcag ttgccatcag gtgatgctgg gcactctgga gatactgcca ccgtaaggtg

1140

tgaggaaggt ggggatgacg tcaaatcagc acggccctta cgtccggggc tacacacgtg

1200

ttacaatggc cggtacagag cgttggttgt atgcaaatac gatctaatcc ttaaagccgg

1260

tcccagttcg gactggggtc tgcaacccga ccccacgaag ctggattcgc tagtaatcgc

1320

gcatcagcca tggcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagcca

1380

tgaaagccgg gggtgcctga agtctgtgac cgcaaggaaa cggcctaggg caaaactggt

1440

gattggggct aagtcgta

1458

<210> 1522

<211> 1479

<212> DNA

<213> Prevotella sp. JCM 6330

<400> 1522

ggctcaggat gaacgctagc tacaggctta acacatgcaa gtcgagggga aacggcgttt

60

agtgcttgca ctgttcggac gtcgaccggc gcacgggtga gtaacgcgta tccaaccttc

120

ccataactaa gggataacct gccgaaaggc agactaatac cttatgtaat tcttagatga

180

catcagaaga gaatgaaaga tttatcggtt atggatgggg atgcgtctga ttagcttgtt

240

ggcggggtaa cagcccacca aggcgacgat cagtaggggt tctgagagga aggtccccca

300

cattggaact gagacacggt ccaaactcct acgggaggca gcagtgagga atattggtca

360

atgggcgaga gcctgaacca gccaagtagc gtgcaggaag acggccctat gggttgtaaa

420

ctgcttttgt atggggataa agtcaatcac gtgtgattgt ttgcaggtac catacgaata

480

aggaccggct aattccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg aaggttcggg cgttatccgg

540

atttattggg tttaaaggga gcgtaggccg gagattaagt gtgttgtgaa atgtagacgc

600

tcaacgtctg acttgcagcg catactggtt tccttgagta cgcacaacgt tggcggaatt

660

cgtcgtgtag cggtgaaatg cttagatatg acgaagaact ccgattgcga aggcagctga

720

cgggagcgcc actgacgctt aagctcgaag gtgcgggtat cgaacaggat tagataccct

780

ggtagtccgc acagtaaacg atggatgccc gctgttggta cctggtatca gcggctaagc

840

gaaagcatta agcatcccac ctggggagta cgccggcaac ggtgaaactc aaaggaattg

900

acgggggccc gcacaagcgg aggaacatgt ggtttaattc gatgatacgc gaggaacctt

960

acccgggctt gaattgcaga ggaaggattt agagataatg acgcccttcg gggtctctgt

1020

gaaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt gtcggcttaa gtgccataac

1080

gagcgcaacc cctctcttca gttgccatca ggtaatgctg ggcactctgg agacactgcc

1140

accgtaaggt gtgaggaagg tggggatgac gtcaaatcag cacggccctt acgtccgggg

1200

ctacacacgt gttacaatgg ccggtacaga gggacggtgt aatgcaaatt gcatccaatc

1260

ttgaaagccg gtcccagttc ggactggggt ctgcaacccg accccacgaa gctggattcg

1320

ctagtaatcg cgcatcagcc atggcgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc

1380

ccgtcaagcc atgaaagccg ggggtgcctg aagtccgtga ccggaaggat cggcctaggg

1440

caaaactggt gattggggct aagtcgtaac aaggtaacc

1479

<210> 1523

<211> 1374

<212> DNA

<213> Prevotella sp. SEQ053

<400> 1523

tgcaagtcgc ggggcagcat gagggttgct tgcaaccttt gatggcgacc ggcgcacggg

60

tgagtaacac gtatccaacc tactccttac aacggaataa cccggcgaaa gtcggactaa

120

taccgtatga tatcctatgc aggcatctaa ytaggattaa aggtttagcg gtaagggatg

180

gggatgcgtc tgattaggca gttggcgggg taacggccca ccaaaccgac gatcagtagg

240

ggttctgaga ggaaggtccc ccacattgga actgagacac ggtccaaact cctacgggag

300

gcagcagtga ggaatattgg tcaatggacg gaagtctgaa ccagccaagt agcgtgcagg

360

atgacggccc tatgggttgt aaactgcttt tatacgggga taaagttagg gacgtgtccc

420

tatttgcagg taccgtatga ataaggaccg gctaattccg tgccagcagc cgcggtaata

480

cggaaggtcc gggcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggagcgtagg ccgtagatta

540

agtgtgttgt gaaatgtaga cgctcaacgt ctgacttgca gcgcatactg gtttacttga

600

gtttgcacaa cgttggcgga attcgtcgtg tagcggtgaa atgcttagat atgacgaaga

660

actccgattg cgaaggcagc ttgcgggagc aaaactgacg ctgaagctcg aaagtgcggg

720

tatcgaacag gattagatac cctggtagtc cgcacggtaa acgatggatg cccgttgtat

780

ggcctttcgg ctatgtgacc aagcgaaagc attaagcatc ccacctgggg agtacgccgg

840

caacggtgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggaggaac atgtggttta

900

attcgatgat acgcgaggaa ccttacccgg gcttgaactg taggygaacg atctagagat

960

agtgaggccc ttcggggcgc ctacggaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg

1020

aggtgtcggc ttaagtgcca taacgagcgc aacccctgtt ctcagttgcc atcgggtgat

1080

gccgggcact ctgaggatac tgcctccgca aggagtgagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1140

tcagcacggc ccttacgtcc ggggctacac acgtgttaca atggccggta cagagcgtcg

1200

gtcgtatgca aatacgatct aatctttaaa accggtctca gttcggactg gggtctgcaa

1260

cccgacccca cgaagctgga ttcgctagta atcgcgcatc agccatggcg cggtgaatac

1320

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca agccatgaaa gccgggggcg cctg

1374

<210> 1524

<211> 1227

<212> DNA

<213> Prevotella sp. SEQ065

<400> 1524

agtcgaggga ccggcgcacg ggtgagtaac gcgtatccaa cctwcccatt actgtgggat

60

aacctgccga aaggcagact aataccgcat rgttaaagtc ggtaatggat ggggatgcgt

120

ctgattagct tgttggcggg gtaacggccc accaaggcaa cgatcagtag gggttctgag

180

aggaaggtcc cccacattgg aactgagaca cggtccaaac tcctacggga ggcagcagtg

240

aggaatattg gtcaatggac gagagtctga accagccaag tagcgtgcag gatgacggcc

300

tatgggttgt aaactgcttt tgtatgggga tatgcaggta ccatacgaat aaggaccggc

360

taattccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaaggtccgg gcgttatccg gatttattgg

420

gtttaaaggg agcgtaggcy ggagattaag tgtgttgtga aatgtagacg ctcaacgtct

480

gacttgcagc gcatactggt ttccttgagt acgcacaacg ttggcggaat tcgtcgtgta

540

gcggtgaaat gcttagatat gacgaagaac tccgattgcg aaggcagctg acgggagcga

600

ctgacgctta agctcgaagg tgcgggtatc gaacaggatt agataccctg gtagtccgca

660

cagtaaacga tggatgcccg ctgttggtat atcagcggct aagcgaaagc attaagcatc

720

ccacctgggg agtacgccgg caacggtgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa

780

gcggaggaac atgtggttta attcgatgat acgcgaggaa ccttacccgg gcttgaattg

840

tgaaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg tgccgtgagg tgtcggctta agtgccataa

900

cgagcgcaac ccctctcttc agttgccatc agctgggcac tctggagaca ctgccaccgt

960

aaggtggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcagcacggc ccttacgtcc ggggctacac

1020

acgtgttaca atggccggca gagggatggt gtaatgcaaa ttgcatcaaa tcttgccggt

1080

cccagttcgg atggggtctg caacccgacc ccagaagctg gattcgctag taatcgcgca

1140

tcagccatgg cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt caagccatga

1200

aagccggggg tgcctgaagt ccgtacc

1227

<210> 1525

<211> 1273

<212> DNA

<213> Prevotella sp. SEQ072

<400> 1525

tgatcctggc tcaggatgaa cgctagctac aggcttaaca catgcaagtc gcgggaccgg

60

cgcacgggtg agtaacgcgt atccaacctt cccattacta cggcataccc cgttgaaagg

120

cggcctaatt ccgtatgcag aaagtcggta atggatgggg atgcgtccga ttagccagtc

180

ggcggggtaa cggcccaccg aggcatcgat cggtaggggt tctgagagga aggtccccca

240

cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgagga atattggtca

300

atgggcgtaa gcctgaacca gccaagtagc gtgcaggatg acggcctatg ggttgtaaac

360

tgcttttatg cggggatatg caggtaccgc atgaataagg accggctaat tccgtgccag

420

cagccgcggt aatacggaag gtccgggcgt tatccggatt tattgggttt aaagggagcg

480

taggcagttt tttaagcgtg ctgtgaaatg taccggctca accggtgatg tgcagcgcga

540

actgggaatc ttgagtacgc agtaagcagg cggaattcgt ggtgtagcgg tgaaatgctt

600

agatatcacg aagaactccg attgcgtagg cagcttgctg tagcgactga cgctgaagct

660

cgaaagtgcg ggtatcgaac aggattagat accctggtag tccgcacggt aaacgatgga

720

tgcccgctgt cggtcggtcg gtggccaagc gaaagcgtta agcatcccac ctggggagta

780

cgccggcaac ggtgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg aggaacatgt

840

ggtttaattc gatgatacgc gaggaacctt acccgggctt gaactgtgga ggtgctgcat

900

ggttgtcgtc agctcgtgcc gtgaggtgtc ggcttaagtg ccataacgag cgcaacccct

960

tttttcagtt gccatcggcc gggcactctg tgaatactgc cgccgtaagg tggaggaagg

1020

tggggatgac gtcaaatcag cacggccctt acgtccgggg stacacacgt gttacaatgg

1080

cgcgcagcga gtcggccgta tgtaaatacg gtccaatcct tcgcgcctca gttcggatgg

1140

ggtctgcaac ccgaccccag aagctggatt cgctagtaat cgcgcatcag ccatggcgcg

1200

gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaag ccatgaaagc cgggggtgcc

1260

tgaagtccgt acc

1273

<210> 1526

<211> 1274

<212> DNA

<213> Prevotella sp. SEQ116

<400> 1526

ttgatcctgg ctcaggatga acgctagcta caggcttaac acatgcaagt cgagggaccg

60

gcgcacgggt gagtaacgcg tatccaactt tcccattact gtggaataac ctgccgaaag

120

gcagactaat accgcatagt taaagtcggt aatggatggg gatgcgtctg attagcttgt

180

tggcggggta acggcccacc aaggcgacga tcagtagggg ttctgagagg aaggtccccc

240

acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc agcagtgagg aatattggtc

300

aatgggcgag agcctgaacc agccaagtag cgtgcaggat gacggcctat gggttgtaaa

360

ctgcttttgt atggggatat gcaggtacca tacgaataag gaccggctaa ttccgtgcca

420

gcagccgcgg taatacggaa ggtccaggcg ttatccggat ttattgggtt taaagggagc

480

gtaggccgga gattaagtgt gttgtgaaat gtagacgctc aacgtctgac ttgcagcgca

540

tactggtttc cttgagtacg cacaacgttg gcggaattcg tcgtgtagcg gtgaaatgct

600

tagatatgac gaagaactcc gattgcgaag gcagctgacg ggagcgactg acgcttaagc

660

tcgaaggtgc gggtatcaaa caggattaga taccctggta gtccgcacag taaacgatgg

720

atgcccgctg ttggtatatc agcggctaag cgaaagcatt aagcatccca cctggggagt

780

acgccggcaa cggtgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gaggaacatg

840

tggtttaatt cgatgatacg cgaggaacct tacccgggct tgaattgtga aggtgctgca

900

tggttgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt cggcttaagt gccataacga gcgcaacccc

960

tctcttcagt tgccatcagc tgggcactct ggagacactg ccaccgtaag gtggaggaag

1020

gtggggatga cgtcaaatca gcacggccct tacgtccggg gctacacacg tgttacaatg

1080

gccggcagag ggacggtgta atgcaaattg catccaatct tgccggtccc agttcggatg

1140

gggtctgcaa cccgacccca gaagctggat tcgctagtaa tcgcgcatca gccatggcgc

1200

ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcaa gccatgaaag ccgggggtgc

1260

ctgaagtccg tacc

1274

<210> 1527

<211> 1340

<212> DNA

<213> Prevotella sp. SG12

<400> 1527

cccctgatgg cgaccggcgc acgggtgagt aacgcgtatc caacctgccc ttcaccacgg

60

gataacccgg cgaaagtcgg actaataccg tatgttgtcc attgacggca tccgatttgg

120

acgaaaggct tagcggtgag ggatggggat gcgtccgatt agcttgacgg cggggtaacg

180

gcccaccgtg gcaacgatcg gtaggggttc tgagaggaag gtcccccaca ctggaactga

240

gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtgaggaat attggtcaat gggcggaagc

300

ctgaaccagc caagtagcgt gcaggatgac ggccctatgg gttgtaaact gcttttatgc

360

ggggataaag gggcccacgt gtgggttttt gcaggtaccg catgaataag gaccggctaa

420

ttccgtgcca gcagccgcgg taatacggaa ggtccgggcg ttatccggga tttattgggt

480

ttaaagggag cgtaggccgc cccttaagcg tgttgtgaaa tgcgggtgct caacatccga

540

cttgcagcgc gaactggggg gcttgagtgc gccgaaagta ggcggaattc gtggtgtagc

600

ggtgaaatgc ttagatatca cgaagaactc cgattgcgaa ggcagcttac tgtagcgcaa

660

ctgacgctga tgctcgaaag cgtgggtatc gaacaggatt agataccctg gtagtccacg

720

cggtaaacga tggatgctcg ttgtcggcct ttatggtcgg tgaccaagcg aaagcgttaa

780

gcatcccacc tggggagtac gccggcaacg gtgaaactca aaggaattga cgggggcccg

840

cacaagcgga ggaacatgtg gtttaattcg atgatacgcg aggaacctta cccgggcttg

900

aactgcggcg gaacgattcc gagaggatga ggcccttcgg ggctgccgcg gaggtgctgc

960

atggttgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg tcggcttaag tgccataacg agcgcaaccc

1020

ccgtcttcag ttgccatcgg gttatgctgg gcactctgga gatactgcca ccgcaaggtg

1080

tgaggaaggt ggggacgacg tcaaatcagc acggccctta cgtccggggc tacacacgtg

1140

ttacaatggc gcatacagag agtaggtggc atgcgaatgc catccaatcc ttaaagtgcg

1200

tctcagttcg gactggggtc tgcaacccga ccccacgaag ctggattcgc tagtaatcgc

1260

gcatcagcca tggcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagcca

1320

tgaaagccgg gggggcggcc

1340

<210> 1528

<211> 1451

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone AA020

<400> 1528

ttcaggatga acgctagcta caggcttaac acrtgcaagt cgaggggaaa cgacggggaa

60

gcttgcttct ccggtcgtcg accggcgcac gggtgagtaa cgcgtatcca acctgcctct

120

gaccaaggga taacccgtcg aaagtcggac taatacctta tgcagtcgtc ggaagtcatc

180

tgatgacgac gaaagatttc atcggtgaga gatggggatg cgtctgatta gcttgttggc

240

ggggtaacgg cccaccaagg cgacgatcag taggggttct gagaggaagg tcccccacat

300

tggaactgag acacggtcca aactcctacg ggaggcagca gtgaggaata ttggtcaatg

360

gacgagagtc tgaaccagcc aagtagcgtg caggatgacg gccctatggg ttgtaaactg

420

cttttatgcg gggataaagt gagggacgtg tccttcattg caggtaccgc atgaataagg

480

accggctaat tccgtgccag cagccgcggt aatacggaag gtccgggcgt tatccggatt

540

tattgggttt aaagggagcg taggccgtgg attaagcgtg ttgtgaaatg tagacgctca

600

acgtctgact tgcagcgcga actggtccac ttgagtgtgc acaacgcagg cggaattcgt

660

cgtgtagcgg tgaaatgctt agatatgacg aagaaccccg attgcgaagg cagcttgcgg

720

gagcacgact gacgctgaag ctcgaaagtg cgggtatcga acaggattag ataccctggt

780

agtccgcacg gtaaacgatg gatgcccgtt atcaggcttt ttagtctggt gaccaagcga

840

aagcattaag catcccacct ggggagtacg ccggcaacgg tgaaactcaa aggaattgac

900

gggggcccgc acaagcggag gaacatgtgg tttaattcga tgatacgcga ggaaccttac

960

ccgggcttga attgcagacg tacgattcag agatgaagag gcccttcggg gcgtctgtga

1020

aggtgctgca tggttgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt cggcttaagt gccataacga

1080

gcgcaacccc tattctcggt tgccatcggg taatgccggg cactccgtgg agactgccac

1140

cgtaagtgtg aggaagtggg gacgacgtca aatcagcacg gsccttacgt ccggggctac

1200

acacgtgtta caatggccgg tacagcgagt cggccgcatg caaatgcggt ccaatcctga

1260

aagccggtcc cagttcggac cggggtctgc aacccgaccc cgcgaagccg gattcgctag

1320

taatcgcgca tcagccatgg cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

caagccatga aagccggggg tgcctgaagt ccgttaccgc gagggtcggc ctaaggcaaa

1440

accggtgatt g

1451

<210> 1529

<211> 1365

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone ASCG10

<220>

<221> modified_base

<222> (1)..(1)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (259)..(259)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1529

ngagtttgat cttggctcag gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg

60

gaccggcgca cgggtgcgta acgcgtatca aacctgcctc atactcgggg atagccttgc

120

gaaagtaaga ttaatacccg atgttcaaag tcggtatgag atggtgatgc gtccgattag

180

gtagtaggcg gggtaacggc ccacctagcc ttcgatcggt aggggttctg agaggaaggt

240

cccccacact gtaactgana cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat

300

tggtcaatgg acgcaagtct gaaccagcca agtagcgtga aggatgacgg cctctgggtt

360

gtaaactgct tttagttggg aatatgtatg taccttcaga aaaaggaccg gctaattccg

420

tgccagcagc cgcggtaata cggaaggtcc aggcgttatc cggatttatt gggtttaaag

480

ggagcgtagg cggattatta agtcagtggt gaaagacggt ggctcaacca tcgttagcca

540

ttgatactgg tagtcttgag tgcagcaggg gatgctggaa ctcgtggtgt agcggtgaaa

600

tgcttagata tcacgatgaa ctccgatcgc gaaggcaggt gtccgggctg actgacgctg

660

aggctcgaaa gtgtgggtat caaacaggat tagataccct ggtagtccac acagtaaacg

720

atgtatactc gcggtttgcg agtaagccgc caagcgaaag cattaagtat accacctggg

780

gagtacgccg gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa

840

catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttacccg ggcttgaact atggaggtgc

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa

960

ccctttttct tggttgccat cagctgggca ctccagggat actgccatcg taagatggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg cccttacgtc cggggctaca cacgtgttac

1080

aatggggggc agaaggtcgc tacctggtga caggatgcta atctcacctc tctcagttcg

1140

gatggagtct gcaacccgac tccagaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg

1200

gcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg aaagtcggaa

1260

gtacccaaag ccggtgggta gccagccgtc taaggtaaag tcgatgattg gggtgaagtc

1320

gtaacaaggt agccgtatcg gaaggtgcgg ctggaacacc tcctt

1365

<210> 1530

<211> 1319

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone ASCG12

<220>

<221> modified_base

<222> (334)..(334)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1530

gagtttgatc ttggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc aagtcgcggg

60

accggcgcac gggtgagtaa cgcttatcca acctgccctt caccacggga taacccggcg

120

aaagtcggac taataccgta tgttgaaagg cggtgaagga tggggatgcg tccgattagc

180

tggacggcgg ggtaacggcc caccgtggca acgatcggta ggggttctga gaggaaggtc

240

ccccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt

300

ggtcaatggg cgtaagcctg aaccagccaa gtancgtgca ggatgacggc cttatggttg

360

taaactgctt ttatgcgggg atatgcaggt accgcatgaa taaggaccgg ctaattccgt

420

gccagcagcc gcggtaatac ggaaggtccg ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg

480

gagcgtaggc cgcgccttaa gcgtgttgtg aaatccggtt gctcaacatc cggcttgcag

540

cgcgaactgg ggcgcttgag tgcgcagaaa gtaggcggaa ttcgtggtgt agcagtgaaa

600

tgcttagata tcacgaggaa ctccgattgc gaaggcagcc tactgtagcg actgacgctg

660

atgctcgaaa gcgtgggtat cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gcggtaaacg

720

atggatgctc gttgtcggcc ggtcggtgac caagcgaaag cgttaagcat cccacctggg

780

gagtacgccg gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa

840

catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttacccg ggcttgaact gcggaggtgc

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa

960

cccccgtctt cagttgccat cggccgggca ctctggagat actgccaccg caaggtggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcaa atgagcacgg cccttacgtg ggctacacac gtgctacaat

1080

ggcgtacaga gggcgacgaa gccgcgaggt ggagtgaatc tcagtacgtc taagtccgga

1140

tggagtctgc aacccgaccc cagaagctgg attcgctagt aatcgcgcat cagccatggc

1200

gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc aagccatgaa agccgggggc

1260

gcctgaagtc cgtgtcggcc tagggtgaaa ccggtgattg gggctaagtc gtaacaagg

1319

<210> 1531

<211> 1470

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone AU069

<400> 1531

agagtttgat catggctcag gatgaacgct agctacaggc ctaacacatg caagtcgtgg

60

ggcagcgggt atgcttgttt tcaagtatat gccggcgacc ggcgcacggg tgagtaacgc

120

gtatccaacc tgcccatcac aagggaataa cccgtcgaaa gtcggcctaa tgccctatgt

180

attccgatga agtcctctga atcggaataa agcatttgcg gtgatggatg gggatgcgtc

240

tgattagctt gtcggcgggg taacggccca ccgaggcaac gatcagtagg ggttctgaga

300

ggaaggtccc ccacattgga actgagacac ggtccaaact cctacgggag gcagcagtga

360

ggaatattgg tcaatgggcg tgagcctgaa ccagccaagt agcgtgcagg atgacggccc

420

tatgggttgt aaactgcttt tatacgggga taaagtgagg gacgcgtccc tttttgcagg

480

taccgtatga ataaggaccg gctaattccg tgccagcagc cgcggtaata cggaaggtcc

540

tggcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggagcgcagg ctgcacttta agcgtgttgt

600

gaaatgtacc ggctcaaccg gtaacgtgca gcgcgaactg gggtgcttga gtacgaagag

660

ggaaggcgga actcgtggtg tagcggtgaa atgcttagat atcacgagga actccgatcg

720

cgaaggcagc tttccgtttc ggaactgacg ctgaggctcg aaagtgcggg tatcgaacag

780

gattaggtac cctggtagtc cgcacggtaa acgatggatg cccgctgtcg gcgccttgcg

840

ccggcggcca agcgaaagcg ttaagcatcc cacctgggga gtacgccggc aacggtgaaa

900

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggaggaaca tgtggtttaa ttcgatgata

960

cgcgaggaac cttacccggg cttgaatcgc aggaagaacg atacagagat gttgaggtcc

1020

ttcgggactc ctgcgaaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgtcggc

1080

ttaagtgcca taacgagcgc aacccctctc cccagttgcc atcgggtgat gccgggcact

1140

tcggggacac tgccgccgca aggtgcgaag aaggccggga tgacgtcaaa tcagcacggc

1200

ccttacgtcc ggggctacac acgtgttaca atggccggca cagaaggccg gtgcggcgcg

1260

agccgcatct aatcttgaaa accggtctta gttcggactg gggtctgcaa cccgacccca

1320

cgaagctgga ttcgctagta atcgcgcatc agccacggcg cggtgaatac gttcccgggc

1380

cttgtacaca ccgcccgtca agccatgaaa gccgggggtg cctgaagtcc gtgaccgcga

1440

ggatcggcct agggcaaaac tggtgattgg

1470

<210> 1532

<211> 1446

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone CY006

<400> 1532

gagtttgatt ctggctcagg atgaacgcta gctacaggcc taacacatgc gagtcgtggg

60

gcagcgggta tgcttgtttt caagtatatg ccggcgaccg gcgcacgggt gagtaacgcg

120

tatccaacct gcccatcaca agggaataac ccgtcgaaag tcggcctaat gccctatgta

180

ttccgatgaa gtcctctgaa tcggaataaa gcatttgcgg tgatggatgg ggatgcgtct

240

gattagcttg tcggcggggt aacggcccac cgaggcaacg atcagtaggg gttctgagag

300

gaaggtcccc cacattggaa ctgagacacg gtccaaactc ctacgggagg cagcagtgag

360

gaatattggt caatgggcgt gagcctgaac cagccaagta gcgtgcagga tgacggccct

420

atgggttgta aactgctttt atacggggat aaaagggtga acgtgttctc ctttgcaggt

480

accgtatgaa taaggaccgg ctaattccgt gccagcagcc gcggtaatac ggaaggtcct

540

ggcgttatcc gggtttattg ggtttaaagg gagcgcaggc tgcactttaa gcgtgttgtt

600

aaatgtgccg gctcaaccgg taacgtgcag cgcgaactgg ggtgcttgag cacgaagagg

660

gaaggcggaa ctcgtggtgt agcggtgaaa tgcttagata tcattaggaa ctccgatcgc

720

gaaggcagct ttccgtttcg gaactgacgc tgaggctcga aagtgcgggt atcgaacagg

780

attagatacc ctggtagtcc gcacggtaaa cgatggatgc tcgctgttgg atatttttat

840

tcagtggcta agtgaaaacg ttaagcatcc cacctgggga gtacgccggc aacggtgaaa

900

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggaggaaca tgtggtttaa ttcgatgata

960

cgcgaggaac cttacccggg cttgaattgc agctgaacga tccagagatg gtgaggccct

1020

tcggggcagc tgtgaaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct cgtgccgtga ggtgtcggct

1080

taagtgccat aacgagcgca acccctctcc gcagttgcca tcggttgatg ccgggcactc

1140

tgcggacact gcctccgcaa ggagtgagga aggtggggat gacgtcaaat cagcacggcc

1200

cttacgtccg gggctacaca cgtgttacaa tggcgcgtac agagtgtcgg tgctgtgcaa

1260

acagtatcta accaataaaa cgcgtcccag ttcggaccgg ggtctgcaac ccgaccccgc

1320

gaactggatt cgctagtaat cgcgcatcag ccatggcgcg gtgaatacgt tcccgggcct

1380

tgtacacacc gcccgtcaag ccatgaaagc cgmgggcgcc tgaagtccgt gaccgcaagg

1440

atcggc

1446

<210> 1533

<211> 1524

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone DA058

<400> 1533

gagtttgaty ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacccatgc aagtcgaggg

60

gcatcaaatt ggttgcttgc aaccgatgtt gscgaccggc gcacgggtga gtaacgcgta

120

tccaaccttc cctttactct ggtatagccc agcgaaagtt ggattaatac cggatgttat

180

cgaaagctct catgagactt tgatcaaaga ttttatcggt aaaggatggg gatgcgtctg

240

attaggcagt tggcggggta acggcccacc aaaccgacga tcagtagggg ttctgagagg

300

aaggtccccc acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc agcagtgagg

360

aatattggtc aatggacgta agtctgaacc agccaagtag cgtgcaggat gactgcccta

420

tgggttgtaa actgctttta tgcggggata aagtcagcca cgtgtggttg tttgcaggta

480

ccgcatgaat aaggaccggc taattccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaaggtccgg

540

gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgtaggct gttggttaag cgtgttgtga

600

aatgtagatg ctcaacatct gaattgcagc gcgaactgtc cgacttgagt gcgcggaaag

660

caggcggaat tcgttgtgta gcggtgaaat gcttagatat gacgaagaac tccgattgcg

720

aaggcagctt gctgtagcgt aactgacgct gaagctcgaa agtgcgggta tcgaacagga

780

ttagataccc tggtagtccg cacggtaaac gatggatgct cgctgtgtgc ttatttttag

840

tatgcggcta agggaaacca ttaagcatcc cacctgggga gtacgccggc aacggtgaaa

900

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggaggaaca tgtggtttaa ttcgatgata

960

cgcgaggaac cttacccggg cttgaactgc cggtgctggc atgagagatc atgctttcct

1020

tcgggacact ggtggaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct cgtgccgtga ggtgtcggct

1080

taagtgccat aacgagcgca acccctgtcg tcagttgcca tcaggtaatg ctgggcactc

1140

tggtgatact gccaccgtaa ggtgtgagga aggtggggat gacgtcaaat cagcacggcc

1200

cttacgtccg gggctacaca cgtgttacaa tggcgtgtac agcgagtcgg taccgggcaa

1260

ccggtatcca atcaatataa cacgtctcag ttcggactgg ggtctgcaac ccgaccccac

1320

gaagctggat tcgctagtaa tcgcgcatca gccatggcgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1380

ttgtacacac cgcccgtcaa gccatgaaag ccgggggcgc ttgaagtccg tgaccgcaag

1440

gatcggccta gagcgaaact ggtaattggg gctaagtcgt aacaaggtag ccgtaccgga

1500

aggtgcggct ggaacacctc cttc

1524

<210> 1534

<211> 1356

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone FL019

<400> 1534

gagtttgatt ctggctcagg atgaacgcta gctacaggcc taacacatgc aagtcgtggg

60

accggcgcac gggtgagtaa cgcgtatcca acctgcccat cacaagggaa taacccgtcg

120

aaagtcggcc taatgcccta tgtgtaaagg cggtgatgga tggggatgcg tctgattagc

180

ttgtcggcgg ggtaacggcc caccgaggcg acgatcagta ggggttctga gaggaaggtc

240

ccccacattg gaactgagac acggtccaaa ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt

300

ggtcaatggg cgtgagcctg aaccagccaa gtagcgtgca ggatgacggc ctatgggttg

360

taaactgctt ttatacgggg atatgcaggt accgtatgaa taaggaccgg ctaattccgt

420

gccagcagcc gcggtaatac ggaaggtcct ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg

480

gagcgcaggc tgcactttaa gcgtgttgtg aaatgtaccg gctcaaccgg taacgtgcag

540

cgcgaactgg ggtgcttgag tacgaagagg gaaagcggaa ctcgtggtgt agcggtgaaa

600

tgcttagata tcacgaggaa ctccgatcgc gaaggcagct ttccgtttcg actgacgctg

660

aggctcgaaa gtgcgggtat cgaacagggt tagataccct ggtagtccgc acggtaaacg

720

atggatgctc gctgttggat attcagtggc taagtgaaaa cgttaagcat cccacctggg

780

gagtacgccg gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa

840

catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttacccg ggcttgaatt gtgaaggtgc

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa

960

cccctctccg cagttgccat cggccgggca ctctgcggac actgcctccg caaggaggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg cccttacgtc cggggctaca cacgtgttac

1080

aatggcgcgc agagtgtcgg tgctgtgcaa acagtatcta atcaatcgcg tcccagttcg

1140

gacggggtct gcaacccgac cccggaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg

1200

gcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg aaagccgggg

1260

gcgcctgaag tccgttcggc ctagggcgag accggtgatt ggggctaagt cgtaacaagg

1320

tagccgtacc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctt

1356

<210> 1535

<211> 1356

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone FU048

<400> 1535

gagtttgatt ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc aagtcgaggg

60

accggcgcac gggtgagtaa cgcgtatcca accttcccat tactgtggaa taacctgccg

120

aaaggcagac taataccgca tggttaaagt cggtaatgga tggggatgcg tctgattagc

180

ttgttggcgg ggtaacggcc caccaaggcg acgatcagta ggggttctga gaggaaggtc

240

ccccacatcg gaactgagac acggtccaaa ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt

300

ggtcaatgga cgtaagtctg aaccagccaa gtagcgtgca ggatgacggc ctatgggttg

360

taaactgctt ttgtatgggg atatgcaggt accatacgaa taaggaccgg ctaattccgt

420

gccagcagcc gcggtaatac ggaaggtcca ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg

480

gagcgtaggc cggagattaa gtgtgttgtg aaatgtagac gctcaacgtc tgacttgcag

540

cgcatactgg tttccttgag tacgcacaac gttggcggaa ttcgtcgtgt agcggtgaaa

600

tgcttagata tgacgaagaa ctccgattgc gaaggcagct gacgggagcg actgacgctt

660

aagctcgaag gtgcgggtat caaacaggat tagataccct ggtagtccgc acagtaaacg

720

atggatgccc gctgttggta tatcagcggc taagcgaaag cattaagcat cccacctggg

780

gagtacgccg gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa

840

catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttacccg ggcttgaatt gtgaaggtgc

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa

960

cccctctctt cagttgccat cagctgggca ctctggagac actgccaccg taaggtggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg cccttacgtc cggggctaca cacgtgttac

1080

aatggccggc agagggacgg tgtaatgcaa attgcatcca atcttgccgg tcccagttcg

1140

gatggggtct gcaacccgac cccagaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg

1200

gcgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcaagccatg aaagccgggg

1260

gtgcctgaag tccgttcggc ctagggcaaa actggtgatt ggggctaagt cgtaacaagg

1320

tagccgtacc ggaaggtgcg gttggatcac ctcctt

1356

<210> 1536

<211> 1354

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone FW035

<400> 1536

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc aagtcgaggg

60

accggcgaat gggtgagtaa cgcgtatcca acctgccccc ggctggggta taacccgtcg

120

aaaggcggcc taatccccca tggttaaagc cggccgggga tggggatgcg tccgattagc

180

ttgctggtga ggtaacggct caccagggca tcgatcggta ggggttctga gaggaaggtc

240

ccccacactg gtactgagac acggaccaga ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt

300

ggtcaatggg cgcaagcctg aaccagccaa gtagcgtgca ggatgaaggc ctatgggtcg

360

taatctgctt ttatgtgggg atatgcaggt accacatgaa taaggaccgg ctaattccgt

420

gccagcagcc gcggtaatac ggaaggtccg ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg

480

gagcgtaggc cgcctcttaa gcgtgttgtg aaaaccgggc gctcaccgtc cggcttgcag

540

cgcgaactgg ggggcttgag tgcgtgcgac gccggcggaa ttcgtcgtgt agcggtgaaa

600

tgcttagata tgacgaggaa ctccgattgc gaaggcagct ggcgagtgcg actgacgcta

660

atgctcgaag gcgcgggtat cgaacaggat tagataccct ggtagtccgc gctgtaaacg

720

atggatgccc gccgtgggta tttccgcggc caagcgaaag cgttaagcat cccacctggg

780

gagtacgccg gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa

840

catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttacccg ggcttgaatt gcgaaggtgc

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa

960

cccctctccg cagttgccat cggccgggca ctctgcggac actgccgccg caaggtggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg cccttacgtc cggggctaca cacgtgttac

1080

aatggccggc agagagttgc gcgcgcaagc gttgccaatc cctccggcct cagttcggat

1140

ggggtctgca acccgacccc agaagctgga ttcgctagta atcgcgcatc agccatggcg

1200

cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca agccatgaaa gctgggggcg

1260

cctgaagtcc gtgtcggcct agggcgaaac cggtgattgg ggctaagtcg taacaaggta

1320

gccgtaccgg aaggtgcggc tggatcacct cctt

1354

<210> 1537

<211> 1356

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone GI030

<400> 1537

gagtttgatt ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc aagtcgaggg

60

accggcgcac gggtgagtaa cgcgtatcca acctacccat tactgtggga taacctgccg

120

aaaggcagac taataccgca tggttaaagt cggtaatgga tggggatgcg tctgattagc

180

ttgttggcgg ggtaacggcc caccaaggca acgatcagta ggggttctga gaggaaggtc

240

ccccacattg gaactgagac acggtccaaa ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt

300

ggtcaatgga cggaagtctg aaccagccaa gtagcgtgca ggatgacggc ctatgggttg

360

taaactgctt ttgtatgggg atatgcaggt accatacgaa taaggaccgg ctaattccgt

420

gccagcagcc gcggtaatac ggaaggtcca ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg

480

gagcgtaggc cggagattaa gtgtgttgtg aaatgtagac gctcaacgtc tgacttgcag

540

cgcatactgg tttccttgag tacgcacaac gttggcggaa ttcgtcgtgt agcggtgaaa

600

tgcttagata tgacgaagaa ctccgattgc gaaggcagct gacgggagcg actgacgctt

660

aagctcgaag gtgcgggtat cgaacaggat tagataccct ggtagtccgc acagtaaacg

720

atggatgccc gctgttggta tatcagcggc taagcgaaag cattaagcat cccacctggg

780

gagtacgccg gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg ggcctgcaca agcggaggaa

840

catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttacccg ggcttgaatt gtgaaggtgc

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa

960

cccctctctt cagttgccat cagctgggca ctctggagac actgccaccg taaggtggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg cccttacgtc cggggctaca cacgtgttac

1080

aatggccggc agagggatgg tgtaatgcaa attgcatcaa atcttgccgg tcccagttcg

1140

gatggggtct gcaacccgac cccagaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg

1200

gcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccacccg tcaagccatg aaagccgggg

1260

gtgcctgaag tccgttcggc ctagggcaaa actggtgatt ggggctaagt cgtaacaagg

1320

tagccgtacc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctt

1356

<210> 1538

<211> 1356

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone GI032

<400> 1538

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc aagtcgaggg

60

accggcgcac gggtgagtaa cgcgtatcca acctgcctct gactaaggga taacccggcg

120

aaagtcggac taatacctta tgaggaaagt cggtcagtga tggggatgcg tctgattagc

180

ttgttggcgg ggtaacggcc caccaaggca acgatcagta ggggttctga gaggaaggtc

240

ccccacattg gaactgagac acggtccaaa ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt

300

ggtcaatggg cgagagcctg aaccagccaa gtagcgtgca ggatgacggc ctatgggttg

360

taaactgctt ttatgtgggg atatgcaggt accacatgaa taaggaccgg ctaattccgt

420

gccagcagcc gcggtaatac ggaaggtcca ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg

480

gagcgtaggc cgtggattaa gcgtgttgtg aaatgtagac gctcaacgtc tgaattgcag

540

tgcgaactgg ttcacttgag tatgcacaac gtaggcggaa ttcgtcgtgt agcggtgaaa

600

tgcttagata tgacgaagaa ctccgattgc gaaggcagct tacgggagca actgacgctg

660

aagctcgaag gtgcgggtat caaacaggat tagataccct ggtagtccgc acagtaaacg

720

atggatgccc gttgttagtt aattagcgac caagcgaaag cattaagcat cccacctggg

780

gagtacgccg gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa

840

catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttacccg ggcttgaatt gtgaaggtgc

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt aagtgccata acgggcgcaa

960

cccctctctt cagttgccat cagctgggca ctctggagac actgccaccg taaggtggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg cccttacgtc cggggctaca cacgtgttac

1080

aatggccggc agagggacgg tgtaatgcaa attgcatcca atcttgccgg tcccagttcg

1140

gatggggtct gcaacccgac cccagaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg

1200

gcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg aaagccgggg

1260

gtgcctgaag tccgttcggc ctagggcaaa actggtaatt ggggctaagt cgtaacaagg

1320

tagccgtacc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctt

1356

<210> 1539

<211> 1341

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone GI059

<400> 1539

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc aagtcgaggg

60

accggcgcac gggtgagtaa cgcgtatcca accttcccat tactgtggga taacctgccg

120

gaaggcagac taatacctca tagttaaagt cggtaatgga tggggatgcg tctgattagc

180

ttgttggcgg ggtaacggcc caccaaggca acgatcagta ggggttctga gaggaaggtc

240

ccccacattg gaactgagac acggtccaaa ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt

300

ggtcaatgga cgtaagtctg aaccagccaa gtagcgtgca ggatgacggc ctatgggttg

360

taaactgctt ttgtatgggg atatgcaggt accatacgaa taaggaccgg ctaattccgt

420

gccagcagcc gcggtaatac ggaaggttcg ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg

480

gagcgtaggc cggagattaa gtgtgttgtg aaatgtagac gctcaacgtc tgacttgcag

540

cgcatactgg tttccttgag tacgcacaac gttggcggaa ttcgtcgtgt agcggtgaaa

600

tgcttagata tgacgaagaa ctccgattgc gaaggcagct gacgggagcg actgacgctg

660

aagctcgaag gtgcgggtat cgaacaggat tagataccct ggtagtccgc acagtaaacg

720

atggatgccc gctgttggta tatcagcggc taagcgaaag cattaagcat cccacctggg

780

gagtacgccg gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa

840

catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttacccg ggcttgaatt gtgaaggtgc

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa

960

cccctctctt cagttgccat cagctgggca ctctggagac actgccaccg taaggtggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg cccttacgtc cggggctaca cacgtgttac

1080

aatggccggc agagggacgg tgtaatgcaa attgcatcca atcttgccgg tcccagttcg

1140

gatggggtct gcaacccgac cccagaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg

1200

gcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg aaagccgggg

1260

gtgcctgaag tccgttcggc ctagggcaaa actggtaatt ggggctaagt cgtaacaagg

1320

tagccgtacc ggaaggtgcg g

1341

<210> 1540

<211> 1357

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone GU027

<400> 1540

gagtttgatt ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc aagtcgcggg

60

accggcgcac gggtgagtaa cgcgtatcca acctgccctt caccacggga taacccggcg

120

aaagtcggac taataccgta tgttgaaagg cggtgaagga tggggatgcg tccgattagc

180

cagacggcgg ggtaacggcc caccgtggcg acgatcggta ggggttctga gaggaaggtc

240

ccccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt

300

ggtcaatggg cgtaagcctg aaccagccaa gtagcgtgca ggatgacggc ctatgggttg

360

taaactgctt ttatgcgggg atatgcaggt accgcatgaa taaggaccgg ctaattccgt

420

gccagcagcc gcggtaatac ggaaggtccg ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg

480

gagcgtaggc cgcgccttaa gcgtgttgtg aaatccgggt gctcaacatc cggcttgcag

540

cgcgaactgg ggcgcttgag tgcgcagaaa gtaggcggaa ttcgtggtgt agcggtgaaa

600

tgcttagata tcacgaggaa ctccgattgc gaaggcagcc tactgtagcg actgacgctg

660

atgctcgaaa gcgtgggtat cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gcggtaaacg

720

atggatgctc gttgtcggcc ggtcggtgac caagcgaaag cgttaagcat cccacctggg

780

gagtacgccg gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa

840

catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttacccg ggcttgaact gcggaggtgc

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa

960

cccccgtctt cagttgccat cggccgggca ctctggagat actgccaccg caaggtggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg cccttacgtc cggggctaca cacgtgttac

1080

aatggcgcac agagagtcgg tggcatgcga gtgccatcca atcctctgcg tctcagttcg

1140

gatggggtct gcaacccgac cccagaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg

1200

gcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg aaagccgggg

1260

gcgcctgaag tccgtgtcgg cctagggtga aaccggtgat tggggctaag tcgtaacaag

1320

gtagccgtac cggaaggtgc ggctggatca cctcctt

1357

<210> 1541

<211> 1357

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone HF050

<400> 1541

gagtttgatt ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc aagtcgaggg

60

accggcgcac gggtgcgtaa cgcgtatcaa acctgcctca tactcgggga tagccttgcg

120

aaagtaagat taatacccga tgttcaaagt cggtatgaga tggtgatgcg tccgattagg

180

tagtaggcgg ggtaacggcc cacctagcct tcgatcggta ggggttctga gaggaaggtc

240

ccccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt

300

ggtcaatgga cgcaagtctg aaccagccaa gtagcgtgca ggatgacggc ctctgggttg

360

taaactgctt ttagttggga atatgtatgt accttcagaa aaaggaccgg ctaattccgt

420

gccagcagcc gcggtaatac ggaaggtcca ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg

480

gagcgtaggc ggattattaa gtcagtggtg aaagacggtg gctcaaccat cgttaaccat

540

tgaaactggt agtcttgagt gcagacaggg atgctggaac tcgtggtgta gcggtgaaat

600

gcttagatat cacgatgaac tccgatcgcg aaggcaggtg tccgggctga ctgacgctga

660

ggctcgaaag tgtgggtatc acacaggatt agataccctg gtagtccaca cagtaaacga

720

tgtatactcg cggtttgcga gtaagccgcc aagcgaaagc attaagtata ccacctgggg

780

agtacgccgg caacggtgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggaggaac

840

atgtggttta attcgatgat acgcgaggaa ccttacccgg gcttgaacta tggaggtgct

900

gcatggttgt cgtcagctcg tgccgtgagg tgtcggctta agtgccataa cgagcgcaac

960

ccttttcctt ggttgccatc agctgggcac tccagggaaa ctgccatcgg taagatggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcga atcagcacgg cccttacgtc cggggctaca cacgtgttac

1080

aatggggggc agaaggtcgc tacctggtga caggatgcta atctgccctc tctcagttcg

1140

gatggagtct gcaacccgac tccagaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg

1200

gcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg aaagccgggg

1260

gtgcctgaaa gccgtgtcgg cctagggtaa aactggtgat tggggctaag tcataacaag

1320

gtacccgtac cggaaggtgc ggctggaaca cctcctt

1357

<210> 1542

<211> 1518

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone ID019

<400> 1542

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc aagtcgaggg

60

gcagcatgga agaagcttgc ttcttctgat ggcgaccggc gcacgggtgc gtaacgcgta

120

tcaaacctgc ctcatactcg gggatagcct tgcgaaagta agattaatac ccgatgttat

180

tagttctccg catggtggac taatcaaaga tttatcggta tgagatggtg atgcgtccga

240

ttaggtagta ggcggggtaa cggcccacct agccttcgat cggtaggggt tctgagagga

300

aggtccccca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgagga

360

atattggtca atggacgaaa gtctgaacca gccaagtagc gtgcaggatg acggccctcc

420

gggttgtaaa ctgctttcag tcgggaataa aaaaagggac gtgtccctta ttgtatgtac

480

cttcagaaaa aggaccggct aattccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg aaggtccagg

540

cgttatccgg atttattggg tttaaaggga gcgtaggcgg attgttaagt cagcggttaa

600

agggtgtggc tcaaccatac attgccgttg aaactggcga tcttgagtgc agacagggat

660

gccggaattc gtggtgtagc ggtgaaatgc ttagatatca tgaagaactc cgatcgcgaa

720

ggcaggtgtc cgggctgcaa ctgacgctga ggctcgaaag tgtgggtatc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtccaca cagtaaacga tgtatactcg cggtttgcga tagattgtaa

840

gccgccaagc gaaagcatta agtataccac ctggggagta cgccggcaac ggtgaaactc

900

aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg aggaacatgt ggtttaattc gatgatacgc

960

gaggaacctt acccgggctt gaactaacgg tgacgaatct agagatagat ttttcttcgg

1020

acaccgttgg aggtgctgca tggttgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt cggcttaagt

1080

gccataacga gcgcaaccct tctcctcggt tgccatcggg taatgccggg cactccgtgg

1140

acactgccat cgtaagatgt gaggaaggtg gggatgacgt caaatcagca cggcccttac

1200

gtccggggct acacacgtgt tacaatggcc ggtacagagg gatggtgtaa tgcaaattgc

1260

atcatatctt gaaagccggt cccagttcgg actggggtct gcaacccgac cccacgaagc

1320

tggattcgct agtaatcgcg catcagccat ggcgcggtga atacgttccc gggccttgta

1380

cacaccgccc gtcaagccat gaaagccggg ggtgcctgaa gtccgtgacc gcaaggatcg

1440

gcctagggca aaactggtga ttggggctaa gtcgtaacaa ggtagccgta ccggaaggtg

1500

cggctggaac acctcctt

1518

<210> 1543

<211> 1269

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone IDR-CEC-0055

<400> 1543

tcctggctca ggatgaacgc tagctacagg cttaacacat gcaagtcgag ggaccggcgc

60

acgggtgagt aacgcgtatc caaccttccc ataactaagg aataccccgt agaaatgcgg

120

cctaatccct tatggttaaa gtcggttatg gatggggatg cgtctgatta gcttgctggc

180

ggggtaacgg cccaccaggg catcgatcag taggggttct gagaggaagg tcccccacat

240

tggaactgag acacggtcca aactcctacg ggaggcagca gtgaggaata ttggtcaatg

300

ggcggaagcc tgaaccagcc aagtagcgtg caggatgacg gcctatgggt cgtaaactgc

360

tttttaaggt gaatatgcat gtagccttgg aataaggacc ggctaattcc gtgccagcag

420

ccgcggtaat acggaaggtc caggtgttat ccggatttat tgggtttaaa gggagcgtag

480

gccgcaggtt aagtgtgttg tgaaaagcag tcgcccaacg tctgccttgc agcgcaaact

540

gtcctgcttg agtgcgcaca acgcaggcgg aattcgtcgt gtagcggtga aatgcttaga

600

tatgacgaag aactccgatt gcgaaggcag cttgcgggag cgactgacgc tgaagctcga

660

aagtgcgggt atcgaacagg attagatacc ctggtagtcc gcacggtaaa cgctggatgc

720

ccgtttttgg ctagtcagag accaagcgaa agcattaagc atcccacctg gggagtacgc

780

cggcaacggt gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggagg aacatgtggt

840

ttaattcgat gatacgcgag gaaccttacc cgggcttgaa ttgtgaaggt gctgcatggt

900

tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgtcggc ttaagtgcca taacgagcgc aacccctttc

960

ttcagttgcc atcggccggg cactctgtag atactgccgc cgtaaggtgg aggaaggtgg

1020

ggatgacgtc aaatcagcac ggcccttacg tccggggcta cacacgtgtt acaatggggg

1080

gcagcgagcg ggatgcccgc aaggtcattc aaatcaatcc cccctcagtt cggatggggt

1140

ctgcaacccg accccagaag ctggattcgc tagtaatcgc gcatcagcca tggcgcggtg

1200

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagcca tgaaagccgg gggtgcctga

1260

agtccgtac

1269

<210> 1544

<211> 1355

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone IK053

<400> 1544

gagtttgatt ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc aagtcgcggg

60

accggcgcac gggtgagtaa cgcgtatcca acctacctat taccacggga taacccggcg

120

aaagtcggac taataccgta tgtgtaaagc ggtaatagat ggggatgcgt ccgattagtt

180

agttggcggg gtaacggccc accaagacgt cgatcggtag gggttctgag aggaaggtcc

240

cccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg aggaatattg

300

gtcaatgggc gtaagcctga accagccaag tagcgtgcag gatgacggcc tatgggttgt

360

aaactgcttt tatgcaagaa tatgcaggta ttgcatgaat aaggaccggc taattccgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg gaaggtccga gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg

480

agcgtaggcg gccttttaag cgtgttgtga aattcagttg ctcaacatct gacttgcagc

540

gcgaactggg gggcttgagt atgctgaagg taggcggaat tcgtggtgta gcggtgaaat

600

gcttagatat cacgaagaac tccgattgcg aaggcagctt actgcagcta ctgacgctga

660

tgctcgaaag cgtgggtatc gaacaggatt agataccctg gtagtccacg cggtaaacga

720

tggatgctcg ttgttggtat atcagtgacc aagtgaaaac gttaagcatc ccacctgggg

780

agtacgccgg caacggtgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggaggaac

840

atgtggttta attcgatgat acgcgaggaa ccttacccgg gcttgaactg cggaggtgct

900

gcatggttgt cgtcagctcg tgccgtgagg tgtcggctta agtgccataa cgagcgcaac

960

ccctttttat agttgccatc ggccgggcac tctgtagata ctgccgccga aggtggagga

1020

aggcggggat gacgtcaaat catcacggcc cttacgtccg gggctacaca cgtgttacaa

1080

tggcgcgcag cgagttggtg ttatgtgagt agcatctaat cctgcgcgcc tcagttcgga

1140

tggggtctgc aacccgaccc cagaagctgg attcgctagt aatcgcgcat cagccatggc

1200

gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc aagccatgaa agccgggggc

1260

gcctgaagtc cgtgtcggcc taaggtgaaa ccggtgattg gggctaagtc gtaacaaggt

1320

agccgtaccg gaaggtgcgg ctggatcacc tcctt

1355

<210> 1545

<211> 1356

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone IK062

<400> 1545

gagtttgatt ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc aagtcgaggg

60

accggcgcac gggtgcgtaa cgcgtatcaa acctgcctca tactcgggga tagccttgcg

120

aaagtaagat taatacccga tgttcaaagt cggtatgaga tggtgatgcg tccgattagg

180

tagtaggcgg ggtaacggcc cacctagcct tcgatcggta ggggttctga gaggaaggtc

240

ccccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt

300

ggtcaatgga cgaaagtctg aaccagccaa gtagcgtgca ggatgacggc ctctgggttg

360

taaactgctt ttagttggga atatgtatgt accttcagaa aaaggaccgg ctaattccgt

420

gccagcagcc gcggtaatac ggaaggtcca ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg

480

gagcgtaggc ggattattaa gtcagtggtg aaagacggtg gctcaaccat cgttagccat

540

tgaaactggt agtcttgagt gcagacaggg atgctggaac tcgtggtgta gcggtgaaat

600

gcttagatat cacgatgaac tccgatcgcg aaggcaggtg tccgggctga ctgacgctga

660

ggctcgaaag tgtgggtatc aaacaggatt agataccctg gtagtccaca cagtaaacga

720

tgtatactcg cggtttgcgt gtaagccgcc aagcgaaagc attaagtata ccacctgggg

780

agtacgccgg caacggtgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggaggaac

840

atgtggttta attcgatgat acgcgaggaa ccttacccgg gcttgaacta tggaggtgct

900

gcatggttgt cgtcagctcg tgccgtgagg tgtcggctta agtgccataa cgagcgcaac

960

ccttttcctt ggttgccatc agctgggcac tccagggata ctgccatcgt aagatggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaaa tcagcacggc ccttacgtcc ggggctacac acgtgttaca

1080

atggggggca gaaggtcgct acctggtgac aggatgctaa tctcacctct ctcagttcgg

1140

atggagtctg caacccgact ccagaagctg gattcgctag taatcgcgca tcagccatgg

1200

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt caagccatga aagccggggg

1260

tgcctgaaag ccgtgtcggc ctagggtaaa actggtgatt ggggctaagt cgtaacaagg

1320

tagccgtacc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctt

1356

<210> 1546

<211> 1285

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral clone P4PB_83 P2

<400> 1546

gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg gaccggcgca cgggtgagta

60

tcgcgtatcc aaccttccca ttactgtggg ataacctgcc gaaaggcaga ctaataccgc

120

atggttaaag tcggtaatgg atggggatgc gtctgattag cttgttggcg gggtaacggc

180

ccaccaaggc gacgatcagt aggggttctg agaggaaggt cccccacatt ggaactgaga

240

cacggtccaa actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat tggtcaatgg acgtaagtct

300

gaaccagcca agtagcgtgc aggatgacgg cctatgggtt gtaaactgct tttacagggg

360

aatatgcatg taccctgcga ataaggaccg gctaattccg tgccagcagc cgcggtaata

420

cggaaggtcc tggtgttatc cggatttatt gggtttaaag ggagcgtagg ccgtagatta

480

agtgtgttgt gaaatgtagt cgcccaacgt ctgccttgca gcgcaaactg gtttacttga

540

gtacgcacaa cgcaggcgga attcgtcgtg tagcggtgaa atgcttagat atgatgaaga

600

actcctattg cgaaggcagc ttgcgggagc gactgacgct gaggctcgaa agtgcgggta

660

tcgaacagga ttagataccc tggtagtccg cacggtaaac gatggatgcc cgtttttggc

720

tagccagaga ccaagcgaaa gcattaagca tcccacctgg ggagtacgcc ggcaacggtg

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggagga catgtggtta attcgatgat

840

acgcgaggaa ccttacccgg gcttgaattg tgaaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg

900

tgccgtgagg tgtcggctta agtgccataa cgagcgcaac ccctctcttc agttgccatc

960

agctgggcac tctggagaca ctgccaccgt aaggtggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1020

tcagcacggc ccttacgtcc ggggctacac acgtgttaca atggccggca gagggatggt

1080

gtaatgcaaa ttgcatcaaa tcttgccggt cccggttcgg atggggtctg caacccgacc

1140

ccagaagctg gattcgctag taatcgcgca tcagccatgg cgcggtgaat acgttcccgg

1200

gccttgtaca caccgcccgt caagccatga aagccggggg tgcctgaagt tcgtagcgac

1260

ctagggcaaa actggtgatg ggggc

1285

<210> 1547

<211> 1508

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral taxon 292

<400> 1547

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg

60

ggaaacgggg gaatagcttg ctattctttg tcgtcgaccg gcgcacgggt gagtaacgcg

120

tatccaacct tcccataact aaggaatacc ccgtagaaat gcggcctaat cccttatggt

180

ctcttatgcc tgtcatggga ataagagtaa agatttatcg gttatggatg gggatgcgtc

240

tgattagctt gctggcgggg taacggccca ccagggcatc gatcagtagg ggttctgaga

300

ggaaggtccc ccacattgga actgagacac ggtccaaact cctacgggag gcagcagtga

360

ggaatattgg tcaatgggcg taagcctgaa ccagccaagt agcgtgcagg atgacggccc

420

tatgggttgt aaactgcttt ttaaggtgaa taaagagggg cacgcgtgcc ctgttgcatg

480

tagccttgga ataaggaccg gctaattccg tgccagcagc cgcggtaata cggaaggtcc

540

gggtgttatc cggatttatt gggtttaaag ggagcgtags ccgcaggtta agtgtgttgt

600

gaaaagcagt cgcccaacgt ctgccttgca gcgcaaactg tcctgcttga gtgcgcacaa

660

cgcaggcgga attcgtcgtg tagcggtgaa atgcttagat atgacgaaga actccgattg

720

cgaaggcagc ttgcgggagc gcaactgacg ctgaagctcg aaagtgcggg tatcgaacag

780

gattagatac cctggtagtc cgcacggtaa acgctggatg cccgtttttg gcttatttta

840

agtcagagac caagcgaaag cattaagcat cccacctggg gagtacgccg gcaacggtga

900

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa catgtggttt aattcgatga

960

tacgcgagga accttacccg ggcttgaatt gccagagacg gctccagaga tggagcttcc

1020

cttcggggct ctggtgaagg tgctgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgccgt gaggtgtcgg

1080

cttaagtgcc ataacgagcg caaccccttt cttcagttgc catcgggtaa tgccgggcac

1140

tctgtagata ctgccgccgt aaggtgtgag gaaggtgggg atgacgtcaa atcagcacgg

1200

cccttacgtc cggggctaca cacgtgttac aatggtcgga gcagcaggaa gctacctggc

1260

gacaggatgc tgatcccgaa acccggcctc agttcggact ggagtctgca acccgactcc

1320

acgaagccgg attcgctagt aatcgcgcat cagccatggc gcggtgaata cgttcccggg

1380

ccttgtacac accgcccgtc aagccatgaa agccgggggt gcctgaaagc cgtgaccgcg

1440

agggtcggcc tagggtaaaa ccggtgattg gggctaagtc gtaacaaggt agccgtaccg

1500

gaaggtgc

1508

<210> 1548

<211> 1533

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral taxon 299

<400> 1548

ttacaatgta gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc

60

aagtcgaggg gcagcatgtt ggttgcttgc aaccaatgat ggcgaccggc gcacgggtga

120

gtaacgcgta tccaacctac ccaatactca ggcataaccc gttgaaagac ggactaattc

180

ctgatggtat gtatttttct catgatttat acattaaaga acttcggtat tggatgggga

240

tgcgtctgat tagtttgttg gtgaggtaac ggctcaccaa ggcatcgatc agtaggggtt

300

ctgagaggaa ggtcccccac attggaactg agacacggtc caaactccta cgggaggcag

360

cagtgaggaa tattggtcaa tggatgaaaa tctgaaccag ccaagtagcg tgcaggatga

420

cggccctatg ggttgtaaac tgcttttatg tgagaataaa gttaggtatg tatacttatt

480

tgcatgtatc acatgaataa ggaccggcta attccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga

540

aggtccaggc gttatccgga tttattgggt ttaaagggtg cgtaggccgt ttgataagcg

600

tgctgtgaaa tatagtggct caacctctat cgtgcagcgc gaactgtcga acttgagtgc

660

gtagtaggta ggcggaattc gtggtgtagc ggtgaaatgc ttagatatca cgaagaactc

720

cgattgcgaa ggcagcttac cgtaacgtta ctgacgctta agcacgaagg tgcgggtatc

780

gaacaggatt agataccctg gtagtccgca cagtaaacga tggatgctcg ctgttggcct

840

tttatggtca gtggcttagc gaaagcgtta agcatcccac ctggggagta cgccggcaac

900

ggtgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg aggaacatgt ggtttaattc

960

gatgatacgc gaggaacctt acccgggctt gaactgcagc tgaacgattc agagatgatg

1020

aggcccttcg gggcagctgt ggaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt

1080

gtcggcttaa gtgccataac gagcgcaacc ccttttctta gttgccatca ggtaatgctg

1140

ggcactctgg gaatactgcc accgtaaggt gtgaggaagg tggggatgac gtcaaatcag

1200

cacggccctt acgtccgggg ctacacacgt gttacaatgg cgcatacaga atgttggttt

1260

catgcaaatg agatctaatc ttcaaagtgc gtctcagttc ggactggggt ctgcaacccg

1320

accccacgaa gctggattcg ctagtaatcg cgcatcagcc atggcgcggt gaatacgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcaagcc atgaaagccg ggggcgccta aagtccgtga

1440

ccgcaagggt cggcctaggg tgaaactggt gattggggct aagtcgtaac aaggtagccg

1500

taccggaagg tgcggctgga acacctcctt tct

1533

<210> 1549

<211> 1209

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral taxon 300

<400> 1549

gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg ggaaacggga gaatagcttg

60

ctattctttg tcgtcgaccg gcgcacgggt gagtaacgcg tatccaacct tcccatagct

120

aaggaatacc ccgtagaaat gcggcctaat cccttatggt ctcttatacc tgacatcgga

180

ataagagtaa agatttatcg gttatggatg gggatgcgtc tgattagctt gctggcgggg

240

taacggccca ccagggcatc gatcagtagg ggttctgaga ggaaggtccc ccacattgga

300

actgagacac ggtccaaact cctacgggag gcagcagtga ggaatattgg tcaatgggcg

360

agagcctgaa ccagccaagt agcgtgcagg atgacggccc tatgggtgtg taaactgctt

420

tttaaggtga ataaagaagg gcacgtgtgc cctgttgcat gtagccttgg aataaggacc

480

ggctaattcc gtgccagcag ccgcggtaat acggaaggtc caggtgttat ccggatttat

540

tgggtttaaa gggagcgtag gccgcaggtt aagtgtgttg tgaaaagcag tcgcccaacg

600

tctgccttgc agcgcaaact gtcctgcttg agtgcgcaca acgcaggcgg aattcgtcgt

660

gtagcggtga aatgcttaga tatgacgaag aactccgatt gcgaaggcag cttgcgggag

720

cgcaactgac gctgaagctc gaaagtgcgg gtatcgaaca ggattagata ccctggtagt

780

ccgcacggta aacgctggat gcccgttttt ggcttatttt aagtcagaga ccaagcgaaa

840

gcattaagca tcccacctgg ggagtacgcc ggcaacggtg aaactcaaag gaattgacgg

900

gggcccgcac aagcggagga acatgtggtt taattcgatg atacgcgagg aaccttaccc

960

ggggcttgaa ttgccagaga cggctccaga gatggagctt cccttcgggg gctctggtga

1020

cggtgctgca tgggttgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg tcagcttaag tgccataacg

1080

agcgcacccc ctttcttcag ttgccatcgg ggtattgccc tggcactctg taaaatccgc

1140

cgccgatcgg gttgaggaag ggtgggacta cgtcaaatag caggccctac gtcgggctaa

1200

caggttaaa

1209

<210> 1550

<211> 1521

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral taxon 302

<400> 1550

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg

60

ggaaacgaca ttgaaagctt gcttttaatg ggcgtcgacc ggcgcacggg tgcgtaacgc

120

gtatcgaacc tgccctttac tcagggatag ccttgcgaaa gtaagattaa tacctgatag

180

tgttgtgatg aggcatcttg ttgcaactaa agatttattg gtaaaggatg gcgatgcgtc

240

tgattaggta gtaggcgggg taacggccca cctagccgac gatcagtagg ggttctgaga

300

ggaaggtccc ccacattgga actgagacac ggtccaaact cctacgggag gcagcagtga

360

ggaatattgg tcaatgggcg agagcctgaa ccagccaagt agcgtgcagg atgacggccc

420

tctgggttgt aaactgcttt tagttgggaa caaaaaaggc gacgtgtcgc ctctggagtg

480

taccatcaga aaaaggaccg gctaattccg tgccagcagc cgcggtaata cggaaggtcc

540

aggcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggagcgtagg cggacgatta agtcagctgt

600

gaaagtttgc ggctcaaccg taaaattgca gttgaaactg gttgtcttga gtgcacgcag

660

ggatgttgga attcatggtg tagcggtgaa atgcttagat atcatgaaga actccgatcg

720

cgaaggcata tgtccggagt gcaactgacg ctgaggctcg aaagtgcggg tatcgaacag

780

gattagatac cctggtagtc cgcacagtaa acgatgaata ctcgcagtat gcgatatagt

840

gtatgctgcc aagtgaaaac gttaagtatt ccacctgggg agtacgccgg caacggtgaa

900

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggaggaac atgtggttta attcgatgat

960

acgcgaggaa ccttacccgg gcttgaacta agcaggaaga tgggcagaga ggcctgttgt

1020

cttcggacct gcttggaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgtcggc

1080

ttaagtgcca taacgagcgc aacccttctc cacgtttgcc atcaggtaga gctgggcact

1140

ccgtggatac tgccatcgta agatgtgagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcagcacggc

1200

ccttacgtcc ggggctacac acgtgttaca atggccggta cagagggaag ccaccaggcg

1260

actgggcgct gatccattaa aaccggtctc agttcggact ggagtctgca acccgactcc

1320

acgaagctgg attcgctagt aatcgcgcat cagccatggc gcggtgaata cgttcccggg

1380

ccttgtacac accgcccgtc aagccatgaa agccgggggt gcctgaaagc tgtgaccgta

1440

aggggcggcc tagggtaaaa ccggtgattg gggctaagtc gtaacaaggt agccgtaccg

1500

gaaggtgcgg ctggaacacc t

1521

<210> 1551

<211> 1505

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral taxon 310

<400> 1551

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc aagtcgaggg

60

gaaacggcat ttagtgcttg caccgaatgg acgtcgaccg gcacacgggt gagtaacgcg

120

tatccaacct tcccacaact aagggataac ctgccgaaag gcagactaat accttatgta

180

atcctttgat ggcatcagat aaggataaaa gatttatcgg taaaggatgg ggatgcgtct

240

gattagcttg ttggtgaggt aaaggctcac caaggcgacg atcagtaggg gttctgagag

300

gaaggtcccc cacattggaa ctgagacacg gtccaaactc ttacgggagg cagcagtgag

360

gaatattggt caatgggcgg aagcctgaac cagccaagta gcgtgcagga agacggccct

420

atgggttgta aactgctttt atacgagaat aatttgatgc acgtgtgcgt tattgcatgt

480

atcgtatgaa taaggaccgg ctaattccgt gccagcagcc gcggtaatac ggaaggtcca

540

ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg gagtgtaggc ggtttgttaa gcgtgttgtg

600

aaatttaggt gctcaacatt taacttgcag cgcgaactgt cagtcttgag tacacgcaac

660

gtatgcggaa ttcatggtgt agcggtgaaa tgcttagata tcatgaagaa ctccgattgc

720

gaaggcagca tacgggagtg taactgacgc ttaagctcga aggtgcgggt atcgaacagg

780

attagatacc ctggtagtcc gcacagtaaa cgatggatgc ccgctgttag cgcctggcgt

840

tagcggctaa gcgaaagcat taagcatccc acctggggag tacgccggca acggtgaaac

900

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat tcgatgatac

960

gcgaggaacc ttacccgggc ttgaattgca gaggaattat ttagagataa atacgccctt

1020

cggggtctct gtgaaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt

1080

aagtgccata acgagcgcaa ccccttttct tagttgccat caggtaatgc tgggcactct

1140

gggaacactg ccaccgcaag gtgtgaggaa ggtggggatg acgtcaaatc agcacggccc

1200

ttacgtccgg ggctacacac gtgttacaat ggccggtaca gagggatggt gtaatgcaaa

1260

ttgcatcaaa tcttaaaagc cggtcccagt tcggactgag gtctgcaacc cgacctcacg

1320

aagctggatt cgctagtaat cgcgcatcag ccatggcgcg gtgaatacgt tcccgggcct

1380

tgtacacacc gcccgtcaag ccatgaaagc cgggggtgcc tgaagttcgt aaccgtaagg

1440

agcgacctag ggcaaaactg gtaattgggg ctaagtcgta acaaggtagc cgtaccggaa

1500

ggtgc

1505

<210> 1552

<211> 1534

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral taxon 317

<400> 1552

ttacaatgga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc

60

aagtcgcggg gcagcatggg ggttgcttgc aatccctgat ggcgaccggc gcacgggtga

120

gtaacgcgta tccaacctgc ccttcaccac gggataaccc ggcgaaagtc ggactaatac

180

cgtatgttgt ccattgacgg catccgattt ggacgaaagg cttagcggtg agggatgggg

240

atgcgtccga ttagctcgac ggcggggtaa cggcccaccg tggcgacgat cggtaggggt

300

tctgagagga aggtccccca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca

360

gcagtgagga atattggtca atgggcgtaa gcctgaacca gccaagtagc gtgcaggatg

420

acggccctat gggttgtaaa ctgcttttat gcggggataa aggagcccac gtgtgggctt

480

tttgcaggta ccgcatgaat aaggaccggc taattccgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

gaaggtccgg gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgtaggcc gccccttaag

600

cgtgttgtga aatgcgggtg ctcaacatcc gacttgcagc gcgaactggg gggcttgagt

660

gcgccgaaag taggcggaat tcgtggtgta gcggtgaaat gcttagatat cacgaagaac

720

tccgattgcg aaggcagctt actgtagcgc aactgacgct gatgctcgaa agcgtgggta

780

tcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgcggtaaac gatggatgct cgttgtcggc

840

ctttgaggcc ggtgaccaag cgaaagcgtt aagcatccca cctggggagt acgccggcaa

900

cggtgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gaggaacatg tggtttaatt

960

cgatgatacg cgaggaacct tacccgggct tgaactgcgg cggaacgatt ccgagaggat

1020

gaggcccttc ggggctgccg cggaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg tgccgtgagg

1080

tgtcggctta agtgccataa cgagcgcaac ccccgtcttc agttgccatc gggttatgcc

1140

gggcactctg gagatactgc caccgcaagg tgtgaggaag gtggggatga cgtcaaatca

1200

gcacggccct tacgtccggg gctacacacg tgttacaatg gcgcatacag agagtaggtg

1260

gcatgcgaat gccatccaat ccttaaagtg cgtctcagtt cggactgggg tctgcaaccc

1320

gaccccacga agctggattc gctagtaatc gcgcatcagc catggcgcgg tgaatacgtt

1380

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcaagc catgaaagcc gggggcgcct gaagtccgtg

1440

accgcgaggg tcggcctagg gtgaaaccgg tgattggggc taagtcgtaa caaggtagcc

1500

gtaccggaag gtgcggctgg aacacctcct ttct

1534

<210> 1553

<211> 1434

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral taxon 472

<400> 1553

tggcgaccgg cgcacgggtg agtaacgcgt atccaacctg cccttcacca cgggataacc

60

cggcgaaagt cggactaata ccgtatgttg tccattgacg gcatccgatt tggacgaaag

120

gctttgcggt gaaggatggg gatgcgtccg attagctgga cggcggggta acggcccacc

180

gtggctacga tcggtagggg ttctgagagg aaggtccccc acactggaac tgagacacgg

240

tccagactcc tacgggaggc agcagtgagg aatattggtc aatgggcgta agcctgaacc

300

agccaagtag cgtgcaggat gacggcccta tgggttgtaa actgctttta tgcggggata

360

aagtggccca cgtgtgggtt tttgcaggta ccgcatgaat aaggaccggc taattccgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg gaaggtccgg gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg

480

agcgtaggcc gcgccttaag cgtgttgtga aatccgggtg ctcaacatcc ggcttgcagc

540

gcgaactggg gcgcttgagt gcgctgaaag taggcggaat tcgtggtgta gcggtgaaat

600

gcttagatat cacgaggaac tccgattgcg aaggcagcct actgtagcgc tactgacgct

660

gatgctcgaa agcgtgggta tcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgcggtaaac

720

gatggatgct cgttgtcggc ccttcgggtc ggtgaccaag cgaaagcgtt aagcatccca

780

cctggggagt acgccggcaa cggtgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg

840

gaggaacatg tggtttaatt cgatgatacg cgaggaacct tacccgggct tgaactgcgg

900

cggaacgatt cggagacgat gaggcccttc ggggccgccg cggaggtgct gcatggttgt

960

cgtcagctcg tgccgtgagg tgtcggctta agtgccataa cgagcgcaac ccccgtcttc

1020

agttgccatc gggtgatgcc gggcactctg gagatactgc caccgcaagg tgcgaggaag

1080

gtggggatga cgtcaaatca gcacggccct tacgtccggg gctacacacg tgttacaatg

1140

gcgcatacag agagtcggtg gcatgcgaat gccatccaat cctcaaagtg cgtctcagtt

1200

cggactgggg tctgcaaccc gaccccacga agctggattc gctagtaatc gcgcatcagc

1260

catggcgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcaagc catgaaagcc

1320

gggggcgcct gaagtccgtg accgcgaggg tcggcctagg gtgaaaccgg tgattggggc

1380

taagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag gtgcggctgg aacacctcct ttct

1434

<210> 1554

<211> 1504

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral taxon 781

<400> 1554

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc aagtcgcggg

60

gcagcatgtt ggttgcttgc aaccgatgat ggcgaccggc gcacgggtga gtaacgcgta

120

tccaacctac ctattaccac gggataaccc ggcgaaagtc ggactaatac cgtatgtagt

180

cctccaatgg catcagcagt ggactaaagg tttggcggta atagatgggg atgcgtccga

240

ttagctagtt ggtgaggtaa tggctcccca aggcttcgat cggtaggggt tctgagagga

300

aggtccccca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgagga

360

atattggtca atggacgaga gtctgaacca gccaagtagc gtgcaggatg actgccctat

420

gggttgtaaa ctgcttttat gcggggataa agtgaggaac gtgttctcta ttgcaggtac

480

cgcatgaata aggaccggct aattccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg aaggttcagg

540

cgttatccgg atttattggg tttaaaggga gcgtaggccg ttttttaagc gtgttgtgaa

600

atgtaccggc tcaaccggtg atgtgcagcg cgaactggaa gacttgagtg cgtagtaagc

660

aggcggaatt cgtggtgtag cggtgaaatg cttagatatc acgaagaact ccgatagcgc

720

aggcagcttg ctgcatcgca actgacgctg atgctcgaaa gcgtgggtat caaacaggat

780

tagataccct ggtagtccac gcggtaaacg atggatgctc gttgtcaggc ctttgggttt

840

ggtgaccaag tgaaaacgtt aagcatccca cctggggagt acgccggcaa cggtgaaact

900

caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gaggaacatg tggtttaatt cgatgatacg

960

cgaggaacct tacccgggct tgaactgcgg cggaacgatt cagagatgat gaggtccttc

1020

gggactgccg cggaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg tgccgtgagg tgtcggctta

1080

agtgccataa cgagcgcaac cccttttctt agttgccatc gggtaatgcc gggcactctg

1140

ggaatactgc caccgtaagg tgtgaggaag gtggggatga cgtcaaatca gcacggccct

1200

tacgtccggg gctacacacg tgttacaatg gcgcatacag atagttggtt gtgtgcaaac

1260

atgatctaat ctttaaagtg cgtctcagtt cggactgggg tctgcaaccc gaccccacga

1320

agctggattc gctagtaatc gcgcatcagc catggcgcgg tgaatacgtt cccgggcctt

1380

gtacacaccg cccgtcaagc catgaaagcc gggggcgcct gaagtccgtg accgcgaggg

1440

tcggcctagg gtgaaaccgg tgattggggc taagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag

1500

gtgc

1504

<210> 1555

<211> 1505

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral taxon 782

<400> 1555

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc aagtcgaggg

60

gaaacggcgt tgagtgcttg cactcttcgg acgtcgaccg gcgcacgggt gagtaacgcg

120

tatccaacct tcccatgact gggggataac ctgccgaaag gcagactaat accccatggt

180

cttcactgac ggcatcatat gtgaagtaaa gattcatcgg tcatggatgg ggatgcgtct

240

gattagcttg ttggcggggt aacggcccac caaggcaacg atcagtaggg gttctgagag

300

gaaggtcccc cacattggaa ctgagacacg gtccaaactc ctacgggagg cagcagtgag

360

gaatattggt caatgggcgc aagcctgaac cagccaagta gcgtgcagga cgacggccct

420

atgggttgta aactgctttt gtacggggat aaaacggcgg acgcgtccgt ccttgcaggt

480

accgtacgaa taaggaccgg ctaattccgt gccagcagcc gcggtaatac ggaaggtccg

540

ggcgttatcc ggatttattg ggtttaaagg gagcgtaggc cggggattaa gtgtgttgtg

600

aaatgtagac gctcaacgtc tgacttgcag cgcatactgg ttcccttgag tacgcacaac

660

gtcggcggaa ttcgtcgtgt agcggtgaaa tgcttagata tgacgaagaa ctccgattgc

720

gaaggcagct gacgggagcg caactgacgc ttaagctcga aggtgcgggt atcgaacagg

780

attagatacc ctggtagtcc gcacggtaaa cgatggatgc ccgctgttgg tacctggtat

840

cagcggctaa gcgaaagcat taagcatccc acctggggag tacgccggca acggtgaaac

900

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat tcgatgatac

960

gcgaggaacc ttacccgggc ttgaattgca ggagaacgat acagagatgt tgaggtcctt

1020

cgggactcct gtgaaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcggctt

1080

aagtgccata acgagcgcaa cccctctctt cagttgccat caggttatgc tgggcactct

1140

ggagacactg ccaccgtaag gtgtgaggaa ggtggggatg acgtcaaatc agcacggccc

1200

ttacgtccgg ggctacacac gtgttacaat ggccggtaca gagggacggt gcaacgcaag

1260

ttgcatccaa tcttgaaagc cggtcccagt tcggactggg gtctgcaacc cgaccccacg

1320

aagctggatt cgctagtaat cgcgcatcag ccatggcgcg gtgaatacgt tcccgggcct

1380

tgtacacacc gcccgtcaag ccatgaaagc cgggggtgcc tgaagtccgt gaccggaagg

1440

atcggcctag ggcaaaactg gtgattgggg ctaagtcgta acaaggtagc cgtaccggaa

1500

ggtgc

1505

<210> 1556

<211> 1386

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral taxon F68

<400> 1556

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggctacaggc ttaacacatg caagtcgtgg

60

ggaaacgatt ggaggcgctt gcgcctctga ggcgtcgacc ggcgcacggg tgagtaacgc

120

gtatccaacc tgccccgcgg caagggataa tccgcagaaa tgcggtctaa taccttatgt

180

gctccgaaga ggacatctga ttcggagcaa aggcttgccg ccgcgggatg gggatgcgtc

240

tgattagata gtaggcgggg taacggccca cctagtcgtc gatgggtagg ggttctgaga

300

ggaaggtccc ccacattgga actgagacac ggtccaaact cctacgggag gcagcagtga

360

ggaatattgg tcaatgggcg agagcctgaa ccagccaagt agcgtgcagg aagacggccc

420

tatgggttgt aaactgcttt tatacgggaa taaagtttgc cacgtgtggc attttgcatg

480

taccgtaaga aaaaggatcg gctaattccg tgccagcagc cgcggtaata cggaagatcc

540

gagcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggagcgtagg cgggaatcca agtcagttgt

600

gaaaccctgc ggctcaaccg tagtcgtgca gttgaaactg gatttcttga gtgcgcacag

660

ggcagacgga atttgtggtg tagcggtgaa atgcttagat atcacgaaga actccgatcg

720

cgaaggcagt ctgccggggc gctactgacg ctgaggctcg aaagtgcggg tatcaaacag

780

gattagatac cctggtagtc cgcactgtaa acgatggata cccgtggtcg gtttttttta

840

ttcggtcacc aagcgaaagc gttaagtatc ccacctgggg agtacgccgg caacggtgaa

900

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggaggaac atgtggttta attcgatgat

960

acgcgaggaa ccttacccgg gcttgaattg cagaggaagt caccggagac ggtgatgtct

1020

ttatagtctc tgtgaaggtg ctgcatggtt gtcgtcagct cgtgccgtga ggtgtcggct

1080

taagtgccat aacgagcgca accccttttt ccggttgcca tcaggtgatg ctgggcactc

1140

cggagacact gccatcgtaa gatgtgagga aggtggggat gacgtcaaat cagcacggcc

1200

cttacgtccg gggctacaca cgtgttacaa tggccggtac agaaggcagc tcccacgcga

1260

gtggttgcga atcccgaaag ccggtcccag ttcggactgg agtctgcaac ccgactccac

1320

gaagctggat tcgctagtaa tcgcgcatca gccacggcgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1380

ttgtac

1386

<210> 1557

<211> 1216

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral taxon G60

<400> 1557

gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg ggaaacgatg agagagcttg

60

ctctctcagg cgtcgaccgg cgcacgggtg agtaacgcgt atccaacctg cccattacag

120

gggaataacc ttgcgaaagt aagactaatg ccccatggta ttctcagcag acatctaatg

180

aggattaaag atttatcggt aatggatggg gatgcgtctg attagcttgt tggcggggta

240

acggcccacc aaggcaacga tcagtagggg ttctgagagg aaggtccccc acattggaac

300

tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattggtc aatggacgag

360

agtctgaacc agccaagtag cgtgcaggat gacggcccta tgggttgtaa actgctttta

420

taggggaata aagtgatcta cgtgtagttt attgtatgta ccctatgaat aaggaccggc

480

taattccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaaggttcgg gcgttatccg gatttattgg

540

gtttaaaggg agcgtaggcc gtagattaag cgtgttgtga aatgtagatg ctcaacatct

600

gacttgcagc gcgaactggt ttactagagt gtgcacaacg taggcggaat tcgtcgtgta

660

gcggtgaaat gcttagatat gacgaagaac tccgattgcg aaggcagctt acgggagcac

720

aactgacgct gaagctcgaa ggtgcgggta tcaaacagga ttagataccc tggtagtccg

780

cacagtaaac gctggatgcc cgctgttggt tcattagagt cagcggccaa gcgaaagcat

840

taagcatccc acctggggag tacgccggca acggtgaaac tcaaaggaat tgacgggggc

900

ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat tcgatgatac gcgaggaacc ctaccccggg

960

cctgaaattg cagacgaacg cggcagagat gccaagggcc cttcggggcg tctgtgaagg

1020

tgctgcattg gtgtcgtcag ctcgtgccgt gaggtgtcgg cctaagtgcc ataacgagcg

1080

caaccccttt tcttagttgc catcagggtc atgcctgggc actcatggaa aatccgccca

1140

cgataggggt gtaggaacgg gtgggaaata cgttcaaatc accacggccc ttacgttcgg

1200

gggcctacac ctgtta

1216

<210> 1558

<211> 1211

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral taxon G70

<400> 1558

gatgaacgct ggctacaggc ttaacacatg caagtcgagg ggaaacggca ttgagtgctt

60

gcactgaatg gacgtcgacc ggcgcacggg tgagtaacgc gtatccaacc ttcccgttac

120

tgcgggataa cctgccgaaa ggcagactaa taccgcatgt tcttcgatga cggcatcaga

180

ttcgaagcaa agatccgtcg gtaacggagg gggatgcgtc tgattagctg gttggcgggg

240

cgacggccca ccaaggcgac gatcagtagg ggttctgaga ggaaggtccc ccacattgga

300

actgagacac ggtccaactc ctacgggagg cagcagtgag gaatattggt caatgggcgg

360

aagcctgaac cagccaagta gcgtgcagga ggacggccct acgggtgtgt aaactgcttt

420

tatgcgggga taaagtgagg gacgcgtccc tttttgcagg taccgcatga ataaggaccg

480

gctaattccg tgccagcagc cgcggtaata cggaaggtcc gggcgttatc cggatttatt

540

gggtttaaag ggagcgtagg ccgtggatta agcgtgttgt gaaatgcagg tgctcaacgt

600

ctgcactgca gcgcgaactg gtccacttga gtgtgcgcaa cgcaggcgga attcgtcgtg

660

tagcggtgaa atgcttagat atgacgaaga actccgattg cgaaggcagc ttgcgggagc

720

acaactgacg ctgaagctcg aaagtgcggg tatcgaacag gattagatac cctggtagtc

780

cgcacggtaa acgatggatg cccgttgtca ggctgtttca gcctggtgac caagcgagag

840

cattaagcat cccacctggg gagtacgccg gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg

900

ggcccgcaca agcggaggat catgtggttt aattcgatga tacgcgagga acctgacccg

960

gggcttgaat tgcagacgaa cgattcagag atgatgaggc ccttcggggc gtctgtgaca

1020

ggtgctgcat gggttgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt cagcctaaag tgccatagcg

1080

agcgccagcc cctttcttca gtttgcacag ggtgatgcct gggcactctg aaaaccctgc

1140

caccgcaagg gtgtgaggaa gggtggcaat acgtcaaaca ccacgaccct acgttcgggg

1200

caacacagtt t

1211

<210> 1559

<211> 1218

<212> DNA

<213> Prevotella sp. oral taxon G71

<400> 1559

gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg ggaaacggcg aagggtgctt

60

gcactctccg gacgtcgacc ggcgcacggg tgagtaacgc gtatccaacc ttcccatgac

120

cgggggataa cctgccgaaa ggcagactaa taccccatgg ccttcactga cggcatcata

180

tgtgaagtaa agattcatcg gtcatggatg gggatgcgtc tgattagctt gttggcgggg

240

aaacggccca ccaaggcgac gatcagtagg ggttctgaga ggaaggtccc ccacattgga

300

actgagacac ggtccaaact cctacgggag gcagcagtga ggaatattgg tcaatgggcg

360

caagcctgaa ccagccaagt agcgtgcagg atgacggccc tatgggttgt aaactgcttt

420

tgtacgggga taaaacggcg gacgtgtccg tccttgcagg taccgtacga ataaggaccg

480

gctaattccg tgccagcagc cgcggtaata cggaaggtcc gggcgttatc cggatttatt

540

gggtttaaag ggagcgtagg ccggggatta agtgtgttgt gaaatgtaga cgctcaacgt

600

ctgacttgca gcgcatactg gttcccttga gtacgcacaa cgttggcgga attcgtcgtg

660

tagcggtgaa atgcttagat atgacgaaga actccgattg cgaaggcagc tgacgggagc

720

gcaactgacg cttaagctcg aaggtgcggg tatcgaacag gattagatac cctggtagtc

780

cgcacggtaa acgatggatg cccgctgttg gtacctggta tcagcggcta agcgaaagca

840

ttaagcatcc cacctgggga gtacgccggc aacggtgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg

900

cccgcacaag cggaggaaca tgtggtttaa ttcgatgata cgcgaggaac cttacccggg

960

gcttgaattg caagagaacg atacaagaga tgttgagggt ccttcgggac tcctgtgaag

1020

gtgctgcatg gttgtcgtca gctcgtgccg tgaggtgtcg gcctaagtgc cataccgagg

1080

cgcaccccct ctcttcagtt gcccatcaag gtattgcctg gcacctcttg gaaacccggt

1140

gccaccctta ggggtttagg aaagggtggg gagttacgtt aaattcccca cgggccttta

1200

ctttcggggg cctcacct

1218

<210> 1560

<211> 1433

<212> DNA

<213> Prevotella sp. sp24

<400> 1560

atgcaagtcg aggggcagca tgatcgaagc ttgctttgat tgatggcgac cggcgcacgg

60

gtgagtaacg cgtatccaac cttcccttta gtagaggata gcccggcgaa agtcggatta

120

atactctata ttgtatttag aagacatctg aagaatacca aaggtttacc gctaaaggat

180

ggggatgcgt ctgattaggt tgttggcggg gtaacggccc accaagccta cgatcagtag

240

gggttctgag aggaaggtcc cccacattgg aactgagaca cggtccaaac tcctacggga

300

ggcagcagtg aggaatattg gtcaatggac gaaagtctga accagccaag tagcgtgcag

360

gatgacggcc ctatgggttg taaactgctt ttatataggg ataaagtcgg ggacgtgtcc

420

ccgtttgtag gtactatatg aataaggacc ggctaattcc gtgccagcag ccgcggtaat

480

acggaaggtc caggcgttat ccggatttat tgggtttaaa gggagcgcag gctgatgatt

540

aagcgtgacg tgaaatgtag ccgctcaacg gctgtactgc gtcgcgaact ggttatcttg

600

agtgagttcg atgttggcgg aattcgtggt gtagcggtga aatgcttaga tatcacgaag

660

aactccgatt gcgaaggcag ccaacaaggc ctttactgac gctaaagctc gaaggtgcgg

720

gtatcgaaca ggattagata ccctggtagt ccgcacggta aacgatggat gcccgctgtt

780

tgcgatatac tgtgagcggc caagagaaat cgttaagcat cccacctggg gagtacgccg

840

gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa catgtggttt

900

aattcgatga tacgcgagga accttacccg ggcttgaact gcagcggaag gatacagaga

960

tgttgacgcc ttcggggccg ctgtggaggt gctgcatggt tgccgtcagc tcgtgccgtg

1020

aggtgtcggc ttaagtgcca taacgagcgc aacccttttc tttagttgcc atcaggtaat

1080

gctgggcact ctggagatac tgccaccgta aggtgtgagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1140

tcagcacggc ccttacgtcc ggggctacac acgtgttaca atgggaggta cagagagctg

1200

gatgtacgca agtacgttct aatcctaaaa gccttcctca gttcggattg gggtctgcaa

1260

cccgacccca tgaagctgga ttcgctagta atcgcgcatc agccatggcg cggtgaatac

1320

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca agccatgaaa gccgggggcg cttgaagtcc

1380

gtgaccgcaa ggatcggcct agagcgaaac tggtaattgg ggctaagtcg taa

1433

<210> 1561

<211> 1433

<212> DNA

<213> Prevotella sp. sp34

<400> 1561

atgcaagtcg aggggcagca tgatcgaagc ttgctttgat tgatggcgac cggcgcacgg

60

gtgagtaacg cgtatccaac cttcccttta gtagaggata gcccggcgaa agtcggatta

120

atactctatg ttgtatttag aagacatctg aagaatacca aaggtttacc gctataggat

180

ggggatgcgt ctgattaggt tgttggcggg gtaacggccc accaagccta cgatcagtag

240

gggttctgag aggaaggtcc cccacattgg aactgagact cggtccaaac tcctacggga

300

ggcagcagtg aggaatattg gtcaatggac gaaagtctga accagccaag tagcgtgcag

360

gatgacggcc ctatgggttg taaactgctt ttatataggg ataaagtcgg ggacgtgtcc

420

ccgtttgtag gtactatatg aataaggacc ggctaattcc gtgccagcag ccgcggtaat

480

acggaaggtc caggcgttat ccggatttat tgggtttaaa gggagcgcag gctgatgatt

540

aagcgtgacg tgaaatgtag ccgctcaacg gctgaactgc gtcgcgaact ggttatcttg

600

agtgagttcg atgttggcgg aattcgtggt gtagcggtga aatgcttaga tatcacgaag

660

aactccgatt gcgaaggcag ccaacaaggc ctttactgac gctaaagctc gaaggtgcgg

720

gtatcgaaca ggattagata ccctggtagt ccgcacggta aacgatggat gcccgctgtt

780

tgcgatatac tgtgagcggc caagagaaat cgttaagcat cccacctggg gagtacgccg

840

gcaacggtga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggaggaa catgtggttt

900

aattcgatga tacgcgagga accttacccg ggcttgaact gcagcggaag gatacagaga

960

tgttgacgcc ttcggggccg ctgtggaggt gctgcatggt tgtcgtcagc tcgtgccgtg

1020

aggtgtcggc ttaagtgcca taacgagcgc aacccttttc tttagttgcc atcaggtaat

1080

gctgggcact ctggagatac tgccaccgta aggtgtgagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1140

tcagcacggc ccttacgtcc ggggctacac acgtgttaca atgggaggta cagagagctg

1200

gatgtacgca agtacgttct aatcctaaaa gccttcctca gttcggattg gggtctgcaa

1260

cccgacccca tgaagctgga ttcgctagta atcgcgcatc agccatggcg cggtgaatac

1320

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca agccatgaaa gccgggggcg cttgaagtcc

1380

gtgaccgcaa ggatcggcct agagcgaaac tggtaattgg ggctaagtcg taa

1433

<210> 1562

<211> 1488

<212> DNA

<213> Prevotella stercorea

<400> 1562

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agctacaggc ttaacacatg caagtcgagg

60

ggcagcatgt cggttgcttg caaccgatga tggcgaccgg cgcacgggtg agtaacgcgt

120

atccaaccta cccttgtcca tcggataacc cgtcgaaagg cggcctaaca cgatatgcgg

180

ttcacagcag gcatctaacg tgaacgaaat gtgaaggaga aggatgggga tgcgtctgat

240

tagcttgttg gcggggtaac ggcccaccaa ggctacgatc agtaggggtt ctgagaggaa

300

ggtcccccac attggaactg agacacggtc caaactccta cgggaggcag cagtgaggaa

360

tattggtcaa tggacgagag tctgaaccag ccaagtagcg tgcaggatga cggccctatg

420

ggttgtaaac tgcttttata gggggataaa gtgtgccacg tgtggcatat tgcaggtacc

480

ctatgaataa ggaccggcta attccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga aggtccgggc

540

gttatccgga tttattgggt ttaaagggag cgtaggccgt ttggtaagcg tgttgtgaaa

600

tgtcggggct caacctgggc attgcagcgc gaactgccag acttgagtgc gcaggaagta

660

ggcggaattc gtcgtgtagc ggtgaaatgc ttagatatga cgaagaactc cgattgcgaa

720

ggcagcctgc tgtagcgcaa ctgacgctga agctcgaaag cgtgggtatc gaacaggatt

780

agataccctg gtagtccacg cggtaaacga tggatgctcg ctgtttgcgt ctgacgtaag

840

cggccaagcg aaagcgttaa gcatcccacc tggggagtac gccggcaacg gtgaaactca

900

aaggaattga cgggggcccg cacaagcgga ggaacatgtg gtttaattcg atgatacgcg

960

aggaacctta cccgggcttg aactgtaggc gaacgattca gagatgatga ggcccttcgg

1020

ggcgcctatg gaggtgctgc atggttgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg tcggcttaag

1080

tgccataacg agcgcaaccc ttgttcgtag ttgccatcgg gtgatgccgg gcactctgcg

1140

aagactgcct ccgtaaggag tgaggaaggt ggggatgacg tcaaatcagc acggccctta

1200

cgtccggggc tacacacgtg ttacaatggc atgtacagaa agcggggtgt atgcaaatac

1260

gctcgaatcc ctaaaacatg tctcagttcg gactggggtc tgcaacccga ccccacgaag

1320

ctggattcgc tagtaatcgc gcatcagcca tggcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcaagcca tgaaagccgg gggcgcctaa agtccgtgac cgcgagggtc

1440

ggcctagggt gaaaccggtg attggggcta agtcgtaaca aggtaacc

1488

<210> 1563

<211> 1533

<212> DNA

<213> Prevotella tannerae

<400> 1563

tacaatgtag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctgg ctacaggctt aacacatgca

60

agtcgtgggg cagcggatgc ttagcttgct aagtatgccg gcgaccggcg cacgggtgag

120

taacgcgtac cgaacctgcc catcacacag ggataggctt gcgaaagcaa gattaatact

180

gatggtctca gttgtatgca tgtatgattg agtaaagcct tcgggcggtg atggatggcg

240

gtgcgtccca ttaggacgtt ggcggggtaa cggcccacca atccttcgat gggtaggggt

300

tctgagagga aggtccccca cattggaact gagatacggt ccaaactcct acgggaggca

360

gcagtgagga atattggtca atgggcgaga gcctgaacca gccaagtagc gtgcgggatg

420

aaggcccttg tggtcgtaaa ccgcttttat cagtgaataa agtgcaccac gtgtggtgtc

480

attgcaggta gctgaagaaa aaggaccggc taattccgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

gaaggtccgg gcgttatccg gaattattgg gtttaaaggg agcgcaggcg ggagtataag

600

tcagctgtta aatatcagag cccaactctg ttatgcagtt gaaactatat ttcttgagta

660

cgcacaggga tggcggaatt cagggtgtag cggtgaaatg cttagatatc ctgaagaact

720

ccgatcgcga aggcagccat ccggagcgta actgacgctg aggctcgaag gtgcgggtat

780

cgaacaggat tagataccct ggtagtccgc acggtaaacg atgaatactc gcagttcggc

840

cgtttaggtc gagttgtcca gcgaaagcgt taagtattcc acctggggag tacgccggca

900

acggtgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat

960

tcgatgatac gcgaggaacc ttacccgggc ttgaaccaag agtgcggagt gcagagatgc

1020

gctttttctt cggacacttt tggaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg tgccgtgagg

1080

tgtcggctta agtgccataa cgagcgcaac ccttttctac gtttgccatc gggtaatgcc

1140

gggaactccg tggatactgc cgccgcaagg cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcag

1200

cacggccctt acgtccgggg ctacacacgt gttacaatgg tcggagcagc aggaagctac

1260

ctggcgacag gatgctgatc ccaaaacccg gcctcagttc ggactggagt ctgcaacccg

1320

actccacgaa gccggattcg ctagtaatcg cgcatcagcc atggcgcggt gaatacgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcaagcc atgaaagccg ggggtgcctg aaagccgtga

1440

ccgcgagggt cggcctaggg taaaaccggt gattggggct aagtcgtaac aaggtagccg

1500

taccggaagg tgcggctgga acacctcctt tct

1533

<210> 1564

<211> 1536

<212> DNA

<213> Prevotella timonensis

<400> 1564

ttacaatgta gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gctacaggct taacacatgc

60

aagtcgcagg gtaacatgag gaaagcttgc tttccttgat gacgactggc gcacgggtga

120

gtaacgcgta tccaaccttc ccataactac gggataaccc gttgaaagac ggcctaatac

180

cgtatgacat cgtttgctga catcaaataa cgattaaagg tttagcggtt atggatgggg

240

atgcgtctga ttagcttgtt ggcggggtaa cggcccacca aggcgacgat cagtaggggt

300

tctgagagga aggtccccca cattggaact gagacacggt ccaaactcct acgggaggca

360

gcagtgagga atattggtca atgggcgaga gcctgaacca gccaagtagc gtgcaggatg

420

acggccctat gggttgtaaa ctgcttttat gtggggataa agtgcgtgac gtgtcatgca

480

ttgcaggtac cacatgaata aggaccggct aattccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

aaggtccggg cgttatccgg atttattggg tttaaaggga gcgtaggctg tctattaagc

600

gtgttgtgaa atttaccggc tcaaccggtg gcttgcagcg cgaactggtc gacttgagta

660

tgcaggaagt aggcggaatt catggtgtag cggtgaaatg cttagatatc atgacgaact

720

ccgattgcgc aggcagctta ctgtagcata actgacgctg atgctcgaaa gtgcgggtat

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccgc acggtaaacg atggatgctc gctattcgtc

840

ctatttggat gagtggccaa gtgaaaacat taagcatccc acctggggag tacgccggca

900

acggtgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggaggaacat gtggtttaat

960

tcgatgatac gcgaggaacc ttacccgggc ttgaactgcc agcgaacgat acagagatgt

1020

tgaggccctt cggggcgctg gtggaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag

1080

gtgtcggctt aagtgccata acgagcgcaa cccttttctt tagttgccat caggtgatgc

1140

tgggcactct atggatactg ccaccgtaag gtgtgaggaa ggtggggatg acgtcaaatc

1200

agcacggccc ttacgtccgg ggctacacac gtgttacaat ggggcataca gagtgttggc

1260

ttaacgcaag tttggtctaa tcttcaaagt gtctcccagt tcggattggg gtctgcaacc

1320

cgaccccatg aagctggatt cgctagtaat cgcgcatcag ccatggcgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaag ccatgaaagc tgggggtgcc tgaagtccgt

1440

aaccgttaag gagcggccta gggcaaaact ggtgattggg gctaagtcgt aacaaggtag

1500

ccgtaccgga aggtgcggct ggaacacctc ctttct

1536

<210> 1565

<211> 1531

<212> DNA

<213> Prevotella veroralis

<400> 1565

tacaatggag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctag ctacaggctt aacacatgca

60

agtcgagggg aaacggcgtt gagtgcttgc actcttcgga cgtcgaccgg cgcacgggtg

120

agtaacgcgt atccaacctt cccataacta agggataacc tgccgaaagg cagactaata

180

ccttatgtaa ttcttagatg acatcagaag agaatgaaag atttatcggt tatggatggg

240

gatgcgtctg attagcttgt tggtggggta acagcccacc aaggcaacga tcagtagggg

300

ttctgagagg aaggtccccc acattggaac tgagacacgg tccaaactcc tacgggaggc

360

agcagtgagg aatattggtc aatgggcgag agcctgaacc agccaagtag cgtgcaggat

420

gacggcccta tgggttgtaa actgcttttg tatggggata aagtcaatca cgtgtgattg

480

tttgcaggta ccatacgaat aaggaccggc taattccgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

gaaggttcgg gcgttatccg gatttattgg gtttaaaggg agcgtaggcc ggagattaag

600

tgtgttgtga aatgtagacg ctcaacgtct gacttgcagc gcatactgtt ttccttgagt

660

acgcacaacg ttggcggaat tcgtcgtgta gcggtgaaat gcttagatat gacgaagaac

720

tccgattgcg aaggcagctg acgggagcgc cactgacgct taagctcgaa ggtgcgggta

780

tcgaacagga ttagataccc tggtagtccg cacagtaaac gatggatgcc cgctgttggt

840

acctagtatc agcggctaag cgaaagcatt aagcatccca cctggggagt acgccggcaa

900

cggtgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gaggaacatg tggtttaatt

960

cgatgatacg cgaggaacct tacccgggct tgaattgcag aggaaggatt tagagataat

1020

gacgcccttc ggggtctctg tgaaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg tgccgtgagg

1080

tgtcggctta agtgccataa cgagcgcaac ccctctcttc agttgccatc aggtgatgct

1140

gggcactctg gagacactgc caccgtaagg tgtgaggaag gtggggatga cgtcaaatca

1200

gcacggccct tacgtccggg gctacacacg tgttacaatg gccggtacag agggacggtg

1260

taatgcaaat tgcatccaat cttgaaagcc ggtcccagtt cggactgggg tctgcaaccc

1320

gaccccacga agctggattc gctagtaatc gcgcatcagc catggcgcgg tgaatacgtt

1380

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcaagc catgaaagcc gggggtgcct gaagtccgtg

1440

accgcaagga tcggcctagg gcaaaactgg tgattggggc taagtcgtaa caaggtagcc

1500

gtaccggaag gtgcggctgg aacacctcct t

1531

<210> 1566

<211> 1302

<212> DNA

<213> Prevotellaceae bacterium P4P_62 P1

<400> 1566

gaacgctagc tacaggctta acacatgcaa gtcgagggac cggcgcacgg gtgcgtaacg

60

cgtatcgaac ctgcccttta ctcagggata gccttgcgaa agtaagatta atacctgata

120

gttaaagttg gtaaaggatg gcgatgcgtc tgattaggta gtaggcgggg taatggccca

180

cctagccgac gatcagtagg ggttctgaga ggaaggtccc ccacattgga actgagacac

240

ggtccaaact cctacgggag gcagcagtga ggaatattgg tcaatggacg agagtctgaa

300

ccagccaagt agcgtgcagg atgacggcct ctgggttgta aactgctttt agttgggaac

360

aggagtgtac catcagaaaa aggaccggct aattccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

420

aaggtccagg cgttatccgg atttattggg tttaaaggga gcgtaggcgg acgattaagt

480

cagctgtgaa agtttgcggc tcaaccgtaa aattgcagtt gaaactggtt gtcttgagtg

540

cacgcaggga tgttggaatt catggtgtag cggtgaaatg cttagatatc atgaagaact

600

ccgatcgcga aggcatatgt ccggagtgac tgacgctgag gctcgaaagt gcgggtatcg

660

aacaggatta gataccctgg tagtccgcac agtaaacgat gaatactcgc agtatgcgtg

720

tatgctgcca agtgaaaacg ttaagtattc cacctgggga gtacgccggc aacggtgaaa

780

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggaggaaca tgtggtttaa ttcgatgata

840

cgcgaggaac cttacccggg cttgaactat ggaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt

900

gccgtgaggt gtcggcttaa gtgccataac gagcgcaacc cttctccacg tttgccatca

960

gctgggcact ccgtggatac tgccatcgta agatggagga aggtggggat gacgtcaaat

1020

cagcacggcc cttacgtccg gggctacaca cgtgttacaa tggccggcag agggaagcca

1080

ccaggcgact gggcgctgat ccattccggt ctcagttcgg atggagtctg caacccgact

1140

ccagaagctg gattcgctag taatcgcgca tcagccatgg cgcggtgaat acgttcccgg

1200

gccttgtaca caccgcccgt caagccatga aagccggggg tgcctgaaag ctgtggcggc

1260

ctagggtaaa accggtgatt ggggctaagt cgtaacaagg ta

1302

<210> 1567

<211> 1465

<212> DNA

<213> Prochlorococcus marinus

<400> 1567

ggctcaggat gaacgctggc ggcgtgctta acacatgcaa gtcgaacgaa ccttcgggtt

60

agtggcggac gggtgagtaa cgcgtgagaa tctgccctca ggagggggat aacggttgga

120

aacgaccgct aataccccat atgcctactg gtgaaacgaa tttcgcctga ggatgagctc

180

gcgtctgatt agcttgttgg tgaggtaatg gctcaccaag gcttcgatca gtagctggtc

240

tgagaggatg atcagccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

300

agtggggaat tttccgcaat gggcgaaagc ctgacggagc aacgccgcgt gagggacgaa

360

ggcctctggg ctgtaaacct cttttctcaa ggaagaagat atgacggtac ttgaggaata

420

agccacggct aattccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg gagtggcaag cgttatccgg

480

aattattggg cgtaaagcgt ccgcaggcgg cttttcaagt ctgctgttaa agcgtggagc

540

ttaactccat catggcagtg gaaactgaaa ggcttgagta tggtaggggc agagggaatt

600

cccggtgtag cggtgaaatg cgtagatatc gggaagaaca ccagtggcga aggcgctctg

660

ctgggccatt actgacgctc atggacgaaa gccaggggag cgaaagggat tagatacccc

720

tgtagtcctg gccgtaaacg atgaacacta ggtgtcgggg gaatcgaccc cttcggtgtc

780

gtagctaacg cgttaagtgt tccgcctggg gagtacgcac gcaagtgtga aactcaaagg

840

aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag tatgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga

900

accttaccag ggtttgacat cctgcgaacc tcttagaaat ttgagggtgc cttcgggaat

960

gcagtgacag gtggtgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1020

cgcaacgagc gcaacccacg tttttagttg ccagcattta gttgggcact ctagaaagac

1080

cgccggtgat aaaccggagg aaggtgtgga tgacgtcaag tcatcatgcc ccttacaccc

1140

tgggctacac acgtactaca atgctacgga caaagggcag caaactcgcg agagctagca

1200

aatcccataa accgtggctc agttcagatc gtaggctgca actcgcctac gtgaagtagg

1260

aatcgctagt aatcgcaggt cagcatactg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1320

ccgcccgtca caccatggaa gttggccatg cccgaagtcg ttactccaac ccttgtggag

1380

gaggacgccg aaggtggggc taatgactgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtaccgg

1440

aaggtgcggc tggatcacct cctaa

1465

<210> 1568

<211> 1320

<212> DNA

<213> Propionibacteriaceae bacterium NML 02-0265

<400> 1568

gctggcggcg tgcttaacac atgcaagtcg aacgagtggc gaacgggtga gtaacacgtg

60

agcaacctac ccttgacact ggaataagcg ctcgaaaggg cgtctaatac cggatattga

120

aaggcggtca aggatgggct cgcggcctat cagctagttg gtgaggtaac ggctcaccaa

180

ggcttcgacg ggtagccggc ctgagagggc gaccggccac actgggactg agatacggcc

240

cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag

300

caacgccgcg tgcgggatga cggccttcgg gttgtaaacc gctttcagca ccgacgatga

360

cggtaggtgc agaagaagga ccggccaact acgtgccagc agccgcggtg atacgtaggg

420

tccgagcgtt gtccggaatt attgggcgta aagagctcgt aggcggtttg tcgcgtcgga

480

agtgaaaact cagggcttaa ctctgagcct gcttccgata cgggcagact agaggaagtt

540

aggggagaac ggaattcctg gtggagcggt ggaatgcgca gatatcagga ggaacaccgg

600

tggcgaaggc ggttctctgg gactcctgac gctgaggagc gaaagcgtgg ggagcaaaca

660

ggcttagata ccctggtagt ccacgccgta aacggtgggc actaggtgtg ggtcgatccg

720

tgccgtagct aacgcattaa gtgccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca

780

aaggaattga cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgcg gattaattcg atgcaacgcg

840

aagaacctta cctgggtttg acatatacag gtggtgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg

900

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctcg tcctatgttg ccagcggccg

960

gggactcata ggagactgcc ggggtcaact cggaggaagg tggggatgag gtcaagtcat

1020

catgcccctt atgtccaggg cttcacgcat gctacaatgg ctggcaaagg gctgcgaaac

1080

cgcaaggttt agcgaatccc aaccagtctc agttcggatg gggtctgcaa ctcgacccca

1140

gaagtcggag tcgctagtaa tcgcagatca gcaacgctgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1200

ttgtacacac cgcccgtcaa gtcatgaaag tcggcaacac ccgaagccgg tgcccaggga

1260

gccgtcgaag gtggggctgg taattaggac taagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag

1320

<210> 1569

<211> 1522

<212> DNA

<213> Propionibacterium acidipropionici

<400> 1569

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggtaaggccc tttcgggggt acacgagtgg cgaacgggtg agtaacacgt gagtaacctg

120

cccacttctt cgggataacg ctaggaaact ggtgctaata ccggatatga gctttcaccg

180

catggtgggg gttggaaagt gtttgtggtg gtggatggac tcgcggccta tcagcttgtt

240

ggtgaggtag tggctcacca aggcggtgac gggtagccgg cctgagaggg tgaccggcca

300

cattgggact gagatacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca

360

atgggcggaa gcctgatgca gcaacgccgc gtgcgggatg acggccttcg ggttgtaaac

420

cgctttcacc aggggcgaag gcattctttt ggggtgttga cggtacctgg agaagaagca

480

ccggctaact acgtgccagc agccgcggtg atacgtaggg tgcgagcgtt gtccggattt

540

attgggcgta aagggctcgt aggcggttga tcgcgtcgga agtgaaaact tggggcttaa

600

ccctgagcgt gctttcgata cgggttgact tgaggaaggt aggggagaat ggaattcctg

660

gtggagcggt ggaatgcgca gatatcagga ggaacaccag tggcgaaggc ggttctctgg

720

acctttcctg acgctgagga gcgaaagcgt ggggagcaaa caggcttaga taccctggta

780

gtccacgctg taaacggtgg gtactaggtg tggggtccat tccacggatt ccgtgccgta

840

gctaacgcat taagtacccc gcctggggag tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat

900

tgacggggcc ccgcacaagc ggcggagcat gcggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc

960

ttacctgggt ttgacatgga ttggtaacgg tcagagatgg ccgcccccct tgtgggccgg

1020

ttcacaggtg gtgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1080

aacgagcgca accctcgtcc actgttgcca gcatttggtt ggggactcag tggagaccgc

1140

cggggtcaac tcggaggaag gtggggatga cgtcaagtca tcatgcccct tatgtccagg

1200

gcttcacgca tgctacaatg gccggtacaa agagtggcga catcgtgagg tggagcgaat

1260

ctcagaaagc cggtctcagt tcggattggg gtctgcaact cgaccccatg aagtcggagt

1320

cgctagtaat cgcagatcag caacgctgcg gtgaatacgt tcccggggct tgtacacacc

1380

gcccgtcaag tcatgaaagt cggtaacacc cgaagccggt ggcccaacac gttctgcgtg

1440

ggggagtcgt cgaaggtggg actggtaatt aggactaagt cgtaacaagg tagccgtacc

1500

ggaaggtgcg gctggatcac ct

1522

<210> 1570

<211> 1326

<212> DNA

<213> Propionibacterium acnes

<220>

<221> modified_base

<222> (46)..(46)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1301)..(1301)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1316)..(1316)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1320)..(1320)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1570

gtgagtaaca cgtgagtaac ctgcccttga ctttgggata acttcnggaa actggggcta

60

ataccggata ggagctcctg ctgcatggtg ggggttggaa agtttcggcg gttggggatg

120

gactcgcggc ttatcagctt gttggtgggg tagtggctta ccagggcttt gacgggtagc

180

cggcctgaga gggtgaccgg ccacattggg actgagatac ggcccagact cctacgggag

240

gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg gaagcctgat gcatcaacgc cgcgtgcggg

300

atgacggcct tcgggtgtaa ccgctttcgc tgtgacgaag cgtgagtgac gtatgggtag

360

aagcaccggc taactacgtg ccagcaccgc ggtgatacta gggtgcgagc gttgtccgga

420

tttattgggc gtaaagggct gtaggtggtt gatcgcgtcg gaagtgtaat cttggggctt

480

aaccctgagc gtgctttcat acgggttgac ttgaggaagg taggggagaa tggaattcct

540

ggtggagcgg tggaatgcgc aatatcagag gaacaccagt ggcgaaggcg gttctctggg

600

cctttcctga cgctgaggag cgaaagcgtg gggagcgaac aggcttagat accctggtag

660

tccacgctgt aaacggtggg tactaggtgt ggggtccatt ccacgggttc cgcgccgtaa

720

ctaacgcttt aagtaccccg cctggggagt acggccgcaa ggctaaacct caaaggaatt

780

gacggggccc cgcacaagcg gcggagcatg cggattaatt cgatgcaacg cgtataacct

840

tggatgggtt tgacatggat cgggagtgct caaagatggg tgtgcctctt ttggggtcgg

900

ttcacaggtg gtgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

960

aacgagcgca acccttgttc actgttgcca gcacgttatg gtggggactc agtggagacc

1020

gccggggtca actcggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatgccc cttatgtcca

1080

gggcttcacg catgctacaa tggctggtac agagagtggc gagcctgtga gggtgagcga

1140

atctcggaaa gccggtctca gttcggattg gggtctgcaa ctcgacctca tgaagtcgga

1200

gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg cggtgaatac gttcccgggg cttgtacaca

1260

ccgcccgtca agtcatgaaa gttggtaaca cccgaagccg ntggcctaac cgttgngggn

1320

gagccg

1326

<210> 1571

<211> 1500

<212> DNA

<213> Propionibacterium avidum

<400> 1571

tcaggacgaa cgctggcggc gtgcttaaca catgcaagtc gaacggaaag ggccttcggg

60

ggtactcgag tggcgaacgg gtgagtaaca cgtgagtaac ctgcccttga cttcgggata

120

acttcaggaa actggggcta ataccggata ggaatccttg ctgcatggtg ggggttggaa

180

agcttcggcg gttttggatg gactcgcggc ttatcagctt gttggtgggg tagtggctta

240

ccaaggcttt gacgggtagc cggcctgaga gggcgaccgg ccacattggg actgagatac

300

ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc acaatgggcg gaagcctgat

360

gcagcaacgc cgcgtgcggg atgacggcct tcgggttgta aaccgctttc agcaggggcg

420

aacttgtggt gacggtacct gcagaagaag caccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

480

tgatacgtag ggtgcgagcg ttgtccggat ttattgggcg taaagagctc gtaggtggtt

540

gattgcgtcg gaagtgaaaa cttggggctt aaccctgagc gtgctttcga tacgggttga

600

cttgaggaag gtaggggaga atggaattcc tggtggagcg gtggaatgcg cagatatcag

660

gaggaacacc agtggcgaag gcggttctct ggacctttcc tgacgctgag gagcgaaagc

720

gtggggagcg aacaggctta gataccctgg gtagtccacg ctgtaaacgg tgggtactag

780

gtgtggggtc cattccacgg attccgtgcc gtagctaacg cattaagtac cccgcctggg

840

gagtacggcc gcaaggtaaa actcaaagga attgacgggg ccccgcacaa gcggcggagc

900

atgcggatta attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg gtttgacatg gactgggagt

960

gctcagagat gggtatgcct ccttgtgggg ctggttcaca ggtggtgcat ggctgtcgtc

1020

agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc gttcactgtt

1080

gccagcacgt tatggtgggg actcagtgga gaccgccggg gtcaactcgg aggaaggtgg

1140

ggatgacgtc aagtcatcat gccccttatg tccagggctt cacgcatgct acaatggccg

1200

gtacaaagag ttgcgagcct gtgagggtga gcgaatctcg gaaagccggt ctcagttcgg

1260

attggggtct gcaactcgac cccatgaagt cggagtcgct agtaatcgca gatcagcaac

1320

gctgcggtga atacgttccc ggggcttgta cacaccgccc gtcaagtcat gaaagtcggt

1380

aacacccgaa gccggtggcc taacctgtgt gggggagccg tcgaaggtgg gactggtaat

1440

taggactaag tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc ggctggatca cctcctttct

1500

<210> 1572

<211> 1510

<212> DNA

<213> Propionibacterium freudenreichii

<400> 1572

agtttgatcc tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca agtcggacgg

60

taaggcccct ttcggggggt acacgagtgg cgaacgggtg agtaacacgt gaggaacgtg

120

cccttgactt cggtatagct ccaggaaact ggtggtaatc ccgaatatga gcctggcctg

180

catgggttgg gttggaaagc tttatgcggt cagggatcgt ctcgcggcct atcagcttgt

240

tggtggggta atggcctacc aaggcagcga cgggtagccg gcctgagagg gtgaccggcc

300

acattgggac tgagatacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac

360

aatgggcgca agcctgatgc agcaacgccg cgtgcgggat gacggccttc gggttgtaaa

420

ccgctttcat ccatgacgaa gcgcaagtga cggtagtggg agaagaagca ccggctaact

480

acgtgccagc agccgcggtg atacgtaggg tgcgagcgtt gtccggaatt attgggcgta

540

aagagcttgt aggcggttga tcacgtcgga agtgaaattc cagggcttaa ctctgggctt

600

gctttcgata cgggttgact tgaggaatgt aggggagaat ggaactctcg gtggagcggt

660

ggaatgcgca gatatcggga agaacaccag tggcgaaggc ggttctctgg acatttcctg

720

acgctgagaa gcgaaagcgt ggggagcaaa caggcttaga taccctggta gtccacgccg

780

taaacggtgg gtactaggtg tgggtccctt ccacggggtc cgtgccgtag ctaacgcatt

840

aagtaccccg cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact caaaggaatt gacggggccc

900

cgcacaagcg gcggagcatg cggattaatt cgatgcaacg cgaagaacct tacctgggtt

960

tgacatgtac tggaagcgtt cagagatggg cgtgcctttt tggctggtac acaggtggtg

1020

catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

1080

ctcgtccaat gttgccagca gttcggctgg ggactcattg gagaccgccg gggccaactc

1140

ggaggaaggt ggggatgagg tcaagtcatc atgcccctta tgtccagggc ttcacgcatg

1200

ctacaatggc cggtacaaag agttgcgagc ctgtgagggt gagcgaatct cagaaagccg

1260

gtctcagttc ggattggggt ctgcaactcg accccatgaa gtcggagtcg ctagtaatcg

1320

cagatcagca acgctgcggt gaatacgttc ccggggcttg tacacaccgc ccgtcaagtc

1380

atgaaagtcg gtaacacccg aagccggtgg cccaaccttt tggggggagc cgtcgaaggt

1440

gggactggtg attaggacta agtcgtaaca aggtagccgt accggaaggt gcggctggat

1500

cacctccttt

1510

<210> 1573

<211> 1442

<212> DNA

<213> Propionibacterium granulosum

<400> 1573

tgatcatggc tcaggacgaa cgctggcggc gtgcttaaca catgcaagtc gtacggtaag

60

gccctttcgg gggtacacga gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagtaa cctgcccaca

120

actttgggat aacgctagga aactggtgct aatactggat atgtgctcct gctgcatggt

180

gggggttgga aagctccggc ggttgtggat ggactcgcgg cctatcagct tgttggtggg

240

gtagtggcct accaaggcgg cgacgggtag ccggcctgag agggtgaccg gccacattgg

300

gactgagata cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc

360

gcaagcctga tgcagcaacg ccgcgtgcgg gatgacggcc ttcgggttgt aaaccgcttt

420

cagcagggac gaagcttttt gtgacggtac ctgcagaaga agcaccggct aactacgtgc

480

cagcagccgc ggtgatacgt agggtgcgag cgttgtccgg atttattggg cgtaaagggc

540

tcgtaggcgg ttgatcgcgt cggaagtgga aacttgatgc ttaacgttga gcgtgctttc

600

gatacgggtt gacttgagga aggtagggga gaatggaatt cctggtggag cggtggaatg

660

cgcagatatc aggaggaaca ccagtggcga aggcggttct ctggaccttt cctgacgctg

720

aggagcgaaa gcgtggggag cgaacaggct tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg

780

gtgggtacta ggtgtggggt ccattccacg gattctgtgc cgtagctaac gcattaagta

840

ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg ggccccgcac

900

aagcggcgga gcatgcggat taattcgatg caacgcgaag aaccttacct gggtttgaca

960

tggatcggaa gcttccagag atggttgtgc ctcttttggg gtcggttcac aggtggtgca

1020

tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct

1080

cgtccactgt tgccagcaat tcggttgggg actcagtgga gaccgccggg gtcaactcgg

1140

aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat gccccttatg tccagggctt cacgcatgct

1200

acaatggccg gtacagtgag ttgcgacatc gtaaggtgga gcgaatctca aaaagccggt

1260

ctcagttcgg attggggtct gcaactcgac ctcatgaagt cggagtcgct agtaatcgca

1320

gatcagcaac gctgcggtga atacgttccc ggggcttgta cacaccgccc gtcaagtcat

1380

gaaagtcggt aacactcgaa gccggtggcc taacactttt tgtgggggag ctgtcgaagg

1440

tg

1442

<210> 1574

<211> 1487

<212> DNA

<213> Propionibacterium jensenii

<400> 1574

agttttgatt cctgggcttc aaggaacgaa accgctgggt ggcgttgctt aaccctgcaa

60

agtcggaacc gggttaaggc cccttttggg ggggttacca cgaagtggcg aaccgggttg

120

agtaaacacc gtggagttaa cccttcccca ttccactttc gggattaacg ctagggaaac

180

ctggtggcta aattcccgga tatgagctct catcgccatg gtgggggttg gaaagttctg

240

gcggtggtgg atggactcgc gtcctatcag cttgttggtg aggttgtggc tcaccaaggc

300

gtcgacgggt agccggcctg agagggtgac cggccacatt gggactgaga tacggcccag

360

actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcaa

420

cgccgcgtgc gggatgacgg ccttcgggtt gtaaaccgct ttcaccaggg acgaagtgcc

480

tttcggggtg tgacggtacc tggagaagaa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg

540

gtgatacgta gggtgcgagc gttgtccgga tttattgggc gtaaagagct cgtaggtggt

600

tgatcacgtc ggaagtgaaa acttggggct taaccctggg cgtgctttcg atacgggttg

660

acttgaggaa ggtaggggag aatggaattc ctggtggagc ggtggaatgc gcagatatca

720

ggaggaacac cagtggcgaa ggcggttctc tggacctttc ctgacgctga ggagcgaaag

780

cgtggggagc aaacaggctt agataccctg gtagtccacg ctgtaaacgg tgggtactag

840

gtgtggggtc cattccacgg attccgtgcc gtagctaacg cattaagtac cccgcctggg

900

gagtacggcc gcaggctaaa ctcaaaggaa ttgacggggc cccgcacaag cggcggagca

960

tgcggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggg tttgacatgg attggtaacg

1020

gtcagagatg gccgcccccc ttgtgggccg attcacaggt ggtgcatggc tgtcgtcagc

1080

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aaccctcgtc cactgttgcc

1140

agcaattcgg ttggggactc agtggagacc gccggggtca actcggagga aggtggggat

1200

gacgacaagt catcatgccc cttatgtcca gggcttcacg catgctacaa tggctggtac

1260

aaagagttgc gacactgtga ggtggagcga atctcaaaaa gccagtctca gttcggattg

1320

gggtctgcaa ctcgacccca tgaagtcgga gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg

1380

cggtgaatac gttcccgggg cttgtacaca ccgcccgtca agtcatgaaa gtcggtaaca

1440

cccgaagccg gtggcccaac cttttggggg ggagccgtcc aaggtgg

1487

<210> 1575

<211> 1506

<212> DNA

<213> Propionibacterium propionicum

<400> 1575

tcaggacgaa cgctggcggc gtgcttaaca catgcaagtc gaacggaaag gcccctttgg

60

gggtactcga gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagtaa cctgcccttg acttcgggat

120

aacttcagga aactggggct aataccggat agacatcctt gctgcatggt gggggttgga

180

aagcttcggc ggttttggat ggactcgcgg cttatcagct tgttggtggg gtagtggctt

240

accaaggctt tgacgggtag ccggcctgag agggcgaccg gccacattgg gactgagata

300

cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc ggaagcctga

360

tgcagcaacg ccgcgtgcgg gatgacggct tcgggttgta aacccgcttt cagcaggggc

420

gaagcttttg tgacggtacc tgcagaagaa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg

480

gtgatacgta gggtgcgagc gttgtccgga tttattgggc gtaaagagct cgtaggtggt

540

tgattgcgtc ggaagtgaaa acttggggct taaccctgag cgtgctttcg atacgggttg

600

acttgaggaa ggtaggggag aatggaattc ctggtggagc ggtggaatgc gcagatatca

660

ggaggaacac cagtggcgaa ggcggttctc tggacctttc ctgacgctga ggagcgaaag

720

cgtggggagc gaacaggctt agataccctg ggtagtccac gctgtaaacg gtgggtacta

780

ggtgtggggt ccattccacg gattccgtgc cgtagctaac gcattaagta ccccgcctgg

840

ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg ggccccgcac aagcggcgga

900

gcatgcggat taattcgatg caacgcgaag aaccttacct gggtttgaca tggactggga

960

gtgctcagag atgggtatgc ctccttgtgg ggctggttca caggtggtgc atggctgtcg

1020

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc tcgttcactg

1080

ttgccagcac gttatggtgg ggactcagtg gagaccgccg gggtcaactc ggaggaaggt

1140

ggggatgacg tcaagtcatc atgcccctta tgtccagggc ttcacgcatg ctacaatggc

1200

cggtacaaag agttgcgagc ctgtgagggt gagcgaatct cggaaagccg gtctcagttc

1260

ggattggggt ctgcaactcg accctatgaa gtcggagtcg ctagtaatcg cagatcagca

1320

acgctgcggt gaatacgttc ccggggcttg tacacaccgc ccgtcaagtc atgaaagtcg

1380

gtaacacccg aagccggtgg cctaacctgt gtgggggagc cgtcgaaggt gggactggta

1440

attaggacta agtcgtaaca aggtagccgt accggaaggt gcggctggat cacctccttt

1500

ctaagg

1506

<210> 1576

<211> 1530

<212> DNA

<213> Propionibacterium sp. 434-HC2

<400> 1576

tttcattgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaaggccct gcttttgtgg ggtgctcgag tggcgaacgg gtgagtaaca

120

cgtgagtaac ctgcccttga ctttgggata acttcaggaa actggggcta ataccggata

180

ggagctcctg ctgcatggtg ggggttggaa agtttcggcg gttggggatg gactcgcggc

240

ttatcagctt gttggtgggg tagtggctta ccaaggcttt gacgggtagc cggcctgaga

300

gggtgaccgg ccacattggg actgagatac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg

360

ggaatattgc acaatgggcc ggaagcctga tgcagcaacg ccgcgtgcgg gatgacggcc

420

ttcgggttgt aaaccgcttt cgcctgtgac gaagcgtgag tgacggtaat gggtaaagaa

480

gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtgatacgta gggtgcgagc gttgtccgga

540

tttattgggc gtaaagggct cgtaggtggt tgatcgcgtc ggaagtgtaa tcttggggct

600

taaccctgag cgtgctttcg atacgggttg acttgaggaa ggtaggggag aatggaattc

660

ctggtggagc ggtggaatgc gcagatatca ggaggaacac cagtggcgaa ggcggttctc

720

tgggcctttc ctgacgctga ggagcgaaag cgtggggagc gaacaggctt agataccctg

780

gtagtccacg ctgtaaacgg tgggtactag gtgtggggtc cattccacgg gttccgtgcc

840

gtagctaacg ctttaagtac cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg

900

aattgacggg gccccgcaca agcggcggag catgcggatt aattcgatgc aacgcgtaga

960

accttacctg ggtttgacat ggatcgggag tgctcagaga tgggtgtgcc tcttttgggg

1020

tcggttcaca ggtggtgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc

1080

ccgcaacgag cgcaaccctt gttcactgtt gccagcacgt tatggtgggg actcagtgga

1140

gaccgccggg gtcaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat gccccttatg

1200

tccagggctt cacgcatgct acaatggctg gtacagagag tggcgagcct gtgagggtga

1260

gcgaatctcg gaaagccggt ctcagttcgg attggggtct gcaactcgac ctcatgaagt

1320

cggagtcgct agtaatcgca gatcagcaac gctgcggtga atacgttccc ggggcttgta

1380

cacaccgccc gtcaagtcat gaaagttggt aacacccgaa gccggtggcc taaccgttgt

1440

gggggagccg tcgaaggtgg gactggtgat taggactaag tcgtaacaag gtagccgtac

1500

cggaaggtgc ggctggatca cctcctttct

1530

<210> 1577

<211> 1367

<212> DNA

<213> Propionibacterium sp. H456

<400> 1577

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgagta acctgccctt gacttcggga taacttcagg

120

aaactggggc taataccgga tagggaaagg cggttttgga tggactcgcg gcttatcagc

180

ttgttggtgg ggtagtggct taccaaggct ttgacgggta gccggcctga gagggcgacc

240

ggccacattg ggactgagat acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

300

gcacaatggg cggaagcctg atgcagcaac gccgcgtgcg ggatgacggc cttcgggttg

360

taaaccgctt tcagcagggg cgatgacggt acctgcagaa gaagcaccgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtgatac gtagggtgcg agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaaga

480

gctcgtaggt ggttgattgc gtcggaagtg aaaacttggg gcttaaccct gagcgtgctt

540

tcgatacggg ttgacttgag gaaggtaggg gagaatggaa ttcctggtgg agcggtggaa

600

tgcgcagata tcaggaggaa caccagtggc gaaggcggtt ctctggacct cctgacgctg

660

aggagcgaaa gcgtggggag cgaacaggct tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg

720

gtgggtacta ggtgtggggt attccgtgcc gtagctaacg cattaagtac cccgcctggg

780

gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg gccccgcaca agcggcggag

840

catgcggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg ggtttgacat gcacaggtgg

900

tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

ccctcgttca ctgttgccag caygtgggga ctcagtggag accgccgggg tcaactcgga

1020

ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg ccccttatgt ccagggcttc acgcatgcta

1080

caatggccgg caaagagttg cgagcctgtg agggtgagcg aatctcggcc ggtctcagtt

1140

cggatggggt ctgcaactcg accctagaag tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa

1200

cgctgcggtg aatacgttcc cggggcttgt acacaccgcc cgtcaagtca tgaaagtcgg

1260

taacacccga agccggtgcc tagggagccg tcgaaggtgg gactggtaat taggactaag

1320

tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc ggctggatca cctcctt

1367

<210> 1578

<211> 966

<212> DNA

<213> Propionibacterium sp. LG

<220>

<221> modified_base

<222> (876)..(876)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (900)..(900)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (914)..(914)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (947)..(949)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1578

ttttgtgggg tgctcgagtg gcgaacgggt gagtaacacg tgagtaacct gcccttgact

60

ttgggataac ttcaggaaac tggggctaat accggatagg agctcctgct gcatggtggg

120

ggttggaaag tttcggcggt tggggatgga ctcgcggctt atcagcttgt tggtggggta

180

gtggcttacc aaggctttga cgggtagccg gcctgagagg gtgaccggcc acattgggac

240

tgagatacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatgggcgga

300

agcctgatgc agcaacgccg cgtgcgggat gacggccttc gggttgtaaa ccgctttcgc

360

ctgtgacgaa gcgtgagtga cggtaatggg taaagaagca ccggctaact acgtgccagc

420

agccgcggtg atacgtaggg tgcgagcgtt gtccggattt attgggcgta aagggctcgt

480

aggtggttga tcgcgtcgga agtgtaatct tggggcttaa ccctgagcgt gctttcgata

540

cgggttgact tgaggaaggt aggggagaat ggaattcctg gtggagcggt ggaatgcgca

600

gatatcagga ggaacaccag tggcgaaggc ggttctctgg gcctttcctg acgctgagga

660

gcgaaagcgt ggggagcgaa caggcttaga taccctggta gtccacgctg taaacggtgg

720

gtactaggtg tggggtccat tccacgggtt ccgtgccgta gctaacgctt taagtacccc

780

gcctggggag tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat tgacggggcc ccgcacaagc

840

ggcggagcat gcggattaat tcgatgcaac gcgtanaacc ttacctgggt ttgacatggn

900

tcgggagtgc tcanagatgg gtgtgcctct tttggggtcg gttcacnnng gtgcatggct

960

gtcgtc

966

<210> 1579

<211> 1359

<212> DNA

<213> Propionibacterium sp. S555a

<220>

<221> modified_base

<222> (574)..(574)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1579

aaggccctgc ttttgtgggg tgctcgagtg gcgaacgggt gagtacacac gtgagtaacc

60

tgcccttgac tttgggataa cttcaggaaa ctggggctaa taccggatag gagctcctgc

120

tgcatggtgg gggttggaaa gtttcggcgg ttggggatgg actcgcggct tatcagcttg

180

ttggtggggt agtggcttac caaggctttg acgggtagcc ggcctgagag ggtgaccggc

240

cacattggga ctgagatacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca

300

caatgggcgg aagctgatgc agcaacgccg cgtgcgggat gacggccttc gggttgtaaa

360

ccgctttcgc ctgtgacgaa gcgtgagtga cggtaatggg taaagaagca ccggctaact

420

acgtgccagc agccgcggtg atacgtaggg tgcgagcgtt gtccggattt attgggcgtt

480

aaagggctcg taggtggtgg atcgcgtcgg aagtgtaatc ttggcggctt aaccctgagc

540

gtgctttcga cacgggttga cttgaggaag gtangggaga atggaattcc tggtggagcg

600

gtggaatgcg cagatatcag gaggaacacc agtggcgaag gcgttctctg ggcctttcct

660

gacgctgagg agcgaaagcg tggggagcga acaggcttag ataccctggt agtccacgct

720

gtaaacggtg ggtactaggt gtggggtcca ttccacgggt tccgtgccgt actaacgctt

780

taagtacccc gcctggggag tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat tgacggggcc

840

ccgcacaagc ggcggagcat gcggattaat tcgatgcaac gcgtagaacc ttacctgggt

900

ttgacatgga tcgggagtgc tcagagatgg gtgtgcctct tttggggtcg gttcacaggt

960

ggtgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc

1020

aacccttgtt cactgttgcc agcacgttat ggtggggact cagtggagac cgccggggtc

1080

aactcggagg aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatgcc ccttatgtcc agggcttcac

1140

gcatgctaca atggctggta cagagagtgg cgagcctgtg agggtgagcg aatctcggaa

1200

agccggtctc agttcggatt ggggtctgca actcgacctc atgaagtcgg agtcgctagt

1260

aatcgcagat cagcaacgct gcggtgaata cgttcccggg gcttgtacac accgcccgtc

1320

aagtcatgaa agttggtaac acccgaagcc ggtggccta

1359

<210> 1580

<211> 1494

<212> DNA

<213> Propionibacterium sp. oral taxon 192

<400> 1580

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

gtaaggccct ttcgggggta cacgagtggc gaacgggtga gtaacacgtg agtaacctgc

120

ccctgacttt gggataacgg atggaaacgt ttgctaatac cggatattca gctcttgagg

180

catcttttgg gttggaaagt tttttcggtt ggggatgggc tcgcgtccta tcagcttgtt

240

gttggggtag tggcctacca aggcgtcgac gggtagccgg cctgagaggg cgaccggcca

300

cattgggact gagatacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca

360

atggacggaa gtctgatgca gcaacgccgc gtgcgggatg acggccttcg ggttgtaaac

420

cgctttcagc catgacgaag cgtgagtgac ggtagtggta gaagaagcac cggctaacta

480

cgtgccagca gccgcggtga tacgtagggt gcgagcgttg tccggattta ttgggcgtaa

540

agagcttgta ggcggttgat tgcgtcgaaa gtgcaaactc agggcttaac tctgagcctg

600

ctttcgatac gggttgactt gagggatgta ggggagaatg gaattcccgg tggagcggtg

660

gaatgcgcag atatcgggag gaacaccagt ggcgaaggcg gttctctgga catttcctga

720

cgctgagaag cgaaagcgtg gggagcaaac aggcttagat accctggtag tccacgctgt

780

aaacggtggg cattaggtgt gggtcacatt ccacgtggtc tgtgccgtag ctaacgcatt

840

aagtaccccg cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact caaaggaatt gacggggccc

900

cgcacaagcg gcggagcatg cggattaatt cgatgcaacg cgaagaacct tacctgggtt

960

tgacatatgc cggaagcatg cagagatgtg tgtgcctttt tggtcggttt acaggtggtg

1020

catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

1080

ctcgtccaat gttgccagca cgttatggtg gggactcatt ggagaccgcc ggggtcaact

1140

cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catgcccctt atgtccaggg cttcacgcat

1200

gctacaatgg ccggtacaaa gagttgcgag cctgtgaggg tgagcgaatc tcataaagcc

1260

ggtctcagtt cggattgggg tctgcaactc gaccccatga agtcggagtc gctagtaatc

1320

gcagatcagc aatgctgcgg tgaatacgtt ctcggggctt gtacacaccg cccgtcaagt

1380

catgaaagtt ggtaacaccc gaagccggtg gcctaacctt tgtgggggga gccgtcgaag

1440

gtgggactgg taattaggac taagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag gtgc

1494

<210> 1581

<211> 1467

<212> DNA

<213> Propionibacterium thoenii

<400> 1581

agttttgatc ctggctcagg acgaaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caattcgaac

60

ggtaaggccc ttttcggggg tacaacgagt ggccaacggg tgagtaacac gtgagtaacc

120

ctgcccatca cttcgggata acgctgggaa actggtgcta ataccggata tgagctcctg

180

ctgcatggtg ggggttggaa agtttttgcg gtggtggatg gactcgcgtc ctatcagctt

240

gttggtgagg ttgtggctca ccaaggcgtc gacgggtagc cggcctgaga gggtgaccgg

300

ccacattggg actgagatac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc

360

acaatgggcg aaagcctgat gcagcaacgc cgcgtgcggg atgacggcct tcgggttgta

420

aaccgctttc accagggacg aagggccttt cggggtttga cggtacctgg agaagaagca

480

ccggctaact acgtgccagc agccgcggtg atacgtaggg tgcgagcgtt gtccggattt

540

attgggcgta aagagctcgt aggtggttga tcgcgtcgga agtgaaaact tggggcttaa

600

ccctgggcgt gctttcgata cgggttgact tgtggaaggt aggggagaat ggaattcttg

660

gtggagcggt ggaatgcgca gatatcagga ggaacaccag tggcgaaggc ggttctctgg

720

acctttcctg acgctgagga gcgaaagcgt ggggagcaaa caggcttaga taccctggta

780

gtccacgctg taaacggtgg gtactaggtg tggggtccat tccacggatt ccgttacgta

840

gctattcgct taagataccc cgcctgggga gtacggccgc aggctaaaac tcaaaggaat

900

tgacggggcc ccgcacaagc ggcggagcat gcggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc

960

ttacctgggt ttgacatgga ttggtaacgg tcagagatgg ccgcccccct tgtgggccga

1020

ttcacaggtg gtgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1080

aacgagcgca accctcgtcc actgttgcca gcaattcggt tggggactca gctggagacc

1140

gccggggtca actcggagga aggtgggcaa tgacgcacaa gtcatcatgc cccttatgtc

1200

cagggcttca cgcatgctac aatggccggt acaaacagtt gcgacactgt gaggtggagc

1260

gaatctcaaa aagccggtct cagttcggat tggggtctgc aactcaaccc catgaagtcg

1320

gagtcgctag taatcgcaga tcagcaacgc tgcggtgaat acgttcccgg ggcttgtaca

1380

caccgcccgt caagtcatga aagtcagtaa cacccttgag cgggtggccc tacccttgtg

1440

ggggggccgt cgaaggtgga ctggttc

1467

<210> 1582

<211> 1401

<212> DNA

<213> Proteus mirabilis

<400> 1582

tcgagcggta acaggagaaa gcttgctttc ttgctgacga gcggcggacg ggtgagtaat

60

gtatggggat ctgcccgata gagggggata actactggaa acggtggcta ataccgcata

120

atgtctacgg accaaagcag gggctcttcg gaccttgcac tatcggatga acccatatgg

180

gattagctag taggtggggt aaaggctcac ctaggcgacg atctctagct ggtctgagag

240

gatgatcagc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg

300

gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagccatgcc gcgtgtatga agaaggcctt

360

agggttgtaa agtactttca gcggggagga aggtgataag gttaataccc ttgtcaattg

420

acgttacccg cagaagaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

480

gtgcaagcgt taatcggaat tactgggcgt aaagcgcacg caggcggtca attaagtcag

540

atgtgaaagc cccgagctta acttgggaat tgcatctgaa actggttggc tagagtcttg

600

tagagggggg tagaattcca tgtgtagcgg tgaaatgcgt agagatgtgg aggaataccg

660

gtggcgaagg cggccccctg gacaaagact gacgctcagg tgcgaaagcg tggggagcaa

720

acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacgatg tcgatttaga ggttgtggtc

780

ttgaaccgtg gcttctggag ctaacgcgtt aaatcgaccg cctggggagt acggccgcaa

840

ggttaaaact caaatgaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

900

cgatgcaacg cgaagaacct tacctactct tgacatccag cgaatccttt agagatagag

960

gagtgccttc gggaacgctg agacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgttgtgaa

1020

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcct ttgttgccag cacgtaatgg

1080

tgggaactca aaggagactg ccggtgataa accggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1140

atcatggccc ttacgagtag ggctacacac gtgctacaat ggcagataca aagagaagcg

1200

acctcgcgag agcaagcgga actcataaag tctgtcgtag tccggattgg agtctgcaac

1260

tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgtagatca gaatgctacg gtgaatacgt

1320

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgcaaa agaagtaggt

1380

agcttaacct tcgggagggc g

1401

<210> 1583

<211> 1402

<212> DNA

<213> Proteus penneri

<400> 1583

tcgagcggta acagaagaaa gcttgctttc ttgctgacga gcggcggacg ggtgagtaat

60

gtatggggat ctgcccgata gagggggata actactggaa acggtggcta ataccgcatg

120

acgtctacgg accaaagcag gggctcttcg gaccttgcgc tatcggatga acccatatgg

180

gattagctag taggtgaggt aatggctcac ctaggcaacg atctctagct ggtctgagag

240

gatgatcagc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg

300

gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagccatgcc gcgtgtatga agaaggcctt

360

agggttgtaa agtactttca gcggggagga aggtgataaa gttaatacct ttgtcaattg

420

acgttacccg cagaagaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

480

gtgcaagcgt taatcggaat tactgggcgt aaagcgcacg caggcggtca attaagtcag

540

atgtgaaagc cccgagctta acttgggaat tgcatctgaa actggttggc tagagtcttg

600

tagagggggg tagaattcca cgtgtagcgg tgaaatgcgt agagatgtgg aggaataccg

660

gtggcgaagg cggccccctg gacaaagact gacgctcagg tgcgaaagcg tggggagcaa

720

acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacgatg tcgatttaga ggttgtggtc

780

ttgaaccgtg gcttctggag ctaacgcgtt aaatcgaccg cctggggagt acggccgcaa

840

ggttaaaact caaatgaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

900

cgatgcaacg cgaagaagct tacctactct tgacttccag cgaatccttt agagatagag

960

gagtgccttc gggaacgctg agacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgttgtgaa

1020

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcct ttgttgccag cgcgtaatgg

1080

cgggaactca aaggagactg ccggtgataa accggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1140

atcatggccc ttacgagtag ggctacacac gtgctacaat ggcagataca aagagaagcg

1200

acctcgcgag agcaagcgga actcataaag tctgtcgtag tccggattgg agtctgcaac

1260

tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgtagatca gaatgctacg gtgaatacgt

1320

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgcaaa agaagtaggt

1380

agcttaacct tcgggagggc gc

1402

<210> 1584

<211> 1374

<212> DNA

<213> Proteus sp. HS7514

<400> 1584

gagcggcgga cgggtgagta atgtatgggg atctgcccga tagaggggga taactactgg

60

aaacggtggc taataccgca taatgtctac ggaccaaagc aggggctctt cggaccttgc

120

actatcggat gaacccatat gggattagct agtaggtggg gtaaaggctc acctaggcga

180

cgatctctag ctggtctgag aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac

240

tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagccatg

300

ccgcgtgtat gaagaaggcc ttagggttgt aaagtacttt cagcggggag gaaggtgata

360

aggttaatac ccttgtcaat tgacgttacc cgcagaagaa gcaccggcta actccgtgcc

420

agcagccgcg gtaatacgga gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgca

480

cgcaggcggt caattaagtc agatgtgaaa gccccgagct taacttggga attgcatctg

540

aaactggttg gctagagtct tgtagagggg ggtagaattc catgtgtagc ggtgaaatgc

600

gtagagatgt ggaggaatac cggtggcgaa ggcggccccc tggacaaaga ctgacgctca

660

ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ctgtaaacga

720

tgtcgattta gaggttgtgg tcttgaaccg tggcttctgg agctaacgcg ttaaatcgac

780

cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag

840

cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctact cttgacatcc

900

agcgaatcct ttagagatag aggagtgcct tcgggaacgc tgagacaggt gctgcatggc

960

tgtcgtcagc tcgtgttgtg aaatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc

1020

ctttgttgcc agcacgtcat ggtgggaact caaaggagac tgccggtgat aaaccggagg

1080

aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatggc ccttacgagt agggctacac acgtgctaca

1140

atggcagata caaagagaag cgacctcgcg agagcaagcg gaactcataa agtctgtcgt

1200

agtccggatt ggagtctgca actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtagat

1260

cagaatgcta cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga

1320

gtgggttgca aaagaagtag gtagcttaac cttcgggagg gcgcttacca cttt

1374

<210> 1585

<211> 1495

<212> DNA

<213> Proteus vulgaris

<400> 1585

gattgaacgc tggcggcagg cctaacacat gcaagtcgag cggtaacaga ggaaagcttg

60

ctttcttgct gacgagcggc ggacgggtga gtaatgtatg gggatctgcc cgatagaggg

120

ggataactac tggaaacggt agctaatacc gcatgacgtc tacggaccaa agcaggggct

180

cttcggacct tgcgctatcg gatgaaccca tatgggatta gctagtaggt gaggtaatgg

240

ctcacctagg cgacgatctc tagctggtct gagaggatga tcagccacac tgggactgag

300

acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggcgcaagcc

360

tgatgcagcc atgccgcgtg tatgaagaag gccttagggt tgtaaagtac tttcagcggg

420

gaggaaggtg ttaagattaa tactcttagc aattgacgtt acccgcagaa gaagcaccgg

480

ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgca agcgttaatc ggaattactg

540

ggcgtaaagc gcacgcaggc ggtcaattaa gtcagatgtg aaagccccga gcttaacttg

600

ggaattgcat ctgaaactgg ttggctagag tcttgtagag gggggtagaa ttccacgtgt

660

agcggtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa taccggtggc gaaggcggcc ccctggacaa

720

agactgacgc tcaggtgcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

acgctgtaaa cgatgtcgat ttggaggttg tgcccttgag gcgtggcttc cggagctaac

840

gcgttaaatc gaccgcctgg ggagtacggc cgcaaggtta aaactcaaat gaattgacgg

900

gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg caacgcgaag aaccttacct

960

actcttgaca tccagagaat cctttagaga tagaggagtg ccttcgggaa ctctgagaca

1020

ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtt gtgaaatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1080

cgcaaccctt atcctttgtt gccagcacgt aatggtggga actcaaagga gactgccggt

1140

gataaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat ggcccttacg agtagggcta

1200

cacacgtgct acaatggcag atacaaagag aagcgacctc gcgagagcaa gcggaactca

1260

taaagtctgt cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac tccatgaagt cggaatcgct

1320

agtaatcgta gatcagaatg ctacggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg

1380

tcacaccatg ggagtgggtt gcaaaagaag taggtagctt aaccttcggg agggcgctta

1440

ccactttgtg attcatgact ggggtgaagt cctaacaagg taaccgtagg ggaac

1495

<210> 1586

<211> 1397

<212> DNA

<213> Providencia alcalifaciens

<400> 1586

gtcgagcggt aacaggggaa gcttgcttct cgctgacgag cggcggacgg gtgagtaatg

60

tatggggatc tgcccgatag agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcataa

120

tctcttagga gcaaagcagg ggaacttcgg tccttgcgct atcggatgaa cccatatggg

180

attagctagt tggtgaggta atggctcacc aaggcgacga tccctagctg gtctgagagg

240

atgatcagcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

300

aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtatgaa gaaggcctta

360

gggttgtaaa gtactttcag ttgggaggaa ggcgttgatg ctaatatcat caacgattga

420

cgttaccaac agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg

480

tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggttga ttaagttaga

540

tgtgaaatcc ccgggcttaa cctgggaatg gcatctaaga ctgtcagcta gagtcttgta

600

gaggggggta gaattccatg tgtagcggtg aaatgcgtag agatgtggag gaataccggt

660

ggcgaaggcg gccccctgga caaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac

720

aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacgatgtc gatttggagg ttgttccctt

780

gaggagtggc ttccggagct aacgcgttaa atcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg

840

ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

900

atgcaacgcg aagaacctta cctactcttg acatccagag aatttagcag agatgcttta

960

gtgccttcgg gaactctgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gttgtgaaat

1020

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg attcggtcgg

1080

gaactcaaag gagactgccg gtgataaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc

1140

atggccctta cgagtagggc tacacacgtg ctacaatggc gtatacaaag agaagcgacc

1200

tcgcgagagc aagcggaact cataaagtac gtcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg

1260

actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg tagatcagaa tgctacggtg aatacgttcc

1320

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgcaaaaga agtaggtagc

1380

ttaaccttcg ggagggc

1397

<210> 1587

<211> 1391

<212> DNA

<213> Providencia rettgeri

<220>

<221> modified_base

<222> (939)..(939)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (956)..(956)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1113)..(1113)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1380)..(1380)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1587

gcggtaacag gggaagcttg cttctcgctg acgagcggcg gacgggtgag taatgtatgg

60

ggatctgccc gatagagggg gataactact ggaaacggta gctaataccg cataatctct

120

caggagcaaa gcaggggaac ttcggtcctt gcgctatcgg atgaacccat atgggattag

180

ctagtaggtg aggtaatggc tcacctaggc gacgatccct agctggtctg agaggatgat

240

cagccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

300

tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcca tgccgcgtgt atgaagaagg ccctagggtt

360

gtaaagtact ttcagtcggg aggaaggcgt tgatgctaat atcatcaacg attgacgtta

420

ccgacagaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa

480

gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg cacgcaggcg gttgattaag ttagatgtga

540

aatccccggg cttaacctgg gaatggcatc taagactggt cagctagagt cttgtagagg

600

ggggtagaat tccatgtgta gcggtgaaat gcgtagagat gtggaggaat accggtggcg

660

aaggcggccc cctggacaaa gactgacgct caggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

720

ttagataccc tggtagtcca cgctgtaaac gatgtcgatt tgaaggttgt tcccttgagg

780

agtggctttc ggagctaacg cgttaaatcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

840

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

900

aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat ccagagaant tagcagagat gctttngtgc

960

cttcgggaac tctgagacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg

1020

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta tcctttgttg ccagcgattc ggtcgggaac

1080

tcaaaggaga ctgccggtga taaaccggag ganggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgg

1140

cccttacgag tagggctaca cacgtgctac aatggcgtat acaaagagaa gcgacctcgc

1200

gagagcaagc ggaactcata aagtrcgtcg tagtccggat tggagtctgc aactcgactc

1260

catgaagtcg gaatcgctag taatcgtaga tcagaatgct acggtgaata cgttcccggg

1320

ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggttgc aaaagaagta ggtagcttan

1380

ccttcgggag g

1391

<210> 1588

<211> 1516

<212> DNA

<213> Providencia rustigianii

<400> 1588

ttgatcctgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt cgagcggtaa

60

caggggaagc ttgcttctcg ctgacgagcg gcggacgggt gagtaatgta tggggatctg

120

cccgatagag ggggataact actggaaacg gtagctaata ccgcataatc tctttggagc

180

aaagcagggg aacttcggtc cttgcgctat cggatgaacc catatgggat tagctagttg

240

gtggggtaat ggctcaccaa ggcgacgatc cctagctggt ctgagaggat gatcagccac

300

actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa

360

tgggcgcaag cctgatgcag ccatgccgcg tgtatgaaga aggccttagg gttgtaaagt

420

actttcagtt gggaggaagg cgttgatgct aatatcatca acgattgacg ttaccaacag

480

aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg caagcgttaa

540

tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggttgatt aagttagatg tgaaatcccc

600

gggcttaacc tgggaatggc atctaagact ggtcagctag agtcttgtag aggggggtag

660

aattccatgt gtagcggtga aatgcgtaga gatgtggagg aataccggtg gcgaaggcgg

720

ccccctggac aaagactgac gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata

780

ccctggtagt ccacgctgta aacgatgtcg atttggaggt tgttcccttg aggagtggct

840

tccggagcta acgcgttaaa tcgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt taaaactcaa

900

atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga tgcaacgcga

960

agaaccttac ctactcttga catccagaga atttagcaga gatgctttag tgccttcggg

1020

aactctgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg ttgggttaag

1080

tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcctttg ttgccagcac gtcatggtgg gaactcaaag

1140

gagactgccg gtgataaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atggccctta

1200

cgagtagggc tacacacgtg ctacaatggc gtatacaaag agaagcgacc tcgcgagagc

1260

aagcggaact cataaagtac gtcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg actccatgaa

1320

gtcggaatcg ctagtaatcg tagatcagaa tgctacggtg aatacgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgcaaaaga agtaggtagc ttaaccttcg

1440

ggagggcgct taccactttg tgattcatga ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtaaccgta

1500

ggggaacctg cggctg

1516

<210> 1589

<211> 1494

<212> DNA

<213> Providencia stuartii

<400> 1589

tgatcctggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc gagcggtaac

60

aggggaagct tgcttctcgc tgacgagcgg cggacgggtg agtaatgtat ggggatctgc

120

ccgatagagg gggataacta ctggaaacgg tggctaatac cgcataatct cttaggagca

180

aagcagggga ccttagggcc ttgcgctgtc ggatgaaccc atatgggatt agctagtagg

240

taaggtaatg gcttacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg atcagccaca

300

ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat

360

gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtatgaagaa ggccctaggg ttgtaaagta

420

ctttcagtcg ggaggaaggc gttgatgtta ataccatcaa cgattgacgt taccgacaga

480

agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc aagcgttaat

540

cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg cggttaatta agttagatgt gaaatccccg

600

ggcttaacct gggaatggca tctaagactg gttagctaga gtcttgtaga ggggggtaga

660

attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagag atgtggagga ataccggtgg cgaaggcggc

720

cccctggaca aagacttacg ctcaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac

780

cctggtagtc cacgctgtaa acgatgtcga tttggaggtt gttccctaga ggagtggctt

840

ccggagctaa cgcgttaaat cgaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa

900

tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gcaacgcgaa

960

gaaccttacc tactcttgac atccagagaa tttagcagag atgctttagt gccttcggga

1020

gctctgagac aggtgctgca tggctgtcgt caactcgtgt tgtgaaatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaaccct tatcctttgt tgccagcgat tcggtcggga actcaaagga

1140

gactgccggt gataaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat ggcccttacg

1200

agtagggcta cacacgtgct acaatggcgt atacaaagag aagcgacctc gcgagagcaa

1260

gcggaactca taaagtacgt cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac tccatgaagt

1320

cggaatcgct agtaatcgta gatcagaatg ctacggtgaa tacgttcccg ggccttgtac

1380

acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaaaagaag taggtagctt aaccttcggg

1440

agggcgctta ccactttgtg atccatgact ggggtgaagt cgtaacaagg tagc

1494

<210> 1590

<211> 1445

<212> DNA

<213> Pseudoclavibacter sp. Timone

<400> 1590

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gatgaagcct tagcttgctt

60

tggtggatta gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagcaa cgtgcccagg actctggaat

120

aaccgcggga aaccgtggct aataccggat aggtgccgag gccgcatggt cttcggttgg

180

aaagtttttg cggttctgga tcggctcacg gcctatcagc ttgttggtgg ggtaatggcc

240

taccaaggcg acgacgggta gccggcctga gagggtgacc ggccacactg ggactgagac

300

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg

360

atgcagcaac gccgcgtggg ggatgacggc cttcgggttg taaacctctt ttagtaggga

420

agaagcgcaa gtgacggtac ctgcagaaaa agcaccggct aactacgtgc cagcagccgc

480

ggtaatacgt agggtgcaag cgttgtccgg atttattggg cgtaaagagc tcgtaggcgg

540

tttgtcgcgt ctgctgtgaa agcccgaggc tcaacctcgg gtctgcagtg ggtacgggca

600

ggctagagtg cggtagggga gattggaatt cctggtgtag cggtggaatg cgcagatatc

660

aggaggaaca ccgatggcga aggcagatct ctgggccgtt actgacgctg aggagcgaaa

720

gcatggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gccgtaaacg ttgggcgcta

780

gatgtgggga cctttccacg gtttctgtgt cgtagctaac gcattaagcg ccccgcctgg

840

ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga

900

gcatgcggat taattcgatg caacgcgaag aaccttacca aggcttgaca tatatcggaa

960

tcggctagag atagtcgcgc cctttgggtc ggtatacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag

1020

ctcgtgtcgt gagatgttcg gttaagtccg gcaacgagcg caacccttgt cctatgttrc

1080

cagcacgtta tggtgggaac tcatgggata ctgccgtggt caacacggag gaaggtgggg

1140

atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgtc ttgggcttca cgcatgctac aatggccggt

1200

acaatgggct gcgataccgc gaggtggagc gaatcccaaa aagccggtct cagttcggat

1260

tggggtctgc aactcgaccc catgaagtcg gagtcgctag taatcgcaga tcagcattgc

1320

tgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt caagtcatga aagtcggtaa

1380

cacccgaagc cggtggccta accttttggg gggagctgtc gaaggtggga tcggtgatta

1440

ggact

1445

<210> 1591

<211> 1385

<212> DNA

<213> Pseudoflavonifractor capillosus

<400> 1591

tcgaacggag tgctcatgac ggagttttcg gacaacggat tgggttactt agtggcggac

60

gggtgagtaa cgcgtgagga acctgcctcg gagtggggaa taacacaccg aaaggtgtgc

120

taataccgca taatgcagtt gggtcgcatg actctgactg ccaaagattt atcgctctga

180

gatggcctcg cgtctgatta gctagttggc ggggtaacgg cccaccaagg cgacgatcag

240

tagccggact gagaggttga ccggccacat tgggactgag acacggccca gactcctacg

300

ggaggcagca gtggggaata ttgggcaatg ggcgcaagcc tgacccagca acgccgcgtg

360

aaggaagaag gctttcgggt tgtaaacttc ttttgtcagg gacgaaacaa atgacggtac

420

ctgacgaata agccacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag

480

cgttatccgg atttactggg tgtaaagggc gtgtaggcgg gactgcaagt caggtgtgaa

540

aaccaggggc tcaacctctg gcctgcattt gaaactgtag ttcttgagtg ctggagaggc

600

aatcggaatt ccgtgtgtag cggtgaaatg cgtagatata cggaggaaca ccagtggcga

660

aggcggattg ctggacagta actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag caaacaggat

720

tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atggatacta ggtgtggggg gactgacccc

780

ctccgtgccg cagttaacac aataagtatc ccacctgggg agtacgatcg caaggttgaa

840

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagt atgtggttta attcgaagca

900

acgcgaagaa ccttaccagg gcttgacatc ctactaacga agcagagatg cattaggtgc

960

ccttcgggga aagtagagac aggtggagca tgggagtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

1020

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc tattgttagt tgctacgcaa gagcactcta

1080

gcgagactgc cgttgacaaa acggaggaag gtggggacga cgtcaaatca tcatgcccct

1140

tatgtcctgg gccacacacg tactacaatg gtggttaaca gagggaagca ataccgcgag

1200

gtggagcaaa tccctaaaag ccatcccagt tcggattgca ggctgaaacc cgcctgtatg

1260

aagttggaat cgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt

1320

gtacacaccg cccgtcacac catgagagtc gggaacaccc gaagtccgta gcctaaccgc

1380

aagga

1385

<210> 1592

<211> 1382

<212> DNA

<213> Pseudomonas aeruginosa

<400> 1592

tcgagcggat gaagggagct tgctcctgga ttcagcggcg gacgggtgag taatgcctgg

60

gaatctgcct ggtagtgggg gataacgtcc ggaaacgggc gctaataccg catacgtcct

120

gagggagaaa gtgggggatc ttcggacctc acgctatcag atgagcctag gtcggattag

180

ctagttggtg gggtaaaggc ctaccaaggc gacgatccgt aactggtctg agaggatgat

240

cagtcacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

300

tggacaatgg gcgaaagcct gatccagcca tgccgcgtgt gtgaagaagg tcttcggatt

360

gtaaagcact ttaagttggg aggaagggca gtagttaata ccttgctgtt ttgacgttac

420

caacagaata agcaccggct aacttcgtgc cagcagccgc ggtaatacga agggtgcaag

480

cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc gcgtaggtgg ttcagcaagt tggatgtgaa

540

atccccgggc tcaacctggg aactgcatcc aaaactactg agctagagta cggtagaggg

600

tggtggaatt tcctgtgtag cggtgaaatg cgtagatata ggaaggaaca ccagtggcga

660

aggcgaccac ctggactgat actgacactg aggtgcgaaa gcgtggggag caaacaggat

720

tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtcgacta gccgttggga tccttgagat

780

cttagtggcg cagctaacgc gataagtcga ccgcctgggg agtacggccg caaggttaaa

840

actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca

900

acgcgaagaa ccttacctgg ccttgacatg ctgagaactt tccagagatg gattggtgcc

960

ttcgggaact cagacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg

1020

gttaagtccc gtaacgagcg caacccttgt ccttagttac cagcacctcg ggtgggcact

1080

ctaaggagac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatggc

1140

ccttacggcc agggctacac acgtgctaca atggtcggta caaagggttg ccaagccgcg

1200

aggtggagct aatcccataa aaccgatcgt agtccggatc gcagtctgca actcgactgc

1260

gtgaagtcgg aatcgctagt aatcgtgaat cagaatgtca cggtgaatac gttcccgggc

1320

cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgct ccagaagtag ctagtctaac

1380

cg

1382

<210> 1593

<211> 851

<212> DNA

<213> Pseudomonas fluorescens

<220>

<221> modified_base

<222> (25)..(31)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (557)..(557)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (669)..(669)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (783)..(784)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (810)..(810)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (814)..(814)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (830)..(830)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (841)..(841)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1593

tctcttgaga gcggcggacg ggtgnnnnnn ncctaggaat ctgcctggta gtgggggata

60

acgctcggaa acggacgcta ataccgcata cgtcctacgg gagaaagcag gggaccttcg

120

ggccttgcgc tatcagatga gcctaggtcg gattagctag ttggtgaggt aatggctcac

180

caaggcgacg atccgtaact ggtctgagag gatgatcagt cacactggaa ctgagacacg

240

gtccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgga caatgggcga aagcctgatc

300

cagccatgcc gcgtgtgtga agaaggtctt cggattgtaa agcactttaa gttgggagga

360

agggcattaa cctaatacgt tagtgttttg acgttaccga cagaataagc accggctaac

420

tctgtgccag cagccgcggt aatacagagg gtgcaagcgt taatcggaat tactgggcgt

480

aaagcgcgcg taggtggttc gttaagttgg atgtgaaatc cccgggctca acctgggaac

540

tgcattcaaa actgtcnagc tagagtatgg tagagggtgg tggaatttcc tgtgtagcgg

600

tgaaatgcgt agatatagga aggaacacca gtggcgaagg cgaccacctg gactgatact

660

gacactgang tgcgaaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc

720

cgtaaacgat gtcaactagc cgttgggagc cttgagctct tagtggcgca gctaacgcat

780

tannttgacc gcctggggag tacggccgcn aggntaaaac tcaaatgaan ttgacggggg

840

nccgcacaag c

851

<210> 1594

<211> 1466

<212> DNA

<213> Pseudomonas gessardii

<400> 1594

agattgaacg ctggcggcag gcctaacaca tgcaagtcga gcggtagaga gaagctttgc

60

ttctcttgag agcggcggac gggtgagtaa tgcctaggaa tctgcctggt agtgggggat

120

aacgttcgga aacggacgct aataccgcat acgtcctacg ggagaaagca ggggaccttc

180

gggccttgcg ctatcagatg agcctaggtc ggattagcta gttggtgggg taatggctca

240

ccaaggcgac gatccgtaac tggtctgaga ggatgatcag tcacactgga actgagacac

300

ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg acaatgggcg aaagcctgat

360

ccagccatgc cgcgtgtgtg aagaaggtct tcggattgta aagcacttta agttgggagg

420

aagggttgta gattaatact ctgcaatttt gacgttaccg acagaataag caccggctaa

480

ctctgtgcca gcagccgcgg taatacagag ggtgcaagcg ttaatcggaa ttactgggcg

540

taaagcgcgc gtaggtggtt agttaagttg gatgtgaaat ccccgggctc aacctgggaa

600

ctgcattcaa aactgactga ctagagtatg gtagaggggg gtggaatttc ctgtgtagcg

660

gtgaaatgcg tagatatagg aaggaacacc agtggcgaag gcgaccacct ggactgatac

720

tgacactgag gtgcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc

780

cgtaaacgat gtcaactagc cgttgggagc cttgagctct tagtggcgca gctaacgcat

840

taagttgacc gcctggggag tacggccgca aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc

900

ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggcc

960

ttgacatcca atgaactttc tagagataga ttggtgcctt cgggaacatt gagacaggtg

1020

ctgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgt aacgagcgca

1080

acccttgtcc ttagttacca gcacgttatg gtgggcactc taaggagact gccggtgaca

1140

aaccggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc cttacggcct gggctacaca

1200

cgtgctacaa tggtcggtac agagggttgc caagccgcga ggtggagcta atcccagaaa

1260

accgatcgta gtccggatcg cagtctgcaa ctcgactgcg tgaagtcgga atcgctagta

1320

atcgcgaatc agaatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac

1380

accatgggag tgggttgcac cagaagtagc tagtctaacc ttcggcagga cggttaccac

1440

ggtgtgattc atgactgggg tgaagt

1466

<210> 1595

<211> 1537

<212> DNA

<213> Pseudomonas mendocina

<400> 1595

tgaactgaag agtttgatca tggctcagat tgaacgctgg cggcaggcct aacacatgca

60

agtcgagcgg atgaggggag cttgctccct gatttagcgg cggacgggtg agtaatgtct

120

aggaatctgc ctggtagtgg gggataacgt tccgaaagga acgctaatac cgcatacgtc

180

ctacgggaga aagcagggga ccttcgggcc ttgcgctatc agatgagcct aggtcggatt

240

agctagttgg tgaggtaatg gctcaccaag gcgacgatcc gtaactggtc tgagaggatg

300

atcagtcaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

360

attggacaat gggcgaaagc ctgatccagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggtcttcgga

420

ttgtaaagca ctttaagttg ggaggaaggg cattaaccta atacgttagt gttttgacgt

480

taccaacaga ataagcaccg gctaacttcg tgccagcagc cgcggtaata cgaagggtgc

540

aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcgcgtagg tggttcgtta agttggatgt

600

gaaagccccg ggctcaacct gggaactgca tccaaaactg gcgagctaga gtacggtaga

660

gggtggtgga atttcctgtg tagcggtgaa atgcgtagat ataggaagga acaccagtgg

720

cgaaggcgac cacctggact gatactgaca ctgaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgtcaa ctagccgttg gaatccttga

840

gattttagtg gcgcagctaa cgcattaagt tgaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt

900

aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa

960

gcaacgcgaa gaaccttacc tggccttgac atgctgagaa ctttccagag atggattggt

1020

gccttcggga actcagacac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

1080

tgggttaagt cccgtaacga gcgcaaccct tgtccttagt taccagcacc tcgggtgggc

1140

actctaagga gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat

1200

ggcccttacg gccagggcta cacacgtgct acaatggtcg gtacaaaggg ttgccaagcc

1260

gcgaggtgga gctaatccca taaaaccgat cgtagtccgg atcgcagtct gcaactcgac

1320

tgcgtgaagt cggaatcgct agtaatcgtg aatcagaatg tcacggtgaa tacgttcccg

1380

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gctccagaag tagctagtct

1440

aaccttcggg gggacggtta ccacggagtg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1500

tagccgtagg ggaacctgcg gctggatcac ctcctta

1537

<210> 1596

<211> 1517

<212> DNA

<213> Pseudomonas monteilii

<400> 1596

atcctggctc agattgaacg ctgcggcagg cctaacacat gcaagtcgag cggatgacgg

60

gagcttgctc cttgattcag cggcggacgg gtgagtaatg cctaggaatc tgcctggtag

120

tgggggacaa cgtttcgaaa ggaacgctaa taccgcatac gtcctacggg agaaagcagg

180

ggaccttcgg gccttgcgct atcagatgag cctaggtcgg attagctagt tggtggggta

240

atggctcacc aaggcgacga tccgtaactg gtctgagagg atgatcagtc acactggaac

300

tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattggac aatgggcgaa

360

agcctgatcc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggtcttc ggattgtaaa gcactttaag

420

ttgggaggaa gggcagtaag ttaatacctt gctgttttga cgttaccgac agaataagca

480

ccggctaact ctgtgccagc agccgcggta atacagaggg tgcaagcgtt aatcggaatt

540

actgggcgta aagcgcgcgt aggtggttcg ttaagttgga tgtgaaagcc ccgggctcaa

600

cctgggaact gcatccaaaa ctggcgagct agagtacggt agagggtggt ggaatttcct

660

gtgtagcggt gaaatgcgta gatataggaa ggaacaccag tggcgaaggc gaccacctgg

720

actgatactg acactgaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta

780

gtccacgccg taaacgatgt caactagccg ttggaatcct tgagatttta gtggcgcagc

840

taacgcatta agttgaccgc ctggggagta cggccgcaag gttaaaactc aaatgaattg

900

acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt

960

accaggcctt gacatgcaga gaactttcca gagatggatt ggtgccttcg ggaactctga

1020

cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgtaa

1080

cgagcgcaac ccttgtcctt agttaccagc acgtaatggt gggcactcta aggagactgc

1140

cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca tcatggccct tacggcctgg

1200

gctacacacg tgctacaatg gtcggtacag agggttgcca agccgcgagg tggagctaat

1260

ctcacaaaac cgatcgtagt ccggatcgca gtctgcaact cgactgcgtg aagtcggaat

1320

cgctagtaat cgcgaatcag aatgtcgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1380

cccgtcacac catgggagtg ggttgcacca gaagtagcta gtctaacctt cgggaggacg

1440

gttaccacgg tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac aaggtagccg taggggaacc

1500

tgcggctgga tcacctc

1517

<210> 1597

<211> 1348

<212> DNA

<213> Pseudomonas poae

<400> 1597

cttgagagcg gcggacgggt gagtaatgcc taggaatctg cctggtagtg ggggataacg

60

ttcggaaacg gacgctaata ccgcatacgt cctacgggag aaagcagggg accttcgggc

120

cttgcgctat cagatgagcc taggtcggat tagctagttg gtgaggtaat ggctcaccaa

180

ggcgacgatc cgtaactggt ctgagaggat gatcagtcac actggaactg agacacggtc

240

cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa tgggcgaaag cctgatccag

300

ccatgccgcg tgtgtgaaga aggtcttcgg attgtaaagc actttaagtt gggaggaagg

360

gcattaacct aatacgttag tgttttgacg ttaccgacag aataagcacc ggctaactct

420

gtgccagcag ccgcggtaat acagagggtg caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa

480

gcgcgcgtag gtggtttgtt aagttggatg tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc

540

attcaaaact gactgactag agtatggtag agggtggtgg aatttcctgt gtagcggtga

600

aatgcgtaga tataggaagg aacaccagtg gcgaaggcga ccacctggac taatactgac

660

actgaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta

720

aacgatgtca actagccgtt ggaagccttg agcttttagt ggcgcagcta acgcattaag

780

ttgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc

840

acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggccttga

900

catccaatga actttctaga gatagattgg tgccttcggg aacattgaga caggtgctgc

960

atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgtaacg agcgcaaccc

1020

ttgtccttag ttaccagcac gtaatggtgg gcactctaag gagactgccg gtgacaaacc

1080

ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atggccctta cggcctgggc tacacacgtg

1140

ctacaatggt cggtacagag ggttgccaag ccgcgaggtg gagctaatcc cacaaaaccg

1200

atcgtagtcc ggatcgcagt ctgcaactcg actgcgtgaa gtcggaatcg ctagtaatcg

1260

cgaatcagaa tgtcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca

1320

tgggagtggg ttgcaccaga agtagcta

1348

<210> 1598

<211> 1492

<212> DNA

<213> Pseudomonas pseudoalcaligenes

<400> 1598

attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc ggatgaaggg agcttgctcc

60

ctgatttagc ggcggacggg tgagtaatgc ctaggaatct gcctggtagt gggggataac

120

gttccgaaag gaacgctaat accgcatacg tcctacggga gaaagcaggg gaccttcggg

180

ccttgcgcta tcagatgagc ctaggtcgga ttagctagtt ggtgaggtaa tggctcacca

240

aggcgacgat ccgtaactgg tctgagagga tgatcagtca cactggaact gagacacggt

300

ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattggaca atgggcgaaa gcctgatcca

360

gccatgccgc gtgtgtgaag aaggtcttcg gattgtaaag cactttaagt tgggaggaag

420

ggcagtaagc taataccttg ctgttttgac gttaccgaca gaataagcac cggctaactt

480

cgtgccagca gccgcggtaa tacgaagggt gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa

540

agcgcgcgta ggtggttcgt taagttggat gtgaaagccc cgggctcaac ctgggaactg

600

catccaaaac tggcgagcta gagtacggta gagggtggtg gaatttcctg tgtagcggtg

660

aaatgcgtag atataggaag gaacaccagt ggcgaaggcg accacctgga ctgatactga

720

cactgaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt

780

aaacgatgtc aactagccgt tgggttcctt gagaacttag tggcgcagct aacgcattaa

840

gttgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg

900

cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta cctggccttg

960

acatgctgag aactttccag agatggattg gtgccttcgg gaactcagac acaggtgctg

1020

catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgtaac gagcgcaacc

1080

cttgtcctta gttaccagca cgtaatggtg ggcactctaa ggagactgcc ggtgacaaac

1140

cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catggccctt acggccaggg ctacacacgt

1200

gctacaatgg tcggtacaaa gggttgccaa gccgcgaggt ggagctaatc ccataaaacc

1260

gatcgtagtc cggatcgcag tctgcaactc gactgcgtga agtcggaatc gctagtaatc

1320

gtgaatcaga atgtcacggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc

1380

atgggagtgg gttgctccag aagtagctag tctaaccttc ggggggacgg ttaccacgga

1440

gtgattcatg actggggtga agtcgtaaca aggtagccgt aggggaacct gc

1492

<210> 1599

<211> 1394

<212> DNA

<213> Pseudomonas putida

<220>

<221> modified_base

<222> (1384)..(1384)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1599

tcgagcggat gagaagagct tgctcttcga ttcagcggcg gacgggtgag taatgcctag

60

gaatctgcct ggtagtgggg gacaacgttt cgaaaggaac gctaataccg catacgtcct

120

acgggagaaa gcaggggacc ttcgggcctt gcgctatcag atgagcctag gtcggattag

180

ctagttggtg aggtaatggc tcaccaaggc gacgatccgt aactggtctg agaggatgat

240

cagtcacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

300

tggacaatgg gcgaaagcct gatccagcca tgccgcgtgt gtgaagaagg tcttcggatt

360

gtaaagcact ttaagttggg aggaagggca ttaacctaat acgttagtgt tttgacgtta

420

ccgacagaat aagcaccggc taactctgtg ccagcagccg cggtaataca gagggtgcaa

480

gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg cgcgtaggtg gtttgttaag ttggatgtga

540

aagccccggg ctcaacctgg gaactgcatc caaaactggc aagctagagt acggtagagg

600

gtggtggaat ttcctgtgta gcggtgaaat gcgtagatat aggaaggaac accagtggcg

660

aaggcgacca cctggactga tactgacact gaggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

720

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgtcaact agccgttgga atccttgaga

780

ttttagtggc gcagctaacg cattaagttg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

840

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc

900

aacgcgaaga accttaccag gccttgacat gcagagaact ttccagagat ggattggtgc

960

cttcgggaac tctgacacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

1020

ggttaagtcc cgtaacgagc gcaacccttg tccttagtta ccagcacgtt atggtgggca

1080

ctctaaggag actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg

1140

gcccttacgg cctgggctac acacgtgcta caatggtcgg tacagagggt tgccaagccg

1200

cgaggtggag ctaatctcac aaaaccgatc gtagtccgga tcgcagtctg caactcgact

1260

gcgtgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcga atcagaatgt cgcggtgaat acgttcccgg

1320

gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttg caccagaagt agctagtcta

1380

accntcggga ggac

1394

<210> 1600

<211> 1524

<212> DNA

<213> Pseudomonas sp. 2_1_26

<400> 1600

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc

60

ggatgaaggg agcttgctcc tgaattcagc ggcggacggg tgagtaatgc ctaggaatct

120

gcctgatagt gggggataac gtccggaaac gggcgctaat accgcatacg tcctgaggga

180

gaaagtgggg gatcttcgga cctcacgcta tcagatgagc ctaggtcgga ttagctagtt

240

ggtggggtaa aggcctacca aggcgacgat ccgtaactgg tctgagagga tgatcagtca

300

cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattggaca

360

atgggcgaaa gcctgatcca gccatgccgc gtgtgtgaag aaggtcttcg gattgtaaag

420

cactttaagt tgggaggaag ggcagtaagt taataccttg ctgttttgac gttaccaaca

480

gaataagcac cggctaactt cgtgccagca gccgcggtaa tacgaagggt gcaagcgtta

540

atcggaatta ctgggcgtaa agcgcgcgta ggtggttcag caagttggat gtgaaatccc

600

cgggctcaac ctgggaactg catccaaaac tactgagcta gagtacggta gagggtggtg

660

gaatttcctg tgtagcggtg aaatgcgtag atataggaag gaacaccagt ggcgaaggcg

720

accacctgga ctgatactga cactgaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

780

accctggtag tccacgccgt aaacgatgtc gactagccgt tgggatcctt gagatcttag

840

tggcgcagct aacgcgataa gtcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg ttaaaactca

900

aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg

960

aagaacctta cctggccttg acatgctgag aactttccag agatggattg gtgccttcgg

1020

gaactcagac acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1080

gtcccgtaac gagcgcaacc cttgtcctta gttaccagca cctcgggtgg gcactctaag

1140

gagactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atggccctta

1200

cggccagggc tacacacgtg ctacaatggt cggtacaaag ggttgccaag ccgcgaggtg

1260

gagctaatcc cataaaaccg atcgtagtcc ggatcgcagt ctgcaactcg actgcgtgaa

1320

gtcggaatcg ctagtaatcg tgaatcagaa tgtcacggtg aatacgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgctccaga agtagctagt ctaaccgcaa

1440

gggggacggt taccacggag tgattcatga ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1500

ggggaacctg cggctggatc acct

1524

<210> 1601

<211> 1284

<212> DNA

<213> Pseudomonas sp. G1229

<400> 1601

cctaggaatc tgcctggtag tgggggacaa cgtttcgaaa ggaacgctaa taccgcatac

60

gtcctacggg agaaagcagg ggaccttcgg gccttgcgct atcagatgag cctaggtcgg

120

attagctagt tggtgaggta atggctcacc aaggctacga tccgtaactg gtctgagagg

180

atgatcagtc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

240

aatattggac aatgggcgaa agcctgatcc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggtcttc

300

ggattgtaaa gcactttaag ttgggaggaa gggttgtaga ttaatactct gcaattttga

360

cgttaccgac agaataagca ccggctaact ctgtgccagc agccgcggta atacagaggg

420

tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcgcgt aggtggttcg ttaagttgga

480

tgtgaaatcc ccgggctcaa cctgggaact gcatccaaaa ctggcgagct agagtatggt

540

agagggtggt ggaatttcct gtgtagcggt gaaatgcgta gatataggaa ggaacaccag

600

tggcgaaggc gaccacctgg actgatactg acactgaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa

660

caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatgt caactagccg ttgggagcct

720

tgagctctta gtggcgcagc taacgcatta agttgaccgc ctggggagta cggccgcaag

780

gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc

840

gaagcaacgc gaagaacctt accaggcctt gacatccaat gaactttcca gagatggatt

900

ggtgccttcg ggaacattga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

960

tgttgggtta agtcccgtaa cgagcgcaac ccttgtcctt agttaccagc acgtaatggt

1020

gggcactcta aggagactgc cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca

1080

tcatggccct tacggcctgg gctacacacg tgctacaatg gtcggtacaa agggttgcca

1140

agccgcgagg tggagctaat cccataaaac cgatcgtagt ccggatcgca gtctgcaact

1200

cgactgcgtg aagtcggaat cgctagtaat cgcgaatcag aatgtcgcgg tgattacgtt

1260

cccgggcctt gtacacaccg cccg

1284

<210> 1602

<211> 1402

<212> DNA

<213> Pseudomonas sp. NP522b

<400> 1602

catgcaagtc gagcggatga agggagcttg cttctggatt cagcggcgga cgggtgagta

60

atgcctagga atctgcctgg tagtggggga caacgttccg aaaggagcgc taataccgca

120

tacgtcctac gggagaaagt gggggatctt cggacctcac gctatcagat gagcctaggt

180

cggattagct agtaggtggg gtaatggctc acctaggcga cgatccgtaa ctggtctgag

240

aggatgatca gtcacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg

300

gggaatattg gacaatgggc gaaagcctga tccagccatg ccgcgtgtgt gaagaaggtc

360

ttcggattgt aaagcacttt aagttgggag gaagggcagt aagttaatac cttgctgttt

420

tgacgttacc aacagaataa gcaccggcta acttcgtgcc agcagccgcg gtaatacgaa

480

gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgcg cgtaggtggt ttggtaagat

540

ggatgtgaaa tccccgggct caacctggga actgcatcca taactgcctg actagagtac

600

ggtagagggt ggtggaattt cctgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatag gaaggaacac

660

cagtggcgaa ggcgaccacc tggactgata ctgacactga ggtgcgaaag cgtggggagc

720

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgtcgactag ccgttgggat

780

ccttgagatc ttagtggcgc agctaacgcg ataagtcgac cgcctgggga gtacggccgc

840

aaggttaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

900

ttcgaagcaa cgcgaagaac cttacctggc cttgacatgt ccggaatcct gcagagatgc

960

gggagtgcct tcgggaatcg gaacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1020

gagatgttgg gttaagtccc gtaacgagcg caccctttgt ccttagttac cagcacgtta

1080

tggtgggcac tctaaggaga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgaggtcaa

1140

gtcatcatgg cccttacggc cagggctaca cacgtgctac aatggtcggt tcagagggtt

1200

gccaagccgc gaggtggagc taatcccaga aaaccgattg tagtccggat cgcagtctgc

1260

aactcgactg cggaagtcgg aatcgctagt aatcgtgaat cagaatgtca cggtgaatac

1320

gttcccgggc cttgtacact ccgcccgtca caccatggga gtgggttgct ccagaagtag

1380

ctagtctaac cgcaaggggg ac

1402

<210> 1603

<211> 1363

<212> DNA

<213> Pseudomonas stutzeri

<400> 1603

gcttgctctc tgattcagcg gcggacgggt gagtaatgcc taggaatctg cctgrtagtg

60

ggggacaacg tttcgaaagg aacgctaata ccgcatacgt cctacgggag aaagcagggg

120

accttcgggc cttgcgctat cagatgagcc taggtcggat tagctagttg gtgaggtaac

180

ggctcaccaa ggcgacgatc cgtaactggt ctgagaggat gatcagtcac actggaactg

240

agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa tgggcgaaag

300

cctgatccag ccatgccgcg tgtgtgaaga aggtcttcgg attgtaaagc actttaagtt

360

gggaggaagg gcattaacct aatacgttag tgttttgacg ttaccgacag aataagcacc

420

ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgaagggtg caagcgttaa tcggaattac

480

tgggcgtaaa gcgcgcgtag gtggtttgtt aagttgaatg tgaaagcccc gggctcaacc

540

tgggaactgc atccaaaact ggcaagctag agtatggcag agggtggtgg aatttcctgt

600

gtagcggtga aatgcgtaga tataggaagg aacaccagtg gcgaaggcga ccacctgggc

660

taatactgac actgaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt

720

ccacgccgta aacgatgtcg actagccgtt gggatccttg agatcttagt ggcgcagcta

780

acgcattaag tcgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt taaaactcaa atgaattgac

840

gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac

900

caggccttga catgcagaga actttccaga gatggattgg tgccttcggg aactctgaca

960

caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgtaacg

1020

agcgcaaccc ttgtccttag ttaccagcac gttaaggtgg gcactctaag gagactgccg

1080

gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atggccctta cggcctgggc

1140

tacacacgtg ctacaatggt cggtacaaag ggttgccaag ccgcgaggtg gagctaatcc

1200

cataaaaccg atcgtagtcc ggatcgcagt ctgcaactcg actgcgtgaa gtcggaatcg

1260

ctagtaatcg tgaatcagaa tgtcacggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1320

cgtcacacca tgggagtggg ttgctccaga agtagctagt cta

1363

<210> 1604

<211> 1450

<212> DNA

<213> Pseudomonas tolaasii

<400> 1604

agagtttgat cctggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc

60

ggtagagaga agcttgcttc tcttgagagc ggcggacggg tgagtaatgc ctaggaatct

120

gcctggtagt gggggataac gtccggaaac ggacgctaat accgcatacg tcctacggga

180

gaaagcaggg gaccttcggg ccttgcgcta tcagatgagc ctaggtcgga ttagctagtt

240

ggtgaggtaa tggctcacca aggcgacgat ccgtaactgg tctgagagga tgatcagtca

300

cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattggaca

360

atgggcgaaa gcctgatcca gccatgccgc gtgtgtgaag aaggtcttcg gattgtaaag

420

cactttaagt tgggaggaag ggcagttgcc taatacgtaa ctgttttgac gttaccgaca

480

gaataagcac cggctaactc tgtgccagca gccgcggtaa tacagagggt gcaagcgtta

540

atcggaatta ctgggcgtaa agcgcgcgta ggtggtttgt taagttggat gtgaaatccc

600

cgggctcaac ctgggaactg cattcaaaac tgactgacta gagtatggta gagggtggtg

660

gaatttcctg tgtagcggtg aaatgcgtag atataggaag gaacaccagt ggcgaaggcg

720

accacctgga ctaatactga cactgaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

780

accctggtag tccacgccgt aaacgatgtc aactagccgt tggaagcctt gagcttttag

840

tggcgcagct aacgcattaa gttgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg ttaaaactca

900

aatgaattga csggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg

960

aagaacctta ccaggccttg acatccaatg aactttccag agatggattg gtgccttcgg

1020

gaacattgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1080

gtcccgtaac gagcgcaacc cttgtcctta gttaccagca cgttatggtg ggcactctaa

1140

ggagactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catggccctt

1200

acggcctggg ctacacacgt gctacaatgg tcggtacaga gggttgccaa gccgcgaggt

1260

ggagctaatc ccataaaacc gatcgtagtc cggatcgcag tctgcaactc gactgcgtga

1320

agtcggaatc gctagtaatc gcgaatcaga atgtcgcggt gaatacgttc ccgggccttg

1380

tacaaaccgc ccgtcacacc atgggagtgg gttgcaccag aagtagctag tctaaccttc

1440

gggaggacgg

1450

<210> 1605

<211> 1439

<212> DNA

<213> Pseudomonas viridiflava

<400> 1605

tgcgagtcga tcggtagaga gaagcttgct tctcttgaga gcggcggacg ggtgagtaat

60

gcctaggaat ctgcctggta gtgggggata acgctcggaa acggacgcta ataccgcata

120

cgtcctacgg gagaaagcag gggaccttcg ggccttgcgc tatcagatga gcctaggtcg

180

gattagctag ttggtgaggt aatggctcac caaggcgacg atccgtaact ggtctgagag

240

gatgatcagt cacactggaa ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtggg

300

gaatattgga caatgggcga aagcctgatc cagccatgcc gcgtgtgtga agaaggtctt

360

cggattgtaa agcactttaa gttgggagga agggcagtaa cctaatacgt tattgttttg

420

acgttaccga cagaataagc accggctaac tctgtgccag cagccgcggt aatacagagg

480

gtgcaagcgt taatcggaat tactgggcgt aaagcgcgcg taggtggttt gttaagttga

540

atgtgaaatc cccgggctca acctgggaac tgcatccaaa actggcaagc tagagtaggg

600

cagagggtgg tggaatttcc tgtgtagcgg tgaaatgcgt agatatagga aggaacacca

660

gtggcgaagg cgaccacctg ggctcatact gacactgagg tgcgaaagcg tggggagcaa

720

acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg tcaactagcc gttggaatcc

780

ttgagatttt agtggcgcag ctaacgcatt aagttgaccg cctggggagt acggccgcaa

840

ggttaaaact caaatgaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

900

cgaagcaacg cgaagaacct taccaggcct tgacatccaa tgaatccttt agagatagag

960

gagtgccttc gggagcattg agacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1020

atgttgggtt aagtcccgta acgagcgcaa cccttgtcct tagttaccag cacgttaagg

1080

tgggcactct aaggagactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1140

atcatggccc ttacggcctg ggctacacac gtgctacaat ggtcggtaca gagggttgcc

1200

aagccgcgag gtggagctaa tctcacaaaa ccgatcgtag tccggatcgc agtctgcaac

1260

tcgactgcgt gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcgaatca gaatgtcgcg gtgaatacgt

1320

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgcacc agaagtagct

1380

agtctaacct tcgggaggac ggttaccgcg gtgtgattca tgactggggt gaagtcgaa

1439

<210> 1606

<211> 1480

<212> DNA

<213> Pseudoramibacter alactolyticus

<400> 1606

taagtcaaaa agaacagttt gatcatggct caggacgaac gctggcggta tgcttaacac

60

atgcaagtcg aacgagaagt tttttattga ccttcggggg atataagaga cagacagtgg

120

cgaacgggtg agtaacgcgt gggcaaccta cctatcggag cgggatagcc tcgagaaatc

180

gggagtaaaa ccgcataaca cagcagaatc gcatgacttt gctgtcaaaa ctccggtgcc

240

gatagatggg cccgcgtctg attagctagt tggtaaggta agggcttacc aaggcaacga

300

tcagtagccg gtctgagagg gcgaacggcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc

360

tacgggaggc agcagtgggg aatattgcgc aatgggggca accctgacgc agcaataccg

420

cgtgagtgaa gaaggttttc ggatcgtaaa gctctgttat tggggaagaa gcagtgacgg

480

tacccaatga ggaagtcccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggggac

540

gagcgttgtc cggaatcact gggcgtaaag ggcgcgtagg cggttttata agtcagatgt

600

gaaaggtacc ggctcaaccg gtgacgtgca tttgaaactg taagacttga gtactgaaga

660

ggcaagcgga attcctagtg tagcggtgaa atgcgtagat attaggaaga acaccggtgg

720

cgaaggcggc ttgctgggca gatactgacg ctgaggtgcg aaagcgtggg gagcgaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgaata ctaggtgttg gcgaataagt

840

cagtgccgga gttaacacaa taagtattcc gcctggggag tacgaccgca aggttgaaac

900

tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc agcggagcat gtggtttaat tcgaagcaac

960

gcgaagaacc ttaccaggcc ttgacatcct ctgagcgcaa tagagatatt gctttccctt

1020

cggagacaga gagacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt

1080

taagtcccgc aacgagcgca acccctgtca ttagttgcca tcattgagtt gggcactcta

1140

atgagactgc cgtagacaat acggaggaag gtggggacga cgtcaaatca tcatgcccct

1200

tatggcctgg gctacacacg tgctacaatg gtctgaacaa agggaagcga aggagcgatt

1260

cggagcgaat ctcataaaac agatcccagt tcggattgca ggctgcaact cgcctgcatg

1320

aagatggagt tgctagtaat cgcggatcag aatgtcgcgg tgaatgcgtt cccgggtctt

1380

gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtc ggtaacaccc gaagccagtg agacaaccgg

1440

aaggagtcag ctgtcgaagg tgggatcggt aattggggtg

1480

<210> 1607

<211> 1610

<212> DNA

<213> Psychrobacter arcticus

<400> 1607

atgagccaag tttagtagcc tctttaaagg gttacatagc aagattaaac tgaagagttt

60

gatcatggct cagattgaac gctggcggca ggcttaacac atgcaagtcg agcggaaacg

120

atggtagctt gctaccaggc gtcgagcggc ggacgggtga gtaatactta ggaatctacc

180

tagtagtggg ggatagcacg gggaaactcg tattaatacc gcatacgacc tacgggagaa

240

agggggcagt ttactgctct cgctattaga tgagcctaag tcggattagc tagatggtgg

300

ggtaaaggcc taccatggcg acgatctgta gctggtctga gaggatgatc agccacaccg

360

ggactgagac acggcccgga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg

420

ggaaaccctg atccagccat gccgcgtgtg tgaagaaggc cttttggttg taaagcactt

480

taagcagtga agaagactcc atggttaata cccatggacg atgacattag ctgcagaata

540

agcaccggct aactctgtgc cagcagccgc ggtaatacag agggtgcaag cgttaatcgg

600

aattactggg cgtaaaggga gcgtaggtgg ctcgataagt cagatgtgaa atccccgggc

660

tcaacctggg aactgcatct gatactgttg agctagagta tgtgagagga aggtagaatt

720

ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata ccgatggcga aggcagcctt

780

ctggcataat actgacactg aggctcgaaa gcgtgggtag caaacaggat tagataccct

840

ggtagtccac gccgtaaacg atgtctacta gtcgttgggt cccttgagga cttagtgacg

900

cagctaacgc aataagtaga ccgcctgggg agtacggccg caaggttaaa actcaaatga

960

attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgca acgcgaagaa

1020

ccttacctgg tcttgacata tctagaatcc tgcagagatg cgggagtgcc ttcgggaatt

1080

agaatacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1140

gcaacgagcg caacccttgt ccttagttac cagcgggtta agccgggaac tctaaggata

1200

ctgccagtga caaactggag gaaggcgggg acgacgtcaa gtcatcatgg cccttacgac

1260

cagggctaca cacgtgctac aatggtaggt acagagggca gctacacagc gatgtgatgc

1320

gaatctcaaa aagcctatcg tagtccagat tggagtctgc aactcgactc catgaagtag

1380

gaatcgctag taatcgcgga tcagaatgcc gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac

1440

accgcccgtc acaccatggg agttgattgc accagaagtg gatagcttaa ccttcgggaa

1500

ggcgttcacc acggtgtggt tgatgactgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtagggg

1560

aacctgcggc tggatcacct ccttatagat ggcattcggt cagcaagaat

1610

<210> 1608

<211> 1428

<212> DNA

<213> Psychrobacter cibarius

<400> 1608

aagcttgctt ctcgctgacg agcggcggac gggtgagtaa tacttaggaa tctacctagt

60

agtgggggat agcacgggga aactcgtatt aataccgcat acgacctacg ggagaaaggg

120

ggcagtttac tgctctcgct attagatgag cctaagtcgg attagctaga tggtggggta

180

aaggcctacc atggcgacga tctgtagctg gtctgagagg atgatcagcc acaccgggac

240

tgagacacgg cccggactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattggac aatgggggaa

300

accctgatcc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggccttt tggttgtaaa gcactttaag

360

cagtgaagaa gactccatgg ttaataccca tggacgatga cattagctgc agaataagca

420

ccggctaact ctgtgccagc agccgcggta atacagaggg tgcaagcgtt aatcggaatt

480

actgggcgta aagggagcgt aggtggctct ataagtcaga tgtgaaatcc ccgggcttaa

540

cctgggaact gcatctgaaa ctgtagagct agagtatgtg agaggaaggt agaattccag

600

gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccga tggcgaaggc agccttctgg

660

cataatactg acactgaggc tcgaaagcgt gggtagcaaa caggattaga taccctggta

720

gtccacgccg taaacgatgt ctactagtcg ttgggtccct tgaggactta gtgacgcagc

780

taacgcaata agtagaccgc ctggggagta cggccgcaag gttaaaactc aaatgaattg

840

acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gatgcaacgc gaagaacctt

900

acctggtctt gacatatcta gaatcctgca gagatgcggg agtgccttcg ggaattagaa

960

tacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1020

cgagcgcaac ccttgtcctt agttaccagc gggttaagcc gggaactcta aggatactgc

1080

cagtgacaaa ctggaggaag gcggggacga cgtcaagtca tcatggccct tacgaccagg

1140

gctacacacg tgctacaatg gtaggtacag agggcagcta cacagcgatg tgatgcgaat

1200

ctcaaaaagc ctatcgtagt ccagattgga gtctgcaact cgactccatg aagtaggaat

1260

cgctagtaat cgcggatcag aatgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1320

cccgtcacac catgggagtt gattgcacca gaagtggata gcttaacctt cgggggagcg

1380

ttcaccacgg tgtggttgat gactggggtg aagtcgtaac aaggtagc

1428

<210> 1609

<211> 1586

<212> DNA

<213> Psychrobacter cryohalolentis

<400> 1609

gatgagccaa gtttagaagt ctctttaaag gacttcatag caagattaaa ctgaagagtt

60

tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcttaaca catgcaagtc gagcggaaac

120

gatgatagct tgctatcagg cgtcgagcgg cggacgggtg agtaatactt aggaatctac

180

ctagtagtgg gggatagcac ggggaaactc gtattaatac cgcatacgac ctacgggaga

240

aagggggcag tttactgctc tcgctattag atgagcctaa gtcggattag ctagatggtg

300

gggtaaaggc ctaccatggc gacgatctgt agctggtctg agaggatgat cagccacacc

360

gggactgaga cacggcccgg actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tggacaatgg

420

gggaaaccct gatccagcca tgccgcgtgt gtgaagaagg ccttttggtt gtaaagcact

480

ttaagcagtg aagaagactc ttcggttaat acccggagac gatgacatta gctgcagaat

540

aagcaccggc taactctgtg ccagcagccg cggtaataca gagggtgcaa gcgttaatcg

600

gaattactgg gcgtaaaggg agcgtaggtg gctcgataag tcagatgtga aatccccggg

660

ctcaacctgg gaactgcatc tgatactgtt gagctagagt atgtgagagg aaggtagaat

720

tccaggtgta gcggtgaaat gcgtagagat ctggaggaat accgatggcg aaggcagcct

780

tctggcataa tactgacact gaggctcgaa agcgtgggta gcaaacagga ttagataccc

840

tggtagtcca cgccgtaaac gatgtctact agtcgttggg tcccttgagg acttagtgac

900

gcagctaacg caataagtag accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa aactcaaatg

960

aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga

1020

accttacctg gtcttgacat atctagaatc ctgcagagat gcgggagtgc cttcgggaat

1080

tagaatacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1140

cgcaacgagc gcaacccttg tccttagtta ccagcgggtt aagccgggaa ctctaaggat

1200

actgccagtg acaaactgga ggaaggcggg gacgacgtca agtcatcatg gcccttacga

1260

ccagggctac acacgtgcta caatggtagg tacagagggc agctacacag cgatgtgatg

1320

cgaatctcaa aaagcctatc gtagtccaga ttggagtctg caactcgact ccatgaagta

1380

ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagaatgc cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca

1440

caccgcccgt cacaccatgg gagttgattg caccagaagt ggatagctta accttcgggg

1500

gagcgttcac cacggtgtgg ttgatgactg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtaggg

1560

gaacctgcgg ctggatcacc tcctta

1586

<210> 1610

<211> 1472

<212> DNA

<213> Psychrobacter faecalis

<400> 1610

ggctcagatt gaacgctggc ggcaggctta acacatgcaa gtcgagcggt aacaggagaa

60

gcttgcttct cgctgacgag cggcggacgg gtgagtaata cttaggaatc tacctagtag

120

tgggggatag ctcggggaaa ctcgaattaa taccgcatac gacctacggg agaaaggggg

180

caacttgttg ctctcgctat tagatgagcc taagtcggat tagctagatg gtggggtaaa

240

ggcctaccat ggcgacgatc tgtagctggt ctgagaggat gatcagccac accgggactg

300

agacacggcc cggactccta cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa tgggggcaac

360

cctgatccag ccatgccgcg tgtgtgaaga aggccttttg gttgtaaagc actttaagca

420

gtgaagaaga ctccatggtt aatacccatg gacgatgaca ttagctgcag aataagcacc

480

ggctaactct gtgccagcag ccgcggtaat acagagggtg caagcgttaa tcggaattac

540

tgggcgtaaa gcgagcgtag gtggcttgat aagtcagatg tgaaagcccc gggcttaacc

600

tgggaacggc atctgatact gttaggctag agtaggtgag aggaaggtag aattccaggt

660

gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccgatg gcgaaggcag ccttctggca

720

tcatactgac actgaggttc gaaagcgtgg gtagcaaaca ggattagata ccctggtagt

780

ccacgccgta aacgatgtct actagtcgtt gggtcccttg aggacttagt gacgcagcta

840

acgcaataag tagaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt taaaactcaa atgaattgac

900

gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga tgcaacgcga agaaccttac

960

ctggtcttga catatctaga atcctgcaga gatgcgggag tgccttcggg aattagaata

1020

caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc ttgtccttag ttaccagcgg tttggccggg aactctaagg atactgccag

1140

tgacaaactg gaggaaggcg gggacgacgt caagtcatca tggcccttac gaccagggct

1200

acacacgtgc tacaatggta ggtacagagg gcagctacac agcgatgtga tgcgaatctc

1260

aaaaagccta tcgtagtcca gattggagtc tgcaactcga ctccatgaag taggaatcgc

1320

tagtaatcgc ggatcagaat gccgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc

1380

gtcacaccat gggagttgat tgcaccagaa gtgggtagcc taacctttta ggatggcgct

1440

caccacggtg tggttgatga ctggggtgaa gt

1472

<210> 1611

<211> 1468

<212> DNA

<213> Psychrobacter nivimaris

<400> 1611

agattgaacg ctggcggcag gcttaacaca tgcaagtcga gcggaaacga tgatagcttg

60

ctatcaggcg tcgagcggcg gacgggtgag taatacttag gaatctacct agtagtgggg

120

gatagcacgg ggaaactcgt attaataccg catacgacct acgggagaaa gggggcagtt

180

tactgctctc gctattagat gagcctaagt cggattagct agatggtggg gtaaaggcct

240

accatggcga cgatctgtag ctggtctgag aggatgatca gccacaccgg gactgagaca

300

cggcccggac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggg gaaaccctga

360

tccagccatg ccgcgtgtgt gaagaaggcc ttttggttgt aaagcacttt aagcagtgaa

420

gaagactctt cggttaatac ccggagacga tgacattagc tgcagaataa gcaccggcta

480

actctgtgcc agcagccgcg gtaatacaga gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc

540

gtaaagcgag cgtaggtggc ttgataagtc agatgtgaaa tccccgggct taacctggga

600

actgcatctg aaactgttag gctagagtag gtgagaggga ggtagaattt caggtgtagc

660

ggtgaaatgc gtagagatct gaaggaatac cgatggcgaa ggcagcctcc tggcatcata

720

ctgacactga ggctcgaaag cgtgggtagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg

780

ccgtaaacga tgtctactag tcgttgggtc ccttgaggac ttagtgacgc agctaacgca

840

ataagtagac cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg

900

cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggt

960

cttgacatat ctagaatcct gcagagatgc gggagtgcct tcgggaatta gaatacaggt

1020

gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc

1080

aacccttgtc cttagttacc agcgggttaa gccgggaact ctaaggatac tgccagtgac

1140

aaactggagg aaggcgggga cgacgtcaag tcatcatggc ccttacgacc agggctacac

1200

acgtgctaca atggtaggta cagagggcag ctacacagcg atgtgatgcg aatctcaaaa

1260

agcctatcgt agtccagatt ggagtctgca actcgactcc atgaagtagg aatcgctagt

1320

aatcgcggat cagaatgccg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca

1380

caccatggga gttgattgca ccagaagtgg atagcctaac cttcgggaag gcgttcacca

1440

cggtgtggtt gatgactggg gtgaagtc

1468

<210> 1612

<211> 1468

<212> DNA

<213> Psychrobacter pulmonis

<400> 1612

agattgaacg ctggcggcag gcttaacaca tgcaagtcga gcggtaacag gagaagcttg

60

cttctcgctg acgagcggcg gacgggtgag taatacttag gaatctacct agtagtgggg

120

gatagctcgg ggaaactcga attaataccg catacgacct acgggagaaa gggggcaact

180

tgttgctctc gctattagat gagcctaagt cggattagct agatggtggg gtaaaggcct

240

accatggcga cgatctgtag ctggtctgag aggatgatca gccacaccgg gactgagaca

300

cggcccggac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggg gcaaccctga

360

tccagccatg ccgcgtgtgt gaagaaggcc ttttggttgt aaagcacttt aagcagtgaa

420

gaagactcca tggttaatac ccatggacga tgacattagc tgcagaataa gcaccggcta

480

actctgtgcc agcagccgcg gtaatacaga gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc

540

gtaaagcgag cgtaggtggc ttgataagtc agatgtgaaa gccccgggct taacctggga

600

acggcatctg atactgttag gctagagtag gtgagaggaa ggtagaattc caggtgtagc

660

ggtgaaatgc gtagagatct ggaggaatac cgatggcgaa ggcagccttc tggcatcata

720

ctgacactga ggttcgaaag cgtgggtagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg

780

ccgtaaacga tgtctactag tcgttgggtc ccttgaggac ttagtgacgc agctaacgca

840

ataagtagac cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg

900

cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggt

960

cttgacatat ctagaatcct gcagagatgc gggagtgcct tcgggaatta gaatacaggt

1020

gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc

1080

aacccttgtc cttagttacc agcggtttgg ccgggaactc taaggatact gccagtgaca

1140

aactggagga aggcggggac gacgtcaagt catcatggcc cttacgacca gggctacaca

1200

cgtgctacaa tggtaggtac agagggcagc tacacagcga tgtgatgcga atctcaaaaa

1260

gcctatcgta gtccagattg gagtctgcaa ctcgactcca tgaagtagga atcgctagta

1320

atcgcggatc agaatgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac

1380

accatgggag ttgattgcac cagaagtggt tagcctaacc ttttaggaag gcgatcacca

1440

cggtgtggtt gatgactggg gtgaagtc

1468

<210> 1613

<211> 1457

<212> DNA

<213> Psychrobacter sp. 13983

<400> 1613

attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgagc ggtaacagga gaagcttgct

60

tctygctgac gagcggcgga cgggtgagta atacttagga atctgcccag tagtggggga

120

tagcacgggg aaactcgtat taataccgca tacaccctac ggggaaaagg gggcgcttgc

180

gctctcgcta ttggatgagc ctaagtcgga ttagctagtt ggtggggtaa aggcctacca

240

aggcgacgat ctgtagctgg tctgagagga tgatcagcca caccgggact gagacacggc

300

ccggactcct acgggaggca gcagtgggga atattggaca atgggggcaa ccctgatcca

360

gccatgccgc gtgtgtgaag aaggcctttt ggttgtaaag cactttaagc agtgaagaag

420

actctatggt taatacccat agacgatgac attagctgca gaataagcac cggctaactc

480

tgtgccagca gccgcggtaa tacagagggt gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa

540

agcgagcgta ggtggcttaa taagtcagat gtgaaatccc cgggcttaac ctgggaactg

600

catctgatac tgttgggcta gagtaggtga gagggaggta gaatttcagg tgtagcggtg

660

aaatgcgtag agatctgaag gaataccgat ggcgaaggca gcctcctggc atcatactga

720

cactgaggtt cgaaagcgtg ggtagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt

780

aaacgatgtc tactagtcgt tggggaactt gattccttag tgacgcagct aacgcaataa

840

gtagaccgcc tggggagtac ggccgcaagg ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg

900

cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctggtcttg

960

acatatctag aatcctgcag agatgcggga gtgccttcgg gaattagaat acaggtgctg

1020

catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

1080

cttttcctta gttaccagcg gtttggccgg ggactctaag gatactgcca gtgacaaact

1140

ggaggaaggc ggggacgacg tcaagtcatc atggccctta cgaccagggc tacacacgtg

1200

ctacaatggt aggtacagag ggctgctaca cagcgatgtg atgcgaatct caaaaagcct

1260

atcgtagtcc agattggagt ctgcaactcg actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg

1320

cggatcagaa tgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca

1380

tgggagttga ttgcaccaga agtgggtagc ctaactttta gagggcgctc accacggtgt

1440

ggtcgatgac tggggtg

1457

<210> 1614

<211> 1327

<212> DNA

<213> Pyramidobacter piscolens

<400> 1614

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagttgagc gagcagcgga cgggtgagta

60

aagcacaagg acttgtccga aagagaggga cacctgcggg aaaccggagc taatacctca

120

taaaaaaggc gcttttggag agacttgtgt cctatcaggc agttggtgag gtaacggctc

180

accaaaccga agacgggtag ccggactgag aggtcgaccg gccacattgg aactgagaga

240

cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg ggcaatgggc gcaagcctga

300

cccagcgacg ccgcgtgagg gaagacagcc ttcgggttgt aaacctctgt tgcaggggaa

360

gatgacggta ccctgcgagg aagctccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

420

tagggagcga gcgttgtccg gaattactgg gcgtaaaggg cgcgtaggcg gcgcttcaag

480

tcgtctgtca aaagccgagg ctcaacctcg gtgcgcagac gaaactggag agcttgagaa

540

gcagagaggc aaacagaatt cctggtgtag cggtgaaatg cgtagatatc aggaagaata

600

ccagtggcga aggcggtttg ctggctgcct gacgctgaag cgcgaaagcc aggggagcaa

660

acgggattag ataccccggt agtcctggca gtaaacgatg tatgctgggt gtgggacgtt

720

ccgtgccgaa gttaacgcga taagcatacc gcctggggag tacggtcgca agattgaaac

780

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcac gtggtttaat tcgatgcaaa

840

ccgaagaacc ttacctggac ttgacatcaa caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg

900

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ctattgccgg ttgctaccag

960

ctgagcactc cggcgagact gccatcgaca agatggagga aggtggggac gacgtcaagt

1020

catcatggcc catatgtcca gggcgacaca catgctacaa tggatggcag agagaagcga

1080

gcccgaaagg agaagcagat cccaaccatc cccagttcgg atgcagtctg caactcgact

1140

gcagaagttg gaatcgctag taatcgcgga tcagccaagc cgcggtgaat acgttcccgg

1200

gccttgtaca caccgcccgt cacaccatcc gagtcgggtg ctctcaaagc cggagcctaa

1260

ggatccgcct aaagagtgtc cggtgaggag ggtgaagtcg taacaaggta accgtacggg

1320

aacgtgc

1327

<210> 1615

<211> 1540

<212> DNA

<213> Ralstonia pickettii

<400> 1615

ttgaactgaa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggcatgcc ttacacatgc

60

aagtcgaacg gcagcatgat ctagcttgct agattgatgg cgagtggcga acgggtgagt

120

aatacatcgg aacgtgccct gtagtggggg ataactagtc gaaagattag ctaataccgc

180

atacgacctg agggtgaaag tgggggaccg caaggcctca tgctatagga gcggccgatg

240

tctgattagc tagttggtgg ggtaaaggcc caccaaggcg acgatcagta gctggtctga

300

gaggacgatc agccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatttt ggacaatggg cgaaagcctg atccagcaat gccgcgtgtg tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagcactt ttgtccggaa agaaatggct ctggttaata cctggggtcg

480

atgacggtac cggaagaata aggaccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

agggtccaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgt gcgcaggcgg ttgtgcaaga

600

ccgatgtgaa atccccgagc ttaacttggg aattgcattg gtgactgcac ggctagagtg

660

tgtcagaggg gggtagaatt ccacgtgtag cagtgaaatg cgtagagatg tggaggaata

720

ccgatggcga aggcagcccc ctgggataac actgacgctc atgcacgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccctaaacg atgtcaacta gttgttgggg

840

attcatttcc ttagtaacgt agctaacgcg tgaagttgac cgcctgggga gtacggtcgc

900

aagattaaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggatga tgtggattaa

960

ttcgatgcaa cgcgaaaaac cttacctacc cttgacatgc cactaacgaa gcagagatgc

1020

attaggtgct cgaaagagaa agtggacaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc

1080

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gtctctagtt gctacgaaag

1140

ggcactctag agagactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcct

1200

catggccctt atgggtaggg cttcacacgt catacaatgg tgcatacaga gggttgccaa

1260

gccgcgaggt ggagctaatc ccagaaaatg catcgtagtc cggatcgtag tctgcaactc

1320

gactacgtga agctggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc

1380

ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtgg gctttaccag aagtagttag

1440

cctaaccgca aggagggcga ttaccacggt agggttcatg actggggtga agtcgtaaca

1500

aggtagccgt atcggaaggt gcggctggat cacctccttt

1540

<210> 1616

<211> 1540

<212> DNA

<213> Ralstonia sp. 5_7_47FAA

<400> 1616

ttgaactgaa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggcatgcc ttacacatgc

60

aagtcgaacg gcagcatgat ctagcttgct agattgatgg cgagtggcga acgggtgagt

120

aatacatcgg aacgtgccct gtagtggggg ataactagtc gaaagattag ctaataccgc

180

atacgacctg agggtgaaag tgggggaccg caaggcctca tgctatagga gcggccgatg

240

tctgattagc tagttggtga ggtaaaggct caccaaggcg acgatcagta gctggtctga

300

gaggacgatc agccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatttt ggacaatggg cgaaagcctg atccagcaat gccgcgtgtg tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagcactt ttgtccggaa agaaatggct ctggttaata cctggggtcg

480

atgacggtac cggaagaata aggaccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

agggtccaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgt gcgcaggcgg ttgtgcaaga

600

ccgatgtgaa atccccgagc ttaacttggg aattgcattg gtgactgcac ggctagagtg

660

tgtcagaggg gggtagaatt ccacgtgtag cagtgaaatg cgtagagatg tggaggaata

720

ccgatggcga aggcagcccc ctgggataac actgacgctc atgcacgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccctaaacg atgtcaacta gttgttgggg

840

attcatttcc ttagtaacgt agctaacgcg tgaagttgac cgcctgggga gtacggtcgc

900

aagattaaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggatga tgtggattaa

960

ttcgatgcaa cgcgaaaaac cttacctacc cttgacatgc cactaacgaa gcagagatgc

1020

attaggtgct cgaaagagaa agtggacaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc

1080

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gtctctagtt gctacgaaag

1140

ggcactctag agagactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcct

1200

catggccctt atgggtaggg cttcacacgt catacaatgg tgcatacaga gggttgccaa

1260

gccgcgaggt ggagctaatc ccagaaaatg catcgtagtc cggatcgtag tctgcaactc

1320

gactacgtga agctggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc

1380

ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtgg gctttaccag aagtagttag

1440

cctaaccgca aggagggcga ttaccacggt agggttcatg actggggtga agtcgtaaca

1500

aggtagccgt atcggaaggt gcggctggat cacctccttt

1540

<210> 1617

<211> 1515

<212> DNA

<213> Raoultella ornithinolytica

<400> 1617

cagattgaac gctggcggca cgcctaacac atgcaagtcg agcggtagca cagagagctt

60

gctctcgggt gacgagcggc ggacgggtga gtaatgtctg ggaaactgcc tgatggaggg

120

ggataactac tggaaacggt agctaatacc gcataacgtc gcaagaccaa agtgggggac

180

cttcgggcct catgccatca gatgtgccca gatgggatta gctagtaggt ggggtaatgg

240

ctcacctagg cgacgatccc tagctggtct gagaggatga ccagccacac tggaactgag

300

acacggtcca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggcgcaagcc

360

tgatgcagcc atgccgcgtg tatgaagaag gccttcgggt tgtaaagtac tttcagcgag

420

gaggaaggcg ttaaggttaa taaccttagt gattgacgtt actcgcagaa gaagcaccgg

480

ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgca agcgttaatc ggaattactg

540

ggcgtaaagc gcacgcaggc ggtctgttaa gtcagatgtg aaatccccgg gctcaacctg

600

ggaactgcat ttgaaactgg caggcttgag tcttgtagag gggggtagaa ttccaggtgt

660

agcggtgaaa tgcgtavaga tctggaggaa taccggtggc gaaggcggcc ccctggacaa

720

agactgacgc tcaggtgcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

780

acgctgtaaa cgatgtcgac ttggaggttg ttcccttgag gagtggcttc cggagctaac

840

gcgttaagtc gaccgcctgg ggagtacggc cgcaaggtta aaactcaaat gaattgacgg

900

gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg caacgcgaag aaccttacct

960

actcttgaca tccagagaac ttagcagaga tgctttggtg ccttcgggaa ctctgagaca

1020

ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtt gtgaaatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1080

cgcaaccctt atcctttgtt gccagcgatt cggtcgggaa ctcaaaggag actgccagtg

1140

ataaactgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg gcccttacga gtagggctac

1200

acacgtgcta caatggcata tacaaagaga agcgacctcg cgagagcaag cggacctcat

1260

aaagtatgtc gtagtccgga ttggagtctg caactcgact ccatgaagtc ggaatcgcta

1320

gtaatcgtag atcagaatgc tacggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

cacaccatgg gagtgggttg caaaagaagt aggtagctta accttcggga gggcgcttac

1440

cactttgtga ttcatgactg gggtgaagtc gtaacaaggt aaccgtaggg gaacctgcgg

1500

ctggatcacc tcctt

1515

<210> 1618

<211> 1398

<212> DNA

<213> Raoultella planticola

<400> 1618

tcgagcggta gcacagagag cttgctctcg ggtgacgagc ggcggacggg tgagtaatgt

60

ctgggaaact gcctgatgga gggggataac tactggaaac ggtagctaat accgcataac

120

gtcgcaagac caaagtgggg gaccttcggg cctcatgcca tcagatgtgc ccagatggga

180

ttagctagta ggtggggtaa tggctcacct aggcgacgat ccctagctgg tctgagagga

240

tgaccagcca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga

300

atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtatgaag aaggccttcg

360

ggttgtaaag tactttcagc gaggaggaag gcattaaggt taataacctt ggtgattgac

420

gttactcgca gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggt

480

gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtttgt taagtcagat

540

gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg catttgaaac tggcaagctt gagtcttgta

600

gaggggggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag gaataccggt

660

ggcgaaggcg gccccctgga caaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac

720

aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacgatgtc gacttggagg ttgttccctt

780

gaggagtggc ttccggagct aacgcgttaa gtcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg

840

ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

900

atgcaacgcg aagaacctta cctactcttg acatccagag aacttagcag agatgctttg

960

gggccttcgg gaactctgag acagaggctg catggctgtc gtcagctcgt gtgatgaaat

1020

tttgggatta gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg gtccggccgg

1080

gaactcaaag gagactgcca gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc

1140

atggccctta cgagtagggc tacacacgtg ctacaatggc atatacaaag agaagcgacc

1200

tcgcgagagc aagcggacct cataaagtat gtcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg

1260

actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg tagatcagaa tgctacggtg aatacgttcc

1320

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgcaaaaga agtaggtagc

1380

ttaaccttcg ggagggcg

1398

<210> 1619

<211> 1454

<212> DNA

<213> Raoultella terrigena

<400> 1619

tgaacgctgg cggcaggcct aacacatgca agtcgagcgg tagcacagaa gagcttgctc

60

ttcgggtgac gagcggcgga cgggtgagta atgtctggga aactgcctga tggaggggga

120

taactactgg aaacggtagc taataccgca taacgtcgca agaccaaagt gggggacctt

180

cgggcctcat gccatcagat gtgcccagat gggattagct agtaggtgag gtaatggctc

240

acctaggcga cgatccctag ctggtctgag aggatgacca gccacactgg aactgagaca

300

cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga

360

tgcagccatg ccgcgtgtat gaagaaggcc ttcgggttgt aaagtacttt cagcgaggag

420

gaaggcgtta aggttaataa ccttagcgat tgacgttact cgcagaagaa gcaccggcta

480

actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc

540

gtaaagcgca cgcaggcggt ctgtcaagtc ggatgtgaaa tccccgggct caacctggga

600

actgcatccg aaactggcag gctagagtct tgtagagggg ggtagaattc caggtgtagc

660

ggtgaaatgc gtagagatct ggaggaatac cggtggcgaa ggcggccccc tggacaaaga

720

ctgacgctca ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg

780

ctgtaaacga tgtcgacttg gaggttgttc ccttgaggag tggcttccgg agctaacgcg

840

ttaagtcgac cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg

900

cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctact

960

cttgacatcc agagaactta gcagagatgc tttggtgcct tcgggaactc tgagacaggt

1020

gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgttgtg aaatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc

1080

aacccttatc ctttgttgcc agcggttcgg ccgggaactc aaaggagact gccagtgata

1140

aactggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc cttacgagta gggctacaca

1200

cgtgctacaa tggcatatac aaagagaagc gacctcgcga gagcaagcgg acctcataaa

1260

gtatgtcgta gtccggatcg gagtctgcaa ctcgactccg tgaagtcgga atcgctagta

1320

atcgtggatc agaatgccac ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac

1380

accatgggag tgggttgcaa aagaagtagg tagcttaacc ttcgggaggg cgcttaccac

1440

tttgtgattc atga

1454

<210> 1620

<211> 1432

<212> DNA

<213> Rhodobacter sp. oral taxon C30

<400> 1620

agagtttgat cctggctcag aacgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac

60

gagatcttcg gatctagtgg cggacgggtg agtaacgcgt gggaacgtgc cctttggttc

120

ggaatagcct cgggaaactg ggagtaatac cggatacgcc cttcggggga aagatttatc

180

gccaaaggat cggcccgcgt tggattaggt agttggtggg gtaacggcct accaagccga

240

cgatccatag ctggtttgag aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac

300

tcctacggga ggcagcagtg gggaatctta gacaatgggg gcaaccctga tctagccatg

360

ccgcgtgatc gatgaaggcc ttagggttgt aaagatcttt cagctgggaa gataatgact

420

gtaccagcag aagaagcccc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggaggggg

480

ctagcgttgt tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgtag gcggaccaga aagtcagagg

540

tgaaatccca gggctcaacc ttggaactgc ctttgaaact cctggtcttg agttcgagag

600

aggtgagtgg aattccgagt gtagaggtga aattcgtaga tattcggagg aacaccagtg

660

gcgaaggcgg ctcactggct cgatactgac gctgaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca

720

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgaat gccagacgtc gggcagccat

780

gctgttcggt gtcacaccta acggattaag cattccgcct ggggagtacg gccgcaaggt

840

taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga

900

agcaacgcgc agaaccttac caacccttga catggcgatc gcggttccag agatggttcc

960

ttcagttcgg ctggatcgca cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1020

tgttcggtta agtccggcaa cgagcgcaac ccacactttc agttgccatc attcagttgg

1080

gcactctgaa agaactgccg gtgataagcc ggaggaaggt gtggatgacg tcaagtcctc

1140

atggccctta cgggttgggc tacacacgtg ctacaatggt ggtgacaatg ggttaatccc

1200

caaaagccat ctcagttcgg attggggtct gcaactcgac cccatgaagt cggaatcgct

1260

agtaatcgcg taacagcatg acgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg

1320

tcacaccatg ggaattgggt ctacccgacg acggtgcgcc aacctcgcaa gaggaagcag

1380

ccggccacgg taggctcagt gactggggtg aagtcgtaac aaggtagccg ta

1432

<210> 1621

<211> 1466

<212> DNA

<213> Rhodobacter sphaeroides

<400> 1621

caacttgaga gtttgatcct ggctcagaat gaacgctggc ggcaggccta acacatgcaa

60

gtcgagcgaa gtcttcggac ttagcggcgg acgggtgagt aacgcgtggg aacgtgccct

120

ttgcttcgga atagccccgg gaaactggga gtaataccga atgtgccctt tgggggaaag

180

atttatcggc aaaggatcgg cccgcgttgg attaggtagt tggtggggta atggcctacc

240

aagccgacga tccatagctg gtttgagagg atgatcagcc acactgggac tgagacacgg

300

cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatcttagac aatgggcgca agcctgatct

360

agccatgccg cgtgatcgat gaaggcctta gggttgtaaa gatctttcag gtgggaagat

420

aatgacggta ccaccagaag aagccccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

gagggggcta gcgttattcg gaattactgg gcgtaaagcg cacgtaggcg gatcggaaag

540

tcagaggtga aatcccaggg ctcaaccctg gaactgcctt tgaaactccc gatcttgagg

600

tcgagagagg tgagtggaat tccgagtgta gaggtgaaat tcgtagatat tcggaggaac

660

accagtggcg aaggcggctc actggctcga tactgacgct gaggtgcgaa agcgtgggga

720

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatgcc agtcgtcggg

780

cagcatgctg ttcggtgaca cacctaacgg attaagcatt ccgcctgggg agtacggccg

840

caaggttaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

900

attcgaagca acgcgcagaa ccttaccaac ccttgacatg gcgatcgcgg ttccagagat

960

ggttccttca gttcggctgg atcgcacaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc

1020

gtgagatgtt cggttaagtc cggcaacgag cgcaacccac gtccttagtt gccagcattc

1080

agttgggcac tctagggaaa ctgccggtga taagccggag gaaggtgtgg atgacgtcaa

1140

gtcctcatgg cccttacggg ttgggctaca cacgtgctac aatggcagtg acaatgggtt

1200

aatcccaaaa agctgtctca gttcggattg gggtctgcaa ctcgacccca tgaagtcgga

1260

atcgctagta atcgcgtaac agcatgacgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1320

cgcccgtcac accatgggaa ttggttctac ccgaaggcgg tgcgccaacc tcgcaagagg

1380

aggcagccga ccacggtagg atcagtgact ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtagg

1440

ggaacctgcg gctggatcac ctcctt

1466

<210> 1622

<211> 1477

<212> DNA

<213> Rhodococcus corynebacterioides

<220>

<221> modified_base

<222> (970)..(970)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1622

cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggtaaggccc

60

ttcggggtac acgagtggcg aacgggtgag taacacgtgg gtgatctgcc ctgcacttcg

120

ggataagccc gggaaactgg gtctaatacc ggataggact gcgcggtgca tgccgtgtgg

180

tggaaagatt tatcggtgca ggatgggccc gcggcctatc agcttgttgg tggggtaatg

240

gcctaccaag gcgacgacgg gtagccggcc tgagagggcg accggccaca ctgggactga

300

gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc

360

ctgatgcagc gacgccgcgt gagggatgac ggccttcggg ttgtaaacct ctttcagcag

420

ggacgaagcg caagtgacgg tacctgcaga agaagcaccg gccaactacg tgccagcagc

480

cgcggtaata cgtagggtgc aagcgttgtc cggaattact gggcgtaaag agctcgtagg

540

cggtttgtcg cgtcgtctgt gaaaaccagc agctcaactg ttggcttgca ggcgatacgg

600

gcagacttga gtatttcagg ggagactgga attcctggtg tagcggtgaa atgcgcagat

660

atcaggagga acaccggtgg cgaaggcggg tctctgggaa ataactgacg ctgaggagcg

720

aaagcgtggg tagcgaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acggtgggcg

780

ctaggtgtgg gtttccttcc acgggatccg tgccgtagct aacgcattaa gcgccccgcc

840

tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggc

900

ggagcatgtg gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctgggtttg acatacaccg

960

gaaagccgtn gagatacggc cccccttgtg gtcggtgtac aggtggtgca tggctgtcgt

1020

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtcctgtgt

1080

tgccagcacg ttatggcggg gactcgcagg agactgccgg ggtcaactcg gaggaaggtg

1140

gggacgacgt caagtcatca tgccccttat gtccagggct tcacacatgc tacaatggcc

1200

ggtacagagg gctgcgatac cgtgaggtgg agcgaatccc ttaaagccgg tctcagttcg

1260

gatcggggtc tgcaactcga ccccgtgaag tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa

1320

cgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacgtca tgaaagtcgg

1380

taacacccga agccggtggc ctaacccctt gtgggaggga gccgtcgaag gtgggatcgg

1440

cgattgggac gaagtcgtaa caaggtagcc gtaccgg

1477

<210> 1623

<211> 1523

<212> DNA

<213> Rhodococcus equi

<400> 1623

cttcaacgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaaggcccc ttcgggggta cacgagtggc gaacgggtga gtaacacgtg

120

ggtgatctgc cctgcactct gggataagcc tgggaaactg ggtctaatac cggatatgag

180

ctcctgtcgc atggcggggg ttggaaaggt ttactggtgc aggatgggcc cgcggcctat

240

cagcttgttg gtggggtaat ggcctaccaa ggcgacgacg ggtagccggc ctgagagggc

300

gaccggccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa

360

tattgcacaa tgggcgaaag cctgatgcag cgacgccgcg tgagggatga cggccttcgg

420

gttgtaaacc tctttcagca gggacgaagc gagagtgacg gtacctgcag aagaagcacc

480

ggccaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggtg cgagcgttgt ccggaattac

540

tgggcgtaaa gagctcgtag gcggtttgtc gcgtcgtccg tgaaaacttg gggctcaacc

600

ccaagcttgc gggcgatacg ggcagacttg agtactgcag gggagactgg aattcctggt

660

gtagcggtga aatgcgcaga tatcaggagg aacaccggtg gcgaaggcgg gtctctgggc

720

agtaactgac gctgaggagc gaaagcgtgg gtagcgaaca ggattagata ccctggtagt

780

ccacgccgta aacggtgggc gctaggtgtg ggtttccttc cacgggatcc gtgccgtagc

840

taacgcatta agcgccccgc ctggggagta cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg

900

acgggggccc gcacaagcgg cggagcatgt ggattaattc gatgcaacgc gaagaacctt

960

acctgggttt gacatatacc ggaaagccgt agagatacgg ccccccttgt ggtcggtata

1020

caggtggtgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc ttgtcctgtg ttgccagcgc gtaatggcgg ggactcgcag gagactgccg

1140

gggtcaactc ggaggaaggt ggggacgacg tcaagtcatc atgcccctta tgtccagggc

1200

ttcacacatg ctacaatggc cggtacagag ggctgcgata ccgtgaggtg gagcgaatcc

1260

cttaaagccg gtctcagttc ggatcggggt ctgcaactcg accccgtgaa gtcggagtcg

1320

ctagtaatcg cagatcagca acgctgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc

1380

ccgtcacgtc atgaaagtcg gtaacacccg aagccggtgg cctaaccctt gtggagggag

1440

ccgtcgaagg tgggatcggc gattgggacg aagtcgtaac aaggtagccg taccggaagg

1500

tgcggctgga tcacctcctt tct

1523

<210> 1624

<211> 1527

<212> DNA

<213> Rhodococcus erythropolis

<400> 1624

acggagagtt tgatcctggc tcaggacgaa cgctggcggc gtgcttaaca catgcaagtc

60

gagcggtaag gcctttcggg gtacacgagc ggcgaacggg tgagtaacac gtgggtgatc

120

tgccctgcac ttcgggataa gcctgggaaa ctgggtctaa taccggatat gacctcaggt

180

tgcatgactt gggtggtgga aagatttatc ggtgcaggat gggcccgcgg cctatcagct

240

tgttggtggg gtaatggcct accaaggcga cgacgggtag ccgacctgag agggtgaccg

300

gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

360

cacaatgggc gaaagcctga tgcagcgacg ccgcgtgagg gatgacggcc ttcgggttgt

420

aaacctcttt cagcagggac gaagcgcaag tgacggtacc tgcagaagaa gcaccggcta

480

actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggtgcaagc gttgtccgga attactgggc

540

gtaaagagtt cgtaggcggt ttgtcgcgtc gtttgtgaaa accagcagct caactgctgg

600

cttgcaggcg atacgggcag acttgagtac tgcaggggag actggaattc ctggtgtagc

660

ggtgaaatgc gcagatatca ggaggaacac cggtggcgaa ggcgggtctc tgggcagtaa

720

ctgacgctga ggaacgaaag cgtgggtagc gaacaggatt agataccctg gtagtccacg

780

ccgtaaacgg tgggcgctag gtgtgggttc cttccacgga atccgtgccg tagctaacgc

840

attaagcgcc ccgcctgggg agtacggccg caaggctaaa actcaaagga attgacgggg

900

gcccgcacaa gcggcggagc atgtggatta attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg

960

gtttgacata taccggaaag ctgcagagat gtggcccccc ttgtggtcgg tatacaggtg

1020

gtgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

1080

acccctatct tatgttgcca gcacgttatg gtggggactc gtaagagact gccggggtca

1140

actcggagga aggtggggac gacgtcaagt catcatgccc cttatgtcca gggcttcaca

1200

catgctacaa tggccagtac agagggctgc gagaccgtga ggtggagcga atcccttaaa

1260

gctggtctca gttcggatcg gggtctgcaa ctcgaccccg tgaagtcgga gtcgctagta

1320

atcgcagatc agcaacgctg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca

1380

cgtcatgaaa gtcggtaaca cccgaagccg gtggcttaac cccttgtggg agggagccgt

1440

cgaaggtggg atcggcgatt gggacgaagt cgtaacaagg tagccgtacc ggaaggtgcg

1500

gctggatcac ctcctttcta aggagca

1527

<210> 1625

<211> 1424

<212> DNA

<213> Rhodococcus fascians

<400> 1625

cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgagc ggtaaggcct

60

ttcggggtac acgagcggcg aacgggtgag taacacgtgg gtgatctgcc ctgcactctg

120

ggataagctt gggaaactgg gtctaatacc ggatatgacc acagcatgca tgtgttgtgg

180

tggaaagatt tatcggtgca ggatgggccc gcggcctatc agcttgttgg tggggtaatg

240

gcctaccaag gcgacgacgg gtagccgacc tgagagggtg accggccaca ctgggactga

300

gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcggaagc

360

ctgatgcagc gacgccgcgt gagggatgaa ggccttcggg ttgtaaacct ctttcagcag

420

ggacgaagcg tgagtgacgg tacctgcaga agaagcaccg gctaactacg tgccagcagc

480

cgcggtaata cgtagggtgc gagcgttgtc cggaattact gggcgtaaag agttcgtagg

540

cggtttgtcg cgtcgtttgt gaaaacccgg ggctcaactt cgggcttgca ggcgatacgg

600

gcagacttga gtgtttcagg ggagactgga attcctggtg tagcggtgaa atgcgcagat

660

atcaggagga acaccggtgg cgaaggcggg tctctgggaa acaactgacg ctgaggaacg

720

aaagcgtggg tagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acggtgggcg

780

ctaggtgtgg gttccttcca cgggatctgt gccgtagcta acgcattaag cgccccgcct

840

ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggcg

900

gagcatgtgg attaattcga tgcaacgcga agaaccttac ctgggtttga catacaccgg

960

aaaaccgtag agatacggtc ccccttgtgg tcggtgtaca ggtggtgcat ggctgtcgtc

1020

agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gtcttatgtt

1080

gccagcacgt aatggtgggg actcgtaaga gactgccggg gtcaactcgg aggaaggtgg

1140

ggacgacgtc aagtcatcat gccccttatg tccagggctt cacacatgct acaatggcca

1200

gtacagaggg ctgcgagacc gtgaggtgga gcgaatccct taaagctggt ctcagttcgg

1260

atcggggtct gcaactcgac cccgtgaagt cggagtcgct agtaatcgca gatcagcaac

1320

gctgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacgtcat gaaagtcggt

1380

aacacccgaa gccggtggcc taacccctta cggggaggga gccg

1424

<210> 1626

<211> 1489

<212> DNA

<213> Rhodopseudomonas palustris

<400> 1626

tccaacttga gagtttgatc ctggctcaga gcgaacgctg gcggcaggct taacacatgc

60

aagtcgaacg ggcatagcaa tatgtcagtg gcagacgggt gagtaacgcg tgggaacata

120

ccttttggtt cggaacaact gagggaaact tcagctaata ccggataagc cctaacgggg

180

aaagatttat cgccgaaaga ttggcccgcg tctgattagc tagttggtga ggtaatggct

240

caccaaggcg acgatcagta gctggtctga gaggatgatc agccacattg ggactgagac

300

acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg cgcaagcctg

360

atccagccat gccgcgtgag tgatgaaggc cctagggttg taaagctctt ttgtgcggga

420

agataatgac ggtaccgcaa gaataagccc cggctaactt cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacgaagggg gctagcgttg ctcggaatca ctgggcgtaa agggtgcgta ggcgggtttt

540

taagtcagag gtgaaatcct ggagctcaac tccagaactg cctttgatac tgaaagtctt

600

gagtacggga gaggtgagtg gaactgcgag tgtagaggtg aaattcgtag atattcgcaa

660

gaacaccagt ggcgaaggcg gctcactggc ccgttactga cgctgaggca cgaaagcgtg

720

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgaa tgccagccgt

780

tagtgggttt actcactagt ggcgcagcta acgctttaag cattccgcct ggggagtacg

840

gtcgcaagat taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg

900

tttaattcga cgcaacgcgc agaaccttac cagcccttga catgtctagg accggtcgca

960

gagatgtgac cttctcttcg gagcctagag cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg

1020

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccccgtcttt agttgctacc

1080

atttagttga gcactctaaa gagactgccg gtgataagcc gcgaggaagg tggggatgac

1140

gtcaagtcct catggccctt acgggctggg ctacacacgt gctacaatgg cggtgacaat

1200

gggatgctaa agggcaacct ctcgcaaatc tcaaaaagcc gtctcagttc ggattgggct

1260

ctgcaactcg agcccatgaa gttggaatcg ctagtaatcg tggatcagca tgccacggtg

1320

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagttgg ttttacctga

1380

aggtagtgcg ctaacccgca agggaggcag ctaaccacgg tagggtcagc gactggggtg

1440

aagtcgtaac aaggtagccg taggggaacc tgcggctgga tcacctcct

1489

<210> 1627

<211> 1508

<212> DNA

<213> Rickettsia akari

<400> 1627

gacagaatca aacttgagag tttgatcctg gctcagaacg aacgctatcg gtatgcttaa

60

cacatgcaag tcggacggac tgattggggt tttctccagt tagtgagtgg cgaacgggtg

120

agtaacacgt gggaatctgc ccatcagtac ggaataactt ttagaaataa aagctaatac

180

cgtatattct ctacggagga aagatttatc gctgatggat gagcccgcgt cggattaggt

240

agttggtgag gtaacggctc accaagccga cgatctgtag ttggtctgag aggatgatca

300

gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

360

gacaatgggc gaaagcctga tccagcaata ccgagtgagt gatgaaggcc ctagggttgt

420

aaagctcttt tagcaaggaa gataatgacg ttacttgcag aaaaagcccc ggctaactcc

480

gtgccagcag ccgcggtaag acggaggggg ctagcgttgt tcggaattac tgggcgtaaa

540

gagtgcgtag gcggtttagt aagttggaag tgaaagcccg gggcttaacc tcggaattgc

600

tttcaaaact actaatctag agtgtagtag gggatgatgg aattcctagt gtagaggtga

660

aattcttaga tattaggagg aacaccggtg gcgaaggcgg tcatctgggc tacgactgac

720

gctgatgcac gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta

780

aacgatgagt gctagatatc ggaagagtct ctttcggttt cgcagctaac gcattaagca

840

ctccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg gggctcgcac

900

aagcggtgga gcatgcggtt taattcgatg ttacgcgaaa aaccttacca acctttgaca

960

tggtggttgc ggatcgcaga gatgctttcc ttcagttcgg ctggaccaca cacaggtgtt

1020

gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1080

cctcattctt atttgccagc gggtaatgcc gggaactata agaaaactgc cggtgataag

1140

ccggaggaag gtggggacga cgtcaagtca tcatggccct tatgggttgg gctacacgcg

1200

tgctacaatg gtgtttacag agggaagcaa gacggtaacg tggagcaaat ccctaaaaga

1260

catctcagtt cggattgttc tctgcaactc gagagcatga agttggaatc gctagtaatc

1320

gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc tcgggccttg tacacactgc ccgtcacgcc

1380

atgggagttg gttttacctg aaggtggtga gctaacgcaa gaggcagcca accacggtag

1440

aattagcgac tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtag gggaacctgc ggctggatta

1500

cctcctta

1508

<210> 1628

<211> 1501

<212> DNA

<213> Rickettsia conorii

<400> 1628

tcaaacttga gagtttgatc ctggctcaga acgaacgcta tcggtatgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gactaattgg ggcttgctcc agttagttag tggcagacgg gtgagtaaca

120

cgtgggaatc tacccattag tacggaataa cttttagaaa taaaagctaa taccgtatat

180

tctctgcgga ggaaagattt atcgctgatg gatgagcccg cgtcagatta ggtagttggt

240

gaggtaatgg ctcaccaagc cgacgatctg tagctggtct gagaggatga tcagccacac

300

tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttggacaatg

360

ggcgaaagcc tgatccagca ataccgagtg agtgatgaag gccttagggt tgtaaagctc

420

ttttagcaag gaagataatg acgttacttg cagaaaaagc cccggctaac tccgtgccag

480

cagccgcggt aagacggagg gggctagcgt tgttcggaat tactgggcgt aaagagtgcg

540

taggcggttt agtaagttgg aagtgaaagc ccggggctta acctcggaat tgctttcaaa

600

actactaatc tagagtgtag taggggatga tggaattcct agtgtagagg tgaaattctt

660

agatattagg aggaacaccg gtggcgaagg cggtcatctg ggctacaact gacgctgatg

720

cacgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg

780

agtgctagat atcggaagat tctctttcgg tttcgcagct aacgcattaa gcactccgcc

840

tggggagtac ggtcgcaaga ttaaaactca aaggaattga cgggggctcg cacaagcggt

900

ggagcatgcg gtttaattcg atgttacgcg aaaaacctta ccaacccttg acatggtggt

960

cgcggatcgc agagatgctt ttcttcagct cggctggacc acacacaggt gttgcatggc

1020

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aaccctcatt

1080

cttatttgcc agcgggtaat gccgggaact ataagaaaac tgccggtgat aagccggagg

1140

aaggtgggga cgacgtcaag tcatcatggc ccttacgggt tgggctacac gcgtgctaca

1200

atggtgttta cagagggaag caagacggcg acgtggagca aatccctaaa agacatctca

1260

gttcggattg ttctctgcaa ctcgagagca tgaagttgga atcgctagta atcgcggatc

1320

agcatgccgc ggtgaatacg ttctcgggcc ttgtacacac tgcccgtcac gccatgggag

1380

ttagttttac ctgaaggtgg tgagctaacg caagaggcag ccaaccacgg taaaattagc

1440

gactggggtg aagtcgtaac aaggtagccg taggggaacc tgcggctgga ttacctcctt

1500

a

1501

<210> 1629

<211> 1501

<212> DNA

<213> Rickettsia prowazekii

<400> 1629

tcaaacttga gagtttgatc ctggctcaga acgaacgcta tcggtatgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gattaactag agctcgcttt agttaattag tggcagacgg gtgagtaaca

120

cgtgggaatc tacccatcag tacggaataa cttttagaaa taaaagctaa taccgtatat

180

tctctacgga ggaaagattt atcgctgatg gatgggcccg cgtcagatta ggtagttggt

240

gaggtaatgg ctcaccaagc cgacgatctg tagctggtct gagaggatga tcagccacac

300

tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttggacaatg

360

ggcgaaagcc tgatccagca ataccgagtg agtgatgaag gccttagggt tgtaaagctc

420

ttttagcaag gaagataatg acgttacttg cagaaaaagc cccggctaac tccgtgccag

480

cagccgcggt aagacggagg gggctagcgt tgttcggaat tactgggcgt aaagagtgcg

540

taggcggttt agtaagttgg aagtgaaagc ccggggctta acctcggaat tgctttcaaa

600

actactaatc tagagtgtag taggggatga tggaattcct agtgtagagg tgaaattctt

660

agatattagg aggaacaccg gtggcgaagg cggtcatctg ggctacaact gacgctgatg

720

cacgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg

780

agtgctagat atcggaggat tctctttcgg tttcgcagct aacgcattaa gcactccgcc

840

tggggagtac ggtcgcaaga ttaaaactca aaggaattga cgggggctcg cacaagcggt

900

ggagcatgcg gtttaattcg atgttacgcg aaaaacctta ccaacccttg acatggtggt

960

tacggattgc agagatgctt tccttcagtt cggctgggcc acacacaggt gttgcatggc

1020

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatt

1080

cttatttgcc agtgggtaat gccgggaact ataagaaaac tgccggtgat aagccggagg

1140

aaggtgggga cgacgtcaag tcatcatggc ccttacgggt tgggctacac gcgtgctaca

1200

atggtgttta cagagggaag caatacggtg acgtggagca aatccctaaa agacatctca

1260

gttcggattg ttctctgcaa ctcgagagca tgaagttgga atcgctagta atcgcggatc

1320

agcatgccgc ggtgaatacg ttctcgggcc ttgtacacac tgcccgtcac gccatgggag

1380

ttggttttac ctgaaggtgg tgagctaacg caagaggcag ccaaccacgg taaaattagc

1440

gactggggtg aagtcgtaac aaggtagccg taggggaacc tgcggctgga ttacctcctt

1500

a

1501

<210> 1630

<211> 1501

<212> DNA

<213> Rickettsia rickettsii

<400> 1630

tcaaacttga gagtttgatc ctggctcaga acgaacgcta tcggtatgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gactaattgg ggcttgctcc aattagttag tggcagacgg gtgagtaaca

120

cgtgggaatc tacccatcag tacggaataa cttttagaaa taaaagctaa taccgtatat

180

tctctgcgga ggaaagattt atcgctgatg gatgagcccg cgtcagatta ggtagttggt

240

gaggtaatgg ctcaccaagc cgacgatctg tagctggtct gagaggatga tcagccacac

300

tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttggacaatg

360

ggcgaaagcc tgatccagca ataccgagtg agtgatgaag gccttagggt tgtaaagctc

420

ttttagcaag gaagataatg acgttacttg cagaaaaagc cccggctaac tccgtgccag

480

cagccgcggt aagacggagg gggctagcgt tgttcggaat tactgggcgt aaagagtgcg

540

taggcggttt agtaagttgg aagtgaaagc ccggggctta acctcggaat tgctttcaaa

600

actactaatc tagagtgtag taggggatga tggaattcct agtgtagagg tgaaattctt

660

agatattagg aggaacaccg gtggcgaagg cggtcatctg ggctaccact gacgctgatg

720

cacgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg

780

agtgctagat atcggaagat tctctttcgg tttcgcagct aacgcattaa gcactccgcc

840

tggggagtac ggtcgcaaga ttaaaactca aaggaattga cgggggctcg cacaagcggt

900

ggagcatgcg gtttaattcg atgttacgcg aaaaacctta ccaacccttg acatggtggt

960

tgcggatcgc agagatgctt ttcttcagct cggctggacc acacacaggt gttgcatggc

1020

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aaccctcatt

1080

cttatttgcc agcgggtaat gccgggaact ataagaaaac tgccggtgat aagccggagg

1140

aaggtgggga cgacgtcaag tcatcatggc ccttacgggt tgggctacac gcgtgctaca

1200

atggtgttta cagagggaag caagacggcg acgtggagca aatccctaaa agacatctca

1260

gttcggattg ttctctgcaa ctcgagagca tgaagttgga atcgctagta atcgcggatc

1320

agcatgccgc ggtgaatacg ttctcgggcc ttgtacacac tgcccgtcac gccatgggag

1380

ttagttttac ctgaaggtgg tgagctaacg caagaggcag ccaaccacgg taaaattagc

1440

gactggggtg aagtcgtaac aaggtagccg taggggaacc tgcggctgga ttacctcctt

1500

a

1501

<210> 1631

<211> 1432

<212> DNA

<213> Rickettsia slovaca

<400> 1631

agaacgaacg ctatcggtat gcttaacaca tgcaagtcga acggactaat tggggcttgc

60

tccaattagt tagtggcaga cgggtgagta acacgtggga atctacccat cagtacggaa

120

taacttttag aaataaaagc taataccgta tattctctgc ggaggaaaga tttatcgctg

180

atggatgagc ccgcgtcaga ttaggtagtt ggtgaggtaa tggctcacca agccgacgat

240

ctgtagctgg tctgagagga tgatcagcca cactgggact gagacacggc ccagactcct

300

acgggaggca gcagtgggga atattggaca atgggcgaaa gcctgatcca gcaataccga

360

gtgagtgatg aaggccttag ggttgtaaag ctcttttagc aaggaagata atgacgttac

420

ttgcagaaaa agccccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaagacgg agggggctag

480

cgttgttcgg aattactggg cgtaaagagt gcgtaggcgg tttagtaagt tggaagtgaa

540

agcccggggc ttaacctcgg aattgctttc aaaactacta atctagagtg tagtagggga

600

tgatggaatt cctagtgtag aggtgaaatt cttagatatt aggaggaaca ccggtggcga

660

aggcggtcat ctgggctaca actgacgctg atgcacgaaa gcgtggggag caaacaggat

720

tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta gatatcggaa gattctcttt

780

cggtttcgta gctaacgcat taagcactcc gcctggggag tacggtcgca agattaaaac

840

tcaaaggaat tgacgggggc tcgcacaagc ggtggagcat gcggtttaat tcgatgttac

900

gcgaaaaacc ttaccaaccc ttgacatggt ggtcgcggat cgcagagatg cttttcttca

960

gctcggctgg accacacaca ggtgttgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

1020

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc attcttattt gccagcgggt aatgccggga

1080

actataagaa aactgccggt gataagccgg aggaaggtgg ggacgacgtc aagtcatcat

1140

ggcccttacg ggttgggcta cacgcgtgct acaatggtgt ttacagaggg aagcaagacg

1200

gcgacgtgga gcaaatccct aaaagacatc tcagttcgga ttgttctctg caactcgaga

1260

gcatgaagtt ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc cgcggtgaat acgttctcgg

1320

gccttgtaca cactgcccgt cacgccatgg gagttagttt tacctgaagg tggtgagcta

1380

acgcaagagg cagccaacca cggtaaaatt agcgactggg gtgaagtcgt aa

1432

<210> 1632

<211> 1501

<212> DNA

<213> Rickettsia typhi

<400> 1632

tcaaacttga gagtttgatc ctggctcaga acgaacgcta tcggtatgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gattaattag agcttgctct agttaattag tggcagacgg gtgagtaaca

120

cgtgggaatc tacccatcag tacggaataa cttttagaaa taaaagctaa taccgtatat

180

tctctacgga ggaaagattt atcgctgatg gatgggcccg cgtcagatta ggtagttggt

240

gtggtaatgg ctcaccaagc cgacgatctg tagctggtct gagaggatga tcagccacac

300

tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttggacaatg

360

ggcgaaagcc tgatccagca ataccgagtg agtgatgaag gccttagggt tgtaaagctc

420

ttttagcaag gaagataatg acgttacttg cagaaaaagc cccggctaac tccgtgccag

480

cagccgcggt aagacggagg gggctagcgt tgttcggaat tactgggcgt aaagagtgcg

540

taggtggttt agtaagttgg aagtgaaagc ccggggctta acctcggaat tgctttcaaa

600

actactaatc tagagtgtag taggggatga tggaattcct agtgtagagg tgaaattctt

660

agatattagg aggaacaccg gtggcgaagg cggtcatctg ggctacaact gacgctgatg

720

cacgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg

780

agtgctagat atcggaggat tctctttcgg tttcgcagct aacgcattaa gcactccgcc

840

tggggagtac ggtcgcaaga ttaaaactca aaggaattga cgggggctcg cacaagcggt

900

ggagcatgcg gtttaattcg atgttacgcg aaaaacctta ccaacccttg acatggtggt

960

tatggattgc agagatgctt tccttcagtt cggctgggcc acacacaggt gttgcatggc

1020

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatt

1080

cttatttgcc agcgggtaat gccgggaact ataagaaaac tgccggtgat aagccggagg

1140

aaggtgggga cgacgtcaag tcatcatggc ccttacgggt tgggctacac gcgtgctaca

1200

atggtgttta cagagggaag caagacggtg acgtggagca aatccctaaa agacatctca

1260

gttcggattg ttctctgcaa ctcgagagca tgaagttgga atcgctagta atcgcggatc

1320

agcatgccgc ggtgaatacg ttctcgggcc ttgtacacac tgcccgtcac gccatgggag

1380

ttggttttac ctgaaggtgg tgagctaacg caagaggcag ccaaccacgg taaaattagc

1440

gactggggtg aagtcgtaac aaggtagccg taggggaacc tgcggctgga ttacctcctt

1500

a

1501

<210> 1633

<211> 1526

<212> DNA

<213> Robinsoniella peoriensis

<400> 1633

gagagtttga ttctggctca ggatgaacgc tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgag

60

cgaagcatta aaacagattt cttcggaawg aagttttrat gactgagcgg cggacgggtg

120

agtaacgcgt gggtgaccyg cctcatacag ggggataaca gacagaaatg tctgctaata

180

ccgcataagc gcacagtgct gcatggcaca gtgtgaaaaa ctccggtggt atgagatgga

240

cccgcgtctg attagctagt tggtaaggta acggcttacc aaggcgacga tcagtagccg

300

gcctgagagg gtgaacggcc acattgggac tgagacacgg cccaaactcc tacgggaggc

360

agcagtgggg aatattgcac aatgggggaa accctgatgc agcgacgccg cgtgaaggaa

420

gaagtatttc ggtatgtaaa cttctatcag cagggaagaa aatgacggta cctgactaag

480

aagccccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggggcaa gcgttatccg

540

gatttactgg gtgtaaaggg agcgtagacg gcatggcaag tctggtgtga aaggcagggg

600

ctcaacccct ggactgcatt ggaaactgtc aggctggagt gcaggagagg taagtggaat

660

tcctagtgta gcggtgaaat gcgtagatat taggaggaac accagtggcg aaggcgactt

720

actggactgt aactgacgtt gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc

780

tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatact aggtgtcagg gagcaaagct ctttggtgcc

840

gcagctaacg caataagtat tccacctggg gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg

900

aattgacggg gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga

960

accttaccaa gtcttgacat cctcttgacc ggacagtaac gtgtcctttc cttcgggaca

1020

agagtgacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1080

cgcaacgagc gcaaccctta tcttcagtag ccagcaattc ggttgggcac tctggagaga

1140

ctgccaggga taacctggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgat

1200

ttgggctaca cacgtgctac aatggcgtaa acaaagggaa gcagccctgt gaaggtgagc

1260

aaatcccaaa aataacgtct cagttcggat tgtagtctgc aactcgacta catgaagctg

1320

gaatcgctag taatcgcgaa tcagaatgtc gcggatsaat acgttcccgg gtcttgtaca

1380

caccgcccgt cacaccatgg gagtcggaaa tgcccgaagt cagtgaccca accgtaagga

1440

gggagctgcc gaaggtggag ccggtaactg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtatcg

1500

gaaggtgcgg ctggatcacc tccttc

1526

<210> 1634

<211> 1371

<212> DNA

<213> Roseburia cecicola

<400> 1634

ggatgaacgc tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgaa cgaagcactc tatttgattt

60

tcttcggaaa tgaagatttt gtgactgagt ggcggacggg tgagtaacgc gtgggtaacc

120

tgctcataca gggggataac agttggaaac gactgctaat accgcataag cgcacagtac

180

tgcatggtac cgtgtgaaaa actccggtgg tatgagatgg acccgcgtct gattagccag

240

ttggcggggt acggcccacc aaagcgacga tcagtagccg acctgagagg gtgaccggcc

300

acattgggac tgagacacgg cccaaactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac

360

aatgggggaa accctgagca gcgacgccgc gtgagcgaag aagtatttcg gtatgtaaag

420

ctctatcagc agggaagaaa aaatgacggt acctgactaa gaagcaccgg ctaaatacgt

480

gccagcagcc gcggtaatac gtatgtgcaa gcgttatccg gatttactgg gtgtaaaggg

540

agcgcaggcg gtgcggcaag tctgatgtga aagcccgggg ctcaaccccg gtactgcatt

600

ggaaactgtc gtactagagt gtcggagggg tagtggaatt cctagtgtag cggtgaaatg

660

cgtagatatt aggaggaaca ccagtggcga aggcggctta ctggacgatt actgacgctg

720

aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagatacctg gtagtccacg ccgtaaacga

780

tgaatactag gtgtcgggga gcattgctct tcggtgccgc agcaaacgca ataagtattc

840

cacctgggga gtacgttcgc aagaatgaaa ctcaaaggaa ttgacgggac ccgcacaagc

900

ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaagtc ttgacatcct

960

tctgacaatg tatgtaatgt atattctctt cggagcagaa gtgacaggtg gtcatggttg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttattct

1080

tagtagccag cggttcgaga ctgccaggga taacctggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1140

tcatcatgcc ccttatgacc tacaatggcg taaacaaagg gaagcaagac cgtgaggtgg

1200

agcaaatccc aaaaataacg tctctgcaac tcgactacac gaagctggaa tcgctagtaa

1260

tcgcgatcag aatgtcgcgg tgaataacac accgcccgtc acaccatggg agttggtaat

1320

gcccgaagtc agtgacccaa ccgcaaggag aggatcgata actggggtga a

1371

<210> 1635

<211> 1361

<212> DNA

<213> Roseburia faecalis

<400> 1635

tatttgattt tcttcggaaa tgaagatttt gtgactgagt ggcggacggg tgagtaacgc

60

gtgggtaacc tgcctcatac agggggataa cagttggaaa cgactgctaa taccgcataa

120

gcgcacagga tcgcatgatc tggtgtgaaa aactccggtg gtatgagatg gacccgcgtc

180

tgattagcca gttggcaggg taacggccta ccaaagcgac gatcagtagc cgacctgaga

240

gggtgaccgg ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag gcagcagtgg

300

ggaatattgc acaatggggg aaaccctgat gcagcgacgc cgcgtgagcg aagaagtatt

360

tcggtatgta aagctctatc agcagggaag aagaatgacg gtacctgact aagaagcacc

420

ggctaaatac gtgccagcag ccgcggtaat acgtatggtg caagcgttat ccggatttac

480

tgggtgtaaa gggagcgcag gcggtgcggc aagtctgatg tgaaagcccg gggctcaacc

540

ccggtactgc attggaaact gtcgtactag agtgtcgagg ggtaagtgga attcctagtg

600

tacggtgaaa tgcgtagata ttaggaggaa caccagtggc gaagcggctt actggacgat

660

aactgacgct gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

720

cgccgtaaac gatgaatact agtgtcgggg agcattgctc ttcggtgccg cacaaacgca

780

ataagtattc cacctgggga gtacgttcgc aagaatgaaa ctcaaggaat tgacggggac

840

ccgcacaagc ggtggagcat gtgggttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaagtc

900

ttgacatccc gatgacaaag tatgtaatgt actttctctt cggagcatcg gtgacaggtg

960

gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

1020

acccctgttc ttagtagcca gcggttcggc cgggcactct agggagactg ccagggataa

1080

cctggaggaa ggcggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacttg ggctacacac

1140

gtgctacaat ggcgtaaaca aagggaagcg gagccgtgag gccgagcaaa tctcaaaaat

1200

aacgtctcag ttcggactgt agtctgcaac ccgactacac gaagctggaa tcgctagtaa

1260

tcgcagatca gaatgctgcg gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca

1320

ccatgggagt tggaaatgcc cgaagtcagt gacccaaccg c

1361

<210> 1636

<211> 1297

<212> DNA

<213> Roseburia faecis

<400> 1636

gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgga cgggtgagta

60

acgcgtgggt aacctgcctc atacaggggg ataacagttg gaaacgactg ctaataccgc

120

ataagaaaaa gtggtatgag atggacccgc gtctgattag ccagttggca gggtaacggc

180

ctaccaaagc gacgatcagt agccgacctg agagggtgac cggccacatt gggactgaga

240

cacggcccaa actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct

300

gatgcagcga cgccgcgtga gcgaagaagt atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg

360

aagatgacgg tacctgacta agaagcaccg gctaaatacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtatggtgc aagcgttatc cggatttact gggtgtaaag ggagcgcagg cggtgcggca

480

agtctgatgt gaaagcccgg ggctcaaccc cggtactgca ttggaaactg tcgtactaga

540

gtgtcggagg ggtaagtgga attcctagtg tagcggtgaa atgcgtagat attaggagga

600

acaccagtgg cgaaggcggc ttactggacg aactgacgct gaggctcgaa agcgtgggga

660

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatact aggtgtcggg

720

gcttcggtgc cgcagcaaac gcaataagta ttccacctgg ggagtacgtt cgcaagaatg

780

aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag

840

caacgcgaag aaccttacca agtcttgaca tcgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

900

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctgtcc ttagtagcca

960

gcggccgggc actctaggga gactgccagg gataacctgg aggaaggcgg ggatgacgtc

1020

aaatcatcat gccccttatg acttgggcta cacacgtgct acaatggcgt acaaagggaa

1080

gcggagccgt gaggccgagc aaatctcaaa acgtctcagt tcggatgtag tctgcaaccc

1140

gactacagaa gctggaatcg ctagtaatcg cagatcagaa tgctgcggtg aatacgttcc

1200

cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagttgg aaatgcccga agtcagtacc

1260

cagggagctg ccgaaggcag gttcgataac tggggtg

1297

<210> 1637

<211> 1376

<212> DNA

<213> Roseburia hominis

<220>

<221> modified_base

<222> (14)..(14)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (45)..(47)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1637

acgaagcact ttanttgatt tcttcggaat gaagtttttg tgacnnnagt ggcggacggg

60

tgagtaacgc gtgggtaacc tgcctcatac agggggataa cagttggaaa cgactgctaa

120

taccgcataa gcgcacagga ttgcatgatc cagtgtgaaa aactccggtg gtatgagatg

180

gacccgcgtc tgattagcca gttggcgggg taacggccca ccaaagcgac gatcagtagc

240

cgacctgaga gggtgaccgg ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag

300

gcagcagtgg ggaatattgc acaatggggg aaaccctgat gcagcgacgc cgcgtgagcg

360

aagaagtatt tcggtatgta aagctctatc agcagggaag aagaatgacg gtacctgact

420

aagaagcacc ggctaaatac gtgccagcag ccgcggtaat acgtatggtg caagcgttat

480

ccggatttac tgggtgtaaa gggagcgcag gcggtacggc aagtctgatg tgaaatcccg

540

gggctcaacc ccggtactgc attggaaact gtcggactag agtgtcggag gggtaagtgg

600

aattcctagt gtagcggtga aatgcgtaga tattaggagg aacaccagtg gcgaaggcgg

660

cttactggac gattactgac gctgaggctc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata

720

ccctggtagt ccacgccgta aacgatgaat actaggtgtc ggggagcatt gctcttcggt

780

gccgcagcaa acgcaataag tattccacct ggggagtacg ttcgcaagaa tgaaactcaa

840

aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga

900

agaaccttac caagtcttga catcccactg acagagtatg taatgtactt tctcttcgga

960

acagtggtga cagatggtgc atgggggtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag

1020

tcccgcaacg agcgcaaccc ctattcttag tagccagcgg tttggccggg cactctaggg

1080

agactgccag ggataacctg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat

1140

gacttgggct acacacgtgc tacaatggcg taaacaaagg gaagcaatcc cgcgaggggg

1200

agcaaatctc aaaaataacg tctcagttcg gactgtagtc tgcaactcga ctacacgaag

1260

ctggaatcgc tagtaatcgc gaatcagaat gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta

1320

cacaccgccc gtcacaccat gggagttggt aatgcccgaa gtcagtgacc caaccg

1376

<210> 1638

<211> 1390

<212> DNA

<213> Roseburia intestinalis

<400> 1638

tcgaacgaag cactttattt gatttcttcg gaatgaagat tttgtgactg agtggcggac

60

gggtgagtaa cgcgtgggta acctgcctca tacaggggga taacagttgg aaacgactgc

120

taataccgca taagcgcaca gggtcgcatg acctggtgtg aaaaactccg gtggtatgag

180

atggacccgc gtctgattag ccagttggtg gggtaacggc ctaccaaagc gacgatcagt

240

agccgacctg agagggtgac cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg

300

gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga

360

gcgaagaagt atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaagaaat gacggtacct

420

gactaagaag caccggcaaa tactgccagc agccgcggta atacgtatgg tgcaagcgtt

480

atccggattt actgggtgta aagggagcgc aggcggtacg gcaagtctga tgtgaaagcc

540

cggggctcaa ccccggtact gcattggaaa ctgtcggact agagtgtcgg aggggtaagt

600

ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta gatattagga ggaacaccag tggcgaaggc

660

ggcttactgg acgattactg acgctgagct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

720

accctggtag tccacgccgt aaacgatgaa tactaggtgt cggggagcat tgctcttcgg

780

tgccgcagca aacgcaataa gtattccacc tggggagtac gttcgcaaga atgaaactca

840

aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggaccatgtg gtttaattcg aagcaacgcg

900

aagaacctta ccaagtcttg acatcccgat gacagaacat gtaatgtgtt ttctcttcga

960

agcatcggtg acagagggtc ggaggggtaa gtgagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1020

gtcccgcaac gagcgcaacc cctattctta gtagccagcg gttaagccgg gcactctagg

1080

gagactgcca gggataacct ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta

1140

tgacttgggc tacacacgtg ctacaatggc gtaaacaaag ggaagcgagc ctgcgagggg

1200

gagcaaatct caaaaataac gtctcagttc ggactgcagt ctgcaactcg actgcacgaa

1260

gctggaatcg ctagtaatcg cgaatcagaa tgtcgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt

1320

acacaccgcc cgtcacacca tgggagttgg taatgcccga agtcagtgac ccaaccgcaa

1380

ggagggagct

1390

<210> 1639

<211> 1374

<212> DNA

<213> Roseburia inulinivorans

<220>

<221> modified_base

<222> (19)..(19)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (51)..(51)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (951)..(951)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1639

gaacgaagca cttttacang atttcttcgg aatgaagttt tagtgactga ntggcggacg

60

ggtgagtaac gcgtgggtaa cctgcctcac acagggggat aacagttgga aacggctgct

120

aataccgcat aagcgcacag taccgcatgg tacagtgtga aaaactccgg tggtgtgaga

180

tggacccgcg tctgattagc tagttggcag ggcaacggcc taccaaggcg acgatcagta

240

gccgacctga gagggtgacc ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg

300

aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcgac gccgcgtgag

360

cgaagaagta tttcggtatg taaagctcta tcagcaggga aaagaaatga cggtacctgc

420

taaacaccgg ctaaatacgt gccagcagcc gcggtaatac gtatggtgca agcgttatcc

480

ggatttactg ggtgtaaagg gagcgcaggc ggaaggctaa gtctgatgtg aaagcccggg

540

gctcaacccc ggtactgcat tggaaactgg tcatctagag tgtcggaggg gtaagtggaa

600

ttcctagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttaggaggaa caccagtggc gaaggcggct

660

tactggacga taactgacgc tgaggctcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc

720

ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgaatac taggtgtcgg aaagcacagc ttttcggtgc

780

cgccgcaaac gcattaagta ttccacctgg ggagtacgtt cgcaagaatg aaactcaaag

840

gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattggtat aaagggagag

900

cagcctgacg actaattctg atcttaaagc ccggggctaa tctgtggttt ncttcgggac

960

agaagtgaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc

1020

ccgcaacgag cgcaaccctt atccccagta gccagcggtt cggccgggca ctctgaggag

1080

actgccaggg ataacctgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga

1140

cttgggctac acacgtgcta caatggcgta aacaaaggga agcgagaccg tgaggtggag

1200

caaatcccaa aaataacgtc tcagttcgga ctgtagtctg caacccgact acacgaagct

1260

ggaatcgcta gtaatcgcag atcagaatgc tgcggtgaat acgttcccgg gtcttgtaca

1320

caccgcccgt cacaccatgg gagttggaaa tgcccgaagt cagtgaccca accg

1374

<210> 1640

<211> 1235

<212> DNA

<213> Roseburia sp. 11SE37

<400> 1640

tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgaa cgagtggcgg acgggtgagt aacgcgtggg

60

taacctgcct catacagggg gataacagtt ggaaacgact gctaataccg cataagaaaa

120

agtggtatga gatggacccg cgtctgatta gccagttggc agggtaacgg cctaccaaag

180

cgacgatcag tagccaacct gagagggtga ccggccacat tgggactgag acacggccca

240

aactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagcg

300

acgccgcgtg agcgaagaag tatttcggta tgtaaagctc tatcagcagg gaagatgacg

360

gtacctgact aagaagcacc ggctaaatac gtgccagcag ccgcggtaat acgtatggtg

420

caagcgttat ccggatttac tgggtgtaaa gggagcgcag gcggtgcggc aagtctgatg

480

tgaaagcccg gggctcaacc ccggtactgc attggaaact gtcgtactag agtgtcggag

540

gggtaagtgg aattcctagt gtagcggtga aatgcgtaga tattaggagg aacaccagtg

600

gcgaaggcgg cttactggac gaactgacgc tgaggctcga aagcgtgggg agcaaacagg

660

attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgaatac taggtgtcgg ggcttcggtg

720

ccgcagcaaa cgcaataagt attccacctg gggagtacgt tcgcaagaat gaaactcaaa

780

ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa

840

gaaccttacc aagtcttgac atcgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

900

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccctgtt cttagtagcc agcggccggg

960

cactctaggg agactgccag ggataacctg gaggaaggcg gggatgacgt caaatcatca

1020

tgccccttat gacttgggct acacacgtgc tacaatggcg tacaaaggga agcaaagccg

1080

tgaggccgag caaatctcaa aacgtctcag ttcggatgta gtctgcaacc cgactacaga

1140

agctggaatc gctagtaatc gcagatcaga atgctgcggt gaatacgttc ccgggtcttg

1200

tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg gaaat

1235

<210> 1641

<211> 1231

<212> DNA

<213> Roseburia sp. 11SE38

<400> 1641

tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgaa cgagtggcgg acgggtgagt aacgcgtggg

60

taacctgcct catacagggg gataacagtt ggaaacgact gctaataccg cataagaaaa

120

agtggtatga gatggacccg cgtctgatta gccagttggc agggtaacgg cctaccaaag

180

cgacgatcag tagccaacct gagagggtga ccggccacat tgggactgag acacggccca

240

aactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagcg

300

acgccgcgtg agcgaagaag tatttcggta tgtaaagctc tatcagcagg gaagatgacg

360

gtacctgact aagaagcacc ggctaaatac gtgccagcag ccgcggtaat acgtatggtg

420

caagcgttat ccggatttac tgggtgtaaa gggagcgcag gcggtgcggc aagtctgatg

480

tgaaagcccg gggctcaacc ccggtactgc attggaaact gtcgtactag agtgtcggag

540

gggtaagtgg aattcctagt gtagcggtga aatgcgtaga tattaggagg aacaccagtg

600

gcgaaggcgg cttactggac gaactgacgc tgaggctcga aagcgtgggg agcaaacagg

660

attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgaatac taggtgtcgg ggcttcggtg

720

ccgcagcaaa cgcaataagt attccacctg gggagtacgt tcgcaagaat gaaactcaaa

780

ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa

840

gaaccttacc aagtcttgac atcgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

900

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccctgtt cttagtagcc agcggccggg

960

cactctaggg agactgccag ggataacctg gaggaaggcg gggatgacgt caaatcatca

1020

tgccccttat gacttgggct acacacgtgc tacaatggcg tacaaaggga agcaaagccg

1080

tgaggccgag caaatctcaa aacgtctcag ttcggatgta gtctgcaacc cgactacaga

1140

agctggaatc gctagtaatc gcagatcaga atgctgcggt gaatacgttc ccgggtcttg

1200

tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg g

1231

<210> 1642

<211> 1469

<212> DNA

<213> Roseiflexus castenholzii

<400> 1642

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatgcatg caagtcgaac

60

gcacgcgctt cggcgcgtga gtggcgcacg gctgagtaac acgtgggaac ccgccctccg

120

gtgggggata acgagacgaa agtcgcgcta atcccgcata cgtccgcaag gggaaagcgc

180

ttcggcgcgc cggaggaggg gcctgcggcc catcaggtgg ttggtggggt aacggcctac

240

caagccgatg acgggtagct ggtctgggag gatgaccagc cagactggga ctgagacacg

300

gcccagactc ctacgggagg cagcagcaag gaattttcgg caatgggcgc aagcctgacc

360

gagcaacgcc gcgtgcggga tgacggcctt cgggttgtaa accgcttttc ggggggacga

420

ctacgacggt acccccggaa gaagccccgg ctaactctgt gccagcagcc gcggtaagac

480

agagggggcg agcgttgtcc ggagttactg ggcgtaaagc gcgcgcaggc ggtggtctca

540

gtgtcgtgtg aaagcccccg gctcaaccgg gggaggtcat ggcaaactag acgactagag

600

cggcggagag gcccctcgaa ttgccggtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tcggcaggaa

660

gaccaagggg gaagccaggg ggctggccgc tggctgacgc tgaggcgcga cagcgtgggg

720

agcaaaccgg attagatacc cgggtagtcc acgccgtaaa cgatgaccac tcggcgtgtg

780

gcgactattg acgtcgcggc gcgcctaagc ttacgcgtga agtggtccgc ctgggaacta

840

cgagcgcaag cttaaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcag cggagcgtgt

900

ggtttaattc gaggcaaccc gaagaacctt acccaggctg gacatgacgg tgcaggcggc

960

ggaaacgtcg cggccttcga gggaccgtca caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg

1020

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ctgcggttag ttaccggtgt

1080

ctaaccggac tgcccttcgg ggaggaaggc ggggatgacg tcaagtccgc atggccctga

1140

cgcctggggc gacacacacg ctacaatggc gccgacaatg cgtggcgacc gcgcgagcgg

1200

aggcaaatcg ccaaacggcg tctcagtgca gatcgggggc tgcaactcgc ccccgtgaag

1260

gcggagttgc tagtaaccgc gtatcagcca tggcgcggtg aatacgtacc cgggccttgt

1320

acacaccgcc cgtcacgtca tgggagttgt caatgcctga agtccgtgcg ctaaccgtca

1380

ggaggcagcg gccgagggca ggggcagcga ctgggacgaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1440

ccggaaggtg cggctggatc acctccttt

1469

<210> 1643

<211> 1312

<212> DNA

<213> Roseomonas cervicalis

<400> 1643

aagcagcgat gcgcctttgg agtaacctgc gtccgattag ctagttggtg gggtaaaggc

60

ctaccaaggc gacgatcggt agctggtctg agaggacgac cagccacact gggactgaga

120

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tggacaatgg gcgcaagcct

180

gatccagcaa tgccgcgtgg gtgaagaagg tcttcggatc gtaaagccct ttcggcgggg

240

acgatgatga cggtacccgc agaagaagcc ccggctaact tcgtgccagc agccgcggta

300

atacgaaggg ggctagcgtt actcggaatt actgggcgta aagggcgcgt aggcggcgct

360

ccaagttagg cgtgaaagcc ctgggctcaa cctggggact gcgcttaaga ctggagtgct

420

agaggatgga agagggttgt ggaattccca gtgtagaggt gaaattcgta gatattggga

480

agaacaccgg tggcgaaggc ggcaacctgg tccatttctg acgctgaggc gcgatagcgt

540

ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatgt gcgctgaatg

600

ttggggttcc tagaacctca gtgttgtagc taacgcggta agcgcaccgc ctggggagta

660

cggccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt

720

ggtttaattc gaagcaacgc gcagaacctt accagccctt gacatggcca cgaccggttc

780

agagatgaac ttttcccgca agggacgtgg tgcacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct

840

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca accctcgcct ttagttgcca

900

gcacgtttgg gtgggcactc tagaggaact gccggtgaca agccggagga aggtggggat

960

gacgtcaagt cctcatggcc cttatgggct gggctacaca cgtgctacaa tggcggtgac

1020

aatgggaagc caggcagcga tgtcgagccg atcccaaaaa gccgtctcag ttcagatcgc

1080

agcctgcaac tcggctgcgt gaaggtggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcacgccgcg

1140

gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt tggttctacc

1200

ttaagcaggt gcggtaaccg caaggagcta gcctgccacg gtagggtcag tgactggggt

1260

gaagtcgtaa caaggtagcc gtaggggaac ctgcggctgg atcacctcct tt

1312

<210> 1644

<211> 1482

<212> DNA

<213> Roseomonas mucosa

<400> 1644

ttagtttgat cctggctcag agcgaacgct ggcggcatgc ttaacacatg caagtcgcac

60

gggcagcaat gtcagtggcg gacgggtgag taacgcgtag gaacgtgtcc tgaggtgggg

120

gacaaccccg ggaaactggg gctaataccg catatgggct gaggcccaaa gccgagaggc

180

gcctttggag cggcctgcgt ccgattaggt agttggtggg gtaaaggcct accaagcctg

240

cgatcggtag ctggtctgag aggacgacca gccacactgg gactgagaca cggcccagac

300

tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggc gaaagcctga tccagcaatg

360

ccgcgtgggt gaagaaggtc ttcggatcgt aaagcccttt cgacggggac gatgatgacg

420

gtacccgtag aagaagcccc ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgaaggggg

480

ctagcgttgc tcggaattac tgggcgtaaa gggcgcgtag gcggcggccc aagtcaggcg

540

tgaaattcct gggctcaacc tggggactgc gcttgatact gggttgcttg aggatggaag

600

aggctcgtgg aattcccagt gtagaggtga aattcgtaga tattgggaag aacaccggtg

660

gcgaaggcgg cgagctggtc cattactgac gctgaggcgc gacagcgtgg ggagcaaaca

720

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgtgc gctggatgtt ggggcccata

780

gggtctcagt gtcgtagcca acgcggtaag cgcaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt

840

tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga

900

agcaacgcgc agaaccttac cagcccttga catggtcacg accggtccag agatggactt

960

tcctagcaat aggcgtgatg cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1020

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac cctcgcctct agttgccagc atgttcgggt

1080

gggcactcta gaggaactgc cggtgacaag ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtcc

1140

tcatggccct tatgggctgg gctacacacg tgctacaatg gcggtgacag agggaagcca

1200

ggtcgcgagg ccgagccgat cccgaaaagc cgtctcagtt cggattgcac tctgcaactc

1260

gggtgcatga aggtggaatc gctagtaatc gcggatcagc acgccgcggt gaatacgttc

1320

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg gttctacctt aagtcgttgc

1380

gctaaccagc gatgggggca ggcgaccacg gtagggtcag cgactggggt gaagtcgtaa

1440

caaggtagcc gtaggggaac ctgcggttgg atcacctcct aa

1482

<210> 1645

<211> 1295

<212> DNA

<213> Roseomonas sp. NML94-0193

<400> 1645

acgctggcgg catgcttaac acatgcaagt cgcacgagtg gcggacgggt gagtaacgcg

60

taggaacgtg tccagaggtg ggggacaacc ccgggaaact ggggctaata ccgcatgggc

120

aaaggcgcca ttggagcggc ctgcgtccga ttaggtagtt ggtggggtaa aggcctacca

180

agcctgcgat cggtagctgg tctgagagga cgaccagcca cactgggact gagacacggc

240

ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattggaca atgggcgaaa gcctgatcca

300

gcaatgccgc gtgggtgaag aaggtcttcg gatcgtaaag ccctttcgac ggggacgatg

360

acggtacccg tagaagaagc cccggctaac ttcgtgccag cagccgcggt aatacgaagg

420

gggctagcgt tgctcggaat tactgggcgt aaagggcgcg taggcggcgg cccaagtcag

480

gcgtgaaatt cctgggctca acctggggac tgcgcttgat actgggttgc ttgaggatgg

540

aagaggctcg tggaattccc agtgtagagg tgaaattcgt agatattggg aagaacaccg

600

gtggcgaagg cggcgagctg gtccaactga cgctgaggcg cgacagcgtg gggagcaaac

660

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgtg cgctggatgt tggggtctca

720

gtgtcgtagc caacgcggta agcgcaccgc ctggggagta cggccgcaag gttgaaactc

780

aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc

840

gcagaacctt accagccctt gacatgcaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc

900

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc gcctctagtt gccagcatgt

960

gggcactcta gaggaactgc cggtgacaag ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtcc

1020

tcatggccct tatgggctgg gctacacacg tgctacaatg gcggtcagag ggaagccagg

1080

tcgcgaggcc gagccgatcc cggccgtctc agttcggatg cactctgcaa ctcgggtgca

1140

gaaggtggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcacgccgcg gtgaatacgt tcccgggcct

1200

tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt tggttctacc ttaagtcgtt cgctaggcag

1260

gcgaccacgg tagggtcagc gactggggtg aagtc

1295

<210> 1646

<211> 1319

<212> DNA

<213> Roseomonas sp. NML97-0121

<400> 1646

agcgaacgct ggcggcatgc ttaacacatg caagtcgcac gagtggcgga cgggtgagta

60

acgcgtagga acgtgtccag aggtggggga caaccccggg aaactggggc taataccgca

120

tatgcaaagg cgcctttgga gcggcctgcg tccgattagg tagttggtgg ggtaaaggcc

180

taccaagcct gcgatcggta gctggtctga gaggacgacc agccacactg ggactgagac

240

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg cgaaagcctg

300

atccagcaat gccgcgtggg tgaagaaggt cttcggatcg taaagccctt tcgacgggga

360

cgatgacggt acccgtagaa gaagccccgg ctaacttcgt gccagcagcc gcggtaatac

420

gaagggggct agcgttgctc ggaattactg ggcgtaaagg gcgcgtaggc ggcggcccaa

480

gtcaggcgtg aaattcctgg gctcaacctg gggactgcgc ttgatactgg gttgcttgag

540

gatggaagag gctcgtggaa ttcccagtgt agaggtgaaa ttcgtagata ttgggaagaa

600

caccggtggc gaaggcggcg agctggtcca actgacgctg aggcgcgaca gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtgcgctg gatgttgggg

720

tctcagtgtc gtagccaacg cggtaagcgc accgcctggg gagtacggcc gcaaggttga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc

840

aacgcgcaga accttaccag cccttgacat gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa ccctcgcctc tagttgccag

960

catgtgggca ctctagagga actgccggtg acaagccgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

agtcctcatg gcccttatgg gctgggctac acacgtgcta caatggcggt cagagggaag

1080

ccaggtcgcg aggccgagcc gatcccggcc gtctcagttc ggatgcactc tgcaactcgg

1140

gtgcagaagg tggaatcgct agtaatcgcg gatcagcacg ccgcggtgaa tacgttcccg

1200

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagttggtt ctaccttaag tcgttcgcta

1260

ggcaggcgac cacggtaggg tcagcgactg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtagg

1319

<210> 1647

<211> 1314

<212> DNA

<213> Roseomonas sp. NML98-0009

<400> 1647

acgctggcgg catgcttaac acatgcaagt cgcacgagtg gcggacgggt gagtaacgcg

60

taggaacgtg tccagaggtg ggggacaacc ccgggaaact ggggctaata ccgcatatgc

120

aaaggcgcct ttggagcggc ctgcgtccga ttaggtagtt ggtggggtaa aggcctacca

180

agcctgcgat cggtagctgg tctgagagga cgaccagcca cactgggact gagacacggc

240

ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattggaca atgggcgaaa gcctgatcca

300

gcaatgccgc gtgggtgaag aaggtcttcg gatcgtaaag ccctttcgac ggggacgatg

360

acggtacccg tagaagaagc cccggctaac ttcgtgccag cagccgcggt aatacgaagg

420

gggctagcgt tgctcggaat tactgggcgt aaagggcgcg taggcggcgg cccaagtcag

480

gcgtgaaatt cctgggctca acctggggac tgcgcttgat actgggttgc ttgaggatgg

540

aagaggctcg tggaattccc agtgtagagg tgaaattcgt agatattggg aagaacaccg

600

gtggcgaagg cggcgagctg gtccaactga cgctgaggcg cgacagcgtg gggagcaaac

660

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgtg cgctggatgt tggggtctca

720

gtgtcgtagc caacgcggta agcgcaccgc ctggggagta cggccgcaag gttgaaactc

780

aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc

840

gcagaacctt accagccctt gacatgcaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc

900

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc gcctctagtt gccagcatgt

960

gggcactcta gaggaactgc cggtgacaag ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtcc

1020

tcatggccct tatgggctgg gctacacacg tgctacaatg gcggtcagag ggaagccagg

1080

tcgcgaggcc gagccgatcc cggccgtctc agttcggatg cactctgcaa ctcgggtgca

1140

gaaggtggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcacgccgcg gtgaatacgt tcccgggcct

1200

tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt tggttctacc ttaagtcgtt cgctaggcag

1260

gcgaccacgg tagggtcagc gactggggtg aagtcgtaac aaggtagccg tagg

1314

<210> 1648

<211> 1297

<212> DNA

<213> Roseomonas sp. NML98-0157

<400> 1648

agcgaacgct ggcggcatgc ttaacacatg caagtcgcac gagtggcgga cgggtgagta

60

acgcgtagga acgtgtcctg aggtggggga caaccccggg aaactggggc taataccgca

120

tatgcaaagg cgcctttgga gcggcctgcg tccgattagg tagttggtgg ggtaaaggcc

180

taccaagcct gcgatcggta gctggtctga gaggacgacc agccacactg ggactgagac

240

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg cgaaagcctg

300

atccagcaat gccgcgtggg tgaagaaggt cttcggatcg taaagccctt tcgacgggga

360

cgatgacggt acccgtagaa gaagccccgg ctaacttcgt gccagcagcc gcggtaatac

420

gaagggggct agcgttgctc ggaattactg ggcgtaaagg gcgcgtaggc ggcggcccaa

480

gtcaggcgtg aaattcctgg gctcaacctg gggactgcgc ttgatactgg gttgcttgag

540

gatggaagag gctcgtggaa ttcccagtgt agaggtgaaa ttsgtagata ttgggaagaa

600

caccggtggy gaaggcggcg agctggtcca actgacgctg aggcgcgaca gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtgcgctg gatgttgggg

720

tctcagtgtc gtagccaacg cggtaagcgc accgcctggg gagtacggcc gcaaggttga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc

840

aacgcgcaga accttaccag cccttgacat gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa ccctcgcctc tagttgccag

960

catgtgggca ctctagagga actgccggtg acaagccgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

agtcctcatg gcccttatgg gctgggctac acacgtgcta cdatggcggt cagagggaag

1080

ccaggtcgcg aggccgagcc gatcccggcc gtctcagttc ggatgcactc tgcaactcgg

1140

gtgcagaagg tggaatcgct agtaatcgcg gatcagcacg ccgcggtgaa tacgttcccg

1200

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagttggtt ctaccttaag tcgttcgcta

1260

ggcaggcgac cacggtaggg tcagcgactg gggtgaa

1297

<210> 1649

<211> 1269

<212> DNA

<213> Rothia aeria

<220>

<221> modified_base

<222> (838)..(838)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1115)..(1115)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1200)..(1200)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1649

ccgtggatta gtggcgaacg ggtgagtaat acgtgagtga cctacctttg actctgggat

60

aagcctggga aactgggtct aataccggat acgaccaatc tctgcatggg gtgttggtgg

120

aaagcgttat ggagtggttt tagatgggct cacggcctat cagcttgttg gtgaggtaat

180

ggcttaccaa ggcgacgacg ggtagccggc ctgagagggt gaccggccac actgggactg

240

agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggcgcaag

300

cctgatgcag cgacgccgcg tgagggatga cggccttcgg gttgtaaacc tctgttagca

360

tcgaagaagc gaaagtgacg gtaggtgcag agaaagcgcc ggctaactac gtgccagcag

420

ccgcggtaat acgtagggcg cgagcgttgt ccggaattat tgggcgtaaa gagcttgtag

480

gcggttggtc gcgtctgctg tgaaaggccg gggcttaact ccggttttgc agtgggtacg

540

ggctaactag agtgcagtag gggagactgg aattcctggt gtagcggtgg aatgcacaga

600

tatcaggagg aacaccgatg gcgaaggcag gtctctgggc tgtaactgac gctgagaagc

660

gaaagcatgg ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacgttgggc

720

actaggtgtg ggggacattc cacgttttcc gcgccgtagc taacgcatta agtgccccgc

780

ctggggagta cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg acgggggccc gcactatngg

840

cggagcatgc ggattaattc gatgcaacgc gaagaacctt accaaggctt gacatgcatt

900

agatcgcgtc agagatggcg tttcccttcg gggctggtgt acaggtggtg catggttgtc

960

gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc ctcgttctat

1020

gttgccagcg gttcggccgg ggactcatag gagactgccg gggttaactc ggaggaaggt

1080

ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgttntgggc ttcacgcatg ctacaatggc

1140

cggtacagag ggttgcgata ctgtgaggtg gagctaatcc cttaaagccg gtctcagttn

1200

ggattggggt atgcaactcg accccatgaa gtcggagtcg ctagtaatcg cagatcagca

1260

acgctgcgg

1269

<210> 1650

<211> 1531

<212> DNA

<213> Rothia dentocariosa

<400> 1650

ttgtaacgga gagtttgatt ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg atgaagccta gcttgctagg tggattagtg gcgaacgggt gagtaatacg

120

tgagtgacct acctttgact ctgggataag cctgggaaac tgggtctaat accggatacg

180

accaatctcc gcatggggtg ttggtggaaa gcgttatgga gtggttttag atgggctcac

240

ggcctatcag cttgttggtg aggtaatggc ttaccaaggc gacgacgggt agccggcctg

300

agagggtgac cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

360

tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcga cgccgcgtga gggatgacgg

420

ccttcgggtt gtaaacctct gttagcatcg aagaagcgaa agtgacggta ggtgcagaga

480

aagcgccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggcgcga gcgttgtccg

540

gaattattgg gcgtaaagag cttgtaggcg gttggtcgcg tctgctgtga aaggctgggg

600

cttaaccctg gttttgcagt gggtacgggc taactagagt gcagtagggg agactggaat

660

tcctggtgta gcggtggaat gcgcagatat caggaggaac accgatggcg aaggcaggtc

720

tctgggctgt aactgacgct gagaagcgaa agcatgggga gcgaacagga ttagataccc

780

tggtagtcca tgccgtaaac gttgggcact aggtgtgggg gacattccac gttttccgcg

840

ccgtagctaa cgcattaagt gccccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa

900

gaaattgacg ggggcccgca caagcggcgg agcatgcgga ttaattcgat gcaacgcgaa

960

gaaccttacc aaggcttgac atatactgga ctgcgtcaga gatggcgttt cccttcgggg

1020

ctggtataca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc

1080

ccgcaacgag cgcaaccctc gttctatgtt gccagcacgt gatggtgggg actcatagga

1140

gactgccggg gtcaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg

1200

tcttgggctt cacgcatgct acaatggccg gtacagaggg ttgcgatact gtgaggtgga

1260

gctaatccct aaaagccggt ctcagttcgg attggggtct gcaactcgac cccatgaagt

1320

cggagtcgct agtaatcgca gatcagcaac gctgcggtga atacgttccc gggccttgta

1380

cacaccgccc gtcaagtcac gaaagttggt aacacccgaa gccggtggcc taaccctggt

1440

ggggggagcc gtcgaaggtg ggactggcga ttgggactaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1500

ccggaaggtg cggctggatc acctcctttc t

1531

<210> 1651

<211> 1535

<212> DNA

<213> Rothia mucilaginosa

<400> 1651

tttcaacgga gagtttgatt ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg atgaagccta gcttgctagg tggattagtg gcgaacgggt gagtaatacg

120

tgagtaacct acctttaact ctgggataag cctgggaaac tgggtctaat accggatacg

180

accaatctcc gcatggggtg ttggtggaaa gcgttatgta gtggttatag atgggctcac

240

ggcctatcag cttgttggtg aggtaacggc tcaccaaggc gacgacgggt agccggcctg

300

agagggtgac cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

360

tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcga cgccgcgtga gggatgacgg

420

ccttcgggtt gtaaacctct gttagcaggg aagaagagaa attgacggta cctgcagaga

480

aagcgccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggcgcga gcgttgtccg

540

gaattattgg gcgtaaagag cttgtaggcg gtttgtcgcg tctgctgtga aaggccggag

600

cttaactccg tgtattgcag tgggtacggg cagactagag tgcagtaggg gagactggaa

660

ctcctggtgt agcggtggaa tgcgcagata tcaggaagaa caccgatggc gaaggcaggt

720

ctctgggctg taactgacgc tgagaagcga aagcatgggg agcgaacagg attagatacc

780

ctggtagtcc atgccgtaaa cgttgggcac taggtgtggg ggacattcca cgttttccgc

840

gccgtagcta acgcattaag tgccccgcct ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa

900

agaaattgac gggggcccgc acaagcggcg gagcatgcgg attaattcga tgcaacgcga

960

agaaccttac caaggcttga catatactgg accgcatcag agatggtgtt tcccttcggg

1020

gctggtatac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaaccct cgttctatgt tgccagcacg taatggtggg gactcatagg

1140

agactgccgg ggtcaactcg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat

1200

gtcttgggct tcacgcatgc tacaatggcc ggtacagagg gttgcgatac tgtgaggtgg

1260

agctaatccc taaaagccgg tctcagttcg gattggggtc tgcaactcga ccccatgaag

1320

tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcaagtca cgaaagttgg taacacccaa agccggtggc ctaacctttt

1440

ggagggagcc gtctaaggtg ggattggcga ttgggactaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1500

ccggaaggtg cggctggatc acctcctttc taagg

1535

<210> 1652

<211> 1481

<212> DNA

<213> Rothia nasimurium

<400> 1652

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gatgaagccc agcttgctgg

60

gtggattagt ggcgaacggg tgagtaatac gtgagtaacc tgcctttaac tctgggataa

120

gccttggaaa cgaggtctaa taccggatac gaccagttcc cgcatgggat gctggtggaa

180

agggatatgt actggtttta gatgggctca cggcctatca gcttgttggt gaggtaacgg

240

ctcaccaagg cgacgacggg tagccggcct gagagggtga ccggccacac tgggactgag

300

acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggcgcaagcc

360

tgatgcagcg acgccgcgtg agggatgacg gccttcgggt tgtaaacctc tttcagcagg

420

gaagaagcga aagtgacggt acctgcagaa gaagcgccgg ctaactacgt gccagcagcc

480

gcggtaatac gtagggcgcg agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaaga gcttgtaggc

540

ggtttgtcgc gtctgctgtg aaagcccggg gcttaacccc gggtttgcag tgggtacggg

600

ctaactagag tgcagtaggg gagactggaa ttcctggtgt agcggtgaaa tgcgcagata

660

tcaggaggaa caccaatggc gaaggcaggt ctctgggctg taactgacgc tgagaagcga

720

aagcatgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc atgccgtaaa cgttgggcac

780

taggtgtggg ggacattcca cgttttccgc gccgtagcta acgcattaag tgccccgcct

840

ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa agaaattgac gggggcccgc acaagcggcg

900

gagcatgcgg attaattcga tgcaacgcga agaaccttac caaggcttga catatactgg

960

accgctctag agatagagtt tcccttcggg gctggtatac aggtggtgca tggttgtcgt

1020

cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct cgttctatgt

1080

tgccagcacg taatggtggg gactcatagg agactgccgg ggtcaactcg gaggaaggtg

1140

gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gtcttgggct tcacgcatgc tacaatggcc

1200

ggtacaaagg gttgcgatac tgtgaggttg agctaatccc aaaaagccgg tctcagttcg

1260

gattggggtc tgcaactcga ccccatgaag tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa

1320

cgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagtca cgaaagttgg

1380

taacacccga agccgatggc ctaacccctt gtgggaggga gtcgtcgaag gtgggattgg

1440

cgattgggac taagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag g

1481

<210> 1653

<211> 1500

<212> DNA

<213> Rothia sp. oral taxon 188

<400> 1653

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

atgaagcggt gcttgcaccg tggattagtg gcgaacgggt gagtaatacg tgagtgacct

120

acctttgact ctgggataag cctgggaaac tgggtctaat accggatacg accaatctct

180

gcatggggtg ttggtggaaa gcgttatgga gtggttttag atgggctcac ggcctatcag

240

cttgttggtg aggtaatggc ttaccaaggc gacgacgggt agccggcctg agagggtgac

300

cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcga cgccgcgtga gggatgacgg ccttcgggtt

420

gtaaacctct gttagcatcg aagaagcgaa agtgacggta ggtgcagaga aagcgccggc

480

taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggcgcga gcgttgtccg gaattattgg

540

gcgtaaagag cttgtaggcg gttggtcgcg tctgctgtga aaggccgggg cttaactccg

600

gttttgcagt gggtacgggc taactagagt gcagtagggg agactggaat tcctggtgta

660

gcggtggaat gcacagatat caggaggaac accgatggcg aaggcaggtc tctgggctgt

720

aactgacgct gagaagcgaa agcatgggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca

780

tgccgtaaac gttgggcact aggtgtgggg gacattccac gttttccgcg ccgtagctaa

840

cgcattaagt gccccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg

900

ggggcccgca caagcggcgg agcatgcgga ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc

960

aaggcttgac atgcattaga tcgcgtcaga gatggcgttt cccttcgggg ctggtgtaca

1020

ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1080

cgcaaccctc gttctatgtt gccagcggtt cggccgggga ctcataggag actgccgggg

1140

ttaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgt cttgggcttc

1200

acgcatgcta caatggccgg tacagagggt tgcgatactg tgaggtggag ctaatccctt

1260

aaagccggtc tcagttcgga ttggggtctg caactcgacc ccatgaagtc ggagtcgcta

1320

gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg

1380

tcaagtcacg aaagttggta acacccgaag ccggtggcct aacccttgtg gggggagccg

1440

tcgaaggtgg gattggcgat tgggactaag tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc

1500

<210> 1654

<211> 1539

<212> DNA

<213> Ruminobacter amylophilus

<400> 1654

aaagtgaaga gtttgatcat ggctcagatt gaacgctggc ggcaggctta atacatgcaa

60

gtcgaacggt aacagcagga agcttgcttc ctggctgacg agtggcggac gggtgagtaa

120

tacctgggga gctgcctgaa tgagggggac aacacctgga aacgggtgct aataccgcgt

180

aagcctgagg gggaaaggct gggcaaccag tcgcattcag atgcgcccag gtgggattag

240

ctagttggtg gggtaacggc ctaccaaggc gacgatctct agctggtctg agaggatgat

300

cagccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatat

360

tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcca tgccgcgtgt gtgaagaagg cctttgggtt

420

gtaaagcact ttcagtatgg aggaagtgta gtatgttaac agcatgctgc attgacgtta

480

catacagaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcga

540

gcgttaatcg gaataactgg gcgtaaagag ctcgtaggcg gtttgtcaag tcagatgtga

600

aagccccggg cttaacctgg gaaccgcatt tgaaactgac agactagagt actgtagagg

660

gaggtagaat tccaggtgta gcggtgaaat gcgtagatat ctggaggaat accggtggcg

720

aaggcggcct cctggacaga gactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgtcaatt agaagcatgt tgccatgagt

840

agtgtgtttc taagctaacg cgataaattg accgcctggg gagtacggcc ggcaaggtta

900

aaactcaaat gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg

960

caacgcgaag aaccttacct ggacttgaca tattgagaag tatttagaga tagatacgtg

1020

ccgcaaggag ctcaaataca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

1080

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gttctttgtt gccagcacgt aaaggtggga

1140

actcaaagaa gactgccggt gacaaaccgg aggaaggcag ggatgacgtc aagtcatcat

1200

ggcccttacg tccagggcta cacacgtgct acaatgggtt gtacagaggg aagcgaagtc

1260

gcgaggtaga gcggaaccca gaaagcaact cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac

1320

tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgcg aatcagaatg tcgcggtgaa tacgttcccg

1380

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgaatt gcaccagaag tagttagctt

1440

aacccgcaag ggagggcgat taccacggtg tggtttatga ctggggtgaa gtcgtaacaa

1500

ggtaaccata ggggaacctg tggttggatc acctcctta

1539

<210> 1655

<211> 1014

<212> DNA

<213> Ruminococcaceae bacterium D16

<220>

<221> modified_base

<222> (907)..(907)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (910)..(910)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (953)..(955)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (973)..(973)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (980)..(981)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (996)..(996)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1002)..(1002)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1655

tgcctttgaa gaggattcgt ccaattgata aggttactta gtggcggacg ggtgagtaac

60

gcgtgaggaa cctgccttgg agtggggaat aacacagtga aaattgtgct aataccgcat

120

aatgcagttg ggtcgcatga ctctgactgc caaagattta tcgctctgag atggcctcgc

180

gtctgattag ctagttggtg gggtaacggc ccaccaaggc gacgatcagt agccggactg

240

agaggttggc cggccacatt gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

300

tggggaatat tgggcaatgg gcgcaagcct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg

360

ctttcgggtt gtaaacttct tttcttaggg acgaagcaag tgacggtacc taaggaataa

420

gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta ggtggcaagc gttatccgga

480

tttactgggt gtaaagggcg tgtaggcggg attgcaagtc agatgtgaaa accacgggct

540

caacctgtgg cctgcatttg aaactgtagt tcttgagtac tggagaggca gacggaattc

600

ctagtgtagc ggtgaaatgc gtagatatta ggaggaacac cagtggcgaa ggcggtctgc

660

tggacagcaa ctgacgctga ggcgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg

720

gtagtccacg ctgtaaacga tggatactag gtgtgggggg tctgaccccc tccgtgccgc

780

agttaacaca ataagtatcc cacctgggga gtacgatcgc aaggttgaaa ctcaaaggaa

840

ttgacggggg cccgcacaag cggtggagta tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac

900

cttaccnggn ttgacatccc gaggtccggt ctagagatag acctttctct tcnnnacctc

960

ggtgacaggt ggngcatggn ngtcgtcagc tcgtgncgtg anatgttggg ttaa

1014

<210> 1656

<211> 1503

<212> DNA

<213> Ruminococcus albus

<400> 1656

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcacgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gagcgaaaga gtgcttgcac tctctagcta gtggcggacg ggtgagtaac acgtgagcaa

120

tctgcctttc ggagagggat accaattgga aacgattgtt aatacctcat aacataacga

180

agccgcatga ctttgttatc aaatgaattt cgccgaaaga tgagctcgcg tctgattagg

240

tagttggtga ggtaacggcc caccaagccg acgatcagta gccggactga gaggttgaac

300

ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

360

gcacaatggg cgaaagcctg atgcagcgat gccgcgtgag ggaagaaggt tttaggattg

420

taaacctctg tctttgggga cgataatgac ggtacccaag gaggaagctc cggctaacta

480

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggga gcgagcgttg tccggaatta ctgggtgtaa

540

agggagcgta ggcgggattg caagtcaggt gtgaaattta ggggcttaac ccctgaactg

600

cacttgaaac tgtagttctt gagtgaagta gaggtaagcg gaattcctag tgtagcggtg

660

aaatgcgtag atattaggag gaacatcagt ggcgaaggcg gcttactggg ctttaactga

720

cgctgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt

780

aaacgatgat tactaggtgt ggggggactg accccttccg tgccgcagtt aacacaataa

840

gtaatccacc tggggagtac ggccgcaagg ctgaaactca aaggaattga cgggggcccg

900

cacaagcagt ggagtatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaggtcttg

960

acatcgtacg catagcatag agatatgtga aatcccttcg gggacgtata gacaggtggt

1020

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1080

ccttactgtt agttgctacg caagagcact ctagcaggac tgccgttgac aaaacggagg

1140

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtactaca

1200

atggctgtta acagagggaa gcaaaacagt gatgtggagc aaaaccctaa aagcagtctt

1260

agttcggatt gtaggctgca acccgcctac atgaagtcgg aattgctagt aatcgcggat

1320

cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca cgccatggga

1380

gtcggtaaca cccgaagcct gtgttctaac cgcaaggagg aagcagtcga aggtgggatt

1440

gatgactggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct ggatcacctc

1500

ctt

1503

<210> 1657

<211> 1391

<212> DNA

<213> Ruminococcus bromii

<220>

<221> modified_base

<222> (21)..(21)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1657

tcgaacggaa cttctttaaa nggatttctt cggaatgaat ttgattaagt ttagtggcgg

60

acgggtgagt aacgcgtgag taacctgcct ctaagagggg aataacattc tgaaaagaat

120

gctaataccg cataatatat atttatcgca tggtagatat atcaaagatt tatcgcttag

180

agatggactc gcgtccgatt agttagttgg tgaggtaacg gctcaccaag accgcgatcg

240

gtagccggac tgagaggttg aacggccaca ttgggactga gacacggccc agactcctac

300

gggaggcagc agtgggggat attgcgcaat gggggaaacc ctgacgcagc aacgccgcgt

360

gaaggatgaa ggtcttcgga ttgtaaactt cttttattaa ggacgaagaa agtgacggta

420

cttaatgaat aagctccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggagcaa

480

gcgttgtccg gatttactgg gtgtaaaggg tgcgtaggcg gctttgcaag tcagatgtga

540

aatctatggg ctcaacccat agcctgcatt tgaaactgca gagcttgagt gaagtagagg

600

caggcggaat tccccgtgta gcggtgaaat gcgtagagat ggggaggaac accagtggcg

660

aaggcggcct gctgggcttt aactgacgct gagcacgaaa gcgtgggtag caaacaggat

720

tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg atgattacta ggtgtggggg gtctgacccc

780

ttccgtgccg gagttaacac aataagtaat ccacctgggg agtacggccg caaggttgaa

840

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcagtgggta tgtggtttaa ttcgaagcaa

900

cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcc tactaacgag atagagatat gttataggcc

960

gtttgggaaa agtagagaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

1020

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gctattagtt gctacgcaag agcactctaa

1080

taggactgcc gttgacaaaa cggaggaagg tggggacgac gtcaaatcat catgcccctt

1140

atgacctggg ctacacacgt actacaatgg acattaacag agggaagcaa tacagtgatg

1200

tggagcaaac ccctaaaaat gttctcagtt cagattgcag gctgcaaccc gcctgtatga

1260

agatggaatt gctagtaatc gcagatcagc atgctgcggt gaatacgttc ccgggccttg

1320

tacacaccgc ccgtcacacc atgggagccg gtaatacccg aagtcagtag tctaaccgca

1380

aggaggacgc t

1391

<210> 1658

<211> 1371

<212> DNA

<213> Ruminococcus callidus

<400> 1658

ttaacacatg caagtcgaac ggagaacatt gagcttgctt aatgttctta gtggcggacg

60

ggtgagtaac acgtgagtaa cctgcctctg agagtgggat agcttctgga aacggatggt

120

aataccgcat aacatcatgg attcgcatgt ttctgtgatc aaagatttat cgcttagaga

180

tggactcgcg tctgattagc tagttggtaa ggtaacggct taccaaggcg acgatcagta

240

gccggactga gaggttgatc ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg

300

aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcgat gccgcgtgga

360

ggaagaaggt tttcggattg taaactcctg ttgaagagga cgataatgac ggtactcttt

420

tagaaagctc cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggga gcgagcgttg

480

tccggaatta ctgggtgtaa agggagcgta ggcgggatgg caagtcagat gtgaaaacta

540

tgggctcaac ccatagactg catttgaaac tgttgttctt gagtgaggta gaggtaagcg

600

gaattcctgg tgtagcggtg aaatgcgtag agatcaggag gaacatcggt ggcgaaggcg

660

gcttactggg cctttactga cgctgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

720

accctggtag tccacgccgt aaacgatgat tactaggtgt ggggggactg accccttccg

780

tgccgcagtt aacacaataa gtaatccacc tggggagtac ggccgcaagg ttgaaactca

840

aaggaattga cgggggcccg cacaagcagt ggagtatgtg gtttaattcg aagcaacgcg

900

aagaacctta ccaggtcttg acatcgagtg acgtacctag agataggtat tttcttcgga

960

acacaaagac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1020

cccgcaacga gcgcaaccct taccattagt tgctacgcaa gagcactcta atgggactgc

1080

cgttgacaaa acggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg

1140

gctacacacg tactacaatg gcaatataac agagggaagc aatacagcga tgtggagcaa

1200

atccccaaaa attgtcccag ttcagattgc aggctgcaac tcgcctgcat gaagtcggaa

1260

ttgctagtaa tcgcagatca gcatgctgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc

1320

gcccgtcaca ccatgggagt cggtaacacc caaagccggt cgtctaacct t

1371

<210> 1659

<211> 1494

<212> DNA

<213> Ruminococcus champanellensis

<400> 1659

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcacgc ctaacacatg caagtcgaac

60

ggagataaag acttcggttt ttatcttagt ggcggacggg tgagtaacac gtgagcaacc

120

tgcctctgag agagggatag cttctggaaa cggatggtaa tacctcataa catagcggta

180

ccgcatgata ctgctatcaa agatttatcg ctcagagatg ggctcgcgtc tgattagcta

240

gatggtgagg taacggctca ccatggcgac gatcagtagc cggactgaga ggttgaacgg

300

ccacattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc

360

acaatgggcg caagcctgat gcagcgatgc cgcgtggagg aagaaggttt tcggattgta

420

aactcctgtc ttaagggacg ataatgacgg taccttagga ggaagctccg gctaactacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtagggagc gagcgttgtc cggaattact gggtgtaaag

540

ggagcgtagg cgggattgca agtcagatgt gaaaactatg ggcttaaccc atagactgca

600

tttgaaactg tagttcttga gtgaagtaga ggtaagcgga attcctagtg tagcggtgaa

660

atgcgtagat attaggagga acatcggtgg cgaaggcggc ttactgggct tttactgacg

720

ctgaggctcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgctgtaa

780

acgatgatta ctaggtgtgg ggggactgac cccttccgtg ccgcagttaa cacaataagt

840

aatccacctg gggagtacgg ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca

900

caagcagtgg agtatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa aaaccttacc aggtcttgac

960

atcgagtgaa tgatctagag atagatcagt ccttcgggac acaaagacag gtggtgcatg

1020

gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta

1080

cctttagttg ctacgcaaga gcactctaga gggactgccg ttgacaaaac ggaggaaggt

1140

ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgta ctacaatggc

1200

aatgaacaga gggaagcaat acagtgatgt ggagcaaatc cccaaaaatt gtcccagttc

1260

agattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa gtcggaattg ctagtaatcg cagatcagca

1320

tgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtcgg

1380

taacacccga agccagtagc ctaaccgcaa ggagggcgct gtcgaaggtg ggattgatga

1440

ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta tcggaaggtg cggctggatc acct

1494

<210> 1660

<211> 1388

<212> DNA

<213> Ruminococcus flavefaciens

<220>

<221> modified_base

<222> (157)..(157)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (276)..(276)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1660

gctggcggca cgcttaacac atgcaagtcg aacggagata atttgagttt acttaggtta

60

tcttagtggc ggacgggtga gtaacacgtg agcaacctac cttagagaga gggatagctt

120

ctggaaacgg atggtaatac ctcataacat aactganccg catgatttag ttatcaaaga

180

tttatcactc tgagatgggc tcgcgtctga ttagatagtt ggtgaggtaa cggctcacca

240

agtcgacgat cagtagccgg actgagaggt tgaacngcca cattgggact gagacacggc

300

ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca atgggggaaa ccctgatgca

360

gcgatgccgc gtggaggaag aaggttttcg gattgtaaac tcctgtctta aaggacgata

420

atgacggtac tttaggagga agctccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

480

agggagcgag cgttgtccgg aattactggg tgtaaaggga gcgtaggcgg gagcgcaagt

540

cagatgtgaa atacatgggc tcaacccatg ggctgcattt gaaactgtgt ttcttgagtg

600

aagtagaggt aagcggaatt cctggtgtag cggtgaaatg cgtagatatc aggaggaaca

660

ccggtggcga aggcggctta ctgggctttt actgacgctg aggctcgaaa gcgtggggag

720

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg atgattacta ggtgtggggg

780

gactgacccc ttccgtgccg cagttaacac aataagtaat ccacctgggg agtacgsccs

840

caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcagtggagt atgtggttta

900

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc gtatgcatag tctagagata

960

gatgaaattc cttcggggac atatagacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg

1020

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta cctttagttg ctacgcaaga

1080

gcactctaaa gggactgccg ttgacamaac ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc

1140

atgcccctta tgacctgggc tacacacgta ctacaatggc aattaacaaa gagaagcaag

1200

acggtgacgt ggagcgaatc tcaccaaatt gtcccagttc agattgcagg ctgcaactcg

1260

cctgcatgaa gtcggaattg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg aatacgttcc

1320

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtcgg taacacccga agtcggtagt

1380

ctaacagc

1388

<210> 1661

<211> 1392

<212> DNA

<213> Ruminococcus gnavus

<220>

<221> modified_base

<222> (1378)..(1380)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1661

gtcgagcgaa gcacttttgc ggatttcttc ggattgaagc aattgtgact gagcggcgga

60

cgggtgagta acgcgtgggt aacctgcctc atacaggggg ataacagttg gaaacggctg

120

ctaataccgc ataagcgcac agtaccgcat ggtaccgtgt gaaaaactcc ggtggtatga

180

gatggacccg cgtctgatta gctagttggt ggggtaacgg cctaccaagg cgacgatcag

240

tagccgacct gagagggtga ccggccacat tgggactgag acacggccca aactcctacg

300

ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagcg acgccgcgtg

360

agcgatgaag tatttcggta tgtaaagctc tatcagcagg gaagaaaatg acggtacctg

420

actaagaagc cccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gggcaagcgt

480

tatccggatt tactgggtgt aaagggagcg tagacggcat ggcaagccag atgtgaaagc

540

ccggggctca accccgggac tgcatttgga actgtcaggc tagagtgtcg gagaggaaag

600

cggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattagg aggaacacca gtggcgaagg

660

cggctttctg gacgatgact gacgttgagg ctcgaaagcg tggggagcaa acaggattag

720

ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg aatactaggt gtcgggtggc aaagccattc

780

ggtgccgcag caaacgcaat aagtattcca cctggggagt acgttcgcaa gaatgaaact

840

caaaggaatt gacggggatc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg

900

cgaagaacct tacctggtct tgacatccct ctgaccgctc tttaatcgga gctttccttc

960

gggacagagg agacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt

1020

aagtcccgca acgagcgcaa cccctatctt tagtagccag catttaagat gggcactcta

1080

gagagactgc cagggataac ctggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct

1140

tatgaccagg gctacacacg tgctacaatg gcgtaaacaa agggaagcga gcccgcgagg

1200

gggagcaaat cccaaaaata acgtctcagt tcggattgta gtctgcaact cgactacatg

1260

aagctggaat cgctagtaat cgcgaatcag aatgtcgcgg tgaatacgtt cccgggtctt

1320

gtacacaccg cccgtcacac catgggagtc agtaacgccc gaagtcagtg acccaacnnn

1380

aaggagggag ct

1392

<210> 1662

<211> 1373

<212> DNA

<213> Ruminococcus hansenii

<400> 1662

tatcattgac tcttcggaag atttgatatt tgactgagcg gcggacgggt gagtaacgcg

60

tgggtaacct gcctcataca ggggaataac agttagaaat ggctgctaat gccgcataag

120

cgcacaggac cgcatggtct ggtgtgaaaa actgaggtgg tatgagatgg acccgcgtct

180

gattaggtag ttggtggggt aacggcctac caagccgacg atcagtagcc ggcctgagag

240

ggtgaacggc cacattggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg

300

gaatattgca caatggggga aaccctgatg cagcgacgcc gcgtgaagga agaagtatct

360

cggtatgtaa acttctatca gcagggaaga aaagacggta cctgactaag aagccccggc

420

taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggggcaa gcgttatccg gatttactgg

480

gtgtaaaggg agcgtagacg gaagagcaag tctgatgtga aaggctgggg cttaacccca

540

ggactgcatt ggaaactgtt tttctagagt gccggagagg taagcggaat tcctagtgta

600

gcggtgaaat gcgtagatat taggaggaac accagtggcg aaggcggctt actggacggt

660

aactgacgtt gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

720

cgccgtaaac gatgaatact aggtgtcggg gtgcaaagca gttcggtgcc gcagcaaacg

780

caataagtat tccacctggg gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg aattgacggg

840

gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga atcttaccaa

900

gtcttgacat ctgcctgacc gtcccttaac cggagctttc cttcgggaca ggcaagacag

960

gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1020

gcaaccccta tccttagtag ccagcagtcc ggctgggcac tctagggaga ctgccgggga

1080

taacccggag gaaggcgggg acgacgtcaa atcatcatgc cccttatgat ttgggctaca

1140

cacgtgctac aatggcgtaa acaaagggaa gcgaagcggt gacgcttagc aaatctcaaa

1200

aataacgtcc cagttcggac tgcagtctgc aactcgactg cacgaagctg gaatcgctag

1260

taatcgcgaa tcagaatgtc gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc

1320

acaccatggg agtcagtaac gcccgaagtc agtgacccaa ccttatggag gga

1373

<210> 1663

<211> 1386

<212> DNA

<213> Ruminococcus lactaris

<400> 1663

tcgagcgaag cacttaggaa agattcttcg gatgatttcc tatttgactg agcggcggac

60

gggtgagtaa cgcgtgggta acctgcctca tacaggggga taacagttag aaatgactgc

120

taataccgca taagaccaca gcaccgcatg gtgcaggggt aaaaactccg gtggtatgag

180

atggacccgc gtctgattag ttagttggtg gggtaacggc ctaccaaggc gacgatcagt

240

agccgacctg agagggtgac cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg

300

gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga

360

gcgaagaagt atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctga

420

ctaagaagcc ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg ggcaagcgtt

480

atccggattt actgggtgta aagggagcgt agacggagca gcaagtctga tgtgaaaacc

540

cggggctcaa ccccgggact gcattggaaa ctgttgatct ggagtgccgg agaggtaagc

600

ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta gatattagga ggaacaccag tggcgaaggc

660

ggcttactgg acggtaactg acgttgaggc tcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga

720

taccctggta gtccacgccg taaacgatga ctactaggtg tcgggtggca aagccattcg

780

gtgccgcagc caacgcaata agtagtccac ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc

840

aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc

900

gaagaacctt acctgctctt gacatcccgg tgacggcaga gtaatgtctg cttttcttcg

960

gaacaccggt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1020

agtcccgcaa cgagcgcaac ccctatcttc agtagccagc ggtaaggccg ggcactctgg

1080

agagactgcc agggataacc tggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt

1140

atgagcaggg ctacacacgt gctacaatgg cgtaaacaaa gggaagcgaa cccgcgaggg

1200

tgggcaaatc ccaaaaataa cgtctcagtt cggattgtag tctgcaactc gactacatga

1260

agctggaatc gctagtaatc gcgaatcaga atgtcgcggt gaatacgttc ccgggtcttg

1320

tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtca gtaacgcccg aagtcagtga cccaaccgta

1380

aggagg

1386

<210> 1664

<211> 1373

<212> DNA

<213> Ruminococcus obeum

<220>

<221> modified_base

<222> (8)..(8)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (762)..(762)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (899)..(899)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1664

acgggaanta cttcattgag acttcggtgg atttgattta gtattctagt ggcggacggg

60

tgagtaacgc gtgggtaacc tgccttatac agggggataa cagtcagaaa tgactgctaa

120

taccgcataa gcgcacagga ccgcatggtc cggtgtgaaa aactccggtg gtataagatg

180

gacccgcgtt ggattagctt gttggtgggg taacggccca ccaaggcgac gatccatagc

240

cggcctgaga gggtgaacgg ccacattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag

300

gcagcagtgg ggaatattgc acaatggggg aaaccctgat gcagcgacgc cgcgtgaagg

360

aagaagtatc tcggtatgta aacttctatc agcagggaag atagtgacgg tacctgacta

420

agaagccccg gcaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggggca agcgttatcc

480

ggtttactgg gtgtaaaggg agcgtagacg gtgtggcaag tctgatgtga aaggcatggg

540

ctcaacctgt ggactgcatt ggaaactgtc atacttgagt gccggagggg taagcggaat

600

tcctagtgta gcggtgaaat gcgtagatat taggaggaac accagtggcg aaggcggctt

660

actggacggt aactgacgtt gaggctgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct

720

ggtagtccac gccgtaaacg atgaatatag gtgtcgggat gntcggtgcc gtcgcaaacg

780

cagtaagtat tccacctggg gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg aattgacggg

840

gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga aacatggcna

900

gtcttgacat ccctttgacc gacttttaac cgagtttttc cttcgggaca gaggagacag

960

gtggtgcatg gttgttgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1020

gcaaccccta tcctcagtag ccagcaagtt gagttgggca ctctgtggag actgccaggg

1080

ataacctgga ggaaggcggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga tttgggctac

1140

acacgtgcta caatggcgta aacaaaggga agcgagattg tgagatggag caaatcccaa

1200

aaataacgtc ccagttcgga ctgtagtctg caacccgact acacgaagct ggaatcgcta

1260

gtaatcgcgg atcagaatgc cgcggtgaat acgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt

1320

cacaccatgg gagtcagtaa cgcccgaagt cagtgaccta actgcaaaga agg

1373

<210> 1665

<211> 1368

<212> DNA

<213> Ruminococcus sp. 18P13

<400> 1665

tcgaacggag ataaagactt cggtttttat cttagtggcg gacggttgag taacacgtga

60

gcaacctgcc tttgagagag ggatagcttc tggaaacgga tggtaatacc tcataacata

120

gcggtaccgc atgatactgc tatcaaagat ttatcgctca gagatgggct cgcgtctgat

180

tagctagatg gtgaggtaac ggttcaccat ggcgacgatc agtagccgga ctgagaggtt

240

gaacggccac attgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtgcggaa

300

tattgcacaa tgacgcaagc ctgatgcagc gatgccgcgt ggaggaagaa ggttttcgga

360

ttgtaaactc ctgtcttaag ggacgataat gacggtacct taggaggaag ctccggctaa

420

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggagcgagcg ttgtccggaa ttactgggtg

480

taaagggagc gtaggcggga ttgcaagtca gatgtgaaaa ctatgggctt aacccataga

540

ctgcatttga aactgtagtt cttgagtgaa gtagaggtaa gcggaattcc tagtgtagcg

600

gtgaaatgcg tagatattag gaggaacatc ggtggcgaag gcggcttact gggcttttac

660

tgacgctgag gctcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc

720

tgtaaacgat gattactagg tgtgggggga ctgacccctt ccgtgccgca gttaacacaa

780

taagtaatcc acctggggag tacggccgca aggttgaaac tcaaaggaat tgacgggggc

840

ccgcacaagc agtggagtat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaaaaacc ttaccaggtc

900

ttgacatcga gtgaatgatc tagagataga tcagtccttc gggacacaaa gacaggtggt

960

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1020

ccttaccttt agttgctacg caagagcact ctagagggac tgccgttgac aaaacggagg

1080

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtactaca

1140

atggcaatga acagagggaa gcaatacagt gatgtggagc aaatccccaa aaattgtccc

1200

agttcagatt gtaggctgca actcgcctac atgaagtcgg aattgctagt aatctgcagc

1260

tcagcatgct gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac gccgcccgtc acaccatggg

1320

agtcggtaac acccgaagcc agtagcctaa ccgcaaggag ggcgctgt

1368

<210> 1666

<211> 1368

<212> DNA

<213> Ruminococcus sp. 5_1_39BFAA

<220>

<221> modified_base

<222> (8)..(8)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (10)..(11)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (15)..(15)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (20)..(20)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (762)..(762)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1666

acgggaantn nttcnttgan acttcggtgg atttagattt atttctagtg gcggacgggt

60

gagtaacgcg tgggtaacct gccttataca gggggataac agtcagaaat ggctgctaat

120

accgcataag cgcacagagc tgcatggctc agtgtgaaaa actccggtgg tataagatgg

180

acccgcgttg gattagctgg ttggtggggt aacggcccac caaggcgacg atccatagcc

240

ggcctgagag ggtgaacggc cacattggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg

300

cagcagtggg gaatattgca caatggggga aaccctgatg cagcgacgcc gcgtgaagga

360

agaagtatct cggtatgtaa acttctatca gcagggaaga tagtgacggt acctgactaa

420

gaagccccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggggca agcgttatcc

480

ggatttactg ggtgtaaagg gagcgtagac ggtgtggcaa gtctgatgtg aaaggcatgg

540

gctcaacctg tggactgcat tggaaactgt catacttgag tgccggaggg taagcggaat

600

tcctagtgta gcggtgaaat gcgtagatat taggaggaac accagtggcg aaggcggctt

660

actggacggt aactgacgtt gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc

720

tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatact agtgtcggca antcggtgcc gtcgcaaacg

780

cagtaagtat tccacctggg gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg aattgacggg

840

gaccgcacaa gcggtggaca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaagt

900

cttgacatcc gcctgaccga tccttaaccg gatctttcct tcgggacagg cgagacaggt

960

ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc

1020

aacccctatc ctcagtagcc agcatttaag gtgggcactc tggggagact gccagggata

1080

acctggagga aggcggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgattt gggctacaca

1140

cgtgctacaa tggcgtaaac aaagggaagc gagattgtga gatggagcaa atcccaaaaa

1200

taacgtccca gttcggactg tagtctgcaa cccgactaca cgaagctgga atcgctagta

1260

atcgcggatc agaatgccgc ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac

1320

accatgggag tcagtaacgc ccgaagtcag tgacctaact gcaaagaa

1368

<210> 1667

<211> 1223

<212> DNA

<213> Ruminococcus sp. 9SE51

<400> 1667

cacgcctaac acatgcaagt cgaacgagtg gcggacgggt gagtaacacg tgagcaacct

60

gcctctgaga gagggatagc ttctggaaac ggatggtaat acctcataac caaagtcgct

120

cagagatggt ctcgcgtctg attagctaga tggtgaggta acggctcacc atggcgacga

180

tcagtagccg gactgagagg ttgaacggcc acattgggac tgagacacgg ccagactcct

240

acgggaggca gcagtgggga atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gcgatgccgc

300

gtggaggaag aaggttttcg gattgtaaac tcctgtctta agggacgatg acggtacctt

360

aggaggaagc tccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gagcgagcgt

420

tgtccggaat tactgggtgt aaagggagcg taggcgggat tgcaagtcag atgtgaaaac

480

tatgggctta acccatagac tgcatttgaa actgtagttc ttgagtgaag tagaggtaag

540

cggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattagg aggaacatcg gtggcgaagg

600

cggcttactg ggcttactga cgctgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat

660

accctggtag tccacgctgt aaagatgatt actaggtgtg ggggcttccg tgccgcagtt

720

aacacaataa gtaatccacc tggggagtac ggccgcaagg ttgaaactca aaggaattga

780

cgggggcccg cacaagcagt ggagtatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aaaaacctta

840

ccaggtcttg acatcgacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

900

ggttaagtcc cgcagcgagc gcaaccctta cctttagttg ctacagcact ctagagggac

960

tgccgttgac aaaacggagg aaggtgggga tgtcgtcaaa tcatcatgcc ccttatgact

1020

gggctacaca cgtactacaa tggcaatcag agggaagcaa tacagtgatg tggagcaaat

1080

ccccattgtc ccagttcaga tgtaggctca actcgcctac agaagtcgga attgctagta

1140

atcgcagctc agcatgccgc ggtgaatacg ttaacgggcc ttgtacacgg cgcccgtcac

1200

accatgggag tcggtaacaa ccg

1223

<210> 1668

<211> 1339

<212> DNA

<213> Ruminococcus sp. ID8

<220>

<221> modified_base

<222> (27)..(27)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1668

ggaggaagag gacagtgact gagcggngga cgggtgagta acggcggtgg gcaacctgcc

60

tcatacaggg ggataacagt tagaaatgac tgctaatacc gcataagcgc acaggaccgc

120

atggtgtagt gtgaaaaact ccggtggtat gagatggacc cgcgtctgat taggtagttg

180

gtggggtaaa ggcctaccaa gccgacgatc agtagccgac ctgagagggt gaccggccac

240

attgggactg agacacggcc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa

300

tgggggaaac cctgatgcag cgacgccgcg tgaaggaaga agtatttcgg tatgtaaact

360

tctatcagca gggaagaaga tgacggtacc tgagtaagaa gcaccggcta aatacgtgcc

420

acagccgcgg taatacgtat ggtgcagcgt tatccggatt tactgggtgt aaagggagcg

480

tagacggata ggcaagtctg gagtgaaaac ccagggctca accctgggac tgctttggaa

540

actgcagatc tggagtgccg gagaggtaag cggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt

600

agatattagg aggaacacca gtggcgaagg cggcttactg gacggtgact gacgttgagg

660

ctcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg

720

actactagtg tcggtgtgca aagcacatcg gtgccgcagc aaacgcaata agtagtccac

780

ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc aaaggaattg accgggaccc gcacaagcgg

840

tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt acctggtctt gacatccgga

900

tgacgggcga gtaatgtcgc cgtcccttcg gggcatccga gacaggtggt gcatggttgt

960

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcttc

1020

agtagccagc atataaggtg ggcactctgg agagactgcc agggagaacc tggaggaagg

1080

tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atggccaggg ctacacacgt gctacaatgg

1140

cgtaaacaaa gggaagcgag agggtgacct ggagcgaatc ccaaaaataa cgtctcagtt

1200

cggattgtag tctgcaactc gactacatga agctggaatc gctagtaatc gcggatcagc

1260

atgccgcggt gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtca

1320

gtaacgcccg aagccagtg

1339

<210> 1669

<211> 898

<212> DNA

<213> Ruminococcus sp. K-1

<220>

<221> modified_base

<222> (719)..(720)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (723)..(723)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (824)..(824)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (877)..(877)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1669

gtggcggacg ggtgagtaac gcgtgggtaa cctgccttat acagggggat aacagtcaga

60

aatggctgct aataccgcat aagcgcacag agctgcatgg ctcagtgtga aaaactccgg

120

tggtataaga tggacccgcg ttggattagc ttgttggtgg ggtaacggcc caccaaggcg

180

acgatccata gccggcctga gagggtgaac ggccacattg ggactgagac acggcccaga

240

ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg ggaaaccctg atgcagcgac

300

gccgcgtgaa ggaagaagta tctcggtatg taaacttcta tcagcaggga agatagtgac

360

ggtacctgac taagaagccc cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggg

420

gcaagcgtta tccggattta ctgggtgtaa agggagcgta gacggtgtgg caagtctgat

480

gtgaaaggca tgggctcaac ctgtggactg cattggaaac tgtcatactt gagtgccgga

540

ggggtaagcg gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag atattaggag gaacaccagt

600

ggcgaaggcg gcttactgga cggtaactga cgttgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac

660

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgaa tactaggtgt cggggagcnn

720

agntcttcgg tgccgtcgca aacgcagtaa gtattccacc tggggagtac gttcgcaaga

780

atgaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggancatgtg gtttaattcg

840

aagcaacgcg aagaacctta ccaagtcttg acatccncct gaccgatcct taaccgga

898

<210> 1670

<211> 1361

<212> DNA

<213> Ruminococcus torques

<400> 1670

ggatgaagag gattgtgact gagcggcgga cgggtgagta acgcgtgggt aacctgcctc

60

atacaggggg ataacagtta gaaatgactg ctaataccgc ataagaccac agcaccgcat

120

ggtgcggggg taaaaactcc ggtggtatga gatggacccg cgtctgatta gctagttggt

180

aaggtaacgg cttaccaagg cgacgatcag tagccgacct gagagggtga ccggccacat

240

tgggactgag acacggccca aactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg

300

ggggaaaccc tgatgcagcg acgccgcgtg agcgaagaag tatttcggta tgtaaagctc

360

tatcagcagg gaagaaaatg acggtacctg actaagaagc accggctaaa tacgtgccag

420

cagccgcggt aatacgtatg gtgcaagcgt tatccggatt tactgggtgt aaagggagcg

480

tagacggatg ggcaagttga tgtgaaaacc cggggctcaa ccccgggact gcattggaaa

540

ctgttcatct agagtgctgg agaggtaagt ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta

600

gatattagga ggaacaccag tggcgaaggc ggcttactgg acagtaactg acgttgaggc

660

tcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga

720

ctactaggtg tcgggtggca aagccattcg gtgccgcagc aaacgcaata agtagtccac

780

ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg

840

tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt acctgctctt gacatcccgc

900

tgaccggacg gtaatgcgtc cttcccttcg gggcagcgga gacaggtggt gcatggttgt

960

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctatcttt

1020

agtagccagc ggccaggccg ggcactctag agagactgcc ggggataacc cggaggaagg

1080

tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgagcaggg ctacacacgt gctacaatgg

1140

cgtaaacaaa gggaagcgag accgcgaggt ggagcaaatc ccaaaaataa cgtctcagtt

1200

cggattgtag tctgcaactc gactacatga agctggaatc gctagtaatc gcgaatcaga

1260

atgtcgcggt gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtca

1320

gtaacgcccg aagtcagtga cccaaccgta aggagggagc t

1361

<210> 1671

<211> 1375

<212> DNA

<213> Saccharomonospora viridis

<220>

<221> modified_base

<222> (95)..(95)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (128)..(128)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (155)..(155)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (167)..(167)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (293)..(293)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (341)..(341)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (776)..(776)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (854)..(854)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (890)..(890)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (917)..(917)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (920)..(920)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1001)..(1001)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1030)..(1031)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1172)..(1172)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1179)..(1179)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1181)..(1181)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1289)..(1290)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1292)..(1292)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1294)..(1294)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1298)..(1298)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1333)..(1333)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1354)..(1354)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1671

tgagtggcga acgggtgagt aacacgtggg taatctgccc tgtactctgg gataagcctg

60

ggaaactggg tctaataccg gataggcacc agctnccgca tggtggtgtg tggaaagctg

120

cggcggtnca ggatgagccg gcggcccatc agctngttgg tggggtnatg gcctaccaag

180

gcgacgacgg gtagccggcc tgagagggtg accggccaca ctgggactga gacacggccc

240

agactcctac cggaggcagc agtggggaat attgcacaat ggacggaagc ctnatgcagc

300

gacgccgcgt gggggatgac ggccttcggg ttgtaaaccc ntttcgcccg ggacgaagcg

360

agagtgacgg taccgggaga agaagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtagggtgc aagcgtggtc cggaatgatt gggcgtaaag agctcgtagg cggtgtgtcg

480

cgtctgccgt gaaaacctgc ggctgaaccg tgggcgtgcg gtggatacgg gcacactgga

540

gttcggtagg ggagactgga attcctggtg tagcggtgaa atgcgcagat atcaggagga

600

acgccagtgg cgaaggcggg gctctgggcc gaaactgacg ctgaggagcg aaagcgtggg

660

gagcgaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acggtgggcg ctaggtgtgg

720

gatgctgtgc acgtgtcccg tgccgtagct aacgcatgaa gcgccccgcc tggggngtac

780

ggccgcaagg ctaaaactca aaggaatgga cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgtg

840

gattaattcg atgnaacgcg aagaacctga cctgggtggg acatgcactn gaccggcgta

900

gagatacgcc ggccctngtn gctggtgcac aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt

960

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct ngtcccatgt tgccagcggg

1020

taatgccggn nactcgtggg agactgccgg ggttaactcg gaggaaggtg gggatgacgt

1080

caagtcatca tgccccttat gcccagggct gcacacatgc tacaatggcc agtacagagg

1140

gtggcgagac cgtgaggtgg agcgaatccc gnaaagctng nctgagttcg gatcgtggtc

1200

tgcaactcga ctgcgtgaag tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg

1260

aatrcgttcc cgggccttgt acacaccgnn cntnacgnca tgaaagtcgg taacacccga

1320

agcccatggc ctnaccccgt caggggaggg agtngtcgaa ggtgggaccc gcgat

1375

<210> 1672

<211> 1545

<212> DNA

<213> Salmonella enterica

<400> 1672

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacaggaa gcagcttgct gcttcgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtgg ctaataccgc

180

ataacgtcgc aagaccaaag agggggacct tcgggcctct tgccatcaga tgtgcccaga

240

tgggattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgta tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagtactt tcagcgggga ggaaggtgtt gtggttaata accgcagcaa

480

ttgacgttac ccgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tctgtcaagt

600

cggatgtgaa atccccgggc tcaacctggg aactgcattc gaaactggca ggcttgagtc

660

ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtctactt ggaggttgtg

840

cccttgaggc gtggcttccg gagctaacgc gttaagtaga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc cacggaagtt ttcagagatg

1020

agaatgtgcc ttcgggaacc gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcgattag

1140

gtcgggaact caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgacc agggctacac acgtgctaca atggcgcata caaagagaag

1260

cgacctcgcg agagcaagcg gacctcataa agtgcgtcgt agtccggatt ggagtctgca

1320

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtggat cagaatgcca cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca aaagaagtag

1440

gtagcttaac cttcgggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttac

1545

<210> 1673

<211> 1545

<212> DNA

<213> Salmonella enterica

<400> 1673

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacaggaa gcagcttgct gcttcgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtgg ctaataccgc

180

ataacgtcgc aagaccaaag agggggacct tcgggcctct tgccatcaga tgtgcccaga

240

tgggattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgta tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagtactt tcagcgggga ggaaggtgtt gtggttaata accgcagcaa

480

ttgacgttac ccgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tctgtcaagt

600

cggatgtgaa atccccgggc tcaacctggg aactgcattc gaaactggca ggcttgagtc

660

ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtctactt ggaggttgtg

840

cccttgaggc gtggcttccg gagctaacgc gttaagtaga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc cacggaagtt ttcagagatg

1020

agaatgtgcc ttcgggaacc gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcgattag

1140

gtcgggaact caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgacc agggctacac acgtgctaca atggcgcata caaagagaag

1260

cgacctcgcg agagcaagcg gacctcataa agtgcgtcgt agtccggatt ggagtctgca

1320

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtggat cagaatgcca cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca aaagaagtag

1440

gtagcttaac cttcgggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttac

1545

<210> 1674

<211> 1545

<212> DNA

<213> Salmonella enterica

<400> 1674

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacaggaa gcagcttgct gcttcgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtgg ctaataccgc

180

ataacgtcgc aagaccaaag agggggacct tcgggcctct tgccatcaga tgtgcccaga

240

tgggattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgta tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagtactt tcagcgggga ggaaggtgtt gtggttaata accgcagcaa

480

ttgacgttac ccgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tctgtcaagt

600

cggatgtgaa atccccgggc tcaacctggg aactgcattc gaaactggca ggcttgagtc

660

ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtctactt ggaggttgtg

840

cccttgaggc gtggcttccg gagctaacgc gttaagtaga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc cacggaagtt ttcagagatg

1020

agaatgtgcc ttcgggaacc gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcgattag

1140

gtcgggaact caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgacc agggctacac acgtgctaca atggcgcata caaagagaag

1260

cgacctcgcg agagcaagcg gacctcataa agtgcgtcgt agtccggatt ggagtctgca

1320

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtggat cagaatgcca cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca aaagaagtag

1440

gtagcttaac cttcgggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttac

1545

<210> 1675

<211> 1545

<212> DNA

<213> Salmonella enterica

<400> 1675

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacaggaa gcagcttgct gcttcgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtgg ctaataccgc

180

ataacgtcgc aagaccaaag agggggacct tcgggcctct tgccatcaga tgtgcccaga

240

tgggattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgta tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagtactt tcagcgggga ggaaggtgtt gtggttaata accgcagcaa

480

ttgacgttac ccgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tctgtcaagt

600

cggatgtgaa atccccgggc tcaacctggg aactgcattc gaaactggca ggcttgagtc

660

ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtctactt ggaggttgtg

840

cccttgaggc gtggcttccg gagctaacgc gttaagtaga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc cacggaagtt ttcagagatg

1020

agaatgtgcc ttcgggaacc gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcgattag

1140

gtcgggaact caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgacc agggctacac acgtgctaca atggcgcata caaagagaag

1260

cgacctcgcg agagcaagcg gacctcataa agtgcgtcgt agtccggatt ggagtctgca

1320

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtggat cagaatgcca cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca aaagaagtag

1440

gtagcttaac cttcgggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttac

1545

<210> 1676

<211> 1545

<212> DNA

<213> Salmonella enterica

<400> 1676

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacaggaa gcagcttgct gcttcgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtgg ctaataccgc

180

ataacgtcgc aagaccaaag agggggacct tcgggcctct tgccatcaga tgtgcccaga

240

tgggattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgta tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagtactt tcagcgggga ggaaggtgtt gtggttaata accgcagcaa

480

ttgacgttac ccgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tctgtcaagt

600

cggatgtgaa atccccgggc tcaacctggg aactgcattc gaaactggca ggcttgagtc

660

ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtctactt ggaggttgtg

840

cccttgaggc gtggcttccg gagctaacgc gttaagtaga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc cacggaagtt ttcagagatg

1020

agaatgtgcc ttcgggaacc gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcgattag

1140

gtcgggaact caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgacc agggctacac acgtgctaca atggcgcata caaagagaag

1260

cgacctcgcg agagcaagcg gacctcataa agtgcgtcgt agtccggatt ggagtctgca

1320

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtggat cagaatgcca cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca aaagaagtag

1440

gtagcttaac cttcgggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttac

1545

<210> 1677

<211> 1545

<212> DNA

<213> Salmonella enterica

<400> 1677

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacaggaa gcagcttgct gcttcgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtgg ctaataccgc

180

ataacgtcgc aagaccaaag agggggacct tcgggcctct tgccatcaga tgtgcccaga

240

tgggattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgta tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagtactt tcagcgggga ggaaggtgtt gtggttaata accgcagcaa

480

ttgacgttac ccgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tctgtcaagt

600

cggatgtgaa atccccgggc tcaacctggg aactgcattc gaaactggca ggcttgagtc

660

ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtctactt ggaggttgtg

840

cccttgaggc gtggcttccg gagctaacgc gttaagtaga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc cacggaagtt ttcagagatg

1020

agaatgtgcc ttcgggaacc gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcgattag

1140

gtcgggaact caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgacc agggctacac acgtgctaca atggcgcata caaagagaag

1260

cgacctcgcg agagcaagcg gacctcataa agtgcgtcgt agtccggatt ggagtctgca

1320

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtggat cagaatgcca cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca aaagaagtag

1440

gtagcttaac cttcgggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttac

1545

<210> 1678

<211> 1545

<212> DNA

<213> Salmonella enterica

<400> 1678

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacaggaa gcagcttgct gcttcgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtgg ctaataccgc

180

ataacgtcgc aagaccaaag agggggacct tcgggcctct tgccatcaga tgtgcccaga

240

tgggattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgta tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagtactt tcagcgggga ggaaggtgtt gtggttaata accgcagcaa

480

ttgacgttac ccgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tctgtcaagt

600

cggatgtgaa atccccgggc tcaacctggg aactgcattc gaaactggca ggcttgagtc

660

ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtctactt ggaggttgtg

840

cccttgaggc gtggcttccg gagctaacgc gttaagtaga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc cacggaagtt ttcagagatg

1020

agaatgtgcc ttcgggaacc gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcgattag

1140

gtcgggaact caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgacc agggctacac acgtgctaca atggcgcata caaagagaag

1260

cgacctcgcg agagcaagcg gacctcataa agtgcgtcgt agtccggatt ggagtctgca

1320

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtggat cagaatgcca cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca aaagaagtag

1440

gtagcttaac cttcgggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttac

1545

<210> 1679

<211> 1545

<212> DNA

<213> Salmonella enterica

<400> 1679

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacaggaa gcagcttgct gcttcgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtgg ctaataccgc

180

ataacgtcgc aagaccaaag agggggacct tcgggcctct tgccatcaga tgtgcccaga

240

tgggattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgta tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagtactt tcagcgggga ggaaggtgtt gtggttaata accgcagcaa

480

ttgacgttac ccgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tctgtcaagt

600

cggatgtgaa atccccgggc tcaacctggg aactgcattc gaaactggca ggcttgagtc

660

ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtctactt ggaggttgtg

840

cccttgaggc gtggcttccg gagctaacgc gttaagtaga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc cacggaagtt ttcagagatg

1020

agaatgtgcc ttcgggaacc gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcgattag

1140

gtcgggaact caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgacc agggctacac acgtgctaca atggcgcata caaagagaag

1260

cgacctcgcg agagcaagcg gacctcataa agtgcgtcgt agtccggatt ggagtctgca

1320

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtggat cagaatgcca cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca aaagaagtag

1440

gtagcttaac cttcgggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttac

1545

<210> 1680

<211> 1545

<212> DNA

<213> Salmonella enterica

<400> 1680

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacaggaa gcagcttgct gcttcgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtgg ctaataccgc

180

ataacgtcgc aagaccaaag agggggacct tcgggcctct tgccatcaga tgtgcccaga

240

tgggattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgta tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagtactt tcagcgggga ggaaggtgtt gtggttaata accgcagcaa

480

ttgacgttac ccgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tctgtcaagt

600

cggatgtgaa atccccgggc tcaacctggg aactgcattc gaaactggca ggcttgagtc

660

ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtctactt ggaggttgtg

840

cccttgaggc gtggcttccg gagctaacgc gttaagtaga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc cacggaagtt ttcagagatg

1020

agaatgtgcc ttcgggaacc gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcgattag

1140

gtcgggaact caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgacc agggctacac acgtgctaca atggcgcata caaagagaag

1260

cgacctcgcg agagcaagcg gacctcataa agtgcgtcgt agtccggatt ggagtctgca

1320

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtggat cagaatgcca cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca aaagaagtag

1440

gtagcttaac cttcgggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttac

1545

<210> 1681

<211> 1416

<212> DNA

<213> Salmonella typhimurium

<400> 1681

catgcaagtc gaacggtaac aggaagcagc ttgctgcttc gctgacgagt ggcggacggg

60

tgagtaatgt ctgggaaact gcctgatgga gggggataac tactggaaac ggtggctaat

120

accgcataac gtcgcaagac caaagagggg gaccttcggg cctcttgcca tcagatgtgc

180

ccagatggga ttagcttgtt ggtgaggtaa cggctcacca aggcgacgat ccctagctgg

240

tctgagagga tgaccagcca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca

300

gcagtgggga atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtatgaag

360

aaggccttcg ggttgtaaag tactttcagc ggggaggaag gtgttgtggt taataaccgc

420

agcaattgac gttacccgca gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacggagggt gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtctgt

540

caagtcggat gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg cattcgaaac tggcaggctt

600

gagtcttgta gaggggggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag

660

gaataccggt ggcgaaggcg gccccctgga caaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg

720

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgtc tacttggagg

780

ttgtgccctt gaggcgtggc ttccggagct aacgcgttaa gtagaccgcc tggggagtac

840

ggccgcaagg ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg

900

gtttaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctggtcttg acatccacag aagtttccag

960

agatggattg gtgccttcgg gaactgtgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt

1020

gttgtgaaat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg

1080

attaggtcgg gaactcaaag gagactgcca gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg

1140

tcaagtcatc atggccctta cgaccagggc tacacacgtg ctacaatggc gcatacaaag

1200

agaagcgacc tcgcgagagc aagcggacct cataaagtgc gtcgtagtcc ggattggagt

1260

ctgcaactcg actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg tggatcagaa tgccacggtg

1320

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgcaaaaga

1380

agtaggtagc ttaaccttcg ggagggcgct taccac

1416

<210> 1682

<211> 1545

<212> DNA

<213> Salmonella enterica

<400> 1682

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacaggaa gcagcttgct gcttcgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtgg ctaataccgc

180

ataacgtcgc aagaccaaag agggggacct tcgggcctct tgccatcaga tgtgcccaga

240

tgggattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgta tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagtactt tcagcgggga ggaaggtgtt gtggttaata accgcagcaa

480

ttgacgttac ccgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tctgtcaagt

600

cggatgtgaa atccccgggc tcaacctggg aactgcattc gaaactggca ggcttgagtc

660

ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtctactt ggaggttgtg

840

cccttgaggc gtggcttccg gagctaacgc gttaagtaga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc cacggaagtt ttcagagatg

1020

agaatgtgcc ttcgggaacc gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcgattag

1140

gtcgggaact caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgacc agggctacac acgtgctaca atggcgcata caaagagaag

1260

cgacctcgcg agagcaagcg gacctcataa agtgcgtcgt agtccggatt ggagtctgca

1320

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtggat cagaatgcca cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca aaagaagtag

1440

gtagcttaac cttcgggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttac

1545

<210> 1683

<211> 1498

<212> DNA

<213> Salmonella bongori

<400> 1683

ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt cgaacggtaa

60

caggaagcag cttgctgctt cgctgacgag tggcggacgg gtgagtaatg tctgggaaac

120

tgcctggtgg agggggataa ctactggaaa cggtggctaa taccgcataa cgtcgcaaga

180

ccaaagaggg ggaccttcgg gcctcttgcc atcagatgtg cccagatggg attagcttgt

240

tggtggggta acggcccacc aaggcgacga tccctagctg gtctgagagg atgaccagcc

300

acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac

360

aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtatgaa gaaggccttc gggttgtaaa

420

gtactttcag cggggaggaa ggcghcaagg ttaataacct tgttgattga cgttacccgc

480

agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg tgcaagcgtt

540

aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtctg tcaagtcgga tgtgaaatcc

600

ccgggctcaa cctgggaact gcatccgaaa ctggcaggct tgagtctcgt agaggggggt

660

agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg tggcgaaggc

720

ggccccctgg acgaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga

780

taccctggta gtccacgccg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct tgaggcgtgg

840

cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag gttaaaactc

900

aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gatgcaacgc

960

gaagaacctt acctggtctt gacatccaca gaaccttgta gagatacgag ggtgccttcg

1020

ggaactgtga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa tgttgggtta

1080

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt tgttgccagc gattaggtcg ggaactcaaa

1140

ggagactgcc agtgataaac tggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catggccctt

1200

acgaccaggg ctacacacgt gctacaatgg cgcatacaaa gagaagcgac ctcgcgagag

1260

caagcggacc tcataaagtg cgtcgtagtc cggattggag tctgcaactc gactccatga

1320

agtcggaatc gctagtaatc gtggatcaga atgccacggt gaatacgttc ccgggccttg

1380

tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtgg gttgcaaaag aagtaggtag cttaaccttc

1440

gggagggcgc ttaccacttt gtgattcatg actggggtga agtcgtaaca aggtaacc

1498

<210> 1684

<211> 1545

<212> DNA

<213> Salmonella enterica

<400> 1684

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacaggaa gcagcttgct gcttcgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtgg ctaataccgc

180

ataacgtcgc aagaccaaag agggggacct tcgggcctct tgccatcaga tgtgcccaga

240

tgggattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgta tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagtactt tcagcgggga ggaaggtgtt gtggttaata accgcagcaa

480

ttgacgttac ccgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tctgtcaagt

600

cggatgtgaa atccccgggc tcaacctggg aactgcattc gaaactggca ggcttgagtc

660

ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtctactt ggaggttgtg

840

cccttgaggc gtggcttccg gagctaacgc gttaagtaga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc cacggaagtt ttcagagatg

1020

agaatgtgcc ttcgggaacc gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcgattag

1140

gtcgggaact caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgacc agggctacac acgtgctaca atggcgcata caaagagaag

1260

cgacctcgcg agagcaagcg gacctcataa agtgcgtcgt agtccggatt ggagtctgca

1320

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtggat cagaatgcca cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca aaagaagtag

1440

gtagcttaac cttcgggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttac

1545

<210> 1685

<211> 1545

<212> DNA

<213> Salmonella enterica

<400> 1685

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacaggaa gcagcttgct gcttcgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtgg ctaataccgc

180

ataacgtcgc aagaccaaag agggggacct tcgggcctct tgccatcaga tgtgcccaga

240

tgggattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgta tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagtactt tcagcgggga ggaaggtgtt gtggttaata accgcagcaa

480

ttgacgttac ccgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tctgtcaagt

600

cggatgtgaa atccccgggc tcaacctggg aactgcattc gaaactggca ggcttgagtc

660

ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtctactt ggaggttgtg

840

cccttgaggc gtggcttccg gagctaacgc gttaagtaga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc cacggaagtt ttcagagatg

1020

agaatgtgcc ttcgggaacc gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcgattag

1140

gtcgggaact caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgacc agggctacac acgtgctaca atggcgcata caaagagaag

1260

cgacctcgcg agagcaagcg gacctcataa agtgcgtcgt agtccggatt ggagtctgca

1320

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtggat cagaatgcca cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca aaagaagtag

1440

gtagcttaac cttcgggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttac

1545

<210> 1686

<211> 1416

<212> DNA

<213> Salmonella typhimurium

<400> 1686

catgcaagtc gaacggtaac aggaagcagc ttgctgcttc gctgacgagt ggcggacggg

60

tgagtaatgt ctgggaaact gcctgatgga gggggataac tactggaaac ggtggctaat

120

accgcataac gtcgcaagac caaagagggg gaccttcggg cctcttgcca tcagatgtgc

180

ccagatggga ttagcttgtt ggtgaggtaa cggctcacca aggcgacgat ccctagctgg

240

tctgagagga tgaccagcca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca

300

gcagtgggga atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtatgaag

360

aaggccttcg ggttgtaaag tactttcagc ggggaggaag gtgttgtggt taataaccgc

420

agcaattgac gttacccgca gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacggagggt gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtctgt

540

caagtcggat gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg cattcgaaac tggcaggctt

600

gagtcttgta gaggggggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag

660

gaataccggt ggcgaaggcg gccccctgga caaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg

720

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgtc tacttggagg

780

ttgtgccctt gaggcgtggc ttccggagct aacgcgttaa gtagaccgcc tggggagtac

840

ggccgcaagg ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg

900

gtttaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctggtcttg acatccacag aagtttccag

960

agatggattg gtgccttcgg gaactgtgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt

1020

gttgtgaaat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg

1080

attaggtcgg gaactcaaag gagactgcca gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg

1140

tcaagtcatc atggccctta cgaccagggc tacacacgtg ctacaatggc gcatacaaag

1200

agaagcgacc tcgcgagagc aagcggacct cataaagtgc gtcgtagtcc ggattggagt

1260

ctgcaactcg actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg tggatcagaa tgccacggtg

1320

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgcaaaaga

1380

agtaggtagc ttaaccttcg ggagggcgct taccac

1416

<210> 1687

<211> 1363

<212> DNA

<213> Sarcina ventriculi

<220>

<221> modified_base

<222> (11)..(12)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1687

tcgagcgaga nngttcttcg gagcttttct agcggcggac gggtgagtaa cacgtgggca

60

acctgcctca tagaggggaa tagccttccg aaaggaagat taataccgca taatattgtt

120

gaaaggcatc ttttaacaat caaaggagca atccgctatg agatgggccc gcggcgcatt

180

agctagttgg tgaggtaacg gctcaccaag gcgacgatgc gtagccgacc tgagagggtg

240

atcggccaca ttggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

300

attgcacaat gggggaaacc ctgatgcagc aacgccgcgt gagtgatgaa ggtcttcgga

360

ttgtaaagct ctgtctttag ggacgataat gacggtacct aaggaggaag ccacggctaa

420

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtggcaagcg ttatccggat ttactgggcg

480

taaagggagc gtaggcggat atttaagtgg gatgtgaaat acccgagctt aacttgggag

540

ctgcattcca aactggatat ctagagtgca ggagaggaga atggaattcc tagtgtagcg

600

gtgaaatgcg tagagattag gaagaacacc agtggcgaag gcgattctct ggactgtaac

660

tgacgctgag gctcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc

720

cgtaaacgat gaatactagg tgtaggggcc ccaagcctct gtgccgccgc taacgcatta

780

agtattccgc ctggggagta cggtcgcaag attaaaactc aaaggaattg acggggaccc

840

gcacaagcag cggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt acctagactt

900

gacctgtcct gaattaccag taatgtggga aattccttcg ggaacaggaa cacaggtggt

960

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1020

ccttattgtt agttggtacc attaagttga ccactctagc gagactgccc gggttaaccg

1080

ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgtctagggc tacacacgtg

1140

ctacaatggc aagtacaaag agaagcaata ctgtgaagtg gagcaaaact caaaaacttg

1200

tctcagttcg gattgtaggc tgaaactcgc ctacatgaag ctggagttgc tagtaatcgc

1260

gaatcagaat gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat

1320

gagagttggc aatacccgaa gtccgtaagc taaccgtaag gag

1363

<210> 1688

<211> 1557

<212> DNA

<213> Scardovia inopinata

<220>

<221> modified_base

<222> (967)..(967)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1688

agagtttgat catggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gggatcctgc ttggtttttg ctgggtgggt gagagtggcg aacgggtgag taatgcgtga

120

ctaacctgcc gtgtagttgg gtatagctcc tggaaacggg tggtaatacc gaatggtcca

180

ctgggctgca tggtctggtg ggaaagtttt gtgtgctatg cgatggggtc gcgtcctatc

240

agcttgttgg tggggtgatg gcctaccaag gcttcgacgg gtagccggcc taagagggcg

300

accggccaca ttgggactga gatacgccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata

360

ttgcacaatg gggggaaccc tgatgcagcg acgccgcgtg cgggatggag gccttcgggt

420

tgtgaaccgc ttttattggg gagcaagctg gccctgtgtt gggttggtga gtgtacttgg

480

tgaataagca ccggccaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg tgccagcgtt

540

gtccggattt attgggcgta aagggctcgt aggcggttcg tcgcgtctgg tgtgaaagct

600

tactgcttaa cggtgggttt gcgttggata cgggcgggct tgagtgcagt aggggagact

660

ggaattctcg gtgtaacggt ggaatgtgta gatatcggga agaacaccta tggcgaaggc

720

aggtctctgg gctgttactg acgctgagga gcgaaagcgt ggggagcgaa caggattaga

780

taccctggta gtccacgctg taaacggtgg acgctggatg tggggcctat ttccacgggt

840

tctgtgtcgg agctaacgcg ttaagcgtcc cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa

900

ctcaaagaaa ttgacggggg cccgcacaag cggcggagca tgcggattaa ttcgatgcaa

960

cgcgaanaac cttaccaggg cttgacatgt gagcgttgat cttagagata gggtttccct

1020

tcggggcgct ttcacaggtg gtgcatggtc gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt

1080

taagtccccg caaacgagcg caacccttgc cttgtgttgc cagccggttc ttgcccgggg

1140

aactcaacaa agggaaccgc ccgggggtta aacttcggga aggaaagggt gggggatgac

1200

gtccagaatc atcatgcccc ttaacgtcct ggggcttcaa cgcatgctac aatggctggt

1260

acagcgggga tgcgatacgg tgacgtggag cggatcctgt aaaaccggtc tcagttcgga

1320

tcggagcctg caactcggct ccgtgaaggt ggagtcgcta gtaatcgcgg atcagcagtg

1380

ccgcggtgaa tgcgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcaagtcatg aaagtgggca

1440

gcacccgaag ccggtggcct aacccttgtg gggagaaccg tctaaggtga ggttcgcgat

1500

tgggactaag tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc ggctggatca cctcctt

1557

<210> 1689

<211> 1294

<212> DNA

<213> Scardovia wiggsiae

<400> 1689

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta

60

atgcgtgact aacctgccgt atggttgggg atagctcctg gaaacgggtg gtaataccca

120

atgctgaaag gtgccatatg atggggtcgc gtcctatcag cttgttggtg gggtgatggc

180

ctaccaaggc gtcgacgggt agccggccta agagggcgac cggccacatt gggactgaga

240

tacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct

300

gatgcagcga cgccgcgtgc gggatggagg ccttcgggtt gtaaaccgct tttatagggg

360

ggcatgagtg gactttatga ataagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtagggtgc aagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag ggctcgtagg cggtttgttg

480

cgtctggtgt gaaagcttac tgcttaacgg taggttgcgc tggatacggg caggcttgag

540

tgcagtaggg gagactggaa ttctcggtgt aacggtggaa tgtgtagata tcgggaagaa

600

cacctatggc gaaggcaggt ctctgggctg actgacgctg aggagcgaaa gcgtggggag

660

cgaacaggat tagataccct ggtagtccat gctgtaaacg gtggacgctg gatgtggggc

720

gttctgtgtc ggagctaacg cgttaagcgt cccgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

780

aactcaaaga aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag catgcggatt aattcgatgc

840

aacgcgaaga accttaccag ggcttgacat atacaggtgg tgcatggtcg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgcctt gtgttaccag

960

cggccgggga ctcacaaggg accgccgggg ttaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

gatcatcatg ccccttacgt cctgggcttc acgcatgcta caatggctgg cagcgggatg

1080

cgatactgta aggtggagcg gatcctgtcc ggtctcagtt cggacggggc ctgcaactcg

1140

gcctcggaag gtggagtcgc tagtaatcgc ggatcagcag tgccgcggtg aatgcgttcc

1200

cgggccttgt acacaccgcc cgtcaagtca tgaaagtggg cagcacccga agccggtgcc

1260

tagggagccg tctaaggtga ggttcgcgat tggg

1294

<210> 1690

<211> 1504

<212> DNA

<213> Segniliparus rotundus

<400> 1690

agagtttgat tctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgaac

60

ggtaaggccc ttcggggtac acgagtggcg aacgggtgag taacacgtgg gcaatctgcc

120

ctgcactctg ggataagcct gggaaactgg gtctaatacc ggatatgagt ctccaccgca

180

tggcggagac tggaaagttt ttcggtgcag gatgagcccg cggcctatca gctagttggt

240

ggggtaatgg cctaccaagg cgacgacggg tagccggcct gagagggtga tcggccacac

300

tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg

360

ggcgaaagcc tgatgcagcg acgccgcgtg cgggatgacg gccttcgggt tgtaaaccgc

420

tttcagcagg gacgaagcgc aagtgacggt acctgcaaaa gaagcaccgg ctaactacgt

480

gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgcg agcgttgttc ggaattactg ggcgtaaaga

540

gctcgtaggc ggactgtcgc gtcgcctgtg aaagcccgtg gctcaaccac gggtctgcag

600

gcgatacggg cagactagag tactgcaggg gagactggaa ttcctggtgt agcggtggaa

660

tgcgcagata tcaggaggaa caccggtggc gaaggcgggt ctctgggcag taactgacgc

720

tgaggagcga aagcgtgggg agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc acgctgtaaa

780

cggtgggcgc taggtgtggg tttccttcca tgaaatccgt gccgtagcta acgcattaag

840

cgccccgcct ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa agaaattgac gggggcccgc

900

acaagcggcg gagcatgtgg attaattcga tgcaacgcga agaaccttac ctgggtttga

960

catggactgg aaagccgtag agatacggcc ccccttgtgg tcggttcaca ggtggtgcat

1020

ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt

1080

gtcctgtgtt gccagcgcgt aatggcgggg actctcagga aactgccggg gtcaactcgg

1140

aggaaggtgg ggacgacgtc aagtcatcat gccccttatg tccagggctt cacacatgct

1200

acaatggcgc gtacagaggg cagcgatatc gcaaggtgga gcgaatccct taaagcgcgt

1260

ctcagttcgg attggggtct gcaactcgac cccatgaagt cggagtcgct agtaatcgca

1320

gatcagcaac gctgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcaagtcac

1380

gaaagtcggt aacacccgaa gccggtggcc caacctttta ggagggagcc gtcgaaggtg

1440

ggattggcga ttgggactaa gtcgaaacaa ggtagccgta ccggaaggtg cggctggatc

1500

acct

1504

<210> 1691

<211> 1520

<212> DNA

<213> Segniliparus rugosus

<400> 1691

ctttcacgga gagtttgatt ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taacacatgc

60

aagtcgaacg atgaagccct tcggggtgga ttagtggcga acgggtgagt aacacgtggg

120

caatctgccc tgcactctgg gataagcctg ggaaactggg tctaataccg gatatgagct

180

tccaccgcat ggtggaggtt ggaaagtttt tcggtgcagg atgagcccgc ggcctatcag

240

ctagttggtg gggtaacggc ctaccaaggc gacgacgggt agccggcctg agagggtgat

300

cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tgcacaatgg gcgaaagcct gatgcagcga cgccgcgtga gggatgacgg ccttcgggtt

420

gtaaacctct ttcagcaggg acgaagcgca agtgacggta cctgcaaaag aagcaccggc

480

taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcga gcgttgttcg gatttactgg

540

gcgtaaagag ctcgtaggcg gactgtcgcg tcgcctgtga aagcccgtgg ctcaaccacg

600

ggtctgcagg cgatacgggc agactagagt actgcagggg agactggaat tcctggtgta

660

gcggtggaat gcgcagatat caggaggaac accggtggcg aaggcgggtc tctgggcagt

720

aactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca

780

cgctgtaaac ggtgggcgct aggtgtgggt ttccttccat gaaatccgtg ccgtagctaa

840

cgcattaagc gccccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa gaaattgacg

900

ggggcccgca caagcggcgg agcatgtgga ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc

960

tgggtttgac atggactgga aagccgtaga gatacggccc cccttgtggt cggttcacag

1020

gtggtgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1080

gcaacccttg tcctgtgttg ccagcgcgta atggcgggga ctctcaggaa actgccgggg

1140

tcaactcgga ggaaggtggg gacgacgtca agtcatcatg ccccttatgt ccagggcttc

1200

acacatgcta caatggcgcg tacagagggc agcgatatcg caaggtggag cgaatccctt

1260

aaagcgcgtc tcagttcgga ttggggtctg caactcgacc ccatgaagtc ggagtcgcta

1320

gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg

1380

tcaagtcacg aaagtcggta acacccgaag ccggtggccc aaccttttag gagggagccg

1440

tcgaaggtgg gattggcgat tgggactaag tcgaaacaag gtagccgtac cggaaggtgc

1500

ggctggatca cctcctttct

1520

<210> 1692

<211> 1520

<212> DNA

<213> Selenomonas artemidis

<400> 1692

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

gagcgaatga aagcttgctt ttatgagctt agtggcaaac gggtgagtaa cacgtagaca

120

acctgccgat cagatgggga caacattccg aaaggaatgc taataccgaa tggcgtgtag

180

gggaggcatc ttccctacat gaaagatggc ctctatatat aagctatcac tgatcgatgg

240

gtctgcgtct gattagctag taggtaaggt aacggcttac ctaggcgacg atcagtagcc

300

ggtctgagag gatgaacggc cacattggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg

360

cagcagtggg gaatcttccg caatgggcgc aagcctgacg gagcaacgcc gcgtgagtga

420

agaaggtctt cggatcgtaa agctctgttg aaggggacga acgtacataa gttgaataag

480

cttatgtaat gacggtacct tttgaggaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

540

taatacgtag gtggcgagcg ttgtccggaa tcattgggcg taaagggagc gcaggcggcc

600

atgtaagtct tgcttaaaag ttcggggctc aaccccgtga tgggcaagaa actatatggc

660

ttgagtgcag gagaggaaag cggaattccc agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattggg

720

aggaacacca gtggcgaagg cggctttctg gactgcaact gacgctgagg ctcgaaagcc

780

aggggagcga acgggattag ataccccggt agtcctggcc gtaaacgatg gatactaggt

840

gtgggaggta tcgaccccta ccgtgccgga gttaacgcaa taagtatccc gcctggggag

900

tacggtcgca agactgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagtat

960

gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacattga ttgaaaggcg

1020

tagagatacg tccctctctt cggagacaag aaaacaggtg gtgcatggct gtcgtcagct

1080

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctgtcc tttgttgcca

1140

gcatgtagtg gtgggcactc aaaggagact gccgcggaga acgcggagga aggcggggat

1200

gacgtcaagt catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtactacaa tgggacggac

1260

agagagcagc gagagagcga tcttaagcga acctcaaaaa ccgtttctca gttcggattg

1320

caggctgcaa ctcgcctgca tgaagtcgga atcgctagta atcgcaggtc agcatactgc

1380

ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac accacggaag tcgttcacac

1440

ccgaagccgg cgcagccgtc taaggtgggg aaggtgactg gggtgaagtc gtaacaaggt

1500

agccgtatcg gaaggtgcgg

1520

<210> 1693

<211> 1520

<212> DNA

<213> Selenomonas dianae

<400> 1693

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

gagcgaatga aagcttgctt ttatgagctt agtggcaaac gggtgagtaa cacgtagaca

120

acctgccgac aggatgggga caacattccg aaaggaatgc taataccgaa tgaagcggat

180

gggaggcatc tcctatccgt gaaagatggc ctctatttat aagctatcac ctgtcgatgg

240

gtctgcgtct gattagctgg ttggtgaggt aacggctcac caaggcgacg atcagtagcc

300

ggtctgagag gatgaacggc cacattggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg

360

cagcagtggg gaatcttccg caatgggcgc aagcctgacg gagcaacgcc gcgtgagtga

420

agaaggtctt cggatcgtaa agctctgttg acggggacga acgtgcgaga ggtgaataaa

480

ctcttgcaat gacggtacct gtcgaggaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

540

taatacgtag gtggcgagcg ttgtccggaa tcattgggcg taaagggagc gcaggcgggc

600

atataagtct ttcttaaaag ttcggggctc aaccccgtga tgggaaagaa actatgtgtc

660

ttgagtacag gagaggaaag cggaattccc agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattggg

720

aggaacacca gtggcgaagg cggctttctg gactgcaact gacgctgagg ctcgaaagcc

780

aggggagcga acgggattag ataccccggt agtcctggcc gtaaacgatg gatactaggt

840

gtgggaggta tcgaccccta ccgtgccgga gttaacgcaa taagtatccc gcctggggag

900

tacggtcgca agactgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagtat

960

gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggcc ttgacattga ctgaaagcgc

1020

tagagatagc tccctctctt cggagacagg aaaacaggtg gtgcatggct gtcgtcagct

1080

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctgttc tttgttgcca

1140

tcacgttatg gtgggcactc aaaggagact gccgcggaga acgcggagga aggcggggat

1200

gacgtcaagt catcatgccc cttatggtct gggctacaca tgtactacaa tggaacggac

1260

agagagcagc gaacccgcga gggcaagcga acctcaaaaa ccgtttccca gttcggattg

1320

caggctgcaa ctcgcctgca tgaagtcgga atcgctagta atcgcaggtc agcatactgc

1380

ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac accacggaag tcgttcacac

1440

ccgaagccgg cgcagccgtc taaggtgggg aaggtgactg gggtgaagtc gtaacaaggt

1500

agccgtatcg gaaggtgcgg

1520

<210> 1694

<211> 1484

<212> DNA

<213> Selenomonas flueggei

<220>

<221> modified_base

<222> (77)..(77)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (82)..(82)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (89)..(90)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (216)..(216)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (218)..(218)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (574)..(574)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (593)..(593)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (602)..(602)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (657)..(657)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (731)..(731)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (781)..(781)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (821)..(821)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (946)..(946)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (948)..(948)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1019)..(1019)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1148)..(1148)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1158)..(1158)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1305)..(1305)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1694

gagagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cttaacacat gcaagtcgaa

60

cggagcgaat gaaagcntgc anttatgann cttagtggca aacgggtgag taacacgtag

120

acaacctgcc gacaggatgg ggacaacatt ccgaaaggaa tgctaatacc gaatgaagcg

180

gaggagaggc atctctcttc cgtgaaagat ggccantntt tatgctatca cctgttgatg

240

ggtctgcgtc tgattagctg gtaggtgagg taacggctca cctaggcgac gatcagtagc

300

cggtctgaga ggatgaacgg ccacattggg actgagacac ggcctagact cctacgggag

360

gcagcagtgg ggaatcttcc gcaatgggcg caagcctgac ggagcaacgc cgcgtgagtg

420

aagaaggtct tcggatcgta aagctctgtt gttcgggacg aacgtgcgtg atgcgaacag

480

tgtcatgcaa tgacggtacc tgtcgaggaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg

540

gtaatacgta ggtggctagc gttgtccgga atcnttgggc gtaaagggag cgnaggcggg

600

cnagtaagtc tttcttaaaa gtgcggggct caaccccgtg atgggaaaga aactacntgt

660

cttgagtacg ggagaggaaa gcggaattcc cagtgtagcg gtgaaatgcg tagatattgg

720

gaggaacgcc ngtggcgaag gcggctttct ggactgcgac tgacgctgag gctcgaaagc

780

naggggagcg aacgggatta gataccccgg tagtcctggc ngtaaacgat ggatactagg

840

tgtgggaggt atcgacccct accgtgccgg agttaacgca ataagtatcc cgcctgggga

900

gtacggccgc aaggctgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcncnag cggtggagta

960

tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaacaac cttaccaggc cttgacattg actgaaagng

1020

ctagagatag ctccctctct tcggagacag gaaaacaggt ggtgcatggc tgtcgtcagc

1080

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccctgtc ctttgttgcc

1140

atcacgtnaa ggtgggcnct caaaggagac tgccgcggag aacgcggagg aaggcgggga

1200

tgacgtcaag tcatcatgcc ccttatgctc tgggctacac acgtactaca atggaacgga

1260

cagagagcag cgaacccgcg agggcaagcg aacctcaaaa accgnttccc agttcggatt

1320

gcaggctgca acccgcctgc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcaggt cagcatactg

1380

cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccacggaa gtcattcaca

1440

cccgaagccg gctargccgt ctaaggtggg gaaggtgact gggg

1484

<210> 1695

<211> 1296

<212> DNA

<213> Selenomonas genomosp. C1

<400> 1695

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcaaa cgggtgagta

60

acgcgtagac aacctgccgc aaagatgggg acaacagccc gaaagggctg ctaataccga

120

atgttcaaag tcgctttgcg atgggtctgc gcctgattag ctggttggcg gggcaacggc

180

ccgccaaggc gacgatcagt agccggtctg agaggatgga cggccacatt gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatct tccgcaatgg gcgaaagcct

300

gacggagcaa cgccgcgtgg gtgaagaagg tcttcggatc gtaaagccct gttgcccggg

360

acgatgacgg taccgggcga ggaagccacg gccaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtggc gagcgttgtc cggaatcatt gggcgtaaag ggagcgcagg cgggcatgca

480

agtccatctt aaaagcgcgg ggcccaaccc cgtgagggga tggaaactgc gtgccttgag

540

tgcaggagag gaaagcggaa ttcccagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttgggaggaa

600

caccagtggc gaaggcggct ttctggactg actgacgctg aggctcgaaa gccaggggag

660

cgaacgggat tagatacccc ggtagtcctg gccgtaaacg atgaatgcta ggtgtggggg

720

ctcccgtgcc ggagtcaacg caataagcat tccgcctggg gagtacggcc gcaaggctga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag tatgtggttc aattcgacgc

840

aacgcgaaga accttaccag ggcttgacat taacaggtgg tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtc aagtcccgca acgagcgcaa cccctgtccc tcgttgccag

960

cgcgcgggga ctcaagggag actgccgcgg acaacgcgga ggaaggcggg gacgacgtca

1020

agtcatcatg ccccttatgc cctgggctac acacgtacta caatgggatg cagagggcag

1080

cgagcccgcg agggcgagcg aaccccggca tcccccagtt cggatgcagg ctgaaacccg

1140

cctgcagaag ttggaatcgc tagtaatcgc aggtcagcat actgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac ggaagtcatt cacacccgaa gccggcacgc

1260

agcaagccgc ccaaggtggg ggcgatgact ggggtg

1296

<210> 1696

<211> 1319

<212> DNA

<213> Selenomonas genomosp. C2

<400> 1696

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcaaa cgggtgagta

60

acgcgtaggc aacctgccct caggatgggg acaacggctc gaaagagccg ctaataccga

120

atgactaaag tcgcctaagg atgggcctgc gtctgattag ccagttggtg aggtaacggc

180

tcaccaaagc gacgatcagt agccggtctg agaggatgaa cggccacaat gggactgaga

240

cacggcccat actcctacgg gaggcagcag tggggaatct tccgcaatgg gcgaaagcct

300

gacggagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg tcttcggatc gtaaagctct gttgtcgggg

360

acgaagacgg tacctgacga ggaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggcggc aagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag ggagcgcagg tgggacggta

480

agtccgtctt aaaaggcagg ggctcagccc ctgtaaggga tggaaactat cgatcttgag

540

tgccggagag gaaagcggaa ttcccagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttgggaagaa

600

caccagtggc gaaggcggct ttctggacgg actgacactg aggctcgaaa gccaggggag

660

cgaacgggat tagatacccc ggtagtcctg gccgtaaacg atggatacta ggtgtaggag

720

ctcctgtgcc ggagttaacg caataagtat cccgcctggg gggtacggtc gcaagactga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag tatgtggttt aattcgacgc

840

aacgcgaaga accttaccag ggcttgacat taacaggtgg tgtatggctg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatatt ctgttgccaa

960

cagctgggaa ctcaggatag actgccgcgg agaacgcgga ggaaggcggg gatgacgtca

1020

agtcatcatg ccccatatga cctgggctac acacgtacta caatgggatg cagagggcag

1080

cgaaagagcg atctggagcg aaccccagca tctcccagtt cggatgcagg ctgaaacccg

1140

cctgcagaag atggaatcgc tagtaatcgc aggtcagcat actgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac ggaagtcatt cacacccgaa gccggaccgt

1260

cgaaggtggg ggcgatgact ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgc

1319

<210> 1697

<211> 1329

<212> DNA

<213> Selenomonas genomosp. P5

<400> 1697

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcaaa cgggtgagta

60

acacgtaggc aacctgccga caggatgggg acaacattcc gaaaggaatg ctaataccga

120

atgaagaaag tcacctgtcg atgggcctgc gtctgattag ccagttggcg gggtaacggc

180

ccaccaaagc gacgatcagt agccggtctg agaggatgaa cggccacatt gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatct tccacaatgg gcgaaagcct

300

gatggagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg tcttcggatc gtaaagctct gttgtacggg

360

acgatgacgg taccgtacga ggaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtggc gagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag ggagcgcagg cggacatata

480

agtccatctt aaaagtgcgg ggctcaaccc cgtgagggga tggaaactgt atgccttgag

540

tgcaggagag gaaagcggaa ttcccagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttgggaggaa

600

caccagtggc gaaggcggct ttctggactg actgacgctg aggctcgaaa gccaggggag

660

cgaacgggat tagatacccc ggtagtcctg gccgtaaacg atgaatgcta ggtgtaggag

720

ctcctgtgcc ggagttaacg caataagcat tccgcctggg gagtacggtc gcaagactga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag tatgtggttt aattcgacgc

840

aacgcgaaga accttaccag ggcttgacat taacaggtgg tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctgtccc ttgttgccag

960

cacgtgggaa ctcaagggag actgccgtgg agaacgcgga ggaaggcggg gatgacgtca

1020

agtcatcatg ccccttatgt cctgggctac acacgtacta caatgggatg cagagggaag

1080

cgagggcgcg agccggagcg gatcccagca tcccccagtt cggatgcagg ctgcaacccg

1140

cctgcagaag tcggaatcgc tagtaatcgc aggtcagcat actgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac ggaagtcatt cacgcccgaa gccggcggcc

1260

aggcagccgt ctaaggcggg ggcgatgact ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtatc

1320

ggaaggtgc

1329

<210> 1698

<211> 1287

<212> DNA

<213> Selenomonas genomosp. P6 oral clone MB3_C41

<400> 1698

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcaaac gagtggcaaa cgggtgagta

60

acgcgtaggc aacctgccct taggatgggg acaacggccc gaaaggaccg ctaataccga

120

atgactaaag tcgccgaagg aagggcctgc gtctgattag ccagttggtg aggtaacggc

180

tcaccaaagc aacgatcagt agccggtctg agaggatgaa cggccacaat gggactgaga

240

cacggcccat actcctacgg gaggcagcag tggggaatct tccgcaatgg gcgcaagcct

300

gacggagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg tcttcggatc gtaaaactct gttgacgggg

360

acgatgacgg tacctgtcga ggaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtggc gagcgttgtc cggaatcatt gggcgtaaag ggagcgcagg cgggcatgta

480

agtctttctt aaaagttcgg ggctcaaccc cgtgatggga aagaaactac atgtcttgag

540

tacaggagag gaaagcggaa ttcccagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttgggaggaa

600

caccagtggc gaaggcggct ttctggactg actgacgctg aggctcgaaa gccaggggag

660

cgaacgggat tagatacccc ggtagtcctg gccgtaaacg atggatacta ggtgtgggag

720

ctaccgtgtc ggagttaacg caataagtat cccgcctggg gagtacggtc gcaagactga

780

aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggag tatgtggttt aattcggagc

840

aacgcgaaga accttaccag gccttgacat taacaggtgg tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgtcatgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctgttct ttgttgccat

960

cacgtgggca ctcaaaggag actgccgcgg agaacgcgga ggaaggcggg gatgacgtca

1020

agtcatcatg ccccttatgg tctgggctac acacgtacta caatggaacg cagagagcag

1080

cgaacccgcg agggcaagcg aacctcaacg tttcccagtt cggatgcagg ctgcaactcg

1140

cctgcagaag tcggaatcgc tagtaatcgc aggtcagcat actgcggtga atacgttccc

1200

gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccac ggaagtcgtt cacacccgaa gccggcgccg

1260

tctaaggtgg ggaaggtgac tggggtg

1287

<210> 1699

<211> 1460

<212> DNA

<213> Selenomonas genomosp. P7 oral clone MB5_C08

<400> 1699

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gggaaccttt atttcggtaa

60

aggtgagagt ggcaaacggg tgagtaacac gtaggcaacc tgccgacagg atggggacaa

120

cattccgaaa ggaatgctaa taccgaatgg agtccgggga tggcatcatc cctggataaa

180

agatggcctc tgaatatgct atcgcctgtc gatgggcctg cgtctgatta gccagttggc

240

ggggtaacgg cccaccaaag cgacgatcag tagccggtct gagaggatga acggccacat

300

tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaatc ttccacaatg

360

ggcgaaagcc tgacggagca acgccgcgtg agtgaagaag gtcttcggat cgtaaagctc

420

tgttgacggg gacgaacgtg caaagggtga ataatccttt gcaatgacgg tacctgtcga

480

ggaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc gagcgttgtc

540

cggaatcatt gggcgtaaag ggagcgcagg cgggcatgta agtctttctt aaaagttcgg

600

ggctcaaccc cgtgatggga aagaaactat gtgtcttgag tacaggagag gaaagcggaa

660

ttcccagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttgggaggaa caccagtggc gaaggcggct

720

ttctggactg caactgacgc tgaggctcga aagccagggg agcgaacggg attagatacc

780

ccggtagtcc tggccgtaaa cgatggatac taggtgtggg aggtatcgac ccctaccgtg

840

ccggagttaa cgcaataagt atcccgcctg ggaagtacga tcgcaagatt aaaactcaaa

900

ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agtatgtggt ttaattcgac gcaacgcgaa

960

gaaccttacc agggcttgac attgagtgac agacttagag acaagtcatt ctcttcggag

1020

acacgaaaac aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaacccc tgttctttgt tgccatcacg taaaggtggg cactcaaagg

1140

agactgccgc ggagaacgcg gaggaaggcg gggatgacgt caagtcatca tgccccttat

1200

ggtctgggct acacacgtac tacaatggaa cggacagaga gcagcgaacc cgcgagggca

1260

agcgaacctc aaaaaccgtt tcccagttcg gattgcaggc tgcaactcgc ctgcatgaag

1320

tcggaatcgc tagtaatcgc aggtcagcat actgcggtga atacgttccc gggtcttgta

1380

cacaccgccc gtcacaccac ggaagtcgtt cacacccgaa gccggcggag ccgtctaagg

1440

tggggaaggt gactggggtg

1460

<210> 1700

<211> 1296

<212> DNA

<213> Selenomonas genomosp. P8 oral clone MB5_P06

<400> 1700

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcaaa cgggtgagta

60

acgcgtagac aacctgccgc aaagatgggg acaacagttc gaaaggactg ctaataccga

120

atgttcaaag tcgctttgcg atgggtctgc gtctgattag ctagttggca gggcaacggc

180

ctaccaaggc gacgatcagt agccggtctg agaggatgaa cggccacatt gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatct tccgcaatgg gcgaaagcct

300

gacggagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg tcttcggatc gtaaagctct gttgccgggg

360

acgatgacgg tacccggcga ggaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtggc gagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag ggagcgcagg cgggcgagta

480

agtctttctt aaaagtgcgg ggctcaaccc cgtgagggga gagaaactac tcatcttgag

540

tgcaggagag gaaagcggaa ttcctagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttaggaagaa

600

caccagtggc gaaggcggct ttctggactg actgacgctg aggctcgaaa gccaggggag

660

cgaacgggat tagatacccc ggtagtcctg gccgtaaacg atgaatgcta ggtgtagggg

720

ctcctgtgcc ggagttaacg caataagcat tccgcctggg gagtacggtc gcaagactga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag tatgtggttt aattcgacgc

840

aacgcgaaga accttaccag ggcttgacat taacaggtgg tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctattct ctgttgccag

960

cacgtgggaa ctcagaggag actgccgcgg acaacgcgga ggaaggcggg gatgacgtca

1020

agtcatcatg ccccttatgt cctgggctac acacgtacta caatgggatg cggagagcag

1080

cgaagccgcg aggccaagcg aaccccaaca tttcccagtt cggatgcagg ctgcaactcg

1140

cctgcagaag atggaatcgc tagtaatcgc aggtcagcat actgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac ggaagtcgtt cacacccgaa gccggtgggc

1260

agctagctgt ctaaggcggg ggcgatgact ggggtg

1296

<210> 1701

<211> 1519

<212> DNA

<213> Selenomonas infelix

<400> 1701

ggagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcttaacaca tgcaagtcga

60

acggagcgaa tgaaagcttg cttttatgag cttagtggca aacgggtgag taacacgtag

120

acaacctgcc gacaggatgg ggacaacatt ccgaaaggaa tgctaatacc gaatgaagcg

180

gaggagaggc atctctcctc cgtgaaagat ggcctctgta tatgctatca cctgtcgatg

240

ggtctgcgtc tgattagcta gttggtgagg taacggctca ccaaggcgac gatcagtagc

300

cggtctgaga ggatgaacgg ccacattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag

360

gcagcagtgg ggaatcttcc gcaatgggcg caagcctgac ggagcaacgc cgcgtgagtg

420

aagaaggtct tcggatcgta aagctctgtt gatggggacg aacgtgcgaa gggtgaataa

480

tcctttgcaa tgacggtacc tatcgaggaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg

540

gtaatacgta ggtggcgagc gttgtccgga atcattgggc gtaaagggag cgcaggcggg

600

catgtaagtc tttcttaaaa gttcggggct caaccccgtg atgggaaaga aactacatgt

660

cttgagtaca ggagaggaaa gcggaattcc cagtgtagcg gtgaaatgcg tagatattgg

720

gaggaacacc agtggcgaag gcggctttct ggactgcaac tgacgctgag gctcgaaagc

780

caggggagcg aacgggatta gataccccgg tagtcctggc cgtaaacgat ggatactagg

840

tgtgggaggt atcgacccct accgtgccgg agttaacgca ataagtatcc cgcctgggga

900

gtacggtcgc aagactgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggagta

960

tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggc cttgacattg actgtaagag

1020

ctagagatag ctccctctct tcggagacag gaaaacaggt ggtgcatggc tgtcgtcagc

1080

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccctgtt ctttgttgcc

1140

atcacgtaaa ggtgggcact caaaggagac tgccgcggag aacgcggagg aaggcgggga

1200

tgacgtcaag tcatcatgcc ccttatggtc tgggctacac acgtactaca atggaacgga

1260

cagagagcag cgaacccgcg agggcaagcg aacctcaaaa accgtttccc agttcggatt

1320

gcaggctgca actcgcctgc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcaggt cagcatactg

1380

cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccacggaa gtcgttcaca

1440

cccgaagccg gcgcagccgt ctaaggtggg gaaggtgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1500

tagccgtatc ggaaggtgc

1519

<210> 1702

<211> 1520

<212> DNA

<213> Selenomonas noxia

<400> 1702

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

gagcgaatga aagcttgctt ttataagctt agtggcaaac gggtgagtaa cacgtaggca

120

acctgccgac aggatgggga caacattccg aaaggaatgc taataccgaa tgaagtcaga

180

gaagggcatc cttttctgat gaaagatggc ctctatatat aagctatcac ctgtcgatgg

240

gcctgcgtct gattagctgg taggtgaggt aacggctcac ctaggcgacg atcagtagcc

300

ggtctgagag gatgaacggc cacattggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg

360

cagcagtggg gaatcttccg caatgggcgc aagcctgacg gagcaacgcc gcgtgagtga

420

agaaggtctt cggatcgtaa agctctgttg atggggacga acgtgcctaa tgcgaatagt

480

tttaggtaat gacggtaccc atcgaggaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

540

taatacgtag gtggctagcg ttgtccggaa tcattgggcg taaagggagc gcaggcgggc

600

atgtaagtct ttcttaaaag tgcggggctc aaccccgtga tgggaaagaa actatgtgtc

660

ttgagtacag gagaggaaag cggaattccc agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattggg

720

aggaacacca gtggcgaagg cggctttctg gactgcaact gacgctgagg ctcgaaagcc

780

aggggagcga acgggattag ataccccggt agtcctggcc gtaaacgatg gatactaggt

840

gtgggaggta tcgaccccta ccgtgccgga gttaacgcaa taagtatccc gcctggggag

900

tacggccgca aggctgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagtat

960

gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggcc ttgacattga ctgaaagagc

1020

tagagatagc tccctctctt cggagacagg aaaacaggtg gtgcatggct gtcgtcagct

1080

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctgttc tttgttgcca

1140

gcatgtaagg atgggcactc aaaggagact gccgcggaga acgcggagga aggcggggat

1200

gacgtcaagt catcatgccc cttatggtct gggctacaca cgtactacaa tgggacggac

1260

agagggcagc gagagagtga tcttaagcga atctcaaaaa ccgtttctca gttcggattg

1320

caggctgcaa ctcgcctgca tgaagtcgga atcgctagta atcgcaggtc agcatactgc

1380

ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac accacggaag tcattcacac

1440

ccgaagccgg ctaggccgtc taaggtgggg aaggtgactg gggtgaagtc gtaacaaggt

1500

agccgtatcg gaaggtgcgg

1520

<210> 1703

<211> 1565

<212> DNA

<213> Selenomonas ruminantium

<400> 1703

attttatgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg agacgattga aagcttgctt ttgagagtcg agtggcaaac gggtgagtaa

120

cgcgtagaca acctgccgca aagatgggga caacagtccg aaaggactgc taataccgaa

180

tgttgtcaga ttcccgcatg ggagactgat taaagatggc ctctacttgt aagctatcgc

240

tttgcgatgg gtctgcgtct gattagctag ttggtggggt aacggcctac caaggcgacg

300

atcagtagcc ggtctgagag gatgaacggc cacattggaa ctgagacacg gtccagactc

360

ctacgggagg cagcagtggg gaatcttccg caatgggcga aagcctgacg gagcaacgcc

420

gcgtgagtga agaagggttt cggctcgtaa agctctgttg acggggacga atgtgcgaaa

480

tgcgaatagt ttttcgcaat gacggtaccc gtcgaggaag ccacggctaa ctacgtgcca

540

gcagccgcgg taatacgtag gtggcgagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagggagc

600

gcaggcggga aggcaagtca gtcttaaaag tgcggggctc aaccccgtga tgggattgaa

660

actgtctttc ttgagtgcag gagaggaaag cggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt

720

agatattagg aggaacacca gtggcgaagg cggctttctg gactgtaact gacgctgagg

780

ctcgaaagcg tggggagcga acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg

840

aatgctaggt gtaggaggta tcgacccctt ctgtgccgga gttaacgcaa taagcattcc

900

gcctggggag tacggtcgca agactgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc

960

ggtggagtat gtggtttaat tcgacgcaac gcgaagaacc ttaccagggc ttgacattga

1020

gtgaaagatc tagagataga tccctctctt cggagacacg aaaacaggtg gtgcatggct

1080

gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctatca

1140

tttgttgcca gcacgttatg gtgggaactc aaatgagact gccgcggaca acgcggagga

1200

aggcggggat gacgtcaagt catcatgccc cttatgtcct gggctacaca cgtactacaa

1260

tgggatggac agagagcagc gaacccgcga gggcaagcga accccataaa ccatctccca

1320

gttcggattg caggctgcaa cccgcctgca tgaagtcgga atcgctagta atcgctggtc

1380

agcatacagc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacggaag

1440

tcattcacac ccgaagccgg tgggcaaacc gcaaggatgc agccgtctaa ggtgggggcg

1500

atgactgggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc

1560

tttct

1565

<210> 1704

<211> 1270

<212> DNA

<213> Selenomonas sp. FOBRC9

<220>

<221> modified_base

<222> (1084)..(1084)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1175)..(1175)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1704

ccctatatga aagatggcct ctatatataa gctatcactg atcgatgggt ctgcgtctga

60

ttagctagta ggtaaggtaa cggcttacct aggcgacgat cagtagccgg tctgagagga

120

tgaacggcca cattgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga

180

atcttccgca atgggcgcaa gcctgacgga gcaacgccgc gtgagtgaag aaggtcttcg

240

gatcgtaaag ctctgttgaa ggggacgaac gatcgagggg cgaacaggct ctcggtatga

300

cggtaccttt tgaggaagcc acggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt

360

ggcgagcgtt gtccggaatc attgggcgta aagggagcgc aggcggccat gtaagtcttg

420

cttaaaagtt cggggctcaa ccccgtgatg ggcaagaaac tatatggctt gagtgcagga

480

gaggaaagcg gaattcccag tgtagcggtg aaatgcgtag atattgggag gaacaccagt

540

ggcgaaggcg gctttctgga ctgcaactga cgctgaggct cgaaagccag gggagcgaac

600

gggattagat accccggtag tcctggccgt aaacgatgga tactaggtgt gggaggtatc

660

gacccctacc gtgccggagt taacgcaata agtatcccgc ctggggagta cggtcgcaag

720

actgaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggagtatgt ggtttaattc

780

gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacattgatt gacagggata gagatatcct

840

attctctttg gagacaagaa aacaggtggt gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

900

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctgtcctt tgttgccagc atgtagtggt

960

gggcactcaa aggagactgc cgcggagaac gcggaggaag gcggggatga cgtcaagtca

1020

tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tactacaatg ggacggacag agagcagcga

1080

gagngcgacc ttaagcgaac ctcaaaaacc gtttctcagt tcggattgca ggctgcaact

1140

cgcctgcatg aagtcggaat cgctagtaat cgcangtcag catactgcgg tgaatacgtt

1200

cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac cacggaagtc gttcacaccc gaagccggcg

1260

cagccgtcta

1270

<210> 1705

<211> 1356

<212> DNA

<213> Selenomonas sp. oral clone FT050

<400> 1705

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcaaac gggtgagtaa cacgtagaca acctgccgac aggatgggga caacattccg

120

aaaggaatgc taataccgaa tgaagaaagt cacctgttga tgggtctgcg tctgattagc

180

tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatcagta gccggtctga gaggatgaac

240

ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatctt

300

ccgcaatggg cgcaagcctg acggagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt cttcggatcg

360

taaagctctg ttgacgggga cgatgacggt acctgtcgag gaagccacgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggcg agcgttgtcc ggaatcattg ggcgtaaagg

480

gagcgcaggc gggccggtaa gtcttactta aaagtgcggg gctcaacccc gtgatgggag

540

agaaactatc ggtcttgagt acaggagagg aaagcggaat tcccagtgta gcggtgaaat

600

gcgtagatat tgggaagaac accagtggcg aaggtggctt tctggactga ctgacgctga

660

ggctcgaaag ccaggggagc gaacgggatt agataccccg gtagtcctgg ccgtaaacga

720

tggatactag gtgtgggagc taccgtgccg gagttaacgc aataagtatc ccgcctgggg

780

agtacggccg caaggctgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggagt

840

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg ccttgacatt aacaggtggt

900

gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccctgttctt tgttgccatc agctgggcac tcaaaggaga ctgccgcgga gaacgcggag

1020

gaaggcgggg atgacgtcaa gtcatcatgc cccttatggc ctgggctaca cacgtactac

1080

aatggaacgc agagagcagc gaacccgcga gggcaagcga acctcaacgt ttcccagttc

1140

ggatgcaggc tgcaacccgc ctgcagaagt cggaatcgct agtaatcgca ggtcagcata

1200

ctgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg gaagtcattc

1260

acacccgaag ccggcgccgt ctaaggtggg gaaggtgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1320

tagccgtatc ggaaggtgcg gctggaacac ctcctt

1356

<210> 1706

<211> 1356

<212> DNA

<213> Selenomonas sp. oral clone GI064

<400> 1706

gagtttgatt ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcaaac gggtgagtaa cacgtagaca acctgccgac aggatgggga caacattccg

120

aaaggaatgc taataccgaa tgaagaaagt cacctgttga tgggtctgcg tctgattagc

180

tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatcagta gccggtctga gaggatgaac

240

ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatctt

300

ccgcaatggg cgcaagcctg acggagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt cttcggatcg

360

taaagctctg ttgacgggga cgatgacggt acctgtcgag gaagccacgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggcg agcgttgtcc ggaatcattg ggcgtaaagg

480

gagcgcaggc gggccggtaa gtcttactta aaagtgcggg gctcaacccc gtgatgggag

540

agaaactatc ggtcttgagt acaggagagg aaagcggaat tcccagtgta gcggtgaaat

600

gcgtagatat tgggaagaac accagtggcg aaggcggctt tctggactga ctgacgctga

660

ggctcgaaag ccaggggagc gaacgggatt agataccccg gtagtcctgg ccgtaaacga

720

tggatactag gtgtgggagc taccgtgccg gagttaacgc aataagtatc ccgcctgggg

780

agtacggccg caaggctgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggagt

840

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg ccttgacatt aacaggtggt

900

gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccctgttctt tgttgccatc agctgggcac tcaaaggaga ctgccgcgga gaacgcggag

1020

gaaggcgggg atgacgtcaa gtcatcatgc cccttatggc ctgggctaca cacgtactac

1080

aatggaacgc agagagcagc gaacccgcga gggcaagcga acctcaacgt ttcccagttc

1140

gggtgcaggc tgcaacccgc ctgcagaagt cggaatcgct agtaatcgca ggtcagcata

1200

ctgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg gaagtcattc

1260

acacccgaag ccggcgccgt ctaaggtggg gaaggtgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1320

tagccgtatc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctt

1356

<210> 1707

<211> 1356

<212> DNA

<213> Selenomonas sp. oral clone GT010

<400> 1707

gagtttgatt ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcaaac gggtgagtaa cacgtaggca acctgccgac aggatgggga caacattccg

120

aaaggaatgc taataccgaa tgaagaaagt cacctgtcga tgggcctgcg tctgattagc

180

tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatcagta gccggtctga gaggatgaac

240

ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatctt

300

ccgcaatggg cgcaagcctg acggagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt cttcggatcg

360

taaagctctg ttgatgggga cgatgacggt acctatcgag gaagccacgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggcg agcgttgtcc ggaatcattg ggcgtaaagg

480

gagcgcaggc gggcatgtaa gtctttctta aaagttcggg gctcaacccc gtgatgggaa

540

agaaactaca tgtcttgagt acaggagagg aaagcggaat tcccagtgta gcggtgaaat

600

gcgtagatat tgggaggaac accagtggcg aaggcggctt tctggactga ctgacgctga

660

ggctcgaaag ccaggggagc gaacgggatt agataccccg gtagtcctgg ccgtaaacga

720

tggatactag gtgtgggagc taccgtgccg gagttaacgc aataagtatc ccgcctgggg

780

agtacggtcg caagactgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggagt

840

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg ccttgacatt aacaggtggt

900

gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccctgttctt tgttgccatc acgtgggcac tcaaaggaga ctgccgcgga gaacgcggag

1020

gaaggcgggg atgacgtcaa gtcatcatgc cccttatggt ctgggctaca cacgtactac

1080

aatggaacgc agagagcagc gaacccgcga gggcaagcga acctcaacgt ttcccagttc

1140

ggatgcaggc tgcaactcgc ctgcagaagt cggaatcgct agtaatcgca ggtcagcata

1200

ctgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg gaagtcgttc

1260

acacccgaag ccggcgccgt ctaaggtggg gaaggcgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1320

tagccgtatc ggaaggtgcg gctggaacac ctcctt

1356

<210> 1708

<211> 1536

<212> DNA

<213> Selenomonas sp. oral clone HU051

<400> 1708

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

gagctattta tttcggtaga tagcttagtg gcaaacgggt gagtaacacg tagacaacct

120

gccgatcaga tggggacaac attccgaaag gaatgctaat accgaatgag gtgtagggga

180

ggcatctccc ctacatgaaa gatggcctct atatataagc tatcactgat cgatgggtct

240

gcgtctgatt agctagtagg taaggtaacg gcttacctag gcgacgatca gtagccggtc

300

tgagaggatg aacggccaca ttgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

360

agtggggaat cttccgcaat gggcgcaagc ctgacggagc aacgccgcgt gagtgaagaa

420

ggtcttcgga tcgtaaagct ctgttgaagg ggacgaacgt gcataggatg aataagcctg

480

tgtaatgacg gtaccttttg aggaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

540

acgtatgtgg cgagcgttgt ccggaatcat tgggcgtaaa gggagcgcag gcggtcatgt

600

aagtcttact taaaagttcg gggctcaacc ccgtgatggg taagaaacta tatgacttga

660

gtacaggaga ggaaagcgga attcccagtg tagcggtgaa atgcgtatga tattgggagg

720

aacaccagtg gcgaaggcgg ctttctggac tgcaactgac actgaggctc gaaagccagg

780

ggagcgaacg ggattagata ccccggtagt cctggccgta cacgatggat actaggtgta

840

ggaggtatcg acccctcctg tgccggagtt aacgcaataa gtatcccgcc tggggagtac

900

ggtcgcaaga ctgaaactca gaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagtatgtg

960

gtttaattcg acgcaacgcg aagaacctta ccagggcttg acattgagtg aaagggcaag

1020

agattgtccc cttatcttcg gataacacga aaacaggtgg tgcatggctg tcgtcagctc

1080

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatatt ctgttgccaa

1140

caggtaaagc tgggaactca ggatagactg ccgcggagaa cgcggaggaa ggcggggatg

1200

acgtcaagtc atcatgcccc atatgacctg ggctacacac gtactacaat gggatgtaca

1260

gagggcagcg aaagagcgat ctggagcgaa ccccagaaaa catctcccag ttcggattgc

1320

aggctgaaac ccgcctgcat gaagatggaa tcgctagtaa tcgcaggtca gcatactgcg

1380

gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc agcccgtcac accacggaag tcattcacac

1440

ccgaagccgg tgaaagccgt cgaaggtggg ggcgatgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1500

tagccgtatc ggaaggtgcg gctggaacac ctcctt

1536

<210> 1709

<211> 1356

<212> DNA

<213> Selenomonas sp. oral clone IK004

<400> 1709

gagtttgatt ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcaaac gggtgagtaa cacgtagaca acctgccgac aggatgggga caacattccg

120

aaaggaatgc taataccgaa tgaagaaagt cacctgccga tgggtctgcg tctgattagc

180

tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatcagta gccggtctga gaggatgaac

240

ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatctt

300

ccgcaatggg cgcaagcctg acggagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt cttcggatcg

360

taaagctctg ttgatgggga cgatgacggt acctatcgag gaagccacgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggcg agcgttgtcc ggaatcattg ggcgtaaagg

480

gagcgcaggc gggcatgtaa gtctttctta aaagttcggg gctcaacccc gtgatgggaa

540

agaaactaca tgtcttgagt acaggagagg aaagcggaat tcccagtgta gcggtgaaat

600

gcgtagatat tgggaggaac accagtggcg aaggcggctt tctggactga ctgacgctga

660

ggctcgaaag ccaggggagc gaacgggatt agataccccg gtagtcctgg ccgtaaacga

720

tggatactag gtgtgggagc taccgtgccg gagttaacgc aataagtatc ccgcctgggg

780

agtacggtcg caagactgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggagt

840

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg ccttgacatt aacaggtggt

900

gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccctgttctt tgttgccatc agctgggcac tcaaaggaga ctgccgcgga gaacgcggag

1020

gaaggcgggg atgacgtcaa gtcatcatgc cccttatggt ctgggctaca cacgtactac

1080

aatggaacgc agagagcagc gaacccgcga gggcaagcga acctcaacgt ttcccagttc

1140

ggatgcaggc tgcaactcgc ctgcagaagt cggaatcgct agtaatcgca ggtcagcata

1200

ctgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg gaagtcgttc

1260

acacccgaag ccggcgccgt ctaaggtggg gaaggtgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1320

tagccgtatc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctt

1356

<210> 1710

<211> 1362

<212> DNA

<213> Selenomonas sp. oral clone IQ048

<400> 1710

agtttgattc tggctcagga cgaacgcggg cggcgtgctt aacacatgca agtcgaacga

60

gtggcaaacg ggtgagtaac acgtaggcaa cctgccgaca ggatggggac aacattccga

120

aaggaatgct aataccgaat gaagaaagtc acctgtcgat gggcctgcgt ctgattagcc

180

agttggcggg gtaacggccc accaaagcga cgatcagtag ccggtctgag aggatgaacg

240

gccacattgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatcttc

300

cacaatgggc gaaagcctga tggagcaacg ccgcgtgagt gaagaaggtc ttcggatcgt

360

aaagctctgt tgcacgggac gaggacggac cgagcgagga atccacggct aactacgtgc

420

cagcggccgc ggtaatacgt acgtggcgag cgttgtccgg aattattggg cgtaaaggga

480

gcgcaggggg acatataagt ccatcttaaa agtgcggtgc tcaaccccgt gaggggatgg

540

aaactgtatg ccttgagtgc aagataggaa agcggaattc ccagtgtagc ggtgaaatgc

600

gtaatattgg gaggaacacc agtggccaat gcggctttct ggactgactg acgctgaggc

660

tcgaaagcca ggggagcgaa cgggattaga taccccggta gtcctggccg taaacgatga

720

atgctaggtg taggagctcc tgtgccggag ttaacgcaat aagcattccg cctggggagt

780

acggtcgcaa gactgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagtatg

840

tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggcct tgacattaac aggtggtgca

900

tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc

960

tgttctttgt tgccagcata tgggcactca aaggagactg ccgcggagaa cgcggaggaa

1020

ggcggggatg acgtcaagtc atcatgcccc ttatggtctg ggctacacac gtactacaat

1080

gggacgcaga gggcagcgag agagtgatct taagcgaatc tcaacgtttc tcagttcgga

1140

tgcaggctgc aactcgcctg cagaagtcgg aatcgctagt aatcgcaggt cagcatactg

1200

cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccatca caccacggaa gtcattcaca

1260

cccgaagccg gcacgcagca agccgcccaa ggtgggggcg atgactgggg tgaagtcgta

1320

acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc tt

1362

<210> 1711

<211> 1366

<212> DNA

<213> Selenomonas sp. oral clone JI021

<400> 1711

ggagtttgat tctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gagtggcaaa cgggtgagta acacgtaggc aacctgccga caggatgggg acaacattcc

120

gaaagggatg ctaataccga atggagaaag tcgcctgtcg atgggcctgc gtctgattag

180

ctagttggtg aggtaaaggc tcaccaaggc gacgatcagt agccggtctg agaggatgaa

240

cggccacatt gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatct

300

tccgcaatgg gcgaaagcct gacggagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg tcttcggatc

360

gtaaagctct gttgtcgagg acgatgacgg tacttgacga ggaagtcacg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttgtc cggaatcatt gggcgtaaag

480

ggagcgcagg tgggaactta ggtctttctt aaaagtgcgg ggctcaaccc cgtgatggga

540

gagaaaccga gattcttgag tgcaggagag gaaagcggaa ttcccggtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata tcgggaggaa caccagtggc gaaggcggct ttctggactg actgacactg

660

aggctcgaaa gccagggtag cgaacgggat tagatacccc ggtagtcctg gccgtaaacg

720

atgaatgcta ggtgtaggag cttctgtgcc ggagttaacg caataagcat tccgcctggg

780

gagtacggcc gcaaggctga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

tatgtggttt aattcgacgc aacgcgaaga accttaccag ggcttgacat taacaggtgg

900

tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctgtcct ttgttgccag cgcgcgggaa ctcaaaggag actgccgcgg agaacgcgga

1020

ggaaggcggg gatgacgtca agtcatcatg ccccttatgt cctgggctac acacgtacta

1080

caatgggatg cagagagcag cgaatgggcg accatgagcg aaccccttca tctctcagtt

1140

cggatgcagg ctgaaacccg cctgcagaag tcggaatcgc tagtaatcgc aggtcagcat

1200

actgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac gaaagtcatt

1260

cacacccgaa gtcggtgagg acctagccgc ctaaggtggg ggcgatgatt ggggtgaagt

1320

cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctt

1366

<210> 1712

<211> 1356

<212> DNA

<213> Selenomonas sp. oral clone JS031

<400> 1712

ggagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gagtggcaaa cgggtgagta acgcgtaggc aacctgccct caggatgggg acaacggctc

120

gaaagagccg ctaataccga atgactaaag tcgcccgagg atgggcctgc gtctgattag

180

ccagttggtg aggtaacggc tcaccaaagc aacgatcagt agccggtctg agaggatgaa

240

cggccacaat gggactgaga cacggcccat actcctacgg gaggcagcag tggggaatct

300

tccgcaatgg gcgaaagcct gacggagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg tcttcggatc

360

gtaaagctct gttgtcgggg acgaagacgg tacccgacga ggaagccacg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggcggc aagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag

480

ggagcgcagg tgggacggta agtctgtctt aaaaggcaag ggctcagccc ctgtaaggga

540

cagaaactat cgttcttgag tgccggagag gaaagcggaa ttcccagtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata ttgggaagaa caccagtggc gaaggcggct ttctggacgg actgacactg

660

aggctcgaaa gccagggtag cgaacgggat tagatacccc ggtagtcctg gccgtaaacg

720

atggatacta ggtgtagggg ctcctgtgcc ggagttaacg caataggtat cccgcctggg

780

gagtacggtc gcaagactga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

tatgtggttt aattcgacgc aacgcgaaga accttaccag ggcttgacat taacaggtgg

900

tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctatatt ctgttgccaa cagctgggaa ctcaggatag actgccgcgg agaacgcgga

1020

ggaaggcggg gatgacgtca agtcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtacta

1080

caatgggatg cagagggcag cgaaggagcg atctggagcg aaccccagca tctctcagtt

1140

cggatgcagg ctgaaacccg cctgcagaag gtggaatcgc tagtaatcgc aggtcagcat

1200

actgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac ggaagtcatt

1260

cacacccgaa gccggaccgt cgaaggtggg ggcgatgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1320

tagccgtatc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctt

1356

<210> 1713

<211> 1414

<212> DNA

<213> Selenomonas sp. oral clone OH4A

<400> 1713

tacggagcga tgaagcttgc ttttataagc ttatggcaac gggtgagtaa caggtggaca

60

acctgccgac aggatgggga caacattccg aaaggaatgc taataccgaa tgaacagagg

120

agaggcatct ctcctctgtg aaagatggcc tctttttatg ctatcacctg ttgatggggc

180

tgctctgatt agctggtagg tggagtaacg gctcacctag gggagaatca gtagccggtc

240

tgagaggatg aacggccaca ttgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

300

agtggggaat cttccgcaat gggcgcaagc ctgacggagc aacgccgcgt gagtgaagaa

360

ggtcttcgga tcgtaaagct ctgttgatgg ggcgaaacgt gcctaatgcg aatagtttta

420

ggtaatgacg gtacccatcg aggaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtaggtgg cgagcgttgt ccggaatcat tgggcgtaaa gggagcgcag gcgggcatgt

540

aagtctttct taaaagtgcg gggctcaacc ccgtgatggg aaagaaacta tgtgtcttga

600

gtacaggaga ggaaagcgga attcccagtg tagcggtgaa atgcgtagat attgggagga

660

acaccagtgg cgaaggcggc tttctggact gcaactgacg ctgaggctcg aaagccaggg

720

gagcgaacgg gattagatac cccggtagtc ctggccgtaa acgatggata ctaggtgtgg

780

gaggtatcga cccctaccgt gccggagtta acgcaataag tatcccgcct ggggagtacg

840

gccgcaaggc tgaaactcaa aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gagtatgtgg

900

tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggccttga cattgactga aagagttaga

960

gataactccc tctcttcgga gacaggaaaa caggtggtgc atggctgtcg tcagctcgtg

1020

tcgtgagatg ttgggttaag tcccacaacg agcgcaaccc ctgttctttg ttgccagcaa

1080

gtgaagttgg gcactcaaag gagactgccg cggagaacgc ggaggaaggc ggggatgacg

1140

tcaagtcatc atgcccctta tggtctgggc tacacacgta ctacaatggg acggacagag

1200

ggcagcgaga gagtgatatt aagcgaatct caaaaaccgt ttttcagttc ggattgcagg

1260

ctgcaactcg cctgcatgaa gtcggaatcg ttagtaatcg caggtcagca tactgcggtg

1320

aatacgttcc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca cggaagtcat tcacacccga

1380

agccggcaaa gccgtctaag gtggggaagg tgac

1414

<210> 1714

<211> 1319

<212> DNA

<213> Selenomonas sp. oral clone P2PA_80 P4

<400> 1714

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcaaa cgggtgagta

60

acgcgtaggc aacctgccct taggatgggg acaacggccc gaaaggaccg ctaataccga

120

atgcagaaag tcgccgaagg aagggcctgc gcctgattag ccagttggtg aggtaacggc

180

tcaccaaagc gacgatcagt agccggtctg agaggatgaa cggccacaat gggactgaga

240

cacggcccat actcctacgg gaggcagcag tggggaatct tccgcaatgg gcgaaagcct

300

gacggagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg tcttcggatc gtaaagctct gttgttgggg

360

acgaagacgg tacccgacga gcaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtggc gagcgttgtc cgggatgatt gggcgtaaag ggagcgcagg tgggacggta

480

agtccttctt aaaagcgtgg ggctcagccc catgaaggga aggaaactat cgatcttgag

540

tgccagagag gaaagcggaa ttcccagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttgggaagaa

600

caccagtggc gaaggcggct ttctggacgg actgacgctg aggctcgaaa gccaggggag

660

cgaacgggat tagatacccc gctagtcctg gccgtaaacg atggatacta ggtgtaggag

720

cttctgtgcc ggagttaacg caataagtat cccgcctggg gagtacggtc gcaagattga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag tatgtggttt aattcgacgc

840

aacgcgaaga accttaccag ggcttgacat taacaggtgg tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatgtt ctgttgccag

960

cgcgcgggca ctcagaagag actgccgcgg agaacgcgga ggaaggcggg ggtgacgtca

1020

agtcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtacta caatgggatg cagagggcag

1080

cgaacgggcg accggaagcg aaccccagca tctcccagtt cggatgcagg ctgaaacccg

1140

cctgcagaag atggaatcgc tagtaatcgc aggtcagcat actgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac ggaagtcatt cacacccgaa gccggaccgt

1260

cgaaggtggg ggcgatgact ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgc

1319

<210> 1715

<211> 1541

<212> DNA

<213> Selenomonas sp. oral taxon 137

<400> 1715

ggagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcttaacaca tgcaagtcga

60

acggagcgaa tgaaagcttg cttttatgag cttagtggca aacgggtgag taacacgtag

120

acaacctgcc gatcagatgg ggacaacatt ccgaaaggaa tgctaatacc gaatggcgtg

180

tggggaggca tcttccctac atgaaagatg gcctctattt ataagctatc actgatcgat

240

gggtctgcgt ctgattagct agtaggtaag gtaacggctt acctaggcga cgatcagtag

300

ccggtctgag aggatgaacg gccacattgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga

360

ggcagcagtg gggaatcttc cgcaatgggc gcaagcctga cggagcaacg ccgcgtgagt

420

gaagaaggtc ttcggatcgt aaagctctgt tgaagggggc gaacgtacgc agtgcgaata

480

gtgctgagta atgacggtac cttttgagga agccacggct aactacgtgc cagcagccgc

540

ggtaatacgt aggtggcgag cgttgtccgg aatcattggg cgtaaaggga gcgcaggcgg

600

ccatgtaagt cttgcttaaa agttcggggc tcaaccccgt gatgggcaag aaactatatg

660

gcttgagtgc aggagaggaa agcggaattc ccagtgtagc ggtgaaatgc gtagatattg

720

ggaggaacac cagtggcgaa ggcggctttc tggactgcaa ctgacgctga ggctcgaaag

780

ccaggggagc gaacgggatt agataccccg gtagtcctgg ccgtaaacga tggatactag

840

gtgtgggagg tatcgacccc taccgtgccg gagttaacgc aataagtatc ccgcctgggg

900

agtacggtcg caagactgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggagt

960

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatt gattgacagg

1020

gatagagata tcctattctc tttggagaca agaaaacagg tggtgcatgg ctgtcgtcag

1080

ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctgt cctttgttgc

1140

cagcatgtag tggtgggcac tcaaaggaga ctgccgcgga gaacgcggag gaaggcgggg

1200

atgacgtcaa gtcatcatgc cccttatgac ctgggctaca cacgtactac aatgggacgg

1260

acagagagca gcgagagggc gaccttaagc gaacctcaaa aaaccgtttc tcagttcgga

1320

ttgcaggctg caactcgcct gcatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcag gtcagcatac

1380

tgcggtgaat acgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccacgg aagtcgttca

1440

cacccgaagc cggcgcagcc gtctaaggtg gggaaggtga ctggggtgaa gtcgtaacaa

1500

ggtagccgta tcggaaggtg cggctggatc acctcctttc t

1541

<210> 1716

<211> 1265

<212> DNA

<213> Selenomonas sp. oral taxon 149

<400> 1716

ggctcaccaa ggcgacgatc agtagccggt ctgagaggat gaacggccac attgggactg

60

agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tcttccgcaa tgggcgcaag

120

cctgacggag caacgccgcg tgagtgaaga aggtcttcgg atcgtaaagc tctgttgacg

180

gggacgaacg tgcggagtgc gaatagcgct ttgtaatgac ggtacctgtc gaggaagcca

240

cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg gcgagcgttg tccggaatca

300

ttgggcgtaa agggagcgca ggcgggccgg taagtcttac ttaaaagtgc ggggctcaac

360

cccgtgatgg gagagaaact atcggtcttg agtacaggag aggaaagcgg aattcccagt

420

gtagcggtga aatgcgtaga tattgggaag aacaccagtg gcgaaggcgg ctttctggac

480

tgcaactgac gctgaggctc gaaagccagg ggagcgaacg ggattagata ccccggtagt

540

cctggccgta aacgatggat actaggtgtg ggaggtatcg acccctaccg tgccggagtt

600

aacgcaataa gtatcccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctgaaactca aaggaattga

660

cggggacccg cacaagcggt ggagtatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta

720

ccaggccttg acattgactg aaagagctag agatagcacc ctctcttcgg agacaggaaa

780

acaggtggtg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

840

gagcgcaacc cctgttcttt gttgccatca ggtaaagctg ggcactcaaa ggagactgcc

900

gcggagaacg cggaggaagg cggggatgac gtcaagtcat catgcccctt atggcctggg

960

ctacacacgt actacaatgg aacggacaga gagcagcgaa cccgcgaggg caagcgaacc

1020

tcaaaaaccg tttcccagtt cggattgcag gctgcaaccc gcctgcatga agtcggaatc

1080

gctagtaatc gcaggtcagc atactgcggt gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc

1140

ccgtcacacc acggaagtca ttcacacccg aagccggcgc agccgtctaa ggtggggaag

1200

gtgactgggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc

1260

tttct

1265

<210> 1717

<211> 1548

<212> DNA

<213> Selenomonas sputigena

<400> 1717

ggagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcttaacaca tgcaagtcga

60

acgggaacct ttatttcggt aaaggtgaga gtggcaaacg ggtgagtaac acgtaggcaa

120

cctgccgaca ggatggggac aacattccga ggaatgctaa taccgaatgg agtccgggga

180

tggcatcatc ctcggataag atggcctctg aatatgctat cgcctgtcga tgggcctgcg

240

tctgattagc cagttggcgg ggtaacggcc caccaaagcg acgatcagta gccggtctga

300

gaggatgaac ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatctt ccacaatggg cgaaagcctg atggagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt

420

cttcggatcg taaagctctg ttgcacggga cgaaaaccga gcttgagaat attgagtttg

480

ggtgacggta ccgagcgagg aagccacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

taggtggcga gcgttgtccg gaattattgg gcgtaaaggg agcgcaggcg gacatataag

600

tccatcttaa aagtgcgggg ctcaaccccg tgaggggatg gaaactgtat gccttgagtg

660

caggagagga aagcggaatt cccagtgtag cggtgaaatg cgtagatatt gggaggaaca

720

ccagtggcga aggcggcttt ctggactgta actgacgctg aggctcgaaa gccaggggag

780

cgaacgggat tagatacccc ggtagtcctg gccgtaaacg atgaatgcta ggtgtaggag

840

gtatcgaccc ctcctgtgcc ggagttaacg caataagcat tccgcctggg gagtacggtc

900

gcaagactga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag tatgtggttt

960

aattcgacgc aacgcgaaga accttaccag ggcttgacat tgagtgaaag agctagagat

1020

agcttcctcc cttcggggac acgaaaacag gtggtgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg

1080

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccctg tcctttgttg ccagcgcgta

1140

atggcgggaa ctcaaaggag actgccgcgg agaacgcgga ggaaggcggg gatgacgtca

1200

agtcatcatg ccccttatgt cctgggctac acacgtacta caatgggatg gacagaggga

1260

agcgaaggcg cgagccggag cggaccccac aaaccatccc ccagttcgga ttgcaggctg

1320

caacccgcct gcatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcag gtcagcatac tgcggtgaat

1380

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacgg aagtcattca cgcccaaagc

1440

cggtgggcca accgcaagga ggcagccgtc taaggcgggg gcgatgactg gggtgaagtc

1500

gtaacaaggt agccgtatcg gaaggtgcgg ctggatcacc tcctttct

1548

<210> 1718

<211> 1490

<212> DNA

<213> Serratia fonticola

<400> 1718

tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc gagcggtagc acaaggagct

60

tgctcctggg tgacgagcgg cggacgggtg agtaatgtct gggaaactgc ccgatggagg

120

gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt cttcggacca aagtggggga

180

ccttcgggcc tcacaccatc ggatgtgccc agatgggatt agctagtagg tgaggtaatg

240

gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg accagccaca ctggaactga

300

gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc

360

ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg ttgtaaagca ctttcagcga

420

ggaggaaggg ttctgtgtta atagcaccgt tcattgacgt tactcgcaga agaagcaccg

480

gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc aagcgttaat cggaattact

540

gggcgtaaag cgcacgcagg cggtttgtta agtcagatgt gaaatccccg agcttaactt

600

gggaactgca tttgaaactg gcaagctaga gtcttgtaga ggggggtaga attccaggtg

660

tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga ataccggtgg cgaaggcggc cccctggaca

720

aagactgacg ctcaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc

780

cacgctgtaa acgatgtcga cttggaggtt gtgcccttga ggcgtggctt ccggagctaa

840

cgcgttaagt cgaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa tgaattgacg

900

ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc

960

tactcttgac atccacagaa ctttccagag atggattggt gccttcggga actgtgagac

1020

aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt tgtgaaatgt tgggttaagt cccgcaacga

1080

gcgcaaccct tatcctttgt tgccagcacg taatggtggg aactcaaagg agactgccgg

1140

tgataaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tggcccttac gagtagggct

1200

acacacgtgc tacaatggca tatacaaaga gaagcgaact cgcgagagca agcggacctc

1260

ataaagtatg tcgtagtccg gatcggagtc tgcaactcga ctccgtgaag tcggaatcgc

1320

tagtaatcgt agatcagaat gctacggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc

1380

gtcacaccat gggagtgggt tgcaaaagaa gttagtagct taaccttcgg gagggcgctt

1440

accactttgt gattcatgac tggggtgaag tcctaacaag gtaaccgtag

1490

<210> 1719

<211> 1428

<212> DNA

<213> Serratia liquefaciens

<220>

<221> modified_base

<222> (1070)..(1070)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1719

acacaagaag cttgctctct gggtgacgag cggcggacgg gtgagtaatg tctgggaaac

60

tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcataa cgtctacgga

120

ccaaagtggg ggaccttcgg gcctcatgcc atcagatgtg cccagatggg attagctagt

180

aggtggggta atggctcacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg atgaccagcc

240

acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac

300

aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggccttc gggttgtaaa

360

gcactttcag cgaggaggaa gggttcagtg ttaatagcac tgttcattga cgttactcgc

420

agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg tgcaagcgtt

480

aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga tgtgaaatcc

540

ccgcgcttaa cgtgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt agaggggggt

600

agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg tggcgaaggc

660

ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga

720

taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct tgaggcgtgg

780

cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag gttaaaactc

840

aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gatgcaacgc

900

gaagaacctt acctactctt gacatccaga gaattcgcta gagatagctt agtgccttcg

960

ggaactctga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa tgttgggtta

1020

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt tgttgccagc gcgtaatggn gggaactcaa

1080

aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca tcatggccct

1140

tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcgtatacaa agagaagcga actcgcgaga

1200

gcaagcggac ctcataaagt acgtcgtagt ccggatcgga gtctgcaact cgactccgtg

1260

aagtcggaat cgctagtaat cgtagatcag aatgctacgg tgaatacgtt cccgggcctt

1320

gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta gcttaacctt

1380

cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgta

1428

<210> 1720

<211> 939

<212> DNA

<213> Serratia marcescens

<220>

<221> modified_base

<222> (35)..(35)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (75)..(76)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (81)..(82)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (120)..(120)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (122)..(122)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (129)..(129)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (131)..(132)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (141)..(141)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (165)..(165)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (294)..(294)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (484)..(484)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (492)..(492)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1720

cagccgcggt aatacggagg gtgcaagcgt taatnggaaa ttactgggcg taaagcgcac

60

gcaggcggtc tgatnnaagt nnagatgtga aatccccggg cttaacctgg gaatggcatn

120

tnagactgnt nngctagagt nttgtagagg ggggtagaat tccangtgta gcggtgaaat

180

gcgtagagat gtggaggaat accggtggcg aaggcggccc cctggacaaa gactgacgct

240

caggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgcngtaaac

300

gatgtcgatt tgaaggttgt tcccttgagg agtggctttc ggagctaacg cgttaaatcg

360

accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca

420

agcggtggag catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat

480

ccanagaact tngcagagat gcttaggtgc cttcgggaac tgtgagacag gtgctgcatg

540

gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta

600

tcctttgttg ccagcgattc ggccgggaac tcaaaggaga ctgccagtga taaaccggag

660

gaaggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgg cccttacgac tagggctaca cacgtgctac

720

aatggcgtat acaaagagaa gcgacctcgc gagagcaagc ggacctcata aagtacgtcg

780

tagtccggat tggagtctgc aactcgactc catgaagtcg gaatcgctag taatcgtaga

840

tcagaatgcc acggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg

900

agtgggttgc aaaagaagta ggtagcttaa ccttcggga

939

<210> 1721

<211> 1545

<212> DNA

<213> Serratia odorifera

<400> 1721

tttaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgagcg gtagcacagg agagcttgct ctctgggtga cgagcggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg aaactgcccg atggaggggg ataaccactg gaaacggtgg ctaataccgc

180

ataacgtcta cggaccaaag agggggacct tcgggcctct tgccatcgga tgtgcccaga

240

tgggattagc tagtaggtgg ggtaacggct cacctaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgtg tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagcactt tcagcgagga ggaaggccaa tagcttaata cgctgttgga

480

ttgacgttac tcgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tttgttaagt

600

cagatgtgaa atccccgcgc ttaacgtggg aactgcattt gaaactggca agctagagtc

660

tcgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacgaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg atgtcgattt ggaggttgtg

840

cccttgaggc gtggcttccg gagctaacgc gttaaatcga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctac tcttgacatc cagagaactt tccagagatg

1020

gaagggtgcc ttcgggaact ctgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcggttcg

1140

gccgggaact caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgagt agggctacac acgtgctaca atggcgtata caaagagaag

1260

cgaacttgcg agagtaagcg gacctcataa agtacgtcgt agtccggatt ggagtctgca

1320

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtagat cagaatgcta cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca aaagaagtag

1440

gtagcttaac cttcgggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttac

1545

<210> 1722

<211> 1546

<212> DNA

<213> Serratia proteamaculans

<400> 1722

tttaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgagcg gtagcacaag agagcttgct ctctgggtga cgagcggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtag ctaataccgc

180

ataacgtctt cggaccaaag tgggggacct tcgggcctca cgccatcaga tgtgcccaga

240

tgggattagc tagtaggtgg ggtaatggct cacctaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgtg tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagcactt tcagcgagga ggaagggtag tgtgttaata gcacattgca

480

ttgacgttac tcgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tttgttaagt

600

cagatgtgaa atccccgcgc ttaacgtggg aactgcattt gaaactggca agctagagtc

660

ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg atgtcgactt ggaggttgtg

840

cccttgaggc gtggcttccg gagctaacgc gttaagtcga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctac tcttgacatc cagagaattc gctagagata

1020

gcttagtgcc ttcgggaact ctgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcacgtaa

1140

tggtgggaac tcaaaggaga ctgccggtga taaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1200

gtcatcatgg cccttacgag tagggctaca cacgtgctac aatggcgtat acaaagagaa

1260

gcgaactcgc gagagccagc ggacctcata aagtacgtcg tagtccggat cggagtctgc

1320

aactcgactc cgtgaagtcg gaatcgctag taatcgtaga tcagaatgct acggtgaata

1380

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggttgc aaaagaagta

1440

ggtagcttaa ccttcgggag ggcgcttacc actttgtgat tcatgactgg ggtgaagtcg

1500

taacaaggta accgtagggg aacctgcggt tggatcacct ccttac

1546

<210> 1723

<211> 1546

<212> DNA

<213> Shewanella putrefaciens

<400> 1723

tttaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgagcg gcagcacaag ggagtttact tctgaggtgg cgagcggcgg acgggtgagt

120

aatgcctagg gatctgccca gtcgaggggg ataacagttg gaaacgactg ctaataccgc

180

atacgcccta cgggggaaag gaggggacct tcgggccttc cgcgattgga tgaacctagg

240

tgggattagc tagttggtga ggtaatggct caccaaggcg acgatcccta gctgttctga

300

gaggatgatc agccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg ggaaaccctg atgcagccat gccgcgtgtg tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagcactt tcagtaggga ggaaagggtg tagcttaata cgctatatct

480

gtgacgttac ctacagaaga aggaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtccgag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgt gcgcaggcgg tttgttaagc

600

gagatgtgaa agccctgggc tcaacctagg aatagcattt cgaactggcg aactagagtc

660

ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc atgcacgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtctactc ggagtttggt

840

gtcttgaaca ctgggctctc aagctaacgc attaagtaga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctac tcttgacatc cacggaattg gctagagata

1020

gcttagtgcc ttcgggaacc gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat ccttatttgc cagcacgtaa

1140

tggtgggaac tctagggaga ctgccggtga taaaccggag gaaggtgggg acgacgtcaa

1200

gtcatcatgg cccttacgag tagggctaca cacgtgctac aatggcgagt acagagggtt

1260

gcaaagccgc gaggtggagc taatctcaca aagctcgtcg tagtccggat tggagtctgc

1320

aactcgactc catgaagtcg gaatcgctag taatcgtgga tcagaatgcc acggtgaata

1380

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggctgc aaaagaagtg

1440

ggtagcttaa ccttcggggg ggcgctcacc actttgtggt tcatgactgg ggtgaagtcg

1500

taacaaggta gccctagggg aacctggggc tggatcacct ccttac

1546

<210> 1724

<211> 999

<212> DNA

<213> Shigella boydii

<220>

<221> modified_base

<222> (15)..(17)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (20)..(20)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (31)..(31)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (41)..(42)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (46)..(47)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (54)..(54)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (72)..(72)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (77)..(78)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (203)..(203)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (322)..(322)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (973)..(973)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1724

tactttcagc ggggnnnaan ggagtaaagt naataccttt nntcanngac gttnccgcag

60

aagaagcacc gnctaanncc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg caagcgttaa

120

tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtttgtt aagtcagatg tgaaatcccc

180

gggctcaacc tgggaactgc atntgatact ggcaagcttg agtctcgtag aggggggtag

240

aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg gcgaaggcgg

300

ccccctggac gaagactgac gntcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata

360

ccctggtagt ccacgccgta aacgatgtcg acttggaggt tgtgcccttg aggcgtggct

420

tccggagcta acgcgttaag tcgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt taaaactcaa

480

atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga tgcaacgcga

540

agaaccttac ctggtcttga catccacgga agttttcaga gatgagaatg tgccttcggg

600

aaccgtgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg ttgggttaag

660

tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcctttg ttgccagcgg tccggccggg aactcaaagg

720

agactgccag tgataaactg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tggcccttac

780

gaccagggct acacacgtgc tacaatggcg catacaaaga gaagcgacct cgcgagagca

840

agcggacctc ataaagtgcg tcgtagtccg gattggagtc tgcaactcga ctccatgaag

900

tcggaatcgc tagtaatcgt ggatcagaat gccacggtga atacgttccc gggccttgta

960

cacaccgccc gtnacaccat gggagtgggt tgcaaaaga

999

<210> 1725

<211> 805

<212> DNA

<213> Shigella dysenteriae

<220>

<221> modified_base

<222> (21)..(22)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (272)..(272)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (436)..(436)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (523)..(523)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (536)..(536)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (561)..(561)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (603)..(603)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (621)..(621)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (642)..(642)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (669)..(669)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (684)..(684)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (687)..(687)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (699)..(699)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (713)..(713)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (730)..(730)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (754)..(754)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (770)..(770)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (778)..(778)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (791)..(792)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (797)..(797)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1725

tcgaacggta acaggaagca nnttgctgct ttgctgacga gtggcggacg ggtgagtaat

60

gtctgggaaa ctgcctgatg gagggggata actactggaa acggtagcta ataccgcata

120

acgtcgcaag accaaagagg gggaccttcg ggcctcttgc catcggatgt gcccagatgg

180

gattagctag taggtggggt aaaggctcac ctaggcgacg atccctagct ggtctgagag

240

gatgaccagc cacactggaa ctgagacacg gnccagactc ctacgggagg cagcagtggg

300

gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagccatgcc gcgtgtatga agaaggcctt

360

cgggttgtaa agtactttca gcggggagga agggagtaaa gttaatacct ttgctcattg

420

acgttacccg cagaanaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

480

gtgcaagcgt taatcggaat tactgggcgt aaagcgcacg cangcggttt gttaantcag

540

atgtgaaatc cccgggctca ncctgggaac tgcatctgat actggcaagc ttgagtctcg

600

tanagggggg tagaattcca ngtgtagcgg tgaaatgcgt anagatctgg aggaataccg

660

gtggcgaang cggccccctg gacnaanact gacgctcang tgcgaaagcg tgnggagcaa

720

acaggattan ataccctggt agtccacgcc gtanacgatg tcgacttggn ggttgtgncc

780

ttgaggcgtg nnttccngag ctaac

805

<210> 1726

<211> 1545

<212> DNA

<213> Shigella flexneri

<400> 1726

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgaacg gtaacaggaa gcagcttgct gtttcgctga cgagtggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtag ctaataccgc

180

ataacgtcgc aagaccaaag agggggacct tcgggcctct tgccatcgga tgtgcccaga

240

tgggattagc tagtaggtgg ggtaacggct cacctaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgta tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagtactt tcagcgggga ggaagggagt aaagttaata cctttactca

480

ttgacgttac ccgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tttgttaagt

600

cagatgtgaa atccccgggc tcaacctggg aactgcatct gatactggca agcttgagtc

660

tcgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacgaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg atgtcgactt ggaggttgtg

840

cccttgaggt gtggcttccg gagctaacgc gttaagtcga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatc cacggaagtt ttcagagatg

1020

agaatgtgcc ttcgggaacc gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcggtccg

1140

gccgggaact caaaggagac tgccagtgat aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgacc agggctacac acgtgctaca atggcgcata caaagagaag

1260

cgacctcgcg agagcaagcg gacctcataa agtgcgtcgt agtccggatt ggagtctgca

1320

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtggat cagaatgcca cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca aaagaagtag

1440

gtagcttaac cttcgggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttac

1545

<210> 1727

<211> 1368

<212> DNA

<213> Shigella sonnei

<400> 1727

gcttcgctga cgagtggcgg acgggtgagt aatgtctggg aaactgcctg atggaggggg

60

ataactactg gaaacggtag ctaataccgc ataacgtcgc aagaccaaag agggggacct

120

tcgggcctct tgccatcgga tgtgcccaga tgggattagc ttgttggtgg ggtaacggct

180

caccaaggcg acgatcccta gctggtctga gaggatgacc agccacactg gaactgagac

240

acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg

300

atgcagccat gccgcgtgta tgaagaaggc cttcgggttg taaagtactt tcagcgggga

360

ggaagggagt aaagttaata cctttgctca ttgacgttac ccgcagaaga agcaccggct

420

aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg

480

cgtaaagcgc acgcaggcgg tttgttaagt cagatgtgaa atccccgggc tcaacctggg

540

aactgcatct gatactggca agcttgagtc tcgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag

600

cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata ccggtggcga aggcggcccc ctggacgaag

660

actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac

720

gccgtaaacg atgtcgactt ggaggttgtg cccttgacgc gtggcttccg gagctaacgc

780

gttaagtcga ccgcctgggg agtacggccg caaggttaaa actcaaatga attgacgggg

840

gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgca acgcgaagaa ccttacctgg

900

tcttgacatc cacggaagtt tcagtctcgt agaatgtgcc ttcgggaacg gtgagacagt

960

ggctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1020

caacccttat cctttgttgc cagcggtccg gccgggaact caaaggagac tgccagtgat

1080

aaactggagg aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatggc ccttacgacc agggctacac

1140

acgtgctaca atggcgcata caaagagaag cgacctcgcg agagcaagcg gacctcataa

1200

agtgcgtcgt agtccggatt ggagtctgca actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt

1260

aatcgtggat cagaatgcca cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca

1320

caccatggga gtgggttgca aaagaagtag gtagcttaac cttcggga

1368

<210> 1728

<211> 1539

<212> DNA

<213> Shuttleworthia satelles

<400> 1728

tttaacatga gagttcgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg agaaatgata ttacgatctc ttcggagtga cggttttatt tcgagtggcg

120

gacgggtgag taacgcgtga gcaacctgcc ctataccggg ggataccagt tggaaacgac

180

tgttaatacc gcataagcgc acgataagac atcttgttgt gtgaaaaact ccggtggtat

240

aggatgggct cgcgtatgat tagccagttg gcggggtaaa ggcccaccaa agcgacgatc

300

attagccgac ctgagagggc gaccggccac attgggactg agacacggcc caaactccta

360

cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggcgaaag cctgatgcag cgacgccgcg

420

tgagtgagga agtatttcgg tatgtaaagc tctatcagca gggaagaaag aaatgacggt

480

acctgagtaa gaagctccgg ctaaatacgt gccagcagcc gcggtaatac gtatggagca

540

agcgttatcc ggatttactg ggtgtaaagg gagcgtaggc ggcagagcaa gtctgatgtg

600

aaagcccggg gctcaacccc ggtagtgcat tggaaactgt tcggctcgag tgtcggaggg

660

gtaagcggaa ttcctggtgt agcggtgaaa tgcgtagata tcaggaagaa caccggaggc

720

gaaggcggct tactggacga ttactgacgc tgaggctcga aagcgtgggg agcgaacagg

780

attagatacc ctggtagtcc acgctgtaaa cgatgaatac taggtgtcgg tacccgaagg

840

gtatcggtgc cgtcgcaaac gcattaagta ttccacctgg ggagtacgtt cgcaagaatg

900

aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag

960

caacgcgaag aaccttacca agtcttgaca tcccgatgac aagcgatgta atgtcgtctc

1020

tcttcggagc atcggagaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt

1080

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gttcttagta gccagcaggt gaagctgggc

1140

actctaagga gactgccggg gtgaacccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat

1200

gccccttatg acttgggcta cacacgtgct acaatggcgt aaacaaaggg aggcgaagcc

1260

gtgaggccaa gcgaatccca aaaataacgt ctcagttcgg attgtagtct gcaactcgac

1320

tacatgaagc tggaatcgct agtaatcgca gatcagcatg ctgcggtgaa tacgttcccg

1380

ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagttggta atgcccgaag tcagtgaccc

1440

aaccgcaagg agggagctgc cgaaggcagg actgataact ggggtgaagt cgtaacaagg

1500

tagccgtatc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctttct

1539

<210> 1729

<211> 1451

<212> DNA

<213> Shuttleworthia sp. MSX8B

<400> 1729

gaacgctggc ggcgtgctta acacatgcaa gtcgaacgag aaatgatatt acgatctctt

60

cggagtgacg attttatttc gagtggcgga cgggtgagta acgcgtgagc aacctgccct

120

gtaccggggg ataccagttg gaaacgactg ttaataccgc ataagcgcac gataagacat

180

cttgttgtgt gaaaaactcc ggtggtatag gatgggctcg cgtatgatta gccagttggc

240

ggggtaaagg cccaccaaag cgacgatcat tagccgacct gagagggcga ccggccacat

300

tgggactgag acacggccca aactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg

360

ggcgaaagcc tgatgcagcg acgccgcgtg agtgaggaag tatttcggta tgtaaagctc

420

tatcagcagg gaagaaagaa atgacggtac ctgagtaaga agctccggct aaatacgtgc

480

cagcagccgc ggtaatacgt atggagcaag cgttatccgg atttactggg tgtaaaggga

540

gcgtaggcgg cagagcaagt ctgatgtgaa agcccggggc tcaaccccgg tagtgcattg

600

gaaactgttc agctggagtg tcggaggggt aagcggaatt cctggtgtag cggtgaaatg

660

cgtagatatc aggaagaaca ccggaggcga aggcggctta ctggacgatt actgacgctg

720

aggctcgaaa gcgtggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg

780

atgaatacta ggtgtcggta cccgaagggt atcggtgccg tcgcaaacgc attaagtatt

840

ccacctgggg agtacgttcg caagaatgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa

900

gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccaag tcttgacatc

960

ccgatgacaa gcgatgtaat gtcgtctctc ttcggagcat cggagacagg tggtgcatgg

1020

ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt

1080

tcttagtagc cagcaggtga cgctgggcac tctaaggaga ctgccggggt gaacccggag

1140

gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgac ttgggctaca cacgtgctac

1200

aatggcgtaa acaaagggag gcgaagccgt gaggccaagc gaatcccaaa aataacgtct

1260

cagttcggat tgtagtctgc aactcgacta catgaagctg gaatcgctag taatcgcaga

1320

tcagcatgct gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc acaccatggg

1380

agttggtaat gcccgaagtc agtgacccaa ccgcaaggag ggagctgccg aaggcaggac

1440

tgataactgg g

1451

<210> 1730

<211> 1241

<212> DNA

<213> Shuttleworthia sp. oral taxon G69

<400> 1730

gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacaag caagtcgaac gagaaatgat attacgatct

60

cttcggagtg acggttttat ttcgagtggc ggacgggtga gtaacgcgtg agcaacctgc

120

cctgtaccgg gggataccag ttggaaacga ctgttaatac cgcataagcg cacgataaga

180

catcttgttg tgtgaaaaac tccggtggta taggatgggc tcgcgtatga ttagccagtt

240

ggcggggtaa aggcccacca aagcgacgat cattagccga cctgagaggg cgaccggcca

300

cattgggact gagacacggc ccaaactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca

360

atgggcgaaa gcctgatgca gcgacgccgc gtgagtgagg aagtatttcg gtatgtaaag

420

ctctatcagc agggaagaaa gaaatgacgg tacctgagta agaagctccg gctaaatacg

480

tgccagcagc cgcggtaata cgtatggagc aagcgttatc cggatttact gggtgtaaag

540

ggagcgtagg cggcagagca agtctgatgt gaaagcccgg ggctcaaccc cggtagtgca

600

ttggaaactg ttcagctcga gtgtcggagg ggtaagcgga attcctggtg tagcggtgaa

660

atgcgtagat atcaggaaga acaccggagg cgaaggcggc ttactggacg attactgacg

720

ctgaggctcg aaagcgtggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc cacgctgtaa

780

acgatgaata ctaggtgtcg gtacccgaag ggtatcggtg ccgtcgcaaa cgcattaagt

840

attccacctg gggagtacgt tcgcaagaat gaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca

900

caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc cagtcttgac

960

atcccgatga caagcgatgt aatgtcgtct ctcttcggag catcggagac agggtggtgc

1020

atggctagtc gtcagcctcg tgtcgtgaga agttggggtt aagttcccgc gacgagcgcc

1080

acccctggtt cttgttagcc agcaggtgac gctgggcacc ctaggaaact ggcgaggtga

1140

cccgggagaa gggtgggaat acgtcaatca tcatgcccct tattacctgg gctacacgtt

1200

cctcaagggc ttacccaggg gaggcaagcc cgtaaggcac c

1241

<210> 1731

<211> 1547

<212> DNA

<213> Simonsiella muelleri

<400> 1731

ttgaacataa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggcatgct ttacacatgc

60

aagtcggacg gcagcggggt agtgcttgca ttactgccgg cgagtggcga acgggtgagt

120

ataatattgg aacgtaccga gtaatggggg ataactatcc gaaaggatgg ctaataccgc

180

atacgtcctg agggagaaag cgggggacag gcaactgcct cgcgttattt gagcggccaa

240

tatcggatta gctagttggt ggggtaaagg cttaccaagg cgacgatccg tagcgggtct

300

gagaggatga tccgccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca

360

gtggggaatt ttggacaatg gggggaaccc tgatccagcc atgtcgcgtg tatgaagaag

420

gccttagggt tgtaaagtac ttttgttagg gaagaaaagg catttgctaa tatcagatgc

480

tgatgacggt acctaaagaa taagcaccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

540

gtagggtgcg agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gagcgcagac ggttacttaa

600

gcaagatgtg aaatccccga gctcaacttg ggaactgcgt tttgaactgg gtagctagag

660

tgtgtcagag gggggtagaa ttccacgtgt agcagtgaaa tgcgtagaga tgtggaggaa

720

taccgatggc gaaggcagcc ccctgggata gcactgacgt tcatgctcga aagcgtgggt

780

agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccctaaa cgatgtcaat tagctgttgg

840

ggcactagat gccttagtag cgaagctaac gcgtgaaatt gaccgcctgg ggagtacggt

900

cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga tgatgtggat

960

taattcgatg caacgcgaag aaccttacct ggtcttgaca tgtacggaat ctctcagaga

1020

cgggagagtg ccttcgggag ccgtaacaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc

1080

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gtcattagtt gccatcattt

1140

ggttgggcac tctaatgaga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1200

gtcctcatgg cccttatgac cagggcttca cacgtcatac aatggtcggt acagagggta

1260

gccaagccgc gaggtggagc caatcccaaa aaaccgatcg tagtccggat tgcactctgc

1320

aactcgagtg catgaagtcg gaatcgctag taatcgcagg tcagcatact gcggtgaata

1380

cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggggat accagaagta

1440

ggtagaataa ccgcgaggag ttcgcttacc acggtatgct tcatgactgg ggtgaagtcg

1500

taacaaggta gccgtagggg aacctgcggc tggatcacct cctttct

1547

<210> 1732

<211> 1474

<212> DNA

<213> Slackia equolifaciens

<400> 1732

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgaac

60

gagtaaggcg ccttcgggcg cgtatagagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgaccaacc

120

tgccccccgc cccgggacaa ccgcccgaaa gggcggctaa taccgggcga accggagagg

180

acgcatgccc cctccggcaa agctcaggcg gcgggggatg gggtcgcggc ccatcaggta

240

gacggcgggg tgacggccca ccgtgcctac aacgggtagc cgggctgaga ggccgatcgg

300

ccacattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaattttgc

360

gcaatggggg caaccctgac gcagcaacgc cgcgtgcggg acgaaggcct tcgggtcgta

420

aaccgctttc agcagggaag aaaccatgac ggtacctgca gaagaagccc cggctaacta

480

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggg gcgagcgtta tccggattca ttgggcgtaa

540

agcgcgcgca ggcggcctct caagcggcac cgtcgaagcc gggggctcaa cccccggaag

600

cgggccgaac tggggggctc gaggcaggca gaggaaggcg gaattcccgg tgtagcggtg

660

gaatgcgcag atatcgggaa gaacaccgac ggcgaaggca gccttctggg cctgtcctga

720

cgctcaggcg cgaaagccgg gggagcgaac aggattagat accctggtag tcccggccgt

780

aaacgatggg cgctaggtgt gggggcgaca tgcctccgtg ccgaagccaa cgcattaagc

840

gccccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca

900

caagcggcgg agcatgtggc ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc agggcttgac

960

atcaccgtga gccggcggag acgccggggc cgagaggagc ggtgacaggt ggtgcatggc

1020

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccctgcc

1080

gtatgttgcc agcatgtaac gatggggact catacgggac cgccggcgtc aagccggagg

1140

aaggcgggga cgacgtcaag tcatcatgcc ccttacgccc tgggctgcac acgtgctaca

1200

atggccggta cagagggaag ccaccccgcg agggggagcc gatcccgaaa agccggcccc

1260

agttcggatc ggaggctgca acccgcctcc gtgaagccgg agtcgctagt aatcgcggat

1320

cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccacccga

1380

gtcgtctgca cccgaagccg ccggccgaac ccgagagggg cggaggcgtc gaaggtgtgg

1440

agggtgaggg gggtgaagtc gtaacaaggt aacc

1474

<210> 1733

<211> 1509

<212> DNA

<213> Slackia exigua

<400> 1733

ggagagtttg atcctggctc aggatgaacg ctggcggcgc gcctaacaca tgcaagtcga

60

acggttaagg ccccctttag ggggcgcata gagtggcgaa cgggtgagta acacgtgacc

120

aacccgcccc cccaccggga caacctcggg aaaccgaggc taataccgga tacgccgggg

180

cccccgcatg ggggccccgg gaaagccttg gcgggagggg acggggtcgc ggcccatcag

240

gtagacggcg gggcgaaggc ccgccgtgcc gacgacgggt agccgggctg agaggccgat

300

cggccacatt gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tgcgcaatgg ggggaaccct gacgcagcga cgccgcgtgc gggaaggagg ccttcgggtc

420

gtaaaccgct ttcagcaggg aagaagcctg acggtacctg cagaagaagc cccggctaac

480

tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gggcgagcgt tatccggatt cattgggcgt

540

aaagcgcgcg caggcggccc gccaagcggc ctcgtcgaag ccgggggctc aacccccgga

600

agcgacccga actggcgggc tcgagtgggg caggggagga tggaattccc ggtgtagcgg

660

tgaaatgcgc agatatcggg aggaacaccg acggcgaagg cagccctctg ggccttcact

720

gacgctgagg cgcgaaagct gggggagcga acaggattag ataccctggt agtcccagcc

780

gtaaacgatg ggcgctaggt gcggggggac acgaccctcc gtgccgcagc caacgcatta

840

agcgccccgc ctggggagta cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg acgggggccc

900

gcacaagcag cggagcatgt ggcttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accagggctt

960

gacatgcggg tgaagcggcg gagacgccgt ggccggaagg agcccgcgca ggtggtgcat

1020

ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccccc

1080

gccgcatgtt gccagcattc agttgggcac tcatgcggga ccgccggcgc caagccggag

1140

gaaggcgggg acgacgtcaa gtcatcatgc cccccatgcc ctgggccgca cacgtgctac

1200

aatggccggc acagcgggca gcggacccgc gagggcgagc gaatccctta aagccggccc

1260

cagttcggat cggaggctgc aacccgcctc cgtgaagccg gagttgctag taatcgcgga

1320

tcagcacgcc gcggtgaatg cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacccg

1380

agtcgtctgc acccgaagcc gccggcccaa cccgcaaggg ggggaggcgt cgaaggtgtg

1440

gagggtgagg ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtacc ggaaggtgcg gctggatcac

1500

ctcctttct

1509

<210> 1734

<211> 1476

<212> DNA

<213> Slackia faecicanis

<400> 1734

gatgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgaac ggttaaggcg ccttcgggcg

60

cgaatagagt ggcgaacggg tgagtaacgc gtggccaacc tgccccctcc tccgggacaa

120

cctcgggaaa ccgaggctaa taccggatgc tccgggcccc ccgcatgggg ggcccgggaa

180

agcccaggcg ggaggggatg gggccgcgtc ccatcaggta gtaggcgggg tgacggccca

240

cctagctgac gacgggtagc cggactgaga ggtcgatcgg ccacattggg actgagacac

300

ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaattttgc gcaatggggg aaaccctgac

360

gcagcaacgc cgcgtgcggg acgaaggcct tcgggtcgta aaccgctttc ggcagggaag

420

aattttgacg gtacctgcag aagaagcccc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtaggggg cgagcgttat ccggattcat tgggcgtaaa gcgcgcgtag gcgtctcctc

540

aagcggcacc gtcgaagccg ggggctcaac ccccggaagc gggccgaact ggggggatcg

600

agtgcggtag gggcaggcgg aattcccggt gtagcggtga aatgcgcaga tatcgggaag

660

aacaccgacg gcgaaggcag cctgctgggc cggcactgac gctgaggcgc gaaagctggg

720

ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt cccagccgta aacgatgggc gctaggtgtg

780

ggggagccat tcctccgtgc cgcagccaac gcattaagcg ccccgcctgg ggagtacggc

840

cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcagcgga gcatgtggct

900

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca gggcttgaca tcaccgtgag ccggcggaga

960

cgccggggcc gaaaggagcg gtgacaggtg gtgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga

1020

gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccccgccg tatgttgcca tcgggtaatg

1080

ccgggcactc gtacgggacc gccggagcca atccggagga aggcggggac gacgtcaagt

1140

catcatgccc ctcatgccct gggctgcaca cgtgctacaa tggccggtac aacgggccgc

1200

cacgccgcga ggcggagcga atccctcaaa gccggcccca gttcggatcg caggctgcaa

1260

cccgcctgcg tgaagccgga gttgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg

1320

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacccgag tcgtctgcac ccgaagccgc

1380

cggccgaacc cgaaaggggc ggaggcgtcg aaggtgtgga gggtgagggg ggtgaagtcg

1440

taacaaggta gccgtaccgg aaggtgcggc tggatc

1476

<210> 1735

<211> 1505

<212> DNA

<213> Slackia heliotrinireducens

<400> 1735

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgcgc ctaacacatg caagtcgaac

60

gattaaaccg ccctcgggcg gacatacagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgaccaacc

120

cgccccctcc tccgggacaa cctcgggaaa ccgtggctaa taccggatac tccggcagca

180

gcgcatgctg cggccgggaa agcccagacg ggaggggatg gggtcgcggc ccatcaggta

240

gacggcgggg caacggcccg ccgtgccgac gacgggtagc cgggctgaga ggctgatcgg

300

ccacattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatcttgc

360

gcaatggggg gaaccctgac gcagcgacgc cgcgtgcggg acgaaggcct tcgggtcgta

420

aaccgctttc agcagggaag aaacatgacg gtacctgcag aagaagctcc ggctaactac

480

gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggag cgagcgttat ccggattcat tgggcgtaaa

540

gcgcgcgcag gcggccggcc aagcgggcct cgtcgaagcc gtgggctcaa cccgcggaag

600

cgacccgaac tggccggctc gagtgaggta ggggaggatg gaattcccgg tgtagcggtg

660

gaatgcgcag atatcgggag gaacaccgac ggcgaaggca gtcctctggg ccttcactga

720

cgctgaggcg cgaaagctgg gggagcgaac aggattagat accctggtag tcccagccgt

780

aaacgatggg cgctaggtgt ggggggccgg accccccgtg ccgcagccaa cgcattaagc

840

gccccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca

900

caagcagcgg agcatgtggc ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc agggcttgac

960

atgcaggtga agcggcggaa acgccgtggc ctgaccggag cctgcacagg tggtgcatgg

1020

ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctgc

1080

cgcatgttgc cagcatcaag ttggggactc atgcgggacc gccggcgcca agccggagga

1140

aggcggggac gacgtcaagt catcatgccc ctcatgccct gggctgcaca cgtgctacaa

1200

tggccggcac agcgggctgc gacgcagcga tgcggagcga atccctcaaa gccggcccca

1260

gttcggatcg gaggctgcaa cccgcctccg tgaagccgga gttgctagta atcgcggatc

1320

agcacgccgc ggtgaatgcg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacccgag

1380

tcgtctgcac ccgaagccgc cggccgaacc cgttaagggg cggaggcgtc gaaggtgtgg

1440

agggtgaggg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtacgg gaacgtgcgg ctggatcacc

1500

tcctt

1505

<210> 1736

<211> 1473

<212> DNA

<213> Slackia isoflavoniconvertens

<400> 1736

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgcgc ctaacacatg caagtcgaac

60

gagtaagacg ccttcgggcg tggatagagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgaccaacc

120

tgccccctcc tccgggacaa cctcgggaaa ccgaggctaa taccggatac tccgggcacc

180

ccgcatggga tgcccgggaa agccctggcg ggaggggatg gggtcgcggc ccatcaggta

240

gacggcgggg taacggccca ccgtgcccgc aacgggtagc cgggctgaga ggccgatcgg

300

ccacattggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaattttgc

360

gcaatggggg caaccctgac gcagcgacgc cgcgtgcggg acgaagtcat tcgtgacgta

420

aaccgctttc agcgaggaag aaccatgacg gtactcgcag aagaagcccc ggctaactac

480

gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggggg cgagcgttat ccggaatcat tgggcgtaaa

540

gcgcgcgcag gcgggctttc aagcggcggc gtcgaagccg ggggctcaac ccccggaagc

600

gccccgaact ggaagcctcg gatgcggcag ggggaggcgg aattcccggt gtagcggtga

660

aatgcgcaga tatcgggaag aacaccgacg gcgaaggcag cctcctgggc cggcatcgac

720

gctgaggcgc gaaagctggg ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt cccagccgta

780

aacgatggac gctaggtgtg ggggaggaat ctcctccgtg ccgaagccaa cgcattaagc

840

gtcccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca

900

caagcagcgg agcatgtggc ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc agggcttgac

960

atatcggtga agccggagag atccggtggc cgagaggagc ccacacaggt ggtgcatggc

1020

tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccccgcc

1080

gcgtgttgcc agcattcagt tgggcactca cgcgggactg ccggcgtcaa gccggaggaa

1140

ggcggggacg acgtcaagtc atcatgcccc tcatgccctg ggccgcacac gtgctacaat

1200

ggccggcaca acgggttgcc accccgcgag ggggagcgga tccctaaagc cggccccagt

1260

tcggatcgca ggctgcaacc cgcctgcgtg aagccggagt tgctagtaat cgcggatcag

1320

cacgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac cacccgagtc

1380

gtctgcaccc gaagccgccg gccgaacccc tccggggggc ggaggcgtcg aaggtgtgga

1440

gggtgagggg ggtgaagtcg taacaaggta acc

1473

<210> 1737

<211> 1463

<212> DNA

<213> Slackia piriformis

<400> 1737

gatgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgaac ggttaaggcg ccttcgggcg

60

cgcatagagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgaccaacc tgccccctcc tccgggacaa

120

cctcgggaaa ccgaggctaa taccggatgg tcccgccggg ccgcatggcc gggcggggaa

180

agcccaggcg ggaggggatg gggtcgcggc ccatcaggta gtaggcgggg tgacggccca

240

cctagctgac gacgggtagc cgcgctgaga ggcggaccgg ccacattggg actgagacac

300

ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaattttgc gcaatggggg aaaccctgac

360

gcagcaacgc cgcgtgcggg acgaaggcct tcgggtcgta aaccgctttc agcagggaag

420

aagaatgacg gtacctgcag aagaagcccc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtaggggg cgagcgttat ccggattcat tgggcgtaaa gcgcgcgtag gcgtcccttc

540

aagcggcacc gtcgaagccg ggggctcaac ccccggaagc gggccgaact ggggggatcg

600

agtgcggtag gggaaggcgg aattcccggt gtagcggtga aatgcgcaga tatcgggaag

660

aacaccgacg gcgaaggcag ccttctgggc cgccactgac gctgaggcgc gaaagctggg

720

ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt cccagccgta aacgatgggc gctaggtgtg

780

gggggagatg tccctccgtg ccgcagccaa cgcattaagc gccccgcctg gggagtacgg

840

ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcagcgg agcatgtggc

900

ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc agggcttgac atcaccgtga gccgccggag

960

acggcggggc cgaaaggagc ggtgacaggt ggtgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1020

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccccgcc gcgtgttgcc agcattgagt

1080

tgggcactcg cgcgggactg ccggcgtcaa gccggaggaa ggtggggacg acgtcaagtc

1140

atcatgcccc tcatgccctg ggctgcacac gtgctacaat ggccggtaca gcgggctgcg

1200

acgccgcgag gcggagcgaa tcccacaaag ccggccccag ttcggaccgc aggctgcaac

1260

ccgcctgcgc gaagccggag ttgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt

1320

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccacccgagt cgtctgcacc cgaagccgcc

1380

ggccgaaccc gcaaggggcg gaggcgtcga aggtgtggag ggtgaggggg gtgaagtcgt

1440

aacaaggtag ccgtaccgga agg

1463

<210> 1738

<211> 1355

<212> DNA

<213> Slackia sp. NATTS

<400> 1738

tttgatcatg gctcaggatg aacgctggcg gcgcgcctaa cacatgcaag tcgaacgagt

60

ggcgaacggg tgagtaacac gtgaccaacc tgccccctcc tccgggacaa cctcgggaaa

120

ccgaggctaa taccggatac tgaaaggcgg gaggggatgg ggtcgcggcc catcaggtag

180

acggcggggt aacggcccac cgtgcctgca acgggtagcc gggctgagag gccgatcggc

240

cacattggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaattttgcg

300

caatgggggc aaccctgacg cagcgacgcc gcgtgcggga cgaagtcatt cgtgacgtaa

360

accgctttca gcgaggaaga tgacggtact cgcagaagaa gccccggcta actacgtgcc

420

agcagccgcg gtaatacgta gggggcgagc gttatccgga atcattgggc gtaaagcgcg

480

cgcaggcggg ctttcaagcg gggcgtcgaa gccgggggct caacccccgg aagcgccccg

540

aactggaagc ctcggatgcg gcagggggag gcggaattcc cggtgtagcg gtgaaatgcg

600

cagatatcgg gaagaacacc gacggcgaag gcagcctcct gggccgatcg acgctgaggc

660

gcgaaagctg ggggagcgaa caggattaga taccctggta gtcccagccg taaacgatgg

720

acgctaggtg tgggggcctc cgtgccgaag ccaacgcatt aagcgtcccg cctggggagt

780

acggccgcaa ggctaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagca gcggagcatg

840

tggcttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccagggct tgacatatac aggtggtgca

900

tggctgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc

960

cgccgcgtgt tgccagcatg ggcactcacg cgggactgcc ggcgtcaagc cggaggaagg

1020

cggggacgac gtcaagtcat catgcccctc atgccctggg ccgcacacgt gctacaatgg

1080

ccggcaacgg gttgccaccc cgcgaggggg agcggatccc tccggcccca gttcggacgc

1140

aggctgcaac ccgcctgcgg aagccggagt tgctagtaat cgcggatcag cacgccgcgg

1200

tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac cacccgagtc gtctgcaccc

1260

gaagccgccg ccgacggagg cgtcgaaggt gtggagggtg aggggggtga agtcgtaaca

1320

aggtagccgt accggaaggt gcggctggat cacct

1355

<210> 1739

<211> 1528

<212> DNA

<213> Solobacterium moorei

<400> 1739

tcaaatgaag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca

60

agtcgaacgc tggagatcta gcttgctaga tcgaaggagt ggcgaacggg tgagtaatac

120

ataagcaacc tacccacgaa gactgggata atctctggaa acggggacta ataccggata

180

ggtaatcgga aggcatcttc tggttattaa aggttaaaaa cactggtgga tgggcttatg

240

gcgcattagt tagttggtga ggtaacggcc caccaagacg atgatgcgta gccggcctga

300

gagggtgaac ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

agggaatttt cggcaatggg ggcaaccctg accgagcaac gccgcgtgag tgaagacggc

420

cttcgggttg taaagctctg ttgtaaggga agaacggtag atagagaata tctaagtgac

480

ggtaccttac cagaaagcca cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg

540

gcgagcgtta tccggaatta ttgggcgtaa agggtgcgta ggcggcctgt taagtaagtg

600

gttaaattgt tgggctcaac ccaatccagc cacttaaact ggcaggctag agtattggag

660

aggcaagtgg aattccatgt gtagcggtaa aatgcgtaga tatatggagg aacaccagtg

720

gcgaaggcgg cttgctagcc aaagactgac gctcatgcac gaaagcgtgg ggagcaaata

780

ggattagata ccctagtagt ccacgccgta aacgatgaat actaagtatt ggggaaactc

840

agtgctgcag ctaacgcaat aagtattccg cctgtggagt atgcacgcaa gtgtgaaaca

900

taaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagtatg tggtttaatt cgacgcaacg

960

cgaagaacct taccaggcct tgacatccct tgcaaagctg tagagataca gtagaggtta

1020

tcaaggagac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaaccct tgccttcagt taccagcatt cagttgggga ctctggaggg

1140

actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgg

1200

cctgggctac acacgtacta caatggctgt tacaacgtgc agcgacctag cgataggaag

1260

cgaatcacta aaagacagtc tcagttcgga ttgaagtctg caactcgact tcatgaagct

1320

ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagaatgc cgcggtgaat acgttctcgg gccttgtaca

1380

caccgcccgt cataccatga gagctggtaa tacccgaagc cggtggccta accgcaagga

1440

aggagccgtc gaaggtagga ctagtgattg gggtcaagtc gtaacaaggt atccctacga

1500

gaacgtgggg atggatcacc tcctttct

1528

<210> 1740

<211> 1494

<212> DNA

<213> Sphingobacterium faecium

<400> 1740

ggctcaggat gaacgctagc ggcaggccta atacatgcaa gtcggacggg attcagggag

60

tagcttgcta cgaactgatg agagtggcgc acgggtgcgt aacgcgtgag caacctaccc

120

atatcagggg gatagcctct cgaaagagag attaacaccg cataacatca tttaccggca

180

tcggttaatg atcaaatatt tataggatat ggatgggctc gcgtgacatt agctagttgg

240

aggggtaacg gcccaccaag gctacgatgt ctaggggctc tgagaggaga atcccccaca

300

ctggtactga gacacggacc agactcctac gggaggcagc agtaaggaat attggtcaat

360

ggagggaact ctgaaccagc catgccgcgt gcaggatgac tgccctatgg gttgtaaact

420

gcttttgtca gggaataaac ctttctacgt gtaggaagct gaatgtacct gaagaataag

480

gatcggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag gatccaagcg ttatccggat

540

ttattgggtt taaagggtgc gtaggcggtc ctataagtca gtggtgaaag acggcagctt

600

aactgtcgca gtgcctttga tactgtagga cttgaatcta tttgaagtgg gcggaataag

660

acaagtagcg gtgaaatgca tagatatgtc ttagaactcc gattgcgaag gcagctcact

720

aagttagtat tgacgctgat gcacgaaagc gtggggatca aacaggatta gataccctgg

780

tagtccacgc cctaaacgat gataactcga tgtttgcgat acacagtaag cgtccaagcg

840

aaagcgttaa gttatccacc tggggagtac ggtcgcaaga ttgaaactca aaggaattga

900

cgggggcccg cacaagcgga ggagcatgtg gtttaattcg atgatacgcg aggaacctta

960

cccgggcttg aaagttagtg aatgatccag agacggatca gtccttcggg acacgaaact

1020

aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt tgggttaagt cccgcaacga

1080

gcgcaacccc tatgtttagt tgccagcatg taatgatggg gactctaaac agactgccag

1140

cgtaagctgt gaggaaggtg gggacgacgt caagtcatca tggcccttac gtccggggct

1200

acacacgtgc tacaatggat ggtacagcgg gcagctacat agcaatatga tgctaatctc

1260

taaaagccat tcacagttcg gattgaggtc tgcaactcga cctcatgaag ttggattcgc

1320

tagtaatcgc gtatcagcaa tgacgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1380

cgtcaagcca tgaaagttgg gggtacctaa agcatgtaac cgcaaggagc gtgttagggt

1440

aaaaccgata attggggcta agtcgtaaca aggtagccgt accggaaggt gcgg

1494

<210> 1741

<211> 1454

<212> DNA

<213> Sphingobacterium mizutaii

<400> 1741

gctcaggatg aacgctagcg gcaggcctaa tacatgcaag tcggacggga tccatcggta

60

gcttgctacc gatggtgaga gtggcgcacg ggtgcgtaac gcgtgagcaa cctgcccata

120

tcagggggat agcccggaga aatccggatt aacaccgcat gacactgctt tccggcatcg

180

ggaggtagtc aaatattcat aggatatgga tgggctcgcg tgacattagc tagttggtgg

240

ggtaacggcc caccaaggcg acgatgtcta ggggctctga gaggagaatc ccccacactg

300

gtactgagac acggaccaga ctcctacggg aggcagcagt aaggaatatt ggtcaatggg

360

ggcaaccctg aaccagccat gccgcgtgca ggacgactgc cctatgggtt gtaaactgct

420

tttgttaggg aataaacccc gctacgtgta gcgggctgaa tgtacctaaa gaataaggat

480

cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggaggat ccgagcgtta tccggattta

540

ttgggtttaa agggtgcgta ggcggcactt taagtcaggg gtgaaagacg gcagctcaac

600

tgtcgcagtg cccttgatac tgaagtgctt gaatgcggtt gaagacggcg gaatgagaca

660

agtagcggtg aaatgcatag atatgtctca gaacaccgat tgcgaaggca gctgtctaag

720

ccgttattga cgctgatgca cgaaagcgtg gggatcgaac aggattagat accctggtag

780

tccacgccct aaacgatgat gactcgatgt ttgcgatata ccgtaagcgt ccaagcgaaa

840

gcgttaagtc atccacctgg ggagtacgcc cgcaagggtg aaactcaaag gaattgacgg

900

gggcccgcac aagcggagga gcatgtggtt taattcgatg atacgcgagg aaccttaccc

960

gggcttgaaa gttactgaag ggcgcagaga cgcgcccgtc cttcgggaca ggaaactagg

1020

tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgccgt gaggtgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1080

caacccctat gtttagttgc cagcacgtca aggtggggac tctaaacaga ctgcctgcgc

1140

aagcagagag gaaggcgggg acgacgtcaa gtcatcatgg cccttacgtc cggggctaca

1200

cacgtgctac aatggatggt acagcgggca gctacacagc aatgtggtgc caatctcgaa

1260

aagccattca cagttcggat cggggtctgc aactcgaccc cgtgaagttg gattcgctag

1320

taatcgcgta tcagcaatga cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

caagccatga aagctggggg tacctaaagc atgtaaccgc aaggagcgtg ttagggtaaa

1440

accggtaatt gggg

1454

<210> 1742

<211> 1439

<212> DNA

<213> Sphingobacterium multivorum

<220>

<221> modified_base

<222> (1112)..(1112)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1114)..(1114)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1742

ggctcaggat gaacgctagc ggcaggccta atacatgcaa gtcggacggg atccatcgga

60

gagcttgctc gaagatggtg agagtggcgc acgggtgcgt aacgcgtgag caacctacct

120

ctatcagggg gatagcctct cgaaagagag attaacaccg cataacatca acagttcgca

180

tgttcggttg attaaatatt tataggatag agatgggctc gcgtgacatt agctagttgg

240

tagggtaacg gcttaccaag gcgacgatgt ctaggggctc tgagaggaga atcccccaca

300

ctggtactga gacacggacc agactcctac gggaggcagc agtaaggaat attggtcaat

360

gggcggaagc ctgaaccagc catgccgcgt gcaggatgac tgccctatgg gttgtaaact

420

gcttttgtcc aggaataaac ctaaatacgt gtatttagct gaatgtactg gaagaataag

480

gatcggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag gatccgagcg ttatccggat

540

ttattgggtt taaagggtgc gtaggcggcc tattaagtca ggggtgaaat acggtggctc

600

aaccatcgca gtgcctttga tactgatggg cttgaatcca tttgaagtgg gcggaataag

660

acaagtagcg gtgaaatgca tagatatgtc ttagaactcc gattgcgaag gcagctcact

720

aagctggtat tgacgctgat gcacgaaagc gtggggatcg aacaggatta gataccctgg

780

tagtccacgc cctaaacgat gataactcga tgttggcgat agacagccag cgtcccagcg

840

aaagcgttaa gttatccacc tggggagtac gcccgcaagg gtgaaactca aaggaattga

900

cgggggcccg cacaagcgga ggagcatgtg gtttaattcg atgatacgcg aggaacctta

960

cccgggcttg aaagttagtg aagagtgcag agacgcactc gtccttcggg acacgaaact

1020

aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt tgggttaagt cccgcaacga

1080

gcgcaacccc tatgtttagt tgccagcatg tnanggtggg gactctaaac agactgcctg

1140

tgcaaacaga gaggaaggtg gggacgacgt caagtcatca tggcccttac gtccggggct

1200

acacacgtgc tacaatggat ggtacagcgg gcagctacat agcaatatga tgctaatctc

1260

taaaagccat tcacagttcg gattggggtc tgcaactcga ccccatgaag ttggattcgc

1320

tagtaatcgc gtatcagcaa tgacgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1380

cgtcaagcca tgaaagttgg gggtacctaa agcatgttac cgcaaggagc gtgttaggg

1439

<210> 1743

<211> 1527

<212> DNA

<213> Sphingobacterium spiritivorum

<400> 1743

ttacaatgga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgcta gcggcaggcc taatacatgc

60

aagtcgaacg agattatcca gcttgctgga tatgaaagtg gcgcacgggt gcgtaacgcg

120

tgagcaacct acctctgtca gggggatagc ccggcgaaag tcggattaac accgcatgac

180

attattgatg tggcatcaca ttataatcaa atatttatag gacagagatg ggctcgcgtg

240

acattagcta gttggagagg taacggctca ccaaggcaac gatgtctagg ggctctgaga

300

ggagaatccc ccacactggt actgagacac ggaccagact cctacgggag gcagcagtaa

360

ggaatattgg tcaatggagg gaactctgaa ccagccatgc cgcgtgcagg atgactgccc

420

tatgggttgt aaactgcttt tgtcggggaa taaacctacg tttgtaaacg tagctgaatg

480

tacccgaaga ataaggatcg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggaggatcc

540

aagcgttatc cggatttatt gggtttaaag ggtgcgtagg cggttcttta agtcagaggt

600

gaaagacggc agcttaactg tcgcagtgcc tttgatactg aagaacttga attaggttga

660

ggaatgcgga atgagacaag tagcggtgaa atgcatagat atgtctcaga accccgattg

720

cgaaggcagc attccaagcc tttattgacg ctgatgcacg aaagcgtggg gatcgaacag

780

gattagatac cctggtagtc cacgccctaa acgatgataa ctcgatgttg gcgatagaca

840

gtcagcgtcc cagcgaaagc gttaagttat ccacctgggg agtacgcccg caagggtgaa

900

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggaggagc atgtggttta attcgatgat

960

acgcgaggaa ccttacccgg gcttgaaagt tagtgaatga tccagagacg gatcagtcct

1020

tcgggacacg aaactaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgccgtga ggtgttgggt

1080

taagtcccgc aacgagcgca acccctatgt ttagttgcca gcatgtcatg atggggactc

1140

taaacagact gcctgcgcaa gcagagagga aggtggggac gacgtcaagt catcatggcc

1200

cttacgtccg gggctacaca cgtgctacaa tggtcggtac agcgggcagc tacacagtaa

1260

tgtgatgcca atctctgaaa gccgatcaca gttcggattg aggtctgcaa ctcgacctca

1320

tgaagttgga ttcgctagta atcgcgtatc agcaatgacg cggtgaatac gttcccgggc

1380

cttgtacaca ccgcccgtca agccatgaaa gttgggggtg cctaaagcat gtaaccgcaa

1440

ggagcgtgtt agggcaaaac cgataattgg ggctaagtcg taacaaggta gccgtaccgg

1500

aaggtgcggc tggaatacct cctttct

1527

<210> 1744

<211> 1463

<212> DNA

<213> Sphingomonas echinoides

<220>

<221> modified_base

<222> (439)..(439)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (956)..(959)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1744

tgatcatggc tcagaatgaa cgctggcggc atgcctaaca catgcaagtc gaacgaaggc

60

tttggcctta gtggcgcacg ggtgcgtaac gcgtgggaat ctgccctcag gttcggaata

120

acagcgagaa attgctgcta ataccggatg atatcgcgag atcaaagatt tatcgcctga

180

ggatgagccc gcgtaggatt agctagttgg tgtggtaaag gcgcaccaag gcgacgatcc

240

ttagctggtc tgagaggatg atcagccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac

300

gggaggcagc agtggggaat attggacaat gggcgaaagc ctgatccagc aatgccgcgt

360

gagtgatgaa ggccttaggg ttgtaaagct cttttacccg ggatgataat gacagtaccg

420

ggagaataag ctccggctna ctccgtgcca gcagccgcgg taatacggag ggagctagcg

480

ttattcggaa ttactgggcg taaagcgcac gtaggcggct ttgtaagtta gaggtgaaag

540

cctggagctc aactcctgaa ttgcctttaa gactgcatcg cttgaatcca ggagaggtga

600

gtggaattcc gagtgtagag gtgaaattcg tagatattcg gaagaacacc agtggcgaag

660

gcggctcact ggactggtat tgacgctgag gtgcgaaagc gtggggagca aacaggatta

720

gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gataactagc tgtcggggct cttagagctt

780

cggtggcgca cgtaacgcat taagttatcc gcctggggag tacggccgca aggttaaaac

840

tcaaatgaat tgacgggggc ctgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac

900

gcgcagaacc ttaccagcgt ttgacatgtc cggacgattt cgggagaccg atctcnnnnt

960

cggggactgg aacacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt

1020

taagtcccgc aacgagcgca accctcgtcc ttagttgcca tcattcagtt gggcactcta

1080

aggaaaccgc cggtgataag ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtcc tcatggccct

1140

tacgcgctgg gctacacacg tgctacaatg gcggtgacag tgggcagcaa tctcgcaagg

1200

gtgagctaat ctccaaaagc cgtctcagtt cggattgttc tctgcaactc gagagcatga

1260

aggcggaatc cgtagtaatc gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc ccaggccttg

1320

tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg gattcacccg aaggcagtgc gctaaccgca

1380

aggaggcagc tgaccacggt gggttcagcg actggggtga agtcgtaaca aggtagccgt

1440

aggggaacct gcggctggat cac

1463

<210> 1745

<211> 1362

<212> DNA

<213> Sphingomonas sp. oral clone FI012

<400> 1745

gagtttgatc ctggctcaga acgaacgctg gcggcgtgcc taacacatgc aagtcgaacg

60

agtggcgcac gggtgcgtaa cgcgtgggaa tctgcctctt gcttcggaat aacagtggga

120

aactactgct aataccggat gatcaaagtc ggcaagagat gagcccgcgt aggattaggt

180

agttggtggg gtaaaggcct accaagccga cgatccttag ctggtctgag aggatgatca

240

gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg

300

gacaatgggg gcaaccctga tccagcaatg ccgcgtgagt gatgaaggcc ttagggttgt

360

aaagctcttt taccagggat gatgacagta cctggagaat aagctccggc taactccgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg gagggagcta gcgttgttcg gaattactgg gcgtaaagcg

480

cacgtaggcg gttactcaag tcagaggtga aagcccgggg ctcaaccccg gaactgcctt

540

tgaaactagg taactagaat cctggagagg tgagtggaat tccgagtgta gaggtgaaat

600

tcgtagatat tcggaagaac accagtggcg aaggcggctc actggacaga ttgacgctga

660

ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agatacccag gtagtccacg ccgtaaacga

720

tgataactag ctgtccgggt ttgggtggcg cagctaacgc attaagttat ccgcctgggg

780

agtacggtcg caagattaaa actcaaagga attgacgggg gcctgcacaa gcggtggagc

840

atgtggttta attcgaagca acgcgcagaa ccttaccagc gtttgacatc gacaggtgct

900

gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

cctcgtcctt agttgccatc atgggcactc taaggaaacc gccggtgata agccggagga

1020

aggtggggat gacgtcaagt cctcatggcc cttacacgct gggctacaca cgtgctacaa

1080

tggcggtcag tgggcagcga cctcgcgagg ggtagctaat ctccgccgtc tcagttcgga

1140

tgttctctgc aactcgagag cagaaggcgg aatcgctagt aatcgcggat cagcatgccg

1200

cggtgaatgc gttcccaggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gttggattca

1260

ctcgaaggcg ttaggtaggt aggcgaccac agtgggttta gcgactgggg tgaagtcgta

1320

acaaggtagc cgtaggggaa cctgcggttg gatcacctcc tt

1362

<210> 1746

<211> 1362

<212> DNA

<213> Sphingomonas sp. oral clone FZ016

<400> 1746

gagtttgatt ctggctcaga acgaacgctg gcggcatgcc taatacatgc aagtcgaacg

60

agtggcgcac gggtgcgtaa cgcgtgggaa tctgcccttg ggttcggaat aacagctgga

120

aacggctgct aataccggat gatcaaagtc gcccagggat gagcccgcgt aggattagct

180

agttggtggg gtaaaggcct accaaggcga cgatccttag ctggtctgag aggatgatca

240

gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta gggaatattg

300

gacaatgggg gcaaccctga tccagcaatg ccgcgtgagt gatgaaggcc ttagggttgt

360

aaagctcttt tacccgagat gatgacagta tcgggagaat aagctccggc taactccgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg gagggagcta gcgttgttcg gaattactgg gcgtaaagcg

480

cacgtaggcg gcgatttaag tcagaggtga aagcccgggg ctcaaccccg gaactgcctt

540

tgagactgga ttgcttgaat ccgggagagg tgagtggaat tccgagtgta gaggtgaaat

600

tcgtagatat tcggaagaac accagtggcg aaggcggctc actggaccga ttgacgctga

660

ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga

720

tgataactag ctgccggggt ttcggtggcg cagctaacgc attaagttat ccgcctgggg

780

agtacggtcg caagattaaa actcaaagga attgacgggg gcctgcacaa gcggtggagc

840

atgtggttta attcgaagca acgcgcagaa ccttaccaac gtttgacatc gacaggtgct

900

gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

cctcgccttt agttgccagc atgggtactc taaaggaacc gccggtgata agccggagga

1020

aggtggggat gacgtcaagt cctcatgscc cttacgcgtt gggctacaca cgtgctacaa

1080

tggcgaccag tgggcagcga ccgtgcgagc ggaagctaat ctccgtcgtc tcagttcggg

1140

cgttctctgc aactcgagag cggaaggcgg aatcgctagt aatcgcggat cagcatgccg

1200

cggtgaatac gttcccaggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gttggattca

1260

ctcgaaggcg ttagctaggc aggcgaccac agtgggttta gcgactgggg tgaagtcgta

1320

acaaggtagc cgtaggggaa cctgcggctg gatcacctcc tt

1362

<210> 1747

<211> 1405

<212> DNA

<213> Sphingomonas sp. oral taxon A09

<400> 1747

agagtttgat cctggctcag aatgaacgct ggcggcatgc ctaacacatg caagtcgaac

60

gaagccttcg ggcttagtgg cgcacgggtg cgtaacgcgt gggaatctgc ccttgggttc

120

ggaataacag ttggaaacga ctgataatac cggatgatga cgtaagtcca aagatttatc

180

gcccaaggat gagcccgcgt aggattagct agttggtgag gtaaaggctc accaaggcga

240

cgatccttag ctggtctgag aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac

300

tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggc gaaagcctga tccagcaatg

360

ccgcgtgagt gatgaaggcc ttagggttgt aaagctcttt tacccgggat gataatgaca

420

gtaccgggag aataagctcc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggag

480

ctagcgttat tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgtag gcggctttgt aagttagagg

540

tgaaagccca gagctcaact ctggaattgc ctttaagact gcatcgcttg aatccaggag

600

aggtgagtgg aattccgagt gtagaggtga aattcgtaga tattcggaag aacaccagtg

660

gcgaaggcgg ctcactggac tggtattgac gctgaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca

720

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgata actagctgtt cggggactta

780

gtccgtgagt ggcgcagcta acgcattaag ttatccgcct ggggagtacg gccgcaaggt

840

taaaactcaa atgaattgac gggggcctgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga

900

agcaacgcgc agaaccttac cagcgtttga catggtagga cgactggcag agatgccttt

960

cttcccttcg gggacctaca cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1020

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac cctcgccttt agttgccatc atttagttgg

1080

gcactctaaa ggaaccgccg gtgataagcc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcctc

1140

atggccctta cgcgctgggc tacacacgtg ctacaatggc ggtgacagtg ggcagcaatc

1200

ccgcaagggg gagctaatct ccaaaagccg tctcagttcg gattgcactc tgcaactcga

1260

gtgcatgaag gcggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcac gccgcggtga atacgttccc

1320

aggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagttggg ttcacccgaa ggcgttgcgc

1380

taactcgcaa gagaggcagg cgacc

1405

<210> 1748

<211> 1450

<212> DNA

<213> Sphingomonas sp. oral taxon F71

<400> 1748

agagtttgat cctggctcag aacgaacgct ggcggcacgc ctaacacatg caagtcgaac

60

gaaggcttcg gccttagtgg cgcacgggtg cgtaacgcgt gggaatctgc ccttgggtct

120

gggataacgg cgggaaactg ccgctaatac cggatgatat cgcgagatca aagatttatc

180

gcctgaggat gagcccgcgt aggattaggt agttggtgtg gtaaaggcgc accaagccga

240

cgatccttag ctggtctgag aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac

300

tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggc gcaagcctga tccagcaatg

360

ccgcgtgagt gatgaaggcc ttagggttgt aaagctcttt tacccgggaa gataatgact

420

gtaccgggag aataagcccc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggaggggg

480

ctagcgttgt tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgtag gcggctttgt aagtcagggg

540

tgaaagcctg gagctcaact ccagaactgc ctttgagact gcatcgcttg aatccgggag

600

aggtgagtgg aattccgagt gtagaggtga aattcgtaga tattcggaag aacaccagtg

660

gcgaaggcgg ctcactggac cggtattgac gctgaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca

720

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgata actagctgtc cgggggcttg

780

gcctttgggt ggcgcagcta acgcattaag ttatccgcct ggggagtacg gccgcaaggt

840

taaaactcaa aggaattgac gggggcctgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga

900

agcaacgcgc agaaccttac cagcgtttga catgtccgga cgactggcag agatgccttt

960

cttcccttcg gggactggaa cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1020

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac cctcgccttt agttaccatc atttggttgg

1080

gtactctaaa ggaaccgccg gtgataagcc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcctc

1140

atggccctta cgcgctgggc tacacacgtg ctacaatggc ggtgacagtg ggcagcaatc

1200

ccgcgagggt gagctaatct ccaaaagccg tctcagttcg gattgttctc tgcaactcga

1260

gagcatgaag gcggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat gccgcggtga atacgttccc

1320

aggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagttggg ttcacccgaa ggcgttgcac

1380

taactcgcaa gagaggcagg cgaccacggt gggcttagcg actggggtga agtcgtaaca

1440

aggtagccgt

1450

<210> 1749

<211> 1484

<212> DNA

<213> Sphingopyxis alaskensis

<400> 1749

ttgagagttt gatcctggct cagaacgaac gctggcggca tgcctaacac atgcaagtcg

60

aacgagacct tcgggtctag tggcgcacgg gtgcgtaacg cgtgggaatc tgcccttggg

120

tacggaataa ctcagagaaa tttgagctaa taccgtataa tgacttcggt ccaaagattt

180

atcgcccaag gatgagcccg cgtaagatta gctagttggt ggggtaaagg cctaccaagg

240

cgacgatctt tagctggtct gagaggatga tcagccacac tgggactgag acacggccca

300

gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttggacaatg ggcgaaagcc tgatccagca

360

atgccgcgtg agtgatgaag gccttagggt tgtaaagctc ttttacccgg gatgataatg

420

acagtaccgg gagaataagc tccggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

480

gagctagcgt tgttcggaat tactgggcgt aaagcgcgcg taggcggttt tttaagtcag

540

aggtgaaagc ccagtgctca acactggaac tgcctttgaa actggaaaac ttgaatcttg

600

gagaggtcag tggaattccg agtgtagagg tgaaattcgt agatattcgg aagaacacca

660

gtggcgaagg cgactgactg gacaagtatt gacgctgagg tgcgaaagcg tggggagcaa

720

acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg ataactagct gtccgggttc

780

atggaacttg ggtggcgcag ctaacgcatt aagttatccg cctggggagt acggtcgcaa

840

gattaaaact caaaggaatt gacgggggcc tgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

900

cgaagcaacg cgcagaacct taccagcgtt tgacatcctg atcgcggatt agagagatct

960

tttccttcag ttcggctgga tcagtgacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg

1020

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctca tccctagttg ccatcattca

1080

gttgggcact ctaaggaaac tgccggtgat aagccggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1140

tcctcatggc ccttacgcgc tgggctacac acgtgctaca atggcaacta cagtgggcag

1200

caacctcgcg aggggtagct aatctccaaa agttgtctca gttcggattg ttctctgcaa

1260

ctcgagagca tgaaggcgga atcgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg

1320

ttcccaggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag ttggtttcac ccgaaggcag

1380

tgctctaacc cgcaagggag gaagctgacc acggtgggat cagcgactgg ggtgaagtcg

1440

taacaaggta gccgtagggg aacctgcggc tggatcacct cctt

1484

<210> 1750

<211> 1515

<212> DNA

<213> Spiroplasma insolitum

<400> 1750

tggagagttt gatcctggct caggatgaac gctggcggca tgcctaatac atgcaagtcg

60

aacggggtgc ttgcacccag tggcgaacgg gtgagtaaca cgtatctaat ctacccatta

120

gcgggggata acagttggaa acgactgcta ataccgcata cgacattttc tggcatcaga

180

gaatgttaaa aggtccgttt ggaccactaa tggatgaggg tgcggcgtat tagttagttg

240

gtggggtaat ggcctaccaa gacaatgata cgtagccgaa ctgagaggtt gaacggccac

300

atcgggactg agacacggcc cgaactccta cgggaggcag cagtagggaa tttttcacaa

360

tgggcgaaag cctgatggag caatgccgcg tgactgaaga cggtcttcgg attgtaaagg

420

tctgttgtaa gggaagaaca gtaagtatag gaaatgatac ttatttgacg gtaccttacc

480

agaaagccac ggctaactat gtgccagcag ccgcggtaat acataggtgg caagcgttat

540

ccggatttat tgggcgtaaa gcgtgcgcag acggtttaac aagtttgggg tcaaattctg

600

gagcttaact ccagttcgcc ttgaaaactg ttaagctaga gtgtaggaga ggtcgatgga

660

attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat atatggagga acaccagtgg cgaaggcggt

720

cgactggcct atcactgacg tttaggcacg aaagcgtagg gagcaaatag gattagatac

780

cctagtagtc tacgccgtaa acgatgagta ctaagtgtcg gactaagttc ggtgctgcag

840

ctaacgcatt aagtactccg cctgagtagt atgctcgcaa gagtgaaact caaaggaatt

900

gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct

960

taccaaggct tgacatccag tgcaaagctg tagaaataca gtggaggtta acattgagac

1020

aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt ttggttaagt ccagtaacga

1080

gcgcaaccct tgccgttagt tactccatta agttgagata ctctaacggg actgctagtg

1140

taagctagag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgtc ttgggctaca

1200

cacgtgctac aatggccggt acaaacagtt gcgatctcgt aagagggagc taatctgaaa

1260

aagccggtct cagttcggat tgagggctgc aactcgccct cataaagccg gaatcgctag

1320

taatcgcgaa tcagcaatgt cgcggtgaat acgttctcgg gtcttgtaca caccgcccgt

1380

cacaccatga gagttgataa taccagaagt cggtattcta accgtaagga ggaagccgcc

1440

caaggtagga ttgatgatta gggtgaagtc gtaacaaggt atccgtacga gaacgtgcgg

1500

ctggatcacc tcctt

1515

<210> 1751

<211> 1506

<212> DNA

<213> Sporobacter termitidis

<220>

<221> modified_base

<222> (361)..(361)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (377)..(377)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (863)..(863)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1094)..(1094)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1104)..(1104)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1110)..(1110)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1751

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgaac

60

ggagacaatt ggttcgctga ttgtcttagt ggcggacggg tgagtaacgc gtgagcaatc

120

tgcccttcgg agggggacaa cagctggaaa cggctgctaa taccgcataa tgtatattca

180

aggcatcttg gatataccaa agatttatcg ccgaaggatg agctcgcgtc tgattagcta

240

gttggtgagg taaaggctca ccaaggctgc gatcagtagc cggactgaga ggttgaacgg

300

ccacattgga actgagatac gggccagact cctacgggag ggagcagtgg ggaattttgg

360

ncaatggggg aaagccntac ccagcaacgc cgcgtgaagg aagaaggcct tcgggttgta

420

aacttctttg accagggacg aaacaaatga cggtacctgg aaaacaagcc acggctaact

480

acgtgccagc agccgcggta ttacgtaggt ggcaagcgtt gtccggattt actgggtgta

540

aagggcgcgt aggcgggagt acaagtcaga tgtgaaatct gggggcttaa ccctcaaact

600

gcatttgaaa ctgtatttct tgagtatcgg agaggcaggc ggaattccta gtgtagcggt

660

gaaatgcgtt gatattagga ggaacaccag tggcgaaggc ggcctgctgg acgacaactg

720

actctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgctg

780

taaacgatga atactaggtg tggggggact gaccccctcc gtgccggagt taacacaata

840

agtattccac ctggggagta cgnccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc

900

gcacaagcag tggattatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accagggctt

960

gacatcgtac taacgaagca gagatgcatt aggtgccctt ccggggaaag tatagacagg

1020

tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1080

caacccctat tgtnatttgc tacncgagan cactctagcg aggctgccga tgacaaaccg

1140

gaggaaggtg gggacgacgt caaatcatca tgccccttat gtcctgggct acacacgtaa

1200

tacaatgtct ctcacagagg gaagcaagac cgcgaggtgg agcaaatccc taaaatgcgt

1260

ctcagttcag attgcaggct gcaactcgcc tgcatgaagt cggaattgct agtaatcgcg

1320

gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg

1380

agagccggga acacccgaag tccgtagtct aaccgcaagg gggacgcggc cgaaggtggg

1440

tttggtaatt ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgcg gctggatcac

1500

ctcctt

1506

<210> 1752

<211> 1503

<212> DNA

<213> Sporolactobacillus inulinus

<220>

<221> modified_base

<222> (62)..(62)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (174)..(174)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (243)..(243)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1752

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc gcacagaagg gagcttgctc

60

cnggacgtga gcggcggatg ggtgagtaac acgtgggcaa cctgcctgta agacggggat

120

aacttcggga aaccggagct aataccggat aatccctcgc accgcatggt gcgnggttga

180

aagatggttt cggccatcac ttacagatgg gcccgcggtg cattagttag ttggcggggt

240

aanggcccac caagaccgcg atgcatagcc gacctgagag ggtgatcggc cacattggga

300

ctgagacacg gcccaaactc ctacgggagg cagcagtagg gaatcttcca caatggacga

360

aagtctgatg gagcaacgcc gcgtgagcga agaaggtttt cggatcgtaa agctctgttg

420

ccggagaaga acgagtgcca gaggaaatgc tggtgctgtg acggtatccg gccagaaagc

480

cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt tgtccggaat

540

tattgggcgt aaagcgcgcg caggcggctt cttaagtctg atgtgaaatc ttgcggctca

600

accgcaaaag gtcattggaa actggggagc ttgagtgcag aagaggagag tagaattcca

660

cgtgtagcgg tgaaatgcgt agagatgtgg aggaatacca gtggcgaagg cggctctctg

720

gtctgttact gacgctgagg tgcgaaagca tggggagcaa acaggattag ataccctggt

780

agtccatgcc gtaaacgatg aatgctaggt gttagggggg tccaacccct tagtgctgaa

840

gttaacacat taagcattcc gcctggggag tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat

900

tgacgggggc ccgcacaagc agtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc

960

ttaccaggtc ttgacatcct ctgacaagtc tagagatagg ccgttcccct tcgggggaca

1020

gagtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1080

gcaacgagcg caacccttga tcttagttgc cagcattaag ttgggcactc taaggtgact

1140

gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgatct

1200

gggctacaca cgtgctacaa tgggcggtac aaagggcagc gaaaccgcaa ggtcaagcca

1260

atcccataaa gccgccccca gttcggattg caggctgcaa ctcgcctgca tgaagccgga

1320

attgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatccg ttcccgggcc ttgtacacac

1380

cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccgaagtcgg tgtgggaacc tttatggacc

1440

cagccgccga aggtgggaca aatgattggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtatcgga

1500

agg

1503

<210> 1753

<211> 1518

<212> DNA

<213> Sporolactobacillus nakayamae

<400> 1753

tttcctggct caggacgaac gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg agcgcattga

60

agggagcttg ctcccggatg tgagcggcgg atgggtgagt aacacgtggg taacctgcct

120

gtcagattgg gataactgtg ggaaaccgca gctaataccg aatgatcccc tgcaccacat

180

ggtgcagggt tgaaagatgg tttcggccat cactgacaga tgggcccgcg gtgcattagt

240

tagttggcgg ggtaacggcc caccaagaca gcgatgcata gccgacctga gagggtgatc

300

ggccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

360

ccacaatgga cgaaagtctg atggagcaac gccgcgtgag cgaagaaggt tttcggatcg

420

taaagctctg ttgccggaga agaatgagta tgagaggaaa tgcttgtact gtgacggtat

480

ccggccagaa agccacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag

540

cgttgtccgg aattattggg cgtaaagcgc gcgcaggcgg cttcttaagt ctgatgtgaa

600

atcttgcggc tcaaccgcaa atggtcattg gaaactggga agcttgagtg cagaagagga

660

gagtagaatt ccacgtgtag cggtgaaatg cgtagatatg tggaggaata ccagtggcga

720

aggcggctct ctggtctgta actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag caaacaggat

780

tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgaatgcta ggtgttaggg ggtccaaccc

840

ttagtgctga agttaacaca ttaagcattc cgcctgggga gtacgaccgc aaggttgaaa

900

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cagtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa

960

cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcc tctgacaagt ctagagatag gccgttcccc

1020

ttcgggggac agagtgacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg atcttagttg ccagcattca gttgggcact

1140

ctaaggtgac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc

1200

ccttatgatc tgggctacac acgtgctaca atgggtggta caaagggcag cgaaaccgcg

1260

aggtcaagcg aatcccataa agccaccccc agttcggatt gcaggctgca actcgcctgc

1320

atgaagccgg aattgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatcc gttcccgggc

1380

cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gtttgtaaca cccgaagtcg gtgcgagaac

1440

ctttatgggc tcagccgccg aaggtgggac agatgattgg ggtgaagtcg taacaaggta

1500

gccgtatcgg aaggtgcg

1518

<210> 1754

<211> 1539

<212> DNA

<213> Sporosarcina newyorkensis

<400> 1754

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

gaatctttgg gagcttgctc ccaaagatta gcggcggacg ggtgagtaac acgtgggcaa

120

cctaccttac agatggggat aactccggga aaccggggct aataccgaat aatccatttc

180

ttcgcatgaa gagatgttga aagacggttt cggctgtcac tgtgagatgg gcccgcggcg

240

cattagttag ttggtggggt aacggcctac caagaccacg atgcgtagcc gacctgagag

300

ggtgatcggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg

360

gaatcttcca caatggacga aagtctgatg gagcaacgcc gcgtgagtga agaaggtttt

420

cggatcgtaa agctctgttg taagggaaga acacgtacag gagtaactgc ctgtaccttg

480

acggtacctt accagaaagc cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg

540

tggcaagcgt tgtccggaat tattgggcgt aaagcgcgcg caggcggtcc tttaagtctg

600

atgtgaaagc ccacggctca accgtggagg gtcattggaa actggaggac ttgagtacag

660

aagaggaaag cggaattcca cgtgtagcgg tgaaatgcgt agagatgtgg aggaacacca

720

gtggcgaagg cggctttctg gtctgtaact gacgctgagg cgcgaaagcg tggggagcaa

780

acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaagt gttagggggt

840

ttccgcccct tagtgctgca gctaacgcat taagcactcc gcctggggag tacggccgca

900

aggctgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatccc gctgcccggc atggagacat

1020

gctttccctt cggggacagc ggtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1080

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttaat cttagttgcc atcattcagt

1140

tgggcactct aaggtgactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc

1200

atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat ggacggtaca gagggctgca

1260

aacccgcgag ggggagccaa tcccacaaaa ccgttcccag ttcggattgc aggctgcaac

1320

tcgcctgcat gaagccggaa tcgctagtaa tcgtggatca gcatgccacg gtgaatacgt

1380

tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc cgaagtcggt

1440

ggggtaaccc ttacgggagc cagccgccga aggtgggaca gatgattggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct ggatcacct

1539

<210> 1755

<211> 1474

<212> DNA

<213> Sporosarcina sp. 2681

<400> 1755

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc gratcttygg gagcttgctc

60

cyraagrtta gcggcggacg ggtgagtaac acgtgggcaa cctaccttac agatggggat

120

aactccggga aaccggggct aataccgaat aatccatytc ttcgcatgra gagatgttga

180

aagacggttt cggctgtcac tgtgagatgg gcccgcggcg cattagttag ttggtggggt

240

aacggcctac caagaccacg atgcgtagcc gacctgagag ggtgatcggc cacactggga

300

ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatcttcca caatggacga

360

aagtctgatg gagcaacgcc gcgtgagtga agaaggtttt cggatcgtaa agctctgttg

420

taagggaaga acacgtacag gagtaactgc ctgtaccttg acggtacctt accagaaagc

480

cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt tgtccggaat

540

tattgggcgt aaagcgcgcg caggcggtcc tttaagtctg atgtgaaagc ccacggctca

600

accgtggagg gtcattggaa actggaggac ttgagtacag aagaggaaag cggaattcca

660

cgtgtagcgg tgaaatgcgt agagatgtgg aggaacacca gtggcgaagg cggctttctg

720

gtctgtaact gacgctgagg cgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt

780

agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaagt gttagggggt ttccgcccct tagtgctgca

840

gctaacgcat taagcactcc gcctggggag tacggccgca aggctgaaac tcaaaggaat

900

tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc

960

ttaccaggtc ttgacatccc gctgcccggc atggagacat gcytttccct tcggggacag

1020

cggtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc

1080

gcaacgagcg caacccttaa tcttagttgc catcattyag ttgggcactc taaggtgact

1140

gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct

1200

gggctacaca cgtgctacaa tggacggtac agagggctgc aaacccgcga gggggagcca

1260

atcccacaaa accgttccca gttcggattg caggctgcaa ctcgcctgca tgaagccgga

1320

atcgctagta atcgtggatc agcatgccac ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac

1380

cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccgaagtcgg tggggtaacc cttacgggag

1440

ccagccgccg aaggtgggac agatgattgg ggtg

1474

<210> 1756

<211> 1509

<212> DNA

<213> Staphylococcaceae bacterium NML 92-0017

<400> 1756

gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc gcgactgatt acaccgtyct

60

tcggracacc gtaatcatcg agcggcggac gggtgagtaa cacgtgggca acctaccctt

120

aagactggga taaccgcggg aaaccgtggc taataccgga taatactttt atacaacggt

180

atagaagttg aaaggtggat ttctatcact taaggatggg cctgcggcgc attagctggt

240

tggtaaggta acggcttacc aaggcgacga tgcgtagccg acctgagagg gtgatcggcc

300

acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtaggg aatcttccgc

360

aatgggcgaa agcctgacgg agcaacgccg cgtgtgcgaa gaaggtcttc ggatcgtaaa

420

gcactgttgt taaggaagaa cgacagtaag agtaactgyt tactgtgtga cggtacttaa

480

ccagaaagcc acggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgtt

540

atccggaatt attgggcgta aagcgcgcgt aggcggcgag attagtctga tgtgaaagcc

600

cccggctcaa ccggggaagg tcattggaaa ctgtttcgct tgagtgcaga agaggagagt

660

ggaattccat gtgtagcggt gaaatgcgca gagatatgga ggaacaccag tggcgaaggc

720

ggctctctgg tctgcaactg acgctgatgt gcgaaagcgt ggggatcaaa caggattaga

780

taccctggta gtccacgccg taaacgatga gtgctaagtg ttagggggtt tccgcccctt

840

agtgctgcag caaacgcatt aagcactccg cctggggagt acggccgcaa ggctgaaact

900

caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg

960

cgaagaacct taccaaatct tgacatcctc tgaccgtcat ggagacatga ttttcccttt

1020

gggacagaga gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1080

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttaacttt agttgccatc attcagttgg gcactctaga

1140

gtgactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta

1200

tgatttgggc gacacacgtg ctacaatgga caggaacaaa gggcagcgaa actgtgaagt

1260

caagcgaatc ccataaaact gttctcagtt cggattggag tctgcaactc gactccatga

1320

agctggaatc gctagtaatc gtggatcaga atgccacggt gaatacgttc ccgggtcttg

1380

tacacaccgc ccgtcacacc acgaaagttg gtaacacctg aagccggtgg cctaaccatt

1440

tggagggagc cgtcgaaggt gggaccgatg attggggtga agtcgtaaca aggtagccgt

1500

atcggaagg

1509

<210> 1757

<211> 1401

<212> DNA

<213> Staphylococcus aureus

<220>

<221> modified_base

<222> (48)..(48)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1392)..(1392)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1757

agcgaacgga cgagaagctt gcttctctga tgttagcggc ggacgggnga gtaacacgtg

60

gataacctac ctataagact gggataactt cgggaaaccg gagctaatac cggataatat

120

tttgaaccgc atggttcaaa agtgaaagac ggtcttgctg tcacttatag atggatccgc

180

gctgcattag ctagttggta aggtaacggc ttaccaaggc aacgatgcat agccgacctg

240

agagggtgat cggccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag

300

tagggaatct tccgcaatgg gcgaaagcct gacggagcaa cgccgcgtga gtgatgaagg

360

tcttcggatc gtaaaactct gttattaggg aagaacatat gtgtaagtaa ctgtgcacat

420

cttgacggta cctaatcaga aagccacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

taggtggcaa gcgttatccg gaattattgg gcgtaaagcg cgcgtaggcg gttttttaag

540

tctgatgtga aagcccacgg ctcaaccgtg gagggtcatt ggaaactgga aaacttgagt

600

gcagaagagg aaagtggaat tccatgtgta gcggtgaaat gcgcagagat atggaggaac

660

accagtggcg aaggcgactt tctggtctgt aactgacgct gatgtgcgaa agcgtgggga

720

tcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aagtgttagg

780

gggtttccgc cccttagtgc tgcagctaac gcattaagca ctccgcctgg ggagtacgac

840

cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

900

taattcgaag caacgcgaag aaacttacca aatcttgaca tcctttgacc actctagaga

960

tagagccttc cccttcgggg gacaaagtga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1020

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttaagcttag ttgccatcat

1080

taagttgggc actctaagtt gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1140

aaatcatcat gccccttatg atttgggcta cacacgtgct acaatggaca atacaaaggg

1200

cagcgaaacc gcgaggtcaa gcaaatccca taaagttgtt ctcagttcgg attgtagtct

1260

gcaactcgac tacatgaagc tggaatcgct agtaatcgta gatcagcatg ctacggtgaa

1320

tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta acacccgaag

1380

ccggtggagt anccttttag g

1401

<210> 1758

<211> 1410

<212> DNA

<213> Staphylococcus auricularis

<400> 1758

tcgagcgaac agataaggag cttgctcctt tgacgttagc ggcggacggg tgagtaacac

60

gtgggtaacc tacctataag actggaataa ctccgggaaa ccggggctaa tgccggataa

120

catgttgaac cgcatggttc tacagtgaaa ggcggctttg ctgtcactta tagatggacc

180

cgcgccgtat tagctagttg gtgaggtaac ggctcaccaa ggcaacgata cgtagccgac

240

ctgagagggt gatcggccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag

300

cagtagggaa tcttccgcaa tgggcgaaag cctgacggag caacgccgcg tgagtgatga

360

aggtcttcgg atcgtaaaac tctgttatta gggaagaaca aatgcgtaag taactgtgcg

420

cgtcttgacg gtacctaatc agaaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtaggtgg caagcgttat ccggaattat tgggcgtaaa gcgcgcgtag gcggtttttt

540

aagtctgatg tgaaagccca cggctcaacc gtggagggtc attggaaact gaaaaacttg

600

agtgcagaag aggaaagtgg aattccatgt gtagcggtga aatgcgcaga gatatggagg

660

aacaccagtg gcgaaggcga ctttctggtc tgtaactgac gctgatgtgc gaaagcgtgg

720

ggatcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt gctaagtgtt

780

aggggggttt ccgcccctta gtgctgcagc taacgcatta mgcactccgc ctggggagta

840

cggccgcaag gcttaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt

900

ggtttaaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaaatct tgacatcctt tgaccgctct

960

agagatagag tcttcccctt cgggggacaa agtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

1020

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttaag cttagttgcc

1080

atcattcagt tgggcactct aagttgactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg

1140

acgtcaaatc atcatgcccc ttatgatttg ggctacacac gtgctacaat ggacaataca

1200

aagggcagcg aaaccgcgag gtcaagcaaa tcccataaag ttgttctcag ttcggattgt

1260

agtctgcaac tcgactacat gaagctggaa tcgctagtaa tcgtagatca gcatgctacg

1320

gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc

1380

cgaagtcggt agagtaacct tttggagcta

1410

<210> 1759

<211> 1549

<212> DNA

<213> Staphylococcus capitis

<400> 1759

tggagagttt gatcctggct caggatgaac gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg

60

agcgaacaga cgaggagctt gctcctctga cgttagcggc ggacgggtga gtaacacgtg

120

gataacctac ctataagact gggataactt cgggaaaccg gagctaatac cggataacat

180

gttgaaccgc atggttcaac agtgaaagac ggtcttgctg tcacttatag atggatccgc

240

gccgcattag ctagttggta aggtaacggc ttaccaaggc aacgatgcgt agccgacctg

300

agagggtgat cggccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag

360

tagggaatct tccgcaatgg gcgaaagcct gacggagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg

420

tcttcggatc gtaaaactct gttattaggg aagaacaaat gtgtaagtaa ctatgcacgt

480

cttgacggta cctaatcaga aagccacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

taggtggcaa gcgttatccg gaattattgg gcgtaaagcg cgcgtaggcg gttttttaag

600

tctgatgtga aagcccacgg ctcaaccgtg gagggtcatt ggaaactgga aaacttgagt

660

gcagaagagg aaagtggaat tccatgtgta gcggtgaaat gcgcagagat atggaggaac

720

accagtggcg aaggcgactt tctggtctgt aactgacgct gatgtgcgaa agcgtgggga

780

tcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aagtgttagg

840

gggtttccgc cccttagtgc tgcagctaac gcattaagca ctccgcctgg ggagtacgac

900

cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

960

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca aatcttgaca tcctctgacc cctctagaga

1020

tagagttttc cccttcgggg gacagagtga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1080

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttaagcttag ttgccatcat

1140

taagttgggc actctaagtt gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1200

aaatcatcat gccccttatg atttgggcta cacacgtgct acaatggaca atacaaaggg

1260

tagcgaaacc gcgaggtcaa gcaaatccca taaagttgtt ctcagttcgg attgtagtct

1320

gcaactcgac tacatgaagc tggaatcgct agtaatcgta gatcagcatg ctacggtgaa

1380

tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta acacccgaag

1440

ccggtggagt aaccttttgg agctagccgt cgaaggtggg acaaatgatt ggggtgaagt

1500

cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctttct

1549

<210> 1760

<211> 1551

<212> DNA

<213> Staphylococcus caprae

<400> 1760

tggagagttt gatcctggct caggatgaac gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg

60

agcgaacaga cgaggagctt gctcctttga cgttagcggc ggacgggtga gtaacacgtg

120

gataacctac ctataagact gggataactt cgggaaaccg gagctaatac cggataacat

180

gttgaaccgc atggttcaac agtgaaagac ggtcttgctg tcacttatag atggatccgc

240

gccgcattag ctagttggta aggtaacggc ttaccaaggc aacgatgcgt agccgacctg

300

agagggtgat cggccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag

360

tagggaatct tccgcaatgg gcgaaagcct gacggagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg

420

tcttcggatc gtaaaactct gttattaggg aagaacaaat gtgtaagtaa ctatgcacgt

480

cttgacggta cctaatcaga aagccacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

taggtggcaa gcgttatccg gaattattgg gcgtaaagcg cgcgtaggcg gttttttaag

600

tctgatgtga aagcccacgg ctcaaccgtg gagggtcatt ggaaactgga aaacttgagt

660

gcagaagagg aaagtggaat tccatgtgta gcggtgaaat gcgcagagat atggaggaac

720

accagtggcg aaggcgactt tctggtctgt aactgacgct gatgtgcgaa agcgtgggga

780

tcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aagtgttagg

840

gggtttccgc cccttagtgc tgcagctaac gcattaagca ctccgcctgg ggagtacgac

900

cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

960

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca aatcttgaca tcctctgatc ccctctagag

1020

atagagtttt ccccttcggg ggacagagtg acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt

1080

gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttaagctta gttgccatca

1140

ttaagttggg cactctaagt tgactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt

1200

caaatcatca tgccccttat gatttgggct acacacgtgc tacaatggac aatacaaagg

1260

gtagcgaaaa ccgcgaggtc aagcaaatcc cataaagttg ttctcagttc ggattgtagt

1320

ctgcaactcg actacatgaa gctggaatcg ctagtaatcg tagatcagca tgctacggtg

1380

aatacgttcc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagtttg taacacccga

1440

agccggtgga gtaacctttt ggagctagcc gtcgaaggtg ggacaaatga ttggggtgaa

1500

gtcgtaacaa ggtagccgta tcggaaggtg cggctggatc acctcctttc t

1551

<210> 1761

<211> 1555

<212> DNA

<213> Staphylococcus carnosus

<400> 1761

ttttatggag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca

60

agtcgagcga acagacgagg agcttgctcc tctgacgtta gcggcggacg ggtgagtaac

120

acgtgggtaa cctacctata agactggaat aactccggga aaccggggct aatgccggat

180

aatatgcaga accgcatggt tctgcaatga aagacggttt tgctgtcact tatagatgga

240

cccgcgccgt attagctagt tggtaaggta acggcttacc aaggcaacga tacgtagccg

300

acctgagagg gtgatcggcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc

360

agcagtaggg aatcttccgc aatgggcgaa agcctgacgg agcaacgccg cgtgagtgat

420

gaaggtcttc ggatcgtaaa actctgttat tagggaagaa caagtgcgta ggtaactatg

480

cgcaccttga cggtacctaa tcagaaagcc acggctaact acgtgccagc agccgcggta

540

atacgtaggt ggcaagcgtt atccggaatt attgggcgta aagcgcgcgt aggcggtttt

600

ttaagtctga tgtgaaagcc cacggctcaa ccgtggaggg tcattggaaa ctggaaaact

660

tgagtgcaga agaggaaagt ggaattccat gtgtagcggt gaaatgcgca gagatatgga

720

ggaacaccag tggcgaaggc gactttctgg tctgcaactg acgctgatgt gcgaaagcgt

780

ggggatcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga gtgctaagtg

840

ttagggggtt tccgcccctt agtgctgcag ctaacgcatt aagcactccg cctggggagt

900

acggccgcaa ggctgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg

960

tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaaatct tgacatcctt tgaccgctct

1020

agagatagag tcttcccctt cgggggacaa agtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

1080

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttaag cttagttgcc

1140

agcattaagt tgggcactct aagttgactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg

1200

acgtcaaatc atcatgcccc ttatgatttg ggctacacac gtgctacaat ggacagtaca

1260

aagggcagcg aaaccgcgag gtcaagcaaa tcccataaag ctgttctcag ttcggattgt

1320

agtctgcaac tcgactacat gaagctggaa tcgctagtaa tcgtagatca gcatgctacg

1380

gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt tcgtaacacc

1440

cgaagccggt ggagtaacct tttaggagct agccgtcgaa ggtgggacga atgattgggg

1500

tgaagtcgta acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1555

<210> 1762

<211> 1232

<212> DNA

<213> Staphylococcus cohnii

<400> 1762

gcaagtcgag cgagcggcgg acgggtgagt aacacgtggg taacctacct ataagactgg

60

aataactccg ggaaaccggg gctaatgccg gataacgaaa gttacttata gatggacccg

120

cgccgtatta gctagttggt aaggtaacgg cttaccaagg caacgaaacg tagccgacct

180

gagaggggga tcgtccacac tggaactgag acacggtcca gactcctacc ggaggcagca

240

gtagggaatc ttccgcaatg ggcgaaagcc tgacggagca acgccgcgtg agtgatgaag

300

gtcttcggat cgtaaaactc tgttattagg gaagatgacg gtacctaatc agaaagccac

360

ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg caagcgttat ccggaattat

420

tgggcgtaaa gcgcgcgtag gcggtttctt aagtctgatg tgaaagccca cggctcaacc

480

gtggagggtc attggaaact gggaaacttg agtgcagaag aggaaagtgg aattccatgt

540

gtagcggtga aatgcgcaga gatatggagg aacaccagtg gcgaaggcga ctttctggtc

600

tgactgacgc tgatgtgcga aagcgtgggg atcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

660

acgccgtaaa cgatgagtgc taagtgttag ggccttagtg ctgcagctaa cgcattaagc

720

actccgcctg gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca

780

caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc aaatcttgac

840

atcgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg

900

caacgagcgc aacccttaaa cttagttgcc agcatgggca ctctaagttg actgccggtg

960

acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga tttgggctac

1020

acacgtgcta caatggacaa caaagggcag ctaaaccgcg aggtcatgca aatcccattt

1080

gttctcagtt cggatgtagt ctgcaactcg actacagaag ctggaatcgc tagtaatcgt

1140

agatcagcat gctacggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccac

1200

gagagtttgt aacacccgaa gccggtgagt ag

1232

<210> 1763

<211> 1545

<212> DNA

<213> Staphylococcus condimenti

<220>

<221> modified_base

<222> (11)..(12)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1763

agagtttgat nntggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

gaacagatga ggagcttgct cctctgacgt tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggt

120

aacctaccta taagactgga ataactccgg gaaaccgggg ctaatgccgg ataatatgcg

180

gaaccgcatg gttctgcaat gaaagacggt tttgctgtca cttatagatg gacccgcgcc

240

gtattagcta gttggtaagg taacggctta ccaaggcaac gatacgtagc cgacctgaga

300

gggtgatcgg ccacactgga actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtag

360

ggaatcttcc gcaatgggcg aaagcctgac ggagcaacgc cgcgtgagtg atgaaggtct

420

tcggatcgta aaactctgtt attagggaag aacaagtgcg taggtaacta tgcgcacctt

480

gacggtacct aatcagaaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

540

gtggcaagcg ttatccggaa ttattgggcg taaagcgcgc gtaggcggtt ttttaagtct

600

gatgtgaaag cccacggctc aaccgtggag ggtcattgga aactggaaaa cttgagtgca

660

gaagaggaaa gtggaattcc atgtgtagcg gtgaaatgcg cagagatatg gaggaacacc

720

agtggcgaag gcgactttct ggtctgcaac tgacgctgat gtgcgaaagc gtggggatca

780

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctaag tgttaggggg

840

tttccgcccc ttagtgctgc agctaacgca ttaagcactc cgcctgggga gtacggccgc

900

aaggctgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

960

ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaaat cttgacatcc tttgaccgct ctagagatag

1020

agtcttcccc ttcgggggac aaagtgacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg

1080

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta agcttagttg ccagcattaa

1140

gttgggcact ctaagttgac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1200

tcatcatgcc ccttatgatt tgggctacac acgtgctaca atggacagta caaagggcag

1260

cgaaaccgcg aggtcaagca aatcccataa agctgttctc agttcggatt gtagtctgca

1320

actcgactac atgaagctgg aatcgctagt aatcgtagat cagcatgcta cggtgaatac

1380

gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gttcgtaaca cccgaagccg

1440

gtggagtaac cttttaggag ctagccgtcg aaggtgggac gaatgattgg ggtgaagtcg

1500

taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcacct ccttt

1545

<210> 1764

<211> 1395

<212> DNA

<213> Staphylococcus epidermidis

<400> 1764

tcgagcgaac agacgaggag cttgctcctc tgacgttagc ggcggacggg tgagtaacac

60

gtggataacc tacctataag actgggataa cttcgggaaa ccggagctaa taccggataa

120

tatattgaac cgcatggttc aatagtgaaa gacggttttg ctgtcactta tagatggatc

180

cgcgccgcat tagctagttg gtaaggtaac ggcttaccaa ggcaacgatg cgtagccgac

240

ctgagagggt gatcggccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag

300

cagtagggaa tcttccgcaa tgggcgaaag cctgacggag caacgccgcg tgagtgatga

360

aggtcttcgg atcgtaaaac tctgttatta gggaagaaca aatgtgtaag taactatgca

420

cgtcttgacg gtacctaatc agaaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtaggtgg caagcgttat ccggaattat tgggcgtaaa gcgcgcgtag gcggtttttt

540

aagtctgatg tgaaagccca cggctcaacc gtggagggtc attggaaact ggaaaacttg

600

agtgcagaag aggaaagtgg aattccatgt gtagcggtga aatgcgcaga gatatggagg

660

aacaccagtg gcgaaggcga ctttctggtc tgtaactgac gctgatgtgc gaaagcgtgg

720

ggatcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt gctaagtgtt

780

agggggtttc cgccccttag tgctgcagct aacgcattaa gcactccgcc tggggagtac

840

gaccgcaagg ttgaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggagcatgtg

900

gtttaattcg aagcaacgcg aagaagctta ccaaatcttg acatcctctg acccctctag

960

agatagagtt ttccccttcg ggggacagag tgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

1020

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttaagct tagttgccat

1080

cattaagttg ggcactctaa gttgactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac

1140

gtcaaatcat catgcccctt atgatttggg ctacacacgt gctacaatgg acaatacaaa

1200

gggcagcgaa accgcgaggt caagcaaatc ccataaagtt gttctcagtt cggattgtag

1260

tctgcaactc gactatatga agctggaatc gctagtaatc gtagatcagc atgctacggt

1320

gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc acgagagttt gtaacacccg

1380

aagccggtgg agtaa

1395

<210> 1765

<211> 1494

<212> DNA

<213> Staphylococcus equorum

<400> 1765

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

gaacggataa ggagcttgct cctttgaagt tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggt

120

aacctaccta taagactgga ataacttcgg gaaaccggag ctaatgccgg ataacatttg

180

gaaccgcatg gttctaaagt aaaagatggt tttgctatca cttatagatg gacccgcgcc

240

gtattagcta gttggtaagg taacggctta ccaaggcaac gatacgtagc cgacctgaga

300

gggtgatcgg ccacactgga actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtag

360

ggaatcttcc gcaatggacg aaagtctgac ggagcaacgc cgcgtgagtg atgaaggttt

420

tcggatcgta aaactctgtt attagggaag aacaaatgtg taagtaactg tgcacatctt

480

gacggtacct aatcagaaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

540

gtggcaagcg ttatccggaa ttattgggcg taaagcgcgc gtaggcggtt tcttaagtct

600

gatgtgaaag cccacggctc aaccgtggag ggtcattgga aactgggaaa cttgagtaca

660

gaagaggaaa gtggaattcc atgtgtagcg gtgaaatgcg cagagatatg gaggaacacc

720

agtggcgaag gcgactttct ggtctgtaac tgacgctgat gtgcgaaagc gtggggatca

780

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctaag tgttaggggg

840

tttccgcccc ttagtgctgc agctaacgca ttaagcactc cgcctgggga gtacgaccgc

900

aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

960

ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaaat cttgacatcc tttgaaaact ctagagatag

1020

agccttcccc ttcgggggac aaagtgacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg

1080

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta aacttagttg ccagcattta

1140

gttgggcact ctaggttgac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1200

tcatcatgcc ccttatgatt tgggctacac acgtgctaca atggacaata caaagggcag

1260

ctaaaccgcg aggtcatgca aatcccataa agttgttctc agttcggatt gtagtctgca

1320

actcgactac atgaagctgg aatcgctagt aatcgtagat cagcatgcta cggtgaatac

1380

gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gtttgtaaca cccgaagccg

1440

gtggagtaac catttatgga gctagccgtc gaaggtggga caaatgattg gggt

1494

<210> 1766

<211> 1454

<212> DNA

<213> Staphylococcus fleurettii

<400> 1766

agctggcggc gtgcctaata catgcaagtc gagcgaacag atgagaagct tgcttctctg

60

atgttagcgg cggacgggtg agtaacacgt gggtaaccta cctataagac tgggataact

120

ccgggaaacc ggggctaata cctgataata ttttgaaccg catggttcga tagtgaaagg

180

cggcttcggc tgtcacttat agatggaccc gcgccgtatt agctagttgg taaggtaatg

240

gcttaccaag gcgacgatac gtagccgacc tgagagggtg atcggccaca ctggaactga

300

gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtagggaat cttccgcaat gggcgaaagc

360

ctgacggagc aacgccgcgt gagtgatgaa ggttttcgga tcgtaaaact ctgttgttag

420

ggaagaacaa atttgttagt aactgaacaa gtcttgacgg tacctaacca gaaagccacg

480

gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttatc cggaattatt

540

gggcgtaaag cgcgcgtagg cggtttctta agtctgatgt gaaagcccac ggctcaaccg

600

tggagggtca ttggaaactg gggaacttga gtgcagaaga ggagagtgga attccatgtg

660

tagcggtgaa atgcgcagag atatggagga acaccagtgg cgaaggcggc tctctggtct

720

gtaactgacg ctgatgtgcg aaagcgtggg gatcaaacag gattagatac cctggtagtc

780

cacgccgtaa acgatgagtg ctaagtgtta gggggtttcc gccccttagt gctgcagcta

840

acgcattaag cactccgcct ggggagtacg accgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac

900

ggggacccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac

960

caaatcttga catcctttga tcgctctaga gatagagtct tccccttcgg gggacaaagt

1020

gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1080

cgagcgcaac ccttaagctt agttgccatc attaagttgg gcactctagg ttgactgccg

1140

gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgatttgggc

1200

tacacacgtg ctacaatgga taatacaaag ggcagcgaac ccgcgaggtc aagcaaatcc

1260

cataaaatta ttctcagttc ggattgtagt ctgcaactcg actacatgaa gctggaatcg

1320

ctagtaatcg tagatcagca tgctacggtg aatacgttcc cgggtcttgt gaacaccgcc

1380

cgtcacacca cgagagtctg taacacccga aagccggtgg agtaaccttt tattaggagc

1440

tagccgtcga aggt

1454

<210> 1767

<211> 1549

<212> DNA

<213> Staphylococcus haemolyticus

<400> 1767

tggagagttt gatcctggct caggatgaac gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg

60

agcgaacaga caaggagctt gctcctttga cgttagcggc ggacgggtga gtgacacgtg

120

ggtaacctac ctataagact gggataactt cgggaaaccg gagctaatac cggataatat

180

ttcgaaccgc atggttcgat agtgaaagat ggttttgcta tcacttatag atggacccgc

240

gccgtattag ctagttggta aggtaacggc ttaccaaggc gacgatacgt agccgacctg

300

agagggtgat cggccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag

360

tagggaatct tccgcaatgg gcgaaagcct gacggagcaa cgccgcgtga gtgatgaagg

420

tcttcggatc gtaaaactct gttattaggg aagaacatac gtgtaagtaa ctatgcacgt

480

cttgacggta cctaatcaga aagccacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

taggtggcaa gcgttatccg gaattattgg gcgtaaagcg cgcgtaggcg gttttttaag

600

tctgatgtga aagcccacgg ctcaaccgtg gagggtcatt ggaaactgga aaacttgagt

660

gcagaagagg aaagtggaat tccatgtgta gcggtgaaat gcgcagagat atggaggaac

720

accagtggcg aaggcgactt tctggtctgt aactgacgct gatgtgcgaa agcgtgggga

780

tcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aagtgttagg

840

gggtttccgc cccttagtgc tgcagctaac gcattaagca ctccgcctgg ggagtacgac

900

cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

960

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca aatcttgaca tcctttgaca actctagaga

1020

tagagccttc cccttcgggg gacaaagtga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1080

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttaagtttag ttgccatcat

1140

taagttgggc actctaagtt gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1200

aaatcatcat gccccttatg atttgggcta cacacgtgct acaatggaca atacaaaggg

1260

cagcgaaatc gcgaggtcaa gcaaatccca taaagttgtt ctcagttcgg attgtagtct

1320

gcaactcgac tacatgaagc tggaatcgct agtaatcgta gatcagcatg ctacggtgaa

1380

tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta acacccgaag

1440

ccggtggagt aaccatttgg agctagccgt cgaaggtggg acaaatgatt ggggtgaagt

1500

cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgcg gctggatcac ctcctttct

1549

<210> 1768

<211> 1575

<212> DNA

<213> Staphylococcus hominis

<220>

<221> modified_base

<222> (1)..(1)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1768

ncgvtccagc tccggccgcc atggcggccg cgggaaattc gattagagtt tgattatggc

60

tcaggatgga cgctggcggc gtgcctaata catgcaagtc gagcgaacag acgaggagct

120

tgctccttcg acgttagcgg cggacgggtg agtaacacgt aggtaaccta cctataagac

180

tgggataact tcgggaaacc ggagctaata ccggataata tttcgaaccg catggttcga

240

tagtgaaaga tggctttgct atcacttata gatggacctg cgccgtatta gctagttggt

300

aaggtaacgg cttaccaagg caacgatacg tagccgacct gagagggtga tcggccacac

360

tggaactgag acacggtcca gactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttccgcaatg

420

ggcgaaagcc tgacggagca acgccgcgtg agtgatgaag gtcttcggat cgtaaaactc

480

tgttattagg gaagaacaaa cgtgtaagta actgtgcacg tcttgacggt acctaatcag

540

aaagccacgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttatcc

600

ggaattattg ggcgtaaagc gcgcgtaggc ggttttttaa gtctgatgtg aaagcccacg

660

gctcaaccgt ggagggtcat tggaaactgg aaaacttgag tgcagaagag gaaagtggaa

720

ttccatgtgt agcggtgaaa tgcgcagaga tatggaggaa caccagtggc gaaggcgact

780

ttctggtctg taactgacgc tgatgtgcga aagcgtgggg atcaaacagg attagatacc

840

ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgagtgc taagtgttag ggggtttccg ccccttagtg

900

ctgcagctaa cgcattaagc actccgcctg gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa

960

ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa

1020

gaaccttacc aaatcttgac atcctttgac ccttctagag atagaagttt ccccttcggg

1080

ggacaaagtg acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa

1140

gtcccgcaac gagcgcaacc cttaagctta gttgccatca ttaagttggg cactctaagt

1200

tgactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caaaccatca tgccccttat

1260

gatttgggct acacacgtgc tacaatggac aatacaaagg gcagcgaaac cgcgaggtca

1320

agcaaatccc ataaagttgt tctcagttcg gattgtagtc tgcaactcga ctacatgaag

1380

ctggaatcgc tagtaatcgt agatcagcat gctacggtga atacgttccc gggtcttgta

1440

cacaccgccc gtcacaccac gagagtttgt aacacccgaa gccggtggag taaccatttg

1500

gagctagccg tcgaaggtgg gacaaatgat tggggtgaag tcgtaacaag gtaaccgtaa

1560

atcactagtg aattc

1575

<210> 1769

<211> 970

<212> DNA

<213> Staphylococcus lugdunensis

<400> 1769

tcgagcgaac agatgaggag cttgctcctt tgacgttagc ggcggacggg tgagtaacac

60

gtgggtaacc tacctataag actgggacaa cttcgggaaa ccggagctaa taccggataa

120

tatgttgaac cgcatggttc aatagtgaaa gatggttttg ctatcactta tagatggatc

180

cgcgccgtat tagctagttg gtgaggtaac ggctcaccaa ggcaacgata cgtagccgac

240

ctgagagggt gatcggccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag

300

cagtagggaa tcttccgcaa tgggcgaaag cctgacggag caacgccgcg tgagtgatga

360

aggtcttagg atcgtaaaac tctgttatta gggaagaaca aacgtgtaag taactgtgca

420

cgtcttgacg gtacctaatc agaaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtaggtgg caagcgttat ccggaattat tgggcgtaaa gcgcgcgtag gcggtttttt

540

aagtctgatg tgaaagccca cggctcaacc gtggagggtc attggaaact ggaaaacttg

600

agtgcagaag aggaaagtgg aattccatgt gtagcggtga aatgcgcaga gatatggagg

660

aacaccagtg gcgaaggcga ctttctggtc tgtaactgac gctgatgtgc gaaagcgtgg

720

ggatcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt gctaagtgtt

780

agggggtttc cgccccttag tgctgcagct aacgcattaa gcactccgcc tggggagtac

840

gaccgcaagg ttgaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggagcatgtg

900

gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaatcttga catcctttga ccgctctaga

960

gatagagtct

970

<210> 1770

<211> 1520

<212> DNA

<213> Staphylococcus pasteuri

<400> 1770

ggagagtttg atcctggctc aggatgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtcga

60

gcgaacagat aaggagcttg ctcctttgac gttagcggcg gacgggtgag taacacgtgg

120

ataacctacc tataagactg ggataacttc gggaaaccgg agctaatacc ggataacata

180

ttgaaccgca tggttcaata gtgaaaggcg gctttgctgt cacttataga tggatccgcg

240

ccgtattagc tagttggtaa ggtaacggct taccaaggca acgatacgta gccgacctga

300

gagggtgatc ggccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

agggaatctt ccgcaatggg cgaaagcctg acggagcagc gccgcgtgag tgatgaaggt

420

cttcggatcg taaaactctg ttatcaggga agaacaaatg tgtaagtaac tgtgcacatc

480

ttgacggtac ctgatcagaa agccacggct aacaacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

aggtggcaag cgttatccgg aattattggg cgtaaaagcg cgcgtaggcg gttttttaag

600

tctgatgtga aagcccacgg ctcaaccgtg gagggtcatt ggaaactgga aaacttgagt

660

gcagaagagg aaagtggaat tccatgtgta gcggtgaaat gcgcagagat atggaggaac

720

accagtggcg aaggcgactt tctggtctgt aactgacgct gatgtgcgaa agcgtgggga

780

tcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aagtgttagg

840

gggtttccgc cccttagtgc tgcagctaac gcattaagca cgccgcctgg ggagtacgac

900

cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

960

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca aatcttgaca tcctttgacc gctctagaga

1020

tagagtcttc cccttcgggg gacaaagtga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1080

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttaagcttag ttgccatcat

1140

taagttgggc actctaagtt gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1200

aaatcatcat gccccttatg atttgggcta cacacgtgct acaatggaca atacaaaggg

1260

cagctaaacc gcgaggtcaa gcaaatccca taaagttgtt ctcagttcgg attgtagtct

1320

gcaactcgac tacatgaagc tggaatcgct agtaatcgta gaacagcatg ctacggtgaa

1380

tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta acacccgaag

1440

ccggtggagt aaccatttat ggagctagcc gtcgaaggtg ggacaaatga ttggggtgaa

1500

gtcgtaacaa ggtagccgta

1520

<210> 1771

<211> 1555

<212> DNA

<213> Staphylococcus pseudintermedius

<400> 1771

ttttatggag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca

60

agtcgagcga acagataagg agcttgctcc tttgacgtta gcggcggacg ggtgagtaac

120

acgtgggtaa cctacctata agactggaat aactccggga aaccggggct aatgccggat

180

aacatgttga accgcatggt tctacagtga aagacggtct tgctgtcact tatagatgga

240

cccgcgccgt attagctagt tggtggggta acggcctacc aaggcgacga tacgtagccg

300

acctgagagg gtgatcggcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc

360

agcagtaggg aatcttccgc aatgggcgaa agcctgacgg agcaacgccg cgtgagtgat

420

gaaggtcttc ggatcgtaaa gctctgttgt tagggaagaa caaatgtgta agtaactgtg

480

cacatcttga cggtacctaa ccagaaagcc acggctaact acgtgccagc agccgcggta

540

atacgtaggt ggcaagcgtt atccggaatt attgggcgta aagcgcgcgt aggcggtttt

600

ttaagtctga tgtgaaagcc cacggctcaa ccgtggaggg tcattggaaa ctggaaaact

660

tgagtgcaga agaggaaagt ggaattccat gtgtagcggt gaaatgcgca gagatatgga

720

ggaacaccag tggcgaaggc ggctttctgg tctgcaactg acgctgatgt gcgaaagcgt

780

ggggatcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga gtgctaagtg

840

ttagggggtt tccgcccctt agtgctgcag ctaacgcatt aagcactccg cctggggagt

900

acggtcgcaa gactgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg

960

tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaaatct tgacatcctt tgaccgctct

1020

agagatagag ttttcctctt cggaggacaa agtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

1080

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgag cttagttgcc

1140

atcattcagt tgggcactct aagttgactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg

1200

acgtcaaatc atcatgcccc ttatgatttg ggctacacac gtgctacaat ggacaataca

1260

aagggcagcg aaaccgcgag gtcaagcaaa tcccataaag ttgttctcag ttcggattgt

1320

agtctgcaac tcgactacat gaagctggaa tcgctagtaa tcgtagatca gcatgctacg

1380

gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc

1440

cgaagccggt ggagtaacca ttttggagct agccgtcgaa ggtgggacaa atgattgggg

1500

tgaagtcgta acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1555

<210> 1772

<211> 1527

<212> DNA

<213> Staphylococcus saccharolyticus

<220>

<221> modified_base

<222> (22)..(22)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1505)..(1505)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1772

ctggctcagg atgtaygctg gnggcgtgcc taatacatgc aagtcgagcg aacagacgag

60

gagcttgctc ctctgacgtt agcggcggac gggtgagtaa cacgtggata acctacctat

120

aagactggga taacttcggg aaaccggagc taataccaga taacatgttg aaccgcatgg

180

ttcaacagtg aaagacggtc ttgctgtcac ttatagatgg atccgcgccg cattagctag

240

ttggtaaggt aacggcttac caaggcaacg atgcgtagcc gacctgagag ggtgatcggc

300

cacactggaa ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatcttccg

360

caatgggcga aagcctgacg gagcaacgcc gcgtgagtga tgaaggtctt cggatcgtaa

420

aactctgtta ttagggaaga acaaatgtgt aagtaactat gcacgtcttg acggcaccta

480

atcagaaagc cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt

540

tatccggaat tattgggcgt aaagcgcgcg taggcggttt tttaagtctg atgtgaaagc

600

ccacggctca accgtggagg gtcattggaa actggaaaac ttgagtgcag aagaggaaag

660

tggaattcca tgtgtagcgg tgaaatgcgc agagatatgg aggaacacca gtggcgaagg

720

cgactttctg gtctgtaact gacgctgatg tgcgaaagcg tggggatcaa acaggattag

780

ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaagt gttagggggt ttccgcccct

840

tagtgctgca gctaacgcat taagcactcc gcctggggag tacgaccgca aggttgaaac

900

tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac

960

gcgaagaacc ttaccaaatc ttgacatcct ctgacccctc tagagataga gttttcccct

1020

tcgggggaca gagtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg

1080

gttaagtccc gcaacgagcg caacccttaa gcttagttgc catcattaag ttgggcactc

1140

taagttgact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc

1200

cttatgattt gggctacaca cgtgctacaa tggacaatac aaagggcagc gaaaccgcga

1260

ggtcaagcaa accccataaa gttgttctca gttcggattg tagtctgcaa ctcgactata

1320

tgaagctgga atcgctagta atcgtagatc agcatgctac ggtgaatacg ttcccgggtc

1380

ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccgaagccgg tggagtaacc

1440

tkttggagct agccgtcgaa ggtgggacaa atgattgggg tgaagtcgta acaaggtaag

1500

tcgtnacaag gtaagtcgcc acaaggt

1527

<210> 1773

<211> 1551

<212> DNA

<213> Staphylococcus saprophyticus

<400> 1773

tggagagttt gatcctggct caggatgaac gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg

60

agcgaacaga taaggagctt gctcctttga cgttagcggc ggacgggtga gtaacacgtg

120

ggtaacctac ctataagact gggataactt cgggaaaccg gagctaatac cggataacat

180

ttggaaccgc atggttctaa agtgaaagat ggttttgcta tcacttatag atggacccgc

240

gccgtattag ctagttggta aggtaacggc ttaccaaggc gacgatacgt agccgacctg

300

agagggtgat cggccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag

360

tagggaatct tccgcaatgg gcgaaagcct gacggagcaa cgccgcgtga gtgatgaagg

420

gtttcggctc gtaaaactct gttattaggg aagaacaaac gtgtaagtaa ctgtgcacgt

480

cttgacggta cctaatcaga aagccacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

taggtggcaa gcgttatccg gaattattgg gcgtaaagcg cgcgtaggcg gtttcttaag

600

tctgatgtga aagcccacgg ctcaaccgtg gagggtcatt ggaaactggg aaacttgagt

660

gcagaagagg aaagtggaat tccatgtgta gcggtgaaat gcgcagagat atggaggaac

720

accagtggcg aaggcgactt tctggtctgt aactgacgct gatgtgcgaa agcgtgggga

780

tcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aagtgttagg

840

gggtttccgc cccttagtgc tgcagctaac gcattaagca ctccgcctgg ggagtacgac

900

cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

960

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca aatcttgaca tcctttgaaa actctagaga

1020

tagagccttc cccttcgggg gacaaagtga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1080

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttaagcttag ttgccatcat

1140

taagttgggc actctaggtt gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1200

aaatcatcat gccccttatg atttgggcta cacacgtgct acaatggaca atacaaaggg

1260

cagctaaacc gcgaggtcat gcaaatccca taaagttgtt ctcagttcgg attgtagtct

1320

gcaactcgac tacatgaagc tggaatcgct agtaatcgta gatcagcatg ctacggtgaa

1380

tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta acacccgaag

1440

ccggtggagt aaccatttat ggagctagcc gtcgaaggtg ggacaaatga ttggggtgaa

1500

gtcgtaacaa ggtagccgta tcggaaggtg cggctggatc acctcctttc t

1551

<210> 1774

<211> 1528

<212> DNA

<213> Staphylococcus sciuri

<400> 1774

gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc gaacagatga gaagcttgct

60

tctctgatgt tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggt aacctaccta taagactggg

120

ataactccgg gaaaccgggg ctaataccgg ataatatttt gaaccgcatg gttcaatagt

180

gaaagacggt ttcggctgtc acttatagat ggacccgcgc cgtattagct agttggtaag

240

gtaacggctt accaaggcga cgatacgtag ccgacctgag agggtgatcg gccacactgg

300

aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagta gggaatcttc cgcaatgggc

360

gaaagcctga cggagcaacg ccgcgtgagt gatgaaggtc ttcggatcgt aaaactctgt

420

tgttagggaa gaacaaattt gttagtaact gaacaagtct tgacggtacc taaccagaaa

480

gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta ggtggcaagc gttatccgga

540

attattgggc gtaaagcgcg cgtaggcggt ttcttaagtc tgatgtgaaa gcccacggct

600

caaccgtgga gggtcattgg aaactgggaa acttgagtgc agaagaggag agtggaattc

660

catgtgtagc ggtgaaatgc gcagagatat ggaggaacac cagtggcgaa ggcggctctc

720

tggtctgtaa ctgacgctga tgtgcgaaag cgtggggatc aaacaggatt agataccctg

780

gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa gtgttagggg gtttccgccc cttagtgctg

840

cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg caaggttgaa actcaaagga

900

attgacgggg acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa

960

ccttaccaaa tcttgacatc ctttgaccgc tctagagata gagtcttccc cttcggggga

1020

caaagtgaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc

1080

ccgcaacgag cgcaaccctt aagcttagtt gccatcatta agttgggcac tctaggttga

1140

ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgat

1200

ttgggctaca cacgtgctac aatggataat acaaagggca gcgaatccgc gaggccaagc

1260

aaatcccata aaattattct cagttcggat tgtagtctgc aactcgacta catgaagctg

1320

gaatcgctag taatcgtaga tcagcatgct acggtgaata cgttcccggg tcttgtacac

1380

accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac acccgaagcc ggtggagtaa ccttttagga

1440

gctagccgtc gaaggtggga caaatgattg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtatcg

1500

gaaggtgcgg ctggatcacc tcctttct

1528

<210> 1775

<211> 1364

<212> DNA

<213> Staphylococcus sp. H292

<400> 1775

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtcgagcg

60

agcggcggac gggtgagtaa cacgtaggta acctacctat aagactggga taacttcggg

120

aaaccggagc taataccgga taatgaaagt cacttataga tggacctgcg ccgtattagc

180

tagttggtaa ggtaacggct taccaaggca acgatacgta gccgacctga gagggtgatc

240

ggccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

300

ccgcaatggg cgaaagcctg acggagcaac gccgcgtgag tgatgaaggt cttcggatcg

360

taaaactctg ttattaggga agatgacggt acctaatcag aaagccacgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttatcc ggaattattg ggcgtaaagc

480

gcgcgtaggc ggttttttaa gtctgatgtg aaagcccacg gctcaaccgt ggagggtcat

540

tggaaactgg aaaacttgag tgcagaagag gaaagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa

600

tgcgcagaga tatggaggaa caccagtggc gaaggcgact ttctggtctg actgacgctg

660

atgtgcgaaa gcgtggggat caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgagtgcta agtgttaggg ccttagtgct gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

780

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccaa atcttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccttaagct tagttgccat catgggcact ctaagttgac tgccggtgac aaaccggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgatt tgggctacac acgtgctaca

1080

atggacaaca aagggcagcg aaaccgcgag gtcaagcaaa tcccatttgt tctcagttcg

1140

gatgtagtct gcaactcgac tacagaagct ggaatcgcta gtaatcgtag atcagcatgc

1200

tacggtgaat acgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa

1260

cacccgaagc cggtgagtag ctagccgtcg aaggtgggac aaatgattgg ggtgaagtcg

1320

taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcacct cctt

1364

<210> 1776

<211> 1364

<212> DNA

<213> Staphylococcus sp. H780

<400> 1776

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtcgagcg

60

agcggcggac gggtgagtaa cacgtggata acctacctat aagactggga taacttcggg

120

aaaccggagc taataccgga taatgaaagt cacttataga tggatccgcg ccgcattagc

180

tagttggtaa ggtaacggct taccaaggca acgatgcgta gccgacctga gagggtgatc

240

ggccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

300

ccgcaatggg cgaaagcctg acggagcaac gccgcgtgag tgatgaaggt cttcggatcg

360

taaaactctg ttattaggga agatgacggt acctaatcag aaagccacgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttatcc ggaattattg ggcgtaaagc

480

gcgcgtaggc ggttttttaa gtctgatgtg aaagcccacg gctcaaccgt ggagggtcat

540

tggaaactgg aaaacttgag tgcagaagag gaaagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa

600

tgcgcagaga tatggaggaa caccagtggc gaaggcgact ttctggtctg actgacgctg

660

atgtgcgaaa gcgtggggat caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgagtgcta agtgttaggg ccttagtgct gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

780

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccaa atcttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccttaagct tagttgccat catgggcact ctaagttgac tgccggtgac aaaccggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgatt tgggctacac acgtgctaca

1080

atggacaaca aagggcagcg aaaccgcgag gtcaagcaaa tcccatttgt tctcagttcg

1140

gatgtagtct gcaactcgac tatagaagct ggaatcgcta gtaatcgtag atcagcatgc

1200

tacggtgaat acgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa

1260

cacccgaagc cggtgagtag ctagccgtcg aaggtgggac aaatgattgg ggtgaagtcg

1320

taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcacct cctt

1364

<210> 1777

<211> 1545

<212> DNA

<213> Staphylococcus sp. clone bottae7

<400> 1777

gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtcgagcg

60

aacagataag gagcttgctc ctttgacgtt agcggcggac gggtgagtaa cacgtgggta

120

acctacctat aagactggga taactccggg aaaccggggc taataccgga taatatttag

180

aaccgcatgg ttctaaagtg aaagatggcc ttgctatcac ttatagatgg acccgcgccg

240

tattagctag ttggtaaggt aacggcttac caaggcaacg atacgtagcc gacctgagag

300

ggtgatcggc cacactggaa ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtagg

360

gaatcttccg caatgggcga aagcctgacg gagcaacgcc gcgtgagtga tgaaggtctt

420

cggatcgtaa aactctgtta ctagggaaga acaaatgcgt aagtaactgt gcgcgtcttg

480

acggtaccta atcagaaagc cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg

540

tggcaagcgt tatccggaat tattgggcgt aaagcgcgcg taggcgggtt tttaagtctg

600

atgtgaaagc ccacggctca accgtggagg gtcattggaa actggaaaac ttgagtgcag

660

aagaggaaag tggaattcca tgtgtagcgg tgaaatgcgc agagatatgg aggaacacca

720

gtggcgaagg cgactttctg gtctgtaact gacgctgatg tgcgaaagcg tggggatcaa

780

acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacgatg agtgctaagt gttagggggt

840

ttccgcccct tagtgctgca gctaacgcat taagcactcc gcctggggag tacgaccgca

900

aggttgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaaatc ttgacatcct ttgaccacgc tagagatagc

1020

gttttcccct tcgggggaca aagtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttaa gcttagttgc catcattaag

1140

ttgggcactc taggttgact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1200

catcatgccc cttatgattt gggctacaca cgtgctacaa tggacaatac aaagggcagc

1260

taaaccgcga ggtcatgcaa atcccataaa gttgttctca gttcggattg tagtctgcaa

1320

ctcgactaca tgaagctgga atcgctagta atcgtagatc agcatgctac ggtgaatacg

1380

ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccgaagccgg

1440

tggagtaacc ttttggagct agccgtcgaa ggtgggacaa atgattgggg tgaagtcgta

1500

acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1545

<210> 1778

<211> 1548

<212> DNA

<213> Staphylococcus succinus

<400> 1778

tggagagttt gatcctggct caggatgaac gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg

60

agcgaacgga taaggagctt gctcctttga agttagcggc ggacgggtga gtaacacgtg

120

ggtaacctac ctataagact ggaataactt cgggaaaccg gagctaatgc cggataacat

180

atagaaccgc atggttctat agtgaaagat ggttttgcta tcacttatag atggacccgc

240

gccgtattag ctagttggta aggtaatggc ttaccaaggc gacgatacgt agccgacctg

300

agagggtgat cggccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag

360

tagggaatct tccgcaatgg gcgaaagcct gacggagcaa cgccgcgtga gtgatgaagg

420

ttttcggatc gtaaaactct gttattaggg aagaacaaat gcgtaagtaa ctgtgcgcat

480

cttgacggta cctaatcaga aagccacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

540

taggtggcaa gcgttatccg gaattattgg gcgtaaagcg cgcgtaggcg gtttcttaag

600

tctgatgtga aagcccacgg ctcaaccgtg gagggtcatt ggaaactggg aaacttgagt

660

gcagaagagg aaagtggaat tccatgtgta gcggtgaaat gcgcagagat atggaggaac

720

accagtggcg aaggcgactt tctggtctgt aactgacgct gatgtgcgaa agcgtgggga

780

tcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aagtgttagg

840

gggtttccgc cccttagtgc tgcagctaac gcattaagca ctccgcctgg ggagtacgac

900

cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

960

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca aatcttgaca tcctttgaaa actctagaga

1020

tagagccttc cccttcgggg gacaaagtga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1080

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttaagcttag ttgccatcat

1140

taagttgggc actctaggtt gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1200

aaatcatcat gccccttatg atttgggcta cacacgtgct acaatggaca atacaaaggg

1260

cagctaaacc gcgaggtcat gcaaatccca taaagttgtt ctcagttcgg attgtagtct

1320

gcaactcgac tacatgaagc tggaatcgct agtaatcgta gatcagcatg ctacggtgaa

1380

tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta acacccgaag

1440

ccggtggagt aaccatttat ggagctagcc gtcgaaggtg ggacaaatga ttggggtgaa

1500

gtcgtaacaa ggtagccgta tcggaaggtg cggctggatc acctcctt

1548

<210> 1779

<211> 1497

<212> DNA

<213> Staphylococcus vitulinus

<400> 1779

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc

60

gaacagatga gaagcttgct tctctgatgt tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggt

120

aacctaccta taagactggg ataactccgg gaaaccgggg ctaatacctg ataatatttt

180

gaaccgcatg gttcaatagt gaaagacggc ttcggctgtc acttatagat ggacccgcgc

240

cgtattagct agttggtaag gtaatggctt accaaggcaa cgatacgtag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc cgcaatgggc gaaagcctga cggagcaacg ccgcgtgagt gatgaaggtc

420

ttaggatcgt aaaactctgt tgttagggaa gaacaaattt gttagtaact gaacaagtct

480

tgacggtacc taaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

ggtggcaagc gttatccgga attattgggc gtaaagcgcg cgtaggcggt ttcttaagtc

600

tgatgtgaaa gtccacggct caaccgtgga aggtcattgg aaactgggga acttgagtgc

660

agaagaggag agtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gcagagatat ggaggaacac

720

cagtggcgaa ggcggctctc tggtctgtaa ctgacgctga tgtgcgaaag cgtggggatc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa gtgttagggg

840

gtttccgccc cttagtgctg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg

900

caaggttgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccaaa tcttgacatc ctttgatcgc tctagagata

1020

gagttttccc cttcggggga caaagtgaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc

1080

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt aagcttagtt gccatcatta

1140

agttgggcac tctaggttga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1200

atcatcatgc cccttatgat ttgggctaca cacgtgctac aatggataat acaaagggca

1260

gcgaaaccgc gaggtcaagc aaatcccata aaattattct cagttcggat tgtagtctgc

1320

aactcgacta catgaagctg gaatcgctag taatcgtaga tcagcatgct acggtgaata

1380

cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac acccgaagcc

1440

ggtggagtaa ccttttatta ggagctagcc gtcgaaggtg ggacagatga ttggggt

1497

<210> 1780

<211> 1403

<212> DNA

<213> Staphylococcus warneri

<400> 1780

cgaacagata aggagcttgc tcctttgacg ttagcggcgg acgggtgagt aacacgtgga

60

taacctacct ataagactgg gataacttcg ggaaaccgga gctaataccg gataacatat

120

tgaaccgcat ggttcaatag tgaaaggcgg ctttgctgtc acttatagat ggatccgcgc

180

cgtattagct agttggtaag gtaacggctt accaaggcaa cgatacgtag ccgacctgag

240

agggtgatcg gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagta

300

gggaatcttc cgcaatgggc gaaagcctga cggagcaacg ccgcgtgagt gatgaaggtc

360

ttcggatcgt aaaactctgt tatcagggaa gaacaaatgt gtaagtaact gtgcacatct

420

tgacggtacc tgatcagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

480

ggtggcaagc gttatccgga attattgggc gtaaagcgcg cgtaggcggt tttttaagtc

540

tgatgtgaaa gcccacggct caaccgtgga gggtcattgg aaactggaaa acttgagtgc

600

agaagaggaa agtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gcagagatat ggaggaacac

660

cagtggcgaa ggcgactttc tggtctgtaa ctgacgctga tgtgcgaaag cgtggggatc

720

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa gtgttagggg

780

gtttccgccc cttagtgctg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg

840

caaggttgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggggagca tgtggtttaa

900

ttcgaagcaa cgcgaagaac cttacgaaat catgacgtcc tttgacgttt ctagagatag

960

agtcgtctac atcgggggac aaagtgacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg

1020

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta agcttagttg ccatcattaa

1080

gttgggcact ctaagttgac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1140

tcatcatgcc ccttatgatt tgggctacac acgtgctaca atggacaata caaagggcag

1200

ctaaaccgcg aggtcaagca aatcccataa agttgttctc agttcggatt gtagtctgca

1260

actcgactac atgaagctgg aatcgctagt aatcgtagat cagcatgcta cggtgaatac

1320

gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gtttgtaaca cccgaagccg

1380

gtggagtaac catttatgga gct

1403

<210> 1781

<211> 1487

<212> DNA

<213> Staphylococcus xylosus

<400> 1781

tggcggggtg cctaatacat gcaagtcgag cgaacagata aggagcttgc tcctttgacg

60

ttagcggcgg acgggtgagt aacacgtggg taacctacct ataagactgg gataacttcg

120

ggaaaccgga gctaataccg gataacattt ggaaccgcat ggttctaaag tgaaagatgg

180

ttttgctatc acttatagat ggacccgcgc cgtattagct agttggtaag gtaacggctt

240

accaaggcaa cgatacgtag ccgacctgag agggtgatcg gccacactgg aactgagaca

300

cggtccagac tcctacggga ggcagcagta gggaatcttc cgcaatgggc gaaagcctga

360

cggagcaacg ccgcgtgagt gatgaagggt ttcggctcgt aaaactctgt tattagggaa

420

gaacaaatgt gtaagtaact gtgcacatct tgacggtacc taatcagaaa gccacggcta

480

actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta ggtggcaagc gttatccgga attattgggc

540

gtaaagcgcg cgtaggcggt ttcttaagtc tgatgtgaaa gcccacggct caaccgtgga

600

gggtcattgg aaactgggaa acttgagtgc agaagaggaa agtggaattc catgtgtagc

660

ggtgaaatgc gcagagatat ggaggaacac cagtggcgaa ggcgactttc tggtctgtaa

720

ctgacgctga tgtgcgaaag cgtggggatc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg

780

ccgtaaacga tgagtgctaa gtgttaggtg ggtttccgcc ccttagtgct gcagctaacg

840

cattaagcac tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg

900

gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccaa

960

atcttgacat cctttgaaaa ctctagagat agagccttcc ccttcggggg acaaagtgac

1020

aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1080

gcgcaaccct taagcttagt tgccatcatt aagttgggca ctctaggttg actgccggtg

1140

acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga tttgggctac

1200

acaccgtgct acaatggaca atacaaaggg cagctaaacc gcgaggtcat gcaaatccca

1260

taaagttgtt ctcagttcgg attgtagtct gcaactcgac tacatgaagc tggaatcgct

1320

agtaatcgta gatcagcatg ctacggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg

1380

tcacaccacg agagtttgta acacccgaag ccggtggagt aaccatttat ggagctagcc

1440

gtcgaaggtg ggacaaatga ttggggtgaa gtcgtaacaa gggaacc

1487

<210> 1782

<211> 1547

<212> DNA

<213> Stenotrophomonas maltophilia

<400> 1782

taagtgaaga gtttgatcct ggctcagagt gaacgctggc ggtaggccta acacatgcaa

60

gtcgaacggc agcacagtaa gagcttgctc ttacgggtgg cgagtggcgg acgggtgagg

120

aatacatcgg aatctacttt ttcgtggggg ataacgtagg gaaacttacg ctaataccgc

180

atacgaccta cgggtgaaag caggggatct tcggaccttg cgcgattgaa tgagccgatg

240

tcggattagc tagttggcgg ggtaaaggcc caccaaggcg acgatccgta gctggtctga

300

gaggatgatc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt ggacaatggg cgcaagcctg atccagccat accgcgtggg tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagccctt ttgttgggaa agaaatccag ctggttaata cccggttggg

480

atgacggtac ccaaagaata agcaccggct aacttcgtgc cagcagccgc ggtaatacga

540

agggtgcaag cgttactcgg aattactggg cgtaaagcgt gcgtaggtgg ttgtttaagt

600

ctgttgtgaa agccctgggc tcaacctggg aactgcagtg gaaactggac gactagagtg

660

tggtagaggg tagcggaatt cctggtgtag cagtgaaatg cgtagagatc aggaggaaca

720

tccatggcga aggcagctac ctggaccaac actgacactg aggcacgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccctaaacg atgcgaactg gatgttgggt

840

gcaatttggc acgcagtatc gaagctaacg cgttaagttc gccgcctggg gagtacggtc

900

gcaagactga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag tatgtggttt

960

aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg gccttgacat gtcgagaact ttccagagat

1020

ggattggtgc cttcgggaac tcgaacacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg

1080

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg tccttagttg ccagcacgta

1140

atggtgggaa ctctaaggag accgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca

1200

agtcatcatg gcccttacgg ccagggctac acacgtacta caatggtagg gacagagggc

1260

tgcaagccgg cgacggtaag ccaatcccag aaaccctatc tcagtccgga ttggagtctg

1320

caactcgact ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcag atcagcattg ctgcggtgaa

1380

tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtttgtt gcaccagaag

1440

caggtagctt aaccttcggg agggcgcttg ccacggtgtg gccgatgact ggggtgaagt

1500

cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgcg gctggatcac ctccttt

1547

<210> 1783

<211> 1508

<212> DNA

<213> Stenotrophomonas sp. FG-6

<400> 1783

gtttgatcct ggctcagagt gaacgctggc ggtaggccta acacatgcaa gtcgaacggc

60

agcacagtaa gagcttgctc ttacgggtgg cgagtggcgg acgggtgagg aatgcatcgg

120

aatctactct gtcgtggggg ataacgtagg gaagcttacg ctaataccgc atacgaccta

180

cgggtgaaag caggggatct tcggaccttg cgcgattgaa tgagccgatg cccgattagc

240

tagttggcgg ggtaagagcc caccaaggcg acgatcggta gctggtctga gaggatgatc

300

agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

360

ggacaatggg cgcaagcctg atccagccat accgcgtggg tgaagaaggc cttcgggttg

420

taaagccctt ttgttgggaa agaaaagcag ccggttaata cccggttgtt ctgacggtac

480

ccaaagaata agcaccggct aacttcgtgc cagcagccgc ggtaatacga agggtgcaag

540

cgttactcgg aattactggg cgtaaagcgt gcgtaggtgg ttgtttaagt ctgtcgtgaa

600

agccctgggc tcaacctggg aatggcgatg gaaactgggc gactagagtg tggcagaggg

660

tagtggaatt cctggtgtag cagtgaaatg cgtagagatc aggaggaaca tccgtggcga

720

aggcgactgc ctgggccaac actgacactg aggcacgaaa gcgtggggag caaacaggat

780

tagataccct ggtagtccac gccctaaacg atgcgaactg gatgttgggt gcaatttggc

840

acgcagtatc gaagctaacg cgttaagttc gccgcctggg gagtacggtc gcaagactga

900

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag tatgtggttt aattcgatgc

960

aacgcgaaga accttacctg gccttgacat gcacggaact ttccagagat ggattggtgc

1020

cttcgggaac cgtgacacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg tccttagttg ccagcacgta atggtgggaa

1140

ctctaaggag accgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg

1200

gcccttacgg ccagggctac acacgtacta caatggtagg gacagagggc tgcaagccgg

1260

cgacggtgag ccaatcccag aaaccctatc tcagtccgga ttggagtctg caactcgact

1320

ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcag atcagcattg ctgcggtgaa tacgttcccg

1380

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtttgtt gcaccagaag caggtagctt

1440

aaccttcggg agggcgcttg ccacggtgtg gccgatgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1500

tagccgta

1508

<210> 1784

<211> 1485

<212> DNA

<213> Streptobacillus moniliformis

<400> 1784

agagtttgat cctggctcag gatgaacgct gacagaatgc ttaacacatg caaatctatg

60

tatgaaatgt aagcttgctt acatagacta catggtggac tggtgagtaa cgtgtaaaga

120

acttacctct tagactggga taaccattag gaaatgatgg ataatactag atattattag

180

tagtaggcat ctactattaa tgaaaggaga gattgctaag agagagcttt gcatcctatt

240

agctagttgg tggggtaaag gcctaccaag gctatgatag gtagccggcc cgagaggtga

300

acggccacaa ggggactgag atacggccct tactcctacg ggaggcagca gtggggaata

360

ttggacaatg gaggaaactc tgatccagca attctgtgtg cacgaagaag gttttcggat

420

tgtaaagtgc tttcagtagg gaagaagaag atgacggtac ctacagaaga agcgacggct

480

aaatacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt atgtcgcaag cgttatccgg aattattggg

540

cttaaagggc atctaggcgg tctaacaagt tgaaggtgaa aagctgtggc tcaaccatag

600

tcttgcctac aaaactgtca gactagagta ctggaaaggt gggtggaact acacgagtag

660

aggtgaaatt cgtagatatg tgtaggaatg ccgatgatga agataactca ctggacagaa

720

actgacgctg aagtgcgaaa cgtaggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccta

780

gctgtaaacg atgatcactg ggtgtggggg tgtgaagcct ctgtgccgaa gcaaaagcga

840

taagtgatcc gcctggggag tacgtacgca agtatgaaac tcaaaggaat tgacggggac

900

ccgcacaagt ggtggagcat gtggtttaat tcgacgcaac gcgaggaacc ttaccaggtc

960

ttgacatact cggaataaga tggaagcatc ttagtgcctt tgggaaccga gatacaggtg

1020

gtgcatggct gtcgacagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgaa

1080

acccctatca ttagttgcca tcattaagtt ggggactcta atgaaactgc ccgcgacgag

1140

caggaggaag gtggggatga cgtcaagtca ttctgcccct tatgatctgg gctacacacg

1200

tgctacaatg ggtagtacaa agaggagcta agcagtgatg tggagcaaat ctttcaaagc

1260

tactctcagt tcggattgaa gtctgcaact cgacttcatg aagttggaat cactagtaat

1320

cgcaaatcag caatgttgcg gtgaatacgt tctcgggtct tgtacacacc gcccgtcaca

1380

ccacgagagt tagttgcacc tgaagttact ggcctaaccc gtaagggagg gaagtaccta

1440

aggtgtgatt agtgattggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgta

1485

<210> 1785

<211> 1550

<212> DNA

<213> Streptococcus agalactiae

<400> 1785

tgagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca ttgcaagtag

60

aacgctgagg gttttggtgt ttacactaga ctgatgagtt gcgaacgggt gagtaacgcg

120

taggtaacct gcctccatag cgggggataa ctattggaaa cgatagctaa taccgcataa

180

gagtaattaa cacatgttag ttatttaaaa ggagcaattg cttcactgtg agatggacct

240

gcgttgtatt agctagttgg tgaggtaaag gctcaccaag gcgacgatac atagccgacc

300

tgagagggtg atcggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

360

agtagggaat cttcggcaat ggacggaagt ctgaccgagc aacgccgcgt gagtgaagaa

420

ggttttcgga tcgtaaagct ctgttgttag agaagaacgt tggtaggagt ggaaaatcta

480

ccaagtgacg gtaactaacc agaaagggac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

540

acgtaggtcc cgagcgttgt ccggatttat tgggcgtaaa gcgagcgcag gcggttcttt

600

aagtctgaag ttaaaggcag tggcttaacc attgtacgct ttggaaactg gaggacttga

660

gtgcagaagg ggagagtgga attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat atatgaggga

720

ccaccggtgg cgaaagcggc tctctggtct gtaactgacg ctgaggctcg aaagcgtggg

780

gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaggtgtta

840

ggccctttcc ggggcttagt gccgcagcta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg

900

accgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg

960

tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catccttctg accggcctag

1020

agataggctt tctcttcgga gcagaagtga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1080

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ctattgttag ttgccatcat

1140

taagttgggc actctagcga gactgccggt aataaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1200

aaatcatcat gccccttatg acctgggcta cacacgtgct acaatggttg gtacaacgag

1260

tcgcaagccg gtgacggcaa gctaatctct taaagccaat ctcagttcgg attgtaggct

1320

gcaactcgcc tacatgaagt cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcacg ccgcggtgaa

1380

tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta acacccgaag

1440

tcggtgaggt aaccttttag gagccagccg cctaaggtgg gatagatgat tggggtgaag

1500

tcgtaacaag gtagccgtat cggaaggtgc ggctggatca cctcctttct

1550

<210> 1786

<211> 1437

<212> DNA

<213> Streptococcus alactolyticus

<400> 1786

atggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtagaacg ctgaagaaag

60

gagcttgctt cttttggatg agttgcgaac gggtgagtaa cgcgtaggta acctgccttg

120

tagcggggga taactattgg aaacgatagc taataccgca taacagcttt tgacacatgt

180

tagaagcttg aaagatgcaa ttgcatcact acgagatgga cctgcgttgt attagctagt

240

aggtagggta acggcctacc taggcgacga tacatagccg acctgagagg gtgatcggcc

300

acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtaggg aatcttcggc

360

aatgggggca accctgaccg agcaacgccg cgtgagtgaa gaaggttttc ggatcgtaaa

420

gctctgttgt aagagaagaa cgtgtgtgag agtggaaagt tcacacagtg acggtaactt

480

accagaaagg gacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg tcccgagcgt

540

tgtccggatt tattgggcgt aaagcgagcg caggcggttt aataagtctg aagttaaagg

600

cagtggctta accattgttc gctttggaaa ctgttaaact tgagtgcaga aggggagagt

660

ggaattccat gtgtagcggt gaaatgcgta gatatatgga ggaacaccgg tggcgaaagc

720

ggctctctgg tctgtaactg acgctgaggc tcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga

780

taccctggta gtccacgccg taaacgatga gtgctaggtg ttaggccctt tccggggctt

840

agtgccgcag ctaacgcatt aagcactccg cctggggagt acgaccgcaa ggttgaaact

900

caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg

960

cgaagaacct taccaggtct tgacatccca gtgaccgctc tagagataga gtttttcttc

1020

ggaacactgg tgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt

1080

aagtcccgca acgagcgcaa cccttattgt tagttgccat cattcagttg ggcactctag

1140

cgagactgcc ggtaataaac cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt

1200

atgacctggg ctacacacgt gctacaatgg ttggtacaac gagtcgcaag tcggtgacgg

1260

caagcaaatc tcttaaagcc aatctcagtt cggattgtag gctgcaactc gcctacatga

1320

agtcggaatc gctagtaatc gcggatcagc acgccgcggt gaatacgttc ccgggccttg

1380

tacacaccgc ccgtcacacc acgagagttt gtaacacccg aagtcggtga ggtaacc

1437

<210> 1787

<211> 1553

<212> DNA

<213> Streptococcus anginosus

<400> 1787

tgagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtagg

60

acgcacagtt tataccgtag cttgctacac catagactgt gagttgcgaa cgggtgagta

120

acgcgtaggt aacctgccta ttagaggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc

180

ataacagtat gtaacacatg ttagatgctt gaaagatgca attgcatcgc tagtagatgg

240

acctgcgttg tattagctag taggtagggt aatggcctac ctaggcgacg atacatagcc

300

gacctgagag ggtgatcggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg

360

cagcagtagg gaatcttcgg caatgggggg aaccctgacc gagcaacgcc gcgtgagtga

420

agaaggtttt cggatcgtaa agctctgttg ttaaggaaga acgagtgtga aaatggaaag

480

ttcatactgt gacggtactt aaccagaaag ggacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

540

taatacgtag gtcccgagcg ttgtccggat ttattgggcg taaagcgagc gcaggcggtt

600

agaaaagtct gaagtgaaag gcagtggctc aaccattgta ggctttggaa actgtttaac

660

ttgagtgcag aaggggagag tggaattcca tgtgtagcgg tgaaatgcgt agatatatgg

720

aggaacaccg gtggcgaaag cggctctctg gtctgtaact gacgctgagg ctcgaaagcg

780

tggggagcga acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaggt

840

gttaggtcct ttccgggact tagtgccgca gctaacgcat taagcactcc gcctggggag

900

tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat

960

gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatccc gatgctattt

1020

ctagagatag gaagtttctt cggaacatcg gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

1080

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttattg ttagttgcca

1140

tcattgagtt gggcactcta gcgagactgc cggtaataaa ccggaggaag gtggggatga

1200

cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tgctacaatg gctggtacaa

1260

cgagtcgcaa gccggtgacg gcaagctaat ctctgaaagc cagtctcagt tcggattgta

1320

ggctgcaact cgcctacatg aagtcggaat cgctagtaat cgcggatcag cacgccgcgg

1380

tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt tgtaacaccc

1440

gaagtcggtg aggtaaccgt aaggagccag ccgcctaagg tgggatagat gattggggtg

1500

aagtcgtaac aaggtagccg tatcggaagg ggcggctgga tcacctcctt tct

1553

<210> 1788

<211> 938

<212> DNA

<213> Streptococcus australis

<220>

<221> modified_base

<222> (26)..(27)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (35)..(35)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (287)..(287)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (929)..(929)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1788

gccagcagcc gcggtaatac gtaggnncga gcgtnatccg gatttattgg gcgtaaagcg

60

agcgcaggcg gttagataag tctgaagtta aaggctgtgg cttaaccata gtacgctttg

120

gaaactgttt aacttgagtg cagaagggga gagtggaatt ccatgtgtag cggtgaaatg

180

cgtagatata tggaggaaca ccggtggcga aagcggctct ctggtctgta actgacgctg

240

aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtncac gccgtaaacg

300

atgagtgcta ggtgttgggt cctttccggg actcagtgcc gcagctaacg cattaagcac

360

tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca

420

agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat

480

ccctctgacc gctctagaga tagagctttc cttcgggaca gaggtgacag gtggtgcatg

540

gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccccta

600

ttgttagttg ccatcattta gttgggcact ctagcgagac tgccggtaat aaaccggagg

660

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

720

atggctggta caacgagtcg cgagtcggtg acggcaagct aatctcttaa agccagtctc

780

agttcggatt gtaggctgca actcgcctac atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcggat

840

cagcacgccg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga

900

gtttgtaaca cccgaagtcg gtgaggtanc cttttagg

938

<210> 1789

<211> 1546

<212> DNA

<213> Streptococcus bovis

<400> 1789

tgagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtaga

60

acgctgacta ctttagcttg ctagagtaga aggagttgcg aacgggtgag taacgcgtag

120

gtaacctgcc tactagcggg ggataactat tggaaacgat agctaatacc gcataacagt

180

gtttaacaca tgttagatgc ttgaaagatg caattgcatc actagtagat ggacctgcgt

240

tgtattagct agttggtggg gtaacggccc accaaggcga cgatacatag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc ggcaatgggg gcaaccctga ccgagcaacg ccgcgtgagt gaagaaggtt

420

ttcggatcgt aaagctctgt tgtaagagaa gaacgtgtgt gagagtggaa agttcacaca

480

gtgacggtaa cttaccagaa agggacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

aggtcccgag cgttgtccgg atttattggg cgtaaagcga gcgcaggcgg tttaataagt

600

ctgaagttaa aggcagtggc ttaaccattg ttcgctttgg aaactgttaa acttgagtgc

660

agaaggggag agtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat ggaggaacac

720

cggtggcgaa agcggctctc tggtctgtaa ctgacgctga ggctcgaaag cgtggggagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag gtgttaggcc

840

ctttccgggg cttagtgccg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg

900

caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ccgatgctat ttctagagat

1020

agaaagtttc ttcggaacat cggtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat tgttagttgc catcatttag

1140

ttgggcactc tagcgagact gccggtaata aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1200

catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggttggtac aacgagtcgc

1260

aagtcggtga cggcaagcaa atctcttaaa gccaatctca gttcggattg taggctgcaa

1320

ctcgcctaca tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agcacgccgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccgaagtcgg

1440

tgaggtaacc atttaggagc cagccgccta aggtgggata gatgattggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct ggatcacctc ctttct

1546

<210> 1790

<211> 1472

<212> DNA

<213> Streptococcus canis

<400> 1790

tgtttgatcc tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca agtagaacgc

60

tgaggacagg tgcttgcact agtctaagga gttgcgaacg ggtgagtaac gcgtaggtaa

120

cctacctgat agcgggggat aactattgga aacgatagct aataccgcat aaaagtgctt

180

aacacatgtt aagaacttaa aaggggcaac tgctccacta tgagatggac ctgcgttgta

240

ttagctagtt ggtgaggtaa aggctcacca aggcgacgat acatagccga cctgagaggg

300

tgatcggcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtaggga

360

atcttcggca atggggggaa ccctgaccga gcaacgccgc gtgagtgaag aaggttttcg

420

gatcgtaaag ctctgttgtt agagaagaac ggtaatggga gtggaaaacc cattatgtga

480

cggtaactaa ccagaaaggg acggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt

540

cccgagcgtt gtccggattt attgggcgta aagcgagcgc aggcggttct ttaagtctga

600

agttaaaggc attggctcaa ccaatgtatg ctttggaaac tggagaactt gagtgcagaa

660

ggggagagtg gaattccatg tgtagcggtg aaatgcgtag atatatggag gaacaccggt

720

ggcgaaagcg gctctctggt ctgtaactga cgctgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac

780

aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag tgctaggtgt tagccccttt

840

ccggggctta gtgccggagc taacgcatta agcactccgc ctggggagta cgaccgcaag

900

gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc

960

gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatcccga tgcccgctct agagatagag

1020

ttttacttcg gtacatcggt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1080

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctattgtt agttgccatc attaagttgg

1140

gcactctagc gagactgccg gtaataaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc

1200

atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatggt tggtacaacg agtcgcaagc

1260

cggtgacggc aagctaatct ctgaaagcca atctcagttc ggattgtagg ctgcaactcg

1320

cctacatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg cggatcagca cgccgcggtg aatacgttcc

1380

cgggcctggt acacaccgcc cgtcacacca cgagagtttg taacacccga agtcggtgag

1440

gtaacctatt aggagccagc cgcctaaggt gg

1472

<210> 1791

<211> 1508

<212> DNA

<213> Streptococcus constellatus

<400> 1791

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac gcacaggatg caccgtagtt

60

tactacaccg tattctgtga gttgcgaacg ggtgagtaac gcgtaggtaa cctgcctggt

120

agcgggggat aactattgga aacgatagct aataccgcat aagaacattt actgcatggt

180

agatgtttaa aaggtgcaag agcatcacta ccagatggac ctgcgttgta ttagctagtt

240

ggtgaggtaa cggctcacca aggcaacgat acatagccga cctgagaggg tgatcggcca

300

cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtaggga atcttcggca

360

atggggggaa ccctgaccga gcaacgccgc gtgagtgaag aaggttttcg gatcgtaaag

420

ctctgttgtt aaggaagaac gtgtgtgaga gtggaaagtt cacacagtga cggtacttaa

480

ccagaaaggg acggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt cccgagcgtt

540

gtccggattt attgggcgta aagcgagcgc aggcggttag ataagtctga agtgaaaggc

600

agtggctcaa ccattgtagg ctttggaaac tgtttaactt gagtgcagaa ggggagagtg

660

gaattccatg tgtagcggtg aaatgcgtag atatatggag gaacaccggt ggcgaaagcg

720

gctctctggt ctgtaactga cgctgaggct cgaaagcgtg gggagcgaac aggattagat

780

accctggtag tccacgccgt aaacgatgag tgctaggtgt taggtccttt ccgggactta

840

gtgccgcagc taacgcatta agcactccgc ctggggagta cgaccgcaag gttgaaactc

900

aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc

960

gaagaacctt accaggtctt gacatcccga tgcccgctct agagatagag ctttacttcg

1020

gtacatcggt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1080

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttattgtt agttgccatc attcagttgg gcactctagc

1140

gagactgccg gtaataaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta

1200

tgacctgggc tacacacgtg ctacaatggc tggtacaacg agtcgcaagc cggtgacggc

1260

aagctaatct ctgaaagcca gtctcagttc ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa

1320

gtcggaatcg ctagtaatcg cggatcagca cgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacca cgagagtttg taacacccga agtcggtgag gtaaccgtaa

1440

ggagccagcc gcctaaggtg ggatagatga ttggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta

1500

tcggaagg

1508

<210> 1792

<211> 1544

<212> DNA

<213> Streptococcus cristatus

<400> 1792

tgagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtaga

60

acgctgaagg aggagcttgc tcttctggat gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt

120

aacctacctg gtagcggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc ataatattga

180

ctattgcatg atagtcaatt aaaaggtgca aatgcaccac taccagatgg acctgcgttg

240

tattagctag ttggtggggt aacggctcac caaggcgacg atacatagcc gacctgagag

300

ggtgatcggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg

360

gaatcttcgg caatggacgg aagtctgacc gagcaacgcc gcgtgagtga agaaggtttt

420

cggatcgtaa agctctgttg taagagaaga acgagtgtga gagtggaaag ttcacactgt

480

gacggtatct taccagaaag ggacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

540

gtcccgagcg ttgtccggat ttattgggcg taaagcgagc gcaggcggtt agataagtct

600

gaagttaaag gctgtggctt aaccatagta cgctttggaa actgtttaac ttgagtgcag

660

aaggggagag tggaattcca tgtgtagcgg tgaaatgcgt agatatatgg aggaacaccg

720

gtggcgaaag cggctctctg gtctgtaact gacgctgagg ctcgaaagcg tggggagcaa

780

acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaggt gttgggtcct

840

ttccgggact cagtgccgca gctaacgcat taagcactcc gcctggggag tacgaccgca

900

aggttgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatccc ggtgcccgtc ctagagatag

1020

gattttgctt cggcacaccg gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga

1080

gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttattg ttagttgcca tcatttagtt

1140

gggcactcta gcgagactgc cggtaataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaaatca

1200

tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tgctacaatg gctggtacaa cgagtcgcaa

1260

gtcggtgacg gcaagctaat ctcttaaagc cagtctcagt tcggattgta ggctgcaact

1320

cgcctacatg aagtcggaat cgctagtaat cgcggatcag cacgccgcgg tgaatacgtt

1380

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt tgtaacaccc gaagtcggtg

1440

aggtaacctt ttaggagcca gccgcctaag gtgggataga tgattggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtagcc gtatcggaag gtgcggctgg atcacctcct ttct

1544

<210> 1793

<211> 1555

<212> DNA

<213> Streptococcus downei

<400> 1793

tgagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtgga

60

acgcattgat atcaccggag cttgctccac tgatattaat gagtcgcgaa cgggtgagta

120

acgcgtaggt aacctgcctg atagcggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc

180

atgagagtgt ttaacacatg ttagagactt aaaagatacc attgtatcac tatcagatgg

240

acctgcgttg tattagctag ttggtagggt agcggcctac caaggcaccg atacatagcc

300

gacctgagag ggtgatcggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg

360

cagcagtagg gaatcttcgg caatggacga aagtctgacc gagcaacgcc gcgtgagtga

420

agaaggtttt cggatcgtaa agctctgttg tagcggaaga acgcgtgtaa gagtggaaag

480

tttacacagt gacggtacgc taccagaaag ggacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

540

taatacgtag gtcccgagcg ttgtccggat ttattgggcg taaagggagc gcaggcggtt

600

tagtaagtct gaagttaaag gcattggctc aaccaatgta tgctttggaa actgttagac

660

ttgagtgcag aaggggagag tggaattcca tgtgtagcgg tgaaatgcgt agatatatgg

720

aggaacaccg gtggcgaaag cggctctctg gtctgtcact gacgctgagg ctcgaaagcg

780

tgggtagcga acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaggt

840

gttaggtcct ttccgggact tagtgccgca gctaacgcaa taagcactcc gcctggggag

900

tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat

960

gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatccc gatgcccgct

1020

ctagagatag agttttactt tttgtacatc ggagacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc

1080

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatt gttagttgcc

1140

atcattgagt tgggcactct agcgagactg ccggtaataa accggaggaa ggtggggatg

1200

acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat ggttggtaca

1260

acgagtcgca agccggtgac ggcaagctaa tctctgaaag ccaatctcag ttcggattgt

1320

aggctgcaac tcgcctacat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcacgccgcg

1380

gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc

1440

caaagtcggt gaggtaacct tataggagcc agccgcctaa ggtgggacag atgattgggg

1500

tgaagtcgta acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1555

<210> 1794

<211> 1546

<212> DNA

<213> Streptococcus dysgalactiae

<400> 1794

tgagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtaga

60

acgctgagga ctggtgcttg caccggtcca aggagttgcg aacgggtgag taacgcgtag

120

gtaacctacc tcatagcggg ggataactat tggaaacgat agctaatacc gcataaaagt

180

gtttaaccca tgttaaccat ttaaaaggtg caattgcatc actatgagat ggacctgcgt

240

tgtattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgatacatag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc ggcaatggac ggaagtctga ccgagcaacg ccgcgtgagt gaagaaggtt

420

ttcggatcgt aaagctctgt tgttagagaa gaatgatggt gggagtggaa aatccaccat

480

gtgacggtaa ctaaccagaa agggacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

aggtcccgag cgttgtccgg atttattggg cgtaaagcga gcgcaggcgg ttctttaagt

600

ctgaagttaa aggcagtggc tcaaccattg tacgctttgg aaactggaga acttgagtgc

660

agaaggggag agtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat ggaggaacac

720

cggtggcgaa agcggctctc tggtctgtaa ctgacgctga ggctcgaaag cgtggggagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag gtgttaggcc

840

ctttccgggg cttagtgccg gagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg

900

caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ctcctgaccg gtctagagat

1020

aggctttccc ttcggggcag gagtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat tgttagttgc catcattaag

1140

ttgggcactc tagcgagact gccggtaata aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1200

catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggttggtac aacgagtcgc

1260

aagccggtga cggcaagcta atctcttaaa gccaatctca gttcggattg taggctgcaa

1320

ctcgcctaca tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agcacgccgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccgaagtcgg

1440

tgaggtaacc tattaggagc cagccgccta aggtgggata gatgattggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct ggatcacctc ctttct

1546

<210> 1795

<211> 1545

<212> DNA

<213> Streptococcus equi

<400> 1795

gagagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaatacat gcaagtagaa

60

cgcagaggtc aggtgcttgc actagactga tgagttgcga acgggtgagt aacgcgtagg

120

taacctagct tatagcgggg gataactatt ggaaacgata gctaataccg cataaaagtg

180

gttgacccat gttaacgatt taaaaggagc aacagctcca ctatgagatg gacctgcgtt

240

gtattagcta gttggtaggg taaaggccta ccaaggcgac gatacatagc cgacctgaga

300

gggtgaacgg ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtag

360

ggaatcttcg gcaatggggg gaaccctgac cgagcaacgc cgcgtgagtg aagaaggttt

420

tcggatcgta aagctctgtt gttagagaag aacagtgatg ggagtggaaa gtccatcatt

480

tgacggtaac taaccagaaa gggacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

ggtcccgagc gttgtccgga tttattgggc gtaaagcgag cgcaggcggt ttgataagtc

600

tgaagttaaa ggcagtggct taaccattgt atgctttgga aactgttaaa cttgagtgca

660

gaaggggaga gtggaattcc atgtgtagcg gtgaaatgcg tagatatatg gaggaacacc

720

ggtggcgaaa gcggctctct ggtctgtaac tgacgctgag gctcgaaagc gtggggagca

780

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgct gagtgctagg tgttaggccc

840

tttccggggc ttagtgccgt agctaacgca ttaagcactc cgcctgggga gtacgaccgc

900

aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

960

ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcc cgatgctatt cttagagata

1020

agaagttact tcggtacatt ggagacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1080

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatt gttagttgcc atcattaagt

1140

tgggcactct agcgagactg ccggtaataa accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc

1200

atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat ggttggtaca acgagtcgca

1260

agccggtgac ggcaagctaa tctctgaaag ccaatctcag ttcggattgt aggctgcaac

1320

tcgcctacat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcacgccgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc cgaagtcggt

1440

gaggtaaccg ttaaggagcc agccgcctaa ggtgggatag atgattgggg tgaagtcgta

1500

acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1545

<210> 1796

<211> 1545

<212> DNA

<213> Streptococcus equinus

<400> 1796

tgagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtaga

60

acgctgaaga ctttagcttg ctaaagttgg aagagttgcg aacgggtgag taacgcgtag

120

gtaacctgcc tactagcggg ggataactat tggaaacgat agctaatacc gcataacagc

180

atttaacaca tgttagatgc ttgaaagaag caattgcttc actagtagat ggacctgcgt

240

tgtattagct agttggtgag gtaaaggctc accaaggcga cgatacatag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc ggcaatgggg gcaaccctga ccgagcaacg ccgcgtgagt gaagaaggtt

420

ttcggatcgt aaagctctgt tgtaagagaa gaacgtgtgt gagagtggaa agttcacaca

480

gtgacggtaa cttaccagaa agggacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

aggtcccgag cgttgtccgg atttattggg cgtaaagcga gcgcaggcgg tttaataagt

600

ctgaagttaa aggcagtggc ttaaccattg ttcgctttgg aaactgttag acttgagtgc

660

agaaggggag agtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat ggaggaacac

720

cggtggcgaa agcggctctc tggtctgtaa ctgacgctga ggctcgaaag cgtggggagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag gtgttaggcc

840

ctttccgggg cttagtgccg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg

900

caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ccgatgctat ttctagagat

1020

aggaagtttc ttcggaacat cggtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat tgttagttgc catcattaag

1140

ttgggcactc tagcgagact gccggtaata aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1200

catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggttggtac aacgagtcgc

1260

gagtcggtga cggcaagcaa atctcttaaa gccaatctca gttcggattg taggctgcaa

1320

ctcgcctaca tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agcacgccgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccgaagtcgg

1440

tgaggtaacc ttttggagcc agccgcctaa ggtgggatag atgattgggg tgaagtcgta

1500

acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1545

<210> 1797

<211> 1546

<212> DNA

<213> Streptococcus gallolyticus

<400> 1797

tgagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtaga

60

acgctgacta ctttagcttg ctagagtaga aggagttgcg aacgggtgag taacgcgtag

120

gtaacctgcc tactagcggg ggataactat tggaaacgat agctaatacc gcataacagt

180

gtttaacaca tgttagatgc ttgaaagatg caaatgcatc actagtagat ggacctgcgt

240

tgtattagct agttggtggg gtaacggcct accaaggcga cgatacatag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc ggcaatgggg gcaaccctga ccgagcaacg ccgcgtgagt gaagaaggtt

420

ttcggatcgt aaagctctgt tgtaagagaa gaacgtgtgt gagagtggaa agttcacaca

480

gtgacggtaa cttaccagaa agggacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

aggtcccgag cgttgtccgg atttattggg cgtaaagcga gcgcaggcgg tttaataagt

600

ctgaagttaa aggcagtggc ttaaccattg ttcgctttgg aaactgttaa acttgagtgc

660

agaaggggag agtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat ggaggaacac

720

cggtggcgaa agcggctctc tggtctgtaa ctgacgctga ggctcgaaag cgtggggagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag gtgttaggcc

840

ctttccgggg cttagtgccg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg

900

caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ccgatgctat ttctagagat

1020

agaaagtttc ttcggaacat cggtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat tgttagttgc catcattcag

1140

ttgggcactc tagcgagact gccggtaata aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1200

catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggttggtac aacgagtcgc

1260

aagtcggtga cggcaagcaa atctcttaaa gccaatctca gttcggattg taggctgcaa

1320

ctcgcctaca tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agcacgccgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccgaagtcgg

1440

tgaggtaacc ttttaggagc cagccgccta aggtgggata gatgattggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct ggatcacctc ctttct

1546

<210> 1798

<211> 1293

<212> DNA

<213> Streptococcus genomosp. C1

<400> 1798

gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac gagttgcgaa cgggtgagta

60

acgcgtaggt aacctgcctc ttagcggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc

120

ataagaaagt cactaagaga tggacctgcg ttgtattagc tagttggtga ggtaacggct

180

caccaaggcg acgatacata gccgacctgg gagggtgatc ggccacactg ggactgagac

240

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt cggcaatggg ggcaaccctg

300

accgagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt tttcggatcg taaagctctg ttgtaagaga

360

agatgacggt aacttaccag aaagggacgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

420

gtaggtcccg agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaagc gagcgcaggc ggttagatag

480

gtctgaagtt aaaggctgtg gcttaaccat agtacgcttt ggaaactgtt taacttgagt

540

gcagaagggg agagtggaat tccatgtgta gcggtgaaat gcgtagatat atggaggaac

600

accggtggcg aaagcggctc tctggtctga ctgacgctga ggctcgaaag cgtggggagc

660

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctgg gtgttgggta

720

ctcagtgccg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg caaggttgaa

780

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca

840

acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

900

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctattgtt agttgccatc

960

atgggcactc tagcgagact gccggtaata aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1020

catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggctggcaa cgagtcgcga

1080

gtcggtgacg gcaagctaat ctcttccagt ctcagttcgg atgtaggctg caactcgcct

1140

acagaagtcg gaatcgctag taatcgcgga tcagcacgcc gcggtgaata cgttcccggg

1200

ccttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac acccgaagtc ggtaggtagc

1260

cagccgccta aggtgggata gatgattggg gtg

1293

<210> 1799

<211> 1294

<212> DNA

<213> Streptococcus genomosp. C2

<400> 1799

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac gagttgcgaa cgggtgagta

60

acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc

120

ataagaaaag tcactaccag atggacctgc gttgtattag ctagttggtg aggtaacggc

180

tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat tggccacact gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tcggcaatgg acggaagtct

300

gaccgagcaa cgccgcgtgt gtgaagaagg ttttcggatc gtaaagctct gttgtaagag

360

aagatgacgg tatcttacca gaaagggacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtccc aagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag cgagcgcagg cggttagata

480

agtctgaagt taaaggctgt ggcttaacca tagtacgctt tggaaactgt ttaacttgag

540

tgcaagaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tatggaggaa

600

caccggtggc gaaagcggct ctctggcttg actgacgctg aggctcgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttagac

720

gtttagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc

840

aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcga cccctattgt tagttgccat

960

catgggcact ctagcgagac tgccggtaat aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1020

tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca atggctggca acgagtcgca

1080

agccggtgac ggcaagctaa tctcttccag tctcagttcg gatgtaggct gcaactcgcc

1140

tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc cgcggtgaat acgttccctg

1200

gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccgaagt cggtaggtag

1260

ccagccgcct aaggtgggat agatgattgg ggtg

1294

<210> 1800

<211> 1327

<212> DNA

<213> Streptococcus genomosp. C3

<400> 1800

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac gagttgcgaa cgggtgagta

60

acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc

120

ataaagaaag tcactaccag atggacctgc gttgtattag ctagttggtg gggtaacggc

180

tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat cggccacact gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tcggcaatgg acggaagtct

300

gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc gtaaagctct gttgtaagag

360

aagatgacgg tatcttacca gaaagggacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtccc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag cgagcgcagg cggttagata

480

agtctgaagt taaaggctgt ggcttaacca tagtacgctt tggaaactgt ttaacttgag

540

tgcaagaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tatggaggaa

600

caccggtggc gaaagcggct ctctggcttg actgacgctg aggctcgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttagac

720

gtttagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc

840

aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctattgc tagttgccat

960

catgggcact ctagcgagac tgccggtaat aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1020

tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca atggctggca acgagtcgca

1080

agccggtgac ggcaagctaa tctcttccag tctcagttcg gatgtaggct gcaactcgcc

1140

tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc cgcggtgaat acgttcccgg

1200

gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccgaagt cggtaggtag

1260

ccagccgcct aaggtgggat agatgattgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtatcgg

1320

aaggtgc

1327

<210> 1801

<211> 1327

<212> DNA

<213> Streptococcus genomosp. C4

<400> 1801

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac gagttgcgaa cgggtgagta

60

acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc

120

ataaaaaaag tcactaccag atggacctgc gttgtattag ctagttggtg gggtaacggc

180

tcaccaaggc aacgatacat agccgacctg agagggtgat cggccacact gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tcggcaatgg acggaagtct

300

gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc gtaaagctct gttgtaagag

360

aagatgacgg tatcttacca gaaagggacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtccc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag cgagcgcagg cggttagata

480

agtctgaagt taaaggctgt ggcttaacca tagtacgctt tggaaactgt ttaacttgag

540

tgcaagaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tatggaggaa

600

caccggtggc gaaagcggct ctctggcttg actgacgctg aggctcgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttagac

720

gtttagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc

840

aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctattgt tagttgccat

960

catgggcact ctagcgagac tgccggtaat aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1020

tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca atggctggca acgagtcgca

1080

agccggtgac ggcaagctaa tctcttccag tctcagttcg gatgtaggct gcaactcgcc

1140

tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc cgcggtgaat acgttcccgg

1200

gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccgaagt cggtaggtag

1260

ccagccgcct aaggtgggat agatgattgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtatcgg

1320

aaggtgc

1327

<210> 1802

<211> 1294

<212> DNA

<213> Streptococcus genomosp. C5

<400> 1802

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac gagttgcgaa cgggtgagta

60

acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc

120

ataacgaaag tcactaccag atggacctgc gttgtattag ctagttggtg gggtaacggc

180

tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat cggccacact gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggagtct tcggcaatgg acggaagtct

300

gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc gtaaagctct gttgtaagag

360

aagatgacgg tatcttacca gaaagggacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtccc gagcgttgtc cggatttatt gggtgtaaag cgagcgcagg cggttagata

480

agtctgaagt taaaggctgt ggcttaacca tagtacgctt tggaaactgt ttaacttgag

540

tgcaagaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tatggaggaa

600

caccggtggc gaaagcggct ctctggcttg actgacgctg aggctcgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttagac

720

gtttagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc

840

aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctattgt tagttgccat

960

catgggcact ctagcgagac tgccggtaat aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1020

tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca atggctggca acgagtcgca

1080

agtcggtgac ggcaagctaa tctcttccag tctcagttcg gatgtaggct gcaactcgcc

1140

tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc cgcggtgaat acgttcccgg

1200

gccttgtaca caccgcccgc cacaccacga gagtttgtaa cacccgaagt cggtaggtag

1260

ccagccgcct aaggtgggat agatgattgg ggtg

1294

<210> 1803

<211> 1293

<212> DNA

<213> Streptococcus genomosp. C6

<400> 1803

gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac gagttgcgaa cgggtgagta

60

acgcgtaggt aacctgcctc ttagcggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc

120

ataagaaagt cactaagaga tggacctgcg ttgtattagc tagttggtga ggtaacggct

180

caccaaggcg acgatacaca gccgacctga gagggtgatc ggccacactg ggactgagac

240

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt cggcaatggg ggcaaccctg

300

accgagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt tttcggatcg taaagctctg ttgtaagaga

360

agatgacggt aacttaccag aaagggacgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

420

gtaggtcccg agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaagc gagcgcaggc ggttagataa

480

gtctgaagtt aaaggctgtg gcttaaccat agtacgcttt ggaaactgtt taacttgagt

540

gcagaagggg agagtggaat tccatgtgta gcggtgaaat gcgtagatat atggaggaac

600

accggtggcg aaagcggctc tctggtctga ctgacgctga ggctcgaaag cgtggggagc

660

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag gtgttgggta

720

ctcagtgccg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg caaggttgaa

780

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca

840

acgcgaagaa ccttaccagg ccttgacatc gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

900

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctattgtt agttgccatc

960

atgggcactc tagcgagact gccggtaata aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1020

catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggctggcaa cgagtcgcga

1080

gtcggtgacg gcaagctaac ctcttccagt ctcagttcgg atgtaggctg caactcgcct

1140

acagaagtcg gaatcgctag taatcgcaga tcagcacgcc gcggtgaata cgttcccggg

1200

ccttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac acccgaagtc ggtaggttgc

1260

cagccgccta aggtgggata gatgattggg gtg

1293

<210> 1804

<211> 1294

<212> DNA

<213> Streptococcus genomosp. C7

<400> 1804

gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac gagttgcgaa cgggtgagta

60

acgcgtaggt aacctgcctc ttagcggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc

120

ataaagaaag tcactaagag atggacctgc gttgtattag ctagttggtg aggtaacggc

180

tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat cggccacact gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tcggcaatgg gggcaaccct

300

gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc gtaaggctct gttgtaagag

360

aagatgacgg tatcttacca gaaagggacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtccc gagcgttatc cggatttatt gggcgtaaag cgagcgcagg cggttagata

480

agtctgaagt taaaggctgt ggcttaacca tagtacgctt tggaaactgt ttaacttgag

540

tgcagaaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tatggaggaa

600

caccggtggc gaaagcggct ctctggtctg actgacgctg aggctcgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttgggt

720

actcagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc

840

aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctattgt tagttgccat

960

catgggcact ctagcgagac tgccggtaat aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1020

tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca atggctggca acgagtcgcg

1080

agtcggtgac ggcaagctaa tctcttccag tctcagttcg gatgtaggct gcaactcgcc

1140

tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc cgcggtgaat acgttcccgg

1200

gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccgaagt cggtaggtag

1260

ccagccgcct aaggtgggat agatgattgg ggtg

1294

<210> 1805

<211> 1327

<212> DNA

<213> Streptococcus genomosp. C8

<400> 1805

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac gagttgcgaa cgggtgagta

60

acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc

120

ataataaaag tcactaccag atggacctgc gttgtattag ctagttggtg aggtaacggc

180

tcaccaaggc aacgatacat agccgacctg agagggtgat cggccacact gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tcggcaatgg acggaagtct

300

gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc gtaaagctct gttgtaagag

360

aagatgacgg tatcttacca gaaagggacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtccc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag cgagcgcagg cggttagata

480

agtctgaagt taaaggctgt ggcttaacca tagtacgctt tggaaactgt ttaacttgag

540

tgcaagaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tatggaggaa

600

caccggtggc gaaagcggct ctctggcttg actgacgctg aggctcgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttagac

720

gtttagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc

840

aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctattgt tagttgccat

960

catgggcact ctagcgagac tgccggtaat aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1020

tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca atggctggca acgagtcgca

1080

agccggtgac ggcaagctaa tctcttccag tctcagttcg gatgtaggct gcaactcgcc

1140

tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc cgcggtgaat acgttcccgg

1200

gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccgaagt cggtaggtag

1260

ccagccgcct aaggtgggat agatgattgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtatcgg

1320

aaggtgc

1327

<210> 1806

<211> 962

<212> DNA

<213> Streptococcus gordonii

<220>

<221> modified_base

<222> (17)..(17)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (953)..(953)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1806

agaaagggac ggctaantac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtcc cgagcgttgt

60

ccggatttat tgggcgtaaa gcgagcgcag gcggttagat aagtctgaag ttaaaggctg

120

tggcttaacc atagtacgct ttggaaactg tttaacttga gtgcagaagg ggagagtgga

180

attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat atatggagga acaccggtgg cgaaagcggc

240

tctctggtct gtaactgacg ctgaggctcg aaagcgtggg gagcgaacag gattagatac

300

cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaggtgtta ggccctttcc ggggcttagt

360

gccgcagcta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg accgcaaggt tgaaactcaa

420

aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga

480

agaaccttac caggtcttga catcccgatg cccgctctag agatagagtt ttacttcggt

540

acatcggtga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag

600

tcccgcaacg agcgcaaccc ttattgttag ttgccatcat tcagttgggc actctagcga

660

gactgccggt aataaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg

720

acctgggcta cacacgtgct acaatggctg gtacaacgag tcgcaagtcg gtgacggcaa

780

gctaatctct taaagccagt ctcagttcgg attgtaggct gcaactcgcc tacatgaagt

840

cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcacg ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac

900

acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta acacccgcaa gtcggtgagg tancctttta

960

gg

962

<210> 1807

<211> 1546

<212> DNA

<213> Streptococcus infantarius

<400> 1807

tgagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtaga

60

acgctgaaaa ctttagcttg ctaaagtttg aagagttgcg aacgggtgag taacgcgtag

120

gtaacctgcc tactagcggg ggataactat tggaaacgat agctaatacc gcataacagc

180

atttaaccca tgttagatgc ttgaaaggag caattgcttc actagtagat ggacctgcgt

240

tgtattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgatacatag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc ggcaatgggg gcaaccctga ccgagcaacg ccgcgtgagt gaagaaggtt

420

ttcggatcgt aaagctctgt tgtaagagaa gaatgtgtgt gagagtggaa agttcacaca

480

gtgacggtaa cttaccagaa agggacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

aggtcccgag cgttgtccgg atttattggg cgtaaagcga gcgcaggcgg tttaataagt

600

ctgaagttaa aggcagtggc ttaaccattg ttcgctttgg aaactgttag acttgagtgc

660

agaaggggag agtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat ggaggaacac

720

cggtggcgaa agcggctctc tggtctgtaa ctgacgctga ggctcgaaag cgtggggagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag gtgttaggcc

840

ctttccgggg cttagtgccg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg

900

caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ccgatgctat tcctagagat

1020

aggaagtttc ttcggaacat cggtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat tgttagttgc catcattaag

1140

ttgggcactc tagcgagact gccggtaata aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1200

catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggttggtac aacgagtcgc

1260

gagtcggtga cggcaagcaa atctcttaaa gccaatctca gttcggattg taggctgcaa

1320

ctcgcctaca tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agcacgccgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccgaagtcgg

1440

tgaggtaacc ttttaggagc cagccgccta aggtgggata gatgattggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct ggatcacctc ctttct

1546

<210> 1808

<211> 1547

<212> DNA

<213> Streptococcus infantis

<400> 1808

tgagagtttg atcctggctc aggatgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtaga

60

acgctgaagc ttggtgcttg caccgagcgg atgagttgcg aacgggtgag taacgcgtag

120

gtaacctgcc tggtagcggg ggataactat tggaaacgat agctaatacc gcatgacaac

180

agttattgca tgataactgt ttaaaagggg caattgctcc actaccagat ggacctgcgt

240

tgtattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgatacatag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc ggcaatggac ggaagtctga ccgagcaacg ccgcgtgagt gaagaaggtt

420

ttcggatcgt aaagctctgt tgtaagagaa gaacgagtgt gagagtggaa agttcacact

480

gtgacggtat cttaccagaa agggacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

aggtcccgag cgttatccgg atttattggg cgtaaagcga gcgcaggcgg ttagataagt

600

ctgaagttaa aggctgtggc ttaaccatag tacgctttgg aaactgttta acttgagtgc

660

aagaggggaa gagtggaatt ccatgtgtag cggtgtaaat gcgtagatat atggaggaac

720

accggtggcg aaagcggctc tctggcttgt aactgacgct gaggctcgaa agcgtgggga

780

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aggtgttaga

840

ccctttccgg ggtttagtgc cgtagctaac gcattaagca ctccgcctgg ggagtacgat

900

cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

960

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca tccctctgac cgctctggag

1020

atagagtttt ccttcgggac agaggtgaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc

1080

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct attgttagtt gccatcattc

1140

agttgggcac tctagcgaga ctgccggtaa taaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1200

atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca cacgtgctac aatggctggt acaacgagtc

1260

gcaagtcggt gacggcaagc taatctctta aagccagtct cagttcggat tgtaggctgc

1320

aactcgccta catgaagtcg gaatcgctag taatcgcgga tcagcacgcc gcggtgaata

1380

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac acccgaagtc

1440

ggtgaggtaa ccatttggag ccagccgcct aaggtgggat agatgattgg ggtgaagtcg

1500

taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcacct cctttct

1547

<210> 1809

<211> 1544

<212> DNA

<213> Streptococcus intermedius

<400> 1809

tttgatcctg gttcaggacg aacgctggcg gcgtgcctaa tacatgcaag tagaacgcac

60

aggatgcacc gtagtttact acaccgtatt ctgtgagttg cgaacgggtg agtaacgcgt

120

aggtaacctg cctggtagcg ggggataact attggaaacg atagctaata ccgcataaga

180

acatttactg catggtagat gtttaaaagg tgcaaatgca tcactaccag atggacctgc

240

gttgtattag ctagtaggtg aggtaacggc tcacctaggc gacgatacat agccgacctg

300

agagggtgat cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

360

tagggaatct tcggcaatgg ggggaaccct gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg

420

ttttcggatc gtaaagctct gttgttaagg aagaacgagt gtgagaatgg aaagttcata

480

ctgtgacggt acttaaccag aaagggacgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

540

gtaggtcccg agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc gagcgcaggc ggttagataa

600

gtctgaagtt aaaggcagtg gctcaaccat tgtaggcttt ggaaactgtt taacttgagt

660

gcagaagggg agagtggaat tccatgtgta gcggtgaaat gcgtagatat atggaggaac

720

accggtggcg aaagcggctc tctggtctgt aactgacgct gaggctcgaa agcgtgggga

780

gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aggtgttagg

840

tcctttccgg gacttagtgc cgcagctaac gcattaagca ctccgcctgg ggagtacgac

900

cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

960

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca tcccgatgcc cgctctagag

1020

atagagcttt acttcggtac atcggtgaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc

1080

gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt attgttagtt gccatcattc

1140

agttgggcac tctagcgaga ctgccggtaa taaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1200

atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca cacgtgctac aatggctggt acaacgagtc

1260

gcaagccggt gacggcaagc taatctctga aagccagtct cagttcggat tgtaggctgc

1320

aactcgccta catgaagtcg gaatcgctag taatcgcgga tcagcacgcc gcggtgaata

1380

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac acccgaagtc

1440

ggtgaggtaa ccgtaaggag ccagccgcct aaggtgggat agatgattgg ggtgaagtcg

1500

taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcacct cctt

1544

<210> 1810

<211> 1395

<212> DNA

<213> Streptococcus lutetiensis

<220>

<221> modified_base

<222> (1383)..(1383)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1810

gaagacttta gcttgctaaa gttggaagag ttgcgaacgg gtgagtaacg cgtaggtaac

60

ctgcctacta gcgggggata actattggaa acgatagcta ataccgcata acagcattta

120

acccatgtta gatgcttgaa aggagcaatt gcttcactag tagatggacc tgcgttgtat

180

tagctagttg gtgaggtaac ggctcaccaa ggcgacgata catagccgac ctgagagggt

240

gatcggccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtagggaa

300

tcttcggcaa tgggggcaac cctgaccgag caacgccgcg tgagtgaaga aggttttcgg

360

atcgtaaagc tctgttgtaa gagaagaacg tgtgtgagag tggaaagttc acacagtgac

420

ggtaacttac cagaaaggga cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtc

480

ccgagcgttg tccggattta ttgggcgtaa agcgagcgca ggcggtttaa taagtctgaa

540

gttaaaggca gtggcttaac cattgttcgc tttggaaact gttagacttg agtgcagaag

600

gggagagtgg aattccatgt gtagcggtga aatgcgtaga tatatggagg aacaccggtg

660

gcgaaagcgg ctctctggtc tgtaactgac gctgaggctc gaaagcgtgg ggagcaaaca

720

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt gctaggtgtt aggccctttc

780

cggggcttag tgccgcagct aacgcattaa gcactccgcc tggggagtac gaccgcaagg

840

ttgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg

900

aagcaacgcg aagaacctta ccaggtcttg acatcccgat gctattccta gagataggaa

960

gtttcttcgg aactgtgaga cttgagggca gaagggtaga gtgcacttgt atggggagct

1020

gtggaatgcg ttcccgcaac gagcgcaacc cctattgtta gttgccatca ttaagttggg

1080

cactctagcg agactgccgg taataaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca

1140

tgccccttat gacctgggct acacacgtgc tacaatggtt ggtacaacga gtcgcgagtc

1200

ggtgacggca agcaaatctc ttaaagccaa tctcagttcg gattgtaggc tgcaactcgc

1260

ctacatgaag tcggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcac gccgcggtga atacgttccc

1320

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagtttgt aacacccgaa gtcggtgagg

1380

tancctttta ggagc

1395

<210> 1811

<211> 1470

<212> DNA

<213> Streptococcus massiliensis

<400> 1811

gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac gcagaggatt ggtgcttgca

60

ctaatctaat gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg

120

ataactattg gaaacgatag ctaataccgc ataatagttt atgactcatg ttataaactt

180

gaaagataca actgtatcac taccagatgg acctgcgttg tattagctag taggtagggt

240

aacggcctac ctaggcgacg atacatagcc gacctgagag ggtgatcggc cacactggga

300

ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatcttcgg caatgggggg

360

aaccctgacc gagcaacgcc gcgtgagtga agaaggtttt cggatcgtaa agctctgttg

420

ttaaggaaga acgggagtag gagtggaaag cctactttgt gacggtactt aaccagaaag

480

ggacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtcccgagcg ttatccggat

540

ttattgggcg taaagcgagc gcaggcggtt agataagtct ggagtaaaag gctatggctc

600

aaccatagtg tgctctggaa actgtttaac ttgagtgcag aaggggagag tggaattcca

660

tgtgtagcgg tgaaatgcgt agatatatgg aggaacaccg gtggcgaaag cggctctctg

720

gtctgtaact gacgctgagg ctcgaaagcg tggggagcga acaggattag ataccctggt

780

agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaggt gttaggccct ttccggggct tagtgccgta

840

gctaacgcaa taagcactcc gcctggggag tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat

900

tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc

960

ttaccaggtc ttgacatccc gatgcccgtc ctagagatag gattttactt cggtacatcg

1020

gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1080

aacgagcgca acccttattg ttagttgcca tcattgagtt gggcactcta gcgagactgc

1140

cggtaataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg

1200

gctacacacg tgctacaatg gctggtacaa cgagtcgcaa gtcggtgacg acaagctaat

1260

ctctgaaagc cagtctcagt tcggattgta ggctgcaact cgcctacatg aagtcggaat

1320

cgctagtaat cgcggatcag cacgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1380

cccgtcacac cacgagagtt tgtaacaccc gaagtcggtg aggtaaccgt aaggagccag

1440

ccgcctaagg tgggatagat gattggggtg

1470

<210> 1812

<211> 945

<212> DNA

<213> Streptococcus milleri

<220>

<221> modified_base

<222> (934)..(934)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1812

gtctataccg tagcttgcta caccataggc tgtgagttgc gaacgggtga gtaacgcgta

60

ggtaacctgc ctattagagg gggataacta ttggaaacga tagctaatac cgcataacag

120

tatgtaacac atgttagatg cttgaaagat gcaattgcat cgctagtaga tggacctgcg

180

ttgtattagc tagtaggtag ggtaatggcc tacctaggca acgatacata gccgacctga

240

gagggtgatc ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

300

agggaatctt cggcaatggg gggaaccctg accgagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt

360

tttcggatcg taaagctctg ttgttaagga agaacgagtg tgagaatgga aagttcatac

420

tgtgacggta cttaaccaga aagggacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

taggtcccga gcgttgtccg gatttattgg gcgtaaagcg agcgcaggcg gttagaaaag

540

tctgaagtga aaggcagtgg ctcaaccatt gtaggctttg gaaactgttt aacttgagtg

600

cagaagggga gagtggaatt ccatgtgtag cggtgaaatg cgtagatata tggaggaaca

660

ccggtggcga aagcggctct ctggtctgta actgacgctg aggctcgaaa gcgtggggag

720

cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttaggt

780

cctttccggg acttagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacgacc

840

gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt

900

aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcntgacat cccag

945

<210> 1813

<211> 976

<212> DNA

<213> Streptococcus mitis

<220>

<221> modified_base

<222> (47)..(47)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (135)..(136)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (143)..(143)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (154)..(154)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (244)..(244)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1813

ggaaagttca cactgtgacg gtatcttacc agaaagggac ggctaantac gtgccagcag

60

ccgcggtaat acgtaggtcc cgagcgttgt ccggatttat tgggcgtaaa gcgagcgcag

120

gcggttagat aagtnngaag ttnaaggctg tggnttaacc atagtacgct ttggaaactg

180

tttaacttga gtgcaagagg ggagagtgga attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat

240

atanggagga acaccggtgg cgaaagcggc tctctggctt gtaactgacg ctgaggctcg

300

aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg

360

ctaggtgtta gaccctttcc ggggtttagt gccgcagcta acgcattaag cactccgcct

420

ggggagtacg accgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg

480

gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catccctctg

540

accgctctag agatagagtt ttccttcggg acagaggtga caggtggtgc atggttgtcg

600

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ctattgttag

660

ttgccatcat ttagttgggc actctagcga gactgccggt aataaaccgg aggaaggtgg

720

ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg acctgggcta cacacgtgct acaatggctg

780

gtacaacgag tcgcaagccg gtgacggcaa gctaatctct taaagccagt ctcagttcgg

840

attgtaggct gcaactcgcc tacatgaagt cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcacg

900

ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta

960

acacccgaag tcggtg

976

<210> 1814

<211> 971

<212> DNA

<213> Streptococcus mutans

<220>

<221> modified_base

<222> (950)..(950)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1814

agaacacact gtgcttgcac accgtgtttt cttgagtcgc gaacgggtga gtaacgcgta

60

ggtaacctgc ctattagcgg gggataacta ttggaaacga tagctaatac cgcataatat

120

taattattgc atgataattg attgaaagat gcaagcgcat cactagtaga tggacctgcg

180

ttgtattagc tagttggtaa ggtaagagct taccaaggcg acgatacata gccgacctga

240

gagggtgatc ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

300

agggaatctt cggcaatgga cgaaagtctg accgagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt

360

tttcggatcg taaagctctg ttgtaagtca agaacgtgtg tgagagtgga aagttcacac

420

agtgacggta gcttaccaga aagggacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

taggtcccga gcgttgtccg gatttattgg gcgtaaaggg agcgcaggcg gtcaggaaag

540

tctggagtaa aaggctatgg ctcaaccata gtgtgctctg gaaactgtct gacttgagtg

600

cagaagggga gagtggaatt ccatgtgtag cggtgaaatg cgtagatata tggaggaaca

660

ccagtggcga aagcggctct ctggtctgtc actgacgctg aggctcgaaa gcgtgggtag

720

cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttaggc

780

cctttccggg gcttagtgcc ggagctaacg caataagcac tccgcctggg gagtacgacc

840

gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt

900

aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cccgatgctn ttcttagaga

960

taggaagtta c

971

<210> 1815

<211> 1510

<212> DNA

<213> Streptococcus oligofermentans

<400> 1815

cggcgtgcct aatacatgca agtagaacgc tgaaggaagg agcttgctct ttccggaaga

60

gttgcgaacg ggtgagtaac gcgtaggtaa cctacctttt agcgggggat aactattgga

120

aacgatagct aataccgcat aagacatttt actgcatggt aagatgttaa aagatgcaaa

180

tgcatcacta agagatggac ctgcgttgta ttagctagta ggtgaggtaa cggctcacct

240

aggcgacgat acatagccga cctgagaggg tgatcggcca cactgggact gagacacggc

300

ccagactcct acgggaggca gcagtaggga atcttcggca atggacggaa gtctgaccga

360

gcaacgccgc gtgagtgaag aaggttttcg gatcgtaaag ctctgttgta agagaagaac

420

gagtgtgaga gtggaaagtt cacactgtga cggtaactta ccagaaaggg acggctaact

480

acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt cccgagcgtt gtccggattt attgggcgta

540

aagcgagcgc aggcggttag ataagtctga agttaaaggc tgtggcttaa ccatagtacg

600

ctttggaaac tgtttaactt gagtgcagaa ggggagagtg gaattccatg tgtagcggtg

660

aaatgcgtag atatatggag gaacaccggt ggcgaaagcg gctctctggt ctgtaactga

720

cgctgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt

780

aaacgatgag tgctaggtgt tgggtccttt ccgggactca gtgccgtagc taacgcatta

840

agcactccgc ctggggagta cgaccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc

900

gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt

960

gacatcccgg tgcccgtcct agagatagga ttttgcttcg gcacaccggt gacaggtggt

1020

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1080

ccttattgtt agttgccatc attcagttgg gcactctagc gagactgccg gtaataaacc

1140

ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg

1200

ctacaatggc tggtacaacg agtcgcaagt cggtgacggc aagctaatct cttaaagcca

1260

gtctcagttc ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg

1320

cggatcagca cgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca

1380

cgagagtttg taacacccga agtcggtgag gtaacctttt aggagccagc cgcctaaggt

1440

gggatagatg attggggtga agtcgtaaca aggtagccgt atcggaaggt gcggctggat

1500

caccttctta

1510

<210> 1816

<211> 801

<212> DNA

<213> Streptococcus oralis

<220>

<221> modified_base

<222> (507)..(507)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (520)..(520)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (551)..(551)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (591)..(591)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (625)..(625)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (682)..(682)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (696)..(697)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (713)..(713)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (737)..(737)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (751)..(751)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (784)..(784)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1816

tgcttctctg gatgagttgc gaacgggtga gtaacgcgta ggtaacctgc ctggtagcgg

60

gggataacta ttggaaacga tagctaatac cgcataagat tgattattgc atgatagtca

120

attaaaaggt gcaattgcat cactaccaga tggacctgcg ttgtattagc tagttggtga

180

ggtaacggct caccaaggca acgatacata accgacctga gagggtgatc ggccacactg

240

ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt cggcaatgga

300

cggaagtctg accgagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt tttcggatcg taaagctctg

360

ttgtaagaga agaacgagtg tgagagtgga aagttcacac tgtgacggta tcttaccata

420

aagggacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg taggtcccga gcgttgtccg

480

gatttattgg gcgtaaagcg agcgcangcg gttagataan tctgaagtta aaggctgtgg

540

cttaaccata ntacgctttg gaaactgttt aacttgagtg caagagggga nagtggaatt

600

ccatgtgtag cggtgaaatg cgtanatata tggaggaaca ccggtggcga aagcggctct

660

ctggcttgta actgacgctg angctcgaaa gcgtgnngag caaacaggat tanataccct

720

ggtagtccac gccgtanacg atgagtgcta ngtgttagac cctttccggg gtttagtgcc

780

gcanctaacg cattaagcac t

801

<210> 1817

<211> 1393

<212> DNA

<213> Streptococcus parasanguinis

<220>

<221> modified_base

<222> (1384)..(1384)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1817

gctgaagctt ggtgcttgca ccgagcggaa gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt

60

aacctgcctc ttagcggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc ataaaagtcg

120

acattgcatg atgttgactt gaaaggtgca actgcaccac taagagatgg acctgcgttg

180

tattagctag ttggtgaggt aacggctcac caaggcgacg atacatagcc gacctgagag

240

ggtgatcggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg

300

gaatcttcgg caatggacgg aagtctgacc gagcaacgcc gcgtgagtga agaaggtttt

360

cggatcgtaa agctctgttg taagagaaga acgagtgtga gagtggaaag ttcacactgt

420

gacggtaact taccagaaag ggacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

480

gtccgagcgt tatccggatt tattgggcgt aaagcgagcg caggcggtta gataagtctg

540

aagttaaagg ctgtggctta accatagtac gctttggaaa ctgtttaact tgagtgcaga

600

aggggagagt ggaattccat gtgtagcggt gaaatgcgta gatatatgga ggaacaccgg

660

tggcgaaagc ggctctctgg tctgtaactg acgctgaggc tcgaaagcgt ggggagcaaa

720

caggattaga taccctggta gtcacgccgt aaacgatgag tgctaggtgt tgggtccttt

780

ccgggactca gtgccgcagc taacgcatta agcactccgc ctggggagta cgaccgcaag

840

gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc

900

gaagcaacgc gaagaacctt acccggtctt gacatccctc tgaccgctct agagatagag

960

ctttccttcg ggacagaggt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga

1020

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctattgtt agttgccatc atttagttgg

1080

gcactctagc gagactgccg gtaataaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc

1140

atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatggc tggtacaacg agtcgcgagt

1200

cggtgacggc aagctaatct cttaaagcca gtctcagttc ggattgtagg ctgcaactcg

1260

cctacatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg cggatcagca cgccgcggtg aatacgttcc

1320

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagtttg taacacccga agtcggtgag

1380

gtancctttt agg

1393

<210> 1818

<211> 1372

<212> DNA

<213> Streptococcus pasteurianus

<400> 1818

gaaatggagt ttgatcctgg ctcaggacga acgctggcgg cgtgcctaat acatgcaagt

60

agaacgagtt gcgaacgggt gagtaacgcg taggtaacct gcctactagc gggggataac

120

tattggaaac gatagctaat accgcataac gaaagtcact agtagatgga cctgcgttgt

180

attagctagt tggtggggta acggcccacc aaggcgacga tacatagccg acctgagagg

240

gtgatcggcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtaggg

300

aatcttcggc aatgggggca accctgaccg agcaacgccg cgtgagtgaa gaaggttttc

360

ggatcgtaaa gctctgttgt aagagaagat gacggtaact taccagaaag ggacggctaa

420

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtcccgagcg ttgtccggat ttattgggcg

480

taaagcgagc gcaggcggtt taataagtct gaagttaaag gcagtggctt aaccattgtt

540

cgctttggaa actgttaaac ttgagtgcag aaggggagag tggaattcca tgtgtagcgg

600

tgaaatgcgt agatatatgg aggaacaccg gtggcgaaag cggctctctg gtctgactga

660

cgctgaggct cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt

720

aaacgatgag tgctaggtgt taggcgctta gtgccgcagc taacgcatta agcactccgc

780

ctggggagta cgaccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg

840

tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatcgaca

900

ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

960

cgcaacccct attgttagtt gccatcatgg gcactctagc gagactgccg gtaataaacc

1020

ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg

1080

ctacaatggt tggcaacgag tcgcaagtcg gtgacggcaa gcaaatctct tccaatctca

1140

gttcggatgt aggctgcaac tcgcctacag aagtcggaat cgctagtaat cgcggatcag

1200

cacgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt

1260

tgtaacaccc gaagtcggta ggtagccagc cgcctaaggt gggatagatg attggggtga

1320

agtcgtaaca aggtagccgt atcggaaggt gcggctggat cacctccttt ct

1372

<210> 1819

<211> 1543

<212> DNA

<213> Streptococcus peroris

<400> 1819

tgagagtttg atcctggctc aggatgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtaga

60

acgctgaagg aggagcttgc ttctctggat gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt

120

aacctgcctg gtagcggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc ataagagcag

180

ttgttgcatg acagctgttt aaaaggtgca attgcaccac taccagatgg acctgcgttg

240

tattagctag ttggtgaggt aacggctcac caaggcgacg atacatagcc gacctgagag

300

ggtgatcggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg

360

gaatcttcgg caatgggggc aaccctgacc gagcaacgcc gcgtgagtga agaaggtttt

420

cggatcgtaa agctctgttg taagagaaga acgagtgtga gagtggaaag ttcacgctgt

480

gacggtatct taccagaaag ggacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

540

gtcccgagcg ttatccggat ttattgggcg taaagcgagc gcaggcggtt agataagtct

600

gaagttaaag gctgtggctt aaccatagta cgctttggaa actgtttaac ttgagtgcaa

660

gaggggagag tggaattcca tgtgtagcgg tgaaatgcgt agatatatgg aggaacaccg

720

gtggcgaaag cggctctctg gcttgtaact gacgctgagg ctcgaaagcg tggggagcaa

780

acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaggt gttagaccct

840

ttccggggtt tagtgccgca gctaacgcat taagcactcc gcctggggag tacgaccgca

900

aggttgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatccc gatgccattt ctagagatag

1020

gaagttactt cggtacatcg gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga

1080

gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctattg ttagttgcca tcattcagtt

1140

gggcactcta gcgagactgc cggtaataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaaatca

1200

tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tgctacaatg gctggtacaa cgagtcgcga

1260

gtcggtgacg gcaagctaat ctcttaaagc cagtctcagt tcggattgta ggctgcaact

1320

cgcctacatg aagtcggaat cgctagtaat cgcggatcag cacgccgcgg tgaatacgtt

1380

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt tgtaacaccc gaagtcggtg

1440

aggtaaccat ttggagccag ccgcctaagg tgggatagat gattggggtg aagtcgtaac

1500

aaggtagccg tatcggaagg tgcggctgga tcacctcctt tct

1543

<210> 1820

<211> 1365

<212> DNA

<213> Streptococcus pneumoniae

<400> 1820

agcttgcttc tccggatgag ttgcgaacgg gtgagtaacg cgtaggtaac ctgcctggta

60

gcgggggata actattggaa acgatagcta ataccgcata agagtagatg ttgcatgaca

120

tttgcttaaa aggtgcaatt gcatcactac cagatggacc tgcgttgtat tagctagttg

180

gtggggtaac ggctcaccaa ggcgacgata catagccgac ctgagagggt gatcggccac

240

actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtagggaa tcttcggcaa

300

tggacggaag tctgaccgag caacgccgcg tgagtgaaga aggttttcgg atcgtaaagc

360

tctgttgtaa gagaagaacg agtgtgagag tggaaagttc acactgtgac ggtatcttac

420

cagaaaggga cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtc ccgagcgttg

480

tccggattta ttgggcgtaa agcgagcgca ggcggttaga taagtctgaa gttaaggctg

540

tggcttaacc atagtacgct ttggaaactg tttaacttga gtgcaagagg ggagagtgga

600

attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat ataggaggaa caccggtggc gaaagcggct

660

ctctggcttg taactgacgc tgaggctcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc

720

ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgagtgc taggtgttag accctttccg gggtttagtg

780

ccgcagctaa cgcattaagc actccgcctg gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa

840

ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcgacgcgaa

900

gaaccttacc aggtcttgac ttccctctga ccgctctaga gatagagttt tccttcggga

960

cagaggtgac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1020

cccgcaacga gcgcaacccc tattgttagt tgccatcatt tagttgggca ctctagcgag

1080

actgccggta ataaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga

1140

cctgggctac acacgtgcta caatggctgg tacaacgagt cgcaagccgg tgacggcaag

1200

ctaatctctt aaagccagtc tcagttcgga ttgtaggctg caactcgcct acatgaagtc

1260

ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca

1320

caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccgaagt cggtg

1365

<210> 1821

<211> 1445

<212> DNA

<213> Streptococcus porcinus

<400> 1821

cgctggcggc gtgcctaata catgcaagta gaacgcagag gacaggtgct tgcaccagtc

60

taatgagttg cgaacgggtg agtaacgcgt aggtaaccta ccttatagcg ggggataact

120

attggaaacg atagctaata ccgcatgaaa gtagaagaca catgtcatct acttaaaagg

180

ggcaaatgct ctactatgag atggacctgc gttgtattag ctagttggtg aggtaaaggc

240

tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat cggccacact gggactgaga

300

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tcggcaatgg ggggaaccct

360

gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc gtaaagctct gttgttagag

420

aagaacggta atgggagtgg aaaatccatt acgtgacggt aactaaccag aaagggacgg

480

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtcccg agcgttgtcc ggatttattg

540

ggcgtaaagc gagcgcaggc ggtttgataa gtctgaagtt aaaggctgtg gcttaaccat

600

agttcgcttt ggaaactgtc aaacttgagt gcagaagggg agagtggaat tccatgtgta

660

gcggtgaaat gcgtagatat atggaggaac accggtggcg aaagcggctc tctggtctgt

720

aactgacgct gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

780

cgccgtaaac gatgagtgct aggtgttagg ccctttccgg ggcttagtgc cggagctaac

840

gcattaagca ctccgcctgg ggagtacgac cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg

900

gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacca

960

ggtcttgaca tccttctgac cgtcctagag ataggatttc ccttcggggc aggagtgaca

1020

ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1080

cgcaacccct attgttagtt gccatcatta agttgggcac tctagcgaga ctgccggtaa

1140

taaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca

1200

cacgtgctac aatggttggt acaacgagtc gcaagccggt gacggcaagc taatctctta

1260

aagccaatct cagttcggat tgtaggctgc aactcgccta catgaagtcg gaatcgctag

1320

taatcgcgga tcagcacgcc gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc

1380

acaccacgag agtttgtaac acccgaagtc ggtgaggtaa ccatttagga gccagccgcc

1440

taagg

1445

<210> 1822

<211> 1376

<212> DNA

<213> Streptococcus pseudopneumoniae

<400> 1822

tgcaagtaga acgctgaagg aggagcttgc ttctctggat gagttgcgaa cgggtgagta

60

acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc

120

ataagagtag atgttgcatg acatttrctt aaaaggtgca attgcatcac taccagatgg

180

acctgcgttg tattagctag ttggtggggt aacggctcac caaggcgacg atacatagcc

240

gacctgagag ggtgatcggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg

300

cagcagtagg gaatcttcgg caatggacgg aagtctgacc gagcaacgcc gcgtgagtga

360

agaaggtttt cggatcgtaa agctctgttg taagagaaga acgagtgtga gagtggaaag

420

ttcacactgt gacggtatct taccagaaag ggacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

480

taatacgtag gtcccgagcg ttgtscggaw ttattgggcg taaagcgagc gcaggcggtt

540

agataagtct gaagttaaag gctgtggctt aaccatagta ggctttggaa actgtttaac

600

ttgagtgcaa gaggggagag tggaattcca tgtgtagcgg tgaaatgcgt agatatatgg

660

aggaacaccg gtggcgaaag cggctctctg gcttgtaact gacgctgagg ctcgaaagcg

720

tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaggt

780

gttagaccct ttccggggtt tagtgccgta gctaacgcat taagcactcc gcctggggag

840

tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat

900

gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatccc tctgaccgct

960

ctagagatag agctttcctt cgggacagag gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct

1020

cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctattg ttagttgcca

1080

tcattcagtt gggcactcta gcgagactgc cggtaataaa ccggaggaag gtggggatga

1140

cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tgctacaatg gctggtacaa

1200

cgagtcgcaa gccggtgacg gcaagctaat ctcttaaagc cagtctcagt tcggattgta

1260

ggctgcaact cgcctacatg aagtcggaat cgctagtaat cgcggatcag cacgccgcgg

1320

tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt tgtaac

1376

<210> 1823

<211> 1545

<212> DNA

<213> Streptococcus pseudoporcinus

<400> 1823

gagagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaatacat gcaagtagaa

60

cgctgaggtc tggtgcttgc actagaccaa ggagttgcga acgggtgagt aacgcgtagg

120

taacctacct catagcgggg gataactatt ggaaacgata gctaataccg catgagactg

180

gggttcacat gaacccgagt taaaaggagc aaaagcttca ctatgagatg gacctgcgtt

240

gtattagcta gttggtgagg taaaggctca ccaaggcgac gatacatagc cgacctgaga

300

gggtgatcgg ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtag

360

ggaatcttcg gcaatggggg gaaccctgac cgagcaacgc cgcgtgagtg aagaaggttt

420

tcggatcgta aagctctgtt gttagagaag aacggtaatg ggagtggaaa atccattatg

480

tgacggtaac taaccagaaa gggacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

540

ggtcccgagc gttgtccgga tttattgggc gtaaagcgag cgcaggcggt ttgataagtc

600

tgaagttaaa ggctgtggct taaccatagt atgctttgga aactgtcaaa cttgagtgca

660

gaaggggaga gtggaattcc atgtgtagcg gtgaaatgcg tagatatatg gaggaacacc

720

ggtggcgaaa gcggctctct ggtctgtaac tgacgctgag gctcgaaagc gtggggagca

780

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctagg tgttaggccc

840

tttccggggc ttagtgccgg agctaacgca ttaagcactc cgcctgggga gtacgaccgc

900

aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

960

ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcc ttctgaccgg cctagagata

1020

ggctttctct taggagcaga agagacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1080

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccctatt gttagttgcc atcattaagt

1140

tgggcactct agcgagactg ccggtaataa accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc

1200

atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat ggttggtaca acgagtcgca

1260

agccggtgac ggcaagctaa tctcttaaag ccaatctcag ttcggattgt aggctgcaac

1320

tcgcctacat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcacgccgcg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc cgaagtcggt

1440

gaggtaacct tttaggagcc agccgcctaa ggtgggatag atgattgggg tgaagtcgta

1500

acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttct

1545

<210> 1824

<211> 1547

<212> DNA

<213> Streptococcus pyogenes

<400> 1824

gagagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaatacat gcaagtagaa

60

cgctgagaac tggtgcttgc accggttcaa ggagttgcga acgggtgagt aacgcgtagg

120

taacctacct catagcgggg gataactatt ggaaacgata gctaataccg cataagagag

180

actaacgcat gttagtaatt taaaaggggc aattgctcca ctatgagatg gacctgcgtt

240

gtattagcta gttggtgagg taaaggctca ccaaggcgac gatacatagc cgacctgaga

300

gggtgatcgg ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtag

360

ggaatcttcg gcaatggggg caaccctgac cgagcaacgc cgcgtgagtg aaagaaggtt

420

ttcggatcgt aaagctctgt tgttagagaa gaatgatggt gggagtggaa aatccaccaa

480

gtgacggtaa ctaaccagaa agggacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

aggtcccgag cgttgtccgg atttattggg cgtaaagcga gcgcaggcgg ttttttaagt

600

ctgaagttaa aggcattggc tcaaccaatg tacgctttgg aaactggaga acttgagtgc

660

agaaggggag agtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat ggaggaacac

720

cggtggcgaa agcggctctc tggtctgtaa ctgacgctga ggctcgaaag cgtggggagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag gtgttaggcc

840

ctttccgggg cttagtgccg gagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg

900

caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ccgatgcccg ctctagagat

1020

agagttttac ttcggtacat cggtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat tgttagttgc catcattaag

1140

ttgggcactc tagcgagact gccggtaata aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1200

catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggttggtac aacgagtcgc

1260

aagccggtga cggcaagcta atctcttaaa gccaatctca gttcggattg taggctgcaa

1320

ctcgcctaca tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agcacgccgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccgaagtcgg

1440

tgaggtaacc tattaggagc cagccgccta aggtgggata gatgattggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct ggatcacctc ctttcta

1547

<210> 1825

<211> 1334

<212> DNA

<213> Streptococcus ratti

<220>

<221> modified_base

<222> (66)..(66)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (85)..(85)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (138)..(138)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (142)..(142)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (207)..(207)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (240)..(240)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (260)..(261)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (282)..(284)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (449)..(449)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (475)..(475)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (493)..(493)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (523)..(523)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (842)..(843)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (855)..(855)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (926)..(926)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (954)..(954)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (956)..(956)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1018)..(1018)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1070)..(1070)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1121)..(1121)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1295)..(1295)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1304)..(1304)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1825

gaacgggtga gtaacgcgta ggtaacctgc ctattagcgg gggataacta ttggaaacga

60

tagctnatac cgcataagag agttnaacac atgttagacg cttgaaagat gcaagagcat

120

cactagtaga tggacctncg tngtattagc tagtaggtag ggtaaaggcc tacctaggcg

180

acgatacata gccgacctga gagggtnacc ggccacactg ggactgagac acggcccagn

240

ctcctacggg aggcagcagn ngggaatctt cggcaatggg gnnnaccctg accgagcaac

300

gccgcgtgag tgaagaaggt tttcggatcg taaagctctg ttgtcagaga cgaacgtgtg

360

tgagagtgga aagttcacac agtgacggta actgaccaga aagggacggc taactacgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg taggtcccna gcgttgtccg gatttattgg gcgtnaagcg

480

agcgcaggcg gtnttgtaag tctgaagtca aaggcagtgg ctnaaccatt gtgtgctttg

540

gaaactgcag gacttgagtg cagaagggga gagtggaatt ccatgtgtag cggtgaaatg

600

cgtagatata tggaggaaca ccggtggcga aagcggctct ctggtctgta actgacgctg

660

aggctcgaaa gcgtgggtag cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

ctgagtgcta ggtgttaggc cctttccggg gcttagtgcc ggagctaacg cattaagcac

780

tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggccgcacaa

840

gnngtggagc atgtngttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc

900

ccgatgcccg ctctagagat agagtnttac tttcgtacat cggtgacagg tggngnatgg

960

ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caaccctnat

1020

tgttagttgc catcattgag ttgggcactc tagcgagact gccggtaatn aaccggagga

1080

aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct nggctacaca cgtgctacaa

1140

tggtcggtac aacgagtcgc gagccggtga cggcaagcta atctctgaaa gccgatctca

1200

gttcggattg gaggctgcaa ctcgcctcca tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc

1260

agcacgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtncacac cgcncgtcac accacgagag

1320

tttgtaacac ccga

1334

<210> 1826

<211> 1012

<212> DNA

<213> Streptococcus salvarius

<220>

<221> modified_base

<222> (998)..(998)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1005)..(1006)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1826

tagaacgctg aagagaggag cttgctcttc ttggatgagt tgcgaacggg tgagtaacgc

60

gtaggtaacc tgccttgtag cgggggataa ctattggaaa cgatagctaa taccgcataa

120

caatggatga cacatgtcat ttatttgaaa ggggcaattg ctccactaca agatggacct

180

gcgttgtatt agctagtagg tgaggtaacg gctcacctag gcgacgatac atagccgacc

240

tgagagggtg atcggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

300

agtagggaat cttcggcaat gggggcaacc ctgaccgagc aacgccgcgt gagtgaagaa

360

ggttttcgga tcgtaaagct ctgttgtaag tcaagaacga gtgtgagagt ggaaagttca

420

cactgtgacg gtagcttacc agaaagggac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtaggtcc cgagcgttgt ccggatttat tgggcgtaaa gcgagcgcag gcggtttgat

540

aagtctgaag ttaaaggctg tggctcaacc atagttcgct ttggaaactg tcaaacttga

600

gtgcagaagg ggagagtgga attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat atatggagga

660

acaccggtgg cgaaagcggc tctctggtct gtaactgacg ctgaggctcg aaagcgtggg

720

gagcgaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaggtgttg

780

gatcctttcc gggattcagt gccgcagcta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg

840

accgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg

900

tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catcccgatg ctatttctag

960

agatagaaag ttacttcggt acatcggtga caggtggngc atggnngtcg tc

1012

<210> 1827

<211> 966

<212> DNA

<213> Streptococcus sanguinis

<220>

<221> modified_base

<222> (47)..(48)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (700)..(700)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (714)..(714)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (721)..(721)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (799)..(799)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (855)..(855)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (917)..(917)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (920)..(920)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (930)..(930)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (955)..(955)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1827

cgctgaagag aggagcttgc tcttcttgga tgagttgcga acgggtnngt aacgcgtagg

60

taacctgcct ggtagcgggg gataactatt ggaaacgata gctaataccg catgaaattg

120

cttatcgcat gataattaat tgaaagatgc aactgcatca ctaccagatg gacctgcgtt

180

gtattagcta gttggtgagg taacggctca ccaaggcgac gatacatagc cgacctgaga

240

gggtgatcgg ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtag

300

ggaatcttcg gcaatggggg gaaccctgac cgagcaacgc cgcgtgagtg aagaaggttt

360

tcggatcgta aagctctgtt gtaagagaag aacgggtgtg agagtggaaa gttcacactg

420

tgacggtatc ttaccagaaa gggacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

480

ggtcccgagc gttgtccgga tttattgggc gtaaagcgag cgcaggcggt tagataagtc

540

tgaagttaaa ggctgtggct taaccatagt atgctttgga aactgtttaa cttgagtgca

600

gaaggggaga gtggaattcc atgtgtagcg gtgaaatgcg tagatatatg gaggaacacc

660

ggtggcgaaa gcggctctct ggtctgtaac tgacgctgan gctcgaaagc gtgnggagca

720

nacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctagg tgttaggccc

780

tttccggggc ttagtgccnc agctaacgca ttaagcactc cgcctgggga gtacgaccgc

840

gaggttgaaa ctcanaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

900

ttcgaagcaa cgcgaanaan cttaccaggn cttgacatcc ctctgaccgc tctanagata

960

gagttt

966

<210> 1828

<211> 1510

<212> DNA

<213> Streptococcus sinensis

<400> 1828

agtttgatcc tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca agtggaacgc

60

acaaggtgca ccgtagttta ctacaccgta ctttgtgagt cgcgaacggg tgagtaacgc

120

gtaggtaacc taccttttag cgggggataa ctattggaaa cgatagctaa taccgcataa

180

gatatcttac tgcatggtaa gatattaaaa gatgcaattg catcactaag agatggacct

240

gcgttgtatt agctagtagg tgaggtaacg gctcacctag gcaacgatac atagccgacc

300

tgagagggtg atcggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

360

agtagggaat cttcggcaat ggggggaacc ctgaccgagc aacgccgcgt gagtgaagaa

420

ggttttcgga tcgtaaagct ctgttgtaag agaagaacga gtgtgagagt ggaaagttca

480

cactgtgacg gtaacttacc agaaagggac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

540

acgtaggtcc cgagcgttgt ccggatttat tgggcgtaaa gcgagcgcag gcggttagat

600

aagtctgaag ttaaaggctg tggcttaacc atagtacgct ttggaaactg tttaacttga

660

gtgcagaagg ggagagtgga attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat atatggagga

720

acaccggtgg cgaaagcggc tctctggtct gtaactgacg ctgaggctcg aaagcgtggg

780

gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaggtgttg

840

ggtcctttcc gggactcagt gccgcagcta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg

900

accgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg

960

tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catcccggtg cccgtcctag

1020

agataggatt ttgcttcggc acaccggtga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1080

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttattgttag ttgccatcat

1140

tcagttgggc actctagcga gactgccggt aataaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1200

aaatcatcat gccccttatg acctgggcta cacacgtgct acaatggctg gtacaacgag

1260

tcgcaagtcg gtgacggcaa gctaatctct taaagccagt ctcagttcgg attgtaggct

1320

gcaactcgcc tacatgaagt cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcacg ccgcggtgaa

1380

tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta acacccgaag

1440

tcggtgaggt aaccttttag gagccagccg cctaaggtgg gatagatgat tggggtgaag

1500

tcgtaacaag

1510

<210> 1829

<211> 1478

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. 16362

<400> 1829

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtaggac gcacagtcta taccgtagct

60

tgctacacca taggctgtga gttgcgaacg ggtgagtaac gcgtaggtaa cctgcctatt

120

agagggggat aactattgga aacgatagct aataccgcat aatagtatgt aacacatgtt

180

agatgcttga aagatgcaat tgcatcgcta gtagatggac ctgcgttgta ttagctagta

240

ggtagggtaa aggcctacct aggcaacgat acatagccga cctgagaggg tgatcggcca

300

cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtaggga atcttcggca

360

atggggggaa ccctgaccga gcaacgccgc gtgagtgaag aaggttttcg gatcgtaaag

420

ctctgttgtt aaggaagaat gagtgtgaga atggaaagtt catactgtga cggtacttaa

480

ccagaaaggg acggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt cccgagcgtt

540

gtccggattt attgggcgta aagcgagcgc aggcggttag aaaagtctga agtgaaaggc

600

agtggctcaa ccattgtagg ctttggaaac tgtttaactt gagtgcagaa ggggagagtg

660

gaattccatg tgtagcggtg aaatgcgtag atatatggag gaacaccggt ggcgaaagcg

720

gctctctggt ctgtaactga cgctgaggct cgaaagcgtg gggagcgaac aggattagat

780

accctggtag tccacgccgt aaacgatgag tgctaggtgt taggtccttt ccgggactta

840

gtgccgcagc taacgcatta agcactccgc ctggggagta cgaccgcaag gttgaaactc

900

aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc

960

gaagaacctt accaggtctt gacatcccga tgctatttct agagatagga agtttcttcg

1020

gaacatcggt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta

1080

agtcccgcaa cgagcgcaac ccttattgtt agttgccatc attgagttgg gcactctagc

1140

gagactgccg gtaataaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta

1200

tgacctgggc tacacacgtg ctacaatggc tggtacaacg agtcgcaagc cggtgacggc

1260

aagctaatct ctgaaagcca gtctcagttc ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa

1320

gtcggaatcg ctagtaatcg cggatcagca cgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1380

acacaccgcc cgtcacacca cgagagtttg taacacccga agtcggtgag gtaaccgtaa

1440

ggagccagcc gcctaaggtg ggatagatga ttggggtg

1478

<210> 1830

<211> 1501

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. 2285-97

<400> 1830

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac gctgaggtca tgtgcttgca

60

caagaccaag gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctc atagcggggg

120

ataactattg gaaacgatag ctaataccgc atgagagttt ttaacacatg ttaggaactt

180

aaaaggagca actgcttcac tatgagatgg acctgcgttg tattagctag ttggtgaggt

240

aacggctcac caaggcgacg atacatagcc gacctgagag ggtgatcggc cacactggga

300

ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatcttcgg caatgggggc

360

aaccctgacc gagcaacgcc gcgtgagtga agaaggtttt cggatcgtaa agctctgttg

420

ttagagaaga atggaagtag gagtggaaag tctacttcgt gacggtaact aaccagaaag

480

ggacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtcccgagcg ttgtccggat

540

ttattgggcg taaagcgagc gcaggcggtt ctataagtct gaagttaaag gcagtggctc

600

aaccattgtt cgctttggaa actgtagaac ttgagtgcag aaggggagag tggaattcca

660

tgtgtagcgg tgaaatgcgt agatatatgg aggaacaccg gtggcgaaag cggctctctg

720

gtctgtaact gacgctgagg ctcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt

780

agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaggt gttaggccct ttccggggct tagtgccgca

840

gctaacgcat taagcactcc gcctggggag tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat

900

tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc

960

ttaccaggtc ttgacatccc gatgcccgct ctagagatag agttttactt cggtacatcg

1020

gagacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1080

aacgagcgca acccctattg ttagttgcca tcattcagtt gggcactcta gcaagactgc

1140

cggtaataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg

1200

gctacacacg tgctacaatg gttggtacaa cgagtcgcaa gtcggtgacg acaagctaat

1260

ctcttaaagc caatctcagt tcggattgta ggctgcaact cgcctacatg aagtcggaat

1320

cgctagtaat cgcggatcag cacgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1380

cccgtcacac cacgagagtt tgtaacaccc gaagtcggtg aggtaacctt ttaggagcca

1440

gccgcctaag gtgggataga tgattggggt gaagtcgtaa caaggtagcc gtatcggaag

1500

g

1501

<210> 1831

<211> 1401

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. 2_1_36FAA

<220>

<221> modified_base

<222> (1392)..(1392)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1831

acagtttata tcgtagcttg ctacaccata gactgtgagt tgcgaacggg tgagtaacgc

60

gtaggtaacc tgcctggtag cgggggataa ctattggaaa cgatagctaa taccgcataa

120

tattaattat tgcatgataa ttaattgaaa ggtgcaattg caccactacc agatggacct

180

gcgttgtatt agctagtagg tgaggtaacg gctcacctag gcgacgatac atagccgacc

240

tgagagggtg atcggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

300

agtagggaat cttcggcaat ggacgaaagt ctgaccgagc aacgccgcgt gagtgaagaa

360

ggttttcgga tcgtaaagct ctgttgtaag agaagaacgg gtgtgagagt ggaaagttca

420

cactgtgacg gtatcttacc agaaagggac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtaggtcc cgagcgttgt ccggatttat tgggcgtaaa gcgagcgcag gcggttagat

540

aagtctgaag ttaaaggctg tggcttaacc atagtacgct ttggaaactg tttaacttga

600

gtgcagaagg ggagagtgga attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat atatggagga

660

acaccggtgg cgaaagcggc tctctggtct gtaactgacg ctgaggctcg aaagcgtggg

720

agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgagtgc taggtgttag

780

gccctttccg gggcttagtg ccgcagctaa cgcattaagc actccgcctg gggagtacga

840

ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt

900

ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc aggtcttgac ctcccgatgc ccgctctaga

960

gatagagttt tacttcggta catcggtgac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt

1020

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tattgttagt tgccatcatt

1080

cagttgggca ctctagcgag actgccggta ataaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca

1140

aatcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtgcta caatggctgg tacaacgagt

1200

cgcaagtcgg tgacggcaag ctaatctctt aaagccagtc tcagttcgga ttgtaggctg

1260

caactcgcct acatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc cgcggtgaat

1320

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccgcaag

1380

tcggtgaggt anccttttag g

1401

<210> 1832

<211> 1395

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. 69130

<220>

<221> modified_base

<222> (39)..(40)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (44)..(44)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (89)..(89)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (831)..(831)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1832

agttgcgaac gggtgagtaa cgcgtaggta acctacctnn tagnggggga taactattgg

60

aaacgatagc taataccgca taacagtang taacacatgt tagatgcttg aaagatgcaa

120

ttgcatcgct agtagatgga cctgcgttgt attagctagt aggtagggta atggcctacc

180

taggcgacga tacatagccg acctgagagg gtgatcggcc acactgggac tgagacacgg

240

cccagactcc tacgggaggc agcagtaggg aatcttcggc aatgggggga accctgaccg

300

agcaacgccg cgtgagtgaa gaaggttttc ggatcgtaaa gctctgttgt taaggaagaa

360

cgagtgtgag aatggaaagt tcatgctgtg acggtactta accagaaagg gacggctaac

420

tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg tcccgagcgt tgtccggatt tattgggcgt

480

aaagcgagcg caggcggtta gaaaagtctg aagtgaaagg cagtggctca accattgtag

540

gctttggaaa ctgtttaact tgagtgcaga aggggagagt ggaattccat gtgtagcggt

600

gaaatgcgta gatatatgga ggaacaccgg tggcgaaagc ggctctctgg tctgtaactg

660

acgctgaggc tcgaaagcgt ggggagcgaa caggattaga taccctggta gtccacgccg

720

taaacgatga gtgctaggtg ttaggtcctt tccgggactt agtgccgcag ctaacgcatt

780

aagcactccg cctggggagt acgaccgcaa ggttgaaact caaaggaatt nacgggggcc

840

gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt

900

gacatcccag tgactgccct agagataggg ttttccttcg gggcactggt gacaggtggt

960

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1020

ccttattgtt agttgccatc attgagttgg gcactctagc gagactgccg gtaataaacc

1080

ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg

1140

ctacaatggc tggtacaacg agtcgcaagc cggtgacggc aagctaatct ctgaaagcca

1200

gtctcagttc ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg

1260

cggatcagca cgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca

1320

cgagagtttg taacacccga agtcggtgag gtaaccgtaa gagccagccg cctaaggtgg

1380

gatagatgat tgggg

1395

<210> 1833

<211> 1272

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. AC15

<400> 1833

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtaggac gagttgcgaa cgggtgagta

60

acgcgtaggt aacctgccta ttagaggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc

120

ataacgaaag tcgctagtag atggacctgc gttgtattag ctagtaggta gggtaatggc

180

ctacctaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat cggccacact gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tcggcaatgg ggggaaccct

300

gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc gtaaagctct gttgttaagg

360

aagatgacgg tacttaacca gaaagggacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtccc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag cgagcgcagg cggttagaaa

480

agtctgaagt gaaaggcagt ggctcaacca ttgtaggctt tggaaactgt ttaacttgag

540

tgcagaaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tatggaggaa

600

caccggtggc gaaagcggct ctctggtctg actgacgctg aggctcgaaa gcgtggggag

660

cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttaggt

720

acttagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc

840

aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttattgt tagttgccat

960

catgggcact ctagcgagac tgccggtaat aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1020

tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca atggctggca acgagtcgca

1080

agccggtgac ggcaagctaa tctctgccag tctcagttcg gatgtaggct gcaactcgcc

1140

tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc cgcggtgaat acgttcccgg

1200

gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccgaagt cggtaggtag

1260

ccagccgcct aa

1272

<210> 1834

<211> 1262

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. ACS2

<400> 1834

ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt

60

aacctgcctt gtagcggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc ataacgaaag

120

ccactacaag atggacctgc gttgtattag ctagtaggtg aggtaacggc tcacctaggc

180

gacgatacat agccgacctg agagggtgat cggccacact gggactgaga cacggcccag

240

actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tcggcaatgg gggcaaccct gaccgagcaa

300

cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc gtaaagctct gttgtaagtc aagatgacgg

360

tagcttacca gaaagggacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtccc

420

gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag cgagcgcagg cggtttgata agtctgaagt

480

taaaggctgt ggctcaacca tagttcgctt tggaaactgt caaacttgag tgcagaaggg

540

gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tatggaggaa caccggtggc

600

gaaagcggct ctctggtctg actgacgctg aggctcgaaa gcgtggggag cgaacaggat

660

tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttggat attcagtgcc

720

gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg

780

aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga

840

accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag

900

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctattgt tagttgccat catgggcact

960

ctagcgagac tgccggtaat aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc

1020

ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca atggttggca acgagttgcg agtcggtgac

1080

ggcaagctaa tctcttccaa tctcagttcg gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagtc

1140

ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca

1200

caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccgaagt cggtaggtag ccagccgcct

1260

aa

1262

<210> 1835

<211> 1449

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. AS20

<220>

<221> modified_base

<222> (1361)..(1361)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1835

acgctggcgg cgtgcctaat acatgcaagt agaacgcaca ggatgcaccg tagtttacta

60

caccgtattc tgtgagttgc gaacgggtga gtaacgcgta ggtaacctgc ctggtagcgg

120

gggataacta ttggaaacga tagctaatac cgcataagaa catttactgc atggtagatg

180

tttaaaaggt gcaagagcat cactaccaga tggacctgcg ttgtattagc tagttggtga

240

ggtaacggct caccaaggca acgatacata gccgacctga gagggtgatc ggccacactg

300

ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt cggcaatggg

360

gggaaccctg accgagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt tttcggatcg taaagctctg

420

ttgttaagga agaacgtgtg tgagagtgga aagttcacac agtgacggta cttaaccaga

480

aagggacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg taggtcccga gcgttgtccg

540

gatttattgg gcgtaaagcg agcgcaggcg gttagataag tctgaagtga aaggcagtgg

600

ctcaaccatt gtaggctttg gaaactgttt aacttgagtg cagaagggga gagtggaatt

660

ccatgtgtag cggtgaaatg cgtagatata tggaggaaca ccggtggcga aagcggctct

720

ctggtctgta actgacgctg aggctcgaaa gcgtggggag cgaacaggat tagataccct

780

ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttaggt cctttccggg acttagtgcc

840

gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg

900

aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga

960

accttaccag gtcttgacat cccgatgccc gctctagaga tagagcttta cttcggtaca

1020

tcggtgacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc

1080

cgcaacgagc gcaaccctta ttgttagttg ccatcattca gttgggcact ctagcgagac

1140

tgccggtaat aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc

1200

tgggctacac acgtgctaca atggctggta caacgagtcg caagccggtg acggcaagct

1260

aatctctgaa agccagtctc agttcggatt gtaggctgca actcgcctac atgaagtcgg

1320

aatcgctagt aatcgcggat cagcacgccg cgggtggaat ncgttcccgg gccttgtaca

1380

caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccgaagt cggtgaggta accgtaagga

1440

gccagccgc

1449

<210> 1836

<211> 1360

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. BS35a

<400> 1836

atacatgcaa gtagaacgct gaagagagga gcttgctctt cttggatgag ttgcgaacgg

60

gtgagtaacg cgtaggtaac ctgcctggta gcgggggata actattggaa acgatagcta

120

ataccgcata aaatggatta tcgcatgata attcattgaa aggtgcaaat gcatcactac

180

cagatggacc tgcgttgtat tagctagttg gtggggtaac ggctcaccaa ggcgacgata

240

catagccgac ctgagagggt gatcggccac actgggactg agacacggcc cagactccta

300

cgggaggcag cagtagggaa tcttcggcaa tggacggaag tctgaccgag caacgccgcg

360

tgagtgaaga aggttttcgg atcgtaaagc tctgttgtaa gagaagaacg agtgtgagag

420

tggaaagttc acactgtgac ggtatcttac cagaaaggga cggctaacta cgtgccagca

480

gccgcggtaa tacgtaggtc ccgagcgttg tccggattta ttgggcgtaa agcgagcgca

540

ggcggttaga taagtctgaa gttaaaggct gtggcttaac catagtacgc tttggaaact

600

gtttaacttg agtgcaagag gggagagtgg aattccatgt gtagcggtga aatgcgtaga

660

tatatggagg aacaccggtg gcgaaagcgg ctctctggct tgtaactgac gctgaggctc

720

gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgagt

780

gctaggtgtt agaccctttc cggggtttag tgccgcagct aacgcattaa gcactccgcc

840

tggggagtac gaccgcaagg ttgaaactca aaggaattga cgggggcccg caccagcggt

900

ggagcatgtg gtttaatttg aagcaacgcg aagaacctta ccaggtcttg acatcccttt

960

gaccgctcta gagaaagagt tttccttcgg gacagaggtg acaggtggtg catggttgtt

1020

gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctattgtta

1080

gttgccatca ttcagttggg cactctagcg agactgccgg taataaaccg gaggaaggtg

1140

gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gacctgggct acacacgtgc tacaatggct

1200

ggtacaacga gtcgcaagcc ggtgacggca agctaatttt ttaaagccag tctcagttcg

1260

gattgtaggc tgcaacttgc ctacatgaag ttggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcac

1320

gccgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc

1360

<210> 1837

<211> 1037

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. C150

<220>

<221> modified_base

<222> (995)..(995)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1002)..(1003)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1016)..(1016)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1018)..(1018)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1020)..(1021)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1028)..(1028)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1030)..(1030)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1837

aacgctgaag agaggagctt gctcttcttg gatgagttgc gaacgggtga gtaacgcgta

60

ggtaacctgc cttgtagcgg gggataacta ttggaaacga tagctaatac cgcataacaa

120

tggatgaccc atgtcattta tttgaaaggg gcaaatgctc cactacaaga tggacctgcg

180

ttgtattagc tagtaggtga ggtaacggct cacctaggcg acgatacata gccgacctga

240

gagggtgatc ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

300

agggaatctt cggcaatggg ggcaaccctg accgagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt

360

tttcggatcg taaagctctg ttgtaagtca agaacgagtg tgagagtgga aagttcacac

420

tgtgacggta gcttaccaga aagggacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

480

taggtcccga gcgttgtccg gatttattgg gcgtaaagcg agcgcaggcg gtttgataag

540

tctgaagtta aaggctgtgg ctcaaccata gttcgctttg gaaactgtca aacttgagtg

600

cagaagggga gagtggaatt ccatgtgtag cggtgaaatg cgtagatata tggaggaaca

660

ccggtggcga aagcggctct ctggtctgta actgacgctg aggctcgaaa gcgtggggag

720

cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttggat

780

cctttccggg attcagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacgacc

840

gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt

900

aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cccgatgcta tttctagaga

960

tagaaagtta cttcggtaca tcggtgacag gtggngcatg gnngtcgtca gctcgngncn

1020

ngagatgntn gggttaa

1037

<210> 1838

<211> 974

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. CM6

<400> 1838

tagaacgctg aagagaggag cttgctcttc ttggatgagt tgcgaacggg tgagtaacgc

60

gtaggtaacc tgcctggtag cgggggataa ctattggaaa cgatagctaa taccgcataa

120

aattgattat cgcatgataa tcaattgaaa ggtgcaaatg catcactacc agatggacct

180

gcgttgtatt agctagttgg tggggtaacg gctcaccaag gcgacgatac atagccgacc

240

tgagagggtg atcggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

300

agtagggaat cttcggcaat ggacggaagt ctgaccgagc aacgccgcgt gagtgaagaa

360

ggttttcgga tcgtaaagct ctgttgtaag agaagaacga gtgtgagagt ggaaagttca

420

cactgtgacg gtatcttacc agaaagggac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtaggtcc cgagcgttgt ccggatttat tgggcgtaaa gcgagcgcag gcggttagat

540

aagtctgaag ttaaaggctg tggcttaacc atagtacgct ttggaaactg tttaacttga

600

gtgcaagagg ggagagtgga attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat atatggagga

660

acaccggtgg cgaaagcggc tctctggctt gtaactgacg ctgaggctcg aaagcgtggg

720

gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaggtgtta

780

gaccctttcc ggggtttagt gccgcagcta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg

840

accgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg

900

tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catccctctg accgctctag

960

agatagagtt ttcc

974

<210> 1839

<211> 1432

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. CM7

<400> 1839

caggacgaac gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtag gacgcacagt ttataccgta

60

gcttgctaca ccatagactg tgagttgcga acgggtgagt aacgcgtagg taacctgcct

120

attagagggg gataactatt ggaaacgata gctaataccg cataacagta tgtaacacat

180

gttagatgct tgaaagatgc aattgcatcg ctagtagatg gacctgcgtt gtattagcta

240

gtaggtaggg taatggccta cctaggcgac gatacatagc cgacctgaga gggtgatcgg

300

ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtag ggaatcttcg

360

gcaatggggg gaaccctgac cgagcaacgc cgcgtgagtg aagaaggttt tcggatcgta

420

aagctctgtt gttaaggaag aacgagtgtg aaaatggaaa gttcatactg tgacggtact

480

taaccagaaa gggacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta ggtcccgagc

540

gttgtccgga tttattgggc gtaaagcgag cgcaggcggt tagaaaagtc tgaagtgaaa

600

ggcagtggct caaccattgt aggctttgga aactgtttaa cttgagtgca gaaggggaga

660

gtggaattcc atgtgtagcg gtgaaatgcg tagatatatg gaggaacacc ggtggcgaaa

720

gcggctctct ggtctgtaac tgacgctgag gctcgaaagc gtggggagcg aacaggatta

780

gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctagg tgttaggtcc tttccgggac

840

ttagtgccgc agctaacgca ttaagcactc cgcctgggga gtacgaccgc aaggttgaaa

900

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa

960

cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcc cgatgctatt tctagagata ggaagtttct

1020

tcggaacatc ggtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg

1080

ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatt gttagttgcc atcattgagt tgggcactct

1140

agcgagactg ccggtaataa accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc

1200

ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat ggctggtaca acgagtcgca agccggtgac

1260

ggcaagctaa tctctgaaag ccagtctcag ttcggattgt aggctgcaac tcgcctacat

1320

gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcacgccgcg gtgaatacgt tcccgggcct

1380

tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc cgaagtcggt ga

1432

<210> 1840

<211> 1387

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. ICM10

<220>

<221> modified_base

<222> (1346)..(1352)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1840

tagaacgctg aaggaggagc ttgctcttct ggatgagttg cgaacgggtg agtaacgcgt

60

aggtaacctg cctggtagcg ggggataact attggaaacg atagctaata ccgcataaga

120

gtagatgttg catgacattt gcttaaaagg tgcaattgca tcactaccag atggacctgc

180

gttgtattag ctagttggtg aggtaacggc tcaccaaggc aacgatacat agccgacctg

240

agagggtgat cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

300

tagggaatct tcggcaatgg acggaagtct gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg

360

ttttcggatc gtaaagctct gttgtaagag aagaacgagt gtgagagtgg aaagttcaca

420

ctgtgacggt atcttaccag aaagggacgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

480

gtaggtcccg agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc gagcgcaggc ggttagataa

540

gtctgaagtt aaaggctgtg gcttaaccat agtacgcttt ggaaactgtt taacttgagt

600

gcaagagggg agagtggaat tccatgtgta gcggtgaaat gcgtagatat atggaggaac

660

accggtggcg aaagcggctc tctggcttgt aactgacgct gagctcgaaa gcgtggggag

720

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttagac

780

cctttccggg gtttagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacgacc

840

gcaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

900

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc cctctgaccg ctctagagat

960

agagttttcc ttcgggacag aggtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1020

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat tgttagttgc catcatttag

1080

ttgggcactc tagcgagact gccggtaata aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1140

catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggctggtac aacgagtcgc

1200

aagccggtga cggcaagcta atctcttaaa gccagtctca gttcggattg taggctgcaa

1260

ctcgcctaca tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agcacgccgc ggtgaatacg

1320

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccnnnnn nncacgagag tttgtaacac ccgaagtcgg

1380

tgaggta

1387

<210> 1841

<211> 1439

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. ICM12

<400> 1841

ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac gctgaagaga ggagcttgct cttcttggat

60

gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataaaatgga ttatcgcatg ataatccatt gaaaggtgca

180

aatgcatcac taccagatgg acctgcgttg tattagctag ttggtggggt aacggctcac

240

caaggcgacg atacatagcc gacctgagag ggtgatcggc cacactggga ctgagacacg

300

gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatcttcgg caatggacgg aagtctgacc

360

gagcaacgcc gcgtgagtga agaaggtttt cggatcgtaa agctctgttg taagagaaga

420

acgagtgtga gagtggaaag ttcacactgt gacggtatct taccagaaag ggacggctaa

480

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtcccgagcg ttgtccggat ttattgggcg

540

taaagcgagc gcaggcggtt agataagtct gaagttaaag gctgtggctt aaccatagta

600

cgctttggaa actgtttaac ttgagtgcaa gaggggagag tggaattcca tgtgtagcgg

660

tgaaatgcgt agatatatgg aggaacaccg gtggcgaaag cggctctctg gcttgtaact

720

gacgctgagg ctcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc

780

gtaaacgatg agtgctaggt gttagaccct ttccggggtt tagtgccgca gctaacgcat

840

taagcactcc gcctggggag tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat tgacgggggc

900

ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc

960

ttgacatccc tctgatcgct ctagagatag agttttcctt cgggacagag gtgacaggtg

1020

gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

1080

acccctattg ttagttgcca tcatttagtt gggcactcta gcgagactgc cggtaataaa

1140

ccggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg

1200

tgctacaatg gctggtacaa cgagtcgcaa gccggtgacg gcaagctaat ctcttaaagc

1260

cagtctcagt tcggattgta ggctgcaact cgcctacatg aagtcggaat cgctagtaat

1320

cgcggatcag cacgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac

1380

cacgagagtt tgtaacaccc gaagtcggtg aggtaacctt ttaggagcca gccgcctaa

1439

<210> 1842

<211> 1432

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. ICM2

<220>

<221> modified_base

<222> (203)..(203)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1842

ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac gctgaagctt ggtgcttgca ccgagcggat

60

gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataaaatgga ttatcgcatg ataattcatt gaaaggtgca

180

aatgcatcac taccagatgg acntgcgttg tattagctag ttggtggggt aacggctcac

240

caaggcgacg atacatagcc gacctgagag ggtgatcggc cacactggga ctgagacacg

300

gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatcttcgg caatggacgg aagtctgacc

360

gagcaacgcc gcgtgagtga agaaggtttt cggatcgtaa agctctgttg taagagaaga

420

acgagtgtga gagtggaaag ttcacactgt gacggtatct taccagaaag ggacggctaa

480

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtcccgagcg ttgtccggat ttattgggcg

540

taaagcgagc gcaggcggtt agataagtct gaagttaaag gctgtggctt aaccatagta

600

cgctttggaa actgtttaac ttgagtgcaa gaggggagag tggaattcca tgtgtagcgg

660

tgaaatgcgt agatatatgg aggaacaccg gtggcgaaag cggctctctg gcttgtaact

720

gacgctgagg ctcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc

780

gtaaacgatg agtgctaggt gttagaccct ttccggggtt tagtgccgca gctaacgcat

840

taagcactcc gcctggggag tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat tgacgggggc

900

ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc

960

ttgacatccc tctgaccgct ctagagatag agttttcctt cgggacagag gtgacaggtg

1020

gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

1080

acccctattg ttagttgcca tcatttagtt gggcactcta gcgagactgc cggtaataaa

1140

ccggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg

1200

tgctacaatg gctggtacaa cgagtcgcaa gccggtgacg gtaagctaat ctcttaaagc

1260

cagtctcagt tcggattgta ggctgcaact cgcctacatg aagtcggaat cgctagtaat

1320

cgcggatcag cacgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac

1380

cacgagagtt tgtaacaccc gaagtcggtg aggtaacctt ttaggagcca gc

1432

<210> 1843

<211> 1261

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. ICM45

<400> 1843

cgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca agtagaacga gttgcgaacg ggtgagtaac

60

gcgtaggtaa cctgcctggt agcgggggat aactattgga aacgatagct aataccgcat

120

aacaaaagtc actaccagat ggacctgcgt tgtattagct agttggtggg gtaacggctc

180

accaaggcga cgatacatag ccgacctgag agggtgatcg gccacactgg gactgagaca

240

cggcccagac tcctacggga ggcagcagta gggaatcttc ggcaatggac ggaagtctga

300

ccgagcaacg ccgcgtgagt gaagaaggtt ttcggatcgt aaagctctgt tgtaagagaa

360

gatgacggta tcttaccaga aagggacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

420

taggtcccga gcgttgtccg gatttattgg gcgtaaagcg agcgcaggcg gttagataag

480

tctgaagtta aaggctgtgg cttaaccata gtacgctttg gaaactgttt aacttgagtg

540

caagagggga gagtggaatt ccatgtgtag cggtgaaatg cgtagatata tggaggaaca

600

ccggtggcga aagcggctct ctggcttgac tgacgctgag gctcgaaagc gtggggagca

660

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctagg tgttagacgt

720

ttagtgccgt agctaacgca ttaagcactc cgcctgggga gtacgaccgc aaggttgaaa

780

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa

840

cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcg acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt

900

gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctattgtta gttgccatca

960

tgggcactct agcgagactg ccggtaataa accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc

1020

atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat ggctggcaac gagtcgcaag

1080

ccggtgacgg caagctaatc tcttccagtc tcagttcgga tgtaggctgc aactcgccta

1140

cagaagtcgg aatcgctagt aatcgcggat cagcacgccg cggtgaatac gttcccgggc

1200

cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gtttgtaaca cccgaagtcg gtaggtagcc

1260

a

1261

<210> 1844

<211> 1421

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. ICM4

<400> 1844

taatacatgc aagtagaacg ctgaagagag gagcttgctc ttcttggatg agttgcgaac

60

gggtgagtaa cgcgtaggta acctgccttg tagcggggga taactattgg aaacgatagc

120

taataccgca taacaatgga tgacacatgt catttatttg aaaggggcaa ttgctccact

180

acaagatgga cctgcgttgt attagctagt aggtgaggta acggctcacc taggcgacga

240

tacatagccg acctgagagg gtgatcggcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc

300

tacgggaggc agcagtaggg aatcttcggc aatgggggca accctgaccg agcaacgccg

360

cgtgagtgaa gaaggttttc ggatcgtaaa gctctgttgt aagtcaagaa cgagtgtgag

420

agtggaaagt tcacactgtg acggtagctt accagaaagg gacggctaac tacgtgccag

480

cagccgcggt aatacgtagg tcccgagcgt tgtccggatt tattgggcgt aaagcgagcg

540

caggcggttt gataagtctg aagttaaagg ctgtggctca accatagttc gctttggaaa

600

ctgtcaaact tgagtgcaga aggggagagt ggaattccat gtgtagcggt gaaatgcgta

660

gatatatgga ggaacaccgg tggcgaaagc ggctctctgg tctgtaactg acgctgaggc

720

tcgaaagcgt ggggagcgaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga

780

gtgctaggtg ttggatcctt tccgggattc agtgccgcag ctaacgcatt aagcactccg

840

cctggggagt acgaccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg

900

gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggtct tgacatcccg

960

atgctatttc tagagataga aagttacttc ggtacatcgg tgacaggtgg tgcatggttg

1020

tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctattgt

1080

tagttgccat cattcagttg ggcactctag cgagactgcc ggtaataaac cggaggaagg

1140

tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgacctggg ctacacacgt gctacaatgg

1200

ttggtacaac gagttgcgag tcggtgacgg caagctaatc tcttaaagcc aatctcagtt

1260

cggattgtag gctgcaactc gcctacatga agtcggaatc gctagtaatc gcggatcagc

1320

acgccgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acgagagttt

1380

gtaacacccg aagtcggtga ggtaaccttt tggagccagc c

1421

<210> 1845

<211> 923

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. M143

<220>

<221> modified_base

<222> (882)..(888)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1845

gccgcggtaa tacgtaggtc ccgagcgttg tccgggattt attgggcgta aagcgagcgc

60

aggcggttag ataagtctga agttaaaggc tgtggcttaa ccatagtacg ctttggaaac

120

tgtttaactt gagtgcaaga ggggagagtg gaattccatg tgtagcggtg aaatgcgtag

180

atatatggag gaacaccggt ggcgaaagcg gctctctggc ttgtaactga cgctgaggct

240

cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag

300

tgctaggtgt tagacccttt ccggggttta gtgccgcagc taacgcatta agcactccgc

360

ctggggagta cgaccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg

420

tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatccctc

480

tgaccgctct agagatagag ttttccttcg ggacagaggt gacaggtggt gcatggttgt

540

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctattgtt

600

agttgccatc atttagttgg gcactctagc gagactgccg gtaataaacc ggaggaaggt

660

ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatggc

720

tggtacaacg agtcgcaagc cggtgacggc aagctaatct cttaaagcca gtctcagttc

780

ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg cggatcagca

840

cgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cnnnnnnnca cgagagtttg

900

taacacccga agtcggtgag gta

923

<210> 1846

<211> 1543

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. M334

<400> 1846

tgagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtaga

60

acgctgaagg aggagcttgc ttctctggat gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt

120

aacctgcctg gtagcggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc ataagagtag

180

atgttgcatg acatttgctt aaaaggtgca attgcatcac taccagatgg acctgcgttg

240

tattagctag ttggtggggt aacggcttac caaggcgacg atacatagcc gacctgagag

300

ggtgatcggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg

360

gaatcttcgg caatggacgg aagtctgacc gagcaacgcc gcgtgagtga agaaggtttt

420

cggatcgtaa agctctgttg taagagaaga acgagtgtga gagtggaaag ttcacactgt

480

gacggtatct taccagaaag ggacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

540

gtcccgagcg ttgtccggat ttattgggcg taaagcgagc gcaggcggtt agataagtct

600

gaagttaaag gctgtggctt aaccatagta cgctttggaa actgtttaac ttgagtgcaa

660

gaggggagag tggaattcca tgtgtagcgg tgaaatgcgt agatatatgg aggaacaccg

720

gtggcgaaag cggctctctg gcttgtaact gacgctgagg ctcgaaagcg tggggagcaa

780

acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaggt gttagaccct

840

ttccggggtt tagtgccgta gctaacgcat taagcactcc gcctggggag tacgaccgca

900

aggttgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatccc tctgaccgct ctagagatag

1020

agttttcctt cgggacagag gtgacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga

1080

gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctattg ttagttgcca tcattcagtt

1140

gggcactcta gcgagactgc cggtaataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaaatca

1200

tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tgctacaatg gctggtacaa cgagtcgcaa

1260

gccggtgacg gtaagctaat ctcttaaagc cagtctcagt tcggattgta ggctgcaact

1320

cgcctacatg aagtcggaat cgctagtaat cgcggatcag cacgccgcgg tgaatacgtt

1380

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac cacgagagtt tgtaacaccc gaagtcggtg

1440

aggtaaccgt aaggagccag ccgcctaagg tgggatagat gattggggtg aagtcgtaac

1500

aaggtagccg tatcggaagg tgcggctgga tcacctcctt tct

1543

<210> 1847

<211> 1258

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. OBRC6

<400> 1847

acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtaggacg agttgcgaac gggtgagtaa

60

cgcgtaggta acctgcctat tagaggggga taactattgg aaacgatagc taataccgca

120

taacgaaagt cgctagtaga tggacctgcg ttgtattagc tagtaggtag ggtaatggcc

180

tacctaggcg acgatacata gccgacctga gagggtgatc ggccacactg ggactgagac

240

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt cggcaatggg gggaaccctg

300

accgagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt tttcggatcg taaagctctg ttgttaagga

360

agatgacggt acttaaccag aaagggacgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

420

gtaggtcccg agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc gagcgcaggc ggttagaaaa

480

gtctgaagtg aaaggcagtg gctcaaccat tgtaggcttt ggaaactgtt taacttgagt

540

gcagaagggg agagtggaat tccatgtgta gcggtgaaat gcgtagatat atggaggaac

600

accggtggcg aaagcggctc tctggtctga ctgacgctga ggctcgaaag cgtggggagc

660

gaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag gtgttaggta

720

cttagtgccg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg caaggttgaa

780

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca

840

acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

900

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttattgtt agttgccatc

960

atgggcactc tagcgagact gccggtaata aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1020

catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggctggcaa cgagtcgcaa

1080

gccggtgacg gcaagctaat ctctgccagt ctcagttcgg atgtaggctg caactcgcct

1140

acagaagtcg gaatcgctag taatcgcgga tcagcacgcc gcggtgaata cgttcccggg

1200

ccttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac acccgaagtc ggtaggta

1258

<210> 1848

<211> 1447

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. SHV515

<220>

<221> modified_base

<222> (84)..(84)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (126)..(126)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (311)..(311)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1444)..(1444)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1848

ttaatcatga gtcgcgaacg ggtgagtaac gcgtaggtaa cctgcctgat agcgggggat

60

aactattgga aacgatagct aatnccgcat aagagtcgtt aacacatgtt aatgatttaa

120

aaggancaat tgcttcacta tcagatggac ctgcgttgta ttagctagtt ggtgaggtaa

180

cggctcacca aggcttcgat acatagccga cctgagaggg tgatcggcca cactgggact

240

gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtaggga atcttcggca atggacgaaa

300

gtctgaccga ncaacgccgc gtgagtgaag aaggttttcg gatcgtaaag ctctgttata

360

agcgaagaac gggagtaaga gtggaaagtt tactctgtga cggtagctta tcagaaaggg

420

acggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt cccgagcgtt gtccggattt

480

attgggcgta aagcgagcgc aggtggttta ataagtctga agttaaaggc attggctcaa

540

ccaatgtacg ctttggaaac tgttgaactt gagtgcagaa ggggagagtg gaattccatg

600

tgtagcggtg aaatgcgtag atatatggag gaacaccggt ggcgaaagcg gctctctggt

660

ctgtaactga cactgaggct cgaaagcgtg ggtagcgaac aggattagat accctggtag

720

tccacgccgt aaacgatgag tgctaggtgt tgggtccttt ccgggactca gtgccgcagc

780

taacgcatta agcactccgc ctggggagta cgaccgcaag gttgaaactc aaaggaattg

840

acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt

900

accaggtctt gacatcccag tgaccatcct agagatagga tttcccttcg gggcactggt

960

gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1020

cgagcgcaac ccctattgtt agttgccatc attgagttgg gcactctagc gagactgccg

1080

gtaataaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc

1140

tacacacgtg ctacaatggt cggtacaacg agttgcgagc tggtgacagt aagctaatct

1200

cttaaagccg atctcagttc ggattgtagg ctgcaactcg cctacatgaa gtcggaatcg

1260

ctagtaatcg cggatcagca cgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1320

cgtcacacca cgagagtttg taacacccga agtcggtgag gtaaccattt ggagccagcc

1380

gcctaaggtg ggatagatga ttggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta tcggaaggtg

1440

cggntgg

1447

<210> 1849

<211> 1365

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASB02

<220>

<221> modified_base

<222> (336)..(336)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (373)..(373)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (697)..(697)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1014)..(1014)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1849

ggagtttgat tatggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac

60

gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataacgaaag ccactaccag atggacctgc gttgtattag

180

ctagttggtg aggtaacggc tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat

240

cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct

300

tcggcaatgg acggaagtct gaccgagcaa cgccgngtga gtgaagaagg ttttcggatc

360

gtaaagctct gtngtaagag aagatgacgg tatcttacca gaaagggacg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtccc gagcgttatc cggatttatt gggcgtaaag

480

cgagcgcagg cggttagata agtctgaagt taaaggctgt ggcttaacca tagtacgctt

540

tggaaactgt ttaacttgag tgcaagaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagatg tatggaggaa caccggtggc gaaagcggct ctctggcttg actgacgctg

660

aggctcgaaa gcgtggggag catacaggat tagatancct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgagtgcta ggtgttgggt actcagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

780

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacagg ggcccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgatga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctattgt tagttgccat catgggcact ctagcgagac tgccggtaat aaancggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1080

atggctggca acgagtcgca agttggtgac ggcaagctaa tctcttccag tctcagttcg

1140

gatgtagtct gcaactcgcc tccagaagtt ggattcgcta gtaatcgcgg atcagccatg

1200

gcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta

1260

acacccgaag tcggtaggta gccggccgcc taaggtggga tagatgattg gggtgaagtc

1320

gtaacaaggt agccgtatcg gaaggtgcgg ctggaacacc tcctt

1365

<210> 1850

<211> 1363

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCA03

<220>

<221> modified_base

<222> (1014)..(1014)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1059)..(1059)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1084)..(1084)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1123)..(1123)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1136)..(1136)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1148)..(1148)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1160)..(1160)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1285)..(1286)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1348)..(1348)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1850

ggagtttgat tctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac

60

gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataataaaag tcactaccag atggacctgc gttgtattag

180

ctagttggtg aggtaacggc tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat

240

cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct

300

tcggcaatgg acggaagtct gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc

360

gtaaagctct gttgtaagaa aaaatgacgg tatcttacca gaaagggacg gctaactact

420

cgccagcagc cgcggtaata cgtaggtccc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag

480

cgagcgcagg cggttagata agtctgaagt taaaggctgt ggcttaacca tagtacgctt

540

tggaaactgt ttaacttgag tgcaagaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata tatggaggaa caccggtggc gaaagcggct ctctggcttg actgacgctg

660

aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgagtgcta ggtgttagac gtttagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

780

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctattgt tagttgccat catgggcact ctagcgagac tgccggtaat aaancggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatganc gggctacaca cgtggtacga

1080

tggntggcaa cgagtcgcaa gccggtgacg gcaagctaat ctnttccagt ctcagntcgg

1140

atgtaggntg caaatcgccn acagaagtcg gaatcgctag taatcgcgga tcagcacgcc

1200

gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac

1260

acccgaagtc ggtaggtagc cagcnnccta aggtgggata gatgattggg gtgaagtcgt

1320

aacaaggtag ccgtatcgga aggtacgnct gggacacctc ctt

1363

<210> 1851

<211> 1366

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCA04

<220>

<221> modified_base

<222> (1016)..(1016)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1851

ggagtttgat tatggctcag gactaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac

60

gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataatgaaag tcactaccag atggacctgc gttgtattag

180

ctagttggtg gggtaagggc tcaccaaggc gacgatatat agccgacctg agagggtgat

240

cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct

300

tcggcaatgg acggaagtct gaccgagcca cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc

360

gtaaagctct gttgtaagag aagatgacgg tatcttacca gaaagggacg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtccc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag

480

cgagcgcagg cggttagata agtctgaagt taaaggctgt ggcttaacca tagtacgctt

540

tggaaactgt ttaacttgag tgcaagaggg gagagtggaa ttccatgtgt accggtgaaa

600

tgggtagata tatggaggaa caccggtggc gaaagcggct ctctggcttg actgacgctg

660

aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgagtgcta ggtgttagac gtttagtgcc gtagctaacg cattaagcac tccgcctggg

780

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaagg accttaccag gtcttgccat cgacaggtga

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctattgt tagttgccat cagttgggca ctctagcgag actgccggta ataaancgga

1020

ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtgcta

1080

caatggctgg caacgagtcg caagccggtg acggcaagct aatctcttcc agtctcagtt

1140

cggatgtagg ctgcaactcg cctacagaag tcggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcac

1200

gccgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagtttgt

1260

aacacccgaa gtcggtaggt agccagccgc ctaaggtggg atagatgatt ggggtgaagt

1320

cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgcg gctggaacac ctcctt

1366

<210> 1852

<211> 1364

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCA09

<220>

<221> modified_base

<222> (1014)..(1014)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1852

ggagtttgat catggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac

60

gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataacaaaag tcactaccag atggacctgc gttgtattag

180

ctagttggtg gggtaacggc tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat

240

cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct

300

tcggcaatgg acggaagtct gaccgagcaa cgccacgtga gtgaagaagg ttttcggatc

360

gtaaagctct gttgtaagag aagatgacgg tatcttacca gaaagggacg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtccc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag

480

cgagcgcagg cggttagata agtctgaagt aaaaggctgt ggcttaacca tagtacgctt

540

tggaaactgt ttaacttgag tgcaagaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata tatggaggaa cacccgtggc gaaagcggct ctctggcttg actgacgctg

660

aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgagtgcta ggtgttagac gtttagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

780

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctattgt tagttgccat catgggcact ctagcgagac tgccggtaat aaancggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1080

atggctggca acgagtcgca agccggtgac ggcaagctaa tctcttccag tctcagttcg

1140

gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc

1200

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa

1260

cacccgaagt cggtaggtag ccagccgcct aaggtgggat agatgattgg ggtgaagtcg

1320

taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcacct cctt

1364

<210> 1853

<211> 1361

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCB04

<400> 1853

ggagtttgat catggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac

60

gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataatgaaag tcactaccag atgaacctgc gttgtattag

180

ctagttggtg aggtaacggc tcaccaaggc gacgatacat agccgaactg agagggtgaa

240

cccccacact gggactgaga cacggaccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct

300

tcggcaatgg acggaagtct gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc

360

gtaaagctct gttgtaagag aagatgacgg tatcttacca gaaagggacg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtccc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag

480

cgagcgcagg cggttagata agtctgaagt taaaggctgt ggcttaacca tagtacgctt

540

tggaaactgt ttaacttgag tgcaagaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata tatggaggaa caccggtggc gaaagcggct ctctggcttg actgacgctg

660

aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagatacccg gtagtccacc ccgtaaacga

720

tgagtgctag gtgttagacg tttagtaccg tagctaacgc attaagcact ccgcctgggg

780

agtacgaccg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc

840

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc gacaggtggt

900

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

cctattgtta gttgccatca tgggcactct agcgagactg ccggtaataa accggaggaa

1020

ggtgggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tgctacaatg

1080

gctggcaacg agtcgcaagc cggtgacggc aagctaatct cttccagtct cagttcggat

1140

gtaggctgca actcgcctac agaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agcacgccgc

1200

ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac

1260

ccgaagtcgg taggtagcca gccgcctaag gtgggataga tgattggggt gaagtcgtaa

1320

caaggtagcc gtatcggaag gtgcggctgg aacacctcct t

1361

<210> 1854

<211> 1358

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCB06

<220>

<221> modified_base

<222> (59)..(59)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (457)..(457)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1854

ggagtttgat tatggctcag atgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtagaant

60

agttgcgaac gggtgagtaa cgcgtaggta acctgcctct tagcggggga taactattgg

120

aaacgatagc taataccgca taagaaagtc actaagagat ggacctgcgt tgtattagct

180

agttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgataaatag ccgacctgag aggatgatcc

240

gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta gggaatcttc

300

gacaatggac gcaactgacc cagcaacgcc gcgtgactga agaaggcctt cggatcgtaa

360

agcactgttg taagagaaga tgacggtaac ttaccagaaa gggacggcta actacgtgcc

420

agcagccgcg gtaatacgta ggtcccgagc gttatcngga tttattgggc gtaaagcgag

480

cgcaggcggt tagataagtc tgaagttaaa ggctgtggct taaccatagt acgctttgga

540

aactgtttaa cttgagtgca gaaggggaga gtggaattcc atgtgtagcg gtgaaatgcg

600

tagatatatg gaggaacacc ggtggcgaaa gcggctctct ggtctgactg acgctgaggc

660

tcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccaccccg taaacgatga

720

gtgctaggtg ttgggtactc agtgccgcag ctaacgcatt aagcactccg cctggggagt

780

accaccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg

840

tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggtct tgacatcgac aggtggtgca

900

tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct

960

attgttagtt gccatcatgg gcactctagc gagactgccg gtaataaacc ggaggaaggt

1020

gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gacctgggct acacacgtgc tacaatggct

1080

ggcaacgagt cgcgagtcgg tgacggcaag ctaatctctt ccagtctcag ttcggatgta

1140

ggctgcaact cgcctacaga agtcggaatc gttagtaatc gcggatcagc acgccgcggt

1200

gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acgagagttt gtaacacccg

1260

aagtcggtag gtagtcagcc gcctaaggtg ggatagatga ttggggtgaa gtcgtaacaa

1320

ggtagccgta tcggaaggtg cggctggatc acctcctt

1358

<210> 1855

<211> 1359

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCC04

<220>

<221> modified_base

<222> (1012)..(1012)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1855

agtttgatta tggctcagga tgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca agtagaacga

60

gttgcgaacg ggtgagtaac gcgtaggtaa cctgcctggt agcgggggat aactattgga

120

aacgatagct aataccgcat aacgaaagtc actaccagat ggacctgcgt tgtattagct

180

agttggtgag gtaacggctc accaaggcga cgatacatag ccgacctgag agggtgatcg

240

gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta gggaatcttc

300

ggcaatggac ggaagtctga ccgagcaacg ccgcgtgagt gaagaaggtt ttcggatcgt

360

aaagctctgt tgtaagagaa gaggacggta tcttaccaga aagggacggc taactacgtg

420

ccagcagctg cggtaatacg taggtcccga gcgttatccg gatttattgg gcgtaaagcg

480

agcgcaggcg gttagataag tctgaagtta aaggctgtgg cttaaccata gtacgctttg

540

gaaactgttt aacttgagtg caagagggga gagtggaatt ccatgtgtag cggtgaaatg

600

cgtagatata tggaggaaca tcggtggcga aagcggctct ctggcttgac tgacgctgag

660

gctcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat

720

gagtgctagg tgttgggtac tcagtgccgc agctaacgca ttaagcactc cgcctgggga

780

gtacgaccgc aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca

840

tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcg acaggtggtg

900

catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

960

cctatagtta gttgccatca tgggcactct agcgagactg ccggtaataa ancggaggaa

1020

ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat

1080

ggctggcaac gagtcgcaag tcggtgacgg caagctaatc tcttccagtc tcagttcgga

1140

tgtaggctgc aactcgccca cagaagtcgg aatcgctagt aatcgcggat cagcacgccg

1200

cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gtttgtaaca

1260

cccgaagtcg gtaggtagcc agccgcctaa ggtgggatag atgattgggg tgaagtcgta

1320

acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg gaacacctc

1359

<210> 1856

<211> 1364

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCC05

<220>

<221> modified_base

<222> (594)..(595)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1856

ggagtttgat catggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac

60

gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataacaaaag ccactaccag atggacctgc gttgtattag

180

ctagttggtg aggtaacggc tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat

240

cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct

300

tcggcaatgg acggaagtct gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc

360

gtaaagctct gttgtaagag aagatgacgg tatcttacca gaaagggacg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtccc gagcgttatc cggatttatt gggcgtaaag

480

cgagcgcagg cggttagata agtctgaagt taaaggctgt ggcttaacca tagtacgctt

540

tggaaactgt ttaacttgag tgcaagaggg gagagtggaa ttccatgtgt accnncgaaa

600

tgcgtagata tatggaggaa caccggtggc gaaagcggct ctctggcttg actgacgctg

660

aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagatacccc ggtagtccac gccgtaaatg

720

atgagtgcta ggtgttgggt actcagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

780

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttagcag gtcttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atattgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctattgt tagttgccat catgggcact ctagcgagac tgccggtaat aaaccggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1080

atggctggca acgagtcgca agccggtgac ggcaagctaa tctcttccag tctcagttcg

1140

gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc

1200

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa

1260

cacccgaagt cggtaggtag ccagccgcct aaggtgggat agatgattgg ggtgaagtcg

1320

taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcacct cctt

1364

<210> 1857

<211> 1564

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCC12

<220>

<221> modified_base

<222> (445)..(445)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (936)..(936)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (939)..(939)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1857

gacgttttga ttcttggctc agtgaccaac gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtag

60

aacgctgaag gaggagcttg cttctccgga tgacgttgcg aacgggtgag taacgcgtag

120

gtaacctgcc tggtagcggg ggataactat tggaaacgat agctaatacc gcataacagt

180

agatatcgca tgatagctgc ttgaaaggtg caattgcacc actaccagat ggacctgcgt

240

tgtattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggcaa cgatacatag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc ggcattgtga cggaagtctt gaccgagcca acgcctcggt gagtgaagaa

420

ggttttccgg atcgtaaagc tctgnttgta agagacagaa cgagttgtga gacgtggaaa

480

gttcacactg gtgacggtat cttaccagaa agggacggct aactacgtgc cagcagccgc

540

ggtaatacgt aggtcccaag cgttgtccgg atttattggg cgtaaagcga gcgcaggcgg

600

ttagataagt ctgaagttaa aggctgtggc ttaaccatag tacgctttgg aaactgttta

660

acttgagtgc aagaggggag agtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat

720

ggaggaacac cggtggcgaa aagcggctct ctgggcttgt aactgacgct gaggctcgaa

780

agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac tgatgagtgc

840

taggtgttag accctttccg gggtttagtg ccgtagctaa cgcattaagc actccgcctg

900

gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaatnganc gggggcccgc acaagcggtg

960

gagcatgtgg tttaattcga tgcaacgcga agaaccttac ctggtcttga catccctgtg

1020

accgttctag agatggattg tttccttcgg gagcagaggt gacaggtggt gcatggttgt

1080

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctattgct

1140

taggtaaaac tccccgggga gttgggcact ctagcgagac tgccggtgat aaaccggagg

1200

aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatggc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1260

atggcgtata cagagggaag cgatagtgcg agctggagcg aatctcacaa agtacgtcta

1320

agtccggatt ggagtctgca actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcaaat

1380

cagaatgttg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga

1440

gtgggttgta ccagaagtag atagcttaac cttttggagg gcgtttacca cggtatgatt

1500

catgactggg gtgaagtcgt aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggct ggaacacctc

1560

cttc

1564

<210> 1858

<211> 1366

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCD01

<400> 1858

ggagtttgat tctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac

60

gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataacaaaag tcactaccag atggacctgc gttgtattag

180

ctagttggtg gggtaacggc tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat

240

cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct

300

tcggcaatgg acggaagtct gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc

360

gtaaagctct gttgtaagag aagatgatgg tatcttacca gaaagggacg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtccc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag

480

cgagcgcagg cggttagata agtctgaagt taaaggctgt ggcttaacca tagtacgctt

540

tggaaactgt ttaacttgag tgcaagaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata tatggaggaa caccggtggc gaaagcggct ctctggcttg actgacgctg

660

aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgagtgcta ggtgttagac gtttagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

780

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctattgt tagttgccat cagttgggcg ctctagcgag actgccggta ataaaccgga

1020

ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtgcta

1080

caatggctgg caacgtgtcg caagccggtg acggcaagct aatctcttcc agtctcagtt

1140

cggatgtagg ctgcaactcg cctacagaag tcggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcac

1200

gccgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagtttgt

1260

aacacccgaa gtcggtaggt agccagccgc ctaaggtggg atagatgatt ggggtgaagt

1320

cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgcg gctggaacac ctcctt

1366

<210> 1859

<211> 1364

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCD09

<220>

<221> modified_base

<222> (1076)..(1076)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1078)..(1078)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1298)..(1298)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1318)..(1318)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1357)..(1357)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1859

ggagtttgat tatggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac

60

gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataacaaaag tcactaccag atggacctgc gttgtattag

180

ctagttggtg gggtaacggc tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat

240

cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct

300

tcggcaatgg acggaagtct gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttctcggatc

360

gtaaagctct gttgtaagag aagatgacgg tatcttacca gacagggacg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtccc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag

480

cgagcgcagg cggttagata agtctgaagt taaaggctgt ggcttaacca tagtacgctt

540

tggaaactgt ttaacttgag tgcaagaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata tatggaggaa caccggtggc gaaagcggct ctctggcttg actgacgctg

660

aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat cagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgagtgcta ggtgttagac gtttagtgcc gtagctaacg cattaagcac tccgcctggg

780

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctattgt tagttgccat catgggcact ctagcgagac tgccggtaat aaaccggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgntnca

1080

atggctggca acgagtcgca agccggtgac ggcaagctaa tctcttccag tctcagttcg

1140

gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc

1200

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa

1260

cacccgaagt cggtaggtag ccagccgcct aaggtggnat agatgattgg ggggaaancg

1320

taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggc tggatcnctt cctt

1364

<210> 1860

<211> 1342

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCD10

<220>

<221> modified_base

<222> (244)..(244)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (250)..(250)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1860

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg taagtagaac gagttgcgaa cgggtgagta

60

acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc

120

ataacaaaag tcactaccag atggacctgc gttgtattag ctagttggtg gggtaacggc

180

tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat cggccacact gggactgaga

240

cacngcccan actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tcggcagtgg acggaagtct

300

gaccgagcac gccgcgtgag tgaagaaggt ttccggatcg taaagctctg ttgtaagaga

360

agatgacggt atcttaccag aaagggacgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

420

gtaggtcccg agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc gagcgcaggc ggttagataa

480

gtctgaagtt aaaggctgtg gcttaaccat agtacgcttt ggaaactgtt taacttgagt

540

gcaagagggg agagtggaat tccatgtgta gcggtgaaat gcgtagatat atggaggaac

600

accggtggcg aaagcggctc tctggcttga ctgacgctga ggctcgaaag cgtggggagc

660

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag gtgttagacg

720

tttagtgccg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg caaggttgaa

780

atcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa

840

cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcg acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt

900

gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctattgtta gttgccatca

960

tgggcactct agcgagactg ccggtaataa accggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc

1020

atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat ggctggcaac gagtcgcaag

1080

ccggtgacgg caagctaatc tctgccagtc tcagttcgga tgtaggctgc aactcgccta

1140

cagaagtcgg aatcgctagt aatcgcggat cagcacgccg cggtgaatac gttcccgggc

1200

cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gtttgtaaca cccgaagtcg gtaggtagcc

1260

agccgcctaa ggtgggatag atgattgggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtatcggaa

1320

ggtgcggctg gaacacctcc tt

1342

<210> 1861

<211> 1356

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCE03

<220>

<221> modified_base

<222> (1143)..(1143)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1343)..(1343)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1861

ggagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac

60

gagttacgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataaaaaagt cactaccaga tggacctgcg ttgtattagc

180

tagttggtgg ggtaaaggct taccaaggcg acgatacata gccgacctga gagggtgaac

240

ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

300

cggcaatgga cggaagtctg accgagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt tttcggatcg

360

taaagctctg ttgtaagaga agatgccggt atcttaccag aaagggacgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtcccg agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagg

480

gagcgcaggc ggttagaaaa gtctgaagtt aaaggctgtg gcttaaccat agtaggcttt

540

ggaaactgtt taacttgagt gcaagagggg agagtggaat tccatgtgta gcggtgaaat

600

gcgtagatat atggaggaac accggtggcg aaagcggctc tctggcttga ctgacgctga

660

ggctcgaaag cgtggggatc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacgc

720

tgagggctag gtgttagacg tttagtgccg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg

780

agtacgaccg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc

840

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc tacaggtggt

900

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccctattgtt agttgccatc atgggcactc tagcgagact gccggtaata aaccggagga

1020

aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa

1080

tggctggcaa cgagtcgcaa gccggtgacg gcaagctaat ctctgccagt ctcagttcgg

1140

atntaggctg caactcgcct acagaagtcg gaatcgctag taatcgcgga tcagcacgcc

1200

gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac

1260

acccgaagtc ggtaggtagc cagccgccta aggtgggata gatgattggg gtgaagtcgt

1320

aacaaggtag ccgtatcgaa agntgcggct ggaaca

1356

<210> 1862

<211> 1360

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCE04

<220>

<221> modified_base

<222> (31)..(31)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (334)..(334)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (680)..(680)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (684)..(684)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1862

ggagtttgat tttggctcag gacgaacgct ncggcgtgcc taatacatgc aagtagaacg

60

agttgcgaac tggtgagtaa cgcgtaggta acctgcctgg tagcggggga taactattgg

120

aaacgatagc taataccgca taacaaaagt cactaccaga tggacctgcg ttgtattagc

180

tagttggtgg ggtaacggct caccaaggcg acgatacata gccgacctga gagggtgatc

240

ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

300

cggcaatgga cggaagtctg accgagcaac gccngtgagt gaagaaggtt ttcggatcgt

360

aaagctctgt tgtaagagaa gatgacggta tcttaccaga aagggacggc taactacgtg

420

ccagcagccg cggtaatacg taggtcccga gcgttgtccg gatttattgg gcgtaaagcg

480

agcgcaggcg gttagataag tctgaagttt aaggctgtgg cttaaccata gtacgctttg

540

gaaactgttt aacttgagtg caagagggga gagtggaatt ccatgtgtag cggtgaaatg

600

cgtagatata tggaggaaca ccggtggcga aagcggctct ccgcttgact gacgctgagg

660

ctcgaaagcg tggggagcan acangattag ataccctggt agtcacgccg taaacgatga

720

gtgctaggtg ttagacgttt agtgccgcag ctaacgcatt aagcactccg cctggggagt

780

acgaccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg

840

tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggtct tgacatcgac aggtggtgca

900

tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc

960

tattgttagt tgccatcatg ggcactctag cgagactgcc ggtaataaac cggaggaagg

1020

tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgacctggg ctacacacgt gctacaatgg

1080

ctggcaacga gtcgcaagcc ggtgacggca agctaatctc ttccagtctc agttcggatg

1140

taggctgcaa ctcgcctaca gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcacgccgcg

1200

gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgagagt ttgtaacacc

1260

cgaagtcggt aggtagccag ccgcctaagg tgggatagat gattggggtg aagtcgtaac

1320

aaggtagccg tatcggaagg tgcggctgga tcacctcctt

1360

<210> 1863

<211> 1363

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCE05

<220>

<221> modified_base

<222> (544)..(544)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (634)..(634)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (697)..(697)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (727)..(727)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1863

ggagtttgat tatggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac

60

gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctc ttagcggggg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataagaaaga cactaagaga tggacctgcg ttgtattagc

180

tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatacata gccgacctga gagggtgatc

240

ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

300

cggcaatggg ggcaaccctg accgagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt tttcggatcg

360

taaagctctg ttgtaagaga agatgacggt aacttaccag aaagggacgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtcccg agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaagc

480

gagcgcaggc ggttagataa gtctgaagtt aaaggctgtg gcttaaccat agtacgcttt

540

gganactgtt taacttgagt gcagaagggg agagtggaat tccatgtgta gcggtgaaat

600

gcgtagatat atggaggaac accggtggcg aaancggctc tctggtctga ctgacgctga

660

ggctcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agatagnctg gtagtccacg ccgtaaacga

720

tgagtgntag gtgttgggta ctcagtgccg cagctaacgc attaagcact ccgcctgagg

780

agtacgacag caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc

840

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc tacaggtggt

900

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccctattgtt agttgccatc atgggcactc tagcgagact gccggtaata aaccggagga

1020

aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa

1080

tggctggcaa cgagtcgcga gtcggtgacg gcaagctaat ctcttccagt ctcagttcgg

1140

atgtaggctg caactcgcct acagaagtcg gaatcgctag taatcgcgga tcagcacgcc

1200

gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac

1260

acccgaagtc ggtaggtagc cagcagccta aggtgggata gatgattggg gtgaagtcgt

1320

aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct ggatcacctc ctt

1363

<210> 1864

<211> 1364

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCE06

<220>

<221> modified_base

<222> (398)..(398)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (401)..(401)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1014)..(1014)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1864

ggagtttgat tatggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac

60

gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataacaaaag tcactaccag atggacctgc gttgtattag

180

ctagttggtg gggtaacggc tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat

240

cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct

300

tcggcaatgg acggaagtct gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc

360

gtaaagctct gttgtaagag acgatgacgg tatcttanca naaagggacg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtccc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag

480

cgagcgcagg cggttagata agtctgaagt taaaggctgt ggcttaacca tagtacgctt

540

tggaaactgt ttaacttgag tgcaagaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata tatggaggaa caccggtggc gaaagcggct ctctggcttg actgacgctg

660

aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccca gcaagtccac gccgtaaacg

720

atgagtgcta ggtgttagac gtttagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

780

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctattgt tagttgccat catgggcact ctagcgagac tgccggtaat aaancggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1080

atggctggca acgagtcgca agccggtgac ggcaagctaa tctcttccag tctcagttcg

1140

gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc

1200

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa

1260

cacccgaagt cggtaggtag ccagccgcct aaggtgggat agatgattgg ggtgaagtcg

1320

taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggt tggaacacct cctt

1364

<210> 1865

<211> 1365

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCE09

<400> 1865

ggagtttgat tatggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac

60

gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataacaaaag tcactaccag atggacctgc gttgtattag

180

ctagttggtg gggtaacggc tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat

240

cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct

300

tcggcaatgg acggaagtct gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc

360

gtaaagctct gttgtaagag aagatgacgg tatcttacca gaaagggacg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtccc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag

480

cgagcgcagg cggttagata agtctgaagt taaaggctgt ggcttaacca tagtaccgct

540

ttggaaactg tttaacttga gtgcaagagg ggagagtgga attccatgtg tagcggtgaa

600

atgcgtagat atatggagga acaccggtgg cgaaagcggc tctctggctt gactgacgct

660

gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac

720

gatgagtgct aggtgttaga cgtttagtgc cgcagctaac gcattaagca ctccgcctgg

780

ggagtacgac cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga

840

gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca tcgacaggtg

900

gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

960

acccctattg ttagttgcca tcatgggcac tctagcgaga ctgccggtaa taaaccggag

1020

gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca cacgtgctac

1080

aatggctggc aacgagtcgc aagccggtga cggcaagcta atctcttcca gtctcagttc

1140

ggatgtaggc tgcaactcgc ctacagaagt cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcacg

1200

ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg agagtttgta

1260

acacccgaag tcggtaggta gccagccgcc taaggtggga tagatgattg gggtgaagtc

1320

gtaacaaggt agccgtatcg gaaggtgcgg ctggaacacc tcctt

1365

<210> 1866

<211> 1262

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCE10

<220>

<221> modified_base

<222> (1065)..(1065)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1067)..(1067)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1137)..(1137)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1223)..(1223)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1250)..(1250)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1866

ggagtttgat tctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac

60

gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataacaaaag tcactaccag atggacctgc gttgtattag

180

ctagttggtg gggtaacggc tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat

240

cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct

300

tcggcaatgg acggaagtct gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc

360

gtaaagctct gttgtaagag aagatgacgg tatcttacca gaaagggacg gctaactacg

420

tgccagctgc cgcggtaata cgtaggtccc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag

480

cgagcgcagg cggttagata agtctgaagt taaaggctgt ggcttatcca tagtacgctt

540

tggaaactgt ttaacttgag tgcaagaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata tatggaggaa caccggtggc gaaagcggct ctctggcttg actgacgctg

660

aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataacct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgagtgcta ggtgttagac gtttagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

780

gagtacgacc gcaaggtgga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttatcca gtcttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctattgt tagttcccat catgggcact ctagcgagac tgccggtaat aaaccggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgact ggaancncac acgtgctaca

1080

atggctggca acgagtcgcc aaccggtgac ggcaagctaa tctcttccag tctcagntcg

1140

gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc

1200

cgcggtgaat acgttcccgg gcnttgtaca cgccgcccgt cacccccccn gagtttgtaa

1260

ca

1262

<210> 1867

<211> 1362

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCE12

<220>

<221> modified_base

<222> (587)..(587)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1867

ggagtttgat tctggctcag gacgaacgcc ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac

60

gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataaaaaagt cactaccaga tggacctgcg ttgtattagc

180

tagttggtgg ggtaacggct caccaaggcg acgatacata gccgacttga gagggtgatc

240

ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

300

cggcaatgga cggaagtctg accgagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt tttcggatcg

360

taaagctctg ttgtaagaga agatgacggt atcttaccag aaagggacgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtcccg agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc

480

gagcgcaggc ggttagataa gtctgaagtt aaaggctgtg gcttaaccat agtacgcttt

540

ggaaactgtt taacttgagt gcaagagggg agagtggaat tccatgngta gcggtgaaat

600

gcgtaatata tggaggaaca ccggtggcga aagcggctct ctggcttgac tgacgctgag

660

gctcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat

720

gagtgctagg tgttagacgt ttagtgccgc agctaacgca ttaagcactc cgcctgggga

780

gtacgaccgc aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca

840

tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcg acaggtggtg

900

catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

960

cctattgtta gttgccatca tgggcactct agcgagactg ccggtaataa accggaggaa

1020

ggtggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtgctacaat

1080

ggctggcaac gagtcgcaag ccggtgacgg caagctaatc tcttccagtc tcagttcgga

1140

tgtaggctgc aactcgccta cagaagtcgg aatcgctagt aatcgcggat cagcacgccg

1200

cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gtttgtaaca

1260

cccgaagtcg gtaggtagcc agccgcctaa ggtgggatag atgattgggg tgaagtcgta

1320

acaaggtagc cgtatcggaa ggtgcggctg gaacacctcc tt

1362

<210> 1868

<211> 1364

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCF05

<220>

<221> modified_base

<222> (1014)..(1014)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1206)..(1206)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1336)..(1336)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1338)..(1338)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1355)..(1355)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1868

ggagtttgat catggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac

60

gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggagg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataacaaaag tcactaccag atggacctgc gttgtattag

180

ctagttggtg gggtaacggc tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat

240

cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct

300

tcggcaatgg acggaagtct gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc

360

gtaaagctct gttgtaagag aagatgacgg tatcttacca gaaagggacg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtccc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag

480

cgagcgcagg cggttagata agtctgaagt taaaggctgt ggcttaacca tagtacgctt

540

tggaaactgt ttaacttgag tgcaagaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata tatggaggaa caccggtggc gaaagcggct ctctggcttg actgacgctg

660

aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgagtgcta ggtgttagac gtttagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

780

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaggg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctattgt tagttgccat catgggcact ctagcgagac tgccggtaat aaancggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1080

atggctggca acgagtcgca agtcggtgac ggcaagctaa tctcttccag tctcagttcg

1140

gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc

1200

cgcggnaaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa

1260

cacccgaagt cggtaggtag ccagccgcct aaggtgggat agatgattgg ggtgaagtcg

1320

taacaaggta gccggntngg aaggtgcggc taaancacct cctt

1364

<210> 1869

<211> 1364

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCF07

<220>

<221> modified_base

<222> (232)..(232)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (657)..(657)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1122)..(1122)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1869

ggagtttgat tctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac

60

gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctc ttagcggggg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataagaaagt cactaagaga tggacctgcg ttgtattagc

180

tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatacata gccgacctga gngggtgatc

240

ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

300

cggcaatggg ggcaaccctg accgagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt tttcggatcg

360

taaagctctg ttgtaagaga agatgacggt aacttaccag aaagggacgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtcccg agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaagc

480

gagcgcaggc ggttagataa gtctgaagtt aaaggctgtg gcttaaccat agctacgctt

540

tggaaactgt ttaacttgag tgcagaaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata tatggaggaa caccggtggc gaaagcggct ctctggtctg actgacnctg

660

aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg

720

atgagtgcta ggtgttgggt actcagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

780

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

900

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctattgt tagttgccat catgggcact ctagcgagac tgccggtaat aaaccggagg

1020

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1080

atggctggca acgagtcgcg agtcggtgac ggcaagctaa tntcttccag tctcagttcg

1140

gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc

1200

cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa

1260

cacccgaagt cggtaggtag ccagccgcct aagatgggat agatgattgg ggtgaagtcg

1320

taacaaggta gccgtatcgg aaggtgcggt tggaacacct cctt

1364

<210> 1870

<211> 1357

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCF09

<220>

<221> modified_base

<222> (787)..(787)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1870

ggagtttgat tctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac

60

gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg

120

gaaacgatag ctaataccgc ataataaaag ccactaccag atggacctgc gttgaattag

180

ctagttggtg gggtaacggc tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat

240

cggccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct

300

tcggcaatgg acgaaagtct gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc

360

gtaaagctct gttgtaagag aagatgacgg tatcttacca gaaagggacg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtccc gagcgtgtcc ggatttattg ggcgtaaagc

480

gagcgcaggc ggttagataa gtctgaagtt aaaggctgtg gcttaaccat agtacgcttt

540

ggaaactgtt taacttgagt gcaagagggg agagtggaat tccatgtgta gcggtgaaat

600

gcgtagatat atggaggaac accggtggcg aaagcgactc tctggcttga ctgacgctga

660

ggctcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccccg gtaatccacg ccgtaaacaa

720

tgagtgctag gtgttagacg tttagtgccg tagctaacgc attaagcact ccgcctgggg

780

agtacgnccg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc

840

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc gacaggtggt

900

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccctatagtt agttgccatc atgggcactc tagcgagact gccggtaata aaccggagga

1020

aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa

1080

tggctggcaa cgagtcgcaa gtcggtgacg gcaagctaat ctcttccagt ctcagttcgg

1140

atgtaggctg caactcgcct acagaagtcg gaatcgctag taatcgcgga tcagcacgcc

1200

gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac

1260

acccgaagtc ggtaggtagc cagccgccta aggtgggata gatgattggg gtgaagtcgt

1320

aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct ggaacac

1357

<210> 1871

<211> 1549

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone ASCG04

<220>

<221> modified_base

<222> (630)..(630)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (782)..(782)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (901)..(901)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1305)..(1305)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1871

tgctcatggc tcaggacgaa cgctggcggc gtgcctaata catgcaagta gaacgctgaa

60

ggaggagctt gctcttctgg atgagttgcg aacgggtgag taacgcgtag gtaacctgcc

120

tggtagcggg ggataactat tggaaacgat agctaatacc gcataatatt gactattgca

180

tgatagtcaa ttgaaaggtg caaatgcacc actaccagat ggacctgcgt tgtattagct

240

agttggtggg gtaacggctc accaaggcga cgatacatag ccgacctgag agggtgatcg

300

gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta gggaatcttc

360

ggcaatggac ggaagtctga ccgagcaacg ccgcgtgagt gaagaaggtt ttcggatcgt

420

aaagctctgt tgtaagagaa gaacgagtgt gagagtggaa agttcacact gtgacggtat

480

cttaccagaa agggacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtcccgag

540

cgttgtccgg atttattggg cgtaaagcga gcgcaggcgg ttagataagt ctgaagttaa

600

aggctgtggc ttaaccatag tacgctttgn gaaactgtta aacttggagt gcagaagggg

660

agagtggaat tcccatatgt agcggtaaaa tgcgtagata tatgggagga accaccgctg

720

ggcgaaagcg gctatctggt ctgtgaactg acgctgaggg ctcgaaagcg tggggagcaa

780

ancaggatta gataccacgg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag gtgttgggtc

840

ctttccggga ctcagtgccg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg

900

ncaaggttga aactcaaagg aattgaccgc gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

960

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca tcccggtgcc cgtcctagag

1020

ataggatttt gcttcggcac acccggtgac aggtgggtgc atggttgtcg tcagctcgtg

1080

tcgtgagaat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttattacta gttgccagca

1140

ttgagttggg cactctagtg agactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt

1200

caaatcatca tgccccttat gacttgggct acacacgtgc tacaatggat ggtacaacga

1260

gcagcgaact cgcgagggta agcgaatctc ttaaagccat tctcngttcg gattgtaggc

1320

tgcaactcgc ctacatgaag ccggaatcgc tagtaatcgt ggatcagcac gccgcggtga

1380

atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagtttgt aacacccaaa

1440

gtcggtgagg taacctttat ggagccagcc gcctaaggtg ggatagatga ttggggtgaa

1500

gtcgtaacaa ggtagccgta tcggaaggtg cggctggatc acctccttc

1549

<210> 1872

<211> 1540

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone BW009

<400> 1872

gagagtttga tyctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaatacat gcaagtagaa

60

cgctgaagga ggagcttgct tctctggatg agttgcgaac gggtgagtaa cgcgtaggta

120

acctgcctgg tagcggggga taactattgg aaacgatagc taataccgca taatattgat

180

tattgcatga tagtcaatta aaaggtgcaa ttgcatcact accagatgga cctgcgttgt

240

attagctagt tggtggggta acggctcacc aaggcgacga tacatagccg acctgagagg

300

gtgatcggcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtaggg

360

aatcttcggc aatggacgga agtctgaccg agcaacgccg cgtgagtgaa gaaggttttc

420

ggatcgtaaa gctctgttgt aagagaagaa cgagtgtgag agtggaaagt tcacactgtg

480

acggtatctt accagaaagg gacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg

540

tcccgagcgt tgtccggatt tattgggcgt aaagcgagcg caggcggtta gataagtctg

600

aagttaaagg ctgtggctta accatagtac gctttggaaa ctgtttaact tgagtgcaag

660

aggggagagt ggaattccat gtgtagcggt gaaatgcgta gatatatgga ggaacaccgg

720

tggcgaaagc ggctctctgg cttgtaactg acgctgaggc tcgaaagcgt ggggagcaaa

780

caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga gtgctaggtg ttagaccctt

840

tccggggttt agtgccgtag ctaacgcatt aagcactccg cctggggagt acgaccgcaa

900

ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

960

cgaagcaacg cgaagaacct taccaggtct tgacatccct ctgaccgctc tagagataga

1020

gttttccttc gggacagagg tgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1080

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctattgt tagttgccat cattcagttg

1140

ggcactctag cgagactgcc ggtaataaac cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat

1200

catgcccctt atggcctggg ctacacacgt gctacaatgg ctggtacaac gagtcgcaag

1260

ccggtgacgg caagctaatc tcttaaagcc agtctcagtt cggattgtag gctgcaactc

1320

gcctacatga agtcggaatc gctagtaatc gcggatcagc acgccgcggt gaatacgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acgagagttt gtaacacccg aagtcggtga

1440

ggtaaccatt tggagccagc cgcctaaggt gggatagatg attggggtga agtcgtaaca

1500

aggtagccgt atcggaaggt gcggctggat cacctccttc

1540

<210> 1873

<211> 1541

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone CH016

<400> 1873

gagagtttga ttctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaatacat gcaagtagaa

60

cgctgaagga ggagcttgct tctctggatg agttgcgaac gggtgagtaa cgcgtaggta

120

acctgcctgg tagcggggga taactattgg aaacgatagc taataccgcg taaaattgat

180

tattgcatga tagtcaatta aaaggtgcaa ttgcatcact accagatgga cctgcgttgt

240

attagctagt tggtgaggta acggctcacc aaggcaacga tacatagccg acctgagagg

300

gtgatcggcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtaggg

360

aatcttcggc aatggacgga agtctgaccg agcaacgccg cgtgagtgaa gaaggttttc

420

ggatcgtaaa gctctgttgc aagagaagaa cgagtgtgag agtggaaagt tcacactgtg

480

acggtatctt accagaaagg gacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg

540

tcccgagcgt tgtccggatt tattgggcgt aaagcgagcg caggcggtta gataagtctg

600

aagttaaagg ctgtggctta accatagtac gctttggaaa ctgtttaact tgagtgcaag

660

aggggagagt ggaattccat gtgtagcggt gaaatgcgta gatatatgga ggaacaccgg

720

tggcgaaagc ggctctctgg cttgtaactg acgctgaggc tcgaaagcgt ggggagcaaa

780

caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga gtgctaggtg ttagaccctt

840

tccggggttt agtgccgcag ctaacgcatt aagcactccg cctggggagt acgaccgcaa

900

ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

960

cgaagcaacg cgaagaacct taccaggtct tgacatccct ccgaccgctc tagagataga

1020

gttttccttc gggacagagg tgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag

1080

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctattgt tagttgccat catttagttg

1140

ggcactctag cgagactgcc ggtaataaac cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat

1200

catgcccctt atgacctggg ctacacacgt gctacaatgg ctggtacaac gagtcgcaag

1260

ccggtgacgg caagctaatc tcttaaagcc agtctcagtt cggattgtag gctgcaactc

1320

gcctacatga agtcggaatc gctagtaatc gcggatcagc acgccgcggt gaatacgttc

1380

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acgagagttt gtaacacccg aagtcggtga

1440

ggtaaccttt taggagccag ccgcctaagg tgggatagat gattggggtg aagtcgtaac

1500

aaggtagccg tatcggaagg tgcggctgga tcacctcctt c

1541

<210> 1874

<211> 1363

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone GK051

<400> 1874

gagtttgatt ctggctcagg atgaacgcag gcggcgtgcc taatacatgc aagtagaacg

60

agttgcgaac gggtgagtaa cgcgtaggta acctgcctgg tagtggggga taactattgg

120

aaacgatagc taataccgca taatgaaagt cactaccaga tggacctgcg ttgtattagc

180

tagttggtgg ggtaacggct caccaaggcg acgatacata gccgacctga gagggtgatc

240

ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

300

cggcaatgga cgaaagtctg accgagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt tttcggatcg

360

taaagctctg ttgtaagaga agatgacggt atcttaccag aaagggacgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtcccg agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc

480

gagcgcagac ggttagataa gtctgaagtt aaaggctgtg gcttaaccat agtacgcttt

540

ggaaactgtt taacttgagt gcaagagggg agagtggaat tccatgtgta gcggtgaaat

600

gcgtagatat atggaggaac accggtggcg aaagcggctc tctggcttga ctgacgctga

660

ggctcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga

720

tgagtgctag gtgttagacg tttagtgccg tagctaacgc attaagcact ccgcctgggg

780

agtacgaccg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc

840

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc gacaggtggt

900

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccctactgtt agttgccatc atgggcactc tagcgagact gccggtaata aaccggagga

1020

aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa

1080

tggctggcaa cgagtcgcaa gtcggtgacg acaagctaat ctcttccagt ctcagttcgg

1140

atgtaggctg caactcgcct acagaagtcg gaatcgctag taatcgcgga tcagcacgcc

1200

gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac

1260

acccgaagtc ggtaggtagc cagccgccta aggtgggata gatgattggg gtgaagtcgt

1320

aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct ggaacacctc ctt

1363

<210> 1875

<211> 1363

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone GM006

<400> 1875

gagtttgatt ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtagaacg

60

agttgcgaac gggtgagtaa cgcgtaggta acctgcctgg tagcggggga taactattgg

120

aaacgatagc taataccgca taacaaaagc cactaccaga tggacctgcg ttgtattagc

180

tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatacata gccgacctga gagggtgatc

240

ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

300

cggcaatgga cggaagtctg accgagcaac cccgcgtgag tgaagaaggt tttcggatcg

360

taaaactctg ttgttagaga agatgacggt atctaaccag aaagacacgg ctaactacgt

420

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggatttattg ggcgtaaagc

480

gagcgcaggc ggttagataa gtctgaagtt aaaggctgtg gcttaaccat agtacgcttt

540

ggaaactgtt taacttgagt gcagaagggg agagtggaat tccatgtgta gcggtgaaat

600

gcgtagatat atggaggaac accggtggcg aaagcggctc tctggtctga ctgacgctga

660

agctcgaaag cggggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga

720

tgagtgctag gtgttgggta ctcagtgccg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg

780

agtacgaccg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc

840

atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc gacaggtggt

900

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccctattgtt agttgccatc atgggcactc tagcgagact gccggtaata aaccggagga

1020

aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa

1080

tggctggcaa cgagtcgcaa gccggtgacg gcaagctaat ctcttccagt ctcagttcgg

1140

atgtaggctg caactcgcct acagaagtcg gaatcgctag taatcgcgga tcagcacgcc

1200

gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttgtaac

1260

acccgaagtc ggtaggtagc cagccgccta aggtgggata gatgattggg gtgaagccgt

1320

aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct ggaacacctc ctt

1363

<210> 1876

<211> 1324

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone P2PA_41 P2

<400> 1876

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac gagttgcgaa cgggtgagta

60

acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc

120

ataatgaaag tcactaccag atggacctgc gttgtattag ctagttggtg aggtaacggc

180

tcaccaaggc aacgatacat agccgacctg agagggtgat cggccacact gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tcggcaatgg acggaagtct

300

gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc gtaaagctct gttgtaagag

360

aagatgacgg tatcttacca gaaagggacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtccc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag cgagcgcagg cggttagata

480

agtctgaagt taaaggctgt ggcttaacca tagtacgctt tggaaactgt ttaacttgag

540

tgcaagaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tatggaggaa

600

caccggtggc gaaagcggct ctctggcttg actgacgctg aggctcgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttagac

720

gtttagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc

840

aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctattgt tagttgccat

960

catgggcact ctagcgagac tgccggtaat aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1020

tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca atggctggca acgagtcgca

1080

agccggtgac ggcaagctaa tctcttccag tctcagttcg gatgtaggct gcaactcgcc

1140

tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc cgcggtgaat acgttcccgg

1200

gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga gagtttgtaa cacccgaagt cggtaggtag

1260

ccagccgcct aaggtgggat agatgattgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtatcgg

1320

aagg

1324

<210> 1877

<211> 1324

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral clone P4PA_30 P4

<400> 1877

gacgaacgtt ggtggcgtgc ctaatacatg caagtagaac gagttgcgaa cgggtgagta

60

acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg ataactattg gaaacgatag ctaataccgc

120

ataaagaaag tcactaccag atggacctgc gttgtattag ctagttggtg gggtaacggc

180

tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat cggccacact gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tcggcaatgg acggaagtct

300

gaccgagcaa cgccgcgtga gcgaagaagg ttttcggatc gtaaagctct gttgtaagag

360

aagatgacgg tatcttacca gaaagggacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtccc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag cgagcgcagg cggttagata

480

agtctgaagt taaaggctgt ggcttaacca tagtacgctt tggaaactgt ttaacttgag

540

tgcaagaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tatggaggaa

600

caccggtggc gaaagcggct ctctggcttg actgacgctg aggctcgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttagac

720

gtttagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacgacg caggtgaaac

780

tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac

840

gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacatcga ctggtggtgc atggttgtcg tcagcttgtg

900

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ctattgttag ttgccatcat

960

gggcactcta gcgagactgc cggtaataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaaatca

1020

tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tgctacaatg gctggcaacg agtcgcaagc

1080

cggtgacggc aagctaatct cttccagtct cagttcggat gtaggctgca actcgcctac

1140

agaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agcacgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1200

ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccgaagtcgg taggtagcca

1260

gccgcctaag gtgggataga tgattggggt gaagtcgtaa caaggtagcc gtatcggaag

1320

gtgc

1324

<210> 1878

<211> 1546

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral taxon 071

<400> 1878

tgagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtaga

60

acgctgaaga gaggagcttg ctcttcttgg atgagttgcg aacgggtgag taacgcgtag

120

gtaacctgcc tggtagcggg ggataactat tggaaacgat agctaatacc gcataaaatg

180

gattatcgca tgatgattca ttgaaaggtg caaatgcatc actaccagat ggacctgcgt

240

tgtattagct agttggtggg gtaacggctc accaaggcaa cgatacatag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc ggcaatggac ggaagtctga ccgagcaacg ccgcgtgagt gaagaaggtt

420

ttcggatcgt aaagctctgt tgtaagagaa gaacgagtgt gagagtggaa agttcacact

480

gtgacggtat cttaccagaa agggacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

aggtcccgag cgttgtccgg atttattggg cgtaaagcga gcgcaggcgg ttagataagt

600

ctgaagttaa aggctgtggc ttaaccatag tacgctttgg aaactgttta acttgagtgc

660

aagaggggag agtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat ggaggaacac

720

cggtggcgaa agcggctctc tggcttgtaa ctgacgctga ggctcgaaag cgtggggagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag gtgttagacc

840

ctttccgggg tttagtgccg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg

900

caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc cctctgatcg ctctagagat

1020

agagctttcc ttcgggacag aggtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat tgttagttgc catcattcag

1140

ttgggcactc tagcgagact gccggtaata aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1200

catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggctggtac aacgagtcgc

1260

aagccggtga cggcaagcta atctcttaaa gccagtctca gttcggattg taggctgcaa

1320

ctcgcctaca tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agcacgccgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccgaagtcgg

1440

tgaggtaacc ttttaggagc cagccgccta aggtgggata gatgattggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtag ccgtatcgga aggtgtggct ggatcacctc ctttct

1546

<210> 1879

<211> 1203

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral taxon G59

<400> 1879

gatgtacgct ggcggcgtgc ctgatacatg caagtagcac gctgaagctt aggtgcttgc

60

accgagcgga tgagttgcga accggggtga ggtcaaacgg cggtagggta aaccttgccc

120

ttcttagcgg gggatatact aatgtgtgaa aacgaatagc ttaatacccg catcataaga

180

gactgatatc gcatgatatt gatttgaaag atgcaattgc atcagctaag agatggacct

240

gtgttgtatt agctagttgg tgaggtaacg gctgcaccaa ggcaacgata catagccgac

300

ctgagagggt gatcggccac actgggactg agacacggcc cagactcgta cgggaggcag

360

cagtagggta tcttcggcaa tgggggcaac cctgaaccga gcaacgccgc gtgagtgaag

420

aaggttttcg gatcgtaaag ctctgttgta agagaagaac gagtgtgaga gtggaaagtt

480

cacactgtga cggtaactta ccagaaaggg acggctaact acgtgccagc agccgcggta

540

atacgtaggt cccgagcgtt atccggattt attgggcgta aagcgagcgc aggcggttag

600

ataagtctga agttaaaggc tgtggcttaa ccatagtacg ctttggaaac tgtttaactt

660

gagtgcagaa ggggagagtg gaattccatg tgtagcggtg aaatgcgtag atatatggag

720

gaacaccggt ggcgaaagcg gctctctggt ctgtaactga cgctgaggct cgaaagcgtg

780

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag tgctaggtgt

840

tgggtccttt ccgggactca gtgccgcagc taacgcatta agcactccgc ctggggagta

900

cgaccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt

960

ggtgtaattc gaagcaacgc gaagaacctt accatgtctt gacatccctc tgaccgctct

1020

agagatagag tgtcgcttcg ggacagaggt gacaggtggt gcatgggtgt cgtcagctcg

1080

tgtcgtgaga tgtggggtta agtccgcaac gagcgcaccc ctatgatagt gccatcatta

1140

cgtgggcact ctagcgaact gcgggtatta acccgaggaa gggtgggaat acgtcaatat

1200

atg

1203

<210> 1880

<211> 1216

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral taxon G62

<400> 1880

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtggaac gctgaagaga ggagcttgct

60

cttcttggat gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg

120

ataactattg gaaacgatag ctaataccgc atgaaatgga ttatcgcatg ataatcgatt

180

gaaaggtgca aatgcatcac taccagatgg acctgcgttg tattagctag ttggtgaggt

240

aacggctcac caaggcaacg atacatagcc gacctgagag ggtgatcggc cacactgggg

300

ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatcttcgg caatggacgg

360

aagtctgacc gagcaacgcc gcgtgagtga agaaggtttt cggatcgtaa agctctgttg

420

taagagaaga acgagtgtga gagtggaaag ttcacactgt gacggtatct taccagaaag

480

ggacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtcccgagcg ttgtccggat

540

ttattgggcg taaagcgagc gcaggcggtt agataagtct gaagttaaag gctgtggctt

600

aaccatagta cgctttggaa actgtttaac ttgagtgcaa gaggggagag tggaattcca

660

tgtgtagcgg tgaaatgcgt agatatatgg aggaacaccg gtggcgaaag cggctctctg

720

gcttgcaact gacgctgagg ctcgaaagcg tggggagcaa acaggattag gtaccctggt

780

agtccacgcc gtaaacgatg agtgctaggt gttagaccct ttccggggtt tagtgccgca

840

gctaacgcat taagcactcc gcctggggag tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat

900

agacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc

960

taccaggtct tgacatccct ctgaccgctc tagagataga gttttccctc gggacagagg

1020

tgacagggtg gtgcatgggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgtcggg gttaggtccg

1080

ccacgagcgc acccctattg ttgttgccat cattagttgg gcaccctagc ggactgccgg

1140

tatttacccg aaggagggtg gggattacgt caagttacta tgccccctat gatcggggct

1200

acacgagtcc tacatg

1216

<210> 1881

<211> 1204

<212> DNA

<213> Streptococcus sp. oral taxon G63

<400> 1881

gacgtacgct ggcggtgtgc ctgatacatg caagtagcac gctgaagaga ggtgcttgct

60

cttcttggat gagttgcgaa cgggtgagtc acgcgtaggt aacctgcctg atagcggggg

120

ctaactattg taaacgatag ctaataccgc atgaaatgga ttatcgcatg ataatcgatt

180

gaaaggtgca gatgcatcac taccagatgg acctgcgttg tattagctag ttggtgaggt

240

aacggctcac cacggcaacg atacatagcc gacctgagag ggtgatcggc cacactggga

300

ctgagacacg gccccagaca cgtacgggga ggcagcagta gggtatcttc ggcaatggac

360

ggaagtactg accgagcaac gccgcgtgag tgaagaaggt gttcggatcg taaagctctg

420

ttgtaagaga agaacgagtg tgagagtgga aagttcacac tgtgacggta tcttaccaga

480

aagggacggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg taggtcccga gcgttgtccg

540

gatttattgg gcgtaaagcg agcgcaggcg gttagataag tctgaagtta aaggctgtgg

600

cttaaccata gtacgctttg gaaactgttt aacttgagtg caagagggga gagtggaatt

660

ccatgtgtag cggtgaaatg cgtagatata tggaggaaca ccggtggcga aagcggctct

720

ctggcttgta actgacgctg aggctcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct

780

ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta ggtgttagac cctttccggg gtttagtgcc

840

gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacgacc gcaaggtgga aactcaaagg

900

aattgacggg ggcacgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga

960

accttaccag gtcttgacat ccctctgacc gctctagaga tagagttttc cctcgggaca

1020

gaggtgacag ggtggtgcat gggttgtcgt cagccgtgtc gtgagatgtt cgggttaagt

1080

ccgccacgag cgccacccct attgttagtt gcccatcatt taggtgggtc accttagcga

1140

gactgcccgg tattaaccgg agggagggtg ggaatacgtc aaatatcatg ccccttatac

1200

gtgg

1204

<210> 1882

<211> 1547

<212> DNA

<213> Streptococcus suis

<400> 1882

tgagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtaga

60

acgctgaagt ctggtgcttg cactagacgg atgagttgcg aacgggtgag taacgcgtag

120

gtaacctgcc tcatagcggg ggataactat tggaaacgat agctaatacc gcataacagt

180

atttaccgca tggtagatat ttgaaaggag caattgcttc actatgagat ggacctgcgt

240

tgtattagct agttggtgag gtaacggctc accaaggctt cgatacatag ccgacctgag

300

agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta

360

gggaatcttc ggcaatgggg gcaaccctga ccgagcaacg ccgcgtgagt gaagaaggtt

420

ttcggatcgt aaagctctgt tgtaagagaa gaactgtgag aagagtggaa agtttctcac

480

ttgacggtat cttaccagaa agggacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

aggtcccgag cgttgtccgg atttattggg cgtaaagcga gcgcaggcgg tttgataagt

600

ctgaagtaaa aggctgtggc ttaaccatag tacgctttgg aaactgtcaa acttgagtgc

660

agaaggggag agtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat ggaggaacac

720

cggtggcgaa agcggctctc tggtctgtaa ctgacgctga ggctcgaaag cgtggggagc

780

gaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag gtgttgggtc

840

ctttccggga ctcagtgccg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg

900

caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ccgatgaccg ccctagagat

1020

agggtttctc ttcggagcat cggtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt

1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctat tgttagttgc catcattcag

1140

ttgggcactc tagcgagact gccggtaata aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat

1200

catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggctggtac aacgagtcgc

1260

aagtcggtga cggcaagcta atctcttaaa gccagtctca gttcggattg taggctgcaa

1320

ctcgcctaca tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc agcacgccgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac ccgaagtcgg

1440

tgaggtaacc ttttaggagc cagccgccta aggtgggata gatgattggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct ggatcacctc ctttcta

1547

<210> 1883

<211> 1012

<212> DNA

<213> Streptococcus thermophilus

<220>

<221> modified_base

<222> (998)..(998)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1005)..(1006)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1883

tagaacgctg aagagaggag cttgctcttc ttggatgagt tgcgaacggg tgagtaacgc

60

gtaggtaacc tgccttgtag cgggggataa ctattggaaa cgatagctaa taccgcataa

120

caatggatga cacatgtcat ttatttgaaa ggggcaattg ctccactaca agatggacct

180

gcgttgtatt agctagtagg tgaggtaacg gctcacctag gcgacgatac atagccgacc

240

tgagagggtg atcggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc

300

agtagggaat cttcggcaat gggggcaacc ctgaccgagc aacgccgcgt gagtgaagaa

360

ggttttcgga tcgtaaagct ctgttgtaag tcaagaacga gtgtgagagt ggaaagttca

420

cactgtgacg gtagcttacc agaaagggac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtaggtcc cgagcgttgt ccggatttat tgggcgtaaa gcgagcgcag gcggtttgat

540

aagtctgaag ttaaaggctg tggctcaacc atagttcgct ttggaaactg tcaaacttga

600

gtgcagaagg ggagagtgga attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat atatggagga

660

acaccggtgg cgaaagcggc tctctggtct gtaactgacg ctgaggctcg aaagcgtggg

720

gagcgaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaggtgttg

780

gatcctttcc gggattcagt gccgcagcta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg

840

accgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg

900

tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catcccgatg ctatttctag

960

agatagaaag ttacttcggt acatcggtga caggtggngc atggnngtcg tc

1012

<210> 1884

<211> 1431

<212> DNA

<213> Streptococcus uberis

<400> 1884

agtagaacgc tgaggactgg tgcttgcact ggtctaagga gttgcgaacg ggtgagtaac

60

gcgtaggtaa cctacctcat agcgggggat aactattgga aacgatagct aataccgcat

120

gacaataggg tacacatgta ccctatttaa aaggggcaaa tgcttcacta tgagatggac

180

ctgcgttgta ttagctagtt ggtaaggtaa cggcttacca aggcgacgat acatagccga

240

cctgagaggg tgatcggcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

300

gcagtaggga atcttcggca atggggggaa ccctgaccga gcaacgccgc gtgagtgaag

360

aaggttttcg gatcgtaaag ctctgttgtt agagaagaac ggtaatggga gtggaaaatc

420

cattacgtga cggtaactaa ccagaaaggg acggctaact acgtgccagc agccgcggta

480

atacgtaggt cccgagcgtt gtccggattt attgggcgta aagcgagcgc aggcggtttg

540

ataagtctga agttaaaggc tgtggcttaa ccatagttcg ctttggaaac tgtcaaactt

600

gagtgcagaa ggggagagtg gaattccatg tgtagcggtg aaatgcgtag atatatggag

660

gaacaccggt ggcgaaagcg gctctctggt ctgtaactga cgctgaggct cgaaagcgtg

720

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgag tgctaggtgt

780

taggcccttt ccggggctta gtgccggagc taacgcatta agcactccgc ctggggagta

840

cgaccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt

900

ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacatcccga tgcccgctct

960

agagatagag ctttacttcg gtacatcggt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

1020

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctattgtt agttgccatc

1080

attaagttgg gcactctagc gagactgccg gtaataaacc ggaggaaggt ggggatgacg

1140

tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc tacacacgtg ctacaatggt tggtacaacg

1200

agtcgcaagc cggtgacggc aagctaatct cttaaagcca atctcagttc ggattgtagg

1260

ctgcaactcg cctacatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg cggatcagca cgccgcggtg

1320

aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cgagagtttg taacacccga

1380

agtcggtgag gtaacctatt aggagccagc cgcctaaggt gggatagatg a

1431

<210> 1885

<211> 1466

<212> DNA

<213> Streptococcus urinalis

<400> 1885

cgctggcggc gtgcctaata catgcaagta gaacgctgag gtcatgtgct tgcacaagac

60

caaggagttg cgaacgggtg agtaacgcgt aggtaacctg cctcatagcg ggggataact

120

attggaaacg atagctaata ccgcatgaga gtttttaaca catgttagga acttaaaagg

180

agcaactgct tcactatgag atggacctgc gttgtattag ctagttggtg aggtaacggc

240

tcaccaaggc gacgatacat agccgacctg agagggtgat cggccacact gggactgaga

300

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tcggcaatgg gggcaaccct

360

gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg ttttcggatc gtaaagctct gttgttagag

420

aagaatggaa gtaggagtgg aaagtctact tcgtgacggt aactaaccag aaagggacgg

480

ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtaggtcccg agcgttgtcc ggatttattg

540

ggcgtaaagc gagcgcaggc ggttctataa gtctgaagtt aaaggcagtg gctcaaccat

600

tgttcgcttt ggaaactgta gaacttgagt gcagaagggg agagtggaat tccatgtgta

660

gcggtgaaat gcgtagatat atggaggaac accggtggcg aaagcggctc tctggtctgt

720

aactgacgct gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

780

cgccgtaaac gatgagtgct aggtgttagg ccctttccgg ggcttagtgc cgcagctaac

840

gcattaagca ctccgcctgg ggagtacgac cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg

900

gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacca

960

ggtcttgaca tcccgatgcc cgctctagag atagagtttt acttcggtac atcggagaca

1020

ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1080

cgcaacccct attgttagtt gccatcattc agttgggcac tctagcaaga ctgccggtaa

1140

taaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca

1200

cacgtgctac aatggttggt acaacgagtc gcaagtcggt gacgacaagc taatctctta

1260

aagccaatct cagttcggat tgtaggctgc aactcgccta catgaagtcg gaatcgctag

1320

taatcgcgga tcagcacgcc gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc

1380

acaccacgag agtttgtaac acccgaagtc ggtgaggtaa ccttttagga gccagccgcc

1440

taaggtggga tagatgattg gggtga

1466

<210> 1886

<211> 1043

<212> DNA

<213> Streptococcus vestibularis

<220>

<221> modified_base

<222> (925)..(925)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (932)..(932)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (942)..(942)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (978)..(978)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1005)..(1007)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1019)..(1019)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1024)..(1024)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1027)..(1028)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1886

agaacgctga agagaggagc ttgctcttct tggatgagtt gcgaacgggt gagtaacgcg

60

taggtaacct gccttgtagc gggggataac tattggaaac gatagctaat accgcataac

120

aatggatgac acatgtcatt tatttgaaag gggcaattgc tccactacaa gatggacctg

180

cgttgtatta gctagtaggt gaggtaacgg ctcacctagg cgacgataca tagccgacct

240

gagagggtga tcggccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca

300

gtagggaatc ttcggcaatg ggggcaaccc tgaccgagca acgccgcgtg agtgaagaag

360

gttttcggat cgtaaagctc tgttgtaagt caagaacgag tgtgagagtg gaaaattcac

420

actgtgacgg tagcttacca gaaagggacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

480

cgtaggtccc gagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag cgagcgcagg cggtttgata

540

agtctgaagt taaaggctgt ggctcaacca tagttcgctt tggaaactgt caaacttgag

600

tgcagaaggg gagagtggaa ttccatgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tatggaggaa

660

caccggtggc gaaagcggct ctctggtctg taactgacgc tgaggctcga aagcgtgggg

720

agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgagtgc taggtgttgg

780

atcctttccg ggattcagtg ccgcagctaa cgcattaagc actccgcctg gggagtacga

840

ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt

900

ttaatttcga agcaacgcga agaancttac cnggtcttga cntcccgatg ctatttctag

960

agatagaaag ttacttcngt acatcggtga caggtggtgc atggnnntcg tcagctcgng

1020

tcgngannat gttgggttaa gtc

1043

<210> 1887

<211> 1195

<212> DNA

<213> Streptococcus viridans

<400> 1887

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtagaacg

60

cacagtttat accgtagctt gctacaccat agactgtgag ttgcgaacgg gtgagtaacg

120

cgtaggtaac ctgcctggta gcgggggata actattggaa acgatagcta ataccgcata

180

atattaatta ttgcatgata attaattgaa aggtgcaatt gcaccactac cagatggacc

240

tgcgttgtac tagctagtag gtgaggtaac ggctcaccta ggcgacgata catagccgac

300

ctgagagggt gatcggccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag

360

cagtagggaa tcttcggcaa tggacgaaag tctgaccgag caacgccgcg tgagtgaaga

420

aggttttcgg atcgtaaagc tctgttgtta gagaagaacg ggtgttagag tggaaagttc

480

acactgtgac ggtatcttac cagaaaggga ccgctaacta agtgccagca gccgcggtaa

540

tacgtaggtc ccgagcgttg tccggattta ttgggcgtaa acgagcgcag ccggttagat

600

aagtctgaag ttaaaggctg tggcttaacc atagtacgct ttggaaactg tttaacttga

660

gtgcagaagg ggagagtgaa ttccatgtgt agcggtaaat gcgtagatat atggaggaac

720

accggtggcg aaagcggctc tctggtctgt aactgacgct gaggctcgag agcgtgggga

780

gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct aggtgttagg

840

ccctttccgg ggcttagtgc cgcagctaac gcattaagca ctccgcctgg ggagtacgac

900

cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt

960

taattcgaag caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca tcccgatgcc cgctctagag

1020

atagagtttt acttcggtac atcggtgaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc

1080

gtgaggtgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt attgttagtt gccatcattc

1140

agttgggcac tctagcgaga ctgccggtaa taaaccggag gaaggtgggg atgac

1195

<210> 1888

<211> 1313

<212> DNA

<213> Streptomyces albus

<400> 1888

acgctggcgg cgtgcttaac acatgcaagt cgaacgagtg gcgaacgggt gagtaacacg

60

tgggcaatct gccctgcact ctgggacaag ccctggaaac ggggtctaat accggatatg

120

gaaaggcggt gcaggatgag cccgcggcct atcagcttgt tggtggggtg atggcctacc

180

aaggcgacga cgggtagccg gcctgagagg gcgaccggcc acactgggac tgagacacgg

240

cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc

300

agcgacgccg cgtgagggat gacggccttc gggttgtaaa cctctttcag cagggaagat

360

gacggtacct gcagaagaag caccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

420

ggtgcgagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagagctc gtaggcggct tgtcgcgtcg

480

gatgtgaaag cccggggctt aaccccgggt ctgcattcga tacgggcagg ctagagttcg

540

gcaggggaga ttggaattcc tggtgtagcg gtgaaatgcg cagatatcag gaggaacacc

600

ggtggcgaag gcggatctct gggccgactg acgctgagga gcgaaagcgt ggggagcgaa

660

caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgttgg gcactaggtg tgggcgcgtc

720

cgtgccgcag ctaacgcatt aagtgccccg cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact

780

caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gcggagcatg tggcttaatt cgacgcaacg

840

cgaagaacct taccaaggct tgacatatac aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt

900

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtcctgtgt tgccagcaat

960

tggggactca cgggagactg ccggggtcaa ctcggaggaa ggtggggacg acgtcaagtc

1020

atcatgcccc ttatgtcttg ggctgcacac gtgctacaat ggccggcaat gagctgcgat

1080

gccgtgaggt ggagcgaatc tcaaccggtc tcagttcgga tggggtctgc aactcgaccc

1140

cagaagtcgg agtcgctagt aatcgcagat cagcattgct gcggtgaata cgttcccggg

1200

ccttgtacac accgcccgtc acgtcacgaa agtcggtaac acccgaagcc ggtgcccagg

1260

gaatcgtcga aggtgggact ggcgattggg acgaagtcgt aacaaggtag ccg

1313

<210> 1889

<211> 1533

<212> DNA

<213> Streptomyces griseus

<400> 1889

ttcacggaga gtttgatcct ggctcaggac gaacgctggc ggcgtgctta acacatgcaa

60

gtcgaacgat gaagcctttc ggggtggatt agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgggca

120

atctgccctt cactctggga caagccctgg aaacggggtc taataccgga taacactctg

180

tcccgcatgg gacggggtta aaagctccgg cggtgaagga tgagcccgcg gcctatcagc

240

ttgttggtgg ggtaatggcc taccaaggcg acgacgggta gccggcctga gagggcgacc

300

ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

360

gcacaatggg cgaaagcctg atgcagcgac gccgcgtgag ggatgacggc cttcgggttg

420

taaacctctt tcagcaggga agaagcgaga gtgacggtac ctgcagaaga agcgccggct

480

aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggcgcaag cgttgtccgg aattattggg

540

cgtaaagagc tcgtaggcgg cttgtcacgt cggatgtgaa agcccggggc ttaaccccgg

600

gtctgcattc gatacgggct agctagagtg tggtagggga gatcggaatt cctggtgtag

660

cggtgaaatg cgcagatatc aggaggaaca ccggtggcga aggcggatct ctgggccatt

720

actgacgctg aggagcgaaa gcgtggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccac

780

gccgtaaacg ttgggaacta ggtgttggcg acattccacg tcgtcggtgc cgcagctaac

840

gcattaagtt ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg

900

gggcccgcac aagcagcgga gcatgtggct taattcgacg caacgcgaag aaccttacca

960

aggcttgaca tataccggaa agcatcagag atggtgcccc ccttgtggtc ggtatacagg

1020

tggtgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1080

caacccttgt tctgtgttgc cagcatgccc ttcggggtga tggggactca caggagactg

1140

ccggggtcaa ctcggaggaa ggtggggacg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgtcttg

1200

ggctgcacac gtgctacaat ggccggtaca atgagctgcg atgccgcgag gcggagcgaa

1260

tctcaaaaag ccggtctcag ttcggattgg ggtctgcaac tcgaccccat gaagtcggag

1320

ttgctagtaa tcgcagatca gcattgctgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1380

cgcccgtcac gtcacgaaag tcggtaacac ccgaagccgg tggcccaacc ccttgtggga

1440

gggagctgtc gaaggtggga ctggcgattg ggacgaagtc gtaacaaggt agccgtaccg

1500

gaaggtgcgg ctggatcacc tcctttctaa gga

1533

<210> 1890

<211> 1415

<212> DNA

<213> Streptomyces sp. 1 AIP-2009

<400> 1890

tgcaagtcga cgatgaaccg ctttcgggcg gggattagtg gcgaacgggt gagtaacacg

60

tgggcaatct gccctgcact ctgggacaag ccctggaaac ggggtctaat accggatact

120

cactgccttg ggcatccttg gcggtggaaa gctccggcgg tgcaggatga gcccgcggcc

180

tatcagctag ttggtgaggt aatggctcac caaggcgacg acgggtagcc ggcctgagag

240

ggcgaccggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg

300

gaatattgca caatgggcga aagcctgatg cagcgacgcc gcgtgaggga tgacggcctt

360

cgggttgtaa acctctttca gcagggaaga agcgagagtg acggtacctg cagaagaagc

420

gccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gcgcaagcgt tgtccggaat

480

tattgggcgt aaagagctcg taggcggctt gtcacgtcgg ttgtgaaagc ccggggctta

540

accccgggtc tgcagtcgat acgggcaggc tagagttcgg taggggagat cggaattcct

600

ggtgtagcgg tgaaatgcgc agatatcagg aggaacaccg gtggcgaagg cggatctctg

660

ggccgatact gacgctgagg agcgaatgcg tggggagcga acaggattag ataccctggt

720

agtccacgcc gtaaacggtg ggcactaggt gtgggcaaca ttccacgttg tccgtgccgc

780

agctaacgca ttaagtgccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa

840

ttgacggggg cccgcacaag cagcggagca tgtggcttaa ttcgacgcaa cgcgaagaac

900

cttaccaagg cttgacatac accggaaagc attagagata gtgcccccct tgtggtcggt

960

gtacaggtgg tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1020

acgagcgcaa cccttgtccc gtgttgccag caagcccttc ggggtgttgg ggactcacgg

1080

gagaccgccg gggtcaactc ggaggaaggt ggggacgacg tcaagtcatc atgcccctta

1140

tgtcttgggc tgcacacgtg ctacaatggc cggtacaatg agctgcgata ccgcgaggtg

1200

gagcgaatct caaaaagccg gtctcagttc ggattggggt ctgcaactcg accccatgaa

1260

gtcggagttg ctagtaatcg cagatcagca ttgctgcggt gaatacgttc ccgggccttg

1320

tacacaccgc ccgtcacgtc acgaaagtcg gtaacacccg aagccggtgg cccaacccct

1380

tgtgggaggg agctgtcgaa ggtgggacca gcgat

1415

<210> 1891

<211> 1436

<212> DNA

<213> Streptomyces sp. SD 511

<220>

<221> modified_base

<222> (6)..(7)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (9)..(9)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (15)..(15)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1300)..(1300)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1891

atgaanncnt ttcgntgggg gattagtggc gaacgggtga gtaacacgtg ggcaatctgc

60

cctgcactct gggacaagcc ctggaaacgg ggtctaatac cggatacgac cgcttcgggc

120

atccgatggt ggtggaaagc tccggcggtg caggatgagc ccgcggccta tcagcttgtt

180

ggtgaggtaa cggctcacca aggcgacgac gggtagccgg cctgagaggg cgaccggcca

240

cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca

300

atgggcgcaa gcctgatgca gcgacgccgc gtgagggatg acggccttcg ggttgtaaac

360

ctctttcagc agggaagaag cgcaagtgac ggtacctgca gaagaagcgc cggctaacta

420

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggc gcaagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa

480

agagctcgta ggcggcttgt cgcgtcggat gtgaaagccc ggggcttaac tccgggtctg

540

cattcgatac gggcaggcta gagttcggta ggggagatcg gaattcctgg tgtagcggtg

600

aaatgcgcag atatcaggag gaacaccggt ggcgaaggcg gatctctggg ccgatactga

660

cgctgaggag cgaaagcgtg gggagcgaac aggattagat accctggtag tccacgccgt

720

aaacgttggg aactaggtgt gggcgacatt ccacgtcgtc cgtgccgcag ctaacgcatt

780

aagttccccg cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact caaaggaatt gacgggggcc

840

cgcacaagcg gcggagcatg tggcttaatt cgacgcaacg cgaagaacct taccaaggct

900

tgacatacac cggaaacatc cagagatggg tgcccccttg tggtcggtgt acaggtggtg

960

catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc

1020

cttgtcccgt gttgccagca ggcccttgtg gtgctgggga ctcacgggag accgccgggg

1080

tcaactcgga ggaaggtggg gacgacgtca agtcatcatg ccccttatgt cttgggctgc

1140

acacgtgcta caatggccgg tacaaagagc tgcgataccg tgaggtggag cgaatctcaa

1200

aaagccggtc tcagttcgga ttggggtctg caactcgacc ccatgaagtc ggagtcgcta

1260

gtaatcgcag atcaacattg ctgcggtgaa tacgttcccn ggccttgtac acaccgcccg

1320

tcacgtcacg aaagtcggta acacccgaaa ccggtggccc aaccccttgt gggaaggagc

1380

tgtccaaggt gggactggcg attgggacga atcgtaacaa ggtacctacc ggaagg

1436

<210> 1892

<211> 1447

<212> DNA

<213> Streptomyces sp. SD 524

<220>

<221> modified_base

<222> (23)..(23)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1892

caagtgcaac gatgaaccac ttnggtgggg attagtggcg aacgggtgag taacacgtgg

60

gcaatctgcc ctgcactctg ggacaagccc tggaaacggg gtctaatacc ggatactgag

120

cctcgcaggc atctgcgggg ttcgaaagct ccggcggtgc aggatgagcc cgcggcctat

180

cagcttgttg gtgaggtaac ggctaccaag gcgacgacgg gtagccggcc tgagagggcg

240

accggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

300

attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc gacgccgcgt gagggatgac ggccttcggg

360

ttgtaaacct ctttcagcag ggaagaagcg caagtgacgg tacctgcaga agaagcgccg

420

gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggcgc gagcgttgtc cggaattatt

480

gggcgtaaag agctcgtagg cggcttgtcg cgtcggttgt gaaagcccgg ggcttaaccc

540

cgggtctgca gtcgatacgg gcaggctaga gttcggtagg ggagatcgga attcctggtg

600

tagcggtgaa atgcgcagat atcaggagga acaccggtgg cgaaggcgga tctctgggcc

660

gatactgacg ctgaggagcg aaagcgtggg gagcgaacag gattagatac cctggtagtc

720

cacgccgtaa acggtgggca ctaggtgtgg gcgacattcc acgtcgtccg tgccgcagct

780

aacgcattaa gtgccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga

840

cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgtg gcttaattcg acgcaacgcg aagaacctta

900

ccaaggcttg acatacaccg gaaagcatca gagatggtgc cccccttgtg gtcggtgtac

960

aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1020

gcgcaaccct tgtcccgtgt tgccagcaag cccttcgggg tgttggggac tcacgggaga

1080

ccgccggggt caactcggag gaaggtgggg acgacgtcaa gtcatcatgc cccttatgtc

1140

ttgggctgca cacgtgctac aatggccggt acaatgagct gcgataccgc gaggtggagc

1200

gaatctcaaa aagccggtct cagttcggat tggggtctgc aactcgaccc catgaagtcg

1260

gagtcgctag taatcgcaga tcagcattgc tgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca

1320

caccgcccgt cacgtcacga aagtcggtaa cacccgaagc cggtggccca accccttgtg

1380

ggagggagct gtcgaaggtg ggactggcga ttgggacgaa gtcgtaacaa ggtaccgtac

1440

cggaagg

1447

<210> 1893

<211> 1405

<212> DNA

<213> Streptomyces sp. SD 528

<220>

<221> modified_base

<222> (1385)..(1385)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1893

caagtcgaac gatgaacctc cttcgggagg ggattagtgg cgaacgggtg agtaacacgt

60

gggcaatctg ccctgcactc tgggacaagc cctggaaacg gggtctaata ccggatacga

120

catcctcggg catccgatgg atgtggaaag ctccggcggt gcaggatgag cccgcggcct

180

atcagcttgt tggtgaggta acggctcacc aaggcgacga cgggtagccg gcctgagagg

240

gcgaccggcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg

300

aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agcgacgccg cgtgagggat gacggccttc

360

gggttgtaaa cctctttcag cagggaagaa gcgcaagtga cggtacctgc agaagaagcg

420

ccggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg cgcgagcgtt gtccggaatt

480

attgggcgta aagagctcgt aggcggcttg tcgcgtcggt tgtgaaagcc cggggcttaa

540

ccccgggtct gcagtcgata cgggcaggct agagttcggt aggggagatc ggaattcctg

600

gtgtagcggt gaaatgcgca gatatcagga ggaacaccgg tggcgaaggc ggatctctgg

660

gccgatactg acgctgagga gcgaaagcgt ggggagcgaa caggattaga taccctggta

720

gtccacgccg taaacggtgg gcactaggtg tgggcaacat tccacgttgt ccgtgccgca

780

gctaacgcat taagtgcccc gcctggggag tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat

840

tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat gtggcttaat tcgacgcaac gcgaagaacc

900

ttaccaaggc ttgacataca ccggaaagct ctggagacag agcccccttg tggtcggtgt

960

acaggtggtg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac

1020

gagcgcaacc cttgtcccgt gttgccagca ggcccttgtg gtgctgggga ctcacgggag

1080

accgccgggg tcaactcgga ggaaggtggg gacgacgtca agtcatcatg ccccttatgt

1140

cttgggctgc acacgtgcta caatggccgg tacaatgagc tgcgataccg cgaggtggag

1200

cgaatctcaa aaagccggtc tcagttcgga ttggggtctg caactcgacc ccatgaagtc

1260

ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcattg ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac

1320

acaccgcccg tcacgtcacg aaagtcggta acacccgaag ccggtggccc aaccccttgt

1380

ggganggagc tgtcgaagtg ggact

1405

<210> 1894

<211> 1441

<212> DNA

<213> Streptomyces sp. SD 534

<400> 1894

cgatgaaccc acttcggtgg gggattagtg gcgaacgggt gagtaacacg tgggcaatct

60

gccctgcact ctgggacaag ccctggaaac ggggtctaat accggatacg accactttag

120

gcatctgatg gtggtggaaa gctccggcgg tgcaggatga gcccgcggcc tatcagcttg

180

ttggtgaggt aacggctcac caaggcgacg acgggtagcc ggcctgagag ggcgaccggc

240

cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca

300

ccatgggcga aagcctgatg cagcgacgcc gcgtgaggga tgacggcctt cgggttgtaa

360

acctctttca gcagggaaga agcgaaagtg acggtacctg cagaagaagc gccggctaac

420

tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gcgcaagcgt tgtccggaat tattgggcgt

480

aaagagctcg taggcggctt gtcgcgtcgg atgtgaaagc ccggggctta accccgggtc

540

tgcattcgat acgggcaggc tagagttcgg taggggagat cggaattcct ggtgtagcgg

600

tgaaatgcgc agatatcagg aggaacaccg gtggcgaagg cggatctctg ggccgatact

660

gacgctgagg agcgaaagcg tggggagcga acaggattag ataccctggt agtccacgcc

720

gtaaacgttg ggaactaggt gtgggcgaca ttccacgttg tccgtgccgc agctaacgca

780

ttaagttccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg

840

cccgcacaag cggcggagca tgtggcttaa ttcgacgcaa cgcgaagaac cttaccaagg

900

cttgacatac accggaaaca cccagagatg ggtgccccct tgtggtcggt gtacaggtgg

960

tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

1020

cccttgtccc gtgttgccag caggcccttg tggtgctggg gactcacggg agaccgccgg

1080

ggtcaactcg gaggaaggtg gggacgacgt caagtcatca tgccccttat gtcttgggct

1140

gcacacgtgc tacaatggcc ggtacaaaga gctgcgatac cgcgaggtgg agcgaatctc

1200

aaaaagccgg tctcagttcg gattggggtc tgcaactcga ccccatgaag tcggagtcgc

1260

tagtaatcgc agatcagcat tgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1320

cgtcacgtca cgaaagtcgg taacacccga agccggtggc ccaacccctt gtgggaggga

1380

gctgtcgaag gtgggactgg cgattgggac gaagtcgtta caaggtagcc gtaccggaag

1440

g

1441

<210> 1895

<211> 1483

<212> DNA

<213> Streptomyces thermoviolaceus

<400> 1895

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gatgaagccc cttcgggggt

60

ggattagtgg cgaacgggtg agtaacacgt gggcaatctg ccctgcactc tgggacaagc

120

cctggaaacg gggtctaata ccggatacga cacagggagg catctcctct gtgtggaaag

180

ctccggcggt gcaggatgag cccgcggcct atcagcttgt tggtgaggta acggctcacc

240

aaggcgacga cgggtagccg gcctgagagg gcgaccggcc acactgggac tgagacacgg

300

cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc

360

agcgacgccg cgtgagggat gacggccttc gggttgtaaa cctctttcag cagggaagaa

420

gcgcaagtga cggtacctgc agaagaagcg ccggctaact acgtgccagc agccgcggta

480

atacgtaggg cgcaagcgtt gtccggaatt attgggcgta aagagctcgt aggcggcttg

540

tcgcgtcggt tgtgaaagcc cggggcttaa ctccgggtct gcagtcgata cgggcaggct

600

agagttcggt aggggagatc ggaattcctg gtgtagcggt gaaatgcgca gatatcagga

660

ggaacaccgg tggcgaaggc ggatctctgg gccgatactg acgctgagga gcgaaagcgt

720

ggggagcgaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacggtgg gcactaggtg

780

tgggcagcat tccacgttgt ccgtgccgta gctaacgcat taagtgcccc gcctggggag

840

tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggcggagcat

900

gtggcttaat tcgacgcaac gcgaagaacc ttaccaaggc ttgacataca ccggaaacat

960

ccagagatgg gtgccccctt gtggtcggtg tacaggtggt gcatggctgt cgtcagctcg

1020

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcccg tgttgccagc

1080

aggcccttgt ggtgctgggg actcacggga gaccgccggg gtcaactcgg aggaaggtgg

1140

ggacgacgtc aagtcatcat gccccttatg tcttgggctg cacacgtgct acaatggccg

1200

gtacaaagag ctgcgatacc gcgaggtgga gcgaatctca aaaagccggt ctcagttcgg

1260

attggggtct gcaactcgac cccatgaagt cggagtcgct agtaatcgca gatcagcatt

1320

gctgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacgtcac gaaagtcggt

1380

aacacccgaa gccggtggcc caaccccttg tgggagggag ctgtcgaagg tgggactggc

1440

gattgggacg aagtcgtaac aaggtagccg taccggaagg tgc

1483

<210> 1896

<211> 1368

<212> DNA

<213> Subdoligranulum variabile

<220>

<221> modified_base

<222> (23)..(23)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (25)..(25)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (44)..(44)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1320)..(1320)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1896

gttatttcgg ttgaagtttt cgnanggata ctggtttaac ttantggcga acgggtgagt

60

aacgcgtgag taacctgccc tggagtgggg gacaacagtt ggaaacgact gctaataccg

120

cataagccca cggtccggca tcggattgag ggaaaaggat ttattcgctt caggatggac

180

tcgcgtccaa ttagctagtt ggtgaggtaa cggcccacca aggcgacgat tggtagccgg

240

actgagaggt tgaacggcca cattgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

300

gcagtggggg atattgcaca atgggggaaa ccctgatgca gcgacgccgc gtggaggaag

360

aaggttttcg gattgtaaac tcctgtcgtt agggacgaat cttgacggta cctaacaaga

420

aagcaccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaaaacg tagggtgcaa gcgttgtccg

480

gaattactgg gtgtaaaggg agcgcaggcg gaccggcaag ttggaagtga aatctatggg

540

ctcaacccat aaattgcttt caaaactgct ggccttgagt agtgcagagg taggtggaat

600

tcccggtgta gcggtggaat gcgtagatat cgggaggaac accagtggcg aaggcgacct

660

actgggcacc aactgacgct gaggctcgaa agcatgggta gcaaacagga ttagataccc

720

tggtagtcca tgccgtaaac gatgattact aggtgttgga ggattgaccc cttcagtgcc

780

gcagttaaca caataagtaa tccacctggg gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg

840

aattgacggg ggcccgcaca agcagtggag tatgtggtta ttcgaagcaa cgcgaagaac

900

cttaccaggt cttgacatcc gatgcataat gcagatatgc atgaagtcct tcgggacatc

960

gagacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1020

aacgagcgca acccttattg ccagttacta cgcaagagga ctctggcgag actgccgttg

1080

acaaaacgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccctttatga cctgggctac

1140

acacgtacta caatggcgtt taacaaagag aagcaagacc gcgaggtgga gcaaaactca

1200

aaaacaacgt ctcagttcag attgcaggct gcaactcgcc tgcatgaagt cggaattgct

1260

agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccn

1320

tcacaccatg agagccgggg ggacccgaag tcggtagtct aaccgcaa

1368

<210> 1897

<211> 1514

<212> DNA

<213> Succinatimonas hippei

<400> 1897

tgaagagttt gatcatggct cagattgaac gctggcggca ggcttaatac atgcaagtcg

60

aacggtaaca tagcgaaagc ttgcttttgc tgatgacgag tggcggacgg gtgagtagta

120

tctgggaaac tgccctgaag agggggacaa cagctggaaa cggctgctaa taccgcataa

180

accctgcggg ggaaaggaag gcaacttccg cttcaggatg tgcccagaag ggattagcta

240

gtaggtgagg taaaggctca cctaggcgac gatctctagc cggtctgaga ggatgaccgg

300

ccacatcggg actgagacac ggcccggact cctacgggag gcagcagtag ggaatattgc

360

acaatggggg gaaccctgat gcagccatgc cgcgtgtgtg aagaaggcct tcgggttgta

420

aagcactttc agcggggagg aaattaagtt agacgttacc cgcagaagaa gcaccggcta

480

actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga gggtgcgagc gttaatcgga ataactgggc

540

gtaaagggca cgcaggcggg ctgataagta aggtgtgaaa taccggggct caacctcggg

600

gctgcatttt aaactgtcag tctagagtat tgcagaggga gacggaattc cgggtgtagc

660

ggtgaaatgc gtagatatcc ggaagaacac cggaggcgaa ggcggtcttc tgggcaaata

720

ctgacgctca ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg

780

ccgtaaacga tgtcgattag gagattgagc agaagcttgg ttttcggagc aaacgcgcta

840

aatcgaccgc ctggggagta cggccgcaag gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc

900

gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gatgcaacgc gaagaacctt acctgacctt

960

gacatctgag gaatgcctga gagatttagg cagtgccttc gggagcctca agacaggtgc

1020

tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

1080

cccttgtcct ttgttgccag cgcgtgatgg cgggaactca aaggagactg ccggtgacaa

1140

accggaggaa ggcagggatg acgtcaagtc atcatggccc ttacggtcag ggctacacac

1200

gtgctacaat ggggcgtaca gagggaagcg aggccgtgag gcggagcgga gcccacaaag

1260

cgtcccacag ttcggattgg agtctgcaac tcgactccat gaaggcggaa tcgctagtaa

1320

tcgcaaatca gaatgttgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca

1380

ccatgggagt ggattgcacc agaagtggct tgcctaaccc gtaagggagg gcggttacca

1440

cggtgtggtt tatgactggg gtgaagtcgt aacaaggtaa ccctagggga acctggggtt

1500

ggatcacctc ctta

1514

<210> 1898

<211> 1391

<212> DNA

<213> Sutterella morbirenis

<400> 1898

cacatgcaag tcgaacggca gcacgaggag cttgctcctt ggtggcgagt ggcgcacggg

60

tgagtaatat atcggaacgt gtcctattgt gggggataac tagccgaaag gttagctaat

120

accgcataag acctgagggt gaaagcgggg gatcttcgga cctcgcgcag ttggagcggc

180

cgatagccga ttagctagtt ggtagggtaa tggcctacca aggcaacgat cggtagctgg

240

tctgagagga cgaccagcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

300

gcagtgggga attttggaca atgggggcaa ccctgatcca gccatgccgc gtgcaggatg

360

aaggtcttcg gattgtaaac tgcttttgtc agggaagaaa agtttagagc gaataactct

420

gaatgctgac ggtacctgaa gaataagcac cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa

480

tacgtagggt gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa agcgtgcgca ggcggttctg

540

taagatgggt gtgaaagccc cgggctcaac ctgggaattg cattcatgac tgcaggacta

600

gagttcacca gaggggggtg gaattccaag tgtagcagtg aaatgcgtag atatttggaa

660

gaacaccgat ggcgaaggca gccccctggg gtgcgactga cgctcatgca cgaaagcgtg

720

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccct aaacgatgtc tactggttgt

780

tggggattta tatccttggt aacgaagcta acgcgtgaag tagaccgcct ggggagtacg

840

gtcgcaagat taaaactcaa aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gatgatgtgg

900

attaattcga tgcaacgcga aaaaccttac ctagccttga catgtcgaga atcccgaaga

960

gatttgggag tgcccgcaag ggaattcgaa cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg

1020

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcatt agttgctacg

1080

caagagcact ctaatgagac tgccggtgac aaaccggagg aaggcaggga tgacgtcaag

1140

tcctcatggc ccttatggct agggcttcac acgtcataca atggtcggaa cagagggcag

1200

cgaagccgcg aggtggagcc aatcccagaa aaccgatcgt agtccggatt ggagtctgca

1260

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac

1320

gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtggggttca ccagaagacg

1380

ttagtttaac c

1391

<210> 1899

<211> 1489

<212> DNA

<213> Sutterella parvirubra

<400> 1899

attgaacgct ggcggcatgc tttacacatg caagtcgaac ggcagcacag ggagcttgct

60

cccgggtggc gagtggcgca cgggtgagta agacatcgga acgtgtcctc ttgtggggga

120

taactacccg aaagggtggc taataccgca taagtcctga gggagaaagc gggggatctt

180

cggacctcgc gcgagaggag cggccgatgg ccgattagct agttggtgag gtaaaggctc

240

accaaggcga cgatcggtag ctggtctgag aggacgacca gccacactgg gactgagaca

300

cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaattttg gacaatgggc gaaagcctga

360

tccagccatg ccgcgtgtgg gatgaaggcc ttcgggttgt aaaccacttt tgtcagggac

420

gaaaaggttc aggcyaatac cttgaactgc tgacggtacc tgaagaataa gcaccggcta

480

actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc

540

gtaaagcgtg cgcaggcggt tctgtaagat agatgtgaaa tccccgggct taaccttgga

600

attgcattta tgactgcagg actcgagttt gtcagagggg ggtggaattc caagtgtagc

660

agtgaaatgc gtagatattt ggaagaacac cgatggcgaa ggcagccccc tgggacatga

720

ctgacgctca tgcacgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg

780

ccctaaacga tgtctactgg ttgttgggga cgatttggtc cttggtaacg aagctaacgc

840

gtgaagtaga ccgcctgggg agtacggtcg caagattaaa actcaaagga attgacgggg

900

acccgcacaa gcggtggatg atgtggatta attcgatgca acgcgaaaaa ccttacctag

960

ccttgacatg tcggaaagct ctgagagatc ggagygtgcc cgcaagggaa tccgaacaca

1020

ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1080

cgcaaccctt gtcactagtt gctacgaaag ggcactctag tgagactgcc ggtgacaaac

1140

cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcct catggccctt atggctaggg cctcacacgt

1200

catacaatgg tcggaacaga gggcagcgaa gccgcgaggt ggagcaaatc ccagaaaacc

1260

gatcgtagtc cggattgcag tctgcaactc gactgcatga agtcggaatc gctagtaatc

1320

gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc

1380

atgggagtgg ggttcaccag aagacgtttg tctaaccgca aggaggacgg cgtccacggt

1440

gggtttcatg actggggtga agtcgtaaca aggtagccgt accggaagg

1489

<210> 1900

<211> 1457

<212> DNA

<213> Sutterella sanguinus

<400> 1900

attgaacgct ggcggcatgc tttacacatg caagtcgaac ggcagcacga ggagcttgct

60

ccttggtggc gagtggcgca cgggtgagta atatatcgga acgtgtccta ttgtggggga

120

taactagccg aaaggttagc taataccgca taagacctga gggtgaaagc gggggatctt

180

cggacctcgc gcagttggag cggccgatag ccgattagct agttggtagg gtaatggcct

240

accaaggcaa cgatcggtag ctggtctgag aggacgacca gccacactgg gactgagaca

300

cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaattttg gacaatgggg gcaaccctga

360

tccagccatg ccgcgtgcag gatgaaggtc ttcggattgt aaactgcttt tgtcagggaa

420

gaaaagttta gagcgaataa ctctgaatgc tgacggtacc tgaagaataa gcaccggcta

480

actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc

540

gtaaagcgtg cgcaggcggt tctgtaagat gggtgtgaaa gccccgggct caacctggga

600

attgcattca tgactgcagg actagagttc accagagggg ggtggaattc caagtgtagc

660

agtgaaatgc gtagatattt ggaagaacac cgatggcgaa ggcagccccc tggggtgcga

720

ctgacgctca tgcacgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg

780

ccctaaacga tgtctactgg ttgttgggga tttatatcct tggtaacgaa gctaacgcgt

840

gaagtagacc gcctggggag tacggtcgca agattaaaac tcaaaggaat tgacggggac

900

ccgcacaagc ggtggatgat gtggattaat tcgatgcaac gcgaaaaacc ttacctagcc

960

ttgacatgtc gagaatcccg aagagatttg ggagtgcccg caagggaatt cgaacacagg

1020

tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1080

caacccttgt cattagttgc tacgcaagag cactctaatg agactgccgg tgacaaaccg

1140

gaggaaggca gggatgacgt caagtcctca tggcccttat ggctagggct tcacacgtca

1200

tacaatggtc ggaacagagg gcagcgaagc cgcgaggtgg agccaatccc agaaaaccga

1260

tcgtagtccg gattggagtc tgcaactcga ctccatgaag tcggaatcgc tagtaatcgc

1320

ggatcagcat gccgcggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat

1380

gggagtgggg ttcaccagaa gacgttagtt taaccgcaag gaggacgacg tccacggtgg

1440

gcttcatgac tggggtg

1457

<210> 1901

<211> 1320

<212> DNA

<213> Sutterella sp. YIT 12072

<400> 1901

attgaacgct ggcggcatgc cttacacatg caagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta

60

atacatcgga acgtgtccgt ttgtggggga caaccagccg aaaggttggc taataccgca

120

taaggaaagg cgcagacgga gcggccgatg attgattagc ttgttggcgg ggtaaaggcc

180

caccaaggcg acgatcaata gctggtctga gaggacgacc agccacactg gaactgagac

240

acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatttt ggacaatggg ggcaaccctg

300

atccagccat gccgcgtgcg ggaagaaggc cttcgggttg taaaccgctt ttgtcaggga

360

cgatgacggt acctgaagaa taagcaccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

420

gtagggtgca agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gtgcgcaggc ggttgggtaa

480

gacagatgtg aaatccccgg gcttaacctg ggaactgcat ttgtgactgt ccgactggag

540

tacgtcagag gggggtggaa ttccgcgtgt agcagtgaaa tgcgtagata tgcggaagaa

600

caccgatggc gaaggcagcc ccctgggacg actgacgctc atgcacgaaa gcgtggggag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccctaaacg atgtctgccg gttgttgggg

720

cttcagtaac gaagctaacg cgtgaagcag accgcctggg gagtacggtc gcaagattaa

780

aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggat gatgtggatt aattcgatgc

840

aacgcgaaaa accttaccta gccttgacat gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtcat cagttgctac

960

ggcactctga tgagactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcct

1020

catggccctt atggctaggg cctcacacgt catacaatgg tcggcagagg gcagcgaagc

1080

cgcgaggtga agccaatccc agccgatcgt agtccggatg cagtctgcaa ctcgactgca

1140

gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt tcccgggtct

1200

tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt ggggttcacc agaaggcgtt gcccaaggcg

1260

gcgcccacgg tgggtttcat gactggggtg aagtcgtaac aaggtagtcg taccggaagg

1320

<210> 1902

<211> 1455

<212> DNA

<213> Sutterella stercoricanis

<400> 1902

ggcggcatgc tttacacatg caagtcgaac ggcagcacag ggagcttgct cctgggtggc

60

gagtggcgca cgggtgagta atacatcgga acgtgtccta ttgtggggga taactgtcgg

120

aaagggtggc taataccgca taagacctga gggtgaaagc gggggatcgc aagacctcgc

180

gcaattggag cggccgatgc ccgattagct agttggtgag gtaatagctt accaaggcga

240

cgatcggtag ctggtctgag aggacgacca gccacactgg gactgagaca cggcccagac

300

tcctacggga ggcagcagtg gggaattttg gacaatgggg gcaaccctga tccagccatg

360

ccgcgtgcag gatgaaggtc ttcggattgt aaactgcttt tgtcagggac gaaaaggatt

420

gtgctaatac catgatctgc tgacggtacc tgaagaataa gcaccggcta actacgtgcc

480

agcagccgcg gtaatacgta gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgtg

540

cgcaggcggt tctgtaagac agatgtgaaa tccccgggct caacctggga attgcatttg

600

tgactgcagg actagagttc atcagagggg ggtggaattc caagtgtagc agtgaaatgc

660

gtagatattt ggaagaacac caatggcgaa ggcagccccc tgggatgcga ctgacgctca

720

tgcacgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccctaaacga

780

tgtctactgg ttgttgggga ttaatatcct tggtaacgaa gctaacgcgt gaagtagacc

840

ccctggggag agcggtcgca agattaaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc

900

ggtggatgat gtggattaat tcgatgcaac gcgaaaaacc ttacgtagcc ttgacatgcc

960

aggaatcctg aagagatttg ggagtgcccg caagggaatc tggacacagg tgctgcatgg

1020

ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt

1080

cattagttgc tacgcaagag cactctaatg agactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg

1140

gggatgacgt caagtcctca tggcccttat ggctagggcc tcacacgtca tacaatggtc

1200

ggaacagagg gcagcgaagc cgcgaggtgg agcaaatccc agaaaaccga tcgtagtccg

1260

gattgcagtc tgcaactcga ctgcatgaag tcggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat

1320

gccgcggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggg

1380

ttcaccagaa gacgtttgtc taaccgtaag gaaggacggc gtccacggtg ggtttcatga

1440

ctggggtgaa gtcgt

1455

<210> 1903

<211> 1537

<212> DNA

<213> Sutterella wadsworthensis

<400> 1903

ttgaactaaa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgctg gcggcatgct ttacacatgc

60

aagtcgaacg gcagcgcggg gagcttgctc cctggcggcg agtggcgcac gggtgagtaa

120

tacatcggaa cgtgtcttct agtgggggat aactgcccga aagggcagct aataccgcat

180

gagacctgag ggtgaaagcg ggggatcgca agacctcgcg ctggaagagc ggccgatgtc

240

cgattagcta gttggtgagg taaaggctca ccaaggcgac gatcggtagc tggtctgaga

300

ggacgaccag ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg

360

ggaattttgg acaatggggg caaccctgat ccagccatgc cgcgtgcagg atgaaggtct

420

tcggattgta aactgctttt gtcagggacg aaaagggatg cgataacacc gcattccgct

480

gacggtacct gaagaataag caccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

540

ggtgcaagcg ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgtgc gcaggcggtt ctgtaagata

600

gatgtgaaat ccccgggctc aacctgggaa ttgcatatat gactgcagga cttgagtttg

660

tcagaggagg gtggaattcc acgtgtagca gtgaaatgcg tagatatgtg gaagaacacc

720

gatggcgaag gcagccctct gggacatgac tgacgctcat gcacgaaagc gtggggagca

780

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cctaaacgat gtctactagt tgttggggac

840

gatagtcctt ggtaacgcag ctaacgcgtg aagtagaccg cctggggagt acggtcgcaa

900

gattaaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggatgatg tggattaatt

960

cgatgcaacg cgaaaaacct tacctagcct tgacatgcca ggaaggtctg agagatcagg

1020

ccgtgcccgc aagggaatct ggacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1080

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc attagttgct acgaaagggc

1140

actctaatga gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcctcat

1200

ggcccttatg gctagggcct cacacgtcat acaatggtcg gaacagaggg aagcgaagcc

1260

gcgaggtgaa gccaatccca gaaaaccgat cgtagtccgg attgcagtct gcaactcgac

1320

tgcatgaagt cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg

1380

ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtggggt tcaccagaag acgtttgccc

1440

aaccgaaagg aaggcggcgt ccacggtggg cttcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1500

tagccgtacc ggaaggtgcg gctggatcac ctccttt

1537

<210> 1904

<211> 1328

<212> DNA

<213> Synergistes genomosp. C1

<400> 1904

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagttgagc gagcagcgga cgggtgagta

60

aagcacaagg acttgtccga aagagaggga cacctgcggg aaaccggagc taatacctaa

120

taaaaaaggc gcttttggag agacttgtgt cctatcaggc agttggtgag gtaacggctc

180

accaaaccga agacgggtag ccggactgag aggtcgaccg gccacattgg aactgagaga

240

cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg ggcaatgggc gcaagcctga

300

cccagcgacg ccgcgtgagg gaagacagcc ttcgggttgt aaacctctgt tgcaggggaa

360

gatgacggta ccctgcgagg aagctccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg

420

tagggagcga gcgttgtccg gaattactgg gcgtaaaggg cgcgtaggcg gcgcttcaag

480

tcgtctgtca aaagccgagg ctcaacctcg gtgcgcagac gaaactggag agcttgagaa

540

gcagagaggc aaacagaatt cctggtgtag cggtgaaatg cgtagatatc aggaagaata

600

ccagtggcga aggcggtttg ctggctgctc taacgctgaa gcgcgaaagc caggggagca

660

aacgggatta gataccccgg tagtcctggc agtaaacgat gtatgctggg tgtgggacgt

720

tccgtgccga agttgacgcg ataagcatac cgcctgggga gtacggtcgc aagattgaaa

780

ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca cgtggtttaa ttcgatgcaa

840

accgaagaac cttacctgga cttgacatca acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt

900

gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctattgccg gttgctacca

960

gctgagcact ccggcgagac tgccatcgac aagatggagg aaggtgggga cgacgtcaag

1020

tcatcatggc ccatatgtcc agggcgacac acatgctaca atggatggca gagagaagcg

1080

agaccgaaag gagaagcaga tcccaaccat ccccagttcg gatgcagtct gcaactcgac

1140

tgcagaagtt ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagccaag ccgcggtgaa tacgttcccg

1200

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatc cgagtcgggt gctctcaaag ccggagccta

1260

aggatccgcc taaagagtgt ccggtgaggg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtacgg

1320

gaacgtgc

1328

<210> 1905

<211> 1412

<212> DNA

<213> Synergistes sp. RMA 14551

<400> 1905

tggcgaacga agacctagag gagcttgctt taatatggtt ttagtggcgg acgggtgagt

60

aacgcgtgag gacttgtcga gtacaggggg acaacaggtg gaaacgtctg ctaatacccc

120

ataagccttc gggtaaaagg agcgatccgg tacacgagag acttgtgtcc tatcagctag

180

taggtggggt aacgagccca cccaggccaa gacggatagc cggactgaga ggtcgatcgg

240

ccacactgga actgagacac ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg

300

gcaatggggg caaccctgac ccagcgacgc cgcgtgagkg aagamakccy tcgggwtgta

360

aamctctgtt gcwgtgggaa gataggacgt gacggtacca ctrcgaggaa gccccggcaa

420

actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggagcgagc gttatccgga attactgggc

480

gtaaagcggc gcgtaggctg gtgttcaagt cgttcgttaa atattgaggc ttaacctcaa

540

ggagctggcc gaaactgaga cactggagac acagagaggc aaacagaatt cctggtgtag

600

cggtgaaatg cgtagatatc aggaagaata ccggtggcga aggcggtttg cttggatgtg

660

atctgacgct tgaagcgcga aagccggggg agcgaacggg attagatacc ccggtagtcc

720

cggcagtaaa ctgatgtatg ctgggtgtgg ccgtagcgat acagccgtgc cgaagttaac

780

gcgataagca taccgcctgg ggagtactgg tcgcaagatt gaaactcaaa ggaattgacg

840

ggggcccgca caagcggtgg agcacgtggt ttaattcgat gcaaaccgaa gaaccttacc

900

tggacttgac atacacgtag tagcgaatcg aaagaggagc gaggatgtag caatacattc

960

agcgtgaaca ggtgctgcat ggcttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1020

cccgcaacga gcgcaacccc ttgttgccgg ttgctaacgc gcaaaggcga gcactccggc

1080

gagactgcca tcgacaagat ggaggaaggt ggggacgacg tcaagtcatc atggccctta

1140

tgtccagggc gacacacatg ctacaatggc tggtacagag agaagcgaag ccgagaggcc

1200

gagcagatcc catcaaagcc agtcccagtt cggattgcag tctgcaactc gactgcatga

1260

agttggaatc gctagtaatc gcggatcagc caagccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt

1320

gtacacaccg cccgtcacac catccgagtt gggtgctctc gaagtcggag gcttaaccgc

1380

aaggaaaaga tccgcctaaa gagtgtccgg tg

1412

<210> 1906

<211> 1432

<212> DNA

<213> Synergistetes bacterium ADV897

<400> 1906

gaagcgacgc tggcggcgtg cctaacacat gcaagttgag cggagagttt tcgaagaaga

60

cttcggttgg aattggaaac gatcagcagc ggacgggtga gtaaagcaca aggacgtatc

120

cttttgaggg ggacaactgc gggaaaccgg agctaatagc ccataagccg agaggtgaaa

180

gcgcgcaagc gcgcaagagg agcgacttgt gtcctatcag gcagttggtg aggtaagagc

240

tcaccaaacc gaagacgggt agccggactg agaggttgta cggccacatt ggaactgaga

300

gacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgggcaatgg gggcaaccct

360

gacccagcga cgccgcgtga gggaagacag ccttcgggtt gtaaacctct gttgcagggg

420

aagaaggacg tgacggtacc ctgcgaggaa gctccggcta actacgtgcc agcagccgcg

480

gtaatacgta gggagcgagc gttatccgga attactgggc gtaaagggcg cgtaggcggt

540

gtttcaagtc gttcgttaaa tattgaggct taacctcaag gagcggccga aactgagaca

600

ctggagacac agagaggcaa acagaattcc tggtgtagcg gtgaaatgcg tagatatcag

660

gaagaatacc ggtggcgaag gcggtttgct ggatgtgatc tgacgctgaa gcgcgaaagc

720

cgggggagcg aacgggatta gataccccgg tagtcccggc agtaaacgat gtatgctggg

780

tgtggccgta gcgatacagc cgtgccgaag ttaacgcgat aagcataccg cctggggagt

840

acggtcgcaa gattgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcacg

900

tggtttaatt cgatgcaaac cgaagaacct tacctggact tgacatacac gtagtagcga

960

atcgaaagag gagcgaggat gtatcaatgc attcagcgtg aacaggtgct gcatggctgt

1020

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctgttgcc

1080

ggttgctaac gcgcaaaggc gagcactccg gcgagactgc catcgacaag atggaggaag

1140

gtggggacga cgtcaagtca tcatggcccc tatgtccagg gcgacacaca tgctacaatg

1200

gctggtacag agagaagcga agccgagagg ccgagcagat cccatcaaag ccagtcccag

1260

ttcggattgc agtctgcaac tcgactgcat gaagttggaa tcgctagtaa tcgcggatca

1320

gccaagccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatccgag

1380

ttgggtgctc tcgaagtcgg aggcttaacc gcaaggaaag atccgcctaa ag

1432

<210> 1907

<211> 1447

<212> DNA

<213> Synergistetes bacterium LBVCM1157

<400> 1907

cccggacgac gctggcggcg tgcctaacac atgcaagtcg aacgaaatta cgaagaaagc

60

ttgctttaat cgtaatttag tggcggacgg gtgagtaacg cgtgaggact tgtcggatac

120

agggggacaa cagatggaaa cgtctgctaa taccccataa gccttcgggt aaaaggagca

180

atccggtatt tgagagactc gcgttctatc agctagtagg tggggtaacg gcccacctag

240

gccaagacgg atagccggac tgagaggtcg accggccaca ctggaactga gagacggtcc

300

agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgggcaat gggggcaacc ctgacccagc

360

gacgccgcgt gggtgaagaa atccttcggg atgtaaagcc ctgttgtgtg ggaagataat

420

gacggtacca cacgaggaag ccccggcaaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

480

ggggcaagcg ttgttcggaa ttactgggcg taaagcgcac gcaggctgac cgttaagtct

540

gtcgtcaaag gcggaggctc aacctccgtt ctacgataga tactgtcggt ctagagtatg

600

tgagagggaa gtggaattcc cggtgtagcg gtgaaatgcg tagatatcgg gaggaacacc

660

agtggcgaag gcggcttcct ggcacacaac tgacgctcat gtgcgaaagc cagggcagcg

720

aacgggatta gataccccgg tagtcctggc cgtaaacgat ggatactggg tgtgggtgaa

780

gcagttcatc cgtgccgtag ttaacgcgtt aagtatcccg cctggggact acggtcgcaa

840

gactgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcacg tggtttaatt

900

cgatgcaaac cgaagaacct tacctgggtt tgacatacaa gtggtactga gatgaaagtt

960

gagggactgt agcttgctac agagcttgaa caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg

1020

tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ctatgtccag ttgctaacaa

1080

gtgaagttga gcactctgga gagactgccg ccgacaaggc ggaggaaggt ggggatgacg

1140

tcaagtcatc atggccttta tgcccagggc gacacacgtg ctacaatggc cggcacagaa

1200

ggcagcttgc tagtgatagt tggcgaatcc ttaaaagccg gtcccagttc ggattgtagt

1260

ctgcaacccg actacatgaa gccggaatcg ctagtaatcg cagatcagcc aagctgcggt

1320

gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc acccgagttg ggggcacccg

1380

atagccgcag gctataaccg cagtaaggga aagaagcgtc taaggtgcgc gcgagtaaca

1440

gcatctc

1447

<210> 1908

<211> 1474

<212> DNA

<213> Synergistetes bacterium oral clone 03 5 D05

<400> 1908

gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtagaac gctgaaggaa ggagcttgct

60

ctttccggat gagttgcgaa cgggtgagta acgcgtaggt aacctgcctg gtagcggggg

120

ataactattg gaaacgatag ctaataccgc ataatagcag ttattgcatg ataactgttt

180

gaaaggtgca aatgcatcac taccagatgg acctgcgttg tattagctag ttggtgaggt

240

aacggctcac caaggcgacg atacatagcc gacctgagag ggtgatcggc cacactggga

300

ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatcttcgg caatggacgg

360

aagtctgacc gagcaacgcc gcgtgagtga agaaggtttt cggatcgtaa agctctgttg

420

taagagaaga acgagtgtga gagtggaaag ttcacactgt gacggtatct taccagaaag

480

ggacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtcccgagcg ttgtccggat

540

ttattgggcg taaagcgagc gcaggcggtt agataagtct gaagttaaag gctgtggctt

600

aaccatagta cgctttggaa actgggagac ttgagtgcag aagaggagag cggaattcca

660

tgtgtagcgg tgaaatgcgt agatatatgg aggaacacca gtggcgaagg cggctctctg

720

gtctgtaact gacgccgagg ctcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt

780

agtccatgcc gtaaacgttg ggcactaggt gtgggggaca ttccacgttt tccgcgccgt

840

agctaacgca ttaagtgccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa

900

ttgacggggg cccgcacaag cggcggagca tgcggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac

960

cttaccaagg cttgacatgc attagatcgc gtcagagatg gcgtttccct tcggggctgg

1020

tatacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc

1080

aacgagcgca accctcgttc tatgttgcca gcacgtgatg gtggggactc ataggagact

1140

gccggggtca actcggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgtctt

1200

gggcctcacg catgctacaa tggccggtac agagggttgc gatactgtga ggtggagcta

1260

atccctaaaa gccggtctca gttcggattg gggtctgcaa ctcgacccca tgaagtcgga

1320

gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1380

ccgcccgtca agtcacgaaa gttggtaaca cccgaagccg gtggcctaac cctggtgggg

1440

ggagccgtcg aaggtgggac tggcgattgg gact

1474

<210> 1909

<211> 1453

<212> DNA

<213> Synergistetes bacterium oral taxon 362

<400> 1909

gatgaacgct ggcggcgtgc gtaacacatg caagttggac gacgatgcca tgaagtggta

60

acacggaatg gtatacggag tagcggacgg gtgagtaaaa catgaggagc tgtcctgttg

120

agggggataa cgttcggaaa cggaccctaa taccccatag gccgagaggt taaaggcaga

180

gatgcgcgac aggaggcact cgtgtcctat cagctggttg gtgaggtaac ggctcaccaa

240

ggcgacgacg ggtagccggc ctgagagggt gaccggccac actggaactg agacacggtc

300

cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgggcaa tgggaggaat cctgacccag

360

cgacgccgcg tgaacgaaga cggccttcgg gttgtaaagt tcttttatgt gggaagaatg

420

aagtgacggt accacatgaa taagccccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

480

gtagggggcg agcgttgtcc ggaattactg ggcgtaaagg gcacgcaggc tgtgcttcaa

540

gtcagctgta aaaggatgcg gcttaaccgt gttatgcagt tgagactgag gtgctggaat

600

accggagagg caagtggaat tcccagtgta gcggtgaaat gcgtagatat tgggaagaac

660

atcggtggcg aaggcgactt gctggacggt aactgacgct gaggtgcgaa agccagggta

720

gcgaacggga ttagataccc cggtagtcct ggccgtaaac gatgaatgct aggtgtgcga

780

gcagagatgt tggtgtgccg cagttaacgc gataagcatt ccgcctgggg agtacggtcg

840

caagattgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc acgtggttta

900

attcgatgca aaccgaagaa ccttacctgg gtttgacatg tatgtggtag gagatggaaa

960

cattgacgac gctgctttcg ggcagtgagc atacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc

1020

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccctgcg attagttgcc

1080

agcgagttaa gtcgggcact ctaatgggac tgccatcgac aagatggagg aaggtgggga

1140

tgacgtcaag tcatcatggc ccttatgtcc agggcgacac acgtgctaca atggccggta

1200

cagagggaag cgaggctgtg aggttgagcg gatcccataa agccggtctc agtccggatt

1260

gaagtctgca attcgacttc atgaagctgg aatcgctagt aatcgcagat cagccaagct

1320

gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacccg agccgggtgt

1380

acccgaagcc ggtggcctaa ccttatggga ggagccgtcg aaggtgtgtc tggtgaggag

1440

ggtgaagtcg taa

1453

<210> 1910

<211> 1337

<212> DNA

<213> Synergistetes bacterium oral taxon D48

<400> 1910

gatgaacgct ggcggcgtgc gtaacacatg caagttgaac gacggtgcca tgaagtggta

60

acacggagtg gtatacggag tagcggacgg gtgagtaaag catgagaatc tgtcctgtcg

120

agggggatag cgttcggaaa cggaccctaa taccccatag tccgagaggt taaaggcagc

180

gatgcgcggc aggaggagct cgtgtcctat cagctggttg gtgaggtaac ggctcaccaa

240

ggcaacgacg ggtagccggc ctgagagggt gaccggccac actggaactg agaaacggtc

300

cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgggcaa tgggaggaat cctgacccag

360

cgacgccgcg tgaacgaaga cggccttcgg gttgtaaagt tcttttatgt gggaagaagg

420

aagtgacggt accacatgaa taagccccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

480

gtagggggcg agcgttgtcc ggaattactg ggcgtaaagg gcacgcaggc tgtgcttcaa

540

gtcagctgta aaaggatgcg gcttaaccgt gttatgcggc tgagactgag gtgctggagt

600

accggagagg caagtggaat tcccagtgta gcggtgaaat gcgtagatat tgggaagaac

660

atcggtggcg aaggcgactt gctggacggt aactgacgct gaggtgcgaa agccagggta

720

gcgaacggga ttagataccc cggtagtcct ggccgtaaac gatgaatgct aggtgtgcga

780

gcagagatgt tggtgtgccg cagttaacgc gataagcatt ccgcctgggg agtacggtcg

840

caagattgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

900

attcgatggt acgcgaggaa ccttacctgg gtttgacata gtatctgatg ccgtagagat

960

acggcagcgt agcaatacga ggtacaacgg gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg

1020

tgagatgtta ggttaagtcc tgcaacgagc gcaaccctcg tcgtatattg ccagcggttc

1080

ggccgggcac tctggcagga ctgccatcga caagattgga ggaaggtggg gatgacgtca

1140

gtcatcatgg cccatatgtc cagggcgaca cacgtgctac aatgggcggt acagagggaa

1200

gcgacactgc gaggtgaagc ggatcccatt aaagccgctc tcagttcgga ttgaagtctg

1260

caattcgact tcatgaagtt ggaatcgcta gtaatcgcag atcagccaag ctgcggtgaa

1320

tccgttcccg ggccttg

1337

<210> 1911

<211> 1535

<212> DNA

<213> Syntrophococcus sucromutans

<400> 1911

agagtttgat catggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgagc

60

gaagcacttt tgatttcttc ggattgaagg agtgactgag cggcggacgg gtgagtaacg

120

cgtggggaac ctgccccata ccgggggata acagttggaa acgactgcta ataccgcata

180

agcgcacagg aaggcatctt ccagtgtgaa aaactccggt ggtatgggat ggacccgcgt

240

tggattagcc agttggtggg gtaacggcct accaaagcga cgatccatag ccggcctgag

300

agggcgaccg gccacattgg gactgagaca cggcccaaac tcctacggga ggcagcagtg

360

gggaatattg cacaatgggg gaaaccctga tgcagcgacg ccgcgtgagt gatgaagtat

420

ttcggtatgt aaagctctat cagcagggaa gaagacgacg gtacctgact aagaagcccc

480

ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggggg caagcgttat ccggatttac

540

tgggtgtaaa gggagcgcag acggcagtgc aagtctgaag tgaaaacccg aggctcaacc

600

acgggattgc tttggaaact gtacagctag agtgtcggag gggtaagcgg aattcctagt

660

gtagcggtga aatgcgtaga tattaggagg aacaccggtg gcgaaggcgg cttactggac

720

gataactgac gttgaggctc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt

780

ccacgcggta aacgatgaat actaggtgtt ggcacgcaag gcgtgtcggt gccgccgcaa

840

acgcattaag tattccacct ggggagtacg ttcgcaagaa tgaaactcaa aggaattgac

900

ggggacccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac

960

caagtcttga catccgcctg accggccggt aacgcggccc ttccttcggg acaggcgaga

1020

caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc ttatcctcag tagccagcac gaaaggtggg cactctgggg agactgccag

1140

ggagaacctg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gatttgggct

1200

acacacgtgc tacaatggcg tgaacagagg gaagcgaagg ggcgatccgg agcaaatctc

1260

aaaaaacacg tcccagttcg gactgcaggc tgcaacccgc ctgcacgaag ctggaatcgc

1320

tagtaatcgc agatcagaat gctgcggtga atatgttccc gggtcttgta cacaccgccc

1380

gtcacaccat gggagtcggt aatgcccgaa gcctgtgacc caaccagcaa tggagggagc

1440

agtcgaaggc agggccggtg actggggtga agtcgtaaca aggtagccgt atcggaaggt

1500

gcggctggat cacctcctta agcttggtac ccggg

1535

<210> 1912

<211> 1295

<212> DNA

<213> Syntrophomonadaceae genomosp. P1

<400> 1912

acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg agtggcgaac gggtgagtaa

60

cgcatgagta atctgcccat aagcggggga taccaaatgg aaacatttgc taataccgca

120

tacggaaagc cacttatgga tgagctcgcg tctgattagc tggttggcag ggtaaaggcc

180

taccaaggca acgatcagta gccggcctga gagggtgacc ggccacactg ggactgagac

240

acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcgcaatggg ggaaaccctg

300

acgcagcgac gccgcgtgag cgaagaaggc cttagggttg taaagctctg ttttaaggga

360

cgaagacggt accttaagag gaagccccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaagac

420

gtagggggcg agcgttgtcc ggaatcactg ggtgtaaagg gcacgcaggc gggtgtttaa

480

gtcattcgtg aaataccgca gcttaactgc ggggttgcga gtgaaactgg aaatcttgag

540

ggcaagagag gacagtagaa ttcctggtgt agcggtgaaa tgcgtagaaa tcaggaggaa

600

taccggtggc gaaggcgact gtctggattg cctgacgctg aggtgcgaaa gcgtgggtag

660

caaacaggat tagataccct ggtagtctac gctgtaaacg atggatacta ggtgtaggag

720

cttctgtgcc ggagcaaacg caataagtat cccacctggg gagtacgatc gcaaggttga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtgagc atgtggttta attcgatgca

840

acgcgaagaa ccttaccagg tcttaacatc gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

900

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctgccatt agttactaac

960

aattgaggac tctaatggga ccgcctgtga caagcaggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1020

atcatcatgc cctttatgat ctgggctaca cacgtgctac aatggatggc aaagagcagc

1080

aaagcagcga tgccgagcca atctcatcca ttcccagttc ggatggagtc tgcaactcga

1140

cttcagaagc aggaatcgct agtaatcgtg gatcagcatg ccacggtgaa tgcgttcccg

1200

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg aaagtcggca acacccgaag ccggtagcta

1260

ggcagccgtt gaaggtgggg ttggtgattg gggtg

1295

<210> 1913

<211> 1451

<212> DNA

<213> Tannerella forsythia

<400> 1913

agcgataggc ttaacacatg caagtcgagg ggcatcgagg gtagcaatac ctgtcggcga

60

ccggcgcacg ggtgagtaac gcgtatgtaa cctgcccgca acagagggat aacccggcga

120

aagtcggact aatacctcat aaaacagggg ttccgcatgg ggctatttgt taaagattta

180

ttggttgcgg atgggcatgc gtaccattag gtagttggtg aggtaacggc tcaccaagcc

240

atcgatggtt aggggttctg agaggaaggt cccccacact ggtactgaga cacggaccag

300

actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct gaaccagcca

360

agtcgcgtga aggatgactg ccctatgggt tgtaaacttc ttttacaggg gaataaaatg

420

agatacgtgt attttattgc atgtaccttg tgaataagca tcggctaact ccgtgccagc

480

agccgcggta atacggagga tgcgagcgtt atccggattt attgggttta aagggtgcgt

540

aggtgggctg ttaagtccgc ggtgaaagtt tgtcgcttaa cgataaaatt gccgttgaaa

600

ctggtagtct tgagtataga tgaagtaggc ggaatgcgtg gtgtagcggt gaaatgcata

660

gagatcacgc agaactccga ttgcgaaggc agcttactaa ggtataactg acactgaagc

720

acgaaagcgt gggtatcaaa caggattaga taccctggta gtccacgcag taaacgatga

780

ttactaggag tttgcgatat agtgtaagct ctacagcgaa agcgttaagt aatccacctg

840

gggagtacgc cggcaacggt gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggagg

900

aacatgtggt ttaattcgat gatacgcgag gaaccttacc cgggattgaa atgtagacga

960

cggagagtga gagctttctt cccttcgggg cgtctatgta ggtgctgcat ggttgtcgtc

1020

agctcgtgcc gtgaggtgtc ggcttaagtg ccataacgag cgcaaccctg actgtcagtt

1080

gctaacaggt aaagctgagg actctggcgg gactgccggc gtaagctgtg aggaaggttg

1140

ggatgacgtc aaatcagcac ggcccttaca tccggggcga cacacgtgtt acaatggcag

1200

ggacaaaggg cagctaccgg gcgaccggat gccaatctcc aaaccctgtc tcagttcgga

1260

tcggagtctg caactcgact ccgtgaagct ggattcgcta gtaatcgcgc atcagccatg

1320

gcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcaagccatg ggagccgggg

1380

gtacctgaag tccgtaaccg cgaggatcgg cctagggtaa aactggtgac tggggctaag

1440

tcgtaacaag g

1451

<210> 1914

<211> 1375

<212> DNA

<213> Tannerella sp. 6_1_58FAA_CT1

<400> 1914

caacatggta tcagcttgct gatactgatg gcgaccggcg cacgggtgag taacgcgtat

60

gtaatctacc tgtaacagag ggataacccg gagaaatccg gactaatacc tcatagcaca

120

tattattcgc atgaatttta tgttaaagag actcggttac agatgaacat gcgttccatt

180

agctagttgg cggggttacg gcccaccaag gcaacgatgg ataggggttc tgagaggaag

240

gtcccccaca ctggtactga gacacggacc agactcctac gggaggcagc agtgaggaat

300

attggtcaat gggcgaaagc ctgaaccagc caagtcgcgt ggaggaagac ggccctacgg

360

gttgtaaact ccttttacct gggaataacg ggcgctacgt gtagcgctgt gcaagtaccg

420

ggagaataag catcggctaa ttccgtgcca gcagccgcgg taatacggaa gatgcgagcg

480

ttatccggat ttattgggtt taaagggtgc gtaggcggaa gaataagtca gcggtgaaat

540

gcttcagctc aactggagaa ttgccgatga aactgttttt ctagagtata aaagaggtat

600

gcggaatgcg tggtgtagcg gtgaaatgca tagatatcac gcagaacccc gattgcgaag

660

gcagcatact gggctataac tgacgctgaa gcacgaaagc gtgggtatcg aacaggatta

720

gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gaatactaac tgtttgcgat ataatgtaag

780

cggtacagcg aaagcgttaa gtattccacc tggggagtac gccggcaacg gtgaaactca

840

aaggaattga cgggggcccg cacaagcgga ggaacatgtg gtttaattcg atgatacgcg

900

aggaacctta cccgggctca aacgacaggg gaataatccc gaaaaggatt agccagcaat

960

gggcgctgtc gaggtgctgc atggttgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg tcggcttaag

1020

tgccataacg agcgcaaccc ttaccggtag ttactaacag gtcaagctga ggactctacc

1080

gggactgcca gcgcaagctg cgaggaaggt ggggatgacg tcaaatcagc acggccctta

1140

cgtccggggc gacacacgtg ttacaatggc aggtacagag agtcgcttcg tagcaatacg

1200

tagccaatcc caaaaacctg tctcagttcg gatcggagtc tgcaactcga ctccgtgaag

1260

ctggattcgc tagtaatcgc gcatcagcca tggcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt

1320

acacaccgcc cgtcaagcca tgggagccgg gagtacctga agtatgcaac cgcaa

1375

<210> 1915

<211> 1474

<212> DNA

<213> Tatlockia micdadei

<220>

<221> modified_base

<222> (5)..(5)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (12)..(14)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (29)..(30)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (37)..(37)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (48)..(48)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (80)..(80)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (82)..(88)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (117)..(117)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (130)..(130)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (136)..(137)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (163)..(163)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (169)..(169)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (176)..(176)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (179)..(179)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (222)..(224)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (229)..(229)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (249)..(249)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (304)..(304)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (335)..(335)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (420)..(420)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (426)..(426)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (452)..(452)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (479)..(479)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (508)..(508)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (552)..(552)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (571)..(571)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (589)..(591)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (598)..(598)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (625)..(625)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (652)..(653)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (828)..(828)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (886)..(886)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (945)..(945)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (957)..(959)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (983)..(983)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (993)..(993)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1042)..(1042)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1092)..(1092)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1117)..(1117)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1213)..(1213)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1276)..(1276)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1287)..(1287)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1296)..(1296)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1302)..(1302)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1915

aactnaagag tnnnatcctg gctcagatnn aacgctngcg gcatgctnaa cacatgcaag

60

tcgaacggca gcacggtctn gnnnnnnnat gggtgacgag tggcgaacgg gtgagtnacg

120

cgtaggaatn tgcctnnaag tgtgggataa cttggggaaa ctnaagctna taccgnatna

180

gctctaagga ggaaagctgg ggaccgcgag gcctgcgcgc tnnnagatna gcctgcgtcc

240

gattagctng ttggtggggg aagggcctac caaggcgacg atcggtagct ggtctgagag

300

gatnatcagc cacactggga ctgagacacg gcccngtctc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaatattgga caatgggggg aaccctratc cagcaatgcc gcgtgtgtga agaaggcctn

420

agggtngtaa agcactttca gtggggagga gngrtgatag gttaagagct aattatctng

480

acgttaccca cagaagaagc accggctnac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

540

gtgcgagcgt tnatcggaat tactgggcgt naagggtgcg taggtggtnn nataagtnat

600

ctgtgaaatt cctgggctca acctngggtg gtcagataag actgtgagac tnngagtata

660

ggagagggta gtggaatttc cggtgtagcg gtgaaatgcg tagagatcgg aaggaacacc

720

agtggcgaag gcggctacct ggcctaatac tgacactgag gcacgaaagc gtggggagca

780

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc tgtaaacgat gtcaactngt tgttggcctt

840

atgaatgagg ttagtgacga agcaaacgcg ataagttgac cgcctnggga gtacggtcgc

900

aagatyaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtngagca tgtggtnnna

960

ttcgatgcaa cgcgaagaac ctnacctacc ctngacatac agtgaattct gcagagatgt

1020

ggaagtgccg cgaggagcac tnatacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg

1080

agatgttggg tnaagtcccg taacgagcgc aaccctngty cttagttgcc agcgcgtaga

1140

tggyggggac tctaaggaga ctgccggtga caaaccggag gaaggcgggg atgacgtcaa

1200

gtcatcatgg ccnttacggg tagggctaca cacgtgctac aatggccggt acagagggcg

1260

gcgaagggga gacctngagc aaatctntga aagctngtcg tngtccggat tgaagtctgc

1320

aactcgactk catgaagtcg gaatcgctag taatcgcgaa tcagcatgtc gcggtgaata

1380

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggttgc accagaagta

1440

gatagtctaa ccaatggggg acgtatacca cggt

1474

<210> 1916

<211> 1480

<212> DNA

<213> Tatumella ptyseos

<400> 1916

ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac ggtagcacag aggagcttgc tccttgggtg

60

acgagtggcg gacgggtgag taatgtctgg gaaactgcct gatggagggg gataactact

120

ggaaacggta gctaataccg cataatgtcg caagaccaaa gcgggggacc ttcgggcctc

180

gcaccatcgg atgtgcccag atgggattag cttgtaggtg aggtaatggc tcacctaggc

240

gacgatccct agctggtctg agaggatgac cagccacact ggaactgaga cacggtccag

300

actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcca

360

tgccgcgtgt atgaagaagg ccttcgggtt gtaaagtact ttcagcgggg aggaaggcag

420

tcgtgttaat agcacgattg attgacgtta cccgcagaag aagcaccggc taactccgtg

480

ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg

540

cacgcaggcg gtctgtcaag tcggatgtga aatccccggg ctcaacccgg gaactgcatt

600

cgaaactggc agactagagt cttctagagg ggggtagaat tccaggtgta gcggtgaaat

660

gcgtagagat ctggaggaat accggtggcg aaggcggccc cctggacaaa gactgacgct

720

caggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac

780

gatgtcgact tggaggctgt tcccttgagg agtggcttcc ggagctaacg cgttaagtcg

840

accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca

900

agcggtggag catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat

960

ccagagaact tgccagagat ggattggtgc cttcgggaac tctgagacag gtgctgcatg

1020

gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccccta

1080

tcctttgttg ccagcgattc ggtcgggaac tcaaaggaga ctgccggtga taaaccggag

1140

gaaggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgg cccttacgag tagggctaca cacgtgctac

1200

aatggcgcat acaaagagaa gcgacctcgc gagagcaagc ggacctcata aagtgcgtcg

1260

tagtccggat tggagtctgc aactcgactc catgaagtcg gaatcgctag taatcgtaga

1320

tcagaatgct acggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg

1380

agtgggttgc aaaagaagta gatagcttaa ccttcgggag ggcgtttacc actttgtgat

1440

tcatgactgg ggtgaagtcg taacaaggta accgtagggg

1480

<210> 1917

<211> 1479

<212> DNA

<213> Tessaracoccus sp. oral taxon F04

<400> 1917

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

ggtaaggccc tttcgggggt acacgagtgg cgaacgggtg agtaacacgt gagtaacctg

120

cccttgactc tgggataaca tctggaaaca ggtgctaata ctggatattc tgcgatgcct

180

gcatgggtgt cgttggaaag ttccggcggt cagggatgga ctcgcggcct atcagcttgt

240

tggtgaggta gtggctcacc aaggcttcga cgggtagccg gactgagagg ttgaccggcc

300

acattgggac tgagatacgg cccaaactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac

360

aatggacgga agtctgatgc agcaacgccg cgtgcgggat gacggccttc gggttgtaaa

420

ccgctttcat ccatgacgaa gcgagagtga cggtagtggg agaagaagca ccggctaact

480

acgtgccagc agccgcggtg atacgtaggg tgcgagcgtt gtccggattt attgggcgta

540

aagagcttgt aggcggtttg ttgcgtcggg agtgaaaact cagggcttaa ccctgagcct

600

gctttcgata cgggcagact tgaggaaggt aggggagaat ggaattcctg gtgaagcggt

660

ggaatgcgta gatatcagga ggaacaccag tggcgaaggc ggttctctgg acctttcctg

720

atgctgagaa gcgaaagcgt ggggagcaaa caggcttaga taccctggta gtccacgccg

780

taaacggtgg gtactaggtg tgggggacat tccacgttct ccgtgccgca gctaacgcat

840

taagtacccc gcctggggag tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat tgacggggcc

900

ccgcacaagc ggcggagcat gcggattaat tcgatgcaac gcggagaacc ttacctgggt

960

ttgacatatg ccggaaacat ctagagatag gtgccccttt ttggtcggta taccggtggt

1020

gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

1080

cctcgtccta tgttgccagc gggtaatgcc ggggactcat aggagaccgc cggggtcaac

1140

tcggaggaag gtggggatga cgtcaagtca tcatgcccct tatgtccagg gcttcacgca

1200

tgctacaatg gccggtacaa agagctgcga acctgtgagg gtgagcgaat ctcaaaaagc

1260

cggtctcagt tcggattggg gtctgcaact cgaccccatg aagtcggagt cgctagtaat

1320

cgcagatcag caacgctgcg gtgaatacgt tcccggggct tgtacacacc gcccgtcaag

1380

tcatgaaagt cggtaacacc cgaagccggt ggcctaaccc cttgtgggag ggagctgtcg

1440

aaggtgggac cggtaattag gactaagtcg taacaaggt

1479

<210> 1918

<211> 1562

<212> DNA

<213> Tetragenococcus halophilus

<400> 1918

tcaagatgag agtttgatcc tggctcagga cgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca

60

agtcgaacgc tgcttaagaa gaaacttcgg ttttttctta agtggagtgg cggacgggtg

120

agtaacacgt ggggaaccta tccatcagcg ggggataaca cttggaaaca ggtgctaata

180

ccgcatacgg ctttttttca cctgaaagaa agctcaaagg cgctttacag cgtcactgat

240

ggctggtccc gcggtgcatt agccagttgg tgaggtaacg gctcaccaaa gcaacgatgc

300

atagccgacc tgagagggtg atcggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac

360

gggaggcagc agtagggaat cttcggcaat ggacgcaagt ctgaccgagc aacgccgcgt

420

gagtgaagaa ggttttcgga tcgtaaagct ctgttgtcag caaagaacag gagaaagagg

480

aaatgctttt tccatgacgg tagctgacca gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc

540

cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag cgagcgcagg

600

cggtgattta agtctgatgt gaaagccccc agctcaactg gggagggtca ttggaaactg

660

gatcacttga gtgcagaaga ggagagtgga attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagat

720

atatggagga acaccagtgg cgaaggcggc tctctggtct gtaactgacg ctgaggctcg

780

aaagcgtggg tagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg

840

ctaagtgttg gagggtttcc gcccttcagt gctgcagtta acgcattaag cactccgcct

900

ggggagtacg accgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg

960

gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catcctttga

1020

ccgccctaga gatagggttt ccccttcggg ggcaaagtga caggtggtgc atggttgtcg

1080

tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgtaacg agcgcaaccc ttattgttag

1140

ttgccagcat tgagttgggc actctagcaa gactgccggt gacaaaccgg aggaaggcgg

1200

ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg acctgggcta cacacgtgct acaatgggaa

1260

gtacaacgag caagccaagc cgcaaggcct agcgaatctc tgaaagcttc tctcagttcg

1320

gattgcaggc tgcaactcgc ctgcatgaag ccggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat

1380

gccgcggtga atccgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagtttgt

1440

aacacccaaa gtcggtgcgg caacccttag gggagccagc cgcctaaggt gggacgaatg

1500

attggggtga agtcgtaaca aggtagccgt atcggaaggt gcggctggat cacctccttt

1560

ct

1562

<210> 1919

<211> 1492

<212> DNA

<213> Tetragenococcus koreensis

<400> 1919

ctcaggacga acgctggcgg cgtgcctaat acatgcaagt cgaacgctgc ttcgatcgaa

60

acttcggttt cttttgaagc ggagtggcgg acgggtgagt aacacgtggg gaacctatcc

120

atcagcgggg gataacactt ggaaacaggt gctaataccg cataaggctt tctttcgcct

180

gaaagaaagc taaaaggcgc tttttgcgtc actgatggct ggtcccgcgg tgcattagcc

240

agttggtgag gtaacggctc accaaagcaa cgatgcatag ccgacctgag agggtgatcg

300

gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagta gggaatcttc

360

ggcaatggac gaaagtctga ccgagcaacg ccgcgtgagt gaagaaggtt ttcggatcgt

420

aaagctctgt tgtcagtaaa gaacaggaaa aagaggcaat gctttttcta tgacggtagc

480

tgaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta ggtggcaagc

540

gttgtccgga tttattgggc gtaaagcgag cgcaggcggt gatttaagtc tgatgtgaaa

600

gcccccggct caaccgggga gggtcattgg aaactggatc acttgagtgc agaagaggag

660

agtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat ggaggaacac cagtggcgaa

720

ggcggctctc tggtctgtaa ctgacgctga ggctcgaaag cgtgggtagc aaacaggatt

780

agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa gtgttggagg gtttccgccc

840

ttcagtgctg cagttaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg caaggttgaa

900

actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca

960

acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ctttgaccac gcgagagatc gcgtttcccc

1020

ttcgggggca aagtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg

1080

gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat tgttagttgc cagcattcag ttgggcactc

1140

tagcaagact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc

1200

cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tgggaagtac aacgagcaag ccaagccgca

1260

aggccgcgcg aatctctgaa agcttctctc agttcggatt gcaggctgca actcgcctgc

1320

atgaagccgg aatcgctagt aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatcc gttcccgggc

1380

cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaga gtttgtaaca cccaaagtcc ggtgcggcaa

1440

cctcattaga ggagccagcc gcctaaggtg ggatgaatga ttggggtgaa gt

1492

<210> 1920

<211> 1454

<212> DNA

<213> Thermoanaerobacter pseudethanolicus

<400> 1920

agttgagtgc cggatagcgg cggacgggtg agtaacgcgt gggcaaccta cccttaagac

60

cgggataaca cctcgaaagg ggtgctaata ctggataagc tccttgtagg gcatcctatg

120

aggagggaag gtagcgggag ctaccgctta aggatgggcc cgcgtcccat cagctagttg

180

gtagggtaac ggcctaccaa ggcgacgacg ggtagccggc ctgagagggt ggtcggccac

240

actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tcttgcgcaa

300

tgggcgaaag cctgacgcag cgacgccgcg tgagcgagga aggccttcgg gtcgtaaagc

360

tcgatagtgt gggaagaagg gatgacggta ccacacgaaa gccccggcta actacgtgcc

420

agcagccgcg gtaagacgta gggggcgagc gttgtccgga attactgggc gtaaagggcg

480

cgtaggcggc cgttcaagtc aggtgtaaaa tacccgggct caacccgggg atagcacttg

540

aaactgggcg gctagagggc aggagagggg agtggaattc ccggtgtagc ggtgaaatgc

600

gtagatatcg ggaggaatac cagtggcgaa ggcgactctc tggactgacc ctgacgctga

660

ggcgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga

720

tgggtactag gtgtgggatg cggaagcatt ccgtgccgta gttaacgcaa taagtacccc

780

gcctggggag tacggccgca aggttgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc

840

ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccagggc ttgacatgca

900

ggtagtagcg agccgaaagg tgagcgacct taccttaaag gtgaggagcc tgcacaggtg

960

gtgcatggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

1020

acccctgcct ctagttgcca gcgggtgaag ccgggcactc tagagggact gccgtggaca

1080

acacggagga aggtggggat gacgtcaaat catcatgccc tatatgccct gggccacaca

1140

cgtgctacaa tggccggtac agagggaagc gaagccgcga ggtggagcga aacccaaaaa

1200

gccggtccaa gttcggattg caggctgcaa ctcgcctgca tgaagtcgga atcgctagta

1260

atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac

1320

accacgagag tctgcaacac ccgaagccgg tgacccaacc gggaaggagg gagccgtcga

1380

aggtggggca gatgattggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtatcgga aggtgcggct

1440

ggatcacctc cttt

1454

<210> 1921

<211> 1542

<212> DNA

<213> Thermobifida fusca

<400> 1921

ggagagtttg atcctggctc aggacgaacg ctggcggcgt gcttaacaca tgcaagtcga

60

gcggtaaggc cccttcgggg gtacacgagc ggcgaacggg tgagtaacac gtgagtaacc

120

tgcccctgac tctgggataa gcctgggaaa ctgggtctaa taccggatat gacctcgtgc

180

cgcatggtgt ggggtggaaa ggtgtttttc cggtcaggga tgggctcgcg gcctatcagc

240

ttgttggtgg ggtaacggcc taccaaggcg atgacgggta gccggcctga gagggcgacc

300

ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctgcggg aggcagcagt ggggaatatt

360

gcgcaatggg cggaagcctg acgcagcgac gccgcgtggg ggatgaaggc cttcgggttg

420

taaacctctt ttaccactca cgaaggcccc tggttttctg ggggttgacg gtaggtggtg

480

aataaggacc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggtc cgagcgttgt

540

ccggaattat tgggcgtaaa gagctcgtag gcggcctgtc gcgtctgctg tgaaagtccg

600

gggcttaact ccgggtgtgc agtggatacg ggcaggcttg aggtaggtag gggagactgg

660

aattcctggt gtagcggtga aatgcgcaga tatcaggagg aacaccggtg gcgaaggcgg

720

gtctctgggc cttacctgac gctgaggagc gaaagcgtgg ggagcgaaca ggattagata

780

ccctggtagt ccacgccgta aacgttgggc gctaggtgtg gggactttcc acggtttccg

840

tgccgtagct aacgcattaa gcgccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca

900

aaggaattga cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgtt gcttaattcg acgcaacgcg

960

aagaacctta ccaaggcttg acatcaccgg taatcctcca gagatggggg gtccttcggg

1020

gatcggtgac aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt

1080

cccgcaacga gcgcaacccc tgtcccatgt tgccagcacg tggtggtggg gactcatggg

1140

agactgccgg ggtcaactcg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tgccccttat

1200

gccttgggct gcaaacatgc tacaatggcc ggtacagagg gcgtgcgatg tcgtgaggcg

1260

gagcgaatct cttaaagccg gtctcagttc ggattggggt ctgcaactcg accccatgaa

1320

ggtggagtcg ctagtaatcg cggatcagca acgccgcggt gaatacgttc ccgggccttg

1380

tacacaccgc ccgtcacgtc acgaaagtcg gcaacacccg aaacacgtgg cctaaccctt

1440

tgtggggggg agcgtgtgaa ggtggggctg gcgattggga cgaagtcgta acaaggtagc

1500

cgtaccggaa ggtgcggctg gatcacctcc tttctaagga gc

1542

<210> 1922

<211> 1503

<212> DNA

<213> Thermofilum pendens

<400> 1922

actccggttg atcctgccgg acccgaccgc tatcggggtg gggctaaccc atggaagtct

60

aggagccggg gctacggccg gctccggcgg acggctcagt agcacgtggc taacctaccc

120

tcgggagggg gataaccccg ggaaactggg gataaacccc cataggcgcg gacacctgga

180

atgggtccgc gctgaaaggg ccacggtacc atgcttaccg tggccgcccg aggatggggc

240

tgcgccctat caggtagttg gcggggtaac ggcccgccaa gccgataacg ggtgggggcc

300

gtgagagcgg gagccccgag atgggcactg agacaagggc ccaggcccta cggggtgcac

360

caggggcgaa acttccgcaa tgcgggaaac cgtgacggag tcaccccgag tgccacccga

420

agagggtggc ttttgcccgg tctaaaaagc cgggcgaata agcggggggc aagcttggtg

480

tcagccgccg cggtaatacc aaccccgcga gtggtcggga cgtttattgg gcctaaagcg

540

tccgtagccg gcccggtaag tccctcctta aagcccacgg ctcaaccgtg ggagcggagg

600

gatactgccg ggctaggggg cgggagaggc cgggggtact cctggggtag gggcgaaatc

660

ctataatccc aggaggacca ccagtggcga aggcgcccgg ctagcacgcg cccgacggtg

720

agggacgaaa gctgggggag caaaggggat tagatacccc cgtagtccca gctgtaaacg

780

atgcgggcta ggtgttggac gggcttcgag cccgtccagt gccgtaggga agccgttaag

840

cccgccgcct ggggagtacg gccgcaaggc tgaaacttaa aggaattggc gggggagcac

900

cacaaggggt gaagcttgcg gtttaattgg agtcaacgcc ggaaacctta ccgggggcga

960

cagcaggatg aaggccaggc tgacgacctt gccagacgag ctgagaggag gtgcatggcc

1020

gtcgccggct cgtgccgtga ggtgtcctgt taagtcaggg aacgagcgag acccccgccc

1080

ctagttgcta cccagccctt cggggctggg gcactctagg gggactgccg gcgataagcc

1140

ggaggaaggt gggggctacg gcaggtcagt atgccccgaa acccccgggc tacacgcgag

1200

ctgcaatggc ggggacagcg ggttccgacc ccgaaagggg gaggtaatcc cttaaacccc

1260

gcctcagtag gaatcgaggg ctgcaactcg ccctcgtgaa cgtggaatcc ctagtaaccg

1320

cgtgtcacca acgcgcggtg aatacgtccc tgctccttgc acacaccgcc cgtcgctcca

1380

cccgagggag gcctaggtga ggcctcctgc cgacgaggtg ggaggtcgaa cctgggcctc

1440

ccaagggggg agaagtcgta acaaggtggc cgtaggggaa cctgcggccg gatcacctcc

1500

ttt

1503

<210> 1923

<211> 1470

<212> DNA

<213> Thermus aquaticus

<400> 1923

gctcagggtg aacgctggcg gcgtgcctaa gacatgcaag tcgtgcgggc cgtggggtat

60

ctcacggtca gcggcggacg ggtgagtaac gcgtgggtga cctacccgga agagggggac

120

aacatgggga aacccaggct aatcccccat gtggacacat cctgtggggt gtgtttaaag

180

ggttttgccc gcttccggat gggcccgcgt cccatcagct agttggtggg gtaagagccc

240

accaaggcga cgacgggtag ccggtctgag aggacggccg gccacagggg cactgagaca

300

cgggccccac tcctacggga ggcagcagtt aggaatcttc cgcaatgggc gcaagcctga

360

cggagcgacg ccgcttggag gaggaagccc ttcggggtgt aaactcctga acccgggacg

420

aaacccccga tgaggggact gacggtaccg gggtaatagc gccggccaac tccgtgccag

480

cagccgcggt aatacggagg gcgcgagcgt tacccggatt tactgggcgt aaagggcgtg

540

taggcggctt ggggcgtccc atgtgaaagg ccacggctca accgtggagg agcgtgggat

600

acgctcaggc tagacggtgg gagagggtgg tggaattccc ggagtagcgg tgaaatgcgc

660

agataccggg aggaacgccg atggcgaagg cagccacctg gtccactcgt gacgctgagg

720

cgcgaaagcg tggggagcaa accggattag atacccgggt agtccacgcc ctaaacgatg

780

cgcgctaggt ctctgggtta tctgggggcc gaagctaacg cgttaagcgc gccgcctggg

840

gagtacggcc gcaaggctga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

900

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gccttgacat gctagggaac

960

ctgggtgaaa gcctggggtg ccccgcgagg ggagccctag cacaggtgct gcatggccgt

1020

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctgccgtt

1080

agttgccagc gggtgaagcc gggcactcta acgggactgc ctgcgaaagc aggaggaagg

1140

cggggacgac gtctggtcat catggccctt acggcctggg cgacacacgt gctacaatgc

1200

ccactacaga gcgaggcgac ctggcaacag ggagcgaatc gcaaaaaggt gggcgtagtt

1260

cggattgggg tctgcaaccc gaccccatga agccggaatc gctagtaatc gcggatcagc

1320

catgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacgc catgggagcg

1380

ggttctaccc gaagtcgccg ggagccttag ggcaggcgcc gagggtaggg cccgtgactg

1440

gggcgaagtc gtaacaaggt agctgtaccg

1470

<210> 1924

<211> 1400

<212> DNA

<213> Tissierella praeacuta

<400> 1924

ggctcaggac gaacgctggc ggcgtgccta acacatgcaa gtcgagcgaa gtttttaaag

60

aagatttctt cggaatgaaa ctttaattat cttagcggcg gacgggtgag taacgcgtga

120

gaaacctgcc ttttacaaag ggatagcctc gggaaactgg gattaatacc ttatgacact

180

gtcgcatgag atttaagtca aagcgtaaag cggtaaaaga tggtctcgcg tcccattagt

240

tagttggtga ggtaaaggct caccaagaca gcgatgggta gccggcctga gagggtgaac

300

ggccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

360

gcacaatgga ggaaactctg atgcagcgac gccgcgtgaa cgatgaaggc tttcgggtcg

420

taaagttctg tcctaaggga cgataatgac ggtaccttag gaggaagccc cggctaacta

480

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggg gcaagcgttg tccggattta ttgggcgtaa

540

agggtgcgta ggcggccttt taagtcagat gtgaaagatc acggctcaac cgtggtaagc

600

atttgaaact gaaaggcttg agttaaggag aggaaagtgg aattcctagt gtagcggtga

660

aatgcgtaga tattaggagg aataccagtg gcgaaggcga ctttctggac ttatactgac

720

gctgaggcac gaaagcgtgg ggagcgaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta

780

aacgatgagt gctaggtgtt gggggtcaaa cctcggtgcc gcagctaacg cattaagcac

840

tccgcctggg gagtacgtac gcaagtatga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca

900

agcagcggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag ggcttgacat

960

gcccctgacc gtcctagaga tagggcttta ccttcgggta caggggacac aggtggtgca

1020

tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct

1080

tgcctttagt tgctaacaga taagctgagc actctagagg gactgccgat gacaaatcgg

1140

aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccctttatg tcctgggcta cacacgtgct

1200

acaatggtcg gtacaacgag cagctactta gcgataagat gctaatctct taaagccgat

1260

cccagttcgg attgcaggct gcaactcgcc tgcatgaagt cggagttgct agtaatcgcg

1320

gatcagaatg tcgcggtgaa tgcgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccatg

1380

ggagttggca atacccgaag

1400

<210> 1925

<211> 1441

<212> DNA

<213> Trabulsiella guamensis

<400> 1925

acgctggcgc agccttacac atgcaagtcg agcggcagcg ggggaaagct gctttcccgc

60

cggcgagcgg cggacgggtg agtaatgtct gggaaactgc ctgatggagg gggataacta

120

ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt cttcggacca aagtggggga ccttcgggcc

180

tcatgccatc agatgtgccc agatgggatt agctagtagg tggggtaacg gctcacctag

240

gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg accagccaca ctggaactga gacacggtcc

300

agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc

360

catgccgcgt gtatgaagaa ggccttcggg ttgtaaagta ctttcagcgg ggaggaaggt

420

gttgtggtta ataaccagag caattgacgt tacccgcaga agaagcaccg gctaactccg

480

tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag

540

cgcacgcagg cggtctgtca agtcggatgt gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca

600

tccgaaactg gcaggcttga gtcttgtaga ggggggtaga attccaggtg tagcggtgaa

660

atgcgtagag atctggagga ataccggtgg cgaaggcggc cccctggaca aagactgacg

720

ctcaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa

780

acgatgtcga cttggaggtt gtgcccttga ggcgtggctt ccggagctaa cgcgttaagt

840

cgaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca

900

caagcggtgg agcatgtgtt ttaatttcga tgcaacgcga agaaccttac ctggtcttga

960

cacccacaga accctgtaga gatacggggg tgccttcggg aactgtgaga caggtgctgc

1020

atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc

1080

ttatcctttg ttgccagcgg tccggccggg aactcaaagg agactgccag tgataaactg

1140

gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tggcccttac gaccagggct acacacgtgc

1200

tacaatgcat atacaagaga agcgacctcg cgagagcaag cggcctcata aagtatgtcg

1260

tagtccggat tggagtctgc aactcgactc catgaagtcg gaatcgctag taatcgtgga

1320

tcagaatgcc acggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg

1380

agtgggttgc aaaagaagta ggtagcttaa ccttcgggag ggcgcttacc acttgtgatt

1440

a

1441

<210> 1926

<211> 1543

<212> DNA

<213> Treponema denticola

<400> 1926

tggagagttt gatcctggct cagaacgaac gctggcggcg cgtcttaagc atgcaagtcg

60

aacggtaagg gagagcttgc tctcccctag agtggcggac tggtgagtaa cgcgtgggtg

120

acctgccctg aagatgggga tagctagtag aaatattaga taataccgaa tgtgctcatt

180

tacataaagg taaatgagga aaggagctac ggctccgctt caggatgggc ccgcgtccca

240

ttagctggtt ggtgaggtaa aggctcacca aggcaacgat gggtatccgg cctgagaggg

300

tgaacggaca cattgggact gagatacggc ccaaactcct acgggaggca gcagctaaga

360

atcttccgca atggacgaaa gtctgacgga gcgacgccgt gtgaatgaag aaggccgaaa

420

ggttgtaaaa ttcttttgca gatgaagaat aagaagaaga gggaatgctt ctttgatgac

480

ggtagtcatg cgaataagcc ccggctaatt acgtgccagc agccgcggta acacgtaagg

540

ggcgagcgtt gttcggaatt attgggcgta aagggtatgt aggcggttag gtaagcctgg

600

tgtgaaatct acgagctcaa ctcgtaaact gcattgggta ctgcttgact tgaatcacgg

660

aggggaaacc ggaattccaa gtgtaggggt ggaatctgta gatatttgga agaacaccgg

720

tggcgaaggc gggtttctgg ccgatgattg acgctgatat acgaaggtgc ggggagcaaa

780

caggattaga taccctggta gtccgcacag taaacgatgt acactaggtg tcggggcaag

840

agcttcggtg ccgacgcaaa cgcattaagt gtaccgcctg ggaagtatgc ccgcaagggt

900

gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccaca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat

960

gatacgcgag aaaccttacc tgggtttgac atcaagagca atgacataga gatatggcag

1020

cgtagcaata cggctcttga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg

1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ctactgccag ttactaacag gtaaagctga

1140

ggactctggc ggaactgccg atgacaaatc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc

1200

atggccctta cgtccagggc tacacacgtg ctacaatggt tgctacaaat cgaagcgaca

1260

ccgcgaggtc aagcaaaacg caaaaaagca atcgtagtcc ggattgaagt ctgaaactcg

1320

acttcatgaa gttggaatcg ctagtaatcg cacatcagca cggtgcggtg aatacgttcc

1380

tgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tccgagtcga gggtacccga agtcgctagt

1440

ctaacccgta agggaggacg gtgccgaagg tacgtttggt aaggagggtg aagtcgtaac

1500

aaggtagccg taccggaagg tgcggctgga tcacctcctt tct

1543

<210> 1927

<211> 1297

<212> DNA

<213> Treponema genomosp. P1

<400> 1927

aacgaacgct ggcggcgcgt cttaagcatg caagtcgaac gagtggcgga ctggtgagga

60

acacgtgggt aatctaccct taagatgggg atagctgtta gaaatagcag gtaataccga

120

atacagaaag tcgcttgagg atgagcttgc gtcccattag ctagttggtg aggtaacggc

180

ccaccaaggc gacgatgggt atccggcctg agagggtgaa cggacacatt gggactgaga

240

tacggcccaa actcctacgg gaggcagcag ctaagaatat tccgcaatgg acggaagtct

300

gacggagcga cgccgcgtgg atgaagaagg ctgaaaagtt gtaaaatcct tttgttgatg

360

aagatgacgg tagtcggtga ataagccccg gctaattacg tgccagcagc cgcggtaaca

420

cgtaaggggc gagcgttgtt cggaattatt gggcgtaaag ggcatgtagg cggttatgta

480

agcctgatgt gaaatcctgg ggcttaaccc cagaatagca ttgggtactg tgtaactcga

540

attacggaag ggaaactgga attccaagtg taggggtgga atctgtagat atttggaaga

600

acaccggtgg cgaaggcggg tttctggccg aattgacgct gagatgcgaa agtgtgggga

660

tcgaacagga ttagataccc tggtagtcca caccgtaaac gatgtacact aggtgttggg

720

gcttcagtgc caaagcaaac gcgataagtg taccgcctgg ggagtatgcc cgcaagggtg

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg

840

gtacgcgagg aaccttacct gggtttgaca tcgacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct

900

cgtgccgtga ggtgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctactg ccagttacta

960

acagctgagg actctggcgg aactgccgat gacaaatcgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1020

aagtcatcat ggcccttatg tccagggcta cacacgtgct acaatggttg ccaaagcgac

1080

gcgagaccgt aaggtggagc aaaccgcaag cgatcgtagt tcggatgaag tctgaaactc

1140

gacttcagaa gttggaatcg ctagtaatcg cgcatcagca cggcgcggtg aatacgttcc

1200

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tccgagttgg gggtacccga agtcgctgtc

1260

taggacggtg ccgaaggtac gcttggtaag gagggtg

1297

<210> 1928

<211> 1297

<212> DNA

<213> Treponema genomosp. P4 oral clone MB2_G19

<400> 1928

aacgaacgct ggcggtgcgt tttaagcatg caagtcgaac gagtggcgga ctggtgagta

60

acgcgtgggt gatctacctt taagatgggg atagctttta gaaataagag ataataccga

120

atatggaaag ccgcttgaag atgagcctgc gtcccattag ctagttggtg gggtaaaggc

180

ctaccaaggc aatgatgggt atccggcctg agagggtgac cggacacatt gggactgaga

240

tacggcccaa actcctacgg gaggcagcag ctgagaatct tccgcaatgg acgaaagtct

300

gacggagcga caccgcgtga atgatgaagg ccgaaaggtt gtaaagttct tttgcagaca

360

aagatgacgg tagtttgcga ataagccccg gctaattacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaaggggc gagcgttgtt cggaattatt gggcgtaaag ggcatgtagg cggtttagta

480

agcctgatgt gaaatctacg agcttaactc gtaaactgca ttgggtactg cttaactaga

540

gttatggagg ggaaactgga attccaagtg taggggtgga atctgtagat atttggaaga

600

acaccggtgg cgaaggcggg tttctagcca aactgacgct gatatgcgaa ggtgcgggga

660

gcaaacagga ttagataccc tggtagtccg cacagtaaac tatgtacact agatgttggg

720

gactcagtgt tgaagcaaac gcaataagtg taccgcctgg ggagtatgcc cgcaagggtg

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccacac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg

840

atacgcgagg aaccttacct gggtttgaca tcgacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct

900

cgtgccgtga ggtgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctactg ccagttacta

960

acagctgagg actctggcgg aactgccggt gataaaccgg aggaaggtgg gggtgacgtc

1020

aagtcatcat ggcccttatg tccagggcta cacacgtgct acaatggttg tcaaagtgat

1080

gcgaagtcgc gagacggagc gaaacgcatg caatcgtagt ccggatggaa tctgaaacct

1140

gattccagaa gctggaatcg ctagtaatcg catatcagca cgatgcggtg aatacgttcc

1200

tgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tccgagtcga gggtacccga agatgctgtc

1260

taggacggtg gcgaaggtac gtttggtaag gagggtg

1297

<210> 1929

<211> 1297

<212> DNA

<213> Treponema genomosp. P5 oral clone MB3_P23

<400> 1929

aacgaacgct ggcggtgcgt cttaagcatg caagtcgaac gagtggcgga ctggtgagta

60

acgcgtggat gatctacctt tgagatgggg atagcttcta gaaataggag gtaataccga

120

ataacaaaag ccgctcgaag atgagtctgc gtcccattag ctagttggtg aggtaaaggc

180

ccaccaaggc gacgatgggt acccggcctg agagggtgaa cgggcacatt gggactgaga

240

tacggcccaa actcctacgg gaggcagcag ctgagaatct tccgcaatgg acgaaagtct

300

gacggagcga caccgcgtga acgatgaagg ccggaaggtt gtaaagttct tttgcagaca

360

aagatgacgg tagtttgcga ataagccccg gctaattacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaaggggc gagcgttgtt cggaattatt gggcgtaaag ggcatgtagg cggttaggta

480

agcctgatgt gaaatgtatg agcttaactc ataaactgca ttgggtactg cttgacttga

540

atcatggagg ggaaactgga attccaagtg taggggtgga atctgtagat atttggaaga

600

acaccggtgg cgaaggcggg tttctagcca aattgacgct aaggtgcgag ggtgcgggga

660

gcaaacagga ttagataccc tggtagtccg cacagtaaac gatgtacact aggtgttggg

720

gactcagtgc cggagcaaac gcaataagtg taccgcctgg ggagtatgcc cgcaagggtg

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccacac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg

840

atacgcgagg aaccttacct gggtttgaca tcgacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct

900

cgtgccgtga ggtgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctactg ccagttacta

960

acagctgagg actcaggcgg aactgccggt gatataccgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1020

aagtcatcat ggcccttatg tccagggcta cacacgtgct acaatggttg tcaaagtgag

1080

gcgaagccgc gaggttaagc gaatcgcaag caatcgtagt ccggatggaa tctgaaacct

1140

gattccagaa gctggaatcg ctagtaatcg catatcagca cgatgcggtg aatacgttcc

1200

tgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tccgagtcga aggtacccga agatgctgtc

1260

taggacggtg gcgaaggtac gtttggtaag gagggtg

1297

<210> 1930

<211> 1297

<212> DNA

<213> Treponema genomosp. P6 oral clone MB4_G11

<400> 1930

aacgaacgct ggcggtgcgt tttaagcttg caagtcgaac gagtggcgga ctggtgagta

60

acgcgtaggt gatctacctt taagactggg acagccttta gaaataaggg gtaataccgg

120

atgtgggaag ccgcttagag atgagcctgc gtcccattag ctagttggta aggtaacggc

180

ctaccaaggc gatgatgggt atccgacctg agagggtgat cggacacatt gggactgaga

240

tacggcccaa actcctacgg gaggcagcag ctgagaatct tccgcaatgg acgaaagtcg

300

gacggagcga caccgcgtga atgatgaagg ccgaagggtt gtaaagttct tttgcagaca

360

aagatgacgg tagtttgcga ataagccccg gctaattacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaaggggc gagcgttgct cggaattatt gggcgtaaag ggcatgtagg cggttgggta

480

agcctgatgt gaaatctacg agcttaactc gtaaactgca ttgggtactg ctcatcttga

540

atcatagagg gggaactgga attccaagtg taggggtgga atctgtagat atttggaaga

600

acaccggtgg cgaaggcggg ttcctagcta aattgacgct gatgtgcgaa ggtgcgggga

660

gcaaacagga ttagataccc tggtagtccg ctcagtaaac gatgtacact aggtgttggg

720

gactcagtgc cggcgcaaac gcaataagtg taccgcctgg ggagtatgcc cgcaagggtg

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccacac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg

840

atacgcgagg aaccttacct gggtttgaca tcgacaggtg cagcatggct gtcgtcagct

900

cgtgccgtga ggtgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctactg ccagttacta

960

acagctgagg actctggcgg aactgccggt gataaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc

1020

aagtcatcat ggcccttatg tccagggcta cacacgtgct acaatggttg tcaaagtgat

1080

gcgaagtcgc gagacggagc gaaacgcatg caatcgtagt ccggatggaa tctgaaacct

1140

gattccagaa gctggaatcg ctagtaatcg catatcagca cgatgcggtg aatacgttcc

1200

tgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca tccgagtcga gggtacccga agatgctgtc

1260

taggacggtg gcgaaggtac gtttggtaag gagggtg

1297

<210> 1931

<211> 1479

<212> DNA

<213> Treponema lecithinolyticum

<220>

<221> modified_base

<222> (897)..(897)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1440)..(1440)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1449)..(1449)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1458)..(1458)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1931

aacgaacgct ggcggcgcgt cttaaacatg caagtcgaac ggtaaggaag gagcttgctc

60

ctttctgaga gtggcggact ggtgagtaac acgtgggtga catacctttt agatggggat

120

agctattaga aatagtaggt aataccgaat gtgaccgtat ctgttagagg gatacgagga

180

aaggagctaa ggcttcgcta aaagaatggc ccgcggccca ttatgctcgt tggtgaggta

240

acggcccacc aaggcgatga tgggtatccg gcctgagagg gtggacggac acattgggac

300

tgagatacgg cccagacttc tacgggaggc agcagttaag aatattccgc aatggacgaa

360

agtctgacgg agcgacgccg cgtggatgaa gaatgccgaa aggttgtaaa atccttttaa

420

gcctgaggaa taagcacagt agggaatgat tgtgtggtga ctgtagggct tgaataagca

480

ccggcaaatt acgtgccagc agccgcggta acacgtaagg tgcgagcgtt gttcggaatt

540

attgggcgta aagggcatgt aggcggatga gcaagcttgg tgtgaaatgc tacagcttaa

600

ctgtgggaca gcattgagaa ctgcacatct tgaattactg aagggtaact agaattccac

660

gtgtaggggt gaaatctgta gatatgtgga agaataccaa tggcgaaggc aagttaccgg

720

cagataattg acgctgaggt gcgaaagtgc ggggagcgaa caggattaga taccctggta

780

gtccgcacag taaacgatgt acactaggtg tctggcaaca aagctgggtg ccaaagcaaa

840

cgtggtaagt gtaccgcctg gggagtatgc ccgcaagggt gaaactcaaa ggaattnacg

900

ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat ggtacgcgag gaaccttacc

960

tgggtttgac atagtactta agttcgtaga gatacggatg cgtagcaata cgaagtacaa

1020

caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc ctactgccag ttactaacag gtaatgcttg aggactctgg cggaactgcc

1140

ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catggccctt atgtccaggg

1200

ctacacacgt gctacaatgg tagcgacaga gtgaagcgaa gccgcgaggt ggagcaaaac

1260

gcagaaaagc tatcgtagtt cggattggag tctgaaactc gactccatga agttggaatc

1320

gctagtaatc gcatatcagc acgatgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc

1380

ccgtcacacc atccgagtag agggtacccg aagtcggtag tctaaccgca aggaggacgn

1440

tgccgaagnt atgctttnta aggagggtga agtcgtaac

1479

<210> 1932

<211> 1548

<212> DNA

<213> Treponema pallidum

<400> 1932

atggagagtt tgatcctggc tcagaacgaa cgctggcggt gcgttttaag catgcaagtc

60

gaacggcaag gaagcgaatt ttcgtttctc tagagtggcg gactggtgag taacgcgtgg

120

gtaatctgcc tttgagatgg ggatagcctc tagaaatagg gggtaatacc gaatacgctc

180

ttttggacgt aggtctttga gaggaaaggg gctgcggcct cgctcagaga tgagcctgcg

240

acccattagc ttgttggtgg ggtaatggcc taccaaggcg tcgatgggta tccgacctga

300

gagggtgacc ggacacactg ggactgagat acggcccaga ctcctacggg aggcagcagc

360

taagaatatt ccgcaatggg cgaaagcctg acggagcgac accgcgtgga tgaggaaggt

420

cgaaagattg taaagttctt ttgccgacga agaatgagga cgggagggaa tgcccgtttg

480

atgacggtag tcgtgcgaat aagccccggc taattacgtg ccagcagccg cggtaacacg

540

taaggggcga gcgttgttcg gaattattgg gcgtaaaggg catgcaggcg gactggtaag

600

cctggtgtga aatccccgag ctcaacttgg gaactgcact gggtactgct ggtctagaat

660

cacggagggg aaaccggaat tccaagtgta ggggtggaat ctgtagatat ttggaagaac

720

accggtggcg aaggcgggtt tctggccgat gattgacgct gaggtgcgaa ggtgtgggga

780

gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cacagtaaac gatgtacact aggtgttggg

840

gcatgagtct cggcgccgac gcgaacgcat taagtgtacc gcctggggag tatgctcgca

900

agagtgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat

960

tcgatgatac gcgaggaacc ttacccgggt ttgacatcaa gaggagcgcc gtagaaatgc

1020

ggtggcgtag cgatacgcct cttgacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgccgtg

1080

aggtgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccctact gccagttgcc agcaagtggt

1140

gttggggact ctggcggaac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttatgtcc ggggctacac acgtgctaca atggttgcta cagagcgatg

1260

cgaggttgtg aagtggagca aaccgcaaaa aggcaatcgt agtccggatt gaagtctgaa

1320

actcgacttc atgaagttgg aatcgctagt aatcgcacat cagcatggtg cggtgaatgt

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatccga gttggagata cccgaagtca

1440

ctagcctaac ccgcaaggga gggcggtgcc gaaggtatgt ttggtaagga gggtgaagtc

1500

gtaacaaggt agccgtaccg gaaggtgcgg ctggatcacc tcctttct

1548

<210> 1933

<211> 1485

<212> DNA

<213> Treponema parvum

<400> 1933

gctcagaacg aacgctggcg gcgcgtctta agcatgcaag tcgaacggca agaggaaagc

60

ttgcttttct cctagagtgg cggactggtg agtaacacgt gggtgacgaa ccctcctgac

120

agggatagct ggtagaaata tcagataata ccggatacga actctatagt tagagtatag

180

agaggaaagg tgctttggca ccgcaggggg atcggctcgc ggcctatcag ctagttggca

240

gggtaaaggc ctgccaaggc gacgacgggt atccggcctg agagggtgga cggacacatt

300

gggactgaga tacggcccag actcctacgg gaggcagcag ctaagaatat tccgcaatgg

360

gcgaaagcct gacggagcga cgccgcgtgg acgatgaagg ccgaaaggtt gtaaagtcct

420

tttgaacctg aagaataagt ttaagaggga atgcttaagc ggtgacagaa aggtttgaat

480

aagcaacggc taattacgtg ccagcagccg cggtaacacg taagttgcga gcgttgttcg

540

gaattattgg gcgtaaaggg catctaggcg gtcattcaag cttggtgtga aataccgggg

600

cttaactccg gggctgcatt gagaactgga tgactggagt cactgaaggg caaccagaat

660

tccaggtgta ggggtgaaat ctgtagatat ctggaagaat accaatggcg aaggcaggtt

720

accggcagat gactgacgct gaagtgcgaa ggtgcgggga gcaaacagga ttagataccc

780

tggtagtccg cacagtcaac aatgtacact cggtgtccgg ccaagaggct gggtgccaaa

840

gcaaacgcga taagtgtacc gcctggggag tatgcccgca agggtgaaac tcaaaggaat

900

tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgatggtac gcgaggaacc

960

ttacctgggt ttgacataca cagcgatcat atagagatat gtgagcgtag caatacggct

1020

gtgaacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgccgtg aggtgttggg ttaagtcccg

1080

caacgagcgc aacccctact gccagttacc agcatgtaaa gatggggact ctggcggaac

1140

tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatggc ccttatgtcc

1200

agggcaacac acgtgctaca atggtcgcga cagagtgaag cgaagtcgag aggcgaagca

1260

aaacgcataa aagcgatcgt agtccggatt ggagtctgaa acccgactcc atgaagttgg

1320

aatcgctagt aatcgcacat cagcacggtg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca

1380

ccgcccgtca caccatccga gtaaaggata cccgaagcca gtggttcaac cgcaaggagg

1440

gcgctgtcga aggtatgctt tgtaaggggg gtgaagtcgt aacaa

1485

<210> 1934

<211> 1547

<212> DNA

<213> Treponema phagedenis

<400> 1934

tggagagttt gatcctggct cagaacgaac gctggcggcg cgtcttaagc atgcaagtcg

60

aacggcaagg gaggagcttg cttctcccct agagtggcgg actggtgagt aacgcgtggg

120

tgatctaccc ttaagatggg gatagctcct agaaatagga ggtaataccg aatacgctta

180

tacggataaa gccgtataag gaaaggaggc tgcggccttg cttgaggatg agcccgcgtc

240

ccattatgct tgttggtgag gtaacggctt accaaggcga cgatgggtat ccggcctgag

300

agggtggacg gacacattgg gactgagata cggcccaaac tcctacggga ggcagcagct

360

aagaatattc cgcaatggac ggaagtctga cggagcgacg ccgcgtggac gaagaaggcc

420

gaaaggttgt aaagttcttt tgccgatgaa gaataagagg atgagggaat gcgtccttga

480

tgacggtagt cgagcgaata agccccggct aattacgtgc cagcagccgc ggtaacacgt

540

aaggggcgag cgttgttcgg aattattggg cgtaaagggc acgcaggcgg gttggtaagc

600

ctgatgtgaa atactcaagc ttaacttgag aattgcattg ggtactgcca gtcttgaatc

660

acggagggga aaccggaatt ccaagtgtag gggtggaatc tgtagatatt tggaagaaca

720

ccggtggcga aggcgggttt ctggccgatg attgacgctg aggtgcgaag gtgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac acagtaaacg atgtacacta ggtgttgggg

840

caagagcttc agtgccggcg caaacgcaat aagtgtaccg cctggggagt atgcccgcaa

900

gggtgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

960

cgatgatacg cgaggaatct tacctgggtt tgacatcaaa agcaatatta tagagatatg

1020

gtagcgtagc aatacggctt ttgacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgccgtga

1080

ggtgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctactg tcagttgcta acaggtaaag

1140

ctgaggactc tggcggaact gccgatgaca aatcggagga aggtggggat gacgtcaagt

1200

catcatggcc cttatgtcca gggctacaca cgtgctacaa tggttgctac aaagtgaagc

1260

gagactgtga ggttaagcaa atcgcaaaaa agcaatcgta gttcggattg aagtctgaaa

1320

ctcgacttca tgaagttgga atcgctagta atcgcacatc agcacggtgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatccgag ttgagggtac ccgaagtcgc

1440

cagtctaacc cgtaagggag ggcggtgccg aaggtatgtt tggcaaggag ggtgaagtcg

1500

taacaaggta gccgtaccgg aaggtgcggc tggatcacct cctttct

1547

<210> 1935

<211> 1260

<212> DNA

<213> Treponema putidum

<400> 1935

agtggcggac tggtgagtaa cgcgtgggtg acctgccctg aagatgggga tagctagtag

60

aaatattaga taataccgaa tgtggaaagc cgctttagga tgggcctgcg tcccattagc

120

tagttggtga ggtaaaggct caccaaggca acgatgggta tccggcctga gagggtgaac

180

ggacacattg ggactgagat acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagc taagaatctt

240

ccgcaatgga cgaaagtctg acggagcgac gccgtgtgaa tgaagaaggc cgaaaggttg

300

taaaattctt ttgcagatga agatgacggt agtctgcgaa taagccccgg ctaattacgt

360

gccagcagcc gcggtaacac gtaaggggcg agcgttgttc ggaattattg ggcgtaaagg

420

gtatgtaggc ggttaggtaa gcctggtgtg aaatctacga gctcaactcg taaactgcat

480

tgggtactgc ttaacttgaa tcacggaggg gaaaccggaa ttccaagtgt aggggtggaa

540

tctgtagata tttggaagaa caccggtggc gaaggcgggt ttctggccga attgacgctg

600

atatacgaag gtgcggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccgc acagtaaacg

660

atgtacacta ggtgtcgggg cttcggtgcc gacgcaaacg cattaagtgt accgcctggg

720

aagtatgccc gcaagggtga aactcaaagg aattgacggg ggcccacaca agcggtggag

780

catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttacctg ggtttgacat cgacaggtgc

840

tgcatggctg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

900

cccctactgc cagttactaa cagctgagga ctctggcgga actgccgatg acaaatcgga

960

ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg gcccttacgt ccagggctac acacgtgcta

1020

caatggttgc caaatcgaag cgacaccgcg aggtcaagca aaacgcaagc aatcgtagtc

1080

cggatgaagt ctgaaactcg acttcagaag ttggaatcgc tagtaatcgc acatcagcac

1140

ggtgcggtga atacgttcct gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat ccgagtcgag

1200

ggtacccgaa gtcgctgtct aggacggtgc cgaaggtacg tttggtaagg agggtgaagt

1260

<210> 1936

<211> 1455

<212> DNA

<213> Treponema refringens

<220>

<221> modified_base

<222> (1447)..(1447)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1454)..(1454)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1936

acgaacgctg gcggcgcgtt ttaagcatgc aagtcgaacg gcaaggtaag agcttgctct

60

taccctagag tggcggactg gtgagtaacg cgtgggtaat ctacctttag gatggggata

120

gctactagaa atagtagata ataccgaatg tgcttatatg ttaaatcatg taaggaaagg

180

gagctaaggc tttgcctaaa gaagagctcg cgtcccatta gctagttggt atggtaagag

240

cgtaccaagg caacgatggg tatccgacct gagagggtga tcggacacat tgggactgag

300

acacagccca gactcctacg ggaggcagca gctaagaatc ttccgcaatg ggcgcaagcc

360

tgacggagcg acgccgcgtg aatgaagaag gccgaaaggt tgtaaaattc ttttaagttt

420

gaagaataat cagtrtaggg aatgatactg agatgacggt aaaacttgaa taagccccgg

480

ctaattacgt gccagcagcc gcggtaacac gtaaggggcg agcgttgttc ggaattattg

540

ggcgtaaagg gtatgcaggc ggttagataa gcccgatgtg aaatgctcaa gcttaacttg

600

agaactgcat taggtactgt ttaacttgaa tcacgaaggg gaaactggaa ttccgggtgt

660

aggggtggaa tctgtagata tccggaggaa taccggtggc gaaggcgggt ttctggtcga

720

tgattgacgc tgagatacga aagtgtgggg agcaaacagg attagatgcc ctggtagtcc

780

acaccataaa cgatgtacac taggtgttgg ggcaagagct tcagtgccga agcaaacgtg

840

ataagtgtac cgcctgggga gtatgccggc aacggtgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg

900

cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaggata cgcgaggaac cttacctggg

960

tttgacatca agagtaatac ggtagagata ctgtagcgta gcaatacgac ttttgacagg

1020

tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgccgt gaggtgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1080

caacccctac tgccagttac taacaggtga agctgaggac tctggcggaa ctgccgatga

1140

caaatcggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgg cccttatgcc cagggctaca

1200

cacgtgctac aatggttgct acagaatgaa gctaaactgc gaagtggagc gaaacgtaaa

1260

aaagcaatcg tagtccggat tgaagtctga aacccgactt catgaagttg gaatcgctag

1320

taatcgcaca tcagcacggt gcggtgaata cgttcctggg ccttgtacac accgcccgtc

1380

acaccatccg agtcgaagat acccgaagtc gcttgtttaa cccgcaaggg aggacggtgc

1440

cgaaggnatg tttng

1455

<210> 1937

<211> 1477

<212> DNA

<213> Treponema socranskii

<220>

<221> modified_base

<222> (1458)..(1458)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1937

gctcagaacg aacgctggcg gcgcgtctta accatgcaag tcgagcggca ggcagcaatg

60

ccgagagcgg cggactggtg agtaacacgt ggataacgta ccccgatgcc cgggacagcc

120

tgtagaaata gagggtgata ccggatagat cactgtatac ggaaggtaga cagcgggaaa

180

ggagcttcgg ctccgcgccg ggaacggtct gcggcccatc agctggacgg cggggtaacg

240

gcccgccgtg gcgaggacgg gtatccggcc tgagagggcg gacggacaca ttgggactga

300

gatacggccc agactcctac gggaggcagc aggtaagaat attccgcaat ggggggaacc

360

ctgacggagc gacgccgcgt gaacgaagaa ggccggaagg ttgtaaagtt cttttctgtc

420

cgaggaataa gtgtaggagg aaatgcctgc atggtgacgg taggacagga ataagcaccg

480

gctaattacg tgccagcagc cgcggtaaca cgtaaggtgc gagcgttgtt cggaattatt

540

gggcgtaaag ggcatgcagg cgggtcgcca agcttggtaa gaaataccgg ggctcaactc

600

cggagctata ttgagaactg gcgagctgga gttgccgaag ggtatccgga attccgcgtg

660

aaggggtgaa atctgtagat atgcggaaga acaccgatgg cgaaggcagg ataccggcgg

720

acgactgacg ctgaggtgcg aaggtgcggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc

780

cgcacagtca acgatgtaca ctgggcgtgt gcgcaagagc gtgcgtgccg aagcaaacgc

840

gataagtgta ccgcctgggg agtatgcccg caagggtgaa actcaaagga attgacgggg

900

gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatggt acgcgaggaa ccttacctgg

960

gtttgacatc aagagggatc atatagagat atgtgagcgt agcaatacgg ctcttgacag

1020

gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgccg tgaggtgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1080

gcaaccccta ctgccggtta ctaacaggta aagctgagga ctcaggcgga actgcctgcg

1140

acaagcagga ggaaggcggg gacgacgtca agtcatcatg gcccttatgt ccagggctac

1200

acacgtgcta caatggccgc cacagagcga ggcgaagccg agaggcggag cagaacgcag

1260

aaaagcggtc gtagtccgga ttgaagtctg aaactcgact tcatgaagct ggaatcgcta

1320

gtaaccgcac atcagcacgg cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

cacaccatcc gagcaggggg tacccgaagc cggcagtcca accgcaaggg ggacgctgtc

1440

gaaggtacgc tttgtgangg gggtgaagtc gtaacaa

1477

<210> 1938

<211> 1498

<212> DNA

<213> Treponema sp. 6:H:D15A-4

<400> 1938

cggcgcgtct taaccatgca agtcgagcgg caggcagcaa tgccgagagc ggcggactgg

60

tgagtaacac gtggataacg taccccgatg cccgggacag cctgtagaaa tagagggtaa

120

taccggatag gtcaccatat tcgcaaggga tatggcggga aaggagcttc ggctccgcgc

180

cgggaacggt ctgcggccca tcagctggac ggcggggtaa aagcccgccg tggcgaggac

240

gggtatccgg cctgagaggg cggacggaca cattgggact gagatacggc ccagactcct

300

acgggaggca gcaggtaaga atattccgca atggggggaa ccctgacgga gcgacgccgc

360

gtgaacgaag aaggccggaa ggttgtaaag ttcttttctg ttcgaggaat aagtgtagga

420

ggaaatgcct gcatggtgac ggtagggcag gaataagcac cggctaatta cgtgccagca

480

gccgcggtaa cacgtaaggt gcgagcgttg ttcggaatta ttgggcgtaa agggcatgca

540

ggcgggtcgc caagcttgat gagaaatacc ggggctcaac tccggagcta tattgagaac

600

tggcgagcta gagttgccga agggtatccg gaattccgcg tgaaggggtg aaatctgtag

660

atatgcggaa gaacaccgat ggcgaaggca ggataccggc ggacgactga cgctgaggtg

720

cgaaggtgcg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccgcacagt caacgatgta

780

cactgggcgt gtgcgcaaga gcgtgcgtgc cgaagcaaac gcgataagtg taccgcctgg

840

ggagtatgcc cgcaagggtg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga

900

gcatgtggtt taattcgatg gtacgcgagg aaccttacct gggtttgaca tacacagcaa

960

tcatatagag atatgtgagc gtagcaatac ggctgtgaac aggtgctgca tggctgtcgt

1020

cagctcgtgc cgtgaggtgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc tactgccggt

1080

tactaacagg taaagctgag gactcaggcg gaactgcctg cgacaagcag gaggaaggcg

1140

gggacgacgt caagtcatca tggcccttat gtccagggct acacacgtgc tacaatggcc

1200

gccacagagc ggggcgaagc cgagaggcgg agcagaacgc agaaaagcgg tcgtagtccg

1260

gattgaagtc tgaaactcga cttcatgaag ctggaatcgc tagtaaccgc acatcagcac

1320

ggcgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat ccgagcaggg

1380

ggtacccgaa gccggcagtc caaccgcaag ggggacgctg tcgaaggtac gctttgtgag

1440

gggggtgaag tcgtaacaag gtagtcgtac cggaaggtgc ggctggawca cctccttc

1498

<210> 1939

<211> 1404

<212> DNA

<213> Treponema sp. clone DDKL-4

<220>

<221> modified_base

<222> (821)..(821)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (831)..(831)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (840)..(841)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (843)..(843)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (886)..(886)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1939

tagagtggcg gactggtgag taacgcgtgg gtgatctgcc cttaagatgg ggatagctcc

60

tagaaatagg aggtaatacc gaatacgctt atacggataa agccgtataa ggaaaggagg

120

ctacggcctt gcttgaggat gagcccgcgt cccattatgc ttgttggtga ggtaacggct

180

taccaaggcg acgatgggta tccggcctga gagggtggac ggacacattg ggactgagat

240

acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagc taagaatatt ccgcaatgga cggaagtctg

300

acggagcgac gccgcgtgga cgaagaaggc cgaaaggttg taaagttctt ttgccgatga

360

agaataagag gatgagggaa tgcgtccttg atgacggtag tcgagcgaat aagccccggc

420

taattacgtg ccagcagccg cggtaacacg taaggggcga gcgttgttcg gaattattgg

480

gcgtaaaggg cacgcaggcg ggttggtaag cctgatgtga aatactcaag cttaacttga

540

gaattgcatt gggtactgcc agtsttgaat cacggagggg aaaccggaat tccaagtgta

600

ggggtggaat ctgtagatat ttggaagaac accggtggcg aaggcgggtt tctggccgat

660

gattgacgct gaggtgcgaa ggtgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

720

cacagtaaac gatgtacact aggtgttggg caagagcttc agtgccggcg caaacgcaat

780

aagtgtaccg cctggggagt atgcccgcaa gggtgaaact naaaggaatt nacgggggcn

840

ngnacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgatgatacg cgaggnatct tacctgggtt

900

tgacatcaaa agcaatatta tagagatatg gtagcgtagc aatacggctt ttgacaggtg

960

ctgcatggct gtcgtcagct cgtgccgtga ggtgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

1020

acccctactg tcagttgcta acaggtaacg ctgaggactc tggcggaact gccgatgaca

1080

aatcggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc cttatgtcca gggctacaca

1140

cgtgctacaa tggttgctac aaagtgaagc gagactgtga ggttaagcaa atcgcaaaaa

1200

agcaatcgta gttcggattg aagtctgaaa ctcgacttca tgaagttgga atcgctagta

1260

atcgcacatc agcacggtgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac

1320

accatccgag ttgagggtac ccgaagtcgc cagtctaacc cgtaagggag ggcggtgccg

1380

aaggtatgtt tggcaaggag ggtg

1404

<210> 1940

<211> 1327

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral clone JU025

<400> 1940

ggagtttgat cctggctcag aacgaacgct ggcggcgcgt cttaaacatg caagtcgaac

60

gagtggcgga ctggtgagta acacgtgggt gatatacctt ttagttgggg atagctgtta

120

gaaatagcag gtaataccga atgtggaaag ccgctagaag aatggctcgc ggcccattag

180

ctcgttggtg aggtaacggc ccaccaaggc aatgatgggt atccggcctg agagggtgaa

240

cggacacatt gggactgaga tacggcccag acttctacgg gaggcagcag ttaagaatat

300

tccgcaatgg acgaaagtct gacggagcga cgccgcgtgg atgaagaatg ccgaaaggtt

360

gtaaaatcct tttaagcctg aggatgacag tagggcttga ataagcaacg gctaattacg

420

tgccagcagc cgcggtaaca cgtaagttgc gagcgttgtt cggaattatt gggcgtaaag

480

ggcatgtagg cggatatgca agcttggtgt gaaatactgc agcttaactg cggaactgca

540

ttgagaactg cacatcttga attactgaag ggtaaccaga attccacgtg taggggtgaa

600

atctgtagat atgtggaaga ataccaatgg cgaaggcagg ttaccggcag aattgacgct

660

gaggtgcgaa agtgcgggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtccg caccgtaaac

720

gatgtacact aggtgtccgg cgctgggtgc caaagcaaac gtgataagtg taccgcctgg

780

ggagtatgcc cgcaagggtg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga

840

gcatgtggtt taattcgatg gtacgcgagg aaccttacct gggtttgaca taaacaggtg

900

ctgcatggct gtcgtcagct cgtgccgtga ggtgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

960

acccctactg ccagttacta acagctgagg actctggcgg aactgccggt gacaaaccgg

1020

aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat ggcccttatg tccagggcta cacacgtgct

1080

acaatggtag gcaaagtgag gcgaagctgt aaagcggagc aaaacgcaaa ctatcgtagt

1140

ccggatggag tctgaaactc gactccagaa gttggaatcg ctagtaatcg cgcatcagca

1200

cggcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tccgagtaga

1260

gggtacccga agtcggtgtc taggacgctg ccgaaggtat gttttgtaag gagggtgaag

1320

tcgtaac

1327

<210> 1941

<211> 1327

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral clone JU031

<400> 1941

ggagtttgat cctggctcag aacgaacgct ggcggcgcgt cttaagcatg caagtcgaac

60

gagtggcgga ctggtgagta acacgtgggt gatctaccct tgagatgggg atagccgtta

120

ggaatagcgg gtaataccga atacagaaag tcgctcgagg atgagcttgc gtcccattag

180

ctagttggtg aggtaagggc ccaccaaggc gacgatgggt atccggcctg agagggtgaa

240

cggacacatt gggactgaga tacggcccaa actcctacgg gaggcagcag ctaagaatat

300

tccgcaatgg acggaagtct gacggagcga cgccgcgtgg atgaagaagg ctgaaaagtt

360

gtaaaatcct tttgctgatg aagatgacga taatcggcga ataagccccg gctaattacg

420

tgccagcagc cgcggtaaca cgtaaggggc gagcgttgtt cggaattatt gggcgtaaag

480

ggcatgtagg cggttatgta agcctgatgt gaaatgctgg ggctcaaccc cagaactgca

540

ttgggtactg cgtagcttga attacggaag ggaaactgga attccaagtg taggggtgga

600

atctgtagat atttggaaga acaccggtgg cgaaggcggg tttctggccg aattgacgct

660

gagatgcgaa agtgtgggga tcgaacagga ttagataccc tggtagtcca caccgtaaac

720

gatgtacact aggtgctgga gcttcagtgc caaagcaaac gtgataagtg taccgcctgg

780

ggagtatgcc cgcaagggtg aaactcaaag ggattgacgg gggcccgcac aagcggtgga

840

gcatgtggtt taattcgatg gtacgcgagg aaccttacct gggttcgaca tcgacaggtg

900

ctgcatggct gtcgtcagct cgtgccgtga ggtgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

960

acccctactg ccagttacta gcagctgagg actctggcgg aactgccgat gacaaatcgg

1020

aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat ggcccttatg tccagggcta cacacgtgct

1080

acaatggttg ccaaagcgaa gcgatgctgt gaggctaagc aaaccgcaag caatcgtagt

1140

tcggatgaag tctgaaactc gacttcagaa gttggaatcg ctagtaatcg cgcatcagca

1200

cggcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tccgagttga

1260

gggtacccga agtcgctgtc taggacggtg ccgaaggtac gtttggtaag gagggtgaag

1320

tcgtaac

1327

<210> 1942

<211> 1295

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral clone P2PB_53 P3

<400> 1942

aacgaacgct ggcggcgcgt cttaagcatg caagtcgaac gagtggcgga ctggtgagta

60

acgcgtgggt gacctgccct gaagatgggg atagctagta gaaatattag ataataccga

120

atgtggaaag ccgcttcagg atgggcctgc gtcccattag ctggttggtg aggtaaaggc

180

tcaccaaggc aacgatgggt atccggcctg agagggtgaa cggacacatt gggactgaga

240

tacggcccaa actcctacgg gaggcagcag ctaagaatct tccgcaatgg acgaaagtct

300

gacggagcga cgccgtgtga atgaagaagg ccgaaaggtt gtaaaattct tttgcagatg

360

aagatgacgg taatctgcga ataagccccg gctaattacg tgccagcagc cgcggtaaca

420

cgtaaggggc gagcgttgtt cggaattatt gggcgtaaag ggtatgtagg cggttaggta

480

agcctggtgt gaaatctacg agctcaactc gtaaactgca tcgggtactg cttgacttga

540

atcacggagg ggaaaccgga attccaagtg taggggtgga atctgtagat atttggaaga

600

acaccggtgg cgaaggcggg tttctggccg aattgacgct gatatacgaa ggtgcgggga

660

gcaaacagga ttagataccc tggtaatccg cacagtaaac gatgtacact aggtgtcgga

720

gcttcggtgc cgacgcaaac gcattaagtg taccgcctgg gaagtatgcc cgcaagggtg

780

aaactcaaag gaattgacgg gggcccacac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg

840

atacgcgaga aaccttacct gggttgacat cgacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

900

gtgccgtgag gtgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctactgc cagttactaa

960

cagctgagga ctctggcgga actgccgatg acaaatcgga ggaaggtggg gatgacgtca

1020

agtcatcatg gcccttacgt ccagggctac acacgtgcta caatggttgc caaatcgaag

1080

cgacaccgcg aggtcaagca aaacgcagca atcgtagtcc ggatgaagtc tgaaactcga

1140

cttcagaagt tggaatcgct agtaatcgca catcagcacg gtgcggtgaa tacgttcctg

1200

ggccttgtac acaccgcccg tcataccatc cgagtcgagg gtacccgaag tcgctgtcta

1260

ggacggtgcc gaaggtacgt ttggtaagga gggtg

1295

<210> 1943

<211> 1460

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral taxon 228

<400> 1943

aacgaacgct ggcggcgcgt cttaagcatg caagtcgaac ggcaagagag gagcttgctt

60

ctctcctaga gtggcggact ggtgaggaac gcgtgggtaa tctaccctta agatggggat

120

agccgctaga aatagcgggt aataccaata gacttatagc tgagaaagaa gtgataagga

180

aaggaagcta aggcttcgct taaggatgag cctgcgtccc attagctagt tggtaaggta

240

acggcctacc aaggcgacga tgggtatccg gcctgagagg gtgaacggac acattgggac

300

tgagatacgg cccaaactcc tacgggaggc agcagctaag aatattccgc aatggacgaa

360

agtctgacgg agcgacgccg cgtggatgaa gaaggctgaa aagttgtaaa atccttttgt

420

tgatgaagaa taagggtgag agggaatgtt catctgatga cggtaatcag cgaataagcc

480

ccggctaatt acgtgccagc agccgcggta acacgtaagg ggcgagcgtt gttcggaatt

540

actgggcgta aagggcatgt aggcggttat gtaagcctga tgtgaaatcc tgaggcttaa

600

cctcagaata gcattgggta ctgtgtaact tgaattacgg aagggaaact ggaattccaa

660

gtgtaggggt ggaatctgta gatatttgga agaacaccgg tggcgaaggc gggtttctgg

720

ccgataattg acgctgagat gcgaaagtgt ggggatcgaa caggattaga taccctggta

780

gtccacaccg taaacgatgt acactaggtg ttggggcaag agcttcagtg ccaaagtaaa

840

cgcgataagt gtaccgcctg gggagtatgc ccgcaagggt gaaactcaaa ggaattgacg

900

ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat ggtacgcgag gaaccttacc

960

tgggtttgac atctagtgga atgtcttaga gataaggcag tgtagcaata caccgctaga

1020

caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc ctactgccag ttactaacag gtaaagcttg agactctggc ggaactgccg

1140

atgacaaatc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atggccctta tgtccagggc

1200

tacacacgtg ctacaatggt tgctacaaag cgaagcgaga ccgtaaggtg gagcaaaccg

1260

caaaaaagca atcgtagttc ggattgaagt ctgaaactcg acttcatgaa gttggaatcg

1320

ctagtaatcg cgcatcagca cggcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1380

cgtcacacca tccgagttgg gggtgcccga agtcgcttgt ctaacccgca agggagacgg

1440

tgccgaaggt acgcttggta

1460

<210> 1944

<211> 1423

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral taxon 230

<400> 1944

aacgaacgct ggcggcgcgt cttaagcatg caagtcgaac ggcaagagag gagcttgctt

60

ctctcctaga gtggcggact ggtgaggaac cgtgggtaat ctacccttaa gatggggata

120

gcgtagaaat agcgtaatac cgaatactgg aggaaagggc taggctcgct aggatgagcg

180

cgtcccatta gctagttggt aggtaaggcc accaaggcga cgatgggtat ccggcctgag

240

agggtgacgg acacattggg actgagatac ggcccaaact cctacgggag gcagcagcta

300

agaatattcc gcaatggacg gtctgacgga gcgacgccgc gtggatgaag aaggctgaaa

360

agttgtaaaa tccttttgtt gatgaggaat aagggtgaga gggaatgctc atctgatgac

420

ggtaatcgac gaataagccc cggctaatta cgtgccagca gccgcggtaa cacgtaaggg

480

gcgagcgttg ttcggaatta ttgggcgtaa agggcatgta ggcggttatg taagcctgat

540

gtgaaatcct ggggcttaac cctagaatag cattgggtac tgtataactt gaattacgga

600

aggggaactg gaattccaag tgtaggggtg gaatctgtag atatttggaa gaacaccggt

660

ggcgaaggcg ggtttctggc cgataattga cgctgagatg cgaaagtgtg gggatcgaac

720

aggattagat accctggtag tccacaccgt aaacgatgta cactaggtgt tggggcaaga

780

gcttcagtgc caaagcaaac gcgataagtg taccgcctgg ggagtatgcc cgcaagggtg

840

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg

900

gtacgcgagg aaccttacct gggtttgaca tctagtggaa tgccttagag ataaggtagt

960

gtagtttact acaccgctag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gccgtgaggt

1020

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcgacc cctattgcca gttactaaca ggtaaagctt

1080

gaggactctg gcggaactgc cgatgacaaa tcggaggaag gtggggatga cgtcaagtca

1140

tcatggccct tatgtccagg gctacacacg tgctacaatg gctgctacaa agcgaggcga

1200

gactgtgaag gtgagcaaac cgcaaaaaag cagccgtagt tcggattgaa gtctgaaact

1260

cgacttcatg aagttggaat cgctagtaat cgcgcatcag cacggcgcgg tgaatacgtt

1320

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catccgagtt gggggtaccc gaagtcgctc

1380

gtctaacccg taagggagga cggtgccgaa ggtacgcttg gtg

1423

<210> 1945

<211> 1439

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral taxon 231

<400> 1945

aacgaacgct ggcggcgcgt cttaagcatg caagtcgaac ggcaagagag gagcttgctt

60

ctctcctaga gtggcggact ggtgaggaac acgtgggtaa tctaccctta agatggggat

120

agctgctaga aatagcagat aataccgaat acactcggcg cttcataaga ggcgttgagg

180

aaaggaagct acggcttcgc ttgaggatga gcttgcgtcc cattagctag ttggtgaggt

240

aacggcccac caaggcgacg atgggtatcc ggcctgagag ggtgaacgga cacattggga

300

ctgagatacg gcccaaactc ctacgggagg cagcagctaa gaatattccg caatggacgg

360

aagtctgacg gagcgacgcc gcgtggatga agaaggctga aaagttgtaa gatccttttg

420

ttgatgaaga ataaggatga gagggaatgc tcatctgatg acggtaatcg acgaataagc

480

cccgttacgt gccagcagcc gcggtaacac gtaaggggcg agcgttgttc ggaattattg

540

ggcgtaaagg gcatgtaggc ggttatgtaa gcctgtgtga aatctgggct taaccctgaa

600

agcattgggt actgttactt gaattacgga agggaactga attccaagtg taggggtgga

660

atctgtgata tttggaagaa caccggtggc gaaggcgggt ttctggccga taattgacgc

720

tgagtgcgaa agtgtgggga tcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cactgtaaac

780

gatgtacact aggtgttggg aagagcttca gtgccaaaga aacggataag tgtaccgcct

840

ggggagtatg cccgcaaggg tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg

900

gagcatgtgg tttaattcga tggtacgcga ggaaccttac ctgggtttga catctaggag

960

tagagataag tagcaatacc gctagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgccgt

1020

gaggtgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccctac tgccagttac taacaggtaa

1080

agcttgagga ctctggcgga actgccgatg acaaatcgga ggaaggtggg gatgacgtca

1140

agtcatcatg gcccttatgt ccagggctac acacgtgcta caatggttct acaaagcgag

1200

caaccgtagg ggagcaaacc gcaaaaaagc aatcgtagtt cggattgaag tctgaaactc

1260

gacttcatga agttggaatc gctagtaatc gcgcatcagc acggtgcggt gaatacgttc

1320

ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atccgagttg ggggtacccg aagtcgcttg

1380

tctaaccgca aggggacggt gccgaggtac gcttggtaag gagggtgaag tcgtaacaa

1439

<210> 1946

<211> 1482

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral taxon 232

<400> 1946

aacgaacgct ggcggcgcgt cttaagcatg caagtcgaac ggcaagagag gagcttgctt

60

ctctcctaga gtggcggact ggtgaggaac gcgtgggtaa tctaccctta agatggggat

120

agccgctaga aatagcgggt aataccgaat agacttatag ctgagaaaga agtgataagg

180

aaaggaagct aaggcttcgc ttaaggatga gcctgcgtcc cattagctag ttggtaaggt

240

aacggcctac caaggcgacg atgggtatcc ggcctgagag ggtgaacgga cacattggga

300

ctgagatacg gcccaaactc ctacgggagg cagcagctaa gaatattccg caatggacgg

360

aagtctgacg gagcgacacc gcgtggatga agaaggctga aaagttgtaa aattcttttg

420

ctgatgaaga ataaagataa gagggaatgc ttatcagatg acggtagtcg gcgaataagc

480

cccggctaat tacgtgccag cagccgcggt aacacgtaag gggcgagcgt tgttcggaat

540

tattgggcgt aaagggcatg caggcggttg tgtaagcctg atgtgaaatc ctgaggctta

600

accttggggc tgcattgggt actgcacgac ttgaattacg gaaggggaac tggaattcca

660

agtgtagggg tggaatctgt agatatttgg aagaacaccg gtggcgaagg cgggtttctg

720

gccgataatt gacgctgaga tgcgaaagtg tggggatcga acaggattag ataccctggt

780

agtccacact gtaaacgatg tacactaggt gttggggtaa caatctcagt gccgaagcaa

840

acgtgataag tgtaccgcct ggggagtatg cccgcaaggg tgaaactcaa aggaattgac

900

gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga tggtacgcga ggaatcttac

960

ctgggtttga catctagtgg gatactttag agataaggta gtgtagcaat acaccgctag

1020

acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gccgtgaggt gttgggttaa gtcccgcaac

1080

gagcgcaacc cctactgcca gttactaaca ggtaaagctt gaggactctg gcggaactgc

1140

cgatgacaaa tcggaggaag gtggggatga cgtcaagtca tcatggccct tatgtccagg

1200

gctacacacg tgctacaatg gctgctacaa agcgaggcga gactgtgaag gtgagcaaac

1260

cgcaaaaaag cagccgtagt tcggattgaa gtctgaaact cgacttcatg aagttggaat

1320

cgctagtaat cgcgcatcag cacggcgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

1380

cccgtcacac catccgagtt gagggtaccc gaagtcgctt gtctaacccg caagggagga

1440

cggtgccgaa ggtatgcttg gtgaggaggg tgaagtcgta ac

1482

<210> 1947

<211> 1480

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral taxon 235

<400> 1947

aacgaacgct ggcggcgcgt cttaagcatg caagtcgaac ggcaagagag gagcttgctt

60

ctctcctaga gtggcggact ggtgaggaac acgtgggtaa tctaccctta agatggggat

120

agctgctaga aatagcagat aataccgaat acactcaatt tttcataaga ggagttgagg

180

aaagaggcta cggcctcgct taaggatgag cttgcgtccc attagctagt tggtgaggta

240

aaggctcacc aaggcgacga tgggtatccg gcctgagagg gtgaacggac acattgggac

300

tgagatacgg cccaaactcc tacgggaggc agcagctaag aatattccgc aatggacgga

360

agtctgacgg agcgacgccg cgtggatgaa gaaggctgaa aagttgtaaa atccttttgt

420

tgatgaagaa taagggtaag agggaatgct tgcctgatga cggtaatcgg cgaataagcc

480

ccggctaatt acgtgccagc agccgcggta acacgtaagg ggcgagcgtt gttcggaatt

540

attgggcgta aagggcatgt aggcggttat gtaagcctga tgtgaaatgc cggggcttaa

600

ccccggaaca gcattgggta ctgtataact tgaattacgg aagggaaact ggaattccaa

660

gtgtaggggt ggaatctgta gatatttgga agaacaccgg tggcgaaggc gggtttctgg

720

ccgataattg acgctgagat gcgaaagtgt ggggatcgaa caggattaga taccctggta

780

gtccacaccg taaacgatgt acactaggtg ttggggcaag agcttcagtg ccaaagcaaa

840

cgcgataagt gtaccgcctg gggagtatgc ccgcaagggt gaaactcaaa ggaattgacg

900

ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat ggtacgcgag gaaccttacc

960

tgggtttgac atctagagga atactgtaga gatacggtag cgtagcaata cgccgctaga

1020

caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg ttgggttaag tcccgcaacg

1080

agcgcaaccc ctactgccag ttactaacag gtaacgcttg aggactctgg cggaactgcc

1140

gatgacaaat cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catggccctt atgtccaggg

1200

ctacacacgt gctacaatgg ttgctacaaa gcgaagcaag accgtaaggt ggagcaaacc

1260

gcaaaaaagc aatcgtagtt cggattgaag tctgaaactc gacttcatga agttggaatc

1320

gctagtaatc gcgcatcagc acggcgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc

1380

ccgtcacacc atccgagttg ggggtacccg aagtcgcttg tctaacctgc aaagggggac

1440

ggtgccgagg gtacgcttgg taaggagggt gaagtcgtaa

1480

<210> 1948

<211> 1461

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral taxon 239

<400> 1948

aacgaacgct ggcggcgcgt cttaagcatg caagtcgaac ggcaagagag gagcttgctt

60

ctctcctaga gtggcggact ggtgaggaac acgtgggtaa tctaccctta agatggggat

120

agctgctaga aatagcaggt aataccgaat accctcacgt tcataaaggg atgtgaggaa

180

aggaagctac ggcttcgctc gaggatgagc ctgcgtccca ttagctagtt ggtgaggtaa

240

aggcccacca aggcgacgat gggtatccgg cctgagaggg tgatcggaca cattgggact

300

gagatacggc ccaaactcct acgggaggca gcagctaaga atattccgca atggacggaa

360

gtctgacgga gcgacgccgc gtggatgaag aaggctgaaa agttgtaaaa tccttttgct

420

gatgaagaat aagggtagga gggaatgcct atctgatgac ggtaatcggc gaataagccc

480

cggctaatta cgtgccagca gccgcggtaa cacgtaaggg gcgagcgttg ttcggaatta

540

ttgggcgtaa agggcatgta ggcggttatg taagcctgat gtgaaatact ggggctcaac

600

cccagaactg cattgggtac tgcgtagctt gaattacgga agggaaactg gaattccaag

660

tgtaggggtg gaatctgtag atatttggaa gaacaccggt ggcgaaggcg ggtttctggc

720

cgataattga cgctgagatg cgaaagtgtg gggatcgaac aggattagat accctggtag

780

tccacaccgt aaacgatgta cactaggtgc tggagtggaa gcttcagtgc caaagcaaac

840

gtgataagtg taccgcctgg ggagtatgcc cgcaagggtg aaactcaaag gaattgacgg

900

gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg gtacgcgagg aaccttacct

960

gggtttgaca tctagtggaa tgttttagag ataagacagt gtagcaatac accgctagac

1020

aggtgctgca tggctgtcgc cagctcgtgc cgtgaggtgt tgggttaagt cccgcaacga

1080

gcgcaacccc tactgccagt tactaacagg taaagcttga ggactctggc ggaactgccg

1140

atgacaaatc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atggccctta tgtccagggc

1200

tacacacgtg ctacaatggt tgctacaaag cgaagcgatg ctgtgaggct aagcaaaccg

1260

caaaaaagca atcgtagttc ggattgaagt ctgaaactcg acttcatgaa gttggaatcg

1320

ctagtaatcg cgcatcagca cggcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc

1380

cgtcacacca tccgagttga gggtacccga agtcgctcgt ctaacctgca aaggaggacg

1440

gtgccgaagg tacgtttggt a

1461

<210> 1949

<211> 1463

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral taxon 247

<400> 1949

aacgaacgct gacggcgcgt cttaagcatg caagtcgaac ggtaagagag gagcctaggt

60

gttctcctag agtggcggac tggtgagtaa cgcgtgggtg acctgcccta aagatgggga

120

tagctagtag aaatattaga taataccgaa tgtgctcatt tacataaagg tagatgagga

180

aagggggcta cggctccgct ttaggatggg cccgcgtccc attagctcgt tggtgaggta

240

acggcccacc aaggcaacga tgggtatccg gcctgagagg gtgaacggac acattgggac

300

tgagatacgg cccaaactcc tacgggaggc agcagctaag aatcttccgc aatggacgaa

360

agtctgacgg agcgacgccg tgtgaatgaa gaaggccgaa aggttgtaaa attcttttgc

420

agatgaagaa taaggataag agggaatgct tgtccgatga cggtagttat gcgaataagc

480

cccggctaat tacgtgccag cagccgcggt aacacgtaag gggcgagcgt tgttcggaat

540

tattgggcgt aaagggcatg taggcggtta ggtaagcctg atgtgaaatc tacgagctta

600

actcgtaaac tgcattgggt actgcttgac ttgaatcacg gaggggaaac cggaattcca

660

agtgtagggg tggaatctgt agatatttgg aagaacaccg gtggcgaagg cgggtttctg

720

gccgatgatt gacgctgata tgcgaaggtg cggggagcaa acaggattag ataccctggt

780

agtccgcaca gtaaacgatg tacactaggt gttggggcaa gagcttcagt gcctaagcaa

840

acgcaataag tgtaccgcct gggaagtatg cccgcaaggg tgaaactcaa aggaattgac

900

gggggcccac acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga tgatacgcga ggaaccttac

960

ctgggtttga catcaagagc aatactatag agatatggta gcgtagcaat acggctcttg

1020

acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gccgtgaggt gttgggttaa gtcccgcaac

1080

gagcgcaacc cctactgcca gttactaaca ggtaaagctt gaggactctg gcggaactgc

1140

cgatgacaaa tcggaggaag gtggggatga cgtcaagtca tcatggccct tacgtccagg

1200

gctacacacg tgctacaatg gttgctacaa atcgatgcaa aaccgtgagg tcaagcaaaa

1260

cgcaaaaaag caatcgtagt ccggattgaa gtctgaaact cgacttcatg aagttggaat

1320

cgctagtaat cgcacatcag cacggtgcgg tgaatacgtt cctgggcctt gtacacaccg

1380

cccgtcacac catccgagtc gagggtaccc gaagtcgcca gtctaacctg caaaggggga

1440

cgacgccgaa ggtacgcttg gta

1463

<210> 1950

<211> 1470

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral taxon 250

<400> 1950

aacgaacgct ggcggtgcgt cttaagcatg caagtcgaac ggtaagaggg gagcttagct

60

cccttcctag agtggcggac tggtgagtaa cgcgtggatg atctaccttt gagatgggga

120

tagcttctag aaataggaga taataccgaa taaccttatt gcgttttgat gtagtaagaa

180

aaggagcgtc agctccgctt aaagatgagt ctgcgtccca ttagctagtt ggtaaggtaa

240

aggcctacca aggcgacgat gggtacccgg cctgagaggg tgaacgggca cattgggact

300

gagatacggc ccaaactcct acgggaggca gcagctgaga atcttccgca atggacgaaa

360

gtctgatgga gcgacaccgc gtgaacgatg aaggccggaa ggttgtaaag ttcttttgca

420

gacaaagaat aaggatagaa ggaaatgact atctgatgac ggtagttatg cgaataagcc

480

ccggctaatt acgtgccagc agccgcggta atacgtaagg ggcgagcgtt gttcggaatt

540

attgggcgta aagggcatgt aggcggttag gtaagcctga tgtgaaatgt atgagcttaa

600

ctcataaact gcattgggta ctgcttgact tgaatcatgg aggggaaact ggaattccaa

660

gtgtaggggt ggaatctgta gatatttgga agaacaccgg tggcgaaggc gggtttctag

720

ccaatgattg acgctaaggt gcgaaggtgc ggggagcaaa caggattaga taccctggta

780

gtccgcacag taaacgatgt acactaggtg ttggggtaag actcagtgcc gaaagcaaac

840

gcaataagtg taccgcctgg ggagtatgcc cgcaagggtg aaactcaaag gaattgacgg

900

gggcccacac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg atacgcgagg aaccttacct

960

gggtttgaca tcaagaggga tactgtagag atatggtagc gtagcaatac gactcttgac

1020

aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt tgggttaagt cccgcaacga

1080

gcgcaacccc tactgccagt tactaacagg taaagcttga ggactctggc ggaactgccg

1140

gtgataaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atggccctta tgtccagggc

1200

tacacacgtg ctacaatggt tgttacaaag tgaagcgaag ccgcgaggtt aagcgaatgg

1260

caaaaaagca atcgtagtcc agattggaat ctgaaacctg attccatgaa gctggaatcg

1320

ctagtaatcg catatcagca cgatgcggtg aatacgttcc tgggccttgt acacaccgcc

1380

cgtcacacca tccgagtcga aggtacccga agacgctagt ctaaccgtaa ggaggacggt

1440

ggcgaaggta cgtttggtaa ggagggtgaa

1470

<210> 1951

<211> 1461

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral taxon 251

<400> 1951

aacgaacgct ggcggtgcgt cttaagcatg caagtcgaac ggtaagaaga gagcttgctc

60

ttttcctaga gtggcggact ggtgagtaac gcgtggatga tctaccttta agatggggat

120

agcttctaga aataggagat aataccgaat aaccttatcg tgttatgacg tgataagaaa

180

atggagcgtt agctccgctt gaagatgagt ctgcgtccca ttagctagtt ggtagggtaa

240

aggcttacca aggcgatgat gggtatccgg cctgagaggg tgaacggaca cattgggact

300

gagacacggc ccaaactcct acgggaggca gcagctgaga atcttccgca atggacgaaa

360

gtctgacgga gcgacaccgc gtgaacgatg aaggccggaa ggttgtaaag ttcttttgca

420

gacaaagaat aaggatagaa ggaaatgact atctgatgac ggtagttatg cgaataagcc

480

ccggctaatt acgtgccagc agccgcggta atacgtaagg ggcgagcgtt gttcggaatt

540

attgggcgta aagggcatgt aggcggttag gtaagcctga tgtgaaatgt atgagcttaa

600

ctcataaact gcattgggta ctgcttgact tgaatcatgg aggggaaact ggaattccaa

660

gtgtaggggt ggaatctgta gatatttgga agaacaccgg tggcgaaggc gggtttctag

720

ccaatgattg acgctaaggt gcgaaggtgc ggggagcaaa caggattaga taccctggta

780

gtccgcacag taaacgatgt acactaggtg ttggggtaag actcagtgcc aaagcaaacg

840

caataagtgt accgcctggg gagtatgcct gcaagggtga aactcaaagg aattgacggg

900

ggcccacaca agcggtggag catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttacctg

960

ggtttgacat caagagggat gctatagaga tatggtagcg tagtaatacg tctcttgaca

1020

ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgcc gtgaggtgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1080

cgcaacccct actgccagtt actaacaggt aaagctgagg actcaggcgg aactgccggt

1140

gataaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat ggcccttatg tccagggcta

1200

cacacgtgct acaatggttg ttacaaagtg aagcgaagcc gcgaggttga gcgaatcgca

1260

aaaaagcaat cgtagtccgg attggaatct gaaacctgat tccatgaagc tggaatcgct

1320

agtaatcgca tatcagcacg atgcggtgaa tacgttcctg ggccttgtac acaccgcccg

1380

tcacaccatc cgagtcgaag gtacccgaag acgctagtct aaccgtaagg aggacggtgg

1440

cgaaggtatg tttggtaagg a

1461

<210> 1952

<211> 1382

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral taxon 254

<400> 1952

aacgaacgct ggcggtgcgt cttaagcatg caagtcgaac ggcaagaaag tgcttgcact

60

ttcctagagt ggcggactgg tgagtaacgc gtgggtgatc tacctttaag atggggatag

120

cttttagaaa taagagataa taccgaatgt gcttgcgatg ctttggcgtt gcaaggaaag

180

gagcgtttgc tcgcttaaag atgagcctgc gtcccattag ctagttggtg aggtaatggc

240

ccaccaaggc gatgatgggt atccgacctg agagggtgat cggacacatt gggactgaga

300

tacggcccaa actcctacgg gatgcagcag ctgagaatct tccgcaatgg acgaaagtct

360

gacggagcga caccgcgtga atgatgaagg ccgaaaggtt gtaaaattct tttgcagaca

420

aagaataagt gtaggaggaa atgcctacat gatgacggta gttatgcgaa taagccccgg

480

ctaattacgt gcggggcgag cgttttcgga attattgggc gtaaagggca tgtaggcggt

540

ttaagcctgt gtgaatctac gagcttaact cgtaaatgca ttgggtactg cttgaatcag

600

aggggaactg gaattccaag tgtaggggtg gaatctgtag atatttggaa gaacaccggt

660

ggcgaaggcg ggtttctagc atgattgacg ctatgcgaag gtgggggagc aaacaggatt

720

agataccctg gtagtccgca cagtcatgta cactagtggg ggtaagactc agtgggcaaa

780

cgcataagtg taccgcctgg ggagtatgcc cgcaaggtga aactcaaagg aattgacggg

840

ggcccacaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgt acgcgaggaa ccttacctgg

900

gtttgacata aggattatag agatatggta gcgtagatac gctttacagg tgctgcatgg

960

ctgtcgtcag ctcgtgccgt gaggtgttgg gtaagtcccg caacgagcgc aaccctactg

1020

ccagttacta acaggtaaag tgaggactcg gcggaactgc cggtgataaa ccggaggaag

1080

gtggggatga cgtcaagtca tcatggccct tatgtccagg gctacacacg tgctacaatg

1140

gttgttacaa agtgaagcga agccgcgagg tgagcgaatg caaaagcaat cgtagtcgat

1200

tggaatctga aacctgattc atgaagctgg aatcgctagt aatcgctatc agcacgatgc

1260

ggtgaatacg ttcctgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatccgag tcgaggtacc

1320

caagagctag tctaacgagg gacggtggcg aaggtacgtg gtaaggaggg tgaagtcgta

1380

ac

1382

<210> 1953

<211> 1456

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral taxon 265

<400> 1953

aacgaacgct ggcggcgcgt cttaagcatg caagtcgaac ggtaagaagg agcttgcttc

60

ttcctagagt ggcggactgg tgagtatcgc gtggatgacg tacccttttg acggggatag

120

ccgatagaaa tatcagataa taccggataa tctcttttgg ggtaaagacg aaagaggaaa

180

gcagcttcgg ctgcgcagga ggaacggtcc gcgtcctatc agctagtcgg cagggtaaag

240

gcctgccgag gcgacgacgg gtatccggcc tgagagggtg gacggacaca ttgggactga

300

gatacggccc agactcctac gggaggcagc agctaagaat attccgcaat ggacgaaagt

360

ctgacggagc gacgccgcgt ggacgatgaa ggccggaggg ttgtaaagtc cttttatccg

420

tgaagaagaa gcgtaagagg aaatgcttgc gtggtgacgg tagcggatga ataagcaccg

480

gctaattacg tgccagcagc cgcggtaaca cgtaaggtgc gagcgttgtt cggaattatt

540

gggcgtaaag ggcatgcagg cggtcaggca agcccggcgt gaaaggcggg ggctcaactc

600

ccgaactgcg ctgggaactg cagggcttga gtttctgaag ggtagccgga attccacgtg

660

taggggtgaa atctgtagat atgtggaaga acaccaatgg cgaaggcagg ctactggcag

720

aagactgacg ctgaggtgcg aaggtgcggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc

780

cgcacagtca acgatgtgca ctagatgtct gtccacgagg atgggtgtca aagcaaacgc

840

gataagtgca ccgcctgggg agtatgcccg caagggtgaa actcaaagga attgacgggg

900

gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatggt acgcgaggaa ccttacctgg

960

gtttgacata cacagtgatt atgtagagat atataagcgc agcaatgcga ctgtgaacag

1020

gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgccg tgaggtgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1080

gcaaccccta ctgccagtta ccagcatgta atgatgggga ctctggcgga actgcctgcg

1140

acaagcagga ggaaggcggg gatgacgtca agtcatcatg gcccttatgt ccagggctac

1200

acacgtgcta caatggttgg gacaaagcgg agcgagtgcg agagtatgag cagaacgcag

1260

aaagccgatc gtagtccgga ttggagtctg aaactcgact ccatgaagtt ggaatcgcta

1320

gtaatcgcat atcagcacga tgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

cacaccatcc gagtggagag tacccgaagc cggcagtcta accgcaaggg ggacgctgtc

1440

gaaggtatgc ttcgtg

1456

<210> 1954

<211> 1522

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral taxon 270

<400> 1954

gagtttgatc ctggctcaga acgaacgctg gcggcgcgtc ttaagcatgc aagtcgaatg

60

gcaagattgg tgcttgcact gatcctagaa tggcggactg gtgagtaacg cgtgggtgac

120

gtaccctttg gacggggata gctgctagaa atagcagata ataccggata aggtggcctg

180

tgtcagaggc aggtcaggaa aggaacattt gttccgccga aggaacggct cgcgagctat

240

tagctagttg gtgaggtaac ggcccaccaa ggcgatgata gctacccggc ctaagagggt

300

gaacgggcac attgggactg agatacggcc cagactccta cgggaggcag cagctaagaa

360

tattccgcaa tggacgaaag tctgacggag cgacgccgcg tggatgatga aggtcggaag

420

attgtaaaat ccttttatga ctgaagaata agtatggtga gagaaacgcc gtatggtgac

480

agtaggtcat gaataagcaa cggctaatta cgtgccagca gccgcggtaa cacgtaagtt

540

gcgagcgttg ttcggaatta ttgggcgtaa agggcatgca ggcggaattg caagcttggt

600

gtgaaatacc ggggcttaac tccggaatag cattgagaac tgcaaaacta gagtcactga

660

ggggcaatca gaattccagg tgtaggggtg aaatctgtag atatctggaa gaataccaat

720

ggcgaaggca ggttaccagc agatgactga cgctgaggtg cgaaggtgcg gggagcaaac

780

aggattagag accctggtag tccgcacagt caactatgtg cactagatgt ctggtcgaca

840

gaccgggtgt cgaagcaaac gcgataagtg caccgcctgg ggagtatgcc cgcaagggtg

900

aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg

960

gtacgcgagg aaccttacct gggtttgaca tacacaggaa ttatatagag atatgtaagc

1020

gcagcaatgc gcctgtgaac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt

1080

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc tgctgccagt tactaacacg taaaggtgag

1140

gactctggcg gaactgccgg tgacaaaccg gaggaaggcg gggatgacgt caagtcatca

1200

tggcccttat gtccagggct acacacgtgc tacaatggga gatacagagt gaagcgaagc

1260

agcgatgcgg agcaaaacgc agaaaacctc tcgtagtccg gattggagtc tgaaactcga

1320

ctccatgaag ttggaatcgc tagtaatcgc acatcagcac ggtgcggtga atacgttccc

1380

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat ccgagtagat tctacccgaa gccggcagtc

1440

taaccgcaag gaggacgctg tcgaaggtag gatttgtgag gggggtgaag tcgtaacaag

1500

gtagtcgtac cggaaggtgc gg

1522

<210> 1955

<211> 1475

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral taxon 271

<400> 1955

aacgaacgct ggcggcgcgt cttaagcatg caagtcgaac ggcaaggaag tgcttgcact

60

tccctagagt ggcggactgg tgagtaacac gtgggtaaca tgccttttag ttggggatag

120

ctactagaaa tagtagataa taccgaatac gattttacag ggtaaggctg taaaaggaaa

180

ggagctacgg ctctgctgaa agattggctc gcggcccatt agctagttgg tgaggtaaat

240

gcttaccaag gcaatgatgg gtatccggcc tgagagggtg aacggacaca ttgggactga

300

gatacggccc agactcctac gggaggcagc agctaagaat gttccgcaat ggagggaact

360

ctgacggagc gacgccgcgt ggatgaagaa ggtcgaaaga ttgtaaagtt cttttgagat

420

ggaagaataa gtattgcagg gaatggcagt atggtgacag tacattttga ataagaggcg

480

gctaattacg tgccagcagc cgcggtaaca cgtaagcctc gagcgttgtt cggaattatt

540

gggcgtaaag ggcatgtagg cggtcataaa agcttggtgt gaaatctatg ggcttaaccc

600

ataaactgcg ttgagaactg tatgacttga gttactgaag ggaaactaga attccaggtg

660

taggggtgga atctgtagat atctggaaga ataccaatgg cgaaggcaag tttctggcag

720

ataactgacg ctgaggtgcg aaggtgcggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc

780

cgcacagtaa actatgtaca ctaggtgtct gacataagtc tgggtgccaa agcaaacgcg

840

ataagtgtac cgcctgggga gtatgcccgc aagggtgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg

900

cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatggta cgcgaggaac cttacctggg

960

tttgacatag tacttaatag agtagagata ctttagcgta gcaatacgaa gtactacagg

1020

tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgccgt gaggtgttgg gttaagtccc gcaacgagcg

1080

caacccctac tgccagttac taacaggaaa gctgaggact ctggcggaac tgccggtgac

1140

aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatggc ccttatgtcc agggctacac

1200

acgtgctaca atggtagaaa cagagtgaag cgaagcggcg acgtggagca aaacgcaaaa

1260

aagctatcgt agttcggatt ggagtctgaa actcgactcc atgaagttgg aatcgctagt

1320

aatcgcacat cagcacggtg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca

1380

caccatccga gtagaggata cccgaagccg gtagtctaac cgcaaggagg acgctgtcga

1440

aggtatgctt tgtaaggagg gtgaagtcgt aacaa

1475

<210> 1956

<211> 1381

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral taxon 508

<400> 1956

aacgaacgct ggcggtgcgt cttaagcatg caagtcgaac ggcaagaaag tgcttgcact

60

ttcctagagt ggcggactgg tgagtaacgc gtgggtgatc tacctttaag atggggatag

120

cttttagaaa taagagataa taccgaatgt gcttacggtg ttttgacatt gtaaggaaag

180

gagcgtttgc tccgcttaaa gatgagcctg cgtcccatta gctagttggt gaggtaaagg

240

ctcaccaagg cgatgatggg tatccggcct gagagggtga ccgacacatt gggactgaga

300

tacggcccaa actcctacgg gaggcagcag ctgagaatct tccgcaatgg acgaaagtct

360

gacggagcga caccgcgtga atgatgaagg ccgaaaggtt gtaaaattct tttgcagaca

420

aagaataagg atagtaggaa ataactgtct gatgacggta gttacgcgaa taagccccgg

480

ctaattacgt gcggggcgag cgttttcgga attattgggc gtaaagggca tgtaggcggt

540

ttaagcctgt gtgaatctac gagcttaact cgtaaatgca ttgggtactg cttgaatcag

600

aggggaactg gaattccaag tgtaggggtg gaatctgtag atatttggaa gaacaccggt

660

ggcgaaggcg ggtttctagc atgattgacg ctatgcgaag gtgggggagc aaacaggatt

720

agataccctg gtagtccgca cagtcatgta cactagtggg ggtaagactc agtgggcaaa

780

cgcataagtg taccgcctgg ggagtatgcc cgcaaggtga aactcaaagg aattgacggg

840

ggcccacaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgt acgcgaggaa ccttacctgg

900

gtttgacata aggattatag agatatggta gcgtagatac gctttacagg tgctgcatgg

960

ctgtcgtcag ctcgtgccgt gaggtgttgg gtaagtcccg caacgagcgc aaccctactg

1020

ccagttacta acaggtaaag tgaggactcg gcggaactgc cggtgataaa ccggaggaag

1080

gtggggatga cgtcaagtca tcatggccct tatgtccagg gctacacacg tgctacaatg

1140

gttgttacaa agtgaagcga accgcgaggt gagcgaatgc aaaagcaatc gtagtcgatt

1200

ggaatctgaa acctgattca tgaagctgga atcgctagta atcgctatca gcacgatgcg

1260

gtgaatacgt tcctgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatccgagt cgaggtaccc

1320

aagagctagt ctaacgaggg acggtggcga aggtacgtgg taaggagggt gaagtcgtaa

1380

c

1381

<210> 1957

<211> 1383

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral taxon 518

<400> 1957

aacgaacgct ggcggtgcgt tttaagcatg caagtcgaac ggcaggaagg tgcttgcact

60

ttcctagagt ggcggactgg tgagtaacgc gtaggtgatc tacctttaag actgggacag

120

cctttagaaa taaggggtaa taccggatgt gcttattatg ttttgacgta gtaagggaag

180

gagcgtttgc tccgcttaga gatgagcctg cgtcccatta gctagttggt aaggtaacgg

240

cctaccaagg cgatgatggg tatccgacct gagagggtga tcggacacat tgggactgag

300

atacggccca aactcctacg ggaggcagca gctgagaatc ttccgcaatg gacgaaagtc

360

tgacggagcg acaccgcgtg aatgatgaag gccgaaaggt tgtaaagttc ttttgcagac

420

aaagaataag gatagaagga aatgtctatt tgatgacggt agttatgcga ataagccccg

480

gctaattacg tgcggggcga gcgttttcgg aattattggg cgtaaagggc atgtaggcgg

540

tttaagcctg tgtgaatcta cgagcttaac tcgtaaatgc attgggtact gcttgaatca

600

gaggggaact ggaattccaa gtgtaggggt ggaatctgta gatatttgga agaacaccgg

660

tggcgaaggc gggtttctag catgattgac gctatgcgaa ggtgggggag caaacaggat

720

tagataccct ggtagtccgc acagtcatgt acactagtgg gggtaagact cagtgggcaa

780

acgcataagt gtaccgcctg gggagtatgc ccgcaaggtg aaactcaaag gaattgacgg

840

gggcccacac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg tacgcgagga accttacctg

900

ggtttgacat aaggattata gagatatggt agcgtagata cgctttacag gtgctgcatg

960

gctgtcgtca gctcgtgccg tgaggtgttg ggtaagtccc gcaacgagcg caaccctact

1020

gccagttact aacaggtaaa gtgaggactc ggcggaactg ccggtgataa accggaggaa

1080

ggtggggatg acgtcaagtc atcatggccc ttatgtccag ggctacacac gtgctacaat

1140

ggttgttaca aagtgaagcg aagccgcgag gtgagcgaat gcaaaagcaa tcgtagtcga

1200

ttggaatctg aaacctgatt catgaagctg gaatcgctag taatcgctat cagcacgatg

1260

cggtgaatac gttcctgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatccga gtcgaggtac

1320

ccaagagcta gtctaacgag ggacggtggc gaaggtacgt ggtaaggagg gtgaagtcgt

1380

aac

1383

<210> 1958

<211> 1405

<212> DNA

<213> Treponema sp. oral taxon G85

<400> 1958

aacgaacgct ggcggcgcgt cttaagcatg caagtcggac ggcaagaagg ggctcgcccc

60

ttcctagagt ggcggactgg tgagtaacgc gtggacgacg cgcccacccg acggggacag

120

ccggtagaaa taccggataa taccggatga tctcttttgg aataaaggcg aaagaggaaa

180

gcggctccgg ccgcgcgggt ggagcggtcc gcgtcctatc agctagtcgg cggggtgaag

240

gcctgccgag gcgacgacgg gtatccggcc tgagagggtg gacggacaca ttgggactga

300

gatacggccc agactcctac gggaggcagc agctaagaat attccgcaat ggggggaacc

360

ccgacggagc gacgccgcgt ggacgacgaa ggccggaagg ttgtaaagtc cttttttccg

420

cgaggaataa ggccgggagg gaatgcccgg ccggtgacgg tagcggagga ataagcaccg

480

gctaattacg tgctaacacg taaggtgcga gcgttgttcg gaattattgg gcgtaaaggg

540

catgcaggcg gtcgcaagcc cggcgtgaaa ggggggctaa ctcccatgcg ctgggaactg

600

aggcttgagt ttctgaaggg agcggaattc cacgtgtagg ggtgaaatct gtagatatgt

660

ggaagaacac caatggcgaa ggcaggtcgg cgaagactga cgctgaggtg cgaaggtgcg

720

gggagcaaac aggattagat ccctggtagt ccgcacagtc aacgatgtgc actagatgtc

780

tgtccaagga tgggtgtcaa agcaaacgcg ataagtgcac cgcctgggga gtatgcccgc

840

aagggtgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

900

ttcgatggta cgcgaggaac cttacctggg tttgacatac acagattatt agagatatta

960

agcgcagcaa tgctctgtga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ccgtgaggtg

1020

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ctactgcagt taccagcgta gggggactct

1080

ggcggaactg cctgcgacaa gcaggaggaa ggggggatga cgtcaagtca tcatggccct

1140

tatgtccagg gcacacacgt gctacaatgg ttgggacaag cgagcgagtg cgagagtaag

1200

cagaacgcag aaaccgatcg tagtccggat tggagtctga aactcgactc catgaagttg

1260

gaatcgctag taatcgcaat cagcacgtgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1320

cgcccgtcac accatccgag tgggggtacc cgaagccggc agtctaaccg caagggggac

1380

gctgtcgaag gtatgcttcg tgagg

1405

<210> 1959

<211> 1543

<212> DNA

<213> Treponema sp. ovine footrot

<400> 1959

agagtttgat catggctcag aacgaacgct ggcggcgcgt cttaagcatg caagtcgaac

60

ggcaagagag gagcttgctt ctctcctaga gtggcggact ggtgaggaac acgtgggtaa

120

tctaccctta agatggggat agctgctaga aatagcaggt aataccgaat atactcagtg

180

cttcataagg ggtattgagg aaaggaagct acggcttcgc ttgaggatga gcttgcgtcc

240

cattagctag ttggtgaggt aaaggcccac caaggcgacg atgggtatcc ggcctgagag

300

ggtgatcrga cacattggga ctgagatacg gcccaaactc ctacgggagg cagcagctaa

360

gaatattccg caatggacgg aagtctgacg gagcgacgcc gcgtggatga agaaggctga

420

aaagttgtaa aatccttttg ttgatgaaga ataagggtga gagggaatgc tcatctgatg

480

acggtaatcg acgaataagc cccggctaat tacgtgccag cagccgcggt aacacgtaag

540

gggcgagcgt tgttcggaat tattgggcgt aaagggcatg taggcggtta tgtaagcctg

600

atgtgaaatc ctggggctta accccagaat agcattgggt actgtgtaac ttgaattacg

660

gaagggaaac tggaattcca agtgtagggg tggaatctgt agatatttgg aagaacaccg

720

gtggcgaagg cgggtttctg gccgataatt gacgctgaga tgcgaaagtg tggggatcga

780

acaggattag ataccctggt agtccacacc gtaaacgatg tacactaggt gttggggcaa

840

gagcttcagt gccaaagcaa acgcgataag tgtaccgcct ggggagtatg cccgcaaggg

900

tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga

960

tggtacgcga ggaaccttac ctgggtttga catctagtag aaggtcttag agataaggcc

1020

gggtagcaat accctgctag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gccgtgaggt

1080

gttgggttaa gtcccgcaat gagcgcaacc cctactgcca gttactaaca ggtaaagctt

1140

gaggactctg gcggaactgc cgatgacaaa tcggaggaag gtggggatga cgtcaagtca

1200

tcatggccct tatgtccagg gctacacacg tgctacaatg gttgctacaa agcgaagcaa

1260

gaccgtaagg tggagcaagc cgcaaaaaag caatcgtagt tcggattgaa gtctgaaact

1320

cgacttcatg aagttggaat cgctagtaat cgcgcatcag cacggcgcgg tgaatacgtt

1380

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catccgagtt gggggtaccc gaagtcgctt

1440

gtctaacctg caaaggagga cggtgccgaa ggtacgcttg gtaaggaggg tgaagtcgta

1500

acaaggtagc cgtaccggaa ggtgcggctg gatcacctcc tta

1543

<210> 1960

<211> 1548

<212> DNA

<213> Treponema vincentii

<400> 1960

tggagagttt gatcctggct cagaacgaac gctggcggcg cgtcttaagc atgcaagtcg

60

aacggcaaga gagaagcttg cttctctcct agagtggcgg actggtgagg aacacgtggg

120

taatctaccc ttaagatggg gatagctgct agaaatagca ggtaataccg aatagtctca

180

atggttcata agaagtattg aggaaaggaa gctacggctt cgcttgagga tgagcttgcg

240

tcccattagc tagttggtga ggtaaaggcc caccaaggcg acgatgggta tccggcctga

300

gagggtgatc ggacacattg ggactgagat acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagc

360

taagaatatt ccgcaatgga cggaagtctg acggagcgac gccgcgtgga tgaagaaggc

420

tgaaaagttg taaaatcctt ttgttgatga agaataaggg tgagagggaa tgctcatctg

480

atgacggtaa tcgacgaata agccccggct aattacgtgc cagcagccgc ggtaacacgt

540

aaggggcgag cgttgttcgg aattattggg cgtaaagggc atgtaggcgg ttatgtaagc

600

ctggtgtgaa atcctggggc ttaaccctag aatagcattg ggtactgtat aacttgaatt

660

acggaaggga aactggaatt ccaagtgtag gggtggaatc tgtagatatt tggaagaaca

720

ccggtggcga aggcgggttt ctggccgata attgacgctg agatgcgaaa gtgtggggat

780

cgaacaggat tagataccct ggtagtccac actgtaaacg atgtacacta ggtgttgggg

840

caagagcttc agtgccaaag caaacgcgat aagtgtaccg cctggggagt atgcccgcaa

900

gggtgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

960

cgatggtacg cgaggaacct tacctgggtt tgacatctag tagacagtct tagagataag

1020

gcttggtagc aataccctgc tagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgccgtga

1080

ggtgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctactg ccagttacta acaggtaaag

1140

cttgaggact ctggcggaac tgccgatgac aaatcggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttatgtcc agggctacac acgtgctaca atggttgcta caaagcgaag

1260

cgagaccgta aggtggagca aaccgcaaaa aagcaatcgt agttcggatt gaagtctgaa

1320

actcgacttc atgaagttgg aatcgctagt aatcgcgcat cagcacggcg cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatccga gttgggggta cccgaagtcg

1440

cttgtctaac ctgcaaagga ggacggtgcc gaaggtacgc ttggtgagga gggtgaagtc

1500

gtaacaaggt agccgtaccg gaaggtgcgg ctggatcacc tcctttct

1548

<210> 1961

<211> 1530

<212> DNA

<213> Tropheryma whipplei

<400> 1961

ttattatgga gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc

60

aagtcgaacg gaaatcaggg agcttgctcc ctgtgattag tggcgaacgg gtgagtaaca

120

cgtgagcaac ctgcccctaa ctttgggata acttcgggaa accggggcta ataccaaata

180

cgacccatga gggcatcctc tgtgggtgga aagaatttcg gttggggatg ggctcgcggc

240

ctatcagctt gttggtgggg taacggccta ccaaggcatc gacgggtagc cggcctgaga

300

gggtgatcgg ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg

360

ggaatattgc acaatgggcg caagcctgat gcagcaacgc cgcgtggggg aagaaggcct

420

tcgggttgta aacctctttt ggcagggaag aagcgaaagt gacggtacct gcagaaaaag

480

cgccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggcgcgagcg ttgtccggaa

540

ttattgggcg taaagagctc gtaggcggtt tgtcacgtct gccgtgaaaa tccgaggctc

600

aacctcggac ctgcggtggg tacgggcagg ctagagtgcg ataggggaga gcggaattcc

660

tggtgtagcg gtgaaatgcg cagatatcag gaggaacacc gatggcgaag gcagctctct

720

gggtcgctac tgacgctgag gagcgaaagc gtggggagcg aacaggatta gataccctgg

780

tagtccacgc cgtaaacgtt gggcgctaga cgtgggggtg gttccaccgc ttccgtgtcg

840

cagctaacgc attaagcgcc ccgcctgggg agtacggccg caaggctaaa actcaaggga

900

attgacgggg gcccgcacaa gcggcggagc atgcggatta attcaatgca acgcgaagaa

960

ccttaccaag gcttgatata taccggaaag gcgtagagat acgccccccg caaggtcggt

1020

atacaggtgg tgcacggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1080

acgagcgcaa ccctcgtcct gtgttgccag cgcgtaatgg cggggactca caggagactg

1140

ccggggtcaa ctcggaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcatgccct tcggtcttgg

1200

gcttcacgcg tgctacaatg gctggtacag agggttgcaa tatcgcaagg tggagcgaat

1260

ctcaaaaagc cagtctcagt tcggattggg gtctgcaact cgaccccatg aagtcggagt

1320

cgctagtaat cgcagatcag caatgctgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc

1380

gcccgtcaag tcatgaaagc tggtaacacc cgaagccggt gacttaacct tttttggaga

1440

gagccgtcga aggtgggatt ggtgattggg actaagtcgt aacaaggtag ccgtaccgga

1500

aggtgcggct ggatcacctc ctttctaagg

1530

<210> 1962

<211> 1323

<212> DNA

<213> Trueperella pyogenes

<220>

<221> modified_base

<222> (1119)..(1119)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1154)..(1154)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1237)..(1237)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1276)..(1276)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1279)..(1279)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1962

ggcgtgctta acacatgcaa gtcgaacgat gaagccgggg ctttttgttt tggtggatta

60

gtggcgaacg ggtgagtaat acgtgagtaa cctgcccttg tctttgggat aagcctggga

120

aactgggtct aataccggat attctgcttt tgccgcatgg tgggggttgg aaagattttt

180

tggatgggga tgggctcacg gcctatcagc ttgttggtgg ggtgatggcc taccaaggcg

240

tcgacgggta gccggcctga gagggtgacc ggccacattg ggactgagat acggcccaga

300

ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatgga cgcaagtctg atgcagcgac

360

gccgcgtggg ggatgaaggc tttcgggttg taaactcctt tcagtacaga agaagcattt

420

ttgtgacggt atgtgcagaa gaagcgccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

480

gtagggcgcg agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaaga gctcgtaggc ggtttgttgc

540

gcctgctgtg aaagaccggg gcttaacttc ggggttgcag tgggtacggg cagactagag

600

tgtggtaggg gtaattggaa ttcctggtgt agcggtggaa tgcgcagata tcaggaggaa

660

caccgatggc gaaggcaggt tactgggcca ttactgacgc tgaggagcga aagcgtgggt

720

agcgaacagg attagatacc ctggtagtcc acgctgtaaa cgttgggcac taggtgtggg

780

gccttttcca cgggttctgc gccgtagcta acgctttaag tgccccgcct ggggagtacg

840

gccgcaaggt taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggcg gagcatgcgg

900

attaattcga tgcaacgcga agaaccttac caaggcttga catacactgc gatgtgccag

960

agatggtgca gccttcgggg tggtgtacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg

1020

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg tcctgtgttg ccagcatgtt

1080

gtggtgggga ctcacgggag actgccgggg ttaactcgna ggaaggtggg gatgacgtca

1140

aatcatcatg cccnttatgt cttgggcttc acgcatgcta caatggccgg tacagagggt

1200

tgcgagcctg tgagggtgag ctaatccctt aaagctngtc tcagttcgga ttggggtctg

1260

caactcgacc ccatgnagnc ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa

1320

tac

1323

<210> 1963

<211> 1486

<212> DNA

<213> Tsukamurella paurometabola

<400> 1963

cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggtaaggccc

60

tttcgggggt acacgagtgg cgaacgggtg agtaacacgt gggtgacctg ccctgtactt

120

tgggataagc ctgggaaact gggtctaata ccggatatga ccttctcctg catgggggtt

180

ggtggaaagc ttttgcggta caggatgggc ccgcggccta tcagcttgtt ggtggggtaa

240

tggcctacca aggcgacgac gggtagccgg cctgagaggg cgaccggcca cactgggact

300

gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca atgggcgcaa

360

gcctgatgca gcgacgccgc gtgagggatg acggccttcg ggttgtaaac ctctttcagt

420

agggacgaag cgcaagtgac ggtacctaca gaagaagcac cggccaacta cgtgccagca

480

gccgcggtaa tacgtagggt gcaagcgttg tccggaatta ctgggcgtaa agagctcgta

540

ggcggtttgt cacgtcgtct gtgaaaaccc gaggcttaac ctcgggcctg caggcgatac

600

gggcagactt gagtactgta ggggagactg gaattcctgg tgtagcggtg gaatgcgcag

660

atatcaggag gaacaccggt ggcgaaggcg ggtctctggg cagtaactga cgctgaggag

720

cgaaagcgtg ggtagcgaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacggtggg

780

tactaggtgt gggtttcctt ccacgggatc cgtgccgtag ctaacgcatt aagtaccccg

840

cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg

900

gcggagcatg tggattaatt cgatgcaacg cgaagaacct tacctgggtt tgacatatac

960

accatcgccg cagagatgtg gtttgccttg tgccttctat acaggtggtg catggctgtc

1020

gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtctcat

1080

gttgccagca cgtaatggtg gggactcgtg agagactgcc ggggtcaact cggaggaagg

1140

tggggatgac gtcaagtcat catgcccctt atgtccaggg cttcacacat gctacaatgg

1200

cgcgtacaga gggctgcgat accgtgaggt ggagcgaatc ccttaaagcg cgtctcagtt

1260

cggattgggg tctgcaactc gaccccatga agtcggagtc gctagtaatc gcagatcagc

1320

aacgctgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacgt catgaaagtc

1380

ggtaacaccc gaagccggtg gcctaaccct tgtggaggga gctgtcgaag gtgggattgg

1440

cgattgggac gaagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag gtgcgg

1486

<210> 1964

<211> 1417

<212> DNA

<213> Tsukamurella tyrosinosolvens

<400> 1964

ggctcaggac gaacgctggc ggcgtgctta acacatgcaa gtcgaacggt aaggcccttt

60

cgggggtaca cgagtggcga acgggtgagt aacacgtggg tgacctgccc tgtacttcgg

120

gataagcctg ggaaactggg tctaataccg gatatgacct tctcctgcat gggggttggt

180

ggaaagtttt tgcggtacag gatgggcccg cggcctatca gcttgttggt ggggtaatgg

240

cctaccaagg cgacgacggg tagccggcct gagagggcga ccggccacac tgggactgag

300

acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggcgaaagcc

360

tgatgcagcg acgccgcgtg agggatgacg gccttcgggt tgtaaacctc tttcagtagg

420

gacgaagcgc aagtgacggt acctacagaa gaagcaccgg ccaactacgt gccagcagcc

480

gcggtaatac gtagggtgcg agcgttgtcc ggatttactg ggcgtaaaga gctcgtaggc

540

ggtttgtccg tcgtctgtga aaacccgagg cttaacctcg ggcctgcagg cgatacgggc

600

agacttgagt actgtagggg agactggaat tcctggtgta gcggtggaat gcgcagatat

660

caggaggaac accggtggcg aaggcgggtc tctgggcagt aactgacgct gaggagcgaa

720

agcgtgggta gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac ggtgggtact

780

aggtgtgggt ttccttccac gggatccgtg ccgtagctaa cgcattaagt accccgcctg

840

gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggcgg

900

agcatgtgga ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc tgggtttgac atatagagga

960

tcgccggaga gattcggttt gccttgtgcc ttctatacag gtggtgcatg gctgtcgtca

1020

gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg tctcatgttg

1080

ccagcacgta atggtgggga ctcgtgagag actgccgggg tcaactcgga ggaaggtggg

1140

gatgacgtca agtcatcatg ccccttatgt ccagggcttc acacatgcta caatggcgcg

1200

tacagagggc tgcgataccg tgaggtggag cgaatccctt aaagcgcgtc tcagttcgga

1260

ttggggtctg caactcgacc ccatgaagtc ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcaacg

1320

ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacgtcatg aaagtcggta

1380

acacccgaag ccggggccta accccttgtg ggaggga

1417

<210> 1965

<211> 1371

<212> DNA

<213> Turicibacter sanguinis

<220>

<221> modified_base

<222> (50)..(50)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1965

tcgagcgaac cacttcggtg gtgagcggcg aacgggtgag taacacgtan gttatctgcc

60

catcagacgg ggacaacgat tggaaacgat cgctaatacc ggataggacg aaagtttaaa

120

ggtgcttcgg caccactgat ggatgagcct gcggcgcatt agctagttgg tagggtaaag

180

gcctaccaag gcgacgatgc gtagccgacc tgagagggtg aacggccaca ctgggactga

240

gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtagggaat cttcggcaat gggcgaaagc

300

ctgaccgagc aacgccgcgt gaatgatgaa ggccttcggg ttgtaaaatt ctgttataag

360

ggaagaatgg ctctagtagg aaatggctag agtgtgacgg taccttatga gaaagccacg

420

gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc gagcgttatc cggaattatt

480

gggcgtaaag agcgcgcagg tggttgatta agtctgatgt gaaagcccac ggcttaaccg

540

tggagggtca ttggaaactg gtcaacttga gtgcagaaga gggaagtgga attccatgtg

600

tagcggtgaa atgcgtagag atatggagga acaccagtgg cgaaggcggc ttcctggtct

660

gtaactgaca ctgaggcgcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc

720

cacgccgtaa acgatgagtg ctaagtgttg ggggtcgaac ctcagtgctg aagttaacgc

780

attaagcact ccgcctgggg agtacggtcg caagactgaa actcaaagga attgacgggg

840

acccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg

900

tcttgacata ccagtgaccg tcctagagat aggattttcc cttcggggac aatggataca

960

ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1020

cgcaacccct gtcgttagtt gccagcattc agttggggac tctaacgaga ctgccagtga

1080

caaactggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca

1140

cacgtgctac aatggttggt acaaagagaa gcgaagcggt gacgtggagc aaacctcata

1200

aagccaatct cagttcggat tgtaggctgc aactcgccta catgaagttg gaatcgctag

1260

taatcgcgaa tcagcatgtc gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc

1320

acaccacgag agtttacaac acccgaagtc agtggcctaa ccgcaaggag g

1371

<210> 1966

<211> 1561

<212> DNA

<213> Ureaplasma parvum

<400> 1966

tgttctttga aaactaaata gaatccgtca attttaaaga gtttgatcct ggctcaggat

60

taacgctggc ggcatgccta atacatgcaa atcgaacgaa gccttttagg cttagtggtg

120

aacgggtgag taacacgtat ccaatctacc cttaagttgg ggataactag tcgaaagatt

180

agctaatacc gaataataac atcaatatcg catgagaaga tgtagaaagt cgctctttgt

240

ggcgacgctt ttggatgagg gtgcgacgta tcagatagtt ggtgaggtaa tggctcacca

300

agtcaatgac gcgtagctgt actgagaggt agaacagcca caatgggact gagacacggc

360

ccatactcct acgggaggca gcagtaggga atttttcaca atgggcgcaa gccttatgaa

420

gcaatgccgc gtgaacgatg aaggtcttat agattgtaaa gttcttttat atgggaagaa

480

acgctaaaat aggaaatgat tttagtttga ctgtaccatt tgaataagta tcggctaact

540

atgtgccagc agccgcggta atacatagga tgcaagcgtt atccggattt actgggcgta

600

aaacgagcgc aggcgggttt gtaagtttgg tattaaatct agatgcttaa cgtctagctg

660

tatcaaaaac tgtaaaccta gagtgtagta gggagttggg gaactccatg tggagcggta

720

aaatgcgtag atatatggaa gaacaccggt ggcgaaggcg ccaacttgga ctatcactga

780

cgcttaggct cgaaagtgtg gggagcaaat aggattagat accctagtag tccacaccgt

840

aaacgatcat cattaaatgt cggcccgaat gggtcggtgt tgtagctaac gcattaaatg

900

atgtgcctgg gtagtacatt cgcaagaatg aaactcaaac ggaattgacg gggacccgca

960

caagtggtgg agcatgttgc ttaatttgac aatacacgta gaaccttacc taggtttgac

1020

atctattgcg atgctataga aatatagttg aggttaacaa tatgacaggt ggtgcatggt

1080

tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccctttc

1140

gttagttact tttctagcga tactgctacc gcaaggtaga ggaaggtggg gatgacgtca

1200

aatcatcatg ccccttatat ctagggctgc aaacgtgcta caatggctaa tacaaactgc

1260

tgcaaaatcg taagatgaag cgaaacagaa aaagttagtc tcagttcgga tagagggctg

1320

caattcgtcc tcttgaagtt ggaatcacta gtaatcgcga atcagacatg tcgcggtgaa

1380

tacgttctcg ggtcttgtac acaccgcccg tcaaactatg ggagctggta atatctaaaa

1440

ccgcaaagct aaccttttgg aggcatgcgt ctagggtagg atcggtgact ggagttaagt

1500

cgtaacaagg tatccctacg agaacgtggg gatggatcac ctcctttctt cggagtaaat

1560

t

1561

<210> 1967

<211> 1517

<212> DNA

<213> Ureaplasma urealyticum

<400> 1967

caattttaaa gagtttgatc ctggctcagg attaacgctg gcggcatgcc taatacatgc

60

aaatcgaacg aagcctttta ggcttagtgg tgaacgggtg agtaacacgt atccaaccta

120

cccttaagtt ggggataact agtcgaaaga ttagctaata ccgaataata acatcaatat

180

cgcatgagaa gatgtagaaa gtcgcgtttg cgacgctttt ggatgggggt gcgacgtatc

240

agatagttgg tgaggtaatg gctcaccaag tcaatgacgc gtagctgtac tgagaggtag

300

aacagccaca atgggactga gacacggccc atactcctac gggaggcagc agtagggaat

360

ttttcacaat gggcgcaagc cttatgaagc aatgccgcgt gaacgatgaa ggtcttatag

420

attgtaaagt tcttttatat gggaagaaac gctaagatag gaaatgattt tagtttgact

480

gtaccatttg aataagtatc ggctaactat gtgccagcag ccgcggtaat acataggatg

540

caagcgttat ccggatttac tgggcgtaaa acgagcgcag gcgggtttgt aagtttggta

600

ttaaatctag atgcttaacg tctagctgta tcaaaaactg taaacctaga gtgtagtagg

660

gagttgggga actccatgtg gagcggtaaa atgcgtagat atatggaaga acaccggtgg

720

cgaaggcgcc aacttggact atcactgacg cttaggctcg aaagtgtggg gagcaaatag

780

gattagatac cctagtagtc cacaccgtaa acgatcatca ttaaatgtcg gctcgaacga

840

gtcggtgttg tagctaacgc attaaatgat gtgcctgggt agtacattcg caagaatgaa

900

actcaaacgg aattgacggg gacccgcaca agtggtggag catgttgctt aatttgacaa

960

tacacgtaga accttaccta ggtttgacat ctattgcgac gctatagaaa tatagttgag

1020

gttaacaata tgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt

1080

aagtcccgca acgagcgcaa cccctttcgt tagttgcttt tctagcgata ctgctaccgc

1140

aaggtagagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatatct agggctgcaa

1200

acgtgctaca atggctaata caaactgctg caaaatcgta agatgaagcg aaacagaaaa

1260

agttagtctc agttcggata gagggctgca attcgccctc ttgaagttgg aatcactagt

1320

aatcgcgaat cagacatgtc gcggtgaata cgttctcggg tcttgtacac accgcccgtc

1380

aaactatggg agctggtaat atctaaaacc gcaaagctaa ccttttggag gcatgcgtct

1440

agggtaggat cggtgactgg agttaagtcg taacaaggta tccctacgag aacgtgggga

1500

tggatcacct cctttct

1517

<210> 1968

<211> 958

<212> DNA

<213> Ureibacillus composti

<220>

<221> modified_base

<222> (15)..(15)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (90)..(90)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (97)..(97)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (170)..(170)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1968

acggctaact acgtnccagc agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgtt gtccggaatt

60

attgggcgta aagcgcgcgc aggcggtctn ttaagtntga tgtgaaagcc cccggctcaa

120

ccggggaggg tcattggaaa ctgggagact tgagtgcagg agagggaagn ggaattccat

180

gtgtagcggt gaaatgcgta gagatatgga ggaacaccag tggcgaaggc ggcttcctgg

240

cctgtaactg acgctgaggc gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta

300

gtccacgccg taaacgatga gtgctaggtg ttagggggtt tccgcccctt agtgctgcag

360

ctaacgcatt aagcactccg cctggggagt acggtcgcaa gactgaaact caaaggaatt

420

gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct

480

taccaggtct tgacatcccg ctgaccgcca tggagacatg gctttccctt cggggacagc

540

ggtgacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg

600

caacgagcgc aacccttgtc cttagttgcc atcattcagt tgggcactct aaggagactg

660

ccgtacaaat acggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg

720

gctacacacg tgctacaatg ggtggtacaa agggcagcaa acccgcgagg gggagcgaat

780

cccaaaaagc cactctcagt tcggattgca ggctgcaact cgcctgcatg aagccggaat

840

cgctagtaat cgcggatcag catgccgcgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg

900

cccgtcacac cacgagagtc tgtaacaccc gaagtcggtg aggtaaccct ccgggagc

958

<210> 1969

<211> 1405

<212> DNA

<213> Ureibacillus suwonensis

<220>

<221> modified_base

<222> (9)..(10)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1969

gcggaccann ttagaaagct tgctttttag attggttagc ggcggacggg tgagtaacac

60

gtgggtaacc tgccctatag accgggataa ctcgcggaaa cgcgtgctaa taccggataa

120

cacaccgaag cgcatgcttc ggggttgaaa gatggttctg ctatcactat aggatgggcc

180

cgcggcgcat tagctagttg gtggggtaac ggcctaccaa ggcgacgatg cgtagccgac

240

ctgagagggt gatcggccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag

300

cagtagggaa tcttccacaa tgggcgaaag cctgatggag caacgccgcg tgagcgaaga

360

aggtcttcgg atcgtaaagc tctgttgtaa gggaagaaca agcgcagcag tcactggctg

420

cgccctgacg gtaccttact agaaagccac ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat

480

acgtaggtgg caagcgttgt ccggaattat tgggcgtaaa gcgcgcgcag gcggtctctt

540

aagtctgatg tgaaagcccc cggctcaacc ggggagggtc attggaaact gggagacttg

600

agtgcaggag agggaaggga attccatgtg tagcggtgaa atgcgtagag atatggagga

660

acaccagtgg cgaaggcggc ttcctggcct gtaactgacg ctgaggcgcg aaagcgtggg

720

gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaggtgtta

780

gggggtttcc gccccttagt gctgcagcta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg

840

gtcgcaagac tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg

900

tttaattcga agcaacgcga agaaccttac caggtcttga catcccgctg accgccatgg

960

acacatggcg ttcccatggg ggacagcggt gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg

1020

tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttgtcctt agttgccatc

1080

attcagttgg gcactctaag gagactgccg tacaaatacg gaggaaggtg gggatgacgt

1140

caaatcatca tgccccttat gacctgggct acacacgtgc tacaatgggt ggtacaaagg

1200

gcagcaaacc cgcgaggggg agcgaatccc aaaaagccac tctcagttcg gattgcaggc

1260

tgcaactcgc ctgcatgaag ccggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat gccgcggtga

1320

atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac gagagtctgt aacacccgaa

1380

gtcggtgagg taaccctccg ggagc

1405

<210> 1970

<211> 1489

<212> DNA

<213> Ureibacillus terrenus

<220>

<221> modified_base

<222> (382)..(382)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1970

tggcggcgtg cctaatacat gcaagtcgag cggacctcat aggaagcttg ctttttatga

60

ggttagcggc ggacgggtga gtaacacgtg ggtaacctgc cctatagacc gggataactc

120

gcggaaacgc gtgctaatac cggataacac agcggagcgc atgctccggt gttgaaaggt

180

ggttctgcta ccgctatagg atgggcccgc ggcgcattag ctagttggtg gggtaacggc

240

ctaccaaggc gacgatgcgt agccgacctg agagggtgat cggccacact gggactgaga

300

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tagggaatct tccacaatgg gcgaaagcct

360

gatggagcaa cgccgcgtga gngaagaagg tcttcggatc gtaaagctct gttgtaaggg

420

aagaacaagt gcggtagtaa ctgaccgcac cctgacggta ccttacgaga aagccacggc

480

taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg taggtggcga gcgttgtccg gaattattgg

540

gcgtaaagcg cgcgcaggcg gtctcttaag tctgatgtga aagcccccgg ctcaaccggg

600

gagggtcatt ggaaactggg agacttgagt gcaggagagg gaagcggaat tccatgtgta

660

gcggtgaaat gcgtagagat atggaggaac accagtggcg aaggcggctt cctggcctgt

720

aactgacgct gaagcgcgaa agcgtgggga ccaaacagga ttagataccc tggtagtcca

780

cgccgtaaac gatgagtgct aagtgttagg gggcttgccc cttagtgctg cagctaacgc

840

attaagcact ccgcctgggg agtacggtcg caagactgaa actcaaagga attgacgggg

900

gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg

960

tcttgacatc ccgctgaccg ccatggagac atggccttcc cttcggggac agcggtgaca

1020

ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1080

cgcaaccctt gtccttagtt gccatcattc agttgggcac tctaaggaga ctgccgtaca

1140

aatacggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac

1200

acgtgctaca atgggcggta caaagggctg cgaacccgcg agggggagcg aatcccaaaa

1260

agccgctctc agttcggatt gcaggctgca actcgcctgc atgaagccgg aatcgctagt

1320

aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca

1380

caccacgaga gtctgtaaca cccgaagtcg gtgaggtaac ccttccggga gccagccgcc

1440

gaaggtggga cagatgattg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtatc

1489

<210> 1971

<211> 1402

<212> DNA

<213> Ureibacillus thermophilus

<220>

<221> modified_base

<222> (30)..(30)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1393)..(1393)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1971

cggaccaatt aagaagcttg ctttttgatn tggttagcgg cggacgggtg agtaacacgt

60

gggtaacctg ccctatagac tgggataact cgcggaaacg tgagctaata ccggataaca

120

catcaaagtg catgctttga tgttgaaaga tggttctgct atcactatag gatgggcccg

180

cggcgcatta gctagttggt ggggtaacgg cctaccaagg cgacgatgcg tagccgacct

240

gagagggtga tcggccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca

300

gtagggaatc ttccacaatg ggcgaaagcc tgatggagca acgccgcgtg agcgaagaag

360

gtcttcggat cgtaaagctc tgttgtaagg gaagaacaag cgcagcagta actggctgcg

420

ccctgacggt accttactag aaagccacgg ctaatacgtg ccagcagccg cggtaatagt

480

aggtggcaag cgttgtccgg aattattggg cgtaaagcgc gcgcaggcgg tttcttaagt

540

ctgatgtgaa agcccccggc tcaaccgggg agggtcattg gaaactggga gacttgagtg

600

caggagaggg aagtggaatt ccatgtgtag cggtgaaatg cgtagagata tggaggaaca

660

ccagtggcga aggcggcttc ctggcctgta actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag

720

caaacaggat tagatacctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag gtgttagggg

780

gtttccaccc cttagtgctg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgtcgc

840

aagactgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

900

ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggt cttgacatcc cgctgaccgc catggagaca

960

tggctttccc ttcggggaca gcggtgacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg

1020

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccttg tccttagttg ccatcattca

1080

gttgggcact ctaaggagac tgccgtacaa atacggagga aggtggggat gacgtcaaat

1140

catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tgggcagtac aaagggctgc

1200

gaacccgcga gggggagcga atcccaaaaa gctgctctca gttcggattg caggctgcaa

1260

ctcgcctgca tgaagccgga atcgctagta atcgcagatc agcatgctgc ggtgaatacg

1320

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tctgtaacac ccgaagtcgg

1380

tggggtaacc ctncgggagc ca

1402

<210> 1972

<211> 1540

<212> DNA

<213> Ureibacillus thermosphaericus

<400> 1972

tagagtttga tcatggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cctaatacat gcaagtcgag

60

cgaaccaatt gaaagcctag ctttcatgag gttagcggcg gacgggtgag taacacgtgg

120

gtaacctgcc ctatagactg ggataactcg cggaaacgcg tgctaatacc ggataacaca

180

tcaaagtgca tgctttgatg ttgaaagatg gttctgctat cactatagga tgggcccgcg

240

gcgcattagc ttgttggtgg ggtaacggcc taccaaggcg acgatgcgta gccgacctga

300

gagggtgatc ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

agggaatctt ccacaatggg cgaaagcctg atggagcaac gccgcgtgag cgaagaaggt

420

cttcggatcg taaagctctg ttgtaaggga agaacaagtg cagtagtaac tggctgcacc

480

ttgacggtac cttactagaa agccacggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

aggtggcaag cgttgtccgg aattattggg cgtaaagcgc gcgcaggcgg tctcttaagt

600

ctgatgtgaa agcccccggc ttaaccgggg agggtcattg gaaactggga gacttgagtg

660

caggagaggg aagcggaatt ccatgtgtag cggtgaaatg cgtagagata tggaggaaca

720

ccagtggcga aggcggcttc ctggcctgta actgacgctg aggcgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgagtgcta agtgttaggg

840

ggtttccacc ccttagtgct gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg gagtacggtc

900

gcaagactga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt

960

aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cccgctgacc gctatggaga

1020

catagccttc ccttcgggga cagcggtgac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt

1080

cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtccttagt tgccatcatt

1140

cagttgggca ctctaaggag actgccgtac aaatacggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1200

atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca cacgtgctac aatggacggt acaaacggtc

1260

gcgaagtcgc gagacggagc caatccgaaa aaaccgttct cagttcggat tgcaggctgc

1320

aactcgcctg catgaagccg gaatcgctag taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaata

1380

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtctgtaac acccgaagtc

1440

ggtgaggtaa ccctttcggg agccagccgc cgaaggtggg acagatgatt ggggtgaagt

1500

cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgcg gctggatcac

1540

<210> 1973

<211> 1469

<212> DNA

<213> Vagococcus fluvialis

<400> 1973

acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtcgaacg ctttgatttt caccggagct

60

tgctccaccg aaaatcaaag agtggcggac gggtgagtaa cacgtgggca acctgcccaa

120

cagaggggga taacacttgg aaacaggtgc taataccgca taatttgttt tcccgcatgg

180

gagaataata aaagacgctt cggtgtcact gttggatggg cccgcgctgc attagttagt

240

tggtggggta atggcctacc aagaccgtga tgcatagccg acctgagagg gtgatcggcc

300

acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtaggg aatcttcggc

360

aatggacgaa agtctgaccg agcaacgccg cgtgagtgaa gaaggttttc ggatcgtaaa

420

actctgttgt tagagaagaa caagtgggag agtaactgtt cccaccttga cggtatctaa

480

ccagaaagcc acggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggt ggcaagcgtt

540

gtccggattt attgggcgta aagcgagcgc aggcggtttc ttaagtctga tgtgaaagcc

600

ctcggctcaa ccgaggaagg tcattggaaa ctggggaact tgaatgcaga agaggagagt

660

ggaattccat gtgtagcggt gaaatgcgta gatatatgga ggaacaccag tggcgaaggc

720

gactctctgg tctgtaattg acgctgaggc tcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga

780

taccctggta gtccacgccg taaacgatga gtgctaagtg ttggagggtt tccgcccttc

840

agtgctgcag ttaacgcatt aagcactccg cctggggagt acggccgcaa ggctgaaact

900

caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg

960

cgaagaacct taccaggtct tgacatcctt tgaccactct agagatagag ctttcccttc

1020

ggggacaaag tgacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt

1080

aagtcccgca acgagcgcaa cccttattgt tagttgccat cattcagttg ggcactctag

1140

cgagactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt

1200

atgacctggg ctacacacgt gctacaatgg acggtacaat gagtcgcgag accgcgaggt

1260

ttagctaatc tcttaaagcc gttctcagtt cggattgtag gctgcaactc gcctacatga

1320

agccggaatc gctagtaatc gtggatcagc acgccacggt gaatacgttc ccgggccttg

1380

tacacaccgc ccgtcacacc acgagagttt gtaacaccca aagtcggtga ggtaaccttt

1440

tggagccagc cgcctaaggt gggatagat

1469

<210> 1974

<211> 1389

<212> DNA

<213> Veillonella atypica

<220>

<221> modified_base

<222> (530)..(530)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1974

gcgatggaag cttgcttcta tcaatcttag tggcgaacgg gtgagtaacg cgtaatcaac

60

ctgcccttca gagggggaca acagttggaa acgactgcta ataccgcata cgatccaatc

120

tcggcatcga gactggatga aaggtggcct ctatttataa gctatcactg aaggagggga

180

ttgcgtctga ttagctagtt ggaggggtaa cggcccacca aggcgatgat cagtagccgg

240

tctgagagga tgaacggcca cattgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca

300

gcagtgggga atcttccgca atggacgaaa gtctgacgga gcaacgccgc gtgagtgatg

360

acggccttcg ggttgtaaag ctctgttaat cgggacgaat ggttcttgtg cgaatagtgc

420

gaggatttga cggtaccgga atagaaagcc acggctaact acgtgccagc agccgcggta

480

atagtaggtg gcaagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa gcgcgcaggn gagtctgtct

540

taaaagttcg gggcttaacc ccgtgatggg atggaaactg cgatctagag tatcggagag

600

gaaagtggaa ttcctagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttaggaagaa caccagtggc

660

gaaggcgact ttctggacga aaactgacgc tgaggcgcga aagccagggg agcgaacggg

720

attagatacc ccggtagtcc tggccgtaaa cgatgggtac tagtgtagag gtatcgaccc

780

cttctgtgcc ggagttaacg caataagtac cccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga

840

aactcaaagg aattgagggg gcccgcacaa gcggtggagt atgtggttta attcgacgca

900

acgcgaagaa cttaccaggt ctgacattga tggacagaac tagagatagt tcttcttctt

960

cggaagccag aaaacaggtg gtgcacggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt

1020

taagtcccgc aacgagcgca acccctatct tatgttgcca gcacttcggg tgggaactca

1080

tgagagactg ccgcagacaa tgcggaggaa ggcggggatg acgtcaaatc atcatgcccc

1140

ttatgacctg ggctacacac gtactacaat gggagttaat agacggaagc gaaaccgcga

1200

ggtggagcaa acccgagaaa cactctctca gttcggatcg taggctgcaa ctcgcctacg

1260

tgaagtcgga atcgctagta atcgcaggtc agcatactgc ggtgaatacg ttcccgggcc

1320

ttgtacacac cgcccgtcac accacgaaag tcggaagtgc ccaaagccgg tggggtaacc

1380

ttcgggagc

1389

<210> 1975

<211> 1005

<212> DNA

<213> Veillonella dispar

<220>

<221> modified_base

<222> (820)..(820)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (855)..(855)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (938)..(938)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (992)..(992)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1975

tcgaacgaag agcgatggaa gcttgcttct atcaatctta gtggcgaacg ggtgagtaac

60

gcgtaatcaa cctgcccttc agagggggac aacagttgga aacgactgct aataccgcat

120

acgatctaac ctcggcatcg aggatggatg aaaggtggcc tctatttata agctatcact

180

gaaggagggg attgcgtctg attagctagt tggaggggta acggcccacc aaggcgatga

240

tcagtagccg gtctgagagg atgaacggcc acattgggac tgagacacgg cccagactcc

300

tacgggaggc agcagtgggg aatcttccgc aatggacgaa agtctgacgg agcaacgccg

360

cgtgagtgat gacggccttc gggttgtaaa gctctgttaa tcgggacgaa aggccttctt

420

gcgaatagtt agaaggattg acggtaccgg aatagaaagc cacggctaac tacgtgccag

480

cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt tgtccggaat tattgggcgt aaagcgcgcg

540

caggcggatt ggtcagtctg tcttaaaagt tcggggctta accccgtgat gggatggaaa

600

ctgccaatct agagtatcgg agaggaaagt ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta

660

gatattagga agaacaccag tggcgaaggc gactttctgg acgaaaactg acgctgaggc

720

gcgaaagcca ggggagcgaa cgggattaga taccccggta gtcctggccg taaacgatgg

780

gtactaggtg taggaggtat cgaccccttc tgtgccggan ttaacgcaat aagtaccccg

840

cctggggagt acgancgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg

900

gtggagtatg tggtttaatt cgacgcaacg cgaagaanct taccaggtct tgacattgat

960

ggacagaact agagatagtt cctcttcttc gnaagccaga aaaca

1005

<210> 1976

<211> 1296

<212> DNA

<213> Veillonella genomosp. P1 oral clone MB5_P17

<400> 1976

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta

60

acgcgtaatc aacctgccct tcagaggggg acaacagttg gaaacgactg ctaataccgc

120

atacggaaag tcactgaagg aggggattgc gtctgattag ctagttggag gggtaacggc

180

ccaccaaggc gatgatcagt agccggtctg agaggatgaa cggccacatt gggactgaga

240

cacggcccag actcctacgg gaggcagcag ttgggaatct tccgcaatgg acgaaagtct

300

gacggagcaa cgccgcgtga gtgatgacgg ccttcgggtt gtaaagctct gttaatcggg

360

acgatgacgg taccggaata gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata

420

cgtaggtggc aagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag cgcgcgcagg cggattggtc

480

agtctgtctt aaaagttcgg ggcttaaccc cgtgatggga tggaaactgc caatctagag

540

tatcggagag gaaagtggaa ttcctagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttaggaagaa

600

caccagtggc gaaggcgact ttctggacga actgacgctg aggcgcgaaa gccaggggag

660

cgaacgggat tagatacccc ggtagtcctg gccgtaaacg atgggtacta ggtgtaggag

720

cttctatgcc ggagttaacg caataagtac cccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga

780

aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag tatgtggttt aattcgacgc

840

aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat taacaggtgg tgcacggttg tcgtcagctc

900

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatctt atgttgccag

960

cacgtgggaa ctcatgagag actgccgcag acaatgcgga ggaaggcggg gatgacgtca

1020

aatcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtacta caatgggagt tagacggaag

1080

cgaaaccgcg aggtggagca gacccgagac tctctcagtt cggatgtagg ctgcaactcg

1140

cctacggaag tcggaatcgc tagtaatcgc aggtcagcat actgcggtga atacgttccc

1200

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac gaaagtcgga agtgcccaaa gccggtgggt

1260

agccagccgt ctaaggtaaa gtcgatgatt ggggtg

1296

<210> 1977

<211> 1409

<212> DNA

<213> Veillonella montpellierensis

<400> 1977

gagcacggga gcttgctcct atgaatctta gtggcgaacg ggtgagtaac gcgtaatcaa

60

cctgccctac aatgggggac aacagttgga aacgactgct aataccgcat acgacctacg

120

gttggcatca atcgtaggtg aaaggtggcc tctacatgta agctatcgtt gtaggagggg

180

attgcgtctg attagctagt tggaggggta acggcccacc aaggcgatga tcagtagccg

240

gtctgagagg atgaacggcc acattgggac tgagacacgg cccaaactcc tacgggaggc

300

agcagtgggg aatcttccgc aatggacgaa agtctgacgg agcaacgccg cgtgagtgat

360

gacggtcttc ggattgtaaa gctctgttaa tcgggacgaa tggtttgtgt gcaaatagtg

420

catagacatg acggtaccgg aatagaaagc cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt

480

aatacgtagg tggcaagcgt tgtccggaat tattgggcgt aaagcgcgcg caggcggact

540

agccagtcag tcttaaaagt tcggggctta accccgtgat gggattgaaa ctactagtct

600

agagtatcgg agaggaaagt ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta gatattagga

660

agaacaccag tggcgaaggc gactttctgg acgaacactg acgctgaggc gcgaaagcca

720

ggggagcgaa cgggattaga taccccggta gtcctggccg taaacgatgg gtactaagtg

780

tgggaggtat cgaccccttc cgtgctgcag ttaacgcaat aagtaccccg cctggggagt

840

acggtcgcaa gactgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagtatg

900

tggtttaatt cgacgcaacg cgaagaacct taccaggtct tgacattgat ggacagaact

960

agagatagtt tttcttcttc ggaagccaga aaacaggtgg tgcacggttg tcgtcagctc

1020

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatctt atgttgccag

1080

cacgtaatgg tgggaactca tgagagactg ccgcagacaa tgcggaggaa ggcggggatg

1140

acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac gtactacaat gggagttaat

1200

aaagagaagc gaaaccgcga ggtggagcga acctcacaaa cactctctca gttcggattg

1260

caggctgcaa ctcgcctgca tgaagtcgga atcgctagta atcgcaggtc agcatactgc

1320

ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgaaag tcggaagtac

1380

ccaaagccgg tggggtaacc ttcgggagc

1409

<210> 1978

<211> 1564

<212> DNA

<213> Veillonella parvula

<400> 1978

ttggagagtt tgatcctggc tcaggacgaa cgctggcggc gtgcttaaca catgcaagtc

60

gaacgaagag cgatggaagc ttgcttctat caatcttagt ggcgaacggg tgagtaacgc

120

gtaatcaacc tgcccttcag agggggacaa cagttggaaa cgactgctaa taccgcatac

180

gatctaatct cggcatcgag gatagatgaa aggtggcctc tacatgtaag ctatcactga

240

aggaggggat tgcgtctgat tagctagttg gaggggtaac ggcccaccaa ggcgatgatc

300

agtagccggt ctgagaggat gaacggccac attgggactg agacacggcc cagactccta

360

cgggaggcag cagtggggaa tcttccgcaa tggacgaaag tctgacggag caacgccgcg

420

tgagtgatga cggccttcgg gttgtaaagc tctgttaatc gggacgaaag gccttcttgc

480

gaatagtgag aaggattgac ggtaccggaa tagaaagcca cggctaacta cgtgccagca

540

gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa agcgcgcgca

600

ggcggatcag gtcagtctgt cttaaaagtt cggggcttaa ccccgtgatg ggatggaaac

660

tgccaatcta gagtatcgga gaggaaagtg gaattcctag tgtagcggtg aaatgcgtag

720

atattaggaa gaacaccagt ggcgaaggcg actttctgga cgaaaactga cgctgaggcg

780

cgaaagccag gggagcgaac gggattagat accccggtag tcctggccgt aaacgatggg

840

tactaggtgt aggaggtatc gaccccttct gtgccggagt taacgcaata agtaccccgc

900

ctggggagta cgaccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg

960

tggagtatgt ggtttaattc gacgcaacgc gaagaacctt accaggtctt gacattgatg

1020

gacagaacca gagatggttc ctcttcttcg gaagccagaa aacaggtggt gcacggttgt

1080

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccctatctta

1140

tgttgccagc actttgggtg gggaactcat gagagactgc cgcagacaat gcggaggaag

1200

gcggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgacctgg gctacacacg tactacaatg

1260

ggagttaata gacggaagcg agatcgcgag atggagcaaa cccgagaaac actctctcag

1320

ttcggatcgt aggctgcaac tcgcctacgt gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcaggtca

1380

gcatactgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccacgaaagt

1440

cggaagtgcc caaagccggt ggggtaacct tcgggagcca gccgtctaag gtaaagtcga

1500

tgattggggt gaagtcgtaa caaggtagcc gtatcggaag gtgcggctgg atcacctcct

1560

ttct

1564

<210> 1979

<211> 1000

<212> DNA

<213> Veillonella sp. 3_1_44

<220>

<221> modified_base

<222> (992)..(994)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1979

tcgaacgaag agcgatggaa gcttgcttct atcaatctta gtggcgaacg ggtgagtaac

60

gcgtaatcaa cctgcccttc agagggggac aacagttgga aacgactgct aataccgcat

120

acgatctaat ctcggcatcg aggatagatg aaaggtggcc tctacatgta agctatcact

180

gaaggagggg attgcgtctg attagctagt tggaggggta acggcccacc aaggcgatga

240

tcagtagccg gtctgagagg atgaacggcc acattgggac tgagacacgg cccagactcc

300

tacgggaggc agcagtgggg aatcttccgc aatggacgaa agtctgacgg agcaacgccg

360

cgtgagtgat gacggccttc gggttgtaaa gctctgttaa tcgggacgaa aggccttctt

420

gcgaatagtg agaaggattg acggtaccgg aatagaaagc cacggctaac tacgtgccag

480

cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt tgtccggaat tattgggcgt aaagcgcgcg

540

caggcggata ggtcagtctg tcttaaaagt tcggggctta accccgtgat gggatggaaa

600

ctgccaatct agagtatcgg agaggaaagt ggaattccta gtgtagcggt gaaatgcgta

660

gatattagga agaacaccag tggcgaaggc gactttctgg acgaaaactg acgctgaggc

720

gcgaaagcca ggggagcgaa cgggattaga taccccggta gtcctggccg taaacgatgg

780

gtactaggtg taggaggtat cgaccccttc tgtgccggag ttaacgcaat aagtaccccg

840

cctggggagt acgaccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg

900

gtggagtatg tggtttaatt cgacgcaacg cgaagaaccc ttaccaggtc ttgacattga

960

tggacagaac tagagatagt tcctcttctt cnnnagccag

1000

<210> 1980

<211> 1354

<212> DNA

<213> Veillonella sp. 6_1_27

<400> 1980

agcgatggaa gcttgcttct atcaatctta gtggcgaacg ggtgagtaac gcgtaatcaa

60

cctgcccttc agagggggac aacagttgga aacgactgct aataccgcat acgatctaac

120

ctcggcatcg aggaaagatg aaaggtggcc tctatttata agctatcact gaaggagggg

180

attgcgtctg attagctagt tggaggggta acggcccacc aaggcgatga tcagtagccg

240

gtctgagagg atgaacggcc acattgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc

300

agcagtgggg aatcttccgc aatggacgaa agtctgacgg agcaacgccg cgtgagtgat

360

gacggccttc gggttgtaaa gctctgttaa tcgggacgaa aggccttctt gcgaacagtt

420

agaaggattg acggtaccgg aatagaaagc cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt

480

aatagtaggt ggcaagcgtt gtccggaatt attgggcgta aagcgcgcgc aggcggatca

540

gtagtctgtt taaaagttcg gggcttaacc ccgtgatggg atggaaactg ctgatctaga

600

gtatcggaga ggaaagtgga attcctagtg tagcggtgaa atgcgtagat attaggaaga

660

acaccagtgg cgaaggcgac tttctggacg aaaactgacg tgaggcgcga aagccagggg

720

agcgaacggg attagatacc ccggtagtcc tggccgtaaa cgatgggtac taggtgtagg

780

aggtatcgac cccttctgtg ccggagttaa cgcaataagt accccgcctg gggagtacga

840

ccgcaaggtt gaaactcaag atagggggcc cgccagggga ggttatgagg aaactacagg

900

ttgacttcgc ggtacagaac cagagatggt tcttcttctt cggaagccag aaaacaggtg

960

gtgcacggtt gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca

1020

acccctatct tatgttgcca gcactttggg tgggaactca tgagagactg ccgcagacaa

1080

tgcggaggaa ggcggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg ggctacacac

1140

gtactacaat gggagttaat agacggaagc gagatcgcga gatggagcaa acccgagaaa

1200

cactctctca gttcggatcg taggctgcaa ctcgcctacg tgaagtcgga atcgctagta

1260

atcgcaggtc agcatactgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac

1320

accacgaaag tcggaagtgc ccaaagccgg tggg

1354

<210> 1981

<211> 1264

<212> DNA

<213> Veillonella sp. ACP1

<400> 1981

ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagtggcgaa cgggtgagta acgcgtaatc

60

aacctgccct tcagaggggg acaacagttg gaaacgactg ctaataccgc atacggaaag

120

tcactgaagg aggggattgc gtctgattag ctagttggag gggtaacggc ccaccaaggc

180

gatgatcagt agccggtctg agaggatgaa cggccacatt gggactgaga cacggcccag

240

actcctacgg gaggcagcag tggggaatct tccgcaatgg acgaaagtct gacggagcaa

300

cgccgcgtga gtgatgacgg ccttcgggtt gtaaagctct gttaatcggg acgatgacgg

360

taccggaata gaaagccacg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc

420

aagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag cgcgcgcagg cggattggtc agtctgtctt

480

aaaagttcgg ggcttaaccc cgtgatggga tggaaactgc caatctagag tatcggagag

540

gaaagtggaa ttcctagtgt agcggtgaaa tgcgtagata ttaggaagaa caccagtggc

600

gaaggcgact ttctggacga actgacgctg aggcgcgaaa gccaggggag cgaacgggat

660

tagatacccc ggtagtcctg gccgtaaacg atgggtacta ggtgtaggag cttctgtgcc

720

ggagttaacg caataagtac cccgcctggg gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg

780

aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag tatgtggttt aattcgacgc aacgcgaaga

840

accttaccag gtcttgacat taacaggtgg tgcacggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag

900

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatctt atgttgccag cacgtgggaa

960

ctcatgagag actgccgcag acaatgcgga ggaaggcggg gatgacgtca aatcatcatg

1020

ccccttatga cctgggctac acacgtacta caatgggagt tagacggaag cgaaaccgcg

1080

aggtggagca aacccgagac tctctcagtt cggacgtagg ctgcaactcg cctacggaag

1140

tcggaatcgc tagtaatcgc aggtcagcat actgcggtga atacgttccc gggccttgta

1200

cacaccgccc gtcacaccac gaaagtcgga agtgcccaaa gccggtgggt agccagccgt

1260

ctaa

1264

<210> 1982

<211> 1209

<212> DNA

<213> Veillonella sp. AS16

<400> 1982

agtggcgaac gggtgagtaa cgcgtaatca acctgccctt cagaggggga caacagttgg

60

aaacgactgc taataccgca tacggaaagt cactgaagga ggggattgcg tctgatcagc

120

tagttggagg ggtaacggcc caccaaggcg atgatcagta gccggtctga gaggatgaac

180

ggccacattg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatctt

240

ccgcaatgga cgaaagtctg acggagcaac gccgcgtgag tgatgacggc cttcgggttg

300

taaagctctg ttaatcggga cgatgacggt accggaatag aaagccacgg ctaactacgt

360

gccagcagcc gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaagc

420

gcgcgcaggc ggatcagtca gtctgtctta aaagttcggg gcttaacccc gtgaggggat

480

ggaaactgct gatctagagt atcggagagg aaagtggaat tcctagtgta gcggtgaaat

540

gcgtagatat taggaagaac accagtggcg aaggcgactt tctggacgaa ctgacgctga

600

ggcgcgaaag ccaggggagc gaacgggatt agataccccg gtagtcctgg ccgtaaacga

660

tgggtactag gtgtaggagc ttctgtgccg gagttaacgc aataagtacc ccgcctgggg

720

agtacgaccg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagt

780

atgtggttta attcgacgca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatt aacaggtggt

840

gcacggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

900

ccttatctta tgttgccagc acgtggggac tcatgagaga ctgccgcaga caatgcggag

960

gaaggcgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca cacgtactac

1020

aatgggagtt agacggaagc gaagccgcga ggtggagcga acccgagact ctctcagttc

1080

ggacgtaggc tgcaactcgc ctacggaagt cggaatcgct agtaatcgca ggtcagcata

1140

ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg aaagtcggaa

1200

gtacccaaa

1209

<210> 1983

<211> 844

<212> DNA

<213> Veillonella sp. BS32b

<220>

<221> modified_base

<222> (45)..(45)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (50)..(50)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (656)..(656)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (663)..(663)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (713)..(713)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (782)..(782)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (788)..(788)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (815)..(816)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1983

cgaagagcga tggaagcttg cttctatcaa tcttagtggc gaacnggagn gtaacgcgta

60

atcaacctgc ccttcagagg gggacaacag ttggaaacga ctgctaatac cgcatacgat

120

ccaatctcgg catcgagact ggatgaaagg tggcctctat ttataagcta tcactgaagg

180

aggggattgc gtctgattag ctagttggag gggtaacggc ccaccaaggc gatgatcagt

240

agccggtctg agaggatgaa cggccacatt gggactgaga cacggcccag actcctacgg

300

gaggcagcag tggggaatct tccgcaatgg acgaaagtct gacggagcaa cgccgcgtga

360

gtgatgacgg ccttcgggtt gtaaagctct gttaatcggg acgaatggtt cttgtgcgaa

420

tagtgcgagg atttgacggt accggaatag aaagccacgg ctaactacgt gccagcagcc

480

gcggtaatac gtaggtggca agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaagc gcgcgcaggc

540

ggattggtca gtctgtctta aaagttcggg gcttaacccc gtgatgggat ggaaactgcc

600

aatctagagt atcggagagg aaagtggaat tcctagtgta gcggtgaaat gcgtanatat

660

tangaagaac accagtggcg aaggcgactt tctggacgaa aactgacgct gangcgcgaa

720

agccagggga gcgaacggga ttagataccc cggtagtcct ggccgtaaac gatgggtact

780

angtgtanga ggtatcgacc ccttctgtgc cgganntaac gcaataagta ccccgcctgg

840

ggag

844

<210> 1984

<211> 1015

<212> DNA

<213> Veillonella sp. ICM51a

<220>

<221> modified_base

<222> (709)..(709)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (979)..(979)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (996)..(998)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1008)..(1008)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1984

gagcgatgga agcttgcttc tatcaatctt agtggcgaac gggtgagtaa cgcgtaatca

60

acctgccctt cagaggggga caacagttgg aaacgactgc taataccgca tacgatccaa

120

tctcggcatc gagactggat gaaaggtggc ctctatttat aagctatcac tgaaggaggg

180

gattgcgtct gattagctag ttggaggggt aacggcccac caaggcgatg atcagtagcc

240

ggtctgagag gatgaacggc cacattggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg

300

cagcagtggg gaatcttccg caatggacga aagtctgacg gagcaacgcc gcgtgagtga

360

tgacggcctt cgggttgtaa agctctgtta atcgggacga atggttcttg tgcaaatagt

420

gcgaggattt gacggtaccg gaatagaaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

480

taatacgtag gtggcaagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagcgcgc gcaggcggat

540

tggtcagtct gtcttaaaag ttcggggctt aaccccgtga tgggatggaa actgccaatc

600

tagagtatcg gagaggaaag tggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattagg

660

aagaacacca gtggcgaagg cgactttctg gacgaaaact gacgctgang cgcgaaagcc

720

aggggagcga acgggattag ataccccggt agtcctggcc gtaaacgatg ggtactaggt

780

gtaggaggta tcgacccctt ctgtgccgga gttaacgcaa taagtacccc gcctggggag

840

tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagtat

900

gtggtttaat tcgacgcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacattga tggacagaac

960

tagagatagt tcctcttcnt cggaagccag aaaacnnngg tgcacggntg tcgtc

1015

<210> 1985

<211> 971

<212> DNA

<213> Veillonella sp. MSA12

<220>

<221> modified_base

<222> (591)..(591)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (703)..(703)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (772)..(772)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (869)..(869)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1985

tggaagcttg cttctatcaa tcttagtggc gaacgggtga gtaacgcgta atcaacctgc

60

ccttcagagg gggacaacag ttggaaacga ctgctaatac cgcatacgat ctgacctcgg

120

catcgaggat ggatgaaagg tggcctctat ttataagcta tcactgaagg aggggattgc

180

gtctgattag ctagttggag gggtaacggc ccaccaaggc gatgatcagt agccggtctg

240

agaggatgaa cggccacatt gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag

300

tggggaatct tccgcaatgg acgaaagtct gacggagcaa cgccgcgtga gtgatgacgg

360

ccttcgggtt gtaaagctct gttaatcggg acgaaaggcc ttcttgcgaa tagttagaag

420

gattgacggt accggaatag aaagccacgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac

480

gtaggtggca agcgttgtcc ggaattattg ggcgtaaagc gcgcgcaggc ggattggtca

540

gtctgtctta aaagttcggg gcttaacccc gtgatgggat ggaaactgcc natctagagt

600

atcggagagg aaagtggaat tcctagtgta gcggtgaaat gcgtagatat taggaagaac

660

accagtggcg aaggcgactt tctggacgaa aactgacgct gangcgcgaa agccagggga

720

gcgaacggga ttagataccc cggtagtcct ggccgtaaac gatgggtact angtgtagga

780

ggtatcgacc ccttctgtgc cggagttaac gcaataagta ccccgcctgg ggagtacgac

840

cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacng gggcccgcac aagcggtgga gtatgtggtt

900

taattcgacg caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca ttgatggaca gaactagaga

960

tagttcctct t

971

<210> 1986

<211> 1344

<212> DNA

<213> Veillonella sp. NVG 100cf

<400> 1986

cgcgtaatca acctgccctt cagaggggga caacagttgg aaacgactgc taataccgca

60

tacgatccaa cctcggcatc gaggatggat gaaaggtggc ctctatttat aagctatcac

120

tgaaggaggg gattgcgtct gattagctag ttggaggggt aacggcccac caaggcaatg

180

atcagtagcc ggtctgagag gatgaacggc cacattggga ctgagacacg gcccagactc

240

ctacgggagg cagcagtggg gaatcttccg caatggacga aagtctgacg gagcaacgcc

300

gcgtgagtga tgacggcctt cgggttgtaa agctctgtta atcgggacga aaggtcctct

360

tgcgaatagt tagaggaatt gacggtaccg gaatagaaag ccacggctaa ctacgtgcca

420

gcagccgcgg taatacgtag gtggcaagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagcgcgc

480

gcaggcggat cagtcagtct gtcttaaaag ttcggggctt aaccccgtga tgggatggaa

540

actgctgatc tagagtatcg gagaggaaag tggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt

600

agatattagg aagaacacca gtggcgaagg cgactttctg gacgaaaact gacgctgagg

660

cgcgaaagcc aggggagcga acgggattag ataccccggt agtcctggcc gtaaacgatg

720

ggtactaggt gtaggaggta tcgacccctt ctgtgccgga gttaacgcaa taagtacccc

780

gcctggggag tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc

840

ggtggagtat gtggtttaat tcgacgcaac gcgaagaacc ttaccaggtc ttgacattga

900

tggacagaac tagagatagt tcctcttctt cggaagccag aaaacaggtg gtgcacggtt

960

gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctatct

1020

tatgttgcca gcacgtaatg gtgggaactc atgagagact gccgcagaca atgcggagga

1080

aggcggggat gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtactacaa

1140

tgggagttaa tagacggaag cgagatcgcg agatggagca aacccgagaa acactctctc

1200

agttcggatc gtaggctgca actcgcctac gtgaagtcgg aatcgctagt aatcgcaggt

1260

cagcatactg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccacgaaa

1320

gtcggaagtg cccaaagccg gtgg

1344

<210> 1987

<211> 1441

<212> DNA

<213> Veillonella sp. OK11

<220>

<221> modified_base

<222> (9)..(9)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (150)..(150)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1987

tcgcgtctnc catgcagtcg aaacgaagag cgatggtaag cttgcttcta tcaatcttag

60

tggcgaacgg gtgagtaacg cgtaatcaac cctgcccttc agagggggac aacagttgga

120

aacgactgct aataccgcat acgatccaan ctcggcatcg aggatggatg aaaggtggcc

180

tctatttata agctatcact gaaggagggg attgcgtctg attagctagt tggaggggta

240

acggcccacc aaggcaatga tcagtagccg gtctgagagg atgaacggcc acattgggac

300

tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatcttccgc aatggacgaa

360

agtctgacgg agcaacgccg cgtgagtgat gacggccttc gggttgtaaa gctctgttaa

420

tcgggacgaa aggtcttctt gcgaatagtt agaagaattg acggtaccgg aatagaaagc

480

cacggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg tggcaagcgt tgtccggaat

540

tattgggcgt aaagcgcgcg caggcggatc agtcagtctg tcttaaaagt tcggggctta

600

accccgtgat gggatggaaa ctgctgatct agagtatcgg agaggaaagt ggaattccta

660

gtgtagcggt gaaatgcgta gatattagga agaacaccag tggcgaaggc gactttctgg

720

acgaaaactg acgctgaggc gcgaaagcca ggggagcgaa cgggattaga taccccggta

780

gtcctggccg taaacgatgg gtactaggtg taggaggtat cgaccccttc tgtgccggag

840

ttaacgcaat aagtaccccg cctggggagt acgaccgcaa ggttgaaact caaaggaatt

900

gacgggggcc cgcacaagcg gtggagtatg tggtttaatt cgacgcaacg cgaagaacct

960

taccaggtct tgacattgat ggacagaact agagatagtt cctcttcttc ggaagccaga

1020

aaacaggtgg tgcacggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca

1080

acgagcgcaa cccctatctt atgttgccag cacgtaatgg tgggaactca tgagagactg

1140

ccgcagacaa tgcggaggaa ggcggggatg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgacctg

1200

ggctacacac gtactacaat gggagttaat agacggaagc gagatcgcga gatggagcaa

1260

acccgagaaa cactctctca gttcggatcg taggctgcaa ctcgcctacg tgaagtcgga

1320

atcgctagta atcgcaggtc agcatactgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac

1380

cgcccgtcac accacgaaag tcggaagtgc ccaaagccgg tggggtaacc ttcggagccg

1440

c

1441

<210> 1988

<211> 1364

<212> DNA

<213> Veillonella sp. oral clone ASCA08

<220>

<221> modified_base

<222> (12)..(12)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (445)..(445)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (728)..(728)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (815)..(815)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1340)..(1340)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1344)..(1344)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1988

ggagtttgat tntggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gagtggcgaa cgggtgagta acgcgtaatc aacctgccct tcagaggggg ataacaacgg

120

gaaaccgttg ctaataccgc gtacggaaag tcgctgaagg aggggattgc gtctgattag

180

ctagttggag gggtaacggc ccaccaaggc aatgatcagt agccggtctg agaggatgaa

240

cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg gaggcagcag tggggaatct

300

tccgcaatgg acgaaagtct gacggagcaa cgccgcgtga gtgatgaagg tcttcggatt

360

gtaaagctct gttaatcggg acgatgacgg taccggaata gaaagccacg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtangtggc aagcgttgtc cgaaattatt gggcgtaaag

480

cgcgcgcagc cggcctatcc agtctgtctt aaaagttcgg ggctcaaccc cgtgatggga

540

tggaaactag taggctagag tatcggagag gaaagcggaa ttcctagtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata ttaggaagaa caccagtggc gaaggcggct ttctggacga actgacgctg

660

aggcgcgaaa gcaaggcgag cgaacgggat tagatacccc ggtagtcctt gccgtaaacg

720

atgggtanta ggtgtaggag cttctgtgcc ggagttaacg caataatacc ccgcctgggg

780

agtacggtcg caaggctgaa actcaaagga attgncgggg gcccgcacaa gcggtggagt

840

acgtggttta attcgacgca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatt aacaggtggt

900

gcacggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac

960

ccctatctta tgttgccagc acgtgggaac tcatgagaga ctgccgcaga caatgcggag

1020

gaaggagggg atgacgtcaa gtcatcatgc cccttatgac ctgggctaca cacgtactac

1080

aatgggcttt agaggggagc gaagccgcga ggtggagcaa accccagagc tctcagttcg

1140

gaagtaggct gcaactcgcc tacggaagtc ggaatcgcta gtaatcacag gtcagcatac

1200

tgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacacaacga aagtcggaag

1260

tacccaaagc cggtgggtag ccagccgtct aaggtaaagt cgatgattgg ggtgaagtcg

1320

taacaaggta gccgtatcgn aagntgcggc tggaacacct cctt

1364

<210> 1989

<211> 1323

<212> DNA

<213> Veillonella sp. oral clone ASCB03

<220>

<221> modified_base

<222> (667)..(667)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (676)..(676)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (714)..(714)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (720)..(720)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (792)..(792)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (803)..(803)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1989

ggagtttgat tctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gagtggcgaa cgggtgagta acgcgtaatc aacctgccct tcagaggggg ataacaacgg

120

gaaaccgttg ctaataccgc gtacggaaag tcgctgaagg aggggattgc gtctgattag

180

ctagttggag gggtaacggc ccaccaaggc aatgatcagt agccggtctg agaggatgaa

240

cggccacatt gggactgaga cacggcccaa actcctacgg gaggcagcag tggggaatct

300

tccgcaatgg acgaaagtct gacggaacaa cgccgcgtga gtgatgaagg tctgcggatt

360

gtaaagctct gttaatcggg acgatgacgg taccggaata gaaagccacg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag

480

cgcgcgcagg cggcctatcc agtctgtctt aaaagttcgg ggctcaaccc cgtgatggga

540

tggaaactac taggctagag tatcggagag gaaagcggaa ttcctagtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata ttaggaagaa caccagtggc gaaggcggct ttctggacga actgacgctg

660

aggcgcnaaa gccagnggag cgaacgggat tagatacccc ggtagtcctg gccntaaacn

720

atgggtacta ggtgtaggag cttctgtgcc ggagttaacg caataagtac cccgcctggg

780

gagtacggtc gnaaggctga aantcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

tatgtggttt aattcgacgc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat taacaggtgg

900

tgcacggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctatctt atgttgccag cacgtgggaa ctcatgagag actgccgcag acaatgcgga

1020

ggaaggcggg gatgacgtca agtcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtacta

1080

caatgggctt tagagggaag cgaagccgcg aggtggagca aaccccagag ctctcagttc

1140

ggacgtaggc tgcaactcgc ctacggaagt cggaatcgct agtaatcgca ggtcagcata

1200

ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccacg aaagtcggaa

1260

gtacccaaag ccggtgggta gccagccgtc taaggtaaag tcgatgattg gggtgaagtc

1320

gta

1323

<210> 1990

<211> 1363

<212> DNA

<213> Veillonella sp. oral clone ASCG01

<220>

<221> modified_base

<222> (360)..(360)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1990

ggagtttgat tatggctcag gactaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gagtggcgaa cgggtgagta acgcgtaatc aacctgccct tcagaggggg acaacagttg

120

gaaacgactg ctaataccgc atacggaaag tcactgaagg aggggattgc gtctgattag

180

ctagttggag gggtaacggc ccaccaaggc aatgatcagt agccggtctg agaggatgaa

240

cggccacatt gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatct

300

tccgcaatgg acgaaagtct gacggtgcaa cgccgcgtga gtgatgacgg ccttcgggtn

360

gtaaagctct gttaatcggg acgatgacgg taccggaata gaaagccacg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag

480

cgcgcgcagg cggatcagtc agtctgtctt aaaagttcgg ggcttaaccc cgtgatggga

540

tggaaactgc tgatctagag tatcggagag gaaagtggaa ttcctagtgt agcggtgaaa

600

tgcgtagata ttaggaagaa caccagtggc gaaggcgact ttctggacga actgacgctg

660

aggcgcgaaa gccaggggag cgaacgggat tagatacccc ggtagtcctg gccgtaaacg

720

atgggtacta ggtgtaggag cttctgtgcc ggagttaacg caataagtac cccgcctggg

780

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag

840

tatgtggttt aattcgacgc aacgcgaaga accttaccgg gtcttgacat taacaggtgg

900

tgcacggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctatctt atgttgccag cacgtgggaa ctcatgagag actgccgcag acaatgcgga

1020

ggaaggagag gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga cctgggctac acacgtacta

1080

caatgggagt tagacggaag cgagatcgcg agatggagca aacccgagac tctctcagtt

1140

cggacgtagg ctgcaactcg cctacggaag tcggaatcgc tagtaatcgc aggtcagcat

1200

actgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccac gaaagtcgga

1260

agtgcccaaa gccggtgggt agccagccgt ctaaggtaaa gtcgatgatt ggggtgaagt

1320

cgtaacaagg tagccgtatc ggaaggtgcg gctggaacac ctc

1363

<210> 1991

<211> 1296

<212> DNA

<213> Veillonella sp. oral clone ASCG02

<220>

<221> modified_base

<222> (1102)..(1102)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1143)..(1143)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1991

ggagtttgat tctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gagtggcgaa cgggtgagta acgcgtaatc aacctgccct tcagaggggg acaacagttg

120

gaaacgactg ctaataccgc atacggaaag tcactgaagg aggggattgc gtctgattag

180

ctagttggag gggtaacggc ccaccaaggc aatgatcagt agccggtctg agaggatgaa

240

cggccacatt gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatct

300

tccgcaatgg acgaaagtct gacggagcaa cgccgcgtga gtgatgacgg ccttcgggtt

360

gtaaagctct gttaatcggg acgatgacgg taccggaata gaaagccacg gctaactacg

420

tgccagcagc cgcggtaata cgtaggtggc aagcgttgtc cggaattatt gggcgtaaag

480

cgcgcgcagg cggatcagtt agtctgtctt aaaagttcgg ggcttaaccc cgttgatggg

540

atggaaactg ctgatctaga gtatcggaga ggaaagtgga attcctagtg tagcggtgaa

600

attcgtagat attaggaaga acaccagtgg cgaaggcgac tttctggacg aactgacgct

660

gaggcgcgaa agccagggga gcgaacggga ttagataccc cggtagtcct ggccgtaaac

720

gatgggtact aggtgtagga gcttctgtgc cggagttaac gcaataagta ccccgcctgg

780

ggagtacgac cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga

840

gtatgtggtt taattcgacg caacgcgaag aaccttacca ggtcttgaca tcacaggtgg

900

tgcacggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

960

cccctatctt atgttgccag cacgtgggaa ctcatgagag actgccgcag acaatgcgga

1020

ggaaggcggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga cctgggctac tcacgtacta

1080

caatgggata gacggaagcg anatcgcgag atggagcaaa cccgagactc tctcagttcg

1140

gangtaggct gcaactcgcc tacggaagtc ggaatcgcta gtaatcgcag gtcagcatac

1200

tgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga aagtcggaag

1260

tgcccaaagc cggtgggtag ccagccgtct aaggta

1296

<210> 1992

<211> 1464

<212> DNA

<213> Veillonella sp. oral clone OH1A

<220>

<221> modified_base

<222> (2)..(2)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (7)..(7)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1992

antcgancga agagcgatgg aagcttgctt ctatcagtct tagtggcgaa cgggtgagta

60

acgcgtaatc aacctgccct tcagaggggg acaacagttg gaaacgactg ctaataccgc

120

atacgatcta acctcggcat tcaggataga tgaaaggtgg cctctatttt taagctatca

180

ctgaaggagg ggattgcgtc tgatatgcga tagtgagggg ggacggggcc ccccggcgga

240

tgaccagtgc cggtttgaga ggatgaacgg ccaccattgg actgagacac ggcccagact

300

cctacgggag gcagcagtgg ggaatcttcc gcaatggacg aaagtctgac ggagcaacgc

360

cgcgtgagtg atgacggcct tcgggtttaa agcttcgtta atcgggaaga aagggcctct

420

gcgcgaacag tgagaaggat tgacggtacc ggaatagaaa gccacggcta actacgtgcc

480

agcagccgcg gtaatacgta ggtggcaagc gttgtccgga attattgggc gtaaagcgcg

540

cgcaggcgga tcagtcagtc tgtcttaaaa gttcggggct taaccccgtg atgggatgga

600

aactgctgat ctagagtatc ggagaggaaa gtggaattcc tagtgtagcg gtgaaatgcg

660

tagatattag gaagaacacc agtggcgaag gcgactttct ggacgaaaac tgacgctgag

720

gcgcgaaagc caggggagcg aacgggatta gataccccgg tagtcctggc cgtaaacgat

780

gggtactagg tgtaggaggt atcgacccct tctgtgccgg agttaacgca ataagtaccc

840

cgcctgggga gtacgaccgc aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag

900

cggtggagta tgtggtttaa ttcgacgcaa cgcgaagaac cttaccaggt cttgacattg

960

agtgaaaggg caagagattg tccccttatc ttcggataac acgaaaacag gtggtgcatg

1020

gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccccta

1080

tcttatgttg ccagcacttc gggtgggaac tcatgagaga ctgccgcaga caatgcagag

1140

gaaggcgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca cacgtactac

1200

aatgggagtt aatagacgga agcgagatcg cgagatggag caaacccgag aaacactctt

1260

tcagttcgga tggtaggctg caactcgcct acgtgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcag

1320

gtcagcatac tgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccacga

1380

aagtcggaag tgcccaaagc cggtggggta accttcggga gccagccgtc taaggtaaag

1440

tcgatgattg gggaaaagtc gtaa

1464

<210> 1993

<211> 976

<212> DNA

<213> Veillonella sp. oral taxon 158

<220>

<221> modified_base

<222> (543)..(543)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (875)..(875)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (897)..(897)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (918)..(918)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (925)..(925)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (936)..(936)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (961)..(961)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (968)..(968)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1993

gagcgatgga agcttgcttc tatcaatctt agtggcgaac gggtgagtaa cgcgtaatca

60

acctgccctt cagaggggga caacagttgg aaacgactgc taataccgca tacgatccaa

120

cctcggcatc gaggatggat gaaaggtggc ctctatttat aagctatcac tgaaggaggg

180

gattgcgtct gattagctag ttggaggggt aacggcccac caaggcaatg atcagtagcc

240

ggtctgagag gatgaacggc cacattggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg

300

cagcagtggg gaatcttccg caatggacga aagtctgacg gagcaacgcc gcgtgagtga

360

tgacggcctt cgggttgtaa agctctgtta atcgggacga aaggtcctct tgcgaatagt

420

tagaggaatt gacggtaccg gaatagaaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg

480

taatacgtag gtggcaagcg ttgtccggaa ttattgggcg taaagcgcgc gcaggcggat

540

canttagtct gtcttaaaag ttcggggctt aaccccgtga tgggatggaa actgctgatc

600

tagagtatcg gagaggaaag tggaattcct agtgtagcgg tgaaatgcgt agatattagg

660

aagaacacca gtggcgaagg cgactttctg gacgaaaact gacgctgagg cgcgaaagcc

720

aggggagcga acgggattag ataccccggt agtcctggcc gtaaacgatg ggtactaggt

780

gtaggaggta tcgacccctt ctgtgccgga gttaacgcaa taagtacccc gcctggggag

840

tacgaccgca aggttgaaac tcaaaggaat tgacnggggc ccgcacaagc ggtggantat

900

gtggtttaat tcgacgcnac gcgangaacc ttaccnggtc ttgacattga tggacagaac

960

nagagatngt tcctct

976

<210> 1994

<211> 1229

<212> DNA

<213> Veillonellaceae bacterium oral taxon 131

<400> 1994

gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gagacggatt gggagcttgc

60

tcctgacaag tcgagtggca aacgggtgag taacgcgtag acaacctgcc gcaaagatgg

120

ggacaacagc ccgaaagggc tgctaatacc gaatgttgcg cccctcccgc atgggagggg

180

cgccaaagat ggcctctgcc tgcaagccat cgctttgcga tgggtcctgc gccttattag

240

ccagttggcg gggcaacggc ccaccaaggc gacgatcagt agccggtcct gagaggatgg

300

acggccacat tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaatc

360

ttccgcaatg ggcgaaagcc tgacggagca acgccgcgtg ggtgaagaag gtcttcggat

420

gcgtaaagcc ctgttgcccg ggacgaacgc ccccggcgcg aacagcgccg gggggtgacg

480

gtaccgggcg aggaagccac ggccaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtaggtgg

540

cgagcgttgt ccggaatcat tgggcgtaaa gggagcgcag gcgggcatgc aagtccatct

600

taaaagcgcg gggcccaacc ccgcgagggg atggaaactg catgccttga gtgcaggaga

660

ggaaagcgga attcccagtg tagcggtgaa atgcgtagat attgggagga acaccagtgg

720

cgaaggcggc tttctggact gcaactgacg ctgaggctcg aaagccaggg gagcgaacgg

780

gattagatac cccggtagtc ctggccgtaa acgatgaatg ctaggtgtgg ggggtatcga

840

cccctcccgt gccggagtca acgcaataag cattccgcct ggggagtacg gccgcaaggc

900

tgagactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagtatgtgg ttcaattcga

960

cgcatggcga aggaacctta ccagggcctt gacattgagt gacacgggcc ggagacggcc

1020

cccctcccct cgggggacac ggaaaacagg gtggtgcagt ggctgtcgtc agcctcgttg

1080

tcgtgagatg tggggtcaag atcccgccac cgagcgccac cccccgttcc ctcgttggcc

1140

agcgacgcac agggcgggga acccaaggga agaccgccgc cggactacgc cgaggaaggc

1200

gggggacgac gttcagttat tcatgcccc

1229

<210> 1995

<211> 1511

<212> DNA

<213> Veillonellaceae bacterium oral taxon 155

<400> 1995

gagtttgatc ctggctcagg acgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg

60

gagctgattt atttcggtaa atcgcttagt ggcaaacggg tgagtaacgc gtaggcaacc

120

tgccctcagg atggggacaa cggctcgaaa gagccgctaa taccgaatga cgtaactctt

180

ccacatggaa gagatactaa agatgggtca aaccatcgcc taaggatggg cctgcgtctg

240

attagccagt tggtgaggta acggctcacc aaagcgacga tcagtagccg gtctgagagg

300

atgaacggcc acaatgggac tgagacacgg cccatactcc tacgggaggc agcagtgggg

360

aatcttccgc aatgggcgaa agcctgacgg agcaacgccg cgtgagtgaa gaaggtcttc

420

ggatcgtaaa gctctgttgt cggggacgaa agagtagacg aggaaatgcg tctactaaga

480

cggtacccga cgaggaagcc acggctaact acgtgccagc agccgcggta atacgtaggc

540

ggcaagcgtt gtccggaatt attgggcgta aagggagcgc aggtgggacg gtaagtccgt

600

cttaaaaggc aggggctcag cccctgtaag ggatggaaac tatcgatctt gagtgccgga

660

gaggaaagcg gaattcccag tgtagcggtg aaatgcgtag atattgggaa gaacaccagt

720

ggcgaaggcg gctttctgga cggcaactga cactgaggct cgaaagccag gggagcgaac

780

gggattagat accccggtag tcctggccgt aaacgatgga tactaggtgt aggaggtatc

840

gacccctcct gtgccggagt taacgcaata agtatcccgc ctggggagta cggtcgcaag

900

actgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagtatgt ggtttaattc

960

gacgcaacgc gaagaacctt accagggctt gacattgagt gaaagggcaa gagattgtcc

1020

ccttatcttc ggataacacg aaaacaggtg gtgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga

1080

gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccctatat tctgttgcca acaggtaaag

1140

ctgggaactc aggatagact gccgcggaga acgcggagga aggcggggat gacgtcaagt

1200

catcatgccc catatgacct gggctacaca cgtactacaa tgggatgtac agagggcagc

1260

gaaagagcga tctggagcga accccagaaa acatctccca gttcggattg caggctgaaa

1320

cccgcctgca tgaagatgga atcgctagta atcgcaggtc agcatactgc ggtgaatacg

1380

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacggaag tcattcacac ccgaagccgg

1440

tgaaagccgt cgaaggtggg ggcgatgact ggggtgaagt cgtaacaagg tagccgtatc

1500

ggaaggtgcg g

1511

<210> 1996

<211> 1547

<212> DNA

<213> Vibrio cholerae

<400> 1996

tttaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgagcg gcagcacaga ggaacttgtt ccttgggtgg cgagcggcgg acgggtgagt

120

aatgcctggg aaattgcccg gtagaggggg ataaccattg gaaacgatgg ctaataccgc

180

ataacctcgc aagagcaaag caggggacct tcgggccttg cgctaccgga tatgcccagg

240

tgggattagc tagttggtga ggtaagggct caccaaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgatc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgta tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagtactt tcagtaggga ggaaggtggt taagctaata ccttaatyat

480

ttgacgttac ctacagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc atgcaggtgg tttgttaagt

600

cagatgtgaa agccctgggc tcaacctagg aatcgcattt gaaactgaca agctagagta

660

ctgtagaggg gggtagaatt tcaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tgaaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacagat actgacactc agatgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtctactt ggaggttgtg

840

mcctagaggt cgtggctttc ggagctaacg cgttaagtag accgcctggg gagtacggtc

900

gcaagattaa aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt

960

aattcgatgc aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat ccagagaatc tagcggagac

1020

gctggagtgc cttcgggaac tctgagacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg

1080

tgaaatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta tccttgtttg ccagcacgta

1140

atggtgggaa ctccagggag actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg gacgacgtca

1200

agtcatcatg gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggcgta tacagagggc

1260

agcgataccg cgaggtggag cgaatctcac aaagtacgtc gtagtccgga ttggagtctg

1320

caactcgact ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcaa atcagaatgt tgcggtgaat

1380

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggctg caaaagaagc

1440

aggtagttta accttcggga ggacgcttgc cactttgtgg ttcatgactg gggtgaagtc

1500

gtaacaaggt agcgctaggg gaacctggcg ctggatcacc tccttac

1547

<210> 1997

<211> 1537

<212> DNA

<213> Vibrio fluvialis

<220>

<221> modified_base

<222> (11)..(12)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 1997

agagtttgat nntggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc

60

ggcagcgaca gagaaacttg tttctcgggc ggcgagcggc ggacgggtga gtaatgcctg

120

ggaaattgcc ctgatgtggg ggataaccat tggaaacgat ggctaatacc gcatgatagc

180

ttcggctcaa agagggggac cttcgggcct ctcgcgtcag gatatgccca ggtgggatta

240

gctagttggt gaggtaaggg ctcaccaagg cgacgatccc tagctggtct gagaggatga

300

tcagccacac tggaactgag acacggtcca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata

360

ttgcacaatg ggcgcaagcc tgatgcagcc atgccgcgtg tatgaagaag gccttcgggt

420

tgtaaagtac tttcagcagt gaggaaggag gtatcgttaa tagcggtatc ttttgacgtt

480

agctgcagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgcg

540

agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gcatgcaggt ggtttgttaa gtcagatgtg

600

aaagcccggg gctcaacctc ggaattgcat ttgaaactgg caggctagag tactgtagag

660

gggggtagaa tttcaggtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tctgaaggaa taccggtggc

720

gaaggcggcc ccctggacag atactgacac tcagatgcga aagcgtgggg agcaaacagg

780

attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgtctac ttggaggttg tggccttgag

840

ccgtggcttt cggagctaac gcgttaagta gaccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta

900

aaactcaaat gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg

960

caacgcgaag aaccttacct actcttgaca tccagagaac ttagcagaga tgctttggtg

1020

ccttcgggaa ctctgagaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtt gtgaaatgtt

1080

gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt atccttgttt gccagcgagt aatgtcggga

1140

actccaggga gactgccggt gataaaccgg aggaaggtgg ggacgacgtc aagtcatcat

1200

ggcccttacg agtagggcta cacacgtgct acaatggcgc atacagaggg cggccaactt

1260

gcgaaagtga gcgaatccca aaaagtgcgt cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac

1320

tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgtg aatcagaatg tcacggtgaa tacgttcccg

1380

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggct gcaaaagaag caggtagttt

1440

aaccttcggg aggacgcttg ccactttgtg gttcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg

1500

tagcgctagg ggaacctggc gctggatcac ctccttt

1537

<210> 1998

<211> 1554

<212> DNA

<213> Vibrio furnissii

<400> 1998

taaattgaag agtttgatca tggctcagat tgaacgctgg cggcaggcct aacacatgca

60

agtcgagcgg cagcgacaac attgaacctt cgggggattt gttgggcggc gagcggcgga

120

cgggtgagta atgtctggga aattgccctg atgtggggga taaccattgg aaacgatggc

180

taataccgca tgatagcttc ggctcaaaga gggggacctt cgggcctctc gcgtcaggat

240

atgcccaggt gggattagct agttggtgag gtaagggctc accaaggcga cgatccctag

300

ctggtctgag aggatgatca gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga

360

ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagccatg ccgcgtgtat

420

gaagaaggcc ttcgggttgt aaagtacttt cagcagtgag gaaggggata tcgttaatag

480

cggtattctt tgacgttagc tgcagaagaa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg

540

gtaatacgga gggtgcgagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgca tgcaggtggt

600

ttgttaagtc agatgtgaaa gcccggggct caacctcgga attgcatttg aaactggcag

660

gctagagtac tgtagagggg ggtagaattt caggtgtagc ggtgaaatgc gtagagatct

720

gaaggaatac cggtggcgaa ggcggccccc tggacagata ctgacactca gatgcgaaag

780

cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgtctacttg

840

gaggttgtgg ccttgagccg tggctttcgg agctaacgcg ttaagtagac cgcctgggga

900

gtacggtcgc aagattaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca

960

tgtggtttaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctact cttgacatcc agagaactta

1020

gcagagatgc tttggtgcct tcgggaactc tgagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc

1080

tcgtgttgtg aaatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc cttgtttgcc

1140

agcgagtaat gtcgggaact ccagggagac tgccggtgat aaaccggagg aaggtgggga

1200

cgacgtcaag tcatcatggc ccttacgagt agggctacac acgtgctaca atggcgcata

1260

cagagggcag ccaacttgcg aaagtgagcg aatcccaaaa agtgcgtcgt agtccggatt

1320

ggagtctgca actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtggat cagaatgcca

1380

cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggctgca

1440

aaagaagcag gtagtttaac cttcgggagg acgcttgcca ctttgtggtt catgactggg

1500

gtgaagtcgt aacaaggtag cgctagggga acctggcgct ggatcacctc ctta

1554

<210> 1999

<211> 1536

<212> DNA

<213> Vibrio mimicus

<400> 1999

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc

60

ggcagcacag aggaacttgt tccttgggtg gcgagcggcg gacgggtgag taatgcctgg

120

gaaattgccc ggtagagggg gataaccatt ggaaacgatg gctaataccg cataacctcg

180

caagagcaaa gcaggggacc ttcgggcctt gtgctaccgg atatgcccag gtgggattag

240

ctagttggtg aggtaagggc tcaccaaggc gacgatccct agctggtctg agaggatgat

300

cagccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcca tgccgcgtgt atgaagaagg ccttcgggtt

420

gtaaagtact ttcagtaggg aggaaggtgg ttaagttaat accttaatca tttgacgtta

480

cctacagaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa

540

gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg catgcaggtg gtttgttaag tcagatgtga

600

aagccctggg ctcaacctag gaattgcatt tgaaactgac aagctagagt actgtagagg

660

ggggtagaat ttcaggtgta gcggtgaaat gcgtagagat ctgaaggaat accggtggcg

720

aaggcggccc cctggacaga tactgacact cagatgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgtctact tggaggttgt gacctagagt

840

cgtggctttc ggagctaacg cgttaagtag accgcctggg gagtacggtc gcaagattaa

900

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

960

aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat ccagagaatc tagcggagac gctggagtgc

1020

cttcgggaac tctgagacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta tccttgtttg ccagcacgta atggtgggaa

1140

ctccagggag actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg gacgacgtca agtcatcatg

1200

gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggcgta tacagagggc agcgataccg

1260

cgaggtggag cgaatctcac aaagtacgtc gtagtccgga ttggagtctg caactcgact

1320

ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcaa atcagaatgt tgcggtgaat acgttcccgg

1380

gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggctg caaaagaagc aggtagttta

1440

accttcggga ggacgcttgc cactttgtgg ttcatgactg gggtgaagtc gtaacaaggt

1500

agcgctaggg gaacctggcg ctggatcacc tcctta

1536

<210> 2000

<211> 1554

<212> DNA

<213> Vibrio parahaemolyticus

<400> 2000

taaattgaag agtttgatca tggctcagat tgaacgctgg cggcaggcct aacacatgca

60

agtcgagcgg aaacgagtta tctgaacctt cggggaacga tatcggcgtc gagcggcgga

120

cgggtgagta atgcctagga aattgccctg atgtggggga taaccattgg aaacgatggc

180

taataccgca tgatgcctac gggccaaaga gggggacctt cgggcctctc gcgtcaggat

240

atgcctaggt gggattagct agttggtgag gtaagggctc accaaggcga cgatccctag

300

ctggtctgag aggatgatca gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga

360

ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagccatg ccgcgtgtgt

420

gaagaaggcc ttcgggttgt aaagcacttt cagtcgtgag gaaggtagtg tagttaatag

480

ctgcattatt tgacgttagc gacagaagaa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg

540

gtaatacgga gggtgcgagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgca tgcaggtggt

600

ttgttaagtc agatgtgaaa gcccggggct caacctcgga attgcatttg aaactggcag

660

actagagtac tgtagagggg ggtagaattt caggtgtagc ggtgaaatgc gtagagatct

720

gaaggaatac cggtggcgaa ggcggccccc tggacagata ctgacactca gatgcgaaag

780

cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgtctacttg

840

gaggttgtgg ccttgagccg tggctttcgg agctaacgcg ttaagtagac cgcctgggga

900

gtacggtcgc aagattaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca

960

tgtggtttaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctact cttgacatcc agagaacttt

1020

ccagagatgg attggtgcct tcgggaactc tgagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc

1080

tcgtgttgtg aaatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc cttgtttgcc

1140

agcgagtaat gtcgggaact ccagggagac tgccggtgat aaaccggagg aaggtgggga

1200

cgacgtcaag tcatcatggc ccttacgagt agggctacac acgtgctaca atggcgcata

1260

cagagggcgg ccaacttgcg aaagtgagcg aatcccaaaa agtgcgtcgt agtccggatt

1320

ggagtctgca actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtggat cagaatgcca

1380

cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggctgca

1440

aaagaagtag gtagtttaac cttcgggggg acgcttacca ctttgtggtt catgactggg

1500

gtgaagtcgt aacaaggtag cgctagggga acctggcgct ggatcacctc ctta

1554

<210> 2001

<211> 1536

<212> DNA

<213> Vibrio sp. RC341

<400> 2001

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc

60

ggcagcacag aggaacttgt tccttgggtg gcgagcggcg gacgggtgag taatgcctgg

120

gaaattgccc ggtagagggg gataaccatt ggaaacgatg gctaataccg cataacctcg

180

caagagcaaa gcaggggacc ttcgggcctt gcgctaccgg atatgcccag gtgggattag

240

ctagttggtg aggtaagggc tcaccaaggc gacgatccct agctggtctg agaggatgat

300

cagccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcca tgccgcgtgt atgaagaagg ccttcgggtt

420

gtaaagtact ttcagtaggg aggaaggtgg ttaagctaat accttaatca tttgacgtta

480

cctacagaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa

540

gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg catgcaggtg gtttgttaag tcagatgtga

600

aagccctggg ctcaacctag gaatcgcatt tgaaactgac aagctagagt actgtagagg

660

ggggtagaat ttcaggtgta gcggtgaaat gcgtagagat ctgaaggaat accggtggcg

720

aaggcggccc cctggacaga tactgacact cagatgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgtctact tggaggttgt gacctagagt

840

cgtggctttc ggagctaacg cgttaagtag accgcctggg gagtacggtc gcaagattaa

900

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

960

aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat ccagagaatc tagcggagac gctggagtgc

1020

cttcgggaac tctgagacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta tccttgtttg ccagcacgta atggtgggaa

1140

ctccagggag actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg gacgacgtca agtcatcatg

1200

gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggcgta tacagagggc agcgataccg

1260

cgaggtggag cgaatctcac aaagtacgtc gtagtccgga ttggagtctg caactcgact

1320

ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcaa atcagaatgt tgcggtgaat acgttcccgg

1380

gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggctg caaaagaagc aggtagttta

1440

accttcggga ggacgcttgc cactttgtgg ttcatgactg gggtgaagtc gtaacaaggt

1500

agcgctaggg gaacctggcg ctggatcacc tcctta

1536

<210> 2002

<211> 1542

<212> DNA

<213> Vibrio vulnificus

<400> 2002

aattgaagag tttgatcatg gctcagattg aacgctggcg gcaggcctaa cacatgcaag

60

tcgagcggca gcacagagaa acttgtttct cgggtggcaa gcggcggacg ggtgagtaat

120

gcctgggaaa ttgccctgat gtgggggata accattggaa acgatggcta ataccgcatg

180

atgcctacgg gccaaagagg gggaccttcg ggcctctcgc gtcaggatat gcccaggtgg

240

gattagctag ttggtgaggt aagggctcac caaggcgacg atccctagct ggtctgagaa

300

gatgatcagc cacactggaa ctgagacacg gtccagactt ctacgggagg cagcagtggg

360

gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagccatgcc gcgtgtgtga agaaggcctt

420

cgggttgtaa agcactttca gttgtgagga aggtggtgtc gttaatagcg gcatcatttg

480

acgttagcaa cagaagaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

540

gtgcgagcgt taatcggaat tactgggcgt aaagcgcatg caggtggttt gttaagtcag

600

atgtgaaagc ccggggctca acctcggaac tgcatttgaa actggcagac tagagtactg

660

tagagggggg tagaatttca ggtgtagcgg tgaaatgcgt agagatctga aggaataccg

720

gtggcgaagg cggccccctg gacagatact gacactcaga tgcgaaagcg tggggagcaa

780

acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacgatg tctacttgga ggttgtggcc

840

ttgagccgtg gctttcggag ctaacgcgtt aagtagaccg cctggggagt acggtcgcaa

900

gattaaaact caaatgaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

960

cgatgcaacg cgaagaacct tacctactct tgacatccag agaagccagc ggagacgcag

1020

gtgtgccttc gggaactctg agacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgttgtgaa

1080

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcct tgtttgccag cgagtaatgt

1140

cgggaactcc agggagactg ccggtgataa accggaggaa ggtggggacg acgtcaagtc

1200

atcatggccc ttacgagtag ggctacacac gtgctacaat ggcgcataca gagggcggcc

1260

aacttgcgaa agtgagcgaa tcccaaaaag tgcgtcgtag tccggattgg agtctgcaac

1320

tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgtggatca gaatgccacg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggctgcaaa agaagtgggt

1440

agtttaacct tcgggaggac gctcaccact ttgtggttca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtagcg ctaggggaac ctggcgctgg atcacctcct ta

1542

<210> 2003

<211> 1467

<212> DNA

<213> Victivallaceae bacterium NML 080035

<400> 2003

tcagaacgaa cgctggcggc atggattagg catgcaagtt gaacgaacca cttcggtgga

60

gagtagcgga agggtgagga acgcgtgagt aatctgcccc ctagttggga ataacagttg

120

gaaacgactg ctaataccga atgtggcttc aatcctgcat gggatggagg ctaaagattt

180

atcgctaggg gatgagctcg cgtcccatta ggtagttggt gaggtaacgg cccaccaagc

240

cgacgatggg tagctggtct gagaggatgg tcagccacac tgggactgag acactgccca

300

gactcctacg ggaggctgca gtcgagaatc ttgggcaatg cgcgaaagcg tgacccagca

360

atgccgcgtg tgtgatgaag gccttcgggt cgtaaagcac tgtctcccgt gacgaaattt

420

gacggtagcg gggaaggaag ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag

480

gtggcgagcg ttgttcggat ttattgggcg taaagggtct gtaggaggtt cgttaaatac

540

gaggtgaaat cccgaagctc aacttcggaa ctgccttgta gactgacgga ctagagtacc

600

ggagaggtaa gcggaatacc aggtgtagcg gtggaatgcg tagatatctg gtagaacacc

660

aatagcgaag gcagcttgct ggacggaaac tgactctgaa agacgaaagc atggggagca

720

aacaggatta gataccctgg tagtccatgc cgtaaacgtt gtcaacttga tgtgggggga

780

tttagtcctc tccgtatcga agctaacgcg ataagttgac cgcctgggga ctacggccgc

840

aaggctaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggcttaa

900

ttcgaggcaa cgcgaagaac cttacctggt cttgaaatat atcggaccgc ctgtgaaagc

960

aggcttccct tcggggctga tatacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgccgtga

1020

ggtgttcggt taagtccggc aacgagcgca acccgtgtca ctagttgcca tcaagtaatg

1080

ttggggactc tagtgagact gcctgtgtta agcaggagga aggcgcggat gacgtcaagt

1140

cagtatggcc cttacgacca gggctgcaca cgtgctacaa tggggggtac aatgggatgc

1200

aatgtcgcga ggcggagcaa atccacaaaa cctctcttag ttcagattgc agtctgcaac

1260

tcgactgcat gaagttggaa tcgctagtaa aggcgtatca gctacgacgc cttgaatacg

1320

ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac atcatgggag ttgactgcac ccgaaatcgg

1380

tgatctaacc tgcaaaggaa gaagccgcct aaggtgtggt cgatgactgg gatgaagtcg

1440

taacaaggta gccgtagggg aacctgc

1467

<210> 2004

<211> 1332

<212> DNA

<213> Victivallis vadensis

<400> 2004

cttcgggagt gagtagcgaa agggtgagga acgcgtgagt aatctgccca taagttggga

60

acaacagttg gaaacgactg ctaataccga atgtggctat tgacccgcat gggtttttgg

120

ctaaagattt atcgcttatg gatgagctcg cgtcccatta gctagttggt gaggtaacgg

180

cccaccaagg ctacgatggg tagctggtct gagaggatgg tcagccacac tgggactgag

240

acactgccca gactcctacg ggaggctgca gtcgagaatc ttgggcaatg cgcgaaagcg

300

tgacccagca atgccgcgtg catgatgaag gccctcgggt cgtaaaatgc tgtctcccgt

360

gacgaataat gacggtagcg gggaaggaag ccacggctaa ctactgccag cagcgcggta

420

atacgtaggt ggcgagcgtt gttcggattt attgggcgta aagggtctgt aggaggtttg

480

ttaaatacga ggtgaaatcc gggggctcac ttccgaattg ccttgtagac tgatgaacta

540

gagtactgga gaggtaagcg gaataccagg tgtagcggtg gaatgcgtag atatctggta

600

gaacaccaat agcgaaggca gcttgctgga cagaaactga ctctgaaaga cgaaagcatg

660

gggagcaaac aggattagat accctggtag tccatgccgt aaacgttgtc aacttgatgt

720

gggcggattt agtcctgtcc gtatcgaagc taacgcgata agttgaccgc ctgggaacta

780

cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt

840

ggcttaattc gaggcaacgc gaagaacctt acctgggctt gaaatatacc ggaccggctg

900

tgaaagcagt cttctcttcg gagctggtat acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt

960

gccgtgagtt gctcggttaa gtccggcaac gagcgcaacc cgtgtcatta gttgccaaca

1020

ggtaatgctg gggactctaa tgagactgcc tgtgttaagc aggaggaagg cgcggatgac

1080

gtcaagtcag tatggccctt acgcccaggg ctgcacacgt gctacaatgg ggggtacaat

1140

gagaagcgaa gtcgcgaggc ggagcaaatc tacaaaacct ctcttagttc agattgcagt

1200

ctgcaactcg actgcatgaa gttggaatcg ctagtaaatg cgtatcagct acgacgcatt

1260

gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacatc atgggagttg attgcacccg

1320

aaatcggtga tc

1332

<210> 2005

<211> 1506

<212> DNA

<213> Virgibacillus proomii

<400> 2005

gcggcgtgcc taatacatgc aagtcgagcg cgggaagcaa gcagaacccc ttcgggggtg

60

acgcatgtgg aacgagcggc ggacgggtga gtaacacgtg ggcaacctgc ctgtaagact

120

gggataactc cgggaaaccg gggctaatac cggataatac gttttcttgc ataaggagac

180

gttaaaaggc ggcgcaagct gtcacttaca gatgggcccg cggcgcatta gctagttggt

240

ggggtaaaag cctaccaagg cgacgatgcg tagccgacct gagagggtga tcggccacac

300

tgggactgag acacrgccca gactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttccgcaatg

360

gacgaaagtc tgacggagca acgccgcgtg agtgaagaag gttttcggat cgtaaaactc

420

tgttgttagg gaagaacaag tgccgttcaa atagggcggc accttgacgg tacctaacca

480

gaaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc aagcgttgtc

540

cggaattatt gggcgtaaag cgcgcgcagg cggtctttta agtctgatgt gaaagcccac

600

ggcttaaccg tggagggcca ttggaaactg gaggacttga gtacagaaga ggagagtgga

660

attccacgtg tagcggtgaa atgcgtagag atgtggagga acaccagtgg cgaaggcgac

720

tctctggtct gtaactgacg ctgaggtgcg aaagcgtggg tagcgaacag gattagatac

780

cctggtagtc cacgccgtaa acgatgagtg ctaggtgtta gggggtttcc gccccttagt

840

gctgcagtta acgcattaag cactccgcct ggggagtacg gccgcaaggc tgaaactcaa

900

aagaattgac ggggacccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcga

960

agaaccttac caggtcttga catcctctga cggccctaga gatagggagt tcccttcggg

1020

gacagagtga caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag

1080

tcccgcaacr agcgcaaccc ttgatcttar ttgccagcat tcagttgggc actctaaggt

1140

gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg

1200

acctgggcta cacacgtgct acaatggatg gaacaaaggg cagcgaagcc gtgaggccaa

1260

gcaaatccca caaaaccatt ctcagttcgg attgcaggct gcaactcgcc tgcatgaagc

1320

cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac

1380

acaccgcccg tcacaccacg agagttggta acacccgaag tcggtgaggt aaccgtaagg

1440

agccagccgc cgaaggtggg accaatgatt ggggtgaagt cgtaacaagg tasccgtatc

1500

ggaagg

1506

<210> 2006

<211> 1483

<212> DNA

<213> Weissella beninensis

<400> 2006

gcctggcggc gtgcctaata catgcaagtc gaacgcattg tcgtggttat gatttgttaa

60

gcttgcttaa cattgattaa tcgccataca atgagtggcg aacgggtgag taacacgtgg

120

gaaacctacc tcttagcagg ggataacatt tggaaacaga tgctaatacc gtataacaaa

180

taaaaccgca tggttttatt ttaaaagatg gttctgctat cactaagaga tggtcccgcg

240

gtgtattagc tagatggtga ggtaatggct caccatggca atgatacata gccgagttga

300

gagactgatc ggccacattg gaactgagac acggtccaaa ctcctacggg aggcagcagt

360

agggaatctt ccacaatggg cgcaagcctg atggagcaac gccgcgtgtg tgatgaaggg

420

tttcggctcg taaaacactg ttataagaga agaacgtcag tgagagtaac tgttcattga

480

gtgacggtat cttatcagaa agggacggct aaatacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt

540

atgtcccaag cgttatccgg atttattggg cgtaaagcga gcgcaggcgg ttatttaagt

600

ctgatgtgaa agcctacggc tcaaccgtag aattgcatcg gaaactggat gacttgagtg

660

cagtagagga gagtggaact ccatgtgtag cggtgaaatg cgtagatata tggaagaaca

720

ccagaggcga aggcggctct ctggactgta actgacgctg aggctcgaaa gtgtgggtag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac accgtaaacg atgaatgcta gttgttagag

840

ggtttccgcc ctttagtgac gcagctaacg cagtaagcat tccgcctggg gagtacgacc

900

gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt

960

aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat ctttcgctat cttaagagat

1020

taagagttcc cttcggggac ggaatgacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg

1080

tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta ttactagttg ccagcattta

1140

gttgggcact ctagtgagac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa

1200

tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca atggatggta caacgagtcg

1260

caaagtcgcg aggctaagct aatctcttaa agccattctc agttcggatt gtagtctgca

1320

actcgactac atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcggat cagcacgccg cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatgaga gtttgtaaca cccaaagtcg

1440

gtggggtaac cttttaggag ccagccgcct aaggtgggat aga

1483

<210> 2007

<211> 1529

<212> DNA

<213> Weissella cibaria

<400> 2007

gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac gctttgtggt tcaactgatt

60

tgaagagctt gctcagatat gacgatggac attgcaaaga gtggcgaacg ggtgagtaac

120

acgtgggaaa cctacctctt agcaggggat aacatttgga aacagatgct aataccgtat

180

aacaatagca accgcatggt tgctacttaa aagatggttc tgctatcact aagagatggt

240

cccgcggtgc attagttagt tggtgaggta atggctcacc aagacgatga tgcatagccg

300

agttgagaga ctgatcggcc acaatgggac tgagacacgg cccatactcc tacgggaggc

360

agcagtaggg aatcttccac aatgggcgaa agcctgatgg agcaacgccg cgtgtgtgat

420

gaagggtttc ggctcgtaaa acactgttgt aagagaagaa tgacattgag agtaactgtt

480

caatgtgtga cggtatctta ccagaaagga acggctaaat acgtgccagc agccgcggta

540

atacgtatgt tccaagcgtt atccggattt attgggcgta aagcgagcgc agacggttat

600

ttaagtctga agtgaaagcc ctcagctcaa ctgaggaatt gctttggaaa ctggatgact

660

tgagtgcagt agaggaaagt ggaactccat gtgtagcggt gaaatgcgta gatatatgga

720

agaacaccag tggcgaaggc ggctttctgg actgtaactg acgttgaggc tcgaaagtgt

780

gggtagcaaa caggattaga taccctggta gtccacaccg taaacgatga gtgctaggtg

840

tttgagggtt tccgccctta agtgccgcag ctaacgcatt aagcactccg cctggggagt

900

acgaccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggagcatg

960

tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggtct tgacatccct tgacaactcc

1020

agagatggag cgttcccttc ggggacaagg tgacaggtgg tgcatggttg tcrtcagctc

1080

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acragcgcaa cccttattac tagttgccag

1140

cattyagttg ggcactctag tgagactgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac

1200

gtcaaatcat catgcccctt atgacctggg ctacacacgt gctacaatgg cgtatacaac

1260

gagttgccaa cccgcgaggg tgagctaatc tcttaaagta cgtctcagtt cggattgtag

1320

gctgcaactc gcctacatga agtcggaatc gctagtaatc gcggatcagc acgccgcggt

1380

gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc atgagagttt gtaacaccca

1440

aagccggtgg ggtaaccttc gggagccagc cgtctaaggt gggacagatg attagggtga

1500

agtcgtaaca aggtagccgt aggagaacc

1529

<210> 2008

<211> 992

<212> DNA

<213> Weissella confusa

<220>

<221> modified_base

<222> (954)..(954)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (973)..(973)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (976)..(976)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (983)..(983)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 2008

ggttcaactg atttgaagag cttgctcaga tatgacgatg gacattgcaa agagtggcga

60

acgggtgagt aacacgtggg aaacctacct cttagcaggg gataacattt ggaaacagat

120

gctaataccg tataacaatg acaaccgcat ggttgttatt taaaagatgg ttctgctatc

180

actaagagat ggtcccgcgg tgcattagct agttggtaag gtaatggctt accaaggcga

240

tgatgcatag ccgagttgag agactgatcg gccacaatgg gactgagaca cggcccatac

300

tcctacggga ggcagcagta gggaatcttc cacaatgggc gaaagcctga tggagcaacg

360

ccgcgtgtgt gatgaagggt ttcggctcgt aaaacactgt tgtaagagaa gaatgacatt

420

gagagtaact gttcaatgtg tgacggtatc ttaccagaaa ggaacggcta aatacgtgcc

480

agcagccgcg gtaatacgta tgttccaagc gttatccgga tttattgggc gtaaagcgag

540

cgcagacggt tatttaagtc tgaagtgaaa gccctcagct caactgagga attgctttgg

600

aaactggatg acttgagtgc agtagaggaa agtggaactc catgtgtagc ggtgaaatgc

660

gtagatatat ggaagaacac cagtggcgaa ggcggctttc tggactgtaa ctgacgttga

720

ggctcgaaag tgtgggtagc aaacaggatt agataccctg gtagtccaca ccgtaaacga

780

tgagtgctag gtgtttgagg gtttccgccc ttaagtgccg cagctaacgc attaagcact

840

ccgcctgggg agtacgaccg caaggttgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa

900

gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tctngacatc

960

ccttgacact ccnganatgg agngttccct tc

992

<210> 2009

<211> 1496

<212> DNA

<213> Weissella hellenica

<400> 2009

gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac gctttgtgct taattgatat

60

gacgagcttg ctctgatttg attttttgat ttcaaagagt ggcgaacggg tgagtaacac

120

gtgggtaacc tacctcttag caggggataa catttggaaa caagtgctaa taccgtataa

180

taccaacaac cgcatggttg ttggttgaaa gatggttctg ctatcactaa gagatggacc

240

cgcggtgcat tagctagttg gtaaggtaat ggcttaccaa ggcaatgatg catagccgag

300

ttgagagact gatcggccac aatgggactg agacacggcc catactccta cgggaggcag

360

cagtagggaa tcttccacaa tgggcgcaag cctgatggag caacgccgcg tgtgtgatga

420

agggtttcgg ctcgtaaaac actgttataa gagaagaacg gcactgagag taactgttca

480

gtgtgtgacg gtatcttacc agaaaggaac ggctaaatac gtgccagcag ccgcggtaat

540

acgtatgttc caagcgttat ccggatttat tgggcgtaaa gcgagcgcag acggttattt

600

aagtctgaag tgaaagccct cagctcaact gaggaattgc tttggaaact ggatgacttg

660

agtgcagtag aggaaagtgg aactccatgt gtagcggtga aatgcgtaga tatatggaag

720

aacaccagtg gcgaaggcgg ctttctggac tgtaactgac gttgaggctc gaaagtgtgg

780

gtagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacaccgta aacgatgagt gctagatgtt

840

cgagggtttc cgcccttgag tgtcgcagct aacgcattaa gcactccgcc tggggagtac

900

gaccgcaagg ttgaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggagcatgtg

960

gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaggtcttg acatcccttg acaacgctag

1020

aaatagcgcg ttcccttcgg ggacaaggtg acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt

1080

gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttattatta gttgccagca

1140

ttcagttggg cactctagtg agactgccgg tgataaaccg gaggaaggtg gggatgacgt

1200

caaatcatca tgccccttat gacctgggct acacacgtgc tacaatggca tatacaacga

1260

gtcgctaacc cgcgagggta cgctaatctc ttaaagtatg tctcagttcg gattgtaggc

1320

tgcaactcgc ctacatgaag tcggaatcgc tagtaatcgc ggatcagaac gccgcggtga

1380

atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat gagagtttgt aacacccaaa

1440

gccggtgggg taacctttta ggagccagcc gtctaaggtg ggacagatga ttaggg

1496

<210> 2010

<211> 1528

<212> DNA

<213> Weissella kandleri

<220>

<221> modified_base

<222> (1)..(2)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (163)..(163)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (273)..(273)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (372)..(372)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (388)..(388)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (440)..(440)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (583)..(583)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (665)..(666)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (802)..(803)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (970)..(970)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1005)..(1005)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1060)..(1060)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1090)..(1090)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1137)..(1137)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1425)..(1425)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<220>

<221> modified_base

<222> (1524)..(1524)

<223> a, c, t, g, unknown or other

<400> 2010

nntaaattga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgaacg cactgtggtt gaaatgagat gagaagcttg cttcaagtca aatgccaaca

120

ttgcagtgag tggcgaacgg gtgagtaaca cgtgggaaac ctncctctta gcaggggata

180

acatctggaa acaggtgcta ataccgtata acaataaaaa ccgcatggtt ttgatttaaa

240

agatggttct gctatcacta agagatggtc ccncggtgca ttagttagtt ggtgaggtaa

300

aggctcacca agacgatgat gcatagccga gttgagagac tgatcggcca caatgggact

360

gagacacggc cnatactcct acgggagnca gcagtaggga atcttccaca atggacgaaa

420

gtctgatgga gcaacgccgn gtgtgtgatg aagggtttcg gctcgtaaaa cactgttgta

480

agagaagaat gacattgaga gtaactgttc aatgtgtgac ggtatcttac cagaaaggaa

540

cggctaaata cgtgccagca gccgcggtaa tacgtatgtt ccnagcgtta tccggattta

600

ttgggcgtaa agcgagcgca gacggttatt taagtctgaa gtgaaagccc tcggcttaac

660

cgagnnattg ctttggaaac tggataactt gagtgcagta gaggaaagtg gaactccatg

720

tgtagcggtg aaatgcgtag atatatggaa gaacaccagt ggcgaaggcg gctttctgga

780

ctgtaactga cgttgaggct cnnaagtgtg ggtagcaaac aggattagat accctggtag

840

tccacaccgt aaacgatgag tgctagctgt tcgagggttt ccgcccttga gtggcgaagc

900

taacgcatta agcactccgc ctggggagta cgaccgcaag gttgaaactc aaaggaattg

960

acggggaccn gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagnaacgc gaagaacctt

1020

accaggtctt gacatccttt gaccactcca gagatggagn tttcccttcg gggtcaaagt

1080

gacaggtggn gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccncaa

1140

cgagcgcaac ccttattgtt agttgccagc atttagttgg gcactctagc aagactgccg

1200

gtgacaaacc ggaggaaggc ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc

1260

tacacacgtg ctacaatggc aagtacaacg agcagccaac ccgcgagggt gcgcaaatct

1320

cttaaagctt gtctcagttc ggactgtagg ctgcaactcg cctacacgaa gtcggaatcg

1380

ctagtaatcg cggatcagca cgccgcggtg aatacgttcc cgggncttgt acacaccgcc

1440

cgtcacacca tgagagtttg taacacccaa agtcggtgag gtaaccttta taggggccag

1500

ccgcctaagg tgggacagat gatnaggg

1528

<210> 2011

<211> 1591

<212> DNA

<213> Weissella koreensis

<400> 2011

tttaaattga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgaacg cattgtggtt gaaatgatat gaagaacttg ttcagatttg attttcaaca

120

ttgcaatgag tggcgaacgg gtgagtaaca cgtgggaaac ctacctctta gcaggggata

180

acatttggaa acaaatgcta ataccgtata ataattaaaa ccgcatggtt ttagtttaaa

240

agatggtctt gctatcacta agagatggtc ccgcggtgta ttagttagtt ggtgaggtaa

300

tggctcacca agacaatgat acatagccga gttgagagac tgaccggcca caatgggact

360

gagacacggc ccatactcct acgggaggca gcagtaggga atcttccaca atggacgaaa

420

gtctgatgga gcaacgccgc gtgtgtgatg aagggtttcg gctcgtaaaa cactgttgta

480

agagaagaat gacattgaga gtaactgttc aatgtgtgac ggtatcttac cagaaaggaa

540

cggctaaata cgtgccagca gccgcggtaa tacgtatgtt ccaagcgtta tccggattta

600

ttgggcgtaa agcgagcgca gacggttatt taagtctgaa gtgaaagccc tcggctcaac

660

cgaggaattg ctttggaaac tggataactt gagtgcagta gaggaaagtg gaactccatg

720

tgtagcggtg aaatgcgtag atatatggaa gaacaccagt ggcgaaggcg gctttctgga

780

ctgtaactga cgttgaggct cgaaagtgtg ggtagcaaac aggattagat accctggtag

840

tccacactgt aaacgatgag tgctagttgt tcgagggttt ccgcccttga gtgacgaagc

900

taacgcatta agcactccgc ctggggagta cgaccgcaag gttgaaactc aaaggaattg

960

acggggaccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gaagaacctt

1020

accaggtctt gacatccttt gaccactcca gagatggagc tttcccttcg gggacaaagt

1080

gacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa

1140

cgagcgcaac ccttattgtt agttgccagc atttagttgg gcactctagc aagactgccg

1200

gtgacaaacc ggaggaaggc ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgacctgggc

1260

tacacacgtg ctacaatggc aagtacaacg agtcgccaac ccgcgagggt gcgcaaatct

1320

cttaaagctt gtctcagttc ggactgtagg ctgcaactcg cctacacgaa gtcggaatcg

1380

ctagtaatcg cggatcagca cgccgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt acacaccgcc

1440

cgtcacacca tgagagtttg taacacccaa agtcggtgag gtaacctttt attaggagcc

1500

agccgcctaa ggtgggacag atgattaggg tgaagtcgta acaaggtagc cgtaggagaa

1560

cctgcggctg gatcacctcc tttctaagga a

1591

<210> 2012

<211> 1579

<212> DNA

<213> Weissella paramesenteroides

<400> 2012

tttaaaatga gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc

60

aagtcgaacg ctttgtcttt aactgatatg aagagcttgc tctgatttga ttttatctga

120

caaagagtgg cgaacgggtg agtaacacgt gggtaaccta cctcttagca ggggataaca

180

tttggaaaca agtgctaata ccgtataata ccaacaaccg catggttgtt ggttgaaaga

240

tggttctgct atcactaaga gatggacccg cggtgcatta gctagttggt aaggtaacgg

300

cttaccaagg caatgatgca tagccgagtt gagagactga tcggccacaa tgggactgag

360

acacggccca tactcctacg ggaggcagca gtagggaatc ttccacaatg ggcgcaagcc

420

tgatggagca acgccgcgtg tgtgatgaag ggtttcggct cgtaaaacac tgttataaga

480

gaagaacggc actgagagta actgttcagt gtgtgacggt atcttaccag aaaggaacgg

540

ctaaatacgt gccagcagcc gcggtaatac gtatgttcca agcgttatcc ggatttattg

600

ggcgtaaagc gagcgcagac ggttatttaa gtctgaagtg aaagccctca gctcaactga

660

ggaatggctt tggaaactgg atgacttgag tgcagtagag gaaagtggaa ctccatgtgt

720

agcggtgaaa tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct ttctggactg

780

taactgacgt tgaggctcga aagtgtgggt agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc

840

acaccgtaaa cgatgagtgc tagatgttcg agggtttccg cccttgagtg tcgcagctaa

900

cgcattaagc actccgcctg gggagtacga ccgcaaggtt gaaactcaaa ggaattgacg

960

gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc

1020

aggtcttgac atcccttgct aatcctagaa ataggacgtt cccttcgggg acaaggtgac

1080

aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga

1140

gcgcaaccct tattattagt tgccagcatt cagttgggca ctctagtgag actgccggtg

1200

acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatga cctgggctac

1260

acacgtgcta caatggcata tacaacgagt cgccaacccg cgagggtgcg ctaatctctt

1320

aaagtatgtc tcagttcgga ttgtaggctg caactcgcct acatgaagtc ggaatcgcta

1380

gtaatcgcgg atcagcacgc cgcggtgaat acgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt

1440

cacaccatga gagtttgtaa cacccaaagc cggtggggta accttttagg agccagccgt

1500

ctaaggtggg acagatgatt agggtgaagt cgtaacaagg tagccgtagg agaacctgcg

1560

gctggatcac ctcctttct

1579

<210> 2013

<211> 1234

<212> DNA

<213> Weissella sp. KLDS 7.0701

<400> 2013

agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgggaa acctacctct tagcagggga taacatttgg

60

aaacagatgc taataccgta taacaaaagt cactaagaga tggtcccgcg gtgcattagt

120

tagttggtga ggtaatggct caccaagacg atgatgcata gccgagttga gagactgatc

180

ggccacaatg ggactgagac acggcccata ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt

240

ccacaatggg cgaaagcctg atggagcaac gccgcgtgtg tgatgaaggg tttcggctcg

300

taaaacactg ttgtaagaga agatgacggt atcttaccag aaaggaacgg ctaaatacgt

360

gccagcagcc gcggtaatac gtatgttcca agcgttatcc ggatttattg ggcgtaaagc

420

gagcgcagac ggttatttaa gtctgaagtg aaagccctca gctcaactga ggaattgctt

480

tggaaactgg atgacttgag tgcagtagag gaaagtggaa ctccatgtgt agcggtgaaa

540

tgcgtagata tatggaagaa caccagtggc gaaggcggct ttctggactg actgacgttg

600

aggctcgaaa gtgtgggtag caaacaggat tagataccct ggtagtccac accgtaaacg

660

atgagtgcta ggtgtttgag cttaagtgcc gcagctaacg cattaagcac tccgcctggg

720

gagtacgacc gcaaggttga aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggtggag

780

catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag gtcttgacat cgacaggtgg

840

tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa

900

cccttattac tagttgccag catgggcact ctagtgagac tgccggtgac aaaccggagg

960

aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac acgtgctaca

1020

atggcgtaca acgagttgcc aacccgcgag ggtgagctaa tctctttacg tctcagttcg

1080

gatgtaggct gcaactcgcc tacagaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcacgc

1140

cgcggtgaat acgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatga gagtttgtaa

1200

cacccaaagc cggtgggtag ccagccgtct aagg

1234

<210> 2014

<211> 1480

<212> DNA

<213> Wolinella succinogenes

<400> 2014

agagtttgat cctggctcag agtgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac

60

ggtaacaggg tgtagcttgc tatactgctg acgagtggcg cacgggtgag taatgcatag

120

gttatgtgcc ccatagtctg gaatagccac tggaaacggt gattaatacc ggatattccc

180

gagaggggaa agtttttcgc tatgggatca gcctatgtcc tatcagcttg ttggtgaggt

240

aatggctcac caaggctatg acgggtatcc ggcctgagag ggtgatcgga cacactggaa

300

ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtagg gaatattgct caatgggcga

360

aagcctgaag cagcaacgcc gcgtggagga tgaaggtctt cggattgtaa actccttttc

420

taagagaaga ttatgacggt atcttaggaa taagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc

480

gcggtaatac ggagggtgca agcgttactc ggaatcactg ggcgtaaaga gcacgtaggc

540

ggccttgcaa gtcagatgtg aaatccaacg gcttaaccgt tgaactgcat ttgaaactgc

600

aaggctagag tatgggagag gtaggtggaa ttctcggtgt aggggtaaaa tccgtagaga

660

tcgagaggaa tactcattgc gaaggcgacc tgctggaaca ttactgacgc tgaggtgcga

720

aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccctaaa cgatgaatgc

780

tagttgttgc cctgcttgtc agggcagtaa tgcagttaac acattaagca ttccgcctgg

840

ggagtacggt cgcaagatta aaactcaaag gaatagacgg ggacccgcac aagcggtgga

900

gcatgtggtt taattcgaag atacgcgaag aaccttacct gggcttgaca ttgatagaat

960

cctatagaga tatgggagtg ccagtttact ggagcttgaa aacaggtgct gcacggctgt

1020

cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac cctcgtcact

1080

agttgctaac ggttcggccg agcactctag tgagactgcc ttcgcaagga ggaggaaggt

1140

gaggacgacg tcaagtcatc atggccctta cgcccagggc tacacacgtg ctacaatggt

1200

gtgtacaaag agaagcaata ccgcgaggtg gagcaaatct ttaaaacaca tctcagttcg

1260

gattgtagtc tgcaactcga ctacatgaag ctggaatcgc tagtaatcgt agatcagcaa

1320

tgctacggtg aatacgttcc cgggtcttgt actcaccgcc cgtcacacca tgggagttgt

1380

attcgcctta agccgggacg ctaaactggc taccgtccac ggcggatgca gcgactgggg

1440

tgaagtcgta acaaggtaac cgtaggtgaa cctgcggttg

1480

<210> 2015

<211> 1491

<212> DNA

<213> Xanthomonadaceae bacterium NML 03-0222

<400> 2015

agtgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac ggcagcgcga gagagcttgc

60

tctcttggcg gcgagtggcg gacgggtgag gaatacgtcg gaatctgcct atttgtgggg

120

gataacgtag ggaaacttac gctaataccg catacgtcct acgggagaaa gcaggggacc

180

ttcgggcctt gcgcagatag atgagccgac gtcggattag ctagttgggg gggtaatggc

240

ccaccaaggc aacgatccgt agctggtctg agaggatgat cagccacact ggaactgaga

300

cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tggacaatgg gcgcaagcct

360

gatccagcca tgccgcgtgg gtgaagaagg ccttcgggtt gtaaagccct tttgttggga

420

aagaaaagca tgcggttaat acccgtgtgt catgacggta cccaaagaat aagcaccggc

480

taacttcgtg ccagcagccg cggtaatacg aagggtgcaa gcgttactcg gaattactgg

540

gcgtaaagcg tgcgtaggtg gtttgttaag tcagatgtga aagccctggg ctcaacctgg

600

gaactgcatt tgatactggc aagctagagt gcggtagagg atagcggaat tcctggtgta

660

gcagtgaaat gcgtagagat caggaggaac atccgtggcg aaggcggcta tctgggccag

720

cactgacact gaggcacgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

780

cgccctaaac gatgcgaact ggatgttggg ctcaacttgg agttcagtat cgaagctaac

840

gcgttaagtt cgccgcctgg ggagtacggt cgcaagactg aaactcaaag gaattgacgg

900

gggcccgcac aagcggtgga gtatgtggtt taattcgaag caacgcgcag aaccttacct

960

ggccttgaca tgtcgagaac ttggcagaga tgccttggtg ccttcgggaa ctcgaacaca

1020

ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag

1080

cgcaaccctt gtccttagtt gccagcacgt aatggtggga actctaagga gaccgccggt

1140

gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat ggcccttacg gccagggcta

1200

cacacgtact acaatgggaa ggacagaggg ctgcgaaccc gcgagggcaa gccaatccca

1260

gaaaccttct ctcagtccgg attggagtct gcaactcgac tccatgaagt cggaatcgct

1320

agtaatcgca gatcagcatt gctgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc

1380

gtcacaccat gggagtttgt tgcaccagaa gcaggtagct taaccttcgg gagggcgctt

1440

gccacggtgt ggccgatgac tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtac c

1491

<210> 2016

<211> 1548

<212> DNA

<213> Xanthomonas campestris

<400> 2016

agagtttggt cctggctcag agtgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac

60

ggcagcacag taagagcttg ctcttacggg tggcgagtgg cggacgggtg aggaatacat

120

cggaatctac tctttcgtgg gggataacgt agggaaactt acgctaatac cgcatacgac

180

ctacgggtga aagcggagga ccttcgggct tcgcgcgatt gaatgagccg atgtcggatt

240

agctagttgg cggggtaaag gcccaccaag gcgacgatcc gtagctggtc tgagaggatg

300

atcagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat

360

attggacaat gggcgcaagc ctgatccatc catgccgcgt gggtgaagaa ggccttcggg

420

ttgtaaagcc cttttgttgg gaaagaaaag cagtcggtta tacccgattg ttctgacggt

480

acccaaagaa taagcaccgg ctaacttcgc gccagcagcc gcggtaatac gaagggtgca

540

agcgttactc ggaattactg ggcgtaaagc gtgcgtaggt ggtggtttaa gtctgttgtg

600

aaagccctgg gctcaacctg ggaattgcag tggatactgg gtcactagag tgtggtagag

660

ggtagcggaa ttcccggtgt agcagtgaaa tgcgtagaga tcgggaggaa catccgtggc

720

gaaggcggct acctggacca acactgacac tgaggcgcga aagcgtgggg agcaaacagg

780

attagatacc ctggtagtcc acgccctaaa cgatgcgaac tggatgttgg gtgcaatttg

840

gcacgcagta tcgaagctaa cgcgttaagt tcgccgcctg gggagtacgg tcgcaagact

900

gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agtatgtggt ttaattcgat

960

gcaacgcgaa gaaccttacc tggtcttgac atccacggaa ctttccagag atggattggt

1020

tgccttcggg aaccgtgaga cagtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

1080

tgggttaagt cccgcaagag cgcaaccctt gtccttagtt gccaagccaa cgtaatggtg

1140

ggaactctaa ggagaccggc cgtgacaaac cggaggaagg tggggatgac gtcaaagtca

1200

atcatggcca cttacgtcca gggctacaca cgtactacaa tggtagggta cagagggctg

1260

caaacaccgc gagggtaagc caatcccaga aaccctatct cagtccggat tggagtctgc

1320

aactcgactc catgaagtcg gaatcagcta gtaatcgcag atcagcattg ctgcggtgaa

1380

tacgttcccg ggccttgtac acacacagca ccgtcacaca tgggagtttg ttgcaccaga

1440

agcaggtagc ttaaccttcg ggagggcgct tgccacggtg tggccgatga ctggggtgaa

1500

gtcgtaacaa ggtagccgta tcggaaggtg cggctggatc acctcctt

1548

<210> 2017

<211> 1301

<212> DNA

<213> Xanthomonas sp. kmd_489

<400> 2017

gaatctaccg ttttcgtggg ggataacgta gggaaactta cgctaatacc gcatacgacc

60

ttagggtgaa agcggaggac cttcgggctt cgcgcggata gatgagccga tgtcggatta

120

gctagttggc ggggtaaagg cccaccaagg cgacgatccg tagctggtct gagaggatga

180

tcagccacac tggaactgag acacggtcca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata

240

ttggacaatg ggcgcaagcc tgatccagcc atgccgcgtg ggtgaagaag gccttcgggt

300

tgtaaagccc ttttgttggg aaagaaaagc agtcggttaa tacccgattg ttctgacggt

360

acccaaagaa taagcaccgg ctaacttcgt gccagcagcc gcggtaatac gaagggtgca

420

agcgttactc ggaattactg ggcgtaaagc gtgcgtaggt ggttgtttaa gtccgttgtg

480

aaagccctgg gctcaacctg ggaattgcag tggatactgg gcaactagag tgtggtagag

540

gatggcggaa ttcccggtgt agcagtgaaa tgcgtagaga tcgggaggaa catctgtggc

600

gaaggcggcc atctggacca acactgacac tgaggcacga aagcgtgggg agcaaacagg

660

attagatacc ctggtagtcc acgccctaaa cgatgcgaac tggatgttgg gtgcaacttg

720

gcacgcagta tcgaagctaa cgcgttaagt tcgccgcctg gggagtacgg tcgcaagact

780

gaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agtatgtggt ttaattcgat

840

gcaacgcgaa gaaccttacc tggtcttgac atccacggaa ctttccagag atggattggt

900

gccttcggga accgtgagac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt

960

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtccttagt tgccagcacg taatggtggg

1020

aactctaagg agaccgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca

1080

tggcccttac gaccagggct acacacgtac tacaatggtt aggacagagg gctgcaaact

1140

cgcgagagta agccaatccc agaaacctaa tctcagtccg gattggagtc tgcaactcga

1200

ctccatgaag tcggaatcgc tagtaatcgc agatcagcat tgvtgtcggw gaatacgttc

1260

ccggggcgtt tgtacacacc gcccgtcact ccwtacaagt t

1301

<210> 2018

<211> 1471

<212> DNA

<213> Xenophilus aerolatus

<400> 2018

cacatgcaag tcgaacggta acaggtcttc ggatgctgac gagtggcgaa cgggtgagta

60

atacatcgga acgtgcccag tcgtggggga taactacgcg aaagcgtagc taataccgca

120

tacgatctat ggatgaaagc gggggatcgc aagacctcgc gcgattggag cggccgatgg

180

cagattaggt agttggtggg gtaaaggctc accaagccga cgatctgtag ctggtctgag

240

aggacgacca gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg

300

gggaattttg gacaatgggc gcaagcctga tccagccatg ccgcgtgcag gatgaaggcc

360

ttcgggttgt aaactgcttt tgtacggaac gaaaagtctc tttctaataa agagggatca

420

tgacggtacc gtaagaataa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta

480

gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgtg cgcaggcggt gatgtaagac

540

agttgtgaaa tccccgggct caacctggga actgcatctg tgactgcatc gctggagtgc

600

ggcagagggg gatggaattc cgcgtgtagc agtgaaatgc gtagatatgc ggaggaacac

660

cgatggcgaa ggcaatcccc tgggcctgca ctgacgctca tgcacgaaag cgtggggagc

720

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccctaaacga tgtcaactgg ttgttgggaa

780

ttcactttct cagtaacgaa gctaacgcgt gaagttgacc gcctggggag tacggccgca

840

aggttgaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggatgat gtggtttaat

900

tcgatgcaac gcgaaaaacc ttacccacct ttgacatgta cggaatttgc cagagatggc

960

ttagtgctcg aaagagaacc gtaacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt

1020

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt cattagttgc tacattcagt

1080

tgggcactct aatgagactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1140

ctcatggccc ttataggtgg ggctacacac gtcatacaat ggctggtaca aagggttgcc

1200

aacccgcgag ggggagctaa tcccataaag ccagtcgtag tccggatcgc agtctgcaac

1260

tcgactgcgt gaagtcggaa tcgctagtaa tcgtggatca gaatgtcacg gtgaatacgt

1320

tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagc gggttctgcc agaagtagtt

1380

agcctaaccg caaggagggc gattaccacg gcagggttcg tgactggggt gaagtcgtaa

1440

caaggtagcc gtatcggaag gtgcggctgg a

1471

<210> 2019

<211> 1504

<212> DNA

<213> Yersinia aldovae

<400> 2019

gagtttgatc ttggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc aagtcgagcg

60

gcagcgggaa gtagtttact actttgccgg cgagcggcgg acgggtgagt aatgtctggg

120

aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtag ctaataccgc atgacctcgc

180

aagagcaaag tgggggacct tcgggcctca cgccatcgga tgtgcccaga tgggattagc

240

tagtaggtgg ggtaatggct cacctaggcg acgatcccta gctggtctga gaggatgacc

300

agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

360

gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgtg tgaagaaggc cttcgggttg

420

taaagcactt tcagcgagga ggaaggcaat cgtgttaata gcacggttga ttgacgttac

480

tcgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg agggtgcaag

540

cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tttgttaagt cagatgtgaa

600

atccccgcgc ttaacgtggg aactgcattt gaaactggca agctagagtc ttgtagaggg

660

gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata ccggtggcga

720

aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag caaacaggat

780

tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg atgtcgactt ggaggttgtg cccttgaggc

840

gtggcttccg gagctaacgc gttaagtcga ccgcctgggg agtacggccg caaggttaaa

900

actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgca

960

acgcgaagaa ccttacctac tcttgacatc cacagaactt agcagagatg cttcggtgcc

1020

ttcgggaact gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt gaaatgttgg

1080

gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcacgtaa tggtgggaac

1140

tcaagggaga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgg

1200

cccttacgag tagggctaca cacgtgctac aatggcagat acaaagtgaa gcgaactcgc

1260

gagagccagc ggaccacata aagtctgtcg tagtccggat tggagtctgc aactcgactc

1320

catgaagtcg gaatcgctag taatcgtaga tcagaatgct acggtgaata cgttcccggg

1380

ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggttgc aaaagaagta ggtagcttaa

1440

ccttcgggag ggcgcttacc actttgtgat tcatgactgg ggtgaagtcg taacaaggta

1500

gccg

1504

<210> 2020

<211> 1419

<212> DNA

<213> Yersinia aleksiciae

<400> 2020

cacatgcaag tcgagcggca gcggggagta gtttactact ctgccggcga gcggcggacg

60

ggtgagtaat gtctggggat ctgcctgatg gagggggata actactggaa acggtagcta

120

ataccgcatg acctcgcaag agcaaagtgg gggaccttcg ggcctcacgc catcggatga

180

acccagatgg gattagctag taggtgaggt aatggctcac ctaggcgacg atccctagct

240

ggtctgagag gatgaccagc cacactggaa ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg

300

cagcagtggg gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagccatgcc gcgtgtgtga

360

agaaggcctt cgggttgtaa agcactttca gcgaggagga aggcagtcgt gttaatagca

420

cgattgattg acgttactcg cagaagaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt

480

aatacggagg gtgcaagcgt taatcggaat tactgggcgt aaagcgcacg caggcggttt

540

gttaagtcag atgtgaaatc cccgcgctta acgtgggaac tgcatttgaa actggcaagc

600

tagagtcttg tagagggggg tagaattcca ggtgtagcgg tgaaatgcgt agagatctgg

660

aggaataccg gtggcgaagg cggccccctg gacaaagact gacgctcagg tgcgaaagcg

720

tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacgatg tcgacttgga

780

ggttgtgccc ttgaggcgtg gcttccggag ctaacgcgtt aagtcgaccg cctggggagt

840

acggccgcaa ggttaaaact caaatgaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg

900

tggtttaatt cgatgcaacg cgaagaacct tacctactct tgacatccac ggaatttagc

960

agagatgctt aagtgccttc gggaaccgtg agacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc

1020

gtgttgtgaa atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcct ttgttgccag

1080

cacgtaatgg tgggaactca agggagactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg

1140

acgtcaagtc atcatggccc ttacgagtag ggctacacac gtgctacaat ggcagataca

1200

aagtgaagcg aactcgcgag agcaagcgga ccacataaag tctgtcgtag tccggattgg

1260

agtctgcaac tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgtagatca gaatgctacg

1320

gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgcaaa

1380

agaagtaggt agcttaacct tcgggagggc gcttaccac

1419

<210> 2021

<211> 1461

<212> DNA

<213> Yersinia bercovieri

<400> 2021

attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc ggcagcggga agtagtttac

60

tactttgccg gcgagcggcg gacgggtgag taatgtctgg ggatctgcct gatggagggg

120

gataactact ggaaacggta gctaataccg catgacctcg taagagcaaa gtgggggacc

180

ttcgggcctc acgccatcgg atgaacccag atgggattag ctagtaggtg gggtaatggc

240

tcacctaggc gacgatccct agctggtctg agaggatgac cagccacact ggaactgaga

300

cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct

360

gatgcatcca tgccgcgtgt gtgaagaagg ccttcgggtt gtaaagcact ttcagcgagg

420

aggaaggcag tcgtgttaat agcacgattg attgacgtta ctcgcagaag aagcaccggc

480

taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg

540

gcgtaaagcg cacgcaggcg gtttgttaag tcagatgtga aatccccgcg cttaacgtgg

600

gaactgcatt tgaaactggc aagctagagt cttgtagagg ggggtagaat tccaggtgta

660

gcggtgaaat gcgtagagat ctggaggaat accggtggcg aaggcggccc cctggacaaa

720

gactgacgct caggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

780

cgctgtaaac gatgtcgact tggaggttgt gcccttgagg cgtggcttcc ggagctaacg

840

cgttaagtcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa aactcaaatg aattgacggg

900

ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccta

960

ctcttgacat ccacagaact tagcagagat gcttcagtgc cttcgggaac tgtgagacag

1020

gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1080

gcaaccctta tcctttgttg ccagcacgta atggtgggaa ctcaagggag actgccggtg

1140

acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg gcccttacga gtagggctac

1200

acacgtgcta caatggcaga tacaaagtga agcgaactcg cgagagcaag cggaccacat

1260

aaagtctgtc gtagtccgga ttggagtctg caactcgact ccatgaagtc ggaatcgcta

1320

gtaatcgtag atcagaatgc tacggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

cacaccatgg gagtgggttg caaaagaagt aggtagctta accttcggga gggcgcttac

1440

cactttgtga ttcatgactg g

1461

<210> 2022

<211> 1546

<212> DNA

<213> Yersinia enterocolitica

<400> 2022

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgagcg gcagcgggaa gtagtttact actttgccgg cgagcggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg aaactgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtag ctaataccgc

180

ataacgtctt cggaccaaag tgggggacct tcgggcctca cgccatcgga tgtgcccaga

240

tgggattagc tagtaggtgg ggtaatggct cacctaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgtg tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagcactt tcagcgagga ggaaggcata aaggttaata acctttgtga

480

ttgacgttac tcgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tttgttaagt

600

cagatgtgaa atccccgcgc ttaacgtggg aactgcattt gaaactggca agctagagtc

660

ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg atgtcgactt ggaggttgtg

840

cccttgaggc gtggcttccg gagctaacgc gttaagtcga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctac tcttgacatc cacggaattt agcagagatg

1020

ctttagtgcc ttcgggaacc gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgccag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcacgtga

1140

tggtgggaac tcaaaggaga ctgctggtga taaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1200

gtcatcatgg cccttacgag tagggctaca cacgtgctac aatggcagat acaaagtgaa

1260

gcgaactcgc gagagcaagc ggaccacata aagtctgtcg tagtccggat tggagtctgc

1320

aactcgactc catgaagtcg gaatcgctag taatcgtaga tcagaatgct acggtgaata

1380

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggttgc aaaagaagta

1440

ggtagcttaa ccttcgggag ggcgcttacc actttgtgat tcatgactgg ggtgaagtcg

1500

taacaaggta accgtagggg aacctgcggt tggatcacct ccttac

1546

<210> 2023

<211> 1461

<212> DNA

<213> Yersinia frederiksenii

<400> 2023

attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc ggcagcggaa agtagtttac

60

tactttgccg gcgagcggcg gacgggtgag taatgtctgg gaaactgcct gatggagggg

120

gataactact ggaaacggta gctaataccg catgacctcg caagagcaaa gtgggggacc

180

ttcgggcctc acgccatcgg atgtgcccag atgggattag ctagtaggtg gggtaatggc

240

tcacctaggc gacgatccct agctggtctg agaggatgac cagccacact ggaactgaga

300

cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct

360

gatgcagcca tgccgcgtgt gtgaagaagg ccttcgggtt gtaaagcact ttcagcgagg

420

aggaaggggt tgagtttaat acgctcaatc attgacgtta ctcgcagaag aagcaccggc

480

taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg

540

gcgtaaagcg cacgcaggcg gtttgttaag tcagatgtga aatccccgcg cttaacgtgg

600

gaactgcatt tgaaactggc aagctagagt cttgtagagg ggggtagaat tccaggtgta

660

gcggtgaaat gcgtagagat ctggaggaat accggtggcg aaggcggccc cctggacaaa

720

gactgacgct caggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

780

cgctgtaaac gatgtcgact tggaggttgt gcccttgagg cgtggcttcc ggagctaacg

840

cgttaagtcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa aactcaaatg aattgacggg

900

ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccta

960

ctcttgacat ccacagaact tagcagagat gcttcggtgc cttcgggaac tgtgagacag

1020

gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1080

gcaaccctta tcctttgttg ccagcacgta atggtgggaa ctcaaaggag actgccggtg

1140

acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg gcccttacga gtagggctac

1200

acacgtgcta caatggcaga tacaaagtga agcgaactcg cgagagcaag cggaccacat

1260

aaagtctgtc gtagtccgga ttggagtctg caactcgact ccatgaagtc ggaatcgcta

1320

gtaatcgtag atcagaatgc tacggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

cacaccatgg gagtgggttg caaaagaagt aggtagctta accttcggga gggcgcttac

1440

cactttgtga ttcatgactg g

1461

<210> 2024

<211> 1461

<212> DNA

<213> Yersinia intermedia

<400> 2024

attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc ggcagcggga agtagtttac

60

tactttgccg gcgagcggcg gacgggtgag taatgtctgg gaaactgcct gatggagggg

120

gataactact ggaaacggta gctaataccg catgacctcg taagagcaaa gtgggggacc

180

ttcgggcctc acgccatcgg atgtgcccag atgggattag ctagtaggtg gggtaatggc

240

tcacctaggc gacgatccct agctggtctg agaggatgac cagccacact ggaactgaga

300

cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct

360

gatgcagcca tgccgcgtgt gtgaagaagg ccttcgggtt gtaaagcact ttcagcgagg

420

aggaaggcag tcgtgttaat agcacgattg attgacgtta ctcgcagaag aagcaccggc

480

taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg

540

gcgtaaagcg cacgcaggcg gtttgttaag tcagatgtga aatccccgcg cttaacgtgg

600

gaactgcatt tgaaactggc aagctagagt cttgtagagg ggggtagaat tccaggtgta

660

gcggtgaaat gcgtagagat ctggaggaat accggtggcg aaggcggccc cctggacaaa

720

gactgacgct caggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

780

cgctgtaaac gatgtcgact tggaggttgt gcccttgagg cgtggcttcc ggagctaacg

840

cgttaagtcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa aactcaaatg aattgacggg

900

ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccta

960

ctcttgacat ccacagaact tagcagagat gctttagtgc cttcgggaac cgtgagacag

1020

gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1080

gcaaccctta tcctttgttg ccagcacgta atggtgggaa ctcaagggag actgccggtg

1140

acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg gcccttacga gtagggctac

1200

acacgtgcta caatggcaga tacaaagtga agcgaactcg cgagagcaag cggaccacat

1260

aaagtctgtc gtagtccgga ttggagtctg caactcgact ccatgaagtc ggaatcgcta

1320

gtaatcgtag atcagaatgc tacggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

cacaccatgg gagtgggttg caaaagaagt aggtagctta accttcggga gggcgcttac

1440

cactttgtga ttcatgactg g

1461

<210> 2025

<211> 1543

<212> DNA

<213> Yersinia kristensenii

<400> 2025

aattgaagag tttgatcatg gctcagattg aacgctggcg gcaggcctaa cacatgcaag

60

tcgagcggca gcgggaagta gtttactact ttgccggcga gcggcggacg ggtgagtaat

120

gtctgggaaa ctgcctgatg gagggggata actactggaa acggtagcta ataccgcatg

180

acctcgcaag agcaaagtgg gggaccttcg ggcctcacgc catcggatgt gcccagatgg

240

gattagctag taggtggggt aatggctcac ctaggcgacg atccctagct ggtctgagag

300

gatgaccagc cacactggaa ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtggg

360

gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg cagccatgcc gcgtgtgtga agaaggcctt

420

cgggttgtaa agcactttca gcgaggagga agggttcagt gttaatagca ctgagcattg

480

acgttactcg cagaagaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg

540

gtgcaagcgt taatcggaat tactgggcgt aaagcgcacg caggcggttt gttaagtcag

600

atgtgaaatc cccgcgctta acgtgggaac tgcatttgaa actggcaagc tagagtcttg

660

tagagggggg tagaattcca ggtgtagcgg tgaaatgcgt agagatctgg aggaataccg

720

gtggcgaagg cggccccctg gacaaagact gacgctcagg tgcgaaagcg tggggagcaa

780

acaggattag ataccctggt agtccacgct gtaaacgatg tcgacttgga ggttgtgccc

840

ttgaggcgtg gcttccggag ctaacgcgtt aagtcgaccg cctggggagt acggccgcaa

900

ggttaaaact caaatgaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt

960

cgatgcaacg cgaagaacct tacctactct tgacatccac agaacttagc agagatgctt

1020

aggtgccttc gggaactgtg agacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgttgtgaa

1080

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttatcct ttgttgccag cacgtaatgg

1140

tgggaactca agggagactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc

1200

atcatggccc ttacgagtag ggctacacac gtgctacaat ggcagataca aagtgaagcg

1260

aactcgcgag agcaagcgga ccacataaag tctgtcgtag tccggattgg agtctgcaac

1320

tcgactccat gaagtcggaa tcgctagtaa tcgtagatca gaatgctacg gtgaatacgt

1380

tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt gggttgcaaa agaagtaggt

1440

agcttaacct tcgggagggc gcttaccact ttgtgattca tgactggggt gaagtcgtaa

1500

caaggtaacc gtaggggaac ctgcggttgg atcacctcct tac

1543

<210> 2026

<211> 1461

<212> DNA

<213> Yersinia mollaretii

<400> 2026

attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc ggcagcggaa agtagcttgc

60

tactttgccg gcgagcggcg gacgggtgag taatgtctgg gaaactgcct gatggagggg

120

gataactact ggaaacggta gctaataccg catgacctcg caagagcaaa gtgggggacc

180

ttcgggcctc acgccatcgg atgtgcccag atgggattag ctagtaggtg gggtaatggc

240

tcacctaggc gacgatccct agctggtctg agaggatgac cagccacact ggaactgaga

300

cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct

360

gatgcatcca tgccgcgtgt gtgaagaagg ccttcgggtt gtaaagcact ttcagcgagg

420

aggaaggcag tcgtgttaat agcacgattg attgacgtta ctcgcagaag aagcaccggc

480

taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg

540

gcgtaaagcg cacgcaggcg gtttgttaag tcagatgtga aatccccgcg cttaacgtgg

600

gaactgcatt tgaaactggc aagctagagt cttgtagagg ggggtagaat tccaggtgta

660

gcggtgaaat gcgtagagat ctggaggaat accggtggcg aaggcggccc cctggacaaa

720

gactgacgct caggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca

780

cgctgtaaac gatgtcgact tggaggttgt gcccttgagg cgtggcttcc ggagctaacg

840

cgttaagtcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa aactcaaatg aattgacggg

900

ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccta

960

ctcttgacat ccacagaact tagcagagat gcttcggtgc cttcgggaac tgtgagacag

1020

gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc

1080

gcaaccctta tcctttgttg ccagcacgta atggtgggaa ctcaagggag actgccggtg

1140

acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg gcccttacga gtagggctac

1200

acacgtgcta caatggcaga tacaaagtga agcgaactcg cgagagccag cggaccacat

1260

aaagtctgtc gtagtccgga ttggagtctg caactcgact ccatgaagtc ggaatcgcta

1320

gtaatcgtag atcagaatgc tacggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt

1380

cacaccatgg gagtgggttg caaaagaagt aggtagctta accttcggga gggcgcttac

1440

cactttgtga ttcatgactg g

1461

<210> 2027

<211> 1587

<212> DNA

<213> Yersinia pestis

<400> 2027

taaattgaag agtttgatca tggctcagat tgaacgctgg cggcaggcct aacacatgca

60

agtcgagcgg cagcgggaag tagtttacta ctttgccggc gagcggcgga cgggtgagta

120

atgtctgggg atctgcctga tggaggggga taactactgg aaacggtagc taataccgca

180

tgacctcgca agagcaaagt gggggacctt agggcctcac gccatcggat gaacccagat

240

gggattagct agtaggtggg gtaatggctc acctaggcga cgatccctag ctggtctgag

300

aggatgacca gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg

360

gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagccatg ccgcgtgtgt gaagaaggcc

420

ttcgggttgt aaagcacttt cagcgaggag gaaggggttg agtttaatac gctcaatcat

480

tgacgttact cgcagaagaa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga

540

gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgca cgcaggcggt ttgttaagtc

600

agatgtgaaa tccccgcgct taacgtggga actgcatttg aaactggcaa gctagagtct

660

tgtagagggg ggtagaattc caggtgtagc ggtgaaatgc gtagagatct ggaggaatac

720

cggtggcgaa ggcggccccc tggacaaaga ctgacgctca ggtgcgaaag cgtggggagc

780

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ctgtaaacga tgtcgacttg gaggttgtgc

840

ccttgaggcg tggcttccgg agctaacgcg ttaagtcgac cgcctgggga gtacggccgc

900

aaggttaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa

960

ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctact cttgacatcc acagaatttg gcagagatgc

1020

taaagtgcct tcgggaactg tgagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgttgtg

1080

aaatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc ctttgttgcc agcacgtaat

1140

ggtgggaact caagggagac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaag

1200

tcatcatggc ccttacgagt agggctacac acgtgctaca atggcagata caaagtgaag

1260

cgaactcgcg agagccagcg gaccacataa agtctgtcgt agtccggatt ggagtctgca

1320

actcgactcc atgaagtcgg aatcgctagt aatcgtagat cagaatgcta cggtgaatac

1380

gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca aaagaagtag

1440

gtagcttaac cttcgggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg gtgaagtcgt

1500

aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttacctaac gatacgcatt

1560

gcgcagtgcc cacacagatt gtctgat

1587

<210> 2028

<211> 1546

<212> DNA

<213> Yersinia pseudotuberculosis

<400> 2028

ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc

60

aagtcgagcg gcagcgggaa gtagtttact actttgccgg cgagcggcgg acgggtgagt

120

aatgtctggg gatctgcctg atggaggggg ataactactg gaaacggtag ctaataccgc

180

atgacctcgc aagagcaaag tgggggacct tagggcctca cgccatcgga tgaacccaga

240

tgggattagc tagtaggtgg ggtaatggct cacctaggcg acgatcccta gctggtctga

300

gaggatgacc agccacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt

360

ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgtg tgaagaaggc

420

cttcgggttg taaagcactt tcagcgagga ggaaggggtt gagtttaata cgctcaatca

480

ttgacgttac tcgcagaaga agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg

540

agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc acgcaggcgg tttgttaagt

600

cagatgtgaa atccccgcgc ttaacgtggg aactgcattt gaaactggca agctagagtc

660

ttgtagaggg gggtagaatt ccaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tggaggaata

720

ccggtggcga aggcggcccc ctggacaaag actgacgctc aggtgcgaaa gcgtggggag

780

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gctgtaaacg atgtcgactt ggaggttgtg

840

cccttgaggc gtggcttccg gagctaacgc gttaagtcga ccgcctgggg agtacggccg

900

caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta

960

attcgatgca acgcgaagaa ccttacctac tcttgacatc cacggaattt agcagagatg

1020

ctttagtgcc ttcgggaacc gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt

1080

gaaatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cctttgttgc cagcacgtaa

1140

tggtgggaac tcaagggaga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa

1200

gtcatcatgg cccttacgag tagggctaca cacgtgctac aatggcagat acaaagtgaa

1260

gcgaactcgc gagagccagc ggaccacata aagtctgtcg tagtccggat tggagtctgc

1320

aactcgactc catgaagtcg gaatcgctag taatcgtaga tcagaatgct acggtgaata

1380

cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggttgc aaaagaagta

1440

ggtagcttaa ccttcgggag ggcgcttacc actttgtgat tcatgactgg ggtgaagtcg

1500

taacaaggta accgtagggg aacctgcggt tggatcacct ccttac

1546

<210> 2029

<211> 1531

<212> DNA

<213> Yersinia rohdei

<400> 2029

agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc

60

ggcagcggga agtagtttac tactttgccg gcgagcggcg gacgggtgag taatgtctgg

120

gaaactgcct gatggagggg gataactact ggaaacggta gctaataccg catgacctcg

180

caagagcaaa gtgggggacc ttcgggcctc acgccatcgg atgtgcccag atgggattag

240

ctagtaggtg gggtaatggc tcacctaggc gacgatccct agctggtctg agaggatgac

300

cagccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcca tgccgcgtgt gtgaagaagg ccttcgggtt

420

gtaaagcact ttcagcgagg aggaaggcca atagcttaat acgctgttgg attgacgtta

480

ctcgcagaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa

540

gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg cacgcaggcg gtttgttaag tcagatgtga

600

aatccccgcg cttaacgtgg gaactgcatt tgaaactggc aagctagagt cttgtagagg

660

ggggtagaat tccaggtgta gcggtgaaat gcgtagagat ctggaggaat accggtggcg

720

aaggcggccc cctggacaaa gactgacgct caggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgctgtaaac gatgtcgact tggaggttgt gcccttgagg

840

cgtggcttcc ggagctaacg cgttaagtcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

900

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

960

aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat ccacagaact tagcagagat gcttcggtgc

1020

cttcgggaac tgtgagacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta tcctttgttg ccagcacgta atggtgggaa

1140

ctcaagggag actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg

1200

gcccttacga gtagggctac acacgtgcta caatggcaga tacaaagtga agcgaactcg

1260

cgagagcaag cggaccacat aaagtctgtc gtagtccgga ttggagtctg caactcgact

1320

ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgtag atcagaatgc tacggtgaat acgttcccgg

1380

gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttg caaaagaagt aggtagctta

1440

accttcggga gggcgcttac cactttgtga ttcatgactg gggtgaagtc gtaacaaggt

1500

aaccgtaggg gaacctgcgg ttggatcacc t

1531

<210> 2030

<211> 1488

<212> DNA

<213> Yokenella regensburgei

<400> 2030

tagagtttga tccatggctc agattgaacg ctggcggcag gcctaacaca tgcaagtcga

60

acggtagcac agagagcttg ctctcgggtg acgagtggcg gacgggtgag taatgtctgg

120

gaaactgcct gatggagggg gataactact ggaaacggta gctaataccg cataacgtcg

180

caagaccaaa gagggggacc ttcgggcctc ttgccatcag atgtgcccag atgggattag

240

ctagtaggtg gggtaacggc tcacctaggc gacgatccct agctggtctg agaggatgac

300

cagccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat

360

tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcca tgccgcgtgt atgaagaagg ccttcgggtt

420

gtaaagtact ttcagcgagg aggaaggcga tacggttaat aaccgtgtcg attgacgtta

480

ctcgcagaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa

540

gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg cacgcaggcg gtctgtcaag tcttatgtga

600

aatccccggg ctcaacctgg gaactgcatt cgaaactggc aggcttgagt cttgtagagg

660

ggggtagaat tccaggtgta gcggtgaaat gcgtagagat ctggaggaat accggtggcg

720

aaggcggccc cctggacaaa gactgacgct caggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga

780

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgtcgact tggaggttgt gcccttgagg

840

cgtggcttcc ggagctaacg cgttaagtcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa

900

aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc

960

aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat ccacggaact tagcagagat gctttggtgc

1020

cttcgggaac cgtgagacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg

1080

ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta tcctttgttg ccagcggttc ggccgggaac

1140

tcaaaggaga ctgccagtga taaactggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgg

1200

cccttacgag tagggctaca cacgtgctac aatggcatat acaaagagaa gcgacctcgc

1260

gagagcaagc ggacctcata aagtatgtcg tagtccggat tggagtctgc aactcgactc

1320

catgaagtcg gaatcgctag taatcgtgga tcagaatgcc acggtgaata cgttcccggg

1380

ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggttgc aaaagaagta ggtagcttaa

1440

ccttcgggag ggcgcttacc actttgtgat tcatgactgg ggtgaagt

1488

<210> 2031

<211> 1485

<212> DNA

<213> Zimmermannella bifida

<400> 2031

agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gatgaagcct tagcttgctt tggtggatta gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagcaa

120

cgtgcccaga actctggaat aaccgccgga aacggtggct aatactggat aggtgccaag

180

gccgcatggt ctttggttgg aaagattttt cggttctgga tcggctcgcg gcctatcagc

240

ttgttggtgg ggtaatggcc taccaaggcg acgacgggta gccggcctga gagggtgacc

300

ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt

360

gcacaatggg cgcaagcctg atgcagcaac gccgcgtgag ggatgacggc cttcgggttg

420

taaacctctt ttagtaggga agaagcgaaa gtgacggtac ctgcagaaaa agcaccggct

480

aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggtgcaag cgttgtccgg aattattggg

540

cgtaaagagc tcgtaggcgg tttgtcgcgt ctgctgtgaa attccgaggc tcaacctcgg

600

gcgtgcagtg ggtacgggca gacttgagtg cggtagggga gattggaatt cctggtgtag

660

cggtggaatg cgcagatatc aggaggaaca ccgatggcga aggcagatct ctgggccgtt

720

actgacgctg aggagcgaaa gcatggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccat

780

gccgtaaacg ttgggcgcta gatgtgggga ccattccacg gtttctgtgt cgtagctaac

840

gcattaagcg ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg

900

gggcccgcac aagcggcgta gcatgcggat taattcgatg caacgcgaag aaccttacca

960

aggcttgaca tataccggaa acggccagag atggtcgccc ccttttgggt cggtatacag

1020

gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttc ggttaagtcc ggcaacgagc

1080

gcaaccctcg tcctatgttg ccagcacgtt atggtgggaa ctcatgggat actgccgtgg

1140

tcaacacgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgt cttgggcttc

1200

acgtatgcta caatggccgg tacaatgggc tgcgataccg cgaggtggag cgaatcccaa

1260

aaagccggtc tcagttcgga ttggggtccg caactcgacc ccatgaagtc ggagtcgcta

1320

gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg

1380

tcaagtcatg aaagtcggta acacccgaag ccggtggcct aaccttttgg ggggagccgt

1440

cgaaggtggg atcggtgatt aggactaagt cgtaacaagg tagcc

1485

<210> 2032

<211> 1482

<212> DNA

<213> Zymomonas mobilis

<400> 2032

agagtttgat tctggctcag aacgaacgct ggcggcatgc ttaacacatg caagtcgaac

60

gaaggcttcg gccttagtgg cgcacgggtg cgtaacgcgt gggaatctgc cttcaggtac

120

ggaataacta ggggaaactc gagctaatac cgtatgatat cgagagatca aagatttatc

180

gcctgaagat gagcccgcgt tggattagct agttggtagg gtaaaggctt accaaggcga

240

cgatccatag ctggtctgag aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac

300

tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggg gaaaccctga tccagcaatg

360

ccgcgtgagt gaagaaggcc ttagggttgt aaagctcttt tacccgggat gataatgaca

420

gtaccgggag aataagctcc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggag

480

ctagcgttgt tcggaattac tgggcgtaaa gcgtacgtag gcggtttaat aagtcagggg

540

tgaaagccca gagctcaact ctggaactgc ctttgagact gttagactag aacatagaag

600

aggtaagtgg aattccgagt gtagaggtga aattcgtaga tattcggaag aacaccagtg

660

gcgaaggcga cttactggtc tatagttgac gctgaggtac gaaagcgtgg gtagcaaaca

720

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgata actagctgtc cgggtacatg

780

gtatctgggt ggcggagcta acgcattaag ttatccgcct ggggagtacg gtcgcaagat

840

taaaactcaa agaaattgac gggggcctgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga

900

agcaacgcgc agaaccttac cagcgtttga catcctgatc gcggaaagtg gagacacatt

960

ctttcagttc ggctggatca gagacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga

1020

gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca accctcacct ctagttgcca tcattaagtt

1080

gggcacttta gaggaactgc cggtgataag ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtcc

1140

tcatggccct tacgcgctgg gctacacacg tgctacaatg gcggtgacag agggccgcaa

1200

gcctgcaaag gttagctaat ctcaaaaagc cgtctcagtt cggattgttc tctgcaactc

1260

gagagcatga aggcggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc

1320

ccaggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg gattcacccg aaggcgctgc

1380

gctaacccgc aagggaggca ggcgaccacg gtgggtttag cgactggggt gaagtcgtaa

1440

caaggtagcc gtaggggaac ctgcggctgg atcacctcct tt

1482

<---