Способ прогнозирования ответа на периоперационную химиотерапию при раке желудка II-III стадий Российский патент 2025 года по МПК G01N33/50 G01N33/574 C12Q1/6806 C12Q1/6827 C12Q1/686 C12Q1/6886 

Изобретение относится к области медицины, а именно к онкологии, и может быть использовано для персонификации тактики лечения у больных с раком желудка.

В настоящее время значительно расширились показания к проведению периоперационной химиотерапии при раке желудка. Задачами этого этапа лечения являются уменьшение размеров первичной опухоли, увеличение числа органосохраняющих операций, количества R0-операций, а также раннее воздействие на микрометастазы. Несмотря на современные достижения химиотерапии, у ряда пациентов эффект от проведенного лечения оказывается недостаточным. Доля полного морфологического ответа после проведения периоперационной химиотерапии по данным литературы составляет не более 15%. При этом крупные исследования показывают, что только достижение полного лечебного патоморфоза может значимо повлиять на отдаленные результаты лечения больных с раком желудка. Для остальных пациентов проведение периоперационного этапа только отодвигает сроки проведения операции, что может негативно сказаться на результатах лечения. В настоящее время существует необходимость в эффективных методах прогнозирования ответа на проводимую периоперационную химиотерапию при раке желудка.

К настоящему времени проведен ряд исследований, направленных на поиск биологических маркеров ответа на периоперационную химиотерапии при раке желудка.

Например, в результате исследований команде авторов под руководством Cheong Ja.Ho. (Cheong Ja.Ho et al. System for prediction of prognosis and use of adjuvant chemotherapy for patients with stomach cancer of II and III stage) удалось разработать алгоритм, прогнозирующий эффективность проведения химиотерапии у пациентов с раком желудка II и III стадии на основании измерения уровней экспрессии мРНК группы генов, включающей в себя WARS, GZMB, CDX1 и SFRP4, и группы эталонных генов, включающей в себя ACTB, ATP5E, GPX1, UBB и HPRT1. На основании профиля экспрессии авторы выделили 3 прогностических группы (кластера), различающихся по ответу на проводимую химиотерапию. Так общая 5-летняя выживаемость в этих группах составляла 83,3, 71,8 и 58,2%, соответственно, что указывает на то, что прогностический кластер I имел лучший прогноз среди трех групп, а прогностический кластер III имел худший прогноз среди них. Недостатком этого метода является техническая невозможность проведения данных диагностических мероприятий в большинстве клиник из-за отсутствия необходимого оборудования и специалистов, интерпретирующих результаты сложных геномных исследований. Также отличием является определение полиморфного варианта гена CHEK2 Ile157Thr в заявляемом способе, что не достигается в известном исследовании.

Более доступным и простым в интерпретации генетическим тестом является определение полиморфных вариантов генов.

В своем исследовании коллектив авторов под руководством Chen Z. H. (Chen ZH, Wang L, Luo LP. Association of DNA repair gene polymorphisms with response to chemotherapy and prognosis of gastric cancer. Genet Mol Res. 2014 Sep 12;13(3):7484-91. doi: 10.4238/2014.September.12.15. PMID: 25222248.) произвели оценку связи полиморфизмов гена репарации ДНК XPF с ответом опухоли на проводимую периоперационную химиотерапию на основе препаратов платины/5-фторурацила у пациентов с раком желудка. Было выявлено, что носители генотипа XPF rs6498486 CC и генотипа XPF rs2276465 ​​GG имели достоверно более высокие шансы получения полного клинического ответа на проводимую химиотерапию по классификации ВОЗ в 3,88 (1,23-16,07) и 2,66 (1,17-6,45) раз соответственно по сравнению с носителями других генотипов. Данное исследование показывает возможность использования определения полиморфизмов генов в качестве прогностического маркера эффективности проводимой химиотерапии. Однако оно учитывает только клинический ответ опухоли на проведенное лечение, не опираясь на данные послеоперационного морфологического исследования.

В зависимости от носительства различных полиморфных аллелей одного гена у пациентов с разной частотой регистрируется достижение полного морфологического ответа, который является критерием эффективности проведенной химиотерапии.

Технический результат – прогнозирование ответа на проводимую периоперационную химиотерапию по схеме FLOT или XELOX с помощью определения полиморфных вариантов генов у пациентов до начала лечения с выявлением носителей полиморфизмов, ассоциированных с более благоприятным ответом на химиотерапию, что будет определять тактику лечения в пользу назначения периоперационной химиотерапии.

Технический результат достигается тем, что предлагаемое изобретение позволит спрогнозировать ответ на проводимую периоперационную химиотерапию по схеме FLOT или XELOX, определяемый по достижению полного морфологического ответа в опухоли (TRG1 по Mandard) у пациентов с раком желудка II-III стадий в зависимости от носительства полиморфных аллелей гена CHEK2 (Ile157Thr).

Сущность изобретения

Для определения полиморфного варианта гена проводится выделение ДНК из лейкоцитов венозной крови пациента с последующей её амплификацией с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) с фиксацией результата путём электрофоретической детекции в агарозном геле. В результате у пациента определяется один из вариантов полиморфизма: гомозигота доминантному аллелю; гетерозигота или гомозигота по рецессивному аллелю.

Проанализированы результаты лечения 37 пациентов с диагнозом рак желудка II-III стадий, которым планировалось проведение радикального лечения. Всем пациентам проводилась периоперационная химиотерапия согласно одобренным клиническими рекомендациями схемам. В дальнейшем пациентам без признаков прогрессирования заболевания по критериям RECIST 1.1 проводилось радикальное хирургическое лечение. При патогистологическом исследовании определялась степень лечебного патоморфоза по классификации Mandard. Наличие I степени патоморфоза (отсутствие жизнеспособных клеток опухоли) свидетельствовало о высокой эффективности проведённого периоперационного этапа. Наличие иных показателей лечебного патоморфоза свидетельствовало о слабовыраженном лечебном эффекте.

Согласно полученным результатам лечебного патоморфоза все пациенты были разделены на 2 группы. Пациенты, у которых после проведенной периоперационной химиотерапии в микропрепарате не осталось жизнеспособных опухолевых клеток (что соответствует I степени патоморфоза по Mandard), составили группу благоприятного ответа - 4 случая. Остальные 33 пациента вошли в группу неблагоприятного ответа.

При оценке распределения полиморфных вариантов гена CHEK2 (Ile157Thr) было выявлено, что большая часть пациентов являлись носителями гомозиготного фенотипа по доминантному аллелю Ile/Ile (89,2%), остальные (10,8%) относились к носителям гетерозиготного фенотипа Ile/Thr. Гомозигот по рецессивному аллелю зафиксировано не было.

При анализе полиморфных вариантов генов в группе благоприятного ответа у пациентов достоверно преобладал гетерозиготный генотип CHEK2 (Ile157Thr) Ile/Thr (р=0,049). У носителей гетерозиготного генотипа в 15,5 раз выше вероятность получения полного лечебного патоморфоза (TRG1 по Mandard), чем у носителей другого генотипа (OШ = 15,5 95% ДИ [1,37; 175]). Результаты представлены в таблице 1.

Таблица 1

Ген CHEK2 (Ile157Thr) Клиническая группа/Генотип Ile/Ile Ile/Thr Всего p ОШ, 95%ДИ Благоприятный ответ 2 (5,4%) 2 (5,4%) 4 (10,8%) 0,049 15,5; 1,37; 175 Неблагоприятный ответ 31 (83,8%) 2 (5,4%) 33 (89,2%) Всего 33 (89,2%) 4 (10,8%) 37 (100%)

Таким образом, определение полиморфного варианта вариантов гена CHEK2 (Ile157Thr) перед началом лечения позволяет прогнозировать ответ на периоперационную химиотерапию у пациентов с раком желудка II-III стадий. Данный метод может быть использован при разработке индивидуальных планов лечения у пациентов с раком желудка.

Изобретение относится к медицине, а именно к онкологии, и может быть использовано для прогнозирования ответа на периоперационную химиотерапию при раке желудка II-III стадий. Из лейкоцитов венозной крови пациента выделяют ДНК. Проводят определение полиморфного варианта гена CHEK2 Ile157Thr с помощью полимеразной цепной реакции с последующей детекцией продуктов амплификации методом электрофореза в агарозном геле. При определении носительства гетерозиготного генотипа Ile/Thr прогнозируют благоприятный ответ на периоперационную химиотерапию при раке желудка II-III стадий. Способ обеспечивает возможность прогнозирования ответа на проводимую периоперационную химиотерапию по схеме FLOT или XELOX за счет определения носительства гетерозиготного генотипа Ile/Thr полиморфного варианта Ile157Thr гена CHEK2. 1 табл.

Способ прогнозирования ответа на периоперационную химиотерапию при раке желудка II-III стадий, включающий выделение ДНК из лейкоцитов венозной крови пациента, определение полиморфного варианта гена CHEK2 Ile157Thr с помощью полимеразной цепной реакции с последующей детекцией продуктов амплификации методом электрофореза в агарозном геле, где при определении носительства гетерозиготного генотипа Ile/Thr прогнозируют благоприятный ответ на периоперационную химиотерапию при раке желудка II-III стадий.