ГЕНЕТИЧЕСКАЯ КОНСТРУКЦИЯ НА ОСНОВЕ СИСТЕМЫ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМА CRISPR/CAS9, КОДИРУЮЩАЯ НУКЛЕАЗУ CAS9, ДЛЯ ГЕНОМНОГО РЕДАКТИРОВАНИЯ ОДНОДОЛЬНЫХ ЗЕРНОВЫХ КУЛЬТУР НА ОСНОВЕ ДВОЙНОГО ОТБОРА РАСТЕНИЙ Российский патент 2021 года по МПК C12N15/09 C12N15/63 C12N15/85 

Описание патента на изобретение RU2762830C1

Область техники, к которой относится изобретение

Изобретение относится к области биотехнологии и генной инженерии растений, а именно к технологии редактирования генома растений CRISPR/Cas9, в частности редактирования генома зерновых культур.

Предшествующий уровень техники

Несмотря на большой потенциал систем геномного редактирования ДНК, таких как CRISPR/CAS9, для получения новых высокопродуктивных сельскохозяйственных культур, их внедрение в широкую селекционную практику имеет ряд ограничений. Как правило, геномное редактирование достигается с помощью стандартных методов трансгеноза, а именно путем переноса в регенерирующие клетки растений последовательностей «инструментов редактирования». В случае систем CRISPR/CAS9 - это генетические последовательности, обеспечивающие экспрессию нуклеазного агента, который состоит из белка Cas9 и направляющей РНК, называемой РНК-проводником (sgRNA), образующих комплекс Cas9-sgRNA для таргетной модификации определенной нуклеотидной последовательности. При этом последовательности, кодирующие Cas9 и sgRNA, могут находиться как на одном, так и на разных генетических векторах. Доставка последовательностей инструментов геномного редактирования в клетки зерновых культур чаще всего осуществляется методом биобаллистики, позволяющим переносить несколько векторов одновременно. Для облегчения работ по геномному редактированию, один из векторов может быть универсальным (не изменяемым), тогда как второй создаваться для модификации конкретного участка генома.

Задачей изобретения является разработка универсального вектора, который может быть использован в системах CRISPR-Cas9 для редактирования генетических последовательностей зерновых культур, а именно ДНК-конструкции, кодирующей последовательность белка Cas9 и содержащей последовательности, обеспечивающие эффективный отбор модифицированных растений.

Проблема эффективной регенерации in vitro и отбора трансгенных растений после переноса гетерологичных последовательностей в клетки зерновых культур давно известна. При использовании технологии геномного редактирования CRJSPR/Cas9 проблема еще больше осложняется тем, что необходимо отобрать растения, в которых благодаря успешному переносу последовательностей компонентов системы CRISPR/Cas9 и их экспрессии произойдет редактирование гена-мишени. В настоящий момент нет универсальных и эффективных способов отбора трансгенных/геномно-редактированных растений зерновых культур среди растений-регенерантов, образующихся из клеток, подвергнутых бомбардировке. Это связано с тем, что при трансгенозе зерновых не существует селективных генов-маркеров, которые могут обеспечить 100% отбор. Чаще всего для однодольных злаковых культур используют генетические конструкции, содержащие селективный ген bar (bialaphos resistance) или его аналог - ген pat (phosphinothricin acetyl transferase), клонированные из геномов различных видов Streptomicis. Этот ген кодирует фермент фосфинотрицин-ацетилтрансферазу, который ацетилирует три аминогруппы L-фосфинотрицина. L-фосфинотрицин является компонентом гербицидов "Basta", "Liberty", "Harvest", "Herbiace", "Bialaphos" и "Ignite", которые способны блокировать метаболический путь с участием фермента глютамин-синтазы, нарушая процессы ассимиляции аммиака в клетках, что вызывает гибель растений из-за его накопления (Wilmink и Dons, 1993). Поскольку продукт гена bar ацетилирует фосфинотрицин, последний теряет сродство с глютаминсинтазой, и растения приобретают устойчивость. Для геномного редактирования зерновых культур, также чаще всего используют вектора, содержащие ген bar для отбора растений. При биолистическим переносе его чаще используют на отдельной плазмиде, не содержащей последовательностей инструментов геномного редактирования. Тогда как при агробактриальном переносе bar ген размещают на одном векторе с последователостями нуклеазы Cas9. Например, в работе Zhang et al. (2018; Doi: 10.1186/s 12870-018-1496-х) для мутагенеза пшеницы применяли вектор, который одновременно содержал последовательности Cas9 и гена bar. Аналогичную стратегию использовали Lee et al. (2019; Doi: 10.1111/pbi.12982) для геномного редактирования кукурузы, сочетая в Т-ДНК бинарного вектора различные варианты последовательностей нуклеазы Cas9 с последовательностью гена bar. В указанных работах для экспрессии bar гена использовали 35S промотер вируса мозаики цветной капусты (CaMV 35S). Несмотря на то, что ген bar значительно более эффективен, чем другие селективные гены для однодольных культур, при его использовании приходится выявлять трансгенные растения среди огромного числа нетрансгенных проростков. Вследствие природной устойчивости к L-фосфинотрицину доля таких побегов-регенерантов у отдельных сортов зерновых, например пшеницы, может достигать 95%. Распространенная в настоящий момент система отбора трансформантов по устойчивости к гербициду приводит к тому, что скрининг первичных образцов становится затратным и трудоемким, поскольку для поиска и отбора приходится активно использовать молекулярно-биологические методы.

Решением этой технической проблемы может быть добавление в векторную конструкцию, содержащую компоненты редактирования генома, не только селективного гена bar, но и дополнительного репортерного гена, который позволит вести прижизненную детекцию клеток и тканей. В качестве таких генов могут выступать гены, кодирующие флуоресцентные белки, например GFP или RFP. Экспрессия gfp (rfp) обеспечивает специфическую флуоресценцию клеток при помещении их в УФ свет определенного спектра, и таким образом является «визуальным» маркером трансгенной ткани, позволяя отбраковывать нетрансгенные растения на всех этапах.

Раскрытие сущности изобретения

Задачей настоящего изобретения является создание генно-инженерной конструкции, которая позволяет получить растения злаковых культур, содержащие компоненты геномного редактирования CRISPR/Cas9, благодаря эффективному «двойному» отбору по селективному гену bar и репортерному гену gfp. Он основывается на одновременном отборе ткани по устойчивости клеток к веществу (гербициду), находящемуся в культуральной среде (экспрессия гена bar), и по флуоресценции трансгенной ткани (экспрессия гена gfp). Сочетание в векторе генов gfp и bar позволяет выявлять трансгенные растения без дополнительных молекулярно-биологических тестов, что сокращает время и ресурсы.

Для создания векторной конструкции использовали маркерные гены, слитые с промотором/интроном генов актина Act1 или убиквитина Ubi1 риса и кукурузы. Применение этих регуляторных элементов обеспечивает высокую экспрессию в тканях пшеницы, начиная от первичной клетки и заканчивая полноценными растениями и семенами, что повышает возможность целевого редактирования.

Созданный вектор можно применять для получения «базовых» растений, экспрессирующих Cas9, которые в дальнейшем можно будет использовать для редактирования целевых генов-мишеней с помощью ген-специфичных РНК-проводников. Разработанная конструкция также пригодна для совместного переноса с векторами, несущими последовательности РНК-проводников, специфичных для различных генов-мишеней в исследованиях по получению отредактированных растений зерновых злаковых культур, включая пшеницу, рис, кукурузу, тритикале и ячмень.

Краткое описание чертежей

На Фигуре 1 приведена электрофореграмма продуктов рестрикции ДНК pTaCas9.6 и psGFP-BAR, а также выделенных для клонирования фрагментов.

На Фигуре 2 приведена рестрикционная карта рекомбинантных ДНК - возможных продуктов лигирования, образующихся при конструировании вектора для геномного редактирования зерновых культур.

На Фигуре 3 приведен пример электрофореграммы продуктов рестрикции ДНК клонов при создании вектора для геномного редактирования.

На Фигуре 4 приведена электрофореграмма продуктов рестрикции ДНК создаваемого плазмидного вектора для геномного редактирования, на которой указан размер характерных фрагментов (п.н.).

На Фигуре 5 представлена схема генетической конструкции для геномного редактирования однодольных зерновых культур с применением системы CRJSPR/Cas9 на основе двойного отбора растений.

На Фигуре 6 представлен ПЦР анализ геномной ДНК независимых растений пшеницы, полученных в результате биобаллистического переноса разработанной конструкции в смеси с вектором, несущим последовательность направляющей РНК для внесения мутаций в промоторную область гена пшеницы VRN-1A. Наличие искомых фрагментов размером 220 п. н. для гена Cas9 и 606 п. н. для репортерного гена gfp во всех анализируемых образцах подтверждает 100% эффективность отбора первичных образцов (трансгенных растений) вследствие двойного отбора, основанного на культивировании тканей на селективных средах при одновременной прижизненной детекции трансгенных клеток по их флуоресценции благодаря использованию разработанной конструкции.

Далее описание настоящего изобретения будет продолжено путем приведения конкретных примеров его осуществления.

Примеры

Пример 1

С целью повышения эффективности отбора клеток, содержащих компоненты редактирования генома, создали вектор pGCB, несущий одновременно кассеты экспрессии гена нуклеазы Cas9 (компонент геномного редактирования), гена GFP (позволяет вести визуальный обор трансформированных клеток) и гена bar (обеспечивает устойчивость трансформированных клеток к фосфинотрицину). Кассету экспрессии гена нуклеазы Cas9 под контролем убиквитинового промотора (ubi1) кукурузы и терминатора гена теплового шока выделяли из плазмиды pTaCas9.6, предоставленной др. Д. Войтас (Daniel Voytas, Addgene plasmid # 91169; http://n2t.net/addgene:91169; RRID:Addgene_91169). С этой целью плазмидную ДНК вектора pTaCas9.6 обрабатывали эндонуклеазами рестрикции ЕсоRI и MssI с последующей «достройкой» ДНК-концов с помощью набора для быстрого восстановления концов ДНК. Полученный в результате фрагмент размером 6684 п. н. очищали и выделяли из 1%-го агарозного геля (Фиг. 1А). В качестве донора маркерных последовательностей использовали вектор psGFP-BAR (Richards et al. 2001), хорошо зарекомендовавший себя в исследованиях по биобаллистической трансформации пшеницы. Плазмидную ДНК вектора psGFP-BAR обрабатывали эндонуклеазой рестрикции SmaI и щелочной фосфотазой FastAP™ (Thermo Fisher Scientific Inc.), а затем очищали и выделяли из 1%-го агарозного геля (Фиг. 1 В).

Фрагменты плазмид соединяли с помощью ДНК-лигазы, и затем полученный вектор трансформировали в клетки E.coli JM109. В результате клонирования по тупым концам ожидали образования двух вариантов: все три кассеты экспрессии могут быть расположены «голова-к-хвосту» (Фиг. 2А) или кассета экспрессии гена Cas9 может находиться в обратной ориентации относительно кассет экспрессии генов GFP и bar (Фиг. 2В). Наличие вставки и ее ориентацию определяли с помощью обработки эндонуклеазами рестрикции ЕсоRI, HindIII и SalI (Фиг. 3). Согласно рестрикционной карте (Фиг. 4), наличие вставки можно подтвердить с помощью ЕсоRI рестрикции, при этом должен появляться дополнительный к исходным продуктам (3194 п. н., 1979 п. н., 1481 п. н. и 1429 п. н.) фрагмент длиной 8124 п. н.

Длины возможных фрагментов ДНК после обработки эндонуклеазой рестрикции HindIII:

- в случае продукта (А) - 8650 п. н., 5667 п. н. и 461 п. н.;

- в случае продукта (В) - 6274 п. н., 5667 п. н. и 2837 п. н.;

- для исходного вектора - 5693 п. н. и 2402 п. н.

Длины возможных фрагментов ДНК после обработки эндонуклеазой рестрикции SalI:

- в случае продукта (А) - 6109 п. н., 6063 п. н., 1399 п. н., 621 п. н. и 589 п. н.;

- в случае продукта (В) - 11529 п. н., 1399 п. н., 644 п. н., 621 п. н. и 589 п. н.;

- для исходного вектора - 5489 п. н., 1399 п. н., 621 п. н. и 589 п. н.

На основании проведенного рестрикционного анализа выбрали клоны №3 и №5, в которых все три кассеты экспрессии расположены «голова-к-хвосту» (Фиг. 1А) и направление транскрипции всех генов совпадает. Структуру плазмидного вектора подтвердили рестрикционным анализом (Фиг. 2).

Созданный вектор pGCB (Рис. 5), содержащий последовательности Cas9/GFP/bar может быть использован для получения «базовых» растений с конститутивной экспрессией компонента Cas9, которые в дальнейшем можно использовать для редактирования целевых генов-мишеней с помощью ген-специфичных РНК-проводников (sgRNA). Вектор также можно использовать для совместного переноса с векторами, несущими последовательности sgRNA, в исследованиях по редактированию геномов растений пшеницы и тритикале.

Пример 2

Для получения растений с отредактированным геномом требуется взаимодействие комплексов Саз9-РНК-проводник с геномной ДНК. Полученную по примеру 1 конструкцию, смешивали с вектором несущим последовательность гРНК для внесения мутаций в промоторную область гена пшеницы VRN-1A и переносили в клетки пшеницы с помощью генной пушки. В качестве эксплантов использовали эмбриогенные каллусы, инициированные из тканей незрелых зиготических зародышей пшеницы 'Chinese Spring' (Triticum aestivum L.). В результате визуального скринига трансгенной ткани по ее флуоресценции и по устойчивости к L-фосфинотрицину, присутствующему в среде для регенерации, отобрали 10 побегов-регенерантов. Благодаря методике двойного отбора все полученные в результате трансформации линии пшеницы оказались трансгенными и содержали вставку Cas9. Наличие вставки Cas9 подтверждали ПЦР анализом тотальной ДНК, выделенной из растений-регенерантов. На Фиг. 6 представлен образец агарозных гелей после проведения ПЦР анализа. Подтвердили, что геном всех первичных предполагаемых трансформантов содержит переносимые последовательности, т.к наблюдали амплификацию искомых фрагментов размером 220 п. н. для гена Cas9 и 606 п.н. для репортерного гена gfp. Благодаря использованию вектора, обеспечивающего двойной отбор, основанный на культивировании тканей на селективных средах при одновременной прижизненной детекции трансгенных клеток по их флуоресценции, эффективность отбора первичных образцов (трансгенных растений) превысила аналогичные зарубежные аналоги и достигла 100%.

--->

Перечень последовательностей

<110> ФГБНУ ВНИИСБ

<120> ГЕНЕТИЧЕСКАЯ КОНСТРУКЦИЯ НА ОСНОВЕ СИСТЕМЫ

РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМА CRISPR/CAS9, КОДИРУЮЩАЯ НУКЛЕАЗУ

CAS9, ДЛЯ ГЕНОМНОГО РЕДАКТИРОВАНИЯ ОДНОДОЛЬНЫХ ЗЕРНОВЫХ

КУЛЬТУР НА ОСНОВЕ ДВОЙНОГО ОТБОРА РАСТЕНИЙ

<130> GCB

<160> 1

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 11989

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Фрагмент ДНК, содержащий кассеты экспрессии генов GFP, Cas9 и BAR

<400> 1

CTCGAGGTCATTCATATGCTTGAGAAGAGAGTCGGGATAGTCCAAAATAAAACAAAGGTAAGATTACCTGGTCAAAAGTGAAAACATCAGTTAAAAGGTGGTATAAAGTAAAATATCGGTAATAAAAGGTGGCCCAAAGTGAAATTTACTCTTTTCTACTATTATAAAAATTGAGGATGTTTTTGTCGGTACTTTGATACGTCATTTTTGTATGAATTGGTTTTTAAGTTTATTCGCTTTTGGAAATGCATATCTGTATTTGAGTCGGGTTTTAAGTTCGTTTGCTTTTGTAAATACAGAGGGATTTGTATAAGAAATATCTTTAAAAAAACCCATATGCTAATTTGACATAATTTTTGAGAAAAATATATATTCAGGCGAATTCTCACAATGAACAATAATAAGATTAAAATAGCTTTCCCCCGTTGCAGCGCATGGGTATTTTTTCTAGTAAAAATAAAAGATAAACTTAGACTCAAAACATTTACAAAAACAACCCCTAAAGTTCCTAAAGCCCAAAGTGCTATCCACGATCCATAGCAAGCCCAGCCCAACCCAACCCAACCCAACCCACCCCAGTCCAGCCAACTGGACAATAGTCTCCACACCCCCCCACTATCACCGTGAGTTGTCCGCACGCACCGCACGTCTCGCAGCCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAACAGCAGGTGGGTCCGGGTCGTGGGGGCCGGAAACGCGAGGAGGATCGCGAGCCAGCGACGAGGCCGGCCCTCCCTCCGCTTCCAAAGAAACGCCCCCCATCGCCACTATATACATACCCCCCCCTCTCCTCCCATCCCCCCAACCCTACCACCACCACCACCACCACCTCCACCTCCTCCCCCCTCGCTGCCGGACGACGAGCTCCTCCCCCCTCCCCCTCCGCCGCCGCCGCGCCGGTAACCACCCCGCCCCTCTCCTCTTTCTTTCTCCGTTTTTTTTTCCGTCTCGGTCTCGATCTTTGGCCTTGGTAGTTTGGGTGGGCGAGAGGCGGCTTCGTGCGCGCCCAGATCGGTGCGCGGGAGGGGCGGGATCTCGCGGCTGGGGCTCTCGCCGGCGTGGATCCGGCCCGGATCTCGCGGGGAATGGGGCTCTCGGATGTAGATCTGCGATCCGCCGTTGTTGGGGGAGATGATGGGGGGTTTAAAATTTCCGCCATGCTAAACAAGATCAGGAAGAGGGGAAAAGGGCACTATGGTTTATATTTTTATATATTTCTGCTGCTTCGTCAGGCTTAGATGTGCTAGATCTTTCTTTCTTCTTTTTGTGGGTAGAATTTGAATCCCTCAGCATTGTTCATCGGTAGTTTTTCTTTTCATGATTTGTGACAAATGCAGCCTCGTGCGGAGCTTTTTTGTAGGTAGACCATGGTGAGCAAGGGCGAGGAGCTGTTCACCGGGGTGGTGCCCATCCTGGTCGAGCTGGACGGCGACGTAAACGGCCACAAGTTCAGCGTGTCCGGCGAGGGCGAGGGCGATGCCACCTACGGCAAGCTGACCCTGAAGTTCATCTGCACCACCGGCAAGCTGCCCGTGCCCTGGCCCACCCTCGTGACCACCTTCACCTACGGCGTGCAGTGCTTCAGCCGCTACCCCGACCACATGAAGCAGCACGACTTCTTCAAGTCCGCCATGCCCGAAGGCTACGTCCAGGAGCGCACCATCTTCTTCAAGGACGACGGCAACTACAAGACCCGCGCCGAGGTGAAGTTCGAGGGCGACACCCTGGTGAACCGCATCGAGCTGAAGGGCATCGACTTCAAGGAGGACGGCAACATCCTGGGGCACAAGCTGGAGTACAACTACAACAGCCACAACGTCTATATCATGGCCGACAAGCAGAAGAACGGCATCAAGGTGAACTTCAAGATCCGCCACAACATCGAGGACGGCAGCGTGCAGCTCGCCGACCACTACCAGCAGAACACCCCCATCGGCGACGGCCCCGTGCTGCTGCCCGACAACCACTACCTGAGCACCCAGTCCGCCCTGAGCAAAGACCCCAACGAGAAGCGCGATCACATGGTCCTGCTGGAGTTCGTGACCGCCGCCGGGATCACTCACGGCATGGACGAGCTGTACAAGTAAAGCGGCCGCCCCCTGCAGCCCCCGATCGTTCAAACATTTGGCAATAAAGTTTCTTAAGATTGAATCCTGTTGCCGGTCTTGCGATGATTATCATATAATTTCTGTTGAATTACGTTAAGCATGTAATAATTAACATGTAATGCATGACGTTATTTATGAGATGGGTTTTTATGATTAGAGTCCCGCAATTATACATTTAATACGCGATAGAAAACAAAATATAGCGCGCAAACTAGGATAAATTATCGCGCGCGGTGTCATCTATGTTACTAGATCGGGAATTCCTGCAGCCCAATTCGAGCTCGGTACCCGGGGATCTGCAGGCGCGCCTGCAGTGCAGCGTGACCCGGTCGTGCCCCTCTCTAGAGATAATGAGCATTGCATGTCTAAGTTATAAAAAATTACCACATATTTTTTTTGTCACACTTGTTTGAAGTGCAGTTTATCTATCTTTATACATATATTTAAACTTTACTCTACGAATAATATAATCTATAGTACTACAATAATATCAGTGTTTTAGAGAATCATATAAATGAACAGTTAGACATGGTCTAAAGGACAATTGAGTATTTTGACAACAGGACTCTACAGTTTTATCTTTTTAGTGTGCATGTGTTCTCCTTTTTTTTTGCAAATAGCTTCACCTATATAATACTTCATCCATTTTATTAGTACATCCATTTAGGGTTTAGGGTTAATGGTTTTTATAGACTAATTTTTTTAGTACATCTATTTTATTCTATTTTAGCCTCTAAATTAAGAAAACTAAAACTCTATTTTAGTTTTTTTATTTAATAATTTAGATATAAAATAGAATAAAATAAAGTGACTAAAAATTAAACAAATACCCTTTAAGAAATTAAAAAAACTAAGGAAACATTTTTCTTGTTTCGAGTAGATAATGCCAGCCTGTTAAACGCCGTCGACGAGTCTAACGGACACCAACCAGCGAACCAGCAGCGTCGCGTCGGGCCAAGCGAAGCAGACGGCACGGCATCTCTGTCGCTGCCTCTGGACCCCTCTCGAGAGTTCCGCTCCACCGTTGGACTTGCTCCGCTGTCGGCATCCAGAAATTGCGTGGCGGAGCGGCAGACGTGAGCCGGCACGGCAGGCGGCCTCCTCCTCCTCTCACGGCACCGGCAGCTACGGGGGATTCCTTTCCCACCGCTCCTTCGCTTTCCCTTCCTCGCCCGCCGTAATAAATAGACACCCCCTCCACACCCTCTTTCCCCAACCTCGTGTTGTTCGGAGCGCACACACACACAACCAGATCTCCCCCAAATCCACCCGTCGGCACCTCCGCTTCAAGGTACGCCGCTCGTCCTCCCCCCCCCCCTCTCTACCTTCTCTAGATCGGCGTTCCGGTCCATGGTTAGGGCCCGGTAGTTCTACTTCTGTTCATGTTTGTGTTAGATCCGTGTTTGTGTTAGATCCGTGCTGCTAGCGTTCGTACACGGATGCGACCTGTACGTCAGACACGTTCTGATTGCTAACTTGCCAGTGTTTCTCTTTGGGGAATCCTGGGATGGCTCTAGCCGTTCCGCAGACGGGATCGATTTCATGATTTTTTTTGTTTCGTTGCATAGGGTTTGGTTTGCCCTTTTCCTTTATTTCAATATATGCCGTGCACTTGTTTGTCGGGTCATCTTTTCATGCTTTTTTTTGTCTTGGTTGTGATGATGTGGTCTGGTTGGGCGGTCGTTCTAGATCGGAGTAGAATTAATTCTGTTTCAAACTACCTGGTGGATTTATTAATTTTGGATCTGTATGTGTGTGCCATACATATTCATAGTTACGAATTGAAGATGATGGATGGAAATATCGATCTAGGATAGGTATACATGTTGATGCGGGTTTTACTGATGCATATACAGAGATGCTTTTTGTTCGCTTGGTTGTGATGATGTGGTGTGGTTGGGCGGTCGTTCATTCGTTCTAGATCGGAGTAGAATACTGTTTCAAACTACCTGGTGTATTTATTAATTTTGGAACTGTATGTGTGTGTCATACATCTTCATAGTTACGAGTTTAAGATGGATGGAAATATCGATCTAGGATAGGTATACATGTTGATGTGGGTTTTACTGATGCATATACATGATGGCATATGCAGCATCTATTCATATGCTCTAACCTTGAGTACCTATCTATTATAATAAACAAGTATGTTTTATAATTATTTTGATCTTGATATACTTGGATGATGGCATATGCAGCAGCTATATGTGGATTTTTTTAGCCCTGCCTTCATACGCTATTTATTTGCTTGGTACTGTTTCTTTTGTCGATGCTCACCCTGTTGTTTGGTGTTACTTCCTGCAGGGCGATCTATTCGAATGGACAAGAAGTACTCGATCGGCCTCGACATCGGGACGAACTCAGTTGGCTGGGCCGTGATCACCGACGAGTACAAGGTGCCCTCTAAGAAGTTCAAGGTCCTGGGGAACACCGACCGCCATTCCATCAAGAAGAACCTCATCGGCGCTCTCCTGTTCGACAGCGGGGAGACCGCTGAGGCTACGAGGCTCAAGAGAACCGCTAGGCGCCGGTACACGAGAAGGAAGAACAGGATCTGCTACCTCCAAGAGATTTTCTCCAACGAGATGGCCAAGGTTGACGATTCATTCTTCCACCGCCTGGAGGAGTCTTTCCTCGTGGAGGAGGATAAGAAGCACGAGCGGCATCCCATCTTCGGCAACATCGTGGACGAGGTTGCCTACCACGAGAAGTACCCTACGATCTACCATCTGCGGAAGAAGCTCGTGGACTCCACCGATAAGGCGGACCTCAGACTGATCTACCTCGCTCTGGCCCACATGATCAAGTTCCGCGGCCATTTCCTGATCGAGGGGGATCTCAACCCAGACAACAGCGATGTTGACAAGCTGTTCATCCAACTCGTGCAGACCTACAACCAACTCTTCGAGGAGAACCCGATCAACGCCTCTGGCGTGGACGCGAAGGCTATCCTGTCCGCGAGGCTCTCGAAGTCCAGGAGGCTGGAGAACCTGATCGCTCAGCTCCCAGGCGAGAAGAAGAACGGCCTGTTCGGGAACCTCATCGCTCTCAGCCTGGGGCTCACCCCGAACTTCAAGTCGAACTTCGATCTCGCTGAGGACGCCAAGCTGCAACTCTCCAAGGACACCTACGACGATGACCTCGATAACCTCCTGGCCCAGATCGGCGATCAATACGCGGACCTGTTCCTCGCTGCCAAGAACCTGTCGGACGCCATCCTCCTGTCAGATATCCTCCGCGTGAACACCGAGATCACGAAGGCTCCACTCTCTGCCTCCATGATCAAGCGCTACGACGAGCACCATCAGGATCTGACCCTCCTGAAGGCGCTGGTCCGCCAACAGCTCCCGGAGAAGTACAAGGAGATTTTCTTCGATCAGTCGAAGAACGGCTACGCTGGGTACATCGACGGCGGGGCCTCACAAGAGGAGTTCTACAAGTTCATCAAGCCAATCCTGGAGAAGATGGACGGCACGGAGGAGCTCCTGGTGAAGCTCAACAGGGAGGACCTCCTGCGGAAGCAGAGAACCTTCGATAACGGCAGCATCCCCCACCAAATCCATCTCGGGGAGCTGCACGCCATCCTGAGAAGGCAAGAGGACTTCTACCCTTTCCTCAAGGATAACCGGGAGAAGATCGAGAAGATCCTGACCTTCAGAATCCCATACTACGTCGGCCCTCTCGCGCGGGGGAACTCAAGATTCGCTTGGATGACCCGCAAGTCTGAGGAGACCATCACGCCGTGGAACTTCGAGGAGGTGGTGGACAAGGGCGCTAGCGCTCAGTCGTTCATCGAGAGGATGACCAACTTCGACAAGAACCTGCCCAACGAGAAGGTGCTCCCTAAGCACTCGCTCCTGTACGAGTACTTCACCGTCTACAACGAGCTCACGAAGGTGAAGTACGTCACCGAGGGCATGCGCAAGCCAGCGTTCCTGTCCGGGGAGCAGAAGAAGGCTATCGTGGACCTCCTGTTCAAGACCAACCGGAAGGTCACGGTTAAGCAACTCAAGGAGGACTACTTCAAGAAGATCGAGTGCTTCGATTCGGTCGAGATCAGCGGCGTTGAGGACCGCTTCAACGCCAGCCTCGGGACCTACCACGATCTCCTGAAGATCATCAAGGATAAGGACTTCCTGGACAACGAGGAGAACGAGGATATCCTGGAGGACATCGTGCTGACCCTCACGCTGTTCGAGGACAGGGAGATGATCGAGGAGCGCCTGAAGACGTACGCCCATCTCTTCGATGACAAGGTCATGAAGCAACTCAAGCGCCGGAGATACACCGGCTGGGGGAGGCTGTCCCGCAAGCTCATCAACGGCATCCGGGACAAGCAGTCCGGGAAGACCATCCTCGACTTCCTGAAGAGCGATGGCTTCGCCAACAGGAACTTCATGCAACTGATCCACGATGACAGCCTCACCTTCAAGGAGGATATCCAAAAGGCTCAAGTGAGCGGCCAGGGGGACTCGCTGCACGAGCATATCGCGAACCTCGCTGGCTCCCCCGCGATCAAGAAGGGCATCCTCCAGACCGTGAAGGTTGTGGACGAGCTCGTGAAGGTCATGGGCCGGCACAAGCCTGAGAACATCGTCATCGAGATGGCCAGAGAGAACCAAACCACGCAGAAGGGGCAAAAGAACTCTAGGGAGCGCATGAAGCGCATCGAGGAGGGCATCAAGGAGCTGGGGTCCCAAATCCTCAAGGAGCACCCAGTGGAGAACACCCAACTGCAGAACGAGAAGCTCTACCTGTACTACCTCCAGAACGGCAGGGATATGTACGTGGACCAAGAGCTGGATATCAACCGCCTCAGCGATTACGACGTCGATCATATCGTTCCCCAGTCTTTCCTGAAGGATGACTCCATCGACAACAAGGTCCTCACCAGGTCGGACAAGAACCGCGGCAAGTCAGATAACGTTCCATCTGAGGAGGTCGTTAAGAAGATGAAGAACTACTGGAGGCAGCTCCTGAACGCCAAGCTGATCACGCAAAGGAAGTTCGACAACCTCACCAAGGCTGAGAGAGGCGGGCTCTCAGAGCTGGACAAGGCCGGCTTCATCAAGCGGCAGCTGGTCGAGACCAGACAAATCACGAAGCACGTTGCGCAAATCCTCGACTCTCGGATGAACACGAAGTACGATGAGAACGACAAGCTGATCAGGGAGGTTAAGGTGATCACCCTGAAGTCTAAGCTCGTCTCCGACTTCAGGAAGGATTTCCAGTTCTACAAGGTTCGCGAGATCAACAACTACCACCATGCCCATGACGCTTACCTCAACGCTGTGGTCGGCACCGCTCTGATCAAGAAGTACCCAAAGCTGGAGTCCGAGTTCGTGTACGGGGACTACAAGGTTTACGATGTGCGCAAGATGATCGCCAAGTCGGAGCAAGAGATCGGCAAGGCTACCGCCAAGTACTTCTTCTACTCAAACATCATGAACTTCTTCAAGACCGAGATCACGCTGGCCAACGGCGAGATCCGGAAGAGACCGCTCATCGAGACCAACGGCGAGACGGGGGAGATCGTGTGGGACAAGGGCAGGGATTTCGCGACCGTCCGCAAGGTTCTCTCCATGCCCCAGGTGAACATCGTCAAGAAGACCGAGGTCCAAACGGGCGGGTTCTCAAAGGAGTCTATCCTGCCTAAGCGGAACAGCGACAAGCTCATCGCCAGAAAGAAGGACTGGGACCCAAAGAAGTACGGCGGGTTCGACAGCCCTACCGTGGCCTACTCGGTCCTGGTTGTGGCGAAGGTTGAGAAGGGCAAGTCCAAGAAGCTCAAGAGCGTGAAGGAGCTCCTGGGGATCACCATCATGGAGAGGTCCAGCTTCGAGAAGAACCCAATCGACTTCCTGGAGGCCAAGGGCTACAAGGAGGTGAAGAAGGACCTGATCATCAAGCTCCCGAAGTACTCTCTCTTCGAGCTGGAGAACGGCAGGAAGAGAATGCTGGCTTCCGCTGGCGAGCTCCAGAAGGGGAACGAGCTCGCGCTGCCAAGCAAGTACGTGAACTTCCTCTACCTGGCTTCCCACTACGAGAAGCTCAAGGGCAGCCCGGAGGACAACGAGCAAAAGCAGCTGTTCGTCGAGCAGCACAAGCATTACCTCGACGAGATCATCGAGCAAATCTCCGAGTTCAGCAAGCGCGTGATCCTCGCCGACGCGAACCTGGATAAGGTCCTCTCCGCCTACAACAAGCACCGGGACAAGCCCATCAGAGAGCAAGCGGAGAACATCATCCATCTCTTCACCCTGACGAACCTCGGCGCTCCTGCTGCTTTCAAGTACTTCGACACCACGATCGATCGGAAGAGATACACCTCCACGAAGGAGGTCCTGGACGCGACCCTCATCCACCAGTCGATCACCGGCCTGTACGAGACGAGGATCGACCTCTCACAACTCGGCGGGGATAAGAGACCCGCAGCAACCAAGAAGGCAGGGCAAGCAAAGAAGAAGAAGTGACTCGAGATATGAAGATGAAGATGAAATATTTGGTGTGTCAAATAAAAAGCTTGTGTGCTTAAGTTTGTGTTTTTTTCTTGGCTTGTTGTGTTATGAATTTGTGGCTTTTTCTAATATTAAATGAATGTAAGATCACATTATAATGAATAAACAAATGTTTCTATAATCCATTGTGAATGTTTTGTTGGATCTCTTCTGCAGCATATAACTACTGTATGTGCTATGGTATGGACTATGGAATATGATTAAAGATAAGGAGCTCCGGTGACGGACTGGCACTGGCCGTCGTTTTACAACGTCGTGACTGGGAAAACCCTGGCGTTACCCAACTTAATCGCCTTGCAGCACATCCCCCTTTCGCCAGCTGGCGTAATAGCGAAGAGGCCCGCACCGATCGCCCTTCCCAACAGTTGCGCAGCCTGAATGGCGAATGCTAGAGCAGCTTGAGCTTGGATCAGATTGTCGTTTCCCGCCTTCAGTTTGGGGATCCGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTTGCATGCCTGCAGTGCAGCGTGACCCGGTCGTGCCCCTCTCTAGAGATAATGAGCATTGCATGTCTAAGTTATAAAAAATTACCACATATTTTTTTTGTCACACTTGTTTGAAGTGCAGTTTATCTATCTTTATACATATATTTAAACTTTACTCTACGAATAATATAATCTATAGTACTACAATAATATCAGTGTTTTAGAGAATCATATAAATGAACAGTTAGACATGGTCTAAAGGACAATTGAGTATTTTGACAACAGGACTCTACAGTTTTATCTTTTTAGTGTGCATGTGTTCTCCTTTTTTTTTGCAAATAGCTTCACCTATATAATACTTCATCCATTTTATTAGTACATCCATTTAGGGTTTAGGGTTAATGGTTTTTATAGACTAATTTTTTTAGTACATCTATTTTATTCTATTTTAGCCTCTAAATTAAGAAAACTAAAACTCTATTTTAGTTTTTTTATTTAATAATTTAGATATAAAATAGAATAAAATAAAGTGACTAAAAATTAAACAAATACCCTTTAAGAAATTAAAAAAACTAAGGAAACATTTTTCTTGTTTCGAGTAGATAATGCCAGCCTGTTAAACGCCGTCGACGAGTCTAACGGACACCAACCAGCGAACCAGCAGCGTCGCGTCGGGCCAAGCGAAGCAGACGGCACGGCATCTCTGTCGCTGCCTCTGGACCCCTCTCGAGAGTTCCGCTCCACCGTTGGACTTGCTCCGCTGTCGGCATCCAGAAATTGCGTGGCGGAGCGGCAGACGTGAGCCGGCACGGCAGGCGGCCTCCTCCTCCTCTCACGGCACGGCAGCTACGGGGGATTCCTTTCCCACCGCTCCTTCGCTTTCCCTTCCTCGCCCGCCGTAATAAATAGACACCCCCTCCACACCCTCTTTCCCCAACCTCGTGTTGTTCGGAGCGCACACACACACAACCAGATCTCCCCCAAATCCACCCGTCGGCACCTCCGCTTCAAGGTACGCCGCTCGTCCTCCCCCCCCCCCCCTCTCTACCTTCTCTAGATCGGCGTTCCGGTCCATGGTTAGGGCCCGGTAGTTCTACTTCTGTTCATGTTTGTGTTAGATCCGTGTTTGTGTTAGATCCGTGCTGCTAGCGTTCGTACACGGATGCGACCTGTACGTCAGACACGTTCTGATTGCTAACTTGCCAGTGTTTCTCTTTGGGGAATCCTGGGATGGCTCTAGCCGTTCCGCAGACGGGATCGATTTCATGATTTTTTTTGTTTCGTTGCATAGGGTTTGGTTTGCCCTTTTCCTTTATTTCAATATATGCCGTGCACTTGTTTGTCGGGTCATCTTTTCATGCTTTTTTTTGTCTTGGTTGTGATGATGTGGTCTGGTTGGGCGGTCGTTCTAGATCGGAGTAGAATTCTGTTTCAAACTACCTGGTGGATTTATTAATTTTGGATCTGTATGTGTGTGCCATACATATTCATAGTTACGAATTGAAGATGATGGATGGAAATATCGATCTAGGATAGGTATACATGTTGATGCGGGTTTTACTGATGCATATACAGAGATGCTTTTTGTTCGCTTGGTTGTGATGATGTGGTGTGGTTGGGCGGTCGTTCATTCGTTCTAGATCGGAGTAGAATACTGTTTCAAACTACCTGGTGTATTTATTAATTTTGGAACTGTATGTGTGTGTCATACATCTTCATAGTTACGAGTTTAAGATGGATGGAAATATCGATCTAGGATAGGTATACATGTTGATGTGGGTTTTACTGATGCATATACATGATGGCATATGCAGCATCTATTCATATGCTCTAACCTTGAGTACCTATCTATTATAATAAACAAGTATGTTTTATAATTATTTTGATCTTGATATACTTGGATGATGGCATATGCAGCAGCTATATGTGGATTTTTTTAGCCCTGCCTTCATACGCTATTTATTTGCTTGGTACTGTTTCTTTTGTCGATGCTCACCCTGTTGTTTGGTGTTACTTCTGCAGGTCGACTCTAGAGGATCCATCGATTAGGAAGTAACCATGAGCCCAGAACGACGCCCGGCCGACATCCGCCGTGCCACCGAGGCGGACATGCCGGCGGTCTGCACCATCGTCAACCACTACATCGAGACAAGCACGGTCAACTTCCGTACCGAGCCGCAGGAACCGCAGGAGTGGACGGACGACCTCGTCCGTCTGCGGGAGCGCTATCCCTGGCTCGTCGCCGAGGTGGACGGCGAGGTCGCCGGCATCGCCTACGCGGGCCCCTGGAAGGCACGCAACGCCTACGACTGGACGGCCGAGTCGACCGTGTACGTCTCCCCCCGCCACCAGCGGACGGGACTGGGCTCCACGCTCTACACCCACCTGCTGAAGTCCCTGGAGGCACAGGGCTTCAAGAGCGTGGTCGCTGTCATCGGGCTGCCCAACGACCCGAGCGTGCGCATGCACGAGGCGCTCGGATATGCCCCCCGCGGCATGCTGCGGGCGGCCGGCTTCAAGCACGGGAACTGGCATGACGTGGGTTTCTGGCAGCTGGACTTCAGCCTGCCGGTGCCGCCCCGTCCGGTCCTGCCCGTCACCGAGATCTAGTCCGTCGACCTGCAGCCCCCGATCGTTCAAACATTTGGCAATAAAGTTTCTTAAGATTGAATCCTGTTGCCGGTCTTGCGATGATTATCATATAATTTCTGTTGAATTACGTTAAGCATGTAATAATTAACATGTAATGCATGACGTTATTTATGAGATGGGTTTTTATGATTAGAGTCCCGCAATTATACATTTAATACGCGATAGAAAACAAAATATAGCGCGCAAACTAGGATAAATTATCGCGCGCGGTGTCATCTATGTTACTAGATC

<---

Похожие патенты RU2762830C1

название год авторы номер документа
СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ РАСТЕНИЯ ПШЕНИЦЫ С НУКЛЕОТИДНОЙ ДЕЛЕЦИЕЙ В ПРОМОТОРНОЙ ОБЛАСТИ ГЕНА VRN-A1 ПРИ ПОМОЩИ ТЕХНОЛОГИИ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМА РАСТЕНИЙ CRISPR/CAS9 2020
  • Мирошниченко Дмитрий Николаевич
  • Тимербаев Вадим Рафаилович
  • Клементьева Анна Александровна
  • Шульга Ольга Альбертовна
  • Долгов Сергей Владимирович
RU2772577C2
СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ РАСТЕНИЯ ПШЕНИЦЫ С БИАЛЛЕЛЬНЫМИ МУТАЦИЯМИ В ПРОТОМОТОРНОЙ ОБЛАСТИ ГЕНА VRN-A1 ПРИ ПОМОЩИ ТЕХНОЛОГИИ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМА РАСТЕНИЙ CRISPR/CAS9 2020
  • Мирошниченко Дмитрий Николаевич
  • Тимербаев Вадим Рафаилович
  • Клементьева Анна Александровна
  • Шульга Ольга Альбертовна
  • Долгов Сергей Владимирович
RU2772575C2
МОЛЕКУЛА РНК-ПРОВОДНИКА ДЛЯ ГЕНОМНОГО РЕДАКТИРОВАНИЯ ПРОТОМОТОРНОЙ ОБЛАСТИ ГЕНА VRN-A1 ОДНОДОЛЬНЫХ ЗЕРНОВЫХ С ПРИМЕНЕНИЕМ СИСТЕМЫ CRISPR/CAS9 2020
  • Тимербаев Вадим Рафаилович
  • Мирошниченко Дмитрий Николаевич
  • Клементьева Анна Александровна
  • Шульга Ольга Альбертовна
  • Салина Елена Артемовна
  • Долгов Сергей Владимирович
RU2762831C1
СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ РАСТЕНИЯ ПШЕНИЦЫ С НУКЛЕОТИДНОЙ ВСТАВКОЙ В ПРОМОТОРНОЙ ОБЛАСТИ ГЕНА VRN-A1 ПРИ ПОМОЩИ ТЕХНОЛОГИИ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМА РАСТЕНИЙ CRISPR/CAS9 2020
  • Мирошниченко Дмитрий Николаевич
  • Тимербаев Вадим Рафаилович
  • Клементьева Анна Александровна
  • Шульга Ольга Альбертовна
  • Долгов Сергей Владимирович
RU2772578C2
Средство редактирования генома на основе белка LigD из бактерии Pseudomonas putida и Cas9 комплекса 2022
  • Шараев Никита Ильдарович
  • Чакон-Мачадо Лаура
  • Мушарова Ольга Сергеевна
  • Савицкая Екатерина Евгеньевна
  • Северинов Константин Викторович
RU2797049C1
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ КОНСТРУКЦИЯ НА ОСНОВЕ СИСТЕМЫ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМА CRISPR/CAS9, КОДИРУЮЩАЯ НУКЛЕАЗУ CAS9, СПЕЦИФИЧЕСКИ ИМПОРТИРУЕМУЮ В МИТОХОНДРИИ КЛЕТОК ЧЕЛОВЕКА 2015
  • Орищенко Константин Евгеньевич
  • Мазунин Илья Олегович
RU2634395C1
СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ РАСТЕНИЯ КАРТОФЕЛЯ С ТЕТРААЛЛЕЛЬНЫМИ МУТАЦИЯМИ В КОДИРУЮЩЕЙ ОБЛАСТИ ГЕНА EDR1 ПРИ ПОМОЩИ ТЕХНОЛОГИИ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМА РАСТЕНИЙ CRISPR/CAS9 2022
  • Дивашук Михаил Георгиевич
  • Злобин Николай Евгеньевич
  • Иванова Любовь Александровна
  • Комахин Роман Александрович
  • Коновалова Людмила Николаевна
  • Крупина Александра Юрьевна
  • Лебедева Марина Валерьевна
  • Самарина Мария Алексеевна
  • Таранов Василий Васильевич
RU2800828C1
СИСТЕМА РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМА ДРОЖЖЕЙ DEBARYOMYCES HANSENII НА ОСНОВЕ CRISPR/CAS9 2019
  • Котлов Михаил Игоревич
  • Черников Денис Львович
RU2710731C1
Рибонуклеопротеиновый комплекс для редактирования генома человека 2020
  • Иваненко Александр Вячеславович
  • Белоусов Всеволод Вадимович
RU2749741C1
ОРТОГОНАЛЬНЫЕ БЕЛКИ CAS9 ДЛЯ РНК-НАПРАВЛЯЕМОЙ РЕГУЛЯЦИИ И РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОВ 2021
  • Чёрч, Джордж М.
  • Эсвельт, Кевин
  • Мали, Прашант
RU2771583C1

Иллюстрации к изобретению RU 2 762 830 C1

Реферат патента 2021 года ГЕНЕТИЧЕСКАЯ КОНСТРУКЦИЯ НА ОСНОВЕ СИСТЕМЫ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМА CRISPR/CAS9, КОДИРУЮЩАЯ НУКЛЕАЗУ CAS9, ДЛЯ ГЕНОМНОГО РЕДАКТИРОВАНИЯ ОДНОДОЛЬНЫХ ЗЕРНОВЫХ КУЛЬТУР НА ОСНОВЕ ДВОЙНОГО ОТБОРА РАСТЕНИЙ

Изобретение относится к области биотехнологии, в частности к генетической конструкции на основе системы редактирования генома CRISPR/Cas9, кодирующей нуклеазу Cas9, содержащей ген-селективный маркер bar и репортерный ген gfp. Изобретение обеспечивает эффективный отбор модифицированных растений без дополнительных молекулярно-биологических тестов. 6 ил., 2 пр.

Формула изобретения RU 2 762 830 C1

Генетическая конструкция на основе системы редактирования генома CRISPR/Cas9, кодирующая нуклеазу Cas9, содержащая ген-селективный маркер bar, отличающаяся тем, что она дополнительно содержит репортерный ген gfp и имеет нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 1.

Документы, цитированные в отчете о поиске Патент 2021 года RU2762830C1

KEUNSUB LEE et al., Activities and specificities of CRISPR/Cas9 and Cas12a nucleases for targeted mutagenesis in maize, Plant Biotechnology Journal, 2019, Vol
Печь для сжигания твердых и жидких нечистот 1920
  • Евсеев А.П.
SU17A1
Способ получения и применения продуктов конденсации фенола или его гомологов с альдегидами 1920
  • Петров Г.С.
SU362A1
SHUJUAN ZHANG et al., Targeted mutagenesis using the Agrobacterium tumefaciens-mediated CRISPR-Cas9 system in common wheat, BMC Plant Biology, 2018, Vol
Способ использования делительного аппарата ровничных (чесальных) машин, предназначенных для мериносовой шерсти, с целью переработки на них грубых шерстей 1921
  • Меньщиков В.Е.
SU18A1
WO

RU 2 762 830 C1

Авторы

Шульга Ольга Альбертовна

Мирошниченко Дмитрий Николаевич

Клементьева Анна Александровна

Тимербаев Вадим Рафаилович

Долгов Сергей Владимирович

Даты

2021-12-23Публикация

2020-10-05Подача