Гибридный ген, состоящий из рецептора RBD поверхностного белка S коронавируса SARS-CoV-2, эпитопов S14P5 и S21P2, Fc-фрагмента, для получения рекомбинантного антигена и его применения в составе вакцинной композиции против коронавирусной инфекции Российский патент 2023 года по МПК C12Q1/68 C07K14/00 

Описание патента на изобретение RU2795160C1

Область техники, к которой относится изобретение.

Изобретение относится к биотехнологии, иммунологии, вирусологии и касается создания вакцины против коронавирусной инфекции, способа ее получения, конструкции гибридного гена и конструкции для экспрессии рекомбинантного антигена RBD/S21/S14- Fc, представляющего собой участок S-белка SARS-CoV-2, включающего RBD, часть SD1 и S2, слитого с Fc фрагментом IgG1, клеточной линии, продуцирующей рекомбинантный антиген, способа получения рекомбинантного антигена, который в сочетании с корпускулярным адъювантом на основе бетулина, способен индуцировать у животных и человека длительный гуморальный и клеточный иммунитет против коронавируса.

Уровень техники.

Вакцинация рассматривается в современных условиях как одно из наиболее эффективных средств борьбы с инфекцией. Таким образом, многие страны и фармацевтические компании включились в разработку вакцин и лекарственных препаратов против SARS-CoV-2, нового РНК-содержащего вируса, относящегося к семейству Coronaviridae к линии Beta-CoV.

При традиционной технологии создания вакцин на основе использования полноразмерного патогена резко возрастает сложность производства, обусловленная опасностью работы и необходимостью строгого контроля за полнотой инактивации возбудителя, что делает данный вариант менее экономически выгодным. В связи с этим, проверенная в последние годы технология получения вакцин на основе субъединиц вируса имеет определенные преимущества, такие как безопасность и возможность бустерного введения вакцины. Однако, отдельные вирусные субъединицы имеют низкую иммуногенность, вследствие чего необходимо применение адъювантов.

Вакцины на основе целых инактивированных вирусов, в целом, широко используются для иммунизации, однако имеют серьезные недостатки - от технологических, связанных с трудностью получения больших количеств препарата в сжатые сроки, до проблем, касающихся их эффективности - нежелательные побочные эффекты и проблемы с таргетностью вырабатываемых антител на необходимый эпитоп белков вирусной оболочки, а также примесными белками, остающимися в вакцине после культивирования вируса.

Вакцины на основе нуклеиновых кислот основаны на принципе введения в клетки генетической информации, с которой продуцируются белки патогена, вызывающие иммунную реакцию. В случае использования для доставки вирусных векторов существует опасность интеграции чужеродной ДНК в геном клетки вакцинируемого, возможное развитие аутоиммунных реакций против клеток, экспрессирующих вирусный антиген, или реакция на чужеродную ДНК. Помимо перечисленных недостатков, существуют трудности с доставкой таких препаратов. Стоит отметить, что РНК и ДНК вакцины, а также вакцины на основе аденовирусных векторов вызывают определенную осторожность в использовании, так как неизвестны долговременные последствия их применения.

Субъединичные вакцины представлены, прежде всего, рекомбинантными препаратами, на основе очищенных белков. При создании таких типов вакцин важной частью является поиск новых эффективных адъювантов. Их использование позволяет уменьшить дозу антигена, снизить стоимость конечного препарата, повысить иммуногенность «слабых» или малых антигенов, на которые чрезвычайно сложно выработать иммунитет и получить вакцину к данному классу патогенов. Это позволяет предотвратить конкуренцию антигенов в комбинированных вакцинах, увеличить скорость развития и продолжительность иммунного ответа у привитых, индуцировать защитные свойства слизистых оболочек, а также увеличить силу иммунного ответа. В настоящее время признано невозможным создание эффективных и безопасных субъединичных или эпитопных вакцин без применения адъювантов.

За функцию проникновения коронавируса в клетки хозяина отвечает RBD (рецептор-связывающий домен) S-белка, а также отдельные его эпитопы. В экспериментальных исследованиях установлено, что большинство антител, обладающих вируснейтрализующей активностью в отношении вида коронавирусов (например, MERS или SARS), специфически связываются с различными эпитопами RBD. RBD образует сайт связывания с рецептором АСЕ2, поэтому антитела, способные связываться с RBD доменом, могут блокировать контакт с рецептором и, как следствие, препятствовать проникновению вируса в клетки, что в случае SARS-CoV-2 установлено. На основании этого, в качестве последовательности для создания антигена была выбрана именно последовательность RBD. Стоит отметить, что выбор целого S-белка мог бы привести к выработке не только нейтрализующих антител, но и маскирующих, повышая развитие антитело-зависимого усиления инфекции.

Домен S1 состоит из субдомена NTD (N-концевой домен), RBD (остатки 319-527), и субдоменов SD1 и SD2, которые наиболее близки к домену S2. Таким образом, важнейшей задачей вакцинации является не просто выработка антител к S-белку, а именно нейтрализующих антител к RBD. Однако, простое использование RBD в качестве антигена вакцины не представляется возможным, так как масса белка довольно мала (менее 40 кДа), а также он быстро выводится из организма, поэтому кандидатами в антиген стали RBD, часть SD1 и S2, конъюгированные с Fc фрагментом IgG1.

Добавление адъюванта позволит снизить количество белка на дозу, себестоимость вакцины, а увеличить иммунный ответ на антиген. В настоящее время в экспериментальных и клинических исследованиях применяют: минеральные (гидроксид или фосфат алюминия), растительные (сапонины - QuilA, QS21), микробные (убитые бактерии, липополисахарид, и его производные, CpG-мотивы ДНК) и другие виды адъювантов. Вследствие токсичности или недостаточной эффективности большинства адъювантов для общего использования разрешены только соли алюминия и водно-масляные эмульсии MF-59, AS03, QS 21, VLP (virus-like particles) и ИСКОМы (ImmunoStimulating COMplex). Наиболее перспективными являются корпускулярные адъюванты - сферические аморфные наночастицы (САНЧ). Одна из причин использования - их эффективное поглощение антиген-представляющими клетками иммунной системы, что приводит к усилению иммунного ответа. К таким адъювантам можно отнести бетулиновые адъюванты на основе тритерпеноидов из экстракта бересты (патент RU 2,545,714). Бетулиновые частицы, кроме выраженного спектра биологической активности (противомикробное, противогрибковое, противовирусное действия, гепатопротективное, противовоспалительное, противораковое, противоаллергическое, мембраностабилизирующее, иммуномодулирующее, антиоксидантное), обладают и адъювантными свойствами.

Техническое решение согласно патенту RU 2,749,193 выбрано авторами заявляемого изобретения за прототип. Из данного патента известны варианты использования антигенов, включающие RBD для индукции специфического иммунитета против вируса SARS-CoV-2 в качестве антигенного компонента, вместе с бетулиновыми сферическим аморфными наночастицами (САНЧ) размера 80-160 нм в качестве адъюванта. Данный адъювант производится в промышленных масштабах в соответствии с требованиями опытно-промышленного регламента, а также был протестирован ранее в доклинических исследованиях гриппозных вакцин, которые показали, что наличие корпускулярного адъюванта в составе вакцины приводит к усилению иммунного ответа и не влияет на безопасность применения препарата.

Раскрытие сущности изобретения.

Существенный недостаток известных вакцин против SARS-CoV-2, состоит в сложности их производства, недостаточной иммуногенной активности, нежелательных побочных явлениях, и проблемах с таргетностью вырабатываемых антител к необходимому эпитопу белка вирусной оболочки. Техническая задача настоящего изобретения заключается в создании антигенной композиции, позволяющей вызвать индукцию специфического гуморального и клеточного иммунного ответа к необходимому эпитопу белка вирусной оболочки SARS-CoV-2. Техническим результатом раскрываемого изобретения является создание антигенной композиции с корпускулярным бетулином в качестве адъюванта и рекомбинантным белком в качестве активного компонента. Технический результат достигается за счет создания гибридного гена RBD/S21/S14-Fc, кодирующего рекомбинантный антиген SARS-CoV-2 слитый с Fc-фрагментом иммуноглобулина через линкер, клеточной линии, экспрессирующей рекомбинантный антиген в культуральную жидкость, выделение и очистку - рекомбинантного антигена RBD/S21/S14- Fc, формулирование вакцины с использованием корпускулярного адъюванта на основе природного бетулина, применения вакцины для иммунизации животных и человека с целью получения иммунного ответа против коронавируса.

Краткое описание чертежей

Рис. 1. Карта вектора P-Pharma-Zeo - RBD/S21 /S14-Fc.

Рис. 2. Электрофореграммы реакций секвенирования для праймера RBD-Rev 1.

Рис. 3. Электрофореграммы реакций секвенирования для праймера RBD-short.

Рис. 4. Электрофореграммы реакций секвенирования для праймера RBD-short (продолжение).

Рис. 5. Электрофореграммы реакций секвенирования для праймера SolR.

Рис. 6. Электрофореграммы реакций секвенирования для праймера SolR (продолжение).

Рис. 7, Электрофореграммы реакций секвенирования для праймера RBD-Fwd3.

Рис. 8. Результаты оценки экспрессии и секреции белка RBD/S21/S14-Fc с помощью Вестерн Блоттинга. 1 - лизат клеток; 2 - культуральная жидкость. Столбец слева - стандарт молекулярных масс.

Рис. 9. Покрытие триптическими пептидами последовательности RBD/S21/S14-Fc.

Рис. 10. Результаты гель-фильтрационной хроматографии на колонке Superdex 200 Increase в Na-фосфатном буфере рН 7.4.

Осуществление изобретения.

Дизайн гибридного гена RBD/S21/S14-Fc. На первом этапе работы был разработан дизайн гибридного гена RBD/S21/S14-Fc для экспрессии и получения антигена-рекомбинантного белка вируса SARS-CoV-2. Последовательность рекомбинантного антигена на основе RBD с дополнительными эпитопами была слита с С-концевой частью RBD, FcIgG1 дикого типа (без модификации), для получения RBD/S21/S14-Fc. Модификации RBD были направлены на увеличение иммуногенности антигена. Было добавлено два пептидных эпитопа. Эпитоп S14P5 находится в области за RBD в SD1 субдомене, по всей видимости антитела к этому участку стерически препятствуют связыванию с рецептором. Эпитоп S21P2 находится в области S2, перекрывается с фьюжн пептидом (FP), причем антитела к этому участку препятствуют слиянию вируса с таргетной клеткой. Порядок эпитопов был изменен для повышения стабильности белка. Его аминокислотная последовательность представлена SEQ ID NO: 1. Расчетный молекулярный вес 107,2 кДа (димер), 53,6 кДа (восстановленный мономер).

Получение экспрессионной конструкции и ее подготовка к трансфекции. На первом этапе получили оптимизированную нуклеотидную последовательность (SEQ ID NO: 2). Нуклеотидную последовательность гибридного гена оптимизировали для экспрессии в культуре клеток СНО-НР с помощью программы GeneArt GeneOptimizer. В данной последовательности первые 60 нуклеотидов являются лидерным пептидом IL-2 (SEQ ID NO: 3).

Карта плазмиды RBD/S21/S14-Fc представлена на рис. 1. В табл.1 приведены основные характерные кодирующие последовательности плазмиды RBD/S21/S14-Fc. Полная нуклеотидная последовательность вектора представлена SEQ ID NO: 4.

RBD/S21/S14-Fc гибридный ген амплифицируют в реакции ПЦР с использованием праймеров SEQ ID NO: 5 и SEQ ID NO: 6 и ДНК полимеразой, обладающей корректирующей 3'-5' экзонуклеазной активностью. Продукт реакции очищается с использованием протокола очистки ДНК на спин колонках.

Вектор P-Pharma-Zeo линеаризуют с использованием рестриктаз HindIII и XbaI, очищают продукт методом агарозного гель-электрофореза и выделяют из геля с использованием протокола очистки ДНК на спин колонках. Концы вектора затупляют с использованием ДНК полимеразы, обладающей 3'-5' экзонуклеазной активностью, далее вектор очищают с использованием протокола очистки ДНК на спин колонках. Реакцию лигирования осуществляют с использованием Т4-ДНК полимеразы в соотношении вставка/вектор=1/10 с использованием 5% ПЭГ-4000 в реакции лигирования. Полученную плазмидную ДНК очищают с использованием протокола очистки ДНК на спин колонках. Осуществляют трансформации лигазной смеси в химически-компетентные клетки Е. Coli (штамм 10beta), после трансформации высеивают клетки в LB-агар на чашку петри, содержащую 100 мкг/мл ампициллина. Клетки инкубировали при 37°С в течение 18 часов до появления отдельных колоний (бактериальных клонов).

Далее осуществляли проверку наличия вставки и ориентации с использованием праймеров, SEQ ID NO: 7 и SEQ ID NO: 8 (для проверки наличия гена в плазмиде) и SEQ ID NO: 9 SEQ ID NO: 10 (для проверки правильной ориентации гена) в выбранных бактериальных клонах. Объемы реагентов для реакции ПЦР представлены в табл. 2.

После проведения реакции ПЦР продукт реакции анализируют методом агарозного гель-электрофореза (1% агарозы). Бактериальные клоны, ПЦР продукты от которых имеют размер ПЦР продукта ~ 1700 п. н.) и корректно ориентированный (размер ПЦР продукта ~ 400 п. н.), переносят в 50 мл среды LB, содержащей 100 мкг/мл ампициллина, культивируют при перемешивании в течение 24 ч. Полученную суспензию центрифугируют и удаляют супернатант, не затрагивая осадка клеток. Из осадка клеток выделяют плазмидную ДНК с использованием протокола очистки на спин-колонках.

Плазмидную ДНК из выбранных колоний выделяли из бактериальной культуры с помощью набора Plasmid Midiprep 2.0 согласно рекомендациям производителя. 50 мл культуры центрифугировали при скорости 3000 g и температуре 4±2°С в течение 20 минут. Супернатант полностью удаляли, к осадку вносили 5 мл ресуспендирующего раствора с РНКазой А. Смесь тщательно перемешивали на вибромешалке до полного ресуспендирования осадка и вносили 5 мл лизирующего раствора. Содержимое пробирки аккуратно переворачивали 10 раз. Затем вносили 5 мл нейтрализующего раствора, предварительно охлажденного до 4±2°С, и перемешивали переворачиванием. Лизат осаждали при скорости 3000 g в течение 45 мин на центрифуге Allegra 25R. Перед нанесением лизата на мембрану спин-колонки наносили 1,0 мл раствора для удаления эндотоксинов, полностью смачивая всю поверхность сорбента. Инкубировали в течение 1 минуты и наносили на мембрану весь объем бактериального лизата. Центрифугировали спин-колонку при скорости 3000 g в течение 2 минут. Затем на мембрану наносили 1 мл раствора для удаления эндотоксинов и центрифугировали при 3000 g в течение 1 минуты. Вносили 15 мл промывочного раствора с этанолом и центрифугировали при 3000 g в течение 1 минуты, промывку повторяли с тем же объемом промывочного раствора. После второй промывки, спин-колонку центрифугировали при скорости 3000 g в течение 5 минут для удаления остатков жидкости. Спин-колонку помещали в новую пробирку вместимостью 50 мл и оставляли открытой под ламинарным боксом на 5 минут для удаления остатков этанола. После на мембрану наносили 4 мл элюирующего раствора, предварительно подогретого на водяной бане TW-2 до 50±2°С, и инкубировали при комнатной температуре в течение 2 минут. Центрифугировали спин-колонку при скорости 3000 g в течение 2 минут. Элюат концентрировали с использованием ультрафильтрационных концентраторов VivaSpin6 (предел отсечения 10 кДа) до 500 мкл при скорости 3000 g.

К 500 мкл раствора плазмидной ДНК прибавляли 50 мкл 3 М натрия ацетата. К смеси вносили 1400 мкл этанола, предварительно охлажденного до минус 20°С, перемешивали и инкубировали при минус 20±2°С в течение 20 минут. Полученный раствор центрифугировали при скорости 14000 g в течение 20 минут при температуре 4±2°С, супернатант полностью удаляли, к осадку плазмидной ДНК аккуратно вносили 500 мкл 70% этанола. Образец центрифугировали при скорости 14000 об/мин в течение 10 минут, удаляли супернатант. Осадок высушивали под ламинарным потоком стерильного воздуха в течение 10 минут и растворяли в 20 мкл стерильной воды, не содержащей ДНКаз и РНКаз.

1 мкл отбирают для оценки концентрации ДНК, а также определения последовательности гена RBD/S21/S14-Fc. Для секвенирования внедренного гена методом Сэнгера используют праймеры SEQ ID N0:11, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 14.

На рисунках 2-7 приведены электрофореграммы реакций секвенирования. Итоговые результаты секвенирования с использованием праймеров, покрывающих всю последовательность гена RBD/S21/S14-Fc подтвердили идентичность последовательности гибридного гена RBD/S21/S14-Fc с референтной последовательностью.

Трансфекция и селекция трансфектантов. Создание штамма-продуцента.

Для трансфекции клеток СНО получили 8,6 мг/мл чистой ("transfection grade") плазмидной ДНК P-Pharma-Zeo- RBD/S21/S14-Fc. В результате трансфекции экспрессионным вектором Р-Pharma-Zeo- RBD/S21/S14-Fc получили один пул клеток, в котором жизнеспособность культуры клеток через 48 ч после трансфекции составила 92%. Контрольная трансфекция вектором, содержащим ген флуоресцентного зеленого белка GFP, продемонстрировала эффективность трансфекции на уровне 50±20%. Через 72 ч начинали селекцию трансфектантов путем культивирования с добавлением 400 мкг/мл зеоцина и 500 нМ МТХ. В течение 10 суток под селективным давлением жизнеспособность достигала минимума - 55±5%. Восстановление жизнеспособности культуры в пуле до 90±5% произошло на 16-е сутки, после чего часть клеток пула замораживалась, и осуществлялись предельные разведения с плотностью 0,5 клеток на лунку. Общее количество планшетов равнялось 100 шт. Из 96-луночных планшетов со стадии клонирования методом предельных разведений было отобрано 105 клонов и перенесено в 24-луночные планшеты. Все клоны, выросшие в 24-луночных (77) планшетах были перенесены в 6-луночные планшеты с увеличенным до 1,4% содержанием Anti Clumping Agent В для разрушения агрегатов клеток. После масштабирования для адаптации к культивированию при перемешивании в колбах выбрали 10 субклонов, которые имели наилучшие характеристики по параметрам: удельная продуктивность (pcd) ≥20 пг/клетку, содержание жизнеспособных клеток ≥0,9 млн/мл, содержание белка в культуральной жидкости ≥30 мкг/мл. Пересев субклонов осуществляли в течение 2 пассажей (1 пассаж-4 суток), после второго пассажа клетки замораживали с содержанием клеток 10±1,5 млн клеток/криопробирку. В табл.3 приведены данные по продуктивности клонов на втором пассаже, считая от пересева из 96-луночных планшетов.

На основе клеточной линии СНО-НР, трансфицированной вектором P-Pharma-Zeo-RBD/S21/S14-Fc, получены четыре первичные клона-продуцента гибридного белка RBD/S21/S14-Fc не менее 17±2 пг/(клетку*день). В качестве штамма-продуцента выбран клон наибольшей продуктивности (табл. 3, клон номер 10).

Таким образом, была создана клеточная линия СНО-НР, полученная из линии клеток СНО-К1 (вид Cricetulus griseus) путем адаптации к суспензионному культивированию, содержащая ген гибридного белка RBD/S21/S14 домена S-белка из SARS-CoV-2, соединенного с Fc фрагментом IgG1 человека в составе вектора P-Pharma-Zeo. Таким образом, была проведена сборка и апробация RBD/S21/S14-Fc и создан штамм-продуцент для наработки белка RBD/S21/S14-FC.

Анализ секреции и подтверждение подлинности белка. На рис. 8 приведены результаты оценки экспрессии RBD/S21/S14-Fc методом вестерн-блоттинга.

Для масс спектрометрической идентификации белка после проведения SDS-PAGE электрофореза вырезали окрашенные кумасси полосы и проводили трипсинолиз в геле. Разделение триптических пептидов проводили на хроматографической системе Ultimate 3000 Nano LC System (Thermo Fisher Scientific), сопряженной с масс-спектрометром Q Exactive Plus (Thermo Fisher Scientific) посредством наноэлектроспрейного источника (Thermo Fisher Scientific). Анализ MS/MS-данных проводили при помощи компьютерной программы PEAKS Studio 8. Первичные структуры пептидов, генерируемые программой PEAKS Studio, анализировали против базы данных соответствующих белковых последовательностей. Анализ проводили со следующими настройками: окисление Met, дезамидирование Asn/Gln и карбомидометилирование Cys. На рис. 9 представлено покрытие триптическими пептидами последовательности RBD/S21/S14-Fc. На рис. 10 представлены результаты гель-фильтрационной хроматографии на колонке Superdex 200 Increase в Na-фосфатном буфере рН 7.4.

Способ получения рекомбинантного антигена из клеток штамма-продуцента. Разработанный способ получения рекомбинантного антигена включает следующие этапы: 1) культивирование штамма-продуцента рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2; 2) отбор и осветляющая фильтрация культуральной жидкости; 3) хроматограф ическая очистка рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2; 4) подтверждение подлинности полученного рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2.

Культивирование. Пробирку из главного банка клеток, содержащую 107 клеток штамма-продуцента рекомбинантного антигена RBD/S21/S14-Fc, размораживали при 37°С в водяной бане в течение 10 минут, добавляли 4 мл среды ActiPro (Hyclone, США), содержащую 4 мМ L-аланин-L-глутамина (Gibco, США) и 0,4% реагента против агрегации клеток, перемешивали и центрифугировали при 200 g в течение 5 минут, супернатант удаляли, пеллету клеток ресуспендировали в 5 мл среды ActiPro (Hyclone, США), содержащую 4 мМ L-аланин-L-глутамина (Gibco, США) и 0,4% реагента против агрегации клеток, и инкубировали в течение суток в инкубаторе при 37°С и влажности не менее 70%. Для культивирования в биореакторе наращивают инокулят в необходимом количестве для начального засева в реактор с клеточной плотностью 0,5×106 кл/мл, т.е. в количестве не менее 400×106 кл в колбах при перемешивании, культуру клеток пересевают с увеличением объема колб. Культуру клеток пересевали в колбу вместимостью 125 мл с 20 мл среды и культивировали в течение 4 суток в шейкере-CO2-инкубаторе при скорости вращения платформы 120±5 об/мин, температуре 37±1°С, содержании CO2 5±1% и относительной влажности 70±5%. Весь объем культуры переносили в колбу вместимостью 500 мл со 125 мл среды и культивировали в течение 3 суток, при тех же условиях. Необходимый объем клеток переносят в биореактор BioFlo 320 с рабочим объемом 1 литр (Eppendorf, Германия) до клеточной плотности 0,5×106 кл/мл с конечноым объемом культуры 800 мл. Культивирование клеток штамма-продуцента проводят в биореакторе BioFlo 320 с рабочим объемом 1 литр (Eppendorf, Германия) на среде ActiPro (Hyclone, США), содержащую 4 мМ L-аланин-L-глутамина (Gibco, США) и 0,4% реагент против агрегации клеток (Lonza, Швейцария). Ежедневно с третьих суток культивирования вносят комплекс добавок: Cell Boost 7А (Cytiva, США) 1,5-3,5% от объема культивирования и смесь аминокислот L-цистин (152 мМ), L-триптофан (90 мМ), L-тирозин (250 мМ) (AppliChem, США для трех аминокислот).

Количество смеси аминокислот используют в 10 раз меньше относительно объема Cell Boost 7А. В течение всего процесса ежедневно добавляют концентрированный раствор глюкозы 200 г/л (Panreac, США) для поддержания концентрации глюкозы в культуральной жидкости около 5 г/л. Все указанные добавки ежедневно вносят через насос контроллера биореактора таким образом, чтобы рассчитанный объем на сутки не влиял на резкое изменение рН и осмолялыюсти. В первый день культивирования подготовленную биомассу переносят в биореактор для получения начальной концентрации живых клеток 0,5±0,1×106 клеток/мл. Культивирование осуществляют при рН 7,0±0,2 и концентрации растворенного кислорода 40±5%. Регуляцию рН осуществляют подачей CO2 и 0,5 М NaHCO3 (Sigma-Aldrich, США). Регуляцию концентрации растворенного кислорода в начале процесса осуществляют азотом и воздухом, затем воздухом и кислородом по мере увеличения концентрации жизнеспособных клеток и скорости потребления кислорода. Смесь газов подают через макробарботер со скоростью от 0,2 до 1,5 л/мин. Культивирование осуществляют при скорости вращения мешалки типа «морской винт» от 60 до 100 об/мин (каскадное регулирование) и температуре 37°С с последующим понижением до 35°С в экспоненциальной фазе роста и до 33°С на следующие сутки культивирования.

Отбор и осветляющая фильтрация культуральной жидкости. Начиная с третьих суток культивирования, осуществляют ежедневный отбор пробы культуральной жидкости для определения в ней количества жизнеспособных клеток, концентрации глюкозы и лактата. Культивирование останавливают при снижении жизнеспособности ниже 90%. Культуральную жидкость осветляют методом центрифугирования в две стадии: 1000 g в течение 30 минут и 3270 g в течение 15 минут. Для стерилизации культуральной жидкости используют фильтр с рейтингом 0,22 мкм. Полученный объем стерильной культуральной жидкости составлял 1,05 л. Из полученной культуральной жидкости путем очистки по описанному ниже протоколу было получено 375 мг рекомбинантного антигена RBD/S21/S14-FC.

Хроматографическая очистка белка. Хроматографическая очистка белка из осветленной культуральной жидкости проводится на препаративном хроматографе. Первая стадия очистки -аффиный сорбент Mab Select Shure LX (Cytiva), а также MabSelect Prisma (Cytiva), Mab Select (Cytiva) объемом 4,7 мл. Уравновешивание буфером 20 мМ фосфат натрия, 150 мМ хлорид натрия, рН 7,0 в течение 10 колоночных объемов со скоростью 2,5 мл/мин. Нанесение культуральной жидкости на колонку, время контакта 1 мин. После окончания нанесения, колонку промывают буфером 20 мМ фосфат натрия, 150 мМ хлорид натрия, рН 7,0 в течение 5 колоночных объемов со скоростью 5 мл/мин. После окончания промывки проводят элюцию буфером 20 мМ цитрат натрия, рН 3,0 в течение 4 колоночных объемов со скоростью 1 мл/мин. Доведение рН в полупродукте 1М раствором трис до значения 7,0.Вторая стадия очистки - сорбент смешанного действия НА Ultrogel (Sartorius), а также СНТ Ceramic Hydroxyapatite(Biorad), Ca++Pure-HA (Tosoh Biosciences) объемом 10 мл. Уравновешивание буфером 20 мМ фосфат натрия, 150 мМ хлорид натрия, рН 7,0 в течение 8 колоночных объемов со скоростью 2 мл/мин. Нанесение полупродукта, полученного с первой стадии очистки на колонку происходит в 50% градиенте буфера 20 мМ фосфат натрия, 150 мМ хлорид натрия, рН 7,0, время контакта 5 мин. После окончания нанесения, колонку промывают буфером 20 мМ фосфат натрия, 150 мМ хлорид натрия, рН 7,0 в течение 4 колоночных объемов со скоростью 2 мл/мин. После окончания промывки проводят элюцию буфером 20 мМ фосфат натрия, 1М хлорид натрия, рН 7,0 в течение 4 колоночных объемов со скоростью 1 мл/мин. Добавление в полупродукт NaCl до конечного содержания 2 М. Доведение рН в полупродукте 1М раствором фосфорной кислоты до значения 6,0.Третья стадия очистки -гидрофобный сорбент Butyl Sepharose HP (Cytiva), а также Capto Butyl ImpRes (Cytiva), Phenyl Sepharose HP (Cytiva), Capto Phenyl ImpRes (Cytiva) объемом 5 мл. Уравновешивание буфером 20 мМ фосфат натрия, 2 М хлорид натрия, рН 6,0 в течение 10 колоночных объемов со скоростью 2,5 мл/мин. Нанесение полупродукта, полученного со второй стадии очистки на колонку, время контакта 5 мин. После окончания нанесения колонку промывают буфером 20 мМ фосфат натрия, 2 М хлорид натрия, рН 6,0 в течение 5 колоночных объемов со скоростью 2,5 мл/мин. После окончания промывки проводят элюцию в градиент 100% буфера 20 мМ фосфат натрия, рН 6,0 в течение 3 колоночных объемов со скоростью 2 мл/мин. Четвертая стадия очистки - перевод в буфер ГЛФ, используя сорбент Sephadex G25 объемом 53 мл. Перед нанесением колонка уравновешена буфером 20 мМ фосфат натрия, рН 7,0, нанесение проходит со скоростью 1 мл/мин, после окончания нанесения промывка колонки буфером 20 мМ фосфат натрия, рН 7,0 в течение 3 колоночных объемов на скорости 10 мл/мин. Пятая стадия - нормирование концентрации белка. Концентрацию доводят буфером 20 мМ фосфат натрия, рН 5,0-7,0 до значения 2 мг/мл и стерильно фильтруют через фильтр насадку на флакон Steritop 0,22 mkm (Merck - Millipore, Германия). Получили 180 мл стерильного очищенного рекомбинантного антигена RBD/S21/S14-Fc. Рекомбинантный антиген хранят в холодильнике при температуре +4 С.

Подтверждение подлинности белка. Подтверждение подлинности полученного рекомбинантного антигена RBD/S21/S14-Fc проводят при помощи электрофореза в полиакриламидном геле с последующим иммуноблоттингом. Для проведения электрофореза используют градиентный полиакриламидный гель 4-20% (Bio-Rad, кат №4561093). Анализ образцов методом электрофореза проводят в восстанавливающих условиях. В лунки геля вносят 100 нг раствора белка. Разделение проводят при напряжении 200 В в течение 50 мин. Перенос на PVDF мембрану осуществляют с использованием системы Trans Blot Turbo (Biorad), согласно рекомендациям производителя. После забивки мембраны 3% раствором бычьего сывороточного альбумина, проводят конъюгирование с анти-IgG1 антителом (Abcam, кат №ab6760), меченным щелочной фосфатазой. После отмывки мембраны проведят детектирование конъюгата с использованием раствора BCIP/NBT.

Получение гомогенной дисперсии корпускулярного адъюванта на основе бетулина (КА). С целью получения гомогенных дисперсии корпускулярного адъюванта (КА) на основе бетулина к стерильной смеси 1% раствора бетулина в тетрагидрофуране, которую пропускали через нейлоновую мембрану с диаметром пор 0,22 мкм, в соответствии с технологией, добавляли 25 объемов стерильного 0,01 М трис-буфера рН-9,0±0,1 с помощью перистальтического насоса при постоянном перемешивании в течение 15 минут магнитной мешалкой пропеллерного типа. После добавления буфера содержание ТГФ в растворе составляло 3,85%. Далее полученную суспензию обрабатывали ультразвуком при 35 кГц в течение 10 минут. Для этого стеклянную емкость с полученной суспензией корпускулярного адъюванта помещали в ультразвуковую баню. И обрабатывали в вышеописанном режиме. В результате обработки получали белую равномерную суспензию без конгламератов и включений. За гомогенностью суспензии следили по светорассеянию, последовательно обрабатывая по 30 секунд до получения двух одинаковых спектров распределения частиц в диапазоне 100-150 нанометров. На следующем этапе производили очистку дисперсии КА от тетрагидрофурана. Применяли ультрафильтрацию на полых волокнах с номинальной отсекающей молекулярной массой 100 кДа в режиме фильтрации. Для предотвращения сорбции использовали 2-3 кратное разведение исходной дисперсии КА. При этом скорость ультрафильтрации составляла 1,0-1,2 л/минуту, давление устанавливали в пределах 0,6-0,8 атм. Для диафильтрации использовали 10-кратный объем (25 литров) 0,01 М трис-буфера. Затем дисперсию концентрировали до содержания бетулина 1,0-2,0 мг/мл (4,5 л буфера). Концентрацию бетулина определяли методом ВЭЖХ. Емкость с корпускулярным адъювантом хранили в холодильной камере при температуре около +4 С.

Получение кандидатной вакцины для иммунизации животных и добровольцев. Полученный в соответствии с перечисленными этапами стерильный рекомбинантный антиген RBD/S21/S14-FC, растворенный в Трис-HCl буферном растворе объемом 100 мл добавляли в емкость с предварительно приготовленным стерильным адъювантом объемом 1 литр в 0,05М буферном растворе Трис-HCl с добавлением 0,15М NaCl (рН 7,5) тщательно перемешивали в течение двух часов при +4°С. Полученный полуфабрикат, содержащий RBD/S21/S14-Fc, прошедший все контроли, доводят до концентрации белка 40 мкг/мл и концентрации адъюванта 400 мкг/мл в фосфатном буферном растворе рН 7,5. Компоненты тщательно перемешали и поместили в шейкер в холодильник при температуре от 2 до 8°С на 3 часа. Затем емкости с «балком» кандидатной вакцины разливали по 0,5 мл во флаконы и хранили в холодильнике при 2-8°С. Содержание антигена и адъюванта в одной дозе (0,5 мл) составляло 20 мкг и 200 мкг соответственно. По такой же схеме готовили образец кандидатной вакцины с содержанием антигена и адъюванта в дозе (0,5 мл): 5 мкг рекомбинантного антигена RBD/S21/S14-Fc и 200 мкг корпускулярного адъюванта.

Полученную вакцину применяли в качестве кандидатной вакцины для проведения доклинических и клинических исследований.

Определение содержания корпускулярного адъюванта (КА). Определение проводили методом обращено-фазовой ВЭЖХ. Исследование проводили с использованием жидкостного хроматографа Shimadzu LC-2010 (Япония) и аналитической колонки Kromasil 300-5С8 250 х 4.6 мм с размером частиц 5 мкм, AkzoNobel (Голландия) в изократическом режиме элюирования и детектировании при 210 нм. Результаты представлены в табл. 4.

Оценка специфической активности вакцины. Целью исследования являлось сравнительное изучение иммуногенности вакцины в опытах на животных. В ходе исследования сравнивали выработку антител у иммунизированных опытными вакцинами мышей линии Balb/c массой 12 - 14 г обоего пола. Испытуемые препараты вводили двукратно (по схеме 0-14) внутрибрюшинно по 0,5 мл шприцем вместимостью 1 мл. Аналогично контрольным группам животных вводили натрия хлорид, раствор для инфузий 0,9%. Забор крови осуществляли на 14 день после однократной иммунизации и на 14 день после двукратной иммунизации. Антитела определяли в сыворотках с помощью метода ИФА. Исследовали специфическую активность вакцины, содержащей только RBD (в двух дозировках: 5 и 20 мкг рекомбинантного белка в дозе (0,5 мл), вакцину N+RBD в дозировке 5 мкг антигена в дозе (0,5 мл), а также вакцину без адъюванта. Данные о числе животных, о вакцинах и их дозировке при иммунизации представлены в табл.5.

Полученные из крови мышей сыворотки (индивидуально от каждого животного) контролировали на наличие антител к антигену SARS-CoV-2 методом иммуноферментного анализа с использованием экспериментальной тест-системы (ИФТС). При конструировании ИФТС использовались коммерческие реагенты: a/mouse IgG (H+L) Strong Zyme HRP Conjugate (фирмы «SDT», Германия); хромоген - 3,3,5,5-тетраметилбензидин (фирмы «Хема», Россия); блокатор -белково-солевой раствор, в качестве стоп-реагента применялся 5% раствор серной кислоты. Иммуноферментную реакцию выполняли на полистироловых планшетах фирмы Greiner bio-one, Германия. На подложку наносили 1 мкг антигена SARS-CoV-2 и сорбировали в течение суток. Результаты иммуноферментного анализа регистрировали на спектрофотометре PR 2100 производства фирмы «Sanofi Diagnostiks Pasteur» (Франция) при двух длинах волн 450/620 нм и они представлены в табл.6.

Изучение иммунного ответа (титра антител) кандидатной вакцины на основе рекомбинантного белка RBD/S21/S14-Fc и корпускулярного адъюванта на основе природного бетулина. В исследовании были использованы самки линии BALB/c (Филиал "Столбовая" ФГБУН НЦБМТ ФМБА России). Животных содержали в стандартных условиях (18-22°С и относительной влажности воздуха 50-70%, NH3=0,001 мг/м3, СО2=0,1%, 12 ч темноты/12 ч света), кормили гранулированным полнорационным экструдированным кормом для мышей, крыс, и хомяков (ООО «Лабораторкорм», Москва) ad libitum в соответствии с Директивой 2010/63/EU Европейского парламента и совета Европейского Союза от 22 сентября 2010 г. по охране животных, используемых в научных целях и в соответствии с санитарно-эпидемиологическими правилами СП 2.2.1.3218-14 "Санитарно-эпидемиологические требования к устройству, оборудованию и содержанию экспериментально-биологических клиник (вивариев)" (утв. постановлением Главного государственного санитарного врача РФ от 29 августа 2014 г. №51).

В табл. 7 приведены препараты кандидатной вакцины на основе рекомбинантного белка RBD/S21/S14-Fc с корпускулярным адъювантом для иммунизации животных и дизайн исследования. В качестве препарата плацебо использовали физиологический раствор (0,9% NaCl).

Мышам линии BALB/c массой 18-20 г препараты вводили внутрибрюшинно по 0,5 мл шприцем вместимостью 1 мл, двукратно, 1-й и 14-й день, согласно дизайну исследования. Перед каждым заполнением шприца препарат перемешивали 5-6 раз. Контрольной группе мышей той же партии вводили раствор 0,9% натрия хлорида. Через 28 дней после первой иммунизации у мышей осуществляли забор крови из нижнечелюстной вены. Образцы крови отстаивали при комнатной температуре в течение 2-х часов, центрифугировали 10 мин при 5000 об/мин и отбирали образовавшуюся цельную сыворотку. До момента использования сыворотки хранили при температуре - 20°С. Полученные из крови мышей сыворотки (индивидуально от каждого животного) контролировали на наличие антител методом иммуноферментного анализа (ИФА) и РМН. Статистический анализ первичных данных проводили в GraphPad Prism v9. Для представления данных использовали следующие статистические показатели: среднее геометрическое, стандартное отклонение, среднее арифметическое, ошибка среднего. Для определения значимости различий между групповыми средними использовали однофакторный дисперсионный анализ ANOVA, затем критерий Тьюки для апостериорных попарных сравнений групп между собой. Групповой уровень значимости принимали равным α=0,05. Различия считали достоверными при р<α.

Иммуноферментный анализ. Наличие специфических иммуноглобулинов класса G (IgG) определяли в образцах сывороток мышей после двукратной иммунизации. Сорбцию антигена, разведенного в стерильном DPBS до концентрации 1,0 мкг/мл проводили в течение ночи при +4°С в 96-луночных планшетах Maxisorp (Nunc) (по 100 мкл/лунку). Затем планшеты дважды отмывали раствором 0,1% TWEEN20 (Serva) в PBS с использованием автоматического промывателя ELx50 (BioTek) по 500 мкл/лунку. После отмывки планшеты инкубировали с блокирующим буфером (PBS-T, содержащий 5% сухое молоко, «ТФ Дитол»), в течение 2-х часов при комнатной температуре и повторно отмывали. После чего на планшет вносили серии двукратных разведений сывороток, начиная с разведения 1:400 для групп животных, получивших вакцинные препараты и с разведения 1:50 для группы плацебо. Планшеты с мышиными сыворотками инкубировали 1 ч при комнатной температуре, затем три раза отмывали. В качестве вторичных антител использовали меченые пероксидазой хрена Goat anti mouse IgG (H+L) HRP (Abcam) в разведении 1:7500 по 100 мкл/лунку. После инкубации со вторичными антителами планшеты четыре раза отмывали. В качестве цветного субстрата использовали раствор ТМВ (ООО «Имтек», Россия) по 100 мкл/лунку в течение 10 мин при комнатной температуре, затем реакцию останавливали добавлением IN H2SO4 («Вектон», Россия). Оптическую плотность (ОП) при длине волны 450 нм измеряли на мультипланшетном ридере с LVF монохроматорами CLARIOstar (BMG LABTECH).Для вакцинных препаратов после двукратной иммунизации в дозе 5 мкг и 20 мкг было проведено определение уровня специфических антител IgG к белку RBD/S21/S14-Fc в сыворотках иммунизированных животных с помощью непрямого варианта ИФА с использованием экспериментальной тест системы. Результаты определения уровня специфических антител представлены в таблице. Статистический анализ был выполнен при помощи однофакторного дисперсионного анализа (ANOVA) с последующим попарным сравнением групп при помощи критерия Тьюки. В ходе исследования показано формирование выраженного уровня сывороточных антител, специфических к белку RBD/S21/S14-Fc после двукратной иммунизации вакцинными препаратами в обоих использованных дозах. Результаты представлены в табл.8.

Реакция микронейтрализации (МНТ). Для проведения реакции нейтрализации сыворотки мышей разводили стерильным DPBS в соотношении 1:4 и прогревали 30 мин при 56°С. Затем готовили разведения сывороток на среде МЕМ+2% FBS в объеме 50 мкл, начиная с 1:10 (в пересчете на цельную сыворотку). К разведениям сывороток добавляли эквивалентный объем вируса SARS-CoV-2 (заражающая доза 25 ТЦИД50) и инкубировали 1 час при 37°С. Затем разведения переносили на клетки Vero в 96-луночных планшетах. Планшеты инкубировали в течение 4 суток при 37°С, после чего проверяли на наличие ЦПД. Нейтрализующим титром считали наибольшее разведение сыворотки, при котором наблюдается отсутствие ЦПД. Все исследования с инфекционным коронавирусом проводили в лаборатории иммунологии и профилактики вирусных инфекций ФГБНУ «ИЭМ» (Санитарно-эпидемиологическое заключение Роспотребнадзора по Санкт-Петербургу №77.ПЧ.01.000.М.000053.08.20 от 05.08.2020 для проведения работ с ПБА II-IV группы патогенности). Результаты определения уровня нейтрализующих антител против коронавируса SARS-CoV-2 в сыворотках крови мышей после двукратной иммунизации показали, что вирус-нейтрализующие антитела в количестве, достоверно отличающимся от группы плацебо, формируются в группе животных, получивших кандидатную вакцину, содержащую рекомбинантный белок как в дозе 5 мкг, так и в дозе 20 мкг. Уровень вируснейтрализующих антител, достоверно не отличался от такового в обеих группах. Статистический анализ был выполнен при помощи однофакторного дисперсионного анализа (ANOVA) с последующим попарным сравнением групп при помощи критерия Тьюки. Результаты представлены в табл.8. В ходе исследования показано, что двукратная иммунизация приводила к формированию вируснейтрализующих антител в количестве достоверно отличающемся от группы плацебо только в группе животных, привитых кандидатной вакциной, содержащей рекомбинантный белок в дозе 5 или 20 мкг. Таким образом, установлено, что вакцина, содержащая корпускулярный адъювант на основе природного бетулина, обладает высокой антигенной активностью.

Изучение иммуногенных свойств (оценки клеточного иммунного ответа) кандидатной вакцины на основе рекомбинантного белка RBD/S21/S14-Fc и корпускулярного адъюванта на основе природного бетулина. Для оценки Т-клеточного иммунного ответа, мышам линии C57/black SPF (n=5 на группу) препарат RBD1 вводили внутрибрюшинно по 5 или 20 мкг, двукратно, 1-й и 22-й день. Селезенки были собраны через 28 дней после второй иммунизации. Невакцинированная группа (n=3) служила контролем. Дизайн исследования представлен в табл.9.

Гомогенаты селезенки фильтровали (поры 70 мкм), промывали DPBS, содержащим 2,5% FCS (Gibco), лишали красных кровяных телец буфером для лизиса RBC (BioLegend), промывали DPBS (2,5% FCS). Клетки селезенки высевали на 96-луночные планшеты с плоским дном при плотности 2x106 клеток и стимулировали пулом пептида S-белка SARS-CoV-2 (PepTivator® SARS-CoV-2 Prot S) в течение 6 часов в присутствии анти-CD28 (BioLegend) и Брефельдина A (BD Biosciences). Фенотип клеток изучали с с помощью проточной цитометрии и CD8-PE/Cy7, CD4-PerCP/Cy5.5, CD44-BV510, CD62L-APC/Cy7, IFNγ-BV780, TNFα-BV421, IL2-PE (BioLegend). Мертвые клетки обнаруживали с помощью Zombie Red (BioLegend). True Stain, содержащий анти-CD16/CD32 (BioLegend), использовали для блокирования неспецифического связывания. Окрашивание клеток проводили с помощью Cytofix/Cytoperm (BD Biosciences) в соответствии с инструкциями. Определяли относительное соотношение CD8+ и CD4+Т-лимфоцитов с фенотипом эффекторных клеток памяти (CD44+CD62L-). Значительное увеличение S-белок специфических CD4+ и CD8+Tem клеток было измерено после двух иммунизаций по 20 мкг, тогда как иммунизация в количестве 5 мкг антигена привела к статистически значимому увеличению только CD4+Tem (р<0,05). Наблюдалась тенденция к дозозависимому росту клеток, продуцирующих Th1-цитокин (IFNγ, IL-2, TNFα), среди обеих популяций Tem. Эффект достиг значимости для Tem, продуцирующего IL-2 (IFNγ-IL-2+TNFα-), и для многофункциональных CD8+Т-клеток (IFNγ+IL-2+TNFα+) в обеих группах дозирования. В группе с высокими дозами рост IL-2, продуцируемого CD8+Tem, также был значительным.

Изучение иммуногенных свойств (оценки клеточного иммунного ответа) кандидатной вакцины на основе рекомбинантного белка RBD/S21/S14-Fc и корпускулярного адъюванта на основе природного бетулина на добровольцах.

Для строгого контроля за возникновением нежелательных явлений и любых поствакцинальных осложнений, для добровольцев была предусмотрена двукратная госпитализация в стационар на 3-е полных суток (4 дня) для проведения каждого из двух введений вакцины / плацебо. Добровольцы были госпитализированы в стационар за один день до введения вакцины. Через двое суток после первой и второй инъекции вакцины / плацебо, при отсутствии нежелательных явлений (НЯ) и серьезных нежелательных явлений (СНЯ) добровольцев выписали из стационара. Дальнейшее наблюдение осуществлялось амбулаторно. Исследование проводили в два этапа.

Первый этап исследования первой фазы. Первый этап клинического исследования представляет собой открытое рандомизированное исследование безопасности, переносимости (реактогенности) и иммуногенности вакцины при двукратном внутримышечном введении в дозах 20 мкг+5 мкг и 20 мкг+20 мкг. С учетом предполагаемого количества испытуемых, признанных по результатам скрининга не соответствующими критериям включения и/или соответствующими критериям невключения, исследование проведено у 20 здоровых добровольцев в параллельных группах в возрасте от 18 до 60 лет. Группа 1 (10 человек) - получала исследуемый вакцинный препарат по следующей схеме: первая инъекция 20 мкг - 0,5 мл суспензии для внутримышечного введения (40 мкг/мл), вторая инъекция 5 мкг - 0,5 мл суспензии для внутримышечного введения (10 мкг/мл), через 28 дней (далее - «двукратная иммунизация по схеме 20 мкг+5 мкг»). Группа 2 (10 человек) - получала исследуемый препарат по следующей схеме: первая и вторая инъекции по 20 мкг - по 0,5 мл раствора для внутримышечного введения (40 мкг/мл), через 28 дней (далее -«двукратная иммунизация по схеме 20 мкг+20 мкг»). Добровольцы были госпитализированы в стационар за один день до каждого из двух введений вакцины. Длительность пребывания в стационаре составила два периода по 4 дня (4 Визита).

Второй этап исследования первой фазы. Второй этап клинического исследования представляет собой двойное слепое рандомизированное с параллельными группами клиническое исследование безопасности, переносимости и иммуногенности вакцины при двукратном внутримышечном введении в дозах 20 мкг+5 мкг и 20 мкг+20 мкг. С учетом предполагаемого количества испытуемых, признанных по результатам скрининга не соответствующими критериям включения и/или соответствующими критериям невключения, исследование проведено у 96 здоровых добровольцев в возрасте от 18 до 60 лет. Группа 3 (32 человека) - получала исследуемый препарат по следующей схеме: первая инъекция 20 мкг - 0,5 мл суспензии для внутримышечного введения (40 мкг/мл), вторая инъекция 5 мкг - 0,5 мл суспензии для внутримышечного введения (10 мкг/мл), внутримышечно, через 28 дней; Группа 4 (32 человека) - получала исследуемый препарат по следующей схеме: первая и вторая инъекции по 20 мкг - по 0,5 мл раствора для внутримышечного введения (40 мкг/мл), внутримышечно, через 28 дней; Группа 5 (32 человека) -получала плацебо по следующей схеме: первая и вторая инъекции - по 0,5 мл натрия хлорида, раствора для инъекций 0,9%, внутримышечно, через 28 дней.

96 добровольцев (Групп 3, 4 и 5) госпитализированы в стационар за 1 день до первого введения исследуемого препарата / плацебо. Длительность пребывания в стационаре составила 4 дня (3-е суток). Все добровольцы Групп 3, 4 и 5 наблюдались у врача-исследователя в течение 6-ти месяцев (180±5 дней) после первого введения исследуемого препарата / плацебо с целью выявления возможных поздних нежелательных реакций, оценки иммуногенности. Итоговая оценка безопасности и переносимости проводилась на Визите 20 (180±5 дней от момента первого введения исследуемого препарата / плацебо).

Анализ данных показал, что по всем изучаемым системам НЯ в анализируемых группах значимо не различались между собой. У одного добровольца с рандомизационным порядковым номером R004 (из Г1) на Визите 4 была зарегистрирована Коронавирусная инфекция COVID-19 на основании подтверждения наличия РНК вируса SARS-CoV-2 методом ГЩР и клинических проявлений (лихорадка, кашель), что являлось критерием исключения из исследования. Данное НЯ было легкой степени тяжести, продолжалось на момент проведения промежуточного анализа данных. Оценка различий между Г1 и Г2 с применением Fisher exact test показала отсутствие статистической значимости (р=1.000) по критерию «Доля добровольцев с симптомами COVID-19 и подтвержденным методом ШДР заражением SARS-CoV-2 инфекцией». Сравнительная характеристика первичных и вторичных критериев безопасности и переносимости показала отсутствие статистически значимых различий между исследуемыми группами.

Помимо безопасности кандидатной вакцины у добровольцев Группы 1-4 выявляли в крови специфические антитела к вирусу SARS-CoV-2. Результаты определения специфических антител у привитых добровольцев приведены в табл.10.

Результаты определения специфических антител после иммунизации добровольцев двумя дозами вакцины Betuvax-CoV-2 показали, что при внутримышечном введении вакцины с интервалом 28 дней и использовании испытуемых схем введения (20 мкг+5 мкг и 20 мкг+20 мкг) у большинства добровольцев наблюдается синтез специфических антител в высоком титре.

ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

--->

<110> Betuvaks LLC

Krasilnikov, Igor V

Isaev, Artur A

Kudriavtsev, Aleksandr V

Frolova, Maria E

Vakhrusheva, Anna V

Ivanov, Aleksandr V

Djonovic, Milana

Ivanishin, Taras V

Askretkov, Aleksandr D

Voronina, Yekaterina V

Zyryanov, Dmitry A

Serogin, Yuriy A

Stukova, Marina A

Romanovskaya-Romanko, Yekaterina A

Smirnov, Ivan V

Mokrushina, Yuliana A

Kryuchkov, Nikolay A

Blagodatskikh, Konstantin A

<120> Генная композиция для экспрессии рекомбинантного антигена,

клеточная линия, продуцирующая рекомбинантный антиген, способ

получения рекомбинантного антигена, вакцина против коронавирусной

инфекции, способ ее получения

<130> KF

<160> 14

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 479

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Recombinant fusion protein

<400> 1

Ala Pro Asn Ile Thr Asn Leu Cys Pro Phe Gly Glu Val Phe Asn Ala

1 5 10 15

Thr Arg Phe Ala Ser Val Tyr Ala Trp Asn Arg Lys Arg Ile Ser Asn

20 25 30

Cys Val Ala Asp Tyr Ser Val Leu Tyr Asn Ser Ala Ser Phe Ser Thr

35 40 45

Phe Lys Cys Tyr Gly Val Ser Pro Thr Lys Leu Asn Asp Leu Cys Phe

50 55 60

Thr Asn Val Tyr Ala Asp Ser Phe Val Ile Arg Gly Asp Glu Val Arg

65 70 75 80

Gln Ile Ala Pro Gly Gln Thr Gly Lys Ile Ala Asp Tyr Asn Tyr Lys

85 90 95

Leu Pro Asp Asp Phe Thr Gly Cys Val Ile Ala Trp Asn Ser Asn Asn

100 105 110

Leu Asp Ser Lys Val Gly Gly Asn Tyr Asn Tyr Leu Tyr Arg Leu Phe

115 120 125

Arg Lys Ser Asn Leu Lys Pro Phe Glu Arg Asp Ile Ser Thr Glu Ile

130 135 140

Tyr Gln Ala Gly Ser Thr Pro Cys Asn Gly Val Glu Gly Phe Asn Cys

145 150 155 160

Tyr Phe Pro Leu Gln Ser Tyr Gly Phe Gln Pro Thr Asn Gly Val Gly

165 170 175

Tyr Gln Pro Tyr Arg Val Val Val Leu Ser Phe Glu Leu Leu His Ala

180 185 190

Pro Ala Thr Val Cys Gly Pro Lys Lys Ser Thr Gln Ile Leu Pro Asp

195 200 205

Pro Ser Lys Pro Ser Lys Arg Ser Phe Ile Glu Asp Leu Leu Phe Asn

210 215 220

Lys Val Thr Leu Ala Thr Glu Ser Asn Lys Lys Phe Leu Pro Phe Gln

225 230 235 240

Gln Phe Gly Arg Asp Ile Ala Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His

245 250 255

Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val

260 265 270

Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr

275 280 285

Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu

290 295 300

Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys

305 310 315 320

Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser

325 330 335

Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys

340 345 350

Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile

355 360 365

Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro

370 375 380

Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu

385 390 395 400

Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn

405 410 415

Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser

420 425 430

Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg

435 440 445

Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu

450 455 460

His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys

465 470 475

<210> 2

<211> 1500

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Hybrid RBD-Fc codon-optimized sequence

<400> 2

atgtacagga tgcaactcct gtcttgcatt gcactaagtc ttgcacttgt cacgaattcc 60

gcacccaata tcaccaatct gtgccccttc ggcgaggtgt tcaatgccac cagattcgcc 120

tctgtgtacg cctggaaccg gaagcggatc agcaattgcg tggccgacta ctccgtgctg 180

tacaactccg ccagcttcag caccttcaag tgctacggcg tgtcccctac caagctgaac 240

gacctgtgct tcacaaacgt gtacgccgac agcttcgtga tccggggaga tgaagtgcgg 300

cagattgccc ctggacagac aggcaagatc gccgactaca actacaagct gcccgacgac 360

ttcaccggct gtgtgattgc ctggaacagc aacaacctgg actccaaagt cggcggcaac 420

tacaattacc tgtaccggct gttccggaag tccaatctga agcccttcga gcgggacatc 480

tccaccgaga tctatcaggc cggcagcacc ccttgtaacg gcgtggaagg cttcaactgc 540

tacttcccac tgcagtccta cggctttcag cccacaaatg gcgtgggcta tcagccctac 600

agagtggtgg tgctgagctt cgaactgctg catgcccctg ccacagtgtg cggccctaag 660

aaaagcaccc agattctgcc cgatcctagc aagcccagca agcggagctt catcgaggac 720

ctgctgttca acaaagtgac actggccaca gagagcaaca agaagttcct gccattccag 780

cagtttggcc gggatatcgc cgagcccaaa tcttgtgaca aaactcacac atgcccaccg 840

tgcccagcac ctgaactcct ggggggaccg tcagtcttcc tcttcccccc aaaacccaag 900

gacaccctca tgatctcccg gacccctgag gtcacatgcg tggtggtgga cgtgagccac 960

gaagaccctg aggtcaagtt caactggtac gtggacggcg tggaggtgca taatgccaag 1020

acaaagccgc gggaggagca gtacaacagc acgtaccgtg tggtcagcgt cctcaccgtc 1080

ctgcaccagg actggctgaa tggcaaggag tacaagtgca aggtctccaa caaagccctc 1140

ccagccccca tcgagaaaac catctccaaa gccaaagggc agccccgaga accacaggtg 1200

tacaccctgc ccccatcccg ggatgagctg accaagaacc aggtcagcct gacctgcctg 1260

gtcaaaggct tctatcccag cgacatcgcc gtggagtggg agagcaatgg gcagccggag 1320

aacaactaca agaccacgcc tcccgtgctg gactccgacg gctccttctt cctctacagc 1380

aagctcaccg tggacaagag caggtggcag caggggaacg tcttctcatg ctccgtgatg 1440

catgaggctc tgcacaacca ctacacgcag aagagcctct ccctgtctcc gggtaaatga 1500

<210> 3

<211> 60

<212> DNA

<213> Homo sapiens

<400> 3

atgtacagga tgcaactcct gtcttgcatt gcactaagtc ttgcacttgt cacgaattcc 60

<210> 4

<211> 9290

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Plasmid DNA

<400> 4

ctagagtcgg ggcggccggc cgctcgctga tcagcctcga ctgtgccttc tagttgccag 60

ccatctgttg tttgcccctc ccccgtgcct tccttgaccc tggaaggtgc cactcccact 120

gtcctttcct aataaaatga ggaaattgca tcgcattgtc tgagtaggtg tcattctatt 180

ctggggggtg gggtggggca ggacagcaag ggggaggatt gggaagacaa tagcaggcat 240

gctggggatt aattaagatc gcatgcttct atattatttt ctaaaagatt taaagttttg 300

ccttctccat ttagacttat aattcactgg aatttttttg tgtgtatggt atgacatatg 360

ggttcccttt tattttttac atataaatat atttccctgt ttttctaaaa aagaaaaaga 420

tcgcatgctt ctatattatt ttctaaaaga tttaaagttt tgccttctcc atttagactt 480

ataattcact ggaatttttt tgtgtgtatg gtatgacata tgggttccct tttatttttt 540

acatataaat atatttccct gtttttctaa aaaagaaaaa gatccgtacg catttaattc 600

taccgggtag gggaggcgct tttcccaagg cagtctggag catgcgcttt agcagccccg 660

ctgggcactt ggcgctacac aagtggcctc tggcctcgca cacattccac atccaccggt 720

aggcgccaac cggctccgtt ctttggtggc cccttcgcgc caccttctac tcctccccta 780

gtcaggaagt tcccccccgc cccgcagctc gcgtcgtgca ggacgtgaca aatggaagta 840

gcacgtctca ctagtctcgt gcagatggac agcaccgctg agcaatggaa gcgggtaggc 900

ctttggggca gcggccaata gcagctttgc tccttcgctt tctgggctca gaggctggga 960

aggggtgggt ccgggggcgg gctcaggggc gggctcaggg gcggggcggg cgcccgaagg 1020

tcctccggag gcccggcatt ctgcacgctt caaaagcgca cgtctgccgc gctgttctcc 1080

tcttcctcat ctccgggcct ttctcgagct caggcttggg gggggggaca gctcagggct 1140

gcgatttcgc gccaaacttg acggcaatcc tagcgtgaag gctggtagga ttttatcccc 1200

gctgccatca tggttcgacc gctgaactgc atcgtcgccg tgtcccagaa tatgggcatc 1260

ggcaagaacg gagattttcc ctggccaatg ctcaggaacg aattcaagta cttccaaaga 1320

atgaccacca cctcctcagt ggaaggtaaa cagaacctgg tgattatggg ccggaaaacc 1380

tggttctcca ttcctgagaa gaatcgacct ttaaaggaca gaattaatat agttctcagt 1440

agagagctca aggaaccacc acaaggagct cattttcttg ccaaaagttt ggatgatgcc 1500

ttaagactta ttgaacaacc ggaattggca agtaaagtag acatggtttg gatagtcgga 1560

ggcagttctg tttaccagga agccatgaat caaccaggcc acctcagact ctttgtgaca 1620

aggatcatgc aggaatttga aagtgacacg tttttcccag aaattgattt ggggaaatat 1680

aaacttctcc cagaataccc aggcgtcctc tctgaggtcc aggaggaaaa aggcatcaag 1740

tataagtttg aagtctacga gaagaaagac taacaggaag atgctttcaa gttctctgct 1800

cccctcctaa agctatgcat ttttataaga ccatgggact tttgctggct ttagatcgta 1860

caagtaaagc ggccgcgacg ttcgatcata atcagccata ccacatttgt agaggtttta 1920

cttgctttaa aaaacctccc acacctcccc ctgaacctga aacataaaat gaatgcaatt 1980

gttgttgtta acttgtttat tgcagcttat aatggttaca aataaagcaa tagcatcaca 2040

aatttcacaa ataaagcatt tttttcactg cattctagtt gtggtttgtc caaactcatc 2100

aatgtatctt aaggcgtaaa ttgtaagcgt taataggatc cgtcgatcga ccgatgccct 2160

tgagagcctt caacccagtc agctccttcc ggtgggcgcg gggcatgact atcgtcgccg 2220

cacttatgac tgtcttcttt atcatgcaac tcgtaggaca ggtgccggca gcgctcttcc 2280

gcttcctcgc tcactgactc gctgcgctcg gtcgttcggc tgcggcgagc ggtatcagct 2340

cactcaaagg cggtaatacg gttatccaca gaatcagggg ataacgcagg aaagaacatg 2400

tgagcaaaag gccagcaaaa ggccaggaac cgtaaaaagg ccgcgttgct ggcgtttttc 2460

cataggctcc gcccccctga cgagcatcac aaaaatcgac gctcaagtca gaggtggcga 2520

aacccgacag gactataaag ataccaggcg tttccccctg gaagctccct cgtgcgctct 2580

cctgttccga ccctgccgct taccggatac ctgtccgcct ttctcccttc gggaagcgtg 2640

gcgctttctc atagctcacg ctgtaggtat ctcagttcgg tgtaggtcgt tcgctccaag 2700

ctgggctgtg tgcacgaacc ccccgttcag cccgaccgct gcgccttatc cggtaactat 2760

cgtcttgagt ccaacccggt aagacacgac ttatcgccac tggcagcagc cactggtaac 2820

aggattagca gagcgaggta tgtaggcggt gctacagagt tcttgaagtg gtggcctaac 2880

tacggctaca ctagaagaac agtatttggt atctgcgctc tgctgaagcc agttaccttc 2940

ggaaaaagag ttggtagctc ttgatccggc aaacaaacca ccgctggtag cggtggtttt 3000

tttgtttgca agcagcagat tacgcgcaga aaaaaaggat ctcaagaaga tcctttgatc 3060

ttttctacgg ggtctgacgc tcagtggaac gaaaactcac gttaagggat tttggtcatg 3120

agattatcaa aaaggatctt cacctagatc cttttaaatt aaaaatgaag ttttaaatca 3180

atctaaagta tatatgagta aacttggtct gacagttacc aatgcttaat cagtgaggca 3240

cctatctcag cgatctgtct atttcgttca tccatagttg cctgactccc cgtcgtgtag 3300

ataactacga tacgggaggg cttaccatct ggccccagtg ctgcaatgat accgcgagaa 3360

ccacgctcac cggctccaga tttatcagca ataaaccagc cagccggaag ggccgagcgc 3420

agaagtggtc ctgcaacttt atccgcctcc atccagtcta ttaattgttg ccgggaagct 3480

agagtaagta gttcgccagt taatagtttg cgcaacgttg ttgccattgc tacaggcatc 3540

gtggtgtcac gctcgtcgtt tggtatggct tcattcagct ccggttccca acgatcaagg 3600

cgagttacat gatcccccat gttgtgcaaa aaagcggtta gctccttcgg tcctccgatc 3660

gttgtcagaa gtaagttggc cgcagtgtta tcactcatgg ttatggcagc actgcataat 3720

tctcttactg tcatgccatc cgtaagatgc ttttctgtga ctggtgagta ctcaaccaag 3780

tcattctgag aatagtgtat gcggcgaccg agttgctctt gcccggcgtc aatacgggat 3840

aataccgcgc cacatagcag aactttaaaa gtgctcatca ttggaaaacg ttcttcgggg 3900

cgaaaactct caaggatctt accgctgttg agatccagtt cgatgtaacc cactcgtgca 3960

cccaactgat cttcagcatc ttttactttc accagcgttt ctgggtgagc aaaaacagga 4020

aggcaaaatg ccgcaaaaaa gggaataagg gcgacacgga aatgttgaat actcatactc 4080

ttcctttttc aatattattg aagcatttat cagggttatt gtctcatgag cggatacata 4140

tttgaatgta tttagaaaaa taaacaaata ggggttccgc gcacatttcc ccgaaaagtg 4200

ccacctgacg cgccctgtag cggcgcatta agcgcggcgg gtgtggtggt tacgcgcagc 4260

gtgaccgcta cacttgccag cgccctagcg cccgctcctt tcgctttctt cccttccttt 4320

ctcgccacgt tcgccggctt tccccgtcaa gctctaaatc gggggctccc tttagggttc 4380

cgatttagtg ctttacggca cctcgacccc aaaaaacttg attagggtga tggttcacgt 4440

agtgggccat cgccctgata gacggttttt cgccctttga cgttggagtc cacgttcttt 4500

aatagtggac tcttgttcca aactggaaca acactcaacc ctatctcggt ctattctttt 4560

gatttataag ggattttgcc gatttcggcc tattggttaa aaaatgagct gatttaacaa 4620

aaatttaacg cgaattttaa caaaatatta acgcttacaa tttgccattc gccattcagg 4680

ctgcgcaact gttgggaagg gcgatcggtc gacgatccac tagttctagc tagaatggtg 4740

gggttgcgcc ttttccaagg cagccctggg tttgcgcagg gacgcggctg ctctgggcgt 4800

ggttccggga aacgcagcgg cgccgaccct gggtctcgca cattcttcac gtccgttcgc 4860

agcgtcaccc ggatcttcgc cgctaccctt gtgggccccc cggcgacgct tcctgctccg 4920

cccctaagtc gggaaggttc cttgcggttc gcggcgtgcc ggacgtgaca aacggaagcc 4980

gcacgtctca ctagtaccct cgcagacgga cagcgccagg gagcaatggc agcgcgccga 5040

ccgcgatggg ctgtggccaa tagcggctgc tcagcagggc gcgccgagag cagcggccgg 5100

gaaggggcgg tgcgggaggc ggggtgtggg gcggtagtgt gggccctgtt cctgcccgcg 5160

cggtgttccg cattctgcaa gcctccggag cgcacgtcgg cagtcggctc cctcgttctc 5220

gagttgagac gaccttccat ggccaagttg accagtgccg ttccggtgct caccgcgcgc 5280

gacgtcgccg gagcggtcga gttctggacc gaccggctcg ggttctcccg ggacttcgtg 5340

gaggacgact tcgccggtgt ggtccgggac gacgtgaccc tgttcatcag cgcggtccag 5400

gaccaggtgg tgccggacaa caccctggcc tgggtgtggg tgcgcggcct ggacgagctg 5460

tacgccgagt ggtcggaggt cgtgtccacg aacttccggg acgcctccgg gccggccatg 5520

accgagatcg gcgagcagcc gtgggggcgg gagttcgccc tgcgcgaccc ggccggcaac 5580

tgcgtgcact tcgtggccga ggagcaggac tgagcggccg caataaaata tctttatttt 5640

cattacatct gtgtgttggt tttttgtgtg aatcgatagt actaacatac gctctccatc 5700

aaaacaaaac gaaacaaaac aaactagcaa aataggctgt ccccagtgca agtgcaggtg 5760

ccagaacatt tctctatcga taacgcgtct catcacggtc acgcatggct gcgcccgcgc 5820

agcgcccccc gacccccccc cgatccccgg aacgccagcc gccatccacc gcccgcagcc 5880

cccggagccc gcggaccccg accccccgcc gctcgcccgc cgttgcgccg ctctctgcgg 5940

gggggctagg gggccgcggg gggaaggcca cgccccctcc actttttcca ggaatgcgcg 6000

gcatgacccg ccccccccat gacccgccaa cacccccccg atgccccccg ggggtctttc 6060

ctggggggcc tttgtcaggg ttgcctgtgt cacccacggg ccccttggcc acgcttgcct 6120

gggtcacccc ggagccccgg gtcacgtttg ccggggtcag ccctggggcg cttcttcacg 6180

ctccattgcc ggtacctagt tattaatagt aatcaattac ggggtcatta gttcatagcc 6240

catatatgga gttccgcgtt acataactta cggtaaatgg cccgcctggc tgaccgccca 6300

acgacccccg cccattgacg tcaataatga cgtatgttcc catagtaacg ccaataggga 6360

ctttccattg acgtcaatgg gtggagtatt tacggtaaac tgcccacttg gcagtacatc 6420

aagtgtatca tatgccaagt acgcccccta ttgacgtcaa tgacggtaaa tggcccgcct 6480

ggcattatgc ccagtacatg accttatggg actttcctac ttggcagtac atctacgtat 6540

tagtcatcgc tattaccatg ggtgaggctc cggtgcccgt cagtgggcag agcgcacatc 6600

gcccacagtc cccgagaagt tggggggagg ggtcggcaat tgaaccggtg cctagagaag 6660

gtggcgcggg gtaaactggg aaagtgatgt cgtgtactgg ctccgccttt ttcccgaggg 6720

tgggggagaa ccgtatataa gtgcagtagt cgccgtgaac gttctttttc gcaacgggtt 6780

tgccgccaga acacaggtaa gtgccgtgtg tggttcccgc gggcctggcc tctttacggg 6840

ttatggccct tgcgtgcctt gaattacttc cacctggctg cagtacgtga ttcttgatcc 6900

cgagcttcgg gttggaagtg ggtgggagag ttcgaggcct tgcgcttaag gagccccttc 6960

gcctcgtgct tgagttgagg cctggcctgg gcgctggggc cgccgcgtgc gaatctggtg 7020

gcaccttcgc gcctgtctcg ctgctttcga taagtctcta gccatttaaa atttttgatg 7080

acctgctgcg acgctttttt tctggcaaga tagtcttgta aatgcgggcc aagatctgca 7140

cactggtatt tcggtttttg gggccgcggg cggcgacggg gcccgtgcgt cccagcgcac 7200

atgttcggcg aggcggggcc tgcgagcgcg gccaccgaga atcggacggg ggtagtctca 7260

agctggccgg cctgctctgg tgcctggcct cgcgccgccg tgtatcgccc cgccctgggc 7320

ggcaaggctg gcccggtcgg caccagttgc gtgagcggaa agatggccgc ttcccggccc 7380

tgctgcaggg agctcaaaat ggaggacgcg gcgctcggga gagcgggcgg gtgagtcacc 7440

cacacaaagg aaaagggcct ttccgtcctc agccgtcgct tcatgtgact ccacggagta 7500

ccgggcgccg tccaggcacc tcgattagtt ctcgagcttt tggagtacgt cgtctttagg 7560

ttggggggag gggttttatg cgatggagtt tccccacact gagtgggtgg agactgaagt 7620

taggccagct tggcacttga tgtaattctc cttggaattt gccctttttg agtttggatc 7680

ttggttcatt ctcaagcctc agacagtggt tcaaagtttt tttcttccat ttcaggtgtc 7740

gtgaggaatt agcttggtac taatacgact cacaagctgc cgccaccatg tacaggatgc 7800

aactcctgtc ttgcattgca ctaagtcttg cacttgtcac gaattccgca cccaatatca 7860

ccaatctgtg ccccttcggc gaggtgttca atgccaccag attcgcctct gtgtacgcct 7920

ggaaccggaa gcggatcagc aattgcgtgg ccgactactc cgtgctgtac aactccgcca 7980

gcttcagcac cttcaagtgc tacggcgtgt cccctaccaa gctgaacgac ctgtgcttca 8040

caaacgtgta cgccgacagc ttcgtgatcc ggggagatga agtgcggcag attgcccctg 8100

gacagacagg caagatcgcc gactacaact acaagctgcc cgacgacttc accggctgtg 8160

tgattgcctg gaacagcaac aacctggact ccaaagtcgg cggcaactac aattacctgt 8220

accggctgtt ccggaagtcc aatctgaagc ccttcgagcg ggacatctcc accgagatct 8280

atcaggccgg cagcacccct tgtaacggcg tggaaggctt caactgctac ttcccactgc 8340

agtcctacgg ctttcagccc acaaatggcg tgggctatca gccctacaga gtggtggtgc 8400

tgagcttcga actgctgcat gcccctgcca cagtgtgcgg ccctaagaaa agcacccaga 8460

ttctgcccga tcctagcaag cccagcaagc ggagcttcat cgaggacctg ctgttcaaca 8520

aagtgacact ggccacagag agcaacaaga agttcctgcc attccagcag tttggccggg 8580

atatcgccga gcccaaatct tgtgacaaaa ctcacacatg cccaccgtgc ccagcacctg 8640

aactcctggg gggaccgtca gtcttcctct tccccccaaa acccaaggac accctcatga 8700

tctcccggac ccctgaggtc acatgcgtgg tggtggacgt gagccacgaa gaccctgagg 8760

tcaagttcaa ctggtacgtg gacggcgtgg aggtgcataa tgccaagaca aagccgcggg 8820

aggagcagta caacagcacg taccgtgtgg tcagcgtcct caccgtcctg caccaggact 8880

ggctgaatgg caaggagtac aagtgcaagg tctccaacaa agccctccca gcccccatcg 8940

agaaaaccat ctccaaagcc aaagggcagc cccgagaacc acaggtgtac accctgcccc 9000

catcccggga tgagctgacc aagaaccagg tcagcctgac ctgcctggtc aaaggcttct 9060

atcccagcga catcgccgtg gagtgggaga gcaatgggca gccggagaac aactacaaga 9120

ccacgcctcc cgtgctggac tccgacggct ccttcttcct ctacagcaag ctcaccgtgg 9180

acaagagcag gtggcagcag gggaacgtct tctcatgctc cgtgatgcat gaggctctgc 9240

acaaccacta cacgcagaag agcctctccc tgtctccggg taaatgataa 9290

<210> 5

<211> 28

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Primer

<400> 5

gccgccacca tgtacaggat gcaactcc 28

<210> 6

<211> 21

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Primer

<400> 6

ttatcattta cccggagaca g 21

<210> 7

<211> 22

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Primer

<400> 7

ctttttgagt ttggatcttg gt 22

<210> 8

<211> 18

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Primer

<400> 8

caaacaacag atggctgg 18

<210> 9

<211> 22

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Primer

<400> 9

ctttttgagt ttggatcttg gt 22

<210> 10

<211> 20

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Primer

<400> 10

acttcatctc cccggatcac 20

<210> 11

<211> 20

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Primer

<400> 11

acttcatctc cccggatcac 20

<210> 12

<211> 21

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Primer

<400> 12

aattgcgtgg ccgactactc c 21

<210> 13

<211> 18

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Primer

<400> 13

caaacaacag atggctgg 18

<210> 14

<211> 22

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Primer

<400> 14

cagcacgtac cgtgtggtca gc 22

<---

Похожие патенты RU2795160C1

название год авторы номер документа
Генная конструкция для экспрессии рекомбинантных белков на основе участка S-белка SARS-CoV-2, включающего RBD и SD1, слитого с Fc фрагментом IgG, способ получения рекомбинантных белков, антигены и антигенные композиции для индукции длительного антительного и клеточного иммунитета против вируса SARS-CoV-2 2021
  • Исаев Артур Александрович
  • Кудрявцев Александр Викторович
  • Фролова Мария Евгеньевна
  • Вахрушева Анна Владимировна
  • Иванов Александр Викторович
  • Джонович Милана
  • Иванишин Тарас Владимирович
  • Красильников Игорь Викторович
RU2802825C2
Рекомбинантный вакцинный штамм для живой интраназальной вакцины, обеспечивающей сочетанную профилактику гриппозной и коронавирусной инфекций 2022
  • Исакова-Сиван Ирина Николаевна
  • Степанова Екатерина Алексеевна
  • Меженская Дарья Андреевна
  • Матюшенко Виктория Аркадьевна
  • Руденко Лариса Георгиевна
RU2782531C1
Вакцина на основе AAV5 для индукции специфического иммунитета к вирусу SARS-CoV-2 и/или профилактики коронавирусной инфекции, вызванной SARS-CoV-2 2020
  • Прокофьев Александр Владимирович
  • Гершович Павел Михайлович
  • Стрелкова Анна Николаевна
  • Спирина Наталья Александровна
  • Кондинская Диана Александровна
  • Яковлев Павел Андреевич
  • Морозов Дмитрий Валентинович
RU2783313C1
Средство и способ терапии и экстренной профилактики заболеваний, вызываемых вирусом SARS-CoV-2 на основе рекомбинантного антитела и гуманизированного моноклонального антитела 2021
  • Щебляков Дмитрий Викторович
  • Есмагамбетов Ильяс Булатович
  • Фаворская Ирина Алексеевна
  • Должикова Инна Вадимовна
  • Лебедин Юрий Степанович
  • Деркаев Артем Алексеевич
  • Рябова Екатерина Игоревна
  • Прокофьев Владимир Владимирович
  • Алексеева Ирина Александровна
  • Воронина Дарья Владимировна
  • Зорков Илья Дмитриевич
  • Ковыршина Анна Витальевна
  • Илюхина Анна Алексеевна
  • Ботиков Андрей Геннадьевич
  • Карпов Андрей Павлович
  • Лубенец Надежда Леонидовна
  • Зубкова Ольга Вадимовна
  • Семихин Александр Сергеевич
  • Народицкий Борис Савельевич
  • Логунов Денис Юрьевич
  • Гинцбург Александр Леонидович
RU2769223C1
Однодоменное антитело и его модификации, специфически связывающиеся с RBD S белка вируса SARS-CoV-2, и способ их применения для терапии и экстренной профилактики заболеваний, вызываемых вирусом SARS-CoV-2 2021
  • Фаворская Ирина Алексеевна
  • Щебляков Дмитрий Викторович
  • Есмагамбетов Ильяс Булатович
  • Деркаев Артем Алексеевич
  • Алексеева Ирина Александровна
  • Рябова Екатерина Игоревна
  • Воронина Дарья Владимировна
  • Прокофьев Владимир Владимирович
  • Должикова Инна Вадимовна
  • Зорков Илья Дмитриевич
  • Илюхина Анна Алексеевна
  • Ботиков Андрей Геннадьевич
  • Гроусова Дарья Михайловна
  • Егорова Дарья Андреевна
  • Народицкий Борис Савельевич
  • Логунов Денис Юрьевич
  • Гинцбург Александр Леонидович
RU2763001C1
Вакцина на основе AAV5 для индукции специфического иммунитета к вирусу SARS-CoV-2 и/или профилактики коронавирусной инфекции, вызванной SARS-CoV-2 2020
  • Гершович Павел Михайлович
  • Прокофьев Александр Владимирович
  • Стрелкова Анна Николаевна
  • Спирина Наталья Александровна
  • Шугаева Татьяна Евгеньевна
  • Яковлев Павел Андреевич
  • Морозов Дмитрий Валентинович
RU2760301C1
Вакцина на основе AAV5 для индукции специфического иммунитета к вирусу SARS-CoV-2 и/или профилактики коронавирусной инфекции, вызванной SARS-CoV-2 2021
  • Прокофьев Александр Владимирович
  • Гершович Павел Михайлович
  • Стрелкова Анна Николаевна
  • Спирина Наталья Александровна
  • Кондинская Диана Александровна
  • Яковлев Павел Андреевич
  • Морозов Дмитрий Валентинович
RU2761879C1
Гуманизированное моноклональное антитело, специфически связывающиеся с RBD S белка вируса SARS-CoV-2, средство и способ для терапии и экстренной профилактики заболеваний, вызываемых вирусом SARS-CoV-2 2021
  • Есмагамбетов Ильяс Булатович
  • Щебляков Дмитрий Викторович
  • Лебедин Юрий Степанович
  • Фаворская Ирина Алексеевна
  • Должикова Инна Вадимовна
  • Деркаев Артем Алексеевич
  • Рябова Екатерина Игоревна
  • Прокофьев Владимир Владимирович
  • Алексеева Ирина Александровна
  • Воронина Дарья Владимировна
  • Зорков Илья Дмитриевич
  • Ковыршина Анна Витальевна
  • Илюхина Анна Алексеевна
  • Ботиков Андрей Геннадьевич
  • Карпов Андрей Павлович
  • Лубенец Надежда Леонидовна
  • Зубкова Ольга Вадимовна
  • Семихин Александр Сергеевич
  • Народицкий Борис Савельевич
  • Логунов Денис Юрьевич
  • Гинцбург Александр Леонидович
RU2765731C1
Рекомбинантная ДНК, обеспечивающая получение рекомбинантного белка Cov1, обладающего иммуногенными свойствами в отношении вируса SARS-CoV-2 2021
  • Королева Ирина Владимировна
  • Суворов Александр Николаевич
  • Леонтьева Галина Федоровна
  • Крамская Татьяна Анатольевна
  • Дешева Юлия Андреевна
  • Шведова Тамара Николаевна
RU2776484C1
Способ создания живого штамма энтерококка L3-SARS на основе биологически активного штамма Е. faecium L3 2021
  • Суворов Александр Николаевич
  • Гупалова Татьяна Виталиевна
  • Бормотова Елена Алексеевна
RU2782529C1

Иллюстрации к изобретению RU 2 795 160 C1

Реферат патента 2023 года Гибридный ген, состоящий из рецептора RBD поверхностного белка S коронавируса SARS-CoV-2, эпитопов S14P5 и S21P2, Fc-фрагмента, для получения рекомбинантного антигена и его применения в составе вакцинной композиции против коронавирусной инфекции

Изобретение относится к биотехнологии, иммунологии и вирусологии. Описан гибридный ген, кодирующий рекомбинантный антиген, состоящий из рецептора RBD поверхностного белка S коронавируса SARS-CoV-2, эпитопов S14P5 и S21P2, Fc-фрагмента иммуноглобулина IgG1, представленный в виде аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1. Также описана экспрессионная конструкция в составе вектора P-Pharma-Zeo, представленного SEQ ID NO: 4, содержащая нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 2, состоящую из описанного выше гибридного гена и последовательности SEQ ID NO: 3, кодирующей лидерный пептид IL2. Описана линия клеток СНО-НР, трансфицированная экспрессионной конструкцией, описанной выше, для продуцирования рекомбинантного антигена RBD/S21/S14-FC. Представлен способ получения рекомбинантного антигена RBD/S21/S14-Fc, предусматривающего культивирование указанной выше линии клеток СНО-НР, в условиях подпитки 4 мМ L-аланин-L-глутамина и реагента против агрегации клеток с последующим отбором культуральной жидкости, ее осветлением, фильтрацией, хроматографической очисткой целевого рекомбинантного антигена, включающей аффинную хроматографию, хроматографию на НА сорбенте, гидрофобную и гель-проникающую хроматографию с последующей стерилизующей фильтрацией. Представлен рекомбинантный антиген RBD/S21/S14-Fc, полученный указанным выше способом, стимулирующий иммунный ответ в организме на коронавирусную инфекцию. Представлена вакцинная композиция для профилактики коронавирусной инфекции, содержащая указанный выше рекомбинантный антиген и корпускулярный адъювант на основе природного бетулина в буферном растворе. Раскрыт способ профилактики коронавирусной инфекции, предусматривающий иммунизацию нуждающихся в защите от инфекции коронавирусов указанной выше вакцинной композицией. Изобретение расширяет арсенал средств для борьбы с SARS-CoV-2. 7 н.п. ф-лы, 10 ил., 10 табл.

Формула изобретения RU 2 795 160 C1

1. Гибридный ген, кодирующий рекомбинантный антиген, состоящий из рецептора RBD поверхностного белка S коронавируса SARS-CoV-2, эпитопов S14P5 и S21P2, Fc-фрагмента иммуноглобулина IgG1, представленный в виде аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1.

2. Экспрессионная конструкция в составе вектора P-Pharma-Zeo, представленного SEQ ID NO: 4, содержащая нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 2, состоящую из гибридного гена по п. 1 и последовательности SEQ ID NO: 3, кодирующей лидерный пептид IL2.

3. Линия клеток СНО-НР, трансфицированная экспрессионной конструкцией по п. 2, способная продуцировать рекомбинантный антиген RBD/S21/S14-FC.

4. Способ получения рекомбинантного антигена RBD/S21/S14-Fc, предусматривающего культивирование линии клеток СНО-НР по п. 3, в условиях подпитки 4 мМ L-аланин-L-глутамина и реагента против агрегации клеток с последующим отбором культуральной жидкости, ее осветлением, фильтрацией, хроматографической очисткой целевого рекомбинантного антигена, включающей аффинную хроматографию, хроматографию на НА сорбенте, гидрофобную и гель-проникающую хроматографию с последующей стерилизующей фильтрацией.

5. Рекомбинантный антиген RBD/S21/S14-Fc, полученный способом по п. 4, стимулирующий иммунный ответ в организме на коронавирусную инфекцию.

6. Вакцинная композиция для профилактики коронавирусной инфекции, содержащая рекомбинантный антиген по п. 5 и корпускулярный адъювант на основе природного бетулина в буферном растворе.

7. Способ профилактики коронавирусной инфекции, предусматривающий иммунизацию нуждающихся в защите от инфекции коронавирусов вакцинной композицией по п. 6.

Документы, цитированные в отчете о поиске Патент 2023 года RU2795160C1

CN 111825762 A, 27.10.2020
US 20220001006 A1, 06.01.2022
Способ получения штамма клеток яичника китайского хомячка, продуцента рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, штамм клеток яичника китайского хомячка, продуцент рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, способ получения рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, тест-система для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека и ее применение 2020
  • Щебляков Дмитрий Викторович
  • Есмагамбетов Ильяс Булатович
  • Логунов Денис Юрьевич
  • Деркаев Артем Алексеевич
  • Симакин Павел Вячеславович
  • Ижаева Фатима Магометовна
  • Джаруллаева Алина Шахмировна
  • Зубкова Ольга Вадимовна
  • Ожаровская Татьяна Андреевна
  • Должикова Инна Вадимовна
  • Тухватулин Амир Ильдарович
  • Тухватулина Наталья Михайловна
  • Фаворская Ирина Алексеевна
  • Народицкий Борис Савельевич
  • Гинцбург Александр Леонидович
RU2723008C1

RU 2 795 160 C1

Авторы

Красильников Игорь Викторович

Исаев Артур Александрович

Кудрявцев Александр Викторович

Фролова Мария Евгеньевна

Вахрушева Анна Владимировна

Иванов Александр Викторович

Джонович Милана

Иванишин Тарас Владимирович

Аскретков Александр Дмитриевич

Воронина Екатерина Владимировна

Зырянов Дмитрий Алексеевич

Серёгин Юрий Александрович

Стукова Марина Анатольевна

Романовская-Романько Екатерина Андреевна

Смирнов Иван Витальевич

Мокрушина Юлиана Анатольевна

Крючков Николай Александрович

Благодатских Константин Александрович

Даты

2023-04-28Публикация

2022-06-10Подача