ТЕСТ-СИСТЕМА ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ ВИРУСА БОРОЗДЧАТОСТИ ДРЕВЕСИНЫ ЯБЛОНИ МЕТОДОМ ПЦР В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ Российский патент 2025 года по МПК C12Q1/68 C12Q1/6876 

Описание патента на изобретение RU2835202C1

В открытых базах данных не было обнаружено российских патентов, посвященных ПЦР-диагностике вируса бороздчатоcти древесины яблони. Единственным обнаруженным патентом является RU2384045C2, предметом которого является разработка способа оценки растений яблони на вирусную инфекцию с использованием оптических характеристик листьев - степени когерентности светорассеяния и оценки изменения оптической плотности листа. Данный подход предполагает выявление заражённости вирусами, в том числе при латентном протекании инфекции. Однако, эффективность предполагаемого подхода в значительной степени зависит от квалификации персонала, а также использование специализированного оборудования.

Было обнаружено несколько патентов Китайской Народной Республики, предметом которых являются методы ПЦР-диагностики ASGV.

CN103382508A (прекратил свое действие, но может быть восстановлен). Предметом патентования являются 4 тест-системы на 3 ключевых вируса (в т.ч. ASGV) с использованием мультиплексной ПЦР с обратной транскрипцией. При этом, способом детекции в предлагаемом подходе является гель-электрофорез, использование которого сопряжено с высокими рисками контаминации рабочего пространства продуктами амплификации, приводящей в конечном итоге к получению ложноположительных результатов. Также проблемой мультиплексного подхода является возможное конкурентное ингибирование параллельных реакций, особенно в случаях, когда генетический материал патогена находится в низкой концентрации. Кроме того, не вполне ясна чувствительность разработанных систем.

CN111057794A (прекратил свое действие, но может быть восстановлен). Предмет патентования - несколько праймерных систем для выявления ключевых вирусных патогенов яблони, в т.ч. ASGV. Однако и в данном случае детекция осуществляется исключительно электрофоретическим методом.

CN103966362A (прекратил свое действие, но может быть восстановлен). Метод определения 4-х вирусов яблони в формате мультиплексной ПЦР с обратной транскрипцией. Преимуществом данной разработки является то, что, помимо специфических праймеров, в её состав входят также праймеры внутреннего контроля (ген фактора элонгации трансляции 1 альфа яблони), позволяющие проводить выявление ложноотрицательных результатов. Детекция результатов также осуществляется исключительно в формате гель-электрофореза. Также не приводятся данные по чувствительности тест-системы.

CN110567951A (действующий). Предмет патента - новый способ выявления вируса бороздчатости древесины яблони с использованием технологии CRISPR-Cas и колориметрической детекции. Согласно данным авторов, чувствительность системы достигает 5.62*102 копий, что на 2 порядка превышает чувствительность известных систем, основанных на классической ПЦР. При этом, настоящий подход достаточно сложен технически, а также требует использования золотых наночастиц, поэтому проблематичен с точки зрения рутинного применения.

Литературные данные свидетельствуют о том, что для диагностики ASGV используются, главным образом, иммунохимические методы (ELISA) и различные подходы, основанные на амплификации нуклеиновых кислот. Иммунохимические методы [1-3] просты в исполнении, однако не обладают достаточной чувствительностью. В ряде ранних работ, посвященных ПЦР-детекции ASGV [4-7], детекция результатов анализа осуществлялась с помощью гель-электрофореза, что влекло высокие риски контаминации рабочей зоны продуктами амплификации, и, как следствие, получения ложноположительных результатов. Ma et al., [8] предложили способ выявления вируса с помощью рекомбиназно-полимеразной реакции с детекцией с помощью иммунохроматографических тест-полосок. Метод обладает высокой чувствительностью, однако, характеризуется сложностями, связанными с дизайном праймеров, которые, в случае с высокополиморфными вирусами яблони, могут не обладать достаточной специфичностью. В последние годы для выявления вирусов яблони, в том числе ASGV, используется также высокопроизводительное секвенирование [9]. Метод позволяет выявлять большое количество патогенов в одной пробе, однако является дорогостоящим и на сегодняшний день не применим для рутинной диагностики.

Тест-системой с наиболее оптимальными характеристиками, и наиболее близкой к разработке, описываемой в настоящем патенте, является предложенный Nickel and Fajardo [10] предложили метод мультиплексной ПЦР с использованием гидролизуемых (TaqMan) зондов для определения трех вирусов яблони в одной пробе. Как было упомянуто выше, ограничением мультиплексной ПЦР может быть ингибирование одной или инескольких параллельных реакций амплификации. Кроме того, авторы не дают точной информации о чувствительности тест-системы: предел обнаружения составил 2 фг тотальной кДНК, однако данных по минимально детектируемому количеству геном-эквивалентов на реакцию не приводится.

Список иллюстраций

Рис. 1. Выравнивание фрагментов генов белка оболочки ASGV и близкородственных вирусов, использованных для подбора прямого (ASGVF) и обратного (ASGVR) праймеров. Последовательности праймеров подчёкнуты.

Рис. 2. Карта вектора pAL2T, использованного для клонирования положительных контролей.

Рис. 3. Результаты ПЦР последовательных десятикратных разведений плазмиды, содержащей специфический продукт амплификации. По оси абсцисс показано логарифмические значения концентраций (геном-эквиваленты/реакцию), по оси ординат - значения соответствующих пороговых циклов.

Рис. 4. Флуоресцентный сигнал, детектируемый при ПЦР-анализе последовательных десятикратных разведений плазмид, содержащих специфический ампликон, с парой праймеров ASGVF-ASGVR и зондом ASGVT.

Техническим результатом является разработка тест-системы для проведения высокоспецифичной идентификации кДНК, с высокой чувствительностью для обнаружения вируса бороздчатости древесины яблони методом ПЦР в реальном времени.

Предлагаемое техническое решение позволяет повысить чувствительность детекции, а также избежать проблем, связанных с контаминацией рабочего пространства продуктами амплификации.

Дизайн праймеров проводили с помощью выравнивания последовательностей нуклеотидов, депонированных в базе данных NCBI c использованием алгоритма ClustalW. Помимо последовательностей нуклеотидов ASGV, для выравнивания использовались последовательности нуклеотидов близкородственных видов. Наиболее вариабельным и пригодным для подбора праймеров был фрагмент гена белка оболочки. На рис. 1 приведены выравнивания фрагментов генов белка оболочки ASGV и близкородственных вирусов, использованных для подбора праймеров.

В результате проведённого биоинформатического анализа был проведён дизайн олигонуклеотидов: прямого праймера (Seq1), обратного праймера (Seq2) и флуоресцентно-меченого зонда (Seq3).

Оценку специфичности тест-системы проводили с использованием заражённых образцов листьев и коры яблони, предоставленных сотрудниками Ставропольского государственного аграрного университета. Диагностика проводилась визуально с использование контрольных (не заражённых) растений в качестве референсов.

Ниже приведены результаты ПЦР-анализа 18 образцов растений яблони.

Табл. 1. Результаты ПЦР-анализа специфичности используемых систем.

№ образца Материал Зараженность ASGV, данные визуального осмотра Результат ПЦР, +/- (Cq) 1 Яблоня, лист Не заражен - 2 Яблоня, лист Не заражен - 3 Яблоня, лист Заражен + 4 Яблоня, лист Заражен + 5 Яблоня, лист Заражен + 6 Яблоня, лист Не заражен + 7 Яблоня, лист Не заражен - 8 Яблоня, лист Заражен + 9 Яблоня, лист Не заражен - 10 Яблоня, лист Заражен + 11 Яблоня, лист Не заражен - 12 Яблоня, лист Не заражен - 13 Яблоня, лист Не заражен - 14 Яблоня, лист Заражен + 15 Яблоня, лист Не заражен - 16 Яблоня, лист Не заражен - 17 Яблоня, кора Заражен + 18 Яблоня, кора Не заражен -

Продукты ПЦР, полученные в результате амплификации фрагмента ДНК «положительных» образцов были проклонированы в плазмидный вектор pAL2T (схема вектора приведена на рис. 2). Соответствие проклонированной последовательности фрагменту генома ASGV подтверждали с помощью секвенирования по методу Сэнгера. Для вектора, содержащего вставку специфического продукта (pAL2T-ASGV, Seq4), было проведено определение концентрации с использованием флуориметра QUBIT. Плазмида pAL2T-ASGV затем использовалась в качестве положительного контрольного образца.

Чувствительность тест-системы определяли с использованием последовательных десятикратных разведений плазмиды pAL2T-ASGV.

Табл. 2. Определение чувствительности тест-системы

Матрица Количество, нг/реакцию Число геном-эквивалентов/реакцию Результат ПЦР, Cq pAL2T-ASGV 3.5 1*109 + (7,1) pAL2T-ASGV 3.5*10-1 1*108 + (9,5) pAL2T-ASGV 3.5*10-2 1*107 + (12,6) pAL2T-ASGV 3.5*10-3 1*106 + (14,9) pAL2T-ASGV 3.5*10-4 1*105 + (18,8) pAL2T-ASGV 3.5*10-5 1*104 + (23,1) pAL2T-ASGV 3.5*10-6 1*103 + (25,7) pAL2T-ASGV 3.5*10-7 1*102 + (27,1) pAL2T-ASGV 3.5*10-8 1*101 + (30,4) pAL2T-ASGV 3.5*10-9 1*100 -

Зависимость сигнала ПЦР (пороговый цикл) от концентрации ДНК в реакционной пробирке, выраженной в количестве геном-эквивалентов, приведена на рис. 3. На рис. 4 показаны уровни флуоресцентного сигнала при ПЦР последовательных десятикратных разведений положительного контрольного образца.

Тест-системы для определения РНК вируса бороздчатости древесины яблони используются следующим образом.

Предварительно выделяют РНК из биологического материала любым подходящим методом. В настоящей работе использовался подход, основанный на использовании реагента TRIZOL с последующей очисткой смесью фенол:хлороформ и переосаждением этиловым спиртом.

Проводится реакция обратной транскрипции, для чего может быть использован термостат, либо ПЦР-амплификатор.

Для проведения реакции используют готовую смесь для амплификации, состоящую из буфера, дезоксинуклеозидтрифосфатов, олигонуклеотидных праймеров, флуоресцентно-меченого зонда, Taq-полимеразы. Готовую реакционную смесь смешивают с образцами кДНК, положительным контрольным образцом и отрицательным контрольным образцом. ПЦР проводили в амплификаторе ДТ96 по следующей программе аплификации с детекцией в каналах FAM и HEX: 94°C - 90 сек 1 цикл; 94°C - 30 сек, 60°С - 30 сек - 5 циклов; 94°С - 10 сек, 60°С - 30 сек - 45 циклов.

Результат, для конкретного образца, считается положительным образца при превышении порового уровня флуоресценции в канале FAM выше определённого уровня. При этом. Пороговый уровень флуоресценции определяется программным обеспечением оборудования.

Для апробации разработанной тест-системы сотрудниками Ставропольского государственного аграрного университета было передано 6 образцов листьев яблони (вместе с черешками), выделенных в различных хозяйствах в разных районах Ставропольского края. Для проведения анализа на первом этапе проводилось выделение РНК. Для этого зелёную массу листьев гомогенизировали в 1 мл реагента TRIZOL (Ambion, Германия), после чего к гомогенату добавляли 0.3 мл хлороформа, центрифугировали 10 мин при 13400 об/мин, к верхней фазе добавляли 500 мкл изпропанола, инкубировали 10 мин во льду. После чего повторно центрифугировали 10 мин при 13400 об/мин, удаляли надосадочную жидкость, осадок промывали 75 % этанолом, после чего растворяли в 50 мкл деионизированной воды. Полученные РНК использовали для обратной транскрипции, которую проводили с использованием набора MMLV RT kit (Евроген, Россия) по протоколу производителя. Полученные кДНК использовали в качестве матриц в ПЦР в реальном времени с использованием разработанных специфических праймеров и зонда. ПЦР и анализ результатов проводили по протоколам, приведённым выше. В таблице 3 приведены результаты ПЦР-анализа.

Табл. 3. Результаты ПЦР-анализа образцов, переданных из Ставропольского государственного аграрного университета

Образец Происхождение Матрица Результат ПЦР, Cq Яблоня, лист Ставропольский край, Александровский район кДНК - Яблоня, лист Ставропольский край, Новоселицкий район кДНК - Яблоня, лист+черенок Ставропольский край, Александровский район кДНК - Яблоня, лист+черенок Ставропольский край, Новоалександровский район кДНК + (23.1) Яблоня, лист Ставропольский край, Новоалександровский район кДНК - Яблоня, лист Ставропольский край, Шпаковский район кДНК -

Как видно из полученных данных, 1 из 6 переданных образцов заражён ASGV. Достоверность полученных данных была подтверждена секвенированием продуктов амплификации, показавшим соответствие их нуклеотидных последовательностей структурам специфического фрагмента ASGV.

По результатам проведённого исследования были предложены рекомендации по принятию мер фитосанитарного контроля. В частности, рекомендовано не использовать зараженные растения в качестве посадочного и/или прививочного материала; желательно утилизировать уже собранный материал.

Перечень используемых нуклеотидных последовательностей

Seq1

Олигонуклеотид: прямой праймер

Наименование: ASGVF

Последовательность (5’-3’): AGRCGCCACCGGGTAGG

В структуру входит вырожденный нуклеотид R=G или А

Seq2

Олигонуклеотид: обратный праймер

Наименование: ASGVR

Последовательность (5’-3’): CCTTCRAARCTTTCACCTTCTTTRA

В структуру входят вырожденные нуклеотиды: R=G или А

Seq3

Олигонуклеотид: флуоресецнтно-меченый зонд

Наименование: ASGVT

Последовательность (5’-3’): (BHQ1) - TGGAGTCCATCTT(FAMdT)CGCGARCATAGC

В структуру входят вырожденные нуклеотиды: R=G или А

В структуру входят флуорофор 6-карбоксифлуоресцеин (6-FAM) и гаситель флуоресценции Black Hole Quencher 1 (BHQ1)

Seq4

Специфический продукт амплификации, представляющий собой фрагмент гена белка оболочки вируса бороздчатости древесины яблони, проклонированный в плазмидный вектор pAL2T, длина 109 п.о.

Последовательность (5’-3’): AGGCGCCACCGGGTAGGAGTGTATCTGTGGAAGACCCATATAGACCCGGCAAAGGAACTTCTGACGGTTCCTCCCCCTGAATCATTCAAAGAAGGTGAAAGCTTTGAAGG

Список литературы

1. Paduch-Cichal E., Tomala K. Detection of Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV) and Apple stem grooving virus (ASGV) in different tissues of ‘mustu’ apple cultivar trees by ELISA. Phytopathologia Polonica 2007, 43, 53-59.

2. Метлицкая К.В., Упадышев М.Т., Петрова А.Д. Диагностика вредоносных вирусов на сортах яблони в Московской области. Сборник научных работ «Плодоводство и ягодоводство России», Методы и способы защиты растений от вредителей и болезней 2018, Т. 55, 271-274.

3. Кузмицкая П.В., Урбанович О.Ю., Козловская З.А. Идентификация вируса хлоротической пятнистости листьев яблони методом ОТ-ПЦР. Молекулярная и прикладная генетика 2013, 15, 26-32.

4. Kinard G.R., Scott S. W. Detection of Apple chlorotic leaf spot and Apple stem grooving viruses using RT-PCR. Plant Disease 1996, 80, 616-621.

5. Kundu J.K. The occurrence of Apple stem pitting virus and Apple stem grooving virus within field-grown apple cultivars evaluated by RT-PCR. Plant Protection Science 2003, 39, 88-92.

6. Kundu J.K. The application of RT-PCR assay for the detection of Apple stem pitting virus and Apple stem grooving virus in four apple cultivars. Plant Protection Science 2002, 38, 13-17.

7. Park H., Yoon J., Kim H., Baek K. Multiplex RT-PCR assay for the detection of Apple stem grooving virus and apple chlorotic leaf spot virus in infected Korean apple cultivars. Plant Pathology Journal 2006, 22, 168-173.

8. Ma X., Bao J., Li J., Cheng X., Tahir M.M., Liu M., Lu X., Wang M., Hamborg Z., Zhang D. Rapid detection of apple stem grooving virus from reverse transcription recombinase polymerase amplification with a lateral flow dipstick (RT-RPA-LFD). Fruit Research 2023, 3, 22.

9. Canales C., Morán F., Olmos A., Ruiz-García A.B. First detection and molecular characterization of Apple stem grooving virus, Apple chlorotic leaf spot virus and Apple hammerhead viroid in Loquat in Spain. Plants 2021, 10, 2293.

10. Nickel O., Fajardo T.V.M. Detection of viruses in apples and pears by real time RT-PCR using 5’-hydrolysis probes. Journal of Plant Pathology 2014, 96, 207-213.

--->

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>

<!DOCTYPE ST26SequenceListing PUBLIC "-//WIPO//DTD Sequence Listing

1.3//EN" "ST26SequenceListing_V1_3.dtd">

<ST26SequenceListing dtdVersion="V1_3" fileName="ТЕСТ-СИСТЕМА ДЛЯ

ОБНАРУЖЕНИЯ ВИРУСА БОРОЗДЧАТОСТИ ДРЕВЕСИНЫ ЯБЛОНИ МЕТОДОМ ПЦР В

РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ.xml" softwareName="WIPO Sequence"

softwareVersion="2.2.0" productionDate="2024-08-13">

<ApplicationIdentification>

<IPOfficeCode>RU</IPOfficeCode>

<ApplicationNumberText>ТЕСТ-СИСТЕМА ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ ВИРУСА

БОРОЗДЧАТОСТИ ДРЕВЕСИНЫ ЯБЛОНИ МЕТОДОМ ПЦР В РЕАЛЬНОМ

ВРЕМЕНИ</ApplicationNumberText>

<FilingDate></FilingDate>

</ApplicationIdentification>

<ApplicantFileReference>ТЕСТ-СИСТЕМА ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ ВИРУСА

БОРОЗДЧАТОСТИ ДРЕВЕСИНЫ ЯБЛОНИ МЕТОДОМ ПЦР В РЕАЛЬНОМ

ВРЕМЕНИ</ApplicantFileReference>

<ApplicantName languageCode="ru">Федеральное государственное

бюджетное учреждение науки Государственный научный центр Российской

Федерации Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина

и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук</ApplicantName>

<ApplicantNameLatin>Shemyakin-Ovchinnikov Institute of Bioorganic

Chemistry</ApplicantNameLatin>

<InventionTitle languageCode="ru">ТЕСТ-СИСТЕМА ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ

ВИРУСА БОРОЗДЧАТОСТИ ДРЕВЕСИНЫ ЯБЛОНИ МЕТОДОМ ПЦР В РЕАЛЬНОМ

ВРЕМЕНИ</InventionTitle>

<SequenceTotalQuantity>4</SequenceTotalQuantity>

<SequenceData sequenceIDNumber="1">

<INSDSeq>

<INSDSeq_length>17</INSDSeq_length>

<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>

<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>

<INSDSeq_feature-table>

<INSDFeature>

<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>

<INSDFeature_location>1..17</INSDFeature_location>

<INSDFeature_quals>

<INSDQualifier>

<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>

<INSDQualifier_value>unassigned DNA</INSDQualifier_value>

</INSDQualifier>

<INSDQualifier id="q2">

<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>

<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>

</INSDQualifier>

</INSDFeature_quals>

</INSDFeature>

</INSDSeq_feature-table>

<INSDSeq_sequence>agrcgccaccgggtagg</INSDSeq_sequence>

</INSDSeq>

</SequenceData>

<SequenceData sequenceIDNumber="2">

<INSDSeq>

<INSDSeq_length>25</INSDSeq_length>

<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>

<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>

<INSDSeq_feature-table>

<INSDFeature>

<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>

<INSDFeature_location>1..25</INSDFeature_location>

<INSDFeature_quals>

<INSDQualifier>

<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>

<INSDQualifier_value>unassigned DNA</INSDQualifier_value>

</INSDQualifier>

<INSDQualifier id="q4">

<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>

<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>

</INSDQualifier>

</INSDFeature_quals>

</INSDFeature>

</INSDSeq_feature-table>

<INSDSeq_sequence>ccttcraarctttcaccttctttra</INSDSeq_sequence>

</INSDSeq>

</SequenceData>

<SequenceData sequenceIDNumber="3">

<INSDSeq>

<INSDSeq_length>25</INSDSeq_length>

<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>

<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>

<INSDSeq_feature-table>

<INSDFeature>

<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>

<INSDFeature_location>1..25</INSDFeature_location>

<INSDFeature_quals>

<INSDQualifier>

<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>

<INSDQualifier_value>unassigned DNA</INSDQualifier_value>

</INSDQualifier>

<INSDQualifier id="q6">

<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>

<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>

</INSDQualifier>

</INSDFeature_quals>

</INSDFeature>

</INSDSeq_feature-table>

<INSDSeq_sequence>tggagtccatcttcgcgarcatagc</INSDSeq_sequence>

</INSDSeq>

</SequenceData>

<SequenceData sequenceIDNumber="4">

<INSDSeq>

<INSDSeq_length>110</INSDSeq_length>

<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>

<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>

<INSDSeq_feature-table>

<INSDFeature>

<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>

<INSDFeature_location>1..110</INSDFeature_location>

<INSDFeature_quals>

<INSDQualifier>

<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>

<INSDQualifier_value>unassigned DNA</INSDQualifier_value>

</INSDQualifier>

<INSDQualifier id="q8">

<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>

<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>

</INSDQualifier>

</INSDFeature_quals>

</INSDFeature>

</INSDSeq_feature-table>

<INSDSeq_sequence>aggcgccaccgggtaggagtgtatctgtggaagacccatatagacccgg

caaaggaacttctgacggttcctccccctgaatcattcaaagaaggtgaaagctttgaagg</INSDSeq

_sequence>

</INSDSeq>

</SequenceData>

</ST26SequenceListing>

<---

Похожие патенты RU2835202C1

название год авторы номер документа
ТЕСТ-СИСТЕМА ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ ВИРУСА ХЛОРОТИЧЕСКОЙ ПЯТНИСТОСТИ ЛИСТЬЕВ ЯБЛОНИ МЕТОДОМ ПЦР В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ 2024
  • Стахеев Александр Александрович
  • Рязанцев Дмитрий Юрьевич
  • Самохвалова Лариса Вадимовна
  • Завриев Сергей Кириакович
  • Величко Виталий Юрьевич
  • Селиванова Мария Владимировна
RU2835209C1
СПОСОБ ЭКСТРАКЦИИ РНК ИЗ РАСТИТЕЛЬНЫХ ОБРАЗЦОВ 2008
  • Упадышев Михаил Тарьевич
  • Походенко Павел Алексеевич
  • Саунина Ирина Ивановна
RU2389795C1
Способ дифференциации генома вакцинного штамма "ВНИИЗЖ" от полевых изолятов вируса бешенства методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени с анализом пиков температур плавления ампликонов и применением асимметричного красителя SYBR Green 2023
  • Доронин Максим Игоревич
  • Малыгин Максим Павлович
  • Михалишин Дмитрий Валерьевич
  • Чвала Илья Александрович
  • Борисов Алексей Валерьевич
  • Прохватилова Лариса Борисовна
  • Ручнова Ольга Ивановна
RU2822037C1
НАБОРЫ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ-ПРАЙМЕРОВ И ЗОНДОВ, БИОЛОГИЧЕСКИЙ МИКРОЧИП И ТЕСТ-СИСТЕМА ДЛЯ ИДЕНТИФИКАЦИИ И ТИПИРОВАНИЯ ВИРУСА ГРИППА А И В С ИХ ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ 2013
  • Кривенчук Николай Андреевич
  • Антонов Николай Александрович
  • Майданюк Валерий Григорьевич
  • Шестопалов Александр Михайлович
  • Алексеев Александр Юрьевич
  • Суслопаров Иван Михайлович
  • Гуляева Марина Александровна
RU2538168C2
Набор олигодезоксирибонуклеотидных праймеров и флуоресцентно-меченого зонда для идентификации РНК JMTV методом ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией 2023
  • Лутковский Роман Юрьевич
  • Кривошеина Екатерина Ильинична
  • Терновой Владимир Александрович
RU2818960C1
Набор олигонуклеотидных праймеров для выявления РНК вируса желтой лихорадки методом изотермической амплификации в режиме реального времени 2024
  • Кривошеина Екатерина Ильинична
RU2824209C1
НАБОР ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫХ ПРАЙМЕРОВ И ФЛУОРЕСЦЕНТНО-МЕЧЕНЫХ ЗОНДОВ ДЛЯ СУБТИПОСПЕЦИФИЧНОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ РНК ВИРУСА ДЕНГЕ НА ОСНОВЕ МУЛЬТИПЛЕКСНОЙ ПЦР В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ 2012
  • Берилло Сания Александровна
  • Терновой Владимир Александрович
  • Сергеева Елена Игоревна
  • Шиков Андрей Николаевич
  • Демина Ольга Константиновна
  • Агафонов Александр Петрович
  • Сергеев Александр Николаевич
RU2483115C1
НАБОР ВЫСОКОСПЕЦИФИЧНЫХ ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫХ ПРАЙМЕРОВ И ЗОНДОВ ДЛЯ ДЕТЕКЦИИ И ДИФФЕРЕНЦИАЦИИ ВИРУСОВ АЧС, КЧС И ВД 2024
  • Равилов Рустам Хаметович
  • Зубринкин Данил Александрович
  • Галеева Антонина Глебовна
  • Хаммадов Наиль Ильдарович
  • Мингалеев Данил Наильевич
  • Ефимова Марина Анатольевна
  • Хаертынов Камил Саубанович
  • Хисамутдинов Алмаз Гаптраупович
  • Гарипов Ленар Наильевич
RU2828887C1
СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ ВИРУСА ЛЕЙКОЗА КРС ПО НУКЛЕОТИДНЫМ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЯМ КОНСЕРВАТИВНЫХ ОБЛАСТЕЙ ВИРУСНОГО ГЕНОМА 2012
  • Косовский Глеб Юрьевич
  • Климов Евгений Александрович
  • Горюнов Денис Валерьевич
  • Сиволапова Анастасия Борисовна
RU2521330C2
Набор реагентов для обнаружения возбудителей клещевых нейроинфекций 2022
  • Комаровский Юрий Юрьевич
  • Ольховский Игорь Алексеевич
  • Горбенко Алексей Сергеевич
  • Столяр Марина Александровна
  • Васильева Дарья Ивановна
  • Кузнецова Надежда Николаевна
RU2800261C1

Иллюстрации к изобретению RU 2 835 202 C1

Реферат патента 2025 года ТЕСТ-СИСТЕМА ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ ВИРУСА БОРОЗДЧАТОСТИ ДРЕВЕСИНЫ ЯБЛОНИ МЕТОДОМ ПЦР В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ

Изобретение относится к молекулярной биологии. Изобретение представляет собой тест-систему для обнаружения вируса бороздчатости древесины яблони методом ПЦР в реальном времени. Тест-система включает: смесь для проведения амплификации, состоящую из реакционного буфера, дезоксинуклеотидтрифосфатов, двух олигонуклеотидных праймеров, специфичных к фрагменту гена, кодирующего белок оболочки вируса, одного олигонуклеотидного зонда, меченного флуоресцентным красителем FAM. Смесь также включает положительный контрольный образец, представляющий собой рекомбинантную плазмидную ДНК, содержащую соответствующий фрагмент генома вируса. Изобретение позволяет проводить высокоспецифичную идентификацию ДНК вируса бороздчатости древесины яблони с высокой чувствительностью. 4 ил., 3 табл.

Формула изобретения RU 2 835 202 C1

Тест-система для обнаружения вируса бороздчатости древесины яблони ASGV, включающая смесь для проведения амплификации, состоящую из реакционного буфера, дезоксинуклеотидтрифосфатов, двух олигонуклеотидных праймеров Seq1 и Seq2, специфичных к фрагменту гена, кодирующего белок оболочки вируса, одного олигонуклеотидного зонда Seq3, меченного флуоресцентным красителем FAM, положительного контрольного образца, представляющего собой рекомбинантную плазмидную ДНК Seq4, содержащую соответствующий фрагмент генома вируса.

Документы, цитированные в отчете о поиске Патент 2025 года RU2835202C1

Аппарат для регистрации артериального и венозного давления 1932
  • Занчевский Д.И.
SU33634A1
CN 107794311 A, 13.03.2018
RU 2001108572 A, 20.08.2004.

RU 2 835 202 C1

Авторы

Стахеев Александр Александрович

Рязанцев Дмитрий Юрьевич

Габриелян Назик Григоровна

Завриев Сергей Кириакович

Величко Виталий Юрьевич

Ситников Владимир Николаевич

Даты

2025-02-24Публикация

2024-08-21Подача