Н-ФОСФОНАТЫ ГИДРОКСИЛСОДЕРЖАЩИХ СТЕРОИДОВ В КАЧЕСТВЕ РЕАГЕНТА ДЛЯ ТВЕРДОФАЗНОГО СИНТЕЗА СТЕРОИДНЫХ ПРОИЗВОДНЫХ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ ИЛИ ИХ АНАЛОГОВ Российский патент 1994 года по МПК C07J9/00 

Описание патента на изобретение RU2009147C1

Изобретение относится к биорганической химии, а именно к новым химическим соединениям - Н-фосфонатам гидроксилсодержащих стероидов общей формулы I XO--H где X - остаток гидроксилсодержащего стероида,
например:
холестерина (Chs)
тестостерона (TS) которые могут быть использованы как исходные реагенты для твердофазного синтеза стероидных производных олигонуклеотидов и их аналогов.

Известен лишь один пример твердофазного синтеза холестеринсодержащих олигонуклеотидов, основанный на использовании 2-(холестерилоксикарбониламино)этиламина формулы II [1] NH(CH2)2NH-O-холестерин который получают из холестерилхлорформиата и этилендиамина (выход - 76% ). С помощью этого реагента получен ряд олигодезоксирибонуклеотидов с остатком холестерина, связанным с 31-концевым межнуклеотидным фосфатом. Выход холестеринсодержащего олигонуклеотида - 50% .

Недостатком данного метода является сравнительно низкий выход стероидных производных олигонуклеотидов, а также то, что межнуклеотидная связь, содержащая холестериновый остаток, существует в виде R- и S-стереоизомеров по атому фосфора, различающихся по своим физико-химическим свойствам, в частности, образующих комплексы различной устойчивости с нуклеиновыми кислотами.

Твердофазный синтез олигонуклеотидов и их аналогов является в настоящее время наиболее широко используемым методом вследствие своей быстроты и эффективности. Испытания стероидных производных олигонуклеотидов в клеточных системах показали их перспективность в качестве средств подавления развития вирусов. Поэтому весьма актуальной задачей является повышение выхода стероидных производных олигонуклеотидов и их аналогов при твердофазном синтезе этих производных.

Указанная задача решается тем, что в качестве реагента для твердофазного синтеза стероидсодержащих олигонуклеотидов и их аналогов используют новые химические соединения - Н-фосфонаты гидроксилсодержащих стероидов формулы 1, которые получают из соответствующих стероидов обработкой триимидазолидом фосфора с последующим гидролизом водой и выделением хроматографией на силикагеле.

Синтезированные Н-фосфонаты гидроксилсодержащих стероидов были использованы в качестве реагентов для твердофазного синтеза стероидных производных олигонуклеотидов дезоксирибо-ряда, рибо-ряда и 21-0-метилрибо-ряла, предварительно полученных твердофазным Н-фосфонатным методом. Полученные результаты подтверждают возможность твердофазного синтеза стероидных производных олигонуклеотидов с использованием данного реагента, при этом выход целевых продуктов составляет 80-90% . Проведение реакции в твердофазном варианте существенно облегчает процедуру избытка реагентов и может быть легко автоматизировано.

П р и м е р 1. Синтез Н-фосфонатов гидроксилсодержащих стероидов.

а) Синтез Н-фосфоната холестерина.

Колбу заполняют аргоном 1,2 г (17,5 ммоль) имидазола, предварительно высушенного над P2O5 при 1-2 мм рт. ст. , растворяют в 60 мл абс. ацетонитрила и охлаждают льдом. Затем при перемешивании добавляют 0,35 мл (5,25 ммоль) PCl3 и 1,5 мл (18 ммоль) триэтиламина. Через 15 мин по каплям добавляют раствор предварительно высушенного холестерина (0,5 г, 1,25 ммоль) в 60 мл абс. хлороформа в течение 30 мин, затем охлаждение убирают и продолжают перемешивание еще 2 ч. За ходом реакции следят с помощью тонкослойной хроматографии (ТСХ) в системе хлороформ - этанол (9: 1). Затем реакционную смесь разлагают добавлением 15 мл воды и упаривают досуха. Смесь растворяют в хлороформе (75 мл), экстрагируют водой (2 x 50 мл). Органическую фазу после отделения высушивают безводным Na2SO4, упаривают и хроматографируют на силикагеле (колонка 150 мл, градиент концентрации этанола (0 -> 50% ) в хлороформе, содержащем 1% триэтиламина). Фракции, содержащие продукт с Rf = = 0,23 (ТСХ, система хлороформ - этанол 6: 4), упаривают досуха. Выход 0,6 г (85% ).

Продукт гомогенен по данным ТСХ и дает положительный нингидриновый тест.

ИК-спектр, см-1: 1000, 1060, 1090 (цикл), 1240 (Р= О), 1340 (-СН), 1460 (С-СН3), 1600 (С= С), 2400, 2500 (Р-ОН), 2690 (Р-Н), 2860, 2950 (-СН2-, -СН3, С-Н).

31Р-ЯМР, δм.д. (CDCl3): 0,86 (J = 618 Гц)
1Н-ЯМР, δм.д. (CDCl3): 0,82 (S, 3Н, 13-CH3), 0,88 (S, H, -(CH3)2), 0,95 (S, 3H, 20-CH2), 1,31 (t, 9Н, СН3СН2-N), 0,8-2,40 (m, 3Н, цикл), 3,03 (g, 6H, CH3CH2-N), 3,94 (m, 3H, 10-CH3), 5,27 (Sm, 1H, 3-H), 6,98 (d, 1H, P-H (J = 618 Гц)), 8,35 (S, 1H, N-H).

Сигналы фосфорсодержащей части молекулы в ИК, 31Р- и 1Н-ЯМР-спектрах хорошо коррелируют с литературными данными [2] . Сигналы стероидной части молекулы в спектрах ИК- и 1Н-ЯМР также согласуются со справочными данными [3] .

б) Синтез Н-фосфоната тестостерона.

Синтез ведут аналогично описанному выше. Выход 0,49 г (69% ). Rf= 0,29 (ТСХ, система хлороформ-этанол 6: 4).

ИК-спектр, см-1: 1220 (P= O), 1460 (С-СН3), 1000-1100 (цикл), 1600 (С= С), 1680 (С= O), 2500 (P-OH), 2600 (P-H), 2800-3000 (C-H, -CH2, -CH3).

УФ-спектр (этанол): λmax 241 нм, lg ε = = 4,18.

31Р-ЯМР, δм.д. (CDCl3): 3,43 м. д. (J = 608 Гц).

1Н-ЯМР, δм.д. (CDCl3): 0,68 (S, 3H, 13-CH3), 1,34 (S, 3H, 10-CH3), 1,21 (t, 9H, CH3-CH2-N), 0,80-2,1 (m, 17H, цикл), 2,94 (g, 6H, CH3-CH2-N), 3,95 (m, 1H, 10-CH3), 5,57 (Sm, 1H, 17-Н), 6,68 (d, 1H, P-H (J = 608 Гц)), 8,11 (S, 1H, N-H).

Данные ИК, УФ и ЯМР согласуются с литературными данными [2-3] .

П р и м е р 2. Синтез стероидных производных олигонуклеотидов.

Для синтеза использованы полученные твердофазным методом на автоматическом синтезаторе "Виктория" [4] защищенные олигонуклеотиды в виде Н-фосфонатов, связанные по 31-концу с полимерным носителем и имеющие на 51-конце свободную оксигруппу.

а) Синтез холестеринового производного декатимидилата
ChSpT(pT)9
К высушенной навеске (8 мг, емкость 70 мкмоль/г по первому нуклеотидному звену, т. е. 0,5 мкмоль) полимер-связанного декатимидилата с Н-фосфонатными межнуклеотидными связями, добавляют 50 мкл абс. пиридина, 25 мкл абс. ацетонитрила, 25 мкл 0,1 М раствора (25 мкмоль) Н-фосфоната холестерина в хлороформе и 6 мкл (75 мкмоль) пивалоилхлорида. Смесь выдерживают 15 мин при комнатной температуре, промывают полимерный носитель пиридином, добавляют 100 мкл 0,2 М раствора I1 в смеси пиридин - вод (98: 2), выдерживают 30 мин и промывают ацетоном. Затем носитель обрабатывают 1 мл конц. NH4OH в течение 1 ч, раствор сливают, упаривают досуха, растворяют в 1 мл воды и наносят на колонку с ионообменным сорбентом. Выделенные фракции вновь упаривают, растворяют в воде и наносят на колонку с обращенной фазой. Условия хроматографии приведены в таблице. После выделения фракцию, содержащую целевой продукт, упаривают досуха, растворяют в 100 мкл воды и добавляют по каплям в 1 мл 2% -ного раствора LiClO4 в ацетоне. Выпавший осадок литиевой соли олигонуклеотида отделяют центрифугированием, промывают ацетоном и сушат при 14-2 мм рт. ст. Выход и характеристики полученного холестеринового производного декатимидилата приведены в таблице.

б) Синтез тестостеронового производного декатимидилата.

TSpT(pT)9
Синтез и выделение ведут аналогично описанному в примере 2а. Выход и характеристики целевого продукта приведены в таблице.

в) Синтез холестеринового производного декауридилата.

ChSpU(pU)9
Синтез ведут аналогично описанному в примере 2а, при этом в процедуру выделения вводят дополнительную стадию: полученный в результате ионообменной и обращенно-фазовой хроматографии стероидсодержащий олигонуклеоимд с тетрагидропиранильными защитными группами в 21-положении рибозы обрабатывают 1 мл 0,01 М HCl в течение 2 ч при 50оС. Затем раствор нейтрализуют конц. NH4OH, упаривают досуха и растворяют в 1 мл воды. Затем наносят на колонку с обращенной фазой (условия хроматографии приведены в таблице) и после хроматографии выделяют целевой продукт аналогично описанному в примере 2а. Выход и характеристики продукта приведены в таблице.

г) Синтез тестостеронового производного декауридилата.

TSpU(pU)9
Синтез и выделение ведут аналогично описанному в примере 2в. Результаты приведены в таблице.

д) Синтез холестеринового производного дека(21-0-метилуридилата)
ChSpUm(pUm)9
Синтез и выделение ведут аналогично описанному в примере 2а. Результаты приведены в таблице.

е) Синтез тестостеронового производного дека(21-0-метилуридилата)
TSpUm(pUm)9
Синтез и выделение ведут аналогично описанному в примере 2а.

Результаты приведены в таблице. (56) Letsinger R. L. , Zhang G. , Sun D. K. , Ikeuchi T. , Sarin P. S. PNAS, 1989, v. 86, N 17, p. 6553-6556.

Garegg P. J. , Regberg T. , Stawinski J. Chem. Ser. 1986, v. 26, N 1, p. 59-62.

The Sadtler Standard Spectra. Philadelphia Sadtler research Lab. 1966-1988.

Веньяминова А. Г. , Левина А. С. , Репкова М. Н. , Ченцова Н. А. Биоорганическая химия: 1989, т. 15, N 6, с. 844-847.

Похожие патенты RU2009147C1

название год авторы номер документа
3'-ФОСФАТ, N, P-НЕЗАЩИЩЕННЫЕ ФОСФОТИОАТНЫЕ ОЛИГОДЕЗОКСНУКЛЕОТИДЫ В КАЧЕСТВЕ ИСХОДНЫХ СОЕДИНЕНИЙ ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ ФОСФОТИОАТНЫХ, ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫХ РЕАГЕНТОВ ДЛЯ БИОТЕХНОЛОГИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОВ, ФОСФОТИОАТНЫЕ ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫЕ ПРОИЗВОДНЫЕ, СОДЕРЖАЩИЕ 3'- И/ИЛИ 5'-СВЯЗАННЫЕ ХИМИЧЕСКИЕ ГРУППИРОВКИ В КАЧЕСТВЕ ФОСФОТИОАТНЫХ ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫХ РЕАГЕНТОВ ДЛЯ БИОТЕХНОЛОГИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОВ И СПОСОБ ИХ ПОЛУЧЕНИЯ 1994
  • Амирханов Н.В.
  • Зарытова В.Ф.
RU2069214C1
СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ДЕЗОКСИНУКЛЕОЗИД-5'-ТРИФОСФАТОВ 1994
  • Богачев В.С.
RU2080325C1
СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ НАТРИЕВОЙ СОЛИ 2-НИТРО-4-СУЛЬФОФЕНИЛОВОГО ЭФИРА БИОТИНА 1996
  • Беклемишев А.Б.
  • Пичко Н.П.
  • Карягин А.Ю.
RU2102395C1
СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ БИОТИНМЕЧЕННЫХ ОЛИГОДЕЗОКСИРИБОНУКЛЕОТИДОВ 1994
  • Годовикова Т.С.
  • Орлова Т.Н.
  • Абрамова Т.В.
  • Куликова В.Ф.
  • Залите И.К.
  • Медведкин В.Н.
RU2083584C1
СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ 3'-ФОСФАТ,N,P-НЕЗАЩИЩЕННЫХ ФОСФОТИОАТНЫХ АНАЛОГОВ ОЛИГОДЕЗОКСИРИБОНУКЛЕОТИДОВ 1997
  • Амирханов Н.В.
RU2131881C1
СПОСОБ ИНГИБИРОВАНИЯ РЕПРОДУКЦИИ ВИРУСА ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА 1997
  • Плясунова О.А.
  • Покровский А.Г.
  • Сметанников А.А.
  • Федюк Н.В.
  • Зарытова В.Ф.
  • Иванова Е.М.
  • Пышный Д.В.
  • Пышная И.А.
  • Воробьев П.Е.
RU2136752C1
СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ПРОИЗВОДНЫХ ДЕЗОКСИТИОНУКЛЕОТИДОВ 1987
  • Амирханов Н.В.
SU1487425A3
ПИРАЗОЛИДЫ ЦИКЛОПРОПАНКАРБОНОВЫХ КИСЛОТ В ВИДЕ СМЕСИ ДИАСТЕРЕОМЕРОВ В КАЧЕСТВЕ ПРОМЕЖУТОЧНЫХ СОЕДИНЕНИЙ ПРИ ПОЛУЧЕНИИ ПИРЕТРОИДОВ 1995
  • Попов С.А.
  • Ткачев А.В.
RU2095351C1
1S,3R-2,2-ДИМЕТИЛ-3-(2-МЕТИЛ-2-ОКСИПРОПИЛ)ЦИКЛОПРОПАНКАРБОНИТРИЛ В КАЧЕСТВЕ ПРОМЕЖУТОЧНОГО СОЕДИНЕНИЯ В СИНТЕЗЕ ПИРЕТРОИДНОГО ИНСЕКТИЦИДА-ДЕЛЬТАМЕТРИНА И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ПРОМЕЖУТОЧНОГО СОЕДИНЕНИЯ 1989
  • Рукавишников А.В.
  • Ткачев А.В.
RU1679761C
1,2,4-Оксадиазольные производные дезоксихолевой кислоты, обладающие простатопротекторным действием, гипохолестеринемической и противовоспалительной активностями 2020
  • Сорокина Ирина Васильевна
  • Попадюк Ирина Игоревна
  • Жукова Наталья Анатольевна
  • Низомов Сирожиддин Ашуралиевич
  • Мешкова Юлия Владимировна
  • Баев Дмитрий Сергеевич
  • Борисов Сергей Алкисович
  • Саломатина Оксана Владимировна
  • Толстикова Татьяна Генриховна
  • Салахутдинов Нариман Фаридович
RU2750488C1

Иллюстрации к изобретению RU 2 009 147 C1

Реферат патента 1994 года Н-ФОСФОНАТЫ ГИДРОКСИЛСОДЕРЖАЩИХ СТЕРОИДОВ В КАЧЕСТВЕ РЕАГЕНТА ДЛЯ ТВЕРДОФАЗНОГО СИНТЕЗА СТЕРОИДНЫХ ПРОИЗВОДНЫХ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ ИЛИ ИХ АНАЛОГОВ

Использование: в качестве реагента для твердофазного синтеза стероидных производных олигонуклеотидов. Сущность: продукт - Н-фосфонат гидроксилсодержащих стероидов общей ф-лы 1 , где X - остаток холестерина или тестостерона. Выход 69 - 89% . 1 табл.

Формула изобретения RU 2 009 147 C1

Н-Фосфонаты гидроксилсодержащих стероидов общей формулы
XO-H
где X - остаток холестерина или тестостерона,
в качестве реагента для твердофазного синтеза стероидных производных олигонуклеотидов или их аналогов.

RU 2 009 147 C1

Авторы

Веньяминова А.Г.

Сергеева З.А.

Баширова В.З.

Даты

1994-03-15Публикация

1991-02-08Подача