ГИБРИДНЫЙ РЕЦЕПТОРОТОКСИН S304 И ФРАГМЕНТ ДНК NS 304, КОДИРУЮЩИЙ ГИБРИДНЫЙ РЕЦЕПТОРОТОКСИН S 304 Российский патент 1997 года по МПК C12N15/12 C12N15/31 

Описание патента на изобретение RU2096458C1

Изобретение относится к биотехнологии, генной инженерии и вирусологии и представляет собой гибридный полипептид рецепторотоксин, в котором токсическая часть представляет собой А-фрагмент и неполный B-фрагмент дифтерийного токсина (DT), а рецепторная часть N-концевой фрагмент CD4-рецептора Т-лимфоцитов человека. Полипептид проявляет антивирусную (вирус иммунодефицита человека (ВИЧ)) активность в системе in vitro и является потенциальным терапевтическим агентом при синдроме приобретенного иммунодефицита, вызываемого ВИЧ. ВИЧ при попадании в организм человека поражает клетки иммунной системы (Т-лимфоциты, моноциты и макрофаги) и клетки центральной нервной системы. Основным путем проникновения ВИЧ в клетку является взаимодействие гликопротеина оболочки вируса gp120 с CD4-рецептором. В этом взаимодействии ключевую роль играют первые два иммуноглобулинподобных домена CD4, расположенных на N-конце молекулы (первые 180 аминокислот) (Nature, 312, 159 161, 1988; 331, 82 84, 1988). На поверхности зараженной клетки экспрессируется gp120 ВИЧ. Показано, что различные растворимые рекомбинантные формы CD4-рецептора, связываясь с ВИЧ, ингибируют как процесс проникновения вируса в чувствительные клетки, так и вирусиндуцированное образование синцитий (Nature, 331, 76 78, 1988; 331, 78 81, 1988). Это предполагает, что различные рекомбинантные формы CD4-рецептора могут быть потенциальными антивирусными агентами при лечении ВИЧ-инфекции. Действие рецепторотоксина основано не только на конкурентном связывании ВИЧ, но и на направленном элиминировании зараженных клеток, так как на поверхности последних экспрессируется вирусный гликопротеин gp120. Например, было показано, что рецепторотоксин на основе CD4-рецептора и экзотоксина А из Pseudomonas aeruginosa блокирует развитие ВИЧ-инфекции in vitro и активен против клеток, экспрессирующих гликопротеины оболочки от различных ретровирусов иммунодефицита приматов (PNAS USA, 86, 9539 9543, 1989).

Дифтерийный токсин принадлежит к группе токсинов, способных инактивировать белоксинтезирующий аппарат эукариотической клетки. В DT каталитической активностью обладает N-концевая часть молекулы А-фрагмент (J. Biolog. Chem. 4265, 7331 7337, 1990).

Сущность данного технического решения состоит в том, что предложен оригинальный гибридный полипептид S304, состоящий из полипептида продукта фрагмента гена дифтерийного токсина и полипептида продукта фрагмента гена CD4-рецептора, обладающий анти-ВИЧ активностью in vitro; фрагмент ДНК, кодирующий полипептид S304.

Изобретение иллюстрируется следующими примерами.

Пример 1. Получение и экспрессия в Escherichia coli гибридного полипептида S304.

Гибридный полипептид синтезируется в бактериальной системе E. coli с использованием экспрессирующих плазмидных векторов. В качестве штаммов-продуцентов были использованы трансформированные экспрессирующими векторами производные штаммов TG1 и BL21(DE3). Внедрение плазмидной ДНК в клетки E. coli проводили путем их трансформации с использованием хлорида кальция (J. Mol. Biol. 166, 557 580, 1983).

Нуклеотидная последовательность ДНК, кодирующей гибридный полипептид, была получена путем объединения в составе экспрессирующих векторов последовательностей ДНК, кодирующих фрагменты CD4-рецептора и дифтерийного токсина. Из Т-лимфоцитов периферической крови человека выделяли ДНК (Eur. J. Biochem. 36, 32, 1973), которую затем амплифицировали с помощью цепной полимеразной реакции (Meth. Enzymol. 155, 335, 1987) с использованием олигодезоксирибонуклеотидных зондов: 5'-GCGAGATCTAGTGGAACTGACCTG-3' и 5'-GCGGGATCCTCCAGCTGAGACAC-3' и после обработки эндонуклеазами рестрикции BgIII и BaMHI выделяли из 1% -ной легкоплавкой агарозы фрагмент ДНК, кодирующий участок CD4-рецептора. Аналогичный метод использовали для выделения фрагмента ДНК, кодирующего участок DT. Олигодезоксирибонуклеотиды синтезировали аминофосфитным триэфирным методом в твердофазном варианте с использованием дезоксирибонуклеид-3'- О(β-цианэтил-N, N-диизопропиламино)фосфитов (Nucleic Acids Res. 12, 4539, 1984). Определенная методом Сэнгера (PNAS USA, 474, 15463 15467, 1977) первичная структура ДНК, кодирующей гибридный полипептид S304, представлена на фиг. 1.

Приведенная на фиг. 1 последовательность соответствует следующей аминокислотной последовательности, приведенной на фиг. 2.

В гибридном полипептиде присутствуют, таким образом, фрагменты двух белков: дифтерийного токсина и CD4-рецептора. Дифтерийный токсин представлен полным A-фрагментом и B-фрагментом без 50 C-концевых аминокислотных остатков и имеет следующую первичную структуру, приведенную на фиг. 3.

Фрагмент CD4 с Val 14 по Glu 152 представляет собой следующую полипептидную последовательность, приведенную на фиг. 4.

Пример 2. Приготовление лизатов клеток.

Ночную культуру клеток E. coli разводят в 100 раз свежей средой LB и выращивают при постоянной аэрации при 30oC. После достижения культурой оптической плотности 0,5 при длине волны 530 нм индуцируют экспрессию гибридных генов добавлением изопропилтиогалактозида до конечной концентрации 0,005% После индуцирующего воздействия культуру выращивают при 30oC и постоянной аэрации в течение 90 мин. Затем клетки собирают центрифугированием при 4000 об/мин в течение 15 мин и лизируют путем обработки ультразвуком в буфере, содержащем 20 мМ трис-HCl pH 8,0, 10 мМ EDTA и 2 мМ фенилметилсульфонилфторида.

Пример 3. Применение гибридного полипептида S304 в качестве ингибитора цитопатического действия вируса иммунодефицита человека в системе in vitro.

Степень ингибирования рекомбинантным рецепторотоксином цитопатического действия вируса иммунодефицита человека 1 типа определяют следующим образом. Сначала определяют токсичность бактериального лизата для линии клеток SEM (T-лимфоциты человека). Для этого суспензию клеток инкубируют на плашке с различными разведениями лизата в среде RPMI-1640. При этом исходная концентрация клеток составляет 0,5 млн./мл. Затем с использованием витального красителя (трепановой синий) проводят подсчет количества погибших и выживших клеток и выбирают такую концентрацию лизата, при которой нет отличия от клеточного контроля (КК клетки без лизата). При концентрации лизата 0,1 - 0,2 мг суммарного белка/мл не было отличий между опытом и КК ни в проценте погибших клеток (1 2%), ни в значении индекса пролиферации (около 2). Для определения антивирусной активности рекомбинантного рецепторотоксина клетки инкубируют в тех же условиях, добавляя бактериальный лизат, содержащий рецепторотоксин, до конечной концентрации 0,15 мг/мл и 1 ЦТД50 ВИЧ1 (цитотоксическая доза вируса для клеток линии SEM). В качестве контроля используют клеточный контроль (КК), вирусный контроль (ВК суспензия клеток SEM с вирусом без лизата) и контроль лизата (КЛ суспензия клеток SEM с вирусом с добавлением лизата бактерий E. coli, не экспрессирующих рекомбинантный рецепторотоксин, в концентрации 0,15 мг/мл). В контрольных лунках (ВК и КЛ) наблюдали более 30% погибших клеток, а в КК и опыте практически все клетки выжили (менее 1% погибших клеток). Таким образом, рекомбинантный рецепторотоксин практически полностью ингибирует цитопатическое действие вируса иммунодефицита человека in vitro.

Похожие патенты RU2096458C1

название год авторы номер документа
ПОЛИПЕПТИД Е 206, ПРЕДНАЗНАЧЕННЫЙ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АНТИТЕЛ К ВИРУСУ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА ВТОРОГО ТИПА, ФРАГМЕНТ ДНК НЕ 206, КОДИРУЮЩИЙ ПОЛИПЕПТИД Е 206, РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК РНЕ 206, КОДИРУЮЩАЯ ПОЛИПЕПТИД Е 206, ШТАММ БАКТЕРИЙ ESCHERICHIA COLI - ПРОДУЦЕНТ ПОЛИПЕПТИДА Е 206 1992
  • Зайцев И.З.
  • Суханова Л.Л.
  • Сазонов А.Э.
  • Карасева Е.В.
  • Алаторцева Г.И.
  • Гольцов В.А.
  • Анджапаридзе О.Г.
  • Гринев А.А.
  • Алаторцев В.Е.
  • Зверев В.В.
  • Полетаева Н.Н.
  • Блинов В.М.
  • Покровский В.В.
  • Суворова З.К.
  • Буравцова Е.В.
  • Красных В.Н.
  • Яковлев А.Г.
  • Амиантова И.И.
  • Пугач А.В.
  • Алексеев С.Б.
  • Чижова М.М.
  • Малюшова В.В.
RU2043412C1
БЕЛКОВЫЙ ХИМЕРНЫЙ РЕЦЕПТОР, ДНК, КОДИРУЮЩАЯ БЕЛКОВЫЙ ХИМЕРНЫЙ РЕЦЕПТОР 1994
  • Брайан Сид
  • Чарльз Ромео
  • Вальдемар Коланус
RU2158305C2
ПОЛИПЕПТИД 1106, ПРЕДНАЗНАЧЕННЫЙ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АНТИТЕЛ К ВИРУСУ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА ПЕРВОГО ТИПА, ФРАГМЕНТ ДНК Н 1106, КОДИРУЮЩИЙ ПОЛИПЕПТИД 1106, РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК РН 1106, КОДИРУЮЩАЯ ПОЛИПЕПТИД 1106, ШТАММ БАКТЕРИЙ ESCHERICHIA COLI - ПРОДУЦЕНТ ПОЛИПЕПТИДА 1106 1992
  • Суханова Л.Л.
  • Алаторцева Г.И.
  • Гольцов В.А.
  • Алаторцев В.Е.
  • Зверев В.В.
  • Полетаева Н.Н.
  • Блинов В.М.
  • Гринев А.А.
  • Красных В.Н.
RU2085586C1
ПОЛИПЕПТИД E 117, ПРЕДНАЗНАЧЕННЫЙ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АНТИТЕЛ К ВИРУСУ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА ПЕРВОГО ТИПА, ФРАГМЕНТ ДНК HE 117, КОДИРУЮЩИЙ ПОЛИПЕПТИД E 117, РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pHE 117, КОДИРУЮЩАЯ ПОЛИПЕПТИД E 117, ШТАММ БАКТЕРИЙ ESCHERICHIA COLI - ПРОДУЦЕНТ ПОЛИПЕПТИДА E 117 1992
  • Зайцев И.З.
  • Звонарев А.Ю.
  • Суханова Л.Л.
  • Сазонов А.Э.
  • Карасева Е.В.
  • Алаторцева Г.И.
  • Амиантова И.И.
  • Гольцов В.А.
  • Анджапаридзе О.Г.
  • Алаторцев В.Е.
  • Зверев В.В.
  • Полетаева Н.Н.
  • Блинов В.М.
  • Титаев А.В.
RU2043413C1
ПОЛИПЕПТИД G 103, ПРЕДНАЗНАЧЕННЫЙ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АНТИТЕЛ К ВИРУСУ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА ПЕРВОГО ТИПА, ФРАГМЕНТ ДНК HG 103, КОДИРУЮЩИЙ ПОЛИПЕПТИД G 103, РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pHG 103, КОДИРУЮЩАЯ ПОЛИПЕПТИД G 103, ШТАММ БАКТЕРИЙ ESCHERICHIA COLI - ПРОДУЦЕНТ ПОЛИПЕПТИДА G 103 1992
  • Зайцев И.З.
  • Звонарев А.Ю.
  • Суханова Л.Л.
  • Сазонов А.Э.
  • Карасева Е.В.
  • Алаторцева Г.И.
  • Амиантова И.И.
  • Гольцов В.А.
  • Анджапаридзе О.Г.
  • Алаторцев В.Е.
  • Зверев В.В.
  • Полетаева Н.Н.
  • Блинов В.М.
  • Титаев А.В.
RU2043414C1
ПОЛИПЕПТИЛ Р102, ПРЕДНАЗНАЧЕННЫЙ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АНТИТЕЛ К ВИРУСУ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА ПЕРВОГО ТИПА, ФРАГМЕНТ ДНК НР 102, КОДИРУЮЩИЙ ПОЛИПЕПТИД Р102, РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК РН А102, КОДИРУЮЩАЯ ПОЛИПЕПТИД Р102, ШТАММ БАКТЕРИЙ ESCHERICHIA COLI - ПРОДУЦЕНТ ПОЛИПЕПТИДА Р102 1992
  • Зайцев И.З.
  • Суханова Л.Л.
  • Алаторцева Г.И.
  • Гольцов В.А.
  • Гринев А.А.
  • Алаторцев В.Е.
  • Зверев В.В.
  • Полетаева Н.Н.
  • Блинов В.М.
  • Носкова О.В.
  • Лобанова А.Л.
  • Покровский В.В.
  • Суворова З.К.
  • Буравцова Е.В.
  • Красных В.Н.
RU2071502C1
Генетическая конструкция для экспрессии генов mNG_CD4-CXCR4, рекомбинантная плазмида rVSV_mNG_CD4-CXCR4 и рекомбинантный штамм вируса везикулярного стоматита rVSV_mNG_CD4-CXCR4, обеспечивающий таргетный виролизис клеток, экспонирующих на своей поверхности белки gp120/gp 41 ВИЧ-1 тропности X4 2021
  • Бочкарева Мария Дмитриевна
  • Иматдинов Ильназ Рамисович
  • Иматдинов Алмаз Рамисович
  • Сульгина Татьяна Владимировна
  • Тишин Антон Евгеньевич
  • Сульгин Александр Андреевич
  • Прудникова Елена Юрьевна
  • Гаврилова Елена Васильевна
  • Максютов Ринат Амирович
RU2768032C1
ПЕРЕНАПРАВЛЕНИЕ КЛЕТОЧНОГО ИММУНИТЕТА ПОСРЕДСТВОМ ХИМЕРНЫХ РЕЦЕПТОРОВ 1996
  • Брайен Сид
  • Чарльз Ромео
  • Вальдемар Коланус
RU2167676C2
СПОСОБ НАПРАВЛЕНИЯ КЛЕТОЧНОГО ИММУННОГО ОТВЕТА ПРОТИВ ВИЧ-ИНФИЦИРОВАННОЙ КЛЕТКИ МЛЕКОПИТАЮЩЕГО, БЕЛКОВЫЙ МЕМБРАННОСВЯЗАННЫЙ ХИМЕРНЫЙ РЕЦЕПТОР, ДНК 1995
  • Сид Брайан
  • Банапур Бабак
  • Ромео Чарльз
  • Коланус Вальдемар
RU2173167C2
Генетическая конструкция для экспрессии генов mNG_CD4-CCR5, рекомбинантная плазмида rVSV_mNG_CD4-CCR5 и рекомбинантный штамм вируса везикулярного стоматита rVSV_mNG_CD4-CCR5, обеспечивающий таргетный виролизис клеток, экспонирующих на своей поверхности белки gp120/gp41 ВИЧ-1 тропности R5 2021
  • Бочкарева Мария Дмитриевна
  • Иматдинов Ильназ Рамисович
  • Иматдинов Алмаз Рамисович
  • Сульгина Татьяна Владимировна
  • Тишин Антон Евгеньевич
  • Сульгин Александр Андреевич
  • Прудникова Елена Юрьевна
  • Гаврилова Елена Васильевна
  • Максютов Ринат Амирович
RU2769125C1

Иллюстрации к изобретению RU 2 096 458 C1

Реферат патента 1997 года ГИБРИДНЫЙ РЕЦЕПТОРОТОКСИН S304 И ФРАГМЕНТ ДНК NS 304, КОДИРУЮЩИЙ ГИБРИДНЫЙ РЕЦЕПТОРОТОКСИН S 304

Использование: биотехнология и медицина. Сущность: получение гибридного рецепторотоксина S304, состоящего из двух фрагментов. Первый фрагмент является фрагментом дифтерийного токсина, а второй - фрагментом CD4-рецептора Т-лимфоцитов человека. Гибридный белок ингибирует цитопатическое действие вируса иммунодефицита человека. Кроме того, сущность изобретения заключается в получении фрагмента ДНК NS304, кодирующего данный рецепторотоксин. 2 с.п. ф-лы, 4 ил.

Формула изобретения RU 2 096 458 C1

1. Гибридный рецепторотоксин S 304, полученный путем экспрессии в бактериальной системе E.coli, состоящий из фрагмента дифтерийного токсина и фрагмента CD4 рецептора Т-лимфоцитов человека, имеющий первичную структуру I, приведенную в конце текста формулы и подавляющий цитопатическое действие вируса иммунодефицита человека первого типа in vitro. 2. Фрагмент ДНК NS 304, кодирующий гибридный рецепторотоксин S 304 и имеющий первичную структуру II.

RU 2 096 458 C1

Авторы

Сидоров Александр Викторович

Здановский Алексей Геннадьевич

Зверев Виталий Васильевич

Пугач Андрей Викторович

Малюшова Вера Васильевна

Даты

1997-11-20Публикация

1994-06-14Подача